KR102559726B1 - 유전자 다형성 마커 기반 여성형 탈모증 위험도 예측 모델 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 여성형 탈모증 위험 예측을 위한 정보제공방법, 여성형 탈모증 위험 예측용 키트 및 여성형 탈모증 위험 예측 모델 등에 관한 것으로서, 본 발명에 의하면 각각의 개체에 대하여 여성형 탈모증이 발생할 위험성을 사전에 예측할 수 있으며, 높은 정확도로 여성형 탈모증의 위험성 예측할 수 있다. 나아가 본 발명의 예측 방법, 예측용 키트 및 예측 모델을 통해 얻은 정보를 토대로 여성형 탈모 증상을 미리 예방하고, 호전 또는 현상 유지를 시킬 수 있는 개인 맞춤형 의료기기, 의약품, 화장품 및 유효성분 등의 개발에 응용될 수 있을 것이다.
Description
본 발명은 여성형 탈모증 위험 예측을 위한 정보제공방법, 여성형 탈모증 위험 예측용 키트 및 여성형 탈모증 위험 예측 모델 등에 관한 것이다.
최근 의료 서비스에 대한 수요가 질환의 치료에서 질환별 위험도 예측을 통한 예방으로 점차 옮겨 감에 따라, 질환이 발생할 가능성을 사전에 예측하는 기술에 대한 중요성이 더욱 높아지고 있다. 현재 개인별 질환 위험도 예측을 위한 도구로서 유전자가 주로 사용되고 있으며, 개인별 유전자 검사를 이용하여 질병의 위험도를 예측하고, 환경적 요인에 대한 선제적 관리를 통해 향후 의료비용을 절감하고자 하는 수요가 증가하고 있는 추세이다. 급증하고 있는 소비자 직접 의뢰 유전자 검사(direct to consumer genetic test; DTC) 수요는 이를 뒷받침한다고 볼 수 있다.
한편, 여성형 탈모증은 여성에서 가장 흔하게 발생하는 탈모 질환이다. 여성형 탈모증의 원인에 대해서는 아직 명확하게 밝혀진 바 없으나, 남성형 탈모와 마찬가지로 유전적 영향과 환경적 영향에 의해 복합적으로 발생하는 것으로 추정하고 있다. 현재까지 남성형 탈모증과 관련된 유전자와 해당 유전자 연관 단일염기 다형성(single nucleotide polymorphism; SNP) 마커는 상당 부분 알려져 있으며, 이 중 일부 유전자(AR/EDA2R, 1p36.22, 2q35, 2q37.3, 3q25.1, 5q33.3, 7p21.1, 7q11.22, 12p12.1, 17q21.31, 18q21.1, 20p11, CYP19A1, ESR1/2, PGR, SRD5A1/2, MC4R 등)는 남성형 탈모증의 위험도를 계산하거나 예측하는데 활용되고 있다. 그러나, 여성형 탈모증은 남성형 탈모증과 유사한 병태생리를 공유한다고 알려져 있음에도 불구하고, 여성형 탈모증에서는 상기 유전자 및 해당 유전자의 단일염기 다형성 마커가 탈모증과 유의한 관련성을 찾을 수 없음이 보고되었다(S. Redler, A. G. Messenger, and R. C. Betz, “Genetics and other factors in the aetiology of female pattern hair loss”, Experimental Dermatology, vol. 26, no. 6, pp. 510-517, 2017). 이에 따라 여성형 탈모증과 연관된 유전자 및 해당 유전자의 단일염기 다형성 마커를 발굴할 필요성이 대두되고 있다.
S. Redler, A. G. Messenger, and R. C. Betz, "Genetics and other factors in the aetiology of female pattern hair loss", Experimental Dermatology, vol. 26, no. 6, pp. 510-517, 2017.
본 발명자들은 여성형 탈모증과 유의적 상관관계를 갖는 특정 유전자와 해당 유전자의 단일염기 다형성(single nucleotide polymorphism; SNP) 마커를 선별하고, 이를 이용한 개인별 여성형 탈모증 예측 모델, 개인별 여성형 탈모증의 발생 위험 예측 방법 및 이들을 적용한 여성형 탈모증 예측용 키트를 개발하여 본 발명을 완성하였다.
따라서 본 발명의 목적은 여성형 탈모증 위험 예측을 위한 정보제공방법을 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 여성형 탈모증 위험 예측용 키트를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 여성형 탈모증 위험 예측 모델을 제공하는 것이다.
그러나 본 발명이 이루고자 하는 기술적 과제는 이상에서 언급한 과제에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다.
상기와 같은 본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 개체로부터 분리한 시료로부터 하기 (1) 내지 (20)으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 위험도 스코어를 산출하는 단계를 포함하고, 상기 산출된 위험도 스코어의 합계가 0 보다 클수록 여성형 탈모증의 발생 확률이 높은 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험 예측을 위한 정보제공방법을 제공한다:
(1) 서열번호 1의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP(single nucleotide polymorphism) 위치의 염기가 T인 경우 위험도 스코어는 +1.63;
(2) 서열번호 2의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우 위험도 스코어는 +1.63;
(3) 서열번호 3의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우 위험도 스코어는 +1.59;
(4) 서열번호 4의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우 위험도 스코어는 +1.57;
(5) 서열번호 5의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우 위험도 스코어는 +1.85;
(6) 서열번호 6의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우 위험도 스코어는 +1.55;
(7) 서열번호 7의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우 위험도 스코어는 +1.55;
(8) 서열번호 8의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우 위험도 스코어는 +1.78;
(9) 서열번호 9의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우 위험도 스코어는 +2.11;
(10) 서열번호 10의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우 위험도 스코어는 +1.27;
(11) 서열번호 11의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 CA인 경우 위험도 스코어는 +1.47;
(12) 서열번호 12의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우 위험도 스코어는 +1.22;
(13) 서열번호 13의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우 위험도 스코어는 +1.59;
(14) 서열번호 14의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우 위험도 스코어는 +1.09;
(15) 서열번호 15의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우 위험도 스코어는 +1.17;
(16) 서열번호 16의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우 위험도 스코어는 +1.24;
(17) 서열번호 17의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우 위험도 스코어는 +1.69;
(18) 서열번호 18의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우 위험도 스코어는 +1.03;
(19) 서열번호 19의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우 위험도 스코어는 +1.54; 및
(20) 서열번호 20의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우 위험도 스코어는 +1.27.
더욱이, 본 발명은 개체로부터 분리한 시료로부터 상기 (1) 내지 (20)으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 위험도 스코어를 산출하는 단계를 포함하고, 상기 산출된 위험도 스코어의 합계가 0 보다 클수록 여성형 탈모증의 발생 확률이 높은 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험 예측 방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 개체로부터 분리한 시료로부터 하기 수식 1에 의해 여성형 탈모증 위험도(FPHLR)를 도출하는 단계를 포함하고, 상기 도출된 FPHLR이 0 보다 클수록 여성형 탈모증의 발생 확률이 높은 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험 예측을 위한 정보제공방법을 제공한다:
[수식 1]
상기 Rn은 서열번호 n의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 하기 표 1의 소수 대립유전자인 경우 이에 대응하는 위험도 스코어 값이고, 상기 Fn은 서열번호 n의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 소수 대립유전자인 빈도 값이며, 상기 n은 1 내지 20의 정수로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 정수이다;
[표 1]
더욱이, 본 발명은 개체로부터 분리한 시료로부터 상기 수식 1에 의해 여성형 탈모증 위험도(FPHLR)를 도출하는 단계를 포함하고, 상기 도출된 FPHLR이 0 보다 클수록 여성형 탈모증의 발생 확률이 높은 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험 예측 방법을 제공한다.
본 발명의 일 구현예에 있어서, 상기 정보제공방법 또는 예측 방법은 상기 수식 1에 의해 도출된 FPHLR 값에 따라 하기 표 2에 의해 예측 민감도 및 특이도를 결정하는 것일 수 있다:
[표 2]
본 발명의 다른 구현예에 있어서, 상기 SNP는 시퀀싱(sequencing), 엑솜 시퀀싱(exome sequencing), 마이크로어레이에 의한 혼성화(microarray hybridization), 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 동적 대립유전자 혼성화 기법(dynamic allele-specific hybridization), PCR 연장 분석 및 Taqman 기법으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 방법에 의해 확인될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 또 다른 구현예에 있어서, 상기 여성형 탈모증은 한국인에 대한 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명은 하기 (1) 내지 (20)의 SNP(single nucleotide polymorphism)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 SNP를 검출 또는 증폭하는 제제를 유효성분으로 포함하는 여성형 탈모증 위험 예측용 키트로서, 상기 키트는 상기 수식 1에 의해 여성형 탈모증 위험도(FPHLR)를 수치화하여 그 값이 0 보다 클수록 여성형 탈모증의 발생 확률이 높은 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험 예측용 키트를 제공한다:
(1) 서열번호 1의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(2) 서열번호 2의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(3) 서열번호 3의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(4) 서열번호 4의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(5) 서열번호 5의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(6) 서열번호 6의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(7) 서열번호 7의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(8) 서열번호 8의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(9) 서열번호 9의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(10) 서열번호 10의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(11) 서열번호 11의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 CA인 SNP;
(12) 서열번호 12의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(13) 서열번호 13의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP;
(14) 서열번호 14의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(15) 서열번호 15의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(16) 서열번호 16의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(17) 서열번호 17의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(18) 서열번호 18의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP;
(19) 서열번호 19의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP; 및
(20) 서열번호 20의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP.
본 발명의 일 구현예에 있어서, 상기 키트는 상기 수식 1에 의해 도출된 FPHLR 값에 따라 상기 표 2에 의해 예측 민감도 및 특이도를 결정하는 것일 수 있다.
본 발명의 다른 구현예에 있어서, 상기 SNP를 검출하는 제제는 상기 (1) 내지 (20)의 SNP로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 SNP를 검출할 수 있는 프로브(probe)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 또 다른 구현예에 있어서, 상기 SNP를 증폭하는 제제는 상기 (1) 내지 (20)의 SNP로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 SNP를 증폭할 수 있는 프라이머(primer) 세트일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 또 다른 구현예에 있어서, 상기 키트는 RT-PCR 키트 또는 마이크로어레이 칩 키트일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명은 하기 수식 1에 의해 산출된 여성형 탈모증 위험도(FPHLR) 값이 클수록 여성형 탈모증의 발생 확률이 높은 것으로 예측하고, 하기 표 2의 FPHLR 값에 대응하는 예측 민감도 및 특이도를 갖는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험 예측 모델을 제공한다:
[수식 1]
상기 Rn은 서열번호 n의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 하기 표 1의 소수 대립유전자인 경우 이에 대응하는 위험도 스코어 값이고, 상기 Fn은 서열번호 n의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 소수 대립유전자인 빈도 값이며, 상기 n은 1 내지 20의 정수로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 정수이다;
[표 1]
[표 2]
본 발명의 단일염기 다형성 마커를 이용한 여성형 탈모증 위험 예측을 위한 정보제공방법, 여성형 탈모증 위험 예측용 키트 및 여성형 탈모증 위험 예측 모델은 각각의 개체에 대하여 여성형 탈모증이 발생할 위험성을 사전에 예측할 수 있으며, 높은 정확도로 여성형 탈모증의 위험성 예측할 수 있는 효과가 있다. 나아가 본 발명의 예측 방법, 예측용 키트 및 예측 모델을 통해 얻은 정보를 토대로 여성형 탈모 증상을 미리 예방하고, 호전 또는 현상 유지를 시킬 수 있는 개인 맞춤형 의료기기, 의약품, 화장품 및 유효성분 등의 개발에 응용될 수 있을 것으로 기대된다.
도 1은 본 발명에 따른 여성형 탈모증 위험도 값을 기준으로 도출한 ROC(receiver operating characteristic) 곡선을 나타낸 도이다.
본 발명자들은 여성형 탈모증 외에는 다른 병력이 없는 건강한 여성을 대상으로 유전자를 확보하고, 특정 유전자 및 상기 유전자 상에 존재하는 수천 개의 단일염기 다형성(single nucleotide polymorphism; SNP)이 여성형 탈모증과 연관성이 있음을 확인하였다. 보다 정확한 예측 시스템을 구축하기 위해 상기 수천 개의 SNP 중 170개의 SNP를 선별하였고, 다시 이들 중 20개의 SNP를 선별하여 여성형 탈모증 위험 예측 모델을 구축하였다.
본 발명의 일 실시예에서는, 진단 또는 예측의 정확도를 높이기 위해 탈모증에 영향을 줄 수 있는 과거력이 있거나 질환을 앓고 있는 자를 연구 대상자에서 제외하였고, 선별된 연구 대상자의 유전자를 분석하여 여성형 탈모증과 연관된 SNP를 확보하였다(실시예 1 및 실시예 2 참조).
본 발명의 다른 실시예에서는, 여성형 탈모증과 연관된 유전자형을 검출하기 위하여 시험군/대조군들의 SNP 마커를 이용한 연관분석을 수행하였고, 정상 대조군과 비교하여 여성형 탈모증 환자에서 통계적으로 유의하게 많이 관찰되는 170 가지의 SNP를 선별하였다(실시예 3 참조).
따라서 본 발명은 하기 (1) 내지 (20)의 폴리뉴클레오타이드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 폴리뉴클레오타이드를 포함하는, 여성형 탈모증 진단 또는 예측용 SNP(single nucleotide polymorphism) 마커 조성물을 제공할 수 있다:
(1) 서열번호 1의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(2) 서열번호 2의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(3) 서열번호 3의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(4) 서열번호 4의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(5) 서열번호 5의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(6) 서열번호 6의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(7) 서열번호 7의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(8) 서열번호 8의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(9) 서열번호 9의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(10) 서열번호 10의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(11) 서열번호 11의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 CA인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(12) 서열번호 12의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(13) 서열번호 13의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(14) 서열번호 14의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(15) 서열번호 15의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(16) 서열번호 16의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(17) 서열번호 17의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(18) 서열번호 18의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(19) 서열번호 19의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드; 및
(20) 서열번호 20의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드.
본 발명에 있어서, 상기 조성물은 하기 (1) 내지 (150)의 폴리뉴클레오타이드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 폴리뉴클레오타이드를 더 포함할 수 있다:
(1) 서열번호 21의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(2) 서열번호 22의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(3) 서열번호 23의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(4) 서열번호 24의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(5) 서열번호 25의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 GTATAGCAT인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(6) 서열번호 26의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(7) 서열번호 27의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(8) 서열번호 28의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(9) 서열번호 29의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(10) 서열번호 30의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(11) 서열번호 31의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(12) 서열번호 32의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(13) 서열번호 33의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(14) 서열번호 34의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(15) 서열번호 35의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(16) 서열번호 36의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(17) 서열번호 37의 염기서열 내에서 101번째 염기가 TACAA 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(18) 서열번호 38의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(19) 서열번호 39의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(20) 서열번호 40의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(21) 서열번호 41의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(22) 서열번호 42의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(23) 서열번호 43의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(24) 서열번호 44의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(25) 서열번호 45의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(26) 서열번호 46의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(27) 서열번호 47의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(28) 서열번호 48의 염기서열 내에서 101번째 염기가 TCAAA 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(29) 서열번호 49의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(30) 서열번호 50의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(31) 서열번호 51의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(32) 서열번호 52의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(33) 서열번호 53의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(34) 서열번호 54의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(35) 서열번호 55의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(36) 서열번호 56의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(37) 서열번호 57의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(38) 서열번호 58의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(39) 서열번호 59의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(40) 서열번호 60의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(41) 서열번호 61의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(42) 서열번호 62의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(43) 서열번호 63의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(44) 서열번호 64의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(45) 서열번호 65의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(46) 서열번호 66의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(47) 서열번호 67의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(48) 서열번호 68의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(49) 서열번호 69의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(50) 서열번호 70의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(51) 서열번호 71의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(52) 서열번호 72의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 GA인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(53) 서열번호 73의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(54) 서열번호 74의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(55) 서열번호 75의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(56) 서열번호 76의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(57) 서열번호 77의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(58) 서열번호 78의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(59) 서열번호 79의 염기서열 내에서 101번째 염기가 TG 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(60) 서열번호 80의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(61) 서열번호 81의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(62) 서열번호 82의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(63) 서열번호 83의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(64) 서열번호 84의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(65) 서열번호 85의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(66) 서열번호 86의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(67) 서열번호 87의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(68) 서열번호 88의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(69) 서열번호 89의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(70) 서열번호 90의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(71) 서열번호 91의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(72) 서열번호 92의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(73) 서열번호 93의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(74) 서열번호 94의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(75) 서열번호 95의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(76) 서열번호 96의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(77) 서열번호 97의 염기서열 내에서 101번째 염기가 AC 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(78) 서열번호 98의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(79) 서열번호 99의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(80) 서열번호 100의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(81) 서열번호 101의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(82) 서열번호 102의 염기서열 내에서 101번째 염기가 AT 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(83) 서열번호 103의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(84) 서열번호 104의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(85) 서열번호 105의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(86) 서열번호 106의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(87) 서열번호 107의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(88) 서열번호 108의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(89) 서열번호 109의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(90) 서열번호 110의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(91) 서열번호 111의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(92) 서열번호 112의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(93) 서열번호 113의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(94) 서열번호 114의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(95) 서열번호 115의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(96) 서열번호 116의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(97) 서열번호 117의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(98) 서열번호 118의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(99) 서열번호 119의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(100) 서열번호 120의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(101) 서열번호 121의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(102) 서열번호 122의 염기서열 내에서 101번째 염기가 CT 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(103) 서열번호 123의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(104) 서열번호 124의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(105) 서열번호 125의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(106) 서열번호 126의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(107) 서열번호 127의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(108) 서열번호 128의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(109) 서열번호 129의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(110) 서열번호 130의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(111) 서열번호 131의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(112) 서열번호 132의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(113) 서열번호 133의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(114) 서열번호 134의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(115) 서열번호 135의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(116) 서열번호 136의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(117) 서열번호 137의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(118) 서열번호 138의 염기서열 내에서 101번째 염기가 TG 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(119) 서열번호 139의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(120) 서열번호 140의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(121) 서열번호 141의 염기서열 내에서 101번째 염기가 TCTCA 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(122) 서열번호 142의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(123) 서열번호 143의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(124) 서열번호 144의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(125) 서열번호 145의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(126) 서열번호 146의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(127) 서열번호 147의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(128) 서열번호 148의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(129) 서열번호 149의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(130) 서열번호 150의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(131) 서열번호 151의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(132) 서열번호 152의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(133) 서열번호 153의 염기서열 내에서 101번째 염기가 GTC 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(134) 서열번호 154의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(135) 서열번호 155의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(136) 서열번호 156의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(137) 서열번호 157의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(138) 서열번호 158의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(139) 서열번호 159의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(140) 서열번호 160의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(141) 서열번호 161의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(142) 서열번호 162의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(143) 서열번호 163의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(144) 서열번호 164의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(145) 서열번호 165의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(146) 서열번호 166의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(147) 서열번호 167의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(148) 서열번호 168의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드;
(149) 서열번호 169의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드; 및
(150) 서열번호 170의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 C인 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드.
