JP7457331B2 - 神経膠腫の治療および予防剤、脳腫瘍の悪性度のマーカーおよび脳腫瘍の予後マーカー、脳腫瘍の悪性度および予後の判定方法並びに腫瘍増殖を抑制する抗体 - Google Patents
神経膠腫の治療および予防剤、脳腫瘍の悪性度のマーカーおよび脳腫瘍の予後マーカー、脳腫瘍の悪性度および予後の判定方法並びに腫瘍増殖を抑制する抗体 Download PDFInfo
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Description
[1]HVEM阻害剤を有効成分として含んでなる、神経膠腫の治療または予防剤。
[2]神経膠腫が、乏突起膠腫、乏突起星細胞腫、星細胞腫および多形性膠芽腫のいずれかである、上記[1]に記載の治療または予防剤。
[3]多形性膠芽腫が、Proneuralサブタイプ、Neuralサブタイプ、ClassicalサブタイプおよびMesenchymalサブタイプのいずれかに属する、上記[2]に記載の治療または予防剤。
[4]HVEM阻害剤が、HVEMに対する抗体または核酸である、上記[1]~[3]のいずれかに記載の治療または予防剤。
[5]HVEMに対する抗体がHVEMとリガンドとの結合を阻害する抗体である、上記[4]に記載の治療または予防剤。
[6]神経膠腫がHVEM発現依存性またはHVEMリガンド依存性である、上記[1]~[5]のいずれかに記載の治療または予防剤。
[7]リガンドがAPRILである、上記[5]または[6]に記載の治療または予防剤。
[8]HVEM発現量が健常な対象のHVEM発現量または正常組織試料のHVEM発現量を上回る対象に投与するための、上記[1]~[7]のいずれかに記載の治療または予防剤。
[9]HVEMタンパク質またはHVEM遺伝子からなる、脳腫瘍の悪性度のマーカーまたは脳腫瘍の予後マーカー。
[10]対象の生体試料中のHVEM発現量を測定する工程を含んでなる、脳腫瘍の悪性度の判定方法。
[11]前記対象の生体試料中のHVEM発現量が、健常な対象の生体試料中のまたは正常組織試料中の当該HVEM発現量を上回る場合に、該生体試料が悪性度の高い腫瘍細胞集団を含むことが示される、上記[10]に記載の判定方法。
[12]前記対象の生体試料中のHVEM発現量が、健常な対象の生体試料中のまたは正常組織試料中の当該HVEM発現量を上回る場合に、対象が悪性度の高い脳腫瘍に罹患していることが示される、上記[10]に記載の判定方法。
[13]対象の生体試料中のHVEM発現量を測定する工程を含んでなる、脳腫瘍患者の予後の判定方法。
[14]前記対象の生体試料中のHVEM発現量が、健常な対象の生体試料中のまたは正常組織試料中の当該HVEM発現量を上回る場合に、対象の予後が不良であることが示される、上記[13]に記載の判定方法。
[15]80nM未満のEC50値でHVEMと結合し、かつ、腫瘍増殖を抑制する、免疫グロブリン単一可変ドメイン。
[16]相補性決定領域1~3(CDR1、CDR2およびCDR3)を含み、かつ、CDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列が下記の(i)、(ii)、(iii)、(iv)、(v)、(vi)または(vii)である、上記[15]に記載の免疫グロブリン単一可変ドメイン
(i)配列番号36で表されるアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号37で表されるアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号38で表されるアミノ酸配列を含むCDR3;
(ii)配列番号39で表されるアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号40で表されるアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号41で表されるアミノ酸配列を含むCDR3;
(iii)配列番号42で表されるアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号43で表されるアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号44で表されるアミノ酸配列を含むCDR3;
(iv)配列番号45で表されるアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号46で表されるアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号47で表されるアミノ酸配列を含むCDR3;
(v)配列番号48で表されるアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号49で表されるアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号50で表されるアミノ酸配列を含むCDR3;
(vi)配列番号51で表されるアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号52で表されるアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号53で表されるアミノ酸配列を含むCDR3;
(vii)配列番号54で表されるアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号55で表されるアミノ酸配列を含むCDR2および配列番号56で表されるアミノ酸配列を含むCDR3。
