JP7216460B2 - 検出対象の分析用センサ作製用基材、検出対象の分析用センサ、及び検出対象の分析法 - Google Patents
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Description
(項目1)
検出対象の標的を受け入れる分子インプリント凹部と、
前記分子インプリント凹部内に設けられた、前記標的に対する結合性分子の結合用基と
を有する分子インプリントポリマーを含み、
前記結合性分子の結合用基が小型物質に適合される基である、
検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目2)
検出対象の標的を受け入れる分子インプリント凹部と、
前記分子インプリント凹部内に設けられた、前記標的に対する結合性分子の結合用基と
を有する分子インプリントポリマーを含み、
前記分子インプリント凹部が、小型物質に適合される形状または構成を有する、
検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目3)
前記分子インプリント凹部内に、更にシグナル物質の結合用基を有する、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目4)
前記分子インプリント凹部表面において、前記結合性分子の結合用基及び前記シグナル物質の結合用基が互いに独立している、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目5)
前記分子インプリント凹部内において、前記結合性分子の結合用基及び前記シグナル物質の結合用基が、下記式(1)で示される機能性基を構成している、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目6)
前記シグナル物質の結合用基を含む連結基が、下記式(2)又は(3)で示される、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目7)
前記結合性分子の結合用基が、アミノ基、カルボキシ基、ボロン酸基、cis-ジオール基、アルデヒド基、ケトン基、オキシアミノ基、ヒドラジド基、ビオチン(ビオシチン、デスチオビオチン)基、ニッケル-ニトリロトリ酢酸由来基、チオ―ル基、およびピリジルジスルフィド基からなる群から選択される基である、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目8)
前記結合性分子の結合用基が、ニッケル-ニトリロトリ酢酸由来基、チオ―ル基、およびピリジルジスルフィド基からなる群から選択される基である、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目9)
前記結合性分子の結合用基が、抗体のFcドメイン結合タンパク質、アビジン、ストレプトアビジン、ニュートラアビジン、項目7に記載の結合用基を1つもしくは複数含むポリマー、デンドリマー、またはオリゴDNAを介して小型物質に適合される、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目10)
前記抗体のFcドメイン結合タンパク質が、プロテインA、プロテインG、プロテインL、またはプロテインA/Gである、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目11)
前記分子インプリント凹部内に、前記検出対象又は前記分子インプリント凹部の鋳型との相互作用基を更に有する、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目12)
前記結合性分子が、特異的結合性分子である、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目13)
前記特異的結合性分子が、抗体ミメティック、リン脂質結合性タンパク質、人工(高分子)レセプター及びレクチンからなる群から選択される、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目14)
前記検出対象が、膜構造を有する微小粒体である、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目15)
前記分子インプリント凹部の鋳型が粒子コアまたは生体分子である、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目16)
前記分子インプリント凹部の鋳型がシリカ粒子または血清タンパク質である、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目17)
前記分子インプリント凹部の鋳型が血清タンパク質であり、前記検出対象が膜構造を有する微小粒体であり、前記標的が前記微小粒体の表面に発現している分子である、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目18)
基板と、前記基板の表面上に設けられたポリマー膜と、を含み