본 명세서에서 사용된 용어 “폴리뉴클레오타이드(polynucleotide)”란, 단일 또는 이중 가닥의 형태로 된 디옥시리보핵산(deoxyribonucleic acid, DNA) 또는 리보핵산(ribonucleic acid, RNA)를 의미한다. 다른 제한이 없는 한, 자연적으로 생성되는 뉴클레오타이드와 비슷한 방법으로 핵산에 혼성화되는 자연적 뉴클레오타이드의 공지된 아날로그(analog)도 포함된다. 일반적으로 DNA는 아데닌(adenine, A), 구아닌(guanine, G), 시토신(cytosine, C), 티민(thymine, T)의 네 가지 염기로 구성되어 있으며, RNA는 티민 대신 우라실(Uracil, U)을 가지고 있다. 핵산 이중 가닥에서 A는 T 또는 U, C는 G 염기와 수소결합을 이루는데, 이러한 염기의 관계를 '상보적(complementary)'이라고 한다.
상기 용어 “상보적(complementary)”은 소정의 혼성화 또는 어닐링 조건, 구체적으로는 생리학적 조건하(세포 내)에서 핵산 분자 내 타겟팅 모이어티가 타겟(예컨대, EDN 유전자)에 선택적으로 혼성화할 정도로 충분히 상보적인 것을 의미하는 것으로 하나 또는 그 이상의 미스매치(mismatch) 염기서열을 가질 수 있으며, 실질적으로 상보적(substantially complementary) 및 완전히 상보적(perfectly complementary)인 것을 모두 포괄하는 의미를 가지며, 보다 구체적으로는 완전히 상보적인 것을 의미한다.
본 명세서에서 사용된 용어 “다형성(polymorphism)”이란, 유전적으로 결정된 집단 내에서 2 이상의 대체적 서열 또는 대립형질(또는 대립유전자)의 발생을 의미하며, “단일염기 다형성(single nucleotide polymorphism; SNP)”은 하나의 염기의 다형성을 의미한다. 구체적으로, 유전체에서 단일염기(A, T, C 또는 G)가 종의 멤버들 간 또는 한 개체(individual)의 쌍 염색체 간에 발생하는 DNA 서열의 다양성을 의미한다. 예를 들어, 서로 다른 개체의 세 개의 DNA 단편들(예를 들어 AAGT[A/A]AG, AAGT[A/G]AG, AAGT[G/G]AG)처럼 단일염기에서 차이를 포함하는 경우, 두 개의 대립유전자(A 또는 G)라고 부르며, 일반적으로 거의 모든 SNP는 두 개의 대립 유전자를 가진다. 또한, SNP가 특정 질환과 유전적으로 밀접하게 연관되어 있는 경우, SNP는 확인된 정상(normal) 또는 야생형(wild-type, WT) 개체 또는 대립유전자와 비교하여 특정 위치의 하나의 염기에 변이가 발생한 것을 의미하기도 한다.
본 명세서에서 사용되는 용어 “마커(marker)”는, 유전적으로 불특정 연관된 유전자좌를 동정할 때 참고점으로 사용되는 염기서열을 말한다. 이 용어는 또한 마커 서열을 증폭할 수 있는 프라이머 세트로 사용되는 핵산과 같은 마커 서열에 상보적인 핵산 서열에도 적용된다. 유전자 마커(genetic marker)의 유전자 지도상의 위치는 유전자좌(genetic locus)로 일컬어진다.
본 명세서에서 사용되는 용어 “유전자 마커”는, DNA 마커, 바이오마커, 분자마커 등의 용어와 상호 교환적으로 사용될 수 있다. 상기 마커는 작물의 재배 환경이나 성장 시기에 영향을 받지 않고 신속하게 형질을 구별할 수 있으므로 유용하게 사용될 수 있다. 유전자 마커는 유전현상의 본질인 DNA의 염기서열 차이를 대상으로 개체간 다형성(polymorphism)을 나타내는 방법으로서, 주로 반복되는 단순 염기서열로 이루어진 마이크로새틀라이트(microsatellite)나 유전자 염기서열을 이용한 마커 또는 RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism) 프로브나 SCAR(Sequence Characterised Amplified Region) 마커가 이용되고 있다.
본 명세서에서 사용된 용어 “대립유전자”는 상동염색체의 동일한 유전자 좌위에 존재하는 한 유전자가 서로 다른 형질을 갖는 것을 의미한다.
본 명세서에서 사용된 용어 “여성형 탈모증”이란, 위험도를 예측 또는 진단하고자 하는 개체의 특성을 의미하는 것으로, 본 발명에 따른 SNP 마커를 이용하여 측정할 수 있는 표현형은 제한 없이 포함하나, 바람직하게는 여성형 탈모증일 수 있다. 본 발명의 SNP 마커는 여성형 탈모증의 위험성을 예측하고 진단할 수 있도록 하므로, 유효성분과 접촉된 두피 및 모발의 변화된 정보도 줄 수 있다.
본 명세서에서 사용된 용어 “진단”은 특정 질병 또는 질환에 대한 한 객체의 감수성(susceptibility)을 판정하는 것, 한 객체가 특정 질병 또는 질환을 현재 가지고 있는지 여부를 판정하는 것, 특정 질병 또는 질환에 걸린 한 객체의 예후(prognosis)를 판정하는 것, 또는 테라메트릭스(therametrics)(예컨대, 치료 효능에 대한 정보를 제공하기 위하여 객체의 상태를 모니터링 하는 것)를 모두 포함하는 개념이다.
본 발명에 있어서, 상기 여성형 탈모증은 한국인에 대한 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 다른 양태로서, 본 발명은 하기 (1) 내지 (20)의 SNP(single nucleotide polymorphism)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 SNP를 검출 또는 증폭하는 제제를 유효성분으로 포함하는, 여성형 탈모증 진단 또는 예측용 조성물을 제공할 수 있다:
(1) 서열번호 1의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(2) 서열번호 2의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(3) 서열번호 3의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(4) 서열번호 4의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(5) 서열번호 5의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(6) 서열번호 6의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(7) 서열번호 7의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(8) 서열번호 8의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(9) 서열번호 9의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(10) 서열번호 10의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(11) 서열번호 11의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 CA인 SNP;
(12) 서열번호 12의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(13) 서열번호 13의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP;
(14) 서열번호 14의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(15) 서열번호 15의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(16) 서열번호 16의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(17) 서열번호 17의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(18) 서열번호 18의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP;
(19) 서열번호 19의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP; 및
(20) 서열번호 20의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP.
본 발명에 있어서, 상기 조성물은 하기 (1) 내지 (150)의 SNP로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 SNP를 검출 또는 증폭하는 제제를 더 포함할 수 있다:
(1) 서열번호 21의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(2) 서열번호 22의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(3) 서열번호 23의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(4) 서열번호 24의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(5) 서열번호 25의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 GTATAGCAT인 SNP;
(6) 서열번호 26의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP;
(7) 서열번호 27의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(8) 서열번호 28의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 T인 SNP;
(9) 서열번호 29의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(10) 서열번호 30의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(11) 서열번호 31의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 G인 SNP;
(12) 서열번호 32의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 T인 SNP;
(13) 서열번호 33의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 T인 SNP;
(14) 서열번호 34의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(15) 서열번호 35의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 G인 SNP;
(16) 서열번호 36의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(17) 서열번호 37의 염기서열 내에서 101번째 염기가 TACAA 또는 T인 SNP;
(18) 서열번호 38의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP;
(19) 서열번호 39의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 C인 SNP;
(20) 서열번호 40의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 C인 SNP;
(21) 서열번호 41의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(22) 서열번호 42의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(23) 서열번호 43의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(24) 서열번호 44의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(25) 서열번호 45의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 C인 SNP;
(26) 서열번호 46의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 G인 SNP;
(27) 서열번호 47의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(28) 서열번호 48의 염기서열 내에서 101번째 염기가 TCAAA 또는 T인 SNP;
(29) 서열번호 49의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(30) 서열번호 50의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(31) 서열번호 51의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(32) 서열번호 52의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(33) 서열번호 53의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 T인 SNP;
(34) 서열번호 54의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(35) 서열번호 55의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(36) 서열번호 56의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(37) 서열번호 57의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(38) 서열번호 58의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 T인 SNP;
(39) 서열번호 59의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 C인 SNP;
(40) 서열번호 60의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(41) 서열번호 61의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(42) 서열번호 62의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(43) 서열번호 63의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(44) 서열번호 64의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(45) 서열번호 65의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(46) 서열번호 66의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 G인 SNP;
(47) 서열번호 67의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(48) 서열번호 68의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 T인 SNP;
(49) 서열번호 69의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(50) 서열번호 70의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 C인 SNP;
(51) 서열번호 71의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(52) 서열번호 72의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 GA인 SNP;
(53) 서열번호 73의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(54) 서열번호 74의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(55) 서열번호 75의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(56) 서열번호 76의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(57) 서열번호 77의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(58) 서열번호 78의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(59) 서열번호 79의 염기서열 내에서 101번째 염기가 TG 또는 T인 SNP;
(60) 서열번호 80의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(61) 서열번호 81의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(62) 서열번호 82의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP;
(63) 서열번호 83의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(64) 서열번호 84의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(65) 서열번호 85의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(66) 서열번호 86의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(67) 서열번호 87의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 G인 SNP;
(68) 서열번호 88의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(69) 서열번호 89의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(70) 서열번호 90의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 T인 SNP;
(71) 서열번호 91의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(72) 서열번호 92의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 G인 SNP;
(73) 서열번호 93의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(74) 서열번호 94의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(75) 서열번호 95의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(76) 서열번호 96의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(77) 서열번호 97의 염기서열 내에서 101번째 염기가 AC 또는 A인 SNP;
(78) 서열번호 98의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(79) 서열번호 99의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 G인 SNP;
(80) 서열번호 100의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 C인 SNP;
(81) 서열번호 101의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP;
(82) 서열번호 102의 염기서열 내에서 101번째 염기가 AT 또는 T인 SNP;
(83) 서열번호 103의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(84) 서열번호 104의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 C인 SNP;
(85) 서열번호 105의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(86) 서열번호 106의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(87) 서열번호 107의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 C인 SNP;
(88) 서열번호 108의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(89) 서열번호 109의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(90) 서열번호 110의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(91) 서열번호 111의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP;
(92) 서열번호 112의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(93) 서열번호 113의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(94) 서열번호 114의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(95) 서열번호 115의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(96) 서열번호 116의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(97) 서열번호 117의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(98) 서열번호 118의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 C인 SNP;
(99) 서열번호 119의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 T인 SNP;
(100) 서열번호 120의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(101) 서열번호 121의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP;
(102) 서열번호 122의 염기서열 내에서 101번째 염기가 CT 또는 C인 SNP;
(103) 서열번호 123의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(104) 서열번호 124의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP;
(105) 서열번호 125의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(106) 서열번호 126의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(107) 서열번호 127의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 C인 SNP;
(108) 서열번호 128의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(109) 서열번호 129의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(110) 서열번호 130의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(111) 서열번호 131의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 G인 SNP;
(112) 서열번호 132의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(113) 서열번호 133의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 G인 SNP;
(114) 서열번호 134의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 G인 SNP;
(115) 서열번호 135의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(116) 서열번호 136의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(117) 서열번호 137의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(118) 서열번호 138의 염기서열 내에서 101번째 염기가 TG 또는 T인 SNP;
(119) 서열번호 139의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(120) 서열번호 140의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(121) 서열번호 141의 염기서열 내에서 101번째 염기가 TCTCA 또는 T인 SNP;
(122) 서열번호 142의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(123) 서열번호 143의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 T인 SNP;
(124) 서열번호 144의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(125) 서열번호 145의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP;
(126) 서열번호 146의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(127) 서열번호 147의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(128) 서열번호 148의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP;
(129) 서열번호 149의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(130) 서열번호 150의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(131) 서열번호 151의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(132) 서열번호 152의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(133) 서열번호 153의 염기서열 내에서 101번째 염기가 GTC 또는 G인 SNP;
(134) 서열번호 154의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 T인 SNP;
(135) 서열번호 155의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(136) 서열번호 156의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(137) 서열번호 157의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP;
(138) 서열번호 158의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(139) 서열번호 159의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP;
(140) 서열번호 160의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(141) 서열번호 161의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(142) 서열번호 162의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(143) 서열번호 163의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(144) 서열번호 164의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(145) 서열번호 165의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(146) 서열번호 166의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(147) 서열번호 167의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(148) 서열번호 168의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(149) 서열번호 169의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP; 및
(150) 서열번호 170의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 C인 SNP.
상기 언급된 서열번호 1 내지 서열번호 170의 염기서열은 본 발명에 따른 SNP 위치에 해당하는 염기를 r로 표시하고, 상기 SNP 위치를 기준으로 하여, 5' 방향의 서열 100 nt, 3' 방향의 서열 100 nt를 표시한 것이다. 예를 들어, 서열번호 1(rs_id, rs11831183)의 염기서열은 SNP 위치를 r로 표시하고 이를 기준으로 각각 100 nt 길이의 염기서열을 양쪽으로 표시한 것으로서, 총 길이 201 nt의 서열이 표시된 것이다. 또한, r로 표시한 염기가 예를 들어, 다수 대립유전자인 C 또는 소수 대립유전자인 T로 확인된 경우 서열목록의 식별번호 <223> 항목에 r = c or t로 표시하였다. 상기 서열번호 1 내지 서열번호 170의 염기서열은 개체, 특히 인간에서 SNP의 위치를 특정하기 위한 목적으로 사용되는 것이며, 따라서 상기 서열번호 1 내지 서열번호 170의 염기서열이 갖는 길이나 표시한 범위에 의해 본 발명이 제한되는 것은 아니다.
본 명세서에서 사용된 용어 “검출”이란, 목적하는 물질(본 발명에서의 SNP)의 존재 여부를 측정 및 확인하는 것, 또는 목적하는 물질의 존재 수준의 변화를 측정 및 확인하는 것을 모두 포함하는 의미이다. 따라서 상기 “제제”는 본 발명에 따른 SNP가 포함된 부위에 특이적으로 결합하여 인식할 수 있도록 하거나 상기 SNP가 포함된 부위를 증폭시킬 수 있는 제제로서, 구체적으로는 상기 SNP가 포함된 부위에 특이적으로 결합할 수 있는 프로브(probe), 상기 SNP가 포함된 부위를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드를 특이적으로 증폭할 수 있는 프라이머(primer) 세트일 수 있다.
본 명세서에서 사용된 용어 “프라이머(primer)”란, DNA 합성의 개시점(starting point)으로 작용하는 짧은 단일가닥 올리고뉴클레오타이드(single strand oligonucleotide)이다. 프라이머는 적합한 완충액(buffer)와 온도 조건에서 주형(template)인 폴리뉴클레오타이드에 특이적으로 결합하고, DNA 중합효소가 프라이머에 주형 DNA에 상보적인 염기를 갖는 뉴클레오사이드 트리포스페이트를 추가하여 연결함으로써 DNA가 합성된다. 프라이머는 일반적으로 15 내지 30개의 염기서열로 이루어져 있으며, 염기 구성과 길이에 따라 주형 가닥에 결합하는 온도(melting temperature, Tm)가 달라진다. 프라이머의 서열은 주형의 일부 염기 서열과 완전하게 상보적인 서열을 가질 필요는 없으며, 주형과 혼성화되어 프라이머 고유의 작용을 할 수 있는 범위 내에서의 충분한 상보성을 가지면 충분하다. 따라서 본 발명에서 상기 SNP 부위의 cDNA 또는 genomic DNA의 염기서열을 참조하여 본 발명에 따른 검출 제제인 프라이머 세트를 용이하게 디자인할 수 있다. SNP를 검출하기 위한 프라이머는 각 유전자 서열에 완벽하게 상보적인 서열을 가질 필요는 없으며, DNA 합성을 통해 mRNA 또는 cDNA의 특정 구간을 증폭하여 mRNA의 양을 측정하려는 목적에 맞는 길이와 상보성을 갖는 것이면 충분하다. 상기 증폭 반응을 위한 프라이머는 증폭하고자 하는 mRNA의 특정 구간의 양쪽 끝부분의 주형(또는 센스, sense)과 반대편(안티센스, antisense)에 각각 상보적으로 결합하는 한 세트(쌍)으로 구성된다.
