KR101125745B1 - A Method for Identifying Barley Varieties using Molecular Markers - Google Patents

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Abstract

본 발명은 국내에서 유통되고 있는 보리 품종에 대하여 다형성을 나타내는 보리 품종을 식별하기 위한 마커, 보리 품종 식별 방법, 및 상기 마커를 포함하는 키트에 관한 것이다. 구체적으로, 본 발명은 국내에서 유통되고 있는 보리 71개 품종에 대해 높은 다형성을 갖는 초위성체 마커의 조합을 선별하고 이를 이용하여 국내에 육성된 보리 품종 식별을 식별할 수 있게 한다. 본 발명의 방법에서 사용된 보리 품종 식별용 분자 표지는 국내에서 육성된 보리 71개 품종을 식별할 수 있다. 따라서, 본 발명은 보리 품종의 진위성 규명, 보급종 및 원종 종자 생산시 혼종 여부의 검정, 품종 보호 출원시 대조 품종의 선정 및 침해 여부의 확인 등과 같은 여러 분야에 매우 유용하게 사용될 수 있다.The present invention relates to a marker for identifying barley varieties exhibiting polymorphism with respect to barley varieties distributed in Korea, a barley variety identification method, and a kit including the markers. In detail, the present invention selects a combination of supersatellite markers having a high polymorphism for 71 varieties of barley distributed in Korea and makes it possible to identify barley varieties grown in Korea. The molecular label for barley variety identification used in the method of the present invention can identify 71 varieties of barley grown in Korea. Therefore, the present invention can be very useful in various fields, such as the authenticity of barley varieties, the verification of hybridity in the production of spread and seed seeds, the selection of control varieties and the verification of infringement in varietal protection applications.

보리, 품종 식별, 초위성체 마커 Barley, Breed Identification, Supersatellite Marker

Description

분자 표지를 이용한 보리 품종 식별 방법{A Method for Identifying Barley Varieties using Molecular Markers}A Method for Identifying Barley Varieties using Molecular Markers

본 발명은 국내에서 유통되고 있는 보리 품종에 대해 다형성을 나타내는 보리 품종을 식별하기 위한 마커, 보리 품종 식별 방법 및 상기 마커를 포함하는 키트에 관한 것이다.The present invention relates to a marker for identifying barley varieties exhibiting polymorphism with respect to barley varieties distributed in Korea, a barley variety identification method, and a kit including the markers.

분자 생물학과 유전학이 급속도로 발전하면서 염색체 내에 존재하는 특정 염기 서열 부위의 단편에 대한 다형성을 탐색하여 분자 표지(marker)로 개발한 다음, 개발된 분자 표지를 유전자 지도 작성, 내병성과 관련된 유전자의 맵핑(mapping), 형태적 특성 및 품질 관련 유전자의 염색체 상 위치 확인 및 품종 식별 등 다양한 분야에 활용하고 있다. 이러한 분자 표지 기술은 표현형에 기반한 분석 방법보다는 재배 환경, 연차간 변이 등이 극히 적을 뿐만 아니라 분석에 소요되는 기간과 노력을 크게 절감시킬 수 있다는 장점이 있다.As molecular biology and genetics develop rapidly, polymorphisms of fragments of specific nucleotide sequences within the chromosome can be searched and developed into molecular markers, and then the developed molecular markers can be mapped to genes, mapping of genes associated with disease resistance ( mapping), morphological characteristics and quality-related gene identification on the chromosome and breed identification. Such molecular labeling technology has the advantage that the cultivation environment, annual variation, etc. are extremely small, as well as the time and effort required for analysis, rather than the phenotype-based analysis method.

분자 표지를 이용한 여러 가지 기술 중 품종 식별에 대한 국외의 동향을 살펴보면, 네덜란드에서는 장미와 토마토, 스페인의 경우 고추, 가지, 체리, 토마토, 멜론 및 포도 등의 작물에 대한 각 품종별 DNA 프로파일을 데이터베이스화하고 있 고, 일본은 딸기, 벼, 복숭아, 밤, 자두 등, 중국은 옥수수와 벼에 대한 품종 식별 방법을 개발하고 있는 실정이다. 이들 국가가 개발한 품종 식별용 분자 표지 및 품종별 DNA 프로파일 데이터베이스는 품종 보호 품종의 권리 침해와 종자유통관리 및 자국 농산물의 보호에 이용하고 있다.If you look at the international trends in the identification of varieties of various techniques using molecular labels, you can find a database of DNA profiles for each variety of crops such as rose and tomato in the Netherlands and pepper, eggplant, cherry, tomato, melon and grape in Spain. Japan is developing methods to identify varieties of corn and rice, such as strawberries, rice, peaches, chestnuts and plums. The molecular labeling and varietal DNA profile database developed by these countries is used to cultivate varieties for protection of varieties, seed distribution management and protection of domestic produce.

분자 표지를 이용한 품종식별 기술의 활용에 대한 여러 가지 논의가 국제 신품종보호연맹(UPOV)의 분자생물학 생화학 실무작업반회의에서 주로 이루어지고 있다. 이 회의에 참가한 여러 국가뿐만 아니라 국제종자연맹(ISF, International Seed Federation), 국제 무성번식 관광 식물 및 과수 품종 육종가 협회(CIOPORA, International Community of Breeders of Asexually Reproduced Ornamental and Fruit-Tree Varieties)에서는 분자 표지 기술을 품종의 구별성을 판단하는데 직접 이용하기에는 큰 문제점이 있으나, 이를 품종보호침해 등과 같은 분야에 직접적인 활용 의지를 표명하고 있다. 실제로 중국의 경우 옥수수에 대해 유전자 분석 결과만으로 품종 보호 침해 여부를 직접 판단하는데 이용하고 있다. 한편, 우리나라의 경우 농촌진흥청에서 벼와 콩에 대한 품종 식별 기술을 보고한 바 있고, 국립 종자원에서도 고추, 수박, 멜론, 참외 및 토마토 등에 대한 작물의 품종 식별 체계가 어느 정도 구축되어 있으며, 몇몇 작물의 분자 표지는 분쟁 종자 대비 시험, 회사간의 종자 분쟁 발생시 품종의 진위성 판단에 직접적으로 이용한 바 있다.Various discussions on the use of molecular labeling techniques in molecular labeling take place at the UPOV International Conference on Molecular Biology and Biochemistry. In addition to the countries participating in this conference, the International Seed Federation (ISF), the International Community of Breeders of Asexually Reproduced Ornamental and Fruit-Tree Varieties (CIOPORA) There is a big problem to use directly in judging the distinction of varieties, but it expresses a willingness to directly use it in fields such as varieties protection. Indeed, in China, the genetic analysis of maize is used to directly determine whether there is a breach of breed protection. On the other hand, in Korea, the Rural Development Administration reported varieties for rice and soybeans, and in the national species, there are some varieties of crop identification systems for peppers, watermelons, melons, melons, and tomatoes. Molecular labeling of crops has been directly used for testing against seed seeds and for determining the authenticity of varieties in case of seed disputes between companies.

우리나라 보리의 재배 면적은 2007년 기준 56,000 ha이며 생산량은 176,000톤으로 과거에 비해 그 중요도가 감소하고 있다. 그러나, 최근 국민 건강과 정부의 녹색 성장 정책으로 인해 앞으로 그 중요도는 점점 커질 것으로 예상된다. 국내 보리 품종은 국가 목록 등재 및 품종 보호 출원 및 등록된 92개 품종이 국내에 유통 및 보급되고 있다.The barley cultivation area in Korea is 56,000 ha in 2007 and the output is 176,000 tons, which is less important than in the past. However, due to the recent national health and the government's green growth policy, the importance is expected to increase. Domestic barley varieties are distributed and distributed in the country, 92 varieties registered and registered in the national inventory protection and varieties.