[17]免疫グロブリン単一可変ドメインが、フレームワーク領域(FR1、FR2、FR3およびFR4)を含み、かつ、FR1、FR2、FR3およびFR4のアミノ酸配列が下記(viii)、(ix)、(x)、(xi)、(xii)、(xiii)または(xiv)である、上記[16]に記載の免疫グロブリン可変ドメイン
(viii)配列番号57で表されるアミノ酸配列を含むFR1、配列番号58で表されるアミノ酸配列を含むFR2、配列番号59で表されるアミノ酸配列を含むFR3および配列番号60で表されるアミノ酸配列を含むFR4;
(ix)配列番号61で表されるアミノ酸配列を含むFR1、配列番号62で表されるアミノ酸配列を含むFR2、配列番号63で表されるアミノ酸配列を含むFR3および配列番号64で表されるアミノ酸配列を含むFR4;
(x)配列番号65で表されるアミノ酸配列を含むFR1、配列番号66で表されるアミノ酸配列を含むFR2、配列番号67で表されるアミノ酸配列を含むFR3および配列番号68で表されるアミノ酸配列を含むFR4;
(xi)配列番号69で表されるアミノ酸配列を含むFR1、配列番号70で表されるアミノ酸配列を含むFR2、配列番号71で表されるアミノ酸配列を含むFR3および配列番号72で表されるアミノ酸配列を含むFR4;
(xii)配列番号73で表されるアミノ酸配列を含むFR1、配列番号74で表されるアミノ酸配列を含むFR2、配列番号75で表されるアミノ酸配列を含むFR3および配列番号76で表されるアミノ酸配列を含むFR4;
(xiii)配列番号77で表されるアミノ酸配列を含むFR1、配列番号78で表されるアミノ酸配列を含むFR2、配列番号79で表されるアミノ酸配列を含むFR3および配列番号80で表されるアミノ酸配列を含むFR4;
(xiv)配列番号81で表されるアミノ酸配列を含むFR1、配列番号82で表されるアミノ酸配列を含むFR2、配列番号83で表されるアミノ酸配列を含むFR3および配列番号84で表されるアミノ酸配列を含むFR4。
[18]下記(xv)、(xvi)または(xvii)のポリペプチドを含んでなる、上記[15]に記載の免疫グロブリン可変ドメイン
(xv)配列番号29~35のいずれかのアミノ酸配列を有するポリペプチド;
(xvi)配列番号29~35のいずれかのアミノ酸配列に対して80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ、HVEM結合能および腫瘍増殖抑制能を有するポリペプチド;
(xvii)配列番号29~35のいずれかのアミノ酸配列において、1または複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列を含み、かつ、HVEM結合能および腫瘍増殖抑制能を有するポリペプチド。
[19]上記[15]~[18]のいずれかに記載の免疫グロブリン単一可変ドメインを含んでなる、抗体または免疫グロブリン単一可変ドメイン多量体。
[20]上記[15]~[18]のいずれかに記載の免疫グロブリン単一可変ドメインまたは上記[19]に記載の抗体または多量体をコードするポリヌクレオチド。
[21]上記[15]~[18]のいずれかに記載の免疫グロブリン単一可変ドメインまたは上記[19]に記載の抗体または多量体を含んでなる、医薬組成物。
[22]神経膠腫の治療または予防に用いるための、上記[21]に記載の医薬組成物。
[23]HVEM阻害剤を有効成分として含んでなる、神経膠腫の発症リスクの低減剤および神経膠腫の発症リスクの低減用組成物。
[24]HVEM阻害剤を有効成分として含んでなる、悪性脳腫瘍の治療における予後改善剤および悪性脳腫瘍の治療における予後改善剤用組成物。
[25]有効量のHVEM阻害剤を、それを必要とする対象に投与する工程を含んでなる、神経膠腫の治療または予防方法。
[26]神経膠腫の治療方法であって、上記[10]~[12]のいずれかに記載の脳腫瘍の悪性度の判定方法を実施する工程と、悪性度の高い脳腫瘍に罹患しているか、または罹患している可能性が高いと判定された対象(あるいは神経膠腫に羅患しているか、または羅患している可能性が高いと判定された対象)に、有効量の抗癌剤(特にHVEM阻害剤)を投与する工程を含んでなる、治療方法。
本発明の用剤および組成物は、HVEM阻害剤を有効成分として含んでなるものである。ここで、「HVEM」とはHerpes Virus entry mediatorの略語であり、TNF/NGF受容体スーパーファミリーに属するI型膜貫通タンパク質をいう。HVEMは、TNFRSF14(tumor necrosis factor (TNF) receptor superfamily member 14)、CD270、LIGHTRまたはATARとも呼ばれる。すなわち、本発明における「HVEM」は「HVEM/TNFRSF14」と同義である。
後記実施例に記載される通り、HVEMの高発現が、脳腫瘍、特にMesenchymalサブタイプに属する多形性膠芽腫と相関すること、また、HVEMの高発現が膠芽腫患者の予後不良と相関することが示された。また、HVEMの過剰発現により多形性膠芽腫細胞の増殖、ニューロスフェア形成およびイン・ビボにおける腫瘍増殖がそれぞれ促進されることが確認された。従って、本発明によれば、HVEMタンパク質またはHVEM遺伝子からなる、脳腫瘍の悪性度のマーカーと、HVEMタンパク質またはHVEM遺伝子からなる、脳腫瘍の予後マーカーが提供される。本発明の脳腫瘍の悪性度のマーカーは、脳腫瘍患者における脳腫瘍の悪性度の判定に用いることができ、また、神経膠腫(特に多形性膠芽腫)の判定に用いることができる。本発明の脳腫瘍の予後マーカーは、脳腫瘍治療における脳腫瘍患者の予後の予測または推定に用いることができる。従って、本発明のこれらのマーカーは脳腫瘍の治療方針を決定する際の指標として有用である。