본 명세서에서 사용된 용어 “프로브(probe)”란, 특정 유전자의 mRNA나 cDNA(complementary DNA), DNA 등에 특이적으로 결합할 수 있는 짧게는 수개 내지 길게는 수백 개의 염기(base pair) 길이의 RNA 또는 DNA 등의 폴리뉴클레오타이드 단편을 의미하며, 표지(labeling)되어 있어서 결합하는 대상 mRNA나 cDNA의 존재 유무, 발현량 등을 확인할 수 있다. 프로브의 선택 및 혼성화 조건은 당업계에 공지된 기술에 따라 적절하게 선택할 수 있다. 상기 프로브는 대립형질(또는 대립유전자, allele)을 검출하기 위한 진단 방법 등에 사용될 수 있다. 상기 진단 방법에는 서던 블롯 등과 같은 핵산의 혼성화에 근거한 검출 방법들이 포함되며, DNA 칩을 이용한 방법에서 DNA 칩의 기판에 미리 결합된 형태로 제공될 수도 있다. 본 발명에서 상기 프라이머 또는 프로브는 포스포아미다이트(phosphoramidite) 고체지지체 합성법이나 기타 널리 공지된 방법을 이용하여 화학적으로 합성할 수 있다. 또한, 프라이머 또는 프로브는 검출하고자 하는 표적이 되는 폴리뉴클레오타이드와의 혼성화를 방해하지 않는 범위에서 당해 기술분야에 공지된 방법에 따라 다양하게 변형시킬 수 있다. 이러한 변형의 예로는 메틸화, 캡화, 천연 뉴클레오타이드 하나 이상의 동족체로의 치환 및 뉴클레오타이드 간의 변형, 예를 들면 하전되지 않은 연결체(예: 메틸 포스포네이트, 포스포트리에스터, 포스포로아미데이트, 카바메이트 등) 또는 하전된 연결체(예: 포스포로싸이오에이트, 포스포로디싸이오에이트 등), 그리고 형광 또는 효소를 이용한 표지 물질(labeling material)의 결합 등이 있다.
상기 프로브는 이의 5' 말단에 리포터(reporter)가 추가로 더 접합될 수 있다. 상기 리포터는 FAM(6-carboxyfluorescein), 텍사스 레드(texas red), 플루오레신(fluorescein), 플루오레신 클로로트리아지닐(fluorescein chlorotriazinyl), HEX(2',4',5',7'-tetrachloro-6-carboxy-4,7-dichlorofluorescein), 로다민 그린(rhodamine green), 로다민 레드(rhodamine red), 테트라메틸로다민(tetramethylrhodamine), FITC(fluorescein isothiocyanate), 오레곤 그린(oregon green), 알렉사 플루오로(alexa fluor), JOE(6-Carboxy-4',5'-Dichloro-2',7'-Dimethoxyfluorescein), ROX(6-Carboxyl-X-Rhodamine), TET(Tetrachloro-Fluorescein), TRITC(tertramethylrodamine isothiocyanate), TAMRA(6-carboxytetramethyl-rhodamine), NED(N-(1-Naphthyl)ethylenediamine), 시아닌(Cyanine) 계열 염료 및 씨아디카르보시아닌(thiadicarbocyanine)으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상일 수 있으나, 이외에 당업계에서 리포터로 사용될 수 있는 물질이라고 알려진 것이라면 모두 사용할 수 있다.
상기 프로브는 이의 3' 말단에 소광자(quencher)가 추가로 더 접합될 수 있다. 상기 소광자는 TAMRA, BHQ(black hole quencher) 1, BHQ2, BHQ3, NFQ(nonfluorescent quencher), 답실(dabcyl), Eclipse, DDQ(deep dark quencher), 블랙베리 퀸처(Blackberry Quencher), 아이오와 블랙(Iowa black)으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상일 수 있으나, 이외에 당업계에서 소광자로 사용될 수 있는 물질이라고 알려진 것이라면 모두 사용할 수 있다.
본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 본 발명에 따른 조성물을 포함하는 여성형 탈모증 진단 또는 예측용 키트를 제공할 수 있다.
상기 키트는 여성형 탈모증 진단 또는 예측용 SNP 마커를 증폭을 통해 확인하거나, SNP 마커에서 특정 대립유전자, 예를 들어 소수 대립유전자의 존재 여부를 확인함으로써 여성형 탈모증을 진단하거나 발생 위험성을 예측할 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 키트는 RT-PCR 키트 또는 마이크로어레이 칩 키트일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 RT-PCR 키트는 상기 SNP 부위를 포함하는 핵산을 증폭할 수 있는 각각의 프라이머 세트를 포함할 수 있으며, 그 외 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액, 디옥시뉴클레오타이드(dNTPs), Taq-중합효소 및 역전사효소와 같은 효소, DNase, RNAse 억제제, DEPC-물(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한 정량 대조군으로 사용되는 유전자에 특이적인 프라이머 세트를 함께 포함할 수 있다.
상기 마이크로어레이 칩 키트는 상기 SNP 부위를 포함하는 핵산이 고정화되어 있는 기판을 갖는 마이크로어레이를 포함할 수 있다. 상기 마이크로어레이는 본 발명의 폴리뉴클레오타이드, 프라이머 세트 또는 프로브를 포함하는 것을 제외하고는 통상적인 마이크로어레이로 이루어질 수 있다. 마이크로어레이 상에서 핵산의 혼성화 및 혼성화 결과의 검출은 당업계에 잘 알려져 있다. 상기 검출은 예를 들면, 핵산 시료를 형광 물질, 예를 들면, Cy3 및 Cy5와 같은 물질을 포함하는 검출 가능한 신호를 발생시킬 수 있는 표지 물질로 표지한 다음, 마이크로어레이 상에 혼성화하고 상기 표지 물질로부터 발생하는 신호를 검출함으로써 혼성화 결과를 검출할 수 있다.
본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 개체로부터 분리한 핵산 시료로부터 하기 (1) 내지 (20)으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상을 만족하는 SNP가 확인된 경우, 여성형 탈모증으로 진단하거나 여성형 탈모증이 발생할 것으로 예측하는 단계를 포함하는, 여성형 탈모증 진단 또는 예측을 위한 정보제공방법 또는 여성형 탈모증 진단 또는 예측 방법을 제공할 수 있다:
(1) 서열번호 1의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(2) 서열번호 2의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(3) 서열번호 3의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(4) 서열번호 4의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(5) 서열번호 5의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(6) 서열번호 6의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(7) 서열번호 7의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(8) 서열번호 8의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(9) 서열번호 9의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(10) 서열번호 10의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(11) 서열번호 11의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 CA인 경우;
(12) 서열번호 12의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(13) 서열번호 13의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(14) 서열번호 14의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(15) 서열번호 15의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(16) 서열번호 16의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(17) 서열번호 17의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(18) 서열번호 18의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(19) 서열번호 19의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우; 및
(20) 서열번호 20의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우.
본 발명에 있어서, 상기 정보제공방법 또는 방법은 개체로부터 분리한 핵산 시료로부터 하기 (1) 내지 (150)으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상을 만족하는 SNP가 확인된 경우, 여성형 탈모증으로 진단하거나 여성형 탈모증이 발생할 것으로 예측하는 단계를 더 포함할 수 있다:
(1) 서열번호 21의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(2) 서열번호 22의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(3) 서열번호 23의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(4) 서열번호 24의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(5) 서열번호 25의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 GTATAGCAT인 경우;
(6) 서열번호 26의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(7) 서열번호 27의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(8) 서열번호 28의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(9) 서열번호 29의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(10) 서열번호 30의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(11) 서열번호 31의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(12) 서열번호 32의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(13) 서열번호 33의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(14) 서열번호 34의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(15) 서열번호 35의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(16) 서열번호 36의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(17) 서열번호 37의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(18) 서열번호 38의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(19) 서열번호 39의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(20) 서열번호 40의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(21) 서열번호 41의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(22) 서열번호 42의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(23) 서열번호 43의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(24) 서열번호 44의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(25) 서열번호 45의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(26) 서열번호 46의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(27) 서열번호 47의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(28) 서열번호 48의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(29) 서열번호 49의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(30) 서열번호 50의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(31) 서열번호 51의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(32) 서열번호 52의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(33) 서열번호 53의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(34) 서열번호 54의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(35) 서열번호 55의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(36) 서열번호 56의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(37) 서열번호 57의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(38) 서열번호 58의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(39) 서열번호 59의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(40) 서열번호 60의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(41) 서열번호 61의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(42) 서열번호 62의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(43) 서열번호 63의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(44) 서열번호 64의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(45) 서열번호 65의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(46) 서열번호 66의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(47) 서열번호 67의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(48) 서열번호 68의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(49) 서열번호 69의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(50) 서열번호 70의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(51) 서열번호 71의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(52) 서열번호 72의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 GA인 경우;
(53) 서열번호 73의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(54) 서열번호 74의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(55) 서열번호 75의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(56) 서열번호 76의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(57) 서열번호 77의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(58) 서열번호 78의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(59) 서열번호 79의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(60) 서열번호 80의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(61) 서열번호 81의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(62) 서열번호 82의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(63) 서열번호 83의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(64) 서열번호 84의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(65) 서열번호 85의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(66) 서열번호 86의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(67) 서열번호 87의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(68) 서열번호 88의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(69) 서열번호 89의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(70) 서열번호 90의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(71) 서열번호 91의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(72) 서열번호 92의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(73) 서열번호 93의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(74) 서열번호 94의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(75) 서열번호 95의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(76) 서열번호 96의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(77) 서열번호 97의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(78) 서열번호 98의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(79) 서열번호 99의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(80) 서열번호 100의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(81) 서열번호 101의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(82) 서열번호 102의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(83) 서열번호 103의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(84) 서열번호 104의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(85) 서열번호 105의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(86) 서열번호 106의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(87) 서열번호 107의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(88) 서열번호 108의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(89) 서열번호 109의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(90) 서열번호 110의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(91) 서열번호 111의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(92) 서열번호 112의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(93) 서열번호 113의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(94) 서열번호 114의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(95) 서열번호 115의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(96) 서열번호 116의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(97) 서열번호 117의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(98) 서열번호 118의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(99) 서열번호 119의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(100) 서열번호 120의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(101) 서열번호 121의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(102) 서열번호 122의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(103) 서열번호 123의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(104) 서열번호 124의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(105) 서열번호 125의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(106) 서열번호 126의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(107) 서열번호 127의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(108) 서열번호 128의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(109) 서열번호 129의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(110) 서열번호 130의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(111) 서열번호 131의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(112) 서열번호 132의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(113) 서열번호 133의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(114) 서열번호 134의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(115) 서열번호 135의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(116) 서열번호 136의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(117) 서열번호 137의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(118) 서열번호 138의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(119) 서열번호 139의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(120) 서열번호 140의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(121) 서열번호 141의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(122) 서열번호 142의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(123) 서열번호 143의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(124) 서열번호 144의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(125) 서열번호 145의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(126) 서열번호 146의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(127) 서열번호 147의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(128) 서열번호 148의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(129) 서열번호 149의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(130) 서열번호 150의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(131) 서열번호 151의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(132) 서열번호 152의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(133) 서열번호 153의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(134) 서열번호 154의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(135) 서열번호 155의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(136) 서열번호 156의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(137) 서열번호 157의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(138) 서열번호 158의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(139) 서열번호 159의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우;
(140) 서열번호 160의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(141) 서열번호 161의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(142) 서열번호 162의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(143) 서열번호 163의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(144) 서열번호 164의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우;
(145) 서열번호 165의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(146) 서열번호 166의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우;
(147) 서열번호 167의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(148) 서열번호 168의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우;
(149) 서열번호 169의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우; 및
(150) 서열번호 170의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우.
본 발명에 있어서, 본 발명에 따른 SNP 마커의 여성형 탈모증 위험성 예측 및 진단 여부는 각 마커들의 빈도 수를 측정하여 판단하였다. 이와 같은 유의성은 0.05 미만, 0.01 미만, 0.001 미만, 0.0001 미만, 0.00001 미만, 0.000001 미만, 0.0000001 미만, 또는 0.00000001 미만의 p 값(p-value)을 갖는 것을 특징으로 하나, 이에 제한되는 것은 아니다.
일 구현예로서, 개체의 유전자를 확인하여 본 발명에 따른 SNP 부위의 염기가 소수 대립유전자(minor allele)인 경우, 정상 대조군(control)과 여성형 탈모 환자인 시험군(case)의 빈도 값 중 빈도 값이 높은 군의 표현형으로 판단하며, SNP 부위의 염기가 다수 대립유전자(major allele)인 경우에는 정상 대조군과 여성형 탈모 환자인 시험군의 빈도 값 중 빈도 값이 낮은 군의 표현형으로 판단할 수 있다. 예를 들면, 하기 실시예 3의 표 3에서 개체의 4번 염색체의 23,486,441번째 염기가 G인 경우에는 시험군의 빈도 값이 더 높으므로 소수 대립유전자인 G가 나온 상기 개체는 시험군인 여성형 탈모증 환자로 진단하거나 여성형 탈모증 발생 위험이 높아진 것으로 예측할 수 있는 것이다. 다른 예로, 개체의 12번 염색체의 112,165,066번째 염기가 다수 대립유전자인 C인 경우에는 대조군의 빈도 값이 더 낮으므로 이는 대조군인 정상으로 볼 수 있다.
본 명세서에서 사용된 용어 “개체” 또는 “대상체”는 여성형 탈모증의 진단 또는 예측을 하기 위한 피험자를 의미한다.
본 명세서에서 사용된 용어 “시료”는 여성형 탈모증을 진단 또는 예측하고자 하는 개체 또는 대상체로부터 채취된 것이라면 제한 없이 사용할 수 있으며, 예를 들어 생검 등으로 얻어진 세포나 조직, 혈액, 전혈, 혈청, 혈장, 타액, 뇌척수액, 각종 분비물, 소변, 대변 등일 수 있다. 바람직하게는 혈액, 혈장, 혈청, 타액, 비액, 객담, 복수, 질 분비물 및 소변으로 이루어진 군에서 선택될 수 있으며, 바람직하게는 혈액, 혈장 또는 혈청일 수 있다. 상기 시료는 검출 또는 진단에 사용하기 전에 전처리할 수 있다. 예를 들어, 균질화(homogenization), 여과, 증류, 추출, 농축, 방해 성분의 불활성화, 시약의 첨가 등을 포함할 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 SNP는 시퀀싱(sequencing), 엑솜 시퀀싱(exome sequencing), 마이크로어레이에 의한 혼성화(microarray hybridization), 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 동적 대립유전자 혼성화 기법(dynamic allele-specific hybridization), PCR 연장 분석 및 Taqman 기법으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 방법에 의해 확인될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
한편, 본 발명의 일 실시예에서는, 전술한 170개의 SNP 마커 중 20개의 SNP 마커를 다시 선별하여 리스크 스코어를 부여하고, 각 개체별로 유전자형을 검출하여 확보된 각 SNP 마커의 빈도에 따라 여성형 탈모증의 위험도(FPHLR)를 계산하였다. 이렇게 계산된 FPHLR 기준값에 따라 민감도와 특이도를 계산하였고, 이를 토대로 ROC 곡선 및 AUC 값을 확보하였다. 상기와 같이 확보한 데이터를 이용하여 여성형 탈모증의 위험도를 수치화하여 그 발생 위험을 예측할 수 있는 모델을 구축하였다(실시예 4 참조).
따라서 본 발명의 다른 양태로서, 본 발명은 개체로부터 분리한 시료로부터 하기 (1) 내지 (20)으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 위험도 스코어를 산출하는 단계를 포함하고, 상기 산출된 위험도 스코어의 합계가 0 보다 클수록 여성형 탈모증의 발생 확률이 높은 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험 예측을 위한 정보제공방법 또는 여성형 탈모증 위험 예측 방법을 제공할 수 있다:
(1) 서열번호 1의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP(single nucleotide polymorphism) 위치의 염기가 T인 경우 위험도 스코어는 +1.63;
(2) 서열번호 2의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우 위험도 스코어는 +1.63;
(3) 서열번호 3의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우 위험도 스코어는 +1.59;
(4) 서열번호 4의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우 위험도 스코어는 +1.57;
(5) 서열번호 5의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우 위험도 스코어는 +1.85;
(6) 서열번호 6의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우 위험도 스코어는 +1.55;
(7) 서열번호 7의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우 위험도 스코어는 +1.55;
(8) 서열번호 8의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우 위험도 스코어는 +1.78;
(9) 서열번호 9의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우 위험도 스코어는 +2.11;
(10) 서열번호 10의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우 위험도 스코어는 +1.27;
(11) 서열번호 11의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 CA인 경우 위험도 스코어는 +1.47;
(12) 서열번호 12의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우 위험도 스코어는 +1.22;
(13) 서열번호 13의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우 위험도 스코어는 +1.59;
(14) 서열번호 14의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 G인 경우 위험도 스코어는 +1.09;
(15) 서열번호 15의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 경우 위험도 스코어는 +1.17;
(16) 서열번호 16의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우 위험도 스코어는 +1.24;
(17) 서열번호 17의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우 위험도 스코어는 +1.69;
(18) 서열번호 18의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우 위험도 스코어는 +1.03;
(19) 서열번호 19의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 경우 위험도 스코어는 +1.54; 및
(20) 서열번호 20의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 A인 경우 위험도 스코어는 +1.27.
