JPS63208763A - 塩基配列決定装置 - Google Patents
塩基配列決定装置Info
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- JPS63208763A JPS63208763A JP62044463A JP4446387A JPS63208763A JP S63208763 A JPS63208763 A JP S63208763A JP 62044463 A JP62044463 A JP 62044463A JP 4446387 A JP4446387 A JP 4446387A JP S63208763 A JPS63208763 A JP S63208763A
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- tubes
- nucleic acid
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- Pending
Links
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Landscapes
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
（産業上の利用分野）
本発明はマクサム・ギルバート（Ｍａｘａｍ−Ｇｉｌｂ
ｅｒｔ）法又はサンガー（Ｓａｎｇｅｒ）法を利用して
核酸の塩基配列を決定する装置の最終段階で用いるゲル
電気泳動装置のパターン解析部分に関するものである。
ｅｒｔ）法又はサンガー（Ｓａｎｇｅｒ）法を利用して
核酸の塩基配列を決定する装置の最終段階で用いるゲル
電気泳動装置のパターン解析部分に関するものである。
（従来の技術）
塩基配列の決定装置としてはラジオアイソトープ法によ
る装置と、蛍光ラベル法による装置（特公昭６０−２２
０８６０号公報参照）が知られている。
る装置と、蛍光ラベル法による装置（特公昭６０−２２
０８６０号公報参照）が知られている。
（発明が解決しようとする問題点）
ラジオアイソトープ・ラベルを用いる装置では放射線の
取扱いが容易ではないという問題があり、また、最終的
なシーケンスの決定までに例えば３日間というような長
時間を用する問題がある。
取扱いが容易ではないという問題があり、また、最終的
なシーケンスの決定までに例えば３日間というような長
時間を用する問題がある。
蛍光ラベルを用いる装置では、ラジオアイソトープ法に
比べて感度が１〜２桁劣る。そのため、誤り率が１％以
上に達している（ ｒＮａｔｕｒｅＪ誌３２１巻１２号
６７４〜６７９ページ参照）。
比べて感度が１〜２桁劣る。そのため、誤り率が１％以
上に達している（ ｒＮａｔｕｒｅＪ誌３２１巻１２号
６７４〜６７９ページ参照）。
そのため、蛍光ラベル法では定常蛍光法に代って時間分
解蛍光法が提案されている（特開昭６１−２０７７号公
報を参照）０時間分解蛍光法では励起光をパルス的に照
射し、励起光が消光した後のみの蛍光を検出することに
よってバックグラウンドを減少させることができるが、
蛍光の発光時間が非常に短かいので、励起光パルスの立
下り時間を１ナノ秒以下にするスイッチングが必要であ
る。このような高速のスイッチングは機械的なシャッタ
では実現することができず、モードロックレーザを用い
なければならない。そのため、装置が高価になる。また
、高速での信号処理が難しく、時間分解蛍光法は現在の
ところ提案のみに留まっている。
解蛍光法が提案されている（特開昭６１−２０７７号公
報を参照）０時間分解蛍光法では励起光をパルス的に照
射し、励起光が消光した後のみの蛍光を検出することに
よってバックグラウンドを減少させることができるが、
蛍光の発光時間が非常に短かいので、励起光パルスの立
下り時間を１ナノ秒以下にするスイッチングが必要であ
る。このような高速のスイッチングは機械的なシャッタ
では実現することができず、モードロックレーザを用い
なければならない。そのため、装置が高価になる。また
、高速での信号処理が難しく、時間分解蛍光法は現在の
ところ提案のみに留まっている。
本発明は、ＤＮＡなどの核酸の断片をラジオアイソトー
プや蛍光物質でラベルすることなく、泳動中の核酸断片
を直接検出して塩基配列を決定することのできる装置を
提供することを目的とするものである。
プや蛍光物質でラベルすることなく、泳動中の核酸断片
を直接検出して塩基配列を決定することのできる装置を
提供することを目的とするものである。