本発明の別の面によれば、対象(特に脳腫瘍患者)の生体試料中のHVEM発現量を測定する工程を含んでなる、脳腫瘍の悪性度の判定方法が提供される。
カットオフ値=(健常対象の生体試料または正常組織試料のHVEM発現量の平均値)±k×(健常対象の生体試料または正常組織試料のHVEM発現量の標準偏差)・・・式(1)
(上記式中、kは0~3の定数であり、好ましくはk=1~3であり、特に2とすることができる。)
本発明によれば、HVEMと特異的に結合し、かつ、腫瘍細胞の増殖(特に悪性腫瘍細胞の増殖)を抑制する、免疫グロブリン単一可変ドメインが提供される。本発明の単一可変ドメインはHVEMに対して80nM未満のEC50値で結合することができる。
本発明の別の面によれば、有効量のHVEM阻害剤を、それを必要とする対象に投与することを含んでなる、神経膠腫の治療または予防方法が提供される。本発明の別の面によればまた、有効量のHVEM阻害剤を、それを必要とする対象に投与することを含んでなる、神経膠腫の発症リスクの低減方法が提供される。本発明の別の面によればまた、有効量のHVEM阻害剤を、それを必要とする対象に投与することを含んでなる、悪性脳腫瘍の治療における予後改善方法が提供される。本発明の方法は、本発明の用剤および組成物に関する記載に従って実施することができる。
分子脳のためのリポジトリ新生児データRepository for Molecular Brain Neoplasia Data(REMBRANDT)およびThe Cancer Genome Atlas(TCGA)は、Project Betastasis(http://www.betastasis.com)、TCGAデータポータル(https://tcga-data.nci.nih.gov)およびNIH’s Genome Data Commons(https://api.gdc.cancer.gov)から抽出した。
統計解析(ウェルチのt検定、スチューデントt検定、二元配置分散分析、クラスカル・ウォリス検定およびログランク検定)は、統計ソフトウェアR(http://www.R-project.org)によって実施した。
(1)ヒト膠芽腫細胞の培養条件
ヒト多形性膠芽腫細胞であるU3024MG、U3031MGおよびU3054MG細胞株をヒト膠芽腫細胞培養物リソース(Human Glioblastoma Cell Culture、http://www.hgcc.se/#、本明細書において単に「HGCC」ということがある)から得て、膠芽腫幹細胞(glioma-initiating cells、本明細書において単に「GIC」ということがある)特性(Xie Y et al., EBioMedicine, 2:1351-63(2015))を維持する条件下で維持した。具体的には、B-27サプリメント(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)、N-2サプリメント(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)、20ng/mLの上皮成長因子(Epidermal Growth Factor;EGF、PeproTech社製)および塩基性線維芽細胞増殖因子(Fibroblast growth factor-basic;bFGF、PeproTech社製)で富化した、DMEM/F12(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)およびNeurobasal培地(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)で培養した。
上記(1)で調製した細胞に、30ng/mLの組換えヒトBMP-4(R&Dシステムズ社製)を添加した。また、対照として該BMP-4を添加しない群を作製した。
上記(2)で調製した細胞を7日間培養し、イン・ビトロ細胞増殖アッセイを行った。細胞カウントキット-8(ナカライテスク社製)を製造者の指示に従って使用した。マイクロプレートリーダー(Model680、バイオラッド社製)またはEnspire(パーキンエルマー社製)を用いて、450nmおよび595nmでの吸光度を測定することにより細胞数を測定した。
上記(2)で調製した細胞を1~100細胞/ウェルの密度で超低付着性マイクロプレート(コーニング社製)上に播種し、7日間培養した。直径が20μm以上の細胞塊をスフェアとみなした。スフェアがないウェルを各条件において計測した。
結果は図1に示した通りであった。無血清条件下の細胞増殖アッセイおよびニューロスフェア形成(Lenkiewicz M. et al., Curr Protoc Stem Cell Biol., Chapter 3: Unit3.3 (2009))において、BMP-4はU3024MGおよびU3031MG細胞の増殖を強力に阻害することを見出した。対照的に、BMP-4は、U3054MG細胞の増殖およびスフェア形成を阻害しないことが確認された。
(1)RNA配列分析
ヒト膠芽腫細胞TGS-04を用いてBMP標的遺伝子を同定するためにRNA配列分析を行った(Raja E. et al., Oncogene, 36: 4963-4974 (2017))。RNA配列データにおいてBMP-4刺激により制御される遺伝子の発現量をそのFPKM値(fragments per kilobase of exon per million fragments)に基づいて解析し、FPKM値がBMP-4刺激により1/2以下に抑制される遺伝子を抽出した。さらに抽出された遺伝子の中から膜貫通タンパク質をコードする遺伝子を探索した。その結果、TGS-04細胞においてBMP-4によりHVEMの発現が1/2以下に抑制されることが確認された(データ示さず)。
