JP7692829B2 - Murf1を標的とする核酸医薬 - Google Patents
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Description
また、本発明の核酸は、医薬として使用するために十分安全である。
(1-1)配列番号609の188位~229位、1039位~1060位、1427位~1447位、1510位~1530位又は1715位~1737位からなる塩基配列に対して相補的な少なくとも15塩基以上の塩基配列を有する15~30ヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドを含む、MURF1の発現を抑制する核酸。
(1-2)該塩基配列に相補的な塩基配列を含む(1-1)記載の核酸。
(2-1)以下の(a)又は(b)の塩基配列を含む、(1-1)又は(1-2)記載の核酸:
(a)配列番号619、622若しくは623の塩基配列;
(b)配列番号620若しくは621の塩基配列のうち少なくとも15塩基の連続した塩基配列。
(2-2)該塩基配列に相補的な塩基配列を含む(2-1)記載の核酸。
(3-1)配列番号24、26、30、56、60、104、106、146、212、218、314、360、382、384、388、390、484、504、514、536、556、584、586、588、594、596、606若しくは608の塩基配列;又は
配列番号24、26、30、56、60、104、106、146、212、218、314、360、382、384、388、390、484、504、514、536、556、584、586、588、594、596、606若しくは608の塩基配列において、1~3の塩基が欠失、置換若しくは挿入された塩基配列;
を含み、かつ、MURF1の発現を抑制する核酸。
(3-2)該塩基配列に相補的な塩基配列を含む(3-1)記載の核酸。
(4-1)配列番号22、34、38、50、76、80、158、176、188、194、210、216、222、226、232、236、244、254、266、278、282、302、336、364、386、394、464、472、476、482、510、564、568、574若しくは578の塩基配列;又は、
配列番号22、34、38、50、76、80、158、176、188、194、210、216、222、226、232、236、244、254、266、278、282、302、336、364、386、394、464、472、476、482、510、564、568、574若しくは578の塩基配列の2~18位において、1~3の塩基が欠失、置換若しくは挿入された塩基配列;
を含み、かつ、MURF1の発現を抑制する核酸。
(4-2)該塩基配列に相補的な塩基配列を含む(4-1)記載の核酸。
(5)以下のいずれかの組み合わせを含む二本鎖核酸:
配列番号21の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号22の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号23の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号24の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号25又は624の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号26の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号29の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号30の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号33の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号34の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号37又は625の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号38の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号626の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号42の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号49の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号50の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号55の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号56の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号59の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号60の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号75又は627の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号76の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号79の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号80の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号103の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号104の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号105の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号106の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号145の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号146の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号157の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号158の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号175の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号176の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号187の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号188の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号193又は628の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号194の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号209の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号210の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号211又は629の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号212の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号215の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号216の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号217又は630の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号218の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号221又は631の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号222の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号225の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号226の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号231の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号232の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号235の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号236の