JP7621664B2 - 受容体タンパク質を標的とする治療薬、検査薬、受容体タンパク質に結合する抗体、及び分子標的薬のスクリーニング方法 - Google Patents
受容体タンパク質を標的とする治療薬、検査薬、受容体タンパク質に結合する抗体、及び分子標的薬のスクリーニング方法 Download PDFInfo
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Description
(1)Cholinergic Receptor Nicotinic Beta 2 Subunit (CHRNB2)の発現を中和、又は抑制する物質を有効成分として含有する分子標的治療薬。
(2)前記有効成分が、抗体、又は核酸であることを特徴とする(1)記載の分子標的治療薬。
(3)前記有効成分が、CHRNB2のWKPEEFDNMKKVRLPSKH(配列番号8)、又はTFLHSDHSAPSSK(配列番号9)のいずれかを認識するものであることを特徴とする(1)、又は(2)記載の分子標的治療薬。
(4)前記有効成分が抗体であることを特徴とする(3)に記載の分子標的治療薬。
(5)前記抗体が受託番号NITE BP-02857で表されるハイブリドーマにより産生されるものである(4)記載の分子標的治療薬。
(6)前記有効成分が、CHRNB2に対するsiRNA、miRNA、アンチセンスオリゴ、アプタマー、又はデコイであることを特徴とする(1)、又は(2)に記載の分子標的治療薬。
(7)前記分子標的治療薬の対象疾患が、胃癌、大腸癌、乳癌、肺癌、膵癌、食道癌であることを特徴とする(1)~(6)記載の分子標的治療薬。
(8)受託番号NITE BP-02857で表されるハイブリドーマにより産生されるモノクローナル抗体。
(9)受託番号NITE BP-02857で表されるハイブリドーマ。
(10)CHRNB2を認識する抗体、又はCHRNB2のmRNA発現を定量するプライマー、及び測定に必要な試薬を含む検査キット。
(11)前記CHRNB2を認識する抗体が、CHRNB2のWKPEEFDNMKKVRLPSKH(配列番号8)、又はTFLHSDHSAPSSK(配列番号9)のいずれかを認識するものであることを特徴とする(10)記載の検査キット。
(12)前記CHRNB2を認識する抗体が、受託番号NITE BP-02857で表されるハイブリドーマにより産生されるものである(10)記載の検査キット。
(13)前記CHRNB2のmRNAを定量するためのプライマーが配列番号1及び2で表されるプライマーであることを特徴とする(10)記載の検査キット。
(14)被験物質とCHRNB2の細胞表面に表出している領域への結合性を指標とする分子標的薬のスクリーニング方法。
(15)被験物質存在下で細胞を培養し、CHRNB2の発現を指標とすることにより分子標的薬をスクリーニングする方法。
(16)Neuronal pentraxin receptor(NPTXR)の発現を中和、又は抑制する物質を有効成分として含有する分子標的治療薬。
(17)前記有効成分が、抗体、又は核酸であることを特徴とする(16)記載の分子標的治療薬。
(18)前記有効成分が、NPTXRのCESGLPRGLQGAGPRRDT(配列番号10)、又はKERVALSHSSRRQRQEVE(配列番号11)のいずれかを認識するものであることを特徴とする(16)、又は(17)記載の分子標的治療薬。
(19)前記有効成分が抗体であることを特徴とする(18)に記載の分子標的治療薬。
(20)前記抗体が受託番号NITE BP-02856で表されるハイブリドーマにより産生されるものである(19)記載の分子標的治療薬。
(21)前記有効成分が、NPTXRに対するsiRNA、miRNA、アンチセンスオリゴ、アプタマー、又はデコイであることを特徴とする(16)、又は(17)に記載の分子標的治療薬。
