KR100951057B1 - 면역특이단백질 항원을 사용하는 우결핵 특이 효소면역진단키트 및 이를 이용한 우결핵 진단방법 - Google Patents
면역특이단백질 항원을 사용하는 우결핵 특이 효소면역진단키트 및 이를 이용한 우결핵 진단방법 Download PDFInfo
- Publication number
- KR100951057B1 KR100951057B1 KR1020070118743A KR20070118743A KR100951057B1 KR 100951057 B1 KR100951057 B1 KR 100951057B1 KR 1020070118743 A KR1020070118743 A KR 1020070118743A KR 20070118743 A KR20070118743 A KR 20070118743A KR 100951057 B1 KR100951057 B1 KR 100951057B1
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- ala
- leu
- val
- gly
- arg
- Prior art date
Links
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6803—General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S435/00—Chemistry: molecular biology and microbiology
- Y10S435/975—Kit
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
본 발명은 우결핵 특이 효소면역진단 키트 및 이를 이용한 우결핵 진단방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 우결핵균의 단백질항원 중 면역특이단백질 항원인 MPB70 등을 이용한 효소면역측정법을 통하여 신속하고 정확하게 우결핵을 진단하는 우결핵 특이 효소면역진단 키트 및 이를 이용한 우결핵 진단방법에 관한 것이다.
우결핵, 정제단백질, 효소면역측정법, 피내검사
Description
본 발명은 우결핵 특이 효소면역진단 키트 및 이를 이용한 우결핵 진단방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 우결핵균의 단백질항원 중 면역특이단백질 항원인 MPB70 등을 이용한 효소면역측정법을 통하여 신속하고 정확하게 우결핵을 진단하는 우결핵 특이 효소면역진단 키트 및 이를 이용한 우결핵 진단방법에 관한 것이다.
1. 우결핵 혈청진단법의 특성
결핵은 사람과 동물에 공중보건적 및 경제적으로 심각한 피해를 일으키고 있다. 마이코박테리움 튜버클로시스 , 마이코박테리움 보비스 , 마이코박테리움 마이크 로티 및 마이코박테리움 카네티를 포함하는 마이코박테리움 튜버클로시스군은 결핵 을 일으키는 주요한 마이코박테리움 속균이며, 소에서는 특히, 마이코박테리움 보비스가 직접적인 결핵원인균이다. 사람 결핵에서와 같이 우결핵은 지연형 과민반응에 의한 진단, 즉, 결핵유래 단백질체의 피내접종 후 종창 및 경결을 관찰하여 진단하는 것이 일반적으로 사용되고 있다. 그러나, 이 진단법은 피내접종과 3일후 관찰이라는 큰 불편함이 있어 특이항체가 측정에 의한 진단법 개발에 대한 연구가 계속되어 왔다. 우결핵의 야외 공인진단법으로 쓰이고 있는 피내진단법은 우결핵항원에 대한 면역반응 중 탐식세포 및 T 세포 등이 관여하는 세포성 면역반응 정도를 측정하는 것이다. 이러한 세포성 면역반응은 우결핵 병변이 진행됨에 따라 증가하다가, 우결핵 말기에서는 감소하는 일반적인 경향을 보인다. 한편, 우결핵 항원에 대한 항체 반응은 우결핵 초기에는 반응을 나타내지 않다가, 우결핵 병변이 진행됨에 따라 서서히 증가하는 경향을 보이고 있다. 따라서, 세포성 면역반응이 감소하는 시기에 우결핵 항원에 특이적으로 반응하는 항체를 측정하는 것은 세포성면역반응을 이용한 피내진단법에서 나타날 수 있는 우결핵 감염후기개체의 음성진단결과를 우결핵 특이항체 검출에 의해 양성으로 진단할 수 있어서 체액성면역반응을 이용한 우결핵특이항체 진단법은 세포성면역반응을 이용한 피내진단법과 상호보완적인 진단법으로 유용하다. 우결핵은 세계적으로 피내진단, 도축장 육안 결절검사 및 병리조직학적 및 세균유전학적 확진을 공인 진단법으로 채택하고 있다. 우결핵 진단에 있어 피내진단과 상호보완적인 혈청진단법을 병용한다면, 양성개체 탐색율을 더욱 향상시킬 수 있을 것으로 사료된다. 또한, 도축장 검사에서 육안결절 검사와 더불어 도축우 혈청검사를 통한 우결핵 검진법이 적용된다면, 도축장에서 우결핵 검색율이 향상되는 효과를 가져올 수 있다.
우결핵 혈청학적 진단법으로 적용된 것을 살펴보면, 보체결합반응, 효소면역측정법, 면역크로마토그래피 및 라텍스비드 응집반응 등을 들 수 있다[재검토를 위해 Koo 일행, 2004와 2005]. 효소면역측정법은 96웰 플레이트에 특이항원을 코팅하여 혈청을 반응시킴으로써 혈청내의 특이항체 양을 측정하는 방법으로서 대량의 시료를 동시에 처리가 용이한 방법이며, PPD, MPB70, ESAT-6 등의 특이항원 단백질을 이용한 검사법이 연구되어져 왔다[재검토를 위해 Harboe 일행, 1990; Cho, 1998]. 면역크로마토그래피는 특이항원을 나이트로셀룰로오스막에 코팅하고 혈청을 흘려보내줌으로써 항원, 항체 반응유무를 육안적으로 관찰하는 진단법으로서 신속하게 판독장비 없이 용이하게 진단할 수 있는 진단법이며, 주로 재조합 단백질 항원, MPB70, MPB83, ESAT-6, CFP10 등이 활용되어 왔다[재검토를 위해 Lyashchenko 일행, 1998]. 라텍스비드 응집반응은 특이항원을 라텍스 비드에 결합시키고 혈청을 반응시킴으로써 항원, 항체 응집 복합체를 육안적으로 관찰하는 방법으로서 면역크로마토그래피와 마찬가지로 신속하고 판독이 용이한 장점을 갖고 있다.
이러한 혈청학적 진단법은 여러 연구자 보고에 따르면, 특이성과 민감성에서 많은 차이를 보이는데, 일반적으로 특이성은 높은 반면, 민감성은 낮은 경향을 보이고 있다[재검토를 위해 Fifis 일행, 1992]. 이러한 결과는 결핵균의 증식속도가 느리고 이에 따라 일어나는 면역반응이 1차적으로 세포성 면역반응이 주를 이루고 2차적으로 체액성면역반응인 항체반응이 뒤따르는데 따른 특징으로 보인다. 따라서, 사람에서도 현재까지 사람결핵의 원인균인 마이코박테리움 튜버클로시스의 항 원 중 특이성이 뛰어난 항원은 아직 발견되지 않고 있다 [재검토를 위해 Garg 일행, 2003]. 따라서, 많은 연구자들이 결핵의 특이 항원을 찾아내고, 재조합 단백질과 천연 단백질을 이용하여 효소면역측정법, 면역크로마토그래피 및 라텍스비드 응집반응 등의 혈청학적 진단법 개발을 해오고 있으나, 아직까지 상용화되어 국가방역상 사용되는 예는 극히 제한적이며, 피내진단이나 결절검사를 대체할 공인진단법으로 활용되지는 못하고 있으며, 결핵진단을 보완 내지 보조하는 진단법으로 활용되고 있다.
2. 우결핵 효소면역측정법 특성 및 진단용 항원
효소면역측정법은 대량·신속·정확한 진단법으로 질병진단에 있어 널리 활용되고 있다. 이에 덧붙여서, 효소면역측정법의 결과는 흡광도라는 수치로 표현되기 때문에 진단결과의 객관성 확보라는 결정적인 장점도 가지고 있다. 효소면역측정법에 이용할 수 있는 시료들은 항체를 가지고 있는 체액들, 예를 들면, 혈청 및 우유 등을 이용할 수 있다. 또한, 효소면역측정법에 활용하는 2차 항체의 면역글로블린 서브클래스에 따라 각각의 서브클래스별 면역글로블린 양을 알 수 있고, 이를 통하여 T 세포 아군의 면역반응 관여 정도를 간접적으로 알 수 있다. 효소면역측정법은 개체의 사전과 사후에 모두 검사할 수 있으며, 효소면역측정법의 관건은 특이성과 민감성이 뛰어난 항원의 사용이라고 할 수 있겠다. 특히, 특이성은 뛰어나지만 민감성이 낮기 때문에 특이성을 유지하면서 민감성이 높은 항원을 구성하는 것이 앞으로의 과제라 할 수 있다.
효소면역측정법에 가장 널리 활용되고 있는 항원은 피내진단 항원으로 활용되고 있는 PPD와 분비항원 중 가장 많은 부분을 차지하고 면역원성이 우수한 MPB70 항원이다[재검토를 위해 Lightbody 일행, 2000]. 최근에는 MPB70과 비슷한 생화학적 성상을 가지고 있는 MPB83이 뛰어난 우결핵 항원으로 주목을 받고 있다[재검토를 위해 McNair 일행, 2001; Amadori 일행, 2002]. 우결핵균은 그 유전체가 완전 해독되었고, 4,000여개의 단백질이 표현되는 것으로 밝혀졌다[재검토를 위해 Garnier 일행, 2003]. 이중 면역학적으로 Antigen 85와 ESAT-6, CFP10 등이 새로운 항원으로 많이 연구되고 있다[재검토를 위해 Linenbaum 일행, 2001]. 특히, ESAT-6와 CFP10은 우결핵균이 초기에 분비하는 단백질항원이기 때문에 이를 이용한 혈청 내에서의 조기 항체 진단가능성 때문에 효소면역측정법에 적용하는 연구가 진행되고 있다[재검토를 위해 Liu 일행, 2007].
우결핵을 검진하는 모든 나라에서는 우결핵균 배양상층액 단백질인 피피디의 피내접종에 의한 지연형 과민반응정도를 측정함으로써 진단하고 있다. 피피디 피내검사에 의해 성공적으로 우결핵을 근절한 나라도 있으며, 우리나라도 우결핵 피내검진과 양성우 살처분 등의 일관된 방제대책으로 1960년대 0.56%이었던 양성율이 2006년 현재 0.16%로 감소시켰다. 피내진단법의 이러한 성공적인 결과에도 불구하고, 피내진단법이 가지고 있는 단점들 때문에 많은 과학자들이 피내진단을 보완할 수 있는 진단법을 개발하고자 연구하여 왔다. 피내진단법의 단점은 첫째, 혈청진단법과 달리, 접종 시와 접종반응 측정 시, 두 번 개체를 보정해야 한다는 점이다. 둘째, 결핵병변이 심하게 진행된 개체에서는 피내진단항원에 대한 지연형 과민반응 이 나타나지 않아 음성으로 진단될 수 있다는 점이다. 이점은 결핵후기 개체가 결핵초기 개체보다 우결핵균 배설량과 배설빈도가 더 많아 전파위험성이 높다는 점을 고려할 때, 이를 보완할 수 있는 진단법의 개발이 요구되어 왔다. 따라서, 혈청 내에 있는 우결핵 특이항체가를 측정함으로써 우결핵을 진단하고자 하는 연구들이 계속되고 있다.
이에 본 발명자들은 현재 우결핵 진단법인 피내검사의 단점을 보완하기 위해 혈청내의 우결핵 특이항체가를 측정하는 효소면역측정법을 개발하고자 연구를 거듭한 결과, 우결핵균 배양상층액으로부터 순수정제한 면역특이단백질 항원을 이용한 효소면역측정법을 통하여 신속하고 정확하게 우결핵을 진단할 수 있음을 발견하고 본 발명을 완성하게 되었다.
따라서, 본 발명의 목적은 우결핵 스크리닝 진단용 효소면역측정 키트 및 이를 이용한 우결핵 진단방법을 제공하는 것이다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명에서는 서열번호 1 내지 10의 우결핵 면역특이단백질 항원을 이용한 우결핵 스크리닝 진단용 효소면역측정 키트 및 이를 이용한 우결핵 진단방법을 제공한다.
본 발명에서는 면역특이단백질 항원을 포함하는 효소면역측정 진단키트를 이용하여 혈청으로 우결핵을 대량으로 신속하게 스크리닝하여 진단을 할 수 있었고, 결핵 피내진단과 도축장 결절검사 등의 우결핵 진단법을 보완하여 우결핵의 검색율을 높일 수 있었다.
우결핵은 마이코박테리움속균 중 우결핵균인 마이코박테리움 보비스가 호흡기와 소화기 계통에 감염되어 경우에 따라 기침, 콧물, 설사, 변비 및 쇠약 등의 임상증상을 보일 수 있는 만성소모성 질병이다. 우결핵균은 다른 고병원성 마이코박테리움속균들과 마찬가지로 세대시간이 24시간 정도로 일반세균에 비해 상당히 긴 것을 특징으로 한다. 따라서, 우결핵균은 체내에 감염되어도 서서히 증식하는 특성을 갖고 있다. 면역반응에 있어 우결핵균의 특징은 일반세균이 감염된 후 탐식되어 제거되는 과정을 거치는 것과는 달리, 탐식된 후에도 그 탐식세포 내에서 생존할 수 있는 능력을 가지고 있다는 점이다. 이에 근거하여 기존 우결핵의 진단은 우결핵 단백질항원을 미근부 또는 경부 피내에 접종하여 72시간 후 접종부위의 지연형 과민반응정도를 검사해 왔다.
우결핵에 감염된 소는 소뿐 아니라 사람에게도 전염시킬 수 있기 때문에, 축산업뿐만 아니라 인류 보건을 위해서도 방제되어야 할 중요한 인수공통전염병이다. 따라서, 우결핵으로 진단된 소는 소각 또는 매몰 등의 방법으로 우결핵균 전파를 미연에 방지하고 있다.
본 발명은 우결핵균의 배양상층액 중 정제된 면역특이단백질 항원을 이용하는 효소면역측정법을 통하여 우결핵을 보다 신속하고 정확하게 진단하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에서 사용하는 면역특이단백질 항원으로는 각각 서열번호 1 내지 10으로 표현되는 MPB70, MPB83, MPT64, Fas, Smc, Nrp, RpoC, 유전자전위효 소(Transposase), LeuA 및 MbtE 등의 단백질들을 들 수 있다.
본 발명은 상기 서열번호 1 내지 10으로 표현되는 MPB70, MPB83, MPT64, Fas, Smc, Nrp, RpoC, 유전자전위효소(Transposase), LeuA 및 MbtE를 포함하는 우결핵 효소면역진단용 키트에 관한 것이다.
또한 본 발명에서는 소 혈청을 이용하여 우결핵 특이항체를 진단할 수 있는 효소면역측정진단키트를 이용하여 우결핵을 신속하고 정확하게 진단하는 방법을 제공한다.
본 발명에 의한 우결핵 진단방법은 하기 단계들을 포함한다:
1) 서열번호 1 내지 10으로 표현되는 면역특이단백질 항원을 플레이트에 코팅한 후 젤라틴을 처리하여 항원 표면을 봉쇄하는 단계;
2) 우결핵 특이 항체를 처리하여 플레이트에 코팅된 면역특이단백질 항원과 특이 결합시키는 단계; 및
3) 상기 특이결합된 항체의 양을 측정하기 위하여 퍼옥시다아제가 부착된 2차 항체를 첨가한 후 발색반응을 관찰하는 단계.
상기 과정을 보다 상세히 살펴보면, 먼저, 96웰 엘라이자 플레이트에 우결핵균 배양액으로부터 정제한 특이항원을 코팅한 다음, 각 웰에 젤라틴을 처리하여 표면을 봉쇄하여 이후 항체가 웰에 결합할 수 없도록 하였다. 혈청을 각 웰에 접종하여 혈청내의 항체 중 웰 표면에 코팅된 항원과의 특이결합을 하도록 하였다. 특이항원과 결합한 특이항체의 양을 측정하기 위해 소 항체에 대한 항체에 퍼옥시다아제를 부착시킨 2차 항체[친화성 정제 항체 퍼옥시다아제 라벨된 염소 항- 소(Affinity purified antibody peroxidase labelled goat anti-bovine) IgG(H+L); Kirkegaard & Perry Laboratories, Gaithersburg, Maryland, USA]를 첨가하여 결합시킨 다음, 기질(ABTS, 2,2'-아지노(azino)-비스(3-에틸벤조티아졸린(ethylbenzothiazoline)-6-설폰산)디암모늄염; Sigma Co., St. Louis, MO, USA)을 첨가하여 발색반응을 관찰하였다. 발색정도는 흡광도로 측정하였으며, 음성 흡광도의 2배되는 흡광도를 보이는 개체를 양성으로 판정하였다. 매 실험마다 음성 흡광도는 0.2에서 0.4의 범위에 있어야 유효한 실험으로 인정한다.
기존 우결핵 효소면역측정법은 피내진단액으로 사용하는 피피디, 면역원성단백질로 동정되어 이를 유전자재조합기법으로 생산한 단백질인 MPB70(재조합 MPB70) 등을 이용한 효소면역측정법이 주로 사용되었는 바, 본 발명에서는 기존의 피피디와 재조합 MPB70를 이용한 효소면역측정법과 우결핵균 배양 상층액으로부터 분리 정제한 면역원성 단백질을 이용한 효소면역측정법을 비교하였다.
우결핵 진단 시 종래의 피내진단법 대신에 본 발명에 의한 효소면역측정법을 적용한다면, 채혈시 1회 보정, 진단시간 3일에서 2일로 단축 및 진단결과의 객관성 제고 등의 효과를 얻을 수 있다. 더욱이, 우결핵균 감염에 따른 세포성면역반응은 초기에는 항체반응에 앞서 나타나며, 후기로 갈수록 차차 감소하는 반면, 항체반응은 후기로 갈수록 증가하는 경향을 보이기 때문에 만약 결핵 감염후기에 피내진단을 적용했을 때는 감염되었음에도 불구하고 음성으로 나타날 수 있으며, 이 시기에 높게 형성된 항체를 측정함으로써 결핵을 진단할 수 있다. 현재 혈청을 이용한 소 질병진단은 브루셀라 등 주요 가축전염병에 대해서 실시하도록 되어있는바, 주요 가축전염병 진단용 혈청을 공동 활용할 수 있기 때문에 진단 노동력과 시간을 그만큼 절감하는 효과를 가져 올 수 있다. 본 발명에서 개발된 효소면역측정키트로 우결핵 진단이 보완된다면, 우결핵 양성우의 색출이 강화되어 우결핵 방제를 통한 농장위생제고와 인류보건 향상에 이바지할 것이다.
이하, 실시 예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시 예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로서, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시 예에 의해 제한되지 않는다는 것은 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.
[실시예 1] 사용균주 및 배양조건
우결핵균으로서는 마이코박테리움 보비스 AN5(ATCC 35726)를 사용하였다. 동결건조되어 냉동보관(-70℃)되어 있던 균주를 LJ 사면배지[LJ(Lowenstein-Jensen) 기본 배지(Difco Co.) 37.2 g, D.W. 600㎖, 전체 계란(whole eggs) 1,000㎖]에 접종하여 37℃에서 8주간 배양한 균태를 스파툴라 루프(spat㎕a loop)로 소톤(Sauton) 배지[아스파라긴 4.8g, 시트르산 2.4g, MgSO4 0.6g, K2HPO4 0.6 g, 구연산철암모늄(ferric ammonium citrate) 0.06g, 글리세린 72㎖, ZnSO4 0.0096g, CuSO4 0.0012g, 암모니아수 2.70 ㎖, D.W. 1,200㎖, pH 7.2]를 10㎖씩 소분한 배양액의 액면에 균체를 부유시켜 37℃에서 8주간 배양하여 종균주로 하였다.
종균주는 니아신 테스트(niacin test), 질산 환원 테스트(nitrate reduction test), 카탈라아제 테스트(catalase test) 및 Tween 80 가수분해 테스트(hydrolysis test)의 생화학시험과 PCR(polymerase chain reaction; 중합효소연쇄반응)에 의한 IS6110과 IS1081의 특이유전자를 검사하여 동정하였다.
IS6110 특이유전자 검사를 위한 프라이머 서열과 반응조건은 다음과 같다: 서열번호 15의 IS6110 유전자를 주형으로 하고 서열번호 11 및 12의 프라이머를 사용하여 95℃에서 5분간 예비변성한 후 95℃에서 45초간 변성, 60℃에서 45초간 어닐링 및 72℃에서 45초간 확장하는 사이클을 35회 거친 다음 72℃에서 10분간 확장하였다.
IS1081 특이유전자 검사를 위한 프라이머 서열과 반응조건은 다음과 같다: 서열번호 16의 IS1081 유전자를 주형으로 하고 서열번호 13 및 14의 프라이머를 사용하여 95℃에서 5분간 예비변성한 후 95℃에서 1분간 변성, 60℃에서 1분간 어닐링, 및 72℃에서 1분간 확장하는 사이클을 35회 실시하였다. 10㎖의 소톤(Sauton) 배지에 배양된 종균주를 100㎖씩 소분한 소톤(Sauton) 배지 액면에 다시 계대하여 37℃에서 8주간 배양하였다.
1. 니아신 테스트(niacin test), 질산 환원 테스트(nitrate reduction test), 카탈라아제 테스트(catalase test) 및 Tween 80 가수분해 테스트(hydrolysis test)의 생화학시험
1) 니아신 테스트 (niacin test)
LJ 사면배지에 3주 이상 배양하고 뚜렷이 배양된 균을 사용하였다. 2ml 멸균 증류수나 식염수를 사면배지의 표면에 첨가하였다. 주사침으로 사면배지를 자르거나 찔렀다. 사면배지를 37℃, 2시간 정치배양하거나, 실온에서 20분간 사면배지를 수평으로 놓거나 121℃, 30분간 사면배지를 수평으로 놓았다. 5분간 사면배지를 정치하였다. 이 용액을 1ml를 취하여 시험샘플로 사용하였다. 니아신 테스트 키트(HiMedia, India)의 Part A 1ml를 Part B 1ml에 첨가하였다. 시험샘플 1ml를 주사기로 시약(Part A + Part B)에 첨가하였다. 5분 내에 노란색으로 변하면 양성이며, 우결핵균은 5분 내에 노란색으로 변화하지 않는 니아신 음성이다.
2) 질산 환원 테스트(nitrate reduction test)
3-5주 배양된 균으로 실험하였다. 한 루프의 배양균을 질산 환원 테스트 키트 (HiMedia, India)의 R056에 무균적으로 풀고 잘 섞어주었다. 37℃ 항온수조에서 2시간 배양한다. 0.1N HCl 2방울을 첨가하였다. 질산 환원 테스트 키트(HiMedia, India)의 R060 2-3방울을 배양된 R056에 무균적으로 첨가하였다. 30-60초 내에 빨간 색으로 변하면 양성이며, 우결핵균은 색깔변화가 없는 음성이다.
