KR20140060323A - 심혈관 병폐의 약리유전학적 치료를 위한 방법들 및 시스템들 - Google Patents

Abstract

본 명세서에서는 개인에서 로스타퓨록신 (rostafuroxin)과 연관된 생물학적 활성들에 미치는 유전적 변이들 (genetic variations)의 효과들에 근거하는 방법들 및 시스템들이 제공된다. 상세하게는, 본 명세서에서 KCNS3, THSD7A, FAM46A, LOC389970, HLA-G, 및 TTC29로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 유전자의 유전자간 (intergenic) 또는 유전자내 (intragenic) 부위에서의 하나 이상의 다형성증들 (polymorphisms) 및/또는 이들의 연관 불균형 (linkage disequilibrium)에서의 유전적 변이의 로스타퓨록신에 대한 개인 반응에 미치는 확인된 영향에 근거하는 조성물들, 방법들 및 시스템들이 기술되고 있다.

Description

심혈관 병폐의 약리유전학적 치료를 위한 방법들 및 시스템들 {METHODS AND SYSTEMS FOR PHARMACOGENOMIC TREATMENT OF CARDIOVASCULAR CONDITIONS}

본 발명은 본 명세서에서 전체적으로 로스타퓨록신 (rostafuroxin)으로서 표시되는, 17β-(3-퓨릴)-5β-안드로스탄-3β, 14β, 17α-트리올에 의해 형성되는 화합물들의 부류, 및 그들의 유도체들에 관한 것이다.

로스타퓨록신 (rostafuroxin)은 개인들에게 생물학적 활성을 가지는 것으로 알려진 화합물이다. 상세하게, 로스타퓨록신은 개인들의 심혈관 시스템에 미치는 활성을 가지는 것으로 밝혀져 왔으며, 이에 제한되는 것은 아니지만 심부전, 관상 심장 질환 (CHD), 뇌졸중 및 신부전을 포함하는 동맥성 고혈압 및 관련된 기관 합병증들과 같은 심혈관 장애들의 치료를 위해 개발 중에 있다.

보다 상세하게, 로스타퓨록신은 혈압 또한 이에 제한되는 것은 아니지만 우아바인 (ouabain) 또는 ADD1, ADD2, ADD3와 같은 세포골격 애덕신 (adducin)을 코딩하는 유전자들의 유전적 변이들에 의해 유발되는 Na-K 펌프 및 Src에서의 변경들 (alterations)을 정상화시키는 화합물인 것으로 밝혀져 왔다.

또한, 로스타퓨록신은 과다한 단백뇨 (proteinuria), 사구체 경화증 (glomerulosclerosis) 및 신부전을 유발하는 발세포 (podocyte) 단백질들의 변경들을 정상화시키고, 동맥절개술 (arteriotomy) 및 혈관성형술 (angioplasty) 이후에 동맥 협착증 (arterial stenosis)을 유발하는 생물학적 공정들을 길항할 수 있는 것으로 밝혀져 왔다.

본 명세서에서는 로스타퓨록신에 대한 개인의 반응에 미치는 유전적 변이들의 영향에 근거하는 로스타퓨록신의 치료적 및/또는 분석적 용도들을 허용하는 방법들 및 시스템들이 여러 가지 구현예들로 제공된다.

상세하게, 본 명세서에서는 KCNS3, THSD7A, FAM46A, LOC389970, HLA-G, 및 TTC29로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 유전자의 유전자간 (intergenic) 또는 유전자내 (intragenic) 부위에서의 하나 이상의 다형성증들 (polymorphisms) 및/또는 이들의 연관 불균형 (linkage disequilibrium)에서의 유전적 변이의 로스타퓨록신에 대한 개인 반응에 미치는 확인된 영향에 근거하는 조성물들, 방법들 및 시스템들이 기술되고 있다. 상기 부위들은 이전에 인간에서 심혈관 병폐 (cardiovascular condition), 유전적 성향 (genetic predisposition) 또는 약물 반응과 상호관련 있는 것으로 알려진 바가 전혀 없었다.

보다 상세하게, 본 명세서에서는 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증들 (본 명세서에서는 코아 SNPs라고도 불림) 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이의 로스타퓨록신에 대한 개인 반응에 미치는 확인된 영향에 근거하는 조성물들, 방법들 및 시스템들이 기술된다.

첫 번째 관점에 따르면, rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이의 보균자인 것으로 선택되었던 개인에서, 심혈관 병폐의 치료 또는 예방에 사용되는 로스타퓨록신이 기술되고 있다. 한 가지 구현예에서, 개인에서 심혈관 병폐를 치료하거나 예방하는 방법이 기술된다. 본 방법은 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증, 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이의 보균자인 것으로 결정되었던 개인에게, 로스타퓨록신을 투여하거나 처방하는 것을 포함한다.

두 번째 관점에 따르면, 0.005 mg/일로부터 5 mg/일까지 범위의 용량으로 약제로서 사용되는 로스타퓨록신이 기술된다. 상세하게, rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375의 적어도 하나를 포함하는 유전형, 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이를 가지도록 선택되었던 개인을 치료하기 위한 0.005 mg/일로부터 5 mg/일까지의 용량으로 로스타퓨록신의 용도가 기술된다. 상세하게는, 한 가지 구현예에서 로스타퓨록신으로 개인을 치료하는 방법이 기술된다. 본 방법은 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375의 적어도 하나를 포함하는 유전형, 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이를 가지도록 결정되었던 개인에게 0.05 mg/일로부터 5 mg/일까지의 용량으로, 상세하게는 0.05 mg/일로부터 0.5 mg/일까지의 용량으로 로스타퓨록신을 투여하거나 처방하는 것:을 포함한다.

세 번째 관점에 따르면, 개인에서 로스타퓨록신을 사용한 치료법 (therapy)을 평가하는 방법 및 시스템이 기재되어 있다. 본 방법은 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증, 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이에 대한 개인 서열 정보를 검출하고; 또한 검출된 서열 정보에 근거하여 개인에서 로스타퓨록신을 사용한 치료법을 결정하는 것을 포함한다. 상세하게, 서열 정보는 개인의 분리된 DNA 시료로부터 또는 서열 정보를 제공하는 데 적합한 개인의 기타 다른 분리된 시료들에서 검출될 수 있다. 본 시스템은 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증, 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이에 대한 프로브 (probe); 또한 0.005 mg으로부터 5 mg/일까지, 상세하게는 0.05 mg으로부터 0.5 mg/일까지 범위의 용량으로 로스타퓨록신, 및 약제학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 약제학적 조성물을 포함한다.

네 번째 관점에 따르면, 개인에서 로스타퓨록신에 대한 반응을 예측하는 방법 및 시스템이 기재되어 있다. 본 방법은 KCNS3, THSD7A, FAM46A, LOC389970, HLA-G, 및 TTC29로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 유전자의 유전자간 또는 유전자내 부위에 대한 개인의 유전형을 검출하고, 또한 로스타퓨록신에 대한 기지의 반응과 연관된, rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증을 포함하는 이전에 확인된 유전형들을 비교하는 것:을 포함한다. 본 시스템은 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증에 대한 프로브, 또한 프로브 혼성화의 결과들 및 이전에 확인된 유전형들을 관련시키는 조사 표 (look-up table)를 포함한다. 상세하게, 유전형을 검출하는 것은 개인의 분리된 DNA 시료로부터 또는 유전형에 관한 정보를 제공하는 데 적합한 개인의 기타 다른 분리된 시료들에서 수행될 수 있다. 본 방법 및 시스템에서, 개인에서 확인된 유전형이 로스타퓨록신 반응과 연관된 것과 동일한 유전형인 경우라면, 로스타퓨록신에 대한 개인의 반응은 기지의 반응이 될 것으로 예측된다.

다섯 번째 관점에 따르면, KCNS3, THSD7A, FAM46A, LOC389970, HLA-G, 및 TTC29로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 유전자의 유전자간 또는 유전자내 부위에서 단일 뉴클레오타이드 다형성증 (single nucleotide polymorphism, SNP)를 검출하는 방법 및 시스템이 기재되어 있다. 상세하게, 유전형을 검출하는 것은 개인의 분리된 DNA 시료로부터 또는 유전형에 관한 정보를 제공하는 데 적합한 개인의 기타 다른 분리된 시료들에서 수행될 수 있다. 본 시스템은 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9 및 서열번호 11의 뉴클레오타이드 서열들의 어느 하나에서 단일 뉴클레오타이드 다형성증 (SNP)을 포함하는 핵산 분자에 특이적으로 혼성화하는 분리된 폴리뉴클레오타이드; 완충용액; 또한 효소를 포함한다. 본 방법은 KCNS3, THSD7A, FAM46A, LOC389970, HLA-G, 및 TTC29로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 유전자의 유전자간 또는 유전자내 부위들을 포함하는 게놈 단편들을 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9 및 서열번호 11로부터 나온 뉴클레오타이드 서열들의 적어도 하나 또는 그들의 일부분에 대한 단일 염기 특이 프로브와 접촉시키는 것을 포함한다. 상세하게, 접촉시키는 것은 개인의 분리된 DNA 시료로부터 또는 게놈 단편들에 관한 정보를 제공하는 데 적합한 개인의 다른 분리된 시료들에서 수행될 수 있다.

여섯 번째 관점에 따르면, 뉴클레오타이드들의 하나가 서열번호 2, 서열번호 4, 서열번호 6, 서열번호 8, 서열번호 10, 및 서열번호 12, 또는 그들의 상보체에서 뉴클레오타이드 서열들의 어느 하나로부터 선택되는 단일 뉴클레오타이드 다형성증 (SNP)인 적어도 약 100개의 연속된 뉴클레오타이드들을 포함하는 분리된 핵산 분자가 기재되어 있다.

일곱 번째 관점에 따르면, 심혈관 병폐를 치료적으로 또는 예방적으로 치료하는 데 유용한 제제를 확인하는 방법 및 시스템이 기재되어 있다.

본 방법은 후보 제제 (candidate agent)를 제공하고; 후보 제제를 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증, 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이를 보유하는 개인에게 투여하고; 또한 상기 후보 제제에 대한 개인 반응을 검출하는 것을 포함한다.

여러 가지 구현예들에서, 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들은 심혈관 병폐, 상세하게는 고혈압의 치료법의 성공률을 현재 30 - 40%로부터 약 80%까지 증가시키는 것을 허용한다.

여러 가지 구현예들에서, 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들은 치료 받은 적이 없는 개인들에서 심혈관 병폐, 상세하게는 고혈압을 위한 치료법의 성공률을 증가시키는 것을 허용한다.

여러 가지 구현예들에서, 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들은 반응자 (responder) 개인들을 선택하고 유효 용량을 감소시켜서 가능한 원치 않는 부작용들의 결과로서 역효과 및 부작용의 비율을 이용 가능한 치료법들에 비하여 감소시키는 데 사용될 수 있다.

본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들은 개인에서 로스타퓨록신의 활성이라면 모두와 연관된 의학적, 진단적 및 화장품 및 약제학적 적용들과 같은 적용(application)이라면 모두와 연결하여 적용될 수 있다.

본 기재내용의 하나 이상의 구현예들의 자세한 사항들은 하기 첨부된 도면들 및 기술내용에서 설명되어 있다. 기타 다른 특징들, 목적들, 및 장점들은 본 기술내용 및 도면들로부터, 또한 청구항들로부터 자명해질 것이다.

본 기재내용은 2009년 10월 19일자로 제출된 "심혈관 병폐의 약리유전학적 치료를 위한 방법들 및 시스템들"이라는 제목으로 된 미국 가특허출원 제 S/N 61/253,020호 및 2009년 11월 25일자로 제출된 "심혈관 병폐의 약리유전학적 치료를 위한 방법들 및 시스템들"이라는 제목으로 된 유럽 특허출원 제 S/N 09177111.3호와 관련되고 이들에 대한 우선권을 주장하고 있으며, 이들 각각의 기재내용은 본 명세서에서 참고문헌으로 전부 통합되어 있다.

본 명세서에서는 개인에서 로스타퓨록신과 연관된 생물학적 활성에 미치는 유전적 변이의 효과들에 근거하는 방법들 및 시스템들이 제공된다.

상세하게, 본 명세서에서 제공되는 방법들 및 시스템들은 KCNS3, THSD7A, FAM46A, LOC389970, HLA-G, 및 TTC29로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 유전자의 유전자간 (intergenic) 또는 유전자내 (intragenic) 부위에서의 다형성증 (polymorphism) 및/또는 이들의 연관 불균형 (linkage disequilibrium)에서의 유전적 변이에 근거하고 있다.

보다 상세하게, 본 명세서에서 기술된 조성물들, 방법들 및 시스템들은 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 하나 이상의 다형성증, 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이의 로스타퓨록신에 대한 개인 반응에 미치는 확인된 영향에 근거하고 있다.

본 명세서에서 사용되는 바, "유전적 변이 (genetic variation)" 또는 "다형성증 (polymorphism)"은 개인들의 집단에서 유전적 다양성 (diversity)를 의미하고, 상세하게는 DNA 또는 염색체 부위의 변경된 상태이다. 대표적인 다형성증들은 VNTR (다양한 수의 일렬 반복서열들 (variable number of tandem repeats), 소염색체 (minisatellite) 및 미세염색체 (microsatellite)라고도 알려져 있음), 염기쌍 치환, 염기쌍 삽입, 염기쌍 결실, 핵형에서 변화 (이수성, 배수성) 또한 염색체 재배열 (결실, 전위, 역위)을 포함한다.

본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "로스타퓨록신 (rostafuroxin)"은 17β-(3-퓨릴)-5β-안드로스탄-3β, 14β, 17α-트리올, 및 그의 유도체들에 의해 형성되는 부류의 화합물이라면 모두를 의미한다. 보다 상세하게는, 로스타퓨록신 화합물들은 화학식 1의 화합물들이다.

화학식 1

여기에서: 기호

는 17번 위치에서 치환들이 α 또는 β 입체형태를 가질 수 있는 것을 의미하고; 기호

는 단일 또는 이중 결합을 나타내고; Y는 3번 위치에서 기호

가 이중 결합일 때, 산소 또는 구아니디노이미노이고; Y가 3번 위치에서 기호

가 단일 결합일 때, 하이드록시, OR⁴ 또는 SR⁴이고 α또는 β 입체형태를 가질 수 있고;

R은 비치환 또는 치환된 3-퓨릴 또는 4-피리다지닐 그룹이고;

R¹은 수소; 메틸; 에틸 또는 OH 또는 NR⁵R⁶에 의해 치환된 n-프로필이고;

R²는 수소이거나 R³와 함께 옥시란 고리의 결합이고;

R³는 수소이거나 R²와 함께 옥시란 고리의 결합이고;

R⁴는 수소; 메틸; C2-C6 알킬 또는 C3-C6 알케닐 또는 C2-C6 아실이고, 이들 알킬, 알케닐 및 아실 그룹들은 사차 암모니움 그룹 또는 하나 이상의 OR⁷, NR⁸R⁹, 포르밀, 아미디노, 구아니디노이미노에 의해 또는 NR⁸R⁹ 및 하이드록시에 의해 비치환 또는 치환되고;

R⁵, R⁶은 독립적으로 수소; 메틸; 하나의 NR¹⁰R¹¹ 또는 NR¹⁰R¹¹ 및 하이드록시에 의해 비치환 또는 치환된 C2-C6 알킬이거나, 질소 원자와 함께 가져온 R⁵ 및 R⁶은 비치환 또는 치환된 포화 또는 불포화 펜타- 또는 헥사-모노헤테로사이클 고리를 형성하고, 임의적으로 산소 또는 황 또는 질소로부터 선택되는 또 다른 헤테로원자를 포함하고;

R⁷은 수소, 메틸, 또는 C2-C4 알킬이고, 본 알킬은 하나 이상의 NR¹⁰R¹¹에 의해 또는 NR¹⁰R¹¹ 및 하이드록시에 의해 비치환 또는 치환되고;

R⁸, R⁹는 독립적으로 수소; 메틸; C2-C6 알킬 또는 C3-C6 알케닐이고, 이들 알킬 또는 알케닐 그룹들은 하나 이상의 NR¹⁰R¹¹ 또는 NR¹⁰R¹¹ 및 하이드록시에 의해 비치환 또는 치환되고, 또는 질소 원자와 함께 가져온 R⁸ 및 R⁹는 비치환 또는 치환된 포화 또는 불포화 펜타- 또는 헥사-모노헤테로사이클 고리를 형성하고, 임의적으로 산소 또는 황 또는 질소로부터 선택되는 또 다른 헤테로원자를 포함하거나, R⁸은 수소이면서 R⁹는 아미디노이고;

R¹⁰, R¹¹은 독립적으로 수소, C1-C6 알킬이거나, 질소 원자와 함께 가져온 R¹⁰ 및 R¹¹은 포화 또는 불포화 펜타- 또는 헥사-모노헤테로사이클 고리를 형성한다.

상세하게는, 본 명세서에서 사용되는 바 용어 로스타퓨록신은 모든 가능한 입체이성질체들, 상세하게 Z 및 E 이성질체들, 광학 이성질체들 및 그들의 혼합물들뿐만 아니라 화학식 1의 화합물들의 대사물들 및 대사 전구체들을 포함한다.

본 명세서에서 사용되는 바 용어 "유도체 (derivative)"는 화학식 1의 화합물과 연관된 생물학적 활성들의 적어도 하나를 보유하는 화학적으로 변형된 화학식 1의 화합물을 의미한다. 예를 들어, 화학적 변형들은 알킬, 아실, 하이드록실, 또는 아미노 그룹에 의한 수소의 치환 또한 당업자라면 확인 가능한 추가적인 변형들을 포함할 수 있다.

참고문헌도 역시 미국 특허 제 US 5,591,734호, Bianchi al., 2003, 및 Quadri et al 1997 [문헌 4, 5] 또한 관련된 도움 정보로 작성되어 있고 (각각은 본 명세서에서 참고문헌으로 전부 통합되어 있음), 이들은 로스타퓨록신 화합물들의 합성 및 생물학적 활성을 기술하고 있다.

로스타퓨록신과 연관된 추가적인 생물학적 활성들은 Ferrari P. et al., 1998 [문헌 6]에 기술되고, 역시 본 명세서에서 참고문헌으로 전부 통합되어 있다.

용어 "생물학적 활성 (biological activity)"은 로스타퓨록신과 관련하여 본 명세서에서 사용되는 바 살아있는 물질에 미치는 로스타퓨록신의, 또는 이에 관한 효과들이라면 모두의 질 (quality) 또는 상태 (state)를 의미한다. 로스타퓨록신의 생물학적 활성들은, 이에 제한되는 것은 아니지만 우아바인 (ouabain) 고혈압 효과의 선택적인 저해, 우아바인에 의해 유발된 Na-K 펌프 및 Src에서 변경들 (alterations)의 정상화 (normalization), 또한 내인성 우아바인 수준들 및 Na-K 펌프와 Src에서 변경들의 동시적인 증가에 의해 지속되는 고혈압 형태들에서 정상화를 포함한다. 상세하게, 로스타퓨록신의 생물학적 활성들은 내인성 우아바인의 합성 및 운반에 관여하는 애덕신 (adducin) 또는 다른 효소들을 코딩하는 유전자들의 유전적 변이들과 연관된 고혈압 효과의 선택적인 길항작용 (antagonism), 애덕신 유전적 변이들에 의해 유발된 Na-K 펌프 및 Src에서 변경들의 정상화 [문헌 1, 2, 3], 또한 애덕신 유전적 변이들 및 Na-K 펌프와 Src에서 변경들의 동시적인 효과에 의해 지속되는 고혈압 형태들에서 정상화를 포함한다. 로스타퓨록신의 생물학적 활성들은 또한, 이에 제한되는 것은 아니지만 과다한 단백뇨, 사구체 경화증 및 신부전을 유발하는 발세포 단백질들의 변경들의 정상화, 동맥절개술 및 혈관성형술 이후에 동맥 협착증을 유발하는 생물학적 공정들의 길항작용 또한 당업자라면 본 기재내용의 해독 시 확인 가능한 추가적인 활성들을 포함한다.

본 기재내용에 기술된 바와 같이, 로스타퓨록신과 연관된 생물학적 활성들은 개인들의 유전적 변이들에 의해 영향을 받기 때문에, 여러 가지 구현예들에서 로스타퓨록신을 사용한 치료는 유전적 변이들을 표현하지 않는 개인들에서 나타나는 생물학적 활성에 비하여 증진된 생물학적 활성을 유도한다.

또한 로스타퓨록신 활성은 용량-의존적이기 때문에, 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들은 여러 가지 구현예들에서 유전자 변이들을 보유하는 개인들에게 이에 해당하는 가능한 부작용들의 감소와 함께, 로스타퓨록신의 효과적인 투여를 허용한다.

개인에서 로스타퓨록신과 연관된 검출 가능한 생물학적 활성들은 로스타퓨록신에 대한 개인의 반응을 정의한다. 생물학적 활성들은 당업자라면 확인 가능한 방법들 및 기법들로 검출될 수 있고, 이들은 이에 제한되는 것은 아니지만 생물학적 활성과 연관된 바이오마커들의 검출, 또한 활력 징후들 (vital signs) 및 특정하게 개인의 혈압에 관련하여 개인에서 생물학적 활성과 연관된 기타 다른 임상적 정보의 검출을 포함한다.

본 발명의 여러 가지 구현예들에서, 본 발명의 기재내용에 따른 유전적 변이를 보유하는 개인에게 로스타퓨록신의 투여는 개인에서 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응을 유도한다.

상세하게 본 발명의 기술내용의 의미에서, "개선된 반응 (improved response)"은 개인에서 검출되는 바와 같은 로스타퓨록신의 증진된 활성들을 의미하고, 이는 여러 가지 구현예들에서 고혈압의 예방, 혈압의 감소, 혈압의 정상화, 또한 심혈관, 신장, 혈관, 안구 및 신경 손상들 또는 고혈압과 연관된 합병증들의 예방을 포함한다. 상세하게, 개선된 반응은 여러 가지 구현예들에서 치료를 시작하기 이전에 개인에서 측정되는 혈압에 비하여 치료실 수축기 혈압 (office systolic blood pressure)의 약 23 mmHg로부터 약 12 mmHg까지 범위의 평균 감소에 의해 정의될 수 있다.

여러 가지 구현예에서, 개선된 반응은 치료를 시작하기 이전에 개인에서 측정되는 혈압에 각각 대비하여, 개인들의 치료실 수축기 혈압 및/또는 야간 혈압의 적어도 약 15 및 약 9 mmHg의 평균 감소에 의해 정의될 수 있다. 또한 여러 가지 구현예들에서, 개선된 반응은 하이드로클로로티아자이드 (Hydrochlorothiazide, HCTZ) 또는 로사탄 (Losartan)과 같은 다른 항고혈압제 (antihypertensive)의 투여 이후에 개인에서 검출되는 해당 평균 감소보다 유의하게 더 큰 (예로, 40% 이상) 치료실 수축기 혈압의 적어도 하나가 되는, 개인들의 치료실 수축기 혈압 및/또는 야간 혈압의 평균 감소에 의해 정의될 수 있다.

혈압과 관련하여 본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "평균 감소 (average decrease)" 또는 "평균 강하 (average drop)"는 검출될 혈압의 견지에서 (예로, 야간 또는 치료실 혈압) 의학적 지침들에 따라 정해진 선결정된 시간 동안 개인에게 수행된 혈압 측정 세트의 중간 또는 기대 수치의 척도가 되는 감소를 의미한다. 평균 감소를 계산하도록 혈압 측정의 중심 경향성 (central tendency)의 측정으로서 사용될 수 있는, 측정의 특정한 시간대 및 설명적 통계학은 당업자라면 본 기재내용의 해독 시 확인 가능하다.