보리에 대한 분자 유전학적 연구 동향을 살펴보면, 외국의 경우 국제 보리 게놈 프로젝트(Barley genome project)가 수행되어 유전자 지도, 분자 표지 정보 등을 데이터베이스화하여 이를 공개하고 있다(http://barleygenomics.wsu.edu/databases / databases . html). 특히 독일에서는 775개의 SSR(simple sequence repeat) 마커를 활용하여 보리의 통합화된 고밀도 유전자 지도를 작성한 바 있고(Varshney RK, Marcel TC, Ramsay L, Russell J, Roder MS, Stein N, Waugh R, Langridge P, Niks RE, Graner A. 2007 Theor Appl Genet 114, 1091-1103), 영국에서는 네덜란드, 독일, 오스트리아, 스웨덴, 프랑스에서 육성된 보리 24개 품종의 식별에 효율적인 분자 표지를 보고한바 있다(MaCaulay M, Ramsay L, Powell W, Waugh R. 2001 Theor Appl Genet 102, 801-809). 국내의 경우 RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA) 마커와 형태적 특성간의 효율성 비교(Jang DH, Suh SJ, Baek SB, Kim JG, Nam JH. Korean J Breed 33, 300-305), 마이크로새틀라이트(Microsatellite)를 이용한 한국 보리 유전자원의 유연관계 분석(Baek HJ, Yoon MS, Kim HH, Lee JR, Park KL, Cho YH, Choi WY. Korean J Breed 36, 249-259) 등에 대한 연구를 수행한바 있다. 그러나, 국내 보리 품종을 국제 신품종 보호 연맹(UPOV)이 제안한 분석 기술인 초위성체 마커를 이용하여 보리 품종을 실용적으로 식별할 수 있는 기술은 아직까지 확립되지 못한 상태이다.Looking at the trends of molecular genetic research on barley, the international Barley genome project has been conducted in foreign countries, and the database of genetic maps and molecular labeling information is disclosed ( http: //barleygenomics.wsu). edu / databases / databases. html) . In Germany, in particular, 775 simple sequence repeat (SSR) markers have been used to construct an integrated high-density genetic map of barley (Varshney RK, Marcel TC, Ramsay L, Russell J, Roder MS, Stein N, Waugh R, Langridge P). , Niks RE, Graner A. 2007 Theor Appl Genet 114, 1091-1103), in the UK, have reported molecular markers for the identification of 24 varieties of barley grown in the Netherlands, Germany, Austria, Sweden and France (MaCaulay M, Ramsay L, Powell W, Waugh R. 2001 Theor Appl Genet 102, 801-809. Comparison of efficiency between random amplified polymorphic DNA (RAPD) marker and morphological characteristics in Korea (Jang DH, Suh SJ, Baek SB, Kim JG, Nam JH.Korean J Breed 33, 300-305), Microsatellite We have studied the flexibility relationship of Korean barley gene sources (Baek HJ, Yoon MS, Kim HH, Lee JR, Park KL, Cho YH, Choi WY. Korean J Breed 36, 249-259). However, a technique for practically identifying barley varieties by using a supersatellite marker, which is an analysis technique proposed by the International New Variety Protection Federation (UPOV), has not yet been established.

이에 본 발명자는 국내에서 육성된 보리 71개 품종에 대해 다형성을 나타내는 초위성체 마커를 선별하고, 이를 프라이머를 이용하여 보리 게놈 DNA를 증폭시킨 후 생성된 증폭 산물을 확인함으로써, 대립 유전자 패턴 및 PIC(Polymorphic Information Content) 값을 살펴 보았을 때 상기 초위성체 마커가 보리 품종 식별 방법에 적합하여 원종 및 보급종의 혼종 여부에 대한 검증, 품종 보호 출원시 대조 품종 선정 등에 실용적으로 활용할 수 있음을 밝혀, 본 발명을 완성하게 되었다.In this regard, the present inventors screened allelic markers for polymorphism for 71 varieties of barley grown in Korea, and amplified barley genomic DNA using primers to identify amplification products. Polymorphic Information Content), the supersatellite marker was found to be suitable for barley varieties identification method, and can be useful for verifying the hybridization of the original and disseminated species, and selecting the control varieties when applying for the protection of varieties. To complete.

본 발명의 목적은 국내에서 육종되어 재배되고 있는 보리 71개 품종에 대해 높은 다형성을 나타내는 초위성체 마커의 조합을 선별하고, 이를 이용한 보리 품종 식별 방법을 제공하는 것이다.An object of the present invention is to select a combination of supersatellite markers showing a high polymorphism for the 71 varieties of barley grown in Korea and to provide a method for identifying barley varieties using the same.

본 발명의 또 다른 목적은 국내 보리 육성 기관에서 육성된 품종의 유전적 거리의 예측을 가능하게 하여 품종 보호 출원시 보조 자료로 활용될 수 있는 보리 품종 식별 방법을 제공하는 것이다.Still another object of the present invention is to provide a method for identifying barley varieties that can be used as supplementary data for varietal protection applications by enabling the prediction of genetic distance of varieties grown in domestic barley breeding institutions.

본 발명의 또 다른 목적은 보리 품종 식별에 분자생물학적 기술을 접목하여 실용화함으로써 농업인에 대한 신뢰도 높은 종자의 보급을 통한 소득 향상뿐만 아니라 품종 육종에 이용하여 신품종 개발 효율을 높이고자 하는 것이다.Still another object of the present invention is to improve the efficiency of new breed development by breeding varieties as well as improving income by supplying highly reliable seeds to farmers by applying molecular biological technology to barley varieties identification.

상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 국내에서 유통되고 있는 보리 품종에 대하여 다형성을 나타내는 프라이머 세트(서열번호 1 내지 40)를 포함하는, 보리 품종을 식별하기 위한 마커를 제공한다.In order to achieve the above object, the present invention provides a marker for identifying barley varieties, including a set of primers (SEQ ID NOS: 1 to 40) exhibiting polymorphism for barley varieties in circulation in Korea.

또한, 본 발명은 보리로부터 유래된 게놈 DNA를 주형으로 하고 서열번호 1 내지 서열번호 40의 프라이머 세트를 프라이머로 사용하여 핵산을 증폭하는 단계; 및In addition, the present invention comprises amplifying a nucleic acid using a genomic DNA derived from barley as a template and a primer set of SEQ ID NO: 1 to SEQ ID NO: 40 as a primer; And

상기 증폭 산물로부터 보리 품종을 식별하는 단계를 포함하는, 보리 품종을 식별하는 방법을 제공한다.It provides a method for identifying barley varieties, comprising the step of identifying barley varieties from the amplification products.

또한, 본 발명은 서열번호 1 내지 40의 프라이머 세트를 포함하는 보리 품종을 식별하기 위한 키트를 제공한다.The present invention also provides a kit for identifying barley varieties comprising primer sets of SEQ ID NOs: 1-40.

이하, 본 발명을 보다 상세하게 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail.

본 발명은 국내에서 유통되고 있는 보리 품종에 대하여 다형성을 나타내는 프라이머 세트(서열번호 1 내지 40)를 포함하는, 보리 품종을 식별하기 위한 마커를 제공한다.The present invention provides a marker for identifying barley varieties, including primer sets (SEQ ID NOS: 1 to 40) that exhibit polymorphism for barley varieties in circulation in Korea.

