KR101090343B1 - 사상체질 진단용 다중 ｓｎｐ 마커，그를 포함하는 마이크로어레이，및 그를 이용한 사상체질 진단용 키트 - Google Patents

사상체질 진단용 다중 ｓｎｐ 마커，그를 포함하는 마이크로어레이，및 그를 이용한 사상체질 진단용 키트 Download PDF

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Abstract

본 발명은 사상체질 진단용 다중 SNP(Single Nucleotide Polymorphism) 마커, 그를 포함하는 마이크로어레이, 및 그를 이용한 사상체질 진단용 키트에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 서열번호 1 내지 124로 구성된 폴리뉴클레오티드들에 있어서 각 SNP 위치(각 서열의 101번째) 염기를 포함하는 10개 이상의 연속 염기로 구성되는 폴리뉴클레오티드들로부터 선택되는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적 폴리뉴클레오티드를 포함하나 사상체질 진단용 다중 SNP, 그를 포함하는 마이크로어레이, 및 그를 이용한 사상체질 진단용 키트에 관한 것이다. 본 발명에 의해, 사상체질을 보다 객관적이고 정확하며 신속하게 진단할 수 있다.
사상체질, 다중 SNP, 마이크로어레이, 사상체질 진단용 키트.

Description

사상체질 진단용 다중 ＳＮＰ 마커，그를 포함하는 마이크로어레이，및 그를 이용한 사상체질 진단용 키트{Multiple SNP markers，microarray and diagnosis kit for Sasang constitution}
본 발명은 사상체질 진단용 다중 SNP(Single Nucleotide Polymorphism) 마커, 그를 포함하는 마이크로어레이, 및 그를 이용한 사상체질 진단용 키트에 관한 것이다.
1894년 동무 이제마 선생에 의하여 창안된 사상의학은 사람의 체질을 태양, 소양, 태음 및 소음의 네 가지로 분류하고 각 체질에 대한 생리, 병리, 진단 감별법, 치료와 약물, 식품 섭취에 이르기까지 서로 연계를 갖고 이를 임상에 응용할 수 있는 새로운 방법을 제시하였으며(동의수세보원, 1984, 이제마), 현재, 한의학에서 중요한 임상적 방법으로 이용되고 있다.　
전통적으로 사상체질의 판별은 개인의 음성, 외모, 체형, 성격 및 다양한 외형적인 생물학적 지표를 종합적으로 이용하여 수행하여 왔으며, 숙련된 전문가에 의하여 주관적 판단을 바탕으로 진단이 행해지고 있다(조동욱 외, 사상의학회지 8권 12호, 1996).　
한편, 동의수세보원에 의하면, 체질은 선천적이며 일생에 걸쳐서 변하지 않는다고 알려져 있으므로, 생물학적으로는 유전적인 특성이라고 할 수 있다. 사람의 모든 생물학적 형질은 유전자의 정보를 근간으로 발현되는 것이며, 따라서, 사상의학에서 제시하는 체질적 속성 역시 유전자가 지닌 형질에 내재되어 있는 속성이라 할 수 있다.
모든 생물의 유전체는 진화과정에서 자손들의 유전체에 변이(genomic variation)를 생기게 하는 자발적 돌연변이(mutation)를 겪는다(Gusella, Ann. Rev. Biochem. 55, 831-854, 1986). 유전체의 변이는 해당 생물종에게 있어서 진화적으로 이익 또는 불이익을 주거나 중성적일 수 있다. 기능적으로 매우 중요한 유전자의 변이의 경우, 치사적인 불이익을 주어 자손에게 전달되지 않는 경우도 있으며, 그렇지 않은 경우에는, 결국에는 종의 대부분에 DNA가 삽입되어 효과적으로 선조 형태가 되며, 다양한 생물학적 형질과 연관되어 종 집단 중에 서열의 다형성(polymorphism) 형태로 공존한다. 이러한 다형에는 RFLP(restriction fragment length polymorphism), STR(short tandem repeats) 및 SNP(single nucleotide polymorphism) 등이 알려져 있다.
이　중 SNP는 동일한 종의 개체 사이의 단일 뉴클레오티드(nucleotide) 변이이며, SNP가 단백질 암호화 영역에 발생하는 경우, 다형성 형태 중 어느 하나에 의 하여 결함 있거나 변이된 단백질이 발현될 수도 있다. 비코딩 영역에 SNP가 발생할 경우는 결함 있는 스플라이싱(splicing)의 결과로서 결함 있거나 변이된 단백질의 발현을 초래할 수도 있으며, 어떤 SNP는 표현형에 아무런 영향을 미치지 않을 수도 있다. 인간의 경우 약 1,000 bp 마다 1회의 빈도로 SNP가 발생하는 것으로 알려져 있으며, 이들 SNP가 질병과 같은 표현형에 영향을 미치는 경우, SNP를 포함하는 폴리뉴클레오티드(polynucleotide)는 이러한 질병이나 생물학적 표현 형질을 진단하기 위한 프라이머(primer) 또는 탐침(probe)으로 사용될 수 있다.
상기한　바와　같이 전통적으로 행해져온 사상체질의 판별은 피검자의　음성, 외모, 체형, 성격을　포함하는　다양한 내외형적인 생물학적 지표를 종합하여 숙련된 전문가에 의하여 주관적 판단을 바탕으로 이루어지고 있다. 상기 체질 판별방법에 있어서, 생물학적 지표의 측정이 객관적이고　과학적인　방법을　통하여 정밀하게 이루어지지 않고 있으며, 측정된 지표의 값을 종합하여 최종 체질을 판별함에　있어서도　기준이 판정자의 주관에 의존하므로 판정된 체질의 정확성과 재현성에　심각한　문제가　존재한다．
사상체질의 판별을 용이하게 하기 위하여, 종래에는 손가락과 금이나 은가락지의 접촉 시의 신체 반응을 측정하거나(대한민국 등록특허 10-0455996, 대한민국 등록실용 20-0325651), 체질에 맞는 식품 또는 약품 접촉 시의 손목의 압력(대한민국 등록특허 10-0563127), 또는 수지근력(대한민국 등록실용 2020000032492), 또는 몸의 반응(대한민국 등록실용 20-0365859)을 측정하거나, 음성 신호의 정보를 분석 하여 체형에 관한 정보를 추출하거나(대한민국 공개특허 10-2009-0009430, 대한민국 등록특허 10-0427243), 손목에서의 맥진(대한민국 등록특허 10-0464806, 대한민국 등록특허 10-0672083)을 이용하여 판별을 수행하는 방법들을　개발하여　적용하고자　하는　노력이　있어　왔으나, 적용 원리에 있어서 과학적 근거가 부족하고 측정 정밀도가 낮으며, 체질의 판정 지표 중 극히 일부를 사용하여 판정함으로써 정확도와　재현성　및　신뢰도를　개선하지　못하였다．
최근에는, 체질문진표(Sasangin diagnosis questionnaire)를 고안하여, 다양한 체질의 판정지표를 체계적으로 종합하여 체질판정을 과학화하고 객관화하고자 하였으며(Jung-Hee Yoo외, J. Alternative and Complementary Medicine, 13(1), 2007), 체질을 유전학적인 면에서 검토하고 조사하여 체질별 상이성 및 상관성을 찾아보고, 체질분류의 객관화를 위한 기초를 마련하려는 연구(조동욱 외, 사상의학회지 8(12), 1996; 이수경 외, 사상체질학회지 14(2), 2002; 한성규 외, 사상체질학회지 15(1), 2003; 김판준 외, 사상체질의학회지 18(3), 2006)가 수행되어 왔다.
그러나, 이러한 연구들은 사상체질의 유전성을 이용하여 사상체질과 연관된 유전체 부위를 과학적으로 규명하려는 시도로서의 가치가 있으나, 결과적으로는 사상체질과 뚜렷하게 연관된 유전자를 밝히거나 진단에 이용할 수 있는 유전적 지표를 밝혀내지는 못하였다.
이에, 본 발명자들은 상기한 종래의 사상체질 진단 방법의 비과학성，비객관성，낮은 정확도　및　재현성　문제를 개선하기 위해 사상체질의 유전성에 근거하 여 사상체질과 연관된 SNP들을 발굴하기 위한 연구를 진행하던 중, 특정 사상체질의 인구 집단은 특정 SNP들에서 특정 유전형을 가지고 있고, 상기 SNP들의 유전형 정보를 이용하여 개인의 사상체질 확률을 진단할 수 있음을 확인함으로써 본 발명을 완성하였다.
본 발명의 목적은 사상체질을 진단할 수 있는 다중 SNP(Single Nucleotide Polymorphism) 지표들, 그를 포함하는 탐침을 이용하는 마이크로어레이, 및 그를 이용한 사상체질 진단용 키트를 제공하는 것이다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 1 내지 124로 구성된 폴리뉴클레오티드에 있어서 각 SNP(Single Nucleotide Polymorphism)의 위치(각 서열의 101번째)의 염기를 포함하는 10개 이상의 연속 염기로 구성되는 폴리뉴클레오티드들로부터 선택되는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드를 포함하는, 사상체질 진단용 다중 SNP를 제공한다.　
또한, 본 발명은 상기 SNP의 폴리뉴클레오티드, 그의 상보적 폴리뉴클레오티드, 그들과 혼성화 하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그에 의해 코딩되는 폴리펩티드를 포함하는 사상체질 진단용 마이크로어레이를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 마이크로어레이를 포함하는 사상체질 진단용 키트를 제공한다.
아울러, 본 발명은 1) 피검체로부터 핵산 시료를 분리하는 단계; 2) 상기 핵산 시료를 형광물질로 표지하는 단계; 3) 형광물질로 표지된 핵산시료를 상기 마이크로어레이와 혼성화하는 단계; 3) 반응한 마이크로어레이를 분석하여 서열번호 1 내지 124 중에서 선택되는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드의 각 다형성 부위의 유전자형을 결정하는 단계; 및 4) 상기 유전자형을 이용하여 피검체의 사상체질을 결정하는 단계를 포함하는 사상체질 진단 방법을 제공한다.
본 발명에 따른 다중 SNP는 사상체질 중 특정한 체질에서만 특이적으로 나타나고 그 외 체질인들에게서는 거의 나타나지 않는 SNP의 특정 조합 및 이들의 유전자형을 가지고 있으므로, 개인의 사상체질을 효과적으로 진단할 수 있다. 특히, 사상체질의 유전성에 근거하여 개인마다 특이적으로 다른 유전적 변이를 정확하게 측정하여 분석한 결과에 근거한 것으로, 본 발명에 따른 다중 SNP, 이를 이용한 마이크로어레이, 및 이를 이용한 사상체질 진단용 키트는 보다 과학적이고, 객관적이며, 정확한 사상체질의 진단을 가능하게 한다.
이하, 본 발명을 보다 상세히 설명한다.
본 발명은 서열번호 1 내지 124로 구성된 폴리뉴클레오티드에 있어서 각 SNP(Single Nucleotide Polymorphism, 단일염기다형성)의 위치(각 서열의 101번째)의 염기를 포함하는 10개 이상의 연속 염기로 구성되는 폴리뉴클레오티드들로부터 선택되는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드를 포 함하는, 사상체질 진단용 다중 SNP를 제공한다.
상기 서열번호 1 내지 124로 표시되는 SNP 위치의 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드들은 하기 [표 1]에 기재된 바와 같다:
SNP의 dbSNP 등록번호 SNP가 포함된 폴리뉴클레오티드 SNP의 dbSNP 등록번호 SNP가 포함된 폴리뉴클레오티드
rs732509 서열번호 1 rs324571 서열번호 63
rs3933369 서열번호 2 rs4561699 서열번호 64
rs16982495 서열번호 3 rs1566732 서열번호 65
rs3929608 서열번호 4 rs974676 서열번호 66
rs7200468 서열번호 5 rs9886510 서열번호 67
rs891989 서열번호 6 rs6499515 서열번호 68
rs3744793 서열번호 7 rs4882132 서열번호 69
rs1558531 서열번호 8 rs2415627 서열번호 70
rs12022351 서열번호 9 rs6548270 서열번호 71
rs7841724 서열번호 10 rs7395662 서열번호 72
rs4947644 서열번호 11 rs2359378 서열번호 73
rs10835536 서열번호 12 rs897735 서열번호 74
rs6596224 서열번호 13 rs12420372 서열번호 75
rs9313235 서열번호 14 rs2915414 서열번호 76
rs714693 서열번호 15 rs868243 서열번호 77
rs4880851 서열번호 16 rs11042702 서열번호 78
rs7761051 서열번호 17 rs2677112 서열번호 79
rs7454257 서열번호 18 rs41447647 서열번호 80
rs4510645 서열번호 19 rs17138409 서열번호 81
rs512948 서열번호 20 rs7155547 서열번호 82
rs4282653 서열번호 21 rs667770 서열번호 83
rs3801534 서열번호 22 rs4533500 서열번호 84
rs2805543 서열번호 23 rs1791169 서열번호 85
rs818361 서열번호 24 rs4882017 서열번호 86
rs259073 서열번호 25 rs423541 서열번호 87
rs10928683 서열번호 26 rs1546256 서열번호 88
rs4937842 서열번호 27 rs9287986 서열번호 89
rs10055080 서열번호 28 rs17171399 서열번호 90
rs4573896 서열번호 29 rs6581515 서열번호 91
rs4555755 서열번호 30 rs16992170 서열번호 92
rs10040260 서열번호 31 rs2173709 서열번호 93
rs17517219 서열번호 32 rs979309 서열번호 94
rs17575938 서열번호 33 rs12951421 서열번호 95
rs2147897 서열번호 34 rs3784120 서열번호 96
rs756679 서열번호 35 rs3843579 서열번호 97
rs10455733 서열번호 36 rs387873 서열번호 98
rs1703663 서열번호 37 rs9546127 서열번호 99
rs7201911 서열번호 38 rs2246872 서열번호 100
rs1659794 서열번호 39 rs1576166 서열번호 101
rs4141371 서열번호 40 rs10520501 서열번호 102
rs6487998 서열번호 41 rs10238431 서열번호 103
rs11075059 서열번호 42 rs6805864 서열번호 104
rs10843984 서열번호 43 rs857120 서열번호 105
rs560084 서열번호 44 rs2002284 서열번호 106
rs10499695 서열번호 45 rs425155 서열번호 107
rs904759 서열번호 46 rs9819987 서열번호 108
rs1917927 서열번호 47 rs1571125 서열번호 109
rs4964821 서열번호 48 rs1956537 서열번호 110
rs1942761 서열번호 49 rs779741 서열번호 111
rs4358154 서열번호 50 rs11703846 서열번호 112
rs1667280 서열번호 51 rs10800462 서열번호 113
rs2418979 서열번호 52 rs6765444 서열번호 114
rs2257043 서열번호 53 rs9826255 서열번호 115
rs10140209 서열번호 54 rs1675035 서열번호 116
rs11039820 서열번호 55 rs1326357 서열번호 117
rs10838954 서열번호 56 rs2797129 서열번호 118
rs4325783 서열번호 57 rs422779 서열번호 119
rs762899 서열번호 58 rs3935264 서열번호 120
rs3764474 서열번호 59 rs2202159 서열번호 121
rs6485872 서열번호 60 rs12481102 서열번호 122
rs7131779 서열번호 61 rs1913754 서열번호 123
rs324572 서열번호 62 rs4726423 서열번호 124
상기 용어 'SNP'는 개인간의 DNA에 존재하는 한 염기쌍(single base-pair variation)의 차이로 DNA 서열 다형성 중에서 가장 많이 존재하는 형태를 의미한다(약 1개/1kb).
