JPWO2021069903A5 - - Google Patents

Claims (22)

1. 微生物細胞及び抗菌剤を含む試料から生存微生物を回収する方法であって、
   ａ）前記試料を被覆された粒子とともにインキュベートして粒子－微生物複合体を形成するステップと、
   ｂ）粒子－微生物複合体を抗菌剤から分離し、それによって試料から生存微生物を回収するステップと、
   ｃ）工程ｂ）で回収された生存微生物のインキュベート及び／又は培養するステップと
   を含み、前記試料は、前記抗菌剤で処置された対象由来であり、前記試料中の前記微生物は、前記抗菌剤に対して感受性であるか若しくは感受性であると考えられ、前記試料は体液を含む、方法。
2. 回収された生存微生物を検出及び／又は特徴付けるステップをさらに含む、請求項１に記載の方法。
3. 前記方法が、抗菌剤を含み、微生物を含有することが疑われる試料中の生存微生物の不存在又は存在を検出する方法であって、
   ｄ）前記回収された微生物の不存在又は存在を確認するステップ
   をさらに含み、前記試料は、前記抗菌剤で処置された対象由来であり、前記試料中の前記微生物は、前記抗菌剤に対して感受性であるか若しくは感受性であると考えられる、請求項１又は２に記載の方法。
4. 前記試料がまた非微生物細胞も含み、ステップｂ）が粒子－微生物複合体を抗微生物剤及び非微生物細胞から分離し；任意選択で、非微生物細胞が血液細胞を含む、請求項１～３のいずれか一項に記載の方法。
5. ステップｂ）が、界面活性剤の不存在下で行われる、請求項１～４のいずれか一項に記載の方法。
6. ステップｂ）が、試料中に存在する無傷の微生物を保持しながら、ポリアネトールスルホン酸ナトリウム、及び／又は試料中の非微生物細胞を選択的に溶解する試薬の存在下で行われる、請求項１～４のいずれか一項に記載の方法。
7. ステップｂ）が、分離された粒子－微生物複合体を洗浄するステップを含み、任意選択で、分離された粒子－微生物複合体が、界面活性剤を含有しない溶液で洗浄される、請求項１～６のいずれか一項に記載の方法。
8. ステップｂ）が、磁場又は遠心分離を使用するステップを含む、請求項１～７のいずれか一項に記載の方法。
9. ａ）抗菌剤及び生存微生物を含有する試料と、
   ｂ）試料中の生存微生物と複合体を形成することができる被覆された粒子と
   を含み、前記試料は、前記抗菌剤で処置された対象由来であり、前記試料中の前記微生物は、前記抗菌剤に対して感受性であるか若しくは感受性であると考えられ、前記試料は体液を含む、組成物。
10. 抗菌剤と、被覆された粒子と複合体化された生存微生物とを含有する試料を含み、前記試料は、前記抗菌剤で処置された対象由来であり、前記試料中の前記微生物は、前記抗菌剤に対して感受性であるか若しくは感受性であると考えられ、前記試料は体液を含む、組成物。
11. 生存微生物細胞を含有する試料が、非微生物細胞をさらに含み、任意選択で、非微生物細胞が血液細胞を含む、請求項９又は請求項１０に記載の組成物。
12. ａ）生存微生物と複合体を形成することができる被覆された粒子を含有する容器；
    ｂ）被覆された粒子を用いて回収された生存微生物をインキュベート及び／又は培養するのに適した培地であって、抗菌剤及び／又は抗菌剤と結合することができる薬剤を含有しない培地を含有する容器；及び／又は
    ｃ）試料から回収された被覆された粒子を洗浄するための洗浄緩衝液を含有する容器であって、洗浄緩衝液は生存微生物を溶解しない容器
    を含む、請求項１～８のいずれか一項に記載の方法を行うためのキット。
13. 成分ａ）、ｂ）及びｃ）（別々の容器内）を含む、請求項１２に記載のキット。
14. 前記洗浄緩衝液が、
    ａ）界面活性剤を含まず；
    ｂ）Ｔｒｉｓ及び／又は塩化ナトリウムを含み；及び／又は
    ｃ）は非微生物細胞を溶解しない、
    請求項１２又は１３に記載のキット。
15. ａ）生存微生物の核酸修飾活性の基質として作用し、したがって、微生物が試料中に存在するかどうかの検出を可能にする核酸分子；並びに／又は
    ｂ）生存微生物由来の核酸に特異的にハイブリダイズし、したがって、試料中の微生物の特徴付けを可能にするプライマー及び／若しくはプローブ
    をさらに含む、請求項１２～１４のいずれか一項に記載のキット。
16. 前記微生物が細菌又は真菌である、請求項１～８のいずれか一項に記載の方法、請求項９～１１のいずれか一項に記載の組成物、又は請求項１２～１５のいずれか一項に記載のキット。
17. 前記抗菌剤が抗生物質又は抗真菌剤である、請求項１～８及び１６のいずれか一項に記載の方法、請求項９～１１及び１６のいずれか一項に記載の組成物、又は請求項１２～１６のいずれか一項に記載のキット。
18. 前記試料が、血液、脳脊髄液（ＣＳＦ）、関節液、尿及び気管支肺胞洗浄（ＢＡＬ）から選択される、請求項１～８、１６及び１７のいずれか一項に記載の方法、請求項９～１１、１６及び１７のいずれか一項に記載の組成物、又は請求項１２～１７のいずれか一項に記載のキット。
19. 前記試料が血液又は血液培養試料を含み、任意選択で、前記試料が全血を含む、請求項１～８及び１６～１８のいずれか一項に記載の方法、請求項９～１１及び１６～１８のいずれか一項に記載の組成物、又は請求項１２～１８のいずれか一項に記載のキット組成物。
20. 前記被覆された粒子が磁性である、請求項１～８及び１６～１９のいずれか一項に記載の方法、請求項９～１１及び１６～１９のいずれか一項に記載の組成物、又は請求項１２～１９のいずれか一項に記載のキット。
21. 前記被覆された粒子がポリマー表面を含み、任意選択で、前記ポリマー表面が炭素ベースのポリマーを含む、請求項１～８及び１６～２０のいずれか一項に記載の方法、請求項９～１１及び１６～２０のいずれか一項に記載の組成物、又は請求項１２～２０のいずれか一項に記載のキット。
22. 前記被覆された粒子が、外面に、
    ｉ）カルボン酸基
    ｉｉ）アミノ基
    ｉｉｉ）疎水性基、及び
    ｉｖ）ストレプトアビジン
    のうちのいずれか１つ又は複数を含む、請求項１～８及び１６～２１のいずれか一項に記載の方法、請求項９～１１及び１６～２１のいずれか一項に記載の組成物、又は請求項１２～２１のいずれか一項に記載のキット。