3) 카탈라아제 테스트(catalase test)
카탈라아제 테스트 키트(HiMedia, India)의 카탈라아제 버퍼 R057 0.5ml에 시험균주를 풀었다. 항온수조에 68℃, 20분간 튜브를 놓았다. 튜브를 제거하고 실온에 식혔다. 신선한 카탈라아제 시약 R058 0.5ml을 첨가하였다. 20분 동안 용액의 표면에 기포생성유무를 관찰하였다. 기포가 생성되면 양성이며, 우결핵균은 기포가 생성되지 않는 음성이다.
4) Tween 80 가수분해 테스트(hydrolysis test)
0.067M 인산 완충액(pH 7) 100ml과 Tween 80 0.5 ml, 0.1% 수용성 뉴트럴 레드(neutral red)를 순서대로 섞고 121℃, 10분간 멸균시키고 갈색병에 담아 4℃에 보관하면서 기질로 사용하였다. 기질이 담겨진 튜브에 3 mm의 균괴를 풀고 37℃에서 배양하였다. 1, 5, 10일째에 기질 튜브가 분홍색 또는 빨간색으로 변하는 지를 관찰하였다. 10일후에도 색깔변화가 없으면 음성이며, 우결핵균이 이에 해당된다.
2. IS6110과 IS1081의 특이유전자(도 1a 및 도 1b 참조)
1) 서열번호 15의 IS6110과 서열번호 16의 IS1081은 마이코박테리움 보비스를 유전자적으로 특이검색하기 위한 부위이다. 이 유전자 유무를 확인함으로써 마이코박테리움 보비스로 동정할 수 있다(http://genolist.pasteur.fr/BoviList/).
3. PCR에 사용한 프라이머의 염기서열
IS6110과 IS1081 PCR에 사용한 프라이머 염기서열은 하기 표 1에 나타내었다:
프라이머 서열 | ||
IS6110 PCR | 프라이머 F | 5' - GGACAACGCCGAATTGCG - 3' (서열번호 11) |
프라이머 R | 5' - TAGGCGTCGGTGACAAAGGCCAC - 3' (서열번호 12) | |
IS1081 PCR | 프라이머 F | 5' - AAGCGAGCTGAACGCGCACTG - 3' (서열번호 13) |
프라이머 R | 5' - TGGATGCCCAGGATCTCTCGG - 3' (서열번호 14) |
[실시예 2] 단백질추출 및 침전
상기 실시예 1에서 8주간 배양한 균액의 잡균오염 유무를 육안 및 항산성 염색으로 확인하여 오염여부를 확인한 후, 배양된 균액을 잘 흔들어 균막을 배지 중에 완전히 가라앉혀 진탕부유시키고 100℃ 증기압에서 3시간동안 살균하였다. 살균된 것을 실온에서 냉각한 다음 60 메쉬의 동망으로 여과하고 이어서 여과지로 여과하여 투명한 황갈색의 액체를 12,000 rpm, 30분간 원심침전시켰다. 그 상층액에 암모늄 설페이트(ammonium sulfate)가 85% 되게 용해시켜 단백질을 침전시킨 후, 10,000×g에서 10분간 원심침전하여 2부피의 멸균 PBS에 재부유하여 멸균 PBS로 투석막(MWCO 3,500)을 이용하여 암모늄 설페이트를 제거하였다. 투석 후 BCA 단백질 분석 키트(BCA protein assay kit, Pierce Co.)로 단백질 농도를 측정한 다음, 진공원심농축기를 이용하여 건조시켜 정제에 공시하였다.
[실시예 3] 특이단백질 정제
상기 실시예 2에서 건조시킨 단백질을 음이온 교환수지 크로마토그래피인 MonoQ HR5/5과 FPLC 시스템을 이용하여 분획하였다(도 2). 이를 위하여 건조된 단백질을 버퍼 A(30mM 트리스-HCl w/ 2% 부탄올, pH 8.8)에 9.5㎎/㎖ 농도로 재부유하였다. 유속을 분당 1㎖로 하였으며, 바이알(vial)당 1㎖을 분획하였다. 6번 분획부터 26번 분획까지 20개 분획은 NaCl 농도를 0 에서 1M까지 직선성으로 경사를 주었고, 26번 분획부터 31번 분획까지 5개 분획은 1M에서 2M까지 직선성으로 경사를 주었다.
도 2에서 X축은 흘려보낸 버퍼의 양을 나타내며, Y축은 단백질 측정파장인 280 nm에서의 흡광도를 나타낸다. X축상의 빨간색 번호는 수집한 분획의 수이며, 초록색은 버퍼의 염농도 경사를 보여준다. 원 단백질 9.5 mg/ml을 MonoQ HR5/5에 로딩하고, 버퍼를 흘려보내준 후 1번부터 5번까지는 염농도 경사를 가해주지 않은 상태에서 분획을 수집하였으며, 6번 분획부터는 염농도 경사를 초록색 그래프에서 보여주는 것과 같이 가해주었다. 각각의 수집된 분획에 대한 흡광도 결과는 파란색그래프와 같이 나타났으며, 높은 흡광도를 나타낸 분획인 1번, 2번, 3번, 18번, 19번, 20번 및 21번 분획에 대해 단백질 분석 및 면역원성을 확인하였다.
도 3에서 나타난 바와 같이 염농도 경사없이 수집한 분획 중 2번 분획은 25 kDa, 20 kDa 및 10 kDa 등을, 3번 분획은 20 kDa과 10 kDa 단백질이 함유되어 있음을 확인할 수 있었고, 18번, 19번, 20번 분획도 20 kDa과 10 kDa의 단백질이 함유되어 있음을 확인할 수 있었다(도 3의 왼쪽 그림). 도 3의 오른쪽그림은 단백질이 함유된 각각의 분획이 전개된 SDS-PAGE 젤의 단백질을 나이트로셀룰로오스 멤브레인으로 옮긴 후, 우결핵균 AN5(우결핵 표준균주)를 인공감염시킨 소 양성혈청과 반응시킨 결과이다. 그림에서 관찰된 바와 같이, 염농도경사전 분획중에는 2번과 3번 분획이, 염농도경사후 분획중에는 18번과 19번 분획이 20 kDa에서 양성혈청과 뚜렷한 반응을 보여 이 단백질이 면역원성 단백질임을 확인하였다. 분획된 단백질중 우결핵 효소면역측정법에 활용할 적합한 항원은 염농도경사를 가해준 후에 수집된 분획중 면역원성이 뚜렷이 확인된 18번과 19번 분획임을 알 수 있었다. 18번과 19번 분획의 면역원성 단백질을 동정하고자 각각의 분획을 1차원 전기영동으로 전개하였으며, 면역원성이 확인된 20 kDa 부위를 각각 절단하여 트립신으로 단백질을 분해한 다음, 분해된 펩타이드를 질량분석기와 우결핵균 단백질에 대한 아미노산서열의 데이터베이스를 이용하여 동정하였다. 18번 분획은 MPB70, MPB83, MPT64, Fas, Smc, Nrp, RpoC, 유전자전위효소(Transposase), LeuA 및 MbtE 등 10종의 단백질이, 19번 분획은 MPB70, MPB83, MPT64, CFP21, 분지산변위효소(chorismate mutase), GroEL, PepA, FixB, PpiA, LppX, GreA, CFP10, MPT32, EsxN, Fas, Mb3713c 및 RpoC 등 17종의 단백질이 함유되어 있음을 확인하였다. 이들 단백질들의 아미노산 서열 번호는 표 2와 같다. 이들 두개의 분획과 이전의 우결핵 효소면역측정법용 항원인 피피디, 재조합 MPB70을 비교하였다.
일련번호 | 면역원성 단백질 | 해당 분획 | 아미노산 서열번호 |
1 | Smc | 18 | 5 |
2 | Nrp | 18 | 6 |
3 | 유전자전위효소 (Transposase) | 18 | 8 |
4 | LeuA | 18 | 9 |
5 | MbtE | 18 | 10 |
6 | MPB70 | 18, 19 | 1 |
7 | MPB83 | 18, 19 | 2 |
8 | MPT64 | 18, 19 | 3 |
9 | Fas | 18, 19 | 4 |
10 | RpoC | 18, 19 | 7 |
11 | CFP21 | 19 | 17 |
12 | 분지산 변위효소 (Chorismate mutase) | 19 | 18 |
13 | GroEL | 19 | 19 |
14 | PepA | 19 | 20 |
15 | FixB | 19 | 21 |
16 | PpiA | 19 | 22 |
17 | LppX | 19 | 23 |
18 | GreA | 19 | 24 |
19 | CFP10 | 19 | 25 |
20 | MPT32 | 19 | 26 |
21 | EsxN | 19 | 27 |
22 | Mb3713c | 19 | 28 |
[시험예 4] 효소면역측정법
먼저, 하기 표 3에 기재된 표준혈청 96웰 플레이트에 PPD, rMPB70, MonoQ18 및 MonoQ19 항원을 각각 코팅 완충액[Na2CO3 1.59g, NaHCO3 2.93g, NaN3 0.2g, D.W. 1,000 ml, pH 9.6]에 1㎍/ml로 희석시켰다. ELISA 플레이트에 1㎍/ml로 희석된 상기 항원들을 100 ㎕씩 접종하여 4℃에서 하룻밤동안 정치하여 흡착시켰다. 모든 플레이트는 항온배양 전에 1분 동안 진탕(shaking)하였다. 블로킹(Blocking) 완충액은 1% 젤라틴을 PBS에 녹여서 필요한 만큼(예를 들면, 블로킹용 15 ml/플레이트, 컨쥬게이트(conjugate)용 10ml/플레이트) 미리 만들어 놓는다. 코팅 플레이트를 Tween-PBS(NaCl 8g, KH2PO4 0.2g, Na2HPO4·7H2O 1.15g, KCl 0.2g, Tween 20 0.5ml, D.W. 1,000 ml, pH 7.4)로 250 ㎕씩 4회 세척하였다. 세척 후 와이프올을 바닥에 놓고 ELISA 플레이트를 그 표면 위에 털었다. 미리 만들어 놓은 블로킹 완충액을 150 ㎕씩 각 웰(well)에 접종하여 1시간동안 37℃에서 반응시켰다. 모든 플레이트는 항온배양 전에 1분 동안 진탕하였다. 혈청을 꺼내어 준비해 놓았다. 처리한 샘플 수가 많으면, 미리 희석시켜 놓았다(혈청 5㎕ : PBS 1,000 ㎕). 블로킹(Blocking) 완충액으로 1시간 동안 반응 후 Tween-PBS 250 ㎕씩 4회 세척하였다. 희석시켜 놓은 혈청을 각 웰에 100 ㎕씩 접종하였다. 모든 플레이트는 항온배양 전에 1분 동안 진탕하였다. 같은 혈청을 두 웰에 반복 접종하였다.
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | |
A | S1 | S2 | S3 | S4 | S5 | S6 | ||||||
B | S7 | S8 | S9 | S10 | S11 | S12 | ||||||
C | S13 | S14 | S15 | S16 | S17 | S18 | ||||||
D | S19 | S20 | S21 | S22 | S23 | S24 | ||||||
E | S25 | S26 | S27 | S28 | S29 | S30 | ||||||
F | S31 | S32 | S33 | S34 | S35 | S36 | ||||||
G | S37 | S38 | S39 | S40 | S41 | S42 | ||||||
H | S43 | S44 | S45 | S46 | NC | PC |
NC(Negative Control): 우결핵 음성혈청
PC(Positive Control): 표준균주를 감염시킨 소에서 채취한 양성혈청
접종 후 1시간동안 37℃에서 반응시켰다. 컨쥬게이트를 블로킹 완충액으로 실험 전 즉시 희석해 놓았다(소 IgG의 경우, 2,000 배). 반응 후 위 세척과정과 같이 세척하였다. 희석해 놓은 컨쥬게이트를 100 ㎕씩 각 웰에 접종한 다음 실온(20± 3℃)에서 30분 동안 반응시켰다. 모든 플레이트는 항온배양 전에 1분 동안 진탕하였다. 기질용액[H2O2 10㎕, ABTS 1 타블릿(10mg), 시트르산 완충액(시트르산{1.92 g/100ml} 12.15 ml, Na2HPO4 {2.82g/100ml} 12.85 ml, D.W. 25 ml, pH5.0) 50 ml]을 접종 바로 전에 미리 제조해 놓았다. 30분 반응 후 위와 동일하게 세척하고 상기 기질 용액을 각 웰에 100 ㎕씩 접종시켰다. 15분 후 반응이 완성되었다. 반응이 완성되면, 반응중지용액(원액 HCl 4.4 ml, D.W. 1,000 ml)을 50 ㎕씩 각 웰에 접종하고 405nm에서 흡광도를 측정하였다.
각 혈청의 평균값을 구하였다. 양성혈청의 흡광도는 0.8 이상, 음성혈청의 흡광도는 0.4이하를 보여야 유효한 시험으로 인정하였다. 샘플혈청의 흡광도를 음성혈청의 흡광도로 나누어 2.0 이상이면 양성으로 하고, 2.0미만 음성으로 하였다.
또한 민감성은 양성인 개체가 새로운 진단법에서 양성으로 판정되는 퍼센트이며, 특이성은 음성인 개체가 새로운 진단법에서 음성으로 판정될 퍼센트이며, 하기 수학식 1로 표현될 수 있다:
양성예측치는 새로운 진단법에서 양성결과가 양성일 퍼센트이며, 음성예측치는 새로운 진단법에서 음성결과가 음성일 퍼센트이며, 하기 수학식 2로 표현될 수 있다:
bTB IST | PPV & NPV | |||
+ | - | |||
PPD ELISA | + | 7 | 0 | PPV = 100 |
- | 8 | 7 | NPV = 47 | |
Se & Sp | Se = 47 | Sp = 100 |
bTB IST | PPV & NPV | |||
+ | - | |||
rMPB70 ELISA | + | 1 | 0 | PPV = 100 |
- | 14 | 7 | NPV = 33 | |
Se & Sp | Se = 7 | Sp = 100 |
bTB IST | PPV & NPV | |||
+ | - | |||
MonoQ18 ELISA | + | 8 | 0 | PPV = 100 |
- | 7 | 7 | NPV = 50 | |
Se & Sp | Se = 53 | Sp = 100 |
bTB IST | PPV & NPV | |||
+ | - | |||
MonoQ19 ELISA | + | 6 | 0 | PPV = 100 |
- | 9 | 7 | NPV = 44 | |
Se & Sp | Se = 40 | Sp = 100 |
[ELISA : 효소면역측정법 (enzyme-linked immunosorbent assay),
bTB : 우결핵 (bovine tuberculosis),
IST : 피내진단법 (intradermal skin test),
Se : 민감성 (sensitivity),
Sp : 특이성 (specificity),
PPV : 양성예측치 (positive predicitive value),
NPV : 음성예측치 (negative predictive value).]
도 4는 MPB70 등 정제단백질을 이용한 효소면역측정법 결과이며, 도 5는 피피디, 재조합 MPB70, 18번 분획(MonoQ18) 및 19번 분획(MonoQ19)에 대한 효소면역측정법 결과를 비교한 그래프로서 피내검진에 의한 우결핵 양성우, 의양성우 및 음성우의 흡광도를 음성혈청 흡광도로 나눈 값을 보여준다. 우결핵 양성우, 의양성 및 음성우 각각에 대해 18번 분획이 기존의 피피디, 재조합 MPB70 항원보다 민감성(Se), 특이성(Sp), 양성예측치(PPV), 음성예측치(NPV) 등에서 우수한 결과를 나타내었다(표 4 내지 표 7 참조).
우결핵 효소면역측정법은 우결핵이 감염되어 후기로 진행된 개체를 피내진단법으로 검진 시 음성결과가 나올 수 있기 때문에 이를 보완하여 우결핵 양성개체를 보다 완전하게 색출할 수 있는 진단법으로서 우결핵 항체반응이 높아지는 후기에 피내진단법과 병행하여 적용한다면, 보다 정확하게 우결핵을 진단할 수 있는 방법이다. 또한, 우군전체에 대한 우결핵균에 대한 감염여부를 파악하기 위한 우결핵 스크리닝 검사로도 적합하다. 본 발명에 의한 우결핵 효소면역측정법으로 양성 개체가 나타난다면, 그 우군은 우결핵균에 노출되었을 가능성이 있음을 알 수 있다. 우결핵 스크리닝 검사를 기존의 피내진단법으로 시행한다면, 3일의 시간이 소요되며, 접종시와 결과 판정시 두 번 소를 보정해야 하지만, 효소면역측정법으로 스크리닝한다면, 채혈시 1번만 보정하면 되며, 결과 또한, 보다 객관적인 수치로 표현될 수 있다는 장점과 대량의 혈청가검물을 동시에 신속히 검사할 수 있으며, 동일한 개체의 혈청으로 다른 전염병, 예를 들면, 브루셀라 등의 혈청검진을 할 수 있어 노동력의 절감효과를 가져올 수 있을 것이다.
[참고문헌]
1. Amadori, M., Lyashchenko, K.P., Gennaro, M.L., Pollock, J.M., Zerbini, I. Use of recombinant proteins in antibody tests for bovine tuberc㎕osis. Veterinary Microbiology, 85:379-389, 2002.
2. Cho, S.-N. Isolation and Characterization of Glycolipid Antigens from Mycobacterium bovis for the Serodiagnosis of Bovine Tuberc㎕osis. Kor. J. Vet. Publ. Hlth. 22(2):113-122, 1998.
3. Fifis, T., Costopo㎕os, C., Corner, L.A., Wood, P.R. Serological reactivity to Mycobacterium bovis protein antigens in cattle. Veterinary Microbiology, 30:343-354, 1992.
4. Garg, S.K., Tiwari, R.P., Tiwari, D., Singh, R., Malhotra, D., Ramnani, V.K., Prasad, G.B.K.S., Chandra, R., Fraziano, M., Colizzi, V., Bisen, P.S., Diagnosis of Tuberc㎕osis: Available Technologies, Limitations, and Possibilities. Journal of Clinical Laboratory Analysis 17:155-163, 2003.
5. Garnier, T., Eiglmeier, K., Camus, J.-C., Medina, N., Mansoor, H., Pryor, M., Duthoy, S., Grodin, S., Lacroix, C., Monsempe, C., Simon, S., Harris, B., Atkin, R., Doggett, J., Mayes, R., Keating, L., Wheeler, P.R., Parkhill, J., Barrell, B.G., Cole, S.T., Gordon, S.V., Hewinson, R.G. The complete genome sequence of Mycobacterium bovis. PNAS, 100(13):7877-7882, 2003.
6. Harboe, M., Wiker, H.G., Duncan, J.R., Garcia, M.M., Dukes, T.W., Brooks, B.W., Turcotte, C., Nagai, S. Protein G-Based Enzyme-Linked Immunosorbent Assay for Anti-MPB70 Antibodies in Bovine Tuberc㎕osis. Journal of Clinical Microbiology, 28(5):913-921, 1990.
7. Koo, H.C., Park, Y.H., Ahn, J., Waters, W.R., Hamilton, M.J., Barrington, G., Mosaad, A.A., Palmer, M.V., Shin, S., Davis, W.C. New Latex Bead Agglutination Assay for Differential Diagnosis of Cattle Infected with Mycobacterium bovis and Mycobacterium avium subsp. paratuberc㎕osis. Clinical and Diagnostic Laboratory Immunology, 11(6):1070-1074, 2004.
8. Koo, H.C., Park, Y.H., Ahn, J., Waters, W.R., Palmer, M.V., Hamilton, M.J., Barrington, G., Mosaad, A.A., Park, K.T., Jung, W.K., Hwang, I.Y., Cho, S.-N. Shin, S.J., Davis, W.C. Use of rMPB70 Protein and ESAT-6 Peptide as Antigens for Comparison of the Enzyme-Linked Immunsorbent, Immunochromatographic, and Latex Bead Agglutination Assays for Serodiagnosis of Bovine Tuberc㎕osis. Journal of Clinical Microbiology, 43(9):4498-4506, 2005.
9. Lightbody, K.A., McNair, J., Neill, S.D., Pollock, J.M. IgG isotype antibody responses to epitopes of the Mycobacterium bovis protein MPB70 in immunised and in tuberc㎕in skin test-reactor cattle. Veterinary Microbiology, 75:177-188, 2000.
10. Lyashchenko, K.P., Pollock, J.M., Colangeli, R., Gennaro, M.L. Diversity and Antigen Recognition by Serum Antibodies in Experimental Bovine Tuberc㎕osis. Infection and Immunity, 66(11):5344-5349, 1998.
11. Lilenbaum, W., Pessolani, M.C.V., Fonseca, L.S. The Use of Ag85 Complex as Antigen in ELISA for the Diagnosis of Bovine Tuberc㎕osis in Dairy Cows in Brazil. J. Vet Med. B 48:161-166, 2001.
12. Liu, S., Guo, S., Wang, C., Shao, M., Zhang, X., Guo, Y., Gong, Q. A novel fusion protein-based indirect enzyme-linked immunosorbent assay for the detection of bovine tuberc㎕osis. Tuberc㎕osis. 87:212-217, 2007.
13. McNair, J., Corbett, D.M., Girvin, R.M., Mackie, D.P., Pollock, J.M. Characterization of the Early Antibody Response in Bovine Tuberc㎕osis: MPB83 is an Early Target with Diagnostic Potential. Scand. J. Immunol. 53:365-371, 2001.
도 1a 및 1b는 마이코박테리움 보비스를 유전자적으로 특이검색하기 위한 부위에 해당하는 IS6110과 IS1081 유전자 및 이들의 주변 서열을 각각 보여준다. 상기 도면에서 넘버링된 부분이 각각 IS6110과 IS1081에 해당하는 유전자이며, 굵은 색으로 밑줄 친 부분은 상기 유전자들을 PCR 증폭 시 사용할 수 있는 프라이머 서열이다.
도 2는 우결핵균 단백질 중 음이온 크로마토그래피 MonoQ HR 5/5에 의한 분획을 나타낸 것이다.
도 3은 면역특이단백질을 조사하기 위하여 단백질 분획의 1차원 전기영동 사진(왼쪽), 우결핵균 감염 혈청에 의한 웨스턴블럿(오른쪽) 결과를 나타낸 것이다.