例1(2)で調製したGBM細胞(U3024MG細胞またはU3031MG細胞)から、RNeasy Mini Kit(Qiagen社製)を用いて全RNAを抽出し、ヒトHVEMおよびヒトGAPDH(相対発現量の標準化のために使用)の発現を解析した。定量的RT-PCRに使用したプライマーを表1に示す。相補DNAは、PrimeScript II 1st strand cDNA合成キット(Takara Bio社製)を用いて合成した。遺伝子発現レベルを、FastStart Universal SYBR Green Master Mix(Roche社製)を用いてStep One Plus Real-Time PCR Systems(Applied Biosystems社製)で定量した。
国立がん研究所ゲノムデータコモンズ(The National Cancer Institute Genomic Data Commons、本明細書において単に「GDC」ということがある)TCGA脳腫瘍データセットを用いて、下記(1)~(4)の解析を行った。
脳腫瘍におけるHVEMの機能を調べるために、GDC TCGAデータセットを用いてHVEMmRNAの発現レベルを解析した。結果は図3aに示される通りであった。正常な脳組織や、乏突起膠腫、乏突起星細胞腫および星細胞腫などの低悪性度神経膠腫組織と比較して、GBMにおいては有意に上昇したHVEMの発現が観察された。正常脳および低悪性度神経膠腫における発現レベル間に有意差は観察されなかった。しかし、星細胞腫では乏突起膠腫や乏突起星細胞腫と比較して有意に上昇したHVEMの発現が観察された。
GDC TCGAデータセットを用いて脳腫瘍患者の生存を分析した。結果は図3bに示される通りであった。腫瘍におけるHVEMの発現が低いGBM患者では、HVEMの発現が高い患者と比較して有意に長い生存期間が観察され、同様の結果が低グレードの神経膠腫(Lower Grade Glioma、LGG)、乏突起膠腫、乏突起星細胞腫および星細胞腫の患者においても確認された。
GBMの4つのサブタイプ(Proneural、Neural、ClassicalおよびMesenchymal、Verhaak et al., Cancer Cell, 17:98-110 (2010)の分類に基づく)におけるHVEMの発現を解析した。結果は図3cに示される通りであった。Mesenchymalサブタイプでは最も高いHVEMの発現が観察されたが、Proneuralサブタイプでは最も低い発現が観察された。
13の異なるGBM細胞株(HGCCリソースより入手(Xie Y et al., EBioMedicine, 2:1351-63(2015))およびH9 hESC由来ヒト神経幹細胞(hNSC、サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)におけるHVEMの発現を定量的RT-PCRにより解析した。なお、hNSCは、StemPro神経サプリメント(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)、EGF(20ng/mL)およびbFGF(20ng/mL)を補充したKnockOut DMEM/F12(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)で培養した。該細胞について、プライマーは表1に記載の配列番号1~4を使用し、例2(2)に記載の方法に従って、RT-PCRを実施した。結果は図3dに示される通りであった。Mesenchymalサブタイプの5株すべてにおいて、HVEMの高発現が見られた。対照的に、Proneural、NeuralおよびClassicalサブタイプのそれぞれにおいて試験された2~3株のうちの1株のみが、増加したHVEMの発現を示し、MesenchymalサブタイプにおけるHVEM発現のレベルは、一般に他のサブタイプよりも高いことが確認された。これらの結果から、特定のヒト脳腫瘍、特にGBMのMesenchymalサブタイプにおいて、HVEM発現が増加し、HVEMの高発現が、膠芽腫患者の予後不良と相関することが示された。
表2に示すショートヘアピンRNA(shRNA)をコードするDNA配列をpENTR4-H1またはpENTR4-mU6ベクターに挿入した。pENTR4-H1とCS-RfA-CMV-PuroRベクター間、またはpENTR4-mU6とCS-RfA-CGとの間のLR反応をLRクローナーゼ(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)によって触媒した。ベクタープラスミドpCAG-HIVgpおよびpCMV-VSV-G-Revを、Lipofectamine 2000(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)を用いてHEK293FT細胞に形質導入した。レンチウイルス粒子をLenti-X concentrator(タカラバイオ社製)で濃縮し、次いで無血清緩衝液で再構成した。
ヒトHVEMに対する抗体(MAB356、R&Dシステムズ社製)または対照としてマウスIgG1抗体(MAB002、R&Dシステムズ社製)を用いて、GBM細胞(U3024MG細胞、U3031MG細胞またはU3054MG細胞)表面のHVEMの機能を抑制することによるGBM細胞の増殖を調べた。具体的には、10μg/mLのヒトHVEM抗体またはマウスIgG1アイソタイプ対照抗体を培養液に添加して、GBM細胞を抗ヒトHVEM抗体または対照抗体により処理した。
上記(1)および(2)で調製した細胞について、例1(3)に記載の方法に従ってイン・ビトロ細胞増殖アッセイを行った。
上記(1)で調製した細胞について、例1(4)に記載の方法に従って、スフェア形成アッセイを行った。
