JP7389744B2 - ムコ多糖症iiia型のための遺伝子療法 - Google Patents
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Description
本出願人は、本明細書により、本明細書と共に電子形態で提出された配列表を参照により取り込む。このファイルを、「18-8476PCT_ST25.txt」と名前を付ける。
1つの態様において、機能的ヒトN-スルホグルコサミンスルホヒドラーゼ(hSGSH)および標的細胞におけるその発現を指示する制御配列をコードする操作された核酸配列を含むベクターが提供される。1つの実施形態において、hSGSHコード配列は、配列番号1と少なくとも96%同一である。さらなる実施形態において、hSGSHコード配列は、配列番号1である。
実施形態において、AAVカプシドは、AAV9カプシドである。1つの実施形態において、rAAV(AAV9.CB7.CI.hSGSHco.RBG)は、AAV9カプシドおよび配列番号4の配列を含むベクターゲノムを含む。
クターベースの方法は、必要とする対象においてSGSHタンパク質の発現をもたらすことにより、SGSHの所望される機能を回復させるか、MPS IIIAと関連する症状を緩和するか、MPS IIIA関連バイオマーカーを改善するか、またはMPS IIIAのための他の処置(複数可)を促進するのを助ける、新規処置オプションを提供する。
冠;多発性骨形性不全症;成長異常;尿中のヘパラン硫酸排出;脳脊髄液(CSF)、血清、尿および/もしくは任意の他の生物学的試料中のGAG蓄積;N-アセチル-アルファ-D-グルコサミニダーゼ(NAGLU)もしくはN-スルホグルコサミンスルホヒドラーゼ(IDUA)の異常な発現および/もしくは酵素活性;GM2およびGM3の蓄積;リソソーム酵素の変化した活性;CNSにおける遊離の非エステル化コレステロールの蓄積;CNSおよび骨格組織における炎症反応;過剰な毛成長(多毛);過剰活性;卵形胸腰椎骨;脾腫;眉毛叢生;肥厚した肋骨;ヘルニア;ならびに不安定および迷走性歩行を含むが、これらに限定されない。
本明細書において使用される、用語「N-スルホグルコサミンスルホヒドラーゼ」および「SGSH」は、ヘパラン-N-スルファターゼ、HNSと互換的に使用される。本発明は、本明細書において提供される核酸配列から発現されるSGSHタンパク質、または
その機能的フラグメントの任意のバリアントを含み、本明細書において提供される組成物においてまたは方法によりデリバリーされるとき、所望される機能を回復させるか、症状を改善するか、MPS IIIA関連バイオマーカーと関連する症状を改善するか、またはMPS IIIAのための他の処置を促進する。 MPSIIIに適当なバイオマーカーの例は、国際公開第2017/136533号において記載されるものを含み、参照により本明細書に取り込まれる。
mucopolysaccharidosis type IIIA (Sanfilippo syndrome)、PLoS One、2015年3月25日;10(3):e0121511、 doi: 10.1371/journal.pone.0121511、eCollection 2015を参照のこと、これは、参照により全体が本明細書に取り込まれる。
Exchangeability of Amino Acids in Proteins、Genetics、2005年8月;170(4):1459~1472頁も参照のこと、これらのそれぞれは、参照により全体が本明細書に取り込まれる。
SGSH and SUMF1 cDNAs in children with mucopolysaccharidosis type IIIA disease: results of a phase I/II trial、Hum Gene Ther、2014年6月;25(6):506~16頁、doi: 10.1089/hum.2013.238、Epub 2014年5月5日;Whyte LSら、Variables influencing fluorimetric N-sulfoglucosamine sulfohydrolase (SGSH) activity measurement in brain homogenates、Mol Genet Metab Rep、2015年10月22日;5:60~62頁、doi:
10.1016/j.ymgmr.2015.10.005、eCollection
2015年12月;Hopwood JJら、Diagnosis of Sanfilippo type A syndrome by estimation of sulfamidase activity using a radiolabelled tetrasaccharide substrate、Clin Chim Acta、1982年8月18日;123(3):241~50頁を参照のこと、これらのそれぞれが、参照により全体が本明細書に取り込まれる。
