상기의 목적을 달성하기 위하여 본 발명은 2환-, 3환-, 4환-방향족 탄화수소를 효과적으로 분해하는 균주 Pseudomonas sp. KM1(KCCM 10740P)를 제공한다.
또한 본 발명은 생물학적으로 다환 방향족 탄화수소를 분해하는 방법에 있어서, 상기 균주 Pseudomonas sp. KM1(KCCM 10740P)를 이용하는 것을 특징으로 하는 다환 방향족 탄화수소의 분해 방법을 제공한다.
이하, 본 발명을 상세하게 설명한다.
상기 균주는 PAHs로 오염된 토양으로부터 분리된다. 채취한 토양을 yeast 1%을 포함한 MSM배지 10㎖에 넣고, 균 성장은 탁도를 통해 확인하였다. 성장이 확인된 균주들은 다시 계대배양을 통해 원하는 균주를 분리하고자 하였다. 이를 반복한 후 , 단일 콜로니를 분리하고 스트리킹(streaking)함으로써 원하는 균주를 얻을 수 있었다. 분리된 단일균은 마지막으로 PAHs 중 하나인 나프탈렌을 탄소원으로 이용할 수 있는 최소(MSM)배지에 colony를 접종하고, 탁도와 색의 변화를 통해 PAHs 분해능을 가진 Pseudomonas sp. KM1을 분리 할 수 있었다. Pseudomonas sp. KM1은 국 제 기탁 기관인 한국미생물보존센터에 기탁번호 KCCM 10740P로 기탁하였다.
또한 본 발명은 상기 미생물 KCCM 10740P(Pseudomonas sp. KM1)이 수용액 및 토양 슬러리 용액에 존재하는 다환방향족 탄화수소를 분해함에 있어 7종의 PAHs 물질들(naphthalene, acenaphthylene, acenaphthene, fluorene, phenanthrene, pyrene, fluoranthene)을 단시간에 분해하는 성질을 갖는 균주의 분해 특성을 제공한다. 또한 균주 KCCM 10740P는 이들 다환 방향족 탄화수소가 혼합되어 있는 경우 혼합된 오염물 전체를 동시에 분해할 수 있으며, 특히 fluoranthene의 분해속도에 비해 naphthalene, acenaphthylene, acenaphthene, fluorene, phenanthrene 과 pyrene의 분해 속도가 빠른 특징을 가진다.
이하, 본 발명의 이해를 돕기 위하여 바람직한 실시예를 제시한다. 그러나 하기의 실시예는 본 발명을 보다 쉽게 이해하기 위하여 제공되는 것일 뿐 본 발명이 하기의 실시 예에 한정되는 것은 아니다.
[ 실시예1 ] Pseudomonas sp. KM1균주의 분리
토양 시료를 채취한 다음 mineral salt medium(표1 참조)과 yeast 1g/ℓ를 넣은 액체배지(10㎖)에 일정량의 토양을 넣고, 습식 배양하여 미생물 성장확인을 탁도를 통해 확인한다. 탁도를 통해 균의 성장이 확인된 경우 다환 방향족 탄화수소(1%)를 포함하고 있는 최소영양배지에 다시 성장된 균 1%를 접종시킨다. 이후 성장이 확인되면 다시 신선한 최소영양배지에 배양액을 접종하고 다환방향족탄화수소의 기질이용을 탁도를 통해 확인하였다. 다음 LB고체배지(표1 참조)에 백금이를 이 용하여 도말한 후 24시간 정도 배양, 형성되는 단일 콜로니를 선택하여 분리하고자 하는 균을 순수 분리하였다. 도1은 본 발명의 균주 Pseudomonas sp. KM1(KCCM 10740P)의 SEM 사진이다.
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배지
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조성
|
함유량(
per
liter
)
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mineral salt medium |
KH2PO4 |
3.4g |
Na2HPO4 |
3.55g |
(NH4)SO4 |
1g |
Hunter mineral base |
10㎖ |
LB고체배지 |
Bacto-tryptone |
10g |
Bacto-yeast extract |
5g |
NaCl |
5g |
Bacto-agar |
15g |
[ 실시예2 ] 분리된 균주의 동정
상기한 방법으로 분리된 균주는 먼저 그람염색을 통한 현미경 상에서의 형태학적 관찰과 API 20E kit를 이용한 생화학적 특성을 검사하였으며, 분리균의 형태는 전자 현미경(SEM, DSM940A, Germany)을 이용하여 관찰하였다(도1 참조). 동정 방법은 다음과 같다.