상기 용어 'SNP의 dbSNP(The Single Nucleotide Polymorphism Database) 등록번호'는 상기 각 SNP의 서열 및 그 위치를 나타내는 것이다. 당업자라면 상기 등록번호를 이용하여 SNP의 위치 및 서열을 용이하게 확인할 수 있을 것이다. NCBI의 dbSNP에 등록되어 있는 SNP의 rs 번호에 해당하는 구체적인 서열은 시간이 지남에 따라 약간 변경될 수 있다. 본 발명의 범위가 상기 변경된 서열에도 미치는 것은 당업자에게 자명할 것이다.
상기 '서열번호 1 내지 124'는 다형성 부위를 포함하는 다형성 서열(polymorphic sequence)이다. 다형성 서열이란 폴리뉴클레오티드 서열 중에 SNP를 나타내는 다형성 부위(polymorphic site)를 포함하는 서열을 말한다. 상기 폴리뉴클레오티드 서열은 DNA 또는 RNA가 될 수 있다.
상기 서열번호 1 내지 124로 표시되는 SNP 위치의 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드에 존재하는 각 SNP의 특성은 하기 [표 2]에 기재된 바와 같다:
SNP의
dbSNP
등록번호		 SNP가 포함된 폴리뉴클레오티드 밴드 유전자 SNP역할 유의확률 진단체질
rs732509 서열번호 1 1p32.3 THEA 인트론 0.003742 소음
rs3933369 서열번호 2 13q12.12 intergenic 0.004374 소음
rs16982495 서열번호 3 2p24.3 intergenic 0.0007666 소음
rs3929608 서열번호 4 15q25.1 intergenic 0.000505 소음
rs7200468 서열번호 5 16p13.3 LOC440337 프로모터 0.003065 소음
rs891989 서열번호 6 5q31.3 GNPDA1 intergenic 0.002938 소음
rs3744793 서열번호 7 17q25.3 USP36 코딩 엑손 0.002268 소음
rs1558531 서열번호 8 12p13.31 CD163 프로모터 0.004418 소음
rs12022351 서열번호 9 1q41 DUSP10 프로모터 0.003378 소음
rs7841724 서열번호 10 8q24.23 ENSG00000169438 인트론 0.00198 소음
rs4947644 서열번호 11 7p12.2 DDC 인트론 0.001133 소음
rs10835536 서열번호 12 11p14.1 intergenic 0.004287 소음
rs6596224 서열번호 13 5q31.1 H2AFY 프로모터 0.001013 소음
rs9313235 서열번호 14 5p15.31 intergenic 0.0003285 소음
rs714693 서열번호 15 6q21 ENSG00000053328 인트론 0.002106 소음
rs4880851 서열번호 16 10p15.3 ADARB2 인트론 0.001461 소음
rs7761051 서열번호 17 6q23.2 MOXD1 인트론 0.001593 소음
rs7454257 서열번호 18 6q27 intergenic 0.0006561 소음
rs4510645 서열번호 19 6q27 intergenic 0.0006812 소음
rs512948 서열번호 20 13q14.3 FLJ13639 인트론 0.004322 소음
rs7470823 서열번호 21 9p13.3 OR13J1 프로모터 0.00363 소음
rs3801534 서열번호 22 7q21.11 SEMA3E 인트론 0.000203 소음
rs2805543 서열번호 23 10p15.3 ADARB2 인트론 0.002202 소음
rs818361 서열번호 24 2q31.1 intergenic 0.002731 소음
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상기 [표 2]에서 용어 '밴드'는 각 단일 SNP가 위치하는 염색체 번호, 각 염색체 상의 동원체를 중심으로 한 단완(short arm; p) 부분 또는 장완(long arm; q) 부분 및 밴드 번호를 의미한다. 예를 들어, 서열번호 1에 포함되어 있는 SNP의 위치는 1p32.3이며, 이는 1번 염색체 상의 단완 부분(p)의 32.3 밴드 상에 존재함을 의미한다.
상기 용어 '유전자'는 각 SNP를 포함하는 유전자를 의미한다.
상기 용어 'SNP의 역할'은 상기 유전자 내에서 상기 각 단일 SNP가 수행하는 역할을 의미한다.
상기 용어 '진단 체질'은 각 SNP를 이용하여 진단에 사용할 수 있는 체질이다. 예를 들어, 서열번호 1에 해당하는 SNP는 소음 체질을 진단하는데 사용될 수 있다.
상기 용어 '유의확률'은 각 SNP가 사상체질 중의 특정 체질에 연관되어 있지 않을 확률을 의미하며, 특정 체질 집단과 나머지 체질 집단 간의 각 SNP의 유전형 분포가 균일하다는 귀무가설 하에서 실제 검사된 유전형 분포가 얻어질 확률을 카이제곱 검정으로 계산한 것이다. 즉, 유의확률의 값이 작을수록 그 SNP가 특정 체질에 깊이 연관되어 있음을 나타내어 준다. 예를 들어, 상기 [표 2]에서 서열번호 1에 해당하는 SNP가 소음 체질에 연관되어 있지 않다는 가정 하에서, 실험적으로 얻어진 유전형 분포가 나타날 확률은 약 0.004에 해당하며, 이것은 서열번호 1에 해당하는 SNP가 소음 체질에 깊이 연관되어 있음을 알 수 있는 것이다. 상기 [표 2]에 나타낸 바와 같이, 서열번호 1 내지 124에 해당하는 SNP들은 유의확률이 0.00008에서 0.005에 이르는 낮은 값으로, 상기의 SNP들이 각 진단체질에 해당하는 사상체질에　깊이 연관되어 있으며, 상기 SNP들의 유전형 정보를 이용하여 사상체질의 진단에 효과적으로 활용할 수 있음을 기대할 수 있다.
상기 용어 '카이제곱 검정(Chi-square Test)'은 두 변수 사이의 연관성을 평가하기 위하여 교차분석에서 사용하는 통계적 검정으로, 두 변수가 연관성이 없다는 귀무가설 하에서, 표 3에 나타낸 특정 SNP의 집단별 유전형 빈도에 대한 교차 분할표로부터 수학식 1로 계산된 카이제곱 통계량은 자유도가(분할표 컬럼수-1)×(분할표 줄수-1)인 카이제곱 분포를 한다는 것을 이용하여 관측된 데이터가 나올 수 있는 유의 확률을 계산하는 통계적 검정법이다.
Figure 112009028925065-pat00001
유전형 유전형 관측빈도(observed) 유전형 기대빈도(expected)
관심 체질 타 체질 전체 관심 체질 타 체질 전체
AA O11 O12 n1+ E11 E12 n1+
AB O21 O22 n2+ E21 E22 n2+
BB O31 O32 n3+ E31 E32 n3+
전체 n+1 n+2 n n+1 n+2 n
본 발명에 따른 사상체질 진단용 다중 SNP에 있어서, 상기 하나 이상의 폴리뉴클레오티드는 서열번호 1 내지 124로 구성된 폴리뉴클레오티드들에 있어서 각 SNP의 위치(각 서열의 101번째) 염기를 포함하는 10개 이상의 연속 염기로 구성되는 폴리뉴클레오티드들로 부터，하기 표 4의 조합으로 선택되는 1 내지 108로 구성된 군에서 선택되는 것이 바람직하다.
번호 다중 SNP 진단체질
1 서열번호 17, 서열번호 32, 서열번호 41 소음
2 서열번호 21, 서열번호 22, 서열번호 34 소음
3 서열번호 17, 서열번호 33, 서열번호 41 소음
4 서열번호 4, 서열번호 27, 서열번호 35 소음
5 서열번호 27, 서열번호 29, 서열번호 35 소음
6 서열번호 2, 서열번호 39, 서열번호 45 소음
7 서열번호 22, 서열번호 34, 서열번호 42 소음
8 서열번호 10, 서열번호 13, 서열번호 41 소음
9 서열번호 8, 서열번호 22, 서열번호 42 소음
10 서열번호 2, 서열번호 7, 서열번호 47 소음
11 서열번호 6, 서열번호 12, 서열번호 20 소음
12 서열번호 10, 서열번호 15, 서열번호 25 소음
13 서열번호 10, 서열번호 13, 서열번호 43 소음
14 서열번호 2, 서열번호 11, 서열번호 39 소음
15 서열번호 9, 서열번호 22, 서열번호 42 소음
16 서열번호 27, 서열번호 30, 서열번호 44 소음
17 서열번호 14, 서열번호 27, 서열번호 44 소음
18 서열번호 10, 서열번호 13, 서열번호 34 소음
19 서열번호 18, 서열번호 22, 서열번호 34 소음
20 서열번호 19, 서열번호 22, 서열번호 34 소음
21 서열번호 6, 서열번호 20, 서열번호 18 소음
22 서열번호 6, 서열번호 20, 서열번호 19 소음
23 서열번호 22, 서열번호 34, 서열번호 36 소음
24 서열번호 3, 서열번호 10, 서열번호 13 소음
25 서열번호 28, 서열번호 31, 서열번호 34 소음
26 서열번호 19, 서열번호 37, 서열번호 48 소음
27 서열번호 38, 서열번호 39, 서열번호 40 소음
28 서열번호 18, 서열번호 37, 서열번호 48 소음
29 서열번호 5, 서열번호 39, 서열번호 40 소음
30 서열번호 28, 서열번호 34, 서열번호 46 소음
31 서열번호 23, 서열번호 24, 서열번호 26 소음
32 서열번호 1, 서열번호 34, 서열번호 48 소음
33 서열번호 16, 서열번호 22, 서열번호 34 소음
34 서열번호 16, 서열번호 24, 서열번호 26 소음
35 서열번호 61, 서열번호 62, 서열번호 76 소양
36 서열번호 61, 서열번호 63, 서열번호 76 소양
37 서열번호 54, 서열번호 64, 서열번호 67 소양
38 서열번호 64, 서열번호 67, 서열번호 70 소양
39 서열번호 64, 서열번호 67, 서열번호 82 소양
40 서열번호 51, 서열번호 65, 서열번호 79 소양
41 서열번호 65, 서열번호 79, 서열번호 85 소양
42 서열번호 65, 서열번호 66, 서열번호 79 소양
43 서열번호 65, 서열번호 79, 서열번호 80 소양
44 서열번호 59, 서열번호 65, 서열번호 79 소양
45 서열번호 54, 서열번호 71, 서열번호 78 소양
46 서열번호 70, 서열번호 71, 서열번호 78 소양
47 서열번호 71, 서열번호 78, 서열번호 82 소양
48 서열번호 69, 서열번호 79, 서열번호 85 소양
49 서열번호 66, 서열번호 69, 서열번호 79 소양
50 서열번호 51, 서열번호 69, 서열번호 79 소양
51 서열번호 69, 서열번호 79, 서열번호 80 소양
52 서열번호 50, 서열번호 54, 서열번호 78 소양
53 서열번호 50, 서열번호 70, 서열번호 78 소양
54 서열번호 54, 서열번호 57, 서열번호 78 소양
55 서열번호 57, 서열번호 70, 서열번호 78 소양
56 서열번호 59, 서열번호 69, 서열번호 79 소양
57 서열번호 50, 서열번호 78, 서열번호 82 소양
58 서열번호 57, 서열번호 78, 서열번호 82 소양
59 서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 56 소양
60 서열번호 79, 서열번호 75, 서열번호 80 소양
61 서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 55 소양
62 서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 60 소양
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65 서열번호 51, 서열번호 74, 서열번호 79 소양
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69 서열번호 70, 서열번호 78, 서열번호 84 소양
70 서열번호 78, 서열번호 82, 서열번호 84 소양
71 서열번호 52, 서열번호 68, 서열번호 81 소양
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73 서열번호 91, 서열번호 95, 서열번호 100 태음
74 서열번호 117, 서열번호 120, 서열번호 122 태음
75 서열번호 91, 서열번호 98, 서열번호 103 태음
76 서열번호 91, 서열번호 103, 서열번호 107 태음
77 서열번호 89, 서열번호 94, 서열번호 101 태음
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80 서열번호 111, 서열번호 118, 서열번호 122 태음
81 서열번호 104, 서열번호 111, 서열번호 113 태음
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101 서열번호 107, 서열번호 99, 서열번호 104 태음
102 서열번호 107, 서열번호 99, 서열번호 114 태음
103 서열번호 107, 서열번호 99, 서열번호 115 태음
104 서열번호 114, 서열번호 98, 서열번호 99 태음
105 서열번호 115, 서열번호 98, 서열번호 99 태음
106 서열번호 111, 서열번호 112, 서열번호 122 태음
107 서열번호 90, 서열번호 102, 서열번호 103 태음
108 서열번호 108, 서열번호 110, 서열번호 120 태음
상기 '진단 체질'은 소음, 소양, 태음 중의 한 체질로, '다중 SNP'의 유전형을 이용하여 진단할 수 있는 체질이다.
본 발명에 따른 사상체질 진단용 다중 SNP에 있어서, 상기 선택된 폴리뉴클레오티드들의 각 SNP 위치(각 서열의 101번째) 염기의 대립 유전자형은 표 5에 나타낸 대립 유전자형이 바람직하다.