도 4는 MPB70등 정제단백질을 이용한 효소면역측정법을 실시하기 위한 평판배양기 사진이다.
도 5는 기존과 신규 MonoQ 항원과 효소면역측정법를 실시한 결과이다:
[PPD : 기존 효소면역측정용 항원 1 (우결핵 피내진단액),
rMPB70 : 기존 효소면역측정용 항원 1 (재조합 MPB70)
MonoQ18 : MonoQ 컬럼으로 정제된 18번 분획,
MonoQ19 : MonoQ 컬럼으로 정제된 19번 분획,
TB, 피내진단 결핵(tuberculosis diagnosed by intradermal test),
S/N: 샘플OD/음성OD의 비율].
<110> REPUBLIC OF KOREA(Management : Ministry of Agriculture and forestry, National Veterinary Research)
<120> Bovine tuberculosis specific enzyme immuno assay kit comprising
immune specific protein antigen and other immunogens and the
method for diagnosing the bovine tuberculosis by using the same
<160> 28
<170> KopatentIn 1.71
<210> 1
<211> 193
<212> PRT
<213> MPB70 protein of Mycobacterium bovis
<400> 1
Met Lys Val Lys Asn Thr Ile Ala Ala Thr Ser Phe Ala Ala Ala Gly
1 5 10 15
Leu Ala Ala Leu Ala Val Ala Val Ser Pro Pro Ala Ala Ala Gly Asp
20 25 30
Leu Val Gly Pro Gly Cys Ala Glu Tyr Ala Ala Ala Asn Pro Thr Gly
35 40 45
Pro Ala Ser Val Gln Gly Met Ser Gln Asp Pro Val Ala Val Ala Ala
50 55 60
Ser Asn Asn Pro Glu Leu Thr Thr Leu Thr Ala Ala Leu Ser Gly Gln
65 70 75 80
Leu Asn Pro Gln Val Asn Leu Val Asp Thr Leu Asn Ser Gly Gln Tyr
85 90 95
Thr Val Phe Ala Pro Thr Asn Ala Ala Phe Ser Lys Leu Pro Ala Ser
100 105 110
Thr Ile Asp Glu Leu Lys Thr Asn Ser Ser Leu Leu Thr Ser Ile Leu
115 120 125
Thr Tyr His Val Val Ala Gly Gln Thr Ser Pro Ala Asn Val Val Gly
130 135 140
Thr Arg Gln Thr Leu Gln Gly Ala Ser Val Thr Val Thr Gly Gln Gly
145 150 155 160
Asn Ser Leu Lys Val Gly Asn Ala Asp Val Val Cys Gly Gly Val Ser
165 170 175
Thr Ala Asn Ala Thr Val Tyr Met Ile Asp Ser Val Leu Met Pro Pro
180 185 190
Ala
<210> 2
<211> 220
<212> PRT
<213> MPB83 protein of Mycobacterium bovis
<400> 2
Met Ile Asn Val Gln Ala Lys Pro Ala Ala Ala Ala Ser Leu Ala Ala
1 5 10 15
Ile Ala Ile Ala Phe Leu Ala Gly Cys Ser Ser Thr Lys Pro Val Ser
20 25 30
Gln Asp Thr Ser Pro Lys Pro Ala Thr Ser Pro Ala Ala Pro Val Thr
35 40 45
Thr Ala Ala Met Ala Asp Pro Ala Ala Asp Leu Ile Gly Arg Gly Cys
50 55 60
Ala Gln Tyr Ala Ala Gln Asn Pro Thr Gly Pro Gly Ser Val Ala Gly
65 70 75 80
Met Ala Gln Asp Pro Val Ala Thr Ala Ala Ser Asn Asn Pro Met Leu
85 90 95
Ser Thr Leu Thr Ser Ala Leu Ser Gly Lys Leu Asn Pro Asp Val Asn
100 105 110
Leu Val Asp Thr Leu Asn Gly Gly Glu Tyr Thr Val Phe Ala Pro Thr
115 120 125
Asn Ala Ala Phe Asp Lys Leu Pro Ala Ala Thr Ile Asp Gln Leu Lys
130 135 140
Thr Asp Ala Lys Leu Leu Ser Ser Ile Leu Thr Tyr His Val Ile Ala
145 150 155 160
Gly Gln Ala Ser Pro Ser Arg Ile Asp Gly Thr His Gln Thr Leu Gln
165 170 175
Gly Ala Asp Leu Thr Val Ile Gly Ala Arg Asp Asp Leu Met Val Asn
180 185 190
Asn Ala Gly Leu Val Cys Gly Gly Val His Thr Ala Asn Ala Thr Val
195 200 205
Tyr Met Ile Asp Thr Val Leu Met Pro Pro Ala Gln
210 215 220
<210> 3
<211> 228
<212> PRT
<213> MPT64 protein of Mycobacterium bovis
<400> 3
Met Arg Ile Lys Ile Phe Met Leu Val Thr Ala Val Val Leu Leu Cys
1 5 10 15
Cys Ser Gly Val Ala Thr Ala Ala Pro Lys Thr Tyr Cys Glu Glu Leu
20 25 30
Lys Gly Thr Asp Thr Gly Gln Ala Cys Gln Ile Gln Met Ser Asp Pro
35 40 45
Ala Tyr Asn Ile Asn Ile Ser Leu Pro Ser Tyr Tyr Pro Asp Gln Lys
50 55 60
Ser Leu Glu Asn Tyr Ile Ala Gln Thr Arg Asp Lys Phe Leu Ser Ala
65 70 75 80
Ala Thr Ser Ser Thr Pro Arg Glu Ala Pro Tyr Glu Leu Asn Ile Thr
85 90 95
Ser Ala Thr Tyr Gln Ser Ala Ile Pro Pro Arg Gly Thr Gln Ala Val
100 105 110
Val Leu Lys Val Tyr Gln Asn Ala Gly Gly Thr His Pro Thr Thr Thr
115 120 125
Tyr Lys Ala Phe Asp Trp Asp Gln Ala Tyr Arg Lys Pro Ile Thr Tyr
130 135 140
Asp Thr Leu Trp Gln Ala Asp Thr Asp Pro Leu Pro Val Val Phe Pro
145 150 155 160
Ile Val Gln Gly Glu Leu Ser Lys Gln Thr Gly Gln Gln Val Ser Ile
165 170 175
Ala Pro Asn Ala Gly Leu Asp Pro Val Asn Tyr Gln Asn Phe Ala Val
180 185 190
Thr Asn Asp Gly Val Ile Phe Phe Phe Asn Pro Gly Glu Leu Leu Pro
195 200 205
Glu Ala Ala Gly Pro Thr Gln Val Leu Val Pro Arg Ser Ala Ile Asp
210 215 220
Ser Met Leu Ala
225
<210> 4
<211> 3069
<212> PRT
<213> Fas protein of Mycobacterium bovis
<400> 4
Met Thr Ile His Glu His Asp Arg Val Ser Ala Asp Arg Gly Gly Asp
1 5 10 15
Ser Pro His Thr Thr His Ala Leu Val Asp Arg Leu Met Ala Gly Glu
20 25 30
Pro Tyr Ala Val Ala Phe Gly Gly Gln Gly Ser Ala Trp Leu Glu Thr
35 40 45
Leu Glu Glu Leu Val Ser Ala Thr Gly Ile Glu Thr Glu Leu Ala Thr
50 55 60
Leu Val Gly Glu Ala Glu Leu Leu Leu Asp Pro Val Thr Asp Glu Leu
65 70 75 80
Ile Val Val Arg Pro Ile Gly Phe Glu Pro Leu Gln Trp Val Arg Ala
85 90 95
Leu Ala Ala Glu Asp Pro Val Pro Ser Asp Lys His Leu Thr Ser Ala
100 105 110
Ala Val Ser Val Pro Gly Val Leu Leu Thr Gln Ile Ala Ala Thr Arg
115 120 125
Ala Leu Ala Arg Gln Gly Met Asp Leu Val Ala Thr Pro Pro Val Ala
130 135 140
Met Ala Gly His Ser Gln Gly Val Leu Ala Val Glu Ala Leu Lys Ala
145 150 155 160
Gly Gly Ala Arg Asp Val Glu Leu Phe Ala Leu Ala Gln Leu Ile Gly
165 170 175
Ala Ala Gly Thr Leu Val Ala Arg Arg Arg Gly Ile Ser Val Leu Gly
180 185 190
Asp Arg Pro Pro Met Val Ser Val Thr Asn Ala Asp Pro Glu Arg Ile
195 200 205
Gly Arg Leu Leu Asp Glu Phe Ala Gln Asp Val Arg Thr Val Leu Pro
210 215 220
Pro Val Leu Ser Ile Arg Asn Gly Arg Arg Ala Val Val Ile Thr Gly
225 230 235 240
Thr Pro Glu Gln Leu Ser Arg Phe Glu Leu Tyr Cys Arg Gln Ile Ser
245 250 255
Glu Lys Glu Glu Ala Asp Arg Lys Asn Lys Val Arg Gly Gly Asp Val
260 265 270
Phe Ser Pro Val Phe Glu Pro Val Gln Val Glu Val Gly Phe His Thr
275 280 285
Pro Arg Leu Ser Asp Gly Ile Asp Ile Val Ala Gly Trp Ala Glu Lys
290 295 300
Ala Gly Leu Asp Val Ala Leu Ala Arg Glu Leu Ala Asp Ala Ile Leu
305 310 315 320
Ile Arg Lys Val Asp Trp Val Asp Glu Ile Thr Arg Val His Ala Ala
325 330 335
Gly Ala Arg Trp Ile Leu Asp Leu Gly Pro Gly Asp Ile Leu Thr Arg
340 345 350
Leu Thr Ala Pro Val Ile Arg Gly Leu Gly Ile Gly Ile Val Pro Ala
355 360 365
Ala Thr Arg Gly Gly Gln Arg Asn Leu Phe Thr Val Gly Ala Thr Pro
370 375 380
Glu Val Ala Arg Ala Trp Ser Ser Tyr Ala Pro Thr Val Val Arg Leu
385 390 395 400
Pro Asp Gly Arg Val Lys Leu Ser Thr Lys Phe Thr Arg Leu Thr Gly
405 410 415
Arg Ser Pro Ile Leu Leu Ala Gly Met Thr Pro Thr Thr Val Asp Ala
420 425 430
Lys Ile Val Ala Ala Ala Ala Asn Ala Gly His Trp Ala Glu Leu Ala
435 440 445
Gly Gly Gly Gln Val Thr Glu Glu Ile Phe Gly Asn Arg Ile Glu Gln
450 455 460
Met Ala Gly Leu Leu Glu Pro Gly Arg Thr Tyr Gln Phe Asn Ala Leu
465 470 475 480
Phe Leu Asp Pro Tyr Leu Trp Lys Leu Gln Val Gly Gly Lys Arg Leu
485 490 495
Val Gln Lys Ala Arg Gln Ser Gly Ala Ala Ile Asp Gly Val Val Ile
500 505 510
Ser Ala Gly Ile Pro Asp Leu Asp Glu Ala Val Glu Leu Ile Asp Glu
515 520 525
Leu Gly Asp Ile Gly Ile Ser His Val Val Phe Lys Pro Gly Thr Ile
530 535 540
Glu Gln Ile Arg Ser Val Ile Arg Ile Ala Thr Glu Val Pro Thr Lys
545 550 555 560
Pro Val Ile Met His Val Glu Gly Gly Arg Ala Gly Gly His His Ser
565 570 575
Trp Glu Asp Leu Asp Asp Leu Leu Leu Ala Thr Tyr Ser Glu Leu Arg
580 585 590
Ser Arg Ala Asn Ile Thr Val Cys Val Gly Gly Gly Ile Gly Thr Pro
595 600 605
Arg Arg Ala Ala Glu Tyr Leu Ser Gly Arg Trp Ala Gln Ala Tyr Gly
610 615 620
Phe Pro Leu Met Pro Ile Asp Gly Ile Leu Val Gly Thr Ala Ala Met
625 630 635 640
Ala Thr Lys Glu Ser Thr Thr Ser Pro Ser Val Lys Arg Met Leu Val
645 650 655
Asp Thr Gln Gly Thr Asp Gln Trp Ile Ser Ala Gly Lys Ala Gln Gly
660 665 670
Gly Met Ala Ser Ser Arg Ser Gln Leu Gly Ala Asp Ile His Glu Ile
675 680 685
Asp Asn Ser Ala Ser Arg Cys Gly Arg Leu Leu Asp Glu Val Ala Gly
690 695 700
Asp Ala Glu Ala Val Ala Glu Arg Arg Asp Glu Ile Ile Ala Ala Met
705 710 715 720
Ala Lys Thr Ala Lys Pro Tyr Phe Gly Asp Val Ala Asp Met Thr Tyr
725 730 735
Leu Gln Trp Leu Arg Arg Tyr Val Glu Leu Ala Ile Gly Glu Gly Asn
740 745 750
Ser Thr Ala Asp Thr Ala Ser Val Gly Ser Pro Trp Leu Ala Asp Thr
755 760 765
Trp Arg Asp Arg Phe Glu Gln Met Leu Gln Arg Ala Glu Ala Arg Leu
770 775 780
His Pro Gln Asp Phe Gly Pro Ile Gln Thr Leu Phe Thr Asp Ala Gly
785 790 795 800
Leu Leu Asp Asn Pro Gln Gln Ala Ile Ala Ala Leu Leu Ala Arg Tyr
805 810 815
Pro Asp Ala Glu Thr Val Gln Leu His Pro Ala Asp Val Pro Phe Phe
820 825 830
Val Thr Leu Cys Lys Thr Leu Gly Lys Pro Val Asn Phe Val Pro Val
835 840 845
Ile Asp Gln Asp Val Arg Arg Trp Trp Arg Ser Asp Ser Leu Trp Gln
850 855 860
Ala His Asp Ala Arg Tyr Asp Ala Asp Ala Val Cys Ile Ile Pro Gly
865 870 875 880
Thr Ala Ser Val Ala Gly Ile Thr Arg Met Asp Glu Pro Val Gly Glu
885 890 895
Leu Leu Asp Arg Phe Glu Gln Ala Ala Ile Asp Glu Val Leu Gly Ala
900 905 910
Gly Val Glu Pro Lys Asp Val Ala Ser Arg Arg Leu Gly Arg Ala Asp
915 920 925
Val Ala Gly Pro Leu Ala Val Val Leu Asp Ala Pro Asp Val Arg Trp
930 935 940
Ala Gly Arg Thr Val Thr Asn Pro Val His Arg Ile Ala Asp Pro Ala
945 950 955 960
Glu Trp Gln Val His Asp Gly Pro Glu Asn Pro Arg Ala Thr His Ser
965 970 975
Ser Thr Gly Ala Arg Leu Gln Thr His Gly Asp Asp Val Ala Leu Ser
980 985 990
Val Pro Val Ser Gly Thr Trp Val Asp Ile Arg Phe Thr Leu Pro Ala
995 1000 1005
Asn Thr Val Asp Gly Gly Thr Pro Val Ile Ala Thr Glu Asp Ala Thr
1010 1015 1020
Ser Ala Met Arg Thr Val Leu Ala Ile Ala Ala Gly Val Asp Ser Pro
1025 1030 1035 1040
Glu Phe Leu Pro Ala Val Ala Asn Gly Thr Ala Thr Leu Thr Val Asp
1045 1050 1055
Trp His Pro Glu Arg Val Ala Asp His Thr Gly Val Thr Ala Thr Phe
1060 1065 1070
Gly Glu Pro Leu Ala Pro Ser Leu Thr Asn Val Pro Asp Ala Leu Val
1075 1080 1085
Gly Pro Cys Trp Pro Ala Val Phe Ala Ala Ile Gly Ser Ala Val Thr
1090 1095 1100
Asp Thr Gly Glu Pro Val Val Glu Gly Leu Leu Ser Leu Val His Leu
1105 1110 1115 1120
Asp His Ala Ala Arg Val Val Gly Gln Leu Pro Thr Val Pro Ala Gln
1125 1130 1135
Leu Thr Val Thr Ala Thr Ala Ala Asn Ala Thr Asp Thr Asp Met Gly
1140 1145 1150
Arg Val Val Pro Val Ser Val Val Val Thr Gly Ala Asp Gly Ala Val
1155 1160 1165
Ile Ala Thr Leu Glu Glu Arg Phe Ala Ile Leu Gly Arg Thr Gly Ser
1170 1175 1180
Ala Glu Leu Ala Asp Pro Ala Arg Ala Gly Gly Ala Val Ser Ala Asn
1185 1190 1195 1200
Ala Thr Asp Thr Pro Arg Arg Arg Arg Arg Asp Val Thr Ile Thr Ala
1205 1210 1215
Pro Val Asp Met Arg Pro Phe Ala Val Val Ser Gly Asp His Asn Pro
1220 1225 1230
Ile His Thr Asp Arg Ala Ala Ala Leu Leu Ala Gly Leu Glu Ser Pro
1235 1240 1245
Ile Val His Gly Met Trp Leu Ser Ala Ala Ala Gln His Ala Val Thr
1250 1255 1260
Ala Thr Asp Gly Gln Ala Arg Pro Pro Ala Arg Leu Val Gly Trp Thr
1265 1270 1275 1280
Ala Arg Phe Leu Gly Met Val Arg Pro Gly Asp Glu Val Asp Phe Arg
1285 1290 1295
Val Glu Arg Val Gly Ile Asp Gln Gly Ala Glu Ile Val Asp Val Ala
1300 1305 1310
Ala Arg Val Gly Ser Asp Leu Val Met Ser Ala Ser Ala Arg Leu Ala
1315 1320 1325
Ala Pro Lys Thr Val Tyr Ala Phe Pro Gly Gln Gly Ile Gln His Lys
1330 1335 1340
Gly Met Gly Met Glu Val Arg Ala Arg Ser Lys Ala Ala Arg Lys Val
1345 1350 1355 1360
Trp Asp Thr Ala Asp Lys Phe Thr Arg Asp Thr Leu Gly Phe Ser Val
1365 1370 1375
Leu His Val Val Arg Asp Asn Pro Thr Ser Ile Ile Ala Ser Gly Val
1380 1385 1390
His Tyr His His Pro Asp Gly Val Leu Tyr Leu Thr Gln Phe Thr Gln
1395 1400 1405
Val Ala Met Ala Thr Val Ala Ala Ala Gln Val Ala Glu Met Arg Glu
1410 1415 1420
Gln Gly Ala Phe Val Glu Gly Ala Ile Ala Cys Gly His Ser Val Gly
1425 1430 1435 1440
Glu Tyr Thr Ala Leu Ala Cys Val Thr Gly Ile Tyr Gln Leu Glu Ala
1445 1450 1455
Leu Leu Glu Met Val Phe His Arg Gly Ser Lys Met His Asp Ile Val
1460 1465 1470
Pro Arg Asp Glu Leu Gly Arg Ser Asn Tyr Arg Leu Ala Ala Ile Arg
1475 1480 1485
Pro Ser Gln Ile Asp Leu Asp Asp Ala Asp Val Pro Ala Phe Val Ala
1490 1495 1500
Gly Ile Ala Glu Ser Thr Gly Glu Phe Leu Glu Ile Val Asn Phe Asn
1505 1510 1515 1520
Leu Arg Gly Ser Gln Tyr Ala Ile Ala Gly Thr Val Arg Gly Leu Glu
1525 1530 1535
Ala Leu Glu Ala Glu Val Glu Arg Arg Arg Glu Leu Thr Gly Gly Arg
1540 1545 1550
Arg Ser Phe Ile Leu Val Pro Gly Ile Asp Val Pro Phe His Ser Arg
1555 1560 1565
Val Leu Arg Val Gly Val Ala Glu Phe Arg Arg Ser Leu Asp Arg Val
1570 1575 1580
Met Pro Arg Asp Ala Asp Pro Asp Leu Ile Ile Gly Arg Tyr Ile Pro
1585 1590 1595 1600
Asn Leu Val Pro Arg Leu Phe Thr Leu Asp Arg Asp Phe Ile Gln Glu
1605 1610 1615
Ile Arg Asp Leu Val Pro Ala Glu Pro Leu Asp Glu Ile Leu Ala Asp
1620 1625 1630
Tyr Asp Thr Trp Leu Arg Glu Arg Pro Arg Glu Met Ala Arg Thr Val
1635 1640 1645
Phe Ile Glu Leu Leu Ala Trp Gln Phe Ala Ser Pro Val Arg Trp Ile
1650 1655 1660
Glu Thr Gln Asp Leu Leu Phe Ile Glu Glu Ala Ala Gly Gly Leu Gly
1665 1670 1675 1680
Val Glu Arg Phe Val Glu Ile Gly Val Lys Ser Ser Pro Thr Val Ala
1685 1690 1695
Gly Leu Ala Thr Asn Thr Leu Lys Leu Pro Glu Tyr Ala His Ser Thr
1700 1705 1710
Val Glu Val Leu Asn Ala Glu Arg Asp Ala Ala Val Leu Phe Ala Thr
1715 1720 1725
Asp Thr Asp Pro Glu Pro Glu Pro Glu Glu Asp Glu Pro Val Ala Glu
1730 1735 1740
Ser Pro Ala Pro Asp Val Val Ser Glu Ala Ala Pro Val Ala Pro Ala
1745 1750 1755 1760
Ala Ser Ser Ala Gly Pro Arg Pro Asp Asp Leu Val Phe Asp Ala Ala
1765 1770 1775
Asp Ala Thr Leu Ala Leu Ile Ala Leu Ser Ala Lys Met Arg Ile Asp
1780 1785 1790
Gln Ile Glu Glu Leu Asp Ser Ile Glu Ser Ile Thr Asp Gly Ala Ser
1795 1800 1805
Ser Arg Arg Asn Gln Leu Leu Val Asp Leu Gly Ser Glu Leu Asn Leu
1810 1815 1820
Gly Ala Ile Asp Gly Ala Ala Glu Ser Asp Leu Ala Gly Leu Arg Ser
1825 1830 1835 1840
Gln Val Thr Lys Leu Ala Arg Thr Tyr Lys Pro Tyr Gly Pro Val Leu
1845 1850 1855
Ser Asp Ala Ile Asn Asp Gln Leu Arg Thr Val Leu Gly Pro Ser Gly
1860 1865 1870
Lys Arg Pro Gly Ala Ile Ala Glu Arg Val Lys Lys Thr Trp Glu Leu
1875 1880 1885
Gly Glu Gly Trp Ala Lys His Val Thr Val Glu Val Ala Leu Gly Thr
1890 1895 1900
Arg Glu Gly Ser Ser Val Arg Gly Gly Ala Met Gly His Leu His Glu
1905 1910 1915 1920
Gly Ala Leu Ala Asp Ala Ala Ser Val Asp Lys Val Ile Asp Ala Ala
1925 1930 1935
Val Ala Ser Val Ala Ala Arg Gln Gly Val Ser Val Ala Leu Pro Ser
1940 1945 1950
Ala Gly Ser Gly Gly Gly Ala Thr Ile Asp Ala Ala Ala Leu Ser Glu
1955 1960 1965
Phe Thr Asp Gln Ile Thr Gly Arg Glu Gly Val Leu Ala Ser Ala Ala
1970 1975 1980
Arg Leu Val Leu Gly Gln Leu Gly Leu Asp Asp Pro Val Asn Ala Leu
1985 1990 1995 2000
Pro Ala Ala Pro Asp Ser Glu Leu Ile Asp Leu Val Thr Ala Glu Leu
2005 2010 2015
Gly Ala Asp Trp Pro Arg Leu Val Ala Pro Val Phe Asp Pro Lys Lys
2020 2025 2030
Ala Val Val Phe Asp Asp Arg Trp Ala Ser Ala Arg Glu Asp Leu Val
2035 2040 2045
Lys Leu Trp Leu Thr Asp Glu Gly Asp Ile Asp Ala Asp Trp Pro Arg
2050 2055 2060
Leu Ala Glu Arg Phe Glu Gly Ala Gly His Val Val Ala Thr Gln Ala
2065 2070 2075 2080
Thr Trp Trp Gln Gly Lys Ser Leu Ala Ala Gly Arg Gln Ile His Ala
2085 2090 2095
Ser Leu Tyr Gly Arg Ile Ala Ala Gly Ala Glu Asn Pro Glu Pro Gly
2100 2105 2110
Arg Tyr Gly Gly Glu Val Ala Val Val Thr Gly Ala Ser Lys Gly Ser
2115 2120 2125
Ile Ala Ala Ser Val Val Ala Arg Leu Leu Asp Gly Gly Ala Thr Val
2130 2135 2140
Ile Ala Thr Thr Ser Lys Leu Asp Glu Glu Arg Leu Ala Phe Tyr Arg
2145 2150 2155 2160
Thr Leu Tyr Arg Asp His Ala Arg Tyr Gly Ala Ala Leu Trp Leu Val
2165 2170 2175
Ala Ala Asn Met Ala Ser Tyr Ser Asp Val Asp Ala Leu Val Glu Trp
2180 2185 2190
Ile Gly Thr Glu Gln Thr Glu Ser Leu Gly Pro Gln Ser Ile His Ile
2195 2200 2205
Lys Asp Ala Gln Thr Pro Thr Leu Leu Phe Pro Phe Ala Ala Pro Arg
2210 2215 2220
Val Val Gly Asp Leu Ser Glu Ala Gly Ser Arg Ala Glu Met Glu Met
2225 2230 2235 2240
Lys Val Leu Leu Trp Ala Val Gln Arg Leu Ile Gly Gly Leu Ser Thr
2245 2250 2255
Ile Gly Ala Glu Arg Asp Ile Ala Ser Arg Leu His Val Val Leu Pro
2260 2265 2270
Gly Ser Pro Asn Arg Gly Met Phe Gly Gly Asp Gly Ala Tyr Gly Glu
2275 2280 2285
Ala Lys Ser Ala Leu Asp Ala Val Val Ser Arg Trp His Ala Glu Ser
2290 2295 2300
Ser Trp Ala Ala Arg Val Ser Leu Ala His Ala Leu Ile Gly Trp Thr
2305 2310 2315 2320
Arg Gly Thr Gly Leu Met Gly His Asn Asp Ala Ile Val Ala Ala Val
2325 2330 2335
Glu Glu Ala Gly Val Thr Thr Tyr Ser Thr Asp Glu Met Ala Ala Leu
2340 2345 2350
Leu Leu Asp Leu Cys Asp Ala Glu Ser Lys Val Ala Ala Ala Arg Ser
2355 2360 2365
Pro Ile Lys Ala Asp Leu Thr Gly Gly Leu Ala Glu Ala Asn Leu Asp
2370 2375 2380
Met Ala Glu Leu Ala Ala Lys Ala Arg Glu Gln Met Ser Ala Ala Ala
2385 2390 2395 2400
Ala Val Asp Glu Asp Ala Glu Ala Pro Gly Ala Ile Ala Ala Leu Pro
2405 2410 2415
Ser Pro Pro Arg Gly Phe Thr Pro Ala Pro Pro Pro Gln Trp Asp Asp
2420 2425 2430
Leu Asp Val Asp Pro Ala Asp Leu Val Val Ile Val Gly Gly Ala Glu
2435 2440 2445
Ile Gly Pro Tyr Gly Ser Ser Arg Thr Arg Phe Glu Met Glu Val Glu
2450 2455 2460
Asn Glu Leu Ser Ala Ala Gly Val Leu Glu Leu Ala Trp Thr Thr Gly
2465 2470 2475 2480
Leu Ile Arg Trp Glu Asp Asp Pro Gln Pro Gly Trp Tyr Asp Thr Glu
2485 2490 2495
Ser Gly Glu Met Val Asp Glu Ser Glu Leu Val Gln Arg Tyr His Asp
2500 2505 2510
Ala Val Val Gln Arg Val Gly Ile Arg Glu Phe Val Asp Asp Gly Ala
2515 2520 2525
Ile Asp Pro Asp His Ala Ser Pro Leu Leu Val Ser Val Phe Leu Glu
2530 2535 2540
Lys Asp Phe Ala Phe Val Val Ser Ser Glu Ala Asp Ala Arg Ala Phe
2545 2550 2555 2560
Val Glu Phe Asp Pro Glu His Thr Val Ile Arg Pro Val Pro Asp Ser
2565 2570 2575
Thr Asp Trp Gln Val Ile Arg Lys Ala Gly Thr Glu Ile Arg Val Pro
2580 2585 2590
Arg Lys Thr Lys Leu Ser Arg Val Val Gly Gly Gln Ile Pro Thr Gly
2595 2600 2605
Phe Asp Pro Thr Val Trp Gly Ile Ser Ala Asp Met Ala Gly Ser Ile
2610 2615 2620
Asp Arg Leu Ala Val Trp Asn Met Val Ala Thr Val Asp Ala Phe Leu
2625 2630 2635 2640
Ser Ser Gly Phe Ser Pro Ala Glu Val Met Arg Tyr Val His Pro Ser
2645 2650 2655
Leu Val Ala Asn Thr Gln Gly Thr Gly Met Gly Gly Gly Thr Ser Met
2660 2665 2670
Gln Thr Met Tyr His Gly Asn Leu Leu Gly Arg Asn Lys Pro Asn Asp
2675 2680 2685
Ile Phe Gln Glu Val Leu Pro Asn Ile Ile Ala Ala His Val Val Gln
2690 2695 2700
Ser Tyr Val Gly Ser Tyr Gly Ala Met Ile His Pro Val Ala Ala Cys
2705 2710 2715 2720
Ala Thr Ala Ala Val Ser Val Glu Glu Gly Val Asp Lys Ile Arg Leu
2725 2730 2735
Gly Lys Ala Gln Leu Val Val Ala Gly Gly Leu Asp Asp Leu Thr Leu
2740 2745 2750
Glu Gly Ile Ile Gly Phe Gly Asp Met Ala Ala Thr Ala Asp Thr Ser
2755 2760 2765
Met Met Arg Gly Arg Gly Ile His Asp Ser Lys Phe Ser Arg Pro Asn
2770 2775 2780
Asp Arg Arg Arg Leu Gly Phe Val Glu Ala Gln Gly Gly Gly Thr Ile
2785 2790 2795 2800
Leu Leu Ala Arg Gly Asp Leu Ala Leu Arg Met Gly Leu Pro Val Leu
2805 2810 2815
Ala Val Val Ala Phe Ala Gln Ser Phe Gly Asp Gly Val His Thr Ser
2820 2825 2830
Ile Pro Ala Pro Gly Leu Gly Ala Leu Gly Ala Gly Arg Gly Gly Lys
2835 2840 2845
Asp Ser Pro Leu Ala Arg Ala Leu Ala Lys Leu Gly Val Ala Ala Asp
2850 2855 2860
Asp Val Ala Val Ile Ser Lys His Asp Thr Ser Thr Leu Ala Asn Asp
2865 2870 2875 2880
Pro Asn Glu Thr Glu Leu His Glu Arg Leu Ala Asp Ala Leu Gly Arg
2885 2890 2895
Ser Glu Gly Ala Pro Leu Phe Val Val Ser Gln Lys Ser Leu Thr Gly
2900 2905 2910
His Ala Lys Gly Gly Ala Ala Val Phe Gln Met Met Gly Leu Cys Gln
2915 2920 2925
Ile Leu Arg Asp Gly Val Ile Pro Pro Asn Arg Ser Leu Asp Cys Val
2930 2935 2940
Asp Asp Glu Leu Ala Gly Ser Ala His Phe Val Trp Val Arg Asp Thr
2945 2950 2955 2960
Leu Arg Leu Gly Gly Lys Phe Pro Leu Lys Ala Gly Met Leu Thr Ser
2965 2970 2975
Leu Gly Phe Gly His Val Ser Gly Leu Val Ala Leu Val His Pro Gln
2980 2985 2990
Ala Phe Ile Ala Ser Leu Asp Pro Ala Gln Arg Ala Asp Tyr Gln Arg
2995 3000 3005
Arg Ala Asp Ala Arg Leu Leu Ala Gly Gln Arg Arg Leu Ala Ser Ala
3010 3015 3020
Ile Ala Gly Gly Ala Pro Met Tyr Gln Arg Pro Gly Asp Arg Arg Phe
3025 3030 3035 3040
Asp His His Ala Pro Glu Arg Pro Gln Glu Ala Ser Met Leu Leu Asn
3045 3050 3055
Pro Ala Ala Arg Leu Gly Asp Gly Glu Ala Tyr Ile Gly
3060 3065
<210> 5
<211> 1205
<212> PRT
<213> Smc protein of Mycobacterium bovis
<400> 5
Met Tyr Leu Lys Ser Leu Thr Leu Lys Gly Phe Lys Ser Phe Ala Ala
1 5 10 15
Pro Thr Thr Leu Arg Phe Glu Pro Gly Ile Thr Ala Val Val Gly Pro
20 25 30
Asn Gly Ser Gly Lys Ser Asn Val Val Asp Ala Leu Ala Trp Val Met
35 40 45
Gly Glu Gln Gly Ala Lys Thr Leu Arg Gly Gly Lys Met Glu Asp Val
50 55 60
Ile Phe Ala Gly Thr Ser Ser Arg Ala Pro Leu Gly Arg Ala Glu Val
65 70 75 80
Thr Val Ser Ile Asp Asn Ser Asp Asn Ala Leu Pro Ile Glu Tyr Thr
85 90 95
Glu Val Ser Ile Thr Arg Arg Met Phe Arg Asp Gly Ala Ser Glu Tyr
100 105 110
Glu Ile Asn Gly Ser Ser Cys Arg Leu Met Asp Val Gln Glu Leu Leu
115 120 125
Ser Asp Ser Gly Ile Gly Arg Glu Met His Val Ile Val Gly Gln Gly
130 135 140
Lys Leu Glu Glu Ile Leu Gln Ser Arg Pro Glu Asp Arg Arg Ala Phe
145 150 155 160
Ile Glu Glu Ala Ala Gly Val Leu Lys His Arg Lys Arg Lys Glu Lys
165 170 175
Ala Leu Arg Lys Leu Asp Thr Met Ala Ala Asn Leu Ala Arg Leu Thr
180 185 190
Asp Leu Thr Thr Glu Leu Arg Arg Gln Leu Lys Pro Leu Gly Arg Gln
195 200 205
Ala Glu Ala Ala Gln Arg Ala Ala Ala Ile Gln Ala Asp Leu Arg Asp
210 215 220
Ala Arg Leu Arg Leu Ala Ala Asp Asp Leu Val Ser Arg Arg Ala Glu
225 230 235 240
Arg Glu Ala Val Phe Gln Ala Glu Ala Ala Met Arg Arg Glu His Asp
245 250 255
Glu Ala Ala Ala Arg Leu Ala Val Ala Ser Glu Glu Leu Ala Ala His
260 265 270
Glu Ser Ala Val Ala Glu Leu Ser Thr Arg Ala Glu Ser Ile Gln His
275 280 285
Thr Trp Phe Gly Leu Ser Ala Leu Ala Glu Arg Val Asp Ala Thr Val
290 295 300
Arg Ile Ala Ser Glu Arg Ala His His Leu Asp Ile Glu Pro Val Ala
305 310 315 320
Val Ser Asp Thr Asp Pro Arg Lys Pro Glu Glu Leu Glu Ala Glu Ala
325 330 335
Gln Gln Val Ala Val Ala Glu Gln Gln Leu Leu Ala Glu Leu Asp Ala
340 345 350
Ala Arg Ala Arg Leu Asp Ala Ala Arg Ala Glu Arg Ala Asp Arg Glu
355 360 365
Arg Arg Ala Ala Glu Ala Asp Arg Ala His Leu Ala Ala Val Arg Glu
370 375 380
Glu Ala Asp Arg Arg Glu Gly Leu Ala Arg Leu Ala Gly Gln Val Glu
385 390 395 400
Thr Met Arg Ala Arg Val Glu Ser Ile Asp Glu Ser Val Ala Arg Leu
405 410 415
Ser Glu Arg Ile Glu Asp Ala Ala Met Arg Ala Gln Gln Thr Arg Ala
420 425 430
Glu Phe Glu Thr Val Gln Gly Arg Ile Gly Glu Leu Asp Gln Gly Glu
435 440 445
Val Gly Leu Asp Glu His His Glu Arg Thr Val Ala Ala Leu Arg Leu
450 455 460
Ala Asp Glu Arg Val Ala Glu Leu Gln Ser Ala Glu Arg Ala Ala Glu
465 470 475 480
Arg Gln Val Ala Ser Leu Arg Ala Arg Ile Asp Ala Leu Ala Val Gly
485 490 495
Leu Gln Arg Lys Asp Gly Ala Ala Trp Leu Ala His Asn Arg Ser Gly
500 505 510
Ala Gly Leu Phe Gly Ser Ile Ala Gln Leu Val Lys Val Arg Ser Gly
515 520 525
Tyr Glu Ala Ala Leu Ala Ala Ala Leu Gly Pro Ala Ala Asp Ala Leu
530 535 540
Ala Val Asp Gly Leu Thr Ala Ala Gly Ser Ala Val Ser Ala Leu Lys
545 550 555 560
Gln Ala Asp Gly Gly Arg Ala Val Leu Val Leu Ser Asp Trp Pro Ala
565 570 575
Pro Gln Ala Pro Gln Ser Ala Ser Gly Glu Met Leu Pro Ser Gly Ala
580 585 590
Gln Trp Ala Leu Asp Leu Val Glu Ser Pro Pro Gln Leu Val Gly Ala
595 600 605
Met Ile Ala Met Leu Ser Gly Val Ala Val Val Asn Asp Leu Thr Glu
610 615 620
Ala Met Gly Leu Val Glu Ile Arg Pro Glu Leu Arg Ala Val Thr Val
625 630 635 640
Asp Gly Asp Leu Val Gly Ala Gly Trp Val Ser Gly Gly Ser Asp Arg
645 650 655
Lys Leu Ser Thr Leu Glu Val Thr Ser Glu Ile Asp Lys Ala Arg Ser
660 665 670
Glu Leu Ala Ala Ala Glu Ala Leu Ala Ala Gln Leu Asn Ala Ala Leu
675 680 685
Ala Gly Ala Leu Thr Glu Gln Ser Ala Gly Gln Asp Ala Ala Glu Gln
690 695 700
Ala Leu Ala Ala Leu Asn Glu Ser Asp Thr Ala Ile Ser Ala Met Tyr
705 710 715 720
Glu Gln Leu Gly Arg Leu Gly Gln Glu Ala Arg Ala Ala Glu Glu Glu
725 730 735
Trp Asn Arg Leu Leu Gln Gln Arg Thr Glu Gln Glu Ala Val Arg Thr
740 745 750
Gln Thr Leu Asp Asp Val Ile Gln Leu Glu Thr Gln Leu Arg Lys Ala
755 760 765
Gln Glu Thr Gln Arg Val Gln Val Ala Gln Pro Ile Asp Arg Gln Ala
770 775 780
Ile Ser Ala Ala Ala Asp Arg Ala Arg Gly Val Glu Val Glu Ala Arg
785 790 795 800
Leu Ala Val Arg Thr Ala Glu Glu Arg Ala Asn Ala Val Arg Gly Arg
805 810 815
Ala Asp Ser Leu Arg Arg Ala Ala Ala Ala Glu Arg Glu Ala Arg Val
820 825 830
Arg Ala Gln Gln Ala Arg Ala Ala Arg Leu His Ala Ala Ala Val Ala
835 840 845
Ala Ala Val Ala Asp Cys Gly Arg Leu Leu Ala Gly Arg Leu His Arg
850 855 860
Ala Val Asp Gly Ala Ser Gln Leu Arg Asp Ala Ser Ala Ala Gln Arg
865 870 875 880
Gln Gln Arg Leu Ala Ala Met Ala Ala Val Arg Asp Glu Val Asn Thr
885 890 895
Leu Ser Ala Arg Val Gly Glu Leu Thr Asp Ser Leu His Arg Asp Glu
900 905 910
Leu Ala Asn Ala Gln Ala Ala Leu Arg Ile Glu Gln Leu Glu Gln Met
915 920 925
Val Leu Glu Gln Phe Gly Met Ala Pro Ala Asp Leu Ile Thr Glu Tyr
930 935 940
Gly Pro His Val Ala Leu Pro Pro Thr Glu Leu Glu Met Ala Glu Phe
945 950 955 960
Glu Gln Ala Arg Glu Arg Gly Glu Gln Val Ile Ala Pro Ala Pro Met
965 970 975
Pro Phe Asp Arg Val Thr Gln Glu Arg Arg Ala Lys Arg Ala Glu Arg
980 985 990
Ala Leu Ala Glu Leu Gly Arg Val Asn Pro Leu Ala Leu Glu Glu Phe
995 1000 1005
Ala Ala Leu Glu Glu Arg Tyr Asn Phe Leu Ser Thr Gln Leu Glu Asp
1010 1015 1020
Val Lys Ala Ala Arg Lys Asp Leu Leu Gly Val Val Ala Asp Val Asp
1025 1030 1035 1040
Ala Arg Ile Leu Gln Val Phe Asn Asp Ala Phe Val Asp Val Glu Arg
1045 1050 1055
Glu Phe Arg Gly Val Phe Thr Ala Leu Phe Pro Gly Gly Glu Gly Arg
1060 1065 1070
Leu Arg Leu Thr Glu Pro Asp Asp Met Leu Thr Thr Gly Ile Glu Val
1075 1080 1085
Glu Ala Arg Pro Pro Gly Lys Lys Ile Thr Arg Leu Ser Leu Leu Ser
1090 1095 1100
Gly Gly Glu Lys Ala Leu Thr Ala Val Ala Met Leu Val Ala Ile Phe
1105 1110 1115 1120
Arg Ala Arg Pro Ser Pro Phe Tyr Ile Met Asp Glu Val Glu Ala Ala
1125 1130 1135
Leu Asp Asp Val Asn Leu Arg Arg Leu Leu Ser Leu Phe Glu Gln Leu
1140 1145 1150
Arg Glu Gln Ser Gln Ile Ile Ile Ile Thr His Gln Lys Pro Thr Met
1155 1160 1165
Glu Val Ala Asp Ala Leu Tyr Gly Val Thr Met Gln Asn Asp Gly Ile
1170 1175 1180
Thr Ala Val Ile Ser Gln Arg Met Arg Gly Gln Gln Val Asp Gln Leu
1185 1190 1195 1200
Val Thr Asn Ser Ser
1205
<210> 6
<211> 2512
<212> PRT
<213> Nrp protein of Mycobacterium bovis
<400> 6
Met His Arg Val Arg Leu Ser Arg Ser Gln Arg Asn Leu Tyr Asn Gly
1 5 10 15
Val Arg Gln Asp Asn Asn Pro Ala Leu Tyr Leu Ile Gly Lys Ser Tyr
20 25 30
Arg Phe Arg Arg Leu Glu Leu Ala Arg Phe Leu Ala Ala Leu His Ala
35 40 45
Thr Val Leu Asp Asn Pro Val Gln Leu Cys Val Leu Glu Asn Ser Gly
50 55 60
Ala Asp Tyr Pro Asp Leu Val Pro Arg Leu Arg Phe Gly Asp Ile Val
65 70 75 80
Arg Val Gly Ser Ala Asp Glu His Leu Gln Ser Thr Trp Cys Ser Gly
85 90 95
Ile Leu Gly Lys Pro Leu Val Arg His Thr Val His Thr Asp Pro Asn
100 105 110
Gly Tyr Val Thr Gly Leu Asp Val His Thr His His Ile Leu Leu Asp
115 120 125
Gly Gly Ala Thr Gly Thr Ile Glu Ala Asp Leu Ala Arg Tyr Leu Thr
130 135 140
Thr Asp Pro Ala Gly Glu Thr Pro Ser Val Gly Ala Gly Leu Ala Lys
145 150 155 160
Leu Arg Glu Ala His Arg Arg Glu Thr Ala Lys Val Glu Glu Ser Arg
165 170 175
Gly Arg Leu Ser Ala Val Val Gln Arg Glu Leu Ala Asp Glu Ala Tyr
180 185 190
His Gly Gly His Gly His Ser Val Ser Asp Ala Pro Gly Thr Ala Ala
195 200 205
Lys Gly Val Leu His Glu Ser Ala Thr Ile Cys Gly Asn Ala Phe Asp
210 215 220
Ala Ile Leu Thr Leu Ser Glu Ala Gln Arg Val Pro Leu Asn Val Leu
225 230 235 240
Val Ala Ala Ala Ala Val Ala Val Asp Ala Ser Leu Arg Gln Asn Thr
245 250 255
Glu Thr Leu Leu Val His Thr Val Asp Asn Arg Phe Gly Asp Ser Asp
260 265 270
Leu Asn Val Ala Thr Cys Leu Val Asn Ser Val Ala Gln Thr Val Arg
275 280 285
Phe Pro Pro Phe Ala Ser Val Ser Asp Val Val Arg Thr Leu Asp Arg
290 295 300
Gly Tyr Val Lys Ala Val Arg Arg Arg Trp Leu Arg Glu Glu His Tyr
305 310 315 320
Arg Arg Met Tyr Leu Ala Ile Asn Arg Thr Ser His Val Glu Ala Leu
325 330 335
Thr Leu Asn Phe Ile Arg Glu Pro Cys Ala Pro Gly Leu Arg Pro Phe
340 345 350
Leu Ser Glu Val Pro Ile Ala Thr Asp Ile Gly Pro Val Glu Gly Met
355 360 365
Thr Val Ala Ser Val Leu Asp Glu Glu Gln Arg Thr Leu Asn Leu Ala
370 375 380
Ile Trp Asn Arg Ala Asp Leu Pro Ala Cys Lys Thr His Pro Lys Val
385 390 395 400
Ala Glu Arg Ile Ala Ala Ala Leu Glu Ser Met Ala Ala Met Trp Asp
405 410 415
Arg Pro Ile Ala Met Ile Val Asn Asp Trp Phe Gly Ile Gly Pro Asp
420 425 430
Gly Thr Arg Cys Gln Gly Asp Trp Pro Ala Arg Gln Pro Ser Thr Pro
435 440 445
Ala Trp Phe Leu Asp Ser Ala Arg Gly Val His Gln Phe Leu Gly Arg
450 455 460
Arg Arg Phe Val Tyr Pro Trp Val Ala Trp Leu Val Gln Arg Gly Ala
465 470 475 480
Ala Pro Gly Asp Val Leu Val Phe Thr Asp Asp Asp Thr Asp Lys Thr
485 490 495
Ile Asp Leu Leu Ile Ala Cys His Leu Ala Gly Cys Gly Tyr Ser Val
500 505 510
Cys Asp Thr Ala Asp Glu Ile Ser Val Arg Thr Asn Ala Ile Thr Glu
515 520 525
His Gly Asp Gly Ile Leu Val Thr Val Val Asp Val Ala Ala Thr Gln
530 535 540
Leu Ala Val Val Gly His Asp Glu Leu Arg Lys Val Val Asp Glu Arg
545 550 555 560
Val Thr Gln Val Thr His Asp Ala Leu Leu Ala Thr Lys Thr Ala Tyr
565 570 575
Ile Met Pro Thr Ser Gly Thr Thr Gly Gln Pro Lys Leu Val Arg Ile
580 585 590
Ser His Gly Ser Leu Ala Val Phe Cys Asp Ala Ile Ser Arg Ala Tyr
595 600 605
Gly Trp Gly Ala His Asp Thr Val Leu Gln Cys Ala Pro Leu Thr Ser
610 615 620
Asp Ile Ser Val Glu Glu Ile Phe Gly Gly Ala Ala Cys Gly Ala Arg
625 630 635 640
Leu Val Arg Ser Ala Ala Met Lys Thr Gly Asp Leu Ala Ala Leu Val
645 650 655
Asp Asp Leu Val Ala Arg Glu Thr Thr Ile Val Asp Leu Pro Thr Ala
660 665 670
Val Trp Gln Leu Leu Cys Ala Asp Gly Asp Ala Ile Asp Ala Ile Gly
675 680 685
Arg Ser Arg Leu Arg Gln Ile Val Ile Gly Gly Glu Ala Ile Arg Cys
690 695 700
Ser Ala Val Asp Lys Trp Leu Glu Ser Ala Ala Ser Gln Gly Ile Ser
705 710 715 720
Leu Leu Ser Ser Tyr Gly Pro Thr Glu Ala Thr Val Val Ala Thr Phe
725 730 735
Leu Pro Ile Val Cys Asp Gln Thr Thr Met Asp Gly Ala Leu Leu Arg
740 745 750
Leu Gly Arg Pro Ile Leu Pro Asn Thr Val Phe Leu Ala Phe Gly Glu
755 760 765
Val Val Ile Val Gly Asp Leu Val Ala Asp Gly Tyr Leu Gly Ile Asp
770 775 780
Gly Asp Gly Phe Gly Thr Val Thr Ala Ala Asp Gly Ser Arg Arg Arg
785 790 795 800
Ala Phe Ala Thr Gly Asp Arg Val Thr Val Asp Ala Glu Gly Phe Pro
805 810 815
Val Phe Ser Gly Arg Lys Asp Ala Val Val Lys Ile Ser Gly Lys Arg
820 825 830
Val Asp Ile Ala Glu Val Thr Arg Arg Ile Ala Glu Asp Pro Ala Val
835 840 845
Ser Asp Val Ala Val Glu Leu His Ser Gly Ser Leu Gly Val Trp Phe
850 855 860
Lys Ser Gln Arg Thr Arg Glu Gly Glu Gln Asp Ala Ala Ala Ala Thr
865 870 875 880
Arg Ile Arg Leu Val Leu Val Ser Leu Gly Val Ser Ser Phe Phe Val
885 890 895
Val Gly Val Pro Asn Ile Pro Arg Lys Pro Asn Gly Lys Ile Asp Ser
900 905 910
Asp Asn Leu Pro Arg Leu Pro Gln Trp Ser Ala Ala Gly Leu Asn Thr
915 920 925
Ala Glu Thr Gly Gln Arg Ala Ala Gly Leu Ser Gln Ile Trp Ser Arg
930 935 940
Gln Leu Gly Arg Ala Ile Gly Pro Asp Ser Ser Leu Leu Gly Glu Gly
945 950 955 960
Ile Gly Ser Leu Asp Leu Ile Arg Ile Leu Pro Glu Thr Arg Arg Tyr
965 970 975
Leu Gly Trp Arg Leu Ser Leu Leu Asp Leu Ile Gly Ala Asp Thr Ala
980 985 990
Ala Asn Leu Ala Asp Tyr Ala Pro Thr Pro Asp Ala Pro Thr Gly Glu
995 1000 1005
Asp Arg Phe Arg Pro Leu Val Ala Ala Gln Arg Pro Ala Ala Ile Pro
1010 1015 1020
Leu Ser Phe Ala Gln Arg Arg Leu Trp Phe Leu Asp Gln Leu Gln Arg
1025 1030 1035 1040
Pro Ala Pro Val Tyr Asn Met Ala Val Ala Leu Arg Leu Arg Gly Tyr
1045 1050 1055
Leu Asp Thr Glu Ala Leu Gly Ala Ala Val Ala Asp Val Val Gly Arg
1060 1065 1070
His Glu Ser Leu Arg Thr Val Phe Pro Ala Val Asp Gly Val Pro Arg
1075 1080 1085
Gln Leu Val Ile Glu Ala Arg Arg Ala Asp Leu Gly Cys Asp Ile Val
1090 1095 1100
Asp Ala Thr Ala Trp Pro Ala Asp Arg Leu Gln Arg Ala Ile Glu Glu
1105 1110 1115 1120
Ala Ala Arg His Ser Phe Asp Leu Ala Thr Glu Ile Pro Leu Arg Thr
1125 1130 1135
Trp Leu Phe Arg Ile Ala Asp Asp Glu His Val Leu Val Ala Val Ala
1140 1145 1150
His His Ile Ala Ala Asp Gly Trp Ser Val Ala Pro Leu Thr Ala Asp
1155 1160 1165
Leu Ser Ala Ala Tyr Ala Ser Arg Cys Ala Gly Arg Ala Pro Asp Trp
1170 1175 1180
Ala Pro Leu Pro Val Gln Tyr Val Asp Tyr Thr Leu Trp Gln Arg Glu
1185 1190 1195 1200
Ile Leu Gly Asp Leu Asp Asp Ser Asp Ser Pro Ile Ala Ala Gln Leu
1205 1210 1215
Ala Tyr Trp Glu Asn Ala Leu Ala Gly Met Pro Glu Arg Leu Arg Leu
1220 1225 1230
Pro Thr Ala Arg Pro Tyr Pro Pro Val Ala Asp Gln Arg Gly Ala Ser
1235 1240 1245
Leu Val Val Asp Trp Pro Ala Ser Val Gln Gln Gln Val Arg Arg Ile
1250 1255 1260
Ala Arg Gln His Asn Ala Thr Ser Phe Met Val Val Ala Ala Gly Leu
1265 1270 1275 1280
Ala Val Leu Leu Ser Lys Leu Ser Gly Ser Pro Asp Val Ala Val Gly
1285 1290 1295
Phe Pro Ile Ala Gly Arg Ser Asp Pro Ala Leu Asp Asn Leu Val Gly
1300 1305 1310
Phe Phe Val Asn Thr Leu Val Leu Arg Val Asn Leu Ala Gly Asp Pro
1315 1320 1325
Ser Phe Ala Glu Leu Leu Gly Gln Val Arg Ala Arg Ser Leu Ala Ala
1330 1335 1340
Tyr Glu Asn Gln Asp Val Pro Phe Glu Val Leu Val Asp Arg Leu Lys
1345 1350 1355 1360
Pro Thr Arg Ala Leu Thr His His Pro Leu Ile Gln Val Met Leu Ala
1365 1370 1375
Trp Gln Asp Asn Pro Val Gly Gln Leu Asn Leu Gly Asp Leu Gln Ala
1380 1385 1390
Thr Pro Met Pro Ile Asp Thr Arg Thr Ala Arg Met Asp Leu Val Phe
1395 1400 1405
Ser Leu Ala Glu Arg Phe Ser Glu Gly Ser Glu Pro Ala Gly Ile Gly
1410 1415 1420
Gly Ala Val Glu Tyr Arg Thr Asp Val Phe Glu Ala Gln Ala Ile Asp
1425 1430 1435 1440
Val Leu Ile Glu Arg Leu Arg Lys Val Leu Val Ala Val Ala Ala Ala
1445 1450 1455
Pro Glu Arg Thr Val Ser Ser Ile Asp Ala Leu Asp Gly Thr Glu Arg
1460 1465 1470
Ala Arg Leu Asp Glu Trp Gly Asn Arg Ala Val Leu Thr Ala Pro Ala
1475 1480 1485
Pro Thr Pro Val Ser Ile Pro Gln Met Leu Ala Ala Gln Val Ala Arg
1490 1495 1500
Ile Pro Glu Ala Glu Ala Val Cys Cys Gly Asp Ala Ser Met Thr Tyr
1505 1510 1515 1520
Arg Glu Leu Asp Glu Ala Ser Asn Arg Leu Ala His Arg Leu Ala Gly
1525 1530 1535
Cys Gly Ala Gly Pro Gly Glu Cys Val Ala Leu Leu Phe Glu Arg Cys
1540 1545 1550
Ala Pro Ala Val Val Ala Met Val Ala Val Leu Lys Thr Gly Ala Ala
1555 1560 1565
Tyr Leu Pro Ile Asp Pro Ala Asn Pro Pro Pro Arg Val Ala Phe Met
1570 1575 1580
Leu Gly Asp Ala Val Pro Val Ala Ala Val Thr Thr Ala Gly Leu Arg
1585 1590 1595 1600
Ser Arg Leu Ala Gly His Asp Leu Pro Ile Ile Asp Val Val Asp Ala
1605 1610 1615
Leu Ala Ala Tyr Pro Gly Thr Pro Pro Pro Met Pro Ala Ala Val Asn
1620 1625 1630
Leu Ala Tyr Ile Leu Tyr Thr Ser Gly Thr Thr Gly Glu Pro Lys Gly
1635 1640 1645
Val Gly Ile Thr His Arg Asn Val Thr Arg Leu Phe Ala Ser Leu Pro
1650 1655 1660
Ala Arg Leu Ser Ala Ala Gln Val Trp Ser Gln Cys His Ser Tyr Gly
1665 1670 1675 1680
Phe Asp Ala Ser Ala Trp Glu Ile Trp Gly Ala Leu Leu Gly Gly Gly
1685 1690 1695
Arg Leu Val Ile Val Pro Glu Ser Val Ala Ala Ser Pro Asn Asp Phe
1700 1705 1710
His Gly Leu Leu Val Ala Glu His Val Ser Val Leu Thr Gln Thr Pro
1715 1720 1725
Ala Ala Val Ala Met Leu Pro Thr Gln Gly Leu Glu Ser Val Ala Leu
1730 1735 1740
Val Val Ala Gly Glu Ala Cys Pro Ala Ala Leu Val Asp Arg Trp Ala
1745 1750 1755 1760
Pro Gly Arg Val Met Leu Asn Ala Tyr Gly Pro Thr Glu Thr Thr Ile
1765 1770 1775
Cys Ala Ala Ile Ser Ala Pro Leu Arg Pro Gly Ser Gly Met Pro Pro
1780 1785 1790
Ile Gly Val Pro Val Ser Gly Ala Ala Leu Phe Val Leu Asp Ser Trp
1795 1800 1805
Leu Arg Pro Val Pro Ala Gly Val Ala Gly Glu Leu Tyr Ile Ala Gly
1810 1815 1820
Ala Gly Val Gly Val Gly Tyr Trp Arg Arg Ala Gly Leu Thr Ala Ser
1825 1830 1835 1840
Arg Phe Val Ala Cys Pro Phe Gly Gly Ser Gly Ala Arg Met Tyr Arg
1845 1850 1855
Thr Gly Asp Leu Val Cys Trp Arg Ala Asp Gly Gln Leu Glu Phe Leu
1860 1865 1870
Gly Arg Thr Asp Asp Gln Val Lys Ile Arg Gly Tyr Arg Ile Glu Leu
1875 1880 1885
Gly Glu Val Ala Thr Ala Leu Ala Glu Leu Ala Gly Val Gly Gln Ala
1890 1895 1900
Val Val Ile Ala Arg Glu Asp Arg Pro Gly Asp Lys Arg Leu Val Gly
1905 1910 1915 1920
Tyr Ala Thr Glu Ile Ala Pro Gly Ala Val Asp Pro Ala Gly Leu Arg
1925 1930 1935
Ala Gln Leu Ala Gln Arg Leu Pro Gly Tyr Leu Val Pro Ala Ala Val
1940 1945 1950
Val Val Ile Asp Ala Leu Pro Leu Thr Val Asn Gly Lys Leu Asp His
1955 1960 1965
Arg Ala Leu Pro Ala Pro Glu Tyr Gly Asp Thr Asn Gly Tyr Arg Ala
1970 1975 1980
Pro Ala Gly Pro Val Glu Lys Thr Val Ala Gly Ile Phe Ala Arg Val
1985 1990 1995 2000
Leu Gly Leu Glu Arg Val Gly Val Asp Asp Ser Phe Phe Glu Leu Gly
2005 2010 2015
Gly Asp Ser Leu Ala Ala Met Arg Val Ile Ala Ala Ile Asn Thr Thr
2020 2025 2030
Leu Asn Ala Asp Leu Pro Val Arg Ala Leu Leu His Ala Ser Ser Thr
2035 2040 2045
Arg Gly Leu Ser Gln Leu Leu Gly Arg Asp Ala Arg Pro Thr Ser Asp
2050 2055 2060
Pro Arg Leu Val Ser Val His Gly Asp Asn Pro Thr Glu Val His Ala
2065 2070 2075 2080
Ser Asp Leu Thr Leu Asp Arg Phe Ile Asp Ala Asp Thr Leu Ala Thr
2085 2090 2095
Ala Val Asn Leu Pro Gly Pro Ser Pro Glu Leu Arg Thr Val Leu Leu
2100 2105 2110
Thr Gly Ala Thr Gly Phe Leu Gly Arg Tyr Leu Val Leu Glu Leu Leu
2115 2120 2125
Arg Arg Leu Asp Val Asp Gly Arg Leu Ile Cys Leu Val Arg Ala Glu
2130 2135 2140
Ser Asp Glu Asp Ala Arg Arg Arg Leu Glu Lys Thr Phe Asp Ser Gly
2145 2150 2155 2160
Asp Pro Glu Leu Leu Arg His Phe Lys Glu Leu Ala Ala Asp Arg Leu
2165 2170 2175
Glu Val Val Ala Gly Asp Lys Ser Glu Pro Asp Leu Gly Leu Asp Gln
2180 2185 2190
Pro Met Trp Arg Arg Leu Ala Glu Thr Val Asp Leu Ile Val Asp Ser
2195 2200 2205
Ala Ala Met Val Asn Ala Phe Pro Tyr His Glu Leu Phe Gly Pro Asn
2210 2215 2220
Val Ala Gly Thr Ala Glu Leu Ile Arg Ile Ala Leu Thr Thr Lys Leu
2225 2230 2235 2240
Lys Pro Phe Thr Tyr Val Ser Thr Ala Asp Val Gly Ala Ala Ile Glu
2245 2250 2255
Pro Ser Ala Phe Thr Glu Asp Ala Asp Ile Arg Val Ile Ser Pro Thr
2260 2265 2270
Arg Thr Val Asp Gly Gly Trp Ala Gly Gly Tyr Gly Thr Ser Lys Trp
2275 2280 2285
Ala Gly Glu Val Leu Leu Arg Glu Ala Asn Asp Leu Cys Ala Leu Pro
2290 2295 2300
Val Ala Val Phe Arg Cys Gly Met Ile Leu Ala Asp Thr Ser Tyr Ala
2305 2310 2315 2320
Gly Gln Leu Asn Met Ser Asp Trp Val Thr Arg Met Val Leu Ser Leu
2325 2330 2335
Met Ala Thr Gly Ile Ala Pro Arg Ser Phe Tyr Glu Pro Asp Ser Glu
2340 2345 2350
Gly Asn Arg Gln Arg Ala His Phe Asp Gly Leu Pro Val Thr Phe Val
2355 2360 2365
Ala Glu Ala Ile Ala Val Leu Gly Ala Arg Val Ala Gly Ser Ser Leu
2370 2375 2380
Ala Gly Phe Ala Thr Tyr His Val Met Asn Pro His Asp Asp Gly Ile
2385 2390 2395 2400
Gly Leu Asp Glu Tyr Val Asp Trp Leu Ile Glu Ala Gly Tyr Pro Ile
2405 2410 2415
Arg Arg Ile Asp Asp Phe Ala Glu Trp Leu Gln Arg Phe Glu Ala Ser
2420 2425 2430
Leu Gly Ala Leu Pro Asp Arg Gln Arg Arg His Ser Val Leu Pro Met
2435 2440 2445
Leu Leu Ala Ser Asn Ser Gln Arg Leu Gln Pro Leu Lys Pro Thr Arg
2450 2455 2460
Gly Cys Ser Ala Pro Thr Asp Arg Phe Arg Ala Ala Val Arg Ala Ala
2465 2470 2475 2480
Lys Val Gly Ser Asp Lys Asp Asn Pro Asp Ile Pro His Val Ser Ala
2485 2490 2495
Pro Thr Ile Ile Asn Tyr Val Thr Asn Leu Gln Leu Leu Gly Leu Leu
2500 2505 2510
<210> 7
<211> 1316
<212> PRT
<213> RpoC protein of Mycobacterium bovis
<400> 7
Met Leu Asp Val Asn Phe Phe Asp Glu Leu Arg Ile Gly Leu Ala Thr
1 5 10 15
Ala Glu Asp Ile Arg Gln Trp Ser Tyr Gly Glu Val Lys Lys Pro Glu
20 25 30
Thr Ile Asn Tyr Arg Thr Leu Lys Pro Glu Lys Asp Gly Leu Phe Cys
35 40 45
Glu Lys Ile Phe Gly Pro Thr Arg Asp Trp Glu Cys Tyr Cys Gly Lys
50 55 60
Tyr Lys Arg Val Arg Phe Lys Gly Ile Ile Cys Glu Arg Cys Gly Val
65 70 75 80
Glu Val Thr Arg Ala Lys Val Arg Arg Glu Arg Met Gly His Ile Glu
85 90 95
Leu Ala Ala Pro Val Thr His Ile Trp Tyr Phe Lys Gly Val Pro Ser
100 105 110
Arg Leu Gly Tyr Leu Leu Asp Leu Ala Pro Lys Asp Leu Glu Lys Ile
115 120 125
Ile Tyr Phe Ala Ala Tyr Val Ile Thr Ser Val Asp Glu Glu Met Arg
130 135 140
His Asn Glu Leu Ser Thr Leu Glu Ala Glu Met Ala Val Glu Arg Lys
145 150 155 160
Ala Val Glu Asp Gln Arg Asp Gly Glu Leu Glu Ala Arg Ala Gln Lys
165 170 175
Leu Glu Ala Asp Leu Ala Glu Leu Glu Ala Glu Gly Ala Lys Ala Asp
180 185 190
Ala Arg Arg Lys Val Arg Asp Gly Gly Glu Arg Glu Met Arg Gln Ile
195 200 205
Arg Asp Arg Ala Gln Arg Glu Leu Asp Arg Leu Glu Asp Ile Trp Ser
210 215 220
Thr Phe Thr Lys Leu Ala Pro Lys Gln Leu Ile Val Asp Glu Asn Leu
225 230 235 240
Tyr Arg Glu Leu Val Asp Arg Tyr Gly Glu Tyr Phe Thr Gly Ala Met
245 250 255
Gly Ala Glu Ser Ile Gln Lys Leu Ile Glu Asn Phe Asp Ile Asp Ala
260 265 270
Glu Ala Glu Ser Leu Arg Asp Val Ile Arg Asn Gly Lys Gly Gln Lys
275 280 285
Lys Leu Arg Ala Leu Lys Arg Leu Lys Val Val Ala Ala Phe Gln Gln
290 295 300
Ser Gly Asn Ser Pro Met Gly Met Val Leu Asp Ala Val Pro Val Ile
305 310 315 320
Pro Pro Glu Leu Arg Pro Met Val Gln Leu Asp Gly Gly Arg Phe Ala
325 330 335
Thr Ser Asp Leu Asn Asp Leu Tyr Arg Arg Val Ile Asn Arg Asn Asn
340 345 350
Arg Leu Lys Arg Leu Ile Asp Leu Gly Ala Pro Glu Ile Ile Val Asn
355 360 365
Asn Glu Lys Arg Met Leu Gln Glu Ser Val Asp Ala Leu Phe Asp Asn
370 375 380
Gly Arg Arg Gly Arg Pro Val Thr Gly Pro Gly Asn Arg Pro Leu Lys
385 390 395 400
Ser Leu Ser Asp Leu Leu Lys Gly Lys Gln Gly Arg Phe Arg Gln Asn
405 410 415
Leu Leu Gly Lys Arg Val Asp Tyr Ser Gly Arg Ser Val Ile Val Val
420 425 430
Gly Pro Gln Leu Lys Leu His Gln Cys Gly Leu Pro Lys Leu Met Ala
435 440 445
Leu Glu Leu Phe Lys Pro Phe Val Met Lys Arg Leu Val Asp Leu Asn
450 455 460
His Ala Gln Asn Ile Lys Ser Ala Lys Arg Met Val Glu Arg Gln Arg
465 470 475 480
Pro Gln Val Trp Asp Val Leu Glu Glu Val Ile Ala Glu His Pro Val
485 490 495
Leu Leu Asn Arg Ala Pro Thr Leu His Arg Leu Gly Ile Gln Ala Phe
500 505 510
Glu Pro Met Leu Val Glu Gly Lys Ala Ile Gln Leu His Pro Leu Val
515 520 525
Cys Glu Ala Phe Asn Ala Asp Phe Asp Gly Asp Gln Met Ala Val His
530 535 540
Leu Pro Leu Ser Ala Glu Ala Gln Ala Glu Ala Arg Ile Leu Met Leu
545 550 555 560
Ser Ser Asn Asn Ile Leu Ser Pro Ala Ser Gly Arg Pro Leu Ala Met
565 570 575
Pro Arg Leu Asp Met Val Thr Gly Leu Tyr Tyr Leu Thr Thr Glu Val
580 585 590
Pro Gly Asp Thr Gly Glu Tyr Gln Pro Ala Ser Gly Asp His Pro Glu
595 600 605
Thr Gly Val Tyr Ser Ser Pro Ala Glu Ala Ile Met Ala Ala Asp Arg
610 615 620
Gly Val Leu Ser Val Arg Ala Lys Ile Lys Val Arg Leu Thr Gln Leu
625 630 635 640
Arg Pro Pro Val Glu Ile Glu Ala Glu Leu Phe Gly His Ser Gly Trp
645 650 655
Gln Pro Gly Asp Ala Trp Met Ala Glu Thr Thr Leu Gly Arg Val Met
660 665 670
Phe Asn Glu Leu Leu Pro Leu Gly Tyr Pro Phe Val Asn Lys Gln Met
675 680 685
His Lys Lys Val Gln Ala Ala Ile Ile Asn Asp Leu Ala Glu Arg Tyr
690 695 700
Pro Met Ile Val Val Ala Gln Thr Val Asp Lys Leu Lys Asp Ala Gly
705 710 715 720
Phe Tyr Trp Ala Thr Arg Ser Gly Val Thr Val Ser Met Ala Asp Val
725 730 735
Leu Val Pro Pro Arg Lys Lys Glu Ile Leu Asp His Tyr Glu Glu Arg
740 745 750
Ala Asp Lys Val Glu Lys Gln Phe Gln Arg Gly Ala Leu Asn His Asp
755 760 765
Glu Arg Asn Glu Ala Leu Val Glu Ile Trp Lys Glu Ala Thr Asp Glu
770 775 780
Val Gly Gln Ala Leu Arg Glu His Tyr Pro Asp Asp Asn Pro Ile Ile
785 790 795 800
Thr Ile Val Asp Ser Gly Ala Thr Gly Asn Phe Thr Gln Thr Arg Thr
805 810 815
Leu Ala Gly Met Lys Gly Leu Val Thr Asn Pro Lys Gly Glu Phe Ile
820 825 830
Pro Arg Pro Val Lys Ser Ser Phe Arg Glu Gly Leu Thr Val Leu Glu
835 840 845
Tyr Phe Ile Asn Thr His Gly Ala Arg Lys Gly Leu Ala Asp Thr Ala
850 855 860
Leu Arg Thr Ala Asp Ser Gly Tyr Leu Thr Arg Arg Leu Val Asp Val
865 870 875 880
Ser Gln Asp Val Ile Val Arg Glu His Asp Cys Gln Thr Glu Arg Gly
885 890 895
Ile Val Val Glu Leu Ala Glu Arg Ala Pro Asp Gly Thr Leu Ile Arg
900 905 910
Asp Pro Tyr Ile Glu Thr Ser Ala Tyr Ala Arg Thr Leu Gly Thr Asp
915 920 925
Ala Val Asp Glu Ala Gly Asn Val Ile Val Glu Arg Gly Gln Asp Leu
930 935 940
Gly Asp Pro Glu Ile Asp Ala Leu Leu Ala Ala Gly Ile Thr Gln Val
945 950 955 960
Lys Val Arg Ser Val Leu Thr Cys Ala Thr Ser Thr Gly Val Cys Ala
965 970 975
Thr Cys Tyr Gly Arg Ser Met Ala Thr Gly Lys Leu Val Asp Ile Gly
980 985 990
Glu Ala Val Gly Ile Val Ala Ala Gln Ser Ile Gly Glu Pro Gly Thr
995 1000 1005
Gln Leu Thr Met Arg Thr Phe His Gln Gly Gly Val Gly Glu Asp Ile
1010 1015 1020
Thr Gly Gly Leu Pro Arg Val Gln Glu Leu Phe Glu Ala Arg Val Pro
1025 1030 1035 1040
Arg Gly Lys Ala Pro Ile Ala Asp Val Thr Gly Arg Val Arg Leu Glu
1045 1050 1055
Asp Gly Glu Arg Phe Tyr Lys Ile Thr Ile Val Pro Asp Asp Gly Gly
1060 1065 1070
Glu Glu Val Val Tyr Asp Lys Ile Ser Lys Arg Gln Arg Leu Arg Val
1075 1080 1085
Phe Lys His Glu Asp Gly Ser Glu Arg Val Leu Ser Asp Gly Asp His
1090 1095 1100
Val Glu Val Gly Gln Gln Leu Met Glu Gly Ser Ala Asp Pro His Glu
1105 1110 1115 1120
Val Leu Arg Val Gln Gly Pro Arg Glu Val Gln Ile His Leu Val Arg
1125 1130 1135
Glu Val Gln Glu Val Tyr Arg Ala Gln Gly Val Ser Ile His Asp Lys
1140 1145 1150
His Ile Glu Val Ile Val Arg Gln Met Leu Arg Arg Val Thr Ile Ile
1155 1160 1165
Asp Ser Gly Ser Thr Glu Phe Leu Pro Gly Ser Leu Ile Asp Arg Ala
1170 1175 1180
Glu Phe Glu Ala Glu Asn Arg Arg Val Val Ala Glu Gly Gly Glu Pro
1185 1190 1195 1200
Ala Ala Gly Arg Pro Val Leu Met Gly Ile Thr Lys Ala Ser Leu Ala
1205 1210 1215
Thr Asp Ser Trp Leu Ser Ala Ala Ser Phe Gln Glu Thr Thr Arg Val
1220 1225 1230
Leu Thr Asp Ala Ala Ile Asn Cys Arg Ser Asp Lys Leu Asn Gly Leu
1235 1240 1245
Lys Glu Asn Val Ile Ile Gly Lys Leu Ile Pro Ala Gly Thr Gly Ile
1250 1255 1260
Asn Arg Tyr Arg Asn Ile Ala Val Gln Pro Thr Glu Glu Ala Arg Ala
1265 1270 1275 1280
Ala Ala Tyr Thr Ile Pro Ser Tyr Glu Asp Gln Tyr Tyr Ser Pro Asp
1285 1290 1295
Phe Gly Ala Ala Thr Gly Ala Ala Val Pro Leu Asp Asp Tyr Gly Tyr
1300 1305 1310
Ser Asp Tyr Arg
1315
<210> 8
<211> 459
<212> PRT
<213> Transposase of Mycobacterium bovis
<400> 8
Met Ala Lys Phe Glu Ile Pro Glu Gly Trp Met Val Gln Ala Phe Arg
1 5 10 15
Phe Thr Leu Asp Pro Thr Ala Glu Gln Ala Arg Ala Leu Ala Arg His
20 25 30
Phe Gly Ala Arg Arg Lys Ala Tyr Asn Trp Thr Val Ala Thr Leu Lys
35 40 45
Ala Asp Ile Asp Ala Trp Gln Ala Thr Gly Ile Gln Thr Ala Lys Pro
50 55 60
Ser Leu Arg Val Leu Arg Lys Arg Trp Asn Thr Val Lys Asn Asp Val
65 70 75 80
Cys Val Asn Ile Glu Thr Gly Val Val Trp Trp Pro Glu Cys Ser Lys
85 90 95
Glu Ala Tyr Ala Asp Gly Ile Asp Gly Ala Val Asp Ala Tyr Trp Asn
100 105 110
Trp Gln Asn Ser Arg Ser Gly Lys Arg Asp Gly Lys Arg Met Gly Phe
115 120 125
Pro Arg Phe Lys Lys Lys Gly Arg Asp Pro Asp Arg Val Thr Phe Thr
130 135 140
Thr Gly Ala Met Arg Val Glu Pro Asp Arg Arg His Leu Thr Leu Pro
145 150 155 160
Val Ile Gly Thr Val Arg Thr His Glu Asn Thr Arg Arg Val Glu Arg
165 170 175
Leu Ile Ala Lys Gly Arg Ser Arg Val Leu Ala Ile Thr Val Arg Arg
180 185 190
Asn Gly Thr Arg Ile Asp Ala Ser Val Arg Val Leu Val Gln Arg Pro
195 200 205
Gln Gln Pro Lys Val Thr Asp Pro Gly Ser Arg Val Gly Val Asp Val
210 215 220
Gly Val Arg Arg Leu Ala Thr Val Ala Thr Ala Asp Gly Ala Val Leu
225 230 235 240
Glu Arg Val Pro Asn Pro Arg Pro Leu Asp Ala Ala Leu Asn Glu Leu
245 250 255
Arg His Val Cys Arg Ala Arg Ser Arg Cys Thr Lys Gly Ser Arg Arg
260 265 270
Tyr Arg Glu Arg Thr Thr Glu Ile Ser Arg Leu His Arg Arg Val Asn
275 280 285
Asp Val Arg Thr His His Leu His Cys Leu Thr Thr His Leu Ala Lys
290 295 300
Thr His Gly Arg Ile Val Val Glu Gly Leu Asp Ala Ala Gly Met Leu
305 310 315 320
Arg Gln Gln Gly Leu Ser Gly Ala Arg Ala Arg Arg Arg Gly Leu Ser
325 330 335
Asp Ala Ala Leu Gly Thr Pro Arg Arg His Leu Ser Tyr Lys Thr Gly
340 345 350
Trp Tyr Gly Ser Gln Leu Val Val Ala Asp Arg Trp Phe Pro Ser Ser
355 360 365
Lys Thr Cys His Val Cys Gly His Val Gln Glu Ile Gly Trp Ala Glu
370 375 380
His Trp Gln Cys Asp Ser Cys Ser Ala Ser His Gln Arg Asp Asp Cys
385 390 395 400
Ala Ala Ile Asn Leu Ala Arg Tyr Glu Asp Thr Ser Ser Val Val Gly
405 410 415
Pro Val Gly Ala Ala Val Lys Arg Gly Ala Asp Arg Lys Thr Arg Pro
420 425 430
Gly Arg Ala Gly Gly Arg Glu Ala Arg Lys Gly Ser Ser Arg Lys Ala
435 440 445
Ala Glu Gln Pro Arg Asp Gly Val Gln Val Ala
450 455
<210> 9
<211> 701
<212> PRT
<213> LeuA protein of Mycobacterium bovis
<400> 9
Met Thr Thr Ser Glu Ser Pro Asp Ala Tyr Thr Glu Ser Phe Gly Ala
1 5 10 15
His Thr Ile Val Lys Pro Ala Gly Pro Pro Arg Val Gly Gln Pro Ser
20 25 30
Trp Asn Pro Gln Arg Ala Ser Ser Met Pro Val Asn Arg Tyr Arg Pro
35 40 45
Phe Ala Glu Glu Val Glu Pro Ile Arg Leu Arg Asn Arg Thr Trp Pro
50 55 60
Asp Arg Val Ile Asp Arg Ala Pro Leu Trp Cys Ala Val Asp Leu Arg
65 70 75 80
Asp Gly Asn Gln Ala Leu Ile Asp Pro Met Ser Pro Ala Arg Lys Arg
85 90 95
Arg Met Phe Asp Leu Leu Val Arg Met Gly Tyr Lys Glu Ile Glu Val
100 105 110
Gly Phe Pro Ser Ala Ser Gln Thr Asp Phe Asp Phe Val Arg Glu Ile
115 120 125
Ile Glu Gln Gly Ala Ile Pro Asp Asp Val Thr Ile Gln Val Leu Thr
130 135 140
Gln Cys Arg Pro Glu Leu Ile Glu Arg Thr Phe Gln Ala Cys Ser Gly
145 150 155 160
Ala His Arg Ala Ile Val His Phe Tyr Asn Ser Thr Ser Ile Leu Gln
165 170 175
Arg Arg Val Val Phe Arg Ala Asn Arg Ala Glu Val Gln Ala Ile Ala
180 185 190
Thr Asp Gly Ala Arg Lys Cys Val Glu Gln Ala Ala Lys Tyr Pro Gly
195 200 205
Thr Gln Trp Arg Phe Glu Tyr Ser Pro Glu Ser Tyr Thr Gly Thr Glu
210 215 220
Leu Glu Tyr Ala Lys Gln Val Cys Asp Ala Val Gly Glu Val Ile Ala
225 230 235 240
Pro Thr Pro Glu Arg Pro Ile Ile Phe Asn Leu Pro Ala Thr Val Glu
245 250 255
Met Thr Thr Pro Asn Val Tyr Ala Asp Ser Ile Glu Trp Met Ser Arg
260 265 270
Asn Leu Ala Asn Arg Glu Ser Val Ile Leu Ser Leu His Pro His Asn
275 280 285
Asp Arg Gly Thr Ala Val Ala Ala Ala Glu Leu Gly Phe Ala Ala Gly
290 295 300
Ala Asp Arg Ile Glu Gly Cys Leu Phe Gly Asn Gly Glu Arg Thr Gly
305 310 315 320
Asn Val Cys Leu Val Thr Leu Gly Leu Asn Leu Phe Ser Arg Gly Val
325 330 335
Asp Pro Gln Ile Asp Phe Ser Asn Ile Asp Glu Ile Arg Arg Thr Val
340 345 350
Glu Tyr Cys Asn Gln Leu Pro Val His Glu Arg His Pro Tyr Gly Gly
355 360 365
Asp Leu Val Tyr Thr Ala Phe Ser Gly Ser His Gln Asp Ala Ile Asn
370 375 380
Lys Gly Leu Asp Ala Met Lys Leu Asp Ala Asp Ala Ala Asp Cys Asp
385 390 395 400
Val Asp Asp Met Leu Trp Gln Val Pro Tyr Leu Pro Ile Asp Pro Arg
405 410 415
Asp Val Gly Arg Thr Tyr Glu Ala Val Ile Arg Val Asn Ser Gln Ser
420 425 430
Gly Lys Gly Gly Val Ala Tyr Ile Met Lys Thr Asp His Gly Leu Ser
435 440 445
Leu Pro Arg Arg Leu Gln Ile Glu Phe Ser Gln Val Ile Gln Lys Ile
450 455 460
Ala Glu Gly Thr Ala Gly Glu Gly Gly Glu Val Ser Pro Lys Glu Met
465 470 475 480
Trp Asp Ala Phe Ala Glu Glu Tyr Leu Ala Pro Val Arg Pro Leu Glu
485 490 495
Arg Ile Arg Gln His Val Asp Ala Ala Asp Asp Asp Gly Gly Thr Thr
500 505 510
Ser Ile Thr Ala Thr Val Lys Ile Asn Gly Val Glu Thr Glu Ile Ser
515 520 525
Gly Ser Gly Asn Gly Pro Leu Ala Ala Phe Val His Ala Leu Ala Asp
530 535 540
Val Gly Phe Asp Val Ala Val Leu Asp Tyr Tyr Glu His Ala Met Ser
545 550 555 560
Ala Gly Asp Asp Ala Gln Ala Ala Ala Tyr Val Glu Ala Ser Val Thr
565 570 575
Ile Ala Ser Pro Ala Gln Pro Gly Glu Ala Gly Arg His Ala Ser Asp
580 585 590
Pro Val Thr Ile Ala Ser Pro Ala Gln Pro Gly Glu Ala Gly Arg His
595 600 605
Ala Ser Asp Pro Val Thr Ile Ala Ser Pro Ala Gln Pro Gly Glu Ala
610 615 620
Gly Arg His Ala Ser Asp Pro Val Thr Ile Ala Ser Pro Ala Gln Pro
625 630 635 640
Gly Glu Ala Gly Arg His Ala Ser Asp Pro Val Thr Ile Ala Ser Pro
645 650 655
Ala Gln Pro Gly Glu Ala Gly Arg His Ala Ser Asp Pro Val Thr Ser
660 665 670
Lys Thr Val Trp Gly Val Gly Ile Ala Pro Ser Ile Thr Thr Ala Ser
675 680 685
Leu Arg Ala Val Val Ser Ala Val Asn Arg Ala Ala Arg
690 695 700
<210> 10
<211> 1682
<212> PRT
<213> MbtE protein of Mycobacterium bovis
<400> 10
Met Trp Phe Val Gln Met Ala Asp Pro Ser Gly Ala Leu Leu Asn Ile
1 5 10 15
Cys Val Ser Tyr Arg Ile Thr Gly Asp Ile Asp Leu Ala Arg Leu Arg
20 25 30
Asp Ala Val Asn Ala Val Ala Arg Arg His Arg Ile Leu Arg Thr Thr
35 40 45
Tyr Pro Val Gly Asp Asp Gly Val Ala Gln Pro Thr Val His Ala Asp
50 55 60
Leu Arg Pro Gly Trp Thr Gln Tyr Asp Leu Thr Asp Leu Ser Gln Arg
65 70 75 80
Ala Gln Arg Leu Arg Leu Glu Val Leu Ala Gln Arg Glu Phe Cys Ala
85 90 95
Pro Phe Glu Leu Ser Arg Asp Ala Pro Leu Arg Ile Thr Val Val Arg
100 105 110
Thr Ala Ala Asp Glu His Val Leu Leu Leu Val Ala His His Ile Ala
115 120 125
Trp Asp Asp Gly Ser Trp Arg Val Phe Phe Thr Asp Leu Thr Gln Ala
130 135 140
Tyr Ser Arg Ala Asp Leu Gly Ala Asp Leu Gly Pro Glu His Arg Pro
145 150 155 160
Ser Ala Ala Ser Gly Pro Asp Thr Thr Glu Ala Asp Leu Asn Tyr Trp
165 170 175
Arg Ala Ile Met Ala Asp Pro Pro Glu Pro Leu Glu Leu Pro Gly Pro
180 185 190
Ala Gly Thr Cys Val Pro Thr Ser Trp Arg Ala Ala Arg Ala Thr Leu
195 200 205
Arg Leu Pro Ala Asp Thr Ala Ala Arg Val Ala Thr Met Ala Lys Asn
210 215 220
Thr Gly Cys Thr Pro Tyr Met Val Leu Leu Ala Ala Phe Gly Ala Leu
225 230 235 240
Val His Arg Tyr Thr His Ser Asp Asp Phe Leu Val Ala Ala Pro Val
245 250 255
Leu Asn Arg Gly Ala Gly Thr Glu Asp Ala Ile Gly Tyr Phe Gly Asn
260 265 270
Thr Val Ala Met Arg Leu Arg Pro Gln Ser Ala Met Ser Phe Arg Glu
275 280 285
Leu Leu Thr Ala Thr Arg Asp Ile Ala Ser Gly Ala Phe Ala His Gln
290 295 300
Arg Ile Asn Leu Asp Arg Val Val Arg Glu Leu Asn Pro Asp Arg Arg
305 310 315 320
His Gly Ala Glu Arg Met Thr Arg Val Ser Phe Gly Phe Arg Glu Pro
325 330 335
Asp Gly Gly Gly Phe Asn Pro Pro Gly Ile Glu Cys Glu Arg Tyr Asp
340 345 350
Leu Arg Ser Asn Ile Thr Gln Leu Pro Leu Gly Phe Met Val Glu Phe
355 360 365
Asp Arg Ala Gly Val Leu Val Glu Ala Glu His Leu Val Glu Ile Leu
370 375 380
Glu Pro Ala Leu Ala Lys Gln Met Leu Arg His Phe Gly Val Leu Leu
385 390 395 400
Asp Asn Ala Leu Ala Ala Pro Asp Asn Thr Leu Ser Gly Leu Ala Leu
405 410 415
Met Asp Glu Arg Asp Ala Ala Arg Leu Arg Glu Val Ser Arg Gly Glu
420 425 430
Arg Phe Asp Thr Pro Val Lys Thr Leu Val Asp Leu Val Asn Glu Gln
435 440 445
Thr Thr Arg Thr Pro Asp Ala Thr Ala Val Val Tyr Glu Gly Gln His
450 455 460
Phe Thr Tyr His Asp Leu Asn Glu Ala Ser Asn Arg Leu Gly His Trp
465 470 475 480
Leu Ile Glu Gln Gly Ile Gly Ser Glu Asp Arg Val Ala Val Leu Leu
485 490 495
Asp Lys Ser Pro Asp Leu Ile Val Thr Ala Leu Gly Val Val Lys Ser
500 505 510
Gly Ala Val Tyr Val Pro Val Asp Pro Ser Tyr Pro Gln Asp Arg Leu
515 520 525
Asp Phe Ile Leu Ala Asp Cys Asp Ala Lys Leu Val Leu Arg Thr Pro
530 535 540
Val Arg Glu Leu Ala Gly Tyr Arg Ser Asp Asp Pro Thr Asp Ala Asp
545 550 555 560
Arg Ile Arg Pro Leu Arg Pro Asp Asn Thr Ala Tyr Leu Ile Tyr Thr
565 570 575
Ser Gly Thr Thr Gly Leu Pro Lys Gly Val Ala Val Pro His Arg Pro
580 585 590
Val Ala Glu Tyr Phe Val Trp Phe Lys Gly Glu Tyr Asp Val Asp Asp
595 600 605
Thr Asp Arg Leu Leu Gln Val Ala Ser Pro Ser Phe Asp Val Ser Ile
610 615 620
Ala Glu Ile Phe Gly Thr Leu Ala Cys Gly Ala Arg Met Val Ile Pro
625 630 635 640
Arg Pro Gly Gly Leu Thr Asp Ile Gly Tyr Leu Thr Ala Leu Leu Arg
645 650 655
Asp Glu Gly Ile Thr Ala Met His Phe Val Pro Ser Leu Leu Gly Leu
660 665 670
Phe Leu Ser Leu Pro Gly Val Ser Gln Trp Arg Thr Leu Gln Arg Val
675 680 685
Pro Ile Gly Gly Glu Pro Leu Pro Gly Glu Val Ala Asp Lys Phe His
690 695 700
Ala Thr Phe Asp Ala Leu Leu His Asn Phe Tyr Gly Pro Thr Glu Thr
705 710 715 720
Val Ile Asn Ala Ser Arg Phe Lys Val Val Gly Pro Gln Gly Thr Arg
725 730 735
Ile Val Pro Ile Gly Arg Pro Lys Ile Asn Thr Thr Met His Leu Leu
740 745 750
Asp Asp Ser Leu Gln Pro Val Pro Thr Gly Val Ile Gly Glu Ile Tyr
755 760 765
Ile Gly Gly Thr His Val Ala Tyr Gly Tyr His Arg Arg Ala Gly Leu
770 775 780
Thr Ala Glu Arg Phe Val Ala Asp Pro Phe Asn Pro Gly Ser Arg Met
785 790 795 800
Tyr Arg Ser Gly Asp Leu Ala Arg Arg Asn Ala Asp Gly Asp Ile Glu
805 810 815
Phe Val Gly Arg Ala Asp Glu Gln Val Lys Ile Arg Gly Phe Arg Ile
820 825 830
Glu Leu Gly Asp Val Ala Ala Ala Ile Ala Val Asp Pro Thr Val Gly
835 840 845
Gln Ala Val Val Val Val Ser Asp Leu Pro Arg Leu Gly Lys Ser Leu
850 855 860
Val Gly Tyr Val Thr Pro Ala Ala Gly Gly Asp Gly Pro Ala Asp Val
865 870 875 880
Gly Val Asp Leu Asp Arg Ile Arg Ala Arg Val Ala Ala Ala Leu Pro
885 890 895
Glu Tyr Met Leu Pro Ala Ala Tyr Val Val Leu Asp Glu Ile Pro Ile
900 905 910
Thr Ala His Gly Lys Ile Asp Arg Ala Ala Leu Pro Glu Pro Gln Ile
915 920 925
Ala Ser Asp Thr Glu Phe Arg Ala Pro Gln Thr Ala Thr Glu Arg Arg
930 935 940
Leu Ala Gln Leu Phe Gly Glu Leu Leu Gly Arg Asp Arg Val Gly Ala
945 950 955 960
Asp Asp Ser Phe Phe Asp Leu Gly Gly His Ser Leu Leu Ala Thr Lys
965 970 975
Leu Val Ala Ala Val Arg Asn Ala Phe Gly Val Asp Val Gly Val Arg
980 985 990
Glu Ile Phe Glu Phe Ala Thr Val Thr Ala Leu Ala Gly His Ile Asp
995 1000 1005
Thr Leu Asp Ser Asp Ser Ala Arg Pro Arg Leu Thr Arg Val Asp His
1010 1015 1020
Asp Gly Pro Val Arg Leu Ser Ser Ser Gln Met Arg Ser Trp Phe Asn
1025 1030 1035 1040
Tyr Arg Phe Asp Gly Pro Asn Ala Val Asn Asn Ile Pro Phe Ala Ala
1045 1050 1055
Ala Leu His Gly Pro Cys Asp Thr Asn Ala Phe Ala Ala Ala Ile Thr
1060 1065 1070
Asp Val Val Ala Arg His Glu Ile Leu Arg Thr Val Tyr Arg Glu Ile
1075 1080 1085
Gly Gly Val Pro His Gln Ile Ile Gln Pro Pro Ala Glu Val Pro Val
1090 1095 1100
Arg Cys Ala Ala Gly Ser Asp Ala Ala Trp Leu Arg Ala Glu Leu Asn
1105 1110 1115 1120
Asn Glu Arg Gly Tyr Val Phe Asp Leu Glu Thr Asp Trp Pro Ile Arg
1125 1130 1135
Ala Ala Leu Leu Ser Thr Pro Glu Gln Thr Val Leu Ser Leu Val Val
1140 1145 1150
His His Ile Ala Gly Asp His Trp Ser Ala Gly Val Leu Phe Thr Asp
1155 1160 1165
Leu Leu Thr Ala Tyr Arg Ala Arg Ser Thr Gly Gln Arg Pro Ser Trp
1170 1175 1180
Ala Pro Leu Pro Val Gln Tyr Ala Asp Tyr Ser Val Trp Gln Ser Ala
1185 1190 1195 1200
Leu Leu Asp Asp Gly Ala Gly Ile Val Gly Pro Gln Arg Asp Tyr Trp
1205 1210 1215
Ile Arg Gln Leu Gly Gly Leu Ala Gly Glu Thr Gly Leu Arg Pro Asp
1220 1225 1230
Phe Pro Arg Pro Ala Leu Leu Ser Gly Ala Gly Asp Ala Val Glu Phe
1235 1240 1245
Arg Leu Gly Ala Ala Ile Arg Asp Lys Leu Ala Ala Val Ser Arg Asp
1250 1255 1260
Leu Gly Val Thr Glu Phe Met Leu Leu Gln Ala Ala Val Ala Val Val
1265 1270 1275 1280
Leu His Lys Ala Gly Gly Gly Val Asp Val Pro Ile Gly Ala Pro Val
1285 1290 1295
Ala Gly Arg Ser Glu Ala Asn Leu Asp Gln Leu Ile Gly Phe Phe Ile
1300 1305 1310
Asn Ile Val Val Leu Arg Asn Asp Leu Arg Gly Asn Pro Thr Leu Arg
1315 1320 1325
Glu Val Leu Gln Arg Thr Arg Gln Met Ala Leu Ala Ala Tyr Ala His
1330 1335 1340
Gln Asp Leu Pro Phe Asp Gln Val Val Glu Ala Val Asn Pro Gln Arg
1345 1350 1355 1360
Ser Leu Ser Arg Asn Pro Leu Phe Asp Ile Val Val His Val Arg Glu
1365 1370 1375
Gln Met Pro Gln Asp His Val Ile Asp Thr Gly Pro Asp Gly Asp Thr
1380 1385 1390
Thr Leu Arg Val Leu Glu Pro Thr Phe Asp Ala Ala Gln Ala Asp Leu
1395 1400 1405
Ser Val Asn Phe Phe Ala Cys Gly Asp Glu Tyr Arg Gly His Val Ile
1410 1415 1420
Tyr Arg Thr Glu Leu Tyr Glu Arg Ala Thr Ala Gln Arg Phe Ala Asp
1425 1430 1435 1440
Trp Leu Val Arg Val Val Glu Ala Phe Ala Asp Arg Pro Asp Gln Pro
1445 1450 1455
Leu Arg Glu Val Glu Met Val Ser Ala Gln Ala Arg Arg Arg Ile Leu
1460 1465 1470
Asp Arg Ser Asn Ala Gly Ala Gly Thr Ala Arg Val Tyr Leu Leu Asp
1475 1480 1485
Asp Ala Leu Lys Pro Val Pro Val Gly Val Val Gly Asp Val Tyr Tyr
1490 1495 1500
Gly Gly Gly Pro Ala Val Gly Ala Arg Leu Ala Arg Pro Ser Glu Thr
1505 1510 1515 1520
Ala Thr Arg Phe Val Ala Asp Pro Phe Ala Ala Gln Pro Gly Ser Arg
1525 1530 1535
Leu Tyr Arg Asn Gly Glu Arg Gly Val Trp Lys Ala Asp Gly Gln Leu
1540 1545 1550
Glu Leu Leu Ala Glu Ile Glu Arg Leu Pro Thr Ala Gln Ala Ala Pro
1555 1560 1565
Val Pro Ala Glu Pro Ala Asp Thr Glu Thr Glu Arg Ala Leu Ala Ala
1570 1575 1580
Ile Leu Ala Asp Val Leu Glu Val Gly Glu Val Gly Arg Tyr Asp Asp
1585 1590 1595 1600
Phe Phe Asn Leu Gly Gly Asp Ser Ile Leu Ala Thr Gln Val Ala Ala
1605 1610 1615
Arg Ala Arg Asp Gly Gly Ile Pro Leu Thr Ala Arg Met Val Phe Glu
1620 1625 1630
His Pro Val Leu Cys Glu Leu Ala Ala Ala Val Asp Ala Lys Pro His
1635 1640 1645
Val Glu Ala Glu Pro Asp Asp Lys His His Ala Pro Met Ser Thr Ser
1650 1655 1660
Gly Leu Ser Pro Asp Glu Leu Ser Ala Leu Thr Ala Ser Trp Asp Gln
1665 1670 1675 1680
Trp Pro
<210> 11
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Primer F
<400> 11
ggacaacgcc gaattgcg 18
<210> 12
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer R
<400> 12
taggcgtcgg tgacaaaggc cac 23
<210> 13
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer F
<400> 13
aagcgagctg aacgcgcact g 21
<210> 14
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer R
<400> 14
tggatgccca ggatctctcg g 21
<210> 15
<211> 837
<212> DNA
<213> IS6110 (Mb2838c) of Mycobacterium bovis
<400> 15
gtgccgatcg ccccatcgac ctactacgac cacatcaacc gggagcccag ccgccgcgag 60
ctgcgcgatg gcgaactcaa ggagcacatc agccgcgtcc acgccgccaa ctacggtgtt 120
tacggtgccc gcaaagtgtg gctaaccctg aaccgtgagg gcatcgaggt ggccagatgc 180
accgtcgaac ggctgatgac caaactcggc ctgtccggga ccacccgcgg caaagcccgc 240
aggaccacga tcgctgatcc ggccacagcc cgtcccgccg atctcgtcca gcgccgcttc 300
ggaccaccag cacctaaccg gctgtgggta gcagacctca cctatgtgtc gacctgggca 360
gggttcgcct acgtggcctt tgtcaccgac gcctacgctc gcaggatcct gggctggcgg 420
gtcgcttcca cgatggccac ctccatggtc ctcgacgcga tcgagcaagc catctggacc 480
cgccaacaag aaggcgtact cgacctgaaa gacgttatcc accatacgga taggggatct 540
cagtacacat cgatccggtt cagcgagcgg ctcgccgagg caggcatcca accgtcggtc 600
ggagcggtcg gaagctccta tgacaatgca ctagccgaga cgatcaacgg cctatacaag 660
accgagctga tcaaacccgg caagccctgg cggtccatcg aggatgtcga gttggccacc 720
gcgcgctggg tcgactggtt caaccatcgc cgcctctacc agtactgcgg cgacgtcccg 780
ccggtcgaac tcgaggctgc ctactacgct caacgccaga gaccagccgc cggctga 837
<210> 16
<211> 1248
<212> DNA
<213> IS1081 (Mb2540c) of Mycobacterium bovis
<400> 16
atgacctctt ctcatcttat cgacaccgag cagcttctgg ctgaccaact cgcacaggcg 60
agcccggatc tgctgcgcgg gctgctctcg acgttcatcg ccgccttgat gggggctgaa 120
gccgacgccc tgtgcggggc gggctaccgc gaacgcagcg atgagcggtc caatcagcgc 180
aacggctacc gccaccgtga tttcgacacc cgtgccgcaa ccatcgacgt cgcgatcccc 240
aagctgcgcc agggcagcta tttcccggac tggctgctgc agcgccgcaa gcgagctgaa 300
cgcgcactga ccagcgtggt ggcgacctgc tacctgctgg gagtatccac tcgccggatg 360
gagcgcctgg tcgaaacact tggtgtgaca aagctttcca agtcgcaagt gtcgatcatg 420
gccaaagagc tcgacgaagc cgtagaggcg tttcggaccc gcccgctcga tgccggcccg 480
tataccttcc tcgccgccga cgccctggtg ctcaaggtgc gcgaggcagg ccgcgtcgtc 540
ggagtgcaca ccttgatcgc caccggcgtc aacgccgagg gctaccgaga gatcctgggc 600
atccaggtca cctccgccga ggacggggcc ggctggctgg cgttcttccg cgacctggtc 660
gcccgcggcc tgtccggggt cgcgctggtc accagcgacg cccacgccgg cctggtggcc 720
gcgatcggcg ccaccctgcc cgcagcggcc tggcagcgct gcagaaccca ctacgcagcc 780
aatctgatgg cagccacccc gaagccctcc tggccgtggg tgcgcaccct gctgcactcc 840
atctacgacc agcccgacgc cgaatcagtt gttgcccaat atgatcgggt actcgacgct 900
ctgaccgaca aactccccgc ggtggccgag cacctcgaca ccgcccgcac cgacctgctg 960
gcgttcaccg ccttccccaa gcagatctgg cgccaaatct ggtccaacaa cccccaggaa 1020
cgcctcaacc gagaggtacg acgccgaacc gacgtcgtgg gcatcttccc cgaccgcgcc 1080
tcgatcatcc gcctcgtcgg agccgtcctc gccgaacaac acgacgaatg gatcgaagga 1140
cggcgctacc tgggcctcga ggtcctcacc cgagcccgag cagcactgac cagcaccgaa 1200
gaacccgcca agcagcaaac caccaacacc ccagcactga ccacctag 1248
<210> 17
<211> 217
<212> PRT
<213> CFP21 protein of Mycobacterium bovis
<400> 17
Met Thr Pro Arg Ser Leu Val Arg Ile Val Gly Val Val Val Ala Thr
1 5 10 15
Thr Leu Ala Leu Val Ser Ala Pro Ala Gly Gly Arg Ala Ala His Ala
20 25 30
Asp Pro Cys Ser Asp Ile Ala Val Val Phe Ala Arg Gly Thr His Gln
35 40 45
Ala Ser Gly Leu Gly Asp Val Gly Glu Ala Phe Val Asp Ser Leu Thr
50 55 60
Ser Gln Val Gly Gly Arg Ser Ile Gly Val Tyr Ala Val Asn Tyr Pro
65 70 75 80
Ala Ser Asp Asp Tyr Arg Ala Ser Ala Ser Asn Gly Ser Asp Asp Ala
85 90 95
Ser Ala His Ile Gln Arg Thr Val Ala Ser Cys Pro Asn Thr Arg Ile
100 105 110
Val Leu Gly Gly Tyr Ser Gln Gly Ala Thr Val Ile Asp Leu Ser Thr
115 120 125
Ser Ala Met Pro Pro Ala Val Ala Asp His Val Ala Ala Val Ala Leu
130 135 140
Phe Gly Glu Pro Ser Ser Gly Phe Ser Ser Met Leu Trp Gly Gly Gly
145 150 155 160
Ser Leu Pro Thr Ile Gly Pro Leu Tyr Ser Ser Lys Thr Ile Asn Leu
165 170 175
Cys Ala Pro Asp Asp Pro Ile Cys Thr Gly Gly Gly Asn Ile Met Ala
180 185 190
His Val Ser Tyr Val Gln Ser Gly Met Thr Ser Gln Ala Ala Thr Phe
195 200 205
Ala Ala Asn Arg Leu Asp His Ala Gly
210 215
<210> 18
<211> 105
<212> PRT
<213> Chorismate mutase of Mycobacterium bovis
<400> 18
Met Arg Pro Glu Pro Pro His His Glu Asn Ala Glu Leu Ala Ala Met
1 5 10 15
Asn Leu Glu Met Leu Glu Ser Gln Pro Val Pro Glu Ile Asp Thr Leu
20 25 30
Arg Glu Glu Ile Asp Arg Leu Asp Ala Glu Ile Leu Ala Leu Val Lys
35 40 45
Arg Arg Ala Glu Val Ser Lys Ala Ile Gly Lys Ala Arg Met Ala Ser
50 55 60
Gly Gly Thr Arg Leu Val His Ser Arg Glu Met Lys Val Ile Glu Arg
65 70 75 80
Tyr Ser Glu Leu Gly Pro Asp Gly Lys Asp Leu Ala Ile Leu Leu Leu
85 90 95
Arg Leu Gly Arg Gly Arg Leu Gly His
100 105
<210> 19
<211> 539
<212> PRT
<213> GroEL protein of Mycobacterium bovis
<400> 19
Met Ser Lys Leu Ile Glu Tyr Asp Glu Thr Ala Arg Arg Ala Met Glu
1 5 10 15
Val Gly Met Asp Lys Leu Ala Asp Thr Val Arg Val Thr Leu Gly Pro
20 25 30
Arg Gly Arg His Val Val Leu Ala Lys Ala Phe Gly Gly Pro Thr Val
35 40 45
Thr Asn Asp Gly Val Thr Val Ala Arg Glu Ile Glu Leu Glu Asp Pro
50 55 60
Phe Glu Asp Leu Gly Ala Gln Leu Val Lys Ser Val Ala Thr Lys Thr
65 70 75 80
Asn Asp Val Ala Gly Asp Gly Thr Thr Thr Ala Thr Ile Leu Ala Gln
85 90 95
Ala Leu Ile Lys Gly Gly Leu Arg Leu Val Ala Ala Gly Val Asn Pro
100 105 110
Ile Ala Leu Gly Val Gly Ile Gly Lys Ala Ala Asp Ala Val Ser Glu
115 120 125
Ala Leu Leu Ala Ser Ala Thr Pro Val Ser Gly Lys Thr Gly Ile Ala
130 135 140
Gln Val Ala Thr Val Ser Ser Arg Asp Glu Gln Ile Gly Asp Leu Val
145 150 155 160
Gly Glu Ala Met Ser Lys Val Gly His Asp Gly Val Val Ser Val Glu
165 170 175
Glu Ser Ser Thr Leu Gly Thr Glu Leu Glu Phe Thr Glu Gly Ile Gly
180 185 190
Phe Asp Lys Gly Phe Leu Ser Ala Tyr Phe Val Thr Asp Phe Asp Asn
195 200 205
Gln Gln Ala Val Leu Glu Asp Ala Leu Ile Leu Leu His Gln Asp Lys
210 215 220
Ile Ser Ser Leu Pro Asp Leu Leu Pro Leu Leu Glu Lys Val Ala Gly
225 230 235 240
Thr Gly Lys Pro Leu Leu Ile Val Ala Glu Asp Val Glu Gly Glu Ala
245 250 255
Leu Ala Thr Leu Val Val Asn Ala Ile Arg Lys Thr Leu Lys Ala Val
260 265 270
Ala Val Lys Gly Pro Tyr Phe Gly Asp Arg Arg Lys Ala Phe Leu Glu
275 280 285
Asp Leu Ala Val Val Thr Gly Gly Gln Val Val Asn Pro Asp Ala Gly
290 295 300
Met Val Leu Arg Glu Val Gly Leu Glu Val Leu Gly Ser Ala Arg Arg
305 310 315 320
Val Val Val Ser Lys Asp Asp Thr Val Ile Val Asp Gly Gly Gly Thr
325 330 335
Ala Glu Ala Val Ala Asn Arg Ala Lys His Leu Arg Ala Glu Ile Asp
340 345 350
Lys Ser Asp Ser Asp Trp Asp Arg Glu Lys Leu Gly Glu Arg Leu Ala
355 360 365
Lys Leu Ala Gly Gly Val Ala Val Ile Lys Val Gly Ala Ala Thr Glu
370 375 380
Thr Ala Leu Lys Glu Arg Lys Glu Ser Val Glu Asp Ala Val Ala Ala
385 390 395 400
Ala Lys Ala Ala Val Glu Glu Gly Ile Val Pro Gly Gly Gly Ala Ser
405 410 415
Leu Ile His Gln Ala Arg Lys Ala Leu Thr Glu Leu Arg Ala Ser Leu
420 425 430
Thr Gly Asp Glu Val Leu Gly Val Asp Val Phe Ser Glu Ala Leu Ala
435 440 445
Ala Pro Leu Phe Trp Ile Ala Ala Asn Ala Gly Leu Asp Gly Ser Val
450 455 460
Val Val Asn Lys Val Ser Glu Leu Pro Ala Gly His Gly Leu Asn Val
465 470 475 480
Asn Thr Leu Ser Tyr Gly Asp Leu Ala Ala Asp Gly Val Ile Asp Pro
485 490 495
Val Lys Val Thr Arg Ser Ala Val Leu Asn Ala Ser Ser Val Ala Arg
500 505 510
Met Val Leu Thr Thr Glu Thr Val Val Val Asp Lys Pro Ala Lys Ala
515 520 525
Glu Asp His Asp His His His Gly His Ala His
530 535
<210> 20
<211> 355
<212> PRT
<213> PepA protein of Mycobacterium bovis
<400> 20
Met Ser Asn Ser Arg Arg Arg Ser Leu Arg Trp Ser Trp Leu Leu Ser
1 5 10 15
Val Leu Ala Ala Val Gly Leu Gly Leu Ala Thr Ala Pro Ala Gln Ala
20 25 30
Ala Pro Pro Ala Leu Ser Gln Asp Arg Phe Ala Asp Phe Pro Ala Leu
35 40 45
Pro Leu Asp Pro Ser Ala Met Val Ala Gln Val Gly Pro Gln Val Val
50 55 60
Asn Ile Asn Thr Lys Leu Gly Tyr Asn Asn Ala Val Gly Ala Gly Thr
65 70 75 80
Gly Ile Val Ile Asp Pro Asn Gly Val Val Leu Thr Asn Asn His Val
85 90 95
Ile Ala Gly Ala Thr Asp Ile Asn Ala Phe Ser Val Gly Ser Gly Gln
100 105 110
Thr Tyr Gly Val Asp Val Val Gly Tyr Asp Arg Thr Gln Asp Val Ala
115 120 125
Val Leu Gln Leu Arg Gly Ala Gly Gly Leu Pro Ser Ala Ala Ile Gly
130 135 140
Gly Gly Val Ala Val Gly Glu Pro Val Val Ala Met Gly Asn Ser Gly
145 150 155 160
Gly Gln Gly Gly Thr Pro Arg Ala Val Pro Gly Arg Val Val Ala Leu
165 170 175
Gly Gln Thr Val Gln Ala Ser Asp Ser Leu Thr Gly Ala Glu Glu Thr
180 185 190
Leu Asn Gly Leu Ile Gln Phe Asp Ala Ala Ile Gln Pro Gly Asp Ser
195 200 205
Gly Gly Pro Val Val Asn Gly Leu Gly Gln Val Val Gly Met Asn Thr
210 215 220
Ala Ala Ser Asp Asn Phe Gln Leu Ser Gln Gly Gly Gln Gly Phe Ala
225 230 235 240
Ile Pro Ile Gly Gln Ala Met Ala Ile Ala Gly Gln Ile Arg Ser Gly
245 250 255
Gly Gly Ser Pro Thr Val His Ile Gly Pro Thr Ala Phe Leu Gly Leu
260 265 270
Gly Val Val Asp Asn Asn Gly Asn Gly Ala Arg Val Gln Arg Val Val
275 280 285
Gly Ser Ala Pro Ala Ala Ser Leu Gly Ile Ser Thr Gly Asp Val Ile
290 295 300
Thr Ala Val Asp Gly Ala Pro Ile Asn Ser Ala Thr Ala Met Ala Asp
305 310 315 320
Ala Leu Asn Gly His His Pro Gly Asp Val Ile Ser Val Thr Trp Gln
325 330 335
Thr Lys Ser Gly Gly Thr Arg Thr Gly Asn Val Thr Leu Ala Glu Gly
340 345 350
Pro Pro Ala
355
<210> 21
<211> 318
<212> PRT
<213> FixB protein of Mycobacterium bovis
<400> 21
Met Ala Glu Val Leu Val Leu Val Glu His Ala Glu Gly Ala Leu Lys
1 5 10 15
Lys Val Ser Ala Glu Leu Ile Thr Ala Ala Arg Ala Leu Gly Glu Pro
20 25 30
Ala Ala Val Val Val Gly Val Pro Gly Thr Ala Ala Pro Leu Val Asp
35 40 45
Gly Leu Lys Ala Ala Gly Ala Ala Lys Ile Tyr Val Ala Glu Ser Asp
