KR102277529B1 - 변형된 피코르나바이러스 3c 프로테아제 및 그의 방법 - Google Patents
변형된 피코르나바이러스 3c 프로테아제 및 그의 방법 Download PDFInfo
- Publication number
- KR102277529B1 KR102277529B1 KR1020197004446A KR20197004446A KR102277529B1 KR 102277529 B1 KR102277529 B1 KR 102277529B1 KR 1020197004446 A KR1020197004446 A KR 1020197004446A KR 20197004446 A KR20197004446 A KR 20197004446A KR 102277529 B1 KR102277529 B1 KR 102277529B1
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- protease
- modified
- picornavirus
- fmdv
- amino acid
- Prior art date
Links
Images
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/12—Viral antigens
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
- C12N9/64—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
- C12N9/6421—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
- C12N9/6472—Cysteine endopeptidases (3.4.22)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
- C12N9/503—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from viruses
- C12N9/506—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from viruses derived from RNA viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/12—Viral antigens
- A61K39/125—Picornaviridae, e.g. calicivirus
- A61K39/135—Foot- and mouth-disease virus
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/32011—Picornaviridae
- C12N2770/32022—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/32011—Picornaviridae
- C12N2770/32023—Virus like particles [VLP]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/32011—Picornaviridae
- C12N2770/32034—Use of virus or viral component as vaccine, e.g. live-attenuated or inactivated virus, VLP, viral protein
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/32011—Picornaviridae
- C12N2770/32051—Methods of production or purification of viral material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y304/00—Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
- C12Y304/22—Cysteine endopeptidases (3.4.22)
- C12Y304/22028—Picornain 3C (3.4.22.28)
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Virology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
본원은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것으로서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 변경된 2차 구조 및 야생형 구제역 바이러스 (FMDV) 3C 프로테아제의 위치 16 내지 25, 99, 100 및 115 내지 130에 상응하는 하나 이상의 아미노산 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함하고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드는, 숙주 세포에서 형질전환되고 공동-발현될 때, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 형질전환되고 공동-발현된 숙주 세포에서 나타내는 P1 전구체 폴리펩타이드 형질전환 유전자의 발현양과 비교하여, P1 전구체 폴리펩타이드의 형질전환 유전자 발현을 증가시키고, 상기 하나 이상의 상응하는 아미노산 위치(들)은 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 하나 이상의 야생형 FMDV 3C 프로테아제(들)의 정렬에 의해 동정된다. 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드를 사용하여 피코르나바이러스 P1 전구체 폴리펩타이드를 피코르나바이러스 바이러스 단백질 및/또는 바이러스-유사 입자로 가공하는 방법이 또한 제공된다.
Description
[연관 출원에 대한 상호 참조]
본원은, 그 전문이 본원에 참조로서 포함되고, 2018 년 5 월 22 일자로 출원된 미국 출원 제 15/986,214 호의 일부 계속 출원이다.
[서열 목록]
본원은 EFS-Web을 통해 제출된 서열 목록을 포함하고, 그 전문이 본원에 참조로서 포함된다. 2018 년 5 월 20 일에 작성된 ASCII 사본은 DHS-0162_ST.25.txt로 명명되고, 크기는 1,892 KB이다.
[분야]
본원은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제(picornaviruses 3C proteases)에 관한 것이다. 상기 변형된 피코르나바이러스 프로테아제는 숙주 세포에서 발현될 때 감소된 세포 독성을 나타낸다.
아프토바이러스(Aphthovirus) [예: 구제역 바이러스 (Foot-and-Mouth Disease Virus, FMDV)], 엔테로바이러스 (Enterovirus) (예: 폴리오바이러스 및 리노바이러스) 및 헤파토바이러스 (Hepatovirus) [A형 간염 바이러스 (Hepatitis A virus, HAV)]와 같은 속(genera)을 포함하는 피코르나바이러스는 인간과 동물의 건강에 중요한 영향을 미친다. 일부 감염은 경미할 수 있지만, 많은 피코르나바이러스 균주는 심각한 질병과 실질적인 경제적 부담을 유발한다.
구조적으로, 피코르나바이러스는 단일-가닥의 게놈 RNA의 코어를 둘러싸고 있는 캡시드 (capsid)를 특징으로 하는 비외피형 (non-enveloped) RNA 바이러스이다. 상기 게놈 RNA는 하나의 개방 판독 프레임(open reading frame)을 포함하고, 이것은 바이러스-코딩된 프로테아제에 의해 구조 및 비구조 단백질들로 순차적으로 절단되는 큰 폴리프로테인으로 번역된다. 상기 캡시드를 조립하는 데 사용되는 상기 구조 단백질은 궁극적으로 중간 절단 생성물, P1 (또한 P1-2A라고도 알려짐)에서 유도된다.
상기 조립된 캡시드 (바이러스-유사 입자: Virus-Like Particles 또는 VLPs)만을 사용하는 다양한 피코르나바이러스 균주에 대한 서브유닛(subunit) 백신이 현재 개발 중에 있다. 숙주 세포에서 재조합적으로 발현될 수 있는, 이러한 다중단백질 구조는 진정(authentic) 천연 바이러스의 구조 및 형태를 모방하지만, 상기 바이러스 게놈이 결여되어 있다. 결과적으로, 바이러스의 일부만을 포함하는 그러한 백신은, 예를 들어, 보다 일반적으로 사용되는 비활성화된 전바이러스 생 백신(whole live viral vaccines) 보다 제조 과정 동안 우연한 발병의 결과를 일으킬 가능성이 적다.
VLPs를 포함하는 피코르나바이러스 서브유닛 백신의 잠재적 안전성에도 불구하고, 상기 구조를 숙주 세포로부터 수득하는 것이 어려울 수 있다. 예를 들어, 피코르나바이러스 3C 프로테아제 (또는 3Cpro), 또는 3Cpro와 3D 폴리머아라제 (또는 3CD)의 융합 단백질의 세포질 발현은 P1 폴리프로테인을 상기 캡시드로 조립되는 개별적인 구조 단백질로 가공하기 위해 전형적으로 요구된다. 그러나, 숙주 세포에서 3Cpro 또는 3CD의 사용은 세포 생존과 연관된 것들을 포함하여, 다양한 숙주 단백질의 단백질 분해 (proteolysis)를 일으킬 수 있다. 따라서, 숙주 세포에서 야생형 3Cpro 또는 3CD의 발현은 백신 제조 플랫폼 옵션을 제한하고 항원 수율을 감소시킬 수 있다.
최근 보고서는, 재조합 FMDV P1 폴리프로테인을 가공하는 능력을 유지하면서, 대장균(E.coli)과 같은 숙주 세포에 대한 해로운 영향을 완화시키는 FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체를 기술하고 있다. 그러나, 상기 특성들을 가진 다른 피코르나바이러스 3C 또는 3CD 프로테아제 돌연변이체는 기술되어 있지 않다. 또한, 신규 FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체가 대장균, 포유동물 숙주 세포 또는 다른 발현 시스템에서 추가적인 이점을 제공할 수 있기 때문에 바람직하다. 결과적으로, 숙주 세포에서 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 상기 발현을 촉진시키는 추가 피코르나바이러스 3C 또는 3CD 프로테아제 돌연변이체에 대한 요구가 있다.
제 1 측면에 있어서, 본원은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것으로서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 구제역 바이러스[Foot-and-Mouth Disease Virus (FMDV)] 3C 프로테아제의 위치 16 내지 25, 99, 100, 및 115 내지 130에 상응하는 하나 이상의 아미노산 위치(들)에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함한다. 전형적으로, 본원에 기재된 상기 야생형 FMDV 3C 프로테아제는 서열 번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18 및 20 중에서 선택된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 정의된 것과 같이, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드는, 숙주 세포에서 형질전환되고 공동-발현될때, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제로 형질전환되고 공동-발현되는 숙주 세포에서 나타나는 P1 전구체 폴리펩타이드 형질전환 유전자(transgene) 발현양과 비교하여, P1 전구체 폴리펩타이드의 형질전환 유전자 발현을 증가시킨다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기재된 것과 같이, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 피코르나바이러스 P1 전구체 폴리펩타이드에 대한 단백질 분해 활성을 나타낸다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기재된 것과 같이, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩되는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 발현하는 숙주 세포에서 단백질 분해에 의해 절단된 eIF4A1와 비교하여, 숙주 세포에서 단백질 분해에 의해 절단된 eIF4A1의 양의 증가 또는 감소를 나타낸다. 전형적으로, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 발현하는 숙주 세포에서 단백질 분해에 의해 절단된 eIF4A1의 양과 비교하여, 숙주 세포에서 단백질 분해에 의해 절단된 eIF4A1 양의 감소를 나타낸다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기재된 것과 같이, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 발현하는 숙주 세포에서 히스톤 H3, NEMO 또는 SAM68의 양과 비교하여, 히스톤 H3, 핵 전사 인자 카파 B 필수 조절 인자 (nuclear transcription factor kappa B essential modulator, NEMO), 또는 유사분열에서 68 kDa의 Src-연관 기질 (Src-associated substrate, SAM68)의 양의 증가 또는 감소를 나타낸다. 전형적으로, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 발현하는 숙주 세포에서 히스톤 H3, NEMO, 또는 SAM68의 양과 비교하여, 숙주 세포에서 히스톤 H3, NEMO, 또는 SAM68의 양의 감소를 나타낸다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드는 상기 변경된 단백질 2차 구조를 발현한다. 예를 들어, 변경된 알파-헬릭스, 변경된 베타 시트, 변경된 루프 등, 전형적으로, 상기 변경된 2차 구조는 변경된 A1-B1 β 시트, F1 β 가닥과 A2 β 가닥 사이의 변경된 루프, 및 변경된 A2-B2 시트로부터 선택되고, 상기 하나 이상의 아미노산 치환(들)이 하기 중에서 적어도 하나로부터 선택되는 하나 이상의 위치에 위치된다: 야생형 구제역 바이러스(FMDV) 3C 프로테아제의 상기 A1-B1 β 시트에서 아미노산 16-25 중에서 하나 이상에 상응하는 위치(들), 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 F1 β 가닥과 A2 β 가닥 사이의 상기 루프에서 아미노산 99 및 100 중에서 하나 이상에 상응하는 위치(들), 및 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 상기 A2-B2 β 시트에서 아미노산 115-130 중에서 하나 이상에 상응하는 위치(들).
일부 구현예들에 있어서, 아미노산 위치에 상응하는 상기 하나 이상은 상기 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 상기 하나 이상의 1차 아미노산 서열과 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 1차 아미노산 서열의 정렬(alignment)에 의해 동정된다. 전형적으로, 상기 정렬은 기본(default) 매개변수를 갖는 Blossum 62을 이용하여 2015년 1월 1일 Clone Manager 9, Professional Edition, Version 9.4을 사용하여 수행된다.
일부 구현예들에 있어서, 아미노산 위치에 상응하는 상기 하나 이상은 본원에서 기재된 것과 같이 상기 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 상기 하나 이상의 단백질 형태(conformation)와 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 단백질 형태를 비교함으로써 동정된다. 그러나, 전형적으로 상기 1차 아미노산 서열들의 정렬은 상응하는 아미노산 위치를 결정하기 위해 사용된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 배제한다. 다른 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 하나 이상의 아미노산 치환들을 갖는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 배제하고, 상기 하나 이상의 아미노산 치환들은 위치 125에서의 아미노산 치환, 위치 126에서의 아미노산 치환, 위치 127에서의 아미노산 치환, 위치 128에서의 아미노산 치환, 위치 129에서의 아미노산 치환, 위치 130에서의 아미노산 치환 및 이들의 조합들로 이루어진 군으로부터 선택된다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 아프토바이러스 (Aphthovirus), 아쿠아마바이러스 (Aquamavirus), 아비헤파토바이러스 (Avihepatovirus), 카디오바이러스 (Cardiovirus), 코사바이러스 (Cosavirus), 디시피바이러스 (Dicipivirus), 엔테로바이러스 (Enterovirus), 에르보바이러스(Erbovirus), 헤파토바이러스 (Hepatovirus), 코부바이러스 ( Kobuvirus ), 메기바이러스 (Megrivirus), 파레코바이러스 (Parechovirus), 피스세바이러스 (Piscevirus), 살리바이러스 (Salivirus), 사펠로바이러스 (Sapelovirus), 세네카바이러스(Senecavirus), 테스코바이러스 (Teschovirus) 및 트레모바이러스(Tremovirus)를 포함하는 상기 피코르나바이러스 속의 임의의 것으로부터의 임의의 종, 아형(subtype) 및/또는 혈청형(serotype)으로부터 수득될 수 있고 또는 유도될 수 있다. 전형적으로, 상기 속은 아프토바이러스 (Aphthovirus), 엔테로바이러스 (Enterovirus) 및 헤파토바이러스 (Hepatovirus)를 포함한다.
상기 아프토바이러스 (Aphthovirus) 속 내에 전형적인 종들은 소 비염 A 바이러스 (Bovine rhinitis A virus), 소 비염 B 바이러스 (Bovine rhinitis B virus), 말 비염 A 바이러스(Equine rhinitis A virus) 및 구제역 바이러스 (Foot-and-mouth disease virus, FMDV)를 포함한다. 전형적인 엔테로바이러스 (Enterovirus) 종들은 엔테로바이러스 A (Enterovirus A), 엔테로바이러스 B (Enterovirus B), 엔테로바이러스 C (Enterovirus C), 리노바이러스 A (Rhinovirus A) 및 리노바이러스 B (Rhinovirus B)를 포함한다. 상기 헤파토바이러스 (Hepatovirus) 내에 전형적인 종은 A형 간염 바이러스 (Hepatitis A virus)를 포함한다.
FMDV 내에 전형적인 바람직한 혈청형은 O, A, C, Southern African Territories (SAT) 1, SAT 2, SAT 3 및 Asia 1을 포함한다.
엔테로바이러스 A (Enterovirus A) 내에 전형적인 바람직한 혈청형은 콕사키바이러스 A10 (coxsackievirus A10) 및 엔테로바이러스 A71 (Enterovirus A71)을 포함한다.
엔테로바이러스 B (Enterovirus B) 내에 전형적인 바람직한 혈청형은 돼지 소낭병 바이러스 (swine vesicular disease virus), 콕사키바이러스 B1 (coxsackievirus B1), 및 콕사키바이러스 B3 (coxsackievirus B3), 더 전형적으로 콕사키바이러스 B1 (coxsackievirus B1) 및 콕사키바이러스 B3 (coxsackievirus B3)를 포함한다.
엔테로바이러스 C (Enterovirus C) 내에 전형적인 바람직한 혈청형은 콕사키바이러스 A1 (coxsackievirus A1), 폴리오바이러스 1, 폴리오바이러스 2 및 폴리오바이러스 3을 포함한다.
리노바이러스 A (Rhinovirus A) 내에 전형적인 바람직한 혈청형은 인간 리노바이러스 A2 (Human rhinovirus A2), 인간 리노바이러스 A20 및 인간 리노바이러스 A89를 포함한다.
리노바이러스 B (Rhinovirus B) 내에 전형적인 바람직한 혈청형은 인간 리노바이러스 B14를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 하기로부터 선택된다: 변형된 FMDV 3C 프로테아제, 변형된 소 비염 A 바이러스 (Bovine rhinitis A virus) 3C 프로테아제, 변형된 소 비염 B (Bovine rhinitis B) 3C 프로테아제, 변형된 말 비염(Equine rhinitis) 3C 프로테아제와 같은 변형된 아프토바이러스 (Aphthovirus) 3C 프로테아제; 변형된 엔테로바이러스 A (Enterovirus A) 3C 프로테아제, 변형된 엔테로바이러스 B (Enterovirus B) 3C 프로테아제, 변형된 엔테로바이러스 C (Enterovirus C) 3C 프로테아제, 변형된 리노바이러스 A (Rhinovirus A) 3C 프로테아제, 변형된 리노바이러스 B (Rhinovirus B) 3C 프로테아제와 같은 변형된 엔테로바이러스 (Enterovirus) 3C 프로테아제; 및 변형된 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus) 3C 프로테아제와 같은 변형된 헤파토바이러스 (Hepatovirus) 3C 프로테아제.
일부 구현예들에 있어서, 상기 하나 이상의 아미노산 치환들은 임의의 아미노산 치환(들)을 포함한다. 전형적으로, 상기 아미노산 치환(들)은 비-보존적 치환을 포함한다. 더 전형적으로, 상기 아미노산 치환은 프롤린이다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 잔기 16-25, 99-100 및 115-124와 같은, 잔기 16-25, 99-100 및 115-130 내에 또는 이에 상응하는 것에 하나 이상의 아미노산 치환을 갖는 변형된 FMDV 3C 프로테아제; 야생형 소 비염 A (Bovine rhinitis A) 3C 프로테아제의 잔기 16-25, 95, 96 및 111-124 내에 또는 이에 상응하는 것에 하나 이상의 아미노산 치환들을 갖는 변형된 소 비염(Bovine rhinitis) 3C 프로테아제; 야생형 소 비염 B (Bovine rhinitis B) 3C 프로테아제의 잔기 16-25, 96, 97 및 112-125 내에 또는 이에 상응하는 것에 하나 이상의 아미노산 치환들을 갖는 변형된 소 비염 3C 프로테아제; 야생형 말 비염 A (Equine rhinitis A) 3C 프로테아제의 잔기 16-25, 99-100 및 115-130 내에 또는 이에 상응하는 것에 하나 이상의 아미노산 치환들을 갖는 변형된 말 비염 A (Equine rhinitis A) 3C 프로테아제; 야생형 인간 콕사키바이러스(Human coxsackievirus) A10 3C 프로테아제의 잔기 19-24, 86, 87 및 100-113 내에 또는 이에 상응하는 것에 하나 이상의 아미노산 치환들을 갖는 변형된 엔테로바이러스 A (Enterovirus A) 3C 프로테아제; 야생형 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제의 잔기 19-24, 86, 87 및 100-113 내에 또는 이에 상응하는 것에 하나 이상의 아미노산 치환들을 갖는 변형된 엔테로바이러스 A (Enterovirus A) 3C 프로테아제; 야생형 인간 콕사키바이러스(Human coxsackievirus) B1 또는 B3 3C 프로테아제의 잔기 18-23, 87, 88 및 102-112 내에 또는 이에 상응하는 것에 하나 이상의 아미노산 치환들을 갖는 변형된 엔테로바이러스 (Enterovirus) B 3C 프로테아제; 야생형 인간 콕사키바이러스(Human coxsackievirus) A1 3C 프로테아제의 잔기 19-24, 86, 87 및 100-113 내에 또는 이에 상응하는 것에 하나 이상의 아미노산 치환들을 갖는 변형된 엔테로바이러스 C (Enterovirus C) 3C 프로테아제; 야생형 폴리오바이러스 3C 프로테아제의 잔기 18-23, 86, 87 및 100-113 내에 또는 이에 상응하는 것에 변형된 엔테로바이러스 C (Enterovirus C) 3C 프로테아제; 야생형 리노바이러스 A (Rhinovirus A) 또는 야생형 리노바이러스 B (Rhinovirus B)의 잔기 18-23, 86, 87 및 101-114 내에 또는 이에 상응하는 것에 하나 이상의 아미노산 치환들을 갖는 변형된 리노바이러스 3C 프로테아제; 야생형 인간 A형 간염 바이러스 (Hepatitis A virus) 3C 프로테아제의 잔기 15-20, 99, 100 및 124-131 내에 또는 이에 상응하는 것에 하나 이상의 아미노산 치환들을 갖는 헤파토바이러스 (Hepatovirus) 3C 프로테아제로부터 선택된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 I22 및 L23 중에서 선택되는 것과 같은, I99, L99 및 T100 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 D123, V124, G125 및 I128 중에서 선택되는 것과 같은, I22, L23, I99, L99, T100, D123, V124, G125, R126 및 I128 중에서 선택되는 하나 이상의 위치(들)에서 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 갖는 하나 이상의 변형된 FMDV 3C 프로테아제; 야생형 소 비염 A (Bovine rhinitis A) 바이러스 3C 프로테아제의 V22 및 C23 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 T96와 같은, 또는 L123 및 F124 중에서 선택되는 것과 같은, V22, C23, T96, L123 및 F124 중에서 선택되는 하나 이상의 위치(들)에서 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함하는 변형된 소 비염 A (Bovine rhinitis A) 바이러스 3C 프로테아제; 야생형 소 비염 B (Bovine rhinitis B) 3C 프로테아제의 V22, 및 R23 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 T97과 같은, 또는 V121 및 L124 중에서 선택되는 것과 같은, V22, R23, T97, V121 및 L124 중에서 선택되는 하나 이상의 위치(들)에서 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함하는 변형된 소 비염 B (Bovine rhinitis B) 바이러스; 야생형 말 비염 A (Equine rhinitis A) 3C 프로테아제의 T22 및 C23 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 T100과 같은, 또는 A125 및 T127 중에서 선택되는 것과 같은, Y22, C23, T100, A125 및 T127 중에서 선택되는 하나 이상의 위치(들)에서 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함하는 변형된 말 비염 A (Equine rhinitis A) 3C 프로테아제 중 하나 이상에서 선택되는 변형된 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제일 수 있다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 하기 중 하나 이상과 같은, 하나 이상의 변형된 엔테로바이러스 A (Enterovirus A) 3C 프로테아제 중에서 선택되는 변형된 엔테로바이러스(Enterovirus) 3C 프로테아제이다: 야생형 인간 콕사키바이러스(Human coxsackievirus) A10 바이러스 3C 프로테아제의 A71 3C의 Q19 및 T20 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 T87과 같은, 또는 L102, I104, N105, M109 및 M112 중에서 선택되는 것과 같은, Q19, T20, T87, L102, I104, N105, M109 및 M112 중에서 선택되는 하나 이상의 위치(들)에서 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함하는 하나 이상의 변형된 인간 콕사키바이러스(Human coxsackievirus) A10 바이러스, 및 야생형 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제의 Q19, 및 Q20 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 T87과 같은, 또는 I104, N105, T106 및 M109 중에서 선택되는 것과 같은, Q19, T20, T87, I104, N105, T106 및 M109 중에서 선택되는 하나 이상의 위치(들)에서 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함하는 변형된 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제; 야생형 인간 콕사키바이러스 B1의 K19 및 T20 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 R87과 같은, 또는 L102, I104, N105, T106, F109, M112 및 I114 중에서 선택되는 것과 같은, K19, T20, R87, L102, I104, N105, T106, F109, M112 및 I114 중에서 선택되는 하나 이상의 위치(들)에서 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함하는 변형된 인간 콕사키바이러스 B1 3C 프로테아제와 같은, 변형된 엔테로바이러스 B (Enterovirus B) 3C 프로테아제, 및 야생형 인간 콕사키바이러스 B3 3C 프로테아제의 K19 및 T20 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 R87과 같은, 또는 L102, I104, N105, T106, F109, M112 및 I114 중에서 선택되는 것과 같은, K19, T20, R87, L102, I104, N105, T106, F109, M112 및 I114 중에서 선택되는 하나 이상의 위치(들)에서 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함하는 변형된 인간 콕사키바이러스 B3 3C 프로테아제; 야생형 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제의 T19 및 T20 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 R87과 같은, 또는 L102, V104, N105, T106, F109 및 M112 중에서 선택되는 것과 같은, T19, T20, R87, L102, V104, N105, T106, F109 및 M112 중에서 선택되는 하나 이상의 위치(들)에서 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함하는 하나 이상의 변형된 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제 중에서 선택된 변형된 엔테로바이러스 C (Enterovirus C) 3C 프로테아제, 및 야생형 인간 폴리오바이러스 3C 프로테아제의 T19 및 T20 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 R87과 같은, 또는 L102, I103, 및 V104 중에서 선택되는 것과 같은, T19, T20, R87, L102, I103, 및 V104 중에서 선택되는 하나 이상의 위치(들)에서 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함하는 변형된 인간 폴리오바이러스 3C 프로테아제; 야생형 리노바이러스 A (Rhinovirus A) 3C 프로테아제의 T19 및 T20 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 I86 및 R87 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 L102, L104, Q108, T112 및 I114 중에서 선택되는 것과 같은, T19, T20, I86, R87, L102, L104, Q108, T112 및 I114 중에서 선택되는 하나 이상의 위치(들)에서 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함하는 하나 이상의 변형된 리노바이러스 A (Rhinovirus A) 3C 프로테아제 중에서 선택된 변형된 엔테로바이러스(Enterovirus) 3C 프로테아제, 및 야생형 리노바이러스 B (Rhinovirus B) 3C 프로테아제의 T19 및 T20 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 I86 및 I87 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 I112 및 E114 중에서 선택되는 것과 같은, T19, T20, I86, R87, I114 및 E114 중에서 선택되는 하나 이상의 위치(들)에서 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 갖는 변형된 리노바이러스 B (Rhinovirus B) 3C 프로테아제, 및 야생형 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus) 3C 프로테아제의 G19 및 E20 중에서 선택되는 것과 같은, 또는 T100과 같은, 또는 T100, L119, T121, M128 및 I130 중에서 선택되는 것과 같은, G17, G18, G19, E20, T100, L19, T121, M128 및 I130 중에서 선택되는 하나 이상의 위치(들)에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 갖는 변형된 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus) 3C 프로테아제와 같은 변형된 헤파토바이러스(Hepatovirus).
전형적으로, 본원에 기술된 상기 야생형 FMDV 3C 프로테아제는 서열 번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18 및 20의 적어도 하나 중에서 선택된다. 전형적으로, 본원에 기술된 상기 야생형 소 비염 3C 프로테아제는 서열 번호 422 및 434 중에서 선택된다. 전형적으로, 본원에 기술된 상기 야생형 말 비염 3C 프로테아제는 서열 번호 444이다. 전형적으로, 본원에 기술된 상기 야생형 인간 콕사키바이러스 A10 3C 프로테아제는 서열 번호 478이다. 전형적으로, 본원에 기술된 상기 야생형 인간 콕사키바이러스 B1 3C 프로테아제는 서열 번호 494이다. 전형적으로, 본원에 기술된 상기 야생형 인간 콕사키바이러스 B3 3C 프로테아제는 서열 번호 510이다. 전형적으로, 본원에 기술된 상기 야생형 인간 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제는 서열 번호 462이다. 전형적으로, 본원에 기술된 상기 야생형 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제는 서열 번호 536이다. 전형적으로, 본원에 기술된 상기 야생형 인간 간염 바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 538이다. 전형적으로, 본원에 기술된 상기 야생형 인간 폴리오바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 552, 566, 및 580 중에서 선택된다. 전형적으로, 본원에 기술된 상기 야생형 리노바이러스 A (Rhinovirus A) 3C 프로테아제는 서열 번호 604, 618 및 620 중에서 선택된다. 전형적으로, 본원에 기술된 상기 야생형 리노바이러스 B (Rhinovirus B) 3C 프로테아제는 서열 번호 594이다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18 및 20 중에서 선택된 하나 이상의 야생형 FMDV 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 91%와 같은, 적어도 92%와 같은, 적어도 93%와 같은, 적어도 94%와 같은, 적어도 95%와 같은, 적어도 96%와 같은, 적어도 97%와 같은, 적어도 98%와 같은, 적어도 99%의 상동성을 갖는 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 FMDV 3C 프로테아제이다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 422 및 434 중에서 선택된 하나 이상의 야생형 소 비염 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 91%와 같은, 적어도 92%와 같은, 적어도 93%와 같은, 적어도 94%와 같은, 적어도 95%와 같은, 적어도 96%와 같은, 적어도 97%와 같은, 적어도 98%와 같은, 적어도 99%를 상동성을 갖는 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 소 비염 3C 프로테아제이다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 444의 상기 야생형 말 비염 A 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 91%와 같은, 적어도 92%와 같은, 적어도 93%와 같은, 적어도 94%와 같은, 적어도 95%와 같은, 적어도 96%와 같은, 적어도 97%와 같은, 적어도 98%와 같은, 적어도 99%와 같은 상동성을 갖는 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 말 비염 3C 프로테아제이다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 478의 상기 야생형 인간 콕사키바이러스 A10 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 91%와 같은, 적어도 92%와 같은, 적어도 93%와 같은, 적어도 94%와 같은, 적어도 95%와 같은, 적어도 96%와 같은, 적어도 97%와 같은, 적어도 98%와 같은, 적어도 99%와 같은 상동성을 갖는 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 엔테로바이러스 A (Enterovirus A) 3C 프로테아제이다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 536의 상기 야생형 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 91%와 같은, 적어도 92%와 같은, 적어도 93%와 같은, 적어도 94%와 같은, 적어도 95%와 같은, 적어도 96%와 같은, 적어도 97%와 같은, 적어도 98%와 같은, 적어도 99%와 같은 상동성을 갖는 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 엔테로바이러스 A (Enterovirus A) 3C 프로테아제이다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 494의 상기 야생형 인간 콕사키바이러스 B1 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 91%와 같은, 적어도 92%와 같은, 적어도 93%와 같은, 적어도 94%와 같은, 적어도 95%와 같은, 적어도 96%와 같은, 적어도 97%와 같은, 적어도 98%와 같은, 적어도 99%와 같은 상동성을 갖는 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 엔테로바이러스 B (Enterovirus B) 3C 프로테아제이다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 510의 상기 야생형 인간 콕사키바이러스 B3 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 91%와 같은, 적어도 92%와 같은, 적어도 93%와 같은, 적어도 94%와 같은, 적어도 95%와 같은, 적어도 96%와 같은, 적어도 97%와 같은, 적어도 98%와 같은, 적어도 99%와 같은 상동성을 갖는 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 엔테로바이러스 B (Enterovirus B) 3C 프로테아제이다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 462의 상기 야생형 인간 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 91%와 같은, 적어도 92%와 같은, 적어도 93%와 같은, 적어도 94%와 같은, 적어도 95%와 같은, 적어도 96%와 같은, 적어도 97%와 같은, 적어도 98%와 같은, 적어도 99%와 같은 상동성을 갖는 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 엔테로바이러스 C (Enterovirus C) 3C 프로테아제이다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 552, 566 및 580 중에서 선택되는 하나 이상의 야생형 인간 폴리오바이러스 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 91%와 같은, 적어도 92%와 같은, 적어도 93%와 같은, 적어도 94%와 같은, 적어도 95%와 같은, 적어도 96%와 같은, 적어도 97%와 같은, 적어도 98%와 같은, 적어도 99%와 같은 상동성을 갖는 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 엔테로바이러스 C (Enterovirus C) 3C 프로테아제이다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 604, 618 및 620 중에서 선택되는 하나 이상의 야생형 리노바이러스 A (Rhinovirus A) 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 91%와 같은, 적어도 92%와 같은, 적어도 93%와 같은, 적어도 94%와 같은, 적어도 95%와 같은, 적어도 96%와 같은, 적어도 97%와 같은, 적어도 98%와 같은, 적어도 99%와 같은 상동성을 갖는 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 엔테로바이러스(Enterovirus) 3C 프로테아제이다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 594의 상기 야생형 리노바이러스 B (Rhinovirus B) 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 91%와 같은, 적어도 92%와 같은, 적어도 93%와 같은, 적어도 94%와 같은, 적어도 95%와 같은, 적어도 96%와 같은, 적어도 97%와 같은, 적어도 98%와 같은, 적어도 99%와 같은 상동성을 갖는 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 엔테로바이러스(Enterovirus) 3C 프로테아제이다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 538의 상기 야생형 인간 간염 바이러스 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 91%와 같은, 적어도 92%와 같은, 적어도 93%와 같은, 적어도 94%와 같은, 적어도 95%와 같은, 적어도 96%와 같은, 적어도 97%와 같은, 적어도 98%와 같은, 적어도 99%와 같은 상동성을 갖는 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus) 3C 프로테아제이다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 FMDV 3C 프로테아제는 서열 번호 22, 24, 26, 28, 30, 32, 34, 36, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 74, 76, 78, 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 102, 104, 106, 108, 110, 112, 114, 116, 178, 180, 138, 140, 142, 144, 146, 148, 150, 152, 154, 156, 182, 184, 186, 188, 190, 192, 194, 196, 198, 200, 202, 204, 206, 208, 210, 212, 214, 216, 218, 220, 222, 224, 226, 228, 230, 232, 234, 236, 238, 240, 242, 244, 246, 248, 250, 252, 254, 256, 258, 260, 262, 264, 266, 268, 270, 272, 274, 276, 278, 280, 302, 304, 306, 308, 310, 312, 314, 316, 318, 320, 322, 324, 326, 328, 330, 332, 334, 336, 338, 340, 342, 344, 346, 348, 350, 352, 354, 356, 358 및 360 중에서 선택된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 소 비염 3C 프로테아제는 서열 번호 412, 414, 416, 418, 420, 424, 426, 428, 430 및 432 중에서 선택된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 말 비염 3C 프로테아제는 서열 번호 436, 438, 440, 442 및 446 중에서 선택된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 엔테로바이러스 A(Enterovirus A) 3C 프로테아제는 서열 번호 464, 466, 468, 470, 472, 474, 476, 512, 514, 516, 518, 520, 522 및 524 중에서 선택된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 엔테로바이러스 A (Enterovirus A) 3C 프로테아제는 서열 번호 480, 482, 484, 486, 488, 490, 492, 496, 498, 500, 502, 504, 506 및 508 중에서 선택된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 엔테로바이러스 C (Enterovirus C) 3C 프로테아제는 서열 번호 448, 450, 452, 454, 456, 458, 460, 540, 542, 544, 546, 548, 550, 554, 556, 558, 560, 562, 564, 568, 570, 572, 574, 576 및 578 중에서 선택된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 리노바이러스 A (Rhinovirus A) 3C 프로테아제는 서열 번호 596, 598, 600, 602, 604, 606, 608, 610, 612, 614, 616, 618, 620, 622, 624, 626, 628, 630, 632 및 634 중에서 선택된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 리노바이러스 B (Rhinovirus B) 3C 프로테아제는 서열 번호 582, 584, 586, 588, 590 및 592 중에서 선택된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus) 3C 프로테아제는 서열 번호 528, 530, 532, 534, 536, 652 및 654 중에서 선택된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기재된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드는 피코르나바이러스 P1 전구체 폴리펩타이드를 코딩하는 적어도 하나의 폴리뉴클레오타이드 서열을 추가 포함한다. 전형적으로, 상기 피코르나바이러스 P1 전구페 폴리펩타이드는 본원에 기재된 것과 같이 상기 피코르나바이러스 속, 종들 및/또는 균주들의 임의의 것으로부터 수득된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기재된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드는 3D 펩타이드를 코딩하는 적어도 하나의 폴리뉴클레오타이드 서열을 추가 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기재된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드는 융합 폴리펩타이드를 코딩하고, 상기 융합 폴리펩타이드는 적어도 3D 펩타이드를 코딩하는 폴리펩타이드 서열을 포함한다. 전형적으로, 상기 융합 폴리펩타이드는 3CD 폴리펩타이드이다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 피코르나바이러스 P1 전구체 폴리펩타이드는 FMDV P1 전구체 폴리펩타이드이다. 일부 구현예들에 있어서, FMDV P1 전구체 폴리펩타이드는 서열 번호 363, 366, 369, 372, 375, 378, 381, 384 및 387의 적어도 하나로부터 선택된다. 일부 구현예들에 있어서, FMDV P1 전구체 폴리펩타이드와 같은, 상기 피코르나바이러스 P1 전구체 폴리펩타이드는 서열 번호 362, 365, 368, 371, 374, 377, 380, 383 및 386에서 적어도 90% 상동성, 적어도 91% 상동성과 같은, 적어도 92% 상동성과 같은, 적어도 93% 상동성과 같은, 적어도 94% 상동성과 같은, 적어도 95% 상동성과 같은, 적어도 96% 상동성과 같은, 적어도 97% 상동성과 같은, 적어도 98% 상동성과 같은, 적어도 99% 상동성과 같은, 100% 상동성과 같은 폴리뉴클레오타이드 서열을 갖는다.
또 다른 측면에 있어서, 본원은, 본원의 제 1 측면의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다. 본원의 후속 측면에 있어서, 상기 제 1 측면의 옵션과 구현예들을 준용 (mutatis mutandis)하여 적용한다.
또 다른 측면에 있어서, 본원은, 본원의 상기 제 1 측면에서 기재된 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 벡터에 관한 것이다. 본원의 후속 측면에 있어서, 상기 일 측면의 옵션과 구현예들을 준용하여 적용한다. 본원의 상기 벡터의 추가적인 옵션과 구현예들은 아래에 기재된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 본원의 벡터는 본원에 기재된 것과 같이 미니서클 벡터, 플라스미드 벡터, 바큘로바이러스 벡터 (baculovirus vector) , 알파바이러스 벡터 (alphavirus vector), 렌티바이러스 벡터 (lentivirus vector), 복제 결핍 아데노바이러스 벡터 (replication deficient adenovirus vector), 또는 우두 바이러스 벡터 (vaccinia virus vector)이다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 벡터는, 본원에 기재된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 폴리뉴클레오타이드에 추가하여 적어도 하나의 목적 단백질 또는 목적 폴리펩타이드를 코딩하는 폴리뉴클레오타이드를 추가 포함한다. 예를 들어, 상기 벡터는, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 상기 폴리뉴클레오타이드 서열 또는 다른 목적 단백질에 작동가능하게 연결된, 적어도 하나의 프로모터 또는 다른 전사 조절 요소, 적어도 하나의 원핵 생물 또는 진핵 생물 번역 개시 서열 또는 다른 번역 조절 요소, 적어도 하나의 번역 인터럽터 서열, 및/또는 적어도 하나의 리포터 유전자를 추가 포함할 것이다. 다른 목적 단백질은, 예를 들어, VP0, VP3, VP1 및, 선택적으로, 3D, 2A, △1D2A, GLuc 및/또는 SGLuc에 대해 코딩하는 적어도 하나의 폴리뉴클레오타이드 서열과 같은 피코르나바이러스 단백질을 포함한다.
또 다른 측면에 있어서, 본원은 위에서 기재된 상기 벡터를 포함하는 숙주 세포에 관한 것이다. 본원의 후속 측면에 있어서, 상기 제 1 측면의 옵션과 구현예들 및 상기 벡터에 관한 상기 측면을 준용하여 적용한다. 본원의 상기 숙주 세포의 추가적인 옵션과 구현예들은 아래에 기재된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기재된 상기 벡터는 본원의 숙주 세포에서 발현된다. 상기 본원 숙주 세포는 진핵 또는 원핵 숙주 세포들 일 수 있다. 본원에 기재된 상기 벡터, 폴리뉴클레오타이드 구조체, 조성물 및/또는 방법에 사용될 수 있는 적합한 진핵 세포는, 사카로마이세스 세레비시아 (Saccharomyces cerevisiae), 피키아 파스토리스 (Pichia pastoris)와 같은 진균류 세포; 애기장대 (Arabidopsis thaliana), 클라미도모나스 레인하티 (Chlamydomonas reinhardtii), 대두 (Glycine max), 니코티아나 벤타미아나 (Nicotiana benthamiana), 재배담배 (Nicotiana tabacum), 벼 (Oryza sativa), 옥수수 (Zea mays)와 같은 식물 세포들; 담배거세미나방종 (Spodoptera frugiperda), 노랑초파리 (Drosophila melanogaster), Sf9, Sf21와 같은 곤충 세포; 예를 들어, HEK-293-T (인간 신장 배아) 세포, 중국 햄스터 난소 [Chinese Hamster Ovary (CHO)] 세포, 아기 햄스터 신장(BHK) 세포, LF-BK (돼지 세포), 및/또는 LF-BK αV/β6 세포인 포유동물 세포와 같은 척추동물 세포를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기재된 상기 벡터는, 예를 들어, FMDV 감염인 피코르나바이러스의 감염에 민감한 동물 세포와 같은 포유동물 세포와 같은, 척추 동물 세포와 같은, 동물세포와 같은 숙주세포에서 발현된다.
적합한 원핵 세포는, 간균 (Bacillus), 락토코코스 (Lactococcus), 스트렙토미세스 (Streptomyces), 로도코커스 (Rhodococcus), 코리네박테리움 (Corynebacterium) 및/또는 미코박테륨 (Mycobacterium)과 같은 그람-양성 원핵 세포, 및 대장균 (Escherichia) 및 슈도모나스(Pseudomonas)와 같은 그람-음성 원핵 세포를 포함한다.
다른 측면에 있어서, 본원은, 본원에 기술된 것과 같이 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 폴리뉴클레오타이드 또는 벡터, 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의한 단백질 분해에 적합한 약학적으로 허용가능한 부형제, 보조제, 완충제 또는 용액을 포함하는 조성물에 관한 것이다. 이하 본원의 측면에서, 상기 제 1 측면의 옵션과 구현예들 및 상기 벡터에 관한 상기 측면을 준용하여 적용한다.
다른 측면에 있어서, 본원은 또한 피코르나바이러스 P1 전구체 폴리펩타이드를 피코르나바이러스 바이러스 단백질 및/또는 바이러스-유사 입자(VLPs)로 가공하는 방법에 관한 것으로서, 상기 방법은 하기를 포함한다: 적합한 배지에서 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 숙주 세포 및/또는 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 벡터를 배양하고; VP0, VP1, VP2, VP3 및 VP4 및/또는 VLPs 중에서 선택되는 적어도 하나의 바이러스 단백질을 회수함. 본원의 후속하는 측면에 있어서, 상기 제 1 측면의 옵션과 구현예들을 준용하여 적용한다. 상기 벡터 측면 및 숙주 세포 측면의 상기 옵션과 구현예들 또한 준용하여 적용한다. 본원의 추가적인 옵션과 구현예들은 아래에 기재된다.
일부 구현예들에 있어서, 적어도 VP0, VP1 및 VP3이 회수된다. 일부 구현예들에 있어서, 회수되는 상기 VLPs는 FMDV VLPs이다.
일부 구현예들에 있어서, 피코르나바이러스 바이러스 단백질 및/또는 VLPs에서 피코르나바이러스 P1 전구체 폴리펩타이드를 가공하기 위한 방법은, 분비된 루시퍼라아제(luciferase)의 양을 측정함으로써, FMDV P1 전구체 폴리펩타이드 발현과 같은, 변형된 FMDV 3C 프로테아제 또는 피코르나바이러스 P1 전구체 폴리펩타이드 발현과 같은, 피코르나바이러스 3C 프로테아제 활성을 모니터링하는 것을 추가 포함한다.
상기 방법의 일부 구현예들에 있어서, 본원의 숙주 세포에 의해 발현된, FMDV P1 전구체 폴리펩타이드와 같은 상기 피코르나바이러스 P1 전구체 폴리펩타이드의 적어도 90%, 또는 적어도 95%가, 본원에 기재된 변형된 FMDV 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 절단된다.
상기 방법의 일부 구현예들에 있어서, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 발현하는 다른 상동성 숙주 세포와 비교하여, 하나 이상의 숙주 세포 단백질의, 5% 미만과 같은, 2% 미만과 같은, 10% 미만이 본원에 기술된 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 절단된다.
상기 방법의 일부 구현예들에 있어서, FMDV P1 전구체 폴리펩타이드와 같은, 본원에 기재된 피코르나바이러스 P1 전구체 폴리펩타이드는, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 발현하는 다른 상동성 숙주 세포로부터의 양보다 숙주 세포에서 더 많이 발현되거나 또는 더 많이 회수된다.
상기 방법의 일부 구현예들에 있어서, VP0, VP1, VP2, VP3, VP4 및/또는 VLPs는, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서의 양보다 숙주 세포에서 더 많은 양이 발현되거나 또는 회수된다.
상기 방법의 일부 구현예들에 있어서, 본원에 기재된 숙주 세포에서 본원에 기재된 벡터는, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 2A 또는 다른 변역 인터럽터 서열, 및 N-말단 메티오닌 잔기가 없는 FMDV P1 전구체 폴리펩타이드와 같은 피코르나바이러스 P1 전구체 폴리펩타이드, 및 선택적으로, 분비될 수 있는 GLuc, SGLuc 또는 다른 루시퍼라아제 중 적어도 하나를 코딩한다.
상기 방법의 일부 구현예들에 있어서, 본원에 기재된 숙주 세포에서 벡터는, 본원에 기재된 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 피코르나바이러스 3D 폴리머라아제, 2A 또는 다른 번역 인터럽터 서열, 및 N-말단 메티오닌 잔기 내, FMDV P1 전구체 폴리펩타이드와 같은 피코르나바이러스 P1 전구체 폴리펩타이드, 및 선택적으로, 분비될 수 있는 GLuc, SGLuc 또는 다른 루시퍼라아제 중 적어도 하나를 코딩한다.
상기 방법의 일부 구현예들에 있어서, 본원의 숙주 세포는, 본원에 기재된 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 본원에 기재된 FMDV P1 전구체 폴리펩타이드와 같은 피코르나바이러스 P1 전구체 폴리펩타이드, 및 분비될 수 있는 GLuc, SGLuc 또는 다른 루시퍼라아제 중 하나 이상, 및 선택적으로 3D, 2A, △1D2A, 또는 다른 번역 인터럽터 서열 중 하나 이상을 포함하는 융합 단백질을 발현하는 벡터를 포함한다.
상기 방법의 일부 구현예들에 있어서, 본원의 숙주 세포는, 본원에 기재된 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 본원에 기재된 FMDV P1 전구체와 같은 피코르나바이러스 P1 전구체 폴리펩타이드, 피코르나바이러스 3D 폴리머라아제, 및 분비될 수 있는 GLuc, SGLuc 또는 다른 루시퍼라아제 중 하나 이상, 및 선택적으로, 2A, △1D2A, 또는 다른 번역 인터럽터 서열 중 하나 이상을 포함하는 융합 단백질을 발현하는 벡터를 포함한다.
본원은 또한, 본원에 기재된 것과 같이, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및 P1 전구체 폴리펩타이드를 코딩하는 벡터 또는 폴리뉴클레오타이드 구조체(construct)를 그것을 필요로 하는 대상에게 투여하는 것을 포함하는, 피코르나바이러스에 대한 면역 반응을 유도하는 방법에 관한 것이다.
본원은 또한, 본원에 기재된 것과 같이, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및 P1 전구체 폴리펩타이드를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드의 주입을 통한 진핵 세포 및/또는 원핵 세포에서 생성되는, 본원에 기재된 것과 같은 VP0, VP1, VP2, VP3 및 VP4 및/또는 VLPs를 필요로 하는 대상에게 투여하는 것을 포함하는, 피코르나바이러스에 대한 면역 반응을 유도하는 방법에 관한 것이다.
본원의 후속 측면에 있어서, 상기 일 측면의 옵션과 구현예들을 준용하여 적용한다.
도 1은, 단일 개방-판독 프레임 (open-reading frame, ORF) 및 단일 ORF에서 바이러스 폴리프로테인을 코딩하는 피코르나바이러스 RNA 게놈의 연관된 유전적 요소를 나타낸 것이다. 도 1은, 또한 중간 전구체 폴리펩타이드로, 그리고 및 궁극적으로 개별적인 바이러스 단백질로 상기 바이러스 폴리프로테인을 가공하는 것을 나타낸 것이다.
도 2는, 발명의 설명에 기술한 것과 같이, FMDV 3C 프로테아제 결정 구조의 다이아그램을 나타낸 것이다.
도 3은, 예시적으로 야생형 FMDV 균주 Asia Lebanon 89 (서열 번호 6)의 3C 프로테아제의 알려진 2차 구조 및 그것의 아미노산 서열 내에 위치 46, 84 및 163에서 촉매성 잔기의 트리아드의 상대적 위치들을 나타낸다.
도 4는, 발명의 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV, 소 비염 A (Bovine rhinitis A), 소 비염 B (Bovine rhinitis B) 및 말 비염 A (Equine rhinitis A)로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조는 또한 동정된다.
도 5는, 발명의 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV, 콕사키바이러스 (coxsackievirus) A10 및 콕사키바이러스(coxsackievirus) A1로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조는 또한 동정된다.
도 6은, 발명의 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV 및 인간 엔테로바이러스(Enterovirus) A71로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조들은 또한 동정된다.
도 7은, 발명의 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV, 콕사키바이러스 B3 및 콕사키바이러스 B1로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조들은 또한 동정된다.
도 8은, 발명의 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV, 폴리오바이러스 1, 폴리오바이러스 2 및 폴리오바이러스 3으로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조들은 또한 동정된다.
도 9는, 발명의 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV, 인간 리노바이러스 A2, 인간 리노바이러스 A89 및 인간 리노바이러스 A20으로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조들은 또한 동정된다.
도 10은, 발명의 자세한 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV 및 인간 리노바이러스 B14로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조들은 또한 동정된다.
도 11은, 발명의 자세한 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV 및 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus)로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조들은 또한 동정된다.
도 12는, 발명의 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV, 콕사키바이러스(coxsackievirus) A10, 콕사키바이러스(coxsackievirus) A1, 폴리오바이러스 1, 폴리오바이러스 2, 폴리오바이러스 3, 인간 리노바이러스 A2, 인간 리노바이러스 A89, 인간 리노바이러스 A20, 인간 리노바이러스 B14, 인간 리노바이러스 A71, 콕사키바이러스(coxsackievirus) B1, A 형 간염 바이러스, 소 비염 A (Bovine rhinitis A), 소 비염 B (Bovine rhinitis B) 및 말 비염 A (Equine rhinitis A) 로부터 야생형 3C 프로테아제 일부의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조들은 또한 동정된다.
도 13a 내지 13d: 도 13a는, 실시예 2A에 기재된 것과 같이 아미노산 123 내지 128에 의해 형성된 사이드 체인을 나타내는 FMDV 3C 프로테아제의 결정 구조의 일부를 나타낸 것이다. 도 13b는, 실시예 2A 및 2B에 기재된 것과 같이, FMDV P1 폴리펩타이드 (O1MP1), 3C 프로테아제 및 마커 (△1D2A-GLuc △1M)를 코딩하는 pJJP 발현 플라스미드의 맵(map)을 나타낸 것이다. 도 13c 및 도 13d는 각각, 실시예 2A 및 2B에 기재된 것과 같이, 잔기 123 내지 128에서 프롤린 치환들을 포함하는 FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체, 야생형 FMDV 3C 프로테아제 및 잔기 163에서 시스테인의 위치에 알라닌을 포함하는 FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체를 코딩하는 pJJP 플라스미드를 형질주입한 HEK293T 세포로부터 수득된, 세포 용해물(lysates)의 루시퍼라아제 판독 값 및 웨스턴 블롯 (Western blot)을 나타낸 것이다.
도 14는, 실시예 2B에 기재된 것과 같이, 대장균(E.coli) 콜로니 성장에 대한 야생형 3C 프로테아제 발현 및 3C 프로테아제 돌연변이체, L23P, L43H 및 T100P의 효과 평가를 위해, 카베니실린 (carbenicillin) (+CARB) 또는 카베니실린/이소프로필 β-D-1-티오갈락토피라노시드 (thiogalactopyranoside) (+CARB/IPTG) 한천(agar) 성장 배지에서 형질전환된 대장균(E.coli) 박테리아를 나타낸 것이다.
도 15a 내지 15b: 도 15a 및 도 15b는, 실시예 2B에 기재된 것과 같이, 잔기 22, 23, 99, 100 및 127에서 프롤린 치환을 포함하는 FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체, 야생형 FMDV 3C 프로테아제 및 잔기 163에서 시스테인의 위치에 알라닌을 포함하는 FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체를 코딩하는 pJJP 플라스미드로 형질주입된 HEK293T 세포로부터 수득된 루시퍼라아제 판독 값 및 세포 용해물의 웨스턴 블롯을 각각 나타낸 것이다.
도 16은, 야생형 FMDV 3C 프로테아제에서 잔기 T100, V124 및 L127의 위치 및 상기 잔기들을 포함하는 상기 구조들의 상대적인 위치를 나타낸 것이다.
도 17a 내지 17b: 도 17a 및 도 17b는, 실시예 2C에 기재된 것과 같이, 잔기 22, 100 및 127 및 잔기 22, 100 및 124에서 3중(triple) 프롤린 치환들을 포함하는 FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체, 야생형 FMDV 3C 프로테아제 및 잔기 163에서 시스테인의 위치에 알라닌을 포함하는 FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체를 코딩하는 pJJP 플라스미드로 형질주입된 HEK293T 세포로부터 수득된 루시퍼라아제 판독 값 및 세포 용해물의 웨스턴 블롯을 각각 나타낸 것이다.
도 18은, 실시예 2D에 기재된 것과 같이, 잔기 22, 23, 100, 124, 125, 126, 127에서 3Cpro 프롤린 돌연변이, 및 잔기 127와 잔기 22 또는 124의 이중 돌연변이 조합을 포함하는 pJJP 플라스미드로 형질주입된 HEK293-T 세포에서 숙주 eIF4AI의 가공을 나타내는 웨스턴 블롯을 나타낸 것이다.
도 19a 내지 19d: 도 19a는, 실시예 2G(ⅰ)에 기재된 것과 같이, C163 잔기를 포함하는 상기 루프와 비교하여 야생형 FMDV 3C 프로테아제에서 상기 B2-A2 β 시트의 구조를 나타낸 것이다. 도 19b는, 또한 실시예 2G(ⅰ)에 기재된 것과 같이, Y162와 비교하여 잔기 V119, N121, V124, 및 L127에 대한 상기 프로테아제 사이드 체인 구조를 나타낸 것이다. 도 19c는, 상기 기질 결합 포켓(binding pocket)과 비교하여, 상기 N-말단 α 헬릭스 및 A1 β 가닥을 포함하는, 상기 구조 스패닝(spanning) 잔기 7 내지 28을 나타낸 것이다. 잔기 I22 및 L23의 사이드 체인 또한 나타낸다. 실시예 2G(ⅱ) 참조. 도 19d는, 실시예 2G(ⅲ)에 기재된 것과 같이, 잔기 I99 및 T100에 연결되거나 근접한 구조들을 나타낸 것이다.
도 20은, 실시예 2G(ⅰ)에 기재된 것과 같이, 6 개의 피코르나바이러스로 부터 3C 프로테아제의 결정 구조체들에서 상기 촉매성 시스테인에 인접한 잔기에 근접한(proximity) 사이드 체인을 갖는 상기 잔기들을 나타낸 것이다.
도 21은, 실시예 2G(ⅱ)에 기재된 것과 같이, FMDV 3C 프로테아제의 잔기 I22 및 L23에 구조적 동족성을 갖는 5 개의 피코르나바이러스에서 상기 잔기들을 나타낸 것이다.
도 22는, 실시예 2G(ⅲ)에 기재된 것과 같이, FMDV 3C 프로테아제의 잔기 T100에 구조적 동족성을 갖는 5 개의 피코르나바이러스에서 상기 잔기들을 나타낸 것이다.
도 23은, 실시예 2E에 기재된 것과 같이, 잔기 I22, L23, T100, V124, G125, R126, L127에서 FMDV 3Cpro 프롤린 돌연변이 및 이중 돌연변이체 조합 I22/L127 및 V124/L127을 포함하는 pJJP 플라스미드로 형질주입된 CHO-K1 (어두운 회색) 및 BHK-21 (밝은 회색) 세포로부터 루시퍼라아제 판독 값을 나타낸 것이다.
도 24a 내지 24c: 도 24a는, 실시예 2E에 기재된 것과 같이, 잔기 I22, L23, T100, V124, G125, R126, L127에서 FMDV 3Cpro 프롤린 돌연변이 및 이중 돌연변이체 조합들 I22/L127 및 V124/L127을 포함하는 pJJP 플라스미드로 형질주입된 CHO-K1 및 BHK-21 세포로부터 세포 용해물의 웨스턴 블롯을 나타낸 것이다. 도 24b는, 실시예 2E에 기재된 것과 같이, 상기 L127P 돌연변이 및 O1 Manisa P1 폴리펩타이드를 포함하는 pJJP 플라스미드로 형질주입된 CHO-K1 세포들에서 VLP 어레이의 전자 현미경 이미지를 나타낸 것이다. 도 24c는, 실시예 2E에 기재된 것과 같이, 상기 V124P 돌연변이 및 O1 Manisa P1 폴리펩타이드를 포함하는 pJJP 플라스미드로 형질주입된 BHK-21 세포들에서 VLP 어레이의 전자 현미경 이미지를 나타낸 것이다.
도 25는, 실시예 4에 기재된 것과 같이, 3D 폴리머라아제로 융합된 폴리오바이러스 3C 프로테아제 및 3C 프로테아제를 발현하기 위해 사용되는 상기 발현 시스템을 나타낸 것이다.
도 26은, 실시예 4에 기재된 것과 같이, 항-Gluc 항체를 사용하여 가우시아(Gaussia) 루시퍼라아제 ("Gluc") 발현에 대한 2 개의 돌연변이체, R87P 및 L102P의 발현의 효과를 나타낸 것이다.
도 2는, 발명의 설명에 기술한 것과 같이, FMDV 3C 프로테아제 결정 구조의 다이아그램을 나타낸 것이다.
도 3은, 예시적으로 야생형 FMDV 균주 Asia Lebanon 89 (서열 번호 6)의 3C 프로테아제의 알려진 2차 구조 및 그것의 아미노산 서열 내에 위치 46, 84 및 163에서 촉매성 잔기의 트리아드의 상대적 위치들을 나타낸다.
도 4는, 발명의 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV, 소 비염 A (Bovine rhinitis A), 소 비염 B (Bovine rhinitis B) 및 말 비염 A (Equine rhinitis A)로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조는 또한 동정된다.
도 5는, 발명의 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV, 콕사키바이러스 (coxsackievirus) A10 및 콕사키바이러스(coxsackievirus) A1로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조는 또한 동정된다.
도 6은, 발명의 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV 및 인간 엔테로바이러스(Enterovirus) A71로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조들은 또한 동정된다.
도 7은, 발명의 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV, 콕사키바이러스 B3 및 콕사키바이러스 B1로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조들은 또한 동정된다.
도 8은, 발명의 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV, 폴리오바이러스 1, 폴리오바이러스 2 및 폴리오바이러스 3으로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조들은 또한 동정된다.
도 9는, 발명의 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV, 인간 리노바이러스 A2, 인간 리노바이러스 A89 및 인간 리노바이러스 A20으로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조들은 또한 동정된다.
도 10은, 발명의 자세한 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV 및 인간 리노바이러스 B14로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조들은 또한 동정된다.
도 11은, 발명의 자세한 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV 및 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus)로부터 야생형 3C 프로테아제의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조들은 또한 동정된다.
도 12는, 발명의 설명 및 실시예 3에 기재된 것과 같이, FMDV, 콕사키바이러스(coxsackievirus) A10, 콕사키바이러스(coxsackievirus) A1, 폴리오바이러스 1, 폴리오바이러스 2, 폴리오바이러스 3, 인간 리노바이러스 A2, 인간 리노바이러스 A89, 인간 리노바이러스 A20, 인간 리노바이러스 B14, 인간 리노바이러스 A71, 콕사키바이러스(coxsackievirus) B1, A 형 간염 바이러스, 소 비염 A (Bovine rhinitis A), 소 비염 B (Bovine rhinitis B) 및 말 비염 A (Equine rhinitis A) 로부터 야생형 3C 프로테아제 일부의 정렬을 나타낸 것이다. 선택된 2차 구조들은 또한 동정된다.
도 13a 내지 13d: 도 13a는, 실시예 2A에 기재된 것과 같이 아미노산 123 내지 128에 의해 형성된 사이드 체인을 나타내는 FMDV 3C 프로테아제의 결정 구조의 일부를 나타낸 것이다. 도 13b는, 실시예 2A 및 2B에 기재된 것과 같이, FMDV P1 폴리펩타이드 (O1MP1), 3C 프로테아제 및 마커 (△1D2A-GLuc △1M)를 코딩하는 pJJP 발현 플라스미드의 맵(map)을 나타낸 것이다. 도 13c 및 도 13d는 각각, 실시예 2A 및 2B에 기재된 것과 같이, 잔기 123 내지 128에서 프롤린 치환들을 포함하는 FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체, 야생형 FMDV 3C 프로테아제 및 잔기 163에서 시스테인의 위치에 알라닌을 포함하는 FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체를 코딩하는 pJJP 플라스미드를 형질주입한 HEK293T 세포로부터 수득된, 세포 용해물(lysates)의 루시퍼라아제 판독 값 및 웨스턴 블롯 (Western blot)을 나타낸 것이다.
도 14는, 실시예 2B에 기재된 것과 같이, 대장균(E.coli) 콜로니 성장에 대한 야생형 3C 프로테아제 발현 및 3C 프로테아제 돌연변이체, L23P, L43H 및 T100P의 효과 평가를 위해, 카베니실린 (carbenicillin) (+CARB) 또는 카베니실린/이소프로필 β-D-1-티오갈락토피라노시드 (thiogalactopyranoside) (+CARB/IPTG) 한천(agar) 성장 배지에서 형질전환된 대장균(E.coli) 박테리아를 나타낸 것이다.
도 15a 내지 15b: 도 15a 및 도 15b는, 실시예 2B에 기재된 것과 같이, 잔기 22, 23, 99, 100 및 127에서 프롤린 치환을 포함하는 FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체, 야생형 FMDV 3C 프로테아제 및 잔기 163에서 시스테인의 위치에 알라닌을 포함하는 FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체를 코딩하는 pJJP 플라스미드로 형질주입된 HEK293T 세포로부터 수득된 루시퍼라아제 판독 값 및 세포 용해물의 웨스턴 블롯을 각각 나타낸 것이다.
도 16은, 야생형 FMDV 3C 프로테아제에서 잔기 T100, V124 및 L127의 위치 및 상기 잔기들을 포함하는 상기 구조들의 상대적인 위치를 나타낸 것이다.
도 17a 내지 17b: 도 17a 및 도 17b는, 실시예 2C에 기재된 것과 같이, 잔기 22, 100 및 127 및 잔기 22, 100 및 124에서 3중(triple) 프롤린 치환들을 포함하는 FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체, 야생형 FMDV 3C 프로테아제 및 잔기 163에서 시스테인의 위치에 알라닌을 포함하는 FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체를 코딩하는 pJJP 플라스미드로 형질주입된 HEK293T 세포로부터 수득된 루시퍼라아제 판독 값 및 세포 용해물의 웨스턴 블롯을 각각 나타낸 것이다.
도 18은, 실시예 2D에 기재된 것과 같이, 잔기 22, 23, 100, 124, 125, 126, 127에서 3Cpro 프롤린 돌연변이, 및 잔기 127와 잔기 22 또는 124의 이중 돌연변이 조합을 포함하는 pJJP 플라스미드로 형질주입된 HEK293-T 세포에서 숙주 eIF4AI의 가공을 나타내는 웨스턴 블롯을 나타낸 것이다.
도 19a 내지 19d: 도 19a는, 실시예 2G(ⅰ)에 기재된 것과 같이, C163 잔기를 포함하는 상기 루프와 비교하여 야생형 FMDV 3C 프로테아제에서 상기 B2-A2 β 시트의 구조를 나타낸 것이다. 도 19b는, 또한 실시예 2G(ⅰ)에 기재된 것과 같이, Y162와 비교하여 잔기 V119, N121, V124, 및 L127에 대한 상기 프로테아제 사이드 체인 구조를 나타낸 것이다. 도 19c는, 상기 기질 결합 포켓(binding pocket)과 비교하여, 상기 N-말단 α 헬릭스 및 A1 β 가닥을 포함하는, 상기 구조 스패닝(spanning) 잔기 7 내지 28을 나타낸 것이다. 잔기 I22 및 L23의 사이드 체인 또한 나타낸다. 실시예 2G(ⅱ) 참조. 도 19d는, 실시예 2G(ⅲ)에 기재된 것과 같이, 잔기 I99 및 T100에 연결되거나 근접한 구조들을 나타낸 것이다.
도 20은, 실시예 2G(ⅰ)에 기재된 것과 같이, 6 개의 피코르나바이러스로 부터 3C 프로테아제의 결정 구조체들에서 상기 촉매성 시스테인에 인접한 잔기에 근접한(proximity) 사이드 체인을 갖는 상기 잔기들을 나타낸 것이다.
도 21은, 실시예 2G(ⅱ)에 기재된 것과 같이, FMDV 3C 프로테아제의 잔기 I22 및 L23에 구조적 동족성을 갖는 5 개의 피코르나바이러스에서 상기 잔기들을 나타낸 것이다.
도 22는, 실시예 2G(ⅲ)에 기재된 것과 같이, FMDV 3C 프로테아제의 잔기 T100에 구조적 동족성을 갖는 5 개의 피코르나바이러스에서 상기 잔기들을 나타낸 것이다.
도 23은, 실시예 2E에 기재된 것과 같이, 잔기 I22, L23, T100, V124, G125, R126, L127에서 FMDV 3Cpro 프롤린 돌연변이 및 이중 돌연변이체 조합 I22/L127 및 V124/L127을 포함하는 pJJP 플라스미드로 형질주입된 CHO-K1 (어두운 회색) 및 BHK-21 (밝은 회색) 세포로부터 루시퍼라아제 판독 값을 나타낸 것이다.
도 24a 내지 24c: 도 24a는, 실시예 2E에 기재된 것과 같이, 잔기 I22, L23, T100, V124, G125, R126, L127에서 FMDV 3Cpro 프롤린 돌연변이 및 이중 돌연변이체 조합들 I22/L127 및 V124/L127을 포함하는 pJJP 플라스미드로 형질주입된 CHO-K1 및 BHK-21 세포로부터 세포 용해물의 웨스턴 블롯을 나타낸 것이다. 도 24b는, 실시예 2E에 기재된 것과 같이, 상기 L127P 돌연변이 및 O1 Manisa P1 폴리펩타이드를 포함하는 pJJP 플라스미드로 형질주입된 CHO-K1 세포들에서 VLP 어레이의 전자 현미경 이미지를 나타낸 것이다. 도 24c는, 실시예 2E에 기재된 것과 같이, 상기 V124P 돌연변이 및 O1 Manisa P1 폴리펩타이드를 포함하는 pJJP 플라스미드로 형질주입된 BHK-21 세포들에서 VLP 어레이의 전자 현미경 이미지를 나타낸 것이다.
도 25는, 실시예 4에 기재된 것과 같이, 3D 폴리머라아제로 융합된 폴리오바이러스 3C 프로테아제 및 3C 프로테아제를 발현하기 위해 사용되는 상기 발현 시스템을 나타낸 것이다.
도 26은, 실시예 4에 기재된 것과 같이, 항-Gluc 항체를 사용하여 가우시아(Gaussia) 루시퍼라아제 ("Gluc") 발현에 대한 2 개의 돌연변이체, R87P 및 L102P의 발현의 효과를 나타낸 것이다.
정의
본원에 사용된, 용어 "단리된(isolated)"은 천연적으로 연관된 적어도 하나의 성분으로부터 제거된 폴리뉴클레오타이드, 폴리펩타이드 또는 다른 성분을 의미한다. 예를 들어, 단리된 폴리뉴클레오타이드, 폴리펩타이드 또는 다른 성분은, 정제하거나 정제하지 않은 것으로서, 자연에서 전형적으로 발견되는 세포의 외부에 존재할 수 있다. 추가적으로 또는 대안적으로, 상기 단리된 성분은, 예를 들어, 자연에서 전형적으로 근접하게 존재하는 뉴클레오타이드 서열, 또는 전형적으로 근접하지 않은 인접한 [또는 인접한(contiguous)] 뉴클레오타이드 서열로부터 분리되는, 자연적으로 발견되는 것과 다른 콘텍스트(context)에서 발견된다. 선택적으로, 폴리뉴클레오타이드 또는 폴리펩타이드와 같은 단리된 성분에 대해 세포 용해(lysis), 추출, 원심분리, 정제 등과 같은 하나 이상의 농축 또는 정제 과정이 실시될 수 있다.
"뉴클레오타이드"는 DNA 및 RNA와 같은 핵산의 모노머, 또는 서브유닛으로서 작용하는 유기체 분자를 의미한다. 뉴클레오타이드는 핵산의 빌딩 블럭이고, 질소성 염기[예: A(아데닌), G(구아닌), C(시토신), T/U(티민/우라실)], 5탄당(리보오스 또는 디옥시리보오스), 및 적어도 하나의 인산기로 구성된다. 따라서, 뉴클레오시드와 인산기는 뉴클레오타이드를 형성한다. 폴리뉴클레오타이드 서열에서 뉴클레오타이드는 일반적으로 그것들의 질소성 염기에 기초하여 표시된다.
"뉴클레오타이드 서열", "폴리뉴클레오타이드 서열" 또는 "핵산 서열"은 DNA (GACT 사용) 또는 RNA 분자 (GACU 사용) 내에 뉴클레오타이드 또는 핵산의 순서를 나타내는 일련의 문자이다. DNA 분자, RNA 분자 또는 다른 폴리뉴클레오타이드 서열은 단일 또는 이중 가닥일 수 있고, 게놈, 재조합, 합성, 전사, PCR 생성물, 증폭 생성물, mRNA 또는 cDNA일 수 있다. "뉴클레오타이드 서열", "폴리뉴클레오타이드 서열" 또는 "핵산 서열"은 선택적으로 변형된 염기 또는 변형된 백본(backbone)을 포함할 수 있다. 상기 용어들은 또한 센스(sense) 또는 안티센스(antisense) 배향 및 이들의 보체(complement) 서열을 또한 포함하는 것을 의미한다.
"재조합 폴리뉴클레오타이드"는, 예를 들어, 상기 폴리뉴클레오타이드가 자연에서 발견되지 않는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 것과 같은, 천연 상태에 있지 않는 폴리뉴클레오타이드이다. 예를 들어, 목적 서열은 벡터에서 복제될 수 있고, 또는 하나 이상의 추가 핵산으로 재조합될 수 있다.
본원에서 사용된, 용어 "피코르나바이러스"는 정이십면체 (icosahedral) 캡시드를 갖는 작고, 세포질, 플러스-가닥 RNA (~7.0-8.5 kb) 바이러스의 과(family)를 나타내는 비-외피형 바이러스를 의미한다. 상기 과의 속(Genera)은 아프토바이러스 (Aphthovirus), 아쿠아마바이러스 (Aquamavirus), 아비헤파토바이러스 (Avihepatovirus), 카디오바이러스 (Cardiovirus), 코사바이러스 (Cosavirus), 디시피바이러스 (Dicipivirus), 엔테로바이러스 (Enterovirus), 에르보바이러스(Erbovirus), 헤파토바이러스 (Hepatovirus), 코부바이러스 ( Kobuvirus ), 메기바이러스 (Megrivirus), 파레코바이러스 (Parechovirus), 피스세바이러스 (Piscevirus), 살리바이러스 (Salivirus), 사펠로바이러스 (Sapelovirus), 세네카바이러스(Senecavirus), 테스코바이러스 (Teschovirus) 및 트레모바이러스(Tremovirus)를 포함한다. 피코르나바이러스의 바이러스 게놈은 전체적으로 구조 단백질 영역, P1, 및 비-구조 단백질 영역, P2 및 P3을 포함하는 단일 폴리프로테인을 코딩하는 하나의 개방 판독 프레임을 포함한다 (도 1 참조). 상기 폴리프로테인으로부터 성숙한 기능성 단백질의 방출은 주로 3C 프로테아제를 포함하는 바이러스 프로테아제에 의해 매개된다.
본원에 사용된, 용어 "아프토바이러스(Aphthovirus)"는, 소 비염 A 바이러스 (Bovine rhinitis A virus), 소 비염 B 바이러스 (Bovine rhinitis B virus), 말 비염 A 바이러스 (Equine rhinitis A virus) 및 FMDV와 같은 종들을 포함하는, 상기 피코르나바이러스 과의 속을 의미한다.
본원에 사용된, 용어 "소 비염(Bovine rhinitis)"은 소 비염 A 바이러스 (Bovine rhinitis A virus) (BRAV) 및 소 비염 B 바이러스 (Bovine rhinitis B virus) (BRBV)를 포함하는 모든 소 비염 종들을 의미한다. 상기 용어는, 각각, 소 비염 1 & 3으로 알려진 소 비염 A 바이러스 1 및 소 비염 A 바이러스 2를 포함하는 소 비염 A 바이러스 (Bovine rhinitis A virus) 혈청형을 포함하는 것을 또한 의미한다.
본원에 사용된, 용어 "말 비염(Equine rhinitis)"은 또한 말 비염 1로 알려진, 말 비염 A 바이러스 (Equine rhinitis A virus) (ERAV)를 포함하는 임의의 말 비염 종들을 의미한다.
본원에 사용된, "인간 엔테로바이러스 A(Human enterovirus A)"로 또한 알려진 용어 "엔테로바이러스 A (Enterovirus A)"는 상기 엔테로바이러스(Enterovirus) 유전자의 종들을 의미한다. 용어 "엔테로바이러스 A (Enterovirus A)"는 CV-A2, CV-A3, CV-A4, CV-A5, CV-A6, CV-A7, CV-A8, CV-A10, CV-A12, CV-A14 & CV-A16과 같은 콕사키바이러스(coxsackievirus) 혈청형들 및 EV-A71, EV-A76, EV-A89, EV-A90, EV-A91, EV-A92, EV-A114, 및 EV-A119와 같은 엔테로바이러스(EV) 혈청형을 포함하는 상기 종들의 혈청형을 포함하는 것을 의미한다. SV19, SV43, SV46과 같은 시미언 바이러스(Simian virus) 혈청형 및 BA13과 같은 바분 (Baboon) 혈청형이 또한 상기 종들에 포함된다.
본원에 사용된, 또한 "인간 엔테로바이러스 B (Human enterovirus B)"로 알려져 있는 용어 "엔테로바이러스 B (Enterovirus B)"는 상기 엔테로바이러스(Enterovirus) 속의 종들을 의미한다. 용어 "엔테로바이러스 B (Enterovirus B)"는 CV-B1, CV-B2, CV-B3, CV-B4, CV-B5, CV-B6 및 CV-A9와 같은 콕사키바이러스(coxsackievirus, CV) 혈청형들 및 EV-B69, EV-B73, EV-B74, EV-B75, EV-B77, EV-B78, EV-B79, EV-B80, EV-B81, EV-B82, EV-B83, EV-B84, EV-B85, EV-B86, EV-B87, EV-B88, EV-B93, EV-B97, EV-B98, EV-B100, EV-B101, EV-B106, EV-B107, EV-B110 및 SA5과 같은 엔테로바이러스(EV) 혈청형들을 포함하는 상기 종들의 혈청형을 포함하는 것을 의미한다. E-1, E-2, E-3, E-4, E-5, E-6, E-7, E-9, E-11, E-12, E-13, E-14, E-15, E-16, E-17, E-18, E-19, E-20, E-21, E-24, E-25, E-26, E-27, E-29, E-30, E-31, E-32, & E-33과 같은 에코바이러스 (Echovirus, E) 혈청형들 또한 상기 종들에 포함된다.
본원에 사용된, "인간 엔테로바이러스 C (Human enterovirus C)"라고도 알려진, 용어 "엔테로바이러스 C (Enterovirus C)"는 상기 엔테로바이러스(Enterovirus) 속의 종들을 의미한다. 용어 "엔테로바이러스 C (Enterovirus C)"는 CV-A1, CV-A11, CV-A13, CV-A17, CV-A19, CV-A20, CV-A21, CV-A22 및 CV-A24와 같은 콕사키바이러스(CV) 혈청형들 및 EV-C95, EV-C96, EV-C99, EV-C102, EV-C104, EV-C105, EV-C109, EV-C116, EV-C117 및 EV-C118와 같은 엔테로바이러스(EV) 혈청형들을 포함하는 상기 종들의 혈청형을 포함하는 것을 의미한다. PV1, PV2 및 PV3을 포함하는 폴리오바이러스(poliovirus) 혈청형 또한 상기 종들에 포함된다.
본원에 사용된, 용어 "인간 콕사키바이러스(human coxsackievirus)"는 인간을 감염시키는 상기 콕사키바이러스 혈청형들을 포함하는 것을 의미한다. 이러한 혈청형들은 CV-A10과 같은 엔테로바이러스 A (Enterovirus A) 혈청형들, CV-B1 및 CV-B3과 같은 엔테로바이러스 B (Enterovirus B) 혈청형들; 및 CV-A1과 같은 엔테로바이러스 C (Enterovirus C) 혈청형들을 포함한다.
본원에 사용된, 용어 "인간 폴리오바이러스(human poliovirus)"는 인간을 감염시키는 상기 폴리오바이러스(poliovirus) 혈청형들을 포함하는 것을 의미한다. 이러한 혈청형들은 폴리오바이러스-(PV-) 1, PV-2 및 PV-3과 같은 엔테로바이러스 C (Enterovirus C) 를 포함한다.
본원에 사용된, "인간 리노바이러스 A (Human rhinovirus A)"라고도 알려진 용어 "리노바이러스(Rhinovirus) A"는 상기 엔테로바이러스(Enterovirus) 속의 종들을 의미한다. 용어 "리노바이러스 A (Rhinovirus A)"는 HRV-A1, HRV-A2, HRV-A7, HRV-A8, HRV-A9, HRV-A10, HRV-A11, HRV-A12, HRV-A13, HRV-A15, HRV-A16, HRV-A18, HRV-A19, HRV-A20, HRV-A21, HRV-A22, HRV-A23, HRV-A24, HRV-A25, HRV-A28, HRV-A29, HRV-A30, HRV-A31, HRV-A32, HRV-A33, HRV-A34, HRV-A36, HRV-A38, HRV-A39, HRV-A40, HRV-A41, HRV-A43, HRV-A44, HRV-A45, HRV-A46, HRV-A47, HRV-A49, HRV-A50, HRV-A51, HRV-A53, HRV-A54, HRV-A55, HRV-A56, HRV-A57, HRV-A58, HRV-A59, HRV-A60, HRV-A61, HRV-A62, HRV-A63, HRV-A64, HRV-A65, HRV-A66, HRV-A67, HRV-A68, HRV-A71, HRV-A73, HRV-A74, HRV-A75, HRV-A76, HRV-A77, HRV-A78, HRV-A80, A81, HRV-A82, HRV-A85, HRV-A88, HRV-A89, HRV-A90, HRV-A94, HRV-A95, HRV-A96, HRV-A98, HRV-A100, HRV-A101, HRV-A102 및 HRV-A103와 같은 인간 리노바이러스(HRV) 혈청형을 포함한다.
본원에 사용된, "인간 리노바이러스 B (Human rhinovirus B)"라고도 알려진, 용어 "리노바이러스 B (Rhinovirus B)"는 상기 엔테로바이러스(Enterovirus) 속의 종들을 의미한다. 용어 "리노바이러스 B (Rhinovirus B)"는 HRV-B3, HRV-B4, HRV-B5, HRV-B6, HRV-B14, HRV-B17, HRV-B26, HRV-B27, HRV-B35, HRV-B37, HRV-B42, HRV-B48, HRV-B52, HRV-B69, HRV-B70, HRV-B72, HRV-B79, HRV-B83, HRV-B84, HRV-B86, HRV-B91, HRV-B92, HRV-B93, HRV-B97 및 HRV-B99와 같은 인간 리노바이러스 (HRV) 혈청형을 포함한다.
본원에 사용된, 용어 "A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus)"는 상기 헤파토바이러스(Hepatovirus) 속에 속하는 바이러스 종들을 의미하고 및 A 형 간염 바이러스 1을 포함하는 상기 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus) 내의 모든 혈청형들을 포함한다.
본원에 사용된, 용어 "3CPRO", "3C 프로테아제", "피코르나바이러스 3CPRO" 또는 "피코르나바이러스 3C 프로테아제"는 피코르나바이러스 종들에서 발견되는 시스테인 프로테아제를 의미하고, 전형적으로 그의 활성 부위 내에 보존된 시스테인-히스티딘-아스파라긴 산/글루타민 산 촉매성 트리아드 또는 시스테인-히스티딘 다이아드(dyad) [예: A 형 간염 바이러스 (Hepatitis A)]를 포함한다. 상기 촉매성 트리아드 또는 다이아드는 전형적으로 공유성의 중간체를 형성하기 위해 기재를 공격하는 친핵체 (전형적으로, 시스테인)를 분극화하고 활성화하는 전하-릴레이 네트워크를 형성하고, 이것은 그 후 유리(free) 효소를 재생하기 위해 가수분해된다. 3CPRO가 상기 폴리프로테인의 상기 구조 및 비구조 영역에서 돌연변이 절단을 수행하고 글루타민-글리신/세린/알라닌/발린/히스티딘/아르기닌 및 글루타민 산-세린/글리신/아르기닌/메티오닌에서 현저한 기질 선호를 가진다.
본원에 사용된, "FMDV 3C 프로테아제"는 상기 FMDV 종들로부터 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 의미한다. 전체적으로, FMDV 3C 프로제아제는 약 23.1-kDa 분자량을 갖고 213 개 아미노산을 포함하는 시스테인 프로테아제이다. 상기 FMDV 3C 프로테아제의 활성 부위에서 상기 시스테인-히스티딘-아스파라긴 산 촉매성 트리아드는 잔기 H46, D84 및 C163에 의해 형성된다. 구조적으로, FMDV 3C 프로테아제는 N-말단 β-배럴 도메인 및 C-말단 β-배럴 도메인을 포함하는 키모트립신(chymotrypsin)-유사 접힘(fold)을 채용한다(도 2 참조). 상기 β-배럴 도메인들의 각각은 펩타이드 또는 기질 결합 틈(cleft)을 형성하기 위해 함께 팩킹되는 네 가닥 역-평행 β-시트의 한 쌍으로 구성된다. 상기 β-시트는 B1, A1, D1, E1 β-가닥 및 B1, C1, F1, E1 β-가닥 (N-말단 도메인) 및 B2, A2, D2, E2 β-가닥 및 B2, C2, F2, E2 β-가닥 (C-말단 도메인)으로 구성되어 있고, 각각의 도메인의 상기 B 및 E 가닥은 상기 두 개의 β-시트에 기여한다. 상기 N-말단 및 C-말단 β-배럴 도메인들의 다른 2차 구조들은, 예를 들어, A1-B1, A2-B2, B1-C1, B2-C2, C1-D1, C2-D2, E1-F1, E2-F2 루프와 같은, 상기 β-가닥들을 연결하는 루프(loop) 또는 회전(turn)을 포함한다. N-말단 α-헬릭스 ("αN") 및 C-말단 α-헬릭스 ("αC")는 또한 FMDV 3C 프로테아제들 내에서 발견되는 2차 구조들이다.
상기 두 개의 β-배럴 도메인에 추가하여, 상기 FMDV 3C 프로테아제는 두 개의 짧은 역-평행 β-가닥들의 작은 β-시트, 및 상기 두 개의 β-가닥들을 연결하는 꼭지점 루프(apical loop)를 갖는 β-가닥의 형성에서 다른 현저한 3차 구조를 보유한다. 도 2에서 볼 수 있는 것과 같이, 상기 β-가닥은 상기 기재 결합 틈 및 활성 부위에 대하여 접히고 기질 인식 및 특이성에 기여한다. 도 3에 나타낸 것과 같이, 상기 두 개의 β-가닥들 및 상기 꼭지점 루프를 포함하는 상기 β-가닥은 상기 FMDV 3C 프로테아제의 잔기들 138 내지 150에 의해 형성된다.
본원에 사용된, "1차 구조(primary structure)"는 단백질의 선형 아미노산 서열을 의미하며, 이것은 화학적으로 펩타이드 결합들에 의해 연결된 아미노산들로 구성된 폴리펩타이드 체인이다.
본원에 사용된, "2차 구조"는, 단백질의 국소 단편(local segments)의 3차원 형태를 의미한다. 2차 구조는, 펩타이드의 3차원 구조로의 접힘을 용이하게 하는 알파-헬릭스, 베타-시트, 루프, β 가닥들, 및 다른 형태를 형성하는 폴리펩타이드 체인 내에 아미노산의 탄소, 산소 및 NH 기 사이에서 발생하는 상호 작용에 기인된다. 2차 구조들의 특정 예는, B2 β 가닥 및 A2 β 가닥으로부터 형성된 A2-B2 β 시트들, 및 B1 β 가닥 및 A1 β 가닥으로부터 형성된 A1-B1 β 시트들과 같은, β-시트들을 포함한다. 다른 예들은, FMDV와 같은 아프토바이러스(Aphthovirus) 종들에서 존재할 수 있는 B2' β 가닥을 포함한다. 도 13a 참조. 또한, 상기 아미노산 서열에서 그것들의 상응하는 잔기들을 갖는 FMDV 3C 프로테아제의 예시적인 2차 구조들을 정렬하는, 도 3 참조.
본원에 사용된. "변경된 2차 구조"는, 야생형 단백질과 같은, 부모 단백질의 그것과 비교하여, 알파-헬릭스 또는 베타-시트와 같은, 파괴(disrupted)되거나 또는 변화된 단백질 2차 구조를 의미한다. 변경된 2차 구조는, 예를 들어, 본원에 개시된 것과 같이, 2차 구조에서 잔기를 프롤린에 의해 치환하는 것에 의해 실현될 수 있다.
본원에 사용된, 용어 "단백질 형태(protein conformation)"는 펩타이드 체인의 2차[나선(helix), 시트, 가닥], 초이차(supersecondary) (모티프), 3차 (도메인) 및 4차(다중합체 단백질들) 구조를 포함하는, 단백질의 특징적 3차원 형상을 의미한다. 본원에 사용된, 용어 "천연 형태(native conformation)"는 생체 시스템에서 그것의 생물학적으로 활성 형태의 야생형 단백질의 특징적 상태, 형성, 모양 또는 구조를 의미한다.
본원에 사용된, 용어 "구조적 동족성(structural homology)"은 두 개 이상의 핵산들 또는 폴리펩타이드들 사이에서 공유되는 3차원 구조를 의미하고, 이것은 공유된 또는 보존된 1차 아미노산 또는 뉴클레오타이드 서열과 연관될 수 있거나 연관되지 않을 수 있다.
본원에 사용된, "변형된 3C 프로테아제(modified 3C protease)"는, 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제로부터 유도되거나 수득되는 피코르나바이러스 종들로부터의 전장(full-length) 3C 프로테아제를 의미한다. 본원에 사용된 "유도되거나 또는 수득된"은 부모 아미노산 서열, 또는 부모 아미노산 서열을 코딩하는 폴리뉴클레오타이드에, 하나 이상의 돌연변이, 예를 들어, 하나 이상의 아미노산들의 치환, 결실 또는 삽입, 또는, 예를 들어, 하나 이상의 아미노산의 치환, 결실, 또는 삽입을 위한 코딩하는 것을 도입하는 것을 나타낸다.
본원에 사용된, 용어 "부모(parent)" 또는 "부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제"는, 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 생성하기 위한 코딩 뉴클레오타이드 서열 및/또는 폴리펩타이드 서열에 돌연변이가 도입된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 의미한다. 상기 부모는 야생형과 상이한 야생형 피코르나바이러스 3C 프로테아제 또는 3C 프로테아제일 수 있다. 즉, 부모 3C 프로테아제는 돌연변이될 수 있어, 그것은 야생형 3C 프로테아제와 상이하나, 그럼에도 불구하고 본원에서 후속으로 변형된 폴리펩타이드와 비교하여 부모 펩타이드로서 나타낸다. 그러므로, 야생형 3C 프로테아제와 같은 변형되지 않은 기준 단백질과 비교함으로써, 특정 활성, 성질 또는 특성에서 요구되는 증가 또는 감소를 가지도록 변형된, 본 기술 분야에 공지된 존재하는 3C 프로테아제들이, 개시(starting) 폴리펩타이드로서 즉, 부모 폴리펩타이드로서 선택되어 사용될 수 있다. 예를 들어, 하나 이상의 단일 아미노산 변화에 의해 그것들의 천연 형태로부터 변형되어, 야생형 3C 프로테아제와 같은 변형되지 않은 기준 단백질과 비교하여 P1 전구체 폴리펩타이드를 가공하는 그것의 능력에서 증가 또는 감소와 같은, 요구되는 특성에서 증가 또는 감소를 보유하는 3C 프로테아제는, 부모로서 사용될 수 있고, 동일하거나 상이한 특성을 갖는, 본원의 변형된 3C 프로테아제를 수득하기 위해 추가 변형될 수 있다.
본원에 사용된, 용어 "돌연변이(mutation)"는 변경된 핵산 또는 변경된 폴리펩타이드를 생성하는 핵산 및/또는 폴리펩타이드의 임의의 유전적 변형을 나타낸다. 돌연변이들은 유전자의 단백질-코딩 영역 내에 발생하는 변경뿐만 아니라 조절 서열 또는 프로모터 서열과 같은 단백질-코딩 서열의 외부 영역에서의 변경을 포함하는, 폴리뉴클레오타이드에서 단일 또는 다중 뉴클레오타이드의 점 돌연변이, 결실, 및/또는 삽입을 포함하나, 이에 제한되는 것은 아니다. 돌연변이들은 사일런트(silent), 프레임-이동 또는 논센스 돌연변이(nonsense mutation)를 나타낼 수 있다.
용어들 "돌연변이된(mutated)", "돌연변이(mutant)", "변형된(modified)", "변경된(altered)", "변이된(variant)", 또는 "조작된(engineered)"은, 부모 3C 프로테아제와 비교하여 변경된, 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 같은, 뉴클레오타이드 서열 또는 단백질을 기재하는 형용사로서 본원에서 서로 교환가능하게 사용된다. 비제한적인 예에 있어서, "피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 돌연변이된 뉴클레오타이드 서열"은, 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 위해 코딩하는 야생형, 뉴클레오타이드 서열 코딩과 같은 부모와 상이하게 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 위해 코딩하는 뉴클레오타이드 서열 코딩을 의미한다. 상기 돌연변이된 뉴클레오타이드 서열은 하기 중에서 적어도 하나를 야기하거나 야기하지 않을 수 있다: 하나 이상의 아미노산 치환들, 및 적절하게 접히는 (및 기능적 또는 기능적이지 않을 수 있음) 변역된 펩타이드 생성물에 대한 개방 판독 프레임에서 이동(shift). 다른 비제한적인 예에 있어서, "돌연변이된 피코르나바이러스 3C 프로테아제", "돌연변이 피코르나바이러스 3C 프로테아제", "변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제" 또는 "변경된 피코르나바이러스 3C 프로테아제"는, 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 위해 코딩하는 돌연변이된 뉴클레오타이드 서열 코딩으로부터 발현되는 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 의미하고, 상기 야생형 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 비교하여, 예를 들어, 하나 이상의 아미노산 치환들 또는 상기 프로테아제의 부분의 결실(일반적으로 상기 C-말단으로부터)에 의하여 상기 아미노산 서열이 변경되며, 이것은, 단백질 발현 수준 (예: 형질전환 유전자 발현), 기질 특이성, 피코르나바이러스 폴리펩타이드 전구체들에 대한 숙주 단백질에 대한 단백질 분해 활성, 열적 안정성, 용해 등을 포함하는 단백질/프로테아제 특성들 중 하나 이상의 변경을 또한 유도할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
돌연변이, 변이된 또는 변형된 폴리펩타이드는, 본원 및 서열 목록에 기재된 것들과 같이, 공지된 피코르나바이러스 폴리뉴클레오타이드 또는 폴리펩타이드 서열과 75, 80, 85, 90, 95, 97.5, 98, 99 또는 100% 서열 상동성 또는 서열 유사성을 가질 수 있다.
BLASTN는 기준 폴리뉴클레오타이드와 적어도 75%, 80%, 85%, 87.5%, 90%, 92.5%, 95%, 97.5%, 98%, 99% 서열 상동성을 갖는 폴리뉴클레오타이드 서열을 동정하는데 사용될 수 있다. 높게 유사한 서열들을 찾기 위해 최적화된 대표적인 BLASTN 설정은 예상 임계값 10, 글자 크기 28, 0의 쿼리 범위(query range)의 최대 매치, 1/-2의 매치/미스매치 스코어, 및 선형 갭 코스트(linear gap cost)를 사용한다. 낮은 복잡도 영역은 필터링되거나 마스크될 수 있다. 표준 뉴클레오타이드 BLAST의 기본 설정은 blast.ncbi.nlm.nih.gov/_Blast.cgi?PROGRAM=blastn&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on&LINK_LOC=blasthome (2016.02.04에 마지막으로 액세스됨)에 의해 기술되며 본원에 참조로서 포함된다.
BLASTP는 기준 아미노산에 적어도 75%, 80%, 85%, 87.5%, 90%, 92.5%, 95%, 97.5%, 98%, 99% 서열 상동성 또는 유사성을 갖는 아미노산 서열을 BLOSUM45, BLOSUM62 또는 BLOSUM80과 같은 유사성 매트릭스를 사용하여 동정하기 위해 사용될 수 있으며, 여기서 BLOSUM45는 밀접한 관련 서열에, BLOSUM62는 중간 범위 서열, 및 BLOSUM80은 더 멀리 연관된 서열에 대해 사용될 수 있다. 달리 명시하지 않는 한 언급된 유사성 스코어(score)는 BLOSUM62의 사용을 기준으로 한다. BLASTP가 사용될 때, 백분율 유사성은 상기 BLASTP 양성 스코어(positives score)에 기초하고 상기 백분율 서열 상동성은 상기 BLASTP 상동성 스코어에 기초한다. BLASTP "상동성"은 상동성인 높은 스코어링 서열 쌍의 총 잔기의 수 및 비율을 나타내고; BLASTP "양성(Positives)"은 정렬 스코어가 양수 값을 가지고 서로 유사한 잔기의 수 및 비율을 나타낸다. 본원에 개시된 상기 아미노산 서열과 이러한 상동성 또는 유사성의 정도 또는 임의의 중간 정도의 상동성 또는 유사성을 갖는 아미노산 서열은 본원에 포함되고 고려된다. 대표적인 BLASTP 설정은 예상 임계값 10, 단어 크기 3, 매트릭스 BLOSUM 62, 및 갭 페널티 11 (존재) 및 1 (확장), 및 조건부 구성 스코어 매트릭스 조정을 사용한다. BLASTP에 대한 다른 기본 설정은 blast.ncbi.nlm.nih.gov/_Blast.cgi?PROGRAM=blastp&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome(2016.06.29에 마지막으로 엑세스됨)에 의해 표시되며 본원에 참조로서 포함된다.
본원에 사용된, 용어 "돌연변이체(mutant)"는 본원에서 문맥에 따라 명사로서 사용되거나, 또는 용어 "변이체(variant)"는 하기를 포함한다: 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 돌연변이체 뉴클레오타이드 서열, 돌연변이체 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 돌연변이체 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 형질전환 유전자 발현 카세트, 및 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 돌연변이체 뉴클레오타이드 서열을 담지하는 벡터. 비제한적인 예에서, "C163A 돌연변이체", 또는 "3C(163A) 돌연변이체"는, 문맥에 따라서, 하기 중 하나를 의미한다: 위치 163에서 시스테인 잔기가 알라닌으로 치환된, FMDV 3C 프로테아제와 같은, 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열, 위치 163에서 시스테인 잔기가 알라닌으로 치환된, FMDV 3C 프로테아제와 같은, 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 위치 163에서 시스테인 잔기가 알라닌으로 치환된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 형질전환 유전자 발현 카세트, 및 위치 163에서 시스테인 잔기가 알라닌으로 치환된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 담지하는 벡터.
본원에 사용된, "치환된", 또는 "치환들"은 다른 아미노산 또는 상기 부모에 존재하지 않는 아미노산을 코딩하는 코돈으로 부모 서열 (야생형 폴리펩타이드 또는 야생형 폴리뉴클레오타이드 서열)의 특정 위치에서 하나 이상의 아미노산 잔기(들) 또는 뉴클레오타이드(들)을 치환하는 것을 의미한다. 예를 들어, 상기 치환 V124P는 부모 3C 프로테아제 내에 위치 124에서 발린이 프롤린으로 치환된 변형된 폴리펩타이드를 의미한다.
본원에 사용된, 용어 "대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제" 또는 "대조군 3C 프로테아제"는, 본원에서 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 비교되는, 활성, 특성, 전사 수준 및/또는 번역 수준을 갖는 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 의미한다. 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 본원에 기재된 것과 같이, 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 위치 16-25, 99-100 및 115-130에 상응하는 위치에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하지 않는 것을 제외하고 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 동일한 1차 아미노산 서열을 갖는다. 일부 구현예들에 있어서, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 야생형 3C 프로테아제와 같은, 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제이다. 다른 구현예들에 있어서, 대조군 피코르나바이러스는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 위치 20-25, 99-100 및 115-128에 상응하는 위치에 위치된 하나 이상의 치환들을 포함하지 않으나, 다른 돌연변이들을 포함한다. 예를 들어, 대조군 3C 프로테아제는 C163A와 같은, 상기 촉매성 트리아드에서 돌연변이를 제외하고, 야생형 FMDV 3C 프로테아제와 동일한 1차 서열을 가질 수 있다.
용어 "야생형(wild-type)", 그것의 약어 "wt", 및 용어 "천연(native)"은 유전적으로 변형되지 않은 생물학적 분자, 예를 들어, 자연에 존재하고 유전적으로 변형되지 않은 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열, 자연에 존재하고 유전적으로 변형되지 않은 코딩 뉴클레오타이드 서열로부터 번역된 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 자연에 존재하고 유전적으로 변형되지 않은 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 형질전환 유전자 발현 카세트, 및 자연에 존재하고 유전적으로 변형되지 않은 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 담지하는 벡터를 의미한다.
본원에 사용된, "P1 전구체", "P1 전구체 폴리펩타이드" 또는 "P1 전구체 단백질"은 구조 단백질, VP0, VP1, VP2, VP3, 및 VP4 뿐만 아니라 2A 번역 인터럽터의 구조 단백질 및/또는 전구체를 포함하는 폴리펩타이드이다. P1 전구체들은, 본원에 개시된 것과 같이, 상기 피코르나바이러스 속, 종들, 혈청형 또는 균주의 임의의 것으로부터 유도될 수 있거나 또는 수득될 수 있으며, 예를 들어, P1 전구체는, 야생형 FMDV로부터 수득될 수 있거나 유도될 수 있고, 분자량이 약 85 kDa이다.
본원에 사용된, 문구 "피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드에 대한 단백질 분해 활성을 나타낸다"는, 3C 프로테아제에 의하여, P1 전구체 폴리펩타이드를, 예를 들어, VP0, VP1 및 VP3와 같은 구조 단백질로 가공하는 것을 의미한다. 전형적으로, 상기 구조 단백질들은 비-외피형 정이십면체 (icosahedral) 캡시드 및/또는 바이러스-유사 입자들 "VLPs"로 자기조립된다.
본원에 사용된, "바이러스-유사 입자들(Virus-Like Particles)" 또는 "VLPs"는 전형적으로 바이러스 외피 또는 바이러스 캡시드로 조립되는 구조체를 나타내며, 바이러스와 유사하나, 바이러스 유전체 물질이 결여되어 비-감염성이다. VLPs 는 전형적으로 전바이러스(full virus)에 유사한 면역 반응 자극을 가능하게 한다.
본원에 사용된, 용어 "VP0 단백질"은 VP2 및 VP4 구조 단백질에 포함된 전구체 펩타이드를 의미한다. 상기 VP0 단백질은 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의한 상기 P1 전구체 단백질의 가공에 의해 생성된다. 일부 구현예들에 있어서, VP3 및 VP1와 함께 상기 VP0 단백질은 캡시드 및/또는 VLP 조립체에 사용될 수 있다.
본원에 사용된, "2A"는 FMDV 번역 인터럽터 서열이다 [Luke, 등, Biotech. Genetic Eng. Revs. 26: 223-260 (2009) 참조; 그 전문이 본원에 참조로서 포함됨]. 2A 폴리뉴클레오타이드 서열은 서열 번호 645의 뉴클레오타이드 34-87 및 그에 의해 코딩되는 아미노산 잔기들에 의해 기재된다. 다른 2A 서열은 서열 번호 647로 기재된 아미노산 모티프에 따를 수 있다. 다른 아프토바이러스(Apthoviruses)로부터의 2A 인터럽터들이 또한 사용될 수 있다.