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号243の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号244の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号253の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号254の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号265又は632の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号266の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号277の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号278の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号281の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号282の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号301の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号302の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号313の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号314の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号335の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号336の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号359の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号360の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号363の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号364の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号381の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号382の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号383の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号384の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号385の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号386の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号387又は633の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号388の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号389又は634の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号390の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号393の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号394の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号635の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号402の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号463の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号464の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号471の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号472の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号475の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号476の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号481又は636の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号482の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号483又は637の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号484の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号503の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号504の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号509の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号510の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号513の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号514の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号535の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号536の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号555又は638の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号556の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号563の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号564の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号567の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号568の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号573の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号574の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号577又は639の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号578の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号583の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号584の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号585の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号586の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号587の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号588の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号593の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号594の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号595の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号596の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号605の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号606の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド又は
配列番号607の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号608の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの配列。
(6)MURF1の発現を抑制する、(5)記載の核酸。
(7)siRNA、アンチセンスオリゴヌクレオチド、shRNA又はmiRNAである、(1-1)~(6)のいずれかに記載の核酸。
(8)センス鎖及び/又はアンチセンス鎖の3´末端にオーバーハングを含むsiRNAである、(7)記載の核酸。
(9)(1-1)~(8)のいずれかに記載の核酸を含有する医薬組成物。
(10)MURF1が関連する疾患の予防又は治療のために用いる、(9)記載の医薬組成物。
(11)該疾患が、筋量の低下、筋力の低下及び筋機能の低下からなる群から選ばれる1以上の症状を伴う疾患である、(10)記載の医薬組成物。
(13)MURF1が関連する疾患の予防又は治療剤を製造するための、(1-1)~(8)のいずれかに記載の核酸。
(14)MURF1が関連する疾患の予防又は治療のための、(1-1)~(8)のいずれかに記載の核酸。
(15)該疾患が、筋量の低下、筋力の低下及び筋機能の低下からなる群から選ばれる1以上の症状を伴う疾患である、(12)記載の方法又は(13)若しくは(14)記載の核酸。
本発明においては、当該分野で公知の遺伝子操作的手法が利用可能である。例えば、Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Forth Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press (2012)、Current Protocols Essential Laboratory Techniques, Current Protocols (2012)に記載された方法等が挙げられる。
配列番号609の188位~229位(より好ましくは、193~229位)、1039位~1060位、1427位~1447位、1510位~1530位又は1715位~1737位からなる塩基配列に対して相補的な少なくとも15塩基以上の塩基配列を有する15~30ヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドを含む、MURF1の発現を抑制する核酸
が挙げられる。該核酸は、該塩基配列に相補的な塩基配列をさらに含んでいてもよい。上記標的領域は、それぞれ、ヒトMURF1のmRNAの中で特に、核酸のノックダウン活性に関連する領域である。該標的領域に「相補的な」オリゴヌクレオチドとは、実質的に相補的な配列であれば、長さやヌクレオチドの修飾や変異の有無に関わらず、本発明の核酸に含まれる。「実質的に相補的な配列」とは、上記塩基配列の完全相補配列と少なくとも70%以上、好ましくは80%以上、より好ましくは90%以上、もっとも好ましくは95%以上の相同性を有するオリゴヌクレオチドが挙げられる。ここで、相同性は、例えば、Altschulら(The Journal of Molecular Biology,215,403-410(1990).)の開発したアルゴリズムを使用した検索プログラムBLASTを用いることにより、スコアで類似度が示される。
配列番号609の1039位~1060位からなる塩基配列に対して相補的な少なくとも15塩基以上の塩基配列を有する15~30ヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドを含む、MURF1の発現を抑制する核酸として、例えば、SNG-191~SNG-195、SNG-314及びSNG-315が挙げられる。
配列番号609の1427位~1447位からなる塩基配列に対して相補的な少なくとも15塩基以上の塩基配列を有する15~30ヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドを含む、MURF1の発現を抑制する核酸として、例えば、SNG-239~SNG-242、SNG-317及びSNG-318が挙げられる。
配列番号609の1510位~1530位からなる塩基配列に対して相補的な少なくとも15塩基以上の塩基配列を有する15~30ヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドを含む、MURF1の発現を抑制する核酸として、例えば、SNG-285~SNG-298が挙げられる。
配列番号609の1715位~1737位からなる塩基配列に対して相補的な少なくとも15塩基以上の塩基配列を有する15~30ヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドを含む、MURF1の発現を抑制する核酸として、例えば、SNG-300~SNG-304が挙げられる。
(a)配列番号619、622若しくは623の塩基配列;
(b)配列番号620若しくは621の塩基配列のうち少なくとも15塩基の連続した塩基配列。該核酸は、該塩基配列に相補的な塩基配列をさらに含んでいてもよい。
配列番号622の塩基配列(5´-AAGCACCAAAUUG-3´)を含む核酸として、例えば、SNG-291~SNG-298が挙げられる。
配列番号623の塩基配列(5´-ACAACAUAUAACACA-3´)を含む核酸として、例えば、SNG-300~SNG-304が挙げられる。
配列番号620の塩基配列(5´-UCCAUGUUCUCAAAGC-3´)のうち少なくとも15塩基の連続した塩基配列を含む核酸として、例えば、SNG-191~SNG-195、SNG-314及びSNG-315が挙げられる。
配列番号621の塩基配列(5´-UAGAAAAGUGUCCUGUG-3´)のうち少なくとも15塩基の連続した塩基配列を含む核酸として、例えば、SNG-239~SNG-242、SNG-317及びSNG-318が挙げられる。
(c)配列番号24、26、30、56、60、104、106、146、212、218、314、360、382、384、388、390、484、504、514、536、556、584、586、588、594、596、606若しくは608の塩基配列を含み、かつ、MURF1の発現を抑制する核酸;
(d)配列番号24、26、30、56、60、104、106、146、212、218、314、360、382、384、388、390、484、504、514、536、556、584、586、588、594、596、606若しくは608の塩基配列において、1~3の塩基が欠失、置換若しくは挿入された塩基配列を含み、かつ、MURF1の発現を抑制する核酸;
(e)配列番号22、34、38、50、76、80、158、176、188、194、210、216、222、226、232、236、244、254、266、278、282、302、336、364、386、394、464、472、476、482、510、564、568、574若しくは578の塩基配列を含み、かつ、MURF1の発現を抑制する核酸;又は、
(f)配列番号22、34、38、50、76、80、158、176、188、194、210、216、222、226、232、236、244、254、266、278、282、302、336、364、386、394、464、472、476、482、510、564、568、574若しくは578の塩基配列の2~18位において、1~3の塩基が欠失、置換若しくは挿入された塩基配列を含み、かつ、MURF1の発現を抑制する核酸。該核酸は、該塩基配列に相補的な塩基配列をさらに含んでいてもよい。
本発明の「核酸」は、該塩基配列を含み、ヒトMURF1発現抑制活性を有する限り、長さやヌクレオチドの修飾の有無に関わらず、本発明の核酸に含まれる。
配列番号21の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号22の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-11);
配列番号23の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号24の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-12);
配列番号25又は624の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号26の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-13又はSNG-305);
配列番号29の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号30の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-15);
配列番号33の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号34の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-17);
配列番号37又は625の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号38の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-19又はSNG-306);
配列番号41又は626の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号42の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-21又はSNG-307);
配列番号49の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号50の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-25);
