KR100970109B1 - 나리 유래의 약에 특이적인 프로모터, 재조합 벡터,형질전환체 및 그의 제조 방법 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 단자엽 및 쌍자엽 식물의 약 특이 프로모터에 관한 것이다. 특히, 본 발명은 단자엽 및 쌍자엽 식물의 약에서 3' 말단에 위치한 유전자의 발현을 유도할 수 있는 프로모터를 제공한다. 본 발명의 식물 약 특이성을 갖는 프로모터는 대상 유전자 및 단백질을 식물 약에 특이적으로 발현시키는 용도로 사용할 수 있어, 약에 특정 유전자를 도입한 후 교배 육종에 이용할 수 있다.
약 특이 발현, 프로모터
Description
도 1은 페튜니아를 형질전환하기 위한 재조합 벡터의 지도이다.
도 2는 페튜니아를 형질전환한 후 서든 분석한 결과이다. 도 2에서, C(E)는 EcoRI으로 절단한 대조군 DNA이고, # 16, 20, 21, 53 및 62는 페튜니아 형질전환체의 DNA를 EcoRI으로 절단한 것이다.
도 3은 페튜니아를 형질전환한 후 GUS 발현을 분석한 결과이다.
도 4는 페튜니아를 형질전환한 후 GUS 발현을 현미경으로 확인한 결과이다.
기술분야
본 발명은 식물 약 특이 프로모터에 관한 것으로, 보다 구체적으로는, 단자엽 및 쌍자엽 식물의 약에서 유전자의 발현을 유도할 수 있는 프로모터 및 상기 프로모터를 이용한 대상 유전자 및 단백질을 식물 약에 다량 발현시킬 수 있는 방법에 관한 것이다.
종래기술
식물의 형질전환시 사용되는 프로모터들은, 대체로 식물의 전체 조직 또는 세포에서 주로 발현되는 프로모터들이다. 이러한 프로모터들은 조직-선택성 또는 기관-선택성이 결여되어 있어, 발현시킨 유전자가 전체 식물에서 발현되는 문제가 있다. 또한 프로모터의 특성상 도입한 유전자의 발현을 목적하는 기관에 국한되어 충분히 발현시키지 못하므로 형질전환체의 경제성이 떨어지게 된다. 그러나, 현재 기관 특이적인 특성을 갖는 식물에서 분리된 프로모터에 대한 연구는 미비한 실정이다.
현재, 형질전환에서 가장 흔히 사용되는 프로모터로는 35S CaMV가 있으며, 그외에도 Ubi(Ubiquitin: 옥수수, 1993), Act1(actin; 벼, 1994), OsCc1(cytichrome C, 2002) 등이 있다. 그러나, 이들 프로모터들은 유전자가 식물체의 전 기관에서 발현되도록 작동한다.
특정한 기관(예, 약, 꽃잎, 뿌리, 약 등)이나 특정 시기(예, 병원체의 공격)에서만 발현되어야 하는 유전자(예, 화색, 웅성 불임, 화형, 특정 대사관련 물질, 방어물질 등)를 형질전환시킬 경우, 특정 기관이나 시기에만 작동하는 프로모터가 반드시 필요한 실정이다. 이러한 프로모터로는 벼(약, 종자), 애기장대(종자, 꽃잎, 뿌리, 약 등), 담배(약), 감자(상처) 등에서 보고된 바 있으며, 최근에도 계속 적으로 발표되고 있다. 그러나, 이들 프로모터 역시 이종 작물간의 적용은 어려운 문제가 있다.
상기 종래기술의 문제점을 해결하기 위하여 안출된 것으로서, 본 발명의 목적은 식물 약에서만 특이적으로 유전자의 발현을 유도하는 프로모터를 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 식물 약에서 특이적으로 발현되는 유전자의 프로모터를 사용하여 목적 유전자의 단백질을 다량 발현시켜 형질전환체의 품질을 향상시키거나 대상 단백질을 약에 저장하거나 또는 생산하는 방법을 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 식물 약 특이 발현성을 갖는 벡터를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 식물의 약에서 특이적으로 대상 유전자를 발현시키는 방법을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 식물의 약 프로모터를 이용하여 웅성불임 및 교배육종법을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 대상 단백질이 식물 약에서 특이적으로 발현되는 형질전환체를 제공하는 것이다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 1의 핵산단편으로 이루어지는 식물 약 특이 프로모터를 제공한다.
또한 본 발명은 서열번호 2의 염기서열로 이루어진 것을 특징으로 하는 식물 약 특이 프로모터를 제공한다.
또한 본 발명은 서열번호 2의 염기서열로 이루어진 것을 특징으로 하는 식물 약 특이 프로모터를 제공한다.
또한 본 발명은 상기 식물 약 특이 프로모터의 3' 방향에 대상 단백질에 대한 유전자가 발현되도록 연결된 벡터를 제조하고, 상기 벡터를 식물에 형질전환하여 식물 약에서 상기 대상 유전자의 발현을 유도하는 것을 포함하는 식물 약에서의 대상 단백질 생산방법을 제공한다.