본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 개체로부터 분리한 시료로부터 하기 수식 1에 의해 여성형 탈모증 위험도(FPHLR)를 도출하는 단계를 포함하고, 상기 도출된 FPHLR이 0 보다 클수록 여성형 탈모증의 발생 확률이 높은 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험 예측을 위한 정보제공방법 또는 여성형 탈모증 위험 예측 방법을 제공할 수 있다:
[수식 1]
상기 Rn은 서열번호 n의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 하기 표 1의 소수 대립유전자인 경우 이에 대응하는 위험도 스코어 값이고, 상기 Fn은 서열번호 n의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 소수 대립유전자인 빈도 값이며, 상기 n은 1 내지 20의 정수로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 정수이다;
[표 1]
일 구현예에서, 상기 FPHLR은 본 발명의 선별된 20가지 SNP 마커 중 1개 또는 2개 이상의 조합을 확인하여 도출된다. 개체의 각 SNP 부위에서 소수 대립유전자(minor allele) 빈도에 따라, 상기 표 1에 표시된 해당 SNP 마커의 위험도 스코어를 모두 합산함으로써 위험도(FPHLR)를 계산할 수 있다. 예를 들어, 상기 수식 1에서 n이 1이고 빈도 값이 2인 경우, 즉 개체에서 서열번호 1의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 T인 빈도가 2인 경우, 다시 말하면 개체의 12번 염색체의 112,165,066번째 염기(rs11831183)가 T인 빈도가 2인 경우, 1.63 × 2 만큼 위험도가 증가하며, 해당 마커의 염기 T의 빈도가 1인 경우는 1.63 × 1 만큼 위험도가 증가한다. 반면, 12번 염색체의 112,225,799번째 염기가 모두 C라면 위험도는 증가하지 않는다. 상기 FPHLR은 서열번호 1 내지 서열번호 20의 염기서열 중 어느 하나 이상의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기 및 빈도 값을 확인하고, 이를 할당된 위험도 스코어를 곱한 값을 모두 합산하여 도출된다. 이와 같이 하나 이상의 SNP로부터 도출되는 위험도 스코어 값의 합산은 상기 수식 1에서 시그마(Σ)로 표현하였다.
본 발명에 있어서, 상기 정보제공방법 또는 예측 방법은 상기 수식 1에 의해 도출된 FPHLR 값에 따라 하기 표 2에 의해 예측 민감도 및 특이도를 결정하는 것일 수 있다:
[표 2]
일 구현예에 있어서, 위험도 합계값(FPHLR) 기준 2.87에서 민감도 90.48%, 특이도 76.63%로 여성형 탈모증을 예측할 수 있다.
본 명세서에서 사용된 용어 “민감도”란, 최종 임상병리학적 진단이 여성형 탈모증인 시료 또는 환자에 대하여 본 발명에 따른 정보제공방법 또는 방법을 통해 여성형 탈모증의 위험도가 증가한 것으로 예측된 비율을 의미한다.
본 명세서에서 사용된 용어 “특이도”란, 최종 임상병리학적 진단이 정상인 시료 또는 환자에 대하여, 본 발명에 따른 정보제공방법 또는 방법을 통해 여성형 탈모증의 위험도가 없는 것, 즉 정상으로 예측된 비율을 의미한다.
본 발명에 있어서, 상기 SNP는 시퀀싱(sequencing), 엑솜 시퀀싱(exome sequencing), 마이크로어레이에 의한 혼성화(microarray hybridization), 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 동적 대립유전자 혼성화 기법(dynamic allele-specific hybridization), PCR 연장 분석 및 Taqman 기법으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 방법에 의해 확인될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에 있어서, 상기 여성형 탈모증은 한국인에 대한 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 하기 (1) 내지 (20)의 SNP(single nucleotide polymorphism)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 SNP를 검출 또는 증폭하는 제제를 유효성분으로 포함하는 여성형 탈모증 위험 예측용 키트로서, 상기 키트는 상기 수식 1에 의해 여성형 탈모증 위험도(FPHLR)를 수치화하여 그 값이 0 보다 클수록 여성형 탈모증의 발생 확률이 높은 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험 예측용 키트를 제공할 수 있다:
(1) 서열번호 1의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(2) 서열번호 2의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(3) 서열번호 3의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(4) 서열번호 4의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(5) 서열번호 5의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(6) 서열번호 6의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(7) 서열번호 7의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(8) 서열번호 8의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(9) 서열번호 9의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(10) 서열번호 10의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(11) 서열번호 11의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 CA인 SNP;
(12) 서열번호 12의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(13) 서열번호 13의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP;
(14) 서열번호 14의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(15) 서열번호 15의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(16) 서열번호 16의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(17) 서열번호 17의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(18) 서열번호 18의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP;
(19) 서열번호 19의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP; 및
(20) 서열번호 20의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP.
본 발명에 있어서, 상기 키트는 상기 수식 1에 의해 도출된 FPHLR 값에 따라 상기 표 2에 의해 예측 민감도 및 특이도를 결정하는 것일 수 있다.
상기 서열번호, 키트 및 SNP에 대한 설명은 전술한 바와 같다.
상기 “제제”는 본 발명에 따른 SNP가 포함된 부위에 특이적으로 결합하여 인식할 수 있도록 하거나 상기 SNP가 포함된 부위를 증폭시킬 수 있는 제제로서, 구체적으로는 상기 SNP가 포함된 부위에 특이적으로 결합할 수 있는 프로브(probe), 상기 SNP가 포함된 부위를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드를 특이적으로 증폭할 수 있는 프라이머(primer) 세트일 수 있으며, 구체적인 설명은 전술한 바와 같으므로 생략한다.
본 발명에 있어서, 상기 키트는 RT-PCR 키트 또는 마이크로어레이 칩 키트일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 하기 수식 1에 의해 산출된 여성형 탈모증 위험도(FPHLR) 값이 클수록 여성형 탈모증의 발생 확률이 높은 것으로 예측하고, 하기 표 2의 FPHLR 값에 대응하는 예측 민감도 및 특이도를 갖는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험 예측 모델을 제공할 수 있다:
[수식 1]
상기 Rn은 서열번호 n의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 하기 표 1의 소수 대립유전자인 경우 이에 대응하는 위험도 스코어 값이고, 상기 Fn은 서열번호 n의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 소수 대립유전자인 빈도 값이며, 상기 n은 1 내지 20의 정수로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 정수이다;
[표 1]
[표 2]
본 명세서에서 사용된 용어 “예측 모델”은 데이터를 수집한 것에 예측 방법을 적용함으로써 얻어지는 특정한 수학적 모델을 의미한다. 본 명세서에 기재된 실시예에서, 이러한 데이터는 개체의 시료, 보다 구체적으로 핵산 시료로부터 본 발명에 따른 SNP 위치의 염기가 소수 대립유전자인지 다수 대립유전자인지 여부 및 소수 대립유전자에 할당된 위험도 스코어와 빈도 값의 곱을 합산한 수치로 구성된다.
본 명세서 및 청구범위에 사용된 용어나 단어는 통상적이거나 사전적인 의미로 한정해서 해석되어서는 아니 되며, 발명자는 그 자신의 발명을 가장 최선의 방법으로 설명하기 위해 용어의 개념을 적절하게 정의할 수 있다는 원칙에 입각하여 본 발명의 기술적 사상에 부합하는 의미와 개념으로 해석되어야만 한다.
이하, 본 발명의 이해를 돕기 위하여 바람직한 실시예를 제시한다. 그러나 하기의 실시예는 본 발명을 보다 쉽게 이해하기 위하여 제공되는 것일 뿐, 하기 실시예에 의해 본 발명의 내용이 한정되는 것은 아니다.
[실시예]
실시예 1. 개체의 분류 및 유전자 채취
본 발명자들은 서울대학교병원 피부과에 내원하여 여성형 탈모증으로 진단받은 병력 외의 기타 병력이 없는 25 내지 39세의 건강한 여성과 여성형 탈모증을 포함한 모든 병력이 없는 정상 여성 401명을 연구 대상자로 선정하여 유전자 확보를 위한 혈액을 채취하였다.
상기 연구 대상자 중 ① 두피에 손상을 입은 과거력이 있는 경우, ② 심각한 급성 신장 또는 심장 질환 또는 기타 만성질환(고혈압, 당뇨 등)을 앓고 있는 경우 혹은 현재 급성 질환을 앓고 있는 경우, ③ 혈우병과 같은 출혈성 경향의 질병을 앓고 있는 경우, ④ 임신 상태인 경우, ⑤ 채혈하기 어려운 사유가 있는 경우, ⑥ 최근 3개월 동안 모발에 파마, 염색 등을 시행한 경우, ⑦ 그 외 주 시험자의 판단으로 시험이 곤란하다고 판단되는 경우는 제외하였다.
실시예 2. 유전자형 분석
연구 대상자의 혈액에서 gDNA를 추출하여 OD260/280 값 1.7 이상, 농도 10 ng/μl 이상, 그리고 1X TAE(Tris-acetate-EDTA) 1% 아가로스 겔에서 intact gDNA 밴드가 확인된 gDNA만 이후 분석에 사용하였다. 유전자형 분석을 위해, Affymetrix Axiom KORV1.1 chip (Ref 550769)를 이용하여 연구 대상자의 혈액에서 분리한 gDNA 시료들의 유전자형 분석(geno-typing)을 수행하였다. 상기 분석은 gDNA 증폭, DNA 단편화(fragmentation), 품질관리(quality control), 혼성화(hybridizaion), 염색(staining) 및 스캐닝(scanning)의 과정을 거쳐 수행하였다. 칩(chip)의 이미지는 GeneTitan MC(Affymetrix) 시스템과 Gene Chip Command Console Software(AGCC)를 이용하여 스캔한 이미지를 확보하고, 이를 기반으로 .cel 파일을 획득하였다. 획득한 .cel 파일은 Axiom™ Genotyping Solution Data Analysis 프로그램을 이용하여 데이터 품질관리 및 genotype call을 수행하였다. 이를 통하여 827,783개의 SNP에 대한 유전자형을 획득하였다. 이때, 사용한 칩에 존재하는 단일염기 다형성(SNP) 외에 대치 방법(imputation method; NARD + 1KGp3 reference by Eagle v2.4.1 phasing, InfoScore > 0.9 filtering)을 통해 추가 SNP를 확보하였다. 확보한 유전형 분석의 오류를 최소화하기 위하여 SNP에 대한 품질관리(QC)를 하기와 같이 수행하였다:
① QC1: 유전자형 0.05 미만 제거, Hardy-Weinberg equilibrium 0.000001 미만 제거;
② QC2: MAF 1% 미만 제거;
③ 최종적으로 4,930,354 개의 단일염기 다형성(SNP)을 연구 대상자의 유전형 분석에 사용.
실시예 3. 여성형 탈모증과 관련된 단일염기 다형성 조사 및 선별
여성형 탈모증과 연관된 유전자형을 검출하기 위하여 시험군/대조군들의 SNP 마커를 이용한 연관분석을 수행하였다. 연관분석을 수행하기 위해 PLINK 전장 유전체 데이터 분석 프로그램을 사용하여 카이제곱검정(Chi-squared test)을 수행하였으며 유의수준은 p 값(p-value)을 통해 확인하였다. 마커들 중 여성형 탈모증과 관련된 유의수준(p-value)이 0.01 이하인, 즉 정상 대조군과 비교하여 여성형 탈모증 환자에서 통계적으로 유의하게 많이 관찰되는 SNP를 선별하였다. 상기 선별된 각 마커들에 대하여, 염색체내 위치, 염기서열, 빈도, 유의수준 등의 정보를 하기 표 3에 나타내었다. 하기 표 3에서 “rs_id”란 생물체의 유전정보를 축적하고 있는 NCBI(National Center for Biotechnology Information)에 등록된 단일염기 다형성(SNP)에 대하여 부여된 고유 표지자인 rs-ID를 의미한다.
[표 3]
실시예 4. 유전자형을 기반으로 한 여성형 탈모증 위험도 예측
상기 선별된 170개 SNP 마커 중 20개의 SNP를 별도로 선별하여 하기 표 4에 나타내었다.
[표 4]
상기 유전자형을 기반으로 하여 여성형 탈모증 위험도를 예측하기 위해, 각 개체별로 유전자형을 검출하여, 상기 표 4에 나타낸 각 SNP 마커의 빈도를 확보하였다. 위험도 스코어(risk score)는 여성형 탈모증 환자군과 정상군에서 상기 SNP의 연관성을 카이제곱(chi-square) 검정 방법을 이용하여 통계적으로 산출하고, 이렇게 산출된 각 SNP의 오즈비(odds ratios)에 자연로그(ln)을 취하여 얻은 값을 소수점 셋째 자리에서 반올림하여 도출하였다. 상기 확보된 빈도에 따라 각 SNP에 산출된 위험도 스코어를 합산하여 여성형 탈모증의 위험도(FPHLR)를 계산하였고, 이 위험도 평가의 유효성을 평가하기 위해 병력 유/무를 구분하기 위한 위험도의 기준값에 따른 민감도와 특이도를 계산하였다. 이는 하기 표 2에 나타내었다.
[표 2]
결과적으로 위험도 합계값 기준 2.87에서 민감도 90.48%, 특이도 76.63%로 여성형 탈모증을 예측할 수 있었다. 위험도 합계값을 기준으로 ROC(receiver operating characteristic) 곡선을 확보하였다(도 1 참조). 이를 기반으로 AUC(area under curve)를 계산하였으며, 계산 결과는 0.8828로 확인하였다.
상기 표 4에 기재된 20개의 SNP는 서열번호 1 내지 서열번호 20에 나타내었고, 상기 표 3에 기재된 170개의 SNP 중 표 4에 기재된 20개의 SNP를 제외한 나머지 150개의 SNP는 서열번호 21 내지 서열번호 170에 나타내었다. 이를 정리하여 하기 표 5에 나타내었다. 서열목록에 첨부된 각각의 염기서열은 본 발명에 따른 SNP 위치를 기준으로 하여 5' 방향의 서열 100 nt, 3' 방향의 서열 100 nt를 표시한 것이다.
[표 5]
상기 실시예를 통해 개시한 결과들은 본 발명에 따른 170 가지의 SNP 유전자 마커를 이용하면, 여성형 탈모증을 진단하거나 발생 위험이 있는 것으로 예측할 수 있으며, 나아가 추가로 선별된 20 가지의 SNP 유전자 마커는 개개인에 대해 높은 정확도로 여성형 탈모증의 위험도를 예측할 수 있음을 시사한다. 이러한 일련의 발견을 통해 여성형 탈모 증상을 호전시키거나 또는 현상을 유지시킬 수 있는 개인 맞춤형 의료기기, 의약품, 화장품 및 유효성분 등을 개발할 수 있을 것으로 기대된다.
전술한 본 발명의 설명은 예시를 위한 것이며, 본 발명이 속하는 기술분야의 통상의 지식을 가진 자는 본 발명의 기술적 사상이나 필수적인 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 쉽게 변형이 가능하다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적이 아닌 것으로 이해해야만 한다.