상기 마커는 국내에서 재배되어 유통되고 있는 보리 71개 품종에 대해 높은 다형성을 나타내는 초위성체 마커로서, 국내에서 유통되고 있는 보리 품종을 특이적으로 식별할 수 있다. 본 발명의 마커는 국내에서 육성되어 농가에 보급되고 있는 보리 71개 품종에 대해 높은 다형성을 나타내는 SSR(simple sequence repeat) 마커이다. 구체적으로, 본 발명의 마커는 하기 표 2에 기재된 보리 71개 품종에 대하여 높은 다형성을 나타내었다.The marker is a supersatellite marker exhibiting high polymorphism for 71 varieties of barley cultivated and distributed in Korea, and can specifically identify barley varieties distributed in Korea. The marker of the present invention is a simple sequence repeat (SSR) marker showing high polymorphism for 71 varieties of barley grown in Korea and spread to farms. Specifically, the marker of the present invention showed high polymorphism for 71 varieties of barley described in Table 2 below.

바람직하게는, 본 발명의 마커는 하기 표 1에 기재된 염기 서열(서열번호 1 내지 40)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 마커를 포함할 수 있다.Preferably, the marker of the present invention may include one or more markers selected from the group consisting of the nucleotide sequences shown in Table 1 below (SEQ ID NOS: 1 to 40).

<표 1> 본 발명의 보리 품종 식별에 사용된 마커TABLE 1 Markers Used to Identify Barley Varieties of the Present Invention

서열번호SEQ ID NO: 초위성체 표지인자Supersatellite markers 프라이머의 염기서열(5'→3')Base sequence of primer (5 '→ 3') 형광 염색Fluorescent dyeing 1One Bmac0134
Bmac0134
정방향:CCAACTGAGTCGATCTCGForward direction: CCAACTGAGTCGATCTCG VICVIC
22 역방향:CTTCGTTGCTTCTCTACCTTReverse: CTTCGTTGCTTCTCTACCTT 33 Bmac0209
Bmac0209
정방향:CTAGCAACTTCCCAACCGACForward direction: CTAGCAACTTCCCAACCGAC NED
NED
44 역방향:ATGCCTGTGTGTGGACCATReverse: ATGCCTGTGTGTGGACCAT 55 Bmac0273
Bmac0273
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FAM
66 역방향:AGGGAGTATTTCACCCTTGReverse: AGGGAGTATTTCACCCTTG 77 Bmag0211
Bmag0211
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PET
88 역방향:ACATCATGTCGATCAAAGCReverse: ACATCATGTCGATCAAAGC 99 Bmag0323
Bmag0323
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VIC
1010 역방향:TGACAAACAAATAATCACAGGReverse: TGACAAACAAATAATCACAGG 1111 Bmag0337
Bmag0337
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NED
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EBmac0711
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HVM40
정방향:CGATTCCCCTTTTCCCACForward direction: CGATTCCCCTTTTCCCAC PET
PET
1616 역방향:ATTCTCCGCCGTCCACTCReverse: ATTCTCCGCCGTCCACTC 1717 HVM67
HVM67
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VIC
1818 역방향:CCGGTACCCAGTGACGACReverse: CCGGTACCCAGTGACGAC 1919 EBmac0764
EBmac0764
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NED
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Bmac0018
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Bmag0009
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PET
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Bmag0382
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VIC
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EBmac0415
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EBmac0603
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FAM
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EBmac0871
정방향:TGCCTCTGTTGTGTTATTGTForward direction: TGCCTCTGTTGTGTTATTGT PET
PET
3232 역방향:CCCCAAGTGAACATTGACReverse: CCCCAAGTGAACATTGAC 3333 HVM74
HVM74
정방향:AGGAAGTCATTGCGTGAGForward direction: AGGAAGTCATTGCGTGAG VIC
VIC
3434 역방향:TGATCAAGAATGATAACATGGReverse: TGATCAAGAATGATAACATGG 3535 Bmag0223
Bmag0223
정방향:TTAGTCACCCTCAACGGTForward direction: TTAGTCACCCTCAACGGT NED
NED
3636 역방향:CCCCTAACTGCTGTGATGReverse: CCCCTAACTGCTGTGATG 3737 Bmag0378
Bmag0378
정방향:CTTTTGTTTCCGTAGCATCTAForward direction: CTTTTGTTTCCGTAGCATCTA FAM
FAM
3838 역방향:ATCCAACTATAGTAGCAAAGCCReverse: ATCCAACTATAGTAGCAAAGCC 3939 Bmag0136
Bmag0136
정방향:GTACGCTTTCAAACCTGGForward direction: GTACGCTTTCAAACCTGG PET
PET
4040 역방향:GTAGGAGGAAGAATAAGGAGGReverse: GTAGGAGGAAGAATAAGGAGG

또한, 본 발명은 보리로부터 유래된 게놈 DNA를 주형으로 하고 서열번호 1 내지 서열번호 40의 프라이머 세트를 프라이머로 사용하여 핵산을 증폭하는 단계; 및In addition, the present invention comprises amplifying a nucleic acid using a genomic DNA derived from barley as a template and a primer set of SEQ ID NO: 1 to SEQ ID NO: 40 as a primer; And

상기 증폭 산물로부터 보리 품종을 식별하는 단계를 포함하는, 보리 품종을 식별하는 방법을 제공한다.It provides a method for identifying barley varieties, comprising the step of identifying barley varieties from the amplification products.

본 발명의 보리 품종 식별 방법에서 보리로부터 유래된 게놈 DNA는 보리의 종자 및 보리의 식물 전체로부터 DNA를 채취하는 통상적인 방법을 사용함으로써 얻을 수 있다. 바람직하게는, 보리의 종자 또는 보리의 잎, 특히 종자를 파종하고 출아한 후 보리의 어린 식물체의 잎으로부터 게놈 DNA를 채취할 수 있다.In the barley variety identification method of the present invention, genomic DNA derived from barley can be obtained by using a conventional method of collecting DNA from the seed of barley and the whole barley plant. Preferably, genomic DNA can be harvested from the seed of barley or the leaves of barley, in particular the seed of the barley and the leaves of young plants of barley after seeding.

본 발명의 보리 품종 식별 방법에서 게놈 DNA의 증폭은 PCR(polymerase chain reaction)을 사용하는 것이 바람직하다. 일반적인 PCR 수행 방법에 대해서는 당업계에 잘 알려져 있다. 구체적으로, PCR 반응은 당업계에서 PCR 반응에 필요하다고 알려진 여러 성분을 포함하는 PCR 반응액을 이용하여 수행될 수 있다. 예를 들어, 상기 PCR 반응액은 분석하고자 하는 보리로부터 유래된 게놈 DNA, 본 발명의 마커, 적당량의 DNA 중합 효소(예를 들면, Taq polymerase), dNTP 혼합물, PCR 완충용액(buffer) 및 물을 포함한다. 상기 PCR 완충용액은 KCl, Tris-HCl 및 MgCl2를 함유할 수 있다.In the barley variety identification method of the present invention, amplification of genomic DNA is preferably performed using a polymerase chain reaction (PCR). General PCR methods are well known in the art. Specifically, the PCR reaction may be carried out using a PCR reaction solution containing various components known in the art for the PCR reaction. For example, the PCR reaction solution may include genomic DNA derived from barley to be analyzed, a marker of the present invention, an appropriate amount of DNA polymerase (eg, Taq polymerase), dNTP mixture, PCR buffer, and water. Include. The PCR buffer may contain KCl, Tris-HCl and MgCl 2 .