또한 본 발명은 상기 식물 약 특이 프로모터를 포함하는 벡터를 제공한다.
또한 본 발명은 상기 벡터로 형질전환된 식물 조직 배양법에 의한 무성번식되는 식물을 제공한다.
이하, 본 발명을 상세히 설명한다.
본 발명자들은, 식물의 조직 또는 기관 특이적인 유전자 발현을 조절할 수 있는 프로모터들을 발굴함으로써, 식물의 특정 조직 또는 기관에 국한시켜 목적 유전자를 특이적으로 발현 또는 저해할 수 있는 시스템을 확립하고자 하였다. 이에, 본 발명자들은 약 특이적인 프로모터를 연구하던 중, 단자엽 식물인 나리(Lilium hybrid cv. Acapulco)의 게놈 라이브러리를 통해 약 특이적인 프로모터를 클로닝하였고, 이를 쌍자엽 식물인 페츄니아에서 실험한 결과 안정적으로 약 특이적인 프로모터로서 기능하는 것을 발견하여, 이를 토대로 본 발명을 완성하였다.
본 발명에서 언급하는 "식물 약 특이 프로모터"는 상기 프로모터의 3' 위치 에 연결되어 발현이 조절되는 유전자를 식물 약에서 특이적으로 발현시키는 프로모터를 의미하며, 식물 약 이외의 식물 조직에서는 상기 유전자의 발현이 거의 이루어지지 않는 것을 의미한다.
본 발명의 약 특이 프로모터는 단자엽 식물인 나리에서 분리되었으나, 쌍자엽 식물인 페츄니아에서도 성공적으로 기능하는 것으로 확인하였으므로, 상기 약 특이 프로모터는 단자엽 및 쌍자엽 식물 모두에 사용가능하다.
상기 식물은 통상의 단자엽 식물, 쌍자엽 식물, 초본 식물 또는 목본 식물일 있으며, 바람직하기로는 농작물, 화훼작물, 채소작물 또는 과수작물이며, 더욱 바람직하기로는 무성생식법이 공지된 식물이다. 식물의 일예로는, 벼, 밀, 보리, 귀리, 기장, 조, 수수, 옥수수, 율무, 아스파라거스, 양파, 대나무, 호밀, 사탕수수, 파인애플, 바나나, 토마토, 담배, 목화, 포도, 고추, 상추, 콩과 식물, 양배추, 브로콜리, 해바라기, 당근, 가지, 시금치, 오이, 호박, 감자, 고구마, 사과, 복숭아, 배, 포플러, 소나무 및 아라비돕시스 등이 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다. 식물의 무성생식법으로는 삽목, 분주, 포기번식, 조직배양, 화분배양 등이 있다. 조직 배양법은 식물의 잎의 일부를 취하여 배지에서 배양한 후 식물 뿌리 형성 배지에서 배양하여 뿌리를 형성시킨 후 이를 토양에 식수하는 방법이다.
본 발명의 식물 약 특이 프로모터는 서열번호 1에 기재한 염기서열과 적어도 70 % 이상의 상동성을 갖으며, 약 특이적인 프로모터 기능을 가지는 뉴클레오티드이다. 바람직하기로는, 상기 프로모터는 80, 85, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99 % 이상의 상동성을 갖으며, 약 특이적인 프로모터 기능을 가지는 뉴클레오티드이다. 상기 식물 약 조직 특이 프로모터의 서열의 예로는 서열번호 1 또는 서열번호 2의 핵산 서열을 포함하나, 이로 한정되는 것은 아니다.