번호 다중 SNP 대립 유전자형 진단체질
1 (서열번호 17, 서열번호 32, 서열번호 41) (AA, AA, AG) 소음
2 (서열번호 21, 서열번호 22, 서열번호 34) (GG, GG, AA) 소음
3 (서열번호 17, 서열번호 33, 서열번호 41) (AA, AA, AG) 소음
4 (서열번호 4, 서열번호 27, 서열번호 35) (AA, CC, CC) 소음
5 (서열번호 27, 서열번호 29, 서열번호 35) (CC, AA, CC) 소음
6 (서열번호 2, 서열번호 39, 서열번호 45) (CC, TT, AA) 소음
7 (서열번호 22, 서열번호 34, 서열번호 42) (GG, AA, GG) 소음
8 (서열번호 10, 서열번호 13, 서열번호 41) (GG, AA, AG) 소음
9 (서열번호 8, 서열번호 22, 서열번호 42) (CC, GG, GG) 소음
10 (서열번호 2, 서열번호 7, 서열번호 47) (CC, TT, GG) 소음
11 (서열번호 6, 서열번호 12, 서열번호 20) (GG, AA, AA) 소음
12 (서열번호 10, 서열번호 15, 서열번호 25) (GG, AA, TT) 소음
13 (서열번호 10, 서열번호 13, 서열번호 43) (GG, AA, CT) 소음
14 (서열번호 2, 서열번호 11, 서열번호 39) (CC, TT, TT) 소음
15 (서열번호 9, 서열번호 22, 서열번호 42) (TT, GG, GG) 소음
16 (서열번호 27, 서열번호 30, 서열번호 44) (CC, CC, CC) 소음
17 (서열번호 14, 서열번호 27, 서열번호 44) (CC, CC, CC) 소음
18 (서열번호 10, 서열번호 13, 서열번호 34) (GG, AA, AA) 소음
19 (서열번호 18, 서열번호 22, 서열번호 34) (AA, GG, AA) 소음
20 (서열번호 19, 서열번호 22, 서열번호 34) (CC, GG, AA) 소음
21 (서열번호 6, 서열번호 20, 서열번호 18) (GG, AA, AA) 소음
22 (서열번호 6, 서열번호 20, 서열번호 19) (GG, AA, CC) 소음
23 (서열번호 22, 서열번호 34, 서열번호 36) (GG, AA, CC) 소음
24 (서열번호 3, 서열번호 10, 서열번호 13) (AG, GG, AA) 소음
25 (서열번호 28, 서열번호 31, 서열번호 34) (AA, AA, AA) 소음
26 (서열번호 19, 서열번호 37, 서열번호 48) (CC, CC, GG) 소음
27 (서열번호 38, 서열번호 39, 서열번호 40) (GG, TT, AG) 소음
28 (서열번호 18, 서열번호 37, 서열번호 48) (AA, CC, GG) 소음
29 (서열번호 5, 서열번호 39, 서열번호 40) (GG, TT, AG) 소음
30 (서열번호 28, 서열번호 34, 서열번호 46) (AA, AA, GG) 소음
31 (서열번호 23, 서열번호 24, 서열번호 26) (CC, AA, CC) 소음
32 (서열번호 1, 서열번호 34, 서열번호 48) (TT, AA, GG) 소음
33 (서열번호 16, 서열번호 22, 서열번호 34) (GG, GG, AA) 소음
34 (서열번호 16, 서열번호 24, 서열번호 26) (GG, AA, CC) 소음
35 (서열번호 61, 서열번호 62, 서열번호 76) (AT, CC, CC) 소양
36 (서열번호 61, 서열번호 63, 서열번호 76) (AT, GG, CC) 소양
37 (서열번호 54, 서열번호 64, 서열번호 67) (TT, GG, CT) 소양
38 (서열번호 64, 서열번호 67, 서열번호 70) (GG, CT, GG) 소양
39 (서열번호 64, 서열번호 67, 서열번호 82) (GG, CT, TT) 소양
40 (서열번호 51, 서열번호 65, 서열번호 79) (TT, AA, AA) 소양
41 (서열번호 65, 서열번호 79, 서열번호 85) (AA, AA, TT) 소양
42 (서열번호 65, 서열번호 66, 서열번호 79) (AA, TT, AA) 소양
43 (서열번호 65, 서열번호 79, 서열번호 80) (AA, AA, TT) 소양
44 (서열번호 59, 서열번호 65, 서열번호 79) (GG, AA, AA) 소양
45 (서열번호 54, 서열번호 71, 서열번호 78) (TT, GG, AG) 소양
46 (서열번호 70, 서열번호 71, 서열번호 78) (GG, GG, AG) 소양
47 (서열번호 71, 서열번호 78, 서열번호 82) (GG, AG, TT) 소양
48 (서열번호 69, 서열번호 79, 서열번호 85) (TT, AA, TT) 소양
49 (서열번호 66, 서열번호 69, 서열번호 79) (TT, TT, AA) 소양
50 (서열번호 51, 서열번호 69, 서열번호 79) (TT, TT, AA) 소양
51 (서열번호 69, 서열번호 79, 서열번호 80) (TT, AA, TT) 소양
52 (서열번호 50, 서열번호 54, 서열번호 78) (AA, TT, AG) 소양
53 (서열번호 50, 서열번호 70, 서열번호 78) (AA, GG, AG) 소양
54 (서열번호 54, 서열번호 57, 서열번호 78) (TT, GG, AG) 소양
55 (서열번호 57, 서열번호 70, 서열번호 78) (GG, GG, AG) 소양
56 (서열번호 59, 서열번호 69, 서열번호 79) (GG, TT, AA) 소양
57 (서열번호 50, 서열번호 78, 서열번호 82) (AA, AG, TT) 소양
58 (서열번호 57, 서열번호 78, 서열번호 82) (GG, AG, TT) 소양
59 (서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 56) (AA, TT, TT) 소양
60 (서열번호 79, 서열번호 75, 서열번호 80) (AA, AA, TT) 소양
61 (서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 55) (AA, TT, GG) 소양
62 (서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 60) (AA, TT, CC) 소양
63 (서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 72) (AA, TT, CC) 소양
64 (서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 86) (AA, TT, CC) 소양
65 (서열번호 51, 서열번호 74, 서열번호 79) (TT, GG, AA) 소양
66 (서열번호 53, 서열번호 77, 서열번호 83) (AG, CC, CC) 소양
67 (서열번호 49, 서열번호 73, 서열번호 83) (AA, AA, TT) 소양
68 (서열번호 54, 서열번호 78, 서열번호 84) (TT, AG, AA) 소양
69 (서열번호 70, 서열번호 78, 서열번호 84) (GG, AG, AA) 소양
70 (서열번호 78, 서열번호 82, 서열번호 84) (AG, TT, AA) 소양
71 (서열번호 52, 서열번호 68, 서열번호 81) (TT, CT, CC) 소양
72 (서열번호 58, 서열번호 73, 서열번호 83) (CG, AA, TT) 소양
73 (서열번호 91, 서열번호 95, 서열번호 100) (TT, CT, CG) 태음
74 (서열번호 117, 서열번호 120, 서열번호 122) (AG, CC, GG) 태음
75 (서열번호 91, 서열번호 98, 서열번호 103) (TT, AT, AA) 태음
76 (서열번호 91, 서열번호 103, 서열번호 107) (TT, AA, AG) 태음
77 (서열번호 89, 서열번호 94, 서열번호 101) (AG, AG, AA) 태음
78 (서열번호 91, 서열번호 103, 서열번호 116) (TT, AA, AC) 태음
79 (서열번호 91, 서열번호 103, 서열번호 119) (TT, AA, AT) 태음
80 (서열번호 111, 서열번호 118, 서열번호 122) (CC, AG, GG) 태음
81 (서열번호 104, 서열번호 111, 서열번호 113) (GG, CC, AA) 태음
82 (서열번호 111, 서열번호 113, 서열번호 114) (CC, AA, TT) 태음
83 (서열번호 111, 서열번호 113, 서열번호 115) (CC, AA, CC) 태음
84 (서열번호 105, 서열번호 113, 서열번호 123) (AG, AA, AG) 태음
85 (서열번호 88, 서열번호 104, 서열번호 124) (TT, GG, AG) 태음
86 (서열번호 88, 서열번호 114, 서열번호 124) (TT, TT, AG) 태음
87 (서열번호 88, 서열번호 115, 서열번호 124) (TT, CC, AG) 태음
88 (서열번호 93, 서열번호 104, 서열번호 124) (CC, GG, AG) 태음
89 (서열번호 93, 서열번호 114, 서열번호 124) (CC, TT, AG) 태음
90 (서열번호 93, 서열번호 115, 서열번호 124) (CC, CC, AG) 태음
91 (서열번호 94, 서열번호 103, 서열번호 106) (AG, AA, CC) 태음
92 (서열번호 109, 서열번호 110, 서열번호 121) (CT, CC, TT) 태음
93 (서열번호 87, 서열번호 99, 서열번호 104) (AG, AA, GG) 태음
94 (서열번호 87, 서열번호 99, 서열번호 114) (AG, AA, TT) 태음
95 (서열번호 87, 서열번호 99, 서열번호 115) (AG, AA, CC) 태음
96 (서열번호 92, 서열번호 111, 서열번호 118) (CC, CC, AG) 태음
97 (서열번호 96, 서열번호 109, 서열번호 121) (CC, CT, TT) 태음
98 (서열번호 97, 서열번호 104, 서열번호 124) (CC, GG, AG) 태음
99 (서열번호 97, 서열번호 114, 서열번호 124) (CC, TT, AG) 태음
100 (서열번호 97, 서열번호 115, 서열번호 124) (CC, CC, AG) 태음
101 (서열번호 107, 서열번호 99, 서열번호 104) (AG, AA, GG) 태음
102 (서열번호 107, 서열번호 99, 서열번호 114) (AG, AA, TT) 태음
103 (서열번호 107, 서열번호 99, 서열번호 115) (AG, AA, CC) 태음
104 (서열번호 114, 서열번호 98, 서열번호 99) (TT, AT, AA) 태음
105 (서열번호 115, 서열번호 98, 서열번호 99) (CC, AT, AA) 태음
106 (서열번호 111, 서열번호 112, 서열번호 122) (CC, CT, GG) 태음
107 (서열번호 90, 서열번호 102, 서열번호 103) (AA, GG, AA) 태음
108 (서열번호 108, 서열번호 110, 서열번호 120) (GT, CC, CG) 태음
상기 용어, '다중 SNP 컬럼'은 선택된 3개의 단일 SNP의 조합을 나타내는 것이고, '대립 유전자형 컬럼'은 동일한 순서의 각 단일 SNP의 SNP 위치에서의 대립 유전자형을 나타낸 것을 의미한다. 예를 들어, 상기 [표 5]의 다중 SNP 1번에 있어서, rs7761051의 유전자형은 AA이고, rs17517219의 유전자형은 AA이며, rs6487998의 유전자형은 AG이다.
상기 용어, '사상체질'은 소양, 소음, 태양 및 태음을 의미하며, 본 발명이 제공하는 체질의 진단 대상은 소양, 소음 및 태음의 3 체질인 것이 바람직하나 이에 한정되지 않는다. 태양인 체질은 한국인에 있어서 그 빈도가 매우 낮기 때문이다.
본 발명자들은, 상기 각 단일 SNP들로부터 소양, 소음 및 태음의 각 체질에 연관성이 매우 큰 단일 SNP들의 조합, 즉 다중 SNP를 개발하기 위하여 일련의 선별 과정을 거쳤다. 소양, 소음 및 태음의 각 체질집단에 해당하는 피검자들의 혈액으로부터 DNA를 분리 및 증폭하고, 상기 DNA 중 SNP 위치의 서열을 분석한 다음, 소양, 소음, 태음의 각 체질 집단에서만 특이적으로 나타나고 그 외 집단에서는 거의 나타나지 않는 SNP의 특정 조합 및 그들의 유전자형을 확인하였다. 본 발명의 실시예에서 확인된 각 체질별 SNP 조합 및 그들의 대립 유전자형은 각각 상기 [표 4] 및 [표 5]에 나타내었으며, 각 다중 SNP의 특성에 관하여는 하기 [표 6]에 나타내었다.
