KR102548752B1 - 마이코스포린 유사 아미노산 생산능을 갖는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산의 생산 방법 - Google Patents
마이코스포린 유사 아미노산 생산능을 갖는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산의 생산 방법 Download PDFInfo
- Publication number
- KR102548752B1 KR102548752B1 KR1020220123621A KR20220123621A KR102548752B1 KR 102548752 B1 KR102548752 B1 KR 102548752B1 KR 1020220123621 A KR1020220123621 A KR 1020220123621A KR 20220123621 A KR20220123621 A KR 20220123621A KR 102548752 B1 KR102548752 B1 KR 102548752B1
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- mycosporine
- amino acids
- microorganism
- amino acid
- microorganisms
- Prior art date
Links
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 title claims abstract description 116
- 244000005700 microbiome Species 0.000 title claims abstract description 87
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims abstract description 28
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 97
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 53
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 32
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 27
- XZQILKYKJYHEHD-JTQLQIEISA-N 2-[[(5s)-5-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-2-methoxy-3-oxocyclohexen-1-yl]amino]acetic acid Chemical compound COC1=C(NCC(O)=O)C[C@@](O)(CO)CC1=O XZQILKYKJYHEHD-JTQLQIEISA-N 0.000 claims description 12
- 108010080376 3-Deoxy-7-Phosphoheptulonate Synthase Proteins 0.000 claims description 12
- 108020001657 6-phosphogluconate dehydrogenase Proteins 0.000 claims description 12
- 108020003338 D-alanine-D-alanine ligase Proteins 0.000 claims description 12
- XZQILKYKJYHEHD-UHFFFAOYSA-N mycosporine glycine Natural products COC1=C(NCC(O)=O)CC(O)(CO)CC1=O XZQILKYKJYHEHD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 102000004567 6-phosphogluconate dehydrogenase Human genes 0.000 claims description 11
- 102100035172 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase Human genes 0.000 claims description 11
- 101710155861 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase Proteins 0.000 claims description 11
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 claims description 11
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 claims description 10
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 claims description 10
- VIZAVBQHHMQOQF-KKUJBODISA-N porphyra-334 Chemical compound COC1=C(NCC(O)=O)CC(O)(CO)C\C1=N\[C@H]([C@H](C)O)C(O)=O VIZAVBQHHMQOQF-KKUJBODISA-N 0.000 claims description 10
- VIZAVBQHHMQOQF-UHFFFAOYSA-N porphyra-334 Natural products COC1=C(CC(O)(CO)C/C/1=NC(C(C)O)C(=O)O)NCC(=O)O VIZAVBQHHMQOQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 101710116650 FAD-dependent monooxygenase Proteins 0.000 claims description 9
- 101710128228 O-methyltransferase Proteins 0.000 claims description 9
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 7
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 7
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 claims description 6
- WXEQFJUHQIGKNG-MZNRBSSJSA-N shinorine Chemical compound COC1=C(C[C@@](O)(CO)C\C1=N/[C@@H](CO)C(O)=O)NCC(O)=O WXEQFJUHQIGKNG-MZNRBSSJSA-N 0.000 claims description 5
- WXEQFJUHQIGKNG-UHFFFAOYSA-N shinorine Natural products COC1=C(CC(O)(CO)C/C/1=NC(CO)C(=O)O)NCC(=O)O WXEQFJUHQIGKNG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- HWSJJSITUUMTSO-UHFFFAOYSA-N 2-[[5-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-3-(1-hydroxypropan-2-ylamino)-2-methoxycyclohex-2-en-1-ylidene]amino]acetic acid Chemical compound COC1=C(NC(C)CO)CC(O)(CO)CC1=NCC(O)=O HWSJJSITUUMTSO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- VVTDHOIRNPCGTH-NSHDSACASA-N Mycosporine Chemical compound COC1=C(NC(CO)CO)C[C@@](O)(CO)CC1=O VVTDHOIRNPCGTH-NSHDSACASA-N 0.000 claims description 4
- NKJVQFFOGWSVTJ-AMIZOPFISA-N palythinol Natural products COC1=C(C[C@](O)(CO)CC1=N[C@H](C)CO)NCC(=O)O NKJVQFFOGWSVTJ-AMIZOPFISA-N 0.000 claims description 4
- OMPMQQQHTAPTHR-UHFFFAOYSA-N usujirene Natural products COC1=C(CC(O)(CO)C/C/1=NC=C/C)NCC(=O)O OMPMQQQHTAPTHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims description 3
- ZONRIYAALKITGT-UHFFFAOYSA-N 3,5-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)-2-methoxycyclohex-2-en-1-one Chemical compound COC1=C(O)CC(O)(CO)CC1=O ZONRIYAALKITGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- OTZURLUZDRIZEM-JYRVWZFOSA-N Asterina 330 Natural products COC1=C(CC(O)(CO)C/C/1=N/CCO)NCC(=O)O OTZURLUZDRIZEM-JYRVWZFOSA-N 0.000 claims description 2
- KYCBIRYKYQCBFO-KPKJPENVSA-N Palythine Chemical compound COC1=C(N)CC(O)(CO)C\C1=[NH+]/CC([O-])=O KYCBIRYKYQCBFO-KPKJPENVSA-N 0.000 claims description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 2
- 229960003104 ornithine Drugs 0.000 claims description 2
- AJGGWXHQTXRTPE-SNVBAGLBSA-N palythine Natural products COC1=C(C[C@@](O)(CO)CC1=N)NCC(=O)O AJGGWXHQTXRTPE-SNVBAGLBSA-N 0.000 claims description 2
- 229960003080 taurine Drugs 0.000 claims description 2
- 239000004474 valine Substances 0.000 claims description 2
- -1 methylamine-threonine Chemical compound 0.000 claims 2
- 230000004952 protein activity Effects 0.000 claims 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 abstract description 47
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 abstract description 46
- 101100435897 Petunia hybrida DAHP1 gene Proteins 0.000 abstract description 7
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 abstract 1
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 95
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 95
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 34
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 34
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 34
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 33
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 28
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 23
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 18
- 101150058005 ARO3 gene Proteins 0.000 description 16
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 15
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 15
- NGHMDNPXVRFFGS-IUYQGCFVSA-N D-erythrose 4-phosphate Chemical compound O=C[C@H](O)[C@H](O)COP(O)(O)=O NGHMDNPXVRFFGS-IUYQGCFVSA-N 0.000 description 14
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 14
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 14
- 101150114788 ARO4 gene Proteins 0.000 description 13
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 13
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 13
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 13
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 12
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 11
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 11
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 10
- 230000001851 biosynthetic effect Effects 0.000 description 10
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 10
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 10
- 230000004108 pentose phosphate pathway Effects 0.000 description 10
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 8
- JDTUMPKOJBQPKX-GBNDHIKLSA-N sedoheptulose 7-phosphate Chemical compound OCC(=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)COP(O)(O)=O JDTUMPKOJBQPKX-GBNDHIKLSA-N 0.000 description 8
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 8
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 8
- PJWIPEXIFFQAQZ-PUFIMZNGSA-N 7-phospho-2-dehydro-3-deoxy-D-arabino-heptonic acid Chemical compound OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CC(=O)C(O)=O PJWIPEXIFFQAQZ-PUFIMZNGSA-N 0.000 description 7
- 108020005004 Guide RNA Proteins 0.000 description 7
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 7
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 7
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 7
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 6
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 6
- JXOHGGNKMLTUBP-HSUXUTPPSA-N shikimic acid Chemical compound O[C@@H]1CC(C(O)=O)=C[C@@H](O)[C@H]1O JXOHGGNKMLTUBP-HSUXUTPPSA-N 0.000 description 6
- JXOHGGNKMLTUBP-JKUQZMGJSA-N shikimic acid Natural products O[C@@H]1CC(C(O)=O)=C[C@H](O)[C@@H]1O JXOHGGNKMLTUBP-JKUQZMGJSA-N 0.000 description 6
- 241000235015 Yarrowia lipolytica Species 0.000 description 5
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 5
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 5
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 5
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 5
- 239000000463 material Substances 0.000 description 5
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 5
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 5
- 229960001153 serine Drugs 0.000 description 5
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 5
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 4
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 4
- 101100491995 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) aro-1 gene Proteins 0.000 description 4
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 4
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 4
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 4
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 4
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 4
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 4
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 4
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 4
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 4
- 235000013379 molasses Nutrition 0.000 description 4
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 4
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 4
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 4
- 229960002898 threonine Drugs 0.000 description 4
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 4
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 3
- 229910009891 LiAc Inorganic materials 0.000 description 3
- 241000555676 Malassezia Species 0.000 description 3
- KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M Potassium hydroxide Chemical compound [OH-].[K+] KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 102000055026 Protein O-Methyltransferase Human genes 0.000 description 3
- 108700040119 Protein O-Methyltransferase Proteins 0.000 description 3
- 108010019477 S-adenosyl-L-methionine-dependent N-methyltransferase Proteins 0.000 description 3
- 241000078013 Trichormus variabilis Species 0.000 description 3
- 230000006696 biosynthetic metabolic pathway Effects 0.000 description 3
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 3
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 3
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 3
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 3
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 3
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 3
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 3
- 108010000785 non-ribosomal peptide synthase Proteins 0.000 description 3
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 3
- DTBNBXWJWCWCIK-UHFFFAOYSA-N phosphoenolpyruvic acid Chemical compound OC(=O)C(=C)OP(O)(O)=O DTBNBXWJWCWCIK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 3
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 3
- BIRSGZKFKXLSJQ-SQOUGZDYSA-K 6-phosphonatooxy-D-gluconate Chemical compound [O-]P(=O)([O-])OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C([O-])=O BIRSGZKFKXLSJQ-SQOUGZDYSA-K 0.000 description 2
- 241000123665 Actinosynnema mirum Species 0.000 description 2
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonia chloride Chemical compound [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L Calcium carbonate Chemical compound [Ca+2].[O-]C([O-])=O VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 241000907165 Coleofasciculus chthonoplastes Species 0.000 description 2
- 241000065716 Crocosphaera watsonii Species 0.000 description 2
- 241001263141 Cylindrospermum stagnale Species 0.000 description 2
- FNZLKVNUWIIPSJ-UHNVWZDZSA-N D-ribulose 5-phosphate Chemical compound OCC(=O)[C@H](O)[C@H](O)COP(O)(O)=O FNZLKVNUWIIPSJ-UHNVWZDZSA-N 0.000 description 2
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 2
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 2
- 101100010303 Drosophila melanogaster PolG1 gene Proteins 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001138401 Kluyveromyces lactis Species 0.000 description 2
- 241000235058 Komagataella pastoris Species 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 241000192710 Microcystis aeruginosa Species 0.000 description 2
- 241001223105 Nodularia spumigena Species 0.000 description 2
- 241000424623 Nostoc punctiforme Species 0.000 description 2
- 241000320412 Ogataea angusta Species 0.000 description 2
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 2
- DUBBPFYCKYTXKN-YFRKJXKXSA-N P(=O)(O)(O)OC[C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@H](C(=O)O1)O)O)O.P(=O)(O)(O)OC[C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@H](C(=O)O1)O)O)O Chemical compound P(=O)(O)(O)OC[C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@H](C(=O)O1)O)O)O.P(=O)(O)(O)OC[C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@H](C(=O)O1)O)O)O DUBBPFYCKYTXKN-YFRKJXKXSA-N 0.000 description 2
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 2
- 101150078890 POLG gene Proteins 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000235648 Pichia Species 0.000 description 2
- 241000190117 Pyrenophora tritici-repentis Species 0.000 description 2
- LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-N Pyruvic acid Chemical compound CC(=O)C(O)=O LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FNZLKVNUWIIPSJ-UHFFFAOYSA-N Rbl5P Natural products OCC(=O)C(O)C(O)COP(O)(O)=O FNZLKVNUWIIPSJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000235060 Scheffersomyces stipitis Species 0.000 description 2
- 241000235347 Schizosaccharomyces pombe Species 0.000 description 2
- 241000311088 Schwanniomyces Species 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 2
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000192117 Trichodesmium erythraeum Species 0.000 description 2
- 101100386816 Trichormus variabilis (strain ATCC 29413 / PCC 7937) Ava_3858 gene Proteins 0.000 description 2
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 2
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 2
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 2
- VFRROHXSMXFLSN-KCDKBNATSA-N aldehydo-D-galactose 6-phosphate Chemical compound OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C=O VFRROHXSMXFLSN-KCDKBNATSA-N 0.000 description 2
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 2
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OENHQHLEOONYIE-UKMVMLAPSA-N beta-Carotene Chemical compound CC=1CCCC(C)(C)C=1/C=C/C(/C)=C/C=C/C(/C)=C/C=C/C=C(C)C=CC=C(C)C=CC1=C(C)CCCC1(C)C OENHQHLEOONYIE-UKMVMLAPSA-N 0.000 description 2
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 2
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 2
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 2
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 2
- 239000001569 carbon dioxide Substances 0.000 description 2
- 229910002092 carbon dioxide Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 2
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 2
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 2
- 238000012136 culture method Methods 0.000 description 2
- JHIVVAPYMSGYDF-UHFFFAOYSA-N cyclohexanone Chemical compound O=C1CCCCC1 JHIVVAPYMSGYDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007857 degradation product Substances 0.000 description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 2
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 2
- 230000006238 glycylation Effects 0.000 description 2
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 2
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 2
- 150000002484 inorganic compounds Chemical class 0.000 description 2
- 229910010272 inorganic material Inorganic materials 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 2
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 2
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 2
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 2
- DTBNBXWJWCWCIK-UHFFFAOYSA-K phosphonatoenolpyruvate Chemical compound [O-]C(=O)C(=C)OP([O-])([O-])=O DTBNBXWJWCWCIK-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 229930001118 polyketide hybrid Natural products 0.000 description 2
- 125000003308 polyketide hybrid group Chemical group 0.000 description 2
- LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K potassium phosphate Substances [K+].[K+].[K+].[O-]P([O-])([O-])=O LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 229960004793 sucrose Drugs 0.000 description 2
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 2
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 description 2
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 2
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 2
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 2
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PAWQVTBBRAZDMG-UHFFFAOYSA-N 2-(3-bromo-2-fluorophenyl)acetic acid Chemical compound OC(=O)CC1=CC=CC(Br)=C1F PAWQVTBBRAZDMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MBPQVWGCNCNOQG-UHFFFAOYSA-N 2-aminocyclohex-2-en-1-one Chemical compound NC1=CCCCC1=O MBPQVWGCNCNOQG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N Ammonium acetate Chemical compound N.CC(O)=O USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005695 Ammonium acetate Substances 0.000 description 1
- ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N Ammonium bicarbonate Chemical compound [NH4+].OC([O-])=O ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004254 Ammonium phosphate Substances 0.000 description 1
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 1
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 1
- 241001247255 Aphanothece halophytica Species 0.000 description 1
- 101100365087 Arabidopsis thaliana SCRA gene Proteins 0.000 description 1
- 241001523626 Arxula Species 0.000 description 1
- 241000228212 Aspergillus Species 0.000 description 1
- 241000228193 Aspergillus clavatus Species 0.000 description 1
- 241000351920 Aspergillus nidulans Species 0.000 description 1
- 108010023063 Bacto-peptone Proteins 0.000 description 1
- 241000680806 Blastobotrys adeninivorans Species 0.000 description 1
- 241000123650 Botrytis cinerea Species 0.000 description 1
- 108091033409 CRISPR Proteins 0.000 description 1
- 238000010354 CRISPR gene editing Methods 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 241000222120 Candida <Saccharomycetales> Species 0.000 description 1
- 241000222122 Candida albicans Species 0.000 description 1
- 241000222178 Candida tropicalis Species 0.000 description 1
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 1
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 1
- 101001030456 Coprinopsis cinerea (strain Okayama-7 / 130 / ATCC MYA-4618 / FGSC 9003) Adenylate-forming reductase 03009 Proteins 0.000 description 1
- 101001000081 Coprinopsis cinerea (strain Okayama-7 / 130 / ATCC MYA-4618 / FGSC 9003) Adenylate-forming reductase 06235 Proteins 0.000 description 1
- 108010051219 Cre recombinase Proteins 0.000 description 1
- PANKHBYNKQNAHN-JTBLXSOISA-N Crocetin Natural products OC(=O)C(\C)=C/C=C/C(/C)=C\C=C\C=C(\C)/C=C/C=C(/C)C(O)=O PANKHBYNKQNAHN-JTBLXSOISA-N 0.000 description 1
- 241000195493 Cryptophyta Species 0.000 description 1
- 241000235646 Cyberlindnera jadinii Species 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-UWTATZPHSA-N D-alanine Chemical compound C[C@@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-UWTATZPHSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 230000007018 DNA scission Effects 0.000 description 1
- 241000235035 Debaryomyces Species 0.000 description 1
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 201000004624 Dermatitis Diseases 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 101150099000 EXPA1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100029095 Exportin-1 Human genes 0.000 description 1
- 229930091371 Fructose Natural products 0.000 description 1
- 239000005715 Fructose Substances 0.000 description 1
- RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N Fructose Chemical compound OC[C@H]1O[C@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 241000223195 Fusarium graminearum Species 0.000 description 1
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 1
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 1
- 101001124319 Heterobasidion annosum Adenylate-forming reductase Nps10 Proteins 0.000 description 1
- 241000934742 Heterocapsa triquetra Species 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 241000665874 Karlodinium veneficum Species 0.000 description 1
- 241000235649 Kluyveromyces Species 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001291477 Malassezia restricta Species 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 1
- 240000003183 Manihot esculenta Species 0.000 description 1
- 235000016735 Manihot esculenta subsp esculenta Nutrition 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 241000191342 Nematostella vectensis Species 0.000 description 1
- 108020004485 Nonsense Codon Proteins 0.000 description 1
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 1
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 1
- 241000200171 Oxyrrhis marina Species 0.000 description 1
- 241000736122 Parastagonospora nodorum Species 0.000 description 1
- 101001053399 Paxillus involutus Atromentin synthetase invA1 Proteins 0.000 description 1
- 101001053402 Paxillus involutus Atromentin synthetase invA2 Proteins 0.000 description 1
- 101000599707 Paxillus involutus Atromentin synthetase invA5 Proteins 0.000 description 1
- 101001053396 Paxillus involutus Inactive atromentin synthetase invA3 Proteins 0.000 description 1
- 101000599706 Paxillus involutus Inactive atromentin synthetase invA4 Proteins 0.000 description 1
- 101000599710 Paxillus involutus Inactive atromentin synthetase invA6 Proteins 0.000 description 1
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 1
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 1
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010009736 Protein Hydrolysates Proteins 0.000 description 1
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 1
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 1
- 230000004570 RNA-binding Effects 0.000 description 1
- 108020005091 Replication Origin Proteins 0.000 description 1
- 101150105073 SCR1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000235070 Saccharomyces Species 0.000 description 1
- 101100119348 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) EXP1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100134054 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) NTG1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000235346 Schizosaccharomyces Species 0.000 description 1
- 241001123650 Schwanniomyces occidentalis Species 0.000 description 1
- 101001124317 Serpula lacrymans var. lacrymans (strain S7.9) Adenylate-forming reductase Nps11 Proteins 0.000 description 1
- 101000577223 Serpula lacrymans var. lacrymans (strain S7.9) Adenylate-forming reductase Nps9 Proteins 0.000 description 1
- 101001124346 Serpula lacrymans var. lacrymans (strain S7.9) Atromentin synthetase nps3 Proteins 0.000 description 1
- 240000006394 Sorghum bicolor Species 0.000 description 1
- 235000011684 Sorghum saccharatum Nutrition 0.000 description 1
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 1
- 101100269618 Streptococcus pneumoniae serotype 4 (strain ATCC BAA-334 / TIGR4) aliA gene Proteins 0.000 description 1
- 101001034059 Suillus grevillei Atromentin synthetase greA Proteins 0.000 description 1
- GWEVSGVZZGPLCZ-UHFFFAOYSA-N Titan oxide Chemical compound O=[Ti]=O GWEVSGVZZGPLCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700009124 Transcription Initiation Site Proteins 0.000 description 1
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 1
- 241001123669 Verticillium albo-atrum Species 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 241000235013 Yarrowia Species 0.000 description 1
- XLOMVQKBTHCTTD-UHFFFAOYSA-N Zinc monoxide Chemical compound [Zn]=O XLOMVQKBTHCTTD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000222124 [Candida] boidinii Species 0.000 description 1
- 241001231403 [Nectria] haematococca Species 0.000 description 1
- 238000000862 absorption spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 238000005377 adsorption chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000000735 allogeneic effect Effects 0.000 description 1
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019257 ammonium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 229940043376 ammonium acetate Drugs 0.000 description 1
- 239000001099 ammonium carbonate Substances 0.000 description 1
- 235000012501 ammonium carbonate Nutrition 0.000 description 1
- 235000019270 ammonium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 239000000908 ammonium hydroxide Substances 0.000 description 1
- 229910000148 ammonium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019289 ammonium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000002518 antifoaming agent Substances 0.000 description 1
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 1
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 239000011648 beta-carotene Substances 0.000 description 1
- 235000013734 beta-carotene Nutrition 0.000 description 1
- TUPZEYHYWIEDIH-WAIFQNFQSA-N beta-carotene Natural products CC(=C/C=C/C=C(C)/C=C/C=C(C)/C=C/C1=C(C)CCCC1(C)C)C=CC=C(/C)C=CC2=CCCCC2(C)C TUPZEYHYWIEDIH-WAIFQNFQSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 1
- 229960002747 betacarotene Drugs 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 229910000019 calcium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 229940095731 candida albicans Drugs 0.000 description 1
- 235000021466 carotenoid Nutrition 0.000 description 1
- PANKHBYNKQNAHN-JUMCEFIXSA-N carotenoid dicarboxylic acid Natural products CC(=C/C=C/C=C(C)/C=C/C=C(C)/C(=O)O)C=CC=C(/C)C(=O)O PANKHBYNKQNAHN-JUMCEFIXSA-N 0.000 description 1
- 150000001747 carotenoids Chemical class 0.000 description 1
- 108010079058 casein hydrolysate Proteins 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 1
- 239000000490 cosmetic additive Substances 0.000 description 1
- 239000013601 cosmid vector Substances 0.000 description 1
- PANKHBYNKQNAHN-MQQNZMFNSA-N crocetin Chemical compound OC(=O)C(/C)=C/C=C/C(/C)=C/C=C/C=C(\C)/C=C/C=C(\C)C(O)=O PANKHBYNKQNAHN-MQQNZMFNSA-N 0.000 description 1
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 1
- 150000001923 cyclic compounds Chemical class 0.000 description 1
- HKZLNGQCWGVZIW-UHFFFAOYSA-N cyclohex-2-en-1-imine Chemical compound N=C1CCCC=C1 HKZLNGQCWGVZIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 1
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 1
- MNNHAPBLZZVQHP-UHFFFAOYSA-N diammonium hydrogen phosphate Chemical compound [NH4+].[NH4+].OP([O-])([O-])=O MNNHAPBLZZVQHP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- 235000013681 dietary sucrose Nutrition 0.000 description 1
- ZPWVASYFFYYZEW-UHFFFAOYSA-L dipotassium hydrogen phosphate Chemical compound [K+].[K+].OP([O-])([O-])=O ZPWVASYFFYYZEW-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000396 dipotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019797 dipotassium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 238000003912 environmental pollution Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 108700002148 exportin 1 Proteins 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 1
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 1
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 238000012224 gene deletion Methods 0.000 description 1
- 102000034356 gene-regulatory proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091006104 gene-regulatory proteins Proteins 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000034659 glycolysis Effects 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 1
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 1
- 230000000415 inactivating effect Effects 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 238000007852 inverse PCR Methods 0.000 description 1
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- FBAFATDZDUQKNH-UHFFFAOYSA-M iron chloride Chemical compound [Cl-].[Fe] FBAFATDZDUQKNH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229910000358 iron sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- BAUYGSIQEAFULO-UHFFFAOYSA-L iron(2+) sulfate (anhydrous) Chemical compound [Fe+2].[O-]S([O-])(=O)=O BAUYGSIQEAFULO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 1
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 238000001638 lipofection Methods 0.000 description 1
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 229940099596 manganese sulfate Drugs 0.000 description 1
- 239000011702 manganese sulphate Substances 0.000 description 1
- 235000007079 manganese sulphate Nutrition 0.000 description 1
- SQQMAOCOWKFBNP-UHFFFAOYSA-L manganese(II) sulfate Chemical compound [Mn+2].[O-]S([O-])(=O)=O SQQMAOCOWKFBNP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 238000012269 metabolic engineering Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 239000002808 molecular sieve Substances 0.000 description 1
- 229910000402 monopotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019796 monopotassium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 230000037434 nonsense mutation Effects 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- 125000001477 organic nitrogen group Chemical group 0.000 description 1
- DXGLGDHPHMLXJC-UHFFFAOYSA-N oxybenzone Chemical compound OC1=CC(OC)=CC=C1C(=O)C1=CC=CC=C1 DXGLGDHPHMLXJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001173 oxybenzone Drugs 0.000 description 1
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 1
- 229930029653 phosphoenolpyruvate Natural products 0.000 description 1
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 229920001522 polyglycol ester Polymers 0.000 description 1
- GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M potassium dihydrogen phosphate Chemical compound [K+].OP(O)([O-])=O GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000001376 precipitating effect Effects 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- 229940107700 pyruvic acid Drugs 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 1
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 1
- 238000005185 salting out Methods 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N sodium aluminosilicate Chemical compound [Na+].[Al+3].[O-][Si]([O-])=O.[O-][Si]([O-])=O URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 238000000527 sonication Methods 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 1
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 1
- 238000005728 strengthening Methods 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000005846 sugar alcohols Chemical class 0.000 description 1
- 230000000475 sunscreen effect Effects 0.000 description 1
- 239000000516 sunscreening agent Substances 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 238000011426 transformation method Methods 0.000 description 1
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 239000007222 ypd medium Substances 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/80—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
- C12N15/81—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts
- C12N15/815—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts for yeasts other than Saccharomyces
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/80—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
- C12N15/81—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0006—Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1003—Transferases (2.) transferring one-carbon groups (2.1)
- C12N9/1007—Methyltransferases (general) (2.1.1.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1085—Transferases (2.) transferring alkyl or aryl groups other than methyl groups (2.5)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/88—Lyases (4.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/93—Ligases (6)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/005—Amino acids other than alpha- or beta amino acids, e.g. gamma amino acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y205/00—Transferases transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (2.5)
- C12Y205/01—Transferases transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (2.5) transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (2.5.1)
- C12Y205/01054—3-Deoxy-7-phosphoheptulonate synthase (2.5.1.54)
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Mycology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
본 발명은 마이코스포린 유사 아미노산 생산능을 갖는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산 생산 방법에 관한 것으로, 본 발명의 일 양상에 따라 시키메이트 경로에 관여하는 3-데옥시-7-포스포헵툴로네이트 합성 효소 (DAHPS)를 불활성화시키는 경우 마이코스포린 유사 아미노산의 생산능이 향상되므로, 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는데 유용하게 사용될 수 있다.