본원에 사용된, 용어 "Δ1D2A"는 전형적으로 FMDV 1D 잔기들 및 FMDV 2A 아미노산 잔기들을 포함하는 번역 종료 서열을 의미한다. 서열 번호 645의 폴리뉴클레오타이드 서열은 서열 번호 646의 상기 Δ1D2A 폴리펩타이드를 코딩한다. 서열 번호 646의 상기 폴리펩타이드를 코딩하는 다른 퇴화한(degenerate) 서열들 또한 사용될 수 있다. 서열 번호 645 및 646로 나타낸 것과 같이, 폴리뉴클레오타이드 1-33은 FMDV 1D 잔기들을 코딩하고, 폴리뉴클레오타이드 34-84은 상기 2A 아미노산 잔기들을 코딩하고, 폴리뉴클레오타이드 88-90은 C-말단 프롤린 잔기를 코딩한다. Δ1D2A와 유사한 다른 번역 종료 서열들은, Δ1D2A보다 상기 1D 단백질의 잔기가 더 적거나 많을 수 있고, 또는 번역 종료 서열로서 작용하는 그것의 능력에 영향을 미치지 않는 상기 2A 서열에 1, 2, 3 또는 그 이상의 점 돌연변이들을 포함할 수 있다.
본원에 사용된, "가우시아 루시퍼라아제 (Gaussia luciferase)"(GLuc)는 작고, 자연적으로 분비된 185 개 아미노산 (서열 번호 649) 루시퍼라아제 및 상기 분비된 루시퍼라아제를 코딩하는 핵산을 의미한다. 상기 용어는, 예를 들어, 서열 번호 649로 나타내는, 천연 GLuc 단백질과 적어도 90%, 적어도 95%와 같은 또는 적어도 99%와 같은 서열 상동성을 갖는 단백질들 및 루시퍼라아제 특성들을 나타내는 GLuc 변이체를 코딩하는 핵산들을 포함하는 것을 또한 의미한다. 전형적으로, GLuc은 반딧불 또는 레닐라 (Renilla) 루시퍼라아제와 비교할 때 더 높은 강도를 가진다.
본원에 사용된, "SGLuc"는 저수준의 단백질 발현을 조사하는데 유용한 초발광성 GLuc 변이체 (예: 서열 번호 651)를 의미한다. SGLuc 변이체는, 전형적으로 GLuc 루시퍼라아제의 분비형을 발현 및/또는 분비될 수 있는 GLuc 루시퍼라아제를 발현하는 가우시아 루시퍼라아제 (Gaussia luciferase) (GLuc) 유전자의 아미노산 89 및 90에서 돌연변이를 포함한다.
본원에서 사용된, "벡터(vector)"는 유기체, 세포, 또는 세포 성분들 사이에서 핵산이 전파되고/되거나 전달될 수 있는 임의의 수단을 나타낸다. 벡터는 바이러스, 박테리오파지, 프로-바이러스, 플라스미드, 파지미드(phagemids), 트랜스포존(transposon), 코즈미드(cosmide), 바이러스 벡터, 발현 벡터, 유전자 전달 벡터, 미니서클 벡터, 및 효모 인공 염색체 (yeast artificial chromosomes, YACs), 박테리아 인공 염색체 (bacterial artificial chromosomes, BACs), 및 식물 인공 염색체 (plant artificial chromosomes, PLACs) 등과 같은 인공 염색체를 포함하는 것으로서, "에피좀", 즉, 자율적으로 복제하거나 숙주 세포의 염색체에 집적될 수 있는 것이다. 벡터는 전형적으로 적어도 복제의 원점, 복제 부위 및 선택가능한 마커 (예: 항생제 내성)를 포함한다. 전술한 비제한적인 예들의 천연 버전은 단리, 정제, 및/또는 변형될 수 있어, 그 수득되는 천연 버전은 그것의 자연 상태의 물질과 구별될 수 있다. 벡터는 또한 네이키드(naked) RNA 폴리뉴클레오타이드, 네이키드 DNA 폴리뉴클레오타이드, 동일한 가닥 내에 DNA 및 RNA 모두로 구성된 폴리뉴클레오타이드, 폴리라이신-컨쥬게이트된 DNA 또는 RNA, 펩타이드-컨쥬게이트된 DNA 또는 RNA, 리포좀-컨쥬게이트된 DNA 등으로서, 본질적으로 에피좀이 아니거나, 또는 아그로박테리움(Agrobacterium) 또는 박테리아와 같은 하나 이상의 상기 폴리뉴클레오타이드 구조체를 포함하는 유기체일 수 있다.
본원에 사용된 용어 "재조합 벡터"는 상이한 소스로부터 핵산 조각들을 연결함으로써 생성된 벡터로 정의된다.
"미니서클 DNA 벡터 (minicircle DNA vector)", "미니서클 벡터", 또는 "미니서클"은 작은 (일반적으로 3 kb 내지 4kb, 또는 일반적으로 10kb 이하) 원형, 에피좀 플라스미드 유도체로서, 모든 원핵생물 벡터 부분 (예: 박테리아 복제 원점, 플라스미드의 박테리아 전파와 연관된 유전자)이 제거된 것이다. 미니서클 벡터는 원핵생물 DNA 서열을 포함하지 않기 때문에, 그것들이 목적 포유동물 세포로 형질전환 유전자를 전달하기 위한 비히클로서 사용될 때 외래종으로 인식될 가능성이 적고, 파괴될 가능성이 적다.
"형질전환 유전자 발현 카세트", "형질전환 유전자 발현 구조체", "발현 카세트", "발현 구조체", "구조체(construct)", "키메라(chimera)", "키메라성 DNA", "DNA 키메라" 또는 "키메라성 유전자"는 자연에서 함께 발견되지 않는 하나 이상의 기능적 단위들 [예: 프로모터, 조절 요소, 컨센서스 서열(consensus sequence), 번역 프레임-이동 서열, 단백질 코딩 유전자 등]을 포함하도록 인공적으로 구축된 핵산 서열이며, 목적 서열(들)을 코딩하는 유전자 뿐만 아니라 shRNAs, microRNAs, siRNAs, 안티-센스 RNAs와 같은 비-번역된 RNAs를 포함하여, 상기 카세트가 전달된 유기체에서 임의의 RNA 전사의 발현을 지시할 수 있다, 형질전환 유전자 발현 카세트는 단일- 또는 이중-가닥이고 원형 또는 선형일 수 있다. 형질전환 유전자 발현 카세트는 표적 세포에서 핵산 서열을 전달, 복제 및/또는 발현시키기 위한 비히클로서 작용하는 것으로서, 벡터에 구축되거나, 삽입 또는 복제될 수 있다.
본원에 사용된, 용어 "형질전환"은 벡터 또는 폴리뉴클레오타이드 구조체가 숙주 세포에 도입되는 과정을 나타낸다. 형질전환 [또는 형질도입 (transduction), 또는 형질주입 (transfection)]은 화학적 형질전환 (예, 아세트산 리튬 형질전환), 전기천공 (electroporation), 미세주입(microinjection), 바이오리스틱 (biolistic) [또는 입자 폭격 (particle bombardment)-매개 전달] 또는 아그로박테리움 매개 형질전환을 포함하는 다수의 수단들 중 임의의 하나에 의해 달성될 수 있다.
본원에 사용된, 용어 "형질주입"은 벡터 (DNA 또는 RNA) 내에서 복제된 유전자와 같은 핵산이 진핵생물 숙주 세포 내로 전달되는 과정을 나타낸다.
본원에 사용된, 용어 "숙주 세포"는, 자연적으로 감염되거나, 예를 들어, 백신접종에 의하여, 바이러스 또는 벡터로 인공적으로 형질주입되거나 형질전환된 원핵생물 세포 (예: 박테리아) 또는 진핵생물 세포 (예: 포유동물, 곤충, 효모 등) 를 의미한다. 상기 숙주 세포에 도입된 상기 바이러스는 살아있거나(live), 불활성화, 약화 또는 변형될 수 있지만, 상기 도입된 벡터는, 숙주 세포에서 발현될 때, 자기조립하여 바이러스-유사 입자(VLPs)를 형성하는 바이러스 구조 단백질을 생성할 수 있는, 형질전환 유전자 발현 카세트를 담지한다. 일부 경우, 숙주 세포는 숙주 또는 대상의 내부에 있을 수 있고, 상기 숙주 또는 대상은, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 및 FMDV P1 전구체와 같은 적어도 하나의 다른 피코르나바이러스 항원을 코딩하는 핵산-기반 백신의 투여에 의해 치료될 수 있다. 일부 구현예들에 있어서, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제-코딩 폴리뉴클레오타이드는 본 기술분야에 잘 공지된 트랜스포존의 사용에 의한, 또는 다른 재조합 DNA 방법들에 의한, 재조합을 통해 숙주 세포 게놈에 도입된다. FMDV 3C 프로테아제와 같은 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 및 FMDV P1 전구체와 같은 다른 피코르나바이러스 항원들은 숙주 세포 내부의 동일하거나 상이한 플라스미드, 에피좀 및/또는 다른 DNA 또는 RNA 구조체들로부터 발현될 수 있다.
피코르나바이러스 3C 프로테아제, 피코르나바이러스 P1 전구체 단백질, 다른 단백질들 또는 항원 서열뿐만 아니라, 다른 목적 단백질의 발현을 위한 숙주 세포는 원핵생물 또는 진핵생물 세포일 수 있다. 상기 용어 "숙주 세포"는 사카로미세스 세레비시아 (Saccharomyces cerevisiae), 또는 피히아 파스토리스 (Pichia pastoris)와 같은, 효모 또는 곰팡이 숙주 세포; 애기장대 (Arabidopsis thaliana), 클라미도모나스 레인하티 (Chlamydomonas reinhardtii), 대두 (Glycine max), 니코티아나 벤타미아나 (Nicotiana benthamiana), 재배담배 (Nicotiana tabacum), 벼 (Oryza sativa), 옥수수 (Zea mays)와 같은, 식물 숙주 세포; 또는 담배거세미나방종 (Spodoptera frugiperda), 노랑초파리 (Drosophila melanogaster), Sf9, Sf21과 같은 곤충 세포 또는 곤충 세포주; HEK-293-T (인간 신장 배아) 세포, 중국 햄스터 난소 [Chinese Hamster Ovary (CHO)] 세포, 아기 햄스터 신장(BHK) 세포, LF-BK (돼지 세포), LF-BK αV/β6, 또는 피코르나바이러스 감염에 민감한 동물과 같은 척추 동물의 세포 또는 포유동물의 세포 또는 포유동물 세포주; 간균 (Bacillus), 락토코코스 (Lactococcus), 스트렙토미세스 (Streptomyces), 로도코커스 (Rhodococcus), 코리네박테리움 (Corynebacterium), 미코박테륨 (Mycobacterium)과 같은 그람-양성 박테리아와 같은 원핵생물 숙주 세포 또는 대장균 (Escherichia), 슈도모나스(Pseudomonas)와 같은 그람-음성 박테리아와 같은 원핵생물 숙주 세포를 포함한다.
본원에 사용된, 용어 "잔기(residue)" 또는 "아미노산 잔기"는 펩타이드, 폴리펩타이드 또는 단백질의 폴리머 체인 내에 특정 아미노산을 의미한다. 상기 용어는 22 개의 통상적인 단백질 생성 아미노산 잔기 (셀레노시스테인 및 피롤라이신을 포함), 변형된 단백질 생성 아미노산 잔기, 및/또는 비-단백질 생성 아미노산 잔기 중 임의의 것을 포함한다. 본원을 통해, 아미노산 잔기는 3 개의 글자 코드 또는 단일 글자 코드로 나타낼 수 있으며, 알라닌의 경우 Ala (A), 아르기닌의 경우 Arg (R), 아스파라긴의 경우 Asn (N), 아스파라긴 산의 경우 Asp (D), 시스테인의 경우 Cys (C), 글루타민의 경우 Gln (Q), 글루타민 산의 경우 Glu (E), 글리신의 경우 Gly (G), 히스티딘의 경우 His (H), 이소류신의 경우 Ile (I), 류신의 경우 Leu (L), 라이신의 경우 Lys (K), 메티오닌의 경우 Met (M), 페닐알라닌의 경우 Phe (F), 프롤린의 경우 Pro (P), 세린의 경우 Ser (S), 트레오닌의 경우 Thr (T), 트립토판의 경우 Trp (W), 티로신의 경우 Tyr (Y), 발린의 경우 Val (V), 피롤라이신의 경우 Pyl (O), 셀레노시스테인의 경우 Sec (U)를 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
용어 "아미노산 서열", "펩타이드 서열" 또는 "단백질 서열"은, 펩타이드 결합들에 의해 연결된 아미노산 잔기들이 펩타이드 또는 단백질 체인에서 나타나는 순서를 의미한다. 아미노산 서열은 일반적으로 유리(free) 아미노기를 포함하는 N-말단으로부터 유리 카르복실기를 포함하는 상기 C-말단으로 리포트(report)된다. 본원에 사용된, "비-코딩된 아미노산", "비-단백질 생성 아미노산", "합성 아미노산" 또는 "비천연 아미노산"은 임의의 유기체의 유전자 코드 (DNA 또는 mRNA)로 자연적으로 코딩되지 않거나 자연적으로 발견되지 않아, in vitro 합성되어야 하는 아미노산을 나타낸다.
"유전적으로 코딩된 아미노산", "코딩된 아미노산" 또는 "천연 아미노산"은, 알라닌, 아르기닌, 아스파라긴, 아스파라긴산, 시스테인, 글루타민, 글루타민산, 글리신, 히스티딘, 이소류신, 류신, 라이신, 메티오닌, 페닐알라닌, 프롤린, 세린, 트레오닌, 트립토판, 티로신, 발린, 피롤라이신 및 셀레노시스테인과 같은, 유기체의 유전자 코드 (DNA 또는 mRNA)로 자연적으로 코딩되거나 상기 유전자 코드에서 발견되는 아미노산을 의미한다.
본원에서 사용된, 용어 "예방하다(prevent)" 및 "예방하는(preventing)"은 질병, 장애, 상태 및/또는, 피코르나바이러스 감염과 같은, 감염의 재발, 전염 또는 발병의 예방을 포함한다. 본원의 개시가 완전한 예방으로 제한되는 것은 아니다. 본원의 일부 구현예들에 있어서, 예방은 질병 발병을 지연시키거나, 중증을 감소시키거나, 전염을 감소시키거나, 또는 증상 및 예후(presentation)를 변경시킨다.
본원에서 사용된, 용어 "치료하다(treat)" 및 "치료하는(treating)"는 질병 진행 지연, 특정 증상의 감소, 전염의 감소를 포함하고, 또는 질병 예후, 증상 또는 진행에 영향을 미친다. 본원에 따른 백신을 이용한 예방 또는 치료는 세포 면역 (예: T 세포를 통한) 또는 체액(humoral) 면역 (예: 항체를 통한)의 유도를 포함할 수 있다. 이러한 백신은, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 발현하는 숙주 세포에 의해 생성된, 하나 이상의 FMDV 항원과 같은, 하나 이상의 피코르나바이러스 항원을 일반적으로 포함할 것이다. 그러나, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 및, 다른 FMDV 항원(들)과 같은 다른 피코르나바이러스 항원들을 발현하는 DNA-기반 백신 또한 고려된다.
피코르나바이러스 VLPs의 생성, 유전자 발현 (예: FMDV 폴리펩타이드 전구체, 야생형 또는 변형된 FMDV 3C 프로테아제의 발현 등), DNA 전사, mRNA 번역, FMDV과 같은 피코르나바이러스의 절단, 폴리펩타이드 전구체 (예: P1 등)의 생성과 같은 반응을 나타낼 때, 용어 "in vivo"는 바이러스 숙주 세포와 같은, 살아있는 세포의 환경 내에서 상기 반응이 일어남을 의미한다. 상기 살아있는 세포는 숙주 또는 다른 유기체 또는 인공 배양 배지 내에서 살아있는 세포일 수 있다.
VLPs, 유전자 발현 (예: FMDV 폴리펩타이드 전구체, 야생형 또는 변형된 FMDV 3C 프로테아제의 발현 등), DNA 전사, mRNA 번역, FMDV과 같은, 피코르나바이러스의 절단, 폴리펩타이드 전구체 (예: P1 등)의 생성과 같은 반응을 나타낼 때, 용어 "in vitro"는 시험관, 플라스크, 페트리 접시 등에서 용액, 액체/고체 배양 배지를 포함하는, 살아있는 세포를 제외한 임의의 환경에서 상기 반응이 일어남을 의미한다.
[자세한 설명]
FMDV
3C 프로테아제 내 아미노산 위치에 상응하는 위치에서 변형을 갖는 폴리뉴클레오타이드 및 폴리펩타이드
FMDV 상응 위치
본원의 일 측면은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이다. 일부 구현예들에 있어서, 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩되는 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 아미노산 서열 번호 2, 4, 6, 10, 12, 14, 16, 18 및 20으로 표시되는 야생형 FMDV 3C 프로테아제 서열과 같은, 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치(들) 16-25, 99-100 및 115-130에 상응하는 위치(들)에 위치하는 하나 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 이러한 단리된 폴리뉴클레오타이드들에 의해 코딩된 변형된 3C 프로테아제들 또한 고려된다.
다른 피코르나바이러스 상응 위치
일부 측면들에 있어서, 본원은 또한 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이며, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 예를 들어, 야생형 소 비염(Bovine rhinitis) 3C 프로테아제의 아미노산 위치 22, 23, 96, 97, 121, 123 및 124 중 하나 이상에 상응하는 위치에 위치하는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 소 비염(Bovine rhinitis) 3C 프로테아제 치환들; 야생형 말 비염(Equine rhinitis) 3C 프로테아제의 아미노산 위치 23, 100, 125 및 127 중 하나 이상에 상응하는 위치에 위치하는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 말 비염(Equine rhinitis) 3C 프로테아제; 야생형 인간 콕사키바이러스(Human coxsackievirus)의 19, 20, 87, 102, 104, 105, 106, 109, 112 및 114 아미노산 위치 중 하나 이상에 상응하는 위치에 위치하는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 인간 콕사키바이러스 3C 프로테아제; 야생형 인간 엔테로바이러스 3C 프로테아제의 아미노산 19, 20, 104, 105, 106 및 109 중 하나 이상에 상응하는 위치에 위치하는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 인간 엔테로바이러스 3C 프로테아제; 야생형 인간 폴리오바이러스(poliovirus) 3C 프로테아제의 아미노산 19, 20, 100, 119, 121, 128 및 130 중 하나 이상에 상응하는 위치에 위치하는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 인간 폴리오바이러스 3C 프로테아제; 및/또는 야생형 인간 리노바이러스 (Human rhinovirus) 3C 프로테아제의 아미노산 위치 19, 20, 87, 88, 102, 104, 108, 112 및 114 중 하나 이상에 상응하는 위치에 위치하는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 인간 리노바이러스 3C 프로테아제; 야생형 인간 간염 바이러스(Human hepatitis) 3C 프로테아제의 아미노산 19, 20, 100, 119, 121, 128 및 130 중 하나 이상에 상응하는 위치에 위치하는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus) 3C 프로테아제로부터 선택된다. 이러한 단리된 폴리뉴클레오타이드들에 의해 코딩되는 변형된 3C 프로테아제 또한 고려된다.
예시적 야생형 서열
일부 구현예들에 있어서, 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드 서열 또는 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 변형되어 본원의 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 생성한다. 일부 구현예들에 있어서, 변형되는 부모 폴리뉴클레오타이드 또는 부모 폴리펩타이드는 본 기술 분야에 공지되고 본원에서 제공되는 임의의 피코르나바이러스 속, 종, 아형, 이디오타입(idiotype), 균주 및/또는 단리물(isolate)로부터의 것과 같은, 임의의 야생형 피코르나바이러스 3C 프로테아제로부터 수득되거나 유도될 수 있다. 예를 들어, 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 부모 폴리뉴클레오타이드 또는 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 아프토바이러스 (Aphthovirus), 아쿠아마바이러스 (Aquamavirus), 아비헤파토바이러스 (Avihepatovirus), 카디오바이러스 (Cardiovirus), 코사바이러스 (Cosavirus), 디시피바이러스 (Dicipivirus), 엔테로바이러스 (Enterovirus), 에르보바이러스(Erbovirus), 헤파토바이러스 (Hepatovirus), 코부바이러스 ( Kobuvirus), 메기바이러스 (Megrivirus), 파레코바이러스 (Parechovirus), 피스세바이러스 (Piscevirus), 살리바이러스 (Salivirus), 사펠로바이러스 (Sapelovirus), 세네카바이러스(Senecavirus), 테스코바이러스 (Teschovirus) 및 트레모바이러스(Tremovirus)를 포함하는 상기 피코르나바이러스 속의 임의로부터 수득되거나 유도될 수 있다. 특별히 적합한 속은 아프토바이러스 (Aphthovirus), 엔테로바이러스 (Enterovirus), 및 헤파토바이러스 (Hepatovirus)를 포함한다.
3C 프로테아제 또는 부모 3C 프로테아제를 코딩하는 부모 폴리뉴클레오타이드가 수득되거나 유도되어 본원의 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 생성하기 위한 상기 아프토바이러스 (Aphthovirus) 속 내에 특별히 적합한 종들은 FMDV의 혈청형, 예를 들어, A, O, C, Asia 1, SAT1, SAT2, 및 SAT3 혈청형의 임의의 혈청형, 아형, 지역형, 및/또는 균주, 균주 sd-1과 같은, 소 비염 A 바이러스 (Bovine rhinitis A virus), 소 비염 B 바이러스 (Bovine rhinitis B virus) 및 말 비염 A 바이러스 (Equine rhinitis A virus)를 포함한다. 적합한 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 특정 예는 서열 번호 2 (A Turkey 2006), 서열 번호 4 (A24 Cruzeiro iso71), 서열 번호 6 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1), 서열 번호 8 (Asia 1 shamir), 서열 번호 10 (C3 Indaial), 서열 번호 12 (O1 PanAsia), 서열 번호 14 (O1 Manisa 분리주 87 균주, 혈청형 O), 서열 번호 16 (SAT1-20 iso11), 서열 번호 18 (SAT2 Egypt 2010) 및 서열 번호 20 (SAT3 ZIM/6/91)를 포함한다. 적합한 부모 FMDV 폴리뉴클레오타이드 3C 프로테아제 서열의 예는 각각 서열 번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18 및 20을 코딩하는, 서열 번호 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, 17 및 19로 기재된 것들을 포함한다. 부모 3C 프로테아제로서 사용될 수 있는 야생형 소 비염(Bovine rhinitis) 3C 프로테아제의 예는 서열 번호 422 [소 비염 A 바이러스 (Bovine rhinitis A virus)] 및 서열 번호 434 [소 비염 B 바이러스 (Bovine rhinitis B virus)]를 포함한다. 적합한 부모 소 비염(Bovine rhinitis) 폴리뉴클레오타이드 3C 프로테아제 서열의 예는 서열 번호 421 [소 비염 A 바이러스 (Bovine rhinitis A virus)] 및 서열 번호 433 [소 비염 B 바이러스 (Bovine rhinitis B virus)]로 기재된 것들을 포함한다. 부모로서 사용될 수 있는 야생형 말 비염(Equine rhinitis) 3C 프로테아제의 예는 서열 번호 444를 포함한다. 적합한 부모 말 비염(Equine rhinitis) 폴리뉴클레오타이드 3C 프로테아제 서열의 예는 서열 번호 443으로 기재된 것을 포함한다.
3C 프로테아제를 코딩하는 부모 폴리뉴클레오타이드 또는 부모 3C 프로테아제가 수득되거나 유도될 수 있는 특히 적합한 부모 엔테로바이러스(Enterovirus) 종들은 엔테로바이러스 A (Enterovirus A), 엔테로바이러스 B (Enterovirus B), 엔테로바이러스 C (Enterovirus C), 리노바이러스 A (Rhinovirus A) 및 리노바이러스 B (Rhinovirus B)를 포함한다. 적절한 엔테로바이러스 A (Enterovirus A) 혈청형 및 균주는 Kowalik 균주와 같은 인간 콕사키바이러스(Human coxsackievirus) A10, 및 인간 엔테로바이러스 (Human enterovirus) A71, C4 균주와 같은 인간 엔테로바이러스(Human enterovirus) A71을 포함한다. 적합한 엔테로바이러스 B (Enterovirus B) 혈청형 및 균주는, 인간 콕사키바이러스 (Human coxsackievirus) B1, 마코시 (Macocy) 균주와 같은 인간 콕사키바이러스 (Human coxsackievirus) B3, 및 돼지 수포 병 바이러스(swine vesicular disease virus)와 같은 인간 콕사키바이러스 B5, 예를 들어, 서열 번호 640에 기재된 것과 같은 야생형 돼지 수포 병 바이러스 3C 프로테아제와 같은 부모 3C 프로테아제를 포함한다. 적합한 엔테로바이러스 C (Enterovirus C) 혈청형, 균주 및 단리물은 Tompkins 균주와 같은 인간 콕사키바이러스 A1, Mahoney 균주와 같은 인간 폴리오바이러스 1 (poliovirus 1), 균주 R93152와 같은 인간 폴리오바이러스 2 (Human poliovirus 2), 및 단리물 CHN5275/JX/CHN/2001과 같은 인간 폴리오바이러스 3 (Human poliovirus 3)을 포함한다. 특히 적합한 리노바이러스 A (Rhinovirus A) 혈청형 및 균주는 인간 리노바이러스 (Human rhinovirus) A2, 균주 VR1130과 같은 인간 리노바이러스 (Human rhinovirus) A20, 및 균주 R1199과 같은 인간 리노바이러스 (Human rhinovirus) A89를 포함한다. 적합한 리노바이러스 B (Rhinovirus B) 혈청형은 인간 리노바이러스(Human rhinovirus) B14를 포함한다. 특히 적합한 헤파토바이러스(Hepatovirus) 종들은 인간 A 형 간염 바이러스(Human hepatitis A virus)를 포함한다.
적합한 부모 엔테로바이러스(Enterovirus) 3C 프로테아제의 특정 예는 서열 번호 478로 기재된 야생형 인간 콕사키바이러스(Human coxsackievirus) A10 3C 프로테아제, 서열 번호 480으로 기재된 야생형 인간 콕사키바이러스 B1 3C 프로테아제, 서열 번호 510으로 기재된 야생형 인간 콕사키바이러스 B3 3C 프로테아제, 서열 번호 462로 기재된 야생형 인간 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제 및 서열 번호 526으로 기재된 야생형 인간 엔테로바이러스(Human enterovirus) A71 3C 프로테아제를 포함한다. 부모로서 사용하기 위한 특히 적합한 인간 A 형 간염 바이러스는 서열 번호 538로 기재되어 있다.
엔테로바이러스(Enterovirus) 3C 프로테아제를 코딩하는 적합한 부모 폴리뉴클레오타이드의 예에는 서열 번호 477로 기재된 야생형 인간 콕사키바이러스 A10 3C 프로테아제, 서열 번호 479로 기재된 야생형 인간 콕사키바이러스 B1 3C 프로테아제, 서열 번호 509로 기재된 야생형 인간 콕사키바이러스 B3 3C 프로테아제, 서열 번호 461로 기재된 야생형 인간 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제, 서열 번호 525로 기재된 야생형 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제 및 서열 번호 439로 기재된 것과 같은 야생형 돼지 수포 병 바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 것들을 포함한다. 부모로서 사용하기 위한 특히 적합한 인간 A 형 간염 바이러스는 서열 번호 537로 기재되어 있다.
변형에 적합한 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 수득하거나 유도하기 위해 사용될 수 있는 다른 적합한 피코르나바이러스는, 서열 번호 636에 기재된, 돼지 테스코바이러스 (Porcine Teschovirus) 3C 프로테아제와 같은 테스코바이러스 (Teschovirus genus) 속, 및, 서열 번호 638에 기재된 것, 세네카 밸리 (Sereca Valley) 바이러스 3C 프로테아제와 같은 세네카 바이러스(Senecavirus) 속을 포함한다. 돼지 테스코바이러스(Porcine Teschovirus) 3C 프로테아제를 코딩하는 적합한 부모 폴리뉴클레오타이드의 예는 서열 번호 635로 기재된 야생형 돼지 테스코바이러스(Porcine Teschovirus) 3C 프로테아제를 포함한다. 세네카 밸리 (Seneca Valley) 바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 적합한 부모 폴리뉴클레오타이드의 예는 서열 번호 637에 기재된 야생형 세네카 밸리 (Sereca Valley) 바이러스 3C 프로테아제를 포함한다.
상기 및 본원에 기재된 상기 야생형 3C 프로테아제 서열 및 상기 야생형 3C 프로테아제를 코딩하는 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드는, 본원에 기술된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드를 달성하기 위하여 변형되는 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제로서, 및/또는, 예를 들어, 야생형 FMDV 3C 프로테아제 아미노산 위치들 16-25, 99-100 및 115-130 또는 이러한 위치들을 코딩하는 코돈에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 위치를 결정하기 위한 정렬의 주형으로서 본원에 기술된 임의의 구현예들에서 사용될 수 있다.
상응 위치의 결정
야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치(들) 16-25, 99-100 및 115-130에 상응하는 상기 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 위치(들)은, 예를 들어, 비교 모델링을 사용하여 결정될 수 있다. 상기 구현예들에 있어서, 부모 3C 프로테아제의 3-차원 모델은 공지된 FMDV 3C 프로테아제의 3-차원 구조에 기초하여 1차 아미노산 서열로부터 구축될 수 있다. 모델을 구축할 수 있게 하기 위해, 상기 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 예를 들어, FMDV 3C 프로테아제와 적어도 30% 서열 상동성을 나타내는 것이 보통 바람직하다. 상기 모델 구조는 본 기술 분야에 공지된 임의의 적합한 소프트웨어, 예를 들어, Modeller (Andrej Sali, Roberto Sanchez, Azat Badretdinov, Andrαs Fiser, and Eric Feyfant, The Rockefeller University, 1230 York Avenue, New York, N.Y. 10021-6399, USA), 또는 WHAT IF: A molecular modeling and drug design program (G. Vriend, J. Mol. Graph. (1990) 8, 52-56)를 사용하여 구축될 수 있고, 여기서 그 전문은 본원에 참조로서 포함된다. 생성된 비교 모델은 FMDV 3C 프로테아제에 대한 3차원 구조 유사성에 대해 스코어링(scored) 될 수 있다. 예를 들어, TM 정렬과 같은 프로그램, DALI 서버 (예: DaliLite v.3 available at ekhidna.biocenter.helsinki.fi/dali_server) 또는 PyMOL에서 수행되는 cealign 알고리즘(예: version 1.7.6, www.pymol.org에서 이용가능함)은 각각 TM 정렬 스코어, Z-스코어, 또는 RMSD 값을 계산함으로써 구조 유사성을 평가하기 위해 사용될 수 있다.
그러나, 더 전형적으로, 상기 상응하는 위치(들)은, 편리하게 하나 이상의 부모 피코르나바이러스 3C 프로타아제(들), 전형적으로 야생형 3C 프로타아제들로부터 수득되거나 또는 유도되는 하나 이상의 1차 아미노산 서열(들), 및 하나 이상의 야생형 FMDV 3C 프로테아제(들)와 같은, 하나 이상의 야생형 3C 프로타아제로부터 수득되거나 또는 유도되는 하나 이상의 1차 아미노산 서열(들) 사이의 정렬에 기초하여 편리하게 결정된다. 상기 1차 아미노산 서열(들)은 상기 본 기술 분야에 공지된 임의의 방법에 의해 정렬될 수 있다. 이러한 방법들은 전형적으로 매치를 최대화시키며 매뉴얼 정렬들을 사용하는 방법들을 포함하고/포함하거나 이용가능한 다수의 정렬 프로그램들[예: 기본 매개변수를 사용하는 BLASTP 및 CLUSTALW 버전 1.74 및 Thompson 등, 1994, CLUSTAL W: "Improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice", Nucleic Acids Research, 22:4673-4680, 그 전문이 본원에 참조로서 포함됨]을 사용한다. 일부 구현예들에 있어서, 기본 매개변수를 갖는 Blossum 62를 사용하는 2015년 1월 1일, version 9.4, Professional Edition, Clone Manager 9는 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 3C 프로테아제를 달성하고/하거나 본원의 변형된 3C 프로테아제를 달성하기 위해 부모 3C 프로테아제에서 치환될 수 있는 상응하는 아미노산(들)을 결정하기 위한 상기 정렬을 제조하기 위해 사용된다.
상응하는 위치들의 예
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 본원의 변형된 3C 프로테아제는, 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 22 및 23과 같은 아미노산 위치들 16-25에 상응하는 위치(들)에 위치하는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하도록 변형된 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제이다. 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 위치 22 및 23에 상응하는 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 아미노산 위치들의 예들은, 예를 들어, 야생형 FMDV 3C 프로테아제와 같은 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus)의 I22 및 L23 각각, 야생형 소 비염 A 바이러스 (Bovine rhinitis A virus) 3C 프로테아제와 같은 야생형 아프토바이러스 (Aphthovirus)의 V22 및 C23 각각, 야생형 말 비염 B 바이러스 (Equine rhinitis B virus) 3C 프로테아제와 같은 야생형 아프토바이러스 (Aphthovirus) 3C 프로테아제의 V22 및 R23 각각, 및, 야생형 말 비염 A 바이러스 (Equine rhinitis A virus) 3C 프로테아제와 같은 야생형 아프토바이러스 (Aphthovirus) 3C 프로테아제의 Y22 및 C23 각각을 포함한다. 야생형 FMDV 3C 프로테아제, 소 비염 A 바이러스 (Bovine rhinitis A virus) 3C 프로테아제, 소 비염 B 바이러스 (Bovine rhinitis B virus) 3C 프로테아제 및 말 비염 A 바이러스 (Equine rhinitis A virus) 3C 프로테아제 사이의 정렬을 나타내는 도 4 참조.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 20 및 21과 같은, 아미노산 위치들 16-25 상응하는 위치(들)에 위치하는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제이다. 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 위치들 20 및 21에 상응하는 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 아미노산 위치들의 예들은, 예를 들어, 야생형 인간 콕사키바이러스 A10 3C 프로테아제와 같은 야생형 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제의 Q19 및 T20 각각, 및 야생형 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제와 같은, 야생형 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제의 Q19 및 T20 각각을 포함한다 (도 5 및 도 6 참조).
다른 구현예들에 있어서, 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 20 및 21에 상응하는 위치들은, 예를 들어, 야생형 인간 콕사키바이러스 B1 또는 B3 프로테아제과 같은, 야생형 엔테로바이러스 B (Enterovirus B) 3C 프로테아제의 K19 및 T20 각각을 포함한다 (도 7 참조).
야생형 FMDV 3C 프로테아제의 위치들 21 및 22에 상응하는 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 아미노산 위치들의 예들은, 예를 들어, 야생형 인간 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제 및 야생형 인간 폴리오바이러스 3C 프로테아제와 같은 야생형 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제의 T19 및 T20 각각을 추가 포함한다 (도 5 및 도 8 참조).
다른 구현예들에 있어서, 야생형 FMDV 3C의 아미노산 위치들 21 및 22에 상응하는 위치들은, 예를 들어, 야생형 리노바이러스 A 3C 프로테아제의 T19 및 T20 각각을 포함한다 (도 9 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 3C 프로테아제는, 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 16 및 17과 같은, 아미노산 위치들 16-25에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제이다. 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 위치들 16 및 17에 상응하는 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 아미노산 위치들의 예는, 예를 들어, 야생형 리노바이러스 B (Rhinovirus B) 3C 프로테아제의 T19 및 T20 각각을 포함한다 (도 10 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩되는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 16, 17, 24 및 25와 같은, 아미노산 위치들 16-25에 상응하는 위치(들)에서 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 위치들 16, 17, 24 및 25에 상응하는 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 아미노산 위치들의 예들은, 예를 들어, 야생형 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus) 3C 프로테아제의 G17, V18, G19 및 E20 각각을 포함한다 (도 11 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 123-128과 같은, 아미노산 위치들 115-130에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함한다. 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 123-126 및 128에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 위치들의 예들은 야생형 FMDV 3C 프로테아제와 같은 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제의 D123, V124, G125, R126 및 I128 각각을 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 127 및 128과 같은, 아미노산 위치들 115-130에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함한다. 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 124 및 127에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 위치들의 예들은 야생형 소 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제의 F120 및 L123 각각을 포함한다 (도 4 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 124 및 127과 같은, 아미노산 위치들 115-130에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 아미노산 위치들 124 및 127에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 위치들의 예들은 야생형 소 비염 B 3C 프로테아제와 같은, 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제의 V121 및 L124 각각을 포함한다 (도 4 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C의 아미노산 위치들 125 및 127과 같은, 아미노산 위치들 115-130에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 아미노산 위치들 125 및 127에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 위치들의 예들은 야생형 말 비염 A 3C 프로테아제과 같은, 야생형 아프토바이러스 3C 프로테아제의 A125 및 T127 각각을 포함한다(도 4 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 117, 119, 124 및 127과 같은, 아미노산 위치들 115-130에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 아미노산 위치들 117, 120, 124 및 127에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 아미노산 위치들의 예들은 인간 콕사키바이러스 A10과 같은 야생형 엔테로바이러스 A (Enterovirus A) 3C 프로테아제의 L102, I104, N105, M109 및 M112 각각을 포함한다 (도 5 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C의 아미노산 위치들 119, 120, 121 및 124와 같은, 아미노산 위치들 115-130에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 아미노산 위치들 119, 120, 121 및 124에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 아미노산 위치들의 예들은 인간 엔테로바이러스 A71과 같은 야생형 엔테로바이러스 A (Enterovirus A) 3C 프로테아제의 I104, N105, T106 및 M109 각각을 포함한다 (도 6 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 116, 118, 119, 120, 123, 126 및 128과 같은, 아미노산 위치들 115-120에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 아미노산 위치들 116, 118, 119, 120, 123, 126 및 128에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 아미노산 위치들의 예들은 인간 콕사키바이러스 B와 같은 야생형 엔테로바이러스 B (Enterovirus B) 3C 프로테아제의 각각, L102, I104, N105, T106, F109, M112 및 I114 각각을 포함한다 (도 7 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 117, 119, 120, 124 및 127과 같은, 아미노산 위치들 115-130에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 아미노산 위치들 117, 119, 120, 124 및 127에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 아미노산 위치들의 예들은 인간 콕사키바이러스 A1과 같은 야생형 엔테로바이러스 C (Enterovirus C) 3C 프로테아제의 L102, V104, N105, T106, F109 및 M112 각각을 포함한다 (도 5 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 117, 118 및 119와 같은, 아미노산 위치들 115-130에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 아미노산 위치들 117, 118 및 119에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 아미노산 위치들의 예들은 인간 폴리오바이러스와 같은, 야생형 엔테로바이러스 C (Enterovirus C) 3C 프로테아제의 L102, I103, 및 V104 각각을 포함한다 (도 8 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 116, 118, 122, 126 및 128과 같은, 아미노산 위치들 115-130에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 아미노산 위치들 116, 118, 122, 126 및 128에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 위치들의 예들은 야생형 리노바이러스 A (Rhinovirus A) 3C 프로테아제의 L102, L104, Q108, T112 및 I114 각각을 포함한다 (도 9 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 125 및 127과 같은 아미노산 위치들 115-130에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 아미노산 위치들 128 및 130에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 아미노산 위치들의 예들은 야생형 리노바이러스 B (Rhinovirus B) 3C 프로테아제의 I112 및 E114 각각을 포함한다 (도 10 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 115, 117, 124 및 128과 같은, 아미노산 위치들 115-130에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 아미노산 위치들 115, 117, 124 및 128에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 아미노산 위치들의 예들은 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus) 3C 프로테아제의 L119, T121, M128 및 I130 각각을 포함한다 (도 11 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 99 및 100에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 위치 99에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 위치들의 실시예들은 야생형 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제의 I99 및 L99를 포함한다. 위치 100에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 위치들의 예들은 야생형 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제의 T100을 포함한다 (도 4 및 도 12 참조).
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치 100과 같은 아미노산 위치들 99 및 100에 상응하는 위치(들)에 위치되는 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 위치 100에 상응하는 피코르나바이러스 3C 프로테아제에서 위치들의 실시예들은 야생형 소 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제의 T96, 야생형 소 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제의 T97, 야생형 말 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제의 V100을 포함한다(도 4 및 도 12 참조).
다른 구현예들에 있어서, 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치 100에 상응하는 위치들은 예를 들어, 야생형 인간 콕사키바이러스 A10 3C 프로테아제 및 야생형 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제와 같은, 야생형 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제의 T87를 포함한다 (도 5, 도 6 및 도 12 참조).
다른 구현예들에 있어서, 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치 100에 상응하는 위치들은 야생형 인간 콕사키바이러스 B1 또는 B3 3C 프로테아제와 같은, 야생형 엔테로바이러스 B 3C 프로테아제의 R87을 포함한다 (도 12 참조).
다른 구현예들에 있어서, 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치 100에 상응하는 위치들은 예를 들어, 야생형 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제 및 야생형 인간 폴리오바이러스 3C 프로테아제와 같은, 야생형 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제의 R87을 포함한다 (도 5, 도 8 및 도 12 참조).
다른 구현예들에 있어서, 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치 99 및 100에 상응하는 위치들은 예를 들어, 야생형 리노바이러스 A 3C 프로테아제의 I86 및 R87을 각각 포함한다 (도 9 및 도 12 참조).
다른 구현예들에 있어서, 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치 99 및 100에 상응하는 위치들은 예를 들어, 야생형 리노바이러스 B 3C 프로테아제의 I86 및 R87을 각각 포함한다 (도 10 및 도 12 참조).
다른 구현예들에 있어서, 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치 100에 상응하는 위치들은 예를 들어, 야생형 A 형 간염 바이러스 3C 프로테아제의 T100을 포함한다 (도 11 및 도 12 참조).
아미노산 치환들의 예시적 위치들
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제와 같은, 야생형 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 위치 I22 및 L23에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은, 예를 들어, 위치 I22 및 L23에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환을 포함하는 변형된 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제와 같은, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 변형된 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제와 같은, 야생형 소 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 위치 V22 및 C23에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은, 위치 V22 및 C23에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제와 같은, 변형된 소 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제와 같은, 야생형 소 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 위치 Y22 및 R23에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 위치 Y22 및 R23 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는, 변형된 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제와 같은, 변형된 소 비염 B 바이러스 (Bovine rhinitis B virus) 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제와 같은, 야생형 말 비염 A 바이러스 (Equine rhinitis A virus) 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 위치 Y22 및 C23에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 위치 Y22 및 C23에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는, 변형된 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제와 같은, 변형된 말 비염 A 바이러스 (Equine rhinitis A virus) 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 엔테로바이러스 A (Enterovirus A) 3C 프로테아제와 같은, 야생형 인간 콕사키바이러스 A10 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 Q19 및 T20 위치들에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은, Q19 및 T20 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 변형된 인간 콕사키바이러스 A10 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은, 야생형 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 야생형 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 Q19 및 T20 위치들에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 Q19 및 T20 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 변형된 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은, 야생형 엔테로바이러스 B 3C 프로테아제와 같은, 야생형 인간 콕사키바이러스 B1 및/또는 B3 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 K19 및 T20 위치들에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 K19 및 T20 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 엔테로바이러스 B 3C 프로테아제와 같은, 변형된 인간 콕사키바이러스 B1 및/또는 B3 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제와 같은, 야생형 인간 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제 및/또는 야생형 인간 폴리오바이러스와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 T19 및 T20 위치들에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은, T19 및 T20 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는, 변형된 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제와 같은, 변형된 인간 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제 및/또는 변형된 인간 폴리오바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 리노바이러스 A 3C 프로테아제아 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 T19 및 T20 위치들에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 T19 및 T20 위치들에 위치된 상기 하나 이상의 아미노산 치환들은 포함하는 변형된 리노바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 리노바이러스 B 3C 프로테아제아 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 T19 및 T20 위치들에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 T19 및 T20 위치들에 위치된 상기 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 리노바이러스 B 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus) 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 G19 및 T20 위치들에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 G19 및 G20 위치들에 위치된 상기 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus) 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제와 같은, 야생형 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 D123, V124, G125, R126 및 I128 위치들에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 D123, V124, G125, R126 및 I128 위치들에 위치된 상기 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제와 같은, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제와 같은, 야생형 소 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 F120 및 L123 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면에 있어서, 본원은 위치 F120 및 L123에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환을 포함하는 야생형 아프토바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 소 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제와 같은, 야생형 소 비염 B 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 V121 및 L124 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 V121 및 L124 위치들에 위치된 상기 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제와 같은, 변형된 소 비염 B 바이러스 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제와 같은, 야생형 말 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 A125 및 T127 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 A125 및 T127 위치들에 위치된 상기 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 아프토바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 말 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 야생형 인간 콕사키바이러스 A10 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 L102, I104, N105, M109 및 M112 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 L102, I104, N105, M109 및 M112 위치들에 위치된 상기 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 변형된 인간 콕사키바이러스 A10 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 야생형 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 I104, N105, T106 및 M109 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 I104, N105, T106 및 M109 위치들에 위치된 상기 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 변형된 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 엔테로바이러스 B 3C 프로테아제와 같은, 야생형 인간 콕사키바이러스 B1 및/또는 B3 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 L102, I104, N105, T106, F109, M112 및 I114 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 L102, I104, N105, T106, F109, M112 및 I114 위치들에 위치된 상기 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 엔테로바이러스 B 3C 프로테아제와 같은, 변형된 인간 콕사키바이러스 B1 및/또는 B3 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제와 같은, 야생형 인간 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 L102, V104, N105, T106, F109, 및 M112 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 L102, V104, N105, T106, F109, 및 M112 위치들에 위치된 상기 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제와 같은, 변형된 인간 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제와 같은, 야생형 인간 폴리오바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 L102, I103, 및 V104 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 L102, I103, 및 V104 위치들에 위치된 상기 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제와 같은, 변형된 인간 폴리오바이러스 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 리노바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 L102, L104, Q108, T112 및 I114 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 L102, L104, Q108, T112 및 I114 위치들에 위치된 상기 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 리노바이러스 A 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 리노바이러스 B 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 I112 및 E114 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 I112 및 E114 위치들에 위치된 상기 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 리노바이러스 B 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus) 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 L119, T121, M128 및 I130 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 L119, T121, M128 및 I130 위치들에 위치된 상기 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus) 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 아프토바이러스 3C 프로테아제와 같은, 야생형 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 I99, L99 및 T100 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 I99, L99 및 T100 위치들에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 아프토바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 아프토바이러스 3C 프로테아제와 같은, 야생형 소 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 T96 위치에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 T96 위치에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 아프토바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 소 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 아프토바이러스 3C 프로테아제와 같은, 야생형 소 비염 B 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 T97 위치에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 T97 위치에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 아프토바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 소 비염 B 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 아프토바이러스 3C 프로테아제와 같은, 야생형 말 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 V100 위치에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 V100 위치에 위치된 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 아프토바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 말 비염 A 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 야생형 인간 콕사키바이러스 A10 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 T87 위치에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 T87 위치에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 변형된 인간 콕사키바이러스 A10 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 야생형 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 T87 위치에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 T87 위치들에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 변형된 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 엔테로바이러스 B 3C 프로테아제와 같은, 야생형 인간 콕사키바이러스 B1 및/또는 B3 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 R87 위치에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 R87 위치에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 엔테로바이러스 B 3C 프로테아제와 같은, 변형된 인간 콕사키바이러스 B1 및/또는 B3 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제와 같은, 야생형 인간 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 R87 위치에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 R87 위치에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제와 같은, 변형된 인간 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 야생형 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제와 같은, 야생형 인간 폴리오바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 R87 위치에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 R87 위치에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제와 같은, 변형된 인간 폴리오바이러스(Human poliovirus) 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 리노바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 I86 및 R87 및 I114 위치들에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 I86 및 R87 및 I114 위치들에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 리노바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 리노바이러스 B 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 I86 및 R87 위치들에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 I86 및 R87 위치들에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 리노바이러스 B 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
일부 측면들에 있어서, 본원은 A 형 간염 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이고, 여기서 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 T100 위치에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함한다. 다른 측면들에 있어서, 본원은 T100 위치에서 하나 이상의 아미노산 치환들을 포함하는 변형된 A 형 간염 바이러스 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 관한 것이다.
아미노산 치환들
본원에 기술된 상기 아미노산 치환을 수득하는 돌연변이들은 본원에 기술된 상기 야생형 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 같은 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제 또는 본원에 기술된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 본 기술분야에 공지된 임의의 방법론을 사용하여 도입될 수 있다. 돌연변이들은 무작위로, 예를 들어, 2가 금속 이온 보조인자(cofactor)로서 망간의 존재하에 PCR 반응을 수행함으로써 도입될 수 있다. 다른 일부 구현예들에 있어서, 올리고뉴클레오타이드-지시 돌연변이는 본원의 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 폴리뉴클레오타이드를 생성하는데 사용될 수 있고, 이것은 코딩 DNA 분자를 따라 임의의 결정된 부위에서 염기쌍 변화의 가능한 모든 부류를 허용한다. 일반적으로, 상기 기술은, 상기 목적 부모 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단일 가닥 뉴클레오타이드 서열에 상보적(하나 이상의 미스매치를 제외)인 올리고뉴클레오타이드를 어닐링(annealing)하는 것을 포함한다. 그 후, 상기 미스매치된 올리고뉴클레오타이드는 DNA 폴리머라아제에 의해 연장되어, 한 가닥의 서열로 요구되는 아미노산 치환을 포함하는 이중-가닥 DNA 분자를 생성한다. 그 후, 상기 이중-가닥 폴리뉴클레오타이드는 적절한 발현 벡터에 삽입될 수 있고, 이에 따라 돌연변이체 또는 변형된 폴리펩타이드를 생산할 수 있다. 상기 전술한 올리고뉴클레오타이드-지시 돌연변이 또는 부위-지시 돌연변이유발은 선택적으로, PCR을 통해 수행될 수 있다.
상기 아미노산 치환은 아르기닌, 알라닌, 아스파라긴, 아르파라긴 산, 시스테인, 글루타민, 글루타민 산, 글리신, 히스티딘, 이소류신, 류신, 라이신, 메티오닌, 페닐알라닌, 프롤린, 세린, 트레오닌, 트립토판, 티로신, 발린, 또는 비천연 아미노산을 포함할 수 있다. 예를 들어, 야생형 리노바이러스 B 3C 프로테아제로부터 3C 프로테아제 내에 R87은 알라닌, 아스파라긴, 아르파라긴 산, 시스테인, 글루타민, 글루타민 산, 글리신, 히스티딘, 이소류신, 류신, 라이신, 메티오닌, 페닐알라닌, 프롤린, 세린, 트레오닌, 트립토판, 티로신, 발린, 또는 비천연 아미노산으로 대체될 수 있다.
일부 구현예들에 있어서, 하나 이상의 아미노산 치환들은 하나 이상의 비-보존적 치환을 포함한다. 비-보존적 아미노산 치환은 상이한 화학적 성질 (예를 들어, 극성, 수소 결합 가능성, 산성, 염기성, 형태, 소수성, 방향족 특성 등)을 갖는 다른 아미노산으로 아미노산을 대체하는 것을 의미한다. 예들은 Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Trp 또는 Met와 같은 소수성, 비극성 아미노산을, Ser, Thr, Cys, Tyr, Asn 또는 Gln과 같은 친수성, 극성 아미노산, 또는 Asp 또는 Glu와 같은 산성의 음전하를 띈 아미노산, Lys, Arg 또는 His와 같은 염기성의 양전하를 띈 아미노산으로 대체하는 것을 포함한다. 비-보존적 치환의 다른 예들은 하기 표 1의 하기 그룹들 사이에서 아미노산을 치환하는 것을 포함한다.
[표 1] 아미노산 사이드 체인 특성
일부 구현예들에 있어서, 하나 이상의 아미노산 치환들은 프롤린을 포함한다. 본 기술분야에 공지된 것과 같이, 프롤린은 전형적으로 알파 나선 및 베타 시트를 포함하는 2차 구조 요소의 구조 파괴자(disrupter)로서 작용한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩되는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 1-19 아미노산 치환들과 같은 1-27 아미노산 치환, 예를 들어, 1-4 또는 1-3 아미노산 치환들과 같은, 1 또는 2 아미노산 치환들과 같은 1-10, 1-8, 1-6, 1-5 아미노산 치환들을 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 하나 이상의 아미노산 치환(들)은 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 상기 단백질 형태 및/또는 기능적 특성을 변경시키지 않는다. 그러나, 보다 전형적으로, 상기 하나 이상의 아미노산 치환(들)은 본원의 변형된 3C 프로테아제의 상기 형태 및/또는 기능적 특성을 변경시킨다. 전형적으로, 본원의 3C 프로테아제의 상기 형태 및 하나 이상의 기능적 특성은 대조군 3C 프로테아제의 것과 비교하여 변형된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 상기 하나 이상의 아미노산 치환(들)은 알파 나선, 베타 시트, 베타 가닥 또는 루프와 같은, 2차 구조를 변경시킨다. 2차 구조의 변경은 SPIDER2, Heffernan 등, "Highly Accurate Sequence-based Prediction of Half-Sphere Exposures of Amino Acid Residues in Proteins", Bioinformatics 2016, 32: 843- 849 및 PSIPRED Jones DT. "Protein secondary structure prediction based on position-specific scoring matrices", J. Mol. Biol., 9, 292: 195-202]을 포함하여 잘 알려진 단백질 2차 구조 예측 프로그램을 이용하여 결정될 수 있고, 그 전문은 본원에서 참조로서 포함된다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 번역된 아미노산 서열에서 하나 이상의 아미노산 치환들, 구체적으로 A1-B1 β 시트, A2-B2 β 시트 및/또는 F1 β 가닥 및 A2 β 가닥 사이의 루프, 또는 A1, A2, B1 및/또는 B2 β 가닥 중 하나 이상을 표적으로 하는 하나 이상의 점 돌연변이를 초래할 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열에 하나 이상의 점 돌연변이를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 A1-B1 시트들을 변경, 예를 들어, 파괴하는 상기 하나 이상의 아미노산 치환들은 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 하나 이상의 아미노산 위치들 16-25에 상응하는 위치(들)에 위치된다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 A1-B1 시트들을 변경, 예를 들어, 파괴하는 상기 하나 이상의 아미노산 치환들은 상기 A1 β 시트를 변경, 예를 들어, 파괴시킨다. 전형적으로, 상기 A1 β 시트를 변경, 예를 들어, 파괴하는 상기 하나 이상의 아미노산 치환들은 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 하나 이상의 아미노산 위치들 20-23에 상응하는 위치(들)에 위치된다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 A1-B1 시트들을 변경, 예를 들어, 파괴하는 상기 하나 이상의 아미노산 치환들은 상기 A1 β 가닥과 B1 β 가닥 사이의 루프를 변경, 예를 들어, 파괴시킨다. 전형적으로, 상기 A1 β 가닥과 B1 β 가닥 사이의 상기 루프를 변경, 예를 들어, 파괴하는 상기 하나 이상의 아미노산 치환들은 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 하나 이상의 아미노산 위치들 24 및 25에 상응하는 위치(들)에 위치된다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 F1 β 가닥과 상기 A2 β 가닥 사이의 상기 루프를 변경, 예를 들어, 파괴하는 하나 이상의 아미노산 치환들은 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 하나 이상의 아미노산 위치들 99 및 100에 상응하는 위치(들)에 위치된다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 A2-B2 β 시트를 변경, 예를 들어, 파괴하는 하나 이상의 아미노산 치환들은 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 하나 이상의 아미노산 위치들 115-130에 상응하는 위치(들)에 위치된다.
일부 구현예들에 있어서, 하나 이상의 아미노산 치환들은 상기 A2-B2 β 시트의 상기 B2 β 가닥을 변경, 예를 들어, 파괴한다. 일부 구현예들에 있어서, 상기 B2 β 가닥은 FMDV 3C 프로테아제와 같은 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 잔기 123 내지 128을 포함한다. 일부 구현예들에 있어서, 상기 A2-B2 β 시트의 상기 B2 β 가닥을 변경, 예를 들어, 파괴하는 하나 이상의 아미노산 치환들은 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 하나 이상의 잔기 123 내지 128에 상응하는 위치(들)에 위치된다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 하나 이상의 아미노산 치환들은 상기 B2' β 가닥을 분열시킨다. 상기 B2' β 가닥은 소 비염 A 바이러스, 소 비염 B 바이러스, 말 비염 A 바이러스 및 FMDV를 포함하는 상기 아프토바이러스 속 내에 종들에서 잔기 130 내지 133에 상응한다. 리노바이러스 A, 리노바이러스 B, 및 A 형 간염 바이러스를 포함하는 종들과 같은 일부 구현예들에 있어서, 상기 B2' β 가닥은 존재하지 않는다. 예를 들어, 상기 A2-B2 β 시트의 상기 B2' β 가닥은 잔기 103 내지 116 (리노바이러스 A) 및 잔기 100 내지 114 (리노바이러스 B)에 상응하고, FMDV 에서 잔기 117 내지 130에 상동성이다. A 형 간염 바이러스(Hepatitis A virus)로부터 3C 프로테아제와 같은, 일부 구현예들에 있어서, 상기 A2-B2 β 시트의 상기 B2 β 가닥은 잔기 121 내지 132에 상응하고, FMDV에서 잔기 120 내지 132에 상동성이다. 따라서, 일부 구현예들에 있어서, 상기 A2-B2 β 시트를 변경, 예를 들어, 파괴하는 하나 이상의 치환들은 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 아미노산 위치들 117 내지 130에 상응하는 위치(들)에 위치된다. 다른 구현예들에 있어서, 상기 A2-B2 β 시트를 변경 예를 들어, 파괴하는 하나 이상의 치환들은 아미노산 위치들 120 내지 130과 같은 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 하나 이상의 위치들 120 내지 132에 상응하는 위치(들)에 위치된다.
일부 구현예들에 있어서, A1-B1 시트와 같은, A2-B2 β 시트 및/또는 F1 β 가닥과 A2 β 가닥 사이의 루프와 같은 2차 구조의 변경, 예를 들어 파괴하는 대조군 3C 프로테아제의 것과 비교하여, 기능적 특성의 변화와 연관된다. 예를 들어, 일부 구현예들에 있어서, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 대조군 3C 프로테아제의 것과 비교하여, 숙주 세포에서 발현될 때, 감소된 독성 및/또는 P1 전구체 폴리펩타이드와 같은 폴리펩타이드의 형질전환 유전자 발현의 향상을 가능하게 한다. 일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 상기 단백질 분해 가공 능력은 대조군 3C 프로테아제의 것과 비교하여 감소된다.
피코르나바이러스 단백질 분해 가공 동안, 피코르나바이러스 RNA 게놈의 단일 개방 판독 프레임으로부터 번역될 수 있는, 단일 폴리펩타이드 전구체는 야생형 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 포함하는 바이러스 코딩된 프로테아제에 의해 기능적 단백질로 절단된다. 전형적으로, 절단은 도 2에 나타낸 것과 같이 상이한 단계들에서 일어나고, 구조 단백질 VP1, VP2, VP3 및 VP4 뿐만 아니라 비-구조 단백질 L, 2A, 2B, 2C, 3A, 3B1, 3B2, 3B3, 3C 및 3D를 형성하기 위해 추가 절단되는 P1, P2 및 P3을 포함하는 다중 중간체 폴리펩타이드 전구체들을 형성한다.
P1은 전형적으로 야생형 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의한 성숙 바이러스의 조립 동안 절단되어 VP0 VP1 및 VP3을 생성하고, 자기 조립되어 대략 구형의 단백질 쉘 (캡시드)을 형성한다. 전형적으로, VP2 및 VP4로의 VP0의 자기 촉매성 절단은 성숙한 바이러스를 생성하기 위한 상기 바이러스 게놈의 캡슐화 동안 발생한다. 상기 캡시드는, 일반적으로 바이러스가 세포 외부에 있는 동안 상기 게놈을 보호하는 역할을 하고, 또한 특정 세포-표면 수용체 (예: 특정 인테그린)와의 상호 작용을 통해 그것이 세포에 결합하고 그 후 세포로 진입하는 것을 허용한다. 상기 바이러스 캡시드는 VP1, VP2, VP3 및 VP4 각각의 수많은 복제, 예를 들어 60 개의 복제로 구성될 수 있다.
본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 단백질 분해 활성은 대조군 3C 프로테아제의 것보다 더 크거나 더 작을 수 있다. 일부 구현예들에 있어서, 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 상기 단백질 분해 활성은 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 상기 단백질 분해 활성의 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100%, 110%, 120%, 130%, 140%, 150% 또는 200%를 나타낸다. 상기 활성은 VP0, VP1 및 VP3 바이러스 단백질, 또는 일부 구현예들에 있어서, VP1, VP2, VP3 및 VP4를 생산하는 것과 같은, P1의 하나 이상의 절단을 수행하기 위한 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 상대적인 능력에 기초하여 결정될 수 있다, 일 비제한적 예에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프포테아제는, 가장 가까운 천연 대립 유전자와 같은, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 것과 비교하여, P1을 절단하는 능력이 적어도 90%를 나타낸다.
추가 구현예들에 있어서, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 또는 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 비교하여, 숙주 세포에서 발현되는 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체의 총량의 적어도 90%, 적어도 95%와 같이, 또는 적어도 99%와 같이, 또는 적어도 99.9%와 같이, 예를 들어, 99.9% 내지 100%와 같은 가공 능력을 가진다.
통상적이고 유리하게, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 본원에 기술된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체를 전체 가공하여, 개별적인 캡시드 단백질 VP1, VP2, VP3 및 VP4 또는 VP0, VP1 및 VP3로 절단하는 능력을 유지하고, 이어서 숙주 세포에서 상기 절단된 바이러스 캡시드 단백질을 빈 피코르나바이러스 캡시드로의 조립을 허용한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 본원에 기술된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 P1, P2 및 P3를 포함하는 단일 피코르나바이러스 폴리프로테인 번역 생성물의 총량의 적어도 90%를 가공하는 능력을 갖는다. 일부 구현예들에 있어서, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 본원에 기술된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 P2 (또는 2ABC), P3 (또는 3ABCD), P1 (또는 1ABCD), 1ABC, 2BC, 3AB, 및 3CD와 같은 피코르나바이러스 폴리펩타이드 전구체의 총량의 적어도 90%를 가공하기 위한 능력을 가진다 (도 1 참조). 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 본원에 기술된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 야생형 피코르나바이러스 단백질에서의 본래 부위 및/또는 피코르나바이러스 3C 절단 부위를 포함하기 위해 조작된 단백질과 같은, 비-피코르나바이러스 단백질들에서 동일하거나 또는 유사한 3C 절단 부위를 절단하거나 가공하기 위해 사용될 수 있다. 일부 구현예에 있어서, 상기 피코르나바이러스 폴리펩타이드 전구체들은 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체를 포함하지 않는다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 및/또는 본원에 기술된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 대조군 3C 프로테아제와 비교하여, 숙주 세포에서 상기 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 독성을 감소하거나 제거한다.
예를 들어, 숙주 세포의 성장률 또는 형질전환된 숙주 세포에서 코딩되고 발현된 적어도 하나의 단백질의 수율은 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 발현하는 숙주 세포의 성장률 또는 적어도 하나의 단백질 수율과 비교할 때, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩되는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제가 발현되고 및/또는 본원에 기술된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제가 숙주 세포에서 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 300% 또는 그 이상 증가될 것이다.
일부 구현예들에 있어서, 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 변형은 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 돌연변이 뉴클레오타이드 서열 및 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 적어도 포함하는 형질전환 유전자 발현 카세트 및/또는 재조합 발현 벡터의 발현 산물(output)을 증가시킬 수 있다, 일부 비제한적인 구현예들에 있어서, 상기 형질전환 유전자 발현 산물은, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열 및 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 형질전환 유전자 발현 카세트 및/또는 재조합 발현 카세트의 것과 비교하여, 20 배 이하, 2-20 배와 같은, 5-15 배와 같은, 10-15 배와 같은 양 만큼 증가한다. 숙주 세포가 이러한 형질전환 유전자 발현 카세트 및/또는 재조합 발현 벡터로 형질주입될 때, 형질전환 유전자 발현 생산량의 증가는 숙주 세포에서의 바이러스-유사 입자 (VLPs)의 생산 증가로 이어진다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 형질전환 유전자 발현 생산량(output)은, 상기 형질전환 유전자 발현 카세트에, 가우시아(Gaussia) 루시페라아제 유전자 (GLuc) 또는 비제한적으로 SGLuc를 포함하는 그의 변이체와 같은, 발광 리포터 유전자를 융합한 후 조도계 (luminometer)에서 0.5 초의 집적 시간을 이용하여 상대적인 발광 단위 (RLU)의 양을 측정함으로써 평가될 수 있다. 일부 비제한적인 구현예들에 있어서, 형질전환 유전자 발현 카세트를 포함하는 재조합 발현 벡터, 또는 적어도 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 돌연변이체 뉴클레오타이드 서열 및 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체를 코딩하는 뉴클레오타이드를 포함하는 재조합 발현 벡터는 숙주 세포에서 109-1010 RLU/0.5s, 전형적으로 2x109 내지 8x1010 RLU/0.5s, 보다 전형적으로 4x109 내지 3x1010 RLU/0.5s의 형질전환 유전자 발현 생산량을 갖는다.
다른 일부 구현예들에 있어서, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 발현하는 숙주 세포의 생존 가능한 능력 또는 계대(passage) 능력 (세대 대 세대에 걸쳐 형질전환 유전자를 안정하게 유지 및 발현하는 숙주 세포의 능력) 은 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 발현하는 다른 상동성 숙주 세포와 비교하여 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200% 또는 그 이상 증가할 수 있다.
본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩되는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 하나 이상의 숙주 단백질 표적 부위에서 하나 이상의 숙주 세포 단백질 또는 형질전환 유전자에 의해 코딩된 것과 같은 다른 공동-발현된 단백질에 대하여 대조군 피코르나바이러스 3C의 단백질 분해 활성의 100, 90, 80, 70, 60, 50, 40, 30, 20 또는 10% 미만을 나타내며, 피코르나바이러스 P1 전구체 단백질을 배제한 피코르나바이러스 P1 전구체 단백질 또는 피코르나바이러스 폴리펩타이드 전구체와 같은, 하나 이상의 피코르나바이러스 폴리펩타이드 전구체를 가공하는 현저한 능력을 유지한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 숙주 세포 단백질에 대한 단백질 분해 활성이 100, 90, 80, 70, 60, 50, 40,30, 20 또는 10% 미만, 또는 10% 이하와 같은 것을 나타내며, 상기 숙주 단백질은, 진핵생물 번역 개시 인자 4A1 (eIF4A1), 히스톤 H3, 핵 전사 인자 카파 B 필수 조절자 (NEMO), 유사 분열에서 68 kDa의 Src-연관 기질 (SAM68), 진핵생물 세포 번역 개시 인자 4G (eIF4G)를 비제한적으로 포함한다. 일부 구현예들에 있어서, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 존재는, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 발현하는 다른 상동성 숙주 세포와 비교하여, 숙주 세포에서 골지(Golgi) 단편화를 덜 나타내고 및 미세소관 시스템 집적의 손실을 감소시킨다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 다른 상동성의 변형되지 않은 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 즉 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제와 비교하여, eIF4A1 진핵 세포 개시 인자에 대한 단백질 분해 활성이 감소될 것이다. 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 것과 비교하여, eIF4A1의 진핵 개시 인자 0.001, 0.01, 0.1, 1, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 또는 95% 만을 분해시킬 것이다. 일부 구현예들에 있어서, 이러한 감소된 활성은 숙주 세포에서 발현된 eIF4A1의 총량을 기준으로 10% 이하, 예를 들어, 8% 이하, 예를 들어, 5% 이하, 예를 들어, 1% 이하, 및 0.001% 내지 1.0%이다.
본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 것과 비교하여, 히스톤 H3, 핵 전사 인자 카파 B 필수 조절자 (NEMO), 유사 분열에서 68 kDa의 Src-연관 기질 (SAM68) 및/또는 진핵생물 번역 개시 인자 4G (eIF4G)의 적어도 하나에 대한 활성 손실을 나타낼 것이다. 본원의 상기 변형된 3C 프로테아제는, 다른 상동성의 변형되지 않은 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 즉, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 것과 비교하여, 히스톤 H3, 핵 전사 인자 카파 B 필수 조절자 (NEMO), 유사 분열에서 68 kDa의 Src-연관 기질 (SAM68) 및/또는 진핵생물 번역 개시 인자 4G (eIF4G)의 적어도 하나의 0.001, 0.01, 0.1, 1, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 또는 95%만을 분해시킬 것이다. 추가 구현예들에 있어서, 숙주 세포의 골지(Golgi) 단편화 및 미세소관 시스템 집적의 손실을 유도하는 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 능력은, 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 것과 비교하여, 본원의 하나 이상의 돌연변이들에 의해 감소되거나 제거될 수 있다.
예시적 피코르나바이러스 변형된 3C 프로테아제
일부 구현예들에 있어서, 변형된 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제, 예를 들어, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 서열 번호 2 (A Turkey 2006), 서열 번호 4 (A24 Cruzeiro iso71), 서열 번호 6 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1), 및 서열 번호 8 (Asia 1 Shamir), 서열 번호 10 (C3 Indaial), 서열 번호 12 (O1 PanAsia), 서열 번호 14 [O1 Manisa 단리물(isolate) 87 균주, 혈청형 O], 서열 번호 16 (SAT1-20 iso11), 서열 번호 18 (SAT2 이집트 2010), 및 서열 번호 20 (SAT3 ZIM/6/91) 중에서 선택되는 야생형 FMDV 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 99% 상동성이다.
일부 구현예들에 있어서, 변형된 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제, 예를 들어, 변형된 소 비염(Bovine rhinitis) 3C 프로테아제와 같은, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 서열 번호 422 [소 비염 A (Bovine rhinitis A) Sd-1] 및 서열 번호 434 [소 비염 B (Bovine rhinitis B)] 중에서 선택된 야생형 소 비염(Bovine rhinitis) 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 99% 상동성이다.
일부 구현예들에 있어서, 변형된 아프토바이러스(Aphthovirus) 3C 프로테아제, 예를 들어, 변형된 말 비염 A (Equine rhinitis A) 3C 프로테아제와 같은, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 서열 번호 444의 야생형 말 비염 A (Equine rhinitis A) 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 99% 상동성이다.
일부 구현예들에 있어서, 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제와 같은 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 서열 번호 478의 상기 야생형 인간 콕사키바이러스 A10 3C 프로테아제 및 서열 번호 526의 상기 야생형 인간 엔테로바이러스 A71 3C 프로테아제 중에서 선택되는 야생형 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 99% 상동성이다.
일부 구현예들에 있어서, 엔테로바이러스 B 3C 프로테아제와 같은, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 서열 번호 494의 상기 야생형 인간 콕사키바이러스 B1 3C 프로테아제 및 서열 번호 510의 상기 인간 콕사키바이러스 B3 (인간 콕사키바이러스 B3 마코시) 중에서 선택되는 야생형 엔테로바이러스 B 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 99% 상동성이다.
일부 구현예들에 있어서, 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제와 같은, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 서열 번호 462의 상기 야생형 인간 콕사키바이러스 A1 3C 프로테아제(인간 콕사키바이러스 A1 Tompkins), 및 서열 번호 552 (인간 폴리오바이러스 2 균주 R93152), 서열 번호 565 (인간 폴리오바이러스 3 단리물 CHN5275/JX/CHN/2001) 및 서열 번호 580 (인간 폴리오바이러스 Mahoney) 중에서 선택되는 야생형 인간 폴리오바이러스 3C 프로테아제 중에서 선택되는 야생형 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 99% 상동성이다.
일부 구현예들에 있어서, 변형된 리노바이러스 A 3C 프로테아제와 같은, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 서열 번호 604 (인간 리노바이러스 A20, 균주 VR1130)의 야생형 인간 리노바이러스, 서열 번호 618 (인간 리노바이러스 A89, 균주 VR1199)의 야생형 인간 리노바이러스 및 서열 번호 620 (인간 리노바이러스 A2)의 야생형 인간 리노바이러스 A 3C 중에서 선택되는 야생형 리노바이러스 A 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 99% 상동성이다.
일부 구현예들에 있어서, 변형된 리노바이러스 B 3C 프로테아제와 같은, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 서열 번호 594 (인간 리노바이러스 B14)의 야생형 리노바이러스 B 3C 프로테아제와 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 99% 상동성이다.
일부 구현예들에 있어서, 변형된 헤파토바이러스(Hepatovirus) 3C 프로테아제와 같은, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 서열 번호 538 (A 형 인간 간염 바이러스)의 야생형 헤파토바이러스(Hepatovirus)와 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 99% 상동성이다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는, 서열 번호 22 (A Turkey 2006, D123P), 서열 번호 24 (A24 Cruzeiro iso71, D123P), 서열 번호 26 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1, D123P), 서열 번호 28 (Asia1 Shamir, D123P), 서열 번호 30 (C3 Indaial, D123P), 서열 번호 32 (O1 PanAsia, D123P), 서열 번호 34 (O1 Manisa 단리물 87 균주, 혈청형 O, D123P), 서열 번호 36 (SAT1-20 iso11, D123P), 서열 번호 38 (SAT2 Egypt 2010, D123P) 및 서열 번호 40 (SAT3 ZIM/6/91, D123P) 중에서 선택되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩되는 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 42 (A Turkey 2006, G125P), 서열 번호 44 (A24 Cruzeiro iso71, G125P) 서열 번호 46 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia1, G125P), 서열 번호 48 (Asia 1 Shamir, G125P), 서열 번호 50 (C3 Indaial, G125P), 서열 번호 52 (O1 PanAsia, G125P), 서열 번호 54 (O1 Manisa 단리물 87 균주, 혈청형 O, G125P), 서열 번호 56 (SAT1-20 iso11, G125P), 서열 번호 58 (SAT2 Egypt 2010, G125P) 및 서열 번호 60 (SAT3 ZIM/6/91, G125P) 중에서 선택되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 62 (A Turkey 2006, I128P), 서열 번호 64 (A24 Cruzeiro iso71, I128P), 서열 번호 66 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1, G125P), 서열 번호 68 (Asia1 Shamir, I128P), 서열 번호 70 (C3 Indaial, I128P) 서열 번호 72 (O1 PanAsia, G125P), 서열 번호 74 (O1 Manisa 단리물 87 균주, 혈청형 O, I128P), 서열 번호 76 (SAT1-20 iso11, I128P), 서열 번호 78 (SAT2 Egypt 2010, I128P) 및 서열 번호 80 (SAT3 ZIM/6/91, I128P) 중에서 선택되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 82 (A Turkey 2006, I22P), 서열 번호 84 (A24 Cruzeiro iso71, I22P), 서열 번호 86 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1, I22P), 서열 번호 88 (Asia 1 Shamir, I22P), 서열 번호 90 (C3 Indaial, I22P), 서열 번호 92 (O1 PanAsia, I22P), 서열 번호 94 (O1 Manisa 단리물 87 균주, 혈청형 O, I22P), 서열 번호 96 (SAT1-20 iso11, I22P), 서열 번호 98 (SAT2 Egypt 2010, I22P), 및 서열 번호 100 (SAT3 ZIM/6/91, I22P) 중에서 선택되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 102 (A Turkey 2006, I99P), 서열 번호 104 (A24 Cruzeiro iso71, I99P), 서열 번호 106 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1, I99P), 서열 번호 108 (Asia1 Shamir, I99P), 서열 번호 110 (C3 Indaial, I99P), 서열 번호 112 (O1 PanAsia, I99P), 서열 번호 114 (O1 Manisa 단리물 87 균주, 혈청형 O, I99P), 서열 번호 116 (SAT2 Egypt 2010, I99P), 서열 번호 178 (SAT1-20 iso11, I99P) 및 서열 번호 180 (SAT3 ZIM/6/91, I99P) 중에서 선택되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 138 (A Turkey 2006, L23P), 서열 번호 140 (A24 Cruzeiro iso71, L23P), 서열 번호 142 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1, L23P), 서열 번호 144 (Asia1 Shamir, L23P), 서열 번호 146 (C3 Indaial, L23P), 서열 번호 148 (O1 PanAsia, L23P), 서열 번호 150 (O1 Manisa 단리물 87 균주, 혈청형 O, L23P), 서열 번호 152 (SAT1-20 iso11, L23P), 서열 번호 154 (SAT2 Egypt 2010, L23P) 및 서열 번호 156 (SAT3 ZIM/6/91, L23P) 중에서 선택되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 182 (A Turkey 2006, R126P), 서열 번호 184 (A24 Cruzeiro iso71, R126P), 서열 번호 186 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1, R126P), 서열 번호 188 (Asia1 Shamir, R126P), 서열 번호 190 (C3 Indaial, R126P), 서열 번호 192 (O1 PanAsia, R126P), 서열 번호 194 (O1 Manisa 단리물 87 균주, 혈청형 O, R126P), 서열 번호 196 (SAT1-20 iso11, R126P), 서열 번호 198 (SAT2 Egypt 2010, R126P), 및 서열 번호 200 (SAT3 ZIM/6/91, R126P) 중에서 선택되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 202 (A Turkey 2006, T100P), 서열 번호 204 (A24 Cruzeiro iso71, T100P), 서열 번호 206 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1, T100P), 서열 번호 208 (Asia1 Shamir, T100P), 서열 번호 210 (C3 Indaial, T100P), 서열 번호 212 (O1 PanAsia, T100P), 서열 번호 214 (O1 Manisa 단리물 87 균주, O 형 혈청형 T100P), 서열 번호 216 (SAT1-20 iso11, T100P), 서열 번호 218 (SAT2 Egypt 2010, T100P), 및 서열 번호 220 (SAT3 ZIM/6/91, T100P) 중에서 선택되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 222 (A Turkey 2006, V124P), 서열 번호 224 (A24 Cruzeiro iso71, V124P), 서열 번호 226 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1, V124P), 서열 번호 228 (Asia1 Shamir, V124P), 서열 번호 230 (C3 Indaial, V124P), 서열 번호 232 (O1 PanAsia, V124P), 서열 번호 234 (O1 Manisa 단리물 87 균주, 혈청형 O, V124P), 서열 번호 236 (SAT1-20 iso11, V124P), 서열 번호 238 (SAT2 Egypt 2010, V124P), 및 서열 번호 240 (SAT3 ZIM/6/91, V124P) 중에서 선택되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 242 (A Turkey 2006, I22P/L127P), 서열 번호 244 (A24 Cruzeiro iso71, I22P/L127P), 서열 번호 246 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1, I22P/L127P), 서열 번호 248 (Asia1 Shamir, I22P/L127P) 서열 번호 250 (C3 Indaial, I22P/L127P), 서열 번호 252 (O1 PanAsia, I22P/L127P), 서열 번호 254 (O1 Manisa 단리물 87 균주, 혈청형 O, I22P/L127P), 서열 번호 256 (SAT1-20 iso11, I22P/L127P), 서열 번호 258 (SAT2 Egypt 2010, I22P/L127P) 및 서열 번호 260 (SAT3 ZIM/6/91, I22P/L127P) 중에서 선택되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 262 (A Turkey 2006, T100P/L127P), 서열 번호 264 (A24 Cruzeiro iso71, T100P/L127P), 서열 번호 266 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1, T100P/L127P), 서열 번호 268 (Asia1 Shamir, T100P/L127P), 서열 번호 270 (C3 Indaial, T100P/L127P), 서열 번호 272 (O1 PanAsia, T100P/L127P), 서열 번호 274 (O1 Manisa 단리물 87 균주, O 형 혈청형, T100P/L127P), 서열 번호 276 (SAT1-20 iso11, T100P/L127P), 서열 번호 278 (SAT2 Egypt 2010, T100P/L127P), 및 서열 번호 280 (SAT3 ZIM/6/91, T100P/L127P) 중에서 선택되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 302 (A Turkey 2006, V124P/L127P), 서열 번호 304 (A24 Cruzeiro iso71, V124P/L127P), 서열 번호 306 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1, V124P/L127P), 서열 번호 308 (Asia1 Shamir, V124P/L127P), 서열 번호 310 (C3 Indaial, V124P/L127P), 서열 번호 312 (O1 PanAsia, V124P/L127P), 서열 번호 314 (O1 Manisa 단리물 87 균주, 혈청형 O, V124P/L127P), 서열 번호 316 (SAT1-20 iso11, V124P/L127P), 서열 번호 318 (SAT2 Egypt 2010, V124P/L127P) 및 서열 번호 320 (SAT3 ZIM/6/91, V124P/L127P) 중에서 선택되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 322 (A Turkey 2006, I22P/T100P/L127P), 서열 번호 324 (A24 Cruzeiro iso71, I22P/T100P/L127P), 서열 번호 326 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1, I22P/T100P/L127P), 서열 328 (Asia1 Shamir, I22P/T100P/L127P), 서열 번호 330 (C3 Indaial, I22P/T100P/L127P), 서열 번호 332 (O1 PanAsia, I22P/T100P/L127P), 서열 번호 334 (O1 Manisa 단리물 87 균주, 혈청형 O, I22P/T100P/L127P) 서열 번호 336 (SAT1-20 iso11, I22P/T100P/L127P), 서열 번호 338 (SAT2 Egypt 2010, I22P/T100P/L127P), 및 서열 번호 340 (SAT3 ZIM/6/91, I22P/T100P/L127P) 중에서 선택되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 342 (A Turkey 2006, I22P/T100P/V124P), 서열 344 (A24 Cruzeiro iso71, I22P/T100P/V124P), 서열 번호 346 (Asia Lebanon 89, 혈청형 Asia 1, I22P/T100P/V124P), 서열 번호 348 (Asia1 Shamir, I22P/T100P/V124P), 서열 번호 350 (C3 Indaial, I22P/T100P/V124P), 서열 번호 352 (O1 PanAsia, I22P/T100P/V124P), 서열 번호 354 (O1 Manisa 단리물 87 균주, 혈청형 O, I22P/T100P/V124P), 서열 번호 356 (SAT1-20 iso11, I22P/T100P/V124P), 서열 번호 358 (SAT2 Egypt 2010, I22P/T100P/V124P), 및 서열 번호 360 (SAT3 ZIM/6/91, I22P/T100P/V124P) 중에서 선택되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 412 [소 비염 A (Bovine rhinitis A) Sd-1, C23P], 서열 번호 414 (소 비염 A Sd-1, F120P), 서열 번호 416 (소 비염 A Sd-1, L123P), 서열 번호 418 (소 비염 A Sd-1, T96P), 서열 번호 420 (소 비염 A Sd-1, V22P), 서열 번호 424 (소 비염 B, L124P), 서열 번호 426 (소 비염 B, R23P), 서열 번호 428 (소 비염 B, T97P), 서열 번호 430 (소 비염 B, V121), 및 서열 번호 432 (소 비염 B, V22P) 중에서 선택되는 변형된 소 비염 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 436 (말 비염 A, A125P), 서열 번호 438 (말 비염 A, C23P), 서열 번호 440 (말 비염 A, T127P), 서열 번호 442 (말 비염 A, V100P) 및 서열 번호 446 (말 비염 A, Y22P) 중에서 선택되는 변형된 말 비염 A 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 464 [인간 콕사키바이러스 A10 코왈릭, L102P], 서열 번호 466 (인간 콕사키바이러스 A10 코왈릭, M109P), 서열 번호 468 (인간 콕사키바이러스 A10 코왈릭, N105P), 서열 번호 470 (인간 콕사키바이러스 A10 코왈릭, Q19P), 서열 번호 472 (인간 콕사키바이러스 A10 코왈릭, T106P), 서열 번호 474 (인간 콕사키바이러스 A10 코왈릭, T20P), 서열 번호 476 (인간 콕사키바이러스 A10 코왈릭, T87P), 서열 번호 512 (인간 엔테로바이러스 A71 균주 C4, I104P), 서열 번호 514 (인간 엔테로바이러스 A71 균주 C4, M109P), 서열 번호 516 (인간 엔테로바이러스 A71 균주 C4, N105P), 서열 번호 518 (인간 엔테로바이러스 A71 균주 C4, Q19P), 서열 번호 520 (인간 엔테로바이러스 A71 균주 C4, T106P), 서열 번호 522 (인간 엔테로바이러스 A71 균주 C4, T20P), 및 서열 번호 524 (인간 엔테로바이러스 A71 균주 C4, T87P) 중에서 선택되는 변형된 엔테로바이러스 A 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 480 [인간 콕사키바이러스(coxsackievirus) B1, F109P], 서열 번호 482 (인간 콕사키바이러스 B1, K19P), 서열 번호 484 (인간 콕사키바이러스 B1, L102P), 서열 번호 486 (인간 콕사키바이러스 B1, N105P), 서열 번호 488 (인간 콕사키바이러스 B1, R87P), 서열 번호 490 (인간 콕사키바이러스 B1, T106P), 서열 번호 492 (인간 콕사키바이러스 B1, T20P), 서열 번호 496 (인간 콕사키바이러스 B3 Macocy, F109P), 서열 번호 498 (인간 콕사키바이러스 B3 Macocy, K19P), 서열 번호 500 (인간 콕사키바이러스 B3 Macocy, L102P), 서열 번호 502 (인간 콕사키바이러스 B3 Macocy, N105P), 서열 번호 504 (인간 콕사키바이러스 B3 Macocy, R87P), 서열 번호 506 (인간 콕사키바이러스 B3 Macocy, T106P) 및 서열 번호 508 (인간 콕사키바이러스 B3 Macocy, T20P) 중에서 선택되는 변형된 엔테로바이러스 B 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 448 [인간 콕사키바이러스(coxsackievirus) A1 Tompkins, F109P], 서열 번호 450 (인간 콕사키바이러스 A1 Tompkins, L102P), 서열 번호 452 (인간 콕사키바이러스 A1 Tompkins, N105P), 서열 번호 454 (인간 콕사키바이러스 A1 Tompkins, R87P), 서열 번호 456 (인간 콕사키바이러스 A1 Tompkins, T106P), 서열 번호 458 (인간 콕사키바이러스 A1 Tompkins, T19P), 서열 번호 460 (인간 콕사키바이러스 A1 Tompkins, T20P), 서열 번호 540 (인간 폴리오바이러스 2 균주 R93152, I103P) 서열 번호 542 (인간 폴리오바이러스 2 균주 R93152, L102P), 서열 번호 544 (인간 폴리오바이러스 2 균주 R93152, R87P), 서열 번호 546 (인간 폴리오바이러스 2 균주 R93152, T19P), 서열 번호 548 (인간 폴리오바이러스 2 균주 R93152, T20P), 서열 번호 550 (인간 폴리오바이러스 2 균주 R93152, V104P), 서열 번호 554 (인간 폴리오바이러스 3 단리물 CHN5275/JX/CHN/2001, I103P), 서열 번호 556 (인간 폴리오바이러스 3 단리물 CHN5275/JX/CHN/2001, L102P), 서열 번호 558 (인간 폴리오바이러스 3 단리물 CHN5275/JX CHN5275/JX/CHN/2001, R87P), 서열 번호 560 (인간 폴리오바이러스 3 단리물 CHN5275/JX/CHN/2001, T19P), 서열 번호 562 (인간 폴리오바이러스 3 단리물 CHN5275/JX/CHN/2001, T20P) 서열 번호 564 (인간 폴리오바이러스 3 단리물 CHN5275/JX/CHN/2001, V104P), 서열 번호 568 (인간 폴리오바이러스 Mahony, I103P), 서열 번호 570 (인간 폴리오바이러스 Mahony, L102P), 서열 번호 572 (인간 폴리오바이러스 Mahoney, T10P), 서열 번호 574 (인간 폴리오바이러스 Mahony,T19P), 서열 번호 576 (인간 폴리오바이러스 Mahoney, T20P), 및 서열 번호 578 (인간 폴리오바이러스 Mahoney, V104P) 중에서 선택되는 변형된 엔테로바이러스 C 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 596 (인간 리노바이러스 A20, 균주 VR1130, K88P), 서열 번호 598 (인간 리노바이러스 A20, 균주 VR1130, R87P), 서열 번호 600 (인간 리노바이러스 A20, 균주 VR1130, T19P), 서열 번호 602 (인간 리노바이러스 A20, 균주 VR1130, T20P), 서열 번호 606 (인간 리노바이러스 A89, 균주 VR1199, I114P), 서열 번호 608 (인간 리노바이러스 A89, 균주 VR1199, K88P), 서열 번호 610 (인간 리노바이러스 A89, 균주 VR1199, R87P), 서열 번호 612 (인간 리노바이러스 A89, 균주 VR1199, T112P), 서열 번호 614 (인간 리노바이러스 A89, 균주 VR1199, T19P), 서열 번호 616 (인간 리노바이러스 A89, 균주 VR1199, T20P), 서열 번호 622 (인간 리노바이러스 A2, I114P), 서열 번호 624 (인간 리노바이러스 A2, Q108P), 서열 626 (인간 리노바이러스 A2, R87P), 서열 628 (인간 리노바이러스 A2, R88P), 서열 번호 630 (인간 리노바이러스 A2, T112P), 서열 번호 632 (인간 리노바이러스 A2, T19P), 및 서열 번호 634 (인간 리노바이러스 A2, T20P) 중에서 선택되는 변형된 리노바이러스 A 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 582 (인간 리노바이러스 B14, E114P), 서열 번호 584 (인간 리노바이러스 B14, G88P), 서열 번호 586 (인간 리노바이러스 B14, I112P), 서열 번호 588 (인간 리노바이러스 B14, R87P), 서열 번호 590 (인간 리노바이러스 B14, T19P) 및 서열 번호 592 (인간 리노바이러스 B14, T20P) 중에서 선택되는 변형된 리노바이러스 B 3C 프로테아제를 포함한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 단리된 폴리뉴클레오타이드 및 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의해 코딩된 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제는 서열 번호 654 (인간 A 형 간염 바이러스, V18P), 서열 번호 652 (인간 A 형 간염 바이러스, G17P), 서열 번호 528 (인간 A 형 간염 바이러스, E20P), 서열 번호 530 (인간 A 형 간염 바이러스, G19P), 서열 번호 532 (인간 A 형 간염 A 바이러스, I130P), 서열 번호 534 (인간 A 형 간염 바이러스, M128P), 및 서열 번호 536 (인간 A 형 간염 바이러스, T100P) 중에서 선택되는 변형된 헤파토바이러스 3C 프로테아제를 포함한다.
추가 변형, 단서
본원에 기술된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 폴리뉴클레오타이드 및/또는 본원에 기술된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 추가 변형을 할 수 있다. 예를 들어, 숙주 세포의 형질전환 전에, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 폴리뉴클레오타이드 서열의 코돈 빈도(frequency)는 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 핵산의 발현 또는 안정성의 최적화를 위해 변형될 수 있다. 코돈 사용(usage)을 최적화하는 데 적합한 소프트웨어는 알려져 있고, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 핵산의 코돈 사용(usage)을 최적화하는 데 사용될 수 있다 (genomes._urv.cat/OPTIMIZER/ 에서 이용가능한 Optimizer 참조, 2016.02.05 마지막으로 엑세스됨). 다양한 유기체들에 대한 코돈 사용 빈도는 알려져 있고 at www._kazusa.or.jp/codon/ (2016.02.05 마지막으로 엑세스됨)의 코돈 사용 데이터베이스가 참조로서 또한 본원에 포함된다.
모든 아미노산 코돈이 퇴화(degenerate)되어 있는 것은 아니며, 예를 들어, 대부분의 생물체의 유전 코드에서, Met와 Trp는 단일 코돈으로 코딩된다. 그러나, 퇴화성 코돈의 경우, 코돈 사용의 빈도 또는 평균 빈도는 0% (공통 퇴화 코돈 없음) 내지 100% (숙주 세포 게놈과 동일한 코돈 사용 빈도)의 범위로 선택될 수 있다. 상기 범위는 0%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% 및 100%를 포함하는 모든 중간 값을 포함한다. 유사하게, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 핵산의 G+C 함량은, 더 많거나 적은 G 또는 C 뉴클레오타이드를 갖는 퇴화 코돈의 선택에 의해 상기 숙주 세포의 것과 매치되거나, 더 가깝게 이동되거나, 더 멀리 이동될 수 있다. 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 외인성 핵산의 G+C 함량은 숙주 세포의 평균 G+C 함량보다 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50% 초과 또는 미만의 범위일 수 있다.
대안적으로, 코돈 사용은 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 발현을 조절 또는 제어하고/하거나 숙주 세포의 생존력, 성장 또는 견고성에 요구되는 숙주 세포 단백질의 상기 발현을 약화시키기 위해 변형될 수 있다. 예를 들어, Kew 등의 미국 특허 제8,846,051호가 그 전문이 본원에서 참조로서 포함된다. 일부 구현예들에 있어서, 숙주 세포에 의한 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 발현은 최대 발현률과 비교하여(예: 코돈 빈도가 숙주 세포와 매치되는 경우) 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 95% 또는 그 이상에 의해 제한되거나 감소될 수 있다.
특정 구현들에 있어서, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제의 위치 126 (R126)의 아르기닌 잔기는 치환되지 않는 것이 바람직하다. 비제한적 예로서, 본원에서 제공된 변형된 FMDV 3C 프로테아제는, 아스파르트 산 및 글루탐산과 같은 산성 아미노산에 의한 R126의 치환을 포함하지 않는다. 더욱 특별하게, 상기 변형된 FMDV 3C 프로테아제는 R126의 글루탐산에 의한 치환(즉, R126E)을 포함하지 않는다.
특정 구현들에 있어서, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩되는 변형된 피코르나바이러스의 변형된 FMDV 3C 프로테아제의 위치 42 (L42)의 류신 잔기는 히스티딘으로 치환되는 것이 바람직하다. 상기 변형된 FMDV 3C 프로테아제는 본원에 기술된 임의의 혈청형으로부터 유도되거나 수득될 수 있다. 위치 42에 히스티딘을 도입한, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩되는 예시적인 변형된 FMDV 3C 프로테아제는, 서열 번호 158, 160, 162, 164, 166, 168, 170, 172, 174 및 176에 의해 기재되어 있다. 서열 번호 158, 160, 162, 164, 166, 168, 170, 172, 174 및 176은 각각 서열 번호 157, 159, 161, 163, 165, 167, 169, 171, 173 및 175에 의해 코딩된다.
특정 구현들에 있어서, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩되는 변형된 FMDV 3C 프로테아제에서 위치 34의 트레오닌 잔기는 알라닌으로 치환되고, 위치 88의 메티오닌은 류신으로 치환되는 것이 바람직하다. 상기 변형된 FMDV 3C 프로테아제는 본원에 기술된 임의의 혈청형으로부터 유도되거나 수득될 수 있다. 각각 위치 34 및 88에서 알라닌 및 류신을 각각 포함하는, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩되는 예시적인 변형된 FMDV 3C 프로테아제는 서열 번호 282, 284, 286, 288, 290, 292, 294, 296, 298 및 300으로 기재되고, 이것들은 서열 번호 281, 283, 285, 287, 289, 291, 293, 295, 297 및 299로 각각 코딩된다.
형질전환 유전자 발현 카세트
본원의 다른 측면은 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 단리된 폴리뉴클레오타이드에 관한 것이다. 일부 구현예들에 있어서, 상기 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드는 형질전환 유전자 발현 카세트이다. 일부 구현예들에 있어서, 상기 형질전환 유전자 발현 카세트는 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 추가 포함한다. 일부 구현예들에 있어서, 상기 P1 폴리펩타이드 전구체를 코딩하는 상기 뉴클레오타이드 서열은 A, O, C, Asia 1, SAT1, SAT2 및 SAT3 혈청형, 및 이들 7 가지 혈청형의 아형, 지역형 및 균주들 또는 다른 피코르나바이러스 단리물 또는 변이체의 임의의 것으로 수득될 수 있거나, 유래될 수 있다.
일부 구현예들에 있어서, FMDV P1 폴리펩타이드 전구체와 같은, 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열은 서열 번호 362 (A Turkey 2006, 야생형), 서열 번호 365 (서열 번호 A24 Cruzeiro iso71, 야생형), 서열 번호 368 (Asia1 Shamir, 야생형), 서열 번호 371 (C3 Indaial, 야생형), 서열 번호 374 (O1 Manisa 단리물 87 균주, 혈청형 O, 야생형), 서열 번호 377 (O1 PanAsia, 야생형), 서열 번호 380 (SAT1-20 iso11, 야생형), 및 서열 번호 383 (SAT2 Egypt 2010, 야생형), 서열 번호 386 (SAT3 ZIM/6/91, 야생형) 중에서부터 선택된다.
상기 바로 위의 뉴클레오타이드 서열에 의해 코딩된 상기 P1 폴리펩타이드의 상기 아미노산 서열들은 각각, 서열 번호 363, 366, 369, 372, 375, 378, 381, 384 및 387에 의해 기재된 것을 포함한다. P1 폴리펩타이드는, 예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 또는 그 이상의 아미노산 잔기들의 결실, 치환 또는 삽입에 의해 변형되며, 단, 상기 P1 폴리펩타이드는 동물의 면역계 (예를 들어, FMDV 포유동물 숙주)에 의해 인식된, 체액성 및 세포성 에피토프 모두를 포함하여, 하나 이상의 에피토프를 유지하거나 포함한다. 천연 P1 폴리펩타이드는 적어도 62%-100% 동족성(homologous)이다. 일부 구현예들에 있어서, 본원에 따른 P1 폴리펩타이드는, FMDV 캡시드와 같은, 피코르나바이러스 캡시드로 가공 및 조립될 수 있는 것으로 기재된다. P1 폴리펩타이드는 본원에 기술된 임의의 상기 P1 폴리펩타이드 또는 다른 공지의 알려진 P1 폴리펩타이드와 60, 70, 80, 90, 95, 96, 97, 98, 99 또는 100% (또는 임의의 중간 값) 상동성 또는 유사성을 갖는 것으로서 구조적으로 기술될 수 있다.
다른 구현예들에 있어서, FMDV P1 폴리펩타이드 전구체와 같은, 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체를 코딩하는 상기 폴리뉴클레오타이드 서열은 내부 제한 부위들을 제거하기 위해 변형된다. 이러한 FMDV P1 폴리펩타이드 전구체는 서열 번호 361 (A Turkey 2006, 제한 부위 제거됨), 서열 번호 364 (A24 Cruzeiro iso71, 제한 부위 제거됨), 서열 번호 367 (Asia1 Shamir, 제한 부위 제거됨), 서열 번호 370 (C3 Indaial, 제한 부위들이 제거됨), 서열 번호 373 (O1 Manisa 단리물 87 균주, 혈청형 O), 서열 번호 376 (O1 PanAsia, 제한 부위들이 제거됨), 서열 번호 379 (SAT1-20 iso11, 제한 부위들이 제거됨), 서열 번호 381 (SAT2 Egypt 2010, 제한 부위 제거됨), 및 서열 번호 385 (SAT3 ZIM/6/91, 제한 부위들이 제거됨) 중에서 선택될 수 있다.
본원의 다른 구현예에 있어서, 본원에 기술된 돌연변이 전략 및 기술들은 상기 P1 전구체를 코딩하는 상기 뉴클레오타이드 서열에 하나 이상의 돌연변이들을 도입하여, 최종 조립된 캡시드 생성물의 안정성을 향상하기 위해 적용될 수 있다. 도입될 수 있는 상기 돌연변이들 중, 논센스 돌연변이들을 포함할 수 있으며, 상기 논센스 돌연변이들은 임의의 아미노산 치환을 야기하지 않음으로써 복제 및 서브-클로닝을 용이하지만 동일한 변역된 단백질 생산물을 유지하도록 제한 효소 인식 부위를 효과적으로 제거한다. 상기 돌연변이들은 개별적인 발병의 필요에 즉시 응답하기 위해, 예를 들어, FMDV 혈청형과 상이한 다른 P1 폴리펩타이드 전구체들을 교환하기 위한 형질전환 유전자 발현 카세트에 상기 P1 폴리펩타이드 전구체의 클로닝-in 및 클로닝-out을 향상시킨다.
