JP7406511B2 - テルペン化合物の生体触媒的な製造方法 - Google Patents
テルペン化合物の生体触媒的な製造方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP7406511B2 JP7406511B2 JP2020567944A JP2020567944A JP7406511B2 JP 7406511 B2 JP7406511 B2 JP 7406511B2 JP 2020567944 A JP2020567944 A JP 2020567944A JP 2020567944 A JP2020567944 A JP 2020567944A JP 7406511 B2 JP7406511 B2 JP 7406511B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- seq
- amino acid
- acid sequence
- diphosphate
- sequence according
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- -1 terpene compounds Chemical class 0.000 title claims description 143
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims description 62
- 235000007586 terpenes Nutrition 0.000 title claims description 59
- 230000002210 biocatalytic effect Effects 0.000 title claims description 24
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 181
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 175
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 175
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 158
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 154
- 239000001177 diphosphate Substances 0.000 claims description 129
- 235000011180 diphosphates Nutrition 0.000 claims description 107
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 106
- 102000004160 Phosphoric Monoester Hydrolases Human genes 0.000 claims description 88
- 108090000608 Phosphoric Monoester Hydrolases Proteins 0.000 claims description 88
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 84
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 84
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 67
- 108010021809 Alcohol dehydrogenase Proteins 0.000 claims description 47
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims description 33
- 102000007698 Alcohol dehydrogenase Human genes 0.000 claims description 29
- CRDAMVZIKSXKFV-FBXUGWQNSA-N (2-cis,6-cis)-farnesol Chemical compound CC(C)=CCC\C(C)=C/CC\C(C)=C/CO CRDAMVZIKSXKFV-FBXUGWQNSA-N 0.000 claims description 24
- 239000000260 (2E,6E)-3,7,11-trimethyldodeca-2,6,10-trien-1-ol Substances 0.000 claims description 24
- 229930002886 farnesol Natural products 0.000 claims description 24
- 229940043259 farnesol Drugs 0.000 claims description 24
- CRDAMVZIKSXKFV-UHFFFAOYSA-N trans-Farnesol Natural products CC(C)=CCCC(C)=CCCC(C)=CCO CRDAMVZIKSXKFV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 24
- WUOACPNHFRMFPN-UHFFFAOYSA-N alpha-terpineol Chemical compound CC1=CCC(C(C)(C)O)CC1 WUOACPNHFRMFPN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 23
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 21
- 102000002727 Protein Tyrosine Phosphatase Human genes 0.000 claims description 19
- 108020000494 protein-tyrosine phosphatase Proteins 0.000 claims description 19
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 claims description 19
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 18
- OJISWRZIEWCUBN-QIRCYJPOSA-N (E,E,E)-geranylgeraniol Chemical compound CC(C)=CCC\C(C)=C\CC\C(C)=C\CC\C(C)=C\CO OJISWRZIEWCUBN-QIRCYJPOSA-N 0.000 claims description 17
- 125000002015 acyclic group Chemical group 0.000 claims description 17
- XWRJRXQNOHXIOX-UHFFFAOYSA-N geranylgeraniol Natural products CC(C)=CCCC(C)=CCOCC=C(C)CCC=C(C)C XWRJRXQNOHXIOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 17
- OJISWRZIEWCUBN-UHFFFAOYSA-N geranylnerol Natural products CC(C)=CCCC(C)=CCCC(C)=CCCC(C)=CCO OJISWRZIEWCUBN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 17
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 claims description 16
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 claims description 12
- 125000001183 hydrocarbyl group Chemical group 0.000 claims description 12
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 claims description 11
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims description 11
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 10
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 claims description 8
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 claims description 7
- 229930195733 hydrocarbon Natural products 0.000 claims description 7
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 6
- 239000004215 Carbon black (E152) Substances 0.000 claims description 6
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 claims description 6
- 229930182470 glycoside Natural products 0.000 claims description 6
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 5
- 150000001241 acetals Chemical class 0.000 claims description 5
- 150000002009 diols Chemical class 0.000 claims description 5
- 150000002118 epoxides Chemical class 0.000 claims description 5
- 150000002338 glycosides Chemical class 0.000 claims description 5
- 150000002430 hydrocarbons Chemical class 0.000 claims description 5
- 150000002576 ketones Chemical class 0.000 claims description 5
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims description 5
- XSTXAVWGXDQKEL-UHFFFAOYSA-N Trichloroethylene Chemical compound ClC=C(Cl)Cl XSTXAVWGXDQKEL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- DHKHKXVYLBGOIT-UHFFFAOYSA-N acetaldehyde Diethyl Acetal Natural products CCOC(C)OCC DHKHKXVYLBGOIT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 150000002596 lactones Chemical class 0.000 claims description 4
- XPPKVPWEQAFLFU-UHFFFAOYSA-N diphosphoric acid Chemical class OP(O)(=O)OP(O)(O)=O XPPKVPWEQAFLFU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 197
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 190
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 172
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 106
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 106
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 81
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 77
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 71
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 68
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 67
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 53
- XPPKVPWEQAFLFU-UHFFFAOYSA-J diphosphate(4-) Chemical compound [O-]P([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O XPPKVPWEQAFLFU-UHFFFAOYSA-J 0.000 description 52
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 48
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 48
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 48
- VWFJDQUYCIWHTN-YFVJMOTDSA-N 2-trans,6-trans-farnesyl diphosphate Chemical compound CC(C)=CCC\C(C)=C\CC\C(C)=C\CO[P@](O)(=O)OP(O)(O)=O VWFJDQUYCIWHTN-YFVJMOTDSA-N 0.000 description 40
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 40
- 239000000047 product Substances 0.000 description 40
- OINNEUNVOZHBOX-XBQSVVNOSA-N Geranylgeranyl diphosphate Natural products [P@](=O)(OP(=O)(O)O)(OC/C=C(\CC/C=C(\CC/C=C(\CC/C=C(\C)/C)/C)/C)/C)O OINNEUNVOZHBOX-XBQSVVNOSA-N 0.000 description 39
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 39
- OINNEUNVOZHBOX-QIRCYJPOSA-K 2-trans,6-trans,10-trans-geranylgeranyl diphosphate(3-) Chemical compound CC(C)=CCC\C(C)=C\CC\C(C)=C\CC\C(C)=C\COP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O OINNEUNVOZHBOX-QIRCYJPOSA-K 0.000 description 38
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 38
- VWFJDQUYCIWHTN-UHFFFAOYSA-N Farnesyl pyrophosphate Natural products CC(C)=CCCC(C)=CCCC(C)=CCOP(O)(=O)OP(O)(O)=O VWFJDQUYCIWHTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 37
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 35
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 34
- JCAIWDXKLCEQEO-ATPOGHATSA-N 5alpha,9alpha,10beta-labda-8(20),13-dien-15-yl diphosphate Chemical compound CC1(C)CCC[C@]2(C)[C@@H](CCC(/C)=C/COP(O)(=O)OP(O)(O)=O)C(=C)CC[C@H]21 JCAIWDXKLCEQEO-ATPOGHATSA-N 0.000 description 33
- JCAIWDXKLCEQEO-LXOWHHAPSA-N Copalyl diphosphate Natural products [P@@](=O)(OP(=O)(O)O)(OC/C=C(\CC[C@H]1C(=C)CC[C@H]2C(C)(C)CCC[C@@]12C)/C)O JCAIWDXKLCEQEO-LXOWHHAPSA-N 0.000 description 33
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 33
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 32
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 32
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 31
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 31
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 29
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 28
- 150000003505 terpenes Chemical class 0.000 description 27
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 26
- NUHSROFQTUXZQQ-UHFFFAOYSA-N Isopentenyl diphosphate Natural products CC(=C)CCO[P@](O)(=O)OP(O)(O)=O NUHSROFQTUXZQQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 26
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 26
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 25
- 239000002987 primer (paints) Substances 0.000 description 25
- 102100039291 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase Human genes 0.000 description 23
- CBIDRCWHNCKSTO-UHFFFAOYSA-N prenyl diphosphate Chemical compound CC(C)=CCO[P@](O)(=O)OP(O)(O)=O CBIDRCWHNCKSTO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 22
- KJTLQQUUPVSXIM-ZCFIWIBFSA-N (R)-mevalonic acid Chemical compound OCC[C@](O)(C)CC(O)=O KJTLQQUUPVSXIM-ZCFIWIBFSA-N 0.000 description 21
- KJTLQQUUPVSXIM-UHFFFAOYSA-N DL-mevalonic acid Natural products OCCC(O)(C)CC(O)=O KJTLQQUUPVSXIM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 21
- 125000002619 bicyclic group Chemical group 0.000 description 21
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 21
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical group [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 19
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 19
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 19
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 18
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 18
- 229930004069 diterpene Natural products 0.000 description 17
- 238000002290 gas chromatography-mass spectrometry Methods 0.000 description 17
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 17
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 17
- 108010064741 ent-kaurene synthetase A Proteins 0.000 description 16
- 230000006870 function Effects 0.000 description 16
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 16
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 16
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 16
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 15
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 15
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 15
- 239000002028 Biomass Substances 0.000 description 14
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 14
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 14
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 14
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 13
- 108010066605 Geranylgeranyl-Diphosphate Geranylgeranyltransferase Proteins 0.000 description 13
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 13
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 13
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 13
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 13
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 13
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 12
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 12
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 12
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 12
- 125000000567 diterpene group Chemical group 0.000 description 12
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 12
- 230000008569 process Effects 0.000 description 12
- 101100329253 Salvia miltiorrhiza CPS1 gene Proteins 0.000 description 11
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 11
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 11
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 10
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 10
- 239000000463 material Substances 0.000 description 10
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 10
- JCAIWDXKLCEQEO-PGHZQYBFSA-N 5beta,9alpha,10alpha-labda-8(20),13-dien-15-yl diphosphate Chemical compound CC1(C)CCC[C@@]2(C)[C@H](CCC(/C)=C/COP(O)(=O)OP(O)(O)=O)C(=C)CC[C@@H]21 JCAIWDXKLCEQEO-PGHZQYBFSA-N 0.000 description 9
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 108010007508 Farnesyltranstransferase Proteins 0.000 description 9
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- YPZUZOLGGMJZJO-LQKXBSAESA-N ambroxan Chemical compound CC([C@@H]1CC2)(C)CCC[C@]1(C)[C@@H]1[C@]2(C)OCC1 YPZUZOLGGMJZJO-LQKXBSAESA-N 0.000 description 9
- NERNKRPBSOBEHC-UHFFFAOYSA-N anti-copalol Natural products CC1(C)CCCC2(C)C(CCC(C)=CCO)C(=C)CCC21 NERNKRPBSOBEHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 9
- 150000004141 diterpene derivatives Chemical class 0.000 description 9
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 9
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 9
- VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N n-Hexane Chemical compound CCCCCC VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 8
- 101150094690 GAL1 gene Proteins 0.000 description 8
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- YPZUZOLGGMJZJO-UHFFFAOYSA-N ambrofix Natural products C1CC2C(C)(C)CCCC2(C)C2C1(C)OCC2 YPZUZOLGGMJZJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 8
- SNRUBQQJIBEYMU-UHFFFAOYSA-N dodecane Chemical compound CCCCCCCCCCCC SNRUBQQJIBEYMU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 8
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 8
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 8
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 8
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 8
- 101710118490 Copalyl diphosphate synthase Proteins 0.000 description 7
- 101150038242 GAL10 gene Proteins 0.000 description 7
- 102100024637 Galectin-10 Human genes 0.000 description 7
- 101100121078 Homo sapiens GAL gene Proteins 0.000 description 7
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 7
- 241000588912 Pantoea agglomerans Species 0.000 description 7
- 101710174833 Tuberculosinyl adenosine transferase Proteins 0.000 description 7
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 7
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 7
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 7
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 7
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 7
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 7
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 7
- 125000001443 terpenyl group Chemical group 0.000 description 7
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 7
- 241000972773 Aulopiformes Species 0.000 description 6
- 102100035111 Farnesyl pyrophosphate synthase Human genes 0.000 description 6