본 발명에서 상기 증폭된 산물로부터 보리 품종을 식별하는 단계는 자동 염기 서열 분석기를 이용하여 대립 유전자(밴드)의 크기를 컴퓨터 프로그램에 의해 확인한 다음 각각의 품종을 식별할 수 있다. 구체적으로는, 각각의 보리 품종에 대하여 본 발명의 마커에 의한 증폭 산물의 유무를 표로 작성하고 상기 증폭된 산물과의 비교 분석으로 통해 보리 품종을 식별할 수 있다. 예를 들면, 본 발명의 마커를 이용하여 각각의 보리 품종으로부터 나온 대립 유전자의 크기를 미리 하나의 표 로 정리한 다음 대립 유전자의 존재 유무에 따라 존재할 때에는 "1"로 나타내었고 존재하지 않을 때에는 "0"으로 나타낸다. 따라서, 품종을 식별하고자 하는 보리로부터 게놈 DNA를 분리한 후, 본 발명의 마커를 이용하여 증폭하고, 증폭된 산물의 크기를 분석한 다음 통계 프로그램을 통하여 모든 품종을 확인할 수 있다.In the present invention, the step of identifying the barley varieties from the amplified product can be identified by the computer program after confirming the size of the allele (band) by using an automatic sequencing analyzer to identify each variety. Specifically, barley varieties can be identified by tabulating the presence or absence of an amplification product by the marker of the present invention for each barley variety and comparing the amplified products with the amplified products. For example, using the markers of the present invention, the size of the alleles from each barley variety is summarized in one table, and then indicated as "1" when present, depending on the presence or absence of alleles, and " 0 ". Therefore, after genomic DNA is isolated from the barley to identify the breed, the amplification using the marker of the present invention, the size of the amplified product can be analyzed and then all varieties can be identified through a statistical program.

또한, 본 발명은 서열번호 1 내지 40의 프라이머 세트를 포함하는 보리 품종을 식별하기 위한 키트를 제공한다. 본 발명의 키트는 본 발명의 프라이머 세트 중 하나 이상, DNA 중합 효소 및 PCR 완충 용액(buffer)을 포함한다. 이외에 PCR 산물 의 증폭 여부를 확인할 수 있는 전기영동 수행에 필요한 구성 성분들이 본 발명의 키트에 추가로 포함될 수 있다.The present invention also provides a kit for identifying barley varieties comprising primer sets of SEQ ID NOs: 1-40. Kits of the invention include one or more of the primer sets of the invention, DNA polymerase and PCR buffers. In addition, the components necessary for performing electrophoresis to confirm amplification of PCR products may be additionally included in the kit of the present invention.

본 발명의 보리 품종 식별용 마커 만을 사용하여 국내에서 육성 보급되고 있는 보리 71개 품종을 식별할 수 있다. 따라서, 보리 품종의 진위성 규명, 보리 원종 및 보급종의 혼종에 대한 과학적 검증 및 품종 보호권의 침해 여부 및 품종 보호 출원시 대조품종의 선정 등과 같은 여러 분야에 유용하게 사용될 수 있다.Using only the barley varieties identification marker of the present invention can be identified 71 varieties of barley that are being fostered in Korea. Therefore, it can be usefully used in various fields such as identifying the authenticity of barley varieties, scientific verification of hybrids of barley varieties and spread varieties, whether or not infringement of varieties protection rights, and selection of control varieties when applying for varieties protection.

이하, 본 발명을 실시 예에 의해 보다 상세히 설명한다. 그러나 본 발명이 하기 실시 예에 의해 제한되는 것은 아니다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples. However, the present invention is not limited by the following examples.

실시예Example : 보리 품종 식별 방법: How to Identify Barley Varieties

(1) 보리 시료(1) barley sample

본 발명에서는 하기 표 2에 기재된 보리 71개 품종을 품종 식별용 프라이머 세트의 선별 및 보리 품종 식별 가능성 검정을 위해 사용하였다.In the present invention, 71 varieties of barley described in Table 2 were used for selection of the primer set for identifying the varieties and barley varieties discrimination assay.

<표 2> 품종 식별용 보리 71개 품종<Table 2> 71 Varieties of Barley for Variety Identification

연번Serial number 품종명Breed name 연번Serial number 품종명Breed name 연번Serial number 품종명Breed name 1One 우호friendship 2525 대아Daeah 4949 탑골Top Goal 22 소만Shoman 2626 큰알보리 1호Big Alvor No. 1 5050 새올Newall 33 유연softness 2727 새늘Birds 5151 The 44 다진chop 2828 대영British 5252 새강New river 55 너른들Nerds 2929 태평Peace 5353 서둔찰Rush 66 다송Dasong 3030 동호쌀Dongho Rice 5454 삼도Samdo 77 다향Multidirectional 3131 일진ILJIN 5555 미락Mirak 88 삼광찰Samgwangchal 3232 대연Daeyeon 5656 대백Great 99 광안Gwangan 3333 재강쌀Red rice 5757 낙영Dairy 1010 상원senate 3434 신호signal 5858 큰알Large egg 1111 호진Hojin 3535 상록Evergreen 5959 새알A new egg 1212 청호쌀Cheongho Rice 3636 단원Unit 6060 밀양겉Sheepskin 1313 영양nutrition 3737 대호쌀Great Lake Rice 6161 대진Daejin 1414 동한찰Donghanchal 3838 진미찹쌀Jinmi glutinous rice 6262 알찬full 1515 태강Taegang 3939 팔도eight provinces of Korea 6363 광활쌀Vast rice 1616 호품Article 4040 무등쌀Mudeung Rice 6464 올쌀Rice 1717 남호South Lake 4141 두산 8호Doosan 8 6565 흰찰쌀White rice 1818 호반찰Lakeside 4242 두산 29호Doosan 29 6666 흰쌀White rice 1919 선우Sunwoo 4343 제주Jeju 6767 내한쌀Cold rice 2020 새한찰Saehanchal 4444 진양Jinyang 6868 긴쌀Long rice 2121 건강health 4545 남향South 6969 늘쌀Ever rice 2222 수영swimming 4646 찰쌀Rice 7070 새쌀New rice 2323 풍산찰Poongsan Temple 4747 새찰쌀Rice flour 7171 송학Songhak 2424 제안찰Proposal 4848 두원찰쌀Dowon Rice

(2) 게놈 DNA의 추출(2) extraction of genomic DNA

상기 표 2에 기재된 공시된 보리 품종의 종자를 50공 플러그 육묘판에 파종하고 3주일 경과 후, 연한 부위의 유엽을 채취하여 게놈 DNA의 분리 재료로 이용하였다. 채취한 보리의 유엽이 보관되어 있는 2 ml 튜브에 텅스텐 구슬 3개를 넣고 액체 질소(-196℃)를 이용하여 급속 동결시킨 다음 볼텍싱(Vortexing) 과정을 반복하면서 조직을 고르게 마쇄하였다. 충분히 마쇄된 조직은 NucleoSpin® Plant II(Macherey-Nagel Cat. 740 770.250) 키트를 이용하여 게놈 DNA를 분리하였다. 추 출된 게놈 DNA는 1.0% 아가로스 겔에서 전기영동하여 DNA의 농도를 확인하였고, 정량한 후 ㎕당 10 ng의 농도로 희석한 다음 이를 PCR 분석에 이용하였다.Seeds of the barley varieties disclosed in Table 2 were sown on a 50-hole plug seedling plate, and after 3 weeks, the leaves of the soft region were collected and used as a material for separating genomic DNA. Three tungsten beads were placed in a 2 ml tube in which the leaves of the barley collected were stored and rapidly frozen with liquid nitrogen (-196 ° C), and the tissues were evenly ground while repeating the vortexing process. Fully ground tissue was isolated genomic DNA using NucleoSpin ® Plant II (Macherey-Nagel Cat. 740 770.250) kit. The extracted genomic DNA was electrophoresed on 1.0% agarose gel to confirm the DNA concentration. After quantification, the genomic DNA was diluted to a concentration of 10 ng per μl and used for PCR analysis.