본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "치료실 혈압 (office blood pressure)"은 혈압계 (sphygmomanometer), 전자 BP 기록계 또는 당업자라면 확인 가능한 추가적인 장치와 같은 적합한 장치에 의해 외래에서 의사가 측정하는 혈압 수준을 의미한다.

본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "야간 혈압 (nightly blood pressure)"은 전자 혈압 기록계, 상세하게 홀터의 방법 (Holter's method)에 따라 또는 당업자라면 확인 가능한 추가적인 장치와 같은 적합한 장치에 의해 야간에 전형적으로 오후 12시로부터 오전 6시까지 기록되는 혈압 수준들을 의미한다.

본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "하이드로클로로티아자이드 (hydrochlorothiazide)"는 신장의 물을 보유하는 능력을 저해하여 작용하고 화학식 6-클로로-1,1-디옥소-3,4-디하이드로-2H-1,2,4-벤조티아디아진-7-설폰아마이드를 가지는 티아자이드 부류의 1세대 이뇨 약물을 의미한다.

본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "로사탄 (losartan)"은 고혈압을 치료하도록 주로 사용되고 화학식 (2-부틸-4-클로로-1-{[2'-(1H-테트라졸-5-일)비페닐-4-일]}-1H-이미다졸-5-일)메탄올을 가지는 안지오텐신 Ⅱ 수용체 길항제 약물을 의미한다.

본 발명에 따르면, 로스타퓨록신에 대한 개인의 반응은 소정의 유전적 변이들, 상세하게는 개인의 유전형에서 검출가능한 단일 뉴클레오타이드 다형성증들에 의해 영향을 받는다. 본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "단일 뉴클레오타이드 다형성증 (single nucelotide polymorphism)" 또는 "SNP"는 점 돌연변이 (point mutation)라고도 불리는 단일 염기쌍 치환 (single base pair substitution)에 의해 형성되는 유전적 변이를 의미한다. 본 기재내용에 따르면, SNPs 또는 점 돌연변이는 유전자의 유전자간 (예로, 유전자의 인트론 또는 엑손 부위들에서) 또는 유전자 사이에 끼어있는 (flanking) 유전자간 부위들에서 위치할 수 있고, 이는 전형적으로 조절 기능들 또는 미지의 기능을 가지는 게놈 부위들로 구성된다.

본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "개인들 (individuals)"은 고등 동물과 같은 단일 생물학적 생명체, 상세하게는 포유동물과 같은 척추동물, 보다 상세하게는 인간을 의미한다.

본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "유전형 (genotype)"는 고려되는 유전적 변이들 각각에 대한 동종유래 (homologous) 염색체들 상에 위치하는 대립유전자들 (alleles)의 조합을 의미한다. 상세하게 본 기재내용에서는, 특이적 유전자 또는 자리 (position)를 위한 유전형 1 (g1)은 특이적 유전자 또는 자리를 위한 덜 흔한 동형접합 (homozygous) 유전형의 연관성을 의미하고, 특이적 유전자 또는 자리를 위한 유전형 2 (g2)는 특이적 유전자 또는 자리를 위한 이형접합 (heterozygous) 유전형의 연관성을 의미하고, 또한 특이적 유전자 또는 자리를 위한 유전형 3 (g3)은 특이적 유전자 또는 자리를 위한 더 흔한 동형접합 유전형의 연관성을 의미한다.

여러 가지 구현예들에서, 개인에서 로스타퓨록신 활성들에 영향을 주는 유전적 변이들은 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 SNP (본 명세서에서는 "코아 SNPs (core SNPs)"라고도 불림) 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이를 포함한다. 본 명세서에서 코아 SNPs 뿐만 아니라 다른 SNPs는 종종 국립 생물기술학 정보센터 (National Center for Biotechnology Information, NCBI)에 의해 확립되고, 예를 들어 본 출원의 제출일에 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/에서 입수가능한 dbSNP rsID 인식자들 (identifiers)를 사용하여 표시된다. 본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "연관 불균형 (linkage disequilibrium)"은 반드시 동일한 염색체 상일 필요는 없지만 둘 이상의 유전자좌에서 대립유전자들의 작위적 (non-random) 연관성을 의미하고, 대립유전자들 또는 유전적 마커들의 일정 조합들이 그들의 빈도에 근거하여 대립유전자로부터 나온 반수체들의 무작위적 형성으로부터 예상될 수 있는 것보다 다소간 흔히 집단에서 발생하는 상황에 관한 것이다. 서로 다른 유전자좌에서 다형성증들 간 작위적 연관성은 연관 불균형 (LD)에 의해 측정된다. 본 발명에 표시된 연관 불균형에서의 유전적 변이들은 0.9 - 1 범위의 연관 불균형 r2의 수준을 가지고 당업자라면 본 기재내용의 해독 시 진뱅크 (GenBank) 출처를 사용하여 확인할 수 있다.

일정 구현예들에서, 로스타퓨록신에 대한 개인의 반응에 미치는 유전적 변이들의 효과들은 본 명세서에서 기술된 로스타퓨록신 치료법을 수행하거나 평가하는 방법들에서 고려된다. 본 명세서에서 사용되는 바, 관련된 용어들 "치료법 (therapy)", "치료적 (therapeutic)" 및 "치료적으로 (therapeutically)"는 개인에서 병폐의 치료 또는 예방의 또는 이에 관한 항목을 의미하고, 상세하게 로스타퓨록신이 언급될 때, 개인에서 로스타퓨록신과 연관된 생물학적 활성이라면 모두와 연관된 병폐의 치료 또는 예방의 또는 이에 관한 항목을 의미한다.

본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "병폐 (condition)"는 보통 완전한 신체적, 정신적 및 가능하게는 사회적 복지 (well-being)와 연관된 개인 (전부 또는 그의 일부의 하나 이상)의 물리적 상태와는 일치하지 않는 개인 신체의 물리적 상태를 의미한다. 본 명세서에서 기술되는 병폐로는, 이에 제한되는 것은 아니지만 장애들 및 질환들을 포함하고, 여기에서 용어 "장애 (disorder)"는 신체 또는 그의 일부라면 모두의 기능적 이상 (abnormality)와 연관된 살아있는 개인의 병폐를 의미하고, 용어 "질환 (disease)"은 신체 또는 그의 일부라면 모두의 정상적 기능성을 손상시키고 전형적으로 구별되는 징후들 및 증상들에 의해 표현되는 살아있는 개인의 병폐를 의미한다. 대표적인 병폐로는, 이에 제한되는 것은 아니지만 외상들, 불구들 (disabilities), 장애들 (정신적 및 신체적 장애들), 증후군들, 감염들, 개인의 일탈 행동들 또한 개인의 신체 또는 그의 일부들의 구조 및 기능들의 비정상적 변화들을 포함한다.

본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "연관된 (associated to)"은 두 가지 항목들과 관련하여 두 가지 항목들 간의 관련성을 의미하고, 첫 번째 항목의 발생은 두 번째 항목의 발생을 수반하고, 이는 이에 제한되는 것은 아니지만 원인-효과 관련성 및 징후/증상들-질환 관련성을 포함한다.

개인에서 로스타퓨록신과 연관된 생물학적 활성과 연관된 병폐는 이에 제한되는 것은 아니지만 심혈관 병폐 (예로, 일차 고혈압 (primary hypertension), 심장 비대 (cardiac hypertrophy), 증가된 혈관 저항 (increased vascular resistances) 및 동맥성 협착증 (arterial restenosis)를 포함하는 고혈압), 신부전 (renal failure), 사구체 경화증 (glomerulosclerosis), 단백뇨 (proteinuria), 다낭성 신장 질환 (polycistic renal disease), 뇌혈관 장애 (cerebrovascular damage), 메니에르 증후군 (Meniere syndrome), 인식 장애 (cognitive disorders), 양극성 장애 (bipolar disorders), 및 심부전 (cardiac failure), 뇌졸중 (stroke), 허혈 (ischemia), 망막 손상 (retinal damage)과 같은 일차 고혈압과 연관된 심혈관 합병증들 또한 당업자라면 확인가능한 추가적인 병폐들을 포함한다.

용어 "일차 고혈압 (primary hypertension)"은 신전국 사회들에서 성인 인구의 25-30%가 앓고 있고 그의 심장, 뇌 및 신장 합병증들을 통해 건강 부담 및 비용의 많은 비율을 차지하는 임상적 병폐를 의미하고, 혈압의 수준 및 당업자라면 확인가능한 연관된 혈관, 망막 합병증의 존재에 근거하는 제 I기, 제 Ⅱ기, 제 Ⅲ기, 제 Ⅳ기 고혈압을 포함한다.

본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "치료 (treatment)"는 의학적으로 또는 외과적으로 병폐를 위한 진료의 일부분이거나 이를 다루는 활성이라면 모두를 의미한다. 본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "예방 (prevention)"은 개인에서 병폐로부터 치사율 또는 유병률의 부담을 감소시키는 활성이라면 모두를 의미한다. 이것은 일차, 이차 및 삼차 예방 수준들로 발생하고, 여기에서: a) 일차 예방은 질환의 발생을 피하고; b) 이차 예방 활성들은 초기 질환 치료를 목표로 하고, 이에 의해 질환의 진행 및 증상들의 출현을 예방하도록 개입의 기회를 증가시키며; 또한 c) 삼차 예방은 기능을 회복시키고 질환-관련 합병증들을 감소시켜서 이미 확립된 질환의 부정적인 충격을 감소시킨다.

상세하게는 일정 구현예들에서, 개인의 유전형에서 SNPs에 관한 정보가 개인에서 심혈관 병폐를 치료하거나 예방하는 방법으로서 사용된다. 이들 구현예들에서, 로스타퓨록신은 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증의 보균자 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이의 보균자가 되도록 결정되었던, 개인에게 투여되거나 처방된다.

상세하게는 일정 구현예들에서, 하나 이상의 코아 SNPs를 보유하는 개인들은 실시예 섹션에서 자세하게 기술된 바와 같이 위약을 사용한 치료의 측면에서 치료법 이후에 측정되는 개인에서 적어도 15 mmHg의 혈압의 평균 감소로 형성되는 정량적 표현형 (DSBP5_0)을 기초로 하여 계산될 수 있는 개인에서 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응을 나타낸다.

여러 가지 구현예들에서, 정량적 표현형 DSBP5_0을 기초로 하여, 하나 이상의 코아 SNPs를 보유하는 개인들은 치료받은 적 없는 환자들에서 HCTZ 또는 로사탄과 같은 기타 항고혈압 제제들을 사용하여 획득되는 평균 혈압 강하보다 로스타퓨록신을 사용하여 획득되는 약 40% 이상, 상세하게는 약 40% 내지 50% 이상이 되는 평균 혈압 강하의 크기에 의해 정의되는 (유의하게 치료 이전의 수치들과 대비됨)개선된 반응을 나타낸다.

여러 가지 구현예들에서, 하나 이상의 코아 SNPs를 보유하는 개인들은 실시예 섹션에서 자세하게 기술된 바와 같이 위약을 사용한 치료의 측면에서 치료법 이후에 측정되는 개인에서 적어도 9 mmHg의 야간 혈압의 평균 감소에 의해 형성되는 정량적 표현형 (DSBP5_0)을 기초로 하여 계산될 수 있는 개인에서 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응을 나타낸다.

또한, DSBP5_0는 실시예 섹션에 보고된 통계적 및 실험적 분석의 정량적 표현형이기 때문에, 혈압의 평균 강하에 의해 정의되는 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 바이오마커들 또는 혈압 측정이 아닌 임상적 정보를 사용하여 검출가능한 로스타퓨록신과 연관된 생물학적 활성들이라면 모두에 의해 정의되는 대표적인 개선된 반응이라면 모두라고 사료된다. 따라서, 바이오마커들 또는 혈압 측정이 아닌 임상적 정보를 사용하여 검출가능한 로스타퓨록신과 연관된 생물학적 활성들이라면 모두에 의해 정의되는 개선된 반응은 본 발명의 기재내용의 범위 이내에 포함되고 당업자라면 확인 가능하다.

본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들의 일정 구현예들에서, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 다음의 코아 SNPs의 하나 이상을 보유하는 개인에게 로스타퓨록신을 투여하거나 처방하여 성취된다: 염색체 6 (rs2345088)의 자리 18079898번에서 뉴클레오타이드 C 또는 T, 염색체 7 (rs16877182)의 자리 11753617번에서 뉴클레오타이드 C 또는 T, 염색체 6 (rs16893522)의 자리 82560511번에서 뉴클레오타이드 G 또는 A, 염색체 10 (rs2461911)의 자리 57078480번에서 뉴클레오타이드 G 또는 A, 염색체 6 (rs5013093)의 자리 29928565번에서 뉴클레오타이드 C 또는 T, 또한 염색체 4 (rs12513375)의 자리 148244380번에서 뉴클레오타이드 T 또는 G.

본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들의 일정 구현예들에서, 로스타퓨록신은 단독으로 또는 서로의 조합으로 다음의 유전형들의 적어도 하나의 보균자가 되는 개인에게 투여되거나 처방된다: rs2345088의 경우 유전형 TT 또는 유전형 1, rs16877182의 경우 유전형 C/T 또는 유전형 2, rs16893522의 경우 유전형 AA 또는 유전형 1, rs2461911의 경우 유전형 AA 또는 유전형 1, rs5013093의 경우 유전형 TT 또는 유전형 1, 또한 rs12513375의 경우 유전형 TT 또는 유전형 1.

상세하게, 상기 나열된 SNPs라면 모두를 위한 적어도 하나의 적절한 유전형의 단독으로 또는 서로 조합으로의 존재는 개인에서 용량들 또는 유전형들의 조합에 따라 (프로파일들은 실시예 섹션을 참조하라) 23으로부터 12 mmHg까지 범위의 DSBNP5_0 평균 수축기 혈압 감소와 연관된다.

여러 가지 구현예들에서, 하나 이상의 코아 SNPs 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이들은 개인에서 로스타퓨록신에 대한 반응에도 역시 영향을 주는 하나 이상의 추가적인 유전적 변이들과 연관될 수 있고, 이로는 실시예 섹션에서 자세하게 기술되는 CAND 1, CAND 2 및 GWS로서 확인되는 SNPs를 예로 들 수 있다. 상세하게 개인에서 로스타퓨록신에 대한 반응에도 역시 영향을 주는 하나 이상의 추가적인 유전적 변이들은 애덕신 발현 및 내인성 우아바인 (Endogenous Ouabain, EO) 합성과 운반에 직접적으로 또는 간접적으로 관여하는 유전자들의 그룹을 포함한다. 이들 유전자들은 이에 제한되는 것은 아니지만 ADD1, ADD2, ADD3, LSS, CYP11A1, HSD3B1-2, SLCO4C1, MDR1 및 관련된 다형성증들과 같은 CAND 1 유전자들을 포함한다.

본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들의 여러 가지 구현예들에서, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 다음의 추가적인 적절한 CAND 1 SNPs의 적어도 하나를 단독으로 또는 코아 SNPs와 조합으로 보유하는 개인에게 로스타퓨록신을 투여하거나 처방하는 것과 연결하여 검출된다: rs4961, rs4984, rs3731566, rs914247, 및 rs1045642 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이.

상세하게 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들의 여러 가지 구현예들에서, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 다음의 CAND 1 유전형들의 단독으로 또는 코아 SNPs에 대한 유전형의 조합으로 적어도 하나의 보균자인 개인에게 로스타퓨록신을 투여하거나 처방하는 것과 연결하여 검출된다: rs4961의 경우 GT, rs4984의 경우 CT, rs3731566의 경우 AG, rs914247의 경우 GA, 및 rs1045642의 경우 TC. 상세하게, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 rs914247의 경우 CAND 1 유전형 AA의 보균자인 개인에게 로스타퓨록신을 투여하거나 처방하는 것과 연결하여 검출된다.

본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들의 여러 가지 구현예들에서, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 다음의 추가적인 적절한 CAND 2 SNPs의 적어도 하나를 단독으로 또는 코아 SNPs와의 조합으로 보유하는 개인에게 로스타퓨록신을 투여하거나 처방하는 것과 연결하여 검출된다: rs242093, rs1996396, rs10503806, rs13251780, rs17430706, rs10102024, rs526302, rs544104, rs3102087, rs5183, rs3772627, rs2276736, rs2131127, rs3741559, rs2217342, rs10927888, rs6604909, rs945403, rs7117314, rs10790212, rs11216598, rs910682, rs13218316, rs4309483, rs13280307, rs4739037, rs17596774, rs2728108, rs17786456, rs7696304, rs2725222, rs17199565, rs2758152, rs1057293, rs16960712, rs759359, rs404214, rs1005213, rs17025453, rs2110923, rs1428571, rs435404, rs12908787, rs11647727, rs880054, 및 rs11064584 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이.

본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들의 여러 가지 구현예들에서, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 다음의 추가적인 적절한 GWS SNPs의 적어도 하나를 단독으로 또는 코아 SNPs와의 조합으로 보유하는 개인에게 로스타퓨록신을 투여하거나 처방하는 것과 연결하여 검출된다: rs12996186, rs9893372, rs7216331, rs7521668, rs188334, rs4998662, rs16893522, rs6457110, rs3893464, rs2517718, rs1362126, rs5013093, rs2345088, rs6718282, rs721207, rs2555500, rs2461911, rs8179654, rs1901139, rs2427832, rs9361863, rs1998394, ga001619, rs2275531, rs748140, rs4710592, rs2743951, rs10159569, rs3087816, rs10493940, rs16877182, rs2326912, rs11 10446, rs12513375, 및 rs17414954 또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이.

본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들의 일정 구현예들에서, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 다음의 추가적인 적절한 SNPs의 적어도 하나를 단독으로 또는 코아 SNPs와의 조합으로 보유하는 개인에게 로스타퓨록신을 투여하거나 처방하는 것과 연결하여 검출된다: rs4961, rs4984, rs10923835, rs947130, rs914247, rs1045642, rs880054, rs10502933, rs2131127, rs4309483, 및 rs4739037 또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이.

보다 상세하게, 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들의 일정 구현예들에서, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 다음의 추가적인 적절한 SNPs의 적어도 하나를 단독으로 또는 코아 SNPs와의 조합으로 보유하는 개인에게 로스타퓨록신을 투여하거나 처방하여 성취된다: Rs4961의 경우 뉴클레오타이드 G 또는 T, Rs4984의 경우 뉴클레오타이드 G 또는 A, Rs10923835의 경우 뉴클레오타이드 A 또는 T, Rs947130의 경우 뉴클레오타이드 C 또는 T, Rs914247의 경우 뉴클레오타이드 A 또는 G, Rs1045642의 경우 뉴클레오타이드 C 또는 T, Rs880054의 경우 뉴클레오타이드 C 또는 T, Rs10502933의 경우 뉴클레오타이드 C 또는 T, Rs2131127의 경우 뉴클레오타이드 C 또는 T, Rs4309483의 경우 뉴클레오타이드 C 또는 A, 또한 Rs4739037의 경우 뉴클레오타이드 G 또는 A.

보다 상세하게, 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들의 일정 구현예들에서, 로스타퓨록신은 단독으로 또는 코아 SNPs에 대한 유전형과의 조합으로 다음의 유전형들의 적어도 하나의 보균자인 개인에게 투여되거나 처방된다: Rs4961의 경우 유전형 GT 또는 유전형 TT, Rs4984의 경우 유전형 CC, Rs10923835의 경우 유전형 AT 또는 유전형 TT, Rs947130의 경우 유전형 GG, Rs914247의 경우 유전형 AA, Rs1045642의 경우 유전형 TT, Rs880054의 경우 유전형 AG 또는 유전형 GG, Rs10502933의 경우 유전형 CT, Rs2131127의 경우 유전형 CC, Rs4309483의 경우 유전형 AA, 또한 Rs4739037의 경우 유전형 GA.

상세하게, 로스타퓨록신으로 개인을 치료하는 방법의 여러 가지 구현예들이 기술된다. 본 방법은 개인에게 로스타퓨록신을 0.005 mg/일로부터 5 mg/일까지, 바람직하게는 0.01 mg/일 내지 1.5 mg/일, 더욱 바람직하게는 0.05 mg/일 내지 0.5 mg/일 범위의 용량으로 투여하거나 처방하는 것을 포함한다. 용량 치료 (dosage treatment)는 의사의 판단에 따라 단일 용량 스케줄 또는 다중 용량 스케줄로 수행될 수 있다.

상세하게 여러 가지 구현예들에서, 더 낮은 용량들 (0.05 mg/일; 0.15 mg/일; 0.5 mg/일과 같음)이 더욱 효과적일 수 있고, 본 명세서에서 기술된 유전적 변이들을 보유하는 개인들의 소집합에서 높은 용량들 (1.5 mg/일; 5.0 mg/일)보다 수축기 혈압을 감소시키는 데, 높은 용량들에 의해 유도되는 -12 mmHg에 비하여 대략 18 mmHg의 수축기 혈압에서의 평균 감소를 나타낸다.

상세하게 여러 가지 구현예들에서, 0.05로부터 0.5 mg/일까지의 범위에 포함되는 로스타퓨록신의 코아 SNPs 용량으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증을 포함하는 이전에 확인된 유전형들을 보유하는 고혈압을 가진 개인들은 -12로부터 -34 mmHg까지 범위의 혈압 강하를 생성하고, 1.5 mg/일로부터 5 mg/일까지의 범위에 포함되는 용량은 -0.6로부터 -23 mmHg까지 범위의 혈압 강하를 생산한다.

따라서 여러 가지 구현예들에서, 모든 코아 SNPs 낮은 용량들을 보유하는 개인들은 높은 용량들 (평균 -15 mmHg)의 측면에서 더 큰 반응 (평균 -23 mmHg)을 제공한다.

여러 가지 구현예들에서, 로스타퓨록신을 사용한 치료 이후에 본 명세서에서 기술된 유전적 변이들을 보유하는 개인들은 로스타퓨록신 치료 이전에 검출된 혈압에 비하여 적어도 10%의 혈압에서 감소를 나타낸다.

여러 가지 구현예들에서, 로스타퓨록신을 사용한 치료 이후에 본 명세서에서 기술된 유전적 변이들을 보유하는 개인들은 개인의 치료실 혈압 및/또는 야간 혈압에서 각각 적어도 약 15 및 약 9 mmHg의 평균 감소를 나타낸다.

여러 가지 구현예들에서, 본 명세서에서 기술된 유전적 변이들을 보유하는 개인들은 수축기 혈압의 경우 140 mmHg 미만 또한 확장기 혈압의 경우 90 mmHg 미만의 혈압의 정상화를 나타낸다.

여러 가지 구현예들에서, 본 명세서에서 기술된 유전적 변이들을 보유하는 개인들은 HCTZ 또는 로사탄으로 획득된 평균 혈압 감소보다 약 40% 이상이 되는 평균 혈압 감소를 나타낸다 (실시예 2를 참조하라).

본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들에서, 로스타퓨록신은 개인적으로 환자에게 투여될 조성물들에 포함될 수 있고 및/또는 기타 다른 제제들, 약물들 또는 호르몬들과 조합하여 투여될 수 있다. 상세하게 일정 구현예들에서, 약제는 또한 치료적 제제의 투여에 적합한 담체들로부터 선택되는 약제학적으로 허용가능한 담체를 포함할 수 있다. 약제학적으로 허용가능한 담체들의 철저한 논의는 본 명세서에서 참고문헌으로 전부 통합되어 있는 레밍턴의 약제학적 과학 (Remington's Pharmaceutical Science), (맥 출판사, 뉴욕, 1991)에서 입수 가능하다.