- 101710125754 Farnesyl pyrophosphate synthase Proteins 0.000 description 6
- 229920001917 Ficoll Polymers 0.000 description 6
- 102100028501 Galanin peptides Human genes 0.000 description 6
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M Potassium hydroxide Chemical compound [OH-].[K+] KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 101000912647 Salvia sclarea Copal-8-ol diphosphate hydratase TPSSA3, chloroplastic Proteins 0.000 description 6
- 101000912650 Salvia sclarea Copal-8-ol diphosphate hydratase TPSSA9, chloroplastic Proteins 0.000 description 6
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 6
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 6
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 6
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 6
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000003205 fragrance Substances 0.000 description 6
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 6
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 6
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 6
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 6
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 6
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 6
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 6
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 6
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 6
- 238000011160 research Methods 0.000 description 6
- 235000019515 salmon Nutrition 0.000 description 6
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 6
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 6
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 5
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 101150084072 ERG20 gene Proteins 0.000 description 5
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 5
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 5
- 241000304195 Salvia miltiorrhiza Species 0.000 description 5
- 235000011135 Salvia miltiorrhiza Nutrition 0.000 description 5
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 101100522756 Talaromyces verruculosus PvCPS gene Proteins 0.000 description 5
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 5
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 5
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 5
- 230000006696 biosynthetic metabolic pathway Effects 0.000 description 5
- 239000006227 byproduct Substances 0.000 description 5
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 5
- 125000002837 carbocyclic group Chemical group 0.000 description 5
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 5
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 5
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 5
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 5
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 5
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 5
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 5
- 125000000325 methylidene group Chemical group [H]C([H])=* 0.000 description 5
- 125000002950 monocyclic group Chemical group 0.000 description 5
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 5
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 5
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 5
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 5
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 5
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 5
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 5
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 5
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 5
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 5
- 241000894007 species Species 0.000 description 5
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 5
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 5
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 4
- 102000005345 Acetyl-CoA C-acetyltransferase Human genes 0.000 description 4
- 108010006229 Acetyl-CoA C-acetyltransferase Proteins 0.000 description 4
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonia chloride Chemical compound [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 101000943795 Artemisia spiciformis Monoterpene synthase FDS-5, chloroplastic Proteins 0.000 description 4
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 4
- 108010006731 Dimethylallyltranstransferase Proteins 0.000 description 4
- 102000005454 Dimethylallyltranstransferase Human genes 0.000 description 4
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 4
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 4
- 108700040132 Mevalonate kinases Proteins 0.000 description 4
- PVNIIMVLHYAWGP-UHFFFAOYSA-N Niacin Chemical compound OC(=O)C1=CC=CN=C1 PVNIIMVLHYAWGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 4
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 4
- 108020005091 Replication Origin Proteins 0.000 description 4
- AUNGANRZJHBGPY-SCRDCRAPSA-N Riboflavin Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CN1C=2C=C(C)C(C)=CC=2N=C2C1=NC(=O)NC2=O AUNGANRZJHBGPY-SCRDCRAPSA-N 0.000 description 4
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 4
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241001516650 Talaromyces verruculosus Species 0.000 description 4
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 4
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 4
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 4
- ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-N acetyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)C)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-N 0.000 description 4
- 125000003342 alkenyl group Chemical group 0.000 description 4
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 4
- 125000001118 alkylidene group Chemical group 0.000 description 4
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 4
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 4
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 4
- 239000012876 carrier material Substances 0.000 description 4
- YCIMNLLNPGFGHC-UHFFFAOYSA-N catechol Chemical compound OC1=CC=CC=C1O YCIMNLLNPGFGHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 4
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 4
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 4
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 4
- MVPPADPHJFYWMZ-UHFFFAOYSA-N chlorobenzene Chemical compound ClC1=CC=CC=C1 MVPPADPHJFYWMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 4
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 4
- 125000000392 cycloalkenyl group Chemical group 0.000 description 4
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 4
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 4
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 4
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 4
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 4
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 4
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 4
- OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N folic acid Chemical compound C=1N=C2NC(N)=NC(=O)C2=NC=1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 4
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 4
- 238000004817 gas chromatography Methods 0.000 description 4
- GVVPGTZRZFNKDS-JXMROGBWSA-N geranyl diphosphate Chemical compound CC(C)=CCC\C(C)=C\CO[P@](O)(=O)OP(O)(O)=O GVVPGTZRZFNKDS-JXMROGBWSA-N 0.000 description 4
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 4
- IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-N hexadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 4
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 4
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 4
- 102000002678 mevalonate kinase Human genes 0.000 description 4
- 235000013379 molasses Nutrition 0.000 description 4
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 4
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 4
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 4
- 230000004853 protein function Effects 0.000 description 4
- LXNHXLLTXMVWPM-UHFFFAOYSA-N pyridoxine Chemical compound CC1=NC=C(CO)C(CO)=C1O LXNHXLLTXMVWPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000012429 reaction media Substances 0.000 description 4
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 4
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 4
- 238000007363 ring formation reaction Methods 0.000 description 4
- 229930004725 sesquiterpene Natural products 0.000 description 4
- 238000012289 standard assay Methods 0.000 description 4
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 4
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 4
- 150000003467 sulfuric acid derivatives Chemical class 0.000 description 4
- 108010087432 terpene synthase Proteins 0.000 description 4
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 4
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 4
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 description 4
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 description 4
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 4
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 4
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- YHRUHBBTQZKMEX-YFVJMOTDSA-N (2-trans,6-trans)-farnesal Chemical compound CC(C)=CCC\C(C)=C\CC\C(C)=C\C=O YHRUHBBTQZKMEX-YFVJMOTDSA-N 0.000 description 3
- YHRUHBBTQZKMEX-UHFFFAOYSA-N (2E,6E)-3,7,11-trimethyl-2,6,10-dodecatrien-1-al Natural products CC(C)=CCCC(C)=CCCC(C)=CC=O YHRUHBBTQZKMEX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101710165761 (2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase Proteins 0.000 description 3
- 102100030310 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid oxidase Human genes 0.000 description 3
- 101710163881 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid oxidase Proteins 0.000 description 3
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 3
- UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N Benzene Chemical compound C1=CC=CC=C1 UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108700010070 Codon Usage Proteins 0.000 description 3
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 3
- YHRUHBBTQZKMEX-FBXUGWQNSA-N E,E-Farnesal Natural products CC(C)=CCC\C(C)=C/CC\C(C)=C/C=O YHRUHBBTQZKMEX-FBXUGWQNSA-N 0.000 description 3
- 241000588722 Escherichia Species 0.000 description 3
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 3
- VWFJDQUYCIWHTN-FBXUGWQNSA-N Farnesyl diphosphate Natural products CC(C)=CCC\C(C)=C/CC\C(C)=C/COP(O)(=O)OP(O)(O)=O VWFJDQUYCIWHTN-FBXUGWQNSA-N 0.000 description 3
- 101710156207 Farnesyl diphosphate synthase Proteins 0.000 description 3
- 101710089428 Farnesyl pyrophosphate synthase erg20 Proteins 0.000 description 3
- 108700007698 Genetic Terminator Regions Proteins 0.000 description 3
- 102000004286 Hydroxymethylglutaryl CoA Reductases Human genes 0.000 description 3
- 108090000895 Hydroxymethylglutaryl CoA Reductases Proteins 0.000 description 3
- 241000766694 Hyphozyma Species 0.000 description 3
- 108090000769 Isomerases Proteins 0.000 description 3
- 102000004195 Isomerases Human genes 0.000 description 3
- RRHGJUQNOFWUDK-UHFFFAOYSA-N Isoprene Chemical group CC(=C)C=C RRHGJUQNOFWUDK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241001443590 Naganishia albida Species 0.000 description 3
- 108091005461 Nucleic proteins Proteins 0.000 description 3
- MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N Oxalic acid Chemical compound OC(=O)C(O)=O MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102100024279 Phosphomevalonate kinase Human genes 0.000 description 3
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101710150389 Probable farnesyl diphosphate synthase Proteins 0.000 description 3
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 3
- 241000235070 Saccharomyces Species 0.000 description 3
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 3
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 3
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000009471 action Effects 0.000 description 3
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 3
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 3
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 150000001450 anions Chemical class 0.000 description 3
- 101150035354 araA gene Proteins 0.000 description 3
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 3
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 3
- 230000002457 bidirectional effect Effects 0.000 description 3
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 3
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 3
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 3
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 3
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 3
- 238000002425 crystallisation Methods 0.000 description 3
- 230000008025 crystallization Effects 0.000 description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 3
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 3
- IMKJGXCIJJXALX-UHFFFAOYSA-N ent-Norambreinolide Natural products C1CC2C(C)(C)CCCC2(C)C2C1(C)OC(=O)C2 IMKJGXCIJJXALX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000012262 fermentative production Methods 0.000 description 3
- 239000000796 flavoring agent Substances 0.000 description 3
- 235000019634 flavors Nutrition 0.000 description 3
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 3
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 3
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 3
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 3
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 3
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 3
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 3
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 3
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 3
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 3
- 150000004712 monophosphates Chemical class 0.000 description 3
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 3
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 3
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 3
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 3
- 108091000116 phosphomevalonate kinase Proteins 0.000 description 3
- 150000003013 phosphoric acid derivatives Chemical class 0.000 description 3
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 3
- 125000003367 polycyclic group Chemical group 0.000 description 3
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 3
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 3
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 3
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 3
- 150000004354 sesquiterpene derivatives Chemical class 0.000 description 3