配列番号55の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号56の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-28);
配列番号59の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号60の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-30);
配列番号75又は627の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号76の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-38又はSNG-308);
配列番号79の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号80の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-40);
配列番号103の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号104の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-52);
配列番号105の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号106の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-53);
配列番号145の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号146の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-73);
配列番号157の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号158の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-79);
配列番号175の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号176の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-88);
配列番号187の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号188の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-94);
配列番号193又は628の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号194の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-97又はSNG-309);
配列番号209の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号210の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-105);
配列番号211又は629の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号212の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-106又はSNG-310);
配列番号215の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号216の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-108);
配列番号217又は630の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号218の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-109又はSNG-311);
配列番号221の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号222の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-111);
配列番号225の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号226の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-113);
配列番号231の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号232の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-116);
配列番号235の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号236の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-118);
配列番号243の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号244の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-122);
配列番号253の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号254の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-127);
配列番号265又は632の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号266の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-133又はSNG-313);
配列番号277の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号278の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-139);
配列番号281の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号282の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-141);
配列番号301の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号302の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-151);
配列番号313の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号314の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-157);
配列番号335の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号336の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-168);
配列番号359の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号360の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-180);
配列番号363の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号364の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-182);
配列番号381の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号382の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-191);
配列番号383の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号384の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-192);
配列番号385の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号386の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-193);
配列番号387又は633の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号388の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-194又はSNG-314);
配列番号389又は634の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号390の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-195又はSNG-315);