50 55 60
Leu Val Asp Lys Tyr Leu Ile Thr Pro Ala Val Asp Val Leu Ala Gly
65 70 75 80
Leu Ala Glu Ser Ser Ala Pro Ala Gly Val Leu Ile Ala Ala Thr Ala
85 90 95
Asp Gly Lys Glu Ile Ala Gly Arg Leu Ala Ala Arg Ile Gly Ser Gly
100 105 110
Leu Leu Val Asp Val Val Asp Val Arg Glu Gly Gly Val Gly Val His
115 120 125
Ser Ile Phe Gly Gly Ala Phe Thr Val Glu Ala Gln Ala Asn Gly Asp
130 135 140
Thr Pro Val Ile Thr Val Arg Ala Gly Ala Val Glu Ala Glu Pro Ala
145 150 155 160
Ala Gly Ala Gly Glu Gln Val Ser Val Glu Val Pro Ala Ala Ala Glu
165 170 175
Asn Ala Ala Arg Ile Thr Ala Arg Glu Pro Ala Val Ala Gly Asp Arg
180 185 190
Pro Glu Leu Thr Glu Ala Thr Ile Val Val Ala Gly Gly Arg Gly Val
195 200 205
Gly Ser Ala Glu Asn Phe Ser Val Val Glu Ala Leu Ala Asp Ser Leu
210 215 220
Gly Ala Ala Val Gly Ala Ser Arg Ala Ala Val Asp Ser Gly Tyr Tyr
225 230 235 240
Pro Gly Gln Phe Gln Val Gly Gln Thr Gly Lys Thr Val Ser Pro Gln
245 250 255
Leu Tyr Ile Ala Leu Gly Ile Ser Gly Ala Ile Gln His Arg Ala Gly
260 265 270
Met Gln Thr Ser Lys Thr Ile Val Ala Val Asn Lys Asp Glu Glu Ala
275 280 285
Pro Ile Phe Glu Ile Ala Asp Tyr Gly Val Val Gly Asp Leu Phe Lys
290 295 300
Val Ala Pro Gln Leu Thr Glu Val Ile Lys Ala Arg Lys Gly
305 310 315
<210> 22
<211> 182
<212> PRT
<213> PpiA protein of Mycobacterium bovis
<400> 22
Met Ala Asp Cys Asp Ser Val Thr Asn Ser Pro Leu Ala Thr Ala Thr
1 5 10 15
Ala Thr Leu His Thr Asn Arg Gly Asp Ile Lys Ile Ala Leu Phe Gly
20 25 30
Asn His Ala Pro Lys Thr Val Ala Asn Phe Val Gly Leu Ala Gln Gly
35 40 45
Thr Lys Asp Tyr Ser Thr Gln Asn Ala Ser Gly Gly Pro Ser Gly Pro
50 55 60
Phe Tyr Asp Gly Ala Val Phe His Arg Val Ile Gln Gly Phe Met Ile
65 70 75 80
Gln Gly Gly Asp Pro Thr Gly Thr Gly Arg Gly Gly Pro Gly Tyr Lys
85 90 95
Phe Ala Asp Glu Phe His Pro Glu Leu Gln Phe Asp Lys Pro Tyr Leu
100 105 110
Leu Ala Met Ala Asn Ala Gly Pro Gly Thr Asn Gly Ser Gln Phe Phe
115 120 125
Ile Thr Val Gly Lys Thr Pro His Leu Asn Arg Arg His Thr Ile Phe
130 135 140
Gly Glu Val Ile Asp Ala Glu Ser Gln Arg Val Val Glu Ala Ile Ser
145 150 155 160
Lys Thr Ala Thr Asp Gly Asn Asp Arg Pro Thr Asp Pro Val Val Ile
165 170 175
Glu Ser Ile Thr Ile Ser
180
<210> 23
<211> 233
<212> PRT
<213> Lppx protein of Mycobacterium bovis
<400> 23
Met Asn Asp Gly Lys Arg Ala Val Thr Ser Ala Val Leu Val Val Leu
1 5 10 15
Gly Ala Cys Leu Ala Leu Trp Leu Ser Gly Cys Ser Ser Pro Lys Pro
20 25 30
Asp Ala Glu Glu Gln Gly Val Pro Val Ser Pro Thr Ala Ser Asp Pro
35 40 45
Ala Leu Leu Ala Glu Ile Arg Gln Ser Leu Asp Ala Thr Lys Gly Leu
50 55 60
Thr Ser Val His Val Ala Val Arg Thr Thr Gly Lys Val Asp Ser Leu
65 70 75 80
Leu Gly Ile Thr Ser Ala Asp Val Asp Val Arg Ala Asn Pro Leu Ala
85 90 95
Ala Lys Gly Val Cys Thr Tyr Asn Asp Glu Gln Gly Val Pro Phe Arg
100 105 110
Val Gln Gly Asp Asn Ile Ser Val Lys Leu Phe Asp Asp Trp Ser Asn
115 120 125
Leu Gly Ser Ile Ser Glu Leu Ser Thr Ser Arg Val Leu Asp Pro Ala
130 135 140
Ala Gly Val Thr Gln Leu Leu Ser Gly Val Thr Asn Leu Gln Ala Gln
145 150 155 160
Gly Thr Glu Val Ile Asp Gly Ile Ser Thr Thr Lys Ile Thr Gly Thr
165 170 175
Ile Pro Ala Ser Ser Val Lys Met Leu Asp Pro Gly Ala Lys Ser Ala
180 185 190
Arg Pro Ala Thr Val Trp Ile Ala Gln Asp Gly Ser His His Leu Val
195 200 205
Arg Ala Ser Ile Asp Leu Gly Ser Gly Ser Ile Gln Leu Thr Gln Ser
210 215 220
Lys Trp Asn Glu Pro Val Asn Val Asp
225 230
<210> 24
<211> 164
<212> PRT
<213> GreA protein of Mycobacterium bovis
<400> 24
Met Thr Asp Thr Gln Val Thr Trp Leu Thr Gln Glu Ser His Asp Arg
1 5 10 15
Leu Lys Ala Glu Leu Asp Gln Leu Ile Ala Asn Arg Pro Val Ile Ala
20 25 30
Ala Glu Ile Asn Asp Arg Arg Glu Glu Gly Asp Leu Arg Glu Asn Gly
35 40 45
Gly Tyr His Ala Ala Arg Glu Glu Gln Gly Gln Gln Glu Ala Arg Ile
50 55 60
Arg Gln Leu Gln Asp Leu Leu Ser Asn Ala Lys Val Gly Glu Ala Pro
65 70 75 80
Lys Gln Ser Gly Val Ala Leu Pro Gly Ser Val Val Lys Val Tyr Tyr
85 90 95
Asn Gly Asp Lys Ser Asp Ser Glu Thr Phe Leu Ile Ala Thr Arg Gln
100 105 110
Glu Gly Val Ser Asp Gly Lys Leu Glu Val Tyr Ser Pro Asn Ser Pro
115 120 125
Leu Gly Gly Ala Leu Ile Asp Ala Lys Val Gly Glu Thr Arg Ser Tyr
130 135 140
Thr Val Pro Asn Gly Ser Thr Val Ser Val Thr Leu Val Ser Ala Glu
145 150 155 160
Pro Tyr His Ser
<210> 25
<211> 100
<212> PRT
<213> CFP10 protein of Mycobacterium bovis
<400> 25
Met Ala Glu Met Lys Thr Asp Ala Ala Thr Leu Ala Gln Glu Ala Gly
1 5 10 15
Asn Phe Glu Arg Ile Ser Gly Asp Leu Lys Thr Gln Ile Asp Gln Val
20 25 30
Glu Ser Thr Ala Gly Ser Leu Gln Gly Gln Trp Arg Gly Ala Ala Gly
35 40 45
Thr Ala Ala Gln Ala Ala Val Val Arg Phe Gln Glu Ala Ala Asn Lys
50 55 60
Gln Lys Gln Glu Leu Asp Glu Ile Ser Thr Asn Ile Arg Gln Ala Gly
65 70 75 80
Val Gln Tyr Ser Arg Ala Asp Glu Glu Gln Gln Gln Ala Leu Ser Ser
85 90 95
Gln Met Gly Phe
100
<210> 26
<211> 325
<212> PRT
<213> MPT32 protein of Mycobacterium bovis
<400> 26
Met His Gln Val Asp Pro Asn Leu Thr Arg Arg Lys Gly Arg Leu Ala
1 5 10 15
Ala Leu Ala Ile Ala Ala Met Ala Ser Ala Ser Leu Val Thr Val Ala
20 25 30
Val Pro Ala Thr Ala Asn Ala Asp Pro Glu Pro Ala Pro Pro Val Pro
35 40 45
Thr Thr Ala Ala Ser Pro Pro Ser Thr Ala Ala Ala Pro Pro Ala Pro
50 55 60
Ala Thr Pro Val Ala Pro Pro Pro Pro Ala Ala Ala Asn Thr Pro Asn
65 70 75 80
Ala Gln Pro Gly Asp Pro Asn Ala Ala Pro Pro Pro Ala Asp Pro Asn
85 90 95
Ala Pro Pro Pro Pro Val Ile Ala Pro Asn Ala Pro Gln Pro Val Arg
100 105 110
Ile Asp Asn Pro Val Gly Gly Phe Ser Phe Ala Leu Pro Ala Gly Trp
115 120 125
Val Glu Ser Asp Ala Ala His Leu Asp Tyr Gly Ser Ala Leu Leu Ser
130 135 140
Lys Thr Thr Gly Asp Pro Pro Phe Pro Gly Gln Pro Pro Pro Val Ala
145 150 155 160
Asn Asp Thr Arg Ile Val Leu Gly Arg Leu Asp Gln Lys Leu Tyr Ala
165 170 175
Ser Ala Glu Ala Thr Asp Ser Lys Ala Ala Ala Arg Leu Gly Ser Asp
180 185 190
Met Gly Glu Phe Tyr Met Pro Tyr Pro Gly Thr Arg Ile Asn Gln Glu
195 200 205
Thr Val Ser Leu Asp Ala Asn Gly Val Ser Gly Ser Ala Ser Tyr Tyr
210 215 220
Glu Val Lys Phe Ser Asp Pro Ser Lys Pro Asn Gly Gln Ile Trp Thr
225 230 235 240
Gly Val Ile Gly Ser Pro Ala Ala Asn Ala Pro Asp Ala Gly Pro Pro
245 250 255
Gln Arg Trp Phe Val Val Trp Leu Gly Thr Ala Asn Asn Pro Val Asp
260 265 270
Lys Gly Ala Ala Lys Ala Leu Ala Glu Ser Ile Arg Pro Leu Val Ala
275 280 285
Pro Pro Pro Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ala Glu Pro Ala Pro Ala Pro
290 295 300
Ala Pro Ala Gly Glu Val Ala Pro Thr Pro Thr Thr Pro Thr Pro Gln
305 310 315 320
Arg Thr Leu Pro Ala
325
<210> 27
<211> 94
<212> PRT
<213> EsxN protein of Mycobacterium bovis
<400> 27
Met Thr Ile Asn Tyr Gln Phe Gly Asp Val Asp Ala His Gly Ala Met
1 5 10 15
Ile Arg Ala Gln Ala Ala Ser Leu Glu Ala Glu His Gln Ala Ile Val
20 25 30
Arg Asp Val Leu Ala Ala Gly Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Val
35 40 45
Ala Cys Gln Glu Phe Ile Thr Gln Leu Gly Arg Asn Phe Gln Val Ile
50 55 60
Tyr Glu Gln Ala Asn Ala His Gly Gln Lys Val Gln Ala Ala Gly Asn
65 70 75 80
Asn Met Ala Gln Thr Asp Ser Ala Val Gly Ser Ser Trp Ala
85 90
<210> 28
<211> 154
<212> PRT
<213> Mb3713c protein of Mycobacterium bovis
<400> 28
Met Ala Glu Leu Lys Ser Gln Leu Arg Ser Asp Leu Thr Gln Ala Met
1 5 10 15
Lys Thr Gln Asp Lys Leu Arg Thr Ala Thr Ile Arg Met Leu Leu Ala
20 25 30
Ala Ile Gln Thr Glu Glu Val Ser Gly Lys Gln Ala Arg Glu Leu Ser
35 40 45
Asp Asp Glu Val Ile Lys Val Leu Ala Arg Glu Ser Arg Lys Arg Gly
50 55 60
Glu Ala Ala Glu Ile Tyr Thr Gln Asn Gly Arg Gly Glu Leu Ala Ala
65 70 75 80
Thr Glu His Ala Glu Ala Arg Ile Ile Asp Glu Tyr Leu Pro Thr Pro
85 90 95
Leu Thr Glu Gly Glu Leu Ala Asp Val Ala Asp Thr Ala Ile Ala Glu
100 105 110
Val Ala Glu Glu Leu Gly His Arg Pro Ser Met Lys Gln Met Gly Leu
115 120 125
Val Met Lys Ala Ala Thr Val Ile Ala Ala Gly Lys Ala Asp Gly Ala
130 135 140
Arg Leu Ser Ala Ala Val Lys Glu Arg Leu
145 150
Claims (3)
- 서열번호 1 내지 10으로 표현되는 MPB70, MPB83, MPT64, Fas, Smc, Nrp, RpoC, 유전자전위효소(Transposase), LeuA 및 MbtE로 구성된 면역특이단백질 항원을 포함하는 우결핵 특이 효소면역측정 혈청진단용 키트.
- 삭제
- 1) 서열번호 1 내지 10으로 표현되는 MPB70, MPB83, MPT64, Fas, Smc, Nrp, RpoC, 유전자전위효소(Transposase), LeuA 및 MbtE로 구성된 면역특이단백질 항원을 플레이트에 코팅한 후 젤라틴을 처리하여 항원 표면을 봉쇄하는 단계;2) 우결핵 특이 항체를 처리하여 플레이트에 코팅된 면역특이단백질 항원과 특이 결합시키는 단계; 및3) 상기 특이결합된 항체의 양을 측정하기 위하여 퍼옥시다아제가 부착된 2차 항체를 첨가한 후 발색반응을 관찰하는 단계;를 거치는 우결핵의 진단방법.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020070118743A KR100951057B1 (ko) | 2007-11-20 | 2007-11-20 | 면역특이단백질 항원을 사용하는 우결핵 특이 효소면역진단키트 및 이를 이용한 우결핵 진단방법 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020070118743A KR100951057B1 (ko) | 2007-11-20 | 2007-11-20 | 면역특이단백질 항원을 사용하는 우결핵 특이 효소면역진단키트 및 이를 이용한 우결핵 진단방법 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20090052175A KR20090052175A (ko) | 2009-05-25 |
KR100951057B1 true KR100951057B1 (ko) | 2010-04-07 |
Family
ID=40860046
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020070118743A KR100951057B1 (ko) | 2007-11-20 | 2007-11-20 | 면역특이단백질 항원을 사용하는 우결핵 특이 효소면역진단키트 및 이를 이용한 우결핵 진단방법 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
KR (1) | KR100951057B1 (ko) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20200096699A (ko) | 2018-01-05 | 2020-08-12 | 주식회사 씨젠 | 시료에서 M. tuberculosis, M. bovis 및 M. bovis BCG의 존재 또는 부존재를 결정하는 방법 |
WO2022035248A1 (ko) * | 2020-08-14 | 2022-02-17 | 서울대학교산학협력단 | 코리스미산 이성화효소를 포함하는 결핵 예방용 백신 조성물 |
Families Citing this family (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR101994515B1 (ko) * | 2016-04-06 | 2019-06-28 | 중앙대학교 산학협력단 | 우결핵 진단용 스트립 및 이를 이용한 우결핵 진단 방법 |
EP3330286A1 (en) * | 2016-11-30 | 2018-06-06 | CZ Veterinaria S.A | Methods and compositions for tuberculosis diagnosis |
KR102157770B1 (ko) * | 2019-01-11 | 2020-09-18 | 주식회사 파이지노믹스 | 가축의 결핵 진단을 위한 항원 펩타이드 조성물 및 이의 용도 |
CN115902217B (zh) * | 2023-03-08 | 2023-06-16 | 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所(中国动物卫生与流行病学中心哈尔滨分中心) | 一种牛副结核病间接elisa检测试剂盒及其应用 |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2002062299A (ja) | 2000-08-24 | 2002-02-28 | Kyowa Medex Co Ltd | 結核菌の検出方法及び試薬 |
KR20030028059A (ko) * | 2001-09-27 | 2003-04-08 | (주)시로텍코리아 | 항-결핵균 항체를 포함하는 결핵균 항원 진단키트 |
KR20040079070A (ko) * | 2003-03-06 | 2004-09-14 | (주)프로테옴텍 | 결핵균 특이적인 단백질 |
-
2007
- 2007-11-20 KR KR1020070118743A patent/KR100951057B1/ko active IP Right Grant
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2002062299A (ja) | 2000-08-24 | 2002-02-28 | Kyowa Medex Co Ltd | 結核菌の検出方法及び試薬 |
KR20030028059A (ko) * | 2001-09-27 | 2003-04-08 | (주)시로텍코리아 | 항-결핵균 항체를 포함하는 결핵균 항원 진단키트 |
KR20040079070A (ko) * | 2003-03-06 | 2004-09-14 | (주)프로테옴텍 | 결핵균 특이적인 단백질 |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
논문1:수의공중보건학회지 |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20200096699A (ko) | 2018-01-05 | 2020-08-12 | 주식회사 씨젠 | 시료에서 M. tuberculosis, M. bovis 및 M. bovis BCG의 존재 또는 부존재를 결정하는 방법 |
WO2022035248A1 (ko) * | 2020-08-14 | 2022-02-17 | 서울대학교산학협력단 | 코리스미산 이성화효소를 포함하는 결핵 예방용 백신 조성물 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
KR20090052175A (ko) | 2009-05-25 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Golshani et al. | A review of brucellosis in Iran: epidemiology, risk factors, diagnosis, control, and prevention | |
Deplazes et al. | An enzyme-linked immunosorbent assay for diagnostic detection of Taenia saginata copro-antigens in humans | |
Triccas et al. | A 35-kilodalton protein is a major target of the human immune response to Mycobacterium leprae | |
Barnes et al. | Characterization of T cell antigens associated with the cell wall protein-peptidoglycan complex of Mycobacterium tuberculosis. | |
KR100951057B1 (ko) | 면역특이단백질 항원을 사용하는 우결핵 특이 효소면역진단키트 및 이를 이용한 우결핵 진단방법 | |
Manish et al. | Brucellosis: An updated review of the disease | |
Stanford et al. | Preliminary taxonomic studies on the leprosy bacillus. | |
Filipović et al. | Molecular and serological prevalence of Anaplasma phagocytophilum, A. platys, Ehrlichia canis, E. chaffeenses, E. ewingii, Borrelia burgdorferi, Babesia canis, B. gibsoni and B. vogeli among clinically healthy outdoor dogs in Serbia | |
JPH07507387A (ja) | 通常のスタフィロコーカス抗原と反応する広い反応性のオプソニン抗体 | |
Al-orry et al. | Leptospirosis: transmission, diagnosis and prevention | |
JPH06508513A (ja) | マイコバクテリウムタンパク質およびその使用 | |
Lepper et al. | Characterisation and quantitation of pilus antigens of Moraxella bovis by ELISA | |
PT97150A (pt) | Novos metodos para o diagnostico da tuberculose | |
CN102279257B (zh) | 一种用于诊断人或动物的免疫相关性疾病的试剂盒 | |
KR100968069B1 (ko) | 우결핵균 특이단백질 및 그 정제방법 | |
CN106226520A (zh) | 结核分枝杆菌抗原蛋白Rv0865及其B细胞表位肽的应用 | |
CN106198971A (zh) | 结核分枝杆菌抗原蛋白Rv2351c的应用 | |
HENDERSON et al. | EPIDEMIC TYPHUS FEVER: NEUTRALIZATION OF THE TOXIC SUBSTANCE ¹ | |
JPH07501797A (ja) | ライム病に対する組換えワクチン | |
RU2341288C1 (ru) | СРЕДСТВО, ОБЛАДАЮЩЕЕ СВОЙСТВОМ ФОРМИРОВАТЬ КЛЕТОЧНЫЙ ИММУНИТЕТ ПРОТИВ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS H37 Rv, СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ЕГО (ВАРИАНТЫ), РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ И СРЕДСТВО ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ ТУБЕРКУЛЕЗА | |
IE904536A1 (en) | New methods for diagnosis of tuberculosis | |
Rauch | Response of leukocytes in culture from tuberculous patients and vaccinated subjects | |
Refai | Brucellosis in animals and man in Egypt | |
Nyirenda | Natural immunity to Salmonella in humans | |
KR20110052295A (ko) | 소결핵 피내검사용 피내진단액 및 이를 이용한 소결핵 진단방법 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A201 | Request for examination | ||
E902 | Notification of reason for refusal | ||
E701 | Decision to grant or registration of patent right | ||
GRNT | Written decision to grant |