JPWO2015133547A1 - γ−グルタミルバリン合成酵素、及び、γ−グルタミルバリルグリシンの製造法 - Google Patents

γ−グルタミルバリン合成酵素、及び、γ−グルタミルバリルグリシンの製造法 Download PDF

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Abstract

γ-Glu-Valを生成するのに好適なγ-Glu-Val合成酵素、及びそれを用いたγ-Glu-Val-Glyの製造法を提供する。コクリア・ロゼア(AJ3132)のγ-Glu-Val合成酵素等の、γ−グルタミルグリシン合成酵素活性に対するγ−グルタミルバリン合成酵素活性の比率が2.0以上であるγ-Glu-Val合成酵素を利用して、Glu、Val、及びGlyを原料としてγ-Glu-Val-Glyを製造する。

Description

本発明は、γ−グルタミルバリン合成酵素(γ-Glu-Val合成酵素)、及びそれを用いたγ−グルタミルバリルグリシンの製造法に関する。γ−グルタミルバリルグリシンは、食品及び医薬品等の分野で有用である。
γ−グルタミルバリルグリシン(L-γ-glutamyl-L-valyl-glycine;以下、「γ-Glu-Val-Gly」ともいう。)のようなある種のペプチドは、カルシウム受容体活性化作用を有している(特許文献1)。このようなカルシウム受容体活性化作用を有するペプチドは、飲食品にコク味を付与できること(特許文献2)、低脂肪食品の呈味、特に脂肪様濃厚感及び滑らかさ、を改善できること(特許文献3)、及び、甘味物質のボディー感を改善し、甘味物質特有の苦味を改善できること(特許文献4)が知られている。
また、前記のようなペプチドは、下痢(特許文献5)、糖尿病(特許文献6)の予防又は治療効果、及び、消化管の重炭酸分泌促進効果(特許文献7)を有することが知られている。
一般に、γ−グルタミルトリペプチドの製造法としては、化学合成法および酵素法が知られている。化学合成法としては、N-保護グルタミン酸無水物を利用して、ジペプチドから選択的にγ−グルタミルトリペプチドを得る方法が知られている(特許文献8)。酵素法としては、グルタミン酸−システインリガーゼ(GSHA)およびグルタチオン合成酵素(GSHB)を利用する方法が知られている(特許文献9、10)。また、酵素法としては、γ−グルタミルトランスフェラーゼを利用し、Val-Glyをγ−グルタミル化してγ-Glu-Val-Glyを生成する方法も知られている(特許文献11)。
グルタミン酸−システインリガーゼ(GSHA)は、GluとCysとATPを基質として、γ-Glu-CysとADPとリン酸を生成する反応を触媒する活性を有する酵素(EC 6.3.2.2)として知られている。GSHAは、通常、酵素反応にMg2+やMn2+等の2価の金属イオンを要求する。
エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)のGSHAは、Mg2+またはMn2+の存在下でGluと各種のアミノ酸およびATPを基質としてγ−グルタミルジペプチドを生成するが、補因子となる金属イオンの種類が基質特異性に影響することが知られている(非特許文献1)。具体的には、Mg2+を補因子とした場合には、γ-Glu-Gly生成活性は、Vmax = 251 mol/mg/hr, Km = 17.6 mMであるのに対して、γ-Glu-Val生成活性は、Vmax = 59 mol/mg/hr, Km = 27.1 mMであると報告されている。すなわち、Vmax/Kmを活性の指標として比較すれば、Mg2+を補因子とした場合のγ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率は0.15と算出できる。一方、Mn2+を補因子とした場合には、γ-Glu-Gly生成活性は、Vmax = 39 mol/mg/hr, Km = 1.7 mMであるのに対して、γ-Glu-Val生成活性は、Vmax = 95 mol/mg/hr, Km = 21 mMであると示されている。すなわち、Vmax/Kmを活性の指標として比較すれば、Mn2+を補因子とした場合のγ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率は0.20と算出できる。また、エシェリヒア・コリ由来GSHAの基質特異性に関しては、他の活性測定例も挙げることができる(非特許文献2)。同文献では、Mg2+の存在下でGluと各種のアミノ酸およびATPを基質として反応を行い、γ-Glu-Gly生成活性を100%とした場合には、γ-Glu-Val生成活性は52%程度であると報告されている。すなわち、これら相対活性に基づいて比較をすれば、γ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率は0.52と算出できる。このように、エシェリヒア・コリのGSHAのγ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率は0.15〜0.5程度であると言える。
また、グラム陰性細菌の1種であるプロテウス・ミラビリス(Proteus mirabilis)由来のGSHAは、Mg2+またはMn2+を補因子とし、Gluと各種のアミノ酸およびATPを基質としてγ-グルタミルジペプチドを生成することが知られている(非特許文献3)。プロテウス・ミラビリス由来のGSHAについて、γ-Glu-Cys生成活性を100%とした場合には、γ-Glu-Gly生成活性は14.5%、γ-Glu-Val生成活性は7.2%であると報告されている。すなわち、これら相対活性に基づいて比較をすれば、γ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率は0.50と算出できる。
また、ストレプトコッカス・アガラクチア(Streptococcus agalactiae)由来のγ-glutamylcysteine synthetase-glutatione synthetase(γ-GCS-GS)は、Mg2+の存在下でGluと各種のアミノ酸およびATPを基質としてγ−グルタミルジペプチドを生成することが知られている。ストレプトコッカス・アガラクチア由来のγ-GCS-GSについて、γ-Glu-Gly生成活性を100%とした場合に、γ-Glu-Val生成活性は21%程度であると報告されている(非特許文献2)。すなわち、これら相対活性に基づいて比較をすれば、γ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率は0.21と算出できる。
また、ミクロコッカス・グルタミカス(Micrococcus glutamicus)の培養液を各種カラムにかけペプチド等を分離し、γ-Glu-Glu、γ-Glu-Val、γ-Glu-Leuを単離したと報告されている(非特許文献5)。しかしながら、これらγ−グルタミルジペプチドの生合成経路については報告されていない。
このように、γ-Glu-Val生成についての知見はいくつかあるものの、γ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率が約0.5よりも大きいγ-Glu-Val生成活性を有するタンパク質についての報告例は見当たらない。
WO2007/055388 WO2007/055393 WO2008/139945 WO2008/139946 WO2008/139947 WO2009/107660 WO2009/119554 特開平08-119916 WO2013/054447 特開2012-85637 WO2013/051685
Brenda S. Kelly et al., J. Biol. Chem., 277, 50-58, 2002 Kino, K. et al., Biochem. Biophys. Res. Commun., 352, 351-359, 2007 Kumagai, H. et al., Agric. Biol. Chem., 46, 1301-1309, 1982 Ronald A. Vitali et al., J. Biol. Chem., 240, 2508‐2511, 1965
グルタミン酸−システインリガーゼ(GSHA)は、生体内において、グルタチオンの前駆体であるγ-Glu-Cysを生成する役割を担っている。GSHAは、Cys以外にも種々のアミノ酸を基質として利用し得るが、通常、Cysと比較して、分岐鎖アミノ酸の1種であるValを基質とする活性が相対的に低い。そのため、GSHAおよびグルタチオン合成酵素(GSHB)を利用し、Glu、Val、Glyを原料としてγ-Glu-Val-Glyを製造する場合、γ-Glu-Val-Glyの収量が低いという問題がある。そこで、本発明は、γ-Glu-Valを生成するのに好適なγ-Glu-Val生成活性を有するタンパク質(γ-Glu-Val合成酵素)、及びそれを用いたγ-Glu-Val-Glyの製造法を提供することを課題とする。
本発明者は、上記課題を解決するために鋭意検討を行った結果、γ-Glu-Gly生成活性に対するγ-Glu-Val生成活性の比率が高いγ-Glu-Val生成活性を有するタンパク質(γ-Glu-Val合成酵素)を見出し、本発明を完成させた。
すなわち本発明は、以下のとおり例示できる。
[1]
下記工程(A)を含む、γ-Glu-Valおよび/またはその塩の製造法:
(A)下記(a)、(b)、又は(c)に記載のタンパク質をGluおよびValに作用させることによりγ-Glu-Valを生成する工程:
(a)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列を含むタンパク質;
(b)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列において、1〜10個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質;
(c)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列に対し90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質。
[2]
下記工程(A)および(B)を含む、γ-Glu-Val-Glyおよび/またはその塩の製造法:
(A)下記(a)、(b)、又は(c)に記載のタンパク質をGluおよびValに作用させることによりγ-Glu-Valを生成する工程;および
(B)グルタチオン合成酵素を工程(A)で生成したγ-Glu-ValおよびGlyに作用させることによりγ-Glu-Val-Glyを生成する工程:
(a)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列を含むタンパク質;
(b)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列において、1〜10個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質;
(c)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列に対し90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質。
[3]
下記工程(C)を含む、γ-Glu-Val-Glyおよび/またはその塩の製造法:
(C)下記(a)、(b)、又は(c)に記載のタンパク質およびグルタチオン合成酵素を、Glu、Val、およびGlyに作用させることにより、γ-Glu-Val-Glyを生成する工程:
(a)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列を含むタンパク質;
(b)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列において、1〜10個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質;
(c)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列に対し90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質。
[4]
前記タンパク質におけるγ−グルタミルグリシン合成酵素活性に対するγ−グルタミルバリン合成酵素活性の比率が2.0以上である、前記方法。
[5]
下記工程(C)を含む、γ-Glu-Val-Glyおよび/またはその塩の製造法:
(C)γ−グルタミルグリシン合成酵素活性に対するγ−グルタミルバリン合成酵素活性の比率が2.0以上であるγ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質およびグルタチオン合成酵素を、Glu、Val、およびGlyに作用させることにより、γ-Glu-Val-Glyを生成する工程。
[6]
前記タンパク質が、精製酵素である、前記方法。
[7]
前記タンパク質が、固定化酵素である、前記方法。
[8]
前記タンパク質が、該タンパク質を有する微生物の培養物、培養菌体、または該菌体の処理物に含有されるものである、前記方法。
[9]
前記グルタチオン合成酵素が、該酵素を有する微生物の培養物、培養菌体、または該菌体の処理物に含有されるものである、前記方法。
[10]
前記タンパク質およびグルタチオン合成酵素が、両酵素を有する微生物の培養物、培養菌体、または該菌体の処理物に含有されるものである、前記方法。
[11]
前記微生物が、γ−グルタミルトランスフェラーゼの活性が低下するように改変されている、前記方法。
[12]
前記微生物が、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)である、前記方法。
[13]
前記工程がATPの存在下で実施される、前記方法。
[14]
下記(a)、(b)、又は(c)に記載のタンパク質:
(a)配列番号6に示すアミノ酸配列を含むタンパク質;
(b)配列番号6に示すアミノ酸配列において、1〜10個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質;
(c)配列番号6に示すアミノ酸配列に対し90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質。
[15]
γ−グルタミルグリシン合成酵素活性に対するγ−グルタミルバリン合成酵素活性の比率が2.0以上である、前記タンパク質。
[16]
γ−グルタミルグリシン合成酵素活性に対するγ−グルタミルバリン合成酵素活性の比率が2.0以上である、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質。
[17]
前記タンパク質をコードする遺伝子。
[18]
前記遺伝子を搭載するベクター。
[19]
前記遺伝子または前記ベクターを有する微生物。
[20]
γ−グルタミルトランスフェラーゼの活性が低下するように改変されている、前記微生物。
[21]
グルタチオン合成酵素をコードする遺伝子を有する、前記微生物。
[22]
エシェリヒア・コリである、前記微生物。
γ-Glu-Gly合成活性に対するγ-Glu-Val合成活性の比率(B)/(A)と、反応開始1時間後におけるγ-Glu-Glyとγ-Glu-Gly-Glyの和に対するγ-Glu-Valとγ-Glu-Val-Glyの和の比率(D)/(C)との相関図。
以下、本発明を詳細に説明する。尚、本明細書において、アミノ酸は特記しない限りL−体である。
<1>γ−グルタミルバリン合成酵素(γ-Glu-Val合成酵素)
本発明において、「γ−グルタミルバリン合成酵素(γ-glutamylvaline synthethase)(γ-Glu-Val合成酵素(γ-Glu-Val synthethase))」とは、GluとValとATPを基質として、γ-Glu-ValとADPとリン酸を生成する反応を触媒する活性を有するタンパク質をいう。同活性を、「γ−グルタミルバリン合成酵素活性」または「γ-Glu-Val生成(合成)活性」ともいう。
また、本発明において、GluとGlyとATPを基質として、γ-Glu-GlyとADPとリン酸を生成する反応を触媒する活性を、「γ−グルタミルグリシン合成酵素(γ-glutamylglycine synthethase)活性」または「γ-Glu-Gly生成(合成)活性」ともいう。
また、本発明において、GluとCysとATPを基質として、γ-Glu-CysとADPとリン酸を生成する反応を触媒する活性を、「γ−グルタミルシステイン合成酵素(γ-glutamylcysteine synthetase)活性」ともいう。
本発明において、γ−グルタミルバリン合成酵素は、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有する限り、γ−グルタミルバリン以外のγ−グルタミルジペプチドを生成する活性を有していてもよく、有していなくてもよい。すなわち、例えば、γ−グルタミルバリン合成酵素は、γ−グルタミルシステイン合成酵素活性を有していてもよく、有していなくてもよい。また、例えば、γ−グルタミルバリン合成酵素は、γ−グルタミルグリシン合成酵素活性を有していてもよく、有していなくてもよい。γ−グルタミルバリン合成酵素は、γ−グルタミルグリシン合成酵素活性を有さないのが好ましい。
γ−グルタミルバリン合成酵素においては、γ−グルタミルグリシン合成酵素活性(比活性)に対するγ−グルタミルバリン合成酵素活性(比活性)の比率が高いのが好ましい。γ−グルタミルバリン合成酵素においては、γ−グルタミルグリシン合成酵素活性(比活性)に対するγ−グルタミルバリン合成酵素活性(比活性)の比率は、例えば、2.0以上、5.0以上、10以上、15以上、または20以上であってよい。また、γ−グルタミルバリン合成酵素においては、γ−グルタミルグリシン合成酵素活性(比活性)に対するγ−グルタミルバリン合成酵素活性(比活性)の比率は、例えば、100以下、または50以下であってよい。
比活性の比率は、実施例11に記載の条件でγ−グルタミルグリシン合成酵素活性およびγ−グルタミルグリシン合成酵素活性を測定し、算出できる。具体的な活性測定条件は以下の通りである。γ−グルタミルバリン合成酵素のγ−グルタミルバリン合成酵素活性は、反応液(100mmol/L Tris-HCl緩衝液、10mmol/L Glu、10mmol/L Val、10mmol/L ATP、10mmol/L硫酸マグネシウム、pH9.0)に適切な量のγ−グルタミルバリン合成酵素を添加し、30℃で30分間反応を行い、生成したγ-Glu-Val量に基づいて測定することができる。本発明においては、本条件で1分間に1μmolのγ-Glu-Valを生成する酵素活性を1 Uのγ−グルタミルバリン合成酵素活性とする。同様に、γ−グルタミルバリン合成酵素のγ−グルタミルグリシン合成酵素活性は、反応液(100mmol/L Tris-HCl緩衝液、10mmol/L Glu、10mmol/L Gly、10mmol/L ATP、10mmol/L硫酸マグネシウム、pH9.0)に適切な量のγ−グルタミルバリン合成酵素を添加し、30℃で30分間反応を行い、生成したγ-Glu-Gly量に基づいて測定することができる。本発明においては、本条件で1分間に1μmolのγ-Glu-Glyを生成する酵素活性を1 Uのγ−グルタミルグリシン合成酵素活性とする。
