JPWO2019176048A1 - 細胞画像処理装置 - Google Patents
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Abstract
Description
例えば、iPS細胞になっているか否かを見極めるには、多能性を持つ細胞が発現しているOct3/4、Nanog、TRA−1−60、TRA−1−81等の未分化マーカと呼ばれるタンパク質を、qPCR法あるいは免疫染色法により検査する方法が知られている(例えば、特許文献1参照。)。
特に、コロニーが小さい場合には形状の差異も小さく、iPS細胞であるか否かの見極めが困難であった。
すなわち、観察者が画像を見ながら、特定の細胞、例えば、万能細胞が存在している測定領域であると判断して観察を行った場合に、当該測定領域と同様の増殖速度を有する他の測定領域を簡易に抽出することができる。つまり、特定の増殖速度を有する細胞を選んで観察を行うことができ、コロニーの大きさにかかわらず、培養容器内に存在している特定の細胞を効率的に抽出することができる。
この構成により、表示部により表示された増殖速度により測定領域を簡易に選んで観察を行うことができる。
この構成により、同一グループに属する測定領域を簡易に特定することができ、観察を容易にすることができる。
この構成により、同一グループに属する測定領域を色により簡易に特定することができ、観察を容易にすることができる。
この構成により、測定領域をヒートマップで表示することができ、増殖速度の相違を認識し易くして細胞の選別を精度よく行うことができる。
本実施形態に係る細胞画像処理装置51は、観察装置(図8参照)100によって取得された複数の画像を処理する装置であって、図1に示されるように、観察装置100から時系列に入力されてくる画像を記憶する画像記憶部52と、画像間において共通する複数の測定領域を抽出する測定領域抽出部53と、抽出された各測定領域に含まれる細胞の増殖速度を算出する増殖速度算出部54と、算出された増殖速度と、各測定領域の位置情報とを対応づけて記憶する情報記憶部(記憶部)55とを備えている。測定領域抽出部53および増殖速度算出部54はプロセッサによって構成され、画像記憶部52および情報記憶部55はメモリあるいは記憶媒体等によって構成されている。
増殖速度算出部54は、選択された2以上の画像Gにおいて共通の測定領域R内における細胞数を測定し、細胞数の単位時間当たりの変化量として増殖速度を測定領域R毎に算出する。
まず、測定領域R内におけるエッジ検出や輪郭追跡により、細胞Xと細胞X以外との境界を抽出し、その境界が閉じているものを細胞XあるいはコロニーYとして認識し、その大きさから細胞XとコロニーYとを区別する。
情報記憶部55は、抽出された測定領域Rの代表点の座標(位置情報)と当該測定領域Rについて算出された増殖速度とを対応づけて記憶する。
観察装置100により、所定の時間間隔をあけて容器(培養容器)1における培養面の2枚の画像Gが取得されると、取得された画像Gが細胞画像処理装置51に送られる。
例えば、図3に示されるように、表示部が、観察装置100から送られて来たいずれかの画像Gを表示するとともに、画像Gに重畳して、測定領域Rを増殖速度に応じて色分けして、表示することにしてもよい。また、図4に示されるように、画像Gと重畳することなく、測定領域Rのみを色分けして、表示してもよい。これにより、測定領域R毎の増殖速度をヒートマップによって表示することができる。
この場合においては、エッジ検出あるいは輪郭追跡により、境界を認識することによって、境界が閉じているものを細胞XやコロニーYとして認識し、その大きさから細胞XとコロニーYとを区別すればよい。
この場合には、コロニーY毎に増殖速度が算出され、図5に示されるように、コロニーY毎に増殖速度で色分けされて表示されるので、観察者はさらに効率的に細胞Xを選別して、観察することができるという利点がある。
また、観察者がいずれかの画像Gにおいて、いずれかの測定領域Rを指定したときに、図6に示されるように、指定された測定領域Rにおける細胞数の時間変化を示すグラフを表示することにしてもよい。
観察装置100は、図8に示されるように、試料Aを収容した容器1を支持するステージ2と、該ステージ2に支持された試料Aに照明光を照射する照明部3と、試料Aを透過した照明光をラインセンサ13によって検出して試料Aの画像Gを取得する撮像部4と、試料Aに対する撮像部4の焦点の位置を調整するフォーカス調整機構5と、撮像部4をラインセンサ13の長手方向に直交する走査方向に移動させる走査機構6とを備えている。照明部3、撮像部4、フォーカス調整機構5、走査機構6およびラインセンサ13はステージ2によって上面を閉塞された筐体101内に密封状態に収容されている。
ステージ2は、水平に配置された平板状の載置台2aを備え、載置台2a上に容器1が載置される。載置台2aは、照明光を透過させるように光学的に透明な材質、例えばガラスからなる。
図10Aおよび図10Bのライン光源8において、光源本体81は、Y方向に一列に配列したLEDからなるLED列81aと、LED列81aから発せられた光を拡散する拡散板81bとを備えている。照明マスク82は、拡散板81bの射出側の面上に設けられている。
