KR20100087891A - Ssr primer derived from peanut and use thereof - Google Patents
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Abstract
Description
본 발명은 땅콩에서 분리된 SSR 프라이머 및 이의 용도에 관한 것으로서, 땅콩의 DNA 다형성 검출방법에 관한 것이다.The present invention relates to an SSR primer isolated from a peanut and its use, and to a method for detecting DNA polymorphism of a peanut.
현재까지 분자 생물학의 발전으로 핵산(DNA) 수준에서 유전자원의 다양성(bio-diversity) 연구를 가능케 하는 핵산 지문 분석방법 및 다양한 DNA 마커들이 개발되어 있다. 이를 통해 유용 형질 탐색, 생물의 종 동종, 품종 분류 동정 및 집단 개체군의 유연관계 분석을 DNA 수준에서 간단하고, 신속하게 수행할 수 있게 되었다. 지금까지 개발된 PCR(polymerase chain reaction)을 이용한 지문분석법에는 RAPD(randomly amplifed polymorphic DNAs)방법, AFLP(Amplified fragment length polymorphic DNA) 방법, SSR(Simple sequence repeat) 방법 등이 있다. 상기방법 중 RAPD와 AFLP 방법은 재현성이 떨어지거나, 분석이 복잡한 단점이 있다. 이에 반해, SSR 방법은 DNA 반복 배열인 초위성체(microsatellite) 영역의 염기배열 정보를 근거로 PCR 프라이머를 제작하여 이용하는 방법으로서, 분석이 용이하고, 높은 재현성을 가지는 장점으로 생물종의 동정에 많이 이용되고 있다. To date, advances in molecular biology have led to the development of nucleic acid fingerprint analysis methods and various DNA markers that enable bio-diversity studies at the nucleic acid (DNA) level. This makes it possible to search useful traits, identify species of species, classify varieties, and analyze flexible relationships of populations at the DNA level. Fingerprint analysis using polymerase chain reaction (PCR) developed so far includes randomly amplifed polymorphic DNAs (RAPD), amplified fragment length polymorphic DNA (AFLP), and simple sequence repeat (SSR). RAPD and AFLP methods of the above methods are disadvantageous in reproducibility or complicated analysis. In contrast, the SSR method is a method of preparing PCR primers based on nucleotide sequence information of a microsatellite region, which is a DNA repeat sequence, and is easily used for identification of a species because of its easy analysis and high reproducibility. It is becoming.
대표적인 작물인 벼에서는 벼 게놈에 반복되는 SSR을 PCR 기술로 증폭하여 벼 품종의 유전자형을 동정하는 초위성체 마커들이 개발되었다(대한민국 특허출원번호 제2001-34003호). 이외에도, 보리, 콩, 밀, 땅콩 등에서도 많은 SSR 마커들이 개발되었다. 미국에서 땅콩으로부터 SSR마커를 제작하여(Fegurson, 2003) 수집종간 판정을 위해 사용하였고, 기존에 보고된 SSR 마커와 microsatellite 마커를(Krishna, 2004) 이용하여 외국 수집종에 대한 구별에 사용하였다. 그러나 국내에서는 아직 땅콩에서 품종 동종을 위한 SSR 마커가 전혀 개발된 바 없다. In rice, a representative crop, supersatellite markers have been developed that identify genotypes of rice varieties by amplifying SSR repeated in the rice genome by PCR technology (Korean Patent Application No. 2001-34003). In addition, many SSR markers have been developed in barley, soybeans, wheat and peanuts. In the United States, SSR markers were prepared from peanuts (Fegurson, 2003) and used for determination of collection species, and previously reported SSR markers and microsatellite markers (Krishna, 2004) were used to distinguish foreign collection species. In Korea, however, no SSR markers have been developed for the same kind of varieties in peanuts.
이에 본 발명자들은 땅콩의 품종간 차이를 효율적으로 평가할 수 있는 SSR 마커를 찾기 위하여 보고된 모든 자료로부터 땅콩 SSR마커의 염기서열을 찾아서 합성하여 시험재료로 사용하였고, 분석결과 다형성을 보이는 SSR 프라이머쌍을 개발함으로써 본 발명을 완성하였다.Therefore, the present inventors synthesized the nucleotide sequences of peanut SSR markers from all the data reported to find SSR markers that can efficiently evaluate the differences between peanut varieties, and used them as test materials. The present invention was completed by developing.
본 발명은 땅콩에서 분리된 SSR 프라이머를 이용한 땅콩 품종을 효율적으로 동종함으로서 기존유전자원과의 중복성 분석 및 신규성 확보 우리나라에서 육성된 품종 보호에 기여하고자 한다.The present invention seeks to contribute to the protection of varieties grown in Korea by efficiently analyzing the varieties of peanuts using SSR primers isolated from peanuts.
상기의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 1 내지 서열번호 24로 이루어진 군에서 선택되는 2개의 염기서열을 갖는 SSR 프라이머 쌍을 제공한다.In order to achieve the above object, the present invention provides an SSR primer pair having two nucleotide sequences selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1 to SEQ ID NO: 24.