また、特に、γ−グルタミルバリン合成酵素活性(比活性)が高いγ−グルタミルグリシン合成酵素を利用することにより、GluおよびValを原料としてγ−グルタミルバリンを効率的に生産できると期待される。
γ−グルタミルバリン合成酵素としては、例えば、コクリア(Kocuria)属細菌、ミクロコッカス(Micrococcus)属細菌、コリネバクテリウム(Corynebacterium)属細菌のγ−グルタミルバリン合成酵素が挙げられる。コクリア属細菌としては、コクリア・ロゼア(Kocuria rosea)やコクリア・リゾフィラ(Kocuria rhizophila)が挙げられる。ミクロコッカス属細菌としては、ミクロコッカス・ルテウス(Micrococcus luteus)が挙げられる。コリネバクテリウム属細菌としては、コリネバクテリウム・グルタミカム(Corynebacterium glutamicum)が挙げられる。すなわち、γ−グルタミルバリン合成酵素は、例えば、このような細菌に由来するタンパク質であってよい。
コクリア・ロゼア(AJ3132)のγ−グルタミルバリン合成酵素のアミノ酸配列、およびそれをコードする遺伝子の塩基配列を、それぞれ、配列番号6および3に示す。コクリア・リゾフィラDC2201株(ATCC 9341)のγ−グルタミルバリン合成酵素のアミノ酸配列、およびそれをコードする遺伝子の塩基配列を、それぞれ、配列番号10および7に示す。ミクロコッカス・ルテウスNCTC2665株(ATCC 15307)のγ−グルタミルバリン合成酵素のアミノ酸配列、およびそれをコードする遺伝子の塩基配列を、それぞれ、配列番号16および11に示す。コリネバクテリウム・グルタミカムK051株(ATCC 13032)のγ−グルタミルバリン合成酵素のアミノ酸配列、およびそれをコードする遺伝子の塩基配列を、それぞれ、配列番号22および17に示す。すなわち、γ−グルタミルバリン合成酵素は、例えば、配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列を有するタンパク質であってよい。また、γ−グルタミルバリン合成酵素は、例えば、配列番号3、7、11、または17に示す塩基配列を有する遺伝子にコードされるタンパク質であってよい。なお、「(アミノ酸または塩基)配列を有する」という表現は、当該「(アミノ酸または塩基)配列を含む」場合および当該「(アミノ酸または塩基)配列からなる」場合を包含する。
γ−グルタミルバリン合成酵素は、元の機能が維持されている限り、上記例示したγ−グルタミルバリン合成酵素(例えば、配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列を有するタンパク質)のバリアントであってもよい。同様に、γ−グルタミルバリン合成酵素をコードする遺伝子(「γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子」ともいう)は、元の機能が維持されている限り、上記例示したγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子(例えば、配列番号3、7、11、または17に示す塩基配列を有する遺伝子)のバリアントであってもよい。なお、このような元の機能が維持されたバリアントを「保存的バリアント」という場合がある。保存的バリアントとしては、例えば、上記例示したγ−グルタミルバリン合成酵素やそれをコードする遺伝子のホモログや人為的な改変体が挙げられる。
「元の機能が維持されている」とは、遺伝子やタンパク質のバリアントが、元の遺伝子やタンパク質の機能(活性や性質)に対応する機能(活性や性質)を有することをいう。すなわち、「元の機能が維持されている」とは、γ−グルタミルバリン合成酵素にあっては、タンパク質のバリアントが、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有することをいう。また、「元の機能が維持されている」とは、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子にあっては、遺伝子のバリアントが、元の機能が維持されたタンパク質(すなわちγ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質)をコードすることをいう。
γ−グルタミルバリン合成酵素のホモログとしては、例えば、上記アミノ酸配列を問い合わせ配列として用いたBLAST検索やFASTA検索によって公開データベースから取得されるタンパク質が挙げられる。また、上記γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子のホモログは、例えば、各種微生物の染色体を鋳型にして、これら公知の遺伝子配列に基づいて作製したオリゴヌクレオチドをプライマーとして用いたPCRにより取得することができる。
γ−グルタミルバリン合成酵素は、元の機能が維持されている限り、上記アミノ酸配列(例えば、配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列を有するタンパク質)において、1若しくは数個の位置での1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、挿入または付加されたアミノ酸配列を有するタンパク質であってもよい。なお上記「1若しくは数個」とは、アミノ酸残基のタンパク質の立体構造における位置や種類によっても異なるが、具体的には、例えば、1〜50個、1〜40個、1〜30個、好ましくは1〜20個、より好ましくは1〜10個、さらに好ましくは1〜5個、特に好ましくは1〜3個を意味する。
上記の1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、または付加は、タンパク質の機能が正常に維持される保存的変異である。保存的変異の代表的なものは、保存的置換である。保存的置換とは、置換部位が芳香族アミノ酸である場合には、Phe、Trp、Tyr間で、置換部位が疎水性アミノ酸である場合には、Leu、Ile、Val間で、極性アミノ酸である場合には、Gln、Asn間で、塩基性アミノ酸である場合には、Lys、Arg、His間で、酸性アミノ酸である場合には、Asp、Glu間で、ヒドロキシル基を持つアミノ酸である場合には、Ser、Thr間でお互いに置換する変異である。保存的置換とみなされる置換としては、具体的には、AlaからSer又はThrへの置換、ArgからGln、His又はLysへの置換、AsnからGlu、Gln、Lys、His又はAspへの置換、AspからAsn、Glu又はGlnへの置換、CysからSer又はAlaへの置換、GlnからAsn、Glu、Lys、His、Asp又はArgへの置換、GluからGly、Asn、Gln、Lys又はAspへの置換、GlyからProへの置換、HisからAsn、Lys、Gln、Arg又はTyrへの置換、IleからLeu、Met、Val又はPheへの置換、LeuからIle、Met、Val又はPheへの置換、LysからAsn、Glu、Gln、His又はArgへの置換、MetからIle、Leu、Val又はPheへの置換、PheからTrp、Tyr、Met、Ile又はLeuへの置換、SerからThr又はAlaへの置換、ThrからSer又はAlaへの置換、TrpからPhe又はTyrへの置換、TyrからHis、Phe又はTrpへの置換、及び、ValからMet、Ile又はLeuへの置換が挙げられる。また、上記のようなアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、または逆位等には、タンパク質が由来する生物の個体差、種の違いに基づく場合などの天然に生じる変異(mutant又はvariant)によって生じるものも含まれる。
また、γ−グルタミルバリン合成酵素は、元の機能が維持されている限り、上記アミノ酸配列全体に対して、80%以上、好ましくは90%以上、より好ましくは95%以上、さらに好ましくは97%以上、特に好ましくは99%以上の相同性を有するアミノ酸配列を有するタンパク質であってもよい。尚、本明細書において、「相同性」(homology)は、「同一性」(identity)を指すことがある。
また、γ−グルタミルバリン合成酵素は、元の機能が維持されている限り、上記塩基配列(例えば、配列番号3、7、11、または17に示す塩基配列)から調製され得るプローブ、例えば上記塩基配列の全体または一部に対する相補配列、とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAにコードされるタンパク質であってもよい。そのようなプローブは、例えば、上記塩基配列に基づいて作製したオリゴヌクレオチドをプライマーとし、上記塩基配列を含むDNA断片を鋳型とするPCRによって作製することができる。「ストリンジェントな条件」とは、いわゆる特異的なハイブリッドが形成され、非特異的なハイブリッドが形成されない条件をいう。一例を示せば、相同性が高いDNA同士、例えば80%以上、好ましくは90%以上、より好ましくは95%以上、さらに好ましくは97%以上、特に好ましくは99%以上の相同性を有するDNA同士がハイブリダイズし、それより相同性が低いDNA同士がハイブリダイズしない条件、あるいは通常のサザンハイブリダイゼーションの洗いの条件である60℃、1×SSC、0.1% SDS、好ましくは60℃、0.1×SSC、0.1% SDS、より好ましくは68℃、0.1×SSC、0.1% SDSに相当する塩濃度および温度で、1回、好ましくは2〜3回洗浄する条件を挙げることができる。また、例えば、プローブとして、300 bp程度の長さのDNA断片を用いる場合には、ハイブリダイゼーションの洗いの条件としては、50℃、2×SSC、0.1% SDSが挙げられる。
γ−グルタミルバリン合成酵素は、上記のようなγ−グルタミルバリン合成酵素の内、そのアミノ酸配列またはそれをコードする遺伝子の塩基配列が本発明の出願時に公知であるものを除いたものであってもよい。
γ−グルタミルバリン合成酵素は、他のペプチドとの融合タンパク質であってもよい。「他のペプチド」は、γ−グルタミルバリン合成酵素がγ−グルタミルバリン合成酵素活性を有する限り、特に制限されない。「他のペプチド」は、その利用目的等の諸条件に応じて適宜選択できる。「他のペプチド」としては、ペプチドタグ、シグナルペプチド、プロテアーゼの認識配列が挙げられる。「他のペプチド」は、例えば、γ−グルタミルバリン合成酵素のN末端、若しくはC末端、またはその両方に連結されてよい。「他のペプチド」としては、1種のペプチドを用いてもよく、2種またはそれ以上のペプチドを組み合わせて用いてもよい。
ペプチドタグとして、具体的には、Hisタグ、FLAGタグ、GSTタグ、Mycタグ、MBP(maltose binding protein)、CBP(cellulose binding protein)、TRX(Thioredoxin)、GFP(green fluorescent protein)、HRP(horseradish peroxidase)、ALP(Alkaline Phosphatase)、抗体のFc領域が挙げられる。Hisタグとしては、6xHisタグが挙げられる。ペプチドタグは、例えば、発現したγ−グルタミルバリン合成酵素の検出や精製に利用できる。
シグナルペプチドは、γ−グルタミルバリン合成酵素を発現させる宿主で機能するものであれば、特に制限されない。シグナルペプチドとしては、Sec系分泌経路で認識されるシグナルペプチドやTat系分泌経路で認識されるシグナルペプチドが挙げられる。Tat系分泌経路で認識されるシグナルペプチドとして、具体的には、E. coliのTorAシグナル配列、E. coliのSufIシグナル配列、Bacillus subtilisのPhoDシグナル配列、Bacillus subtilisのLipAシグナル配列、Arthrobacter globiformisのIMDシグナル配列が挙げられる(WO2013/118544)。シグナルペプチドは、例えば、γ−グルタミルバリン合成酵素の分泌生産に利用できる。シグナルペプチドを利用してγ−グルタミルバリン合成酵素を分泌生産する場合、分泌時にシグナルペプチドが切断され、シグナルペプチドを有さないγ−グルタミルバリン合成酵素が菌体外に分泌され得る。
プロテアーゼの認識配列として、具体的には、Factor Xaプロテアーゼの認識配列やproTEVプロテアーゼの認識配列が挙げられる。プロテアーゼの認識配列は、例えば、発現したγ−グルタミルバリン合成酵素の切断に利用できる。具体的には、例えば、γ−グルタミルバリン合成酵素をペプチドタグとの融合タンパク質として発現させる場合、γ−グルタミルバリン合成酵素とペプチドタグの連結部にプロテアーゼの認識配列を導入することにより、発現したγ−グルタミルバリン合成酵素からプロテアーゼを利用してペプチドタグを切断し、ペプチドタグを有さないγ−グルタミルバリン合成酵素を得ることができる。
γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、上記例示したγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子またはその保存的バリアントの塩基配列において、任意のコドンをそれと等価のコドンに置換したものであってもよい。例えば、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、使用する宿主のコドン使用頻度に応じて最適なコドンを有するように改変されてよい。具体的には、例えば、開始コドンがATG以外である場合に、開始コドンをATGに改変することができる。
なお、本発明において、「遺伝子」という用語は、目的のタンパク質をコードする限り、DNAに限られず、任意のポリヌクレオチドを包含してよい。すなわち、「γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子」とは、γ−グルタミルバリン合成酵素をコードする任意のポリヌクレオチドを意味してよい。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、DNAであってもよく、RNAであってもよく、その組み合わせであってもよい。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、一本鎖であってもよく、二本鎖であってもよい。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、一本鎖DNAであってもよく、一本鎖RNAであってもよい。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、二本鎖DNAであってもよく、二本鎖RNAであってもよく、DNA鎖とRNA鎖からなるハイブリッド鎖であってもよい。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、単一のポリヌクレオチド鎖中に、DNA残基とRNA残基の両方を含んでいてもよい。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子がRNAを含む場合、上記例示した塩基配列等のDNAに関する記載は、RNAに合わせて適宜読み替えてよい。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の態様は、その利用態様等の諸条件に応じて適宜選択できる。
<2>γ−グルタミルバリン合成酵素の製造
γ−グルタミルバリン合成酵素は、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主にγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を発現させることにより製造できる。なお、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主を、γ−グルタミルバリン合成酵素を有する宿主ともいう。また、γ−グルタミルバリン合成酵素は、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を無細胞タンパク質合成系で発現させることによっても製造できる。
γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主は、本来的にγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有するものであってもよく、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有するように改変されたものであってもよい。
本来的にγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主としては、上記のような各γ−グルタミルバリン合成酵素が由来する細菌、例えば、コクリア・ロゼア(AJ3132)、コクリア・リゾフィラDC2201株(ATCC 9341)、ミクロコッカス・ルテウスNCTC2665株(ATCC 15307)、コリネバクテリウム・グルタミカムK051株(ATCC 13032)、が挙げられる。
γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有するように改変された宿主としては、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子が導入された宿主が挙げられる。
γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を導入する宿主は、機能するγ−グルタミルバリン合成酵素を発現できるものであれば特に制限されない。宿主としては、例えば、細菌、放線菌、酵母、真菌、植物細胞、昆虫細胞、および動物細胞が挙げられる。好ましい宿主としては、細菌や酵母等の微生物が挙げられる。より好ましい宿主としては、細菌が挙げられる。細菌としては、グラム陰性細菌やグラム陽性細菌が挙げられる。グラム陰性細菌としては、例えば、エシェリヒア(Escherichia)属細菌、エンテロバクター(Enterobacter)属細菌、パントエア(Pantoea)属細菌等の腸内細菌科(Enterobacteriaceae)に属する細菌が挙げられる。グラム陽性細菌としては、バチルス(Bacillus)属細菌、コリネバクテリウム(Corynebacterium)属細菌等のコリネ型細菌が挙げられる。宿主としては、中でも、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)を好適に用いることができる。
γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する生物からのクローニングにより取得できる。クローニングには、同遺伝子を含むゲノムDNAやcDNA等の核酸を利用できる。また、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、化学合成によっても取得できる(Gene, 60(1), 115-127 (1987))。