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 3
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 3
- NERNKRPBSOBEHC-ATPOGHATSA-N (+)-copalol Chemical compound CC1(C)CCC[C@]2(C)[C@@H](CCC(/C)=C/CO)C(=C)CC[C@H]21 NERNKRPBSOBEHC-ATPOGHATSA-N 0.000 description 2
- AIALTZSQORJYNJ-LQKXBSAESA-N (1r,2r,4as,8as)-1-(2-hydroxyethyl)-2,5,5,8a-tetramethyl-3,4,4a,6,7,8-hexahydro-1h-naphthalen-2-ol Chemical compound OCC[C@H]1[C@](C)(O)CC[C@H]2C(C)(C)CCC[C@@]21C AIALTZSQORJYNJ-LQKXBSAESA-N 0.000 description 2
- 125000006656 (C2-C4) alkenyl group Chemical group 0.000 description 2
- GHOKWGTUZJEAQD-ZETCQYMHSA-N (D)-(+)-Pantothenic acid Chemical compound OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(O)=O GHOKWGTUZJEAQD-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 2
- 125000004973 1-butenyl group Chemical group C(=CCC)* 0.000 description 2
- DURPTKYDGMDSBL-UHFFFAOYSA-N 1-butoxybutane Chemical compound CCCCOCCCC DURPTKYDGMDSBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000006019 1-methyl-1-propenyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000006021 1-methyl-2-propenyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000006018 1-methyl-ethenyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000006017 1-propenyl group Chemical group 0.000 description 2
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PAWQVTBBRAZDMG-UHFFFAOYSA-N 2-(3-bromo-2-fluorophenyl)acetic acid Chemical compound OC(=O)CC1=CC=CC(Br)=C1F PAWQVTBBRAZDMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000004974 2-butenyl group Chemical group C(C=CC)* 0.000 description 2
- 125000006020 2-methyl-1-propenyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000006022 2-methyl-2-propenyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000003903 2-propenyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])=C([H])[H] 0.000 description 2
- OINNEUNVOZHBOX-QIRCYJPOSA-N 2-trans,6-trans,10-trans-geranylgeranyl diphosphate Chemical compound CC(C)=CCC\C(C)=C\CC\C(C)=C\CC\C(C)=C\COP(O)(=O)OP(O)(O)=O OINNEUNVOZHBOX-QIRCYJPOSA-N 0.000 description 2
- YQUVCSBJEUQKSH-UHFFFAOYSA-N 3,4-dihydroxybenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=C(O)C(O)=C1 YQUVCSBJEUQKSH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000004975 3-butenyl group Chemical group C(CC=C)* 0.000 description 2
- HBAQYPYDRFILMT-UHFFFAOYSA-N 8-[3-(1-cyclopropylpyrazol-4-yl)-1H-pyrazolo[4,3-d]pyrimidin-5-yl]-3-methyl-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-2-one Chemical class C1(CC1)N1N=CC(=C1)C1=NNC2=C1N=C(N=C2)N1C2C(N(CC1CC2)C)=O HBAQYPYDRFILMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 2
- ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N Ammonium bicarbonate Chemical compound [NH4+].OC([O-])=O ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004254 Ammonium phosphate Substances 0.000 description 2
- 241000228260 Aspergillus wentii Species 0.000 description 2
- 241000330870 Azoarcus toluclasticus Species 0.000 description 2
- 101150027267 BUD9 gene Proteins 0.000 description 2
- 108091033409 CRISPR Proteins 0.000 description 2
- VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L Calcium carbonate Chemical compound [Ca+2].[O-]C([O-])=O VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RGSFGYAAUTVSQA-UHFFFAOYSA-N Cyclopentane Chemical compound C1CCCC1 RGSFGYAAUTVSQA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AUNGANRZJHBGPY-UHFFFAOYSA-N D-Lyxoflavin Natural products OCC(O)C(O)C(O)CN1C=2C=C(C)C(C)=CC=2N=C2C1=NC(=O)NC2=O AUNGANRZJHBGPY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 2
- HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N D-ribofuranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N 0.000 description 2
- ZAQJHHRNXZUBTE-NQXXGFSBSA-N D-ribulose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)C(=O)CO ZAQJHHRNXZUBTE-NQXXGFSBSA-N 0.000 description 2
- ZAQJHHRNXZUBTE-UHFFFAOYSA-N D-threo-2-Pentulose Natural products OCC(O)C(O)C(=O)CO ZAQJHHRNXZUBTE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- 108020005199 Dehydrogenases Proteins 0.000 description 2
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 2
- RWSOTUBLDIXVET-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen sulfide Chemical class S RWSOTUBLDIXVET-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150051269 ERG10 gene Proteins 0.000 description 2
- 101150014913 ERG13 gene Proteins 0.000 description 2
- 101100507308 Enterococcus faecalis mvaS gene Proteins 0.000 description 2
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 2
- 229930091371 Fructose Natural products 0.000 description 2
- 239000005715 Fructose Substances 0.000 description 2
- RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N Fructose Chemical compound OC[C@H]1O[C@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N 0.000 description 2
- 102100039555 Galectin-7 Human genes 0.000 description 2
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 2
- 101100520453 Haloferax volcanii (strain ATCC 29605 / DSM 3757 / JCM 8879 / NBRC 14742 / NCIMB 2012 / VKM B-1768 / DS2) mvaD gene Proteins 0.000 description 2
- 241000517785 Helicocarpus griseus Species 0.000 description 2
- 101000608772 Homo sapiens Galectin-7 Proteins 0.000 description 2
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010000775 Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase Proteins 0.000 description 2
- 102100028888 Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic Human genes 0.000 description 2
- 108010093096 Immobilized Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 2
- LKDRXBCSQODPBY-AMVSKUEXSA-N L-(-)-Sorbose Chemical compound OCC1(O)OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O LKDRXBCSQODPBY-AMVSKUEXSA-N 0.000 description 2
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 2
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical compound [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- 102000008109 Mixed Function Oxygenases Human genes 0.000 description 2
- 108010074633 Mixed Function Oxygenases Proteins 0.000 description 2
- ZOKXTWBITQBERF-UHFFFAOYSA-N Molybdenum Chemical compound [Mo] ZOKXTWBITQBERF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101100390535 Mus musculus Fdft1 gene Proteins 0.000 description 2
- IMNFDUFMRHMDMM-UHFFFAOYSA-N N-Heptane Chemical compound CCCCCCC IMNFDUFMRHMDMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OVBPIULPVIDEAO-UHFFFAOYSA-N N-Pteroyl-L-glutaminsaeure Natural products C=1N=C2NC(N)=NC(=O)C2=NC=1CNC1=CC=C(C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 OVBPIULPVIDEAO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 2
- 101100445407 Neosartorya fumigata (strain ATCC MYA-4609 / Af293 / CBS 101355 / FGSC A1100) erg10B gene Proteins 0.000 description 2
- 101100390536 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) erg-6 gene Proteins 0.000 description 2
- 244000061176 Nicotiana tabacum Species 0.000 description 2
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 description 2
- IMKJGXCIJJXALX-SHUKQUCYSA-N Norambreinolide Chemical compound CC([C@@H]1CC2)(C)CCC[C@]1(C)[C@@H]1[C@]2(C)OC(=O)C1 IMKJGXCIJJXALX-SHUKQUCYSA-N 0.000 description 2
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 description 2
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 description 2
- 235000021314 Palmitic acid Nutrition 0.000 description 2
- 235000019483 Peanut oil Nutrition 0.000 description 2
- OFBQJSOFQDEBGM-UHFFFAOYSA-N Pentane Chemical compound CCCCC OFBQJSOFQDEBGM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000045595 Phosphoprotein Phosphatases Human genes 0.000 description 2
- 108700019535 Phosphoprotein Phosphatases Proteins 0.000 description 2
- 241000235648 Pichia Species 0.000 description 2
- NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N Piperidine Chemical compound C1CCNCC1 NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 2
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 2
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 2
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 description 2
- 101100132333 Pseudomonas mevalonii mvaA gene Proteins 0.000 description 2
- 241000589774 Pseudomonas sp. Species 0.000 description 2
- MUPFEKGTMRGPLJ-RMMQSMQOSA-N Raffinose Natural products O(C[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O[C@@]2(CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O2)O1)[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 MUPFEKGTMRGPLJ-RMMQSMQOSA-N 0.000 description 2
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 2
- 101000896804 Salvia miltiorrhiza Copalyl diphosphate synthase CPS1, chloroplastic Proteins 0.000 description 2
- 108091081021 Sense strand Proteins 0.000 description 2
- CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L Sodium Carbonate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]C([O-])=O CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 108010073771 Soybean Proteins Proteins 0.000 description 2
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 2
- 235000021355 Stearic acid Nutrition 0.000 description 2
- 241000193998 Streptococcus pneumoniae Species 0.000 description 2
- 241000187747 Streptomyces Species 0.000 description 2
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 2
- 235000019486 Sunflower oil Nutrition 0.000 description 2
- 108700005078 Synthetic Genes Proteins 0.000 description 2
- JZRWCGZRTZMZEH-UHFFFAOYSA-N Thiamine Natural products CC1=C(CCO)SC=[N+]1CC1=CN=C(C)N=C1N JZRWCGZRTZMZEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 2
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 2
- 108020004566 Transfer RNA Proteins 0.000 description 2
- 244000098338 Triticum aestivum Species 0.000 description 2
- MUPFEKGTMRGPLJ-UHFFFAOYSA-N UNPD196149 Natural products OC1C(O)C(CO)OC1(CO)OC1C(O)C(O)C(O)C(COC2C(C(O)C(O)C(CO)O2)O)O1 MUPFEKGTMRGPLJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical group O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XJLXINKUBYWONI-DQQFMEOOSA-N [[(2r,3r,4r,5r)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-hydroxy-4-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] [(2s,3r,4s,5s)-5-(3-carbamoylpyridin-1-ium-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl phosphate Chemical compound NC(=O)C1=CC=C[N+]([C@@H]2[C@H]([C@@H](O)[C@H](COP([O-])(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]3[C@H]([C@@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](O3)N3C4=NC=NC(N)=C4N=C3)O)O2)O)=C1 XJLXINKUBYWONI-DQQFMEOOSA-N 0.000 description 2
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 2
- 239000003463 adsorbent Substances 0.000 description 2
- 125000002070 alkenylidene group Chemical group 0.000 description 2
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 description 2
- PNEYBMLMFCGWSK-UHFFFAOYSA-N aluminium oxide Inorganic materials [O-2].[O-2].[O-2].[Al+3].[Al+3] PNEYBMLMFCGWSK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012080 ambient air Substances 0.000 description 2
- 125000003277 amino group Chemical class 0.000 description 2
- 239000001099 ammonium carbonate Substances 0.000 description 2
- 235000012501 ammonium carbonate Nutrition 0.000 description 2
- 235000019270 ammonium chloride Nutrition 0.000 description 2
- 229910000148 ammonium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000019289 ammonium phosphates Nutrition 0.000 description 2
- 150000003863 ammonium salts Chemical class 0.000 description 2
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 2
- 239000003957 anion exchange resin Substances 0.000 description 2
- 239000002518 antifoaming agent Substances 0.000 description 2
- 101150006429 atoB gene Proteins 0.000 description 2
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 2
- 150000007514 bases Chemical class 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 2
- 239000011942 biocatalyst Substances 0.000 description 2
- 238000002306 biochemical method Methods 0.000 description 2
- 238000010352 biotechnological method Methods 0.000 description 2
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 2
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 2
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 2
- 230000036983 biotransformation Effects 0.000 description 2
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 2
- 125000002843 carboxylic acid group Chemical group 0.000 description 2
- 239000003729 cation exchange resin Substances 0.000 description 2
- 229940023913 cation exchange resins Drugs 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 2
- 150000001805 chlorine compounds Chemical class 0.000 description 2
- 238000012411 cloning technique Methods 0.000 description 2
- 239000010941 cobalt Substances 0.000 description 2
- 229910017052 cobalt Inorganic materials 0.000 description 2
- GUTLYIVDDKVIGB-UHFFFAOYSA-N cobalt atom Chemical compound [Co] GUTLYIVDDKVIGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000003240 coconut oil Substances 0.000 description 2
- 235000019864 coconut oil Nutrition 0.000 description 2
- 238000002742 combinatorial mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 2
- 230000003750 conditioning effect Effects 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 2
- 125000000753 cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 2
- SUYRLXYYZQTJHF-VMBLUXKRSA-N dalfopristin Chemical compound O=C([C@@H]1N(C2=O)CC[C@H]1S(=O)(=O)CCN(CC)CC)O[C@H](C(C)C)[C@H](C)\C=C\C(=O)NC\C=C\C(\C)=C\[C@@H](O)CC(=O)CC1=NC2=CO1 SUYRLXYYZQTJHF-VMBLUXKRSA-N 0.000 description 2
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 2
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 2
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- MNNHAPBLZZVQHP-UHFFFAOYSA-N diammonium hydrogen phosphate Chemical compound [NH4+].[NH4+].OP([O-])([O-])=O MNNHAPBLZZVQHP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZPWVASYFFYYZEW-UHFFFAOYSA-L dipotassium hydrogen phosphate Chemical compound [K+].[K+].OP([O-])([O-])=O ZPWVASYFFYYZEW-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 238000004821 distillation Methods 0.000 description 2
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 2
- 101150116391 erg9 gene Proteins 0.000 description 2
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 2
- 125000000219 ethylidene group Chemical group [H]C(=[*])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 238000005188 flotation Methods 0.000 description 2
- 235000013312 flour Nutrition 0.000 description 2
- 238000005187 foaming Methods 0.000 description 2
- 235000019152 folic acid Nutrition 0.000 description 2
- 229960000304 folic acid Drugs 0.000 description 2
- 239000011724 folic acid Substances 0.000 description 2
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 2
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 2
- 230000000855 fungicidal effect Effects 0.000 description 2
