JPH03247288A - クロストリジウムサーモハイドロスルフリカムのキシロースイソメラーゼ遺伝子 - Google Patents
クロストリジウムサーモハイドロスルフリカムのキシロースイソメラーゼ遺伝子Info
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- JPH03247288A JPH03247288A JP4471690A JP4471690A JPH03247288A JP H03247288 A JPH03247288 A JP H03247288A JP 4471690 A JP4471690 A JP 4471690A JP 4471690 A JP4471690 A JP 4471690A JP H03247288 A JPH03247288 A JP H03247288A
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- xylose isomerase
- isomerase gene
- clostridium thermohydrosulfuricum
- thermohydrosulfuricum
- xylose
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- Pending
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
〔産業上の利用分野〕
る)のキシロースイソメラーゼ遺伝子に関する。
キシロースイソメラーゼは、D−キシロースとD−キシ
ルロースの相互変換を触媒する酵素であるが、同時にグ
ルコースをフラクトースに変換する能力も有し、工業的
に重要である。
ルロースの相互変換を触媒する酵素であるが、同時にグ
ルコースをフラクトースに変換する能力も有し、工業的
に重要である。
一方、C,サーモハイドロスルフリカムは、高熱性細菌
の一種であり、ATCC33223の寄託番号が付され
ている。
の一種であり、ATCC33223の寄託番号が付され
ている。
C,サーモハイドロスルフリカムがキシロースイソメラ
ーゼを産生ずることは、従来から知られていた[J、B
acteriol、 164.1146−1152(1
985)参照〕しかし、C,サーモハイドロスルフリカ
ムのキシロースイソメラーゼ遺伝子は知られていなかっ
た。
ーゼを産生ずることは、従来から知られていた[J、B
acteriol、 164.1146−1152(1
985)参照〕しかし、C,サーモハイドロスルフリカ
ムのキシロースイソメラーゼ遺伝子は知られていなかっ
た。
714の十ンロースイソメラーで遺伝子を提供すること
にある。
にある。
高熱性細菌であるC、サーモハイドロスルフリカムのキ
シロースイソメラーゼは、好熱性であることから、その
遺伝子をタンパク質生産性の高い細菌に導入すれば、好
熱性のキシロースイソメラーゼを大量に生産することが
可能となる。
シロースイソメラーゼは、好熱性であることから、その
遺伝子をタンパク質生産性の高い細菌に導入すれば、好
熱性のキシロースイソメラーゼを大量に生産することが
可能となる。
本発明のC,サーモハイドロスルフリカムのキシロース
イソメラーゼ遺伝子は、例えば第1図に示す塩基配列を
有する。C,サーモハイドロスルフリ旦のキシロースイ
ソメラーゼ遺伝子は、以下の方法で大腸菌へクローニン
グすることにより調製し、その塩基配列を決定すること
ができる。
イソメラーゼ遺伝子は、例えば第1図に示す塩基配列を
有する。C,サーモハイドロスルフリ旦のキシロースイ
ソメラーゼ遺伝子は、以下の方法で大腸菌へクローニン
グすることにより調製し、その塩基配列を決定すること
ができる。
l巷:
クロストリジウム サーモハイドロスルフリカム:AT
CC33223 大腸菌MV1184:ara、△(Iac−pro)、
5trA、thi、(φ80△1aclZ△M15)、
△ (srl−recA)306: :TnlO
(tet’);F’ ;traD36゜proAB、
1acI”Z△M15(1)生育条件 C,サーモハイドロスルフリカム菌は、メラスニエミ(
Melasniemi)によって記載されているように
キシロースを炭素源として用い、かつNH,cl 1
g/f、CoC1’20.03g / IIを補充した
培地を用いて65℃で生育させた。
CC33223 大腸菌MV1184:ara、△(Iac−pro)、
5trA、thi、(φ80△1aclZ△M15)、
△ (srl−recA)306: :TnlO
(tet’);F’ ;traD36゜proAB、
1acI”Z△M15(1)生育条件 C,サーモハイドロスルフリカム菌は、メラスニエミ(
Melasniemi)によって記載されているように
キシロースを炭素源として用い、かつNH,cl 1
g/f、CoC1’20.03g / IIを補充した