치료적 조성물들에서 약제학적으로 허용가능한 담체들은 추가적으로 물, 식염수, 글리세롤 및 에탄올과 같은 액체들을 포함할 수 있다. 또한, 습윤화 또는 에멀전화제들, pH 완충 물질들 등과 같은 보조 물질들이 이러한 조성물들에 존재할 수 있다. 이러한 담체들은 개인의 섭취를 위해 약제학적 조성물들을 정제, 알약, 당의정, 캡슐, 액체, 젤, 시럽, 슬러리, 현탁액 등으로 제형화 될 수 있다.

로스타퓨록신을 포함하는 약제는, 이에 제한되는 것은 아니지만 경구적 (oral), 정맥내 (intravenous), 근육내 (intramuscular), 동맥내 (intra-arterial), 골수내 (intramedullary), 경막내 (intrathecal), 심실내 (intraventricular), 경피부 (transdermal), 또는 경피적 (transcutaneous) 적용, 피하적 (subcutaneous), 복강내 (intraperitoneal), 비강내 (intranasal), 장내 (enteral), 국소적 (topical), 설하 (sublingual), 직장 (rectal) 수단에 의하여 또는 외과적 수술 이후에 질환을 가진 조직에 국부적으로 (locally) 투여를 포함하는 경로들이라면 모두에 의해 기술되는 본 명세서에서 기술된 방법들에 투여될 수 있다. 본 발명의 화합물은 또한 심지어 조절된-방출 (controlled-release) 매트릭스 내에 통합된 스텐트 (stent) 위에 적용 (코팅)될 수 있다.

여러 가지 구현예들에서, 코아 SNPs의 적어도 하나 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이를 보유하는 개인들에서 로스타퓨록신의 투여에 이어지는 치료 및 예방의 견지에서 기대되는 치료적 효과들로는, 이에 제한되는 것은 아니지만 심장 비대, 심장 기능부전, 심장성 허혈, 증가된 혈관 반응성, 혈관 경직, 증가된 혈관 비후, 신장 비대, 신부전, 사구체 경화증, 단백뇨, 뇌혈관 장애, 뇌졸중, 인식 장애, 망막 손상의 예방 또는 감소:를 포함한다. 상기 언급된 장애들 모두가 CAND1 SNPs, CAND 2 SNPs, 선택된 GWS SNPs 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이들을 가지고 코아 SNPs 단독으로 또는 서로 조합으로 보유하는 개인들에서 로스타퓨록신에 의해 정상화되는 혈압의 병리학적 증가 (제 Ⅲ기 및 제 Ⅵ기 고혈압)와 직접적으로 또는 간접적으로 연속되기 때문에 이러한 효과들이 기대된다. 또한, 증가된 신장의 소듐 재흡수 및 Src 신호 전달 경로의 활성화와 같은 고혈압의 일정 기작들을 길항하는 로스타퓨록신의 능력으로 인하여, 높은 혈압에 의해 직접적으로 유발되는 것이 아닌 신장 손상들이 치료에 의해 예방될 수 있다. 예를 들어, 동일한 수준의 혈압의 경우, ADD1 Trp460 유전적 변이를 보유하는 개인들이 Gly460 ADD1 변이의 보균자보다 심혈관 합병증들의 더 높은 발병률을 보여준다. 또한, 높은 수준의 혈장 우아바인을 가지는 고혈압을 가진 개인들은 유사한 혈압 수준들이지만 낮은 우아바인 혈장 수준을 가지는 개인들보다 심혈관 합병증들의 더 높은 발생률을 보여준다. 적어도 하나의 선택된 코아 SNPs를 보유하는 개인들에서 로스타퓨록신 투여 이후에 증가된 혈압 강하의 정확한 기작들은 알려져 있지 않더라도, 그들은 로스타퓨록신에 의한 분자적 표적 자극 (hit)에 의해 촉발된 기작들과 관련된 것이 틀림없다. 결론적으로, 로스타퓨록신에 의해 유도된 혈압 강하에 관련되는 점의 유익들은 적어도 하나의 코아 SNPs 유전형들을 보유하는 개인들에서 기대된다.

일정 구현예들에서 적어도 하나의 코아 SNPs를 보유하는 개인들에서, 0.05로부터 0.15 mg/일까지 범위의 (낮은 용량들) 로스타퓨록신 용량들은 1.5로부터 5 mg/일까지 범위의 (높은 용량들) 것들과 같은 더 높은 용량들보다 혈압 강하를 더 많이 유도할 것으로 기대된다. 상세하게, 더 낮은 용량들은 약 23 mmHg의 평균 혈압 강하를 생산할 것으로 기대되는 한편, 더 높은 용량들은 약 15 mmHg의 평균 혈압 강하를 생산할 것으로 기대된다. 또한, 적어도 하나의 코아 SNPs를 보유하는 개인들에서, 로스타퓨록신의 이들 용량들은 이에 제한되는 것은 아니지만 심장 비대, 심부전, 증가된 혈관 저항, 신부전, 사구체 경화증, 단백뇨, 다낭성 신장 질환, 망막 손상, 뇌혈관 장애, 메니에르 증후군, 인식 장애들, 양극성 장애들과 같은 고혈압과 연관된 심혈관 합병증들의 발생을 예방할 것으로 기대된다.

일정 구현예들에서, 적어도 하나의 코아 SNPs를 보유하는 개인에게 로스타퓨록신 치료는 5 μg으로부터 50,000 μg까지, 바람직하게는 10 μg 내지 15,000 μg, 가장 바람직하게는 50 μg 내지 500 μg의 범위의 하루 μg의 용량에서 수행될 수 있다.

용량들에 따르면, 0.05로부터 0.50 mg/일까지의 범위를 가진 낮은 용량들 (낮은 용량들)은 1.5로부터 5 mg/일까지의 범위로 높은 용량들 (높은 용량들)에 비하여 혈압 강하의 견지에서 더 높은 (+50%) 반응을 유도한다. 또한, 낮은 용량들은 높은 용량들에 비하여 적절하게 더 높은 야간 혈압의 강하를 생산한다.

일정 구현예들에서, 적어도 하나의 코아 SNPs를 서로 조합으로 및/또는 CAND 1, 2 및 GWS SNPs에 포함된 것들과 같은 다른 적절한 SNPs와 조합으로 보유하는 개인들에게 로스타퓨록신의 투여는 (실시예 2의 프로파일 8 및 9를 참조하라), 로스타퓨록신이 약 8로부터 약 22.5 mmHg까지의 범위로 평균 혈압 감소를 유도할 것으로 기대된다.

일정 구현예들에서, 적어도 하나의 코아 SNPs를 서로 조합으로 또한 CAND 1, CAND 2 및 GWS SNPs에 포함된 것들과 같은 다른 적절한 SNPs와 조합으로 보유하는 개인들에게 로스타퓨록신의 투여는 (실시예 2의 프로파일 8 및 9를 참조하라), 로스타퓨록신이 약 23 mmHg의 치료실 (수축기, 매일) 혈압 및 약 9 mmHg의 야간 혈압의 평균 혈압 감소를 유도할 것으로 기대된다.

일정 구현예들에서, 적어도 하나의 코아 SNPs를 단독으로 또는 서로 조합 또는 추가적인 적절한 SNPs와의 조합으로 보유하는 개인에게 로스타퓨록신의 투여는 로사탄 또는 하이드로클로로티아자이드와 같은 다른 고혈압 약물들에 대한 개인의 반응과 비교하는 경우라면 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응을 유도한다. 상세하게, 적어도 하나의 코아 SNPs를 단독으로 또는 서로 (또는 추가적인 적절한 SNPs)와의 조합으로 보유하는 개인에게 로스타퓨록신의 투여는 로사탄 또는 HCTZ에 의해 생산되는 것들보다 적어도 40% 더 높은 혈압 강하를 각각 생산할 것으로 기대된다.

일정 구현예들에서, 본 명세서에서 기술된 치료법을 평가하는 방법은 코아 SNPs로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증에 관한 서열 정보를 획득하는 것을 포함하고: rs16877182, rs5013093, rs2461911, rs12513375, rs16893522, rs2345088, 여기에서 정보는 개인에서 로스타퓨록신 효능을 예측한다.

일정 구현예들에서, 서열 정보는 또한 CAND 1 유전자들, CAND2 유전자들 및/또는 GWS 유전자들과 같은 로스타퓨록신에 대한 반응에 영향을 주는 추가적인 적절한 유전적 변이들에 대하여 획득될 수 있고, 이에 제한되는 것은 아니지만 rs4961 (ADD1), rs4984 (ADD2), rs3731566 (ADD3), rs914247 (LSS2), rs1045642 (MDR2), rs10502933, rs2131127, rs4309483, rs4739037 및 추가적인 SNPs를 포함한다. 프로파일 8-9로부터 나온 추가적인 SNPs: rs10923835 (HSD18), rs947130 (HSD19), rs880054 (WNK1)가 당업자라면 본 기재내용의 해독 시 확인 가능하다.

일정 구현예들에서, 서열 정보는 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9 및 서열번호 11의 서열들의 적어도 하나를 포함하고, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 서열번호 2, 서열번호 4, 서열번호 6, 서열번호 8, 서열번호 10, 및 서열번호 12와 같은 해당하는 검출된 서열 정보를 사용하여 각각 예측될 수 있다.

보다 상세하게는, 서열 정보는 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9 및 서열번호 11의 서열들의 적어도 하나를 포함하는 구현예들에서, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 서열번호 1의 경우 서열번호 13 및 14, 서열번호 3의 경우 서열번호 15 및 16, 서열번호 5의 경우 서열번호 17 및 18, 서열번호 7의 경우 서열번호 19 및 20, 서열번호 9의 경우 서열번호 21 및 22, 또한 서열번호 11의 경우 서열번호 23 및 24를 포함하는 해당하는 검출된 대립유전자 서열 정보를 사용하여 예측될 수 있다.

여러 가지 구현예들에서, 본 방법은 rs4961, rs4984, rs10923835, rs947130, rs914247, rs1045642, rs880054, rs10502933, rs2131127, rs4309483, 및 rs4739037로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증에 대한 서열 정보를 획득하는 것을 포함한다. 상세하게 여러 가지 구현예들에서, 추가적인 적절한 서열 정보는 좀 더 나아가 서열번호 25, 서열번호 27, 서열번호 29, 서열번호 31, 서열번호 33, 서열번호 35, 서열번호 37, 서열번호 39, 서열번호 41, 서열번호 43 및 서열번호 45를 포함하고, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 서열번호 26, 서열번호 28, 서열번호 30, 서열번호 32, 서열번호 34, 서열번호 36, 서열번호 38, 서열번호 40, 서열번호 42, 서열번호 44 및 서열번호 46와 같은 해당하는 검출된 서열 정보를 사용하여 각각 예측될 수 있다.

보다 상세하게는, 서열 정보는 서열번호 25, 서열번호 27, 서열번호 29, 서열번호 31, 서열번호 33, 서열번호 35, 서열번호 37, 서열번호 39, 서열번호 41, 서열번호 43 및 서열번호 45의 서열들의 적어도 하나를 포함하는 구현예들에서, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 서열번호 25의 경우 서열번호 47 및 48, 서열번호 27의 경우 서열번호 49 및 50, 서열번호 29의 경우 서열번호 51 및 52, 서열번호 31의 경우 서열번호 53 및 54, 서열번호 33의 경우 서열번호 55 및 56, 서열번호 35의 경우 서열번호 57 및 58, 서열번호 37의 경우 서열번호 59 및 60, 서열번호 39의 경우 서열번호 61 및 62, 서열번호 41의 경우 서열번호 63 및 64, 서열번호 43의 경우 서열번호 65 및 66, 또한 서열번호 45의 경우 서열번호 67 및 68을 포함하는 해당하는 검출된 대립유전자 서열 정보를 사용하여 예측될 수 있다.

상세하게, 서열 정보는 유전형 분석을 사용하여 획득될 수 있다: ILLUMINA로부터 나온 유전자칩 (GenChip) 또는 당업자라면 확인가능한 추가적인 방법들 및 시스템들. 일정 구현예들에서, 본 명세서에서 기재된 로스타퓨록신을 평가하는 방법은 하기 실시예 8에서 나열된 서열번호 35 내지 서열번호 58로부터 나온 프라이머들과 같은 코아 SNPs 서열 정보 또는 그의 일부분에 대한 프로브들을 포함하는 시스템에 의해 수행될 수 있다.

일정 구현예들에서, 로스타프록신을 사용한 치료를 평가하는 방법은 백인뿐만 아니라 아프리카인, 아시아인 또는 아프리카계-미국인을 포함하는 다양한 인종의 적어도 18세 이상의 남성들 또는 여성들이 되는 고혈압을 가진 환자들, 선호하기로는 이에 제한되는 것은 아니지만 제 I기 또는 제 Ⅱ기의 일차 고혈압을 가지고, 치료받은 적이 없거나 단지 하나의 약물 또는 많아야 두 가지 항고혈압 제제들을 포함하는 조합 정제로 치료 중이고, 중증 또는 악성 고혈압 또는 (신장 동맥성 질환의 진료기록을 포함하는) 이차 고혈압이 없으며, 연관된 병폐 및 많아야 두 가지의 추가적인 심혈관 위험인자들이 없고, 로스타퓨록신의 흡수 또는 간 해독에 영향을 줄 수 있는 위장관계의 수술 또는 질환들이 없고, 로스타퓨록신 투여의 적어도 6개월 이전부터 다른 실험용 약물이라면 모두를 사용한 치료가 없는 환자들의 선별을 포함한다. 환자들은 유럽 고혈압 협회 (European Society of Hypertension) 및 유럽 심장학 협회 (European Society of Cardiology)의 2003년 지침들에 따라 치료되었다 [문헌 7].

혈압은 통상적 및 외래의 혈압 측정을 위한 유럽 고혈압 협회의 권고사항들에 따라 외래 조건들 하에서 감시될 수 있다 [문헌 8]. 혈압의 측정은 진동측정 기록계들 또는 기타 다른 검증된 외래의 기록계들 또는 혈압계를 사용하여 수행될 수 있다. 혈압은 환자가 앉은 자리에서 적어도 5분 동안 휴식을 취한 이후에 팔에서 감시되어야 한다. 환자들의 유전형은 분지된 정맥에서 가져온 혈액 시료 상에서 측정될 수 있다. DNA는 표준 방법에 따라 [문헌 9] 또는 맞춤 키트의 사용으로 (예를 들어, 프로메가사 게놈 DNA 정제 (Promega genomic DNA purification) 카탈로그 번호 A2360 또는 퀴아젠사 팩스젠 혈액 DNA 키트 (Qiagen PAXgene Blood DNA Kit)) 추출되고, 보관되고 또한 선택된 핵산분해효소 검출 검정법을 사용하여 (예로, 대립유전자 구별이 필요할 시 ABI 검정법) 관심 있는 SNP에 대한 유전형이 분석될 것이다. 일정 구현예들에서, 서열 정보는 당업자라면 확인가능한 방법들을 사용하여 나올 수 있다.

적어도 하나의 코아 SNPs, 상세하게는 본 명세서에서 기술된 선별된 유전형을 단독으로 또는 서로 조합으로, 및/또는 CAND 1 CAND 2 및 GWS SNPs에 속하는 추가적인 적절한 SNPs을 보유하고 및/또는 관련된 서열 정보를 가지는 개인들은 정의된 약제학적 조성물에 넣은 물질을 0.05로부터 5 mg/일까지 범위의 용량으로, 바람직하게는 오전 7시 및 9시 사이 아침에, 하루 한 번 경구적 경로에 의해 투여하여 로스타퓨록신으로 치료된다. 치료는 적어도 5주로부터 환자의 전 인생 동안까지 지속될 수 있다.

일정 구현예들에서, 로스타퓨록신 활성에 미치는 유전적 변이들의 효과들은 개인에서 로스타퓨록신에 대한 반응을 예측하는 방법의 기초가 될 수 있다. 본 방법은 개인에서 KCNS3, THSD7A, FAM46A, LOC389970, HLA-G, 및 TTC29로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 유전자의 유전자간 또는 유전자내 부위에 대한 유전형을 단일 뉴클레오타이드 다형성증을 검출하는 것, 또한 로스타퓨록신에 대한 기지의 반응과 연관된 이전에 확인된 유전형들, rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증을 포함하는 이전에 확인된 유전형들과 검출된 유전형을 비교하는 것:을 포함한다.

본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "검출하다 (detect)" 또는 "검출 (detection)" 및 "검출가능한 (detectable)"은, 이에 제한되는 것은 아니지만 조직 시료, 반응 혼합물, 분자적 복합체 및 물질을 포함하는 제한된 일부 공간에서 화합물, 서열 또는 유전형의 존재 (existence), 존재 (presence) 또는 실재 (fact)의 판단을 의미한다. 검출은 화합물의 질 또는 양의 측정을 언급하거나 이에 관한 것이거나 이에 관여될 때 "정량적 (quantitative)"이고 (정량 (quantitation)이라고도 약칭됨), 이에 제한되는 것은 아니지만 화합물의 양들 또는 비율들을 정하도록 설계된 분석법이라면 모두를 포함한다. 검출은 정량되지 않은 또 다른 표적 또는 신호에 대한 상대적 과다 (rich)의 견지에서, 화합물의 질 또는 종류의 확인을 언급하거나 이에 관한 것이거나 이에 관여될 때 "정성적 (quantitative)"이다.

유전형을 검출하는 것은 당업자라면 확인가능한 여러 가지 기법들에 따라 수행될 수 있다. 일반적으로 단일 SNP 분석의 방법들은 PCR-RFLP 분석법, DNA 서열결정법 (DNA sequencing), 타크맨 검정법 (Taqman assay), 동적 PCR (kinetic PCR)이다. 본 방법의 하나, 타크맨 검정법은 본 발명의 보고서에서 CAND1 SNPs (실시예 3) 및 ADD1, ADD2, HSD18, HSD19, LSS2, MDR2, WNK 유전자들 (실시예 4)을 유전형 분석하도록 사용되었다.

복수의 SNP 분석을 위한 검정법은 여러 가지 시판되는 플랫폼 및 각 칩을 위한 다양한 (수백 내지 수백만) 유전자들을 가진 입수가능하거나 맞춤 유전자-칩을 사용한다. 본 발명에서는 휴먼햅 1M 듀오 칩 유전형 분석 비드 칩 (HumanHap 1M Duo CHIP genotyping Beads Chip) 및 일루미나 인피니움 Ⅱ 기술학 (lllumina Infinium II Technology)이 실시예 4 (rs10502933, rs2131127, rs4309483, rs4739037) 또한 실시예 5 및 6에서 SNPs의 유전형분석에 사용되었다.

본 방법에서, 개인에서 검출되는 유전형이 로스타퓨록신과 연관된 동일한 유전형인 경우라면 로스타퓨록신에 대한 개인의 반응은 기지의 반응이 될 것으로 예측된다. 본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "반응 (response)"은 로스타퓨록신과 관련하여, 개인에게 로스타퓨록신의 투여와 연관된 개인에서 작용 또는 병폐라면 모두를 의미한다. 개인에서 로스타퓨록신에 대한 대표적인 반응은 임상적으로 적절한 혈압 강하를 포함한다. 상세하게, 혈압 강하는 위약에 의해 초래되는 것보다 유의하게 더 높거나, 특이적으로 치료 이전에 혈압 수치의 10%와 적어도 동등하거나 수축기 혈압의 경우 140 mmHg 또는 팽창기 혈압의 경우 90 mmHg 보다 더 낮다.

일정 구현예들에서, 본 방법은 좀 더 나아가 ADD1, ADD2, ADD3, CYP11A1, HSD3B1, LSS, ABCB1/MDR1, SLCO4C로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 유전자의 유전자간 또는 유전자내 부위에 대한 유전형을, 예로 개인의 분리된 DNA에서 검출하는 것; 또한 기지의 로스타퓨록신 반응과 연관된 이전에 확인된 유전형들, rs4961, rs4984, rs3731566, rs914247, rs1045642로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이를 포함하는 이전에 확인된 유전형들과 검출된 유전형을 비교하는 것:을 포함할 수 있다. 일정 구현예들에서, 본 방법은 좀 더 나아가 ACTN1, ADRA1A, AGTR1, AQP2, ATP1A3, CLCNKA, CLCNKB, FXYD2, FXYD6, FYN, NEDD4L, NKAIN3, PKD1, PKD2, SCNN1B, SGK1 , SLC12A1, SLC8A1, TJP1, UMOD, 및 WNK1로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 유전자의 유전자간 또는 유전자내 부위에 대한 유전형을 개인에서 검출하는 것; 또한 기지의 로스타퓨록신 반응과 연관된 이전에 확인된 유전형들, rs242093, rs1996396, rs10503806, rs13251780, rs17430706, rs10102024, rs526302, rs544104, rs3102087, rs5183, rs3772627, rs2276736, rs2131127, rs3741559, rs2217342, rs10927888, rs6604909, rs945403, rs7117314, rs10790212, rs11216598, rs910682, rs13218316, rs4309483, rs13280307, rs4739037, rs17596774, rs2728108, rs17786456, rs7696304, rs2725222, rs17199565, rs2758152, rs1057293, rs16960712, rs759359, rs404214, rs1005213, rs17025453, rs2110923, rs1428571, rs435404, rs12908787, rs11647727, rs880054, 및 rs11064584로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이를 포함하는 이전에 확인된 유전형들과 검출된 유전형을 비교하는 것:을 포함할 수 있다. 일정 구현예들에서, 본 방법은 좀 더 나아가 ARL5A, ATP2A3, COX10, DPH5, FAIM3, FAM46A, HCG9, HLA-A, HLA-F, HLA-G, KCNS3, LOC131691, LOC389174, LOC389970, LOC642727, LOC644192, LOC649458, LOC728360, LOC728316, PIGR, RCADH5, RP3-377H14.5, SH3PXD2A, SLC30A7, THSD7A, TMEM200A, TRIM31, TTC29, 및 VCAM1으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 유전자의 유전자간 또는 유전자내 부위에 대한 유전형을 개인에서 검출하는 것; 또한 기지의 로스타퓨록신 반응과 연관된 이전에 확인된 유전형들, rs12996186, rs9893372, rs7216331, rs7521668, rs188334, rs4998662, rs16893522, rs6457110, rs3893464, rs2517718, rs1362126, rs5013093, rs2345088, rs6718282, rs721207, rs2555500, rs2461911, rs8179654, rs1901139, rs2427832, rs9361863, rs1998394, ga001619, rs2275531, rs748140, rs4710592, rs2743951, rs10159569, rs3087816, rs10493940, rs16877182, rs2326912, rs11 10446, rs12513375, 및 rs17414954로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이를 포함하는 이전에 확인된 유전형들과 검출된 유전형을 비교하는 것:을 포함할 수 있다.

일정 구현예들에서, 본 명세서에서 기재된 로스타퓨록신에 대한 반응을 예측하는 방법은 반응자들 및 미반응자들로 환자들의 분류에 단 한 번 적용되는 유전형 분석을 위한 첫 번째 성분 및 로스타퓨록신과 약제학적으로 허용가능한 담체를 하루 500-500 γ 범위의 용량으로 포함하는 시스템에 의해 수행될 수 있다.

일정 구현예들에서, 로스타퓨록신에 대한 개인의 반응을 예측하는 시스템은 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증에 대한 프로브, 또한 프로브 혼성화의 결과들 및 이전에 확인된 유전형들을 연관시키는 조사 표를 포함한다.