번호 진단체질 출현빈도 오즈비 95% 신뢰 구간 유의 확률 자유도
진단 체질군 타체질군
1 소음 10 0 75.06 4.34 1299.54 5.20E-09 24
2 소음 13 0 114.8 6.72 1959.91 4.59E-08 22
3 소음 10 0 75.26 4.35 1303.15 8.99E-08 24
4 소음 11 0 83.43 4.85 1435.47 1.05E-07 23
5 소음 11 0 83.49 4.85 1436.27 1.63E-07 23
6 소음 10 0 75.2 4.34 1302.26 1.65E-07 26
7 소음 11 0 91.83 5.33 1581.61 1.95E-07 25
8 소음 11 0 82.43 4.79 1417.94 2.64E-07 23
9 소음 10 0 75.68 4.37 1310.67 3.20E-07 25
10 소음 10 0 75.2 4.34 1302.26 3.51E-07 26
11 소음 13 0 106.6 6.25 1818.56 3.86E-07 25
12 소음 11 0 81.4 4.73 1400.06 4.84E-07 24
13 소음 10 0 79.72 4.6 1381.03 6.09E-07 22
14 소음 10 0 74.13 4.28 1283.83 6.87E-07 26
15 소음 12 0 89.62 5.24 1533.75 1.01E-06 24
16 소음 11 0 85.11 4.95 1464.46 1.05E-06 26
17 소음 11 0 85.65 4.98 1474.09 1.41E-06 26
18 소음 11 0 93.5 5.43 1610.66 1.82E-06 25
19 소음 10 0 82.29 4.75 1425.8 2.35E-06 26
20 소음 10 0 82.29 4.75 1425.8 2.41E-06 26
21 소음 10 0 74 4.28 1280.61 2.57E-06 26
22 소음 10 0 74 4.28 1280.61 2.88E-06 26
23 소음 10 0 82.29 4.75 1425.8 2.91E-06 26
24 소음 10 0 74.68 4.32 1292.59 4.06E-06 26
25 소음 9 0 77.26 4.42 1349.89 4.47E-06 26
26 소음 10 0 76.32 4.41 1321.33 5.35E-06 22
27 소음 12 0 89.32 5.22 1528.57 5.88E-06 25
28 소음 10 0 76.32 4.41 1321.33 5.96E-06 22
29 소음 12 0 89.32 5.22 1528.57 6.03E-06 25
30 소음 9 0 75.49 4.32 1318.55 6.31E-06 26
31 소음 11 0 78.66 4.57 1354.4 7.91E-06 25
32 소음 9 0 75.71 4.34 1322.03 9.02E-06 24
33 소음 10 0 82.29 4.75 1425.8 9.14E-06 26
34 소음 11 0 78.66 4.57 1354.4 9.45E-06 25
35 소양 12 0 57.6 3.37 983.65 2.52E-08 21
36 소양 12 0 57.6 3.37 983.65 2.52E-08 21
37 소양 13 0 61.93 3.64 1052.99 3.93E-08 26
38 소양 13 0 61.93 3.64 1052.99 3.93E-08 26
39 소양 13 0 61.45 3.61 1044.97 5.08E-08 26
40 소양 14 0 67.82 4 1148.88 1.19E-07 23
41 소양 13 0 62.4 3.67 1061 1.47E-07 22
42 소양 13 0 62.26 3.66 1058.66 1.79E-07 23
43 소양 13 0 62.5 3.68 1062.71 1.88E-07 23
44 소양 13 0 61.93 3.64 1052.99 3.21E-07 23
45 소양 16 0 78.46 4.66 1321.69 4.14E-07 25
46 소양 16 0 78.46 4.66 1321.69 4.14E-07 25
47 소양 16 0 77.85 4.62 1311.35 4.67E-07 25
48 소양 12 0 58.44 3.42 998.19 8.84E-07 22
49 소양 12 0 58.32 3.41 996.12 1.02E-06 23
50 소양 12 0 58.44 3.42 998.19 1.35E-06 23
51 소양 12 0 58.54 3.43 999.94 1.36E-06 23
52 소양 16 0 78.95 4.69 1329.61 1.45E-06 25
53 소양 16 0 78.95 4.69 1329.61 1.45E-06 25
54 소양 16 0 78.95 4.69 1329.61 1.45E-06 25
55 소양 16 0 78.95 4.69 1329.61 1.45E-06 25
56 소양 12 0 58 3.4 990.62 1.51E-06 23
57 소양 16 0 78.36 4.65 1319.56 1.53E-06 25
58 소양 16 0 78.36 4.65 1319.56 1.53E-06 25
59 소양 12 0 57.16 3.35 976.22 1.99E-06 23
60 소양 12 0 57.16 3.35 976.22 2.19E-06 23
61 소양 12 0 57.16 3.35 976.22 2.19E-06 23
62 소양 12 0 57.16 3.35 976.22 2.19E-06 23
63 소양 12 0 57.16 3.35 976.22 2.19E-06 23
64 소양 12 0 57.16 3.35 976.22 2.19E-06 23
65 소양 12 0 57.47 3.36 981.48 2.53E-06 25
66 소양 12 0 57.6 3.37 983.65 2.63E-06 26
67 소양 12 0 57.42 3.36 980.83 2.98E-06 25
68 소양 17 0 84.68 5.04 1422.56 3.30E-06 25
69 소양 17 0 84.68 5.04 1422.56 3.30E-06 25
70 소양 17 0 84.04 5 1411.81 3.89E-06 25
71 소양 19 0 96.46 5.77 1613.87 4.29E-06 23
72 소양 12 0 57.96 3.39 990.15 8.93E-06 26
73 태음 15 0 39.94 2.37 673.55 6.89E-07 26
74 태음 16 0 43.62 2.59 733.5 8.81E-07 23
75 태음 15 0 40.77 2.42 687.58 9.66E-07 25
76 태음 15 0 40.77 2.42 687.58 9.66E-07 25
77 태음 20 0 55.07 3.3 919.19 1.08E-06 26
78 태음 15 0 40.84 2.42 688.78 1.73E-06 25
79 태음 15 0 41.25 2.45 695.8 1.97E-06 25
80 태음 16 0 43.62 2.59 733.5 2.41E-06 23
81 태음 15 0 40.63 2.41 685.22 3.12E-06 25
82 태음 15 0 40.63 2.41 685.22 3.12E-06 25
83 태음 15 0 40.63 2.41 685.22 3.12E-06 25
84 태음 29 1 42.29 5.7 313.98 4.99E-06 24
85 태음 16 0 43.21 2.57 726.67 5.24E-06 25
86 태음 16 0 43.21 2.57 726.67 5.24E-06 25
87 태음 16 0 43.21 2.57 726.67 5.24E-06 25
88 태음 16 0 43.21 2.57 726.67 5.24E-06 25
89 태음 16 0 43.21 2.57 726.67 5.24E-06 25
90 태음 16 0 43.21 2.57 726.67 5.24E-06 25
91 태음 23 0 65.81 3.96 1093.45 5.30E-06 23
92 태음 17 0 46.58 2.78 781.53 5.80E-06 26
93 태음 14 0 40.55 2.4 686.38 6.36E-06 24
94 태음 14 0 40.55 2.4 686.38 6.36E-06 24
95 태음 14 0 40.55 2.4 686.38 6.36E-06 24
96 태음 16 0 43.62 2.59 733.5 7.48E-06 23
97 태음 17 0 46.58 2.78 781.53 8.05E-06 26
98 태음 16 0 43.21 2.57 726.67 8.50E-06 25
99 태음 16 0 43.21 2.57 726.67 8.50E-06 25
100 태음 16 0 43.21 2.57 726.67 8.50E-06 25
101 태음 14 0 39.92 2.36 675.59 8.56E-06 24
102 태음 14 0 39.92 2.36 675.59 8.56E-06 24
103 태음 14 0 39.92 2.36 675.59 8.56E-06 24
104 태음 14 0 39.92 2.36 675.59 8.56E-06 24
105 태음 14 0 39.92 2.36 675.59 8.56E-06 24
106 태음 17 0 46.64 2.78 782.4 9.25E-06 23
107 태음 16 0 43.56 2.59 732.62 9.60E-06 25
108 태음 15 0 40.63 2.41 685.22 9.73E-06 26
상기 [표 6]에 있어서, 용어 '번호'는 다중 SNP의 번호를 나타내는 것으로, 상기 [표 4]에 기재되어 있는 번호와 동일하다.
상기 용어 '진단체질'은 사상 체질 중 본 발명에서 다루는 소음, 소양 및 태음 중 하나로서, 상기 '번호'에 해당하는 다중 SNP를 이용하여 체질을 판별하고자 하는 체질을 의미한다.
상기 용어 '출현빈도'는 '관심 체질군'과 '타 체질군' 내에서 해당 다중 SNP를 갖는 것으로 판명된 관심 체질인과 타 체질인 수를 의미한다.
상기 용어 '오즈비(odds ratio)'는 관심 체질군 중에서 해당 다중 SNP를 가질 확률에 대한 타 체질군 중에서 해당 다중 SNP를 가질 확률의 비율을 의미한다. 즉, 오즈비는 ad/bc로서, 상기 식에서 a는 상기 [표 6]의 1번 다중 SNP의 유전형의 소음인군의 출현 빈도를 나타내고, c는 타 체질군, 즉, 소양, 태음인군의 출현 빈도를 나타낸다. 그리고, b = [(총 소음인 수)-a]이고, d = [(총 타 체질인 수)-c]이다. 시험된 소음인, 소양인, 태음인 군이 각각 91명, 123명 및 173명이므로 결국 b = [91-a]이고, d = [296-c]이다.
상기 오즈비가 1을 초과하는 경우 해당 다중 SNP가 진단체질과 연관성이 있음을 의미하는 것이다. 오즈비가 클수록 상기 연관성도 증가한다. 상기 [표 6]에 나타난 바와 같이, 본 발명에 따른 다중 SNP 1 내지 108은 39.9 내지 114.8의 오즈비를 갖는다. 이 수치는 1 보다 훨씬 큰 수치이므로, 본 발명에 따른 다중 SNP 1 내지 34는 소음　체질，다중 SNP 35 내지 72은 소양　체질，다중 SNP 73 내지 108은 태음　체질과　큰 연관성이 있음을 알 수 있다.
상기 용어 '95% 신뢰구간'은 해당 오즈비가 존재할 확률이 95%인 구간을 의미하는 것으로서, 하기 [수학식 2]와 같이 계산된다. 신뢰구간이 1을 포함하는 경우, 즉 신뢰구간의 하계가 1 이하이고 상계가 1 이상인 경우에는 각　진단체질과의 연관성이 유의하다고 판단할 수 없다.
Figure 112009028925065-pat00002
(여기서, V = 1/a + 1/b + 1/c + 1/d )
상기 용어 '유의확률'은 각 다중 SNP의 유전형 분포가 관심　체질군과　타 체질군 사이에서 차이가 없다는 귀무가설 하에서 계산한, 각 다중 SNP의 유전형 빈도가 측정결과와 같이 얻어질 확률을 의미한다.
상기 용어 '자유도'는 상기 '유의확률'을 계산하기 위하여 사용된 카이제곱 분포의 자유도를 의미한다. 즉, 유의확률이 낮을수록 측정에서 얻어진 다중 SNP의 유전형 빈도가 관심　체질군과 타 체질군에서 다르게 나타남을 의미한다.
본 발명의 사상체질 진단용 다중 SNP는 상기 다중 SNP 각각으로 구성될 수 있고, 더욱 바람직하게는 2개 이상의 다중 SNP로 구성될 수 있으며, 가장 바람직하 게는 상기 다중 SNP 1 내지 108개 전부로 구성될 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명의 사상체질　진단용 다중 SNP를 구성하는 각 단일 SNP의 폴리뉴클레오티드는 10개 이상의 연속 염기인 것이 바람직하고, 10 내지 100개의 연속 염기인 것이 더욱 바람직하나 이에 한정되지 않는다.
또한, 본 발명은 상기 SNP의 폴리뉴클레오티드, 그의 상보적 폴리뉴클레오티드, 그들과 혼성화하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그에 의해 코딩되는 폴리펩티드를 포함하는 사상체질 진단용 마이크로어레이를 제공한다.
상기 SNP의 폴리뉴클레오티드, 그의 상보적 폴리뉴클레오티드, 그들과 혼성화하는 폴리뉴클레오티드는 10개 이상의 연속 염기인 것이 바람직하고, 10 내지 100개의 연속 염기인 것이 더욱 바람직하나 이에 한정되지 않는다.
상기 사상체질 진단용 마이크로어레이는 서열번호 1 내지 124의 각 다형성 서열 중의 다형성 부위의 염기를 특이적으로 구별할 수 있도록 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드, 그의 상보적 폴리뉴클레오티드, 또는 그들과 혼성화하는 폴리뉴클레오티드, 그에 의해 코딩되는 폴리펩티드 또는 그의 cDNA를 이용하여 프로브로 사용함으로써, 당업자에게 알려져 있는 통상적인 방법에 의해 제조될 수 있다.
상기 폴리뉴클레오티드는 아미노-실란(amino-silane), 폴리-L-라이신(poly-L-lysine) 및 알데히드(aldehyde)로 이루어진 군에서 선택되는 하나의 활성기가 코팅된 기판 상에 고정되는 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 기판은 실리콘 웨이퍼, 유리, 석영, 금속 및 플라스틱으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나를 사용하는 것이 바람직하나 이에 한정되지 않는다.
상기 폴리뉴클레오티드를 기판에 고정화시키는 방법으로는 피에조일렉트릭(piezoelectric) 방식을 이용한 마이크로피펫팅(micropipetting)법, 핀(pin) 형태의 스팟터(spotter)를 이용한 방법 등을 사용하는 것이 바람직하나 이에 한정되지 않는다.
상기 마이크로어레이의 이용과 제작은 당업계에서는 보편화되어 제공되고 있으며, 본 발명의 서열과 같이 프로브 제작을 위한 용도가 밝혀진 변이 부위의 정보를 가진 당업자들은 용이하게 마이크로어레이의 제작과 연구적 사용이 가능할 것이다.
또한, 본 발명은 본 발명의 마이크로어레이를 포함하는 사상체질 진단용 키트를 제공한다.
상기 사상체질 진단용 키트는 당업자에게 알려져 있는 통상적인 방법으로 제조될 수 있으며, 상기 마이크로어레이 이외에 피검체로부터 해당 SNP를 포함하는 DNA를 분리 및 증폭하는데 사용되는 프라이머 세트를 추가로 포함할 수 있다.
상기 적절한 프라이머 세트는 본 발명의 서열을 참조하여 당업자가 용이하게 설계할 수 있다.
본 발명의 다중 SNP를 이용하면 개인의 사상체질을 효과적으로 진단할 수 있다. 구체적으로, 피검체로부터 핵산 시료를 분리하고 서열번호 1 내지 124 중에서 선택되는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드의 각 SNP 위치(각 서열의 101번째) 염기인 다형성 부위의 유전자형을 결정하여 사상체질을 진단할 수 있다.
상기 키트에 추가적으로 형광물질을 포함할 수 있으며, 상기 형광물질은 스트렙아비딘-알칼리 탈인화효소 접합물질(strepavidin-like phosphatease conjugate), 화학형광물질(chemiflurorensce) 및 화학발광물질(chemiluminescent)로 이루어진 군으로부터 선택되는 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니며, 본 발명의 바람직한 실시예에서는 Cy3을 사용하였다.
상기 키트에 추가적으로 반응 시약을 포함시킬 수 있으며, 상기 반응 시약은 혼성화에 사용되는 완충용액, RNA로부터 cDNA를 합성하기 위한 역전사효소, cNTPs 및 rNTP(사전 혼합형 또는 분리 공급형), 형광 염색제의 화학적 유도제와 같은 표식시약, 세척 완충용액 등으로 구성될 수 있으나 이에 한정된 것은 아니며, 당업자에게 알려진 DNA 마이크로어레이 칩의 혼성화 반응에 필요한 반응 시약은 모두 포함시킬 수 있다.
아울러, 본 발명은 본 발명의 다중 SNP를 이용하여 사상체질을 진단하는 방법을 제공한다.
구체적으로,
1) 피검체로부터 핵산 시료를 분리하는 단계;
2) 상기 핵산 시료를 형광물질로 표지하는 단계;
3) 형광물질로 표지된 핵산시료를 본 발명의 마이크로어레이와 혼성화하는 단계;
3) 반응한 마이크로어레이를 분석하여 서열번호 1 내지 124 중에서 선택되는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드의 각 다형성 부위의 유전자형을 결정하는 단계; 및
4) 상기 유전자형을 이용하여 피검체의 사상체질을 결정하는 단계를 포함하는 사상체질 진단하기 위해, 본 발명의 다중 SNP를 검출하는 방법을 제공한다.
상기 방법에 있어서, 피검체로부터 DNA를 분리하는 방법은 당업계에 알려진 통상적인 방법으로 행할 수 있다. 예를 들어, 조직 또는 세포로부터 DNA를 직접적으로 정제하거나 PCR과 같은 증폭 방법을 사용하여 특정한 영역을 특이적으로 증폭하고 이를 분리함으로써 이루어질 수 있다.