培地を用いて65℃で生育させた。
大腸菌細胞は、2倍濃度のイーストエキス・トリプトン
培地(Dirco)中で37℃で生育させた。
培地(Dirco)中で37℃で生育させた。
クローニング及びシーフェンシング操作ゲノムDNAは
、斉藤の方法[’5aito、 H,及びMiura、
K、 Preparation of transf
orming DNA byphenol treat
ment、 Biochim、 Biophys、
Acta 1963、72(619−629) ] に
より、C,サーモハイドロスルフリカムから抽出した。
、斉藤の方法[’5aito、 H,及びMiura、
K、 Preparation of transf
orming DNA byphenol treat
ment、 Biochim、 Biophys、
Acta 1963、72(619−629) ] に
より、C,サーモハイドロスルフリカムから抽出した。
凍結ペレット(0,34g)をNaClを200 mM
、 EDTAを100mM含むトリス50mM (1)
H8,0) 4.5mlに溶解した。10%SD S
0.5 dを加え、混合物は600C15分間ゆっくり
と回転させ、次いで60°C30分間 RNA5eA
(0,05mg/d) テ処理した。次i:60℃テ
ロ0分間プロティナーゼK(0,5■/−)で処理した
。溶菌液は、フェノール/トリスバッファーで3回、フ
ェノール/クロロホルムで1回抽出した。
、 EDTAを100mM含むトリス50mM (1)
H8,0) 4.5mlに溶解した。10%SD S
0.5 dを加え、混合物は600C15分間ゆっくり
と回転させ、次いで60°C30分間 RNA5eA
(0,05mg/d) テ処理した。次i:60℃テ
ロ0分間プロティナーゼK(0,5■/−)で処理した
。溶菌液は、フェノール/トリスバッファーで3回、フ
ェノール/クロロホルムで1回抽出した。
残渣を遠心分離(10分間、15000 rpm )で
除去した。0.8容のイソプロパツールを添加した後、
DNAを巻き出し、EDTAyfr:1 [11M含む
トリス10mM (pH8,0) 1.5艷に溶解した
。最後に、DNAをDEAEカラム(洗浄バッファー:
トリス5゜mM、 pH8,0、EDTA 1mM、
NaC10,15M ;溶出バッファー、トリス50
mMXp)18. O1EDTA 1 mM。
除去した。0.8容のイソプロパツールを添加した後、
DNAを巻き出し、EDTAyfr:1 [11M含む
トリス10mM (pH8,0) 1.5艷に溶解した
。最後に、DNAをDEAEカラム(洗浄バッファー:
トリス5゜mM、 pH8,0、EDTA 1mM、
NaC10,15M ;溶出バッファー、トリス50
mMXp)18. O1EDTA 1 mM。
NaCl LM)を用いたアニオン交換樹脂により精
製した。
製した。
ゲノムDNAは、EcoRI 、 Hindlll及び
PstIを用いて消化した。フラグメントは、0.4%
アガロースゲル電気泳動で分離した。DNAは、25分
間1.5 MNaCl、0.5 M NaOH中にゲ
ルを浸すことにより変性した。ゲルは、3M酢酸ナトリ
ウム(pH5,5)で中和した。DNAは、エレクトロ
ブロッティング(3時間、2 mA/ cm)によりナ
イロン膜(Biodyne)に移し、80℃で1時間焼
成した。
PstIを用いて消化した。フラグメントは、0.4%
アガロースゲル電気泳動で分離した。DNAは、25分
間1.5 MNaCl、0.5 M NaOH中にゲ
ルを浸すことにより変性した。ゲルは、3M酢酸ナトリ
ウム(pH5,5)で中和した。DNAは、エレクトロ
ブロッティング(3時間、2 mA/ cm)によりナ
イロン膜(Biodyne)に移し、80℃で1時間焼
成した。
このプロットを、バチルス スブチリス(Bacill
ussubtilis) キシロースイソメラーゼ遺
伝子から得た32pラベルされた240ヌクレオチドB
beI −Ddelフラグメント(10’cprn/m
l)を用いて58°Cでハイブリダイズさせた。このフ
ラグメントは、violaceoni er)及びアン
プラリエラ(Ampulariella)から得たキシ
ロースイソメラーゼアミノ酸配列と比べると分かるよう
に、2つの比較的高いホモロジー領域を含む。ハイブリ
ダイゼーションの後、EcoRIでは8.7 Kb、
HindIIIでは2.2Kb及びPstlでは3.6
Kb付近に単一のバンドが現れた。
ussubtilis) キシロースイソメラーゼ遺
伝子から得た32pラベルされた240ヌクレオチドB
beI −Ddelフラグメント(10’cprn/m
l)を用いて58°Cでハイブリダイズさせた。このフ
ラグメントは、violaceoni er)及びアン
プラリエラ(Ampulariella)から得たキシ
ロースイソメラーゼアミノ酸配列と比べると分かるよう
に、2つの比較的高いホモロジー領域を含む。ハイブリ