てより少ない頻度で使用されるコドンであり、より好ましいコドンは、好ましくないコドンより生物においてより高い頻度で使用されるコドンである。特定の生物についてのコドン利用の頻度は、www. kazusa.jp/codonのような、コドン頻度の表において見ることができる。好ましくは、1つより多くの好ましくないコドン、好ましくは、大部分または全ての好ましくないコドンは、より好ましいコドンにより置換される。好ましくは、生物において最も頻繁に使用されるコドンは、操作された配列において使用される。好ましいコドンによる置換は、一般に、より高い発現を導く。多数の異なる核酸分子が、同じポリペプチドを遺伝子コードの縮重の結果としてコードし得ることはまた、当業者により理解される。当業者が、日常的な技術を使用し、ポリペプチドが発現されるべき、任意の特定の宿主生物のコドン使用を反映するよう、核酸分子によりコードされるアミノ酸配列に影響しないヌクレオチド置換を行うことはまた、理解される。それ故、別段特定されない限り、「アミノ酸配列をコードする核酸配列」は、互いのバージョンを縮重し、同じアミノ酸配列をコードする、全てのヌクレオチド配列を含む。核酸配列は、日常的な分子生物学的技術を使用し、クローニングされ得るか、または日常的な手法を使用し、DNA合成および/または分子クローニングの分野におけるビジネスを有するサービス会社(例えば、GeneArt、GenScript、Life Technologies、Eurofins)により行われ得る、DNA合成により新規に生成され得る。
%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%の同一性であり、機能的hSGSHをコードする。
るかまたは追加の塩基もしくはアミノ酸についての補正を大抵含有する、複数の核酸配列またはタンパク質(アミノ酸)配列を指す。
1つの態様において、機能的hSGSHをコードする操作された核酸配列、およびその発現を指示する制御配列を含む発現カセットが、提供される。1つの実施形態において、機能的hSGSHをコードする、本明細書において記載される操作された核酸配列、およびその発現を指示する制御配列を含む発現カセット。
Adeno-Associated Viral Vector Serotype-9 Carrying the Human Survival Motor Neur
on Gene、Mol Biotechnol、2016年1月;58(1):30~6頁、doi: 10.1007/s12033-015-9899-5を参照)を含み得るが、これらに限定されない。
Ther、3:1002~9頁;アルファフェトプロテイン(AFP)、Arbuthnotら、(1996年)、Hum. Gene Ther、7:1503~14頁)、ニューロン(例えば、ニューロン特異的エノラーゼ(NSE)プロモーター、Andersenら、(1993年)、Cell. Mol. Neurobiol、13:503~15頁;ニューロフィラメント鎖遺伝子、Piccioliら、(1991年)、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、88:5611~5頁;およびニューロン特異的vgf遺伝子、Piccioliら、(1995年)、Neuron、15:373~84頁)、および他の組織について周知である。 あるいは、制御可能なプロモーターが、選択されてもよい。例えば、参照により本明細書に取り込まれる、国際公開第2011/126808B2号を参照。
1つの態様において、機能的ヒトN-スルホグルコサミンスルホヒドラーゼ(hSGSH)および標的細胞におけるその発現を指示する制御配列をコードする操作された核酸配列を含むベクターが、本明細書において提供される。1つの実施形態において、hSGSHコード配列は、配列番号1と少なくとも96%同一である。さらなる実施形態において、hSGSHコード配列は、配列番号1である。
スウイルスまたはレンチウイルスである。
1つの態様において、AAVカプシドおよびそこにパッケージングされたベクターゲノムを含む組換えAAV(rAAV)が、本明細書において提供される。rAAVは、ムコ多糖症IIIA(MPS IIIA)の処置における使用のためである。ベクターゲノムは、AAV5’末端逆位配列(ITR)、本明細書において記載される機能的hSGSHをコードする操作された核酸配列、標的細胞におけるhSGSHの発現を指示する制御配列、およびAAV3’ITRを含む。1つの実施形態において、hSGSHコード配列は、配列番号1と少なくとも95%同一である。さらなる実施形態において、hSGSHコード配列は、配列番号1である。
れた核酸配列を指す。1つの実施形態において、ベクターゲノムは、rAAVカプシド形成rAAVベクター内にパッケージングされた核酸配列を指す。かかる核酸配列は、AAV末端逆位配列(ITR)を含有する。1つの実施形態において、ITRは、カプシドを供給するものと異なるAAV由来である。好ましい実施形態において、便宜上使用して、規制上の承認を加速し得る、AAV2由来のITR配列、またはその欠損バージョン(ΔITR)。しかしながら、他のAAV源由来のITRが、選択されてもよい。ITRの源が、AAV2由来であり、AAVカプシドが、別のAAV源由来である場合、得られたベクターは、偽型と呼ばれてもよい。典型的には、AAVベクターゲノムは、AAV5’ITR、SGSHコード配列および任意の制御配列、ならびにAAV3’ITRを含む。しかしながら、これらのエレメントの他の配置が、適当であってもよい。D配列および末端分離部位(trs)が欠損されている、ΔITRと呼ばれる5’ITRの短縮バージョンが、記載されている。他の実施形態において、全長AAV5’および3’ITRが、使用される。
