JPH02291267A - α―フェトプロテイン遺伝子のエンハンサーに結合する蛋白質をコードするDNA - Google Patents

α―フェトプロテイン遺伝子のエンハンサーに結合する蛋白質をコードするDNA

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JPH02291267A
JPH02291267A JP1112519A JP11251989A JPH02291267A JP H02291267 A JPH02291267 A JP H02291267A JP 1112519 A JP1112519 A JP 1112519A JP 11251989 A JP11251989 A JP 11251989A JP H02291267 A JPH02291267 A JP H02291267A
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 定栗よ優肌ユ分団 本発明は、α−フェトプロテインエンハンサに特異的に
結合し、該α−フエトプロテイン遺伝子の転写を促進さ
せる蛋白質をコードするDNAに関する。
このDNAは動物細胞における遺伝子の大量発現系に有
用である。
征1)胤 真核細胞の遺伝情報の調節は、転写(transcri
ption)RNAブロセッシング(process 
ing)蛋白質への翻訳及び翻訳後のプロセッシングの
各段階で行われているが、このうち転写レベルでの調節
は遺伝情゜報の発現に最も強い影響を及ぼしている。
ところで、RNAポリメラーゼHによって転写される遺
伝子の5′側には転写を制御するプロモーター及びプロ
モーター活性を調節するエンハンサーが存在する例もみ
られる。そして、最近、これらプロモーターやエンハン
サーの特異的な塩基配列を認識して結合する核内因子が
発見され、これらの因子の結合によりプロモーターの活
性が制御されることが明らかとなった。
上記因子に関しては、プロモーター領域に存在するTA
TAボックス、CAATポソクス、GCボックスに結合
し、RNAポリメラーゼHによる転写を促進させる蛋白
質の研究が進められており、CAATボックス結合因子
とGCボソクス結合因子に関してはcDNAがクローニ
ングされている。
一方、エンハンサー領域に結合する因子についても研究
が行われており、例えば、免疫グロブリンのκ鎖遺伝子
エンハンサーに結合するB細胞の特異的な因子O T 
F −2 (Octamer transcripti
onfactor−2)  (Michael et 
al. rネイチ+  (Na ture) Jy狙,
 544−551,(1988))や同一エンハンサー
配列を認識するが他の組識にも汎在するOTF−1等(
R.A, Stur+m.、G. Das and W
. Herr rジーンアンドディベロソブメントJ 
(Gene & Development)1. 15
82(1988))のcDNΔが単離されている。
ヒトα−フェトプロテイン遺伝子では、転写開始点の5
′側3.5 Kbの位置にエンハンサー活性を示ず領域
の存在が確認されており、このエンハンサー領域に結合
する因子が発見され、AFP−1と称せられている(S
AWADAISHI et al. rモレキュラーア
ンドセルラーバイオロジー(Molecularand
 Cellular Biology)J vol.8
. 5179−5187 (1988))。
しかし、AFP−1の構造、物理化学的性質及びそれを
コードする遺伝子は未だ明らかにされていない。
允朋プ」仁(骸夫立{】}り策皿 本発明者らは、α−フェトプロテイン遺伝子のエンハン
サー頭域に存在するTTAATAATT’A構造を中心