일정 이들 구현예들에서, 프로브는 서열번호 2, 서열번호 4, 서열번호 6, 서열번호 8, 서열번호 10 및 서열번호 12, 또는 서열번호 2, 서열번호 4, 서열번호 6, 서열번호 8, 서열번호 10 또는 서열번호 12에 상보적인 서열과 특이적으로 혼성화할 수 있는 그들의 단편으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 분리된 폴리뉴클레오타이드를 포함한다.

이들 구현예들에서, 본 시스템은 좀 더 나아가 rs4961, rs4984, rs10923835, rs947130, rs914247, rs1045642, rs880054, rs10502933, rs2131127, rs4309483, 및 rs4739037로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증에 대한 프로브를 포함할 수 있다.

상세하게, 프로브는 서열번호 26, 서열번호 28, 서열번호 30, 서열번호 32, 서열번호 34, 서열번호 36, 서열번호 38, 서열번호 40, 서열번호 42, 서열번호 44 및 서열번호 46, 또는 서열번호 26, 서열번호 28, 서열번호 30, 서열번호 32, 서열번호 34, 서열번호 36, 서열번호 38, 서열번호 40, 서열번호 42, 서열번호 44 또는 서열번호 46에 상보적인 서열과 특이적으로 혼성화할 수 있는 그들의 단편으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 분리된 폴리뉴클레오타이드를 포함할 수 있다. 일정 구현예들에서, 프로브는 서열번호 35 내지 서열번호 58로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 서열을 가질 수 있다.

여러 가지 구현예들에서, 본 시스템은 혈액 시료들 수집을 위한 튜브들, 게놈 DNA 추출을 위한 완충용액들, DNA 증폭 (예로, 프라이머들, 완충용액들, 및/또는 dNTPs 효소들) 또한 당업자라면 확인가능한 추가적인 성분들을 포함할 수 있다.

여러 가지 구현예들에서, 여러 가지 절차들이 a) 전-설계된 SNP 검정법 (Pre-Designed SNP assay) 또는 ABI사로부터 나온 맞춤 SNP 유전형 분석 검정법을 사용하여 대립유전자 특이 MGB 프로브들로 실시간 PCR SNP 유전형 분석 및 데이타 분석을 위한 실시간 PCR 시스템; b) 광범위 에너지 전달 프라이머들 (앰플리플루어 테크놀로지사 (Amplifluor technology)) 및 데이타 분석을 위한 실시간 PCR 시스템; c) PCR-RFLP 분석 및 아가로스-젤 검출; d) 동적 PCR; 또한 e) 직접적 서열결정법 (direct sequencing):을 포함하는 단일 SNP 분석에 사용될 수 있다. 단일 SNP 분석을 수행하는 데 적합한 추가적인 절차들은 당업자라면 확인가능하고 좀 더 자세하게는 논의되지 않을 것이다.

여러 가지 구현예들에서, 본 시스템은 일루미나사 (ILLUMINA), 애피메트릭스사 (AFFIMETRIX) 또는 ABI사 또는 기타 특수화된 회사들로부터 나온 유전자-칩 (마이크로-어레이)의 맞춤 서비스를 포함하여 사용될 수 있다. 우리의 목적으로, 단일 유전자-칩에 포함될 SNPs의 수는 상대적으로 낮아질 수 있다 (20 내지 30개). 특이적 유전자-칩을 조립하는 주요 성분들은 다섯 가지의 주요한 공정들에 기초하고 있다: DNA 정제; 특이적 프라이머 믹스 (mix)를 사용한 정제된 DNA의 PCR 증폭; 증폭된 산물들의 단편화 (fragmentation) 및 표지 (labeling); 증폭된 산물들의 마이크로어레이에 혼성화 및 결합된 산물들의 염색; 마이크로어레이의 스캐닝 및 분석.

일정 구현들에서, 로스타퓨록신 활성에 미치는 유전적 변이들의 효과들은 로스타퓨록신에 대한 반응을 가진 개인을 확인하는 방법의 기초가 된다. 본 방법은 개인들의 유전자간 또는 유전자내 부위들에 있는 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9 및 서열번호 11의 뉴클레오타이드 서열들이라면 모두에서의 단일 뉴클레오타이드 다형성증을 검출하는 것을 포함하고, 여기에서 코아 SNPs의 존재는 상기 개인에서 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응과 상호 관련된다. 여러 가지 구현예들에서, 본 명세서에서 기술된 추가적인 적절한 SNPs도 역시 로스타퓨록신에 대한 반응을 가진 개인을 확인하는 방법에서 검출될 수 있다.

일정 구현예들에서, 로스타퓨록신 활성에 미치는 유전적 변이들의 효과들은 심혈관 병폐를 가진 개인에서 로스타퓨록신에 대한 치료적 반응을 개선하는 방법의 기초가 된다. 본 방법은 코아 SNPs의 적어도 하나 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이의 보균자가 되도록 결정되었던 상기 개인에게 로스타퓨록신을 투여하는 것을 포함한다.

일정 구현예들에서, 로스타퓨록신 활성에 미치는 유전적 변이들의 효과들은 로스타퓨록신으로 개인을 치료하는 방법의 기초가 된다. 본 방법은 코아 SNPs의 존재를 의미하고 임의적으로는 개인에서 로스타퓨록신 반응에 영향을 주는 추가적인 SNPs에 관한 정보를 획득하고; 로스타퓨록신을 0.005 mg/일로부터 50 mg/일까지, 바람직하게는 0.01 mg/일 내지 15 mg/일, 가장 바람직하게는 0.05 mg/일 내지 5 mg/일 범위의 용량으로 개선된 반응과 연관된 유전형을 가진 개인에게 투여하는 것:을 포함한다.

일정 구현예들에서, 로스타퓨록신 활성에 미치는 유전적 변이들의 효과들은 심혈관 병폐를 가진 개인을 치료하는 방법의 기초가 된다. 본 방법은 코아 SNPs의 적어도 하나 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이의 보균자가 되는 환자에게 로스타퓨록신의 유효량을 투여하거나 처방하는 것:을 포함한다.

일정 구현예들에서, 심혈관 병폐는 고혈압이고, 개인을 치료하는 방법은

a) 고혈압을 앓는 개인으로부터 나온 핵산 시료를 획득하고;

b) 상기 핵산 시료에서 본 명세서에서 기술된 코아 SNPs:로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 하나 이상의 다형성증들의 존재를 결정하고;

c) 본 명세서에서 기술된 코아 SNPs로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 하나 이상의 다형성증들을 소유할 것으로 보였던 환자들에서 로스타퓨록신의 치료적으로 활성을 가진 양을 투여하는 것에 의해 수행될 수 있다.

본 명세서에서 기술된 개인들을 치료하는 방법들에서, 로스타퓨록신은 전형적으로 약제학적 조성물의 형태로 투여된다. 이러한 조성물들은 약제학적 기술에서 잘 알려져 있는 방식으로 제조될 수 있고 적어도 하나의 활성을 가진 화합물 및 운반체 (vehicle)를 포함한다. 본 명세서에서 사용되는 바, "운반체 (vehicle)"는 보통 조성물에서 활성 성분으로서 포함되는 로스타퓨록신 화합물을 위한 용매, 담체, 결합제, 희석제 또는 부형제로서 작용하는 다양한 배지라면 모두를 의미한다. 당업자라면 약제학적 조성물을 제형화에 적합한 이와 같은 다양한 용매, 담체, 희석제 또는 부형제 전부를 인식하고 있다.

통상적으로 사용되는 아쥬반트, 담체, 희석제 또는 부형제와 함께 로스타퓨록신은 약제학적 조성물들 및 그들의 단위 용량들의 형태 내로 담길 수 있고, 이러한 형태는 정제 또는 충전된 캡슐과 같은 고형물, 또는 용액, 현탁액, 에멀전, 엘리시르와 같은 액상물, 동일한 것으로 충전된 캡슐, 경구적 사용을 위한 모두로서, 또는 비경구적 사용 (피하적 사용을 포함함)을 위한 무균의 주사 가능한 용액의 형태로 사용될 수 있다. 이러한 약제학적 조성물들 및 그들의 단위 용량 형태들은 추가적인 활성을 가진 화합물들 또는 성분들 (principles)이 있거나 없이 통상적인 비율들로 성분들을 포함할 수 있고, 이러한 단위 용량 형태들은 의도하는 사용될 하루 용량 범위에 해당하는 활성 성분의 적합한 유효량이라면 모두를 포함할 수 있다.

일정 구현예들에서, 로스타퓨록신은 "치료적 유효량 (pharmaceutically effective amount)"으로 투여된다. 실제로 투여되는 화합물의 양은 전형적으로 치료될 조건, 선택된 투여 경로, 약물 조합, 환자 개인의 연령, 체중, 및 반응, 환자의 중증도 등을 포함하는 적절한 상황들에 비추어, 의사가 결정할 것이다. 일반적으로 유효 용량은 하루 단일 투여의 경우 0.005 mg/일로부터 50 mg/일까지, 바람직하게는 0.01 mg/일 내지 15 mg/일, 가장 바람직하게는 0.05 mg/일 내지 5 mg/일 범위이다.

조성물들은 환자에게 개별적으로 투여될 수 있고, 기타 다른 제제들, 약물들 또는 호르몬들과 조합으로 투여될 수 있다. 환자에게 투여될 조성물의 유효 용량들은 0.05 mg/일로부터 5 mg/일까지의 범위이다.

의도하는 운반 경로에 의존하여, 로스타퓨록신은 바람직하게 비경구적, 국소적 또는 경구적 조성물들로서, 더욱 바람직하게는 경구적 제형으로 제제된다. 경구적 투여를 위한 조성물들은 대용량 액상 용액 또는 현탁액, 또는 대용량 파우더의 형태를 가질 수 있다. 그러나 보다 보편적으로는, 본 조성물들은 정확한 용량을 용이하게 하도록 단위 용량 형태들로 표현될 수 있다. 용어 "단위 용량 형태들 (unit dosage forms)"은 인간 개체들 및 기타 다른 포유동물들을 위한 단위 용량들로서 적합한 물리적으로 구별되는 단위들을 말하고, 각 단위는 적합한 약제학적 부형제와 연관하여 원하는 치료적 효과를 생산하도록 계산된 선결정된 양의 활성 물질을 포함한다. 전형적인 단위 용량 형태들은 액상 조성물들의 재충전되고, 미리-측정된 앰풀 또는 주사 또는 고형 조성물들의 경우 알약, 정제, 캡슐 등을 포함한다. 이러한 조성물들에서, 본 발명의 화합물은 보통 소수의 성분이고 (무게로 약 0.1로부터 약 10%까지 또는 바람직하게 무게로 약 1로부터 약 40%까지) 나머지는 다양한 운반체들 또는 담체들이 될 수 있고 또한 프로세싱 조력이 원하는 용량 형태를 형성하는 데 도움이 된다.

용량 치료는 단일 용량 스케줄 또는 다중 용량 스케줄일 수 있다.

경구적 투여에 적합한 액상 형태들은 적합한 수성 또는 비수성 운반체를 완충용액, 현탁 및 분산제, 착색제, 향미제 등과 함께 포함할 수 있다.

고형물 형태들은 예를 들어 다음의 성분들, 또는 유사한 성질의 화합물들이라면 모두를 포함할 수 있다: 미세결정성 셀룰로스 (microcrystalline cellulose), 아카시아, 검 트라칸스 (gum tragacanth), 젤라틴 또는 폴리비닐-피롤리돈과 같은 결합제; 전분 또는 락토스 같은 부형제; 알긴산, 프리모겔 (Primogel), 또는 감자 또는 옥수수의 전분과 같은 붕해제; 마그네슘 스테아레이트, 탈크, 폴리에틸렌 글리콜 또는 실리카와 같은 광택제; 콜로이드성 이산화실리콘과 같은 글리던트 (glidant); 슈크로스 또는 사카린과 같은 감미제; 또는 페퍼민트, 메틸 살리실레이트, 또는 오렌지 향미와 같은 향미제. 본 정제들은 약제학적 시행 기술의 당업자로부터 나온 잘 알려진 방법들에 따라 코팅될 수 있다.

비경구적 조성물들은 전형적으로 주사 가능한 무균의 식염수 또는 인산-완충 식염수 또는 선행기술에 알려진 기타 다른 주사 가능한 담체들을 기초로 한다. 상기에 언급된 바와 같이, 이러한 조성물들에서 화학식 1의 화합물들은 전형적으로 주사 가능한 담체 등의 나머지와 함께 흔히 무게로 0.05 내지 10% 사이의 범위를 가진 소수의 성분이다.

또한 로스타퓨록신은 지속적인 방출 형태로 또는 지속적인 방출 약물 전달 시스템들로부터 투여될 수 있다. 대표적인 방출 물질들의 기술내용도 역시 레밍턴의 약제학적 과학에 있는 통합된 물질들에서 찾아볼 수 있다.

경구적으로 투여되거나 비경구적 조성물들을 위한 상기-기술된 성분들은 예시일 뿐이다. 좀 더 많은 물질들뿐만 아니라 프로세싱 기법들 등이 레밍턴의 약제학적 과학의 제 5부, 제 20판, 2000년, 맥 출판사, 펜실베니아 이스턴에 설명되어 있고, 이는 본 명세서에서 참고문헌으로 전부 통합되어 있다.

일정 구현예들에서, 뉴클레오타이드들의 하나는 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9, 및 서열번호 11, 또는 그들의 상보체의 뉴클레오타이드 서열들이라면 모두에서 선택되는 단일 뉴클레오타이드 다형성증 (SNP)인 적어도 약 100개의 연속된 뉴클레오타이드들을 포함하는 분리된 핵산 분자가 기재되어 있다.

일정 구현예들에서, 로스타퓨록신 활성에 미치는 유전적 변이들의 효과들은 심혈관 병폐를 치료적으로 또는 예방적으로 치료하는 데 유용한 제제를 확인하는 방법의 기초가 된다.

본 방법은 후보 제제를 제공하고; 후보 제제를 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증 또는 이들의 연관 불균형에서 다형성증을 보유하는 개인에게 투여하고; 또한 상기 후보 제제에 대한 개인의 반응을 검출하는 것을 포함한다.

여러 가지 구현예들에서, 후보 제제는 본 명세서에서 표시된 CAND 1, CAND 2 및 GWS SNPs의 하나 이상도 역시 보유하는 개인에게 투여된다.

여러 가지 구현예들에서, 본 방법은 고혈압 환자들을 선별하고 개인들에서 로스타퓨록신을 사용한 치료를 평가하는 데 사용되는 절차들에 따라 측정 및 검출을 수행하여 수행될 수 있다. 이들 일정 구현예들에서, 개인에서 로스타퓨록신 치료를 평가하는 방법은 rs16877182, rs5013093, rs2461911, rs12513375, rs16893522, rs2345088로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증에 관하여, 개인에서 로스타퓨록신 효능을 예측하는 서열 정보를 획득하여 수행될 수 있다.

이들 일정 구현예들에서, 서열 정보는 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9 및 서열번호 11의 서열들의 적어도 하나를 포함하고, 또한 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 서열번호 2, 서열번호 4, 서열번호 6, 서열번호 8, 서열번호 10, 및 서열번호 12로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 해당하는 검출된 서열 정보를 사용하여 각각 예측될 수 있다.

이들 일정 구현예들에서, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 서열번호 1의 경우 서열번호 13 및 14, 서열번호 3의 경우 서열번호 15 및 16, 서열번호 5의 경우 서열번호 17 및 18, 서열번호 7의 경우 서열번호 19 및 20, 서열번호 9의 경우 서열번호 21 및 22, 또한 서열번호 11의 경우 서열번호 23 및 24를 포함하는 해당하는 검출된 대립유전자 서열 정보를 사용하여 예측될 수 있다.

이들 일정 구현예들에서, 본 평가하는 방법은 좀 더 나아가 rs4961, rs4984, rs10923835, rs947130, rs914247, rs1045642, rs880054, rs10502933, rs2131127, rs4309483, 및 rs4739037로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증에 대한 서열 정보를 획득하는 것을 포함할 수 있다. 상세하게, 본 서열 정보는 좀 더 나아가 서열번호 25, 서열번호 27, 서열번호 29, 서열번호 31, 서열번호 33, 서열번호 35, 서열번호 37, 서열번호 39, 서열번호 41, 서열번호 43 및 서열번호 45를 포함할 수 있다. 이들 서열 정보의 경우에, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 서열번호 26, 서열번호 28, 서열번호 30, 서열번호 32, 서열번호 34, 서열번호 36, 서열번호 38, 서열번호 40, 서열번호 42, 서열번호 44 및 서열번호 46로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 해당하는 검출된 서열 정보를 사용하여 각각 예측될 수 있다.

이들 일정 구현예들에서, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 서열번호 25, 서열번호 27, 서열번호 29, 서열번호 31, 서열번호 33, 서열번호 35, 서열번호 37, 서열번호 39, 서열번호 41, 서열번호 43 및 서열번호 45의 서열들의 적어도 하나를 포함하는 구현예들에서, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응은 서열번호 25의 경우 서열번호 47 및 48, 서열번호 27의 경우 서열번호 49 및 50, 서열번호 29의 경우 서열번호 51 및 52, 서열번호 31의 경우 서열번호 53 및 54, 서열번호 33의 경우 서열번호 55 및 56, 서열번호 35의 경우 서열번호 57 및 58, 서열번호 37의 경우 서열번호 59 및 60, 서열번호 39의 경우 서열번호 61 및 62, 서열번호 41의 경우 서열번호 63 및 64, 서열번호 43의 경우 서열번호 65 및 66, 또한 서열번호 45의 경우 서열번호 67 및 68로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 해당하는 검출된 대립유전자 서열 정보를 사용하여 예측될 수 있다.

일정 구현예들에서, 본 명세서에서 기재된 심혈관 병폐를 치료적으로 또는 예방적으로 치료하는 데 유용한 제제를 확인하는 방법은 본 명세서에서 기술된 바와 같이 적절한 유전적 변이들을 검출하고 확인하는 데 적합한 성분들을 포함하는 시스템에 의해 수행될 수 있다.

일정 구현예들에서, KCNS3, THSD7A, FAM46A, LOC389970, HLA-G, 및 TTC29로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 유전자의 유전자간 또는 유전자내 부위에서 단일 뉴클레오타이드 다형성증 (SNP)을 검출하는 시스템이 기재된다. 본 시스템은 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9 및 서열번호 11의 뉴클레오타이드 서열들이라면 모두에서 단일 뉴클레오타이드 다형성증 (SNP)을 포함하는 핵산 분자에 특이적으로 혼성화할 수 있는 분리된 폴리뉴클레오타이드, 핵산 분자를 위한 적어도 하나의 완충용액 (혼성 (hybridization) 및/또는 중합 (polymerization) 완충용액), 또한 핵산 서열의 조합으로 SNP의 검출에 사용될 효소를 포함한다. 상세하게, 본 효소는 조사되는 하나 이상의 유전자간 및/또는 유전자내 부위를 위한 중합효소 연쇄반응을 촉매 작용할 수 있는 중합효소 (polymerase)일 수 있다.

본 명세서에서 사용되는 바, 용어 혼성화는 단일 하이브리드 (hybrid) 내로 둘 이상의 핵산의 상보적 가닥들 간의 비공유적, 서열-특이적 상호작용을 의미하고, 두 개의 가닥들인 경우 이중체 (duplex)라고 말한다. 특이적 혼성화는 특이적 서열-서열 상호작용을 유도하는 혼성화이다. 본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "특이적 (specific)", "특이적으로 (specifically)" 또는 "특이도 (specificity)"는 한 분자의 또 다른 분자에 결합과 관련하여, 한 분자와 또 다른 분자 각각 및 기타 다른 분자 간의 인식, 접촉 및 안정한 복합체의 형성이 실질적으로 적어도 없는 동시에, 한 분자 및 또 다른 분자 간의 인식, 접촉 및 안정한 복합체의 형성을 말한다.

본 명세서에서 사용되는 바, 용어 "중합효소 연쇄반응 (polymerase chain reaction)"은 여러 크기의 차수 (order of magnitude)를 거쳐서 특정한 DNA 서열의 수천 내지 수백만 개의 사본들을 생성하는, 핵산의 단편의 단일 또는 수 개의 사본들을 증폭시키는 적합한 기법이라면 모두를 의미한다. 본 방법은 핵산의 변성 (melting) 및 핵산의 효소적 복제를 위한 반응의 반복된 가열 및 식힘의 순환 (cycles)으로 이루어진 열적 순환과정에 의존한다.

일정 구현예들에서, 본 시스템은 또한 서열번호 25, 서열번호 27, 서열번호 29, 서열번호 31, 서열번호 33, 서열번호 35, 서열번호 37, 서열번호 39, 서열번호 41, 서열번호 43 및 서열번호 45의 뉴클레오타이드 서열들의 하나라면 모두에서 단일 뉴클레오타이드 다형성증 (SNP)를 포함하는 핵산 분자에 특이적으로 혼성화하는 분리된 폴리뉴클레오타이드를 포함할 수 있다. 본 명세서에서 기재된 시스템들은 부분들의 키트들의 형태로 제공될 수 있다. 본 부분들의 키트에서, 프로브들, 약제학적 조성물들 및 기타 다른 성분들 및 기질은 키트에 독립적으로 포함된다. 상세하게, 프로브들은 하나 이상의 조성물들에 포함될 수 있고, 각 프로브는 적합한 운반체 담체 또는 보조적 제제와 함께 조성물 내에 포함될 수 있다.

일정 구현예들에서는, 완충용액들, 효소 및 적합한 용기가 좀 더 나아가 키트의 추가적인 성분으로서 제공될 수 있다. 추가적인 성분들은 표지들 (방사성 동위원소들, 형광단들 (fluorophores), 화학발광 염색제들 (chemiluminiscent dyes), 발색단들, 효소들, 효소 기질들, 효소 보조인자들 (enzyme cofactors), 효소 저해제들, 염색제들 (dyes), 금속 이온들, 나노입자들, 금속 졸들 (metal sols), 바이오틴, 아비딘, 스트렙트아비딘 또는 헵텐과 같은 리간드들과 같은 검출할 수 있는 분자) 등, 미세유동성 칩 (microfluidic chip), 기준 표준물질들 (reference standards), 또한 당업자라면 본 기재내용의 해독 시 확인가능한 추가적인 성분들을 포함할 수 있다. 상세하게, 키트의 성분들은 본 명세서에서 기재된 방법들을 수행하도록 적합한 안내서들 및 다른 필요한 반응액들과 함께 제공될 수 있다. 본 키트는 정상적으로 별도의 용기들에 넣은 조성물들을 포함할 것이다. 본 검정법을 수행하기 위한 안내서들, 예를 들어 종이 또는 테입 또는 CD-ROMs와 같은 전자적 지원 상의 문서화 또는 오디오 안내서들은 보통 키트 내에 포함될 것이다. 또한 키트는 사용되는 특정한 방법에 의존하여, 기타 다른 포장된 반응액들 및 물질들을 포함할 수 있다 (예로, 세척 완충용액들 등).

본 조성물들의 적합한 담체 제제 또는 보조적 제제의 확인, 또한 일반적으로 키트의 제조 및 포장하는 것에 관한 좀 더 자세한 사항들은 당업자라면 본 기재내용의 해독 시 확인할 수 있다.