추가 구현예에 있어서, 본원의 상기 형질전환 유전자 발현 카세트는 발현 벡터에 복제하기 위한 상기 발현 카세트의 N-말단 및 C-말단의 각각에서 제한 효소 인식 부위 또는 서열들을 추가 포함한다. 이러한 제한 효소 인식 부위의 예로는 EcoRI, EcoRII, BamHI, HindIII, TaqI, NotI, HinFI, Sau3AI, PvuII, SmaI, NheI, HaeIII, HgaI, AluI, EcoRV, KpnI, PstI, SacI, SpeI, StuI, SphI, XbaI, SalI, ScaI, XcmI, BsiWI, XhoI, BstEII, PflMI, AccI, SacII, PpuMI, AgeI, NcoI, BstXI, MluI 및 AatI에 대한 인식 서열들을 포함하나, 이에 제한되는 것은 아니다. 이러한 형질전환 유전자 구조체는 벡터 또는 폴리뉴클레오타이드 구조체에 복제될 수 있고 숙주 세포에 형질주입 될 수 있다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 구현예들에 따른 상기 형질전환 유전자 발현 카세트는, 완전한 피코르나바이러스 게놈을 코딩하지 않아 상기 형질전환 유전자 발현 카세트를 포함하는 백신의 제조 또는 투여 동안 우연적인 발병, 예를 들어, 구제역 바이러스 발생이 일어날 수 없다.
또한, 전형적으로, 상기 형질전환 유전자 발현 카세트는, 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 예를 들어, FMDV 비-구조 단백질인 하나의 피코르나바이러스 비-구조 단백질만을 코딩한다. 전형적으로, 상기 형질전환 유전자 발현 카세트를 포함하는 백신으로 치료된 동물들은 자연적 피코르나바이러스 감염 동안 발현되는 엔테로바이러스(Enterovirus)와 같은, 다른 피코르나바이러스, 비-구조 단백질에 대한 항체들을 생성하지 않을 것이다. 예를 들어, 상기 형질전환 유전자 발현 카세트가 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 돌연변이 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 경우, 상기 변형된 FMDV 3C 프로테아제에 대한 항체만을 생성하고, 2B, 2C, 3B, 3D 등과 같은 다른 비-구조 단백질들에 대한 항체를 생성하지 않는다 (도 1 참조). 상기 형질전환 유전자 발현 카세트에 의한 백신 접종과 비교하여, 자연적 감염 후에 생성된 항체 프로파일의 차이는, 백신 접종된 동물들로부터 감염된 동물의 구별과 그 반대의 경우를 구별하는 능력을 부여한다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 따른 상기 형질전환 유전자 발현 카세트는 단일 개방 판독 프레임으로서 구축된다. 상기 P1 폴리펩타이드 전구체를 코딩하는 상기 뉴클레오타이드 서열은, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같이, 변형된 피코르나바이러스를 코딩하는 상기 뉴클레오타이드 서열에 대하여 5' 또는 3'에 위치될 수 있다.
특정 구현예들에 있어서, 상기 형질전환 유전자 발현 카세트는 P1 폴리펩타이드 전구체를 코딩하는 상기 뉴클레오타이드 서열과, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 상기 돌연변이 뉴클레오타이드 서열 사이에 위치된 변역 조절 요소를 추가 포함하여, 단일 개방 판독 프레임에서 상기 두 개의 단백질의 개별, 동일 몰량의 동등한 발현을 유익하게 가능하게 한다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 번역 조절 요소는 5 개 내지 50 개 아미노산 잔기 길이, 전형적으로 15 개 내지 40 개 잔기들, 더 전형적으로 25 개 내지 35 개 잔기들의 번역 인터럽터 서열이다. 추가 구현예들에 있어서, 상기 번역 인터럽터 서열은 하나 이상의 번형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제(들) 비-구조 단백질 (예: 1A, 1B, 1C, 1D, 2A, 2B, 2C, 3A, 3B, 3C, 3D)의 일부를 포함할 수 있다. 일부 구현예들에 있어서, 상기 번역 인터럽터 서열은 상기 18-아미노산 FMDV 2A 단백질에 상기 1D FMDV 단백질의 C-말단의 11-아미노산 서열을 도입하고 FMDV 2A 단백질의 C-말단에 프롤린 잔기를 도입함으로써 형성된다.
일부 구현예들에 있어서, 상기 형질전환 유전자 발현 카세트는 Kozak 컨센서스 서열과 같은, 진핵생물에서 번역의 개시를 위한 뉴클레오타이드 서열을 추가 포함한다. 일부 구현예들에 있어서, 상기 P1 폴리뉴클레오타이드 전구체를 코딩하는 상기 뉴클레오타이드 서열은, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 돌연변이 뉴클레오타이드 서열에 대하여 5'에 위치되고, 상기 진핵생물 번역 개시 서열은 상기 P1 폴리펩타이드 전구체를 코딩하는 상기 뉴클레오타이드 서열에 대하여 업스트림(upstream) 또는 5'에 위치된다. 대안적인 구현예에 있어서, 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 상기 돌연변이 뉴클레오타이드 서열은 상기 P1 폴리펩타이드 전구체를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열에 대하여 5'에 위치되고, 상기 진핵 생물 번역 개시 서열은 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 돌연변이 뉴클레오타이드 서열에 대하여 업스트림 또는 5'에 위치된다.
추가 구현예들에 있어서, 상기 형질전환 유전자 발현 카세트는 프로모터를 포함한다. 특정 구현예들에 있어서 상기 진핵생물 번역 개시 서열과 같이, 상기 프로모터는, 상기 P1 폴리펩타이드 전구체 및 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은 변형된 피코르나바이러스 3C를 코딩하는 두 개의 뉴클레오타이드 서열의 정렬에 의존하여, 상기 P1 폴리펩타이드 전구체를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열 또는 돌연변이 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 상기 돌연변이체 뉴클레오타이드에 대하여, 업스트림 또는 5'에 위치된다. 특정 구현예들에 있어서, SV40, CMV, UBC, EF1A, PGK 및 CAG를 비제한적으로 포함하는 강하고 구조적인(constitutive) 프로모터는 강한 면역 응답을 유도하기 위해 포유동물 숙주에서 형질전환 유전자 발현의 연장된 높은 수준을 위하여 본원의 상기 형질전환 유전자 발현 카세트가 유리하게 도입될 수 있다. 정지 코돈 서열 (예: TAA, TGA 및 TAG)은 mRNA 번역의 중단을 확실히 하기 위해 본원의 상기 형질전환 유전자 발현 카세트의 말단에 선택적으로 첨가될 수 있다.
벡터(Vectors)
본원의 다른 측면은 본원에 기술된 상기 형질전환 유전자 발현 카세트를 포함하는 벡터들에 관한 것이다. 전형적으로, 상기 형질전환 유전자 발현 카세트는 포유동물 발현 벡터 시스템에 복제될 수 있다. 일부 구현예들에 있어서, 상기 형질전환 유전자 발현 카세트는 pSNAP 벡터 (New England Biolabs)에 복제될 수 있다. 본원의 상기 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 pSNAP 벡터들의 예들은 서열 번호 406 내지 408 및 410에서 기재된다. 추가 구현예들에 있어서, 상기 pSNAP 벡터의 변형은 전체 벡터 크기의 감소 및/또는 다중 복제 부위에서 하나 이상의 제한 효소 인식 서열의 제거를 포함하나, 이에 제한되는 것은 아니다.
다른 구현예들에 있어서, 상기 형질전환 유전자 발현 카세트를 전달하기 위해 사용되는 상기 벡터는 미니서클(minicircle) DNA 벡터이다. 전형적으로, 미니서클 DNA 벡터는 형질전환 유전자 발현 카세트를 담지하는 미니서클이고, 삽입이 없는 빈(empty) 벡터를 포함하지 않는다.
형질전환 유전자 발현 카세트를 담지하고 전달하기 위한 미니서클 DNA 벡터의 사용은 포유동물 세포가 중간 진핵생물 숙주 세포 시스템 (예: 곤충 세포주 생산 시스템)을 이용하지 않고 형질주입(예: 직접적으로)되도록 한다. 포유동물 세포를 형질전환 유전자 발현 카세트를 담지한 미니서클 DNA 벡터에 직접 형질주입하는 것은 생산 설비에서 대량 부피의 중간 숙주 세포 배양을 유지하고 중간 숙주 세포에 의해 생성된 빈 캡시드 또는 바이러스-유사 입자 (VLPs)를 수확하는 것과 연관된 비용 및 노동을 제거할 수 있다
또한, 미니서클 벡터들은 전형적으로 표준 플라스미드 벡터보다 더 작고 외인성 박테리아 서열들이 결여되어 있다. 일부 구현예들에 있어서, 이러한 특징들은 세포들의 형질주입을 향상시키고 포유동물 숙주 세포 내에서 형질전환 유전자 발현의 연장된 지속을 가능하게 한다. 예를 들어, 미니서클 벡터는 플라스미드에서 발견되는 외인성 박테리아 서열이 결여되기 때문에 표준 벡터보다 더 작다. 플라스미드 벡터들과 미니서클 벡터 사이의 크기의 차이는 외인성 박테리아 서열의 결여, 상기 플라스미드 및 이들의 변이체와 비교하여 현저히 더 작은 것과 같이, 비외인성 박테리아 서열들을 실질적으로 포함하지 않는 것에 기인될 수 있다.
포유동물 숙주 세포에서 피코르나바이러스 바이러스-유사 입자의 생성을 유도 할 수 있는 미니서클 벡터들을 생성하는 방법은 전형적으로 2-단계 과정을 포함한다. 첫째, 박테리아 서열 및 형질전환 유전자를 포함하는 전체-크기 부모 플라스미드가, 예를 들어, 대장균에서 생성된다. 상기 부모 플라스미드가 여전히 상기 대장균 숙주 내부에 있는 동안, 부위-특이적 재조합효소(recombinase)의 발현이 유도되고 상기 원핵생물 또는 박테리아 본(bone)이 상기 재조합효소 인식 부위에서 상기 효소에 의해 절단된다. 부위-특이적 재조합효소의 비제한적인 예는 Cre 재조합효소, Flp 재조합효소, ParA 절단효소(resolvase) 및 PhiC31 인테그라아제(integrase)와 같은 Tyr- 및 Ser- 재조합효소가 있다. 적합한 재료, 기술, 접근법 및 방법의 그 전문이 본원에 참조로 포함되는, 미국 특허 제8,236,548호에 기재되어 있다. 추가 설명은 Kay 등, A Robust System for Production of Minicircle DNA Vectors, Nature Biotechnology 28 1287-1289 (2010)에서 찾을 수 있고, 이것의 전문은 본원에 참조로 포함된다.
형질전환된 숙주 세포
본원의 다른 측면은 적어도 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체 및 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 예를 들어, FMDV 3C 프로테아제를 발현하는 형질전환 유전자 발현 카세트를 담지하는 벡터로 형질전환 유전자되거나 형질주입된 세포에 관한 것으로서, 이것은, 대조군 3C 프로테아제 및 적어도 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체로 형질전환된 숙주 세포와 비교하여, 상기 형질전환된 또는 형질주입된 숙주 세포에 대한 독성이 감소되지 않으며, FMDV P1 폴리펩타이드 전구체와 같은 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체를 VP1, VP2, VP3 및 VP4 또는 VP0, VP1 및 VP3의 FMDV 캡시드 단백질과 같은, 개별 피코르나바이러스 캡시드 단백질로 전체적으로 가공할 수 있다. 상기 숙주 세포들은 박테리아 세포와 같은, 또는 원핵생물, 또는 진핵생물일 수 있다. 전형적으로, 상기 숙주 세포는, 인간 배아 신장 세포주 (HEK-293) 또는 연속적인 돼지 세포주 LF-BK αV/β6와 같은, 진핵생물, 동물 세포 (특히 포유동물 세포), 식물 세포 및 효모 세포일 수 있다. 구체적인 적합한 숙주 세포는 본원에서 "요약" 표제 하에 기술된 것들을 포함하여 기재되어 있다.
상기 숙주 세포들은 통상의 기술자에게 잘 알려져 있고 본원에 기재된 바와 같은 임의의 통상적인 형질전환 유전자 기술을 사용하여 형질전환될 수 있다. 본원의 상기 숙주 세포는, 조절된 조건 하에서, 본원의 형질전환 유전자 카세트 및/또는 재조합 벡터들로 형질주입되기 전 및/또는 후, 세포 배양과 같은, 그것들의 자연 환경의 외부에서 일반적으로 성장될 수 있다. 다른 구체예들에 있어서, 상기 숙주 세포는 그것들의 자연 환경의 내부에서, 예를 들어, 유기체의 일부로서 성장된다.
조성물
본원의 다른 측면들은, 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드, 형질전환 유전자 발현 카세트 및/또는 재조합 벡터, 및 약학적으로 허용가능하고 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제에 의한 단백질 분해에 적합한, 부형제, 보조제, 완충액 또는 용액을 포함하는 조성물에 관한 것이다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 조성물은 백신과 같은 면역원성 조성물, 전형적으로 DNA 백신이다. 본원에 사용된 것과 같이, 용어 "면역원" 또는 "면역원성(immunogenic)"은 숙주에서 면역 반응, 예를 들어, 항체 반응을 유도하는 임의의 기질을 의미한다. 본원에 기재된 면역원성 조성물은 면역보호성 또는 치료성일 수도 있고 또는 아닐 수도 있다. 따라서, 용어 "면역원성"은 백신에만 국한되지 않는다.
용어 "면역 반응 유도"는, 항원과 같은 자극에 반응하는 생체 내 (in vivo)에 면역 세포의 자극을 의미한다. 상기 면역 반응은, 예를 들어, T 세포 및 대식세포 자극과 같은, 세포성 면역 반응, 및, 예를 들어, B 세포 및 보체 자극과 같은 체액성 면역 반응, 및 항체 생성 중 하나 또는 둘을 포함할 수 있다. 면역 반응은, 예를 들어, 항체 면역 분석법, 증식 분석법 및 기타를 포함하여, 본 기술분야에 공지된 기술을 사용하여 측정될 수 있다.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 기술된 상기 면역원성 조성물은 항체 조성물을 수득하는데 사용될 수 있고, 이어서 일시적인 면역, 즉 인공적으로 수득된 수동 면역을 제공하기 위하여 대상(subject)에게 투여될 수 있다. 상기 항체 조성물들을 제조하고 투여하는 방법은 본 기술분야에 공지되어 있고, 예를 들어, 본원에 참조로 그 전문이 포함된 미국 특허 제4,748,018호에 기재되어 있다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 면역원성 조성물은 백신이다. 본원에 사용된 용어 "백신"은 항원을 포함하는 조성물을 의미하고, 이것은 상기 대상에서 바이러스에 대한 면역성을 확립하는데 유용하다. 백신은 예방적 또는 치료적일 수 있다. 예를 들어, 백신은 대상에 대한 바이러스의 영향을 예방, 완화, 경감 또는 제거 할 수 있다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 상기 면역원성 조성물은, FMDV P1 폴리펩타이드 전구체와 같은, 적어도 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체, 및 변형된 FMDV 3C 프로테아제와 같은, 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제를 발현하는 형질전환 유전자 발현 카세트를 담지하는 면역원성 양의 하나 이상의 벡터를 포함할 수 있으며, 이것은 대조군 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 및 적어도 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체로 형질전환된 또는 형질주입된 숙주 세포와 비교하여, 형질전환된 또는 형질주입된 숙주 세포에 대한 감소된 독성을 가지는 VP1, VP2, VP3 및 VP4 또는 VP0, VP1 및 VP3의 개별 피코르나바이러스 캡시드 단백질로 상기 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체를 전체적으로 가공할 수 있다. "면역원성 양"은 피코르나바이러스 (예: FMDV)에 대한 면역 반응을 유도할 수 있는 양이다.
하나 이상의 구현예들에 있어서, 본원의 상기 조성물, 백신과 같은 면역원성 조성물은 임의의 알려진 방법에 의해 제제화될 수 있다. 상기 조성물들은, 예를 들어, 주사제 (예 : 피하, 피내 및 근육 내 주사, 제트 주사), 경구 투여용 제제, 비내 투여 (예 : 에어로졸 흡입 또는 점적), 눈 국소 투여, 전기천공, 유전자 총, 형질주입, 리포좀 매개 전달 또는 이들의 조합물로서 액체 용액 또는 현탁액으로서 제제화될 수 있다. 주사 또는 다른 투여 전에 액체의 용액 또는 현탁액에 적합한 고체 형태로도 제조될 수 있다. 상기 제제는 또한 유화되거나 또는 리포좀에 캡슐화될 수 있다.
하나 이상의 구현예들에 있어서, 본원의 상기 백신은 동일한 종 또는 상이한 종의 2 종 이상의 상이한 균주에 대한 면역 반응을 자극하는 면역원성 조성물들을 포함하는 다중(multivalent) 또는 다가(polyvalent) 백신으로서 제제화될 수 있다. 추가 구현예들에 있어서, 본원의 다중 백신은 본원의 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 또는 3CD 융합체 또는 본원의 재조합 벡터를 사용하여 P1 전구체로부터 가공된 VLPs로부터 형성된 적어도 하나의 피코르나바이러스 캡시드를 포함한다. 또 다른 구현예들에 있어서, 상기 다중 백신은 살아 있는, 죽은, 약화 또는 불활성화된 완전 미생물; 그의 독소(toxoids), 그의 서브유닛; 그의 VLPs; 그의 컨쥬게이트; 또는 그의 핵산을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
하나 이상의 구현예들에 있어서, 상기 활성 면역원성 성분들, 예를 들어, 변형된 3C 프로테아제를 코딩하는 폴리뉴클레오타이드, 또는 3CD 융합체, 및 P1 전구체 폴리펩타이드를 포함하는 벡터를 보조제, 염, 담체, 부형제 또는 희석제와 혼합하며, 이것들은 약학적으로 허용가능하고 상기 활성 성분과 상용성이다.
일부 구현예들에 있어서, 보조제들은 백신과 같은 면역원성 조성물에 첨가되어 더 많은 양의 항체 및 더 오래 지속되는 보호를 제공하는 것과 같이 상기 면역 반응을 증가시킴으로써 변형하고, 이에 따라 주입된 이물질의 양을 최소화한다. 보조제들은, 예를 들어, 항체를 분비하는 B 세포 대신에 상기 T 세포를 활성화시키는 것에 의해 면역계의 특정 세포 유형에 대한 상기 면역 반응을 파괴하는 것을 도움으로써 백신의 효능을 향상 시키는데 또한 사용될 수 있다. 보조제들의 예로는, 수성-기반 알루미늄 수산화물 겔 사포닌, 오일-기반의 Montanide ISA 206, 다른 알루미늄-기반 보조제, 불완전 Freunds 보조제 (IFA), 및 파라핀 오일을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
추가 구현예에 있어서, 약학적으로 허용가능한 염은 무기산 (예 : 염산 또는 인산) 및 유기산 (예 : 아세트산, 옥살산, 타르타르산 또는 말레산)으로 형성된 산 부가 염들(펩타이드의 유리 아미노기로 형성됨)을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 유리 카르복실기로 형성된 염은 무기 염기 (예 : 수산화나트륨, 수산화칼륨, 수산화암모늄, 수산화칼슘 또는 수산화 제 2 철) 및 유기 염기 (예 : 이소프로필아민, 트리메틸아민, 2-에틸아미노-에탄올, 히스티딘 및 프로카인)로부터 또한 유도될 수 있다.
추가 구현예에 있어서, 적합한 담체는 액체 담체 (예를 들어, 물, 식염수, 배양 배지, 생리 식염수, 수성 덱스트로스, 수성 글리콜) 및 고체 담체 (예 : 전분, 글루코오스, 락토오스, 수크로오스, 덱스트란과 같은 탄수화물; 아스코빅산 및 글루타티온과 같은 항산화제, 가수분해된 단백질)을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
추가 구현예에 있어서, 적합한 부형제는 물, 식염수, 덱스트로스, 글리세롤, 에탄올 등, 이들의 조합을 포함하나, 이에 제한되는 것은 아니다.
추가의 구현예에 있어서, 희석제들의 예는 물, 생리 식염수, 인간 혈청 알부민, 오일, 폴리에틸렌 글리콜, 글리세린, 프로필렌 글리콜 또는 다른 합성 용매, 벤질 알코올과 같은 항균제, 아스코빅산 또는 이황산나트륨과 같은 항산화제, 에틸렌 디아민-테트라-아세트산과 같은 킬레이트제, 아세테이트, 시트레이트염 또는 포스페이트염과 같은 완충제, 및 염화나트륨 또는 덱스트로스와 같은 삼투압 조절제를 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
추가 구현예에 있어서, 상기 백신은 습윤제 또는 유화제, pH 완충제 및/또는 다른 제제와 같은 소량의 보조 물질들을 포함할 수 있고, 이것은 상기 백신의 유효성을 향상시킨다. 효과적인 제제의 예는 하기를 포함하나, 이에 제한되는 것은 아니다: 수산화알루미늄; N-아세틸-무라밀-L-트레오닐-D-이소글루타민 (thr-MDP); N-아세틸-노르-무라밀-L-알라닐-D-이소글루타민 (CGP 11637, 노르-MDP로 지칭됨); N-아세틸-무라밀-L-알라닐-D-이소글루타민 1-L-알라닌-2 (1'-2'- 디팔미토일-sn-글리세로-3-히드록시포스포릴옥시)-에틸 아민(CGP 19835A, MTP-PE로 지칭됨); 및 박테리아에서 추출된 세 가지 성분을 포함하는 RIBI; 2% 스쿠알렌/트윈 80 유제에서 모노포스포릴 지질 A, 트레할로스 디미코레이트 및 세포벽 골격 (MPL+TDM+DWS). 상기 보조제의 유효성은 문제의 보조제를 포함하는 백신에서 상기 면역원의 투여로 인한 면역원에 대한 항체 (특히 IgG, IgM 또는 19A)의 양을 측정함으로써 결정될 수 있다. 추가 구현예에 있어서, 추가 제제들 및 투여 방식이 또한 사용될 수 있다.
하나 이상의 구현예들에 있어서, FMDV 백신과 같은 본원에 따른 상기 피코르나바이러스 백신은 자연 감염과는 다른 면역 반응을 유도하는, 마커 백신 또는 DIVA (Differentiating Infected from Vaccinated Animals)이다. 이러한 차이는 항체 프로파일에 반영되며, 상기 백신 제제에 사용된 것과 동일한 조성물을 포함하는 효소-연결 면역흡착 분석법 (ELISA)과 같은 진단 테스트 및 분석에 의해 검출될 수 있다. DIVA 전략은 FMDV 백신과 같은 DIVA 피코르나바이러스 백신을 사용한 응급 접종이 집단 밀도가 높은 축산 지역에서의 FMDV 발병과 같은 피코르나바이러스 발병에 효과적인 제어 도구가 될 수 있는 박멸 시나리오에서 유용하다. DIVA 백신 접종은 FMDV 박멸과 같은 피코르나바이러스 박멸 과정에서 추방된 동물 수를 제한할 수 있어, 질병 조절 조치에 대한 대중의 수용을 향상하고 및 경제적 손실을 제한할 수 있다.
피코르나바이러스 DNA 백신의 효능은 12 개월 동안, 백신 접종을 받지 않은 대상 집단의 발생률과 비교하여, 백신 접종된 대상 집단 중에서 피코르나바이러스의 발생률의 감소율에 의해 결정될 수 있다. 백신 유효성은 하기 식을 사용하여 측정할 수 있다: VE = [(ARU - ARV)/ARU] x 100%, 여기서 "VE"는 백신 유효성, "ARU"는 백신 접종을 하지 않은 집단의 발생률, "ARV"는 백신 접종한 집단 발생률.
일부 구현예들에 있어서, 본원에 따른 미니서클 DNA 벡터를 포함하는 FMDV 백신과 같은 피코르나바이러스 DNA 백신은 50-95%, 약 50%, 50% 초과, 50%, 약 75%, 75% 초과, 약 90%, 90% 초과, 95%, 약 95% 또는 95% 초과 사이의 VE 값들을 나타낸다.
특정 구현예들에 있어서, 면역원성 조성물 및 백신을 포함하는 본원의 상기 조성물은, 숙주 세포 배양물, 그의 단편 (들) 또는 서브유닛(들)로부터 단리되고 및 정제된 하나 이상의 피코르나바이러스 VLPs의 면역원성 양을 포함한다. 일부 구현예들에 있어서, 상기 VLP는 본원에서 제공되는 상기 변형된 3C 프로테아제를 사용하여 수득된다. 다른 구현예들에 있어서, 상기 백신은 하나 이상의 피코르니아 바이러스 캡시드 단백질 및/또는 그의 일부를, 피코르나바이러스 VLPs의 표면 상의 보조제 분자 및 그의 일부와 조합하여 포함할 수 있고, 선택적으로, 하나 이상의 바이러스 입자 또는 그로부터 유래된 에피토프 펩타이드와 자연적으로 연관된 하나 이상의 피코르나바이러스 바이러스 성분과 같은 다른 단백질 또는 다른 면역원을 추가 포함할 수 있다.
방법
본원의 다른 측면은, 유전적으로 조작된 DNA (예를 들어, 형질전환 유전자 발현 카세트+발현 벡터)를 포유동물 대상에게 투여함으로써 FMDV와 같은 피코르나바이러스의 하나 이상의 균주에 대해 포유동물 대상을 보호하는 것에 관한 것이고, 상기 포유동물 대상에서 FMDV VLPs와 같은 피코르나바이러스 VLPs의 조립을 통한 면역 반응을 in situ 생성한다. 적합한 포유동물 대상들은, 들소 (bison)와 같은 가축 소 또는 야생 소(wild bovids), 아프리카 버팔로, 영양, 임팔라, 가젤, 양, 염소 및 가축동물을 포함하는, 인간, 영장류 및/또는 갈라진-발굽 동물을 포함하는 임의의 포유동물 대상을 포함할 수 있다.
전통적인 전병원체(whole-pathogen) 백신 및 단백질-기반 백신과 비교하여, DNA 백신 플랫폼과 연관된 많은 이점이 있다. 예를 들어, DNA 백신은 죽었거나 살아 있는 실제 감염원을 포함하지 않는다. DNA 백신들은 또한 장기 저장 및 운송을 위해 쉽게 동결 건조될 수 있고, 콜드 체인(cold chain) 전달을 요구하지 않는다.
또한, DNA 백신의 상기 DNA 벡터는, 종래 백신 제제와 비교하여, 더 빠르고 더 쉽게 생산 및 변형될 수 있다. 이것은, 특정 FMDV 발생과 같은, 개별 피코르나바이러스에 맞추어 DNA 백신을 특이적으로 조작하기 위한 더 신속한 응답을 가능하게 한다. 일부 구현예들에 있어서, 상기 형질변환 유전자 발현 카세트를 담지 및 전달하기 위해 미니서클 DNA 벡터를 사용하는 것은, 중간 진핵생물 숙주 세포 시스템의 사용을 제거하고, 상기 FMDV 발생의 진행과 같은, 발병 동안 중간 숙주 세포 시스템의 변형을 포함하여, 연관된 비용 및 노동을 제거한다.
하나 이상의 구현예들에 있어서, FMDV 백신과 같은 피코르나바이러스 백신은, 복용 제제와 상용할 수 있는 방식으로, 그리고 예방적으로 및/또는 치료학적으로 유효할 수 있는 양 및 방식으로, 예방적으로 (예: 미래 감염의 효과를 예방 또는 개선하기 위해), 치료학적으로 (예: 감염된 유기체의 상기 면역계를 치료하거나 강화하기 위해), 또는 둘 다를 위해 투여될 수 있다. 본원에 기술된 것과 같이 DNA 피코르나바이러스 백신에 대한 투여량은, 전체적으로, 치료 대상, 항체들을 합성하기 위한 상기 숙주 세포 면역계의 능력, 및 요구된 보호의 정도에 의존하여, 투여(dose) 당 예비-조립된 피코르나바이러스 VLPs 및/또는 투여 당 보조제 분자의 1 내지 1000 ㎍, 전형적으로 5 내지 500 ㎍, 더 전형적으로 50 내지 550 ㎍, 더 전형적으로 100 내지 200 ㎍이다. 투여될 필요가 있는 활성 성분의 정확한 양은 수의사 또는 의사의 판단에 의존할 수 있고, 또는 각각의 대상에 특이적 일 수 있으나, 그러한 결정은 이러한 실시자의 기술 내에 있다.
본원의 백신과 같은 면역원성 조성물은, 단일 투여(single dose)로 제공될 수 있다; 2 회 투여 계획, 예를 들어, 2 내지 8주의 간격; 또는 다중 투여 계획으로 제공될 수 있다. 다중 투여 계획은, 1차 백신 접종 과정이 1 회 내지 10 회 또는 그 이상의 개별 투여를 포함할 수 있는 투여에 이어서 상기 면역 반응을 유지 및/또는 강화하는데 필요한 후속 시간 간격으로 투여되는 추가 투여 (예를 들어, 2차 투여의 경우 1 내지 4 개월, 10 개월 간격으로, 그리고 필요한 경우 수 개월 후의 후속 투여).
본원의 추가 측면들은, 본원의 조성물, 예를 들어, 본원에 기재된 백신 조성물와 같은, 면역원성 조성물에 혼입될 수 있는, 피코르나바이러스 바이러스-유사 입자 (VLP), FMDV 바이러스-유사 입자를 제조하는 방법에 관한 것이다. 본원의 특정 구현예에서, FMDV VLP와 같은 피코르나바이러스 VLP는 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체를 본원의 단리된 폴리뉴클레오타이드에 의해 코딩된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 또는 3CD 융합체(fusion)와 접촉시킨 후에 생성된다.
일부 구현예들에 있어서, 본원의 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체 및 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제, 또는 3CD 융합체는, 본원에 기술된 변형된 피코르나바이러스를 코딩하는 적어도 변이체 뉴클레오타이드 서열 3C 프로테아제, 또는 3CD 융합체 및 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체를 포함하는 형질전환 유전자 발현 카세트를 담지하는 재조합 벡터로 형질전환된 숙주 세포에서 in vivo 공동-발현된다. 상기 발현된 피코르나바이러스 P1 폴리펩타이드 전구체는 본원의 상기 발현된 변형된 피코르나바이러스 3C 프로테아제 또는 3CD 융합체에 의해 전체적으로 가공되어 VP1, VP2, VP3 및 VP4 또는 VP0, VP1 또는 VP3의 개별 피코르나바이러스 캡시드 단백질로 절단될 수 있고, 상기 캡시드 단백질은 자기조립되어 빈 피코르나바이러스 캡시드를 형성한다. 피코르나바이러스 VLP는 조립되어 하나 이상의 피코르나바이러스 캡시드를 형성할 수 있고, 이것은 그것들의 숙주 세포로부터 단리 및 정제될 수 있다.
다른 구현예들에 있어서, 피코르나바이러스 VLP 생성은 in vitro에서 일어난다. 이러한 구현예들에 있어서, VLP는, 예를 들어, 적절한 용액, 완충 및/또는 배양 배지를 이용하는 시험관에서 또는 페트리 접시에서 생성된다. 이후, in vitro 생성된 상기 피코르나바이러스 VLPs는 in vitro 환경으로부터 단리 및 정제될 수 있다.
[실시예]
실시예 1. 재료 및 방법
1A. pJJP 돌연변이 구조체의 단리
형질전환 유전자 발현에 대한 변형된 FMDV 3C 프로테아제의 효과를 평가하기 위해, 처음에, 폴리뉴클레오타이드 구조체를 FMDV O1 Manisa iso87 (Accession : AY593823)로부터의 P1-2A 폴리펩타이드를 코딩하는 서열, FMDV Asia1 Shamir 3C (Accession : AY593800) 및 Δ1D2A-SGLuc (Δ1M) 분비된 바이오마커를 포함하는 pJJP 플라스미드(GenScript Inc., Piscataway, NJ)에서 합성하였다. 형질전환 유전자 발현을 위한 리포터로서의 2A 번역 인터럽터 키메라에 대한 설명은 Puckette 등, BMC Biotechnol., 2017, 17:52를 참조하고, 상기 문헌의 전문은 본원에 참조로서 포함된다. 선택 제한 절단 부위는 복제를 용이하게 하기 위해 사일런트(silent) 돌연변이를 사용하여 제거되었다. 상기 폴리뉴클레오타이드 구조체들을 플라스미드 전파에 대한 제조사의 지시에 따라 New England Biolabs (NEB) 5-Alpha competent E. coli (New England Biolabs Inc., Ipswitch, MA)에 형질전환되었다. 배양액은 밀리미터 (μg/mL) 카베니실린 당 100 마이크로그램을 사용하여 테리픽 브로스 (terrific broth)에서 분당 250 회전 (rpm)으로 37℃에서 밤새 성장시켰다. 플라스미드는 QIAGEN® Plasmid Maxi 키트 (Qiagen Inc., Valencia CA)를 사용하여 단리되었다.
1B. 3C 프로테아제의 무작위 돌연변이유발
FMDV 3C 프로테아제의 무작위 돌연변이유발을 Takara Holdings Inc., Shimogyo-ku, Kyoto, Japan를 사용하여 제조사의 추천에 따라 1,000bp 당 2 개의 돌연변이체를 생성하였다. 증폭을 위해 사용된 프라이머들은 Nde-3C-F2 (CATATGAGTGGTGCCCCACCGAC, 서열 번호 641) 및 Rand-XhoXba-R (CCGATTCTAGACTCGAGTTA, 서열 번호 642)이고, 사용된 주형은 pUC57kan (enScript Inc.)에서 합성된 야생형 FMDV Asia1 Shamir 3C (Accession : AY593800)를 이용하였다. QIAQUICK® PCR 정제 키트 (Qiagen Inc.)를 사용하여 PCR 정제가 수행되었고, 제한 효소 NdeI 및 XhoI (New England Biolabs Inc.)에 의해 제조사가 제안한 것과 같이, PCR 산물을 분해하였다. 분해된 PCR 산물을, 제조사의 제안에 따라, T7 리가아제 (Roche Holding AG Basel, 스위스)를 사용하여, 유사하게 가공된 pSNAP-태그 (T7)-2 벡터 (New England Biolabs Inc.)에 복제시켰다.
1C. 박테리아 플레이팅(plating) 및 발현
T7 Express Competent E. coli의 형질전환 (New England Biolabs Inc)은 제조사에 의해 제안된 것과 같이 수행되었다. 플레이팅하기 전에, 형질전환된 대장균은 100 μg/mL 카베니실린 테리픽 브로스 10 mL에서 37℃에서 3 시간 동안 배양되었다. 배양 후, 200 μL를 이소프로필 β-D-1-티오갈락토피라노시드 (IPTG), 카베니실린 (Carb), 루리나-베르타니[Luria-Bertani (LB)] 플레이트 (IPTG +CARB LB 플레이)에 스프레딩하고, 37℃에서 밤새 배양하였다. 개별 대장균 콜로니들을 QIAPREP® Spin Miniprep 키트 (Qiagen Inc.)를 사용하여 플라스미드 단리를 위해 밤새 4 mL의 +CARB LB 배지에서 성장시켰다. 뉴클레오타이드 서열의 결정을 위해 프라이머 T7 (TAATACGACTCACTATAGGG, 서열 번호 643) 및 pSNAP-SR (CGGATATAGTTCCTCCTTTC, 서열 번호 644)을 사용하여 단리된 플라스미드를 시퀀싱하였다. 이어서, 목적 돌연변이를 코딩하는 플라스미드를 T7 Express Competent E. coli에 다시 형질전환 시켰고, 브로스에서 배양되었고, 상기 기재된 것과 같이, 한천(agar)에서 성장시켰다. 그 전문이 본원에서 참조로서 포함되는, Puckette 등, J. Virol., 2017, 91: e00924-17 (페이지 1-13) 참조.
1D. 형질전환 유전자 발현 및 가공 평가
293 성장 배지 [1X Dulbecco's Modified Eagle's medium (DMEM)], 10% 태아 소 혈청, 1X 항생제-향균제 및 1 X 비필수 아미노산을 사용하여 6-웰(well) 플레이트 (VWR International LLC, Radnor, PA)에서 HEK293T 세포 (ATCC CRL-3216)를 성장시켰다. 형질주입을 위해, 세포들을 2 mL Dulbecco 인산염-완충 생리 식염수 (DPBS)로 세척하였다. 4 μg의 플라스미드 DNA 및 10 μL의 리포펙타민 2000 (Invitrogen Inc., Carlsbad, CA)으로 형질주입하기 전에 각 웰에 1 mL의 새로운 배지를 첨가하였다. 수확하기 전에 세포들을 37℃에서 밤새 CO2 인큐베이터에서 성장시켰다.
루시퍼라아제 활성은, 각각의 웰에서 1:4 형질도입 유전자 배지-희석 샘플 100 μL을 사용하여 96-웰 BioSystems VERITAS™ 조도계 (Turner Biosystems Co., Sunnyvale, CA)를 사용하는 형질주입된 세포들로부터 수확된 배지에서 검출되었다. 판독 값은 50 μg/μL 수용성 코엘렌테라진 용액 (NANOLIGHT™ Technologies, Prolume, Ltd Pinetop AZ) 100 μg/μL를 주입한 후 바로, 기질의 주입 전과 후에 0.5 초의 집적 시간을 사용하여 수득하였다.
97℃에서 10 분간 가열된, 리튬도데실설페이트 (LDS) 샘플 완충액 (Invitrogen Inc., Carlsbad, CA)을 10-웰 NUPAGE® 4-12% Bis-Tris 젤 (Invitrogen Inc.)로 로딩하였다. 젤들은 200 V에서 35 분 동안 1X 2-(N-모르폴리노)에탄술폰산 (MES)에서 전기영동되었고, 그 후 상기 IBLOT® 2 시스템 (Invitrogen Inc.)을 사용하여 멤브레인 상에 전달되었다.
멤브레인을 실온에서 1 시간 동안 5% 밀크 블로킹(milk blocking) 완충액에서 배양한 다음, 1X PBS-TWEEN® Tablets (MilliporeSigma Inc., St. Louis, MO)으로 각각 5 분 동안 3 회 세척하였다. 1차 항체는 1:50 희석 쥐 모노클로날 항체 F1412SA (항-VP2) 및 12FE9.2.1 (항-VP1), 항-VP3 토끼 폴리클로날 항체에 대해 1 : 250 희석, 및 eIF4AI(ab31217, ABCAM)에 대해 1 : 1000 희석액에 첨가하고 실온에서 1 시간 동안 배양하였다. 그 전문이 본원에 참조로서 포함된, 항-VP1에 대한 Yang 등 Veterinary Immunology and Immunopathology, 2007, 115: 126-134 (2007) 및 항 VP2에 대한 Stave 등, The Journal of General Virology, 1986, 67: 2083-2092 참조.
멤브레인을 상기 1차 항체 배양 후 5 분 동안 TWEEN® 20 (PBST)의 1X 인산염 완충 생리 식염수로 상기 멤브레인들을 3 회 세척하였다. 2차 항체인 염소 항-쥐-양 고추냉이 퍼옥시다아제 (HRP) 및 염소 항-토끼-HRP (KPL)의 1 : 500 희석액을 상응하는 멤브레인에 실온에서 1 시간 동안 적용하였다. 1x PBST로 3 회 최종 세척 후, 제조사에 의해 제안된 것과 같이, SIGMAFAST?? 3,3'-디아미노벤지딘 정제 (MilliporeSigma Inc)를 사용하여 시각화를 수행하였다.
실시예 2. 결과
2A. B
2
β 가닥 잔기(FMDV 잔기 123-128)의 돌연변이
FMDV 3C 프로테아제 결정 구조에서, L127 잔기는 A2 β 가닥과 β 시트를 형성하는 B2 β 가닥 상에 위치된다 (도 13a). 또한, FMDV 프로테아제 3C 결정 구조에 관하여 그 전문이 본원에 참조로서 포함된 Birtley 등, 2005, The Journal of Biological Chemistry 280: 11520-11527 (2005), Zunszain 등, Journal of Molecular Biology, 2010, 395: 375-389 and Yang 등, 2016, PeerJ 4: 4e (2016) 참조. 프롤린은 가닥 및 β 시트 구조를 파괴하는 것으로 알려져 있으므로, 본 발명자들은 FMDV O1 Manisa (O1M) P1, 3C 프로테아제 및 Δ1D2A-GLuc Δ1M 바이오 마커를 코딩하는 발현 플라스미드를 사용하여 123 내지 128의 각 잔기에 대해 프롤린 돌연변이유발 스캐닝을 수행하였다 (도 13b). L127P를 포함하지 않는 상기 다섯 개 시험된 잔기들 중 네 개가 야생형에 대해 형질전환 유전자 발현을 향상시켰다 (도 13c). 상기 네 가지 돌연변이들 중, V124P는 야생형에 비해 가장 강한 향상을 보였으나, D123P, G125P, 및 I128P는 V124P 활성의 1/3 미만을 나타내었다. 상기 L127P 돌연변이는 B2 β 가닥 프롤린 돌연변이체에서 형질전환 유전자 발현을 가장 많이 향상시켰다. 흥미롭게도, 돌연변이체 R126P는 야생형과 형질전환 유전자 발현에 차이가 없었다 (도 13c).
각각의 돌연변이에 대해, 형질전환된 HEK293T 세포로부터의 세포 용해물(lysates)을 상기 FMDV O1M P1 폴리펩타이드의 가공에 대해 조사하였다 (도 13d). 촉매성 트리아드에서의 C163A 활성 녹아웃(knockout) 돌연변이와는 달리, 상기 돌연변이 여섯개 모두는 상기 O1M P1 폴리펩타이드를 가공하는 능력을 유지하고 전체적으로 가공된 VP2를 나타내었다 (도 13d). 3C 프로테아제는 VP0을 VP4와 VP2로 분리하지 않는다. 그러한 분리는 VLPs의 형성 동안 VP0, VP3, 및 VP1 사이의 적절한 상호 작용에 의존하는 것으로 보고되었다.
B. 무작위 돌연변이유발 잔기들
L127P의 것과 유사한 표현형 (phenotype)을 수득하는 다른 신규 돌연변이를 확인하기 위해, 본 발명자들은 무작위 돌연변이유발 반응을 수행하였고 대장균 박테리아에서 발현을 유도하여 생존가능성 및 콜로니 성장을 향상시키는 3C 프로테아제 돌연변이들을 우선적으로 선택하였다. 다섯개의 다른 돌연변이가 확인되었다. 두개의 돌연변이들은 조기 성숙한 정지 코돈을 보유하였고 더 평가되지 않았다. 대장균의 복제물(clone)에 개별적으로 존재하는 나머지 돌연변이, T100P, L23P 및 L43H를 +CARB/+IPTG 및 +CARB 한천 성장 배지 모두에서 성장하여 대장균의 성장에 대한 영향을 평가하였다. 도 14에 나타낸 것과 같이, L23P 및 T100P만이 대장균 콜로니 성장을 향상시켰다.
상기 HEK293T 포유동물 세포에 대한 평가를 위해, 본 발명자들은, 상기 향상이 잔기 특이적인지, 또는 대신에 프롤린 삽입으로 인한 구조 파괴의 결과 인지를 더 잘 이해하기 위해, 인접 돌연변이체 I22P 및 I99P를 포함시켰다. HEK293T 세포들은 WT, L127P 및 C163A와 비교하여 돌연변이 I22P, I23P, I99P 또는 T100P를 포함하는 pJJP 플라스미드 (도 13b)로 형질주입시켰다. 네 가지의 신규 돌연변이 모두는 야생형과 비교했을 때, 형질전환 유전자 발현이 증가한 것으로 나타났다. 도 15a에 나타낸 것과 같이, 상기 형질전환 유전자 발현 수준은 상기 I22P 돌연변이 및 L127P 사이에서 비교 가능하다.
각각의 돌연변이에 대해, 형질주입된 HEK293T 세포로부터의 세포 용해물을 상기 FMDV O1M P1 폴리펩타이드의 가공에 대해 조사하였다(도 13d). 모든 돌연변이들은, C163A 활성 녹아웃 (knockout)을 제외하고, 상기 O1M P1 폴리펩타이드를 가공하는 능력을 유지하고 전체적으로 가공된 VP2를 나타내었다 (도 13d). VP0의 VP4 및 VP2로의 분리는 3C 프로테아제에 의해 가공되지 않고, VLPs의 형성 동안 VP0, VP3 및 VP1 사이의 적절한 상호작용에 의존하는 것으로 기재되었다.
세포 용해물을 웨스턴 블롯팅(western blotting)에 의한 P1 가공에 대해 평가하였다. 상이한 가공 정도가 측정되었지만, 새로운 돌연변이체 중 어느 것도 P1뿐만 아니라 L127P 돌연변이체를 가공하지 않았다 (도 15b). 소량이 검출될 수 있음에도 불구하고, 돌연변이체 I99P에 의한 단백질 가공의 표시는 나타나지 않았다 (도 15b). 돌연변이체 T100P는, VP2, 가공되지 않은 P1, 및 VP3 및 VP1의 융합 펩타이드(VP3/VP1)의 존재에 의해 나타난 것과 같이, VP1을 부분적으로 가공하였다. I22P와 L23P 모두 유사한 가공 프로파일을 보여주었고, P1은 거의 감지되지 않았다. 그러나, VP3/VP1의 존재는 VP3과 VP1의 접합(junction)을 가공하는 데 어려움을 시사하였다 (도 15b).
돌연변이 I22P, L23P, 및 T100P는 상기 O1M P1 폴리펩타이드를 가공하는 능력을 유지하고 전체적으로 가공된 VP2를 나타내었다 (도 15b). 상기 나타낸 것과 같이, VP0의 VP4 및 VP2로 분리는 3C 프로테아제에 의해 가공되지 않았고, VLPs의 형성 동안 VP0, VP3 및 VP1 사이의 적절한 상호작용에 의존하는 것으로 보고되었다.
2C. 확인된 돌연변이의 조합
돌연변이들은 3Cpro 내의 상이한 구조체로의 변경을 나타낸다. 돌연변이 V124P 및 L127P는 상기 B2 β 가닥 상에 존재하는 반면, I22P는 A1 β 가닥 상에 존재하고 T100은 F1 및 A' β 가닥들 사이의 루프 상에서 발견된다 (도 16). 3Cpro 활성에 대한 그것들의 효과를 결정하기 위해, 본 발명자들은 본원에서 확인된 3 가지 돌연변이체들, 즉 I22P, T100P 및 V124P와 L127P의 조합물을 제조하였다. 도 17a에 나타낸 것과 같이, I22P/T100P/V124P의 상기 형질전환 유전자 발현 수준은 I2P/T100P/L127P [~7.0Х1010 상대 루시퍼라아제 단위 (RLU)/0.5 초 vs ~4.5Х1010 RLU/0.5 초]의 것을 초과하였다.
I22P/L127P, T100P/L127P, 및 V124P/L127P의 세 개의 이중 돌연변이 구조체 및 I22P/T100P/V124P 및 I22P/T100P/L127P의 두 개의 트리플 돌연변이체는 pJJP 플라스미드를 사용하여 발현되었고 P1 가공을 평가하였다 (도 17b). 상기 V124P/L127P 이중 돌연변이체 구조체만 높은 수준의 가공을 유지하였다 (도 17b). I22P/L127P 구조체는 약한 가공을 유지하였지만, 전체적으로 가공된 생산물을 웨스턴 블롯(Western blots)에 의해 나타내지 않았다. 가공된 P1은 T100P/L127P 또는 트리플 돌연변이체를 포함하는 구조체에 대한 웨스턴 블롯에 의해 검출되지 않았다.
2D. FMDV 3C 프로테아제 돌연변이체의 eIF4AI에 대한 효과
3Cpro 는 진핵생물 세포의 번역 기계, eIF4AI의 성분을 가공한다. 형질주입된 HEK293-T 세포 용해물을, WT 및 C163A와 비교하기 위하여, 단일 돌연변이체 I22P, L23P, T100P, V124P, G125P 및 L127P뿐만 아니라, 이중 돌연변이체 I22P/L127P 및 V124P/L127P에 의해 가공된 숙주 세포 eIF4AI에 대해 조사하였다 (도 18). 가공된 eIF4AI에 상응하는 강한 밴드가 WT 및 R126P에서 관찰되었다; 약한 밴드가 G125P에서 관찰되었고, 매우 희미한 밴드가 V124P에서 검출되었다 (도 18).
2E. CHO-K1 및 BHK-21 세포주의 돌연변이 시험
중국 햄스터 난소 (CHO) 세포주는 생물의약 제조를 위해 가장 널리 사용되는 세포주 중 하나이다. 3Cpro에 대한 확인된 돌연변이가 야생형에 비해 형질전환 유전자 발현을 계속 향상시키는지 및 VLP 배열 형성이 유지되는 지 확인하기 위해 널리 사용되는 것을 선택하였다. 돌연변이체 L127P는 단일 돌연변이 중 가장 높은 루시퍼라아제 수준을 나타냈지만, HEK293-T 세포들의 생산량을 증가시키는 모든 돌연변이들 또한 CHO-K1 세포에서의 생산량을 향상시켰다 (도 23).
아기 햄스터 신장 (BHK-21) 세포주는 FMDV 불활성화 백신의 생산에 오랫동안 사용되어 왔다. 형질주입된 BHK-21 세포 돌연변이 I22P의 사용은 가장 높은 루시퍼라아제 수준을 나타내었고, 표준 편차 범위 내에서 약간 낮은 V124P를 나타내었다 (도 23). 돌연변이체 L127P는, 여전히 WT보다 월등히 우수하지만, I22P, T100P, 및 V124P에 비해 감소된 향상을 나타내었다 (도 23).
시험된 3Cpro 돌연변이체의 CHO-K1 및 BHK-21 세포주에서의 가공 효율은 HEK293-T 세포에서 관찰된 것과 유사하였다 (도 24a). 전자 현미경 검사는 형질주입된 CHO-K1 세포 (도 24b)에서 L127P 돌연변이체 및 형질도입된 BHK-21 세포에서 V124P 돌연변이체 (도 24c)로 VLP 형성을 확인하였다.
2F. 다른 피코르나바이러스의 동족성 잔기들
본 발명자들은 FMDV 3C 프로테아제 [Zunszain 등 Journal of Molecular Biology, 2010, 395:375-389) 4 (2016), 그 전문이 본원에 참조로서 포함됨]의 공개된 결정 구조와 연관하여 다섯 개의 추가 피코르나바이러스의 3C 프로테아제 결정 구조를 조사하였다. 상기 다섯 개의 추가 피코르나바이러스 3C 프로테아제 결정 구조는 폴리오바이러스 (Mosimann 등, J. Mol. Biol., 1997, 273: 1032-1047), 인간 리노바이러스 (Kawatkar 등, Bioorg. Med. Chem. Lett., 2016, 26: 3248-3252), 인간 엔테로바이러스 71 (Wang 등, Journal of Virology, 2011, 85: 10021-10030), 콕사키바이러스 B3 (Lee 등, J. Biol. Chem., 2009, 284: 7646-7655) 및 A 형 간염 바이러스 (Bergmann 등, Journal of Virology, 1997, 71: 2436-2448)이고, 그 전문이 본원에 참조로서 포함된다.
2G (i) 다른 피코르나바이러스들의 V124P 및 L127P에 대한 동족성 잔기들
공개된 FMDV 3Cpro 결정 구조에서, A2-B2 β 시트는 기질 결합 포켓의 성분은 아니지만, C163 잔기를 포함하는 루프에 매우 근접되어 있다 [Birtley 등, 2005, The Journal of Biological Chemistry, 280: 11520-11527, Zunszain 등, Journal of Molecular Biology, 2010, 395: 375-389, Yang 등, PeerJ, 2016, 4: 4e (1964), 그 전문이 본원에 참조로서 포함됨]. 이러한 발견은 상기 A2-B2 β 시트가 기질 특이성에서 역할을 한다는 추론을 이끌어 냈다 [Birtley 등, 2005, The Journal of Biological Chemistry, 280: 11520-11527, 그 전문이 본원에 참조로서 포함됨]. 잔기 V124 및 L127의 사이드 체인은, 촉매성 잔기 C163에 인접한 잔기 Y162의 사이드 체인에 대하여 상기 B2 β 가닥 상에 가장 가까운 잔기이다 (도 19a 및 도 19b). 상기 A2 가닥의 잔기 I119 및 N121과 함께, 이들 잔기의 사이드 체인들은 Y162의 사이드 체인을 향해 있다(도 19a). 이것은 상기 B2 β 가닥, 3Cpro 결합 포켓, 및 촉매성 트리아드에 대한 접촉점을 제공한다. 돌연변이 V124P 또는 L127P 어느 것도 단백질 분해 활성을 감소시키지 않았고, 이것은 상기 촉매 트리아드에 심각한 영향을 미치지 않았음을 시사한다. 잔기 Y162에 대한 V124P 및 L127P의 가까운 근접부(proximity)는 프롤린에 대한 각각 잔기의 돌연변이가 3Cpro의 숙주 세포 단백질을 쉽게 가공하는 능력을 감소시키는 수단을 제공할 수 있다 (도 19b). 유사한 구조가 가닥 구조의 상기 사이드 체인과 연관되어 촉매성 시스테인에 바로 인접한 잔기의 위치를 조사함으로써 다른 피코르나바이러스에서 관찰된다 (도 20). 촉매성 시스테인은 FMDV에서 잔기 163, A 형 간염 바이러스에서 172, 폴리오바이러스에서 147, 인간 리노바이러스, 인간 엔테로바이러스 71 및 콕사키바이러스 B3이다. 이것은 A 형 간염 바이러스에 대한 잔기 171과, 폴리오바이러스, 인간 리노바이러스, 인간 엔테로바이러스 71, 및 콕사키바이러스 B3에 대한 잔기 146에 대한 가까운 가닥 구조체의 사이드 체인의 상호작용을 조사하는 것을 가능하게 한다. 본 발명자들은 다음과 같은 잔기가 돌연변이된 경우 3C 프로테아제의 숙주 세포 단백질에 대한 악영향을 감소시킬 수 있음을 제안한다: A 형 간염 바이러스에 대한 M128, I130, T121 및 L119; 폴리오바이러스의 경우 V104, L102 및 T142; 인간 리노바이러스의 경우 Q108, T112, I114, L102 및 L104; 인간 엔테로바이러스 71의 경우 T106, M109 및 I104; 콕사키바이러스 B3의 경우 M112, I114, F109, I104 및 L102.
2G (ii). 다른 피코르나바이러스의 I22P 및 L23P에 동족성 잔기들
FMDV에서, 잔기 I22P 및 L23P는 상기 B1 β 가닥과 쌍을 이루는 상기 A1 β 가닥의 일부이다 (도 19c). 잔기 18-31을 포함하는 상기 A1-B1 β 가닥 쌍은 상기 펩타이드 결합 포켓에 인접하고 (도 18c), 기질에 결합 시 구조적 변화를 겪는다. 그 전문이 본원에 참조로서 포함된, Zunszain 등, Journal of Molecular Biology, 2010, 395: 375-389 참조. 이것은 상기 돌연변이 I22P 및 L23P가 A1-B1 β 가닥 쌍의 구조를 변화시키는 상기 A1 β 가닥 구조의 변경을 통해 기질 결합에 영향을 줄 수 있음을 제시한다. 이러한 변경은, 기질 특이성을 파괴하는 결합 포켓의 크기 및 모양에 영향을 미칠 수 있다.
유사한 구조들이 N-말단 나선(helical) 도메인에 연결된 β-시트 구조의 잔기를 조사함으로써 다른 피코르나바이러스에서 관찰되었다 (도 21). 이것은, 돌연변이된 경우, 3C 프로테아제 숙주 세포 단백질 가공이 감소될 수 있는 하기 잔기의 확인을 가능하게 한다: 폴리오바이러스에서 잔기 T20 및 T19, 인간 리노바이러스에서 T20 및 T19, 인간 엔테로바이러스 71에서 T20 및 Q19, 콕사키바이러스 B3에서 T20 및 K19, 및 A 형 간염 바이러스에서 E20 및 G19 (도 21).
2G (iii) 다른 피코르나바이러스의 T100P와 동족성인 잔기들
FMDV에서, 돌연변이 I99P 및 T100P는 인접하고 있음에도 불구하고 상이한 P1 가공 결과를 나타낸다. 둘 다는 상기 결합 부위로부터 원위(distal)이고, A2' β 가닥과 상기 F1 β 가닥 사이의 루프 내에 위치되고, 상기 N-말단 및 C-말단 α 나선에 가까운 근접부에 위치된다 (도 19d). T100P의 것과 대조적으로, I99P로 관찰된 총 가공에서의 파괴(disruptions)는 상기 말단 나선중의 하나 또는 둘 모두의 영향 및 상기 상호 작용으로 인한 단백질 구조의 후속 파괴를 통해 촉진될 수 있다.
유사한 구조가 다른 피코르나바이러스 3C 프로테아제 구조에서 관찰되었다. 특히, 상기 단백질의 상기 N-말단과 C-말단 사이에 위치된 β 가닥 구조를 따르는 루프 영역의 구조가 모든 구조들에 존재한다 (도 22). 이것은 돌연변이된 경우, 3C 프로테아제의 부작용을 감소시킬 수 있는 하기 잔기들의 확인을 가능하게 하였다: 폴리오바이러스에서 잔기 R87, 인간 리노바이러스에서 R87 및 R88, 인간 엔테로바이러스 71에서 T87 및 K88, 콕사키바이러스 B3에서 R87 및 L90, A 형 간염 바이러스에서 T100 및 Q101 (도 22).
실시예 3. 1차 아미노산 서열의 정렬
FMDV 3C 프로테아제의 1차 아미노산 서열과 다른 피코르나바이러스 종들로부터의 3C 프로테아제의 정렬은 도 4 내지 도 12에 나타내었다. 정렬은 Blossum 62, 기본 매개변수를 사용하여 Clone Manager 9, Professional Edition, 버전 9.4, 2015.01.01 을 사용하여 준비되었다. 1차 서열 배열은 FMDV 3C 프로테아제에서, 예를 들어, V124, L127, I22, L23 및 T100에 상응하는 비-FMDV 피코르나바이러스 3C 프로테아제의 상기 아미노산 잔기를 나타낸다. 상기 1차 서열 정렬에서 동정된 상응하는 아미노산은 전체적으로 상기 기술된 구조 동족성 분석을 사용하여 동정된 것들과 일치한다.
실시예 4. 폴리오바이러스 3C 및 3CD 프로테아제 돌연변이체의 형질전환 유전자 발현을 향상
3D 폴리머라아제 (Gluc-2A-3CD)와 융합된 가우시아 루시퍼라아제 (Gaussia luciferase), 2A 번역 인터럽터 및 인간 폴리오바이러스 1 균주 Mahoney (PV) 3C 프로테아제 돌연변이체 (Gluc-2A-3C) 또는 PV 3C 프로테아제 돌연변이체를 포함하는 구조체가 제조되었다. 이러한 구조체들은 도 25에 나타내었다.
기술된 Gluc-2A-3C 및 Gluc-2A-3CD 구조체들은 하기 PV 돌연변이체들에 대해 형질전환 유전자 발현을 평가하기 위해 사용되었다: PV 3C (R87P), PV 3CD (R87P), PV 3C (L102P) 및 PV 3CD (L102P). 형질전환 유전자 발현을 평가하기 위해, 형질주입된 HEK293-T 세포로부터의 세포 배양 배지 상의 항-gluc 항체를 사용하는 웨스턴 블롯을 사용하였다. FMDV 3C (wt), PV 3C (wt), 활성 녹아웃(knockout) 돌연변이체 FMDV 3C (C163A), 활성 녹아웃(knockout) 돌연변이체 PV 3C (C172A) 및 활성 녹아웃(knockout) 돌연변이체 PV 3CD (C172A)를 포함하는 발현 카세트를 대조군으로 사용하였다. 도 26에서 명백히 나타낸 것과 같이, 상기 3C 구조체에 대한 야생형 (서열 번호 579)에 비해, 돌연변이체 R87P (서열 번호 571) 및 돌연변이체 L102P (서열 번호 569)에서 향상된 형질전환 유전자 발현이 관찰되었다. 상기 향상은 야생형 발현이 쉽게 검출되지 않는 3CD 구조체들에 대해 더욱 명확하였다.
SEQUENCE LISTING
<110> U.S. DEPARTMENT OF HOMELAND SECURITY
PUCKETTE, Michael
NEILAN, John
<120> MODIFIED PICORNAVIRUS 3C PROTEASES AND USES THEREOF
<130> DHS-0162
<160> 655
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> WT_A_2006
<400> 1
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 2
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 2
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 3
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> WT_A24
<400> 3
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc atc ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 4
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 4
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 5
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> WT_Asia_leb_89
<400> 5
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 6
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 6
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 7
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> WT_Asia1_Shamir
<400> 7
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ttg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 8
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 8
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 9
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<223> WT_C3
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> WT_C3
<400> 9
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg att ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 10
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 10
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 11
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> WT_O_pan_asia
<400> 11
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ata ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 12
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 12
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 13
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> WT_O1_Manissa
<400> 13
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 14
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 14
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 15
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> WT_SAT1
<400> 15
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc atc ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 16
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 16
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 17
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> WT_SAT2_Egypt_2010
<400> 17
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ata ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctc atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 18
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 18
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 19
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> WT_SAT3
<400> 19
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 20
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 20
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 21
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> D123P_A_2006
<400> 21
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct ccn gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 22
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 22
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 23
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> D123P_A24
<400> 23
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc atc ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc ccn gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 24
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 24
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 25
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> D123P_Asia_leb_89
<400> 25
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc ccn gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 26
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 26
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 27
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> D123P_Asia1_Shamir
<400> 27
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc ccn gtt ggg aga ttg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 28
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 28
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 29
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> D123P_C3
<400> 29
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg att ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc ccn gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 30
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 30
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 31
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> D123P_O_pan_asia
<400> 31
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ata ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc ccn gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 32
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 32
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 33
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> D123P_O1_Manissa
<400> 33
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc ccn gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 34
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 34
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 35
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> D123P_SAT1
<400> 35
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc atc ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc ccn gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 36
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 36
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 37
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> D123P_SAT2_Egypt_2010
<400> 37
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ata ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc ccn gtt ggg aga ctc atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 38
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 38
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 39
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> D123P_SAT3
<400> 39
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct ccn gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 40
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 40
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Pro Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 41
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> G125P_A_2006
<400> 41
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat gtc ccn aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 42
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 42
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 43
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> G125P_A24
<400> 43
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc atc ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat gtc ccn aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 44
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 44
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 45
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> G125P_Asia_leb_89
<400> 45
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ccn aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 46
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 46
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 47
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> G125P_Asia1_Shamir
<400> 47
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ccn aga ttg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 48
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 49
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> G125P_C3
<400> 49
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg att ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac gtt ccn aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 50
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 50
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 51
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> G125P_O_pan_asia
<400> 51
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ata ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat gtc ccn aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 52
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 52
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 53
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> G125P_O1_Manissa
<400> 53
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac gtt ccn aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 54
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 54
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 55
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> G125P_SAT1
<400> 55
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc atc ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac gtc ccn aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 56
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 56
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 57
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> G125P_SAT2_Egypt_2010
<400> 57
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ata ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ccn aga ctc atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 58
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 58
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 59
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> G125P_SAT3
<400> 59
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat gtc ccn aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 60
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 60
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Pro Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 61
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I128P_A_2006
<400> 61
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat gtc ggg aga ctg ccn 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 62
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 62
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 63
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I128P_A24
<400> 63
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc atc ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg ccn 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 64
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 64
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 65
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I128P_Asia_leb_89
<400> 65
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg ccn 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 66
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 66
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 67
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I128P_Asia1_Shamir
<400> 67
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ttg ccn 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 68
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 68
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 69
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I128P_C3
<400> 69
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg att ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg ccn 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 70
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 70
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 71
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I128P_O_pan_asia
<400> 71
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ata ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg ccn 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 72
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 72
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 73
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I128P_O1_Manissa
<400> 73
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg ccn 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 74
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 74
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 75
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I128P_SAT1
<400> 75
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc atc ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac gtc gga aga ctc ccn 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 76
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 76
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 77
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I128P_SAT2_Egypt_2010
<400> 77
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ata ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctc ccn 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 78
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 78
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 79
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I128P_SAT3
<400> 79
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat gtc gga aga ctc ccn 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 80
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 80
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Pro
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 81
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P_A_2006
<400> 81
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 82
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 82
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 83
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P_A24
<400> 83
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ccn ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 84
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 84
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 85
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P_Asia_leb_89
<400> 85
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 86
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 86
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 87
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P_Asia1_Shami
<400> 87
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ttg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 88
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 88
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 89
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P_C3
<400> 89
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg ccn ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 90
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 90
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 91
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P_O_pan_asia
<400> 91
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ccn ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 92
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 92
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 93
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P_O1_Manissa
<400> 93
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 94
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 94
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 95
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<223> I22P_SAT1
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P_SAT1
<400> 95
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc ccn ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 96
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 96
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 97
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<223> I22P_SAT2_Egypt_2010
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P_SAT2_Egypt_2010
<400> 97
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ccn ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctc atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 98
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 98
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 99
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P_SAT3
<400> 99
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 100
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 100
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 101
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I99P_A_2006
<400> 101
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac ccn acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 102
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 102
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 103
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I99P_A24
<400> 103
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc atc ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac ccn acg aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 104
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 104
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 105
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I99P_Asia_leb_89
<400> 105
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac ccn acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 106
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 106
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 107
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> 199P_Asia_Shamir
<400> 107
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac ccn acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ttg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 108
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 108
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 109
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I99P_C3
<400> 109
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg att ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac ccn acg aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 110
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 110
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 111
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> 199P_O_pan_asia
<400> 111
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ata ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac ccn acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 112
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 112
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 113
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> 199P_01_Manissa
<400> 113
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac ccn acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 114
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 114
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 115
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> 199P_SAT2_Egypt_2010
<400> 115
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ata ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac ccn acg aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctc atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 116
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 116
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Pro Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 117
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L127P_A_2006
<400> 117
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat gtc ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 118
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 118
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 119
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L127P_A24
<400> 119
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc atc ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 120
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 120
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 121
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L127P_Asia_leb_89
<400> 121
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 122
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 122
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 123
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L127P_Asia1_Shamir
<400> 123
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 124
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 124
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 125
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L127P_C3
<400> 125
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg att ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 126
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 126
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 127
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L127P_O_pan_asia
<400> 127
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ata ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 128
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 128
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 129
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L127P_01_Manissa
<400> 129
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 130
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 130
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 131
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L127P_SAT1
<400> 131
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc atc ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac gtc gga aga ccn atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 132
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 132
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 133
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L127P_SAT2_Egypt_2010
<400> 133
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ata ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 134
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 134
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 135
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L127P_SAT3
<400> 135
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat gtc gga aga ccn atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 136
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 136
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 137
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L23P_A_2006
<400> 137
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ccn gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 138
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 138
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 139
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L23P_A24
<400> 139
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc atc ccn gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 140
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 140
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 141
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L23P_Asia_leb_89
<400> 141
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ccn gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 142
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 142
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 143
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L23P_Asia_Shamir
<400> 143
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ccn gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ttg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 144
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 144
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 145
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L23P_C3
<400> 145
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg att ccn gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 146
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 146
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 147
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L23P_O_pan_asia
<400> 147
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ata ccn gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 148
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 148
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 149
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L23P_01_Manissa
<400> 149
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ccn gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 150
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 150
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 151
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L23P_SAT1
<400> 151
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc atc ccn gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 152
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 152
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 153
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L23P_SAT2_Egypt_2010
<400> 153
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ata ccn gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctc atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 154
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 154
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 155
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L23P_SAT3
<400> 155
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ccn gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 156
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 156
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Pro Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 157
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L42H_A_2006
<400> 157
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac cay gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 158
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 158
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 159
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L42H_A24
<400> 159
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc atc ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac cay gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 160
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 160
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 161
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L42H_Asia_leb_89
<400> 161
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac cay gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 162
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 162
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 163
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L42H_Asia1_Shamir
<400> 163
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac cay gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ttg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 164
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 164
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 165
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L42H_C3
<400> 165
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg att ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac cay gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 166
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 166
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 167
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L42H_O_pan_asia
<400> 167
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ata ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac cay gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 168
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 168
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 169
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L42H_01_Manissa
<400> 169
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac cay gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 170
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 170
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 171
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L42H_SAT1
<400> 171
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc atc ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat cay gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 172
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 172
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 173
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L42H_SAT_Egypt_2010
<400> 173
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ata ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat cay gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctc atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 174
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 174
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 175
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L42H_SAT3
<400> 175
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac cay gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 176
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 176
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr His Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 177
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L99P_SAT1
<400> 177
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc atc ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ccn acg gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Pro Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 178
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 178
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Pro Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 179
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> L99P_SAT3
<400> 179
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ccn acg gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Pro Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 180
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 180
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Pro Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 181
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> R126P_A_2006
<400> 181
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat gtc ggg ccn ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 182
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 182
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 183
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> R126P_A24
<400> 183
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc atc ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat gtc ggg ccn ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 184
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 184
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 185
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> R126P_Asia_leb_88
<400> 185
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg ccn ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 186
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 186
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 187
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> R126P_Asia_Shamir
<400> 187
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg ccn ttg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 188
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 188
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 189
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> R126P_C3
<400> 189
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg att ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac gtt ggg ccn ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 190
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 190
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 191
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> R126_O_pan_asia
<400> 191
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ata ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat gtc ggg ccn ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 192
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 192
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 193
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> R126P_01_Manissa
<400> 193
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg ccn ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 194
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 194
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 195
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> R126P_SAT1
<400> 195
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc atc ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac gtc gga ccn ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 196
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 196
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 197
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> R126_SAT_Egypt_2010
<400> 197
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ata ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg ccn ctc atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 198
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 198
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 199
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> R126P_SAT3
<400> 199
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat gtc gga ccn ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 200
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 200
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Pro Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 201
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P_A_2006
<400> 201
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 202
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 202
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 203
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P_A24
<400> 203
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc atc ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 204
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 204
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 205
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P_Asia_leb_89
<400> 205
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 206
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 206
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 207
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P_Asia1_Shamir
<400> 207
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ttg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 208
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 208
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 209
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P_C3
<400> 209
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg att ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 210
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 210
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 211
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P_O_pan_asia
<400> 211
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ata ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc ccn aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 212
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 212
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 213
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P_O1_Manissa
<400> 213
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 214
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 214
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 215
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P_SAT1
<400> 215
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc atc ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc ccn gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 216
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 216
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 217
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P_SAT_Egypt_2010
<400> 217
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ata ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctc atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 218
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 218
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 219
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P_SAT3
<400> 219
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc ccn gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 220
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 220
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 221
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P_A_2006
<400> 221
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat ccn ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 222
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 222
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 223
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P_A24
<400> 223
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc atc ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat ccn ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 224
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 224
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 225
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P_Asia_leb_89
<400> 225
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac ccn ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 226
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 226
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 227
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P_Asia1_Shamir
<400> 227
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac ccn ggg aga ttg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 228
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 228
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 229
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P_C3
<400> 229
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg att ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac ccn ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 230
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 230
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 231
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P_O-pan_asia
<400> 231
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ata ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat ccc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 232
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 232
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 233
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P_01_Manissa
<400> 233
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac ccn ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 234
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 234
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 235
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P_SAT1
<400> 235
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc atc ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac ccn gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 236
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 236
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 237
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P_SAT2_Egypt_2010
<400> 237
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ata ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac ccn ggg aga ctc atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 238
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 238
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 239
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P_SAT3
<400> 239
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat ccn gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 240
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 240
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 241
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/L127P_A_2006
<400> 241
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat gtc ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 242
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 242
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 243
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/L127P_A24
<400> 243
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ccn ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 244
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 244
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 245
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/L127P_asia_leb_89
<400> 245
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 246
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 246
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 247
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/L127P_Asia1_Shamir
<400> 247
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 248
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 248
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 249
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/L127_C3
<400> 249
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg ccn ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 250
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 250
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 251
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/L127P_O_pan_asia
<400> 251
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ccn ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 252
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 252
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 253
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/L127P_01_Manissa
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<400> 253
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 254
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 254
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 255
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/L127P_SAT1
<400> 255
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc ccn ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac gtc gga aga ccn atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 256
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 256
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 257
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/L127P_SAT2_Egypt_2010
<400> 257
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ccn ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 258
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 258
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 259
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/L127_SAT3
<400> 259
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat gtc gga aga ccn atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 260
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 260
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 261
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P/L127P_A_2006
<400> 261
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat gtc ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 262
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 262
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 263
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P/L127P_A24
<400> 263
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc atc ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 264
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 264
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 265
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P/L127P_Asia_leb_89
<400> 265
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 266
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 266
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 267
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P/L127P_Asia1_Shamir
<400> 267
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac ccn ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 268
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 268
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 269
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P/L127P_C3
<400> 269
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg att ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 270
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 270
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 271
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P/L127P_O_pan_asia
<400> 271
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ata ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat ccn ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 272
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 272
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 273
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P/L127P_01_Manissa
<400> 273
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac ccn ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 274
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 274
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 275
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P/L127P_SAT1
<400> 275
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc atc ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc ccn gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac gtc gga aga ccn atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 276
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 276
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 277
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P/L127P_SAT2_Egypt_2010
<400> 277
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ata ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 278
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 278
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 279
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T100P/L127P_SAT3
<400> 279
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc ccn gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat gtc gga aga ccn atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 280
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 280
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 281
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T34A/M88L_A_2006
<400> 281
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct gcn gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc ctn gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 282
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> misc_feature
<222> (88)..(88)
<223> The 'Xaa' at location 88 stands for Leu.
<400> 282
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 283
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T34A/M88L_24
<400> 283
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc atc ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct gcn gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc ctn gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 284
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> misc_feature
<222> (88)..(88)
<223> The 'Xaa' at location 88 stands for Leu.
<400> 284
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 285
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T34A/M88L_Asia_leb_89
<400> 285
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc gcn gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc ctn gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 286
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> misc_feature
<222> (88)..(88)
<223> The 'Xaa' at location 88 stands for Leu.
<400> 286
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 287
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T34A/M88L_Asia1_Shamir
<400> 287
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc gcn gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc ctn gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ttg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 288
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> misc_feature
<222> (88)..(88)
<223> The 'Xaa' at location 88 stands for Leu.
<400> 288
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 289
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T34A/M88L_C3
<400> 289
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg att ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc gcn gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc ctn gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 290
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> misc_feature
<222> (88)..(88)
<223> The 'Xaa' at location 88 stands for Leu.
<400> 290
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 291
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T34A/M88L_O_pan_asia
<400> 291
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ata ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct gcn gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc ctn gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 292
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> misc_feature
<222> (88)..(88)
<223> The 'Xaa' at location 88 stands for Leu.
<400> 292
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 293
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T34A/M88L_01_Manissa
<400> 293
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct gcn gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc ctn gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 294
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> misc_feature
<222> (88)..(88)
<223> The 'Xaa' at location 88 stands for Leu.
<400> 294
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 295
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T34A/M88L_SAT1
<400> 295
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc atc ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct gcn gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc ctn gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 296
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> misc_feature
<222> (88)..(88)
<223> The 'Xaa' at location 88 stands for Leu.
<400> 296
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 297
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T34A/M88L_SAT2_Egypt_2010
<400> 297
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ata ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc gcn gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc ctn gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctc atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 298
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> misc_feature
<222> (88)..(88)
<223> The 'Xaa' at location 88 stands for Leu.
<400> 298
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 299
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> T34A/M88L_SAT3
<400> 299
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg gcn gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc ctn gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat gtc gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 300
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> misc_feature
<222> (88)..(88)
<223> The 'Xaa' at location 88 stands for Leu.
<400> 300
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Ala Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Xaa Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 301
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P/L127P_A_2006
<400> 301
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat ccn ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 302
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 302
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 303
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P/L127P_A24
<400> 303
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc atc ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat ccn ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 304
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 304
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 305
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P/L127P_Asia_leb_89
<400> 305
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac ccn ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 306
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 306
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 307
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P/L127P_Asia1_Shamir
<400> 307
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac ccn ggg aga tcn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Xaa Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 308
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> misc_feature
<222> (127)..(127)
<223> The 'Xaa' at location 127 stands for Ser.
<400> 308
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Xaa Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 309
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P/L127P_C3
<400> 309
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg att ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac ccn ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 310
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 310
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 311
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P/L127P_O_pan_asia
<400> 311
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ata ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc acg aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 312
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 312
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 313
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P/L127P_01_Manissa
<400> 313
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 314
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 314
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 315
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P/L127P_SAT1
<400> 315
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc atc ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac ccn gga aga ccn atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 316
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 316
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 317
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P/L127P_SAT2_Egypt_2010
<400> 317
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ata ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc acg aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac ccn ggg aga ccn atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 318
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 318
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 319
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> V124P/L127P_SAT3
<400> 319
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc atc ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc acg gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat ccn gga aga ccn atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 320
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 320
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Ile Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Thr Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 321
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/L127P_A_2006
<400> 321
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat gtc ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 322
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 322
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 323
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/L127P_A24
<400> 323
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ccn ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 324
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 324
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 325
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/L127P_Asia_leb_89
<400> 325
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 326
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 326
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 327
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/L127P_Asia1_Shamir
<400> 327
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 328
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 328
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 329
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/L127P_C3
<400> 329
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg ccn ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 330
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 330
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 331
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/L127P_O_pan_asia
<400> 331
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ccn ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc ccn aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat gtc ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 332
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 332
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 333
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/L127P_)1_Manissa
<400> 333
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 334
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 334
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 335
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/L127P_SAT1
<400> 335
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc ccn ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc ccn gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac gtc gga aga ccn atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 336
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 336
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 337
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/L127P_SAT2_Egypt_2010
<400> 337
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ccn ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac gtt ggg aga ccn atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 338
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 338
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 339
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/L127P_SAT3
<400> 339
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc ccn gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat gtc gga aga ccn atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 340
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 340
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Val Gly Arg Pro Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 341
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/V124P_A_2006
<400> 341
agt ggt gcc ccc ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgt tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctt gtg cca cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa ggg cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aag ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtt atc aac aac gct gat ccn ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tat tgt gga gga gct gtt ctt gca aag gac gga gcc gag acc ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca ggt ggt aat gga gtt gga tac tgt tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctg cta aag atg aag gca cac atc gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 342
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 342
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 343
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/V124P_A24
<400> 343
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag ttg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ccn ctt gac ggg aag acg gta gcc att tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtt ttc ggc act gct tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gat 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtg atc aac aac gcc gat ccn ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gaa gcc ctt acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggg ctc ttt gcc tac aaa gcc gca acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tat tgc gga gga gcc gtc ctc gct aag gac ggg gct gac acg ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tcc gct gga ggc aat ggc gtt gga tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc agg tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac gtt gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 344
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 344
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Leu Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Val Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 345
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/V124P_Asia_leb_89
<400> 345
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac ccn ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 346
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 346
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 347
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/V124P_Asia1_Shamir
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<400> 347
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg agc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctt gac ggt aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggt act gcc tac ctc gtg cct cgt cac ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gaa aag tac gac agg atc atg ttg gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggc aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cac ttt cgt gat aca gca aga atg aag aaa ggt 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggc gtg atc aac aac gcc gac ccn ggg aga ttg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tcc ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc cta ttt gcc tac aga gcc gct acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcc aag gac gga gct gac aca ttt 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gca gga ggc aat gga gtc ggg tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gta tct agg tcc atg ctc ttg aag atg aag gca cac att gac ccc 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 348
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 348
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ser Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Arg Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 349
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22/T100P/V124P_C3
<400> 349
agc ggt gcc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg ggc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctg ccn ctc gat ggg aag acg gtg gcc atc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc acc gga gtg ttt ggc act gct tac ctc gtg ccg cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gca ctc atg gtg cta cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aag cac ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gta ggc gtg att aac aac gcc gac ccn ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctt acc tac aaa gac att gtg gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgt gga gga gcc gtc ctt gcc aag gat gga gct gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tct gct gga ggc aat gga gtt ggt tac tgc tca 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aga tcc atg ctt ctc aag atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gag cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 350
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 350
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 351
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P?124P_O_pan_asia
<400> 351
agt ggt gct cca ccg act gac ttg caa aag atg gtc atg ggt aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag ccc gtt gag ctc ccn ctt gac ggg aag aca gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct act gga gtg ttt ggc acc gcc tac ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ttg gac ggc aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gcc gcg ctc atg gtg ctc cac cgt ggg aat cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgg gac atc ccn aaa cac ttc cgt gat gtg gca aga atg aag aaa gga 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtc gtt ggt gtt atc aac aac gcc gat ccn ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct ggt gag gcc ctc acc tac aag gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg cct ggc ctc ttt gcc tac aag gcc gcc acc aag gcc 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctc gca aag gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc aca cac tct gcg ggc ggc aac gga gtt gga tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctg ctc aag atg aag gca cac ata gat cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cat gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 352
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 352
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Val Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 353
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/V124P_01_Manissaa
<400> 353
agt ggt gcc cca ccg acc gac ttg cag aag atg gtc atg ggc aac act 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctc gac ggg aag acg gta gcc atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gct acc gga gtg ttt ggc act gcc tac ctc gta cct cgt cac ctc ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gcg gag aag tac gac aag ata atg ttg gac ggt aga gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
agt gac tac aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gac gct gca ctc atg gtg ctt cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aaa cat ttt cgt gac aca gca aga atg aag aaa ggc 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtt gtc ggt gtg atc aac aac gcc gac ccn ggg aga ctg att 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gcc ctt acc tac aaa gac att gta gtg tgc atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
gga gac acc atg ccg ggc ctg ttt gcc tac aga gcc gcc acc aag gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggt tac tgc ggg gga gcc gtt ctc gcc aag gac gga gcc gac aca ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
atc gtt ggc act cac tcc gca ggt ggt aac gga gtt gga tac tgc tcg 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtg tcc agg tcc atg ctc ctg aaa atg aag gca cac att gac cct 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gag 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 354
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 354
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Gly Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Tyr Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Thr Ala Arg Met Lys Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Asp Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Lys Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 355
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/V124P_SAT1
<400> 355
agc gga tgt cca ccg acc gac ctg cag agg atg gtc atg gca aac gtg 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aaa ccc gtt gag ctc ccn ctc gat ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gct acg gga gtg ttc ggg acg gct tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tac gac aag atc atg ctg gac ggc cgt gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttc aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tca gat gcc gcg ctc atg gtt ctc cac tcc gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc ccn gga cac ttc cgt gac aca atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agt ccc gtc gtt ggt gtg gtc aac aac gcc gac ccn gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gac acc atg ccc gga ctc ttc gca tac cgc gcg ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
ggt tat tgt gga gca gcc gtt ctt gca aaa gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtc ggc acc cac tca gcc ggt ggc aac gga gta ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgt gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aaa gcc cac atc gac ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gcc ccc cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 356
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 356
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Arg Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 357
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/V124P_SAT_Egypt_2010
<400> 357
agt gga gcg cca ccc acc gac ttg caa aag atg gtg atg gcc aac acc 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
aaa cca gtc gag ctc ccn ctc gat ggt aag aca gtg gcg atc tgc tgt 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
gcc act gga gtg ttt ggg act gcc tat ctc gtg cct cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gct gag aag tat gac aag atc atg att gac ggc agg gcc atg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
cgt gat ttc aga gtg ttt gag ttt gag att aaa gta aaa gga cag gac 240
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tcg gac gcc gcc ctc atg gtg ctg cac cgt ggg aac cgc gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
aga gac atc ccn aag cac ttt cgt gat caa gca aga atg aga aaa gga 336
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
acc ccc gtg gtt ggc gtg atc aac aac gcc gac ccn ggg aga ctc atc 384
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tct gga gag gca ctc acc tac aaa gac att gta gtg tgt atg gat 432
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggc gac acc atg cca ggc ctc ttt gcc tat aaa gcc gcc acc aaa gct 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
ggc tac tgt gga gga gcc gtt ctt gcg aaa gac gga gcc gag act ttc 528
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
atc gtc ggc act cac tcc gct gga gga aac gga gtt ggt tac tgc tct 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtt tcc aag tcc atg ctc ctg caa atg aag gca cac att gat cct 624
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gaa cca cac cac gaa 639
Glu Pro His His Glu
210
<210> 358
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 358
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Thr
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Ile Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Ile Asp Gly Arg Ala Met Thr Asp
50 55 60
Arg Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Ile Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Arg Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Lys His Phe Arg Asp Gln Ala Arg Met Arg Lys Gly
100 105 110
Thr Pro Val Val Gly Val Ile Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Glu Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Ile Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Lys Ala
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Gly Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Glu Thr Phe
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Lys Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Glu Pro His His Glu
210
<210> 359
<211> 639
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(639)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(639)
<223> I22P/T100P/V124P_SAT3
<400> 359
agc gga tgc cca ccg acc gac ttg caa aag atg gtc atg gca aac gta 48
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
aag cct gtt gag ctc ccn ctc gac ggg aag acc gtt gcg ctc tgc tgc 96
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
gcg acg gga gtg ttt ggg aca gct tac ctc gtg ccc cgt cat ctt ttc 144
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
gca gag aag tat gac aag atc atg ctg gac ggc cgc gcc ctg aca gac 192
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
agt gac ttt aga gtg ttt gag ttt gag gtg aaa gta aaa gga cag gac 240
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
atg ctc tct gat gcc gca ctc atg gtt ctc cac tct gga aac cgt gtg 288
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
cgc gat ctc ccn gga cac ttc cgt gac acc atg aaa ctg tcg aaa ggc 336
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
agc ccc gtc gtt ggt gtt gtc aac aac gct gat ccn gga aga ctc atc 384
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
ttc tca gga gac gca ctg acc tac aaa gac ctg gtc gtt tgt atg gac 432
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
ggt gat acc atg cct gga ctc ttc gct tac cgc gca ggg acc aag gtt 480
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
gga tac tgc gga gct gcc gtt ctc gca aag gac ggc gcc aag act gtg 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
atc gtt ggc acc cac tca gcc gga ggc aac gga gtg ggc tac tgc tcc 576
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
tgc gtc tca cga tcc atg ctc ctg cag atg aag gcc cac att gat ccg 624
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
gct cct cac acc gag 639
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 360
<211> 213
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 360
Ser Gly Cys Pro Pro Thr Asp Leu Gln Lys Met Val Met Ala Asn Val
1 5 10 15
Lys Pro Val Glu Leu Pro Leu Asp Gly Lys Thr Val Ala Leu Cys Cys
20 25 30
Ala Thr Gly Val Phe Gly Thr Ala Tyr Leu Val Pro Arg His Leu Phe
35 40 45
Ala Glu Lys Tyr Asp Lys Ile Met Leu Asp Gly Arg Ala Leu Thr Asp
50 55 60
Ser Asp Phe Arg Val Phe Glu Phe Glu Val Lys Val Lys Gly Gln Asp
65 70 75 80
Met Leu Ser Asp Ala Ala Leu Met Val Leu His Ser Gly Asn Arg Val
85 90 95
Arg Asp Leu Pro Gly His Phe Arg Asp Thr Met Lys Leu Ser Lys Gly
100 105 110
Ser Pro Val Val Gly Val Val Asn Asn Ala Asp Pro Gly Arg Leu Ile
115 120 125
Phe Ser Gly Asp Ala Leu Thr Tyr Lys Asp Leu Val Val Cys Met Asp
130 135 140
Gly Asp Thr Met Pro Gly Leu Phe Ala Tyr Arg Ala Gly Thr Lys Val
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Val Leu Ala Lys Asp Gly Ala Lys Thr Val
165 170 175
Ile Val Gly Thr His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Val Gly Tyr Cys Ser
180 185 190
Cys Val Ser Arg Ser Met Leu Leu Gln Met Lys Ala His Ile Asp Pro
195 200 205
Ala Pro His Thr Glu
210
<210> 361
<211> 2262
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> P1_A2006_cut_sites_removed
<400> 361
ggagccgggc aatccagtcc ggcaaccggg tcacaaaacc aatcaggcaa cactggtagt 60
atcatcaaca actactacat gcagcagtac cagaactcca tggatacaca acttggcgac 120
aacgccatta gcggtggttc caacgagggc tccactgaca ctacctccac acacacaacc 180
aacacacaga acaatgactg gttttcaaag ctggccagtt ctgccttcag cggtctcttc 240
ggcgctcttc tcgctgacaa aaagacagag gagactaccc tcctggaaga ccgcatcctt 300
accacccgca acggacacac cacctcgaca acccagtcga gtgtgggtgt cacctacggg 360
tactccactg gtgaagacca cgtctctgga cctaacacat ctggcctgga gacgcgagtg 420
gtacaggcag agagattctt caagaaacac ttgtttgatt ggacaactga taaggctttt 480
ggacacctgg aaaaactgga actccccacc gaacacaagg gtgtctatgg gcacttggtg 540
gactctttcg catacatgag aaatggctgg gacgtggagg tgacagccgt tggcaatcag 600
ttcaacggtg ggtgtctcct ggtggccatg gttcctgagt ggaaagagtt tacccctcgt 660
gagaaatacc agctcaccct gtttccacac caatttatca accccagaac caacatgaca 720
gcccacatca cggtcccgta ccttggtgtc aataggtatg accagtacaa acagcacaaa 780
ccctggacac tggtcgtgat ggtggtttcg ccactgacca ccagcagcat tggggcctca 840
cagattaagg tctatgccaa cattgcccca accttcgttc acgtggccgg cgagctccca 900
tcgaaagaag ggatcgtgcc ggttgcttgt acagacgggt acggtggcct ggtgacaaca 960
gacccgaaaa cagctgaccc tgtttatggt atggtgtaca acccgcccag aaccaactac 1020
cctgggcgct ttacaaactt gttggacgtg gccgaggctt gcccgacctt cctctgtttt 1080
gacgacggga aaccttacgt tgtgacaagg acggacgacc aacgcctcct ggccaagttt 1140
gacgtttctc ttgctgcaaa gcacatgtca aacacctacc tctcagggat agcacagtac 1200
tacacgcagt actctggcac tatcaatctg catttcatgt tcactggctc tactgaatca 1260
aaggcccggt acatggtggc gtacattcca cctggcatgg acaacccacc ggacacacct 1320
gagaaggctg cacactgcat ccacgccgag tgggacaccg ggctgaactc caaatttact 1380
ttttctatcc cttacgtgtc tgctgcagac tacgcataca ctgcgtctga cgtggcagaa 1440
acaacaaacg tacaggggtg ggtctgcata taccaaatca ctcacgggaa ggctgaacag 1500
gacactctgg tcgtgtcggt cagcgccggc aaggactttg aactgcgcct cccaattgac 1560
ccccgcacgc aaaccaccac tgccggggag tcagcagacc ctgtcaccac caccgttgag 1620
aactacggtg gtgagacaca ggctcagcga cgtcagcaca ctgacgtcgg cttcatcatg 1680
gacaggtttg cgaaaatcag ccccgtgagc cccacgcacg tcattgacct catgcaaaca 1740
caccaacatg cgttggtggg tgcccttttg cgtgcagcca cgtactactt ctccgatctg 1800
gagattgtgg tgcgtcatga tggcaacttg acgtgggtgc ccaatggagc acctgtagaa 1860
gccttggcca acacaagcaa ccccaccgcc taccacaagc agccatttac gagacttgcg 1920
ctcccttaca ccgcgccgca ccgagtgttg gcaacagtgt ataacggagt aagcaagtac 1980
tctacaactg gtaatggcag aaggggtgat ctggggcctc ttgcggcgcg ggtcgccgca 2040
cagctcccca gctctttcaa ttttggtgca attcgggcca cgaccgtcca cgagcttctc 2100
gtgcgcatga aacgtgccga gctctactgt ccaaggcctc tgctggcagt ggaagtgttg 2160
tcgcaggaca gacacaagca aaagatcatt gcacctgcaa agcaactcct gaacttcgac 2220
ctgctcaagt tggcgggaga cgttgagtcc aaccccgggc cc 2262
<210> 362
<211> 2262
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(2262)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(2262)
<223> P1_A2006_wildtype
<400> 362
gga gcc ggg caa tcc agt ccg gca acc ggg tca caa aac caa tca ggc 48
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
aac act ggt agt atc atc aac aac tac tac atg cag cag tac cag aac 96
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
tcc atg gat aca caa ctt ggc gac aac gcc att agc ggt ggt tcc aac 144
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
gag ggc tcc act gac act acc tcc aca cac aca acc aac aca cag aac 192
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Thr Asn Thr Gln Asn
50 55 60
aat gac tgg ttt tca aag ctg gcc agt tct gcc ttc agc ggt ctc ttc 240
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Ser Ser Ala Phe Ser Gly Leu Phe
65 70 75 80
ggc gct ctt ctc gct gac aaa aag aca gag gag act acc ctc ctg gag 288
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
gac cgc atc ctt acc acc cgc aac gga cac acc acc tcg aca acc cag 336
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
tcg agt gtg ggt gtc acc tac ggg tac tcc act ggt gaa gac cac gtc 384
Ser Ser Val Gly Val Thr Tyr Gly Tyr Ser Thr Gly Glu Asp His Val
115 120 125
tct gga cct aac aca tct ggc ctg gag acg cga gtg gta cag gca gag 432
Ser Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Val Gln Ala Glu
130 135 140
aga ttc ttc aag aaa cac ttg ttt gat tgg aca act gat aaa gct ttt 480
Arg Phe Phe Lys Lys His Leu Phe Asp Trp Thr Thr Asp Lys Ala Phe
145 150 155 160
gga cac ctg gaa aaa ctg gaa ctc ccc acc gaa cac aag ggt gtc tac 528
Gly His Leu Glu Lys Leu Glu Leu Pro Thr Glu His Lys Gly Val Tyr
165 170 175
ggg cac ttg gtg gac tct ttc gca tac atg aga aat ggc tgg gac gtg 576
Gly His Leu Val Asp Ser Phe Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
gag gtg acc gcc gtt ggc aac cag ttc aac ggt ggg tgt ctc ctg gtg 624
Glu Val Thr Ala Val Gly Asn Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val
195 200 205
gcc atg gta cct gag tgg aaa gag ttt acc cct cgt gag aaa tac cag 672
Ala Met Val Pro Glu Trp Lys Glu Phe Thr Pro Arg Glu Lys Tyr Gln
210 215 220
ctc acc ctg ttt cca cac caa ttt atc aac ccc aga acc aac atg aca 720
Leu Thr Leu Phe Pro His Gln Phe Ile Asn Pro Arg Thr Asn Met Thr
225 230 235 240
gcc cac atc acg gtc ccg tac ctt ggt gtc aat agg tat gac cag tac 768
Ala His Ile Thr Val Pro Tyr Leu Gly Val Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr
245 250 255
aaa cag cac aaa ccc tgg aca ctg gtc gtg atg gtg gtt tcg cca ctg 816
Lys Gln His Lys Pro Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ser Pro Leu
260 265 270
acc acc agc agc att ggg gcc tca cag att aag gtc tac gcc aac att 864
Thr Thr Ser Ser Ile Gly Ala Ser Gln Ile Lys Val Tyr Ala Asn Ile
275 280 285
gcc cca acc ttc gtt cac gtg gcc ggc gag ctc cca tcg aaa gaa ggg 912
Ala Pro Thr Phe Val His Val Ala Gly Glu Leu Pro Ser Lys Glu Gly
290 295 300
atc gtg ccg gtt gct tgt aca gac ggg tac ggt ggc ctg gtg aca aca 960
Ile Val Pro Val Ala Cys Thr Asp Gly Tyr Gly Gly Leu Val Thr Thr
305 310 315 320
gac ccg aaa aca gct gac cct gtt tat ggt atg gtg tac aac ccg ccc 1008
Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Val Tyr Gly Met Val Tyr Asn Pro Pro
325 330 335
aga acc aac tac cct ggg cgc ttt aca aac ttg ttg gac gtg gcc gag 1056
Arg Thr Asn Tyr Pro Gly Arg Phe Thr Asn Leu Leu Asp Val Ala Glu
340 345 350
gct tgc ccg acc ttc ctc tgt ttt gac gac ggg aaa ccg tac gtt gtg 1104
Ala Cys Pro Thr Phe Leu Cys Phe Asp Asp Gly Lys Pro Tyr Val Val
355 360 365
aca agg acg gac gac caa cgc ctc ctg gcc aag ttt gac gtt tct ctt 1152
Thr Arg Thr Asp Asp Gln Arg Leu Leu Ala Lys Phe Asp Val Ser Leu
370 375 380
gct gca aag cac atg tca aac acc tac ctc tca ggg ata gca cag tac 1200
Ala Ala Lys His Met Ser Asn Thr Tyr Leu Ser Gly Ile Ala Gln Tyr
385 390 395 400
tac acg cag tac tct ggc act atc aat ctg cat ttc atg ttc act ggc 1248
Tyr Thr Gln Tyr Ser Gly Thr Ile Asn Leu His Phe Met Phe Thr Gly
405 410 415
tct act gaa tca aag gcc cgg tac atg gtg gcg tac att cca cct ggc 1296
Ser Thr Glu Ser Lys Ala Arg Tyr Met Val Ala Tyr Ile Pro Pro Gly
420 425 430
atg gac aac cca ccg gac aca cct gag aag gct gca cac tgc atc cac 1344
Met Asp Asn Pro Pro Asp Thr Pro Glu Lys Ala Ala His Cys Ile His
435 440 445
gcc gag tgg gac acc ggg ctg aac tcc aaa ttt act ttt tct atc ccg 1392
Ala Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Ser Ile Pro
450 455 460
tac gtg tct gct gca gac tac gca tac act gcg tct gac gtg gca gaa 1440
Tyr Val Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Ala Ser Asp Val Ala Glu
465 470 475 480
aca aca aac gta cag ggg tgg gtc tgc ata tac caa atc act cac ggg 1488
Thr Thr Asn Val Gln Gly Trp Val Cys Ile Tyr Gln Ile Thr His Gly
485 490 495
aag gct gaa cag gac act ctg gtc gtg tcg gtc agc gcc ggc aag gac 1536
Lys Ala Glu Gln Asp Thr Leu Val Val Ser Val Ser Ala Gly Lys Asp
500 505 510
ttt gaa ctg cgc ctc cca att gac ccc cgc acg caa acc acc act gcc 1584
Phe Glu Leu Arg Leu Pro Ile Asp Pro Arg Thr Gln Thr Thr Thr Ala
515 520 525
ggg gag tca gca gac cct gtc acc acc acc gtt gag aac tac ggt ggt 1632
Gly Glu Ser Ala Asp Pro Val Thr Thr Thr Val Glu Asn Tyr Gly Gly
530 535 540
gag aca cag gct cag cga cgt cag cac act gac gtc ggc ttc atc atg 1680
Glu Thr Gln Ala Gln Arg Arg Gln His Thr Asp Val Gly Phe Ile Met
545 550 555 560
gac agg ttt gcg aaa atc agc ccc gtg agc ccc acg cac gtc att gac 1728
Asp Arg Phe Ala Lys Ile Ser Pro Val Ser Pro Thr His Val Ile Asp
565 570 575
ctc atg caa aca cac caa cac gcg ttg gtg ggt gcc ctt ttg cgt gca 1776
Leu Met Gln Thr His Gln His Ala Leu Val Gly Ala Leu Leu Arg Ala
580 585 590
gcc acg tac tac ttc tcc gat ctg gag att gtg gtg cgt cat gat ggc 1824
Ala Thr Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Glu Ile Val Val Arg His Asp Gly
595 600 605
aac ttg acg tgg gtg ccc aat gga gca cct gta gaa gcc ttg gcc aac 1872
Asn Leu Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Val Glu Ala Leu Ala Asn
610 615 620
aca agc aac ccc acc gcc tac cac aag cag cca ttt acg aga ctt gcg 1920
Thr Ser Asn Pro Thr Ala Tyr His Lys Gln Pro Phe Thr Arg Leu Ala
625 630 635 640
ctc cct tac acc gcg ccg cac cga gtg ttg gca aca gtg tat aac gga 1968
Leu Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala Thr Val Tyr Asn Gly
645 650 655
gta agc aag tac tct aca act ggt aat ggc aga agg ggt gac ctg ggg 2016
Val Ser Lys Tyr Ser Thr Thr Gly Asn Gly Arg Arg Gly Asp Leu Gly
660 665 670
cct ctt gcg gcg cgg gtc gcc gca cag ctc ccc agc tct ttc aat ttt 2064
Pro Leu Ala Ala Arg Val Ala Ala Gln Leu Pro Ser Ser Phe Asn Phe
675 680 685
ggt gca att cgg gcc acg acc gtc cac gag ctt ctc gtg cgc atg aaa 2112
Gly Ala Ile Arg Ala Thr Thr Val His Glu Leu Leu Val Arg Met Lys
690 695 700
cgt gcc gag ctc tac tgt ccc agg cct ctg ctg gca gtg gaa gtg ttg 2160
Arg Ala Glu Leu Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu Ala Val Glu Val Leu
705 710 715 720
tcg cag gac aga cac aag caa aag atc att gca cct gca aag caa ctc 2208
Ser Gln Asp Arg His Lys Gln Lys Ile Ile Ala Pro Ala Lys Gln Leu
725 730 735
ctg aac ttc gac ctg ctc aag ttg gcg gga gac gtt gag tcc aac cct 2256
Leu Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro
740 745 750
ggg ccc 2262
Gly Pro
<210> 363
<211> 754
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 363
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Thr Asn Thr Gln Asn
50 55 60
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Ser Ser Ala Phe Ser Gly Leu Phe
65 70 75 80
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
Ser Ser Val Gly Val Thr Tyr Gly Tyr Ser Thr Gly Glu Asp His Val
115 120 125
Ser Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Val Gln Ala Glu
130 135 140
Arg Phe Phe Lys Lys His Leu Phe Asp Trp Thr Thr Asp Lys Ala Phe
145 150 155 160
Gly His Leu Glu Lys Leu Glu Leu Pro Thr Glu His Lys Gly Val Tyr
165 170 175
Gly His Leu Val Asp Ser Phe Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
Glu Val Thr Ala Val Gly Asn Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val
195 200 205
Ala Met Val Pro Glu Trp Lys Glu Phe Thr Pro Arg Glu Lys Tyr Gln
210 215 220
Leu Thr Leu Phe Pro His Gln Phe Ile Asn Pro Arg Thr Asn Met Thr
225 230 235 240
Ala His Ile Thr Val Pro Tyr Leu Gly Val Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr
245 250 255
Lys Gln His Lys Pro Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ser Pro Leu
260 265 270
Thr Thr Ser Ser Ile Gly Ala Ser Gln Ile Lys Val Tyr Ala Asn Ile
275 280 285
Ala Pro Thr Phe Val His Val Ala Gly Glu Leu Pro Ser Lys Glu Gly
290 295 300
Ile Val Pro Val Ala Cys Thr Asp Gly Tyr Gly Gly Leu Val Thr Thr
305 310 315 320
Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Val Tyr Gly Met Val Tyr Asn Pro Pro
325 330 335
Arg Thr Asn Tyr Pro Gly Arg Phe Thr Asn Leu Leu Asp Val Ala Glu
340 345 350
Ala Cys Pro Thr Phe Leu Cys Phe Asp Asp Gly Lys Pro Tyr Val Val
355 360 365
Thr Arg Thr Asp Asp Gln Arg Leu Leu Ala Lys Phe Asp Val Ser Leu
370 375 380
Ala Ala Lys His Met Ser Asn Thr Tyr Leu Ser Gly Ile Ala Gln Tyr
385 390 395 400
Tyr Thr Gln Tyr Ser Gly Thr Ile Asn Leu His Phe Met Phe Thr Gly
405 410 415
Ser Thr Glu Ser Lys Ala Arg Tyr Met Val Ala Tyr Ile Pro Pro Gly
420 425 430
Met Asp Asn Pro Pro Asp Thr Pro Glu Lys Ala Ala His Cys Ile His
435 440 445
Ala Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Ser Ile Pro
450 455 460
Tyr Val Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Ala Ser Asp Val Ala Glu
465 470 475 480
Thr Thr Asn Val Gln Gly Trp Val Cys Ile Tyr Gln Ile Thr His Gly
485 490 495
Lys Ala Glu Gln Asp Thr Leu Val Val Ser Val Ser Ala Gly Lys Asp
500 505 510
Phe Glu Leu Arg Leu Pro Ile Asp Pro Arg Thr Gln Thr Thr Thr Ala
515 520 525
Gly Glu Ser Ala Asp Pro Val Thr Thr Thr Val Glu Asn Tyr Gly Gly
530 535 540
Glu Thr Gln Ala Gln Arg Arg Gln His Thr Asp Val Gly Phe Ile Met
545 550 555 560
Asp Arg Phe Ala Lys Ile Ser Pro Val Ser Pro Thr His Val Ile Asp
565 570 575
Leu Met Gln Thr His Gln His Ala Leu Val Gly Ala Leu Leu Arg Ala
580 585 590
Ala Thr Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Glu Ile Val Val Arg His Asp Gly
595 600 605
Asn Leu Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Val Glu Ala Leu Ala Asn
610 615 620
Thr Ser Asn Pro Thr Ala Tyr His Lys Gln Pro Phe Thr Arg Leu Ala
625 630 635 640
Leu Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala Thr Val Tyr Asn Gly
645 650 655
Val Ser Lys Tyr Ser Thr Thr Gly Asn Gly Arg Arg Gly Asp Leu Gly
660 665 670
Pro Leu Ala Ala Arg Val Ala Ala Gln Leu Pro Ser Ser Phe Asn Phe
675 680 685
Gly Ala Ile Arg Ala Thr Thr Val His Glu Leu Leu Val Arg Met Lys
690 695 700
Arg Ala Glu Leu Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu Ala Val Glu Val Leu
705 710 715 720
Ser Gln Asp Arg His Lys Gln Lys Ile Ile Ala Pro Ala Lys Gln Leu
725 730 735
Leu Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro
740 745 750
Gly Pro
<210> 364
<211> 2262
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> P1_A24_Cruzeiro_cut_sites_removed
<400> 364
ggggccgggc aatccagtcc ggcgaccggc tcgcagaacc aatctggcaa cactggcagc 60
ataattaaca actactacat gcagcaatac cagaactcca tggacacaca gttgggagac 120
aatgccatca gtggaggctc caacgagggc tccacggaca caacttcaac acacacaacc 180
aacactcaaa acaatgactg gttctcgaag ctcgccagtt cagcttttac aggtctgttc 240
ggtgcactgc tcgccgacaa gaagacagag gaaacgacac ttcttgagga ccgcatcctc 300
accacccgca acgggcacac cacctcgacg acccaatcga gtgtgggtgt cacacacggg 360
tactccacag aggaggacca cgttgctggg ccaaacacat cgggcctgga gacgcgagtg 420
gtgcaggcag agagattcta caaaaagtac ttgtttgact ggacaacgga caaggcattt 480
ggacacctgg aaaagctgga gctcccgtcc gaccaccacg gtgtctttgg acacttggtg 540
gactcgtacg cctatatgag aaatggctgg gatgttgagg tgtccgctgt tggcaaccag 600
ttcaacggcg ggtgcctcct ggtggccatg gttcctgaat ggaaggaatt tgacacacgg 660
gagaaatacc aactcaccct tttcccgcac cagtttatta gccccagaac taacatgact 720
gcccacatca cggtccccta ccttggtgtg aacaggtatg atcagtacaa gaagcataag 780
ccctggacat tggttgtcat ggtcgtgtcg ccacttacgg tcaacaacac cagtgcggca 840
caaatcaagg tctatgccaa catagctccg acctatgttc acgtggccgg tgaactcccc 900
tcgaaagagg ggattttccc ggttgcatgt gcggacggtt acggaggatt ggtgacgaca 960
gacccgaaga cagctgaccc tgcttatggc aaggtgtaca acccgcctag gactaactac 1020
cctgggcgct tcaccaacct gttggacgtg gccgaagcgt gtcccacttt cctctgcttt 1080
gacgacggga aaccgtacgt caccacgcgg acggatgaca cccgactttt ggccaagttt 1140
gacctttccc ttgccgcaaa acacatgtcc aacacatacc tgtcagggat tgctcagtac 1200
tacacacagt actctggcac catcaatttg catttcatgt tcacaggttc cactgattca 1260
aaggcccgat acatggtggc ctacatccca cctggggtgg agacaccacc ggacacacct 1320
gaaagggctg cccactgcat tcacgctgaa tgggacactg gactaaactc caaattcact 1380
ttctcaatcc cgtacgtatc cgccgccgat tatgcgtaca cagcgtctga cacggcagaa 1440
acaatcaacg tacagggatg ggtctgcatc taccaaatta cacacgggaa ggctgaaaat 1500
gacaccttgg tcgtgtcggt tagcgccggc aaagactttg agttgcgcct cccgattgac 1560
ccccgccagc agaccaccgc taccggggaa tcagcagacc cggtcacaac caccgtggag 1620
aactacggcg gtgagacaca aatccagaga cgtcaccaca cggacattgg tttcatcatg 1680
gacagatttg tgaagatcca gagcttgagc ccaacacatg tcattgacct catgcagact 1740
caccaacacg gtctggtggg tgccttgctg cgtgcagcca cgtactactt ttctgacctg 1800
gaaattgttg tacggcacga aggcaatctg acctgggtgc ccaacggcgc ccctgaatca 1860
gccctgttga acaccagcaa ccccactgcc tacaacaagg caccattcac gagactcgct 1920
ctcccctaca ctgcgccgca ccgtgtgctg gcaacagtgt acaacgggac gagtaagtat 1980
gctgtgggtg gttcaggcag aagaggcgac atggggtctc tcgcggcgcg agtcgtgaaa 2040
cagcttcctg cttcatttaa ctacggtgca atcaaggccg acgccatcca cgaacttctc 2100
gtgcgcatga aacgggccga gctctactgc cccagaccgc tgttggcaat agaggtgtct 2160
tcgcaagaca ggcacaagca aaagatcatt gcaccagcaa agcagcttct gaattttgac 2220
ctgctcaagt tggccggaga cgttgagtcc aaccctgggc cc 2262
<210> 365
<211> 2262
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(2262)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(2262)
<223> P1_A24_Cruzeiro_wild_type
<400> 365
ggg gcc ggg caa tcc agt ccg gcg acc ggc tcg cag aac caa tct ggc 48
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
aac act ggc agc ata att aac aac tac tac atg cag caa tac cag aac 96
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
tcc atg gac aca cag ttg gga gac aat gcc atc agt gga ggc tcc aac 144
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
gag ggc tcc acg gac aca act tca aca cac aca acc aac act caa aac 192
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Thr Asn Thr Gln Asn
50 55 60
aat gac tgg ttc tcg aag ctc gcc agt tca gct ttt acc ggt ctg ttc 240
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Ser Ser Ala Phe Thr Gly Leu Phe
65 70 75 80
ggt gca ctg ctc gcc gac aag aag aca gag gaa acg aca ctt ctt gag 288
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
gac cgc atc ctc acc acc cgc aac ggg cac acc acc tcg acg acc caa 336
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
tcg agt gtg ggt gtc aca cac ggg tac tcc aca gag gag gac cac gtt 384
Ser Ser Val Gly Val Thr His Gly Tyr Ser Thr Glu Glu Asp His Val
115 120 125
gct ggg ccc aac aca tcg ggc ctg gag acg cga gtg gtg cag gca gag 432
Ala Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Val Gln Ala Glu
130 135 140
aga ttc tac aaa aag tac ttg ttt gac tgg aca acg gac aag gca ttt 480
Arg Phe Tyr Lys Lys Tyr Leu Phe Asp Trp Thr Thr Asp Lys Ala Phe
145 150 155 160
gga cac ctg gaa aag ctg gag ctc ccg tcc gac cac cac ggt gtc ttt 528
Gly His Leu Glu Lys Leu Glu Leu Pro Ser Asp His His Gly Val Phe
165 170 175
gga cac ttg gtg gac tcg tac gcc tat atg aga aat ggc tgg gat gtt 576
Gly His Leu Val Asp Ser Tyr Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
gag gtg tcc gct gtt ggc aac cag ttc aac ggc ggg tgc ctc ctg gtg 624
Glu Val Ser Ala Val Gly Asn Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val
195 200 205
gcc atg gta cct gaa tgg aag gaa ttt gac aca cgg gag aaa tac caa 672
Ala Met Val Pro Glu Trp Lys Glu Phe Asp Thr Arg Glu Lys Tyr Gln
210 215 220
ctc acc ctt ttc ccg cac cag ttt att agc ccc aga act aac atg act 720
Leu Thr Leu Phe Pro His Gln Phe Ile Ser Pro Arg Thr Asn Met Thr
225 230 235 240
gcc cac atc acg gtc ccc tac ctt ggt gtg aac agg tat gat cag tac 768
Ala His Ile Thr Val Pro Tyr Leu Gly Val Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr
245 250 255
aag aag cat aag ccc tgg aca ttg gtt gtc atg gtc gtg tcg cca ctt 816
Lys Lys His Lys Pro Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ser Pro Leu
260 265 270
acg gtc aac aac act agt gcg gca caa atc aag gtc tac gcc aac ata 864
Thr Val Asn Asn Thr Ser Ala Ala Gln Ile Lys Val Tyr Ala Asn Ile
275 280 285
gct ccg acc tat gtt cac gtg gcc ggt gaa ctc ccc tcg aaa gag ggg 912
Ala Pro Thr Tyr Val His Val Ala Gly Glu Leu Pro Ser Lys Glu Gly
290 295 300
att ttc ccg gtt gca tgt gcg gac ggt tac gga gga ttg gtg acg aca 960
Ile Phe Pro Val Ala Cys Ala Asp Gly Tyr Gly Gly Leu Val Thr Thr
305 310 315 320
gac ccg aag aca gct gac cct gct tat ggc aag gtg tac aac ccg cct 1008
Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Ala Tyr Gly Lys Val Tyr Asn Pro Pro
325 330 335
agg act aac tac cct ggg cgc ttc acc aac ctg ttg gac gtg gcc gaa 1056
Arg Thr Asn Tyr Pro Gly Arg Phe Thr Asn Leu Leu Asp Val Ala Glu
340 345 350
gcg tgt ccc act ttc ctc tgc ttt gac gac ggg aaa ccg tac gtc acc 1104
Ala Cys Pro Thr Phe Leu Cys Phe Asp Asp Gly Lys Pro Tyr Val Thr
355 360 365
acg cgg acg gat gac acc cga ctt ttg gcc aag ttt gac ctt tcc ctt 1152
Thr Arg Thr Asp Asp Thr Arg Leu Leu Ala Lys Phe Asp Leu Ser Leu
370 375 380
gcc gca aaa cat atg tcc aac aca tac ctg tca ggg att gct cag tac 1200
Ala Ala Lys His Met Ser Asn Thr Tyr Leu Ser Gly Ile Ala Gln Tyr
385 390 395 400
tac aca cag tac tct ggc acc atc aat ttg cat ttc atg ttc aca ggt 1248
Tyr Thr Gln Tyr Ser Gly Thr Ile Asn Leu His Phe Met Phe Thr Gly
405 410 415
tcc act gat tca aag gcc cga tac atg gtg gcc tac atc cca cct ggg 1296
Ser Thr Asp Ser Lys Ala Arg Tyr Met Val Ala Tyr Ile Pro Pro Gly
420 425 430
gtg gag aca cca ccg gac aca cct gaa agg gct gcc cac tgc att cac 1344
Val Glu Thr Pro Pro Asp Thr Pro Glu Arg Ala Ala His Cys Ile His
435 440 445
gct gaa tgg gac act gga cta aac tcc aaa ttc act ttc tca atc ccg 1392
Ala Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Ser Ile Pro
450 455 460
tac gta tcc gcc gcg gat tac gcg tac aca gcg tct gac acg gca gaa 1440
Tyr Val Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Ala Ser Asp Thr Ala Glu
465 470 475 480
aca atc aac gta cag gga tgg gtc tgc atc tac caa att aca cac ggg 1488
Thr Ile Asn Val Gln Gly Trp Val Cys Ile Tyr Gln Ile Thr His Gly
485 490 495
aag gct gaa aat gac acc ttg gtc gtg tcg gtt agc gcc ggc aaa gac 1536
Lys Ala Glu Asn Asp Thr Leu Val Val Ser Val Ser Ala Gly Lys Asp
500 505 510
ttt gag ttg cgc ctc ccg att gac ccc cgc cag cag acc acc gct acc 1584
Phe Glu Leu Arg Leu Pro Ile Asp Pro Arg Gln Gln Thr Thr Ala Thr
515 520 525
ggg gaa tca gca gac ccg gtc acc acc acc gtg gag aac tac ggc ggt 1632
Gly Glu Ser Ala Asp Pro Val Thr Thr Thr Val Glu Asn Tyr Gly Gly
530 535 540
gag aca caa atc cag aga cgt cac cac acg gac att ggt ttc atc atg 1680
Glu Thr Gln Ile Gln Arg Arg His His Thr Asp Ile Gly Phe Ile Met
545 550 555 560
gac aga ttt gtg aag atc caa agc ttg agc cca aca cat gtc att gac 1728
Asp Arg Phe Val Lys Ile Gln Ser Leu Ser Pro Thr His Val Ile Asp
565 570 575
ctc atg cag act cac caa cac ggt ctg gtg ggt gcc ttg ctg cgt gca 1776
Leu Met Gln Thr His Gln His Gly Leu Val Gly Ala Leu Leu Arg Ala
580 585 590
gcc acg tac tac ttt tct gac ctg gaa att gtt gta cgg cac gaa ggc 1824
Ala Thr Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Glu Ile Val Val Arg His Glu Gly
595 600 605
aat ctg acc tgg gtg ccc aac ggc gcc cct gaa tca gcc ctg ttg aac 1872
Asn Leu Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Glu Ser Ala Leu Leu Asn
610 615 620
acc agc aac ccc act gcc tac aac aag gca cca ttc acg aga ctc gct 1920
Thr Ser Asn Pro Thr Ala Tyr Asn Lys Ala Pro Phe Thr Arg Leu Ala
625 630 635 640
ctc ccc tac act gcg ccg cac cgt gtg ctg gca aca gtg tac aac ggg 1968
Leu Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala Thr Val Tyr Asn Gly
645 650 655
acg agt aag tat gct gtg ggt ggt tca ggc aga aga ggc gac atg ggg 2016
Thr Ser Lys Tyr Ala Val Gly Gly Ser Gly Arg Arg Gly Asp Met Gly
660 665 670
tct ctc gcg gcg cga gtc gtg aaa cag ctt cct gct tca ttt aac tac 2064
Ser Leu Ala Ala Arg Val Val Lys Gln Leu Pro Ala Ser Phe Asn Tyr
675 680 685
ggt gca atc aag gcc gac gcc atc cac gaa ctt ctc gtg cgc atg aaa 2112
Gly Ala Ile Lys Ala Asp Ala Ile His Glu Leu Leu Val Arg Met Lys
690 695 700
cgg gcc gag ctc tac tgc ccc aga ccg ctg ttg gca ata gag gtg tct 2160
Arg Ala Glu Leu Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu Ala Ile Glu Val Ser
705 710 715 720
tcg caa gac agg cac aag caa aag atc att gca cca gca aag cag ctt 2208
Ser Gln Asp Arg His Lys Gln Lys Ile Ile Ala Pro Ala Lys Gln Leu
725 730 735
ctg aat ttt gac ctg ctc aag ttg gcc gga gac gtt gag tcc aac cct 2256
Leu Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro
740 745 750
ggg ccc 2262
Gly Pro
<210> 366
<211> 754
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 366
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Thr Asn Thr Gln Asn
50 55 60
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Ser Ser Ala Phe Thr Gly Leu Phe
65 70 75 80
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
Ser Ser Val Gly Val Thr His Gly Tyr Ser Thr Glu Glu Asp His Val
115 120 125
Ala Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Val Gln Ala Glu
130 135 140
Arg Phe Tyr Lys Lys Tyr Leu Phe Asp Trp Thr Thr Asp Lys Ala Phe
145 150 155 160
Gly His Leu Glu Lys Leu Glu Leu Pro Ser Asp His His Gly Val Phe
165 170 175
Gly His Leu Val Asp Ser Tyr Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
Glu Val Ser Ala Val Gly Asn Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val
195 200 205
Ala Met Val Pro Glu Trp Lys Glu Phe Asp Thr Arg Glu Lys Tyr Gln
210 215 220
Leu Thr Leu Phe Pro His Gln Phe Ile Ser Pro Arg Thr Asn Met Thr
225 230 235 240
Ala His Ile Thr Val Pro Tyr Leu Gly Val Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr
245 250 255
Lys Lys His Lys Pro Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ser Pro Leu
260 265 270
Thr Val Asn Asn Thr Ser Ala Ala Gln Ile Lys Val Tyr Ala Asn Ile
275 280 285
Ala Pro Thr Tyr Val His Val Ala Gly Glu Leu Pro Ser Lys Glu Gly
290 295 300
Ile Phe Pro Val Ala Cys Ala Asp Gly Tyr Gly Gly Leu Val Thr Thr
305 310 315 320
Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Ala Tyr Gly Lys Val Tyr Asn Pro Pro
325 330 335
Arg Thr Asn Tyr Pro Gly Arg Phe Thr Asn Leu Leu Asp Val Ala Glu
340 345 350
Ala Cys Pro Thr Phe Leu Cys Phe Asp Asp Gly Lys Pro Tyr Val Thr
355 360 365
Thr Arg Thr Asp Asp Thr Arg Leu Leu Ala Lys Phe Asp Leu Ser Leu
370 375 380
Ala Ala Lys His Met Ser Asn Thr Tyr Leu Ser Gly Ile Ala Gln Tyr
385 390 395 400
Tyr Thr Gln Tyr Ser Gly Thr Ile Asn Leu His Phe Met Phe Thr Gly
405 410 415
Ser Thr Asp Ser Lys Ala Arg Tyr Met Val Ala Tyr Ile Pro Pro Gly
420 425 430
Val Glu Thr Pro Pro Asp Thr Pro Glu Arg Ala Ala His Cys Ile His
435 440 445
Ala Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Ser Ile Pro
450 455 460
Tyr Val Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Ala Ser Asp Thr Ala Glu
465 470 475 480
Thr Ile Asn Val Gln Gly Trp Val Cys Ile Tyr Gln Ile Thr His Gly
485 490 495
Lys Ala Glu Asn Asp Thr Leu Val Val Ser Val Ser Ala Gly Lys Asp
500 505 510
Phe Glu Leu Arg Leu Pro Ile Asp Pro Arg Gln Gln Thr Thr Ala Thr
515 520 525
Gly Glu Ser Ala Asp Pro Val Thr Thr Thr Val Glu Asn Tyr Gly Gly
530 535 540
Glu Thr Gln Ile Gln Arg Arg His His Thr Asp Ile Gly Phe Ile Met
545 550 555 560
Asp Arg Phe Val Lys Ile Gln Ser Leu Ser Pro Thr His Val Ile Asp
565 570 575
Leu Met Gln Thr His Gln His Gly Leu Val Gly Ala Leu Leu Arg Ala
580 585 590
Ala Thr Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Glu Ile Val Val Arg His Glu Gly
595 600 605
Asn Leu Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Glu Ser Ala Leu Leu Asn
610 615 620
Thr Ser Asn Pro Thr Ala Tyr Asn Lys Ala Pro Phe Thr Arg Leu Ala
625 630 635 640
Leu Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala Thr Val Tyr Asn Gly
645 650 655
Thr Ser Lys Tyr Ala Val Gly Gly Ser Gly Arg Arg Gly Asp Met Gly
660 665 670
Ser Leu Ala Ala Arg Val Val Lys Gln Leu Pro Ala Ser Phe Asn Tyr
675 680 685
Gly Ala Ile Lys Ala Asp Ala Ile His Glu Leu Leu Val Arg Met Lys
690 695 700
Arg Ala Glu Leu Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu Ala Ile Glu Val Ser
705 710 715 720
Ser Gln Asp Arg His Lys Gln Lys Ile Ile Ala Pro Ala Lys Gln Leu
725 730 735
Leu Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro
740 745 750
Gly Pro
<210> 367
<211> 2249
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> P1_Asia1_Shamir_cut_sites_removed
<400> 367
ggagccggtc aatccagtcc ggcaaccggg tcacagaacc aatctggcaa cactggaagc 60
atcattaaca actactacat gcaacagtac cagaactcaa tggacacaca gcttggtgac 120
aacgctatta gcggaggttc caacgaaggt tccacggata ccacttccac acacacaaac 180
aacacccaaa acaacgactg gttctcgcgc ctggcaagct ctgcattcag tggactattt 240
ggtgcacttt tggctgacaa gaagacagaa gagacaactc tgcttgaaga ccgcattctc 300
accaccagga acggccacac aacatcgacg acacagtcga gcgttggcgt aacatacggt 360
tacgctgtgg ccgaggacgc ggtgtctgga cccaatacct cgggactcga gactcgtgtt 420
caacaggcag aacggttttt caagaaacac ctgtttgact ggacaccgaa cttggcattt 480
ggacactgtt actacctgga acttcccact gaacacaaag gcgtgtacgg cagtctcatg 540
ggctcatacg cctacatgag aaatggatgg gacatagagg tgactgctgt tggaaaccaa 600
ttcaacggtg gttgtctcct tgtcgcgctc gtgccagagc tgaaggaact cgacacgcga 660
cagaagtacc aactgaccct ctttccccac cagttcatca acccacgcac caacatgacg 720
gcccacatca acgtgccata cgtgggtatc aacaggtacg accagtacgc cctccacaag 780
ccgtggacgc ttgttgtgat ggtggtagcc ccactcaccg tcaaaactgg tggttctgaa 840
cagatcaagg tttacatgaa tgcagcgcca acctacgtgc atgtggcggg agagctgccc 900
tcgaaagagg gaatagttcc cgtcgcgtgt gcggacggtt acggcaacat ggtgacaacg 960
gacccgaaga cggccgatcc agtttacggg aaagtgttca acccccccag gacaaacctc 1020
cctgggcgct tcacgaactt ccttgatgtt gcggaggcat gtccaacttt cctccgcttt 1080
ggagaagtac catttgtgaa gacggtgaac tctggagacc gcttgctggc caagttcgac 1140
gtgtccctcg cagcagggca catgtccaac acctacttgg ctggcctggc gcagtactac 1200
acacagtaca gcggcaccat gaacgtccac ttcatgttca ccggacccac ggatgctaaa 1260
gcccgataca tggtggctta tgtcccccct ggcatgacac cgcccacgga ccctgagcac 1320
gccgcacact gcattcactc tgagtgggat actggtctta actctaagtt taccttttcc 1380
ataccttacc tctctgctgc tgactatgcc tacactgctt ctgacgtggc ggagaccacg 1440
agtgtgcagg gatgggtgtg tatctatcag atcacccacg gcaaggctga gggagacgca 1500
ctggtcgttt ctgtcagcgc cggcaaagac tttgagtttc gcttgcctgt tgacgcacgc 1560
cagcaaacca ccaccactgg cgaatcagca gatccagtca caaccacggt tgagaactat 1620
ggaggagaga ctcagacagc cagacggctt cacactgacg tcgccttcat tcttgacagg 1680
tttgtgaaac tcactgctcc caagaacatc caaaccctcg atctcatgca gatcccctca 1740
cacacgctgg ttggagcact acttcgttct gcgacgtact acttctcaga cctggaggtc 1800
gcgcttgtcc acacaggccc agtcacctgg gtgcccaacg gagcgcccaa ggatgctcta 1860
aacaaccaga ccaacccaac tgcctatcag aagcaaccca tcacccgcct ggcactcccc 1920
tacaccgccc cccatcgtgt gctggcaaca gtgtacaacg ggaagacggc ttacggggaa 1980
acgacctcaa ggcgcggcga catggcggcc ctcgcacaaa ggttgagcgc tcggctgccc 2040
acctccttca actacggcgc cgtgaaggcc gacaccatca ctgagctttt gatccgcatg 2100
aagcgcgcgg agacatattg ccctaggcct ttactagccc ttgacaccac tcaggaccgc 2160
cgcaaacagg agatcattgc acctgagaag caggttttga actttgacct actcaagttg 2220
gcaggagacg ttgagtccaa ccccgggcc 2249
<210> 368
<211> 2250
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(2250)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(2250)
<223> P1_Asia1_Shamir_wildtype
<400> 368
gga gcc ggt caa tcc agt ccg gca acc ggg tca cag aac caa tct ggc 48
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
aac act gga agc atc att aac aac tac tac atg caa cag tac cag aat 96
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
tcc atg gac aca cag ctt ggt gac aac gct att agc gga ggt tcc aac 144
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
gaa ggt tcc acg gat acc act tcc aca cac aca aac aac acc caa aac 192
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Asn Asn Thr Gln Asn
50 55 60
aac gac tgg ttc tcg cgc ctg gct agc tct gca ttc agt ggt ctc ttt 240
Asn Asp Trp Phe Ser Arg Leu Ala Ser Ser Ala Phe Ser Gly Leu Phe
65 70 75 80
ggt gca ctt ttg gct gac aag aag aca gaa gag aca act ctg ctt gaa 288
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
gac cgc att ctc acc acc agg aac ggc cac aca aca tcg acg aca cag 336
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
tcg agc gtt ggc gta aca tac ggt tac gct gtg gcc gag gac gcg gtg 384
Ser Ser Val Gly Val Thr Tyr Gly Tyr Ala Val Ala Glu Asp Ala Val
115 120 125
tct gga ccc aat acc tcg ggt cta gag act cgt gtt caa cag gca gaa 432
Ser Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Gln Gln Ala Glu
130 135 140
cgg ttt ttc aag aaa cac ctg ttt gac tgg aca ccg aac ttg gca ttt 480
Arg Phe Phe Lys Lys His Leu Phe Asp Trp Thr Pro Asn Leu Ala Phe
145 150 155 160
gga cac tgt tac tac ctg gaa ctt ccc act gaa cac aaa ggc gtg tac 528
Gly His Cys Tyr Tyr Leu Glu Leu Pro Thr Glu His Lys Gly Val Tyr
165 170 175
ggc agt ctc atg ggc tcg tac gcc tac atg aga aat gga tgg gac ata 576
Gly Ser Leu Met Gly Ser Tyr Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Ile
180 185 190
gag gtg act gct gtt gga aac caa ttc aac ggt ggt tgt ctc ctt gtc 624
Glu Val Thr Ala Val Gly Asn Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val
195 200 205
gcg ctc gtg cca gag ctg aag gaa ctc gac acg cga cag aag tac cag 672
Ala Leu Val Pro Glu Leu Lys Glu Leu Asp Thr Arg Gln Lys Tyr Gln
210 215 220
ctg acc ctc ttt ccc cac cag ttc atc aac cca cgc acc aac atg acg 720
Leu Thr Leu Phe Pro His Gln Phe Ile Asn Pro Arg Thr Asn Met Thr
225 230 235 240
gcc cac atc aac gtg ccg tac gtg ggt atc aac agg tac gac cag tac 768
Ala His Ile Asn Val Pro Tyr Val Gly Ile Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr
245 250 255
gcc ctc cac aag ccg tgg acg ctt gtt gtg atg gtg gta gcc cca ctc 816
Ala Leu His Lys Pro Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ala Pro Leu
260 265 270
acc gtc aaa act ggt ggt tct gaa cag atc aag gtt tac atg aat gca 864
Thr Val Lys Thr Gly Gly Ser Glu Gln Ile Lys Val Tyr Met Asn Ala
275 280 285
gcg cca acc tac gtg cat gtg gcg gga gag ctg ccc tcg aaa gag gga 912
Ala Pro Thr Tyr Val His Val Ala Gly Glu Leu Pro Ser Lys Glu Gly
290 295 300
ata gtt ccc gtc gcg tgt gcg gac ggt tac ggc aac atg gtg acc acg 960
Ile Val Pro Val Ala Cys Ala Asp Gly Tyr Gly Asn Met Val Thr Thr
305 310 315 320
gac ccg aag acg gcc gat cca gtt tac ggg aaa gtg ttc aac ccc ccc 1008
Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Val Tyr Gly Lys Val Phe Asn Pro Pro
325 330 335
agg aca aac ctc cct ggg cgc ttc acg aac ttc ctt gat gtt gcg gag 1056
Arg Thr Asn Leu Pro Gly Arg Phe Thr Asn Phe Leu Asp Val Ala Glu
340 345 350
gca tgt cca act ttc ctc cgc ttt gga gaa gta cca ttt gtg aag acg 1104
Ala Cys Pro Thr Phe Leu Arg Phe Gly Glu Val Pro Phe Val Lys Thr
355 360 365
gtg aac tct ggt gac cgc ttg ctg gcc aag ttc gac gtg tcc ctc gct 1152
Val Asn Ser Gly Asp Arg Leu Leu Ala Lys Phe Asp Val Ser Leu Ala
370 375 380
gca ggg cac atg tcc aac acc tac ttg gct ggc ctg gcg cag tac tac 1200
Ala Gly His Met Ser Asn Thr Tyr Leu Ala Gly Leu Ala Gln Tyr Tyr
385 390 395 400
aca cag tac agc ggc acc atg aac gtc cac ttc atg ttc acc ggg ccc 1248
Thr Gln Tyr Ser Gly Thr Met Asn Val His Phe Met Phe Thr Gly Pro
405 410 415
acg gat gct aaa gcc cga tac atg gtg gct tat gtc ccc cct ggc atg 1296
Thr Asp Ala Lys Ala Arg Tyr Met Val Ala Tyr Val Pro Pro Gly Met
420 425 430
aca ccg ccc acg gac cct gag cac gcc gca cac tgc att cac tct gag 1344
Thr Pro Pro Thr Asp Pro Glu His Ala Ala His Cys Ile His Ser Glu
435 440 445
tgg gat act ggt ctt aac tct aag ttt acc ttt tcc ata cct tac ctc 1392
Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Ser Ile Pro Tyr Leu
450 455 460
tct gct gct gac tat gcc tac act gct tct gac gtg gcg gag acc acg 1440
Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Ala Ser Asp Val Ala Glu Thr Thr
465 470 475 480
agt gtg cag gga tgg gtg tgt atc tat cag atc acc cac ggc aag gct 1488
Ser Val Gln Gly Trp Val Cys Ile Tyr Gln Ile Thr His Gly Lys Ala
485 490 495
gag gga gac gca ctg gtc gtt tct gtc agc gcc ggc aaa gac ttt gag 1536
Glu Gly Asp Ala Leu Val Val Ser Val Ser Ala Gly Lys Asp Phe Glu
500 505 510
ttt cgc ttg cct gtt gac gca cgc cag caa acc acc acc act ggc gaa 1584
Phe Arg Leu Pro Val Asp Ala Arg Gln Gln Thr Thr Thr Thr Gly Glu
515 520 525
tca gca gat cca gtc aca acc acg gtt gag aac tat gga gga gag act 1632
Ser Ala Asp Pro Val Thr Thr Thr Val Glu Asn Tyr Gly Gly Glu Thr
530 535 540
cag aca gcc aga cgg ctt cac act gac gtc gcc ttc att ctt gac agg 1680
Gln Thr Ala Arg Arg Leu His Thr Asp Val Ala Phe Ile Leu Asp Arg
545 550 555 560
ttt gtg aaa ctc act gct ccc aag aac atc caa acc ctc gat ctc atg 1728
Phe Val Lys Leu Thr Ala Pro Lys Asn Ile Gln Thr Leu Asp Leu Met
565 570 575
cag atc ccc tca cac acg ctg gtt gga gca cta ctt cgt tct gcg acg 1776
Gln Ile Pro Ser His Thr Leu Val Gly Ala Leu Leu Arg Ser Ala Thr
580 585 590
tac tac ttc tca gac ctg gag gtc gcg ctt gtc cac aca ggc ccg gtc 1824
Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Glu Val Ala Leu Val His Thr Gly Pro Val
595 600 605
acc tgg gtg ccc aac ggc gcg ccc aag gat gct cta aac aac cag acc 1872
Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Lys Asp Ala Leu Asn Asn Gln Thr
610 615 620
aac cca act gcc tat cag aag caa ccc atc acc cgc ctg gca ctc ccc 1920
Asn Pro Thr Ala Tyr Gln Lys Gln Pro Ile Thr Arg Leu Ala Leu Pro
625 630 635 640
tac acc gcc ccc cat cgt gtg ctg gca aca gtg tac aac ggg aag acg 1968
Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala Thr Val Tyr Asn Gly Lys Thr
645 650 655
gcg tac ggg gaa acg acc tca agg cgc ggc gac atg gcg gcc ctc gca 2016
Ala Tyr Gly Glu Thr Thr Ser Arg Arg Gly Asp Met Ala Ala Leu Ala
660 665 670
caa agg ttg agc gct cgg ctg ccc acc tcc ttc aac tac ggc gcc gtg 2064
Gln Arg Leu Ser Ala Arg Leu Pro Thr Ser Phe Asn Tyr Gly Ala Val
675 680 685
aag gcc gac acc atc act gag ctt ttg atc cgc atg aag cgc gcg gag 2112
Lys Ala Asp Thr Ile Thr Glu Leu Leu Ile Arg Met Lys Arg Ala Glu
690 695 700
aca tat tgc cct agg cct tta cta gcc ctt gac acc act cag gac cgc 2160
Thr Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu Ala Leu Asp Thr Thr Gln Asp Arg
705 710 715 720
cgc aaa cag gag atc att gca cct gag aag cag gtt ttg aac ttt gac 2208
Arg Lys Gln Glu Ile Ile Ala Pro Glu Lys Gln Val Leu Asn Phe Asp
725 730 735
cta ctc aag ttg gca gga gac gtt gag tcc aac cct ggg ccc 2250
Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro Gly Pro
740 745 750
<210> 369
<211> 750
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 369
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Asn Asn Thr Gln Asn
50 55 60
Asn Asp Trp Phe Ser Arg Leu Ala Ser Ser Ala Phe Ser Gly Leu Phe
65 70 75 80
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
Ser Ser Val Gly Val Thr Tyr Gly Tyr Ala Val Ala Glu Asp Ala Val
115 120 125
Ser Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Gln Gln Ala Glu
130 135 140
Arg Phe Phe Lys Lys His Leu Phe Asp Trp Thr Pro Asn Leu Ala Phe
145 150 155 160
Gly His Cys Tyr Tyr Leu Glu Leu Pro Thr Glu His Lys Gly Val Tyr
165 170 175
Gly Ser Leu Met Gly Ser Tyr Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Ile
180 185 190
Glu Val Thr Ala Val Gly Asn Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val
195 200 205
Ala Leu Val Pro Glu Leu Lys Glu Leu Asp Thr Arg Gln Lys Tyr Gln
210 215 220
Leu Thr Leu Phe Pro His Gln Phe Ile Asn Pro Arg Thr Asn Met Thr
225 230 235 240
Ala His Ile Asn Val Pro Tyr Val Gly Ile Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr
245 250 255
Ala Leu His Lys Pro Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ala Pro Leu
260 265 270
Thr Val Lys Thr Gly Gly Ser Glu Gln Ile Lys Val Tyr Met Asn Ala
275 280 285
Ala Pro Thr Tyr Val His Val Ala Gly Glu Leu Pro Ser Lys Glu Gly
290 295 300
Ile Val Pro Val Ala Cys Ala Asp Gly Tyr Gly Asn Met Val Thr Thr
305 310 315 320
Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Val Tyr Gly Lys Val Phe Asn Pro Pro
325 330 335
Arg Thr Asn Leu Pro Gly Arg Phe Thr Asn Phe Leu Asp Val Ala Glu
340 345 350
Ala Cys Pro Thr Phe Leu Arg Phe Gly Glu Val Pro Phe Val Lys Thr
355 360 365
Val Asn Ser Gly Asp Arg Leu Leu Ala Lys Phe Asp Val Ser Leu Ala
370 375 380
Ala Gly His Met Ser Asn Thr Tyr Leu Ala Gly Leu Ala Gln Tyr Tyr
385 390 395 400
Thr Gln Tyr Ser Gly Thr Met Asn Val His Phe Met Phe Thr Gly Pro
405 410 415
Thr Asp Ala Lys Ala Arg Tyr Met Val Ala Tyr Val Pro Pro Gly Met
420 425 430
Thr Pro Pro Thr Asp Pro Glu His Ala Ala His Cys Ile His Ser Glu
435 440 445
Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Ser Ile Pro Tyr Leu
450 455 460
Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Ala Ser Asp Val Ala Glu Thr Thr
465 470 475 480
Ser Val Gln Gly Trp Val Cys Ile Tyr Gln Ile Thr His Gly Lys Ala
485 490 495
Glu Gly Asp Ala Leu Val Val Ser Val Ser Ala Gly Lys Asp Phe Glu
500 505 510
Phe Arg Leu Pro Val Asp Ala Arg Gln Gln Thr Thr Thr Thr Gly Glu
515 520 525
Ser Ala Asp Pro Val Thr Thr Thr Val Glu Asn Tyr Gly Gly Glu Thr
530 535 540
Gln Thr Ala Arg Arg Leu His Thr Asp Val Ala Phe Ile Leu Asp Arg
545 550 555 560
Phe Val Lys Leu Thr Ala Pro Lys Asn Ile Gln Thr Leu Asp Leu Met
565 570 575
Gln Ile Pro Ser His Thr Leu Val Gly Ala Leu Leu Arg Ser Ala Thr
580 585 590
Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Glu Val Ala Leu Val His Thr Gly Pro Val
595 600 605
Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Lys Asp Ala Leu Asn Asn Gln Thr
610 615 620
Asn Pro Thr Ala Tyr Gln Lys Gln Pro Ile Thr Arg Leu Ala Leu Pro
625 630 635 640
Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala Thr Val Tyr Asn Gly Lys Thr
645 650 655
Ala Tyr Gly Glu Thr Thr Ser Arg Arg Gly Asp Met Ala Ala Leu Ala
660 665 670
Gln Arg Leu Ser Ala Arg Leu Pro Thr Ser Phe Asn Tyr Gly Ala Val
675 680 685
Lys Ala Asp Thr Ile Thr Glu Leu Leu Ile Arg Met Lys Arg Ala Glu
690 695 700
Thr Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu Ala Leu Asp Thr Thr Gln Asp Arg
705 710 715 720
Arg Lys Gln Glu Ile Ile Ala Pro Glu Lys Gln Val Leu Asn Phe Asp
725 730 735
Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro Gly Pro
740 745 750
<210> 370
<211> 2247
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> P1_C3_cut_sites_removed
<400> 370
ggagccggac aatccagccc ggcgactggc tcgcagaacc aatctggcaa cactggtagc 60
ataatcaaca actactacat gcaacagtac caaaattcaa tggacacaca actgggtgac 120
aatgctatta gtggtggctc caacgagggc tccacagata caacttccac ccacacaacc 180
aacactcaaa acaacgactg gttttccaaa ctcgccagtt ctgcctttag cggtcttttc 240
ggtgctcttc ttgccgacaa gaagaccgag gaaaccacac tacttgaaga ccgcatcctc 300
accacccgca acggccacac gacttcgaca actcagtcga gcgttggggt cacatacggg 360
tacgcaacaa ctgaggatag cacgtcaggg cctaacacat ccggccttga gacacgtgtt 420
caccaggcag aacggttttt caagatgaca ctctttgaat gggttccctc ccagagtttt 480
ggacacatgc acaaggtcgt tctgccctca gaaccgaaag gtgtctatgg gggtctcgtc 540
aagtcttatg cgtacatgcg caatggctgg gacgttgagg tgactgctgt tggaaaccag 600
ttcaacggcg gttgtctcct ggtggcgctc gttcctgaaa tgggtgacat cagtgacaga 660
gagaagtacc aactgactct ctacccccac caattcatca acccacgcac taacatgacg 720
gcacacatca ccgtgcctta cgtgggtgtc aacagatacg accaatacaa ccaacacaag 780
ccctggactc ttgtcgtcat ggtcgttgct ccacttactg tgaacacatc aggtgcccag 840
cagatcaagg tgtatgccaa catagcccca accaacgttc acgttgctgg tgaacttccc 900
tccaaggagg ggatcttccc cgttgcgtgt gccgacggct atggcaacat ggtgacaact 960
gacccgaaga cggctgaccc tgcctacggg aaagtctata atccacccag gaccgccctg 1020
ccgggccggt tcacaaacta cctggatgtt gctgaggctt gccccactct cctgacgttc 1080
gagaacgtgc cttacgtttc aacacggact gatggacaaa ggctgttggc caagttcgac 1140
gtgtcattgg cagcgaaaca catgtcaaac acttacttgg ctggcttggc ccagtactac 1200
acacagtacg ctgggacaat caacctgcac ttcatgttca ctgggccaac cgacgcgaaa 1260
gctcggtaca tggtggcata cgtgccccct ggcatggaag caccagacaa cccagaggag 1320
gctgcccact gcatacacgc agagtgggac actggtttga actctaagtt cacattttca 1380
atcccgtaca tctcggccgc tgactacgca tacaccgcgt ccagcgaggc tgaaacaaca 1440
agcgtacagg gatgggtttg tgtgtaccag atcactcacg gcaaggcaga cgctgacgcg 1500
ctcgtcgtct ccgcttcggc ggggaaagac tttgaactcc ggctacctgt ggacgctaga 1560
cagcaaacta cgaccactgg cgaatctgcc gaccccgtca ccactaccgt tgagaactac 1620
ggaggagaaa cacaaactca acgtcgccac cacactgacg ttgccttcgt tcttgatcgg 1680
tttgtgaagg tccaggtgtc gggcaaccaa cacacactgg acgttatgca ggtacacaag 1740
gacagtattg tgggtgcact cctacgcgca gccacatact acttctctga cttggaaata 1800
gcagtgactc acactgggaa gctcacatgg gtgcccaacg gcgccccagt ttctgcactt 1860
gacaacacaa ccaaccccac tgcctaccac aaggggccgc tgactcggct ggctctccca 1920
tacaccgcac cacaccgcgt gctggccacg gcgtacactg gtacaacggc ctacactaca 1980
ggtgtacgca ggggagacct agcccacttg gcggcggcgc acgctcggca cctgccaacg 2040
tcgttcaact ttggtgcagt taaagcagag acaatcacag agctgcttgt gcgcatgaag 2100
cgtgctgaac tctactgccc caggccggtc cttccggtcc aaccagcggg cgataggcac 2160
aaacaaccgc tcattgcgcc agcgaaacaa ctgctgaact tcgaccttct caagttggcg 2220
ggagatgtcg agtccaaccc tgggccc 2247
<210> 371
<211> 2247
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(2247)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(2247)
<223> P1_C3_wildtype
<400> 371
gga gcc gga caa tcc agc ccg gcg act ggc tcg cag aac caa tct ggc 48
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
aac act ggt agc ata atc aac aac tac tac atg caa cag tac caa aat 96
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
tcc atg gac aca cag ctg ggt gac aat gct att agt ggt ggc tcc aac 144
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
gag ggc tcc aca gat aca act tcc acc cac aca acc aac act caa aac 192
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Thr Asn Thr Gln Asn
50 55 60
aac gac tgg ttt tcc aaa ctc gcc agt tct gcc ttt agc ggt ctt ttc 240
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Ser Ser Ala Phe Ser Gly Leu Phe
65 70 75 80
ggt gct ctt ctt gcc gac aag aag acc gag gaa acc aca cta ctt gaa 288
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
gac cgc atc ctc acc acc cgc aac ggc cac acg acg tcg aca act cag 336
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
tcg agc gtt ggg gtc aca tac ggg tac gca aca act gag gat agc acg 384
Ser Ser Val Gly Val Thr Tyr Gly Tyr Ala Thr Thr Glu Asp Ser Thr
115 120 125
tca ggg ccc aac aca tcc ggc ctt gag aca cgt gtt cac cag gca gaa 432
Ser Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val His Gln Ala Glu
130 135 140
cgg ttt ttc aag atg aca ctc ttt gaa tgg gtt ccc tcc cag agt ttt 480
Arg Phe Phe Lys Met Thr Leu Phe Glu Trp Val Pro Ser Gln Ser Phe
145 150 155 160
gga cac atg cac aag gtc gtt ctg ccc tca gaa ccg aaa ggt gtc tat 528
Gly His Met His Lys Val Val Leu Pro Ser Glu Pro Lys Gly Val Tyr
165 170 175
ggg ggt ctc gtc aag tca tac gcg tac atg cgc aat ggc tgg gac gtt 576
Gly Gly Leu Val Lys Ser Tyr Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
gag gtg act gct gtt gga aac cag ttc aac ggc ggt tgt ctc ctg gtg 624
Glu Val Thr Ala Val Gly Asn Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val
195 200 205
gcg ctc gtt cct gaa atg ggt gac atc agt gac aga gag aag tac caa 672
Ala Leu Val Pro Glu Met Gly Asp Ile Ser Asp Arg Glu Lys Tyr Gln
210 215 220
ctg act ctc tac ccc cac caa ttc atc aac cca cgc act aac atg acg 720
Leu Thr Leu Tyr Pro His Gln Phe Ile Asn Pro Arg Thr Asn Met Thr
225 230 235 240
gca cac atc acc gtg cct tac gtg ggt gtc aac aga tac gac caa tac 768
Ala His Ile Thr Val Pro Tyr Val Gly Val Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr
245 250 255
aac caa cac aag ccc tgg act ctt gtc gtc atg gtc gtt gct cca ctt 816
Asn Gln His Lys Pro Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ala Pro Leu
260 265 270
act gtg aac aca tca ggt gcc cag cag atc aag gtg tat gcc aac ata 864
Thr Val Asn Thr Ser Gly Ala Gln Gln Ile Lys Val Tyr Ala Asn Ile
275 280 285
gcc cca acc aac gtt cac gtt gct ggt gaa ctt ccc tcc aag gag ggg 912
Ala Pro Thr Asn Val His Val Ala Gly Glu Leu Pro Ser Lys Glu Gly
290 295 300
atc ttc ccc gtt gcg tgt gcc gac ggc tat ggc aac atg gtg aca act 960
Ile Phe Pro Val Ala Cys Ala Asp Gly Tyr Gly Asn Met Val Thr Thr
305 310 315 320
gac ccg aag aca gct gac cct gcc tac ggg aaa gtc tac aat cca ccc 1008
Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Ala Tyr Gly Lys Val Tyr Asn Pro Pro
325 330 335
agg acc gcc ctg ccg ggc cgg ttc aca aac tac ctg gat gtt gct gag 1056
Arg Thr Ala Leu Pro Gly Arg Phe Thr Asn Tyr Leu Asp Val Ala Glu
340 345 350
gct tgc ccc act ctc ctg acg ttc gag aac gtg cct tac gtt tca aca 1104
Ala Cys Pro Thr Leu Leu Thr Phe Glu Asn Val Pro Tyr Val Ser Thr
355 360 365
cgg act gat gga caa agg ctg ttg gcc aag ttc gac gtg tca ttg gca 1152
Arg Thr Asp Gly Gln Arg Leu Leu Ala Lys Phe Asp Val Ser Leu Ala
370 375 380
gcg aaa cac atg tca aac act tac ttg gct ggc ttg gcc cag tac tac 1200
Ala Lys His Met Ser Asn Thr Tyr Leu Ala Gly Leu Ala Gln Tyr Tyr
385 390 395 400
aca cag tac gct ggg aca atc aac ctg cac ttc atg ttc act ggg cca 1248
Thr Gln Tyr Ala Gly Thr Ile Asn Leu His Phe Met Phe Thr Gly Pro
405 410 415
acc gac gcg aaa gct cgg tac atg gtg gca tac gtg ccc cct ggc atg 1296
Thr Asp Ala Lys Ala Arg Tyr Met Val Ala Tyr Val Pro Pro Gly Met
420 425 430
gaa gca cca gac aac cca gag gag gct gcc cac tgc ata cac gca gag 1344
Glu Ala Pro Asp Asn Pro Glu Glu Ala Ala His Cys Ile His Ala Glu
435 440 445
tgg gac act ggt ttg aac tct aag ttc aca ttt tca atc ccg tac atc 1392
Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Ser Ile Pro Tyr Ile
450 455 460
tcg gcc gct gac tac gca tac acc gcg tcc agc gag gct gaa aca aca 1440
Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Ala Ser Ser Glu Ala Glu Thr Thr
465 470 475 480
agc gta cag gga tgg gtt tgt gtg tac cag atc act cac ggc aag gca 1488
Ser Val Gln Gly Trp Val Cys Val Tyr Gln Ile Thr His Gly Lys Ala
485 490 495
gac gct gac gcg ctc gtc gtc tcc gct tcg gcg ggg aaa gac ttt gag 1536
Asp Ala Asp Ala Leu Val Val Ser Ala Ser Ala Gly Lys Asp Phe Glu
500 505 510
ctc cgg cta cct gtg gac gct aga cag caa act acg acc act ggc gaa 1584
Leu Arg Leu Pro Val Asp Ala Arg Gln Gln Thr Thr Thr Thr Gly Glu
515 520 525
tct gcc gac ccc gtc acc act acc gtt gag aac tac gga gga gaa aca 1632
Ser Ala Asp Pro Val Thr Thr Thr Val Glu Asn Tyr Gly Gly Glu Thr
530 535 540
caa act caa cgt cgc cac cac act gac gtt gcc ttc gtt ctt gac cgg 1680
Gln Thr Gln Arg Arg His His Thr Asp Val Ala Phe Val Leu Asp Arg
545 550 555 560
ttt gtg aag gtc cag gtg tcg ggc aac caa cac aca ctg gac gtt atg 1728
Phe Val Lys Val Gln Val Ser Gly Asn Gln His Thr Leu Asp Val Met
565 570 575
cag gta cac aag gac agt att gtg ggt gca ctc cta cgc gca gcc aca 1776
Gln Val His Lys Asp Ser Ile Val Gly Ala Leu Leu Arg Ala Ala Thr
580 585 590
tac tac ttc tct gac ttg gaa ata gca gtg act cac act ggg aag ctc 1824
Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Glu Ile Ala Val Thr His Thr Gly Lys Leu
595 600 605
aca tgg gtg ccc aac ggc gcc cca gtt tct gca ctt gac aac aca acc 1872
Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Val Ser Ala Leu Asp Asn Thr Thr
610 615 620
aac ccc act gcc tac cac aag ggg ccg ctg act cgg ctg gct ctc cca 1920
Asn Pro Thr Ala Tyr His Lys Gly Pro Leu Thr Arg Leu Ala Leu Pro
625 630 635 640
tac acc gca cca cac cgc gtg ctg gcc acg gcg tac acc ggt aca acg 1968
Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala Thr Ala Tyr Thr Gly Thr Thr
645 650 655
gcc tac act acc ggt gta cgc agg gga gac cta gcc cac ttg gcg gcg 2016
Ala Tyr Thr Thr Gly Val Arg Arg Gly Asp Leu Ala His Leu Ala Ala
660 665 670
gcg cac gct cgg cac ctg ccg acg tcg ttc aac ttt ggt gca gtt aaa 2064
Ala His Ala Arg His Leu Pro Thr Ser Phe Asn Phe Gly Ala Val Lys
675 680 685
gca gag aca atc aca gag ctg ctt gtg cgc atg aag cgt gct gaa ctc 2112
Ala Glu Thr Ile Thr Glu Leu Leu Val Arg Met Lys Arg Ala Glu Leu
690 695 700
tac tgc ccc aga ccg gtc ctt ccg gtc caa cca gcg ggc gat agg cac 2160
Tyr Cys Pro Arg Pro Val Leu Pro Val Gln Pro Ala Gly Asp Arg His
705 710 715 720
aaa caa ccg ctc att gcg cca gcg aaa cag ctg ctg aac ttc gac ctt 2208
Lys Gln Pro Leu Ile Ala Pro Ala Lys Gln Leu Leu Asn Phe Asp Leu
725 730 735
ctc aag ttg gcg gga gac gtc gag tcc aac cct ggg ccc 2247
Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro Gly Pro
740 745
<210> 372
<211> 749
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 372
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Thr Asn Thr Gln Asn
50 55 60
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Ser Ser Ala Phe Ser Gly Leu Phe
65 70 75 80
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
Ser Ser Val Gly Val Thr Tyr Gly Tyr Ala Thr Thr Glu Asp Ser Thr
115 120 125
Ser Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val His Gln Ala Glu
130 135 140
Arg Phe Phe Lys Met Thr Leu Phe Glu Trp Val Pro Ser Gln Ser Phe
145 150 155 160
Gly His Met His Lys Val Val Leu Pro Ser Glu Pro Lys Gly Val Tyr
165 170 175
Gly Gly Leu Val Lys Ser Tyr Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
Glu Val Thr Ala Val Gly Asn Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val
195 200 205
Ala Leu Val Pro Glu Met Gly Asp Ile Ser Asp Arg Glu Lys Tyr Gln
210 215 220
Leu Thr Leu Tyr Pro His Gln Phe Ile Asn Pro Arg Thr Asn Met Thr
225 230 235 240
Ala His Ile Thr Val Pro Tyr Val Gly Val Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr
245 250 255
Asn Gln His Lys Pro Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ala Pro Leu
260 265 270
Thr Val Asn Thr Ser Gly Ala Gln Gln Ile Lys Val Tyr Ala Asn Ile
275 280 285
Ala Pro Thr Asn Val His Val Ala Gly Glu Leu Pro Ser Lys Glu Gly
290 295 300
Ile Phe Pro Val Ala Cys Ala Asp Gly Tyr Gly Asn Met Val Thr Thr
305 310 315 320
Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Ala Tyr Gly Lys Val Tyr Asn Pro Pro
325 330 335
Arg Thr Ala Leu Pro Gly Arg Phe Thr Asn Tyr Leu Asp Val Ala Glu
340 345 350
Ala Cys Pro Thr Leu Leu Thr Phe Glu Asn Val Pro Tyr Val Ser Thr
355 360 365
Arg Thr Asp Gly Gln Arg Leu Leu Ala Lys Phe Asp Val Ser Leu Ala
370 375 380
Ala Lys His Met Ser Asn Thr Tyr Leu Ala Gly Leu Ala Gln Tyr Tyr
385 390 395 400
Thr Gln Tyr Ala Gly Thr Ile Asn Leu His Phe Met Phe Thr Gly Pro
405 410 415
Thr Asp Ala Lys Ala Arg Tyr Met Val Ala Tyr Val Pro Pro Gly Met
420 425 430
Glu Ala Pro Asp Asn Pro Glu Glu Ala Ala His Cys Ile His Ala Glu
435 440 445
Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Ser Ile Pro Tyr Ile
450 455 460
Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Ala Ser Ser Glu Ala Glu Thr Thr
465 470 475 480
Ser Val Gln Gly Trp Val Cys Val Tyr Gln Ile Thr His Gly Lys Ala
485 490 495
Asp Ala Asp Ala Leu Val Val Ser Ala Ser Ala Gly Lys Asp Phe Glu
500 505 510
Leu Arg Leu Pro Val Asp Ala Arg Gln Gln Thr Thr Thr Thr Gly Glu
515 520 525
Ser Ala Asp Pro Val Thr Thr Thr Val Glu Asn Tyr Gly Gly Glu Thr
530 535 540
Gln Thr Gln Arg Arg His His Thr Asp Val Ala Phe Val Leu Asp Arg
545 550 555 560
Phe Val Lys Val Gln Val Ser Gly Asn Gln His Thr Leu Asp Val Met
565 570 575
Gln Val His Lys Asp Ser Ile Val Gly Ala Leu Leu Arg Ala Ala Thr
580 585 590
Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Glu Ile Ala Val Thr His Thr Gly Lys Leu
595 600 605
Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Val Ser Ala Leu Asp Asn Thr Thr
610 615 620
Asn Pro Thr Ala Tyr His Lys Gly Pro Leu Thr Arg Leu Ala Leu Pro
625 630 635 640
Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala Thr Ala Tyr Thr Gly Thr Thr
645 650 655
Ala Tyr Thr Thr Gly Val Arg Arg Gly Asp Leu Ala His Leu Ala Ala
660 665 670
Ala His Ala Arg His Leu Pro Thr Ser Phe Asn Phe Gly Ala Val Lys
675 680 685
Ala Glu Thr Ile Thr Glu Leu Leu Val Arg Met Lys Arg Ala Glu Leu
690 695 700
Tyr Cys Pro Arg Pro Val Leu Pro Val Gln Pro Ala Gly Asp Arg His
705 710 715 720
Lys Gln Pro Leu Ile Ala Pro Ala Lys Gln Leu Leu Asn Phe Asp Leu
725 730 735
Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro Gly Pro
740 745
<210> 373
<211> 2259
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> P1_O1_Manissa_cut_sites_removed
<400> 373
ggagccgggc aatccagccc ggcaaccggg tcacagaacc aatcaggcaa cactgggagc 60
atcatcaaca attactacat gcagcagtac caaaactcta tggacacaca acttggtgac 120
aacgctacaa gcggaggctc aaacgagggg tccacggaca caacctccac ccacacaacc 180
aacactcaga acaacgactg gttctcgaag ctggccagtt ccgctttcag cggtcttttc 240
ggcgctcttc tcgccgacaa gaaaaccgag gagaccactc ttcttgagga ccgcatcctc 300
actactcgta acggacacac cacctcgaca acccagtcga gcgtaggagt cacatacggg 360
tatgcaacgg ctgaggattt cgtgagcggg ccaaacacct ctggtcttga gaccagggtt 420
gcccaggcag agcggttctt taaaacccac ctgttcgact gggtcacaag tgacccgttc 480
ggacggtgcc acctgctaga acttccaact gaccacaaag gtgtctatgg cagcctgacc 540
gactcgtatg cttatatgag gaacggctgg gatgttgaag tcactgctgt gggaaatcag 600
ttcaatggag gatgcctgtt ggtggctatg gtgccagaac tttgctccat acagaagagg 660
gagctgtacc agctcacgct ctttcctcac cagttcatca accctcggac gaacatgaca 720
gcacacatca ctgtgccctt tgttggcgtc aaccgttatg accagtacaa ggtacacaaa 780
ccttggaccc tcgtggttat ggttgtagcc cccctgaccg tcaacagtga aggtgccccg 840
caaatcaagg tgtatgccaa catcgcacct accaacgtac acgtcgcggg tgagttccct 900
tccaaagagg ggatcttccc tgtggcttgc agcgatggtt atggcggtct ggtgacaact 960
gacccgaaaa cggctgaccc cgcttacggg aaagtgttta accccccccg caacatgttg 1020
ccggggcggt tcaccaattt tcttgacgtg gctgaggcgt gccccacgtt tctccacttc 1080
gagggtgacg tgccatacgt gaccacgaag acggattcag acagggtgct cgctcagttc 1140
gacttgtctt tggcagcaaa gcacatgtcc aacaccttcc ttgcaggtct cgcccagtac 1200
tacacacagt acagcggcac catcaacctg cacttcatgt tcacagggcc tactgacgcg 1260
aaggcgcgtt acatgattgc gtatgctcct cctggcatgg aaccacctaa aacgccagag 1320
gcggctgccc actgcatcca tgctgaatgg gacacagggt tgaactcaaa attcacattt 1380
tcaatccctt acctttcggc ggctgattac gcttacacag cgtctgacac tgctgagacc 1440
acaaatgtac agggatgggt ttgcctgttt caaataacac acgggaaagc tgacggcgac 1500
gcactggtcg ttttggccag cgccggaaag gactttgagc tgcgcctgcc ggtggatgct 1560
cgcacacaga ctacctcagc gggcgagtca gcagaccccg tgaccgccac cgttgagaat 1620
tacggtggcg agacacaggt ccagaggcgc caacacacgg acgtgtcatt tatattagac 1680
agatttgtga aagtgacacc aaaagaccaa attaatgtat tggacctgat gcaaacccct 1740
gctcacactt tggtgggagc actccttcgt actgccactt actatttcgc tgacttagag 1800
gtggcagtga agcacgaggg aaacctcacc tgggtgccga acggggcgcc tgaagcggcg 1860
ttggacaaca ccaccaaccc aacagcttac cacaaggcac cactcacccg acttgcactg 1920
ccttacacgg cgccacaccg cgtgttggct actgtttaca acgggaacag caagtatggt 1980
gacggcacgg tggccaatgt gagaggtgat ctgcaagtgt tggcccagaa ggcggcgaga 2040
gcgctgccta cctccttcaa ctacggtgcc attaaagcta ctcgggtgac tgaactgctt 2100
taccgcatga agagggctga gacatactgt ccccggcctc ttttggccat tcacccggac 2160
caggctagac acaagcagaa gattgtggct ccggtgaaac agcttctaaa ttttgacctg 2220
ctcaaattgg cgggagatgt ggagtccaac cctgggccc 2259
<210> 374
<211> 2259
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(2259)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(2259)
<223> P1_01_Marissa_wild_type
<400> 374
gga gcc ggg caa tcc agc ccg gca acc ggg tca cag aac caa tca ggc 48
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
aac act ggg agc atc atc aac aat tac tac atg cag cag tac caa aac 96
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
tcc atg gac aca caa ctt ggt gac aac gct aca agc gga ggc tca aac 144
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Thr Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
gag ggg tcc acg gac aca acc tcc acc cac aca acc aac act cag aac 192
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Thr Asn Thr Gln Asn
50 55 60
aac gac tgg ttc tcg aag ctg gcc agt tcc gct ttc agc ggt ctt ttc 240
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Ser Ser Ala Phe Ser Gly Leu Phe
65 70 75 80
ggc gct ctt ctc gcc gac aag aaa acc gag gag acc act ctt ctc gag 288
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
gac cgc atc ctc act act cgt aac gga cac acc acc tcg aca acc cag 336
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
tcg agc gtt gga gtc acg tac ggg tat gca aca gct gag gat ttc gtg 384
Ser Ser Val Gly Val Thr Tyr Gly Tyr Ala Thr Ala Glu Asp Phe Val
115 120 125
agc ggg cca aac acc tct ggt ctc gag acc agg gtt gcc cag gca gag 432
Ser Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Ala Gln Ala Glu
130 135 140
cgg ttc ttt aaa acc cac ctg ttc gac tgg gtc acc agt gac ccg ttc 480
Arg Phe Phe Lys Thr His Leu Phe Asp Trp Val Thr Ser Asp Pro Phe
145 150 155 160
gga cgg tgc cac ctg ctg gaa ctt cca act gac cac aaa ggt gtc tac 528
Gly Arg Cys His Leu Leu Glu Leu Pro Thr Asp His Lys Gly Val Tyr
165 170 175
ggc agc ctg acc gac tcg tat gct tat atg agg aac ggc tgg gat gtt 576
Gly Ser Leu Thr Asp Ser Tyr Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
gaa gtc act gca gtg gga aac cag ttc aat gga gga tgc ctg ttg gtg 624
Glu Val Thr Ala Val Gly Asn Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val
195 200 205
gcc atg gtg cca gaa ctt tgc tcc ata cag aag agg gag ctg tac cag 672
Ala Met Val Pro Glu Leu Cys Ser Ile Gln Lys Arg Glu Leu Tyr Gln
210 215 220
ctc acg ctc ttt cct cac cag ttc atc aac cct cgg acg aac atg aca 720
Leu Thr Leu Phe Pro His Gln Phe Ile Asn Pro Arg Thr Asn Met Thr
225 230 235 240
gca cac atc act gtg ccc ttt gtt ggc gtc aac cgt tat gac cag tac 768
Ala His Ile Thr Val Pro Phe Val Gly Val Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr
245 250 255
aag gta cac aaa cct tgg acc ctc gtg gtt atg gtt gta gcc ccc ctg 816
Lys Val His Lys Pro Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ala Pro Leu
260 265 270
acc gtc aac agt gaa ggt gcc ccg caa atc aag gtg tat gcc aac atc 864
Thr Val Asn Ser Glu Gly Ala Pro Gln Ile Lys Val Tyr Ala Asn Ile
275 280 285
gca cct acc aac gta cac gtc gcg ggt gag ttc cct tcc aaa gag ggg 912
Ala Pro Thr Asn Val His Val Ala Gly Glu Phe Pro Ser Lys Glu Gly
290 295 300
atc ttc cct gtg gct tgc agc gat ggt tat ggc ggt ctg gtg acc act 960
Ile Phe Pro Val Ala Cys Ser Asp Gly Tyr Gly Gly Leu Val Thr Thr
305 310 315 320
gac ccg aaa acg gct gac ccc gct tac ggg aaa gtg ttt aac ccc ccc 1008
Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Ala Tyr Gly Lys Val Phe Asn Pro Pro
325 330 335
cgc aac atg ttg ccg ggg cgg ttc acc aat ttt ctt gac gtg gct gag 1056
Arg Asn Met Leu Pro Gly Arg Phe Thr Asn Phe Leu Asp Val Ala Glu
340 345 350
gcg tgc ccc acg ttt ctc cac ttc gag ggt gac gtg cca tac gtg acc 1104
Ala Cys Pro Thr Phe Leu His Phe Glu Gly Asp Val Pro Tyr Val Thr
355 360 365
acg aag acg gat tca gac agg gtg ctc gct cag ttc gac ttg tct ttg 1152
Thr Lys Thr Asp Ser Asp Arg Val Leu Ala Gln Phe Asp Leu Ser Leu
370 375 380
gca gca aag cac atg tcg aac acc ttc ctt gca ggt ctc gcc cag tac 1200
Ala Ala Lys His Met Ser Asn Thr Phe Leu Ala Gly Leu Ala Gln Tyr
385 390 395 400
tac aca cag tac agc ggc acc atc aac ctg cac ttc atg ttc aca ggg 1248
Tyr Thr Gln Tyr Ser Gly Thr Ile Asn Leu His Phe Met Phe Thr Gly
405 410 415
cct act gac gcg aag gcg cgt tac atg att gcg tat gct cct cct ggc 1296
Pro Thr Asp Ala Lys Ala Arg Tyr Met Ile Ala Tyr Ala Pro Pro Gly
420 425 430
atg gaa cca cct aaa acg cca gag gcg gct gcc cac tgc att cat gct 1344
Met Glu Pro Pro Lys Thr Pro Glu Ala Ala Ala His Cys Ile His Ala
435 440 445
gaa tgg gac aca ggg ttg aac tca aaa ttc aca ttt tca atc cct tac 1392
Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Ser Ile Pro Tyr
450 455 460
ctt tcg gcg gct gat tac gct tac aca gcg tct gac act gct gag acc 1440
Leu Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Ala Ser Asp Thr Ala Glu Thr
465 470 475 480
aca aat gta cag gga tgg gtt tgc ctg ttt caa ata aca cac ggg aaa 1488
Thr Asn Val Gln Gly Trp Val Cys Leu Phe Gln Ile Thr His Gly Lys
485 490 495
gct gac ggc gac gca ctg gtc gtt ttg gct agc gcc gga aag gac ttt 1536
Ala Asp Gly Asp Ala Leu Val Val Leu Ala Ser Ala Gly Lys Asp Phe
500 505 510
gag ctg cgc ctg ccg gtg gat gct cgc aca cag act acc tcc gcg ggc 1584
Glu Leu Arg Leu Pro Val Asp Ala Arg Thr Gln Thr Thr Ser Ala Gly
515 520 525
gag tca gct gac ccc gtg acc gcc acc gtt gag aat tac ggt ggc gag 1632
Glu Ser Ala Asp Pro Val Thr Ala Thr Val Glu Asn Tyr Gly Gly Glu
530 535 540
aca cag gtc cag agg cgc caa cac acg gac gtc tca ttt ata tta gac 1680
Thr Gln Val Gln Arg Arg Gln His Thr Asp Val Ser Phe Ile Leu Asp
545 550 555 560
aga ttt gtg aaa gtg aca cca aaa gac caa att aat gta ttg gac ctg 1728
Arg Phe Val Lys Val Thr Pro Lys Asp Gln Ile Asn Val Leu Asp Leu
565 570 575
atg caa acc cct gct cac act ttg gtg gga gca ctc ctt cgt act gcc 1776
Met Gln Thr Pro Ala His Thr Leu Val Gly Ala Leu Leu Arg Thr Ala
580 585 590
act tac tat ttc gct gac tta gag gtg gca gtg aag cac gag gga aac 1824
Thr Tyr Tyr Phe Ala Asp Leu Glu Val Ala Val Lys His Glu Gly Asn
595 600 605
ctc acc tgg gtc ccg aac ggg gcg cct gaa gcg gcg ttg gac aac acc 1872
Leu Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Glu Ala Ala Leu Asp Asn Thr
610 615 620
acc aac cca aca gct tac cac aag gca cca ctc acc cga ctt gca ctg 1920
Thr Asn Pro Thr Ala Tyr His Lys Ala Pro Leu Thr Arg Leu Ala Leu
625 630 635 640
cct tac acg gcg cca cac cgc gtg ttg gct act gtt tac aac ggg aac 1968
Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala Thr Val Tyr Asn Gly Asn
645 650 655
agc aag tat ggt gac ggc acg gtg gcc aat gtg aga ggt gac ctg caa 2016
Ser Lys Tyr Gly Asp Gly Thr Val Ala Asn Val Arg Gly Asp Leu Gln
660 665 670
gtg ttg gcc cag aag gcg gcg aga gcg ctg cct acc tcc ttc aac tac 2064
Val Leu Ala Gln Lys Ala Ala Arg Ala Leu Pro Thr Ser Phe Asn Tyr
675 680 685
ggt gcc att aaa gct act cgg gtg act gaa ctg ctt tac cgc atg aag 2112
Gly Ala Ile Lys Ala Thr Arg Val Thr Glu Leu Leu Tyr Arg Met Lys
690 695 700
agg gct gag aca tac tgt ccc cgg cct ctt ttg gcc att cac ccg gac 2160
Arg Ala Glu Thr Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu Ala Ile His Pro Asp
705 710 715 720
cag gct aga cac aag cag aag att gtg gca ccg gtg aaa cag ctt cta 2208
Gln Ala Arg His Lys Gln Lys Ile Val Ala Pro Val Lys Gln Leu Leu
725 730 735
aat ttt gac ctg ctc aaa ttg gcg gga gat gtg gag tcc aac cct ggg 2256
Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro Gly
740 745 750
ccc 2259
Pro
<210> 375
<211> 753
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 375
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Thr Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Thr Asn Thr Gln Asn
50 55 60
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Ser Ser Ala Phe Ser Gly Leu Phe
65 70 75 80
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
Ser Ser Val Gly Val Thr Tyr Gly Tyr Ala Thr Ala Glu Asp Phe Val
115 120 125
Ser Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Ala Gln Ala Glu
130 135 140
Arg Phe Phe Lys Thr His Leu Phe Asp Trp Val Thr Ser Asp Pro Phe
145 150 155 160
Gly Arg Cys His Leu Leu Glu Leu Pro Thr Asp His Lys Gly Val Tyr
165 170 175
Gly Ser Leu Thr Asp Ser Tyr Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
Glu Val Thr Ala Val Gly Asn Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val
195 200 205
Ala Met Val Pro Glu Leu Cys Ser Ile Gln Lys Arg Glu Leu Tyr Gln
210 215 220
Leu Thr Leu Phe Pro His Gln Phe Ile Asn Pro Arg Thr Asn Met Thr
225 230 235 240
Ala His Ile Thr Val Pro Phe Val Gly Val Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr
245 250 255
Lys Val His Lys Pro Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ala Pro Leu
260 265 270
Thr Val Asn Ser Glu Gly Ala Pro Gln Ile Lys Val Tyr Ala Asn Ile
275 280 285
Ala Pro Thr Asn Val His Val Ala Gly Glu Phe Pro Ser Lys Glu Gly
290 295 300
Ile Phe Pro Val Ala Cys Ser Asp Gly Tyr Gly Gly Leu Val Thr Thr
305 310 315 320
Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Ala Tyr Gly Lys Val Phe Asn Pro Pro
325 330 335
Arg Asn Met Leu Pro Gly Arg Phe Thr Asn Phe Leu Asp Val Ala Glu
340 345 350
Ala Cys Pro Thr Phe Leu His Phe Glu Gly Asp Val Pro Tyr Val Thr
355 360 365
Thr Lys Thr Asp Ser Asp Arg Val Leu Ala Gln Phe Asp Leu Ser Leu
370 375 380
Ala Ala Lys His Met Ser Asn Thr Phe Leu Ala Gly Leu Ala Gln Tyr
385 390 395 400
Tyr Thr Gln Tyr Ser Gly Thr Ile Asn Leu His Phe Met Phe Thr Gly
405 410 415
Pro Thr Asp Ala Lys Ala Arg Tyr Met Ile Ala Tyr Ala Pro Pro Gly
420 425 430
Met Glu Pro Pro Lys Thr Pro Glu Ala Ala Ala His Cys Ile His Ala
435 440 445
Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Ser Ile Pro Tyr
450 455 460
Leu Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Ala Ser Asp Thr Ala Glu Thr
465 470 475 480
Thr Asn Val Gln Gly Trp Val Cys Leu Phe Gln Ile Thr His Gly Lys
485 490 495
Ala Asp Gly Asp Ala Leu Val Val Leu Ala Ser Ala Gly Lys Asp Phe
500 505 510
Glu Leu Arg Leu Pro Val Asp Ala Arg Thr Gln Thr Thr Ser Ala Gly
515 520 525
Glu Ser Ala Asp Pro Val Thr Ala Thr Val Glu Asn Tyr Gly Gly Glu
530 535 540
Thr Gln Val Gln Arg Arg Gln His Thr Asp Val Ser Phe Ile Leu Asp
545 550 555 560
Arg Phe Val Lys Val Thr Pro Lys Asp Gln Ile Asn Val Leu Asp Leu
565 570 575
Met Gln Thr Pro Ala His Thr Leu Val Gly Ala Leu Leu Arg Thr Ala
580 585 590
Thr Tyr Tyr Phe Ala Asp Leu Glu Val Ala Val Lys His Glu Gly Asn
595 600 605
Leu Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Glu Ala Ala Leu Asp Asn Thr
610 615 620
Thr Asn Pro Thr Ala Tyr His Lys Ala Pro Leu Thr Arg Leu Ala Leu
625 630 635 640
Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala Thr Val Tyr Asn Gly Asn
645 650 655
Ser Lys Tyr Gly Asp Gly Thr Val Ala Asn Val Arg Gly Asp Leu Gln
660 665 670
Val Leu Ala Gln Lys Ala Ala Arg Ala Leu Pro Thr Ser Phe Asn Tyr
675 680 685
Gly Ala Ile Lys Ala Thr Arg Val Thr Glu Leu Leu Tyr Arg Met Lys
690 695 700
Arg Ala Glu Thr Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu Ala Ile His Pro Asp
705 710 715 720
Gln Ala Arg His Lys Gln Lys Ile Val Ala Pro Val Lys Gln Leu Leu
725 730 735
Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro Gly
740 745 750
Pro
<210> 376
<211> 2259
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> P1_O1_pan_Asia_cut_sites_removed
<400> 376
ggtgctgggc aatccagccc ggcgactggg tcacagaacc agtcaggcaa cactggaagc 60
atcatcaaca actactacat gcagcagtac cagaactcca tggacacaca acttggtgac 120
aacgctatca gcggaggctc taacgaaggt tctacagaca ccacctccac ccacacaacc 180
aacactcaga acaacgactg gttttcaaaa ctagccagtt ccgctttcag cggtcttttc 240
ggcgctcttc tcgccgacaa gaaaaccgag gagactactc ttcttgagga ccgcatcctc 300
actacccgta acggacacac aacctcgaca acccagtcga gcgttggagt cacttacggg 360
tacgcaacag ccgaggattt tgtgagcggg ccaaacacat ctggccttga gaccagggtt 420
gtgcaagcag agcggttctt caaaacccac ttgttcgatt gggtcactag tgactcgttc 480
ggacgatgcc acctgctgga acttccaact gaccacaaag gtgtctatgg cagcctgact 540
gattcttatg cgtacatgag aaacggttgg gatgtcgagg tcactgcggt gggaaaccag 600
ttcaacggag gatgcctgtt ggtggccatg gtgccagaac tctgctctat cagcaaaaga 660
gagctgtacc agctcacgct ctttccccac cagttcatca acccccggac gaacatgacg 720
gcacacatca ccgtgccctt tgtcggcgtc aaccgctacg accagtacaa ggtacacaaa 780
ccttggaccc tcgtggtcat ggtcgtggcc ccgctgactg tcaacactga aggtgctcca 840
cagatcaagg tttatgccaa catcgcccct accaacgtgc acgtcgcggg tgagttcccc 900
tccaaggaag ggatcttccc cgtggcctgc agtgacggtt acggcggtct tgtgaccact 960
gacccaaaga cggctgaccc cgtttacggg aaagttttca atccccctcg cagcatgttg 1020
ccagggcgat tcaccaactt ccttgatgtg gctgaggcgt gccctacgtt tctgcatttt 1080
gagggtgacg taccatacgt gaccacaaag acggattcgg acagggttct cgctcagttt 1140
gacttgtctt tggcagcgaa gcacatgtca aacacctttc ttgcaggtct cgcccagtac 1200
tacgcacagt acagtggcac tattaacctg cacttcatgt tcacagggcc aactgacgcg 1260
aaagcgcgtt acatgattgc ctatgccccc cccggcatgg agccgcctaa aacacctgag 1320
gcagccgctc actgcattca cgcggagtgg gatactggat tgaactcaaa attcacattc 1380
tcaatccctt acctctcggc ggctgactat gcgtacaccg cgtctgacac cgccgagacc 1440
acaaatgtac agggatgggt ttgcctgttt caaatcacgc acgggaaggc cgatggtgac 1500
gcacttgttg tcctggccag cgccggtaag gacttcgagc tgcggttgcc agttgatgcc 1560
cgcacgcaga ccacctccac aggtgagtca gctgaccccg tgactgccac tgttgagaac 1620
tacggtggcg aaacacaggt ccagagacgc cagcacacgg acgtctcgtt tatattggac 1680
agatttgtga aagtgacacc aaaagaccaa atcaatgtgt tggacctgat gcaaaccccc 1740
gcccacactt tggtaggtgc actcctccgc accgccacct actacttcgc agatttagag 1800
gtggcagtaa aacacgaggg gaaccttacc tgggtcccga atggggcgcc cgagacagcg 1860
ttggataaca ccactaatcc aacggcttac cacaaggcac cgctcactcg tcttgcactg 1920
ccttacacgg caccgcaccg tgtcttggct accgtttaca acgggaactg caagtacgac 1980
gagagcagca caaccaacgt gagaggagac ctgcaagtgt tggcccaaaa ggcggcgagg 2040
acgctgccca cctccttcaa ctacggtgcc atcaaagcta cacgggtgaa cgagttgctt 2100
taccgcatga agagggctga aacatactgc ccccggcctc ttttggccat tcatccgaat 2160
gaagcaagac acaagcaaaa gatagtggca cctgcgaagc aactcctgaa cttcgacctg 2220
ctcaagttgg cgggagacgt tgagtccaac cccgggccc 2259
<210> 377
<211> 2259
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(2259)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(2259)
<223> P1_O1_pan_Asia_wildtype
<400> 377
ggt gct ggg caa tcc agc ccg gcg act ggg tca cag aac cag tca ggc 48
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
aac act gga agc atc atc aac aac tac tac atg cag cag tac cag aac 96
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
tcc atg gac aca caa ctt ggt gac aac gct atc agc gga ggc tct aac 144
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
gaa ggg tct aca gac acc acc tcc acc cac aca acc aac act cag aac 192
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Thr Asn Thr Gln Asn
50 55 60
aac gac tgg ttt tca aaa cta gcc agt tcc gct ttc agc ggt ctt ttc 240
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Ser Ser Ala Phe Ser Gly Leu Phe
65 70 75 80
ggc gct ctt ctc gcc gac aag aaa acc gag gag act act ctt ctc gag 288
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
gac cgc atc ctc act acc cgt aac gga cac aca acc tcg aca acc cag 336
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
tcg agc gtt gga gtc act tac ggg tac gca aca gcc gag gat ttt gtg 384
Ser Ser Val Gly Val Thr Tyr Gly Tyr Ala Thr Ala Glu Asp Phe Val
115 120 125
agc ggg cca aac aca tct ggc ctt gag acc agg gtt gtg caa gca gag 432
Ser Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Val Gln Ala Glu
130 135 140
cgg ttc ttc aaa acc cac ttg ttc gat tgg gtc act agt gac tcg ttc 480
Arg Phe Phe Lys Thr His Leu Phe Asp Trp Val Thr Ser Asp Ser Phe
145 150 155 160
gga cga tgc cac ctg ctg gaa ctt cca act gac cac aaa ggt gtc tac 528
Gly Arg Cys His Leu Leu Glu Leu Pro Thr Asp His Lys Gly Val Tyr
165 170 175
ggc agc ctg act gat tct tat gcg tac atg aga aac ggt tgg gat gtc 576
Gly Ser Leu Thr Asp Ser Tyr Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
gag gtc act gcg gtg gga aac cag ttc aac gga gga tgc ctg ttg gtg 624
Glu Val Thr Ala Val Gly Asn Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val
195 200 205
gcc atg gtg cca gaa ctc tgc tct atc agc aaa aga gag ctg tac cag 672
Ala Met Val Pro Glu Leu Cys Ser Ile Ser Lys Arg Glu Leu Tyr Gln
210 215 220
ctc acg ctc ttt ccc cac cag ttc atc aac ccc cgg acg aac atg acg 720
Leu Thr Leu Phe Pro His Gln Phe Ile Asn Pro Arg Thr Asn Met Thr
225 230 235 240
gca cac atc acc gtg ccc ttt gtc ggc gtc aac cgc tac gac cag tac 768
Ala His Ile Thr Val Pro Phe Val Gly Val Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr
245 250 255
aag gta cac aaa cct tgg acc ctc gtg gtc atg gtc gtg gcc ccg ctg 816
Lys Val His Lys Pro Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ala Pro Leu
260 265 270
act gtc aac act gaa ggt gct cca cag atc aag gtt tat gcc aac atc 864
Thr Val Asn Thr Glu Gly Ala Pro Gln Ile Lys Val Tyr Ala Asn Ile
275 280 285
gcc cct acc aac gtg cac gtc gcg ggt gag ttc ccc tcc aag gaa ggg 912
Ala Pro Thr Asn Val His Val Ala Gly Glu Phe Pro Ser Lys Glu Gly
290 295 300
atc ttc ccc gtg gcc tgc agt gac ggt tac ggc ggt ctt gtg acc act 960
Ile Phe Pro Val Ala Cys Ser Asp Gly Tyr Gly Gly Leu Val Thr Thr
305 310 315 320
gac cca aag acg gct gac ccc gtt tac ggg aaa gtt ttc aat ccc cct 1008
Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Val Tyr Gly Lys Val Phe Asn Pro Pro
325 330 335
cgc agc atg ttg cca ggg cga ttc acc aac ttc ctt gat gtg gct gag 1056
Arg Ser Met Leu Pro Gly Arg Phe Thr Asn Phe Leu Asp Val Ala Glu
340 345 350
gcg tgc cct acg ttt ctg cat ttt gag ggt gac gta cca tac gtg acc 1104
Ala Cys Pro Thr Phe Leu His Phe Glu Gly Asp Val Pro Tyr Val Thr
355 360 365
aca aag acg gat tcg gac agg gtt ctc gct cag ttt gac ttg tct ttg 1152
Thr Lys Thr Asp Ser Asp Arg Val Leu Ala Gln Phe Asp Leu Ser Leu
370 375 380
gca gcg aag cac atg tca aac acc ttt ctt gca ggt ctc gcc cag tac 1200
Ala Ala Lys His Met Ser Asn Thr Phe Leu Ala Gly Leu Ala Gln Tyr
385 390 395 400
tac gca cag tac agt ggc act att aac ctg cac ttc atg ttc aca ggg 1248
Tyr Ala Gln Tyr Ser Gly Thr Ile Asn Leu His Phe Met Phe Thr Gly
405 410 415
ccc act gac gcg aaa gcg cgt tac atg att gca tat gcc ccc ccc ggc 1296
Pro Thr Asp Ala Lys Ala Arg Tyr Met Ile Ala Tyr Ala Pro Pro Gly
420 425 430
atg gag ccg cct aaa aca cct gag gca gcc gct cac tgc att cac gcg 1344
Met Glu Pro Pro Lys Thr Pro Glu Ala Ala Ala His Cys Ile His Ala
435 440 445
gag tgg gat act gga ttg aat tca aaa ttc aca ttc tca atc cct tac 1392
Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Ser Ile Pro Tyr
450 455 460
ctc tcg gcg gct gac tac gcg tac acc gcg tct gac acc gcc gag acc 1440
Leu Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Ala Ser Asp Thr Ala Glu Thr
465 470 475 480
aca aat gta cag gga tgg gtt tgc ctg ttt caa atc acg cac ggg aag 1488
Thr Asn Val Gln Gly Trp Val Cys Leu Phe Gln Ile Thr His Gly Lys
485 490 495
gcc gat ggt gac gca ctt gtt gtc ctg gct agc gcc ggt aag gac ttc 1536
Ala Asp Gly Asp Ala Leu Val Val Leu Ala Ser Ala Gly Lys Asp Phe
500 505 510
gag ctg cgg ttg cca gtt gat gcc cgc acg cag acc acc tcc aca ggt 1584
Glu Leu Arg Leu Pro Val Asp Ala Arg Thr Gln Thr Thr Ser Thr Gly
515 520 525
gag tca gct gac ccc gtg act gcc act gtt gag aac tac ggt ggc gaa 1632
Glu Ser Ala Asp Pro Val Thr Ala Thr Val Glu Asn Tyr Gly Gly Glu
530 535 540
aca cag gtc cag aga cgc cag cac acg gac gtc tcg ttt ata ttg gac 1680
Thr Gln Val Gln Arg Arg Gln His Thr Asp Val Ser Phe Ile Leu Asp
545 550 555 560
aga ttt gtg aaa gtg aca cca aaa gac caa atc aat gtg ttg gac ctg 1728
Arg Phe Val Lys Val Thr Pro Lys Asp Gln Ile Asn Val Leu Asp Leu
565 570 575
atg caa acc ccc gcc cac act ttg gta ggt gca ctc ctc cgc acc gcc 1776
Met Gln Thr Pro Ala His Thr Leu Val Gly Ala Leu Leu Arg Thr Ala
580 585 590
acc tac tac ttc gca gat tta gag gtg gca gta aaa cac gag ggg aac 1824
Thr Tyr Tyr Phe Ala Asp Leu Glu Val Ala Val Lys His Glu Gly Asn
595 600 605
ctt acc tgg gtc ccg aat ggg gcg ccc gag aca gcg ttg gat aac acc 1872
Leu Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Glu Thr Ala Leu Asp Asn Thr
610 615 620
act aat cca acg gct tac cac aag gca ccg ctc act cgt ctt gca ctg 1920
Thr Asn Pro Thr Ala Tyr His Lys Ala Pro Leu Thr Arg Leu Ala Leu
625 630 635 640
cct tac acg gca ccg cac cgt gtc ttg gct acc gtt tac aac ggg aac 1968
Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala Thr Val Tyr Asn Gly Asn
645 650 655
tgc aag tac gac gag agc agc aca acc aac gtg aga ggt gac ctg caa 2016
Cys Lys Tyr Asp Glu Ser Ser Thr Thr Asn Val Arg Gly Asp Leu Gln
660 665 670
gtg ttg gcc caa aag gcg gcg agg acg ctg ccc acc tcc ttc aac tac 2064
Val Leu Ala Gln Lys Ala Ala Arg Thr Leu Pro Thr Ser Phe Asn Tyr
675 680 685
ggt gcc atc aaa gct acc cgg gtg aac gag ttg ctt tac cgc atg aag 2112
Gly Ala Ile Lys Ala Thr Arg Val Asn Glu Leu Leu Tyr Arg Met Lys
690 695 700
agg gct gaa aca tac tgc ccc cgg cct ctt ttg gcc att cat ccg aat 2160
Arg Ala Glu Thr Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu Ala Ile His Pro Asn
705 710 715 720
gaa gca aga cac aag caa aag ata gtg gca cct gcg aag caa ctc ctg 2208
Glu Ala Arg His Lys Gln Lys Ile Val Ala Pro Ala Lys Gln Leu Leu
725 730 735
aac ttc gac ctg ctc aag ttg gcg gga gac gtt gag tcc aac cct ggg 2256
Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro Gly
740 745 750
ccc 2259
Pro
<210> 378
<211> 753
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 378
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Thr Asn Thr Gln Asn
50 55 60
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Ser Ser Ala Phe Ser Gly Leu Phe
65 70 75 80
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg Asn Gly His Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
Ser Ser Val Gly Val Thr Tyr Gly Tyr Ala Thr Ala Glu Asp Phe Val
115 120 125
Ser Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Val Gln Ala Glu
130 135 140
Arg Phe Phe Lys Thr His Leu Phe Asp Trp Val Thr Ser Asp Ser Phe
145 150 155 160
Gly Arg Cys His Leu Leu Glu Leu Pro Thr Asp His Lys Gly Val Tyr
165 170 175
Gly Ser Leu Thr Asp Ser Tyr Ala Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
Glu Val Thr Ala Val Gly Asn Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val
195 200 205
Ala Met Val Pro Glu Leu Cys Ser Ile Ser Lys Arg Glu Leu Tyr Gln
210 215 220
Leu Thr Leu Phe Pro His Gln Phe Ile Asn Pro Arg Thr Asn Met Thr
225 230 235 240
Ala His Ile Thr Val Pro Phe Val Gly Val Asn Arg Tyr Asp Gln Tyr
245 250 255
Lys Val His Lys Pro Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ala Pro Leu
260 265 270
Thr Val Asn Thr Glu Gly Ala Pro Gln Ile Lys Val Tyr Ala Asn Ile
275 280 285
Ala Pro Thr Asn Val His Val Ala Gly Glu Phe Pro Ser Lys Glu Gly
290 295 300
Ile Phe Pro Val Ala Cys Ser Asp Gly Tyr Gly Gly Leu Val Thr Thr
305 310 315 320
Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Val Tyr Gly Lys Val Phe Asn Pro Pro
325 330 335
Arg Ser Met Leu Pro Gly Arg Phe Thr Asn Phe Leu Asp Val Ala Glu
340 345 350
Ala Cys Pro Thr Phe Leu His Phe Glu Gly Asp Val Pro Tyr Val Thr
355 360 365
Thr Lys Thr Asp Ser Asp Arg Val Leu Ala Gln Phe Asp Leu Ser Leu
370 375 380
Ala Ala Lys His Met Ser Asn Thr Phe Leu Ala Gly Leu Ala Gln Tyr
385 390 395 400
Tyr Ala Gln Tyr Ser Gly Thr Ile Asn Leu His Phe Met Phe Thr Gly
405 410 415
Pro Thr Asp Ala Lys Ala Arg Tyr Met Ile Ala Tyr Ala Pro Pro Gly
420 425 430
Met Glu Pro Pro Lys Thr Pro Glu Ala Ala Ala His Cys Ile His Ala
435 440 445
Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Ser Ile Pro Tyr
450 455 460
Leu Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Ala Ser Asp Thr Ala Glu Thr
465 470 475 480
Thr Asn Val Gln Gly Trp Val Cys Leu Phe Gln Ile Thr His Gly Lys
485 490 495
Ala Asp Gly Asp Ala Leu Val Val Leu Ala Ser Ala Gly Lys Asp Phe
500 505 510
Glu Leu Arg Leu Pro Val Asp Ala Arg Thr Gln Thr Thr Ser Thr Gly
515 520 525
Glu Ser Ala Asp Pro Val Thr Ala Thr Val Glu Asn Tyr Gly Gly Glu
530 535 540
Thr Gln Val Gln Arg Arg Gln His Thr Asp Val Ser Phe Ile Leu Asp
545 550 555 560
Arg Phe Val Lys Val Thr Pro Lys Asp Gln Ile Asn Val Leu Asp Leu
565 570 575
Met Gln Thr Pro Ala His Thr Leu Val Gly Ala Leu Leu Arg Thr Ala
580 585 590
Thr Tyr Tyr Phe Ala Asp Leu Glu Val Ala Val Lys His Glu Gly Asn
595 600 605
Leu Thr Trp Val Pro Asn Gly Ala Pro Glu Thr Ala Leu Asp Asn Thr
610 615 620
Thr Asn Pro Thr Ala Tyr His Lys Ala Pro Leu Thr Arg Leu Ala Leu
625 630 635 640
Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg Val Leu Ala Thr Val Tyr Asn Gly Asn
645 650 655
Cys Lys Tyr Asp Glu Ser Ser Thr Thr Asn Val Arg Gly Asp Leu Gln
660 665 670
Val Leu Ala Gln Lys Ala Ala Arg Thr Leu Pro Thr Ser Phe Asn Tyr
675 680 685
Gly Ala Ile Lys Ala Thr Arg Val Asn Glu Leu Leu Tyr Arg Met Lys
690 695 700
Arg Ala Glu Thr Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu Ala Ile His Pro Asn
705 710 715 720
Glu Ala Arg His Lys Gln Lys Ile Val Ala Pro Ala Lys Gln Leu Leu
725 730 735
Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro Gly
740 745 750
Pro
<210> 379
<211> 2289
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> P1_SAT1_KNP/196/91_cut_sites_removed
<400> 379
ggagcgggcc agtcgtcccc cgccactggg tcacagaacc agtcaggcaa cactggcagc 60
atcatcaaca actactacat gcaacagtac caaaattcaa tggacaccca actcggagac 120
aacgccatct ccggtgggtc aaatgagggt tcgaccgaca caacttcgac ccacaccagc 180
aacacccaaa acaacgattg gttttcaaaa ttggctcaat cggccttctc tggattggtt 240
ggtgcgttgc ttgccgacaa gaagactgag gaaaccacac tccttgagga tcgcatcctc 300
acgaccagtc acggcacaac cacctcgacc acacaaagtt cagtgggcat aacctacggt 360
tacgccgact cggaccgttt cctccccggc ccaaacacca acgggctgga gacacgtgtg 420
gaacaagcag agaggttttt caaacacaaa ttatttgatt ggacacttga acaacgattt 480
ggaacaacac acgttttgga actgcccaca gaccacaaag gcatctatgg acaacttgtt 540
gactcccact catacattcg caatgggtgg gacgttgagg tctccgcgac cgcaacgcag 600
ttcaacgggg gctgcctcct ggtagcgatg gtgcccgaat tgtgcaaact gtcggaaaga 660
gagaaatacc aactcactct cttccctcat caatttctag acccaaggac caacaccacg 720
gcacacatcc aggttcccta cctgggcgtg gatcgccacg accaaggaac acgccacaaa 780
gcgtggaccc tggttgtcat ggtggtggca ccctacacaa acgatcagac gattggctcg 840
aacaaagccg aggtgtacgt gaacattgct cccacaaacg tttacgtcgc cggtgagaag 900
cccgcaaaac agggcattct ccccgtggcc gtctccgttg gctatggtgg cttccaaaat 960
acagatccca aaacatcgga ccccgtatat gggcacgtgt acaacccggc tcgcaccggc 1020
ctacctggga ggttcacaaa cctcttggat gtggctgaag cgtgccctac actgcttgac 1080
ttcaacggag ttccgtatgt gaccacccag gcaaactcag gatctaaagt gttaacttgt 1140
tttgatttgg cttttggtca caaaaatttg aaaaatacat ttatgtctgg tcttgcccag 1200
tactacaccc agtacagtgg cacactcaac ctgcacttca tgtacacagg cccaaccaac 1260
aacaaggcta agtacatggt ggcctacatc ccacctggga cacaccctct cccggaaaca 1320
ccggagatgg agtcccactg tcaccacgcc gagtgggaca caggcctgaa ctcaaccttc 1380
acattcaccg tgccgtatgt gtcggctgcc gacttcgcgt acacctactc tgacgagcct 1440
gaacaggctt cggttcaggg ttgggtgggc gtatatcagg tgactgacac acacgagaag 1500
gacggtgcag ttgttgtgtc cgtcagtgct ggacccgact tcgagttcag gatgcccatc 1560
agcccctcgc gccagaccac atccgctggc gaaggagcgg agcctgtcac gactgatgct 1620
tcccaacacg gaggcgacag acggacaact cgtaggcatc acactgatgt gagcttcttg 1680
ctcgatcggt tcacactggt tggtaaaaca caggacaaca aactgacact agacctgctc 1740
caaaccaagg aaaaagcact ggttggcgca atcctgcgcg cagccacgta ctacttctct 1800
gacttggagg ttgcgtgtgt gggtgacaac aaatgggtcg gctggactcc caacggtgct 1860
ccagaacttg cggaagtggg cgacaaccca gtcgtctttt ccaaaggtag aaccacccgt 1920
tttgcactgc cctacaccgc tccacacagg tgcttggcga cagcctacaa cggtgactgc 1980
aagtacaaac ccactggcac agctccacgc gaaaacattc gtggagacct cgcaactctc 2040
gcggcgagga ttgcaagtga gacacacatt ccaaccacct tcaactatgg caggatttac 2100
acagacactg aggtcgatgt gtacgtcagg atgaagcgcg cggaactcta ctgcccgcga 2160
cccgttctca cgcactacga ccacggtggc agggatcgct acagaactgc gatcaccaaa 2220
cctgtcaaac agatgtgcag tttcgacctg ttaaagctgg ctggagacgt tgagtccaac 2280
cctgggccc 2289
<210> 380
<211> 2289
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(2289)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(2289)
<223> P1_SAT1_KNP/196/91_wildtype
<400> 380
gga gcg ggc cag tcg tcc ccc gcc act ggg tcc cag aac cag tct ggc 48
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
aac act ggc agc atc atc aac aac tac tac atg caa cag tac caa aat 96
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
tcc atg gac acc caa ctc gga gac aac gcc atc tcc ggt ggg tca aat 144
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
gag ggt tcg acc gac aca acg tcg acc cac acc agc aac acc caa aac 192
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Ser Asn Thr Gln Asn
50 55 60
aac gat tgg ttt tca aaa ttg gct caa tcg gcc ttc tct gga ttg gtt 240
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Gln Ser Ala Phe Ser Gly Leu Val
65 70 75 80
ggt gcg ttg ctt gcc gac aag aag act gag gaa acc aca ctc ctc gag 288
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
gat cgc atc ctc acg acc agt cac ggc aca acc acc tcg acc aca caa 336
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Ser His Gly Thr Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
agt tca gtg ggc ata acc tac ggt tac gcc gac tcg gac cgt ttc ctc 384
Ser Ser Val Gly Ile Thr Tyr Gly Tyr Ala Asp Ser Asp Arg Phe Leu
115 120 125
ccc ggc cca aac acc aac ggg ctg gag aca cgt gtg gaa caa gca gag 432
Pro Gly Pro Asn Thr Asn Gly Leu Glu Thr Arg Val Glu Gln Ala Glu
130 135 140
agg ttt ttc aaa cac aaa tta ttt gat tgg aca ctt gaa caa cga ttt 480
Arg Phe Phe Lys His Lys Leu Phe Asp Trp Thr Leu Glu Gln Arg Phe
145 150 155 160
gga aca aca cac gtt ttg gaa ctg ccc aca gac cac aaa ggc atc tat 528
Gly Thr Thr His Val Leu Glu Leu Pro Thr Asp His Lys Gly Ile Tyr
165 170 175
gga caa ctt gtt gac tcc cac tca tac att cgc aat ggg tgg gac gtt 576
Gly Gln Leu Val Asp Ser His Ser Tyr Ile Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
gag gtc tcc gcg acc gca acg cag ttc aac ggg ggc tgc ctc ctg gta 624
Glu Val Ser Ala Thr Ala Thr Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val
195 200 205
gcg atg gtg ccc gaa ttg tgc aaa ctg tcg gaa aga gag aaa tac caa 672
Ala Met Val Pro Glu Leu Cys Lys Leu Ser Glu Arg Glu Lys Tyr Gln
210 215 220
ctc act ctc ttc cct cat caa ttt ctc gac cca agg acc aac acc acg 720
Leu Thr Leu Phe Pro His Gln Phe Leu Asp Pro Arg Thr Asn Thr Thr
225 230 235 240
gca cac atc cag gta ccc tac ctg ggc gtg gat cgc cac gac caa gga 768
Ala His Ile Gln Val Pro Tyr Leu Gly Val Asp Arg His Asp Gln Gly
245 250 255
aca cgc cac aaa gcg tgg acc ctg gtt gtc atg gtg gtg gca ccc tac 816
Thr Arg His Lys Ala Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ala Pro Tyr
260 265 270
aca aac gat cag acg att ggc tcg aac aaa gcc gag gtg tac gtg aac 864
Thr Asn Asp Gln Thr Ile Gly Ser Asn Lys Ala Glu Val Tyr Val Asn
275 280 285
att gct ccc aca aac gtt tac gtc gcc ggt gag aag ccc gca aaa cag 912
Ile Ala Pro Thr Asn Val Tyr Val Ala Gly Glu Lys Pro Ala Lys Gln
290 295 300
ggc att ctc ccc gtg gcc gtc tcc gtt ggc tat ggt ggc ttc caa aat 960
Gly Ile Leu Pro Val Ala Val Ser Val Gly Tyr Gly Gly Phe Gln Asn
305 310 315 320
aca gat ccc aaa aca tcg gac ccc gta tac ggg cac gtg tac aac ccg 1008
Thr Asp Pro Lys Thr Ser Asp Pro Val Tyr Gly His Val Tyr Asn Pro
325 330 335
gct cgc acc ggc cta cct ggg agg ttc aca aac ctc ttg gat gtg gct 1056
Ala Arg Thr Gly Leu Pro Gly Arg Phe Thr Asn Leu Leu Asp Val Ala
340 345 350
gaa gcg tgc cct aca ctg ctt gac ttc aac gga gtt ccg tac gtg acc 1104
Glu Ala Cys Pro Thr Leu Leu Asp Phe Asn Gly Val Pro Tyr Val Thr
355 360 365
acc cag gca aac tct gga tct aaa gtg tta act tgt ttt gat ttg gct 1152
Thr Gln Ala Asn Ser Gly Ser Lys Val Leu Thr Cys Phe Asp Leu Ala
370 375 380
ttt ggt cac aaa aat ttg aaa aat aca ttt atg tct ggt ctt gcc cag 1200
Phe Gly His Lys Asn Leu Lys Asn Thr Phe Met Ser Gly Leu Ala Gln
385 390 395 400
tac tac acc cag tac agt ggc aca ctc aac ctg cac ttc atg tac aca 1248
Tyr Tyr Thr Gln Tyr Ser Gly Thr Leu Asn Leu His Phe Met Tyr Thr
405 410 415
ggc cca acc aac aac aag gct aag tac atg gtg gcc tac atc cca cct 1296
Gly Pro Thr Asn Asn Lys Ala Lys Tyr Met Val Ala Tyr Ile Pro Pro
420 425 430
ggg aca cac cct ctc ccg gaa aca ccg gag atg gag tcc cac tgt cac 1344
Gly Thr His Pro Leu Pro Glu Thr Pro Glu Met Glu Ser His Cys His
435 440 445
cac gcc gag tgg gac aca ggc ctg aac tca acc ttc aca ttc acc gtg 1392
His Ala Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Thr Phe Thr Phe Thr Val
450 455 460
ccg tac gtg tcg gct gcc gac ttc gcg tac acc tac tct gac gag cct 1440
Pro Tyr Val Ser Ala Ala Asp Phe Ala Tyr Thr Tyr Ser Asp Glu Pro
465 470 475 480
gaa cag gct tcg gtt cag ggt tgg gtg ggc gta tac cag gtg act gac 1488
Glu Gln Ala Ser Val Gln Gly Trp Val Gly Val Tyr Gln Val Thr Asp
485 490 495
aca cac gag aag gac ggt gca gtt gtt gtg tcc gtc agt gct gga ccc 1536
Thr His Glu Lys Asp Gly Ala Val Val Val Ser Val Ser Ala Gly Pro
500 505 510
gac ttc gag ttc agg atg ccc atc agc ccc tcg cgc cag acc aca tcc 1584
Asp Phe Glu Phe Arg Met Pro Ile Ser Pro Ser Arg Gln Thr Thr Ser
515 520 525
gct ggc gaa gga gcg gag cct gtc acg act gat gct tcc caa cac gga 1632
Ala Gly Glu Gly Ala Glu Pro Val Thr Thr Asp Ala Ser Gln His Gly
530 535 540
ggc gac aga cgg aca act cgt agg cat cac act gat gtg agc ttc ttg 1680
Gly Asp Arg Arg Thr Thr Arg Arg His His Thr Asp Val Ser Phe Leu
545 550 555 560
ctc gac cgg ttc aca ctg gtt ggt aaa aca cag gac aac aaa ctg aca 1728
Leu Asp Arg Phe Thr Leu Val Gly Lys Thr Gln Asp Asn Lys Leu Thr
565 570 575
cta gac ctg ctc caa acc aag gaa aaa gca ctg gtt ggc gca atc ctg 1776
Leu Asp Leu Leu Gln Thr Lys Glu Lys Ala Leu Val Gly Ala Ile Leu
580 585 590
cgc gca gcc acg tac tac ttc tct gac ttg gag gtt gcg tgt gtg ggt 1824
Arg Ala Ala Thr Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Glu Val Ala Cys Val Gly
595 600 605
gac aac aaa tgg gtc ggc tgg act ccc aac gga gct cca gaa ctt gcg 1872
Asp Asn Lys Trp Val Gly Trp Thr Pro Asn Gly Ala Pro Glu Leu Ala
610 615 620
gaa gtg ggc gac aac cca gtc gtc ttt tcc aaa ggt aga acc acc cgt 1920
Glu Val Gly Asp Asn Pro Val Val Phe Ser Lys Gly Arg Thr Thr Arg
625 630 635 640
ttt gca ctg ccc tac acc gct cca cac agg tgc ttg gcg aca gcc tac 1968
Phe Ala Leu Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg Cys Leu Ala Thr Ala Tyr
645 650 655
aac ggt gac tgc aag tac aaa ccc act ggc aca gct cca cgc gaa aac 2016
Asn Gly Asp Cys Lys Tyr Lys Pro Thr Gly Thr Ala Pro Arg Glu Asn
660 665 670
att cgt gga gac ctc gca act ctc gcg gcg agg att gca agt gag aca 2064
Ile Arg Gly Asp Leu Ala Thr Leu Ala Ala Arg Ile Ala Ser Glu Thr
675 680 685
cac att cca acc acc ttc aac tat ggc agg att tac aca gac act gag 2112
His Ile Pro Thr Thr Phe Asn Tyr Gly Arg Ile Tyr Thr Asp Thr Glu
690 695 700
gtc gac gtg tac gtc agg atg aag cgc gcg gag ctc tac tgc ccg cga 2160
Val Asp Val Tyr Val Arg Met Lys Arg Ala Glu Leu Tyr Cys Pro Arg
705 710 715 720
ccc gtt ctc acg cac tac gac cac ggt ggc agg gat cgc tac aga act 2208
Pro Val Leu Thr His Tyr Asp His Gly Gly Arg Asp Arg Tyr Arg Thr
725 730 735
gcg atc acc aaa cct gtc aaa cag atg tgc agt ttc gac ctg tta aag 2256
Ala Ile Thr Lys Pro Val Lys Gln Met Cys Ser Phe Asp Leu Leu Lys
740 745 750
ctg gct gga gac gtt gag tcc aac cct ggg ccc 2289
Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro Gly Pro
755 760
<210> 381
<211> 763
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 381
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Ser Asn Thr Gln Asn
50 55 60
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Gln Ser Ala Phe Ser Gly Leu Val
65 70 75 80
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Ser His Gly Thr Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
Ser Ser Val Gly Ile Thr Tyr Gly Tyr Ala Asp Ser Asp Arg Phe Leu
115 120 125
Pro Gly Pro Asn Thr Asn Gly Leu Glu Thr Arg Val Glu Gln Ala Glu
130 135 140
Arg Phe Phe Lys His Lys Leu Phe Asp Trp Thr Leu Glu Gln Arg Phe
145 150 155 160
Gly Thr Thr His Val Leu Glu Leu Pro Thr Asp His Lys Gly Ile Tyr
165 170 175
Gly Gln Leu Val Asp Ser His Ser Tyr Ile Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
Glu Val Ser Ala Thr Ala Thr Gln Phe Asn Gly Gly Cys Leu Leu Val
195 200 205
Ala Met Val Pro Glu Leu Cys Lys Leu Ser Glu Arg Glu Lys Tyr Gln
210 215 220
Leu Thr Leu Phe Pro His Gln Phe Leu Asp Pro Arg Thr Asn Thr Thr
225 230 235 240
Ala His Ile Gln Val Pro Tyr Leu Gly Val Asp Arg His Asp Gln Gly
245 250 255
Thr Arg His Lys Ala Trp Thr Leu Val Val Met Val Val Ala Pro Tyr
260 265 270
Thr Asn Asp Gln Thr Ile Gly Ser Asn Lys Ala Glu Val Tyr Val Asn
275 280 285
Ile Ala Pro Thr Asn Val Tyr Val Ala Gly Glu Lys Pro Ala Lys Gln
290 295 300
Gly Ile Leu Pro Val Ala Val Ser Val Gly Tyr Gly Gly Phe Gln Asn
305 310 315 320
Thr Asp Pro Lys Thr Ser Asp Pro Val Tyr Gly His Val Tyr Asn Pro
325 330 335
Ala Arg Thr Gly Leu Pro Gly Arg Phe Thr Asn Leu Leu Asp Val Ala
340 345 350
Glu Ala Cys Pro Thr Leu Leu Asp Phe Asn Gly Val Pro Tyr Val Thr
355 360 365
Thr Gln Ala Asn Ser Gly Ser Lys Val Leu Thr Cys Phe Asp Leu Ala
370 375 380
Phe Gly His Lys Asn Leu Lys Asn Thr Phe Met Ser Gly Leu Ala Gln
385 390 395 400
Tyr Tyr Thr Gln Tyr Ser Gly Thr Leu Asn Leu His Phe Met Tyr Thr
405 410 415
Gly Pro Thr Asn Asn Lys Ala Lys Tyr Met Val Ala Tyr Ile Pro Pro
420 425 430
Gly Thr His Pro Leu Pro Glu Thr Pro Glu Met Glu Ser His Cys His
435 440 445
His Ala Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Thr Phe Thr Phe Thr Val
450 455 460
Pro Tyr Val Ser Ala Ala Asp Phe Ala Tyr Thr Tyr Ser Asp Glu Pro
465 470 475 480
Glu Gln Ala Ser Val Gln Gly Trp Val Gly Val Tyr Gln Val Thr Asp
485 490 495
Thr His Glu Lys Asp Gly Ala Val Val Val Ser Val Ser Ala Gly Pro
500 505 510
Asp Phe Glu Phe Arg Met Pro Ile Ser Pro Ser Arg Gln Thr Thr Ser
515 520 525
Ala Gly Glu Gly Ala Glu Pro Val Thr Thr Asp Ala Ser Gln His Gly
530 535 540
Gly Asp Arg Arg Thr Thr Arg Arg His His Thr Asp Val Ser Phe Leu
545 550 555 560
Leu Asp Arg Phe Thr Leu Val Gly Lys Thr Gln Asp Asn Lys Leu Thr
565 570 575
Leu Asp Leu Leu Gln Thr Lys Glu Lys Ala Leu Val Gly Ala Ile Leu
580 585 590
Arg Ala Ala Thr Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Glu Val Ala Cys Val Gly
595 600 605
Asp Asn Lys Trp Val Gly Trp Thr Pro Asn Gly Ala Pro Glu Leu Ala
610 615 620
Glu Val Gly Asp Asn Pro Val Val Phe Ser Lys Gly Arg Thr Thr Arg
625 630 635 640
Phe Ala Leu Pro Tyr Thr Ala Pro His Arg Cys Leu Ala Thr Ala Tyr
645 650 655
Asn Gly Asp Cys Lys Tyr Lys Pro Thr Gly Thr Ala Pro Arg Glu Asn
660 665 670
Ile Arg Gly Asp Leu Ala Thr Leu Ala Ala Arg Ile Ala Ser Glu Thr
675 680 685
His Ile Pro Thr Thr Phe Asn Tyr Gly Arg Ile Tyr Thr Asp Thr Glu
690 695 700
Val Asp Val Tyr Val Arg Met Lys Arg Ala Glu Leu Tyr Cys Pro Arg
705 710 715 720
Pro Val Leu Thr His Tyr Asp His Gly Gly Arg Asp Arg Tyr Arg Thr
725 730 735
Ala Ile Thr Lys Pro Val Lys Gln Met Cys Ser Phe Asp Leu Leu Lys
740 745 750
Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro Gly Pro
755 760
<210> 382
<211> 2277
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> P1_SAT2_Egypt_2010_cut_sites_removed
<400> 382
ggggccgggc aatccagccc ggctactggt tcccaaaatc aatcaggcaa tactggtagc 60
attattaaca actactacat gcaacagtac cagaactcaa tggacacaca gcttggtgac 120
aacgccatta gcggtggttc caacgagggg tcaacggaca ccacgtcaac acacacaaac 180
aacacacaga acaatgactg gttttccaaa ttggctcaat cagccatttc agggcttttc 240
ggtgctctgc ttgcagacaa gaaaacagag gagaccacac tgctggagga cagaatcctg 300
accacacgtc acgggaccac gacctccacc acgcaaagtt ctgtgggagt gacatttggt 360
tatgctgatg ctgattcgtt tcgcccagga ccaaacacct ctgggcttga gacgcgcgtg 420
caacaggcag aacgcttctt caaggagaaa ctttttgact ggaccagtga caaacctttc 480
ggtacgctgt acgtgttgga gttgcccaaa gaccacaagg gcatctacgg taaacttacc 540
gactcctaca cgtacatgcg taacggttgg gacgttcagg tcagcgcgac cagcacacag 600
tttaacggcg gatcactgct cgtggcaatg gtcccagagt tgtgcagtct aaaagccaga 660
gaagaatttc aactcactct ctacccacac cagttcatta acccgcgcac caacacaacc 720
gcacacatac aggttcctta cctgggtgta aacagacacg accagggtaa gcgccaccag 780
gcgtggtctc tggttgtgat ggtgctcacg cctcttacca ccgaggcgca gatgaacagc 840
ggcaccgtcg aggtgtacgc caacatcgca ccaacaaatg tggttgtggc gggtgaactg 900
ccgggtaagc agggcatcat tccggtcgct gccgctgacg ggtatggtgg tttccagaac 960
accgacccga aaacggctga ccccatttac gggcatgtgt acaacccgtc cagaaacgac 1020
tgccacgggc gatactccaa tcttatggat gtcgccgagg cgtgtccaac actcctcaac 1080
tttgatggca agccctacgt cgtgaccaag aacaacggtg acaaggtgat ggcacgcttc 1140
gatgtcgcct ttacacacaa ggtgcatggg aacacgtttc tggcgggctt ggccgactac 1200
tacacacagt attcaggcag cctaaactac cacttcatgt acactggacc cacacatcac 1260
aaggcaaagt tcatggtggc atacgtgccc cctggtgttg cagttgacca actgcctagc 1320
acaccggagg atgctgcgca ctgctaccat gcggaatggg acaccgggtt gaactcttct 1380
ttctcgttcg cagtgcctta catctccgct gcggactttt cttacacaca cacagacaca 1440
ccagcaatgg ccaccactaa tggctgggta gttgtactac aggtcacaga cacgcactct 1500
gcggaagctg ccgttgtagt gtcagtcagc gcgggaccag atttggagtt ccgattccct 1560
atcgaccctg tgcgacagac tacctcggcg ggagaaggcg cagatgttgt caccacggac 1620
ccatcgacac acggtgggaa tgttcaagag ggacgacgca aacacaccga cgttgcgttc 1680
cttcttgatc gcagtacaca cgttcacaca aataagacat cttttgttgt ggacctcatg 1740
gacacaaggg agaaggcgct cgtaggcgca atcctgcgag catccaccta ctacttttgt 1800
gaccttgaaa ttgcatgtgt gggcgaccac acaagggtct tctggcagcc caacggggca 1860
ccacggacta cccagctcgg cgacaaccct atggtttttg ccaagggcgg cgtaacccgc 1920
tttgccatcc cgtttacggc tccacacagg ctgctatcta ctgtttacaa cggcgagtgt 1980
gtgtacacca aggccgccgc tgccattcgt ggtgatcgtg cggcacttgc ggcaaagtac 2040
gctgacacca accacacttt gccgccaacc ttcaacttcg ggtacgtgac cgttgacaaa 2100
ccagttgacg tttactaccg gatgaagagg gctgagctgt actgcccacg cccactgctg 2160
ccagcctaca aacacacaga cagagacaga ttcgacgcgc ccatcggcgt cgaaagacag 2220
accctgaatt ttgacctgct gaaactggca ggagacgttg agtccaaccc tgggccc 2277
<210> 383
<211> 2277
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(2277)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(2277)
<223> P1_SAT2_Egypt_2010_wildtype
<400> 383
ggg gcc ggg caa tcc agc ccg gct act gga tcc caa aat caa tca ggc 48
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
aat act ggt agc att att aac aac tac tac atg caa cag tac cag aac 96
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
tca atg gac aca cag ctt ggt gac aac gcc att agc ggt ggt tcc aac 144
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
gag ggg tcg acg gac acc acg tcg aca cac aca aac aac aca cag aac 192
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Asn Asn Thr Gln Asn
50 55 60
aat gac tgg ttt tcc aaa ttg gct caa tca gcc att tca ggg ctt ttc 240
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Gln Ser Ala Ile Ser Gly Leu Phe
65 70 75 80
gga gct ctg ctt gca gac aag aaa aca gag gag acc aca ctg ctg gag 288
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
gac aga atc ctg acc acg cgt cac ggg acc acg acc tcc acc acg caa 336
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg His Gly Thr Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
agt tct gtg gga gtg aca ttt ggt tat gct gat gct gat tcg ttt cgc 384
Ser Ser Val Gly Val Thr Phe Gly Tyr Ala Asp Ala Asp Ser Phe Arg
115 120 125
cca gga ccc aac acc tct ggg ctt gag acg cgc gtg caa cag gca gaa 432
Pro Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Gln Gln Ala Glu
130 135 140
cgc ttc ttc aag gag aag ctt ttt gac tgg acc agt gac aaa cct ttc 480
Arg Phe Phe Lys Glu Lys Leu Phe Asp Trp Thr Ser Asp Lys Pro Phe
145 150 155 160
ggt acg ctg tac gtg ttg gag ttg ccc aaa gac cac aag ggc atc tac 528
Gly Thr Leu Tyr Val Leu Glu Leu Pro Lys Asp His Lys Gly Ile Tyr
165 170 175
ggt aaa ctt acc gac tcc tac acg tac atg cgt aac ggt tgg gac gtt 576
Gly Lys Leu Thr Asp Ser Tyr Thr Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
cag gtc agc gcg acc agc aca cag ttt aac ggc gga tca ctg ctc gtg 624
Gln Val Ser Ala Thr Ser Thr Gln Phe Asn Gly Gly Ser Leu Leu Val
195 200 205
gca atg gtc cca gag ttg tgc agt cta aaa gcc aga gaa gaa ttt caa 672
Ala Met Val Pro Glu Leu Cys Ser Leu Lys Ala Arg Glu Glu Phe Gln
210 215 220
ctc act ctc tac cca cac cag ttc att aac ccg cgc acc aac aca acc 720
Leu Thr Leu Tyr Pro His Gln Phe Ile Asn Pro Arg Thr Asn Thr Thr
225 230 235 240
gca cac ata cag gtt cct tac ctg ggt gta aac aga cac gac cag ggt 768
Ala His Ile Gln Val Pro Tyr Leu Gly Val Asn Arg His Asp Gln Gly
245 250 255
aag cgc cac cag gcg tgg tct ctg gtt gtg atg gtg ctc acg cct ctt 816
Lys Arg His Gln Ala Trp Ser Leu Val Val Met Val Leu Thr Pro Leu
260 265 270
acc acc gag gcg cag atg aac agc ggc acc gtc gag gtg tac gcc aac 864
Thr Thr Glu Ala Gln Met Asn Ser Gly Thr Val Glu Val Tyr Ala Asn
275 280 285
atc gca cca aca aat gtg gtt gtg gcg ggt gaa ctg ccg ggt aag cag 912
Ile Ala Pro Thr Asn Val Val Val Ala Gly Glu Leu Pro Gly Lys Gln
290 295 300
ggc atc att ccg gtc gct gcc gct gac ggg tat ggt ggt ttc cag aac 960
Gly Ile Ile Pro Val Ala Ala Ala Asp Gly Tyr Gly Gly Phe Gln Asn
305 310 315 320
acc gac ccg aaa acg gct gac ccc att tac ggg cat gtg tac aac ccg 1008
Thr Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Ile Tyr Gly His Val Tyr Asn Pro
325 330 335
tcc aga aac gac tgc cac ggg cga tac tcc aat ctt atg gat gtc gcc 1056
Ser Arg Asn Asp Cys His Gly Arg Tyr Ser Asn Leu Met Asp Val Ala
340 345 350
gag gcg tgt cca aca ctc ctc aac ttt gat ggc aag ccc tac gtc gtg 1104
Glu Ala Cys Pro Thr Leu Leu Asn Phe Asp Gly Lys Pro Tyr Val Val
355 360 365
acc aag aac aac ggt gac aag gtg atg gca cgc ttc gac gtc gcc ttt 1152
Thr Lys Asn Asn Gly Asp Lys Val Met Ala Arg Phe Asp Val Ala Phe
370 375 380
aca cac aag gtg cat ggg aac acg ttt ctg gcg ggc ttg gcc gac tac 1200
Thr His Lys Val His Gly Asn Thr Phe Leu Ala Gly Leu Ala Asp Tyr
385 390 395 400
tac aca cag tat tca ggc agc cta aac tac cac ttc atg tac act gga 1248
Tyr Thr Gln Tyr Ser Gly Ser Leu Asn Tyr His Phe Met Tyr Thr Gly
405 410 415
ccc aca cat cac aag gca aag ttc atg gtg gca tac gtg ccc cct ggt 1296
Pro Thr His His Lys Ala Lys Phe Met Val Ala Tyr Val Pro Pro Gly
420 425 430
gtt gca gtt gac cag ctg cct agc aca ccg gag gat gct gcg cac tgc 1344
Val Ala Val Asp Gln Leu Pro Ser Thr Pro Glu Asp Ala Ala His Cys
435 440 445
tac cat gcg gaa tgg gac acc ggg ttg aat tct tct ttc tcg ttc gca 1392
Tyr His Ala Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Ser Phe Ser Phe Ala
450 455 460
gtg cct tac atc tcc gct gcg gac ttt tct tac aca cac aca gac aca 1440
Val Pro Tyr Ile Ser Ala Ala Asp Phe Ser Tyr Thr His Thr Asp Thr
465 470 475 480
ccg gcc atg gcc acc acc aat ggc tgg gtg gtt gta ctg cag gtc acc 1488
Pro Ala Met Ala Thr Thr Asn Gly Trp Val Val Val Leu Gln Val Thr
485 490 495
gac acg cac tct gcg gaa gct gcc gtt gta gtg tca gtc agc gcg gga 1536
Asp Thr His Ser Ala Glu Ala Ala Val Val Val Ser Val Ser Ala Gly
500 505 510
cca gat ttg gaa ttc cga ttc cct atc gac cct gtg cga cag act acc 1584
Pro Asp Leu Glu Phe Arg Phe Pro Ile Asp Pro Val Arg Gln Thr Thr
515 520 525
tcg gcg gga gaa ggc gca gat gtt gtc acc acg gac cca tcg aca cac 1632
Ser Ala Gly Glu Gly Ala Asp Val Val Thr Thr Asp Pro Ser Thr His
530 535 540
ggt ggg aat gtt caa gag ggt cga cgc aaa cac acc gac gtt gcg ttc 1680
Gly Gly Asn Val Gln Glu Gly Arg Arg Lys His Thr Asp Val Ala Phe
545 550 555 560
ctt ctt gat cgc agt aca cac gtt cac aca aat aag aca tct ttt gtt 1728
Leu Leu Asp Arg Ser Thr His Val His Thr Asn Lys Thr Ser Phe Val
565 570 575
gtg gac ctc atg gac aca agg gag aag gcg ctc gta ggc gca atc ctg 1776
Val Asp Leu Met Asp Thr Arg Glu Lys Ala Leu Val Gly Ala Ile Leu
580 585 590
cga gca tcc acc tac tac ttt tgt gac ctt gaa att gca tgt gtg ggc 1824
Arg Ala Ser Thr Tyr Tyr Phe Cys Asp Leu Glu Ile Ala Cys Val Gly
595 600 605
gac cac aca agg gtc ttc tgg cag ccc aac ggg gca ccg cgg act acc 1872
Asp His Thr Arg Val Phe Trp Gln Pro Asn Gly Ala Pro Arg Thr Thr
610 615 620
cag ctc ggc gac aac cct atg gtt ttt gcc aag ggc ggc gta acc cgc 1920
Gln Leu Gly Asp Asn Pro Met Val Phe Ala Lys Gly Gly Val Thr Arg
625 630 635 640
ttt gcc atc ccg ttt acg gct cca cac agg ctg ctg tct act gtt tac 1968
Phe Ala Ile Pro Phe Thr Ala Pro His Arg Leu Leu Ser Thr Val Tyr
645 650 655
aac ggc gag tgt gtc tac acc aag gcc gcc gct gcc att cgt ggt gat 2016
Asn Gly Glu Cys Val Tyr Thr Lys Ala Ala Ala Ala Ile Arg Gly Asp
660 665 670
cgt gcg gca ctt gcg gca aag tac gct gac acc aac cac act ttg ccg 2064
Arg Ala Ala Leu Ala Ala Lys Tyr Ala Asp Thr Asn His Thr Leu Pro
675 680 685
cca acc ttc aac ttc ggg tac gtg acc gtt gac aaa cca gtc gac gtt 2112
Pro Thr Phe Asn Phe Gly Tyr Val Thr Val Asp Lys Pro Val Asp Val
690 695 700
tac tac cgg atg aag agg gct gag ctg tac tgc cca cgc cca ctg ctg 2160
Tyr Tyr Arg Met Lys Arg Ala Glu Leu Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu
705 710 715 720
cca gcc tac aaa cac aca gac aga gac aga ttc gac gcg ccc atc ggc 2208
Pro Ala Tyr Lys His Thr Asp Arg Asp Arg Phe Asp Ala Pro Ile Gly
725 730 735
gtc gaa aga cag acc ctg aat ttt gac ctg ctg aaa ctg gca gga gac 2256
Val Glu Arg Gln Thr Leu Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp
740 745 750
gtt gag tcc aac cct ggg ccc 2277
Val Glu Ser Asn Pro Gly Pro
755
<210> 384
<211> 759
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 384
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Asn Asn Thr Gln Asn
50 55 60
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Gln Ser Ala Ile Ser Gly Leu Phe
65 70 75 80
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg His Gly Thr Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
Ser Ser Val Gly Val Thr Phe Gly Tyr Ala Asp Ala Asp Ser Phe Arg
115 120 125
Pro Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Gln Gln Ala Glu
130 135 140
Arg Phe Phe Lys Glu Lys Leu Phe Asp Trp Thr Ser Asp Lys Pro Phe
145 150 155 160
Gly Thr Leu Tyr Val Leu Glu Leu Pro Lys Asp His Lys Gly Ile Tyr
165 170 175
Gly Lys Leu Thr Asp Ser Tyr Thr Tyr Met Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
Gln Val Ser Ala Thr Ser Thr Gln Phe Asn Gly Gly Ser Leu Leu Val
195 200 205
Ala Met Val Pro Glu Leu Cys Ser Leu Lys Ala Arg Glu Glu Phe Gln
210 215 220
Leu Thr Leu Tyr Pro His Gln Phe Ile Asn Pro Arg Thr Asn Thr Thr
225 230 235 240
Ala His Ile Gln Val Pro Tyr Leu Gly Val Asn Arg His Asp Gln Gly
245 250 255
Lys Arg His Gln Ala Trp Ser Leu Val Val Met Val Leu Thr Pro Leu
260 265 270
Thr Thr Glu Ala Gln Met Asn Ser Gly Thr Val Glu Val Tyr Ala Asn
275 280 285
Ile Ala Pro Thr Asn Val Val Val Ala Gly Glu Leu Pro Gly Lys Gln
290 295 300
Gly Ile Ile Pro Val Ala Ala Ala Asp Gly Tyr Gly Gly Phe Gln Asn
305 310 315 320
Thr Asp Pro Lys Thr Ala Asp Pro Ile Tyr Gly His Val Tyr Asn Pro
325 330 335
Ser Arg Asn Asp Cys His Gly Arg Tyr Ser Asn Leu Met Asp Val Ala
340 345 350
Glu Ala Cys Pro Thr Leu Leu Asn Phe Asp Gly Lys Pro Tyr Val Val
355 360 365
Thr Lys Asn Asn Gly Asp Lys Val Met Ala Arg Phe Asp Val Ala Phe
370 375 380
Thr His Lys Val His Gly Asn Thr Phe Leu Ala Gly Leu Ala Asp Tyr
385 390 395 400
Tyr Thr Gln Tyr Ser Gly Ser Leu Asn Tyr His Phe Met Tyr Thr Gly
405 410 415
Pro Thr His His Lys Ala Lys Phe Met Val Ala Tyr Val Pro Pro Gly
420 425 430
Val Ala Val Asp Gln Leu Pro Ser Thr Pro Glu Asp Ala Ala His Cys
435 440 445
Tyr His Ala Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Ser Phe Ser Phe Ala
450 455 460
Val Pro Tyr Ile Ser Ala Ala Asp Phe Ser Tyr Thr His Thr Asp Thr
465 470 475 480
Pro Ala Met Ala Thr Thr Asn Gly Trp Val Val Val Leu Gln Val Thr
485 490 495
Asp Thr His Ser Ala Glu Ala Ala Val Val Val Ser Val Ser Ala Gly
500 505 510
Pro Asp Leu Glu Phe Arg Phe Pro Ile Asp Pro Val Arg Gln Thr Thr
515 520 525
Ser Ala Gly Glu Gly Ala Asp Val Val Thr Thr Asp Pro Ser Thr His
530 535 540
Gly Gly Asn Val Gln Glu Gly Arg Arg Lys His Thr Asp Val Ala Phe
545 550 555 560
Leu Leu Asp Arg Ser Thr His Val His Thr Asn Lys Thr Ser Phe Val
565 570 575
Val Asp Leu Met Asp Thr Arg Glu Lys Ala Leu Val Gly Ala Ile Leu
580 585 590
Arg Ala Ser Thr Tyr Tyr Phe Cys Asp Leu Glu Ile Ala Cys Val Gly
595 600 605
Asp His Thr Arg Val Phe Trp Gln Pro Asn Gly Ala Pro Arg Thr Thr
610 615 620
Gln Leu Gly Asp Asn Pro Met Val Phe Ala Lys Gly Gly Val Thr Arg
625 630 635 640
Phe Ala Ile Pro Phe Thr Ala Pro His Arg Leu Leu Ser Thr Val Tyr
645 650 655
Asn Gly Glu Cys Val Tyr Thr Lys Ala Ala Ala Ala Ile Arg Gly Asp
660 665 670
Arg Ala Ala Leu Ala Ala Lys Tyr Ala Asp Thr Asn His Thr Leu Pro
675 680 685
Pro Thr Phe Asn Phe Gly Tyr Val Thr Val Asp Lys Pro Val Asp Val
690 695 700
Tyr Tyr Arg Met Lys Arg Ala Glu Leu Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Leu
705 710 715 720
Pro Ala Tyr Lys His Thr Asp Arg Asp Arg Phe Asp Ala Pro Ile Gly
725 730 735
Val Glu Arg Gln Thr Leu Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp
740 745 750
Val Glu Ser Asn Pro Gly Pro
755
<210> 385
<211> 2277
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> P1_SAT3_ZIM/05/91_cut_sites_removed
<400> 385
ggagcgggcc agtcttcccc tgccactggg tcgcagaacc aatctggcaa cactggcagc 60
atcataaaca actactacat gcagcagtac caaaattcaa tggacaccca gcttggcgac 120
aacgccatct cgggtggttc aaatgaaggc agcacggaca ccacgtccac acacaccaac 180
aacacccaaa acaatgattg gttttcaaaa ttggcccaat ccgccatttc aggactcttc 240
ggggctctgt tggcggacaa aaagaccgag gaaacaacct tgcttgagga ccgaatcctc 300
acaacacgcc acaatactac cacatccacc acgcagagtt cggtgggagt gacttacggt 360
tatgcgtccg ctgatcggtt tctcccagga ccgaacacaa gtgggctgga aacgcgagtg 420
gaacaggccg agagattctt caaggagaga ctcttcactt ggaccgcttc gcagcagtac 480
gcccacgttc acctgcttga acttcccacc gaccacaagg gcatctacgg tgcaatggtg 540
gacaaccacg cttacatacg caacggatgg gacgtgcagg tctccgcgac cagcacgcag 600
ttcaatggtg gtacattgct cgtggcaatg gtcccagagt tacacgcgct cgacacacgt 660
agtgtttcac agctcacgct gtttccacac caattcatca acccacgcac aaacaccact 720
gcccacattg tcgttcccta cattggggta aacaggcatg accaggtaaa aatgcacaag 780
gcctggacat tggtggtcgc ggttctcgca ccgctcacaa catcaaacat gggacaggac 840
aacgttgagg tgtacgccaa catcgcacca accaacgttt ttgttgctgg cgagaagcct 900
accaaacaag gcatcttccc cgtggcctgc aacgacggct acggtggctt tcagaacact 960
gatcccaaga cctctgaccc catatacggg cttgtggcaa acccacctcg caccgctttt 1020
ccagggaggt tcaccaactt ccttgacgtg gcggaggcat gcccgacctt tctggacttc 1080
aacggaacac cttacgtcaa gaccagacac aacagtggga gcaagatact cacccacata 1140
gatttggctt ttgggcacaa gagtttcaag aacacttatc ttgctggtct cgcccagtat 1200
tacgcccaat acagcggatc tctcaacctg cacttcatgt acacgggtcc aacgcaatca 1260
aaggcacgct ttatggttgc atacgtacca ccagggacgg agcccgtacc atcaacaccc 1320
gaggaagcgg cgcactgcta ccactcggaa tgggacactg gactgaactc caagttcacg 1380
ttcacagtgc cgtacatgtc tgctgctgac tatgcctaca cctactgcga cgagcctgaa 1440
caggcctccg cacaagggtg ggtaacactg taccaaatta ctgacacaca tgaccctgat 1500
tcggctgtcc tcatctcagt tagcgcaggc gctgactttg aactcaggct gcccatcaac 1560
cccgttactc agacaacgag cgcgggggaa ggcgcagacg tggtgacaac ggacgttacc 1620
acacatggag gaacagttga cacaccaaga aggcagcaca ccaacgtgga gtttctgctg 1680
gacagattca cacacattgg gtcgatcacc gcctcaaaga ccattgacct ccttgagaca 1740
aaagaacaca cgctggtggg cgcactcctg cgttcagcta cgtactactt ttgtgacctt 1800
gaggtcgcgg tgcttggcaa cgcgaagtgg gttggatggg tgccgaatgg ctgcccacac 1860
accgaccgcg tggaagacaa cccagtcgtt cacgccaagg ggaatgttac ccgctttgca 1920
ctgccctaca cagccccgca cggagtgctt gccacgacct acaacgggac ttgcaagtat 1980
tccaagacgc aaagtgttaa accacgccga ggcgacatgg ctgtgctggc acaacgtgtt 2040
gaaggtgaac aacaaagatg caaacccacg acattcaact tcggtcgatt gttgtgtgat 2100
tcgggtgacg tgtactaccg aatgaagcgg gccgagcttt actgcccacg tccgctgatg 2160
gtcaggtaca ctcacaccac agacagatac aaagttgcgc ttgtgtcacc agctaagcaa 2220
ctgtgcaact tcgacctgtt aaagttggct ggagatgttg agtccaaccc tgggccc 2277
<210> 386
<211> 2277
<212> DNA
<213> Foot-and-mouth disease virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(2277)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(2277)
<223> P1_SAT3_ZIM/05/91_wildtype
<400> 386
gga gcg ggc cag tct tcc cct gcc aca ggg tcg cag aac caa tct ggc 48
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
aac act ggc agc atc ata aac aac tac tac atg cag cag tac cag aat 96
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
tca atg gac acc cag ctt ggc gac aac gcc atc tcg ggt ggt tca aat 144
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
gaa ggc agc acg gac acc acg tcc aca cac acc aac aac acc caa aac 192
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Asn Asn Thr Gln Asn
50 55 60
aat gat tgg ttt tca aaa ttg gcc caa tcc gcc att tca gga ctc ttc 240
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Gln Ser Ala Ile Ser Gly Leu Phe
65 70 75 80
ggg gct ctg ttg gcg gac aaa aag acc gag gaa aca acc ttg ctc gag 288
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
gac cga atc ctc aca aca cgc cac aat act acc aca tcc acc acg cag 336
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg His Asn Thr Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
agt tcg gtg gga gtg acg tac ggt tac gcg tcc gct gac cgg ttt ctc 384
Ser Ser Val Gly Val Thr Tyr Gly Tyr Ala Ser Ala Asp Arg Phe Leu
115 120 125
cca gga ccg aac aca agt ggg ctg gaa acg cga gtg gaa cag gcc gag 432
Pro Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Glu Gln Ala Glu
130 135 140
aga ttc ttc aag gag aga ctc ttc act tgg acc gct tcg cag cag tac 480
Arg Phe Phe Lys Glu Arg Leu Phe Thr Trp Thr Ala Ser Gln Gln Tyr
145 150 155 160
gcc cac gtt cac ctg ctt gaa ctt ccc acc gac cac aag ggc atc tac 528
Ala His Val His Leu Leu Glu Leu Pro Thr Asp His Lys Gly Ile Tyr
165 170 175
ggt gcc atg gtg gac aac cac gcg tac ata cgc aac gga tgg gac gtg 576
Gly Ala Met Val Asp Asn His Ala Tyr Ile Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
cag gtc tcc gcg acc agc acg cag ttc aat ggt ggt aca ttg ctc gtg 624
Gln Val Ser Ala Thr Ser Thr Gln Phe Asn Gly Gly Thr Leu Leu Val
195 200 205
gca atg gtc cca gag tta cac gcg ctc gac acg cgt agt gtt tca cag 672
Ala Met Val Pro Glu Leu His Ala Leu Asp Thr Arg Ser Val Ser Gln
210 215 220
ctc acg ctg ttt cca cac caa ttc atc aac cca cgc aca aac acc act 720
Leu Thr Leu Phe Pro His Gln Phe Ile Asn Pro Arg Thr Asn Thr Thr
225 230 235 240
gcc cac att gtg gtt ccc tac att ggg gta aac agg cat gac cag gta 768
Ala His Ile Val Val Pro Tyr Ile Gly Val Asn Arg His Asp Gln Val
245 250 255
aaa atg cac aag gcc tgg aca ttg gtg gtc gcg gtt ctc gca ccg ctc 816
Lys Met His Lys Ala Trp Thr Leu Val Val Ala Val Leu Ala Pro Leu
260 265 270
acc aca tca aac atg gga cag gac aac gtt gag gtg tac gcc aac atc 864
Thr Thr Ser Asn Met Gly Gln Asp Asn Val Glu Val Tyr Ala Asn Ile
275 280 285
gca cca acc aac gtt ttt gtg gct ggc gag aag cct acc aaa caa ggc 912
Ala Pro Thr Asn Val Phe Val Ala Gly Glu Lys Pro Thr Lys Gln Gly
290 295 300
atc ttc ccc gtg gcc tgc aac gac ggc tac ggt ggc ttt cag aac act 960
Ile Phe Pro Val Ala Cys Asn Asp Gly Tyr Gly Gly Phe Gln Asn Thr
305 310 315 320
gat ccc aag acc tct gac ccc ata tac ggg ctg gtg gca aac cca cct 1008
Asp Pro Lys Thr Ser Asp Pro Ile Tyr Gly Leu Val Ala Asn Pro Pro
325 330 335
cgc acc gct ttt ccc ggg agg ttc acc aac ttc ctg gac gtg gcg gag 1056
Arg Thr Ala Phe Pro Gly Arg Phe Thr Asn Phe Leu Asp Val Ala Glu
340 345 350
gca tgc ccg acc ttt ctg gac ttc aac gga aca cct tac gtc aag acc 1104
Ala Cys Pro Thr Phe Leu Asp Phe Asn Gly Thr Pro Tyr Val Lys Thr
355 360 365
aga cac aac agt ggg agc aag ata ctc acc cac ata gat ttg gct ttt 1152
Arg His Asn Ser Gly Ser Lys Ile Leu Thr His Ile Asp Leu Ala Phe
370 375 380
ggg cac aag agt ttc aag aac act tat ctt gct ggt ctc gcc cag tat 1200
Gly His Lys Ser Phe Lys Asn Thr Tyr Leu Ala Gly Leu Ala Gln Tyr
385 390 395 400
tac gcc caa tac agt gga tct ctc aac ctg cac ttc atg tac acg ggt 1248
Tyr Ala Gln Tyr Ser Gly Ser Leu Asn Leu His Phe Met Tyr Thr Gly
405 410 415
ccc acg caa tca aag gca cgc ttt atg gtt gca tac gta cca ccc ggg 1296
Pro Thr Gln Ser Lys Ala Arg Phe Met Val Ala Tyr Val Pro Pro Gly
420 425 430
acg gag ccc gta cca tca aca ccc gag gaa gcg gcg cac tgc tac cac 1344
Thr Glu Pro Val Pro Ser Thr Pro Glu Glu Ala Ala His Cys Tyr His
435 440 445
tcg gaa tgg gac act gga ctg aac tcc aag ttc acg ttc aca gtg ccg 1392
Ser Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Thr Val Pro
450 455 460
tac atg tct gca gct gac tat gcc tac acc tac tgc gac gag cct gaa 1440
Tyr Met Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Tyr Cys Asp Glu Pro Glu
465 470 475 480
cag gcc tcc gca caa ggg tgg gta aca ctg tac caa att act gac aca 1488
Gln Ala Ser Ala Gln Gly Trp Val Thr Leu Tyr Gln Ile Thr Asp Thr
485 490 495
cat gac cct gat tcg gct gtc ctc atc tca gtt agc gca ggc gct gac 1536
His Asp Pro Asp Ser Ala Val Leu Ile Ser Val Ser Ala Gly Ala Asp
500 505 510
ttt gag ctc agg ctg ccc atc aac ccc gtt act cag aca acg agc gcg 1584
Phe Glu Leu Arg Leu Pro Ile Asn Pro Val Thr Gln Thr Thr Ser Ala
515 520 525
ggg gaa ggc gca gac gtg gtg acc acg gac gtt acc acc cat gga gga 1632
Gly Glu Gly Ala Asp Val Val Thr Thr Asp Val Thr Thr His Gly Gly
530 535 540
aca gtt gac aca cca aga agg cag cac acc aac gtg gag ttt ctg ctg 1680
Thr Val Asp Thr Pro Arg Arg Gln His Thr Asn Val Glu Phe Leu Leu
545 550 555 560
gac aga ttc aca cac att ggg tcg atc acc gcc tca aag acc att gac 1728
Asp Arg Phe Thr His Ile Gly Ser Ile Thr Ala Ser Lys Thr Ile Asp
565 570 575
ctc ctc gag aca aaa gaa cac acg ctg gtg ggc gca ctc ctg cgt tca 1776
Leu Leu Glu Thr Lys Glu His Thr Leu Val Gly Ala Leu Leu Arg Ser
580 585 590
gct acg tac tac ttt tgt gac ctc gag gtc gcg gtg ctt ggc aac gcg 1824
Ala Thr Tyr Tyr Phe Cys Asp Leu Glu Val Ala Val Leu Gly Asn Ala
595 600 605
aag tgg gtt gga tgg gtg ccg aat ggc tgc cca cac acc gac cgc gtg 1872
Lys Trp Val Gly Trp Val Pro Asn Gly Cys Pro His Thr Asp Arg Val
610 615 620
gaa gac aac cca gtc gtt cac gcc aag ggg aat gtt acc cgc ttt gca 1920
Glu Asp Asn Pro Val Val His Ala Lys Gly Asn Val Thr Arg Phe Ala
625 630 635 640
ctg ccc tac aca gcc ccg cac gga gtg ctt gcc acg acc tac aac ggg 1968
Leu Pro Tyr Thr Ala Pro His Gly Val Leu Ala Thr Thr Tyr Asn Gly
645 650 655
act tgc aag tat tcc aag acg caa agt gtt aaa cca cgc cgt ggc gac 2016
Thr Cys Lys Tyr Ser Lys Thr Gln Ser Val Lys Pro Arg Arg Gly Asp
660 665 670
atg gct gtg ctg gca caa cgc gtt gaa ggt gaa caa caa aga tgc aaa 2064
Met Ala Val Leu Ala Gln Arg Val Glu Gly Glu Gln Gln Arg Cys Lys
675 680 685
ccc acg aca ttc aac ttc ggt cga ttg ttg tgt gat tcg ggt gac gtg 2112
Pro Thr Thr Phe Asn Phe Gly Arg Leu Leu Cys Asp Ser Gly Asp Val
690 695 700
tac tac cga atg aag cgg gcc gag ctt tac tgc cca cgt ccg ctg atg 2160
Tyr Tyr Arg Met Lys Arg Ala Glu Leu Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Met
705 710 715 720
gtc agg tac act cac acc aca gac aga tac aaa gtt gcg ctt gtg tca 2208
Val Arg Tyr Thr His Thr Thr Asp Arg Tyr Lys Val Ala Leu Val Ser
725 730 735
cca gct aag caa ctg tgc aac ttc gac ctg tta aag ttg gct gga gat 2256
Pro Ala Lys Gln Leu Cys Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp
740 745 750
gtt gag tcc aac cct ggg ccc 2277
Val Glu Ser Asn Pro Gly Pro
755
<210> 387
<211> 759
<212> PRT
<213> Foot-and-mouth disease virus
<400> 387
Gly Ala Gly Gln Ser Ser Pro Ala Thr Gly Ser Gln Asn Gln Ser Gly
1 5 10 15
Asn Thr Gly Ser Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Met Gln Gln Tyr Gln Asn
20 25 30
Ser Met Asp Thr Gln Leu Gly Asp Asn Ala Ile Ser Gly Gly Ser Asn
35 40 45
Glu Gly Ser Thr Asp Thr Thr Ser Thr His Thr Asn Asn Thr Gln Asn
50 55 60
Asn Asp Trp Phe Ser Lys Leu Ala Gln Ser Ala Ile Ser Gly Leu Phe
65 70 75 80
Gly Ala Leu Leu Ala Asp Lys Lys Thr Glu Glu Thr Thr Leu Leu Glu
85 90 95
Asp Arg Ile Leu Thr Thr Arg His Asn Thr Thr Thr Ser Thr Thr Gln
100 105 110
Ser Ser Val Gly Val Thr Tyr Gly Tyr Ala Ser Ala Asp Arg Phe Leu
115 120 125
Pro Gly Pro Asn Thr Ser Gly Leu Glu Thr Arg Val Glu Gln Ala Glu
130 135 140
Arg Phe Phe Lys Glu Arg Leu Phe Thr Trp Thr Ala Ser Gln Gln Tyr
145 150 155 160
Ala His Val His Leu Leu Glu Leu Pro Thr Asp His Lys Gly Ile Tyr
165 170 175
Gly Ala Met Val Asp Asn His Ala Tyr Ile Arg Asn Gly Trp Asp Val
180 185 190
Gln Val Ser Ala Thr Ser Thr Gln Phe Asn Gly Gly Thr Leu Leu Val
195 200 205
Ala Met Val Pro Glu Leu His Ala Leu Asp Thr Arg Ser Val Ser Gln
210 215 220
Leu Thr Leu Phe Pro His Gln Phe Ile Asn Pro Arg Thr Asn Thr Thr
225 230 235 240
Ala His Ile Val Val Pro Tyr Ile Gly Val Asn Arg His Asp Gln Val
245 250 255
Lys Met His Lys Ala Trp Thr Leu Val Val Ala Val Leu Ala Pro Leu
260 265 270
Thr Thr Ser Asn Met Gly Gln Asp Asn Val Glu Val Tyr Ala Asn Ile
275 280 285
Ala Pro Thr Asn Val Phe Val Ala Gly Glu Lys Pro Thr Lys Gln Gly
290 295 300
Ile Phe Pro Val Ala Cys Asn Asp Gly Tyr Gly Gly Phe Gln Asn Thr
305 310 315 320
Asp Pro Lys Thr Ser Asp Pro Ile Tyr Gly Leu Val Ala Asn Pro Pro
325 330 335
Arg Thr Ala Phe Pro Gly Arg Phe Thr Asn Phe Leu Asp Val Ala Glu
340 345 350
Ala Cys Pro Thr Phe Leu Asp Phe Asn Gly Thr Pro Tyr Val Lys Thr
355 360 365
Arg His Asn Ser Gly Ser Lys Ile Leu Thr His Ile Asp Leu Ala Phe
370 375 380
Gly His Lys Ser Phe Lys Asn Thr Tyr Leu Ala Gly Leu Ala Gln Tyr
385 390 395 400
Tyr Ala Gln Tyr Ser Gly Ser Leu Asn Leu His Phe Met Tyr Thr Gly
405 410 415
Pro Thr Gln Ser Lys Ala Arg Phe Met Val Ala Tyr Val Pro Pro Gly
420 425 430
Thr Glu Pro Val Pro Ser Thr Pro Glu Glu Ala Ala His Cys Tyr His
435 440 445
Ser Glu Trp Asp Thr Gly Leu Asn Ser Lys Phe Thr Phe Thr Val Pro
450 455 460
Tyr Met Ser Ala Ala Asp Tyr Ala Tyr Thr Tyr Cys Asp Glu Pro Glu
465 470 475 480
Gln Ala Ser Ala Gln Gly Trp Val Thr Leu Tyr Gln Ile Thr Asp Thr
485 490 495
His Asp Pro Asp Ser Ala Val Leu Ile Ser Val Ser Ala Gly Ala Asp
500 505 510
Phe Glu Leu Arg Leu Pro Ile Asn Pro Val Thr Gln Thr Thr Ser Ala
515 520 525
Gly Glu Gly Ala Asp Val Val Thr Thr Asp Val Thr Thr His Gly Gly
530 535 540
Thr Val Asp Thr Pro Arg Arg Gln His Thr Asn Val Glu Phe Leu Leu
545 550 555 560
Asp Arg Phe Thr His Ile Gly Ser Ile Thr Ala Ser Lys Thr Ile Asp
565 570 575
Leu Leu Glu Thr Lys Glu His Thr Leu Val Gly Ala Leu Leu Arg Ser
580 585 590
Ala Thr Tyr Tyr Phe Cys Asp Leu Glu Val Ala Val Leu Gly Asn Ala
595 600 605
Lys Trp Val Gly Trp Val Pro Asn Gly Cys Pro His Thr Asp Arg Val
610 615 620
Glu Asp Asn Pro Val Val His Ala Lys Gly Asn Val Thr Arg Phe Ala
625 630 635 640
Leu Pro Tyr Thr Ala Pro His Gly Val Leu Ala Thr Thr Tyr Asn Gly
645 650 655
Thr Cys Lys Tyr Ser Lys Thr Gln Ser Val Lys Pro Arg Arg Gly Asp
660 665 670
Met Ala Val Leu Ala Gln Arg Val Glu Gly Glu Gln Gln Arg Cys Lys
675 680 685
Pro Thr Thr Phe Asn Phe Gly Arg Leu Leu Cys Asp Ser Gly Asp Val
690 695 700
Tyr Tyr Arg Met Lys Arg Ala Glu Leu Tyr Cys Pro Arg Pro Leu Met
705 710 715 720
Val Arg Tyr Thr His Thr Thr Asp Arg Tyr Lys Val Ala Leu Val Ser
725 730 735
Pro Ala Lys Gln Leu Cys Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp
740 745 750
Val Glu Ser Asn Pro Gly Pro
755
<210> 388
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(C163A)-GLuc(-1M)
<400> 388
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcatccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcacg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacg ttgggagact gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctacgctg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 389
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(D123P)-GLuc(-1M)
<400> 389
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcatccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcacg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgcccccg ttgggagact gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 390
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(G125P)-GLuc(-1M)
<400> 390
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcatccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcacg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacg ttccgagact gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 391
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(I128P)-GLuc(-1M)
<400> 391
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcatccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcacg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacg ttgggagact gcctttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 392
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(I22P)-GLuc(-1M)
<400> 392
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcccccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcacg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacg ttgggagact gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 393
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(I22P/L127P)-GLuc(-1M)
<400> 393
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcccccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcacg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacg ttgggagacc gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 394
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(I22P/T100P/L127P)-GLuc(-1M)
<400> 394
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcccccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcccg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacg ttgggagacc gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 395
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(I22P/T100P/V124P)-GLuc(-1M)
<400> 395
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcccccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcccg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacc ctgggagact gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 396
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(I99P)-GLuc(-1M)
<400> 396
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcatccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agaccccacg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacg ttgggagact gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 397
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(L127P)-GLuc(-1M)
<400> 397
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcatccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcacg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacg ttgggagacc gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 398
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(L23P)-GLuc(-1M)
<400> 398
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcatccctg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcacg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacg ttgggagact gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 399
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(R126P)-GLuc(-1M)
<400> 399
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcatccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcacg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacg ttgggccact gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 400
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(T100P)-GLuc(-1M)
<400> 400
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcatccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcccg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacg ttgggagact gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 401
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(T100P/L127P)-GLuc(-1M)
<400> 401
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcatccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcccg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacg ttgggagacc gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 402
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(T34A/M88L)-GLuc(-1M)
<400> 402
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcatccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgccg ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct cctggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcacg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacg ttgggagact gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 403
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(V124P)-GLuc(-1M)
<400> 403
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcatccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcacg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacc ctgggagact gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 404
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(V124P/L127P)-GLuc(-1M)
<400> 404
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcatccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcacg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacc ctgggagacc gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 405
<211> 6674
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pJJP_O1P1-3C(WT)-GLuc(-1M)
<400> 405
tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60
ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240
gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300
agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360
ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420
cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480
gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540
caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600
caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaacaactg 660
cgatcgcccg ccccgttgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata 720
agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc actagaagct ttattgcggt agtttatcac 780
agttaaattg ctaacgcagt cagtgcttct gacacaacag tctcgaagat taaacttaag 840
tgactctatt aaggtagcct tgcagaagtt ggtcgtgagg cactgggcag gtaagtatca 900
aggttacaag acaggtttaa ggagaccaat agaaactggg cttgtcgaga cagagaagac 960
tcttgcgttt ctgataggca cctattggtc ttactgacat ccactttgcc tttctctcca 1020
cagaatcgat attggatccg ccgccaccat gggagccggg caatccagcc cggcaaccgg 1080
gtcacagaac caatcaggca acactgggag catcatcaac aattactaca tgcagcagta 1140
ccaaaactct atggacacac aacttggtga caacgctaca agcggaggct caaacgaggg 1200
gtccacggac acaacctcca cccacacaac caacactcag aacaacgact ggttctcgaa 1260
gctggctagc tccgctttca gcggtctttt cggcgctctt ctcgccgaca agaaaaccga 1320
ggagaccact cttcttgagg accgcatcct cactactcgt aacggacaca ccacctcgac 1380
aacccagtcg agcgtaggag tcacatacgg gtatgcaacg gctgaggatt tcgtgagcgg 1440
gccaaacacc tctggtcttg agaccagggt tgcccaggca gagcggttct ttaaaaccca 1500
cctgttcgac tgggtcacaa gtgacccgtt cggacggtgc cacctgctag aacttccaac 1560
tgaccacaaa ggtgtctatg gcagcctgac cgactcgtat gcttatatga ggaacggctg 1620
ggatgttgaa gtcactgctg tgggaaatca gttcaatgga ggatgcctgt tggtggctat 1680
ggtgccagaa ctttgctcca tacagaagag ggagctgtac cagctcacgc tctttcctca 1740
ccagttcatc aaccctcgga cgaacatgac agcacacatc actgtgccct ttgttggcgt 1800
caaccgttat gaccagtaca aggtacacaa accttggacc ctcgtggtta tggttgtagc 1860
ccccctgacc gtcaacagtg aaggtgcccc gcaaatcaag gtgtatgcca acatcgcacc 1920
taccaacgta cacgtcgcgg gtgaattccc ttccaaagag gggatcttcc ctgtggcttg 1980
cagcgatggt tatggcggtc tggtgacaac tgacccgaaa acggctgacc ccgcttacgg 2040
gaaagtgttt aacccccccc gcaacatgtt gccggggcgg ttcaccaatt ttcttgacgt 2100
ggctgaggcg tgccccacgt ttctccactt cgagggtgac gtgccatacg tgaccacgaa 2160
gacggattca gacagggtgc tcgctcagtt cgacttgtct ttggcagcaa agcacatgtc 2220
caacaccttc cttgcaggtc tcgcccagta ctacacacag tacagcggca ccatcaacct 2280
gcacttcatg ttcacagggc ctactgacgc gaaggcgcgt tacatgattg cgtatgctcc 2340
tcctggcatg gaaccaccta aaacgccaga ggcggctgcc cactgcatcc atgctgaatg 2400
ggacacaggg ttgaactcaa aattcacatt ttcaatccct tacctttcgg cggctgatta 2460
cgcttacaca gcgtctgaca ctgctgagac cacaaatgta cagggatggg tttgcctgtt 2520
tcaaataaca cacgggaaag ctgacggcga cgcactggtc gttttggcca gcgccggaaa 2580
ggactttgag ctgcgcctgc cggtggatgc taggacccag actacctccg cgggcgagtc 2640
agcagacccc gtgaccgcca ccgttgagaa ttacggtggc gagacacagg tccagaggcg 2700
ccaacacacg gacgtgtcat ttatattaga cagatttgtg aaagtgacac caaaagacca 2760
aattaatgta ttggacctga tgcaaacccc tgctcacact ttggtgggag cactccttcg 2820
tactgccact tactatttcg ctgacttaga ggtggcagtg aagcacgagg gaaacctcac 2880
ctgggtgccg aacggggcgc ctgaagcggc gttggacaac accaccaacc caacagctta 2940
ccacaaggca ccactcaccc gacttgcact gccttacacg gcgccacacc gcgtgttggc 3000
tactgtttac aacgggaaca gcaagtatgg tgacggcacg gtggccaatg tgagaggtga 3060
tctgcaagtg ttggcccaga aggcggcgag agcgctgcct acctccttca actacggtgc 3120
cattaaagct actcgggtga ctgaactgct ttaccgcatg aagagggctg agacatactg 3180
tccccggcct cttttggcca ttcacccgga ccaggctaga cacaagcaga agattgtggc 3240
tccggtgaaa cagcttctaa attttgacct gctcaaattg gcgggagatg tggagtccaa 3300
ccctgggccc agtggtgccc caccgaccga cttgcaaaag atggtcatga gcaacactaa 3360
gcctgttgag ctcatccttg acggtaagac ggtggccatc tgctgcgcca ccggagtgtt 3420
tggtactgcc tacctcgtgc ctcgtcacct tttcgcagaa aagtacgaca ggatcatgtt 3480
ggacggcagg gccatgacag acagtgacta cagagtgttt gagtttgaga ttaaagtaaa 3540
aggacaggac atgctctcag acgctgcgct catggtgctc caccgtggca accgtgtgag 3600
agacatcacg aaacactttc gtgatacagc aagaatgaag aaaggtaccc ccgttgtcgg 3660
cgtgatcaac aacgccgacg ttgggagact gattttctcc ggtgaggccc tcacctacaa 3720
ggacattgta gtgtgcatgg atggagacac catgccgggc ctatttgcct acagagccgc 3780
taccaaggct ggctactgtg gaggagccgt tcttgccaag gacggagctg acacatttat 3840
cgtcggcact cactccgcag gaggcaatgg agtcgggtac tgctcatgcg tatctaggtc 3900
catgctcttg aagatgaagg cacacattga ccccgaacca caccacgagg aattccacaa 3960
gcaaaagatc attgcaccag caaagcagct tctgaatttt gacctgctca agttggccgg 4020
agacgttgag tccaacccag gaccaggagt caaagttctg tttgccctga tctgcatcgc 4080
tgtggccgag gccaagccca ccgagaacaa cgaagacttc aacatcgtgg ccgtggccag 4140
caacttcgcg accacggatc tcgatgctga ccgagggaag ttgcccggca agaagctgcc 4200
gctggaggtg ctcaaagaga tggaagccaa tgcccggaaa gctggctgca ccaggggctg 4260
tctgatctgc ctgtcccaca tcaaatgcac gcccaagatg aagaagttca tcccaggacg 4320
ctgccacacc tacgaaggcg acaaagagtc cgcacagggc ggcataggcg aggcgatcgt 4380
tgacattcct gagattcctg ggttcaagga cttggagcca atggagcagt tcatcgcaca 4440
ggtcgatctg tgtgtggact gcacaactgg ctgcctcaaa gggcttgcca acgtgcagtg 4500
ttctgacctg ctcaagaagt ggctgccgca acgctgtgcg acctttgcca gcaagatcca 4560
gggccaggtg gacaagatca agggggccgg tggtgactaa tctagagata tcagacatga 4620
taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caacaagaat gcagtgaaaa aaatgcttta 4680
tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag 4740
ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt 4800
tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaatccga taaggatcgt cgactggctg 4860
cagtcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat 4920
gtatccgctc tcgagacaat aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag 4980
tatgagtatt caacatttca gagtggccct tattcccttt tttgcagcat tttgccttcc 5040
tgtttttgct cacccagaaa cactggtgaa agtaaaagat gctgaagacc agttgggtgc 5100
cagagtgggt tacattgaac tggacctcaa cagtggtaaa atccttgaga gttttagacc 5160
tgaagaaaga tttccaatga tgagcacttt taaagtactg ctatgtggtg ctgtattatc 5220
cagaattgat gcagggcaag agcaacttgg tagaagaata cactattctc agaatgactt 5280
ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacagat ggcatgacag taagagaatt 5340
atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cacagctgcc aacttacttc tgacaaccat 5400
tggtggacct aaagagctaa ctgctttttt gcacaacatg ggggaccatg taactagact 5460
tgataggtgg gaacctgagc tgaatgaagc cattccaaat gatgagaggg acaccacaat 5520
gcctgtagca atggcaacaa ctttgaggaa actattaact ggtgaactac ttactctagc 5580
ttccagacaa caattaatag actggatgga ggcagataaa gttgcaggac cacttctgag 5640
gtcagcctta cctgctggct ggtttattgc tgataaatct ggagcaggtg agagagggtc 5700
taggggtatc attgcagcac tggggccaga tggtaagccc tccagaattg tagttatcta 5760
cacaacaggg agtcaggcaa ctatggatga aagaaataga cagatagctg agataggtgc 5820
ctcactgatt aagcattggt gagcatgcga ccaagtttac tcatatatac tttagattga 5880
tttaaaactt catttttaat ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat 5940
gaccaaaatc ccttaacgtg agttttcgtt ccactgagcg gttaaccccg tagaaaagat 6000
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 6060
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 6120
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 6180
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 6240
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 6300
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 6360
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac 6420
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 6480
gcgcacgagg gagcttccag ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg 6540
ccacctctga cttgagcgtc gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa 6600
aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ccactgcaat 6660
ggccggccag atct 6674
<210> 406
<211> 6531
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pSNAP_3C(L23P)
<400> 406
aactacgtca ggtggcactt ttcggggaaa tgtgcgcgga acccctattt gtttattttt 60
ctaaatacat tcaaatatgt atccgctcat gagacaataa ccctgataaa tgcttcaata 120
atattgaaaa aggaagagta tgagtattca acatttccgt gtcgccctta ttcccttttt 180
tgcggcattt tgccttcctg tttttgctca cccagaaacg ctggtgaaag taaaagatgc 240
tgaagatcag ttgggtgcac gagtgggtta catcgaactg gatctcaaca gcggtaagat 300
ccttgagagt tttcgccccg aagaacgttt cccaatgatg agcactttta aagttctgct 360
atgtggcgcg gtattatccc gtgttgacgc cgggcaagag caactcggtc gccgcataca 420
ctattctcag aatgacttgg ttgagtactc accagtcaca gaaaagcatc ttacggatgg 480
catgacagta agagaattat gcagtgctgc cataaccatg agtgataaca ctgcggccaa 540
cttacttctg acaacgatcg gaggaccgaa ggagctaacc gcttttttgc acaacatggg 600
ggatcatgta actcgccttg atcgttggga accggagctg aatgaagcca taccaaacga 660
cgagcgtgac accacgatgc ctgtagcaat ggcaacaacg ttgcgcaaac tattaactgg 720
cgaactactt actctagctt cccggcaaca attaatagac tggatggagg cggataaagt 780
tgcaggacca cttctgcgct cggcccttcc ggctggctgg tttattgctg ataaatctgg 840
agccggtgag cgtgggtctc gcggtatcat tgcagcactg gggccagatg gtaagccctc 900
ccgtatcgta gttatctaca cgacggggag tcaggcaact atggatgaac gaaatagaca 960
gatcgctgag ataggtgcct cactgattaa gcattggtaa ctgtcagacc aagtttactc 1020
atatatactt tagattgatt taccccggtt gataatcaga aaagccccaa aaacaggaag 1080
attgtataag caaatattta aattgtaaac gttaatattt tgttaaaatt cgcgttaaat 1140
ttttgttaaa tcagctcatt ttttaaccaa taggccgaaa tcggcaaaat cccttataaa 1200
tcaaaagaat agcccgagat agggttgagt gttgttccag tttggaacaa gagtccacta 1260
ttaaagaacg tggactccaa cgtcaaaggg cgaaaaaccg tctatcaggg cgatggccca 1320
ctacgtgaac catcacccaa atcaagtttt ttggggtcga ggtgccgtaa agcactaaat 1380
cggaacccta aagggagccc ccgatttaga gcttgacggg gaaagccggc gaacgtggcg 1440
agaaaggaag ggaagaaagc gaaaggagcg ggcgctaggg cgctggcaag tgtagcggtc 1500
acgctgcgcg taaccaccac acccgccgcg cttaatgcgc cgctacaggg cgcgtaaaag 1560
gatctaggtg aagatccttt ttgataatct catgaccaaa atcccttaac gtgagttttc 1620
gttccactga gcgtcagacc ccgtagaaaa gatcaaagga tcttcttgag atcctttttt 1680
tctgcgcgta atctgctgct tgcaaacaaa aaaaccaccg ctaccagcgg tggtttgttt 1740
gccggatcaa gagctaccaa ctctttttcc gaaggtaact ggcttcagca gagcgcagat 1800
accaaatact gtccttctag tgtagccgta gttaggccac cacttcaaga actctgtagc 1860
accgcctaca tacctcgctc tgctaatcct gttaccagtg gctgctgcca gtggcgataa 1920
gtcgtgtctt accgggttgg actcaagacg atagttaccg gataaggcgc agcggtcggg 1980
ctgaacgggg ggttcgtgca cacagcccag cttggagcga acgacctaca ccgaactgag 2040
atacctacag cgtgagctat gagaaagcgc cacgcttccc gaagggagaa aggcggacag 2100
gtatccggta agcggcaggg tcggaacagg agagcgcacg agggagcttc cagggggaaa 2160
cgcctggtat ctttatagtc ctgtcgggtt tcgccacctc tgacttgagc gtcgattttt 2220
gtgatgctcg tcaggggggc ggagcctatg gaaaaacgcc agcaacgcgg cctttttacg 2280
gttcctggcc ttttgctggc cttttgctca catgttcttt cctgcgttat cccctgattc 2340
tgtggataac cgtattaccg cctttgagtg agctgatacc gctcgccgca gccgaacgac 2400
cgagcgcagc gagtcagtga gcgaggaagc tatggtgcac tctcagtaca atctgctctg 2460
atgccgcata gttaagccag tatacactcc gctatcgcta cgtgactggg tcatggctgc 2520
gccccgacac ccgccaacac ccgctgacgc gccctgacgg gcttgtctgc tcccggcatc 2580
cgcttacaga caagctgtga ccgtctccgg gagctgcatg tgtcagaggt tttcaccgtc 2640
atcaccgaaa cgcgcgaggc agctgcggta aagctcatca gcgtggtcgt gcagcgattc 2700
acagatgtct gcctgttcat ccgcgtccag ctcgttgagt ttctccagaa gcgttaatgt 2760
ctggcttctg ataaagcggg ccatgttaag ggcggttttt tcctgtttgg tcactgatgc 2820
ctccgtgtaa gggggatttc tgttcatggg ggtaatgata ccgatgaaac gagagaggat 2880
gctcacgata cgggttactg atgatgaaca tgcccggtta ctggaacgtt gtgagggtaa 2940
acaactggcg gtatggatgc ggcgggacca gagaaaaatc actcagggtc aatgccagcc 3000
gaacgccagc aagacgtagc ccagcgcgtc ggccgccatg ccggcgataa tggcctgctt 3060
ctcgccgaaa cgtttggtgg cgggaccagt gacgaaggct tgagcgaggg cgtgcaagat 3120
tccgaatacc gcaagcgaca ggccgatcat cgtcgcgctc cagcgaaagc ggtcctcgcc 3180
gaaaatgacc cagagcgctg ccggcacctg tcctacgagt tgcatgataa agaagacagt 3240
cataagtgcg gcgacgatag tcatgccccg cgcccaccgg aaggagctga ctgggttgaa 3300
ggctctcaag ggcatcggtc gagatcccgg tgcctaatga gtgagctaac ttacattaat 3360
tgcgttgcgc tcactgcccg ctttccagtc gggaaacctg tcgtgccagc tgcattaatg 3420
aatcggccaa cgcgcgggga gaggcggttt gcgtattggg cgccagggtg gtttttcttt 3480
tcaccagtga gacgggcaac agctgattgc ccttcaccgc ctggccctga gagagttgca 3540
gcaagcggtc cacgctggtt tgccccagca ggcgaaaatc ctgtttgatg gtggttaacg 3600
gcgggatata acatgagctg tcttcggtat cgtcgtatcc cactaccgag atgtccgcac 3660
caacgcgcag cccggactcg gtaatggcgc gcattgcgcc cagcgccatc tgatcgttgg 3720
caaccagcat cgcagtggga acgatgccct cattcagcat ttgcatggtt tgttgaaaac 3780
cggacatggc actccagtcg ccttcccgtt ccgctatcgg ctgaatttga ttgcgagtga 3840
gatatttatg ccagccagcc agacgcagac gcgccgagac agaacttaat gggcccgcta 3900
acagcgcgat ttgctggtga cccaatgcga ccagatgctc cacgcccagt cgcgtaccgt 3960
cttcatggga gaaaataata ctgttgatgg gtgtctggtc agagacatca agaaataacg 4020
ccggaacatt agtgcaggca gcttccacag caatggcatc ctggtcatcc agcggatagt 4080
taatgatcag cccactgacg cgttgcgcga gaagattgtg caccgccgct ttacaggctt 4140
cgacgccgct tcgttctacc atcgacacca ccacgctggc acccagttga tcggcgcgag 4200
atttaatcgc cgcgacaatt tgcgacggcg cgtgcagggc cagactggag gtggcaacgc 4260
caatcagcaa cgactgtttg cccgccagtt gttgtgccac gcggttggga atgtaattca 4320
gctccgccat cgccgcttcc actttttccc gcgttttcgc agaaacgtgg ctggcctggt 4380
tcaccacgcg ggaaacggtc tgataagaga caccggcata ctctgcgaca tcgtataacg 4440
ttactggttt cacattcacc accctgaatt gactctcttc cgggcgctat catgccatac 4500
cgcgaaaggt tttgcgccat tcgatggtgt ccgggatctc gacgctctcc cttatgcgac 4560
tcctgcatta ggaagcagcc cagtagtagg ttgaggccgt tgagcaccgc cgccgcaagg 4620
aatggtgcat gccggcatgc cgccctttcg tcttcaagaa ttaattccca attccccagg 4680
catcaaataa aacgaaaggc tcagtcgaaa gactgggcct ttcgttttat ctgttgtttg 4740
tcggtgaacg ctctcctgag taggacaaat ccgccgggag cggatttgaa cgttgcgaag 4800
caacggcccg gagggtggcg ggcaggacgc ccgccataaa ctgccaggaa ttaattcccc 4860
aggcatcaaa taaaacgaaa ggctcagtcg aaagactggg cctttcgttt tatctgttgt 4920
ttgtcggtga acgctctcct gagtaggaca aatccgccgg gagcggattt gaacgttgcg 4980
aagcaacggc ccggagggtg gcgggcagga cgcccgccat aaactgccag gaattaattc 5040
cccaggcatc aaataaaacg aaaggctcag tcgaaagact gggcctttcg ttttatctgt 5100
tgtttgtcgg tgaacgctct cctgagtagg acaaatccgc cgggagcgga tttgaacgtt 5160
gcgaagcaac ggcccggagg gtggcgggca ggacgcccgc cataaactgc caggaattaa 5220
ttccccaggc atcaaataaa acgaaaggct cagtcgaaag actgggcctt tcgttttatc 5280
tgttgtttgt cggtgaacgc tctcctgagt aggacaaatc cgccgggagc ggatttgaac 5340
gttgcgaagc aacggcccgg agggtggcgg gcaggacgcc cgccataaac tgccaggaat 5400
taattcccca ggcatcaaat aaaacgaaag gctcagtcga aagactgggc ctttcgtttt 5460
atctgttgtt tgtcggtgaa cgctctcctg agtaggacaa atccgccggg agcggatttg 5520
aacgttgcga agcaacggcc cggagggtgg cgggcaggac gcccgccata aactgccagg 5580
aattggggat cggaattaat tcccggttta aaccggggat ctcgatcccg cgaaattaat 5640
acgactcact ataggggaat tgtgagcgga taacaattcc cctctagaaa taattttgtt 5700
taactttaag aaggagatat acatatgagt ggtgccccac cgaccgactt gcaaaagatg 5760
gtcatgagca acactaagcc tgttgagctc atccctgacg gtaagacggt ggccatctgc 5820
tgcgccaccg gagtgtttgg tactgcctac ctcgtgcctc gtcacctttt cgcagaaaag 5880
tacgacagga tcatgttgga cggcagggcc atgacagaca gtgactacag agtgtttgag 5940
tttgagatta aagtaaaagg acaggacatg ctctcagacg ctgcgctcat ggtgctccac 6000
cgtggcaacc gtgtgagaga catcacgaaa cactttcgtg atacagcaag aatgaagaaa 6060
ggtacccccg ttgtcggcgt gatcaacaac gccgacgttg ggagactgat tttctccggt 6120
gaggccctca cctacaagga cattgtagtg tgcatggatg gagacaccat gccgggccta 6180
tttgcctaca gagccgctac caaggctggc tactgtggag gagccgttct tgccaaggac 6240
ggagctgaca catttatcgt cggcactcac tccgcaggag gcaatggagt cgggtactgc 6300
tcatgcgtat ctaggtccat gctcttgaag atgaaggcac acattgaccc cgaaccacac 6360
cacgagtagc tcgaggttaa ttaagcggcc gcattgatcc ggctgctaac aaagcccgaa 6420
aggaagctga gttggctgct gccaccgctg agcaataact agcataaccc cttggggcct 6480
ctaaacgggt cttgaggggt tttttgctga aaggaggaac tatatccgga t 6531
<210> 407
<211> 6531
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pSNAP_3C(L42H)
<400> 407
aactacgtca ggtggcactt ttcggggaaa tgtgcgcgga acccctattt gtttattttt 60
ctaaatacat tcaaatatgt atccgctcat gagacaataa ccctgataaa tgcttcaata 120
atattgaaaa aggaagagta tgagtattca acatttccgt gtcgccctta ttcccttttt 180
tgcggcattt tgccttcctg tttttgctca cccagaaacg ctggtgaaag taaaagatgc 240
tgaagatcag ttgggtgcac gagtgggtta catcgaactg gatctcaaca gcggtaagat 300
ccttgagagt tttcgccccg aagaacgttt cccaatgatg agcactttta aagttctgct 360
atgtggcgcg gtattatccc gtgttgacgc cgggcaagag caactcggtc gccgcataca 420
ctattctcag aatgacttgg ttgagtactc accagtcaca gaaaagcatc ttacggatgg 480
catgacagta agagaattat gcagtgctgc cataaccatg agtgataaca ctgcggccaa 540
cttacttctg acaacgatcg gaggaccgaa ggagctaacc gcttttttgc acaacatggg 600
ggatcatgta actcgccttg atcgttggga accggagctg aatgaagcca taccaaacga 660
cgagcgtgac accacgatgc ctgtagcaat ggcaacaacg ttgcgcaaac tattaactgg 720
cgaactactt actctagctt cccggcaaca attaatagac tggatggagg cggataaagt 780
tgcaggacca cttctgcgct cggcccttcc ggctggctgg tttattgctg ataaatctgg 840
agccggtgag cgtgggtctc gcggtatcat tgcagcactg gggccagatg gtaagccctc 900
ccgtatcgta gttatctaca cgacggggag tcaggcaact atggatgaac gaaatagaca 960
gatcgctgag ataggtgcct cactgattaa gcattggtaa ctgtcagacc aagtttactc 1020
atatatactt tagattgatt taccccggtt gataatcaga aaagccccaa aaacaggaag 1080
attgtataag caaatattta aattgtaaac gttaatattt tgttaaaatt cgcgttaaat 1140
ttttgttaaa tcagctcatt ttttaaccaa taggccgaaa tcggcaaaat cccttataaa 1200
tcaaaagaat agcccgagat agggttgagt gttgttccag tttggaacaa gagtccacta 1260
ttaaagaacg tggactccaa cgtcaaaggg cgaaaaaccg tctatcaggg cgatggccca 1320
ctacgtgaac catcacccaa atcaagtttt ttggggtcga ggtgccgtaa agcactaaat 1380
cggaacccta aagggagccc ccgatttaga gcttgacggg gaaagccggc gaacgtggcg 1440
agaaaggaag ggaagaaagc gaaaggagcg ggcgctaggg cgctggcaag tgtagcggtc 1500
acgctgcgcg taaccaccac acccgccgcg cttaatgcgc cgctacaggg cgcgtaaaag 1560
gatctaggtg aagatccttt ttgataatct catgaccaaa atcccttaac gtgagttttc 1620
gttccactga gcgtcagacc ccgtagaaaa gatcaaagga tcttcttgag atcctttttt 1680
tctgcgcgta atctgctgct tgcaaacaaa aaaaccaccg ctaccagcgg tggtttgttt 1740
gccggatcaa gagctaccaa ctctttttcc gaaggtaact ggcttcagca gagcgcagat 1800
accaaatact gtccttctag tgtagccgta gttaggccac cacttcaaga actctgtagc 1860
accgcctaca tacctcgctc tgctaatcct gttaccagtg gctgctgcca gtggcgataa 1920
gtcgtgtctt accgggttgg actcaagacg atagttaccg gataaggcgc agcggtcggg 1980
ctgaacgggg ggttcgtgca cacagcccag cttggagcga acgacctaca ccgaactgag 2040
atacctacag cgtgagctat gagaaagcgc cacgcttccc gaagggagaa aggcggacag 2100
gtatccggta agcggcaggg tcggaacagg agagcgcacg agggagcttc cagggggaaa 2160
cgcctggtat ctttatagtc ctgtcgggtt tcgccacctc tgacttgagc gtcgattttt 2220
gtgatgctcg tcaggggggc ggagcctatg gaaaaacgcc agcaacgcgg cctttttacg 2280
gttcctggcc ttttgctggc cttttgctca catgttcttt cctgcgttat cccctgattc 2340
tgtggataac cgtattaccg cctttgagtg agctgatacc gctcgccgca gccgaacgac 2400
cgagcgcagc gagtcagtga gcgaggaagc tatggtgcac tctcagtaca atctgctctg 2460
atgccgcata gttaagccag tatacactcc gctatcgcta cgtgactggg tcatggctgc 2520
gccccgacac ccgccaacac ccgctgacgc gccctgacgg gcttgtctgc tcccggcatc 2580
cgcttacaga caagctgtga ccgtctccgg gagctgcatg tgtcagaggt tttcaccgtc 2640
atcaccgaaa cgcgcgaggc agctgcggta aagctcatca gcgtggtcgt gcagcgattc 2700
acagatgtct gcctgttcat ccgcgtccag ctcgttgagt ttctccagaa gcgttaatgt 2760
ctggcttctg ataaagcggg ccatgttaag ggcggttttt tcctgtttgg tcactgatgc 2820
ctccgtgtaa gggggatttc tgttcatggg ggtaatgata ccgatgaaac gagagaggat 2880
gctcacgata cgggttactg atgatgaaca tgcccggtta ctggaacgtt gtgagggtaa 2940
acaactggcg gtatggatgc ggcgggacca gagaaaaatc actcagggtc aatgccagcc 3000
gaacgccagc aagacgtagc ccagcgcgtc ggccgccatg ccggcgataa tggcctgctt 3060
ctcgccgaaa cgtttggtgg cgggaccagt gacgaaggct tgagcgaggg cgtgcaagat 3120
tccgaatacc gcaagcgaca ggccgatcat cgtcgcgctc cagcgaaagc ggtcctcgcc 3180
gaaaatgacc cagagcgctg ccggcacctg tcctacgagt tgcatgataa agaagacagt 3240
cataagtgcg gcgacgatag tcatgccccg cgcccaccgg aaggagctga ctgggttgaa 3300
ggctctcaag ggcatcggtc gagatcccgg tgcctaatga gtgagctaac ttacattaat 3360
tgcgttgcgc tcactgcccg ctttccagtc gggaaacctg tcgtgccagc tgcattaatg 3420
aatcggccaa cgcgcgggga gaggcggttt gcgtattggg cgccagggtg gtttttcttt 3480
tcaccagtga gacgggcaac agctgattgc ccttcaccgc ctggccctga gagagttgca 3540
gcaagcggtc cacgctggtt tgccccagca ggcgaaaatc ctgtttgatg gtggttaacg 3600
gcgggatata acatgagctg tcttcggtat cgtcgtatcc cactaccgag atgtccgcac 3660
caacgcgcag cccggactcg gtaatggcgc gcattgcgcc cagcgccatc tgatcgttgg 3720
caaccagcat cgcagtggga acgatgccct cattcagcat ttgcatggtt tgttgaaaac 3780
cggacatggc actccagtcg ccttcccgtt ccgctatcgg ctgaatttga ttgcgagtga 3840
gatatttatg ccagccagcc agacgcagac gcgccgagac agaacttaat gggcccgcta 3900
acagcgcgat ttgctggtga cccaatgcga ccagatgctc cacgcccagt cgcgtaccgt 3960
cttcatggga gaaaataata ctgttgatgg gtgtctggtc agagacatca agaaataacg 4020
ccggaacatt agtgcaggca gcttccacag caatggcatc ctggtcatcc agcggatagt 4080
taatgatcag cccactgacg cgttgcgcga gaagattgtg caccgccgct ttacaggctt 4140
cgacgccgct tcgttctacc atcgacacca ccacgctggc acccagttga tcggcgcgag 4200
atttaatcgc cgcgacaatt tgcgacggcg cgtgcagggc cagactggag gtggcaacgc 4260
caatcagcaa cgactgtttg cccgccagtt gttgtgccac gcggttggga atgtaattca 4320
gctccgccat cgccgcttcc actttttccc gcgttttcgc agaaacgtgg ctggcctggt 4380
tcaccacgcg ggaaacggtc tgataagaga caccggcata ctctgcgaca tcgtataacg 4440
ttactggttt cacattcacc accctgaatt gactctcttc cgggcgctat catgccatac 4500
cgcgaaaggt tttgcgccat tcgatggtgt ccgggatctc gacgctctcc cttatgcgac 4560
tcctgcatta ggaagcagcc cagtagtagg ttgaggccgt tgagcaccgc cgccgcaagg 4620
aatggtgcat gccggcatgc cgccctttcg tcttcaagaa ttaattccca attccccagg 4680
catcaaataa aacgaaaggc tcagtcgaaa gactgggcct ttcgttttat ctgttgtttg 4740
tcggtgaacg ctctcctgag taggacaaat ccgccgggag cggatttgaa cgttgcgaag 4800
caacggcccg gagggtggcg ggcaggacgc ccgccataaa ctgccaggaa ttaattcccc 4860
aggcatcaaa taaaacgaaa ggctcagtcg aaagactggg cctttcgttt tatctgttgt 4920
ttgtcggtga acgctctcct gagtaggaca aatccgccgg gagcggattt gaacgttgcg 4980
aagcaacggc ccggagggtg gcgggcagga cgcccgccat aaactgccag gaattaattc 5040
cccaggcatc aaataaaacg aaaggctcag tcgaaagact gggcctttcg ttttatctgt 5100
tgtttgtcgg tgaacgctct cctgagtagg acaaatccgc cgggagcgga tttgaacgtt 5160
gcgaagcaac ggcccggagg gtggcgggca ggacgcccgc cataaactgc caggaattaa 5220
ttccccaggc atcaaataaa acgaaaggct cagtcgaaag actgggcctt tcgttttatc 5280
tgttgtttgt cggtgaacgc tctcctgagt aggacaaatc cgccgggagc ggatttgaac 5340
gttgcgaagc aacggcccgg agggtggcgg gcaggacgcc cgccataaac tgccaggaat 5400
taattcccca ggcatcaaat aaaacgaaag gctcagtcga aagactgggc ctttcgtttt 5460
atctgttgtt tgtcggtgaa cgctctcctg agtaggacaa atccgccggg agcggatttg 5520
aacgttgcga agcaacggcc cggagggtgg cgggcaggac gcccgccata aactgccagg 5580
aattggggat cggaattaat tcccggttta aaccggggat ctcgatcccg cgaaattaat 5640
acgactcact ataggggaat tgtgagcgga taacaattcc cctctagaaa taattttgtt 5700
taactttaag aaggagatat acatatgagt ggtgccccac cgaccgactt gcaaaagatg 5760
gtcatgagca acactaagcc tgttgagctc atccttgacg gtaagacggt ggccatctgc 5820
tgcgccaccg gagtgtttgg tactgcctac cacgtgcctc gtcacctttt cgcagaaaag 5880
tacgacagga tcatgttgga cggcagggcc atgacagaca gtgactacag agtgtttgag 5940
tttgagatta aagtaaaagg acaggacatg ctctcagacg ctgcgctcat ggtgctccac 6000
cgtggcaacc gtgtgagaga catcacgaaa cactttcgtg atacagcaag aatgaagaaa 6060
ggtacccccg ttgtcggcgt gatcaacaac gccgacgttg ggagactgat tttctccggt 6120
gaggccctca cctacaagga cattgtagtg tgcatggatg gagacaccat gccgggccta 6180
tttgcctaca gagccgctac caaggctggc tactgtggag gagccgttct tgccaaggac 6240
ggagctgaca catttatcgt cggcactcac tccgcaggag gcaatggagt cgggtactgc 6300
tcatgcgtat ctaggtccat gctcttgaag atgaaggcac acattgaccc cgaaccacac 6360
cacgagtagc tcgaggttaa ttaagcggcc gcattgatcc ggctgctaac aaagcccgaa 6420
aggaagctga gttggctgct gccaccgctg agcaataact agcataaccc cttggggcct 6480
ctaaacgggt cttgaggggt tttttgctga aaggaggaac tatatccgga t 6531
<210> 408
<211> 6531
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pSNAP_3C(T100P)
<400> 408
aactacgtca ggtggcactt ttcggggaaa tgtgcgcgga acccctattt gtttattttt 60
ctaaatacat tcaaatatgt atccgctcat gagacaataa ccctgataaa tgcttcaata 120
atattgaaaa aggaagagta tgagtattca acatttccgt gtcgccctta ttcccttttt 180
tgcggcattt tgccttcctg tttttgctca cccagaaacg ctggtgaaag taaaagatgc 240
tgaagatcag ttgggtgcac gagtgggtta catcgaactg gatctcaaca gcggtaagat 300
ccttgagagt tttcgccccg aagaacgttt cccaatgatg agcactttta aagttctgct 360
atgtggcgcg gtattatccc gtgttgacgc cgggcaagag caactcggtc gccgcataca 420
ctattctcag aatgacttgg ttgagtactc accagtcaca gaaaagcatc ttacggatgg 480
catgacagta agagaattat gcagtgctgc cataaccatg agtgataaca ctgcggccaa 540
cttacttctg acaacgatcg gaggaccgaa ggagctaacc gcttttttgc acaacatggg 600
ggatcatgta actcgccttg atcgttggga accggagctg aatgaagcca taccaaacga 660
cgagcgtgac accacgatgc ctgtagcaat ggcaacaacg ttgcgcaaac tattaactgg 720
cgaactactt actctagctt cccggcaaca attaatagac tggatggagg cggataaagt 780
tgcaggacca cttctgcgct cggcccttcc ggctggctgg tttattgctg ataaatctgg 840
agccggtgag cgtgggtctc gcggtatcat tgcagcactg gggccagatg gtaagccctc 900
ccgtatcgta gttatctaca cgacggggag tcaggcaact atggatgaac gaaatagaca 960
gatcgctgag ataggtgcct cactgattaa gcattggtaa ctgtcagacc aagtttactc 1020
atatatactt tagattgatt taccccggtt gataatcaga aaagccccaa aaacaggaag 1080
attgtataag caaatattta aattgtaaac gttaatattt tgttaaaatt cgcgttaaat 1140
ttttgttaaa tcagctcatt ttttaaccaa taggccgaaa tcggcaaaat cccttataaa 1200
tcaaaagaat agcccgagat agggttgagt gttgttccag tttggaacaa gagtccacta 1260
ttaaagaacg tggactccaa cgtcaaaggg cgaaaaaccg tctatcaggg cgatggccca 1320
ctacgtgaac catcacccaa atcaagtttt ttggggtcga ggtgccgtaa agcactaaat 1380
cggaacccta aagggagccc ccgatttaga gcttgacggg gaaagccggc gaacgtggcg 1440
agaaaggaag ggaagaaagc gaaaggagcg ggcgctaggg cgctggcaag tgtagcggtc 1500
acgctgcgcg taaccaccac acccgccgcg cttaatgcgc cgctacaggg cgcgtaaaag 1560
gatctaggtg aagatccttt ttgataatct catgaccaaa atcccttaac gtgagttttc 1620
gttccactga gcgtcagacc ccgtagaaaa gatcaaagga tcttcttgag atcctttttt 1680
tctgcgcgta atctgctgct tgcaaacaaa aaaaccaccg ctaccagcgg tggtttgttt 1740
gccggatcaa gagctaccaa ctctttttcc gaaggtaact ggcttcagca gagcgcagat 1800
accaaatact gtccttctag tgtagccgta gttaggccac cacttcaaga actctgtagc 1860
accgcctaca tacctcgctc tgctaatcct gttaccagtg gctgctgcca gtggcgataa 1920
gtcgtgtctt accgggttgg actcaagacg atagttaccg gataaggcgc agcggtcggg 1980
ctgaacgggg ggttcgtgca cacagcccag cttggagcga acgacctaca ccgaactgag 2040
atacctacag cgtgagctat gagaaagcgc cacgcttccc gaagggagaa aggcggacag 2100
gtatccggta agcggcaggg tcggaacagg agagcgcacg agggagcttc cagggggaaa 2160
cgcctggtat ctttatagtc ctgtcgggtt tcgccacctc tgacttgagc gtcgattttt 2220
gtgatgctcg tcaggggggc ggagcctatg gaaaaacgcc agcaacgcgg cctttttacg 2280
gttcctggcc ttttgctggc cttttgctca catgttcttt cctgcgttat cccctgattc 2340
tgtggataac cgtattaccg cctttgagtg agctgatacc gctcgccgca gccgaacgac 2400
cgagcgcagc gagtcagtga gcgaggaagc tatggtgcac tctcagtaca atctgctctg 2460
atgccgcata gttaagccag tatacactcc gctatcgcta cgtgactggg tcatggctgc 2520
gccccgacac ccgccaacac ccgctgacgc gccctgacgg gcttgtctgc tcccggcatc 2580
cgcttacaga caagctgtga ccgtctccgg gagctgcatg tgtcagaggt tttcaccgtc 2640
atcaccgaaa cgcgcgaggc agctgcggta aagctcatca gcgtggtcgt gcagcgattc 2700
acagatgtct gcctgttcat ccgcgtccag ctcgttgagt ttctccagaa gcgttaatgt 2760
ctggcttctg ataaagcggg ccatgttaag ggcggttttt tcctgtttgg tcactgatgc 2820
ctccgtgtaa gggggatttc tgttcatggg ggtaatgata ccgatgaaac gagagaggat 2880
gctcacgata cgggttactg atgatgaaca tgcccggtta ctggaacgtt gtgagggtaa 2940
acaactggcg gtatggatgc ggcgggacca gagaaaaatc actcagggtc aatgccagcc 3000
gaacgccagc aagacgtagc ccagcgcgtc ggccgccatg ccggcgataa tggcctgctt 3060
ctcgccgaaa cgtttggtgg cgggaccagt gacgaaggct tgagcgaggg cgtgcaagat 3120
tccgaatacc gcaagcgaca ggccgatcat cgtcgcgctc cagcgaaagc ggtcctcgcc 3180
gaaaatgacc cagagcgctg ccggcacctg tcctacgagt tgcatgataa agaagacagt 3240
cataagtgcg gcgacgatag tcatgccccg cgcccaccgg aaggagctga ctgggttgaa 3300
ggctctcaag ggcatcggtc gagatcccgg tgcctaatga gtgagctaac ttacattaat 3360
tgcgttgcgc tcactgcccg ctttccagtc gggaaacctg tcgtgccagc tgcattaatg 3420
aatcggccaa cgcgcgggga gaggcggttt gcgtattggg cgccagggtg gtttttcttt 3480
tcaccagtga gacgggcaac agctgattgc ccttcaccgc ctggccctga gagagttgca 3540
gcaagcggtc cacgctggtt tgccccagca ggcgaaaatc ctgtttgatg gtggttaacg 3600
gcgggatata acatgagctg tcttcggtat cgtcgtatcc cactaccgag atgtccgcac 3660
caacgcgcag cccggactcg gtaatggcgc gcattgcgcc cagcgccatc tgatcgttgg 3720
caaccagcat cgcagtggga acgatgccct cattcagcat ttgcatggtt tgttgaaaac 3780
cggacatggc actccagtcg ccttcccgtt ccgctatcgg ctgaatttga ttgcgagtga 3840
gatatttatg ccagccagcc agacgcagac gcgccgagac agaacttaat gggcccgcta 3900
acagcgcgat ttgctggtga cccaatgcga ccagatgctc cacgcccagt cgcgtaccgt 3960
cttcatggga gaaaataata ctgttgatgg gtgtctggtc agagacatca agaaataacg 4020
ccggaacatt agtgcaggca gcttccacag caatggcatc ctggtcatcc agcggatagt 4080
taatgatcag cccactgacg cgttgcgcga gaagattgtg caccgccgct ttacaggctt 4140
cgacgccgct tcgttctacc atcgacacca ccacgctggc acccagttga tcggcgcgag 4200
atttaatcgc cgcgacaatt tgcgacggcg cgtgcagggc cagactggag gtggcaacgc 4260
caatcagcaa cgactgtttg cccgccagtt gttgtgccac gcggttggga atgtaattca 4320
gctccgccat cgccgcttcc actttttccc gcgttttcgc agaaacgtgg ctggcctggt 4380
tcaccacgcg ggaaacggtc tgataagaga caccggcata ctctgcgaca tcgtataacg 4440
ttactggttt cacattcacc accctgaatt gactctcttc cgggcgctat catgccatac 4500
cgcgaaaggt tttgcgccat tcgatggtgt ccgggatctc gacgctctcc cttatgcgac 4560
tcctgcatta ggaagcagcc cagtagtagg ttgaggccgt tgagcaccgc cgccgcaagg 4620
aatggtgcat gccggcatgc cgccctttcg tcttcaagaa ttaattccca attccccagg 4680
catcaaataa aacgaaaggc tcagtcgaaa gactgggcct ttcgttttat ctgttgtttg 4740
tcggtgaacg ctctcctgag taggacaaat ccgccgggag cggatttgaa cgttgcgaag 4800
caacggcccg gagggtggcg ggcaggacgc ccgccataaa ctgccaggaa ttaattcccc 4860
aggcatcaaa taaaacgaaa ggctcagtcg aaagactggg cctttcgttt tatctgttgt 4920
ttgtcggtga acgctctcct gagtaggaca aatccgccgg gagcggattt gaacgttgcg 4980
aagcaacggc ccggagggtg gcgggcagga cgcccgccat aaactgccag gaattaattc 5040
cccaggcatc aaataaaacg aaaggctcag tcgaaagact gggcctttcg ttttatctgt 5100
tgtttgtcgg tgaacgctct cctgagtagg acaaatccgc cgggagcgga tttgaacgtt 5160
gcgaagcaac ggcccggagg gtggcgggca ggacgcccgc cataaactgc caggaattaa 5220
ttccccaggc atcaaataaa acgaaaggct cagtcgaaag actgggcctt tcgttttatc 5280
tgttgtttgt cggtgaacgc tctcctgagt aggacaaatc cgccgggagc ggatttgaac 5340
gttgcgaagc aacggcccgg agggtggcgg gcaggacgcc cgccataaac tgccaggaat 5400
taattcccca ggcatcaaat aaaacgaaag gctcagtcga aagactgggc ctttcgtttt 5460
atctgttgtt tgtcggtgaa cgctctcctg agtaggacaa atccgccggg agcggatttg 5520
aacgttgcga agcaacggcc cggagggtgg cgggcaggac gcccgccata aactgccagg 5580
aattggggat cggaattaat tcccggttta aaccggggat ctcgatcccg cgaaattaat 5640
acgactcact ataggggaat tgtgagcgga taacaattcc cctctagaaa taattttgtt 5700
taactttaag aaggagatat acatatgagt ggtgccccac cgaccgactt gcaaaagatg 5760
gtcatgagca acactaagcc tgttgagctc atccttgacg gtaagacggt ggccatctgc 5820
tgcgccaccg gagtgtttgg tactgcctac ctcgtgcctc gtcacctttt cgcagaaaag 5880
tacgacagga tcatgttgga cggcagggcc atgacagaca gtgactacag agtgtttgag 5940
tttgagatta aagtaaaagg acaggacatg ctctcagacg ctgcgctcat ggtgctccac 6000
cgtggcaacc gtgtgagaga catcccgaaa cactttcgtg atacagcaag aatgaagaaa 6060
ggtacccccg ttgtcggcgt gatcaacaac gccgacgttg ggagactgat tttctccggt 6120
gaggccctca cctacaagga cattgtagtg tgcatggatg gagacaccat gccgggccta 6180
tttgcctaca gagccgctac caaggctggc tactgtggag gagccgttct tgccaaggac 6240
ggagctgaca catttatcgt cggcactcac tccgcaggag gcaatggagt cgggtactgc 6300
tcatgcgtat ctaggtccat gctcttgaag atgaaggcac acattgaccc cgaaccacac 6360
cacgagtagc tcgaggttaa ttaagcggcc gcattgatcc ggctgctaac aaagcccgaa 6420
aggaagctga gttggctgct gccaccgctg agcaataact agcataaccc cttggggcct 6480
ctaaacgggt cttgaggggt tttttgctga aaggaggaac tatatccgga t 6531
<210> 409
<211> 6531
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pSNAP_3C(WT)
<400> 409
aactacgtca ggtggcactt ttcggggaaa tgtgcgcgga acccctattt gtttattttt 60
ctaaatacat tcaaatatgt atccgctcat gagacaataa ccctgataaa tgcttcaata 120
atattgaaaa aggaagagta tgagtattca acatttccgt gtcgccctta ttcccttttt 180
tgcggcattt tgccttcctg tttttgctca cccagaaacg ctggtgaaag taaaagatgc 240
tgaagatcag ttgggtgcac gagtgggtta catcgaactg gatctcaaca gcggtaagat 300
ccttgagagt tttcgccccg aagaacgttt cccaatgatg agcactttta aagttctgct 360
atgtggcgcg gtattatccc gtgttgacgc cgggcaagag caactcggtc gccgcataca 420
ctattctcag aatgacttgg ttgagtactc accagtcaca gaaaagcatc ttacggatgg 480
catgacagta agagaattat gcagtgctgc cataaccatg agtgataaca ctgcggccaa 540
cttacttctg acaacgatcg gaggaccgaa ggagctaacc gcttttttgc acaacatggg 600
ggatcatgta actcgccttg atcgttggga accggagctg aatgaagcca taccaaacga 660
cgagcgtgac accacgatgc ctgtagcaat ggcaacaacg ttgcgcaaac tattaactgg 720
cgaactactt actctagctt cccggcaaca attaatagac tggatggagg cggataaagt 780
tgcaggacca cttctgcgct cggcccttcc ggctggctgg tttattgctg ataaatctgg 840
agccggtgag cgtgggtctc gcggtatcat tgcagcactg gggccagatg gtaagccctc 900
ccgtatcgta gttatctaca cgacggggag tcaggcaact atggatgaac gaaatagaca 960
gatcgctgag ataggtgcct cactgattaa gcattggtaa ctgtcagacc aagtttactc 1020
atatatactt tagattgatt taccccggtt gataatcaga aaagccccaa aaacaggaag 1080
attgtataag caaatattta aattgtaaac gttaatattt tgttaaaatt cgcgttaaat 1140
ttttgttaaa tcagctcatt ttttaaccaa taggccgaaa tcggcaaaat cccttataaa 1200
tcaaaagaat agcccgagat agggttgagt gttgttccag tttggaacaa gagtccacta 1260
ttaaagaacg tggactccaa cgtcaaaggg cgaaaaaccg tctatcaggg cgatggccca 1320
ctacgtgaac catcacccaa atcaagtttt ttggggtcga ggtgccgtaa agcactaaat 1380
cggaacccta aagggagccc ccgatttaga gcttgacggg gaaagccggc gaacgtggcg 1440
agaaaggaag ggaagaaagc gaaaggagcg ggcgctaggg cgctggcaag tgtagcggtc 1500
acgctgcgcg taaccaccac acccgccgcg cttaatgcgc cgctacaggg cgcgtaaaag 1560
gatctaggtg aagatccttt ttgataatct catgaccaaa atcccttaac gtgagttttc 1620
gttccactga gcgtcagacc ccgtagaaaa gatcaaagga tcttcttgag atcctttttt 1680
tctgcgcgta atctgctgct tgcaaacaaa aaaaccaccg ctaccagcgg tggtttgttt 1740
gccggatcaa gagctaccaa ctctttttcc gaaggtaact ggcttcagca gagcgcagat 1800
accaaatact gtccttctag tgtagccgta gttaggccac cacttcaaga actctgtagc 1860
accgcctaca tacctcgctc tgctaatcct gttaccagtg gctgctgcca gtggcgataa 1920
gtcgtgtctt accgggttgg actcaagacg atagttaccg gataaggcgc agcggtcggg 1980
ctgaacgggg ggttcgtgca cacagcccag cttggagcga acgacctaca ccgaactgag 2040
atacctacag cgtgagctat gagaaagcgc cacgcttccc gaagggagaa aggcggacag 2100
gtatccggta agcggcaggg tcggaacagg agagcgcacg agggagcttc cagggggaaa 2160
cgcctggtat ctttatagtc ctgtcgggtt tcgccacctc tgacttgagc gtcgattttt 2220
gtgatgctcg tcaggggggc ggagcctatg gaaaaacgcc agcaacgcgg cctttttacg 2280
gttcctggcc ttttgctggc cttttgctca catgttcttt cctgcgttat cccctgattc 2340
tgtggataac cgtattaccg cctttgagtg agctgatacc gctcgccgca gccgaacgac 2400
cgagcgcagc gagtcagtga gcgaggaagc tatggtgcac tctcagtaca atctgctctg 2460
atgccgcata gttaagccag tatacactcc gctatcgcta cgtgactggg tcatggctgc 2520
gccccgacac ccgccaacac ccgctgacgc gccctgacgg gcttgtctgc tcccggcatc 2580
cgcttacaga caagctgtga ccgtctccgg gagctgcatg tgtcagaggt tttcaccgtc 2640
atcaccgaaa cgcgcgaggc agctgcggta aagctcatca gcgtggtcgt gcagcgattc 2700
acagatgtct gcctgttcat ccgcgtccag ctcgttgagt ttctccagaa gcgttaatgt 2760
ctggcttctg ataaagcggg ccatgttaag ggcggttttt tcctgtttgg tcactgatgc 2820
ctccgtgtaa gggggatttc tgttcatggg ggtaatgata ccgatgaaac gagagaggat 2880
gctcacgata cgggttactg atgatgaaca tgcccggtta ctggaacgtt gtgagggtaa 2940
acaactggcg gtatggatgc ggcgggacca gagaaaaatc actcagggtc aatgccagcc 3000
gaacgccagc aagacgtagc ccagcgcgtc ggccgccatg ccggcgataa tggcctgctt 3060
ctcgccgaaa cgtttggtgg cgggaccagt gacgaaggct tgagcgaggg cgtgcaagat 3120
tccgaatacc gcaagcgaca ggccgatcat cgtcgcgctc cagcgaaagc ggtcctcgcc 3180
gaaaatgacc cagagcgctg ccggcacctg tcctacgagt tgcatgataa agaagacagt 3240
cataagtgcg gcgacgatag tcatgccccg cgcccaccgg aaggagctga ctgggttgaa 3300
ggctctcaag ggcatcggtc gagatcccgg tgcctaatga gtgagctaac ttacattaat 3360
tgcgttgcgc tcactgcccg ctttccagtc gggaaacctg tcgtgccagc tgcattaatg 3420
aatcggccaa cgcgcgggga gaggcggttt gcgtattggg cgccagggtg gtttttcttt 3480
tcaccagtga gacgggcaac agctgattgc ccttcaccgc ctggccctga gagagttgca 3540
gcaagcggtc cacgctggtt tgccccagca ggcgaaaatc ctgtttgatg gtggttaacg 3600
gcgggatata acatgagctg tcttcggtat cgtcgtatcc cactaccgag atgtccgcac 3660
caacgcgcag cccggactcg gtaatggcgc gcattgcgcc cagcgccatc tgatcgttgg 3720
caaccagcat cgcagtggga acgatgccct cattcagcat ttgcatggtt tgttgaaaac 3780
cggacatggc actccagtcg ccttcccgtt ccgctatcgg ctgaatttga ttgcgagtga 3840
gatatttatg ccagccagcc agacgcagac gcgccgagac agaacttaat gggcccgcta 3900
acagcgcgat ttgctggtga cccaatgcga ccagatgctc cacgcccagt cgcgtaccgt 3960
cttcatggga gaaaataata ctgttgatgg gtgtctggtc agagacatca agaaataacg 4020
ccggaacatt agtgcaggca gcttccacag caatggcatc ctggtcatcc agcggatagt 4080
taatgatcag cccactgacg cgttgcgcga gaagattgtg caccgccgct ttacaggctt 4140
cgacgccgct tcgttctacc atcgacacca ccacgctggc acccagttga tcggcgcgag 4200
atttaatcgc cgcgacaatt tgcgacggcg cgtgcagggc cagactggag gtggcaacgc 4260
caatcagcaa cgactgtttg cccgccagtt gttgtgccac gcggttggga atgtaattca 4320
gctccgccat cgccgcttcc actttttccc gcgttttcgc agaaacgtgg ctggcctggt 4380
tcaccacgcg ggaaacggtc tgataagaga caccggcata ctctgcgaca tcgtataacg 4440
ttactggttt cacattcacc accctgaatt gactctcttc cgggcgctat catgccatac 4500
cgcgaaaggt tttgcgccat tcgatggtgt ccgggatctc gacgctctcc cttatgcgac 4560
tcctgcatta ggaagcagcc cagtagtagg ttgaggccgt tgagcaccgc cgccgcaagg 4620
aatggtgcat gccggcatgc cgccctttcg tcttcaagaa ttaattccca attccccagg 4680
catcaaataa aacgaaaggc tcagtcgaaa gactgggcct ttcgttttat ctgttgtttg 4740
tcggtgaacg ctctcctgag taggacaaat ccgccgggag cggatttgaa cgttgcgaag 4800
caacggcccg gagggtggcg ggcaggacgc ccgccataaa ctgccaggaa ttaattcccc 4860
aggcatcaaa taaaacgaaa ggctcagtcg aaagactggg cctttcgttt tatctgttgt 4920
ttgtcggtga acgctctcct gagtaggaca aatccgccgg gagcggattt gaacgttgcg 4980
aagcaacggc ccggagggtg gcgggcagga cgcccgccat aaactgccag gaattaattc 5040
cccaggcatc aaataaaacg aaaggctcag tcgaaagact gggcctttcg ttttatctgt 5100
tgtttgtcgg tgaacgctct cctgagtagg acaaatccgc cgggagcgga tttgaacgtt 5160
gcgaagcaac ggcccggagg gtggcgggca ggacgcccgc cataaactgc caggaattaa 5220
ttccccaggc atcaaataaa acgaaaggct cagtcgaaag actgggcctt tcgttttatc 5280
tgttgtttgt cggtgaacgc tctcctgagt aggacaaatc cgccgggagc ggatttgaac 5340
gttgcgaagc aacggcccgg agggtggcgg gcaggacgcc cgccataaac tgccaggaat 5400
taattcccca ggcatcaaat aaaacgaaag gctcagtcga aagactgggc ctttcgtttt 5460
atctgttgtt tgtcggtgaa cgctctcctg agtaggacaa atccgccggg agcggatttg 5520
aacgttgcga agcaacggcc cggagggtgg cgggcaggac gcccgccata aactgccagg 5580
aattggggat cggaattaat tcccggttta aaccggggat ctcgatcccg cgaaattaat 5640
acgactcact ataggggaat tgtgagcgga taacaattcc cctctagaaa taattttgtt 5700
taactttaag aaggagatat acatatgagt ggtgccccac cgaccgactt gcaaaagatg 5760
gtcatgagca acactaagcc tgttgagctc atccttgacg gtaagacggt ggccatctgc 5820
tgcgccaccg gagtgtttgg tactgcctac ctcgtgcctc gtcacctttt cgcagaaaag 5880
tacgacagga tcatgttgga cggcagggcc atgacagaca gtgactacag agtgtttgag 5940
tttgagatta aagtaaaagg acaggacatg ctctcagacg ctgcgctcat ggtgctccac 6000
cgtggcaacc gtgtgagaga catcacgaaa cactttcgtg atacagcaag aatgaagaaa 6060
ggtacccccg ttgtcggcgt gatcaacaac gccgacgttg ggagactgat tttctccggt 6120
gaggccctca cctacaagga cattgtagtg tgcatggatg gagacaccat gccgggccta 6180
tttgcctaca gagccgctac caaggctggc tactgtggag gagccgttct tgccaaggac 6240
ggagctgaca catttatcgt cggcactcac tccgcaggag gcaatggagt cgggtactgc 6300
tcatgcgtat ctaggtccat gctcttgaag atgaaggcac acattgaccc cgaaccacac 6360
cacgagtagc tcgaggttaa ttaagcggcc gcattgatcc ggctgctaac aaagcccgaa 6420
aggaagctga gttggctgct gccaccgctg agcaataact agcataaccc cttggggcct 6480
ctaaacgggt cttgaggggt tttttgctga aaggaggaac tatatccgga t 6531
<210> 410
<211> 6590
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pSNAP_Flag-3C(L127P)
<400> 410
aactacgtca ggtggcactt ttcggggaaa tgtgcgcgga acccctattt gtttattttt 60
ctaaatacat tcaaatatgt atccgctcat gagacaataa ccctgataaa tgcttcaata 120
atattgaaaa aggaagagta tgagtattca acatttccgt gtcgccctta ttcccttttt 180
tgcggcattt tgccttcctg tttttgctca cccagaaacg ctggtgaaag taaaagatgc 240
tgaagatcag ttgggtgcac gagtgggtta catcgaactg gatctcaaca gcggtaagat 300
ccttgagagt tttcgccccg aagaacgttt cccaatgatg agcactttta aagttctgct 360
atgtggcgcg gtattatccc gtgttgacgc cgggcaagag caactcggtc gccgcataca 420
ctattctcag aatgacttgg ttgagtactc accagtcaca gaaaagcatc ttacggatgg 480
catgacagta agagaattat gcagtgctgc cataaccatg agtgataaca ctgcggccaa 540
cttacttctg acaacgatcg gaggaccgaa ggagctaacc gcttttttgc acaacatggg 600
ggatcatgta actcgccttg atcgttggga accggagctg aatgaagcca taccaaacga 660
cgagcgtgac accacgatgc ctgtagcaat ggcaacaacg ttgcgcaaac tattaactgg 720
cgaactactt actctagctt cccggcaaca attaatagac tggatggagg cggataaagt 780
tgcaggacca cttctgcgct cggcccttcc ggctggctgg tttattgctg ataaatctgg 840
agccggtgag cgtgggtctc gcggtatcat tgcagcactg gggccagatg gtaagccctc 900
ccgtatcgta gttatctaca cgacggggag tcaggcaact atggatgaac gaaatagaca 960
gatcgctgag ataggtgcct cactgattaa gcattggtaa ctgtcagacc aagtttactc 1020
atatatactt tagattgatt taccccggtt gataatcaga aaagccccaa aaacaggaag 1080
attgtataag caaatattta aattgtaaac gttaatattt tgttaaaatt cgcgttaaat 1140
ttttgttaaa tcagctcatt ttttaaccaa taggccgaaa tcggcaaaat cccttataaa 1200
tcaaaagaat agcccgagat agggttgagt gttgttccag tttggaacaa gagtccacta 1260
ttaaagaacg tggactccaa cgtcaaaggg cgaaaaaccg tctatcaggg cgatggccca 1320
ctacgtgaac catcacccaa atcaagtttt ttggggtcga ggtgccgtaa agcactaaat 1380
cggaacccta aagggagccc ccgatttaga gcttgacggg gaaagccggc gaacgtggcg 1440
agaaaggaag ggaagaaagc gaaaggagcg ggcgctaggg cgctggcaag tgtagcggtc 1500
acgctgcgcg taaccaccac acccgccgcg cttaatgcgc cgctacaggg cgcgtaaaag 1560
gatctaggtg aagatccttt ttgataatct catgaccaaa atcccttaac gtgagttttc 1620
gttccactga gcgtcagacc ccgtagaaaa gatcaaagga tcttcttgag atcctttttt 1680
tctgcgcgta atctgctgct tgcaaacaaa aaaaccaccg ctaccagcgg tggtttgttt 1740
gccggatcaa gagctaccaa ctctttttcc gaaggtaact ggcttcagca gagcgcagat 1800
accaaatact gtccttctag tgtagccgta gttaggccac cacttcaaga actctgtagc 1860
accgcctaca tacctcgctc tgctaatcct gttaccagtg gctgctgcca gtggcgataa 1920
gtcgtgtctt accgggttgg actcaagacg atagttaccg gataaggcgc agcggtcggg 1980
ctgaacgggg ggttcgtgca cacagcccag cttggagcga acgacctaca ccgaactgag 2040
atacctacag cgtgagctat gagaaagcgc cacgcttccc gaagggagaa aggcggacag 2100
gtatccggta agcggcaggg tcggaacagg agagcgcacg agggagcttc cagggggaaa 2160
cgcctggtat ctttatagtc ctgtcgggtt tcgccacctc tgacttgagc gtcgattttt 2220
gtgatgctcg tcaggggggc ggagcctatg gaaaaacgcc agcaacgcgg cctttttacg 2280
gttcctggcc ttttgctggc cttttgctca catgttcttt cctgcgttat cccctgattc 2340
tgtggataac cgtattaccg cctttgagtg agctgatacc gctcgccgca gccgaacgac 2400
cgagcgcagc gagtcagtga gcgaggaagc tatggtgcac tctcagtaca atctgctctg 2460
atgccgcata gttaagccag tatacactcc gctatcgcta cgtgactggg tcatggctgc 2520
gccccgacac ccgccaacac ccgctgacgc gccctgacgg gcttgtctgc tcccggcatc 2580
cgcttacaga caagctgtga ccgtctccgg gagctgcatg tgtcagaggt tttcaccgtc 2640
atcaccgaaa cgcgcgaggc agctgcggta aagctcatca gcgtggtcgt gcagcgattc 2700
acagatgtct gcctgttcat ccgcgtccag ctcgttgagt ttctccagaa gcgttaatgt 2760
ctggcttctg ataaagcggg ccatgttaag ggcggttttt tcctgtttgg tcactgatgc 2820
ctccgtgtaa gggggatttc tgttcatggg ggtaatgata ccgatgaaac gagagaggat 2880
gctcacgata cgggttactg atgatgaaca tgcccggtta ctggaacgtt gtgagggtaa 2940
acaactggcg gtatggatgc ggcgggacca gagaaaaatc actcagggtc aatgccagcc 3000
gaacgccagc aagacgtagc ccagcgcgtc ggccgccatg ccggcgataa tggcctgctt 3060
ctcgccgaaa cgtttggtgg cgggaccagt gacgaaggct tgagcgaggg cgtgcaagat 3120
tccgaatacc gcaagcgaca ggccgatcat cgtcgcgctc cagcgaaagc ggtcctcgcc 3180
gaaaatgacc cagagcgctg ccggcacctg tcctacgagt tgcatgataa agaagacagt 3240
cataagtgcg gcgacgatag tcatgccccg cgcccaccgg aaggagctga ctgggttgaa 3300
ggctctcaag ggcatcggtc gagatcccgg tgcctaatga gtgagctaac ttacattaat 3360
tgcgttgcgc tcactgcccg ctttccagtc gggaaacctg tcgtgccagc tgcattaatg 3420
aatcggccaa cgcgcgggga gaggcggttt gcgtattggg cgccagggtg gtttttcttt 3480
tcaccagtga gacgggcaac agctgattgc ccttcaccgc ctggccctga gagagttgca 3540
gcaagcggtc cacgctggtt tgccccagca ggcgaaaatc ctgtttgatg gtggttaacg 3600
gcgggatata acatgagctg tcttcggtat cgtcgtatcc cactaccgag atgtccgcac 3660
caacgcgcag cccggactcg gtaatggcgc gcattgcgcc cagcgccatc tgatcgttgg 3720
caaccagcat cgcagtggga acgatgccct cattcagcat ttgcatggtt tgttgaaaac 3780
cggacatggc actccagtcg ccttcccgtt ccgctatcgg ctgaatttga ttgcgagtga 3840
gatatttatg ccagccagcc agacgcagac gcgccgagac agaacttaat gggcccgcta 3900
acagcgcgat ttgctggtga cccaatgcga ccagatgctc cacgcccagt cgcgtaccgt 3960
cttcatggga gaaaataata ctgttgatgg gtgtctggtc agagacatca agaaataacg 4020
ccggaacatt agtgcaggca gcttccacag caatggcatc ctggtcatcc agcggatagt 4080
taatgatcag cccactgacg cgttgcgcga gaagattgtg caccgccgct ttacaggctt 4140
cgacgccgct tcgttctacc atcgacacca ccacgctggc acccagttga tcggcgcgag 4200
atttaatcgc cgcgacaatt tgcgacggcg cgtgcagggc cagactggag gtggcaacgc 4260
caatcagcaa cgactgtttg cccgccagtt gttgtgccac gcggttggga atgtaattca 4320
gctccgccat cgccgcttcc actttttccc gcgttttcgc agaaacgtgg ctggcctggt 4380
tcaccacgcg ggaaacggtc tgataagaga caccggcata ctctgcgaca tcgtataacg 4440
ttactggttt cacattcacc accctgaatt gactctcttc cgggcgctat catgccatac 4500
cgcgaaaggt tttgcgccat tcgatggtgt ccgggatctc gacgctctcc cttatgcgac 4560
tcctgcatta ggaagcagcc cagtagtagg ttgaggccgt tgagcaccgc cgccgcaagg 4620
aatggtgcat gccggcatgc cgccctttcg tcttcaagaa ttaattccca attccccagg 4680
catcaaataa aacgaaaggc tcagtcgaaa gactgggcct ttcgttttat ctgttgtttg 4740
tcggtgaacg ctctcctgag taggacaaat ccgccgggag cggatttgaa cgttgcgaag 4800
caacggcccg gagggtggcg ggcaggacgc ccgccataaa ctgccaggaa ttaattcccc 4860
aggcatcaaa taaaacgaaa ggctcagtcg aaagactggg cctttcgttt tatctgttgt 4920
ttgtcggtga acgctctcct gagtaggaca aatccgccgg gagcggattt gaacgttgcg 4980
aagcaacggc ccggagggtg gcgggcagga cgcccgccat aaactgccag gaattaattc 5040
cccaggcatc aaataaaacg aaaggctcag tcgaaagact gggcctttcg ttttatctgt 5100
tgtttgtcgg tgaacgctct cctgagtagg acaaatccgc cgggagcgga tttgaacgtt 5160
gcgaagcaac ggcccggagg gtggcgggca ggacgcccgc cataaactgc caggaattaa 5220
ttccccaggc atcaaataaa acgaaaggct cagtcgaaag actgggcctt tcgttttatc 5280
tgttgtttgt cggtgaacgc tctcctgagt aggacaaatc cgccgggagc ggatttgaac 5340
gttgcgaagc aacggcccgg agggtggcgg gcaggacgcc cgccataaac tgccaggaat 5400
taattcccca ggcatcaaat aaaacgaaag gctcagtcga aagactgggc ctttcgtttt 5460
atctgttgtt tgtcggtgaa cgctctcctg agtaggacaa atccgccggg agcggatttg 5520
aacgttgcga agcaacggcc cggagggtgg cgggcaggac gcccgccata aactgccagg 5580
aattggggat cggaattaat tcccggttta aaccggggat ctcgatcccg cgaaattaat 5640
acgactcact ataggggaat tgtgagcgga taacaattcc cctctagaaa taattttgtt 5700
taactttaag aaggagatat acatatggac tataaagacg acgacgacaa acccgggagt 5760
ggtgccccac cgaccgactt gcaaaagatg gtcatgagca acactaagcc tgttgagctc 5820
atccttgacg gtaagacggt ggccatctgc tgcgccaccg gagtgtttgg tactgcctac 5880
ctcgtgcctc gtcacctttt cgcagaaaag tacgacagga tcatgttgga cggcagggcc 5940
atgacagaca gtgactacag agtgtttgag tttgagatta aagtaaaagg acaggacatg 6000
ctctcagacg ctgcgctcat ggtgctccac cgtggcaacc gtgtgagaga catcacgaaa 6060
cactttcgtg atacagcaag aatgaagaaa ggtacccccg ttgtcggcgt gatcaacaac 6120
gccgacgttg ggagaccgat tttctccggt gaggccctca cctacaagga cattgtagtg 6180
tgcatggatg gagacaccat gccgggccta tttgcctaca gagccgctac caaggctggc 6240
tactgtggag gagccgttct tgccaaggac ggagctgaca catttatcgt cggcactcac 6300
tccgcaggag gcaatggagt cgggtactgc tcatgcgtat ctaggtccat gctcttgaag 6360
atgaaggcac acattgaccc cgaaccacac cacgagtagt cgacagacaa gcttaggtat 6420
ttattcggct cgaggttaat taagcggccg cattgatccg gctgctaaca aagcccgaaa 6480
ggaagctgag ttggctgctg ccaccgctga gcaataacta gcataacccc ttggggcctc 6540
taaacgggtc ttgaggggtt ttttgctgaa aggaggaact atatccggat 6590
<210> 411
<211> 627
<212> DNA
<213> Bovine rhinitis
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(627)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(627)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(627)
<223> Bovine_Rhinitis_A_Sd-1_KP236128_3C(C23P)
<400> 411
agt ggt gct cca cca aca gac atg cag caa cac gtt ctc agg aac gtg 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Met Gln Gln His Val Leu Arg Asn Val
1 5 10 15
cgc cca ata tca ctt gtt ccn gat gga aag gtt gtg tct atg tgc tgt 96
Arg Pro Ile Ser Leu Val Pro Asp Gly Lys Val Val Ser Met Cys Cys
20 25 30
ggc ttt ggg gtt ttt ggc aac tgt tac ctt gtg cca aac cat atg ttt 144
Gly Phe Gly Val Phe Gly Asn Cys Tyr Leu Val Pro Asn His Met Phe
35 40 45
gag gag act ttt gac aca att ttg ttg ggg gag act ccc ctg aag aag 192
Glu Glu Thr Phe Asp Thr Ile Leu Leu Gly Glu Thr Pro Leu Lys Lys
50 55 60
aag gat tac gag gtt att aac ctc gaa aca ggc gat ggt gtt tct gat 240
Lys Asp Tyr Glu Val Ile Asn Leu Glu Thr Gly Asp Gly Val Ser Asp
65 70 75 80
gca gca ctg ttg cat gtt ttt aaa ggc ccc aga gtt aag gac atg aca 288
Ala Ala Leu Leu His Val Phe Lys Gly Pro Arg Val Lys Asp Met Thr
85 90 95
atg cac ttc aga gat gaa gta cgc att ccc aag ggg aca act gtt gca 336
Met His Phe Arg Asp Glu Val Arg Ile Pro Lys Gly Thr Thr Val Ala
100 105 110
ggc tgt gtg aac agt cac gag ttt ggg cgc ttg gtt ttt act ggt acc 384
Gly Cys Val Asn Ser His Glu Phe Gly Arg Leu Val Phe Thr Gly Thr
115 120 125
gcc ctt aca ttt aaa gat gtg att gtg tgt tca gac ggt gat gag ctt 432
Ala Leu Thr Phe Lys Asp Val Ile Val Cys Ser Asp Gly Asp Glu Leu
130 135 140
ccg aac gtg ttt gcc tac aaa gct gcc aca caa cgg ggc tac tgt ggc 480
Pro Asn Val Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Gln Arg Gly Tyr Cys Gly
145 150 155 160
agt ccc gtt tta gtg aag aac agt gcg cac aca gtg gtg gtt ggg att 528
Ser Pro Val Leu Val Lys Asn Ser Ala His Thr Val Val Val Gly Ile
165 170 175
cac tct gca ggt ggg aac gga aac ggg tac gcg tcg tgt gtc acc cga 576
His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Asn Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr Arg
180 185 190
tct gtc ctg ttg aag gtt aag aga atg ctt gat cct gat gtc cat ctt 624
Ser Val Leu Leu Lys Val Lys Arg Met Leu Asp Pro Asp Val His Leu
195 200 205
gag 627
Glu
<210> 412
<211> 209
<212> PRT
<213> Bovine rhinitis
<400> 412
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Met Gln Gln His Val Leu Arg Asn Val
1 5 10 15
Arg Pro Ile Ser Leu Val Pro Asp Gly Lys Val Val Ser Met Cys Cys
20 25 30
Gly Phe Gly Val Phe Gly Asn Cys Tyr Leu Val Pro Asn His Met Phe
35 40 45
Glu Glu Thr Phe Asp Thr Ile Leu Leu Gly Glu Thr Pro Leu Lys Lys
50 55 60
Lys Asp Tyr Glu Val Ile Asn Leu Glu Thr Gly Asp Gly Val Ser Asp
65 70 75 80
Ala Ala Leu Leu His Val Phe Lys Gly Pro Arg Val Lys Asp Met Thr
85 90 95
Met His Phe Arg Asp Glu Val Arg Ile Pro Lys Gly Thr Thr Val Ala
100 105 110
Gly Cys Val Asn Ser His Glu Phe Gly Arg Leu Val Phe Thr Gly Thr
115 120 125
Ala Leu Thr Phe Lys Asp Val Ile Val Cys Ser Asp Gly Asp Glu Leu
130 135 140
Pro Asn Val Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Gln Arg Gly Tyr Cys Gly
145 150 155 160
Ser Pro Val Leu Val Lys Asn Ser Ala His Thr Val Val Val Gly Ile
165 170 175
His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Asn Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr Arg
180 185 190
Ser Val Leu Leu Lys Val Lys Arg Met Leu Asp Pro Asp Val His Leu
195 200 205
Glu
<210> 413
<211> 627
<212> DNA
<213> Bovine rhinitis
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(627)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(627)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(627)
<223> Bovine_Rhinitis_A_Sd-1_KP236128_3C(F120P)
<400> 413
agt ggt gct cca cca aca gac atg cag caa cac gtt ctc agg aac gtg 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Met Gln Gln His Val Leu Arg Asn Val
1 5 10 15
cgc cca ata tca ctt gtt tgt gat gga aag gtt gtg tct atg tgc tgt 96
Arg Pro Ile Ser Leu Val Cys Asp Gly Lys Val Val Ser Met Cys Cys
20 25 30
ggc ttt ggg gtt ttt ggc aac tgt tac ctt gtg cca aac cat atg ttt 144
Gly Phe Gly Val Phe Gly Asn Cys Tyr Leu Val Pro Asn His Met Phe
35 40 45
gag gag act ttt gac aca att ttg ttg ggg gag act ccc ctg aag aag 192
Glu Glu Thr Phe Asp Thr Ile Leu Leu Gly Glu Thr Pro Leu Lys Lys
50 55 60
aag gat tac gag gtt att aac ctc gaa aca ggc gat ggt gtt tct gat 240
Lys Asp Tyr Glu Val Ile Asn Leu Glu Thr Gly Asp Gly Val Ser Asp
65 70 75 80
gca gca ctg ttg cat gtt ttt aaa ggc ccc aga gtt aag gac atg aca 288
Ala Ala Leu Leu His Val Phe Lys Gly Pro Arg Val Lys Asp Met Thr
85 90 95
atg cac ttc aga gat gaa gta cgc att ccc aag ggg aca act gtt gca 336
Met His Phe Arg Asp Glu Val Arg Ile Pro Lys Gly Thr Thr Val Ala
100 105 110
ggc tgt gtg aac agt cac gag ccn ggg cgc ttg gtt ttt act ggt acc 384
Gly Cys Val Asn Ser His Glu Pro Gly Arg Leu Val Phe Thr Gly Thr
115 120 125
gcc ctt aca ttt aaa gat gtg att gtg tgt tca gac ggt gat gag ctt 432
Ala Leu Thr Phe Lys Asp Val Ile Val Cys Ser Asp Gly Asp Glu Leu
130 135 140
ccg aac gtg ttt gcc tac aaa gct gcc aca caa cgg ggc tac tgt ggc 480
Pro Asn Val Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Gln Arg Gly Tyr Cys Gly
145 150 155 160
agt ccc gtt tta gtg aag aac agt gcg cac aca gtg gtg gtt ggg att 528
Ser Pro Val Leu Val Lys Asn Ser Ala His Thr Val Val Val Gly Ile
165 170 175
cac tct gca ggt ggg aac gga aac ggg tac gcg tcg tgt gtc acc cga 576
His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Asn Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr Arg
180 185 190
tct gtc ctg ttg aag gtt aag aga atg ctt gat cct gat gtc cat ctt 624
Ser Val Leu Leu Lys Val Lys Arg Met Leu Asp Pro Asp Val His Leu
195 200 205
gag 627
Glu
<210> 414
<211> 209
<212> PRT
<213> Bovine rhinitis
<400> 414
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Met Gln Gln His Val Leu Arg Asn Val
1 5 10 15
Arg Pro Ile Ser Leu Val Cys Asp Gly Lys Val Val Ser Met Cys Cys
20 25 30
Gly Phe Gly Val Phe Gly Asn Cys Tyr Leu Val Pro Asn His Met Phe
35 40 45
Glu Glu Thr Phe Asp Thr Ile Leu Leu Gly Glu Thr Pro Leu Lys Lys
50 55 60
Lys Asp Tyr Glu Val Ile Asn Leu Glu Thr Gly Asp Gly Val Ser Asp
65 70 75 80
Ala Ala Leu Leu His Val Phe Lys Gly Pro Arg Val Lys Asp Met Thr
85 90 95
Met His Phe Arg Asp Glu Val Arg Ile Pro Lys Gly Thr Thr Val Ala
100 105 110
Gly Cys Val Asn Ser His Glu Pro Gly Arg Leu Val Phe Thr Gly Thr
115 120 125
Ala Leu Thr Phe Lys Asp Val Ile Val Cys Ser Asp Gly Asp Glu Leu
130 135 140
Pro Asn Val Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Gln Arg Gly Tyr Cys Gly
145 150 155 160
Ser Pro Val Leu Val Lys Asn Ser Ala His Thr Val Val Val Gly Ile
165 170 175
His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Asn Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr Arg
180 185 190
Ser Val Leu Leu Lys Val Lys Arg Met Leu Asp Pro Asp Val His Leu
195 200 205
Glu
<210> 415
<211> 627
<212> DNA
<213> Bovine rhinitis
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(627)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(627)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(627)
<223> Bovine_Rhinitis_A_Sd-1_KP236128_3C(L123P)
<400> 415
agt ggt gct cca cca aca gac atg cag caa cac gtt ctc agg aac gtg 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Met Gln Gln His Val Leu Arg Asn Val
1 5 10 15
cgc cca ata tca ctt gtt tgt gat gga aag gtt gtg tct atg tgc tgt 96
Arg Pro Ile Ser Leu Val Cys Asp Gly Lys Val Val Ser Met Cys Cys
20 25 30
ggc ttt ggg gtt ttt ggc aac tgt tac ctt gtg cca aac cat atg ttt 144
Gly Phe Gly Val Phe Gly Asn Cys Tyr Leu Val Pro Asn His Met Phe
35 40 45
gag gag act ttt gac aca att ttg ttg ggg gag act ccc ctg aag aag 192
Glu Glu Thr Phe Asp Thr Ile Leu Leu Gly Glu Thr Pro Leu Lys Lys
50 55 60
aag gat tac gag gtt att aac ctc gaa aca ggc gat ggt gtt tct gat 240
Lys Asp Tyr Glu Val Ile Asn Leu Glu Thr Gly Asp Gly Val Ser Asp
65 70 75 80
gca gca ctg ttg cat gtt ttt aaa ggc ccc aga gtt aag gac atg aca 288
Ala Ala Leu Leu His Val Phe Lys Gly Pro Arg Val Lys Asp Met Thr
85 90 95
atg cac ttc aga gat gaa gta cgc att ccc aag ggg aca act gtt gca 336
Met His Phe Arg Asp Glu Val Arg Ile Pro Lys Gly Thr Thr Val Ala
100 105 110
ggc tgt gtg aac agt cac gag ttt ggg cgc ccn gtt ttt act ggt acc 384
Gly Cys Val Asn Ser His Glu Phe Gly Arg Pro Val Phe Thr Gly Thr
115 120 125
gcc ctt aca ttt aaa gat gtg att gtg tgt tca gac ggt gat gag ctt 432
Ala Leu Thr Phe Lys Asp Val Ile Val Cys Ser Asp Gly Asp Glu Leu
130 135 140
ccg aac gtg ttt gcc tac aaa gct gcc aca caa cgg ggc tac tgt ggc 480
Pro Asn Val Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Gln Arg Gly Tyr Cys Gly
145 150 155 160
agt ccc gtt tta gtg aag aac agt gcg cac aca gtg gtg gtt ggg att 528
Ser Pro Val Leu Val Lys Asn Ser Ala His Thr Val Val Val Gly Ile
165 170 175
cac tct gca ggt ggg aac gga aac ggg tac gcg tcg tgt gtc acc cga 576
His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Asn Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr Arg
180 185 190
tct gtc ctg ttg aag gtt aag aga atg ctt gat cct gat gtc cat ctt 624
Ser Val Leu Leu Lys Val Lys Arg Met Leu Asp Pro Asp Val His Leu
195 200 205
gag 627
Glu
<210> 416
<211> 209
<212> PRT
<213> Bovine rhinitis
<400> 416
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Met Gln Gln His Val Leu Arg Asn Val
1 5 10 15
Arg Pro Ile Ser Leu Val Cys Asp Gly Lys Val Val Ser Met Cys Cys
20 25 30
Gly Phe Gly Val Phe Gly Asn Cys Tyr Leu Val Pro Asn His Met Phe
35 40 45
Glu Glu Thr Phe Asp Thr Ile Leu Leu Gly Glu Thr Pro Leu Lys Lys
50 55 60
Lys Asp Tyr Glu Val Ile Asn Leu Glu Thr Gly Asp Gly Val Ser Asp
65 70 75 80
Ala Ala Leu Leu His Val Phe Lys Gly Pro Arg Val Lys Asp Met Thr
85 90 95
Met His Phe Arg Asp Glu Val Arg Ile Pro Lys Gly Thr Thr Val Ala
100 105 110
Gly Cys Val Asn Ser His Glu Phe Gly Arg Pro Val Phe Thr Gly Thr
115 120 125
Ala Leu Thr Phe Lys Asp Val Ile Val Cys Ser Asp Gly Asp Glu Leu
130 135 140
Pro Asn Val Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Gln Arg Gly Tyr Cys Gly
145 150 155 160
Ser Pro Val Leu Val Lys Asn Ser Ala His Thr Val Val Val Gly Ile
165 170 175
His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Asn Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr Arg
180 185 190
Ser Val Leu Leu Lys Val Lys Arg Met Leu Asp Pro Asp Val His Leu
195 200 205
Glu
<210> 417
<211> 627
<212> DNA
<213> Bovine rhinitis
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(627)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(627)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(627)
<223> Bovine_Rhinitis_A_Sd-1_KP236128_3C(T96P)
<400> 417
agt ggt gct cca cca aca gac atg cag caa cac gtt ctc agg aac gtg 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Met Gln Gln His Val Leu Arg Asn Val
1 5 10 15
cgc cca ata tca ctt gtt tgt gat gga aag gtt gtg tct atg tgc tgt 96
Arg Pro Ile Ser Leu Val Cys Asp Gly Lys Val Val Ser Met Cys Cys
20 25 30
ggc ttt ggg gtt ttt ggc aac tgt tac ctt gtg cca aac cat atg ttt 144
Gly Phe Gly Val Phe Gly Asn Cys Tyr Leu Val Pro Asn His Met Phe
35 40 45
gag gag act ttt gac aca att ttg ttg ggg gag act ccc ctg aag aag 192
Glu Glu Thr Phe Asp Thr Ile Leu Leu Gly Glu Thr Pro Leu Lys Lys
50 55 60
aag gat tac gag gtt att aac ctc gaa aca ggc gat ggt gtt tct gat 240
Lys Asp Tyr Glu Val Ile Asn Leu Glu Thr Gly Asp Gly Val Ser Asp
65 70 75 80
gca gca ctg ttg cat gtt ttt aaa ggc ccc aga gtt aag gac atg ccn 288
Ala Ala Leu Leu His Val Phe Lys Gly Pro Arg Val Lys Asp Met Pro
85 90 95
atg cac ttc aga gat gaa gta cgc att ccc aag ggg aca act gtt gca 336
Met His Phe Arg Asp Glu Val Arg Ile Pro Lys Gly Thr Thr Val Ala
100 105 110
ggc tgt gtg aac agt cac gag ttt ggg cgc ttg gtt ttt act ggt acc 384
Gly Cys Val Asn Ser His Glu Phe Gly Arg Leu Val Phe Thr Gly Thr
115 120 125
gcc ctt aca ttt aaa gat gtg att gtg tgt tca gac ggt gat gag ctt 432
Ala Leu Thr Phe Lys Asp Val Ile Val Cys Ser Asp Gly Asp Glu Leu
130 135 140
ccg aac gtg ttt gcc tac aaa gct gcc aca caa cgg ggc tac tgt ggc 480
Pro Asn Val Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Gln Arg Gly Tyr Cys Gly
145 150 155 160
agt ccc gtt tta gtg aag aac agt gcg cac aca gtg gtg gtt ggg att 528
Ser Pro Val Leu Val Lys Asn Ser Ala His Thr Val Val Val Gly Ile
165 170 175
cac tct gca ggt ggg aac gga aac ggg tac gcg tcg tgt gtc acc cga 576
His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Asn Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr Arg
180 185 190
tct gtc ctg ttg aag gtt aag aga atg ctt gat cct gat gtc cat ctt 624
Ser Val Leu Leu Lys Val Lys Arg Met Leu Asp Pro Asp Val His Leu
195 200 205
gag 627
Glu
<210> 418
<211> 209
<212> PRT
<213> Bovine rhinitis
<400> 418
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Met Gln Gln His Val Leu Arg Asn Val
1 5 10 15
Arg Pro Ile Ser Leu Val Cys Asp Gly Lys Val Val Ser Met Cys Cys
20 25 30
Gly Phe Gly Val Phe Gly Asn Cys Tyr Leu Val Pro Asn His Met Phe
35 40 45
Glu Glu Thr Phe Asp Thr Ile Leu Leu Gly Glu Thr Pro Leu Lys Lys
50 55 60
Lys Asp Tyr Glu Val Ile Asn Leu Glu Thr Gly Asp Gly Val Ser Asp
65 70 75 80
Ala Ala Leu Leu His Val Phe Lys Gly Pro Arg Val Lys Asp Met Pro
85 90 95
Met His Phe Arg Asp Glu Val Arg Ile Pro Lys Gly Thr Thr Val Ala
100 105 110
Gly Cys Val Asn Ser His Glu Phe Gly Arg Leu Val Phe Thr Gly Thr
115 120 125
Ala Leu Thr Phe Lys Asp Val Ile Val Cys Ser Asp Gly Asp Glu Leu
130 135 140
Pro Asn Val Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Gln Arg Gly Tyr Cys Gly
145 150 155 160
Ser Pro Val Leu Val Lys Asn Ser Ala His Thr Val Val Val Gly Ile
165 170 175
His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Asn Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr Arg
180 185 190
Ser Val Leu Leu Lys Val Lys Arg Met Leu Asp Pro Asp Val His Leu
195 200 205
Glu
<210> 419
<211> 627
<212> DNA
<213> Bovine rhinitis
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(627)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(627)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(627)
<223> Bovine_Rhinitis_A_Sd-1_KP236128_3C(V22P)
<400> 419
agt ggt gct cca cca aca gac atg cag caa cac gtt ctc agg aac gtg 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Met Gln Gln His Val Leu Arg Asn Val
1 5 10 15
cgc cca ata tca ctt ccn tgt gat gga aag gtt gtg tct atg tgc tgt 96
Arg Pro Ile Ser Leu Pro Cys Asp Gly Lys Val Val Ser Met Cys Cys
20 25 30
ggc ttt ggg gtt ttt ggc aac tgt tac ctt gtg cca aac cat atg ttt 144
Gly Phe Gly Val Phe Gly Asn Cys Tyr Leu Val Pro Asn His Met Phe
35 40 45
gag gag act ttt gac aca att ttg ttg ggg gag act ccc ctg aag aag 192
Glu Glu Thr Phe Asp Thr Ile Leu Leu Gly Glu Thr Pro Leu Lys Lys
50 55 60
aag gat tac gag gtt att aac ctc gaa aca ggc gat ggt gtt tct gat 240
Lys Asp Tyr Glu Val Ile Asn Leu Glu Thr Gly Asp Gly Val Ser Asp
65 70 75 80
gca gca ctg ttg cat gtt ttt aaa ggc ccc aga gtt aag gac atg aca 288
Ala Ala Leu Leu His Val Phe Lys Gly Pro Arg Val Lys Asp Met Thr
85 90 95
atg cac ttc aga gat gaa gta cgc att ccc aag ggg aca act gtt gca 336
Met His Phe Arg Asp Glu Val Arg Ile Pro Lys Gly Thr Thr Val Ala
100 105 110
ggc tgt gtg aac agt cac gag ttt ggg cgc ttg gtt ttt act ggt acc 384
Gly Cys Val Asn Ser His Glu Phe Gly Arg Leu Val Phe Thr Gly Thr
115 120 125
gcc ctt aca ttt aaa gat gtg att gtg tgt tca gac ggt gat gag ctt 432
Ala Leu Thr Phe Lys Asp Val Ile Val Cys Ser Asp Gly Asp Glu Leu
130 135 140
ccg aac gtg ttt gcc tac aaa gct gcc aca caa cgg ggc tac tgt ggc 480
Pro Asn Val Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Gln Arg Gly Tyr Cys Gly
145 150 155 160
agt ccc gtt tta gtg aag aac agt gcg cac aca gtg gtg gtt ggg att 528
Ser Pro Val Leu Val Lys Asn Ser Ala His Thr Val Val Val Gly Ile
165 170 175
cac tct gca ggt ggg aac gga aac ggg tac gcg tcg tgt gtc acc cga 576
His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Asn Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr Arg
180 185 190
tct gtc ctg ttg aag gtt aag aga atg ctt gat cct gat gtc cat ctt 624
Ser Val Leu Leu Lys Val Lys Arg Met Leu Asp Pro Asp Val His Leu
195 200 205
gag 627
Glu
<210> 420
<211> 209
<212> PRT
<213> Bovine rhinitis
<400> 420
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Met Gln Gln His Val Leu Arg Asn Val
1 5 10 15
Arg Pro Ile Ser Leu Pro Cys Asp Gly Lys Val Val Ser Met Cys Cys
20 25 30
Gly Phe Gly Val Phe Gly Asn Cys Tyr Leu Val Pro Asn His Met Phe
35 40 45
Glu Glu Thr Phe Asp Thr Ile Leu Leu Gly Glu Thr Pro Leu Lys Lys
50 55 60
Lys Asp Tyr Glu Val Ile Asn Leu Glu Thr Gly Asp Gly Val Ser Asp
65 70 75 80
Ala Ala Leu Leu His Val Phe Lys Gly Pro Arg Val Lys Asp Met Thr
85 90 95
Met His Phe Arg Asp Glu Val Arg Ile Pro Lys Gly Thr Thr Val Ala
100 105 110
Gly Cys Val Asn Ser His Glu Phe Gly Arg Leu Val Phe Thr Gly Thr
115 120 125
Ala Leu Thr Phe Lys Asp Val Ile Val Cys Ser Asp Gly Asp Glu Leu
130 135 140
Pro Asn Val Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Gln Arg Gly Tyr Cys Gly
145 150 155 160
Ser Pro Val Leu Val Lys Asn Ser Ala His Thr Val Val Val Gly Ile
165 170 175
His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Asn Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr Arg
180 185 190
Ser Val Leu Leu Lys Val Lys Arg Met Leu Asp Pro Asp Val His Leu
195 200 205
Glu
<210> 421
<211> 627
<212> DNA
<213> Bovine rhinitis
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(627)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(627)
<223> Bovine_Rhinitis_A_Sd-1_KP236128_3C(wt)
<400> 421
agt ggt gct cca cca aca gac atg cag caa cac gtt ctc agg aac gtg 48
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Met Gln Gln His Val Leu Arg Asn Val
1 5 10 15
cgc cca ata tca ctt gtt tgt gat gga aag gtt gtg tct atg tgc tgt 96
Arg Pro Ile Ser Leu Val Cys Asp Gly Lys Val Val Ser Met Cys Cys
20 25 30
ggc ttt ggg gtt ttt ggc aac tgt tac ctt gtg cca aac cat atg ttt 144
Gly Phe Gly Val Phe Gly Asn Cys Tyr Leu Val Pro Asn His Met Phe
35 40 45
gag gag act ttt gac aca att ttg ttg ggg gag act ccc ctg aag aag 192
Glu Glu Thr Phe Asp Thr Ile Leu Leu Gly Glu Thr Pro Leu Lys Lys
50 55 60
aag gat tac gag gtt att aac ctc gaa aca ggc gat ggt gtt tct gat 240
Lys Asp Tyr Glu Val Ile Asn Leu Glu Thr Gly Asp Gly Val Ser Asp
65 70 75 80
gca gca ctg ttg cat gtt ttt aaa ggc ccc aga gtt aag gac atg aca 288
Ala Ala Leu Leu His Val Phe Lys Gly Pro Arg Val Lys Asp Met Thr
85 90 95
atg cac ttc aga gat gaa gta cgc att ccc aag ggg aca act gtt gca 336
Met His Phe Arg Asp Glu Val Arg Ile Pro Lys Gly Thr Thr Val Ala
100 105 110
ggc tgt gtg aac agt cac gag ttt ggg cgc ttg gtt ttt act ggt acc 384
Gly Cys Val Asn Ser His Glu Phe Gly Arg Leu Val Phe Thr Gly Thr
115 120 125
gcc ctt aca ttt aaa gat gtg att gtg tgt tca gac ggt gat gag ctt 432
Ala Leu Thr Phe Lys Asp Val Ile Val Cys Ser Asp Gly Asp Glu Leu
130 135 140
ccg aac gtg ttt gcc tac aaa gct gcc aca caa cgg ggc tac tgt ggc 480
Pro Asn Val Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Gln Arg Gly Tyr Cys Gly
145 150 155 160
agt ccc gtt tta gtg aag aac agt gcg cac aca gtg gtg gtt ggg att 528
Ser Pro Val Leu Val Lys Asn Ser Ala His Thr Val Val Val Gly Ile
165 170 175
cac tct gca ggt ggg aac gga aac ggg tac gcg tcg tgt gtc acc cga 576
His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Asn Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr Arg
180 185 190
tct gtc ctg ttg aag gtt aag aga atg ctt gat cct gat gtc cat ctt 624
Ser Val Leu Leu Lys Val Lys Arg Met Leu Asp Pro Asp Val His Leu
195 200 205
gag 627
Glu
<210> 422
<211> 209
<212> PRT
<213> Bovine rhinitis
<400> 422
Ser Gly Ala Pro Pro Thr Asp Met Gln Gln His Val Leu Arg Asn Val
1 5 10 15
Arg Pro Ile Ser Leu Val Cys Asp Gly Lys Val Val Ser Met Cys Cys
20 25 30
Gly Phe Gly Val Phe Gly Asn Cys Tyr Leu Val Pro Asn His Met Phe
35 40 45
Glu Glu Thr Phe Asp Thr Ile Leu Leu Gly Glu Thr Pro Leu Lys Lys
50 55 60
Lys Asp Tyr Glu Val Ile Asn Leu Glu Thr Gly Asp Gly Val Ser Asp
65 70 75 80
Ala Ala Leu Leu His Val Phe Lys Gly Pro Arg Val Lys Asp Met Thr
85 90 95
Met His Phe Arg Asp Glu Val Arg Ile Pro Lys Gly Thr Thr Val Ala
100 105 110
Gly Cys Val Asn Ser His Glu Phe Gly Arg Leu Val Phe Thr Gly Thr
115 120 125
Ala Leu Thr Phe Lys Asp Val Ile Val Cys Ser Asp Gly Asp Glu Leu
130 135 140
Pro Asn Val Phe Ala Tyr Lys Ala Ala Thr Gln Arg Gly Tyr Cys Gly
145 150 155 160
Ser Pro Val Leu Val Lys Asn Ser Ala His Thr Val Val Val Gly Ile
165 170 175
His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Asn Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr Arg
180 185 190
Ser Val Leu Leu Lys Val Lys Arg Met Leu Asp Pro Asp Val His Leu
195 200 205
Glu
<210> 423
<211> 624
<212> DNA
<213> Bovine rhinitis
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(624)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(624)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(624)
<223> Bovine_Rhinitus_B_3C(L124P)
<400> 423
agt ggg aac cct cca act gac atg cag ttg gtg gta ctc aag aac aca 48
Ser Gly Asn Pro Pro Thr Asp Met Gln Leu Val Val Leu Lys Asn Thr
1 5 10 15
caa cca att tca cta gtt aga gat gga caa att gtc gcc act tgt tgt 96
Gln Pro Ile Ser Leu Val Arg Asp Gly Gln Ile Val Ala Thr Cys Cys
20 25 30
gct ctt ggc gtt ttt gga acc acc tat tta gtt ccc tac cac ctc ttt 144
Ala Leu Gly Val Phe Gly Thr Thr Tyr Leu Val Pro Tyr His Leu Phe
35 40 45
gaa gaa agt ttt gac acc ctc att ata gga gac aga cat ctg aaa gaa 192
Glu Glu Ser Phe Asp Thr Leu Ile Ile Gly Asp Arg His Leu Lys Glu
50 55 60
caa gac tac aaa ctt gac act ttt gaa ctc aga gac ggg aaa atc agc 240
Gln Asp Tyr Lys Leu Asp Thr Phe Glu Leu Arg Asp Gly Lys Ile Ser
65 70 75 80
gat gtt gct gcc ctc acc tta aac aaa gga gcc cgt gtg cgt gac att 288
Asp Val Ala Ala Leu Thr Leu Asn Lys Gly Ala Arg Val Arg Asp Ile
85 90 95
acc tca cac ttt cga gac gag gtc aag gtc act aag aat tca cca gtt 336
Thr Ser His Phe Arg Asp Glu Val Lys Val Thr Lys Asn Ser Pro Val
100 105 110
gtc ggt tgt gtc aag aac aca acg gtc ggt caa ccn gta ttt aac ggg 384
Val Gly Cys Val Lys Asn Thr Thr Val Gly Gln Pro Val Phe Asn Gly
115 120 125
aca gct gct ggt ttt aaa gac cat atc atc tgc tct gat ggt gac act 432
Thr Ala Ala Gly Phe Lys Asp His Ile Ile Cys Ser Asp Gly Asp Thr
130 135 140
ctg cct aat atg ttc gtt tac act gcc aac aca cag tac ggg tat tgc 480
Leu Pro Asn Met Phe Val Tyr Thr Ala Asn Thr Gln Tyr Gly Tyr Cys
145 150 155 160
gga agc ggc ata ctc gtc aaa gat ggt tct cac aca gtc atc ata ggc 528
Gly Ser Gly Ile Leu Val Lys Asp Gly Ser His Thr Val Ile Ile Gly
165 170 175
atc cat agt gca gga ggt aac gga aaa ggt tac gct agt tgt gtc act 576
Ile His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Lys Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr
180 185 190
cgt tcc gca ctc ctc gca ctg agg ggc aga gaa agg ccc gag ctc gaa 624
Arg Ser Ala Leu Leu Ala Leu Arg Gly Arg Glu Arg Pro Glu Leu Glu
195 200 205
<210> 424
<211> 208
<212> PRT
<213> Bovine rhinitis
<400> 424
Ser Gly Asn Pro Pro Thr Asp Met Gln Leu Val Val Leu Lys Asn Thr
1 5 10 15
Gln Pro Ile Ser Leu Val Arg Asp Gly Gln Ile Val Ala Thr Cys Cys
20 25 30
Ala Leu Gly Val Phe Gly Thr Thr Tyr Leu Val Pro Tyr His Leu Phe
35 40 45
Glu Glu Ser Phe Asp Thr Leu Ile Ile Gly Asp Arg His Leu Lys Glu
50 55 60
Gln Asp Tyr Lys Leu Asp Thr Phe Glu Leu Arg Asp Gly Lys Ile Ser
65 70 75 80
Asp Val Ala Ala Leu Thr Leu Asn Lys Gly Ala Arg Val Arg Asp Ile
85 90 95
Thr Ser His Phe Arg Asp Glu Val Lys Val Thr Lys Asn Ser Pro Val
100 105 110
Val Gly Cys Val Lys Asn Thr Thr Val Gly Gln Pro Val Phe Asn Gly
115 120 125
Thr Ala Ala Gly Phe Lys Asp His Ile Ile Cys Ser Asp Gly Asp Thr
130 135 140
Leu Pro Asn Met Phe Val Tyr Thr Ala Asn Thr Gln Tyr Gly Tyr Cys
145 150 155 160
Gly Ser Gly Ile Leu Val Lys Asp Gly Ser His Thr Val Ile Ile Gly
165 170 175
Ile His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Lys Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr
180 185 190
Arg Ser Ala Leu Leu Ala Leu Arg Gly Arg Glu Arg Pro Glu Leu Glu
195 200 205
<210> 425
<211> 624
<212> DNA
<213> Bovine rhinitis
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(624)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(624)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(624)
<223> Bovine_Rhinitus_B_3C(R23P)
<400> 425
agt ggg aac cct cca act gac atg cag ttg gtg gta ctc aag aac aca 48
Ser Gly Asn Pro Pro Thr Asp Met Gln Leu Val Val Leu Lys Asn Thr
1 5 10 15
caa cca att tca cta gtt ccn gat gga caa att gtc gcc act tgt tgt 96
Gln Pro Ile Ser Leu Val Pro Asp Gly Gln Ile Val Ala Thr Cys Cys
20 25 30
gct ctt ggc gtt ttt gga acc acc tat tta gtt ccc tac cac ctc ttt 144
Ala Leu Gly Val Phe Gly Thr Thr Tyr Leu Val Pro Tyr His Leu Phe
35 40 45
gaa gaa agt ttt gac acc ctc att ata gga gac aga cat ctg aaa gaa 192
Glu Glu Ser Phe Asp Thr Leu Ile Ile Gly Asp Arg His Leu Lys Glu
50 55 60
caa gac tac aaa ctt gac act ttt gaa ctc aga gac ggg aaa atc agc 240
Gln Asp Tyr Lys Leu Asp Thr Phe Glu Leu Arg Asp Gly Lys Ile Ser
65 70 75 80
gat gtt gct gcc ctc acc tta aac aaa gga gcc cgt gtg cgt gac att 288
Asp Val Ala Ala Leu Thr Leu Asn Lys Gly Ala Arg Val Arg Asp Ile
85 90 95
acc tca cac ttt cga gac gag gtc aag gtc act aag aat tca cca gtt 336
Thr Ser His Phe Arg Asp Glu Val Lys Val Thr Lys Asn Ser Pro Val
100 105 110
gtc ggt tgt gtc aag aac aca acg gtc ggt caa ctg gta ttt aac ggg 384
Val Gly Cys Val Lys Asn Thr Thr Val Gly Gln Leu Val Phe Asn Gly
115 120 125
aca gct gct ggt ttt aaa gac cat atc atc tgc tct gat ggt gac act 432
Thr Ala Ala Gly Phe Lys Asp His Ile Ile Cys Ser Asp Gly Asp Thr
130 135 140
ctg cct aat atg ttc gtt tac act gcc aac aca cag tac ggg tat tgc 480
Leu Pro Asn Met Phe Val Tyr Thr Ala Asn Thr Gln Tyr Gly Tyr Cys
145 150 155 160
gga agc ggc ata ctc gtc aaa gat ggt tct cac aca gtc atc ata ggc 528
Gly Ser Gly Ile Leu Val Lys Asp Gly Ser His Thr Val Ile Ile Gly
165 170 175
atc cat agt gca gga ggt aac gga aaa ggt tac gct agt tgt gtc act 576
Ile His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Lys Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr
180 185 190
cgt tcc gca ctc ctc gca ctg agg ggc aga gaa agg ccc gag ctc gaa 624
Arg Ser Ala Leu Leu Ala Leu Arg Gly Arg Glu Arg Pro Glu Leu Glu
195 200 205
<210> 426
<211> 208
<212> PRT
<213> Bovine rhinitis
<400> 426
Ser Gly Asn Pro Pro Thr Asp Met Gln Leu Val Val Leu Lys Asn Thr
1 5 10 15
Gln Pro Ile Ser Leu Val Pro Asp Gly Gln Ile Val Ala Thr Cys Cys
20 25 30
Ala Leu Gly Val Phe Gly Thr Thr Tyr Leu Val Pro Tyr His Leu Phe
35 40 45
Glu Glu Ser Phe Asp Thr Leu Ile Ile Gly Asp Arg His Leu Lys Glu
50 55 60
Gln Asp Tyr Lys Leu Asp Thr Phe Glu Leu Arg Asp Gly Lys Ile Ser
65 70 75 80
Asp Val Ala Ala Leu Thr Leu Asn Lys Gly Ala Arg Val Arg Asp Ile
85 90 95
Thr Ser His Phe Arg Asp Glu Val Lys Val Thr Lys Asn Ser Pro Val
100 105 110
Val Gly Cys Val Lys Asn Thr Thr Val Gly Gln Leu Val Phe Asn Gly
115 120 125
Thr Ala Ala Gly Phe Lys Asp His Ile Ile Cys Ser Asp Gly Asp Thr
130 135 140
Leu Pro Asn Met Phe Val Tyr Thr Ala Asn Thr Gln Tyr Gly Tyr Cys
145 150 155 160
Gly Ser Gly Ile Leu Val Lys Asp Gly Ser His Thr Val Ile Ile Gly
165 170 175
Ile His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Lys Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr
180 185 190
Arg Ser Ala Leu Leu Ala Leu Arg Gly Arg Glu Arg Pro Glu Leu Glu
195 200 205
<210> 427
<211> 624
<212> DNA
<213> Bovine rhinitis
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(624)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(624)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(624)
<223> Bovine_Rhinitus_B_3C(T97P)
<400> 427
agt ggg aac cct cca act gac atg cag ttg gtg gta ctc aag aac aca 48
Ser Gly Asn Pro Pro Thr Asp Met Gln Leu Val Val Leu Lys Asn Thr
1 5 10 15
caa cca att tca cta gtt aga gat gga caa att gtc gcc act tgt tgt 96
Gln Pro Ile Ser Leu Val Arg Asp Gly Gln Ile Val Ala Thr Cys Cys
20 25 30
gct ctt ggc gtt ttt gga acc acc tat tta gtt ccc tac cac ctc ttt 144
Ala Leu Gly Val Phe Gly Thr Thr Tyr Leu Val Pro Tyr His Leu Phe
35 40 45
gaa gaa agt ttt gac acc ctc att ata gga gac aga cat ctg aaa gaa 192
Glu Glu Ser Phe Asp Thr Leu Ile Ile Gly Asp Arg His Leu Lys Glu
50 55 60
caa gac tac aaa ctt gac act ttt gaa ctc aga gac ggg aaa atc agc 240
Gln Asp Tyr Lys Leu Asp Thr Phe Glu Leu Arg Asp Gly Lys Ile Ser
65 70 75 80
gat gtt gct gcc ctc acc tta aac aaa gga gcc cgt gtg cgt gac att 288
Asp Val Ala Ala Leu Thr Leu Asn Lys Gly Ala Arg Val Arg Asp Ile
85 90 95
ccn tca cac ttt cga gac gag gtc aag gtc act aag aat tca cca gtt 336
Pro Ser His Phe Arg Asp Glu Val Lys Val Thr Lys Asn Ser Pro Val
100 105 110
gtc ggt tgt gtc aag aac aca acg gtc ggt caa ctg gta ttt aac ggg 384
Val Gly Cys Val Lys Asn Thr Thr Val Gly Gln Leu Val Phe Asn Gly
115 120 125
aca gct gct ggt ttt aaa gac cat atc atc tgc tct gat ggt gac act 432
Thr Ala Ala Gly Phe Lys Asp His Ile Ile Cys Ser Asp Gly Asp Thr
130 135 140
ctg cct aat atg ttc gtt tac act gcc aac aca cag tac ggg tat tgc 480
Leu Pro Asn Met Phe Val Tyr Thr Ala Asn Thr Gln Tyr Gly Tyr Cys
145 150 155 160
gga agc ggc ata ctc gtc aaa gat ggt tct cac aca gtc atc ata ggc 528
Gly Ser Gly Ile Leu Val Lys Asp Gly Ser His Thr Val Ile Ile Gly
165 170 175
atc cat agt gca gga ggt aac gga aaa ggt tac gct agt tgt gtc act 576
Ile His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Lys Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr
180 185 190
cgt tcc gca ctc ctc gca ctg agg ggc aga gaa agg ccc gag ctc gaa 624
Arg Ser Ala Leu Leu Ala Leu Arg Gly Arg Glu Arg Pro Glu Leu Glu
195 200 205
<210> 428
<211> 208
<212> PRT
<213> Bovine rhinitis
<400> 428
Ser Gly Asn Pro Pro Thr Asp Met Gln Leu Val Val Leu Lys Asn Thr
1 5 10 15
Gln Pro Ile Ser Leu Val Arg Asp Gly Gln Ile Val Ala Thr Cys Cys
20 25 30
Ala Leu Gly Val Phe Gly Thr Thr Tyr Leu Val Pro Tyr His Leu Phe
35 40 45
Glu Glu Ser Phe Asp Thr Leu Ile Ile Gly Asp Arg His Leu Lys Glu
50 55 60
Gln Asp Tyr Lys Leu Asp Thr Phe Glu Leu Arg Asp Gly Lys Ile Ser
65 70 75 80
Asp Val Ala Ala Leu Thr Leu Asn Lys Gly Ala Arg Val Arg Asp Ile
85 90 95
Pro Ser His Phe Arg Asp Glu Val Lys Val Thr Lys Asn Ser Pro Val
100 105 110
Val Gly Cys Val Lys Asn Thr Thr Val Gly Gln Leu Val Phe Asn Gly
115 120 125
Thr Ala Ala Gly Phe Lys Asp His Ile Ile Cys Ser Asp Gly Asp Thr
130 135 140
Leu Pro Asn Met Phe Val Tyr Thr Ala Asn Thr Gln Tyr Gly Tyr Cys
145 150 155 160
Gly Ser Gly Ile Leu Val Lys Asp Gly Ser His Thr Val Ile Ile Gly
165 170 175
Ile His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Lys Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr
180 185 190
Arg Ser Ala Leu Leu Ala Leu Arg Gly Arg Glu Arg Pro Glu Leu Glu
195 200 205
<210> 429
<211> 624
<212> DNA
<213> Bovine rhinitis
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(624)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(624)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(624)
<223> Bovine_Rhinitus_B_3C(V121P)
<400> 429
agt ggg aac cct cca act gac atg cag ttg gtg gta ctc aag aac aca 48
Ser Gly Asn Pro Pro Thr Asp Met Gln Leu Val Val Leu Lys Asn Thr
1 5 10 15
caa cca att tca cta gtt aga gat gga caa att gtc gcc act tgt tgt 96
Gln Pro Ile Ser Leu Val Arg Asp Gly Gln Ile Val Ala Thr Cys Cys
20 25 30
gct ctt ggc gtt ttt gga acc acc tat tta gtt ccc tac cac ctc ttt 144
Ala Leu Gly Val Phe Gly Thr Thr Tyr Leu Val Pro Tyr His Leu Phe
35 40 45
gaa gaa agt ttt gac acc ctc att ata gga gac aga cat ctg aaa gaa 192
Glu Glu Ser Phe Asp Thr Leu Ile Ile Gly Asp Arg His Leu Lys Glu
50 55 60
caa gac tac aaa ctt gac act ttt gaa ctc aga gac ggg aaa atc agc 240
Gln Asp Tyr Lys Leu Asp Thr Phe Glu Leu Arg Asp Gly Lys Ile Ser
65 70 75 80
gat gtt gct gcc ctc acc tta aac aaa gga gcc cgt gtg cgt gac att 288
Asp Val Ala Ala Leu Thr Leu Asn Lys Gly Ala Arg Val Arg Asp Ile
85 90 95
acc tca cac ttt cga gac gag gtc aag gtc act aag aat tca cca gtt 336
Thr Ser His Phe Arg Asp Glu Val Lys Val Thr Lys Asn Ser Pro Val
100 105 110
gtc ggt tgt gtc aag aac aca acg ccn ggt caa ctg gta ttt aac ggg 384
Val Gly Cys Val Lys Asn Thr Thr Pro Gly Gln Leu Val Phe Asn Gly
115 120 125
aca gct gct ggt ttt aaa gac cat atc atc tgc tct gat ggt gac act 432
Thr Ala Ala Gly Phe Lys Asp His Ile Ile Cys Ser Asp Gly Asp Thr
130 135 140
ctg cct aat atg ttc gtt tac act gcc aac aca cag tac ggg tat tgc 480
Leu Pro Asn Met Phe Val Tyr Thr Ala Asn Thr Gln Tyr Gly Tyr Cys
145 150 155 160
gga agc ggc ata ctc gtc aaa gat ggt tct cac aca gtc atc ata ggc 528
Gly Ser Gly Ile Leu Val Lys Asp Gly Ser His Thr Val Ile Ile Gly
165 170 175
atc cat agt gca gga ggt aac gga aaa ggt tac gct agt tgt gtc act 576
Ile His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Lys Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr
180 185 190
cgt tcc gca ctc ctc gca ctg agg ggc aga gaa agg ccc gag ctc gaa 624
Arg Ser Ala Leu Leu Ala Leu Arg Gly Arg Glu Arg Pro Glu Leu Glu
195 200 205
<210> 430
<211> 208
<212> PRT
<213> Bovine rhinitis
<400> 430
Ser Gly Asn Pro Pro Thr Asp Met Gln Leu Val Val Leu Lys Asn Thr
1 5 10 15
Gln Pro Ile Ser Leu Val Arg Asp Gly Gln Ile Val Ala Thr Cys Cys
20 25 30
Ala Leu Gly Val Phe Gly Thr Thr Tyr Leu Val Pro Tyr His Leu Phe
35 40 45
Glu Glu Ser Phe Asp Thr Leu Ile Ile Gly Asp Arg His Leu Lys Glu
50 55 60
Gln Asp Tyr Lys Leu Asp Thr Phe Glu Leu Arg Asp Gly Lys Ile Ser
65 70 75 80
Asp Val Ala Ala Leu Thr Leu Asn Lys Gly Ala Arg Val Arg Asp Ile
85 90 95
Thr Ser His Phe Arg Asp Glu Val Lys Val Thr Lys Asn Ser Pro Val
100 105 110
Val Gly Cys Val Lys Asn Thr Thr Pro Gly Gln Leu Val Phe Asn Gly
115 120 125
Thr Ala Ala Gly Phe Lys Asp His Ile Ile Cys Ser Asp Gly Asp Thr
130 135 140
Leu Pro Asn Met Phe Val Tyr Thr Ala Asn Thr Gln Tyr Gly Tyr Cys
145 150 155 160
Gly Ser Gly Ile Leu Val Lys Asp Gly Ser His Thr Val Ile Ile Gly
165 170 175
Ile His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Lys Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr
180 185 190
Arg Ser Ala Leu Leu Ala Leu Arg Gly Arg Glu Arg Pro Glu Leu Glu
195 200 205
<210> 431
<211> 624
<212> DNA
<213> Bovine rhinitis
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(624)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(624)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(624)
<223> Bovine_Rhinitus_B_3C(V22P)
<400> 431
agt ggg aac cct cca act gac atg cag ttg gtg gta ctc aag aac aca 48
Ser Gly Asn Pro Pro Thr Asp Met Gln Leu Val Val Leu Lys Asn Thr
1 5 10 15
caa cca att tca cta ccn aga gat gga caa att gtc gcc act tgt tgt 96
Gln Pro Ile Ser Leu Pro Arg Asp Gly Gln Ile Val Ala Thr Cys Cys
20 25 30
gct ctt ggc gtt ttt gga acc acc tat tta gtt ccc tac cac ctc ttt 144
Ala Leu Gly Val Phe Gly Thr Thr Tyr Leu Val Pro Tyr His Leu Phe
35 40 45
gaa gaa agt ttt gac acc ctc att ata gga gac aga cat ctg aaa gaa 192
Glu Glu Ser Phe Asp Thr Leu Ile Ile Gly Asp Arg His Leu Lys Glu
50 55 60
caa gac tac aaa ctt gac act ttt gaa ctc aga gac ggg aaa atc agc 240
Gln Asp Tyr Lys Leu Asp Thr Phe Glu Leu Arg Asp Gly Lys Ile Ser
65 70 75 80
gat gtt gct gcc ctc acc tta aac aaa gga gcc cgt gtg cgt gac att 288
Asp Val Ala Ala Leu Thr Leu Asn Lys Gly Ala Arg Val Arg Asp Ile
85 90 95
acc tca cac ttt cga gac gag gtc aag gtc act aag aat tca cca gtt 336
Thr Ser His Phe Arg Asp Glu Val Lys Val Thr Lys Asn Ser Pro Val
100 105 110
gtc ggt tgt gtc aag aac aca acg gtc ggt caa ctg gta ttt aac ggg 384
Val Gly Cys Val Lys Asn Thr Thr Val Gly Gln Leu Val Phe Asn Gly
115 120 125
aca gct gct ggt ttt aaa gac cat atc atc tgc tct gat ggt gac act 432
Thr Ala Ala Gly Phe Lys Asp His Ile Ile Cys Ser Asp Gly Asp Thr
130 135 140
ctg cct aat atg ttc gtt tac act gcc aac aca cag tac ggg tat tgc 480
Leu Pro Asn Met Phe Val Tyr Thr Ala Asn Thr Gln Tyr Gly Tyr Cys
145 150 155 160
gga agc ggc ata ctc gtc aaa gat ggt tct cac aca gtc atc ata ggc 528
Gly Ser Gly Ile Leu Val Lys Asp Gly Ser His Thr Val Ile Ile Gly
165 170 175
atc cat agt gca gga ggt aac gga aaa ggt tac gct agt tgt gtc act 576
Ile His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Lys Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr
180 185 190
cgt tcc gca ctc ctc gca ctg agg ggc aga gaa agg ccc gag ctc gaa 624
Arg Ser Ala Leu Leu Ala Leu Arg Gly Arg Glu Arg Pro Glu Leu Glu
195 200 205
<210> 432
<211> 208
<212> PRT
<213> Bovine rhinitis
<400> 432
Ser Gly Asn Pro Pro Thr Asp Met Gln Leu Val Val Leu Lys Asn Thr
1 5 10 15
Gln Pro Ile Ser Leu Pro Arg Asp Gly Gln Ile Val Ala Thr Cys Cys
20 25 30
Ala Leu Gly Val Phe Gly Thr Thr Tyr Leu Val Pro Tyr His Leu Phe
35 40 45
Glu Glu Ser Phe Asp Thr Leu Ile Ile Gly Asp Arg His Leu Lys Glu
50 55 60
Gln Asp Tyr Lys Leu Asp Thr Phe Glu Leu Arg Asp Gly Lys Ile Ser
65 70 75 80
Asp Val Ala Ala Leu Thr Leu Asn Lys Gly Ala Arg Val Arg Asp Ile
85 90 95
Thr Ser His Phe Arg Asp Glu Val Lys Val Thr Lys Asn Ser Pro Val
100 105 110
Val Gly Cys Val Lys Asn Thr Thr Val Gly Gln Leu Val Phe Asn Gly
115 120 125
Thr Ala Ala Gly Phe Lys Asp His Ile Ile Cys Ser Asp Gly Asp Thr
130 135 140
Leu Pro Asn Met Phe Val Tyr Thr Ala Asn Thr Gln Tyr Gly Tyr Cys
145 150 155 160
Gly Ser Gly Ile Leu Val Lys Asp Gly Ser His Thr Val Ile Ile Gly
165 170 175
Ile His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Lys Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr
180 185 190
Arg Ser Ala Leu Leu Ala Leu Arg Gly Arg Glu Arg Pro Glu Leu Glu
195 200 205
<210> 433
<211> 624
<212> DNA
<213> Bovine rhinitis
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(624)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(624)
<223> Bovine_Rhinitus_B_3C(wt)
<400> 433
agt ggg aac cct cca act gac atg cag ttg gtg gta ctc aag aac aca 48
Ser Gly Asn Pro Pro Thr Asp Met Gln Leu Val Val Leu Lys Asn Thr
1 5 10 15
caa cca att tca cta gtt aga gat gga caa att gtc gcc act tgt tgt 96
Gln Pro Ile Ser Leu Val Arg Asp Gly Gln Ile Val Ala Thr Cys Cys
20 25 30
gct ctt ggc gtt ttt gga acc acc tat tta gtt ccc tac cac ctc ttt 144
Ala Leu Gly Val Phe Gly Thr Thr Tyr Leu Val Pro Tyr His Leu Phe
35 40 45
gaa gaa agt ttt gac acc ctc att ata gga gac aga cat ctg aaa gaa 192
Glu Glu Ser Phe Asp Thr Leu Ile Ile Gly Asp Arg His Leu Lys Glu
50 55 60
caa gac tac aaa ctt gac act ttt gaa ctc aga gac ggg aaa atc agc 240
Gln Asp Tyr Lys Leu Asp Thr Phe Glu Leu Arg Asp Gly Lys Ile Ser
65 70 75 80
gat gtt gct gcc ctc acc tta aac aaa gga gcc cgt gtg cgt gac att 288
Asp Val Ala Ala Leu Thr Leu Asn Lys Gly Ala Arg Val Arg Asp Ile
85 90 95
acc tca cac ttt cga gac gag gtc aag gtc act aag aat tca cca gtt 336
Thr Ser His Phe Arg Asp Glu Val Lys Val Thr Lys Asn Ser Pro Val
100 105 110
gtc ggt tgt gtc aag aac aca acg gtc ggt caa ctg gta ttt aac ggg 384
Val Gly Cys Val Lys Asn Thr Thr Val Gly Gln Leu Val Phe Asn Gly
115 120 125
aca gct gct ggt ttt aaa gac cat atc atc tgc tct gat ggt gac act 432
Thr Ala Ala Gly Phe Lys Asp His Ile Ile Cys Ser Asp Gly Asp Thr
130 135 140
ctg cct aat atg ttc gtt tac act gcc aac aca cag tac ggg tat tgc 480
Leu Pro Asn Met Phe Val Tyr Thr Ala Asn Thr Gln Tyr Gly Tyr Cys
145 150 155 160
gga agc ggc ata ctc gtc aaa gat ggt tct cac aca gtc atc ata ggc 528
Gly Ser Gly Ile Leu Val Lys Asp Gly Ser His Thr Val Ile Ile Gly
165 170 175
atc cat agt gca gga ggt aac gga aaa ggt tac gct agt tgt gtc act 576
Ile His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Lys Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr
180 185 190
cgt tcc gca ctc ctc gca ctg agg ggc aga gaa agg ccc gag ctc gaa 624
Arg Ser Ala Leu Leu Ala Leu Arg Gly Arg Glu Arg Pro Glu Leu Glu
195 200 205
<210> 434
<211> 208
<212> PRT
<213> Bovine rhinitis
<400> 434
Ser Gly Asn Pro Pro Thr Asp Met Gln Leu Val Val Leu Lys Asn Thr
1 5 10 15
Gln Pro Ile Ser Leu Val Arg Asp Gly Gln Ile Val Ala Thr Cys Cys
20 25 30
Ala Leu Gly Val Phe Gly Thr Thr Tyr Leu Val Pro Tyr His Leu Phe
35 40 45
Glu Glu Ser Phe Asp Thr Leu Ile Ile Gly Asp Arg His Leu Lys Glu
50 55 60
Gln Asp Tyr Lys Leu Asp Thr Phe Glu Leu Arg Asp Gly Lys Ile Ser
65 70 75 80
Asp Val Ala Ala Leu Thr Leu Asn Lys Gly Ala Arg Val Arg Asp Ile
85 90 95
Thr Ser His Phe Arg Asp Glu Val Lys Val Thr Lys Asn Ser Pro Val
100 105 110
Val Gly Cys Val Lys Asn Thr Thr Val Gly Gln Leu Val Phe Asn Gly
115 120 125
Thr Ala Ala Gly Phe Lys Asp His Ile Ile Cys Ser Asp Gly Asp Thr
130 135 140
Leu Pro Asn Met Phe Val Tyr Thr Ala Asn Thr Gln Tyr Gly Tyr Cys
145 150 155 160
Gly Ser Gly Ile Leu Val Lys Asp Gly Ser His Thr Val Ile Ile Gly
165 170 175
Ile His Ser Ala Gly Gly Asn Gly Lys Gly Tyr Ala Ser Cys Val Thr
180 185 190
Arg Ser Ala Leu Leu Ala Leu Arg Gly Arg Glu Arg Pro Glu Leu Glu
195 200 205
<210> 435
<211> 615
<212> DNA
<213> Equine Rhinitus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(615)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(615)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(615)
<223> Equine_Rhinitus_A_3C(A125P)
<400> 435
act gga gtt cca gca act gat ttg caa caa tct att atg aag aat gtt 48
Thr Gly Val Pro Ala Thr Asp Leu Gln Gln Ser Ile Met Lys Asn Val
1 5 10 15
cag cca att gag ctt tat tgt gat ggt aat ttg gtt act gat tgt tct 96
Gln Pro Ile Glu Leu Tyr Cys Asp Gly Asn Leu Val Thr Asp Cys Ser
20 25 30
gct ttg ggt gtt tat gat aac tcc tat ttg gtt ccc ttg cat ttg ttt 144
Ala Leu Gly Val Tyr Asp Asn Ser Tyr Leu Val Pro Leu His Leu Phe
35 40 45
gag ttt gat ttt gac acc att gtg ctt ggc ggt cgc cag tac aag aaa 192
Glu Phe Asp Phe Asp Thr Ile Val Leu Gly Gly Arg Gln Tyr Lys Lys
50 55 60
gct gat tgt gaa aaa gtg gaa ttt gaa ctt gaa att aat gga gat atg 240
Ala Asp Cys Glu Lys Val Glu Phe Glu Leu Glu Ile Asn Gly Asp Met
65 70 75 80
gtg tca tcg gac gcg tgc ttg ctc cgg gtt cca acc gga cca aaa gtg 288
Val Ser Ser Asp Ala Cys Leu Leu Arg Val Pro Thr Gly Pro Lys Val
85 90 95
aga aat att gtt cat ctt ttc aca aat gaa att gag tta aaa aag atg 336
Arg Asn Ile Val His Leu Phe Thr Asn Glu Ile Glu Leu Lys Lys Met
100 105 110
acc caa att aca gga att atg aat tct cca cac caa ccn cgc act gtg 384
Thr Gln Ile Thr Gly Ile Met Asn Ser Pro His Gln Pro Arg Thr Val
115 120 125
ttt ttt ggc agt ttt ttg aca gta aaa aaa tct att ttg aca tca gat 432
Phe Phe Gly Ser Phe Leu Thr Val Lys Lys Ser Ile Leu Thr Ser Asp
130 135 140
ggg act gtt atg cct aat gtc ttg tct tac gca gcc cag acc tcg cgg 480
Gly Thr Val Met Pro Asn Val Leu Ser Tyr Ala Ala Gln Thr Ser Arg
145 150 155 160
ggg tat tgt ggc gca gca att gtg gca ggc tca cct gcc cgc atc att 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Ile Val Ala Gly Ser Pro Ala Arg Ile Ile
165 170 175
ggc att cat tct gct ggt act ggg tct gta gcc ttt tgc tcc ctg gtg 576
Gly Ile His Ser Ala Gly Thr Gly Ser Val Ala Phe Cys Ser Leu Val
180 185 190
tcc aga gat gcg ctg gag cgc act ctc cct cag aaa cag 615
Ser Arg Asp Ala Leu Glu Arg Thr Leu Pro Gln Lys Gln
195 200 205
<210> 436
<211> 205
<212> PRT
<213> Equine Rhinitus
<400> 436
Thr Gly Val Pro Ala Thr Asp Leu Gln Gln Ser Ile Met Lys Asn Val
1 5 10 15
Gln Pro Ile Glu Leu Tyr Cys Asp Gly Asn Leu Val Thr Asp Cys Ser
20 25 30
Ala Leu Gly Val Tyr Asp Asn Ser Tyr Leu Val Pro Leu His Leu Phe
35 40 45
Glu Phe Asp Phe Asp Thr Ile Val Leu Gly Gly Arg Gln Tyr Lys Lys
50 55 60
Ala Asp Cys Glu Lys Val Glu Phe Glu Leu Glu Ile Asn Gly Asp Met
65 70 75 80
Val Ser Ser Asp Ala Cys Leu Leu Arg Val Pro Thr Gly Pro Lys Val
85 90 95
Arg Asn Ile Val His Leu Phe Thr Asn Glu Ile Glu Leu Lys Lys Met
100 105 110
Thr Gln Ile Thr Gly Ile Met Asn Ser Pro His Gln Pro Arg Thr Val
115 120 125
Phe Phe Gly Ser Phe Leu Thr Val Lys Lys Ser Ile Leu Thr Ser Asp
130 135 140
Gly Thr Val Met Pro Asn Val Leu Ser Tyr Ala Ala Gln Thr Ser Arg
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Ile Val Ala Gly Ser Pro Ala Arg Ile Ile
165 170 175
Gly Ile His Ser Ala Gly Thr Gly Ser Val Ala Phe Cys Ser Leu Val
180 185 190
Ser Arg Asp Ala Leu Glu Arg Thr Leu Pro Gln Lys Gln
195 200 205
<210> 437
<211> 615
<212> DNA
<213> Equine rhinitis
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(615)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(615)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(615)
<223> Equine_Rhinitus_A_3C(C23P)
<400> 437
act gga gtt cca gca act gat ttg caa caa tct att atg aag aat gtt 48
Thr Gly Val Pro Ala Thr Asp Leu Gln Gln Ser Ile Met Lys Asn Val
1 5 10 15
cag cca att gag ctt tat ccn gat ggt aat ttg gtt act gat tgt tct 96
Gln Pro Ile Glu Leu Tyr Pro Asp Gly Asn Leu Val Thr Asp Cys Ser
20 25 30
gct ttg ggt gtt tat gat aac tcc tat ttg gtt ccc ttg cat ttg ttt 144
Ala Leu Gly Val Tyr Asp Asn Ser Tyr Leu Val Pro Leu His Leu Phe
35 40 45
gag ttt gat ttt gac acc att gtg ctt ggc ggt cgc cag tac aag aaa 192
Glu Phe Asp Phe Asp Thr Ile Val Leu Gly Gly Arg Gln Tyr Lys Lys
50 55 60
gct gat tgt gaa aaa gtg gaa ttt gaa ctt gaa att aat gga gat atg 240
Ala Asp Cys Glu Lys Val Glu Phe Glu Leu Glu Ile Asn Gly Asp Met
65 70 75 80
gtg tca tcg gac gcg tgc ttg ctc cgg gtt cca acc gga cca aaa gtg 288
Val Ser Ser Asp Ala Cys Leu Leu Arg Val Pro Thr Gly Pro Lys Val
85 90 95
aga aat att gtt cat ctt ttc aca aat gaa att gag tta aaa aag atg 336
Arg Asn Ile Val His Leu Phe Thr Asn Glu Ile Glu Leu Lys Lys Met
100 105 110
acc caa att aca gga att atg aat tct cca cac caa gca cgc act gtg 384
Thr Gln Ile Thr Gly Ile Met Asn Ser Pro His Gln Ala Arg Thr Val
115 120 125
ttt ttt ggc agt ttt ttg aca gta aaa aaa tct att ttg aca tca gat 432
Phe Phe Gly Ser Phe Leu Thr Val Lys Lys Ser Ile Leu Thr Ser Asp
130 135 140
ggg act gtt atg cct aat gtc ttg tct tac gca gcc cag acc tcg cgg 480
Gly Thr Val Met Pro Asn Val Leu Ser Tyr Ala Ala Gln Thr Ser Arg
145 150 155 160
ggg tat tgt ggc gca gca att gtg gca ggc tca cct gcc cgc atc att 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Ile Val Ala Gly Ser Pro Ala Arg Ile Ile
165 170 175
ggc att cat tct gct ggt act ggg tct gta gcc ttt tgc tcc ctg gtg 576
Gly Ile His Ser Ala Gly Thr Gly Ser Val Ala Phe Cys Ser Leu Val
180 185 190
tcc aga gat gcg ctg gag cgc act ctc cct cag aaa cag 615
Ser Arg Asp Ala Leu Glu Arg Thr Leu Pro Gln Lys Gln
195 200 205
<210> 438
<211> 205
<212> PRT
<213> Equine rhinitis
<400> 438
Thr Gly Val Pro Ala Thr Asp Leu Gln Gln Ser Ile Met Lys Asn Val
1 5 10 15
Gln Pro Ile Glu Leu Tyr Pro Asp Gly Asn Leu Val Thr Asp Cys Ser
20 25 30
Ala Leu Gly Val Tyr Asp Asn Ser Tyr Leu Val Pro Leu His Leu Phe
35 40 45
Glu Phe Asp Phe Asp Thr Ile Val Leu Gly Gly Arg Gln Tyr Lys Lys
50 55 60
Ala Asp Cys Glu Lys Val Glu Phe Glu Leu Glu Ile Asn Gly Asp Met
65 70 75 80
Val Ser Ser Asp Ala Cys Leu Leu Arg Val Pro Thr Gly Pro Lys Val
85 90 95
Arg Asn Ile Val His Leu Phe Thr Asn Glu Ile Glu Leu Lys Lys Met
100 105 110
Thr Gln Ile Thr Gly Ile Met Asn Ser Pro His Gln Ala Arg Thr Val
115 120 125
Phe Phe Gly Ser Phe Leu Thr Val Lys Lys Ser Ile Leu Thr Ser Asp
130 135 140
Gly Thr Val Met Pro Asn Val Leu Ser Tyr Ala Ala Gln Thr Ser Arg
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Ile Val Ala Gly Ser Pro Ala Arg Ile Ile
165 170 175
Gly Ile His Ser Ala Gly Thr Gly Ser Val Ala Phe Cys Ser Leu Val
180 185 190
Ser Arg Asp Ala Leu Glu Arg Thr Leu Pro Gln Lys Gln
195 200 205
<210> 439
<211> 615
<212> DNA
<213> Equine Rhinitus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(615)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(615)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(615)
<223> Equine_Rhinitus_A_3C(T127P)
<400> 439
act gga gtt cca gca act gat ttg caa caa tct att atg aag aat gtt 48
Thr Gly Val Pro Ala Thr Asp Leu Gln Gln Ser Ile Met Lys Asn Val
1 5 10 15
cag cca att gag ctt tat tgt gat ggt aat ttg gtt act gat tgt tct 96
Gln Pro Ile Glu Leu Tyr Cys Asp Gly Asn Leu Val Thr Asp Cys Ser
20 25 30
gct ttg ggt gtt tat gat aac tcc tat ttg gtt ccc ttg cat ttg ttt 144
Ala Leu Gly Val Tyr Asp Asn Ser Tyr Leu Val Pro Leu His Leu Phe
35 40 45
gag ttt gat ttt gac acc att gtg ctt ggc ggt cgc cag tac aag aaa 192
Glu Phe Asp Phe Asp Thr Ile Val Leu Gly Gly Arg Gln Tyr Lys Lys
50 55 60
gct gat tgt gaa aaa gtg gaa ttt gaa ctt gaa att aat gga gat atg 240
Ala Asp Cys Glu Lys Val Glu Phe Glu Leu Glu Ile Asn Gly Asp Met
65 70 75 80
gtg tca tcg gac gcg tgc ttg ctc cgg gtt cca acc gga cca aaa gtg 288
Val Ser Ser Asp Ala Cys Leu Leu Arg Val Pro Thr Gly Pro Lys Val
85 90 95
aga aat att gtt cat ctt ttc aca aat gaa att gag tta aaa aag atg 336
Arg Asn Ile Val His Leu Phe Thr Asn Glu Ile Glu Leu Lys Lys Met
100 105 110
acc caa att aca gga att atg aat tct cca cac caa gca cgc ccn gtg 384
Thr Gln Ile Thr Gly Ile Met Asn Ser Pro His Gln Ala Arg Pro Val
115 120 125
ttt ttt ggc agt ttt ttg aca gta aaa aaa tct att ttg aca tca gat 432
Phe Phe Gly Ser Phe Leu Thr Val Lys Lys Ser Ile Leu Thr Ser Asp
130 135 140
ggg act gtt atg cct aat gtc ttg tct tac gca gcc cag acc tcg cgg 480
Gly Thr Val Met Pro Asn Val Leu Ser Tyr Ala Ala Gln Thr Ser Arg
145 150 155 160
ggg tat tgt ggc gca gca att gtg gca ggc tca cct gcc cgc atc att 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Ile Val Ala Gly Ser Pro Ala Arg Ile Ile
165 170 175
ggc att cat tct gct ggt act ggg tct gta gcc ttt tgc tcc ctg gtg 576
Gly Ile His Ser Ala Gly Thr Gly Ser Val Ala Phe Cys Ser Leu Val
180 185 190
tcc aga gat gcg ctg gag cgc act ctc cct cag aaa cag 615
Ser Arg Asp Ala Leu Glu Arg Thr Leu Pro Gln Lys Gln
195 200 205
<210> 440
<211> 205
<212> PRT
<213> Equine Rhinitus
<400> 440
Thr Gly Val Pro Ala Thr Asp Leu Gln Gln Ser Ile Met Lys Asn Val
1 5 10 15
Gln Pro Ile Glu Leu Tyr Cys Asp Gly Asn Leu Val Thr Asp Cys Ser
20 25 30
Ala Leu Gly Val Tyr Asp Asn Ser Tyr Leu Val Pro Leu His Leu Phe
35 40 45
Glu Phe Asp Phe Asp Thr Ile Val Leu Gly Gly Arg Gln Tyr Lys Lys
50 55 60
Ala Asp Cys Glu Lys Val Glu Phe Glu Leu Glu Ile Asn Gly Asp Met
65 70 75 80
Val Ser Ser Asp Ala Cys Leu Leu Arg Val Pro Thr Gly Pro Lys Val
85 90 95
Arg Asn Ile Val His Leu Phe Thr Asn Glu Ile Glu Leu Lys Lys Met
100 105 110
Thr Gln Ile Thr Gly Ile Met Asn Ser Pro His Gln Ala Arg Pro Val
115 120 125
Phe Phe Gly Ser Phe Leu Thr Val Lys Lys Ser Ile Leu Thr Ser Asp
130 135 140
Gly Thr Val Met Pro Asn Val Leu Ser Tyr Ala Ala Gln Thr Ser Arg
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Ile Val Ala Gly Ser Pro Ala Arg Ile Ile
165 170 175
Gly Ile His Ser Ala Gly Thr Gly Ser Val Ala Phe Cys Ser Leu Val
180 185 190
Ser Arg Asp Ala Leu Glu Arg Thr Leu Pro Gln Lys Gln
195 200 205
<210> 441
<211> 615
<212> DNA
<213> Equine Rhinitus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(615)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(615)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(615)
<223> Equine_Rhinitus_A_3C(V100P)
<400> 441
act gga gtt cca gca act gat ttg caa caa tct att atg aag aat gtt 48
Thr Gly Val Pro Ala Thr Asp Leu Gln Gln Ser Ile Met Lys Asn Val
1 5 10 15
cag cca att gag ctt tat tgt gat ggt aat ttg gtt act gat tgt tct 96
Gln Pro Ile Glu Leu Tyr Cys Asp Gly Asn Leu Val Thr Asp Cys Ser
20 25 30
gct ttg ggt gtt tat gat aac tcc tat ttg gtt ccc ttg cat ttg ttt 144
Ala Leu Gly Val Tyr Asp Asn Ser Tyr Leu Val Pro Leu His Leu Phe
35 40 45
gag ttt gat ttt gac acc att gtg ctt ggc ggt cgc cag tac aag aaa 192
Glu Phe Asp Phe Asp Thr Ile Val Leu Gly Gly Arg Gln Tyr Lys Lys
50 55 60
gct gat tgt gaa aaa gtg gaa ttt gaa ctt gaa att aat gga gat atg 240
Ala Asp Cys Glu Lys Val Glu Phe Glu Leu Glu Ile Asn Gly Asp Met
65 70 75 80
gtg tca tcg gac gcg tgc ttg ctc cgg gtt cca acc gga cca aaa gtg 288
Val Ser Ser Asp Ala Cys Leu Leu Arg Val Pro Thr Gly Pro Lys Val
85 90 95
aga aat att ccn cat ctt ttc aca aat gaa att gag tta aaa aag atg 336
Arg Asn Ile Pro His Leu Phe Thr Asn Glu Ile Glu Leu Lys Lys Met
100 105 110
acc caa att aca gga att atg aat tct cca cac caa gca cgc act gtg 384
Thr Gln Ile Thr Gly Ile Met Asn Ser Pro His Gln Ala Arg Thr Val
115 120 125
ttt ttt ggc agt ttt ttg aca gta aaa aaa tct att ttg aca tca gat 432
Phe Phe Gly Ser Phe Leu Thr Val Lys Lys Ser Ile Leu Thr Ser Asp
130 135 140
ggg act gtt atg cct aat gtc ttg tct tac gca gcc cag acc tcg cgg 480
Gly Thr Val Met Pro Asn Val Leu Ser Tyr Ala Ala Gln Thr Ser Arg
145 150 155 160
ggg tat tgt ggc gca gca att gtg gca ggc tca cct gcc cgc atc att 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Ile Val Ala Gly Ser Pro Ala Arg Ile Ile
165 170 175
ggc att cat tct gct ggt act ggg tct gta gcc ttt tgc tcc ctg gtg 576
Gly Ile His Ser Ala Gly Thr Gly Ser Val Ala Phe Cys Ser Leu Val
180 185 190
tcc aga gat gcg ctg gag cgc act ctc cct cag aaa cag 615
Ser Arg Asp Ala Leu Glu Arg Thr Leu Pro Gln Lys Gln
195 200 205
<210> 442
<211> 205
<212> PRT
<213> Equine Rhinitus
<400> 442
Thr Gly Val Pro Ala Thr Asp Leu Gln Gln Ser Ile Met Lys Asn Val
1 5 10 15
Gln Pro Ile Glu Leu Tyr Cys Asp Gly Asn Leu Val Thr Asp Cys Ser
20 25 30
Ala Leu Gly Val Tyr Asp Asn Ser Tyr Leu Val Pro Leu His Leu Phe
35 40 45
Glu Phe Asp Phe Asp Thr Ile Val Leu Gly Gly Arg Gln Tyr Lys Lys
50 55 60
Ala Asp Cys Glu Lys Val Glu Phe Glu Leu Glu Ile Asn Gly Asp Met
65 70 75 80
Val Ser Ser Asp Ala Cys Leu Leu Arg Val Pro Thr Gly Pro Lys Val
85 90 95
Arg Asn Ile Pro His Leu Phe Thr Asn Glu Ile Glu Leu Lys Lys Met
100 105 110
Thr Gln Ile Thr Gly Ile Met Asn Ser Pro His Gln Ala Arg Thr Val
115 120 125
Phe Phe Gly Ser Phe Leu Thr Val Lys Lys Ser Ile Leu Thr Ser Asp
130 135 140
Gly Thr Val Met Pro Asn Val Leu Ser Tyr Ala Ala Gln Thr Ser Arg
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Ile Val Ala Gly Ser Pro Ala Arg Ile Ile
165 170 175
Gly Ile His Ser Ala Gly Thr Gly Ser Val Ala Phe Cys Ser Leu Val
180 185 190
Ser Arg Asp Ala Leu Glu Arg Thr Leu Pro Gln Lys Gln
195 200 205
<210> 443
<211> 615
<212> DNA
<213> Equine Rhinitus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(615)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(615)
<223> Equine_Rhinitus_A_3C(wt)
<400> 443
act gga gtt cca gca act gat ttg caa caa tct att atg aag aat gtt 48
Thr Gly Val Pro Ala Thr Asp Leu Gln Gln Ser Ile Met Lys Asn Val
1 5 10 15
cag cca att gag ctt tat tgt gat ggt aat ttg gtt act gat tgt tct 96
Gln Pro Ile Glu Leu Tyr Cys Asp Gly Asn Leu Val Thr Asp Cys Ser
20 25 30
gct ttg ggt gtt tat gat aac tcc tat ttg gtt ccc ttg cat ttg ttt 144
Ala Leu Gly Val Tyr Asp Asn Ser Tyr Leu Val Pro Leu His Leu Phe
35 40 45
gag ttt gat ttt gac acc att gtg ctt ggc ggt cgc cag tac aag aaa 192
Glu Phe Asp Phe Asp Thr Ile Val Leu Gly Gly Arg Gln Tyr Lys Lys
50 55 60
gct gat tgt gaa aaa gtg gaa ttt gaa ctt gaa att aat gga gat atg 240
Ala Asp Cys Glu Lys Val Glu Phe Glu Leu Glu Ile Asn Gly Asp Met
65 70 75 80
gtg tca tcg gac gcg tgc ttg ctc cgg gtt cca acc gga cca aaa gtg 288
Val Ser Ser Asp Ala Cys Leu Leu Arg Val Pro Thr Gly Pro Lys Val
85 90 95
aga aat att gtt cat ctt ttc aca aat gaa att gag tta aaa aag atg 336
Arg Asn Ile Val His Leu Phe Thr Asn Glu Ile Glu Leu Lys Lys Met
100 105 110
acc caa att aca gga att atg aat tct cca cac caa gca cgc act gtg 384
Thr Gln Ile Thr Gly Ile Met Asn Ser Pro His Gln Ala Arg Thr Val
115 120 125
ttt ttt ggc agt ttt ttg aca gta aaa aaa tct att ttg aca tca gat 432
Phe Phe Gly Ser Phe Leu Thr Val Lys Lys Ser Ile Leu Thr Ser Asp
130 135 140
ggg act gtt atg cct aat gtc ttg tct tac gca gcc cag acc tcg cgg 480
Gly Thr Val Met Pro Asn Val Leu Ser Tyr Ala Ala Gln Thr Ser Arg
145 150 155 160
ggg tat tgt ggc gca gca att gtg gca ggc tca cct gcc cgc atc att 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Ile Val Ala Gly Ser Pro Ala Arg Ile Ile
165 170 175
ggc att cat tct gct ggt act ggg tct gta gcc ttt tgc tcc ctg gtg 576
Gly Ile His Ser Ala Gly Thr Gly Ser Val Ala Phe Cys Ser Leu Val
180 185 190
tcc aga gat gcg ctg gag cgc act ctc cct cag aaa cag 615
Ser Arg Asp Ala Leu Glu Arg Thr Leu Pro Gln Lys Gln
195 200 205
<210> 444
<211> 205
<212> PRT
<213> Equine Rhinitus
<400> 444
Thr Gly Val Pro Ala Thr Asp Leu Gln Gln Ser Ile Met Lys Asn Val
1 5 10 15
Gln Pro Ile Glu Leu Tyr Cys Asp Gly Asn Leu Val Thr Asp Cys Ser
20 25 30
Ala Leu Gly Val Tyr Asp Asn Ser Tyr Leu Val Pro Leu His Leu Phe
35 40 45
Glu Phe Asp Phe Asp Thr Ile Val Leu Gly Gly Arg Gln Tyr Lys Lys
50 55 60
Ala Asp Cys Glu Lys Val Glu Phe Glu Leu Glu Ile Asn Gly Asp Met
65 70 75 80
Val Ser Ser Asp Ala Cys Leu Leu Arg Val Pro Thr Gly Pro Lys Val
85 90 95
Arg Asn Ile Val His Leu Phe Thr Asn Glu Ile Glu Leu Lys Lys Met
100 105 110
Thr Gln Ile Thr Gly Ile Met Asn Ser Pro His Gln Ala Arg Thr Val
115 120 125
Phe Phe Gly Ser Phe Leu Thr Val Lys Lys Ser Ile Leu Thr Ser Asp
130 135 140
Gly Thr Val Met Pro Asn Val Leu Ser Tyr Ala Ala Gln Thr Ser Arg
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Ile Val Ala Gly Ser Pro Ala Arg Ile Ile
165 170 175
Gly Ile His Ser Ala Gly Thr Gly Ser Val Ala Phe Cys Ser Leu Val
180 185 190
Ser Arg Asp Ala Leu Glu Arg Thr Leu Pro Gln Lys Gln
195 200 205
<210> 445
<211> 615
<212> DNA
<213> Equine Rhinitus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(615)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(615)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(615)
<223> Equine_Rhinitus_A_3C(Y22P)
<400> 445
act gga gtt cca gca act gat ttg caa caa tct att atg aag aat gtt 48
Thr Gly Val Pro Ala Thr Asp Leu Gln Gln Ser Ile Met Lys Asn Val
1 5 10 15
cag cca att gag ctt ccn tgt gat ggt aat ttg gtt act gat tgt tct 96
Gln Pro Ile Glu Leu Pro Cys Asp Gly Asn Leu Val Thr Asp Cys Ser
20 25 30
gct ttg ggt gtt tat gat aac tcc tat ttg gtt ccc ttg cat ttg ttt 144
Ala Leu Gly Val Tyr Asp Asn Ser Tyr Leu Val Pro Leu His Leu Phe
35 40 45
gag ttt gat ttt gac acc att gtg ctt ggc ggt cgc cag tac aag aaa 192
Glu Phe Asp Phe Asp Thr Ile Val Leu Gly Gly Arg Gln Tyr Lys Lys
50 55 60
gct gat tgt gaa aaa gtg gaa ttt gaa ctt gaa att aat gga gat atg 240
Ala Asp Cys Glu Lys Val Glu Phe Glu Leu Glu Ile Asn Gly Asp Met
65 70 75 80
gtg tca tcg gac gcg tgc ttg ctc cgg gtt cca acc gga cca aaa gtg 288
Val Ser Ser Asp Ala Cys Leu Leu Arg Val Pro Thr Gly Pro Lys Val
85 90 95
aga aat att gtt cat ctt ttc aca aat gaa att gag tta aaa aag atg 336
Arg Asn Ile Val His Leu Phe Thr Asn Glu Ile Glu Leu Lys Lys Met
100 105 110
acc caa att aca gga att atg aat tct cca cac caa gca cgc act gtg 384
Thr Gln Ile Thr Gly Ile Met Asn Ser Pro His Gln Ala Arg Thr Val
115 120 125
ttt ttt ggc agt ttt ttg aca gta aaa aaa tct att ttg aca tca gat 432
Phe Phe Gly Ser Phe Leu Thr Val Lys Lys Ser Ile Leu Thr Ser Asp
130 135 140
ggg act gtt atg cct aat gtc ttg tct tac gca gcc cag acc tcg cgg 480
Gly Thr Val Met Pro Asn Val Leu Ser Tyr Ala Ala Gln Thr Ser Arg
145 150 155 160
ggg tat tgt ggc gca gca att gtg gca ggc tca cct gcc cgc atc att 528
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Ile Val Ala Gly Ser Pro Ala Arg Ile Ile
165 170 175
ggc att cat tct gct ggt act ggg tct gta gcc ttt tgc tcc ctg gtg 576
Gly Ile His Ser Ala Gly Thr Gly Ser Val Ala Phe Cys Ser Leu Val
180 185 190
tcc aga gat gcg ctg gag cgc act ctc cct cag aaa cag 615
Ser Arg Asp Ala Leu Glu Arg Thr Leu Pro Gln Lys Gln
195 200 205
<210> 446
<211> 205
<212> PRT
<213> Equine Rhinitus
<400> 446
Thr Gly Val Pro Ala Thr Asp Leu Gln Gln Ser Ile Met Lys Asn Val
1 5 10 15
Gln Pro Ile Glu Leu Pro Cys Asp Gly Asn Leu Val Thr Asp Cys Ser
20 25 30
Ala Leu Gly Val Tyr Asp Asn Ser Tyr Leu Val Pro Leu His Leu Phe
35 40 45
Glu Phe Asp Phe Asp Thr Ile Val Leu Gly Gly Arg Gln Tyr Lys Lys
50 55 60
Ala Asp Cys Glu Lys Val Glu Phe Glu Leu Glu Ile Asn Gly Asp Met
65 70 75 80
Val Ser Ser Asp Ala Cys Leu Leu Arg Val Pro Thr Gly Pro Lys Val
85 90 95
Arg Asn Ile Val His Leu Phe Thr Asn Glu Ile Glu Leu Lys Lys Met
100 105 110
Thr Gln Ile Thr Gly Ile Met Asn Ser Pro His Gln Ala Arg Thr Val
115 120 125
Phe Phe Gly Ser Phe Leu Thr Val Lys Lys Ser Ile Leu Thr Ser Asp
130 135 140
Gly Thr Val Met Pro Asn Val Leu Ser Tyr Ala Ala Gln Thr Ser Arg
145 150 155 160
Gly Tyr Cys Gly Ala Ala Ile Val Ala Gly Ser Pro Ala Arg Ile Ile
165 170 175
Gly Ile His Ser Ala Gly Thr Gly Ser Val Ala Phe Cys Ser Leu Val
180 185 190
Ser Arg Asp Ala Leu Glu Arg Thr Leu Pro Gln Lys Gln
195 200 205
<210> 447
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A1_Tompkins_3C(F109P)
<400> 447
ggc cca gta ttt gat tat gca gtt gca atg gca aag aaa aac atc ctg 48
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
aca gcc acc aca gaa aag ggt gaa ttc aca atg tta gga gta cat gat 96
Thr Ala Thr Thr Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aga gtt gca gta ttg cct acc cat tca aac cca ggt gaa aca ata gtt 144
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
gtg tca gga aaa gaa gtg aag atc ttg gat gca aag agg ctg gtt gat 192
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
aat gat gag gtc aat ctt gaa att act att gta acc cta gac aga aac 240
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt aga gac atc aga act cac tta ccg acc caa atc cat gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
acc aat gat gcg gtt ttg gct gtc aac acc tcc aaa ccn cca aat atg 336
Thr Asn Asp Ala Val Leu Ala Val Asn Thr Ser Lys Pro Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gtt gga tca gta gtt gaa cag gga atg ttg aac ctt ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aga ccc aca aat aga acc cta atg tat aac ttt cca act aaa gca 432
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
ggg cag tgt ggt ggt gtc tta atg gcc act ggc aaa gtg att ggc ata 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggt aat gga tct cac ggt ttc gca gct gca ctt aaa aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt act gaa gaa cag 549
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 448
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 448
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Ala Val Leu Ala Val Asn Thr Ser Lys Pro Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 449
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A1_Tompkins_3C(L102P)
<400> 449
ggc cca gta ttt gat tat gca gtt gca atg gca aag aaa aac atc ctg 48
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
aca gcc acc aca gaa aag ggt gaa ttc aca atg tta gga gta cat gat 96
Thr Ala Thr Thr Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aga gtt gca gta ttg cct acc cat tca aac cca ggt gaa aca ata gtt 144
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
gtg tca gga aaa gaa gtg aag atc ttg gat gca aag agg ctg gtt gat 192
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
aat gat gag gtc aat ctt gaa att act att gta acc cta gac aga aac 240
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt aga gac atc aga act cac tta ccg acc caa atc cat gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
acc aat gat gcg gtt ccn gct gtc aac acc tcc aaa ttt cca aat atg 336
Thr Asn Asp Ala Val Pro Ala Val Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gtt gga tca gta gtt gaa cag gga atg ttg aac ctt ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aga ccc aca aat aga acc cta atg tat aac ttt cca act aaa gca 432
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
ggg cag tgt ggt ggt gtc tta atg gcc act ggc aaa gtg att ggc ata 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggt aat gga tct cac ggt ttc gca gct gca ctt aaa aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt act gaa gaa cag 549
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 450
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 450
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Ala Val Pro Ala Val Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 451
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A1_Tompkins_3C(N105P)
<400> 451
ggc cca gta ttt gat tat gca gtt gca atg gca aag aaa aac atc ctg 48
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
aca gcc acc aca gaa aag ggt gaa ttc aca atg tta gga gta cat gat 96
Thr Ala Thr Thr Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aga gtt gca gta ttg cct acc cat tca aac cca ggt gaa aca ata gtt 144
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
gtg tca gga aaa gaa gtg aag atc ttg gat gca aag agg ctg gtt gat 192
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
aat gat gag gtc aat ctt gaa att act att gta acc cta gac aga aac 240
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt aga gac atc aga act cac tta ccg acc caa atc cat gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
acc aat gat gcg gtt ttg gct gtc ccn acc tcc aaa ttt cca aat atg 336
Thr Asn Asp Ala Val Leu Ala Val Pro Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gtt gga tca gta gtt gaa cag gga atg ttg aac ctt ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aga ccc aca aat aga acc cta atg tat aac ttt cca act aaa gca 432
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
ggg cag tgt ggt ggt gtc tta atg gcc act ggc aaa gtg att ggc ata 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggt aat gga tct cac ggt ttc gca gct gca ctt aaa aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt act gaa gaa cag 549
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 452
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 452
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Ala Val Leu Ala Val Pro Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 453
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A1_Tompkins_3C(R87P)
<400> 453
ggc cca gta ttt gat tat gca gtt gca atg gca aag aaa aac atc ctg 48
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
aca gcc acc aca gaa aag ggt gaa ttc aca atg tta gga gta cat gat 96
Thr Ala Thr Thr Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aga gtt gca gta ttg cct acc cat tca aac cca ggt gaa aca ata gtt 144
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
gtg tca gga aaa gaa gtg aag atc ttg gat gca aag agg ctg gtt gat 192
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
aat gat gag gtc aat ctt gaa att act att gta acc cta gac aga aac 240
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt aga gac atc ccn act cac tta ccg acc caa atc cat gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
acc aat gat gcg gtt ttg gct gtc aac acc tcc aaa ttt cca aat atg 336
Thr Asn Asp Ala Val Leu Ala Val Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gtt gga tca gta gtt gaa cag gga atg ttg aac ctt ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aga ccc aca aat aga acc cta atg tat aac ttt cca act aaa gca 432
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
ggg cag tgt ggt ggt gtc tta atg gcc act ggc aaa gtg att ggc ata 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggt aat gga tct cac ggt ttc gca gct gca ctt aaa aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt act gaa gaa cag 549
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 454
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 454
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Ala Val Leu Ala Val Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 455
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A1_Tompkins_3C(T106P)
<400> 455
ggc cca gta ttt gat tat gca gtt gca atg gca aag aaa aac atc ctg 48
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
aca gcc acc aca gaa aag ggt gaa ttc aca atg tta gga gta cat gat 96
Thr Ala Thr Thr Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aga gtt gca gta ttg cct acc cat tca aac cca ggt gaa aca ata gtt 144
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
gtg tca gga aaa gaa gtg aag atc ttg gat gca aag agg ctg gtt gat 192
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
aat gat gag gtc aat ctt gaa att act att gta acc cta gac aga aac 240
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt aga gac atc aga act cac tta ccg acc caa atc cat gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
acc aat gat gcg gtt ttg gct gtc aac ccn tcc aaa ttt cca aat atg 336
Thr Asn Asp Ala Val Leu Ala Val Asn Pro Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gtt gga tca gta gtt gaa cag gga atg ttg aac ctt ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aga ccc aca aat aga acc cta atg tat aac ttt cca act aaa gca 432
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
ggg cag tgt ggt ggt gtc tta atg gcc act ggc aaa gtg att ggc ata 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggt aat gga tct cac ggt ttc gca gct gca ctt aaa aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt act gaa gaa cag 549
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 456
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 456
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Ala Val Leu Ala Val Asn Pro Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 457
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A1_Tompkins_3C(T19P)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A1_Tompkins_3C(T19P)
<400> 457
ggc cca gta ttt gat tat gca gtt gca atg gca aag aaa aac atc ctg 48
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
aca gcc ccn aca gaa aag ggt gaa ttc aca atg tta gga gta cat gat 96
Thr Ala Pro Thr Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aga gtt gca gta ttg cct acc cat tca aac cca ggt gaa aca ata gtt 144
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
gtg tca gga aaa gaa gtg aag atc ttg gat gca aag agg ctg gtt gat 192
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
aat gat gag gtc aat ctt gaa att act att gta acc cta gac aga aac 240
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt aga gac atc aga act cac tta ccg acc caa atc cat gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
acc aat gat gcg gtt ttg gct gtc aac acc tcc aaa ttt cca aat atg 336
Thr Asn Asp Ala Val Leu Ala Val Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gtt gga tca gta gtt gaa cag gga atg ttg aac ctt ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aga ccc aca aat aga acc cta atg tat aac ttt cca act aaa gca 432
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
ggg cag tgt ggt ggt gtc tta atg gcc act ggc aaa gtg att ggc ata 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggt aat gga tct cac ggt ttc gca gct gca ctt aaa aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt act gaa gaa cag 549
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 458
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 458
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
Thr Ala Pro Thr Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Ala Val Leu Ala Val Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 459
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A1_Tompkins_3C(T20P)
<400> 459
ggc cca gta ttt gat tat gca gtt gca atg gca aag aaa aac atc ctg 48
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
aca gcc acc ccn gaa aag ggt gaa ttc aca atg tta gga gta cat gat 96
Thr Ala Thr Pro Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aga gtt gca gta ttg cct acc cat tca aac cca ggt gaa aca ata gtt 144
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
gtg tca gga aaa gaa gtg aag atc ttg gat gca aag agg ctg gtt gat 192
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
aat gat gag gtc aat ctt gaa att act att gta acc cta gac aga aac 240
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt aga gac atc aga act cac tta ccg acc caa atc cat gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
acc aat gat gcg gtt ttg gct gtc aac acc tcc aaa ttt cca aat atg 336
Thr Asn Asp Ala Val Leu Ala Val Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gtt gga tca gta gtt gaa cag gga atg ttg aac ctt ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aga ccc aca aat aga acc cta atg tat aac ttt cca act aaa gca 432
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
ggg cag tgt ggt ggt gtc tta atg gcc act ggc aaa gtg att ggc ata 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggt aat gga tct cac ggt ttc gca gct gca ctt aaa aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt act gaa gaa cag 549
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 460
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 460
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
Thr Ala Thr Pro Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Ala Val Leu Ala Val Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 461
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A1_Tompkins_3C(wt)
<400> 461
ggc cca gta ttt gat tat gca gtt gca atg gca aag aaa aac atc ctg 48
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
aca gcc acc aca gaa aag ggt gaa ttc aca atg tta gga gta cat gat 96
Thr Ala Thr Thr Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aga gtt gca gta ttg cct acc cat tca aac cca ggt gaa aca ata gtt 144
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
gtg tca gga aaa gaa gtg aag atc ttg gat gca aag agg ctg gtt gat 192
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
aat gat gag gtc aat ctt gaa att act att gta acc cta gac aga aac 240
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt aga gac atc aga act cac tta ccg acc caa atc cat gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
acc aat gat gcg gtt ttg gct gtc aac acc tcc aaa ttt cca aat atg 336
Thr Asn Asp Ala Val Leu Ala Val Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gtt gga tca gta gtt gaa cag gga atg ttg aac ctt ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aga ccc aca aat aga acc cta atg tat aac ttt cca act aaa gca 432
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
ggg cag tgt ggt ggt gtc tta atg gcc act ggc aaa gtg att ggc ata 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggt aat gga tct cac ggt ttc gca gct gca ctt aaa aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt act gaa gaa cag 549
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 462
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 462
Gly Pro Val Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Lys Asn Ile Leu
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Glu Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Arg Val Ala Val Leu Pro Thr His Ser Asn Pro Gly Glu Thr Ile Val
35 40 45
Val Ser Gly Lys Glu Val Lys Ile Leu Asp Ala Lys Arg Leu Val Asp
50 55 60
Asn Asp Glu Val Asn Leu Glu Ile Thr Ile Val Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Thr His Leu Pro Thr Gln Ile His Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Ala Val Leu Ala Val Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Ser Val Val Glu Gln Gly Met Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Pro Thr Asn Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ala Thr Gly Lys Val Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Glu Glu Gln
180
<210> 463
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A10_Kowalik_3C(L102P)
<400> 463
gga cct agc ttg gac ttc gct ttg tct ctt ctg agg cgc aac atc aga 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gcg cag acc gac cag gga cac ttc acc atg cta ggc ata cgg gac 96
Gln Ala Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
cgt cta gcc atc ttg cca cgc cac tca caa cca ggg aag acc atc tgg 144
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
ata gag cac aaa ttg gtc aac gta cta gat gca gtt gag ttg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa ggt gtt aat ttg gaa ctc acg ctg gtg acc ttg gac act aat 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gag aag ttt agg gac att acc aag ttc atc cca gag aca ata gct ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
gct agt gat gca act ccn gtt atc aac act gag cat atg ccc tcg atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Pro Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtg cca ata ggt gac gtt gtg cag tat ggg ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggc aaa ccc aca cac aga act atg atg tac aat ttc ccc acg aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt ggg ggg gta gtc act tca gtt ggc aag atc att gga atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggc ggg aat gga cgc cag ggc ttc tgc gct ggt tta aag agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agc tac ttt gcc agc gag caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 464
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 464
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Ala Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Pro Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 465
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A10_Kowalik_3C(M109P)
<400> 465
gga cct agc ttg gac ttc gct ttg tct ctt ctg agg cgc aac atc aga 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gcg cag acc gac cag gga cac ttc acc atg cta ggc ata cgg gac 96
Gln Ala Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
cgt cta gcc atc ttg cca cgc cac tca caa cca ggg aag acc atc tgg 144
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
ata gag cac aaa ttg gtc aac gta cta gat gca gtt gag ttg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa ggt gtt aat ttg gaa ctc acg ctg gtg acc ttg gac act aat 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gag aag ttt agg gac att acc aag ttc atc cca gag aca ata gct ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
gct agt gat gca act cta gtt atc aac act gag cat ccn ccc tcg atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Pro Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtg cca ata ggt gac gtt gtg cag tat ggg ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggc aaa ccc aca cac aga act atg atg tac aat ttc ccc acg aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt ggg ggg gta gtc act tca gtt ggc aag atc att gga atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggc ggg aat gga cgc cag ggc ttc tgc gct ggt tta aag agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agc tac ttt gcc agc gag caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 466
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 466
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Ala Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Pro Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 467
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A10_Kowalik_3C(N105P)
<400> 467
gga cct agc ttg gac ttc gct ttg tct ctt ctg agg cgc aac atc aga 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gcg cag acc gac cag gga cac ttc acc atg cta ggc ata cgg gac 96
Gln Ala Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
cgt cta gcc atc ttg cca cgc cac tca caa cca ggg aag acc atc tgg 144
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
ata gag cac aaa ttg gtc aac gta cta gat gca gtt gag ttg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa ggt gtt aat ttg gaa ctc acg ctg gtg acc ttg gac act aat 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gag aag ttt agg gac att acc aag ttc atc cca gag aca ata gct ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
gct agt gat gca act cta gtt atc ccn act gag cat atg ccc tcg atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Pro Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtg cca ata ggt gac gtt gtg cag tat ggg ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggc aaa ccc aca cac aga act atg atg tac aat ttc ccc acg aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt ggg ggg gta gtc act tca gtt ggc aag atc att gga atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggc ggg aat gga cgc cag ggc ttc tgc gct ggt tta aag agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agc tac ttt gcc agc gag caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 468
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 468
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Ala Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Pro Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 469
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A10_Kowalik_3C(Q19P)
<400> 469
gga cct agc ttg gac ttc gct ttg tct ctt ctg agg cgc aac atc aga 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gcg ccn acc gac cag gga cac ttc acc atg cta ggc ata cgg gac 96
Gln Ala Pro Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
cgt cta gcc atc ttg cca cgc cac tca caa cca ggg aag acc atc tgg 144
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
ata gag cac aaa ttg gtc aac gta cta gat gca gtt gag ttg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa ggt gtt aat ttg gaa ctc acg ctg gtg acc ttg gac act aat 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gag aag ttt agg gac att acc aag ttc atc cca gag aca ata gct ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
gct agt gat gca act cta gtt atc aac act gag cat atg ccc tcg atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtg cca ata ggt gac gtt gtg cag tat ggg ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggc aaa ccc aca cac aga act atg atg tac aat ttc ccc acg aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt ggg ggg gta gtc act tca gtt ggc aag atc att gga atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggc ggg aat gga cgc cag ggc ttc tgc gct ggt tta aag agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agc tac ttt gcc agc gag caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 470
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 470
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Ala Pro Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 471
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A10_Kowalik_3C(T106P)
<400> 471
gga cct agc ttg gac ttc gct ttg tct ctt ctg agg cgc aac atc aga 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gcg cag acc gac cag gga cac ttc acc atg cta ggc ata cgg gac 96
Gln Ala Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
cgt cta gcc atc ttg cca cgc cac tca caa cca ggg aag acc atc tgg 144
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
ata gag cac aaa ttg gtc aac gta cta gat gca gtt gag ttg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa ggt gtt aat ttg gaa ctc acg ctg gtg acc ttg gac act aat 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gag aag ttt agg gac att acc aag ttc atc cca gag aca ata gct ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
gct agt gat gca act cta gtt atc aac ccn gag cat atg ccc tcg atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Pro Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtg cca ata ggt gac gtt gtg cag tat ggg ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggc aaa ccc aca cac aga act atg atg tac aat ttc ccc acg aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt ggg ggg gta gtc act tca gtt ggc aag atc att gga atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggc ggg aat gga cgc cag ggc ttc tgc gct ggt tta aag agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agc tac ttt gcc agc gag caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 472
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 472
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Ala Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Pro Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 473
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A10_Kowalik_3C(T20P)
<400> 473
gga cct agc ttg gac ttc gct ttg tct ctt ctg agg cgc aac atc aga 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gcg cag ccn gac cag gga cac ttc acc atg cta ggc ata cgg gac 96
Gln Ala Gln Pro Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
cgt cta gcc atc ttg cca cgc cac tca caa cca ggg aag acc atc tgg 144
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
ata gag cac aaa ttg gtc aac gta cta gat gca gtt gag ttg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa ggt gtt aat ttg gaa ctc acg ctg gtg acc ttg gac act aat 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gag aag ttt agg gac att acc aag ttc atc cca gag aca ata gct ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
gct agt gat gca act cta gtt atc aac act gag cat atg ccc tcg atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtg cca ata ggt gac gtt gtg cag tat ggg ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggc aaa ccc aca cac aga act atg atg tac aat ttc ccc acg aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt ggg ggg gta gtc act tca gtt ggc aag atc att gga atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggc ggg aat gga cgc cag ggc ttc tgc gct ggt tta aag agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agc tac ttt gcc agc gag caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 474
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 474
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Ala Gln Pro Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 475
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A10_Kowalik_3C(T87P)
<400> 475
gga cct agc ttg gac ttc gct ttg tct ctt ctg agg cgc aac atc aga 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gcg cag acc gac cag gga cac ttc acc atg cta ggc ata cgg gac 96
Gln Ala Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
cgt cta gcc atc ttg cca cgc cac tca caa cca ggg aag acc atc tgg 144
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
ata gag cac aaa ttg gtc aac gta cta gat gca gtt gag ttg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa ggt gtt aat ttg gaa ctc acg ctg gtg acc ttg gac act aat 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gag aag ttt agg gac att ccn aag ttc atc cca gag aca ata gct ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
gct agt gat gca act cta gtt atc aac act gag cat atg ccc tcg atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtg cca ata ggt gac gtt gtg cag tat ggg ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggc aaa ccc aca cac aga act atg atg tac aat ttc ccc acg aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt ggg ggg gta gtc act tca gtt ggc aag atc att gga atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggc ggg aat gga cgc cag ggc ttc tgc gct ggt tta aag agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agc tac ttt gcc agc gag caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 476
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 476
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Ala Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 477
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_A10_Kowalik_3C(wt)
<400> 477
gga cct agc ttg gac ttc gct ttg tct ctt ctg agg cgc aac atc aga 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gcg cag acc gac cag gga cac ttc acc atg cta ggc ata cgg gac 96
Gln Ala Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
cgt cta gcc atc ttg cca cgc cac tca caa cca ggg aag acc atc tgg 144
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
ata gag cac aaa ttg gtc aac gta cta gat gca gtt gag ttg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa ggt gtt aat ttg gaa ctc acg ctg gtg acc ttg gac act aat 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gag aag ttt agg gac att acc aag ttc atc cca gag aca ata gct ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
gct agt gat gca act cta gtt atc aac act gag cat atg ccc tcg atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtg cca ata ggt gac gtt gtg cag tat ggg ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggc aaa ccc aca cac aga act atg atg tac aat ttc ccc acg aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt ggg ggg gta gtc act tca gtt ggc aag atc att gga atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggc ggg aat gga cgc cag ggc ttc tgc gct ggt tta aag agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agc tac ttt gcc agc gag caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 478
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 478
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Ala Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Ile Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Ile Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Val Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Thr Ile Ala Gly
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Ile Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Ile Ile Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 479
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B1_3C(F109P)
<400> 479
gga cct gta ttt gag ttt gcc gta gcc atg atg aag agg aat tcg agc 48
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
aca gtg aaa act gaa tac ggt gag ttc act atg ctg ggt atc tat gat 96
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gct gtt ttg cca cgt cat gcc aaa cct ggg cca acc atc tta 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gaa att ggt gtg cta gac gcc aag gag tta gtg gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggt aca aac ttg gaa ctg aca cta ctt aag ctg aac cga aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat att agg ggc ttc tta gcc aag gaa gag gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gct gtg cta gca att aac acc agc aag ccn cct aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Pro Pro Asn Met
100 105 110
tat atc cca gtg gga caa gtt aca gag tat ggc ttc ctg aat ctg ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggt aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc acg agg gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggc gga gtg ctc atg tcc act ggc aaa gtt ttg ggg atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggc ggg aat ggt cat caa ggc ttc tca gcg gca ctt ctt aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gaa caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 480
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 480
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Pro Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 481
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B1_3C(K19P)
<400> 481
gga cct gta ttt gag ttt gcc gta gcc atg atg aag agg aat tcg agc 48
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
aca gtg ccn act gaa tac ggt gag ttc act atg ctg ggt atc tat gat 96
Thr Val Pro Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gct gtt ttg cca cgt cat gcc aaa cct ggg cca acc atc tta 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gaa att ggt gtg cta gac gcc aag gag tta gtg gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggt aca aac ttg gaa ctg aca cta ctt aag ctg aac cga aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat att agg ggc ttc tta gcc aag gaa gag gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gct gtg cta gca att aac acc agc aag ttc cct aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tat atc cca gtg gga caa gtt aca gag tat ggc ttc ctg aat ctg ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggt aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc acg agg gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggc gga gtg ctc atg tcc act ggc aaa gtt ttg ggg atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggc ggg aat ggt cat caa ggc ttc tca gcg gca ctt ctt aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gaa caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 482
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 482
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Pro Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 483
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B1_3C(L102P)
<400> 483
gga cct gta ttt gag ttt gcc gta gcc atg atg aag agg aat tcg agc 48
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
aca gtg aaa act gaa tac ggt gag ttc act atg ctg ggt atc tat gat 96
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gct gtt ttg cca cgt cat gcc aaa cct ggg cca acc atc tta 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gaa att ggt gtg cta gac gcc aag gag tta gtg gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggt aca aac ttg gaa ctg aca cta ctt aag ctg aac cga aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat att agg ggc ttc tta gcc aag gaa gag gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gct gtg ccn gca att aac acc agc aag ttc cct aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Pro Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tat atc cca gtg gga caa gtt aca gag tat ggc ttc ctg aat ctg ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggt aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc acg agg gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggc gga gtg ctc atg tcc act ggc aaa gtt ttg ggg atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggc ggg aat ggt cat caa ggc ttc tca gcg gca ctt ctt aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gaa caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 484
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 484
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Pro Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 485
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B1_3C(N105P)
<400> 485
gga cct gta ttt gag ttt gcc gta gcc atg atg aag agg aat tcg agc 48
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
aca gtg aaa act gaa tac ggt gag ttc act atg ctg ggt atc tat gat 96
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gct gtt ttg cca cgt cat gcc aaa cct ggg cca acc atc tta 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gaa att ggt gtg cta gac gcc aag gag tta gtg gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggt aca aac ttg gaa ctg aca cta ctt aag ctg aac cga aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat att agg ggc ttc tta gcc aag gaa gag gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gct gtg cta gca att ccn acc agc aag ttc cct aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Pro Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tat atc cca gtg gga caa gtt aca gag tat ggc ttc ctg aat ctg ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggt aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc acg agg gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggc gga gtg ctc atg tcc act ggc aaa gtt ttg ggg atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggc ggg aat ggt cat caa ggc ttc tca gcg gca ctt ctt aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gaa caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 486
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 486
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Pro Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 487
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B1_3C(R87P)
<400> 487
gga cct gta ttt gag ttt gcc gta gcc atg atg aag agg aat tcg agc 48
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
aca gtg aaa act gaa tac ggt gag ttc act atg ctg ggt atc tat gat 96
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gct gtt ttg cca cgt cat gcc aaa cct ggg cca acc atc tta 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gaa att ggt gtg cta gac gcc aag gag tta gtg gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggt aca aac ttg gaa ctg aca cta ctt aag ctg aac cga aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat att ccn ggc ttc tta gcc aag gaa gag gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gct gtg cta gca att aac acc agc aag ttc cct aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tat atc cca gtg gga caa gtt aca gag tat ggc ttc ctg aat ctg ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggt aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc acg agg gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggc gga gtg ctc atg tcc act ggc aaa gtt ttg ggg atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggc ggg aat ggt cat caa ggc ttc tca gcg gca ctt ctt aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gaa caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 488
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 488
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 489
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B1_3C(T106P)
<400> 489
gga cct gta ttt gag ttt gcc gta gcc atg atg aag agg aat tcg agc 48
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
aca gtg aaa act gaa tac ggt gag ttc act atg ctg ggt atc tat gat 96
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gct gtt ttg cca cgt cat gcc aaa cct ggg cca acc atc tta 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gaa att ggt gtg cta gac gcc aag gag tta gtg gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggt aca aac ttg gaa ctg aca cta ctt aag ctg aac cga aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat att agg ggc ttc tta gcc aag gaa gag gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gct gtg cta gca att aac ccn agc aag ttc cct aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Pro Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tat atc cca gtg gga caa gtt aca gag tat ggc ttc ctg aat ctg ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggt aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc acg agg gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggc gga gtg ctc atg tcc act ggc aaa gtt ttg ggg atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggc ggg aat ggt cat caa ggc ttc tca gcg gca ctt ctt aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gaa caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 490
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 490
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Pro Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 491
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B1_3C(T20P)
<400> 491
gga cct gta ttt gag ttt gcc gta gcc atg atg aag agg aat tcg agc 48
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
aca gtg aaa ccn gaa tac ggt gag ttc act atg ctg ggt atc tat gat 96
Thr Val Lys Pro Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gct gtt ttg cca cgt cat gcc aaa cct ggg cca acc atc tta 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gaa att ggt gtg cta gac gcc aag gag tta gtg gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggt aca aac ttg gaa ctg aca cta ctt aag ctg aac cga aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat att agg ggc ttc tta gcc aag gaa gag gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gct gtg cta gca att aac acc agc aag ttc cct aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tat atc cca gtg gga caa gtt aca gag tat ggc ttc ctg aat ctg ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggt aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc acg agg gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggc gga gtg ctc atg tcc act ggc aaa gtt ttg ggg atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggc ggg aat ggt cat caa ggc ttc tca gcg gca ctt ctt aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gaa caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 492
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 492
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Pro Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 493
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B1_3C(wt)
<400> 493
gga cct gta ttt gag ttt gcc gta gcc atg atg aag agg aat tcg agc 48
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
aca gtg aaa act gaa tac ggt gag ttc act atg ctg ggt atc tat gat 96
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gct gtt ttg cca cgt cat gcc aaa cct ggg cca acc atc tta 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gaa att ggt gtg cta gac gcc aag gag tta gtg gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggt aca aac ttg gaa ctg aca cta ctt aag ctg aac cga aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat att agg ggc ttc tta gcc aag gaa gag gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gct gtg cta gca att aac acc agc aag ttc cct aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tat atc cca gtg gga caa gtt aca gag tat ggc ttc ctg aat ctg ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggt aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc acg agg gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggc gga gtg ctc atg tcc act ggc aaa gtt ttg ggg atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggc ggg aat ggt cat caa ggc ttc tca gcg gca ctt ctt aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gaa caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 494
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 494
Gly Pro Val Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Ile Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 495
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B3_Macocy_3C(F109P)
<400> 495
ggc cct gcc ttt gag ttc gcc gtc gca atg atg aaa agg aac tca agc 48
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
acg gtg aag act gaa tat ggc gag ttt acc atg ctg ggc atc tat gac 96
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gcc gtt ttg cca cgc cac gcc aaa cct ggg cca acc atc ttg 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gag gtt ggt gtg cta gat gcc aag gag cta gta gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggc acc aac tta gaa ctg aca cta ctc aaa ttg aac cgg aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gac atc aga ggc ttc tta gcc aag gag gaa gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gca gtg cta gca att aac acc agc aag ccn ccc aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Pro Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gta gga cag gtc aca gaa tac ggc ttc cta aac cta ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc aca aga gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggc cag tgt ggt gga gtg ctc atg tcc acc ggc aag gta ctg ggt atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt gga aat ggc cat cag ggc ttc tca gca gca ctc ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gag caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 496
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 496
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Pro Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 497
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B3_Macocy_3C(K19P)
<400> 497
ggc cct gcc ttt gag ttc gcc gtc gca atg atg aaa agg aac tca agc 48
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
acg gtg ccn act gaa tat ggc gag ttt acc atg ctg ggc atc tat gac 96
Thr Val Pro Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gcc gtt ttg cca cgc cac gcc aaa cct ggg cca acc atc ttg 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gag gtt ggt gtg cta gat gcc aag gag cta gta gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggc acc aac tta gaa ctg aca cta ctc aaa ttg aac cgg aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gac atc aga ggc ttc tta gcc aag gag gaa gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gca gtg cta gca att aac acc agc aag ttt ccc aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gta gga cag gtc aca gaa tac ggc ttc cta aac cta ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc aca aga gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggc cag tgt ggt gga gtg ctc atg tcc acc ggc aag gta ctg ggt atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt gga aat ggc cat cag ggc ttc tca gca gca ctc ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gag caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 498
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 498
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Pro Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 499
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B3_Macocy_3C(L102P)
<400> 499
ggc cct gcc ttt gag ttc gcc gtc gca atg atg aaa agg aac tca agc 48
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
acg gtg aag act gaa tat ggc gag ttt acc atg ctg ggc atc tat gac 96
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gcc gtt ttg cca cgc cac gcc aaa cct ggg cca acc atc ttg 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gag gtt ggt gtg cta gat gcc aag gag cta gta gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggc acc aac tta gaa ctg aca cta ctc aaa ttg aac cgg aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gac atc aga ggc ttc tta gcc aag gag gaa gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gca gtg ccn gca att aac acc agc aag ttt ccc aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Pro Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gta gga cag gtc aca gaa tac ggc ttc cta aac cta ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc aca aga gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggc cag tgt ggt gga gtg ctc atg tcc acc ggc aag gta ctg ggt atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt gga aat ggc cat cag ggc ttc tca gca gca ctc ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gag caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 500
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 500
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Pro Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 501
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B3_Macocy_3C(N105P)
<400> 501
ggc cct gcc ttt gag ttc gcc gtc gca atg atg aaa agg aac tca agc 48
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
acg gtg aag act gaa tat ggc gag ttt acc atg ctg ggc atc tat gac 96
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gcc gtt ttg cca cgc cac gcc aaa cct ggg cca acc atc ttg 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gag gtt ggt gtg cta gat gcc aag gag cta gta gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggc acc aac tta gaa ctg aca cta ctc aaa ttg aac cgg aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gac atc aga ggc ttc tta gcc aag gag gaa gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gca gtg cta gca att ccn acc agc aag ttt ccc aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Pro Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gta gga cag gtc aca gaa tac ggc ttc cta aac cta ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc aca aga gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggc cag tgt ggt gga gtg ctc atg tcc acc ggc aag gta ctg ggt atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt gga aat ggc cat cag ggc ttc tca gca gca ctc ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gag caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 502
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 502
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Pro Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 503
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B3_Macocy_3C(R87P)
<400> 503
ggc cct gcc ttt gag ttc gcc gtc gca atg atg aaa agg aac tca agc 48
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
acg gtg aag act gaa tat ggc gag ttt acc atg ctg ggc atc tat gac 96
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gcc gtt ttg cca cgc cac gcc aaa cct ggg cca acc atc ttg 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gag gtt ggt gtg cta gat gcc aag gag cta gta gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggc acc aac tta gaa ctg aca cta ctc aaa ttg aac cgg aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gac atc ccn ggc ttc tta gcc aag gag gaa gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gca gtg cta gca att aac acc agc aag ttt ccc aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gta gga cag gtc aca gaa tac ggc ttc cta aac cta ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc aca aga gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggc cag tgt ggt gga gtg ctc atg tcc acc ggc aag gta ctg ggt atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt gga aat ggc cat cag ggc ttc tca gca gca ctc ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gag caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 504
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 504
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 505
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B3_Macocy_3C(T106P)
<400> 505
ggc cct gcc ttt gag ttc gcc gtc gca atg atg aaa agg aac tca agc 48
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
acg gtg aag act gaa tat ggc gag ttt acc atg ctg ggc atc tat gac 96
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gcc gtt ttg cca cgc cac gcc aaa cct ggg cca acc atc ttg 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gag gtt ggt gtg cta gat gcc aag gag cta gta gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggc acc aac tta gaa ctg aca cta ctc aaa ttg aac cgg aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gac atc aga ggc ttc tta gcc aag gag gaa gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gca gtg cta gca att aac ccn agc aag ttt ccc aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Pro Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gta gga cag gtc aca gaa tac ggc ttc cta aac cta ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc aca aga gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggc cag tgt ggt gga gtg ctc atg tcc acc ggc aag gta ctg ggt atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt gga aat ggc cat cag ggc ttc tca gca gca ctc ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gag caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 506
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 506
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Pro Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 507
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B3_Macocy_3C(T20P)
<400> 507
ggc cct gcc ttt gag ttc gcc gtc gca atg atg aaa agg aac tca agc 48
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
acg gtg aag ccn gaa tat ggc gag ttt acc atg ctg ggc atc tat gac 96
Thr Val Lys Pro Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gcc gtt ttg cca cgc cac gcc aaa cct ggg cca acc atc ttg 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gag gtt ggt gtg cta gat gcc aag gag cta gta gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggc acc aac tta gaa ctg aca cta ctc aaa ttg aac cgg aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gac atc aga ggc ttc tta gcc aag gag gaa gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gca gtg cta gca att aac acc agc aag ttt ccc aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gta gga cag gtc aca gaa tac ggc ttc cta aac cta ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc aca aga gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggc cag tgt ggt gga gtg ctc atg tcc acc ggc aag gta ctg ggt atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt gga aat ggc cat cag ggc ttc tca gca gca ctc ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gag caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 508
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 508
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Pro Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 509
<211> 549
<212> DNA
<213> Human coxsackievirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Coxsackievirus_B3_Macocy_3C(wt)
<400> 509
ggc cct gcc ttt gag ttc gcc gtc gca atg atg aaa agg aac tca agc 48
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
acg gtg aag act gaa tat ggc gag ttt acc atg ctg ggc atc tat gac 96
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gcc gtt ttg cca cgc cac gcc aaa cct ggg cca acc atc ttg 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aat gat caa gag gtt ggt gtg cta gat gcc aag gag cta gta gac 192
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aag gac ggc acc aac tta gaa ctg aca cta ctc aaa ttg aac cgg aat 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gac atc aga ggc ttc tta gcc aag gag gaa gtg gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtt aat gag gca gtg cta gca att aac acc agc aag ttt ccc aac atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac att cca gta gga cag gtc aca gaa tac ggc ttc cta aac cta ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggc aca ccc acc aag aga atg ctt atg tac aac ttc ccc aca aga gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggc cag tgt ggt gga gtg ctc atg tcc acc ggc aag gta ctg ggt atc 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt gga aat ggc cat cag ggc ttc tca gca gca ctc ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
cac tac ttc aat gat gag caa 549
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 510
<211> 183
<212> PRT
<213> Human coxsackievirus
<400> 510
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ser Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Glu Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Lys Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Gln Val Thr Glu Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Lys
165 170 175
His Tyr Phe Asn Asp Glu Gln
180
<210> 511
<211> 549
<212> DNA
<213> Human enterovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Enterovirus_A71_Strain_C4_KP861243_3C(I104P)
<400> 511
ggc ccg agc ctt gac ttt gct ctc tcc cta ctg aga agg aac atc agg 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gtc caa aca gac caa ggg cat ttc acc atg ttg ggt gtt agg gat 96
Gln Val Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
cgc tta gca gtc ctc cca cgc cac tca caa cct ggc aaa acc att tgg 144
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
att gag cac aaa ctc gtg aac gtc ctt gat gca gtt gaa ctg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa gga gtc aac ctg gaa tta acc ctc atc act ctt gac acc aac 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt agg gat atc acc aaa ttc atc cca gaa aat atc agc act 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
gct agc gat gcc acc cta gtg ccn aac acg gag cac atg cca tca atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Pro Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtc ccg gtg ggt gac gtt gtg cag tat ggc ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggt aag cct acc cat cgc acc atg atg tac aat ttt cct acc aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt gga gga gtg gtg acg tct gtt ggg aag gtt gtc ggt att 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggt ggc aat ggc aga caa ggt ttt tgc gca ggc ctc aaa agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt gct agt gaa caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 512
<211> 183
<212> PRT
<213> Human enterovirus
<400> 512
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Val Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Pro Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 513
<211> 549
<212> DNA
<213> Human enterovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Enterovirus_A71_Strain_C4_KP861243_3C(M109P)
<400> 513
ggc ccg agc ctt gac ttt gct ctc tcc cta ctg aga agg aac atc agg 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gtc caa aca gac caa ggg cat ttc acc atg ttg ggt gtt agg gat 96
Gln Val Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
cgc tta gca gtc ctc cca cgc cac tca caa cct ggc aaa acc att tgg 144
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
att gag cac aaa ctc gtg aac gtc ctt gat gca gtt gaa ctg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa gga gtc aac ctg gaa tta acc ctc atc act ctt gac acc aac 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt agg gat atc acc aaa ttc atc cca gaa aat atc agc act 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
gct agc gat gcc acc cta gtg atc aac acg gag cac ccn cca tca atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Pro Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtc ccg gtg ggt gac gtt gtg cag tat ggc ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggt aag cct acc cat cgc acc atg atg tac aat ttt cct acc aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt gga gga gtg gtg acg tct gtt ggg aag gtt gtc ggt att 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggt ggc aat ggc aga caa ggt ttt tgc gca ggc ctc aaa agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt gct agt gaa caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 514
<211> 183
<212> PRT
<213> Human enterovirus
<400> 514
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Val Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Pro Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 515
<211> 549
<212> DNA
<213> Human enterovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Enterovirus_A71_Strain_C4_KP861243_3C(N105P)
<400> 515
ggc ccg agc ctt gac ttt gct ctc tcc cta ctg aga agg aac atc agg 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gtc caa aca gac caa ggg cat ttc acc atg ttg ggt gtt agg gat 96
Gln Val Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
cgc tta gca gtc ctc cca cgc cac tca caa cct ggc aaa acc att tgg 144
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
att gag cac aaa ctc gtg aac gtc ctt gat gca gtt gaa ctg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa gga gtc aac ctg gaa tta acc ctc atc act ctt gac acc aac 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt agg gat atc acc aaa ttc atc cca gaa aat atc agc act 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
gct agc gat gcc acc cta gtg atc ccn acg gag cac atg cca tca atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Pro Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtc ccg gtg ggt gac gtt gtg cag tat ggc ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggt aag cct acc cat cgc acc atg atg tac aat ttt cct acc aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt gga gga gtg gtg acg tct gtt ggg aag gtt gtc ggt att 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggt ggc aat ggc aga caa ggt ttt tgc gca ggc ctc aaa agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt gct agt gaa caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 516
<211> 183
<212> PRT
<213> Human enterovirus
<400> 516
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Val Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Pro Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 517
<211> 549
<212> DNA
<213> Human enterovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Enterovirus_A71_Strain_C4_KP861243_3C(Q19P)
<400> 517
ggc ccg agc ctt gac ttt gct ctc tcc cta ctg aga agg aac atc agg 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gtc ccn aca gac caa ggg cat ttc acc atg ttg ggt gtt agg gat 96
Gln Val Pro Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
cgc tta gca gtc ctc cca cgc cac tca caa cct ggc aaa acc att tgg 144
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
att gag cac aaa ctc gtg aac gtc ctt gat gca gtt gaa ctg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa gga gtc aac ctg gaa tta acc ctc atc act ctt gac acc aac 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt agg gat atc acc aaa ttc atc cca gaa aat atc agc act 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
gct agc gat gcc acc cta gtg atc aac acg gag cac atg cca tca atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtc ccg gtg ggt gac gtt gtg cag tat ggc ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggt aag cct acc cat cgc acc atg atg tac aat ttt cct acc aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt gga gga gtg gtg acg tct gtt ggg aag gtt gtc ggt att 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggt ggc aat ggc aga caa ggt ttt tgc gca ggc ctc aaa agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt gct agt gaa caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 518
<211> 183
<212> PRT
<213> Human enterovirus
<400> 518
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Val Pro Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 519
<211> 549
<212> DNA
<213> Human enterovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Enterovirus_A71_Strain_C4_KP861243_3C(T106P)
<400> 519
ggc ccg agc ctt gac ttt gct ctc tcc cta ctg aga agg aac atc agg 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gtc caa aca gac caa ggg cat ttc acc atg ttg ggt gtt agg gat 96
Gln Val Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
cgc tta gca gtc ctc cca cgc cac tca caa cct ggc aaa acc att tgg 144
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
att gag cac aaa ctc gtg aac gtc ctt gat gca gtt gaa ctg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa gga gtc aac ctg gaa tta acc ctc atc act ctt gac acc aac 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt agg gat atc acc aaa ttc atc cca gaa aat atc agc act 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
gct agc gat gcc acc cta gtg atc aac ccn gag cac atg cca tca atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Pro Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtc ccg gtg ggt gac gtt gtg cag tat ggc ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggt aag cct acc cat cgc acc atg atg tac aat ttt cct acc aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt gga gga gtg gtg acg tct gtt ggg aag gtt gtc ggt att 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggt ggc aat ggc aga caa ggt ttt tgc gca ggc ctc aaa agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt gct agt gaa caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 520
<211> 183
<212> PRT
<213> Human enterovirus
<400> 520
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Val Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Pro Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 521
<211> 549
<212> DNA
<213> Human enterovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Enterovirus_A71_Strain_C4_KP861243_3C(T20P)
<400> 521
ggc ccg agc ctt gac ttt gct ctc tcc cta ctg aga agg aac atc agg 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gtc caa ccn gac caa ggg cat ttc acc atg ttg ggt gtt agg gat 96
Gln Val Gln Pro Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
cgc tta gca gtc ctc cca cgc cac tca caa cct ggc aaa acc att tgg 144
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
att gag cac aaa ctc gtg aac gtc ctt gat gca gtt gaa ctg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa gga gtc aac ctg gaa tta acc ctc atc act ctt gac acc aac 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt agg gat atc acc aaa ttc atc cca gaa aat atc agc act 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
gct agc gat gcc acc cta gtg atc aac acg gag cac atg cca tca atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtc ccg gtg ggt gac gtt gtg cag tat ggc ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggt aag cct acc cat cgc acc atg atg tac aat ttt cct acc aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt gga gga gtg gtg acg tct gtt ggg aag gtt gtc ggt att 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggt ggc aat ggc aga caa ggt ttt tgc gca ggc ctc aaa agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt gct agt gaa caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 522
<211> 183
<212> PRT
<213> Human enterovirus
<400> 522
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Val Gln Pro Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 523
<211> 549
<212> DNA
<213> Human enterovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Enterovirus_A71_Strain_C4_KP861243_3C(T87P)
<400> 523
ggc ccg agc ctt gac ttt gct ctc tcc cta ctg aga agg aac atc agg 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gtc caa aca gac caa ggg cat ttc acc atg ttg ggt gtt agg gat 96
Gln Val Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
cgc tta gca gtc ctc cca cgc cac tca caa cct ggc aaa acc att tgg 144
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
att gag cac aaa ctc gtg aac gtc ctt gat gca gtt gaa ctg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa gga gtc aac ctg gaa tta acc ctc atc act ctt gac acc aac 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt agg gat atc ccn aaa ttc atc cca gaa aat atc agc act 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
gct agc gat gcc acc cta gtg atc aac acg gag cac atg cca tca atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtc ccg gtg ggt gac gtt gtg cag tat ggc ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggt aag cct acc cat cgc acc atg atg tac aat ttt cct acc aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt gga gga gtg gtg acg tct gtt ggg aag gtt gtc ggt att 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggt ggc aat ggc aga caa ggt ttt tgc gca ggc ctc aaa agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt gct agt gaa caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 524
<211> 183
<212> PRT
<213> Human enterovirus
<400> 524
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Val Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 525
<211> 549
<212> DNA
<213> Human enterovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Enterovirus_A71_Strain_C4_KP861243_3C(wt)
<400> 525
ggc ccg agc ctt gac ttt gct ctc tcc cta ctg aga agg aac atc agg 48
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
caa gtc caa aca gac caa ggg cat ttc acc atg ttg ggt gtt agg gat 96
Gln Val Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
cgc tta gca gtc ctc cca cgc cac tca caa cct ggc aaa acc att tgg 144
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
att gag cac aaa ctc gtg aac gtc ctt gat gca gtt gaa ctg gtg gat 192
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
gag caa gga gtc aac ctg gaa tta acc ctc atc act ctt gac acc aac 240
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt agg gat atc acc aaa ttc atc cca gaa aat atc agc act 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
gct agc gat gcc acc cta gtg atc aac acg gag cac atg cca tca atg 336
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
ttt gtc ccg gtg ggt gac gtt gtg cag tat ggc ttt ttg aat ctc agt 384
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
ggt aag cct acc cat cgc acc atg atg tac aat ttt cct acc aaa gca 432
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga cag tgt gga gga gtg gtg acg tct gtt ggg aag gtt gtc ggt att 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
cac att ggt ggc aat ggc aga caa ggt ttt tgc gca ggc ctc aaa agg 528
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
agt tac ttt gct agt gaa caa 549
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 526
<211> 183
<212> PRT
<213> Human enterovirus
<400> 526
Gly Pro Ser Leu Asp Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Arg Asn Ile Arg
1 5 10 15
Gln Val Gln Thr Asp Gln Gly His Phe Thr Met Leu Gly Val Arg Asp
20 25 30
Arg Leu Ala Val Leu Pro Arg His Ser Gln Pro Gly Lys Thr Ile Trp
35 40 45
Ile Glu His Lys Leu Val Asn Val Leu Asp Ala Val Glu Leu Val Asp
50 55 60
Glu Gln Gly Val Asn Leu Glu Leu Thr Leu Ile Thr Leu Asp Thr Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Thr Lys Phe Ile Pro Glu Asn Ile Ser Thr
85 90 95
Ala Ser Asp Ala Thr Leu Val Ile Asn Thr Glu His Met Pro Ser Met
100 105 110
Phe Val Pro Val Gly Asp Val Val Gln Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Ser
115 120 125
Gly Lys Pro Thr His Arg Thr Met Met Tyr Asn Phe Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Val Thr Ser Val Gly Lys Val Val Gly Ile
145 150 155 160
His Ile Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Cys Ala Gly Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Ala Ser Glu Gln
180
<210> 527
<211> 657
<212> DNA
<213> Human hepatitus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(657)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(657)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(657)
<223> Human_Hepatitis_A_Virus_NC001489_3C(E20P)
<400> 527
tca act ttg gaa ata gca gga ctg gtt agg aag aac ttg gtt cag ttt 48
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
gga gtt gga ccn aag aat gga tgt gtg aga tgg gtt atg aat gcc ttg 96
Gly Val Gly Pro Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
gga gtg aaa gat gat tgg ctg ctt gtg cct tcc cat gct tat aaa ttt 144
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
gag aaa gat tat gaa atg atg gag ttt tat ttt aat aga ggt gga act 192
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
tac tat tca att tca gct ggt aat gtt gtt att caa tct ttg gat gtg 240
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
gga ttc cag gat gtt gtt ctg atg aag gtt cct aca att cct aag ttt 288
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
aga gat att act cag cat ttt att aag aaa ggg gat gtg cct aga gct 336
Arg Asp Ile Thr Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
ttg aat cgc ctg gca aca tta gtg aca act gta aat gga acc cct atg 384
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Met
115 120 125
tta att tct gag ggc cca cta aag atg gaa gag aaa gct act tat gtt 432
Leu Ile Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
cat aag aaa aat gat ggt aca aca gtt gat tta act gtg gat cag gca 480
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
tgg aga gga aaa ggc gaa ggt ctt cct gga atg tgt ggt ggg gcc ttg 528
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
gtt tca tcg aat caa tct ata cag aat gca atc ttg ggc atc cat gtt 576
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
gct gga gga aat tca att ctt gtt gca aaa ttg gtt act caa gaa atg 624
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
ttc caa aat att gat aag aaa att gaa agt cag 657
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 528
<211> 219
<212> PRT
<213> Human hepatitus
<400> 528
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
Gly Val Gly Pro Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Met
115 120 125
Leu Ile Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 529
<211> 657
<212> DNA
<213> Human hepatitus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(657)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(657)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(657)
<223> Human_Hepatitis_A_Virus_NC001489_3C(G19P)
<400> 529
tca act ttg gaa ata gca gga ctg gtt agg aag aac ttg gtt cag ttt 48
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
gga gtt ccn gag aag aat gga tgt gtg aga tgg gtt atg aat gcc ttg 96
Gly Val Pro Glu Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
gga gtg aaa gat gat tgg ctg ctt gtg cct tcc cat gct tat aaa ttt 144
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
gag aaa gat tat gaa atg atg gag ttt tat ttt aat aga ggt gga act 192
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
tac tat tca att tca gct ggt aat gtt gtt att caa tct ttg gat gtg 240
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
gga ttc cag gat gtt gtt ctg atg aag gtt cct aca att cct aag ttt 288
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
aga gat att act cag cat ttt att aag aaa ggg gat gtg cct aga gct 336
Arg Asp Ile Thr Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
ttg aat cgc ctg gca aca tta gtg aca act gta aat gga acc cct atg 384
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Met
115 120 125
tta att tct gag ggc cca cta aag atg gaa gag aaa gct act tat gtt 432
Leu Ile Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
cat aag aaa aat gat ggt aca aca gtt gat tta act gtg gat cag gca 480
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
tgg aga gga aaa ggc gaa ggt ctt cct gga atg tgt ggt ggg gcc ttg 528
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
gtt tca tcg aat caa tct ata cag aat gca atc ttg ggc atc cat gtt 576
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
gct gga gga aat tca att ctt gtt gca aaa ttg gtt act caa gaa atg 624
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
ttc caa aat att gat aag aaa att gaa agt cag 657
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 530
<211> 219
<212> PRT
<213> Human hepatitus
<400> 530
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
Gly Val Pro Glu Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Met
115 120 125
Leu Ile Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 531
<211> 657
<212> DNA
<213> Human hepatitus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(657)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(657)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(657)
<223> Human_Hepatitis_A_Virus_NC001489_3C(I130P)
<400> 531
tca act ttg gaa ata gca gga ctg gtt agg aag aac ttg gtt cag ttt 48
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
gga gtt gga gag aag aat gga tgt gtg aga tgg gtt atg aat gcc ttg 96
Gly Val Gly Glu Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
gga gtg aaa gat gat tgg ctg ctt gtg cct tcc cat gct tat aaa ttt 144
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
gag aaa gat tat gaa atg atg gag ttt tat ttt aat aga ggt gga act 192
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
tac tat tca att tca gct ggt aat gtt gtt att caa tct ttg gat gtg 240
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
gga ttc cag gat gtt gtt ctg atg aag gtt cct aca att cct aag ttt 288
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
aga gat att act cag cat ttt att aag aaa ggg gat gtg cct aga gct 336
Arg Asp Ile Thr Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
ttg aat cgc ctg gca aca tta gtg aca act gta aat gga acc cct atg 384
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Met
115 120 125
tta ccn tct gag ggc cca cta aag atg gaa gag aaa gct act tat gtt 432
Leu Pro Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
cat aag aaa aat gat ggt aca aca gtt gat tta act gtg gat cag gca 480
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
tgg aga gga aaa ggc gaa ggt ctt cct gga atg tgt ggt ggg gcc ttg 528
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
gtt tca tcg aat caa tct ata cag aat gca atc ttg ggc atc cat gtt 576
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
gct gga gga aat tca att ctt gtt gca aaa ttg gtt act caa gaa atg 624
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
ttc caa aat att gat aag aaa att gaa agt cag 657
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 532
<211> 219
<212> PRT
<213> Human hepatitus
<400> 532
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
Gly Val Gly Glu Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Met
115 120 125
Leu Pro Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 533
<211> 657
<212> DNA
<213> Human hepatitus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(657)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(657)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(657)
<223> Human_Hepatitis_A_Virus_NC001489_3C(M128P)
<400> 533
tca act ttg gaa ata gca gga ctg gtt agg aag aac ttg gtt cag ttt 48
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
gga gtt gga gag aag aat gga tgt gtg aga tgg gtt atg aat gcc ttg 96
Gly Val Gly Glu Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
gga gtg aaa gat gat tgg ctg ctt gtg cct tcc cat gct tat aaa ttt 144
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
gag aaa gat tat gaa atg atg gag ttt tat ttt aat aga ggt gga act 192
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
tac tat tca att tca gct ggt aat gtt gtt att caa tct ttg gat gtg 240
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
gga ttc cag gat gtt gtt ctg atg aag gtt cct aca att cct aag ttt 288
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
aga gat att act cag cat ttt att aag aaa ggg gat gtg cct aga gct 336
Arg Asp Ile Thr Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
ttg aat cgc ctg gca aca tta gtg aca act gta aat gga acc cct ccn 384
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Pro
115 120 125
tta att tct gag ggc cca cta aag atg gaa gag aaa gct act tat gtt 432
Leu Ile Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
cat aag aaa aat gat ggt aca aca gtt gat tta act gtg gat cag gca 480
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
tgg aga gga aaa ggc gaa ggt ctt cct gga atg tgt ggt ggg gcc ttg 528
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
gtt tca tcg aat caa tct ata cag aat gca atc ttg ggc atc cat gtt 576
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
gct gga gga aat tca att ctt gtt gca aaa ttg gtt act caa gaa atg 624
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
ttc caa aat att gat aag aaa att gaa agt cag 657
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 534
<211> 219
<212> PRT
<213> Human hepatitus
<400> 534
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
Gly Val Gly Glu Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Pro
115 120 125
Leu Ile Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 535
<211> 657
<212> DNA
<213> Human hepatitus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(657)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(657)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(657)
<223> Human_Hepatitis_A_Virus_NC001489_3C(T100P)
<400> 535
tca act ttg gaa ata gca gga ctg gtt agg aag aac ttg gtt cag ttt 48
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
gga gtt gga gag aag aat gga tgt gtg aga tgg gtt atg aat gcc ttg 96
Gly Val Gly Glu Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
gga gtg aaa gat gat tgg ctg ctt gtg cct tcc cat gct tat aaa ttt 144
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
gag aaa gat tat gaa atg atg gag ttt tat ttt aat aga ggt gga act 192
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
tac tat tca att tca gct ggt aat gtt gtt att caa tct ttg gat gtg 240
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
gga ttc cag gat gtt gtt ctg atg aag gtt cct aca att cct aag ttt 288
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
aga gat att ccn cag cat ttt att aag aaa ggg gat gtg cct aga gct 336
Arg Asp Ile Pro Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
ttg aat cgc ctg gca aca tta gtg aca act gta aat gga acc cct atg 384
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Met
115 120 125
tta att tct gag ggc cca cta aag atg gaa gag aaa gct act tat gtt 432
Leu Ile Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
cat aag aaa aat gat ggt aca aca gtt gat tta act gtg gat cag gca 480
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
tgg aga gga aaa ggc gaa ggt ctt cct gga atg tgt ggt ggg gcc ttg 528
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
gtt tca tcg aat caa tct ata cag aat gca atc ttg ggc atc cat gtt 576
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
gct gga gga aat tca att ctt gtt gca aaa ttg gtt act caa gaa atg 624
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
ttc caa aat att gat aag aaa att gaa agt cag 657
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 536
<211> 219
<212> PRT
<213> Human hepatitus
<400> 536
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
Gly Val Gly Glu Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
Arg Asp Ile Pro Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Met
115 120 125
Leu Ile Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 537
<211> 657
<212> DNA
<213> Human hepatitus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(657)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(657)
<223> Human_Hepatitis_A_Virus_NC001489_3C(wt)
<400> 537
tca act ttg gaa ata gca gga ctg gtt agg aag aac ttg gtt cag ttt 48
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
gga gtt gga gag aag aat gga tgt gtg aga tgg gtt atg aat gcc ttg 96
Gly Val Gly Glu Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
gga gtg aaa gat gat tgg ctg ctt gtg cct tcc cat gct tat aaa ttt 144
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
gag aaa gat tat gaa atg atg gag ttt tat ttt aat aga ggt gga act 192
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
tac tat tca att tca gct ggt aat gtt gtt att caa tct ttg gat gtg 240
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
gga ttc cag gat gtt gtt ctg atg aag gtt cct aca att cct aag ttt 288
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
aga gat att act cag cat ttt att aag aaa ggg gat gtg cct aga gct 336
Arg Asp Ile Thr Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
ttg aat cgc ctg gca aca tta gtg aca act gta aat gga acc cct atg 384
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Met
115 120 125
tta att tct gag ggc cca cta aag atg gaa gag aaa gct act tat gtt 432
Leu Ile Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
cat aag aaa aat gat ggt aca aca gtt gat tta act gtg gat cag gca 480
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
tgg aga gga aaa ggc gaa ggt ctt cct gga atg tgt ggt ggg gcc ttg 528
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
gtt tca tcg aat caa tct ata cag aat gca atc ttg ggc atc cat gtt 576
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
gct gga gga aat tca att ctt gtt gca aaa ttg gtt act caa gaa atg 624
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
ttc caa aat att gat aag aaa att gaa agt cag 657
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 538
<211> 219
<212> PRT
<213> Human hepatitus
<400> 538
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
Gly Val Gly Glu Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Met
115 120 125
Leu Ile Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 539
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_2_Strain_R93152_3C(I103P)
<400> 539
ggc cct ggg ttt gat tac gca gtg gcc atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca acc acc agc aaa ggg gag ttt acg atg ttg gga gtc tat gat 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aat gtg gcc atc ttg cca acc cac gcc tca cct ggt gaa agc att gcg 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Ala
35 40 45
atc gac ggt aaa gag gtg gaa att ctc gac gcc aaa gcc ctt gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
cag gca gga act aat ctt gaa att acc ata att aca cta aag agg aac 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gat atc agg cca cac att ccc acc caa atc acc gaa 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
aca aat gat gga gtt ttg ccn gtg aac act agt aag tac ccc aac atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Pro Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tat gtt ccc gtt ggt gct gtg acc gaa cag ggg tat ctt aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
gga cga caa acc gct cgt acg cta atg tac aac ttt cca act aga gca 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggt ggt gtc atc acg tgc act ggt aaa gtc att ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cat gtt ggt ggg aac ggt tca cat ggg ttc gcg gcg gcc cta aag cgg 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag att caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ile Gln
180
<210> 540
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 540
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Ala
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Pro Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ile Gln
180
<210> 541
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_2_Strain_R93152_3C(L102P)
<400> 541
ggc cct ggg ttt gat tac gca gtg gcc atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca acc acc agc aaa ggg gag ttt acg atg ttg gga gtc tat gat 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aat gtg gcc atc ttg cca acc cac gcc tca cct ggt gaa agc att gcg 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Ala
35 40 45
atc gac ggt aaa gag gtg gaa att ctc gac gcc aaa gcc ctt gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
cag gca gga act aat ctt gaa att acc ata att aca cta aag agg aac 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gat atc agg cca cac att ccc acc caa atc acc gaa 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
aca aat gat gga gtt ccn atc gtg aac act agt aag tac ccc aac atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Pro Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tat gtt ccc gtt ggt gct gtg acc gaa cag ggg tat ctt aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
gga cga caa acc gct cgt acg cta atg tac aac ttt cca act aga gca 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggt ggt gtc atc acg tgc act ggt aaa gtc att ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cat gtt ggt ggg aac ggt tca cat ggg ttc gcg gcg gcc cta aag cgg 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag att caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ile Gln
180
<210> 542
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 542
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Ala
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Pro Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ile Gln
180
<210> 543
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_2_Strain_R93152_3C(R87P)
<400> 543
ggc cct ggg ttt gat tac gca gtg gcc atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca acc acc agc aaa ggg gag ttt acg atg ttg gga gtc tat gat 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aat gtg gcc atc ttg cca acc cac gcc tca cct ggt gaa agc att gcg 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Ala
35 40 45
atc gac ggt aaa gag gtg gaa att ctc gac gcc aaa gcc ctt gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
cag gca gga act aat ctt gaa att acc ata att aca cta aag agg aac 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gat atc ccn cca cac att ccc acc caa atc acc gaa 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
aca aat gat gga gtt ttg atc gtg aac act agt aag tac ccc aac atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tat gtt ccc gtt ggt gct gtg acc gaa cag ggg tat ctt aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
gga cga caa acc gct cgt acg cta atg tac aac ttt cca act aga gca 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggt ggt gtc atc acg tgc act ggt aaa gtc att ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cat gtt ggt ggg aac ggt tca cat ggg ttc gcg gcg gcc cta aag cgg 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag att caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ile Gln
180
<210> 544
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 544
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Ala
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ile Gln
180
<210> 545
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_2_Strain_R93152_3C(T19P)
<400> 545
ggc cct ggg ttt gat tac gca gtg gcc atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca ccn acc agc aaa ggg gag ttt acg atg ttg gga gtc tat gat 96
Thr Ala Pro Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aat gtg gcc atc ttg cca acc cac gcc tca cct ggt gaa agc att gcg 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Ala
35 40 45
atc gac ggt aaa gag gtg gaa att ctc gac gcc aaa gcc ctt gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
cag gca gga act aat ctt gaa att acc ata att aca cta aag agg aac 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gat atc agg cca cac att ccc acc caa atc acc gaa 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
aca aat gat gga gtt ttg atc gtg aac act agt aag tac ccc aac atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tat gtt ccc gtt ggt gct gtg acc gaa cag ggg tat ctt aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
gga cga caa acc gct cgt acg cta atg tac aac ttt cca act aga gca 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggt ggt gtc atc acg tgc act ggt aaa gtc att ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cat gtt ggt ggg aac ggt tca cat ggg ttc gcg gcg gcc cta aag cgg 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag att caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ile Gln
180
<210> 546
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 546
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Pro Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Ala
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ile Gln
180
<210> 547
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_2_Strain_R93152_3C(T20P)
<400> 547
ggc cct ggg ttt gat tac gca gtg gcc atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca acc ccn agc aaa ggg gag ttt acg atg ttg gga gtc tat gat 96
Thr Ala Thr Pro Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aat gtg gcc atc ttg cca acc cac gcc tca cct ggt gaa agc att gcg 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Ala
35 40 45
atc gac ggt aaa gag gtg gaa att ctc gac gcc aaa gcc ctt gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
cag gca gga act aat ctt gaa att acc ata att aca cta aag agg aac 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gat atc agg cca cac att ccc acc caa atc acc gaa 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
aca aat gat gga gtt ttg atc gtg aac act agt aag tac ccc aac atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tat gtt ccc gtt ggt gct gtg acc gaa cag ggg tat ctt aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
gga cga caa acc gct cgt acg cta atg tac aac ttt cca act aga gca 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggt ggt gtc atc acg tgc act ggt aaa gtc att ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cat gtt ggt ggg aac ggt tca cat ggg ttc gcg gcg gcc cta aag cgg 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag att caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ile Gln
180
<210> 548
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 548
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Pro Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Ala
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ile Gln
180
<210> 549
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_2_Strain_R93152_3C(V104P)
<400> 549
ggc cct ggg ttt gat tac gca gtg gcc atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca acc acc agc aaa ggg gag ttt acg atg ttg gga gtc tat gat 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aat gtg gcc atc ttg cca acc cac gcc tca cct ggt gaa agc att gcg 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Ala
35 40 45
atc gac ggt aaa gag gtg gaa att ctc gac gcc aaa gcc ctt gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
cag gca gga act aat ctt gaa att acc ata att aca cta aag agg aac 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gat atc agg cca cac att ccc acc caa atc acc gaa 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
aca aat gat gga gtt ttg atc ccn aac act agt aag tac ccc aac atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Pro Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tat gtt ccc gtt ggt gct gtg acc gaa cag ggg tat ctt aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
gga cga caa acc gct cgt acg cta atg tac aac ttt cca act aga gca 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggt ggt gtc atc acg tgc act ggt aaa gtc att ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cat gtt ggt ggg aac ggt tca cat ggg ttc gcg gcg gcc cta aag cgg 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag att caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ile Gln
180
<210> 550
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 550
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Ala
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Pro Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ile Gln
180
<210> 551
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_2_Strain_R93152_3C(wt)
<400> 551
ggc cct ggg ttt gat tac gca gtg gcc atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca acc acc agc aaa ggg gag ttt acg atg ttg gga gtc tat gat 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aat gtg gcc atc ttg cca acc cac gcc tca cct ggt gaa agc att gcg 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Ala
35 40 45
atc gac ggt aaa gag gtg gaa att ctc gac gcc aaa gcc ctt gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
cag gca gga act aat ctt gaa att acc ata att aca cta aag agg aac 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttc aga gat atc agg cca cac att ccc acc caa atc acc gaa 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
aca aat gat gga gtt ttg atc gtg aac act agt aag tac ccc aac atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tat gtt ccc gtt ggt gct gtg acc gaa cag ggg tat ctt aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
gga cga caa acc gct cgt acg cta atg tac aac ttt cca act aga gca 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggt ggt gtc atc acg tgc act ggt aaa gtc att ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cat gtt ggt ggg aac ggt tca cat ggg ttc gcg gcg gcc cta aag cgg 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag att caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ile Gln
180
<210> 552
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 552
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Ala
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ile Gln
180
<210> 553
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_3_Isolate_CHN5275/JX/CHN/2001_FJ859183_3C(I103P)
<400> 553
ggg cct ggg ttt gac tat gca gtg gct atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca act act agc aaa ggg gag ttc aca atg cta gga gtc cac gac 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aac gtg gcc att ttg cca act cat gcc tca cct ggt gag agt att gta 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
att gat ggc aaa gag gtt gaa atc cta gac gct aaa gcc ctc gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
cag gca ggc act aat ctg gaa atc acc ata ata acc ctc aaa aga aat 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat atc aga caa cac ata ccc act caa atc acc gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gln His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
acg aat gat gga gtt ctg ccn gtg aac act agt aag tac ccc aac atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Pro Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tac gtt cct gtc ggt gct gtg act gag cag gga tac cta aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggg cgc cag act gct cgt act cta atg tac aac ttt cca acc aga gct 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggt gga gtc atc aca tgc act ggg aaa gtc atc ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cac gtt ggt ggg aat ggt tca cat ggg ttt gca gcg gcc ctg aag cgg 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag agc caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 554
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 554
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gln His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Pro Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 555
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_3_Isolate_CHN5275/JX/CHN/2001_FJ859183_3C(L102P)
<400> 555
ggg cct ggg ttt gac tat gca gtg gct atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca act act agc aaa ggg gag ttc aca atg cta gga gtc cac gac 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aac gtg gcc att ttg cca act cat gcc tca cct ggt gag agt att gta 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
att gat ggc aaa gag gtt gaa atc cta gac gct aaa gcc ctc gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
cag gca ggc act aat ctg gaa atc acc ata ata acc ctc aaa aga aat 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat atc aga caa cac ata ccc act caa atc acc gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gln His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
acg aat gat gga gtt ccn att gtg aac act agt aag tac ccc aac atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Pro Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tac gtt cct gtc ggt gct gtg act gag cag gga tac cta aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggg cgc cag act gct cgt act cta atg tac aac ttt cca acc aga gct 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggt gga gtc atc aca tgc act ggg aaa gtc atc ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cac gtt ggt ggg aat ggt tca cat ggg ttt gca gcg gcc ctg aag cgg 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag agc caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 556
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 556
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gln His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Pro Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 557
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_3_Isolate_CHN5275/JX/CHN/2001_FJ859183_3C(R87P)
<400> 557
ggg cct ggg ttt gac tat gca gtg gct atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca act act agc aaa ggg gag ttc aca atg cta gga gtc cac gac 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aac gtg gcc att ttg cca act cat gcc tca cct ggt gag agt att gta 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
att gat ggc aaa gag gtt gaa atc cta gac gct aaa gcc ctc gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
cag gca ggc act aat ctg gaa atc acc ata ata acc ctc aaa aga aat 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat atc ccn caa cac ata ccc act caa atc acc gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Gln His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
acg aat gat gga gtt ctg att gtg aac act agt aag tac ccc aac atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tac gtt cct gtc ggt gct gtg act gag cag gga tac cta aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggg cgc cag act gct cgt act cta atg tac aac ttt cca acc aga gct 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggt gga gtc atc aca tgc act ggg aaa gtc atc ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cac gtt ggt ggg aat ggt tca cat ggg ttt gca gcg gcc ctg aag cgg 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag agc caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 558
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 558
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Gln His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 559
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_3_Isolate_CHN5275/JX/CHN/2001_FJ859183_3C(T19P)
<400> 559
ggg cct ggg ttt gac tat gca gtg gct atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca ccn act agc aaa ggg gag ttc aca atg cta gga gtc cac gac 96
Thr Ala Pro Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aac gtg gcc att ttg cca act cat gcc tca cct ggt gag agt att gta 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
att gat ggc aaa gag gtt gaa atc cta gac gct aaa gcc ctc gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
cag gca ggc act aat ctg gaa atc acc ata ata acc ctc aaa aga aat 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat atc aga caa cac ata ccc act caa atc acc gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gln His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
acg aat gat gga gtt ctg att gtg aac act agt aag tac ccc aac atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tac gtt cct gtc ggt gct gtg act gag cag gga tac cta aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggg cgc cag act gct cgt act cta atg tac aac ttt cca acc aga gct 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggt gga gtc atc aca tgc act ggg aaa gtc atc ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cac gtt ggt ggg aat ggt tca cat ggg ttt gca gcg gcc ctg aag cgg 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag agc caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 560
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 560
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Pro Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gln His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 561
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_3_Isolate_CHN5275/JX/CHN/2001_FJ859183_3C(T20P)
<400> 561
ggg cct ggg ttt gac tat gca gtg gct atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca act ccn agc aaa ggg gag ttc aca atg cta gga gtc cac gac 96
Thr Ala Thr Pro Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aac gtg gcc att ttg cca act cat gcc tca cct ggt gag agt att gta 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
att gat ggc aaa gag gtt gaa atc cta gac gct aaa gcc ctc gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
cag gca ggc act aat ctg gaa atc acc ata ata acc ctc aaa aga aat 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat atc aga caa cac ata ccc act caa atc acc gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gln His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
acg aat gat gga gtt ctg att gtg aac act agt aag tac ccc aac atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tac gtt cct gtc ggt gct gtg act gag cag gga tac cta aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggg cgc cag act gct cgt act cta atg tac aac ttt cca acc aga gct 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggt gga gtc atc aca tgc act ggg aaa gtc atc ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cac gtt ggt ggg aat ggt tca cat ggg ttt gca gcg gcc ctg aag cgg 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag agc caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 562
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 562
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Pro Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gln His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 563
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_3_Isolate_CHN5275/JX/CHN/2001_FJ859183_3C(V104P)
<400> 563
ggg cct ggg ttt gac tat gca gtg gct atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca act act agc aaa ggg gag ttc aca atg cta gga gtc cac gac 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aac gtg gcc att ttg cca act cat gcc tca cct ggt gag agt att gta 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
att gat ggc aaa gag gtt gaa atc cta gac gct aaa gcc ctc gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
cag gca ggc act aat ctg gaa atc acc ata ata acc ctc aaa aga aat 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat atc aga caa cac ata ccc act caa atc acc gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gln His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
acg aat gat gga gtt ctg att ccn aac act agt aag tac ccc aac atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Pro Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tac gtt cct gtc ggt gct gtg act gag cag gga tac cta aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggg cgc cag act gct cgt act cta atg tac aac ttt cca acc aga gct 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggt gga gtc atc aca tgc act ggg aaa gtc atc ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cac gtt ggt ggg aat ggt tca cat ggg ttt gca gcg gcc ctg aag cgg 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag agc caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 564
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 564
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gln His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Pro Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 565
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_3_Isolate_CHN5275/JX/CHN/2001_FJ859183_3C(wt)
<400> 565
ggg cct ggg ttt gac tat gca gtg gct atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca act act agc aaa ggg gag ttc aca atg cta gga gtc cac gac 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aac gtg gcc att ttg cca act cat gcc tca cct ggt gag agt att gta 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
att gat ggc aaa gag gtt gaa atc cta gac gct aaa gcc ctc gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
cag gca ggc act aat ctg gaa atc acc ata ata acc ctc aaa aga aat 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gat atc aga caa cac ata ccc act caa atc acc gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gln His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
acg aat gat gga gtt ctg att gtg aac act agt aag tac ccc aac atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tac gtt cct gtc ggt gct gtg act gag cag gga tac cta aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggg cgc cag act gct cgt act cta atg tac aac ttt cca acc aga gct 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggt cag tgt ggt gga gtc atc aca tgc act ggg aaa gtc atc ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cac gtt ggt ggg aat ggt tca cat ggg ttt gca gcg gcc ctg aag cgg 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag agc caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 566
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 566
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gln His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 567
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_Mahoney_3C(I103P)
<400> 567
gga cca ggg ttc gat tac gca gtg gct atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca act act agc aag gga gag ttc act atg tta gga gtc cac gac 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aac gtg gct att tta cca acc cac gct tca cct ggt gaa agc att gtg 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
atc gat ggc aaa gaa gtg gag atc ttg gat gcc aaa gcg ctc gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
caa gca gga acc aat ctt gaa atc act ata atc act cta aag aga aat 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gac att aga cca cat ata cct act caa atc act gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
aca aat gat gga gtc ttg ccn gtg aac act agc aag tac ccc aat atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Pro Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tat gtt cct gtc ggt gct gtg act gaa cag gga tat cta aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggg cgc caa act gct cgt act cta atg tac aac ttt cca acc aga gca 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
gga cag tgt ggt gga gtc atc aca tgt act ggg aaa gtc atc ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cat gtt ggt ggg aac ggt tca cac ggg ttt gca gcg gcc ctg aag cga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag agt caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 568
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 568
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Pro Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 569
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_Mahoney_3C(L102P)
<400> 569
gga cca ggg ttc gat tac gca gtg gct atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca act act agc aag gga gag ttc act atg tta gga gtc cac gac 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aac gtg gct att tta cca acc cac gct tca cct ggt gaa agc att gtg 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
atc gat ggc aaa gaa gtg gag atc ttg gat gcc aaa gcg ctc gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
caa gca gga acc aat ctt gaa atc act ata atc act cta aag aga aat 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gac att aga cca cat ata cct act caa atc act gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
aca aat gat gga gtc ccn atc gtg aac act agc aag tac ccc aat atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Pro Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tat gtt cct gtc ggt gct gtg act gaa cag gga tat cta aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggg cgc caa act gct cgt act cta atg tac aac ttt cca acc aga gca 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
gga cag tgt ggt gga gtc atc aca tgt act ggg aaa gtc atc ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cat gtt ggt ggg aac ggt tca cac ggg ttt gca gcg gcc ctg aag cga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag agt caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 570
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 570
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Pro Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 571
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_Mahoney_3C(R87P)
<400> 571
gga cca ggg ttc gat tac gca gtg gct atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca act act agc aag gga gag ttc act atg tta gga gtc cac gac 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aac gtg gct att tta cca acc cac gct tca cct ggt gaa agc att gtg 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
atc gat ggc aaa gaa gtg gag atc ttg gat gcc aaa gcg ctc gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
caa gca gga acc aat ctt gaa atc act ata atc act cta aag aga aat 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gac att ccn cca cat ata cct act caa atc act gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
aca aat gat gga gtc ttg atc gtg aac act agc aag tac ccc aat atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tat gtt cct gtc ggt gct gtg act gaa cag gga tat cta aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggg cgc caa act gct cgt act cta atg tac aac ttt cca acc aga gca 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
gga cag tgt ggt gga gtc atc aca tgt act ggg aaa gtc atc ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cat gtt ggt ggg aac ggt tca cac ggg ttt gca gcg gcc ctg aag cga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag agt caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 572
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 572
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 573
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_Mahoney_3C(T19P)
<400> 573
gga cca ggg ttc gat tac gca gtg gct atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca ccn act agc aag gga gag ttc act atg tta gga gtc cac gac 96
Thr Ala Pro Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aac gtg gct att tta cca acc cac gct tca cct ggt gaa agc att gtg 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
atc gat ggc aaa gaa gtg gag atc ttg gat gcc aaa gcg ctc gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
caa gca gga acc aat ctt gaa atc act ata atc act cta aag aga aat 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gac att aga cca cat ata cct act caa atc act gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
aca aat gat gga gtc ttg atc gtg aac act agc aag tac ccc aat atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tat gtt cct gtc ggt gct gtg act gaa cag gga tat cta aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggg cgc caa act gct cgt act cta atg tac aac ttt cca acc aga gca 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
gga cag tgt ggt gga gtc atc aca tgt act ggg aaa gtc atc ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cat gtt ggt ggg aac ggt tca cac ggg ttt gca gcg gcc ctg aag cga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag agt caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 574
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 574
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Pro Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 575
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_Mahoney_3C(T20P)
<400> 575
gga cca ggg ttc gat tac gca gtg gct atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca act ccn agc aag gga gag ttc act atg tta gga gtc cac gac 96
Thr Ala Thr Pro Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aac gtg gct att tta cca acc cac gct tca cct ggt gaa agc att gtg 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
atc gat ggc aaa gaa gtg gag atc ttg gat gcc aaa gcg ctc gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
caa gca gga acc aat ctt gaa atc act ata atc act cta aag aga aat 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gac att aga cca cat ata cct act caa atc act gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
aca aat gat gga gtc ttg atc gtg aac act agc aag tac ccc aat atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tat gtt cct gtc ggt gct gtg act gaa cag gga tat cta aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggg cgc caa act gct cgt act cta atg tac aac ttt cca acc aga gca 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
gga cag tgt ggt gga gtc atc aca tgt act ggg aaa gtc atc ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cat gtt ggt ggg aac ggt tca cac ggg ttt gca gcg gcc ctg aag cga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag agt caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 576
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 576
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Pro Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 577
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_Mahoney_3C(V104P)
<400> 577
gga cca ggg ttc gat tac gca gtg gct atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca act act agc aag gga gag ttc act atg tta gga gtc cac gac 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aac gtg gct att tta cca acc cac gct tca cct ggt gaa agc att gtg 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
atc gat ggc aaa gaa gtg gag atc ttg gat gcc aaa gcg ctc gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
caa gca gga acc aat ctt gaa atc act ata atc act cta aag aga aat 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gac att aga cca cat ata cct act caa atc act gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
aca aat gat gga gtc ttg atc ccn aac act agc aag tac ccc aat atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Pro Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tat gtt cct gtc ggt gct gtg act gaa cag gga tat cta aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggg cgc caa act gct cgt act cta atg tac aac ttt cca acc aga gca 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
gga cag tgt ggt gga gtc atc aca tgt act ggg aaa gtc atc ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cat gtt ggt ggg aac ggt tca cac ggg ttt gca gcg gcc ctg aag cga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag agt caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 578
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 578
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Pro Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 579
<211> 549
<212> DNA
<213> Human poliovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Poliovirus_Mahoney_3C(wt)
<400> 579
gga cca ggg ttc gat tac gca gtg gct atg gct aaa aga aac att gtt 48
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
aca gca act act agc aag gga gag ttc act atg tta gga gtc cac gac 96
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
aac gtg gct att tta cca acc cac gct tca cct ggt gaa agc att gtg 144
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
atc gat ggc aaa gaa gtg gag atc ttg gat gcc aaa gcg ctc gaa gat 192
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
caa gca gga acc aat ctt gaa atc act ata atc act cta aag aga aat 240
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttc aga gac att aga cca cat ata cct act caa atc act gag 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
aca aat gat gga gtc ttg atc gtg aac act agc aag tac ccc aat atg 336
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
tat gtt cct gtc ggt gct gtg act gaa cag gga tat cta aat ctc ggt 384
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
ggg cgc caa act gct cgt act cta atg tac aac ttt cca acc aga gca 432
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
gga cag tgt ggt gga gtc atc aca tgt act ggg aaa gtc atc ggg atg 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
cat gtt ggt ggg aac ggt tca cac ggg ttt gca gcg gcc ctg aag cga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
tca tac ttc act cag agt caa 549
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 580
<211> 183
<212> PRT
<213> Human poliovirus
<400> 580
Gly Pro Gly Phe Asp Tyr Ala Val Ala Met Ala Lys Arg Asn Ile Val
1 5 10 15
Thr Ala Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Val His Asp
20 25 30
Asn Val Ala Ile Leu Pro Thr His Ala Ser Pro Gly Glu Ser Ile Val
35 40 45
Ile Asp Gly Lys Glu Val Glu Ile Leu Asp Ala Lys Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Gln Ala Gly Thr Asn Leu Glu Ile Thr Ile Ile Thr Leu Lys Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro His Ile Pro Thr Gln Ile Thr Glu
85 90 95
Thr Asn Asp Gly Val Leu Ile Val Asn Thr Ser Lys Tyr Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Val Pro Val Gly Ala Val Thr Glu Gln Gly Tyr Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Arg Gln Thr Ala Arg Thr Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Ile Thr Cys Thr Gly Lys Val Ile Gly Met
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Ser His Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Gln Ser Gln
180
<210> 581
<211> 546
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(546)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> Human_Rhinovirus_14_NC001490_3C(E114P)
<400> 581
gga cca aac aca gaa ttt gca cta tcc ctg tta agg aaa aac ata atg 48
Gly Pro Asn Thr Glu Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Ile Met
1 5 10 15
act ata aca acc tca aag gga gag ttc aca ggg tta ggc ata cat gat 96
Thr Ile Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Gly Leu Gly Ile His Asp
20 25 30
cgt gtc tgt gtg ata ccc aca cac gca cag cct ggt gat gat gta cta 144
Arg Val Cys Val Ile Pro Thr His Ala Gln Pro Gly Asp Asp Val Leu
35 40 45
gtg aat ggt cag aaa att aga gtt aag gat aag tac aaa tta gta gat 192
Val Asn Gly Gln Lys Ile Arg Val Lys Asp Lys Tyr Lys Leu Val Asp
50 55 60
cca gag aac att aat cta gag ctt aca gtg ttg act tta gat aga aat 240
Pro Glu Asn Ile Asn Leu Glu Leu Thr Val Leu Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttc aga gat atc agg gga ttt ata tca gaa gat cta gaa ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Ile Ser Glu Asp Leu Glu Gly
85 90 95
gtg gat gcc act ttg gta gta cat tca aat aac ttt acc aac act atc 336
Val Asp Ala Thr Leu Val Val His Ser Asn Asn Phe Thr Asn Thr Ile
100 105 110
tta ccn gtt ggc cct gta aca atg gca gga ctt att aat ttg agt agc 384
Leu Pro Val Gly Pro Val Thr Met Ala Gly Leu Ile Asn Leu Ser Ser
115 120 125
acc ccc act aac aga atg att cgt tat gat tat gca aca aaa act ggg 432
Thr Pro Thr Asn Arg Met Ile Arg Tyr Asp Tyr Ala Thr Lys Thr Gly
130 135 140
cag tgt gga ggt gtg ctg tgt gct act ggt aag atc ttt ggt att cat 480
Gln Cys Gly Gly Val Leu Cys Ala Thr Gly Lys Ile Phe Gly Ile His
145 150 155 160
gtt ggc ggt aat gga aga caa gga ttt tca gct caa ctt aaa aaa caa 528
Val Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Ser Ala Gln Leu Lys Lys Gln
165 170 175
tat ttt gta gag aaa caa 546
Tyr Phe Val Glu Lys Gln
180
<210> 582
<211> 182
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 582
Gly Pro Asn Thr Glu Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Ile Met
1 5 10 15
Thr Ile Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Gly Leu Gly Ile His Asp
20 25 30
Arg Val Cys Val Ile Pro Thr His Ala Gln Pro Gly Asp Asp Val Leu
35 40 45
Val Asn Gly Gln Lys Ile Arg Val Lys Asp Lys Tyr Lys Leu Val Asp
50 55 60
Pro Glu Asn Ile Asn Leu Glu Leu Thr Val Leu Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Ile Ser Glu Asp Leu Glu Gly
85 90 95
Val Asp Ala Thr Leu Val Val His Ser Asn Asn Phe Thr Asn Thr Ile
100 105 110
Leu Pro Val Gly Pro Val Thr Met Ala Gly Leu Ile Asn Leu Ser Ser
115 120 125
Thr Pro Thr Asn Arg Met Ile Arg Tyr Asp Tyr Ala Thr Lys Thr Gly
130 135 140
Gln Cys Gly Gly Val Leu Cys Ala Thr Gly Lys Ile Phe Gly Ile His
145 150 155 160
Val Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Ser Ala Gln Leu Lys Lys Gln
165 170 175
Tyr Phe Val Glu Lys Gln
180
<210> 583
<211> 546
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(546)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> Human_Rhinovirus_14_NC001490_3C(G88P)
<400> 583
gga cca aac aca gaa ttt gca cta tcc ctg tta agg aaa aac ata atg 48
Gly Pro Asn Thr Glu Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Ile Met
1 5 10 15
act ata aca acc tca aag gga gag ttc aca ggg tta ggc ata cat gat 96
Thr Ile Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Gly Leu Gly Ile His Asp
20 25 30
cgt gtc tgt gtg ata ccc aca cac gca cag cct ggt gat gat gta cta 144
Arg Val Cys Val Ile Pro Thr His Ala Gln Pro Gly Asp Asp Val Leu
35 40 45
gtg aat ggt cag aaa att aga gtt aag gat aag tac aaa tta gta gat 192
Val Asn Gly Gln Lys Ile Arg Val Lys Asp Lys Tyr Lys Leu Val Asp
50 55 60
cca gag aac att aat cta gag ctt aca gtg ttg act tta gat aga aat 240
Pro Glu Asn Ile Asn Leu Glu Leu Thr Val Leu Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttc aga gat atc agg ccn ttt ata tca gaa gat cta gaa ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro Phe Ile Ser Glu Asp Leu Glu Gly
85 90 95
gtg gat gcc act ttg gta gta cat tca aat aac ttt acc aac act atc 336
Val Asp Ala Thr Leu Val Val His Ser Asn Asn Phe Thr Asn Thr Ile
100 105 110
tta gaa gtt ggc cct gta aca atg gca gga ctt att aat ttg agt agc 384
Leu Glu Val Gly Pro Val Thr Met Ala Gly Leu Ile Asn Leu Ser Ser
115 120 125
acc ccc act aac aga atg att cgt tat gat tat gca aca aaa act ggg 432
Thr Pro Thr Asn Arg Met Ile Arg Tyr Asp Tyr Ala Thr Lys Thr Gly
130 135 140
cag tgt gga ggt gtg ctg tgt gct act ggt aag atc ttt ggt att cat 480
Gln Cys Gly Gly Val Leu Cys Ala Thr Gly Lys Ile Phe Gly Ile His
145 150 155 160
gtt ggc ggt aat gga aga caa gga ttt tca gct caa ctt aaa aaa caa 528
Val Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Ser Ala Gln Leu Lys Lys Gln
165 170 175
tat ttt gta gag aaa caa 546
Tyr Phe Val Glu Lys Gln
180
<210> 584
<211> 182
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 584
Gly Pro Asn Thr Glu Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Ile Met
1 5 10 15
Thr Ile Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Gly Leu Gly Ile His Asp
20 25 30
Arg Val Cys Val Ile Pro Thr His Ala Gln Pro Gly Asp Asp Val Leu
35 40 45
Val Asn Gly Gln Lys Ile Arg Val Lys Asp Lys Tyr Lys Leu Val Asp
50 55 60
Pro Glu Asn Ile Asn Leu Glu Leu Thr Val Leu Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro Phe Ile Ser Glu Asp Leu Glu Gly
85 90 95
Val Asp Ala Thr Leu Val Val His Ser Asn Asn Phe Thr Asn Thr Ile
100 105 110
Leu Glu Val Gly Pro Val Thr Met Ala Gly Leu Ile Asn Leu Ser Ser
115 120 125
Thr Pro Thr Asn Arg Met Ile Arg Tyr Asp Tyr Ala Thr Lys Thr Gly
130 135 140
Gln Cys Gly Gly Val Leu Cys Ala Thr Gly Lys Ile Phe Gly Ile His
145 150 155 160
Val Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Ser Ala Gln Leu Lys Lys Gln
165 170 175
Tyr Phe Val Glu Lys Gln
180
<210> 585
<211> 546
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(546)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> Human_Rhinovirus_14_NC001490_3C(I112P)
<400> 585
gga cca aac aca gaa ttt gca cta tcc ctg tta agg aaa aac ata atg 48
Gly Pro Asn Thr Glu Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Ile Met
1 5 10 15
act ata aca acc tca aag gga gag ttc aca ggg tta ggc ata cat gat 96
Thr Ile Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Gly Leu Gly Ile His Asp
20 25 30
cgt gtc tgt gtg ata ccc aca cac gca cag cct ggt gat gat gta cta 144
Arg Val Cys Val Ile Pro Thr His Ala Gln Pro Gly Asp Asp Val Leu
35 40 45
gtg aat ggt cag aaa att aga gtt aag gat aag tac aaa tta gta gat 192
Val Asn Gly Gln Lys Ile Arg Val Lys Asp Lys Tyr Lys Leu Val Asp
50 55 60
cca gag aac att aat cta gag ctt aca gtg ttg act tta gat aga aat 240
Pro Glu Asn Ile Asn Leu Glu Leu Thr Val Leu Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttc aga gat atc agg gga ttt ata tca gaa gat cta gaa ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Ile Ser Glu Asp Leu Glu Gly
85 90 95
