KR102338660B1 - 항-edb 항체 및 항체-약물 접합체 - Google Patents

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Abstract

본 발명은 피브로넥틴 1의 엑스트라 도메인 B 스플라이스 변형체에 결합하는 항체 및 항체-약물 접합체, 및 이를 제조하고 사용하는 방법을 제공한다.

Description

항-EDB 항체 및 항체-약물 접합체
본 발명은 항-EDB 항체 및 EDB 항체-약물 접합체(ADC: antibody-drug conjugate)에 관한 것이다. 본 발명은 추가로 EDB+ FN-발현 질환, 예컨대 암을 치료하기 위해 이러한 항체 및 ADC를 사용하는 방법에 관한 것이다.
피브로넥틴(fibronectin)은 혈장 및 기타 체액에서 가용성 형태로 존재하고 세포외 기질(ECM: extracellular matrix)에서 불용성 형태로 존재하는 고분자량의 점착성 당단백질이다. 피브로넥틴 1의 엑스트라 도메인(extra domain) B 스플라이스(splice) 변형체(EDB+ FN 또는 EDB)는 비-내재화 ECM 단백질이다. EDB는, 조직 재형성(remodeling)이 발생할 때마다 1차 전사물의 수준에서 선택적 스플라이싱(alternative splicing)의 기작에 의해 피브로넥틴 분자내로 삽입되는 91개 아미노산 유형 III 상동성 도메인이다. EDB+ FN은 종양 및 기타 병리학에서 새로운 혈관 주변의 스트로마(stroma)에서 선택적으로 축적되지만 정상적인 성인 맥관구조에서는 그다지 존재하지 않는 것으로 제시되어 왔다[자르디(Zardi) 등의 문헌 "Embo J. 6(8): 2337-42 (1987)"]. EDB+ FN은 많은 공격성 종양에서 발현되고, 종양 유형에 따라서, 발현의 혈관성 또는 확산성 스트로마 패턴을 주로 나타낸다[카르네몰라(Carnemolla) 등의 문헌 "J. Cell Biol. 108(3): 1139-48 (1989)"].
피브로넥틴(FN)의 EDB 도메인에 특이적으로 결합하는 항체, 즉 L19 항체는 파아지 디스플레이(phage display) 기술에 의해 단리되고 있다[카르네몰라(Carnemolla) 등의 문헌 "Int. J. Cancer 68(3): 397-405 (1996)"; 네리(Neri) 등의 문헌 "Nat. Biotechnol. 15(12): 1271-5. (1997)"; 피니(Pini) 등의 문헌 "J. Biol. Chem. 273(34): 21769-76 (1998)"]. L19 항체는 광범위한 실험 종양 모델에서, 및 인간 종양 및 기타 혈관형성 질환의 절편 상에서 종양 혈관을 착색시킬 수 있다[카르네몰라(Carnemolla) 등의 문헌 "J. Cell Biol. 108(3): 1139-48 (1989)"; 칵츠마렉(Kaczmarek) 등의 문헌 "Int. J. Cancer 59(1): 11-6 (1994)"; 베른트(Berndt) 등의 문헌 "Histochem. Cell Biol. 109(3): 249-55 (1998)"].
암을 치료하는데 있어서 상이한 형식의 L19 항체를 사용하는 다양한 표적화 전략이 연구되고 있다. 예를 들면, scFv(L19) 단일클론성 항체 단편[비르췰러(Birchler) 등의 문헌 "Nat Biotechnol. 17: 984-8 (1999)"], scFv(L19)와 융합된 인터류킨(interleukin)-12(IL-12) 및 종양 괴사 인자[TNF(tumor necrosis factor)]-알파를 비롯한 융합 단백질[할린(Halin C.) 등의 문헌 "Cancer Res. 63(12): 3202-10 (2003)"], 및 단독으로의 또는 감광제에 접합된 L19 소 면역 단백질(SIP: small immune protein)[파브리니(Fabbrini M.) 등의 문헌 "Int. J. Cancer 118(7): 1805-13 (2006)"]이다.
비록 다양한 L19 항체 기반의 치료법이 개시되어 있지만, EDB+ FN-발현 질환 또는 질병, 예컨대 EDB+ FN 발현과 연관된 암 및/또는 EDB+ FN-발현 암을 앓는 환자를 위하여, 추가로 개선되고 최적화된 EDB+ FN-표적화 치료법, 예컨대 항체-약물 접합체의 개발에 대한 상당한 임상적 요구가 남아 있다.
본 발명은 (a) 피브로넥틴(FN)의 엑스트라 도메인 B(EDB)에 결합하는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편, (b) 연결기 및 (c) 약물을 포함하는 항체-약물 접합체를 제공한다. 몇몇 양태에서, 항체-약물 접합체는 서열 번호 3, 5 및 7을 포함하는 3개의 CDR을 포함하는 중쇄 가변성 영역, 및 서열 번호 12, 13 및 14를 포함하는 3개의 CDR을 포함하는 경쇄 가변성 영역을 포함할 수 있는 항체, 또는 항원 결합 단편을 포함한다. 몇몇 양태에서, 항체-약물 접합체는 서열 번호 1 또는 21을 포함하는 중쇄 가변성 영역, 및 서열 번호 10을 포함하는 경쇄 가변성 영역을 포함할 수 있는 항체, 또는 항원 결합 단편을 포함한다.
본 발명은 서열 번호 1을 포함하는 중쇄 가변성 영역 및 서열 번호 10을 포함하는 경쇄 가변성 영역; 또는 서열 번호 21을 포함하는 중쇄 가변성 영역 및 서열 번호 10을 포함하는 경쇄 가변성 영역을 포함할 수 있는 항체, 또는 항원 결합 단편을 포함하는 항체-약물 접합체를 또한 제공한다. 몇몇 양태에서, 항체-약물 접합체는 서열 번호 8, 17, 19, 23, 25, 27 또는 29를 포함하는 중쇄, 및 서열 번호 15 또는 31을 포함하는 경쇄를 포함하는 항체, 또는 항원 결합 단편을 포함한다.
본 발명은 서열 번호 8을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 8을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 17을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 17을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 19를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 19를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 23을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 23을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 25를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 25를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 27을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 27을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 29를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 또는 서열 번호 29를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄를 포함하는 항체, 또는 항원 결합 단편을 포함하는 항체-약물 접합체를 또한 제공한다.
본 발명은 자리-특이적(site-specific) 접합을 위해 조작된 시스테인 잔기를 포함하는 중쇄 및/또는 경쇄 불변성 영역을 갖는 항체, 또는 항원 결합 단편을 포함하는 항체-약물 접합체를 또한 제공한다. 몇몇 양태에서, 항체-약물 접합체는 카밧(Kabat)의 EU 색인의 넘버링에 따라서 위치 290에서 조작된 시스테인 잔기(K290C)를 포함하는 중쇄 불변성 영역을 갖는다. 몇몇 양태에서, 항체-약물 접합체는 카밧의 넘버링에 따라서 위치 183에서 조작된 시스테인 잔기(κK183C)를 포함하는 경쇄 불변성 영역을 갖는다. 몇몇 양태에서, 항체-약물 접합체는 카밧의 EU 색인의 넘버링에 따라서 위치 290에서 조작된 시스테인 잔기(K290C)를 포함하는 중쇄 불변성 영역 및 위치 183에서 조작된 시스테인 잔기(κK183C)를 포함하는 경쇄 불변성 영역을 갖는다.
본 발명은 항체에 삽입된 조작된 글루타민-함유 태그를 포함하는 중쇄 불변성 영역을 포함하거나, 또는 항체에서 하나 이상의 내생성 아미노산을 대체하는 항체, 또는 항원 결합 단편을 갖는 항체-약물 접합체를 추가로 제공한다. 몇몇 양태에서, 항체-약물 접합체는 위치 E294-N297에서 항체에 삽입된 조작된 글루타민-함유 태그를 갖는다. 몇몇 양태에서, 항체-약물 접합체는 아미노산 서열 LLQG(서열 번호 40)을 포함하는 글루타민-함유 태그를 갖는다. 몇몇 양태에서, 항체-약물 접합체는 카밧의 EU 색인의 넘버링에 따라서 위치 222(K222R)에서 라이신(K) 치환 아르기닌(R)(K222R)을 추가로 포함하는 중쇄 불변성 영역을 갖는다.
본 발명은 카밧의 넘버링에 따라서 위치 94에서 라이신(K) 치환 아르기닌(R)(K94R)을 포함하는 중쇄 가변성 영역을 포함하는 항체, 또는 항원 결합 단편을 갖는 항체-약물 접합체를 또한 제공한다.
본 발명은 분할가능한(cleavable) 연결기인 연결기를 갖는 항체-약물 접합체를 추가로 제공한다. 몇몇 양태에서, 분할가능한 연결기는 vc, diS, diS-C2OCO 및 AcLys-vc로 구성된 군에서 선택된다.
본 발명은 세포독성제인 약물을 갖는 항체-약물 접합체를 추가로 제공한다. 몇몇 양태에서, 세포독성제는 아우리스타틴(auristatin)이다. 몇몇 양태에서, 아우리스타틴은 0101, 1569, 9411 및 4574로 구성된 군에서 선택된다. 몇몇 양태에서, 세포독성제는 CPI 이합체이다. 몇몇 양태에서, CPI 이합체는 CPI-8314 또는 CPI-0326이다.
본 발명은 (a) 서열 번호 3, 5 및 7을 포함하는 3개의 CDR을 포함하는 중쇄 가변성 영역, 및 서열 번호 12, 13 및 14를 포함하는 3개의 CDR을 포함하는 경쇄 가변성 영역을 포함하는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편, (b) vc 연결기 및 (c) 0101 약물을 포함하는 항체-약물 접합체를 또한 제공한다.
본 발명은 (a) 서열 번호 21을 포함하는 중쇄 가변성 영역 및 서열 번호 10을 포함하는 경쇄 가변성 영역을 포함하는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편; (b) vc 연결기 및 (c) 0101 약물을 포함하는 항체-약물 접합체를 또한 제공한다.
본 발명은 (a) 서열 번호 25를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄를 포함하는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편; (b) vc 연결기 및 (c) 0101 약물을 포함하는 항체-약물 접합체를 또한 제공한다.
본 발명은 본 발명의 항체-약물 접합체 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 약학 조성물을 추가로 제공한다. 본 발명은 다수 종의 본 발명의 항체-약물 접합체, 및 임의적으로 약학 담체를 포함하고, 3 내지 5 범위의 평균 약물 대 항체 비(DAR: drug-antibody ratio)를 갖는 조성물을 또한 제공한다. 본 발명은 특허청구범위 제1항 내지 제25항중 어느 한 항의 다수 종의 항체-약물 접합체, 및 임의적으로 약학 담체를 포함하고, 1 내지 3 범위의 평균 DAR을 갖는 조성물을 또한 제공한다.
본 발명은 본 발명의 항체의 중쇄 또는 경쇄를 인코딩하는 핵산을 제공한다. 몇몇 양태에서 핵산은 중쇄를 인코딩하는 서열 번호 9, 18, 20, 24, 26, 28 또는 30을 포함하거나, 경쇄를 인코딩하는 서열 번호 16 또는 32를 포함할 수 있다. 본 발명은 본 발명의 임의의 핵산을 포함하는 벡터를 추가로 제공한다. 또한, 본 발명은 본 발명의 임의의 핵산을 포함하는 숙주 세포를 제공한다.
본 발명은 (a) 연결기를 약물에 연결시키는 단계; (b) 연결기 및 약물을 항체에 접합시키는 단계; 및 (c) 항체-약물 접합체를 정제하는 단계를 포함하는, 본 발명의 항체-약물 접합체의 제조 방법을 제공한다. 몇몇 양태에서, 접합은 항체 위에서 하나 이상의 조작된 시스테인 잔기 및/또는 조작된 글루타민 잔기 상에서 자리-특이적이다.
본 발명은 본 발명의 항체-약물 접합체를 포함하는 효과량의 조성물을 EDB+ FN-발현 질환 또는 질병의 치료가 필요한 피험체에게 투여하는 단계를 포함하는, EDB+ FN-발현 질환 또는 질병을 치료하는 방법을 또한 제공한다. 몇몇 양태에서, EDB+ FN-발현 질환 또는 질병은 암이다. 몇몇 양태에서, 암은 고형 종양 또는 혈액암이다. 몇몇 양태에서, 고형 종양은 갑상선암, 육종, 유방암, 췌장암, 교모세포종, 담낭암, 신장암, 피부암, 자궁암, 중피종, 결장직장암, 두경부암, 난소암, 방광암, 고환암, 전립선암, 간암, 내분비암, 흉선암, 뇌암, 부신암, 안암, 경부암 및 폐암이다. 몇몇 양태에서, 혈액암은 백혈병, 림프종 또는 골수종이다.
본 발명은 피험체에서 EDB+ FN-발현 질환 또는 질병을 치료하기 위한 약제의 제조에 있어서의 본 발명의 항체-약물 접합체의 용도를 추가로 제공한다. 몇몇 양태에서, EDB+ FN-발현 질환 또는 질병은 암이다. 몇몇 양태에서, 암은 고형 종양 또는 혈액암이다. 몇몇 양태에서, 고형 종양은 갑상선암, 육종, 유방암, 췌장암, 교모세포종, 담낭암, 신장암, 피부암, 자궁암, 중피종, 결장직장암, 두경부암, 난소암, 방광암, 고환암, 전립선암, 간암, 내분비암, 흉선암, 뇌암, 부신암, 안암, 경부암 및 폐암이다. 몇몇 양태에서, 혈액암은 백혈병, 림프종 또는 골수종이다.
도 1a 및 1b는 [A] EDB-L19, EDB-PFE 및 EDB-(K94R) 항체; 및 [B] EDB-(K94R) 및 EDB-(κK183C-K94R-290C) 항체의 결합 특성을 보여준다.
도 2는 인간 환자 유래된 이종이식(PDX: patient derived xenograft) 암 모델에서 RNA-서열 분석을 사용하여 EDB+ FN 발현을 보여준다.
도 3a 및 3b는 [A] EDB-L19 항체 및 EDB-L19-vc-0101 ADC, 및 EDB-(κK183C-K94R-290C) 항체 및 EDB-(κK183C-K94R-290C)-vc-0101 ADC; 및 [B] EDB-(K94R) 항체 및 EDB-(K94R)-vc-0101 ADC, 및 EDB-(κK183C-K290C) 항체 및 EDB-(κK183C-K290C)-vc0101 ADC에 대한 ELISA 결합 곡선을 보여준다.
도 4는 WI38-VA13 및 HT-29 세포에서 웨스턴 블롯(western blot)에 의한 EDB+ FN 발현을 보여준다.
도 5a 내지 5f는 인간 암의 높은 EDB+ FN 발현 NSCLC 환자 유래된 이종이식(PDX) 모델인 PDX-NSX-11122에서, [A] 0.3, 0.75, 1.5 및 3 ㎎/㎏에서의 EDB-L19-vc-0101; [B] 3 ㎎/㎏에서의 EDB-L19-vc-0101 및 10 ㎎/㎏에서의 디설파이드 연결된 EDB-L19-diS-DM1; [C] 1 및 3 ㎎/㎏에서의 EDB-L19-vc-0101 및 5 ㎎/㎏에서의 디설파이드 연결된 EDB-L19-diS-C2OCO-1569; [D] 각각 0.3, 1 및 3 ㎎/㎏, 및 1.5 ㎎/㎏의 용량에서의 자리-특이적 접합된 EDB-(κK183C+K290C)-vc-0101 및 종래적으로 접합된 EDB-L19-vc-0101(ADC1); [E] 0.3, 1 및 3 ㎎/㎏의 용량에서의 자리-특이적 접합된 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101; 및 [F] 3 ㎎/㎏으로 투약된 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101 그룹의 항-종양 효능을 각각의 개별적인 종양 함유 마우스에 대한 종양 성장 저해 곡선으로서 보여준다.
도 6a 내지 6f는 인간 암의 중간 내지 높은 EDB+ FN 발현 NSCLC 세포주 이종이식(CLX) 모델인 H-1975에서의, [A] 0.3, 0.75, 1.5 및 3 mg/mg에서의 EDB-L19-vc-0101; [B] 0.3, 1 및 3 ㎎/㎏에서의 EDB-L19-vc-0101 및 EDB-L19-vc-1569; [C] 각각 0.5, 1.5 및 3 ㎎/㎏ 및 0.1, 0.3 및 1 ㎎/㎏에서의 EDB-L19-vc-0101 및 EDB-(H16-K222R)-AcLys-vc-CPI-8314; [D] 0.5, 1.5 및 3 ㎎/㎏에서의 자리-특이적 접합된 EDB-(κK183C+K290C)-vc-0101 및 종래적으로 접합된 EDB-L19-vc-0101; [E] 1 및 3 ㎎/㎏에서의 EDB-L19-vc-0101 및 EDB-(K94R)-vc-0101; 및 [F] 1 및 3 ㎎/㎏에서의 EDB-(κK183C+K290C)-vc-0101 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101의 항-종양 효능을 보여준다.
도 7은 3 ㎎/㎏에서의 EDB-L19-vc-0101 및 EDB-L19-vc-9411의, 인간 암의 중간 EDB+ FN 발현 결장 CLX 모델인 HT29에서의 항-종양 효능을 보여준다.
도 8a 및 8b는 [A] 중간 내지 높은 EDB+ FN 발현 췌장 PDX인 PDX-PAX-13565; 및 [B] 낮은 내지 중간 EDB+ FN 발현 췌장 PDX인 PDX-PAX-12534에서, 0.3, 1 및 3 ㎎/㎏에서의 EDB-L19-vc-0101의 항-종양 효능을 보여준다.
도 9는 인간 암의 중간 EDB+ FN 발현 림프종 CLX 모델인 라모스(Ramos)에서 1 및 3 ㎎/㎏에서의 EDB-L19-vc-0101의 항-종양 효능을 보여준다.
도 10a 및 10b는 마우스 공통유전자(syngeneic) 유방 암종 모델인 EMT-6에서, [A] 4.5 ㎎/㎏에서의 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101; 및 [B] 4.5 ㎎/㎏으로 투약된 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101 그룹의 항-종양 효능을 각각의 개별적인 종양 함유 마우스에 대한 종양 성장 저해 곡선으로서 보여준다.
도 11은 6 ㎎/㎏에서의 자리-특이적 접합된 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101(ADC4)과 비교되는 5 ㎎/㎏에서의 종래적으로 접합된 EDB-L19-vc-0101에 대한 절대 호중구 수를 보여준다.
본 발명은, "EDB+ FN" 또는 "EDB"로서 상호교환적으로 지칭되는, 피브로넥틴(FN)의 엑스트라-도메인 B(EDB)에 결합하는 항체 및 항체 약물 접합체(ADC)를 제공한다. 본 발명은 또한 항-EDB 항체, 연결기, 및 약물[페이로드(payload)]을 사용하여 ADC를 제조하는 방법을 또한 제공한다. 본 발명은 종래의 및/또는 자리-특이적 접합 기술을 사용하여 생성된 ADC를 추가로 제공한다. 본 발명의 항체 및 ADC는 EDB+ FN 발현을 특징으로 하거나 이와 연관된 과증식성 질환, 예컨대 암의 진단, 예방, 및/또는 치료에 사용될 수 있는 조성물, 예컨대 약제의 제조 및 제작을 위해 유용하다. 본 발명은 EDB ADC를 제조하는데에 사용되는 항-EDB 항체를 인코딩하는 핵산을 또한 제공한다.
ADC는 전형적으로 연결기의 사용을 통해 약물에 접합된 항체 성분을 포함한다. 종래의 접합 기술에 의해 생성된 ADC는 항체 중쇄 및/또는 경쇄 상에서 내생성으로 존재하는 라이신 또는 시스테인 잔기를 통해 약물을 항체에 무작위적으로 연결시킨다. 따라서, 이러한 ADC는 상이한 DAR을 갖는 종들의 이종성 혼합물이다. 자리-특이적 접합 기술에 의해 생성된 ADC는 항체 중쇄 및/또는 경쇄 상의 특별히 조작된 잔기에서 약물을 항체에 연결시킨다. 이처럼, 자리-특이적 접합된 ADC는 규정된 약물 : 항체 비(DAR)를 갖는 종으로 구성된 ADC의 동종성 혼합물이다. 이에 따라, 자리-특이적 접합된 ADC는 균일한 화학양론을 나타내어, 개선된 약물동력학, 생체분포 및 안전성 프로파일을 초래한다.
본 발명의 ADC는 연결기를 통해 하나 이상의 약물에 접합된 항-EDB 항체[즉 연결기-약물 작용부분(moiety)을 형성함]를 포함한다. 본 발명은 (a) EDB에 결합하는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편; (b) 연결기 및 (c) 약물을 갖는 ADC를 제공한다. 본 발명은 식 Ab-(L-D)의 ADC를 추가로 제공하고, 여기서 (a) Ab는 EDB에 결합하는 항체, 또는 이의 항원-결합 단편이고, (b) L-D는 연결기-약물 작용부분이며, 이때 L은 연결기이고, D는 약물이다. 또 다른 양태에서, 본 발명은 식 Ab-(L-D)p의 ADC를 제공하고, 여기서 (a) Ab는 EDB에 결합하는 항체, 또는 이의 항원-결합 단편이고, (b) L-D는 연결기-약물 작용부분이며, 이때 L은 연결기이고, D는 약물이며, (c) p는 항체에 부착된 연결기-약물 작용부분의 수이다.
항체에 부착된 연결기-약물 작용부분의 수는 ADC의 개발에 바람직한 임의의 수일 수 있다. 몇몇 양태에서, 항체 1개 당 연결기-약물 작용부분의 수는 4이다. 다른 양태에서, 항체 1개 당 연결기-약물 작용부분의 수는 3이다. 또 다른 양태에서, 항체 1개 당 연결기-약물 작용부분의 수는 2이다. 또 다른 양태에서, 항체 1개 당 연결기-약물 작용부분의 수는 1이다. 다른 양태에서, 항체 1개 당 연결기-약물 작용부분의 수는 4 초과, 예컨대 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 또는 12를 초과한다.
추가로 본 발명은 연결기-약물 작용부분이 종래의 또는 자리-특이적 접합 기술을 통해 항체에 부착되는 ADC를 제공한다. 몇몇 양태에서, 항-EDB 항체, 또는 이의 항원-결합 단편은, 약물, 예컨대 본원에 추가로 기재된 바와 같은 세포독성, 세포정지, 및/또는 치료학적 제제에 접합되거나 연결된다. 예를 들면, 세포독성제는 세포독성제의 표적화된 국소 전달을 위해 본원에 기재된 바와 같은 항-EDB 항체에 연결되거나 접합될 수 있다. 또한 이러한 ADC를 제조 및 제작하는 방법, 및 임상적 적용에서의 이의 용도가 제공된다.
내재화 세포 표면 발현된 단백질을 표적화하기 위해 개발된 다른 ADC와는 대조적으로, 본 발명의 ADC는 EDB, 즉 세포외 기질(ECM)에서 발현된 단백질을 표적화한다. ECM에서 발현된 단백질을 표적화하는 것은 종양 세포 상에서 발현된 단백질을 표적화하는 것 이상의 이점을 제공할 것이다. ADC는, 치료가 어려운 많은 인간 암에서 흔히 일어나는 스트로마 및 ECM 장벽을 통한 침투없이 표적에 직접적으로 접근할 수 있다. 추가로, ADC에 의해 ECM에서 EDB를 표적화하는 것은 종양 환경에서 세포 유형을 표적화하는 많은 어려움에 접근하는 특정 기작을 제공한다. 이는 세포독성 페이로드 또는 약물의 세포외 방출을 일으켜서, 기작, 예컨대 방관자 기작에 의한 종양 세포 및/또는 스트로마 세포의 세포 사멸/세포-주기 정지를 통해 다양한 세포의 사멸을 초래한다. 또한, 추가의 기작으로는, 제한되지 않지만, 조절이상 혈관형성 또는 세포독성 혈관 표적화/붕괴, 혈관 정상화, 면역조절 및 세포 분화의 유도 및/또는 상피의 간충직으로의 전이의 장애가 포함된다.
본원에 제공된 실시예는 항-EDB 항체 및 EDB ADC 생성 동안에 수득된 개선된 특징, 예컨대 면역원성을 감소시키기 위한 알로타입(allotype) 최적화, 생성물 동종성을 증가시키기 위한 COOH-말단 라이신의 제거, 및 잠재적 당화반응 부담(liability)을 완화시키고 이종성을 감소시키기 위한 돌연변이의 도입을 나타낸다(실시예 1 및 2 참조). 추가로, 실시예에 제시된 바와 같이, 종래의 및 자리-특이적 접합 기술(즉 시스테인, 라이신 및/또는 아실 공여체 글루타민-함유("Q") 태그) 및 다양한 연결기-약물 작용부분을 사용하여 생성된 EDB ADC는 확고한 시험관내 및 생체내 효능을 나타낸다(실시예 6 내지 8 참조). 본원에 제공된 예는, 또한 조작된 시스테인 잔기를 통해 자리-특이적 접합을 사용하여 생성된 EDB ADC가 시스테인 잔기를 통해 종래의 접합을 사용하여 생성된 EDB ADC와 비교하여 개선된 특징을 나타냄을 보여주었고, 예컨대 개선된 약물동력학(PK) 프로파일(profile)(즉 표적 이외의 독성 효과의 감소를 유도하는 접합 안정성 및 증가된 노출), 유리한 열 안정성 및 비임상정 안전성 프로파일(즉 골수억제의 경감)이다(각각 실시예 9, 10 및 11을 참조한다). 추가로, 자리-특이적 접합 기술에 의해 생성된 EDB ADC의 개선된 특징은 인간 치료시 더 높은 투여량을 가능하게 하고, 이에 따라 증가된 효능을 제공할 수 있다. 몇몇 양태에서, EDB ADC는 인간 IgG1 중쇄 불변성 영역에서 위치 290(카밧의 EU 색인에 따름)에서의 반응성 시스테인(C)에 의한 라이신(K)의 치환(K290C) 및/또는 인간 카파 경쇄 불변성 영역에서 위치 183(카밧에 따름)에서의 반응성 시스테인(C)에 의한 라이신(K)의 치환(κK183C)을 포함하여 자리-특이적 접합을 가능하게 할 수 있다.
피브로넥틴의 엑스트라-도메인 B
본원에 사용될 경우 "EDB+ FN" 및 "EDB"는 상호교환가능하게 사용되고 엑스트라-도메인 B(EDB)을 함유한 피브로넥틴(FN)을 지칭한다. 추가로, "항-EDB 항체" 및 "항-EDB+ FN 항체"는 상호교환가능하게 사용되고 EDB에 결합하는 항체를 지칭한다. "항-EDB 항체-약물 접합체", "EDB 항체-약물 접합체", "항-EDB ADC", "EDB ADC"는 상호교환가능하게 사용되고, EDB에 결합하고 약물에 접합되거나 연결되는 항체, 또는 이의 항원-결합 단편을 포함하는 ADC를 지칭한다. FN은 세포외 기질(ECM)에 존재하는 고분자량의 당단백질이고, 세포 접착 및 이동 과정, 예컨대 배형성, 상처 치유, 혈액 응고, 숙주 방어, 및 전이에 관여된다. FN은 전형적으로 한쌍의 디설파이드 결합에 의해 C-말단 부근에서 공유적으로 연결된 2개의 거의 동일한 ∼250 kDa의 서브유닛에 의해 형성되는 이합체로서 존재한다. 각각의 단량체는 다음의 3가지 유형의 반복 단위로 구성된다: 유형 I, 유형 II 및 유형 III FN 반복부. 단일 75-kb 유전자는 FN을 인코딩하지만, 인간에서 20가지의 단백질 변형체가 관찰된다. FN 유전자의 선택적 스플라이싱이 3개의 영역에서 발생되어, 엑스트라 도메인 A(EDA) 및 엑스트라 도메인 B(EDB)로 지칭되는 2개의 유형 III 반복부중 하나, 및 유형 III 연결 분절(IIICS)로서 칭해지는 2개의 다른 유형 III 반복부를 연결하는 분절을 포함하거나 배제한다. EDB는 마우스, 래트, 토끼, 개, 사이노몰구스(cynomolgus) 원숭이 및 인간에서 100% 동일한 91개의 아미노산 서열이다. 대표적인 EDB+ FN 뉴클레오티드 서열은 등록 번호 NM_001306129.1하에 제공되고 상응하는 아미노산 서열은 등록 번호 NP_001293058.1.하에 제공된다. EDB 및 재조합 인간 7-EDB-8-9 아미노산 서열이 표 1에 제공된다. 재조합 인간 7-EDB-8-9는 아미노산 말단 상의 도메인 7 및 EDB의 카복시 말단에서의
Figure 112019049414387-pct00001
및 도메인 9에 의해 플랭크화된(flanked) EDB를 포함한다.
Figure 112019049414387-pct00002
항-EDB 항체
본 발명의 항체는 EDB에 특이적으로 결합한다. 본 발명의 ADC를 제조하기 위해, 항체, 또는 이의 항원-결합 단편은 EDB에 특이적으로 결합하는 임의의 항체(본원에 기재된 항체 포함), 또는 이의 항원-결합 단편일 수 있다. 항체, 또는 이의 항원-결합 단편은 EDB ADC의 제조에 사용하기 위해 단리되거나, 정제되거나, 또는 유도체화될 수 있다.
본원에 사용될 경우, "항체" 또는 "Ab"는 특정 표적 또는 항원, 예컨대 탄수화물, 폴리뉴클레오티드, 지질, 폴리펩티드 등을 인식하거나 이에 결합할 수 있는 면역글로불린 분자를 지칭하고, 이때 인식 또는 결합은 면역글로불린 분자의 가변성 영역에 위치된 적어도 하나의 항원 인식 자리를 통해서이다. 이러한 용어는 임의의 유형의 항체를 포괄할 수 있고, 제한되지 않지만, 단일클론성 항체, 다중클론성 항체, 소정의 항원(예를 들어 EDB)에 특이적으로 결합하는 능력을 보유하는 온전한 항체의 "항원-결합 단편"(또는 일부), 예컨대 Fab, Fab', F(ab')2, Fd, Fv, Fc 등, 단리된 상보성 결정 영역(CDR: complementarity determining region), 이중특이성 항체, 이종접합체 항체, 이의 돌연변이체, 항체, 또는 이의 항원-결합 단편을 갖는 융합 단백질(예를 들어, 도메인 항체), 단일 쇄(ScFv) 및 단일 도메인 항체(예를 들어, 상어 및 낙타과 항체), 맥시바디(maxibody), 미니바디(minibody), 인트라바디(intrabody), 디아바디(diabody), 트리아바디(triabody), 테트라바디(tetrabody), v-NAR 및 비스-scFv[예를 들어, 홀리거(Holliger) 및 허드슨(Hudson)의 문헌 "2005, Nature Biotechnology 23(9): 1126-1136" 참조], 인간화된 항체, 키메라성(chimeric) 항체, 및 필요한 특이성의 항원 인식 자리를 포함하는 면역글로불린의 임의의 다른 변형된 입체형태, 예컨대 항체의 글리코실화 변형체, 항체의 아미노산 서열 변형체, 및 공유적으로 변형된 항체가 포함된다. 항체는 뮤린, 래트, 인간, 또는 다른 기원(키메라성 또는 인간화된 항체 포함)일 수 있다. 본 발명의 몇몇 양태에서, 개시된 EDB ADC의 항체, 또는 이의 항원-결합 단편은 키메라성이거나, 인간화되거나, 또는 재조합성의 인간 항체, 또는 이의 EDB-결합 단편이다.