(22)前記分子標的治療薬の対象疾患が、胃癌、大腸癌、乳癌、肺癌、膵癌、食道癌であることを特徴とする(16)~(21)記載の分子標的治療薬。
(23)NPTXRのCESGLPRGLQGAGPRRDT(配列番号10)、
又はKERVALSHSSRRQRQEVE(配列番号11)を認識する抗体。
(24)受託番号NITE BP-02856で表されるハイブリドーマにより産生されるモノクローナル抗体。
(25)受託番号NITE BP-02856で表されるハイブリドーマ。
(26)配列番号12(GLPRGLQGAGPRRDT)で表されるエピトープを認識する抗体。
(27)NPTXRを認識する抗体、又はNPTXRのmRNA発現を定量するプライマー、及び測定に必要な試薬を含む検査キット。
(28)前記NPTXRを認識する抗体が、CESGLPRGLQGAGPRRDT(配列番号10)、又はKERVALSHSSRRQRQEVE(配列番号11)のいずれかを認識するものであることを特徴とする(27)記載の検査キット。
(29)前記NPTXRを認識する抗体が、受託番号NITE BP-02856で表されるハイブリドーマにより産生されるものである(27)記載の検査キット。
(30)前記NPTXRのmRNA発現を定量するプライマーが配列番号3及び4であることを特徴とする(27)記載の検査キット。
(31)被験物質とNPTXRの細胞表面に表出している領域への結合性を指標とする分子標的薬のスクリーニング方法。
(32)被験物質存在下で細胞を培養し、NPTXRの発現を指標とすることにより分子標的薬をスクリーニングする方法。
(33)(1)~(7)記載の分子標的治療薬を用いることを特徴とする治療方法。
(34)CHRNB2発現が高い腫瘍を対象とすることを特徴とする(33)記載の治療方法。
(35)(10)~(13)記載の検査キットを用いてCHRNB2発現を検査することを特徴とする(34)記載の治療方法。
(36)(16)~(22)記載の分子標的治療薬を用いることを特徴とする治療方法。
(37)NPTXR発現が高い腫瘍を対象とすることを特徴とする(36)記載の治療方法。
(38)(27)~(30)記載の検査キットを用いてNPTXR発現を検査することを特徴とする(37)記載の治療方法。
1.CHRNB2、NPTXRの同定
<標的分子となり得る胃癌進展に関与する分子の同定>
これまでに名古屋大学医学部において、ステージIII胃癌で治癒切除術が施行され、術後補助療法としてS-1内服を行った症例を経過に応じて群分けした。胃癌患者は大別すると、長期無再発群と再発転移群に分けることができる。5年以上の長期無再発群は「現行治療で制御し得た胃癌」であり、これをコントロールとし、再発転移群と比較した。また、転移には腹膜播種、肝転移、リンパ節転移という異なる種類の転移があることから、再発転移群を腹膜播種再発群、肝転移再発群、リンパ節再発群に分け、5年以上の長期無再発群と合わせて4群、各4例の胃癌原発巣組織から得られたRNAを対象にトランスクリプトーム解析による発現プロファイリングを行った。
14種の胃癌細胞株、及び非腫瘍性腺管上皮細胞株であるFHS74を用いて、定量的PCRによってCHRNB2、NPTXRのmRNA発現量を定量した(図1)。RNAはRNeasy kit(QIAGEN社製)によって抽出、精製し、定量的PCRは、ABI STEPOnePlus Real-Time PCR System(Applied Biosystems社製)を用いて、95℃10分加熱後、95℃10秒、60℃30秒で40サイクルのPCR条件で増幅を行い解析した。なお、各RNAの値を正規化するためにコントロールとしてglyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase(GAPDH)を用いた。用いたPCRプライマーの配列は下記のとおりである。
Forward:AGCGAGGACGATGACCAG(配列番号1)