とする領域に特異的に結合する核内因子の研究を進めた
結果、この因子をコードする遺伝子DNAを得るととも
に該DNAの塩基配列を明らかにし、本発明をなすに至
った。
したがって、本発明は、α−フエl−プロテイン遺伝子
エンハンサー領域に結合する蛋白質をコドする、新規な
塩基配列で表わされるDNAを提供することを課題とす
る。
課皿{五犬工Akムq王役 本発明に係るα〜フエトプロテイン遺伝子のエンハンサ
ー領域に結合する蛋白質は、第1図に示したアミノ酸配
列を一次配列の中に有する蛋白質であって、細胞核内に
存在し、α−フエ1・プロテイン生産細胞より抽出され
る。
したがって、本発明では、肝臓由来の細胞であって、α
−フェトプロテインを生産する細胞より目的とする遺伝
子DNAを得ることができる。
α−フエトプロテイン生産細胞としては、株化したヒト
肝癌細胞H u H − 7等の細胞を例示し得る。
本発明においては、如上のα−フエトプロテイン生産細
胞を培養し、得られた増殖細胞を回収した後、破砕して
sRNAを抽出し、得られた抽出RNA画分より、オリ
ゴ(dT)セルロースを用いてポリ(A)RNAを常法
にしたがって回収する。
なお、上記mRNAの抽出はグアニジンチオシアネート
塩化セシウム法(J. M. Chirgwin et
 al.+「バイオケミストリーJ (Bio−Che
+++istry)■, 5294,(1979) )
等の方法を採用して行うとよい。
次いで、上述のようにして回収したポリ(A)RNAを
鋳型として逆転写酵素を用いてcDNAを合成し、さら
に、このcDNAを2本鎖c DNAになした後、λフ
ァ一.ジにバッケージングして組換えファージを作製す
る。
ここで用いるλファージとしては市販のバフケージング
システム、例えばバッカージーンバ.7ケジングシステ
ム(ブロメガ社製)等が使用できる。
次に、上述のようにして作製した組換え体をホストであ
る大腸菌、例えばE.coli Y 1090(r−’
)に導入し、さらに、この大腸菌をアガロースブレト上
で増殖させてcDNAライブラリーを作製する。このよ
うにして作製したc DNAライブラリーよりα−フエ
トブロティン遺伝子のエンハンサー頭域のDNAをプロ
ーブとしてスクリーニングすることにより、目的とする
α−フェ1・プロテイン遺伝子エンハンサー領域に結合
する蛋白質をコードするDNAを得ることができる。
以下実施例により本発明を詳しく説明する。
実施例 本例ではヒト肝癌細胞由来の株化細胞H u H −7
よりα−フエトプロテイン遺伝子エンハンサー結合蛋白
質をコードするDNAの調製を示す。
■α−フェトプロテイン生産細胞の培養原料細胞として
ヒト肝臓由来の細胞であって、α−フェトプロテイン遺
伝子の生産能を有する株化ヒト肝癌細胞H u H−7
を用い、下記条件で培養を行った。
なお、上記細胞株は、岡山大学医学部付属癌源研究施設
、病理研究部門佐藤二郎教授の研究室より分譲可能であ
る。
培養条件: 培地としては、ラクトアルブミンの加水分解物(ギプコ
)を3%(一t)添加したR PM I −1640培
地あるいは牛胎児血清を5〜10%(V/ν)を加えた
R P M [−1640培地を用いた。この培養液は
適宜交換し、培養は5%炭酸ガスを含む空気を満たした
培養器内で行った。
■上記培養細胞からボIJ(A)RNAの調製培養細胞
2X10’個からグアニジンイソチオシアネート塩化セ
シウム法〔「バイオケミストリー」(BiocheII
listry) 18, 5294,(1979))を
用い、下記手順によりトータルRNAを抽出した。
細胞に20艷の6Mグアニジンイソチオシアネート、5
IIIMクエン酸ナトリウム、0.1M 2−メルヵブ
トエタノール、0.5%N−ラウロイルサルコシン酸ナ