본 발명의 다른 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 상기 SSR 프라이머쌍을 이용하여 PCR을 수행하는 것을 포함하는 땅콩의 DNA다형성 검출 방법 및 땅콩의 품종 동정 방법을 제공한다.In order to achieve another object of the present invention, the present invention provides a method for detecting DNA polymorphism of a peanut and a method for identifying a variety of peanuts, including performing PCR using the SSR primer pair.
이하 본 발명을 상세히 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in detail.
본 발명은 땅콩의 유전적 다형성을 특이적으로 분석할 수 있는 SSR 마커를 제공하는 것을 특징으로 한다.The present invention is characterized by providing an SSR marker capable of specifically analyzing the genetic polymorphism of peanuts.
본 발명에서는 땅콩의 SSR 마커를 Ferguson et al.(Theor. Appl. Genet. (2003) 108:1064-1070)이 보고한 220개의 SSR 마커의 염기서열 정보와 Krishna et al.(Cellular & Molecular Biology Letter (2004) 9(4A) 685-697)이 보고한 18개의 SSR 마커의 염기서열 정보로부터 획득하고, SSR 마커를 합성하여 사용하였다. 상기 프라이머쌍을 사용하여 36개의 땅콩 품종들의 PCR을 통한 DNA 프로파일링을 수행함으로써 다형성 변이를 많이 나타내는 12쌍의 SSR 프라이머쌍을 선발하였다.In the present invention, SSR markers of peanuts are reported by Ferguson et al. (Theor. Appl. Genet. (2003) 108: 1064-1070), and sequence information of 220 SSR markers and Krishna et al. (Cellular & Molecular Biology Letter). (2004) 9 (4A) 685-697) was obtained from the nucleotide sequence information of 18 SSR markers reported, and synthesized and used SSR markers. By performing DNA profiling through PCR of 36 peanut varieties using the primer pairs, 12 pairs of SSR primer pairs showing many polymorphic mutations were selected.
본 발명에서 제공하는 SSR 마커는 PCR 프라이머쌍을 말하며, 정방향 프라이머와 역방향 프라이머를 포함한다. 본 발명에서 제공되는 SSR 프라이머쌍은 서열번호 1 내지 서열번호 24로 이루어진 군에서 선택되는 2개의 염기서열을 가진다. 바람직하게는 AH4-4(서열번호 1과 2로 표시되는 프라이머쌍), AH4-20(서열번호 3과 4로 표시되는 프라이머쌍), PM-3(서열번호 5와 6으로 표시되는 프라이머쌍), PM-15(서열번호 7과 8로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq3A01(서열번호 9와 10으로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq7G02(서열번호 11과 12로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq8E12(서열번호 13과 14로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq10D4(서열번호 15와 16으로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq13A7(서열번호 17과 18로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq14H6(서열번호 19와 20으로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq15C10(서열번호 21과 22로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq16G8(서열번호 23과 24로 표시되는 프라이머쌍)로 이루어진 군에서 선택된다. 본 발명에서 제공되는 프라이머쌍 및 이들에 의해 증폭되는 초위성체의 크기의 범위, Tm(℃) 및 초위성체가 존재하는 염색체 대립인자에 대한 정보를 하기 표 1에 기재하였다.The SSR marker provided by the present invention refers to a pair of PCR primers, and includes a forward primer and a reverse primer. SSR primer pair provided in the present invention has two base sequences selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1 to SEQ ID NO: 24. Preferably AH4-4 (primary pairs represented by SEQ ID NOs: 1 and 2), AH4-20 (primary pairs represented by SEQ ID NOs: 3 and 4), PM-3 (primer pairs represented by SEQ ID NOs: 5 and 6) PM-15 (primary pairs represented by SEQ ID NOs: 7 and 8), PGPseq3A01 (primary pairs represented by SEQ ID NOs: 9 and 10), PGPseq7G02 (primary pairs represented by SEQ ID NOs: 11 and 12), PGPseq8E12 (SEQ ID NO: 13 And primer pairs represented by SEQ ID NO: 14), PGPseq10D4 (primer pairs represented by SEQ ID NOs: 15 and 16), PGPseq13A7 (primer pairs represented by SEQ ID NOs: 17 and 18), and PGPseq14H6 (primer pairs represented by SEQ ID NOs: 19 and 20) , PGPseq15C10 (primer pairs represented by SEQ ID NOs: 21 and 22), PGPseq16G8 (primer pairs represented by SEQ ID NOs: 23 and 24). Information on the range of primer pairs provided in the present invention and the size of the supersatellites amplified by them, Tm (° C.) and chromosomal alleles in which the supersatellites are present are given in Table 1 below.
[표 1] 본 발명의 SSR 프라이머쌍 및 이로부터 증폭되는 초위성체의 특성TABLE 1 Properties of SSR Primer Pairs of the Present Invention and Supersatellites Amplified therefrom
Fa : 정방향 프라이머 Rb : 역방향 프라이머F a : forward primer R b : reverse primer
본 발명에서 제공되는 SSR 프라이머쌍은 땅콩에서 DNA 다형성을 검출하고 유전적 다양성을 분석하는데 유용하게 사용될 수 있다. 본 발명에 따른 SSR 프라이머를 이용하여 땅콩의 유전자원과 품종을 효율적으로 평가 또는 보존할 수 있다. 따라서 본 발명은 상기 SSR 프라이머쌍을 이용하여 PCR을 수행하는 것을 포함하는 땅콩의 DNA 다형성 검출 방법을 제공한다.SSR primer pairs provided in the present invention can be usefully used for detecting DNA polymorphism and analyzing genetic diversity in peanuts. By using the SSR primers according to the present invention, genetic resources and varieties of peanuts can be efficiently evaluated or preserved. Accordingly, the present invention provides a method for detecting DNA polymorphism of peanut, including performing PCR using the SSR primer pair.