(3) 프라이머 세트의 제작(3) Preparation of primer set

본 발명의 프라이머 세트를 위한 후보 물질로는 국제 유전체 연구 D/B(http://barleygenomics.wsu.edu/)에 정보가 공개된 99개 마커를 이용하였다. 국내 육성된 보리 품종에 대해 높은 다형성을 보이는 마커를 선발하기 위하여 흰찰쌀보리, 새쌀보리, 흰쌀보리, 광활쌀보리, 강호쌀보리, 대호쌀보리, 동호쌀보리, 내한쌀보리, 건강쌀보리 품종과 99개의 프라이머 세트를 이용하여 유전자 증폭한 다음 모세관 전기영동 장치(HDA-GT12TM System, eGEnE, Inc.)와 컴퓨터프로그램 (Biocalculator2.0)을 활용하여 각 시료별 대립 유전자의 차이를 분석한 다음 반복 재현성이 높고 밴드의 패턴이 깨끗하며 다형성 정도가 높은 마커 24개를 1차적으로 선정하였다. 1차 선정된 24개중 유전적 다형성 정도가 낮은 4개를 제외한 20개를 보다 정밀도 높은 결과를 얻고자 표 1의 프라이머의 정방향에 FAM, VIC, NED, PET의 화학 물질 중 한가지로 형광 표지된 올리고뉴클레오타이드를 ㈜정화과학에 주문하여 제작하였다.As candidate material for the primer set of the present invention, 99 markers whose information is published in the International Genome Research D / B ( http://barleygenomics.wsu.edu/ ) were used. To select markers showing high polymorphism for domestically grown barley varieties, white waxy barley, saebare barley, white barley, broad barley, barley barley, Daeho barley, Dongho barley, cold han barley, healthy barley varieties and 99 primer sets were used. After amplification of the gene, the difference between alleles of each sample was analyzed using a capillary electrophoresis device (HDA-GT12 TM System, e GEnE, Inc.) and a computer program (Biocalculator2.0). 24 markers with clear pattern and high degree of polymorphism were selected. Oligofluorescently labeled with one of the chemicals of FAM, VIC, NED, and PET in the forward direction of the primers in Table 1 to obtain more accurate results, except for the four of the 24 selected first, which had low genetic polymorphism. Nucleotide was produced by ordering from Jeonghwa Science.

(4) PCR 증폭 및 전기 영동(4) PCR amplification and electrophoresis

상기 준비된 게놈 DNA와 상기 제작된 마커를 재료로 하여 PCR을 실시하였다. PCR 반응액의 조성은 상기 제조된 보리 게놈 DNA 20 ng, 0.1 μM의 상기 마커, 2.0㎕ dNTP 혼합물(2.5 mM), Taq polymerase 1U(Takara CAT. RR011A), 2.5 ㎕의 10 x PCR 버퍼(50 mM KCl, 20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 2.0 mM MgCl2)에 증류수를 첨가하여 전체 부피를 25 ㎕로 조절하였다. PCR(C1000, BioRad, 미국) 증폭은 94℃에서 5분 동안 게놈 DNA를 충분히 변성시킨 다음 변성은 94℃에서 30초, 어닐링은 52-60℃에서 30초, 그리고 신장을 72℃에서 45초간 40회 반복 수행하였다. PCR 산물의 최종 신장을 위하여 72℃에서 10분 동안 반응시켰고, 어닐링 온도는 각각의 프라이머에 따라 50-60℃로 설정하여 수행하였다. 각각의 프라이머 세트에 대한 어닐링 온도는 하기 표 3에 나타내었다. PCR이 완료된 후, 2% 아가로스 겔에서 전기영동하여 증폭 여부를 확인하였다. 증폭된 시료들은 다음 실험을 위해 -20℃에서 보관하였다. PCR에 증폭된 시료들은 프라이머에 접착된 각기 다른 형광 염색별로 20개의 프라이머를 5개 세트로 분류한 다음 각 세트별 증폭 산물을 초순수 150㎕에 희석하였다. 희석된 PCR 증폭산물 3㎕를 탈이온된 포름아마이드(deionized formamide) 10㎕, 대립유전자 크기를 측정하는 사이즈 마커(Size marker)(LIZ500 size standard) 0.25㎕를 잘 혼합하여 섞은 다음 94℃에서 2분간 변성시켰다. 변성시킨 유전자 증폭 산물은 자동 염기 서열 분석장치(Genetic Analyzer 3130XL, Applied Biosystem)를 활용하여 전기영동한 다음 Peak Scanner 및 GeneMapper 컴퓨터 프로그램(Applied Biosystem)을 이용하여 초위성체 분자 표지별 대립 유전자들의 정확한 크기를 결정하였다.PCR was performed using the prepared genomic DNA and the prepared markers as materials. The composition of the PCR reaction solution was prepared from 20 ng of barley genomic DNA prepared above, the marker of 0.1 μM, 2.0 μl dNTP mixture (2.5 mM), Taq polymerase 1U (Takara CAT. RR011A), 2.5 μl of 10 × PCR buffer (50 mM KCl, 20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 2.0 mM MgCl 2 ) was added to distilled water to adjust the total volume to 25 μl. PCR (C1000, BioRad, USA) amplification was sufficient to denature the genomic DNA for 5 minutes at 94 ° C, then denaturation at 94 ° C for 30 seconds, annealing at 52-60 ° C for 30 seconds, and kidneys at 72 ° C for 45 seconds. Repeated times were performed. The reaction was carried out at 72 ° C. for 10 minutes for the final elongation of the PCR product, and the annealing temperature was set at 50-60 ° C. according to each primer. Annealing temperatures for each primer set are shown in Table 3 below. After the PCR was completed, the amplification was confirmed by electrophoresis on 2% agarose gel. Amplified samples were stored at -20 ° C for the next experiment. Samples amplified by PCR were divided into five sets of 20 primers for different fluorescent stains attached to the primers, and each amplification product of each set was diluted in 150 μl of ultrapure water. Mix 3 µl of the diluted PCR amplification product with 10 µl of deionized formamide and 0.25 µl of size marker (LIZ500 size standard) to measure the size of the allele and mix for 2 minutes at 94 ° C. Denatured. The denatured gene amplification product was electrophoresed using an automated sequencing device (Genetic Analyzer 3130XL, Applied Biosystem), and then the exact size of alleles of each supersatellite molecule label was determined using Peak Scanner and GeneMapper computer program (Applied Biosystem). Decided.

(5) 본 발명에 따른 마커의 보리 품종 식별 가능성 검정 (5) Barley variety identification possibility test of the marker according to the present invention

상기에서 자동염기서열분석기로 확인한 대립유전자 크기를 이용하여 본 발명에 따른 마커의 보리 품종 식별 가능성을 조사하였다. 하기 식 1을 사용하여 PIC(polymorphism information content)값을 산출하였다. 하기 식에서 Pij는 마커 i의 밴드들 중에서 j번째 공통 밴드 패턴의 빈도수이다(Anderson et al., 1993, Genome 36: 181-186).The allelic size identified by the automatic sequencing was examined for the possibility of identifying the barley variety of the marker according to the present invention. Equation 1 was used to calculate the polymorphism information content (PIC) value. In the following equation, P ij is the frequency of the j th common band pattern among the bands of the marker i (Anderson et al., 1993, Genome 36: 181-186).

<식 1> <Equation 1>

Figure 112009054641654-pat00001
Figure 112009054641654-pat00001

그 결과, 각 마커에 따른 증폭 산물의 크기(bp), 대립 유전자의 수 및 PIC 값을 하기 표 3에 나타내었다.As a result, the size (bp) of the amplification products, the number of alleles and the PIC values according to each marker are shown in Table 3 below.