また、取得したγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を適宜改変してそのバリアントを取得することもできる。遺伝子の改変は公知の手法により行うことができる。例えば、部位特異的変異法により、DNAの目的部位に目的の変異を導入することができる。すなわち、例えば、部位特異的変異法により、コードされるタンパク質の特定の部位のアミノ酸残基が置換、欠失、挿入または付加を含むように、遺伝子のコード領域を改変することができる。部位特異的変異法としては、PCRを用いる方法(Higuchi, R., 61, in PCR technology, Erlich, H. A. Eds., Stockton press (1989);Carter, P., Meth. in Enzymol., 154, 382 (1987))や、ファージを用いる方法(Kramer,W. and Frits, H. J., Meth. in Enzymol., 154, 350 (1987);Kunkel, T. A. et al., Meth. in Enzymol., 154, 367 (1987))が挙げられる。
γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を宿主に導入する手法は特に制限されない。宿主において、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、当該宿主で機能するプロモーターの制御下で発現可能に保持されていればよい。宿主において、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、プラスミドのように染色体外で自律複製するベクター上に存在していてもよく、染色体上に導入されていてもよい。宿主は、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を1コピーのみ有していてもよく、2またはそれ以上のコピーで有していてもよい。宿主は、1種類のγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子のみを有していてもよく、2またはそれ以上の種類のγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有していてもよい。
γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を発現させるためのプロモーターは、宿主において機能するものであれば特に制限されない。「宿主において機能するプロモーター」とは、宿主においてプロモーター活性を有するプロモーターをいう。プロモーターは、宿主由来のプロモーターであってもよく、異種由来のプロモーターであってもよい。プロモーターは、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の固有のプロモーターであってもよく、他の遺伝子のプロモーターであってもよい。プロモーターは、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の固有のプロモーターよりも強力なプロモーターであってもよい。エシェリヒア・コリ等の腸内細菌科の細菌において機能する強力なプロモーターとしては、例えば、T7プロモーター、trpプロモーター、trcプロモーター、lacプロモーター、tacプロモーター、tetプロモーター、araBADプロモーター、rpoHプロモーター、PRプロモーター、およびPLプロモーターが挙げられる。また、コリネ型細菌において機能する強力なプロモーターとしては、人為的に設計変更されたP54-6プロモーター(Appl.Microbiol.Biotechnolo., 53, 674-679(2000))、コリネ型細菌内で酢酸、エタノール、ピルビン酸等で誘導できるpta、aceA、aceB、adh、amyEプロモーター、コリネ型細菌内で発現量が多い強力なプロモーターであるcspB、SOD、tuf((EF-Tu))プロモーター(Journal of Biotechnology 104 (2003) 311-323, Appl Environ Microbiol. 2005 Dec;71(12):8587-96.)、lacプロモーター、tacプロモーター、trcプロモーターが挙げられる。また、プロモーターとしては、各種レポーター遺伝子を用いることにより、在来のプロモーターの高活性型のものを取得し利用してもよい。例えば、プロモーター領域内の−35、−10領域をコンセンサス配列に近づけることにより、プロモーターの活性を高めることができる(国際公開第00/18935号)。高活性型プロモーターとしては、各種tac様プロモーター(Katashkina JI et al. Russian Federation Patent application 2006134574)やpnlp8プロモーター(WO2010/027045)が挙げられる。プロモーターの強度の評価法および強力なプロモーターの例は、Goldsteinらの論文(Prokaryotic promoters in biotechnology. Biotechnol. Annu. Rev., 1, 105-128 (1995))等に記載されている。
また、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の下流には、転写終結用のターミネーターを配置することができる。ターミネーターは、宿主において機能するものであれば特に制限されない。ターミネーターは、宿主由来のターミネーターであってもよく、異種由来のターミネーターであってもよい。ターミネーターは、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の固有のターミネーターであってもよく、他の遺伝子のターミネーターであってもよい。ターミネーターとして、具体的には、例えば、T7ターミネーター、T4ターミネーター、fdファージターミネーター、tetターミネーター、およびtrpAターミネーターが挙げられる。
γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、例えば、同遺伝子を含むベクターを用いて宿主に導入することができる。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を含むベクターを、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の発現ベクターまたは組み換えベクターともいう。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の発現ベクターは、例えば、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を含むDNA断片を宿主で機能するベクターと連結することにより、構築することができる。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の発現ベクターで宿主を形質転換することにより、同ベクターが導入された形質転換体が得られる、すなわち、同遺伝子を宿主に導入することができる。ベクターとしては、宿主の細胞内において自律複製可能なベクターを用いることができる。ベクターは、マルチコピーベクターであるのが好ましい。また、ベクターは、形質転換体を選択するために、抗生物質耐性遺伝子などのマーカーを有することが好ましい。また、ベクターは、挿入された遺伝子を発現するためのプロモーターやターミネーターを備えていてもよい。ベクターは、例えば、細菌プラスミド由来のベクター、酵母プラスミド由来のベクター、バクテリオファージ由来のベクター、コスミド、またはファージミド等であってよい。エシェリヒア・コリ等の腸内細菌科の細菌において自律複製可能なベクターとして、具体的には、例えば、pUC19、pUC18、pHSG299、pHSG399、pHSG398、pBR322、pSTV29(いずれもタカラバイオ社より入手可)、pACYC184、pMW219(ニッポンジーン社)、pTrc99A(ファルマシア社)、pPROK系ベクター(クロンテック社)、pKK233‐2(クロンテック社製)、pET系ベクター(ノバジェン社)、pQE系ベクター(キアゲン社)、pACYC、広宿主域ベクターRSF1010が挙げられる。コリネ型細菌で自律複製可能なベクターとして、具体的には、例えば、pHM1519(Agric, Biol. Chem., 48, 2901-2903(1984));pAM330(Agric. Biol. Chem., 48, 2901-2903(1984));これらを改良した薬剤耐性遺伝子を有するプラスミド;特開平3-210184号公報に記載のプラスミドpCRY30;特開平2-72876号公報及び米国特許5,185,262号明細書公報に記載のプラスミドpCRY21、pCRY2KE、pCRY2KX、pCRY31、pCRY3KE及びpCRY3KX;特開平1-191686号公報に記載のプラスミドpCRY2およびpCRY3;特開昭58-192900号公報に記載のpAJ655、pAJ611及びpAJ1844;特開昭57-134500号公報に記載のpCG1;特開昭58-35197号公報に記載のpCG2;特開昭57-183799号公報に記載のpCG4およびpCG11が挙げられる。発現ベクターの構築の際には、例えば、固有のプロモーター領域を含むγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子をそのままベクターに組み込んでもよく、γ−グルタミルバリン合成酵素のコード領域を上記のようなプロモーターの下流に結合してからベクターに組み込んでもよく、ベクター上にもともと備わっているプロモーターの下流にγ−グルタミルバリン合成酵素のコード領域を組み込んでもよい。
各種微生物において利用可能なベクター、プロモーター、ターミネーターに関しては、例えば「微生物学基礎講座8 遺伝子工学、共立出版、1987年」に詳細に記載されており、それらを利用することが可能である。
また、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、例えば、宿主の染色体上へ導入することができる。染色体への遺伝子の導入は、例えば、相同組み換えを利用して行うことができる(MillerI, J. H. Experiments in Molecular Genetics, 1972, Cold Spring Harbor Laboratory)。相同組み換えを利用する遺伝子導入法としては、例えば、Redドリブンインテグレーション(Red-driven integration)法(Datsenko, K. A, and Wanner, B. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 97:6640-6645 (2000))等の直鎖状DNAを用いる方法、温度感受性複製起点を含むプラスミドを用いる方法、接合伝達可能なプラスミドを用いる方法、宿主内で機能する複製起点を持たないスイサイドベクターを用いる方法、ファージを用いたtransduction法が挙げられる。遺伝子は、1コピーのみ導入されてもよく、2コピーまたはそれ以上導入されてもよい。例えば、染色体上に多数のコピーが存在する配列を標的として相同組み換えを行うことで、染色体へ遺伝子の多数のコピーを導入することができる。染色体上に多数のコピーが存在する配列としては、反復DNA配列(repetitive DNA)、トランスポゾンの両端に存在するインバーテッド・リピートが挙げられる。また、本発明の実施に不要な遺伝子等の染色体上の適当な配列を標的として相同組み換えを行ってもよい。また、遺伝子は、トランスポゾンやMini-Muを用いて染色体上にランダムに導入することもできる(特開平2-109985号公報、US5,882,888、EP805867B1)。染色体への遺伝子の導入の際には、例えば、固有のプロモーター領域を含むγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子をそのまま染色体に組み込んでもよく、γ−グルタミルバリン合成酵素のコード領域を上記のようなプロモーターの下流に結合してから染色体に組み込んでもよく、染色体上にもともと存在するプロモーターの下流にγ−グルタミルバリン合成酵素のコード領域を組み込んでもよい。
染色体上に遺伝子が導入されたことは、例えば、同遺伝子の全部又は一部と相補的な塩基配列を有するプローブを用いたサザンハイブリダイゼーション、または同遺伝子の塩基配列に基づいて作成したプライマーを用いたPCRによって確認できる。
形質転換法は特に限定されず、従来知られた方法を用いることができる。形質転換法としては、例えば、エシェリヒア・コリ K-12について報告されているような、受容菌細胞を塩化カルシウムで処理してDNAの透過性を増す方法(Mandel, M. and Higa, A.,J. Mol. Biol. 1970, 53, 159-162)、バチルス・ズブチリスについて報告されているような、増殖段階の細胞からコンピテントセルを調製してDNAを導入する方法(Duncan, C. H., Wilson, G. A. and Young, F. E.., 1997. Gene 1: 153-167)などが挙げられる。また、形質転換法としては、バチルス・ズブチリス、放線菌類及び酵母について知られているような、DNA受容菌の細胞を、組換えDNAを容易に取り込むプロトプラストまたはスフェロプラストの状態にして組換えDNAをDNA受容菌に導入する方法(Chang, S.and Choen, S.N., 1979. Mol. Gen. Genet. 168: 111-115; Bibb, M. J., Ward, J. M. and Hopwood, O. A. 1978. Nature 274: 398-400; Hinnen, A., Hicks, J. B. and Fink, G. R. 1978. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 75: 1929-1933)も応用できる。また、形質転換法としては、コリネ型細菌について報告されているような、電気パルス法(特開平2-207791号公報)を利用することもできる。
また、本来的にγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主を、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の発現が増大するよう改変してもよい。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の発現を増大させる手法としては、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子のコピー数を増加させることやγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の転写効率を向上させることが挙げられる。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子のコピー数の増加は、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を宿主に導入することにより達成できる。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の導入は、上述したように実施できる。なお、導入されるγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子は、同種由来であってもよく、異種由来であってもよい。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の転写効率の向上は、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子のプロモーターをより強力なプロモーターに置換することにより達成できる。より強力なプロモーターとしては上述したような強力なプロモーターが挙げられる。
γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主は、γ−グルタミルペプチドの分解に関与するタンパク質の活性が低下するように改変されていてもよい。γ−グルタミルペプチドの分解に関与するタンパク質としては、γ−グルタミルトランスフェラーゼ(GGT)が挙げられる。GGTの活性が低下することにより、γ-Glu-Valおよびγ-Glu-Val-Glyの分解を抑制することが出来る。GGTの活性は、GGTをコードするggt遺伝子を破壊等することにより、低下させることができる。一例として、エシェリヒア・コリのggt遺伝子の塩基配列及び同遺伝子によってコードされるタンパク質のアミノ酸配列を、それぞれ、配列番号29及び30に示す。
以下、タンパク質の活性を低下させる手法について説明する。
「タンパク質の活性が低下する」とは、同タンパク質の細胞当たりの活性が野性株や親株等の非改変株と比較して減少していることを意味し、活性が完全に消失している場合を含む。「タンパク質の活性が低下する」とは、具体的には、非改変株と比較して、同タンパク質の細胞当たりの分子数が低下していること、および/または、同タンパク質の分子当たりの機能が低下していることをいう。すなわち、「タンパク質の活性が低下する」という場合の「活性」とは、タンパク質の触媒活性に限られず、タンパク質をコードする遺伝子の転写量(mRNA量)または翻訳量(タンパク質の量)を意味してもよい。なお、「タンパク質の細胞当たりの分子数が低下している」ことには、同タンパク質が全く存在していない場合が含まれる。また、「タンパク質の分子当たりの機能が低下している」ことには、同タンパク質の分子当たりの機能が完全に消失している場合が含まれる。タンパク質の活性は、非改変株と比較して低下していれば特に制限されないが、例えば、非改変株と比較して、50%以下、20%以下、10%以下、5%以下、または0%に低下してよい。
タンパク質の活性が低下するような改変は、例えば、同タンパク質をコードする遺伝子の発現を低下させることにより達成される。「遺伝子の発現が低下する」とは、同遺伝子の細胞当たりの発現量が野生株や親株等の非改変株と比較して減少することを意味する。「遺伝子の発現が低下する」とは、具体的には、遺伝子の転写量(mRNA量)が低下すること、および/または、遺伝子の翻訳量(タンパク質の量)が低下することを意味してよい。「遺伝子の発現が低下する」ことには、同遺伝子が全く発現していない場合が含まれる。なお、「遺伝子の発現が低下する」ことを、「遺伝子の発現が弱化される」ともいう。遺伝子の発現は、例えば、非改変株と比較して、50%以下、20%以下、10%以下、5%以下、または0%に低下してよい。