구체적으로 땅콩의 DNA 다형성 검출방법은 Specifically, the method for detecting DNA polymorphism in peanuts
(a) 땅콩으로부터 게놈 DNA를 추출하는 단계;(a) extracting genomic DNA from peanuts;
(b) 추출된 게놈 DNA를 주형으로 하고 본 발명에서 제공하는 SSR 프라이머쌍을 이용하여 PCR을 수행하는 단계; 및(b) performing PCR using the extracted genomic DNA as a template and the SSR primer pair provided by the present invention; And
(c) PCR 산물을 크기별로 분리하는 단계를 포함한다.(c) separating the PCR products by size.
상기(a) 단계에서 게놈 DNA의 추출은 당업계에서 통상적으로 사용되는 페놀/클로로포름 추출법, SDS 추출법(Tai et al., Plant Mol. Biol. Reporter, 8: 297-303), CTAB 분리법(Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide; Murray et al., Nuc. Res., 4321-4325, 1980) 또는 상업적으로 판매되는 DNA 추출 키트를 이용하여 수행할 수 있다.Extraction of genomic DNA in step (a) is performed by phenol / chloroform extraction, SDS extraction (Tai et al., Plant Mol. Biol. Reporter, 8: 297-303), CTAB separation method (Cetyl Trimethyl) commonly used in the art. Ammonium Bromide; Murray et al., Nuc. Res., 4321-4325, 1980) or commercially available DNA extraction kits.
또한 상기 (b) 단계에서 PCR을 PCR 반응에 필요한 당업계에 공지된 여러 성분을 포함하는 PCR 반응 혼합액을 이용하여 수행될 수 있다. 상기 PCR 반응 혼합액에는 분석하고자 하는 땅콩에서 추출된 게놈 DNA와 본 발명에서 제공되는 SSR 프라이머쌍 이외에 적당량의 DNA 중합효소, dNTP, PCR 완충용액 및 물(dH2O)을 포함한다. 상기 PCR 완충용액은 트리스-HCl(Tris-HCl), MgCl2, KCl 등을 포함한다. 이 때 MgCl2 농도는 증폭의 특이성과 수량에 크게 영향을 주며, 바람직하게는 1.5-2.5mM의 범위로 사용될 수 있다. 일반적으로 Mg2 +가 과량인 경우는 비특이적인 PCR 증폭산물이 증가하고, Mg2 + 부족한 경우 PCR산물의 산출율을 감소시킨다. 상기 PCR 완충용 액에는 적당량의 트리톤 X-100(Triton X-100)이 추가로 포함될 수도 있다. 또한 PCR은 94-95℃에서 주형 DNA를 전변성시킨후, 변성(denaturation); 결합(annealing); 및 증폭(extension)의 사이클을 거친 후, 최종적으로 72℃에서 연장(elongation)시키는 일반적인 PCR 반응 조건에서 수행될 수 있다. 상기에서 변성 및 증폭은 94-95℃ 및 72℃에서 각각 수행될 수 있다. 결합시의 온도는 프라이머의 종류에 따라 달라질 수 있다. 바람직하게는 55와 60℃이다. 각 단계의 시간과 싸이클 수는 당업계에 일반적으로 행해지는 조건에 따라 정해질 수 있다. 본 발명에 따른 SSR 프라이머쌍을 이용한 PCR 수행시의 최적의 2가지 반응조건은 다음과 같다. 첫 번째 반응 조건은 프라이머 AH4-4, AH4-20, PM-3, 및 PM-15 등 4종 프라이머의 반응조건으로 95℃에서 12분간 주형 DNA를 전변성시킨 후, 94℃에서 15초; 55℃에서 30초; 및 72℃에서 60초를 45 싸이클 반복 수행한 후, 최종적으로 72℃에서 7분간 반응시킨다. 두 번째 반응조건은 프라이머 PGPseq3A01, PGPseq7G02, PGPseq8E12, PGPseq10D4, PGPseq13A7, PGPseq14H6, PGPseq15C10, 및 PGPseq16G8 등 8종 프라이머의 반응조건으로 94℃에서 2분간 주형 DNA를 전변성시킨 후, 94℃에서 45초; 60℃에서 60초; 및 72℃에서 90초를 35 사이클 반복 수행한 후, 최종적으로 72℃에서 10분간 반응시킨다. In addition, the PCR in the step (b) can be performed using a PCR reaction mixture containing a variety of components known in the art for the PCR reaction. The PCR reaction mixture includes an appropriate amount of DNA polymerase, dNTP, PCR buffer and water (dH 2 O) in addition to genomic DNA extracted from the peanut to be analyzed and the SSR primer pair provided in the present invention. The PCR buffer solution includes Tris-HCl, MgCl 2 , KCl, and the like. At this time, the MgCl 2 concentration greatly affects the specificity and quantity of amplification, and may be preferably used in the range of 1.5-2.5 mM. In general, when Mg 2 + is an excessive increase the non-specific PCR amplification products and reduce the yield of PCR product when Mg 2 + insufficient. The PCR buffer solution may further include an appropriate amount of Triton X-100. PCR also denatured the template DNA at 94-95 ° C., followed by denaturation; Annealing; And a cycle of extension, followed by general PCR reaction conditions which are finally elongated at 72 ° C. Denaturation and amplification in the above can be carried out at 94-95 ℃ and 72 ℃, respectively. The temperature at the time of binding may vary depending on the type of primer. Preferably it is 55 and 60 degreeC. The time and number of cycles in each step can be determined according to the conditions generally made in the art. The two optimal reaction conditions when performing PCR using the SSR primer pair according to the present