Description
본 발명은 마이코스포린 유사 아미노산 생산능을 갖는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산의 생산 방법에 관한 것이다.
자외선으로부터 피부를 보호하기 위해 다양한 화학, 물리적 자외선 차단 소재들이 사용되고 있다. 특히, 옥시벤존(oxybenzone), 산화아연(ZnO), 및 이산화타이타늄(TiO2)은 화장품 첨가제로 널리 사용되는 자외선 차단 물질이지만, 피부염을 초래하거나 환경오염 문제 등의 부정적인 효과 때문에 보다 안전한 바이오 기반의 자외선 차단 소재의 개발이 요구된다.
마이코스포린 유사 아미노산 (mycosporine-like amino acids; MAAs)은 강한 빛에 노출되는 해양 미생물 또는 조류 등이 생산하는 천연 자외선 차단 소재이다. 4-데옥시가두솔(4-Deoxygadusol: 4-DG)은 MAA의 일반적인 전구체로 아미노산의 단일 치환 및 이중 치환은 각각 아미노시클로헥세논(aminocyclohexenone)과 아미노클로헥세이민(aminocycloheximine) 구조를 가진다. 또한 결합된 아미노산의 종류와 추가 변형에 따라 30여개 이상의 다양한 마이코스포린 유사 아미노산이 존재한다. 이러한 다양한 종류의 MAA는 UV-A (315~400 nm)와 UV-B (310~360 nm)를 모두 포함하는 서로 다른 흡수 스펙트럼을 가질 수 있다.
마이코스포린 유사 아미노산은 미세조류 등의 미생물에서 자연적으로 생산되지만, 그 양이 극소량이며 배양 및 추출/정제하는 조건들이 복잡하여 대량 생산하기 어려운 문제가 있다. 따라서, 마이코스포린 유사 아미노산 생산 효율이 우수한 새로운 미생물의 개발이 필요한 실정이다.
이에, 본 발명은 3-데옥시-7-포스포헵툴로네이트 합성 효소 (3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase)의 활성이 비변형 미생물에 비해 불활성화된, 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물을 제공하고자 한다.
또한, 본 발명은 상기 미생물을 배양하는 단계; 및 상기 배양된 미생물 또는 배지로부터 마이코스포린 유사 아미노산을 회수하는 단계를 포함하는, 마이코스포린 유사 아미노산의 생산방법을 제공하고자 한다.
또한, 본 발명은 상기 미생물을 포함하는, 마이코스포린 유사 아미노산 생산용 조성물을 제공하고자 한다.
본 발명의 일 양상은 3-데옥시-7-포스포헵툴로네이트 합성 효소 (3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase)의 활성이 비변형 미생물에 비해 불활성화된, 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물을 제공한다.
본 명세서에서 용어 "3-데옥시-7-포스포헵툴로네이트 합성 효소"는 포스포에놀피루브산 (phosphoenolpyruvate: PEP)와 D-에리트로스 4-포스페이트 (D-erythrose 4-phosphate: E4P)를 3-데옥시-D-아라비노-헵툴로소네이트 7-포스페이트 (3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate: DAHP)로 전환하는데 관여하는 효소이다.
PED + E4P → DAHP
마이코스포린 유사 아미노산은 오탄당 인산경로의 중간물인 세도헵툴로스 7-인산 (sedoheptulose 7-phosphate: S7P)로부터 생산되므로(도 1 참조), 본 발명에서는 오탄당 인산경로의 하위 경로인 시키메이트 경로 (shikimate pathway)를 약화시키고자 하였다. 따라서 시키메이트 경로의 첫번째 단계인 포스포에놀피루브산 (PEP)와 D-에리트로스 4-포스페이트 (E4P)를 3-데옥시-D-아라비노-헵툴로소네이트 7-포스페이트 (DAHP)로 전환하는데 관여하는 효소인 3-데옥시-7-포스포헵툴로네이트 합성 효소 (DAHPS)를 불활성화시키도록 하였다.
본 명세서에서 용어 "불활성화"는 본래 미생물이 가진 효소 단백질의 내재적 활성 또는 변형 전 활성에 비하여 그 활성이 약화되는 경우; 단백질이 전혀 발현이 되지 않는 경우; 또는 발현이 되더라도 그 활성이 없는 경우를 의미한다. 상기 불활성화는 효소를 코딩하는 폴리뉴클레오티드의 변이 등으로 효소 자체의 활성이 본래 미생물이 가지고 있는 효소의 활성에 비해 약화하거나 제거된 경우; 효소를 코딩하는 유전자의 발현 저해 또는 번역(translation) 저해 등으로 세포 내에서 전체적인 효소 활성 정도가 천연형 미생물에 비하여 낮거나 제거된 경우; 효소를 코딩하는 유전자의 일부 또는 전체가 결실된 경우; 및 이들의 조합 역시 포함하는 개념으로, 이에 한정되지는 않는다.
본 명세서에서 용어 "비변형 미생물"은, 비교 대상 미생물의 특정 단백질이 자연적 또는 인위적 요인에 의해 유전적 변이되어 미생물의 형질이 변화하는 경우, 형질 변화 전 모균주가 본래 가지고 있던 특정 단백질의 활성을 갖고 있는 미생물을 말한다. 본원에서 "비변형 미생물"은 유전적 변이가 일어나지 않은 "내재적 활성을 갖는 미생물"과 혼용되어 사용될 수 있다.
상기 효소 활성의 불활성화는, 당해 분야에 잘 알려진 다양한 방법의 적용으로 달성될 수 있다. 상기 방법의 예로, 1) 상기 효소를 코딩하는 염색체상의 유전자의 전체 또는 일부를 결실시키는 방법; 2) 상기 단백질을 코딩하는 염색체상의 유전자의 발현이 감소하도록 발현조절 서열의 변형, 3) 상기 단백질의 활성이 제거 또는 약화되도록 단백질을 코딩하는 염색체 상의 유전자 서열의 변형, 4) 상기 단백질을 코딩하는 염색체상의 유전자의 전사체에 상보적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오티드(예컨대, 안티센스 RNA)의 도입; 5) 상기 단백질을 코딩하는 염색체상의 유전자의 사인-달가르노(Shine-Dalgarno) 서열 앞단에 사인-달가르노 서열과 상보적인 서열을 부가하여 2차 구조물을 형성시켜 리보솜(ribosome)의 부착을 불가능하게 만드는 방법; 6) 상기 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열의 ORF(open reading frame)의 3' 말단에 반대 방향으로 전사되는 프로모터를 부가하는 방법(Reverse transcription engineering, RTE) 등이 있으며, 이들의 조합으로도 달성할 수 있으나, 이에, 특별히 제한되는 것은 아니다.
상기 효소를 코딩하는 염색체상의 유전자의 일부 또는 전체를 결실하는 방법은, 미생물 내 염색체 삽입용 벡터를 통해 염색체 내 내재적 목적 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 일부 뉴클레오티드 서열이 결실된 폴리뉴클레오티드 또는 마커 유전자로 교체함으로써 수행될 수 있다. 이러한 폴리뉴클레오티드의 일부 또는 전체를 결실하는 방법의 일례로 상동 재조합에 의하여 폴리뉴클레오티드를 결실시키는 방법을 사용할 수 있으나, 이에 한정되지는 않는다.
상기 발현 조절 서열을 변형하는 방법은 상기 발현 조절 서열의 활성을 더욱 약화하도록 핵산 서열을 결실, 삽입, 비보전적 또는 보전적 치환 또는 이들의 조합으로 발현 조절 서열상의 변이를 유도하여 수행하거나, 더욱 약한 활성을 갖는 핵산 서열로 교체함으로써 수행할 수 있다. 상기 발현 조절서열에는 프로모터, 오퍼레이터 서열, 리보좀 결합부위를 코딩하는 서열, 및 전사와 해독의 종결을 조절하는 서열을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 염색체상의 유전자 서열을 변형하는 방법은 상기 효소의 활성을 더욱 약화하도록 유전자 서열을 결실, 삽입, 비보전적 또는 보전적 치환 또는 이들의 조합으로 서열상의 변이를 유도하여 수행하거나, 더욱 약한 활성을 갖도록 개량된 유전자 서열 또는 활성이 없도록 개량된 유전자 서열로 교체함으로써 수행할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 폴리뉴클레오티드는 기능을 할 수 있는 폴리뉴클레오티드 집합체인 경우 유전자로 기재될 수 있다. 본원에서 폴리뉴클레오티드와 유전자는 혼용될 수 있으며, 폴리뉴클레오티드 서열과 뉴클레오티드 서열은 혼용될 수 있다.
상기에서 "일부"란, 폴리뉴클레오티드의 종류에 따라서 상이하지만, 구체적으로는 1 내지 300개, 더욱 구체적으로는 1 내지 100개, 보다 더욱 구체적으로는 1 내지 50개일 수 있으나, 특별히 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 미생물은 마이코스포린 유사 아미노산을 생산할 수 있다.
본 명세서에서 용어 "마이코스포린 유사 아미노산(mycosporine-like amino acids; MAAs)"은 자외선을 흡수하는 고리형 화합물을 의미한다. 상기 마이코스포린 유사 아미노산은 자외선을 흡수할 수 있는 한 제한이 없으나, 구체적으로, 사이클로헥세논(cyclohexanone) 또는 사이클로헥센이민(cyclohexenimine)의 중심 링을 가지는 화합물; 또는 상기 중심 링에 아미노산 등의 다양한 물질이 결합된 화합물일 수 있다. 더욱 구체적으로, 마이코스포린-2-글라이신 (mycosporine-2-glycine), 팰라이티놀 (palythinol), 팰라이텐산 (palythenic acid), 데옥시가두솔 (deoxygadusol), 마이코스포린-메틸아민-트레오닌 (mycosporine-methylamine-threonine), 마이코스포린-글라이신-발린 (mycosporine-glycine-valine), 팰라이틴 (palythine), 아스테리나-330 (asterina-330), 시노린 (shinorine), 포피라-334 (porphyra-334), 유하로테스-362 (euhalothece-362), 마이코스포린-글라이신 (mycosporine-glycine), 마이코스포린-오르니틴 (mycosporine-ornithine), 마이코스포린-라이신 (mycosporine-lysine), 마이코스포린-글루탐산-글라이신 (mycosporine-glutamic acid-glycine), 마이코스포린-메틸아민-세린 (mycosporine-methylamine-serine), 마이코스포린-타우린 (mycosporine-taurine), 팰라이텐 (palythene), 팰라이텐-세린 (palythine-serine), 팰라이텐-세린-설페이트 (palythine-serine-sulfate), 팰라이티놀(palythinol), 및 우수지렌 (usujirene)으로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상인 것일 수 있으며, 이에 제한되지 않는다.
본 명세서에서 마이코스포린 유사 아미노산은 MAA 및 MAAs와 혼용될 수 있다.
본 명세서에서 용어 "마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물"은 마이코스포린 유사 아미노산의 생합성에 관여하는 효소의 유전자 또는 상기 유전자들의 클러스터를 포함하는 미생물을 의미할 수 있다. 또한, 본원에서 용어, "마이코스포린 유사 아미노산 생합성 유전자"는 마이코스포린 유사 아미노산 생합성에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자를 의미하는 것으로, 상기 유전자들의 클러스터도 포함한다. 상기 마이코스포린 유사 아미노산 생합성 유전자는 이를 포함하는 미생물이 마이코스포린 유사 아미노산을 생산할 수 있는 한, 미생물의 외래 및/또는 내재적인 유전자를 모두 포함한다. 상기 외래 유전자는 동종 및/또는 이종일 수 있다.