のを含む、公知のAAV配列からもたらされる、任意のAAV配列を意味する。別の実施形態において、AAVカプシドは、任意の記載されるか、または公知のAAVカプシド配列から最大約10%のバリエーションを含み得るバリアントを含む。すなわち、AAVカプシドは、本明細書において提供される、および/または当該技術分野において公知のAAVカプシドと約90%の同一性~約99.9%の同一性、約95%~約99%の同一性または約97%~約98%の同一性を有する。1つの実施形態において、AAVカプシドは、AAVカプシドと少なくとも95%の同一性を有する。AAVカプシドのパーセント同一性を決定するとき、比較は、可変タンパク質(例えば、vp1、vp2、またはvp3)のいずれかに渡り成されてもよい。
9%同一性を有する配列(すなわち、参照された配列から約1%未満のバリエーション)を含んでもよい。かかるAAVは、例えば、天然の単離物(例えば、hu68(2017年2月28日付けで出願された同時係属中の米国特許出願第62/464,748号、および2019年11月27日付けで出願された、米国特許出願第62/591,002号、両方が「Novel Adeno-associated virus (AAV) Clade F Vector and Uses Therefor」と名称付けられ、ならびに国際公開第2018/160582号)、hu31もしくはhu32)、または例えば、AAV9カプシドを用いて整列された任意の他のAAVカプシドにおける対応する位置から「補充された」代替の残基から選択されるアミノ酸置換を含むが、これらに限定されない、アミノ酸置換、欠損、もしくは付加を有するAAV9のバリアント;例えば、米国特許第9,102,949号、米国特許第8,927,514、米国特許第2015/349911;国際公開第2016/049230A1l号;米国特許第9,623,120号;米国特許第9,585,971号において記載されるものなどを含んでもよい。しかしながら、他の実施形態において、上で参照された配列と少なくとも約95%の同一性を有するAAV9、またはAAV9カプシドの他のバリアントが、選択されてもよい。例えば、米国特許出願公開第2015/0079038号を参照。カプシド、そのためのコード配列を生成する方法、およびrAAVウイルスベクターの産生方法が、記載されている。例えば、Gaoら、Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A、100(10)、6081~6086頁(2003年)および米国特許第2013/0045186A1号を参照のこと。
(scAAV) vectors promote efficient transduction independently of DNA synthesis」、Gene Therapy、(2001年8月)、第8巻、No.16、1248~1254頁を参照のこと。自己相補的AAVは、米国特許第6,596,535号;第7,125,717号;および第7,456,683号において記載され、これらのそれぞれが、参照により全体が本明細書に取り込まれる。
ングを可能にするための十分なヘルパー機能を含有する、宿主細胞を培養する工程を含む。AAVカプシドをコードする核酸配列;機能的rep遺伝子;記載されるベクターゲノム;およびベクターゲノムのAAVカプシドタンパク質へのパッケージングを可能にする十分なヘルパー機能を含有する宿主細胞がまた、本明細書において提供される。1つの実施形態において、宿主細胞は、HEK293細胞である。これらの方法は、参照により本明細書に取り込まれる、国際公開第2017160360A2号においてより詳細に記載されている。
Bioeng、2006年12月20日;95(6):1081~92頁;SAMI S. THAKUR、Production of Recombinant Adeno-associated viral vectors in yeast、Thesis presented to the Graduate School of the University of Florida、2012年;Kondratov
Oら、Direct Head-to-Head Evaluation of Recombinant Adeno-associated Viral Vectors
Manufactured in Human versus Insect Cells、Mol Ther、2017年8月10日、pii: S1525-0016(17)30362~3頁、doi: 10.1016/j.ymthe.2017.08.003、[Epub ahead of print];Mietzsch Mら、OneBac 2.0: Sf9 Cell Lines for Production of AAV1, AAV2, and AAV8 Vectors with Minimal Encapsidation of Foreign DNA、Hum Gene Ther Methods、2017年2月;28(1):15~22頁、doi: 10.1089/hgtb.2016.164;Li Lら、Production
and characterization of novel recombinant adeno-associated virus replicative-form genomes: a eukaryotic source of DNA for gene transfer、PLoS One、2013年8月1日;8(8):e69879頁、doi: 10.1371/journal.pone.0069879、2013年出版;Galibert Lら、Latest developments in the large-scale production of adeno-associated virus vectors in insect cells toward the treatment of neuromuscular