invention are as follows. The first reaction condition was the reaction conditions of four primers such as primers AH4-4, AH4-20, PM-3, and PM-15; 30 seconds at 55 ° C .; And 45 cycles of 60 seconds at 72 ° C., followed by reaction at 72 ° C. for 7 minutes. The second reaction conditions were premodified template DNA at 94 ° C. for 2 minutes at 94 ° C. under the reaction conditions of eight primers such as primers PGPseq3A01, PGPseq7G02, PGPseq8E12, PGPseq10D4, PGPseq13A7, PGPseq14H6, PGPseq15C10, and PGPseq16G8; 60 seconds at 60 ° C .; And repeating 90 seconds at 72 ° C. for 35 cycles, and finally reacting at 72 ° C. for 10 minutes.
상기 (c) 단계에서는 당업계에서 널리 공지된 방법에 따라 PCR 산물의 DNA를 크기별로 분리할 수 있다. 바람직하게는 아가로스 겔(agarose gel) 또는 폴리아크릴아마이드 겔(polyacrylamide gel) 전기영동 또는 형광분석장치(ABI prism 3100 genetic analyzer-electropherogram)에 의해 확인할 수 있다. PCR 증폭 결과는 바 람직하게는 폴리아크릴아마이드 겔 전기영동, 더 바람직하게는 변성 폴리아크릴아마이드 겔 전기영동에 의해 확인할 수 있다. 전기영동 후 실버 염색(silver staining)과 형광염색으로 전기영동 결과를 분석할 수 있다. 일반적인 PCR 수행 및 그 결과 분석 방법에 대해서는 당업계에 잘 알려져 있다.In step (c), DNAs of PCR products may be separated according to sizes according to methods well known in the art. Preferably it can be confirmed by an agarose gel (agarose gel) or polyacrylamide gel electrophoresis or fluorescence analysis (ABI prism 3100 genetic analyzer-electropherogram). PCR amplification results can be preferably confirmed by polyacrylamide gel electrophoresis, more preferably modified polyacrylamide gel electrophoresis. After electrophoresis, electrophoresis results can be analyzed by silver staining and fluorescence staining. General PCR performance and resulting analysis methods are well known in the art.
아울러, 본 발명은 상기 SSR 프라이머 쌍을 이용하여 PCR을 수행하는 것을 포함하는 땅콩의 품종 동종 방법을 제공한다.In addition, the present invention provides a method for homogeneous varieties of peanut, including performing PCR using the SSR primer pair.
구체적으로 땅콩의 품종 동종 방법은 Specifically, the method of homologating varieties of peanuts
(a) 땅콩 및 대조군 땅콩 품종으로부터 게놈 DNA를 추출하는 단계;(a) extracting genomic DNA from peanut and control peanut varieties;
(b) 추출된 각 게놈 DNA를 주형으로 하고 본 발명에서 제공하는 SSR 프라이머쌍을 이용하여 PCR을 수행하는 단계;(b) performing PCR using each of the extracted genomic DNA as a template and the SSR primer pair provided by the present invention;
(c) 각 PCR 산물을 크기별로 분리하는 단계; 및(c) separating each PCR product by size; And
(d) 상기 (c) 단계의 각각의 크기별 분리 결과를 서로 비교하는 단계를 포함한다.(d) comparing the separation results for each size of step (c) with each other.
(a) 내지 (c) 단계의 게놈 DNA 추출, PCR 수행 및 PCR 산물의 크기별 분리는 상기에서 기재한 바와 같으며, 상기 (d) 단계에서 땅콩 및 대조군 땅콩 품종에 대한 비교는 동일한 조합의 SSR 프라이머쌍에 대한 시료가 되는 땅콩과 대조군 땅콩 품종의 각각의 PCR 산물의 크기를 서로 비교하는 방법으로 수행된다. 각 SSR 프라이머쌍에 대한 크기 비교 결과를 종합하여 시료가 되는 땅콩과 대조군 땅콩 품종의 결과와 모두 일치하면 시료가 되는 땅콩은 대조군 땅콩 품종과 동일한 품종으로 동정할 수 있다. 이와 같은 품종의 동정 방법은 신규 유전자원 도입시 중복 여부 판단 및 원산지 확인을 통한 원산지 표시 위반 여부의 판정 등 품종의 동정이 필요한 경우에 유용하게 이용될 수 있다.Genomic DNA extraction, PCR, and size separation of PCR products of steps (a) to (c) are as described above, and the comparison of peanut and control peanut varieties in step (d) is the same combination of SSR primers. This is done by comparing the size of each PCR product of the peanut and control peanut varieties that are samples for the pair. By comparing the results of the size comparison for each SSR primer pair, if the sample peanuts and the control peanut varieties match with the results, the sample peanuts can be identified as the same varieties as the control peanut varieties. Such a breed identification method may be useful when the identification of the breed is necessary, such as judging whether there is a duplication in the introduction of new genetic resources and whether the indication of origin is violated by checking the origin.