고유의 또는 자연 발생 항체 및 고유의 면역글로불린은 전형적으로 약 150,000 달톤의 이종사합체성 당단백질로서, 2개의 동일한 경쇄(LC) 및 2개의 동일한 중쇄(HC)로 구성된다. 각각의 중쇄는 "CH 도메인"으로서 지칭되는 다수의 불변성 도메인 또는 영역[예를 들어 힌지(hinge), CH1, CH2 또는 CH3]이 수반되는 가변성 도메인(VH)을 갖는다. 각각의 경쇄는 가변성 도메인(VL) 및 "CL 도메인"으로서 지칭되는 불변성 도메인을 갖는다. 항체의 "불변성 영역" 또는 "불변성 도메인"이라는 용어는 항체 경쇄의 불변성 영역 또는 항체 중쇄의 불변성 영역을 단독으로 또는 조합하여 지칭한다. 불변성 도메인은 항원으로의 항체의 결합에 직접적으로 관여되지 않지만, 다양한 효과자 기능, 예컨대 Fc 수용체(FcR) 결합, 항체-독립적 세포 독성(ADCC: antibody-dependent cellular toxicity)에서의 항체의 참여, 옵소닌작용(opsonization), 보체 의존성 세포독성의 개시, 및 비만 세포 탈과립화를 나타낸다. EDB 항체의 불변성 영역은 IgA, IgD, IgE, IgG, IgM, 이의 임의의 이소타입(isotype)(예를 들어, IgG의 IgG1, IgG2, IgG3, 또는 IgG4 이소타입), 뿐만 아니라 이의 아강(subclasses) 및 돌연변이 버전(version)중 임의의 하나의 불변성 영역으로부터 유래될 수 있다.
CH1 도메인은, 예를 들어 카밧의 EU 색인에 따라서 약 위치 118-215로부터 연장되는 면역글로불린 중쇄의 제1의(거의 아미노 말단의) 불변성 영역 도메인을 포함한다. CH1 도메인은 면역글로불린 중쇄 분자의 힌지 영역으로의 아미노 말단 및 VH 도메인에 인접하고, 면역글로불린 중쇄의 Fc 영역의 일부를 형성하지 않는다.
힌지 영역은 CH1 도메인을 CH2 도메인에 연결시키는 중쇄 분자의 부분을 포함한다. 이러한 힌지 영역은 대략 25개 잔기를 포함하고 가요성이어서, 2개의 N-말단 항원 결합 영역을 독립적으로 이동시킬 수 있다. 힌지 영역은 다음의 3개의 별개의 도메인으로 분류될 수 있다: 상위, 중위, 및 하위 힌지 도메인.
CH2 도메인은 카밧의 EU 색인에 따라서 대략 위치 231-340으로부터 연장되는 중쇄 면역글로불린 분자의 부분을 포함한다. CH2 도메인은 또 다른 도메인과 밀접하게 쌍을 형성하지 않는다는 점에서 특유적이다. 오히려, 2개의 N-연결된 분지화된 탄화수소 쇄가 온전한 고유의 IgG 분자의 2개의 CH2 도메인 사이에 위치된다. 몇몇 양태에서, 본 발명의 항체(또는 이의 단편)는 IgG 분자, 예컨대 IgG1, IgG2, IgG3, 또는 IgG4로부터 유래된 CH2 도메인을 포함한다. 몇몇 양태에서, IgG는 인간 IgG이다.
CH3 도메인은 CH2 도메인의 N-말단으로부터, 예를 들어 카밧의 EU 색인에 따라서 약 위치 341-447로부터 대략 110개의 잔기를 연장하는 중쇄 면역글로불린 분자의 부분을 포함한다. CH3 도메인은 전형적으로 항체의 C-말단 부분을 형성한다. 그러나, 몇몇 면역글로불린에서, 추가적인 도메인이 CH3 도메인으로부터 연장되어 분자의 C-말단 부분을 형성한다(예를 들어 IgM의 μ 쇄 및 IgE의 ε 쇄에서의 CH4 도메인). 몇몇 양태에서, 본 발명의 항체(또는 이의 단편)는 IgG 분자, 예컨대 IgG1, IgG2, IgG3, 또는 IgG4로부터 유래된 CH3 도메인을 포함한다. 몇몇 양태에서, IgG는 인간 IgG이다.
CL 도메인은, 예를 들어 카밧의 EU 색인에 따라서 대략 위치 108-214로부터 연장된 면역글로불린 경쇄의 불변성 영역 도메인을 포함한다. CL 도메인은 VL 도메인에 인접한다. 몇몇 양태에서, 본 발명의 항체(또는 이의 단편)는 카파 경쇄 불변성 도메인(CLκ)을 포함한다. 몇몇 양태에서, 항체(또는 이의 단편)는 람다 경쇄 불변성 도메인(CLλ)을 포함한다. CLκ는 공지된 다형태성(polymorphic) 유전자자리 CLκ-V/A45 및 CLκ-L/V83(카밧 넘버링 사용)을 갖고, 이에 따라 다형태성 Km(1): CLκ-V45/L83; Km(1,2): CLκ-A45/ L83; 및 Km(3): CLκ-A45/V83을 허용한다. 본 발명의 폴리펩티드, 항체 및 ADC는 임의의 이들 경쇄 불변성 영역을 갖는 항체 성분을 포함할 수 있다.
Fc 영역은 일반적으로 CH2 도메인 및 CH3 도메인을 포함한다. 비록 면역글로불린 중쇄의 Fc 영역의 경계가 다양할 수 있지만, 인간 IgG 중쇄 Fc 영역은 대체적으로 위치 Cys226, 또는 Pro230(카밧의 EU 색인에 따름)에서의 아미노산 잔기로부터 이의 카복시-말단으로 연장되는 것으로 정의된다. Fc 영역은 고유의 서열 Fc 영역 또는 변형체 Fc 영역일 수 있다[카밧 등의 문헌 "Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md., 1991"].
항체의 "가변성 영역"은 항체 경쇄의 가변성 영역 또는 항체 중쇄의 가변성 영역을 단독으로 또는 조합하여 지칭한다. 당분야에 공지된 바와 같이, 중쇄 및 경쇄의 가변성 영역은 각각 과가변성 영역으로서도 공지된 3개의 상보성 결정 영역(CDR)에 의해 연결된 4개의 골격구조 영역(FR: framework region)으로 구성된다. 각각의 쇄에서 CDR은 FR에 매우 근접하여 다른 쇄로부터의 CDR에 의해 함께 유지되고, 이는 항체의 항원 결합 자리의 형성에 기여한다.
가변성 도메인의 CDR은 카밧의 정의[카밧 등의 문헌 "1992, Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, NIH, Washington D.C], 코티아(Chothia)의 정의[코티아 등의 문헌 "Nature 342: 877-883, (1989)"], 카밧 및 코티아 둘 다의 누적된 정의, AbM 정의[옥스포드 몰레큘라(Oxford Molecular)의 AbM 항체 모델링 소프트웨어(현재, 악셀리스(Accelrys: 등록상표))를 사용하여 수득됨], 관계 정의[관찰된 항원 관계에 기초함, 맥칼럼(MacCallum) 등의 문헌 "J. Mol. Biol., 262: 732-745, (1996)"에 제시됨], 및/또는 입체배좌적 정의[마카베(Makabe) 등의 문헌 "Journal of Biological Chemistry, 283: 1156-1166, 2008"] 또는 당분야에 공지된 CDR 결정의 임의의 방법에 따라 식별될 수 있다. 본원에 사용될 경우, CDR은 당분야에 공지된 임의의 접근법(접근법의 조합 포함)에 의해 정의된 CDR을 지칭한다. 본 발명의 경우, 하기 표 2에 제시된 CDR은 카밧 및 코티아 정의를 사용하여 수득되었다. 본 발명의 항-EDB 항체, 또는 이의 항원-결합 단편은 하나 이상의 CDR(들)(예컨대 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6개 모두의 CDR)을 포함한다.
표적 또는 항원(예를 들어, EDB 단백질)에 "특이적으로 결합"하거나 "우세하게 결합"하는(본원에서 상호교환적으로 사용됨) 항체, ADC, 또는 폴리펩티드는 당분야에서 잘 이해되는 용어이고, 이러한 특이적 또는 우세한 결합을 결정하는 방법 또한 당분야에 잘 알려져 있다. 분자는, 이것이 다른 세포 또는 물질과 비교하여 특별한 세포 또는 물질과 긴 기간 동안 및/또는 더 큰 친화도로 더욱 빈번하고 더욱 신속히 반응하거나 결합되는 경우, "특이적 결합" 또는 "우세한 결합"을 나타내는 것으로 일컬어진다. 항체는, 이것이 다른 물질에 결합하는 것에 비해 표적 또는 항원에 더 큰 친화도 및 결합력으로 더욱 신속하고/하거나 더욱 긴 기간 동안 결합하는 경우, 표적 또는 항원에 "특이적으로 결합"하거나 "우세하게 결합"하는 것이다. 예를 들면, EDB 에피토프에 특이적으로 또는 우세하게 결합하는 항체는, 다른 EDB 에피토프 또는 비-EDB 에피토프에 결합하는 것에 비해 더 큰 친화도 및 결합력으로, 더욱 신속하게, 및/또는 더 긴 기간 동안 이러한 에피토프에 결합하는 항체이다.
용어 "결합 친화도" 또는 "KD"는 본원에 사용될 경우, 특별한 항원-항체 상호작용의 평행 해리 상수를 지칭하고자 한다. KD는 결합 속도 또는 "온-레이트(on-rate)" 또는 "ka"에 대한, "오프-레이트(off-rate)" 또는 "kd"로서도 지칭되는 해리 속도의 비이다. 이에 따라, KD는 kd/ka와 동일하고 몰 농도(M)로서 표현된다. KD가 작을 수록, 결합 친화도는 더 강해진다는 것이다. 그러므로, 1μΜ의 KD는 1nM의 KD에 비해 약한 결합 친화도를 지시한다. 항체의 KD 값은 당분야에서 확립된 방법을 사용하여 결정될 수 있다. 항체의 KD를 결정하기 위한 하나의 방법은 표면 플라스몬 공명, 전형적으로 바이오센서(biosensor) 시스템, 예컨대 비아코어(BIAcore: 등록상표) 시스템을 사용하여 이루어진다. 표적에 대한 리간드, 예컨대 항체의 결합 능력을 평가하기 위한 다른 표준 검정은 당분야에 공지되어 있고, 예를 들면, ELISA, 웨스턴 블롯, RIA, 및 유세포분석법이 포함된다.
"단리된 항체"는, 본원에 사용될 경우, 상이한 항원 특이성을 갖는 다른 항체가 실질적으로 존재하지 않는 항체를 지칭한다(예를 들어, EDB에 특이적으로 결합하는 단리된 항체에는 EDB 이외의 항원에 특이적으로 결합하는 항체가 실질적으로 존재하지 않는다). 게다가, 단리된 항체에는 다른 세포 물질 및/또는 화학물질이 실질적으로 존재하지 않을 수 있다. 또한, 이러한 정의로부터, 예를 들면, 제1 표적에 특이적으로 또는 우세하게 결합하는 항체(또는 작용부분 또는 에피토프)가 제2 표적에 특이적으로 또는 우세하게 결합하거나 결합하지 않을 수 있음을 또한 이해한다.
본 발명의 몇몇 양태에서, EDB ADC는 인간 EDB에 결합하기 위해 경쟁하고/하거나 본원에 기재된 항체, 또는 이의 항원-결합 단편과 동일한 에피토프에 결합하는 항체를 포함한다.
용어 "경쟁하는"은, 항체에 대하여 본원에 사용될 경우, 제1 항체, 또는 이의 항원-결합 단편이 제2 항체, 또는 이의 항원-결합 단편의 결합과 충분히 유사한 방식으로 에피토프에 결합하여, 제2 항체의 존재하에서의 제1 항체의 그의 동족 에피토프와의 결합 결과가 제2 항체의 부재하에서의 제1 항체의 결합과 비교하여 검출가능하게 감소됨을 의미한다. 제2 항체의 그의 에피토프로의 결합이 또한 제1 항체의 존재하에 검출가능하게 감소되는 다른 경우는 있을 수 있지만 반드시 그럴 필요는 없다. 즉, 제2 항체가 제1 항체의 그의 각각의 에피토프에 결합하는 것을 저해하지 않는 경우에도, 제1 항체는 그의 에피토프에 제2 항체가 결합하는 것을 저해할 수 있다. 그러나, 각각의 항체가 나머지 항체의 그의 동족 에피토프 또는 리간드와의 결합을 검출가능하게 저해하는 경우, 동일한 정도이거나, 더 큰 정도이거나, 더 작은 정도이거나 상관없이, 항체는 이들 개개의 에피토프(들)의 결합을 위해 서로 "교차-경쟁"하는 것으로 일컬어진다. 경쟁 및 교차-경쟁 항체는 본 발명에 의해 포괄된다. 이러한 경쟁 또는 교차-경쟁이 발생하는 기작(예를 들어, 입체 장해, 입체배좌 변화, 또는 공통 에피토프, 또는 이의 일부로의 결합)과 무관하게, 숙련가라면 본원에 제공된 교시에 기초하여, 이러한 경쟁 및/또는 교차-경쟁 항체가 포괄되고 본원에 개시된 방법을 위해 유용할 수 있음을 인식할 것이다.
본원에서 또한 "EDB-L19" 항체로서 지칭되는 "L19" 항체는 EDB에 결합하는 인간 항체이다. L19 항체는 PCT 국제 특허출원 공개공보 제W01997/045544호, 제WO1999/058570호 및 제WO2001/062800호(이는 본원에 참고로 그의 전체가 인용됨)에 개시되고 특징지워 졌고, L19-EDB 서열은 본원에서 표 2에 제공된다(서열 번호 1-16).
본 발명의 몇몇 양태에서, EDB ADC를 제조하기 위해 사용되는 항체는 단일클론성 항체일 수 있다. 용어 "단일클론성 항체" 또는 "mAb"는 실질적으로 동종성인 항체의 개체군으로부터 수득되는 항체를 지칭하고, 즉, 개체군을 구성하는 개별 항체는 소량으로 존재할 수 있는 가능한 자연-발생 돌연변이를 제외하고는 동일하다. 단일클론성 항체는 매우 특이적이고 단일한 항원 자리에 대해 인도된다. 더욱이, 전형적으로 상이한 결정자(에피토프)에 대해 인도되는 상이한 항체를 포함하는 다중클론성 항체 제조물과는 대조적으로, 각각의 단일클론성 항체는 항원 상의 단일한 결정자에 대해 인도된다. 한정어 "단일클론성"은 항체의 실절적으로 동종성인 개체군으로부터 수득된 항체의 특징을 지시하고, 이는 임의의 특별한 방법에 의해 항체를 생산할 필요가 있는 것으로 해석되지 않아야 한다.
본 발명의 몇몇 양태에서, 본 발명의 ADC를 제조하기 위해 사용되는 항체는 1가일 수 있고, 즉, 분자 1개 당 1개의 항원 결합 자리를 갖는다(예를 들어, IgG 또는 Fab). 몇몇 경우에, 1가 항체는 1개 보다 더 많은 항원 결합 자리를 가질 수 있지만, 그러한 결합 자리는 상이한 항원으로부터이다. 본 발명의 몇몇 양태에서, 본 발명의 ADC의 항체, 또는 이의 항원-결합 단편은 "2가 항체"를 포함할 수 있고, 즉, 이는 분자 1개 당 2개의 항원 결합 자리를 갖는다(예를 들어, IgG). 몇몇 경우에, 2개의 결합 자리는 동일한 항원 특이성을 갖는다. 다르게는, 2가 항체는 이중특이성일 수 있다. "이중특이성," "2중-특이적" 또는 "2작용성" 항체는 2개의 상이한 항원 결합 자리를 갖는 잡종(hybrid) 항체이다. 이중특이성 항체의 2개의 항원 결합 자리는 2개의 상이한 에피토프에 결합하고, 이는 동일하거나 상이한 단백질 표적 상에 위치할 수 있다.
용어 "키메라성 항체"는 가변성 영역 서열의 일부 또는 전부가 하나의 종으로부터 유래되고 불변성 영역 서열이 또 다른 종으로부터 유래되는 항체를 지칭하고자 하고, 예컨대 가변성 영역 서열이 마우스 항체로부터 유래되고 불변성 영역 서열이 인간 항체로부터 유래되는 항체이다.
본원에 사용될 경우, "인간화된" 또는 "CDR 이식된(grafted)" 항체는 비-인간 면역글로불린으로부터 유래된 최소한의 서열을 함유하는 키메라성 면역글로불린, 면역글로불린 쇄, 또는 이의 단편[예컨대 Fv, Fab, Fab', F(ab')2 또는 항체의 다른 항원 결합 하위서열]인 비-인간(예를 들어 뮤린) 항체의 형태를 지칭한다. 바람직하게는, 인간화된 항체는 수여자의 하나 이상의 CDR로부터의 잔기가 원하는 특이성, 친화도, 및 수용력을 갖는 비-인간 종(공여자 항체), 예컨대 마우스, 래트, 또는 토끼의 하나 이상의 CDR로부터의 잔기에 의해 대체되는 인간 면역글로불린(수여자 항체)이다.
본 발명의 항체는 당분야에 공지된 기법, 예를 들어, 재조합 기술, 파아지 디스플레이 기술, 합성 기술 또는 이러한 기술의 조합 또는 당분야에 잘 알려진 다른 기술을 사용하여 생산될 수 있다[예를 들면, 자야세나(Jayasena, S.D.)의 문헌 "Clin. Chem., 45: 1628-50 (1999)" 및 펠라우스(Fellouse, F.A.) 등의 문헌 "J. Mol. Biol., 373(4): 924-40 (2007)" 참조]. 추가적인 안내는 샘브룩(Sambrook J.) 및 러셀(Russell D.)의 문헌[Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (2000)]; 어수벨(Ausubel) 등의 문헌[Short Protocols in Molecular Biology: A Compendium of Methods from Current Protocols in Molecular Biology, Wiley, John & Sons, Inc. (2002)]; 할로우(Harlow) 및 래인(Lane)의 문헌[Using Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1998)]; 및 콜리간(Coligan) 등의 문헌[Short Protocols in Protein Science, Wley, John & Sons, Inc. (2003)]에서 찾아볼 수 있다.
본 발명의 ADC를 제조하기 위해 사용되는 항체의 중쇄 및 경쇄를 인코딩하는 핵산은 발현 또는 증식을 위해 벡터내로 클로닝될 수 있다. 관심있는 항체를 인코딩하는 서열은 숙주 세포에서 벡터내에 유지될 수 있고, 이어서 숙주 세포는 팽창되고 미래의 사용을 위해 동결될 수 있다. 세포 배양액에서의 재조합 단일클론성 항체의 생산은 당분야에 공지된 수단에 의해 B 세포로부터 항체 유전자의 클로닝을 통해 실행될 수 있다. 예를 들어 틸러(Tiller) 등의 문헌[J. Immunol. Methods 329: 112-124, 2008]; 미국 특허 제7,314,622호를 참조한다.
본원에 사용될 경우, 용어 "벡터"는 숙주 세포에서 관심있는 하나 이상의 유전자(들) 또는 서열(들)을 전달하고, 바람직하게는 발현할 수 있는 작성물을 지칭한다. 벡터의 예로는, 제한되지 않지만, 바이러스성 벡터, 네이키드(naked) DNA 또는 RNA 발현 벡터, 플라스미드, 코스미드(cosmid) 또는 파아지 벡터, 양이온성 축합제에 의해 결합된 DNA 또는 RNA 발현 벡터, 리포솜에 캡슐화된 DNA 또는 RNA 발현 벡터, 및 특정 진핵 세포, 예컨대 생산자 세포가 포함된다.
본원에 사용될 경우, 용어 "숙주 세포"는 폴리뉴클레오티드 삽입물의 혼입을 위한 벡터(들)에 대한 수여자일 수 있거나 수여자인 개별 세포 또는 세포 배양액을 포함한다. 숙주 세포는 단일 숙주 세포의 자손을 포함하고, 이러한 자손은 자연적, 우연적, 또는 고의적 돌연변이에 기인하여 본래의 모 세포에 대해 완전히 동일(형태 또는 게놈 DNA 보체에 있어서)해야할 필요는 없다. 숙주 세포는 본 발명의 폴리뉴클레오티드(들)에 의해 생체내 형질감염된 세포를 포함한다.
당분야에 공지된 바와 같이, "폴리뉴클레오티드," "핵산/뉴클레오티드," 및 "올리고뉴클레오티드"는 본원에서 상호교환적으로 사용되고, 임의의 길이의 뉴클레오티드의 중합체 형태, 데옥시리보뉴클레오티드 또는 리보뉴클레오티드, 이의 유사체, 또는 DNA 또는 RNA 폴리머라아제(polymerase)에 의해 쇄내로 혼입될 수 있는 임의의 기질을 포함한다. 폴리뉴클레오티드는 임의의 3차원 구조를 가질 수 있고, 공지되거나 공지되지 않은 임의의 기능을 수행할 수 있다. 폴리뉴클레오티드는 자연-발생되거나, 합성되거나, 재조합되거나, 이들이 임의로 조합될 수 있다.
본 발명에서 논의된 모든 중쇄 불변성 영역 아미노산 위치에 대하여, 넘버링은 서열화된 최초의 인간 IgG1인 골수종 단백질 Eu의 아미노산 서열을 설명하는, 에델만(Edelman) 등의 문헌[1969, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 63(1): 78-85]에 최초로 기재된 Eu 색인을 따른다 에델만 등의 Eu 색인은 또한 카밧 등의 문헌[1991, Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed., United States Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda]에 제시된다. 이에 따라, "카밧에 제시된 바와 같은 EU 색인" 또는 "카밧의 EU 색인"은 카밧의 문헌(1991)에 제시된 바와 같은, 에델만 등의 인간 IgG1 Eu 항체에 기초한 잔기 넘버링 시스템을 지칭한다.
경쇄 불변성 영역 아미노산 서열에 대해 사용된 넘버링 시스템은 카밧의 문헌(1991)에 제시된 것이다.
본 발명의 EDB ADC는 종래의 시스테인 기술 또는 자리-특이적 접합 기술을 사용하여 약물/페이로드에 접합될 수 있다. 조작된 시스테인을 통한 자리-특이적 접합을 수용하기 위해, 불변성 도메인은 하나 이상의 특정 자리에서 조작된 반응성 시스테인 잔기를 제공하도록 변형될 수 있다(때때로 "Cys" 돌연변이체로서 지칭됨). 트랜스글루타미나아제(transglutaminase)-기반의 접합을 통한 자리-특이적 접합을 수용하기 위해, 아실 공여체 글루타민-함유("Q") 태그 또는 내생성 글루타민은 트랜스글루타미나아제 및 아민의 존재하에 폴리펩티드 조작에 의해 반응성이 된다.
본 발명은 비-면역원성 항체의 생성에 의해 L19-EDB 항체의 최적화를 제공한다. 몇몇 양태에서, 위치 356에서 아스파르트산(D) 및 위치 358에서 로이신(L)을 갖는 G1m(a) 알로타입을 포함하는 L19-EDB 인간 IgG1 불변성 영역은, 위치 356에서 글루탐산(E) 및 위치 358에서 메티오닌(M)을 갖는 비-G1m(a) 알로타입에 의해 치환될 수 있다(카밧의 EU 색인의 넘버링에 따름).
추가로, 잠재적인 화학적 부담 및 추정적 단백질 당화반응(glycation) 자리에 결합하는 항원을 감소시키기 위해, 본 발명의 항-EDB 항체는 위치 94(카밧의 EU 색인의 넘버링에 따름)에서 라이신(K)의 아르기닌(R)으로의 돌연변이, 예를 들어 (K94R)을 포함하는 중쇄 가변성 영역을 가질 수 있다.
조작된 시스테인을 통한 자리-특이적 접합의 경우, 항-EDB 항체 중쇄 불변성 도메인은 카밧의 EU 색인의 넘버링에 따라서 위치 290에서의 반응성의 조작된 시스테인 잔기(K290C)를 포함할 수 있다. 추가적인 시스테인 치환이 도입될 수 있다. 또 다른 양태에서, 항-EDB 항체 경쇄 불변성 도메인은 카밧의 넘버링에 따라서 위치 183에서의 반응성의 조작된 시스테인 잔기(κK183C)를 포함할 수 있다. 추가적인 시스테인 치환이 도입될 수 있다.
조작된 글루타민 잔기를 통한 자리-특이적 접합의 경우, 항-EDB 항체 중쇄 불변성 도메인은 조작된 H16-글루타민-함유 태그 LLQG(서열 번호 40)를 포함할 수 있다. 추가로, 이러한 자리-특이적 접합을 최적화하기 위해, 중쇄 상에서 위치 222(카밧의 EU 색인에 따름)에서의 라이신(K) 아미노산은 아르기닌(R)에 의해 치환될 수 있고, 예를 들어 (K222R)이다.
아미노산 변형은 당분야에 공지된 임의의 방법에 의해 이루어질 수 있고, 많은 이러한 방법은 당분야의 숙련가에게 잘 알려져 있고 일상적이며, 예를 들어 돌연변이, 치환, 결실, 및/또는 부가이다. 예를 들면, 제한하는 것은 아니지만, 아미노산 치환, 결실 및 삽입은 임의의 공지된 PCR-기반의 기법을 사용하여 달성될 수 있다. 아미노산 치환은 자리-지정 돌연변이생성에 의해 이루어질 수 있다[예를 들면, 졸러(Zoller) 및 스미쓰(Smith)의 문헌 "1982, Nucl. Acids Res. 10: 6487-6500"; 및 쿤켈(Kunkel)의 문헌 "1985, PNAS 82:488" 참조].
본 발명의 몇몇 양태에서, EDB ADC는 본원에 개시된 임의의 중쇄 또는 경쇄에 대해 적어도 90%, 95%, 98%, 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 및/또는 경쇄를 갖는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편을 포함한다. 변경된 잔기는 항체의 가변성 영역 또는 불변성 영역에 존재할 수 있다. 몇몇 양태에서, 본원에 개시된 임의의 중쇄 또는 경쇄와 비교하여 단지 1, 2, 3, 4 또는 5개의 변경된 잔기가 존재한다.
아미노산 서열과 관련하여 용어 "동일성 퍼센트(percent identical)"는 최대 상응을 위해 정렬될 경우 동일한 2개의 서열에서의 잔기의 수를 의미한다. 아미노산 동일성 퍼센트를 측정하기 위해 사용될 수 있는 당분야에 공지된 다수의 알고리즘이 존재한다[즉, 베이직 로컬 얼라인먼트 투울(Basic Local Alignment Tool) 또는 블라스트(BLAST: 등록상표)]. 달리 명시되지 않는 한, 특별한 프로그램 또는 알고리즘에 대한 디폴트(default) 매개변수가 사용된다.
EDB ADC의 제조에 사용하기 위해, 본원에 기재된 항체는 실질적으로 순수하고, 즉, 적어도 50% 순수하고(즉, 오염물질이 없음), 더욱 바람직하게는, 적어도 90% 순수하며, 더욱 바람직하게는, 적어도 95% 순수하고, 더 더욱 바람직하게는, 적어도 98% 순수하며, 가장 바람직하게는, 적어도 99% 순수하다.
표 2 및 3은 본 발명의 항-EDB 항체의 아미노산(단백질) 서열 및 연관된 핵산(DNA) 서열을 제공한다. CDR은 카밧 및 코티아에 의해 정의된 바와 같다. 음영처리된 잔기는 항체 최적화에 관련된 아미노산 돌연변이, 치환 및/또는 삽입을 식별하고, 밑줄쳐진 잔기는 자리-특이적 접합 기술에 관련된 아미노산 돌연변이, 치환 및/또는 삽입을 식별한다.
Figure 112019049414387-pct00003
Figure 112019049414387-pct00004
Figure 112019049414387-pct00005
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Figure 112019049414387-pct00007
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본 발명의 몇몇 양태에서, EDB ADC는 피브로넥틴(FN)의 엑스트라 도메인 B(EDB)에 결합하는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편을 포함한다.
본 발명의 몇몇 양태에서, 본 발명의 항체, 또는 이의 항원 결합 단편은 중쇄 가변성 영역(VH) 및 경쇄 가변성 영역(VL)을 갖고, 여기서 VH는 서열 번호 3, 5 및 7을 포함하는 3개의 CDR을 갖는다. 본 발명의 몇몇 양태에서, 항체, 또는 이의 항원 결합 단편은 중쇄 가변성 영역(VH) 및 경쇄 가변성 영역(VL)을 갖고, 여기서 VL은 서열 번호 12, 13 및 14를 포함하는 3개의 CDR을 갖는다. 항체, 또는 이의 항원-결합 단편은, 서열 번호 3, 5 및 7을 포함하는 3개의 CDR을 갖는 VH; 및 서열 번호 12, 13 및 14를 포함하는 3개의 CDR을 갖는 VL을 가질 수 있다.
또 다른 양태에서, 본 발명의 항체, 또는 이의 항원 결합 단편은, 서열 번호 3의 VH CDR1, 서열 번호 5의 VH CDR2 및 서열 번호 7의 VH CDR3 (카밧에 따름), 또는 서열 번호 4의 VH CDR1, 서열 번호 6의 VH CDR2 및 서열 번호 7의 VH CDR3 (코티아에 따름), 또는 서열 번호 3 또는 4의 VH CDR1, 서열 번호 5 또는 6의 VH CDR2 및 서열 번호 7의 VH CDR3을 포함하는 중쇄 가변성 영역(VH)을 가질 수 있다. 또 다른 양태에서, 항체, 또는 이의 항원 결합 단편은, 서열 번호 12의 VL CDR1, 서열 번호 13의 VL CDR2 및 서열 번호 14의 VL CDR3을 포함하는 경쇄 가변성 영역(VL)을 가질 수 있다(카밧 및 코티아에 따름). 추가의 양태에서, 항체, 또는 이의 항원 결합 단편은, 서열 번호 3 또는 4의 VH CDR1, 서열 번호 5 또는 6의 VH CDR2 및 서열 번호 7의 VH CDR3 및 서열 번호 12의 VL CDR1, 서열 번호 13의 VL CDR2 및 서열 번호 14의 VL CDR3을 가질 수 있다.
본 발명의 몇몇 양태에서, 항체, 또는 이의 항원-결합 단편은, 서열 번호 1 또는 21을 포함하는 중쇄 가변성 영역 및/또는 서열 번호 10을 포함하는 경쇄 가변성 영역을 가질 수 있다. 항체, 또는 이의 항원-결합 단편은: 서열 번호 1에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 가변성 영역, 및 서열 번호 10에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄 가변성 영역; 서열 번호 21에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 가변성 영역 및 서열 번호 10에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄 가변성 영역; 서열 번호 1을 포함하는 중쇄 가변성 영역 및 서열 번호 10을 포함하는 경쇄 가변성 영역; 또는 서열 번호 21을 포함하는 중쇄 가변성 영역 및 서열 번호 10을 포함하는 경쇄 가변성 영역을 포함할 수 있다.
본 발명의 또 다른 양태에서, 항체, 또는 이의 항원-결합 단편은, 서열 번호 8, 17, 19, 23, 25, 27 및 29중 임의의 하나를 포함하는 중쇄, 및/또는 서열 번호 15 또는 31을 포함하는 경쇄를 가질 수 있다.