- 239000000417 fungicide Substances 0.000 description 2
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 2
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 2
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 2
- 230000002363 herbicidal effect Effects 0.000 description 2
- 239000004009 herbicide Substances 0.000 description 2
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 description 2
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 2
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 2
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 2
- 229910017053 inorganic salt Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 2
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 2
- 125000000959 isobutyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 description 2
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- LEOHDQKUMQKLMP-NUKBDRAPSA-N labd-13-en-8,15-diol Chemical compound CC1(C)CCC[C@]2(C)[C@@H](CCC(/C)=C/CO)[C@](C)(O)CC[C@H]21 LEOHDQKUMQKLMP-NUKBDRAPSA-N 0.000 description 2
- 238000011005 laboratory method Methods 0.000 description 2
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 2
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 2
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- XIXADJRWDQXREU-UHFFFAOYSA-M lithium acetate Chemical compound [Li+].CC([O-])=O XIXADJRWDQXREU-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 230000002101 lytic effect Effects 0.000 description 2
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 2
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 2
- WPBNNNQJVZRUHP-UHFFFAOYSA-L manganese(2+);methyl n-[[2-(methoxycarbonylcarbamothioylamino)phenyl]carbamothioyl]carbamate;n-[2-(sulfidocarbothioylamino)ethyl]carbamodithioate Chemical compound [Mn+2].[S-]C(=S)NCCNC([S-])=S.COC(=O)NC(=S)NC1=CC=CC=C1NC(=S)NC(=O)OC WPBNNNQJVZRUHP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 2
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 2
- 108091070501 miRNA Proteins 0.000 description 2
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 2
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 2
- 229910052750 molybdenum Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011733 molybdenum Substances 0.000 description 2
- 229910000402 monopotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000019796 monopotassium phosphate Nutrition 0.000 description 2
- 239000003471 mutagenic agent Substances 0.000 description 2
- 230000003505 mutagenic effect Effects 0.000 description 2
- 231100000243 mutagenic effect Toxicity 0.000 description 2
- WQEPLUUGTLDZJY-UHFFFAOYSA-N n-Pentadecanoic acid Natural products CCCCCCCCCCCCCCC(O)=O WQEPLUUGTLDZJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000004108 n-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 2
- 125000004123 n-propyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 2
- 235000001968 nicotinic acid Nutrition 0.000 description 2
- 229960003512 nicotinic acid Drugs 0.000 description 2
- 239000011664 nicotinic acid Substances 0.000 description 2
- 150000002823 nitrates Chemical class 0.000 description 2
- 229910017464 nitrogen compound Inorganic materials 0.000 description 2
- 150000002830 nitrogen compounds Chemical class 0.000 description 2
- IXQGCWUGDFDQMF-UHFFFAOYSA-N o-Hydroxyethylbenzene Natural products CCC1=CC=CC=C1O IXQGCWUGDFDQMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Natural products CCCCCCCC(C)CCCCCCCCC(O)=O OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000014593 oils and fats Nutrition 0.000 description 2
- 239000012074 organic phase Substances 0.000 description 2
- 150000002898 organic sulfur compounds Chemical class 0.000 description 2
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 2
- 229940014662 pantothenate Drugs 0.000 description 2
- 235000019161 pantothenic acid Nutrition 0.000 description 2
- 239000011713 pantothenic acid Substances 0.000 description 2
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 2
- 239000000312 peanut oil Substances 0.000 description 2
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 description 2
- 108060006174 phosphomevalonate decarboxylase Proteins 0.000 description 2
- PJNZPQUBCPKICU-UHFFFAOYSA-N phosphoric acid;potassium Chemical compound [K].OP(O)(O)=O PJNZPQUBCPKICU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000035479 physiological effects, processes and functions Effects 0.000 description 2
- 229920001522 polyglycol ester Polymers 0.000 description 2
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 2
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 2
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 2
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 2
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 2
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 2
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 2
- 235000008160 pyridoxine Nutrition 0.000 description 2
- 239000011677 pyridoxine Substances 0.000 description 2
- WQGWDDDVZFFDIG-UHFFFAOYSA-N pyrogallol Chemical class OC1=CC=CC(O)=C1O WQGWDDDVZFFDIG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000003254 radicals Chemical class 0.000 description 2
- MUPFEKGTMRGPLJ-ZQSKZDJDSA-N raffinose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O2)O)O1 MUPFEKGTMRGPLJ-ZQSKZDJDSA-N 0.000 description 2
- 239000000376 reactant Substances 0.000 description 2
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 2
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 2
- 238000001953 recrystallisation Methods 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 235000019192 riboflavin Nutrition 0.000 description 2
- 229960002477 riboflavin Drugs 0.000 description 2
- 239000002151 riboflavin Substances 0.000 description 2
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 2
- 229940096995 sclareolide Drugs 0.000 description 2
- 125000002914 sec-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 230000037432 silent mutation Effects 0.000 description 2
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 2
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 2
- RMAQACBXLXPBSY-UHFFFAOYSA-N silicic acid Chemical compound O[Si](O)(O)O RMAQACBXLXPBSY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000012239 silicon dioxide Nutrition 0.000 description 2
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 2
- 238000000638 solvent extraction Methods 0.000 description 2
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 2
- 229940001941 soy protein Drugs 0.000 description 2
- 239000003549 soybean oil Substances 0.000 description 2
- 235000012424 soybean oil Nutrition 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 2
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 2
- 239000008117 stearic acid Substances 0.000 description 2
- 238000011146 sterile filtration Methods 0.000 description 2
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 2
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 2
- LSNNMFCWUKXFEE-UHFFFAOYSA-L sulfite Chemical class [O-]S([O-])=O LSNNMFCWUKXFEE-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 239000002600 sunflower oil Substances 0.000 description 2
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 2
- 238000010189 synthetic method Methods 0.000 description 2
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- KYMBYSLLVAOCFI-UHFFFAOYSA-N thiamine Chemical compound CC1=C(CCO)SCN1CC1=CN=C(C)N=C1N KYMBYSLLVAOCFI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000019157 thiamine Nutrition 0.000 description 2
- 229960003495 thiamine Drugs 0.000 description 2
- 239000011721 thiamine Substances 0.000 description 2
- 150000003568 thioethers Chemical class 0.000 description 2
- 150000003573 thiols Chemical class 0.000 description 2
- 150000004764 thiosulfuric acid derivatives Chemical class 0.000 description 2
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000011573 trace mineral Substances 0.000 description 2
- 235000013619 trace mineral Nutrition 0.000 description 2
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 2
- 238000000844 transformation Methods 0.000 description 2
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 2
- 125000000391 vinyl group Chemical group [H]C([*])=C([H])[H] 0.000 description 2
- 229940011671 vitamin b6 Drugs 0.000 description 2
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 2
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 2
- HICYDYJTCDBHMZ-UHFFFAOYSA-N (+)-alpha-Longipinen Natural products C12C3C(C)=CCC1C3(C)CCCC2(C)C HICYDYJTCDBHMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HICYDYJTCDBHMZ-COMQUAJESA-N (+)-alpha-longipinene Chemical compound CC1(C)CCC[C@]2(C)[C@]3([H])[C@@]1([H])[C@@]2([H])CC=C3C HICYDYJTCDBHMZ-COMQUAJESA-N 0.000 description 1
- MCHQEVJMCLOQAZ-UHFFFAOYSA-N (13R)-labdan-8,15-diol Natural products CC1(C)CCCC2(C)C(CCC(CCO)C)C(C)(O)CCC21 MCHQEVJMCLOQAZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MCHQEVJMCLOQAZ-VBYALHQYSA-N (1r,2r,4as,8as)-1-[(3s)-5-hydroxy-3-methylpentyl]-2,5,5,8a-tetramethyl-3,4,4a,6,7,8-hexahydro-1h-naphthalen-2-ol Chemical compound CC1(C)CCC[C@]2(C)[C@@H](CC[C@@H](CCO)C)[C@](C)(O)CC[C@H]21 MCHQEVJMCLOQAZ-VBYALHQYSA-N 0.000 description 1
- NLEBIOOXCVAHBD-YHBSTRCHSA-N (2r,3r,4s,5s,6r)-2-[(2r,3s,4r,5r,6s)-6-dodecoxy-4,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxy-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](OCCCCCCCCCCCC)O[C@H](CO)[C@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 NLEBIOOXCVAHBD-YHBSTRCHSA-N 0.000 description 1
- JXBSHSBNOVLGHF-BUJBXKITSA-N (6E,10E)-2,6,10-trimethyldodeca-2,6,10-triene Chemical compound C\C=C(/C)CC\C=C(/C)CCC=C(C)C JXBSHSBNOVLGHF-BUJBXKITSA-N 0.000 description 1
- DTCCTIQRPGSLPT-ONEGZZNKSA-N (E)-2-pentenal Chemical compound CC\C=C\C=O DTCCTIQRPGSLPT-ONEGZZNKSA-N 0.000 description 1
- SIGQQUBJQXSAMW-ZCFIWIBFSA-N (R)-5-diphosphomevalonic acid Chemical compound OC(=O)C[C@@](O)(C)CCOP(O)(=O)OP(O)(O)=O SIGQQUBJQXSAMW-ZCFIWIBFSA-N 0.000 description 1
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 1
- 125000006079 1,1,2-trimethyl-2-propenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006059 1,1-dimethyl-2-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006033 1,1-dimethyl-2-propenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006060 1,1-dimethyl-3-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005919 1,2,2-trimethylpropyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006061 1,2-dimethyl-1-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006034 1,2-dimethyl-1-propenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006062 1,2-dimethyl-2-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006035 1,2-dimethyl-2-propenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006063 1,2-dimethyl-3-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005918 1,2-dimethylbutyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006064 1,3-dimethyl-1-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006065 1,3-dimethyl-2-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006066 1,3-dimethyl-3-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006073 1-ethyl-1-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006080 1-ethyl-1-methyl-2-propenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006036 1-ethyl-1-propenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006074 1-ethyl-2-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006081 1-ethyl-2-methyl-1-propenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006082 1-ethyl-2-methyl-2-propenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006037 1-ethyl-2-propenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006075 1-ethyl-3-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006218 1-ethylbutyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000006039 1-hexenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006025 1-methyl-1-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006044 1-methyl-1-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006028 1-methyl-2-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006048 1-methyl-2-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006030 1-methyl-3-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006052 1-methyl-3-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006055 1-methyl-4-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006023 1-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 1-prop-2-ynoxypropan-2-ol Chemical compound CC(O)COCC#C GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006067 2,2-dimethyl-3-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006068 2,3-dimethyl-1-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006069 2,3-dimethyl-2-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006070 2,3-dimethyl-3-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- HNMLWBVQOGTAFV-OFQRWUPVSA-N 2-[(1s,4as,8as)-5,5,8a-trimethyl-2-methylidene-3,4,4a,6,7,8-hexahydro-1h-naphthalen-1-yl]ethanol Chemical compound OCC[C@H]1C(=C)CC[C@H]2C(C)(C)CCC[C@@]21C HNMLWBVQOGTAFV-OFQRWUPVSA-N 0.000 description 1
- 125000006076 2-ethyl-1-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006077 2-ethyl-2-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006078 2-ethyl-3-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006176 2-ethylbutyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])(C([H])([H])*)C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000006040 2-hexenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006026 2-methyl-1-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006045 2-methyl-1-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006029 2-methyl-2-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006049 2-methyl-2-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006031 2-methyl-3-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006053 2-methyl-3-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006056 2-methyl-4-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004493 2-methylbut-1-yl group Chemical group CC(C*)CC 0.000 description 1
- 125000005916 2-methylpentyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006024 2-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 108020005345 3' Untranslated Regions Proteins 0.000 description 1
- 125000006071 3,3-dimethyl-1-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006072 3,3-dimethyl-2-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- UMCMPZBLKLEWAF-BCTGSCMUSA-N 3-[(3-cholamidopropyl)dimethylammonio]propane-1-sulfonate Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(=O)NCCC[N+](C)(C)CCCS([O-])(=O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 UMCMPZBLKLEWAF-BCTGSCMUSA-N 0.000 description 1
- 125000006041 3-hexenyl group Chemical group 0.000 description 1