<110> SEOUL NATIONAL UNIVERSITY R & DB FOUNDATION
<120> A risk prediction model of female pattern hair loss based on a
set of genetic polymorphic markers
<130> MP20-132
<160> 170
<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 1
gttgcagtaa gccaagatcg cgccactgca ctccagcctg ggcgacagag caagactcca 60
tctcaaaaaa ataaataaat aggccgggag cagtggctca rgcctataat cccaccactt 120
tgggaggcca aggcgggtgg atcacgaggt caggagatca agaccatcct ggctaacacg 180
gtgaaatcct gtctctactc a 201
<210> 2
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 2
gggggggccc ctctgcctgg cagccccgtc tgggaaggga ggagcccctc tgcccggcca 60
ccaccccgtc tgggaggtgt acccaacagc tcattgagaa rgggccatga tgacaatggc 120
ggttttgttg aatagaaaag ggggaaatgt ggggaaaaga aagagagatc agattgttat 180
tgtgtctgtg tagaaagaag t 201
<210> 3
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 3
ggagaaagag gacaaagtgc cagcgagtcc accctgctga tcccgctgat ctgcttggct 60
tagagaagag ctgtttcacg aaagaggaga aagtttgcca ratctactgc tggttaagtt 120
tttttcccga agcaaataag gtagagatga atttcttgaa ctgccttgtt tttcttgagg 180
cggagtttca ctctgtccct c 201
<210> 4
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 4
gaaagcccgt ctctactaaa aatacaaaca ttagtcgggc acagtggcag gcgcctgtaa 60
tcccagctac tcaggaggct gaggcaggga gcggcttgaa rcagggaggt ggagattgca 120
gtgagccaag atcacaccac tgcactctag cctgggagac agagcaagac accattacaa 180
aaaaaataca atacaataca a 201
<210> 5
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 5
ttaaggtatg aacatatgca ctaccaccca aagagggaaa tatgaatatt ggctacggtc 60
cttgttttcg caactggtta aaaggctaga gttataatct rctaaatcta gtactcccag 120
tgatgtgaga ggttccactc ctgcttcttc cctttgattc ctggacccat gtggcctgtc 180
cttgggtgaa acaagaccat a 201
<210> 6
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 6
agccaagatt gtgccactgc actacagcct gagtgacaga gtgagactcc atctcaaaaa 60
aaaaagaaaa gacacagact gggctgggca tggtggctta racctgtaat ctcagcactt 120
tgggaggccg aagcgggtgg ttcacaaggt caggagtttg agacaaccct ggctgacatg 180
gtgaaactcc atctctacta a 201
<210> 7
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 7
gtcacccaca ctggattgca gtgatgcaat catagctcat tgaagcccaa actcctgggc 60
tcaagtgatc ctcttgcctc agcctcccaa gtaactggga rcacaggtgc gtacaactat 120
gcccagttaa gtttttcatt ttttatacag acggggtctt gctatgctgt ccaggctgga 180
cttgcacttc tggcttcaag t 201
<210> 8
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 8
ctaaagatag ttctagatca gaagcttgat gactaattca attaaaatga gtgtgtgtct 60
gttggctgca taaatgtctt cttttgagaa gtgtctgttc rtatccttca ccaacttttt 120
gatggggttg tttgcttttt tcttgcaaat ttgtttaagt tccttgtaga ttctggatat 180
tagccctttg tcagatgggt a 201
<210> 9
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 9
tgggctgggt caggccacac aggagcctcc ttccccactc tctgtatacc acctaatggg 60
gtcccttctt ctcctcctca ttcccaggag caaagagagg rgaagcagtt ccagcatggc 120
tgcagttctg ttgattgtga aactcactct cagcccctta caccctagtg gttaacatcg 180
agtcccttta ttctcctcct a 201
<210> 10
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 10
ctgatttcat tcttttttta tgactgaaca gtattccatt gtgtgtgtgt gtgtatataa 60
accacatttt ctaatcttcc attgatggat atgtacgttc rttccatgtc tttgctattg 120
tgaatagggc tgtgataaac atacaaatgc agatatcttt ttgatatagc aatttatttt 180
cctttgggta gatacccagt a 201
<210> 11
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or ca
<400> 11
ctaaggcagc agaatggcgt gaacatggga ggcggagctt gcagtgagcc aagattgtgc 60
cactgcacta cagcctgagt gacagagtga gactccatct raaaaaaaaa agaaaagaca 120
cagactgggc tgggcatggt ggcttacacc tgtaatctca gcactttggg aggccgaagc 180
gggtggttca caaggtcagg a 201
<210> 12
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 12
cactcagaaa atatttctta agcacctact ataagctaag tatttcatat aaaggattca 60
aaatttttaa aaacatggtt tctgctccaa gatacctctt ratagtctgg tagaaagaat 120
aagtgaatca atacacaatt agagtgccac actgaagtta ataacagtat tgtggggtca 180
agataatagc taataaccca c 201
<210> 13
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or a
<400> 13
atgaatggcc cacaaggtct ttcaaccctc atcctttctg cagctttttg ctaattctaa 60
tgtaatcctg agacttttat aatactccac tccccctctg raaccagtat catttcactc 120
ttggtgcctt ttaatgtcgt gggtctcctt tgccctagaa accacccctg aggtgaaagc 180
ctgaaccata agccctggat t 201
<210> 14
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 14
gaggtgggag aatcagaact gtatgaaact ggtaggtgga ggttgcagtg agccgagatc 60
atgccgttgc actccatcct gggcaagaga gcgagactcc ractcaaaaa aataaaataa 120
aatgaaggca ggaaaactca acactaaaat aagtggaaat tatgtgctgg catgtggcat 180
taaaagcgtt tgatacagac c 201
<210> 15
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 15
agaattctcc actagcaaac tacaataaag gaaactctaa aggatggatc caagtttaaa 60
gatctaaaat gcaaaaggaa taaaaaacac taaataaaca rtaactgcat aaaacaacaa 120
tgataatgcc ttatggagtt aaagaaaaac aaaacagact gggcacagtg gctcacgcct 180
gtaatcccaa catgttggga g 201
<210> 16
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 16
agactaagta ggatttcact acagtaaatt caagaattgt agtattagtg tgagtcacac 60
acagcttagg acttgcacca gcatacacac ccgctactca rctccttgac attccccagc 120
ctacatacaa aggataactc caaccagggt ggtttgcctt ggttccgttt taatctacca 180
atatcatgga atagagccct g 201
<210> 17
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 17
tctactccaa tatgttgtaa atattataaa ctatcattta ctgtcattac tttaatgatg 60
tagaatgttg aaaactcaat ctgggttaat ttacaaataa rtaattttga aaggagaaaa 120
aaatatcttt tctatttccg tgtaatgtcc cattacttga cagtcaaaat gtggatacag 180
ccaaaagaaa aataatgaag g 201
<210> 18
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or a
<400> 18
atattcttga taaggcatgc cttcttttta acctcctcat ttcttcgtat gtacaatatc 60
tgtgaaatct aactttatat attttatgtc tgtttttgtc rcttggggat atactgcttt 120
tattatggta aattataaat atgaatagaa atatctccac agtggataat ttacaacaat 180
gaaatctatt ggccttattt c 201
<210> 19
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 19
tgggcttggt ggcaggcgcc tatagtccca gctactcagg aggctgaggc aggagaatgg 60
tgtgaacctg ggaggtggag cttgcagtga gctgagatcg rgccactgca ctccagcctg 120
ggcaacagag cgagactctg tctcagaaaa aaaaataaaa aataaaaaaa ttaaaactta 180
gatgggcgtc ttggcaggca t 201
<210> 20
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 20
gggcggatca cgaggtcagg agttcaagac caacctgacc aacatggtaa aaccccgtct 60
ctactaaaaa tacaaaaatt agccaggcgt ggtggtgcgc rcctgtaatc ccagctagtc 120
aggaggctga ggcaggagaa tcgcttgaac ttgggacgca gaggttgcag tgagccaaga 180
tcgcaccaat gcactccagc c 201
<210> 21
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 21
tgagagtgtt ccatcttgtc tttgaaaaga gtgattcagg gttgcacgaa tgaccaaact 60
gcagccactt ttaaattgac ctcaggcact aaggcagtga rgcctttaca acaaagcctt 120
gtggtgacag aggaaatgag actgcttagg atttcacttc taaactccag aggctccaaa 180
acaaacacaa taggatcaga a 201
<210> 22
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 22
atgaagctgt ttgctcagta ttctgattta agcttacttg gaagaatagt aataattttt 60
attttaatta gagtgacagt aaaggttttc tgtcctcaga rggcagcctc catgatctac 120
ttctctttat agaaccagcg tctaggctct gatatttcat ccttaaggct ctgatttccc 180
aagctagtcc caaggtatga a 201
<210> 23
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 23
agatttcaaa tatattcaaa tgtattactg tatagctgct ataagaaaat ttgtattatt 60
ttaaaacccc ttgtgtacac atattcatta cttttttcta ratcatgttg attttatatt 120
ctcttttatt ttgttctata tgtcttgcca gagatatctt taccatagga atcctttaaa 180
atacattttt tgctaatatt c 201
<210> 24
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 24
ttcatgtgtg tgcatgtctg tgtctgtgtg tttctgctag aaattatttc tcttcttgcc 60
tgagtacttc ccccaataat tttctgaaag agggttgtgt rgggtaaacc tcatgagaac 120
tgaaaatagc tttatttttt aaatttatct tattaaaaat tttaagttta attttgttta 180
acactttgaa aatattgccc c 201
<210> 25
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or gtatagcat
<400> 25
ttacgctgca ttctagaggt atatgcagta atataggtat atatatatat gcctgctata 60
tatatataca tgctatttaa tgataaacta gtaaataata rtatagcatt atcatataat 120
actatcctgt aatatttaat aaattattct cagcttatct gcattaggga tatattattc 180
tatatgttat gcaatggtct c 201
<210> 26
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or a
<400> 26
tcctgcctta actgatgaca ttccaccatt gtgatttgtt cctgccccac cctaactgat 60
cagttgacct tgtgacgttc cttctcctgg acaatgaatc rcaggagctc cccatggagc 120
accttgtggc ccctgcccct gcccgcaaga gaaaaccttc tttaactgta attttccact 180
acctacccaa atcctataaa a 201
<210> 27
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 27
tctgaaaact atttgatttt ctttccctgc actattgtag ttcaattctt ccctgaagcc 60
tattcaaagg tgaggatgga aaataatgac tcgagatcaa racaaatatc atcccaagca 120
gaatagccct tttccatgag cttgccacca ttgtagcctt caattttaca tgacttctgg 180
tcaaactaca taaataatta a 201
<210> 28
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or t
<400> 28
aagtcccaga agaccacttt cactgcgttc gttgatcaaa taatttaaag caaactcaac 60
tccaagaaga tagaaaatag actcacctcc tcagtggtag rttagcaaag atatagcaga 120
cacctttaac ctgtcacatc aagaaaaacc gtaattgcta gatttcaact acccgctcca 180
ctttacacat tatctggtga t 201
<210> 29
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 29
ttctgtttac tctgatgatt atttctactg ttgtacagaa gccttttagt ttaattaaat 60
cccatttatg tattttttgt ttttgttgca tttgcttttc rgatcttagt tatgaattcc 120
ttgtctaggc caatgtccag aagagttttt cctaggtttt cttctaaata gttttggctt 180
cagatcttag atttaagtct t 201
<210> 30
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 30
tactgaggta ttttgctgat aacttagaag ataaatctgt ttctattaaa ccaacaatct 60
ttaactcatc taatttccta aagatttatt tcagtcaaat raactttgaa aagtatttgg 120
gcttaattat ttaattcata catgctcatt ttatctctat gtcaatttgg caccatgtag 180
ataatataca aactcatgta t 201
<210> 31
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or g
<400> 31
aaatacatta ggttgctcaa tacaaaaaaa gagcaaaatt tcagacctga gatgagccca 60
tccatgtctc tttgagactc tataaggaag gcacaaatcc rcagtaaaga ggtcagtggc 120
acattttttt gtgtgcctct ataggtctca gggtcactag aagtctcctt tagatcactt 180
catgtgataa ccgaagatcc g 201
<210> 32
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or t
<400> 32
gtggctagtc acaagggtct ctcctaccca ctcctaagaa agaccacata aaaatcaaat 60
gaacaaagat gagaaagaca gggcaaaaag agcttccaga rtaagatttc tgtttttgtc 120
tcaactggct cctttgtttc tgagtacata gttccatttt tacctcagga gagaaggcta 180
aacaaacaaa caaaaaagtt t 201
<210> 33
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or t
<400> 33
ataatttcag ttagtttaaa tttacaagat ttatttcatg gccctggata caacctacca 60
tggaatgtgg ttcgtaagca cttgaaaatg agtgtatttt rctgttgctt ctttaaaaat 120
attgagtaaa tactgttggt tgatggtatt gttgagttct tctatatccc tgctaatttc 180
tgcctagttt gtctataaat t 201
<210> 34
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 34
aaaatattat agataaatta tatagaaaac tttatgtagc tattgcagtg gttattctag 60
acattacatt gtgtgtgtgt gtgtgtgtgt gtgcatgtat rtgcctgtct atggtgttct 120
atcacagtct actggtgaca ttattttatt attcaaaaaa tcataataat tatatctctc 180
tttagttctc tttgacctcc c 201
<210> 35
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or g
<400> 35
ctctttgacc tcccctagtt ataatatagt tgtcttaaat atttcctctg catatattta 60
taaccacatt ataaactgtt ataatttttg cttcaactac raaaaaaatt agaaagcttg 120
agaagaagga attgctatta tatttttcca ttttttcttg ccttattatc tcctcttccc 180
tgatcttaaa gggtttctta t 201
<210> 36
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 36
attagagatt agagatgctc agatacagtg actctagtat tagtatttca gactggggga 60
tacagcaata atattcaaga attataatga tctctaatat raattttaaa tgattctgct 120
aagggaggga ttcaaaaagt agctgtgggt tttcaacaga tgtactgagc ctcaataagt 180
gagattctag cacaaataca g 201
<210> 37
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = tacaa or t
<400> 37
ttacggggta cataaaatat tttgatatgg gcatgtaatg cacaatagtc acatcgtaga 60
aaatgtggta tccatcccct taagcattta tcctttgtgt racaaacaat ccaattatac 120
acttttagta atttttaaat gtacaatgaa attattagtg accataatca ctctgatgtg 180
ctatcaaata ctaggtctta t 201
<210> 38
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or a
<400> 38
gtgtccatgg gttcaattgt tttgattttt aggtcccaca aatgaatgag agcatgtagt 60
ctgtcttttt gtgcttggct tatttcacct aacataatga rctccagttc cattcatgtt 120
gttgcaaatt acagaatctc aatttttatg actgaatagt actctgttgt atatatgtat 180
cacattttct ttatccactt a 201
<210> 39
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or c
<400> 39
gcaacaaggg gtataataaa attgtgtagc agagagacaa aacctagcct aggggaacag 60
aaagcctttc cagaggaagt gacgtttaaa ctgatgcctt rattttgaat ggggtgagga 120
gggtcagagt taagaaagta cccatcagag tgaatagcct gtgcaaaagc cctgaatgtg 180
gaagttgccc tgcacactgc a 201
<210> 40
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or c
<400> 40
tcaaatagtt ggttcaatgt tggaattaca ctgatgaata tgaatcagtc cctacccgca 60
gcccttaatg tgggaaaaaa gacagatgtg caaaaacacc rttgagcata cccagaaggg 120
tgctgagtgt gacaaaagga aaaagtttta ggatctgaaa ttggaggttt caggatgcag 180
ggtggtggta gggagggggt g 201
<210> 41
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 41
taactgatca atacaatttt taagttaaat atctctattc tcaataacag cagggaaaat 60
gttcttttgt aatctttatt aatatcaaca gaaagcatca rttcataaag aagaaaattt 120
tcagaacaca ctaaattttg tcagttcaga ataagtaagt tacaaaaaaa gttcaggtat 180
tttaacctag gaataaaaaa a 201
<210> 42
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 42
gactgcaggc atgcgccacc atgcccggct aatttttgta tttttagaag agacatggtt 60
tcaccatgtt ggtcaggctg gtctcgaact cctgacctca rgatccgctg gcctcagcct 120
cccaaagtgc tggaattaca ggcataagcc aaagcgccca tccttaagtg cctctttata 180
ggacatatct ccttacagca a 201
<210> 43
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 43
gcatttgcag taggggacat gaggagtggt cagattccag agatatgcag ctgtaaccaa 60
gagaattttc ttatgtatta gatgtgtgct gtgaaaggaa rgcactaaaa agagatcatg 120
ctaagtttct aggcctgaga aactggaagg attctattgt tatttaactg agataagaga 180
gacaatgggt ggaacacgtg t 201
<210> 44
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 44
aagtcccctt ctagactctt cagagaaagc ttgttctttc tgagaccttg atttcagatt 60
tctagcctct agactcatga gagaataaat ttctgttgtt rtaagccacc cagttcatcg 120
tagtttgtta tgaagcctaa aaatttacca tacttagtga aactttactg gccctcagta 180
gtacagaacc atcatttcct c 201
<210> 45
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or c
<400> 45
acaattggga aataagaagg aatctctctc ctaaatagta aattgcaatg ctgatgcaaa 60
atgtgtaagg gtttccagga gagactggtt agcatctgaa rggtgcactg acatgcaaaa 120
gaaataacct gtctgtccat gggaacactc caagaaaaat aagagttgct acattaaatt 180
ctttctgttt cctttgaaaa a 201
<210> 46
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or g
<400> 46
aggaatagtt taaactatct ttaacaccaa agctgcatga aaatggctgt ctcagctggg 60
catggtggct catgcctgta atcccagcag tttggtagac rgagacagga ggattgtttg 120
aggccagaag ttcgagacca gtttgggcaa cgtagtaagg ccccatctct tatttaaaaa 180
taaataaaat atttattttt t 201
<210> 47
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 47
gaaatcgaaa aggaagatat aaaatcattt ttgtttgcag ataacacgat cttatatgta 60
gaaaactcta aagattacac acacacacac acacacacac rcaactgttc aaacaaataa 120
tagaattcag ccaagtagcc agatacaaaa tcaacatgca aaaatcagct gcacttctat 180
gtattaacaa tgaacaatcc a 201
<210> 48
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = tcaaa or t
<400> 48
aaaggaagat ataaaatcat ttttgtttgc agataacacg atcttatatg tagaaaactc 60
taaagattac acacacacac acacacacac acgcaactgt rcaaacaaat aatagaattc 120
agccaagtag ccagatacaa aatcaacatg caaaaatcag ctgcacttct atgtattaac 180
aatgaacaat ccaaaaaaga a 201
<210> 49
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 49
agagcagaag gaagaccatt catttatgta atttatcttt catctagcca taatttcata 60
tagtctacaa atccttattg ataacaaatt aaatcacttg rgtcgctaga gtaatttaaa 120