結果は図4に示される通りであった。shRNAによるHVEMのノックダウンは、3つのMesenchymalサブタイプ細胞株すべての増殖を減弱させた(図4a、b)。また、Mesenchymalサブタイプ細胞のスフェア形成能は、HVEM発現のノックダウンにより強力に抑制された(図4c)。また、抗ヒトHVEM抗体により処理したMesenchymalサブタイプ培養細胞においては、細胞増殖が有意に減弱されることが確認された(図4d)。なお、U3054MG細胞における細胞増殖およびスフェア形成は、BMP-4により阻害されなかった(図1参照)が、HVEMshRNAにより阻害されることが示された。これらの結果から、HVEMがBMP-4以外のシグナル系においてもMesenchymalサブタイプ細胞の細胞増殖およびスフェア形成を促進する作用を有することが示唆された。
(1)GBM細胞におけるshRNAによるHVEMの阻害
ホタルルシフェラーゼ(Luc2、プロメガ社製、以下同様)をpENTR201ベクター(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)にクローニングし、pENTR201-Luc2およびCS-CMV-RfAベクター間の組換えをLRクローナーゼ(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)によって触媒した以外は、例4(1)の記載と同様にして、ホタルルシフェラーゼLuc2をMesenchymalサブタイプ細胞(U3031MG細胞またはU3054MG細胞)に導入し、ホタルルシフェラーゼを発現するMesenchymalサブタイプ細胞を調製した。該Mesenchymalサブタイプ細胞に、表2に記載の対照shRNA#1(配列番号5)またはHVEMshRNA#1または#2(配列番号7または8)を例4(1)に記載の方法に従って導入することにより、ホタルルシフェラーゼおよび対照shRNAまたはHVEMshRNAを発現するMesenchymalサブタイプ細胞を調製した。
上記(1)で調製したGBM細胞をヌードマウスに頭蓋内に同所移植することにより、HVEMの腫瘍形成活性を調べた。具体的には、全部で1×105個の生存細胞をBALB/c nu/nuの頭蓋骨の前項から矢状縫合の右方向に2mm、頭蓋骨の表面から3mm下の位置に移植した。ホタルルシフェリン(プロメガ社製)をマウスに腹腔内注射した後、NightOWL LB981 NC100T(Berthold technologies社製)でイン・ビボ生物発光イメージングを行った。東京大学動物倫理委員会の規則に従って、体重が20%以上減少するまで、あるいは片側不全麻痺などの神経学的徴候を示すまでマウスをモニターした。
結果は図5に示される通りであった。非標的化対照shRNA#1で処理したU3031MGおよびU3054MG細胞の両方が、細胞の移植後に腫瘍を形成したことがイン・ビボ生物発光イメージングにより示された。対照的に、HVEMshRNA#1または#2で処理された細胞は対照細胞よりも小さな腫瘍を形成し、細胞の移植15週間後にマウスにおいて生物発光シグナルが減少したかあるいは検出されなかった(図5a)。また、GBM細胞におけるHVEM発現のサイレンシングは、対照shRNAを発現するGBM細胞を有するマウスと比較して、マウスの生存期間を延長させることが確認された(図5b)。
(1)イン・ビトロにおけるHVEMの過剰発現
改良型緑色蛍光タンパク質(Enhanced Green Fluorescent Protein;EGFP)、HVEMまたはLuc2 cDNAをpENTR201ベクター(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)にクローニングし、pENTR201、CSII-EF-RfAまたはCS-CMV-RfAベクター間の組換えをLRクローナーゼ(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)によって触媒した以外は、例4(1)の記載と同様にして、EGFPまたはHVEMを例1(1)に記載の条件で培養しているGBM非Mesenchymalサブタイプ細胞(U3047MG、U3085MGおよびU3017MG細胞)において発現させた。
上記(1)で調製した細胞について、例1(3)に記載の方法に従ってイン・ビトロ細胞増殖アッセイを行った。
上記(1)で調製した細胞について、例1(4)に記載の方法に従って、スフェア形成アッセイを行った。
上記(1)で調製したEGFPまたはHVEMを過剰発現するU3047MG細胞について、イン・ビボ腫瘍形成活性を検討した。具体的には、例5(2)に記載の方法に従って、ヌードマウス(BALB/cnu/nu)頭蓋内へ該U3047MG細胞を同所移植し、イン・ビボ生物発光イメージングを行った。
結果は、図6および図7に示される通りであった。U3047MG、U3085MGおよびU3017MG細胞は、それぞれGBM細胞のProneural、NeuralおよびClassicalサブタイプであり、Mesenchymalサブタイプ細胞(図3d参照)と比較してHVEMの発現レベルは低い。これらの細胞においてHVEMを過剰発現させた場合、EGFPを導入した対照細胞と比較して細胞の増殖を増加させた(図6a)。さらに、スフェア形成能は、HVEMの過剰発現によって増強された(図6b)。これらの知見から、膠芽腫細胞の幹細胞様特性の維持におけるHVEMの役割が確認された。また、図7において、各マウス間で生物発光シグナルが変化したが、HVEMはイン・ビボで腫瘍増殖を促進し(図7a)、HVEMを発現するU3047MG細胞を移植したマウスでは対照マウスと比較して生存期間が短くなることが確認された(図7b)。
(1)HVEM発現と血清