- NPOAOTPXWNWTSH-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxy-3-methylglutaric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C)CC(O)=O NPOAOTPXWNWTSH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006027 3-methyl-1-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006046 3-methyl-1-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006050 3-methyl-2-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006032 3-methyl-3-butenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006054 3-methyl-3-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006057 3-methyl-4-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003542 3-methylbutan-2-yl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000005917 3-methylpentyl group Chemical group 0.000 description 1
- JUSMYQGXNCVARI-XYJFISCASA-N 4-[(1s,4as,8as)-5,5,8a-trimethyl-2-methylidene-3,4,4a,6,7,8-hexahydro-1h-naphthalen-1-yl]butan-2-one Chemical compound CC1(C)CCC[C@]2(C)[C@@H](CCC(=O)C)C(=C)CC[C@H]21 JUSMYQGXNCVARI-XYJFISCASA-N 0.000 description 1
- 125000006042 4-hexenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006047 4-methyl-1-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006051 4-methyl-2-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003119 4-methyl-3-pentenyl group Chemical group [H]\C(=C(/C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000006058 4-methyl-4-pentenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006043 5-hexenyl group Chemical group 0.000 description 1
- FHVDTGUDJYJELY-UHFFFAOYSA-N 6-{[2-carboxy-4,5-dihydroxy-6-(phosphanyloxy)oxan-3-yl]oxy}-4,5-dihydroxy-3-phosphanyloxane-2-carboxylic acid Chemical compound O1C(C(O)=O)C(P)C(O)C(O)C1OC1C(C(O)=O)OC(OP)C(O)C1O FHVDTGUDJYJELY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000013563 Acid Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108010051457 Acid Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 229920000178 Acrylic resin Polymers 0.000 description 1
- 239000004925 Acrylic resin Substances 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- 241000589158 Agrobacterium Species 0.000 description 1
- 241001135756 Alphaproteobacteria Species 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 1
- 241000219194 Arabidopsis Species 0.000 description 1
- 241000219195 Arabidopsis thaliana Species 0.000 description 1
- 101100178203 Arabidopsis thaliana HMGB3 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000203069 Archaea Species 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 241000773833 Aspergillus wentii DTO 134E9 Species 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 241001135755 Betaproteobacteria Species 0.000 description 1
- 241001453380 Burkholderia Species 0.000 description 1
- 238000010354 CRISPR gene editing Methods 0.000 description 1
- 241001277508 Castellaniella defragrans Species 0.000 description 1
- 241000725101 Clea Species 0.000 description 1
- 241000193403 Clostridium Species 0.000 description 1
- 241000186216 Corynebacterium Species 0.000 description 1
- 241000195493 Cryptophyta Species 0.000 description 1
- 101710095468 Cyclase Proteins 0.000 description 1
- XDTMQSROBMDMFD-UHFFFAOYSA-N Cyclohexane Chemical compound C1CCCCC1 XDTMQSROBMDMFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 1
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 230000008265 DNA repair mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- QRLVDLBMBULFAL-UHFFFAOYSA-N Digitonin Natural products CC1CCC2(OC1)OC3C(O)C4C5CCC6CC(OC7OC(CO)C(OC8OC(CO)C(O)C(OC9OCC(O)C(O)C9OC%10OC(CO)C(O)C(OC%11OC(CO)C(O)C(O)C%11O)C%10O)C8O)C(O)C7O)C(O)CC6(C)C5CCC4(C)C3C2C QRLVDLBMBULFAL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZAFNJMIOTHYJRJ-UHFFFAOYSA-N Diisopropyl ether Chemical compound CC(C)OC(C)C ZAFNJMIOTHYJRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000016680 Dioxygenases Human genes 0.000 description 1
- 108010028143 Dioxygenases Proteins 0.000 description 1
- 102000057412 Diphosphomevalonate decarboxylases Human genes 0.000 description 1
- 101150071502 ERG12 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150045041 ERG8 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000588921 Enterobacteriaceae Species 0.000 description 1
- 101710178665 Error-prone DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 241001198387 Escherichia coli BL21(DE3) Species 0.000 description 1
- 108091029865 Exogenous DNA Proteins 0.000 description 1
- 244000290594 Ficus sycomorus Species 0.000 description 1
- 208000033962 Fontaine progeroid syndrome Diseases 0.000 description 1
- 101150082479 GAL gene Proteins 0.000 description 1
- 102100039556 Galectin-4 Human genes 0.000 description 1
- 241000192128 Gammaproteobacteria Species 0.000 description 1
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 1
- 206010071602 Genetic polymorphism Diseases 0.000 description 1
- GVVPGTZRZFNKDS-YFHOEESVSA-N Geranyl diphosphate Natural products CC(C)=CCC\C(C)=C/COP(O)(=O)OP(O)(O)=O GVVPGTZRZFNKDS-YFHOEESVSA-N 0.000 description 1
- 108010026318 Geranyltranstransferase Proteins 0.000 description 1
- 102000013404 Geranyltranstransferase Human genes 0.000 description 1
- 101100025321 Gibberella zeae (strain ATCC MYA-4620 / CBS 123657 / FGSC 9075 / NRRL 31084 / PH-1) ERG19 gene Proteins 0.000 description 1
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical compound O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100031181 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 1
- CWHLCNVHWBLZRV-UHFFFAOYSA-N Gomeraldehyde Natural products CC1(C)CCCC2(C)C1CCC3(C)OC(C)(CC=O)CCC23 CWHLCNVHWBLZRV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020005004 Guide RNA Proteins 0.000 description 1
- 101150009006 HIS3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150091750 HMG1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108700010013 HMGB1 Proteins 0.000 description 1
- 101150021904 HMGB1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100037907 High mobility group protein B1 Human genes 0.000 description 1
- 108010093488 His-His-His-His-His-His Proteins 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000958922 Homo sapiens Diphosphomevalonate decarboxylase Proteins 0.000 description 1
- 101000608765 Homo sapiens Galectin-4 Proteins 0.000 description 1
- 101001081533 Homo sapiens Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000579123 Homo sapiens Phosphoglycerate kinase 1 Proteins 0.000 description 1
- 241000556622 Hydnomerulius pinastri Species 0.000 description 1
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005909 Kieselgur Substances 0.000 description 1
- 241000235058 Komagataella pastoris Species 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- 101150021716 LPS gene Proteins 0.000 description 1
- 241000194036 Lactococcus Species 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N Methyl tert-butyl ether Chemical compound COC(C)(C)C BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700011259 MicroRNAs Proteins 0.000 description 1
- 102100023072 Neurolysin, mitochondrial Human genes 0.000 description 1
- 241000208125 Nicotiana Species 0.000 description 1
- 241000207746 Nicotiana benthamiana Species 0.000 description 1
- 241000187654 Nocardia Species 0.000 description 1
- 241001655308 Nocardiaceae Species 0.000 description 1
- 108091092724 Noncoding DNA Proteins 0.000 description 1
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 1
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 1
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 1
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 1
- 241000209094 Oryza Species 0.000 description 1
- 101000958925 Panax ginseng Diphosphomevalonate decarboxylase 1 Proteins 0.000 description 1
- 241001055258 Penicillium subrubescens Species 0.000 description 1
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 1
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 1
- 108091036407 Polyadenylation Proteins 0.000 description 1
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 108010026552 Proteome Proteins 0.000 description 1
- 239000012614 Q-Sepharose Substances 0.000 description 1
- 108091030071 RNAI Proteins 0.000 description 1
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 1
- 108010034634 Repressor Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241001633102 Rhizobiaceae Species 0.000 description 1
- 241000316848 Rhodococcus <scale insect> Species 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 229910003798 SPO2 Inorganic materials 0.000 description 1
- 101100434411 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) ADH1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100025327 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) MVD1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000607142 Salmonella Species 0.000 description 1
- 241001415513 Salpida Species 0.000 description 1
- 241001072909 Salvia Species 0.000 description 1
- 235000017276 Salvia Nutrition 0.000 description 1
- 244000182022 Salvia sclarea Species 0.000 description 1
- 235000002911 Salvia sclarea Nutrition 0.000 description 1
- 101100478210 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) spo2 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- 241000194018 Streptococcaceae Species 0.000 description 1
- 241000204060 Streptomycetaceae Species 0.000 description 1
- 101150006914 TRP1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000143485 Talaromyces atroroseus Species 0.000 description 1
- 241001215623 Talaromyces cellulolyticus Species 0.000 description 1
- 241001523006 Talaromyces marneffei Species 0.000 description 1
- 241001288858 Thauera terpenica Species 0.000 description 1
- 108091036066 Three prime untranslated region Proteins 0.000 description 1
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 description 1
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 description 1
- GSEJCLTVZPLZKY-UHFFFAOYSA-N Triethanolamine Chemical compound OCCN(CCO)CCO GSEJCLTVZPLZKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010039203 Tripeptidyl-Peptidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100034197 Tripeptidyl-peptidase 1 Human genes 0.000 description 1
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 1
- 244000126014 Valeriana officinalis Species 0.000 description 1
- 235000013832 Valeriana officinalis Nutrition 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 108020002494 acetyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 102000005421 acetyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 108091006088 activator proteins Proteins 0.000 description 1
- 150000001260 acyclic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 230000010933 acylation Effects 0.000 description 1
- 238000005917 acylation reaction Methods 0.000 description 1
- 101150102866 adc1 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000005273 aeration Methods 0.000 description 1
- 239000000556 agonist Substances 0.000 description 1
- 239000003570 air Substances 0.000 description 1
- 230000001476 alcoholic effect Effects 0.000 description 1
- 229940072056 alginate Drugs 0.000 description 1
- 235000010443 alginic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229920000615 alginic acid Polymers 0.000 description 1
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001338 aliphatic hydrocarbons Chemical class 0.000 description 1
- 230000029936 alkylation Effects 0.000 description 1
- 238000005804 alkylation reaction Methods 0.000 description 1
- HGLAYHSJJRYIBI-UHFFFAOYSA-N allyl diphosphate Chemical compound OP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC=C HGLAYHSJJRYIBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HICYDYJTCDBHMZ-JLNYLFASSA-N alpha-longipinene Natural products CC=1[C@H]2[C@]3(C)[C@H]([C@H]2C(C)(C)CCC3)CC=1 HICYDYJTCDBHMZ-JLNYLFASSA-N 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 description 1
- 230000000845 anti-microbial effect Effects 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 239000012062 aqueous buffer Substances 0.000 description 1
- 239000012736 aqueous medium Substances 0.000 description 1
- 239000012431 aqueous reaction media Substances 0.000 description 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000004507 artificial chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000002819 bacterial display Methods 0.000 description 1
- DTCCTIQRPGSLPT-UHFFFAOYSA-N beta-Aethyl-acrolein Natural products CCC=CC=O DTCCTIQRPGSLPT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001588 bifunctional effect Effects 0.000 description 1
- 238000010364 biochemical engineering Methods 0.000 description 1
- 230000008238 biochemical pathway Effects 0.000 description 1
- 230000003851 biochemical process Effects 0.000 description 1
- 238000005842 biochemical reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001851 biosynthetic effect Effects 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 1
- 229910000019 calcium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 150000001721 carbon Chemical group 0.000 description 1
- UBAZGMLMVVQSCD-UHFFFAOYSA-N carbon dioxide;molecular oxygen Chemical compound O=O.O=C=O UBAZGMLMVVQSCD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000679 carrageenan Substances 0.000 description 1
- 229920001525 carrageenan Polymers 0.000 description 1
- 235000010418 carrageenan Nutrition 0.000 description 1
- 229940113118 carrageenan Drugs 0.000 description 1
- 239000012159 carrier gas Substances 0.000 description 1
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 238000006555 catalytic reaction Methods 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 125000003636 chemical group Chemical group 0.000 description 1
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 1
- 239000012707 chemical precursor Substances 0.000 description 1
- 238000006757 chemical reactions by type Methods 0.000 description 1
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 1
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 1
- 239000002734 clay mineral Substances 0.000 description 1
- 238000000975 co-precipitation Methods 0.000 description 1
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 1
- 238000009833 condensation Methods 0.000 description 1
- 230000005494 condensation Effects 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 239000002537 cosmetic Substances 0.000 description 1
- 101150019098 cps gene Proteins 0.000 description 1
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 1
- 238000012136 culture method Methods 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 125000001995 cyclobutyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000001162 cycloheptenyl group Chemical group C1(=CCCCCC1)* 0.000 description 1
- 125000000582 cycloheptyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000000596 cyclohexenyl group Chemical group C1(=CCCCC1)* 0.000 description 1