Reverse:GGTGCCAAAGACACAGACAA(配列番号2)
[NPTXR]
Forward:TCATTCTGGAGCTGGAGGAC(配列番号3)
Reverse:GGCAGCTGAGAGGTTCACA(配列番号4)
[コントロールGAPDH]
Forward:GAAGGTGAAGGTCGGAGTC(配列番号5)
Reverse:GAAGATGGTGATGGGATTTC(配列番号6)
Probe:CAAGCTTCCCGTTCTCAGCC(配列番号7)
<ノックアウト細胞株を用いた解析結果>
(1)CHRNB2ノックアウト細胞株を用いた機能解析
悪性度の高い胃癌細胞株として知られているMKN1を用い、CRISPR-CAS9法(Gene Art Platinum Cas9 nuclease;Thermo Fisher Scientific社製)によるゲノム編集によってCHRNB2のノックアウト(KO)細胞を作製した。ノックアウト細胞はシングルセルクローニングを経て選択し、ダイレクトシーケンスもしくはWestern blotting法によりノックアウトされていることを確認した。増殖能、アポトーシス比率、遊走能、浸潤能、接着能について、コントロール(未処理のMKN1)細胞と比較した(図2)。
次に、NPTXRについても、同様にして、胃癌細胞株MKN1でCRISPR-CAS9法を用いたノックアウト細胞を作製し、増殖能、アポトーシス比率、遊走能、浸潤能、接着能について解析を行った(図3)。
CHRNB2、あるいはNPTXRをノックアウトしたMKN1細胞、未処理のMKN1細胞を9週齢のヌードマウス(BALBcnu/nu、日本SLC社より入手)の両肩皮下に1×106個移植し、腫瘍体積を経時的に測定した。なお、各群3匹のマウスを用い、腫瘍体積は短径×短径×長径/2によって計測し、算出した。
(1)抗体医薬の作製
[実施例1]
<CHRNB2中和抗体(ポリクローナル抗体)の作製>
CHRNB2の特異的抗体を作用させその活性を抑制することにより、胃癌細胞の活性を阻害できるか検証を行った。エピトープ検索ツール(コスモバイオ社製)を用いて親水性、2次構造、抗原性の推定と最適抗原部位検索を行った。標的配列として以下の2つの配列を選択して、常法に従いウサギを免疫し、CHRNB2(アクセッション番号:NP_000739)に対するポリクローナル抗体を2種作製した。なお、CHRNB2抗体-1は94-111位(標的配列1、配列番号8)、CHRNB2抗体-2は490-502位(標的配列2、配列番号9)のアミノ酸配列を免疫して得られた抗体である。
CHRNB2抗体-1:WKPEEFDNMKKVRLPSKH(配列番号8)
CHRNB2抗体-2:TFLHSDHSAPSSK(配列番号9)
<NPTXR中和抗体(ポリクローナル抗体)の作製>
NPTXRの特異的抗体を作用させその活性を抑制し、胃癌細胞の活性を阻害できるかを検証するため、同様にしてエピトープ検索ツールを用いて親水性、2次構造、抗原性の推定と最適抗原部位検索を行った。標的配列として以下の2つの配列を選択して、常法に従いウサギを免疫し、NPTXR(アクセッション番号:NP_055108)に対するポリクローナル抗体を2種作製した。なお、NPTXR抗体-1は161-178位(標的配列1、配列番号10)、NPTXR抗体-2(標的配列2、配列番号11)は251-268位のアミノ酸配列に対する抗体である。
NPTXR抗体-1:CESGLPRGLQGAGPRRDT(配列番号10)
NPTXR抗体-2:KERVALSHSSRRQRQEVE(配列番号11)
<CHRNB2中和抗体のマウス腹膜播種モデルを用いた効果の検討>