配列番号393の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号394の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-197);
配列番号401又は635の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号402の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-201又はSNG-316);
配列番号463の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号464の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-232);
配列番号471の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号472の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-236);
配列番号475の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号476の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-238);
配列番号481又は636の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号482の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-241又はSNG-317);
配列番号483又は637の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号484の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-242又はSNG-318);
配列番号503の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号504の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-252);
配列番号509の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号510の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-255);
配列番号513の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号514の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-257);
配列番号535の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号536の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-268);
配列番号555又は638の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号556の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-278又はSNG-319);
配列番号561の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号562の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-281);
配列番号563の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号564の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-282);
配列番号567の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号568の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-284);
配列番号573の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号574の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-287);
配列番号577又は639の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号578の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-289又はSNG-320);
配列番号583の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号584の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-292);
配列番号585の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号586の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-293);
配列番号587の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号588の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-294);
配列番号593の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号594の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-297);
配列番号595の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号596の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-298);
配列番号605の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号606の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-303);又は
配列番号607の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号608の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含む二本鎖核酸(例えば、SNG-304)。
下記オーバーハングや末端修飾を含まない核酸を構成する各鎖の長さは、15~30ヌクレオチドが好ましい。例えば、15~25、17~25、17~23、17~21、19~21ヌクレオチドの長さが挙げられる。
a)筋量の低下、筋力の低下及び筋機能の低下からなる群から選ばれる1以上の症状を改善する。
b)CYP酵素(例えば、CYP1A2、CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6、CYP3A4等)に対する阻害作用が弱い。
c)良好な薬物動態を示す。
d)代謝安定性が高い。
e)変異原性を有さない。
f)心血管系のリスクが低い。
g)高い溶解性を示す。
a) 標的遺伝子との親和性が高い。
b) ヌクレアーゼに対する抵抗性が高い。
c) 薬物動態が改善する。
d) 組織移行性が高くなる。
e) 免疫応答および細胞障害性が低い。
よって、修飾された核酸は、無修飾の核酸と比較して、生体内で分解されにくくなり、より安定して標的遺伝子の発現を阻害できる。
リン酸修飾としては、例えば、天然の核酸が有するリン酸ジエステル結合、S-オリゴ(ホスホロチオエート)、D-オリゴ(ホスホジエステル)、M-オリゴ(メチルフォスフォネイト)、ボラノホスフェート等が挙げられる。
核酸塩基修飾としては、例えば、5-メチルシトシン、5-ヒドロキシメチルシトシン、5-プロピニルシトシン等が挙げられる。
糖修飾としては、例えば、2´-O-CH2-CH2-O-CH3(2´MOE)、LNA(Locked nucleic acid)、2´-OMe、2´-Fluoro、BNA(Bridged Nucleic Acid)、AmNA(WO2011/052436参照)、TrNA(WO2014/126229参照)、2´-Deoxy等が挙げられる。
WO98/39352、WO99/014226、WO2000/056748、WO2003/068795、WO2004/016749、WO2005/021570、WO2005/083124、WO2007/143315、WO2009/071680、WO2011/052436、WO2014/112463、WO2014/126229等。
また、本発明の核酸は、上記塩基配列を有する限りにおいて、核酸中に脱塩基型(Abasic)ヌクレオチドが挿入されていてもよい。
WO2009/126933、WO2012/037254、WO2009/069313、WO2009/123185、WO2013/089283、WO2015/105083、WO2018/181428等。
WO2008/042973、WO2009/127060、WO2011/064130、WO2011/123468、WO2011/153542、WO2013/074974、WO2013/075035、WO2013/163258、WO2013/192486等。
経口投与用組成物としては、散剤、顆粒剤、水若しくは非水性媒体に溶解させた懸濁液又は溶液、カプセル、粉末剤、錠剤等が挙げられる。