- 125000000113 cyclohexyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- WJTCGQSWYFHTAC-UHFFFAOYSA-N cyclooctane Chemical compound C1CCCCCCC1 WJTCGQSWYFHTAC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004914 cyclooctane Substances 0.000 description 1
- 125000000522 cyclooctenyl group Chemical group C1(=CCCCCCC1)* 0.000 description 1
- 125000000640 cyclooctyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000002433 cyclopentenyl group Chemical group C1(=CCCC1)* 0.000 description 1
- 125000001511 cyclopentyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000001559 cyclopropyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C1([H])* 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 230000006735 deficit Effects 0.000 description 1
- 230000018044 dehydration Effects 0.000 description 1
- 238000006297 dehydration reaction Methods 0.000 description 1
- 238000003936 denaturing gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- KXGVEGMKQFWNSR-LLQZFEROSA-M deoxycholate Chemical compound C([C@H]1CC2)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC([O-])=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 KXGVEGMKQFWNSR-LLQZFEROSA-M 0.000 description 1
- 229940009976 deoxycholate Drugs 0.000 description 1
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 238000011026 diafiltration Methods 0.000 description 1
- SHFGJEQAOUMGJM-UHFFFAOYSA-N dialuminum dipotassium disodium dioxosilane iron(3+) oxocalcium oxomagnesium oxygen(2-) Chemical compound [O--].[O--].[O--].[O--].[O--].[O--].[O--].[O--].[Na+].[Na+].[Al+3].[Al+3].[K+].[K+].[Fe+3].[Fe+3].O=[Mg].O=[Ca].O=[Si]=O SHFGJEQAOUMGJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UVYVLBIGDKGWPX-KUAJCENISA-N digitonin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H]([C@]2(CC[C@@H]3[C@@]4(C)C[C@@H](O)[C@H](O[C@H]5[C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O[C@H]6[C@@H]([C@@H](O[C@H]7[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)CO7)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O6)O[C@H]6[C@@H]([C@@H](O[C@H]7[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O7)O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O6)O)[C@@H](CO)O5)O)C[C@@H]4CC[C@H]3[C@@H]2[C@@H]1O)C)[C@@H]1C)[C@]11CC[C@@H](C)CO1 UVYVLBIGDKGWPX-KUAJCENISA-N 0.000 description 1
- UVYVLBIGDKGWPX-UHFFFAOYSA-N digitonine Natural products CC1C(C2(CCC3C4(C)CC(O)C(OC5C(C(O)C(OC6C(C(OC7C(C(O)C(O)CO7)O)C(O)C(CO)O6)OC6C(C(OC7C(C(O)C(O)C(CO)O7)O)C(O)C(CO)O6)O)C(CO)O5)O)CC4CCC3C2C2O)C)C2OC11CCC(C)CO1 UVYVLBIGDKGWPX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000118 dimethyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 1
- POLCUAVZOMRGSN-UHFFFAOYSA-N dipropyl ether Chemical compound CCCOCCC POLCUAVZOMRGSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 1
- 230000005014 ectopic expression Effects 0.000 description 1
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 210000002257 embryonic structure Anatomy 0.000 description 1
- 230000009088 enzymatic function Effects 0.000 description 1
- 230000007247 enzymatic mechanism Effects 0.000 description 1
- 150000002170 ethers Chemical class 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 1
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 1
- 210000001723 extracellular space Anatomy 0.000 description 1
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 1
- 239000012467 final product Substances 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 238000010230 functional analysis Methods 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 230000004545 gene duplication Effects 0.000 description 1
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 description 1
- 230000030279 gene silencing Effects 0.000 description 1
- 230000009368 gene silencing by RNA Effects 0.000 description 1
- 238000012226 gene silencing method Methods 0.000 description 1
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 1
- 230000005017 genetic modification Effects 0.000 description 1
- 235000013617 genetically modified food Nutrition 0.000 description 1
- 238000010362 genome editing Methods 0.000 description 1
- 125000002350 geranyl group Chemical group [H]C([*])([H])/C([H])=C(C([H])([H])[H])/C([H])([H])C([H])([H])C([H])=C(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 239000001307 helium Substances 0.000 description 1
- 229910052734 helium Inorganic materials 0.000 description 1
- SWQJXJOGLNCZEY-UHFFFAOYSA-N helium atom Chemical compound [He] SWQJXJOGLNCZEY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DMEGYFMYUHOHGS-UHFFFAOYSA-N heptamethylene Natural products C1CCCCCC1 DMEGYFMYUHOHGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 239000013067 intermediate product Substances 0.000 description 1
- 210000005061 intracellular organelle Anatomy 0.000 description 1
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 125000004491 isohexyl group Chemical group C(CCC(C)C)* 0.000 description 1
- 238000006317 isomerization reaction Methods 0.000 description 1
- 125000001972 isopentyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 1
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 1
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 1
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 1
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 1
- CYPPCCJJKNISFK-UHFFFAOYSA-J kaolinite Chemical compound [OH-].[OH-].[OH-].[OH-].[Al+3].[Al+3].[O-][Si](=O)O[Si]([O-])=O CYPPCCJJKNISFK-UHFFFAOYSA-J 0.000 description 1
- 229910052622 kaolinite Inorganic materials 0.000 description 1
- 101150109249 lacI gene Proteins 0.000 description 1
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000007721 medicinal effect Effects 0.000 description 1
- 229960001961 meglutol Drugs 0.000 description 1
- 230000037353 metabolic pathway Effects 0.000 description 1
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 1
- 210000003470 mitochondria Anatomy 0.000 description 1
- 239000002808 molecular sieve Substances 0.000 description 1
- 229930003658 monoterpene Natural products 0.000 description 1
- 150000002773 monoterpene derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 235000002577 monoterpenes Nutrition 0.000 description 1
- 238000002887 multiple sequence alignment Methods 0.000 description 1
- 230000000869 mutational effect Effects 0.000 description 1
- 125000003136 n-heptyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000001280 n-hexyl group Chemical group C(CCCCC)* 0.000 description 1
- 125000000740 n-pentyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 238000001320 near-infrared absorption spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 125000001971 neopentyl group Chemical group [H]C([*])([H])C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 108091027963 non-coding RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000042567 non-coding RNA Human genes 0.000 description 1
- 239000012457 nonaqueous media Substances 0.000 description 1
- 230000009871 nonspecific binding Effects 0.000 description 1
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 1
- TVMXDCGIABBOFY-UHFFFAOYSA-N octane Chemical compound CCCCCCCC TVMXDCGIABBOFY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 210000003463 organelle Anatomy 0.000 description 1
- 150000007530 organic bases Chemical class 0.000 description 1
- 235000006408 oxalic acid Nutrition 0.000 description 1
- ATYBXHSAIOKLMG-UHFFFAOYSA-N oxepin Chemical compound O1C=CC=CC=C1 ATYBXHSAIOKLMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004043 oxo group Chemical group O=* 0.000 description 1
- TWNQGVIAIRXVLR-UHFFFAOYSA-N oxo(oxoalumanyloxy)alumane Chemical compound O=[Al]O[Al]=O TWNQGVIAIRXVLR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012856 packing Methods 0.000 description 1
- 125000003538 pentan-3-yl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 1
- 239000002304 perfume Substances 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 239000010451 perlite Substances 0.000 description 1
- 235000019362 perlite Nutrition 0.000 description 1
- 101150079312 pgk1 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 1
- 229920001568 phenolic resin Polymers 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 1
- 238000013081 phylogenetic analysis Methods 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 210000002706 plastid Anatomy 0.000 description 1
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 230000003234 polygenic effect Effects 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 229920000098 polyolefin Polymers 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 229920002635 polyurethane Polymers 0.000 description 1
- 239000004814 polyurethane Substances 0.000 description 1
- 125000001844 prenyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])=C(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 150000003141 primary amines Chemical class 0.000 description 1
- OSFBJERFMQCEQY-UHFFFAOYSA-N propylidene Chemical group [CH]CC OSFBJERFMQCEQY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000005484 prostate carcinoma in situ Diseases 0.000 description 1
- 108020001580 protein domains Proteins 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 230000005588 protonation Effects 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 238000002708 random mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 238000006462 rearrangement reaction Methods 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- 238000004064 recycling Methods 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 238000006722 reduction reaction Methods 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 108020004418 ribosomal RNA Proteins 0.000 description 1
- 125000006413 ring segment Chemical group 0.000 description 1
- 238000005185 salting out Methods 0.000 description 1
- 239000001691 salvia sclarea Substances 0.000 description 1
- 229930195734 saturated hydrocarbon Natural products 0.000 description 1
- 125000003548 sec-pentyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 150000003335 secondary amines Chemical class 0.000 description 1
- 229930000044 secondary metabolite Natural products 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 238000004062 sedimentation Methods 0.000 description 1
- 239000002924 silencing RNA Substances 0.000 description 1
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N sodium aluminosilicate Chemical compound [Na+].[Al+3].[O-][Si]([O-])=O.[O-][Si]([O-])=O URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910000029 sodium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 1
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- UNFWWIHTNXNPBV-WXKVUWSESA-N spectinomycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](NC)[C@@H](O)[C@H]([C@@H]([C@H]1O1)O)NC)[C@]2(O)[C@H]1O[C@H](C)CC2=O UNFWWIHTNXNPBV-WXKVUWSESA-N 0.000 description 1
- 229960000268 spectinomycin Drugs 0.000 description 1
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 description 1
- 238000004611 spectroscopical analysis Methods 0.000 description 1
- 238000007447 staining method Methods 0.000 description 1
- 229940031000 streptococcus pneumoniae Drugs 0.000 description 1
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- 229920001059 synthetic polymer Polymers 0.000 description 1
- 125000001973 tert-pentyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- AYEKOFBPNLCAJY-UHFFFAOYSA-O thiamine pyrophosphate Chemical compound CC1=C(CCOP(O)(=O)OP(O)(O)=O)SC=[N+]1CC1=CN=C(C)N=C1N AYEKOFBPNLCAJY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 238000004809 thin layer chromatography Methods 0.000 description 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 238000003151 transfection method Methods 0.000 description 1
- 230000010474 transient expression Effects 0.000 description 1
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 1
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 1
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 1
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- 125000001493 tyrosinyl group Chemical group [H]OC1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 229930195735 unsaturated hydrocarbon Natural products 0.000 description 1
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 1
- 235000016788 valerian Nutrition 0.000 description 1
- 239000008096 xylene Substances 0.000 description 1
- 150000003738 xylenes Chemical class 0.000 description 1
- 150000003751 zinc Chemical class 0.000 description 1
- UHVMMEOXYDMDKI-JKYCWFKZSA-L zinc;1-(5-cyanopyridin-2-yl)-3-[(1s,2s)-2-(6-fluoro-2-hydroxy-3-propanoylphenyl)cyclopropyl]urea;diacetate Chemical compound [Zn+2].CC([O-])=O.CC([O-])=O.CCC(=O)C1=CC=C(F)C([C@H]2[C@H](C2)NC(=O)NC=2N=CC(=CC=2)C#N)=C1O UHVMMEOXYDMDKI-JKYCWFKZSA-L 0.000 description 1
- 108010082737 zymolyase Proteins 0.000 description 1
- 229930010838 α-longipinene Natural products 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/02—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group
- C12P7/04—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0006—Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P17/00—Preparation of heterocyclic carbon compounds with only O, N, S, Se or Te as ring hetero atoms
- C12P17/02—Oxygen as only ring hetero atoms
- C12P17/04—Oxygen as only ring hetero atoms containing a five-membered hetero ring, e.g. griseofulvin, vitamin C
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/02—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group
- C12P7/04—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic
- C12P7/18—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic polyhydric
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y101/00—Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1)
- C12Y101/01—Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1) with NAD+ or NADP+ as acceptor (1.1.1)
- C12Y101/01001—Alcohol dehydrogenase (1.1.1.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y301/00—Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
- C12Y301/07—Diphosphoric monoester hydrolases (3.1.7)
- C12Y301/07003—Monoterpenyl-diphosphatase (3.1.7.3)
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Description
テルペンは、ほとんどの生物(微生物、動物および植物)に見出される。これらの化合物は、イソプレン単位と呼ばれる5個の炭素単位で構成されており、その構造中に存在するこれらの単位の数により分類される。したがって、モノテルペン、セスキテルペンおよびジテルペンは、それぞれ10個、15個および20個の炭素原子を含むテルペンである。例えば、セスキテルペンは、植物界において広く見出される。多くのセスキテルペン分子が、それらのフレーバー特性およびフレグランス特性ならびにそれらの美容効果、薬効および抗微生物効果で知られている。多数の炭化水素セスキテルペンおよびセスキテルペノイドが同定されている。
上述の課題は、驚くべきことに、大きいタンパク質チロシンホスファターゼファミリーの二リン酸除去酵素のサブグループから選択される、テルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を示す新しいクラスの酵素を提供することにより解決することができた。基質としてのテルペニル二リン酸、特にCPPおよびLPPのようなこうした複雑な二環式化合物を利用するホスファターゼとしてのタンパク質チロシンホスファターゼファミリーのこのような酵素の適用性は、先行技術に記述されていない。
ADH アルコールデヒドロゲナーゼ
bp 塩基対
kb キロベース
CPP コパリル二リン酸
CPS コパリル二リン酸シンターゼ
DNA デオキシリボ核酸
cDNA 相補的DNA
DMAPP ジメチルアリル二リン酸
DTT ジチオトレイトール
FPP ファルネシル二リン酸
GPP ゲラニル二リン酸
GGPP ゲラニルゲラニル二リン酸