マウス神経膠腫細胞株GL261(パーキンエルマー社製)を用いてHVEMの機能を解析した。GL261細胞を10%ウシ胎児血清(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)を添加したDMEM(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)培地(ウシ胎児血清含有分化培地)あるいは例1(1)に記載の無血清幹細胞培地で培養した。例2(2)に記載の方法に従って、表3に示すプライマーを使用して定量的RT-PCRを行った。
表4に示すHVEMshRNA#1または#2(配列番号13または14)あるいは対照shRNA#1(配列番号5)をコードするDNA配列およびEGFP配列を有するベクターを、例4(1)に記載の方法に従って、GL261細胞に導入した。該GL261細胞を、C57BL/6Jマウスへ頭蓋内に同所移植することにより、HVEMの発現を抑制した後のGL261細胞におけるHVEMの腫瘍形成活性を検討した。具体的には、全部で1×105個の生存細胞を頭蓋骨の前項から矢状縫合の右方向に2mm、頭蓋骨の表面から3mm下の位置に移植した。膠芽腫細胞を移植したマウスを、4%パラホルムアルデヒドで経心灌流した。マウスの脳組織を10~20%スクロースで凍結保護し、組織切片のヘマトキシリン・エオジン染色をした。結果は図8bに示される通りであった。対照shRNAで処理されたGL261細胞は、細胞の移植後に腫瘍を形成した(EGFPシグナルが観察された)が、HVEMshRNAで処理したマウス神経膠腫細胞は腫瘍を形成しなかった(図8b)。これらの結果から、神経膠腫細胞においてHVEMの発現を抑制することにより神経膠腫細胞の腫瘍形成活性を抑制できることが確認された。
ホタルルシフェラーゼ(RedFLuc)を発現するGL261細胞(BW134246V、パーキンエルマー社製)を、C57BL/6Jマウスの頭蓋内に同所移植することにより、抗HVEM抗体を用いてHVEMの機能をイン・ビボで調べた。具体的には、上記(2)に記載の方法に従ってGL261細胞を頭蓋内に移植してから5日後に、イン・ビボ生物発光イメージングに基づいて、ホタルルシフェラーゼの発光強度をもとにマウスを均等に2群(抗マウスHVEM抗体群およびアイソタイプ対照IgG1群)に分けた。次いで、GL261細胞を頭蓋内に移植してから5日後に7.5mg/kgの抗マウスHVEMハムスターモノクローナルIgG抗体(LBH1、Xu Y et al., Blood, 109:4097-4104(2007)に従って作製)または対照としてハムスターアイソタイプIgG抗体(I-140、Leinco Technologies社製)を腹腔内注射し、これを5日おきに計5回実施した。結果は図8cに示される通りであった。脳組織におけるヘマトキシリン・エオジン染色により、GL261細胞の移植から25日後の対照群では腫瘍を形成するが、抗マウスHVEM抗体を投与した群では、腫瘍の形成が抑制されることが確認された。対照抗体で処置した群のマウスはすべて35日以内に死亡したが、抗マウスHVEM抗体で処置した群の全てのマウスが45日より長く生存した。これらの結果から、神経膠腫細胞においてHVEMの機能を阻害することにより、神経膠腫細胞の腫瘍形成活性を抑制できること、また、生存期間を延長できることが確認された。
(1)GBMにおけるHVEMのリガンドの発現
脳腫瘍におけるHVEMのリガンドの機能を調べるために、GDC TCGAデータセットを用いてAPRILおよびHVEMの既知のリガンド(LIGHT、LTA、BTLA、CD160、SALM5)のmRNAの発現レベルを解析した。結果は図9aに示される通りであった。正常な脳組織とGBMにおいてAPRILはHVEMの既知リガンドと比較して高発現していることが観察された。
13の異なるGBM細胞株およびH9 hESC由来ヒト神経幹細胞(hNSC)の培養上清中のAPRILおよびHVEMの既知のリガンド(LTA、LIGHT)の量をサンドイッチELISA法で測定した。具体的には、細胞上清中のヒトAPRIL、LTAおよびLIGHTは、以下の試薬を使用したイムノアッセイで定量した:ヒトAPRIL/TNFSF13 DuoSet ELISA(DY884B、R&D Systems社)、ヒトLymphotoxin-alpha/TNF-beta DuoSet ELISA(DY211、R&D Systems社)、ヒトLIGHT/TNFSF14 Quantikine ELISAキット(DLIT00、R&D Systems社)、補助試薬キット2(DY008、R&D Systems社)。450nmおよび570nmの吸光度をModel680マイクロプレートリーダー(Bio-rad社)またはEnspire(Perkin Elmer社)で測定した。結果は、図9bに示される通りであった。LTAとLIGHTの培養上清中の濃度は検出感度以下であった。これに対しAPRILは正常の脳組織(hNSC)および13種類のGBMの全てにおいて50pg/mL以上の濃度で存在すること、GBMでは正常脳組織よりも発現量が高いことが確認された。
表5に示すショートヘアピンRNA(shRNA)をコードするDNA配列、Mesenchymalサブタイプ細胞(U3054MG細胞)および表6に示すAPRILのプライマーを用いた以外は、例4(1)に記載の方法に従って、shRNAによりAPRILを阻害した(図10a)。
ヒトAPRILに対する抗体(anti-human APRIL/TNFSF13、MAB5860、R&Dシステムズ社製、以下同様)10μg/mLを用いた以外は、例4(2)の記載に従ってGBM細胞表面のAPRILの機能を抑制することによるGBM細胞の増殖を調べた(図10d)。また、ヒトAPRILに対する抗体10μg/mLおよびGBM非Mesenchymalサブタイプ細胞(U3047MG)を用いた以外は、例4(2)の記載に従って非Mesenchymalサブタイプ細胞表面のAPRILの機能を抑制することによる非Mesenchymalサブタイプ細胞の増殖を調べた(図10e)。