<표 3> 마커의 특징<Table 3> Characteristics of Markers

연번Serial number SSR 마커명SSR Marker Name 어닐링 온도(℃)Annealing Temperature (℃) 대립 유전자 크기Allele size 대립 유전자수Allele number PIC 값PIC value 1One Bmac0134Bmac0134 5555 130~160130-160 99 0.800 0.800 22 Bmac0209Bmac0209 5555 174~195174-195 66 0.669 0.669 33 Bmac0273Bmac0273 5252 137~162137-162 44 0.583 0.583 44 Bmag0211Bmag0211 5252 182~194182 ~ 194 88 0.777 0.777 55 Bmag0323Bmag0323 5252 151~165151-165 88 0.798 0.798 66 Bmag0337Bmag0337 5252 125~146125-146 88 0.767 0.767 77 EBmac0711EBmac0711 5555 196~206196-206 66 0.792 0.792 88 HVM40HVM40 5858 146~163146 ~ 163 44 0.792 0.792 99 HVM67HVM67 6060 106~119106-119 55 0.812 0.812 1010 EBmac0764EBmac0764 5252 129~149129-149 77 0.650 0.650 1111 Bmac0018Bmac0018 5555 131~176131-176 66 0.856 0.856 1212 Bmag0009Bmag0009 5555 168~180168-180 66 0.876 0.876 1313 Bmag0382Bmag0382 5555 084~107084 ~ 107 55 0.842 0.842 1414 EBmac0415EBmac0415 5858 228~248228-248 33 0.676 0.676 1515 EBmac0603EBmac0603 5555 135~152135-152 55 0.496 0.496 1616 EBmac0871EBmac0871 5252 184~207184-207 77 0.683 0.683 1717 HVM74HVM74 5252 187~238187-238 77 0.878 0.878 1818 Bmag0223Bmag0223 5555 133~173133-173 1111 0.852 0.852 1919 Bmag0378Bmag0378 5252 134~149134-149 55 0.522 0.522 2020 Bmag0136Bmag0136 5858 202~204202-204 22 0.499 0.499

상기 표 3에서 살핀 바와 같이, 본 발명에서 활용된 마커 중 EBmac0603은 0.496의 가장 낮은 PIC 값을 나타내었으나, Bmac0134 등 16개의 마커는 0.65 이상의 높은 PIC 값을 나타내었다. 따라서, 본 발명의 마커는 보리 품종을 충분히 식별 가능하게 할 수 있음을 알 수 있다.As shown in Table 3, EBmac0603 showed the lowest PIC value of 0.496 among the markers utilized in the present invention, but 16 markers such as Bmac0134 showed high PIC values of 0.65 or more. Thus, it can be seen that the marker of the present invention can sufficiently identify barley varieties.

또한 마커에 대해 대립유전자의 크기에 따른 품종 밴드의 유무에 따라 NTSYS pc(version 2.10b)(Rohlf, 2000, Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System-Version 2.10b. Applied Biostatistics Inc., New York.) 컴퓨터 프로그램에 입력하고 Jaccard's 방법(Sneath and Sokal 1973, Numerical taxonomy: The Principles and Practice of Numerical Classification, W. H. Freeman, San Francisco.)에 준하여 유전적 유사도 값을 계산하였다. 유전적 유사도를 이용하여 UPGMA(Unweighted Pair-group Method with Arithmetical Average)(Sneath and Sokal, 1973)에 의해 집괴 분석하여 계통도(dendrogram)를 작성하였고 그 결과를 도 1에 나타내었다. 이에 따라 본 발명의 프라이머 세트는 모든 품종의 구별을 가능하게 함을 알 수 있다.In addition, NTSYS pc (version 2.10b) (Rohlf, 2000, Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System-Version 2.10b.Applied Biostatistics Inc., New York.) Genetic similarity values were calculated according to Jaccard's method (Sneath and Sokal 1973, Numerical taxonomy: The Principles and Practice of Numerical Classification, WH Freeman, San Francisco.). Using a genetic similarity, a dendritic diagram was prepared by aggregating by UPGMA (Unweighted Pair-group Method with Arithmetical Average) (Sneath and Sokal, 1973), and the results are shown in FIG. 1. Accordingly, it can be seen that the primer set of the present invention enables the discrimination of all varieties.

도 1은 본 발명에 따른 마커에 의해 분석된 각 보리 품종을 코드화하고 NTSYSPC 컴퓨터 프로그램을 활용하여 보리 품종 식별 및 품종별 유전적 유사도를 나타낸 것이다.Figure 1 shows the coding of each barley varieties analyzed by the marker according to the present invention and shows the genetic similarity of barley varieties identification and varieties using the NTSYSPC computer program.