前記インプリントポリマーが前記ポリマー膜を構成している、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目19)
前記インプリントポリマーが粒子状である、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目20)
粒子状の前記インプリントポリマーが、基板上に固定されている、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
(項目21)
前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材と、
前記特異的結合性分子の結合用基に結合した前記検出対象の標的に対する特異的結合性基とを含み、
前記特異的結合性基が小型物質基である、検出対象の分析用センサ。
(項目22)
前記シグナル物質の結合用基に結合したシグナル基をさらに含む、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ。
(項目23)
前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサに、検出対象を含む試料を接触させ、前記特異的結合性基に前記検出対象を結合する工程と、
前記特異的結合性基と前記検出対象との結合を検出する工程と、
を含む、検出対象の分析法。
(項目24)
基板に、検出対象の標的に対する結合性分子の結合用基と重合開始性基とを表面に有する単分子膜を形成する単分子膜形成工程(1-1)と、
前記結合性分子の結合用基に対し、第1の可逆的連結基を介して、鋳型を導入する工程(1-2)と、
重合性モノマーを加え、前記重合性モノマーを基質とし、前記重合開始性基を重合性開始剤として、前記鋳型の表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成することで前記基板表面にポリマー膜を形成する工程(1-3)と、
前記第1の可逆的連結基を開裂させて前記結合性分子の結合用基へ変換するとともに前記鋳型を除去する工程(1-4)と、
を含み、
前記結合性分子の結合用基が小型物質に適合される基である、検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
(項目25)
基板に、検出対象の標的に対する結合性分子の結合用基と重合開始性基とを表面に有する単分子膜を形成する単分子膜形成工程(1-1)と、
前記結合性分子の結合用基に対し、第1の可逆的連結基を介して、鋳型を導入する工程(1-2)と、
重合性モノマーを加え、前記重合性モノマーを基質とし、前記重合開始性基を重合性開始剤として、前記鋳型の表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成することで前記基板表面にポリマー膜を形成する工程(1-3)と、
前記第1の可逆的連結基を開裂させて前記結合性分子の結合用基へ変換するとともに前記鋳型を除去する工程(1-4)と、
を含み、
該分子インプリント凹部が、小型物質に適合される形状または構成を有する、検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
(項目26)
前記鋳型の前記表面を、第2の可逆的連結基を介して重合性官能基で修飾する修飾工程を含み、
前記工程(1-3)において、前記重合性モノマー及び前記重合性官能基を基質とし、前記重合開始性基を重合性開始剤として、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成し、
前記工程(1-4)において、前記第1の可逆的連結基及び前記第2の可逆的連結基を開裂させてそれぞれ前記結合性分子の結合用基及びシグナル物質の結合用基へ変換するとともに前記鋳型を除去する、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
(項目27)
表面が、第1の可逆的連結基を介して重合性官能基で修飾された、分子インプリントの鋳型を用意する工程(1-11)と、
前記重合性官能基を基質とし、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成する工程(1-12)と、
前記第1の可逆的連結基を開裂させて前記分子インプリントポリマーから前記鋳型を除去し、前記結合性分子の結合用基を生じる工程(1-13)と、を含み、
前記結合性分子の結合用基が小型物質に適合される基である、検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
(項目28)
表面が、第1の可逆的連結基を介して重合性官能基で修飾された、分子インプリントの鋳型を用意する工程(1-11)と、
前記重合性官能基を基質とし、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成する工程(1-12)と、
前記第1の可逆的連結基を開裂させて前記分子インプリントポリマーから前記鋳型を除去し、前記結合性分子の結合用基を生じる工程(1-13)と、を含み、