상기 방법에 있어서, DNA는 DNA 뿐만 아니라 mRNA로부터 합성되는 cDNA도 포함하는 것이다. 피검체로부터 핵산을 얻는 방법은 PCR 증폭법, 리가제 연쇄 반응(LCR)(Wu 및 Wallace, Genomics 4, 560(1989), Landegren 등, Science 241, 1077(1988)), 전사증폭(transcription amplification)(Kwoh 등, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86, 1173(1989)) 및 자가유지 서열 복제(Guatelli 등, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 1874(1990)) 및 핵산에 근거한 서열 증폭(NASBA)이 사용될 수 있다.
상기 방법에 있어서, 형광물질은 Cy3, Cy5, FITC(poly L-lysine-fluorescein isothiocyanate), RITC(rhodamine-B-isothiocyanate) 및 로다민(rhodamine)으로 이루어진 군으로부터 선택되어지는 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니며, 당업자에게 알려진 형광물질은 모두 사용 가능하다.
상기 방법에 있어서, 분리된 DNA의 염기서열의 결정은 당업계에 알려진 다 양한 방법에 의하여 이루어질 수 있다. 예를 들면, 디데옥시 법에 의하여 직접적인 핵산의 뉴클레오티드 서열의 결정을 통하여 이루어지거나 SNP 위치의 서열을 포함하는 프로브 또는 이에 상보적인 프로브를 상기 DNA와 혼성화시키고 이로부터 얻어지는 혼성화 정도를 측정함으로써 다형성 부위의 뉴클레오티드 서열을 결정하는 방법 등이 이용될 수 있다.
상기 방법에 있어서, 혼성화의 정도는 검출가능한 표지를 표적 DNA에 표지하여, 혼성화된 표적 DNA 만을 특이적으로 검출함으로써 이루어질 수 있으나, 그외 전기적 신호 검출방법 등이 사용될 수 있다. 보다 바람직하게, 상기 피검체로부터 분리한 핵산 시료를 본 발명에 따른 SNP를 포함하는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적 폴리뉴클레오티드, 또는 이와 혼성화하는 폴리뉴클레오티드와 혼성화시킨 후 혼성화 결과를 검출하는 단계를 포함할 수 있다.
상기 방법에 있어서, 사상체질의 진단은 상기 서열번호 1 내지 124 중에서 선택되는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드의 다형성 부위의 유전자형이 상기 [표 5]의 1 내지 108 중 하나 이상인 경우 상기 피검체를 해당 진단체질 군에 속하는 것으로 판정할 수 있다.
이하, 본 발명을 실시예에 의해 상세히 설명한다.
단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐 본 발명을 한정하는 것은 아니다.
<실시예 1> 본 발명의 다중 SNP의 선별
본 발명자들은 한국인 중 3인의 사상체질 전문가들에 의하여 공통적으로 소음인, 소양인, 태음인 또는 태양인으로 판정된 사상 체질 분류자들의 혈액으로부터 DNA를 분리하고, SNP 마이크로어레이를 이용하여 유전형 검사를 수행하였으며, 검사가 수행된 SNP들의 유전형 데이터로부터 3개의 SNP의 조합으로 이루어지는 조합 중에서 환자군에서 특이적으로 나타나는 조합을 통계적으로 분석하여 사상체질 중 태양인을 제외한, 소음인, 소양인 또는 태음인 체질을 진단할 수 있는 다중 SNP를 선별하였다.
<1-1> DNA 시료의 준비
한국한의학연구원내의 체질유전자은행으로부터 사상체질이 분류된 소음인 91명, 소양인 123명, 태음인 173명, 태양인 3명의 혈액으로부터 추출한 genomic DNA를 분양받아 사용하였다. 염색체 DNA 추출은 공지의 추출 방법(Molecular cloning: A Laboratory Manual, p392, Sambrook, Fritsch and Maniatis, 2nd edition, Cold Sping Harbor Press, 1989)과 상업용 키트(Gentra system, D-50K)(Gentra Inc., USA)의 설명서에 따라 이루어졌다. 추출된 DNA 중 순도 기준이 UV 측정비율(260/280 nm)로 최소 1.7 이상 되는 것만을 선별하여 사용하였다.
<1-2> SNP의 유전형(genotype) 분석
SNP의 유전자형 검사는 약 50만개의 프로브가 고정된 마이크로어레이 (GeneChip Human Mapping 500K Array Set 및 5.0 Set, 및 GeneChip Fluidics Station 450 시스템)(Affymetrix, USA)를 이용하여 수행하였다.
<1-3> 다중 SNP의 선별
상기 실시예 <1-2>에서 분석한 91명의 소음인, 123명의 소양인, 및 173명의 태음인에 대하여 수행한 마이크로어레이를 이용한 유전형 검사결과를 기초로 하여, 각 체질 별로 자주 발견되는 SNP의 조합, 즉 다중 SNP를 선별하였다.
먼저, 상기 마이크로어레이를 이용한 유전형 검사로부터 387명에 대한 440,974개의 SNP에 대한 유전형 데이터를 얻었다. 단일 SNP 마커를 사용하는 것보다 다중 SNP 마커를 사용하는 것이 표현형에 대한 판별력이 증가하므로 본 발명에서는 3개의 SNP가 조합된 다중 SNP 마커를 사용하고자 하였으며, 이 경우 440,974개의 SNP의 조합으로부터 얻어지는 3중 SNP 마커의 가짓수는 8.6 × 1016 가지에 해당하므로 주어진 전산자원과 기간으로는 분석이 용이하지 않았다. 따라서, 일차적으로 단일 SNP에 대한 연관분석(association study)을 통하여 사상체질과 통계적으로 유의하게 연관된 SNP들을 선별하여 SNP의 개수를 줄이고, 축소된 SNP 집단 내에서의 다중 SNP 마커 조합에 대하여 사상체질과의 연관성을 심도있게 분석하는 2단계의 과정을 수행하였다. 일차로, 연관분석 프로그램인 plink(Shaun Purcell외, http://pngu.mgh.harvard.edu/~purcell/plink/)를 이용하여 사상체질에 연관된 SNP 들을 분석하였다. 전처리 단계에서 하디-와인버그 평형 검사(Hardy-Weinberg equilibrium test)에서 26,133개의 SNP가 제외되었고(유의확률 ≤ 0.0001), 결측치를 10% 이상 포함하고 있는 8,202개의 SNP가 제외되었으며, maf(minor allele frequency)가 5% 미만인 125,743개의 SNP를 제외하여 총 305,803개의 SNP를 대상으로 연관분석을 수행하였다. 그 결과로부터 일차적으로 소음, 소양 또는 태음인을 각각 진단 체질로하는 유의확률이 0.005 보다 작은 사상체질 연관 SNP를 소음인 873개, 소양인 796개, 및 태음인 805개를 각각 선별하였다. 선별된 사상체질 연관 SNP들로부터 3개의 SNP 조합으로 얻어지는 다중 마커의 수는 연관 SNP수가 가장 많은 소음인의 경우 약 1.1×108 가지이며, 이는 일반적인 전산자원과 처리기간을 이용하여 처리할 수 있는 양으로 판단되었다. 각 진단 체질별로 선정한 사상체질 연관 SNP들로부터 3개씩의 SNP 조합으로 얻어지는 다중 SNP 마커에 대하여, 소음, 소양 또는 태음인군을 각각 진단체질군으로 하고, 그 외 체질을 타체질군으로 하여 진단체질군과 타체질군 사이의 유전형 데이터 빈도에 대한 오즈비(odds ratio)와 그에 대한 95% 신뢰구간을 분석하여 다중 마커의 위험요인 정도를 평가하였으며, 카이제곱 검정(chi-square test)을 통하여 그에 대한 통계적 유의성을 평가하였다.
이때, 오즈비는 어느 한 유전자형을 갖거나 갖지 않는 관심 체질인 및 타 체질인의 수가 각각 하기 [표 7]과 같은 경우에 오즈비 = ad/bc로 나타낸다(오즈비가 1을 초과하는 경우 상기 유전자형은 진단체질과 깊이 연관 되어 있음을 의미한다).
특정 다중 SNP 유전자형을 갖는 수 특정 다중 SNP 유전자형을 갖지 않는 수
진단체질군 빈도 a b
타체질군 빈도 c d
각 진단 체질별로 선별된 사상체질 연관 SNP들의 조합으로 얻어진 소음인 약 1.1× 108 개, 소양인 약 8.4× 107 개, 태음인 약 8.7× 107 개의의 다중 SNP에 대해 오즈비와 그에 대한 95% 신뢰구간을 계산하여 하계가 2.0 이상인 것을 선별하고, 카이제곱검정에 의한 유의확률이 10-5보다 작은 다중 SNP 마커 108개를 최종 선별하였다. 상기 108개의 다중 SNP는 [표 4] 내지 [표 5]에 나타내었다.
<실시예 2> 본 발명의 다중 SNP가 고정된 마이크로어레이의 제작
본 발명자들은 상기 <실시예 1>에서 선별된 다중 SNP를 기판 상에 고정하여 마이크로어레이를 제작하였다. 즉, 상기 [표 1]에 나타낸 각 서열번호로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 각 SNP 위치(각 서열의 101번째) 염기를 포함하는 20개의 연속 염기로 구성되는 폴리뉴클레오티드들(각 SNP는 상기 20개 중 11번째에 위치 함)을 기판상에 고정하였다. 각 SNP 위치에 두 개의 대립형질이 존재하므로 각 서열마다 2개씩의 폴리뉴클레오티드를 기판상에 고정화하였다.
구체적으로, 상기 20개의 연속 염기로 구성되는 각 폴리뉴클레오티드의 N-말단을 아민기로 치환한 다음, 실릴화 슬라이드(Telechem사)에 스팟팅하였으며, 이때 상기 스팟팅 버퍼는 2×SSC(saline-sodium citrate, pH 7.0)를 사용하였다. 스팟팅 후 건조기에 두어 결합을 유도한 다음, 0.2% SDS(sodium dodecyl sulfate) 용액으로 2분간, 3차 증류수로 2분간 각각 세척하여 결합되지 않는 올리고를 제거하였다. 상기 슬라이드를 95℃에서 2분간 처리하여 변성을 유도한 후, 블로킹 용액[1.0g NaBH4, PBS(pH 7.4) 300 mL, EtOH 100 mL]으로 15분간, 0.2% SDS 용액으로 1분간, 3차 증류수로 2분간 각각 세척하고 상온에서 건조시켜 마이크로어레이를 제작하였다.
<실시예 3> 다중 SNP가 고정된 마이크로어레이를 이용한 사상체질 진단
본 발명자들은 사상체질을 진단하고자 하는 대상의 혈액으로부터 표적 DNA를 분리하고, Cy3-dUTP(Metabion 사)로 형광 표지시켰다. UniHyb 혼성화 용액(TeleChem 사) 하에서 상기 <실시예 2>에서 제조된 마이크로어레이와 형광 표지된 표적 DNA의 혼성화를 42℃에서 4시간 동안 수행하였다. 2×SSC로 실온에서 5분간 두 번 세척한 후 공기 중에서 건조시켰다. 건조 후 슬라이드를 스캔어레이 5000(ScanArray 5000; GSI Lumonics 사)으로 스캔하고 스캔 결과를 퀀트어레이(QuantArray)(GSI Lumonics 사)와 ImaGene 소프트웨어(BioDiscover사)로 분석하였다. 그 결과, 상기 대상이 본 발명에 따른 다중 SNP 전부 또는 일부를 갖고 있는지 확인하였으며, 그 대상을 소음인, 소양인 또는 태음인 중 하나의 체질로 판정할 수 있었다.
본 발명에 따른 다중 SNP, 이를 이용한 마이크로어레이, 및 이를 이용한 사상체질 진단용 키트는 유전체 변이를 이용하여 신속하고, 객관적이며, 정확한 사상체질의 진단을 가능하게 함으로써 사상체질 진단 확률 및 유전적 감수성을 보다 정확하게 예측하게 하여 대체의학 관련 산업 개발에 기여할 수 있다.