상기 마이코스포린 유사 아미노산 생합성 유전자는, 이를 포함하는 미생물이 마이코스포린 유사 아미노산 생합성에 관여하는 효소를 생산하고 결과적으로 마이코스포린 유사 아미노산을 생산할 수 있는 한, 상기 유전자들의 유래 미생물 종에는 제한이 없으나, 구체적으로, 남세균(cyanobacteria)인 아나베나 바리아빌리스(Anabaena variabilis), 노스탁 펑크티포르메(Nostoc punctiforme), 노두라리아 스푸미게나(Nodularia spumigena), 시아노테스 속 PCC 7424(Cyanothecesp. PCC 7424), 라인비아 속 PCC 8106(Lyngbyasp. PCC 8106), 마이크로카이스티스 아에루기노사(Microcystis aeruginosa), 마이크로코레우스 크토노플라스테스(Microcoleus chthonoplastes), 시아노테스 속 ATCC 51142(Cyanothecesp. ATCC 51142), 크로코스파에라 와트소니(Crocosphaerawatsonii), 시아노테스 속 CCY 0110(Cyanothecesp. CCY 0110), 시린드로스페르멈 스태그날 속 PCC 7417(cylindrospermumstagnale sp,PCC 7417), 아파노테스 할로피티카(Aphanothecehalophytica) 또는 트리코데스미운 에리트라에움(Trichodesmiumerythraeum)이거나, 또는 균류(fungi)인 마그나포르테 오르지아에(Magnaportheorzyae), 피레노포라 트리티씨-레펜티스(Pyrenophora tritici-repentis), 아스퍼질러스 클라바투스(Aspergillus clavatus), 넥트리아 헤마토코카(Nectriahaematococca), 아스퍼질러스 니두란스(Aspergillus nidulans), 지베렐라 제아에(Gibberellazeae), 베르티씰리움 알보-아트룸(Verticillium albo-atrum), 보트리오티니아 푸케리아나(Botryotinia fuckeliana), 파에오스파에리아 노도룸(Phaeosphaerianodorum)이거나, 또는 네마토르텔라 벡텐시스(Nematostellavectensis), 헤테로카프사 트리퀘트라(Heterocapsa triquetra), 옥시리스 마리나(Oxyrrhis marina), 칼로디니움 미크룸(Karlodinium micrum), 악티노신네마 미룸(Actinosynnemamirum) 등일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
일 실시예에 따르면, 미생물은 서로 유래가 다른 마이코스포린 유사 아미노산 생합성 유전자들을 포함할 수 있다.
구체적으로, 상기 마이코스포린 유사 아미노산 생합성 유전자는 미생물이 마이코스포린 유사 아미노산을 생산할 수 있는 한 효소 명칭이나 유래 미생물에 제한되지 않으나, 2-디메틸 4-데옥시가두솔 합성 효소, O-메틸 전이 효소, ATP-grasp 라이게이즈, 및 D-알라닌 D-알라닌 라이게이즈로 이루어지는 군으로부터 선택되는 하나 이상, 구체적으로, 1이상, 2이상, 3이상, 또는 모든 효소 단백질; 또는 이와 동일 및/또는 유사한 활성을 가진 효소 단백질을 코딩하는 유전자를 포함할 수 있다.
또한, 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물은, 마이코스포린 유사 아미노산에 추가적인 아미노산 잔기를 부착하는 활성을 가진 효소의 유전자 또는 상기 유전자들의 클러스터를 포함할 수 있다. 상기 유전자 또는 상기 유전자들의 클러스터는, 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물이 두 개이상의 아미노산 잔기가 부착된 마이코스포린 유사 아미노산을 생산할 수 있는 한 효소 명칭이나 유래 미생물에 제한되지 않으나, 구체적으로 논-리보좀 펩티드 신테타제 (non-ribosomal peptide synthetase: NRPS), 논-리보좀 펩티드 신테타제 유사 효소 (non-ribosomal peptide synthetase-like enzyme: NRPS-like enzyme) 및 D-알라닌 D-알라닌 리가제 (D-Ala D-Ala ligase: DDL) 로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상, 구체적으로, 1이상, 2이상, 3이상, 또는 모든 효소 단백질; 또는 이와 동일 및/또는 유사한 활성을 가진 효소 단백질을 코딩하는 유전자를 포함할 수 있다. 일부 마이코스포린 유사 아미노산은, 마이코스포린-글라이신에 두 번째 아미노산 잔기를 포함한다. 상기 논-리보좀 펩티드 신테타제, 논-리보좀 펩티드 신테타제 유사 효소 및 D-알라닌 D-알라닌 리가제로 이루어지는 군으로부터 선택되는 하나 이상의 효소는, 마이코스포린-글라이신에 두 번째 아미노산 잔기를 부착시킬 수 있다.
본 명세서에서 유전자의 도입 및/또는 유전자의 결실은 순서에 상관없이 동시, 순차, 역순으로 수행될 수 있다.
또한, 상기 미생물은 상기 마이코스포린 유사 아미노산 생합성 유전자를 원래부터 가지고 있는 천연형 미생물; 및 이종 및/또는 동종 유래 마이코스포린 유사 아미노산 생합성 유전자가 도입된 미생물일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
또한, 상기 미생물은 내재적 및/또는 도입된, 마이코스포린 유사 아미노산 생합성 관련 유전자가 코딩하는 효소의 활성이 강화된 미생물일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
또한, 상기 미생물은 구체적으로 효모일 수 있으며, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 효모는 사카로마이세스(Saccharomyces), 캔디다(Candida), 디베리오마이세스(Debaryomyces), 한세눌라(Hansenula), 클루이베로마이세스 (Kluyveromyces), 피키아(Pichia), 스키조사카로마이세스(Schizosaccharomyces), 야로이야(Yarrowia), 슈완니오마이세스(Schwanniomyces), 아르술라(Arxula), 말라세지아(Malassezia) 등의 속의 효모일 수 있다.
구체적으로, 상기 효모는 사카로마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae), 캔디다 트로피칼리스(Candidatropicalis), 캔디다 유틸리스(Candida utilis), 캔디다 보이디니(Candidaboidinii), 캔디다 알비칸스(Candida albicans), 클루이베로마이세스 락티스(Kluyveromyceslactis), 피키아 파스토리스(Pichiapastoris), 피키아 스티피티스(Pichiastipitis), 스키조카로마이세스 폼베(Schizosaccharomycespombe), 한세눌라 폴리모르파(Hansenulapolymorpha), 야로이야 리폴리티카(Yarrowia lipolytica), 슈완니오마이세스 옥시덴탈리스(Schwanniomycesoccidentalis), 아르술라 아데니니모란스(Arxula adeninivorans), 말라세지아 리스트릭타(Malassezai restricta), 말라세지아 퍼퍼(Malassezai furfur) 등일 수 있다.
상기 미생물은 변이 전 모균주 또는 비변형 미생물의 마이코스포린 유사 아미노산 생산능에 비하여 약 1% 이상, 구체적으로는 약 1% 이상, 약 2.5% 이상, 약 5% 이상, 약 6% 이상, 약 7% 이상, 약 8% 이상, 약 9% 이상, 약 10% 이상, 약 11% 이상, 약 11.5% 이상, 약 12% 이상, 약 12.5% 이상, 약 13% 이상, 약 13.5% 이상, 약 14% 이상, 약 14.5% 이상, 약 15% 이상, 약 15.5% 이상, 약 16% 이상, 약 16.5% 이상, 약 17% 이상, 약 17.5% 이상, 약 18% 이상, 약 18.5% 이상, 약 19% 이상, 약 19.5% 이상, 약 20% 이상, 약 20.5% 이상, 약 21% 이상, 약 21.5% 이상, 약 22% 이상, 약 22.5% 이상, 약 23% 이상, 약 23.5% 이상, 약 24% 이상, 약 24.5% 이상, 약 25% 이상, 약 26% 이상, 약 27% 이상, 약 27.5% 이상, 약 30% 이상, 약 35% 이상, 약 40% 이상, 약 45% 이상, 약 50% 이상, 약 55% 이상, 약 60% 이상, 약 65% 이상, 약 70% 이상, 약 75% 이상, 약 80% 이상, 또는 약 85% 이상 (상한값은 특별한 제한은 없으며, 예컨대, 약 200% 이하, 약 150% 이하 또는 약 100% 이하일 수 있음) 증가된 것일 수 있으나, 변이 전 모균주 또는 비변형 미생물의 생산능에 비해 +값의 증가량을 갖는 한, 이에 제한되지 않는다. 다른 예에서, 상기 생산능이 증가된 재조합 균주는 변이 전 모균주 또는 비변형 미생물에 비하여, 마이코스포린 유사 아미노산 생산능이 약 1.01배 이상, 약 1.02배 이상, 약 1.03배 이상, 약 1.05배 이상, 약 1.06배 이상, 약 1.07배 이상, 약 1.08배 이상, 약 1.09배 이상, 약 1.10배 이상, 약 1.11배 이상, 약 1.12배 이상, 약 1.13배 이상, 약 1.14배 이상, 약 1.15배 이상, 약 1.16 배 이상, 약 1.17배 이상, 약 1.18배 이상, 약 1.19배 이상, 약 1.20배 이상, 약 1.5배 이상, 약 2.0배 이상, 약 2.5배 이상, 약 3.0배 이상, 약 4.0배 이상, 약 5.0배 이상, 약 10배 이상, 약 15배 이상, 약 20배 이상, 약 25배 이상, 약 30배 이상, 약 35배 이상, 약 40배 이상, 약 45배 이상, 약 50배 이상, 약 55배 이상 또는 약 60배 이상 (상한값은 특별한 제한은 없으며, 예컨대, 약 100배 이하 또는 약 80배 이하일 수 있음) 증가된 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. 상기 용어 "약(about)"은 ±0.5, ±0.4, ±0.3, ± 0.2, ±0.1 등을 모두 포함하는 범위로, 약 이란 용어 뒤에 나오는 수치와 동등하거나 유사한 범위의 수치를 모두 포함하나, 이에 제한되지 않는다. 또한, 본 명세서에서 숫자 앞에 "약"이 쓰여져 있지 않더라도, "약"이 쓰여져 있는 것과 동일하다.
본 명세서에서 용어 "비변형 미생물"은 미생물에 자연적으로 발생할 수 있는 돌연변이를 포함하는 숙주를 제외하는 것이 아니며, 야생형 숙주 또는 천연형 숙주 자체이거나, 자연적 또는 인위적 요인에 의한 유전적 변이로 형 질이 변화되기 전 숙주를 의미할 수 있다. 상기 "비변형 미생물"은 "변형 전 숙주", "변형 전 균주", "변형 전 미생물", "비변이 숙주", "비변이 균주", "비변이 미생물", "비변형 숙주", "비변형 균주" 또는 "기준 미생물"과 혼용될 수 있다.
일 구체예에 있어서, 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물은 2-디메틸 4-데옥시가두솔 합성 효소 (2-demethyl 4-deoxygadusol synthase: DDGS), O-메틸 전이 효소 (O-methyltransferase: O-MT), ATP-grasp 라이게이즈 (ATP-grasp ligase), 및 D-알라닌 D-알라닌 라이게이즈 (D-Ala D-Ala ligase)로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 단백질을 암호화하는 유전자를 포함하는 것일 수 있으며, 이에 한정되지 않는다.
상기 2-디메틸 4-데옥시가두솔 합성 효소(DDGS)는, 예컨대, 도 1에 나타낸 바와 같이, 세도헵툴로스 7-인산(S7P)으로부터 2-디메틸-4-데옥시가두솔 (2-demethyl 4-deoxygadusol: DDG)을 합성할 수 있으나, 이에 한정되지 않는다.
상기 O-메틸 전이 효소(O-MT)는 예컨대 2-디메틸-4-데옥시가두솔(DDG)을 4-데옥시가두솔 (4-deoxygadusol: 4-DG)로 전환시킬 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 ATP-grasp 라이게이즈는 예컨대 글리신 결합 (glycylation)을 촉매하여 4-데옥시가두솔 (4-DG)를 마이코스포린-글리신 (mycosporine-glycine: MG)으로 전환시킬 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 D-알라닌 D-알라닌 라이게이즈는 마이코스포린-글리신 (MG)에 L-세린 (L-serine) 또는 L-트레오닌 (L-threonine)이 부착되어 시노린 (shinorine) 또는 포피라-334 (porphyra-334)이 형성되는데 관여할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 2-디메틸 4-데옥시가두솔 합성 효소, O-메틸 전이 효소, ATP-grasp 라이게이즈, 및 D-알라닌 D-알라닌 라이게이즈는 미생물의 종 또는 미생물에 따라 활성을 나타내는 단백질의 아미노산 서열에 차이가 존재하는 경우가 있기 때문에, 그 유래나 서열에 한정되지 않는다.
일 구체예에 있어서, 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물은 글루코오스-6-포스페이트 1-데하이드로게나아제 (glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase) 및 6-포스포글루코네이트 데하이드로게나아제 (6-phosphogluconate dehydrogenase)로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 단백질 활성이 비변형 미생물에 비해 강화된 것일 수 있다.
상기 글루코오스-6-포스페이트 1-데하이드로게나아제는 오탄당 인산경로의 첫번째 단계인 글루코스 6-포스페이트 (glucose 6-phosphate: G6P)를 6-포스포-D-글루코노-1,5-락톤 (6-phospho-D-glucono-1,5-lactone)으로 전환하는데 관여하는 효소이며, 이에 한정되지 않는다.
상기 6-포스포글루코네이트 데하이드로게나아제는 D-글루코네이트 6-포스페이트 (D-gluconate 6-phophate)를 D-리불로스 5-포스페이트 (D-ribulose 5-phosphate)로 전환하는데 관여하는 효소이며, 이에 한정되지 않는다.