上記(1)および(2)で調製した細胞について、例1(3)に記載の方法に従ってイン・ビトロ細胞増殖アッセイを行った(図10b、図10d、図10e)。
上記(1)で調製した細胞について、例1(4)に記載の方法に従って、スフェア形成アッセイを行った(図10c)。
脳腫瘍におけるHVEMのリガンドの機能を調べるために、GDC TCGAデータセットを用いてHVEMおよびAPRILの既知のレセプター(BCMA/TNFRSF17とTACI/TNFRSF13B)の正常脳組織とGBMにおけるmRNAの発現レベルを解析した(図10f)。
結果は図10に示される通りであった。
shRNAによるHVEMのノックダウンは、Mesenchymalサブタイプ細胞株の増殖を減弱させた(図10b)。また、Mesenchymalサブタイプ細胞のスフェア形成能は、APRIL発現のノックダウンにより強力に抑制された(図10c)。また、抗ヒトAPRIL抗体により処理したMesenchymalサブタイプ培養細胞においては、細胞増殖が有意に減弱されることが確認された(図10d)。一方、抗ヒトAPRIL抗体により処理した非Mesenchymalサブタイプ培養細胞(U3047MG)においては、細胞増殖が減弱されなかった(図10e)。U3047MG細胞はHVEMを発現していないがAPRILを発現している細胞株であることから、ヒトAPRIL抗体による細胞増殖の抑制には、脳腫瘍細胞上にHVEMの発現が必要であることが示唆された。また、GBMにおいてAPRILの2つのレセプター(BCMA、TACI)はともにHVEMに比べて発現が極めて低いことが確認されたことから、APRILがGBMにおいてAPRILの既知のレセプターと結合して作用している可能性は低いことが示唆された。これらの結果から、GBMにおけるAPRILの細胞増殖能やスフェア形成能にはHVEMの発現が必要であることが示唆された。
(1)HVEMのリガンドの同定
NF-κBの応答配列を有するminimalプロモーターの下流にホタルルシフェラーゼ遺伝子(Luc2、Promega社)を、CMVプロモーターの下流にウミシイタケルシフェラーゼ遺伝子(hRluc、Promega社)をそれぞれクローニングしたpCS-NF-κB-RE-minP-Luc2-CMV-hRlucを作製した。HEK293T細胞にヒト由来のHVEMをLipofectamine 2000(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製、以下同様)を用いて導入した後、NF-κBの応答性のLuc2遺伝子および恒常的に発現するhRluc遺伝子を導入した(HVEM発現細胞)。一方、ヒト由来のLIGHT、APRILおよびSALM5の遺伝子をpENTR4-CMVベクターにクローニングし、pENTR4-CMVとCS-RfA-EF-PuroRの間の組換えをLRクローナーゼ(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)によって触媒した。次いで、LIGHT、APRILおよびSALM5をそれぞれ前述とは別のHEK293T細胞にLipofectamine 2000を用いて発現させて、可溶性のリガンドを発現する細胞を作製した(リガンド発現細胞)。対照細胞として、NF-κBのレポーター遺伝子を発現するが、HVEMおよびリガンドのいずれも発現しない細胞を作製した(Empty)。HVEM発現細胞とリガンド発現細胞とを共培養し、HVEM発現細胞におけるNF-κBの活性をDual luciferase reporter assay kit(Promega社、以下同様)を用いて評価した。
上記(1)で作製したHVEM発現細胞をリコンビナントAPRIL(Peprotech社)、リコンビナントhuman IgG1 Fc(Control-Fc,R&Dシステムズ社)またはリコンビナントSALM5-Fc(免疫グロブリンのFc部位とのキメラタンパク、R&Dシステムズ社)で刺激し、HVEM発現細胞におけるNF-κBの活性をDual luciferase reporter assay kitを用いて評価した。
結果は、図11に示される通りであった。HVEMのリガンドであるLIGHTやSALM5と同様に、APRILもHVEM発現細胞でシグナルを伝達し、NF-κBシグナルを活性化させることが示された(図11a)。また、APRILは、SALM5-Fcと同様に10~30nM以上の濃度でHVEM発現HEK293T細胞においてシグナルを伝達し、NF-κBシグナルを活性化させることが示された(図11b)。これらの結果から、これまでHVEMのリガンドとしては報告されてこなかったAPRILが、HVEMの既知のリガンド(LIGHT、SALM5)と同様に、HVEMのリガンドとして作用することが示された。また、APRILがSALM5と同程度の濃度で作用することが示された。
(1)CRISPR/Cas9システム
表7に示すDNA配列を標的とする、表8に示すgRNAをコードするlentiCRISPR v2ベクターを作製し、Lipofectamine 2000を用いて、hCas9と各gRNAをMesenchymalサブタイプ細胞(U3054MG細胞)またはマウス神経膠腫細胞株GL261(パーキンエルマー社)に導入した。各細胞を限界希釈法でクローニングした。なお、gRNA配列はフリーソフト(CHOP CHOP: http://chopchop.cbu.uib.no/)で選定した。