서열번호 1:
aa ctcggtggtt
tacactcagg ggacttgcta cgaaccaaat tttaaaactg ccagtatggt ggaaataaac
ttctctccgc ctcttctgtc cttggggaat aagattcaaa ccccttcaat ccgaggttat
cgatgccgcc acgttgctta gttaactgct tgttcccaac tatccatctc cctataaaac
ctttcgcccc atacaacctt cacttcatct ctctccatcc actacacctg ctctgcattc
tagtccgact ccgatagtat cttcggtt
서열번호 2:
1 gtcgaccaag ggcaagccga ggcctccaca tttcttatca ttagtgtgtg gtctgagtac
6l aattaggcca tcatgctaat ctaccaagtt cacccagata tgtccctgaa taggtcagca
121 gacaaagccc tgaccttcaa gttggacatc ataagccctg gctaactcct aggtgtgtcc
181 ctgaataggt tggcagtcag agatccgacc ttcaggccaa acttcctaag gccctactaa
241 ctcccaggca tttaagtccc taaattggtt atcgggcaaa gcctcgacct tcaggccaga
301 cttcctaaga tctggctaac tcccaggcat tcaagttcct aaatgagtgg gcggacagag
361 ctctgacctt caggcaagac ttcttaagtc ctgactaact cccaggcatg tccctgaata
421 ggtcggtggg caaaactcct aagccctatc taactcccaa gtgtgtcccc gaacgagtca
481 gcgggtagag ctctgatctt cagaccagac ttcctaagca ttggctaact cctaagggca
541 tccttgaatg ggtcaacggg cagagctctg accttcaggc tggactttct aagccctagc
601 taactctcaa gtattcatgt ccctgaacgg gcggcgggc aaagccctga ccttcaggct
661 attcatgtcc ctgaacgggt cggcggcaa agccctgacc ttcaggctag atatcctaag
721 ccctggctaa cccccaagtg tgtccctgaa tgggttgatg agcagatctc caaccttcat
781 gccagacttc ctaagccttg gctaactccc aggCattcaa gtcccttaat gggtcagtgg
841 gcagagatcc gaccttcaga ccggactttt taaaccttgg caaactccta ggggtgttcc
901 tgaacttgtt ggcgggcaga gctccgacct tcaggccaga ctttccaagc gctagctaac
961 tcccagggcc attcaaagcc cttgaattag tctatgggca tagccccgga cctttagttc
1021 aggcattcca agccctgact atactcccag gcacaataaa cccctgagtc gatctgcgag
1081 catagcaccg atcttcaggc tgggcatccc aaaccctggc tatactccca ggcatataag
1141 tcccagatgc caaaactttt cttcttgcat cgatcccaaa attctcaggc caagcgagca
1201 ttctccctca atccaccttg ccttctcctt aagaagcctg ggcaagaagg agggacaata
1261 gaccaaELgat caaaggatca actccgtgct gacttatccc cgacttctta gcacatgtgc
1321 agggtcaaca aggcgtctcc gacaaactca tacacgggca tacaggctgg cccatgccct
1381 ggtccaaacg acatcgaagg acagtctcct ccggctccgg cgggaagacc cgtgtgccca
1441 atcggtgggt atccctagga tatccatgcc cgacacccac aggatgaccc gtgtgccagg
1501 acaaactaca caataaccag taccttaact gacttctcga cataacatca catatcgcat
1561 ttaatgtgct gacctaggag ttgacgtgtt gtcccttctg ttggatcgct aggctacgta
1621 tgctcaacaa atagtcacac cgacctaagt gatttgacga ctcataggca tatgcgtgga
1681 tccttggaac tcgactccac agtcacccct agtgcatata aaaagcctcc tccactcccc
1741 tttgaggggg taagctttac agactctttg cacgtatata atatgtccgg atcggagcac
1801 aggtactctg ctcacctaag agcggtcagc tgcccagtat cgtagaaact cgacactcac
1861 tctcacatcg gaggagtgtc gcggggatac gtccatgcga ccatgtttag gtgtttcttg
1921 tgctcgcagg tctcgacgac gacctcatcc gtaccagcct gagctctccc agttctccaa
1981 ccactacgat ggaacgtttg tctccagttc gaccctgcga gcgccctgct cacccaggtc
2041 ggagctccac tagctcgtag cccggatctg actgtctcta cgcacacgcc cggctagagc
2101 tctaccagct cgcagcctgg atccgaccat ctccgcgtcc atgacaggcc agagctccac
2161 tagctcgccg gacaaatcct cgacgcccat gcccgtggtt ggccatttcc cgcatcctcg
2221 cctccgaaca aaactcaaca agccaggaat ctgaagcgta gtgtcacgtc agaccccgct
2281 gaagaaggac gtcatcacaa ccaatttatt ttgacgtcat caataagtaa tcttaaatct
2341 gcattctcca aaacatatat ttttgtcatt gaacttatta agtattagac atttctttta
2401 cttggtcatt gatgtcgccg aaatcattcc actgaactct aacaccaaat tgttcaacta
2461 tatctaattc taaaaataag attatatgca acacttcggt accaatttgt tcggctatgt
2521 caaactctac aaataaaatt aataaaatat atgtgatcga ccaattattc aaagagatca
2581 taatcggtcc caatgttaga aggtacacaa aatcgttgtc ccaaaaacaa ctcggtggtt
264l tacactcagg ggacttgcta cgaaccaaat tttaaaactg ccagtatggt ggaaataaac
2701 ttctctccgc ctcttctgtc cttggggaat aagattcaaa ccccttcaat ccgaggttat
2761 cgatgccgcc acgttgctta gttaactgct tgttcccaac tatccatctc cctataaaac
2821 ctttcgcccc atacaacctt cacttcatct ctctccatcc actacacctg ctctgcattc
2881 tagtccgact ccgatagtat cttcggttct aaca
일 예로, 서열번호 1의 핵산 서열을 포함하는 약 특이 프로모터는 약 조직에서 우세적으로 유전자의 전사를 수행한다. 다른 예로, 서열번호 2의 핵산 서열을 포함하는 약 특이 프로모터는 약 조직에서 우세적으로 발현되지만, 일부의 경우에는 자방 조직서도 유전자를 발현시킨다.