（問題点を解決するための手段）
本発明では複数個の泳動管の一端部にそれぞれ電極形検
出器を設ける。
出器を設ける。
（作用）
末端の塩基の異なる核酸断片をそれぞれ異なる泳動管の
他端から注入し、各泳動管の両端に泳動電圧を印加して
泳動を行なうと、一端部の電極の間を核酸断片が通過す
るとき、その電極間の抵抗値が変化するので、これによ
って核酸断片が通過したことを検出する。そして核酸断
片が通過する順位を検出することにより塩基配列を決定
する。
他端から注入し、各泳動管の両端に泳動電圧を印加して
泳動を行なうと、一端部の電極の間を核酸断片が通過す
るとき、その電極間の抵抗値が変化するので、これによ
って核酸断片が通過したことを検出する。そして核酸断
片が通過する順位を検出することにより塩基配列を決定
する。
（実施例）
第１図は一実施例における１本の泳動管についての構造
を示したものである。
を示したものである。
２は泳動管であり、泳動管２の内径は約１ｍｍである。
泳動管２中にはポリアクリルアミド・ゲルが充填されて
いる。泳動管２の上端及び下端はそれぞれ電解液４，６
に浸されており、再電解液４．６を通じて電源８から泳
動管２の両端に泳動電圧が印加される。
いる。泳動管２の上端及び下端はそれぞれ電解液４，６
に浸されており、再電解液４．６を通じて電源８から泳
動管２の両端に泳動電圧が印加される。
泳動管２の下端部には検出器を構成する一対の電極１０
．１２が対向して設けられている。電極１０．１２の間
隔は約０．５ｍｍである。１４は電極１０，１２の検出
信号を増幅する増幅器、１６は増幅された検出信号を処
理するデータ処理回路である。
．１２が対向して設けられている。電極１０．１２の間
隔は約０．５ｍｍである。１４は電極１０，１２の検出
信号を増幅する増幅器、１６は増幅された検出信号を処
理するデータ処理回路である。
泳動管２の上端にはサンガー法などで処理された末端塩
基側のＤＮＡ断片１８が試料として注入され、泳動管２
中を泳動していく。このような泳動管２が第２図に２−
１〜２−ｎとして示されるように複数本配置され、１検
体について４本の泳動管が１組として使用されて塩基配
列が決定される。４本１組の泳動管にはそれぞれ、末端
塩基がＡ（アデニン）、Ｃ（シトシン）、Ｇ（グアニン
）、Ｔ（チミン）のＤＮＡ断片試料が注入される。
基側のＤＮＡ断片１８が試料として注入され、泳動管２
中を泳動していく。このような泳動管２が第２図に２−
１〜２−ｎとして示されるように複数本配置され、１検
体について４本の泳動管が１組として使用されて塩基配
列が決定される。４本１組の泳動管にはそれぞれ、末端
塩基がＡ（アデニン）、Ｃ（シトシン）、Ｇ（グアニン
）、Ｔ（チミン）のＤＮＡ断片試料が注入される。
各泳動管２−１〜２−ｎごとに増幅器１４とデータ処理
回路１６を設けてもよいが、泳動速度は速くはないので
、第３図に示されるように各泳動管２−１〜２− ｎの
電極１０．１２と増幅器１４との接続をスイッチ１８に
よって順次切り換えるようにし、この切換えを信号切換
え回路２０によって制御していく。これによって−組の
増幅器１４とデータ処理回路１６によって複数本の泳動
管２−１〜２−ｎの検出信号を順次取り込むことができ
る。
回路１６を設けてもよいが、泳動速度は速くはないので
、第３図に示されるように各泳動管２−１〜２− ｎの
電極１０．１２と増幅器１４との接続をスイッチ１８に
よって順次切り換えるようにし、この切換えを信号切換
え回路２０によって制御していく。これによって−組の
増幅器１４とデータ処理回路１６によって複数本の泳動
管２−１〜２−ｎの検出信号を順次取り込むことができ
る。
次に、本実施例の動作について説明する。
第２図に示される０本の泳動管２−１〜２−ｎのうち、
１組の泳動管２−１〜２−４の試料Ａ。
１組の泳動管２−１〜２−４の試料Ａ。
Ｃ，Ｇ、Ｔについて図に示されるように泳動が進行して
いるものとする。このとき各泳動管２−１〜２−４の電
極１０．１２からは第４図に示されるように検出信号が
得られる。
いるものとする。このとき各泳動管２−１〜２−４の電
極１０．１２からは第４図に示されるように検出信号が
得られる。
この結果、１組の泳動管２−１〜２−４から得られる試
料の塩基配列はＡＣＧＡＧＡＣＴと決定することができ
る。
料の塩基配列はＡＣＧＡＧＡＣＴと決定することができ
る。
第５図には泳動管２の他の構造を示す。
この泳動管２では一対の電極１０．１２が絶縁物のスペ
ーサ２２を介して泳動方向に配置されている。電極１０