遺伝子の発現の低下は、例えば、転写効率の低下によるものであってもよく、翻訳効率の低下によるものであってもよく、それらの組み合わせによるものであってもよい。遺伝子の発現の低下は、例えば、遺伝子のプロモーター、シャインダルガノ(SD)配列(リボソーム結合部位(RBS)ともいう)、RBSと開始コドンとの間のスペーサー領域等の発現調節配列を改変することにより達成できる。発現調節配列を改変する場合には、発現調節配列は、好ましくは1塩基以上、より好ましくは2塩基以上、特に好ましくは3塩基以上が改変される。また、発現調節配列の一部または全部を欠失させてもよい。また、遺伝子の発現の低下は、例えば、発現制御に関わる因子を操作することによっても達成できる。発現制御に関わる因子としては、転写や翻訳制御に関わる低分子(誘導物質、阻害物質など)、タンパク質(転写因子など)、核酸(siRNAなど)等が挙げられる。また、遺伝子の発現の低下は、例えば、遺伝子のコード領域に遺伝子の発現が低下するような変異を導入することによっても達成できる。例えば、遺伝子のコード領域のコドンを、宿主においてより低頻度で利用される同義コドンに置き換えることによって、遺伝子の発現を低下させることができる。また、例えば、後述するような遺伝子の破壊により、遺伝子の発現自体が低下し得る。
また、タンパク質の活性が低下するような改変は、例えば、同タンパク質をコードする遺伝子を破壊することにより達成できる。「遺伝子が破壊される」とは、正常に機能するタンパク質を産生しないように同遺伝子が改変されることを意味する。「正常に機能するタンパク質を産生しない」ことには、同遺伝子からタンパク質が全く産生されない場合や、同遺伝子から分子当たりの機能(活性や性質)が低下又は消失したタンパク質が産生される場合が含まれる。
遺伝子の破壊は、例えば、染色体上の遺伝子のコード領域の一部又は全部を欠損させることにより達成できる。さらには、染色体上の遺伝子の前後の配列を含めて、遺伝子全体を欠失させてもよい。タンパク質の活性の低下が達成できる限り、欠失させる領域は、N末端領域、内部領域、C末端領域等のいずれの領域であってもよい。通常、欠失させる領域は長い方が確実に遺伝子を不活化することができる。また、欠失させる領域の前後の配列は、リーディングフレームが一致しないことが好ましい。
また、遺伝子の破壊は、例えば、染色体上の遺伝子のコード領域にアミノ酸置換(ミスセンス変異)を導入すること、終止コドンを導入すること(ナンセンス変異)、あるいは1〜2塩基を付加または欠失するフレームシフト変異を導入すること等によっても達成できる(Journal of Biological Chemistry 272: 8611-8617 (1997), Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 95 5511-5515 (1998), Journal of Biological Chemistry 26 116, 20833-20839 (1991))。
また、遺伝子の破壊は、例えば、染色体上の遺伝子のコード領域に他の配列を挿入することによっても達成できる。挿入部位は遺伝子のいずれの領域であってもよいが、挿入する配列は長い方が確実に遺伝子を不活化することができる。また、挿入部位の前後の配列は、リーディングフレームが一致しないことが好ましい。他の配列としては、コードされるタンパク質の活性を低下又は消失させるものであれば特に制限されないが、例えば、抗生物質耐性遺伝子等のマーカー遺伝子や目的物質の生産に有用な遺伝子が挙げられる。
染色体上の遺伝子を上記のように改変することは、例えば、遺伝子の部分配列を欠失し、正常に機能するタンパク質を産生しないように改変した欠失型遺伝子を作製し、該欠失型遺伝子を含む組換えDNAで宿主を形質転換して、欠失型遺伝子と染色体上の野生型遺伝子とで相同組換えを起こさせることにより、染色体上の野生型遺伝子を欠失型遺伝子に置換することによって達成できる。その際、組換えDNAには、宿主の栄養要求性等の形質にしたがって、マーカー遺伝子を含ませておくと操作がしやすい。欠失型遺伝子によってコードされるタンパク質は、生成したとしても、野生型タンパク質とは異なる立体構造を有し、機能が低下又は消失する。このような相同組換えを利用した遺伝子置換による遺伝子破壊は既に確立しており、「Redドリブンインテグレーション(Red-driven integration)」と呼ばれる方法(Datsenko, K. A, and Wanner, B. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 97: 6640-6645 (2000))、Redドリブンインテグレーション法とλファージ由来の切り出しシステム(Cho, E. H., Gumport, R. I., Gardner, J. F. J. Bacteriol. 184: 5200-5203 (2002))とを組み合わせた方法(WO2005/010175号参照)等の直鎖状DNAを用いる方法や、温度感受性複製起点を含むプラスミドを用いる方法、接合伝達可能なプラスミドを用いる方法、宿主内で機能する複製起点を持たないスイサイドベクターを用いる方法などがある(米国特許第6303383号、特開平05-007491号)。
また、タンパク質の活性が低下するような改変は、例えば、突然変異処理により行ってもよい。突然変異処理としては、X線の照射、紫外線の照射、ならびにN−メチル−N'−ニトロ−N−ニトロソグアニジン(MNNG)、エチルメタンスルフォネート(EMS)、およびメチルメタンスルフォネート(MMS)等の変異剤による処理が挙げられる。
なお、タンパク質が複数のサブユニットからなる複合体として機能する場合、結果としてタンパク質の活性が低下する限り、それら複数のサブユニットの全てを改変してもよく、一部のみを改変してもよい。すなわち、例えば、それらのサブユニットをコードする複数の遺伝子の全てを破壊等してもよく、一部のみを破壊等してもよい。また、タンパク質に複数のアイソザイムが存在する場合、結果としてタンパク質の活性が低下する限り、複数のアイソザイムの全ての活性を低下させてもよく、一部のみの活性を低下させてもよい。すなわち、例えば、それらのアイソザイムをコードする複数の遺伝子の全てを破壊等してもよく、一部のみを破壊等してもよい。
タンパク質の活性が低下したことは、同タンパク質の活性を測定することで確認できる。
タンパク質の活性が低下したことは、同タンパク質をコードする遺伝子の発現が低下したことを確認することによっても、確認できる。遺伝子の発現が低下したことは、同遺伝子の転写量が低下したことを確認することや、同遺伝子から発現するタンパク質の量が低下したことを確認することにより確認できる。
遺伝子の転写量が低下したことの確認は、同遺伝子から転写されるmRNAの量を非改変株と比較することによって行うことが出来る。mRNAの量を評価する方法としては、ノーザンハイブリダイゼーション、RT−PCR等が挙げられる(Molecular cloning(Cold spring Harbor Laboratory Press, Cold spring Harbor (USA), 2001))。mRNAの量は、非改変株と比較して、例えば、50%以下、20%以下、10%以下、5%以下、または0%に低下してよい。
タンパク質の量が低下したことの確認は、抗体を用いてウェスタンブロットによって行うことが出来る(Molecular cloning(Cold spring Harbor Laboratory Press, Cold spring Harbor (USA), 2001))。タンパク質の量は、非改変株と比較して、例えば、50%以下、20%以下、10%以下、5%以下、または0%に低下してよい。
遺伝子が破壊されたことは、破壊に用いた手段に応じて、同遺伝子の一部または全部の塩基配列、制限酵素地図、または全長等を決定することで確認できる。
γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主を培養することにより、γ−グルタミルバリン合成酵素を発現させることができる。その際、必要に応じて、遺伝子の発現誘導を行う。宿主の培養条件や遺伝子の発現誘導の条件は、マーカーの種類、プロモーターの種類、および宿主の種類等の諸条件に応じて適宜選択すればよい。培養に用いる培地は、宿主が増殖でき、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素を発現できるものであれば特に制限されない。培地としては、例えば、炭素源、窒素源、イオウ源、無機イオン、及び必要に応じその他の有機成分を含有する通常の培地を用いることができる。
炭素源としては、グルコース、フラクトース、シュクロース、糖蜜、でんぷんの加水分解物等の糖類、グリセロール、エタノール等のアルコール類、フマル酸、クエン酸、コハク酸等の有機酸類が挙げられる。
窒素源としては、硫酸アンモニウム、塩化アンモニウム、リン酸アンモニウム等の無機アンモニウム塩、大豆加水分解物などの有機窒素、アンモニアガス、アンモニア水が挙げられる。
イオウ源としては、硫酸塩、亜硫酸塩、硫化物、次亜硫酸塩、チオ硫酸塩等の無機硫黄化合物が挙げられる、
無機イオンとしては、カルシウムイオン、マグネシウムイオン、マンガンイオン、カリウムイオン、鉄イオン、リン酸イオンが挙げられる。
その他の有機成分としては、有機微量栄養源が挙げられる。有機微量栄養源としては、ビタミンB1などの要求物質や、それらを含む酵母エキス等が挙げられる。
培養温度は、例えば、20℃〜45℃、好ましくは24℃〜45℃であってよい。培養は、通気培養が好ましい。その際の酸素濃度は、例えば、飽和濃度に対して5〜50%に、好ましくは10%程度に調節してよい。培養中のpHは、5〜9が好ましい。尚、pH調整には無機あるいは有機の酸性あるいはアルカリ性物質、例えば炭酸カルシウム、アンモニアガス、アンモニア水等、を使用することができる。
上記のような条件下で、好ましくは10時間〜120時間程度培養することにより、γ−グルタミルバリン合成酵素を含む培養物が得られる。γ−グルタミルバリン合成酵素は、例えば、宿主の菌体内に蓄積し得る。「菌体」は、宿主の種類に応じて、適宜「細胞」と読み替えてよい。尚、使用する宿主及びγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の設計によっては、ペリプラズムにγ−グルタミルバリン合成酵素を蓄積させることや、菌体外にγ−グルタミルバリン合成酵素を分泌生産させることも可能である。
γ−グルタミルバリン合成酵素は、菌体等に含まれたまま使用してもよく、適宜、菌体等から分離精製し粗酵素画分又は精製酵素として使用してもよい。
すなわち、例えば、宿主の菌体内にγ−グルタミルバリン合成酵素が蓄積する場合、適宜、菌体を破砕、溶解、または抽出等し、γ−グルタミルバリン合成酵素を回収することができる。菌体は、遠心分離等により培養物から回収することができる。細胞の破砕、溶解、または抽出等は、公知の方法により行うことができる。そのような方法としては、例えば、例えば、超音波破砕法、ダイノミル法、ビーズ破砕、フレンチプレス破砕、リゾチーム処理が挙げられる。これらの方法は、1種を単独で用いてもよく、2種またはそれ以上を適宜組み合わせて用いてもよい。また、例えば、培地にγ−グルタミルバリン合成酵素が蓄積する場合、遠心分離等により培養上清を取得し、培養上清からγ−グルタミルバリン合成酵素を回収することができる。
γ−グルタミルバリン合成酵素の精製は、酵素の精製に用いられる公知の方法により行うことができる。そのような方法としては、例えば、硫安分画、イオン交換クロマトグラフィー、疎水クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ゲルろ過クロマトグラフィー、等電点沈殿が挙げられる。これらの方法は、1種を単独で用いてもよく、2種またはそれ以上を適宜組み合わせて用いてもよい。γ−グルタミルバリン合成酵素の精製は、所望の程度に行うことができる。例えば、GGT等のγ−グルタミルペプチドの分解に関与する成分がγ−グルタミルバリン合成酵素と共存している場合には、そのような成分を除去するのが好ましい。
精製されたγ−グルタミルバリン合成酵素は、本発明の方法における「γ−グルタミルバリン合成酵素」として利用できる。γ−グルタミルバリン合成酵素は、遊離の状態で利用されてもよいし、樹脂等の固相に固定化された固定化酵素の状態で利用されてもよい。
また、精製されたγ−グルタミルバリン合成酵素に限られず、γ−グルタミルバリン合成酵素を含有する任意の画分を本発明の方法における「γ−グルタミルバリン合成酵素」として利用してもよい。γ−グルタミルバリン合成酵素を含有する画分は、γ−グルタミルバリン合成酵素がGluおよびValに作用できるように含有される限り特に制限されない。そのような画分としては、例えば、γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主(γ−グルタミルバリン合成酵素を有する宿主)の培養物、同培養物から回収した菌体(培養菌体)、同菌体の破砕物、同菌体の溶解物、同菌体の抽出物(無細胞抽出液)、同菌体をアクリルアミド、カラギーナン等で固定化した固定化菌体等の菌体処理物、同培養物から回収した培養上清、それらの部分精製物(粗精製物)、それらの組み合わせが挙げられる。これらの画分は、いずれも、単独で利用されてもよいし、精製されたγ−グルタミルバリン合成酵素と共に利用されてもよい。
<3>グルタチオン合成酵素およびその製造
「グルタチオン合成酵素(glutathione synthase)」は、通常、γ-Glu-CysとGlyとATPを基質として、グルタチオン(γ-Glu-Cys-Gly)とADPとリン酸を生成する反応を触媒する活性を有する酵素(EC 6.3.2.3)として知られている。本発明において、同活性を、「グルタチオン合成酵素活性」ともいう。
また、本発明において、γ-Glu-ValとGlyとATPを基質として、γ-Glu-Val-GlyとADPとリン酸を生成する反応を触媒する活性を、「γ−グルタミルバリルグリシン合成酵素(gamma-Glutamylvalylglycine synthethase)活性」または「γ-Glu-Val-Gly生成(合成)活性」ともいう。
本発明において、グルタチオン合成酵素としては、γ−グルタミルバリルグリシン合成酵素活性を有するものを用いる。すなわち、本発明において、「グルタチオン合成酵素」とは、γ−グルタミルバリルグリシン合成酵素活性を有するタンパク質をいう。
本発明において、グルタチオン合成酵素は、γ−グルタミルバリルグリシン合成酵素活性を有する限り、γ−グルタミルバリルグリシン以外のγ−グルタミルトリペプチドを生成する活性を有していてもよく、有していなくてもよい。すなわち、例えば、グルタチオン合成酵素は、グルタチオン合成酵素活性を有していてもよく、有していなくてもよい。
グルタチオン合成酵素のγ−グルタミルバリルグリシン合成酵素活性は、例えば、反応液組成を12.5 mMγ-Glu-Val、12.5 mM Gly、12.5 mM ATP、12.5 mM MgS04、2 mMジチオスレイトール、100 mM Tris-HCl緩衝液(pH8.0)、反応温度37℃、反応時間1分〜50時間として、適切な量のグルタチオン合成酵素を用いて測定することができる。本条件で1分間に1μmolのγ-Glu-Val-Glyを生成する酵素活性を1 Uのγ−グルタミルバリルグリシン合成酵素活性とする。
グルタチオン合成酵素としては、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)のgshB遺伝子によりコードされるGshBタンパク質やサッカロマイセス・セレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)のGSH2遺伝子によりコードされるGsh2タンパク質が挙げられる。また、グルタチオン合成酵素としては、WO2013/054447に記載の変異型グルタチオン合成酵素も挙げられる。エシェリヒア・コリK-12 MG1655株のgshB遺伝子の塩基配列は、GenBank accession NC_000913.3としてNCBIデータベースに登録されているゲノム配列中の3,089,900〜3,090,850位の配列に相当する。MG1655株(エシェリヒア・コリK-12 W3110株においても同一)のgshB遺伝子の塩基配列を配列番号27に示す。また、同遺伝子によってコードされるタンパク質のアミノ酸配列を配列番号28に示す。すなわち、グルタチオン合成酵素は、例えば、配列番号27に示す塩基配列を有する遺伝子にコードされるタンパク質であってよい。また、グルタチオン合成酵素は、例えば、配列番号28に示すアミノ酸配列を有するタンパク質であってよい。グルタチオン合成酵素は、γ−グルタミルバリルグリシン合成酵素活性を有する限り、上記グルタチオン合成酵素のバリアントであってもよい。バリアントについては、上述したγ−グルタミルバリン合成酵素のバリアントに関する記載を準用できる。グルタチオン合成酵素は、他のペプチドとの融合タンパク質であってもよい。融合タンパク質については、上述したγ−グルタミルバリン合成酵素における融合タンパク質に関する記載を準用できる。
グルタチオン合成酵素は、グルタチオン合成酵素をコードする遺伝子(「グルタチオン合成酵素遺伝子」ともいう)を有する宿主にグルタチオン合成酵素遺伝子を発現させることにより製造できる。なお、グルタチオン合成酵素遺伝子を有する宿主を、グルタチオン合成酵素を有する宿主ともいう。グルタチオン合成酵素遺伝子を有する宿主は、本来的にグルタチオン合成酵素遺伝子を有するものであってもよく、グルタチオン合成酵素遺伝子を有するように改変されたものであってもよい。本来的にグルタチオン合成酵素遺伝子を有する宿主としては、上記gshB遺伝子を有するエシェリヒア・コリや上記GSH2遺伝子を有するサッカロマイセス・セレビシエ等の微生物が挙げられる。グルタチオン合成酵素遺伝子を有するように改変された宿主としては、グルタチオン合成酵素遺伝子が導入された宿主が挙げられる。また、本来的にグルタチオン合成酵素遺伝子を有する宿主を、グルタチオン合成酵素遺伝子の発現が増大するよう改変してもよい。グルタチオン合成酵素遺伝子の導入等の宿主の改変については、上述したγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の導入等の宿主の改変に関する記載を準用できる。グルタチオン合成酵素遺伝子を発現するための宿主は、γ−グルタミルトランスフェラーゼ(GGT)等のγ−グルタミルペプチドの分解に関与するタンパク質の活性が低下するように改変されていてもよい。また、グルタチオン合成酵素は、グルタチオン合成酵素遺伝子を無細胞タンパク質合成系で発現させることによっても製造できる。
グルタチオン合成酵素遺伝子を有する宿主を利用したグルタチオン合成酵素の製造については、上述したγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する宿主を利用したγ−グルタミルバリン合成酵素の製造に関する記載を準用できる。製造されたグルタチオン合成酵素(精製されたグルタチオン合成酵素やグルタチオン合成酵素を含有する画分)は、本発明の方法における「グルタチオン合成酵素」として利用できる。なお、グルタチオン合成酵素は、単独で製造してもよく、γ−グルタミルバリン合成酵素とまとめて製造してもよい。例えば、グルタチオン合成酵素遺伝子とγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子の両方を有する宿主にそれらの遺伝子を発現させることにより、グルタチオン合成酵素とγ−グルタミルバリン合成酵素をまとめて製造することができる。
<4>γ−グルタミルバリルグリシン(γ-Glu-Val-Gly)の製造法
本発明は、γ−グルタミルバリン合成酵素を利用したγ-Glu-Valの製造法やγ−グルタミルバリン合成酵素を利用したγ-Glu-Val-Glyの製造法を提供する。これらの方法を総称して、「本発明の方法」ともいう。