tacatgacta atttattcat atcaggttaa aattacagtc caaaacaaaa caaaacaaaa 180
aacagccaga tgcaatgtca t 201
<210> 50
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 50
tctggggatt tttgattgtc tgatcccatt tgtaaatgaa cgtccagaga gtggttttca 60
aagtgagatc catggacccc taagggttct taagactctt rctgggtgtc tgcaaagcca 120
aaactattta ataggaataa aaaagacttg tttttcctaa tgggtgttca ggtgctcact 180
tcagcagcac atatacaaat g 201
<210> 51
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 51
aacattattt aaagaacttt taaatgagcc attccctcca aacgagcaca ctcctggttg 60
ttaagttgct cgttttgttt taccttgtgg gatagaataa rgatgcagta acattattca 120
caaggcaaag ctggttgcca gctgaaatag acacagaaga aagaattctt tatttttcat 180
tggaaatgct tgggctctgc a 201
<210> 52
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 52
acaattctca aaactctttg aactgagcac ttaagatctg cattctattg tatgtttttt 60
attattatta ttattattat tattattatt tgagacagag rtttgctctt gttgcccagg 120
ctggagtgaa atggcaccat ctctgctcac tgcaacctcc acctcccagg ttcaagcaat 180
tctcctgcct cagcctccca a 201
<210> 53
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or t
<400> 53
agctcaggag taacataatt tgtgtattca tatgtcttgc ccaaccctag acaaaaagaa 60
aaaaaatttt aaagaattta ggctgggtgc agtggctcac rcttgcaatc ccagcactat 120
gggtggctga agtggaagga ccgctcgagg ccaggagttc gagaccagcc tgggcaacac 180
agtaagccct gtctcttaaa a 201
<210> 54
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 54
tttgtttgtt ttttgagatg gagttttgct cttgttgccc aggctggagt gcaatggcac 60
gatcttggct cactgcaacc tctgcctccc gggttcaagc rattctcctg cctcagcctc 120
ctgagtagct gggattacag gcatgcgcca ccatgcccgg ctaattttgt atttttagta 180
gaggtggggt ttctccatgt t 201
<210> 55
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 55
gctctgtaac ccaggctgga gtgcagtggc acaatctcag ctcactgcaa cctctgcttc 60
ccaggttcaa gtgattctca tgcctcagcc tcctgagtag rtggaattac agatgtgtgc 120
caccatgcct ggctaatttt tatattttta gtagagacgg gggtttcacc atgttggcca 180
ggctggtctc gaactcccaa c 201
<210> 56
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 56
gggtctatta gttagcgcta tactgcactg cagggtaata ctctgacagt gtcctaggta 60
atccactctc ccagtctttg aaatgatacc tcctctctct rtgcgccttg aacatctcct 120
tcccctccat actctctgtg gatgacctca cctcttattt cactaaggaa atagagcaat 180
cagaagatga ctcacacatc t 201
<210> 57
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 57
ctgcttgtta gttttccttc taaaagagag gaccctcagc tgcaggtctg ttggagtttg 60
ctagaggtcc actccagacc ctgtttgcct ggaatatcag ragcagtgtc tgcagaacag 120
tggatattga tgaaccgcag atgctgctgc ctgaccgttc ctctggaagt tttgtctcag 180
aggattaccc ggccgggtga g 201
<210> 58
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or t
<400> 58
gccctgttct gctgtggctg agctggtatt taagatgcaa tacaaagtct gccccactct 60
tccatcttct ctcttcaagt gcaagaaagg gttctctttt rgagttgcct ggggttaggg 120
gaggggtgat gctagcactc ccttagtcac cccagctggt gtctcagtat gtcccatgtc 180
cctccaggcc acaggctctg g 201
<210> 59
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or c
<400> 59
attcccttct ttcccaattc ccactgcatt acaatttcta agtacataga cttgaacttg 60
aagcaatcca atggacatgt ccagtttagc caattattat rgtttcctaa tgtcctcaga 120
gattctgatg attagaatca ggagagggtc actcccgagc ttacaagcag caagtgtttt 180
tttaaactgg agccactgct a 201
<210> 60
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 60
ttcctgatac aggagaaaat ctcagtttaa agcagaatgg attttaatcc tttcttaatt 60
tcatttgtgg ccaagaaaat ttaacaaagt ctttaaaaat rtacacatga catggtctat 120
gagagagata cagacataaa tacaactctt attctaaatg gcacaatcat aactgttatt 180
ttaaacaccc aactgtctgt a 201
<210> 61
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 61
cctccatgaa ggcagaaccc agcctggctt tccggagcag catcccttgg atagcaaaga 60
acaagccact cttctagaca aaccagtgag gtaccaggta rccagacaca cacttatctc 120
aggctctctc ctgtcctgag tacaagagga agagcctggc caattctgtc ccctgcaact 180
cagccagcag ggccggggca g 201
<210> 62
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 62
atcttggcag tattgatatc ttgggctggg tagtttttgt tatgagtagg aactgtcttc 60
ggcattttaa tatgtcagta gcatccctgg attctaccca rtagatacca gtatcagagt 120
agatcctcct ccaagtaatg acaaccaaac atgtcaccag atgttgccag ctgtttcctg 180
ggtagaggag aaatttaccc t 201
<210> 63
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 63
tggtaggcac aggtggccag atctcttgag cccaggagtt caagaccagc ctgggcaaac 60
atggcaagac cctgtctcta ctaaagcaca aaaattatcc rggcatggtg gcacacacct 120
gtagtcccag ccactcagga ggctgaggtg ggaggattaa gtgagcctgg ggaggtcaag 180
aatacaatga gctgaaatcc c 201
<210> 64
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 64
aagtgattga tttaactgta gaaatgttag aaaaaaaaaa aaaacagctt ccagtgggaa 60
attcaagtga agctgactag tgaattgtct agtgactaga raatttttag ttgaaaagtc 120
aaagacttaa aaacttctaa atttaaatgg atacaggaat agattatact attaaattac 180
taattaactt aattagaaat a 201
<210> 65
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 65
tgctattctg ccaatgaaac atacattttc ttttataaat tatacagaaa accaagttta 60
cattaaaatt ttaagaaaaa gatgacataa acttaaccac rccattcatg atctctcttg 120
caacaaatat ttaccaagta tggaaatgtg acataccagt agagaatcca ggttctaact 180
tagaggctgc tggggatcaa a 201
<210> 66
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or g
<400> 66
ctagttctgg tcaatgggct gtgtgtagaa atgcaatatg tcacttctgg tccaaagcat 60
agaacagcaa ttgtagcatc ttcctgtgct cactactctt rctgcagcaa ccagcaatat 120
ccagatggca gagccaatat aaggctggat tcttgagtga cttgaggcag aatatccaac 180
ccataaacct gagccacagg g 201
<210> 67
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 67
gctaggcgtg gtggcgggca cctgtagtcc cagctactca ggaggctgag gcaggagaat 60
ggctcgaacc caggaggcgg agcttgcagt gagtggagat rgcgccactg cactccagcc 120
tgcgcgacag agcgagattc tgtctcaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaga aaagaaagaa 180
agaaaatagc aatgaggatt t 201
<210> 68
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or t
<400> 68
attttgggaa gtaggttgca tcatcagtga ttctctgttt atatttgtaa aaacctcagg 60
aggctttagc tggaacttag attcaccaag tcactgataa rcccccttct gagtgtagtc 120
attgtggttc ctgtactcag ctacaaaatg gcaggtgaga gagtggggac cacagctagg 180
gctgcagtga gagcccagcc c 201
<210> 69
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 69
tggcttacat agttcatgca tacaatggaa taatctgtaa acattaaata ttattttata 60
gaagaatatg taatgacatg aaagatgttc ctgatatctt rtgtttaaaa aagcaatcct 120
tttttttgaa aaaaaagtca ggttataaaa ttgtatgcat agttttacta ttctttatca 180
ttttgaagta tatgtgttta t 201
<210> 70
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or c
<400> 70
ccattacacc cagctcattt tttttttttt ttttttttgg gacaaagtct cactctgttg 60
cccaggctgg agtgtagtgg tgcaatctca gctcactgca rcctctgcca caggttcaag 120
caattctcta cctcagcctc cccagtagct aggactacag gtgtgtgcca ctacacccag 180
ctaactcttg tatatttagt a 201
<210> 71
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 71
ccagccacct cttgtttccc ctgtggtgtt ccccacctgt tgttacttcc tattcctcct 60
cacaactttt tattatgaaa catttcagat gtgcagcaaa rtggaaagaa ttgtacagtg 120
aacatgatta taccaaacca cctagattca accattagcc ttttactatg tttactttat 180
catgtctcta cgtgtttcaa t 201
<210> 72
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or ga
<400> 72
tactgcacct cagaacccaa acccttttac ttaatttttt ttaaaaaatt tcattcagat 60
ggtaaaggtt caaacaatac atagagatat aaaacagaaa raaaaaaaaa tacacgcctc 120
tctctagtac ctattcccca gtagtcaaca ctgctacctt ttttttgcag gggaggtaaa 180
ttcctccaga aaaaaactta a 201
<210> 73
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 73
cctactaaaa atagaaaaaa ttagccaggc gtggtggtgg gcacctatgg tcccagctac 60
tcgggaagct gaggcaggag aatggcgtga acccgggaag rggagcttgc agtgagcgga 120
gatcgtgcca ctgcactcca gcctgggcaa cagggcgaga ctctgtctca aaaacaaaaa 180
caaaaacaaa aaaaaacaaa g 201
<210> 74
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 74
tctcattcta atttttatca gtatcctaat tatatcagtt cttcgacatg gggtttcctc 60
ttgggcaata gggcatttcc tatgctgggt ccagttctcc rgagaatgtg aagcaggcct 120
tgctggaaag ccaggcctcc cagaaggtgc ctggcagtga ctccagcctc aggtccctgc 180
cgcggatacc aacatctaat g 201
<210> 75
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 75
tgttccacaa tgagaccgct tcacaatatc tcccagttca caactaaatt aaaataatgc 60
ctggggagaa gactgttaca gatacatgca aacaaattgc rcatcctgtt aagtagggca 120
aaacagacac ttggacagag aaaccagagg aagacaaaat tcacagagaa ggtggagaga 180
actttaactt ctcatgaact g 201
<210> 76
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 76
ggttggtagg caattagtta ttacctcaat ttcaaaacct gttattagtc tattcagaga 60
ttcgacttct tcctggttta gtcttgggag ggtgtatgtg rccaggaatt tatccatttc 120
ttctagattt tctagtttat ctgcattgag gtgtttatag tattctctga tggtagtttg 180
tatttctgtg ggatcagtgg t 201
<210> 77
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 77
gtgtccagag tttcttcctt ctggtgggtt tgtggtctca ctgacttcag gagtgaagct 60
gcagaccttc acagtgagtg ttacagctct taaaggtggc rcagacccaa agagtgagca 120
gcagcaagat ttattgcaaa gagtgaaaga ataaagtttc cacagcatag aagggaaccc 180
gagtgggttg ccactgcttg t 201
<210> 78
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 78
ctatggcctt ataagcaggc acaactggaa ggtaaaacat atctcccaaa attaaggatc 60
ccatttttta taccataact tagatcccaa aacagagaaa rtctgcagaa caatacagtg 120
caatgatttt attgcaaagg aaacaaaatc caatcagccc attctgtgat tagcccatcc 180
tgcatgggag tcttttctcg c 201
<210> 79
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = tg or t
<400> 79
tggcatgatg ggacatgtgg gactgcagct gtgcttctac agagtgggga gaagcaggct 60
tcgtcactgg cagtctctgc ttgtcatcat ctggggggac rgcgtatttg agacagctca 120
gtgtgtccgg gagattgaga ctcggcagca tagactgtat gacatgcatc agccgtgggc 180
agcagaaagc catggtcctt a 201
<210> 80
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 80
gagcaacacg tgctaggagc cacgggctat gtgcaaatgt cagagaagcc ttttgacagg 60
aaagctgctc tcgtctcatt gccccagagg tttctttatt rttagaacac atagtgtact 120
taataaataa ccaactttgt tgtggcttct ttcagccaaa agccacaaag catttgatgc 180
atgtcacttg gtggcaagtt g 201
<210> 81
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 81
tttcctttaa atataatttt acatctcata ggtttgagat gtaaaaattc ttcctgtacc 60
ttgccacttc caatcatatg cttagaattg agactacata raatggtagc aattattata 120
cctttacttc tttgctaaaa tatttaagtt gttagctttg tccctttcat ggaaataact 180
gccactcatc aaaagcatga t 201
<210> 82
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or a
<400> 82
ttgattaggg aggcctaact cctgtgacac acaaccccgt attgtcagtg gcttagcgta 60
gtcaaaattt attttttctc atatgactct ccaaggccag rgggagggct tgatagagtg 120
tggttattgg cttcaccatc ccctaagggc agagcctcac agacaataag gtatttacaa 180
gtctcctggg gatcatgtta a 201
<210> 83
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 83
cagagtggct ggatttacct tcccgtgaag tggaagaatt cacaggggct tagcaaaact 60
agagctcttt aattgcttgt tcctaagact ttcgctgaag rgtgagagaa tatttctgag 120
gtggaggaag tagaatgatg aagagtttga gctctgaagt caaatctatc caggctcaaa 180
tctttctttg ctacgtgcaa g 201
<210> 84
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 84
accccagtgg tgcctggaac accagcaaga cagaaccgtt catttcccgg gaaagggggc 60
tgcagtcagg gagccaagtg gtcttgctca atggagccca rccccatgga gaccagcaag 120
ctaaaaatcc actggcttga aattctcgct tccagcacag cagcctgaag tggacctggg 180
aagctccagc ttggtgaggg g 201
<210> 85
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 85
ctgaaccaag tggaactaac agacatctac agaactttcc accccaaata aacagaatat 60
acattcttct cagcaccaca tagcacttat tctaaaattg rccacgtaat tggaagtaaa 120
atactcctca gcaaatgcaa aacaatggaa atcataacaa acagtctctc agaccacagt 180
gcaatctaat tagaactcag g 201
<210> 86
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 86
ccaatgccca aacacctctg agtccacaaa gaaacagaga gtacaacctt ctttggctag 60
gtttgaatta ttaaagaaga ggtttaaaaa tatttcttgc rtctctctgt gatatactgg 120
aagccttctg cttctctcca tcttcataaa agctactatt caaactgctt ctcttaaatt 180
cacctaaaga ggtatacctt c 201
<210> 87
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or g
<400> 87
gtaggctaat gtaagtgttc tgagcacgtt taaagtaggc taggctaagc tgtggtgttt 60
ggtaggttag atatgttaaa tgcattttcg actagtgata rtttcaactt atgatgagtt 120
tattgggatg tatccccata aagtcgagga gcattataca tatctctgta taacagagtg 180
agttccttat acctttcatc c 201
<210> 88
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 88
tggagtgcag tggcatgatc ttggctcact gcaacctttg cctcccaggt tcaagcgatt 60
ctcctgtctc agcctcccaa gtagctggaa ctacaggagc rcaccaccac acacacctaa 120
tttttgtatt tttagtagag acagggtttc accatgttag ccatgctggt ctcgaactcc 180
tgacctcaag tgatccgccc g 201
<210> 89
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 89
agatgcaact aaattgttga gaaaaggttg gcatctccta ttcactacct cccacctcca 60
gcccctgcca gcacccccga gttcacctct cctcttccac rggcatgtgg tttccctgcc 120
tgcagaatct tccatctcgg taaacaggct tcactcctgc cttgggtgtt ctcaagcatc 180
tactatgtcc cagacaaagt t 201
<210> 90
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or t
<400> 90
gaagagcaaa gccccaggga gttttccttc tttgatttcc ccctctgaat aaaaacactg 60
ttgcacactt ggaataagaa aatcaactaa cccaactgta racatgaaaa cttcactcta 120
gatctccgtt gcactggaca cttacgtgca ttaaatttac ataaggagtt gatgttataa 180
aaagtttata atttttagta c 201
<210> 91
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 91
gactatctag tctaatagca agtcctatga tattacttcc aaaatacatc tcaaaccaac 60
ccactctcca ttctcatttt cctcgtttag ttccaggctg ratttatctc tctccagagg 120
ggggttccct gcttctattc ttgctcctta tgagctcttg accctaggat tccctgtcca 180
tctcccatat catatttcgg g 201
<210> 92
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or g
<400> 92
atctaccttc cccttcctta gttgattttc ttctcttata tttttatgat aatgtctcat 60
cctttctaat acctcttatt tctgttccat ttattattat rtaacccaaa tatctttcag 120
aacatcaccc aaatgtcttc cagaacttca tgcccttttg ggcctgatac attagcactg 180
gatatctagg cctactggat c 201
<210> 93
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 93
tagcctgggc aacagagtaa gactctctct ccaataaata aataaaataa aataaataaa 60
taaatagcat gtgggttgta agagagtaag acacactgta raataaaaag tccattgttt 120
agatgtcaaa agacgaggct gagataatgg ttcttctagt atcttacttt tgagccagta 180
ggtatcaatt ttctcatcta t 201
<210> 94
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 94
ataactagaa caaaagtatg agaataatat cttaccaaat agataacgta aatcaaatgt 60
gaagaaaatg caattgagat tatacattca ggggcagagg raaaaaagta taaagaaaag 120
aacaaagtct caaacaccta tgggtcacct taaagcataa gaatataaga ataataggat 180
tcctaaaagg agagcagaga g 201
<210> 95
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 95
gaatctgtgt ccctgcccaa atttcacgtg ggattgtaat ccttaatgtt ggaagtgggg 60
cacggtgaga ggtgatttga tcatgggggc ggtttctcac raatggtttc gcaccatccc 120
cttggtgctg ttctcatgat agtaagttac catgagatct ggctgtttaa aagtgtgcgg 180
cacctcccac cttgcctttc t 201
<210> 96
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 96
acattggttt caagtaccca caataacata tgctgagata tcctgtgcca taaaacaaat 60
ctcaacaaat ttaaaataat tgaatcataa tattctatga rcacaatgaa ttaaactaaa 120
aatcaataac agaaagatac caagaaattc cccaaacact tgaaaatgaa acacaacacc 180
tccaaataat ccatgaggca a 201
<210> 97
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = ac or a
<400> 97
gatttaacac tgcatctgtt acatgtgttt acctttctct caactgtgac tagcaccata 60
aacagtctgt aaaggcatgt gcaagttttg aaaaatgtta rctttttata atagatttgt 120
gtatatttta tggtagtata cgataaaata gattagtagc tacatatatt gtatggattc 180
atgacatacc taattttctt a 201
<210> 98
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 98
tagggttatt aatttgccta atttcgatat tgttgtgtct cagggaatag gcagacacaa 60
ggagaggaag agatggggaa gaaatggctg gtcgagggag ragttggaca cacaacattt 120
attaaatttt ccatcttata tgctcactgt tcgtggtgcc ccaaaacaat aacaatagta 180
gcatcaaaga tcattgattg c 201
<210> 99