대조군 땅콩 품종에 대한 게놈 DNA 추출, PCR 수행 및 PCR 산물의 크기별 분리는 시료가 되는 땅콩과 동시에 수행될 수도 있으나, 시료가 되는 땅콩보다 이전에 수행되어 동정의 기준표(reference)로 작성될 수도 있다. 이러한 기준표를 이용하면 시료가 되는 땅콩에 대한 게놈 DNA 추출, PCR 수행 및 PCR 산물의 크기별 분리만을 수행하여 기준표와 비교할 수 있어 유용하게 이용할 수 있다.Genomic DNA extraction, PCR, and size separation of PCR products for control peanut varieties may be performed concurrently with the sampled peanut, but may be performed prior to the sampled peanut and prepared as a reference for identification. Using such a reference table can be useful because it can be compared with the reference table by performing genomic DNA extraction, PCR, and size separation of PCR products for peanuts as samples.
본 발명에 적용될 수 있는 땅콩은 Arachis hypogaea L. 및 이들의 변종일 수 있으며, 이에 제한되는 것은 아니다. 바람직하게는 Arachis hypogaea L.일 수 있다.Peanut that can be applied to the present inventionArachis hypogaea L. and variants thereof, but is not limited thereto. PreferablyArachis hypogaea May be L.
또한 본 발명은 상기 SSR 프라이머쌍을 포함하는 땅콩의 DNA 다형성 검출용 키트를 제공한다.The present invention also provides a kit for detecting DNA polymorphism of a peanut comprising the SSR primer pair.
또한, 본 발명은 상기 SSR 프라이머쌍을 포함하는 땅콩의 품종 동종용 키트를 제공한다.In addition, the present invention provides a kit for homogeneous varieties of peanuts comprising the SSR primer pair.
이상 살펴본 바와 같이, 본 발명에서는 땅콩에서 처음으로 SSR 마커를 개발하였다. 본 발명에서 제공되는 SSR 프라이머쌍은 땅콩의 DNA 다형성을 효과적으로 검출하여 땅콩의 DNA 프로파일을 작성하는데 매우 유용하게 이용될 수 있다. 이를 통해 땅콩의 유전자원을 효율적으로 평가함으로써 신규 유전자원 도입시 기존 보유자원과의 중복성 분석 및 신규성 확립을 효과적으로 수행할 수 있으며, 땅콩의 품종을 동종할 수 있다.As described above, in the present invention, the first SSR marker was developed in peanuts. SSR primer pairs provided in the present invention can be very useful for effectively detecting the DNA polymorphism of the peanut and preparing the DNA profile of the peanut. Through this, by efficiently evaluating the genetic resources of peanuts, it is possible to effectively perform redundancy analysis and establishment of novelty with existing resources when introducing new genetic resources, and to homologize the varieties of peanuts.
이하, 본 발명을 실시예에 의해 상세히 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in detail by way of examples.
단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.However, the following examples are illustrative of the present invention, and the present invention is not limited to the following examples.