該分子インプリント凹部が、小型物質に適合される形状または構成を有する、
検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
(項目29)
表面が第3の可逆的連結基を介して重合性官能基で修飾された、分子インプリントの鋳型を用意する工程(1-21)と、
前記重合性官能基を基質とし、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成する工程(1-22)と、
前記第3の可逆的連結基を開裂させて前記分子インプリントポリマーから前記鋳型を除去する工程(1-23)と、
検出対象の標的に対する結合性分子の結合用基及びシグナル物質の結合用基を含む機能性基を有する分子を、第3の可逆的連結基を介して導入する工程(1-24)と、を含み、
前記結合性分子の結合用基が小型物質に適合される基である、検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
(項目30)
表面が第3の可逆的連結基を介して重合性官能基で修飾された、分子インプリントの鋳型を用意する工程(1-21)と、
前記重合性官能基を基質とし、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成する工程(1-22)と、
前記第3の可逆的連結基を開裂させて前記分子インプリントポリマーから前記鋳型を除去する工程(1-23)と、
検出対象の標的に対する結合性分子の結合用基及びシグナル物質の結合用基を含む機能性基を有する分子を、第3の可逆的連結基を介して導入する工程(1-24)と、を含み、
該分子インプリント凹部が、小型物質に適合される形状または構成を有する、
検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
(項目31)
前記工程(1-22)において、前記鋳型との相互作用基を含むモノマーをさらに前記基質とする、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
(項目32)
前記結合性分子が、特異的結合性分子である、前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
(項目33)
前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法を行う工程(1)と、
前記結合性分子の結合用基に、前記結合性分子を結合する工程(2)と、を含む、検出対象の分析用センサの製造方法。
(項目34)
前記項目のいずれか一項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法を行う工程(1)と、
前記結合性分子の結合用基に、前記結合性分子を結合する工程(2)と、
前記シグナル物質結合用基にシグナル物質を結合する工程(3)を含む、検出対象の分析用センサの製造方法。
(項目35)
前記項目のいずれか一項に記載の分析用センサを用いて被験体を診断または検査する方法であって、該診断方法は、
A)被験体から試料(例えば、尿、髄液、汗、鼻水、唾液、血液または涙を含む)を採取する工程、
B)前記試料を前記分析用センサと接触させる工程、
C)前記分析用センサからのシグナルを検出する工程、および
D)前記シグナルを分析してから前記被験体を診断または検査する(例えば、疾患の有無若しくは進行を判定する)工程
を含む、診断または検査方法。
(項目36)
前記項目のいずれか一項に記載の分析用センサを備える診断または検査システムを用いて被験体を診断または検査する方法をコンピュータに実行させるプログラムであって、該方法は、
A)前記被験体から得られた試料(例えば、尿、髄液、汗、鼻水、唾液、血液または涙を含む)を前記診断または検査システムに提供する工程、
B)前記診断または検査システムが、前記試料を前記分析用センサと接触させるように起動する工程、
C)前記診断または検査システムが、前記分析用センサからのシグナルを検出する工程、および
D)前記診断または検査システムが、前記シグナルを分析してから前記被験体を診断または検査する(検出結果から疾患の有無または進行を判定する)工程
を含む、プログラム。
(項目37)
前記項目のいずれか一項に記載の分析用センサを用いて被験体を診断または検査する方法をコンピュータに実行させるプログラムを格納した記録媒体であって、該方法は、
A)前記被験体から得られた試料(例えば、尿、髄液、汗、鼻水、唾液、血液または涙を含む)を前記診断または検査システムに提供する工程、
B)前記診断または検査システムが、前記試料を前記分析用センサと接触させるように起動する工程、
C)前記診断または検査システムが、前記分析用センサからのシグナルを検出する工程、および
D)前記診断または検査システムが、前記シグナルを分析してから該被験体を診断または検査する(検出結果から疾患の有無または進行を判定する)工程
を含む、記録媒体。
(項目38)
診断または検査システムであって、該システムでは、
A)前記被験体から得られた試料(例えば、尿、髄液、汗、鼻水、唾液、血液または涙を含む)提供する提供部、