본 발명의 항체, 또는 이의 항원-결합 단편은: 서열 번호 8에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열 번호 15에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄; 서열 번호 8에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열 번호 31에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄; 서열 번호 17에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열 번호 15에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄; 서열 번호 17에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열 번호 31에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄; 서열 번호 19에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열 번호 15에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄; 서열 번호 19에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열 번호 31에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄; 서열 번호 23에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열 번호 15에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄; 서열 번호 23에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열 번호 31에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄; 서열 번호 25에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열 번호 15에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄; 서열 번호 25에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열 번호 31에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄; 서열 번호 27에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열 번호 15에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄; 서열 번호 27에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열 번호 31에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄; 또는 서열 번호 29에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 중쇄 및 서열 번호 15에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는 경쇄를 포함할 수 있다.
본 발명의 항체, 또는 이의 항원-결합 단편은: 서열 번호 8을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 8을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 17을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 17을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 19를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 19를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 23을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 23을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 25를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 25를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 27을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 27을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 29를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 또는 서열 번호 29를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄를 포함할 수 있다.
항-EDB 항체 중쇄 및 경쇄 가변성 영역을 인코딩하는 대표적인 DNA는 각각 서열 번호 2 및 22 및 서열 번호 11을 포함한다. 항-EDB 항체 중쇄 및 경쇄를 인코딩하는 대표적인 DNA는 각각 서열 번호 9, 18, 20, 24, 26, 28 및 30, 및 서열 번호 16 및 32를 포함한다.
Figure 112019049414387-pct00009
약물
개시된 EDB ADC의 제조시에 유용한 약물로는 생물학적 또는 검출가능한 활성을 갖는 임의의 물질을 포함하고, 예를 들면, 치료제, 검출가능한 표지, 결합제 등, 및 생체내에서 활성제로 대사되는 전구약물이다. 약물은 또한 약물 유도체일 수 있고, 여기서 약물은 본 발명의 항체와의 접합을 가능하게 하도록 작용화될 수 있다.
치료제는 암 세포 또는 활성화된 면역 세포에 대해 세포독성, 세포정지, 및/또는 면역조절 효과를 부과하는 제제이다. 치료제의 예로는 세포독성제, 화학치료제, 세포정지제, 및 면역조절제가 포함된다. 세포독성 효과는 표적 세포(들)의 고갈, 제거 및/또는 살해를 지칭한다. 세포독성제는 세포에 대해 세포독성 및/또는 세포정지 효과를 갖는 제제를 지칭한다. 세포정지 효과는 세포 증식의 저해를 지칭한다. 세포정지제는 세포에 대해 세포정지 효과를 가짐으로써, 특정 하위집단의 세포의 성장 및/또는 확장을 저해하는 제제를 지칭한다. 화학치료제는 암의 치료에 유용한 화학적 화합물인 제제를 지칭한다. 면역조절제는 사이토킨(cytokine) 및/또는 항체의 생산 및/또는 T 세포 기능의 조절을 통해 면역 반응을 자극시킴으로써 직접적으로 또는 간접적으로(또 다른 제제가 더욱 효과적이도록 허용함으로써) 세포(즉, 종양 세포)의 하위집단의 성장을 저해하거나 감소시키는 제제를 지칭한다.
몇몇 양태에서 약물은 막 투과성 약물이다. 이러한 양태에서, 페이로드는 방관자 효과를 이끌어낼 수 있고, 여기서 EDB+ FN을 발현하지 않거나 이들의 표면에 결합된 EDB+ FN을 가질 수 있지만, ADC에 의해 결합된 세포를 둘러싼 세포는 세포 투과성 페이로드에 의해 살해된다. 이는 페이로드가 항체로부터 방출되고(즉, 분할가능한 연결기의 분할에 의해) 세포 막을 통과할 경우 발생하고, 확산시, 주변의 세포 살해를 유도한다.
개시된 방법에 따라서, (a) EDB에 결합하는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편; (b) 연결기 및 (c) 약물을 갖는 EDB ADC가 생산 또는 생성될 수 있다. 약물-대-항체 비(DAR), 또는 약물 적재량은 항체 1개 당 접합된 약물 분자의 수를 지시한다. 다수 종의 ADC의 조성물, 배치(batch), 및/또는 제형은 평균 DAR에 의해 특징지워진다. DAR 및 평균 DAR은 다양한 종래의 수단, 예컨대 UV 분광법, 질량 분광법, ELISA 검정, 방사선계측 방법, 소수성 상호작용 크로마토그래피(HIC: hydrophobic interaction chromatography), 전기영동 및 HPLC에 의해 결정될 수 있다.
본 발명의 양태에서, EDB ADC는 DAR이 1이거나, DAR이 2이거나, DAR이 3이거나, DAR이 4이거나, DAR이 5이거나, DAR이 6이거나, DAR이 7이거나, DAR이 8이거나, DAR이 9이거나, DAR이 10이거나, DAR이 11이거나, DAR이 12이거나, 또는 DAR이 12를 초과한다. 본 발명의 양태에서, EDB ADC는 1개의 약물 분자, 또는 2개의 약물 분자, 또는 3개의 약물 분자, 또는 4개의 약물 분자, 또는 5개의 약물 분자, 또는 6개의 약물 분자, 또는 7개의 약물 분자, 또는 8개의 약물 분자, 또는 9개의 약물 분자, 또는 10개의 약물 분자, 또는 11개의 약물 분자, 또는 12개의 약물 분자 또는 12개 초과의 분자를 가질 수 있다.
본 발명의 양태에서, EDB ADC는 평균 DAR이 약 2 내지 약 4의 범위이거나, 또는 평균 DAR이 약 3 내지 약 5의 범위이거나, 또는 평균 DAR이 약 4 내지 약 6의 범위이거나, 또는 평균 DAR이 약 5 내지 약 7의 범위이거나, 또는 평균 DAR이 약 6 내지 약 8의 범위이거나, 또는 평균 DAR이 약 7 내지 약 9의 범위이거나, 또는 평균 DAR이 약 8 내지 약 10의 범위이거나, 또는 평균 DAR이 약 9 내지 약 11의 범위이거나, 또는 평균 DAR이 약 10 내지 약 12의 범위 등일 수 있다. 몇몇 양태에서 EDB ADC의 조성물, 배치 및/또는 제형은 평균 DAR이 약 1이거나, 또는 평균 DAR이 약 2이거나, 평균 DAR이 약 3이거나, 또는 평균 DAR이 약 4이거나, 또는 평균 DAR이 약 5이거나, 또는 평균 DAR이 약 6이거나, 또는 평균 DAR이 약 7이거나, 또는 평균 DAR이 약 8이거나, 또는 평균 DAR이 약 9이거나, 또는 평균 DAR이 약 10이거나, 또는 평균 DAR이 약 11이거나, 또는 평균 DAR이 약 12이거나, 또는 평균 DAR이 12를 초과할 수 있다. 평균 DAR의 전술된 범위에서 사용될 경우, 용어 "약"은 +/- 0.5%를 의미한다.
EDB ADC의 조성물, 배치, 및/또는 제형은 바람직한 범위의 평균 DAR, 예를 들어, 약 3 내지 약 5 범위의 평균 DAR, 약 3 내지 약 4 범위의 평균 DAR, 또는 약 4 내지 약 5 범위의 평균 DAR을 특징으로 할 수 있다. 추가로, EDB ADC의 조성물, 배치, 및/또는 제형은 바람직한 범위의 평균 DAR, 예를 들어, 3 내지 5 범위의 평균 DAR, 3 내지 4 범위의 평균 DAR, 또는 4 내지 5 범위의 평균 DAR을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 몇몇 양태에서, EDB ADC의 조성물, 배치, 및/또는 제형은 평균 DAR이 약 1.0이거나, 또는 평균 DAR이 1.0이거나, 또는 평균 DAR이 1.1이거나, 또는 평균 DAR이 1.2이거나, 또는 평균 DAR이 1.3이거나, 또는 평균 DAR이 1.4이거나, 또는 평균 DAR이 1.5이거나, 또는 평균 DAR이 1.6이거나, 또는 평균 DAR이 1.7이거나, 또는 평균 DAR이 1.8이거나, 또는 평균 DAR이 1.9임을 특징으로 할 수 있다. 또 다른 양태에서, EDB ADC의 조성물, 배치, 및/또는 제형은 평균 DAR이 약 2.0이거나, 또는 평균 DAR이 2.0이거나, 또는 평균 DAR이 2.1이거나, 또는 평균 DAR이 2.2이거나, 또는 평균 DAR이 2.3이거나, 또는 평균 DAR이 2.4이거나, 또는 평균 DAR이 2.5이거나, 또는 평균 DAR이 2.6이거나, 또는 평균 DAR이 2.7이거나, 또는 평균 DAR이 2.8이거나, 또는 평균 DAR이 2.9임을 특징으로 할 수 있다. 또 다른 양태에서, EDB ADC의 조성물, 배치, 및/또는 제형은 평균 DAR이 약 3.0이거나, 또는 평균 DAR이 3.0이거나, 또는 평균 DAR이 3.1이거나, 또는 평균 DAR이 3.2이거나, 또는 평균 DAR이 3.3이거나, 또는 평균 DAR이 3.4이거나, 또는 평균 DAR이 3.5이거나, 또는 평균 DAR이 3.6이거나, 또는 평균 DAR이 3.7이거나, 또는 평균 DAR이 3.8이거나, 또는 평균 DAR이 3.9임을 특징으로 할 수 있다. 또 다른 양태에서, EDB ADC의 조성물, 배치, 및/또는 제형은 평균 DAR이 약 4.0이거나, 또는 평균 DAR이 4.0이거나, 또는 평균 DAR이 4.1이거나, 또는 평균 DAR이 4.2이거나, 또는 평균 DAR이 4.3이거나, 또는 평균 DAR이 4.4이거나, 또는 평균 DAR이 4.5이거나, 또는 평균 DAR이 4.6이거나, 또는 평균 DAR이 4.7이거나, 또는 평균 DAR이 4.8이거나, 또는 평균 DAR이 4.9이거나, 또는 평균 DAR이 5.0임을 특징으로 할 수 있다.
또 다른 양태에서, EDB ADC의 조성물, 배치, 및/또는 제형은 평균 DAR이 12 이하, 평균 DAR이 11 이하, 평균 DAR이 10 이하, 평균 DAR이 9 이하, 평균 DAR이 8 이하, 평균 DAR이 7 이하, 평균 DAR이 6 이하, 평균 DAR이 5 이하, 평균 DAR이 4 이하, 평균 DAR이 3 이하, 평균 DAR이 2 이하 또는 평균 DAR이 1 이하임을 특징으로 할 수 있다.
다른 양태에서, EDB ADC의 조성물, 배치, 및/또는 제형은 평균 DAR이 11.5 이하, 평균 DAR이 10.5 이하, 평균 DAR이 9.5 이하, 평균 DAR이 8.5 이하, 평균 DAR이 7.5 이하, 평균 DAR이 6.5 이하, 평균 DAR이 5.5 이하, 평균 DAR이 4.5 이하, 평균 DAR이 3.5 이하, 평균 DAR이 2.5 이하, 평균 DAR이 1.5 이하임을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 몇몇 양태에서, 시스테인 잔기을 통한 종래의 접합을 위한 방법 및 본원에 개시된 정제 조건은 최적화된 평균 DAR이 약 3 내지 5의 범위, 바람직하게는 약 4인 EDB ADC의 조성물, 배치, 및/또는 제형을 제공한다.
본 발명의 몇몇 양태에서, 조작된 시스테인 잔기를 통한 자리-특이적 접합을 위한 방법 및 본원에 개시된 정제 조건은 최적화된 평균 DAR이 약 3 내지 5의 범위, 바람직하게는 약 4인 EDB ADC의 조성물, 배치, 및/또는 제형을 제공한다.
본 발명의 몇몇 양태에서, 트랜스글루타미나아제-기반의 접합을 통한 자리-특이적 접합을 위한 방법 및 본원에 개시된 정제 조건은 최적화된 평균 DAR이 약 1 내지 3의 범위, 바람직하게는 약 2인 EDB ADC의 조성물, 배치, 및/또는 제형을 제공한다.
세포독성제의 예로는, 제한되지 않지만 안트라사이클린(anthracycline), 아우리스타틴, CC-1065, 돌라스타틴(dolastatin), 두오카르마이신(duocarmycin), 에네디인(enediyne), 겔다나마이신(geldanamycin), 메이탄신(maytansine), 퓨로마이신(puromycin), 탁산(taxane), 빈카 알칼로이드(vinca alkaloid), SN-38, 튜불라이신(tubulysin), 헤미아스테르린(hemiasterlin), 및 입체이성체, 등배전자체, 이의 유사체 또는 유도체가 포함된다. 식물 독소, 기타 생물활성 단백질, 효소(즉, ADEPT), 방사선동위원소, 감광제[즉, 광역동 치료법(photodynamic therapy)을 위함]가 또한 사용될 수 있다.
안트라사이클린은 박테리아 스트렙토미세스(Streptomyces)로부터 유래되고 광범위한 암, 예컨대 백혈병, 림프종, 유방암, 자궁암, 난소암, 및 폐암을 치료하기 위해 사용되고 있다. 예시적인 안트라사이클린으로는, 제한되지 않지만, 다우노루비신, 독소루비신[즉, 아드리아마이신(adriamycin)], 에피루비신(epirubicin), 이다루비신(idarubicin), 발루비신(valrubicin), 및 미톡산트론(mitoxantrone)이 포함된다.
돌라스타틴 및 이들의 펩티드 유사체 및 유도체, 아우리스타틴은 항암 및 항곰팡이 활성을 갖는 것으로 제시된 매우 강력한 항유사분열제(antimitotic agent)이다. 예를 들어, 미국 특허 제5,663,149호 및 페티트(Pettit) 등의 문헌[Antimicrob. Agents Chemother. 42: 2961-2965, (1998)]을 참조한다. 예시적인 돌라스타틴 및 아우리스타틴으로는, 제한되지 않지만, 돌라스타틴 10, 아우리스타틴 E, 아우리스타틴 EB(AEB), 아우리스타틴 EFP(AEFP), MMAD(모노메틸 아우리스타틴 D 또는 모노메틸 돌라스타틴 10), MMAF(모노메틸 아우리스타틴 F 또는 N-메틸발린-발린-돌라이소로이신-돌라프롤린-페닐알라닌), MMAE(모노메틸 아우리스타틴 E 또는 N-메틸발린-발린-돌라이소로이신-돌라프롤린-노르에페드린), 5-벤조일발레르산-AE 에스테르(AEVB). 및 다른 신규 화합물이 포함된다.
몇몇 양태에서, 약물/페이로드는 아우리스타틴이다. 아우리스타틴은 튜불린(tubulin) 중합의 저해를 통해 유사분열 동안 미세소관의 형성을 저해함으로써 세포 증식을 저해한다. PCT 국제 특허출원 공개공보 제WO 2013/072813호(이는 본원에 참고로 그의 전체가 인용됨)는, 본 발명의 EDB ADC에 유용한 아우리스타틴을 개시하고, 아우리스타틴의 제조 방법을 제공한다. 예를 들면, 하기 화학식 1을 갖는 페이로드 0101, 하기 화학식 2를 갖는 페이로드 1569, 하기 화학식 3을 갖는 페이로드 9411, 하기 화학식 4를 갖는 페이로드 4574, 하기 화학식 5를 갖는 페이로드 DM1, 및 하기 화학식 6을 갖는 페이로드 세마도틴(Cemadotin)이 있다:
[화학식 1]
Figure 112019049414387-pct00010
[화학식 2]
Figure 112019049414387-pct00011
[화학식 3]
Figure 112019049414387-pct00012
[화학식 4]
Figure 112019049414387-pct00013
[화학식 5]
Figure 112019049414387-pct00014
[화학식 6]
Figure 112019049414387-pct00015
두오카르마이신 및 CC-1065는 세포독성 효능을 갖는 DNA 알킬화제로서 작용하는 CPI-기제의 단량체이다. 보거(Boger) 및 존슨(Johnson)의 문헌[PNAS 92: 3642-3649, 1995]을 참조한다. 예시적인 돌라스타틴으로는, 제한되지 않지만, (+)-두오카르마이신 A 및 (+)-두오카르마이신 SA, 및 (+)-CC-1065가 포함된다.
몇몇 양태에서, 약물/페이로드는 CPI 또는 CBI 이합체이다. CPI 이합체는 스트랜드간의 DNA 가교결합 및 강력한 세포독성을 유도한다. PCT 국제 특허출원 공개공보 제WO2015/110935호(이는 본원에 참고로 그의 전체가 인용됨)는, 본 발명의 EDB ADC에서 유용한 CPI 및 CBI 이합체를 개시하고, CPI 및 CBI 이합체를 생산하는 방법을 제공한다. 예를 들면, 하기 화학식 7을 갖는 페이로드 CPI-8314 이합체, 및 하기 화학식 8을 갖는 페이로드 CPI-0326이 있다:
[화학식 7]
Figure 112019049414387-pct00016
[화학식 8]
Figure 112019049414387-pct00017
에네디인은 9-원 및 10-원 고리 또는 접합된 3중-2중-3중 결합의 환형 시스템의 존재를 특징으로 하는 항-종양 박테리아 생성물의 한 부류이다. 예시적인 에네디인으로는, 제한되지 않지만, 칼리케아미신(calicheamicin), 에스페라미신(esperamicin), 및 다이네미신(dynemicin)이 포함된다. 또한 LL-E33288 착체로서 지칭되는 칼리케아미신, 예를 들면, β-칼리케아미신, γ-칼리케아미신 또는 N-아세틸-γ-칼리케아미신(감마-칼리케아미신(γ1))은, 본래 토양 유기체 미크로모노스포라 에키노스포라 아종 칼리켄시스(Micromonospora echinospora ssp. calichensis)로부터의 천연 생성물로서 단리된 에네디인 항생제이고[자인(Zein) 등의 문헌 "Science 27; 240(4856): 1198-1201, 1988"]; 이는 2중-가닥 DNA 파괴를 일으키고, 후속적으로 표적 세포에서 세포자멸(apoptosis)을 유도한다[자인(Zein) 등의 문헌 "Science 27; 240(4856): 1198-1201, 1988"; 니콜라우(Nicolaou) 등의 문헌 "Chem. Biol. Sep; 1(1): 57-66, 1994"; 프로코프(Prokop) 등의 문헌 "Oncogene 22: 9107-9120, 2003"]. 디설파이드 유사체는 N-아세틸-γ-칼리케아미신 디메틸 하이드라자이드이다.
겔다나마이신은 Hsp90(열 충격 단백질 90)에 결합하는 벤조퀴논 안사마이신(ansamycin) 항생제이고, 항종양 약물로서 사용되고 있다. 예시적인 겔다나마이신으로는, 제한되지 않지만, 17-AAG(17-N-알릴아미노-17-데메톡시겔다나마이신) 및 17-DMAG(17-디메틸아미노에틸아미노-17-데메톡시겔다나마이신)가 포함된다.
메이탄신 또는 이들의 유도체 메이탄시노이드(maytansinoid)는 튜불린의 중합의 저해를 통해 유사분열 동안에 미세소관 형성을 저해함으로써 세포 증식을 저해한다. 레밀라드(Remillard) 등의 문헌[Science 189: 1002-1005, 1975]을 참조한다. 예시적인 메이탄신 및 메이탄시노이드로는, 제한되지 않지만, 메르탄신(mertansine)(DM1) 및 그의 유도체 뿐만 아니라 안사미토신(ansamitocin)이 포함된다.
탁산은 항-튜불린제 또는 유사분열 저해제로서 작용하는 디터펜(diterpenes)이다. 예시적인 탁산으로는, 제한되지 않지만, 파클리탁셀(paclitaxel)[예를 들어, 탁솔(TAXOL: 등록상표)] 및 도세탁셀(docetaxel)[탁소테레(TAXOTERE: 등록상표)]이 포함된다.
빈카 알칼로이드는 또한 항-튜불린제이다. 예시적인 빈카 알칼로이드로는, 제한되지 않지만, 빈크리스틴(vincristine), 빈블라스틴(vinblastine), 빈데신(vindesine), 및 비노렐빈(vinorelbine)이 포함된다.
본 발명의 몇몇 양태에서, 제제는 면역조절제이다. 면역조절제의 예로는, 제한되지 않지만, 간사이클로비에르(gancyclovier), 에타네르셉트(etanercept), 타크롤리무스(tacrolimus), 시롤리무스(sirolimus), 보클로스포린(voclosporin), 사이클로스포린(cyclosporine), 라파마이신(rapamycin), 사이클로포스파미드(cyclophosphamide), 아자티오프린(azathioprine), 마이코페놀레이트 모페틸(mycophenolate mofetil), 메토트렉세이트(methotrextrate), 글루코코르티코이드(glucocorticoid) 및 그의 유사체, 사이토킨, 잔틴(xanthine), 줄기 세포 성장 인자, 림프독소, 종양 괴사 인자(TNF: tumor necrosis factor), 조혈 인자, 인터류킨(예를 들어, 인터류킨-1(IL-1), IL-2, IL-3, IL-6, IL-10, IL-12, IL-18, 및 IL-21), 콜로니 자극 인자[예를 들어, 과립구-콜로니 자극 인자(G-CSF: granulocyte-colony stimulating factors) 및 과립구 대식세포-콜로니 자극 인자(GM-CSF: granulocyte macrophage-colony stimulating factor)], 인터페론(예를 들어, 인터페론-a, -β 및 -γ), "S1 인자"로서 지정된 줄기 세포 성장 인자, 에리트로포이에틴(erythropoietin) 및 트롬보포이에틴(thrombopoietin), 또는 이의 조합물이 포함된다.
본 발명에서 유용한 면역조절제로는 종양 상에서의 호르몬 작용을 차단하는 항-호르몬제, 및 사이토킨 생산을 억제하거나, 자가-항원 발현을 하향-조절하거나, 또는 MHC 항원을 차폐하는 면역억제제가 포함된다. 대표적인 항-호르몬제로는, 예를 들면, 타목시펜(tamoxifen), 랄록시펜(raloxifene), 4(5)-이미다졸 저해 방향화효소, 4-하이드록시타목시펜, 트리옥시펜(trioxifene), 케옥시펜(keoxifene), LY 117018, 오나프리스톤(onapristone), 및 토레미펜(toremifene)을 비롯한 항-에스트로겐제; 및 항-안드로겐제, 예컨대 플루타미드(flutamide), 닐루타미드, 비칼루타미드(bicalutamide), 류프롤리드(leuprolide), 및 고세렐린; 및 항-아드레날린제가 포함된다. 대표적인 면역억제제로는 2-아미노-6-아릴-5-치환된 피리미딘, 아자티오프린(azathioprine), 사이클로포스파미드(cyclophosphamide), 브로모크립틴(bromocryptine), 다나졸(danazol), 다프손(dapsone), 글루타르알데히드, MHC 항원 및 MHC 단편에 대한 항-유전자형(idiotypic) 항체, 사이클로스포린 A, 스테로이드, 예컨대 글루코코르티코스테로이드, 사이토킨 또는 사이토킨 수용체 길항물질(예를 들어, 항-인터페론 항체, 항-IL10 항체, 항-TNFα 항체, 항-IL2 항체), 스트렙토키나아제(streptokinase), TGFβ, 라파마이신, T-세포 수용체, T-세포 수용체 단편, 및 T 세포 수용체 항체가 포함된다.
본 발명의 몇몇 양태에서, 약물은, 제한되지 않지만, 독소, 호르몬, 효소, 및 성장 인자를 비롯한 치료 단백질이다.
독소 단백질(또는 폴리펩티드)의 예로는, 제한되지 않지만, 디프테리아(예를 들어, 디프테리아 A 쇄), 슈도모나스(Pseudomonas) 외독소 및 내독소, 리신(ricin)(예를 들어, 리신 A 쇄), 아브린(abrin)(예를 들어, 아브린 A 쇄), 모덱신(modeccin)(예를 들어, 모덱신 A 쇄), 알파-사르신(sarcin), 알로이리테스 포르디(Aleurites fordii) 단백질, 디안틴(dianthin) 단백질, 리보뉴클레아제(ribonuclease)(RN아제), DN아제 I, 포도상구균의(Staphylococcal) 장내독소-A, 미국자리공(pokeweed) 항바이러스성 단백질, 젤로닌(gelonin), 디프테린(diphtherin) 독소, 파이토라카 아메리카나(Phytolaca americana) 단백질(PAPI, PAPII, 및 PAP-S), 모모르디카 카란티아(Momordica charantia) 저해제, 쿠르신(curcin), 크로틴(crotin), 사포나리아 오피시날리스(Saponaria officinalis) 저해제, 미토겔린(mitogellin), 레스트릭토신(restrictocin), 페노마이신(phenomycin), 에노마이신(enomycin), 트리코테센(trichothecene), 저해제 시스틴 매듭(ICK: inhibitor cystine knot) 펩티드[예를 들어, 세라토톡신(ceratotoxin)], 및 코노톡신(conotoxin)(예를 들어, KIIIA 또는 SmIIIa)이 포함된다.
호르몬의 예로는, 제한되지 않지만, 에스트로겐, 안드로겐, 프로게스틴, 코르티코스테로이드가 포함된다.
본 발명의 몇몇 양태에서, 약물은 올리고뉴클레오티드, 예컨대 안티-센스(anti-sense) 올리고뉴클레오티드이다.
본 발명에서 유용한 추가적인 약물로는 혈관 형성을 저해하는 항-혈관형성제, 예를 들면, 파르네실전달효소(farnesyltransferase) 저해제, COX-2 저해제, VEGF 저해제, bFGF 저해제, 스테로이드 설파타아제(steroid sulphatase) 저해제(예를 들어, 2-메톡시에스트라디올 비스-설파메이트(2-MeOE2비스MATE)), 인터류킨-24, 트롬보스폰딘(thrombospondin), 메탈로스폰딘(metallospondin) 단백질, 부류 I 인터페론, 인터류킨 12, 프로타민(protamine), 안지오스타틴(angiostatin), 라미닌(laminin), 엔도스타틴(endostatin), 및 프롤락틴(prolactin) 단편이 포함된다.
항-증식제 및 전구-세포자멸제(pro-apoptotic agent)로는 PPAR-감마의 활성화제[예를 들어, 사이클로펜테논 프로스타글린딘(cyPG: cyclopentenone prostaglandins)], 레티노이드(retinoid), 트리테르피노이드(triterpinoid)[예를 들어, 사이클로아르탄(cycloartane), 루판(lupane), 우르산(ursane), 올레아난(oleanane), 프리에델란(friedelane), 담마란(dammarane), 쿠쿠르비타신(cucurbitacin), 및 리모노이드 트리테르페노이드(limonoid triterpenoid), EGF 수용체의 저해제(예를 들어, HER4), 람파마이신(rampamycin), 칼시트리올(CALCITRIOL: 등록상표)[1,25-디하이드록시콜레칼시페롤(비타민 D)], 방향화효소 저해제[페마라(FEMARA: 등록상표)(레트로존: letrozone)), 텔로머라아제(telomerase) 저해제, 철 킬레이터[예를 들어, 3-아미노피리딘-2-카복시알데하이드 티오세미카바존(트리아핀: Triapine)], 아폽틴(apoptin)(닭의 빈혈 바이러스로부터의 바이러스성 단백질 3 - VP3), Bcl-2 및 Bcl-X(L)의 저해제, TNF-알파, FAS 리간드, TNF-관련된 세포자멸-유도 리간드(TRAIL/Apo2L), TNF-알파/FAS 리간드/TNF-관련된 세포자멸-유도 리간드(TRAIL/Apo2L) 신호발송의 활성화제, 및 PI3K-Akt 생존 경로 신호발송의 저해제(예를 들어, UCN-01 및 겔다나마이신)이 포함된다.
대표적인 화학치료제로는 알킬화제, 예컨대 티오테파(thiotepa) 및 사이클로포스파미드; 알킬 설포네이트, 예컨대 부설판(busulfan), 임프로설판(improsulfan) 및 피포설판(piposulfan); 아지이딘(aziidine) 예컨대 벤조도파(benzodopa), 카보쿠온(carboquone), 메투레도파(meturedopa), 및 우레도파(uredopa); 에틸렌이민 및 메틸멜라민, 예컨대 알트레타민(altretamine), 트리에틸렌멜라민, 트리에틸렌포스포르아미드, 트리에틸렌티오포스포르아미드 및 트리메틸올로멜라민; 질소 머스터드(nitrogen mustard), 예컨대 클로람부실(chlorambucil), 클로르나파진(chlornaphazine), 클로로포스파미드(cholophosphamide), 에스트라무스틴(estramustine), 이포스파미드(ifosfamide), 메키오레타민(mechiorethamine), 메키오레타민 옥사이드 하이드로클로라이드, 멜팔란(melphalan), 노벰비킨(novembichin), 페네스테린(phenesterine), 프레드니무스틴(prednimustine), 트로포스파미드(trofosfamide), 우라실 머스터드(uracil mustard); 니트로스우레아(nitrosurea), 예컨대 카르무스틴(carmustine), 클로로조토신(chlorozotocin), 포테무스틴(fotemustine), 로무스틴(lomustine), 니무스틴(nimustine), 라니무스틴(ranimustine); 항생제, 예컨대 아클라시노마이신(aclacinomycin), 악티노마이신(actinomycin), 아우트라마이신(authramycin), 아자세린(azaserine), 블레오마이신(bleomycin), 칵티노마이신(cactinomycin), 칼리케아미신, 카라비신(carabicin), 카르미노마이신(carminomycin), 카르지노필린(carzinophilin), 크로모마이신(chromomycin), 닥티노마이신(dactinomycin), 다우노루비신, 데토루비신(detorubicin), 6-디아조-5-옥소-L-노르로이신, 독소루비신, 에피루비신, 에소루비신(esorubicin), 이다루비신, 마르셀로마이신(marcellomycin), 미토마이신(mitomycin), 마이코페놀산(mycophenolic acid), 노갈라마이신(nogalamycin), 올리보마이신(olivomycin), 페플로마이신(peplomycin), 포트피로마이신(potfiromycin), 퓨로마이신, 쿠엘라마이신(quelamycin), 로도루비신(rodorubicin), 스트렙토니그린(streptonigrin), 스트렙토조신(streptozocin), 투베르시딘(tubercidin), 우베니멕스(ubenimex), 지노스타틴(zinostatin), 조루비신(zorubicin); 대사길항물질, 예컨대 메토트렉세이트(methotrexate) 및 5-플루오로우라실(5-FU); 엽산 유사체, 예컨대 데노프테린(denopterin), 메토트렉세이트, 프테로프테린(pteropterin), 트리메트렉세이트(trimetrexate); 퓨린 유사체, 예컨대 플루다라빈(fludarabine), 6-머캅토퓨린(mercaptopurine), 티아미프린(thiamiprine), 티오구아닌(thioguanine); 피리미딘 유사체, 예컨대 안시타빈(ancitabine), 아자시티딘(azacitidine), 6-아자우리딘(azauridine), 카르모푸르(carmofur), 사이타라빈(cytarabine), 디데옥시우리딘(dideoxyuridine), 독시플루리딘(doxifluridine), 에노시타빈(enocitabine), 플록수리딘(floxuridine), 5-EU; 안드로겐, 예컨대 칼루스테론(calusterone), 드로모스타놀론(dromostanolone) 프로피오네이트, 에피티오스타놀(epitiostanol), 메피티오스탄(mepitiostane), 테스토락톤(testolactone); 항-부신성 제제, 예컨대 아미노글루테티미드(aminoglutethimide), 미토탄(mitotane), 트릴로스탄(trilostane); 엽산 보충액, 예컨대 프롤린산(frolinic acid); 아세글라톤(aceglatone); 알도포스파미드 글리코시드(aldophosphamide glycoside); 아미노레불린산(aminolevulinic acid); 암사크린(amsacrine); 베스트라부실(bestrabucil); 비산트렌(bisantrene); 에다트렉세이트(edatraxate); 데포파민(defofamine); 데메콜신(demecolcine); 디아지쿠온(diaziquone); 엘포르미틴(elformithine); 엘립티니움(elliptinium) 아세테이트; 에토글루시드(etoglucid); 질산 갈륨; 하이드록시우레아; 레티난(lentinan); 로니다민(lonidamine); 미토구아존(mitoguazone); 미톡산트론; 모피다몰(mopidamol); 니트라크린(nitracrine); 펜토스타틴(pentostatin); 페나메트(phenamet); 피라루비신(pirarubicin); 포도필린산(podophyllinic acid); 2-에틸하이드라자이드; 프로카르바진(procarbazine); 라족산(razoxane); 시조피란(sizofiran); 스피로게르마늄(spirogermanium); 테누아존산(tenuazonic acid); 트리아지쿠온(triaziquone); 2,2',2'-트리클로로트리에틸아민; 우레탄; 빈데신; 다카르바진(dacarbazine); 만노무스틴(mannomustine); 미토브로니톨(mitobronitol); 미토락톨(mitolactol); 피포브로만(pipobroman); 가사이토신(gacytosine); 아라비노시드(arabinoside)(Ara-C); 사이클로포스파미드; 티오테파; 탁소이드(taxoid), 예를 들어 파클리탁셀[탁솔(등록상표), 브리스톨-마이어스 스퀴브 온콜로지 오브 프린스톤(Pristol-Myers Squibb Oncology of Princeton)(뉴저지)], 및 도세탁셀[탁소테레(등록상표), 론-폴루엔크 로러 오브 안토니(Rhone-Poulenc Rorer of Antony)(프랑스)]; 클로람부실; 겜시타빈; 6-티오구아닌; 머캅토퓨린; 메토트렉세이트; 백금 유사체, 예컨대 시스플라틴(cisplatin) 및 카보플라틴(carboplatin); 빈블라스틴; 백금; 에토포시드(etoposide)(VP-16); 이포스파미드; 미토마이신 C; 미톡산트론; 빈크리스틴; 비노렐빈; 나벨빈(navelbine); 노반트론(novantrone); 테니포시드(teniposide); 다우노마이신(daunomycin); 아이니노프테린(aininopterin); 젤로다(xeloda); 이반드로네이트(ibandronate); CPT-11; 토포이소머라아제(topoisomerase) 저해제 RFS 2000; 디플루오로메틸오르니틴(DMFO); 레티노산; 에스페라미신; 및 카페시타빈(capecitabine)이 포함된다.