본 발명에 따른 약 특이 프로모터는 형질전환으로 약에 화분을 제거하거나 색소를 교환하는 등의 특정 형질을 조절할 수 있다. 이에 따라, 채소나 화훼 등의 교배 육종에 이용될 수 있는 모본 식물을 육성하거나, 개약하는 화분으로 인해 상품성이 떨어지는 화훼작물의 단점을 개선할 수도 있다. 이를 위해, 본 발명에 따른 약 특이 프로모터에 대상 유전자 및 단백질을 발현가능하도록 연결시켜, 형질전환함으로써, 원하는 형질을 갖는 식물을 제조할 수 있다.
이를 위하여, 본 발명에서는 상기 식물 약 특이 프로모터를 포함하는 벡터를 제공한다. 상기 벡터는 프로모터 3' 방향에 대상 단백질을 암호화하는 핵산 서열을 발현 가능하게 연결된 형태로 포함할 수 있으며, 또한 복사기점(origen of replication), 프로모터 조절 부위 예컨대 인핸서, 전사 종결부위, 선별 마커 또는 전사 조절 인자를 더욱 포함할 수 있다. 바람직하기로는 상기 벡터는 5' 에서 3' 방향으로, 식물 약 특이 프로모터, 대상 단백질 코딩 부위 및 전사종결부위를 포함하며, 통상의 벡터에 프로모터를 상기 식물 약 특이 프로모터로 치환시킨 것일 수 있다. 상기 통상의 벡터로는 pUC 계열의 벡터, 예컨대, pBR322, pBI121, pCAMBIA, Gateway vector, Ti-plasmid 및 이에 파생된 벡타일 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 "핵산 서열을 발현 가능하게 연결된"은, 핵산 서열의 전사 및 번역이 프로모터에 의하여 조절될 수 있는 것을 의미한다.
상기 "프로모터 3' 방향"은 프로모터의 3' 말단에 대상 단백질을 암호화하는 핵산 서열이 직접 연결되거나 또는 인접하여 연결됨을 의미한다.
상기 선별 마커는, 통상적으로 화학적인 방법으로 선택될 수 있는 특성을 갖는 핵산 서열로, 형질전환된 세포를 비형질전환 세포로부터 구별할 수 있는 모든 유전자가 이에 해당된다. 그 예로는 글리포세이트(glyphosate) 또는 포스피노트리신(phosphinothricin)과 같은 제초제 저항성 유전자, 카나마이신(Kanamycin), G418, 블레오망신(Bleomycin), 하이그로마이신(hygromycein), 클로람페니콜(chloramphenicol)과 같은 항생제 내성 유전자가 있으나, 이로 한정되는 것은 아니다.
상기 전사종결부위는 통상의 전사종결부위를 사용할 수 있으며, 그 예로는 노팔린(nopaline) 합성 종결부위, 파세올린(phaseoline) 종결자, 아그로박테리움 투메파시엔스(agrobacterium tumefaciens)의 옥토핀(Octopine) 유전자의 종결자 등이 있으나, 이로 한정되는 것은 아니다.
상기 전사 조절 인자는, 통상의 당업계에 공지된 것일 수 있으며, 표적 식물에 따라 적절히 조합하여 사용할 수 있다.
상기 대상 단백질은 모든 종류의 식물 또는 동물 유래의 단백질일 수 있으며, 바람직하기로는 사용하는 식물 유래의 단백질일 수 있다. 그 예로, 색소 관련 단백질과 같은 화분의 표현형과 관련있는 단백질이거나, 교배 육종에 이용되는 단백질, 색소 관련 단백질, 예컨대 안토시아닌 색소류, 화분 생성에 관련된 단백질, 예컨대 지질전달 관련 단백질 등, 화분의 생식과 관련된 단백질, 또는 개약 관련 단백질들일 수 있지만, 상기 대상 단백질은 kanamycin, β-glucrinidase(Gus) 및, nopaline synthase로 이루어진 군으로부터 선택되고, 이로 한정되는 것은 아니다.
상기 벡터는 본 발명이 속하는 기술분야의 당업자라면 공지의 방법에 따라 용이하게 제조가능하다.
본 발명의 식물 약 특이 프로모터를 포함하는 벡터는, 통상의 방법에 따라 식물에 도입하여 형질전환된 식물을 제조할 수 있다. 형질전환 방법으로는 칼슘/폴리에틸렌 글리콜법을 이용한 원형질체의 형질전환법, 전기 천공법, 미량주사법, (코팅된) 입자 충격 투입법, 유전자 총, 및 물리적 도입 등이 있으나, 이에 한정되지 않으며, 식물의 종류에 따라 적절히 조절할 수 있다. 이와 같은 직접적인 유전자 형질전환 방법이외에도, 바이러스 벡터(예, 콜리플라워 모자이크 바이러스(CaMV)로부터 수득됨) 및 박테리아 벡터(예, 아그로박테리움 속으로부터 수득됨) 등의 벡터를 포함하는 형질전환 시스템을 널리 이용할 수 있다. 제조한 형질전환 식물을 선별 및 스크리닝한 후, 형질전환된 원형질체, 세포 또는 식물 부분을 공지의 방법에 따라 완전한 식물로 재생시킬 수 있다(Horsch, R. b. et al., 1985). 형질전환법 및 재생기술의 선택은 당업자에게 자명한 사항이다.