<4−1>酵素法
本発明は、γ−グルタミルバリン合成酵素を利用してγ-Glu-Val-Glyを酵素的に製造する方法を提供する。同方法を、「本発明のγ-Glu-Val-Glyの製造法(酵素法)」ともいう。
本発明においては、γ−グルタミルバリン合成酵素を利用することにより、GluとValとを反応させ、γ-Glu-Valを生成することができる。すなわち、本発明は、(A)γ−グルタミルバリン合成酵素をGluおよびValに作用させることによりγ-Glu-Valを生成する工程、を含むγ-Glu-Valの製造法を提供する。同方法を、「本発明のγ-Glu-Valの製造法(酵素法)」ともいう。生成したγ-Glu-Valは、適宜、反応液から回収することができる。
さらに、生成したγ-Glu-Valを原料としてγ-Glu-Val-Glyを製造することができる。γ-Glu-Valを原料としてγ-Glu-Val-Glyを製造する方法としては、グルタチオン合成酵素を利用する方法が知られている(特開2012-85637)。具体的には、グルタチオン合成酵素を利用することにより、γ-Glu-ValとGlyとを反応させ、γ-Glu-Val-Glyを生成することができる。すなわち、本発明のγ-Glu-Val-Glyの製造法(酵素法)の一態様(「第1の態様」ともいう)は、(A)γ−グルタミルバリン合成酵素をGluおよびValに作用させることによりγ-Glu-Valを生成する工程、および(B)グルタチオン合成酵素を工程(A)で生成したγ-Glu-ValおよびGlyに作用させることによりγ-Glu-Val-Glyを生成する工程、を含むγ-Glu-Val-Glyの製造法である。
第1の態様において、工程(A)と工程(B)は、それぞれ別個に実施してもよく、一部または全部の期間において同時に実施してもよい。すなわち、例えば、工程(A)と工程(B)を同時に開始してもよく、工程(A)の進行中または完了後に工程(B)を開始してもよい。反応開始時にγ−グルタミルバリン合成酵素、グルタチオン合成酵素、Glu、Val、およびGlyを反応系に共存させることで、工程(A)と工程(B)を同時に開始することができる。また、グルタチオン合成酵素および/またはGlyが反応系に共存していない条件下で工程(A)を開始し、工程(A)の進行中または完了後にグルタチオン合成酵素および/またはGlyを反応系に共存させることで、工程(B)を開始することができる。また、工程(A)で生成したγ-Glu-Valを回収し、回収したγ-Glu-Valを用いて工程(B)を実施してもよい。γ-Glu-Valは、適宜、精製、希釈、濃縮、乾燥、溶解等の処理に供してから、工程(B)に用いてもよい。
なお、本発明のγ-Glu-Valの製造法(酵素法)の工程(A)は、例えば、第1の態様の工程(A)を単独で実施するのと同様の態様で実施できる。
また、本発明においては、γ−グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を利用することにより、GluとValとGlyとを反応させ、γ-Glu-Val-Glyを生成することができる。すなわち、本発明のγ-Glu-Val-Glyの製造法(酵素法)の別の態様(「第2の態様」ともいう)は、(C)γ−グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を、Glu、Val、およびGlyに作用させることにより、γ-Glu-Val-Glyを生成する工程、を含むγ-Glu-Val-Glyの製造法である。第2の態様においては、γ−グルタミルバリン合成酵素、グルタチオン合成酵素、Glu、Val、およびGlyを反応系に共存させることにより、γ−グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を、Glu、Val、およびGlyにまとめて作用させ、γ-Glu-Val-Glyを製造することができる。
本発明の方法において、γ−グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を総称して「酵素」ともいう。Glu、Val、およびGlyを総称して「アミノ酸」ともいう。γ-Glu-Valおよびγ-Glu-Val-Glyを総称して「ペプチド」ともいう。Glu、Val、Gly、およびγ-Glu-Valを総称して「基質」ともいう。「基質」には、特記しない限り、さらにATPを含めてよい。酵素とそれに対応する基質との反応を「酵素反応」ともいう。
本発明の方法に用いられる各酵素の態様は上述した通りである。すなわち、各酵素としては、例えば、精製された酵素、酵素を含有する任意の画分、またはそれらの組み合わせを用いることができる。各酵素としては、1種の酵素を用いてもよく、2種またはそれ以上の酵素を組み合わせて用いてもよい。
アミノ酸としては、市販品を用いてもよく、適宜製造して取得したものを用いてもよい。アミノ酸の製造方法は特に制限されず、例えば、公知の方法を利用できる。アミノ酸は、例えば、化学合成、酵素反応、またはその組み合わせにより製造することができる。また、アミノ酸は、例えば、当該アミノ酸の生産能を有する微生物を培養し、培養物から当該アミノ酸を回収することにより、製造することができる。アミノ酸の生産能を有する微生物としては、例えば、後述するようなアミノ酸生産菌を利用できる。また、アミノ酸は、例えば、当該アミノ酸を含有する農水畜産物から回収することにより、製造することができる。アミノ酸としては、所望の程度に精製された精製品を用いてもよく、当該アミノ酸を含有する素材を用いてもよい。アミノ酸を含有する素材は、酵素が当該アミノ酸に作用できる態様で当該アミノ酸を含有する限り特に制限されない。アミノ酸を含有する素材として、具体的には、例えば、当該アミノ酸の生産能を有する微生物を培養して得られた培養物、該培養物から分離した培養上清、該培養物から分離した菌体、それらの濃縮物(濃縮液)や濃縮乾燥物等の処理物が挙げられる。
本発明の方法において、アミノ酸およびペプチドは、いずれも、特記しない限り、フリー体、もしくはその塩、またはそれらの混合物であってよい。すなわち、「アミノ酸」という用語は、特記しない限り、フリー体のアミノ酸、もしくはその塩、またはそれらの混合物を意味してよい。また、「ペプチド」という用語は、特記しない限り、フリー体のペプチド、もしくはその塩、またはそれらの混合物を意味してよい。塩は、化学的に許容されるものであれば特に制限されない。また、製造されるγ-Glu-Val-Glyを経口用途(例えば飲食品への添加用途)に用いる場合、γ-Glu-Val-Glyの塩は、化学的に許容される可食性のものであれば特に制限されない。「化学的に許容される可食性の塩」として、具体的には、例えば、カルボキシル基等の酸性基に対しては、アンモニウム塩、ナトリウム、カリウム等のアルカリ金属との塩、カルシウム、マグネシウム等のアルカリ土類金属との塩、アルミニウム塩、亜鉛塩、トリエチルアミン、エタノールアミン、モルホリン、ピロリジン、ピペリジン、ピペラジン、ジシクロヘキシルアミン等の有機アミンとの塩、アルギニン、リジン等の塩基性アミン酸との塩を挙げることができる。また、「化学的に許容される可食性の塩」として、具体的には、例えば、塩基性基に対しては、塩酸、硫酸、リン酸、硝酸、臭化水素酸等の無機酸との塩、酢酸、クエン酸、安息香酸、マレイン酸、フマル酸、酒石酸、コハク酸、タンニン酸、酪酸、ヒベンズ酸、パモ酸、エナント酸、デカン酸、テオクル酸、サリチル酸、乳酸、シュウ酸、マンデル酸、リンゴ酸等の有機カルボン酸との塩、メタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸、p−トルエンスルホン酸等の有機スルホン酸との塩を挙げることができる。塩としては、1種の塩を用いてもよく、2種またはそれ以上の塩を組み合わせて用いてもよい。
酵素反応は、バッチ式で実施してもよく、カラム式で実施してもよい。バッチ式の場合は、反応容器内の反応液中で、酵素と基質を混合することにより、酵素反応を実施できる。酵素反応は、静置で実施してもよく、撹拌下で実施してもよい。カラム式の場合は、固定化菌体又は固定化酵素を充填したカラムに基質を含有する反応液を通液することにより、酵素反応を実施できる。反応液としては、必要な成分を含有する、水や緩衝液等を用いることができる。反応液は、例えば、酵素、基質、ATP、2価の金属イオンを含有していてよい。酵素反応に用いられる成分の組み合わせは、実施する工程の種類およびその実施態様(複数の工程を同時に実施するか等)に応じて適宜選択することができる。
γ−グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素は、いずれも、酵素反応にATPを利用する。よって、反応系には、ATPを適宜供給する。すなわち、反応系(反応液)は、ATPを含有していてよい。前記工程(A)〜(C)は、いずれも、ATPの存在下で実施することができる。ATPの供給方法は、酵素反応にATPを利用できる限り特に制限されない。ATPは、例えば、粉末あるいは水溶液等の任意の形態で、反応液に添加することができる。また、ATPは、例えば、ATPを生成または再生する方法により反応系に供給されてもよい。ATPを生成または再生する方法としては、コリネバクテリウム属細菌を利用して炭素源からATPを供給させる方法(Hori, H et al., Appl. Microbiol. Biotechnol. 48(6): 693-698 (1997))、酵母菌体とグルコースを利用してATPを再生する方法(Yamamoto, S et al., Biosci. Biotechnol. Biochem. 69(4): 784-789 (2005))、ホスホエノールピルビン酸とピルビン酸キナーゼを利用してATPを再生する方法(C. Aug'e and Ch. Gautheron, Tetrahedron Lett. 29:789-790 (1988))、ポリリン酸とポリリン酸キナーゼを利用してATPを再生する方法(Murata, K et al., Agric. Biol. Chem. 52(6): 1471-1477 (1988))等が知られている。
また、例えば、γ−グルタミルバリン合成酵素は、通常、酵素反応に2価の金属イオンを要求する。よって、反応系(反応液)は、2価の金属イオンを含有していてよい。前記工程(A)〜(C)は、いずれも、2価の金属イオンの存在下で実施することができる。好ましい2価の金属イオンとしては、Mg2+やMn2+が挙げられる。2価の金属イオンの濃度は、例えば、1〜200mMであってよい。
反応条件(反応液のpH、反応温度、反応時間、基質や酵素等の各種成分の濃度等)は、γ-Glu-Val-Glyが生成する限り特に制限されない。
反応液のpHは、例えば、通常6.0〜10.0、好ましくは6.5〜9.0であってよい。
反応温度は、例えば、通常15〜50℃、好ましくは15〜45℃、より好ましくは20〜40℃であってよい。
反応時間は、第1の態様の工程(A)および工程(B)のそれぞれについて、例えば、5分〜200時間であってよい。反応時間は、第2の態様の工程(C)について、例えば、5分〜200時間であってよい。反応液の通液速度は、例えば、反応時間が上記例示した反応時間の範囲となるような速度であってよい。
反応液中の各基質の濃度は、例えば、通常0.1〜2000mM、好ましくは1〜2000mM、より好ましくは10〜1000mMであってよい。
反応液中の各基質のモル比は、第1の態様の工程(A)については、例えば、通常、Glu:Val:ATP=1:1:1であってよく、任意の基質の比率を0.1〜10に変化させてもよい。すなわち、例えば、Glu:Val:ATP=0.1〜10:0.1〜10:0.1〜10であってよい。反応液中の各基質のモル比は、第1の態様の工程(B)については、例えば、通常、γ-Glu-Val:Gly:ATP=1:1:1であってよく、任意の基質の比率を0.1〜10に変化させてもよい。すなわち、例えば、γ-Glu-Val:Gly:ATP=0.1〜10:0.1〜10:0.1〜10であってよい。反応液中の各基質のモル比は、第2の態様の工程(C)については、例えば、通常、Glu:Val:Gly:ATP=1:1:1:2であってよく、任意の基質の比率を0.1〜10に変化させてもよく、ATPの比率を0.2〜20に変化させてもよい。すなわち、例えば、Glu:Val:Gly:ATP=0.1〜10:0.1〜10:0.1〜10:0.2〜20であってよい。なお、第1の態様において工程(A)と工程(B)を同時に実施する場合、第1の態様における各基質のモル比については、適宜、第2の態様における各基質のモル比を参考にしてもよい。
酵素の使用量は、例えば、酵素活性に基づいて設定することができる。γ−グルタミルバリン合成酵素の使用量は、GluおよびValの合計量1 mmolに対して、例えば、γ-Glu-Val生成活性に換算して、通常0.01〜1000 U、好ましくは0.1〜500 U、より好ましくは0.1〜100 Uであってよい。グルタチオン合成酵素の使用量は、第1の態様の工程(B)については、γ-Glu-ValおよびGlyの合計量1 mmolに対して、例えば、γ-Glu-Val-Gly生成活性に換算して、通常0.01〜1000 U、好ましくは0.1〜500 U、より好ましくは0.1〜100 Uであってよい。グルタチオン合成酵素の使用量は、第2の態様の工程(C)については、Gluの半量、Valの半量、およびGlyの全量の合計量1 mmolに対して、例えば、γ-Glu-Val-Gly生成活性に換算して、通常0.01〜1000 U、好ましくは0.1〜500 U、より好ましくは0.1〜100 Uであってよい。なお、第1の態様において工程(A)と工程(B)を同時に実施する場合、第1の態様におけるグルタチオン合成酵素の使用量については、適宜、第2の態様におけるグルタチオン合成酵素の使用量を参考にしてもよい。
いずれの態様においても、酵素反応の過程において、基質、酵素、および/またはその他の成分を単独で、あるいは任意の組み合わせで、追加的に反応系に添加してもよい。これらの成分は、1回または複数回添加されてもよく、連続的に添加されてもよい。また、反応条件は、酵素反応の開始から終了まで均一であってもよく、酵素反応の過程において変化してもよい。「反応条件が酵素反応の過程において変化する」とは、反応条件が時間的に変化することに限られず、反応条件が空間的に変化することを含む。「反応条件が空間的に変化する」とは、例えば、カラム式で酵素反応を実施する場合に、反応温度や酵素濃度等の反応条件が流路上の位置に応じて異なっていることをいう。
このようにして酵素反応を実施することにより、γ-Glu-Val-Glyを含有する反応液が得られる。γ-Glu-Val-Glyが生成したことは、化合物の検出または同定に用いられる公知の手法により確認することができる。そのような手法としては、例えば、HPLC、LC/MS、GC/MS、NMRが挙げられる。これらの手法は、1種を単独で用いてもよく、2種またはそれ以上を適宜組み合わせて用いてもよい。γ-Glu-Val-Glyは、適宜、反応液から回収することができる。γ-Glu-Val-Glyの回収は、化合物の分離精製に用いられる公知の手法により行うことができる。そのような手法としては、例えば、イオン交換クロマトグラフィー、逆相高速液体クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー等の各種クロマトグラフィー、溶液からの結晶化、再結晶が挙げられる。これらの手法は、1種を単独で用いてもよく、2種またはそれ以上を適宜組み合わせて用いてもよい。回収されるγ-Glu-Val-Glyは、γ-Glu-Val-Gly以外の成分、例えばγ-Glu-Val-Glyの製造に用いられた成分や水分等、を含んでいてもよい。γ-Glu-Val-Glyは、所望の程度に精製されていてよい。γ-Glu-Val-Glyは、例えば、30%(w/w)以上、50%(w/w)以上、70%(w/w)以上、80%(w/w)以上、90%(w/w)以上、または95%(w/w)以上の純度に精製されてよい。また、γ-Glu-Valの回収も、γ-Glu-Val-Glyの回収と同様に行うことができる。
<4−2>発酵法
本発明は、γ−グルタミルバリン合成酵素を利用してγ-Glu-Val-Glyを発酵により製造する方法を提供する。同方法を、「本発明のγ-Glu-Val-Glyの製造法(発酵法)」ともいう。
本発明においては、γ−グルタミルバリン合成酵素を有する微生物を利用することにより、GluとValからγ-Glu-Valを発酵生産することができる。すなわち、本発明は、(A)γ−グルタミルバリン合成酵素を有する微生物を培地で培養することによりGluおよびValからγ-Glu-Valを生成する工程、を含むγ-Glu-Valの製造法を提供する。同方法を、「本発明のγ-Glu-Valの製造法(発酵法)」ともいう。生成したγ-Glu-Valは、適宜、培養物から回収することができる。
さらに、グルタチオン合成酵素を有する微生物を利用することにより、γ-Glu-ValとGlyからγ-Glu-Val-Glyを発酵生産することができる。すなわち、本発明のγ-Glu-Val-Glyの製造法(発酵法)の一態様(「第3の態様」ともいう)は、(A)γ−グルタミルバリン合成酵素を有する微生物を培地で培養することによりGluおよびValからγ-Glu-Valを生成する工程、および(B)グルタチオン合成酵素を有する微生物を培地で培養することにより工程(A)で生成したγ-Glu-ValおよびGlyからγ-Glu-Val-Glyを生成する工程、を含むγ-Glu-Val-Glyの製造法である。
第3の態様において、工程(A)と工程(B)は、それぞれ別個に実施してもよく、一部または全部の期間において同時に実施してもよい。すなわち、例えば、工程(A)と工程(B)を同時に開始してもよく、工程(A)の進行中または完了後に工程(B)を開始してもよい。また、第3の態様において、工程(A)と工程(B)は、γ−グルタミルバリン合成酵素を有する微生物と、それとは別個の、グルタチオン合成酵素を有する微生物を用いて実施してもよく、γ−グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素の両方を有する単一の微生物を用いて実施してもよい。例えば、γ−グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素の両方を有する微生物を利用し、Glu、Val、およびGlyが利用可能な状態で培養を実施すれば、工程(A)と工程(B)を同時に実施することができる。また、工程(A)で生成したγ-Glu-Valを回収し、回収したγ-Glu-Valを培地に添加して工程(B)を実施してもよい。γ-Glu-Valは、適宜、精製、希釈、濃縮、乾燥、溶解等の処理に供してから、工程(B)に用いてもよい。
なお、本発明のγ-Glu-Valの製造法(発酵法)の工程(A)は、例えば、第3の態様の工程(A)を単独で実施するのと同様の態様で実施できる。
また、本発明においては、γ−グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素の両方を有する微生物を利用することにより、GluとValとGlyとからγ-Glu-Val-Glyを発酵生産することができる。すなわち、本発明のγ-Glu-Val-Glyの製造法(発酵法)の別の態様(「第4の態様」ともいう)は、(C)γ−グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を有する微生物を培地で培養することによりGlu、Val、およびGlyからγ-Glu-Val-Glyを生成する工程、を含むγ-Glu-Val-Glyの製造法である。
発酵法において、酵素、アミノ酸、ペプチド、基質、酵素反応等の用語は、酵素法と同様の意味で使用する。また、γ−グルタミルバリン合成酵素を有する微生物、グルタチオン合成酵素を有する微生物、およびγ−グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を有する微生物を総称して「微生物」ともいう。
基質となる各アミノ酸の供給方法は、酵素反応に当該アミノ酸を利用できる限り特に制限されない。各アミノ酸は、例えば、各工程で用いられる微生物により生合成されてもよく、培地に添加されてもよく、その組み合わせであってもよい。すなわち、例えば、Glu、Val、およびGlyの全てが微生物により生合成されてもよく、Glu、Val、およびGlyの全てが培地に添加されてもよい。また、例えば、Glu、Val、およびGlyの内、1種または2種のアミノ酸が微生物により生合成され、他のアミノ酸が培地に添加されてもよい。Glu、Val、およびGlyのいずれも、微生物により生合成され、且つ、培地に添加されてもよい。
すなわち、本発明のγ-Glu-Valの製造法(発酵法)の一態様は、例えば、(A1)γ−グルタミルバリン合成酵素を有する微生物をGluおよびValを含有する培地で培養することによりγ-Glu-Valを生成する工程、を含むγ-Glu-Valの製造法であってもよく、(A2)γ−グルタミルバリン合成酵素を有し、且つ、GluおよびValの生産能を有する微生物を培地で培養することによりγ-Glu-Valを生成する工程、を含むγ-Glu-Valの製造法であってもよい。
また、第3の態様の一態様は、例えば、(A1)と(A2)のいずれか、および、(B1)と(B2)のいずれかを含むγ-Glu-Val-Glyの製造法であってもよい:
(A1)γ−グルタミルバリン合成酵素を有する微生物をGluおよびValを含有する培地で培養することによりγ-Glu-Valを生成する工程;
(A2)γ−グルタミルバリン合成酵素を有し、且つ、GluおよびValの生産能を有する微生物を培地で培養することによりγ-Glu-Valを生成する工程;
(B1)グルタチオン合成酵素を有する微生物を工程(A1)または(A2)で生成したγ-Glu-ValおよびGlyを含有する培地で培養することによりγ-Glu-Val-Glyを生成する工程;
(B2)グルタチオン合成酵素を有し、且つ、Glyの生産能を有する微生物を工程(A1)または(A2)で生成したγ-Glu-Valを含有する培地で培養することによりγ-Glu-Val-Glyを生成する工程。
また、第4の態様の一態様は、例えば、(C1)γ−グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を有する微生物をGlu、Val、およびGlyを含有する培地で培養することによりγ-Glu-Val-Glyを生成する工程、を含むγ-Glu-Val-Glyの製造法であってもよく、(C2)γ−グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を有し、且つ、Glu、Val、およびGlyの生産能を有する微生物を培地で培養することによりγ-Glu-Val-Glyを生成する工程、を含むγ-Glu-Val-Glyの製造法であってもよい。
γ−グルタミルバリン合成酵素を有する微生物としては、上述したようなγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子を有する微生物を、そのまま、あるいは適宜改変して用いることができる。グルタチオン合成酵素を有する微生物としては、上述したようなグルタチオン合成酵素遺伝子を有する微生物を、そのまま、あるいは適宜改変して用いることができる。γ−グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素を有する微生物としては、上述したようなγ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子とグルタチオン合成酵素遺伝子の両方を有する微生物を、そのまま、あるいは適宜改変して用いることができる。
アミノ酸の生産能を有する微生物は、本来的にアミノ酸の生産能を有するものであってもよく、アミノ酸の生産能を有するように改変されたものであってもよい。アミノ酸の生産能を有する微生物は、微生物にアミノ酸生産能を付与することにより、または、微生物のアミノ酸生産能を増強することにより、取得できる。γ−グルタミルバリン合成酵素遺伝子および/またはグルタチオン合成酵素遺伝子の導入等の酵素生産能の付与または増強と、アミノ酸生産能の付与または増強とは、いずれを先に実施してもよい。すなわち、γ−グルタミルバリン合成酵素および/またはグルタチオン合成酵素を有し、且つ、アミノ酸の生産能を有する微生物は、γ−グルタミルバリン合成酵素および/またはグルタチオン合成酵素を有する微生物を、アミノ酸生産能を有するように改変することにより取得してもよく、アミノ酸生産能を有する微生物を、γ−グルタミルバリン合成酵素および/またはグルタチオン合成酵素を有するように改変することにより取得してもよい。L−アミノ酸生産能の付与または増強は、従来、コリネ型細菌又はエシェリヒア属細菌等のアミノ酸生産菌の育種に採用されてきた方法により行うことができる(アミノ酸発酵、(株)学会出版センター、1986年5月30日初版発行、第77〜100頁参照)。そのような方法としては、例えば、栄養要求性変異株の取得、L−アミノ酸のアナログ耐性株の取得、代謝制御変異株の取得、L−アミノ酸の生合成系酵素の活性が増強された組換え株の創製が挙げられる。また、L−アミノ酸生産能の付与又は増強は、目的のL−アミノ酸の生合成経路から分岐して目的のL−アミノ酸以外の化合物を生成する反応を触媒する酵素の活性を低下させることによっても行うことができる。
L−グルタミン酸生産菌としては、コリネバクテリウム・グルタミカム(ブレビバクテリウム・ラクトファーメンタム)ATCC13869株より取得されたodhA欠損株に、V197M変異を有するmviN遺伝子を導入した組換え株(特開2010-161970)、ブレビバクテリウム・ラクトファーメンタム由来gltA(クエン酸シンターゼ)遺伝子を導入したパントエア・アグロメランスAJ13355株(特許第4285582号)、グルタミンシンセターゼの397位のチロシン残基が他のアミノ酸残基に置換されたグルタミンシンセターゼを有するエシェリヒア属細菌(米国特許出願公開第2003-0148474号明細書)などが例示できる。L−バリン生産菌としては、エシェリヒア・コリVL1970株(米国特許第5658766号)、エシェリヒア属に属し、生育のためにリポ酸を要求する変異および/またはH+-ATPaseを欠損する変異を有するエシェリヒア属細菌、および、これらの性質に加えて、少なくともilvG、ilvM、ilvE、およびilvDの各遺伝子を発現し、且つ、スレオニンデアミナーゼ活性を発現しないilvGMEDAオペロンを含むDNA断片が細胞内に導入されたエシェリヒア属細菌(WO96/06926)などが例示できる。すなわち、例えば、これらの改変を微生物に導入することにより、アミノ酸生産能を付与または増強できる。
また、微生物は、培地中に添加されたアミノ酸を取り込む能力が向上するよう改変されていてもよい。また、微生物は、その利用態様に応じて、生成したγ-Glu-Valを菌体外に排出する能力が向上するよう改変されていてもよく、培地中に添加されたγ-Glu-Valを取り込む能力が向上するよう改変されていてもよい。また、微生物は、生成したγ-Glu-Val-Glyを菌体外に排出する能力が向上するよう改変されていてもよい。
培養条件は、微生物が増殖でき、γ-Glu-Val-Glyが生成する限り、特に制限されない。培養条件については、上述したγ−グルタミルバリン合成酵素の製造法における培養条件の記載を参照できる。
γ−グルタミルバリン合成酵素およびグルタチオン合成酵素は、いずれも、酵素反応にATPを利用する。よって、反応系には、ATPを適宜供給する。すなわち、反応系は、ATPを含有していてよい。前記工程(A)〜(C)は、いずれも、ATPの存在下で実施することができる。ATPの供給方法は、酵素反応にATPを利用できる限り特に制限されない。ATPは、例えば、各工程で用いられる微生物により生成されてもよく、上述したようなATPを生成または再生する方法により反応系に供給されてもよい。ATPの供給には、例えば、通常のエネルギー代謝によるATP再生系が強化された微生物やポリリン酸キナーゼの作用でATPを再生する能力を有する微生物を培養液中に共存させる方法等の共培養系(特公平7-16431、特公平6-69386)が好適に利用できる。
また、例えば、γ−グルタミルバリン合成酵素は、通常、酵素反応に2価の金属イオンを要求する。よって、反応系は、2価の金属イオンを含有していてよい。前記工程(A)〜(C)は、いずれも、2価の金属イオンの存在下で実施することができる。
アミノ酸を含有する培地を用いる場合、アミノ酸は、培養開始時から培地に含まれていてもよく、培養途中の任意の時点で培地に添加されてもよい。添加のタイミングは、培養時間等の諸条件に応じて適宜変更できるが、一例としては、培養終了時の好ましくは0〜50時間前、より好ましくは0.1〜24時間前、特に好ましくは0.5〜6時間前であってよい。アミノ酸は、1回または複数回添加されてもよく、連続的に添加されてもよい。培地中の各アミノ酸の濃度は、例えば、通常0.1〜2000mM、好ましくは1〜2000mM、より好ましくは10〜1000mMであってよい。また、培地中の各基質のモル比については、酵素法における反応液中の各基質のモル比に関する記載を準用してもよい。
このようにして培養を行うことにより、γ-Glu-Val-Glyを含む培養物が得られる。γ-Glu-Val-Glyが生成したことは、上述したように、化合物の検出または同定に用いられる公知の手法により確認することができる。γ-Glu-Val-Glyは、適宜、培養物から回収することができる。γ-Glu-Val-Glyの回収は、上述したように、化合物の分離精製に用いられる公知の手法により行うことができる。なお、菌体内にL−アミノ酸が蓄積する場合には、例えば、菌体を超音波などにより破砕し、遠心分離によって菌体を除去して得られる上清から、イオン交換樹脂法などによってγ-Glu-Val-Glyを回収することができる。
また、微生物が酵母であり、γ-Glu-Val-Glyが菌体内に蓄積する場合、同酵母は、例えば、γ-Glu-Val-Glyを含有する酵母エキスの製造に利用できる。すなわち、本発明は、同酵母を原料として用いて酵母エキスを調製することを含む、γ-Glu-Abuを含有する酵母エキスの製造法を提供する。酵母からの酵母エキスの調製は、通常の酵母エキスの調製と同様にして行えばよい。酵母エキスは、酵母菌体を熱水抽出したものを処理したものでもよいし、酵母菌体を消化したものを処理したものでもよい。また、必要に応じて、得られた酵母エキスを濃縮してもよいし、乾燥し粉末の形態にしてもよい。
以下、本発明を実施例に基づいて更に具体的に説明する。
〔実施例1〕コクリア・ロゼア(AJ3132)無細胞抽出液のγ-Glu-Val合成活性の検出
(1)無細胞抽出液の調製
コクリア・ロゼア(AJ3132)の培養には、培地1(0.5%(w/v)グルコース、1%(w/v)酵母エキス、1%(w/v)ポリペプトン、0.5%(w/v)NaCl、(pH7.0))を用いた。コクリア・ロゼア(AJ3132)を、1.5%(w/v)寒天を含む培地1で、30℃で終夜培養した。得られた菌体を18mlの培地1に接種し、試験管に3mlずつ分注し、30℃、120往復/分で終夜培養した。菌体を遠心分離(12,000g、5分)により集菌し、生理食塩水で洗浄し、生理食塩水を用いて4mlの菌体懸濁液を調製した。菌体懸濁液をマルチビーズショッカーMB701CAJ(S)型(安井器械社製)を用いて破砕(ビーズ径:0.1mm、2,700rpm、ON/OFF=1分/1分、計6分)後、遠心分離(12,000g、10分)した。遠心上清をアミコンウルトラ フィルターユニット−3,000NMWL(メルクミリポア社製)で限外濾過した。フィルター非透過液を回収し、全量4mlとなるように生理食塩水で希釈し、無細胞抽出液とした。
(2)γ-Glu-Val合成活性の検出
0.12mlの反応液1(100mmol/L Tris-HCl緩衝液、50mmol/L Glu、50mmol/L Val、10mmol/L アデノシン三リン酸(ATP)、10mmol/L硫酸マグネシウム、pH8.5)に0.08mlの無細胞抽出液を添加して、全量0.2mlで酵素反応を開始した。対照として、反応液1に無細胞抽出液の代わりに生理食塩水を添加した条件で酵素反応を実施した。反応は30℃で17時間実施し、反応終了後にγ-Glu-ValをHPLCで定量した。
γ-Glu-Valの定量条件は以下の通りである。カラムには、Phenomenex社製Synergi 4μ Hydro-RP 80A(粒子径4ミクロン、内径4.6mm、長さ250mm)を用いた。溶離液には、A液(50mMリン酸二水素ナトリウム(pH2.5、リン酸によってpH調整))、及び、B液(A液とアセトニトリルの1:1(v/v)の混合液)を用いた。カラム温度は40℃、UV検出波長は210nmとし、溶離液のグラジエントは、0〜5分はB液0〜5%、5〜15分はB液5%、15〜30分はB液5〜80%、30〜30.1分はB液80〜0%、30.1〜50分はB液0%とした。
結果を表1に示す。コクリア・ロゼア(AJ3132)の無細胞抽出液によるγ-Glu-Valの生成が認められた。すなわち、コクリア・ロゼア(AJ3132)の無細胞抽出液にγ-Glu-Val合成活性が検出された。
Figure 2015133547
〔実施例2〕コクリア・ロゼア(AJ3132)由来γ-Glu-Val合成酵素の精製
実施例2において、γ-Glu-Val合成活性は、実施例1に記載の反応液1に酵素溶液(無細胞抽出液または活性画分)を適量添加し、実施例1と同様の手順で測定した(特記しない限り、以降の実施例についても同じ)。実施例2においては、本条件で1分間に1μmolのγ-Glu-Valを生成する酵素活性を1 Uのγ-Glu-Val合成活性とした。
(1)無細胞抽出液の調製
コクリア・ロゼア(AJ3132)を、1.5%(w/v)寒天を含む培地1で、30℃で終夜培養した。得られた菌体を4Lの培地1に接種し、500ml容の坂口フラスコに100mlずつ分注し、30℃、110往復/分で16時間培養した。菌体を遠心分離(12,000g、5分)により集菌し、20mMリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)で洗浄し、同緩衝液を用いて600mlの菌体懸濁液を調製した。菌体懸濁液をマルチビーズショッカー(安井器械社製)を用いて破砕後、遠心分離(400g、1分)し、得られた上清を更に遠心分離(29,100g、20分)した。得られた上清を超遠心分離(274,000g、30分)に供し、上清410mlを回収し、無細胞抽出液とした(総タンパク質量:1665mg、総活性(総γ-Glu-Val合成活性):6.9U)。
(2)陰イオン交換クロマトグラフィー
上記(1)にて得られた無細胞抽出液を、予め20mMリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)で平衡化したHiLoad 26/10 Q Sepharose High Performanceカラム(GEヘルスケア社製)にアプライし、0-1M塩化ナトリウムの直線的濃度勾配により酵素を溶出した。溶出画分の内、γ-Glu-Val合成活性を示した画分を、活性画分として集めた(総タンパク質量:128mg、総活性:3.6U)。
(3)疎水性相互作用クロマトグラフィー
上記(2)にて得られた活性画分を、等量の2.4M硫酸アンモニウムを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH 6.0)と混和し、4℃、3時間緩やかに撹拌した後、遠心分離(12,000g、5分)により上清を得た(総タンパク質量:88mg、総活性:3.5U)。得られた上清を、予め1.2M硫酸アンモニウムを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH 6.0)で平衡化したHiTrap Phenyl High Performance 5mlカラム(GEヘルスケア社製)にアプライし、1-0M硫酸アンモニウムの直線的濃度勾配により酵素を溶出した。溶出画分の内、γ-Glu-Val合成活性を示した画分を、活性画分として集めた(総タンパク質量:2.7mg、総活性:1.7U)。
(4)ゲル濾過クロマトグラフィー
上記(3)にて得られた活性画分を、アミコンウルトラ フィルターユニット−10,000NMWL(メルクミリポア社製)により濃縮し、予め20 mMリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)で平衡化したHiLoad 16/600 Superdex 200pgカラム(GEヘルスケア社製)にアプライし、酵素を溶出した。溶出画分の内、γ-Glu-Val合成活性を示した画分を、活性画分として集めた(総タンパク質量:0.3mg、総活性:0.8U)。
(5)疎水性相互作用クロマトグラフィー
上記(4)で得られた活性画分を、等量の2.4M硫酸アンモニウムを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)と混和し、予め1.2M硫酸アンモニウムを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)で平衡化したRESOURCE PHE 1mlカラム(GEヘルスケア社製)にアプライし、1-0M硫酸アンモニウムの直線的濃度勾配により酵素を溶出した。溶出画分の内、γ-Glu-Val合成活性を示した画分を集め、精製酵素とした。精製酵素をポリアクリルアミドゲル電気泳動に供し、クーマシーブリリアントブルー(CBB)染色液でゲルを染色した。活性を示す画分と泳動像より、γ-Glu-Val合成酵素に該当する分子量約40,000のバンドを特定した。
〔実施例3〕コクリア・ロゼア(AJ3132)由来γ-Glu-Val合成酵素の部分アミノ酸配列および同酵素をコードする遺伝子の塩基配列の決定
実施例2で得られた精製酵素をSDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動後、PVDF膜に転写し、プロテインシークエンサーに供し、10残基のN末端アミノ酸配列(配列番号1)を決定した。加えて、実施例2で得られた精製酵素をSDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動後、トリプシンにより消化し、逆相HPLCにより分離した断片をプロテインシークエンサーに供し、14残基の内部アミノ酸配列(配列番号2)を決定した。
次いで、コクリア・ロゼア(AJ3132)のゲノムDNAをNextera XT(イルミナ社製)を用いて調製し、付随のプロトコールに準拠してMiseq(イルミナ社製)にて配列解析したところ、N末端アミノ酸配列および内部アミノ酸配列をそれぞれコードする塩基配列を含むORF領域(配列番号3)が見出された。
〔実施例4〕コクリア・ロゼア(AJ3132)由来γ-Glu-Val合成酵素のエシェリヒア・コリによる発現
(1)コクリア・ロゼア(AJ3132)由来γ-Glu-Val合成酵素発現菌株の構築
実施例3で見出されたコクリア・ロゼア(AJ3132)由来γ-Glu-Val合成酵素をコードする遺伝子(配列番号3のORF領域)の発現プラスミドpET-KrogshAを以下の手順で構築した。なお、同遺伝子の開始コドンはgtgであったため、pET-KrogshAの構築に際し、開始コドンをatgに置換した。
初めに、コクリア・ロゼア(AJ3132)のゲノムDNAを鋳型として、ポリメラーゼとしてKOD-plus-(東洋紡社製)を使用して、製造元のプロトコールに従って98℃で30秒、67℃で1分の条件で30サイクルのPCRを行い、配列番号3のORF領域約1.1kbを増幅した。プライマーとしては、配列番号4および配列番号5のプライマーの組み合わせを使用した。次に、得られたPCR産物をNdeI/HindIIIで消化した後に、アガロースゲル電気泳動にて目的の約1.1kbのDNAを切り出した後、予めNdeI/HindIIIで消化したpET21a(+)とライゲーションコンビニエンスキット(ニッポンジーン社製)を用いて連結した。該反応液でエシェリヒア・コリJM109株を形質転換し、100mg/LのAmpを含むLB寒天培地(1.0%(w/v)ペプトン、0.5%(w/v)酵母エキス、1.0%(w/v)NaCl、1.5%(w/v)寒天)に塗布後、30℃で終夜培養した。生育してきた形質転換体のコロニーから公知の方法に従ってプラスミドを抽出し、3100ジェネティックアナライザー(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて塩基配列の確認を行い、目的の構造を持つプラスミドをpET-KrogshAと名付けた。得られたpET-KrogshAでエシェリヒア・コリBL21(DE3)を形質転換し、pET-KrogshAを有する形質転換体を得た。この形質転換体を、エシェリヒア・コリBL21(DE3)/pET-KrogshAと命名した。
(2)エシェリヒア・コリにより発現させたコクリア・ロゼア(AJ3132)由来γ-Glu-Val合成酵素の精製
エシェリヒア・コリBL21(DE3)/pET-KrogshAを、100mg/LのAmpを含むLB寒天培地で、30℃で終夜培養した。得られた菌体を200mlのOvernight ExpressTM Instant TB培地(Novagen社製)に接種し、500ml容の坂口フラスコに100mlずつ分注し、37℃、110往復/分で16時間培養した。菌体を遠心分離(12,000g、5分)により集菌した後、20mMリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)で洗菌し、同緩衝液を用いて菌体懸濁液を調製した。菌体懸濁液を超音波破砕処理に供して菌体を破砕し、遠心分離(29,100g、20分)し、得られた上清を無細胞抽出液とした。
得られた無細胞抽出液を、予め20mMリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)で平衡化したHiLoad 16/10 Q Sepharose High Performanceカラム(GEヘルスケア製)にアプライし、0-1M塩化ナトリウムの直線的濃度勾配により酵素を溶出し、活性画分を得た。
得られた活性画分を、等量の2.4M硫酸アンモニウムを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH 6.0)と混和し、4℃、3時間緩やかに撹拌した後、遠心分離(12,000g、5分)により上清を得た。得られた上清を、予め1.2M硫酸アンモニウムを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH 6.0)で平衡化した2個連結させたHiTrap Phenyl High Performance 5mlカラム(GEヘルスケア製)にアプライし、1-0M硫酸アンモニウムの直線的濃度勾配により酵素を溶出し、活性画分を得た。
得られた活性画分を、15%(w/v)グリセロールを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH 6.0)に対して透析した。透析後の酵素溶液をポリアクリルアミドゲル電気泳動に供し、CBB染色液でゲルを染色したところ、分子量約40,000の位置に均一なバンドを検出した。
反応液2(100mmol/L Tris-HCl緩衝液、10mmol/L Glu、10mmol/L Val、10mmol/L ATP、10mmol/L硫酸マグネシウム、pH9.0)に透析後の酵素溶液を適量添加し、30℃で30分間反応を行った。反応終了後に実施例1と同様の手順でγ-Glu-Valを定量した。実施例4においては、本条件で1分間に1μmolのγ-Glu-Valを生成する酵素活性を1 Uのγ-Glu-Val合成活性とした。透析後の酵素溶液はγ-Glu-Val合成活性を有しており、比活性は0.883U/mgであった。このことから、配列番号3のORF領域をKrogshAと命名し、KrogshAによりコードされるタンパク質をKroGSHA(配列番号6)と命名した。透析後の酵素溶液を、精製KroGSHAとして以降の実験に用いた。
〔実施例5〕コクリア・リゾフィラDC2201株由来γ-Glu-Val合成酵素(KrhGSHA)のエシェリヒア・コリによる発現
(1)コクリア・リゾフィラDC2201株由来γ-Glu-Val合成酵素発現菌株の構築
コクリア・リゾフィラDC2201株(ATCC 9341)のγ-Glu-Val合成酵素をコードするKrhgshA遺伝子(配列番号7)の発現プラスミドpQE-KrhgshAを以下の手順で構築した。
コクリア・リゾフィラDC2201株のゲノムDNAを鋳型として、ポリメラーゼとしてKOD-plus-(東洋紡社)を使用して、製造元のプロトコールに従って98℃で30秒、67℃で1分の条件で30サイクルのPCRを行い、配列番号7のORF領域約1.2kbを増幅した。プライマーとしては、配列番号8および配列番号9のプライマーの組み合わせを使用した。得られたPCR産物をKpnI/HindIIIで消化した後に、アガロースゲル電気泳動にて目的の約1.2kbのDNAを切り出した後、予めKpnI/HindIIIで消化したpQE30とライゲーションコンビニエンスキット(ニッポンジーン社製)を用いて連結した。該反応液でエシェリヒア・コリJM109株を形質転換し、100mg/LのAmpを含むLB寒天培地に塗布後、30℃で終夜培養した。生育してきた形質転換体のコロニーから公知の方法に従ってプラスミドを抽出し、3100ジェネティックアナライザー(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて塩基配列の確認を行い、目的の構造を持つプラスミドをpQE-KrhgshAと名付けた。また、本プラスミドを有する形質転換体をエシェリヒア・コリJM109/pQE-KrhgshAと名付けた。KrhgshA遺伝子の塩基配列およびそれによりコードされるKrhGSHAのアミノ酸配列を、それぞれ配列番号7および配列番号10に示す。なお、pQE-KrhgshAによれば、KrhGSHAはN末端にHisタグが付加された形態で発現する。
(2)N末端Hisタグ付加組換え型KrhGSHAの精製
エシェリヒア・コリJM109/pQE-KrhgshA を、100mg/LのAmpを含むLB寒天培地で、30℃で終夜培養した。得られた菌体を500mlのTB培地(Terrific Broth(モレキュラークローニング:実験室マニュアル第3版、Sambrook, J.ら,Cold SpringHarbor Laboratory Press(2001年))に接種し、500ml容の坂口フラスコに100mlずつ分注し、30℃、110往復/分で16時間培養した。菌体を遠心分離(12,000g、5分)により集菌した後、20mMリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)で洗菌し、溶離液A(300mM NaCl、10mMイミダゾールを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH6.0))を用いて菌体懸濁液を調製した。菌体懸濁液を超音波破砕処理に供して菌体を破砕し、遠心分離(29,100g、20分)し、得られた上清を無細胞抽出液とした。
得られた無細胞抽出液を、予め溶離液Aで平衡化したHisTALON 5mlカラム(クロンテック社製)にアプライし、10-150mMイミダゾールの直線的濃度勾配により酵素を溶出し、活性画分を得た。
得られた活性画分を、等量の2.4M硫酸アンモニウムを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH 6.0)と混和し、4℃、3時間緩やかに撹拌した後、遠心分離(12,000g、5分)により上清を得た。得られた上清を、予め1.2M硫酸アンモニウムを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH 6.0)で平衡化したHiTrap Phenyl High Performance 1mlカラム(GEヘルスケア社製)にアプライし、1-0M硫酸アンモニウムの直線的濃度勾配により酵素を溶出し、活性画分を得た。
得られた活性画分を、15%(w/v)グリセロールを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH 6.0)に対して透析した。透析後の酵素溶液を、精製KrhGSHAとして以降の実験に用いた。
〔実施例6〕ミクロコッカス・ルテウスNCTC2665株由来γ-Glu-Val合成酵素(MluGSHA)のエシェリヒア・コリによる発現
(1)ミクロコッカス・ルテウスNCTC2665株由来γ-Glu-Val合成酵素発現菌株の構築
ミクロコッカス・ルテウスNCTC2665株(ATCC 15307)のγ-Glu-Val合成酵素をコードするMlugshA遺伝子(配列番号11)の発現プラスミドpQE-MlugshAを以下の手順で構築した。
ミクロコッカス・ルテウスNCTC2665株のゲノムDNAを鋳型として、ポリメラーゼとしてKOD-plus-(東洋紡社)を使用して、製造元のプロトコールに従って98℃で30秒、67℃で1分の条件で30サイクルのPCRを行い、配列番号11のORF領域約1.2kbを増幅した。プライマーとしては、配列番号12および配列番号13のプライマーの組み合わせを使用した。得られたPCR産物をBamHI/HindIIIで消化した後に、アガロースゲル電気泳動にて目的の約1.2kbのDNAを切り出した後、予めBamHI/HindIIIで消化したpQE30とライゲーションコンビニエンスキット(ニッポンジーン社製)を用いて連結した。該反応液でエシェリヒア・コリJM109株を形質転換し、100mg/LのAmpを含むLB寒天培地に塗布後、30℃で終夜培養した。生育してきた形質転換体のコロニーから公知の方法に従ってプラスミドを抽出し、3100ジェネティックアナライザー(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて塩基配列の確認を行ったところ、MluGSHAのアミノ酸配列の263位のグルタミンをコードする塩基配列cagが終止コドンであるtagに置換されていた。そこで、以下の手順で、得られたプラスミドにtagをcagに置換する変異を導入した。ストラタジーン社の「Quik Change Site-Directed Mutagenesis Kit」を使用し、製造元のプロトコールに従い、得られたプラスミドを鋳型として、配列番号14、15の配列で表されるプライマーを用いてPCRを実施した。得られたPCR産物をDpnIで消化した後、該反応液でエシェリヒア・コリJM109株を形質転換し、100mg/LのAmpを含むLB寒天培地に塗布後、30℃で終夜培養した。生育してきた形質転換体のコロニーから公知の方法に従ってプラスミドを抽出し、3100ジェネティックアナライザー(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて塩基配列の確認を行い、目的の構造を持つプラスミドをpQE-MlugshA、本プラスミドを有する形質転換体をエシェリヒア・コリJM109/pQE-MlugshAと名付けた。MlugshA遺伝子の塩基配列およびそれによりコードされるMluGSHAのアミノ酸配列を、それぞれ配列番号11および配列番号16に示す。なお、pQE-MlugshAによれば、MluGSHAはN末端にHisタグが付加された形態で発現する。
(2)N末端Hisタグ付加組換え型MluGSHAの精製
JM109/pQE-MlugshAを、100mg/LのAmpを含むLB寒天培地で、30℃で終夜培養した。得られた菌体を500mlのTB培地に接種し、500ml容の坂口フラスコに100mlずつ分注し、30℃、110往復/分で16時間培養した。菌体を遠心分離(12,000g、5分)により集菌した後、20mMリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)で洗菌し、溶離液Aを用いて菌体懸濁液を調製した。菌体懸濁液を超音波破砕処理に供して菌体を破砕し、遠心分離(29,100g、20分)し、得られた上清を無細胞抽出液とした。
得られた無細胞抽出液を、予め溶離液Aで平衡化したHisTALON 5mlカラム(クロンテック社製)にアプライし、10-150mMイミダゾールの直線的濃度勾配により酵素を溶出し、活性画分を得た。
得られた活性画分を、等量の2.4M硫酸アンモニウムを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH 6.0)と混和し、4℃、3時間緩やかに撹拌した後、遠心分離(12,000g、5分)により上清を得た。得られた上清を、予め1.2M硫酸アンモニウムを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH 6.0)で平衡化したHiTrap Phenyl High Performance 1mlカラム(GEヘルスケア社製)にアプライし、1-0M硫酸アンモニウムの直線的濃度勾配により酵素を溶出し、活性画分を得た。
得られた活性画分を、15%(w/v)グリセロールを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH 6.0)に対して透析した。透析後の酵素溶液を、精製MluGSHAとして以降の実験に用いた。
〔実施例7〕コリネバクテリウム・グルタミカムK051株由来γ-Glu-Val合成酵素(CglGSHA)のエシェリヒア・コリによる発現
(1)コリネバクテリウム・グルタミカムK051株由来γ-Glu-Val合成酵素発現菌株の構築
コリネバクテリウム・グルタミカムK051株(ATCC 13032)のγ-Glu-Val合成酵素をコードするCglgshA遺伝子(配列番号17)の発現プラスミドpET-CglgshAを以下の手順で構築した。
配列番号17のORF領域にはXhoI認識サイトが含まれている。そこで、2段階のPCR反応により、XhoI認識サイトを欠失(配列番号17の145位〜150位のctcgagをctggagに置換)したORF領域の全長を得た。
1段階目のPCRでは、コリネバクテリウム・グルタミカムK051株のゲノムDNAを鋳型として、ポリメラーゼとしてKOD-plus-(東洋紡社)を使用して、製造元のプロトコールに従って98℃で30秒、67℃で1分の条件で30サイクルのPCRを行い、ORF領域約1.2kbを上流部分と下流部分に分けてそれぞれ増幅した。プライマーとしては、上流部分の増幅には配列番号18および配列番号19のプライマーの組み合わせを、下流部分の増幅には、配列番号20および配列番号21のプライマーの組み合わせを使用した。得られたPCR産物をアガロースゲル電気泳動に供し、目的の約160b、約1.0kbのDNA断片を切り出した。
1段階目のPCRで得られた2断片を鋳型として用いて、1段階目のPCRと同一のPCR条件で2段階目のPCRを実施し、XhoI認識サイトを欠失したORF領域約1.2kbの全長を増幅した。プライマーとしては、配列番号18および配列番号21のプライマーの組み合わせを使用した。得られたPCR産物をNdeI/XhoIで消化した後に、アガロースゲル電気泳動にて目的の約1.2kbのDNAを切り出した後、予めNdeI/XhoIで消化したpET21a(+)とライゲーションコンビニエンスキット(ニッポンジーン社製)を用いて連結した。該反応液でエシェリヒア・コリJM109株を形質転換し、100mg/LのAmpを含むLB寒天培地に塗布後、30℃で終夜培養した。生育してきた形質転換体のコロニーから公知の方法に従ってプラスミドを抽出し、3100ジェネティックアナライザー(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて塩基配列の確認を行い、目的の構造を持つプラスミドをpET-CglgshAと名付けた。得られたpET-CglgshAでエシェリヒア・コリBL21(DE3)を形質転換し、pET-CglgshAを有する形質転換体を得た。この形質転換体を、エシェリヒア・コリBL21(DE3)/pET-CglgshAと命名した。CglgshA遺伝子の塩基配列およびそれによりコードされるアミノ酸配列を、それぞれ配列番号17および配列番号22に示す。なお、pET-CglgshAによれば、CglGSHAはC末端にHisタグが付加された形態で発現する。
(2)C末端Hisタグ付加組換え型CglGSHAの精製
エシェリヒア・コリBL21(DE3)/pET-CglgshA を、100mg/LのAmpを含むLB寒天培地で、30℃で終夜培養した。得られた菌体を100mlのOvernight ExpressTM Instant TB培地(Novagen社製)に接種し、500ml容の坂口フラスコで、30℃、110往復/分で16時間培養した。菌体を遠心分離(12,000g、5分)により集菌した後、20mMリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)で洗菌し、300mM NaCl、溶離液Aを用いて菌体懸濁液を調製した。菌体懸濁液を超音波破砕処理に供して菌体を破砕し、遠心分離(29,100g、20分)し、得られた上清を無細胞抽出液とした。
得られた無細胞抽出液を、予め溶離液Aで平衡化したHisTALON 5mlカラム(クロンテック社製)にアプライし、10-150mMイミダゾールの直線的濃度勾配により酵素を溶出し、活性画分を得た。
得られた活性画分を、15%(w/v)グリセロールを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH 6.0)に対して透析した。透析後の酵素溶液を、精製CglGSHAとして以降の実験に用いた。
〔実施例8〕C末端Hisタグ付加組換え型サッカロマイセス・セレビシエS288C株由来GSH1(ScGSH1)の精製
サッカロマイセス・セレビシエS288C株(ATCC 26108)のグルタミン酸−システインリガーゼをコードするGSH1遺伝子(ScGSH1遺伝子;配列番号23)の発現プラスミドpET-ScGSH1を特開2012-85637に記載の方法で構築した。続いて、pET-ScGSH1を用いてエシェリヒア・コリBL21(DE3)を形質転換し、エシェリヒア・コリBL21(DE3)/pET-ScGSH1を得た。ScGSH1遺伝子の塩基配列およびそれによりコードされるScGSH1のアミノ酸配列を、それぞれ配列番号23および配列番号24に示す。なお、pET-ScGSH1によれば、ScGSH1はC末端にHisタグが付加された形態で発現する。
エシェリヒア・コリBL21(DE3)/pET-ScGSH1を、100mg/LのAmpを含むLB寒天培地で、30℃で終夜培養した。得られた菌体を50mlのLB培地に接種し、500ml容の坂口フラスコで、37℃、110往復/分で16時間培養した。得られた培養液のうち2mlを100mlのLB培地が入った坂口フラスコに接種した。37℃、110往復/分で2時間培養後、終濃度が0.5mmol/Lになるようにイソプロピル−β−D−チオガラクトピラノシド(IPTG)を添加して、さらに30℃で4時間培養した。菌体を遠心分離(12,000g、5分)により集菌した後、溶離液B(300mM NaCl、10mMイミダゾール、15%(w/v)グリセロールを含む20mM Tris-HCl緩衝液(pH8.0))で洗菌し、溶離液Bを用いて菌体懸濁液を調製した。菌体懸濁液を超音波破砕処理に供して菌体を破砕し、遠心分離(29,100g、20分)し、得られた上清を無細胞抽出液とした。
得られた無細胞抽出液を、予め溶離液Cで平衡化したHisTALON 5mlカラム(クロンテック社製)にアプライし、10-150mMイミダゾールの直線的濃度勾配により酵素を溶出し、活性画分を得た。
得られた活性画分を、300mM NaCl、15%(w/v)グリセロールを含むTris-HCl緩衝液(pH8.0)に対して透析した。透析後の酵素溶液を、精製ScGSH1として以降の実験に用いた。
〔実施例9〕N末端Hisタグ付加組換え型エシェリヒア・コリK-12 W3110株由来GSHA(EcGSHA)の精製
エシェリヒア・コリK-12 W3110株(ATCC 27325)のグルタミン酸−システインリガーゼをコードするgshA遺伝子(EcgshA遺伝子;配列番号25)の発現プラスミドpQE-EcgshAを特開2012-85637に記載の方法で構築した。続いて、pQE-EcgshAを用いてエシェリヒア・コリBL21(DE3)を形質転換し、エシェリヒア・コリBL21(DE3)/pQE-EcgshAを得た。EcgshA遺伝子の塩基配列およびそれによりコードされるEcGSHAのアミノ酸配列を、それぞれ配列番号25および配列番号26に示す。なお、pQE-EcgshAによれば、EcGSHAはN末端にHisタグが付加された形態で発現する。
エシェリヒア・コリBL21(DE3)/pQE-EcgshAを特開2012-85637と同様の方法で培養した。菌体を遠心分離(12,000g、5分)により集菌した後、溶離液C(300mM NaCl、10mMイミダゾールを含む20 mM Tris-HCl(pH7.6))で洗菌し、溶離液Cを用いて菌体懸濁液を調製した。菌体懸濁液を超音波破砕処理に供して菌体を破砕し、遠心分離(29,100g、20分)し、得られた上清を無細胞抽出液とした。
得られた無細胞抽出液を、予め溶離液Cで平衡化したHisTALON 5mlカラム(クロンテック社製)にアプライし、10-150mMイミダゾールの直線的濃度勾配により酵素を溶出し、活性画分を得た。
得られた活性画分を、20 mM Tris-HCl(pH7.6)に対して透析した。透析後の酵素溶液を精製EcGSHAとして以降の実験に用いた。
〔実施例10〕C末端Hisタグ付加組換え型エシェリヒア・コリK-12 W3110株由来GSHB(EcGSHB)の精製
エシェリヒア・コリK-12 W3110株(ATCC 27325)のグルタチオン合成酵素をコードするgshB遺伝子(EcgshB遺伝子;配列番号27)の発現プラスミドpET-EcgshBを特開2012-85637に記載の方法で構築した。続いて、pET-EcgshBを用いてエシェリヒア・コリBL21(DE3)を形質転換し、エシェリヒア・コリBL21(DE3)/pET-EcgshBを得た。EcgshB遺伝子の塩基配列およびそれによりコードされるEcGSHBのアミノ酸配列を、それぞれ配列番号27および配列番号28に示す。なお、pET-EcgshBによれば、EcgshBはC末端にHisタグが付加された形態で発現する。
本菌株を特開2012-85637と同様の方法で培養した。菌体を遠心分離(12,000g、5分)により集菌した後、溶離液Cで洗菌した後、溶離液Cを用いて菌体懸濁液を調製した。菌体懸濁液を超音波破砕処理に供して菌体を破砕し、遠心分離(29,100g、20分)し、得られた上清を無細胞抽出液とした。
得られた無細胞抽出液を、予め溶離液Cで平衡化したHisTALON 5mlカラム(クロンテック社製)にアプライし、10-150mMイミダゾールの直線的濃度勾配により酵素を溶出し、活性画分を得た。
得られた活性画分を、20 mM Tris-HCl(pH7.6)に対して透析した。透析後の酵素溶液を精製EcGSHBとして以降の実験に用いた。
〔実施例11〕各精製GSHAによるγ−グルタミルジペプチドの生成
実施例4〜9で取得した各精製GSHA(ScGSH1、EcGSHA、KroGSHA、KrhGSHA、MluGSHA、CglGSHA)について、γ-Glu-Val合成活性およびγ-Glu-Gly合成活性を測定した。
<γ-Glu-Val合成活性の測定>
実施例4に記載の反応液2(100mmol/L Tris-HCl緩衝液、10mmol/L Glu、10mmol/L Val、10mmol/L ATP、10mmol/L硫酸マグネシウム、pH9.0)に各精製GSHAを適量添加し、30℃で30分間反応を行った。反応終了後に実施例1と同様の手順でγ-Glu-Valを定量した。実施例11においては、本条件で1分間に1μmolのγ-Glu-Valを生成する酵素活性を1 Uのγ-Glu-Val合成活性とした。
<γ-Glu-Gly合成活性の測定>
反応液3(100mmol/L Tris-HCl緩衝液、10mmol/L Glu、10mmol/L Gly、10mmol/L ATP、10mmol/L硫酸マグネシウム、pH9.0)に各精製GSHAを適量添加し、30℃で30分間反応を行った。反応終了後にγ-Glu-GlyをHPLCにより定量した。実施例11においては、本条件で1分間に1μmolのγ-Glu-Glyを生成する酵素活性を1 Uのγ-Glu-Gly合成活性とした。
γ-Glu-Glyの定量条件は以下の通りである。カラムには、ジーエルサイエンス社製Inertsil ODS-3(粒子径5ミクロン、内径4.6mm、長さ250mm)を用いた。溶離液には、A液(30mMリン酸二水素カリウム、10mMオクタンスルホン酸ナトリウム(pH2.0、リン酸によってpH調整))、及び、B液(アセトニトリル)を85:15(v/v)の比率で混合した混合液を用いた。カラム温度は40℃、UV検出波長は210nmとした。
以上の方法によりγ-Glu-Val合成活性およびγ-Glu-Gly合成活性の比活性を測定し、(A)γ-Glu-Gly合成活性(比活性)に対する(B)γ-Glu-Val合成活性(比活性)の比率(B)/(A)を算出した。結果を表2に示す。
Figure 2015133547
〔実施例12〕各精製GSHAおよび精製EcGSHBを用いたアミノ酸からのγ−グルタミルトリペプチドの生成
実施例4〜9で取得した各精製GSHA(ScGSH1、EcGSHA、KroGSHA、KrhGSHA、MluGSHA、CglGSHA)および実施例10で取得した精製EcGSHBを用い、アミノ酸からのγ-Glu-Val-Gly(CAS 38837-70-6、Gluvalicineとも呼ぶ)等のγ−グルタミルトリペプチドの生成を検討した。γ-Glu-Val-Glyの構造式を下記式(I)に示す。
Figure 2015133547
反応液4(50mmol/L Tris-HCl緩衝液、100mmol/L Glu、100mmol/L Val、100mmol/L Gly、10mmol/L ATP、10 mmol/L硫酸マグネシウム、240mmol/Lホスホエノールピルビン酸、20000U/Lピルビン酸キナーゼ、pH8.5)に各精製GSHAおよび精製EcGSHBを添加し、30℃で反応を実施した。この時、各酵素は、精製EcGSHAは0.2g/l、精製KroGSHAおよび精製MluGSHAは0.1g/l、精製KrhGSHAおよび精製CglGSHAは1g/l、精製GSHBは0.4g/lとなるように反応液4に添加した。
反応開始1時間後、実施例1におけるγ-Glu-Valの定量と同様の方法でγ-Glu-Valおよびγ-Glu-Val-Glyを、実施例11におけるγ-Glu-Glyの定量と同様の方法でγ-Glu-Glyおよびγ-Glu-Gly-Glyを分析し、これらの成分の生成量を算出した。結果を表3に示す。この結果から、(C)γ-Glu-Glyとγ-Glu-Gly-Glyの和、および、(D)γ-Glu-Valとγ-Glu-Val-Glyの和を算出し、(C)γ-Glu-Glyとγ-Glu-Gly-Glyの和に対する(D)γ-Glu-Valとγ-Glu-Val-Glyの和の比率(D)/(C)を算出した。結果を表4に示す。実施例11の表2で示したγ-Glu-Gly合成活性に対するγ-Glu-Val合成活性の比率(B)/(A)と、γ-Glu-Glyとγ-Glu-Gly-Glyの和に対するγ-Glu-Valとγ-Glu-Val-Glyの和の比率(D)/(C)との相関図を図1に示す。(B)/(A)と(D)/(C)の間のピアソンの積率相関係数を算出すると0.991であり、よって、(B)/(A)と(D)/(C)の間に正の相関関係が認められた。
Figure 2015133547
Figure 2015133547
反応開始24時間後、上記と同様にγ-Glu-Val-Glyの生成量を算出した。結果を表5に示す。
Figure 2015133547
本発明のγ-Glu-Val合成酵素は、Valを選択的に基質とし、γ-Glu-Val生成反応を触媒する。したがって、本発明によれば、本発明のγ-Glu-Val合成酵素を利用して、Glu及びValを原料としてγ-Glu-Valを効率よく製造することができ、さらにγ-Glu-Val及びGlyを原料としてγ-Glu-Val-Glyを製造することができる。また、本発明によれば、本発明のγ-Glu-Val合成酵素を利用して、Glu、Val、及びGlyを原料としてγ-Glu-Val-Glyを効率よく製造することができる。
<配列表の説明>
配列番号1:コクリア・ロゼア(AJ3132)のKroGSHAタンパク質のN末端アミノ酸配列
配列番号2:コクリア・ロゼア(AJ3132)のKroGSHAタンパク質の内部アミノ酸配列
配列番号3:コクリア・ロゼア(AJ3132)のKrogshA遺伝子の塩基配列
配列番号4、5:プライマー
配列番号6:コクリア・ロゼア(AJ3132)のKroGSHAタンパク質のアミノ酸配列
配列番号7:コクリア・リゾフィラDC2201株のKrhgshA遺伝子の塩基配列
配列番号8、9:プライマー
配列番号10:コクリア・リゾフィラDC2201株のKrhGSHAタンパク質のアミノ酸配列
配列番号11:ミクロコッカス・ルテウスNCTC2665株のMlugshA遺伝子の塩基配列
配列番号12〜15:プライマー
配列番号16:ミクロコッカス・ルテウスNCTC2665株のMluGSHAタンパク質のアミノ酸配列
配列番号17:コリネバクテリウム・グルタミカムK051株のCglgshA遺伝子の塩基配列
配列番号18〜21:プライマー
配列番号22:コリネバクテリウム・グルタミカムK051株のCglGSHAタンパク質のアミノ酸配列
配列番号23:サッカロマイセス・セレビシエS288C株のScGSH1遺伝子の塩基配列
配列番号24:サッカロマイセス・セレビシエS288C株のScGSH1タンパク質のアミノ酸配列
配列番号25:エシェリヒア・コリK-12 W3110株のEcgshA遺伝子の塩基配列
配列番号26:エシェリヒア・コリK-12 W3110株のEcGSHAタンパク質のアミノ酸配列
配列番号27:エシェリヒア・コリK-12 W3110株のEcgshB遺伝子の塩基配列
配列番号28:エシェリヒア・コリK-12 W3110株のEcGSHBタンパク質のアミノ酸配列
配列番号29:エシェリヒア・コリK-12 MG1655株のggt遺伝子の塩基配列
配列番号30:エシェリヒア・コリK-12 MG1655株のGGTのアミノ酸配列

Claims (22)

  1. 下記工程(A)を含む、γ-Glu-Valおよび/またはその塩の製造法:
    (A)下記(a)、(b)、又は(c)に記載のタンパク質をGluおよびValに作用させることによりγ-Glu-Valを生成する工程:
    (a)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列を含むタンパク質;
    (b)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列において、1〜10個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質;
    (c)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列に対し90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質。
  2. 下記工程(A)および(B)を含む、γ-Glu-Val-Glyおよび/またはその塩の製造法:
    (A)下記(a)、(b)、又は(c)に記載のタンパク質をGluおよびValに作用させることによりγ-Glu-Valを生成する工程;および
    (B)グルタチオン合成酵素を工程(A)で生成したγ-Glu-ValおよびGlyに作用させることによりγ-Glu-Val-Glyを生成する工程:
    (a)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列を含むタンパク質;
    (b)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列において、1〜10個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質;
    (c)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列に対し90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質。
  3. 下記工程(C)を含む、γ-Glu-Val-Glyおよび/またはその塩の製造法:
    (C)下記(a)、(b)、又は(c)に記載のタンパク質およびグルタチオン合成酵素を、Glu、Val、およびGlyに作用させることにより、γ-Glu-Val-Glyを生成する工程:
    (a)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列を含むタンパク質;
    (b)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列において、1〜10個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質;
    (c)配列番号6、10、16、または22に示すアミノ酸配列に対し90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質。
  4. 前記タンパク質におけるγ−グルタミルグリシン合成酵素活性に対するγ−グルタミルバリン合成酵素活性の比率が2.0以上である、請求項1〜3のいずれか1項に記載の方法。
  5. 下記工程(C)を含む、γ-Glu-Val-Glyおよび/またはその塩の製造法:
    (C)γ−グルタミルグリシン合成酵素活性に対するγ−グルタミルバリン合成酵素活性の比率が2.0以上であるγ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質およびグルタチオン合成酵素を、Glu、Val、およびGlyに作用させることにより、γ-Glu-Val-Glyを生成する工程。
  6. 前記タンパク質が、精製酵素である、請求項1〜5のいずれか1項に記載の方法。
  7. 前記タンパク質が、固定化酵素である、請求項1〜5のいずれか1項に記載の方法。
  8. 前記タンパク質が、該タンパク質を有する微生物の培養物、培養菌体、または該菌体の処理物に含有されるものである、請求項1〜5のいずれか1項に記載の方法。
  9. 前記グルタチオン合成酵素が、該酵素を有する微生物の培養物、培養菌体、または該菌体の処理物に含有されるものである、請求項2〜8のいずれか1項に記載の方法。
  10. 前記タンパク質およびグルタチオン合成酵素が、両酵素を有する微生物の培養物、培養菌体、または該菌体の処理物に含有されるものである、請求項2〜5のいずれか1項に記載の方法。
  11. 前記微生物が、γ−グルタミルトランスフェラーゼの活性が低下するように改変されている、請求項8〜10のいずれか1項に記載の方法。
  12. 前記微生物が、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)である、請求項8〜11のいずれか1項に記載の方法。
  13. 前記工程がATPの存在下で実施される、請求項1〜12のいずれか1項に記載の方法。
  14. 下記(a)、(b)、又は(c)に記載のタンパク質:
    (a)配列番号6に示すアミノ酸配列を含むタンパク質;
    (b)配列番号6に示すアミノ酸配列において、1〜10個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質;
    (c)配列番号6に示すアミノ酸配列に対し90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含み、且つ、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質。
  15. γ−グルタミルグリシン合成酵素活性に対するγ−グルタミルバリン合成酵素活性の比率が2.0以上である、請求項14に記載のタンパク質。
  16. γ−グルタミルグリシン合成酵素活性に対するγ−グルタミルバリン合成酵素活性の比率が2.0以上である、γ−グルタミルバリン合成酵素活性を有するタンパク質。
  17. 請求項14〜16のいずれか1項に記載のタンパク質をコードする遺伝子。
  18. 請求項17に記載の遺伝子を搭載するベクター。
  19. 請求項17に記載の遺伝子または請求項18に記載のベクターを有する微生物。
  20. γ−グルタミルトランスフェラーゼの活性が低下するように改変されている、請求項19に記載の微生物。
  21. グルタチオン合成酵素をコードする遺伝子を有する、請求項19または20に記載の微生物。
  22. エシェリヒア・コリである、請求項19〜21のいずれか1項に記載の微生物。
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