ダイゼーションの後、EcoRIでは8.7 Kb、
HindIIIでは2.2Kb及びPstlでは3.6
Kb付近に単一のバンドが現れた。
PstI消化クロスりリジュウムDNAの3.6Kb±
0.6Kbのフラグメントは、ガラスミルク(glas
smilk)を用いた抽出により単離され、Pstl消
化された大腸菌ベクターpUc119とリゲートさせた
。コンピテント大腸菌MV1184細胞をリゲートした
DNAで形質転換した。所望のクロストリジュウムDN
Aを有するコロニーをバチルス スブチリスプローブと
形質転換体のコロニーとのハイブリダイゼーションによ
り検出した。ポジティブなシグナルを与えるコロニーか
らアルカリ溶解法によりプラスミドDNAを抽出し、制
限酵素による消化及びサザンハイプリダイゼーションに
より分析した。
0.6Kbのフラグメントは、ガラスミルク(glas
smilk)を用いた抽出により単離され、Pstl消
化された大腸菌ベクターpUc119とリゲートさせた
。コンピテント大腸菌MV1184細胞をリゲートした
DNAで形質転換した。所望のクロストリジュウムDN
Aを有するコロニーをバチルス スブチリスプローブと
形質転換体のコロニーとのハイブリダイゼーションによ
り検出した。ポジティブなシグナルを与えるコロニーか
らアルカリ溶解法によりプラスミドDNAを抽出し、制
限酵素による消化及びサザンハイプリダイゼーションに
より分析した。
バチルス スブチリスキシロースイソメラーセ遺伝子か
ら得たプローブと強力にハイブリダイズする3、 55
KbPstlフラグメントを得た。
ら得たプローブと強力にハイブリダイズする3、 55
KbPstlフラグメントを得た。
この3.55’Kbフラグメントを、制限酵素Alul
。
。
)1aeIII、 Ndel及び旧ndlllを用いて
小さい−フラグメントに消化した。これらのフラグメン
トは、pUC118及びpUc119を用いて大腸菌M
V1184にサブクローンした。1本鎖DNAをビエイ
ラ(Vieira)の方法に従って調製し、T7DNA
ポリメラーゼ(ンークエンスver2.0 :商品名)
及び7−デアザdGTPを用いて配列を決定した。
小さい−フラグメントに消化した。これらのフラグメン
トは、pUC118及びpUc119を用いて大腸菌M
V1184にサブクローンした。1本鎖DNAをビエイ
ラ(Vieira)の方法に従って調製し、T7DNA
ポリメラーゼ(ンークエンスver2.0 :商品名)
及び7−デアザdGTPを用いて配列を決定した。
ツメラーゼ遺伝子の塩基配列及びアミノ酸配列を第1図
に示す。
に示す。
本発明のC,サーモハイドロスルフリカムのキシロース
イソメラーゼ遺伝子は、例えばバチルスプレビス及び枯
草菌等の菌に導入し、この導入歯を培養することにより
、キシロースイソメラーゼを大量に生産し得ることが期
待される。
イソメラーゼ遺伝子は、例えばバチルスプレビス及び枯
草菌等の菌に導入し、この導入歯を培養することにより
、キシロースイソメラーゼを大量に生産し得ることが期
待される。
第1図に本発明のC,サーモハイドロスルフリカムのキ
シロースイソメラーゼ遺伝子の塩基配列を示す。 第1 図 0 CTGCAGGATA 0 CCACACGGAG 0 CTTTCAAATG 0 TGGAGCAAAG 0 TTTTAAATAA 0 TTATATTTTC 30 AAAAATGTAC 40 CACAAATAAA 50 ATATGAAGGA 90 TTTTACAATC 00 CAGATGAAAT 10 AATAGACGGA 50 GTAGCGTACT 60 GGCACACATT 70 TACAGCCAAT 10 CAAAGGCCAT 20 GGGACCATTT 30 TACTGACCCT 70 GCCTTTGAAC 80 TATTTGAAAA 90 ACTCGACGTA 30 GCTCCGGAAG 40 GAGAGACATT 50 AAGGGAGACG 90 ATAAAAGACT 00 ACTTAAAGAC 10 GAGCAAAACA その ■ 0 AGACAATGGA 0 AGCATATATT 0 GCATGGCACT 00 AAAAAGGAGG 10 AAAATGACAT 20 GGAATACTTC 60 CCAAAATCAA 70 ACAATCCATA 80 TGCATTTAAA 20 AAACCTTTAA 30 AAGAACACTT 40 GCGTTTTTCA 80 GGGACAGATC 90 CATTTGGAGC 00 ACCCACAATG 40 ATGGATATTG 50 CCAAAGCGAG 60 AGTAGAAGCA 00 CCATTTTTCT 10 GTTTCCATGA 20 CAGAGATATA 60 AACAAAAATT 70 TAGATACAAT 80 AGTTGCAATG 20 AAAGTATTAT 30 GGGGCACAGC 40 GAACCTTTTT