[실시예 1] 게놈 DNA 추출Example 1 Genomic DNA Extraction
품종으로 등록되어 있는 땅콩(표 2)으로부터 SDS를 이용한 방법(Tai et al., Plant Mol. Biol. Reporter, 8: 297-303, 1990)에 따라 게놈 DNA를 추출하였다. 이를 상세히 설명하면 다음과 같다. 생육 1개월째의 어린 땅콩 식물체로부터 0.5g의 잎 조직을 채취하여 1.5㎖ 튜브에 넣고 액체 질소로 급랭시켰다. 이후, 즉시 플라스틱 막대로 잎을 곱게 마쇄하였다. 마쇄된 잎이 녹기 전에 추출 완충용액(200mM Tris-HCl(pH 8.0), 200mM NaCl, 25mM EDTA, 0.5% SDS) 750㎕를 첨가하고, 혼합액을 65℃에서 30분간 보관하였다. 여기에 동량의 페놀(phenol):클로로포름(chloroform):이소아밀알코올(isoamylalchol) (25:24:1) 용액을 추가로 첨가한 후, 약 15분간 교반하였다. 이를 13,000 rpm에서 15분간 원심분리하였다. 상등액을 취하여 새 튜브에 옮겼다. 상기 튜브에 동량의 이소프로판올(-20℃)을 첨가하고, -20℃에서 1시간 보관하였다. 이후, 13,000 rpm에서 15분간 원심분리하였다. 상등 액을 버린 후 침전된 DNA를 70% 에탄올로 세척하였다. DNA를 건조시킨 후, 약 300㎕의 RNase (50㎍/㎖)를 함유하는 TE 완충용액(10mM Tris-Cl, 1mM EDTA, pH 7.4)을 첨가하여 충분히 녹인 후, 37℃에서 1시간 동안 보관하였다.Genomic DNA was extracted according to a method using SDS (Tai et al., Plant Mol. Biol. Reporter, 8: 297-303, 1990) from peanuts (Table 2) registered as varieties. This will be described in detail as follows. 0.5 g of leaf tissues were taken from young peanut plants at 1 month of growth and placed in a 1.5 ml tube and quenched with liquid nitrogen. The leaf was then ground finely with a plastic rod immediately. 750 μl of extraction buffer (200 mM Tris-HCl, pH 8.0), 200 mM NaCl, 25 mM EDTA, 0.5% SDS) was added before the ground leaves were dissolved, and the mixture was stored at 65 ° C. for 30 minutes. An equivalent amount of a phenol (chloro): chloroform: isoamylalchol (25: 24: 1) solution was further added thereto, followed by stirring for about 15 minutes. It was centrifuged for 15 minutes at 13,000 rpm. The supernatant was taken and transferred to a new tube. Equal amount of isopropanol (-20 ° C.) was added to the tube and stored at −20 ° C. for 1 hour. Thereafter, centrifugation was performed at 13,000 rpm for 15 minutes. After discarding the supernatant, the precipitated DNA was washed with 70% ethanol. After drying the DNA, TE buffer (10 mM Tris-Cl, 1 mM EDTA, pH 7.4) containing about 300 μl of RNase (50 μg / ml) was added thereto to be sufficiently dissolved, and then stored at 37 ° C. for 1 hour. .
[표 2] 품종으로 등록되어 있는 땅콩으로서 본 발명에 사용된 땅콩 품종명TABLE 2 Peanut varieties used in the present invention as peanuts registered as varieties
[실시예 2] SSR 마커의 선발Example 2 Selection of SSR Markers
상기 실시예 1에서 추출된 게놈 DNA를 PCR을 통한 증폭을 하기 위해 SSR 프라이머를 (주)바이오니어에 의뢰하여 제작해서 사용하였다. 제작된 프라이머쌍 중에서 다양한 땅콩 품종에서 다형성 변이를 많이 나타내는 SSR 프라이머 조합을 선발하기 위하여, 상기 표 2에 기재된 36점의 땅콩 품종에 대하여 PCR을 통한 DNA 프로파일링(profiling) 분석을 수행하였다.In order to amplify the genomic DNA extracted in Example 1 by PCR, SSR primers were manufactured and used by Bioner Corporation. In order to select the SSR primer combination showing a lot of polymorphic variation in various peanut varieties among the prepared primer pairs, DNA profiling analysis by PCR was performed on the 36 peanut varieties described in Table 2 above.
각각의 PCR 반응 혼합물 (20㎕)의 조성은 다음과 같다: 실시예 1의 방법에 의해 분리한 땅콩 주형 DNA 100ng, 정방향 프라이머 0.2μM, 역방향 프라이머 0.2μM, 1X PCR 반응액 (10mM Tris-HCl (pH 8.8), 1.5mM MgCl2, 50mM KCl, 0.1% Triton X-100), 1unit DNA 중합효소. PCR 반응은 두가지 반응 조건을 이용하여 증폭시켰는데, 첫 번째 반응 조건은 프라이머 AH4-4, AH4-20, PM-3, 및 PM-15 등 4종 프라이머의 반응조건으로 95℃에서 12분간 주형 DNA를 전변성시킨 후, 94℃에서 15초; 55℃에서 30초; 및 72℃에서 60초를 45 사이클 반복 수행한 후, 최종적으로 72℃에서 7분간 반응시킨다. 두 번째 반응조건은 프라이머 PGPseq3A01, PGPseq7G02, PGPseq8E12, PGPseq10D4, PGPseq13A7, PGPseq14H6, PGPseq15C10, 및 PGPseq16G8 등 8종 프라이머의 반응조건으로 94℃에서 2분간 주형 DNA를 전변성시킨 후, 94℃에서 45초; 60℃에서 60초; 및 72℃에서 90초를 35 사이클 반복 수행한 후, 최종적으로 72℃에서 10분간 반응시킨다. The composition of each PCR reaction mixture (20 μl) was as follows: 100ng peanut template DNA isolated by the method of Example 1, 0.2 μM forward primer, 0.2 μM reverse primer, 1 × PCR reaction solution (10 mM Tris-HCl ( pH 8.8), 1.5 mM MgCl 2 , 50 mM KCl, 0.1% Triton X-100), 1 unit DNA polymerase. PCR reaction was amplified using two reaction conditions. The first reaction condition was the reaction conditions of four primers such as primers AH4-4, AH4-20, PM-3, and PM-15. 15 seconds at 94 ° C. after full denaturation; 30 seconds at 55 ° C .; And 45 cycles of 60 seconds at 72 ° C., followed by reaction at 72 ° C. for 7 minutes. The second reaction conditions were premodified template DNA at 94 ° C. for 2 minutes at 94 ° C. under the reaction conditions of eight primers such as primers PGPseq3A01, PGPseq7G02, PGPseq8E12, PGPseq10D4, PGPseq13A7, PGPseq14H6, PGPseq15C10, and PGPseq16G8; 60 seconds at 60 ° C .; And repeating 90 seconds at 72 ° C. for 35 cycles, and finally reacting at 72 ° C. for 10 minutes.
