JPWO2015030111A1 - 人工多能性幹細胞の作製方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本明細書は、人工多能性幹細胞の作製に関する。
(2)前記核初期化物質は、さらに、OCTファミリー遺伝子又はその翻訳産物と、SOXファミリー遺伝子又はその翻訳産物と、を含む、(1)に記載の作製方法。
(3)前記核初期化物質は、さらに、KLF4ファミリー遺伝子又はその翻訳産物を含む(1)又は(2)に記載の作製方法。
(4)前記細胞は、歯髄細胞である(1)から(3)のいずれかに記載の作製方法。
(5)前記歯髄細胞は、歯根完成期前の歯髄細胞である(4)に記載の作製方法。
(6)DLX4遺伝子、OCT3/4遺伝子及びSOX2遺伝子を保持する、1又は2以上の組換えベクターを含むベクターセット。
(7)(6)に記載のベクターセットを含む人工多能性幹細胞作製剤。
(8)(6)に記載のベクターセットにより作製されたiPS細胞。
(9)歯根完成期前の歯髄細胞を含む人工多能性幹細胞を作製するための剤。
(10)DLX4遺伝子を含む人工多能性幹細胞作製剤。
本明細書では、核初期化物質を開示する。核初期化物質は、体細胞の核を初期化して多能性を誘導する物質である。
本明細書で開示する核初期化物質は、少なくともDLX4遺伝子を含む。DLX4遺伝子は、iPS細胞の誘導効率を効果的に高めることができる。より具体的には、SOX2遺伝子を含むSOXファミリーに属する遺伝子、OCT3/4遺伝子を含むOCTファミリーに属する遺伝子との組合せにより、iPS細胞の誘導効率を確実かつ飛躍的に高めることができる。さらに、DLX4遺伝子は、特にKLF4遺伝子などのKLFファミリーに属する遺伝子との相乗効果により、一層iPS細胞の誘導効率を高めることができる。
OCTファミリーとしては、OCT3/4遺伝子、OCT1A遺伝子及びOCT6遺伝子等が挙げられる。これらのOCTファミリーは、1種単独で使用してもよく、また2種以上を組み合わせて使用してもよい。OCTファミリーの中では、iPS細胞への効率的な誘導という観点から、OCT3/4遺伝子が好適に使用される。OCT3/4の塩基配列は、公知(NCBI accession No.NM_002701(human)、NM_013633(Mouse))である。また、OCT1A遺伝子の塩基配列(NCBI accession No.NM_002697(human)、NM_198934(Mouse))、OCT6遺伝子の塩基配列(NCBI accession No.NM_002699(human)、NM_011141(Mouse))についても公知である。
SOXファミリーとしては、SOX1遺伝子、SOX2遺伝子、SOX3遺伝子、SOX7遺伝子、SOX15遺伝子、SOX17遺伝子及びSOX18遺伝子が挙げられる。これらのSOXファミリーは、1種単独で使用してもよく、また2種以上を組み合わせて使用してもよい。SOXファミリーの中では、iPS細胞への効率的な誘導という観点から、SOX2遺伝子が好適に使用される。SOX2遺伝子の塩基配列は、公知(NCBI accession No. NM_003106(human)、NM_011443(Mouse))である。また、SOX1遺伝子の塩基配列(NCBI accession No. NM_005986(human)、NM_009233(Mouse))、SOX3遺伝子の塩基配列(NCBI accession No. NM_005634(human)、NM_009237(Mouse))、SOX7遺伝子の塩基配列(NCBI accession No. NM_031439(human)、NM_011446(Mouse))、SOX15遺伝子の塩基配列(NCBI accession No. NM_006942(human)、NM_009235(Mouse))、SOX17遺伝子の塩基配列(NCBI accession No. NM_022454(human)、NM_011441(Mouse))、SOX18遺伝子の塩基配列(NCBI accession No. NM_018419(human)、NM_009236(Mouse))についても公知である。
核初期化物質としては、さらに、KLFファミリーに属する遺伝子を含むこともできる。KLFファミリーとしては、KLF1遺伝子、KLF2遺伝子、KLF4遺伝子及びKLF5遺伝子等が挙げられる。これらのKLFファミリーは、1種単独で使用してもよく、また2種以上を組み合わせて使用してもよい。KLFファミリーの中では、iPS細胞への効率的な誘導という観点から、KLF4遺伝子が好適に使用される。KLF4遺伝子の塩基配列は公知(NCBI accession No. NM_004235(human)、NM_010637(Mouse))である。また、KLF1遺伝子の塩基配列(NCBI accession No. NM_006563(human)、NM_010635(Mouse))、KLF2遺伝子の塩基配列(NCBI accessionNo. NM_016270(human)、NM_008452(Mouse))、及びKLF5遺伝子の塩基配列(NCBIaccession No. NM_001730(human)、NM_009769(Mouse))についても公知である。