ト゛リウム溶液を添加し、ホモジナイズしたのち、この
ホモジネート1〇一当り1gの塩化セシウムを熔解した
。5.7M塩化セシウム、0. LM E D T A
 (pH 7.5)2.5−をボリアロマー遠心管に入
れ、その上からホモジネート10−を重層したのち、日
立超遠心ロクーRPS 40T ニよッ734,00O
rpm テ18時間、20℃で遠心を行った。遠心後、
沈渣をlmlのlOmM} ’J ス−HCI(pH 
7.4)、5wM EDTA,1%SDSに溶解し、こ
の溶液に等量のクロロホルム:n−フタノール(4:1
、ν/v)を加え、十分混合したのち、遠心分離して、
水層を得た。この水層に1/logの3M酢酸ナトリウ
ム(pH 5.5)と2.5倍量のエタノルを加え混合
し、−70’Cに2時間以上放置後遠心して沈澱を得た
。沈澱を70%エタノールで洗った後乾固し、これをト
ータルRNAとした。
トータルRNAからポリ(A) R N Aを調製する
には以下に述べる様にオリゴ(dT)セルロースを用い
たアフィニティーク口マトグラフィーを行った.オリゴ
(dT)セルロース50+ngをIOInMトリスーH
CI(pll7.5)、0.5M NaCl, 1mM
 E DTA, 0.1%S O S溶液で平衡化し、
これに同緩衝液に溶解したトタルRNA390μgを吸
着させた。非吸着RNAを同上緩衝液で洗い、次に、吸
着したRNAを101トリスーHCI(pl1 7.5
)、1a+M EDTA, 0.05%SDSで溶出さ
せた。この?容出液に1/10量の3M酢酸ナトリウム
(pH 5.5)と2.5倍容量のエタノールを加えて
混合したのちに=70℃に2時間以上放置した。遠心分
離によって沈澱を集め、70%エタノルで洗ったのちに
滅菌蒸留水に溶解してポリ(A)RNAとした。
■cDNAの合成 cDNAの合成はファルマシア社製のcDNA合成キッ
トを用いて行った。
2.51g 17)ボ’J(A)RNAと0.4pgO
)ランダムプライマー(dp(N)い宝酒造〕を第一鎖
合成反応液に加エ、以後はファルマシア社のプロトコー
ルにしたがって反応を行った。二本鎖cDNAの両末端
にプロトコールにしたがって、EcoRIアダプターを
連結した。2.5μgのポリ(A) R N Aがら二
本鎖DNA2.3μgが得られた。
■組換えDNAの作製と組換え体ファージの作製組換え
DNAの作製は、プロメガ社製のプロトクローンλgt
llシステムを用い、プロトコールにしたがって行った
。得られた組換えDNAは、プロメガ社製のパフヵージ
ーンバッヶージングシステムを用いて組換え体ファージ
としポスト大腸菌Y1090 (r−)に導入した。こ
の組換え体ファジをアガロースプレート上で増殖させ、
λgtllcDNAライブラリーを作製した。このライ
ブラリのcomplexityは6 X 10’であっ
た。
cDNAの作製とλgtll発現ベクター作製の工程は
第3図に示した。
■スクリーニング 上記λgtllcDNAライブラリーのスクリーニング
はすでに発表されでいる方法に従って行った(Cel1
.52, 415 (1988)) .スクリーニング
用のブローブはヒトα−フエトプロテイン遺伝子の5′
側上流に位置するエンハンサー領域(Molecula
rand Cellular Biology  8.
 5179 (1988))のDNAを材料として作製
した(第4図参照)。エンハンサーを含む領域より、制
限酵素HgiAI とBstN 1によってエンハンサ
ー活性をもつDNAフラグメントを切り出し、この末端
をDNAポリメラーゼKleno−フラグメント用いて
補填した。一方、pUC18ブラスミドをBamHIに
よって切断し、この末端も同様に補填した。この両者を
