KR20110038490A - 한우 육량 증대 연관 분자표지 개발 및 이를 이용한 고능력 한우 조기진단 방법 - Google Patents

한우 육량 증대 연관 분자표지 개발 및 이를 이용한 고능력 한우 조기진단 방법 Download PDF

Info

Publication number
KR20110038490A
KR20110038490A KR1020090095803A KR20090095803A KR20110038490A KR 20110038490 A KR20110038490 A KR 20110038490A KR 1020090095803 A KR1020090095803 A KR 1020090095803A KR 20090095803 A KR20090095803 A KR 20090095803A KR 20110038490 A KR20110038490 A KR 20110038490A
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
hanwoo
pcr
gene
npy
dna
Prior art date
Application number
KR1020090095803A
Other languages
English (en)
Inventor
정의룡
신성철
허재필
Original Assignee
상지대학교산학협력단
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 상지대학교산학협력단 filed Critical 상지대학교산학협력단
Priority to KR1020090095803A priority Critical patent/KR20110038490A/ko
Publication of KR20110038490A publication Critical patent/KR20110038490A/ko

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6827Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6827Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
    • C12Q1/683Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism involving restriction enzymes, e.g. restriction fragment length polymorphism [RFLP]

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

본 발명은 한우의 배최장근단면적(M. longissimus dorsi area)과 밀접하게 연관되어 있는 유전자 분자표지(DNA marker) 개발 및 이를 이용한 우량 한우 조기 진단 방법에 관한 것으로서, 육량 형질이 우수한 한우의 유전적 자질을 예측하고 판정하는 유전적 분자표지를 개발하여 조기선발 및 개체 평가의 정확성을 제고하는 데 활용 가능한 유전자 진단방법을 제공하기 위한 것이다.
더욱 상세하게는, 본 발명은 한우 NPY (neuropeptide Y) 유전자의 인트론(intron) 2번 영역 내에 존재하는 특정 SNP를 이용하여 PCR-RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism; 제한효소절편다형성) 기법으로 한우 개체별 SNP 유전자형에 따른 DNA marker를 검출함으로써 이들 가운데 가장 바람직한 유전자형(TT형)을 가진 개체를 유전적으로 배최장근단면적이 우수한 한우 개체로 진단하여 선발하는 방법을 제공한다.
Hanwoo, NPY(neuropeptide Y), SNP, DNA marker, M. longissimus dorsi area, meat quantity

Description

한우 육량 증대 연관 분자표지 개발 및 이를 이용한 고능력 한우 조기진단 방법{Development of DNA marker associated with higher meat quantity and diagnosis method of high meat quantity producing Hanwoo using the DNA marker}
본 발명은 분자유전학적 분석기법인 PCR-RFLP (polymerase chain reaction - restriction fragment length polymorphism)분석을 통하여 한우 육량형질과 밀접하게 연관되어 있는 NPY (neuropeptide Y) 유전자의 특정 SNP(단일염기다형)를 이용한 한우 육량 증대 연관 분자표지를 개발함으로써, 이를 이용하여 유전적으로 육량이 우수한 한우를 조기에 진단할 수 있는 기술을 제공한다.
현대에는 분자유전학 및 유전자 분석기술의 발달로 인해 DNA 분자수준에서 가축의 특정 형질과 밀접하게 연관되어 있는 후보유전자들의 특이적인 DNA 염기서열 변이에 따른 유전적 형질 진단용 분자표지 기술개발이 활발히 이루어지고 있다. 최근에는 PCR 기술을 이용하는 RAPD (random amplified polymorphic DNA), SSCP (single strand conformation polymorphisms) 기법 및 microsatellite 등 다양한 DNA 분석기법을 이용하여 가축의 주요 경제형질과 관련된 분자표지를 이용한 조기 진단 및 선발 기술은 물론 다양한 산업 전반에 걸쳐 본 기술이 활용되고 있는 실정 이다. 특히, 특정 유전자의 PCR product에 제한효소를 처리하여 해당 염기변이 부위의 차이에 따라 DNA 절편이 각각 다르게 나타나는 것을 이용한 PCR-RFLP (restriction fragment length polymorphism) 분석기법은 타 분석기법들에 비해 재현성과 정확성이 뛰어나 유전자 분석 품종판별 검사에 매우 유용한 기술로 평가되고 있다.
이와 같은 시대적 흐름에 발맞추어 최근에는 분자유전학적 기술을 이용한 한우 경제형질 관련 분자표지를 이용한 고능력 우량 한우 조기진단 기술이 몇몇 개발되어 대한민국 특허청에 특허출원/등록 되어 있다. 그 대표적인 예로, 한우의 근내 지방도 연관 프라이머 및 그를 이용한 한우근내지방도 성적 검사방법(출원번호 : 10-2000-0065925), 한우의 경제형질과 연관성 있는 마이크로새틀라이트 DNA 및 이의 분석용 프라이머 세트(출원번호 : 10-2004-0091892)신규 프라이머 세트 및 이를 이용한 한우 선발방법(출원번호 : 10-2003-0093288) 등 DNA 분자표지를 이용한 한우 경제형질 진단 방법과 관련된 발명기술들이 특허등록되어 있다.
그러나, 상기에 제시한 기존의 발명들은 특정한 형질 발현과 밀접하게 연관되어 있는 유전자를 이용하는 본 발명에서의 분석방법과 달리, 약 2-7 bp 크기의 DNA 염기 반복 수에 따라 개체별 유전적 다형성을 구분하는 마이크로새틀라이트(microsatellite) 분석기술을 이용한 분자표지들로서 본 발명에서 이용한 PCR-RFLP 분석기법에 비해 분자표지의 재현성이 낮아 정확성이 현저하게 떨어지는 단점이 있다. 그에 반해 본 발명에서는 한우 경제형질과 밀접하게 연관되어 있는 NPY 후보유전자의 특정 SNP영역을 이용하여 PCR-RFLP기법으로 분자표지를 개발한 것으 로서 한우 경제형질과 보다 연관성 있는 유전자 분자마커를 제공할 수 있을 뿐만이 아니라, 타 분석기법들에 비해 RFLP 마커의 재현성이 뛰어나 보다 정확성 높은 유전자 분자표지를 제공하는 장점이 있다.
최근 한미 FTA 협상 타결 등 쇠고기 수입개방에 대응한 국내 한우 사육농가의 보호 및 발전을 위해서는 한우육의 육질 고급화를 통한 수입육과의 차별화로 품질경쟁력을 높이고, 또한 고육량화로 한우의 경제성을 높이는 전략이 필요하다. 이를 위해서는 최적의 사육 환경 조성도 중요하겠지만, 근본적으로 유전적 자질이 우수한 한우를 조기에 진단하여 선발하는 최첨단 육종개량 모델을 개발하여 품질 좋고 경제성 높은 고능력 한우를 생산함으로써 소비자들에게 안전하고, 맛 좋은 고급육한우를 보다 저렴한 가격에 제공할 수 있을 것이다. 현재 우리나라 축산물 등급판정은 한우 육량등급 판정의 경우 도체중량(carcass weight), 도체율(dressing percentage), 등지방 두께(backfat thickness) 및 배최장근단면적(M. longissimus dorsi area)등의 도체성적 항목을 이용하여 A, B, C 및 등외등급으로 육량등급을 판정하고 있는데 이들 항목 중에서 특히 배최장근단면적은 육량 등급을 결정하는데 매우 지대한 영향을 미치는 요인 중 하나이다. 따라서, 한우의 경제성을 높이려면 유전적으로 배최장근단면적이 우수한 개체를 조기에 진단하고 선발하여 최적의 환경에서 사육 관리하는 것이 중요하다.
가축의 육종개량에 있어 종래의 양적 유전학적 방법은 가축의 표현형적 기록에 의존해왔다. 즉, 후보종모우는 혈통기록과 체형 발달 등의 당대 기록으로 우선 선발하고 빈우와의 교배에 의해 생산되는 후대 검정우를 사육, 도축하여 도체 및 육질형질들을 기록하고 가축이 사육되어진 환경 요인들을 최대한 배제하면서 가축 의 진정한 육종가를 추정해 내기 위한 가장 적절한 통계 모델식을 고안하여 종축을 선발하게 되는데 이러한 표현형적 관찰치를 측정하는 데는 많은 시간이 소요되므로 종축의 선발을 지연하게 되어 세대 간격이 길어지고 많은 두수의 후보 종축을 사육하게 되므로 사료비, 시설투자비 및 유지비, 인건비 등의 경제적 비용과 과도한 노동력이 소요된다. 이와 같은 매우 비효율적인 방법으로 인해 보다 과학적이고 신속하게 우수한 육량등급의 비육우를 조기에 선발하고 사육하기 위한 한우 육량등급 판정 방법이 절실히 요구되고 있는 실정이다.
따라서, 본 발명은 최첨단 분자육종 기술을 이용한 한우 육량형질 연관 유전자 분자표지를 개발하고 이를 이용하여 유전적으로 육량이 우수한 한우를 조기에 진단하여 선발할 수 있는 기술을 개발하고자 수행하였다.
이에 본 발명자들은 상기와 같은 문제점을 개선시키기 위하여 연구 개발한 결과, 소의 4번 염색체에 존재하는 NPY (neuropeptide Y) 유전자를 한우의 육량형질 관련 후보유전자로 선정하여 한우 배최장근단면적 연관 분자표지를 개발하고 이를 이용한 우량 한우 조기진단 방법을 발명하였다. 본 발명에서 이용한 한우 NPY 유전자는 소의 4번 염색체에 위치하며, 포유동물의 식욕을 자극하여 사료섭취량을 증가시키고, 에너지 밸런스를 조절하여 체내의 균형을 유지시켜주며, 인슐린 저항성과 혈장 내 합성부신당성피질성 스테로이트(glucocorticosteriod) 농도 증가에 관여하여 근육 내 지방침착을 조성하여 주는데 밀접하게 관여하는 유전자로서 leptin 유전자와 더불어 비만에 관련된 대표적인 유전자로 보고되어 있어 새로운 한우 경제형질 관련 후보유전자로 주목받고 있다.
따라서 본 발명에서는 NPY 유전자를 한우 경제형질 관련 후보유전자로 최종 선정하고, NPY 유전자의 특정 SNP를 이용한 PCR-RFLP 분석 및 육량 및 육질관련 형질과의 연관성 통계 분석을 통해 육량형질과 밀접하게 연관되어 있는 분자표지(DNA marker)를 개발하여 유전적으로 배최장근단면적이 넓은 우량 한우 조기 진단 및 선발에 활용할 수 있는 DNA 분자표지 개발하였다. 더욱 상세하게는, 한우의 혈액으로부터 genomic DNA를 분리하고, 이를 NPY 유전자의 인트론 2번 영역을 포함하는 프라이머(primer)를 이용하여 PCR로 증폭한 다음, 증폭된 PCR 산물에 Hinf 제한효소를 첨가하여 절단된 DNA 단편을 아가로즈젤(agarose gel)에 전기영동 하여 각 유전자형별 DNA marker를 결정한 후, 한우의 육량 및 육질형질 관련 도체성적과의 연관성 통계분석을 통해 배최장근단면적과 연관되어 있는 DNA marker를 개발함으로써 이를 이용하여 유전적으로 배최장근단면적이 넓은 육량 우수 한우 진단방법을 제공한다.
한우 NPY 유전자 인트론 2번 영역의 증폭영역 내 419번째 T↔C 염기치환으로 인한 DNA 유전자형 마커(TT, TC 및 CC형)를 이용하여 한우 개체의 배최장근단면적에 대한 도체 특성을 규명할 수 있으며 이를 바탕으로 고능력 한우의 조기 진단 및 선발과 유용 유전자원의 산업적 활용이 가능하다. 즉, NPY 유전자의 TT 유전자형을 보유하고 있는 개체를 조기에 진단하고 선발 육종하여 한우 육종개량사업의 효율성과 개량성과를 극대화하고 동시에 우리나라 고유의 한우 유전자원을 보다 우수하게 개량하고 보존하는 효과를 얻을 수 있다.
또한, 본 발명은 한우의 genomic DNA를 대상으로 PCR-RFLP 분석 방법을 이용하는 최첨단 분자육종 기술로서 본 발명에서 이용한 PCR-RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism; 제한효소절편다형성) 분석 기법은 신속하고 간편하며 정확성이 높아 선발의 효율성과 실용성을 극대화 할 수 있을 뿐만 아니라 다수의 시료를 대상으로 DNA marker 유전자형을 보다 간편하고 신속하며, 정확하게 판정할 수 있는 장점이 있다.
상기에 제시한 목적을 달성하기 위하여 이하 비한정적인 실시 예를 통하여 본 발명을 더욱 상세하게 설명한다.
실시 예 1 : 한우 NPY ( neuropeptide Y)유전자의 SNP 유전자형 검출
1. 공시재료 및 DNA 분리 정제
본 발명에 사용한 한우는 국가 후대검정사업에 등록하고 후대검정을 통하여 혈통기록과 도체성적을 보유하고 있는 후보 종모우 집단 총 150두를 공시축으로 선정하였다. 각 공시축 혈액으로부터의 genomic DNA의 분리 및 정제는 Miller등(1988)의 방법을 일부 변경하여 분리 정제하였으며 스펙트로포토메타(spectrophotometer)를 이용하여 DNA 농도를 측정한 후 TE buffer(10mM Tris-HCl, pH 7.4; 1mM EDTA)에 용해하여 -20℃ 냉동고에 보존하고 공시재료로 사용하였 다.
2. 한우 NPY 유전자의 PCR 증폭 및 단일염기다형(SNP) 검출
한우 NPY 유전자의 intron 2번 영역을 포함하는 서열번호 1에 제시한 713bp 크기의 DNA 단편을 증폭하기 위한 프라이머(primer)는 GenBank 등록번호 AY491054호에 등록된 염기서열 정보를 참고하여 서열번호 2와 서열번호 3에 제시한 바와 같이 각각 설계 및 제작하였으며, 본 발명에 사용한 프라이머 염기서열은 표 1과 같다.
한우 NPY 유전자의 PCR 증폭을 위한 프라이머 염기서열
프라이머 좌위 프라이머 염기서열(5'-3') 서열번호
NPY intron 2 정방향 F-CCCCAGGGTGATTCTAACATCT
역방향 R-GGTGAGTGAGGACATGGTCTGT
2
3
NPY 유전자의 PCR 증폭을 위한 반응 조건은 진엠프 시스템 9700(GenAmp PE Applied Biosystem, USA)을 이용하여 다음과 같은 조건하에 실시하였다. 즉, 반응액 조성은 0.2 ml 튜브에 주형(template) DNA 50 ng, 프라이머 각 0.1 μM, dNTP 각 250 μM, 10X PCR buffer 2㎕, 그리고 Taq DNA 중합효소 1 unit 을 첨가하여 PCR 반응액을 총 20㎕로 조정하였다. PCR 반응조건은 최초 94℃에서 5분간 예비가열 후 94℃에서 40초, 58℃에서 40초 그리고 72℃에서 40초 간의 사이클을 총 35회 반복한 다음 마지막으로 72℃에서 5분간 가열하여 DNA 증폭과정을 종료하였다. PCR 증폭산물은 2% 아가로즈젤(agarose gel)에 전기영동 하여 DNA 증폭 성공여부를 검증하였다. 한우 NPY 유전자의 PCR 증폭산물을 이용하여 direct sequencing 기법으로 염기서열을 분석한 결과 서열번호 1에 제시한 바와 같이 총 713 bp 크기의 염기를 검출하였으며, 검출된 이들 증폭 영역 내 염기에서 총 1개의 단일염기다형(SNP) 부위를 검출하였다. 즉, NCBI GenBank 등록번호 AY491054호의 3032번째(서열번호 1의 419번째) 염기에서 T↔C 염기치환에 따른 SNP를 검출하였다. 검출된 T↔C SNP에 대한 각 검정대상 한우 개체별 SNP 유전자형에 따른 분자표지(DNA marker) 검출을 위해 Hinf 제한효소를 이용하여 RFLP 분석을 실시하였다.
3. PCR-RFLP 기법에 의한 한우 NPY 유전자의 SNP 유전자형 마커 분석
검출된 한우 NPY 유전자의 증폭영역 내 419번째 T↔C SNP 부위에 Hinf 제한효소 인지부위(5'-GANT_C-3')가 존재하여 RFLP 기법으로 한우 NPY 유전자의 세 종류 SNP 유전자형(TT, TC 및 CC)에 상응하는 분자표지(DNA marker)를 검출하였다[도면 1 및 도면 2].
한우 NPY 유전자의 RFLP 분석은 5 ㎕의 PCR 증폭산물에 2 unit의 Hinf 제한효소를 첨가한 다음 37℃에서 약 3시간 이상 반응시켜 절단하였다. PCR 증폭산물을 제한효소로 각각 절단하여 얻어진 DNA 단편은 TBE buffer (90 mM Tris-borate, 2 mM EDTA, pH 8.0)을 이용하여 2% 아가로즈젤에 약 100 volt 전압으로 약 2시간 전기영동하고 EtBr (ethidium bromide)로 염색한 후, DNA 단편 양상을 관찰하여 각 검정 개체별 SNP 유전자형을 판정하였다. 즉, TT 호모 유전자형을 가진 개체들에서는 2개의 제한효소 인지부위가 존재하여 10, 295 및 406 bp 크기를 갖는 총 3개의 DNA band가 검출되었고, CC 호모 유전자형을 가진 개체들에서는 1개의 제한효소 인지부위 존재하여 10 및 701 bp 크기를 갖는 총 2개의 DNA band가 검출되었다. 그리고 TC 헤테로 유전자형을 가진 개체들은 이들 4가지의 DNA 단편이 모두 검출되어 10, 295, 406 및 701 bp 크기를 갖는 DNA band가 검출되었다[도면 1]. 참고적으로 분자량의 크기가 매우 작아 발현량이 미약한 10 bp의 단편은 도면 1의 그림에서 제외하였다.
이상과 같은 방법으로 한우 후대 검정우 집단 총 150두를 대상으로 분석한 NPY 유전자의 증폭영역 내 419번째 SNP 대립유전자 출현빈도와 유전자형 출현율을 분석한 결과 대립유전자 출현빈도는 T 대립유전자가 약 68.0%, C 대립유전자가 약 32.0%로 T 대립유전자 출현빈도가 C 대립유전자에 비해 높게 나타났으며, SNP marker 유전자형 출현빈도는 TT형 46.0%(69두), TC형 44.0%(66두), 그리고 CC형 10.0%로(10두) CC 유전자형이 가장 낮고, TT 유전자형이 가장 높은 것으로 분석되었다.
실시 예 2. 한우 NPY 유전자의 DNA marker 유전자형과 육질 및 육량 형질과의 연관성 통계 분석
본 발명을 통해 검출된 한우 NPY 유전자의 SNP 유전자형이 한우의 육량 및 육질형질 관련 도체성적 및 육종가 추정치에 미치는 효과를 추정하기 위해 SASⓐ8.2 Package/PC 프로그램을 이용하여 PROC GLM 법으로 통계 처리하였으며, 이들 중 유전자형 효과의 유의성이 인정된 형질에 대해 던칸 다중검정(Duncan′s Multiple Range Test; DMRT) 방법으로 각 유전자형의 최소자승평균치간의 차이에 의한 유의성 검정을 실시하였다.
그 결과 한우 NPY 유전자의 인트론 2번 영역 내 T↔C 염기치환에 의한 SNP 부위(서열번호 1의 419번째)의 유전자형은 한우의 배최장근단면적 도체측정치 및 배최장근단면적 육종가 추정치와의 유의적 연관성이 입증되었다(P<.05). 즉, 표 2에서 보는 바와 같이 배최장근단면적 도체측정치에서 TT 유전자형을 가진 개체들이 TC 및 CC 유전자형을 가진 개체들에 비해 각각 2.023 및 5.878 정도 유의적으로 높게 나타났으며(P<.05), 배최장근단면적 육종가 추정치(estimated breeding values)에서도 TT 유전자형을 가진 개체들이 TC 및 CC 유전자형을 가진 개체들에 비해 각각 0.781 및 2.583 정도 유의적으로 높게 나타났다(P<.05).
한우 NPY 유전자의 DNA marker 유전자형과 육량 및 육질형질과의 연관성 통계분석 결과
육량 및 육질형질 DNA marker 유전자형 P-value
TT TC CC
생체중/kg 549.275±5.971 545.757±6.105 528.000±12.807 0.324
도체중/kg 316.188±3.711 313.030±3.794 300.266±7.959 0.196
등지방두께/cm 0.761±0.035 0.721±0.036 0.753±0.075 0.722
배최장근단면적/cm2 78.144±0.950a 76.121±0.972ab 72.266±2.039b 0.027*
마블링스코어/1-7 3.159±0.202 3.121±0.206 2.866±0.433 0.828
도체중 육종가추정치 2.918±1.148 1.740±1.174 -2.214±2.463 0.169
배최장근단면적 육종가추정치 1.430±0.391a 0.649±0.400ab -1.153±0.839b 0.019*
마블링 육종가추정치 0.451±0.103 0.330±0.105 0.215±0.221 0.536
등지방두께 육종가추정치 0.147±0.052a 0.147±0.053 0.168±0.113 0.983
a,b : 서로 다른 부호간에는 유의차가 있음.
이상의 본 발명에 대한 결과를 종합해 볼 때, 본 발명의 한우 NPY 유전자의 증폭영역 내 419번째 T↔C SNP 유전자형은 한우의 육량등급 판정에 있어 매우 중요한 항목인 배최장근단면적에 대한 유의적 연관성이 입증되어 본 분자표지를 이용하여 유전적으로 배최장근단면적이 넓어 육량 생산이 우수한 한우를 조기에 진단하고 선발할 수 있는 DNA 분자표지로 활용할 수 있을 것으로 사료된다.
도면 1은 본 발명에서 PCR-RFLP 분석 기법으로 검출한 서열번호 1의 한우 NPY 유전자 증폭 영역 내 419번째 T↔C 단일염기다형(SNP)으로 인한 각 개체의 SNP 유전자형별 분자표지(DNA marker) 전기영동 사진
도면 2는 본 발명에서 PCR-RFLP 분석 기법으로 검출한 서열번호 1의 한우 NPY 유전자 증폭 영역 내 419번째 T↔C 단일염기다형(SNP)에 대한 각 SNP 유전자형별 분자표지(DNA marker)의 염기서열 분석 크로마토그램
<110> SANGJI UNIVERSITY INDUSTRY ACADEMIC COOPERATION FOUNDATION <120> Development of DNA marker associated with higher meat quantity and diagnosis method of high meat quantity producing Hanwoo using the DNA marker <160> 3 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 713 <212> DNA <213> Bos taurus <220> <221> intron <222> (1)..(713) <223> Hanwoo neuropeptide Y (NPY) gene, intron 2 region <220> <221> primer_bind <222> (1)..(22) <223> Forward primer bind <220> <221> primer_bind <222> (692)..(713) <223> Reverse primer bind <220> <221> variation <222> (419) <223> SNP : y (primidine, T/C) <400> 1 ccccagggtg attctaacat ctagccaggt ttgattttcc tagagatgct atctttgaaa 60 gataaagcat tgtcaagaag aaggataatc cagaattaat tcgagatggg agaacagtca 120 ttgatgctgc tctgggtacc tactactttc tgactacaaa ttctgctatt gcagacttaa 180 gttctctaat ggtaaattgg agaaaatatt caccagttct ttaattcact gcagcatgat 240 gaaaataaac gagttaaggt tgcccaagag ttttaggatt agtaaaatca actgatggac 300 agaataaata catataaatt gctgcctaca gtctgatatc acaacaccag aaaatctttg 360 aggaaatctc gcaaatgatg ggggcgagag agttggcttt gcttttgtat tccttgagyc 420 cctgcaaagg agcaataata ggaacgtttt cctccaaatt tagatttaat tgtgcttgat 480 aggcagctag catatactct ctatcagctt tattccacct gttttatctg atatctaatc 540 aatccaccag tagactattt ttttatttgt gaaaaaaagc agctactgat gtccaatgct 600 ctttttgaga aagggaaaaa tagtgtcttc aaaaaaatac aacttggtgt agatttctca 660 gctcctttgg cagagagaga gagacagaca aacagaccat gtcctcactc acc 713 <210> 2 <211> 22 <212> DNA <213> Bos taurus <220> <221> primer_bind <222> (1)..(22) <223> Forward primer (5'-3') <400> 2 ccccagggtg attctaacat ct 22 <210> 3 <211> 22 <212> DNA <213> Bos taurus <220> <221> primer_bind <222> (1)..(22) <223> Reverse primer (5'-3') <400> 3 ggtgagtgag gacatggtct gt 22

Claims (3)

  1. 서열번호 2 및 서열번호 3의 프라이머(primer)에 의해 PCR (Polymerase chain reaction; 중합효소연쇄반응) 증폭된 한우 NPY (neuropeptide Y) 유전자 증폭산물에 Hinf 제한효소를 처리하는 과정을 포함하는 PCR-RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism; 제한효소절편다형성) 분석법으로 서열번호 1에 제시한 한우 NPY 유전자 염기서열 419번째 T↔C 염기치환에 따른 개체별 분자표지(DNA marker)를 검출하고, 각각의 SNP 유전자형(TT, TC 및 CC)을 분석하여 유전적으로 배최장근단면적이 넓은 한우를 예측하고 판정하는 것을 특징으로 하는 한우 육량 증대 연관 분자표지를 이용한 고능력 한우 조기 진단 방법
  2. 청구항 1에 있어서,
    5'에서 3' 방향으로 CCCCAGGGTGATTCTAACATCT의 염기서열 구조를 갖는 서열번호 2의 정방향 프라이머(Forward primer)와 5'에서 3' 방향으로 GGTGAGTGAGGACATGGTCTGT의 염기서열 구조를 갖는 서열번호 3의 역방향 프라이머(Reverse primer)를 이용하여 한우 NPY 유전자의 intron 2번 영역을 PCR로 증폭하는 것을 특징으로 하는 한우 육량 증대 연관 분자표지를 이용한 고능력 한우 조기 진단 방법
  3. 청구항 1에 있어서,
    PCR-RFLP 분석법으로 검출된 한우 NPY 유전자의 세 가지 분자표지(DNA marker) 유전자형(TT, TC 및 CC) 가운데 TT 유전자형을 나타내는 한우개체를 TC 및 CC 유전자형을 나타내는 한우 개체에 비해 유전적으로 배최장근단면적이 넓은 한우로 예측하여 판정하는 것을 특징으로 하는 한우 육량 증대 연관 분자표지를 이용한 고능력 한우 조기 진단 방법
KR1020090095803A 2009-10-08 2009-10-08 한우 육량 증대 연관 분자표지 개발 및 이를 이용한 고능력 한우 조기진단 방법 KR20110038490A (ko)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020090095803A KR20110038490A (ko) 2009-10-08 2009-10-08 한우 육량 증대 연관 분자표지 개발 및 이를 이용한 고능력 한우 조기진단 방법

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020090095803A KR20110038490A (ko) 2009-10-08 2009-10-08 한우 육량 증대 연관 분자표지 개발 및 이를 이용한 고능력 한우 조기진단 방법

Publications (1)

Publication Number Publication Date
KR20110038490A true KR20110038490A (ko) 2011-04-14

Family

ID=44045552

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020090095803A KR20110038490A (ko) 2009-10-08 2009-10-08 한우 육량 증대 연관 분자표지 개발 및 이를 이용한 고능력 한우 조기진단 방법

Country Status (1)

Country Link
KR (1) KR20110038490A (ko)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR101289484B1 (ko) * 2011-11-07 2013-07-24 상지대학교산학협력단 한우 마블링 진단용 유전자 검사 방법
KR101417389B1 (ko) * 2012-11-05 2014-07-08 상지대학교산학협력단 한우 성숙도 관련 유전자 마커 개발

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR101289484B1 (ko) * 2011-11-07 2013-07-24 상지대학교산학협력단 한우 마블링 진단용 유전자 검사 방법
KR101417389B1 (ko) * 2012-11-05 2014-07-08 상지대학교산학협력단 한우 성숙도 관련 유전자 마커 개발

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US7947444B2 (en) Leptin promoter polymorphisms and uses thereof
KR101083213B1 (ko) 한우 근내지방도 연관 분자표지를 이용한 한우 육질 진단 방법
US20060275793A1 (en) Association between markers in the leptin gene and carcass traits in commercial feedlot steer and heifers
KR100935293B1 (ko) 티엔에프알파 유전자를 이용한 한우 육량형질 연관단일염기다형마커 개발
KR100827544B1 (ko) 한우의 등지방 두께 및 근내지방도 관련 분자표지인자 개발
KR100786534B1 (ko) 한우의 일당 증체량 관련 디엔에이 분자표지 개발
CN116377082B (zh) 绵羊lcorl基因单核苷酸多态性标记在生长性状选择中的应用
KR20110038490A (ko) 한우 육량 증대 연관 분자표지 개발 및 이를 이용한 고능력 한우 조기진단 방법
KR101307008B1 (ko) 한우 근내지방도 연관 분자표지를 이용한 고급육 생산 한우 진단 방법
KR101289576B1 (ko) 한우 육량 관련 분자마커 개발
KR101321219B1 (ko) 유전체 정보 분석에 의한 한우 마블링 유전능력 진단 방법
KR100818166B1 (ko) 고육량 생산 한우 진단용 분자표지인자 개발
KR101289484B1 (ko) 한우 마블링 진단용 유전자 검사 방법
KR100816993B1 (ko) 지방산 생합성 조절효소 유전자를 이용한 한우 생체중 및도체중 연관 분자마커 개발
AU2007286131A1 (en) Leptin and growth hormone receptor gene markers associated with rearing, carcass traits and productive life in cattle
KR101618948B1 (ko) 대립유전자 특이적 중합효소 연쇄반응 기법을 이용한 한우 육질 진단 방법
KR101417389B1 (ko) 한우 성숙도 관련 유전자 마커 개발
KR101280652B1 (ko) 한우 등지방 관련 유전체 선발 기술 개발
KR101307087B1 (ko) 단일염기다형성 마커를 이용한 고품질 우량 한우 진단 방법
KR20080022563A (ko) 분자마커 이용 고능력 한우 진단 방법
KR101853201B1 (ko) 글루타티온과산화효소 유전자의 단일염기다형 마커를 이용한 한우 도체중 진단 방법
KR101764012B1 (ko) 유전자 검사를 통한 도체율이 높은 한우 진단 방법
KR101797876B1 (ko) Snp 표지를 이용한 한우 배최장근단면적 진단 방법
KR20140055203A (ko) 한우 비만유전자를 이용한 마블링 진단 방법
US20050142560A1 (en) Method for identifying and managing livestock by genotype

Legal Events

Date Code Title Description
A201 Request for examination
E902 Notification of reason for refusal
E601 Decision to refuse application