본 발명에 따라 사용될 수 있는 추가적인 치료제로는 광역학 치료법을 위한 감광화 작용제(예컨대 본원에 참고로 전체가 인용된 미국 특허출원 공개 번호 제20020197262호 및 미국 특허 제5,952,329호); 온열 치료법을 위한 자성 입자(예컨대 본원에 참고로 전체가 인용된 미국 특허출원 공개 번호 제20030032995호); 결합제, 예컨대 펩티드, 리간드, 세포 접착 리간드 등, 및 전구약물, 예컨대 인산염-함유 전구약물, 티오인산염-함유 전구약물, 황산염 함유 전구약물, 펩티드 함유 전구약물, β-락탐-함유 전구약물, 치환된 페녹시아세트아미드-함유 전구약물 또는 치환된 페닐아세트아미드-함유 전구약물, 5-플루오로사이토신 및 다른 5-플루오로우리딘 전구약물(이들은 더욱 활성적인 세포독성 부재 약물로 전환될 수 있음)이 포함된다.
항-EDB 항체를 사용하는 진단 방법을 위해, 약물은 EDB+ FN-발현 ECM 또는 세포의 존재를 시험관내 또는 생체내 검출하기 위해 사용되는 검출가능한 표지를 포함할 수 있다. 생체내 검출가능한 방사선동위원소, 예컨대 신티그래피(scintigraphy), 자기 공명 영상촬영, 또는 초음파에 의해 검출가능한 이러한 표지는 임상적 진단 적용에 사용될 수 있다. 유용한 신티그래피 표지로는 양전자 방출체 및 γ-방출체가 포함된다. 자기 공명 영상촬영을 위한 대표적인 조영제는 상자성 또는 초상자성 이온(예를 들어, 철, 구리, 망간, 크롬, 에르븀, 유로퓸, 디스프로슘, 홀뮴 및 가돌리늄), 산화 철 입자, 및 수용성 조영제이다. 초음파 검출을 위해, 기체 또는 액체는 다공질 무기 입자내에 가둬지고, 마이크로버블(microbubble) 조영제로서 방출된다. 시험관내 검출을 위해, 유용한 검출가능한 표지로는 형광단, 검출가능한 에피토프 또는 결합제, 및 방사능 표지가 포함된다.
이에 따라, 본 발명의 몇몇 양태에서, 약물은 영상화소재(imaging agent)[예를 들어, 형광단 또는 양전자 방출 단층촬영(PET: Positron Emission Tomography) 표지, 단일-광자 방출 컴퓨터 단층촬영(SPECT: Single-Photon Emission Computed Tomorgraphy) 표지], 또는 자기 공명 영상촬영(MRI: Magnetic Resonance Imaging) 표지이다.
용어 "표지"는 본원에 사용될 경우 "표지된" 항체를 생성하기 위해 항체에 직접적으로 또는 간접적으로 접합된 검출가능한 화합물 또는 조성물을 지칭한다. 표지는 그 자체로 검출될 수 있거나(예를 들어, 방사성동위원소 표지 또는 형광 표지), 또는 효소 표지의 경우, 검출가능한 기질 화합물 또는 조성물의 화학적 변경을 촉매화할 수 있다. 검출가능한 표지로서 작용하는 방사성핵종으로는, 예를 들면, I-131, I-123, I-125, Y-90, Re-188, Re-186, At-211, Cu-67, Bi-212, 및 Pd-109가 포함된다. 표지는 또한 검출불가능한 실체, 예컨대 독소일 수 있다.
형광단의 예로는, 제한되지 않지만, 플루오레세인 이소티오시아네이트(FITC: fluorescein isothiocyanate)(예를 들어, 5-FITC), 플루오레세인 아미디트(FAM: fluorescein amidite)(예를 들어, 5-FAM), 에오신(eosin), 카복시플루오레세인, 에리트로신(erythrosine), 알렉사 플루오르(Alexa Fluor: 등록상표)(예를 들어, 알렉사 350, 405, 430, 488, 500, 514, 532, 546, 555, 568, 594, 610, 633, 647, 660, 680, 700, 또는 750), 카복시테트라메틸로다민(TAMRA: carboxytetramethylrhodamine)(예를 들어, 5-TAMRA), 테트라메틸로다민(TMR: tetramethylrhodamine), 및 설포로다민(SR: sulforhodamine)(예를 들어, SR101)이 포함된다.
치료학적 또는 진단학적 방사선동위원소 또는 다른 표지(예를 들어, PET 또는 SPECT 표지)는 본원에 기재된 바와 같이 항-EDB 항체로의 접합을 위하여 제제에 혼입될 수 있다. 동위원소는 항체에, 예를 들면, 항체에 존재하는 시스테인 잔기에 직접적으로 결합되거나, 또는 킬레이터가 사용되어 항체 및 방사성동위원소의 결합을 중재할 수 있다. 방사선요법을 위해 적합한 방사선동위원소로는, 제한되지 않지만 α-방출체, β-방출체, 및 오제(auger) 전자가 포함된다. 진단학적 적용을 위하여, 유용한 방사선동위원소로는 양전자 방출체 및 γ-방출체가 포함된다. 본 발명의 항-EDB 항체는, 예를 들면, 항체의 티로신 잔기 상에서 추가로 요오드화되어 항체의 검출 또는 치료 효과를 촉진시킬 수 있다.
방사성동위원소 또는 다른 표지의 예로는, 제한되지 않지만, 3H, 11C, 13N, 14C, 15N, 150, 35S, 18F, 32P, 33P, 47Sc, 51Cr, 57Co, 58Co, 59Fe, 62Cu, 64Cu, 67Cu, 67Ga, 68Ga, 75Se, 76Br, 77Br, 86Y, 89Zr, 90Y, 94Tc, 95Ru, 97Ru, 99Tc, 103Ru, 105Rh, 105Ru, 107Hg, 109Pd, 111Ag, 111In, 113In, 121Te, 122Te, 123I, 124I, 125I, 125Te, 126I, 131I, 131In, 133I, 142Pr, 143Pr, 153Pb, 153Sm, 161Tb, 165Tm, 166Dy, 166H, 167Tm, 168Tm, 169Yb, 177Lu, 186Re, 188Re, 189Re, 197Pt, 198Au, 199Au, 201TI, 203Hg, 211At, 212Bi, 212Pb, 213Bi, 223Ra, 224Ac, 및 225Ac가 포함된다.
연결기
본 발명의 EDB ADC는, 약물을 항체에 직접적으로 또는 간접적으로 연결시키거나 접합시키는 연결기를 사용하여 제조될 수 있다. 연결기는 약물 및 항체를 연결시켜 ADC를 형성하는 2작용성 화합물이다. 이러한 ADC는 특이적 항원 또는 단백질에 결합하는 항체를 경유하여 약물의 선택적 전달을 허용한다. 적합한 연결기로는, 예를 들면, 분할가능한 연결기 및 분할불가능한 연결기가 포함된다. 분할가능한 연결기는 전형적으로 특정한 세포내 및 세포외 조건에 의해 약물이 분할되고 방출되기 쉽다. 접합된 약물이 항체로부터 세포내적으로 분할될 수 있는 주요 기작은 리소좀의 산성 pH에서의 가수분해[하이드라존(hydrazone), 아세탈(acetal), 및 시스-아코니테이트(aconitate)-유사 아미드], 리소좀 효소(카텝신(cathepsin) 및 다른 리소좀 효소)에 의한 펩티드 분할, 및 디설파이드의 환원을 포함한다. 접합된 약물은 종양 미세환경(TME: tumor microenvironment)에서 프로테아제, 예컨대 카텝신에 의해 세포외적으로 항체로부터 분할될 수 있다. 분할을 위한 이들 다양한 기작의 결과로서, 약물을 항체에 연결시키는 기작은 또한 매우 다양하고 임의의 적합한 연결기가 사용될 수 있다.
적합한 연결기는 임의의 분할가능한 연결기를 포함할 수 있다. 몇몇 양태에서, 적합한 연결기는 발린-시트룰린(val-cit) 연결기, 페닐알라닌-라이신(phe-lys) 연결기, 또는 말레이미도카프로일-발린-시트룰린-p-아미노벤질옥시카보닐(vc) 연결기를 포함하거나, 또는 트랜스글루타미나아제-기반의 접합 기술을 위해 적합한, 추가적인 희생 요소에 부착되는 디펩티드, 예컨대 N-2-아세틸-L-라이실-L-발릴-L-시트룰린-p-아미노벤질옥시카보닐-N,N'-디메틸아미노에틸-CO-(AcLys-vc) 연결기를 함유한다. 또 다른 양태에서, 적합한 연결기는 디설파이드 연결기, 예컨대 설파닐 피리딘(diS) 연결기 및 2-(피리딘-2-일디설파닐)에틸 카바모일(diS-C20CO) 연결기를 포함한다. 또 다른 양태에서, 연결기는 분할불가능한 연결기, 예컨대 말레이미도카프로일(mc), 말레이미도-헵타노일(me) 및 말레이미도-Peg6C2(MalPeg6C2)일 수 있다. 다른 양태에서, 적합한 연결기는 특정 pH 또는 pH 범위에서 가수분해가능한 연결기, 예컨대 하이드라존 연결기를 포함한다.
연결기는, 예를 들어 연결기 상에 존재하는 말레이미드 또는 할로아세트아미드와 항체 상에 존재하는 고유의 또는 조작된 시스테인 잔기의 반응에 의해, 티오에스테르 연결을 통해 항체에 공유적으로 결합될 수 있다. 또 다른 양태에서, 연결기는, 예를 들어 연결기 상에 존재하는 N-하이드록시-석신이미드 활성화된 카복실산과 라이신 잔기의 유리 아민과의 반응에 의해, 항체 상에 존재하는 라이신 잔기로의 아미드 연결을 통해 항체에 공유적으로 결합될 수 있다. 또 다른 양태에서, 연결기는, 예를 들어 글루타민 잔기의 측쇄 아미드와 연결기 상에 존재하는 1급 아민으로부터 신규 아미드 결합을 생성하는 트랜스글루타미나아제 효소에 의해 촉매화된 효소적 반응에 의해, 항체 상에 존재하거나 항체내로 조작된 글루타민 잔기의 측쇄로의 아미드 연결을 통해 항체에 공유적으로 결합될 수 있다.
몇몇 양태에서, 본 발명의 연결기는 하기 화학식 9를 갖는 "mc-vc-PABC" 또는 "vc-PABC" 또는 "vc" 연결기, 하기 화학식 10을 갖는 "AcLys-vc-PABC-DMAE-CO" 또는 "AcLys-vc" 연결기, 하기 화학식 11을 갖는 diS 연결기, 및 하기 화학식 12를 갖는 diS-C2OCO 연결기를 포함한다:
[화학식 9]
Figure 112019049414387-pct00018
[화학식 10]
Figure 112019049414387-pct00019
[화학식 11]
Figure 112019049414387-pct00020
[화학식 12]
Figure 112019049414387-pct00021
EDB ADC를 제조하는 방법
본 발명의 EDB ADC를 제조하는 방법이 본원에 제공된다. 본 발명은 추가로 종래적으로 및 본원에 개시된 바와 같이 자리-특이적으로 접합된 EDB ADC를 생산 또는 생성하는 방법을 제공하고, 이는 (a) 연결기를 약물에 연결시키는 단계; (b) 연결기-약물 작용부분을 항체에 접합시키는 단계; 및 (c) 항체 약물 접합체를 정제하는 단계를 포함할 수 있다. 실시예 3 및 4를 참조한다.
몇몇 양태에서, EDB ADC는, 항-EDB 항체, 또는 이의 항원 결합 단편의 하나 이상의 시스테인 잔기를 통해 연결기-페이로드 작용부분의 종래의, 비-특이적 접합을 사용하여 생성될 수 있다.
또 다른 양태에서, EDB ADC는 항-EDB 항체 불변성 도메인내로 조작된 하나 이상의 반응성 시스테인 잔기를 통해 연결기-페이로드 작용부분의 자리-특이적 접합을 사용하여 생성될 수 있다. 조작된 시스테인 잔기를 통한 자리-특이적 접합을 위해 항체를 제조하는 방법은 PCT 국제 특허출원 공개공보 제WO2013/093809호에 기재되어 있고, 이는 본원에 참고로 그의 전체가 인용되어 있다.
항-EDB 항체 중쇄의 하나 이상의 아미노산 잔기는 약물 또는 페이로드로의 접합을 목적으로 또 다른 아미노산, 예컨대 시스테인 잔기로 치환될 수 있다. 하나의 양태에서, 본 발명은 위치: 118(카밧에 따라서 114), 246, 249, 265, 267, 270, 276, 278, 283, 290, 292, 293, 294, 300, 302, 303, 314, 315, 318, 320, 327, 332, 333, 334, 336, 345, 347, 354, 355, 358, 360, 362, 370, 373, 375, 376, 378, 380, 382, 386, 388, 390, 392, 393, 401, 404, 411, 413, 414, 416, 418, 419, 421, 428, 431, 432, 437, 438, 439, 443 또는 444, 또는 임의의 이의 조합된 위치(카밧의 EU 색인의 넘버링에 따름)에서 항체 조작된 시스테인 잔기를 포함하는 항체 중쇄 불변성 영역을 포함하는 항-EDB 항체, 또는 이의 항원 결합 단편을 제공한다. 특별히, 위치 118(카밧에 따라서 114), 290, 334, 347, 373, 375, 380, 388, 392, 421, 443, 또는 임의의 이의 조합된 위치가 사용될 수 있다. 추가적인 시스테인 치환이 도입될 수 있다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 위치 290(카밧의 EU 색인의 넘버링에 따름)에서 조작된 시스테인 잔기(K290C)를 포함하는 중쇄 불변성 도메인을 포함하는 항-EDB 항체, 또는 이의 항원 결합 단편을 제공한다.
항-EDB 항체 경쇄 불변성 도메인의 하나 이상의 아미노산 잔기는 약물 또는 페이로드로의 접합을 목적으로 또 다른 아미노산, 예컨대 시스테인 잔기로 치환된다. 하나의 양태에서, 본 발명은 (i) 위치 110, 111, 125, 149, 155, 158, 161, 183, 185, 188, 189, 191, 197, 205, 207, 208 또는 210, 또는 임의의 이의 조합된 위치(카밧의 넘버링에 따름)에서 조작된 시스테인 잔기; (ii) 불변성 도메인이 서열 번호 37(카파 경쇄)과 정렬될 경우, 서열 번호 37의 잔기 4, 42, 81, 100, 103, 또는 임의의 이의 조합된 위치에 상응하는 위치에서 조작된 시스테인 잔기; 또는 (iii) 불변성 도메인이 서열 번호 38(람다 경쇄)과 정렬되는 경우, 서열 번호 38의 잔기 4, 5, 19, 43, 49, 52, 55, 78, 81, 82, 84, 90, 96, 97, 98, 99, 101, 또는 임의의 이의 조합된 위치에 상응하는 위치에서 조작된 시스테인 잔기를 포함하는 항체 경쇄 불변성 영역을 포함하는 항-EDB 항체, 또는 이의 항원 결합 단편을 제공한다. 추가적인 시스테인 치환이 도입될 수 있다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 (i) 위치 111, 149, 188, 207, 210, 또는 임의의 이의 조합된 위치(바람직하게는 111 또는 210)(카밧의 넘버링에 따름)에서 조작된 시스테인 잔기; 또는 (ii) 불변성 도메인이 서열 번호 37과 정렬되는 경우, 서열 번호 37의 잔기 4, 42, 81, 100, 103, 또는 임의의 이의 조합된 위치(바람직하게는 잔기 4 또는 103)에 상응하는 위치에서 조작된 시스테인 잔기를 포함하는 항체 카파 경쇄 불변성 영역을 포함하는 항-EDB 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 제공한다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 (i) 위치 110, 111, 125, 149, 155, 158, 161, 185, 188, 189, 191, 197, 205, 206, 207, 208, 210, 또는 임의의 이의 조합된 위치(바람직하게는 110, 111, 125, 149, 또는 155)(카밧의 넘버링에 따름)에서 조작된 시스테인 잔기; 또는 (ii) 불변성 도메인이 서열 번호 38과 정렬되는 경우, 서열 번호 38의 잔기 4, 5, 19, 43, 49, 52, 55, 78, 81, 82, 84, 90, 96, 97, 98, 99, 101, 또는 임의의 이의 조합된 위치(바람직하게는 잔기 4, 5, 19, 43, 또는 49)에 상응하는 위치에서 조작된 시스테인 잔기를 포함하는 항체 람다 경쇄 불변성 영역을 포함하는 항-EDB 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 제공한다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 (i) 위치 183(카밧의 넘버링에 따름)에서 조작된 시스테인 잔기(κK183C); 또는 (ii) 불변성 도메인이 서열 번호 37과 정렬되는 경우, 서열 번호 37의 잔기 76에 상응하는 위치에서 조작된 시스테인 잔기를 포함하는 경쇄 불변성 도메인을 포함하는 항-EDB 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 제공한다.
서열 번호 37(Cκ 불변성 도메인)
Figure 112019049414387-pct00022
서열 번호 38(Cλ 불변성 도메인)
Figure 112019049414387-pct00023
또 다른 양태에서, EDB ADC는, 항-EDB 항체 불변성 영역에서 반응성으로 만드는 하나 이상의 조작된 아실 공여체 글루타민-함유 태그 또는 내생성 글루타민 잔기를 통해 자리-특이적 접합 기술을 사용하여 생성될 수 있다. 아실 공여체 글루타민-함유 태그 또는 글루타민 잔기를 통한 자리-특이적 접합을 위한 항체의 제조 방법은 PCT 국제 특허출원 공개공보 제WO2012/059882호(이는 본원에 참고로 그의 전체가 인용됨)에 기재되어 있다.
몇몇 양태에서, 아실 공여체 글루타민-함유 태그는 적어도 하나의 글루타민(Q)을 포함하고, 중쇄 및/또는 경쇄의 상이한 위치(즉, N-말단, C-말단 또는 내부)에 부착될 수 있다. 또 다른 양태에서, 아실 공여체 글루타민-함유 태그는: LLQGG(서열 번호 39), LLQG(서열 번호 40), LSLSQG(서열 번호 41), GGGLLQGG(서열 번호 42), GLLQG(서열 번호 43), LLQ, GSPLAQSHGG(서열 번호 44), GLLQGGG(서열 번호 45), GLLQGG(서열 번호 46), GLLQ(서열 번호 47), LLQLLQGA(서열 번호 48), LLQGA(서열 번호 49), LLQYQGA(서열 번호 50), LLQGSG(서열 번호 51), LLQYQG(서열 번호 52), LLQLLQG(서열 번호 53), SLLQG(서열 번호 54), LLQLQ(서열 번호 55), LLQLLQ(서열 번호 56), 및 LLQGR(서열 번호 57)로부터 선택된 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 몇몇 양태에서, 아실 공여체 글루타민-함유 태그는 중쇄 불변성 도메인에서 야생형 아미노산 위치를 대체한다. 몇몇 양태에서, 항-EDB 항체는, 중쇄의 위치 E294-N297(카밧의 EU 색인에 따름)에서 아미노산을 대체하는 아미노산 서열 LLQG(서열 번호 40)를 갖는 아실 글루타민-함유 태그를 포함할 수 있다.
ADC를 생성하기 위한 최적 반응 조건은 다양한 반응 변수, 예컨대 온도, pH, 연결기-페이로드 작용부분 투입량, 및 첨가제 농도에 의해 실험적으로 결정될 수 있다. 다른 약물의 접합을 위해 적합한 조건은 과도한 실험없이 당분야의 숙련가에 의해 결정될 수 있다. EDB ADC를 접합시키고 특징화하는 대표적인 방법은 실시예 3 및 4에 기재되어 있다.
접합 후, 접합체는 종래의 방법에 의해 접합되지 않은 반응물 및/또는 접합체의 응집된 형태로부터 분리되고, 정제되고, 특징지워진다. 이로는, 예컨대 제한되지 않지만, 질량 분광분석법, 크기 배제 크로마토그래피(SEC: size exclusion chromatography), 한외여과/투석여과, 이온 교환 크로마토그래피(IEC: ion exhange chromatography), 크로마토초점맞춤(CF: chromatofocusing), 자리-인도된 돌연변이생성, 형광-표지화, X-선 결정법, 고성능 액체 크로마토그래피(HPLC: high performance liquid chromatography), 고속 단백질 액체 크로마토그래피(FPLC: fast protein liquid chromatography), 세파크릴(Sephacryl) S-200 크로마토그래피 또는 소수성 상호작용 크로마토그래피(HIC: hydrophobic interaction chromatography)와 같은 공정이 포함된다. 적합한 HIC 매질로는, 제한되지 않지만, 페닐 세파로스(Sepharose) 6 고속 유동 크로마토그래피 매질, 부틸 세파로스 4 고속 유동 크로마토그래피 매질, 옥틸 세파로스 4 고속 유동 크로마토그래피 매질, 토요펄(Toyopearl) 에테르-650M 크로마토그래피 매질, 매크로-프렙(Macro-Prep) 메틸 HIC 매질 또는 매크로-프렙 t-부틸 HIC 매질이 포함된다.
표 13은 본원에 제공된 접합 및 정제 방법에 따라서 생산되고 실시예에서 제공된 데이터를 생성하기 위해 사용되는 EDB ADC를 제공한다.
본 발명의 몇몇 양태에서, 본 발명의 EDB ADC는 (a) EDB에 결합하는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편; (b) 연결기 및 (c) 약물을 포함한다.
본 발명의 또 다른 양태에서, 본 발명의 EDB ADC는 (a) EDB에 결합하는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편; (b) 연결기 및 (c) 약물을 포함하고, 여기서 연결기는 분할가능하거나 분할불가능한 연결기이다. 몇몇 양태에서, 연결기는 vc, diS, diS-C20CO 또는 AcLys-vc이다.
본 발명의 또 다른 양태에서, 본 발명의 EDB ADC는 (a) EDB에 결합하는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편; (b) 연결기 및 (c) 약물을 포함하고, 여기서 약물은 세포독성제이다. 몇몇 양태에서, 약물은 아우리스타틴이다. 몇몇 양태에서, 약물은 CPI 또는 CBI 이합체이다. 몇몇 양태에서, 아우리스타틴은 0101, 1569, 9411 또는 4574이다. 몇몇 양태에서, CPI 이합체는 CPI-8314 또는 CPI-0326이다.
본 발명의 몇몇 양태에서, 본 발명의 EDB ADC는 (a) 서열 번호 8을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 8을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 17을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 17을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 19를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 19를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 23을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 23을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 25를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 25를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 27을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 서열 번호 27을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄; 서열 번호 29를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 또는 서열 번호 29를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄를 포함하는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편; (b) 연결기 및 (c) 약물을 포함한다. 몇몇 양태에서, 연결기는 분할가능하거나 분할불가능한 연결기이다. 몇몇 양태에서, 연결기는 vc, diS, diS-C2OCO 또는 AcLys-vc이다. 몇몇 양태에서, 약물은 세포독성제이다. 몇몇 양태에서, 약물은 아우리스타틴이다. 몇몇 양태에서, 약물은 CPI 또는 CBI 이합체이다. 몇몇 양태에서, 아우리스타틴은 0101, 1569, 9411 또는 4574이다. 몇몇 양태에서, CPI 이합체는 CPI-8314 또는 CPI-0326이다.
EDB ADC의 용도
본 발명의 항-EDB 항체 및 EDB ADC는, 제한되지 않지만, 치료학적 치료 방법 및 진단학적 치료 방법을 비롯한 다양한 적용분야에서 유용하다.
본 발명은 피험체에서 EDB+ FN-발현 질환 또는 질병, 예컨대 EDB+ FN 발현과 연관된 암 또는 암 이외의 질환 또는 질병 및/또는 EDB+ FN-발현 암을 치료하는 방법을 제공한다. 본 발명은 또한 피험체에서 EDB+ FN-발현 질환, 예컨대 EDB+ FN 발현과 연관된 암 또는 암 이외의 질환 및/또는 EDB+ FN-발현 암을 치료하는 방법에서 사용하기 위한, 본원에 기재된 바와 같은 EDB ADC, 또는 약학 조성물을 제공한다. 본 발명은 추가로 피험체에서 EDB+ FN-발현 질환, 예컨대 EDB+ FN 발현과 연관된 암 또는 암 이외의 질환 및/또는 EDB+ FN-발현 암을 치료하기 위한 약제의 제조에 있어서의 본원에 제공된 바와 같은 EDB ADC, 또는 약학 조성물의 용도를 제공한다.
몇몇 양태에서, 본 발명은 본원에 기재된 1종 이상의 EDB ADC를 갖는 효과량의 조성물(즉, 약학 조성물)을 필요한 피험체에게 투여하는 단계를 포함하는, EDB-발현 질환, 예컨대 EDB+ FN 발현과 연관된 암 또는 암 이외의 질환 및/또는 EDB-발현 암을 앓는 피험체에서 종양 성장 또는 진행을 저해하는 방법을 제공한다. 본 발명의 다른 양태에서, 본원에 기재된 1종 이상의 EDB ADC를 갖는 효과량의 조성물(즉, 약학 조성물)을 필요한 피험체에게 투여하는 단계를 포함하는, 피험체에서 EDB+ FN 발현과 연관된 암 세포 및/또는 EDB+ FN-발현 암의 전이를 저해하는 방법이 제공된다. 본 발명의 다른 양태에서, 본원에 기재된 1종 이상의 EDB ADC를 갖는 효과량의 조성물(즉, 약학 조성물)을 필요한 피험체에게 투여하는 단계를 포함하는, 피험체에서 EDB+ FN 발현과 연관된 종양 및/또는 EDB+ FN-발현 암의 퇴행을 유도하는 방법이 제공된다.
몇몇 양태에서, EDB+ FN 발현은 종양 세포에 인접한 세포외 기질(ECM)에서 검출될 수 있다. EDB+ FN은 종양 세포를 비롯하여, 종양 환경에서 섬유아세포 이외의 세포에 의해 발현될 수 있다. 이어서, 분비된 EDB+ FN은 종양 세포에 인접한 기질, 또는 종양 세포의 혈장 막 상에 침적될 수 있다. 다른 양태에서, 본 발명은 상기 기재된 바와 같은 방법에서 사용하기 위해 본원에 기재된 1종 이상의 EDB ADC를 포함하는 약학 조성물을 제공한다. 다른 양태에서, 본 발명은 상기 기재된 방법에서 사용하기 위한 약제의 제조에 있어서의, 본원에 기재된 바와 같은 1종 이상의 EDB ADC 또는 본원에 기재된 바와 같은 EDB ADC를 포함하는 약학 조성물의 용도를 제공한다.
EDB+ FN 발현과 연관된 암 및/또는 EDB+ FN-발현 암은 일반적으로 조직 재형성과 연관된 임의의 암을 포함한다. 추가로, EDB+ FN 발현과 연관된 암 및/또는 EDB+ FN-발현 암으로는, 제한되지 않지만, 고형 종양 및 혈액암이 포함된다. 몇몇 양태에서, 고형 종양으로는, 제한되지 않지만, 갑상선암, 육종, 유방암, 췌장암, 교모세포종, 담낭암, 신장암, 피부암, 자궁암, 중피종, 결장직장암, 두경부암, 난소암, 방광암, 고환암, 전립선암, 간암, 내분비암, 흉선암, 뇌암, 부신암, 안암, 경부암 및 폐암이 포함된다. 또 다른 양태에서, 혈액암으로는, 제한되지 않지만, 백혈병, 림프종 및 골수종이 포함된다.
본 발명의 EDB ADC는 EDB+ FN-발현 질환, 예컨대 EDB+ FN 발현과 연관된 암 및/또는 EDB+ FN-발현 암을 치료하는데 유용하다. 본 발명의 EDB ADC는 높은 수준의 EDB+ FN, 중간 수준의 EDB+ FN 또는 낮은 수준의 EDB+ FN을 발현하는 암을 치료하기 위해 사용될 수 있다.
이에 따라, 본 발명의 EDB ADC에 의해 치료되는 환자는 생체지표(biomarker) 발현, 예컨대 제한되지 않지만 벌크(bulk) 종양 샘플의 mRNA(qPCR) 및 EDB+ FN 단백질의 상승된 발현에 기초하여 선택될 수 있고, 이는 종양 기원 또는 조직학에 비해 강화된 표적 발현을 위해 선택된 환자 집단을 생성한다. 표적 발현은 세포 염색의 강도와 조합된 세포 염색의 수의 함수로서 측정될 수 있다.
암 성장 또는 비정상적 증식은 더욱 진행된 암 형태 또는 질환 상태로의 세포내 변화를 암시하는 다수의 지시자중 어느 하나를 지칭한다. 암 세포 또는 비-신생물 증식 질환의 세포의 성장 저해, 예컨대 지연된 종양 성장 및 전이 저해는 당분야에 공지된 방법에 의해 검정될 수 있다. 암 성장의 저해를 측정하기 위한 다른 지시자로는 암 세포 생존의 감소, 종양 형태 또는 부피의 감소(예를 들면, 컴퓨터 단층촬영(CT), 초음파검사, 또는 다른 영상촬영 방법을 사용하여 결정됨), 종양 맥관구조의 파괴, 지연성 과민감증 피부 시험(delayed hypersensitivity skin test)에서의 개선된 성능, 세포독성 T-림프구의 활성의 증가, 및 종양-특이적 항원의 수준의 감소가 포함된다.
개시된 치료 방법의 요망되는 결과는 대조군 또는 기선 측정과 비교하여 일반적으로 정량화가능한 측정이다. 본원에 사용될 경우, 상대적인 용어, 예컨대 "개선되는", "증가하는" 또는 "감소하는"은 대조 또는 비교 분자에 상대적인 값, 예컨대 본원에 기재된 치료의 개시 이전의 동일한 개별체에서의 측정값, 또는 본원에 기재된 치료의 부재하에 대조적 개별체(또는 다수의 대조적 개별체)에서의 측정값을 지시한다. 대표적인 대조적 개별체는 치료되는 개별체와 동일한 형태의 암으로 고통받는 개별체로서, 이는 치료되는 개별체와 거의 동일한 연령이다(치료되는 개별체 및 대조 개별체에서 질환의 단계는 필적할만하도록 보장하기 위함).
치료법에 반응하는 변화 또는 개선은 일반적으로 통계적으로 유의적이다. 본원에 사용될 경우, 용어 "유의성" 또는 "유의적인"은 둘 이상의 실체 사이의 비-무작위 연관성이 존재하는 가능성에 대한 통계적인 분석에 관련된다. 관계가 "유의적인지" 또는 "유의성"을 갖는지의 여부를 결정하기 위해, 데이터의 통계적 조작은 "p-값"일 수 있다. 사용자-정의된 차단점(cut-off point) 아래로 내려간 p-값은 유의적인 것으로 고려된다. 0.1 이하, 0.05 미만, 0.01 미만, 0.005 미만, 0.001 미만의 p-값은 유의적인 것으로 고려될 수 있다.
생체내 검출 및 진단
또 다른 양태에서, EDB+ FN-발현 질환, 예컨대 EDB+ FN 발현과 연관된 암 및/또는 EDB+ FN-발현 암을 검출, 진단, 및/또는 모니터링하는 방법이 제공된다. 예를 들면, 본원에 기재된 바와 같은 항-EDB 항체는 검출가능한 작용부분, 예컨대 영상화소재 및 효소-기질 표지에 의해 표지화될 수 있다. 본원에 기재된 바와 같은 항체는 또한 생체내 진단학적 검정, 예컨대 생체내 영상촬영(예를 들어, PET 또는 SPECT), 또는 염색 시약을 위해 사용될 수 있다.
EDB ADC를 피험체에 투여하고(여기서 약물은 검출가능한 표지임), 결합을 위한 충분한 시간 이후, 항체에 의해 결합된 EDB+ FN 단백질의 생체분포는 시각화될 수 있다. 개시된 진단학적 방법은 치료 방법과 함께 사용될 수 있다. 또한, 본 발명의 EDB ADC는 검출 및 치료의 이중 목적을 위해 투여될 수 있다.
대표적인 비-침습성 검출 방법은 신티그래피[예를 들어, SPECT(단일-광자 방출 컴퓨터 단층촬영), PET(양전자 방출 단층촬영), 감마 카메라 영상촬영, 및 직선 주사(rectilinear scanning)], 자기 공명 영상촬영[예를 들어, 전통적 자기 공명 영상촬영, 자기화 전달 영상촬영(MTI: magnetization transfer imaging), 양성자 자기 공명 분광법(MRS: proton magnetic resonance spectroscopy), 확산 강조 영상촬영(DWI: diffusion-weighted imaging) 및 기능성 MR 영상촬영(fMRI: functional MR imaging)], 및 초음파를 포함한다
제형
본 발명은 본원에 개시된 임의의 EDB ADC 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 약학 조성물을 추가로 제공한다. 추가로, 조성물은 본원에 개시된 EDB ADC를 1종 보다 많이 포함할 수 있다.
본 발명에 사용된 조성물은 약학적으로 허용가능한 담체, 부형제, 또는 안정화제[레밍턴(Remington)의 문헌 "The Science and practice of Pharmacy 21st Ed., 2005, Lippincott Williams and Wilkins, Ed. K. E. Hoover"]를 동결건조된 제형 또는 수성 용액의 형태로 포함할 수 있다. 허용가능한 담체, 부형제, 또는 안정화제는 투여량 및 농도에서 수여자에게 무독성이고, 완충액, 예컨대 인산염, 시트르산염, 및 기타 유기 산; 항산화제, 예컨대 아스코르브산 및 메티오닌; 보존제(예컨대 염화 옥타데실디메틸벤질 암모늄; 염화 헥사메토늄; 염화 벤즈알코늄, 염화 벤제토늄; 페놀, 부틸 또는 벤질 알코올; 알킬 파라벤, 예컨대 메틸 또는 프로필 파라벤; 카테콜(catechol); 레소르시놀(resorcinol); 사이클로헥사놀; 3-펜타놀; 및 m-크레솔); 저분자량(약 10 미만의 잔기) 폴리펩티드; 단백질, 예컨대 혈청 알부민, 젤라틴, 또는 면역글로불린; 친수성 중합체, 예컨대 폴리비닐피롤리돈; 아미노산, 예컨대 글리신, 글루타민, 아스파라긴, 히스티딘, 아르기닌, 또는 라이신; 단당류, 이당류, 및 다른 탄수화물, 예컨대 글루코스, 만노스, 또는 덱스트린; 킬레이트화제, 예컨대 EDTA; 당분, 예컨대 수크로스, 만니톨, 트레할로스 또는 소르비톨; 염-형성 대이온, 예컨대 나트륨; 금속 복합체(예를 들어 Zn-단백질 복합체); 및/또는 비-이온성 계면활성제, 예컨대 트윈(TWEEN: 상표명), 플루로닉스(PLURONICS: 상표명) 또는 폴리에틸렌 글리콜(PEG: polyethylene glycol)을 포함할 수 있다. "약학적으로 허용가능한 염"은 본원에 사용될 경우 분자 또는 거대분자의 약학적으로 허용가능한 유기 또는 무기 염을 지칭한다. 약학적으로 허용가능한 부형제는 추가로 본원에 기재된다.
제한되지 않지만, 약학적으로 허용가능한 부형제를 포함하는 제형을 비롯한 EDB ADC의 다양한 제형이 투여를 위해 사용될 수 있다. 약학적으로 허용가능한 부형제는 당분야에 공지되어 있고, 약리학적으로 효과적인 물질의 투여를 용이하게 하는 상대적으로 불활성인 물질이다. 예를 들면, 부형제는 형태 또는 점조도를 제공하거나, 희석제로서 작용할 수 있다. 적합한 부형제로는, 제한되지 않지만 안정화제, 습윤제 및 유화제, 다양한 삼투압농도를 위한 염, 캡슐화제, 완충액, 및 경피 흡수 증진제가 포함된다. 부형제 뿐만 아니라 비경구 및 비경구 이외의 약물 전달을 위한 제형은 레밍턴의 문헌[The Science and Practice of Pharmacy 20th Ed. Mack Publishing, 2000]에 제시되어 있다.
본 발명의 몇몇 양태에서, 이들 제제는 주사에 의한(예를 들어, 복강내, 정맥내, 피하, 근육내 등) 투여를 위해 제형화될 수 있다. 따라서, 이들 제제는 약학적으로 허용가능한 비히클, 예컨대 염수, 링거(Ringer) 용액, 덱스트로스 용액 등과 조합될 수 있다. 특별한 투여량 섭생, 즉, 용량, 시기 선택 및 반복은 특별한 개별체 및 그러한 개별체의 병력에 따라 달라질 것이다.
본 발명에 따라 사용되는 EDB ADC의 치료학적 제형은, 동결건조된 제형 또는 수성 용액의 형태로, 원하는 순도를 갖는 항체를 약학적으로 허용가능한 임의적인 담체, 부형제 또는 안정화제와 혼합함으로써 저장을 위해 준비될 수 있다[레밍턴(Remington)의 문헌 "The Science and Practice of Pharmacy 21st Ed. Mack Publishing, 2005"]. 허용가능한 담체, 부형제, 또는 안정화제는 이용되는 투여량 및 농도에서 수여자에게 무독성이고, 완충액, 예컨대 인산염, 시트르산염, 및 기타 유기 산; 염, 예컨대 염화 나트륨; 항산화제, 예컨대 아스코르브산 및 메티오닌; 보존제(예컨대 염화 옥타데실디메틸벤질 암모늄; 염화 헥사메토늄; 염화 벤즈알코늄, 염화 벤제토늄; 페놀, 부틸 또는 벤질 알코올; 알킬 파라벤, 예컨대 메틸 또는 프로필 파라벤; 카테콜(catechol); 레소르시놀(resorcinol); 사이클로헥사놀; 3-펜타놀; 및 m-크레솔); 저분자량(약 10 미만의 잔기) 폴리펩티드; 단백질, 예컨대 혈청 알부민, 젤라틴, 또는 면역글로불린; 친수성 중합체, 예컨대 폴리비닐피롤리돈; 아미노산, 예컨대 글리신, 글루타민, 아스파라긴, 히스티딘, 아르기닌, 또는 라이신; 단당류, 이당류, 및 다른 탄수화물, 예컨대 글루코스, 만노스, 또는 덱스트린; 킬레이트화제, 예컨대 EDTA; 당분, 예컨대 수크로스, 만니톨, 트레할로스 또는 소르비톨; 염-형성 대이온, 예컨대 나트륨; 금속 복합체(예를 들어 Zn-단백질 복합체); 및/또는 비-이온성 계면활성제, 예컨대 트윈(상표명), 플루로닉스(상표명) 또는 폴리에틸렌 글리콜(PEG)을 포함할 수 있다.
치료학적 EDB ADC 조성물은 일반적으로 멸균 진입 포트(access port)를 갖는 용기, 예를 들면, 피하 주사 바늘에 의해 천공가능한 마개를 갖는 정맥내 용액 백(bag) 또는 바이알(vial)내로 위치된다. 본 발명에 따른 조성물은, 경구, 비경구 또는 직장 투여, 또는 흡입 또는 취입에 의한 투여를 위해 단위 투여형, 예컨대 정제, 환제, 캡슐, 분말, 과립, 용제 또는 현탁제, 또는 좌제의 형태로 존재할 수 있다.
적합한 표면-활성제로는, 특별히 비-이온성 제제, 예컨대 폴리옥시에틸렌소르비탄[예를 들어 트윈(상표명) 20, 40, 60, 80 또는 85] 및 다른 소르비탄[예를 들어 스판(Span: 상표명) 20, 40, 60, 80 또는 85]이 포함된다. 표면-활성제를 갖는 조성물은 편리하게는 0.05 내지 5%의 표면-활성제를 포함하고, 0.1 내지 2.5%일 수 있다. 필요하다면, 다른 구성성분들, 예를 들면 만니톨 또는 다른 약학적으로 허용가능한 비히클이 첨가될 수 있음을 인식할 것이다.
적합한 유화액은 상업적으로 입수가능한 지방 유화액, 예컨대 인트라리피드(INTRALIPID: 상표명), 리포신(LIPOSYN: 상표명), 인포누트롤(INFONUTROL: 상표명), 리포푼딘(LIPOFUNDIN: 상표명) 및 리피파이산(LIPIPHYSAN: 상표명)을 사용하여 제조될 수 있다. 활성 구성성분은 예비-혼합된 유화액 조성물에 용해되거나, 또는 다르게는 이는 오일(예를 들어 대두유, 홍화씨유, 목화씨유, 참깨유, 옥수수유 또는 아몬드유), 및 인지질(예를 들어 계란 인지질, 대두 인지질 또는 대두 레시틴) 및 물을 혼합할때 형성되는 유화액에 용해될 수 있다. 유화액의 장성(tonicity)을 조절하기 위해 다른 구성성분, 예를 들면 글리세롤 또는 글루코스가 첨가될 수 있음을 인식할 것이다. 적합한 유화액은 전형적으로 20% 이하의 오일, 예를 들면, 5 내지 20%의 오일을 함유한다. 지방 유화액은 0.1 내지 1.0 ㎛, 특별히 0.1 내지 0.5 ㎛의 지방 방울(fat droplet)을 포함할 수 있고, 5.5 내지 8.0 범위의 pH를 갖는다. 유화액 조성물은 EDB ADC를 인트라리피드(상표명) 또는 이의 성분(대두유, 계란 인지질, 글리세롤 및 물)과 혼합함으로써 제조된 것일 수 있다.
본 발명은 또한 본 방법에 사용하기 위한 키트를 제공한다. 본 발명의 키트는 본원에 기재된 바와 같은 EDB 항체 또는 EDB ADC를 함유하는 하나 이상의 용기 및 본원에 기재된 본 발명의 임의의 방법에 따라 사용하기 위한 지침서를 포함한다. 일반적으로, 이들 지침서는 상기 기재된 진단학적 또는 치료학적 처리를 위한 EDB 항체 또는 EDB ADC의 투여에 대한 설명을 포함한다.
본원에 기재된 바와 같은 EDB 항체 또는 EDB ADC의 사용과 관련된 지침서는 일반적으로 의도된 치료를 위한 투여량, 투약 계획, 및 투여 경로에 대한 정보를 포함한다. 용기는 단위 용량, 벌크 패키지(bulk package)(예를 들어, 다중-용량 패키지) 또는 하위-단위 용량일 수 있다. 본 발명의 키트에 공급된 지침서는 전형적으로 표지상의 서면 지침서 또는 패키지 삽입물(예를 들어, 키트내에 포함된 종이)이지만, 기계-판독형 지침서(예를 들어, 자기 또는 광학 저장 디스크 상에서 실행되는 지침서)가 또한 허용될 수 있다.
이러한 본 발명의 키트는 적합한 포장물로 존재한다. 적합한 포장물로는, 제한되지 않지만, 바이알, 보틀(bottle), 병, 가요성 포장물[예를 들어, 밀봉된 마일러(Mylar) 또는 플라스틱 백(plastic bags)] 등이 포함된다. 또한, 특정 장치, 예컨대 흡입기, 비강 투여 장치(예를 들어, 분무기) 또는 주입 장치, 예컨대 미니펌프와 함께 사용하기 위한 패키지가 고려된다. 키트는 멸균 진입 포트를 가질 수 있다(예를 들면 용기는 피하 주사 바늘에 의해 천공가능한 마개를 갖는 정맥내 용액 백 또는 바이알일 수 있다). 용기는 또한 멸균 진입 포트를 가질 수 있다(예를 들면 용기는 피하 주사 바늘에 의해 천공가능한 마개를 갖는 정맥내 용액 백 또는 바이알일 수 있다). 조성물중 적어도 하나의 활성제는 EDB 항체 또는 EDB ADC이다. 용기는 추가로 제2의 약학적으로 활성인 제제를 포함할 수 있다.
키트는 임의적으로 추가적인 성분, 예컨대 완충액 및 해석 정보를 제공할 수 있다. 정상적으로, 키트는 용기 및 용기 위의 또는 용기와 연결된 표지 또는 패키지 삽입물(들)을 포함한다.
투약 및 투여
본 발명은 효과적인 투여량으로 투여되는 EDB ADC를 제공한다. "효과적인 투여량" 또는 "효과량"이라는 어구는 본원에 사용될 경우 하나 이상의 임의의 유익하거나 요망하는 치료학적 결과를 달성하기 위해 필수적인 ADC, 약물, 페이로드, 화합물 또는 약학 조성물의 양을 지칭한다. 예방학적 사용을 위해, 유익하거나 요망하는 결과는 위험의 제거 또는 감소, 위중성의 경감, 또는 질환, 예컨대 질환의 생화학적, 조직학적 및/또는 행동적 증후, 그의 합병증, 및 질환의 진행동안 제시되는 중간 병리학적 표현형의 개시의 지연을 포함한다. 치료학적 사용을 위해, 유익하거나 요망하는 결과는 임상적 결과, 예컨대 다양한 EDB+ FN-발현 질환, 예컨대 암의 하나 이상의 증후의 발생 또는 증진의 감소, 질환을 치료하기 위해 필요한 다른 약제의 용량의 저하, 또 다른 약제의 효과의 향상, 및/또는 환자의 EDB+ FN-발현 질환의 진행의 지연을 포함한다.
효과적인 투여량은 1회 이상의 투여로 투여될 수 있다. ADC, 약물, 화합물, 또는 약학 조성물의 효과적인 투여량은 또 다른 약물, 화합물, 또는 약학 조성물과 함께 달성될 수 있거나, 그렇지 않을 수 있다. 이에 따라, "효과적인 투여량"은 1종 이상의 치료제를 투여하는 상황에서 고려될 수 있고, 단일 제제는, 1종 이상의 다른 제제와 함께 원하는 결과를 달성하는 경우, 효과량으로 제공되는 것으로 고려될 수 있다.
예를 들면, 암을 앓는 피험체에게 투여될 경우, 효과량은 암 세포 세포용해, 암 세포 증식의 저해, 암 세포 세포자멸의 유도, 암 세포 항원의 감소, 지연된 종양 성장, 및/또는 전이의 저해를 비롯한 항암 활성을 이끌어내기에 충분한 양을 포함한다. 종양 수축은 효능을 위한 임상적 대용 지표로서 용인된다. 효능을 위한 또 다른 용인된 지표는 무진행 생존(progression-free survival)이다.
본 발명의 EDB ADC는 임의의 적합한 경로를 통해 개별체에게 투여될 수 있다. 당분야의 숙련가라면, 본원에 기재된 예는 제한하려는 것이 아니고 이용가능한 기법을 보여주기 위한 것임을 알아야 한다. 따라서, 본 발명의 몇몇 양태에서, EDB ADC는 공지된 방법에 따라서, 예컨대 정맥내 투여, 예를 들어, 일시정맥 투여로서, 또는 일정 기간에 걸친 연속적인 주입에 의해, 근육내로, 복강내로, 뇌척수내로, 두개내(intracranial)로, 경피로, 피하로, 관절내로, 설하로, 활액내(intrasynovial)로, 취입을 통해, 척추강내로, 경구로, 흡입 또는 국부 경로에 의해 투여된다. 투여는 전신성, 예를 들어, 정맥내 투여이거나, 또는 국소적일 수 있다. 액체 제형을 위한 상업적으로 입수가능한 네뷸라이저(nebulizer), 예컨대 제트 네뷸라이저 및 초음파 네뷸라이저가 투여를 위해 유용하다. 액체 제형은 직접적으로 분무될 수 있고, 동결건조된 분말은 재구성 이후 분무화될 수 있다. 다르게는, EDB ADC는 플루오로카본 제형 및 정량 흡입기를 사용하여 분무화되거나, 동결건조되고 제분된 분말로서 흡입될 수 있다.
본 발명의 몇몇 양태에서, EDB ADC는 자리-특이적 또는 표적화된 국소 전달 기법을 통해 투여된다. 자리-특이적 또는 표적화된 국소 전달 기법의 예는 EDC ADC의 다양한 이식가능한 저장 공급원(depot source) 또는 국소 전달 카테터(catheter), 예컨대 주입 카테터, 내재(indwelling) 카테터, 또는 바늘 카테터, 합성 이식편, 외막 랩(adventitial wrap), 션트(shunt) 및 스텐트(stent) 또는 다른 이식가능한 장치, 자리 특이적 담체, 직접 주사, 또는 직접 적용을 포함한다.
본 발명의 목적을 위해, EDB ADC의 적절한 투여량은 이용되는 특별한 EDB ADC(또는 이의 조성물), 치료되는 증후의 유형 및 위중성, 제제가 치료학적 목적을 위해 투여되는지의 여부, 이전의 치료법, 환자의 임상적 병력 및 제제에 대한 반응, 투여된 제제에 대한 환자의 소실율(clearance rate), 및 담당 의사의 재량에 따라 달라질 수 있다. 임상가는 원하는 결과 이상을 달성하는 투여량이 도달될 때까지 EDB ADC를 투여할 수 있다. 용량 및/또는 빈도는 처리 과정에 걸쳐 다양할 수 있지만, 또한 일정하게 유지될 수 있다. 실험적 고려사항, 예컨대 반감기는 일반적으로 투여량의 결정에 기여할 것이다. 예를 들면, 인간 면역 시스템과 상용성인 항체, 예컨대 인간화된 항체 또는 완전한 인간 항체는, 항체의 반감기를 연장시키고 숙주의 면역 시스템에 의해 항체가 공격받는 것을 방지하기 위해 사용될 수 있다. 투여의 빈도는 치료법의 과정에 걸쳐 결정되고 조정될 수 있고, 일반적으로, 필수적인 것은 아니지만, 증후의 치료 및/또는 억제 및/또는 향상 및/또는 지연, 예를 들어, 종양 성장 저해 또는 지연 등에 기초한다. 다르게는, EDB ADC의 연속 지효성 방출 제형이 적절할 수 있다. 지효성 방출을 달성하기 위한 다양한 제형 및 장치는 당분야에 공지되어 있다.
본 발명의 목적을 위해, 전형적인 1 일 투여량은, 상기 언급된 인자에 의존하여, 약 3 ㎍/kg 내지 30 ㎍/kg 내지 300 ㎍/kg 내지 3 ㎎/㎏, 30 ㎎/㎏까지, 100 ㎎/㎏까지, 또는 그 이상의 범위일 수 있다. 예를 들면, 약 1 ㎎/㎏, 약 2.5 ㎎/㎏, 약 5 ㎎/㎏, 약 10 ㎎/㎏, 및 약 25 ㎎/㎏의 투여량이 사용될 수 있다. 질환에 따라서 수 일 또는 그 이상에 걸쳐 반복 투여하기 위해, 증후의 원하는 억제가 발생하거나 충분한 치료학적 수준이 달성될 때까지, 예를 들면, 종양 성장/진행 또는 암 세포의 전이를 저해하거나 지연시킬 때까지 치료는 지속된다. 예시적인 투약 섭생은 증가하는 용량을 투여함을 포함할 수 있다(예를 들어, 1 ㎎/㎏의 초기 용량 및 매주 또는 더 긴 기간의 하나 이상의 더 높은 용량으로의 점진적인 증가). 의사가 달성하고자 하는 약물동력학적 감소 패턴에 의존하여, 다른 투여량 섭생이 또한 유용할 수 있다. 예를 들면, 본 발명의 몇몇 양태에서, 1 주당 1 내지 4회의 투약이 고려된다. 다른 양태에서, 1 개월 마다 1회 또는 2 개월 마다 1회 또는 3 개월 마다 1회가 고려되고, 뿐만 아니라 매주, 2주 마다 1회, 및 3주 마다 1회 또한 고려된다. 이러한 치료법의 진행은 종래의 기법 및 검정에 의해 쉽게 모니터링된다. 투약 섭생(사용되는 EDB ADC 포함)은 시간에 걸쳐 다양할 수 있다.
본 발명의 몇몇 양태에서, EDB ADC의 투여량은 EDB ADC의 1회 이상의 투여(들)가 제공된 개별체에서 실험적으로 결정될 수 있다. 효능을 평가하기 위해, 질환의 표시자가 추적될 수 있다.
본 발명의 방법에 따른 EDB ADC의 투여는, 예를 들면, 수여자의 생리학적 질환, 투여 목적이 치료인지 예방인지의 여부, 및 전문의에게 공지된 다른 요인에 의존하여, 연속적이거나, 또는 간헐적일 수 있다. EDB ADC의 투여는 미리선택된 기간에 걸쳐 본질적으로 연속적일 수 있거나, 또는 일련의 간격을 둔 용량으로일 수 있다.
병용 요법
본 발명의 몇몇 양태에서, 본원에 기재된 방법은 추가로 추가적인 형태의 치료법에 의해 피험체를 치료하는 단계를 포함한다. 몇몇 양태에서, 추가적인 형태의 치료법은, 예컨대 제한되지 않지만, 화학요법, 방사선, 수술, 호르몬 치료법, 및/또는 추가적인 면역요법에서 사용되는 추가적인 항암 치료법이다.
개시된 EDB ADC는 초기 치료로서, 또는 종래의 치료법에 반응하지 않는 암의 치료를 위해 투여될 수 있다. 또한, EDB ADC는 다른 치료법(예를 들어, 외과 절제술, 방사선, 추가적인 항암 약물 등)과 병용되어 부가적인 또는 강화된 치료 효과를 이끌어내고/내거나 일부 항암제의 세포독성을 감소시킨다. 본 발명의 EDB ADC는 추가적인 제제와 공동-투여되거나 공동-제형화될 수 있거나, 또는 임의의 순서로 추가적인 제제와 연속적인 투여를 위해 제형화된다.
본 발명의 EDB ADC는 다른 치료제, 예컨대 제한되지 않지만, 치료 항체, ADC, 면역조절제, 세포독성제, 및 세포정지제와 병용되어 사용될 수 있다. 병용 요법을 위해 유용한 대표적인 제제는 또한 "약물"이라는 소제목하에 EDB ADC의 제조를 위해 유용한 것으로 상기 본원에 기재된 임의의 약물을 포함한다.
치료제로는, 제한되지 않지만, 화학치료제, 백신, CAR-T 세포-기반 치료법, 방사선요법, 사이토킨 치료법, 백신, 이중특이성 항체, ADC, 다른 면역억제 경로의 저해제, 혈관형성의 저해제, T 세포 활성화제, 대사 경로의 저해제, mTOR 저해제, 아데노신 경로의 저해제, 티로신 키나아제 저해제, 예컨대 제한되지 않지만 인라이타(inlyta), ALK 저해제 및 수니티닙(sunitinib), BRAF 저해제, 후성적(epigenetic) 변형제, Treg 세포 및/또는 골수-유래 억제자 세포의 저해제 또는 감소제, JAK 저해제, STAT 저해제, 사이클린(cyclin)-의존성 키나아제 저해제, 생물치료제(제한되지 않지만, VEGF. VEGFR, EGFR, Her2/neu1, 다른 성장 인자 수용체, CD20, CD40, CD-40L, CTLA-4, OX-40, 4-18B, 및 ICGS에 대한 항체), 면역원성 제제[예를 들면, 약화된 암 세포, 종양 항원, 항원 제시 세포, 예컨대 종양 유래된 항원 또는 핵산에 의해 작동된 수지상 세포, 면역 자극 사이토킨(예를 들면, IL-2, IFNa2, GM-CSF), 및 면역자극 사이토킨, 예컨대 제한되지 않지만 G-CSF를 인코딩하는 유전자에 의해 형질감염된 세포]가 포함된다.
단독으로 사용되거나 ADC로서 사용될 수 있는 추가의 대표적인 항체로는, 제한되지 않지만, 항-5T4 항체(예를 들어, A1, A2, 및 A3), 항-CD19 항체, 항-CD20 항체[예를 들어, 리툭산(RITUXAN: 등록상표), 제발린(ZEVALIN: 등록상표), 벡사르(BEXXAR: 등록상표)], 항-CD22 항체, 항-항체[예를 들어, 마일로타르그(MYLOTARG: 등록상표)], 항 CD33 항체-약물 접합체, 항-루이스(Lewis) Y 항체(예를 들어, Hu3S193, Mthu3S193, AGmthu3S193), 항-HER-2 항체[예를 들어, 헤르셉틴(HERCEPTIN: 등록상표)(트라스투추맙: trastuzumab), MDX-210, OMNITARG.RTM(페르투추맙(pertuzumab), rhuMAb 2C4)], 항-CD52 항체[예를 들어, 캄패트(CAMPATH: 등록상표)], 항-EGFR 항체[예를 들어, 에르비툭스(ERBITUX: 등록상표)(세툭시맙: cetuximab), ABX-EGF(파니투무맙: panitumumab)], 항-VEGF 항체[예를 들어, 아바스틴(AVASTIN: 등록상표)(베바시추맙: bevacizumab)], 항-DNA/히스톤(histone) 복합 항체(예를 들어, ch-TNT-1/b), 항-CEA 항체[예를 들어, CEA-시데(Cide), YMB-1003], hLM609, 항-CD47 항체(예를 들어, 6H9), 항-VEGFR2(또는 키나아제 삽입 도메인-함유 수용체, KDR) 항체(예를 들어, IMC-1C11), 항-Ep-CAM 항체(예를 들어, ING-1), 항-FAP 항체[예를 들어, 시브로투추맙(sibrotuzumab)], 항-DR4 항체(예를 들어, TRAIL-R), 항-프로게스테론 수용체 항체(예를 들어, 2C5), 항-CA19.9 항체[예를 들어, 지바렉스(GIVAREX: 등록상표)] 및 항-피브린 항체(예를 들어, MH-1)가 포함된다.
화학치료제의 예로는 알킬화제, 예컨대 티오테파 및 사이클로포스파미드; 알킬 설포네이트, 예컨대 부설판(busulfan), 임프로설판(improsulfan) 및 피포설판(piposulfan); 아지리딘(aziridine), 예컨대 벤조도파(benzodopa), 카르보쿠온(carboquone), 메투레도파(meturedopa), 및 우레도파(uredopa); 에틸렌이민(ethylenimine) 및 메틸멜라민(methylmelamine), 예컨대 알트레타민(altretamine), 트리에틸렌멜라민, 트리에틸렌포스포르아미드, 트리에틸렌티오포스포르아미드 및 트리메틸올로멜라민; 아세토게닌(acetogenin),[특별히 불라타신(bullatacin) 및 불라타시논(bullatacinone)]; 캄포테신(camptothecin)[예컨대 합성 유사체 토포테칸(topotecan)]; 브리오스타틴(bryostatin); 칼리스타틴(callystatin); CC-1065[예컨대 그의 아도젤레신(adozelesin), 카르젤레신(carzelesin) 및 비젤레신(bizelesin) 합성 유사체); 크립토피신(cryptophycin)[특별히 크립토피신 1 및 크립토피신 8); 돌라스타틴; 두오카르마이신(예컨대 합성 유사체, KW-2189 및 CBI-TMI); 엘레우테로빈(eleutherobin); 판크라티스타틴(pancratistatin); 사르코딕티인(sarcodictyin); 스폰기스타틴(spongistatin); 질소 머스타드, 예컨대 클로람부실, 클로르나파진(chlornaphazine), 클로로포스파미드, 에스트라무스틴(estramustine), 이포스파미드, 메클로르에타민(mechlorethamine), 메클로르에타민 옥사이드 하이드로클로라이드, 멜팔란, 노벰비킨, 페네스테린, 프레드니무스틴, 트로포스파르니드, 우라실 머스터드; 니트로스우레아, 예컨대 카르무스틴, 클로로조토신, 포테무스틴, 로무스틴, 니무스틴, 라니무스틴; 항생제, 예컨대 에네디인 항생제{예를 들어 칼리케아미신, 특별히 칼리케아미신 감마 I 및 칼리케아미신 phiM[예를 들어, 아그뉴(Agnew)의 문헌 "Chem. Intl. Ed. Engl., 33: 183-186 (1994)" 참조]; 다이네미신, 예컨대 다이네미신 A; 비스포스포네이트, 예컨대 클로드로네이트; 에스페라미신; 뿐만 아니라 네오카르지노스타틴(neocarzinostatin) 발색단 및 관련된 색소단백질 에네디인 항생제 발색단}, 아클라시노마이신스, 악티노마이신, 아우트라마이신, 아자세린, 블레오마이신, 칵티노마이신, 카라비신, 카르미노마이신, 카르지노필린, 크로모마이신, 닥티노마이신, 다우노루비신, 데토루비신, 6-디아조-5-옥소-L-노르로이신, 독소루비신(예컨대, 모폴리노-독소루비신, 시아노모폴리노-독소루비신, 2-피롤리노-독소루비신, 및 데옥시독소루비신), 페길화된(pegylated) 리포솜성 독소루비신, 에피루비신, 에소루비신, 이다루비신, 마르셀로마이신, 미토마이신, 예컨대 미토마이신 C, 마이코페놀산, 노갈라마이신, 올리보마이신, 페플로마이신, 포트피로마이신, 퓨로마이신, 쿠엘라마이신, 로도루비신, 스트렙토니그린, 스트렙토조신, 투베르시딘, 우베니멕스, 지노스타틴, 조루비신; 대사길항물질, 예컨대 메토트렉세이트 및 5-플루오로우라실(5-FU); 엽산 유사체, 예컨대 데노프테린, 메토트렉세이트, 프테로프테린, 트리메트렉세이트; 퓨린 유사체, 예컨대 플루다라빈, 6-머캅토퓨린, 티아미프린, 티오구아닌; 피리미딘 유사체, 예컨대 안시타빈, 아자시티딘, 6-아자우리딘, 카르모푸르, 사이타라빈, 디데옥시우리딘, 독시플루리딘, 에노시타빈, 플록수리딘; 안드로겐, 예컨대 칼루스테론, 드로모스타놀론 프로피오네이트, 에피티오스타놀, 메피티오스탄, 테스토락톤; 항-부신성 제제, 예컨대 아미노글루테티미드, 미토탄, 트릴로스탄; 엽산 보충액, 예컨대 프롤린산; 아세글라톤; 알도포스파미드 글리코시드; 아미노레불린산; 에닐우라실; 암사크린; 베스트라부실; 비산트렌; 에다트렉세이트; 데포파민; 데메콜신; 디아지쿠온; 엘포르미틴; 엘립티니움 아세테이트; 에포틸론(epothilone); 에토글루시드; 질산 갈륨; 하이드록시우레아; 레티난; 로니다민; 메이탄시노이드, 예컨대 메이탄신 및 안사미토신; 미토구아존; 미톡산트론; 모피다몰; 니트라크린; 펜토스타틴; 페나메트; 피라루비신; 로속잔트론(losoxantrone); 포도필린산; 2-에틸하이드라자이드; 프로카르바진; 라족산; 리족신(rhizoxin); 시조피란; 스피로게르마늄; 테누아존산; 트리아지쿠온; 2,2',2"-트리클로로트리에틸아민; 트리코테센[특별히 T-2 독소, 베라쿠린(verracurin) A, 로리딘(roridin) A 및 안구이딘(anguidine)]; 우레탄; 빈데신; 다카르바진; 만노무스틴; 미토브로니톨; 미토락톨; 피포브로만; 가사이토신; 아라비노시드("Ara-C"); 사이클로포스파미드; 티오테파; 탁소이드, 예를 들어 파클리탁셀 및 도세탁셀; 클로람부실; 겜시타빈; 6-티오구아닌; 머캅토퓨린; 메토트렉세이트; 백금 유사체, 예컨대 시스플라틴 및 카보플라틴; 빈블라스틴; 백금; 에토포시드(VP-16); 이포스파미드; 미톡산트론; 빈크리스틴; 비노렐빈; 노반트론; 테니포시드; 에다트렉세이트(edatrexate); 다우노마이신; 아미노프테린; 젤로다; 이반드로네이트; CPT-11; 토포이소머라아제 저해제 RFS 2000; 디플로오로메틸오르니틴(DMFO); 레티노이드, 예컨대 레티노산; 카페시타빈; 및 임의의 상기 화합물의 약학적으로 허용가능한 염, 산 또는 유도체가 포함된다.
또한, 종양 상에서의 호르몬 작용을 조절하거나 저해하는 작용을 하는 항-호르몬제, 예컨대 항-에스테르겐 및 선택적 에스트로겐 수용체 조절인자(SERM: selective estrogen receptor modulator)가 포함되고, 예를 들면, 타목시펜, 랄록시펜, 드롤록시펜(droloxifene), 4-하이드록시타목시펜, 트리옥시펜, 케옥시펜, LY117018, 오나프리스톤, 및 토레미펜[파레스톤(Fareston)]; 부신에서 에스트로겐 생산을 조절하는, 방향화효소를 저해하는 방향화효소 저해제, 예컨대, 예를 들면, 4(5)-이미다졸, 아미노글루테티미드, 메게스트롤(megestrol) 아세테이트, 엑세메스탄(exemestane), 포르메스탄(formestane), 파드로졸(fadrozole), 보로졸(vorozole), 레트로졸(letrozole), 및 아나스트로졸(anastrozole); 및 항-안드로겐제, 예컨대 플루타미드, 닐루타미드, 비칼루타미드, 류프롤리드, 및 고세렐린; 및 상기 임의의 화합물의 약학적으로 허용가능한 염, 산 또는 유도체가 포함된다.
몇몇 양태에서, EDB ADC는 크리조티닙(crizotinib), 팔보시클립(palbociclib), 겜시타빈, 사이클로포스파미드, 플루오로우라실, 폴폭스(FOLFOX), 엽산, 옥살리플라틴(oxaliplatin), 악시티닙(axitinib), 수니티닙 말레이트(sunitinib malate), 토파시티닙(tofacitinib), 베바시추맙, 리툭시맙(rituximab), 및 트라츠투추맙(traztuzumab)과 병용하여 사용될 수 있다.
하나의 양태에서, EDB ADC에 의한 치료 이후, 림프구에 침윤하는 종양의 증가, CD8/CD4 비의 증가, F4/80+ 대식세포의 증가, 및/또는 면역조절 단백질, 예컨대 PDL1 및 41BB의 증가, 또는 임의의 이의 조합이 발생될 수 있다. 이에 따라, EDB ADC 및 면역 관문 저해제 또는 면역-항암(IO: immune-oncology) 제제, 예컨대 항-41BB 작용물질 및/또는 항-PDL1 길항물질 단일클론성 항체의 병용은 효과적일 수 있다(실시예 12 참조). 추가로, 본 발명의 EDB ADC는 단독으로 면역조절성 및 면역-항암(IO) 제제 능력을 부여하는 기작을 가질 수 있고, 이는 병용 요법에 의해 증가될 수 있다.
몇몇 양태에서, EDB ADC는 면역 관문 조절인자를 표적화하는 하나 이상의 치료제, 예컨대 제한되지 않지만, PD-1, PD-L1, CTLA-4, LAG-3, B7-H3, B7-H4, B7-DC(PD-L2), B7-H5, B7-H6, B7-H8, B7-H2, B7-1, B7-2, ICOS, ICOS-L, TIGIT, CD2, CD47, CD80, CD86, CD48, CD58, CD226, CD155, CD112, LAIR1, 2B4, BTLA, CD160, TIM1, TIM-3, TIM4, VISTA(PD-H1), OX40, OX40L, GITR, GITRL, CD70, CD27, 4-1BB, 4-BBL, DR3, TL1A, CD40, CD40L, CD30, CD30L, LIGHT, HVEM, SLAM(SLAMF1, CD150), SLAMF2(CD48), SLAMF3(CD229), SLAMF4(2B4, CD244), SLAMF5(CD84), SLAMF6(NTB-A), SLAMCF7(CS1), SLAMF8(BLAME), SLAMF9(CD2F), CD28, CEACAM1(CD66a), CEACAM3, CEACAM4, CEACAM5, CEACAM6, CEACAM7, CEACAM8, CEACAM1-3AS CEACAM3C2, CEACAM1-15, PSG1-11, CEACAM1-4C1, CEACAM1-4S, CEACAM1-4L, IDO, TDO, CCR2, CD39-CD73-아데노신 경로(A2AR), BTKs, TIKs, CXCR2, CCR4, CCR8, CCR5, VEGF 경로, CSF-1, 또는 선천적 면역 반응 조절인자를 표적화하는 제제(예컨대 항체)와 병용하여 사용될 수 있다.
병용 요법을 위해, EDB ADC 및/또는 하나 이상의 추가적인 치료제는 의도되는 치료법의 성능에 적합한 임의의 시간 프레임(time frame)내에서 투여된다. 이에 따라, 단일 제제는 실질적으로 동시에(즉, 단일 제형으로서 또는 수 분 또는 수 시간 이내에) 또는 임의의 순서로 연속적으로 투여될 수 있다. 예를 들면, 단일 제제는 서로 약 1 년 이내에, 예컨대 약 10, 8, 6, 4, 또는 2 개월 이내에, 또는 4, 3, 2 또는 1 주 이내에, 약 5, 4, 3, 2 또는 1 일 이내에 투여될 수 있다.
개시된 병용 요법은 상승적인 치료 효과, 즉 이들의 개별적인 효과 또는 치료 결과의 합에 비해 더 큰 효과를 이끌어낼 수 있다. 예를 들면, 상승적인 치료 효과는 단일 제제에 의해 유도되는 치료 효과 또는 소정의 조합의 단일 제제에 의해 유도되는 치료 효과의 합에 비해 적어도 약 2 배 이상의 효과, 또는 적어도 약 5 배 이상, 또는 적어도 약 10 배 이상, 또는 적어도 약 20 배 이상, 또는 적어도 약 50 배 이상, 또는 적어도 약 100 배 이상일 수 있다. 상승적인 치료 효과는 또한 단일 제제에 의해 유도되는 치료 효과, 또는 소정의 조합의 단일 제제에 의해 유도되는 치료 효과의 합과 비교하여 적어도 10%, 또는 적어도 20%, 또는 적어도 30%, 또는 적어도 40%, 또는 적어도 50%, 또는 적어도 60%, 또는 적어도 70%, 또는 적어도 80%, 또는 적어도 90%, 또는 적어도 100%, 또는 그 이상의 치료 효과의 증가로서 관찰될 수 있다. 상승적인 효과는 또한 병용하여 사용될 경우 치료제의 감소된 투약을 허용하는 효과이다.
실시예
본 발명을 실행하기 위한 특정 양태의 하기 실시예는 본 발의 범주를 단지 예시할 목적으로 제공되는 것이지 어떠한 방식으로도 제한하려는 것이 아니다. 실제로, 본원에 제시되고 기재된 변형에 더하여 본 발명의 다양한 변형은 상기 기재내용으로부터 당분야의 숙련가에게 명백할 것이고 첨부된 특허청구범위의 범주에 속할 것이다.
실시예 1
항-EDB 항체의 생성 및 접합을 위한 제조
항-EDB 항체의 생성
EDB에 결합하는 다양한 전체 인간 항체를 인코딩하는 cDNA를 표준 분자 생물학 방법에 의해 작성하고, EDB에 특이적으로 결합하는 L19 인간 단일클론성 항체(이후 본원에서 "항-EDB-L19" 또는 "EDB-L19" 항체)로부터 유도하였다. EDB-L19 항체는 위치 356에서 아스파르트산(D)을 갖고 위치 358에서 로이신(L)을 갖는(카밧의 EU 색인에 따름) G1m(a) 알로타입의 인간 IgG1 불변성 영역 및 인간 카파 경쇄 불변성 영역을 포함한다. EDB-L19 항체 중쇄 및 경쇄 가변성 영역은 각각 서열 번호 1 및 10에 제시되고, 중쇄 및 경쇄는 각각 서열 번호 8 및 15에 제시된다.
비-면역원성 항체를 생산하기 위해, 위치 356에서 글루탐산(E)을 갖고 위치 358에서 메티오닌(M)을 갖는(카밧의 EU 색인에 따름) 비-G1m(a) 알로타입을 EDB-L19 중쇄내로 도입하였다. 중쇄를 생성하기 위해, EDB-L19 중쇄 가변성 영역을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을, Glmz, 비-(a), 비-(x) 알로타입을 갖는 인간 IgG1 불변성 영역 cDNA에 융합시켰다. 몇몇 양태에서, EDB-L19 항체 IgG1 불변성 영역의 C-말단 라이신(K)을 제거함으로써 항체를 추가로 변경시켜 항체의 전하 변형체를 감소시키고 동종성을 증가시켜 EDB-PFE HC(서열 번호 17)를 생성하였다. EDB-PFE 항체 중쇄 및 경쇄는 각각 서열 번호 17 및 15에 제시된다.
표 4에서 볼 수 있듯이, 프린스 오토샘플러(Prince Autosampler)가 구비된 iCE3을 사용하여 영상화 모세관 전기영동(iCE: imaged capillary electrophoresis)을 수행함으로써 항체 제조를 위한 전하 변형체의 퍼센트를 결정하였다. EDB-L19 항체는 EDB-PFE 항체와 비교하여 세포 배양 동안에 불완전한 C-말단 라이신 가공의 결과로서 항체의 주요 피이크의 감소 및 기본 종의 실질적인 증가를 나타내었다.
Figure 112019049414387-pct00024
조작된 시스테인 잔기를 통한 자리-특이적 접합을 위한 항체
반응성의 조작된 시스테인 잔기를 통해 다양한 연결기-페이로드로 자리-특이적 접합을 하기 위한 항-EDB 항체를 제조하는 방법을 일반적으로 PCT 국제 특허출원 공개공보 제WO2013/093809호(이는 본원에 참고로 그의 전체가 인용됨)에 기재된 바와 같이 수행하였다. 중쇄, 예컨대 위치 K290(카밧의 EU 색인에 따름), 또는 경쇄, 예컨대 K183(카밧에 따름) 상의 하나 이상의 잔기를 자리-지정 돌연변이생성에 의해 시스테인(C) 잔기로 변경하였다.
몇몇 양태에서, EDB-PFE 항체의 인간 IgG1 중쇄 불변성 영역에서 위치 K290(카밧의 EU 색인에 따름)을 반응성 시스테인(C)으로 치환함으로써 자리-특이적 접합을 가능하게 하여 EDB-(K290C) HC(서열 번호 19)를 생성하였다. 다른 양태에서, 인간 카파 경쇄 불변성 영역에서 잔기 K183(카밧에 따름)를 반응성 시스테인(C)으로 치환함으로써 자리-특이적 접합을 가능하게 하여 EDB-(κK183C) LC(서열 번호 31)를 생성하였다.
조작된 글루타민 잔기를 통한 자리 특이적 접합을 위한 항체
다양한 연결기-페이로드에 접합하기 위해, 다양한 아미노산 위치에서 반응성 글루타민 잔기, 예컨대 글루타민-함유("Q") 태그에 의해 조작된 인간 IgG1 아형을 갖는 항-EDB 항체를 발현시켰다. 반응성 글루타민 잔기를 통해 자리-특이적 접합을 하기 위한 항-EDB 항체를 제조하는 방법을 일반적으로 PCT 국제 특허출원 공개공보 제WO2012/059882호(이는 본원에 참고로 그의 전체가 인용됨)에 기재된 바와 같이 수행하였다.
몇몇 양태에서, H16-글루타민 태그 LLQG(서열 번호 40)를 EDB-PFE 항체의 인간 IgG1-Fc 영역에서 조작하여 DAR 2 트랜스글루타미나아제 중재된 자리-특이적 접합을 가능하게 하였다. 예를 들면, EDB-PFE 항체 중쇄에서, 위치 E294-N297(카밧의 EU 색인에 따름)의 아미노산을 H16-글루타민-함유 태그 LLQG(서열 번호 40)에 의해 대체하였다. 다른 양태에서, 조작된 H16-글루타민-함유 태그로의 접합의 특이성을 증가시키기 위해 항체를 추가로 변경시켰다. 중쇄 상의 위치 222(카밧의 EU 색인에 따름)에서의 라이신(K) 아미노산을 아르기닌(R)에 의해 치환하여 EDB-(H16-K222R) HC(서열 번호 27)를 생성하였다. K222R 치환은 동종성 ADC의 증가, 항체 및 연결기-페이로드 사이의 개선된 분자간 가교결합, 및/또는 항체 경쇄의 C-말단 상의 H16-글루타민-함유 태그에 의한 쇄간 가교결합의 유의적인 감소를 제공하였다.
잠재적인 화학적 부담
특별히 CDR내에서의 잠재적인 화학적 부담은 분자 이종성에 영향을 주고 추정적인 단백질 당화반응 자리에서의 항원 결합을 초래할 수 있다. 단백질 당화반응은 세포 배양 동안에 재조합 항체에서 발생할 수 있는 비-효소적인 글리코실화 반응이고, 당화된 단백질은 추가의 반응을 거쳐, 총체적으로 최종 당화 산물(advanced glycation end product)로서 지칭되는, 불량한 특징의 이종성 생성물을 생성할 수 있다. 잠재적 당화반응 부담을 약화시키기 위해, EDB-L19 중쇄 가변성 영역에서 CDR3에 인접한 위치 K94(카밧의 넘버링)를 아르기닌(R)으로 돌연변이시켜 EDB-(K94R) VH(서열 번호 21)를 생성하고, 이어서 인간 IgG1 불변성 영역에 융합시켜 EDB-(K94R) HC(서열 번호 23)를 생성하였다. K94R 당화반응 돌연변이를 또한 자리-특이적 접합을 위해 조작된 EDB-(K290C) 및 EDB-(H16-K222R) 중쇄에 도입하여 각각 EDB-(K94R-K290C) HC(서열 번호 25) 및 EDB-(K94R-H16-K222R) HC(서열 번호 29)를 생성하였다.
실시예 2
EDB 항체 변형체 결합 특성의 특징화
결합 친화도 분석
표면 플라스몬 공명(SPR: surface plasmon resonance)을 사용하여, 재조합 인간, 사이노몰구스 원숭이 및 래트 7-EDB-89(각각 서열 번호 34, 서열 번호 35 및 서열 번호 36)에 대한 항-EDB 항체 변형체의 결합 반응속도론(kinetics)을 특징짓고, K94R 당화반응 돌연변이를 갖는 항-EDB 항체의 결합 특성이 완전히 보유되었음을 확인하였다. 표면으로부터 굴절되는 레어저 광의 표면 SPR에 의해 결합을 검출하였다. 신호 반응속도론의 결합-속도(ka) 및 해리-속도(kd)에 대한 분석은, 비-특이적 상호작용 및 특이적 상호작용 사이의 구별을 허용한다.
항-인간 IgG 항체[지이 헬쓰케어(GE Healthcare)]를 제조업체의 프로토콜(protocol)에 따라서 CM5 카복시메틸화된 덱스트란 코팅된 센서 칩(sensor chip)의 모든 4개의 플로우 셀(flow cell) 상으로 약 10,000 공명 단위(RU: resonance unit)의 밀도로 공유적으로 아민 커플링시키고, 이어서 각각의 항-EDB 항체 변형체를 대략 60-90 RU의 수준으로 포획하였다. 사용된 이동 및 샘플 완충액은 HBS-EP+ 완충액(0.01M HEPES, 0.15M NaCl, 3mM EDTA, 및 0.05(부피/부피)% 계면활성제 P20 pH7.4)이었다. 600nM 내지 11.1nM 농도 범위의 7-EDB-89의 3-배 연속 희석물을 50 ㎕/분의 유량으로 60 초 결합 및 120 초 해리 동안 표면 상으로 주입하였다. 이어서 표면을 3M MgCl2의 30 초 펄스(pulse), 이온 재생 완충액(0.46M KSCN, 1.83M MgCl2, 0.92M 우레아, 및 1.83M 구아니딘-HCl pH 7.4)의 30 초 펄스에 의해 재생시키고, 이어서 HBS-EP+ 이동 완충액의 30 초 펄스에 의해 평형화시켰다. 모든 SPR 검정을, 비아코어(BIAcore: 등록상표) T200 기기(지이 헬쓰케어)를 사용하여 1 Hz의 데이터 수집 속도로 25℃에서 수행하였다. 대조 표면 및 완충액 주입 둘 다를 사용하여 생성된 센서그램(sensorgram)을 2중으로 참조하였다[미스즈카(Myszka, D. G.)의 문헌 "J. Mol. Recognit., 12: 279-284, 1999"]. 비아코어(등록상표) T200 평가 소프트웨어 v2.0 및 식 KD = kd/ka에 의해 데이터를 1 : 1 랑뮤(Langmuir) 모델에 정합시킴으로써 속도 상수를 결정하였다. 각각의 실험을 이중으로 실행하고 평균 KD를 결정하였다. 표 5에서 볼 수 있듯이, EDB-L19 및 EDB-(K94R) 항체는 인간 7-EDB-89에 대한 필적할만한 결합을 나타낸다. t1/2 = 반감기, R최대값 = 최대 반응, RU = 공명 단위.
Figure 112019049414387-pct00025
추가로, EDB-L19 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C) 항체의 인간, 사이노몰구스 원숭이 및 래트 7-EDB-89에 대한 결합 친화도를 결정하였다. 도 6에서 볼 수 있듯이, EDB-L19 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C) 항체의 결합 친화도는 유사하였다. 표 7에서 볼 수 있듯이, EDB-(κK183C-K94R-K290C) 항체의 인간, 사이노몰구스 원숭이 및 래트 7-EDB-89에 대한 결합 친화도는 필적할만 하였고, 이로써 EDB-L19 항체의 조작 이후 교차-종 반응성이 보유되어 자리-특이적 접합 및 추정적 당화반응 자리의 제거를 가능하게 하였음을 확인하였다.
Figure 112019049414387-pct00026
Figure 112019049414387-pct00027
ELISA에 의한 경쟁적 결합
비오틴화된(biotinylated) EDB-L19에 의한 경쟁 ELISA를 사용함으로써 EDB-(K94R) 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C) 항체의 결합 특성을 추가로 평가하여 EDB에 대한 결합이 완전히 유지되었음을 확인하였다. 인간 7-EDB-89(서열 번호 34)를 96-웰 ELISA 플레이트 상으로 고정화시키고(100 ng/웰), 20 ng/㎖의 비오틴화된 EDB-L19 항체를 첨가하여 다양한 농도의 변형된 항-EDB 항체 샘플과 경쟁시키고, 항-스트렙타비딘(Streptavidin)-HRP 항체[서던 바이오텍(Southern Biotech), 알라바마주 버닝햄]를 사용하여 결합을 검출하였다.
도 1a 및 표 8에서 볼 수 있듯이, EDB-L19 및 EDB-(K94R) 항체는 유사한 절반의 최대 저해 농도 값(half maximal inhibition concentration value)을 가졌다. 도 1b 및 표 9는 EDB-(K94R) 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C) 항체가 또한 유사한 절반의 최대 저해 농도 값을 가졌음을 보여준다. 이로부터, EDB-(K94R) 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C 변형된 항체가 EDB 결합 특성을 보유하였고 중쇄의 (K94R) 변형 및/또는 자리-특이적 접합을 위한 반응성의 조작된 시스테인의 도입이 EDB에 대한 결합을 변경시키지 않았음을 알 수 있다.
Figure 112019049414387-pct00028
Figure 112019049414387-pct00029
결합력 분석
EDB에 결합하는 EDB-L19 항체의 친화도는 ∼230nM에서의 낮은 결합 상호작용인 것으로 결정되었다. 그러므로, 결합력이 종양 미세환경에서의 차등적인 표적 수준에 대한 결합에 영향을 미치는지의 여부에 대하여 조사하기 위해 SPR을 사용하였다. 다양한 밀도의 인간 7-EDB-89(서열 번호 34)를 CM5 카복시메틸화된 덱스트란 코팅된 센서 칩의 개별 플로우 셀 상으로 공유적으로 아민 커플링시켰다. 이동 및 샘플 완충액은 결합 친화도 분석을 위해 상기 기재된 바와 같았다. 6nM 내지 0.074nM 농도 범위의 EDB-L19 항체의 3-배 연속 희석물을 50 ㎕/분의 유량으로 110 초의 결합 및 900 초의 해리 동안 주입하였다. 이어서 표면을 이온 재생 완충액(0.46M KSCN, 1.83M MgCl2, 0.92M 우레아, 및 1.83M 구아니딘-HCl pH 7.4)의 2회의 30 초 펄스에 의해 재생시키고, 이어서 HBS-EP+ 이동 완충액의 30 초 펄스에 의해 평형화시켰다. 각각의 실험을 이중으로 실행하고, 평균 ka, kd 및 KD를 결정하였다.
표 10에서 알 수 있듯이, 결과는 고정화된 인간 7-EDB-89가 증가할 경우, 해리-속도(kd)는 느려지고 후속적인 친화도는 증가하였음을 보여주었다. 겉보기 KD 값은 인간 7-EDB-89의 고정화 수준에 비례하였고, 이는 EDB-L19 항체가 큰 결합력 성분에 의해 EDB에 결합함을 확인하였다.
Figure 112019049414387-pct00030
항-EDB 항체의 다중반응성(polyreactivity)
다중반응성은 생체내에서의 신속한 소실[호트첼(Hotzel) 등의 문헌 "mAbs 4(6): 753-760, 2012"] 및 원치않는 단백질-단백질 상호작용[수(Xu) 등의 문헌 "Protein Eng Des Sel 26(10): 663-670 (2013)"]과 연관되어 왔다. DNA 및 인슐린 직접 결합 ELISA는 임상적으로 인증된 항체의 공지된 약물동력학(PK)과 상관되는 것으로 보여진다. 10 ㎍/㎖에서 출발하는 항체의 연속 희석물을, ELISA 플레이트 상으로 직접적으로 코팅된 DNA 또는 인슐린으로의 결합에 대한 엄격성이 낮은 검정에서 4중으로 평가하였다.
표 11에서 볼 수 있듯이, EDB-(K94R) 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C) 항체는 둘 다 최적의 PK 특성을 갖는 음성 대조군에 비해 더 높거나 필적할만한 매우 낮은 다중반응성 스코어를 갖는다. 추가로, 다중반응성 스코어는 불량한 PK를 갖고 신속한 소실을 초래하는 양성 대조군 항체에 비해 유의적으로 더 낮았다.
Figure 112019049414387-pct00031
FcRn 크로마토그래피
FcRn 크로마토그래피를 이용하여 반응성의 조작된 시스테인의 야생형 IgG1 불변성 영역으로의 도입이 FcRn-의존성 약물동력학에 미치는 잠재적인 전하-중재된 영향을 조사하였다. FcRn 칼럼 방법을 사용하는 항체의 평가는, 용출 시간이 인간 및 비-인간 영장류 소실과 양성 상관관계를 나타내었음을 입증하였다[스코흐(Schoch A.) 등의 문헌 "PNAS, 2015, Vol. 112"]. FcRn 친화도 칼럼을 스클로타우어(Schlothauer) 등의 문헌[MAbs 5(4): 576-586, 2013]에 따라 준비하였다. 그런 다음, 50 ㎍의 EDB-(κK183C-K94R-K290C) 항체 또는 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101 ADC를 주입하고, 이어서 용출액으로서 20mM MES, 150mM NaCl, pH 5.5 및 20mM 트리스, 150mM NaCl, pH 8.8을 사용하여 60 분 이내에 pH 5.5에서 8.8까지의 선형 pH 구배(30 CV)에 의해 용출시켰다.
표 12에서 볼 수 있듯이, EDB-(κK183C-K94R-K290C) 항체 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101 ADC의 FcRn 칼럼 상대적 용출 시간은 허용가능한 PK 매개변수와 일치하였다. 이들 데이터는 반응성의 조작된 시스테인 잔기 K290의 IgG1 불변성 영역으로의 혼입이 FcRn 결합에 영향을 주지 않음을 입증한다.
Figure 112019049414387-pct00032
실시예 3
EDB ADC의 생체접합
본 발명의 항-EDB 항체를 연결기를 통해 약물/페이로드에 접합시켜 EDB ADC를 생성하였다. 사용된 접합 방법은 종래의 접합(즉 무작위 시스테인 잔기를 통해) 또는 자리-특이적 접합(즉, 조작된 시스테인 잔기 또는 조작된 글루타민 잔기를 통해)이었다. 표 13은 다양한 EDB ADC에 대해 사용된 접합 방법을 보여준다.
방법 A: 시스테인 잔기를 통한 종래의 접합
PBS, pH 7.2중 27 mg/㎖의 항-EDB 항체를 37℃에서 2 시간 동안 2.3 내지 2.6 배(m/m)의 TCEP에 의해 환원시키고, 이어서 접합시켰다. 몰 비는 일반적으로 2.5 배였지만, 약 4.0의 최적의 최종 평균 DAR을 달성하기 위한 항체 접합체의 양에 따라 최적화되었다. 부분적으로 환원된 항체를 10% DMA가 함유된 PBS중에서 6 내지 7 배(m/m)의 연결기-페이로드와 25℃에서 1 시간 동안 접합시켰다. 과량의 연결기-페이로드를 L-시스테인에 의해 25℃에서 15 분 동안 급랭시켰다. 조질의 ADC를 PBS중에서 4 내지 6℃에서 하룻밤 투석하였다.
조질의 ADC를 크기 배제 크로마토그래피(SEC)에 의해 PBS중에서 수퍼덱스(Superdex) 200 상에서 정제하고, 수집된 단량체 피이크를 4 내지 6℃에서 저장하거나 20mM 히스티딘, 8.5% 수크로스, pH 5.8에서 투석하고; 멸균 여과하고 -70℃에서 동결시켰다. 음성 대조군 huNeg-8.8 항체를 동일한 방법에 의해 접합시켰다.
방법 B: 조작된 시스테인 잔기를 통한 자리-특이적 접합
PBS, pH 7.2중에서 27.2 mg/㎖로 반응성의 조작된 시스테인 잔기에 의해 생성된, 2 그램의 항-EDB 항체를 15 배(m/m)의 TCEP에 의해 37℃에서 7 시간 동안 환원시키고, PBS중에서 세파덱스(Sephadex: 등록상표) G-25 상에서 탈염시켜 과량의 TCEP를 제거하였다. 쇄간 시스테인을 30 배 DHA(m/m)에 의해 4 내지 6℃에서 하룻밤 산화시켰다. PBS중에서 세파덱스(등록상표) G-25 상에서 탈염시킴으로써 DHA를 제거하였다. 자리-특이적 시스테인의 바람직한 시스테인 캐핑(capping) 대신에, 더 높은 정도로 글루타티온 캐핑된 ADC를 위해, 환원을 위한 100 배의 TCEP(m/m)를 사용하였다.
환원되고 산화된 항체를 10% DMA가 함유된 PBS중에서 25℃에서 2 시간 동안 9 배(m/m)의 연결기-페이로드와 접합시켰다. 과량의 연결기-페이로드를 9 배(m/m)의 L-시스테인에 의해 25℃에서 15 분 동안 급랭시켰다. 조질의 ADC를 하룻밤 PBS중에서 4 내지 6℃에서 투석하였다.
조질의 ADC를 PBS중에서 수퍼덱스 200 상에서 SEC에 의해 정제하고, 수집된 단량체 피이크를 20mM 히스티딘, 8.5% 수크로스, pH 5.8에서 투석하고; 멸균 여과하고 -70℃에서 동결시켰다. 음성 대조군 huNeg-8.8 항체를 동일한 방법에 의해 접합시켰다.
방법 C: 조작된 글루타민 잔기를 통한 자리-특이적 접합
반응성의 조작된 글루타민 잔기에 의해 생성된 항-EDB 항체를 반응 완충액( 100mM 인산염, 200mM NaCl, pH 7.0)에서 투석하였다. 100mM 인산 칼륨, 200mM NaCl, 10% DMSO중에서 항체 1 ㎎ 당 1 유닛의 시판중인 정제된 트랜스글루타미나아제(TG)를 사용하여 혼합함으로써 20 mg/㎖의 항체를 연결기-페이로드(10 배 m/m)에 실온에서 15 시간 동안 접합시켰다. 조질의 ADC를 원심분리하고 상청액을 SEC에 의해 정제하였다.
조질의 ADC를 PBS중에서 수퍼덱스 200 상에서 SEC에 의해 정제하고, 수집된 단량체 피이크를 20mM 히스티딘, 8.5% 수크로스, pH 5.8에서 투석하고; 멸균 여과하고 -70℃에서 동결시켰다. 음성 대조군 huNeg-8.8 항체를 동일한 방법에 의해 접합시켰다.