74DNAIJガーゼ(宝酒造)によって接続し、組換
え体プラスミドI)A F E (HgiA I / 
BstN I)1を作製した。
pA F E(HgiA I / BstN INを制
限酵素XbalとPstlによって加水,分解し、エク
ソヌクレアーゼ■とマングビーンヌクレアーゼ(宝酒造
)を用いて削除反応を行ったのち、末端をDNAポリメ
ラーゼKleno−フラグメントを用いて補填し、この
末端にXholリンカーを挿入して閉環した。
生じたプラスミドを大腸菌DH5に導入して得゜られた
デリション・ミュータントの中から望ましい塩基配列を
持つクローンを選択し、これをpAFE (HgiA 
I/Xhol)1と名づけだ。pAF E(HgiA 
I / Xho I)1を制限酵素N1arVとXho
lによって加水分解し、エンハンサーを含むフラグメン
トをアガロース電気泳動によって分離した。
このNlarV/Xholフラグメントの末端をDNA
ポリメラーゼκlenowフラグメントによって補填し
、T4DNAリガーゼを用いて連結したのち、llin
e■で加水分解したpUCl8ブラスミドとT4リガゼ
を用いて連結した。生じた組換えプラスミドを大腸菌D
H5α(BRL社)に導入し、組換え体の中から望まし
いクローンを選択した。このクローンに含まれる組換え
プラスミドには上記NlaIV/Xholフラグメント
が6個連結されて旧nel1サイトに挿入されていた。
このプラスミドをρAF E (N1alV/ Xho
 I )6と名づけた。pAF E(N1arV/Xh
ol)6を制限酵素Sma Tと旧ncU(宝酒造)に
よって切断し、エンハンサーを含むSn+a I / 
Ilinc IIフラグメントを分離したのち、T4ボ
リヌクレチオドキナーゼと5′〔γ・”P) ATPを
用いて標識し、これをスクリーニング用ブローブとして
使用した。3XIO’個のプラークをスクリーニングし
てプローブと特異的に結合するクローンを単離し、これ
をλ2と名づけだ。λ2のブラークを含むアガロースを
プレートから切り出し、50mM }リスーHCI(p
ll 7.5)、0.IM NaCl 、8.b+M 
MgSO4、0.1%ゼラチンに懸濁してファージを溶
出したのち、クロロホルムを一滴加えて4℃に保存した
. ■溶原菌抽出液の作製 上記保存ファージをすでに発表されている方法(DNA
クローニング、vot.,1 、D,M.グローバー編
集I R LPress出版、1985年、p49)に
従ってY1089大腸菌に感染させ熔原菌を作製した。
次に溶原苗より Singhらの方法(Cell.52
. 415 1988)に従って抽出液を作製した。コ
ントロールとしてcDNAを含まないλgtllファー
ジをY 1089に惑゜染させ、この溶原菌からも同様
に抽出液を作製した。
■ゲルシフトアッセイ ゲルシフトアッセイは、上記熔原菌抽出液と■で述べた
pA F E (HgiA r / BstN INか
らSma Iと旧ncIIによって切り出したエンハン
サーDNAフラグメントの5′末端を32P標識して作
製したプローブとを用いて既存の方法(Nature 
319154, 1988)に従って行った。
第5図に結果を示すように、λ2の感染した溶原菌の抽
出液を用いた場合にシフトした二本のハンド(a,b)
が検出され、このバンドはcDNAを持たないλgtl
lの溶原菌抽出物では検出されなかったことがらλ2に
クローンされたCDNAにコードされる蛋白質がプロー
ブに結合する性質を持つことが示された。
■ フットプリント法によるDNA塩基配列上の蛍白質
結合部位の同定 10mM トリスーHCI(pH 7.5)、50mM
 NaC1 , lmM DTT, 0.5a+M E
 DTA, 2.5mM MgCIz 、3tlg !