B)前記試料を前記分析用センサと接触させるように起動する起動部、
C)前記分析用センサからのシグナルを検出する検出部、および
D)前記シグナルを分析してから該被験体を診断する(検出結果から疾患の有無または進行を判定する)診断部
を含む、システム。
前記特異的結合性分子が分子量45,000以下の特異的結合性タンパク質又はペプチドである、検出対象の分析用センサ作製用基材。
項2. 前記分子インプリント凹部内に、更にシグナル物質の結合用基を有する、項1に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
項3. 前記分子インプリント凹部表面において、前記特異的結合性分子の結合用基及び前記シグナル物質の結合用基が互いに独立している、項2に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
項4. 前記分子インプリント凹部内において、前記特異的結合性分子の結合用基及び前記シグナル物質の結合用基が、下記式(1)で示される機能性基を構成している、項2に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
項5. 前記シグナル物質の結合用基を含む連結基が、下記式(2)又は(3)で示される、項4に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
項6. 前記分子インプリント凹部内に、前記検出対象又は前記分子インプリント凹部の鋳型との相互作用基を更に有する、項1~5のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
項7. 前記特異的結合性分子が、ナノボディ、抗体ミメティック、リン脂質結合性タンパク質、及びレクチンからなる群から選択される、項1~6のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
項8. 前記検出対象が、膜構造を有する微小粒体である、項1~7のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
項9. 前記分子インプリント凹部の鋳型が血漿タンパク質であり、前記検出対象が膜構造を有する微小粒体であり、前記標的分子が前記微小粒体の表面に発現している分子である、項1~8のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
項10. 基板と、前記基板の表面上に設けられたポリマー膜と、を含み
前記インプリントポリマーが前記ポリマー膜を構成している、項1~9のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
項11. 前記インプリントポリマーが粒子状である、項1~9のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
項12. 粒子状の前記インプリントポリマーが、基板上に固定されている、項11に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
項13. 項1~12のいずれか1項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材と、
前記特異的結合性分子の結合用基に結合した前記検出対象の標的分子に対する特異的結合性基とを含み、
前記特異的結合性基が分子量45,000以下の特異的結合性タンパク質基又はペプチド基である、検出対象の分析用センサ。
項14. 前記シグナル物質の結合用基に結合したシグナル基をさらに含む、項13に記載の検出対象の分析用センサ。
項15. 項13又は14に記載の検出対象の分析用センサに、検出対象を含む試料を接触させ、前記特異的結合性基に前記検出対象を結合する工程と、
前記特異的結合性基と前記検出対象との結合を検出する工程と、
を含む、検出対象の分析法。
項16. 基板に、検出対象の標的分子に対する特異的結合性分子の結合用基と重合開始性基とを表面に有する単分子膜を形成する単分子膜形成工程(1-1)と、
前記特異的結合性分子の結合用基に対し、第1の可逆的連結基を介して、鋳型を導入する工程(1-2)と、
重合性モノマーを加え、前記重合性モノマーを基質とし、前記重合開始性基を重合性開始剤として、前記鋳型の表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成することで前記基板表面にポリマー膜を形成する工程(1-3)と、
前記第1の可逆的連結基を開裂させて前記特異的結合性分子の結合用基へ変換するとともに前記鋳型を除去する工程(1-4)と、
を含み、
前記特異的結合性分子が分子量45,000以下の特異的結合性タンパク質又はペプチドである、検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
項17. 前記鋳型の前記表面を、第2の可逆的連結基を介して重合性官能基で修飾する修飾工程を含み、