GGPS ゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼ
GC ガスクロマトグラフ
IPP イソペンテニル二リン酸
LPP ラブデンジオール二リン酸
LPS ラブデンジオール二リン酸シンターゼ
MS 質量分析計/質量分析法
MVA メバロン酸
PP 二リン酸、ピロリン酸
PCR ポリメラーゼ連鎖反応
RNA リボ核酸
mRNA メッセンジャーリボ核酸
miRNA マイクロRNA
siRNA 低分子干渉RNA
rRNA リボソームRNA
tRNA 転移RNA
TPP テルペニル二リン酸
本明細書において使用される「二リン酸」および「ピロリン酸」は同義語である。
C1-C4-アルキリデンの非限定的な例は、メチリデン(=CH2)、エチリデン、(=CH-CH2)、n-プロピリデン、n-ブチリデン、およびそれらの構造異性体である。
「テルペニル二リン酸シンターゼ」または「テルペニル二リン酸シンターゼ活性を有するポリペプチド」または「テルペニル二リン酸シンターゼタンパク質」または「テルペニル二リン酸を産生する能力を有する」という用語は、非環状テルペンピロリン酸、特にGPP、FPPもしくはGGPPまたはDMAPPと一緒のIPPから出発する、その立体異性体またはその混合物のいずれかの形態のテルペニル二リン酸の合成を触媒することができるポリペプチドに関する。テルペニル二リン酸は、唯一の生成物であってよく、またはテルペニルリン酸類の混合物の一部であってよい。前記混合物は、テルペニル一リン酸および/またはテルペンアルコールを含んでよい。上記の定義は、「二環式ジテルペニル二リン酸シンターゼ」の群にも適用され、これは、CPPまたはLPPのような二環式テルペニル二リン酸を産生する。
http://pfam.xfam.org/search#tabview=tab0、
https://www.ebi.ac.uk/Tools/hmmer/search/hmmscanまたは
https://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/pfamscan/。
本明細書において使用される(+)-マノオールオキシは、4-[(1S,4aS,8aS)-5,5,8a-トリメチル-2-メチレンデカヒドロ-1-ナフタレニル]-2-ブタノンを指し、
本明細書において使用される「Z-11」は、(3S,5aR,7aS,11aS,11bR)-3,8,8,11a-テトラメチルドデカヒドロ-3,5a-エポキシナフト[2,1-c]オキセピンを指す。
本明細書において使用されるAmbrox(登録商標)は、3aR,5aS,9aS,9bR)-3a,6,6,9a-テトラメチルドデカヒドロナフト[2,1-b]フランを指す。
本明細書において使用される「DOL」は、(1R,2R,4aS,8aS)-1-(2-ヒドロキシエチル)-2,5,5,8a-テトラメチル-3,4,4a,6,7,8-ヘキサヒドロ-1H-ナフタレン-2-オール…CAS番号38419-75-9を指す
本明細書において使用される「ファルネソール」は、(2E,6E)-3,7,11-トリメチルドデカ-2,6,10-トリエン-1-オールを指す
本明細書において使用される「ゲラニルゲラニオール」は、(2E,6E,10E)-3,7,11,15-テトラメチルヘキサデカ-2,6,10,14-テトラエン-1-オールを指す。
「立体選択性」は、立体異性的に純粋な形態の化合物のある特定の立体異性体を産生する能力、または複数の立体異性体から本明細書に記載の酵素触媒法においてある特定の立体異性体を特異的に変換する能力を表す。さらに具体的には、これは、本発明のある生成物が、ある特定の立体異性体に対して濃縮されること、またはある遊離体を、ある特定の立体異性体に対して減少させることができることを意味する。これは、以下の式にしたがって計算された純度%ee-パラメータにより定量化することができる:
%ee=[XA-XB]/[XA+XB]×100
[式中、XAおよびXBは、立体異性体AおよびBのモル比(モル分率)を表す]。
-反応の全過程の間またはその前記期間中に観察されるある異性体のより高い最大収率;
-基質の定義された%変換度値におけるある異性体のより多い相対量;および/または
-より高い%変換度値におけるある異性体の同一相対量;
これらのそれぞれは好ましくは標準法と比べて観察され、前記標準法は、その他は同一の条件下、公知の化学的または生化学的手段により実施される。
a.本発明の特定の実施形態
本発明は、以下の特定の実施形態に関する:
1.第1の主な実施形態は、一般式1
Rは、Hを表し、またはとりわけ、好ましくは5で割り切れる総炭素数、特に5、10、15または20、とりわけ10または15を有する、環式または非環式の、線状または分枝状の、飽和または不飽和の、任意選択で置換されたヒドロカルビル残基を表す]
のテルペンアルコール化合物の生体触媒的な製造方法であって、
(1)式(1)の前記テルペン化合物の対応するテルペニル二リン酸前駆体を、テルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を有する、例えばモノ-、セスキ-またはジテルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を有するようなポリペプチドと接触させて、前記テルペンアルコールを生成するステップと、
(2)ステップ(1)のテルペンアルコールを任意選択で単離するステップと
を含み、前記テルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を有するポリペプチドが、タンパク質チロシンホスファターゼファミリーの二リン酸除去酵素メンバーから選択される、方法に関する。
a)前記二環式ジテルペン化合物の対応する二環式ジテルペニル二リン酸前駆体を、テルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を有する、例えばジテルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性またはとりわけ、二環式ジテルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を有するようなポリペプチドと接触させて、前記二環式ジテルペンアルコールを生成するステップと、
b)ステップ(1)の二環式ジテルペンアルコールを任意選択で単離するステップと
を含む、方法に関する。
HCxxGxxR(配列番号57)
[ここで、
各xは互いに独立して、任意の天然アミノ酸残基を表す]
を有するアミノ酸配列によって特徴付けられる二リン酸除去酵素の一クラスから選択される、実施形態1または3記載の方法。
HC(T/S)xGKDRTG(配列番号58)
[ここで、
xは、任意の天然アミノ酸残基を表し、例えば、L、A、GおよびV残基から選択される]
である、実施形態4記載の方法。
a)配列番号2にしたがうアミノ酸配列を含むTalVeTPP、
b)配列番号6にしたがうアミノ酸配列を含むAspWeTPP、
c)配列番号10にしたがうアミノ酸配列を含むHelGriTPP、
d)配列番号13にしたがうアミノ酸配列を含む、UmbPiTPP1、
e)配列番号16にしたがうアミノ酸配列を含む、TalVeTPP2、
f)配列番号19にしたがうアミノ酸配列を含む、HydPiTPP1、
g)配列番号22にしたがうアミノ酸配列を含む、TalCeTPP1、
h)配列番号25にしたがうアミノ酸配列を含む、TalMaTPP1、
i)配列番号28にしたがうアミノ酸配列を含むTalAstroTPP1、および
j)配列番号31にしたがうアミノ酸配列を含むPeSubTPP1、ならびに
k)テルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を有し、かつa)~j)にしたがう前記アミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性の程度を示すアミノ酸配列を含むポリペプチド
からなる群から選択される、先行する実施形態のいずれか1項記載の方法。
a)配列番号34にしたがうアミノ酸配列を含むSmCPS2、
b)配列番号40にしたがうアミノ酸配列を含むTaTps1-del59、
c)配列番号38にしたがうアミノ酸配列を含むSsLPS、および
d)二環式ジテルペニル二リン酸シンターゼ活性を有し、かつa)、b)およびc)にしたがう前記アミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性の程度を示すアミノ酸配列を含むポリペプチド
から選択される、実施形態9記載の方法。
a)配列番号42にしたがうアミノ酸配列を含むCymB;
b)配列番号44にしたがうアミノ酸配列を含むAspWeADH1;
c)配列番号46にしたがうアミノ酸配列を含むPsAeroADH1;
d)配列番号48にしたがうアミノ酸配列を含むAzTolADH1;
e)配列番号50にしたがうアミノ酸配列を含むAroAroADH1;
f)配列番号52にしたがうアミノ酸配列を含むThTerpADH1;
g)配列番号54にしたがうアミノ酸配列を含むCdGeoA;
h)配列番号56にしたがうアミノ酸配列を含むVoADH1;および
i)ADH活性を有し、かつa)~h)にしたがう前記アミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性の程度を示すアミノ酸配列を含むポリペプチド
から選択される、実施形態15記載の方法。
(1)コパリル二リン酸を、コパリル二リン酸(CPP)ホスファターゼ活性を有するポリペプチドと接触させて、実質的に純粋な立体異性体の形態、特に(+)-コパロール、または少なくとも2種の立体異性体の混合物の形態のいずれかのコパロールを生成するステップと、
(2)ステップ(1)のコパロールを任意選択で単離するステップと
を含む、コパロールを生体触媒的に製造するための、実施形態2から6までおよび実施形態9から11までのいずれか1項記載の方法。
a)配列番号2にしたがうアミノ酸配列を含む、TalVeTPP、
b)配列番号6にしたがうアミノ酸配列を含む、AspWeTPP、
c)配列番号10にしたがうアミノ酸配列を含む、HelGriTPP、
d)配列番号13にしたがうアミノ酸配列を含む、UmbPiTPP1、
e)配列番号16にしたがうアミノ酸配列を含む、TalVeTPP2、
f)配列番号19にしたがうアミノ酸配列を含む、HydPiTPP1、
g)配列番号22にしたがうアミノ酸配列を含む、TalCeTPP1、
h)配列番号25にしたがうアミノ酸配列を含む、TalMaTPP1、
i)配列番号28にしたがうアミノ酸配列を含む、TalAstroTPP1、および
j)配列番号31にしたがうアミノ酸配列を含む、PeSubTPP1、ならびに
k)コパリル二リン酸ホスファターゼ活性を有し、かつa)~j)にしたがう前記アミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性の程度を示すアミノ酸配列を含むポリペプチド
からなる群から選択される、実施形態17記載の方法。
a)配列番号34にしたがうアミノ酸配列を含むSmCPS2、
b)配列番号40にしたがうアミノ酸配列を含むTaTps1-del59、および
c)コパリルピロリン酸シンターゼ活性を有し、かつa)およびb)にしたがう前記アミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性の程度を示すアミノ酸配列を含むポリペプチド
から選択される、実施形態19記載の方法。
a)配列番号42にしたがうアミノ酸配列を含むCymB;
b)配列番号44にしたがうアミノ酸配列を含むAspWeADH1;
c)配列番号46にしたがうアミノ酸配列を含むPsAeroADH1;
d)配列番号48にしたがうアミノ酸配列を含むAzTolADH1;
e)配列番号50にしたがうアミノ酸配列を含むAroAroADH1;
f)配列番号52にしたがうアミノ酸配列を含むThTerpADH1;
g)配列番号54にしたがうアミノ酸配列を含むCdGeoA;
h)配列番号56にしたがうアミノ酸配列を含むVoADH1;および
i)a)~h)にしたがう前記アミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性の程度を示すアミノ酸配列を含む、ADH活性を有するポリペプチド
から選択される、実施形態24記載の方法。
(1)ラブデンジオール二リン酸(ラブダ-13-エン-8-オール二リン酸または8α-ヒドロキシコパリル二リン酸とも呼ばれる)を、ラブデンジオール二リン酸(LPP)ホスファターゼ活性を有するポリペプチドと接触させて、実質的に純粋な立体異性体の形態または少なくとも2種の立体異性体の混合物の形態のいずれかのラブデンジオールを生成するステップと、
(2)ステップ(1)のラブデンジオールを任意選択で単離するステップと
を含む、ラブデンジオールを生体触媒的に製造するための、実施形態1記載の方法。
a)配列番号2にしたがうアミノ酸配列を含む、TalVeTPP、
b)配列番号6にしたがうアミノ酸配列を含む、AspWeTPP、
c)配列番号10にしたがうアミノ酸配列を含む、HelGriTPP、
d)配列番号13にしたがうアミノ酸配列を含む、UmbPiTPP1、
e)配列番号16にしたがうアミノ酸配列を含む、TalVeTPP2、
f)配列番号19にしたがうアミノ酸配列を含む、HydPiTPP1、
g)配列番号22にしたがうアミノ酸配列を含む、TalCeTPP1、
h)配列番号25にしたがうアミノ酸配列を含む、TalMaTPP1、
i)配列番号28にしたがうアミノ酸配列を含む、TalAstroTPP1、および
j)配列番号31にしたがうアミノ酸配列を含む、PeSubTPP1、ならびに
k)LPPホスファターゼ活性を有し、かつa)~j)にしたがう前記アミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性の程度を示すアミノ酸配列を含むポリペプチド
からなる群から選択される、実施形態26記載の方法。
a)配列番号38にしたがうアミノ酸配列を含むSsLPS、および
b)ラブデンジオールピロリン酸シンターゼ活性を有し、かつa)にしたがう前記アミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性の程度を示すアミノ酸配列を含むポリペプチド
から選択される、実施形態28記載の方法。
a)配列番号42にしたがうアミノ酸配列を含むCymB;
b)配列番号44にしたがうアミノ酸配列を含むAspWeADH1;
c)配列番号46にしたがうアミノ酸配列を含むPsAeroADH1;
d)配列番号48にしたがうアミノ酸配列を含むAzTolADH1;
e)配列番号50にしたがうアミノ酸配列を含むAroAroADH1;
f)配列番号52にしたがうアミノ酸配列を含むThTerpADH1;
g)配列番号54にしたがうアミノ酸配列を含むCdGeoA;
h)配列番号56にしたがうアミノ酸配列を含むVoADH1;
i)配列番号68にしたがうアミノ酸配列を含むSCH23-ADH1
j)配列番号70にしたがうアミノ酸配列を含むSCH24-ADH1a;および
k)a)~j)にしたがう前記アミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性の程度を示すアミノ酸配列を含む、ADH活性を有するポリペプチド
から選択される、実施形態33記載の方法。
a)配列番号36にしたがうアミノ酸配列を含むポリペプチド、および
b)ゲラニルゲラニルピロリン酸シンターゼ活性を有し、かつa)にしたがう前記アミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性の程度を示すアミノ酸配列を含むポリペプチド
から選択される、実施形態35記載の方法。
a)テルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性、特に二環式ジテルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を有する少なくとも1種のポリペプチド;および任意選択で
b)テルペニル-二リン酸シンターゼ活性、特に二環式ジテルペニル-二リン酸シンターゼ活性を有する少なくとも1種のポリペプチド、および/または
c)ADH活性を有する少なくとも1種のポリペプチド;および/または
d)非環状テルペニル-二リン酸シンターゼ活性、特に非環状ジテルペニル-二リン酸シンターゼ活性を有する少なくとも1種のポリペプチド
をコードする、実施形態38記載の方法。
a)実施形態6に定義されたポリペプチド;または配列番号1、3、4、5、7、8、9、11、12、14、15、17、18、20、21、23、24、26、27、29、30および32から選択されるヌクレオチド配列;もしくは前記配列のいずれか1つとの少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドから選択される、二環式ジテルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を有する少なくとも1種のポリペプチド、および任意選択で以下の
b)実施形態10に定義されたポリペプチド;または配列番号33、37および39から選択されるヌクレオチド配列;もしくは前記配列のいずれか1つとの少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドから選択される、二環式ジテルペニル-二リン酸シンターゼ活性を有する少なくとも1種のポリペプチド
c)実施形態16に定義されたポリペプチド;または配列番号41、43、45、47、49、51、53、および55から選択されるヌクレオチド配列;もしくは前記配列のいずれか1つとの少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドから選択される、ADH活性を有する少なくとも1種のポリペプチド
d)実施形態36に定義された、非環状ジテルペニル-二リン酸シンターゼ活性を有する少なくとも1種のポリペプチド;または配列番号35から選択されるヌクレオチド配列もしくは前記配列との少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされる、非環状ジテルペニル-二リン酸シンターゼ活性を有する少なくとも1種のポリペプチド
のうちの少なくとも1つをコードする、実施形態39記載の方法。
HCxxGxxR(配列番号57)
[ここで、
各xは互いに独立して、任意の天然アミノ酸残基を表す]
を有するアミノ酸配列によって特徴付けられる、実施形態50記載のポリペプチド。
HC(T/S)xGKDRTG(配列番号58)
[ここで、
xは、任意の天然アミノ酸残基を表す]
である、実施形態51記載のポリペプチド。
a)配列番号2にしたがうアミノ酸配列を含むTalVeTPP、
b)配列番号6にしたがうアミノ酸配列を含むAspWeTPP、
c)配列番号10にしたがうアミノ酸配列を含むHelGriTPP、
d)配列番号13にしたがうアミノ酸配列を含む、UmbPiTPP1、
e)配列番号16にしたがうアミノ酸配列を含む、TalVeTPP2、
f)配列番号19にしたがうアミノ酸配列を含む、HydPiTPP1、
g)配列番号22にしたがうアミノ酸配列を含む、TalCeTPP1、
h)配列番号25にしたがうアミノ酸配列を含む、TalMaTPP1、
i)配列番号28にしたがうアミノ酸配列を含むTalAstroTPP1、
j)配列番号31にしたがうアミノ酸配列を含むPeSubTPP1、および
k)ジテルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を有し、かつa)~j)にしたがう前記アミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の配列同一性の程度を示すアミノ酸配列を含むポリペプチド
からなる群から選択される、実施形態50から52までのいずれか1項記載のポリペプチド。
a)実施形態50から53までのいずれか1項記載のポリペプチドをコードする核酸配列;
b)a)の相補的核酸配列;または
c)ストリンジェントな条件下でa)またはb)の核酸配列にハイブリダイズする核酸配列
を含む核酸分子。
a)ゲノムに任意選択で安定して組み込まれた、実施形態54記載の少なくとも1種の単離された核酸分子;または
b)ゲノムに任意選択で安定して組み込まれた、実施形態55記載の少なくとも1種の発現構築物;または
c)実施形態56から59までのいずれか1項記載の少なくとも1種のベクター
を含む組換え宿主細胞または組換え非ヒト宿主生物。
(1)実施形態50から53までのいずれか1項記載の少なくとも1種のポリペプチドを発現または過剰発現させるために、実施形態請求項60から64までのいずれか1項記載の非ヒト宿主生物または宿主細胞を培養するステップと、
(2)ステップ(1)において培養された非ヒト宿主細胞または生物からポリペプチドを任意選択で単離するステップと
を含む、実施形態50から53までのいずれか1項記載の触媒活性のある少なくとも1種のポリペプチドを製造するための方法。
(1)実施形態54記載の核酸分子を選択するステップと、
(2)選択された核酸分子を改変して、少なくとも1種の突然変異核酸分子を得るステップと、
(3)宿主細胞または単細胞宿主生物を突然変異核酸配列で形質転換して、突然変異核酸配列によってコードされるポリペプチドを発現させるステップと、
(4)テルペンシンターゼ活性、特にテルペニル二リン酸シンターゼ活性を備える少なくとも1つの突然変異体を求めて発現産物をスクリーニングするステップと、
(5)任意選択で、ポリペプチドが所望の突然変異活性を持たない場合、所望の突然変異活性を有するポリペプチドが得られるまでプロセスステップ(1)~(4)を繰り返すステップと、
(6)任意選択で、所望の突然変異活性を有するポリペプチドがステップ(4)において同定された場合、ステップ(3)において得られた対応する突然変異核酸を単離するステップと
を含む、テルペンシンターゼ活性、特にテルペニル二リン酸シンターゼ活性を備える突然変異ポリペプチドを製造するための方法。
a)実施形態1から44までのいずれか1項に定義された生体触媒プロセスを実施し、ラブデンジオールまたはコパロール化合物を任意選択で単離することにより前記ラブデンジオールまたはコパロール化合物を提供するステップと、
b)化学合成および/または生化学合成を用いてステップ(1)の前記ラブデンジオールまたはコパロール化合物をアンブロックスまたはアンブロックス様化合物に変換するステップと
を含む、上記で定義されたアンブロックスまたはアンブロックス様化合物の製造方法。
この文脈において以下の定義が適用される:
交換可能に使用することができる「ポリペプチド」または「ペプチド」という一般名は、約10~最大1.000超の残基を含むペプチド結合した連続したアミノ酸残基の天然または合成の線状鎖または配列を指す。最大30の残基を含む短鎖ポリペプチドは「オリゴペプチド」とも呼ばれる。
この文脈において以下の定義が適用される:
「核酸配列」、「核酸」、「核酸分子」および「ポリヌクレオチド」という用語は交換可能に使用され、ヌクレオチドの配列を意味する。核酸配列は、一本鎖または二本鎖のデオキシリボヌクレオチド、または任意の長さのリボヌクレオチドであってよく、遺伝子のコード配列および非コード配列、エクソン、イントロン、センスおよびアンチセンス相補的配列、ゲノムDNA、cDNA、miRNA、siRNA、mRNA、rRNA、tRNA、組換え核酸配列、単離および精製された天然に存在するDNA配列および/またはRNA配列、合成DNA配列およびRNA配列、断片、プライマーならびに核酸プローブが含まれる。RNAの核酸配列はDNA配列と同一であるがチミン(T)がウラシル(U)で置き換えられているという違いがあることを当業者は認識している。「ヌクレオチド配列」という用語は、別々の断片の形態で、またはより大きい核酸の構成要素として、ポリヌクレオチド分子またはオリゴヌクレオチド分子を含むことも理解されるべきである。
「キメラ遺伝子」は、ある種において通常天然に存在しない任意の遺伝子、特に、性質上互いに会合しない核酸配列の1つまたは複数の部分が存在する遺伝子を指す。例えば、プロモーターは、転写領域の一部もしくはすべてと、または別の調節領域と性質上会合しない。「キメラ遺伝子」という用語は、1つ以上のコード配列に、またはアンチセンス、すなわちセンス鎖の逆相補鎖または逆方向反復配列(センスおよびアンチセンス、それによってRNA転写物が転写時に二本鎖RNAを形成する)にプロモーターまたは転写調節配列が作動可能に結合されている発現構築物を含むと理解される。「キメラ遺伝子」という用語は、新しい遺伝子を作製するために1つ以上のコード配列の部分を組み合わせることにより得られた遺伝子も含む。
マルチプルアラインメントパラメータ:
ギャップオープニングペナルティ 10
ギャップ伸長ペナルティ 10
ギャップ長ペナルティ範囲 8
ギャップ長ペナルティ オフ
アラインメント遅延に対する%同一性 40
残基特異的ギャップ オフ
親水性残基ギャップ オフ
トランジション重み付け 0
ペアワイズアラインメントパラメータ:
FASTアルゴリズム オン
K-タプルサイズ 1
ギャップペナルティ 3
ウィンドウサイズ 5
ベストダイアゴナルの数 5
あるいは、同一性は、Chenna, et al. (2003)、ウェブページ:http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw/index.html#および以下の設定にしたがって決定することができる
DNAギャップオープンペナルティ 15.0
DNAギャップ伸長ペナルティ 6.66
DNA行列 同一性
タンパク質ギャップオープンペナルティ 10.0
タンパク質ギャップ伸長ペナルティ 0.2
タンパク質行列 Gonnet
タンパク質/DNA ENDGAP -1
タンパク質/DNA GAPDIST 4
本明細書で述べるすべての核酸配列(一本鎖および二本鎖のDNA配列およびRNA配列、例えばcDNAおよびmRNA)は、ヌクレオチドビルディングブロックから化学合成することにより、例えば、二重らせんの個々のオーバーラップする、相補的な核酸ビルディングブロックを断片縮合することにより、公知の方法で作製することができる。オリゴヌクレオチドの化学合成は、例えば、ホスホアミダイト法により、公知の方法で実施することができる(Voet, Voet, 2nd edition, Wiley Press, New York, pages 896-897)。合成オリゴヌクレオチドの蓄積およびDNAポリメラーゼのクレノウ断片によるギャップの充填および連結反応ならびに一般的なクローニング技法は、Sambrook et al. (1989)に記載されている(下記参照)。
さらに、当業者は、機能的突然変異体、すなわち、本明細書に開示のアミノ酸関連配列番号のいずれか1つとの少なくとも40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の配列同一性を有するポリペプチド、および/または本明細書に開示のヌクレオチド関連配列番号のいずれか1つとの少なくとも70%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む核酸分子によってコードされるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を生成するための方法に精通している。
-飽和突然変異誘発(この場合、任意のアミノ酸のコドンが遺伝子の任意の点において交換または付加され得る)(Kegler-Ebo DM, Docktor CM, DiMaio D (1994) Nucleic Acids Res 22:1593; Barettino D, Feigenbutz M, Valcarel R, Stunnenberg HG (1994) Nucleic Acids Res 22:541; Barik S (1995) Mol Biotechnol 3:1)、
-エラープローンポリメラーゼ連鎖反応(この場合、ヌクレオチド配列がエラープローンDNAポリメラーゼにより突然変異される)(Eckert KA, Kunkel TA (1990) Nucleic Acids Res 18:3739);
-SeSaM法(配列飽和法)(この場合、好ましい交換がポリメラーゼによって妨げられる)。Schenk et al., Biospektrum, Vol. 3, 2006, 277-279
-ミューテーター株における遺伝子の継代(この場合、例えば不完全なDNA修復機構のために、ヌクレオチド配列の突然変異率が増加する)(Greener A, Callahan M, Jerpseth B (1996) An efficient random mutagenesis technique using an E.coli mutator strain. In: Trower MK (Ed.) In vitro mutagenesis protocols. Humana Press, New Jersey)、または
-DNAシャッフリング(この場合、密接に関連した遺伝子のプールが形成および消化され、その断片がポリメラーゼ連鎖反応の鋳型として使用され、ここで鎖分離および再会合が繰り返されることにより、全長のモザイク遺伝子が最終的に生成される)(Stemmer WPC (1994) Nature 370:389; Stemmer WPC (1994) Proc Natl Acad Sci USA 91:10747)。
この文脈において以下の定義が適用される:
「遺伝子の発現」は、「異種発現」および「過剰発現」を包含し、遺伝子の転写およびmRNAのタンパク質への翻訳を含む。過剰発現は、類似の遺伝的背景の非形質転換細胞または生物における産生のレベルを超える、トランスジェニック細胞または生物におけるmRNA、ポリペプチドおよび/または酵素活性のレベルにより測定される遺伝子産物の産生を指す。
本明細書において使用されるとき、「を増幅する」および「増幅」という用語は、以下で詳しく説明する通り、天然に発現された核酸の組換えを生じる、または検出するための任意の適した増幅手法の使用を指す。例えば、本発明は、本発明の天然に発現された(例えばゲノムDNAまたはmRNA)核酸または組換え(例えばcDNA)核酸をイン・ビボ、エクス・ビボまたはイン・ビトロで(例えばポリメラーゼ連鎖反応、PCRにより)増幅するための方法および試薬(例えば特異的縮重オリゴヌクレオチドプライマー対、オリゴdTプライマー)を提供する。
文脈に応じて、「宿主」という用語は、野生型宿主もしくは遺伝子変更された組換え宿主またはその両方を意味し得る。
本発明はさらに、本発明によるポリペプチドまたはその生物学的に活性な機能的断片の組換え産生のための方法であって、ポリペプチドを産生する微生物が培養され、任意選択でポリペプチドの発現が、遺伝子発現を誘導する少なくとも1つの誘導因子を適用することにより誘導され、発現されたポリペプチドが培養物から単離される、方法に関する。ポリペプチドは、希望するならば工業的規模でこのように産生することもできる。
本発明による酵素またはポリペプチドは、本明細書に記載の方法において遊離で、または固定化されて使用することができる。固定化酵素は、不活性担体に固定化された酵素である。適した担体材料およびその上に固定化された酵素は、欧州特許出願公開第1149849号明細書、欧州特許出願公開第1069183号明細書および独国特許出願公開第100193773号明細書およびその中で引用された参考文献により公知である。この点に関して、これらの文書の開示全体が参照される。適した担体材料には、例えば、粘土、粘土鉱物、例えばカオリナイト、珪藻土、パーライト、シリカ、酸化アルミニウム、炭酸ナトリウム、炭酸カルシウム、セルロース粉末、陰イオン交換体材料、合成ポリマー、例えばポリスチレン、アクリル樹脂、フェノールホルムアルデヒド樹脂、ポリウレタンおよびポリオレフィン、例えばポリエチレンおよびポリプロピレンが含まれる。担持された酵素を製造するために、担体材料は、細分された粒子状で通常使用され、多孔質型が好ましい。担体材料の粒径は、通常5mm以下であり、特に2mm以下である(粒径分布曲線)。同様に、全細胞触媒としてデヒドロゲナーゼを使用する場合、遊離型または固定化型を選択することができる。担体材料は、例えばアルギン酸Ca、およびカラギーナンである。酵素ならびに細胞は、グルタルアルデヒドで直接架橋することもできる(CLEAへの架橋)。対応する他の固定化技法は、例えばJ. Lalonde and A. Margolin “Immobilization of Enzymes” in K. Drauz and H. Waldmann, Enzyme Catalysis in Organic Synthesis 2002, Vol. III, 991-1032, Wiley-VCH, Weinheimに記載されている。本発明による方法を行うための生体内変換およびバイオリアクターに関するさらなる情報は、例えばRehm et al. (Ed.) Biotechnology, 2nd Edn, Vol 3, Chapter 17, VCH, Weinheimにも記載されている。
本発明の反応は、イン・ビボまたはイン・ビトロ条件下で実施することができる。