本明細書においては、上記した核初期化物質に加えて、公知の誘導効率改善物質を用いてもよい。iPS細胞の誘導効率改善物質としては、例えば、ヒストンデアセチラーゼ(HDAC)阻害剤[例えば、バルプロ酸(VPA)(Nat. Biotechnol., 26(7): 795-797 (2008))、トリコスタチンA、酪酸ナトリウム、MC 1293、M344等の低分子阻害剤、HDACに対するsiRNAおよびshRNA(例、HDAC1 siRNA Smartpool(登録商標)(Millipore)、HuSH 29mer shRNA Constructs against HDAC1(OriGene)等)等の核酸性発現阻害剤など]、G9aヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤[例えば、BIX−01294(Cell Stem Cell, 2: 525-528 (2008))等の低分子阻害剤、G9aに対するsiRNAおよびshRNA(例、G9a siRNA(human)(Santa Cruz Biotechnology)等)等の核酸性発現阻害剤など]等が挙げられるが、それらに限定されない。核酸性の発現阻害剤はsiRNAもしくはshRNAをコードするDNAを含む発現ベクターの形態であってもよい。
核初期化物質である各遺伝子及び誘導効率改善物質を細胞に供給するためには、組換えベクターが利用される。各遺伝子は、宿主となる細胞で機能し得るプロモーターを含む適当なベクターに導入される。ベクターとしては、例えば、レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ関連ウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、レンチウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、アルファウイルスベクター、EBウイルスベクター、パピローマウイルスベクター、フォーミーウイルスベクターなどのウイルスベクター、動物細胞発現プラスミド(例、pA1−11,pXT1,pRc/CMV,pRc/RSV,pcDNAI/Neo)などが用いられ得る。用いるベクターの種類は、得られるiPS細胞の用途に応じて適宜選択することができる。なお、各遺伝子は、1のベクターに全て導入されてもよいし、2以上のベクターに別々に導入されてもよい。
上述したように、各遺伝子は、1又は2以上のベクターに導入される。本明細書は、各遺伝子が導入された1又は2以上の組換えベクターを含むベクターセットも開示する。即ち、ベクターセットは、1の組換えベクターでもよいし、2以上の組換えベクターの混合物であってもよい。また、2以上の組換えベクターを含むベクターセットの場合において、ベクターセット内に各遺伝子が全て含まれるのであれば、各組換えベクターの数の比率は問わない。しかし、各遺伝子が同量含まれるような、組換えベクターの数の比率とすることが好ましい。
本明細書においてiPS細胞作製のための出発材料として用いることのできる体細胞は、哺乳動物(例えば、マウスまたはヒト)由来の生殖細胞以外のいかなる細胞であってもよい。例えば、角質化する上皮細胞(例、角質化表皮細胞)、粘膜上皮細胞(例、舌表層の上皮細胞)、外分泌腺上皮細胞(例、乳腺細胞)、ホルモン分泌細胞(例、副腎髄質細胞)、代謝・貯蔵用の細胞(例、肝細胞)、境界面を構成する内腔上皮細胞(例、I型肺胞細胞)、内鎖管の内腔上皮細胞(例、血管内皮細胞)、運搬能をもつ繊毛のある細胞(例、気道上皮細胞)、細胞外マトリックス分泌用細胞(例、線維芽細胞)、収縮性細胞(例、平滑筋細胞)、血液と免疫系の細胞(例、Tリンパ球)、感覚に関する細胞(例、桿細胞)、自律神経系ニューロン(例、コリン作動性ニューロン)、感覚器と末梢ニューロンの支持細胞(例、随伴細胞)、中枢神経系の神経細胞とグリア細胞(例、星状グリア細胞)、色素細胞(例、網膜色素上皮細胞)、およびそれらの前駆細胞(組織前駆細胞)等が挙げられる。細胞の分化の程度に特に制限はなく、未分化な前駆細胞(体性幹細胞も含む)であっても、最終分化した成熟細胞であっても、同様に本発明における体細胞の起源として使用することができる。ここで未分化な前駆細胞としては、たとえば神経幹細胞、造血幹細胞、間葉系幹細胞、歯髄幹細胞等の組織幹細胞(体性幹細胞)が挙げられる。なお、細胞としては、好ましくは、DLX4遺伝子の発現量の多い細胞が利用される。DLX4遺伝子の発現量が多い細胞の例として、DPCが挙げられる。特に歯根完成期前のDPCが挙げられる。