diseases、J Invertebr Pathol、2011年7月;107
Suppl:S80~93頁、doi: 10.1016/j.jip.2011.05.008;およびKotin RM、Large-scale recombinant adeno-associated virus production、Hum Mol Genet、2011年4月15日;20(R1):R2~6頁、doi: 10.1093/hmg/ddr141、2011年4月29日に電子公開、を参照のこと。
Ther、(2003年)7:122~128頁を参照のこと。変性したカプシドを試験するために、方法は、処理したAAVストックを、3種のカプシドタンパク質を分離する能力がある任意のゲル、例えば、緩衝液中の3~8%トリス酢酸を含有する勾配ゲルからなる、SDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動の対象にする工程、次に、試料物質が分離されるまで、ゲルを電気泳動する工程、およびゲルをナイロンまたはニトロセルロース膜、好ましくは、ナイロンにブロットする工程を含む。次に、抗AAVカプシド抗体は、変性したカプシドタンパク質に結合する一次抗体、好ましくは、抗AAVカプシドモノクローナル抗体、最も好ましくは、B1抗AAV-2モノクローナル抗体として使用される(Wobusら、J. Virol、(2000年)74:9281~9293頁)。次に、二次抗体、一次抗体に結合し、一次抗体との結合を検出する手段を含有するもの、より好ましくは、それに共有結合した検出分子を含有する抗IgG抗体、最も好ましくは、西洋ワサビペルオキシダーゼに共有結合したヒツジ抗マウスIgG抗体が、使用される。結合を検出する方法、好ましくは、放射性同位元素放射、電磁放射、または比色分析変化を検出する能力がある検出方法、最も好ましくは、化学発光検出キットを使用して、一次と二次抗体の間の結合を半定量的に決定する。例えば、SDS-PAGEのため、カラム分画由来の試料が、採取され、還元剤(例えば、DTT)を含有するSDS-PAGE添加緩衝液において加熱され得、カプシドタンパク質は、成形済勾配ポリアクリルアミドゲル(例えば、Novex)において分解された。銀染色は、製造元の指示に従いSilverXpress(Invitrogen、CA)、または他の適当な染色方法、すな
わち、SYPROルビーまたはクーマシー染色を使用し、行われてもよい。1つの実施形態において、カラム分画中のAAVベクターゲノム(vg)の濃度は、定量的リアルタイムPCR(Q-PCR)により測定することができる。試料を希釈し、DNase I(または別の適当なヌクレアーゼ)を用いて消化して、外来性のDNAを取り除く。ヌクレアーゼの不活性化後、試料は、さらに希釈され、プライマーおよびプライマー間のDNA配列に特異的なTaqMan(商標)蛍光発生プローブを使用して増幅される。定義されたレベルの蛍光(閾値サイクル、Ct)に達するために要求されるサイクル数は、Applied Biosystems Prism 7700配列検出システムにおいてそれぞれの試料について測定される。AAVベクターにおいて含有されるものと同一の配列を含有するプラスミドDNAを利用して、Q-PCR反応における標準曲線を生成する。試料から得られたサイクル閾値(Ct)の値を使用して、それをプラスミド標準曲線のCtに正規化することにより、ベクターゲノムタイターを決定する。デジタルPCRに基づく終点アッセイをまた使用することができる。
KB cells、J. Virol、25:331~338頁;およびRose JA、Maizel JV、Inman JK、Shatkin AJ、1971年、Structural proteins of adenovirus-associated viruses、J. Virol、8:766~770頁を参照のこと。
IAの1つまたは複数の症状の寛解の目的のための組成物(複数可)および/もしくは方法(複数可)、SGSHの所望される機能の回復、または疾患のバイオマーカーの改善を指す。いくつかの実施形態において、用語「処置」または「処置すること」は、本明細書において示される目的のため、対象に本明細書において記載される1つまたは複数の組成物を投与する工程を包含すると定義される。従って、「処置」は、所定の対象において、MPS IIIAの発症もしくは進行を低減すること、疾患を予防すること、疾患症状の重症度を低減すること、それらの進行を遅延させること、疾患の症状を取り除くこと、疾患の進行を遅延させること、または治療の有効性を増大させることの1つまたは複数を含み得る。
1つの態様において、製剤緩衝液中に本明細書において記載されるベクターを含む医薬組成物が、本明細書において提供される。1つの実施形態において、医薬組成物は、機能的hSGSHタンパク質または機能的スルファターゼ変更因子1(SUMF1)との同時投与に適当である。1つの実施形態において、製剤緩衝液中に本明細書において記載されるrAAVを含む医薬組成物が、提供される。1つの実施形態において、rAAVは、約1×109ゲノムコピー(GC)/mL~約1×1014GC/mLにて製剤化される。さらなる実施形態において、rAAVは、約3×109GC/mL~約3×1013GC/mLにて製剤化される。なおさらなる実施形態において、rAAVは、約1×109GC/mL~約1×1013GC/mLにて製剤化される。1つの実施形態において、rAAVは、少なくとも約1×1011GC/mLにて製剤化される。
リブロックコポリマー、SOLUTOL HS 15(マクロゴール-15ヒドロキシステアレート)、LABRASOL(ポリオキシカプリルグリセリド)、ポリオキシ10オレイルエーテル、TWEEN(ポリオキシエチレンソルビタン脂肪酸エステル)、エタノールならびにポリエチレングリコールが、選択されてもよい。1つの実施形態において、製剤は、ポロクサマーを含有する。これらのコポリマーは、文字「P」(ポロクサマーについて)、続いて、3つのアラビア数字:最初の2つのアラビア数字×100が、ポリオキシプロピレン中心のおよその分子量を与え、最後のアラビア数字×10が、パーセンテージポリオキシエチレン含量を与える、を用いて一般に名称付けられる。1つの実施形態において、ポロクサマー188が選択される。界面活性剤は、懸濁液の量最大約0.0005%~約0.001%で存在してもよい。
割投薬量)投与においてデリバリーされる投薬量または量を指すことができる。
tian Hindererら、Widespread gene transfer in the central nervous system of cynomolgus macaques following delivery of AAV9 into the cisterna magna、Mol Ther Methods
Clin Dev、2014年;1:14051頁、2014年12月10日にオンラインで公開、doi:10.1038/mtm.2014.51を参照のこと。
1つの態様において、MPS IIIAと診断されたヒト対象を処置する方法が、本明細書において提供される。現在、MPS IIIの臨床上の疑いが存在するとき、最初の工程は、ジメチルメチレンブルー(DMB)を使用した分光光度方法を介した尿中のGAGの存在を検出するための定量検査の要求である。DMB検査は、GAGのジメチルメチレンブルーへの結合および分光光度計を用いたGAG-DMB複合体の定量に基づく。この検査の感度は100%であり、特異性は75~100%である。尿中のGAGを検出したときの陰性結果は、減弱形態の疾患を有する幾人かの患者において、健常対照を用いたGAG排出のレベルが重複し得、MPS IIIにおけるヘパラン硫酸の増大した排出が、無視され得るという事実に起因して、MPS IIIの存在を除外しない。現在の診断のゴールドスタンダード技術は、培養皮膚線維芽細胞、白血球、血漿または血清における酵素活性の決定である。MPS IIIAの特異的な診断は、患者の白血球または線維芽細胞におけるヘパラン硫酸の分解に関与するSGSH酵素活性の減少または不存在を示すことにより確かにされ;低減は、他のスルファターゼにおいて正常である、健常な個体における活性と比較したとき、10%未満であるべきである。疾患はまた、複数のスルファターゼにおける欠乏に起因して、ヘパランN-スルファターゼ、N-アセチルグルコサミン6-スルファターゼおよび他のスルファターゼの活性における低減を示すので、少なくとも他のスルファターゼの生化学的解析は、MPS IIIの診断を確かにするために要求され、これにより、複数のスルファターゼ欠乏を除外する。しかしながら、診断方法は、本発明の制限ではなく、他の適当な方法が選択されてもよい。
度における低減、把持/攣縮における低減、姿勢における改善、角膜混濁における改善をモニタリングすることにより、決定されてもよい。加えてまたはあるいは、方法の有効性は、動物モデルに基づき、予想されてもよい。適当なマウスモデルの一例が、実施例1において記載される。別の実施形態において、複数パラメーターの評価スケールを開発して、疾患補正および動物モデルにおける本明細書において記載されるMPSIIIAベクター療法への応答を評価した。参照により本明細書に取り込まれる、図5を参照のこと。動物は、振戦、姿勢、毛の質、把持、角膜薄濁、および歩行/運動の組み合わせの評価に基づきスコアを割り当てられる。ある種の実施形態において、これらの要素の1つまたは複数の任意の組み合わせを使用して、単独、または他の要素との組み合わせた有効性を示してもよい。例えば、Burkholderら、Curr Protoc Mouse Biol、2012年6月、2:145~65頁;Tumpeyら、J Virol、1998年5月、3705~10頁;およびGuyenetら、J Vis Exp、2010年5月、39;1787頁を参照のこと。処置された動物の認知の改善および不安の補正は、オープンフィールド(すなわち、例えば、Tatemら、J Vis Exp、2014年、(91):51785頁において記載されるビームブレイク測定)および上昇した十字路迷路(例えば、WalfおよびFrye、Nat Protoc、2007年、2(2):322~328頁において記載される)における運動を評価することにより、評価される。
法を受けとった対象の認知神経科学的低下の減速を指す。
randomized controlled crossover trial、Ann Neurol、2012年1月;71(1):110~20頁、doi: 10.1002/ana.22643を参照のこと。
9GC/g、約5.5×109GC/g、約6.0×109GC/g、約6.5×109GC/g、約7.0×109GC/g、約7.5×109GC/g、約8.0×109GC/g、約8.5×109GC/g、約9.0×109GC/g、約9.5×109GC/g、約1.0×1010GC/g、約1.5×1010GC/g、約2.0×1010GC/g、約2.5×1010GC/g、約3.0×1010GC/g、約3.5×1010GC/g、約4.0×1010GC/g、約4.5×1010GC/g、約5.0×1010GC/g、約5.5×1010GC/g、約6.0×1010GC/g、約6.5×1010GC/g、約7.0×1010GC/g、約7.5×1010GC/g、約8.0×1010GC/g、約8.5×1010GC/g、約9.0×1010GC/g、約9.5×1010GC/g、約1.0×1011GC/g、約1.5×1011GC/g、約2.0×1011GC/g、約2.5×1011GC/g、約3.0×1011GC/g、約3.5×1011GC/g、約4.0×1011GC/g、約4.5×1011GC/g、約5.0×1011GC/g、約5.5×1011GC/g、約6.0×1011GC/g、約6.5×1011GC/g、約7.0×1011GC/g、約7.5×1011GC/g、約8.0×1011GC/g、約8.5×1011GC/g、約9.0×1011GC/g、約9.5×1011GC/g、約1.0×1012GC/g、約1.5×1012GC/g、約2.0×1012GC/g、約2.5×1012GC/g、約3.0×1012GC/g、約3.5×1012GC/g、約4.0×1012GC/g、約4.5×1012GC/g、約5.0×1012GC/g、約5.5×1012GC/g、約6.0×1012GC/g、約6.5×1012GC/g、約7.0×1012GC/g、約7.5×1012GC/g、約8.0×1012GC/g、約8.5×1012GC/g、約9.0×1012GC/g、約9.5×1012GC/g、約1.0×1013GC/g、約1.5×1013GC/g、約2.0×1013GC/g、約2.5×1013GC/g、約3.0×1013GC/g、約3.5×1013GC/g、約4.0×1013GC/g、約4.5×1013GC/g、約5.0×1013GC/g、約5.5×1013GC/g、約6.0×1013GC/g、約6.5×1013GC/g、約7.0×1013GC/g、約7.5×1013GC/g、約8.0×1013GC/g、約8.5×1013GC/g、約9.0×1013GC/g、約9.5×1013GC/g、または約1.0×1014GC/脳質量1gである。
ある種の実施形態において、製剤(場合により、凍結された)において懸濁された濃縮ベクター、任意選択の希釈緩衝液、およびくも膜下腔内、脳室内または嚢内投与に要求される装置および成分を含むキットが、提供される。別の実施形態において、キットは、静脈内デリバリーのための成分をさらにまたは代わりに含んでもよい。1つの実施形態において、キットは、注射を可能にするのに十分な緩衝液を提供する。かかる緩衝液は、濃縮ベクターの約1:1~1:5の希釈、またはそれ以上を可能にする。他の実施形態において、より多いかもしくは少ない量の緩衝液または無菌水を含んで、用量タイトレーションおよび臨床医による他の調節を可能にする。なお他の実施形態において、1つまたは複数の装置が、キットにおいて含まれる。食塩水、リン酸緩衝食塩水(PBS)またはグリセロール/PBSのような、適当な希釈緩衝液が、利用可能である。
1つの態様において、本明細書において提供されるベクターは、例えば、参照により全体が本明細書に取り込まれる、国際公開第2017/136500号において記載される方法および/または装置を介してくも膜下腔内投与されてもよい。あるいは、他の装置および方法が、選択されてもよい。要約すると、方法は、くも膜下穿刺針を患者の大槽に進める工程、長い柔軟性のあるチューブを、くも膜下穿刺針の近位中心に、バルブの出力ポートを柔軟性のあるチューブの近位末端に繋げる工程、および当該進め、繋げる工程後、およびチューブを患者の脳脊髄液を用いて自己刺激することを可能にした後、多量の等調溶液を含有する第1の容器を、バルブのフラッシュ入口ポートに繋げ、その後、多量の医薬組成物を含有する第2の容器を、バルブのベクター入口ポートに繋げる工程を含む。第1および第2の容器をバルブに繋げた後、液体流の通り道が、ベクター入口ポートとバルブの取り出し口の間で開かれ、医薬組成物が、くも膜下穿刺針を通じて患者に注射され、医薬組成物を注射後、液体流の通り道が、フラッシュ入口ポートを通じて開けられ、バルブの取り出し口および等調溶液をくも膜下穿刺針に注入して、医薬組成物を患者に流す。この方法およびこの装置はそれぞれ、場合により、本明細書において提供される組成物のくも膜下腔内デリバリーのため志位陽されてもよい。あるいは、他の方法および装置が、かかるくも膜下腔内デリバリーのため使用されてもよい。
A.ベクター-AAV9.CB7.CI.hSGSHco.rBG
配列番号1において示すhSGSH(MPS IIIA)操作した配列を、CB7プロモーター(サイトメガロウイルス最初期エンハンサーとトリβ-アクチンプロモーターのハイブリッド)、トリβ-アクチンイントロン(CI)、およびウサギベータグロビン(rBG)ポリアデニル化配列を含有する発現コンストラクトにクローニングした。発現コンストラクトに、AAV2末端逆位配列が隣接し、AAV9トランスプラスミドを、キャプシド形成のため使用した。
Titers by Droplet Digital PCR、Human Gene Therapy Methods、2014年、25(2):115~125頁)を用いてタイトレーションした。
全ての動物プロトコールは、ペンシルベニア大学のInstitutional Animal Care and Use Committeeにより承認された。自然発生マウスSGSH変異体を含むマウスコロニーを、ペンシルベニア大学においてGene Therapy Program vivariumにおいて維持した。全ての子孫を、自動システム(Transnetyx Inc、8110 Cordova Road Suite 119 Cordova、TN 38016)を使用し、尾の切れ目のDNAのPCR解析により遺伝子型同定した。マウスを、離乳後、それらの遺伝子型に基づきグループ分けし、その後は混ぜずに、戦闘を防ぎ、所定のケージの全ての動物は、同じ処置を受けた。ケージを、それらのそれぞれの処置に無作為化した(www.randomizer.org)。
当たり1回交換した。水供給を、フィラデルフィア市から引き、Getinge水濾過を使用し、精製した。水の質を、ULARにより塩素レベルについて毎日、ならびにpHおよび硬度について年4回試験した。ネスティング物質(Nestlet(登録商標))を、それぞれの変化後、それぞれのケージにおいて提供した。動物を、GTPスタッフおよびULAR獣医スタッフにより毎日モニターした。
MPS IIIAマウスは、平均14週齢にて右側脳室に、1匹のマウス当たりベクター9×108GC(低用量)または9×109GC(中用量)もしくは9×1010GC(高用量)、またはPBS5μLを受けた。マウスを、イソフルレンを用いて麻酔した。それぞれの麻酔したマウスの後頭部のたるんだ皮膚によりしっかり握り、3mmの深さに挿入するよう調節した、27ゲージの針を取り付けたHamiltonの針を用いてブレグマの前側および後側にフリーハンドで注射した。
ロッキングロータロッドを行い、注射の4ヶ月後の調整および平衡を評価した(MPS
IIIA)。一定の低速(5rpm)にて120秒間の2回のトライアル中に、マウスをロータロッドに慣らした。2分の休憩後、マウスを、ロータロッドに戻し、ロッキングパラダイムに従い、ロッドを、10rpmの一定速度で回転し、他の回転毎に回転の向きを逆転させた。トライアル間の休憩2分間で、3回のトライアルを行った。結果を、ロッドから落下までの平均時間として表す;時間が長いほど、良好な調整。
マウスを、注射の5.5ヶ月後にケタミン/キシラジン麻酔下で心臓穿刺瀉血により安楽死させた。組織を迅速に集め、半分を、ドライアイス上で簡単に凍結し(酵素活性)、半分を、10%中性ホルマリンにおいて浸漬固定し、組織学のためパラフィンに包埋した。集めた組織は、脳、脊髄、肝臓、および心臓であった。
Biologicals、Littleton、CO、1:200)および二次抗体は、FITCまたはTRITC標識したロバ抗ウサギ(Jackson Immunoresearch)であった。LIMP2について陽性に染色した細胞の数を、訓練を受けたGTP Morphologyの中心人物により、それぞれの動物由来の2~4つの脳切片(90日目の剖検)において定量した。
酵素活性アッセイおよびGAG含有量のため、タンパク質を、機械的均質化(Qiagen TissueLizer)により、酸性溶解溶液(0.2%トリトン、0.9%NaCl、pH4に調節)において抽出した。試料を凍結融解し、遠心分離により清澄化した。タンパク質を、BCAアッセイにより定量した。
血清抗hSGSH抗体の測定のための血液を、顎下出血により何回かのインビボでの時間点にて、ならびに心臓穿刺により最終剖検にて集めた。血清を分離させ、ドライアイス上で凍結し、解析まで-80℃にて保存した。ポリスチレンプレートを、pH5.8に設定した、組換えヒトSGSH(R&D Systems)、PBS中の5μg/mLを用いて一晩コーティングした。プレートを洗浄し、1時間、中性PBS中の2%ウシ血清アルブミン(BSA)においてブロッキングした。次に、プレートを、PBSにおいて1:1000希釈した血清試料とインキュベーションした。結合した抗体を、2%BSAを含むPBSにおいて1:10,000希釈した西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)結合ヤギ抗マウス抗体(Abcam)を用いて検出した。アッセイを、テトラメチルベンジジン基質を使用して発生させ、2N硫酸を用いて停止させた後、450nmにて吸光度を測定した。
MPSIIIaのマウスモデルにおいて、実験を行い、AAV9.CB7.CI.hSGSHco.rBG、ヒトSGSHを発現するAAV9ベクターの1回の脳室内(ICV)投与の発現、生物活性、および最小有効用量(MED)を評価した。
IIIaマウス(1群当たりn=10)にICV経路を通じて投与した。ビークル処置したMPS IIIaおよびヘテロ接合体同腹仔のうちの一匹が、対照として機能する(1群当たりn=7~8)。
ロッドでの行動、ならびに注射の6ヶ月後における脳リソソーム貯蔵および神経炎症を測定することにより、決定した。
実験を行い、MPS IIIaマウスにおけるAAV.hSGSHの長期効果を調べた。20匹のMPS IIIaマウスは、2ヶ月齢にて高用量のAAV9.CB7.CI.hSGSH.rBG(9×1010GC、ICV)を受けた。さらに20匹のMPS IIIaマウスおよび20匹の野生型マウスが、PBS対照注射を受けた。マウスを、注射後7ヶ月間モニタリングし、その間、毎週臨床スコアを評価し、行動および認知検査を受けさせた。
use Biol、2012年6月、2:145~65頁;Tumpeyら、J Virol、1998年5月、3705~10頁;およびGuyenetら、J Vis Exp、2010年5月、39;1787頁を参照のこと)に基づき適合させた。AAV.hSGSHを投与した、オス(図6A)とメス(図6B)両方のMPS IIIaマウスについて、臨床スコアが改善した。