식물에서 약은 관상과 생식 이 두가지를 모두 가지고 있는 중요한 기관으로, 관상 측면에서 약의 꽃밥이 터짐으로 해서 관상적인 가치가 낮아져 상품성이 저해 되는 경우가 많다. 이때, 본 발명의 약 특이 프로모터의 조절하에 개약관련 유전자가 발현되도록 형질전환주를 제조함으로써, 정상적인 모양을 갖추면서도 꽃밥이 터지지 않는 상품성이 우수한 화훼작물을 육성할 수 있다. 또한, 채소 작물의 교배시, 교배 대상 작물중 모계 쪽의 작물의 약은 일반적으로 제웅작업을 거쳐 교배가 이루어지는데, 이때, 본 발명의 약 특이 프로모터의 조절하에 약 생식 관련 유전자가 발현되도록 함으로써, 별다른 제웅과정없이도 간단하게 교배를 수행할 수 있는 이점이 있다.
하기 실시예를 들어 본 발명을 상세히 설명한다. 하기 실시예들은 본 발명을 예시하기 위한 것일 뿐, 본 발명의 보호 범위를 한정하는 것은 아니다.
실시예 1 - 게놈 라이브러리의 제조 및 게놈 유전자 분리
오리엔탈 나리 아카풀코(Lilium hybrid cv. Acapulco)의 잎으로부터 머레이 및 톰슨(Rapid isolation of high- molecular-weight plant DNA. 1980)의 방법에 따라 게놈 DNA를 분리하고, 이를 이용하여 Lambda Fix II/XhoI 키트(Startagene) 및 ZAP-cDNA Gigapack cloning kit(Stratagene)으로 제조사의 지침에 따라 실시하여 게놈 라이브러리를 제작하였다.
꽃잎과 약에서 발현이 되는 ALCHS2 cDNA를 RediprimeTM II DNA 레이블링 시스템(Amersham)을 이용하여, 제조사의 지침에 따라 [α-32P]dCTP로 표지하여 프로 브를 제조하였다. 이 프로브로 상기 제조한 게놈 라이브러리를 스크리닝하여 gALCHS7(Genome Acapulco Lily Chalcone Synthase 7: 약 15. 0 kbp)를 분리하였고, 이를 EcoR I로 절단하여, ALCHS2를 포함하는 6.2 kbp의 클론을 확보하였다.
실시예 2: CHS 게놈 유전자의 염기서열 분석 및 전사 조절 부위 조사
약 6.0 kbp의 gALCHS7 클론의 염기서열을 분석하기 위하여, 수종의 제한효소로 절단하여 제한효소 지도를 작성하였다. 이 지도에 따라서, salI과 EcoRI으로 절단하여, pBluescript II SK(+) 벡터로 서브클로닝한 다음, ABI Prime 31O Genetic Anaiyzer(PE Apphed Biosystems)로 분석하여 전장 염기서열을 수득하였다. 총 6203 bp의 염기서열은 genescan (http:// genes. mit. edu)을 이용하여 엑손과 인트론 부위를 확인하였고, PLACE 데이터베이스(PLAnt Cis-acting regulatory DNA Elememt: http//www.dna.affrc.go.jp)에 전송하여 전사 조절 부위를 분석하였다. 그 결과는 하기 표 1에 나타낸다(하기 위치는, ATG를 기준으로 기재함)
인자 또는 부위 명칭 | 위치 | 서열 | 특징 |
GT1CONSENSUS | -362 | GRWAAW | 펙테이트 리아제(pectate lyase)에 대한 상동성을 포이는 토바코 후기 화분 유전자 g10의 프로모터에서 발견되는 GTGA 모티프 |
GTGANTG10 | -1264, -224 |
GTGA | 광-조절 유전자 다수에서의 보존적인 GT-1 결합부 |
INRNTPSADB | -1716, -1057 |
YTCANTYY | TATA 박스가 없는 토바코 psaDb 유전자 프로모터에서 발견된 "Inr(initiator)" 요소 |
INTRONLOWER | -1605 | TGCAGG | 3' 인트론-엑손 스플라이스 정션: 신물 인트론 하위 서열 |
MYB2AT | -1397, -132 |
TAACTG | ATMYB2에 대한 결합부, 아라비돕시스 MYB 상동체(TAACTG) |
MYBCORE | -1315 | CNGTTR | 플라보노이드 생합성 조절에 관여하는 페튜니아 MYB 결합 단백질 |