상기 글루코오스-6-포스페이트 1-데하이드로게나아제 및 6-포스포글루코네이트 데하이드로게나아제는 미생물의 종 또는 미생물에 따라 활성을 나타내는 단백질의 아미노산 서열에 차이가 존재하는 경우가 있기 때문에, 그 유래나 서열에 한정되지 않는다. 예컨대, 글루코스 6-포스페이트 1-데하이드로게나제를 암호화하는 유전자로는 ZWF (YALI0E22649)가 있으며, 6-포스포글루코네이트 데하이드로게나제를 암호화하는 유전자로는 GND (YALI0B15598p)가 있으나, 이에 한정되지 않는다.
본원에서 용어, "활성의 강화"는 효소 단백질의 활성이 도입되거나, 미생물이 가진 내재적 활성 또는 변형 전 활성에 비하여 활성이 향상된 것을 의미한다. 상기 활성의 "도입"은, 미생물이 본래 가지고 있지 않았던 특정 단백질의 활성이 자연적 혹은 인위적으로 나타나게 되는 것을 의미한다. 예를 들어, 상기 활성 강화는 외래의 글루코오스-6-포스페이트 1-데하이드로게나아제 및/또는 6-포스포글루코네이트 데하이드로게나아제를 도입하여 강화하는 것; 또는 내재적 글루코오스-6-포스페이트 1-데하이드로게나아제 및/또는 6-포스포글루코네이트 데하이드로게나아제의 활성을 강화하는 것을 모두 포함할 수 있다.
구체적으로, 본원에서 활성 강화의 방법으로는, 1) 상기 효소들을 암호화하는 폴리뉴클레오티드의 카피수 증가, 2) 상기 폴리뉴클레오티드의 발현이 증가하도록 발현조절 서열의 변형, 3) 상기 효소들의 활성이 강화되도록 염색체 상의 폴리뉴클레오티드 서열의 변형, 또는 4) 이의 조합에 의해 변형하는 방법 등에 의하여 수행할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
상기 1) 폴리뉴클레오티드의 카피수 증가는, 특별히 이에 제한되지 않으나, 벡터에 작동 가능하게 연결된 형태로 수행되거나, 숙주세포 내의 염색체 내로 삽입됨으로써 수행될 수 있다. 또한 카피수 증가의 한 양태로, 효소의 활성을 나타내는 외래 폴리뉴클레오티드 또는 상기 폴리뉴클레오티드의 코돈 최적화된 변이형 폴리뉴클레오티드를 숙주세포 내로 도입하여 수행될 수 있다. 상기 외래 폴리뉴클레오티드는 상기 효소와 동일/유사한 활성을 나타내는 한 그 유래나 서열에 제한 없이 사용될 수 있다. 상기 도입은 공지된 형질전환 방법을 통상의 기술자가 적절히 선택하여 수행할 수 있으며, 숙주 세포 내에서 상기 도입된 폴리뉴클레오티드가 발현됨으로써 효소가 생성되어 그 활성이 증가될 수 있다.
다음으로, 2) 폴리뉴클레오티드의 발현이 증가하도록 발현조절 서열의 변형은, 특별히 이에 제한되지 않으나, 상기 발현조절 서열의 활성을 더욱 강화하도록 핵산 서열을 결실, 삽입, 비보전적 또는 보전적 치환 또는 이들의 조합으로 서열상의 변이를 유도하여 수행하거나, 더욱 강한 활성을 가지는 핵산 서열로 교체함에 의하여 수행될 수 있다. 상기 발현조절 서열은, 특별히 이에 제한되지 않으나 프로모터, 오퍼레이터 서열, 리보좀 결합 부위를 코딩하는 서열, 전사 및 해독의 종결을 조절하는 서열 등을 포함할 수 있다.
구체적으로, 폴리뉴클레오티드 발현 단위의 상부에는 본래의 프로모터 대신 강력한 이종 프로모터가 연결될 수 있는데, 상기 프로모터와 작동 가능하게 연결되어, 상기 효소를 코딩하는 폴리뉴클레오티드의 발현율을 향상시킬 수 있으나, 이에 한정되지 않는다.
아울러, 3) 염색체 상의 폴리뉴클레오티드 서열의 변형은, 특별히 이에 제한되지 않으나, 상기 폴리뉴클레오티드 서열의 활성을 더욱 강화하도록 핵산 서열을 결실, 삽입, 비보전적 또는 보전적 치환 또는 이들의 조합으로 발현조절 서열상의 변이를 유도하여 수행하거나, 더욱 강한 활성을 갖도록 개량된 폴리뉴클레오티드 서열로 교체함에 의하여 수행할 수 있다.
마지막으로, 4) 상기 1) 내지 3)의 조합에 의해 변형하는 방법은, 상기 효소를 암호화하는 폴리뉴클레오티드의 카피수 증가, 이의 발현이 증가하도록 발현조절 서열의 변형, 염색체 상의 상기 폴리뉴클레오티드 서열의 변형 및 상기 효소의 활성을 나타내는 외래 폴리뉴클레오티드 또는 이의 코돈 최적화된 변이형 폴리뉴클레오티드의 변형 중 1 이상의 방법을 함께 적용하여 수행할 수 있다.
일 구체예에 있어서, 글루코오스-6-포스페이트 1-데하이드로게나아제 및 6-포스포글루코네이트 데하이드로게나아제 유전자로 이루어진 군으로부터 선택된 어느 하나 이상의 유전자는 UAS1B8TEF 프로모터와 작동가능하게 연결된 것일 수 있다.
일 구체예에 있어서, UAS1B8TEF 프로모터는 서열번호 18로 구성된 것일 수 있다.
본 명세서에서 용어 "프로모터"는 전사단위의 발현을 제어하는 핵산 서열을 지칭한다. "프로모터 영역 (promoter region)"은 세포 내에서 RNA 중합효소를 결합시키고 다운스트림 (3'방향) 암호화 부위의 전사를 개시할 수 있는 조절 영역을 의미한다. 프로모터 영역 내에서는 추정 -35번째 구역 및 프리브노 구역 (Pribnow box, -10번째 구역)과 같은 RNA 중합효소의 결합을 담당하는 단백질 결합 영역 (공통서열)이 발견될 것이다. 또한, 프로모터 영역은 전사 개시부위 및 조절 단백질을 위한 결합부위를 포함할 수 있다.
본원에서 "아미노산 서열을 포함하는 단백질"은 "아미노산 서열을 가지는 단백질", 또는 "아미노산 서열로 구성되는 단백질"이라는 표현과 혼용되어 사용될 수 있다.
본 명세서에서 상기 효소들은 각각의 효소와 동일하거나 상응하는 생물학적 활성을 가지는 한, 기재된 서열번호뿐만 아니라, 상기 아미노산 서열과 80% 이상, 구체적으로는 90% 이상, 더욱 구체적으로는 95%이상, 보다 더욱 구체적으로는 99% 이상의 상동성을 나타내는 단백질을 포함할 수 있다.
또한 상기 서열과 상동성을 가지는 서열로서 실질적으로 기재된 서열번호의 효소 단백질과 동일하거나 상응하는 생물학적 활성을 가지는 아미노산 서열이라면, 일부 서열이 결실, 변형, 치환 또는 부가된 아미노산 서열을 가지는 경우도 역시 본 출원의 범주에 포함됨은 자명하다.
본 명세서에서 용어 "상동성"은 주어진 아미노산 서열 또는 뉴클레오티드 서열과 일치하는 정도를 의미하며 백분율로 표시될 수 있다. 본 명세서에서, 주어진 아미노산 서열 또는 뉴클레오티드 서열과 동일하거나 유사한 활성을 가지는 그의 상동성 서열이 "% 상동성"으로 표시된다. 예를 들면, 점수(score), 동일성(identity) 및 유사도(similarity) 등의 매개 변수(parameter)들을 계산하는 표준 소프트웨어, 구체적으로 BLAST 2.0을 이용하거나, 정의된 엄격한 조건(stringent condition)하에서 썼던 혼성화 실험에 의해 서열을 비교함으로써 확인할 수 있으며, 정의되는 적절한 혼성화 조건은 해당 기술 범위 내이고, 통상의 기술자에게 잘 알려진 방법(예컨대, J. Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd Edition, Cold Spring Harbor Laboratory press, Cold Spring Harbor, New York, 1989; F.M. Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., New York)으로 결정될 수 있다. 상기에서 용어 "엄격한 조건"이란 폴리뉴클레오티드 간의 특이적 혼성화를 가능하게 하는 조건을 의미한다. 예를 들어, 이러한 조건은 문헌 (예컨대, J. Sambrook et al., 상동)에 구체적으로 기재되어 있다.
본 명세서에서 용어 "벡터"는 적합한 숙주 내에서 목적 단백질을 발현시킬 수 있도록 적합한 조절 서열에 작동 가능하게 연결된 상기 목적 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드의 염기서열을 함유하는 DNA 제조물을 의미한다. 상기 조절 서열은 전사를 개시할 수 있는 프로모터, 그러한 전사를 조절하기 위한 임의의 오퍼레이터 서열, 적합한 mRNA 리보좀 결합부위를 코딩하는 서열, 및 전사 및 해독의 종결을 조절하는 서열을 포함할 수 있다. 벡터는 적당한 숙주세포 내로 형질전환된 후, 숙주 게놈과 무관하게 복제되거나 기능할 수 있으며, 게놈 그 자체에 통합될 수 있다.
일 구체예에 있어서 사용되는 벡터는 숙주세포 내에서 발현 가능한 것이면 특별히 한정되지 않으며, 당업계에 알려진 임의의 벡터를 이용할 수 있다. 통상 사용되는 벡터의 예로는 천연 상태이거나 재조합된 상태의 플라스미드, 코 스미드, 바이러스 및 박테리오파지를 들 수 있다. 예를 들어, 파지 벡터 또는 코스미드 벡터로서 pWE15, M13, MBL3, MBL4, IXII, ASHII, APII, t10, t11, Charon4A, 및 Charon21A 등을 사용할 수 있으며, 플라스미드 벡터로서 pBR계, pUC계, pBluescriptII계, pGEM계, pTZ계, pCL계, pCRE계, pYL계 및 pET계 등을 사용할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 명세서에서 용어 "재조합 벡터"는 통상 이종의 DNA의 단편이 삽입된 재조합 캐리어(recombinant carrier)로서 일반적으로 이중 가닥의 DNA의 단편을 의미한다. 여기서, 이종 DNA는 숙주 세포에서 천연적으로 발견되지 않는 DNA인 이형 DNA를 의미한다. 재조합 벡터는 일단 숙주 세포 내에 있으면 숙주 염색체 DNA와 무관하게 복제할 수 있으며 벡터의 수 개의 카피 및 그의 삽입된 (이종) DNA가 생성될 수 있다.
라이게이션 후에, 상기 유전자 또는 상기 재조합 벡터는 숙주세포에 형질전환 또는 트랜스펙션(transfection)된다. "형질전환" 또는 "트랜스펙션"시키기 위해 원핵 또는 진핵 숙주세포 내로 외인성 핵산(DNA 또는 RNA)을 도입하는 데에 통상 사용되는 여러 종류의 다양한 기술, 예를 들어 전기 영동법, 인산칼슘 침전법, DEAE-덱스트란 트랜스펙션 또는 리포펙션(lipofection) 등을 사용할 수 있다.
당업계에 주지된 바와 같이, 숙주세포에서 형질전환 유전자의 발현 수준을 높이기 위해서는, 해당 유전자가 선택된 발현 숙주 내에서 기능을 발휘하는 전사 및 해독 발현 조절 서열에 작동가능하도록 연결되어야 한다. 구체적으로, 발현 조절서열 및 해당 유전자는 세균 선택 마커 및 복제 개시점(replication origin)을 같이 포함하고 있는 하나의 재조합 벡터 내에 포함되게 된다. 숙주세포가 진핵세포인 경우에는, 재조합 벡터는 진핵 발현 숙주 내에서 유용한 발현 마커를 더 포함하여야 한다.
상술한 재조합 벡터에 의해 형질전환된 숙주 세포는 본 발명의 또 다른 측면을 구성한다. 본 명세서에서 사용된 용어 "형질전환"은 DNA를 숙주로 도입하여 DNA가 염색체 외 인자로서 또는 염색체 통합완성에 의해 복제 가능하게 되는 것을 의미한다. 물론 모든 벡터가 본 발명의 DNA 서열을 발현하는데 모두 동등하게 기능을 발휘하지는 않는다는 것을 이해하여야 한다. 마찬가지로 모든 숙주가 동일한 발현 시스템에 대해 동일하게 기능을 발휘하지는 않는다. 그러나, 통상의 기술자라면 과도한 실험적인 부담 없이 본 발명의 범위를 벗어나지 않는 채로 여러 벡터, 발현 조절 서열 및 숙주 중에서 적절한 선택을 할 수 있다. 예를 들어, 벡터를 선택함에 있어서는 숙주를 고려하여야 하는데, 이는 벡터가 그 안에서 복제되어야 하기 때문이다. 벡터의 복제 수, 복제 수를 조절할 수 있는 능력 및 당해 벡터에 의해 코딩되는 다른 단백질, 예를 들어 항생제 마커의 발현도 또한 고려되어야 한다.