前記工程(1-3)において、前記重合性モノマー及び前記重合性官能基を基質とし、前記重合開始性基を重合性開始剤として、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成し、
前記工程(1-4)において、前記第1の可逆的連結基及び前記第2の可逆的連結基を開裂させてそれぞれ前記特異的結合性分子の結合用基及びシグナル物質の結合用基へ変換するとともに前記鋳型を除去する、項16に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
項18. 表面が、第1の可逆的連結基を介して重合性官能基で修飾された、分子インプリントの鋳型を用意する工程(1-11)と、
前記重合性官能基を基質とし、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成する工程(1-12)と、
前記第1の可逆的連結基を開裂させて前記分子インプリントポリマーから前記鋳型を除去し、前記特異的結合性分子の結合用基を生じる工程(1-13)と、を含み、
前記特異的結合性分子が分子量45,000以下の特異的結合性タンパク質又はペプチドである、検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
項19. 表面が第3の可逆的連結基を介して重合性官能基で修飾された、分子インプリントの鋳型を用意する工程(1-21)と、
前記重合性官能基を基質とし、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成する工程(1-22)と、
前記第3の可逆的連結基を開裂させて前記分子インプリントポリマーから前記鋳型を除去する工程(1-23)と、
検出対象の標的分子に対する特異的結合性分子の結合用基及びシグナル物質の結合用基を含む機能性基を有する分子を、第3の可逆的連結基を介して導入する工程(1-24)と、を含み、
前記特異的結合性分子が分子量45,000以下の特異的結合性タンパク質又はペプチドである、検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
項20. 前記工程(1-22)において、前記鋳型との相互作用基を含むモノマーをさらに前記基質とする、項19に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
項21. 項16~20のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法を行う工程(1)と、
前記特異的結合性分子の結合用基に、前記特異的結合性分子を結合する工程(2)と、を含む、検出対象の分析用センサの製造方法。
項22. 項17、19及び20のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法を行う工程(1)と、
前記特異的結合性分子の結合用基に、前記特異的結合性分子を結合する工程(2)と、
前記シグナル物質結合用基にシグナル物質を結合する工程(3)を含む、検出対象の分析用センサの製造方法。
本明細書の全体にわたり、単数形の表現は、特に言及しない限り、その複数形の概念をも含むことが理解されるべきである。従って、単数形の冠詞(例えば、英語の場合は「a」、「an」、「the」等)は、特に言及しない限り、その複数形の概念をも含むことが理解されるべきである。また、本明細書において使用される用語は、特に言及しない限り、当該分野で通常用いられる意味で用いられることが理解されるべきである。したがって、他に定義されない限り、本明細書中で使用されるすべての専門用語および科学技術用語は、本開示の属する分野の当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。矛盾する場合、本明細書(定義を含めて)が優先する。
本明細書において、本開示において使用される用語および一般的な技術は、適宜説明する。
[1.検出対象の分析用センサ作製用基材]
本開示の検出対象の分析用センサ作製用基材は、後述の発明の分析用センサを作製するための材料となる基材である。この分析用センサ作製用基材は、ユーザが、検出対象をより一層感度高く検出可能なセンサへ簡便にカスタマイズできるように構成されている。
本開示の検出対象の分析センサ作製用基材は、検出対象の標的を受け入れる分子インプリント凹部と、前記分子インプリント凹部内に設けられた、前記標的に対する特異的結合性分子の結合用基とを有する分子インプリントポリマーを含み;前記特異的結合性分子の結合用基が小型物質に適合される基であることを特徴とし、ならびに/あるいは、分子インプリント凹部が、小型物質に適合される形状または構成を有することを特徴とする。この基本構成は、検出対象の分析センサ作製用基材のセンシング前駆部(つまり、分析用センサにカスタマイズされた場合にセンシング部を構成する部分)を構成する。
小型物質としては、任意の種類の物質が使用されることができ、代表的には、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、糖、脂質、核酸、核酸誘導体、人工(高分子)レセプター、その他の有機分子、これらの複合分子、などが挙げられ、好ましくはタンパク質、ポリペプチド、ペプチドが挙げられ、タンパク質、またはペプチドがより好ましい。
図1Aに示した本開示の検出対象の分析センサ作製用基材10’のより具体的な例を、図5(A)、図6(A)、図7(A)に、検出対象の分析センサ作製用基材10-C’,10-P’,10-PC’として示す。本開示の検出対象の分析センサ作製用基材10-C’,10-P’,10-PC’は、それぞれ、図5(B)、図6(B)、図7(B)に模式的に示す検出対象の分析用センサ10-C,10-P,10-PCの作製に用いられる。
以下、これらの検出対象の分析センサ作製用基材を構成するそれぞれの要素について詳述する。
分子インプリント凹部21,21cは、本開示の検出対象の分析用センサにおけるセンサ場を提供する部分であり、検出対象の標的を受け入れるように形成されている。具体的には、分子インプリント凹部21,21cは、分子インプリント重合法において用いられる鋳型(後述の鋳型60,60c)によってポリマーが型取られた部分であり、当該鋳型の表面形状の一部に対応する形状を有する。凹部21,21cは、少なくとも検出対象の標的を受け入れ可能な大きさで形成されていればよい。また、凹部21,21cは、分子インプリント凹部が、小型物質に適合される形状または構成を有する。
標的に対する特異的結合性分子の結合用基22’,22b’は、標的に対する特異的結合性基(図1B-1、図1B-2、図2B-1、図2B-2、図3B、図4B中の特異的結合性基42)を結合させることにより標的に対する特異的結合性分子を導入可能とする基である。ユーザは、標的を自由に選択することができ、選択した標的に対する特異的結合性分子を結合用基22’,22b’へ導入することができる。
シグナル物質の結合用基23’,23b’は、シグナル基(図2B-1、図2B-2、図3B、図4B中のシグナル基43)を結合させることによりシグナル物質を導入可能とする基である。ユーザは、シグナル物質を自由に選択することができ、結合用基23’,23b’へ導入することができる。
上記の特異的結合性分子の結合用基22b’及びシグナル物質の結合用基23b’は、機能性基24bを構成している。機能性基24bは、1個の基に特異的結合性分子の結合用基22b’及びシグナル物質の結合用基23b’の両方を備えるため、検出対象の分析センサ作製用基材にこれらの基を近接させて設けることが容易となる。検出対象の分析センサ作製用基材において特異的結合性分子の結合用基22b’及びシグナル物質の結合用基23b’を近接させて設けることは、即ち、検出対象の分析センサにおいて特異的結合性基42及びシグナル基43を近接させて設けることであり、これによって、検出対象の分析センサが検出対象を認識した時にシグナル変化をより感度高く得ることができる。
が挙げられる。
図4Aに示す検出対象の分析センサ作製用基材10cにおける相互作用基25は、分子インプリント凹部21cの鋳型における相互作用部位(後述の相互作用部位65c)と相互作用する基である。相互作用基25に対応する鋳型(後述の相互作用部位65cを有する鋳型)としては、タンパク質、糖タンパク質等の生体分子が挙げられる。
分子インプリントポリマー20,20a,20b,20cを構成するポリマーの構成成分としては特に限定されない。例えば、当該ポリマーは、生体適合性モノマー由来単位、N-置換又は無置換の(メタ)アクリルアミド由来単位、及び上記相互作用基25を有する機能性モノマー由来単位からなる群より選択される構成単位を含む。なお、本明細書においては、鋳型を用いたインプリンティング重合によって合成されるポリマーを、便宜上、「分子インプリントポリマー」と記載するものとし、本開示では、鋳型として分子でないもの(たとえば膜構造を有する微小粒体)も許容するため、「分子インプリントポリマー」には、鋳型として分子ではないものを用いたインプリンティング重合によって合成されるポリマーも含まれるものとする。
分子インプリントポリマー20,20a,20b,20cを構成するポリマーは、少なくとも生体適合性モノマー由来成分を含むことが好ましい。生体適合性とは、生体物質の接着を誘起しない性質をいう。生体適合性モノマー(例えば、後述の生体適合性モノマーM28として例示される)に由来する成分を含むことにより、分子インプリントポリマー20,20a,20b,20c表面への非特異的吸着を良好に抑制することができる。生体適合性モノマーとしては、好ましくは親水性モノマーが挙げられ、より好ましくは双性イオンモノマーが挙げられる。
分子インプリントポリマー20,20a,20b,20cを構成するポリマーは、N-置換又は無置換の(メタ)アクリルアミド由来単位を含むことができる。特に、分子インプリントポリマー20,20a,20b,20cが粒子状である場合、構成ポリマーにN-置換又は無置換の(メタ)アクリルアミド由来単位を含むことが好ましい。
分子インプリントポリマー20cを構成するポリマーは、機能性モノマー由来単位を含む。機能性モノマーとしては、上記「1-3-5.相互作用基」で述べた相互作用基25を有するモノマーであれば特に限定されない(例えば、後述の鋳型との相互作用基を含むモノマーM25として例示される)。