シロースイソメラーゼ遺伝子の塩基配列を示す。 第1 図 0 CTGCAGGATA 0 CCACACGGAG 0 CTTTCAAATG 0 TGGAGCAAAG 0 TTTTAAATAA 0 TTATATTTTC 30 AAAAATGTAC 40 CACAAATAAA 50 ATATGAAGGA 90 TTTTACAATC 00 CAGATGAAAT 10 AATAGACGGA 50 GTAGCGTACT 60 GGCACACATT 70 TACAGCCAAT 10 CAAAGGCCAT 20 GGGACCATTT 30 TACTGACCCT 70 GCCTTTGAAC 80 TATTTGAAAA 90 ACTCGACGTA 30 GCTCCGGAAG 40 GAGAGACATT 50 AAGGGAGACG 90 ATAAAAGACT 00 ACTTAAAGAC 10 GAGCAAAACA その ■ 0 AGACAATGGA 0 AGCATATATT 0 GCATGGCACT 00 AAAAAGGAGG 10 AAAATGACAT 20 GGAATACTTC 60 CCAAAATCAA 70 ACAATCCATA 80 TGCATTTAAA 20 AAACCTTTAA 30 AAGAACACTT 40 GCGTTTTTCA 80 GGGACAGATC 90 CATTTGGAGC 00 ACCCACAATG 40 ATGGATATTG 50 CCAAAGCGAG 60 AGTAGAAGCA 00 CCATTTTTCT 10 GTTTCCATGA 20 CAGAGATATA 60 AACAAAAATT 70 TAGATACAAT 80 AGTTGCAATG 20 AAAGTATTAT 30 GGGGCACAGC 40 GAACCTTTTT
Claims (2)
- (1)クロストリジウムサーモハイドロスルフリカムの
キシロースイソメラーゼ遺伝子。 - (2)クロストリジウムサーモハイドロスルフリカムが
ATCC33223である請求項1記載のキシロースイ
ソメラーゼ遺伝子。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP4471690A JPH03247288A (ja) | 1990-02-26 | 1990-02-26 | クロストリジウムサーモハイドロスルフリカムのキシロースイソメラーゼ遺伝子 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP4471690A JPH03247288A (ja) | 1990-02-26 | 1990-02-26 | クロストリジウムサーモハイドロスルフリカムのキシロースイソメラーゼ遺伝子 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPH03247288A true JPH03247288A (ja) | 1991-11-05 |
Family
ID=12699143
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP4471690A Pending JPH03247288A (ja) | 1990-02-26 | 1990-02-26 | クロストリジウムサーモハイドロスルフリカムのキシロースイソメラーゼ遺伝子 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JPH03247288A (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US9951326B2 (en) | 2015-07-13 | 2018-04-24 | MARA Renewables Corporation | Enhancing microbial metabolism of C5 organic carbon |
-
1990
- 1990-02-26 JP JP4471690A patent/JPH03247288A/ja active Pending
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US9951326B2 (en) | 2015-07-13 | 2018-04-24 | MARA Renewables Corporation | Enhancing microbial metabolism of C5 organic carbon |
US10662418B2 (en) | 2015-07-13 | 2020-05-26 | MARA Renewables Corporation | Enhancing microbial metabolism of C5 organic carbon |
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