먼저 분리된 미생물을 배양하여 희석액(증류수 혹은 Suspention medium)을 이용하여 20배, 50배 희석하여 스트립에 접종하였다. 접종시 kit 큐플 중 ADH, LCD, ODS 는 혐기적 조건을 위하여 광유(mineral oil)를 채우고, CIT,VP 는 큐플까지 균액을 가득 채워 접종하였다. 다음 스트립 위에 뚜껑을 덮고, Tray 밑에는 증류수를 적당량 부어서 균액이 건조되는 걸 방지하였다. 이 후 호기적 상태에서 35℃, 24시간 건식배양 후 동정 판독표를 참조하여 결과를 얻은 결과 Pseudomonas sp. 임을 확인할 수 있었다(표2 참조).
Characteristics
|
isolated
strain
KM1
|
Morphology |
|
Gram strain |
- |
Shape |
Rod |
Oxidase |
+ |
VP test |
- |
Gelatin liquefaction |
- |
Production of indole |
- |
Utilization of citrate |
+ |
Urease |
- |
Argnine dehydrase |
- |
Ornithine decarboxylase |
- |
Lysine decarboxylase |
- |
Nitrate reduction |
- |
Production of H2S |
- |
Acid form |
|
Glucose |
+ |
Mannitol |
- |
Inositol |
- |
Sorbitol |
- |
Rhamnose |
- |
Sucrose |
- |
Melibiose |
- |
Amygdalin |
- |
Arabinose |
- |
+ : positive reaction, - : negative reaction |
[ 실시예3 ] Pseudomonas sp . KM1의 생장특성
대부분의 토양은 특성에 따라 pH가 5~9의 범위를 나타내는 것으로 보고되고 있다. 따라서 분리된 균종인 Pseudomonas sp. KM1이 활동 가능한 pH 범위를 확인하기 위하여, 인산완충용액(phosphate buffer solution,이하 PBS라 칭한다)로 pH를 3,4,5,6,7,8로 각각 조절하고 탄소원으로 1% 나프탈렌을 첨가한 배양배지를 이용하여 상기 Pseudomonas sp. KM1균종의 pH에 따른 다환방향족 탄화수소의 분해능과 증식 정도를 분석하였다. 분석 결과 Pseudomonas sp. KM1는 pH3와 8 사이에서 성장 가능하였으며, 특히 pH6과 pH8 사이에서 증식율이 우수하였다(도2 참조). 따라서 상기Pseudomonas sp . KM1 균주는 오염 토양의 pH특성에 따라 넓은 범위의 pH의 환경에서 효율적으로 이용할 수 있을 것으로 기대된다.
또한, 온도에 따른 Pseudomonas sp. KM1의 증식 정도를 살펴보기 위해, 상기 균주를 25℃,30℃,35℃에서 성장시킨 결과, 실험온도 모두에서 성장가능 하였으며, 특히 30℃와 35℃에서 성장 속도가 빨랐다(도3 참조).
[ 실시예4 ] Pseudomonas sp. KM1의 분해능 측정
임의로 오염시킨 7종류의 혼합 PAHs의 분해능를 알아보는 실시 예로써, 4.2㎖ vial에 초기농도 범위가 90~2400㎍/ℓ인 PAHs(in methanol)를 넣은 후 시간에 따른 Pseudomonas sp. KM1의 분해능을 HPLC을 이용하여 분석하였다. 실험방법은 다음과 같이 실시하였다. 먼저 전 배양된 Pseudomonas sp. KM1를 포함하는 용액을 15㎖ centrifuge tube에 일정량 넣고, 3000rpm, 10분간 원심분리 한다. 원심 분리 후 상등액은 버리고 다시 멸균된 PBS 용액을 이용하여 기질로 이용되었던 다환 방향족 탄화수소를 3회 정도 세척하여 완전히 제거하였다. 세척된 균주는 OD(600nm)값이 1.0 이상이 되도록 조절하고 다환 방향족 탄화수소로 오염된 4.2㎖ vial에 0.1㎖씩 멸균된 sylinge를 이용하여 접종하였다. 이 후 25℃, 150rpm에서 1일, 3일 또는 5일간 배양하고 원심분리한 후 HPLC 분석용 1㎖ vial에 옮겨 상등액의 PAHs의 농도를 HPLC (Supelcosil LC-PAH 15cm x 4.6mm(5um), acetonitrile:water(90:10), UV/VIS 254nm, flow rate 1.2㎖/min )를 이용하여 분석하였다.