방법 D: 디설파이드 연결기를 사용하는 시스테인 잔기를 통한 종래의 접합
PBS, pH 7.2중 27 mg/㎖의 항-EDB 항체를 5 배(m/m)의 TCEP에 의해 37℃에서 2 시간 동안 부분적으로 환원시키고, 세파덱스(등록상표) G-25 SEC에 의해 탈염시켰다.
부분적으로 환원된 항체를 0.7mM DTPA 및 7% DMA가 함유된 67mM HEPES, pH 7.0중에서 25℃에서 15 분 동안 12 내지 15 배(m/m)의 환원된 연결기-페이로드와 접합시켰다. 과량의 연결기-페이로드를 20 배의 NEM(m/m)에 의해 25℃에서 15 분 동안 급랭시켰다.
조질의 ADC를, 50mM DHA 및 50mM DTPA를 갖는 PBS중에서 수퍼덱스 200 상에서 SEC에 의해 정제하고, 수집된 단량체 피이크를 4 내지 6℃에서 저장하였다. 음성 대조군을 동일한 방법에 의해 접합시켰다.
Figure 112019049414387-pct00033
Figure 112019049414387-pct00034
실시예 4
EDB ADC의 특징화
본 발명의 EDB ADC를 크기-배제 크로마토그래피(SEC), LC-MS 및 소수성 상호작용 크로마토그래피(HIC)의 조합에 의해 특징지웠다. 평균 약물 : 항체 비(DAR)를 질량 분광분석법(MS)에 의해 결정하였다. 표 14는 다양한 EDB ADC의 분석 특징을 제공한다.
LC-MS: 칼럼 = 워터스(Waters) BEH300-C4, 2.1 x 100 mm(P/N = 186004496); 기기 = SQD2 질량 분광 검출기를 갖는 어쿼티(Acquity) UPLC; 유량 = 0.7 ㎖/분; 온도 = 80℃; 완충액 A = 물 + 0.1% 포름산; 완충액 B = 아세토니트릴 + 0.1% 포름산. 구배를 2 분에 걸쳐 3% B로부터 95% B까지 실행하고, 95% B에서 0.75 분 동안 유지시킨 후, 3% B에서 재평형화시킨다. 샘플을 주입 직전에 TCEP 또는 DTT에 의해 환원시킨다. 용출액을 LCMS(400 내지 2000 달톤)에 의해 모니터링하고 단백질 피이크를 MaxEnt1에 의해 데콘볼루션(deconvolution)한다. DAR을 이전에 기재된 바와 같이 중량 평균 적재량으로서 보고한다.
SEC: 칼럼: 수퍼덱스200(5/150 GL); 이동상: 2% 아세토니트릴이 함유된 인산염 완충된 염수, pH 7.4; 유량 = 0.25 ㎖/분; 온도 = 주변 온도; 기기: 아길런트(Agilent) 1100 HPLC.
HIC: 칼럼: TSK겔 부틸 NPR, 4.6 mm x 3.5 cm(P/N = S0557-835); 완충액 A = 10mM 인산염이 함유된 1.5M 황산 암모늄, pH 7; 완충액 B = 10mM 인산염, pH 7 + 20% 이소프로필 알코올; 유량 = 0.8 ㎖/분; 온도 = 주변 온도; 구배 = 12 분에 걸쳐 0% B로부터 100% B까지, 100% B에서 2 분 동안 유지, 이어서 100% A에서 재-평형화; 기기: 아길런트 1100 HPLC.
Figure 112019049414387-pct00035
실시예 5
EDB+ FN 발현
EDB ADC 기반의 치료법을 위한 암 징후의 광범위한 조사를 수행하기 위해, EDB+ FN 발현을 인간 종양 및 PDX 모델에서 단백질 및 mRNA 수준에서 분석하였다.
EDB+ FN 발현의 RNA-서열 분석
RNA-서열 데이터를 31종의 종양 유형으로 확장된 암 유전체 지도(TCGA: The Cancer Genome Atlas) 프로젝트[매릴랜드주 베테스다 HIH의 국립 암 연구소(National Cancer Institute)]의 일부로서 수집된 10660개의 개별 종양 샘플로부터 분석하였다. 동형(isoform) 수준 발현 데이터를 오믹소프트(OmicSoft) 소프트웨어(노쓰캐롤라이나주 캐리)로부터 수득하였다. EDB+ FN 발현을 EDB가 함유된 피브로넥틴의 동형(FN1)의 발현 수준의 누적으로서 계산하였다. 발현 수준을 100만개의 판독물 당 전사물의 킬로베이스 당 단편(FPKM: fragment per kilobase of transcript per million reads)에 의해 측정하였고, 각각의 종양 유형에 대한 EDB+ FN 발현 수준의 요약 통계는 표 15에 나타나 있다. 일반적으로, 유전자는 FPKM이 약 1 또는 그 이상인 경우 발현된 것으로 고려된다.
표 15는 인간 종양에서 EDB+ FN의 RNA-서열 분석을 보여준다. EDB+ FN 발현은 광범위한 인간 종양 징후, 예컨대 제한되지 않지만, 갑상선 암종, 육종, 유방 암종, 췌장 선암, 교모세포종, 담도암, 폐 선암, 신장 암종, 흑색종, 자궁 암육종, 중피종, 폐 편평상피 세포 암종, 직장 및 결장 선암, 간세포 암종, 결장 암종, 난소의 장액 낭선암종, 및 방광 암종에서 나타난다.
Figure 112019049414387-pct00036
유방암, 난소암, 두경부암, 결장직장암, 흑색종, 췌장, 비-소 세포 폐암(NSCLC: non-small cell lung cancer) 및 소 세포 폐암으로부터의 160개의 화이자(Pfizer) 내부 환자 유래된 이종이식(PDX) 모델의 RNA-서열 데이터에 대하여 RSEM 프로그램을 사용하여 유전자 발현 정량화를 수행하였다[리(Li) 등의 문헌 "BMC Bioinformatics, 12: 323, 2011" 참조]. EDB+ FN 발현을 EDB가 함유된 피브로넥틴의 동형(FN1)의 발현 수준의 누적으로서 계산하였다. 도 2에서 볼 수 있듯이, EDB+ FN은 분석된 모든 종양 유형에 걸쳐서 다양한 수준으로 발현되었다(모든 샘플은 > 1 수준을 가졌다). 데이터는 100만개의 판독물 당 전사물의 킬로베이스 당 단편(FPKM)으로 표시되었다.
EDB+ FN 발현의 면역조직화학(IHC) 검출
동결된 절편으로서의 EDB-L19 항체를 사용하는 IHC에 의해 인간 암에서 EDB+ FN 단백질 발현을 인증하였다. 티슈-텍(Tissue-Tek) O.C.T. 화합물[사쿠라 피네텍(Sakura Finetek)]에 함침된, 8 미크론의 신선한 동결된 조직 절편을 4 분 동안 아세톤 대 100% 에탄올의 3 : 1 혼합물에서 고정시키고, 이어서 10% 중성 완충된 포르말린에 20 초 동안 침지시켰다. 슬라이드를 TBS에서 세정하였다. 내생성 과산화효소 활성을 퍼옥시데이즈드(Peroxidazed) 1[바이오케어 메디칼(Biocare Medical)]에 의해 10 분 동안 불활성화시켰다. 비-특이적 단백질 상호작용을 백그라운드 퍼니셔(Background Punisher)(바이오케어 메디칼)에 의해 10 분 동안 차단하였다. EDB-L19 항체 또는 이소타입 음성 대조군 huNeg-8.8 항체를 각각 3 ㎍/㎖ 및 0.5 ㎍/㎖의 최종 농도로 1 시간 동안 실온에서 토끼 항-인간 IgG[잭슨 이뮤노리서치(Jackson ImmunoResearch)]와 함께 예비-착화시켰다. 예비-착화된 혼합물을 과량의 전체 인간 IgG(잭슨 이뮤노리서치)와 함께 15 분 동안 실온에서 항온처리하고, 슬라이드에 1 시간 동안 첨가하였다. 절편을 TBS에서 세척하고, 시그널스테인 부스트 래빗(SignalStain Boost rabbit) HRP[셀시그널링 테크놀로지스(CellSignaling Technologies)]와 함께 30 분 동안 항온처리하였다. DAB+[다코(Dako)]에 의해 5 분 동안 신호를 발색시키고, 후속적으로 증류된 H2O에 의해 급랭시켰다. 슬라이드를 CAT 헤마톡실린(Hematoxylin)(바이오케어 메디칼)에 의해 간단히 대비염색하고, 물로 세척하고, 농도차가 있는(graded) 알코올에서 탈수화하고, 자일렌에서 청정화시키고, 퍼마운트 마운팅 매질(Permount Mounting Medium)[피셔케미칼스(FisherChemicals)]에 의해 커버슬립으로 덮었다. 발현의 분석을 수행하고 확인하였다.
표 16에서 볼 수 있듯이, EDB+ FN 단백질은 두경부 암종(데이터는 제시되지 않음), 췌장 암종, 비-소 세포 폐 암종(NSCLC), 난소 암종 및 유방 암종을 비롯하여, 프로파일링된 모든 인간 암 징후에 걸쳐서 중간 내지 높은 수준으로 발현되었다. 모든 종양에서의 발현은 우세하게는 스트로마성(예컨대 섬유아세포성이고 맥관구조와 연관됨)이었지만, 종양 세포의 일부 염색이 또한 관찰되었다.
Figure 112019049414387-pct00037
실시예 6
EDB ADC의 시험관내 결합
항-EDB 항체 및 EDB ADC의 EDB로의 상대적 결합을 평가하기 위해, 맥시소프(MaxiSorp) 96-웰 플레이트를 PBS중 0.5 또는 1 ㎍/㎖의 인간 7-EDB-89(서열 번호 34)에 의해 코팅하고, 하룻밤 4℃에서 온화하게 진탕시키면서 항온처리하였다. 이어서 플레이트를 비우고, 200 ㎕의 PBS로 세척하고, 100 ㎕의 차단 완충액[써모사이언티픽(ThermoScientific)]에 의해 3 시간 동안 실온에서 차단시켰다. 차단 완충액을 제거하고, 웰을 PBS에 의해 세척하고, ELISA 검정 완충액[EAB; 0.5% BSA/0.02% 트윈(Tween)-20/PBS]중에서 연속적으로 희석된(4-배) 100 ㎕의 항-EDB 항체 또는 EDB ADC와 함께 항온처리하였다. 플레이트의 제1 칼럼을 비어있게 두고, 플레이트의 마지막 칼럼을 블랭크 대조군으로서의 EAB에 의해 충전시켰다. 플레이트를 실온에서 3 시간 동안 항온처리하였다. 시약을 제거하고, 플레이트를 PBS중 200 ㎕의 0.03% 트윈-20(PBST)에 의해 세척하였다. EAB중 1 : 5000으로 희석된 항-인간 IgG-Fc-HRP[써모/피어스(Thermo/Pierce)]를 웰에 100 ㎕로 첨가하고, 15 분 동안 실온에서 항온처리하였다. 플레이트를 200 ㎕의 PBST에 의해 세척하고, 이어서 100 ㎕의 바이오FX TMB[피셔(Fisher)]를 첨가하고, 4 분 동안 실온에서 발색되도록 허용하였다. 반응을 100 ㎕의 0.2N 황산에 의해 중단시키고, 450 nm에서의 흡광도를 빅터(Victor) 플레이트 판독기[퍼킨 엘머(Perkin Elmer), 매사추세츠주 왈탐] 상에서 판독하였다.
표 17은 ELISA 형식으로 96-웰 플레이트에 결합된 인간 7-EDB-89 단백질 단편에 대한 항-EDB 항체 및 EDB ADC의 상대적 결합을 제공한다. EDB를 표적화하는 모든 항체 및 ADC는 19 pM 내지 58 pM의 범위에서 유사한 친화도를 갖고 표적 단백질에 결합하였다. 대조적으로, 비-EDB 표적화 항체 및 ADC는 10,000 pM을 초과하는 높은 EC50 값을 가진다. 대표적인 ELISA 결합 곡선은 도 3a 및 3b에 예시된다.
Figure 112019049414387-pct00038
실시예 7
EDB ADC의 시험관내 세포독성
세포 배양
WI38-VA13은 ATCC로부터 수득된 SV40-형질전환된 인간 폐 섬유아세포이고, 10% FBS, 1% MEM 비-필수 아미노산, 1% 피루브산 나트륨, 100 유닛/㎖의 페니실린(penicillin)-스트렙토마이신(streptomycin), 및 2mM 글루타맥스(GlutaMax)가 보충된 MEM 이글스(Eagles) 배지[셀-그로(Cell-Gro)]에 유지된다. HT29는 인간 결장직장 암종으로부터 유래되고(ATCC), 10% FBS 및 1% 글루타민이 보충된 DMEM 배지에 유지된다.
EDB+ FN 전사물 검출
EDB+ FN의 유전자 발현 및 전사물 분석을 위해, 점착성의 증식중인 WI38-VA13 및 HT29 세포를 TrypLE 익스프레스(Express)[깁코(Gibco)]에 의해 세포-배양 플라스크로부터 분리하였다. 알엔이지 미니 키트(RNeasy Mini Kit)[퀴아겐(Qiagen)]을 사용하여, 수집된 세포 펠릿으로부터 전체 RNA를 정제하였다. 잔여 DNA를 RN아제-부재 DN아제 세트(RNase-Free DNase Set)(퀴아겐)에 의해 RNA 정제 동안 제거하였다. 전체 RNA의 cDNA로의 역 전사를 위해 고 성능 RNA-대-cDNA 키트(High Capacity RNA-to-cDNA Kit)[어플라이드 바이오시스템스(Applied Biosystems)]를 사용하였다. UNG가 구비된 타크만 유니버셜 마스터 믹스(TaqMan Universal Master Mix) II(어플라이드 바이오시스템스)를 사용하여 정량적 실-시간 PCR에 의해 cDNA를 분석하였다. EDB+ FN 신호를 타크만 프라이머 Hs01565271_m1에 의해 검출하고, ACTB(타크만 프라이머 Hs99999903_m1) 및 GAPDH(타크만 프라이머 Hs99999905_m1)로부터의 두 신호의 평균에 의해 정규화하였다. 모든 프라이머는 써모피셔 사이언티픽으로부터였다. 대표적인 실험으로부터의 데이터가 제시된다.
웨스턴 블롯팅(western blotting)에 의한 EDB+ FN 단백질 검출
웨스턴 블롯팅에 의한 EDB+ FN의 검출을 위해, 점착성의 증식중인 WI38-VA13 및 HT29 세포를 세포 스크래핑(scraping)에 의해 수거하였다. 세포 용해물을 프로테아제 저해제 및 포스파타아제(phosphatase) 저해제가 함유된 세포 용해 완충액(Cell Lysis Buffer)(셀 시그널링 테크놀로지)에서 제조하였다. 종양 용해물을 프로테아제 저해제 및 포스파타아제 저해제가 함유된 2X 세포 용해 완충액(셀 시그널링 테크놀로지), 또는 리파 용해 완충액(RIPA Lysis Buffer)에서 제조하였다. 단백질 용해물을 SDS-PAGE에 의해 분석하고, 웨스턴 블롯팅을 수행하였다. 단백질을 니트로셀룰로스 막으로 옮기고, 이어서 5% 밀크/TBS에 의해 차단한 후, EDB-L19 항체 및 항-GAPDH 항체(셀 시그널링 테크놀로지)와 함께 하룻밤 4℃에서 항온처리하였다. 세척 후, 항-EDB 블롯을 ECL HRP-연결된 항-인간 IgG 2차 항체(지이 헬쓰케어)와 함께 1 시간 동안 실온에서 항온처리하였다. 세척 후, 피어스 ECL 2 웨스턴 블롯팅 기질(써모 사이언티픽)에 의해 EDB+ FN 신호를 전개시키고, X-선 필름에 의해 검출하였다. 항-GAPDH 블롯을 차단 완충액중에서 알렉사 플루오르 680 접합된 항-토끼 IgG 2차 항체[인비트로겐(Invitrogen)]와 함께 1 시간 동안 실온에서 항온처리하였다. 세척 후, GAPDH 신호를 LI-COR 오디세이 영상촬영 시스템(Odyssey Imaging System)에 의해 검출하였다. EDB+ FN 웨스턴 블롯의 밀도계측 분석을 바이오-래드(Bio-Rad) GS-800 보정된 영상측정 밀도계(Calibrated Imaging Densitometer)에 의해 수행하고, 퀀터티 원(Quantity One) 버전 4.6.9 소프트웨어에 의해 정량화하였다. 대표적인 실험으로부터의 데이터가 제시된다.
도 4는 WI38-VA13 및 HT29 세포에서 웨스턴 블롯에 의한 EDB+ FN 발현을 보여준다. EDB+ FN은 WI38-VA13 세포주에서 발현되고, HT29 결장 암종 세포주는 시험관내에서 성장될 경우 음성이다.
유세포분석법에 의한 EDB+ FN 단백질
EDB-L19 항체를 사용하여 유세포분석법에 의해 WI38-VA13 또는 HT29 세포의 세포 표면 상에서의 EDB+ FN의 발현을 측정하였다. 세포를 비-효소적 세포 해리 완충액(깁코)에 의해 해리시키고, 차단을 위해 얼음 위에서 차가운 유동 완충액(FB, 3% BSA/PBS+Ca+Mg)과 함께 항온처리하였다. 이어서 세포를 FB중에서 1차 항체와 함께 얼음 상에서 항온처리하였다. 항온처리 후, 세포를 차가운 PBS-Ca-Mg에 의해 세척하고, 이어서 제조업체의 절차에 따라서 생존력 염색약[바이오사이언시즈(Biosciences)]과 함께 항온처리하여 생세포 및 사세포를 구별하였다. 신호를 BD 포르테사(Fortessa) 유세포분석기 상에서 분석하고, 데이터를 BD FACS DIVA 소프트웨어에 의해 분석하였다. 대표적인 실험으로부터의 데이터가 제시된다.
표 18은 웨스턴 블롯, qRT-PCR 및 유세포분석법으로부터의 결과를 요약한다. 데이터는 WI38-VA13이 EDB+ FN 양성이고 HT29가 EDB+ FN 음성임을 입증한다.
Figure 112019049414387-pct00039
시험관내 세포독성 검정
증식중인 WI38-VA13 또는 HT29 세포를 비-효소적 세포 해리 완충액에 의해 배양 플라스크로부터 수거하고, 하룻밤 96-웰 플레이트[코닝(Corning)]에서 1000 세포/웰로 습윤화된 챔버(chamber)(37℃, 5% C02)에서 배양하였다. 다음날, 50 ㎕의 3x 스톡을 이중으로 10배 농도로 첨가함으로써 세포를 EDB ADC 또는 이소타입 대조군 비-EDB-결합 ADC에 의해 처리하였다. 몇몇 실험에서, 세포를 1500 세포/웰로 도말하고 동일한 날에 처리하였다. 이어서 세포를 EDB ADC 또는 이소타입 대조군 비-EDB-결합 ADC와 함께 4 일 동안 항온처리하였다. 수거일에, 50 ㎕의 셀 타이터 글로(Cell Titer Glo)[프로메가(Promega)]를 세포에 첨가하고 0.5 시간 동안 실온에서 항온처리하였다. 발광(luminescence)을 빅터 플레이트 판독기(퍼킨 엘머, 매사추세츠주 왈탐) 상에서 측정하였다. 상대적 세포 생존력을 미처리된 대조 웰의 백분율로서 결정하였다. IC50 값을 XLfit v4.2(IDBS)가 구비된 4-매개변수 로지스틱(logistic) 모델 #203에 의해 계산하였다.
표 19는 WI38-VA13(EDB+ FN 양성 종양 세포주) 및 HT29 결장 암종 세포(EDB+ FN 음성 종양 세포주) 상에서 수행된 세포독성 검정에서 EDB ADC 처리의 IC50(항체의 ng/㎖)을 보여준다. EDB ADC는 EDB+ FN 발현 세포주에서 세포 사멸을 유도하였다. IC50 값은 vc-0101 연결기-페이로드를 갖는 모든 EDB ADC의 경우, 대략 184 ng/㎖ 내지 216 ng/㎖의 범위에서 유사하였다[EDB-L19-vc-0101, EDB-(κK183C-K290C)-vc-0101, EDB-(K94R)-vc-0101, EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101]. 음성 대조군 vc-0101 ADC는 실질적으로 효력이 더 작았고, EDB-vc-0101 ADC에 비해 대략 70-배 내지 200-배 더 높은 IC50 값을 가졌다. 모든 vc-0101 ADC는 EDB+ FN 음성 종양 세포주, HT29에서 46-배 내지 83-배 더 높은 IC50 값을 가졌다. 그러므로, EDB ADC는 이들의 시험관내 세포독성에 대하여 EDB+ FN 발현에 의존하였다.
"vc" 프로테아제-분할가능한 연결기를 갖는 다른 아우리스타틴-기제 EDB ADC, EDB-L19-vc-9411 및 EDB-L19-vc-1569는, 또한 상응하는 음성 대조군 ADC와 비교하여 약 50-배 내지 180-배의 높은 선택성 및 비-발현 세포주와 비교하여 약 25-배 내지 140-배의 선택성을 가지면서 WA38-VA13 세포에서 강력한 세포독성을 나타내었다. EDB-L19-diS-DM1 ADC는 vc-0101 ADC와 유사한 효력을 가졌지만, 음성 대조군 ADC(약 3-배) 및 HT29 세포(약 0.9-배)에 비하여 훨씬 낮은 선택성을 가졌다.
Figure 112019049414387-pct00040
표 20에서 볼 수 있듯이, 접합되지 않은 페이로드는 EDB+ FN 발현과 무관하게 양쪽 세포주에서 매우 강력하였고, 이는 이들 세포가 ADC 페이로드로서 사용된 세포독성제에 민감함을 지시한다.
Figure 112019049414387-pct00041
실시예 8
EDB ADC의 생체내 효능
EDB ADC를 세포주 이종이식(CLX), 환자 유래된 이종이식(PDX) 및 합성 종양 모델에서 평가하였다. EDB+ FN의 발현을 이전에 본원에 기재된 바와 같이 면역조직화학(IHC) 검정에 의해 검출하였다.
CLX 모델을 생성하기 위해, H-1975, HT29, 또는 라모스 종양주의 8 x 106 내지 10 x 106 세포를 흉선제거 암컷 누드 마우스에게 피하로 이식하였다. 접종을 위한 라모스 및 H-1975 세포를 각각 50% 및 100% 마트리겔(Matrigel)[비디 바이오사아언시즈(BD Biosciences)]에 현탁시켰다. 라모스 모델의 경우, 세포 접종 이전에 동물에게 전신 방사선조사(4 Gy)를 가하여 종양의 확립을 용이하게 하였다. 평균 종양 부피가 대략 160 내지 320 ㎣에 도달되었을때, 동물을 각각의 그룹에 8 내지 10 마리씩 치료 그룹으로 무작위로 나누었다. ADC 또는 비히클(PBS)을 0 일째 정맥내로 투여한 다음, 동물에게 4 일 마다 한번씩 4 내지 8 회 투약하였다. 종양을 매주 1회 또는 2회 측정하고, 종양 부피를 부피(㎣) = (폭 x 폭 x 길이)/2로서 계산하였다. 동물의 체중을 4 내지 9 주 동안 모니터링하였고, 동물 체중 감소는 치료 그룹에서 전혀 관찰되지 않았다.
PDX 모델을 생성하기 위해, 종양을 공여자 동물로부터 수집하고, 대략 3x3 mm의 종양 단편을 흉선제거 암컷 누드 마우스(PDX-NSX-11122 모델의 경우) 또는 NOD SCID 마우스(PDX-PAX-13565 및 PDX-PAX-12534 모델의 경우)의 옆구리에 피하로 10 게이지의 투관침에 의해 이식하였다. 평균 종양 부피가 대략 160 내지 260 ㎣에 도달되었을때, 마우스를 각각의 그룹에 7 내지 10 마리씩 치료 그룹으로 무작위로 나누었다. ADC 또는 비히클(PBS) 투약 섭생 및 투여 경로 뿐만 아니라, 종양 측정 절차는 CLX 모델에 대해 상기 기재된 바와 동일하였다. 동물의 체중을 5 내지 14 주 동안 모니터링하였고, 동물 체중 감소는 치료 그룹에서 전혀 관찰되지 않았다. 종양 성장 저해를 종양 크기의 평균 ± SEM으로서 도표화한다.
EDB+ FN의 발현
표 21에서 볼 수 있듯이, H-1975, HT29 및 라모스 CLX 모델, PDX-NSX-11122, PDX-PAX-13565 및 PDX-PAX-12534 PDX 모델 및 EMT-6 공통유전자 종양 모델에서의 EDB+ FN의 발현을 EDB-L19 항체의 결합에 의해 측정하고, IHC 검정에서 후속적으로 검출하였다. CLX HT-29는 CLX를 중간 정도로 발현하였지만, 시험관내에서 검사할 경우 CLX에서의 단백질 발현의 대부분이 종양 스트로마로부터 유래되므로 음성이었다.
Figure 112019049414387-pct00042
PDX-NSX-11122 NSCLC PDX
높은 수준으로 EDB+ FN을 발현하는 인간 암의 PDX-NSX-11122, NSCLC PDX 모델에서 다양한 ADC의 효과를 평가하였다. 도 5a는 0.3, 0.75, 1.5 및 3 ㎎/㎏에서의 EDB-L19-vc-0101에 대한 항-종양 활성을 보여준다. 이러한 데이터는 EDB-L19-vc-0101이 3 ㎎/㎏ 및 1.5 ㎎/㎏에서 용량 의존적 방식으로 종양 퇴행을 나타내었음을 입증한다.
vc-연결된 ADC의 항-종양 효능을 디설파이드-연결된 ADC와 비교하였다. 도 5b 및 5c는, 각각, 10 ㎎/㎏의 디설파이드 연결된 EDB-L19-diS-DM1과 비교된 3 ㎎/㎏에서의 EDB-L19-vc-0101 및 5 ㎎/㎏의 디설파이드 연결된 EDB-L19-diS-C20CO-1569와 비교된 1 및 3 ㎎/㎏에서의 EDB-L19-vc-0101의 항-종양 활성을 보여준다. 도 5b 및 5c에서 볼 수 있듯이, EDB-L19-vc-0101은 이소타입 음성 대조군 ADC 및 디설파이드 연결기, EDB-L19-diS-DM1 및 EDB-L19-dis-C2OCO-1569를 사용하여 생성된 ADC와 비교하여 더 큰 효능을 나타내었다. 추가로, EDB-L19-vc-0101에 의해 치료된 종양을 갖는 동물은 1 ㎎/㎏에서 종양 성장의 지연을, 3 ㎎/㎏에서 완전한 종양의 퇴행을 나타내었다. 데이터는 EDB-L19-vc-0101(ADC1)이 용량-의존적 방식으로 PDX-NSX-11122 NSCLC 이종이식의 성장을 저해하였음을 입증한다.
자리-특이적 및 종래적으로 접합된 ADC의 활성을 평가하였다. 도 5d는 각각 0.3, 1 및 3 ㎎/㎏ 및 1.5 ㎎/㎏의 용량에서 종래적으로 접합된 EDB-L19-vc-0101과 비교되는 자리-특이적 접합된 EDB-(κK183C+K290C)-vc-0101의 항-종양 효능을 보여준다. 용량-수준 기반의 효능은 필적할만 하였고, EDB-(κK183C+K290C)-vc-0101은 용량 의존적 방식으로 종양 퇴행을 유도하였다.
다양한 돌연변이를 갖는 vc-0101 EDB ADC의 활성을 평가하였다. 도 5e는 0.3, 1 및 3 ㎎/㎏의 용량에서의 자리-특이적 접합된 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101의 항-종양 효능을 보여준다. EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101은 1 및 3 ㎎/㎏에서 종양 퇴행을 유도하였다. 도 5f는 도 5e의 3 ㎎/㎏으로 투약된 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101 그룹에서 10 마리의 개별적인 종양 함유 마우스에 대한 종양 성장 저해 곡선을 보여준다. 3 ㎎/㎏ 그룹에서의 종양 퇴행은 연구 종료시(95 일) 10 마리중 8 마리(80%)의 마우스에서 완결되었고 지속적이었다.
H-1975 NSCLC CLX
다양한 vc-연결된 아우리스타틴 및 CPI ADC의 효과를 인간 암의 중간 내지 높은 EDB+ FN 발현 NSCLC CLX 모델인 H-1975에서 평가하였다. 도 6a는 0.3, 0.75, 1.5 및 3 mg/mg에서 항-종양 활성에 대해 평가된 EDB-L19-vc-0101을 보여준다. 데이터는 EDB-L19-vc-0101이 3 ㎎/㎏, 및 1.5 ㎎/㎏만큼 낮은 용량에서도 용량 의존적 방식으로 종양 퇴행을 나타내었음을 입증한다. 도 6b는 0.3, 1 및 3 ㎎/㎏에서 항-종양 활성에 대해 평가된 EDB-L19-vc-0101 및 EDB-L19-vc-1569를 보여준다. 데이터는 EDB-L19-vc-0101 및 EDB-L19-vc-1569가 용량 의존적 방식으로 종양 퇴행을 나타내었음을 입증한다.
vc-연결된 아우리스타틴 ADC의 항-종양 활성을 CPI ADC와 비교하였다. 도 6c에서 볼 수 있듯이, EDB-L19-vc-0101 및 EDB-(H16-K222R)-AcLys-vc-CPI-8314를 각각 0.5, 1.5 및 3 ㎎/㎏, 및 0.1, 0.3 및 1 ㎎/㎏에서 평가하였다. EDB-L19-vc-0101 및 EDB-(H16-K222R)-AcLys-vc-CPI-8314 둘 다는 평가된 가장 높은 용량에서 종양 퇴행을 나타내었다.
자리-특이적 및 종래적으로 접합된 EDB ADC의 활성을 평가하였다. 도 6d는 0.5, 1.5 및 3 ㎎/㎏의 용량에서 종래적으로 접합된 EDB-L19-vc-0101과 비교된 자리-특이적 접합된 EDB-(κK183C+K290C)-vc-0101의 항-종양 효능을 보여준다. 용량-수준 기반의 효능은 필적할만하였고, EDB-(κK183C+K290C)-vc-0101은 용량 의존적 방식으로 종양 퇴행을 유도하였다.
다양한 돌연변이를 갖는 vc-0101 EDB ADC의 활성을 평가하였다. 도 6e는 1 및 3 ㎎/㎏에서의 EDB-L19-vc-0101 및 EDB-(K94R)-vc-0101의 항-종양 효능을 보여준다. 도 6f는 1 및 3 ㎎/㎏에서의 자리-특이적 EDB-(κK183C+K290C)-vc-0101 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101의 항-종양 효능을 보여준다. 4개의 ADC는 이들이 κK183C-K290C 및/또는 K94R 돌연변이를 함유하는지의 여부와 무관하게 H-1975 모델에서 유사한 효능을 나타내었다. 또한, 시험된 모든 ADC는 3 ㎎/㎏에서 종양 퇴행을 비롯한 강한 항-종양 효능을 일으켰다. 이들 데이터로부터, κK183C-K290C 및/또는 K94R 돌연변이의 도입이 ADC의 효능에 부정적인 영향을 주지 않았음이 입증된다.
HT29 결장 CLX
다양한 vc-연결된 아우리스타틴 ADC의 효과를 인간 암의 중간 EDB+ FN 발현 결장 CLX 모델인 HT29에서 평가하였다. 도 7에서 볼 수 있듯이, EDB-L19-vc-0101 및 EDB-L19-vc-9411을 항-종양 활성에 대해 3 ㎎/㎏에서 검사하였다. EDB-L19-vc-0101 및 EDB-L19-vc-9411은 시간이 지남에 따라 3 ㎎/㎏에서 종양 퇴행을 나타내었다.