DPCとは、歯の中核にみられる血管と神経に富んだ結合組織の細胞群である。本発明において、DPCとは、このような生体内での解剖学的な位置で特定される細胞群を意味する。
本明細書では、上記のベクターセットを含むiPS細胞作製剤、歯根完成期前の歯髄細胞を含むiPS細胞を作製するための剤、及び、DLX4遺伝子を含むiPS細胞作製剤も開示する。また、これらのiPS細胞作製剤を組み合わせて、iPS細胞作製剤としてもよい。
本明細書は、iPS細胞の作製方法も提供する。当該作製方法は、核初期化物質と細胞とを接触させる工程を含む。
核初期化物質と細胞とを接触させる工程では、核初期化物質を細胞に接触させることにより、核初期化物質が細胞に導入された状態にすることができる。その結果、iPS細胞を誘導することができる。当該工程において、核初期化物質が遺伝子の場合には、各遺伝子をベクターに組み込み、当該ベクターを直接あるいはウイルスを介して細胞に導入することができる。一方において、核初期化物質がタンパク質の場合には、公知のタンパク質導入法により、当該タンパク質を細胞に導入することができる。核初期化物質を細胞に接触させる方法について、以下で詳細に説明する。
核初期化物質である遺伝子を含むベクターは、ベクターの種類に応じて、自体公知の手法により細胞と接触させることで細胞に導入することができる。例えば、ウイルスベクターの場合、当該核酸を含むプラスミドを適当なパッケージング細胞(例、Plat−E細胞)や相補細胞株(例、293細胞)に導入して、培養上清中に産生されるウイルスベクターを回収し、各ウイルスベクターに応じた適切な方法により、ベクターを細胞に感染させる。一方、プラスミドベクターの場合には、リポフェクション法、リポソーム法、エレクトロポレーション法、リン酸カルシウム共沈殿法、DEAEデキストラン法、マイクロインジェクション法、遺伝子銃法などを用いて該ベクターを細胞に導入することができる。
核初期化物質の細胞への接触は、当該物質がタンパク質である場合、自体公知の細胞へのタンパク質導入方法を用いて実施することができる。そのような方法としては、例えば、タンパク質導入試薬を用いる方法、タンパク質導入ドメイン(PTD)融合タンパク質を用いる方法、マイクロインジェクション法などが挙げられる。タンパク質導入試薬としては、カチオン性脂質をベースとしたBioPOTER Protein Delivery Reagent(GeneTherapy Systmes)、Pro-JectT M Protein Transfection Reagent(PIERCE)及びProVectin(IMGENEX)、脂質をベースとしたProfect-1(Targeting Systems)、膜透過性ペプチドをベースとしたPenetrain Peptide(Q biogene)及びChariot Kit(Active Motif)等が市販されている。導入はこれらの試薬に添付のプロトコルに従って行うことができるが、一般的な手順は以下の通りである。核初期化物質を適当な溶媒(例えば、PBS、HEPES等の緩衝液)に希釈し、導入試薬を加えて室温で5−15分程度インキュベートして複合体を形成させ、これを無血清培地に交換した細胞に添加して37℃で1ないし数時間インキュベートする。その後培地を除去して血清含有培地に交換する。
種々のDPCの誘導効率を判断するために、OCT3/4遺伝子、SOX2遺伝子、KLF4遺伝子及びc−MYC遺伝子の4種類を,9種類のDPC株(DP1,DP31,DP75,DP87,DP94,DP133,DP165,DP166,DP193)のそれぞれに導入し、iPS細胞を作製した。iPS細胞の作製は以下のようにして行った。
実施例1で評価した各DPCのほか、コントロールとして36歳の成人皮膚由来線維芽細胞(HDF)及びヒトES細胞(khES)に関し、遺伝子発現の評価を行った。なお、khESは、京都大学再生医科学研究所より入手した。Real-time PCRによって、各DPC、HDF及びヒトES細胞(khES)から得られた各遺伝子の発現量を評価した。具体的には、RNeasy Plus Mini Kit (Qiagen)を用いて各DPC、HDF及びヒトES細胞(khES)のTotal RNAを採取した。Rever Tra Ace-α(Toyobo) を用いて、Total RNA (500 ng)からcDNA合成を行った。PCR反応は、SYBR Premix Ex Taq (Takara)と、各遺伝子用に設計されたプライマーDLX4 (S)(配列番号5)、DLX4 (AS)(配列番号6)(Takara) を用いて、Thermal Cycler Dice Real Time System (Takara)で行った。発現量の解析もThermal Cycler Dice Real Time Systemを用いて行った。その結果、歯根完成前後において複数の遺伝子の増減があったが、なかでも、DLX4遺伝子についての結果を図2に示す。図2では、DP31から得られたDLX4遺伝子の発現量で規格化して示す。なお、DP31での相対発現量を1.0とした。