본 명세서에서 용어 "작동 가능하게 연결"된 것이란 본 출원의 목적 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드의 전사를 개시 및 매개하도록 하는 프로모터 서열과 상기 폴리뉴클레오티드 서열이 기능적으로 연결되어 있는 것을 의미한다. 작동 가능한 연결은 당업계의 공지된 유전자 재조합 기술을 이용하여 제조할 수 있으며, 부위-특이적 DNA 절단 및 연결은 당업계의 절단 및 연결 효소 등을 사용하여 제작할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 다른 양상은 상기 미생물을 배양하는 단계; 및 상기 배양된 미생물 또는 배지로부터 마이코스포린 유사 아미노산을 회수하는 단계를 포함하는, 마이코스포린 유사 아미노산의 생산방법을 제공한다.
이때, 미생물 및 마이코스포린 유사 아미노산은 전술한 바와 같다.
본 명세서에서 용어 "배양"은 상기 미생물을 적당히 조절된 환경 조건에서 생육시키는 것을 의미한다. 배양과정은 당업계에 알려진 적당한 배지와 배양조건에 따라 이루어질 수 있다. 이러한 배양 과정은 선택되는 미생물에 따라 통상의 기술자가 용이하게 조정하여 사용할 수 있다. 구체적으로 상기 배양은 회분식, 연속식 및/또는 유가식일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 명세서에서 용어 "배지"는 상기 미생물을 배양하기 위해 필요로 하는 영양물질을 주성분으로 혼합한 물질을 의미하며, 생존 및 발육에 불가결한 물을 비롯하여 영양물질 및 발육인자 등을 공급한다. 구체적으로, 상기 미생물의 배양에 사용되는 배지 및 기타 배양 조건은 통상의 미생물의 배양에 사용되는 배지라면 특별한 제한 없이 어느 것이나 사용할 수 있으나, 상기 미생물을 적당한 탄소원, 질소원, 인원, 무기화합물, 아미노산 및/또는 비타민 등을 함유한 통상의 배지 내에서 호기성 조건 하에서 온도, pH 등을 조절하면서 배양할 수 있다.
상기 탄소원으로는 글루코오스, 사카로오스, 락토오스, 프룩토오스, 수크로오스, 말토오스 등과 같은 탄수화물; 만니톨, 소르비톨 등과 같은 당 알코올, 피루브산, 락트산, 시트르산 등과 같은 유기산; 글루탐산, 메티오닌, 리신 등과 같은 아미노산 등이 포함될 수 있다. 또한, 전분 가수분해물, 당밀, 블랙스트랩 당밀, 쌀겨울, 카사버, 사탕수수 찌꺼기 및 옥수수 침지액 같은 천연의 유기 영양원을 사용할 수 있으며, 구체적으로는 글루코오스 및 살균된 전처리 당밀(즉, 환원당으로 전환된 당밀) 등과 같은 탄수화물이 사용될 수 있으며, 그 외의 적정량의 탄소원을 제한없이 다양하게 이용할 수 있다. 이들 탄소원은 단독으로 사용되거나 2 종 이상이 조합되어 사용될 수 있으며, 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 질소원으로는 암모니아, 황산암모늄, 염화암모늄, 초산암모늄, 인산암모늄, 탄산안모늄, 질산암모늄 등과 같은 무기질소원; 글루탐산, 메티오닌, 글루타민 등과 같은 아미노산, 펩톤, NZ-아민, 육류 추출물, 효모 추출물, 맥아 추출물, 옥수수 침지액, 카세인 가수분해물, 어류 또는 그의 분해생성물, 탈지 대두 케이크 또는 그의 분해 생성물 등과 같은 유기 질소원이 사용될 수 있다. 이들 질소원은 단독으로 사용되거나 2 종 이상이 조합되어 사용될 수 있으며, 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 인원으로는 인산 제1칼륨, 인산 제2칼륨, 또는 이에 대응되는 소디움-함유 염 등이 포함될 수 있다. 무기 화합물로는 염화나트륨, 염화칼슘, 염화철, 황산마그네슘, 황산철, 황산망간, 탄산칼슘 등이 사용될 수 있으며, 그 외에 아미노산, 비타민 및/또는 적절한 전구체 등이 포함될 수 있다. 이들 구성성분 또는 전구체는 배지에 회분식 또는 연속식으로 첨가될 수 있다. 그러나, 이에 한정되는 것은 아니다.
또한, 상기 배양 중에 수산화암모늄, 수산화칼륨, 암모니아, 인산, 황산 등과 같은 화합물을 배지에 적절한 방식으로 첨가하여, 배지의 pH를 조정할 수 있다. 또한, 배양 중에는 지방산 폴리글리콜 에스테르와 같은 소포제를 사용하여 기포 생성을 억제할 수 있다. 또한, 배지의 호기 상태를 유지하기 위하여, 배지 내로 산소 또는 산소 함유 기체를 주입하거나 혐기 및 미호기 상태를 유지하기 위해 기체의 주입 없이 혹은 질소, 수소 또는 이산화탄소 가스를 주입할 수 있으며, 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 배양에서 배양온도는 20 내지 45℃, 구체적으로는 25 내지 40℃를 유지할 수 있고, 약 10 내지 160 시간 동안 배양할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 배양에 의하여 생산된 마이코스포린 유사 아미노산은 배지 중으로 분비되거나 세포 내에 잔류할 수 있다.
상기 배양에 따른 배지(배양이 수행된 배지) 또는 상기 미생물로부터 마이코스포린 유사 아미노산을 회수하는 단계에서, 상기 회수는 상기 미생물의 배양 방법, 예를 들어 회분식, 연속식 또는 유가식 배양 방법 등에 따라 당해 기술 분야에 공지된 적합한 방법을 이용하여 목적하는 마이코스포린 유사 아미노산을 수집(collect)하는 것일 수 있다. 예를 들어, 원심 분리, 여과, 결정화 단백질 침전제에 의한 처리(염석법), 추출, 초음파 파쇄, 한외여과, 투석법, 분자체 크로마토그래피(겔여과), 흡착크로마토그래피, 이온교환 크로마토그래피, 친화도 크로마토그래피 등의 각종 크로마토그래피, HPLC 또는 이들의 방법을 조합하여 사용될 수 있으며, 당해 분야에 공지된 적합한 방법을 이용하여 배지 또는 미생물로부터 목적하는 마이코스포린 유사 아미노산을 회수할 수 있다.
또한, 상기 생산방법은 추가적으로 정제 단계를 포함할 수 있다. 상기 정제는 당해 기술분야에 공지된 적합한 방법을 이용하여 수행할 수 있다. 일 예에서, 상기 생산방법이 회수 단계와 정제 단계를 모두 포함하는 경우, 상기 회수 단계와 정제 단계는 순서에 상관없이 연속적 또는 비연속적으로 수행되거나, 동시에 또는 하나의 단계로 통합되어 수행될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 또 다른 양상은 상기 미생물을 포함하는, 마이코스포린 유사 아미노산 생산용 조성물을 제공한다.
이때, 미생물 및 마이코스포린 유사 아미노산은 전술한 바와 같다.
상기 조성물은 (i) 2-디메틸 4-데옥시가두솔 합성 효소, O-메틸 전이 효소, ATP-grasp 라이게이즈 및 D-알라닌 D-알라닌 라이게이즈, 이를 암호화하는 유전자 또는 이를 포함하는 재조합 벡터; (ii) 3-데옥시-7-포스포헵툴로네이트 합성 효소 유전자를 결실시키거나 상기 유전자의 발현을 억제 또는 감소시키도록 조작된 재조합 벡터; (iii) 글루코오스-6-포스페이트 1-데하이드로게나아제 및 6-포스포글루코네이트 데하이드로게나아제, 이를 암호화하는 유전자 또는 이를 포함하는 재조합 벡터; 및/또는 (iv) 상기 (i), (ii), (iii) 또는 이들의 조합을 포함하는 변이 미생물을 포함하는 마이코스포린 유사 아미노산 생산용 조성물을 제공한다. 상기 조성물 또는 상기 조성물에 포함된 변이 미생물은 오탄당 인산경로(pentose phosphate pathway) 강화를 위한 성분을 추가로 포함할 수 있다.
본 발명의 일 양상에 따라 시키메이트 경로에 관여하는 3-데옥시-7-포스포헵툴로네이트 합성 효소 (DAHPS)를 불활성화시키는 경우 마이코스포린 유사 아미노산의 생산능이 향상되므로, 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는데 유용하게 사용될 수 있다.
도 1은 마이코스포린 유사 아미노산 생산 경로 및 경쟁경로를 도식화한 것이다. 여기서 ZWF 및 GND (초록색)은 과발현 타겟이며 ARO3 및 ARO4 (빨간색)는 불활성화 타겟이다.
도 2는 마이코스포린 유사 아미노산 생합성 경로 구축을 위한 유전자 삽입용 플라스미드의 제작 방법을 도식화한 것이다.
도 3은 CBEYL002, CBEYL002aro3△, CBEYL002aro4△, CBEYL002aro3△aro4△ 균주의 성장과 마이코스포린 유사 아미노산 생산량을 나타낸 그래프이다. 여기서 PO는 포피라-334를 지칭하고, SH는 시노린을 지칭한다.
도 4는 CBEYL002aro3△aro4△ [EV], CBEYL002aro3△aro4△ [PEXP-ZWF], CBEYL002aro3△aro4△ [PUAS1B8TEF(136)-ZWF], CBEYL002aro3△aro4△ [PUAS1B8TEF(136)-GND] 균주의 마이코스포린 유사 아미노산 생산량을 나타낸 그래프이다. 여기서 PO는 포피라-334를 지칭하고, SH는 시노린을 지칭한다.
도 2는 마이코스포린 유사 아미노산 생합성 경로 구축을 위한 유전자 삽입용 플라스미드의 제작 방법을 도식화한 것이다.
도 3은 CBEYL002, CBEYL002aro3△, CBEYL002aro4△, CBEYL002aro3△aro4△ 균주의 성장과 마이코스포린 유사 아미노산 생산량을 나타낸 그래프이다. 여기서 PO는 포피라-334를 지칭하고, SH는 시노린을 지칭한다.
도 4는 CBEYL002aro3△aro4△ [EV], CBEYL002aro3△aro4△ [PEXP-ZWF], CBEYL002aro3△aro4△ [PUAS1B8TEF(136)-ZWF], CBEYL002aro3△aro4△ [PUAS1B8TEF(136)-GND] 균주의 마이코스포린 유사 아미노산 생산량을 나타낸 그래프이다. 여기서 PO는 포피라-334를 지칭하고, SH는 시노린을 지칭한다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 보다 상세히 설명하고자 한다. 그러나, 이들 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것으로서, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 한정되는 것은 아니다.
실시예 1: 미세조류 유래 마이코스포린 유사 아미노산 생합성 유전자의 유전체 삽입용 벡터 제작
효모 Yarrowia lipolytica는 마이코스포린 유사 아미노산 생합성 경로가 존재하지 않아 외래의 유전자를 도입하여 마이코스포린 유사 아미노산 생합성 경로를 구축해야 한다 (도 1 참조). 마이코스포린 유사 아미노산인 시노린 및 포피라-334은 오탄당 인산경로의 중간체인 세도헵툴로스 7-인산 (sedoheptulose 7-phosphate: S7P)으로부터 4단계의 효소 전환 반응을 통해 합성된다. 2-디메틸 4-데옥시가두솔 합성 효소 (2-demethyl 4-deoxygadusol synthase: DDGS)에 의하여 세도헵툴로스 7-인산이 2-디메틸-4-데옥시가두솔 (2-demethyl 4-deoxygadusol: DDG)로 전환되며 이후 O-메틸 전이 효소 (O-methyltransferase: O-MT)에 의하여 4-데옥시가두솔 (4-deoxygadusol: 4-DG)로 전환된다. 이후 효소 ATP-grasp 라이게이즈 (ATP-grasp ligase)가 글리신 결합 (glycylation)을 촉매하여 4-DG를 마이코스포린-글리신 (mycosporine-glycine: MG)으로 전환시킨다. 마지막으로 효소 D-알라닌 D-알라닌 라이게이즈 (D-Ala D-Ala ligase)에 의하여 마이코스포린-글리신 (MG)에 L-세린 (L-serine) 또는 L-트레오닌 (L-threonine)이 부착되어 시노린 (shinorine) 또는 포피라-334 (porphyra-334)가 형성된다 (도 1 참조).
DDGS (Ava3858), O-MT (Ava3857), 그리고 ATP-grasp ligase (Ava3856)를 암호화하는 유전자는 아나베나 바리아빌리스 (Anabaena variabilis, ATCC 29413) 유래의 것을 코돈 최적화하여 사용하였으며 D-Ala D-Ala ligase (NpF5597)를 암호화하는 유전자는 노스탁 펑크티포르메 (Nostoc punctiforme, ATCC29133) 유래의 것을 코돈 최적화하여 사용하였다. 각 유전자는 UAS1B8TEF(136) 프로모터로 발현하고자 UAS1B8TEF(136) 프로모터 - 유전자 - CYC1 터미네이터 카세트를 제작하였다.