PDX-PAX-13565 및 PDX-PAX-12534 췌장 PDX
EDB-L19-vc-0101의 항-종양 효능을 인간 췌장 PDX 모델에서 평가하였다. 도 8a에서 볼 수 있듯이, EDB-L19-vc-0101을 0.3, 1 및 3 ㎎/㎏에서 중간 내지 높은 EDB+ FN 발현 췌장 PDX인 PDX-PAX-13565에서 평가하였다. 도 8b에서 볼 수 있듯이, EDB-L19-vc-0101을 0.3, 1 및 3 ㎎/㎏에서 낮은 내지 중간 EDB+ FN 발현 췌장 PDX인 PDX-PAX-12534에서 평가하였다. EDB-L19-vc-0101은 평가된 양쪽 췌장 PDX 모델에서 용량 의존적 방식으로 종양 퇴행을 나타내었다.
라모스 림프종 CLX
EDB-L19-vc-0101의 항-종양 효능을 중간 EDB+ FN 발현 림프종 CLX 모델인 라모스에서 평가하였다. EDB-L19-vc-0101을 항-종양 활성에 대해 1 및 3 ㎎/㎏에서 평가하였다. 도 9에서 볼 수 있듯이, EDB-L19-vc-0101은 3 ㎎/㎏ 용량에서 용량 의존적 방식으로 종양 퇴행을 나타내었다.
EMT-6 유방 공통유전자 모델
EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101의 항-종양 효능을 면역적격(immuncompetent) 배경하에 마우스 공통유전자 유방 암종 모델인 EMT-6에서 평가하였다. 도 10a에서 볼 수 있듯이, EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101은 4.5 ㎎/㎏에서 종양 성장 저해를 나타내었다. 종양 성장 저해를 11 마리의 종양 함유 동물에서의 평균 종양 크기 ± SEM으로서 도표화하였다. 도 10b는 4.5 ㎎/㎏으로 투약된 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101 그룹에서 11 마리의 개별적 종양 함유 마우스에 대한 종양 성장 저해 곡선을 보여준다. 4.5 ㎎/㎏ 그룹에서의 종양 퇴행은 연구 종료시(34 일) 11 마리중 9 마리(82%)의 마우스에서 완결되었고 지속적이었다.
난소
EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101의 활성을, EDB+ FN을 발현하는 난소 및 유방 암종 인간 PDX 모델에서 검사하였다. 활성을 3 ㎎/㎏ 및 10 ㎎/㎏ 용량 수준에서 관찰하였다(데이터는 제시되지 않음).
실시예 9
약물동력학 (PK)
종래적으로 접합된 EDB-L19-vc-0101 및 자리-특이적 접합된 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101 접합된 항체 약물 접합체의 노출을, 각각 사이노몰구스 원숭이에서 5 또는 6 ㎎/㎏의 일시정맥(intravenous(IV) bolus) 용량 투여 이후 결정하였다. 전체 항체(전체 Ab; 접합된 mAb 및 접합되지 않은 mAb 둘 다의 측정값), ADC(적어도 하나의 약물 분자에 접합된 mAb)의 농도를 리간드 결합 검정(LBA: ligand binding assay)에 의해 측정하고 방출된 페이로드 0101의 농도를 질량 분광분석에 의해 측정하였다. 형광 검출에 의한 가이로랩(Gyrolab: 등록상표) 워크스테이션(workstation)을 사용하여 리간드 결합 검정(LBA)에 의해 전체 Ab 및 ADC 농도의 정량화를 달성하였다. 사용된 비오틴화된 포획 단백질은 양 항-hIgG였고, 검출 항체는 전체 항체의 경우 알렉사 플루오르 647 염소 항-hIgG 또는 ADC의 경우 알렉사 플루오르 647 항-0101 mAb였다[데이터는 왓슨(Watson) v7.4 LIMS 시스템에 의해 처리되었다]. 접합되지 않은 페이로드 분석을 위해 단백질 침전을 사용하여 생체내 샘플을 제조하고, 양성 터보 이온스프레이(Turbo IonSpray) 전자분무 이온화(ESI: electrospray ionization) 및 다중 반응 모니터링(MRM: multiple reaction monitoring) 방식을 사용하여 AB 사이엑스(Sciex) API5500(QTRAP) 질량 분광분석기 상으로 주입하였다. 743.6→188.0 및 751.6→188.0의 전이를 각각 피분석물 및 중수소화 내부 표준물에 대해 사용하였다. 데이터 획득 및 처리를 애널리스트(Analyst) 소프트웨어 버전 1.5.2[어플라이드 바이오시스템스(Applied Biosystems)/엠디에스 사이엑스(MDS Sciex), 캐나다]에 의해 실행하였다.
EDB-L19-vc-0101 ADC(5 ㎎/㎏) 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101 ADC(6 ㎎/㎏) 투약된 사이노몰구스 원숭이로부터의 전체 Ab, ADC 및 방출되는 페이로드의 약물동력학이 표 22에 제시된다. 자리-특이적 접합된 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101 ADC의 노출은, 종래의 접합체와 비교할 경우, 증가된 노출(용량 정규화된 AUC에 의해 측정될 경우 ∼2.3 배 증가) 및 증가된 접합 안정성 둘 다를 보여주었다. 각각 종래의 EDB-L19-vc-0101 ADC와 비교하여 자리-특이적 접합된 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101 ADC의 더 높은 ADC/Ab 비(84% 대 75%) 및 더 낮은 방출된 페이로드 노출(용량 정규화된 AUC; 0.0058 대 0.0082 ㎍*h/㎖) 둘 다에 의해 접합 안정성을 평가하였다. NA = 적용 불가능함.
Figure 112019049414387-pct00043
실시예 10
EDB ADC에 대한 열 안정성 평가
시차 주사 열량계(DCS: Differential Scanning Calorimetry)를 사용하여 항-EDB 항체 변형체 및 상응하는 종래의 및 자리-특이적 접합된 EDB ADC의 열 안정성을 결정하였다. PBS-CMF pH 7.2에서 제형화된 샘플을 자동 샘플러가 장착된 마이크로칼(MicroCal) VP-모세관 DSC(지이 헬쓰케어 바이오-사이언스, 뉴저지주 피스카타웨이)의 샘플 트레이내로 분배하고, 5 분 동안 10℃에서 평형화시키고, 이어서 시간 당 100℃의 비율로 110℃까지 상향 스캔하였다. 16 초의 필터링(filtering) 기간을 선택하였다. 원시 자료를 기선 보정하고, 단백질 농도를 정규화하였다. 오리진(Origin) 소프트웨어 7.0[오리진랩 코포레이션(OriginLab Corporation), 매사추세츠주 노르탐프톤, MA]을 사용하여, 적절한 전이 수를 가지면서 데이터를 MN2-스테이트(State) 모델에 정합시켰다.
표 23에서 볼 수 있듯이, 다양한 항-EDB 항체 및 EDB ADC를 자리-특이적 및 종래의 접합 기술 둘 다에 의해 평가하였고, 제1 용융 전이(Tm1) > 65℃에 의해 결정될 경우 유리한 열 안정성을 나타내었다. 이들 결과는 조작된 시스테인 잔기를 혼입한 EDB-(κK183C-K94R-K290C) 항체 및 κK183C-K94R-K290C-vc-0101 ADC가 열적으로 안정함을 입증한다.
Figure 112019049414387-pct00044
실시예 11
독성 연구
종래의 접합된 EDB-L19-vc-0101 및 자리-특이적 접합된 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101의 비임상적 안전성 프로파일을 탐색적 반복-용량(Q3Wx3) 연구에서 위스타-한(Wistar-Han) 래트 및 사이노몰구스 원숭이에서 특징화하였다. 래트 및 사이노몰구스 원숭이는, 실시예 2에서 입증된 바와 같이, 비아코어 검정에 의한 래트, 인간 및 원숭이에 대한 항체 EDB-L19 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C)의 유사한 결합 친화도 뿐만 아니라, 인간 EDB와의 100% 단백질 서열 상동성에 기인하여, 독성 평가를 위한 약리학적으로 관련된 비임상적 종으로서 고려되었다.
EDB-L19-vc-0101을 위스타-한 래트 및 사이노몰구스 원숭이에서 각각 10 및 5 ㎎/㎏/용량까지 평가하였고, EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101을 사이노몰구스 원숭이에서 12 ㎎/㎏/용량까지 평가하였다. 래트 또는 원숭이에게 3 주 마다(1 일, 22 일 및 43 일) 한번씩 정맥내로 투약하고 46 일(3차 투약 후 3 일)째 안락사시켰다. 동물을 임상적 증상, 체중의 변화, 음식물 소비, 임상 병리학 매개변수, 기관 중량, 및 육안 및 현미경 관찰에 대해 평가하였다. 이들 연구에서는 동물의 사망률 또는 임상적 증상에서의 유의적인 변화는 주지되지 않았다.
래트 및 원숭이에서 EDB+ FN 발현 조직/기관에서의 표적-의존성 독성에 대한 징후는 없었다. 두 종에서, 주요 독성은 연관된 혈액학적 변화에 의한 가역적인 골수억제였다. 표 24 및 도 11에서 볼 수 있듯이, 원숭이에서, 현저한 일시적 호중구감소증이 5 ㎎/㎏/용량에서의 종래적으로 접합된 EDB-L19-vc-0101에 의해 관찰된 반면, 6 ㎎/㎏/용량에서의 자리-특이적 접합된 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101에 의해서는 호중구 수에 대하여 단지 최소한의 영향만이 관찰되었다. 점은 평균을 나타내고, 오차 막대는 평균으로부터의 ±1 표준 편차(SD)를 나타낸다.
데이터는 자리-특이적 접합에 의한 골수억제의 유의적인 경감을 입증한다. EDB-L19-vc-0101 및 EDB-(κK183C- K94R-K290C)-vc-0101의 독성 프로파일은 이들 접합체의 표적-독립적 영향과 일치하였고, EDB-L19-vc-0101 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101의 경우 가장 높은 심각하지 않은 독성 용량(HNSTD: highest non-severely toxic dose)은 각각 ≥ 5 ㎎/㎏/용량 및 ≥ 12 ㎎/㎏/용량인 것으로 결정되었다.
Figure 112019049414387-pct00045
실시예 12
IO 병용
암 세포가 사멸될 경우, 이들은 수지상 세포(DC)에 의해 흡취되고 제시되는 항원을 방출한다. 이들 종양 세포에서의 돌연변이 때문에, 이들 항원중 몇몇은 성숙한 DC에 의해 T 세포에 제시될 가능성을 갖는 암 신생에피토프를 포함하여, 이들을 활성화시키고 항-종양 표적화를 유도한다. 그러나, 음성 조절성 기작은 암 환자에서 상향조절된다. 예를 들면, 관문, 예컨대 PD-1/PD-L1 경로를 통한 신호발송은 신생에피토프의 인식 및 T 세포의 활성화를 제한할 수 있다.
ADC 형식으로 항체에 접합된 페이로드는 수지상 세포 성숙 경로와 연결되는 일에 참여하여, 종양 항원 교차 제시를 증가시킬 수 있는데, 이는 T 세포 프라이밍(priming) 및 증가된 종양 T 세포 표적화를 허용한다. 다양한 페이로드, 예컨대 페이로드-0101을 포함하는 본 발명의 EDB ADC는, 면역원성 종양 환경을 생성함으로써 종양 신생항원의 면역 인식을 개선시키기 위해 이용되었다. 이들 환경은, EDB ADC 및 면역-함암 제제가 병용되어 제공될 경우, 음성 조절성 경로를 차단하는 면역-항암 제제에 대해 반응성이 된다.
EDB-L19-vc-0101에 의해 처리된 EMT6 공통유전자 종양에 대한 효능 연구로부터의 데이터는, 페이로드-0101에 대한 효과자 반응이 유도되었음을 시사한다. EDB-L19-vc-0101 처리된 종양에서는 비히클 대조군에 비해 증가된 CD3+ T 세포의 침윤이 관찰되었다. 추가적으로, 처리된 종양에서 PDL1의 증가된 발현이 관찰되었고, 이는 증가된 효과자 T 세포 반응에 기인한 IFNγ 방출을 시사한다.
EDB ADC와 면역조절 경로를 표적화하는 제제, 예컨대 항-PDL1 길항물질 항체 또는 항-41BB 작용물질 항체와의 병용은 항-종양 효능을 쉽게 개선시키고 더욱 지속가능한 반응을 제공할 것이다.
실시예 13
생체지표/작용의 기작
NSCLC PDX 모델 PDX-NSX-11122을 이전에 기재된 바와 같은 누드 마우스에서 개발하였다. EDB-(K94R)-vc-0101, EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101, 및 Neg-vc-0101 ADC를 3 ㎎/㎏으로 꼬리 정맥 주사에 의해 투여하였다(그룹 당 시점 당 4 마리 동물). 단일 투여 이후 96 시간째, 동물을 마취하고 염수를 관류시켰다. 염수 관류 후, 종양을 제거하고 리간드 결합 검정(LBA)을 통해 항체 및 ADC를 측정하기 위해 준비하거나, 또는 면역조직화학(IHC)을 위해 준비하였다.
리간드 결합 검정(LBA)
LBA 검정을 위해, 5x 완충액을 종양 샘플에 첨가하였다. 조직 추출물 시약(인비트로겐)은 1% 프로테아제 저해제[시그마(Sigma)](부피/중량)를 함유하였고, 6x (㎍/㎖ 균질물→㎍/g 조직)의 최종 희석물을 가졌다. 스테인레스 스틸 비이드를 첨가하고 조직을 미니-비이드비터(Mini-Beadbeater)-96[바이오스펙(BioSpec)]에 의해 균질화하였다. 균질물(샘플 크기에 따라 ∼100 내지 300 ㎕)을 적절한 바이알[마르쉬 튜브(Marsh tube)]에 옮기고 14000 rpm에서 10 분 동안 원심분리하였다(4℃). 분석 프로토콜에 따라 분석을 위해 원심분리된 균질물을 수퍼 블록(Super Block: 상표명)에 의해 희석시켰다(MRD).
표 25에서 볼 수 있듯이, 리간드 결합 검정을 사용하여 EDB ADC의 단일 용량 투여 이후 평균 전체 항체 및 ADC 혈장 농도(㎍/㎖) 및 종양 농도(㎍/g)를 결정하였다. 데이터는 전체 항체 및 ADC에 의해 측정될 경우 EDB-(K94R)-vc-0101 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101이 Neg-vc-0101과 비교하여 증가된 수준으로 종양의 자리에서 검출되었음을 입증한다. 더욱이, Neg-vc-0101과 비교하여 EDB-(K94R)-vc-0101 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101에 대해 관찰된 ADC 및 전체 항체 둘 다의 혈장 대 종양 비가 감소되었고, 이는 EDB 표적화 ADC의 종양 특이적인 표적화의 효능이 증가됨을 지시한다.
Figure 112019049414387-pct00046
면역조직화학(IHC)
ADC 분포 및 반응의 다운스트림(downstream) 생체지표의 면역조직화학적 검출을 위해, 샘플을 48 시간 동안 10% 중성 완충된 포르말린에 고정시켰다. 고정 후, 샘플을 파라핀에 함침시키고 5 μΜ에서 절단하였다. 절단된 파라핀 절편을 자일렌 대체물에서 탈파라핀화시키고, 농도차가 있는 알코올에 의해 증류수로 탈수시켰다. 포스포-히스톤(Histone) H3 및 분할된 카스파아제(caspase) 3 검출을 위해 10mM 시트르산염 완충액 pH 6.0(인비트로겐)에서, 또는 프레셔 쿠커(pressure cooker)[일렉트론 마이크로스코피 사이언시즈(Electron Microscopy Sciences)]에서의 항-인간 IgG 검출 및 항-0101 검출을 위해 보르그 데클로커(Borg Decloaker) 완충액 pH 9.5(바이오케어 메디칼)에서 항온을 회수하고 실온으로 냉각시켰다. 내생성 과산화효소를 3% 과산화수소로 10 분 동안 차단시켰다. 비-특이적 단백질 상호작용을 단백질 블록(Protein block)(다코)에 의해 20 분 동안 차단시켰다. 조직 절편을 1차 항체와 함께 1 시간 동안 실온에서 항온처리하였다. 1차 항체는: 0.3 ㎍/㎖의 항-인간 Pan IgG 항체[에피토믹스(Epitomics)]; 10 ㎍/㎖의 항-0101 Ab; 0.13 ㎍/㎖의 항-포스포 히스톤 H3(pHH3, 셀 시그널링 테크놀로지스); 1.3 ㎍/㎖의 항-분할된 카스파아제 3(셀 시그널링 테크놀로지스)이었다. 마우스 온 마우스(mouse on mouse) 검출을 방지하기 위해, 알렉사 플루오르 488 단백질 표지화 키트[라이프 테크놀로지스(Life Technologies)]를 사용하여 항-0101 이소타입 항체를 알렉사 플루오르 488에 의해 표지화하였다. 표지화되지 않은 1차 항체를 실온에서 30 분 동안 시그널스타틴 부스트(Signalstain Boost) 시약(셀 시그널링 테크놀로지스)에 의해 검출하였다. 알렉사 플루오르 488 표지화된 1차 항체를 1 ㎍/㎖의 토끼 항-알렉사 플루오르 488(라이프 테크놀로지스)에 의해 45 분 동안 실온에서 검출하고, 이후 시그널스타틴 부스트 시약(셀 시그널링 테크놀로지)과 함께 30 분 동안 실온에서 항온처리하였다. DAB+(3',3'-디아미노벤지딘; 다코)를 사용하여 5 분 동안 발색시켰다. 절편을 헤마톡실린에서 간단히 대비염색하고, 물로 세척하고, 농도차가 있는 알코올에서 탈수시키고, 자일렌 대체물에서 청정화시키고, 퍼마운트 마운팅 매질에 의해 커버슬립으로 덮었다.
단일 투약 후 96 시간째, 종래의 EDB-(K94R)-vc-0101 및 자리-특이적 접합된 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101 둘 다를 PDX-NSX-11122 PDX 모델에서 항-인간 IgG IHC에 의해 유사하게 검출하였다. 음성 대조군 ADC(Neg-vc-0101)에 의해 처리된 종양과 비교하여, EDB-(K94R)-vc-0101 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101 둘 다에 의해 처리된 종양에서 유사분열 정지의 지표인 pHH3 양성 세포의 증가가 관찰되었다. pHH3 유사분열 정지 지표를 갖는 세포중 대부분은 신생 세포였고, 이는 방관자 효과를 시사한다. 분할된 카파아제 3 염색은, 음성 대조군 ADC(Neg-vc-0101)에 의해 처리된 종양과 비교하여, EDB-(K94R)-vc-0101 및 EDB-(κK183C-K94R-K290C)-vc-0101에 의해 처리된 종양에서의 증가된 세포자멸을 지시하였다.
SEQUENCE LISTING <110> Pfizer Inc. <120> ANTI-EDB ANTIBODIES AND ANTIBODY-DRUG CONJUGATES <130> PC72276 <140> PCT/IB2017/056093 <141> 2017-10-03 <150> US 62/409,081 <151> 2016-10-17 <160> 57 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 116 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic peptide sequence <400> 1 Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Phe 20 25 30 Ser Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ser Ser Ile Ser Gly Ser Ser Gly Thr Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Lys Pro Phe Pro Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val 100 105 110 Thr Val Ser Ser 115 <210> 2 <211> 348 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic nucleotide sequence <400> 2 gaggtgcagc tgttggagtc tgggggaggc 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Tyr Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Gly Ser Pro 35 40 45 Val Lys Ala Gly Val Glu Thr Thr Lys Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn 50 55 60 Lys Tyr Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys 65 70 75 80 Ser His Arg Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val 85 90 95 Glu Lys Thr Val Ala Pro Thr Glu Cys Ser 100 105 <210> 39 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic peptide sequence <400> 39 Leu Leu Gln Gly Gly 1 5 <210> 40 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic peptide sequence <400> 40 Leu Leu Gln Gly 1 <210> 41 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic peptide sequence <400> 41 Leu Ser Leu Ser Gln Gly 1 5 <210> 42 <211> 8 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic peptide sequence <400> 42 Gly Gly Gly Leu Leu Gln Gly Gly 1 5 <210> 43 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic peptide sequence <400> 43 Gly Leu Leu Gln Gly 1 5 <210> 44 <211> 10 <212> 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51 Leu Leu Gln Gly Ser Gly 1 5 <210> 52 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic peptide sequence <400> 52 Leu Leu Gln Tyr Gln Gly 1 5 <210> 53 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic peptide sequence <400> 53 Leu Leu Gln Leu Leu Gln Gly 1 5 <210> 54 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic peptide sequence <400> 54 Ser Leu Leu Gln Gly 1 5 <210> 55 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic peptide sequence <400> 55 Leu Leu Gln Leu Gln 1 5 <210> 56 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic peptide sequence <400> 56 Leu Leu Gln Leu Leu Gln 1 5 <210> 57 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic peptide sequence <400> 57 Leu Leu Gln Gly Arg 1 5

Claims (44)

  1. (a) 피브로넥틴(fibronectin)의 엑스트라 도메인(extra domain) B에 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편, (b) 연결기 및 (c) 약물을 포함하는 항체-약물 접합체에 있어서,
    항체 또는 이의 항원 결합 단편이 서열 번호 3, 5 및 7을 포함하는 3개의 CDR을 포함하는 중쇄 가변성 영역 및 서열 번호 12, 13 및 14를 포함하는 3개의 CDR을 포함하는 경쇄 가변성 영역을 포함하고,
    연결기가 말레이미도카프로일-발린-시트룰린-p-아미노벤질옥시카보닐, 설파닐 피리딘, 2-(피리딘-2-일디설파닐)에틸 카바모일 및 N-2-아세틸-L-라이실-L-발릴-L-시트룰린-p-아미노벤질옥시카보닐-N,N'-디메틸아미노에틸-CO-로부터 선택되고,
    약물이 아우리스타틴(auristatin) 및 1,2,8,8a-테트라히드로시클로프로파[c]피롤로[3,2-e]인돌-4(5H)-온에 기초한 이합체(CPI 이합체)로부터 선택되는,
    항체-약물 접합체.
  2. 제1항에 있어서,
    중쇄 가변성 영역이 서열 번호 1 또는 21을 포함하고 경쇄 가변성 영역이 서열 번호 10을 포함하는, 항체-약물 접합체.
  3. 제2항에 있어서,
    중쇄 가변성 영역이 서열 번호 1을 포함하고 경쇄 가변성 영역이 서열 번호 10을 포함하거나, 또는
    중쇄 가변성 영역이 서열 번호 21을 포함하고 경쇄 가변성 영역이 서열 번호 10을 포함하는, 항체-약물 접합체.
  4. 제3항에 있어서,
    항체 또는 이의 항원 결합 단편이, 서열 번호 8, 17, 19, 23, 25, 27 또는 29를 포함하는 중쇄, 및 서열 번호 15 또는 31을 포함하는 경쇄를 포함하는, 항체-약물 접합체.
  5. 제4항에 있어서,
    항체 또는 이의 항원 결합 단편이,
    서열 번호 8을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄;
    서열 번호 8을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄;
    서열 번호 17을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄;
    서열 번호 17을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄;
    서열 번호 19를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄;
    서열 번호 19를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄;
    서열 번호 23을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄;
    서열 번호 23을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄;
    서열 번호 25를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄;
    서열 번호 25를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄;
    서열 번호 27을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄;
    서열 번호 27을 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄;
    서열 번호 29를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 15를 포함하는 경쇄; 또는
    서열 번호 29를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄를 포함하는, 항체-약물 접합체.
  6. 제1항에 있어서,
    항체 또는 이의 항원 결합 단편이, 자리-특이적 접합을 위해 조작된 시스테인 잔기를 포함하는 중쇄 또는 경쇄 불변성 영역, 또는 자리-특이적 접합을 위해 조작된 시스테인 잔기를 포함하는 중쇄 및 경쇄 불변성 영역을 포함하는, 항체-약물 접합체.
  7. 제6항에 있어서,
    중쇄 불변성 영역이 카밧(Kabta)의 EU 색인의 넘버링(numbering)에 따라서 위치 290에서 조작된 시스테인 잔기(K290C)를 포함하는 항체-약물 접합체.
  8. 제6항에 있어서,
    경쇄 불변성 영역이 카밧의 넘버링에 따라서 위치 183에서 조작된 시스테인 잔기(κK183C)를 포함하는 항체-약물 접합체.
  9. 제6항에 있어서,
    중쇄 불변성 영역이 카밧의 EU 색인의 넘버링에 따라서 위치 290에서 조작된 시스테인 잔기(K290C)를 포함하고, 경쇄 불변성 영역이 카밧의 넘버링에 따라서 위치 183에서 조작된 시스테인 잔기(κK183C)를 포함하는 항체-약물 접합체.
  10. 제1항에 있어서,
    항체 또는 이의 항원 결합 단편이, 항체에 삽입된 조작된 글루타민-함유 태그를 포함하는 중쇄 불변성 영역을 포함하는, 항체-약물 접합체.
  11. 제10항에 있어서,
    조작된 글루타민-함유 태그가 위치 E294-N297에서 항체에 삽입되는 항체-약물 접합체.
  12. 제11항에 있어서,
    글루타민-함유 태그가 아미노산 서열 LLQG(서열 번호 40)를 포함하는 항체-약물 접합체.
  13. 제10항에 있어서,
    중쇄 불변성 영역이 카밧의 EU 색인의 넘버링에 따라서 위치 222에서 라이신(K) 치환 아르기닌(R)(K222R)을 추가로 포함하는 항체-약물 접합체.
  14. 제1항에 있어서,
    항체 또는 이의 항원 결합 단편이, 카밧의 넘버링에 따라서 위치 94에서 라이신(K) 치환 아르기닌(R)(K94R)을 포함하는 중쇄 가변성 영역을 포함하는 항체-약물 접합체.
  15. 제1항에 있어서,
    아우리스타틴이
    Figure 112021105454275-pct00081
    ,
    Figure 112021105454275-pct00082
    ,
    Figure 112021105454275-pct00083
    , 및
    Figure 112021105454275-pct00084

    로 구성된 군에서 선택되는 항체-약물 접합체.
  16. 제1항에 있어서,
    CPI 이합체가
    Figure 112021105454275-pct00085
    또는
    Figure 112021105454275-pct00086
    인 항체-약물 접합체.
  17. (a) 서열 번호 3, 5 및 7을 포함하는 3개의 CDR을 포함하는 중쇄 가변성 영역, 및 서열 번호 12, 13 및 14를 포함하는 3개의 CDR을 포함하는 경쇄 가변성 영역을 포함하는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편;
    (b) 말레이미도카프로일-발린-시트룰린-p-아미노벤질옥시카보닐 연결기; 및
    (c)
    Figure 112021105454275-pct00087

    을 포함하는 항체-약물 접합체.
  18. (a) 서열 번호 21을 포함하는 중쇄 가변성 영역 및 서열 번호 10을 포함하는 경쇄 가변성 영역을 포함하는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편;
    (b) 말레이미도카프로일-발린-시트룰린-p-아미노벤질옥시카보닐 연결기; 및
    (c)
    Figure 112021105454275-pct00088

    을 포함하는 항체-약물 접합체.
  19. (a) 서열 번호 25를 포함하는 중쇄 및 서열 번호 31을 포함하는 경쇄를 포함하는 항체, 또는 이의 항원 결합 단편;
    (b) 말레이미도카프로일-발린-시트룰린-p-아미노벤질옥시카보닐 연결기; 및
    (c)
    Figure 112021105454275-pct00089

    을 포함하는 항체-약물 접합체.
  20. 제1항 내지 제19항 중 어느 한 항의 항체-약물 접합체 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는, 암 치료용 약학 조성물.
  21. 제20항에 있어서,
    3 내지 5 범위의 평균 약물 대 항체 비(DAR: drug-antibody ratio)를 갖는 약학 조성물.
  22. 제20항에 있어서,
    1 내지 3 범위의 평균 DAR을 갖는 약학 조성물.
  23. 제1항 내지 제19항 중 어느 한 항의 항체의 중쇄 또는 경쇄를 인코딩하는 핵산.
  24. 중쇄를 인코딩하는 서열 번호 9, 18, 20, 24, 26, 28 및 30, 및 경쇄를 인코딩하는 서열 번호 16 및 32로 구성된 군에서 선택되는 서열의 핵산.
  25. 제23항의 핵산을 포함하는 벡터.
  26. 제23항의 핵산을 포함하는 숙주 세포.
  27. (a) (ⅰ) 서열 번호 3, 5 및 7을 포함하는 3개의 CDR을 포함하는 중쇄 가변성 영역 및 (ⅱ) 서열 번호 12, 13 및 14를 포함하는 3개의 CDR을 포함하는 경쇄 가변성 영역을 포함하는 항체를 제공하는 단계;
    (b) 연결기를 약물에 연결시키는 단계;
    (c) 연결기 및 약물을 항체에 접합시키는 단계; 및
    (d) 항체-약물 접합체를 정제하는 단계
    를 포함하되,
    연결기가 말레이미도카프로일-발린-시트룰린-p-아미노벤질옥시카보닐, 설파닐 피리딘, 2-(피리딘-2-일디설파닐)에틸 카바모일 및 N-2-아세틸-L-라이실-L-발릴-L-시트룰린-p-아미노벤질옥시카보닐-N,N'-디메틸아미노에틸-CO-로부터 선택되고,
    약물이 아우리스타틴(auristatin) 및 1,2,8,8a-테트라히드로시클로프로파[c]피롤로[3,2-e]인돌-4(5H)-온에 기초한 이합체(CPI 이합체)로부터 선택되는,
    제1항 내지 제19항 중 어느 한 항의 항체-약물 접합체를 제조하는 방법.
  28. 제27항에 있어서,
    접합이 항체 위의 하나 이상의 조작된 시스테인 잔기 또는 조작된 글루타민 잔기 상에서 자리-특이적인 방법.
  29. 제1항 내지 제19항 중 어느 한 항의 항체-약물 접합체를 포함하는 효과량의 조성물을, 암의 치료가 필요한 인간을 제외한 피험체에게 투여하는 단계를 포함하는, 암을 치료하는 방법.
  30. 제29항에 있어서,
    암이 고형 종양 또는 혈액암인 방법.
  31. 제30항에 있어서,
    고형 종양이 갑상선암, 육종, 유방암, 췌장암, 교모세포종, 담낭암, 신장암, 피부암, 자궁암, 중피종, 결장직장암, 두경부암, 난소암, 방광암, 고환암, 전립선암, 간암, 내분비암, 흉선암, 뇌암, 부신암, 안암, 경부암 및 폐암으로 구성된 군에서 선택되는 방법.
  32. 제30항에 있어서,
    혈액암이 백혈병, 림프종 및 골수종으로 구성된 군에서 선택되는 방법.
  33. 제20항에 있어서,
    암이 고형 종양 또는 혈액암인 약학 조성물.
  34. 제33항에 있어서,
    고형 종양이 갑상선암, 육종, 유방암, 췌장암, 교모세포종, 담낭암, 신장암, 피부암, 자궁암, 중피종, 결장직장암, 두경부암, 난소암, 방광암, 고환암, 전립선암, 간암, 내분비암, 흉선암, 뇌암, 부신암, 안암, 경부암 및 폐암으로 구성된 군에서 선택되는 약학 조성물.
  35. 제33항에 있어서,
    혈액암이 백혈병, 림프종 및 골수종으로 구성된 군에서 선택되는 약학 조성물.
  36. 삭제
  37. 삭제
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