<110> KOREA SEED & VARIETY SERVICE <120> A METHOD FOR IDENTIFYING BARLEY VARIETIES USING MOLECULAR MARKERS <130> 085054 <160> 40 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0134 forward primer <400> 1 ccaactgagt cgatctcg 18 <210> 2 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0134 reverse primer <400> 2 cttcgttgct tctctacctt 20 <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0209 forward primer <400> 3 ctagcaactt cccaaccgac 20 <210> 4 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0209 reverse primer <400> 4 atgcctgtgt gtggaccat 19 <210> 5 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0273 forward primer <400> 5 acaaagctcg tggtacgt 18 <210> 6 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0273 reverse primer <400> 6 agggagtatt tcacccttg 19 <210> 7 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0211 forward primer <400> 7 attcatcgat cttgtattag tcc 23 <210> 8 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0211 reverse primer <400> 8 acatcatgtc gatcaaagc 19 <210> 9 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0323 forward primer <400> 9 tttgtgacat ctcaagaaca c 21 <210> 10 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0323 reverse primer <400> 10 tgacaaacaa ataatcacag g 21 <210> 11 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0337 forward primer <400> 11 acaaagaggg agtagtacgc 20 <210> 12 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0337 reverse primer <400> 12 gacccatgat atatgaagat ca 22 <210> 13 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0711 forward primer <400> 13 caaaagcaaa aatcatgaga 20 <210> 14 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0711 reverse primer <400> 14 ctaggtgtga tgagggtttc 20 <210> 15 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HVM40 forward primer <400> 15 cgattcccct tttcccac 18 <210> 16 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HVM40 reverse primer <400> 16 attctccgcc gtccactc 18 <210> 17 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HVM67 forward primer <400> 17 gtcgggctcc attgctct 18 <210> 18 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HVM67 reverse primer <400> 18 ccggtaccca gtgacgac 18 <210> 19 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0764 forward primer <400> 19 agaatcaaga tcgaccaaac 20 <210> 20 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0764 reverse primer <400> 20 aaaaacatga accgatgaa 19 <210> 21 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0018 forward primer <400> 21 gtcctttacg catgaaccgt 20 <210> 22 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0018 reverse primer <400> 22 acatacgcca gactcgtgtg 20 <210> 23 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0009 forward primer <400> 23 aagtgaagca agcaaacaaa ca 22 <210> 24 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0009 reverse primer <400> 24 atccttccat attttgatta ggca 24 <210> 25 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0382 forward primer <400> 25 tgaaacccat agagagtgag a 21 <210> 26 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0382 reverse primer <400> 26 tcaaaagttt cgttccaaat a 21 <210> 27 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0415 forward primer <400> 27 gaaacccatc atagcagc 18 <210> 28 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0415 reverse primer <400> 28 aaacagcagc aagaggag 18 <210> 29 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0603 forward primer <400> 29 accgaaacta aatgaactac ttcg 24 <210> 30 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0603 forward primer <400> 30 tgcaaactgt gctattaagg g 21 <210> 31 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0871 forward primer <400> 31 tgcctctgtt gtgttattgt 20 <210> 32 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0871 reverse primer <400> 32 ccccaagtga acattgac 18 <210> 33 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HVM74 forward primer <400> 33 aggaagtcat tgcgtgag 18 <210> 34 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HVM74 reverse primer <400> 34 tgatcaagaa tgataacatg g 21 <210> 35 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0223 forward primer <400> 35 ttagtcaccc tcaacggt 18 <210> 36 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0223 reverse primer <400> 36 cccctaactg ctgtgatg 18 <210> 37 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0378 forward primer <400> 37 cttttgtttc cgtagcatct a 21 <210> 38 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0378 reverse primer <400> 38 atccaactat agtagcaaag cc 22 <210> 39 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0136 forward primer <400> 39 gtacgctttc aaacctgg 18 <210> 40 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0136 reverse primer <400> 40 gtaggaggaa gaataaggag g 21 <110> KOREA SEED & VARIETY SERVICE <120> A METHOD FOR IDENTIFYING BARLEY VARIETIES USING MOLECULAR MARKERS <130> 085054 <160> 40 <170> Kopatentin 1.71 <210> 1 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0134 forward primer <400> 1 ccaactgagt cgatctcg 18 <210> 2 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0134 reverse primer <400> 2 cttcgttgct tctctacctt 20 <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0209 forward primer <400> 3 ctagcaactt cccaaccgac 20 <210> 4 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0209 reverse primer <400> 4 atgcctgtgt gtggaccat 19 <210> 5 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0273 forward primer <400> 5 acaaagctcg tggtacgt 18 <210> 6 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0273 reverse primer <400> 6 agggagtatt tcacccttg 19 <210> 7 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0211 forward primer <400> 7 attcatcgat cttgtattag tcc 23 <210> 8 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0211 reverse primer <400> 8 acatcatgtc gatcaaagc 19 <210> 9 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0323 forward primer <400> 9 tttgtgacat ctcaagaaca c 21 <210> 10 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0323 reverse primer <400> 10 tgacaaacaa ataatcacag g 21 <210> 11 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0337 forward primer <400> 11 acaaagaggg agtagtacgc 20 <210> 12 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0337 reverse primer <400> 12 gacccatgat atatgaagat ca 22 <210> 13 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0711 forward primer <400> 13 caaaagcaaa aatcatgaga 20 <210> 14 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0711 reverse primer <400> 14 ctaggtgtga tgagggtttc 20 <210> 15 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HVM40 forward primer <400> 15 cgattcccct tttcccac 18 <210> 16 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HVM40 reverse primer <400> 16 attctccgcc gtccactc 18 <210> 17 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HVM67 forward primer <400> 17 gtcgggctcc attgctct 18 <210> 18 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HVM67 reverse primer <400> 18 ccggtaccca gtgacgac 18 <210> 19 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0764 forward primer <400> 19 agaatcaaga tcgaccaaac 20 <210> 20 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0764 reverse primer <400> 20 aaaaacatga accgatgaa 19 <210> 21 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0018 forward primer <400> 21 gtcctttacg catgaaccgt 20 <210> 22 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmac0018 reverse primer <400> 22 acatacgcca gactcgtgtg 20 <210> 23 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0009 forward primer <400> 23 aagtgaagca agcaaacaaa ca 22 <210> 24 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0009 reverse primer <400> 24 atccttccat attttgatta ggca 24 <210> 25 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0382 forward primer <400> 25 tgaaacccat agagagtgag a 21 <210> 26 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0382 reverse primer <400> 26 tcaaaagttt cgttccaaat a 21 <210> 27 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0415 forward primer <400> 27 gaaacccatc atagcagc 18 <210> 28 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0415 reverse primer <400> 28 aaacagcagc aagaggag 18 <210> 29 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0603 forward primer <400> 29 accgaaacta aatgaactac ttcg 24 <210> 30 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0603 forward primer <400> 30 tgcaaactgt gctattaagg g 21 <210> 31 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0871 forward primer <400> 31 tgcctctgtt gtgttattgt 20 <210> 32 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> EBmac0871 reverse primer <400> 32 ccccaagtga acattgac 18 <210> 33 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HVM74 forward primer <400> 33 aggaagtcat tgcgtgag 18 <210> 34 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HVM74 reverse primer <400> 34 tgatcaagaa tgataacatg g 21 <210> 35 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0223 forward primer <400> 35 ttagtcaccc tcaacggt 18 <210> 36 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0223 reverse primer <400> 36 cccctaactg ctgtgatg 18 <210> 37 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0378 forward primer <400> 37 cttttgtttc cgtagcatct a 21 <210> 38 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0378 reverse primer <400> 38 atccaactat agtagcaaag cc 22 <210> 39 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0136 forward primer <400> 39 gtacgctttc aaacctgg 18 <210> 40 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bmag0136 reverse primer <400> 40 gtaggaggaa gaataaggag g 21  

Claims (5)