本発明の手法は、任意選択で立体異性的または鏡像異性的に実質的に純粋な形態の、最終生成物または中間生成物を回収するステップをさらに含むことができる。「回収する」という用語は、培養培地または反応媒体からの化合物を抽出、収集、単離または精製することを含む。化合物の回収は、これらに限定されないが、従来の樹脂(例えば、陰イオンまたは陽イオン交換樹脂、非イオン性吸着樹脂など)による処理、従来の吸着剤(例えば、活性炭、ケイ酸、シリカゲル、セルロース、アルミナなど)による処理、pHの変更、溶媒抽出(例えば、アルコール、酢酸エチル、ヘキサンおよび同種のものなどの従来の溶媒による)、蒸留、透析、濾過、濃縮、結晶化、再結晶化、pH調整、凍結乾燥および同種のものを含む、当技術分野において公知の任意の従来の単離または精製手法にしたがって実施することができる。
本明細書に記載の方法のいずれかにおいて産生される環式テルペン化合物は、これらに限定されないが、炭化水素、エステル、アミド、グリコシド、エーテル、エポキシド、アルデヒド、ケトン、アルコール、ジオール、アセタールまたはケタールなどの誘導体に変換することができる。テルペン化合物誘導体は、これらに限定されないが、酸化、還元、アルキル化、アシル化および/または転位などの化学的方法により得ることができる。あるいは、テルペン化合物誘導体は、テルペン化合物を、これらに限定されないがオキシドレダクターゼ、モノオキシゲナーゼ、ジオキシゲナーゼ、トランスフェラーゼなどの酵素と接触させることにより、生化学的方法を使用して得ることができる。生化学的変換は、単離された酵素、溶解細胞からの酵素を使用してイン・ビトロで、または全細胞を使用してイン・ビボで実施することができる。
本発明は、テルペンアルコールの発酵産生のための方法にも関する。
ここで本発明を以下の実施例によりさらに詳しく説明する。
他に記載されていない限り、本明細書において使用されるすべての化学的および生化学的材料ならびに微生物または細胞は市販の製品である。
コパリル二リン酸ホスファターゼ活性を測定するための標準的なアッセイ
E.コリ(E.coli)細胞(DP1205株)は2種のプラスミド
-コパリル二リン酸(CPP)の生合成に必要な酵素をコードする遺伝子を保有するプラスミド、例えばpACYC-CrtE-SmCPS2プラスミド
-テルペニル-リン酸ホスファターゼ活性を有するタンパク質をコードする遺伝子を保有するプラスミド、例えばpJ401-TalVeTPPまたはpJ401-AspWeTPPプラスミド
で形質転換される。
E.コリ(E.coli)細胞(DP1205株)は2種のプラスミド
-8-ヒドロキシ-コパリル二リン酸(LPP)の生合成に必要な酵素をコードする遺伝子を保有するプラスミド、例えばpACYC-CrtE-SsLPSプラスミド
-テルペニル-リン酸ホスファターゼ活性を有するタンパク質をコードする遺伝子を保有するプラスミド、例えばpJ401-TalVeTPPまたはpJ401-AspWeTPPプラスミド
で形質転換される。
E.コリ(E.coli)細胞(DP1205株)は2種のプラスミド
-コパロールの生合成に必要な酵素をコードする遺伝子を保有するプラスミド、例えばpJ401-CPOL-2プラスミド、
-例えばpJ423をバックグラウンドプラスミドとして使用して、アルコールデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子を保有するプラスミド
で形質転換される。
E.コリ(E.coli)細胞(DP1205株)は2種のプラスミド
-ラブデンジオールの生合成に必要な酵素をコードする遺伝子を保有するプラスミド、例えばpJ401-LOH-2プラスミド、
-例えばpJ423をバックグラウンドプラスミドとして使用して、アルコールデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子を保有するプラスミド
で形質転換される。
Agilent 5975質量検出器に接続されたAgilent 6890シリーズGCシステムを使用して、GC-MSによりテルペン含量を分析した。このGCには、内径0.25mm×30mのHP-5MSキャピラリーカラム(Agilent)が備え付けられていた。キャリヤーガスは、一定流量1mL/minのヘリウムであった。入口温度を250℃に設定した。初期オーブン温度は1分間100℃であり、その後10℃/minの勾配が300℃まで続いた。生成物の同定は、質量スペクトルおよび保持指標と、基準標準および独自の質量スペクトルデータベースとの比較に基づいた。濃度は、内部標準に基づいて推定した。
メバロン酸経路酵素をコードする組換え遺伝子の染色体組込みにより、テルペン前駆体ファルネシル-ピロリン酸(FPP)を産生するようにE.コリ(E.coli)株を操作した。図15に示された構築スキームおよび組換え現象も参照されたい。
テルペン生合成遺伝子を保有する1種または2種の発現プラスミドでE.コリ(E.coli)細胞を形質転換し、この形質転換細胞を、適切な抗生物質(カナマイシン(50μg/ml)および/またはクロラムフェニコール(34μg/ml)を用いてLB-アガロースプレート上で培養した。単一コロニーを使用して、同じ抗生物質、4g/lグルコースおよび10%(v/v)ドデカンを追加した液体LB培地5mLに接種した。翌日、同じ抗生物質および10%(v/v)ドデカンを追加したTB培地2mLに一夜培養物0.2mLを接種した。この培養物を、光学密度が3に達するまで37℃でインキュベートした。1mM IPTGを加えることにより組換えタンパク質の発現を誘導し、この培養物を20℃で72時間インキュベートした。
上記で製造したDP1205 E.コリ(E.coli)細胞をプラスミドpJ401-CPOL-2またはpJ401-LOH-2で形質転換した。この細胞を記載の通り培養し、ジテルペンの産生を方法のセクションに記載の通り分析した。並行して、空のPJ401プラスミドおよびpACYC-CrtE-SsLPSまたはpACYC-CrtE-SmCPSプラスミドで形質転換された細胞を対照として使用した。
-シュードモナスsp.(Pseudomonas sp.)19-rlim株由来のCymB(配列番号42)(GenBankアクセッションAEO27362.1);
-アスペルギルス・ウェンティ(Aspergillus wentii)DTO 134E9非定置ゲノム骨格ASPWEscaffold_5(NCBIアクセッション番号KV878213.1)の2487333..2488627領域内に位置する遺伝子によってコードされるAspWeADH1(配列番号44)(GenBankアクセッションOJJ34588.1);
-シュードモナス・エルギノーサ(Pseudomonas aeruginosa)由来のPsAeroADH1(配列番号46)(GenBankアクセッションWP_079868259.1);
-アゾアルカス・トルクラスチクス(Azoarcus toluclasticus)由来のAzTolADH1(配列番号48)(GenBankアクセッションWP_018990713.1);
-アロマトレウム・アロマティクム(Aromatoleum aromaticum)由来のAroAroADH1(配列番号50)(GenBankアクセッションKM105875.2)。
以下をコードする2種のcDNAを含むオペロンを構築した:
-アスペルギルス・ウェンティ(Aspergillus wentii)由来のAspWeTPP(配列番号6)、
-PvCPS、タラロミセス・ヴェルキュロサス(Talaromyces verruculosus)由来の、プレニル-トランスフェラーゼ活性およびコパリル-二リン酸シンターゼ活性を有するタンパク質(配列番号59)(GenBankアクセッションBBF88128.1)。PvCPSは、IPPおよびDMAPPからのコパリルPPの産生を触媒する。
-PsAeroADH1(配列番号46)、(酵母最適化cDNA配列番号67)
-ハイホジーマ・ロゼオニグラ(Hyphozyma roseonigra)由来のSCH23-ADH1(配列番号:69)(酵母最適化cDNA配列番号68)
-クリプトコッカス・アルビダス(Cryptococcus albidus)由来のSCH24-ADH1a(配列番号:71)(酵母最適化cDNA配列番号70)
S.セレビシエ(S.cerevisiae)細胞内の内因性ファルネシル-二リン酸(FPP)プールのレベルを増加させるために、アセチル-CoA C-アセチルトランスフェラーゼをコードするERG10からFPPシンテターゼをコードするERG20までの、メバロン酸経路に関与するすべての酵母内在性遺伝子の余分なコピーをPaddon et al., Nature, 2013, 496:528-532の記載と同様に、ガラクトース誘導性プロモーターの制御下でS.セレビシエ(S.cerevisiae)株CEN.PK2-1C(Euroscarf、Frankfurt、Germany)のゲノムに組み込んだ。簡潔には、3つのカセットをLEU2、TRP1およびURA3遺伝子座それぞれに組み込んだ。GAL10/GAL1の双方向性プロモーターならびに遺伝子ERG19およびERG13の制御下、同じくGAL10/GAL1プロモーターの制御下の遺伝子ERG20および切断型HMG1(Donald et al., Proc Natl Acad Sci USA, 1997, 109:E111-8に記載のtHMG1)を含む第1のカセット、このカセットは、LEU2の上流部位および下流部位に対応する2つの100ヌクレオチド領域に隣接していた。遺伝子IDI1およびtHMG1がGAL10/GAL1プロモーターの制御下、遺伝子ERG13がGAL7のプロモーター領域の制御下であった第2のカセット、このカセットは、TRP1の上流部位および下流部位に対応する2つの100ヌクレオチド領域に隣接していた。すべてGAL10/GAL1プロモーターの制御下の遺伝子ERG10、ERG12、tHMG1およびERG8を含む第3のカセット、このカセットは、URA3の上流部位および下流部位に対応する2つの100ヌクレオチド領域に隣接していた。3つのカセット内のすべての遺伝子が、200ヌクレオチドのそれ自体のターミネーター領域を含んでいた。また、Griggs and Johnston, Proc Natl Acad Sci USA, 1991, 88:8597-8601に記載の通り、それ自体のプロモーターの突然変異型の制御下のGAL4の余分なコピーをERG9プロモーター領域の上流に組み込んだ。加えて、ERG9の発現をプロモーター交換により改変した。それ自体のプロモーターおよびターミネーターを含むHIS3遺伝子を含むカセットを使用してGAL7、GAL10およびGAL1遺伝子を欠失させた。得られた株をCEN.PK2-1D株(Euroscarf、Frankfurt、Germany)と交配させて、YST045と名付けた二倍体株を得、これをSolis-Escalante et al, FEMS Yeast Res, 2015, 15:2にしたがって胞子形成に誘導した。ザイモリアーゼ(1000U mL-1、Zymo research、Irvine、CA)2μLを含む0.5Mソルビトール200μL中に子嚢を再懸濁させることにより胞子分離を達成し、37℃で20分間インキュベートした。次いで、この混合物を、20g/Lペプトン、10g/L酵母エキスおよび20g/L寒天を含む培地上にプレーティングし、1種の発芽胞子を単離し、YST075と名付けた。
2)配列5’-GCACTTGCTACACTGTCAGGATAGCTTCCGTCACATGGTGGCGATCACCGTACATCTGAG-3’(配列番号72)、GAL1遺伝子のプロモーター領域、S.セレビシエ(S.cerevisiae)内の発現のためにコドン最適化された、アルコールデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子のうちの1つ、PGK1遺伝子のターミネーター領域および配列5’-AGGTGCAGTTCGCGTGCAATTATAACGTCGTGGCAACTGTTATCAGTCGTACCGCGCCAT-3’(配列番号73)を含む断片、この断片をDNA合成により得た(ATUM、Menlo Park、CA 94025)、
3)配列5’-AGGTGCAGTTCGCGTGCAATTATAACGTCGTGGCAACTGTTATCAGTCGTACCGCGCCAT-3’(配列番号73)、それ自体のプロモーターおよびターミネーター領域を含むTRP1遺伝子ならびに配列5’-TGGTCAGCAACAACGCCGAAGAATCACTCTCGTGTTGAGAATTGCACGCCTTGACCACGA-3’(配列番号74)を含む断片、この断片を、pESC-TRP1(Agilent Technologies、California、USA)を鋳型として用いてPCRにより得た;および
4)配列5’-TGGTCAGCAACAACGCCGAAGAATCACTCTCGTGTTGAGAATTGCACGCCTTGACCACGA-3’(配列番号74)およびBUD9遺伝子に対応する344bpを含む断片、この断片を、YST075株由来のゲノムDNAを鋳型として用いてPCRにより得た。
a)プライマー5’AGGTGCAGTTCGCGTGCAATTATAACGTCGTGGCAACTGTTATCAGTCGTACCGCGCCATTCGACTACGTCGTAAGGCC-3’(配列番号75)および5’TCGTGGTCAAGGCGTGCAATTCTCAACACGAGAGTGATTCTTCGGCGTTGTTGCTGACCATCGACGGTCGAGGAGAACTT-3’(配列番号76)を、鋳型としてのプラスミドpESC-LEU(Agilent Technologies、California、USA)と共に使用してPCRにより構築されたLEU2酵母マーカー;
b)プライマー5’-TGGTCAGCAACAACGCCGAAGAATCACTCTCGTGTTGAGAATTGCACGCCTTGACCACGACACGTTAAGGGATTTTGGTCATGAG-3’(配列番号77)および5’-AACGCGTACCCTAAGTACGGCACCACAGTGACTATGCAGTCCGCACTTTGCCAATGCCAAAAATGTGCGCGGAACCCCTA-3’(配列番号78)を、鋳型としてのプラスミドpESC-URAと共に使用してPCRにより構築されたAmpR E.コリ(E.coli)マーカー;
c)プライマー5’-TTGGCATTGGCAAAGTGCGGACTGCATAGTCACTGTGGTGCCGTACTTAGGGTACGCGTTCCTGAACGAAGCATCTGTGCTTCA-3’(配列番号79)および5’-CCGAGATGCCAAAGGATAGGTGCTATGTTGATGACTACGACACAGAACTGCGGGTGACATAATGATAGCATTGAAGGATGAGACT-3’(配列番号80)を、鋳型としてのpESC-URAと共に使用してPCRにより得られた酵母複製開始点;
d)プライマー5’-ATGTCACCCGCAGTTCTGTGTCGTAGTCATCAACATAGCACCTATCCTTTGGCATCTCGGTGAGCAAAAGGCCAGCAAAAGG-3’(配列番号81)および5’-CTCAGATGTACGGTGATCGCCACCATGTGACGGAAGCTATCCTGACAGTGTAGCAAGTGCTGAGCGTCAGACCCCGTAGAA-3’(配列番号82)を、鋳型としてのプラスミドpESC-URAと共に使用してPCRにより得られたE.コリ(E.coli)複製開始点;
e)断片「d」の最後の60ヌクレオチド、酵母遺伝子PGK1の終止コドン下流の200ヌクレオチド、S.セレビシエ(S.cerevisiae)内のその発現のためにコドン最適化されたGGPPシンターゼコード配列CrtE(配列番号62)、GAL10/GAL1の双方向性酵母プロモーター、S.セレビシエ(S.cerevisiae)内のその発現のためにコドン最適化されたTalVeTPPのコード配列(配列番号65)、酵母遺伝子CYC1の終止コドン下流の200ヌクレオチドおよび配列5’-ATTCCTAGTGACGGCCTTGGGAACTCGATACACGATGTTCAGTAGACCGCTCACACATGG-3’(配列番号83)で構成された断片、この断片をDNA合成により得た(ATUM、Menlo Park、CA 94025)および
f)断片「e」の最後の60ヌクレオチド、酵母遺伝子CYC1の終止コドン下流の200ヌクレオチド、S.セレビシエ(S.cerevisiae)内のその発現のためにコドン最適化されたSmCPS2シンターゼコード配列(配列番号63)、GAL10/GAL1の双方向性酵母プロモーターおよび断片「a」の最初に対応する60ヌクレオチドで構成された断片、この断片をDNA合成により得た(ATUM、Menlo Park、CA 94025)。
HCxxGxxR
[ここで、
各xは互いに独立して、任意の天然アミノ酸残基を表す]。
HC(T/S)xGKDRTG
[ここで、
xは、任意の天然アミノ酸残基を表す]。
AAGGAGGTAAAAAA
Claims (10)
- 一般式1
Rは、Hを表し、または環式もしくは非環式の、線状もしくは分枝状の、飽和もしくは不飽和の、任意選択で置換されたヒドロカルビル残基を表す]
のテルペンアルコール化合物の生体触媒的な製造方法であって、
(1)式(1)の前記テルペン化合物の対応するテルペニル二リン酸前駆体を、テルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を有するポリペプチドと接触させて、前記テルペンアルコールを生成するステップと、
(2)ステップ(1)の前記テルペンアルコールを任意選択で単離するステップと
を含み、前記テルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を有するポリペプチドが、タンパク質チロシンホスファターゼファミリーの二リン酸除去酵素メンバーから選択される、方法であって、
前記テルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を有するポリペプチドが、以下の活性部位シグネチャーモチーフ:
HC(T/S)xGKDRTG(配列番号58)
[ここで、xは、任意の天然アミノ酸残基を表す]
を有するアミノ酸配列によって特徴付けられる二リン酸除去酵素の一クラスから選択される、方法。 - 前記テルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を有するポリペプチドが、以下のポリペプチド:
a)配列番号2にしたがうアミノ酸配列を含むTalVeTPP、
b)配列番号6にしたがうアミノ酸配列を含むAspWeTPP、
c)配列番号10にしたがうアミノ酸配列を含むHelGriTPP、
d)配列番号13にしたがうアミノ酸配列を含む、UmbPiTPP1、
e)配列番号16にしたがうアミノ酸配列を含む、TalVeTPP2、
f)配列番号19にしたがうアミノ酸配列を含む、HydPiTPP1、
g)配列番号22にしたがうアミノ酸配列を含む、TalCeTPP1、
h)配列番号25にしたがうアミノ酸配列を含む、TalMaTPP1、
i)配列番号28にしたがうアミノ酸配列を含むTalAstroTPP1、および
j)配列番号31にしたがうアミノ酸配列を含むPeSubTPP1、ならびに
k)テルペニル-二リン酸ホスファターゼ活性を有し、かつa)~j)にしたがう前記アミノ酸配列のうちの少なくとも1つとの少なくとも90%の配列同一性の程度を示すアミノ酸配列を含むポリペプチド
からなる群から選択される、請求項1記載の方法。 - 前記式(1)[式中、Rは、H、または非環式の、線状もしくは分枝状の、飽和もしくは不飽和のヒドロカルビル残基を表す]のテルペンアルコール化合物を製造する、請求項1記載の方法。
- 前記式(1)のテルペンアルコールが、ファルネソールおよびゲラニルゲラニオールから選択される、請求項1記載の方法。
- ステップ(3)として、化学合成もしくは生体触媒合成またはその両方の組合せを用いた、アルコール誘導体へのステップ(1)またはステップ(2)の前記テルペンアルコールの加工をさらに含む、請求項1記載の方法。
- 前記アルコール誘導体が、炭化水素、アルコール、ジオール、トリオール、アセタール、ケタール、アルデヒド、酸、エーテル、アミド、ケトン、ラクトン、エポキシド、アセテート、グリコシドおよび/またはエステルである、請求項5記載の方法。
- 前記テルペンアルコールを、生体触媒的に酸化させる、請求項5記載の方法。
- 前記テルペンアルコールを、アルコールデヒドロゲナーゼ(ADH)と接触させることにより変換する、請求項7記載の方法。
- 前記ADHが、
a)配列番号42にしたがうアミノ酸配列を含むCymB;
b)配列番号44にしたがうアミノ酸配列を含むAspWeADH1;
c)配列番号46にしたがうアミノ酸配列を含むPsAeroADH1;
d)配列番号48にしたがうアミノ酸配列を含むAzTolADH1;
e)配列番号50にしたがうアミノ酸配列を含むAroAroADH1;
f)配列番号52にしたがうアミノ酸配列を含むThTerpADH1;
g)配列番号54にしたがうアミノ酸配列を含むCdGeoA;
h)配列番号56にしたがうアミノ酸配列を含むVoADH1;
i)配列番号68にしたがうアミノ酸配列を含むSCH23-ADH1
j)配列番号70にしたがうアミノ酸配列を含むSCH24-ADH1a;および
k)ADH活性を有し、かつa)~j)にしたがう前記アミノ酸配列のうちの少なくとも1つと少なくとも90%の配列同一性の程度を示すアミノ酸配列を含むポリペプチド
から選択される、請求項8記載の方法。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2023212519A JP2024029002A (ja) | 2018-07-10 | 2023-12-15 | テルペン化合物の生体触媒的な製造方法 |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP18182783.3 | 2018-07-10 | ||
EP18182783 | 2018-07-10 | ||
PCT/EP2019/068609 WO2020011883A1 (en) | 2018-07-10 | 2019-07-10 | Method for biocatalytic production of terpene compounds |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2023212519A Division JP2024029002A (ja) | 2018-07-10 | 2023-12-15 | テルペン化合物の生体触媒的な製造方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2021524261A JP2021524261A (ja) | 2021-09-13 |
JP7406511B2 true JP7406511B2 (ja) | 2023-12-27 |
Family
ID=62916485
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2020567944A Active JP7406511B2 (ja) | 2018-07-10 | 2019-07-10 | テルペン化合物の生体触媒的な製造方法 |
JP2023212519A Pending JP2024029002A (ja) | 2018-07-10 | 2023-12-15 | テルペン化合物の生体触媒的な製造方法 |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2023212519A Pending JP2024029002A (ja) | 2018-07-10 | 2023-12-15 | テルペン化合物の生体触媒的な製造方法 |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US11214775B2 (ja) |
EP (1) | EP3821023A1 (ja) |
JP (2) | JP7406511B2 (ja) |
CN (1) | CN112334581A (ja) |
BR (1) | BR112020024197A2 (ja) |
MX (1) | MX2020012933A (ja) |
WO (1) | WO2020011883A1 (ja) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20230193328A1 (en) * | 2020-03-06 | 2023-06-22 | Board Of Trustees Of Michigan State University | Method to produce the anti-microbial diterpenoid leubethanol and related serrulatane-type diterpenes |
WO2023288293A1 (en) * | 2021-07-16 | 2023-01-19 | Amyris, Inc. | Novel enzymes for the production of e-copalol |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2004500307A (ja) | 1998-03-12 | 2004-01-08 | ウイスコンシン アラムナイ リサーチ フオンデーシヨン | 癌治療のためのモノテルペノイド誘導体 |
WO2017001641A1 (en) | 2015-06-30 | 2017-01-05 | Firmenich S.A. | Production of manool |
CN107119001A (zh) | 2017-04-26 | 2017-09-01 | 福建师范大学 | 基因工程化类球红细菌及其制备方法和法尼醇的生产方法 |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE19931847A1 (de) | 1999-07-09 | 2001-01-11 | Basf Ag | Immobilisierte Lipase |
DE10019380A1 (de) | 2000-04-19 | 2001-10-25 | Basf Ag | Verfahren zur Herstellung von kovalent gebundenen biologisch aktiven Stoffen an Polyurethanschaumstoffen sowie Verwendung der geträgerten Polyurethanschaumstoffe für chirale Synthesen |
CN102016051B (zh) | 2008-01-29 | 2014-05-28 | 弗门尼舍有限公司 | 生产香紫苏醇的方法 |
KR102636404B1 (ko) | 2016-06-15 | 2024-02-13 | 경상국립대학교산학협력단 | 터펜 알코올 또는 그 유도체의 제조 방법 |
-
2019
- 2019-07-10 JP JP2020567944A patent/JP7406511B2/ja active Active
- 2019-07-10 EP EP19739277.2A patent/EP3821023A1/en active Pending
- 2019-07-10 BR BR112020024197-0A patent/BR112020024197A2/pt unknown
- 2019-07-10 MX MX2020012933A patent/MX2020012933A/es unknown
- 2019-07-10 WO PCT/EP2019/068609 patent/WO2020011883A1/en unknown
- 2019-07-10 CN CN201980043113.0A patent/CN112334581A/zh active Pending
- 2019-07-10 US US15/734,887 patent/US11214775B2/en active Active
-
2023
- 2023-12-15 JP JP2023212519A patent/JP2024029002A/ja active Pending
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2004500307A (ja) | 1998-03-12 | 2004-01-08 | ウイスコンシン アラムナイ リサーチ フオンデーシヨン | 癌治療のためのモノテルペノイド誘導体 |
WO2017001641A1 (en) | 2015-06-30 | 2017-01-05 | Firmenich S.A. | Production of manool |
CN107119001A (zh) | 2017-04-26 | 2017-09-01 | 福建师范大学 | 基因工程化类球红细菌及其制备方法和法尼醇的生产方法 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
Biotechnology Journal,2016年,Vol. 11,pp. 1291-1297,DOI: 10.1002/biot.201600250 |
ChemBioChem,2017年,Vol. 18, No. 21,pp. 2104-2109,DOI: 10.1002/cbic.201700445 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP2021524261A (ja) | 2021-09-13 |
US20210222138A1 (en) | 2021-07-22 |
US11214775B2 (en) | 2022-01-04 |
EP3821023A1 (en) | 2021-05-19 |
WO2020011883A1 (en) | 2020-01-16 |
MX2020012933A (es) | 2021-02-15 |
JP2024029002A (ja) | 2024-03-05 |
BR112020024197A2 (pt) | 2021-02-17 |
CN112334581A (zh) | 2021-02-05 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2024029002A (ja) | テルペン化合物の生体触媒的な製造方法 | |
US20230183761A1 (en) | Biocatalytic method for the controlled degradation of terpene compounds | |
WO2018069418A2 (en) | Production of citronellal and citronellol in recombinant hosts | |
JP2021519579A (ja) | バニリンの製造方法 | |
US20230148463A9 (en) | Method for producing albicanol and/or drimenol | |
US11345907B2 (en) | Method for producing albicanol compounds | |
US20210310031A1 (en) | Method for producing drimanyl acetate compounds | |
JP7431733B2 (ja) | チトクロムp450モノオキシゲナーゼが触媒するセスキテルペンの酸化 | |
US10752922B2 (en) | Production of manool | |
US20220042051A1 (en) | Lipoxygenase-catalyzed production of unsaturated c10-aldehydes from polyunsatrurated fatty acids | |
EP4013862A2 (en) | Novel polypeptides for producing albicanol and/or drimenol compounds | |
Ceccoli et al. | Sequential chemo–biocatalytic synthesis of aroma compounds |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20220601 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20230417 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20230426 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20230724 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20230922 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20231115 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20231215 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7406511 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |