KR20100092765A - L-아미노산 생산용 미생물 및 이를 이용하여 l-아미노산을 생산하는 방법 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 수크로스를 주 탄소원으로 이용할 수 있으며, L-아미노산 생산능을 가지는 형질전환된 미생물 및 당해 미생물을 이용하여 L-아미노산을 생산하는 방법에 관한 것이다.
대장균, 수크로스, 만노키나아제, 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제, 수크로스 전사 조절자, L-아미노산
Description
본 발명은 수크로스를 주 탄소원으로 이용하여 고수율의 L-아미노산을 생산하는 형질전환된 미생물 및 이를 이용한 L-아미노산 생산 방법에 관한 것이다.
발효 산업에 주로 이용되는 전분당은 최근 바이오 연료 개발이 가속화됨에 따라 수요가 급증하고, 이상 기후에 의한 작물의 흉작으로 가격이 급상승하고 있다. 이러한 전분당에 비해 값이 싼 수크로스 또는 수크로스를 다량 포함하는 당밀 (molasses)을 발효산업의 탄소원으로 이용할 경우, 보다 높은 원가 경쟁력을 확보할 수 있는 장점이 있다. 자연계에 존재하는 대장균의 약 50 % 정도는 수크로스를 대사할 수 있는 능력을 가지고 있지만, 발효 산업에 주로 이용되고 있는 대장균 K12 균주, B 균주 및 C 균주 등은 수크로스 자화능이 없다(Mol. Microbiol. (1998) 2:1-8, Can. J. Microbiol. (1999) 45:418-422). 그러므로 수크로스 자화능과 관련된 유전자들을 규명하고 이를 개량하여 강화된 수크로스 자화능 관련 유전자들을 확보하는 일과 이들을 수크로스 비자화성 산업용 대장균에 도입하여 목적하는 대사 산물을 생산하는 것은 발효산업의 가장 중요한 연구주제 중 하나이다.
산업용 대장균에 수크로스 자화능을 부여할 수 있는 방법으로서, 수크로스 자화능이 있는 미생물 유래의 수크로스 이용성 유전자 또는 유전자군을 도입하는 방법이 주로 이용되고 있다. 그 예로, 엔테로박테리아세 (Enterobacteriaceae) 과에 속하는 살모넬라 (Salmonella) 종 (J. Bacteriol. (1982) 151:68-76, Mol. Microbiol. (1998) 2:1-8, J. Bacteriol. (1991) 173:7464-7470, 미국등록특허 제7,179,623호), 클렙시엘라 뉴모니애 (Klebsiella pneumoniae) (J. Gen. Microbiol. (1988) 134:1635-1644), 어위니아 아미노보라 (Erwinia amylovora) (J. Bacteriol. (2000) 182:5351-5358)에 존재하는 scr 레귤론(regulon)을 대장균 K12에 형질전환하여 수크로스 자화능을 부여한 것은 이미 당업계에 잘 알려져 있다. 또한 수크로스 자화능을 가지는 non-K12 대장균 또는 병원성 대장균 (Appl. Environ. Microbiol. (1992) 58:2081-2088, 미국 등록특허 제6,960,455호) 유래의 csc 레귤론을 도입한 경우, 대장균 AB1281 (미국 등록특허 제4,806,480호)의 접합 플라스미드(conjugative plasmid) scr53에 존재하는 수크로스 이용성 유전자 군을 도입한 경우 및 그람 양성 미생물인 스트렙토코코스 뮤탄스 (Streptococcus mutans) (J. Bacteriol. (1989) 171:263-271) 및 바실러스 서브틸리스 (Bacillus subtilis) (J. Bactreriol. (1989) 171:1519-1523) 유래의 scr 레귤론, sac 오페론 (operon)을 도입한 경우도 알려져 있다.
수크로스를 이용할 수 있는 시스템은 크게 Scr-PTS 시스템과 Scr-non PTS 시스템으로 나눌 수 있다. 대부분의 수크로스를 이용할 수 있는 미생물은 Scr-PTS (phosphoenolpyruvate dependent sucrose phosphotransferase) 시스템을 가진다.
Scr-PTS 시스템의 대표적인 예로써 그람 음성 미생물인 살모렐라 타이퓨뮤리움(Salmonella typhmurium)의 접합 플라스미드 pUR400이나 클렙시엘라 뉴모니애(Klebsiella pneumoniae)의 염색체상에 존재하는 scr 레귤론을 들 수 있다. scr 레귤론은 도 1에서 보는 바와 같이 scrK (fructokinase), scrY (sucrose porin), scrA (sucrose-specific EIIBC component), scrB (sucrose-6-phosphate hydrolase) 및 scrR (LacI-related sucrose-specific repressor)의 5개의 유전자로 구성되어 있으며, 두 개의 오페론인 scrK 및 scrYAB는 ScrR 리프레서(repressor)에 의하여 음성적으로 조절되고 있다(Mol. Microbiol. (1993) 9:195-209). 그람 양성균의 Scr-PTS 시스템은 스트렙토코코스 뮤탄스 (Streptococcus mutans)의 scr 레귤론이 있으며, scrK, scrA, scrB 및 scrR 유전자로 구성되어 있다(J. Bacteriol. (2003) 185:5791-5799).
Scr-PTS 시스템은 낮은 농도의 수크로스까지 효율적으로 유입할 수 있다는 장점은 있으나, PEP(Phosphoenolpyruvate)를 소모하여 수크로스를 유입하므로 세포내의 PEP 풀(pool)을 감소시키는 단점이 있다. PEP는 중앙 대사경로에서 중요한 중간체(metabolite)로써, 당(sugar) PTS 시스템의 포스페이트 공여자(phosphate donor)의 역할 뿐만이 아니라, 피루베이트 카이네이즈(pyruvate kinase)에 의해 촉매되는 ATP 생성 반응에 관여하기도 하며, 몇 가지 아미노산이나 옥살로아세테이 트(oxaloacetate, OAA)의 직접적인 전구체로도 작용한다(Metab. Eng. (2002) 4:124-137, Microb. Cell Fact. (2005) 4:14). 특히 OAA는 쓰레오닌, 이소로이신 메티오닌, 라이신, 아스파라진 및 아스파틱산 등의 아미노산의 탄소골격(carbon skeleton)으로 이용된다 (미국 등록특허 제6,960,455호).
PEP의 대부분은 당 PTS 시스템에 의해 가장 많이 소모되는 것으로 알려져 있다. 탄소원으로서 글루코스가 포함된 최소배지에서 글루코스 PTS 시스템에 소모되는 PEP의 양은 전체 PEP의 50 %에 이른다고 한다(Microb. Cell Fact. (2005) 4:14). 따라서 당 PTS 시스템 대신 당 non-PTS 시스템을 이용한다면, 세포 내의 PEP 풀을 증가시킬 수 있으며 증가된 PEP를 발효산물의 생합성에 이용함으로써 생산성 및 수율을 향상시킬 수 있다. 최근 대장균의 당 PTS 시스템을 이용할 때보다 당 non-PTS 시스템을 이용할 경우, 아미노산이나 방향족 화합물(aromatic compound)의 수율과 생산성이 증가한다는 사례가 많이 보고되고 있다(Biotechnol. Bioeng. (2001) 74: 364-375, Appl. Microbiol. Biotechnol. (2001) 57:186-191, Metab. Eng. (2005) 7:70-87).
따라서 수크로스 이용에 있어서도 Scr-PTS 시스템보다는 수크로스 유입시 PEP를 소모하지 않는 Scr-non PTS 시스템을 이용하는 것이 더 바람직할 것이다. 이러한 장점을 가진 Scr-non PTS 시스템을 발효에 이용한 예도 몇 가지 알려져 있다. 아지노모토(Ajinomoto)사의 경우 EC3132 유래의 cscBKA를 대장균에 도입하여 쓰레오닌, 이소루이신 및 트립토판 등의 생산에 이용하였다 (미국 등록특허 제6,960,455호). 또한 듀퐁 (DuPont)사는 대장균 ATCC13281 유래 cscBKAR을 대장균 K12에 도입하고 수크로스를 사용하여 타이로신 (tyrosine)을 생산하기도 하였다(Appl. Microbiol. Biotechol. (2007) 74:1031-1040). KO11 유래의 cscBKAR을 락테이트(lactate)을 생산하는 대장균에 도입하여 수크로스와 당밀로부터 락테이트를 생산한 사례도 알려져 있다 (Biotechnol. Lett. (2004) 26:689-693).
Scr-non PTS 시스템은 프로톤 심포트 타입 수크로스 퍼미아제 (proton symport-type sucrose permease)를 이용하는 시스템으로 이 수크로스 퍼미아제를 코딩하는 cscB를 포함하는 csc 유전자군이 잘 알려져 있다. csc 레귤론의 경우 수크로스 자화능이 있는 대장균 유래의 것들이 많으며, 그 예로 야생형 대장균 중 EC3132의 csc 레귤론 (GenBank accession number X81461, Mol. Gen. Genet. (1992) 235:22-32, 미국 등록특허 제6,960,455호), 대장균 KO11 csc 레귤론(GenBank accession number AY314757, Biotechnol. Lett. (2004) 26:689-693), 병원성 대장균 O157:H7의 csc 레귤론(J. Bacteriol. (2002) 184:5307-5316), 및 ATCC13281의 csc 레귤론(GenBank accession number DQ777770, Appl. Microbiol. Biotechnol. (2007) 74:1031-1040)이 알려져 있다.
csc 레귤론은 cscB (proton symport-type sucrose permease), cscK (fructokinase), cscA (sucrose hydolase), cscR (LacI-related sucrose-specific repressor)로 구성되어 있으며, 2개의 오페론, cscKB와 cscA는 CscR에 의해 음성적으로 조절을 받는다(J. Bacteriol. (2002) 184: 5307-5316).
CscB는 프로톤 심포트 타입(proton symport-type)의 수크로스 퍼미아제로써, 수소의 농도 구배에 의해 외부의 수크로스가 세포 내로 유입된다. CscB는 Scr-PTS 시스템과 비교했을 때 Scr-non PTS 시스템의 가장 큰 특징을 보여주는 단백질로써, Scr-PTS 시스템의 ScrA 에 비해 수크로스에 대한 Km 값이 상대적으로 높다. ScrA의 경우 수크로스에 대한 Km 값이 10 μM (J. Bacteriol. (1982) 151:68-76)인 반면, CscB의 경우 Km 값이 1.0 mM (Biochem. BiophysRes. Commun. (1995) 208:1116-1123)인 것으로 알려져 있다. 따라서 csc 레귤론이 도입된 대장균은 0.2% 이하의 수크로스가 포함된 배지에서 대수 증식기 (doubling time)가 20 시간에 이른다(J. Bacteriol. (2002) 184:5307-5316). CscA는 수크로스 하이드로라제(sucrose hydrolase) 활성을 가지며, 세포 내로 유입된 수크로스를 글루코스와 프락토오즈로 가수분해시킨다. CscK는 프락토카이네이즈(fructokinase) 활성을 가지며, 프락토오즈를 프락토오즈-6-포스페이트(fructose-6-phosphate)로 전환시킨다.
한편, Mak는 ATP를 소모하며 만노오스, 프락토오즈를 포함한 헥소스 (hexose)를 6-포스포-에스터(6-phospho-ester) 형태로 전환해주는 카이네이즈 (kinase) 활성을 가진다. 특히 엔테릭 박테리아 (enteric bacteria)의 야생형 Mak (Mak-o)를 코딩하는 유전자(mak 또는 yajF)는 크립틱 (cryptic) 유전자로 알려져 있으며, mak의 프로모터 -35 부위의 염기서열 변이에 의한 Mak (Mak+)는 활성이 크게 증가한다고 알려져 있다(J. Mol. Microbiol. Biotechnol. (2001) 3:355-359, Biochemistry (2005) 44:10776-10783). Mak는 만노오스, 프락토오즈 이외에도 또 다른 기질 글루코스, 소오보오스 및 글루코사민을 인산화시킬 수 있다.
이와 같은 배경하에서, 본 발명자는 수크로스를 고효율적으로 이용하는 미생물을 개발하기 위한 일환으로써, 수크로스 대사에 관여할 것으로 예상되는 유전자들을 탐색하는 연구를 수행하던 중, 수크로스 대사에 있어서 만노키나아제가 중요한 역할을 할 것이라는 사실을 밝혀내게 되었다. 즉, 만노키나아제가 불활성화된 대장균에 온전한 csc 레귤론을 도입하더라도, 만노키나아제가 불활성화되지 않는 야생형 대장균에 비해 수크로스 이용속도가 감소되는 사실을 확인하게 되었으며, 이러한 사실에 근거하여 본 발명을 완성하기에 이르렀다.
본 발명의 하나의 목적은 수크로스를 주 탄소원으로 이용하는 L-아미노산 생산능이 향상된 에스케리키아속 미생물에 관한 것이다. 보다 구체적으로, 수크로스 비자화성 미생물에 수크로스 퍼미아제(sucrose permease), 수크로스 하이드로라제(sucrose hydrolase) 및 수크로스 전사 조절자(sucrose transcriptional regulator)의 활성을 부여하고, 만노키나아제(mannokinase)의 활성이 강화된 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물을 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 하나의 목적은 상기 에스케리키아속 미생물을 이용하여 L-아미노산을 제조하는 방법을 제공하는 것이다.
상기 목적을 달성하기 위한 하나의 양태로서, 본 발명은 수크로스 비자화성 미생물에 수크로스 퍼미아제(sucrose permease), 수크로스 하이드로라제(sucrose hydrolase) 및 수크로스 전사 조절자(sucrose transcriptional regulator)의 활성을 부여하고, 만노키나아제(mannokinase)의 활성이 강화된 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물에 관한 것이다.
본 발명에 있어서, 수크로스 퍼미아제는 외부의 수크로스를 세포 내로 유 입하는 활성을 가지는 펩타이드이며, 수크로스 하이드로라제는 수크로스를 글루코스와 프락토스로 가수분해하는 활성을 가지는 펩타이드이며, 수크로스 전사 조절자는 수크로스 퍼미아제 및 수크로스 하이드로라제를 코딩하는 유전자들의 전사를 조절하는 활성을 가지는 펩타이드를 의미한다. 상기 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제 및 수크로스 전사 조절자의 활성은 수크로스 자화능이 존재하는 미생물에 존재하지만, 에스케리키아속 미생물, 특히 산업적으로 이용되는 산업용 대장균 K12 균주, B 균주 및 C 균주에는 존재하지 않는다.
상기 수크로스 비자화성 에스케리키아 속 미생물에 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제 및 수크로스 전사 조절자의 활성을 부여하도록 하는 방법은 당해 분야에서 잘 알려진 다양한 방법의 적용이 가능하다. 바람직한 활성 부여 방법은 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제 및 수크로스 전사 조절자를 암호화하는 유전자를 벡터에 도입하고, 그 재조합 벡터로 수크로스 비자화성 L- 아미노산 생산능을 가지는 에스케리키아속 미생물을 형질전환시키는 것이다. 상기 수크로스 퍼미아제를 코딩하는 유전자, 수크로스 하이드로라제를 코딩하는 유전자, 수크로스 전사 조절자를 코딩하는 유전자는 바람직하게 수크로스 자화능이 있는 미생물, 바람직하게는 수크로스 자화능이 있는 에스케리아속 미생물, 보다 바람직하게는 수크로스 자화능이 있는 대장균으로부터 유래할 수 있다. 수크로스 자화능이 있는 대장균의 예로는 대장균 ATCC9637 (Appl. Environ. Microbiol. (1989) 55:1943-1948) 등이 있다. 상기 대장균 ATCC9637로부터 얻어지는 수크로스 퍼미아제를 코딩하는 유전자 (cscB)를 서열번호 4로, 수크로스 하이드로라제를 코딩하는 유전자(cscA) 서열번호 6으로, 수크로스 전사 조절자를 코딩하는 유전자(cscR)를 서열번호 7로 각각 나타내었다.
하나의 구체적인 실시에서, 본 발명자는 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제 및 수크로스 전사 조절자를 암호화하는 유전자로서, csc 레귤론으로부터 유래된 서열번호 4, 6 및 7의 cscB, cscA, 및 cscR 유전자를 포함하는 cscBAR 유전자를 벡터에 도입하고, 그 재조합 벡터로 수크로스 비자화성 L- 아미노산 생산능을 가지는 에스케리키아속 미생물을 형질전환시켜 제조할 수 있다.
본 발명에 있어서, 만노키나아제(mannokinase)는 만노오스 등의 헥소스(hexose)를 ATP를 이용하여 6-포스포-에스터 형태로 전환해 주는 활성을 가지는 펩티드를 말한다. 본 발명은 수크로스 비자화성 에스케리키아속 미생물에서 만노키나아제의 활성이 본래의 활성보다 강화(또는 증가)된 것을 특징으로 한다. 상기"본래의 화성"이란 어떠한 유전적 조작이나 변형이 없는 수크로스 비자화성 에스케리키아속 미생물이 가지고 있는 활성을 의미한다. 또한, 상기 "강화" 또는 "증가"는 수크로스 비자화성 에스케리키아속 미생물의 본래의 활성보다 향상된 것을 의미한다.
본 발명의 만노키나아제 활성을 강화(또는 증가)시키는 방법은 당해 분야에서 잘 알려진 다양한 방법의 적용이 가능하다. 그 방법의 예는, 이로 제한되는 것은 아니지만, 만노키나아제를 코딩하는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오타이드를 추가로 염색체에 삽입하는 방법 또는 상기 폴리뉴클레오타이드를 벡터 시스템에 도입하는 방법 등에 의하여 만노키나아제를 코딩하는 염기서열의 카피수를 증가시키는 방법, 강한 프로모터로 교체하는 방법, 프로모터에 변이를 도입하는 방법, 및 유전자 변이에 의한 방법 등이 있다. 하나의 구체적 실시에서, 아미노산 생산능을 가지는 에스케리키아속 미생물의 만노키나아제의 활성을 강화시키기 위해 만노키나아제를 암호화하는 유전자를 벡터에 도입하고 에스케리키아속 미생물을 형질전환시킴으로써 상기 유전자의 카피수를 증가시키는 방법을 사용할 수 있다.
만노키나아제를 암호화하는 유전자는 수크로스 비자화성 에스케리키아속 미생물에 작동 가능한 염기서열을 가지는 유전자이면 족하며, 바람직하게는 엔테릭 박테리아 (enteric bacteria)의 야생형 Mak (Mak-o)를 코딩하는 유전자인 mak 유전자이다. 구체적인 일 실시예에서는 대장균에서 유래하였으며, 바람직하게는 서열번호 15의 염기서열 (GenBank accession number AC000091)을 가지는 폴리뉴클레오타이드를 사용하였다. 한편, 상기 만노키나아제를 코딩하는 염기서열은 그 활성을 유지하는 한 일정 정도 변형이 가능한 것은 당업자에게 자명할 것이다. 본 기술 분야의 당업자라면 이러한 인위적인 변형에 의해 70 % 이상의 상동성이 유지되는 염기서열이 본 발명에서 목적하는 유전자의 활성을 보유하는 한, 본 발명의 상기 염기서열로부터 유래된 것과 균등한 것임을 쉽게 이해할 것이다.
본 발명에 있어서 상기 만노키나아제, 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제 및 수크로스 전사 조절자의 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 추가적으로 향상시키기 위하여, 상기 활성을 보유한 펩티드를 코딩하는 유전자의 카 피수를 증가시키는 방법, 프로모터를 개량하는 방법, 무작위 돌연변이법 (random mutagenesis) 또는 부위 특이적 돌연변이법 (site-directed mutagenesis)을 이용하는 방법 등을 사용할 수 있다. 본 발명의 구체적 실시에서는 만노키나아제, 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제 및 수크로스 전사 조절자를 코딩하는 유전자를 포함하는 염기서열을 하이드록실아민 (hydroxylamine)을 처리하여 무작위 변이를 유발하는 방법 (Methods Enzymol. (1991) 194:302-318)을 이용하였다.
따라서, 바람직한 일 양태로서 본 발명은 상기 변이 유발 방법에 의해 변이된 염기서열 또는 아미노산 서열에 변이가 있는 변이체에 의해 향상된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물에 관한 것이며, 바람직하게 상기 변이체는 만노키나아제, 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제 및 수크로스 전사 조절자 중의 염기서열에 변이가 하나 또는 그 이상의 변이가 존재하는 변이체이다. 보다 바람직하게는 만노키나아제, 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제 및 수크로스 전사 조절자 중의 아미노산 서열에 하나 또는 그 이상의 변이가 존재하는 변이체이다. 가장 바람직하게는 수크로스 전사 조절자의 130번째 아미노산이 히스티딘에서 타이로신으로 치환된 변이체이고, 바람직하게 이러한 변이체는 서열번호 17로 정의되는 변이된 수크로스 전사 조절자를 갖는다.
이와 같은 변이체를 벡터에 도입하고, 그 재조합 벡터를 수크로스 비자화성 L-아미노산 생산능을 가지는 에스케리키아 속 미생물에 형질전환시키는 방법에 의해 본 발명에 따른 향상된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케 리키아속 미생물을 제공할 수 있다. 구체적인 일 실시에서, 본 발명자는 서열번호 18로 정의되는 벡터 pAcscBAR'-mak 플라스미드를 사용하여 수크로스 비자화성 에스케리키아속 미생물을 향상된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물로 형질전환시킬 수 있다.
본 발명에서 "벡터"란 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제, 수크로스 전사 조절자 및 만노키나아제를 암호화하는 유전자를 숙주세포인 수크로스 비자화성 에스케리키아속 미생물로 도입하여 본 발명에 따른 에스케리키아속 미생물을 제공하는데 사용되는 핵산 화합물로서, 목적 단백질을 발현하기 위한 통상의 필수적인 발현 요소를 포함한다. 구체적으로, 프로모터, 오퍼레이터, 개시코돈, 종결코돈 및 폴리아데보화 서열과 같은 조절서열을 가지며, 이의 다양한 변형이 가능하다. 또한, 인핸서 서열 또는 분비 서열을 포함할 수 있다. 통상 사용되는 벡터의 예로는 천연 상태이거나 재조합된 상태의 플라스미드, 코스미드, 바이러스 및 박테리오파지를 들 수 있다. 예를 들어, 파지 벡터 또는 코스미드 벡터로서 pWE15, M13, λMBL3, λMBL4, λIXII, λASHII, λAPII, λt10, λt11, Charon4A, 및 Charon21A 등을 사용할 수 있으며, 플라스미드 벡터로서 pBR계, pUC계, pBluescriptII계, pGEM계, pTZ계, pCL계 및 pET계 등을 사용할 수 있다. 사용 가능한 벡터는 특별히 제한되는 것이 아니며 공지된 발현 벡터를 사용할 수 있다. 바람직하게는 pACYC177, pACYC184, pCL, pECCG117, pUC19, pBR322 및 pMW118 벡터 등을 사용할 수 있다.
본 발명에서 용어 "형질전환"은 유전자를 숙주세포 내에 도입하여 숙주세포 내에서 발현할 수 있도록 하는 것을 의미한다. 형질전환된 유전자는 숙주세포 내에서 발현될 수 있기만 한다면, 숙주세포의 염색체 내에 삽입되어 위치하거나 염색체 외에 위치하든지 이들 모두를 포함한다. 또한, 상기 유전자는 폴리펩티드를 코딩할 수 있는 폴리뉴클레오티드로 DNA 및 RNA를 포함한다. 상기 유전자는 숙주세포내로 도입되어 발현될 수 있는 것이면, 어떠한 형태로 도입되는 것이든 상관없다. 예를 들면, 상기 유전자는, 자체적으로 발현되는데 필요한 모든 요소를 포함하는 폴리뉴클레오티드 구조체인 발현 카세트(expression cassette)의 형태로 숙주세포에 도입될 수 있다. 상기 발현 카세트는 통상 상기 유전자에 작동 가능하게 연결되어 있는 프로모터 (promoter), 전사 종결 신호, 리보좀 결합부위 및 번역 종결신호를 포함한다. 상기 발현 카세트는 자체 복제가 가능한 발현 벡터 형태일 수 있다. 또한, 상기 유전자는 그 자체 또는 폴리뉴클레오티드 구조체의 형태로 숙주세포에 도입되어, 숙주세포에서 발현에 필요한 서열과 작동 가능하게 연결되어 있는 것일 수도 있다.
본 발명의 미생물은 수크로스 비자화성을 갖는 L-아미노산 생산 가능 미생물로서, 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제 및 수크로스 전사 조절자의 활성이 부여되고 만노키나아제의 활성이 강화되어 L-아미노산 생산능이 향상됨과 동시에 수크로스 자화능을 갖는 미생물을 말한다. 따라서, 본 발명의 미생물은 상기 특성을 보유하는 한 원핵 미생물 및 진핵 미생물 어느 것이나 포함하며, 이의 예로 는 에스케리키아 (Escherichia) 속, 어위니아 (Erwinia) 속, 세라티아 (Serratia) 속, 프로비덴시아 (Providencia) 속, 코리네박테리움 (Corynebacterium) 속 및 브레비박테리움 (Brevibacterium) 속에 속하는 미생물 균주가 있다. 바람직하게 본 발명의 미생물은 에스케리키아 속에 속하는 미생물이며, 보다 바람직하게는 대장균이다.
본 발명에 있어서 "L-아미노산"은 L-쓰레오닌, O-석시닐-호모세린(O-succinyl-homoserine), O-아세틸-호모세린(O-Acetyl-homoserine), L-메티오닌, L-라이신, L-호모세린, L-이소루신, L-발린 및 L-트립토판 등이다. 바람직하게 상기 L-아미노산은 L-쓰레오닌, O-석시닐-호모세린, O-아세틸-호모세린 및 L-트립토판이다.
구체적인 일 실시에서, 본 발명자는 특히 L-쓰레오닌 생산능을 가지는 대장균이 cscBAR'-mak 유전자군을 포함한 서열변호 18의 염기서열을 갖는 벡터로 L-쓰레오닌 생산능을 가지는 대장균 ABA5G 균주를 형질전환 하였으며, 제작된 균주를 대장균 CA03-0308로 명명하고, 2008년 12월 23일자로 대한민국 서울특별시 서대문구 홍제 1동 361-221 번지에 소재하는 국제기탁기관인 한국종균협회 부설 한국미생물보존센터에 수탁번호 KCCM10978P로 기탁하였다.
다른 하나의 양태로서, 본 발명은, 상기 향상된 L-아미노산 생산능 및 수 크로스 자화능을 갖는 에스케리키아 속 미생물을 수크로스가 주 탄소원으로 포함되어 있는 배지에 배양하여 아미노산을 생산하는 방법에 관한 것이다.
구체적으로, 본 발명은 탄소원으로서 수크로스가 전체 또는 일부 포함된 배양 배지에 상기의 수크로스 자화능을 가지고 L-아미노산을 생산하는 미생물을 접종하여 배양하는 단계; 및 상기 배양물로부터 L-아미노산을 분리하는 단계를 포함하는, 수크로스를 포함한 탄소원에서 상기 에스케리키아 속 미생물을 이용하여 L-아미노산을 생산하는 방법에 관한 것이다.
본 발명의 상기 배양과정은 당 업계에 알려진 적당한 배지와 배양조건에 따라 이루어질 수 있다. 이러한 배양 과정은 당업자라면 선택되는 균주에 따라 용이하게 조정하여 사용할 수 있다. 상기 배양방법의 예에는 회분식, 연속식 및 유가식 배양이 포함되나, 여기에 한정되는 것은 아니다. 배양에 사용되는 배지는 특정한 균주의 요구 조건을 적절하게 만족시켜야 한다.
본 발명에서 사용되는 배지는 수크로스를 주탄소원으로 사용한다. 주탄소원으로 사용되는 수크로스는 수크로스를 다량으로 포함한 당밀 등의 형태로 탄소원으로 제공될 수 있으며, 수크로스 또는 당밀 외에 적정량의 탄소원을 제한없이 다양하게 포함할 수 있다. 이들 질소원은 단독 또는 조합되어 사용될 수 있다. 상기 배지에 포함되는 인원으로서 인산이수소칼륨, 인산수소이칼륨 및 대응되는 소듐 -함유 염이 포함될 수 있다. 또한, 황산마그네슘 또는 황산 철과 같은 금속염을 포함할 수 있다. 그 외에 아미노산, 비타민 및 적절한 전구체 등이 포함될 수 있다. 이들 배지 또는 전구체는 배양물에 회분식 또는 연속식으로 첨가될 수 있다.
배양 중에 수산화암모늄, 수산화칼륨, 암모니아, 인산 및 황산과 같은 화합물을 배양물에 적절한 방식으로 첨가하여, 배양물의 pH를 조정할 수 있다. 또한 배양 중에는 지방산 폴리클리콜 에스테르와 같은 소포제를 사용하여 기포 생성을 억제할 수 있다. 또한 배양물의 호기 상태를 유지하기 위하여, 배양물 내로 산소 또는 산소 함유 기체를 주입하거나 혐기 및 미호기 상태를 유지하기 위해 기체의 주입 없이 혹은 질소, 수소 또는 이산화탄소 가스를 주입한다. 배양물의 온도는 보통 27℃ 내지 37℃, 바람직하게는 30℃ 내지 35℃이다. 배양 기간은 원하는 유용 물질의 생성량이 수득될 때까지 계속 될 수 있으며, 바람직하게는 10 내지 100 시간이다.
본 발명의 상기 배양 단계에서 생산된 아미노산을 수집 및 회수하는 방법은 배양방법, 예를 들어 회분식, 연속식 또는 유가식 배양 방법 등에 따라 당해 분야에 공지된 적합한 방법을 이용하여 배양액으로부터 목적하는 아미노산을 수집할 수 있다.
본 발명은 따른 향상된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물을 사용하여 L-아미노산을 생산하는 경우, 발효산업에 주로 이용 되었던 전분당 이외에 수크로스를 주탄소원으로 이용함으로써 급변하는 세계 곡물가에 유연하게 대처할 수 있을 뿐만 아니라 고수율의 L-아미노산을 생산할 수 있다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 보다 상세히 설명하고자 한다. 그러나, 이들 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예 1: 수크로스 이용성 유전자
csc
regulon의 획득 및 클로닝
Scr-non PTS 시스템인 cscBKAR 유전자는 미국생물자원센터 (American Type Culture Collection)로부터 구매한 대장균 W 균주 (ATCC9637)의 염색체를 주형으로 PCR법을 통하여 증폭하였다. 서열번호 1과 서열번호 2의 프라이머를 이용하여 PCR 법을 통하여 게놈상에 연속적으로 존재하는 4종의 유전자 전부를 단일 폴리뉴클레오티드로 증폭하였으며, 서열번호 1의 프라이머는 제한 효소 EagI 부위를 가지고 있고, 서열번호 2의 프라이머는 XbaI 부위를 가지고 있다. 이때 이용한 프라이머는 미국 국립보건원 진뱅크 (NIH GeneBank)에 등록되어 있는 EC3132의 cscBKAR 유전자 (GenBank accession number X81461) 및 주변 염기서열에 대한 정보를 바탕으로 제작하였다.
서열 번호 1: 5' CTTACGGCCGGAGTACATTTGAGCGACTGT 3'
서열 번호 2: 5' CGACTCTAGACTCGTTGGCGAGAACAGAGG 3'
PCR법의 조건은 94 ℃에서 3분간 변성 후, 94℃ 30초 변성, 56℃ 30초 어닐링, 72℃ 5분 중합을 25회 반복한 후, 72℃에서 7분간 중합반응을 수행하였다. 그 결과 5199 bp의 폴리뉴클레오티드를 획득할 수 있었다. 얻어진 폴리뉴클레오티드를 EagI 및 XbaI의 제한 효소 처리를 한 후 pACYC184 벡터의 EagI, XbaI자리에 클로닝하여 대장균 DH5α에 형질전환한 후 1 % 수크로스가 포함되어 있는 맥콘키 고체배지 (MacConkey agar plate)에 도말하였다. 콜로니중 진한 자주색 (purple color)을 띠는 콜로니를 선별한 후 통상에 알려진 플라스미드 미니프렙법을 이용하여 플라스미드를 획득하였다.
실시예 2. 획득된
cscBKAR
유전자의 염기서열 결정
획득된 플라스미드를 pAcscBKAR로 명명하고, EagI 및 XbaI 자리에 클로닝된 cscBKAR의 DNA 염기서열 (서열번호 3)을 결정하였을 때, 141번째부터 1388번째 염기서열은 cscB 유전자 (서열번호 4), 1460번째부터 2374번째 염기서열은 cscK 유전자 (서열번호 5), 2590번째부터 4023번째 염기서열은 cscA 유전자 (서열번호 6), 4031번째부터 5026번째 염기서열은 cscR 유전자 (서열번호 7)로 밝혀졌다.
실시예 3. MG1655
mak
유전자 결손 균주 제작
수크로스 대사에 주요하게 영향을 주는 유전자를 탐색하기 위하여, 수크로 스 대사에 관여할 것으로 예상되는 몇 가지 유전자를 선별하고, 그 유전자가 각각 결손 되어 있는 변이 대장균 K12를 제작하였다. 각 유전자가 결손된 변이체 대장균 K12는 원스탭 불화성화 방법 (Proc. Natl. Acad. Sci. (2000) 97:6640-6645) 에 의해 제작하였으며, 항생제 내성부여 표식 유전자를 제거하였다. 특히, mak 결손 균주를 제작하기 위해서, 서열번호 8 과 서열번호 9의 프라이머 쌍과 pKD4 플라스미드 (Proc. Natl. Acad. Sci. (2000) 97:6640-6645, GenBank No. AY048743)를 이용하여 PCR 반응을 수행하고, 그 결과 획득한 DNA 단편을 pKD46 (Proc. Natl. Acad. Sci. (2000) 97:6640-6645, GenBank No. AY048746)을 함유하는 야생형 대장균 K12의 컴피턴트 세포 (competent cell)에 일렉트로포레이션 (electroporation)하였다. 이후 카나마이신 (kanamycine) 내성을 보이는 세포주를 대상으로 PCR 반응을 수행하여, mak 유전자의 결실여부를 확인하고 pCP20 (Proc. Natl. Acad. Sci. (2000) 97:6640-6645) 플라스미드를 도입하여 항생제 내성 표식 유전자를 제거하였다.
서열번호 8: 5' GTGCGTATAGGTATCGATTTAGGCGGCACCAAAACTGAAGTGATTGCACTG TTGCAGCATTACACGTCTTG3'
서열번호 9: 5' TTACTCTTGTGGCCATAACCACGCAGCGCCGCGTACGCCGCTGGAATCACC ACTTAACGGCTGACATGGGA 3'
실시예 4. MG1655
mak
유전자 결손 균주에 pAcscBKAR 도입 및 수크로스 이 용성 확인
수크로스 대사에 주요하게 영향을 줄 것으로 예상되는 유전자가 각각 결실된 변이 대장균 K12를 실시예 3의 방법으로 제작한 후, pAcscBKAR 플라스미드를 형질전환 하였다. pAcscBKAR 플라스미드가 도입된 형질전환체를 33℃ 배양기에서 LB 고체 배지에서 밤새 배양한 균주를 수크로즈가 함유된 표 1의 25 mL 역가 배지에 한 백금이씩 접종한 다음, 이를 33℃, 200 rpm의 배양기에서 36 시간 배양하였으며, 이의 결과를 표 2에 나타내었다.
표 2에서 보는 바와 같이 mak가 결손된 균주는 36시간 동안 수크로스를 24.9 g/L 이용하고, mak가 결손되지 않는 야생형 균주는 33.1 g/L의 수크로스를 이용함에 따라 mak가 결손된 균주가 mak가 결손되지 않는 균주에 비해 수크로스 이용속도가 약 1.3배 감소하는 것을 확인할 수 있었다. 따라서 mak가 수크로스 대사에 있어서 중요한 유전자임을 예상할 수 있었으며, 이러한 사실을 바탕으로 효율적인 수크로스를 이용성 균주를 개발하기 위한 연구를 지속적으로 수행하였다.
실시예 5. pAcscBAR-mak 제작
pAcscBAR-mak는 다음과 같은 방법으로 제작되었다. 우선pAcscBAR을 제작한 후 pAcscBAR에 mak유전자를 클로닝하는 방법을 이용하였다. pAcscBAR의 제작은, 서열번호 10과 11의 프라이머를 이용하여 cscK 부위가 제거된 cscB부위의 폴리뉴클레오티드로 증폭하였다.
서열번호 10: 5' CGCGATATCTAGCATATGCCGGGTACCGCACTAGTTGAGAGTAAACGGC GAAGT 3'
서열번호 11: 5' ATTCGGCCGGAGCCCTGCAGGTGCACGAGTACATTTGAGCGACTGT 3'
PCR법의 조건은 94℃에서 3분간 변성 후, 94℃ 30초 변성, 56℃ 30초 어닐링, 72℃ 1분 30초 중합을 25회 반복한 후, 72℃에서 7분간 중합반응을 수행하였다. 그 결과 1521 bp의 폴리뉴클레오티드를 획득할 수 있었다. 얻어진 폴리뉴클레오티드와 pAcscBKAR를 각각 EcoRV와 EagI으로 제한 효소 처리를 한 후 클로닝하여 대장균 DH5α에 형질전환 하였다. LB 배지에서 성장한 콜로니를 이용한 PCR법을 통하여 pAcscBAR이 포함된 콜로니를 선별하였으며, 통상에 알려진 플라스미드 미니프렙법을 이용하여 플라스미드를 획득하였다. 획득된 pAcscBAR 플라스미드의 XbaI과 EagI자리에 연결된 cscBAR의 염기서열 (서열번호 12) 분석을 통하여 변이가 없는 것을 확인하였다.
pAcscBAR-mak의 제작은, 서열번호 13과 14의 프라이머와 대장균 W3110의 염색체를 주형으로 하여 mak가 포함된 폴리뉴클레오티드로 증폭한 후 pAcscBAR의 PstI과 EagI 의 제한 효소 자리에 클로닝하였다.
서열번호 13: 5' CACTGCAGTGGGGTAAATGCCATCG 3'
서열번호 14: 5' AACGGCCGTCTCGGTGCTCATTACT 3'
PCR법의 조건은 94 ℃에서 3분간 변성 후, 94℃ 30초 변성, 56℃ 30초 어닐링, 72℃ 1분 30초 중합을 25회 반복한 후, 72℃에서 7분간 중합반응을 수행하였다. 그 결과 1388 bp의 폴리뉴클레오티드 (서열번호 15)를 획득할 수 있었다. 얻어진 폴리뉴클레오티드와 pAcscBAR를 각각 PstI과 EagI으로 제한 효소 처리를 한 후 클로닝하여 대장균 DH5α에 형질전환 하였다. LB 배지에서 성장한 콜로니를 이용한 PCR법을 통하여 pAcscBAR-mak가 포함된 콜로니를 선별하였으며, 통상에 알려진 플라스미드 미니프렙법을 이용하여 플라스미드를 획득하였다. 획득된 pAcscBAR-mak 플라스미드의 XbaI과 EagI자리에 연결된 cscBAR-mak의 염기서열 (서열번호 16) 분석을 통하여 변이가 없는 것을 확인하였다.
실시예 6. 쓰레오닌 생산주에 pAcscBAR-mak 도입
pAcscBAR-mak를 쓰레오닌을 생산하는 대장균에 도입하였을 때, 수크로스를 이용하여 성장할 뿐만 아니라, 실제 효율적인 쓰레오닌 생산이 가능한지 확인하기 위하여 통상의 형질전환 방법을 통하여 쓰레오닌 생산주, ABA5G에 도입하였다. 획득된 콜로니에 대하여 PCR 클로닝 법을 통해 수크로스 이용 관련 유전자가 포함된 플라스미드를 갖고있는 콜로니를 획득하였다. 획득한 콜로니를 33℃ 배양기 (incubator)에서 LB 고체 배지 중에 밤새 배양한 후, 표 1의 25 mL 역가 배지에 한 백금이씩 접종한 다음, 이를 33℃, 200 rpm의 배양기에서 30시간 배양하였으며, 이의 결과를 표 3에 나타내었다.
표 3에서 나타난 바와 같이pAcscBKAR 를 포함한 ABA5G균주는 30 시간 배양하였을 경우 18.7 g/L의 수크로스를 이용하고, 6.0 g/L의 L-쓰레오닌을 생산하였으나, pAcscBAR-mak를 포함한 ABA5G 균주는 27.7 g/L의 수크로스를 이용하고 9.7 g/L의 L-쓰레오닌을 생산하였다. 따라서 pAcscBAR-mak가 포함된 ABA5G는 pAcscBKAR을 포함한 ABA5G 균주에 비해 수크로스 이용 속도가 약 1.5 배가량 증가하였으며, 쓰레오닌 생산성도 3.7 g/L 상승하였다.
실시예 7.
cscBAR-mak
도입을 통한 Mak 활성 강화 확인
모균주 ABA5G와 비교하여 pAcscBAR-mak가 포함된 ABA5G 균주에서 만노키나아제의 활성의 증대 또는 강화를 확인하기 위한 하나의 방법으로 프락토카이네이즈 활성 측정(Plant Physiol. (1978) 62:291-294)을 수행하였다. 이 효소 활성 측정법은 프락토오즈를 최초 기질로 하여, 만노키나아제와 포스포글루코스 아이소머라제 (phosphoglucose isomerase) 및 글루코스-6-소프페이트 디하이드라제 (glucose-6-phosphate dehydrogenase)를 이용한 커플링 반응(coupling reaction)을 통하여 만노키나아제의 프락토카이네이즈 활성을 측정할 수 있는 방법이다. 효소액은 LB에서 24시간 배양한 pAcscBAR과 pAcscBAR-mak가 각각 포함된 ABA5G 균주를 소니케이터(sonicator)를 이용하여 파쇄한 후 원심 분리한 상등액을 효소액으로 이용하였으며, 단백질 농도 측정은 브래드포드 분석법 (Bradford assay) (Anal. Biochem. (1976) 72:248-254)을 이용하였다. 효소 반응은 30분간 유지하면서 OD 340 nm에서 흡광도의 변화량을 측정하였고, 이를 통해 커플링 반응에 의해 생성된 NADPH의 양을 측정하였으며, NADPH의 흡광계수 6.22 cm-1 mM-1를 사용하여 활성을 계산하였다. 만노키나아제의 1 unit은 상기의 효소 활성 측정법에 의하여 1 분당 전체 단백질 1 mg에 의해 1 nM의 NADPH를 생성시키는 효소량으로 정의하며, 이의 결과는 표 4에 나타내었다.
표 4에 나타난 바와 같이 pAcscBAR-mak가 포함된 ABA5G의 만노키나아제의 활성은 pAcscBAR만 포함된 ABA5G에 비해 효소 활성이 약 12배 증가 또는 강화 된 것을 확인할 수 있었다.
실시예 8.
cscBAR-mak
의 mutation 도입
수크로스 이용성을 향상시킬 뿐만 아니라 쓰레오닌 생산성을 향상시키기 위하여 하이드록실아민 (Hydroxylamine)을 처리하여 변이된 수크로스 이용성 유전자를 얻는 화학적 무작위 변이법 (chemical random mutagenesis)을 수행하였다 (Methods Enzymol. (1991) 194:302-318). 우선 1 M 하이드록실아민, 2 mM EDTA, 100 mM 소디움 클로라이드 (sodium chloride), 50 mM 소디움 파이로포스페이트 (sodium pyrophosphate) 를 첨가하여 변이유발액 (mutagenesis solution)을 제조한 후, 1 ml 변이유발액에 목적 DNA를 0.2 mg/ml 농도로 25 μl넣었다. pAcscBAR-mak 플라스미드로부터 EagI과 XbaI의 제한 효소를 이용하여, 5887 bp의 cscBAR-mak가 포함된 DNA 조각을 목적 DNA로 이용하였다. 변이유발액을 첨가한 DNA 조각을 75℃에서 30분, 1시간, 2시간, 4시간 마다 500 μl씩 정제컬럼 (purification column)을 이용하여 정제하였다. 하이드록실아민이 처리된 DNA와 EagI과 XbaI의 제한 효소가 처리된 pACYC184 벡터를 T4 DNA 라이게이즈 (ligase)를 이용하여 연결한 후 쓰레오닌 생산주 ABA5G에 형질전환하였다. 형질전환된 균주를 0.1 %의 저농도 수크로스가 포함된 맥콘키 고체 배제에 도말하여 37℃에서 하루 배양 후 진한 자주색을 띠는 콜로니를 선별하였다.
선별된 콜로니들을 표 1의 역가 배지에서 쓰레오닌 생산성과 수크로스 이용속도를 평가하여 최종적으로 쓰레오닌 생산성과 수크로스 이용성이 가장 우수한 한 균주를 선별하였다. 선별된 균주로부터 통상의 플라스미드 미니 프렙법을 이용하여 플라스미드를 얻은 후 염기서열 분석을 수행하였다. 결과적으로 cscR의 388 번째 염기가 C에서 T로 치환되었으며, 그에 따라 130번째 아미노산이 히스티딘에서 타이로신으로 변이가 일어났으며, 이 변이를 가진 수크로스 전사 조절자는 서열번호 17의 염기서열에 의해 암호화된다.
실시예 9. pAcscBAR'-mak도입을 통한 L-쓰레오닌 생산성 향상
cscR 변이 (서열번호 17)가 포함된 pAcscBAR'-mak (서열번호 18) 플라스미드를 ABA5G에 새로 형질전환 하여 플라스크 역가 평가를 수행하였다. 33℃ 배양기에서 LB 고체 배지 중에 밤새 배양한 균주를 표 1의 25 mL 역가 배지에 한 백금이씩 접종한 다음, 이를 33℃, 200 rpm의 배양기에서 30시간 배양하였으며, 이의 결과를 표 5에 나타내었다.
표 5에서 나타난 바와 같이 pAcscBKAR 를 포함한 ABA5G균주는 30 시간 배양하였을 경우 18.7 g/L의 수크로스를 이용하고, 6.0 g/L의 L-쓰레오닌을 생산하였으나, pAcscBAR'-mak를 포함한 ABA5G 균주는 33.4 g/L의 수크로스를 이용하고 12.4 g/L의 L-쓰레오닌을 생산하였다. 즉, pAcscBAR'-mak가 포함된 ABA5G는 pAcscBKAR을 포함한 ABA5G 균주에 비해 수크로스 이용 속도가 약 1.8 배, 쓰레오닌 생산성이 6.4 g/L 상승하였으며, pAcscBAR-mak가 포함된ABA5G에 비해서도 수크로스 이용 속도가 약 1.2 배, 쓰레오닌 생산성이 2.7 g/L 가량 증가하였다. 따라서 cscBAR'-mak을 포함한 재조합 균주의 경우, 수크로스 이용성 및 L-쓰레오닌의 생산성이 향상됨을 확인할 수 있었으며, 상기 형질전환된 미생물을 CA03-0308로 명명하였고, 이를 2008년 12월 23일자로 대한민국 서울특별시 서대문구 홍제 1동 361-221 번지에 소재하는 국제기탁기관인 한국종균협회 부설 한국미생물보존센터에 수탁번호 KCCM10978P로 기탁하였다.
실시예 10. pAcscBAR'-mak도입을 통한 O-석시닐-호모세린 생산성 향상
상기의 실시예 8에서 제작된 pAcscBAR'-mak를 미국특허출원 제 12/062835호에 기재된 O-Succinyl-homoserine 생산균주인 CJM-11A(KCCM-10922P)에 형질전환하여 0.1 %의 저농도 수크로스가 포함된 맥콘키 고체배지에 도말하여 37℃에서 하루 배양 후 진한 자주색을 띠는 콜로니를 선별하였다
선별된 형질전환체를 33℃ 배양기에서 LB 고체 배지 중에 밤새 배양한 균주를 슈크로즈가 함유된 표 1의 25 mL 역가 배지에 한 백금이씩 접종한 다음, 이를 33℃, 200 rpm의 배양기에서 배양하였으며, 이의 결과를 표 6에 나타내었다.
표 6에서 나타낸 바와 같이, 모 균주인 pAcscBKAR을 포함한 CJM-11A 균주는 48시간 배양하였을 경우 30.2 g/L의 수크로스를 이용하고, 12.3 g/L의 O-석시닐-호모세린을 생산하였으나, pAcscBAR'-mak를 포함한 CJM-11A 균주는 50.4 g/L의 수크로스를 이용하고, 20.5 g/L의 O-석시닐-호모세린을 생산하여 pAcscBKAR을 포함한 CJM-11A 에 비해 수크로스 이용 속도가 1.7배 증가하였고, 8.2 g/L의 향상된 O-석시닐-호모세린 생산성을 나타내었다. 따라서 cscBAR'-mak을 포함한 재조합 균주의 경우, 수크로스 이용성 및 O-석시닐-호모세린의 생산성이 향상됨을 확인할 수 있었다.
실시예 11. pAcscBAR'-mak 도입을 통한 O-아세틸-호모세린 생산성 향상
상기의 실시예 8에서 제작된 pAcscBAR'-mak를 미국특허출원 제12/062,927호에 기재된 O-아세틸-호모세린 생산균주인 CJM-X(KCCM-10921P)에 형질전환하여 0.1 %의 저농도 수크로스가 포함된 맥콘키 고체배지에 도말하여 37℃에서 하루 배양 후 진한 자주색을 띠는 콜로니를 선별하였다
선별된 형질전환체를 33℃ 배양기에서 LB 고체 배지 중에 밤새 배양한 균주를 슈크로즈가 함유된 표 1의 25 mL 역가 배지에 한 백금이씩 접종한 다음, 이를 33℃, 200 rpm의 배양기에서 배양하였으며, 이의 결과를 표 7에 나타내었다.
표 7에서 나타낸 바와 같이, 모 균주인 pAcscBKAR을 포함한 CJM-X 균주는 48시간 배양하였을 경우 29.9 g/L의 수크로스를 이용하고, 10.7 g/L의 O-Acetyl-homoserine을 생산하였으나, pAcscBAR'-mak를 포함한 CJM-X 균주는 53.5 g/L의 수크로스를 이용하고, 15.4 g/L의 O-Acetyl-homoserine을 생산하여 pAcscBKAR을 포함한 CJM-X 에 비해 수크로스 이용 속도가 1.8배 증가하였고, 8.8 g/L의 향상된 O-Acetyl-homoserine 생산성을 나타내었다. 따라서 cscBAR'-mak을 포함한 재조합 균주의 경우, 수크로스 이용성 및 O-Acetyl-homoserine의 생산성이 향상됨을 확인할 수 있었다.
실시예 12. pAcscBAR'-mak도입을 통한 L-트립토판 생산성 향상
상기의 실시예 8에서 제작된 pAcscBAR'-mak를 L-트립토판 생산균주인 CJ285에 형질전환하여 0.1 %의 저농도 수크로스가 포함된 맥콘키 고체배지에 도말하여 37℃에서 배양 후 하루 배양 후 진한 자주색을 띠는 콜로니를 선별하였다.
선별된 형질전환체를 37℃ 배양기에서 LB 고체 배지 중에 밤새 배양한 균주를 슈크로즈가 함유된 표 8의 25 mL 역가 배지에 한 백금이씩 접종한 다음, 이를 37℃, 200 rpm의 배양기에서 배양하였으며, 이의 결과를 표 9에 나타내었다.
표 9에서 나타낸 바와 같이, 모 균주인 pAcscBKAR을 포함한 CJ285 균주를 60시간 배양하였을 경우, 24.7 g/L의 수크로스를 이용하고, 4.9 g/L의 L-트립토판을 생산하였으나, pAcscBAR'-mak를 포함한 CJ285균주는 37.1 g/L의 수크로스를 이용하고, 8.9 g/L의 L-트립토판을 생산하여 pAcscBKAR을 포함한 CJ285에 비해 수크로스 이용 속도가 1.5배 증가하였고, 4.0 g/L의 향상된 L-트립토판 생산성을 나타내었다. 따라서 cscBAR'-mak을 포함한 재조합 균주의 경우, 수크로스 이용성 및 L-트립토판의 생산성이 향상됨을 확인할 수 있었다.
이상의 설명으로부터, 본 발명이 속하는 기술분야의 당 업자는 본 발명이 그 기술적 사상이나 필수적 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 실시될 수 있다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 이와 관련하여, 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적인 것이 아닌 것으로서 이해해야만 한다. 본 발명의 범위는 상기 상세한 설명보다는 후술하는 특허 청구범위의 의미 및 범위 그리고 그 등가 개념으로부터 도출되는 모든 변경 또는 변형된 형태가 본 발명의 범위에 포함되는 것으로 해석되어야 한다.
도 1은 scr 레귤론의 개요를 나타낸 도면이다 (J. biotechnol. (2001) 92:133-158). p는 프로모터 (promoters), Ko1 및 Yo2o3는 작동자 (operators), 및 t는 종결자 (terminators)를 의미한다.
도 2는 cscBAR'-mak을 포함하는 재조합 플라스미드 pAcscBAR'-mak의 작제도이다.
<110> CJ CheilJedang Corporation
<120> MICROORGANISMS FOR PRODUCING L-AMINO ACIDS AND PROCESS FOR
PRODUCING L-AMINO ACIDS USING THEM
<130> PA080579/KR
<160> 18
<170> KopatentIn 1.71
<210> 1
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220>
<221> gene
<222> (1)..(30)
<223> primer for amplification of cscBKAR
<400> 1
cttacggccg gagtacattt gagcgactgt 30
<210> 2
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220>
<221> gene
<222> (1)..(30)
<223> primer for amplification of cscBKAR
<400> 2
cgactctaga ctcgttggcg agaacagagg 30
<210> 3
<211> 5179
<212> DNA
<213> Escherichia coli (ATCC9637)
<220>
<221> gene
<222> (1)..(5179)
<223> polynucleotide containing cscBKAR regulon
<400> 3
gagtacattt gagcgactgt accagaacat gaatgaggcg tttggattag gcgattatta 60
gcagggctaa gcattttact attattattt tccggttgag ggatatagag ctatcgacaa 120
caaccggaaa aagtttacgt ctatattgct gaaggtacag gcgtttccat aactatttgc 180
tcgcgttttt tactcaagaa gaaaatgcca aatagcaaca tcaggcagac aatacccgaa 240
attgcgaaga aaactgtctg gtagcctgcg tggtcaaaga gtatcccagt cggcgttgaa 300
agcagcacaa tcccaagcga actggcaatt tgaaaaccaa tcagaaagat cgtcgacgac 360
aggcgcttat caaagtttgc cacgctgtat ttgaagacgg atatgacaca aagtggaacc 420
tcaatggcat gtaacaactt cactaatgaa ataatccagg ggttaacgaa cagcgcgcag 480
gaaaggatac gcaacgccat aatcacaact ccgataagta atgcattttt tggccctacc 540
cgattcacaa agaaaggaat aatcgccatg cacagcgctt cgagtaccac ctggaatgag 600
ttgagataac catacaggcg cgttcctaca tcgtgtgatt cgaataaacc tgaataaaag 660
acaggaaaaa gttgttgatc aaaaatgtta tagaaagacc acgtccccac aataaatatg 720
acgaaaaccc agaagtttcg atccttgaaa actgcgataa aatcctcttt ttttacccct 780
cccgcatctg ccgctacgca ctggtgatcc ttatctttaa aacgcatgtt gatcatcata 840
aatacagcgc caaatagcga gaccaaccag aagttgatat ggggactgat actaaaaaat 900
atgccggcaa agaacgcgcc aatagcatag ccaaaagatc cccaggcgcg cgctgttcca 960
tattcgaaat gaaaatttcg cgccattttt tcggtgaagc tatcaagcaa accgcatccc 1020
gccagatacc cccagccaaa aaacagcgcc cccagaatta gacctacaga aaaattgctt 1080
tgcagtaacg gttcataaac gtaaatcata aacggtccgg tcaagaccag gatgaaactc 1140
atacaccaga tgagcggttt cttcagaccg agtttatcct gaacgatgcc gtagaacatc 1200
ataaatagaa tgctggtaaa ctggttgacc gaataaagtg tacctaattc cgtccctgtc 1260
aaccctagat gtcctttcag ccaaatagcg tataacgacc accacagcga ccaggaaata 1320
aaaaagagaa atgagtaact ggatgcaaaa cgatagtacg catttctgaa tggaatactc 1380
agtgccataa ttacctgcct gtcgttaaaa aattcacgtc ctatttagag ataagagcga 1440
cttcgccgtt tacttctcac tattccagtt cttgtcgaca tggcagcgct gtcattgccc 1500
ctttcgccgt tactgcaagc gctccgcaac gttgagcgag atcgataatt cgtcgcattt 1560
ctctctcatc tgtagataat cccgtagagg acagacctgt gagtaacccg gcaacgaacg 1620
catctcccgc ccccgtgcta tcgacacaat tcacagacat tccagcaaaa tggtgaactt 1680
gtcctcgata acagaccacc accccttctg cacctttagt caccaacagc atggcgatct 1740
catactcttt tgccagggcg catatatcct gatcgttctg tgtttttcca ctgataagtc 1800
gccattcttc ttccgagagc ttgacgacat ccgccagttg tagcgcctgc cgcaaacaca 1860
agcggagcaa atgctcgtct tgccatagat cttcacgaat attaggatcg aagctgacaa 1920
aacctccggc atgccggatc gccgtcatcg cagtaaatgc gctggtacgc gaaggctcgg 1980
cagacaacgc aattgaacag agatgtaacc attcgccatg tcgccagcag ggcaagtctg 2040
tcgtctctaa aaaaagatcg gcactggggc ggaccataaa cgtaaatgaa cgttcccctt 2100
gatcgttcag atcgacaagc accgtggatg tccggtgaca ttcatcttgc ttcagatacg 2160
tgatatcgac tccctcagtt agcagcgttc tttgcattaa cgcaccaaaa ggatcatccc 2220
ccacccgacc tataaaccca cttgttccgc ctaatctggc gattcccacc gcaacgttag 2280
ctggcgcgcc gccaggacaa ggcagtaggc gcccgtctga ttctggcaag agatctacga 2340
ccgcatcccc taaaacccat actttggctg acattttttt cccttaaatt catctgagtt 2400
acgcatagtg ataaacctct ttttcgcaaa atcgtcatgg atttactaaa acatgcatat 2460
tcgatcacaa aacgtcatag ttaacgttaa catttgtgat attcatcgca tttatgaaag 2520
taagggactt tatttttata aaagttaacg ttaacaattc accaaatttg cttaaccagg 2580
atgattaaaa tgacgcaatc tcgattgcat gcggcgcaaa acgccctagc aaaacttcat 2640
gagcaccggg gtaacacttt ctatccccat tttcacctcg cgcctcctgc cgggtggatg 2700
aacgatccaa acggcctgat ctggtttaac gatcgttatc acgcgtttta tcaacatcat 2760
ccgatgagcg aacactgggg gccaatgcac tggggacatg ccaccagcga cgatatgatc 2820
cactggcagc atgagcctat tgcgctagcg ccaggagacg ataatgacaa agacgggtgt 2880
ttttcaggta gtgctgtcga tgacaatggt gtcctctcac ttatctacac cggacacgtc 2940
tggctcgatg gtgcaggtaa tgacgatgca attcgcgaag tacaatgtct ggctaccagt 3000
cgggatggta ttcatctcga gaaacagggt gtgatcctca ctccaccaga aggaatcatg 3060
cacttccgcg atcctaaagt gtggcgtgaa gccgacacat ggtggatggt agtcggggcg 3120
aaagatccag gcaacacggg gcagatcctg ctttatcgcg gcagttcgtt gcgtgaatgg 3180
accttcgatc gcgtactggc ccacgctgat gcgggtgaaa gctatatgtg ggaatgtccg 3240
gactttttca gccttggcga tcagcattat ctgatgtttt ccccgcaggg aatgaatgcc 3300
gagggataca gttaccgaaa tcgctttcaa agtggcgtaa tacccggaat gtggtcgcca 3360
ggacgacttt ttgcacaatc cgggcatttt actgaacttg ataacgggca tgacttttat 3420
gcaccacaaa gctttttagc gaaggatggt cggcgtattg ttatcggctg gatggatatg 3480
tgggaatcgt caatgccctc aaaacgtgaa ggatgggcag gctgcatgac gctggcgcgc 3540
gagctatcag agagcaatgg caaacttcta caacgcccgg tacacgaagc tgagtcgtta 3600
cgccagcagc atcaatctgt ctctccccgc acaatcagca ataaatatgt tttgcaggaa 3660
aacgcgcaag cagttgagat tcagttgcag tgggcgctga agaacagtga tgccgaacat 3720
tacggattac agctcggcac tggaatgcgg ctgtatattg ataaccaatc tgagcgactt 3780
gttttgtggc ggtattaccc acacgagaat ttagacggct accgtagtat tcccctcccg 3840
cagcgtgaca cgctcgccct aaggatattt atcgatacat catccgtgga agtatttatt 3900
aacgacgggg aagcggtgat gagtagtcga atctatccgc agccagaaga acgggaactg 3960
tcgctttatg cctcccacgg agtggctgtg ctgcaacatg gagcactctg gctactgggt 4020
taacataata tcaggtggaa caacggatca acagcgggca agggatccgc gtcactcttc 4080
ccccttcacg accttcaata atatgcaatg cagcttcccg cccgataatg tcatgtggaa 4140
gctgaattgt ggtcagcggc ggtaaaaaca gatgcccgac gccaaccaga ttatcaaagc 4200
ccattacggc gacatcctgc gggattcgta cccccttcgc cagaagaacc tgataagcca 4260
caaaggctgc gcgatcgtta ccacatatca gaacatcaaa atctggtttg cccggtttga 4320
agtgggcatt gagtaaactt gcgagatcgg tgtagtgatc atcacctgtt gccatgtgaa 4380
attgtttcac ctcagccaga tctcgttcag catcacgcca ggcctgctca aatccctgcc 4440
gacgataccc tgttgccaac gcactttccg gtagccagaa gcataacggt tgacgatagc 4500
ccgccgcgag caaatgctgt gttgattcat attgtgcagt gtaatcatca gggatataac 4560
tgggtaacgc tgggtcatcc gccacacagt tcgccaatac aatattttca ccatacagag 4620
actcaggcag cgtgatatgt cgcagcccca ttgtagtata gataatgcca tccggacggt 4680
gggcaagcag ctgacgtgcc gcgcgggcag cgtcatcttc agaaaaaata ttgattaaaa 4740
aactattcca gccgaactcg ctggcggttt gctcaatggc aagcagaata tcaacagaga 4800
aaggagtggt agccgtgtcc tgcgccagca cggcgagagt cgacggctta cgtccttgag 4860
cgcgcatctt acgggcggaa agatcaggaa cataattcag ggtctggatt gcctgcaata 4920
cgcggtcacg cgttgcagga cgcacagatt ctgcattatg catcacccgg gagactgtca 4980
tcatcgacac tcccgccagg cgtgcgacat cctttaatga agccataccc aagccgtttg 5040
ccgtaaaacg ggcactgtag cagaaacaga cgtcactggc gagatccaac gccctatcac 5100
ctgacacagc aatacaataa aaaataacaa taattcccgg acaattgtcc ccagttccgc 5160
ctctgttctc gccaacgag 5179
<210> 4
<211> 1248
<212> DNA
<213> Escherichia coli (ATCC9637)
<220>
<221> gene
<222> (1)..(1248)
<223> cscB
<400> 4
atggcactga gtattccatt cagaaatgcg tactatcgtt ttgcatccag ttactcattt 60
ctctttttta tttcctggtc gctgtggtgg tcgttatacg ctatttggct gaaaggacat 120
ctagggttga cagggacgga attaggtaca ctttattcgg tcaaccagtt taccagcatt 180
ctatttatga tgttctacgg catcgttcag gataaactcg gtctgaagaa accgctcatc 240
tggtgtatga gtttcatcct ggtcttgacc ggaccgttta tgatttacgt ttatgaaccg 300
ttactgcaaa gcaatttttc tgtaggtcta attctggggg cgctgttttt tggctggggg 360
tatctggcgg gatgcggttt gcttgatagc ttcaccgaaa aaatggcgcg aaattttcat 420
ttcgaatatg gaacagcgcg cgcctgggga tcttttggct atgctattgg cgcgttcttt 480
gccggcatat tttttagtat cagtccccat atcaacttct ggttggtctc gctatttggc 540
gctgtattta tgatgatcaa catgcgtttt aaagataagg atcaccagtg cgtagcggca 600
gatgcgggag gggtaaaaaa agaggatttt atcgcagttt tcaaggatcg aaacttctgg 660
gttttcgtca tatttattgt ggggacgtgg tctttctata acatttttga tcaacaactt 720
tttcctgtct tttattcagg tttattcgaa tcacacgatg taggaacgcg cctgtatggt 780
tatctcaact cattccaggt ggtactcgaa gcgctgtgca tggcgattat tcctttcttt 840
gtgaatcggg tagggccaaa aaatgcatta cttatcggag ttgtgattat ggcgttgcgt 900
atcctttcct gcgcgctgtt cgttaacccc tggattattt cattagtgaa gttgttacat 960
gccattgagg ttccactttg tgtcatatcc gtcttcaaat acagcgtggc aaactttgat 1020
aagcgcctgt cgtcgacgat ctttctgatt ggttttcaaa ttgccagttc gcttgggatt 1080
gtgctgcttt caacgccgac tgggatactc tttgaccacg caggctacca gacagttttc 1140
ttcgcaattt cgggtattgt ctgcctgatg ttgctatttg gcattttctt cttgagtaaa 1200
aaacgcgagc aaatagttat ggaaacgcct gtaccttcag caatatag 1248
<210> 5
<211> 915
<212> DNA
<213> Escherichia coli (ATCC9637)
<220>
<221> gene
<222> (1)..(915)
<223> cscK
<400> 5
atgtcagcca aagtatgggt tttaggggat gcggtcgtag atctcttgcc agaatcagac 60
gggcgcctac tgccttgtcc tggcggcgcg ccagctaacg ttgcggtggg aatcgccaga 120
ttaggcggaa caagtgggtt tataggtcgg gtgggggatg atccttttgg tgcgttaatg 180
caaagaacgc tgctaactga gggagtcgat atcacgtatc tgaagcaaga tgaatgtcac 240
cggacatcca cggtgcttgt cgatctgaac gatcaagggg aacgttcatt tacgtttatg 300
gtccgcccca gtgccgatct ttttttagag acgacagact tgccctgctg gcgacatggc 360
gaatggttac atctctgttc aattgcgttg tctgccgagc cttcgcgtac cagcgcattt 420
actgcgatga cggcgatccg gcatgccgga ggttttgtca gcttcgatcc taatattcgt 480
gaagatctat ggcaagacga gcatttgctc cgcttgtgtt tgcggcaggc gctacaactg 540
gcggatgtcg tcaagctctc ggaagaagaa tggcgactta tcagtggaaa aacacagaac 600
gatcaggata tatgcgccct ggcaaaagag tatgagatcg ccatgctgtt ggtgactaaa 660
ggtgcagaag gggtggtggt ctgttatcga ggacaagttc accattttgc tggaatgtct 720
gtgaattgtg tcgatagcac gggggcggga gatgcgttcg ttgccgggtt actcacaggt 780
ctgtcctcta cgggattatc tacagatgag agagaaatgc gacgaattat cgatctcgct 840
caacgttgcg gagcgcttgc agtaacggcg aaaggggcaa tgacagcgct gccatgtcga 900
caagaactgg aatag 915
<210> 6
<211> 1443
<212> DNA
<213> Escherichia coli (ATCC9637)
<220>
<221> gene
<222> (1)..(1443)
<223> cscA
<400> 6
atgattaaaa tgacgcaatc tcgattgcat gcggcgcaaa acgccctagc aaaacttcat 60
gagcaccggg gtaacacttt ctatccccat tttcacctcg cgcctcctgc cgggtggatg 120
aacgatccaa acggcctgat ctggtttaac gatcgttatc acgcgtttta tcaacatcat 180
ccgatgagcg aacactgggg gccaatgcac tggggacatg ccaccagcga cgatatgatc 240
cactggcagc atgagcctat tgcgctagcg ccaggagacg ataatgacaa agacgggtgt 300
ttttcaggta gtgctgtcga tgacaatggt gtcctctcac ttatctacac cggacacgtc 360
tggctcgatg gtgcaggtaa tgacgatgca attcgcgaag tacaatgtct ggctaccagt 420
cgggatggta ttcatctcga gaaacagggt gtgatcctca ctccaccaga aggaatcatg 480
cacttccgcg atcctaaagt gtggcgtgaa gccgacacat ggtggatggt agtcggggcg 540
aaagatccag gcaacacggg gcagatcctg ctttatcgcg gcagttcgtt gcgtgaatgg 600
accttcgatc gcgtactggc ccacgctgat gcgggtgaaa gctatatgtg ggaatgtccg 660
gactttttca gccttggcga tcagcattat ctgatgtttt ccccgcaggg aatgaatgcc 720
gagggataca gttaccgaaa tcgctttcaa agtggcgtaa tacccggaat gtggtcgcca 780
ggacgacttt ttgcacaatc cgggcatttt actgaacttg ataacgggca tgacttttat 840
gcaccacaaa gctttttagc gaaggatggt cggcgtattg ttatcggctg gatggatatg 900
tgggaatcgt caatgccctc aaaacgtgaa ggatgggcag gctgcatgac gctggcgcgc 960
gagctatcag agagcaatgg caaacttcta caacgcccgg tacacgaagc tgagtcgtta 1020
cgccagcagc atcaatctgt ctctccccgc acaatcagca ataaatatgt tttgcaggaa 1080
aacgcgcaag cagttgagat tcagttgcag tgggcgctga agaacagtga tgccgaacat 1140
tacggattac agctcggcac tggaatgcgg ctgtatattg ataaccaatc tgagcgactt 1200
gttttgtggc ggtattaccc acacgagaat ttagacggct accgtagtat tcccctcccg 1260
cagcgtgaca cgctcgccct aaggatattt atcgatacat catccgtgga agtatttatt 1320
aacgacgggg aagcggtgat gagtagtcga atctatccgc agccagaaga acgggaactg 1380
tcgctttatg cctcccacgg agtggctgtg ctgcaacatg gagcactctg gctactgggt 1440
taa 1443
<210> 7
<211> 996
<212> DNA
<213> Escherichia coli (ATCC9637)
<220>
<221> gene
<222> (1)..(996)
<223> cscR
<400> 7
atggcttcat taaaggatgt cgcacgcctg gcgggagtgt cgatgatgac agtctcccgg 60
gtgatgcata atgcagaatc tgtgcgtcct gcaacgcgtg accgcgtatt gcaggcaatc 120
cagaccctga attatgttcc tgatctttcc gcccgtaaga tgcgcgctca aggacgtaag 180
ccgtcgactc tcgccgtgct ggcgcaggac acggctacca ctcctttctc tgttgatatt 240
ctgcttgcca ttgagcaaac cgccagcgag ttcggctgga atagtttttt aatcaatatt 300
ttttctgaag atgacgctgc ccgcgcggca cgtcagctgc ttgcccaccg tccggatggc 360
attatctata ctacaatggg gctgcgacat atcacgctgc ctgagtctct gtatggtgaa 420
aatattgtat tggcgaactg tgtggcggat gacccagcgt tacccagtta tatccctgat 480
gattacactg cacaatatga atcaacacag catttgctcg cggcgggcta tcgtcaaccg 540
ttatgcttct ggctaccgga aagtgcgttg gcaacagggt atcgtcggca gggatttgag 600
caggcctggc gtgatgctga acgagatctg gctgaggtga aacaatttca catggcaaca 660
ggtgatgatc actacaccga tctcgcaagt ttactcaatg cccacttcaa accgggcaaa 720
ccagattttg atgttctgat atgtggtaac gatcgcgcag cctttgtggc ttatcaggtt 780
cttctggcga agggggtacg aatcccgcag gatgtcgccg taatgggctt tgataatctg 840
gttggcgtcg ggcatctgtt tttaccgccg ctgaccacaa ttcagcttcc acatgacatt 900
atcgggcggg aagctgcatt gcatattatt gaaggtcgtg aagggggaag agtgacgcgg 960
atcccttgcc cgctgttgat ccgttgttcc acctga 996
<210> 8
<211> 71
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220>
<221> gene
<222> (1)..(71)
<223> primer for deletion cassette of mak
<400> 8
gtgcgtatag gtatcgattt aggcggcacc aaaactgaag tgattgcact gttgcagcat 60
tacacgtctt g 71
<210> 9
<211> 71
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220>
<221> gene
<222> (1)..(71)
<223> primer for deletion cassette of mak
<400> 9
ttactcttgt ggccataacc acgcagcgcc gcgtacgccg ctggaatcac cacttaacgg 60
ctgacatggg a 71
<210> 10
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220>
<221> gene
<222> (1)..(55)
<223> primer for amplification of cscB to construct pAcscBAR
<400> 10
cgcgatatct agcatatgcc gggtaccgca ctagttgaga agtaaacggc gaagt 55
<210> 11
<211> 46
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220>
<221> gene
<222> (1)..(46)
<223> primer for amplification of cscB to construct pAcscBAR
<400> 11
attcggccgg agccctgcag gtgcacgagt acatttgagc gactgt 46
<210> 12
<211> 4520
<212> DNA
<213> Escherichia coli (ATCC9637)
<220>
<221> gene
<222> (1)..(4520)
<223> polynucleotide containing cscBAR
<400> 12
gagccctgca ggtgcacgag tacatttgag cgactgtacc agaacatgaa tgaggcgttt 60
ggattaggcg attattagca gggctaagca ttttactatt attattttcc ggttgaggga 120
tatagagcta tcgacaacaa ccggaaaaag tttacgtcta tattgctgaa ggtacaggcg 180
tttccataac tatttgctcg cgttttttac tcaagaagaa aatgccaaat agcaacatca 240
ggcagacaat acccgaaatt gcgaagaaaa ctgtctggta gcctgcgtgg tcaaagagta 300
tcccagtcgg cgttgaaagc agcacaatcc caagcgaact ggcaatttga aaaccaatca 360
gaaagatcgt cgacgacagg cgcttatcaa agtttgccac gctgtatttg aagacggata 420
tgacacaaag tggaacctca atggcatgta acaacttcac taatgaaata atccaggggt 480
taacgaacag cgcgcaggaa aggatacgca acgccataat cacaactccg ataagtaatg 540
cattttttgg ccctacccga ttcacaaaga aaggaataat cgccatgcac agcgcttcga 600
gtaccacctg gaatgagttg agataaccat acaggcgcgt tcctacatcg tgtgattcga 660
ataaacctga ataaaagaca ggaaaaagtt gttgatcaaa aatgttatag aaagaccacg 720
tccccacaat aaatatgacg aaaacccaga agtttcgatc cttgaaaact gcgataaaat 780
cctctttttt tacccctccc gcatctgccg ctacgcactg gtgatcctta tctttaaaac 840
gcatgttgat catcataaat acagcgccaa atagcgagac caaccagaag ttgatatggg 900
gactgatact aaaaaatatg ccggcaaaga acgcgccaat agcatagcca aaagatcccc 960
aggcgcgcgc tgttccatat tcgaaatgaa aatttcgcgc cattttttcg gtgaagctat 1020
caagcaaacc gcatcccgcc agataccccc agccaaaaaa cagcgccccc agaattagac 1080
ctacagaaaa attgctttgc agtaacggtt cataaacgta aatcataaac ggtccggtca 1140
agaccaggat gaaactcata caccagatga gcggtttctt cagaccgagt ttatcctgaa 1200
cgatgccgta gaacatcata aatagaatgc tggtaaactg gttgaccgaa taaagtgtac 1260
ctaattccgt ccctgtcaac cctagatgtc ctttcagcca aatagcgtat aacgaccacc 1320
acagcgacca ggaaataaaa aagagaaatg agtaactgga tgcaaaacga tagtacgcat 1380
ttctgaatgg aatactcagt gccataatta cctgcctgtc gttaaaaaat tcacgtccta 1440
tttagagata agagcgactt cgccgtttac ttctcaacta gtgcggtacc cggcatatgc 1500
tagatatcga ctccctcagt tagcagcgtt ctttgcatta acgcaccaaa aggatcatcc 1560
cccacccgac ctataaaccc acttgttccg cctaatctgg cgattcccac cgcaacgtta 1620
gctggcgcgc cgccaggaca aggcagtagg cgcccgtctg attctggcaa gagatctacg 1680
accgcatccc ctaaaaccca tactttggct gacatttttt tcccttaaat tcatctgagt 1740
tacgcatagt gataaacctc tttttcgcaa aatcgtcatg gatttactaa aacatgcata 1800
ttcgatcaca aaacgtcata gttaacgtta acatttgtga tattcatcgc atttatgaaa 1860
gtaagggact ttatttttat aaaagttaac gttaacaatt caccaaattt gcttaaccag 1920
gatgattaaa atgacgcaat ctcgattgca tgcggcgcaa aacgccctag caaaacttca 1980
tgagcaccgg ggtaacactt tctatcccca ttttcacctc gcgcctcctg ccgggtggat 2040
gaacgatcca aacggcctga tctggtttaa cgatcgttat cacgcgtttt atcaacatca 2100
tccgatgagc gaacactggg ggccaatgca ctggggacat gccaccagcg acgatatgat 2160
ccactggcag catgagccta ttgcgctagc gccaggagac gataatgaca aagacgggtg 2220
tttttcaggt agtgctgtcg atgacaatgg tgtcctctca cttatctaca ccggacacgt 2280
ctggctcgat ggtgcaggta atgacgatgc aattcgcgaa gtacaatgtc tggctaccag 2340
tcgggatggt attcatctcg agaaacaggg tgtgatcctc actccaccag aaggaatcat 2400
gcacttccgc gatcctaaag tgtggcgtga agccgacaca tggtggatgg tagtcggggc 2460
gaaagatcca ggcaacacgg ggcagatcct gctttatcgc ggcagttcgt tgcgtgaatg 2520
gaccttcgat cgcgtactgg cccacgctga tgcgggtgaa agctatatgt gggaatgtcc 2580
ggactttttc agccttggcg atcagcatta tctgatgttt tccccgcagg gaatgaatgc 2640
cgagggatac agttaccgaa atcgctttca aagtggcgta atacccggaa tgtggtcgcc 2700
aggacgactt tttgcacaat ccgggcattt tactgaactt gataacgggc atgactttta 2760
tgcaccacaa agctttttag cgaaggatgg tcggcgtatt gttatcggct ggatggatat 2820
gtgggaatcg tcaatgccct caaaacgtga aggatgggca ggctgcatga cgctggcgcg 2880
cgagctatca gagagcaatg gcaaacttct acaacgcccg gtacacgaag ctgagtcgtt 2940
acgccagcag catcaatctg tctctccccg cacaatcagc aataaatatg ttttgcagga 3000
aaacgcgcaa gcagttgaga ttcagttgca gtgggcgctg aagaacagtg atgccgaaca 3060
ttacggatta cagctcggca ctggaatgcg gctgtatatt gataaccaat ctgagcgact 3120
tgttttgtgg cggtattacc cacacgagaa tttagacggc taccgtagta ttcccctccc 3180
gcagcgtgac acgctcgccc taaggatatt tatcgataca tcatccgtgg aagtatttat 3240
taacgacggg gaagcggtga tgagtagtcg aatctatccg cagccagaag aacgggaact 3300
gtcgctttat gcctcccacg gagtggctgt gctgcaacat ggagcactct ggctactggg 3360
ttaacataat atcaggtgga acaacggatc aacagcgggc aagggatccg cgtcactctt 3420
cccccttcac gaccttcaat aatatgcaat gcagcttccc gcccgataat gtcatgtgga 3480
agctgaattg tggtcagcgg cggtaaaaac agatgcccga cgccaaccag attatcaaag 3540
cccattacgg cgacatcctg cgggattcgt acccccttcg ccagaagaac ctgataagcc 3600
acaaaggctg cgcgatcgtt accacatatc agaacatcaa aatctggttt gcccggtttg 3660
aagtgggcat tgagtaaact tgcgagatcg gtgtagtgat catcacctgt tgccatgtga 3720
aattgtttca cctcagccag atctcgttca gcatcacgcc aggcctgctc aaatccctgc 3780
cgacgatacc ctgttgccaa cgcactttcc ggtagccaga agcataacgg ttgacgatag 3840
cccgccgcga gcaaatgctg tgttgattca tattgtgcag tgtaatcatc agggatataa 3900
ctgggtaacg ctgggtcatc cgccacacag ttcgccaata caatattttc accatacaga 3960
gactcaggca gcgtgatatg tcgcagcccc attgtagtat agataatgcc atccggacgg 4020
tgggcaagca gctgacgtgc cgcgcgggca gcgtcatctt cagaaaaaat attgattaaa 4080
aaactattcc agccgaactc gctggcggtt tgctcaatgg caagcagaat atcaacagag 4140
aaaggagtgg tagccgtgtc ctgcgccagc acggcgagag tcgacggctt acgtccttga 4200
gcgcgcatct tacgggcgga aagatcagga acataattca gggtctggat tgcctgcaat 4260
acgcggtcac gcgttgcagg acgcacagat tctgcattat gcatcacccg ggagactgtc 4320
atcatcgaca ctcccgccag gcgtgcgaca tcctttaatg aagccatacc caagccgttt 4380
gccgtaaaac gggcactgta gcagaaacag acgtcactgg cgagatccaa cgccctatca 4440
cctgacacag caatacaata aaaaataaca ataattcccg gacaattgtc cccagttccg 4500
cctctgttct cgccaacgag 4520
<210> 13
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220>
<221> gene
<222> (1)..(13)
<223> primer for amplification of mak released from reference sequence,
AP009048 on GeneBank
<400> 13
cactgcagtg gggtaaatgc catcg 25
<210> 14
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220>
<221> gene
<222> (1)..(14)
<223> primer for amplification of mak released from reference sequence,
AP009048 on GeneBank
<400> 14
aacggccgtc tcggtgctca ttact 25
<210> 15
<211> 1388
<212> DNA
<213> Escherichia coli K12 W3110
<220>
<221> gene
<222> (1)..(1388)
<223> polynucleotide containing mak, amplified using sequence number 13
and 14
<400> 15
cactgcagtg gggtaaatgc catcgaggct agctgttttt ccatctcttc tgcacgcagc 60
gaaatctcgc ggctaagacg gtaaaccatt aaatttttga accacagcat gataatttcc 120
acggccttgt cgttaaattt agcgggcatg ataacgaatt gtcggcggcc ttgcattgcc 180
aatccggttg tccgtctcta cgctattgat attgaaaaaa ataaggagag taccgtgcgt 240
ataggtatcg atttaggcgg caccaaaact gaagtgattg cactgggcga tgcaggggag 300
cagttgtacc gccatcgtct gcccacgccg cgtgatgatt accggcagac tattgaaacg 360
atcgccacgt tggttgatat ggcggagcag gcgacggggc agcgcggaac ggtaggtatg 420
ggcattcctg gctcaatttc gccttacacc ggtgtggtga agaatgccaa ttcaacctgg 480
ctcaacggtc agccattcga taaagactta agcgcgaggt tgcagcggga agtgcggctg 540
gcaaatgacg ctaactgtct ggcggtttca gaagcagtag atggcgcggc agcgggagcg 600
cagacggtat ttgccgtgat tatcggcacg ggatgcggcg cgggcgtggc attcaatggg 660
cgggcgcata tcggcggcaa tggcacggca ggtgagtggg gacacaatcc gctaccgtgg 720
atggacgaag acgaactgcg ttatcgcgag gaagtccctt gttattgcgg taaacaaggt 780
tgtattgaaa cctttatttc gggcacggga ttcgcgatgg attatcgtcg tttgagcgga 840
catgcgctga aaggcagtga aattatccgc ctggttgaag aaagcgatcc ggtagcggaa 900
ctggcattgc gtcgctacga gctgcggctg gcaaaatcgc tggcacatgt cgtgaatatt 960
ctcgatccgg atgtgattgt cctggggggc gggatgagca atgtagaccg tttatatcaa 1020
acggttgggc agttgattaa acaatttgtc ttcggcggcg aatgtgaaac gccggtgcgt 1080
aaggcgaagc acggtgattc cagcggcgta cgcggcgctg cgtggttatg gccacaagag 1140
taaaaaacgt aggcaattgg cgcatcatgc ctgatgcgac gcttgccgcg tcttatcagg 1200
cctacaaaag gtgccagaac cgtaggccgg ataaggcgtt cacgccgcat ccggcaataa 1260
gtgctccgat gcctgatgcg acgcttgccg cgtcttatca ggcctgcaaa atgtgccaga 1320
accgcgtagg gcggataagg cgttcacgcc gcatccggca ataagtaatg agcaccgaga 1380
cggccgtt 1388
<210> 16
<211> 5887
<212> DNA
<213> Escherichia coli (ATCC9637) and K12 W3110
<220>
<221> gene
<222> (1)..(5887)
<223> polynucleotide containing cscBAR-mak
<400> 16
tctcggtgct cattacttat tgccggatgc ggcgtgaacg ccttatccgc cctacgcggt 60
tctggcacat tttgcaggcc tgataagacg cggcaagcgt cgcatcaggc atcggagcac 120
ttattgccgg atgcggcgtg aacgccttat ccggcctacg gttctggcac cttttgtagg 180
cctgataaga cgcggcaagc gtcgcatcag gcatgatgcg ccaattgcct acgtttttta 240
ctcttgtggc cataaccacg cagcgccgcg tacgccgctg gaatcaccgt gcttcgcctt 300
acgcaccggc gtttcacatt cgccgccgaa gacaaattgt ttaatcaact gcccaaccgt 360
ttgatataaa cggtctacat tgctcatccc gccccccagg acaatcacat ccggatcgag 420
aatattcacg acatgtgcca gcgattttgc cagccgcagc tcgtagcgac gcaatgccag 480
ttccgctacc ggatcgcttt cttcaaccag gcggataatt tcactgcctt tcagcgcatg 540
tccgctcaaa cgacgataat ccatcgcgaa tcccgtgccc gaaataaagg tttcaataca 600
accttgttta ccgcaataac aagggacttc ctcgcgataa cgcagttcgt cttcgtccat 660
ccacggtagc ggattgtgtc cccactcacc tgccgtgcca ttgccgccga tatgcgcccg 720
cccattgaat gccacgcccg cgccgcatcc cgtgccgata atcacggcaa ataccgtctg 780
cgctcccgct gccgcgccat ctactgcttc tgaaaccgcc agacagttag cgtcatttgc 840
cagccgcact tcccgctgca acctcgcgct taagtcttta tcgaatggct gaccgttgag 900
ccaggttgaa ttggcattct tcaccacacc ggtgtaaggc gaaattgagc caggaatgcc 960
catacctacc gttccgcgct gccccgtcgc ctgctccgcc atatcaacca acgtggcgat 1020
cgtttcaata gtctgccggt aatcatcacg cggcgtgggc agacgatggc ggtacaactg 1080
ctcccctgca tcgcccagtg caatcacttc agttttggtg ccgcctaaat cgatacctat 1140
acgcacggta ctctccttat ttttttcaat atcaatagcg tagagacgga caaccggatt 1200
ggcaatgcaa ggccgccgac aattcgttat catgcccgct aaatttaacg acaaggccgt 1260
ggaaattatc atgctgtggt tcaaaaattt aatggtttac cgtcttagcc gcgagatttc 1320
gctgcgtgca gaagagatgg aaaaacagct agcctcgatg gcatttaccc cactgcaggt 1380
gcacgagtac atttgagcga ctgtaccaga acatgaatga ggcgtttgga ttaggcgatt 1440
attagcaggg ctaagcattt tactattatt attttccggt tgagggatat agagctatcg 1500
acaacaaccg gaaaaagttt acgtctatat tgctgaaggt acaggcgttt ccataactat 1560
ttgctcgcgt tttttactca agaagaaaat gccaaatagc aacatcaggc agacaatacc 1620
cgaaattgcg aagaaaactg tctggtagcc tgcgtggtca aagagtatcc cagtcggcgt 1680
tgaaagcagc acaatcccaa gcgaactggc aatttgaaaa ccaatcagaa agatcgtcga 1740
cgacaggcgc ttatcaaagt ttgccacgct gtatttgaag acggatatga cacaaagtgg 1800
aacctcaatg gcatgtaaca acttcactaa tgaaataatc caggggttaa cgaacagcgc 1860
gcaggaaagg atacgcaacg ccataatcac aactccgata agtaatgcat tttttggccc 1920
tacccgattc acaaagaaag gaataatcgc catgcacagc gcttcgagta ccacctggaa 1980
tgagttgaga taaccataca ggcgcgttcc tacatcgtgt gattcgaata aacctgaata 2040
aaagacagga aaaagttgtt gatcaaaaat gttatagaaa gaccacgtcc ccacaataaa 2100
tatgacgaaa acccagaagt ttcgatcctt gaaaactgcg ataaaatcct ctttttttac 2160
ccctcccgca tctgccgcta cgcactggtg atccttatct ttaaaacgca tgttgatcat 2220
cataaataca gcgccaaata gcgagaccaa ccagaagttg atatggggac tgatactaaa 2280
aaatatgccg gcaaagaacg cgccaatagc atagccaaaa gatccccagg cgcgcgctgt 2340
tccatattcg aaatgaaaat ttcgcgccat tttttcggtg aagctatcaa gcaaaccgca 2400
tcccgccaga tacccccagc caaaaaacag cgcccccaga attagaccta cagaaaaatt 2460
gctttgcagt aacggttcat aaacgtaaat cataaacggt ccggtcaaga ccaggatgaa 2520
actcatacac cagatgagcg gtttcttcag accgagttta tcctgaacga tgccgtagaa 2580
catcataaat agaatgctgg taaactggtt gaccgaataa agtgtaccta attccgtccc 2640
tgtcaaccct agatgtcctt tcagccaaat agcgtataac gaccaccaca gcgaccagga 2700
aataaaaaag agaaatgagt aactggatgc aaaacgatag tacgcatttc tgaatggaat 2760
actcagtgcc ataattacct gcctgtcgtt aaaaaattca cgtcctattt agagataaga 2820
gcgacttcgc cgtttacttc tcaactagtg cggtacccgg catatgctag atatcgactc 2880
cctcagttag cagcgttctt tgcattaacg caccaaaagg atcatccccc acccgaccta 2940
taaacccact tgttccgcct aatctggcga ttcccaccgc aacgttagct ggcgcgccgc 3000
caggacaagg cagtaggcgc ccgtctgatt ctggcaagag atctacgacc gcatccccta 3060
aaacccatac tttggctgac atttttttcc cttaaattca tctgagttac gcatagtgat 3120
aaacctcttt ttcgcaaaat cgtcatggat ttactaaaac atgcatattc gatcacaaaa 3180
cgtcatagtt aacgttaaca tttgtgatat tcatcgcatt tatgaaagta agggacttta 3240
tttttataaa agttaacgtt aacaattcac caaatttgct taaccaggat gattaaaatg 3300
acgcaatctc gattgcatgc ggcgcaaaac gccctagcaa aacttcatga gcaccggggt 3360
aacactttct atccccattt tcacctcgcg cctcctgccg ggtggatgaa cgatccaaac 3420
ggcctgatct ggtttaacga tcgttatcac gcgttttatc aacatcatcc gatgagcgaa 3480
cactgggggc caatgcactg gggacatgcc accagcgacg atatgatcca ctggcagcat 3540
gagcctattg cgctagcgcc aggagacgat aatgacaaag acgggtgttt ttcaggtagt 3600
gctgtcgatg acaatggtgt cctctcactt atctacaccg gacacgtctg gctcgatggt 3660
gcaggtaatg acgatgcaat tcgcgaagta caatgtctgg ctaccagtcg ggatggtatt 3720
catctcgaga aacagggtgt gatcctcact ccaccagaag gaatcatgca cttccgcgat 3780
cctaaagtgt ggcgtgaagc cgacacatgg tggatggtag tcggggcgaa agatccaggc 3840
aacacggggc agatcctgct ttatcgcggc agttcgttgc gtgaatggac cttcgatcgc 3900
gtactggccc acgctgatgc gggtgaaagc tatatgtggg aatgtccgga ctttttcagc 3960
cttggcgatc agcattatct gatgttttcc ccgcagggaa tgaatgccga gggatacagt 4020
taccgaaatc gctttcaaag tggcgtaata cccggaatgt ggtcgccagg acgacttttt 4080
gcacaatccg ggcattttac tgaacttgat aacgggcatg acttttatgc accacaaagc 4140
tttttagcga aggatggtcg gcgtattgtt atcggctgga tggatatgtg ggaatcgtca 4200
atgccctcaa aacgtgaagg atgggcaggc tgcatgacgc tggcgcgcga gctatcagag 4260
agcaatggca aacttctaca acgcccggta cacgaagctg agtcgttacg ccagcagcat 4320
caatctgtct ctccccgcac aatcagcaat aaatatgttt tgcaggaaaa cgcgcaagca 4380
gttgagattc agttgcagtg ggcgctgaag aacagtgatg ccgaacatta cggattacag 4440
ctcggcactg gaatgcggct gtatattgat aaccaatctg agcgacttgt tttgtggcgg 4500
tattacccac acgagaattt agacggctac cgtagtattc ccctcccgca gcgtgacacg 4560
ctcgccctaa ggatatttat cgatacatca tccgtggaag tatttattaa cgacggggaa 4620
gcggtgatga gtagtcgaat ctatccgcag ccagaagaac gggaactgtc gctttatgcc 4680
tcccacggag tggctgtgct gcaacatgga gcactctggc tactgggtta acataatatc 4740
aggtggaaca acggatcaac agcgggcaag ggatccgcgt cactcttccc ccttcacgac 4800
cttcaataat atgcaatgca gcttcccgcc cgataatgtc atgtggaagc tgaattgtgg 4860
tcagcggcgg taaaaacaga tgcccgacgc caaccagatt atcaaagccc attacggcga 4920
catcctgcgg gattcgtacc cccttcgcca gaagaacctg ataagccaca aaggctgcgc 4980
gatcgttacc acatatcaga acatcaaaat ctggtttgcc cggtttgaag tgggcattga 5040
gtaaacttgc gagatcggtg tagtgatcat cacctgttgc catgtgaaat tgtttcacct 5100
cagccagatc tcgttcagca tcacgccagg cctgctcaaa tccctgccga cgataccctg 5160
ttgccaacgc actttccggt agccagaagc ataacggttg acgatagccc gccgcgagca 5220
aatgctgtgt tgattcatat tgtgcagtgt aatcatcagg gatataactg ggtaacgctg 5280
ggtcatccgc cacacagttc gccaatacaa tattttcacc atacagagac tcaggcagcg 5340
tgatatgtcg cagccccatt gtagtataga taatgccatc cggacggtgg gcaagcagct 5400
gacgtgccgc gcgggcagcg tcatcttcag aaaaaatatt gattaaaaaa ctattccagc 5460
cgaactcgct ggcggtttgc tcaatggcaa gcagaatatc aacagagaaa ggagtggtag 5520
ccgtgtcctg cgccagcacg gcgagagtcg acggcttacg tccttgagcg cgcatcttac 5580
gggcggaaag atcaggaaca taattcaggg tctggattgc ctgcaatacg cggtcacgcg 5640
ttgcaggacg cacagattct gcattatgca tcacccggga gactgtcatc atcgacactc 5700
ccgccaggcg tgcgacatcc tttaatgaag ccatacccaa gccgtttgcc gtaaaacggg 5760
cactgtagca gaaacagacg tcactggcga gatccaacgc cctatcacct gacacagcaa 5820
tacaataaaa aataacaata attcccggac aattgtcccc agttccgcct ctgttctcgc 5880
caacgag 5887
<210> 17
<211> 996
<212> DNA
<213> Escherichia coli (ATCC9637)
<220>
<221> gene
<222> (1)..(996)
<223> cscR mutated tyrosine on 388th amino acid
<400> 17
atggcttcat taaaggatgt cgcacgcctg gcgggagtgt cgatgatgac agtctcccgg 60
gtgatgcata atgcagaatc tgtgcgtcct gcaacgcgtg accgcgtatt gcaggcaatc 120
cagaccctga attatgttcc tgatctttcc gcccgtaaga tgcgcgctca aggacgtaag 180
ccgtcgactc tcgccgtgct ggcgcaggac acggctacca ctcctttctc tgttgatatt 240
ctgcttgcca ttgagcaaac cgccagcgag ttcggctgga atagtttttt aatcaatatt 300
ttttctgaag atgacgctgc ccgcgcggca cgtcagctgc ttgcccaccg tccggatggc 360
attatctata ctacaatggg gctgcgatat atcacgctgc ctgagtctct gtatggtgaa 420
aatattgtat tggcgaactg tgtggcggat gacccagcgt tacccagtta tatccctgat 480
gattacactg cacaatatga atcaacacag catttgctcg cggcgggcta tcgtcaaccg 540
ttatgcttct ggctaccgga aagtgcgttg gcaacagggt atcgtcggca gggatttgag 600
caggcctggc gtgatgctga acgagatctg gctgaggtga aacaatttca catggcaaca 660
ggtgatgatc actacaccga tctcgcaagt ttactcaatg cccacttcaa accgggcaaa 720
ccagattttg atgttctgat atgtggtaac gatcgcgcag cctttgtggc ttatcaggtt 780
cttctggcga agggggtacg aatcccgcag gatgtcgccg taatgggctt tgataatctg 840
gttggcgtcg ggcatctgtt tttaccgccg ctgaccacaa ttcagcttcc acatgacatt 900
atcgggcggg aagctgcatt gcatattatt gaaggtcgtg aagggggaag agtgacgcgg 960
atcccttgcc cgctgttgat ccgttgttcc acctga 996
<210> 18
<211> 9129
<212> DNA
<213> Escherichia coli (ATCC9637) and K12 W3110
<220>
<221> gene
<222> (1)..(9129)
<223> pAcscBAR'-mak
<400> 18
tatggcaatg aaagacggtg agctggtgat atgggatagt gttcaccctt gttacaccgt 60
tttccatgag caaactgaaa cgttttcatc gctctggagt gaataccacg acgatttccg 120
gcagtttcta cacatatatt cgcaagatgt ggcgtgttac ggtgaaaacc tggcctattt 180
ccctaaaggg tttattgaga atatgttttt cgtctcagcc aatccctggg tgagtttcac 240
cagttttgat ttaaacgtgg ccaatatgga caacttcttc gcccccgttt tcaccatggg 300
caaatattat acgcaaggcg acaaggtgct gatgccgctg gcgattcagg ttcatcatgc 360
cgtctgtgat ggcttccatg tcggcagaat gcttaatgaa ttacaacagt actgcgatga 420
gtggcagggc ggggcgtaat ttttttaagg cagttattgg tgcccttaaa cgcctggtgc 480
tacgcctgaa taagtgataa taagcggatg aatggcagaa attcgaaagc aaattcgacc 540
cggtcgtcgg ttcagggcag ggtcgttaaa tagccgctta tgtctattgc tggtttaccg 600
gtttattgac taccggaagc agtgtgaccg tgtgcttctc aaatgcctga ggccagtttg 660
ctcaggctct ccccgtggag gtaataattg acgatatgat catttattct gcctcccaga 720
gcctgataaa aacggttagc gcttcgttaa tacagatgta ggtgttccac agggtagcca 780
gcagcatcct gcgatgcaga tccggaacat aatggtgcag ggcgcttgtt tcggcgtggg 840
tatggtggca ggccccgtgg ccgggggact gttgggcgct gccggcacct gtcctacgag 900
ttgcatgata aagaagacag tcataagtgc ggcgacgata gtcatgcccc gcgcccaccg 960
gaaggagcta ccggacagcg gtgcggactg ttgtaactca gaataagaaa tgaggccgct 1020
catggcgttg actctcagtc atagtatcgt ggtatcaccg gttggttcca ctctctgttg 1080
cgggcaactt cagcagcacg taggggactt ccgcgtttcc agactttacg aaacacggaa 1140
accgaagacc attcatgttg ttgctcaggt cgcagacgtt ttgcagcagc agtcgcttca 1200
cgttcgctcg cgtatcggtg attcattctg ctaaccagta aggcaacccc gccagcctag 1260
ccgggtcctc aacgacagga gcacgatcat gcgcacccgt ggccaggacc caacgctgcc 1320
cgagatgcgc cgcgtgcggc tgctggagat ggcggacgcg atggatatgt tctgccaagg 1380
gttggtttgc gcattcacag ttctccgcaa gaattgattg gctccaattc ttggagtggt 1440
gaatccgtta gcgaggtgcc gccggcttcc attcaggtcg aggtggcccg gctccatgca 1500
ccgcgacgca acgcggggag gcagacaagg tatagggcgg cgcctacaat ccatgccaac 1560
ccgttccatg tgctcgccga ggcggcataa atcgccgtga cgatcagcgg tccagtgatc 1620
gaagttaggc tggtaagagc cgcgagcgat ccttgaagct gtccctgatg gtcgtcatct 1680
acctgcctgg acagcatggc ctgcaacgcg ggcatcccga tgccgccgga agcgagaaga 1740
atcataatgg ggaaggccat ccagcctcgc gtcgcgaacg ccagcaagac gtagcccagc 1800
gcgtcggccg tctcggtgct cattacttat tgccggatgc ggcgtgaacg ccttatccgc 1860
cctacgcggt tctggcacat tttgcaggcc tgataagacg cggcaagcgt cgcatcaggc 1920
atcggagcac ttattgccgg atgcggcgtg aacgccttat ccggcctacg gttctggcac 1980
cttttgtagg cctgataaga cgcggcaagc gtcgcatcag gcatgatgcg ccaattgcct 2040
acgtttttta ctcttgtggc cataaccacg cagcgccgcg tacgccgctg gaatcaccgt 2100
gcttcgcctt acgcaccggc gtttcacatt cgccgccgaa gacaaattgt ttaatcaact 2160
gcccaaccgt ttgatataaa cggtctacat tgctcatccc gccccccagg acaatcacat 2220
ccggatcgag aatattcacg acatgtgcca gcgattttgc cagccgcagc tcgtagcgac 2280
gcaatgccag ttccgctacc ggatcgcttt cttcaaccag gcggataatt tcactgcctt 2340
tcagcgcatg tccgctcaaa cgacgataat ccatcgcgaa tcccgtgccc gaaataaagg 2400
tttcaataca accttgttta ccgcaataac aagggacttc ctcgcgataa cgcagttcgt 2460
cttcgtccat ccacggtagc ggattgtgtc cccactcacc tgccgtgcca ttgccgccga 2520
tatgcgcccg cccattgaat gccacgcccg cgccgcatcc cgtgccgata atcacggcaa 2580
ataccgtctg cgctcccgct gccgcgccat ctactgcttc tgaaaccgcc agacagttag 2640
cgtcatttgc cagccgcact tcccgctgca acctcgcgct taagtcttta tcgaatggct 2700
gaccgttgag ccaggttgaa ttggcattct tcaccacacc ggtgtaaggc gaaattgagc 2760
caggaatgcc catacctacc gttccgcgct gccccgtcgc ctgctccgcc atatcaacca 2820
acgtggcgat cgtttcaata gtctgccggt aatcatcacg cggcgtgggc agacgatggc 2880
ggtacaactg ctcccctgca tcgcccagtg caatcacttc agttttggtg ccgcctaaat 2940
cgatacctat acgcacggta ctctccttat ttttttcaat atcaatagcg tagagacgga 3000
caaccggatt ggcaatgcaa ggccgccgac aattcgttat catgcccgct aaatttaacg 3060
acaaggccgt ggaaattatc atgctgtggt tcaaaaattt aatggtttac cgtcttagcc 3120
gcgagatttc gctgcgtgca gaagagatgg aaaaacagct agcctcgatg gcatttaccc 3180
cactgcaggt gcacgagtac atttgagcga ctgtaccaga acatgaatga ggcgtttgga 3240
ttaggcgatt attagcaggg ctaagcattt tactattatt attttccggt tgagggatat 3300
agagctatcg acaacaaccg gaaaaagttt acgtctatat tgctgaaggt acaggcgttt 3360
ccataactat ttgctcgcgt tttttactca agaagaaaat gccaaatagc aacatcaggc 3420
agacaatacc cgaaattgcg aagaaaactg tctggtagcc tgcgtggtca aagagtatcc 3480
cagtcggcgt tgaaagcagc acaatcccaa gcgaactggc aatttgaaaa ccaatcagaa 3540
agatcgtcga cgacaggcgc ttatcaaagt ttgccacgct gtatttgaag acggatatga 3600
cacaaagtgg aacctcaatg gcatgtaaca acttcactaa tgaaataatc caggggttaa 3660
cgaacagcgc gcaggaaagg atacgcaacg ccataatcac aactccgata agtaatgcat 3720
tttttggccc tacccgattc acaaagaaag gaataatcgc catgcacagc gcttcgagta 3780
ccacctggaa tgagttgaga taaccataca ggcgcgttcc tacatcgtgt gattcgaata 3840
aacctgaata aaagacagga aaaagttgtt gatcaaaaat gttatagaaa gaccacgtcc 3900
ccacaataaa tatgacgaaa acccagaagt ttcgatcctt gaaaactgcg ataaaatcct 3960
ctttttttac ccctcccgca tctgccgcta cgcactggtg atccttatct ttaaaacgca 4020
tgttgatcat cataaataca gcgccaaata gcgagaccaa ccagaagttg atatggggac 4080
tgatactaaa aaatatgccg gcaaagaacg cgccaatagc atagccaaaa gatccccagg 4140
cgcgcgctgt tccatattcg aaatgaaaat ttcgcgccat tttttcggtg aagctatcaa 4200
gcaaaccgca tcccgccaga tacccccagc caaaaaacag cgcccccaga attagaccta 4260
cagaaaaatt gctttgcagt aacggttcat aaacgtaaat cataaacggt ccggtcaaga 4320
ccaggatgaa actcatacac cagatgagcg gtttcttcag accgagttta tcctgaacga 4380
tgccgtagaa catcataaat agaatgctgg taaactggtt gaccgaataa agtgtaccta 4440
attccgtccc tgtcaaccct agatgtcctt tcagccaaat agcgtataac gaccaccaca 4500
gcgaccagga aataaaaaag agaaatgagt aactggatgc aaaacgatag tacgcatttc 4560
tgaatggaat actcagtgcc ataattacct gcctgtcgtt aaaaaattca cgtcctattt 4620
agagataaga gcgacttcgc cgtttacttc tcaactagtg cggtacccgg catatgctag 4680
atatcgactc cctcagttag cagcgttctt tgcattaacg caccaaaagg atcatccccc 4740
acccgaccta taaacccact tgttccgcct aatctggcga ttcccaccgc aacgttagct 4800
ggcgcgccgc caggacaagg cagtaggcgc ccgtctgatt ctggcaagag atctacgacc 4860
gcatccccta aaacccatac tttggctgac atttttttcc cttaaattca tctgagttac 4920
gcatagtgat aaacctcttt ttcgcaaaat cgtcatggat ttactaaaac atgcatattc 4980
gatcacaaaa cgtcatagtt aacgttaaca tttgtgatat tcatcgcatt tatgaaagta 5040
agggacttta tttttataaa agttaacgtt aacaattcac caaatttgct taaccaggat 5100
gattaaaatg acgcaatctc gattgcatgc ggcgcaaaac gccctagcaa aacttcatga 5160
gcaccggggt aacactttct atccccattt tcacctcgcg cctcctgccg ggtggatgaa 5220
cgatccaaac ggcctgatct ggtttaacga tcgttatcac gcgttttatc aacatcatcc 5280
gatgagcgaa cactgggggc caatgcactg gggacatgcc accagcgacg atatgatcca 5340
ctggcagcat gagcctattg cgctagcgcc aggagacgat aatgacaaag acgggtgttt 5400
ttcaggtagt gctgtcgatg acaatggtgt cctctcactt atctacaccg gacacgtctg 5460
gctcgatggt gcaggtaatg acgatgcaat tcgcgaagta caatgtctgg ctaccagtcg 5520
ggatggtatt catctcgaga aacagggtgt gatcctcact ccaccagaag gaatcatgca 5580
cttccgcgat cctaaagtgt ggcgtgaagc cgacacatgg tggatggtag tcggggcgaa 5640
agatccaggc aacacggggc agatcctgct ttatcgcggc agttcgttgc gtgaatggac 5700
cttcgatcgc gtactggccc acgctgatgc gggtgaaagc tatatgtggg aatgtccgga 5760
ctttttcagc cttggcgatc agcattatct gatgttttcc ccgcagggaa tgaatgccga 5820
gggatacagt taccgaaatc gctttcaaag tggcgtaata cccggaatgt ggtcgccagg 5880
acgacttttt gcacaatccg ggcattttac tgaacttgat aacgggcatg acttttatgc 5940
accacaaagc tttttagcga aggatggtcg gcgtattgtt atcggctgga tggatatgtg 6000
ggaatcgtca atgccctcaa aacgtgaagg atgggcaggc tgcatgacgc tggcgcgcga 6060
gctatcagag agcaatggca aacttctaca acgcccggta cacgaagctg agtcgttacg 6120
ccagcagcat caatctgtct ctccccgcac aatcagcaat aaatatgttt tgcaggaaaa 6180
cgcgcaagca gttgagattc agttgcagtg ggcgctgaag aacagtgatg ccgaacatta 6240
cggattacag ctcggcactg gaatgcggct gtatattgat aaccaatctg agcgacttgt 6300
tttgtggcgg tattacccac acgagaattt agacggctac cgtagtattc ccctcccgca 6360
gcgtgacacg ctcgccctaa ggatatttat cgatacatca tccgtggaag tatttattaa 6420
cgacggggaa gcggtgatga gtagtcgaat ctatccgcag ccagaagaac gggaactgtc 6480
gctttatgcc tcccacggag tggctgtgct gcaacatgga gcactctggc tactgggtta 6540
acataatatc aggtggaaca acggatcaac agcgggcaag ggatccgcgt cactcttccc 6600
ccttcacgac cttcaataat atgcaatgca gcttcccgcc cgataatgtc atgtggaagc 6660
tgaattgtgg tcagcggcgg taaaaacaga tgcccgacgc caaccagatt atcaaagccc 6720
attacggcga catcctgcgg gattcgtacc cccttcgcca gaagaacctg ataagccaca 6780
aaggctgcgc gatcgttacc acatatcaga acatcaaaat ctggtttgcc cggtttgaag 6840
tgggcattga gtaaacttgc gagatcggtg tagtgatcat cacctgttgc catgtgaaat 6900
tgtttcacct cagccagatc tcgttcagca tcacgccagg cctgctcaaa tccctgccga 6960
cgataccctg ttgccaacgc actttccggt agccagaagc ataacggttg acgatagccc 7020
gccgcgagca aatgctgtgt tgattcatat tgtgcagtgt aatcatcagg gatataactg 7080
ggtaacgctg ggtcatccgc cacacagttc gccaatacaa tattttcacc atacagagac 7140
tcaggcagcg tgatatatcg cagccccatt gtagtataga taatgccatc cggacggtgg 7200
gcaagcagct gacgtgccgc gcgggcagcg tcatcttcag aaaaaatatt gattaaaaaa 7260
ctattccagc cgaactcgct ggcggtttgc tcaatggcaa gcagaatatc aacagagaaa 7320
ggagtggtag ccgtgtcctg cgccagcacg gcgagagtcg acggcttacg tccttgagcg 7380
cgcatcttac gggcggaaag atcaggaaca taattcaggg tctggattgc ctgcaatacg 7440
cggtcacgcg ttgcaggacg cacagattct gcattatgca tcacccggga gactgtcatc 7500
atcgacactc ccgccaggcg tgcgacatcc tttaatgaag ccatacccaa gccgtttgcc 7560
gtaaaacggg cactgtagca gaaacagacg tcactggcga gatccaacgc cctatcacct 7620
gacacagcaa tacaataaaa aataacaata attcccggac aattgtcccc agttccgcct 7680
ctgttctcgc caacgagtct agaaatattt tatctgatta ataagatgat cttcttgaga 7740
tcgttttggt ctgcgcgtaa tctcttgctc tgaaaacgaa aaaaccgcct tgcagggcgg 7800
tttttcgaag gttctctgag ctaccaactc tttgaaccga ggtaactggc ttggaggagc 7860
gcagtcacca aaacttgtcc tttcagttta gccttaaccg gcgcatgact tcaagactaa 7920
ctcctctaaa tcaattacca gtggctgctg ccagtggtgc ttttgcatgt ctttccgggt 7980
tggactcaag acgatagtta ccggataagg cgcagcggtc ggactgaacg gggggttcgt 8040
gcatacagtc cagcttggag cgaactgcct acccggaact gagtgtcagg cgtggaatga 8100
gacaaacgcg gccataacag cggaatgaca ccggtaaacc gaaaggcagg aacaggagag 8160
cgcacgaggg agccgccagg gggaaacgcc tggtatcttt atagtcctgt cgggtttcgc 8220
caccactgat ttgagcgtca gatttcgtga tgcttgtcag gggggcggag cctatggaaa 8280
aacggctttg ccgcggccct ctcacttccc tgttaagtat cttcctggca tcttccagga 8340
aatctccgcc ccgttcgtaa gccatttccg ctcgccgcag tcgaacgacc gagcgtagcg 8400
agtcagtgag cgaggaagcg gaatatatcc tgtatcacat attctgctga cgcaccggtg 8460
cagccttttt tctcctgcca catgaagcac ttcactgaca ccctcatcag tgccaacata 8520
gtaagccagt atacactccg ctagcgctga tgtccggcgg tgcttttgcc gttacgcacc 8580
accccgtcag tagctgaaca ggagggacag ctgatagaaa cagaagccac tggagcacct 8640
caaaaacacc atcatacact aaatcagtaa gttggcagca tcacccgacg cactttgcgc 8700
cgaataaata cctgtgacgg aagatcactt cgcagaataa ataaatcctg gtgtccctgt 8760
tgataccggg aagccctggg ccaacttttg gcgaaaatga gacgttgatc ggcacgtaag 8820
aggttccaac tttcaccata atgaaataag atcactaccg ggcgtatttt ttgagttatc 8880
gagattttca ggagctaagg aagctaaaat ggagaaaaaa atcactggat ataccaccgt 8940
tgatatatcc caatggcatc gtaaagaaca ttttgaggca tttcagtcag ttgctcaatg 9000
tacctataac cagaccgttc agctggatat tacggccttt ttaaagaccg taaagaaaaa 9060
taagcacaag ttttatccgg cctttattca cattcttgcc cgcctgatga atgctcatcc 9120
ggaattccg 9129
Claims (16)
- 수크로스 비자화성 미생물에 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제 및 수크로스 전사 조절자의 활성을 부여하고, 만노키나아제의 활성을 강화시킨 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물.
- 제1항에 있어서, 만노키나아제의 활성 강화는 만노키나아제 유전자의 카피수 증가, 프로모터 교체, 프로모터 변이 및 유전자 변이로 이루어진 군으로부터 하나 이상 선택되는 방법에 의한 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물.
- 제2항에 있어서, 만노키나아제 유전자의 카피수 증가는 염색체 삽입 및 벡터 도입에 의한 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물.
- 제3항에 있어서, 상기 벡터는 서열번호 15의 염기서열을 포함하는 것을 특 징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물.
- 제1항에 있어서, 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제 및 수크로스 전사 조절자의 활성 부여가 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제 및 수크로스 전사 조절자를 암호화하는 염기서열을 포함하는 벡터로 형질전환된 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물.
- 제5항에 있어서, 상기 염기서열은 각각 서열번호 4, 6 및 7의 염기서열인 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물.
- 제6항에 있어서, 수크로스 전사 조절자의 130번째 아미노산이 타이로신으로 치환된 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물.
- 제7항에 있어서, 수크로스 전사 조절자가 서열번호 17의 염기서열로 암호화된 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물.
- 제1항에 있어서, 수크로스 퍼미아제, 수크로스 하이드로라제, 수크로스 전사 조절자 및 만노키나아제를 암호화하는 염기서열을 모두 포함하는 벡터로 형질전환한 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물.
- 제9항에 있어서, 상기 벡터가 서열번호 18의 염기서열로 암호화된 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물.
- 제1항에 있어서, 에스케리키아속 미생물이 대장균인 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물.
- 제11항에 있어서, 대장균이 대장균 CA03-0308 (수탁번호 KCCM10978P)인 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물.
- 제1항에 있어서, L-아미노산이 L-쓰레오닌, O-석시닐-호모세린, O-아세틸-호모세린, L-메티오닌, L-라이신, L-호모세린, L-이소루신, L-발린 및 L-트립토판으로 이루어진 군으로부터 선택된 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물.
- 제13항에 있어서, L-아미노산이 L-쓰레오닌, O-석시닐-호모세린, O-아세틸-호모세린 및 L-트립토판으로 이루어진 군으로부터 선택된 것을 특징으로 하는 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물.
- 탄소원으로서 수크로스가 전체 또는 일부 포함된 배양 배지에 제1항 내지 제14항 중 어느 한 항에 따른 증가된 L-아미노산 생산능 및 수크로스 자화능을 갖는 에스케리키아속 미생물을 접종하여 배양하는 단계; 및상기 단계에서 수득되는 배양물로부터 L-아미노산을 분리하는 단계를 포함하는 L-아미노산의 생산 방법.
- 제15항에 있어서, L-아미노산이 L-쓰레오닌, O-석시닐-호모세린, O-아세틸-호모세린, L-메티오닌, L-라이신, L-호모세린, L-이소루신, L-발린 및 L-트립토판으로 이루어진 군으로부터 선택된 것을 특징으로 하는 L-아미노산의 생산 방법.
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