上記(1)で調製した細胞について、例1(3)に記載の方法に従ってイン・ビトロ細胞増殖アッセイを行った。なお、GL261細胞は例1(1)の記載に従って、無血清幹細胞培地で培養した。
(4)スフェア形成アッセイ
上記(1)で調製した細胞について、例1(4)に記載の方法に従って、スフェア形成アッセイを行った。
結果は図12に示される通りであった。CRISPR/Cas9システムによるHVEM遺伝子のノックアウトは、Mesenchymalサブタイプ細胞株の増殖を強力に低下させることが確認された(図12a)。また、Mesenchymalサブタイプ細胞のスフェア形成能は、HVEM遺伝子のノックアウトにより抑制された(図4b)。また、マウス神経膠腫細胞株GL261細胞は無血清で培養するとHVEMの発現が上昇する(例7参照)細胞であり、該細胞においてもマウスHVEM遺伝子のノックアウトにより、細胞増殖が減弱されることが確認された(図12c)。
(1)アルパカにおける抗体作製
ヒトHVEM遺伝子(GenBank Accession No. NM_003820.3あるいはHGNC:11912)を発現させたHEK293T細胞をアルパカの皮下に免疫し、抗ヒトHVEMアルパカVHH抗体を作製した。表9に示すアミノ酸配列を有するVHH抗体を取得した。相補性決定領域(CDR)をKabatの分類法に従って同定した。結果は、図13に示される通りであった。
上記(1)で調製したVHH抗体を用いて、HVEMを発現させたHEK293T細胞膜表面上のHVEMにおいてVHH抗体の検出の有無を測定した。具体的には、HVEMを導入したHEK293T細胞および陰性対照としてHVEMを発現しないHEK293T細胞をそれぞれ1×104細胞/ウェルで播種し、4%パラホルムアルデヒドで固定した後、6×Hisタグが付加されているVHH抗体を反応させた。ホースラディッシュペルオキシダーゼHRPで標識された抗ヒスチジンタグ抗体anti-His-tag mAb-HRP-DirecT(MBL社)を反応させ、ELISA POD Substrate TMB Kit(ナカライテスク社)を用いてHRPと基質の酵素反応を測定した。抗体の濃度に対して得られた効果量データを下記式
効果量=バックグラウンド+最大効果量/(1+10^(ヒル係数×(logEC50-log(抗体濃度))))
に基づいてシグモイド曲線に非線形回帰し,50%効果濃度EC50を求めた。その結果、VHH#1~5のEC50はいずれも80nM未満であった。なお、VHH#6およびVHH#7のクローンはファージ・ディスプレー法を用いた抗体スクリーニングで取得した。
Mesenchymalサブタイプ細胞株(U3054MG細胞)に対して、VHH(I)(VHH#3)およびVHH(II)(VHH#2)を100~300nMの濃度で処理し、U3054MG細胞を37℃、5%CO2の条件で7日間培養した。陰性対照としてPBSで処理した。Cell Count Reagent SF(ナカライテスク社)を用いて細胞増殖を定量し、PBS処理群に対する細胞増殖を計測した。結果は、図14に示される通りであった。VHHで処理した細胞では、増殖が抑制されることが示された。
Claims (13)
- HVEM阻害剤を有効成分として含んでなる、神経膠腫の治療または予防剤であって、HVEM阻害剤が、HVEMに対する抗体または核酸(但し、アプタマーを除く)である、治療または予防剤。
- 神経膠腫が、乏突起膠腫、乏突起星細胞腫、星細胞腫および多形性膠芽腫のいずれかである、請求項1に記載の治療または予防剤。
- 多形性膠芽腫が、Proneuralサブタイプ、Neuralサブタイプ、ClassicalサブタイプおよびMesenchymalサブタイプのいずれかに属する、請求項2に記載の治療または予防剤。
- 神経膠腫がHVEM発現依存性である、請求項1~3のいずれか一項に記載の治療または予防剤。
- HVEM発現量が健常な対象のHVEM発現量または正常組織試料のHVEM発現量を上回る対象に投与するための、請求項1~4のいずれか一項に記載の治療または予防剤。
- 対象の生体試料中のHVEM発現量を測定する工程を含んでなる、脳腫瘍の悪性度の判定を補助する方法であって、前記対象の生体試料中のHVEM発現量が、健常な対象の生体試料中のまたは正常組織試料中の当該HVEM発現量を上回る場合に、該生体試料が悪性度の高い腫瘍細胞集団を含むことが示される、方法。
- 対象の生体試料中のHVEM発現量を測定する工程を含んでなる、脳腫瘍の悪性度の判定を補助する方法であって、前記対象の生体試料中のHVEM発現量が、健常な対象の生体試料中のまたは正常組織試料中の当該HVEM発現量を上回る場合に、対象が悪性度の高い脳腫瘍に罹患していることが示される、方法。
- 対象の生体試料中のHVEM発現量を測定する工程を含んでなる、脳腫瘍患者の予後の判定を補助する方法であって、前記対象の生体試料中のHVEM発現量が、健常な対象の生体試料中のまたは正常組織試料中の当該HVEM発現量を上回る場合に、対象の予後が不良であることが示される、方法。
- (xv)配列番号30または31のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含んでなる、免疫グロブリン単一可変ドメイン。
- 請求項9に記載の免疫グロブリン単一可変ドメインを含んでなる、抗体または免疫グロブリン単一可変ドメイン多量体。
- 請求項9に記載の免疫グロブリン単一可変ドメインまたは請求項10に記載の抗体または多量体をコードするポリヌクレオチド。
- 請求項9に記載の免疫グロブリン単一可変ドメインまたは請求項10に記載の抗体または多量体を含んでなる、医薬組成物。
- 神経膠腫の治療または予防に用いるための、請求項12に記載の医薬組成物。
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