본 명세서 내에 통합되어 있고 이의 일부를 구성하는 첨부된 도면들은 본 발명의 하나 이상의 구현예들을 도시하고 있고, 자세한 기술내용 및 실시예들과 함께 본 발명의 기본사항들 및 이행사항들을 설명하도록 제시된다.
도 1은 로스타퓨록신 및 위약으로 치료된 개인들에게 수행된 유전적 설명 분석 (descriptive analysis)과 연결하여 검출된 가우스 분포 (Gaussian distribution)를 나타낸 것이다. 상세하게, 패널 A는 로스타퓨록신 및 위약 또는 둘 다로 치료하고 5주 이후에 개인들에서 혈압 변화 (DSBP5_0)의 분포를 도시하는 도면을 나타내고 있다 (환자 모두). 패널 B는 로스타퓨록신으로 치료하고 5주 이후에 개인들에서 혈압 변화 (DSBP5_0)의 분포를 도시하는 도면을 나타낸다 (로스타퓨록신). 패널 C는 위약으로 치료하고 5주 이후에 개인들에서 혈압 변화 (DSBP5_0)의 분포를 도시하는 도면을 나타낸다 (위약).
도 2는 로스타퓨록신으로 치료된 개인들에게 수행된 유전적 설명 분석과 연결하여 검출된 가우스 분포를 나타낸 것이다. 상세하게, 도 2는 세 가지로 소구분된 도 1B에서 나타낸 로스타퓨록신으로 치료하고 5주 이후에 혈압 변화 (DSBP5_0)의 분포를 도시하는 도면을 나타낸다 (모든 환자들).
도 3은 로스타퓨록신으로 치료된 개인들에게 수행된 유전적 설명 분석과 연결하여 수행된 통계적 분석 결과들을 나타낸 것이다. 상세하게, 도 3은 개인들 중에서 유전적 관련성을 도시하도록 193명 환자들의 경우에서 아이젠소프트 (Eigensoft) 기본 성분 분석의 첨단 두 개 축 분산 (PCA1 및 PCA2)을 나타낸다. 각 점은 개인을 나타낸다. 좌표에서 영점 주변에 분포하는 개인들의 완만한 불균질한 집합이 검출 가능하다.
도 4는 본 명세서에서 기재된 일정 구현예들에 따라 SNPs의 치료법 및 위약에 대한 GXE 연관의 결과들을 도시하는 도면을 나타낸 것이다. 패널 A에서, 좌표의 Y 축은 유의한 p값 (-로그 P값)을 나타내는 한편, X 축은 게놈에서 위치를 나타낸다. 각 점은 SNP를 나타내고, 상세하게 적색 점은 유의한 p값 (p < 10^-4)을 가지는 SNPs를 나타낸다. 패널 B는 GXP 연관 테스트 (Q-Q 좌표)에 의해 생성된 예상된 p값에 대비한 관찰된 값의 분포들의 비교를 나타낸다. 분포의 말단에서 상승 (inflation)은 진정한 양성 연관성을 나타낸다.
도 5는 본 발명의 일정 구현예에 따라 로스타퓨록신의 SNPs 상호작용의 유전형을 선별하는 단계를 도시하는 도면들을 나타낸 것이다. 상세하게, 도 5는 표시된 바와 같이 로스타퓨록신 및 위약으로 치료된 개인들에서 혈압 변화 (DSBP5_0)의 측면에서 rs8899 및 rs4678의 서로 다른 유전형들 간 상호작용을 각각 보고하는 도면들을 나타낸다.
도 6은 본 명세서에서 기재된 일정 구현예들에 따라 로스타퓨록신에 대한 반응에 영향을 주는 유전형들을 선택하도록 수행된 대표적인 단일변수 분석 (univariate analysis)을 나타낸 것이다.
도 7은 하나의 가설적 SNP의 서로 다른 유전형들 또한 로스타퓨록신 및 위약을 사용한 혈압 변화 (DSBP5_0) 사이의 대표적인 상호작용을 도시하는 도면을 나타낸 것이다.
도 8은 본 명세서에서 기재된 일정 구현예들에 따른 유전적 프로파일들에 관한 대표적인 데이타의 요약을 나타낸 것이다.
도 9는 본 명세서에서 기재된 일정 구현예들에 따른 혈압의 혈관, 신장 및 신경 조절에 관련된 선택된 유전자들의 요약을 나타낸 것이다.
도 10은 통상적 및 약리유전학적 접근법들의 효능 및 안정성에 관한 데이타를 나타낸 것이다.

다음의 섹션에서는 본 기재내용이 본 발명의 범위를 제한하지 않는 것으로 참작되는 일정 실시예들에 의하여 설명될 것이다.

실시예들

약리유전학적 연구는 로스타퓨록신에 대한 개인 반응에 미치는 유전적 변이들의 효과를 확인하도록 수행되었다. 342명의 개인들로 이루어진 약리유전학적 연구를 위한 시료는 [문헌 10, 11, 12]에 기술된 절차에 따라 휴먼 1M 듀오 칩 유전형분석 비드 칩 (Human 1M Duo CHIP genotyping Beads Chip)을 사용하는 일루미나사 (Illumina)의 인간 1M 어레이를 사용하여 유전형들이 분석되었다. [문헌 13]에 그래프로 나타난 바와 같이, 첫 번째 기간 (5주)에 개인들 중에서 169명에게 위약 치료 및 173명에게 활성을 가진 약물 (로스퓨록신)이 투여되었다. 상세하게, 환자들은 다음의 로스타퓨록신의 경구적 용량들의 하나로 임의 추출되었다: 5주 동안 0.05, 0.15, 0.5, 1.5, 또는 5 mg/일. 각 용량은 교차 설계 (crossover design)에서 위약과 비교되었다. 이전의 연구들이 1개월의 세척 (washout)이 불충분할 수 있는 것을 보여주었기 때문에 [문헌 14-30], 이전의 치료 (NPT)를 받지 않았던 193명의 환자들이 이전에 치료를 받았던 149명으로부터 분리되어 분석되었다.

상기 개인들의 시료의 경우, 유전적 연관성 분석이 개인들에서 검출된 SNPs와 테스트된 개인들의 표현형을 연관시키도록 수행되었다. 관심 있는 선별된 표현형은 혈압 반응이었다. 검출을 위해 선택된 SNPs는 개인의 상염색체들 상에 있는 1111170개의 SNPs이었다.

유전적 분석은 관심 있는 표현형이 정량적 변수 (QT)가 되는 정량적인 유전적 연관 설계에 따라 수행되었고, 또한 관심 있는 표현형의 분포에 영향을 주는 변수들 (요인들)은 SNPs, 치료법 (위약, 로스타퓨록신) 및 SNP* 치료법 상호작용이다.

상세하게, 통계적 분석들을 위해 선별된 정량적인 표현형은 첫 번째 치료 기간의 말기에 (SBP_5) 치료실 수축기 혈압 (SBP) 및 치료 (run-in)의 첫 달 이후에 (SBP_0) 기저선에서 치료실 수축기 혈압 사이의 mmHg에서 차이였고, 본 명세서에서 DSBP5_0로서도 역시 확인된다. 다음으로 선택된 QT 표현형 및 관심 있는 표현형의 분포에 영향을 주는 다른 요인들은 다음의 정량적인 형질 상호작용 테스트

표현형 = SNP + 치료법 + SNP* 치료법

에 따라 하기에 좀 더 자세하게 설명되는 바와 같이 분석되었다.

유전적 연관을 수행하기 위하여, 설명적인 통계적 분석 및 추론적인 통계적 분석이 수행되었다.

설명적인 통계적 분석은 먼저 데이타의 주요 매개변수들을 정리하고 기술하고 또한 품질 관리들을 수행하도록 수행되었다.

표 1은 분석을 수행하는 데 본 출원인들에 의해 선택된 통계적 절차들, 매개변수들 및 역치들뿐만 아니라 이로부터 나온 성과에서 획득되는 결과들을 정리하고 있다. 하기 표 1은 설명적인 통계적 분석을 나타낸 것이다.

수행된 기술적인 유전적 분석의 결과들은 또한 표 2 또한 도 1, 도 2 및 도 3에 좀 더 자세하게 도시되고 있다.

하기 표 2는 설명적인 통계적 분석의 결과들을 나타낸 것이다.

상세하게, 표 2에서는 전체 시료 및 위약 및 로스타퓨록신으로 치료된 환자들의 경우에 DSBP5_0의 설명적인 통계들이 나열되고 있다. 적당한 기저 수준의 SBP는 위약 그룹의 포함의 의해 요구되는 "약한 (mild)" 고혈압 (140 - 179 mmHg 범위의 SBP)을 가진 환자들을 모집하여 설명될 수 있다. 표 2에 정리된 결과들의 그래프는 전체, 치료 및 위약에서 DSBP5_0 분포를 보여주는 도 1에 도시되고 있다.

NPT 그룹의 경우, 남아있는 개인들에서 전체 유전형 분석율은 99.67%이었다; 6071개의 SNP가 소실 (missingness) 테스트에서 실패하였고 (승인율 < 90%) 또한 258148개의 SNPs가 MAF < 0.05를 가졌다. 빈도 결정 및 유전형 분석 이후에 남아있는 848340개의 SNPs가 0.05의 MAF 역치를 사용하여 다음의 여과 과정을 거쳤다 (데이터 미도시).

상기의 견지에서, 이항의 표현형 변수, 로스타퓨록신에 대한 반응-미반응을 생성하도록 본 출원인들은 DSBP5_0 분포의 가장 낮은 수치에 비하여 (- 11.7 mmHg, 즉 99명의 환자들 중에서 33명) ≤ 11.7 mmHg의 QT DSBP5_0에 대한 컷-오프 수치를 선택하였다.

DSBP5_0 역치 선택은 결과들의 통계적 및 임상적 적정성을 둘 다 표시하는 매개변수를 제공하도록 수행되었다.

선택된 QT 역치를 보여주는 설명적인 통계적 분석의 결과들의 그래프 표현은 도 2에 도시되고 있다.

도 3은 영점 주변에 분포하는 개인들의 완만한 불균질한 집합을 보여주는 변이의 첨단 축을 사용하여 검출된 테스트된 개인들 중에서 유전적 관련성을 도시하고 있다. 집단 계층화의 평가 (및 교정)은 체계적인 계통적 차이점들의 존재로 인하여 위양성 및 위음성의 유의한 연관성들을 피하는 데 적정하다.

다음으로 추론적인 통계적 분석은 치료 (위약 또는 활성을 가진 약물)에 대한 서로 다른 반응과 유의하게 연관된 SNPs를 검출하도록 계산된 QT를 사용하여 수행되었다. 하기 표 3은 추론적인 통계적 분석을 나타낸 것이다.

표 3은 설명적인 통계적 절차의 결과들의 견지에서 본 출원인들에 의해 선택된 통계적 절차들, 역치들 및 분석법을 정리하고 있다.

상세하게, 단일변수 분석 (univariate analysis)과 관련하여 SNPs가 하나씩 고려되는 단일 점 분석법이 수행되었다. 수행된 정량적 형질 상호작용 테스트 (G*E, 유전자*환경)

표현형 = SNP + 치료법 + SNP*치료법

는 다음과 같은 연관성을 평가하고, 여기에서 분석의 중점은 주요한 효과 "치료법"이 유전적 성분을 고려하지 않고 임상 시험들을 테스트하는 것에 해당하기 때문에, 예로 주요한 효과들이 아닌 상호작용에서 SNP* 치료법 성분에 있었다. 주요한 효과 "SNP"는 치료법에 의해 유도되는 변형을 고려하지 않고 혈압에서 변화에 영향을 주는 SNPs를 조사하고 있다. 단지 상호작용 효과 (G*T)만이 SNPs (G = 유전자)가 활성을 가진 약물 또는 위약 (T = 치료법)을 받은 개체들에서 SBP에 영향을 주는 것을 평가한다.

p < 10^-4의 역치가 첨단 SNPs 리스트를 형성할 수 있는 가장 유의한 연관성들을 검색하도록 선택되었다. 상세하게, 본 출원인들은 목적 상으로 덜 유의한 결과들을 골라내도록 위음성에 대비한 "보수적인" p값을 선택하였다 [문헌 34, 35]. 또한, 모든 잠재적인 양성 연관성은 적어도 두 가지의 통계적 프로그램들 (플린크 (plink) 및 스타타 (stata))을 사용하여 유의하게 검증되었다. 상기 접근법에 따라 수행된 단일변수 분석의 결과들은 도 4에 도시되어 있다 (하기 실시예 6도 역시 참조하라).

추론적인 상호작용 분석과 관련하여, 다양한 유전자들을 통한 상호작용들이 QT 표현형 DSBP5_0의 관찰된 변이들이 함께 고려되는 더 많은 SNPs의 연합 효과에 의존하는지 여부를 조사하도록 테스트되었다.

상세하게, StrataSE 9.2에서 시행된 바와 같이 단일 직선상 회귀 모델은 다음으로 로스타퓨록신/위약 내에서 SNP1 및 SNP2의 주변 효과들에 덧붙여 첫 번째 SNPs 세트 (SNP1) 및 두 번째 SNPs 세트 (SNP2) 사이의 상호작용 효과 (SNP1*SNP2*치료법)에 대하여 테스트하는 데 사용되었다.

SNPs 세트가 SNPs가 검출된 유전자들을 고려하여 확립되었고, 기작에서 유전자들의 가능한 관여는 선택된 표현형을 부여하는 것으로 확인되었다 (혈압의 변화).

이들 SNPs는 좀 더 나아가 위약 및 로스타퓨록신에서 의존적 변수로서 DSBP5_0 및 독립적 변수들로서 유의한 후보 SNPs로 스트라타 (STRATA) 소프트웨어를 사용한 통계적인 ANOVA 분석을 수행하여 위약에 대비하여 가장 큰 로스타퓨록신에 대한 반응을 가진 유전형들을 확인하도록 선택되었다. 상세하게, 위약에 대비한 가장 큰 로스타퓨록신에 대한 반응을 가진 두 가지 SNPs 간 상호작용들의 유전형들을 선택하기 위하여, 본 출원인들은 위약 및 로스타퓨록신에서 의존적 변수로서 DSBP5_0 및 독립적 변수들로서 SNPs 간의 상호작용들을 사용하여 ANOVA 통계를 수행하였다. 본 출원인들은 도 5에서 본 절차의 예를 보고하고 있다: rs8899 및 rs4678 간의 상호작용. 본 출원인들은 rs8899의 유전형 AA 및 rs4678의 유전형 BB 간의 상호작용을 이것이 위약 그룹에서는 아니지만 치료 그룹에서 가장 큰 탁월한 감소를 나타내기 때문에 선택하였다.

본 조사의 성과로는, 본 출원인들이 위약 그룹에서는 아니지만 치료 그룹에서 도 5에서 rs8899 및 rs4678의 예와 같은 QT 표현형 DSBP5_0의 탁월한 감소를 가지는 SNPs 상호작용들의 유전형들을 선별하였다.

모든 유전적 분석들은 프로그램 패키지 gPLINT를 사용하여 수행되었다 [문헌 33]. 아이젠소프트 패키지 (리눅스 플랫폼을 위한 버전 2.0, 유전학과, 하버드 의과대학, 미국 보스턴)를 사용하는 기본 성분 분석 (Principal Component Analysis, PCA). 게놈 상승 인자 (genomic inflation factor) λ는 아이젠소프트 패키지의 게놈 컨트롤 (GC)을 사용하여 계산되었다. 통계적인 유전적 분석들을 이들 분석들 모두의 경우 순수한 통계적 유전학 접근법을 넘어 완성하기 위하여, 프로그램 StrataSE 9.2가 사용되었다. 당업자라면 본 기재내용의 해독 시 통계적 분석들의 추가적인 자세한 사항들 모두를 확인할 수 있을 것이다.

기술적 및 추론적인 통계적 분석 이후에, 유전자 분석 프로파일들도 역시 가장 작은 유의한 SNPs의 가능한 세트를 사용하여 미반응자 (NR)로부터 활발한 치료에 이르기까지 반응자들 (R)를 구별할 목적으로 제작되었다. 본 경우에서 "유전적 프로파일"은 단일 SNPs에서 또는 그들의 상호작용들에서 유전형들의 직선상 조합이다.

프로파일들을 제작하기 위하여, 각 SNPs에 대한 서로 다른 유전형들은 변수로서 고려되고, 상세하게는 덜 흔한 동형접합 유전형은 유전형 1 (g1)으로서 확인되었고, 이형접합 유전형은 유전형 2 (g2)로서 확인되었으며 더 흔한 동형접합 유전형은 유전형 3 (g3)로 확인되었다.

따라서, 예를 들어 SNP1 (성분 1)의 g1, SNP2 (성분 2)의 g2 및 SNP4 (성분 3)의 g2와 SNP3의 g1의 상호작용을 인자들로서 가질 수 있는 유전적 프로파일들이 제작되었다. 프로파일은 성분들의 수라면 모두를 가질 수 있다.

주어진 프로파일이라면 모두가 적어도 하나의 성분이 유의하게 연관된 유전형을 표현한 경우 1과 동등하게 코드화되었고 (예로, 이전의 실시예에서 SNP1의 g1), 그렇지 않은 경우라면 프로파일이 0으로서 코드화된다. 다음으로, 모든 개체들은 프로파일 정의된 환자들의 소집합을 특성 분석하도록 허용하는 프로파일에 맞추어 0 또는 1로서 분류된다.

다음으로 개체를 R 또는 NR로 분류하는, 예로 로스타퓨록신에 대한 NR로부터 R을 구별하는 유전형 프로파일들을 찾는 서로 다른 프로파일들의 예측 능력이 [문헌 36, 37]에 기술된 것들과 같은 절차들에 따라 수행된 논리적 회귀분석을 사용하여 테스트되었다.

유전적 프로파일들을 평가하도록 본 출원인들에 의해 선택된 매개변수는 FDA 지침들 [문헌 38]에 따라 약리유전학적 테스트들의 성적 정보를 제공하는 고려된 매개변수들의 하나인 교차비 (Odds Ratio, OR)이었다. 상세하게는, FDA 지침들에 따르면 OR은 위약 대신 약물에 대한 환자 반응자들 간의 서로 다른 유전적 프로파일들에 따른 차이 정도를 평가하는 임상적으로 적절한 매개변수이다.

OR 수치는 정의된 유전적 프로파일에 따라 테스트 음성 환자들 (미반응자들)에서 교차 대비 테스트 양성 환자들 (반응자들)에서 교차의 비율을 의미한다. 교차비는 다음과 같이 양성 (PPV) 및 음성 (NPV) 예측 수치들을 조합한 것이다: PPV x NPV / [(100 - PNV) x (100 -NPV)]. 예측 수치들 (양성 또는 음성 둘 중 하나)는 관심 있는 임상적 조건을 가진 양성 또는 음성 테스트 결과를 가진 환자들의 비율을 나타낸다 (예로, 정의된 유전적 프로파일로 약물에 대한 반응). 달리 말하면, OR은 본 테스트에 대해 반응자 (PPV) 또는 미반응자 (NPV)일 가능성이다. 교차비 1은 테스트가 정보를 주지 못하는 것을 의미하고, 따라서 교차비가 높을 수록 테스트의 예측 능력은 더 높다.

상기 연구의 결과들에 근거하여, 본 출원인들은 로스타퓨록신의 효과를 검출하기 위해 선택된 정량적인 표현형에 유의하게 영향을 주는 여러 가지 SNPs 및 관련된 유전형 프로파일들을 확인하였다.

상세하게, 이전에 혈압에 영향을 주는 경로들과 연관되지 않았던 유전자들에 위치하는 일정 코아 SNPs가 다음의 실시예들에서 설명될 바와 같이 로스타퓨록신의 효과들을 증진시키는 데 탁월한 능력을 놀랍게도 보여주었다.

실시예 1: 코아 SNPs가 로스타퓨록신에 대한 개인의 반응에 영향을 준다

상기 대략적 연구의 성과에서, 본 명세서에서 코아 SNPs라도도 확인된 SNPs의 그룹은 로스타퓨록신에 대한 개인의 반응에 유의하게 영향을 주는 것으로 확인되었다. 본 명세서에서 기술된 코아 SNPs의 주요한 특징은 표 4에 나타나 있다. 하기 표 4는 코아 SNPs를 나타낸 것이다.

코아 SNPs rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375은 인간 게놈에서 정확한 염색체 위치를 가지지만 현재 기능이 알려져 있지 않은, 새로이 확인된 단일 뉴클레오타이드 다형성증들이고, 상기 기술된 통계적 분석의 성과에서 로스타퓨록신에 대한 혈압 반응과 연관된 유의한 SNPs의 가장 작은 세트로서 게놈-와이드 스캐닝 및 연관성 분석 (GWAS)으로 확인되어 왔다.

상세하게, 이들 SNPs는 센트릭스 비트칩 (Sentrix BeadChip) 플랫폼에 기초하는 전체 게놈 유전형분석 (WGG)에 따라 수행된 테스트된 개인들의 전체 게놈의 유전형 분석 이후에 확인되었다 [문헌 10]. 보다 상세하게, WGG는 당업자라면 확인가능하고 [문헌 10, 11, 12]에 좀 더 상세하게 기술된 절차에 따라 미-제한된 좌위 선별을 통하여 환자들의 전체 게놈을 따라 1백만 개의 SNPs를 넘어 조사하도록 인간 1M 듀오 칩 - 인피니움 Ⅱ 검정법을 사용하여 수행되었다.

먼저 유전형 분석의 성과에서 검출된 SNPs는 단일변수 분석을 시행한 다음 상기에 설명된 바와 같이 가장 큰 로스타퓨록신에 대한 반응을 가진 SNPs 유전형들을 선택하도록 좀 더 분석되었다.

상세하게는, 위약에 비하여 가장 큰 로스타퓨록신에 대한 반응을 가진 유전형들을 선별하기 위하여, 본 출원인들은 의존적 변수로서 DSBP5_0를 가지고 위약 및 로스타퓨록신에서 ANOVA 통계 (원웨이)를 수행하였다.

본 분석은 도 6에 예시되고 있고, 여기에서는 위약 그룹 (p = 0.045)에서보다 치료 그룹에서 더 큰 SNP 유전형들 g1, g2 및 g3에서 유의한 표현형 분산을 고려하는 SNP rs2461911에 대한 분석이 나타나 있다.

SNP rs2461911의 세 가지 유전형들 g1, g2 및 g3의 DSBP5_0 수치의 변이도 역시 도 7에 도시되어 있고, 여기에서는 로스타퓨록신 및 위약 그룹들을 비교하여 SNP rs2461911의 세 가지 유전형들의 DSBP5_0 수치의 좌표를 보여준다. 도 7의 도시로부터, 유전형 1에서는 로스타퓨록신을 사용하여 분명한 혈압의 감소가 있는 한편 위약을 사용하여는 혈압이 완만하게 증가되는 것이 밝혀졌다. 반대로, 유전형 3에서는 혈압 강하가 위약을 사용하여 더 커진 것으로 보인다. 중요한 점은 분명하게 정반대의 경향을 따르는 이들 유전형들에 따라 위약 및 로스타퓨록신을 사용한 혈압 반응에서 변화들의 방향성이다. 이것은 분석될 수 있고 우리는 본 모델, 특정한 SNP를 위한 로스타퓨록신 및 위약 간의 상호작용들의 통계적 유의성을 확립할 수 있다. 적절한 통계적 분석은 상호작용의 유의성을 제공한다 (모델의 유의성이 < 0.05인 경우에만 인정됨). 상호작용의 경우 p값은 표 4에서 P-GXE로서 주어진다.

유사한 접근법이 다른 코아 SNPs를 분석하고 선택하는 데 적용되어, 본 연구의 성과에서 본 출원인들은 도 7에서 rs2461911의 예와 같은, 위약 그룹에서는 아니지만 로스타퓨록신에서는 QT 표현형 DSBP5_0의 탁월한 감소를 가지는 SNPs의 유전형들을 선별하였다.

코아 SNPs를 표현하고 로스타퓨록신으로 치료된 개인들 (치료 그룹) 대비 코아 SNPs를 표현하고 위약으로 처리된 개인들 (위약 그룹)에서 DSBP5_0에 관련된 데이터의 요약은 표 5에 나타낸다. 하기 표 5는 코아 SNPs의 DSBP5_0에서의 감소를 나타낸 것이다.

상세하게, 표 5에서 데이터는 유의하게 QT 표현형 DSBP5_0과 연관된 SNPs를 선별하도록 의존적 변수로서 DSBP5_0 및 독립적 변수로서 SNPs를 사용하여 단계별 직선상 회귀분석을 사용하여 획득되었다.

실시예 2: 코아 SNPs를 포함하는 유전적 프로파일은 로스타퓨록신에 대한 개인 반응에 영향을 준다

SNPs의 확인 이후에, 본 출원인들은 실시예 1의 코아 SNPs를 포함하는 유전적 프로파일들의 예측 능력을 조사하였다. 유전적 프로파일들의 제작을 후원하는 이론적 근거는 주어진 SNP의 표현형 효과도 역시 첫 번째 SNPs와 연관된 단백질과 상호작용하는 단백질들을 코딩하는 유전자에 보유되는 기타 다른 SNPs의 맥락 안에서 (유전적 네트워크) 평가되어야 하는 잘 확립된 견해에 의존하고 있다. 본 의미로, 네트워크 분석도 역시 유전적 우위성 (epistasis)의 개념을 설명한다 [문헌 39]. 사실상, 두 가지 유전자좌에서 대립유전자들은 이들 대립유전자들이 별도로 분석될 때 검출가능한 효과라면 모두를 가지지 않을 수 있지만 그들은 함께 분석될 때 동일한 개체들에서 공동-발생할 수 있기 때문에 표현형으로는 (phenotypically) 적절해 질 수 있다.

본 출원인들은 의존적 변수가 이분적 (dicotomic) 표현형 (R 또는 NR)이고 독립적 변수가 특이적 프로파일이 되는 예측 모델 논리적 회귀분석을 사용하여 치료 그룹에서만 코아 SNPs를 포함하는 유전적 프로파일이 치료에 대한 반응자들을 미반응자들로부터 구별할 수 있는지 여부를 평가하였다. 다음으로 본 출원인들은 예측적 매개변수들 (교차비, PPV, NPV)을 계산하는 모델의 적정성 (goodness)을 평가하였다.

실시예 1의 모든 코아 SNPs를 포함하는 유전적 프로파일에 관련된 대표적인 데이터는 도 8에 도시되어 있다. 상세하게, 도 8은 코아 SNPs를 포함하는 프로파일들을 위한 교차비 (OR) 및 예측 수치 (p-값들)에 관한 데이터를 도시하고 있고, 이들은 FDA 지침들에 따라 약리유전학적 테스트들의 성적 정보를 제공하는 고려된 매개변수들이다 [문헌 38].

상세하게는, OR 수치는 정의된 유전적 프로파일에 따라 테스트 음성 환자들 (미반응자들)에서 교차 대비 테스트 양성 환자들 (반응자들)에서 교차의 비율을 의미한다. 상세하게, 교차비는 다음과 같이 양성 (PPV) 및 음성 (NPV) 예측 수치들을 조합한 것이다: PPV x NPV / [(100 - PNV) x (100 -NPV)]. 달리 말하면, OR은 본 테스트에 대해 반응자 (PPV) 또는 미반응자 (NPV)일 가능성이다. 교차비 1은 테스트가 정보를 주지 못하는 것을 의미하고, 따라서 교차비가 높을수록 테스트의 예측 능력은 더 높다. p-값들 (양성 또는 음성 둘 중 하나)는 관심 있는 임상적 조건을 가진 양성 또는 음성 테스트 결과를 가진 환자들의 비율을 나타낸다 (예로, 정의된 유전적 프로파일로 약물에 대한 반응).

p-값 매개변수는 z 점수에 근거하여 계산되고 이것은 OR의 유의성을 의미한다. z 점수 매개변수는: In (OR) / 표준 오차 (InOR)을 의미한다. z 점수는 OR이 1까지 소수인 경우 다음으로 프로파일이 약물에 대한 반응을 예측할 수 없는 경우라면 음성 수치를 가진다. 한편 z 점수는 OR > 1이고 다음으로 프로파일이 약물에 대한 반응을 예측할 수 있는 경우라면 양성 수치를 가지고: z 점수가 높은 경우 OR은 더 작은 분산으로 인하여 더욱 유의하다.

상기 언급된 매개변수들 중에서, 교차비 (OR)은 위약 대신 로스타퓨록신에 대한 환자 반응자들 간의 서로 다른 유전적 프로파일들에 따른 차이 정도를 평가하는 임상적으로 적절한 것으로 고려된다 [문헌 38].

도 8에 정리된 모든 코아 SNPs (프로파일 4)를 포함하는 프로파일과 관련된 데이터는 프로파일에 나열된 코아 SNPs의 하나 이상의 SNPs를 포함하는 환자들로부터 나온 데이터를 고려하여 획득되었다. 판정기준은 보통 단일한 독특한 프로파일에서 적어도 하나의 SNP를 보유하는 환자들의 포함을 후원하는 두 가지 인자들의 발생에 의해 정당화된다: i) SNP의 강한 예측 능력 또한 ii) 논의되는 SNPs를 연결시키는 보편적으로 가능성 있는 생물학적 기작에 의함. 상세하게, SNPs의 예측 능력은 OR 및 당업자라면 확인가능한 방법들에 따라 정확하게 분류된 환자들로부터 평가될 수 있다. 해당하는 매개변수는 프로파일 4를 가진 환자들의 경우 79.8%가 되는 "정확한 (correctly)" 수치이다 (도 8을 참조하라). 본 수치는 100명의 환자들로부터 나온 80명의 환자들에서 프로파일이 반응자들 및 미반응자들로 환자들의 정확한 분류를 제공하는 것을 의미한다.

상기 결과들의 견지에서, 코아 SNPs가 임상적 적절성을 가지고 로스타퓨록신의 약학적 활성에 영향을 주는 것으로 판단하는 것이 가능하다. 상세하게, 임상적 적절성은 약물 (로스타퓨록신) 및 위약 간의 혈압 강하 차이의 크기로 인한 것이고, 이는 로스타퓨록신을 사용하여 26으로부터 15 mmHg 범위가 되는 한편, 문헌에 따르면 본 차이는 ARBs를 사용하여 4 및 6 mmHg 사이의 범위가 된다.

두 가지 별도의 연구들에서 획득된 프로파일 4를 보유하는 환자들에서 예비적인 데이터는 로스타퓨록신으로 획득되는 혈압에서의 강하가 입수 가능한 항고혈압 제제들 중에서 검출되는 것보다 40% 이상 더 큰 것을 보여주고 있다 (도 8, 바닥 부분을 참조하라). 상세하게, 프로파일 4를 보유하는 개인들은 혈압에서 변형을 보여주고: HCTZ를 사용하여 -12.3 ± 1.5 mmHg; 로사탄을 사용하여 -11.3 ± 1.7 또한 로스타퓨록신을 사용하여 -18.74 ± 1.8 mmHg; 프로파일 8을 보유하는 개인들은 혈압에서 감소를 보여주고: HCTZ를 사용하여 -11.3 ± 1.2; 로사탄을 사용하여 -11.6 ± 1.3; 로스타퓨록신을 사용하여 -15.2 ± 1.5 mmHg; 프로파일 9를 보유하는 개인들은 혈압에서 감소를 보여준다: HCTZ를 사용하여 -11.9 ± 1.2; 로사탄을 사용하여 -11.4 ± 1.4; 로스타퓨록신을 사용하여 -15.2±1.5 mmHg.

실시예 3: 적절한 SNPs와 함께 코아 SNPs를 포함하는 유전적 프로파일은 로스타퓨록신에 대한 반응에 영향을 준다

상기 언급된 약리유전학적 연구의 과정에서 확인된 추가적인 SNPs와 코아 SNPs의 상호작용들은 예측 모델로서 논리적 회귀분석을 사용하여 치료에 대한 NR로부터 R을 구별하는 데 적합한 추가적인 유전적 프로파일들의 가능한 확인을 검증하도록 분석되었다.

상세하게 실시예 2 (프로파일 4)의 코아 SNPs 프로파일은 본 연구의 과정에서 확인된 추가적인 적절한 SNPs와 조합되었다.

본 기재내용의 맥락에서, 적절한 SNPs는 로스타퓨록신에 대한 미반응자들로부터 반응자들을 구별하는 데 적합한 SNPs를 의미한다.

상세하게, 먼저 적절한 SNPs가 다음의 세 가지 유전자 그룹들에서 조사되었다: a) 본 명세서에서 CAND 1이라고도 표시되는, 로스타퓨록신의 작용 기작들에 직접적으로 관여하는 유전자들; b) 본 명세서에서 CAND 2라고도 표시되는, 고혈압의 발생 및/또는 고혈압과 연관된 기관 손상에 관여할 수 있는 유전자들 (WNK과 같음 - 실시예 5를 참조하라); 또한 c) 본 명세서에서 GWS라고도 표시되는, 전체 게놈 스캐닝을 수행하여 확인되는 유전자들 (HLA-A와 같음, 실시예 6을 참조하라).

상세하게, 먼저 이들 유전자들에서 SNPs는 선택된 유전자를 유전형 분석하여 확인되었다. 다음으로 적절한 SNPs는 실시예 4 내지 실시예 6에서 좀 더 설명된 바와 같이 기술적 및 추론적인 분석을 시행하여 선별되었다.

다음으로 이와 같이 확인된 적절한 SNPs는 실시예 2의 프로파일 4의 코아 SNPs와 함께 유전적 프로파일들로 그룹화되었다.

결과들은 코아 SNPs 및 적절한 SNPs를 포함하는 유전적 프로파일들은 도 8에서 도시된 바와 같이 미반응자들로부터 로스타퓨록신 반응자들을 구별하는 데 보다 더 효과적인 것을 보여준다.

상세하게, 도 8의 요약에서는 코아 SNPs (프로파일 4) 또한 추가적인 CAND 1, CAND 2 및/또는 GWS SNPs에 의해 형성된 추가적인 프로파일들의 경우 검출되는 OR, p-값 및 DSBP5_0도 역시 설명되고 있다 (상세하게는 도 8의 프로파일 8 및 프로파일 9를 참조하라). 도 8의 데이터 분석으로부터 프로파일들에 추가적인 SNPs를 포함하여, OR 수치들 및 "정확한" 수치는 프로파일 4의 것들의 측면에서 증가된다 (도 8에서 프로파일 8 및 프로파일 9를 참조하라). 또한 이들 SNPs의 포함은 프로파일 4의 전 집단의 26%로부터 프로파일 9의 전 집단의 44%까지 표적 집단의 크기 증가를 결정하고 있다.

도 8에서 나타난 코아 SNPs 및 추가적인 SNPs 간의 상승적 효과의 가능한 설명은, 본 명세서에서 안내의 목적으로 제공되고 이를 제한하지는 않고, 고혈압과 같은 복합적 질환들의 기초가 되는 동일한 유전적 네트워크에서 논의되는 SNPs의 포함이다. 본 출원인들에 의해 획득된 실험적 증거는 이들 SNPs가 다른 유전자들 (혈압에 영향을 주는 경로들과 이미 연관되어 있는 CAND 1 또는 CAND 2와 같음 - 실시예 4 및 실시예 5를 참조하라)을 방해하거나 유전자 네트워크에서 조정하거나 후보들의 선택된 리스트와 상관없을 수 있는 다른 유전자들에 영향 (프로파일들 8 및 9와 비교하여 프로파일 4를 참조하라)을 줄 수 있는 결론을 지지한다.

따라서, 본 명세서에서 보고된 데이터의 가능한 설명은 코아 SNPs (프로파일 4)의 구별시키는 능력 (discriminatory capacity)은 동일한 유전적 네트워크에서 GWS, 코아 SNPs, CAND 1, CAND 2 및 네트워크(들)에 포함되는 추가적인 미지의 SNPs의 효과들을 조합하고/통합하는 포함 때문에 CAND 1 및 CAND 2에 의해 증가된다.

구별시키는 능력의 증가 또한 프로파일 4로부터 프로파일 9까지의 진행에 이해 성취되었던 프로파일에 포함되는 선택된 환자들의 크기의 증가는 네트워크 개념을 지지한다.

실시예 8의 프로파일 8 및 9에 포함되는 추가적인 적절한 유전자들에 대한 특이적 유전형들은 하기 표 6 및 표 7에 좀 더 기술되어 있다. 하기 표 6은 프로파일 8 및 프로파일 9 SNPs를 나타낸 것이다. 하기 표 7은 프로파일 8 및 프로파일 9에서 후보 및 첨단 SNPs 간의 상호작용들을 나타낸 것이다.

상기 결과들이 견지에서, 추가적인 SNPs와 함께 프로파일에 포함되는 코아 SNPs는 코아 SNPs의 활성 단독보다는 보다 더 높을 수 있는 로스타퓨록신의 약학적 활성에 임상적 적정성을 가지고 영향을 주는 것으로 판단하는 것이 가능하다.

실시예 4: 로스타퓨록신에 대한 반응에 영향을 주는 적절한 SNPs: CAND 1 유전자들

본 출원인들은 로스타퓨록신에 대한 반응자들을 확인하는 실시예 1의 코아 SNPs도 역시 포함하는 유전적 프로파일들에서 추가적인 적절한 SNPs의 포함을 조사하였다.

첫 번째 실험들에서, 로스타퓨록신의 작용 기작에 직접적으로 관여하는 유전자들의 SNPs (본 명세서에서 CAND1 유전자들이라고도 확인됨)가 조사되었다.

상세하게, 조사되었던 CAND 1 유전자들은 애덕신 소단위들 (ADD1, ADD2, ADD3)을 코딩하는 유전자들 및 EO 합성 및 대사에 관여하는 유전자들 (CYP11A1, HSD3B1, LSS, ABCB/MDR1, 및 SLCO4C1)을 포함하였다. 조사된 유전자들의 특징의 요약이 표 8에 보고되어 있다. 하기 표 8은 선택된 후보 유전자 (CAND 1)을 나타낸 것이다.

상세하게, 표 8은 선택된 CAND 1 유전자들 및 관련된 염색체 위치, 유전자 기호 및 유전자 명칭을 보여준다.

표 8의 각 CAND 1 유전자의 경우, SNPs가 SNPs를 사용하여 검출되었다: 타크맨 검정법 (Taqman Assay)(요구되는 검정법 또는 ABI사로부터 나온 프로브 및 프라이머 설계를 사용하는 맞춤 MGB)을 사용한 단일 SNP 분석.

검출된 SNPs는 단일변수 분석이 시행되고 적절한 CAND1 SNPs는 본 연구에서 선택된 QT 표현형 DSBP5_0의 검출된 변이를 근거로 하여 선별되었다.

대표적인 적절한 CAND 1 SNPs는 관련된 GXT 연관성 결과들과 함께 표 9 및 표 10에 보고되어 있다. 유의한 p_GXT는 치료 (로스타퓨록신/위약)에 대한 반응이 서로 다른 유의한 DSBP5_0를 의미한다. 하기 표 9는 CAND 1 SNPs를 나타낸 것이다. 하기 표 10도 역시 CAND 1 SNPs를 나타낸 것이다.

상세하게, 표 9는 선택된 대표적인 CAND 1 SNPs의 단일 변수 분석의 결과들을 관련된 유전자 기호, 염색체 위치, 염색체 상의 자리, 유전자 상의 위치 및 p값과 함께 보여준다.

HSD3B1 유전자 (HSD18 및 HSD19)를 위한 두 가지의 적절한 SNPs가 표 6에 자세하게 기술되고 그들의 적절성은 표 7에 기술되어 있다.

표 10에서는 적절한 SNP rs914247에 대한 데이터가 보고되어 있다.

발명의 상세한 설명에 설명된 바와 같이, 애덕신 유전자들 및 표 9에 포함된 유전자들은 애덕신 또한 EO 합성 및 운반에 관여하는 효소들을 인코드하는 것으로 제시된 것들이다. "시험관내 (in vitro)" 피코몰 농도들에서 또는 동물에서 나노몰 용량들에서의 로스타퓨록신은 야생형 애덕신의 효과를 차단하지 않고 Na-K 펌프 및 cSrc에 미치는 돌연변이 된 애덕신 또는 우아바인의 효과를 선택적으로 교정할 수 있다.

실시예 5: 로스타퓨록신에 대한 반응에 영향을 주는 적절한 SNPs: CAND 2 유전자들

두 번째 일련의 실험들에서, 전체 게놈 스캐닝으로 검출된 유전자들 (본 명세서에서 GWS 유전자들이라고도 확인됨)의 SNPs가 조사되었다.

상세하게, 병리생리학적으로 적절한 유전자들의 더 큰 세트가 CAND 2 유전자들로서 선택되었다. 선택의 판정기준은 주로 RAA 효소들 및 수용체들을 코딩하는 유전자들, 신장 소듐 재흡수를 조절하는 이온 통로들 (channels) 및 운반체들 (transporters)의 다양한 패밀리들, 아드레날린성 수용체들 (adrenergic receptors), 발세포 단백질들 및 전사인자들을 포함하였다. 그 결과 얻은 유전자들의 세트는 도 9의 도시에 정리되어 있다.

상세하게, 도 9에서는 선택된 후보 유전자 "CAND 2"가 적절한 염색체 위치, 유전자 기호 및 유전자 명칭과 함께 표시된다. 이들 유전자들에 관한 추가적인 정보는 본 기재내용의 해독 시 당업자라면 확인 가능하다.

도 9 표의 각 CAND 2 유전자의 경우, SNPs는 게놈 전체를 넘어 존재하는 태그 SNPs (Tag SNPs)를 사용하고 후보 유전자들 내의 변이의 평가를 제공할 수 있는 일루미나 칩에서 혈압 반응에 미치는 로스타퓨록신에 대한 이들 유전자의 영향을 평가하도록 검출되었다.

검출된 SNPs는 단일변수 분석이 시행되었고 1.78*10E-4 (rs7117314)로부터 5*10E-2 (rs945403)까지 범위의 p-값 GXT를 가지는 SNPs만이 코아 SNPs의 선택을 위해 설명된 동일한 방법론을 사용하여 선택되었다.

후보 유전자를 다루면서, 우리는 후보 유전자들의 선택을 지지하는 이전의 데이터의 견지에서 p < 0.0001 대신에 p < 0.05를 역치로서 단지 사용하였다.

상세하게, 적절한 CAND 2 SNPs는 QT 표현형 DSBP5_0의 검출된 변이를 근거로 하여 선택되었다.

대표적인 CAND 2 SNPs는 표 11에 관련된 GXT 연관성 결과들과 함께 보고되어 있다. 유의한 p_GXT는 치료 (로스타퓨록신/위약)에 대한 반응이 서로 다른 유의한 DSBP5_0를 의미한다. 하기 표 11은 적절한 CAND 2 SNPs의 단일변수 분석을 나타낸 것이다.

상세하게, 표 11에서는 위약 및 치료에 대한 GXT 연관성 결과들이 설명되어 있다. 유의한 p_GXT는 치료 (로스타퓨록신/위약)에 대한 반응이 서로 다른 유의한 DSBP5_0를 의미한다.

실시예 6: 로스타퓨록신에 대한 반응에 영향을 주는 적절한 SNPs: GWS 유전자들

두 번째 일련의 실험들에서, 고혈압의 발생 및/또는 고혈압과 연관된 기관 손상에 관여할 수 있는 유전자들 (본 명세서에서 CAND 2 유전자들이라고도 확인됨)의 SNPs가 조사되었다.

게놈 SNPs는 [문헌 10, 11, 12]에 기술된 절차에 따라 휴먼 1M 듀오 칩 유전형분석 비드 칩을 사용하는 일루미나사로부터 나온 인간 1M 어레이로 유전형이 분석되었다. 상세하게, 염색체 X 및 Y의 SNPs 뿐만 아니라 X의 유사-상염색체 부위의 SNPs (XY)가 고려되지 않았기 때문에 전체에서 1111190개의 SNPs (전체의 92.66%)가 분석되었다.

검출된 SNPs는 실시예들 섹션에서 기술된 방법론들에 따라 적절한 SNPs를 확인하는 접근법으로 단일변수 분석이 시행되었다.

GWS 유전자들을 위한 단일변수 분석의 결과들 (정량적인 형질 상호작용 - GxE)은 좌표로서 나타내고, 이는 193명의 NPT 환자들로부터 나온 시료에서 유전형 분석된 848340개의 SNPs의 결과들을 p < 10^-4의 확립된 역치보다 낮은 p값을 가지는 107개의 SNPs와 함께 보여주고 있다.

다음으로 자세한 주석 달기가 연관성에 관심을 가진 특이적 게놈 부위의 역할을 명확하게 할 목적으로 확인된 107개의 SNPs에서 수행되었다. 본 GWAS로부터 확인된 107개의 첨단 SNPs는 이들 게놈 자리들에 의해 표시된다: 코딩 부위들에서 7개, 3' UTR에서 4개, 인트론들에서 30개 및 유전자간 부위들에서 66개. 최종-언급된 그룹 중에서, 일정 SNPs는 유전자 부위에 인접하고 친척 프로모터 내에 위치할 수 있는 한편, 일정 다른 것들은 주석을 단 유전자로부터 떨어져서 버려진 부위들이라고 고려된다.

따라서, 더 자세한 주석 달기가 프로파일 4에 포함된 첨단 SNPs을 위해 또한 프로파일 5 (첨단 SNPs와 상호작용함)만을 위해 수행되었고, 우리는 그들의 대다수가 최소의 인트론 SNPs 세트를 가진 유전자간 변이들인 것을 관찰하였다. 이들 변이들 모두는 이미 서론- 1.3 단락에서 언급된 바와 같이 소위 "정크 DNA (junk DNA)" 부위들에 속할 수 있고 [문헌 40], 따라서 진핵생물에서 서열들의 진화적 혁신을 위한 풍부한 기질이 된다.

소모적 주석 달기에 이어지는 절차는: i) MAF > 5%를 보여주는 SNPs; ii) 서로 다른 데이터베이스들 (NCBI Entrez Gene, HapMap, Ensenbl)의 조력으로 더 최신의 지도작성; iii) 유전자 또는 기능적 부위들에서 가능한 위치를 가지고 그들 중에 완벽하거나 강한 ID에 놓인 SNPs의 그룹으로부터 선별; iv) 펍메드 (PubMed) 분석; v) 공개된 miRNA 서열들 및 유사 게놈 표적들의 주석 달기.

유전자간 SNPs의 경우, 본 출원인들은 코딩 또는 스프라이싱 변이들을 전혀 관찰아지 못하였지만 우리는 종종 기능이 알려지지 않은 유전자들에 위치하는 공통적인 인트론 다형성증들을 확인하였다. 두 가지의 첨단 SNPs (rs3893464 및 rs5013093)가 여러 가지 유전자들을 포함하는 광대하고 높은 LD의 특징적인 부위인 6번 염색체 상의 주요 조직적합성 복합체 클래스 1 (major histocompatibility complex class I) 부위 내에 존재하였다. 본 경우에서, 정확한 유전자 주석 달기가 더 복잡하고, 포함된 유전자들의 발현 및 기능적 양상 조사는 올바른 부위를 정의하는 데 도움을 줄 수 있다. SNPs가 miRNA 표적 조성물에도 서로 다른 효과들을 가질 수 있기 때문에, 특히 3'UTR의 경우 첨단 SNPs 모두가 서로 다른 데이터베이스들 (www.patrocles.org, microrna.sanger.ac.uk, www.microrna.org)에서 가상으로 테스트되었지만, 흥미로운 결과들이라면 모두가 복귀되었다. 또한 본 출원인들은 원래의 전구체 서열들 또는 단지 성숙한 miRNAs에 대한 검색을 고려하였다. 그러나, 예측을 위한 약물 반응의 마커 확인은 좀 더 나아가 신호의 출처의 유전적 위치측정 (localization)이 없이는 GWS 연구가 충분하게 진행되지 못할 것이다.