각기 다르게 증폭된 PCR 산물 단편의 크기를 분석하기 위해 폴리아크릴아마 이드 겔(polyacrylamide gel) 전기영동을 이용하여 분석하였다. 폴리아크릴아미이드 농도는 0.6%를 사용하여 분리하였으며 결과는 genet bio사의 형광 염색을 이용하여 염색시킨 후 사진촬영 후 증폭된 초성위체의 크기와 증폭된 단편을 비교하여 해당 단편이 증폭되면 1로 표시하고 증폭되지 않으면 0으로 표시하였다.In order to analyze the size of differently amplified PCR product fragments, polyacrylamide gel electrophoresis was used. The polyacrylamide concentration was separated using 0.6%, and the result was stained using fluorescence staining of genet bio company. After photographing, the size of the amplified supernatant was compared with the amplified fragment. And 0 if not amplified.
그 결과, 국내에서 육성된 땅콩 품종들에서 다형성을 나타내는 SSR 프라이머쌍 12쌍을 확인하여 AH4-4(서열번호 1과 2로 표시되는 프라이머쌍), AH4-20(서열번호 3과 4로 표시되는 프라이머쌍), PM-3(서열번호 5와 6으로 표시되는 프라이머쌍), PM-15(서열번호 7과 8로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq3A01(서열번호 9와 10으로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq7G02(서열번호 11과 12로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq8E12(서열번호 13과 14로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq10D4(서열번호 15와 16으로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq13A7(서열번호 17과 18로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq14H6(서열번호 19와 20으로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq15C10(서열번호 21과 22로 표시되는 프라이머쌍), PGPseq16G8(서열번호 23과 24로 표시되는 프라이머쌍)을 선별하였다(표 1 참조). 상기 12쌍의 프라이머에 의해 증폭된 PCR 단편의 각각을 비교한 결과는 다음 표 3과 같다.As a result, 12 pairs of SSR primer pairs showing polymorphism in the domestically grown peanut varieties were identified. AH4-4 (primary pairs represented by SEQ ID NOS: 1 and 2) and AH4-20 (SEQ ID NOs: 3 and 4) were identified. Primer pairs), PM-3 (primary pairs represented by SEQ ID NOs: 5 and 6), PM-15 (primary pairs represented by SEQ ID NOs: 7 and 8), PGPseq3A01 (primary pairs represented by SEQ ID NOs: 9 and 10), PGPseq7G02 (primary pairs represented by SEQ ID NOs: 11 and 12), PGPseq8E12 (primary pairs represented by SEQ ID NOs: 13 and 14), PGPseq10D4 (primary pairs represented by SEQ ID NOs: 15 and 16), and PGPseq13A7 (SEQ ID NOs: 17 and 18) Primer pairs shown), PGPseq14H6 (primer pairs represented by SEQ ID NOs: 19 and 20), PGPseq15C10 (primer pairs represented by SEQ ID NOs: 21 and 22), and PGPseq16G8 (primer pairs represented by SEQ ID NOs: 23 and 24) were selected. (See Table 1). The results of comparing the PCR fragments amplified by the 12 pairs of primers are shown in Table 3 below.
[표 3] 다형성을 보이는 프라이머의 종류 및 대립인자의 품종별 증폭 여부[Table 3] Amplification by primer type and allele varieties showing polymorphism
인자Opposition
factor
새들One
Birds
대광2
Dae Kwang
남광3
Indigo
대원4
Crew
신남광5
Shin Nam Kwang
왕6
king
대풍7
Dafeng
신대광8
Shin Dae Kwang
신광9
Shin Kwang
조광10
Dimming
기풍11
ethos
대청12
Daecheong
7G02PGPseq
7G02
8E12PGPseq
8E12
16G8PGPseq
16G8
3A1PGPseq
3A1
10D4PGPseq
10D4
13A7PGPseq
13A7
15C10PGPseq
15C10
인자Opposition
factor
팔광13
Eight light
진미14
Delicacy
조안15
Joan
세광16
Light
호광17
Arc
대양18
ocean
대신19
instead
보원20
Bowon
다광21
Dagwang
풍광22
Scenery
아광23
Agwang
대명24
Daemyung
7G02PGPseq
7G02
8E12PGPseq
8E12
16G8PGPseq
16G8
10D4PGPseq
10D4
13A7PGPseq
13A7
15C10PGPseq
15C10
인자Opposition
factor
고광25
High light
자광26
Light
백중27
Baekjung
다누리28
Danuri
백선29
ringworm
상평30
Sangpyeong
백진31
Baekjin
조평32
Chopyeong
참원33
Visit
참평34
Champyeong
풍산35
Poongsan
선안36
Line
7G02PGPseq
7G02
8E12PGPseq
8E12
16G8PGPseq
16G8
10D4PGPseq
10D4
13A7PGPseq
13A7
15C10PGPseq
15C10
상기 표 3에서와 같이 본발명의 프라이머쌍에 의해 증폭된 SSR을 포함하는 부위의 크기가 36품종의 땅콩샘플에서 다형성을 보였으며 이에 본 발명의 프라이머쌍에 의해 증폭된 부위에 위치하는 SSR은 다형성을 가짐을 알 수 있었다. 이때 각각의 SSR의 다형성을 보이는 대립인자 수 역시 표 1에 기재된 바와 같다.As shown in Table 3, the size of the site containing the SSR amplified by the primer pair of the present invention showed polymorphism in 36 kinds of peanut samples, and the SSR located at the site amplified by the primer pair of the present invention was polymorphic. It can be seen that. At this time, the number of alleles showing the polymorphism of each SSR is also as shown in Table 1.