次に、上記2種類の標的を認識するCHRNB2抗体の効果をマウス腹膜播種モデルによって解析した。1×106個のMKN1細胞を8週齢のヌードマウス(BALBcnu/nu、日本SLC社より入手)の腹腔内に移植し治療効果を調べた。なお、各群4匹のマウスを用い、図10に示す投与スケジュールのように、CHRNB2抗体(夫々CHRNB2抗体-1は6.5μg/500μL、CHRNB2抗体-2は8.7μg/500μL)を週2回、6週間腹腔内投与しコントロール群と胃癌腹膜播種形成量を比較した。なお、コントロールは抗体投与を行っていない群である。
<NPTXR中和抗体のマウス腹膜播種モデルを用いた効果の検討>
実施例3と同様にして、NPTXRの2箇所の標的を認識するNPTXR抗体の効果をマウス腹膜播種モデルによって解析した(図11)。
<抗CHRNB2モノクローナル抗体の樹立>
配列番号9で表されるペプチドを抗原として、CHRNB2に対するモノクローナル抗体を常法により樹立した。得られたハイブリドーマから3つのクローンを選択し、モノクローナル抗体を得た。実施例1と同様にして、MKN1細胞を1×104個になるよう、96ウェルプレートに播種し、各抗体を0.7μg/mL濃度になるように添加し、経時的に細胞増殖をWST-1アッセイにより測定した(図12)。いずれのクローンから得られた抗体も細胞増殖に対して同様の阻害効果を示した。
抗CHRNB2モノクローナル抗体(クローン3、CH-01)のマウス腹膜播種モデルに対する治療効果を調べた(図13)。2×106個のMKN1細胞を8週齢のヌードマウス(BALBcnu/nu)の腹腔内に移植し治療効果を調べた。抗CHRNB2モノクローナル抗体25μg/500μlを週3回、4週間腹腔内投与し、無治療群と胃癌腹膜播種形成量を比較した(各群n=5)。
<抗NPTXRモノクローナル抗体の樹立>
配列番号10で表されるペプチドを抗原として、NPTXRに対するモノクローナル抗体を樹立した。実施例1と同様にして、MKN1細胞を1×104個になるよう、96ウェルプレートに播種し、各抗体を0.7μg/mL濃度になるように添加し、経時的に細胞増殖をWST-1アッセイにより測定した(図14(A))。いずれのクローンも細胞増殖に対して同様の阻害効果を示した。
抗NPTXRモノクローナル抗体のマウス腹膜播種モデルに対する治療効果を調べた(図15)。2×106個のMKN1細胞を8週齢のヌードマウス(BALBcnu/nu)の腹腔内に移植し、クローン1~3から得られた抗体の治療効果を調べた。抗NPTXRモノクローナル抗体25μg/500μlを週3回、2週間腹腔内投与し、無治療群と胃癌腹膜播種形成量を比較した(各群n=3)。
NP-01抗体のエピトープ解析を行った。NPTXRタンパク質の151位から190位の領域において、表2に示すように、15アミノ酸からなるペプチドを1つずつN末からC末にずらしながら合成した。各ペプチドに対する結合を競合酵素結合免疫吸着検査法によって測定し、エピトープを決定した(表3)。その結果、164位から178位のアミノ酸配列、GLPRGLQGAGPRRDT(配列番号12)をエピトープとして強く認識していることが明らかとなった。同一のエピトープを認識する抗体は同じような性質を備えていると考えられることから、配列番号12で表されるペプチドを認識する抗体は、NPTXRに対して結合し、癌細胞の増殖を抑制する効果があるものと考えられる。
[実施例7]
<CHRNB2に対する核酸医薬の検討>
核酸医薬によってCHRNB2発現を阻害することにより、胃癌細胞の増殖を抑制できるか解析を行った。CHRNB2に対する特異的siRNAを用いて増殖能への影響をin vitroで解析した。CHRNB2のsiRNA(siCHRNB2)、コントロールsiRNA(siControl)はいずれも北海道システムサイエンス社より得た。また、コントロールは無処理の細胞の増殖を示す。
<NPTXRに対する核酸医薬の検討>
次に、NPTXRに対する特異的siRNAを用い、実施例7と同様にして、増殖能への影響をin vitroで解析を行った。MKN1細胞にNPTXRのsiRNAを導入し、72時間無血清DMEM培地で培養後、増殖能の評価を行った(図16(B))。