DLX4 (AS): CTT ATA CTT GGA GCG TTT GTT CTG A(配列番号6)
Gateway(登録商標) LR反応を用いて、ヒト由来のDLX4遺伝子(配列番号1)を図3に示すpMXs−GWレトロウイルスベクターのORF領域に導入して組み換えpMXs−GWレトロウイルスベクター(以下、DLX4ベクターという。)を作製した。
(1)OCT3/4遺伝子及びSOX2遺伝子(OS)がトランスフェクトされたPlat−E細胞1
(2)OCT3/4遺伝子、SOX2遺伝子及びDLX4遺伝子(OSD)がトランスフェクトされたPlat−E細胞2
(3)OCT3/4遺伝子、SOX2遺伝子及びKLF4遺伝子(OSK)がトランスフェクトされたPlat−E細胞3
(4)OCT3/4遺伝子、SOX2遺伝子、KLF4遺伝子及びDLX4遺伝子(OSKD)がトランスフェクトされたPlat−E細胞4
(5)OCT3/4遺伝子、SOX2遺伝子、KLF4遺伝子及びc−MYC遺伝子がトランスフェクトされたPlat−E細胞5(OSKM)
DLX4遺伝子の異なる2個の領域をターゲットとする2個のsiRNA配列を設計した(配列番号7、配列番号8)。当該2個のsiRNA配列を、2種類のRNAポリメラーゼIIIプロモーター(ヒトU6及びヒトH1)を同時に用いて、2種類のsiRNAを発現し得るpSINsi−DKIレトロウイルスベクター(タカラ製)に導入した。Retrovirus Packaging Kit Eco(タカラ製)を用いて、このsiRNA―DLX4発現レトロウイルスベクターをG3T−hi細胞(タカラ製)にトランスフェクトした。siRNA―DLX4発現レトロウイルスベクターの感染後、DP31/Slc細胞をネオマイシン処理し、安定したsiRNA―DLX4発現DP31を得た。
siRNA-2 : CGA ATT GGA GCT TGA GCT T(配列番号8)
実施例3と同様にして、DP31及びsiRNA―DLX4発現DP31(DP31−siRNA―DLX4)についてDLX4遺伝子の遺伝子発現量の評価を行った。これら2種の細胞から得られた発現量をDP31から得られた発現量で規格化した。なお、DP31の相対発現量を1.0とした。図6に、DP31及びDP31−siRNA―DLX4でのDLX4遺伝子の相対発現量を示す。
実施例1と同様にして、OCT3/4遺伝子、SOX2遺伝子及びKLF4遺伝子を、DP31、DP31−siRNA―DLX4にそれぞれ導入して、実施例1と同様の操作を行った。なお、コロニーのカウントは、実施例1とは異なり、30日後に行った。また、図7には、DP31及びDP31−siRNA―DLX4でのiPS細胞の相対誘導効率を示す。
配列番号7,8:siRNA
Claims (13)
- 少なくともDLX4遺伝子又はその翻訳産物を含む核初期化物質と細胞とを接触させる工程を含む、人工多能性幹細胞の作製方法。
- 前記核初期化物質は、さらに、OCTファミリー遺伝子又はその翻訳産物と、SOXファミリー遺伝子又はその翻訳産物と、を含む、請求項1に記載の作製方法。
- 前記核初期化物質は、さらに、KLF4ファミリー遺伝子又はその翻訳産物を含む請求項1に記載の作製方法。
- 前記核初期化物質は、さらに、KLF4ファミリー遺伝子又はその翻訳産物を含む請求項2に記載の作製方法。
- 前記細胞は、歯髄細胞である請求項1〜4のいずれかに記載の作製方法。
- 前記細胞は、歯髄細胞である請求項2に記載の作製方法。
- 前記歯髄細胞は、歯根完成期前の歯髄細胞である、請求項5に記載の作製方法。
- 前記歯髄細胞は、歯根完成期前の歯髄細胞である、請求項6に記載の作製方法。
- DLX4遺伝子、OCT3/4遺伝子及びSOX2遺伝子を保持する、1又は2以上の組換えベクターを含むベクターセット。
- 請求項9に記載のベクターセットを含む人工多能性幹細胞作製剤。
- 請求項9に記載のベクターセットにより作製されたiPS細胞。
- 歯根完成期前の歯髄細胞を含む人工多能性幹細胞を作製するための剤。
- DLX4遺伝子を含む人工多能性幹細胞作製剤。
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