gtg gat gcc act ttg gta gta cat tca aat aac ttt acc aac act ccn 336
Val Asp Ala Thr Leu Val Val His Ser Asn Asn Phe Thr Asn Thr Pro
100 105 110
tta gaa gtt ggc cct gta aca atg gca gga ctt att aat ttg agt agc 384
Leu Glu Val Gly Pro Val Thr Met Ala Gly Leu Ile Asn Leu Ser Ser
115 120 125
acc ccc act aac aga atg att cgt tat gat tat gca aca aaa act ggg 432
Thr Pro Thr Asn Arg Met Ile Arg Tyr Asp Tyr Ala Thr Lys Thr Gly
130 135 140
cag tgt gga ggt gtg ctg tgt gct act ggt aag atc ttt ggt att cat 480
Gln Cys Gly Gly Val Leu Cys Ala Thr Gly Lys Ile Phe Gly Ile His
145 150 155 160
gtt ggc ggt aat gga aga caa gga ttt tca gct caa ctt aaa aaa caa 528
Val Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Ser Ala Gln Leu Lys Lys Gln
165 170 175
tat ttt gta gag aaa caa 546
Tyr Phe Val Glu Lys Gln
180
<210> 586
<211> 182
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 586
Gly Pro Asn Thr Glu Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Ile Met
1 5 10 15
Thr Ile Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Gly Leu Gly Ile His Asp
20 25 30
Arg Val Cys Val Ile Pro Thr His Ala Gln Pro Gly Asp Asp Val Leu
35 40 45
Val Asn Gly Gln Lys Ile Arg Val Lys Asp Lys Tyr Lys Leu Val Asp
50 55 60
Pro Glu Asn Ile Asn Leu Glu Leu Thr Val Leu Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Ile Ser Glu Asp Leu Glu Gly
85 90 95
Val Asp Ala Thr Leu Val Val His Ser Asn Asn Phe Thr Asn Thr Pro
100 105 110
Leu Glu Val Gly Pro Val Thr Met Ala Gly Leu Ile Asn Leu Ser Ser
115 120 125
Thr Pro Thr Asn Arg Met Ile Arg Tyr Asp Tyr Ala Thr Lys Thr Gly
130 135 140
Gln Cys Gly Gly Val Leu Cys Ala Thr Gly Lys Ile Phe Gly Ile His
145 150 155 160
Val Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Ser Ala Gln Leu Lys Lys Gln
165 170 175
Tyr Phe Val Glu Lys Gln
180
<210> 587
<211> 546
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(546)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> Human_Rhinovirus_14_NC001490(R87P)
<400> 587
gga cca aac aca gaa ttt gca cta tcc ctg tta agg aaa aac ata atg 48
Gly Pro Asn Thr Glu Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Ile Met
1 5 10 15
act ata aca acc tca aag gga gag ttc aca ggg tta ggc ata cat gat 96
Thr Ile Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Gly Leu Gly Ile His Asp
20 25 30
cgt gtc tgt gtg ata ccc aca cac gca cag cct ggt gat gat gta cta 144
Arg Val Cys Val Ile Pro Thr His Ala Gln Pro Gly Asp Asp Val Leu
35 40 45
gtg aat ggt cag aaa att aga gtt aag gat aag tac aaa tta gta gat 192
Val Asn Gly Gln Lys Ile Arg Val Lys Asp Lys Tyr Lys Leu Val Asp
50 55 60
cca gag aac att aat cta gag ctt aca gtg ttg act tta gat aga aat 240
Pro Glu Asn Ile Asn Leu Glu Leu Thr Val Leu Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttc aga gat atc ccn gga ttt ata tca gaa gat cta gaa ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Gly Phe Ile Ser Glu Asp Leu Glu Gly
85 90 95
gtg gat gcc act ttg gta gta cat tca aat aac ttt acc aac act atc 336
Val Asp Ala Thr Leu Val Val His Ser Asn Asn Phe Thr Asn Thr Ile
100 105 110
tta gaa gtt ggc cct gta aca atg gca gga ctt att aat ttg agt agc 384
Leu Glu Val Gly Pro Val Thr Met Ala Gly Leu Ile Asn Leu Ser Ser
115 120 125
acc ccc act aac aga atg att cgt tat gat tat gca aca aaa act ggg 432
Thr Pro Thr Asn Arg Met Ile Arg Tyr Asp Tyr Ala Thr Lys Thr Gly
130 135 140
cag tgt gga ggt gtg ctg tgt gct act ggt aag atc ttt ggt att cat 480
Gln Cys Gly Gly Val Leu Cys Ala Thr Gly Lys Ile Phe Gly Ile His
145 150 155 160
gtt ggc ggt aat gga aga caa gga ttt tca gct caa ctt aaa aaa caa 528
Val Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Ser Ala Gln Leu Lys Lys Gln
165 170 175
tat ttt gta gag aaa caa 546
Tyr Phe Val Glu Lys Gln
180
<210> 588
<211> 182
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 588
Gly Pro Asn Thr Glu Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Ile Met
1 5 10 15
Thr Ile Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Gly Leu Gly Ile His Asp
20 25 30
Arg Val Cys Val Ile Pro Thr His Ala Gln Pro Gly Asp Asp Val Leu
35 40 45
Val Asn Gly Gln Lys Ile Arg Val Lys Asp Lys Tyr Lys Leu Val Asp
50 55 60
Pro Glu Asn Ile Asn Leu Glu Leu Thr Val Leu Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Gly Phe Ile Ser Glu Asp Leu Glu Gly
85 90 95
Val Asp Ala Thr Leu Val Val His Ser Asn Asn Phe Thr Asn Thr Ile
100 105 110
Leu Glu Val Gly Pro Val Thr Met Ala Gly Leu Ile Asn Leu Ser Ser
115 120 125
Thr Pro Thr Asn Arg Met Ile Arg Tyr Asp Tyr Ala Thr Lys Thr Gly
130 135 140
Gln Cys Gly Gly Val Leu Cys Ala Thr Gly Lys Ile Phe Gly Ile His
145 150 155 160
Val Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Ser Ala Gln Leu Lys Lys Gln
165 170 175
Tyr Phe Val Glu Lys Gln
180
<210> 589
<211> 546
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(546)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> Human_Rhinovirus_14_NC001490_3C(T19P)
<400> 589
gga cca aac aca gaa ttt gca cta tcc ctg tta agg aaa aac ata atg 48
Gly Pro Asn Thr Glu Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Ile Met
1 5 10 15
act ata ccn acc tca aag gga gag ttc aca ggg tta ggc ata cat gat 96
Thr Ile Pro Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Gly Leu Gly Ile His Asp
20 25 30
cgt gtc tgt gtg ata ccc aca cac gca cag cct ggt gat gat gta cta 144
Arg Val Cys Val Ile Pro Thr His Ala Gln Pro Gly Asp Asp Val Leu
35 40 45
gtg aat ggt cag aaa att aga gtt aag gat aag tac aaa tta gta gat 192
Val Asn Gly Gln Lys Ile Arg Val Lys Asp Lys Tyr Lys Leu Val Asp
50 55 60
cca gag aac att aat cta gag ctt aca gtg ttg act tta gat aga aat 240
Pro Glu Asn Ile Asn Leu Glu Leu Thr Val Leu Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttc aga gat atc agg gga ttt ata tca gaa gat cta gaa ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Ile Ser Glu Asp Leu Glu Gly
85 90 95
gtg gat gcc act ttg gta gta cat tca aat aac ttt acc aac act atc 336
Val Asp Ala Thr Leu Val Val His Ser Asn Asn Phe Thr Asn Thr Ile
100 105 110
tta gaa gtt ggc cct gta aca atg gca gga ctt att aat ttg agt agc 384
Leu Glu Val Gly Pro Val Thr Met Ala Gly Leu Ile Asn Leu Ser Ser
115 120 125
acc ccc act aac aga atg att cgt tat gat tat gca aca aaa act ggg 432
Thr Pro Thr Asn Arg Met Ile Arg Tyr Asp Tyr Ala Thr Lys Thr Gly
130 135 140
cag tgt gga ggt gtg ctg tgt gct act ggt aag atc ttt ggt att cat 480
Gln Cys Gly Gly Val Leu Cys Ala Thr Gly Lys Ile Phe Gly Ile His
145 150 155 160
gtt ggc ggt aat gga aga caa gga ttt tca gct caa ctt aaa aaa caa 528
Val Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Ser Ala Gln Leu Lys Lys Gln
165 170 175
tat ttt gta gag aaa caa 546
Tyr Phe Val Glu Lys Gln
180
<210> 590
<211> 182
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 590
Gly Pro Asn Thr Glu Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Ile Met
1 5 10 15
Thr Ile Pro Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Gly Leu Gly Ile His Asp
20 25 30
Arg Val Cys Val Ile Pro Thr His Ala Gln Pro Gly Asp Asp Val Leu
35 40 45
Val Asn Gly Gln Lys Ile Arg Val Lys Asp Lys Tyr Lys Leu Val Asp
50 55 60
Pro Glu Asn Ile Asn Leu Glu Leu Thr Val Leu Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Ile Ser Glu Asp Leu Glu Gly
85 90 95
Val Asp Ala Thr Leu Val Val His Ser Asn Asn Phe Thr Asn Thr Ile
100 105 110
Leu Glu Val Gly Pro Val Thr Met Ala Gly Leu Ile Asn Leu Ser Ser
115 120 125
Thr Pro Thr Asn Arg Met Ile Arg Tyr Asp Tyr Ala Thr Lys Thr Gly
130 135 140
Gln Cys Gly Gly Val Leu Cys Ala Thr Gly Lys Ile Phe Gly Ile His
145 150 155 160
Val Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Ser Ala Gln Leu Lys Lys Gln
165 170 175
Tyr Phe Val Glu Lys Gln
180
<210> 591
<211> 546
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(546)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> Human_Rhinovirus_14_NC001490_3C(T20P)
<400> 591
gga cca aac aca gaa ttt gca cta tcc ctg tta agg aaa aac ata atg 48
Gly Pro Asn Thr Glu Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Ile Met
1 5 10 15
act ata aca ccn tca aag gga gag ttc aca ggg tta ggc ata cat gat 96
Thr Ile Thr Pro Ser Lys Gly Glu Phe Thr Gly Leu Gly Ile His Asp
20 25 30
cgt gtc tgt gtg ata ccc aca cac gca cag cct ggt gat gat gta cta 144
Arg Val Cys Val Ile Pro Thr His Ala Gln Pro Gly Asp Asp Val Leu
35 40 45
gtg aat ggt cag aaa att aga gtt aag gat aag tac aaa tta gta gat 192
Val Asn Gly Gln Lys Ile Arg Val Lys Asp Lys Tyr Lys Leu Val Asp
50 55 60
cca gag aac att aat cta gag ctt aca gtg ttg act tta gat aga aat 240
Pro Glu Asn Ile Asn Leu Glu Leu Thr Val Leu Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttc aga gat atc agg gga ttt ata tca gaa gat cta gaa ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Ile Ser Glu Asp Leu Glu Gly
85 90 95
gtg gat gcc act ttg gta gta cat tca aat aac ttt acc aac act atc 336
Val Asp Ala Thr Leu Val Val His Ser Asn Asn Phe Thr Asn Thr Ile
100 105 110
tta gaa gtt ggc cct gta aca atg gca gga ctt att aat ttg agt agc 384
Leu Glu Val Gly Pro Val Thr Met Ala Gly Leu Ile Asn Leu Ser Ser
115 120 125
acc ccc act aac aga atg att cgt tat gat tat gca aca aaa act ggg 432
Thr Pro Thr Asn Arg Met Ile Arg Tyr Asp Tyr Ala Thr Lys Thr Gly
130 135 140
cag tgt gga ggt gtg ctg tgt gct act ggt aag atc ttt ggt att cat 480
Gln Cys Gly Gly Val Leu Cys Ala Thr Gly Lys Ile Phe Gly Ile His
145 150 155 160
gtt ggc ggt aat gga aga caa gga ttt tca gct caa ctt aaa aaa caa 528
Val Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Ser Ala Gln Leu Lys Lys Gln
165 170 175
tat ttt gta gag aaa caa 546
Tyr Phe Val Glu Lys Gln
180
<210> 592
<211> 182
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 592
Gly Pro Asn Thr Glu Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Ile Met
1 5 10 15
Thr Ile Thr Pro Ser Lys Gly Glu Phe Thr Gly Leu Gly Ile His Asp
20 25 30
Arg Val Cys Val Ile Pro Thr His Ala Gln Pro Gly Asp Asp Val Leu
35 40 45
Val Asn Gly Gln Lys Ile Arg Val Lys Asp Lys Tyr Lys Leu Val Asp
50 55 60
Pro Glu Asn Ile Asn Leu Glu Leu Thr Val Leu Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Ile Ser Glu Asp Leu Glu Gly
85 90 95
Val Asp Ala Thr Leu Val Val His Ser Asn Asn Phe Thr Asn Thr Ile
100 105 110
Leu Glu Val Gly Pro Val Thr Met Ala Gly Leu Ile Asn Leu Ser Ser
115 120 125
Thr Pro Thr Asn Arg Met Ile Arg Tyr Asp Tyr Ala Thr Lys Thr Gly
130 135 140
Gln Cys Gly Gly Val Leu Cys Ala Thr Gly Lys Ile Phe Gly Ile His
145 150 155 160
Val Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Ser Ala Gln Leu Lys Lys Gln
165 170 175
Tyr Phe Val Glu Lys Gln
180
<210> 593
<211> 546
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(546)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> Human_Rhinovirus_14_NC001490_3C(wt)
<400> 593
gga cca aac aca gaa ttt gca cta tcc ctg tta agg aaa aac ata atg 48
Gly Pro Asn Thr Glu Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Ile Met
1 5 10 15
act ata aca acc tca aag gga gag ttc aca ggg tta ggc ata cat gat 96
Thr Ile Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Gly Leu Gly Ile His Asp
20 25 30
cgt gtc tgt gtg ata ccc aca cac gca cag cct ggt gat gat gta cta 144
Arg Val Cys Val Ile Pro Thr His Ala Gln Pro Gly Asp Asp Val Leu
35 40 45
gtg aat ggt cag aaa att aga gtt aag gat aag tac aaa tta gta gat 192
Val Asn Gly Gln Lys Ile Arg Val Lys Asp Lys Tyr Lys Leu Val Asp
50 55 60
cca gag aac att aat cta gag ctt aca gtg ttg act tta gat aga aat 240
Pro Glu Asn Ile Asn Leu Glu Leu Thr Val Leu Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttc aga gat atc agg gga ttt ata tca gaa gat cta gaa ggt 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Ile Ser Glu Asp Leu Glu Gly
85 90 95
gtg gat gcc act ttg gta gta cat tca aat aac ttt acc aac act atc 336
Val Asp Ala Thr Leu Val Val His Ser Asn Asn Phe Thr Asn Thr Ile
100 105 110
tta gaa gtt ggc cct gta aca atg gca gga ctt att aat ttg agt agc 384
Leu Glu Val Gly Pro Val Thr Met Ala Gly Leu Ile Asn Leu Ser Ser
115 120 125
acc ccc act aac aga atg att cgt tat gat tat gca aca aaa act ggg 432
Thr Pro Thr Asn Arg Met Ile Arg Tyr Asp Tyr Ala Thr Lys Thr Gly
130 135 140
cag tgt gga ggt gtg ctg tgt gct act ggt aag atc ttt ggt att cat 480
Gln Cys Gly Gly Val Leu Cys Ala Thr Gly Lys Ile Phe Gly Ile His
145 150 155 160
gtt ggc ggt aat gga aga caa gga ttt tca gct caa ctt aaa aaa caa 528
Val Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Ser Ala Gln Leu Lys Lys Gln
165 170 175
tat ttt gta gag aaa caa 546
Tyr Phe Val Glu Lys Gln
180
<210> 594
<211> 182
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 594
Gly Pro Asn Thr Glu Phe Ala Leu Ser Leu Leu Arg Lys Asn Ile Met
1 5 10 15
Thr Ile Thr Thr Ser Lys Gly Glu Phe Thr Gly Leu Gly Ile His Asp
20 25 30
Arg Val Cys Val Ile Pro Thr His Ala Gln Pro Gly Asp Asp Val Leu
35 40 45
Val Asn Gly Gln Lys Ile Arg Val Lys Asp Lys Tyr Lys Leu Val Asp
50 55 60
Pro Glu Asn Ile Asn Leu Glu Leu Thr Val Leu Thr Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Ile Ser Glu Asp Leu Glu Gly
85 90 95
Val Asp Ala Thr Leu Val Val His Ser Asn Asn Phe Thr Asn Thr Ile
100 105 110
Leu Glu Val Gly Pro Val Thr Met Ala Gly Leu Ile Asn Leu Ser Ser
115 120 125
Thr Pro Thr Asn Arg Met Ile Arg Tyr Asp Tyr Ala Thr Lys Thr Gly
130 135 140
Gln Cys Gly Gly Val Leu Cys Ala Thr Gly Lys Ile Phe Gly Ile His
145 150 155 160
Val Gly Gly Asn Gly Arg Gln Gly Phe Ser Ala Gln Leu Lys Lys Gln
165 170 175
Tyr Phe Val Glu Lys Gln
180
<210> 595
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(546)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(546)
<223> Human_Rhinovirus_20_Strain_ATCC_VR1130_3C(K88P)
<400> 595
ggg cca caa gaa gaa ttt gga cgt agt tta atc aaa cat aac act tgt 48
Gly Pro Gln Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Ile Lys His Asn Thr Cys
1 5 10 15
gtt gta aca aca gac aat ggt aag ttc act gga tta ggg atc tat gac 96
Val Val Thr Thr Asp Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
aat ata atg att ata cca aca cat gct gat gct ggg aaa gaa gta gaa 144
Asn Ile Met Ile Ile Pro Thr His Ala Asp Ala Gly Lys Glu Val Glu
35 40 45
ata gat ggg atc aaa act cag gtt gat gat gct tat gat tta cat aat 192
Ile Asp Gly Ile Lys Thr Gln Val Asp Asp Ala Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
tcc cag gga atc aaa ttg gaa att aca gtc ctt aaa ttg cat aga aat 240
Ser Gln Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu His Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt aga gac att aga ccn tac ata cca gag act gaa gat gat 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro Tyr Ile Pro Glu Thr Glu Asp Asp
85 90 95
tat cca gaa tgc cat tta gca ctg gtt gct aat caa cag gag cct act 336
Tyr Pro Glu Cys His Leu Ala Leu Val Ala Asn Gln Gln Glu Pro Thr
100 105 110
ata cta gaa gtt ggc gac tgc tgc tca tat gga aac ata tta tta agt 384
Ile Leu Glu Val Gly Asp Cys Cys Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggc aac cag aca gct aga atg att aaa tac aac tac cca aca aaa tca 432
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr Asn Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
gga ttc tgt gga ggg gtc ttg tat aaa ata gga tta gtg cta ggt ata 480
Gly Phe Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Leu Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggg gga aat ggt agg gat ggt ttt tcc gcg atg cta cta aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
tca tat ttc act gaa caa cag 549
Ser Tyr Phe Thr Glu Gln
180
<210> 596
<211> 182
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 596
Gly Pro Gln Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Ile Lys His Asn Thr Cys
1 5 10 15
Val Val Thr Thr Asp Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Asn Ile Met Ile Ile Pro Thr His Ala Asp Ala Gly Lys Glu Val Glu
35 40 45
Ile Asp Gly Ile Lys Thr Gln Val Asp Asp Ala Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
Ser Gln Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu His Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro Tyr Ile Pro Glu Thr Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Glu Cys His Leu Ala Leu Val Ala Asn Gln Gln Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Leu Glu Val Gly Asp Cys Cys Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr Asn Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
Gly Phe Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Leu Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Glu Gln
180
<210> 597
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_20_Strain_ATCC_VR1130_3C(R87P)
<400> 597
ggg cca caa gaa gaa ttt gga cgt agt tta atc aaa cat aac act tgt 48
Gly Pro Gln Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Ile Lys His Asn Thr Cys
1 5 10 15
gtt gta aca aca gac aat ggt aag ttc act gga tta ggg atc tat gac 96
Val Val Thr Thr Asp Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
aat ata atg att ata cca aca cat gct gat gct ggg aaa gaa gta gaa 144
Asn Ile Met Ile Ile Pro Thr His Ala Asp Ala Gly Lys Glu Val Glu
35 40 45
ata gat ggg atc aaa act cag gtt gat gat gct tat gat tta cat aat 192
Ile Asp Gly Ile Lys Thr Gln Val Asp Asp Ala Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
tcc cag gga atc aaa ttg gaa att aca gtc ctt aaa ttg cat aga aat 240
Ser Gln Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu His Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt aga gac att ccn aaa tac ata cca gag act gaa gat gat 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Lys Tyr Ile Pro Glu Thr Glu Asp Asp
85 90 95
tat cca gaa tgc cat tta gca ctg gtt gct aat caa cag gag cct act 336
Tyr Pro Glu Cys His Leu Ala Leu Val Ala Asn Gln Gln Glu Pro Thr
100 105 110
ata cta gaa gtt ggc gac tgc tgc tca tat gga aac ata tta tta agt 384
Ile Leu Glu Val Gly Asp Cys Cys Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggc aac cag aca gct aga atg att aaa tac aac tac cca aca aaa tca 432
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr Asn Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
gga ttc tgt gga ggg gtc ttg tat aaa ata gga tta gtg cta ggt ata 480
Gly Phe Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Leu Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggg gga aat ggt agg gat ggt ttt tcc gcg atg cta cta aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
tca tat ttc act gaa caa cag 549
Ser Tyr Phe Thr Glu Gln Gln
180
<210> 598
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 598
Gly Pro Gln Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Ile Lys His Asn Thr Cys
1 5 10 15
Val Val Thr Thr Asp Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Asn Ile Met Ile Ile Pro Thr His Ala Asp Ala Gly Lys Glu Val Glu
35 40 45
Ile Asp Gly Ile Lys Thr Gln Val Asp Asp Ala Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
Ser Gln Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu His Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Lys Tyr Ile Pro Glu Thr Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Glu Cys His Leu Ala Leu Val Ala Asn Gln Gln Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Leu Glu Val Gly Asp Cys Cys Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr Asn Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
Gly Phe Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Leu Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Glu Gln Gln
180
<210> 599
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_20_Strain_ATCC_VR1130_3C(T19P)
<400> 599
ggg cca caa gaa gaa ttt gga cgt agt tta atc aaa cat aac act tgt 48
Gly Pro Gln Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Ile Lys His Asn Thr Cys
1 5 10 15
gtt gta ccn aca gac aat ggt aag ttc act gga tta ggg atc tat gac 96
Val Val Pro Thr Asp Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
aat ata atg att ata cca aca cat gct gat gct ggg aaa gaa gta gaa 144
Asn Ile Met Ile Ile Pro Thr His Ala Asp Ala Gly Lys Glu Val Glu
35 40 45
ata gat ggg atc aaa act cag gtt gat gat gct tat gat tta cat aat 192
Ile Asp Gly Ile Lys Thr Gln Val Asp Asp Ala Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
tcc cag gga atc aaa ttg gaa att aca gtc ctt aaa ttg cat aga aat 240
Ser Gln Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu His Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt aga gac att aga aaa tac ata cca gag act gaa gat gat 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Lys Tyr Ile Pro Glu Thr Glu Asp Asp
85 90 95
tat cca gaa tgc cat tta gca ctg gtt gct aat caa cag gag cct act 336
Tyr Pro Glu Cys His Leu Ala Leu Val Ala Asn Gln Gln Glu Pro Thr
100 105 110
ata cta gaa gtt ggc gac tgc tgc tca tat gga aac ata tta tta agt 384
Ile Leu Glu Val Gly Asp Cys Cys Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggc aac cag aca gct aga atg att aaa tac aac tac cca aca aaa tca 432
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr Asn Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
gga ttc tgt gga ggg gtc ttg tat aaa ata gga tta gtg cta ggt ata 480
Gly Phe Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Leu Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggg gga aat ggt agg gat ggt ttt tcc gcg atg cta cta aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
tca tat ttc act gaa caa cag 549
Ser Tyr Phe Thr Glu Gln Gln
180
<210> 600
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 600
Gly Pro Gln Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Ile Lys His Asn Thr Cys
1 5 10 15
Val Val Pro Thr Asp Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Asn Ile Met Ile Ile Pro Thr His Ala Asp Ala Gly Lys Glu Val Glu
35 40 45
Ile Asp Gly Ile Lys Thr Gln Val Asp Asp Ala Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
Ser Gln Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu His Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Lys Tyr Ile Pro Glu Thr Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Glu Cys His Leu Ala Leu Val Ala Asn Gln Gln Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Leu Glu Val Gly Asp Cys Cys Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr Asn Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
Gly Phe Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Leu Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Glu Gln Gln
180
<210> 601
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_20_Strain_ATCC_VR1130_3C(T20P)
<400> 601
ggg cca caa gaa gaa ttt gga cgt agt tta atc aaa cat aac act tgt 48
Gly Pro Gln Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Ile Lys His Asn Thr Cys
1 5 10 15
gtt gta aca ccn gac aat ggt aag ttc act gga tta ggg atc tat gac 96
Val Val Thr Pro Asp Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
aat ata atg att ata cca aca cat gct gat gct ggg aaa gaa gta gaa 144
Asn Ile Met Ile Ile Pro Thr His Ala Asp Ala Gly Lys Glu Val Glu
35 40 45
ata gat ggg atc aaa act cag gtt gat gat gct tat gat tta cat aat 192
Ile Asp Gly Ile Lys Thr Gln Val Asp Asp Ala Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
tcc cag gga atc aaa ttg gaa att aca gtc ctt aaa ttg cat aga aat 240
Ser Gln Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu His Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt aga gac att aga aaa tac ata cca gag act gaa gat gat 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Lys Tyr Ile Pro Glu Thr Glu Asp Asp
85 90 95
tat cca gaa tgc cat tta gca ctg gtt gct aat caa cag gag cct act 336
Tyr Pro Glu Cys His Leu Ala Leu Val Ala Asn Gln Gln Glu Pro Thr
100 105 110
ata cta gaa gtt ggc gac tgc tgc tca tat gga aac ata tta tta agt 384
Ile Leu Glu Val Gly Asp Cys Cys Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggc aac cag aca gct aga atg att aaa tac aac tac cca aca aaa tca 432
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr Asn Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
gga ttc tgt gga ggg gtc ttg tat aaa ata gga tta gtg cta ggt ata 480
Gly Phe Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Leu Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggg gga aat ggt agg gat ggt ttt tcc gcg atg cta cta aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
tca tat ttc act gaa caa cag 549
Ser Tyr Phe Thr Glu Gln Gln
180
<210> 602
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 602
Gly Pro Gln Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Ile Lys His Asn Thr Cys
1 5 10 15
Val Val Thr Pro Asp Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Asn Ile Met Ile Ile Pro Thr His Ala Asp Ala Gly Lys Glu Val Glu
35 40 45
Ile Asp Gly Ile Lys Thr Gln Val Asp Asp Ala Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
Ser Gln Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu His Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Lys Tyr Ile Pro Glu Thr Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Glu Cys His Leu Ala Leu Val Ala Asn Gln Gln Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Leu Glu Val Gly Asp Cys Cys Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr Asn Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
Gly Phe Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Leu Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Glu Gln Gln
180
<210> 603
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_20_Strain_ATCC_VR1130_3C(wt)
<400> 603
ggg cca caa gaa gaa ttt gga cgt agt tta atc aaa cat aac act tgt 48
Gly Pro Gln Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Ile Lys His Asn Thr Cys
1 5 10 15
gtt gta aca aca gac aat ggt aag ttc act gga tta ggg atc tat gac 96
Val Val Thr Thr Asp Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
aat ata atg att ata cca aca cat gct gat gct ggg aaa gaa gta gaa 144
Asn Ile Met Ile Ile Pro Thr His Ala Asp Ala Gly Lys Glu Val Glu
35 40 45
ata gat ggg atc aaa act cag gtt gat gat gct tat gat tta cat aat 192
Ile Asp Gly Ile Lys Thr Gln Val Asp Asp Ala Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
tcc cag gga atc aaa ttg gaa att aca gtc ctt aaa ttg cat aga aat 240
Ser Gln Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu His Arg Asn
65 70 75 80
gaa aag ttt aga gac att aga aaa tac ata cca gag act gaa gat gat 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Lys Tyr Ile Pro Glu Thr Glu Asp Asp
85 90 95
tat cca gaa tgc cat tta gca ctg gtt gct aat caa cag gag cct act 336
Tyr Pro Glu Cys His Leu Ala Leu Val Ala Asn Gln Gln Glu Pro Thr
100 105 110
ata cta gaa gtt ggc gac tgc tgc tca tat gga aac ata tta tta agt 384
Ile Leu Glu Val Gly Asp Cys Cys Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggc aac cag aca gct aga atg att aaa tac aac tac cca aca aaa tca 432
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr Asn Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
gga ttc tgt gga ggg gtc ttg tat aaa ata gga tta gtg cta ggt ata 480
Gly Phe Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Leu Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggg gga aat ggt agg gat ggt ttt tcc gcg atg cta cta aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
tca tat ttc act gaa caa cag 549
Ser Tyr Phe Thr Glu Gln Gln
180
<210> 604
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 604
Gly Pro Gln Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Ile Lys His Asn Thr Cys
1 5 10 15
Val Val Thr Thr Asp Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Asn Ile Met Ile Ile Pro Thr His Ala Asp Ala Gly Lys Glu Val Glu
35 40 45
Ile Asp Gly Ile Lys Thr Gln Val Asp Asp Ala Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
Ser Gln Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu His Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Lys Tyr Ile Pro Glu Thr Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Glu Cys His Leu Ala Leu Val Ala Asn Gln Gln Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Leu Glu Val Gly Asp Cys Cys Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr Asn Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
Gly Phe Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Leu Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Glu Gln Gln
180
<210> 605
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_89_Strain_ATCC_VR1199_3C(I114P)
<400> 605
ggc cca gag gaa gag ttt ggt cgc tca cta ctc aaa cat aat tgc tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Leu Lys His Asn Cys Cys
1 5 10 15
gtt gtg aca acc gac aaa ggc aaa ttc aca ggt ctt ggc ata tat gac 96
Val Val Thr Thr Asp Lys Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
caa gtc atg gta ctt cca aca cat tct gac cca ggc tct gag atc ttg 144
Gln Val Met Val Leu Pro Thr His Ser Asp Pro Gly Ser Glu Ile Leu
35 40 45
gta gat gga gta aaa gtt aag gtc tct gat tcc tat gat ttg cat aac 192
Val Asp Gly Val Lys Val Lys Val Ser Asp Ser Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
cat gag ggt gtt aag cta gag atc aca gtt gtg aaa tta att aga aat 240
His Glu Gly Val Lys Leu Glu Ile Thr Val Val Lys Leu Ile Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttt aaa gac atc aga aaa tat tta ccc tca cgt gaa gat gac 288
Glu Lys Phe Lys Asp Ile Arg Lys Tyr Leu Pro Ser Arg Glu Asp Asp
85 90 95
tat cct gct tgt aac ctt gcc tta cta gct aat caa gat gag cca aca 336
Tyr Pro Ala Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Asp Glu Pro Thr
100 105 110
ata ccn agt gtt ggt gat gca gta tct tat ggt aac atc tta ttg agt 384
Ile Pro Ser Val Gly Asp Ala Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggt acc aat act gca cga atg atc aag tac cac tac ccg aca aaa gct 432
Gly Thr Asn Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr His Tyr Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga tat tgt ggg ggt gtt ttg tac aag gtt ggc tct att ctt ggt ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Val Gly Ser Ile Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggc aat ggt aga gat gga ttt tct gca atg ctt ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Lys
165 170 175
tct tat ttt ggt gaa acc cag 549
Ser Tyr Phe Gly Glu Thr Gln
180
<210> 606
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 606
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Leu Lys His Asn Cys Cys
1 5 10 15
Val Val Thr Thr Asp Lys Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Gln Val Met Val Leu Pro Thr His Ser Asp Pro Gly Ser Glu Ile Leu
35 40 45
Val Asp Gly Val Lys Val Lys Val Ser Asp Ser Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
His Glu Gly Val Lys Leu Glu Ile Thr Val Val Lys Leu Ile Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Lys Asp Ile Arg Lys Tyr Leu Pro Ser Arg Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Ala Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Asp Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Pro Ser Val Gly Asp Ala Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Thr Asn Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr His Tyr Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Val Gly Ser Ile Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Lys
165 170 175
Ser Tyr Phe Gly Glu Thr Gln
180
<210> 607
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_89_Strain_ATCC_VR1199_3C(K88P)
<400> 607
ggc cca gag gaa gag ttt ggt cgc tca cta ctc aaa cat aat tgc tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Leu Lys His Asn Cys Cys
1 5 10 15
gtt gtg aca acc gac aaa ggc aaa ttc aca ggt ctt ggc ata tat gac 96
Val Val Thr Thr Asp Lys Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
caa gtc atg gta ctt cca aca cat tct gac cca ggc tct gag atc ttg 144
Gln Val Met Val Leu Pro Thr His Ser Asp Pro Gly Ser Glu Ile Leu
35 40 45
gta gat gga gta aaa gtt aag gtc tct gat tcc tat gat ttg cat aac 192
Val Asp Gly Val Lys Val Lys Val Ser Asp Ser Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
cat gag ggt gtt aag cta gag atc aca gtt gtg aaa tta att aga aat 240
His Glu Gly Val Lys Leu Glu Ile Thr Val Val Lys Leu Ile Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttt aaa gac atc aga ccn tat tta ccc tca cgt gaa gat gac 288
Glu Lys Phe Lys Asp Ile Arg Pro Tyr Leu Pro Ser Arg Glu Asp Asp
85 90 95
tat cct gct tgt aac ctt gcc tta cta gct aat caa gat gag cca aca 336
Tyr Pro Ala Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Asp Glu Pro Thr
100 105 110
ata ata agt gtt ggt gat gca gta tct tat ggt aac atc tta ttg agt 384
Ile Ile Ser Val Gly Asp Ala Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggt acc aat act gca cga atg atc aag tac cac tac ccg aca aaa gct 432
Gly Thr Asn Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr His Tyr Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga tat tgt ggg ggt gtt ttg tac aag gtt ggc tct att ctt ggt ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Val Gly Ser Ile Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggc aat ggt aga gat gga ttt tct gca atg ctt ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Lys
165 170 175
tct tat ttt ggt gaa acc cag 549
Ser Tyr Phe Gly Glu Thr Gln
180
<210> 608
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 608
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Leu Lys His Asn Cys Cys
1 5 10 15
Val Val Thr Thr Asp Lys Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Gln Val Met Val Leu Pro Thr His Ser Asp Pro Gly Ser Glu Ile Leu
35 40 45
Val Asp Gly Val Lys Val Lys Val Ser Asp Ser Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
His Glu Gly Val Lys Leu Glu Ile Thr Val Val Lys Leu Ile Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Lys Asp Ile Arg Pro Tyr Leu Pro Ser Arg Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Ala Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Asp Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Ile Ser Val Gly Asp Ala Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Thr Asn Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr His Tyr Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Val Gly Ser Ile Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Lys
165 170 175
Ser Tyr Phe Gly Glu Thr Gln
180
<210> 609
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_89_Strain_ATCC_VR1199_3C(R87P)
<400> 609
ggc cca gag gaa gag ttt ggt cgc tca cta ctc aaa cat aat tgc tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Leu Lys His Asn Cys Cys
1 5 10 15
gtt gtg aca acc gac aaa ggc aaa ttc aca ggt ctt ggc ata tat gac 96
Val Val Thr Thr Asp Lys Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
caa gtc atg gta ctt cca aca cat tct gac cca ggc tct gag atc ttg 144
Gln Val Met Val Leu Pro Thr His Ser Asp Pro Gly Ser Glu Ile Leu
35 40 45
gta gat gga gta aaa gtt aag gtc tct gat tcc tat gat ttg cat aac 192
Val Asp Gly Val Lys Val Lys Val Ser Asp Ser Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
cat gag ggt gtt aag cta gag atc aca gtt gtg aaa tta att aga aat 240
His Glu Gly Val Lys Leu Glu Ile Thr Val Val Lys Leu Ile Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttt aaa gac atc ccn aaa tat tta ccc tca cgt gaa gat gac 288
Glu Lys Phe Lys Asp Ile Pro Lys Tyr Leu Pro Ser Arg Glu Asp Asp
85 90 95
tat cct gct tgt aac ctt gcc tta cta gct aat caa gat gag cca aca 336
Tyr Pro Ala Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Asp Glu Pro Thr
100 105 110
ata ata agt gtt ggt gat gca gta tct tat ggt aac atc tta ttg agt 384
Ile Ile Ser Val Gly Asp Ala Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggt acc aat act gca cga atg atc aag tac cac tac ccg aca aaa gct 432
Gly Thr Asn Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr His Tyr Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga tat tgt ggg ggt gtt ttg tac aag gtt ggc tct att ctt ggt ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Val Gly Ser Ile Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggc aat ggt aga gat gga ttt tct gca atg ctt ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Lys
165 170 175
tct tat ttt ggt gaa acc cag 549
Ser Tyr Phe Gly Glu Thr Gln
180
<210> 610
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 610
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Leu Lys His Asn Cys Cys
1 5 10 15
Val Val Thr Thr Asp Lys Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Gln Val Met Val Leu Pro Thr His Ser Asp Pro Gly Ser Glu Ile Leu
35 40 45
Val Asp Gly Val Lys Val Lys Val Ser Asp Ser Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
His Glu Gly Val Lys Leu Glu Ile Thr Val Val Lys Leu Ile Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Lys Asp Ile Pro Lys Tyr Leu Pro Ser Arg Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Ala Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Asp Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Ile Ser Val Gly Asp Ala Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Thr Asn Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr His Tyr Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Val Gly Ser Ile Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Lys
165 170 175
Ser Tyr Phe Gly Glu Thr Gln
180
<210> 611
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_89_Strain_ATCC_VR1199_3C(T112P)
<400> 611
ggc cca gag gaa gag ttt ggt cgc tca cta ctc aaa cat aat tgc tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Leu Lys His Asn Cys Cys
1 5 10 15
gtt gtg aca acc gac aaa ggc aaa ttc aca ggt ctt ggc ata tat gac 96
Val Val Thr Thr Asp Lys Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
caa gtc atg gta ctt cca aca cat tct gac cca ggc tct gag atc ttg 144
Gln Val Met Val Leu Pro Thr His Ser Asp Pro Gly Ser Glu Ile Leu
35 40 45
gta gat gga gta aaa gtt aag gtc tct gat tcc tat gat ttg cat aac 192
Val Asp Gly Val Lys Val Lys Val Ser Asp Ser Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
cat gag ggt gtt aag cta gag atc aca gtt gtg aaa tta att aga aat 240
His Glu Gly Val Lys Leu Glu Ile Thr Val Val Lys Leu Ile Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttt aaa gac atc aga aaa tat tta ccc tca cgt gaa gat gac 288
Glu Lys Phe Lys Asp Ile Arg Lys Tyr Leu Pro Ser Arg Glu Asp Asp
85 90 95
tat cct gct tgt aac ctt gcc tta cta gct aat caa gat gag cca ccn 336
Tyr Pro Ala Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Asp Glu Pro Pro
100 105 110
ata ata agt gtt ggt gat gca gta tct tat ggt aac atc tta ttg agt 384
Ile Ile Ser Val Gly Asp Ala Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggt acc aat act gca cga atg atc aag tac cac tac ccg aca aaa gct 432
Gly Thr Asn Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr His Tyr Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga tat tgt ggg ggt gtt ttg tac aag gtt ggc tct att ctt ggt ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Val Gly Ser Ile Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggc aat ggt aga gat gga ttt tct gca atg ctt ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Lys
165 170 175
tct tat ttt ggt gaa acc cag 549
Ser Tyr Phe Gly Glu Thr Gln
180
<210> 612
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 612
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Leu Lys His Asn Cys Cys
1 5 10 15
Val Val Thr Thr Asp Lys Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Gln Val Met Val Leu Pro Thr His Ser Asp Pro Gly Ser Glu Ile Leu
35 40 45
Val Asp Gly Val Lys Val Lys Val Ser Asp Ser Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
His Glu Gly Val Lys Leu Glu Ile Thr Val Val Lys Leu Ile Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Lys Asp Ile Arg Lys Tyr Leu Pro Ser Arg Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Ala Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Asp Glu Pro Pro
100 105 110
Ile Ile Ser Val Gly Asp Ala Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Thr Asn Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr His Tyr Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Val Gly Ser Ile Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Lys
165 170 175
Ser Tyr Phe Gly Glu Thr Gln
180
<210> 613
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_89_Strain_ATCC_VR1199_3C(T19P)
<400> 613
ggc cca gag gaa gag ttt ggt cgc tca cta ctc aaa cat aat tgc tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Leu Lys His Asn Cys Cys
1 5 10 15
gtt gtg ccn acc gac aaa ggc aaa ttc aca ggt ctt ggc ata tat gac 96
Val Val Pro Thr Asp Lys Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
caa gtc atg gta ctt cca aca cat tct gac cca ggc tct gag atc ttg 144
Gln Val Met Val Leu Pro Thr His Ser Asp Pro Gly Ser Glu Ile Leu
35 40 45
gta gat gga gta aaa gtt aag gtc tct gat tcc tat gat ttg cat aac 192
Val Asp Gly Val Lys Val Lys Val Ser Asp Ser Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
cat gag ggt gtt aag cta gag atc aca gtt gtg aaa tta att aga aat 240
His Glu Gly Val Lys Leu Glu Ile Thr Val Val Lys Leu Ile Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttt aaa gac atc aga aaa tat tta ccc tca cgt gaa gat gac 288
Glu Lys Phe Lys Asp Ile Arg Lys Tyr Leu Pro Ser Arg Glu Asp Asp
85 90 95
tat cct gct tgt aac ctt gcc tta cta gct aat caa gat gag cca aca 336
Tyr Pro Ala Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Asp Glu Pro Thr
100 105 110
ata ata agt gtt ggt gat gca gta tct tat ggt aac atc tta ttg agt 384
Ile Ile Ser Val Gly Asp Ala Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggt acc aat act gca cga atg atc aag tac cac tac ccg aca aaa gct 432
Gly Thr Asn Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr His Tyr Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga tat tgt ggg ggt gtt ttg tac aag gtt ggc tct att ctt ggt ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Val Gly Ser Ile Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggc aat ggt aga gat gga ttt tct gca atg ctt ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Lys
165 170 175
tct tat ttt ggt gaa acc cag 549
Ser Tyr Phe Gly Glu Thr Gln
180
<210> 614
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 614
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Leu Lys His Asn Cys Cys
1 5 10 15
Val Val Pro Thr Asp Lys Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Gln Val Met Val Leu Pro Thr His Ser Asp Pro Gly Ser Glu Ile Leu
35 40 45
Val Asp Gly Val Lys Val Lys Val Ser Asp Ser Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
His Glu Gly Val Lys Leu Glu Ile Thr Val Val Lys Leu Ile Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Lys Asp Ile Arg Lys Tyr Leu Pro Ser Arg Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Ala Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Asp Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Ile Ser Val Gly Asp Ala Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Thr Asn Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr His Tyr Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Val Gly Ser Ile Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Lys
165 170 175
Ser Tyr Phe Gly Glu Thr Gln
180
<210> 615
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_89_Strain_ATCC_VR1199_3C(T20P)
<400> 615
ggc cca gag gaa gag ttt ggt cgc tca cta ctc aaa cat aat tgc tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Leu Lys His Asn Cys Cys
1 5 10 15
gtt gtg aca ccn gac aaa ggc aaa ttc aca ggt ctt ggc ata tat gac 96
Val Val Thr Pro Asp Lys Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
caa gtc atg gta ctt cca aca cat tct gac cca ggc tct gag atc ttg 144
Gln Val Met Val Leu Pro Thr His Ser Asp Pro Gly Ser Glu Ile Leu
35 40 45
gta gat gga gta aaa gtt aag gtc tct gat tcc tat gat ttg cat aac 192
Val Asp Gly Val Lys Val Lys Val Ser Asp Ser Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
cat gag ggt gtt aag cta gag atc aca gtt gtg aaa tta att aga aat 240
His Glu Gly Val Lys Leu Glu Ile Thr Val Val Lys Leu Ile Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttt aaa gac atc aga aaa tat tta ccc tca cgt gaa gat gac 288
Glu Lys Phe Lys Asp Ile Arg Lys Tyr Leu Pro Ser Arg Glu Asp Asp
85 90 95
tat cct gct tgt aac ctt gcc tta cta gct aat caa gat gag cca aca 336
Tyr Pro Ala Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Asp Glu Pro Thr
100 105 110
ata ata agt gtt ggt gat gca gta tct tat ggt aac atc tta ttg agt 384
Ile Ile Ser Val Gly Asp Ala Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggt acc aat act gca cga atg atc aag tac cac tac ccg aca aaa gct 432
Gly Thr Asn Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr His Tyr Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga tat tgt ggg ggt gtt ttg tac aag gtt ggc tct att ctt ggt ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Val Gly Ser Ile Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggc aat ggt aga gat gga ttt tct gca atg ctt ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Lys
165 170 175
tct tat ttt ggt gaa acc cag 549
Ser Tyr Phe Gly Glu Thr Gln
180
<210> 616
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 616
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Leu Lys His Asn Cys Cys
1 5 10 15
Val Val Thr Pro Asp Lys Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Gln Val Met Val Leu Pro Thr His Ser Asp Pro Gly Ser Glu Ile Leu
35 40 45
Val Asp Gly Val Lys Val Lys Val Ser Asp Ser Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
His Glu Gly Val Lys Leu Glu Ile Thr Val Val Lys Leu Ile Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Lys Asp Ile Arg Lys Tyr Leu Pro Ser Arg Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Ala Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Asp Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Ile Ser Val Gly Asp Ala Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Thr Asn Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr His Tyr Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Val Gly Ser Ile Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Lys
165 170 175
Ser Tyr Phe Gly Glu Thr Gln
180
<210> 617
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_89_Strain_ATCC_VR1199_3C(wt))
<400> 617
ggc cca gag gaa gag ttt ggt cgc tca cta ctc aaa cat aat tgc tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Leu Lys His Asn Cys Cys
1 5 10 15
gtt gtg aca acc gac aaa ggc aaa ttc aca ggt ctt ggc ata tat gac 96
Val Val Thr Thr Asp Lys Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
caa gtc atg gta ctt cca aca cat tct gac cca ggc tct gag atc ttg 144
Gln Val Met Val Leu Pro Thr His Ser Asp Pro Gly Ser Glu Ile Leu
35 40 45
gta gat gga gta aaa gtt aag gtc tct gat tcc tat gat ttg cat aac 192
Val Asp Gly Val Lys Val Lys Val Ser Asp Ser Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
cat gag ggt gtt aag cta gag atc aca gtt gtg aaa tta att aga aat 240
His Glu Gly Val Lys Leu Glu Ile Thr Val Val Lys Leu Ile Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttt aaa gac atc aga aaa tat tta ccc tca cgt gaa gat gac 288
Glu Lys Phe Lys Asp Ile Arg Lys Tyr Leu Pro Ser Arg Glu Asp Asp
85 90 95
tat cct gct tgt aac ctt gcc tta cta gct aat caa gat gag cca aca 336
Tyr Pro Ala Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Asp Glu Pro Thr
100 105 110
ata ata agt gtt ggt gat gca gta tct tat ggt aac atc tta ttg agt 384
Ile Ile Ser Val Gly Asp Ala Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggt acc aat act gca cga atg atc aag tac cac tac ccg aca aaa gct 432
Gly Thr Asn Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr His Tyr Pro Thr Lys Ala
130 135 140
gga tat tgt ggg ggt gtt ttg tac aag gtt ggc tct att ctt ggt ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Val Gly Ser Ile Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggt ggc aat ggt aga gat gga ttt tct gca atg ctt ctc aaa 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Lys
165 170 175
tct tat ttt ggt gaa acc cag 549
Ser Tyr Phe Gly Glu Thr Gln
180
<210> 618
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 618
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Arg Ser Leu Leu Lys His Asn Cys Cys
1 5 10 15
Val Val Thr Thr Asp Lys Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Gln Val Met Val Leu Pro Thr His Ser Asp Pro Gly Ser Glu Ile Leu
35 40 45
Val Asp Gly Val Lys Val Lys Val Ser Asp Ser Tyr Asp Leu His Asn
50 55 60
His Glu Gly Val Lys Leu Glu Ile Thr Val Val Lys Leu Ile Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Lys Asp Ile Arg Lys Tyr Leu Pro Ser Arg Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Ala Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Asp Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Ile Ser Val Gly Asp Ala Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Thr Asn Thr Ala Arg Met Ile Lys Tyr His Tyr Pro Thr Lys Ala
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Val Gly Ser Ile Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Lys
165 170 175
Ser Tyr Phe Gly Glu Thr Gln
180
<210> 619
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_A2_3C_X02316
<400> 619
gga cca gag gag gaa ttt ggg atg tct tta att aaa cat aac tca tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
gtt att aca aca gaa aat ggg aaa ttc aca ggt ctt gga gta tac gac 96
Val Ile Thr Thr Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aga ttt gtg gtc gta cca aca cat gca gat cct gga aag gaa att cag 144
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
gtt gat ggt ata act aca aaa gtc att gac tca tat gac cta tac aac 192
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
aag aat ggg ata aag cta gaa ata aca gta ctt aaa tta gat aga aat 240
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttt aga gat atc agg aga tat ata cct aac aat gaa gat gat 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Arg Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
tac ccc aat tgc aac tta gca ctg cta gca aac cag cct gaa cca act 336
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Pro Glu Pro Thr
100 105 110
ata atc aat gtt gga gat gtt gta tcc tat ggc aat ata ctg ctc agt 384
Ile Ile Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggc aac caa acg gct aga atg ctt aaa tac agt tac cca act aaa tct 432
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
ggt tac tgt gga ggt gtc tta tac aaa att ggg caa gtg ctt gga ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggg ggc aat ggt agg gat ggt ttc tca gct atg tta ctc aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
tcc tat ttc act gat gtt cag 549
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 620
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 620
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
Val Ile Thr Thr Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Arg Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Pro Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Ile Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 621
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_A2_3C_X02316_3C(I114P)
<400> 621
gga cca gag gag gaa ttt ggg atg tct tta att aaa cat aac tca tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
gtt att aca aca gaa aat ggg aaa ttc aca ggt ctt gga gta tac gac 96
Val Ile Thr Thr Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aga ttt gtg gtc gta cca aca cat gca gat cct gga aag gaa att cag 144
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
gtt gat ggt ata act aca aaa gtc att gac tca tat gac cta tac aac 192
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
aag aat ggg ata aag cta gaa ata aca gta ctt aaa tta gat aga aat 240
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttt aga gat atc agg aga tat ata cct aac aat gaa gat gat 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Arg Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
tac ccc aat tgc aac tta gca ctg cta gca aac cag cct gaa cca act 336
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Pro Glu Pro Thr
100 105 110
ata ccn aat gtt gga gat gtt gta tcc tat ggc aat ata ctg ctc agt 384
Ile Pro Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggc aac caa acg gct aga atg ctt aaa tac agt tac cca act aaa tct 432
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
ggt tac tgt gga ggt gtc tta tac aaa att ggg caa gtg ctt gga ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggg ggc aat ggt agg gat ggt ttc tca gct atg tta ctc aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
tcc tat ttc act gat gtt cag 549
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 622
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 622
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
Val Ile Thr Thr Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Arg Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Pro Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Pro Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 623
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_A2_3C_X02316_3C(Q108P)
<400> 623
gga cca gag gag gaa ttt ggg atg tct tta att aaa cat aac tca tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
gtt att aca aca gaa aat ggg aaa ttc aca ggt ctt gga gta tac gac 96
Val Ile Thr Thr Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aga ttt gtg gtc gta cca aca cat gca gat cct gga aag gaa att cag 144
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
gtt gat ggt ata act aca aaa gtc att gac tca tat gac cta tac aac 192
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
aag aat ggg ata aag cta gaa ata aca gta ctt aaa tta gat aga aat 240
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttt aga gat atc agg aga tat ata cct aac aat gaa gat gat 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Arg Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
tac ccc aat tgc aac tta gca ctg cta gca aac ccn cct gaa cca act 336
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Pro Pro Glu Pro Thr
100 105 110
ata atc aat gtt gga gat gtt gta tcc tat ggc aat ata ctg ctc agt 384
Ile Ile Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggc aac caa acg gct aga atg ctt aaa tac agt tac cca act aaa tct 432
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
ggt tac tgt gga ggt gtc tta tac aaa att ggg caa gtg ctt gga ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggg ggc aat ggt agg gat ggt ttc tca gct atg tta ctc aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
tcc tat ttc act gat gtt cag 549
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 624
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 624
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
Val Ile Thr Thr Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Arg Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Pro Pro Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Ile Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 625
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_A2_3C_X02316_3C(R87P)
<400> 625
gga cca gag gag gaa ttt ggg atg tct tta att aaa cat aac tca tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
gtt att aca aca gaa aat ggg aaa ttc aca ggt ctt gga gta tac gac 96
Val Ile Thr Thr Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aga ttt gtg gtc gta cca aca cat gca gat cct gga aag gaa att cag 144
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
gtt gat ggt ata act aca aaa gtc att gac tca tat gac cta tac aac 192
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
aag aat ggg ata aag cta gaa ata aca gta ctt aaa tta gat aga aat 240
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttt aga gat atc ccn aga tat ata cct aac aat gaa gat gat 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Arg Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
tac ccc aat tgc aac tta gca ctg cta gca aac cag cct gaa cca act 336
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Pro Glu Pro Thr
100 105 110
ata atc aat gtt gga gat gtt gta tcc tat ggc aat ata ctg ctc agt 384
Ile Ile Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggc aac caa acg gct aga atg ctt aaa tac agt tac cca act aaa tct 432
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
ggt tac tgt gga ggt gtc tta tac aaa att ggg caa gtg ctt gga ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggg ggc aat ggt agg gat ggt ttc tca gct atg tta ctc aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
tcc tat ttc act gat gtt cag 549
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 626
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 626
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
Val Ile Thr Thr Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Pro Arg Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Pro Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Ile Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 627
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_A2_3C_X02316_3C(R88P)
<400> 627
gga cca gag gag gaa ttt ggg atg tct tta att aaa cat aac tca tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
gtt att aca aca gaa aat ggg aaa ttc aca ggt ctt gga gta tac gac 96
Val Ile Thr Thr Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aga ttt gtg gtc gta cca aca cat gca gat cct gga aag gaa att cag 144
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
gtt gat ggt ata act aca aaa gtc att gac tca tat gac cta tac aac 192
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
aag aat ggg ata aag cta gaa ata aca gta ctt aaa tta gat aga aat 240
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttt aga gat atc agg ccn tat ata cct aac aat gaa gat gat 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
tac ccc aat tgc aac tta gca ctg cta gca aac cag cct gaa cca act 336
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Pro Glu Pro Thr
100 105 110
ata atc aat gtt gga gat gtt gta tcc tat ggc aat ata ctg ctc agt 384
Ile Ile Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggc aac caa acg gct aga atg ctt aaa tac agt tac cca act aaa tct 432
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
ggt tac tgt gga ggt gtc tta tac aaa att ggg caa gtg ctt gga ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggg ggc aat ggt agg gat ggt ttc tca gct atg tta ctc aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
tcc tat ttc act gat gtt cag 549
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 628
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 628
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
Val Ile Thr Thr Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Pro Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Pro Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Ile Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 629
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_A2_3C_X02316_3C(T112P)
<400> 629
gga cca gag gag gaa ttt ggg atg tct tta att aaa cat aac tca tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
gtt att aca aca gaa aat ggg aaa ttc aca ggt ctt gga gta tac gac 96
Val Ile Thr Thr Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aga ttt gtg gtc gta cca aca cat gca gat cct gga aag gaa att cag 144
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
gtt gat ggt ata act aca aaa gtc att gac tca tat gac cta tac aac 192
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
aag aat ggg ata aag cta gaa ata aca gta ctt aaa tta gat aga aat 240
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttt aga gat atc agg aga tat ata cct aac aat gaa gat gat 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Arg Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
tac ccc aat tgc aac tta gca ctg cta gca aac cag cct gaa cca ccn 336
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Pro Glu Pro Pro
100 105 110
ata atc aat gtt gga gat gtt gta tcc tat ggc aat ata ctg ctc agt 384
Ile Ile Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggc aac caa acg gct aga atg ctt aaa tac agt tac cca act aaa tct 432
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
ggt tac tgt gga ggt gtc tta tac aaa att ggg caa gtg ctt gga ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggg ggc aat ggt agg gat ggt ttc tca gct atg tta ctc aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
tcc tat ttc act gat gtt cag 549
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 630
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 630
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
Val Ile Thr Thr Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Arg Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Pro Glu Pro Pro
100 105 110
Ile Ile Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 631
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_A2_3C_X02316_3C(T19P)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<400> 631
gga cca gag gag gaa ttt ggg atg tct tta att aaa cat aac tca tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
gtt att ccn aca gaa aat ggg aaa ttc aca ggt ctt gga gta tac gac 96
Val Ile Pro Thr Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aga ttt gtg gtc gta cca aca cat gca gat cct gga aag gaa att cag 144
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
gtt gat ggt ata act aca aaa gtc att gac tca tat gac cta tac aac 192
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
aag aat ggg ata aag cta gaa ata aca gta ctt aaa tta gat aga aat 240
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttt aga gat atc agg aga tat ata cct aac aat gaa gat gat 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Arg Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
tac ccc aat tgc aac tta gca ctg cta gca aac cag cct gaa cca act 336
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Pro Glu Pro Thr
100 105 110
ata atc aat gtt gga gat gtt gta tcc tat ggc aat ata ctg ctc agt 384
Ile Ile Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggc aac caa acg gct aga atg ctt aaa tac agt tac cca act aaa tct 432
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
ggt tac tgt gga ggt gtc tta tac aaa att ggg caa gtg ctt gga ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggg ggc aat ggt agg gat ggt ttc tca gct atg tta ctc aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
tcc tat ttc act gat gtt cag 549
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 632
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 632
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
Val Ile Pro Thr Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Arg Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Pro Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Ile Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 633
<211> 549
<212> DNA
<213> Human rhinovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> n is c, g, a, t/u
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Human_Rhinovirus_A2_3C_X02316_3C(T20P)
<400> 633
gga cca gag gag gaa ttt ggg atg tct tta att aaa cat aac tca tgt 48
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
gtt att aca ccn gaa aat ggg aaa ttc aca ggt ctt gga gta tac gac 96
Val Ile Thr Pro Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
aga ttt gtg gtc gta cca aca cat gca gat cct gga aag gaa att cag 144
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
gtt gat ggt ata act aca aaa gtc att gac tca tat gac cta tac aac 192
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
aag aat ggg ata aag cta gaa ata aca gta ctt aaa tta gat aga aat 240
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
gaa aaa ttt aga gat atc agg aga tat ata cct aac aat gaa gat gat 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Arg Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
tac ccc aat tgc aac tta gca ctg cta gca aac cag cct gaa cca act 336
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Pro Glu Pro Thr
100 105 110
ata atc aat gtt gga gat gtt gta tcc tat ggc aat ata ctg ctc agt 384
Ile Ile Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
ggc aac caa acg gct aga atg ctt aaa tac agt tac cca act aaa tct 432
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
ggt tac tgt gga ggt gtc tta tac aaa att ggg caa gtg ctt gga ata 480
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gtt ggg ggc aat ggt agg gat ggt ttc tca gct atg tta ctc aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
tcc tat ttc act gat gtt cag 549
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 634
<211> 183
<212> PRT
<213> Human rhinovirus
<400> 634
Gly Pro Glu Glu Glu Phe Gly Met Ser Leu Ile Lys His Asn Ser Cys
1 5 10 15
Val Ile Thr Pro Glu Asn Gly Lys Phe Thr Gly Leu Gly Val Tyr Asp
20 25 30
Arg Phe Val Val Val Pro Thr His Ala Asp Pro Gly Lys Glu Ile Gln
35 40 45
Val Asp Gly Ile Thr Thr Lys Val Ile Asp Ser Tyr Asp Leu Tyr Asn
50 55 60
Lys Asn Gly Ile Lys Leu Glu Ile Thr Val Leu Lys Leu Asp Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Arg Tyr Ile Pro Asn Asn Glu Asp Asp
85 90 95
Tyr Pro Asn Cys Asn Leu Ala Leu Leu Ala Asn Gln Pro Glu Pro Thr
100 105 110
Ile Ile Asn Val Gly Asp Val Val Ser Tyr Gly Asn Ile Leu Leu Ser
115 120 125
Gly Asn Gln Thr Ala Arg Met Leu Lys Tyr Ser Tyr Pro Thr Lys Ser
130 135 140
Gly Tyr Cys Gly Gly Val Leu Tyr Lys Ile Gly Gln Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly Arg Asp Gly Phe Ser Ala Met Leu Leu Arg
165 170 175
Ser Tyr Phe Thr Asp Val Gln
180
<210> 635
<211> 615
<212> DNA
<213> Porcine Teschovirus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(615)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(615)
<223> Porcine_Teschovirus_3C(wt)_NC003985
<400> 635
ggg cca aaa gga caa gcc aat atg gaa atg gaa aga act tta atg aag 48
Gly Pro Lys Gly Gln Ala Asn Met Glu Met Glu Arg Thr Leu Met Lys
1 5 10 15
aag aac ata gtg gaa atg aca tat gag aag cac aac ggg agg ttt caa 96
Lys Asn Ile Val Glu Met Thr Tyr Glu Lys His Asn Gly Arg Phe Gln
20 25 30
act acc aca gtc ctg ttt gtg cgt gat cgg att ttt ctg atc aac act 144
Thr Thr Thr Val Leu Phe Val Arg Asp Arg Ile Phe Leu Ile Asn Thr
35 40 45
cac att ttg tca tca att aag aac ttc cac tat gag aac act gag att 192
His Ile Leu Ser Ser Ile Lys Asn Phe His Tyr Glu Asn Thr Glu Ile
50 55 60
cca gca gct tca gtt cag aaa gtt cag gcc ata ttt gat gga cat cca 240
Pro Ala Ala Ser Val Gln Lys Val Gln Ala Ile Phe Asp Gly His Pro
65 70 75 80
tct gat gta act gca gtc cag ttc act gtt gga cga caa tac cgt gac 288
Ser Asp Val Thr Ala Val Gln Phe Thr Val Gly Arg Gln Tyr Arg Asp
85 90 95
atc aca agc aat ttt ata atc agt ctg cca aat cct ggc aca cca ata 336
Ile Thr Ser Asn Phe Ile Ile Ser Leu Pro Asn Pro Gly Thr Pro Ile
100 105 110
gtt ggc ttg atg aag aca gaa ggt agc agt tat atc tgg tct ggt gaa 384
Val Gly Leu Met Lys Thr Glu Gly Ser Ser Tyr Ile Trp Ser Gly Glu
115 120 125
tgt ctc cca ttt aaa aat aca atg aac act tat gaa ggc tgt gtt cct 432
Cys Leu Pro Phe Lys Asn Thr Met Asn Thr Tyr Glu Gly Cys Val Pro
130 135 140
cat gtg tta cca tat aag gcc gtg aca gcc cat ggc tac tgt ggc tct 480
His Val Leu Pro Tyr Lys Ala Val Thr Ala His Gly Tyr Cys Gly Ser
145 150 155 160
gtc atg gtc gca gat gct gga gtc tgg aaa ggc att tgt ggc ata cac 528
Val Met Val Ala Asp Ala Gly Val Trp Lys Gly Ile Cys Gly Ile His
165 170 175
tcc tta gga gat ggt gcc ata ggt gca gca aca gtt ttg tca aga cag 576
Ser Leu Gly Asp Gly Ala Ile Gly Ala Ala Thr Val Leu Ser Arg Gln
180 185 190
cat ttg ctc aac ctt ctt gag gga ttc ctg gaa ttc cag 615
His Leu Leu Asn Leu Leu Glu Gly Phe Leu Glu Phe Gln
195 200 205
<210> 636
<211> 205
<212> PRT
<213> Porcine Teschovirus
<400> 636
Gly Pro Lys Gly Gln Ala Asn Met Glu Met Glu Arg Thr Leu Met Lys
1 5 10 15
Lys Asn Ile Val Glu Met Thr Tyr Glu Lys His Asn Gly Arg Phe Gln
20 25 30
Thr Thr Thr Val Leu Phe Val Arg Asp Arg Ile Phe Leu Ile Asn Thr
35 40 45
His Ile Leu Ser Ser Ile Lys Asn Phe His Tyr Glu Asn Thr Glu Ile
50 55 60
Pro Ala Ala Ser Val Gln Lys Val Gln Ala Ile Phe Asp Gly His Pro
65 70 75 80
Ser Asp Val Thr Ala Val Gln Phe Thr Val Gly Arg Gln Tyr Arg Asp
85 90 95
Ile Thr Ser Asn Phe Ile Ile Ser Leu Pro Asn Pro Gly Thr Pro Ile
100 105 110
Val Gly Leu Met Lys Thr Glu Gly Ser Ser Tyr Ile Trp Ser Gly Glu
115 120 125
Cys Leu Pro Phe Lys Asn Thr Met Asn Thr Tyr Glu Gly Cys Val Pro
130 135 140
His Val Leu Pro Tyr Lys Ala Val Thr Ala His Gly Tyr Cys Gly Ser
145 150 155 160
Val Met Val Ala Asp Ala Gly Val Trp Lys Gly Ile Cys Gly Ile His
165 170 175
Ser Leu Gly Asp Gly Ala Ile Gly Ala Ala Thr Val Leu Ser Arg Gln
180 185 190
His Leu Leu Asn Leu Leu Glu Gly Phe Leu Glu Phe Gln
195 200 205
<210> 637
<211> 525
<212> DNA
<213> Seneca Valley Virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(525)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(525)
<223> Seneca_Valley_Virus_3C(wt)
<400> 637
gac atg ggc ttt gag gct gcg gtc gct aag aaa gtg gtc gtc ccc att 48
Asp Met Gly Phe Glu Ala Ala Val Ala Lys Lys Val Val Val Pro Ile
1 5 10 15
acc ttc atg gtt ccc aac aga cct tct ggg ctt aca cag tcc gct ctt 96
Thr Phe Met Val Pro Asn Arg Pro Ser Gly Leu Thr Gln Ser Ala Leu
20 25 30
ctg gtg acc ggc cgg acc ttc cta atc aat gaa cat aca tgg tcc aat 144
Leu Val Thr Gly Arg Thr Phe Leu Ile Asn Glu His Thr Trp Ser Asn
35 40 45
ccc tcc tgg acc agc ttc aca atc cgc ggt gag gta cac act cgt gat 192
Pro Ser Trp Thr Ser Phe Thr Ile Arg Gly Glu Val His Thr Arg Asp
50 55 60
gag ccc ttc caa acg gtt cat ttc act cac cac ggt att ccc aca gat 240
Glu Pro Phe Gln Thr Val His Phe Thr His His Gly Ile Pro Thr Asp
65 70 75 80
ctg atg atg gta cgt ctc gga ccg ggc aat tct ttc cct aac aat cta 288
Leu Met Met Val Arg Leu Gly Pro Gly Asn Ser Phe Pro Asn Asn Leu
85 90 95
gac aag ttt gga ctt gac cag atg ccg gca cgc aac tcc cgt gtg gtt 336
Asp Lys Phe Gly Leu Asp Gln Met Pro Ala Arg Asn Ser Arg Val Val
100 105 110
ggc gtt tcg tcc agt tac gga aac ttc ttc ttc tct gga aat ttc ctc 384
Gly Val Ser Ser Ser Tyr Gly Asn Phe Phe Phe Ser Gly Asn Phe Leu
115 120 125
gga ttt gtt gat tcc atc acc tct gaa caa gga act tac gca aga ctc 432
Gly Phe Val Asp Ser Ile Thr Ser Glu Gln Gly Thr Tyr Ala Arg Leu
130 135 140
ttt agg tac agg gtg acg acc tac aaa gga tgg tgc ggc tcg gcc ctg 480
Phe Arg Tyr Arg Val Thr Thr Tyr Lys Gly Trp Cys Gly Ser Ala Leu
145 150 155 160
gtc tgt gag gcc ggt ggc gtc cga cgc atc att ggc ctg cat tct 525
Val Cys Glu Ala Gly Gly Val Arg Arg Ile Ile Gly Leu His Ser
165 170 175
<210> 638
<211> 175
<212> PRT
<213> Seneca Valley Virus
<400> 638
Asp Met Gly Phe Glu Ala Ala Val Ala Lys Lys Val Val Val Pro Ile
1 5 10 15
Thr Phe Met Val Pro Asn Arg Pro Ser Gly Leu Thr Gln Ser Ala Leu
20 25 30
Leu Val Thr Gly Arg Thr Phe Leu Ile Asn Glu His Thr Trp Ser Asn
35 40 45
Pro Ser Trp Thr Ser Phe Thr Ile Arg Gly Glu Val His Thr Arg Asp
50 55 60
Glu Pro Phe Gln Thr Val His Phe Thr His His Gly Ile Pro Thr Asp
65 70 75 80
Leu Met Met Val Arg Leu Gly Pro Gly Asn Ser Phe Pro Asn Asn Leu
85 90 95
Asp Lys Phe Gly Leu Asp Gln Met Pro Ala Arg Asn Ser Arg Val Val
100 105 110
Gly Val Ser Ser Ser Tyr Gly Asn Phe Phe Phe Ser Gly Asn Phe Leu
115 120 125
Gly Phe Val Asp Ser Ile Thr Ser Glu Gln Gly Thr Tyr Ala Arg Leu
130 135 140
Phe Arg Tyr Arg Val Thr Thr Tyr Lys Gly Trp Cys Gly Ser Ala Leu
145 150 155 160
Val Cys Glu Ala Gly Gly Val Arg Arg Ile Ile Gly Leu His Ser
165 170 175
<210> 639
<211> 549
<212> DNA
<213> Swine Vesicular Disease
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(549)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(549)
<223> Swine_Vesicular_Disease_Virus_3C(wt)
<400> 639
ggt cca gcg ttt gag ttc gcc gtg gcg atg atg aaa aga aac gcc agt 48
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ala Ser
1 5 10 15
aca gtg aaa act gag tac ggt gaa ttc acc atg ctt ggg att tac gac 96
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
agg tgg gcg gtg ttg cca cgc cat gcc aaa cct ggc ccc acc atc ttg 144
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
atg aac gac cag gta gtc gga gtg ttg gac gcc aag gaa cta gtt gat 192
Met Asn Asp Gln Val Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
aaa gat ggg acc aac ctg gaa ttg act ctc ttg aag ctc aac cgc aac 240
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
gag aag ttt aga gac atc agg gga ttc tta gca cga gag gag gtc gaa 288
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Arg Glu Glu Val Glu
85 90 95
gtg aac gaa gct gtc cta gca ata aac aca agt aaa ttc ccg aat atg 336
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
tac ata ccc gtg ggc cgg gta acc gac tat ggg ttc tta aat ctg ggt 384
Tyr Ile Pro Val Gly Arg Val Thr Asp Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
gga acc ccc acg aag aga atg ctc atg tac aat ttc cca act agg gca 432
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
ggc cag tgt ggg ggt gtc ctt atg tca aca ggg aaa gtc ctg gga ata 480
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
cat gta gga ggg aat gga cac caa ggg ttt tca gcg gca ctc ctc aga 528
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Arg
165 170 175
cac tac ttc aac gag gag cag 549
His Tyr Phe Asn Glu Glu Gln
180
<210> 640
<211> 183
<212> PRT
<213> Swine Vesicular Disease
<400> 640
Gly Pro Ala Phe Glu Phe Ala Val Ala Met Met Lys Arg Asn Ala Ser
1 5 10 15
Thr Val Lys Thr Glu Tyr Gly Glu Phe Thr Met Leu Gly Ile Tyr Asp
20 25 30
Arg Trp Ala Val Leu Pro Arg His Ala Lys Pro Gly Pro Thr Ile Leu
35 40 45
Met Asn Asp Gln Val Val Gly Val Leu Asp Ala Lys Glu Leu Val Asp
50 55 60
Lys Asp Gly Thr Asn Leu Glu Leu Thr Leu Leu Lys Leu Asn Arg Asn
65 70 75 80
Glu Lys Phe Arg Asp Ile Arg Gly Phe Leu Ala Arg Glu Glu Val Glu
85 90 95
Val Asn Glu Ala Val Leu Ala Ile Asn Thr Ser Lys Phe Pro Asn Met
100 105 110
Tyr Ile Pro Val Gly Arg Val Thr Asp Tyr Gly Phe Leu Asn Leu Gly
115 120 125
Gly Thr Pro Thr Lys Arg Met Leu Met Tyr Asn Phe Pro Thr Arg Ala
130 135 140
Gly Gln Cys Gly Gly Val Leu Met Ser Thr Gly Lys Val Leu Gly Ile
145 150 155 160
His Val Gly Gly Asn Gly His Gln Gly Phe Ser Ala Ala Leu Leu Arg
165 170 175
His Tyr Phe Asn Glu Glu Gln
180
<210> 641
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nde-3C-F2 Primer
<400> 641
catatgagtg gtgccccacc gac 23
<210> 642
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CCGATTCTAGACTCGAGTTA
<400> 642
ccgattctag actcgagtta 20
<210> 643
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> T7 Primer
<400> 643
taatacgact cactataggg 20
<210> 644
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pSNAP-SR Primer
<400> 644
cggatatagt tcctcctttc 20
<210> 645
<211> 90
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Delta 1D2A interrupter sequence
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(90)
<223> Nucleotides 34-87 code for the 2A sequence
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(90)
<400> 645
cay aag caa aag atc att gca cca gca aag cag ctt ctg aat ttt gac 48
His Lys Gln Lys Ile Ile Ala Pro Ala Lys Gln Leu Leu Asn Phe Asp
1 5 10 15
ctg ctc aag ttg gcc gga gac gtt gag tcc aac cct gga ccc 90
Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro Gly Pro
20 25 30
<210> 646
<211> 30
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Construct
<400> 646
His Lys Gln Lys Ile Ile Ala Pro Ala Lys Gln Leu Leu Asn Phe Asp
1 5 10 15
Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser Asn Pro Gly Pro
20 25 30
<210> 647
<211> 8
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Conserved 2A motif
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (2)..(2)
<223> XAA is any naturally occurring amino acid
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (4)..(4)
<223> XAA is any naturally occurring amino acid
<400> 647
Asp Xaa Glu Xaa Asn Pro Gly Pro
1 5
<210> 648
<211> 558
<212> DNA
<213> Gaussia princeps
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(558)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(558)
<223> GLuc
<400> 648
atg gga gtc aaa gtt ctg ttt gcc ctg atc tgc atc gct gtg gcc gag 48
Met Gly Val Lys Val Leu Phe Ala Leu Ile Cys Ile Ala Val Ala Glu
1 5 10 15
gcc aag ccc acc gag aac aac gaa gac ttc aac atc gtg gcc gtg gcc 96
Ala Lys Pro Thr Glu Asn Asn Glu Asp Phe Asn Ile Val Ala Val Ala
20 25 30
agc aac ttc gcg acc acg gat ctc gat gct gac cgc ggg aag ttg ccc 144
Ser Asn Phe Ala Thr Thr Asp Leu Asp Ala Asp Arg Gly Lys Leu Pro
35 40 45
ggc aag aag ctg ccg ctg gag gtg ctc aaa gag atg gaa gcc aat gcc 192
Gly Lys Lys Leu Pro Leu Glu Val Leu Lys Glu Met Glu Ala Asn Ala
50 55 60
cgg aaa gct ggc tgc acc agg ggc tgt ctg atc tgc ctg tcc cac atc 240
Arg Lys Ala Gly Cys Thr Arg Gly Cys Leu Ile Cys Leu Ser His Ile
65 70 75 80
aag tgc acg ccc aag atg aag aag ttc atc cca gga cgc tgc cac acc 288
Lys Cys Thr Pro Lys Met Lys Lys Phe Ile Pro Gly Arg Cys His Thr
85 90 95
tac gaa ggc gac aaa gag tcc gca cag ggc ggc ata ggc gag gcg atc 336
Tyr Glu Gly Asp Lys Glu Ser Ala Gln Gly Gly Ile Gly Glu Ala Ile
100 105 110
gtc gac att cct gag att cct ggg ttc aag gac ttg gag ccc atg gag 384
Val Asp Ile Pro Glu Ile Pro Gly Phe Lys Asp Leu Glu Pro Met Glu
115 120 125
cag ttc atc gca cag gtc gat ctg tgt gtg gac tgc aca act ggc tgc 432
Gln Phe Ile Ala Gln Val Asp Leu Cys Val Asp Cys Thr Thr Gly Cys
130 135 140
ctc aaa ggg ctt gcc aac gtg cag tgt tct gac ctg ctc aag aag tgg 480
Leu Lys Gly Leu Ala Asn Val Gln Cys Ser Asp Leu Leu Lys Lys Trp
145 150 155 160
ctg ccg caa cgc tgt gcg acc ttt gcc agc aag atc cag ggc cag gtg 528
Leu Pro Gln Arg Cys Ala Thr Phe Ala Ser Lys Ile Gln Gly Gln Val
165 170 175
gac aag atc aag ggg gcc ggt ggt gac taa 558
Asp Lys Ile Lys Gly Ala Gly Gly Asp
180 185
<210> 649
<211> 185
<212> PRT
<213> Gaussia princeps
<400> 649
Met Gly Val Lys Val Leu Phe Ala Leu Ile Cys Ile Ala Val Ala Glu
1 5 10 15
Ala Lys Pro Thr Glu Asn Asn Glu Asp Phe Asn Ile Val Ala Val Ala
20 25 30
Ser Asn Phe Ala Thr Thr Asp Leu Asp Ala Asp Arg Gly Lys Leu Pro
35 40 45
Gly Lys Lys Leu Pro Leu Glu Val Leu Lys Glu Met Glu Ala Asn Ala
50 55 60
Arg Lys Ala Gly Cys Thr Arg Gly Cys Leu Ile Cys Leu Ser His Ile
65 70 75 80
Lys Cys Thr Pro Lys Met Lys Lys Phe Ile Pro Gly Arg Cys His Thr
85 90 95
Tyr Glu Gly Asp Lys Glu Ser Ala Gln Gly Gly Ile Gly Glu Ala Ile
100 105 110
Val Asp Ile Pro Glu Ile Pro Gly Phe Lys Asp Leu Glu Pro Met Glu
115 120 125
Gln Phe Ile Ala Gln Val Asp Leu Cys Val Asp Cys Thr Thr Gly Cys
130 135 140
Leu Lys Gly Leu Ala Asn Val Gln Cys Ser Asp Leu Leu Lys Lys Trp
145 150 155 160
Leu Pro Gln Arg Cys Ala Thr Phe Ala Ser Lys Ile Gln Gly Gln Val
165 170 175
Asp Lys Ile Lys Gly Ala Gly Gly Asp
180 185
<210> 650
<211> 558
<212> DNA
<213> Gaussia princeps
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(558)
<223> SGLuc
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(558)
<400> 650
atg gga gtc aaa gtt ctg ttt gcc ctg atc tgc atc gct gtg gcc gag 48
Met Gly Val Lys Val Leu Phe Ala Leu Ile Cys Ile Ala Val Ala Glu
1 5 10 15
gcc aag ccc acc gag aac aac gaa gac ttc aac atc gtg gcc gtg gcc 96
Ala Lys Pro Thr Glu Asn Asn Glu Asp Phe Asn Ile Val Ala Val Ala
20 25 30
agc aac ttt gcg acc acg gat ctc gat gct gac cga ggg aag ttg ccc 144
Ser Asn Phe Ala Thr Thr Asp Leu Asp Ala Asp Arg Gly Lys Leu Pro
35 40 45
ggc aag aag ctg ccg ctg gag gtg ctc aaa gag atg gaa gcc aat gcc 192
Gly Lys Lys Leu Pro Leu Glu Val Leu Lys Glu Met Glu Ala Asn Ala
50 55 60
cgg aaa gct ggc tgc acc agg ggc tgt ctg atc tgc ctg tcc cac atc 240
Arg Lys Ala Gly Cys Thr Arg Gly Cys Leu Ile Cys Leu Ser His Ile
65 70 75 80
aag tgc acg ccc aag atg aag aag tgg ctc cca gga cgc tgc cac acc 288
Lys Cys Thr Pro Lys Met Lys Lys Trp Leu Pro Gly Arg Cys His Thr
85 90 95
tac gaa ggc gac aaa gag tcc gca cag ggc ggc ata ggc gag gcg atc 336
Tyr Glu Gly Asp Lys Glu Ser Ala Gln Gly Gly Ile Gly Glu Ala Ile
100 105 110
gtc gat att cct gag att cct ggg ttc aag gac ttg gag cca atg gag 384
Val Asp Ile Pro Glu Ile Pro Gly Phe Lys Asp Leu Glu Pro Met Glu
115 120 125
cag ttc atc gca cag gtc gat ctg tgt gtg gac tgc aca act ggc tgc 432
Gln Phe Ile Ala Gln Val Asp Leu Cys Val Asp Cys Thr Thr Gly Cys
130 135 140
ctc aaa ggg ctt gcc aac gtg cag tgt tct gac ctg ctc aag aag tgg 480
Leu Lys Gly Leu Ala Asn Val Gln Cys Ser Asp Leu Leu Lys Lys Trp
145 150 155 160
ctg ccg caa cgc tgt gcg acc ttt gcc agc aag atc cag ggc cag gtg 528
Leu Pro Gln Arg Cys Ala Thr Phe Ala Ser Lys Ile Gln Gly Gln Val
165 170 175
gac aag atc aag ggg gcc ggt ggt gac taa 558
Asp Lys Ile Lys Gly Ala Gly Gly Asp
180 185
<210> 651
<211> 185
<212> PRT
<213> Gaussia princeps
<400> 651
Met Gly Val Lys Val Leu Phe Ala Leu Ile Cys Ile Ala Val Ala Glu
1 5 10 15
Ala Lys Pro Thr Glu Asn Asn Glu Asp Phe Asn Ile Val Ala Val Ala
20 25 30
Ser Asn Phe Ala Thr Thr Asp Leu Asp Ala Asp Arg Gly Lys Leu Pro
35 40 45
Gly Lys Lys Leu Pro Leu Glu Val Leu Lys Glu Met Glu Ala Asn Ala
50 55 60
Arg Lys Ala Gly Cys Thr Arg Gly Cys Leu Ile Cys Leu Ser His Ile
65 70 75 80
Lys Cys Thr Pro Lys Met Lys Lys Trp Leu Pro Gly Arg Cys His Thr
85 90 95
Tyr Glu Gly Asp Lys Glu Ser Ala Gln Gly Gly Ile Gly Glu Ala Ile
100 105 110
Val Asp Ile Pro Glu Ile Pro Gly Phe Lys Asp Leu Glu Pro Met Glu
115 120 125
Gln Phe Ile Ala Gln Val Asp Leu Cys Val Asp Cys Thr Thr Gly Cys
130 135 140
Leu Lys Gly Leu Ala Asn Val Gln Cys Ser Asp Leu Leu Lys Lys Trp
145 150 155 160
Leu Pro Gln Arg Cys Ala Thr Phe Ala Ser Lys Ile Gln Gly Gln Val
165 170 175
Asp Lys Ile Lys Gly Ala Gly Gly Asp
180 185
<210> 652
<211> 657
<212> DNA
<213> Hepatitis A virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(657)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(657)
<223> Hepatitis A 3C(G17P)
<400> 652
tca act ttg gaa ata gca gga ctg gtt agg aag aac ttg gtt cag ttt 48
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
ccn gtt gga gag aag aat gga tgt gtg aga tgg gtt atg aat gcc ttg 96
Pro Val Gly Glu Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
gga gtg aaa gat gat tgg ctg ctt gtg cct tcc cat gct tat aaa ttt 144
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
gag aaa gat tat gaa atg atg gag ttt tat ttt aat aga ggt gga act 192
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
tac tat tca att tca gct ggt aat gtt gtt att caa tct ttg gat gtg 240
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
gga ttc cag gat gtt gtt ctg atg aag gtt cct aca att cct aag ttt 288
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
aga gat att act cag cat ttt att aag aaa ggg gat gtg cct aga gct 336
Arg Asp Ile Thr Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
ttg aat cgc ctg gca aca tta gtg aca act gta aat gga acc cct atg 384
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Met
115 120 125
tta att tct gag ggc cca cta aag atg gaa gag aaa gct act tat gtt 432
Leu Ile Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
cat aag aaa aat gat ggt aca aca gtt gat tta act gtg gat cag gca 480
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
tgg aga gga aaa ggc gaa ggt ctt cct gga atg tgt ggt ggg gcc ttg 528
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
gtt tca tcg aat caa tct ata cag aat gca atc ttg ggc atc cat gtt 576
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
gct gga gga aat tca att ctt gtt gca aaa ttg gtt act caa gaa atg 624
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
ttc caa aat att gat aag aaa att gaa agt cag 657
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 653
<211> 219
<212> PRT
<213> Hepatitis A virus
<400> 653
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
Pro Val Gly Glu Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Met
115 120 125
Leu Ile Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 654
<211> 657
<212> DNA
<213> Hepatitis A virus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(657)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(657)
<223> Hepatitis A 3C(V18P)
<400> 654
tca act ttg gaa ata gca gga ctg gtt agg aag aac ttg gtt cag ttt 48
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
gga ccn gga gag aag aat gga tgt gtg aga tgg gtt atg aat gcc ttg 96
Gly Pro Gly Glu Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
gga gtg aaa gat gat tgg ctg ctt gtg cct tcc cat gct tat aaa ttt 144
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
gag aaa gat tat gaa atg atg gag ttt tat ttt aat aga ggt gga act 192
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
tac tat tca att tca gct ggt aat gtt gtt att caa tct ttg gat gtg 240
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
gga ttc cag gat gtt gtt ctg atg aag gtt cct aca att cct aag ttt 288
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
aga gat att act cag cat ttt att aag aaa ggg gat gtg cct aga gct 336
Arg Asp Ile Thr Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
ttg aat cgc ctg gca aca tta gtg aca act gta aat gga acc cct atg 384
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Met
115 120 125
tta att tct gag ggc cca cta aag atg gaa gag aaa gct act tat gtt 432
Leu Ile Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
cat aag aaa aat gat ggt aca aca gtt gat tta act gtg gat cag gca 480
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
tgg aga gga aaa ggc gaa ggt ctt cct gga atg tgt ggt ggg gcc ttg 528
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
gtt tca tcg aat caa tct ata cag aat gca atc ttg ggc atc cat gtt 576
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
gct gga gga aat tca att ctt gtt gca aaa ttg gtt act caa gaa atg 624
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
ttc caa aat att gat aag aaa att gaa agt cag 657
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
<210> 655
<211> 219
<212> PRT
<213> Hepatitis A virus
<400> 655
Ser Thr Leu Glu Ile Ala Gly Leu Val Arg Lys Asn Leu Val Gln Phe
1 5 10 15
Gly Pro Gly Glu Lys Asn Gly Cys Val Arg Trp Val Met Asn Ala Leu
20 25 30
Gly Val Lys Asp Asp Trp Leu Leu Val Pro Ser His Ala Tyr Lys Phe
35 40 45
Glu Lys Asp Tyr Glu Met Met Glu Phe Tyr Phe Asn Arg Gly Gly Thr
50 55 60
Tyr Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Asn Val Val Ile Gln Ser Leu Asp Val
65 70 75 80
Gly Phe Gln Asp Val Val Leu Met Lys Val Pro Thr Ile Pro Lys Phe
85 90 95
Arg Asp Ile Thr Gln His Phe Ile Lys Lys Gly Asp Val Pro Arg Ala
100 105 110
Leu Asn Arg Leu Ala Thr Leu Val Thr Thr Val Asn Gly Thr Pro Met
115 120 125
Leu Ile Ser Glu Gly Pro Leu Lys Met Glu Glu Lys Ala Thr Tyr Val
130 135 140
His Lys Lys Asn Asp Gly Thr Thr Val Asp Leu Thr Val Asp Gln Ala
145 150 155 160
Trp Arg Gly Lys Gly Glu Gly Leu Pro Gly Met Cys Gly Gly Ala Leu
165 170 175
Val Ser Ser Asn Gln Ser Ile Gln Asn Ala Ile Leu Gly Ile His Val
180 185 190
Ala Gly Gly Asn Ser Ile Leu Val Ala Lys Leu Val Thr Gln Glu Met
195 200 205
Phe Gln Asn Ile Asp Lys Lys Ile Glu Ser Gln
210 215
Claims (20)
- 변형된 구제역 바이러스 (Foot-and-mouth disease virus, FMDV)3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드로서,
상기 변형된 FMDV 3C 프로테아제는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 22, 23, 100, 123, 및 124 위치에 상응하는 하나 이상의 아미노산 위치(들)에 위치한 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함하는 것이고,
상기 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드는, 숙주 세포에서 형질전환되고 공동-발현될 때, 야생형 FMDV 3C 프로테아제로 형질전환되고 공동-발현된 숙주 세포에서 나타나는 P1 전구체 폴리펩타이드 형질전환 유전자의 발현양과 비교하여, P1 전구체 폴리펩타이드의 형질전환 유전자의 발현을 증가시키는 것인,
변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드. - 삭제
- 제 1 항에 있어서,
상기 변형된 FMDV 3C 프로테아제는 I22 및 L23 중에서 선택되는 하나 이상의 위치(들)에서 하나 이상의 아미노산 치환(들)을 포함하는 변형된 FMDV 3C 프로테아제인 것인,
변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드. - 제 1 항에 있어서,
상기 변형된 FMDV 3C 프로테아제는 V124에서 아미노산 치환을 포함하는 변형된 FMDV 3C 프로테아제인 것인,
변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드. - 제 1 항에 있어서,
상기 변형된 FMDV 3C 프로테아제는 위치 T100에서 아미노산 치환을 포함하는 변형된 FMDV 3C 프로테아제인 것인,
변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드. - 제 1 항에 있어서,
상기 야생형 FMDV 3C 프로테아제는 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18 및 20 중에서 선택되는 것인,
변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드. - 제 1 항에 있어서,
상기 변형된 FMDV 3C 프로테아제는 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18 및 20 중에서 선택되는 야생형 FMDV 3C 프로테아제의 하나 이상과 적어도 95%의 상동성을 갖는 것인,
변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드. - 제 1 항에 있어서,
상기 변형된 FMDV 3C 프로테아제는 서열번호 22, 24, 26, 28, 30, 32, 34, 36, 38, 40, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 138, 140, 142, 144, 146, 148, 150, 152, 154, 156, 182, 184, 186, 188, 190, 192, 194, 196, 198, 200, 202, 204, 206, 208, 210, 212, 214, 216, 218, 220, 222, 224, 226, 228, 230, 232, 234, 236, 238, 240, 242, 244, 246, 248, 250, 252, 254, 256, 258, 260, 262, 264, 266, 268, 270, 272, 274, 276, 278, 280, 302, 304, 306, 308, 310, 312, 314, 316, 318, 320, 322, 324, 326, 328, 330, 332, 334, 336, 338, 340, 342, 344, 346, 348, 350, 352, 354, 356, 358 및 360의 하나 이상 중에서 선택되는 것인,
변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드. - 제 1 항에 있어서,
상기 폴리뉴클레오타이드는, 숙주 세포에서 형질전환되고 공동-발현될 때, 야생형 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 폴리뉴클레오타이드로 형질전환되고 공동-발현된 숙주 세포에서 단백질 분해로 절단된 eIF4A1의 발현양과 비교하여, 단백질 분해로 절단된 eIF4A1의 발?h 양을 증가 또는 감소시키는 것인,
변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드. - 제 1 항에 있어서,
상기 하나 이상의 아미노산 치환(들)은 프롤린에 의한 치환을 포함하는 것인,
변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드. - 제 1 항에 있어서,
P1 전구체 폴리펩타이드를 코딩하는 적어도 하나의 폴리뉴클레오타이드 서열을 추가로 포함하는,
변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드. - 제 1 항 및 제 3 항 내지 제 11 항 중 어느 한 항의 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는, 벡터.
- 제 12 항의 벡터를 포함하는, 숙주 세포.
- 제 1 항 및 제 3 항 내지 제 11 항 중 어느 한 항의 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 폴리뉴클레오타이드 또는 제 1 항 및 제 3 항 내지 제 11 항 중 어느 한 항의 변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 벡터, 및 상기 변형된 FMDV3C 프로테아제에 의한 단백질 분해에 적합한 약학적으로 허용 가능한 부형제, 보조제, 완충제 또는 용액을 포함하는, 개체에 면역 반응을 유도하기 위한 조성물.
- FMDV P1 전구체 폴리펩타이드를 FMDV 바이러스 단백질 또는 바이러스-유사 입자(Virus-Like Particles: VLPs)로 가공하는 방법으로서,
제 13 항의 숙주세포를 적합한 배지에서 배양하는 것; 및
VP0, VP1, VP2, VP3 및 VP4중에서 선택되는 적어도 하나의 바이러스 단백질; 또는 VLPs을 회수하는 것,
을 포함하는, 방법. - 삭제
- 제 1 항 및 제 3 항 내지 제 11 항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 하나 이상의 아미노산 치환은 비-보존적 치환인 것인,
변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드. - 제 1 항 및 제 3 항 내지 제 11 항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 하나 이상의 아미노산 치환(들)은 I22P 및 L23P의 하나 이상을 포함하는 것인,
변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드. - 제 1 항 및 제 3 항 내지 제 11 항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 하나 이상의 아미노산 치환(들)은 T100P를 포함하는 것인,
변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드. - 제 1 항 및 제 3 항 내지 제 11 항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 하나 이상의 아미노산 치환(들)은 V124P를 포함하는 것인,
변형된 FMDV 3C 프로테아제를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US15/986,214 US11339387B2 (en) | 2018-05-22 | 2018-05-22 | Modified foot-and-mouth disease virus 3C proteases and methods for processing FMDV P1 precursor polypeptide |
US15/986,214 | 2018-05-22 | ||
PCT/US2018/051974 WO2019226190A1 (en) | 2018-05-22 | 2018-09-20 | Modified picornavirus 3c proteases and methods thereof |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20190133660A KR20190133660A (ko) | 2019-12-03 |
KR102277529B1 true KR102277529B1 (ko) | 2021-07-14 |
Family
ID=67437088
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020197004446A KR102277529B1 (ko) | 2018-05-22 | 2018-09-20 | 변형된 피코르나바이러스 3c 프로테아제 및 그의 방법 |
Country Status (4)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US11339387B2 (ko) |
EP (1) | EP3589309B1 (ko) |
KR (1) | KR102277529B1 (ko) |
WO (1) | WO2019226190A1 (ko) |
Families Citing this family (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN109536460A (zh) * | 2018-12-07 | 2019-03-29 | 中国医学科学院医学生物学研究所 | 一种cv-a10病毒毒种及其人用灭活疫苗 |
CN113122551B (zh) * | 2021-03-30 | 2022-07-12 | 新乡医学院 | 一种柯萨奇病毒a组19型vp1基因重组表达蛋白、多克隆抗体的制备方法及其应用 |
CN114107392A (zh) * | 2021-11-22 | 2022-03-01 | 昆明理工大学 | 一种cvb5病毒类病毒样颗粒的制备方法 |
CN115010813B (zh) * | 2022-05-19 | 2024-04-05 | 桂林医学院 | 一种肠道病毒71型病毒样颗粒、其制备方法及应用 |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2018048652A1 (en) * | 2016-09-08 | 2018-03-15 | The Government of the United States of America, as represented by the Secretary of Homeland Security | Modified foot-and-mouth disease virus 3c proteases, compositions and methods thereof |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4748018A (en) | 1984-02-07 | 1988-05-31 | Stolle Research & Development Corp. | Method of passive immunization of mammals using avian antibody |
CA2587084C (en) | 2004-10-08 | 2019-07-16 | The Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services, Centers For Disease Control And Prevention | Modulation of replicative fitness by using less frequently used synonym ous codons |
EP2304025B1 (en) | 2008-07-03 | 2015-11-04 | The Board of Trustees of the Leland Stanford Junior University | Minicircle dna vector preparations and methods of making and using the same |
US10308927B2 (en) * | 2017-01-17 | 2019-06-04 | The United States of America, as Represented by the Secretary of Homeland Security | Processing of a modified foot-and-mouth disease virus P1 polypeptide by an alternative protease |
-
2018
- 2018-05-22 US US15/986,214 patent/US11339387B2/en active Active
- 2018-09-20 EP EP18842766.0A patent/EP3589309B1/en active Active
- 2018-09-20 KR KR1020197004446A patent/KR102277529B1/ko active IP Right Grant
- 2018-09-20 WO PCT/US2018/051974 patent/WO2019226190A1/en unknown
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2018048652A1 (en) * | 2016-09-08 | 2018-03-15 | The Government of the United States of America, as represented by the Secretary of Homeland Security | Modified foot-and-mouth disease virus 3c proteases, compositions and methods thereof |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP3589309A1 (en) | 2020-01-08 |
KR20190133660A (ko) | 2019-12-03 |
US20190359964A1 (en) | 2019-11-28 |
US11339387B2 (en) | 2022-05-24 |
WO2019226190A1 (en) | 2019-11-28 |
EP3589309B1 (en) | 2024-09-18 |
EP3589309A4 (en) | 2020-07-15 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
KR102191739B1 (ko) | 변형된 구제역 바이러스 3c 프로테아제, 조성물 및 이의 방법 | |
KR102277529B1 (ko) | 변형된 피코르나바이러스 3c 프로테아제 및 그의 방법 | |
AU2020289750B2 (en) | Engineered meganucleases with recognition sequences found in the human T cell receptor alpha constant region gene | |
KR20210149060A (ko) | Tn7-유사 트랜스포존을 사용한 rna-유도된 dna 통합 | |
AU2021200863A1 (en) | Genetically-modified cells comprising a modified human t cell receptor alpha constant region gene | |
CA2763792C (en) | Expression cassettes derived from maize | |
DK2768848T3 (en) | METHODS AND PROCEDURES FOR EXPRESSION AND SECRETARY OF PEPTIDES AND PROTEINS | |
DK2663645T3 (da) | Gærstammer, der er modificeret til produktion af ethanol fra glycerol | |
AU2020294264A1 (en) | Treatment of retinitis pigmentosa using engineered meganucleases | |
NO338055B1 (no) | Nukleinsyremolekyl for optimalisert ekspresjon av HPV52-L1 i gjær, vektor og vertscelle, samt fremgangsmåte for fremstilling av HPV52L1 viruslignende partikler, og deres anvendelse ved fremstilling av en vaksine for behandling eller forebygging av HPV-assosiert cervikal kreft. | |
KR20150014953A (ko) | 케톨-산 리덕토아이소머라아제 효소 및 사용 방법 | |
KR20140092759A (ko) | 숙주 세포 및 아이소부탄올의 제조 방법 | |
CN108136007A (zh) | 用于治疗犬癌症的嵌合aav-抗vegf | |
CN111218418A (zh) | 重组代谢微生物及其用途 | |
KR20110076868A (ko) | 분리 조건 및/또는 안전한 작업 범위 하에서의 c5 탄화수소가 없는 이소프렌의 제조 방법 및 조성물 | |
KR20220031028A (ko) | 아프리카 돼지 열병 백신 | |
US20200188531A1 (en) | Single-vector gene construct comprising insulin and glucokinase genes | |
CN111349596B (zh) | 产褪黑素的重组大肠杆菌及其构建方法和应用 | |
CN113817775B (zh) | 修饰的阿柏西普、组合物、方法及其在基因治疗中的应用 | |
CN110124023B (zh) | 鹅星状病毒病毒样颗粒新型基因工程亚单位疫苗 | |
CN112912112A (zh) | 肝特异性核酸调节元件以及其方法及用途 | |
CN111212659B (zh) | Hpv疫苗 | |
CN115427071A (zh) | 包含ltb和病原性抗原的组合物及其用途 | |
KR20240001708A (ko) | 유전적 장애의 치료를 위해 생체내 뉴클레아제-매개의 유전자 표적화를 위한 조성물 및 방법 | |
US20040028695A1 (en) | Recombinant immunogenic compositions and methods for protecting against lethal infections from Bacillus anthracis |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A201 | Request for examination | ||
E902 | Notification of reason for refusal | ||
E902 | Notification of reason for refusal | ||
E701 | Decision to grant or registration of patent right | ||
GRNT | Written decision to grant |