<110> Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology <120> Multiple SNP markers, microarray and diagnosis method for Sasang constitution <130> 9p-05-06 <160> 124 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1 tggggatcct tacaggccac tcacaatggt aatgagagtc cacatttact gagcactcac 60 tacacaccag ccactcttct caagggcttt ccatgtggaa ytgcaccaaa tccttacaac 120 aaccctctga ggctggggct ggtgctgtat ccattctaca gaggaggaac ctgagacaag 180 gaagggtgag ggcttgccaa g 201 <210> 2 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 2 tggagccaac aaaccttccc tttagcatgg gcctagcgct cccttgccca ctgccagctt 60 tgttactctt agatccttaa tctctgttaa tctgatgact rtaaagcaaa aggttacttt 120 aatttgcatt ttcctggcaa ctggggagag gctgcatctt ttcaggtcat tgtgtgtctt 180 gtttcctctt ctgataattg c 201 <210> 3 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 3 ccaacttcaa attttgaacc tgtttaggga tctgttaatt aaagcagccc ctgcctccca 60 cacatccttc tcctctctgt ttttgttatc tactttcttc ratatggatt agccacttac 120 ttgaattaat ctgtttttca actttcaaaa gttagttaaa tttcccagta ttttggtgtg 180 cctactttgt tttttgacat t 201 <210> 4 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4 ctggtctacg gtatttttgt tatagcagtc tgaactaacg aagacatatg gtactccata 60 ctggtgagaa aggttcttct cagcaagcct cattcttttt ygctttttga aaacctattt 120 ttttcttttt aaaaaaatcc catggcagca tattaatttt tttttctacc tggcagcaga 180 tcagattctt ttgccatggc t 201 <210> 5 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 5 ctttgcttgc aggaagcagt gcaaactgta ttttggaaca caggttcttt ctgacctggg 60 tccttatctt ctgccattta cctcttggaa gacttacgtt stactgacgc tggactactt 120 gacatttcct atccaagttg tgtctccagg cccttatcta tgctgctccc actgcctgga 180 ataccctttc cctctgccat g 201 <210> 6 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 6 actattgtcc cttcctgaag aaggaagtct agtcttcagg taagaggaag gtatattctt 60 aggcagctgc tgggttggaa ggaaggaaca gtgaagtctg ygttttggaa gggaggaggg 120 agtgacattt ttaagttaca agcctcttct gggagagctg gggacagatc tatttttaga 180 tgtgttccct gacacccagg a 201 <210> 7 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 7 tgcctctgcc aggccccacc tgctccactg cctctgttct gttgcagtga agtgctccgt 60 gtgcaagagc gtctcggaca cctacgaccc ctacttggac rtcgcgctgg agatccgggt 120 acagatctgt cctgcccttc acttttgcag taggagagcg aggccagagg gtgaaacaga 180 acccgcagaa cagtaaaggc a 201 <210> 8 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 8 ggactttatc aaagatggct gactagatgc agctgggaag tgctgtcctc acagagagaa 60 accaaaattt tgactacacc aacataattt gaacagatct ktgatgagaa aacaccaaat 120 gtggatgggg aaaagacaca gttgctgagt cggaagaggg ggaaagctgg gaatcccatg 180 tggagtgccc aaatgctgtg g 201 <210> 9 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 9 actatgctgt ttacaaagca ctttcatatg caggatctca tctgtattca gaggctcact 60 ggtgccctag gcagggatga tgttatcctg gagtaacggc rtaacttagt ctgtgaatga 120 cacaggacac attcttggca actctgtagg acagggcatt tggtccagac aggacactca 180 ccgggctaca aggtctagcc c 201 <210> 10 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 10 ccaatgtctg ctccaatatt ttgtaattga catgtatctg agtctaagag attaaaccaa 60 ctggcacacg acccaacagc atctttggtg attaaaagaa sattggttgt tgcctaaata 120 aaacctgggg ccacgttcgc ccccaggagg acccagtgct aatctcaaat cctgagaacc 180 agtcatttgg gctgggcaaa t 201 <210> 11 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 11 caaattcttc tagagataaa tatttttagt gtcttgaaaa tatattgcca aattttcccc 60 taaaacatgt ataagaatgc tcattttacc atacaatcac ygggcttgaa tatccatttt 120 aagtttaacc agccttaatg attccgttgt actttttttt tttttttttt tgagacgggg 180 cctcactctg tcgcctaggc t 201 <210> 12 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 12 tccaagggga aaaactatct taaaaaataa ttttctatgt attataaaga aagctcgggc 60 ctgttcaacc caacaattct gagttttcaa gtcattctat ragcaggtca accagaaatt 120 gcctgaaccc cctcccatag ccaaaaaact attcacccaa ctggcagaaa gcataaccag 180 cagcttgccc atctcttcat g 201 <210> 13 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 13 agggagaatc tacaccagga aaccataggc tcctgaggtt gaatgcaagt tgcgtgtgtt 60 cctatgtgca aagagaagcc atagctatca ttttctgagg ygtccaagac ccacaaaaag 120 ccaaagactg cactacccga gagactgcag caggaatgag tggattaagc cattcagcat 180 gtccagacat acaaaatcac t 201 <210> 14 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 14 catcgtgagc aatgtattta aggcctccca aaacaaaata atattagcat gacgtatatt 60 tggttaagtg tcataagtat cttaaagcac catccctttc maatctcctt tacagaacat 120 cactaagctg acctctgtat tacaaggcta agaataataa gttttaaaga gtgacaattt 180 tagaattttt cacaatggta t 201 <210> 15 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 15 tgccttttat aagttatgga acattaacat gaaatacata tagaatggaa tttggtagct 60 tgcattacat aaatttattt tggcgagtga agcccatagt yctcaaatcc gattcataaa 120 attaaaacct cttattttct tctggagcct ttaagggctt ttgaaaatca cagttaaaag 180 gtccagattc ttatcgttca t 201 <210> 16 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 16 tttcgaaggg aaaatgattt tatagaaagg gatgggtaac ctttatgata aaattgcttt 60 gctagagcgt gttgcttgtg acagcaccac ctttctgttc ytgacaatgt ttgtcttctt 120 aactaaacaa acgttagctg agttgaatga aattatgtac gaaccagaga agtcgggagg 180 atgtttgagg ctcgagcccc c 201 <210> 17 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 17 cctgtttgta gcccagctac aaacagaaga accaccaagc tgacttgtaa actataacat 60 gtgcttcttc atttaaagct tatttaaagt tgttgaactt ygggttggtt tggttcacag 120 aaatagctaa ccaataaaaa tgaataaaaa attctggtat gttcagaaaa tgaaattcaa 180 agatgaaaat gaacacatta t 201 <210> 18 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 18 gaatatggaa aataaaacca cttttggggt tggggtttcc tcaagccatt cttatttact 60 gagtcggttg cctctggaaa cttttagctc atgtaactaa rcatcgttca ctgccctgtt 120 ctttatgcat ctcagtaagt tccacctgca gaatggtgaa attttgaagt ggaaaggacc 180 ttgatcataa attagttcaa t 201 <210> 19 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 19 tatttaagtc atttgcactt gtgtgtgttt gtaagaactt acgtataaaa tgttcctagt 60 agattttaaa aatgatatta ttttaatatg aaattggcta rtgaagttct agagaattaa 120 tgtttacatt ttgacaacca aattccttat gtactttaca tgtgtttact taaaagtctt 180 acaaaataga atttgccctt c 201 <210> 20 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 20 tgataatgtt ctggcaggtg gcagaaaagc atattgcaga agaggtattt tttctgattt 60 gcacaaaggc atcatattgg atagatgcaa ttgtgagttc yttaactgtt tctttttccc 120 attccttttg cgatacctct ctacctttac tcttctagta tttcctggct atgaaattgg 180 ctaagggcag tggtggcaga a 201 <210> 21 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 21 taactgattt tctacttagc atgctgtttt taaggttcat ctatgttcta gcatgtatca 60 atacttcatt ccttttatgg ctgaataatg tttcattgtc yggctatact acattttatt 120 tatctattta tcagttgata gatatctggg ttgtctccac cttttagcaa ttacaaatag 180 tgctgctata aatatttgtg t 201 <210> 22 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 22 gaaattgatt aaatatggct cttttcctaa gcagatgaat aactctatat tgctcgttct 60 gcatgcctat aaaataatac aatgaacaat gttgacttca kaattgagaa catactccca 120 ttttgctagg tataggcaaa agagaaaaca caagctaaaa cctcaatatc aaggtaatgt 180 ttatagcact atattttcac a 201 <210> 23 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 23 ccttacctgg gagccatcta ctctggaaac catggatacc tacacatctg tgcaaaattg 60 acacagtgcc tcagttattt gggtaaggct gaccagtgaa ytctgataaa ttgctgtaac 120 aatgaccacc catctgtcaa tgtgtcacca agcataggct gtatacactg tgcagactgt 180 aaggatccac tgggctttcg g 201 <210> 24 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 24 tttaaaaaaa actttctgtg aggttcttgg agaagaacct atgaatgagt atgaattccc 60 cttgtgtctg tgacccccag ggtttttaga gactcttgtt ygcttataat aaacctttag 120 caattagtta aaaaatttag cttacttttt cttaccattg tccagtagta tctgtttcag 180 gtaagcaagt gcttgtgact c 201 <210> 25 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 25 gaccttttga catatagggc ctagctgtaa tacatttcaa tgttcagtct ccatcccaag 60 gtgaacatgg gtcatatgtt atatacatat tgtttcaata ygcccgtgtc aggactacct 120 tcatgagtat acatagcact tcctgcaacc tattgaatat gtatgtttag ccagccgggt 180 tggcataaag ctcctacccc a 201 <210> 26 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 26 atagatcaaa atagcctggt ttgttacttc ctcaggtagc tagattatgt ctggattcca 60 gattttgttg tctgaaaagt aagcttctca ttgcttaagt stctcttata ggtttctctc 120 atatgtagcc aagtacaatt catgatgata tagtaaataa aacacatgat gttgtcctca 180 gcaaacctac agttttacaa a 201 <210> 27 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 27 ccgcagcccg gtggctcaga cctgcgaagg aaccaaggca agagggagaa aagccctgcc 60 gcctgatccc acgccgccac tcacagaccc ttcgttgacc sgcagcattg aacaggaaaa 120 aaaaaaaaag atgaaaacac agaaaacccc aaaaacccag acggggagac gatgtgggga 180 agagaacgtg ctgggagcct c 201 <210> 28 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 28 tatgattaca ggaggtacct ggagtagtca aatttataga catagaaagg aggatggtgg 60 ttgccagaat gggtagaatg gggagtggtt atttttcatt yttctgagat gaggtctcgc 120 tctgtcaccc agggtggagt atggtggtgt gatcatagct cactgcaact tcaaattcct 180 ggactcaagc aatcctccca c 201 <210> 29 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 29 gtgtacttca gtgggttttt gtagtggctg gtaatgatct ttccctatca tatttagtgc 60 accttttagg acctcctgta aggcaggtct ggtgataatg mattttctca gcatttgctt 120 gtctgaaaag gatttttatt tctctctcac ttatgaagat tggtttggct ggatatgaaa 180 ttcttggttg aaaattattt t 201 <210> 30 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 30 acctttccct tctgttaaca cggcggtaat ttattacata agagatgtta atcctgggga 60 gaaattctaa atactcaggg aataagtaat ggctgggccg yaaatgatga aaatgtgaat 120 gtgttacata gattctgaat tattcctggc attccctggg gagagagaat agaagtaagt 180 tgcaatcagt tgtgatacct 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attaagaaac 60 cttttattac agcacagctg actgcacgaa ccaaaggaga mgcatgagcc agagagacaa 120 ggaaggcttt caaaggaagg gatggtcaag ctgggtttcc aaggatgact aggagctggc 180 caggcagcaa agggcattcc a 201 <210> 35 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 35 acctcctgct gtgtggcccc gttcctaaca ggccacggac cagtaacagt ccaaggccca 60 ggggttggga atcctgcctt aaggcgcaga gcagttacat yatggcactg aagtttatac 120 atcagtttct tgaaagtttc attatcatgt gtctttcccc aggactgacc agctctcagc 180 acaacttttt aagaaaatga a 201 <210> 36 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 36 aatggctaaa tccatgtcaa aatgtgcaga ataatataat cttatactgt ttcacctatc 60 aaattagcaa ataattttaa aagttctatt cctcatagcc rgtgtgcata tgctgagaga 120 agtccttttt tttcctgtgg gaagcttaat tgataggaaa ataattaatt gaaaaataat 180 ttgacagtat gtaccaattt t 201 <210> 37 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 37 ttccaatttc tagacttttc atgaaatatg ggaagggtgt aaccagaagg actactacat 60 ggtaccttta ggccttgact gtcagtaccc ctccatcagc rtgagtcttg ggcagagctg 120 ggcatcagtg aacagacaca gtgaccaggt acctggcctt cctcacccct