CHRNB2、NPTXRを分子標的とする医薬を臨床で用いる場合には、CHRNB2、NPTXRの発現を予め確認して、腫瘍組織で発現が増強している患者にのみ治療を行えば無駄な治療を行うことがない。そこで、胃癌組織中のCHRNB2、NPTXRのmRNA発現量を切除検体によって解析した。また、予後とmRNA発現量の相関性をROC曲線解析で評価し、mRNA発現量が予後予測に使用できるか検討した。
<胃癌組織中のCHRNB2発現量の定量的解析>
網羅的解析データの再現性を確認するため、300例の胃癌症例から得られた胃癌組織中のCHRNB2のmRNA発現量を定量的PCR法で調べた。正常胃粘膜、ステージI、IIの胃癌121症例、ステージIII、IVの胃癌179症例から得られた組織中のCHRNB2発現を定量的PCRによって測定した(図17(A))。
<胃癌組織中のNPTXR発現量の定量的解析>
実施例9と同様にして、300例の胃癌症例から得られた胃癌組織中のNPTXRのmRNA発現量を定量的PCR法で調べた(図18(A))。NPTXRの発現は、ステージに関わらず、胃癌組織中では正常胃粘膜に比べ発現が有意に増加していた。
<組織マイクロアレイによる発現分布>
(1)各種器官・正常組織における発現分布
CHRNB2、NPTXRに結合する抗体医薬、あるいは発現を阻害する医薬を用いた場合の安全性を検討するデータとして、CHRNB2、NPTXRの各種器官・正常組織における発現分布の解析を行った(図20)。
組織マイクロアレイ(Provitro社製)を用い、種々の癌におけるCHRNB2、NPTXRの発現解析を行った。上記と同様にして、組織染色の結果、解析した組織を、発現なし、低発現、高発現に分類し、グラフに表している。大腸におけるCHRNB2、NPTXR発現解析を行った。CHRNB2は大腸癌の約70%、NPTXRは約50%で発現が認められた(図21)。以下の癌種においても同様にして解析を行った。
Claims (10)
- Neuronal pentraxin receptor(NPTXR)のGLPRGLQGAGPRRDT(配列番号12)、又はCESGLPRGLQGAGPRRDT(配列番号10)のアミノ酸配列からなるペプチドを認識する抗体。
- 前記抗体が、
NPTXRのCESGLPRGLQGAGPRRDT(配列番号10)のアミノ酸配列からなるペプチドを認識するものであることを特徴とする請求項1に記載の抗体。 - 前記抗体が、
GLPRGLQGAGPRRDT(配列番号12)のアミノ酸配列からなるペプチドを認識するものであることを特徴とする請求項1に記載の抗体。 - 前記抗体が受託番号NITE BP-02856で表されるハイブリドーマにより産生されるものである請求項3に記載の抗体。
- 前記抗体が、
胃癌、大腸癌、乳癌、肺癌、膵癌又は食道癌の治療又は診断に使用されることを特徴とする請求項1~4のいずれか1項に記載の抗体。 - 胃癌、大腸癌、乳癌、肺癌、膵癌又は食道癌の治療又は診断に使用される分子標的治療薬であって、請求項1~5のいずれか1項に記載の抗体を有効成分として含む分子標的治療薬。
- 分子標的治療薬が、NPTXRの機能を阻害することを特徴とする請求項6に記載の分子標的治療薬。
- 前記分子標的治療薬が、MKN1細胞増殖試験により測定されるNPTXRの機能を阻害することを特徴とする請求項7に記載の分子標的治療薬。
- 受託番号NITE BP-02856で表されるハイブリドーマ。
- 患者の胃癌、大腸癌、乳癌、肺癌、膵癌又は食道癌の診断を補助するための方法であって、
前記方法は、請求項1~5のいずれか1項に記載の抗体を用いて前記患者からのサンプルにおけるNPTXRの発現を解析する工程を含む方法。
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