이들 4종의 유전자 카세트는 Cre-LoxP 시스템을 활용하여 유전체에 삽입하였다. 유전체 삽입 위치는 문헌 (Holkenbrink et al, Biotechnol. J. 2018, 13, 1700543)을 참고하여 유전자 발현이 잘 되는 곳으로 선정하였다. 먼저 선별 마커 (LoxP-URA3-LoxP) 양 말단에 유전체 삽입 위치의 서열 (0.9~1.0 kb)이 포함되도록 플라스미드를 제작하였다. 유전체 삽입 위치는 IntC3, IntD1, IntE3로 명명하며 이에 해당하는 서열은 서열 목록에서 확인할 수 있다. 4종의 유전자 카세트는 NPF5597, Ava3856, Ava3857, 그리고 Ava3858 순으로 클로닝 하였으며 최종적으로 유전자 삽입용 플라스미드 'IntC3-NAAA', 'IntD1-NAAA', 그리고 'IntE3-NAAA'로 명명하였다 (도 2 및 표 1 참조).
Plasmid | Description |
*유전자 삽입용 | |
IntC3-NAAA | IntC3:: PUAS1B8- TEF (136)-NpF5597-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3856-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3857-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3858-T CYC1 , loxP-URA3-loxP, Amp R , ColE1 |
IntD1-NAAA | IntD1:: PUAS1B8- TEF (136)-NpF5597-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3856-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3857-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3858-T CYC1 , loxP-URA3-loxP, Amp R , ColE1 |
IntE3-NAAA | IntE3:: PUAS1B8- TEF (136)-NpF5597-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3856-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3857-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3858-T CYC1 , loxP-URA3-loxP, Amp R , ColE1 |
pCRE | P EXP1 -Cre-T CYC1 , LEU, ARS18, Amp R , ColE1 |
실시예 2: 마이코스포린 유사 아미노산 생합성 유전자가 삽입된 균주 제작
실시예 1에서 제작된 IntD1-NAAA 플라스미드를 NdeI 제한효소로 처리하여 마이코스포린 유사 아미노산 생합성 유전자 삽입용 카세트를 제작하였다. 해당 카세트를 Polgku70△ura3△ 균주 (Beag et al., Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica for the production of carotenoids, ß-carotene, and crocetin 참조)에 LiAc/SS carrier DNA/PEG 방법을 사용하여 형질 전환시킨 후 SC-Ura 플레이트에서 선별하였다. URA3 선별마커는 Cre 재조합효소를 발현시키는 pCRE를 이용하여 제거하였다. 동일한 방법을 이용하여 상기 실시예 1에서 제작된 IntC3-NAAA와 IntE3-NAAA도 순차적으로 삽입하였고 이를 'CBEYL002' 균주로 명명하였다.
실시예 3: 3-데옥시-7-포스포헵툴로네이트 합성 효소 (DAHP synthase)를 불활성화 시킬 수 있는 벡터 제작
마이코스포린 유사 아미노산은 오탄당 인산경로의 중간물인 S7P로부터 생산 (도 1 참조)되므로 오탄당 인산경로의 하위 경로인 시키메이트 경로 (shikimate pathway)를 약화시켜 중간물인 S7P이 축적될 수 있도록 하였다. 따라서 시키메이트 경로의 첫번째 단계인 포스포에놀피루브산 (phosphoenolpyruvate: PEP)와 D-에리트로스 4-포스페이트 (D-erythrose 4-phosphate: E4P)를 3-데옥시-D-아라비노-헵툴로소네이트 7-포스페이트 (3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate: DAHP)로 전환하는데 관여하는 효소인 3-데옥시-7-포스포헵툴로네이트 합성 효소 (3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase: DAHPS)를 불활성화 시키고자 하였다.
효모 Yarrowia lipolytica 내에는 2가지 이상의 DAHPS isoform이 존재한다. 이에 3-데옥시-7-포스포헵툴로네이트 합성 효소 (DAHPS)를 암호화하는 유전자 ARO3 (YALI0B20020) 또는 ARO4 (YALI0C06952)를 불활성화시켜 마이코스포린 유사 아미노산 생산 증가 효과가 있는지 확인하고자 하였다.
ARO3 또는 ARO4를 불활성화시키기 위하여 CRISPR 시스템 기반의 염기 편집(base editing) 기술 (Bae et al., Biotechnol. J. 2020, 15, 1900238)을 사용하여 타겟 유전자에 종결 코돈을 삽입하고자 하였다. 해당 유전자에 종결 코돈이 삽입될 수 있도록 표 2와 같이 gRNA 서열을 디자인하였으며 해당 서열이 삽입되어 있는 플라스미드는 pCRISPRyl-P TEFin -nCas9-pmCDA1-UGI[W] 플라스미드를 주형으로 inverse PCR을 수행하여 pCRISPRyl-P TEFin -nCas9-pmCDA1-UGI[ARO3], pCRISPRyl-P TEFin -nCas9-pmCDA1-UGI[ARO4] 플라스미드를 제작하였다. 제작된 플라스미드는 표 3과 같다.
타겟 유전자 | gRNA | 서열번호 |
ARO3 | ACCGAAACCGGACCGAGGAC | 26 |
ARO4 | GCTGCGATCCAAGTCCAAGG | 27 |
Plasmid | Description |
* 유전자 불활성화용 | |
pCRISPRyl-P TEFin -nCas9-pmCDA1-UGI[W] | P TEFin -nCAS9-T CYC1 , P SCR1 Gly -TRP1 gRNA, LEU, CEN, Ori1001, Amp R , ColE1 |
pCRISPRyl-P TEFin -nCas9-pmCDA1-UGI[ARO3] | pCRISPRyl-P TEFin -nCas9-pmCDA1-UGI[W] replacing TRP1 gRNA with ARO3 gRNA |
pCRISPRyl-P TEFin -nCas9-pmCDA1-UGI[ARO4] | pCRISPRyl-P TEFin -nCas9-pmCDA1-UGI[W] replacing TRP1 gRNA with ARO3 gRNA |
실시예 4:
ARO3
와
ARO4
가 불활성된 균주 제작
CBEYL002 균주에 실시예 3에서 제작된 pCRISPRyl-P TEFin -nCas9-pmCDA1-UGI[ARO3], 또는 pCRISPRyl-P TEFin -nCas9-pmCDA1-UGI[ARO4] 플라스미드를 LiAc/SS carrier DNA/PEG 방법을 사용하여 형질 전환시켰다. 상기 얻어진 형질전환 효모 균주를 SC-Leu 배지에 접종하여 약 16~18시간 배양한 후 적절히 희석하여 YPD (yeast extract-peptone-dextrose) 플레이트에 배양하였다. 단일 콜로니를 선별하여 ARO3 또는 ARO4 유전자를 PCR 한 후 시퀀싱하여 넌센스 돌연변이가 삽입되었는지 확인하였다 (표 4). 동일한 방법을 사용하여 CBEYL002aro4△ 균주에 pCRISPRyl-P TEFin -nCas9-pmCDA1-UGI[ARO3]를 형질전환하여 CBEYL002aro3△aro4△를 제작하였다. 제작된 균주는 표 4에 나타내었다.
Strain | Description |
CBEYL002 | Polgku70△ura3△ IntC3:: PUAS1B8- TEF (136)-NpF5597-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3856-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3857-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3858-T CYC1 -loxP, IntD1:: PUAS1B8- TEF (136)-NpF5597-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3856-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3857-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3858-T CYC1 -loxP, IntE3:: PUAS1B8- TEF (136)-NpF5597-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3856-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3857-T CYC1 , PUAS1B8- TEF (136)-Ava3858-T CYC1 -loxP |
CBEYL002aro3△ | CBEYL001, Aro3 14R->stop |
CBEYL002aro4△ | CBEYL001, Aro4 40R->stop |
CBEYL002aro3△aro4△ | CBEYL001, Aro3 14R->stop, Aro4 40R->stop |
CBEYL002aro3△aro4△ [EV] | CBEYL002aro3△aro4△ harboring pYL-LEU |
CBEYL002aro3△aro4△ [PEXP-ZWF] | CBEYL002aro3△aro4△ harboring pYL-PEXP-ZWF-LEU |
CBEYL002aro3△aro4△ [PEXP-GND] | CBEYL002aro3△aro4△ harboring pYL-PEXP-GND-LEU |
CBEYL002aro3△aro4△ [PUAS1B8TEF(136)-ZWF] | CBEYL002aro3△aro4△ harboring pYL-PUAS1B8TEF(136)-ZWF-LEU |
CBEYL002aro3△aro4△ [PUAS1B8TEF(136)-GND] | CBEYL002aro3△aro4△ harboring pYL-PUAS1B8TEF(136)-GND-LEU |
실시예 5:
ARO3
와
ARO4
가 불활성화된 균주의 마이코스포린 유사 아미노산 생산능 평가
실시예 2 및 4에서 제작된 균주 CBEYL002, CBEYL002aro3△, CBEYL002aro4△, CBEYL002aro3△aro4△ 균주의 마이코스포린 유사 아미노산의 생산 효과를 확인하기 위해 다음과 같이 실험을 수행하였다.
구체적으로 먼저, YPD 배지 (20 g/L 포도당, 10 g/L yeast extract, 20 /L bacto-peptone)에 O.D600=0.2로 접종하여 30 ℃ 및 220 rpm 조건하에서 148시간 동안 배양하였다. 배지 내 마이코스포린 유사 아미노산 (MAA)을 정량하기 위하여 배양액 1 mL을 원심분리 한 후 상등액을 얻고, 이를 0.22 ㎛ 필터로 여과하여 HPLC 분석을 수행하였다. Agilent Eclipse XDB-C18 컬럼 (5 μm, 4.6 Х 250 mm)을 갖춘 1260 infinity HPLC 시스템 (Agilent)를 이용하였고, 컬럼 온도는 40 ℃로 유지하며 0.5 mL/분의 유속으로 용매 (0.25% Trifluoroacetic acid가 포함된 물 : 0.25% Trifluoroacetic acid가 포함된 아세토니트릴 = 97.5 : 2.5)를 흘려주었다. 파장 334 nm에서 UV-vis 검출기로 시노린 및 포피라-334를 검출하였다. 상기와 같이 HPLC를 이용하여 마이코스포린 유사 아미노산 (시노린 및 포피라-334)을 정량한 결과를 도 3 및 표 5 에 나타내었다.
도 3 및 표 5에 나타낸 바와 같이, CBEYL002 균주와 비교하여 ARO3 유전자가 불활성화된 CBEYL002aro3△ 균주는 마이코스포린 유사 아미노산 생산량이 약 38% 증가하였고 ARO4 유전자가 불활성화된 CBEYL002aro4△ 균주는 마이코스포린 유사 아미노산 생산량이 약 88% 증가하였다. 또한, ARO3 및 ARO4 유전자가 모두 불활성화된 CBEYL002aro3△aro4△ 균주는 마이코스포린 유사 아미노산 생산량이 약 74% 증가하였다.
148 h | O.D 600 | 마이코스포린 유사 아미노산 (mg/L) | ||
시노린 | 포피라-334 | 합계 | ||
CBEYL002 | 27.36±1.48 | 10.20 | 5.96 | 16.16 |
CBEYL002aro3△ | 25.77±1.28 | 16.23 | 6.08 | 22.31 |
CBEYL002aro4△ | 30.05±2.50 | 20.01 | 10.41 | 30.42 |
CBEYL002aro3△aro4△ | 25.40±0.28 | 18.34 | 9.90 | 28.24 |
상기와 같은 실험결과로부터 본 발명의 일 구체예에 따라 시키메이트 경로에 관여하는 3-데옥시-7-포스포헵툴로네이트 합성 효소 (DAHPS)를 암호화하는 유전자 ARO3 (YALI0B20020) 및/또는 ARO4 (YALI0C06952)를 불활성화시키는 경우 마이코스포린 유사 아미노산의 생산이 증가함을 알 수 있다.
실시예 6: 오탄당 인산경로의 강화를 위한
GND
및
ZWF
의 과발현용 벡터 제작
마이코스포린 유사 아미노산은 오탄당 인산경로의 중간물인 S7P로부터 생산되므로(도 1 참조) 해당경로를 강화하여 마이코스포린 유사 아미노산의 생산량을 증대시키고자 하였다. 이에 오탄당 인산경로의 첫번째 단계인 글루코스 6-포스페이트 (glucose 6-phosphate: G6P)를 6-포스포-D-글루코노-1,5-락톤 (6-phospho-D-glucono-1,5-lactone)으로 전환하는데 관여하는 효소 글루코스 6-포스페이트 1-데하이드로게나제 (glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase)를 암호화하는 유전자 ZWF (YALI0E22649)를 강화하고자 하였다. 또한 D-글루코네이트 6-포스페이트 (D-gluconate 6-phophate)를 D-리불로스 5-포스페이트 (D-ribulose 5-phosphate)로 전환하는데 관여하는 효소 6-포스포글루코네이트 데하이드로게나제 (6-phosphogluconate dehydrogenase)를 암호화하는 유전자 GND (YALI0B15598p)를 강화하고자 하였다.