상기 특성 분석에 이어서, 초기의 107개의 GWS SNPs는 좀 더 나아가 위약 및 로스타퓨록신에서 의존적 변수로서 DSBP5_0 및 독립적 변수들로서 107개의 유의한 SNPs로 스트라타 (STRATA) 소프트웨어를 사용한 통계적인 ANOVA 분석을 수행하여 위약에 대비하여 가장 큰 로스타퓨록신에 대한 반응을 가진 유전형들을 확인하도록 선택되었다. 또한 본 분석법으로 상기 언급된 SNPs의 유전형의 적절성도 역시 분석되었다.

본 접근법으로는 궁극적으로 위약 그룹에서는 아닌 치료 그룹에서 DSBP5_0 감소를 가지는 단지 35개의 SNPs (및 그들의 친척 유전형들)가 적절한 GWS로서 고려되도록 선택되었다. 적절한 GWS 유전자의 리스트는 표 12에 정리되어 있다. 하기 표 12는 적절한 GWS SNPs의 단일변수 분석을 나타낸 것이다.

실시예 7: 코아 SNPs를 가진 연관 불균형에서 유전적 변이들

프로파일 4, 8 및 9에서 포함되는 DNA 변이들이 반응자인 환자들을 예측하는 데 강한 유전적 능력을 가진다고 하더라도, 그들은 가장 구별시키는 능력을 가지는 유전적 다양성 모두를 설명하지는 못한다. 연관 불균형의 개념에 따르면, DNA 변이 (태그 SNPs)는 일반적으로 태크 SNP에 비하여 동등하거나 유사하게 변이를 가질 수 있는 인접한 SNPs의 다양한 수에 의해 표현될 수 있다. 따라서, 여러 가지 추가적인 유전적 변이들이 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들의 범위에 포함된다. 로스타퓨록신의 생물학적 활성에 영향을 주는 SNPs를 가진 연관 불균형에서의 대표적인 유전적 변이들은 표 13에 나열되어 있다. 하기 표 13은 CEU HapMap 데이터 Rel 24에 따른 코아 SNPs, 프로파일 8 및 프로파일 9 SNPs에 대비한 인접 SNPs를 나타낸 것이다.

* LD 양상은 유럽 집단에서 계산된다.

표 13에 나열된 유전적 변이들은 유럽 집단의 유전적 데이터에 관한 대표적인 유전적 지도로부터 유래한 상기 언급된 코아 또는 후보 SNP 각각에 대한 해당하는 인접 SNP이다. HapMap 프로젝트에 의해 유래된 정보는 우리에게 유럽 집단에서 인접 SNPs의 최고의 적용범위 (coverage)를 제공하고 있다. 유럽 집단 및/또는 기타 다른 집단들을 위한 연관 불균형에서 유전적 변이에 관한 정보의 추가적인 출처들은 당업자라면 확인가능한 출처들을 통해 회수될 수 있고, 이는 예를 들어 우리 집단에 관한 일루미나 비드칩 1백만 유전형 데이터를 포함한다. HapMap과 같은 출처들을 참조할 때, 본 기재내용의 의미에서 적절한 유전적 변이 모두의 완벽한 리스트임을 입증하도록 출처의 측면에서 계속적인 업데이트가 필요하다.

실시예 8: 로스타퓨록신에 대한 반응에 영향을 주는 코아 SNPs 및 추가적인 SNPs에 관한 서열 정보

본 기재내용의 일정 구현예들에서, 치료법은 로스타퓨록신에 대한 반응에 영향을 주는 여러 가지 유전적 변이들에 관한 서열 정보의 검출에 근거하여 평가될 수 있다. 코아 SNPs 및 관련된 선택된 유전형들에 관한 서열 정보는 표 14 및 표 15에 보고되어 있다. 하기 표 14는 코아 SNPs 서열 정보를 나타낸 것이다. 하기 표 15는 선택된 유전형들 코아 SNPs 서열 정보를 나타낸 것이다.

로스타퓨록신에 대한 반응에 영향을 주는 대표적인 추가적 SNPs 및 관련된 선택된 유전형들에 관한 서열 정보는 표 16 및 표 17에 보고되어 있다. 하기 표 16은 반응에 영향을 주는 추가적인 SNPs의 서열 정보를 나타낸 것이다. 하기 표 17은 반응에 영향을 주는 추가적인 SNPs의 선택된 유전형들의 서열 정보를 나타낸 것이다.

본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들에서 서열 정보를 검출하는 데 사용되기에 적합한 대표적인 프로브들이 표 18에 나열되어 있다. 하기 표 18은 코아 SNPs를 위한 대표적인 프로브들을 나타낸 것이다.

본 명세서에서 예시되는 일정 방법들 및 시스템들은 로스타퓨록신의 비약리유전학적 치료 용도의 소정의 한계를 환자들의 소집합을 그들의 유전적 특성들 (SNPs)에 따라 선별:을 제한하여 극복할 수 있다. 상세하게, 논의되는 SNPs는 로스타퓨록신에 대한 혈압 반응을 (코아 SNPs) 단독으로 또한 고혈압 및 기관 합병증들을 유발하는 기작에 관여하고 로스타퓨록신에 의해 역시 자극되는 기타 다른 SNPs (CAND 1, CAND 2)와 조합으로 뒷받침하는 것으로 보인다.

상세하게, 코아 SNPs 및 CAND 1 또는 CAND 2 SNPs 둘 다는 관심 있는 두 가지 표현형들을 부여한다: a) 선택적 약물에 대한 반응, b) 고혈압 및 그의 기관 합병증들의 발생. 더욱이, 실제적인 관점으로부터 SNPs 그룹 둘 다는 반응자들 및 미반응자들 간을 구별하도록 기여한다. 이러한 발견은 올바른 환자를 위한 올바른 약물을 찾고 인간 환자들에게 질환의 네트워크 개념을 적용하려는 (지금까지는 동물 모델에서 연구됨) 새로운 연구 분야를 개척하는 문제에서 두 가지 중요한 의미를 가질 수 있다.

동물 모델들에서 다중유전자-복수인자 (polygenic-multifactorial) 질환들에 관한 연구들의 결과들은 현재의 패러다임: "하나의 유전적 분자적 변경 (또는 하나의 유전자 변이 또는 SNP), "하나의 병리생리학적 기작", 및 "하나의 임상적 증상 또는 질환"이 더욱 광범위한 개념의 기작들의 유전 환경적 네트워크 덕분에 포기되어야 할 것으로 제안한다. 질환은 본 네트워크의 교란 (perturbation)으로부터 발생될 수 있다. 다음으로 본 교란은 새로운 "우발적 (casual)" 치료법을 위한 표적이 될 수 있다. 동물 모델들에서 개발 중인 본 새로운 개념은 이상증들 (abnormalities)이 관심 있는 질환을 촉발할 수 있는 특이적 조직들 또는 기관들의 입수가능성이 없기 때문에 인간들에 즉시 적용 가능하지 않다.

본 명세서에서 기술된 방법들은 처음으로 인간들에게 새로운 전략을 적용하고 있다. 사실상, 기능적 교란 (매우 강력하고 선택적인 고혈압 제제, 로스타퓨록신에 대한 혈압 반응으로서 측정됨)과 유전적 교란 (두 가지의 SNPs 그룹들에 의해 정의됨)의 조합이 유럽에서만 2천만 명이 되는 임상적으로 적절한 환자들의 소집합에서 (약 25%) 고혈압을 그의 기관 합병증들과 함께 뒷받침하는 특징적인 유전적 네트워크의 확인에 대한 새로운 접근법을 실현시키고 있다.

여러 가지 구현예들에서, 본 명세서에 기술된 방법들 및 시스템들은 프로파일에서 또한 관심 있는 유전자의 우위성을 가지고 개인 환자의 유전적 불균질성을 다루고 있다. 유전적 불균질성 및 우위성은 다중유전자 복수인자 질환들에서 주어진 유전적 기작의 우발성 (casualty)를 보여주기 위해 극복해야 할 두 가지의 주요한 문제점들이다. 용어 유전적 불균질성 (genetic heterogeneity)은 동일한 표현형 (생화학적, 생리학적 또는 증상들)이 서로 다른 유전적 기작들에 의해 생산될 수 있는 것을 의미한다. 용어 우위성 (epistasis)은 동일한 유전적 변이의 효과가 관심 있는 유전자로부터 떨어져 있는 유전자로부터 나오는 또 다른 변이에 의해 조정 (무뎌지거나 확대되는 것 둘 중 하나)될 수 있는 것을 의미한다.

이들 두 가지의 잘 인정된 유전적 현상들은 인간 질환들 또는 치료법에 대한 반응을 뒷받침하는 기작들을 연구하는 유전학을 적용하는 시도들 모두를 방해하고 있다.

예를 들어, 주어진 호르몬 (특이적 우아바인에서) 또는 단백질 (특이적 애덕신에서)이 질환을 유발하는 데 관여하는 것을 가정하는 경우라면 호르몬의 합성, 운반 또는 분비에 관여하는 유전적 경로들도 역시 그의 중요한 (critaical) 조직 수준 및 그의 생물학적 효과를 결정하는 데 관여하는 것을 인정해야 한다.

유사하게, 특정한 단백질의 세포 기능을 조정하는 데 관여하는 단백질들을 코딩하는 모든 유전자들이 고려되어야 한다. 당연하게, 이들 생화학적 경로들 각각은 개인 환자의 유전적 배경에 의해 달리 영향을 받을 수 있다.

여러 가지 구현예들에서는, 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들에서 프로파일의 다양한 SNPs를 연결시키는 공통적인 발견들은 a) 로스타퓨록신에 대한 혈압 반응과 연관되는 SNPs 능력이고; 또한 b) SNPs 능력이 전 임상적 연구들에서 로스타퓨록신의 활성에 영향을 주고 고혈압 및 그의 기관 합병증들 (CAND 1 및 CAND 2 SNPs)을 뒷받침하는 생화학적 경로들과 연관되는 것이다. 현재의 고혈압 치료법과 비교하여 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들의 여러 가지 구현예들의 실제적인 장점들은 25%의 환자들에서 신속한 혈압 조절의 달성, 반응자들 및 미반응자들을 분류하는 현재 전략의 30 - 40%에 대비한 80%의 가능성 또한 로스타퓨록신의 경우 시험 결과들에 의해, 가장 중요한 것은 동물에서 활성을 가진 용량 및 노엘 (NOAEL, 비 역효과 수준들) 용량 사이의 로스타퓨록신의 보다 넓은 간격에 의해 (다른 입수 가능한 약물을 사용하여 단지 20 - 50배이지만, 로스타퓨록신을 사용하여 적어도 100,000배) 나타난 바와 같이 치료된 개인에서 좋은 내성 및 삶의 질을 포함한다. 또한, 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들의 여러 가지 구현예들은 로스타퓨록신에 의해 영향을 받고 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들에 의해 선택된 환자들의 소집합에서 기관 손상을 뒷받침하는 기작들 간의 일치성이 있기 때문에 예측 가능한 기관 합병증의 효율적인 예방과 연관될 수 있다.

이러한 예측 가능한 증가된 효율은 현재의 전략과 비교하여 3가지 분명한 의미들을 가진다: a) 환자들이 위험인자이기는 하지만 임상적 증상들을 교란시키는 질환은 아닌 고혈압의 치료를 따르도록 확신시키는 더 강력한 이론적 근거 (또는 논의들)를 제공하고, b) 고혈압과는 반대로 높은 정도의 장애를 만들 수 있는 심혈관 합병증을 경험한 환자들에게 부담을 덜어준다. c) 고혈압 치료법으로 인한 건강 관리 비용을 감소시키는 것은 가장 중요한 건강 관리 비용의 출처가 되는 심혈관 및 신장 합병증들의 더 높은 위험에 놓인 환자들의 소집단에 초점을 맞출 수 있다.

마지막으로 프로파일 4로 선택된 환자들의 소집합에서 로스타퓨록신을 사용하여 획득된 혈압 강하의 크기는 HCTZ 또는 로사탄을 사용하여 획득된 것보다 약 40% 더 크다. 본 차이는 다양한 고혈압 약물들 중에서 지금까지 검출된 것보다 훨씬 더 큰 것이다.

일반적으로, 여러 가지 구현예들에서 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들은 고혈압과 같은 심혈관 병폐의 치료에서 개선을 허용한다. 현재, 치료받은 적이 없는 고혈압 환자들의 30 - 40%만이 임상적으로 과감한 혈압 강하를 가지면서 치료에 반응한다. 이것은 의사들을 실망시키고, 복수의 치료법 변화들을 요구하고 환자들의 순응을 감소시킨다. 결과적으로, 대부분의 환자들이 적당하게 치료되지 못하고 이것은 높은 혈압과 연관된 기관 합병증들의 예방을 제한한다. 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들은 85%의 환자들을 로스타퓨록신 치료법에 대한 반응자들로서 정확하게 분류하는 것을 허용하고, 따라서 활성을 가진 치료를 찾아야 하는 부담을 덜어준다. 여러 가지 구현예들의 첫 번째 개선은 안전성에 관한 것이고: 선택된 환자들에서 로스타퓨록신의 유효량은 매우 낮고 50으로부터 500 μg/일까지의 범위가 될 수 있다. 적절한 동물 모델들에서 유효량은 0.1로부터 100 μg/일까지의 범위인 한편 동물들에서 아무런 효과를 생산하지 않는 최대의 내성 용량 (NOAEL)은 100 mg/kg이다. 이것은 동물들에서 로스타퓨록신의 활성 및 최대의 내성 용량 간의 간격이 본 간격이 20으로부터 50배까지의 범위인 사용가능한 항고혈압 치료법과 비교하여 100,000배 이상인 것을 의미한다. 새로운 항고혈압 치료법들, 상세하게는 통상적인 치료적 접근법들의 효능 및 안정성에 관한 일정 데이터가 약리유전학적 접근법들과 비교하여 도 10에 보고되어 있다.

요약하면, 본 명세서에서 기술된 방법들 및 시스템들 (유전형 분석 + 로스타퓨록신)은 높은 안전성을 항고혈압 활성의 더욱 정확한 예측과 조합하고, 따라서 기작이 로스타퓨록신에 의해 자극되는 심혈관 병폐의 높은 정도의 예방을 기대하게 한다.

적어도 하나의 선택된 코아 SNPs를 보유하는 개인들에서 로스타퓨록신 투여 이후에 증가된 혈압 강하의 정확한 기작들은 알려져 있지 않더라도, 그들은 로스타퓨록신에 의해 자극되는 분자적 표적에 의해 촉발되는 기작들과 관련되는 것으로 기대된다. 결론적으로, 로스타퓨록신에 의해 유도된 혈압 강하가 관련된 것들의 유익들은 프로파일들 내에 포함된 적어도 하나의 코아 SNPs 유전형들을 보유하는 개인들에서 기대된다.

상기에서 설명된 실시예들은 본 발명의 방법들 및 시스템들의 구현예들을 작성하고 사용하는 방법의 완벽한 기재내용 및 기술내용을 당업자에게 주도록 제공되고 본 발명자들이 그들의 기재내용으로서 고려하는 범위를 제한하려고 의도되지 않는다. 당업자라면 자명하게 여기는 본 기재내용을 수행하는 상기-기술된 방식들의 변형들은 다음의 청구항들의 범위 내에 속하는 것으로 의도된다. 본 명세서에서 언급되는 특허들 및 출판물들은 본 발명이 속하는 기술분야에서 당업자의 기술 수준을 의미하고 있다. 본 기재내용에 인용된 모든 참고문헌들은 각 참고문헌이 전부 참고문헌으로 통합되어 있는 것과 동일한 정도로 개별적으로 참고문헌으로 통합되어 있다.

본 배경기술, 요약, 상세한 설명 및 실시예들에서 인용된 각 문헌 (특허들, 특허출원들, 저널 기사들, 초록들, 실험실 매뉴얼들, 책들, 또는 기타 다른 기재내용들)의 기재내용 전부는 본 명세서에서 참고문헌으로 통합되어 있다.

본 기재내용들은 특정한 조성물 또는 생물학적 시스템들에 제한되지 않고, 당연히 변형될 수 있는 것으로 이해되어야 한다. 또한 본 명세서에서 사용되는 용어들은 특정한 구현예들만 기술할 목적이고 이를 제한하려고 의도되지 않는 것으로 이해되어야 한다. 본 명세서 및 첨부된 청구항들에서 사용되는 바, 단수 형태 "하나 (a)", "하나 (an)", 및 "그 (the)"는 달리 내용상 명확하게 기술되지 않은 경우라면 복수의 형태를 포함한다. 용어 "다수 (plurality)"는 달리 내용상 명확하게 기술되지 않은 경우라면 둘 이상의 형태를 포함한다. 달리 정의되지 않은 경우라면, 본 명세서에서 사용되는 기술적 및 과학적 용어들 모두는 본 발명이 속하는 기술분야의 당업자라면 보편적으로 이해하는 것과 동일한 의미를 가진다.

본 명세서에서 기술된 것들과 유사하거나 동등한 다양한 방법들 및 재료들은 본 명세서에서 기술된 적절한 재료들 및 방법들의 특정한 예들을 테스트하기 위해 실제로 사용될 수 있고 당업자라면 확인 가능하다.

본 발명의 많은 구현예들이 기술되어 왔다. 그럼에도 불구하고, 다양한 변형들이 본 발명의 정신 및 범위를 벗어나지 않고도 만들어질 수 있다. 따라서 다른 구현예들도 다음의 청구항들의 범위 내에 속한다.