非経口、硬膜下腔、又は、脳室内投与用組成物としては、バッファー、希釈剤及びその他の適当な添加剤を含む無菌水溶液等が挙げられる。
MURF1が関連する疾患としては、筋量の低下、筋力の低下及び筋機能の低下からなる群から選ばれる1以上の症状を伴う疾患等が挙げられる。例えば、廃用性筋萎縮(大腿骨骨折、肺炎等により一定期間の入院や筋肉の不使用が想定される患者、ギプス等の使用に起因する)、運動器不安定症、ロコモティブシンドローム、悪液質、ICU-acquired weakness(ICU在室中に生じる筋力低下)、疾患性筋萎縮(COPD(Chronic Obstructive Pulmonary Disease)、心不全、結核、ガン、糖尿病、AIDS(Acquired Immunodeficiency Syndrome)、敗血症、慢性腎症、末梢神経障害、筋肉減少症等に起因する)、薬剤誘発性ミオパチー(ステロイド治療やガン化学療法等による筋萎縮)、加齢による筋量の低下、筋力の低下及び筋機能の低下からなる群から選ばれる1以上の症状(サルコペニア等)、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、筋ジストロフィー、球脊髄性筋萎縮症(SBMA)、脊髄性筋萎縮症(SMA)、シャルコー・マリー・トゥース病(CMT)、先天性ミオパチー、ギラン・バレー症候群、ミトコンドリア脳筋症、先天性代謝異常ミオパチー、多発性筋炎、皮膚筋炎、封入体性筋炎、嚥下障害(脳卒中、脳血管疾患、脳梗塞、脳内出血、パーキンソン病、放射線治療、加齢等に起因する)、クッシング症候群、原発性及び/又は続発性骨粗しょう症、変形性関節症、腰痛症、代謝性疾患(糖尿病、脂質異常症等)、人工呼吸器等の使用に起因する横隔膜の筋量の低下、筋力の低下及び筋機能の低下からなる群から選ばれる1以上の症状、骨折リスク及び/又は転倒リスクの軽減(大腿骨、橈骨、脊椎、上腕骨等)、低重力環境下での筋量の低下、筋力の低下及び筋機能の低下からなる群から選ばれる1以上の症状、その他の難治性/遺伝性筋疾患等が挙げられる。
ヒト及びマウスのMURF1 mRNAを標的とするsiRNAの設計を行った。
設計に使用したmRNA配列はヒトMURF1(GenBank:NM_032588.3、配列番号:609)、マウスMurf1(GenBank:NM_001039048.2、配列番号:611)である。
設計したsiRNAは二重鎖であり、二重鎖は19塩基のアンチセンス鎖と19塩基のセンス鎖から成る。アンチセンス鎖はmRNA配列の相補配列であり、センス鎖はアンチセンス鎖の相補配列である。siRNAは、アンチセンス鎖の5´末端の2~17塩基目がヒト及びマウスのmRNAに対して、100%の相同性を有するように設計した。設計した配列(SNG-1~SNG320)を表1~表16に示す。表中、標的部位(Target site)は、配列番号609中の位置を示し、塩基配列中の大文字はRNAを意味する。
マウスメラノーマ細胞株B16を、MEM(サーモフィッシャーサイエンティフィック)+10%ウシ胎児血清(FBS)(ハイクロン)+ペニシリン(100units/mL)(サーモフィッシャーサイエンティフィック)+ストレプトマイシン(100ug/mL)(サーモフィッシャーサイエンティフィック)で培養し、37℃、95~98%湿度及び5%CO2で維持した。
実施例1で設計したsiRNAのアンチセンス鎖及びセンス鎖の3´末端にオーバーハングとしてdTdTを付加したsiRNA二重鎖をSIGMAより購入した。購入したsiRNA二重鎖を用いて、実施例2の条件下で培養したマウスB16細胞でのノックダウン実験を行った。siRNA二重鎖をLipofectamine(登録商標)3000(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を用いて細胞に導入し、細胞培養液にsiRNA二重鎖の最終濃度が10nmol/Lになるように添加した。導入24時間後にCellAmpTM Direct RNA Prep Kit for RT-PCR (タカラバイオ)にて細胞を回収し、リアルタイムPCRを行った。内在性コントロールとしてGapdhを使用した。
Fwプライマー:(配列番号613);TGTCTCACGTGTGAGGTGCCTA
Rvプライマー:(配列番号614);CACCAGCATGGAGATGCAGTTAC
を用い、
マウスGapdhの発現量を測定するために使用したプライマー配列は、
Fwプライマー:(配列番号615);TGTGTCCGTCGTGGATCTGA
Rvプライマー:(配列番号616);TTGCTGTTGAAGTCGCAGGAG
を用いた。
ノックダウン活性の結果を表17に示す。
ΔΔCt=(Gapdhの発現量―SNG-305の発現量)(ΔCt)―(Gapdhの発現量―各siRNA二重鎖の発現量)(ΔCt)
SNG-305のノックダウン活性をΔΔCt=0とし、SNG-305のノックダウン活性より高い活性を示すsiRNAはプラスの数値を示し、低い活性を示すsiRNAはマイナスの数値を示す。なお、表18の塩基配列中、大文字はRNAを小文字はDNAを意味する。
ヒト骨格筋筋芽細胞を、SkGM-2 BulletKit(ロンザ)で培養後、さらにDMEM(サーモフィッシャーサイエンティフィック)+2%ウマ血清(サーモフィッシャーサイエンティフィック)+ペニシリン(100units/mL)(サーモフィッシャーサイエンティフィック)+ストレプトマイシン(100ug/mL)(サーモフィッシャーサイエンティフィック)で培養し、37℃、95~98%湿度及び5%CO2で維持した。培養容器はマトリゲル(コーニング)でコート後に使用した。
実施例1で設計した一部のsiRNAのアンチセンス鎖及びセンス鎖の3´末端にオーバーハングとしてdTdTを付加したsiRNA二重鎖をSIGMAより購入した。購入したsiRNA二重鎖を用いて、実施例4の条件下で培養したヒト骨格筋筋芽細胞でのノックダウン実験を行った。siRNA二重鎖をLipofectamine(登録商標)3000(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を用いて細胞に導入し、細胞培養液にsiRNA二重鎖の最終濃度が20nmol/Lになるように添加した。導入24時間後にCellAmpTM Direct RNA Prep Kit for RT-PCR (タカラバイオ)にて細胞を回収し、リアルタイムPCRを行った。内在性コントロールとしてGAPDHを使用した。
Fwプライマー:(配列番号640);CGTGTGCAGACCATCATCACTC
Rvプライマー:(配列番号641);CAACGTGTCAAACTTCTGGCTCA
を用い、
ヒトGAPDHの発現量を測定するために使用したプライマー配列は、
Fwプライマー:(配列番号642);GCACCGTCAAGGCTGAGAAC
Rvプライマー:(配列番号643);TGGTGAAGACGCCAGTGGA
を用いた。
mRNA残存率の結果を表19に示す。
まず、未処置(Non-treated : NT)群の細胞におけるヒトMURF1の発現量(Ct値)とヒトGAPDHの発現量(Ct値)の差を算出した(ΔCt)。その後に、各ΔCtの平均値をΔCt(NT_ave.)として算出した。続いて、各siRNA二重鎖を導入した細胞のヒトMURF1の発現量(Ct値)とヒトGAPDHの発現量(Ct値)の差を算出した(ΔCt(siRNA))。その後、各ΔCt(siRNA)とΔCt(NT_ave.)の差(ΔΔCt)を算出した後に、各々について以下の計算式にてmRNA残存率を算出した。
mRNA残存率 = 2ΔΔCt×100 (%),ΔΔCt = ΔCt(siRNA) - ΔCt(NT_ave.)
最後に、各処置群におけるmRNA残存率の平均値を算出した。
この結果、本願siRNAは、mRNA残存率が低く、ヒトMURF1の発現を強く抑制することが分かった。
Claims (11)
- 配列番号609の1427位~1447位からなる塩基配列に対して相補的な少なくとも15塩基以上の塩基配列を有する15~30ヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドを含む、MURF1の発現を抑制する核酸。
- 配列番号621の塩基配列のうち少なくとも15塩基の連続した塩基配列を含む、請求項1記載の核酸。
- 配列番号484の塩基配列を含み、かつ、MURF1の発現を抑制する核酸。
- 配列番号482の塩基配列を含み、かつ、MURF1の発現を抑制する核酸。
- 以下のいずれかの組み合わせを含む二本鎖核酸:
配列番号481又は636の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号482の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、
配列番号483又は637の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び配列番号484の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド。 - MURF1の発現を抑制する、請求項5記載の核酸。
- siRNA、アンチセンスオリゴヌクレオチド、shRNA又はmiRNAである、請求項1~6のいずれかに記載の核酸。
- センス鎖及び/又はアンチセンス鎖の3´末端にオーバーハングを含むsiRNAである、請求項7記載の核酸。
- 請求項1~8のいずれかに記載の核酸を含有する医薬組成物。
- MURF1が関連する疾患の予防又は治療のために用いる、請求項9記載の医薬組成物。
- 該疾患が、筋量の低下、筋力の低下及び筋機能の低下からなる群から選ばれる1以上の症状を伴う疾患である、請求項10記載の医薬組成物。
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