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or g
<400> 99
ggaagatgta gtggttagtg gggagagagc aaggccagaa tgcacaggcc cttgttggcc 60
atgatgtggg gtttgatgtc tttgataatg gagtttgatc rcagctatgg gagcatttta 120
agtagaagaa ttaggtggct caattttttt tttttttttt ctgagccaga gtcttgctct 180
gttgctcagg ctggagtgca g 201
<210> 100
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or c
<400> 100
tgcctgtaat cccagctact caggaggctg aggcaggagg aattgcttga acctgggagg 60
cggaggttgc agtgagctga gattacgcca ctgcactcca rcctgggcaa cagagcaaga 120
ctctgtctca aagaaaaaaa aagaaagaaa gaaaatatgg agataaagac tagttctcct 180
aagacttcct tcagctttcc t 201
<210> 101
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or a
<400> 101
ctacattcac actgtggaac actggacagt tattaaagga gtgaggtagt gaactttatc 60
tctaggaaat actatttagt taaaataata ataataataa raaaataatg gaggccaggc 120
gtggtggctc acacctgtaa tcccagcact ttgggaggca gaggcaggca gatcacttga 180
ggttaggagt ttgaaaccag c 201
<210> 102
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = at or a
<400> 102
catgtaattt acaacactct gtaacactca gaggttacta gtaaaatgaa acaagtttcc 60
ttcttttatg ttcaaaatca tataactgta caattttaga rtttcacaaa aactcctaaa 120
gctacagcaa aatcacctcc aaagacatgt caaatctttt tttattacac tggaaatctg 180
ctgtaccaaa tataacagaa a 201
<210> 103
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 103
aaccctggct gacatggtga aactccatct ctactaaaaa tacaaaaaaa atagccgggt 60
gtggtggctc acacctgtaa tcccagctac tcaggaggcc raggcaggag aattgcttga 120
acctgggagg cggaggttgt agtgagccaa gattgtgcca ctgcactcca gtctggggaa 180
cagagcaaga ctccatctcg g 201
<210> 104
<211> 201
<212> RNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or c
<400> 104
ctagcctggc caacatgatg aaaccccacc tctactaaaa atacaaaaaa attagccggg 60
catctgtaat cctagctact cgggaggctg aggcaggaga rtcacttgaa cccagaaggc 120
ggaggttgca gtgagcagag atcaagccac tgcactccag cctggatgac aagagcgaaa 180
ctccatctca taaataaata a 201
<210> 105
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 105
aaaataagtg agcatgatat tttaatgcag ggtacatata agtagacacg aaaaagcaag 60
ctttcagctt tactaagggt ggatactccc agttggacac ragatatagc actaaaggta 120
catctgagaa atgctaggaa atgatctttc caggccatag agactctctc atccccaaaa 180
tatcagtatt aagaaggcaa g 201
<210> 106
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 106
ttgaaatcat acagaaaaca attattttaa ctcttctacg tagaagcctt aacatgtttg 60
aagacagctg ttctttctaa caaacaaagc tgtcaaacaa rtggagtgta ttcagggcca 120
ctgtttactg cataggttgc ccattataaa actaccggaa ccacaactta catggatgtg 180
aatggcatcc ttggagttgt g 201
<210> 107
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or c
<400> 107
ccttgttagc atgagctatc catgctaaca gatgttagag tggccaaagg tccaaagtat 60
acaaaacact cattggacag gatgatccaa gggtttataa rgtatctcta aggagccagt 120
caagaccagt cctttctttg gaatgtacat aaagtttgaa cacccaaagc ctgctgagtt 180
aaccctttac taaatatcat g 201
<210> 108
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 108
aaattctaaa acaaatactg atgtacatca ttgtatagtt atgctactta atagtttatt 60
tttgcagtca aattttctct ttgaatgctt ttcttagcag rtcaagtcca aaacagatag 120
aatttcatta tcatttactt tgaagaatga caaatatttt aaaactttat gctcaaaaga 180
gtcactgaga aattttaaaa t 201
<210> 109
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 109
caatccaagg tcctcccatg gcccaggaat ccctgcatgg tatggaccct gataatcttt 60
cttttttttt tttttttttt ttttttttga gacagagtct rgctctgtcg cccaggccgg 120
actgcagtgg cgggatctcg gctcactgca ggctccgcgc cctgggggtt cacgccattc 180
tcctgcctca gcctcccaag t 201
<210> 110
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 110
attatagagc tgtgagcttt tatatatatc agtttttcct gacttccaag atgatttacg 60
ttgtctttgc catactacat gtgaagtata tgagcacagc rttttaggtt tgcttgtttg 120
ttttctgaat ttttctgtgt agaaccacct cctcatagaa ttgttcctga tatgtagcat 180
gcacctagaa catttttatg g 201
<210> 111
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or a
<400> 111
tagctctaat tacagacccc accagtacag cttgacagct cccggcacca tcccttcctt 60
catctgactt attgaacttt tacaaactaa cagtcaccag raccaaagaa ttaagtcaac 120
taacctgcct tgaattttag accagcaatc catatggctt tatctggtat aaatcttctg 180
cctttgatca tttctggacc g 201
<210> 112
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 112
gtgtggggtg gagaaagaat ctgtgtgctc gggggagaga gagagaaatg actgtgggat 60
tttgcattga aactcagtgc tgccctgtca cagtggaaag ragcatagga cagaattcag 120
ccagcaccca cagagggagt atttagacta gccctagtca gaggggaatt gtccatccca 180
gtgattagaa tctgaatttc g 201
<210> 113
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 113
gtacaggcaa ccaaagcaaa gatggacaaa tgggatcaca tcaagttaaa aagcttctgc 60
acagcaaagg aaaccatcaa caaagtgaag agacagccca ragaatggga gaaaatattt 120
gcaaactact catctgacaa gggatcaata accagaatat aaaaggcact caagcaactc 180
catagggaaa attttagtaa c 201
<210> 114
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 114
agtttcgctc ttattgccca ggctggagtg cagcggcacg atcttaactc atggcaacca 60
ccgcctcccg ggttcaagca tttctcctgc ctcagtcttg rgagtagctg ggattacagg 120
cacctgccac cacgcctggc taattttttg tatttttagt agagatgggg tttcatcatg 180
tcggccaggc tggtctggaa c 201
<210> 115
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 115
tgtaaaatga aggcatggtg gctcatgcct gtaatcccag cactttggga ggccaagcca 60
ggaggattga ttgaccccag gagtttcaga tcagcctgta raacataggg agaccctgtc 120
tctacaaaca actagaaaag aaattagcca ggcacggtgg cgtgtgcctg tagtcccagc 180
tacttgggag gctgaggtgg g 201
<210> 116
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 116
tgaaaatgta agctttatgg attatgctag tgttttataa tgatccagaa ataccttaca 60
ggttatgaga aagttaatta ccttcagaat cctagtgagc rgagggtatt cagaggaaac 120
cgttatgaag aaagtcagca aggacctgcc cgcagtagtt gtactttcac attaaaattg 180
aactgaaaga atattttttt c 201
<210> 117
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 117
ttaactgatt gtgttatcag taaggcttct ggtaaacagt agtcaaattt tgggagagtc 60
aaaagttata tgtagacttt tgactgcctg ggagtcagca rccctaaccc ctgtgatgtt 120
caagggtcag ttgtattctg ttagctcacc aatgtttacc tgatcttaca cttgtcctaa 180
cttctaatat ggaaaggata g 201
<210> 118
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or c
<400> 118
aacacagaaa aggtaacaca aaaagcaaaa ctgcactatg ctagatttga acttatattt 60
tctaaatact caaattgagt gacaaaaaat gatataccta racttaaaag aaaactaaca 120
tgcagtttat aggagacata catataatgt aagaatagag gagaactaag agtaaaagaa 180
taaaaagaat tctaacacta a 201
<210> 119
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or t
<400> 119
gagatagtca tgtgattttt gtctttagtt ctatttatgt gatgaatcac acttattgat 60
ttgcatatgt tgacctaacg ttgcatctga ggcataaagt rtacttgatt gtggtggata 120
aactttttga tgtgctgctg gattcagttt gccattattt tgctaaggat ttttgcatca 180
gtgttcatca gggatatttg c 201
<210> 120
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 120
ggaaatatgt ataaatatgt gtgcttgtgt atacatacat atatatgtat atatatatac 60
atagacacat attttatata tttctttatt ccatgagaaa ratatgcctc ttcttacaag 120
aagaaacaag actaactggg cacagtggct catgcctgta atcccaacac tttgggaggc 180
caaggcgagt ggatcacctg a 201
<210> 121
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or a
<400> 121
aggtcatgac tgcgatggtt gccctgttca cagtccacac ccctaccttc caggagctcc 60
ttccacatcc tgcccccttc ctgagtacac ctggctggtg rctccagggc tatcctctgc 120
ctccttcctg gcttatgact acagtgggct cacacttcac tatacttctt tgattcttaa 180
cttgaggttt accttctagt t 201
<210> 122
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = ct or c
<400> 122
agaatgtact ttgtgagatc cactcctgcc cacgagagaa caaccccctt tgactgtaat 60
tttccattac cttcccaaat cctataaaat ggccccaccc rtatctccct tctctgactc 120
tcttttggga ctcagccctc ctgcacccag gtgaaataaa cagccatgtt gctcacacaa 180
agcctgtttg gtggtctcct c 201
<210> 123
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 123
acaggtctta gttaatttgg aaagtttatt ttgccaaggt tgaggacgtg cccgtgacag 60
agcctcagga agtcctgacg acatgtgctg aaggtggtcc rggcacagct tggttttaga 120
catttaggga gacgtgagac gtgggacatc aatcagtata tgtaagaagt acaatggttc 180
agtctggaaa ggtgggacaa c 201
<210> 124
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or a
<400> 124
agttcaagac cagtcttgcc aacatggtga aaccctgtct ctaataaaaa tacaaaagta 60
agccaagtgt ggtggtgcac acctatagtc ccagccaatc rcgaggctga ggcaggagaa 120
tctcttgaac ccaggaggca gagattgcag tgagcggaga ttgcagtgag ccaagattgt 180
gccatggcac tccagcctgg g 201
<210> 125
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 125
tctctactaa aaaaaaaaaa atgcaaatca tgaccagcct ggccaacacg gtgaaacctc 60
atctctacta aaaatacaaa aactatttgg gcgtggtggt rggcgcctat aatcccagct 120
actcgggagg ctgaggcagg agaatcactt gaacccggga ggcgcaggtt gtggtgagcc 180
aaaatcgtgc caccgcactc c 201
<210> 126
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 126
ccagctcata gattatatgt ttggcagctt tctctgcaat tggttggcaa catttgtgcc 60
ttctccagat cctactccct agtctcaata ctaatttaga rgcagttcaa acaaacactg 120
agtatttcat atgtgccagg cactggggat atataaaaag atgagtaaca catcatttct 180
gcctcaggga cacccaaagt c 201
<210> 127
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or c
<400> 127
cgcaagcaat acacctgcct cagcttccca aagtgcaggg attacaggcg tgagccatgg 60
tgcccggcca atgatgactt cttagagaca ataccaaaaa rgcatgatcc atgaaagaaa 120
aaaatgataa gttggacttc aataacattt taaaaatctg ctctgtcaaa gacactgtta 180
agagaatgaa aggacaagca a 201
<210> 128
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 128
cttccaaagt tggagaatat ctggctcagg gagtaagtac attaggaagc tgggagaaga 60
gaaaacagct gaaactggga gattctagct tctgcaaggg rgtaaaataa tgttgagaac 120
ttttttggtt tctatgtgcc ttttcttcag gttcaaaaat ctgcttcctc tgctgtttca 180
accaagggat ccagttaatg t 201
<210> 129
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 129
aaaatgaata acaactctca atttagtgta tgccttggca atttccaggg cctggaaatg 60
gttgtttttg ataattgcct gttttagtgt tgctttacgg rtaggggact tgctgagtga 120
ttaattcctc catattagca tagttgactt taaagccaaa agattttaat attaacttag 180
tattaagaat gttcatatta a 201
<210> 130
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 130
caaggtacag aagaatgtgt ataataaatc accatttgtg tacaaaacag aaaaggaaaa 60
acaacacaaa cacatgcact tgtttgtatg tgctccgtcc rtggaaggat gtagaagaaa 120
atgctaacct cacttgcctc tgaggaggga aactgggcta ggaagcaggg taggtgagag 180
acttctgtac cttctgagtt g 201
<210> 131
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or g
<400> 131
acaaacatgg gcaaaagaga ttcaggtggt accaatatcg ggctaagtag cattcaagat 60
aaagattatt aaataataag ttagttaata ctagagtaat rgcatattaa tgaaacataa 120
tctatggtag agatattata gtcaataatt gttttatgta ttcattaagg taacaacaag 180
caaacaagct ttaatagttt t 201
<210> 132
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 132
ggcgcgcatc acaatgccca gctgattttt gtatttttag cagagacagg gtttcaccat 60
gttggccagg ctggtctcgg actcctgatc tcaagtaatc rgcctgcctc ggcctcccaa 120
agtgctggga ttacaggcat gagccactgc gcacggccac cacactgttt taaacaacca 180
gattgcacgt gaacttagag t 201
<210> 133
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or g
<400> 133
tttattttaa catatacagt aaattattat tgagtgccat cactctgttg tgctatgaaa 60
cactagattt tattaattct gtctaactat attttgtacc rattaagaat ccccattttt 120
tgccacactc cctgctacgc ttcccagcct ctggtaacca cccttctact ctctgtctcc 180
atgagtttaa ttattttatt t 201
<210> 134
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or g
<400> 134
ttcctctgtt tatttctcaa tgcaaatggt atcttacatt taacaggtac tgaaaagtga 60
tttgtgagga tcaatggatt cacagggttt tctcctggaa rtgtcagaat gccaaggcag 120
ttcttaagta gattcctgga tgaggaaccc tctctgcaaa ggacaaccat ttgtgatgaa 180
tgaacggaaa cagagctctt a 201
<210> 135
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 135
gtgaggcaag gtaaatatat taaacccaga gacactacac aaatcttttc attccactga 60
gacatggatg gccactgatt cttgatctcc tttgtttgga rgtaggaggg cagaagttca 120
aattacagat ttgcccccac ctttcttttg agagttccct aacttatgtg aagtatgatt 180
tgcttagttg gactgtatat t 201
<210> 136
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 136
aaattttttt taagttttta ttttatatta tctacaaagt aaaagttttt cccttaactt 60
aaaagttgaa ccactgtaga cagtgatcac ctcatcaaac rtgatttata aataataatc 120
cgtcagtttg acggtaagaa tttactgaaa ctttgtcaag tttagtaaaa gggcgttcca 180
agtcttgatt tttttttttt t 201
<210> 137
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 137
taatattaac ctaatgcata ttttgattaa ataaaataaa ttattcccta caagaaagtc 60
cctttgggga gtttattgtc tttatatttt gcattctatt racatgtttt cttacacagt 120
atctgtggtg tgatttttat tttatggaag gagtggctaa gaaatggtct gcacacaggt 180
cagttcagaa ttcccactac t 201
<210> 138
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = tg or t
<400> 138
gggctctgga atcagatgga ccttgattta atcctgactt cgccatttat tgcattgaat 60
gaccaagggc aaactatctc cttcttcaag actcccactt rcaagggtgg agttgtaaaa 120
ttggtggtaa taataatacc tctcatagga gagttataaa gtaatgcata taaaacattg 180
aacacagcac tggatgcatt g 201
<210> 139
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 139
taaatcagtt agctactctg gctcatacat catcttctgg ctgcttttga ctcatagctt 60
ggttaagatg aggttatcta aggtgttcat catttcaaac rgtccttctt aatattgcca 120
agataatttt tacgtcaaac agccatttaa tggcagctta tttctaaatt attcctatct 180
ttcacagtct taatatagtt c 201
<210> 140
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 140
gataattttt acgtcaaaca gccatttaat ggcagcttat ttctaaatta ttcctatctt 60
tcacagtctt aatatagttc acattatgac cctaactcca rtgatatttt atttttattt 120
ttattattta tttattattt atctatctat ttttgagaca gtctcactct atcatccagg 180
ctggagtgca atggtgtgat c 201
<210> 141
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = tctca or t
<400> 141
cacagtctta atatagttca cattatgacc ctaactccat tgatatttta tttttatttt 60
tattatttat ttattattta tctatctatt tttgagacag rctcactcta tcatccaggc 120
tggagtgcaa tggtgtgatc tcggctcact gcatccttgg cctcctgagt ttaagtgatt 180
ctcctgcctc agcctcctaa g 201
<210> 142
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 142
aacaacaatt acaactcagc tcagggcttg ttacatagta atcacttaag taactgtaaa 60
tttatttttg atccctcctc ttcttcctcc ccggcatcct rcatcagact gcatcagcct 120
tgcctctgca ttactgccct gctaatcact ctaaaccagt ggttgtctag cctggctgat 180
ttcagaatca ccagggccca g 201
<210> 143
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or t
<400> 143
tgaactaaga aattaggata cagtgctgtt attataatat ttaaccaaag atccagaaat 60
accaaatttt gtcccagtag ccgcccttca cataggaggg rtgaaacacc cattccttca 120
gtcaacaaat atattaagca cctactattt gccaagttct agggttacag taatgagcaa 180
aacaaatcac attgctactt t 201
<210> 144
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 144
tcacaacctt tttctctttc tttaatatca tctgatacca ggtaatgata tgaggatgat 60
ttttgttact tttaaaattt gatttaactt taccctctat rttttattcc tccttcattt 120
tggtgacctc taagaagtat aaaatacatt tcttttgatt taaaaaatat ctgaagtttt 180
aaaaactaca acagactgta a 201
<210> 145
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or a
<400> 145
tagaaaaaac aaaagatgac tcaaaaaact ctcagaactt ataaacaggt ttactaaggc 60
tgcaggatgc taaatcaaca tacaaaagtc agtagcattt rtacatacca atggtaatat 120
agccgaaaaa gaaatcaaga caatcgcatt cacaatagct acaaaaaaaa aaaaaaaaaa 180
agaaagaaaa agaaatatct g 201
<210> 146
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 146
ttatgctctt ctttaccttc ctatggcctg ctacagtttc agaagctttc ctactctttc 60
tgttgttaat taattctggt tcctatagtc aagggctctc ratctctagc tgaaagtatc 120
tttctttgaa aagctcctag ttgtgtcttt gaaactacca ttttccaagg cgcccaactt 180
tgaacattcc tagaagagag a 201
<210> 147
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 147
atagcctaaa actaaaaaca atccatgtat atgaacaagt gaatggataa ataaataatg 60
atacatttat cctactcaga aattaagaaa aataactgat rcaggatgac tctcaaaaac 120
tatactgaac aagagaattc taacaaaagg gtatgcacaa tgtatttccc atttttatga 180