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SEQUENCE LISTING <110> SIGMA-TAU BIANCHI, Giuseppe FERRARI, Patrizia MACCIARDI, Fabio <120> METHODS AND SYSTEMS FOR PHARMACOGENOMIC TREATMENT OF CARDIOVASCULAR CONDITIONS <130> P310-USP <140> 61/253,020 <141> 2009-10-19 <160> 92 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= A, C, G or T <400> 1 tttgagaata ccaaaataca gaaaaattca atcaaatttt aaagttggta ntaattatac 60 ttgttattgg aatgtaattt agttttctta atttagtttc t 101 <210> 2 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= C or T <400> 2 tttgagaata ccaaaataca gaaaaattca atcaaatttt aaagttggta ntaattatac 60 ttgttattgg aatgtaattt agttttctta atttagtttc t 101 <210> 3 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= A, C, G or T <400> 3 ggaaaaaccc agtgccctcc cctcctctca agcctggcca gctctgacag ngggaggact 60 ccccaaagag aggctctggc cctggctcca tgtccttcca g 101 <210> 4 <211> 101 <212> DNA <213> 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<210> 29 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= A, C, G or T <400> 29 ctacaagtct tttatgctct gaagcttttt gtcttggcaa ttgctttaca ncattcacaa 60 aggacagcat ttacctggag acctcaccag tgggtccctg c 101 <210> 30 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= A or T <400> 30 ctacaagtct tttatgctct gaagcttttt gtcttggcaa ttgctttaca ncattcacaa 60 aggacagcat ttacctggag acctcaccag tgggtccctg c 101 <210> 31 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= A, C, G or T <400> 31 tctgaacaat ttgggatctc ttttaacttg agggtctctt tcgactacta nagctccatt 60 tcccctctta aatgagaagg gatttctttt cttttaaatc t 101 <210> 32 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= C or T <400> 32 tctgaacaat ttgggatctc ttttaacttg agggtctctt tcgactacta nagctccatt 60 tcccctctta aatgagaagg gatttctttt cttttaaatc t 101 <210> 33 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens 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A, C, G or T <400> 37 acagtaatag tctatttagc ctctttctct cctgctctcc tttccatatt nttatgtggc 60 atattaactt aacactaatg tatgcagggt tttgttggtt t 101 <210> 38 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= C or T <400> 38 acagtaatag tctatttagc ctctttctct cctgctctcc tttccatatt nttatgtggc 60 atattaactt aacactaatg tatgcagggt tttgttggtt t 101 <210> 39 <211> 100 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= A, C, G or T <400> 39 aatgtgattt ttgatataat tctcatgttt tagcttttct agtttaaaaa nctgcatact 60 ggaaaataag gaaaaaattc tagaggttgt atgagaagga 100 <210> 40 <211> 100 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= C or T <400> 40 aatgtgattt ttgatataat tctcatgttt tagcttttct agtttaaaaa nctgcatact 60 ggaaaataag gaaaaaattc tagaggttgt atgagaagga 100 <210> 41 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= A, C, G or T <400> 41 aaccaacttt agcataccaa gtttagcatt taggcatacc aactttagca ntgttataca 60 gaataatgtt agcattggaa ggatctatta acaaaagaaa g 101 <210> 42 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= C or T <400> 42 aaccaacttt agcataccaa gtttagcatt taggcatacc aactttagca ntgttataca 60 gaataatgtt agcattggaa ggatctatta acaaaagaaa g 101 <210> 43 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= A, C, G or T <400> 43 cctcatgcaa agcacttgct cacacactgt ctcatttcaa catcaccgcc ncttaaggag 60 atgctatgat caaccccact ttgcagatga ggaaacttca g 101 <210> 44 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= C or A <400> 44 cctcatgcaa agcacttgct cacacactgt ctcatttcaa catcaccgcc ncttaaggag 60 atgctatgat caaccccact ttgcagatga ggaaacttca g 101 <210> 45 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= A, C, G or T <400> 45 ctggagctcg ccttacacca aacagacaca atcgatccat tcgaagtgtc ntaattacac 60 attgagggac caactagacc ttttctcatt gtaaacttgg a 101 <210> 46 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= G or A <400> 46 ctggagctcg ccttacacca aacagacaca atcgatccat tcgaagtgtc ntaattacac 60 attgagggac caactagacc ttttctcatt gtaaacttgg a 101 <210> 47 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= G or T <400> 47 agaagacaag atggctgaac tctggccggg gcgacgaagc ttccgaggaa nggcagaatg 60 gaagcagtcc caagtcgaag actaaggtgt ggacgaacat t 101 <210> 48 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=T <400> 48 agaagacaag atggctgaac tctggccggg gcgacgaagc ttccgaggaa nggcagaatg 60 gaagcagtcc caagtcgaag actaaggtgt ggacgaacat t 101 <210> 49 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=C <400> 49 cttcatcaaa acacacctac caatatgtta ctccagatgt ggagggcaac nctgaagaac 60 tcgcacacgg ccggaccaga gcctggctct cgttcctgtc c 101 <210> 50 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=C <400> 50 cttcatcaaa acacacctac caatatgtta ctccagatgt ggagggcaac nctgaagaac 60 tcgcacacgg ccggaccaga gcctggctct cgttcctgtc c 101 <210> 51 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=A or T <400> 51 ctacaagtct tttatgctct gaagcttttt gtcttggcaa ttgctttaca ncattcacaa 60 aggacagcat ttacctggag acctcaccag tgggtccctg c 101 <210> 52 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=T <400> 52 ctacaagtct tttatgctct gaagcttttt gtcttggcaa ttgctttaca ncattcacaa 60 aggacagcat ttacctggag acctcaccag tgggtccctg c 101 <210> 53 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=G <400> 53 tctgaacaat ttgggatctc ttttaacttg agggtctctt tcgactacta nagctccatt 60 tcccctctta aatgagaagg gatttctttt cttttaaatc t 101 <210> 54 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=G <400> 54 tctgaacaat ttgggatctc ttttaacttg agggtctctt tcgactacta nagctccatt 60 tcccctctta aatgagaagg gatttctttt cttttaaatc t 101 <210> 55 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=A <400> 55 gccagggact gctacctgcc cagaaggcgg cagggagggg aagagcagat naggaggtat 60 agggtgtgcc ctgggcaagg cagcaggggt aacgaagctc t 101 <210> 56 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=A <400> 56 gccagggact gctacctgcc cagaaggcgg cagggagggg aagagcagat naggaggtat 60 agggtgtgcc ctgggcaagg cagcaggggt aacgaagctc t 101 <210> 57 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=T <400> 57 gagaacattg cctatggaga caacagccgg gtggtgtcac aggaagagat ngtgagggca 60 gcaaaggagg ccaacataca tgccttcatc gagtcactgc c 101 <210> 58 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=T <400> 58 gagaacattg cctatggaga caacagccgg gtggtgtcac aggaagagat ngtgagggca 60 gcaaaggagg ccaacataca tgccttcatc gagtcactgc c 101 <210> 59 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N= A or G <400> 59 acagtaatag tctatttagc ctctttctct cctgctctcc tttccatatt nttatgtggc 60 atattaactt aacactaatg tatgcagggt tttgttggtt t 101 <210> 60 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=G <400> 60 acagtaatag tctatttagc ctctttctct cctgctctcc tttccatatt nttatgtggc 60 atattaactt aacactaatg tatgcagggt tttgttggtt t 101 <210> 61 <211> 100 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=C <400> 61 aatgtgattt ttgatataat tctcatgttt tagcttttct agtttaaaaa nctgcatact 60 ggaaaataag gaaaaaattc tagaggttgt atgagaagga 100 <210> 62 <211> 100 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=T <400> 62 aatgtgattt ttgatataat tctcatgttt tagcttttct agtttaaaaa nctgcatact 60 ggaaaataag gaaaaaattc tagaggttgt atgagaagga 100 <210> 63 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=C <400> 63 aaccaacttt agcataccaa gtttagcatt taggcatacc aactttagca ntgttataca 60 gaataatgtt agcattggaa ggatctatta acaaaagaaa g 101 <210> 64 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=C <400> 64 aaccaacttt agcataccaa gtttagcatt taggcatacc aactttagca ntgttataca 60 gaataatgtt agcattggaa ggatctatta acaaaagaaa g 101 <210> 65 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=A <400> 65 cctcatgcaa agcacttgct cacacactgt ctcatttcaa catcaccgcc ncttaaggag 60 atgctatgat caaccccact ttgcagatga ggaaacttca g 101 <210> 66 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=A <400> 66 cctcatgcaa agcacttgct cacacactgt ctcatttcaa catcaccgcc ncttaaggag 60 atgctatgat caaccccact ttgcagatga ggaaacttca g 101 <210> 67 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=G <400> 67 ctggagctcg ccttacacca aacagacaca atcgatccat tcgaagtgtc ntaattacac 60 attgagggac caactagacc ttttctcatt gtaaacttgg a 101 <210> 68 <211> 101 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <222> (51)..(51) <223> N=A <400> 68 ctggagctcg ccttacacca aacagacaca atcgatccat tcgaagtgtc ntaattacac 60 attgagggac caactagacc ttttctcatt gtaaacttgg a 101 <210> 69 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 69 tttgagaata ccaaaataca gaaaaattca atcaaatttt aaagttggta 50 <210> 70 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 70 attaatatga acaataacct tatcattaaa tcaaaagaat taaatcaaag a 51 <210> 71 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 71 taattatact tgttattgga atgtaattta gttttcttaa tttagtttct 50 <210> 72 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 72 aaactcttat ggttttatga ctcttttatt gttagtttaa aatttcaacc at 52 <210> 73 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 73 ggaaaaaccc agtgccctcc cctcctctca agcctggcca gctctgacag 50 <210> 74 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 74 ccctcctgag gggttttctc tccgagaccg ggaccgaggt acaggaaggt c 51 <210> 75 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 75 gggaggactc cccaaagaga ggctctggcc ctggctccat gtccttccag 50 <210> 76 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 76 cctttttggg tcacgggagg ggaggagagt tcggaccggt cgagactgtc 50 <210> 77 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 77 gtccaaatgt aatgttctaa cttagtacat ttggaaaatt ctttcctaac 50 <210> 78 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 78 ggagaccctt ttgtgtttta taatgaatgt ttttatttac gtatttttac 50 <210> 79 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 79 cctctgggaa aacacaaaat attacttaca aaaataaatg cataaaaatg 50 <210> 80 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 80 caggtttaca ttacaagatt gaatcatgta aaccttttaa gaaaggattg 50 <210> 81 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 81 gctcgccttg gtccactgtg acacacaggc tgctttgctg ggaaagttct 50 <210> 82 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 82 ggactgagtg accccgacgt acttcggacc cctccgttcg aagaccgcac 50 <210> 83 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 83 cctgactcac tggggctgca tgaagcctgg ggaggcaagc ttctggcgtg 50 <210> 84 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 84 cgagcggaac caggtgacac tgtgtgtccg acgaaacgac cctttcaaga 50 <210> 85 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 85 tgacacatgt ggcagtctga aaagttctta ttgagccaga ctgtagagtt cttggaaatc 60 <210> 86 <211> 59 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 86 gtatggtaaa gtacccttaa tactaagatg agtccgaccc tcctcatgta attgtcttc 59 <210> 87 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 87 cataccatct tcatgggaat tatgattcta ctcaggctgg gaggagtaca ttaactgaag 60 <210> 88 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 88 actgtgtaca ccgtcagact tttcaagaat aactcggtct gacatctcaa gaacctttag 60 <210> 89 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 89 caacatttgg attatggcat ttgggattct gattttcaga attatgattg gcaattttaa 60 <210> 90 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 90 attaagaccg agccatataa ttattacgtt acgaaaaaag ttcgataaac attcactaag 60 <210> 91 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 91 taattctggc tcggtatatt aataatgcaa tgcttttttc aagctatttg taagtgattc 60 <210> 92 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Polynucleotide <400> 92 gttgtaaacc taataccgta aaccctaaga ctaaaagtct taatactaac cgttaaaatt 60

Claims (42)

1. 개인이 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이의 보균자인 것으로 선택되었던, 상기 개인에서 심혈관 병폐의 치료 또는 예방에 사용되는 로스타퓨록신.
2. 제 1항에 있어서,
   상기 적어도 하나의 다형성증은 rs2345088의 경우 뉴클레오타이드 C 또는 T, rs16877182의 경우 뉴클레오타이드 C 또는 T, rs16893522의 경우 뉴클레오타이드 G 또는 A, rs2461911의 경우 뉴클레오타이드 G 또는 A, rs5013093의 경우 뉴클레오타이드 C 또는 T, 또한 rs12513375의 경우 뉴클레오타이드 T 또는 G로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 로스타퓨록신.
3. 제 1항 또는 제 2항에 있어서,
   상기 개인은 rs2345088의 경우 유전형 TT 또는 유전형 1, rs16877182의 경우 유전형 C/T 또는 유전형 2, rs16893522의 경우 유전형 AA 또는 유전형 1, rs2461911의 경우 유전형 AA 또는 유전형 1, rs5013093의 경우 유전형 TT 또는 유전형 1, 또한 rs12513375의 경우 유전형 TT 또는 유전형 1로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 유전형의 보균자인 것으로 선택되었던, 로스타퓨록신.
4. 제 1항 내지 제 3항의 어느 한 항에 있어서,
   상기 개인은 CAND 1 유전자, CAND 2 유전자 및/또는 GWS 유전자의 적어도 하나에서 다형성증의 보균자인 것으로 선택되었던, 로스타퓨록신.
5. 제 4항에 있어서,
   상기 개인은 ADD1, ADD2, ADD3, CYP11A1, HSD3B1, LSS, ABCB/MDR1, 및 SLCO4C1으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 유전자에서 적어도 하나의 다형성증의 보균자인 것으로도 역시 선택되었던, 로스타퓨록신.
6. 제 1항 내지 제 5항의 어느 한 항에 있어서,
   상기 개인은 rs4961, rs4984, rs3731566, rs914247, 및 rs1045642로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 단일 뉴클레오타이드 다형성증 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이의 보균자인 것으로 선택되었던, 로스타퓨록신.
7. 제 1항 내지 제 6항의 어느 한 항에 있어서,
   상기 개인은 rs4961의 경우 GT, rs4984의 경우 CT, rs3731566의 경우 AG, rs914247의 경우 GA, 및 rs1045642의 경우 TC로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 유전형의 보균자인 것으로 선택되었던, 로스타퓨록신.
8. 제 1항 내지 제 7항의 어느 한 항에 있어서,
   상기 개인은 rs914247의 경우 유전형 AA의 보균자인 것으로 선택되었던, 로스타퓨록신.
9. 제 1항 내지 제 8항의 어느 한 항에 있어서,
   상기 개인은 rs242093, rs1996396, rs10503806, rs13251780, rs17430706, rs10102024, rs526302, rs544104, rs3102087, rs5183, rs3772627, rs2276736, rs2131127, rs3741559, rs2217342, rs10927888, rs6604909, rs945403, rs7117314, rs10790212, rs11216598, rs910682, rs13218316, rs4309483, rs13280307, rs4739037, rs17596774, rs2728108, rs17786456, rs7696304, rs2725222, rs17199565, rs2758152, rs1057293, rs16960712, rs759359, rs404214, rs1005213, rs17025453, rs2110923, rs1428571, rs435404, rs12908787, rs11647727, rs880054, 및 rs11064584로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 단일 뉴클레오타이드 다형성증 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이의 보균자인 것으로 선택되었던, 로스타퓨록신.
10. 제 1항 내지 제 9항의 어느 한 항에 있어서,
    상기 개인은 rs12996186, rs9893372, rs7216331, rs7521668, rs188334, rs4998662, rs16893522, rs6457110, rs3893464, rs2517718, rs1362126, rs5013093, rs2345088, rs6718282, rs721207, rs2555500, rs2461911, rs8179654, rs1901139, rs2427832, rs9361863, rs1998394, ga001619, rs2275531, rs748140, rs4710592, rs2743951, rs10159569, rs3087816, rs10493940, rs16877182, rs2326912, rs11 10446, rs12513375, 및 rs17414954로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 단일 뉴클레오타이드 다형성증 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이의 보균자인 것으로 선택되었던, 로스타퓨록신.
11. 제 1항 내지 제 10항의 어느 한 항에 있어서,
    상기 개인은 rs4961, rs4984, rs10923835, rs947130, rs914247, rs1045642, rs880054, rs10502933, rs2131127, rs4309483, 및 rs4739037로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 단일 뉴클레오타이드 다형성증의 보균자인 것으로 선택되었던, 로스타퓨록신.
12. 제 1항 내지 제 10항의 어느 한 항에 있어서,
    상기 개인은 rs1045642, rs10923835, rs914247, rs4961, rs947130, rs4309483, rs2131127, rs10502933, 및 rs880054 (프로파일 8)로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 단일 뉴클레오타이드 다형성증의 보균자인 것으로 선택되었던, 로스타퓨록신.
13. 제 1항 내지 제 10항의 어느 한 항에 있어서,
    상기 개인은 rs1045642, rs10923835, rs914247, rs947130, rs4739037, rs43909483, rs4984, rs10502933, 및 rs880054 (프로파일 9)로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 단일 뉴클레오타이드 다형성증의 보균자인 것으로 선택되었던, 로스타퓨록신.
14. 제 1항 내지 제 13항의 어느 한 항에 있어서,상기 심혈관 병폐는 고혈압 및/또는 이와 연관된 병폐인, 로스타퓨록신.
15. 제 14항에 있어서,
    상기 심혈관 병폐는 심장 비대 (cardiac hypertrophy), 심장 기능부전 (cardiac insufficiency), 심부전 (cardiac failure), 심장성 허혈 (cardiac ischemia), 증가된 혈관 저항 (increased vascular resistances), 증가된 혈관 반응성 (increased vascular reactivity), 혈관 경직 (vascular stiffness), 증가된 혈관 비후 (increased vascular thickness), 신장 비대 (renal hypertrophy), 신부전 (renal failure), 사구체 경화증 (glomerulosclerosis), 단백뇨 (proteinuria), 다낭성 신장 질환 (polycistic renal disease), 망막 손상 (retinal damage), 뇌혈관 장애 (cerebrovascular damage), 뇌졸중 (stroke), 인식 장애 (cognitive disorders), 및 양극성 장애 (bipolar disorders)의 적어도 하나인, 로스타퓨록신.
16. 개인이 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375의 적어도 하나를 포함하는 유전형 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이를 가지는 것으로 선택되었고, 상기 개인을 치료하기 위하여 0.005 mg/일로부터 5 mg/일까지 범위의 용량으로 투여되는, 약제로서 사용되는 로스타퓨록신.
17. 제 16항에 있어서,
    로스타퓨록신을 사용한 치료는 우아바인 고혈압 효과의 선택적인 저해, 우아바인에 의해 유발된 Na-K 펌프와 Src에서 변경들의 정상화, 내인성 우아바인 수준들 및 Na-K 펌프와 Src에서 변경들의 동시적인 증가에 의해 지속되는 고혈압 형태들의 정상화로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 생물학적 활성을 나타내도록 유도하는, 로스타퓨록신.
18. 제 16항 또는 제 17항에 있어서,
    로스타퓨록신을 사용한 치료는 내인성 우아바인의 합성 및 운반에 관여하는 애덕신 또는 다른 효소들을 코딩하는 유전자들의 유전적 변이들과 연관된 고혈압 효과의 선택적인 길항작용 (antagonism), 애덕신 유전적 변이들에 의해 유발된 Na-K 펌프와 Src에서 변경들의 정상화, 애덕신 유전적 변이들 및 Na-K 펌프와 Src에서 변경들의 동시적인 효과에 의해 지속되는 고혈압 형태들의 정상화로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 생물학적 활성을 나타내도록 유도하는, 로스타퓨록신.
19. 제 16항 내지 제 18항의 어느 한 항에 있어서,
    상기 용량은 0.05 mg/일로부터 0.15 mg/일까지의 범위이고, 상기 개인에게 로스타퓨록신을 투여하거나 처방하는 것은 약 23 mm Hg의 평균 혈압 감소를 유도하는, 로스타퓨록신.
20. 제 16항 내지 제 18항의 어느 한 항에 있어서,
    상기 용량은 1.5 mg/일로부터 5.0 mg/일까지의 범위이고, 상기 개인에게 로스타퓨록신을 투여하거나 처방하는 것은 약 15 mm Hg의 평균 혈압 감소를 유도하는, 로스타퓨록신.
21. 제 16항 내지 제 18항의 어느 한 항에 있어서,
    상기 용량은 0.05 mg/일로부터 1.5 mg/일까지의 범위이고, 상기 개인에게 로스타퓨록신을 투여하는 것은 야간 혈압의 평균 감소를 유도하는, 로스타퓨록신.
22. 제 16항 내지 제 18항의 어느 한 항에 있어서,
    상기 개인은 CAND 1 유전자, CAND 2 유전자 및/또는 GWS 유전자의 적어도 하나에서 다형성증의 보균자인 것으로도 역시 선택되었고, 상기 개인에게 로스타퓨록신을 투여하거나 처방하는 것은 약 8로부터 약 22.5 mm Hg까지 범위의 평균 감소를 유도하는, 로스타퓨록신.
23. 제 22항에 있어서,
    상기 CAND 1 유전자의 적어도 하나는 ADD1, ADD2, ADD3, LSS, MDR1, HSD3B1, CYP11A1, 및 SLCO4C1으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 로스타퓨록신.
24. 제 22항 또는 제 23항에 있어서,
    상기 CAND 2 유전자의 적어도 하나는 ACTN1, ADRA1A, AGTR1, AQP2, ATP1A3, CLCNKA, CLCNKB, FXYD2, FXYD6, FYN, NEDD4L, NKAIN3, PKD1, PKD2, SCNN1B, SGK1, SLC12A1, SLC8A1, TJP1, UMOD, 및 WNK1으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 로스타퓨록신.
25. 제 22항 내지 제 24항의 어느 한 항에 있어서,
    상기 GWS 유전자의 적어도 하나는 ARL5A, ATP2A3, COX10, DPH5, FAIM3, FAM46A, HCG9, HLA-A, HLA-F, HLA-G, KCNS3, LOC131691, LOC389174, LOC389970, LOC642727, LOC644192, LOC649458, LOC728360, LOC728316, PIGR, RCADH5, RP3-377H14.5, SH3PXD2A, SLC30A7, THSD7A, TMEM200A, TRIM31, TTC29, 및 VCAM1으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 로스타퓨록신.
26. 제 23항에 있어서,
    상기 CAND 1 유전자, CAND 2 유전자 및 GWS 유전자의 적어도 하나는 MDSR 2, HSD18, LSS2, HSD19, ADD2, 및 WNK로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 로스타퓨록신.
27. 제 22항 내지 제 26항의 어느 한 항에 있어서,
    상기 CAND 1 유전자, CAND 2 유전자 및/또는 GWS 유전자의 적어도 하나에서의 다형성증은 단일 뉴클레오타이드 다형성증인, 로스타퓨록신.
28. 제 16항 내지 제 27항의 어느 한 항에 있어서,
    상기 용량은 경구적, 정맥내, 근육내, 동맥내, 골수내, 경막내, 심실내, 경피부 (transdermal), 또는 경피 (transcutaneous) 적용, 피하, 복강내, 비강내, 장내, 국소적, 설하, 직장 수단에 의하여 또는 외과적 수술 이후에 질환을 가진 조직에 국부적으로 투여되는, 로스타퓨록신.
29. 개인의 분리된 DNA 시료에서 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9 및 서열번호 11의 뉴클레오타이드 서열들의 어느 하나에서 단일 뉴클레오타이드 다형성증을 검출하는 것을 포함하고, 상기 SNP의 존재는 상기 개인에서 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응과 상호 관련되는, 로스타퓨록신에 대한 개선된 반응으로 개인을 확인하는 방법.
30. 제 29항에 있어서,
    상기 검출된 단일 뉴클레오타이드 다형성증은 rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 방법.
31. 서열번호 2, 서열번호 4, 서열번호 6, 서열번호 8, 서열번호 10, 및 서열번호 12, 또는 그들의 상보체로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 서열을 포함하는, 분리된 핵산 분자.
32. 서열번호 26, 서열번호 28, 서열번호 30, 서열번호 32, 서열번호 34, 서열번호 36, 서열번호 38, 서열번호 40, 서열번호 42, 서열번호 44 및 서열번호 46, 또는 그들의 상보체로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 서열을 포함하는, 분리된 핵산 분자.
33. 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9 및 서열번호 11의 뉴클레오타이드 서열들의 어느 하나에서 단일 뉴클레오타이드 다형성증을 포함하는 핵산 분자에 특이적으로 혼성화하는 분리된 폴리뉴클레오타이드;
    완충용액; 또한
    상기 핵산에서 단일 뉴클레오타이드 다형성증을 검출하도록 상기 분리된 폴리뉴클레오타이드와 조합으로 사용되는 데 적합한 효소:
    를 포함하는, 핵산에서 단일 뉴클레오타이드 다형성증을 검출하는 시스템.
34. 제 33항에 있어서,
    상기 분리된 폴리뉴클레오타이드는 서열번호 2, 서열번호 4, 서열번호 6, 서열번호 8, 서열번호 10 및 서열번호 12 또는 그들의 단편으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 서열을 포함하는, 시스템.
35. 제 33항 또는 제 34항에 있어서,
    상기에 더하여 서열번호 25, 서열번호 27, 서열번호 29, 서열번호 31, 서열번호 33, 서열번호 35, 서열번호 37, 서열번호 39, 서열번호 41, 서열번호 43 및 서열번호 45의 뉴클레오타이드 서열들의 어느 하나에서 단일 뉴클레오타이드 다형성증을 포함하는 핵산 분자에 특이적으로 혼성화하는 분리된 폴리뉴클레오타이드를 포함하는, 시스템.
36. 제 35항에 있어서,
    상기 분리된 폴리뉴클레오타이드는 서열번호 26, 서열번호 28, 서열번호 30, 서열번호 32, 서열번호 34, 서열번호 36, 서열번호 38, 서열번호 40, 서열번호 42, 서열번호 44 및 서열번호 46 또는 그들의 단편으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 서열을 포함하는, 시스템.
37. rs2345088, rs16877182, rs16893522, rs2461911, rs5013093, 및 rs12513375로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증 및/또는 이들의 연관 불균형에서 유전적 변이에 대한 프로브; 또한
    0.005 mg으로부터 5 mg/일까지, 상세하게는 0.05 mg으로부터 0.5 mg/일까지 범위의 용량으로 로스타퓨록신 및 약제학적으로 허용 가능한 담체:
    를 포함하는 약제학적 조성물을 포함하는, 개인을 위한 로스타퓨록신 치료를 평가하는 시스템.
38. 제 37항에 있어서,
    상기 프로브는 서열번호 2, 서열번호 4, 서열번호 6, 서열번호 8, 서열번호 10 및 서열번호 12로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 분리된 폴리뉴클레오타이드, 또는 서열번호 2, 서열번호 4, 서열번호 6, 서열번호 8, 서열번호 10 또는 서열번호 12에 상보적인 서열을 특이적으로 혼성화할 수 있는 그들의 단편을 포함하는, 시스템.
39. 제 37항 또는 제 38항에 있어서,
    상기에 더하여 rs4961, rs4984, rs10923835, rs947130, rs914247, rs1045642, rs880054, rs10502933, rs2131127, rs4309483, 및 rs4739037으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 다형성증에 대한 프로브를 포함하는, 시스템.
40. 제 39항에 있어서,
    상기 프로브는 서열번호 26, 서열번호 28, 서열번호 30, 서열번호 32, 서열번호 34, 서열번호 36, 서열번호 38, 서열번호 40, 서열번호 42, 서열번호 44 및 서열번호 46으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 하나의 분리된 폴리뉴클레오타이드, 또는 서열번호 26, 서열번호 28, 서열번호 30, 서열번호 32, 서열번호 34, 서열번호 36, 서열번호 38, 서열번호 40, 서열번호 42, 서열번호 44 또는 서열번호 46에 상보적인 서열을 특이적으로 혼성화할 수 있는 그들의 단편을 포함하는, 시스템.
41. 제 37항 내지 제 40항의 어느 한 항에 있어서,
    상기 프로브는 서열번호 35 내지 서열번호 58로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 서열을 가지는, 시스템.
42. 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9 및 서열번호 11의 뉴클레오타이드 서열들의 어느 하나에서 단일 뉴클레오타이드 다형성증을 포함하는 핵산 분자에 특이적으로 혼성화하는 분리된 폴리뉴클레오타이드;
    완충용액; 또한
    상기 핵산에서 단일 뉴클레오타이드 다형성증을 검출하도록 상기 분리된 폴리뉴클레오타이드와 조합으로 사용되는 데 적합한 효소:
    를 포함하는, KCNS3, THSD7A, FAM46A, LOC389970, HLA-G, 및 TTC29로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 유전자의 유전자간 또는 유전자내 부위에서 단일 뉴클레오타이드 다형성증을 검출하는 시스템.

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