各対物光学系11は、図12に示されるように、物体側(試料A側)から順に、第1レンズ群G1、開口絞りAS、および第2レンズ群G2を備えている。複数の対物光学系11は、図13に示されるように、光軸をZ方向に平行に延ばしてY方向に配列され、同一面上に光学像を結ぶ。したがって、像面には、Y方向に一列に並ぶ複数の光学像Iが形成される(図15参照。)。開口絞りASも、図14に示されるように、Y方向に一列に配列する。
第1の条件は、各対物光学系11において、図12に示されるように、入射瞳位置が最も試料A側に位置する第1レンズ群G1よりも像側に位置することである。これは、開口絞りASを第1レンズ群G1の像側焦点よりも物体側に配置することによって実現している。第1の条件を満たすことにより、焦点面から第1レンズ群G1に近付くにつれて軸外主光線が対物光学系11の光軸に近付くので、走査方向に垂直な方向(Y方向)の実視野Fが第1レンズ群G1の直径φよりも大きくなる。したがって、隣接する2つの対物光学系11の視野がY方向に互いに重なり合い、視野の欠けがない試料Aの光学像が像面に形成される。
入射瞳の位置(第1レンズ群G1の最も物体側の面から入射瞳までの距離)20.1mm
投影横倍率 −0.756倍
実視野F 2.66mm
第1レンズ群G1のレンズ直径φ 2.1mm
第1レンズ群G1のY方向のレンズ間隔d 2.3mm
視野の重なり幅D 0.36mm(=2.66/2−(2.3−2.66/2))
θmin > 0.5NA (1)
θmax < 1.5NA (2)
θminは、対物光学系11の光軸に対する照明光の入射角度の最小値(最も光軸側に位置する光線の入射角度)、θmaxは、対物光学系11の光軸に対する照明光の入射角度の最大値(光軸に対して最も径方向外側に位置する光線の入射角度)、NAは対物光学系11の開口数である。
L > (θmax−θmin)Fl (3)
Δ=NA/Fl (4)
プリズムの偏向角が45°でない場合には、偏向角の45°からのずれ量に応じてΔが補正される。具体的には、偏向角が45°よりも大きい場合には、Δをより大きくし、偏向角が45°よりも小さい場合には、Δをより小さくする。
なお、走査機構6は、撮像部4および照明光学系7ではなく、ステージ2をX方向に移動させる方式で構成されていてもよく、撮像部4および照明光学系7と、ステージ2との両方をX方向に移動可能に構成されていてもよい。
ライン光源8からX方向に発せられたライン状の照明光は、シリンドリカルレンズ9によって平行光束に変換され、プリズム10によって上方に偏向され、光軸に対して斜め上方に射出される。照明光は、載置台2aおよび容器1の底板1bを透過し、上板1aにおいて斜め下方に向けて反射され、試料A、底板1bおよび載置台2aを透過し、複数の対物光学系11によって集光される。各対物光学系11の内部を斜めに進む照明光は、開口絞りASにおいて部分的にケラレ、一部のみが開口絞りASを通過することにより、陰影の付いた試料Aの光学像を像面に結ぶ。
すなわち、上板1aの位置が低い容器1を使用する場合、上述した条件式(1)〜(4)を満たすためには、照明部3からの照明光の射出位置を、対物光学系群12の光軸に近付ける必要がある。しかし、対物光学系群12のレンズや枠等が邪魔となり、対物光学系群12の近傍にライン光源8を配置することは難しい。
また、本実施形態においては、観察装置100として、ライン状に撮影するものを例示したが、これに代えて、スクエア状に撮影するものを採用してもよい。
52 画像記憶部(メモリ)
53 測定領域抽出部
54 増殖速度算出部(プロセッサ)
55 情報記憶部(メモリ、記憶部)
A 試料(細胞)
G 画像
R 測定領域
X 細胞
Claims (6)
- 培養中の細胞を経時的に撮影することにより取得された複数の画像について、該画像間において共通する複数の測定領域を抽出する測定領域抽出部と、
該測定領域抽出部により抽出された各前記測定領域に含まれる前記細胞の増殖速度を算出する増殖速度算出部と、
該増殖速度算出部により算出された前記増殖速度と、各前記測定領域の位置情報とを対応づけて記憶する記憶部とを備える細胞画像処理装置。 - 前記記憶部に対応づけて記憶されている前記増殖速度と前記測定領域の位置情報とを対応づけて表示する表示部を備える請求項1に記載の細胞画像処理装置。
- 前記記憶部が、前記増殖速度算出部により算出された前記増殖速度に応じた複数のグループに区分して記憶する請求項2に記載の細胞画像処理装置。
- 前記表示部が、いずれかの前記画像を表示するとともに、前記測定領域を前記グループ毎に色分けして表示する請求項3に記載の細胞画像処理装置。
- 前記表示部が、前記増殖速度に応じた色で前記測定領域を色分けして表示する請求項2に記載の細胞画像処理装置。
- プロセッサとメモリとを備え、
前記プロセッサが、培養中の細胞を経時的に撮影することにより取得された複数の画像について、該画像間において共通する複数の測定領域を抽出するとともに、抽出された各前記測定領域に含まれる前記細胞の増殖速度を算出し、
前記メモリが、算出された前記増殖速度と、各前記測定領域の位置情報とを対応づけて記憶する細胞画像処理装置。
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