서열번호 9 및 서열번호 10의 올리고뉴클레오티드로 구성되는 Bmag0323 프라이머 세트;A set of Bmag0323 primers consisting of oligonucleotides of SEQ ID NO: 9 and SEQ ID NO: 10; 서열번호 11 및 서열번호 12의 올리고뉴클레오티드로 구성되는 Bmag0337 프라이머 세트;Bmag0337 primer set consisting of oligonucleotides of SEQ ID NO: 11 and SEQ ID NO: 12; 서열번호 13 및 서열번호 14의 올리고뉴클레오티드로 구성되는 EBmac0711 프라이머 세트;An EBmac0711 primer set consisting of oligonucleotides of SEQ ID NO: 13 and SEQ ID NO: 14; 서열번호 19 및 서열번호 20의 올리고뉴클레오티드로 구성되는 EBmac0764 프라이머 세트;An EBmac0764 primer set consisting of oligonucleotides of SEQ ID NO: 19 and SEQ ID NO: 20; 서열번호 29 및 서열번호 30의 올리고뉴클레오티드로 구성되는 EBmac0603 프라이머 세트; 및An EBmac0603 primer set consisting of the oligonucleotides of SEQ ID NO: 29 and SEQ ID NO: 30; And 서열번호 31 및 서열번호 32의 올리고뉴클레오티드로 구성되는 EBmac0871 프라이머 세트로 구성되는, 하기 보리 품종으로 구성되는 군으로부터 선택되는 하나 이상의 보리품종 식별용 프라이머 세트.A primer set for identifying one or more barley varieties selected from the group consisting of barley varieties, consisting of the EBmac0871 primer set consisting of oligonucleotides of SEQ ID NO: 31 and SEQ ID NO: 32. 연번Serial number 품종명Breed name 연번Serial number 품종명Breed name 연번Serial number 품종명Breed name 1One 우호friendship 2525 대아Daeah 4949 탑골Top Goal 22 소만Shoman 2626 큰알보리 1호Big Alvor No. 1 5050 새올Newall 33 유연softness 2727 새늘Birds 5151 The 44 다진chop 2828 대영British 5252 새강New river 55 너른들Nerds 2929 태평Peace 5353 서둔찰Rush 66 다송Dasong 3030 동호쌀Dongho Rice 5454 삼도Samdo 77 다향Multidirectional 3131 일진ILJIN 5555 미락Mirak 88 삼광찰Samgwangchal 3232 대연Daeyeon 5656 대백Great 99 광안Gwangan 3333 재강쌀Red rice 5757 낙영Dairy 1010 상원senate 3434 신호signal 5858 큰알Large egg 1111 호진Hojin 3535 상록Evergreen 5959 새알A new egg 1212 청호쌀Cheongho Rice 3636 단원Unit 6060 밀양겉Sheepskin 1313 영양nutrition 3737 대호쌀Great Lake Rice 6161 대진Daejin 1414 동한찰Donghanchal 3838 진미찹쌀Jinmi glutinous rice 6262 알찬full 1515 태강Taegang 3939 팔도eight provinces of Korea 6363 광활쌀Vast rice 1616 호품Article 4040 무등쌀Mudeung Rice 6464 올쌀Rice 1717 남호South Lake 4141 두산 8호Doosan 8 6565 흰찰쌀White rice 1818 호반찰Lakeside 4242 두산 29호Doosan 29 6666 흰쌀White rice 1919 선우Sunwoo 4343 제주Jeju 6767 내한쌀Cold rice 2020 새한찰Saehanchal 4444 진양Jinyang 6868 긴쌀Long rice 2121 건강health 4545 남향South 6969 늘쌀Ever rice 2222 수영swimming 4646 찰쌀Rice 7070 새쌀New rice 2323 풍산찰Poongsan Temple 4747 새찰쌀Rice flour 7171 송학Songhak 2424 제안찰Proposal 4848 두원찰쌀Dowon Rice
보리로부터 유래된 게놈 DNA를 주형으로 하고 제1항의 보리 품종 식별용 프라이머 세트를 프라이머로 사용하여 핵산을 증폭하는 단계; 및Amplifying the nucleic acid using genomic DNA derived from barley as a template and using the primer set for barley variety identification according to claim 1 as a primer; And 상기 증폭 산물로부터 보리 품종을 식별하는 단계를 포함하는, 하기 보리 품종으로 구성되는 군으로부터 선택되는 하나 이상의 보리 품종을 식별하는 방법.Identifying one or more barley varieties selected from the group consisting of barley varieties, comprising identifying barley varieties from the amplification products. 연번Serial number 품종명Breed name 연번Serial number 품종명Breed name 연번Serial number 품종명Breed name 1One 우호friendship 2525 대아Daeah 4949 탑골Top Goal 22 소만Shoman 2626 큰알보리 1호Big Alvor No. 1 5050 새올Newall 33 유연softness 2727 새늘Birds 5151 The 44 다진chop 2828 대영British 5252 새강New river 55 너른들Nerds 2929 태평Peace 5353 서둔찰Rush 66 다송Dasong 3030 동호쌀Dongho Rice 5454 삼도Samdo 77 다향Multidirectional 3131 일진ILJIN 5555 미락Mirak 88 삼광찰Samgwangchal 3232 대연Daeyeon 5656 대백Great 99 광안Gwangan 3333 재강쌀Red rice 5757 낙영Dairy 1010 상원senate 3434 신호signal 5858 큰알Large egg 1111 호진Hojin 3535 상록Evergreen 5959 새알A new egg 1212 청호쌀Cheongho Rice 3636 단원Unit 6060 밀양겉Sheepskin 1313 영양nutrition 3737 대호쌀Great Lake Rice 6161 대진Daejin 1414 동한찰Donghanchal 3838 진미찹쌀Jinmi glutinous rice 6262 알찬full 1515 태강Taegang 3939 팔도eight provinces of Korea 6363 광활쌀Vast rice 1616 호품Article 4040 무등쌀Mudeung Rice 6464 올쌀Rice 1717 남호South Lake 4141 두산 8호Doosan 8 6565 흰찰쌀White rice 1818 호반찰Lakeside 4242 두산 29호Doosan 29 6666 흰쌀White rice 1919 선우Sunwoo 4343 제주Jeju 6767 내한쌀Cold rice 2020 새한찰Saehanchal 4444 진양Jinyang 6868 긴쌀Long rice 2121 건강health 4545 남향South 6969 늘쌀Ever rice 2222 수영swimming 4646 찰쌀Rice 7070 새쌀New rice 2323 풍산찰Poongsan Temple 4747 새찰쌀Rice flour 7171 송학Songhak 2424 제안찰Proposal 4848 두원찰쌀Dowon Rice
제2항에 있어서, 상기 게놈 DNA는 보리의 종자 또는 보리의 어린 식물체의 잎으로부터 유래된 것을 특징으로 하는 방법.The method of claim 2, wherein the genomic DNA is derived from seeds of barley or leaves of young plants of barley. 제2항에 있어서, 상기 증폭 산물로부터 보리 품종을 식별하는 단계는 각각의 보리 품종에 대해 제1항의 보리 품종 식별용 프라이머 세트에 의한 증폭 산물의 유무를 표로 작성하고 상기 증폭된 산물과의 비교 분석에 의해 보리 품종을 식별하는 것을 특징으로 하는 방법.The method of claim 2, wherein the step of identifying the barley varieties from the amplification product is a table for the presence or absence of the amplification product by the barley varieties primer identification set of claim 1 for each barley varieties and comparative analysis with the amplified products To identify the barley varieties. 제1항의 보리 품종 식별용 프라이머 세트, DNA 중합 효소 및 PCR 완충 용액(buffer)을 포함하는 하기 보리 품종으로 구성되는 군으로부터 선택되는 하나 이상의 보리 품종 식별용 키트.At least one barley variety identification kit selected from the group consisting of barley varieties comprising the primer set for barley variety identification, DNA polymerase and PCR buffer of claim 1. 연번Serial number 품종명Breed name 연번Serial number 품종명Breed name 연번Serial number 품종명Breed name 1One 우호friendship 2525 대아Daeah 4949 탑골Top Goal 22 소만Shoman 2626 큰알보리 1호Big Alvor No. 1 5050 새올Newall 33 유연softness 2727 새늘Birds 5151 The 44 다진chop 2828 대영British 5252 새강New river 55 너른들Nerds 2929 태평Peace 5353 서둔찰Rush 66 다송Dasong 3030 동호쌀Dongho Rice 5454 삼도Samdo 77 다향Multidirectional 3131 일진ILJIN 5555 미락Mirak 88 삼광찰Samgwangchal 3232 대연Daeyeon 5656 대백Great 99 광안Gwangan 3333 재강쌀Red rice 5757 낙영Dairy 1010 상원senate 3434 신호signal 5858 큰알Large egg 1111 호진Hojin 3535 상록Evergreen 5959 새알A new egg 1212 청호쌀Cheongho Rice 3636 단원Unit 6060 밀양겉Sheepskin 1313 영양nutrition 3737 대호쌀Great Lake Rice 6161 대진Daejin 1414 동한찰Donghanchal 3838 진미찹쌀Jinmi glutinous rice 6262 알찬full 1515 태강Taegang 3939 팔도eight provinces of Korea 6363 광활쌀Vast rice 1616 호품Article 4040 무등쌀Mudeung Rice 6464 올쌀Rice 1717 남호South Lake 4141 두산 8호Doosan 8 6565 흰찰쌀White rice 1818 호반찰Lakeside 4242 두산 29호Doosan 29 6666 흰쌀White rice 1919 선우Sunwoo 4343 제주Jeju 6767 내한쌀Cold rice 2020 새한찰Saehanchal 4444 진양Jinyang 6868 긴쌀Long rice 2121 건강health 4545 남향South 6969 늘쌀Ever rice 2222 수영swimming 4646 찰쌀Rice 7070 새쌀New rice 2323 풍산찰Poongsan Temple 4747 새찰쌀Rice flour 7171 송학Songhak 2424 제안찰Proposal 4848 두원찰쌀Dowon Rice
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* Cited by examiner, † Cited by third party
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Theor. Appl. Genet., Vol. 114, pp. 1091–1103 (2007)
Theor. Appl. Genet., Vol.108, pp. 720-724 (2004.02.28.)

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