tgctgccctc 180 tggccctcaa agccttgagc c 201 <210> 38 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 38 tggaacacag gttctttctg acctgggtcc ttatcttctg ccatttacct cttggaagac 60 ttacgttgta ctgacgctgg actacttgac atttcctatc saagttgtgt ctccaggccc 120 ttatctatgc tgctcccact gcctggaata ccctttccct ctgccatgcc caccaggtga 180 atcacagctt atcctttaag a 201 <210> 39 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 39 ctccacttac tggctattct ttggtttctc tcctctcctt gagccttcct atgccctcag 60 atacaacagt attgaaattt gatcaattag taatcctata rtggtctcta agtgttcaac 120 tgaaaggaaa agttgcgcat ctttctttct ttaccgagac agggtctcgc tctgttgccc 180 aggctagaat gcagtggcgc a 201 <210> 40 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 40 tattttgcat gtaagaagga caaaaatttg ggggtgctgg gcagaatgtt aatgagtgaa 60 tatgttctag aaaaagcgca ttgaaggaga gaaaaatgtg ygagaaagag accaatccat 120 ggtgaaaagt cagtggttta cactccagag aagaactaat cagctctgtt tttatatagc 180 ataagtttaa catgctggga a 201 <210> 41 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 41 caccgcacct ggccccctag caggttcttg atagttgctg acaatggagc tagctgggga 60 ttctttcctc cgatggtcat tatgcattat agacaaggtt yctgtgttct cattatgccc 120 ccaaggaaca tgcttcagca aacgtgaaaa atgccagagc catacatttt tttttttttt 180 tttttgagac agggtctccc t 201 <210> 42 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 42 ggtcacaatt gtgcctctgt gcaggcatgc ttgcgcccct agccttctag tgtttatcct 60 tgctgatctt ttgatttctc tcacagaacc ttggatacct ygtttcccat ttcctggtga 120 ggtcaccacc ctctccggtg gtggcgctgg gccctgatct ttgctgtttc tccaccccat 180 gtgttctgtt tcgcttccat t 201 <210> 43 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 43 agacggggtt tctccatgtt ggtccggctt gtctcaaact cccgacctca ggtgatccac 60 ctgccttggc ctcccaataa catccctact ttaggctaca ycatatataa tgagtttagt 120 tggttaatgg ctacccaaat tcaagtagta agcaaagtac ctttatgcct tgagaggcat 180 gaaaacagca gcctccaggc t 201 <210> 44 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 44 gttcccaagc aggaagctgg ggcgtgatta aatggatgcc ggacaaccaa aaaagcaaaa 60 gcccgcttca cagccacatc cagtgtctaa atccacatca 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rgcagcagtg ccatccactc 120 ccatcccttt cttctcttgc cttctctgtt ccttttctat caatgtgctc agcattcctc 180 ctgctcccac taaattggcc a 201 <210> 96 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 96 agtggaagac aagtgttgag acaagccaaa ggttgcgaca aaggcgtaga aaccatccac 60 cttgtcaaat gggctctcat ccttttcaaa gtggagccat kccatgtaga gcagacactg 120 caagcttgat gggaatgagg catatctggc tcaaaagcat gtttatttgt gtgtttttaa 180 aagtgtaaat attgaaccaa c 201 <210> 97 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 97 agggactttt tcactctggg ttagatcatg aaagttaaag tattgggttt gaactgcata 60 aaaaaacaaa caaaatgtgt gtgtcatgat tctagattgt sctaacctat ccagcaagtt 120 caaaactgtg aactattggc taacagacaa gcatgagagt atggctggat aaatgctaga 180 tttatatcat ttgagagaaa a 201 <210> 98 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 98 atattggtac agctttctga atatataaaa gtatattaat aaaaatagag agctgagttt 60 agctttcttt ttgtgacttt tatatttaat aactccaatg watttgatga aacacaaata 120 aatcagctca gaagaattta actgtaatac gtatgctaat attgtttgca ttcaatctgt 180 aagggaatca gaaaccgaag 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cgaattaaaa tgtatgtttt 60 acaagcattc aaaaaggtaa tggattgttt cacaagtaaa ktcctaagtg ttcagctatt 120 tcagctcttc tttgccattt ggggcttctt acttgttagg tgatttctcc ggccttctat 180 caagcatgat gtgtgtcttc c 201 <210> 103 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 103 ttctctacta agacaactac aatcatatat ttgtgtggaa ttacatatct acataagtgg 60 aaatttattt aatgtcctta catattgtct tgttcattag ytgtctttga aagtcatttt 120 aaaaatcttt gtattacctg cctcaaaagg ttgctaggaa gattggataa aataataaat 180 ataaagcagt gaaatcaatg c 201 <210> 104 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 104 tcatctcttt cgtgtttcta cttaacatta aaaatatgga atacagctat aacaactgtt 60 ttaacatcct tgttggctaa ttctaacatt tctgtcaggt staagtcagt ttggattggt 120 ttttatgttt ttcttctatg ggttgtgttt tcctgctttg catgtcttgt agtctttcat 180 tagatggcag gcactgtgaa t 201 <210> 105 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 105 ggtcacagaa ataacaaggg acttctgtag atcactgcaa gaactttagc atttaccata 60 aatgagattt ttaaaaccac tgaaagcttt tgcaagtaca rgaaaggcat gacctgattt 120 gcattttaaa aaatcatctg gcttctgtct tgaaaataaa atgtgagata aatcggggag 180 accggttagg aggttattgc a 201 <210> 106 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 106 aactcctcac ctcaagtgat ccaccttcct cagcctccca aagtgctggg attacaggcg 60 tgagccactg cactcagcct gtcatctccc atttgcttgt rtaaacgcct gaggctgtgg 120 taggatcctg ccctaaggat agcaattagg gcttggctgc aaggaaggcc cacaggactc 180 aaaatgacaa tgtgtacaca c 201 <210> 107 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 107 aagttctagt tccagtggaa aatttggccc cttggaacta tcagcaacca gcacttcagt 60 catagacctg gctatgttta ccttgtgctt gctttgagtc ytgttgaagt cagttgggaa 120 cacatcatag gtccatcagg attctatgct cgggagacat ggcaagccct atgtgagaag 180 ggtggcaagg aatggcatac a 201 <210> 108 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 108 ggaaatgatt ttgttctttt ttatggctgc atagtattcc atggcatata tgttacgtac 60 cgcagttttt aatccaatcc accaccaatg ggcatcagaa ktgatttaag tctttgctac 120 tgtgaaaaac atatgagtac atgtgtcttt ttgatagcat gatttatttt tctttgggta 180 gatatccagt aatgggattg c 201 <210> 109 <211> 200 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 109 aagcactggt tgacttttgg tgggcaacct gaaagagagc tgtgaatgac atctctcctc 60 cctgctccta actagagagt gtgtctcaga gaactgtgcc rtttaagagc cggaaggcac 120 tctcaaagcc acctggttca atatttccca aagaggagca ttttctgttc atacaatagg 180 atattatttt agcttatgca 200 <210> 110 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 110 cctcctaaat caaccttaga cccacattag ctttcacctg gtgtgactgc tttagttgcc 60 tgttgtctgt gctgctgtcg ctttctccct actaaagcca ycctctgttt tactacctga 120 ttaacctcct ccaagcacac acctaagcac accaccctcc catttacaac cagcaggctc 180 aaaacctttc agtggctccc a 201 <210> 111 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 111 tgctggaggc agagggtgcc aggatgcagc tgtgagccag agaatgccaa ggattttcag 60 ccaccccaaa agctaggaag aggcaaggaa gatttctacc ktgagtttct gatagagtat 120 ggcaatgctc ttgatttggg acttctagcc ttgagaattg tgaaataata catgtatatg 180 ctttaagccc ctccaatttg t 201 <210> 112 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 112 caacacgacc tccctcacat ggctgggggt tgatgctggc tgcaagctgg gagttcagct 60 gggcctatca ggaagggacc tgaactcttc tctatgttga yctctccacg tggctacttg 120 ggcttcctca cagcatggtg actgagttct aagaagaagc actccaagag gcaaaggctg 180 gagctgtgtc atttccgcca t 201 <210> 113 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 113 cttaaataat tctgtgatcc tggctcccga taagaggaaa ttgtctttcc aaaaggcata 60 atagcctcct agggatttgc tttcctttga acaatgaaga rggaggaaaa ggtgtcattg 120 gggatttaaa tttaggagac ttgtttgtac ttaaacttgg cttaataagt gttctttaga 180 gcttgttttt ctttttgtta t 201 <210> 114 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 114 cacacaaaac tgtttctttg gcttgacgaa tacagttaag ccactgctgt ttgttgaaag 60 tgtcattggc ttgtagcgag tgggtctgac tttgggatcc rtttttgaaa ctgactctga 120 agaagttttt aactagaaag gaaaaacaca tgaaaaacaa agtcaatgga cagatccttc 180 ctcaggccaa agagaacaca c 201 <210> 115 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 115 tcctttatag caatgcaaat ggacaccctc cctgtgctgt gtcctgaaat ccctttcaag 60 actggaagtt ggagcaattg cagggctcac ctcatttata yctcttctct tagggtcact 120 gtccttcatt gcctgatgtc cagtgtcttc aaagctatag ctttataggt tttttcatct 180 ttttgttttt atttcagttg c 201 <210> 116 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 116 attcctgtca tattgttgag aacaaattcc ctagtgattc tatgaaataa gatagtattt 60 tatataataa tttggaatcg aatttttctc tgtcatctga mgttacattt cctacttcta 120 ttttatatga aattaatact ctgttttctc acttaattta aatcctgcct gtaaactgtc 180 atgaatgata tgaattaaat a 201 <210> 117 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 117 gaaagtgggt gaacaaaaga cacagggttt tagagacgtg tgtatgtaac tgaagccatt 60 gtatcttgga atacaaggac agttgcacaa aagcagtatg ygatatgtag tcccattcct 120 agatatcatt ggccattttc ctagccagac accaaatagc atgtgataca taaaaataaa 180 ttgatccaat aatagctagg a 201 <210> 118 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 118 tgattgaata aaacacagca gaattagatt tctcaacaaa aatagaacca gaaacacctg 60 tgcacaattg cctagggtgg aataagtgac cttcaggaga rtagggttaa ggtgaagaat 120 tctgaatgcc caaggtggcc tttgggtcag aactggagga atagccttaa tacaaggaga 180 taaccttaca atatttttcc t 201 <210> 119 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 119 atctttttta acataccatt tcaaaacaag gatttgttat gaaaaaattg tctttatccg 60 tcattacttt ttctcatgtt attgtttttt atgcactaaa wagatatgag ttcttgaaat 120 attggtacag ctttctgaat atataaaagt atattaataa aaatagagag ctgagtttag 180 ctttcttttt gtgactttta t 201 <210> 120 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 120 ctttctctcc ctgagatgct ggggtggtca tgagtgcctt ggagaataag ctgaaagccc 60 tagactttgt cttcagagaa aaaatggaca tactcacaca sgtaaaaatt gacattcacc 120 ttcaggccgt ctcctaaaat ctgcctgggt aatagaatag ggtgtctggt aaaatactag 180 cctgggcttg actccagccg g 201 <210> 121 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 121 attagaaagt tttgttgaaa ggacatagat ctaaagatgg ttgagtaggg attacacaaa 60 ttaatgaagg gacaaatgga aatcacattc actcactcga waaacaatta agcacctatt 120 ttgtagcaga gactatagat acaattctgg gttaacaaag aagaatgaga tgtacctgtc 180 atctatttct taacagcttg g 201 <210> 122 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 122 gaagcttgaa aaggagctgg gtgaggcaaa catgcaaatc atgccatgga gattggcaga 60 aaagacgctt gcctccaatt tatggaatgc caagttaatt ygagcccata ggaatgttgt 120 tcccatagat ttagattttt atgaatatat acatatttat gaaagaaaac atttaaagtg 180 tttaattcag taacttatgc a 201 <210> 123 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 123 agaagttaaa tctgtgaaaa aatctttaag tcatcaaata tatacaatta attccacaat 60 ctggaattct cactggcatt tagtcaaaat ggaagttctc ractctcaag aatatattca 120 agaacacaga gtattcagct gtaaatgcaa caattttttc tttgttgatg ggaattgggt 180 gaaatatgat ctttcagatt t 201 <210> 124 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 124 caccacgctg gtcccttcca gaggtgctgt aggtcctctg cctgtaggtc ctctgggcgg 60 actctagttc ctaactgatg gatgatgctg ggccccgctg ytgatgctgc ttaattcata 120 atttggggac tcaagtctct gcaggctcca ctgggccaac ttgcttcctg cagagataca 180 tgttcagact ctactaatta c 201

Claims (11)

  1. 서열번호 1 내지 124의 염기서열로 구성되고 상기 각 염기서열의 101번째 염기를 SNP(Single Nucleotide Polymorphism)로서 포함하는 모든 폴리뉴클레오티드, 또는 이의 상보적인 모든 폴리뉴클레오티드를 포함하는 사상체질 진단용 마이크로어레이.
  2. 삭제
  3. 제 1항에 있어서, 상기 폴리뉴클레오티드들의 SNP 위치인 각 서열의 101번째 염기의 대립 유전자형은 각각 [표 8]에 기재된 대립 유전자형인 것을 특징으로 하는 사상체질 진단용 마이크로어레이.