GND 및 ZWF의 과발현 효과를 확인하기 위해, 이들 유전자를 개별적으로 발현하는 플라스미드를 제작하였다. 각각 유전자의 단편은 CBEYL002의 genomic DNA로부터 PCR을 통해 확보하였고 각 유전자는 EXP 프로모터 또는 UAS1B8TEF(136) 프로모터의 조절하에 발현하였다. 프로모터-유전자-터미네이터 (PEX20) 카세트를 pYL-LEU 플라스미드에 삽입하여 pYL-LEU, pYL-P EXP -ZWF-LEU, pYL-P EXP -GND-LEU, pYL-P UAS1B8TEF(136) -ZWF-LEU, 또는 pYL-P UAS1B8TEF(136) -GND-LEU 플라스미드를 제작하였다. 제작된 플라스미드는 표 6에 나타내었다.
Plasmid | Description |
*유전자 발현용 | |
pYL-LEU | LEU, CEN, Ori1001, Amp R , ColE1 |
pYL-PEXP-ZWF-LEU | P EXP -ZWF-T PEX20 , LEU, CEN, Ori1001, Amp R , ColE1 |
pYL-PEXP-GND-LEU | P EXP -GND-T PEX20 , LEU, CEN, Ori1001, Amp R , ColE1 |
pYL-PUAS1B8TEF(136)-ZWF-LEU | P UAS1B8TEF(136) -ZWF-T PEX20 , LEU, CEN, Ori1001, Amp R , ColE1 |
pYL-PUAS1B8TEF(136)-GND-LEU | P UAS1B8TEF(136) -GND-T PEX20 , LEU, CEN, Ori1001, Amp R , ColE1 |
실시예 7:
GND
및
ZWF
의 과발현을 통한 마이코스포린 유사 아미노산 생산능 평가
GND 또는 ZWF를 과발현 시켰을 때 마이코스포린 유사 아미노산의 생산량이 증가하는지 다음과 같이 확인하였다.
구체적으로, CBEYL002aro3△aro4△ 균주에 실시예 6에서 제작된 pYL-LEU, pYL-P EXP -ZWF-LEU, pYL-P EXP -GND-LEU, pYL-P UAS1B8TEF(136) -ZWF-LEU, 또는 pYL-P UAS1B8TEF(136) -GND-LEU 플라스미드를 LiAc/SS carrier DNA/PEG 방법을 사용하여 형질 전환시켰다. 형질전환 효모 균주는 표 4에 나타내었다. 상기 얻어진 형질전환 효모 균주를 SC-Leu 배지 (20 g/L 포도당, 6.7 g/L YNB without amino acid, 류신을 제외한 아미노산 첨가물)에 O.D600=0.2로 접종하여 30 ℃ 및 220 rpm 조건하에서 148시간 동안 배양하였다. 실시예 5에 명시한 방법과 같이 마이코스포린 유사 아미노산의 농도를 측정하여 도 4 및 표 7에 나타내었다.
도 4 및 표 7에 나타난 바와 같이, 두 유전자를 EXP 프로모터 조절하에 발현한 경우 효과가 없었지만 UAS1B8TEF(136) 프로모터 조절하에 발현한 경우 마이코스포린 유사 아미노산 생산량이 크게 증가하였다. 또한, 공벡터를 보유하는 CBEYL002aro3△aro4△ [EV] 균주와 비교하여 CBEYL002aro3△aro4△ [P UAS1B8TEF(136) -ZWF] 균주와 CBEYL002aro3△aro4△ [P UAS1B8TEF(136) -GND] 균주의 마이코스포린 유사 아미노산 생산량은 각각 2.4배, 2.7배 증가하였다.
120 h | 마이코스포린 유사 아미노산 (mg/L) | ||
시노린 | 포피라-334 | 합계 | |
CBEYL002aro3△aro4△ [EV] | 11.93±0.77 | 12.35±1.73 | 24.28±1.76 |
CBEYL002aro3△aro4△ [PEXP-ZWF] | 13.31±2.82 | 16.22±4.02 | 29.54±4.84 |
CBEYL002aro3△aro4△ [PEXP-GND] | 9.58±1.70 | 10.19±1.94 | 19.77±2.57 |
CBEYL002aro3△aro4△ [PUAS1B8TEF(136)-ZWF] | 24.30±0.67 | 26.90±1.91 | 57.25±1.82 |
CBEYL002aro3△aro4△ [PUAS1B8TEF(136)-GND] | 32.94±2.70 | 38.13±3.01 | 65.02±4.04 |
상기와 같은 실험결과로부터 본 발명의 일 구체예에 따라 본 발명에 따라 시키메이트 경로에 관여하는 3-데옥시-7-포스포헵툴로네이트 합성 효소 (DAHPS)를 암호화하는 유전자가 불활성화된 균주에 UAS1B8TEF(136) 프로모터 조절하에 GND 또는 ZWF를 과발현시킨 경우 마이코스포린 유사 아미노산의 생산이 현저히 증가함을 알 수 있다. 이는 본 발명의 일 구체예에 따른 미생물이 마이코스포린 유사 아미노산 생산에 유용하게 사용될 수 있음을 시사한다.
Claims (8)
- 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물로서 3-데옥시-7-포스포헵툴로네이트 합성 효소 (3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase)의 활성이 내재적 활성에 비해 불활성화된, 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 미생물이 2-디메틸 4-데옥시가두솔 합성 효소 (2-demethyl 4-deoxygadusol synthase), O-메틸 전이 효소 (O-methyltransferase), ATP-grasp 라이게이즈 (ATP-grasp ligase), 및 D-알라닌 D-알라닌 라이게이즈 (D-Ala D-Ala ligase)로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 단백질을 암호화하는 유전자를 포함하는, 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 글루코오스-6-포스페이트 1-데하이드로게나아제 (glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase) 및 6-포스포글루코네이트 데하이드로게나아제 (6-phosphogluconate dehydrogenase)로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 단백질 활성이 내재적 활성에 비해 강화된, 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물.
- 청구항 3에 있어서, 글루코오스-6-포스페이트 1-데하이드로게나아제 및 6-포스포글루코네이트 데하이드로게나아제로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 단백질을 암호화하는 유전자는 UAS1B8TEF 프로모터와 작동가능하게 연결된, 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 미생물은 효모인 것인, 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 마이코스포린 유사 아미노산은 마이코스포린-2-글라이신 (mycosporine-2-glycine), 팰라이티놀 (palythinol), 팰라이텐산 (palythenic acid), 데옥시가두솔 (deoxygadusol), 마이코스포린-메틸아민-트레오닌 (mycosporine-methylamine-threonine), 마이코스포린-글라이신-발린 (mycosporine-glycine-valine), 팰라이틴 (palythine), 아스테리나-330 (asterina-330), 시노린 (shinorine), 포피라-334 (porphyra-334), 유하로테스-362 (euhalothece-362), 마이코스포린-글라이신 (mycosporine-glycine), 마이코스포린-오르니틴 (mycosporine-ornithine), 마이코스포린-라이신 (mycosporine-lysine), 마이코스포린-글루탐산-글라이신 (mycosporine-glutamic acid-glycine), 마이코스포린-메틸아민-세린 (mycosporine-methylamine-serine), 마이코스포린-타우린 (mycosporine-taurine), 팰라이텐 (palythene), 팰라이텐-세린 (palythine-serine), 팰라이텐-세린-설페이트 (palythine-serine-sulfate), 팰라이티놀(palythinol), 및 우수지렌 (usujirene)으로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상인, 재조합 미생물.
- 청구항 1의 미생물을 배양하는 단계; 및
상기 배양된 미생물 또는 배지로부터 마이코스포린 유사 아미노산을 회수하는 단계를 포함하는, 마이코스포린 유사 아미노산의 생산방법. - 청구항 1의 미생물을 포함하는, 마이코스포린 유사 아미노산 생산용 조성물.
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020220123621A KR102548752B1 (ko) | 2022-09-28 | 2022-09-28 | 마이코스포린 유사 아미노산 생산능을 갖는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산의 생산 방법 |
PCT/KR2022/014844 WO2024071491A1 (ko) | 2022-09-28 | 2022-09-30 | 마이코스포린 유사 아미노산 생산능을 갖는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산의 생산 방법 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020220123621A KR102548752B1 (ko) | 2022-09-28 | 2022-09-28 | 마이코스포린 유사 아미노산 생산능을 갖는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산의 생산 방법 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR102548752B1 true KR102548752B1 (ko) | 2023-07-03 |
Family
ID=87157757
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020220123621A KR102548752B1 (ko) | 2022-09-28 | 2022-09-28 | 마이코스포린 유사 아미노산 생산능을 갖는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산의 생산 방법 |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
KR (1) | KR102548752B1 (ko) |
WO (1) | WO2024071491A1 (ko) |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20170002587A (ko) * | 2014-05-13 | 2017-01-06 | 각코우호우징 기타사토켄큐쇼 | 미생물을 사용한 미코스포린 유사 아미노산을 생산하는 방법 |
KR101911186B1 (ko) | 2017-08-16 | 2018-10-25 | 씨제이제일제당 (주) | 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산의 생산방법 |
KR102003911B1 (ko) * | 2018-02-23 | 2019-07-25 | 씨제이제일제당 주식회사 | 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산의 생산방법 |
KR20210082021A (ko) * | 2019-12-24 | 2021-07-02 | 씨제이제일제당 (주) | 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산의 생산방법 |
-
2022
- 2022-09-28 KR KR1020220123621A patent/KR102548752B1/ko active IP Right Grant
- 2022-09-30 WO PCT/KR2022/014844 patent/WO2024071491A1/ko unknown
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20170002587A (ko) * | 2014-05-13 | 2017-01-06 | 각코우호우징 기타사토켄큐쇼 | 미생물을 사용한 미코스포린 유사 아미노산을 생산하는 방법 |
KR101911186B1 (ko) | 2017-08-16 | 2018-10-25 | 씨제이제일제당 (주) | 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산의 생산방법 |
KR102003911B1 (ko) * | 2018-02-23 | 2019-07-25 | 씨제이제일제당 주식회사 | 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산의 생산방법 |
KR20210082021A (ko) * | 2019-12-24 | 2021-07-02 | 씨제이제일제당 (주) | 마이코스포린 유사 아미노산을 생산하는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산의 생산방법 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2024071491A1 (ko) | 2024-04-04 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US7141410B2 (en) | Methods and materials for the production of organic products in cells of Candida species | |
AU748462B2 (en) | Yeast strains for the production of lactic acid | |
EP1474507B1 (en) | Methods and materials for the production of organic products in cells of candida species | |
JP4963488B2 (ja) | 変異体酵母及びこれを用いた物質生産方法 | |
EP2468860A1 (en) | Transformant and process for production thereof, and process for production of lactic acid | |
CA3091909C (en) | A microorganism producing a mycosporine-like amino acid and a method for producing a mycosporine-like amino acid using the same | |
CA3072748C (en) | Microorganism for producing a mycosporine-like amino acid and method for producing a mycosporine-like amino acid using the same | |
KR20210128742A (ko) | 글리세롤 생성이 억제된 재조합 내산성 효모 및 이를 이용한 젖산의 제조방법 | |
CN112725210A (zh) | 抑制乳酸代谢和乙醇产生的重组耐酸酵母及使用其生产乳酸的方法 | |
KR20150034867A (ko) | 세포질 내 피루베이트 풀이 강화된 효모 및 이를 이용한 피루베이트 기반 대사산물을 생산하는 방법 | |
EP1637603B1 (en) | Dna coding for protein having d-lactic acid dehydrogenase activity and use thereof | |
Kunze et al. | Hansenula polymorpha (Pichia angusta): biology and applications | |
KR101819189B1 (ko) | 아세토인 생산능을 갖는 유전적으로 조작된 효모 세포 및 그를 사용하여 아세토인을 생산하는 방법 | |
KR102548752B1 (ko) | 마이코스포린 유사 아미노산 생산능을 갖는 미생물 및 이를 이용한 마이코스포린 유사 아미노산의 생산 방법 | |
KR101773123B1 (ko) | 2,3-부탄다이올 생산능을 갖는 유전적으로 조작된 효모 세포 및 그를 사용하여 2,3-부탄다이올을 생산하는 방법 | |
KR102306725B1 (ko) | 아세토인 생산능을 갖는 유전적으로 조작된 효모 및 이를 이용한 아세토인 생산방법 | |
KR20150056114A (ko) | 락테이트를 생산할 수 있는 유전적으로 조작된 효모 세포, 그를 제조하기 위한 방법, 및 상기 세포를 이용한 락테이트 생산 방법 | |
US9598709B2 (en) | Genetically engineered and stress resistant yeast cell with enhanced MSN2 activity and method of producing lactate using the same | |
KR102330595B1 (ko) | 에탄올 생산 경로가 억제된 내산성 효모 및 이를 이용한 젖산의 제조방법 | |
KR102613937B1 (ko) | 갈락토스 이용에 관여하는 모든 유전자가 결손된 효모 균주 및 이를 이용한 재조합 단백질 생산방법 | |
KR20150013092A (ko) | 숙신산 생산능이 향상된 박테리아 세포 및 이를 이용하여 숙신산을 생산하는 방법 | |
MXPA00002436A (en) | Yeast strains for the production of lactic acid |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
GRNT | Written decision to grant |