実験を行い、2回用量のAAV.hSGSHのくも膜下腔内投与の安全性および周囲の免疫抑制を評価する。
以下の情報は、配列を含むフリーテキストについて数値識別子<223>下で提供される。
Claims (15)
- AAVカプシドおよびそこにパッケージングされたベクターゲノムを含む、組換えAAV(rAAV)であって、前記ベクターゲノムが、AAV5’末端逆位配列(ITR)、機能的N-スルホグルコサミンスルホヒドラーゼ(hSGSH)をコードする操作された核酸配列、標的細胞におけるhSGSHの発現を指示する制御配列、およびAAV3’ITRを含み、前記hSGSHコード配列が、配列番号1と少なくとも99%同一である、組換えAAV(rAAV)。
- 前記hSGSHコード配列が、配列番号1である、請求項1に記載のrAAV。
- 前記制御配列が、プロモーターを含む、請求項1または2に記載のrAAV。
- 前記制御配列が、エンハンサー、イントロンおよび/またはポリAをさらに含む、請求項1~3のいずれか1項に記載のrAAV。
- 前記AAVベクターゲノムが、配列番号4の配列(AAV.CB7.CI.hSGSHco.RBG)を含む、請求項1~4のいずれかに記載のrAAV。
- 前記AAVカプシドが、AAV9カプシドである、請求項1~5のいずれかに記載のrAAV。
- それを必要とする対象における、ムコ多糖症IIIA(MPS IIIA)を処置するのに、および/または歩行もしくは運動を改善するか、振戦を低減するか、攣縮を低減するか、姿勢を改善するか、または視力喪失の進行を低減するのに使用するために適した、請求項1~6のいずれかに記載のrAAV。
- 製剤緩衝液中の請求項1~7のいずれかに記載のrAAVを含む、医薬組成物。
- (a)機能的hSGSHタンパク質または機能的スルファターゼ変更因子1(SUMF1)との同時投与に適当である、
(b)脳室内(ICV)、くも膜下腔内(IT)、嚢内または静脈内(IV)注射を介したデリバリーのため製剤化される、
(c)脳質量1グラム当たり用量1×109GC~脳質量1グラム当たり約1×1013GCにて投与可能である、および/または、
(d)pH約7.28~約7.32を有するように製剤化される、
請求項8に記載の医薬組成物。 - それを必要とする対象における、MPS IIIAと診断されたヒト対象を処置するのに、および/または歩行もしくは運動を改善するか、振戦を低減するか、攣縮を低減するか、姿勢を改善するか、もしくは視力喪失の進行を低減するのに使用するための、請求項1~7のいずれかに記載のrAAVの懸濁液であって、製剤緩衝液中で脳質量1グラム当たり1×109GC~脳質量1グラム当たり約1×1013GCにて、前記rAAVの懸濁液が前記対象に投与される、懸濁液。
- (a)前記処置が、健常対照の少なくとも約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、約95%、または約100%の血清SGSH活性をもたらす、
(b)前記懸濁液が、少なくとも1×109ゲノムコピー(GC)/mLの前記rAAVを有する、
(c)前記懸濁液が、機能的hSGSHタンパク質または機能的SUMF1タンパク質と同時投与するのに適当である、
(d)前記懸濁液が、必要とする前記対象に、脳室内、くも膜下腔内、または静脈内にデリバリーされる、
(e)前記懸濁液が、pH約7.28~約7.32を有する、
(f)前記rAAVが、必要とする前記対象に1回投与される、および/または、
(g)前記rAAVが、必要とする前記対象に1回より多く投与される、
請求項10に記載の使用のためのrAAVの懸濁液。 - (a)前記対象が、酵素補充療法のみを介した標準的処置と比較して、減少した投薬量にて、またはより少ない頻度で前記酵素補充療法を受ける;および/または
(b)前記対象が、MPS IIIAに関連するバイオマーカーの改善を示す
請求項10に記載の使用のためのrAAVの懸濁液。 - 機能的hSGSHをコードする操作された核酸配列および標的細胞におけるその発現を指示する制御配列を含む、ベクターであって、前記hSGSHコード配列が、配列番号1と少なくとも99%同一である、ベクター。
- (a)前記hSGSHコード配列が、配列番号1である、
(b)前記ベクターが、組換えウイルス、プラスミド、Lipoplexes、Polymersome、Polyplexes、デンドリマー、細胞透過性ペプチド(CPP)結合体、磁気粒子、またはナノ粒子である、
(c)前記ベクターが、アデノ随伴ウイルス(AAV)、アデノウイルス、ボカウイルス、ハイブリッドAAV/ボカウイルス、単純ヘルペスウイルス、またはレンチウイルスである、および/または、
(d)前記標的細胞が、単離された細胞、培養細胞、細胞株、大腸菌細胞、酵母細胞、ヒト細胞、非ヒト細胞、哺乳類細胞、非哺乳類細胞、昆虫細胞、HEK-293細胞、肝細胞、腎細胞、中枢神経系の細胞、ニューロン、グリア細胞、または幹細胞である、
請求項13に記載のベクター。 - それを必要とする対象における、MPS IIIAの処置のための方法に、および/または歩行もしくは運動を改善するか、振戦を低減するか、攣縮を低減するか、姿勢を改善するか、または視力喪失の進行を低減するのに使用するための、請求項1~7のいずれかに記載のrAAVまたは請求項13若しくは14に記載のベクター。
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