10ly(dl−dC)poly(di−dC) 、5
%グリセロールを含む75μlの反応液中で16μgの
蛋白質を含むλ2溶原菌抽出液と■で述べたpA F 
E (HgiA I/BstN INから作製したSm
a I /Ilinc■プローブを混合し、室温に30
分放置した。このブローブは片方の5′末端のみが22
pによって標識されている。この反応液に40ng/ 
p l!の[)Naselを1μ/加え、室温で1分間
反応させたのち、0.5MEDTAを2.3μl加えて
反応を止めた。この反応液をゲルシフトアッセイ用の5
%ポリアクリルアミドゲルに供与し、llv/cII1
でプロモフェノールブルが下端近くへ移動するまで電気
泳動を行った。
片方のガラス板を除き、ゲルをサランランプで包んだの
ちX線フイルムを密着させオートラジオグラフィーを作
製した。
蛋白質と結合したDNAのバンドと結合していないDN
Aのバンドに相当する位置のゲルを切り゜出し、0.5
−の0.5M酢酸アンモニウム、0.1%SDS、1m
MEDTAで室温において一夜抽出した。
遠心して上清を取り、ゲル片は同溶出液0.5−で2回
洗い、洗液と上清を合わせた。これに5μgのトランス
ファーRNAを加えたのち等量のフェノール:クロロホ
ルム(1 : 1)で抽出し、水層に2倍量のエタノー
ルを加えて−70℃に30分以上保存した.DNAを遠
心分離によって集め、70%エタノールで1回洗ったの
ち、減圧乾固した。このDNAをlOμlの80%ホル
ムアミド、lOmM NaOH、1sM EDTA,0
.1%キシレンシアノール、0.1%プロモフェノール
ブルーに溶解し、90℃で3分加熱したのち3〜4μl
を塩基配列決定用の7H尿素を含む8%ポリアクリルア
ミドゲルに供与した。
サイズマーカーとしてプローブDNAをマキサムギルバ
ート法によってアデニンとグアニンの位置で化学的に切
断したもの(Methods in Enzymolo
gyvol.65, 499. 1980)を供に泳動
した。
電気泳動終了後オートラジオグラフイーを行った結果を
第6図に示す。図のように蛋白質と結合していないDN
Aと比べ、蛋白質と結合していたDNAではTTAAT
AATTAを中心とする15塩基対がD Nase I
の分解から保護されていることが示された。
■λ2ファージにクローンされたc DNAの塩基配列 λ2フプージのDNAを一般的な方法(Molecul
arcloning , a laboratory 
manual ..p76 * 1982)に従って調
製し、EcoRIによって加水分解したのちアガロース
電気泳動によってインサートDNAを分離した。
このDNAの塩基配列をジデオキシ法(Methods
in Enzymology 65, 560. 19
80)及びMaxam−Gilbert法(Metho
ds in Enzymology 65, 499.
 1980)を用いて決定した結果を第7図に示す。
次に、上述のλ2cDNAにコードされた蛋白質が結合
するD N A ?iJT域がエンハンサー活性を持つ
ことを下記に示すキャソトアソセイにより61i i2
した. [相]キャットアフセイ 実施例において■で述べたpAFE (HgiAI/X
holHより分離したNIalV/Xhorフラグメン
トを、キャットアッセイ用ベクターpAF1.0CAT
のClaサイトに平滑末端ライゲーションによって挿入
し、pAF1.OE24CATを作製した(第8図参照
)。
pAF1.OcATにはα−フェトプロテイン遺伝子の
プロモーター領域のDNAlkbと大腸菌のクロラムフ
ェニコール・アセチルトランスフェラゼの構造遺伝子、
そしてSV40のポリ(A)付加シグナルおよびt一抗
原遺伝子イントロンが含まれている.このベクターはエ
ンハンサー活性をもつDNAフラグメントの検索に用い
られる(J.Biol.Chew. 262, 481
2.1987)。キャットブラスミドのHuH−7細胞
への導入とキャノトアフセイは既存の方法(Mol. 