    번호 다중 SNP 대립 유전자형 진단체질 1 (서열번호 17, 서열번호 32, 서열번호 41) (AA, AA, AG) 소음 2 (서열번호 21, 서열번호 22, 서열번호 34) (GG, GG, AA) 소음 3 (서열번호 17, 서열번호 33, 서열번호 41) (AA, AA, AG) 소음 4 (서열번호 4, 서열번호 27, 서열번호 35) (AA, CC, CC) 소음 5 (서열번호 27, 서열번호 29, 서열번호 35) (CC, AA, CC) 소음 6 (서열번호 2, 서열번호 39, 서열번호 45) (CC, TT, AA) 소음 7 (서열번호 22, 서열번호 34, 서열번호 42) (GG, AA, GG) 소음 8 (서열번호 10, 서열번호 13, 서열번호 41) (GG, AA, AG) 소음 9 (서열번호 8, 서열번호 22, 서열번호 42) (CC, GG, GG) 소음 10 (서열번호 2, 서열번호 7, 서열번호 47) (CC, TT, GG) 소음 11 (서열번호 6, 서열번호 12, 서열번호 20) (GG, AA, AA) 소음 12 (서열번호 10, 서열번호 15, 서열번호 25) (GG, AA, TT) 소음 13 (서열번호 10, 서열번호 13, 서열번호 43) (GG, AA, CT) 소음 14 (서열번호 2, 서열번호 11, 서열번호 39) (CC, TT, TT) 소음 15 (서열번호 9, 서열번호 22, 서열번호 42) (TT, GG, GG) 소음 16 (서열번호 27, 서열번호 30, 서열번호 44) (CC, CC, CC) 소음 17 (서열번호 14, 서열번호 27, 서열번호 44) (CC, CC, CC) 소음 18 (서열번호 10, 서열번호 13, 서열번호 34) (GG, AA, AA) 소음 19 (서열번호 18, 서열번호 22, 서열번호 34) (AA, GG, AA) 소음 20 (서열번호 19, 서열번호 22, 서열번호 34) (CC, GG, AA) 소음 21 (서열번호 6, 서열번호 20, 서열번호 18) (GG, AA, AA) 소음 22 (서열번호 6, 서열번호 20, 서열번호 19) (GG, AA, CC) 소음 23 (서열번호 22, 서열번호 34, 서열번호 36) (GG, AA, CC) 소음 24 (서열번호 3, 서열번호 10, 서열번호 13) (AG, GG, AA) 소음 25 (서열번호 28, 서열번호 31, 서열번호 34) (AA, AA, AA) 소음 26 (서열번호 19, 서열번호 37, 서열번호 48) (CC, CC, GG) 소음 27 (서열번호 38, 서열번호 39, 서열번호 40) (GG, TT, AG) 소음 28 (서열번호 18, 서열번호 37, 서열번호 48) (AA, CC, GG) 소음 29 (서열번호 5, 서열번호 39, 서열번호 40) (GG, TT, AG) 소음 30 (서열번호 28, 서열번호 34, 서열번호 46) (AA, AA, GG) 소음 31 (서열번호 23, 서열번호 24, 서열번호 26) (CC, AA, CC) 소음 32 (서열번호 1, 서열번호 34, 서열번호 48) (TT, AA, GG) 소음 33 (서열번호 16, 서열번호 22, 서열번호 34) (GG, GG, AA) 소음 34 (서열번호 16, 서열번호 24, 서열번호 26) (GG, AA, CC) 소음 35 (서열번호 61, 서열번호 62, 서열번호 76) (AT, CC, CC) 소양 36 (서열번호 61, 서열번호 63, 서열번호 76) (AT, GG, CC) 소양 37 (서열번호 54, 서열번호 64, 서열번호 67) (TT, GG, CT) 소양 38 (서열번호 64, 서열번호 67, 서열번호 70) (GG, CT, GG) 소양 39 (서열번호 64, 서열번호 67, 서열번호 82) (GG, CT, TT) 소양 40 (서열번호 51, 서열번호 65, 서열번호 79) (TT, AA, AA) 소양 41 (서열번호 65, 서열번호 79, 서열번호 85) (AA, AA, TT) 소양 42 (서열번호 65, 서열번호 66, 서열번호 79) (AA, TT, AA) 소양 43 (서열번호 65, 서열번호 79, 서열번호 80) (AA, AA, TT) 소양 44 (서열번호 59, 서열번호 65, 서열번호 79) (GG, AA, AA) 소양 45 (서열번호 54, 서열번호 71, 서열번호 78) (TT, GG, AG) 소양 46 (서열번호 70, 서열번호 71, 서열번호 78) (GG, GG, AG) 소양 47 (서열번호 71, 서열번호 78, 서열번호 82) (GG, AG, TT) 소양 48 (서열번호 69, 서열번호 79, 서열번호 85) (TT, AA, TT) 소양 49 (서열번호 66, 서열번호 69, 서열번호 79) (TT, TT, AA) 소양 50 (서열번호 51, 서열번호 69, 서열번호 79) (TT, TT, AA) 소양 51 (서열번호 69, 서열번호 79, 서열번호 80) (TT, AA, TT) 소양 52 (서열번호 50, 서열번호 54, 서열번호 78) (AA, TT, AG) 소양 53 (서열번호 50, 서열번호 70, 서열번호 78) (AA, GG, AG) 소양 54 (서열번호 54, 서열번호 57, 서열번호 78) (TT, GG, AG) 소양 55 (서열번호 57, 서열번호 70, 서열번호 78) (GG, GG, AG) 소양 56 (서열번호 59, 서열번호 69, 서열번호 79) (GG, TT, AA) 소양 57 (서열번호 50, 서열번호 78, 서열번호 82) (AA, AG, TT) 소양 58 (서열번호 57, 서열번호 78, 서열번호 82) (GG, AG, TT) 소양 59 (서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 56) (AA, TT, TT) 소양 60 (서열번호 79, 서열번호 75, 서열번호 80) (AA, AA, TT) 소양 61 (서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 55) (AA, TT, GG) 소양 62 (서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 60) (AA, TT, CC) 소양 63 (서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 72) (AA, TT, CC) 소양 64 (서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 86) (AA, TT, CC) 소양 65 (서열번호 51, 서열번호 74, 서열번호 79) (TT, GG, AA) 소양 66 (서열번호 53, 서열번호 77, 서열번호 83) (AG, CC, CC) 소양 67 (서열번호 49, 서열번호 73, 서열번호 83) (AA, AA, TT) 소양 68 (서열번호 54, 서열번호 78, 서열번호 84) (TT, AG, AA) 소양 69 (서열번호 70, 서열번호 78, 서열번호 84) (GG, AG, AA) 소양 70 (서열번호 78, 서열번호 82, 서열번호 84) (AG, TT, AA) 소양 71 (서열번호 52, 서열번호 68, 서열번호 81) (TT, CT, CC) 소양 72 (서열번호 58, 서열번호 73, 서열번호 83) (CG, AA, TT) 소양 73 (서열번호 91, 서열번호 95, 서열번호 100) (TT, CT, CG) 태음 74 (서열번호 117, 서열번호 120, 서열번호 122) (AG, CC, GG) 태음 75 (서열번호 91, 서열번호 98, 서열번호 103) (TT, AT, AA) 태음 76 (서열번호 91, 서열번호 103, 서열번호 107) (TT, AA, AG) 태음 77 (서열번호 89, 서열번호 94, 서열번호 101) (AG, AG, AA) 태음 78 (서열번호 91, 서열번호 103, 서열번호 116) (TT, AA, AC) 태음 79 (서열번호 91, 서열번호 103, 서열번호 119) (TT, AA, AT) 태음 80 (서열번호 111, 서열번호 118, 서열번호 122) (CC, AG, GG) 태음 81 (서열번호 104, 서열번호 111, 서열번호 113) (GG, CC, AA) 태음 82 (서열번호 111, 서열번호 113, 서열번호 114) (CC, AA, TT) 태음 83 (서열번호 111, 서열번호 113, 서열번호 115) (CC, AA, CC) 태음 84 (서열번호 105, 서열번호 113, 서열번호 123) (AG, AA, AG) 태음 85 (서열번호 88, 서열번호 104, 서열번호 124) (TT, GG, AG) 태음 86 (서열번호 88, 서열번호 114, 서열번호 124) (TT, TT, AG) 태음 87 (서열번호 88, 서열번호 115, 서열번호 124) (TT, CC, AG) 태음 88 (서열번호 93, 서열번호 104, 서열번호 124) (CC, GG, AG) 태음 89 (서열번호 93, 서열번호 114, 서열번호 124) (CC, TT, AG) 태음 90 (서열번호 93, 서열번호 115, 서열번호 124) (CC, CC, AG) 태음 91 (서열번호 94, 서열번호 103, 서열번호 106) (AG, AA, CC) 태음 92 (서열번호 109, 서열번호 110, 서열번호 121) (CT, CC, TT) 태음 93 (서열번호 87, 서열번호 99, 서열번호 104) (AG, AA, GG) 태음 94 (서열번호 87, 서열번호 99, 서열번호 114) (AG, AA, TT) 태음 95 (서열번호 87, 서열번호 99, 서열번호 115) (AG, AA, CC) 태음 96 (서열번호 92, 서열번호 111, 서열번호 118) (CC, CC, AG) 태음 97 (서열번호 96, 서열번호 109, 서열번호 121) (CC, CT, TT) 태음 98 (서열번호 97, 서열번호 104, 서열번호 124) (CC, GG, AG) 태음 99 (서열번호 97, 서열번호 114, 서열번호 124) (CC, TT, AG) 태음 100 (서열번호 97, 서열번호 115, 서열번호 124) (CC, CC, AG) 태음 101 (서열번호 107, 서열번호 99, 서열번호 104) (AG, AA, GG) 태음 102 (서열번호 107, 서열번호 99, 서열번호 114) (AG, AA, TT) 태음 103 (서열번호 107, 서열번호 99, 서열번호 115) (AG, AA, CC) 태음 104 (서열번호 114, 서열번호 98, 서열번호 99) (TT, AT, AA) 태음 105 (서열번호 115, 서열번호 98, 서열번호 99) (CC, AT, AA) 태음 106 (서열번호 111, 서열번호 112, 서열번호 122) (CC, CT, GG) 태음 107 (서열번호 90, 서열번호 102, 서열번호 103) (AA, GG, AA) 태음 108 (서열번호 108, 서열번호 110, 서열번호 120) (GT, CC, CG) 태음
  4. 제 1항에 있어서, 상기 사상체질은 소음인, 소양인, 태음인 및 태양인 중 소음인, 소양인 및 태음인인 것을 특징으로 하는 사상체질 진단용 마이크로어레이.
  5. 삭제
  6. 삭제
  7. 제 1항에 있어서, 상기 마이크로어레이는 기판 상에 아미노-실란, 폴리-L-라이신 및 알데히드로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나의 활성기가 코팅된 것을 특징으로 하는 사상체질 진단용 마이크로어레이.
  8. 제 7항에 있어서, 상기 기판은 실리콘 웨이퍼, 유리, 석영, 금속 및 플라스틱으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나인 것을 특징으로 하는 사상체질 진단용 마이크로어레이.
  9. 제 1항의 마이크로어레이를 포함하는 사상체질 진단용 키트.
  10. 1) 피검체로부터 유래된 핵산 시료를 준비하는 단계;
    2) 상기 핵산 시료를 형광물질로 표지하는 단계;
    3) 형광물질로 표지된 핵산시료를 제 1항의 마이크로어레이와 혼성화하는 단계;
    4) 반응한 마이크로어레이를 분석하여 서열번호 1 내지 124 중에서 선택되는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드의 각 다형성 부위의 유전자형을 확인하는 단계; 및
    5) 상기 유전자형을 이용하여 하기 [표 9]에 따라 피검체의 사상체질을 판단하는 단계를 포함하는 사상체질 진단의 정보를 제공하기 위한 다중 SNP 검출 방법.
    번호 다중 SNP 진단체질 1 서열번호 17, 서열번호 32, 서열번호 41 소음 2 서열번호 21, 서열번호 22, 서열번호 34 소음 3 서열번호 17, 서열번호 33, 서열번호 41 소음 4 서열번호 4, 서열번호 27, 서열번호 35 소음 5 서열번호 27, 서열번호 29, 서열번호 35 소음 6 서열번호 2, 서열번호 39, 서열번호 45 소음 7 서열번호 22, 서열번호 34, 서열번호 42 소음 8 서열번호 10, 서열번호 13, 서열번호 41 소음 9 서열번호 8, 서열번호 22, 서열번호 42 소음 10 서열번호 2, 서열번호 7, 서열번호 47 소음 11 서열번호 6, 서열번호 12, 서열번호 20 소음 12 서열번호 10, 서열번호 15, 서열번호 25 소음 13 서열번호 10, 서열번호 13, 서열번호 43 소음 14 서열번호 2, 서열번호 11, 서열번호 39 소음 15 서열번호 9, 서열번호 22, 서열번호 42 소음 16 서열번호 27, 서열번호 30, 서열번호 44 소음 17 서열번호 14, 서열번호 27, 서열번호 44 소음 18 서열번호 10, 서열번호 13, 서열번호 34 소음 19 서열번호 18, 서열번호 22, 서열번호 34 소음 20 서열번호 19, 서열번호 22, 서열번호 34 소음 21 서열번호 6, 서열번호 20, 서열번호 18 소음 22 서열번호 6, 서열번호 20, 서열번호 19 소음 23 서열번호 22, 서열번호 34, 서열번호 36 소음 24 서열번호 3, 서열번호 10, 서열번호 13 소음 25 서열번호 28, 서열번호 31, 서열번호 34 소음 26 서열번호 19, 서열번호 37, 서열번호 48 소음 27 서열번호 38, 서열번호 39, 서열번호 40 소음 28 서열번호 18, 서열번호 37, 서열번호 48 소음 29 서열번호 5, 서열번호 39, 서열번호 40 소음 30 서열번호 28, 서열번호 34, 서열번호 46 소음 31 서열번호 23, 서열번호 24, 서열번호 26 소음 32 서열번호 1, 서열번호 34, 서열번호 48 소음 33 서열번호 16, 서열번호 22, 서열번호 34 소음 34 서열번호 16, 서열번호 24, 서열번호 26 소음 35 서열번호 61, 서열번호 62, 서열번호 76 소양 36 서열번호 61, 서열번호 63, 서열번호 76 소양 37 서열번호 54, 서열번호 64, 서열번호 67 소양 38 서열번호 64, 서열번호 67, 서열번호 70 소양 39 서열번호 64, 서열번호 67, 서열번호 82 소양 40 서열번호 51, 서열번호 65, 서열번호 79 소양 41 서열번호 65, 서열번호 79, 서열번호 85 소양 42 서열번호 65, 서열번호 66, 서열번호 79 소양 43 서열번호 65, 서열번호 79, 서열번호 80 소양 44 서열번호 59, 서열번호 65, 서열번호 79 소양 45 서열번호 54, 서열번호 71, 서열번호 78 소양 46 서열번호 70, 서열번호 71, 서열번호 78 소양 47 서열번호 71, 서열번호 78, 서열번호 82 소양 48 서열번호 69, 서열번호 79, 서열번호 85 소양 49 서열번호 66, 서열번호 69, 서열번호 79 소양 50 서열번호 51, 서열번호 69, 서열번호 79 소양 51 서열번호 69, 서열번호 79, 서열번호 80 소양 52 서열번호 50, 서열번호 54, 서열번호 78 소양 53 서열번호 50, 서열번호 70, 서열번호 78 소양 54 서열번호 54, 서열번호 57, 서열번호 78 소양 55 서열번호 57, 서열번호 70, 서열번호 78 소양 56 서열번호 59, 서열번호 69, 서열번호 79 소양 57 서열번호 50, 서열번호 78, 서열번호 82 소양 58 서열번호 57, 서열번호 78, 서열번호 82 소양 59 서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 56 소양 60 서열번호 79, 서열번호 75, 서열번호 80 소양 61 서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 55 소양 62 서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 60 소양 63 서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 72 소양 64 서열번호 79, 서열번호 80, 서열번호 86 소양 65 서열번호 51, 서열번호 74, 서열번호 79 소양 66 서열번호 53, 서열번호 77, 서열번호 83 소양 67 서열번호 49, 서열번호 73, 서열번호 83 소양 68 서열번호 54, 서열번호 78, 서열번호 84 소양 69 서열번호 70, 서열번호 78, 서열번호 84 소양 70 서열번호 78, 서열번호 82, 서열번호 84 소양 71 서열번호 52, 서열번호 68, 서열번호 81 소양 72 서열번호 58, 서열번호 73, 서열번호 83 소양 73 서열번호 91, 서열번호 95, 서열번호 100 태음 74 서열번호 117, 서열번호 120, 서열번호 122 태음 75 서열번호 91, 서열번호 98, 서열번호 103 태음 76 서열번호 91, 서열번호 103, 서열번호 107 태음 77 서열번호 89, 서열번호 94, 서열번호 101 태음 78 서열번호 91, 서열번호 103, 서열번호 116 태음 79 서열번호 91, 서열번호 103, 서열번호 119 태음 80 서열번호 111, 서열번호 118, 서열번호 122 태음 81 서열번호 104, 서열번호 111, 서열번호 113 태음 82 서열번호 111, 서열번호 113, 서열번호 114 태음 83 서열번호 111, 서열번호 113, 서열번호 115 태음 84 서열번호 105, 서열번호 113, 서열번호 123 태음 85 서열번호 88, 서열번호 104, 서열번호 124 태음 86 서열번호 88, 서열번호 114, 서열번호 124 태음 87 서열번호 88, 서열번호 115, 서열번호 124 태음 88 서열번호 93, 서열번호 104, 서열번호 124 태음 89 서열번호 93, 서열번호 114, 서열번호 124 태음 90 서열번호 93, 서열번호 115, 서열번호 124 태음 91 서열번호 94, 서열번호 103, 서열번호 106 태음 92 서열번호 109, 서열번호 110, 서열번호 121 태음 93 서열번호 87, 서열번호 99, 서열번호 104 태음 94 서열번호 87, 서열번호 99, 서열번호 114 태음 95 서열번호 87, 서열번호 99, 서열번호 115 태음 96 서열번호 92, 서열번호 111, 서열번호 118 태음 97 서열번호 96, 서열번호 109, 서열번호 121 태음 98 서열번호 97, 서열번호 104, 서열번호 124 태음 99 서열번호 97, 서열번호 114, 서열번호 124 태음 100 서열번호 97, 서열번호 115, 서열번호 124 태음 101 서열번호 107, 서열번호 99, 서열번호 104 태음 102 서열번호 107, 서열번호 99, 서열번호 114 태음 103 서열번호 107, 서열번호 99, 서열번호 115 태음 104 서열번호 114, 서열번호 98, 서열번호 99 태음 105 서열번호 115, 서열번호 98, 서열번호 99 태음 106 서열번호 111, 서열번호 112, 서열번호 122 태음 107 서열번호 90, 서열번호 102, 서열번호 103 태음 108 서열번호 108, 서열번호 110, 서열번호 120 태음
  11. 제 10항에 있어서, 단계 3)의 형광물질은 Cy3, Cy5, FITC(poly L-lysine-fluorescein isothiocyanate), RITC(rhodamine-B-isothiocyanate) 및 로다민(rhodamine)으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나인 것을 특징으로 하는 방법.
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
대전대학교 한의학연구소 논문집, Vol. 13, No. 1, pp89-96(2004.06.30.)

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20180082801A (ko) 2017-01-11 2018-07-19 인제대학교 산학협력단 사상체질 진단용 조성물 및 이를 이용한 사상체질 진단방법
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