시간에 따른 균주 Pseudomonas sp. KM1에 의한 PAHs의 분해율(%) |
|
1일
|
3일
|
5일
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Napthalene |
100 |
100 |
100 |
Acenaphthylene |
100 |
100 |
100 |
Acenaphthene |
100 |
100 |
100 |
Fluorene |
100 |
100 |
100 |
Phenanthrene |
100 |
100 |
100 |
Flouranthene |
42.9 |
66.1 |
98.2 |
Pyrene |
100 |
100 |
100 |
[표3]은 임의로 오염된 다환방향족탄화수소의 시간경과에 따른 분해율을 알아본 결과로 Flouranthene를 제외한 다른 PAHs의 경우 하루만에 100%의 높은 분해율을 나타내고 있다(도4, 도5, 도6 참조). 반면 Flouranthene은 다른 오염물질의 분해율에 비해 초기 분해율은 낮지만, 시간이 지날수록 98%이상의 높은 분해율을 보여주고 있다. 즉, Pseudomonas sp. KM1은 짧은 시간동안에 혼합되어있는 다양한 PAHs 오염물질을 동시에 분해할 수 있는 것으로 나타났다.
[ 실시예5 ] 토양 유무에 따른 Pseudomonas sp. KM1의 분해능 측정
토양 유무에 따른 Pseudomonas sp. KM1의 분해능을 알아보기 위해 임의의 다환 방향족 탄화수소(napthalene, pyrene, phenanthrene)를 이용하여 분해능을 측정하였다. 실험 방법은 다음과 같이 실시하였다.
유기물 함량 등 물리화학적 특성이 다른 3가지 토양을 4.2㎖ vial에 각각 0.4g씩 넣고, 멸균된 PBS용액으로 이들 토양 샘플을 균질화 한 후, 나프탈렌(naphthalene)은 4ppm, 피렌(pyrene)과 페난트렌(phenanthrene)은 3ppm으로 각각 오염시켰다. 이 후 25℃ ,150rpm에서 48시간 진탕하여, 오염물질이 흡착평형에 이르게 한 후 Pseudomonas sp. KM1를 주입하여 오염물질의 생물학적 분해를 수행하였다. Pseudomonas sp. KM1 주입 하루 후 상등액의 농도와 토양에 흡착된 다환 방향족 탄화수소 농도를 측정하여 Pseudomonas sp. KM1 균주에 의한 다환방향족 탄화수소의 분해율을 계산하였다. 오염물질의 분석방법은 [실시예4]와 같은 조건의 HPLC분석법을 이용하였다.
균주 Pseudomonas sp. KM1에 의한 Naphthalene 분해율 |
|
Naphthalene
|
토양
|
recovery
(%)
|
분해율(%)
|
신동방 |
12.10% |
87.90% |
대조군 |
92.76% |
7.24% |
|
경방 |
0.00% |
100.00% |
대조군 |
77.22% |
27.78% |
균주 Pseudomonas sp. KM1에 의한 phenantherene 분해율 |
|
Phenantherene
|
토양
|
recovery
(%)
|
분해율(%)
|
신동방 |
66.76% |
33.24% |
대조군 |
82.71% |
17.29% |
|
경방 |
51.91% |
48.09% |
대조군 |
82.98% |
17.02% |
|
봉동 |
32.17% |
67.83% |
대조군 |
51.74% |
48.26% |
균주 Pseudomonas sp. KM1에 의한 pyrene 분해율 |
|
pyrene
|
토양
|
recovery
(%)
|
분해율(%)
|
신동방 |
82.03% |
17.97% |
대조군 |
100.00% |
0.00% |
|
경방 |
78.24% |
21.76% |
대조군 |
100.00% |
0.00% |
|
봉동 |
39.72% |
60.28% |
대조군 |
73.05% |
26.95% |
[표4,5,6]은 토양을 넣은 후 결과를 나타내는 것으로, 상기한 결과로부터 기질로 첨가된 나프탈렌의 경우 각각의 토양에서 하루만에 87% 이상의 높은 분해율을 보이고 있는 반면, 페난트렌과 피렌의 경우는 각 토양의 특성에 따라 분해율이 다르게 나타났다. 토양에 유기오염물의 흡착은 토양 및 유기오염물의 물리화학적 특성에 따라 크게 차이가 있으며, 또한 미생물은 강하게 흡착된 오염물을 분해하기가 상대적으로 어려운 것으로 알려져 있다. 실험결과에서 보는 봐와 같이 페난트렌과 피렌은 각각 3환- 및 4환- 방향족 탄화수소로 2환-방향족 탄화수소인 나프탈렌보다 토양에 흡착이 많이 일어나며 상대적으로 미생물에 의한 분해가 서서히 일어나는 것으로 나타났다.
위 실시 예는 하루 동안의 분해정도를 본 것으로 분해 시간이 길어 질 경우 토양에 흡착된 PAHs도 서서히 탈착 후 Pseudomonas sp. KM1에 의해 분해되리라 판단된다.