Cell. Riot. 2, 1044. 1982
)を基本として次のように行った。
75−の培養フラスコに8 X 10’程度の細胞を培
養し、これに20〜30μgのキャノトブラスミドDN
Aをリン酸カルシウム法によって導入した。3%ラクト
アルプミン加水分解物を含むR PM I −1640
培地で2日間培養したのち細胞をPBSで洗い、ポリス
マンを用いて細胞をはがした。細胞を低速遠心(800
rpm.5a+in)によって集め、4kM}−リスー
HCI(pH 7.5)、1sM E D T A ,
 150mM NaCIで一度洗ったのち100μlの
250lllMトリスー1)CI(pH 7.5)に懸
濁した.凍結融解を5回繰り返して細胞を破砕し、エッ
ベンドルフ遠心機で12,OOOrpm+, 5分間遠
心して上清を得た.これを65℃、lO分間熱処理し、
エフペンドルフ遠心機で12, OOOrpm、5分間
遠心して得た上滑を細胞辿出液とした. 細胞抽出液中の蛋白質濃度をバイオランド社のプロテイ
ン・アソセイ・キットを用いて測定し、50〜200μ
gの蛋白質を次のキャフトアッセイに使用した。キャソ
ト アッセイの典型的な反応液180μ/中には250
mM  }リス−1)CI(pl! 7.5)、0.1
゛μCi (”C)クロラムフェニコール(アマシャム
)、0.4mMアセチルCoA、50μg〜200μg
細胞抽出蛋白質が含まれていた。この反応液を37℃で
60分〜180分間インキユベートし、酢酸エチルをl
+++ffi加えてクロラムフエニコールとそのアセチ
ル化物を抽出した。酢酸エチル層を回収し、減圧乾固し
たのち、20μlの酢酸エチルに再溶解し、その一部ま
たは全部をシリカゲルプレート (メルク社)に供与し
て、クロロホルム:メタノール(96 : 4)を用い
て展開した。展開後シリカゲルプレートを室温で乾燥し
、サランラップに包んでオー1・ラジオグラフィーを行
った。 第9図に示すように、αフェトプロテイン遺伝
子上流のエンハンサー領域のDNAを含むキャソトプラ
スミドpA.F1.OE24CATを用いた場合にはp
AF1.OcATに比較して高い活性が認められ、Nl
alV/Xholフラグメントにエンハンサー活性の存
在することがわかった.
【図面の簡単な説明】
第1図は、上記DNAがコードする、α−フエトプロテ
イン遺伝子エンハンサーに結合する蛋白質のアミノ配列
を示し、第2図は、本発明によるDNAの塩基配列を示
す. 第3図は、mRNAよりcDNAを得て、λgtll発
現ベクターに組み込むための手順を示し、図中の→印は
cDNAが組み込まれるlacZ遺伝子の挿入位置を示
す。 第4図はヒトα−フェトプロテイン遺伝子5′上流に存
在するエンハンサー領域の制限酵素地図を表したもので
、イニシエーションサイトの上流−3.3 kbから−
3.7 kbの領域は拡大して示されている. 旧とHaはそれぞれ制限酵素旧ndDIとHae II
Iの認識部位を示す。 第5図は、λ2とλgtllの溶原菌抽出液を用いたゲ
ルシフトアノセイを示したものであり、コントロールは
抽出液を加えない場合のパターン、λ2溶原閑の抽出液
を用いた場合にのみ、二木のシフ゛トしたバンド(a,
b)が見られる。 第6図は、λ2溶原菌抽出液を用いたD Nase 1
フットプリントを表わす.G+AはMayam−Gil
bert法の化学的切断によって作製したサイズマーカ
レーン1はタンパク質と結合していないDNAのバンド
から抽出されたDNA、2と3はそれぞれタンパク質と
結合してシフトしたバンドaとbの位置から抽出したD
NAをそれぞれ表わす。 AはSmalサイトの5′末端が標識された場合、B4
’!HincUサイトの5′末端が標識された場合ノパ
ターン、CはAとBの結果をまとめたものを示す。 第7図は、λ2にクローンされたcDNAの塩基配列と
それにコードされたタンパク質の“アミノ酸配列を示す
。 第8図は、キャソトブラスミドp A F1.0E24
CAT(7)構築を表わし、p A Fl.OE24C
 A TはpAF1.OcATのCla+サイトにエン
ハンサー領域のNlarV/Xholフラグメント(3
1bp)を挿入することによって構築したことを示す。 第9図は、ヒト肝癌細胞培養株H u H〜7株を用い
たキャソトアソセイを示す。

Claims (2)

    【特許請求の範囲】
  1. (1)α−フェトプロティン遺伝子エンハンサーに特異
    的に結合する蛋白質であって、第1図に示されるアミノ
    酸配列をもった蛋白質をコードするDNA。
  2. (2)DNAは添付の第2図に示した塩基配列で表わさ
    れる請求項(1)に記載のDNA。
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