．１２の間隔は０．０５〜１ｍｍである。
ーサ２２を介して泳動方向に配置されている。電極１０
．１２の間隔は０．０５〜１ｍｍである。
一対の電極１０．１２で核酸断片が通過したことを検出
する方式としては、導電率、電位勾配又は誘電率のいず
れを検出する方式であってもよい。
する方式としては、導電率、電位勾配又は誘電率のいず
れを検出する方式であってもよい。
（発明の効果）
本発明の塩基配列決定装置では、複数個の泳動管の一端
部にそれぞれ電極形検出器を設け、その電極形検出器に
よって泳動中の核酸断片を検出して塩基配列を決定する
ので、ラジオアイソトープや蛍光体で核酸断片をラベル
する必要がなく、核酸断片を直接電気的に検出すること
ができる。
部にそれぞれ電極形検出器を設け、その電極形検出器に
よって泳動中の核酸断片を検出して塩基配列を決定する
ので、ラジオアイソトープや蛍光体で核酸断片をラベル
する必要がなく、核酸断片を直接電気的に検出すること
ができる。
第１図は一実施例の１個の泳動管についての構造を示す
概略図、第２図は泳動管の配列を示す概略正面図、第３
図は検出器の切換え部分を示すブロック図、第４図は一
実施例で検出される信号を示す波形図、第５図は他の実
施例における泳動管の電極部分を示す断面図である。 ２．２−１〜２− ｎ・・・・・・泳動管、４．６・・
・・・・電解液。 ８・・・・・・泳動用電源。 １０．１２・・・・・・電極。
概略図、第２図は泳動管の配列を示す概略正面図、第３
図は検出器の切換え部分を示すブロック図、第４図は一
実施例で検出される信号を示す波形図、第５図は他の実
施例における泳動管の電極部分を示す断面図である。 ２．２−１〜２− ｎ・・・・・・泳動管、４．６・・
・・・・電解液。 ８・・・・・・泳動用電源。 １０．１２・・・・・・電極。
Claims (1)
- （１）両端が電解液に浸され、両端の電解液間に泳動電
圧が印加される泳動管が複数個設けられ、各泳動管の一
端部には電極形検出器が設けられており、各泳動管の他
端部から核酸断片が注入される核酸の塩基配列決定装置
。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP62044463A JPS63208763A (ja) | 1987-02-25 | 1987-02-25 | 塩基配列決定装置 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP62044463A JPS63208763A (ja) | 1987-02-25 | 1987-02-25 | 塩基配列決定装置 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPS63208763A true JPS63208763A (ja) | 1988-08-30 |
Family
ID=12692188
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP62044463A Pending JPS63208763A (ja) | 1987-02-25 | 1987-02-25 | 塩基配列決定装置 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JPS63208763A (ja) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP0486559A1 (en) * | 1989-08-07 | 1992-05-27 | Applied Biosystems | FRACTIONATION OF NUCLEIC ACID BY CAPILLARY ELECTROPHORESIS AGAINST MIGRATION. |
-
1987
- 1987-02-25 JP JP62044463A patent/JPS63208763A/ja active Pending
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP0486559A1 (en) * | 1989-08-07 | 1992-05-27 | Applied Biosystems | FRACTIONATION OF NUCLEIC ACID BY CAPILLARY ELECTROPHORESIS AGAINST MIGRATION. |
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