MYBPZM | -936 | CCWACC | 보존적 옥수수 P(myb 상동체) 결합부의 코어, 옥수수 P 유전자는 케르넬 페릭(kernel peric)의 붉은 색소 형성 |
POLLEN1LELAT52 | -1069 | AGAAA | 토마토 lat52 유전자의 화분 특이적인 활성화에 븐응하는 조절 요소 |
QELEMENTZMZM13 | -2811 | AGGTCA | 발현 증강에 관여하는 옥수수(Z.m.) ZM13 유전자 프로모터에서 발견된 모티프 |
ROOTMOTIFTAPOX1 | -556 | ATATT | rolD 및 뿌리 특이적인 밀 페록시다제 프로모터에서 발견된 모티프 |
CAAT BOX | -168 | CAAT | 진핵 유전자의 5'-플랭킹 부위에서 발현되는 일반적인 서열 |
실시예 3: 벡터 제작
6.2 kbp의 게놈 클론(gALCHS7)에서 5'-플랭킹 부위의 270 bp(서열번호 1)를 PCR을 이용하여 증폭한 다음 벡터 제작에 사용하였다. 상기 게놈 뵀Х隙◎주형으로 gSalI(정방향 프라이머: 5'-AACTCGGTGGTCGACACTCAGGGG-3') 및 gXbaI(역방향 프라이머: 5'-ATTTCTAGAACCGAAGATACTA-3') 프라이머로 증폭시킨 다음, SalI 및 XbaI으로 절단 및 분리하고, 동일한 제한효소로 절단한 벡터 pBI101에 연결하여, gALCHS7-7/GUS 벡터를 제작하였다(도 1) .
실시예 4: 형질전환 및 전환체 분석
Horsh 등(A Simple and general method for transferring genes into plants, 1985)의 방법을 변형한 리프 디스크(leaf disk) 방법으로, 아그로박테리움 균주 C58C1을 이용하여, 페튜니아(Dreams Red, PanAmerican Seed)로의 형질전환을 실시하였다.
구체적으로는, 기내에서 파종한 페튜니아 식물체를 총장 7 cm 정도로 키운 다음 1번에서 3번 엽만을 채취하여, 가로 및 세로 길이를 약 5 mm로 절단하고, 호르몬이 포함된 재분화 배지에 치상하여 1일간 배양하였다. 28 ℃에서 2일간 배양한 아그로박테리움 균주는 5,000 rpm으로 10분간 원심분리하여 그 침전물을 액체 배지에 희석하였다. 균 희석액과 절단한 잎을 혼합하여 10분간 접종한 후 재분화 배지에 치상하여 암상태에서 2일간 공동 배양을 실시하였다. 이틀 후, 공동 배양한 잎을 세포탁심 200 mg/L를 포함하는 액체 배지에 넣어 세척한 다음, 형질전환체 선별배지에 치상하였다. 형질전환체 선별 방법은 카나마이신(5O mg/L)이 포함된 배지에서 4주간 키운 슈트(shoot)를 다시 카나마이신(100 mg/L) 포함 배지로 옮겨, 3주간 배양하여 선별하였다. 선별한 형질전환체는 카나마이신이 포함되지 않은 발근 배지로 옮겨 약 4- 6주간 발근을 유도한 뒤 온실로 옮겨 순화시켰다. 선별한 형질전환체의 잎으로부터 DNeasy Plant Mini Kit(Qiagen, Germany)를 이용하여 게놈 DNA를 분리한 다음, NPTII 프라이머(프라이머 1: 5'- GAG GCT ATT CGG CTA TGA CTG - 3', 프라이머 2: 5' - ATC GGG AGC GGC GAT ACC GTA - 3')로 증폭하여 형질 전환 여부를 확인하였다. NPTII 프라이머로 형질전환 여부가 확인된 5 개체는 서던 방법(1975)으로, 서든 혼성화 반응을 수행하였다. 분리한 게놈 DNA 10 ㎍을 EcoR I으로 절단한 후, 0.7 % 아가로즈 젤에서 1 V/cm으로 18시간 동안 0.5 X TBE 완충용액으로 전기영동을 실시하였다. 베타-글루쿠로니다제(GUS)를 RediprimeTM II DNA Labeling system(Amersham)을 이용하여, 제조사의 지침에 따라 [α-32P] dCTP로 표지한 프로브를 서든 혼성화 반응에 사용하였다. 그 결과(도 2), 3개체에서 베타-글루쿠로니다제(GUS)의 삽입을 확인하였으며, 이후 이 개체는 증식 후 온실에서 순화하였다.
실시예
5:
GUS
발현 분석
GUS 활성은 페튜니아 형질전환체의 각 기관을 이용하여 조사하였다. 페튜니아 꽃에서 개약 전 단계의 잎, 꽃잎,약, 암술,자방을 면도칼로 자른 다음, 12시간 동안 37 ℃에서 Gallagher(GUS Protocols: Using the GUS gene as a reporter of gene expression, 1992)의 방법을 약간 변형하여 만든 GUS 용액에 침지하였다. 이때, 형질전환되지 않은 조직에서의 내생 GUS의 유사 발현을 억제하기 위하여, 20% 메탄올을 첨가하여 사용하였다(An improved assay for β-glucoronudase transfomed cells: methanol almost completely suppresses a putative endogenous β-glucoronudase activity, 1990).
GUS 발현 분석 결과(도 3), 시험에 사용한 전체 형질전환체 중 2개의 약에서 강한 발현을 확인할 수 있었다. 그 외에 다른 잎이나 꽃잎 수술대 등의 기관에서는 형질전환하지 않은 식물체와 동일하게, 어떠한 가시적인 GUS 발현도 확인할 수 없었다. 서던이 확인된 3개의 개체 중 나머지 1개의 개체에서는 개약전 약 외에 어 떠한 기관에서도 GUS 발현을 확인할 수 없었다.
실시예
6:
Dark
-
field
기법을 이용한
GUS
발현 분석
Dark-field로 관찰하기 위하여, 다음과 같은 두 가지 방법을 조합하여 시료를 고정하였다(Initiation patterns of flower and floral Organ development in Arabidopsis thaliana, Development, 1996: Method in short protocols in molecular biology, Unit 14.2-3). GUS 활성을 보인 2개체의 약을 GUS로 염색한 후, 상온에서 하기 용액으로 12시간 침지하여 고정시켰다(50% 에탄올, 5% 아세트산 및 3.7% 포름알데하이드). 일련의 에탄올 희석물(70%, 85%, 95%)을 이용하여 탈수한 다음, 크실렌(xylene)과 에탄올 희석물(1:3, 1:1, 3:1)을 이용하여 각각 1시간씩 침지시킨 다음, 100% 크실렌으로 각 1시간씩 2회 더 갈아주었다. 약 5 - 10 ml의 크실렌을 넣은 후 동량의 파라핀(paraplast, Fisher)을 첨가하여, 60 ℃ 오븐에서 12시간 두었다. 녹은 파라핀은 버리고 새로운 파리핀을 붓는 과정을 2- 3회 반복한 다음, 틀에 부어 고정한 후 절단에 알맞은 모양으로 다듬어 두었다. 파라핀 절단기기(Leica)를 이용하여 10 - 15 ㎛로 절단하고, 폴리-프렙 슬라이드(sigma)에 고정하여 37 ℃에서 12시간 정도 건조시킨다. 현미경 관찰을 위해, 시료가 고정된 슬라이드를 100% 크실렌에 12시간 녹인 다음 크실렌과 에탄올 희석물(1: 3, 1: 1, 3: 1)을 이용하여 탈수한 후, Permount(Fisher)를 도포하여 커버 슬립을 덮어 고정하였다. 이를 건조한 다음, dark-field가 장착된 현미경에서 100배 비율로 관찰하였다. 관찰 결과, 화분이 충분히 발달한 약에서는, 화분 뿐만 아니라 약의 지지조직(endothethium, epidermis)에서 강한 GUS 발현이 관찰되었으며(도 4), 다른 기관 즉, 자방이나 암술에서는 GUS 발현과 유사하게 어떠한 눈에 띄는 발현이 관찰되지 않았다. 따라서, gALCHS7-7 프로모터는 약과 약의 지지조직에서만 작동하는 프로모터임이 확인되었다.
상기한 바와 같은, 본 발명의 약 특이적인 프로모터는 형질전환으로 특정 형질을 도입하고자 하는 경우에, 효율 증대와 함께 정확한 발현체를 얻을 수 있어, 약에 특정 유전자를 도입한 후 교배 육종에 이용할 수 있다. 아울러, 관상 식물에 적용하여 정상적인 모양을 갖추면서도 꽃밥이 터지지 않는 상품성이 우수한 화훼작물을 육성할 수 있으며, 채소 작물에 이용하여 약 특이 프로모터의 조절하에 약 생식 관련 유전자가 발현되도록 함으로써, 별다른 제웅과정 없이도 간단하게 교배를 수행할 수 있는 작물을 육성할 수 있다.
<110> Rural Development Administration
<120> ANTHER SPECIFIC PROMOTER DERIVED FROM ACAPULO LILY, RECOMBINANT
VECTOR, TRANSGENIC PLANT AND PREPARATION METHOD
<160> 6
<170> KopatentIn 1.71
<210> 1
<211> 279
<212> DNA
<213> Lilium hybrid cv. Acapulco
<400> 1
aactcggtgg tttacactca ggggacttgc tacgaaccaa attttaaaac tgccagtatg 60
gtggaaataa acttctctcc gcctcttctg tccttgggga ataagattca aaccccttca 120
atcgaggtta tcgatgccgc cacgttgctt agttaactgc ttgttcccaa ctatccatct 180
ccctataaaa cctttcgccc catacaacct tcacttcatc tctctccatc cactacacct 240
gctctgcatt ctagtccgac tccgatagta tcttcggtt 279
<210> 2
<211> 1604
<212> DNA
<213> Lilium hybrid cv. Acapulco
<400> 2
gcacatgtgc agggtcaaca aggcgtctcc gacaaactca tacacgggca tacaggctgg 60
cccatgccct ggtccaaacg acatcgaagg acagtctcct ccggctccgg cgggaagacc 120
cgtgtgccca atcggtgggt atccctagga tatccatgcc cgacacccac aggatgaccc 180
gtgtgccagg acaaactaca caataaccag taccttaact gacttctcga cataacatca 240
catatcgcat ttaatgtgct gacctaggag ttgacgtgtt gtcccttctg ttggatcgct 300
aggctacgta tgctcaacaa atagtcacac cgacctaagt gatttgacga ctcataggca 360
tatgcgtgga tccttggaac tcgactccac agtcacccct agtgcatata aaaagcctcc 420
tccactcccc tttgaggggg taagctttac agactctttg cacgtatata atatgtccgg 480
atcggagcac aggtactctg ctcacctaag agcggtcagc tgcccagtat cgtagaaact 540
cgacactcac tctcacatcg gaggagtgtc gcggggatac gtccatgcga ccatgtttag 600
gtgtttcttg tgctcgcagg tctcgacgac gacctcatcc gtaccagcct gagctctccc 660
agttctccaa ccactacgat ggaacgtttg tctccagttc gaccctgcga gcgccctgct 720
cacccaggtc ggagctccac tagctcgtag cccggatctg actgtctcta cgcacacgcc 780
cggctagagc tctaccagct cgcagcctgg atccgaccat ctccgcgtcc atgacaggcc 840
agagctccac tagctcgccg gacaaatcct cgacgcccat gcccgtggtt ggccatttcc 900
cgcatcctcg cctccgaaca aaactcaaca agccaggaat ctgaagcgta gtgtcacgtc 960
agaccccgct gaagaaggac gtcatcacaa ccaatttatt ttgacgtcat caataagtaa 1020
tcttaaatct gcattctcca aaacatatat ttttgtcatt gaacttatta agtattagac 1080
atttctttta cttggtcatt gatgtcgccg aaatcattcc actgaactct aacaccaaat 1140
tgttcaacta tatctaattc taaaaataag attatatgca acacttcggt accaatttgt 1200
tcggctatgt caaactctac aaataaaatt aataaaatat atgtgatcga ccaattattc 1260
aaagagatca taatcggtcc caatgttaga aggtacacaa aatcgttgtc ccaaaaacaa 1320
ctcggtggtt tacactcagg ggacttgcta cgaaccaaat tttaaaactg ccagtatggt 1380
ggaaataaac ttctctccgc ctcttctgtc cttggggaat aagattcaaa ccccttcaat 1440
ccgaggttat cgatgccgcc acgttgctta gttaactgct tgttcccaac tatccatctc 1500
cctataaaac ctttcgcccc atacaacctt cacttcatct ctctccatcc actacacctg 1560
ctctgcattc tagtccgact ccgatagtat cttcggttct aaca 1604
<210> 3
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer, gSall
<400> 3
aactcggtgg tcgacactca gggg 24
<210> 4
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer, gXbaI
<400> 4
atttctagaa ccgaagatac ta 22
<210> 5
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 5
gaggctattc ggctatgact g 21
<210> 6
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 6
atcgggagcg gcgataccgt a 21
Claims (8)
- 서열번호 1의 핵산단편으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 식물 약 특이 프로모터.
- 서열번호 2의 염기서열로 이루어진 것을 특징으로 하는 식물 약 특이 프로모터.
- 제 1항 또는 제 2항에 따른 식물 약 특이 프로모터의 3' 방향에 대상 단백질에 대한 유전자가 발현되도록 연결된 벡터를 제조하고, 상기 벡터를 식물에 형질전환하여 식물 약에서 상기 대상 유전자 및 단백질의 발현을 유도하는 것을 포함하는 대상 단백질이 약에서 특이적으로 발현되는 식물의 제조 방법.
- 제 3항에 있어서, 상기 대상 단백질은 kanamycin, β-glucrinidase(Gus) 및, nopaline synthase로 이루어진 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법.
- 제 1항 또는 제2항에 따른 식물 약 특이 프로모터를 포함하는 벡터.
- 제 5항에 따른 벡터로 형질전환된 식물 조직 배양법, 삽목, 또는 분주에 의한 무성번식되는 식물.
- 제 6항의 식물로부터 수득되는 식물의 단편 및 식물 세포로 이루어진 군으로부터 선택되는 것을 포함하는 식물.
- 제 6항에 있어서, 상기 식물은 농작물, 화훼작물, 채소작물 및 과수작물로 이루어진 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 식물.
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