<110> Republic of Korea <120> SSR primer derived from peanut and use thereof <160> 24 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 1 cgatttcttt actgagtgag 20 <210> 2 <211> 18 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 2 atttttttgc tccacaca 18 <210> 3 <211> 22 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 3 accaaatagg agagagggtt ct 22 <210> 4 <211> 26 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 4 ctctcttgct ggttctttat taactc 26 <210> 5 <211> 27 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 5 gaaagaaatt atacactcca attatgc 27 <210> 6 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 6 cggcatgaca gctctatgtt 20 <210> 7 <211> 25 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 7 ccttttctaa cacattcaca catga 25 <210> 8 <211> 19 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 8 ggctcccttc gatgatgac 19 <210> 9 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 9 atcattgtgc tgagggaagg 20 <210> 10 <211> 21 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 10 caccattttt ctttttcacc g 21 <210> 11 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 11 actcccgatg cacttgaaat 20 <210> 12 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 12 aacctctgtg cactgtccct 20 <210> 13 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 13 tctgttgaga accaccagca 20 <210> 14 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 14 gtgctagttg cttgacgcac 20 <210> 15 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 15 atccctgatt agtgcaacgc 20 <210> 16 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 16 cgtaggtggt tttaggaggg 20 <210> 17 <211> 21 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 17 aatccgacgc aatgataaaa a 21 <210> 18 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 18 tccccttatt gttccagcag 20 <210> 19 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 19 gcaactaggg tgtatgccgt 20 <210> 20 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 20 caaccctata caccgaggga 20 <210> 21 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 21 attcccatgt cgtcaagacc 20 <210> 22 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 22 gcgacggtat tggcttttag 20 <210> 23 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 23 ctcaaaaagc gcttagccac 20 <210> 24 <211> 20 <212> DNA <213> Arachis hypogaea L. <400> 24 ctgcctactg cctactgcct 20 <110> Republic of Korea <120> SSR primer derived from peanut and use <160> 24 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 1 cgatttcttt actgagtgag 20 <210> 2 <211> 18 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 2 atttttttgc tccacaca 18 <210> 3 <211> 22 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 3 accaaatagg agagagggtt ct 22 <210> 4 <211> 26 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 4 ctctcttgct ggttctttat taactc 26 <210> 5 <211> 27 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 5 gaaagaaatt atacactcca attatgc 27 <210> 6 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 6 cggcatgaca gctctatgtt 20 <210> 7 <211> 25 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 7 ccttttctaa cacattcaca catga 25 <210> 8 <211> 19 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 8 ggctcccttc gatgatgac 19 <210> 9 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 9 atcattgtgc tgagggaagg 20 <210> 10 <211> 21 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 10 caccattttt ctttttcacc g 21 <210> 11 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 11 actcccgatg cacttgaaat 20 <210> 12 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 12 aacctctgtg cactgtccct 20 <210> 13 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 13 tctgttgaga accaccagca 20 <210> 14 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 14 gtgctagttg cttgacgcac 20 <210> 15 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 15 atccctgatt agtgcaacgc 20 <210> 16 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 16 cgtaggtggt tttaggaggg 20 <210> 17 <211> 21 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 17 aatccgacgc aatgataaaa a 21 <210> 18 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 18 tccccttatt gttccagcag 20 <210> 19 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 19 gcaactaggg tgtatgccgt 20 <210> 20 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 20 caaccctata caccgaggga 20 <210> 21 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 21 attcccatgt cgtcaagacc 20 <210> 22 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 22 gcgacggtat tggcttttag 20 <210> 23 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 23 ctcaaaaagc gcttagccac 20 <210> 24 <211> 20 <212> DNA Arachis hypogaea L. <400> 24 ctgcctactg cctactgcct 20
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CN108396075A (en) * | 2018-05-18 | 2018-08-14 | 中国农业科学院油料作物研究所 | With the application of the relevant molecular labeling pPGPseq2A5 of peanut oil content |
CN111020015A (en) * | 2019-11-20 | 2020-04-17 | 广东省农业科学院作物研究所 | Method for rapidly detecting true and false peanut hybrid |
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2009
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CN111020015A (en) * | 2019-11-20 | 2020-04-17 | 广东省农业科学院作物研究所 | Method for rapidly detecting true and false peanut hybrid |
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