aattctacag cagcaaaact a 201
<210> 148
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or a
<400> 148
agcaaccttt tcttcttcca tatattattt ggacaattat tccattatcc atttgtctag 60
cactgagtat atttactgta cctggggatg ctccttagag rtaaaataac attacaaatt 120
gagcaagatt gcatacttgt cctttcacat gttcaagctt tgacaaaaac caggacaaaa 180
gtctttgaag atagtccaga a 201
<210> 149
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 149
agatgagatt atagactatt attctaagtg aagtaactca ggaatggaaa accaaacatc 60
atatgttctc aatgatatgt gagagctaag ctatgaggac rcaaaggcat aagaattata 120
cagtggactt tggggacttg aggggaagag tgggagggga gccagggaca aaagacaata 180
aatgtggtcc agtatatact g 201
<210> 150
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 150
tatcatgtat ttaaatgaga gttcctcaaa ggttcacatt cagaaatgaa acttctcatg 60
cggtaactgc ttaatttctt cttcgacgtt accatatccc rccagactgt tcttcaaatc 120
gttgtgacaa ctcaaacaac tgccaacatg tcatgagaac tttttttgcc agaccatctg 180
agcaacaatt gttattgtca a 201
<210> 151
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 151
ggactgggcg aaggtttctt gagtactacc ccataagcac aggcaactaa agcaaaaatg 60
aacaaatgga atcacagcaa gttaaagaaa acttctgcac rgcacaggaa acaatcagca 120
aagtgacagg aaaatctgca aaatgggaga aaatatttga aaactatcca tctgatgagg 180
gattaataac cagaatatat a 201
<210> 152
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 152
tttgaaatta aattattttt atgttaatgt cggttttact tcccctgcaa ggttaaagtt 60
tgggaaaggt gcactctact gtaatttctg aacatggaat rgaggcagga ggaggatccc 120
tattccttct acataagcaa ttcccaaaag tcagtggggg aggcacattc caggaaaatt 180
cattcattca agcttcagat g 201
<210> 153
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = gtc or g
<400> 153
aggctgaggc aggataatca cttcaacctg ggaggcggag gttgcagtga gccaagattg 60
tgccattgca ctccagactg ggcaacaaga gcacaattct rtctctgtct ccaaaaaaaa 120
aagaaaacac atccatgttc atggattgga agacttgaaa ttgtttaaat gtccataata 180
ttcaaagtga tctacaggat c 201
<210> 154
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or t
<400> 154
tcactctgtc acccaggctg gagtgcagtg gcacgatctc agcccactgc agcctccacc 60
tcccaggttt aagtgattct cctgccccag cctcccgagt rgctgggatt ataggcgccc 120
accgctgtgc ccggctaatt tttgtatctt tagtagagag ggtgttttgc catgttggcc 180
aggctggtct cggactcctg a 201
<210> 155
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 155
gggctagggc actataaaaa aaaggaagat agtctaggaa ccagtgacaa aatgtcttgg 60
tgaggtcaac aaaggaagca gttgaatcgt caagttggag rgataggagc ctgtggctga 120
agggaggcat gattatttta gtaatttccc gggtgatttt aatagctttc atggtatata 180
atttccatga gtgggtttat c 201
<210> 156
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = g or a
<400> 156
tttatttaga agtttggtga tgtttgatga ccagaaatat gccataggaa tttttgtttg 60
tatggatcag tctatggtaa aattggtttc attatacatc rtttcacttc aagccacagt 120
ttccaagaac ctgtcaatga tgttaagcga gcacttactg aatccagata ttcatgttcc 180
cagaatcagc ctgcatgtgc a 201
<210> 157
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or a
<400> 157
atagcactgg cttccatgaa ctccacaaaa cagctgtctg tatcaagaca ggaaaagctg 60
ggacacattt aataaggttt tgttcgggat ttttaaaatg ragcctggag ggatctccct 120
tctgctagag ctgagaaatt aagctgcaga acccggctga aagcagccat tcagaggagc 180
agctgaaagt tatttcacca t 201
<210> 158
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 158
atcaagtttc gttaaccata cattttttgc tgaatacgta cttcatttga agtctgtttt 60
aagtaggctc tgcatgtgga aagtacctgt tttgcaaccc rttctcagag tttcattttt 120
ttgttttata tgtactgttt aatatgacaa atgctccaaa aatatttata acacctattc 180
gtacttttct cactctaaaa a 201
<210> 159
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or a
<400> 159
tccaactctc tggacaacaa ccgagtgttc cacaatttaa cttaattctg acaccaacta 60
cccagagtta atgcagaccc cacaggttaa gggctcagtc rcacaagact gcccacatgt 120
tagacaccat tggcaaatca gggctaatgt attcctgagt gatcggctac aacgttgagg 180
gtacccatga ccctttactt c 201
<210> 160
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 160
atggagagga ccatgtggta aagaattgaa gcctcccaga acagccatgt gaatgaactt 60
gataatagat ctccaaatca cagtcaaatc ttcagagact rcattccctg cctacggctt 120
cactgcaact ccatgaaaga ccctgaggca gaactatagc atctaaagca ctcccgattc 180
ctcaacctca taaattatgt g 201
<210> 161
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 161
tattctttcc tcttggaaaa tattaataaa taaaaaagtc ccacggaaat agtcacaaat 60
gagccaagtg aagatgtgag gaagaacttc atgtgaacta rgacaaaata ttataaaatc 120
ttacagtaga acccataagt tgatcatgtc tgaacaagtc ttccccaaaa aggacataat 180
aaaatacaaa gaaaggcaac t 201
<210> 162
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 162
caggcgtggt ggtgcatgcc tgtagtccca gctactcggg atgctgaggc aggagaattg 60
cttgaacctg ggaggtggag attgcagtga gctgatatcc rgccactgca ctctggcctg 120
gcaacagagt gagactccat ctcaggaaaa aaaaaaaaaa aaaaaagcga ttttaggtgg 180
ggtaaaatga tatccaattg t 201
<210> 163
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 163
tgctgggagg gattgtcatc acctgcccat gccgcactgg ctgaggcaca tcaggaggcc 60
cagccccagg cccacctgca ggacactgtc ctcctcccac rggcgtggat gacgagcact 120
gtgaccacag catggatgaa tggcggggct ggggctggga gcccaggttg ctatggggga 180
cccacacccc ttccctgcct c 201
<210> 164
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 164
tttggaccag tggttttcaa actgtggtcc caggccagca gccacagcac caagtgggaa 60
cttgttagaa atgataaaat tagaaactta ggggtttgaa rtcagctctc tgtatcttaa 120
caagccctcc aggtgattct gattctcaag aaagtttgag gaccactgcg ttagaagaaa 180
gctgggcagg tggttaaaac a 201
<210> 165
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 165
tcatgggctt ttcctttggg tcatgtaagg aaggtgactg gggttagagc gttaaagtaa 60
tagacagtga tgtgtaagtg ttaaagtaat ggacagtgac rtgtaagggc aaagaaacaa 120
taattcataa gaagtttggc taatagctaa gaagcttgag ggatttttgt catttgcagg 180
gtctgtaaag tgtaaggaat c 201
<210> 166
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or g
<400> 166
catgcctgta atcctaacta gtcgggaggc tgaggcagga gaatcgcttg aacctgggag 60
gcggaggttg cagtgagccg atatcgtgcc attgcactcc rgcctggaca acaagaggca 120
gattctgtct caaaaaaaaa aaaaaaaaag aaataaggaa gactagtaaa aatttcaatc 180
aaagcctgga ctatcatttg t 201
<210> 167
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 167
tatggttttg ttttgttata aactcaagag aaagagatga acaaaagtgg ttggtggctt 60
tccaataggg ttaagaggaa aagagggaac taatatttat rgcatgttta caatgtgcca 120
gtaaaataaa agggagatgc tggaattttt ttttttaaat tcccaatttc tatacagcag 180
tatatagttt atcaatagca a 201
<210> 168
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = t or c
<400> 168
tattaatttc ataaagctat ctgttgcttt ggaggcatgg gccccagtct tagcatacct 60
gagcttgagt tctagtattt gcattttatc cttttcatta rtgacaaaat gagaattaat 120
caaacttatt ttaattattc aaagtaatga aatgtatgtg aaaagccttt gtaaggtgta 180
agacactatg aagtgtttgt t 201
<210> 169
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = c or t
<400> 169
aataaggaaa atgaatgaga aagggagaaa catcatcttt ttaaattaaa aggcaacact 60
ttaagtgtga aaatacacta attagaagag ctaatgagtg ratctgaaat tagatcaggg 120
taaaggaaga tgccaggaga ggatgactac attatagagt ttggacagag tcagcacagc 180
atagatttct ccataggggc c 201
<210> 170
<211> 201
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> variation
<222> (101)
<223> r = a or c
<400> 170
gcacccaaaa cacaagcaat acaaggtaaa gtagatacat tggacttctt caaaattaat 60
aacatttgtt tgtaaaagga catatcaaga aagtaagaag raaatctaaa ggatgggaga 120
aaatatttat gaataattta tctgataagg gtctagtatc tagaataaag cactcttaca 180
gcccaacccc aaatagacaa a 201
Claims (12)
- 삭제
- 개체로부터 분리한 시료로부터 하기 수식 1에 의해 여성형 탈모증 위험도(FPHLR)를 도출하는 단계를 포함하고, 상기 도출된 FPHLR이 0 보다 클수록 여성형 탈모증의 발생 확률이 높은 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험 예측을 위한 정보제공방법:
[수식 1]
상기 Rn은 서열번호 n의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 하기 표 1의 소수 대립유전자인 경우 이에 대응하는 위험도 스코어 값이고,
상기 Fn은 서열번호 n의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 소수 대립유전자인 빈도 값이며,
상기 n은 1 내지 20의 정수이다;
[표 1]
- 제2항에 있어서,
상기 정보제공방법은 상기 수식 1에 의해 도출된 FPHLR 값에 따라 하기 표 2에 의해 예측 민감도 및 특이도를 결정하는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험 예측을 위한 정보제공방법:
[표 2]
- 제2항 또는 제3항에 있어서,
상기 SNP는 시퀀싱(sequencing), 엑솜 시퀀싱(exome sequencing), 마이크로어레이에 의한 혼성화(microarray hybridization), 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 동적 대립유전자 혼성화 기법(dynamic allele-specific hybridization), PCR 연장 분석 및 Taqman 기법으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 방법에 의해 확인되는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험 예측을 위한 정보제공방법.
- 제2항 또는 제3항에 있어서,
상기 여성형 탈모증은 한국인에 대한 것인, 여성형 탈모증 위험 예측을 위한 정보제공방법.
- 하기 (1) 내지 (20)의 SNP(single nucleotide polymorphism)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 SNP를 검출 또는 증폭하는 제제를 유효성분으로 포함하는 여성형 탈모증 위험도 예측용 키트로서,
상기 키트는 하기 수식 1에 의해 여성형 탈모증 위험도(FPHLR)를 수치화하여 그 값이 0 보다 클수록 여성형 탈모증의 발생 확률이 높은 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험도 예측용 키트.
(1) 서열번호 1의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(2) 서열번호 2의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(3) 서열번호 3의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(4) 서열번호 4의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(5) 서열번호 5의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(6) 서열번호 6의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(7) 서열번호 7의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(8) 서열번호 8의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(9) 서열번호 9의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(10) 서열번호 10의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(11) 서열번호 11의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 CA인 SNP;
(12) 서열번호 12의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(13) 서열번호 13의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP;
(14) 서열번호 14의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(15) 서열번호 15의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(16) 서열번호 16의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(17) 서열번호 17의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(18) 서열번호 18의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP;
(19) 서열번호 19의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP; 및
(20) 서열번호 20의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP.
[수식 1]
상기 Rn은 서열번호 n의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 하기 표 1의 소수 대립유전자인 경우 이에 대응하는 위험도 스코어 값이고,
상기 Fn은 서열번호 n의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 소수 대립유전자인 빈도 값이며,
상기 n은 1 내지 20의 정수로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 정수이다;
[표 1]
- 제6항에 있어서,
상기 키트는 상기 수식 1에 의해 도출된 FPHLR 값에 따라 하기 표 2에 의해 예측 민감도 및 특이도를 결정하는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험도 예측용 키트.
[표 2]
- 제6항 또는 제7항에 있어서,
상기 SNP를 검출하는 제제는 상기 (1) 내지 (20)의 SNP로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 SNP를 검출할 수 있는 프로브(probe)인 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험도 예측용 키트.
- 제6항 또는 제7항에 있어서,
상기 SNP를 증폭하는 제제는 상기 (1) 내지 (20)의 SNP로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 SNP를 증폭할 수 있는 프라이머(primer) 세트인 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험도 예측용 키트.
- 제6항 또는 제7항에 있어서,
상기 키트는 RT-PCR 키트 또는 마이크로어레이 칩 키트인 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험도 예측용 키트.
- 삭제
- 개체로부터 분리한 시료에서 하기 (1) 내지 (20)의 SNP(single nucleotide p olymorphism)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 SNP를 검출 또는 증폭하여 하기 수식 1에 의해 여성형 탈모증 위험도(FPHLR)를 도출하는 단계를 포함하고, 상기 도출된 FPHLR이 0보다 클수록 여성형 탈모증의 발생 확률이 높은 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 여성형 탈모증 위험 예측을 위한 정보제공방법:
(1) 서열번호 1의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(2) 서열 번호 2의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(3) 서열번호 3의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(4) 서열번호 4의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(5) 서 열번호 5의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(6) 서열번호 6의 염기서열 내에서 101번 째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(7) 서열번호 7의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(8 ) 서열번호 8의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(9) 서열번호 9의 염기서열 내에서 1 01번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(10) 서열번호 10의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(11) 서열번호 11의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 CA인 SNP;
(12) 서열번호 12의 염기서열 내 에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(13) 서열번호 13의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 A인 SNP;
(14) 서열번호 14의 염기서열 내에서 101번째 염기가 A 또는 G인 SNP;
(15) 서열번호 15의 염 기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 C인 SNP;
(16) 서열번호 16의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP;
(17) 서열번호 17의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP;
(18) 서열번호 18의 염기서열 내에서 101번째 염기가 T 또는 A인 SNP;
(19) 서열번호 19의 염기서열 내에서 101번째 염기가 C 또는 T인 SNP; 및
(20) 서열번호 20의 염기서열 내에서 101번째 염기가 G 또는 A인 SNP,
[수식 1]
상기 Rn은 서열번호 n의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 하기 표 1의 소 수 대립유전자인 경우 이에 대응하는 위험도 스코어 값이고,
상기 Fn은 서열번호 n의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치 의 염기가 소수 대립유전자인 빈도 값이며,
상기 n은 1 내지 20의 정수로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 정수이다,
[표 1]
.
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| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR1020200116689A KR102559726B1 (ko) | 2020-09-11 | 2020-09-11 | 유전자 다형성 마커 기반 여성형 탈모증 위험도 예측 모델 |
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|---|---|---|---|
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Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2009124720A1 (en) | 2008-04-07 | 2009-10-15 | Life & Brain Gmbh | Androgenetic alopecia |
| US20130078244A1 (en) | 2009-12-31 | 2013-03-28 | Angela M. Christiano | Methods for detecting and regulating alopecia areata and gene cohorts thereof |
| KR102061317B1 (ko) | 2018-11-22 | 2020-01-02 | 주식회사 다우진유전자연구소 | 단일염기다형성을 이용한 탈모 예측용 키트 및 이를 이용한 탈모 예측 방법 |
| KR102151713B1 (ko) * | 2019-07-15 | 2020-09-04 | 주식회사 테라젠바이오 | 탈모의 위험도를 예측하기 위한 조성물, 마이크로어레이, 및 키트, 및 이를 이용한 방법 |
Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR101533395B1 (ko) * | 2013-01-21 | 2015-07-08 | 이상열 | 단일 염기 다형성을 이용한 개체간의 유사도 산출 방법 및 시스템 |
| KR101933601B1 (ko) * | 2017-04-25 | 2019-04-01 | 연세대학교 산학협력단 | 탈모 예측용 snp 프라이머 및 이의 용도 |
| KR102102200B1 (ko) * | 2018-07-09 | 2020-04-21 | (주)메디젠휴먼케어 | 단일염기다형성을 이용한 탈모 표현형 예측 방법 |
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2020
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Patent Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2009124720A1 (en) | 2008-04-07 | 2009-10-15 | Life & Brain Gmbh | Androgenetic alopecia |
| US20130078244A1 (en) | 2009-12-31 | 2013-03-28 | Angela M. Christiano | Methods for detecting and regulating alopecia areata and gene cohorts thereof |
| KR102061317B1 (ko) | 2018-11-22 | 2020-01-02 | 주식회사 다우진유전자연구소 | 단일염기다형성을 이용한 탈모 예측용 키트 및 이를 이용한 탈모 예측 방법 |
| KR102151713B1 (ko) * | 2019-07-15 | 2020-09-04 | 주식회사 테라젠바이오 | 탈모의 위험도를 예측하기 위한 조성물, 마이크로어레이, 및 키트, 및 이를 이용한 방법 |
Non-Patent Citations (7)
| Title |
|---|
| BRITISH JOURNAL OF DERMATOLOGY, 2009, VOL. 161, P.289-294 [DOI 10.1111/J.1365_2133.2009.09186.X] |
| DERMATOLOGY 2015; VOL.231, P.239-244 [DOI: 10.1159/000433597] |
| Human Molecular Genetics, Vol.17, No.6, pp.835-843 (2008) |
| Nature Genetics, Vol.40, No.11, pp.1282-1284 (2008) |
| NCBI, dbSNP: ss1564948 (2000.09.18.)* |
| PLoS ONE, Vol.10, Issue 5, Article No.e0127852, pp.1-18 (2015) |
| PLoS ONE, Vol.8, Issue 12, Article No.e79789, pp.1-11 (2013)* |
Also Published As
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