分子インプリントポリマー20,20a,20bを構成するポリマーの凹部21表面には、更に、特異的結合性分子の結合用基を与えるモノマー(後述の特異的結合性分子の結合用基及び重合性官能基を含むモノマーM22)由来単位、及び/又はシグナル物質の結合用基を与えるモノマー(後述のシグナル物質の結合用基を与えるモノマーM231,M232)由来単位も存在することができる。特異的結合性分子の結合用基を与えるモノマー由来単位が存在する場合としては、分子インプリントポリマー20,20a,20bが粒子状である場合が挙げられる。シグナル物質の結合用基を与えるモノマー由来単位が存在する場合としては、分子インプリントポリマー20,20a,20bが膜状である場合が挙げられる。
基板30の材料は、例えば、金属、ガラス、及び樹脂からなる群から選択される材料であってよい。金属としては、金、銀、銅、アルミニウム、タングステン、モリブデン等が挙げられる。樹脂としては、ポリ(メタ)アクリレート、ポリスチレン、ABS(アクリロニトリル-ブタジエン-スチレン共重合体)、ポリカーボネート、ポリエステル、ポリエチレン、ポリプロピレン、ナイロン、ポリウレタン、シリコーン樹脂、フッ素樹脂、メチルペンテン樹脂、フェノール樹脂、メラミン樹脂、エポキシ樹脂、塩化ビニル樹脂等が挙げられる。
本開示の検出対象の分析用センサ作製用基材は、特異的結合性分子及びシグナル物質の少なくともいずれかがユーザによってカスタマイズされるように構成されていればよい。したがって、他の態様として、特異的結合性分子の結合用基22’,22b’の方に、標的に対する特異的結合性基42がすでに結合していてもよい。この場合、ユーザはシグナル物質を自由に選択して導入することができる。
本開示の分析用センサは、上述の検出対象の分析用センサ作製用基材と;前記特異的結合性分子の結合用基に結合した前記検出対象の標的に対する特異的結合性基とを含み、前記特異的結合性分子の結合用基が小型物質に適合される基である。あるいは、本開示の分析用センサは、上述の検出対象の分析用センサ作製用基材と;前記特異的結合性分子の結合用基に結合した前記検出対象の標的に対する特異的結合性基とを含み、分子インプリント凹部が、小型物質に適合される形状または構成を有するものである。また、本開示の分析用センサは、上述の検出対象の分析用センサ作製用基材がシグナル物質の結合用基を有する場合は、シグナル物質の結合用基に結合したシグナル基も含む。
本開示の分析用センサの検出対象は、標的を含み、その標的が特異的結合性基42への特異性結合能を有するものであれば原理上特に限定されるものではない。
本開示において、特異的結合性基42は、小型物質基であり、好ましくは分子量45,000以下の特異的結合性タンパク質基又はペプチド基である。分子量は、理論分子量(calculated molecular mass)
を意味する。
糖:糖としては、D-グルコースが、α-1,4グリコシド結合により連結した環状オリゴ糖であるα-シクロデキストリン(D-グルコースが6個連結)、β-シクロデキストリン(D-グルコースが7個連結)、γ-シクロデキストリン(D-グルコースが8個連結)がある。これらの環状構造の内部は疎水性の空洞となっている。その空洞サイズに合った分子を認識して疎水性相互作用で包接することから、検出対象の標的に対する特異的結合能を有する分子として用いることができる。;
硫酸基が付加した2糖の繰り返し構造をもつグリコサミノグルカン:例えば、ヒアルロン酸は、膜タンパク質であるCD44を認識して結合することから、CD44に対して特異的結合能を有する分子として使用可能である。別の例として、ヘパリンは、細胞表面に存在し、ヘパリンバインディングドメインを有する種々の細胞外マトリクスタンパク質と相互作用している。従って、ヘパリンバインディングドメインをもつタンパク質に対する特異的結合能を有する分子として使用可能である。また、ペプチドに糖鎖が結合したプロテオグリカンも多く見られ、検出対象の標的に対する特異的結合能を有する分子として使用可能である。;
脂質:脂質は、例えば、リン酸エステルをもつリン脂質は、様々な官能基がリン酸エステルで結合可能で、リン脂質は、様々な生体分子と相互作用可能であることから、検出対象の標的に対する特異的結合能を有する分子として使用可能である。;
核酸:核酸は、特定の分子と特異的に結合する核酸分子として核酸アプタマーが知られている。in vitro selection法で自在に製造可能で、有機小分子や蛋白質、核酸、細胞、細胞組織、微生物といった様々な目標と特異的に結合するものが報告されていることから、検出対象の標的に対する特異的結合能を有する分子として使用可能である。
シグナル基43は、検出対象の標的と当該標的に対する特異的結合性基42との結合情報を読み出すものとして機能する。シグナル基43としては、分子インプリント凹部21,21cにおいて標的の結合により検知されるシグナル強度が変化したり、スペクトルが変化(例えばピークがシフト)したりするものであれば特に限定されない。たとえば、シグナル基43を与えるシグナル物質(後述のシグナル物質R43)としては、蛍光物質、放射性元素含有物質、磁性物質等が挙げられる。検出容易性等の観点から、シグナル物質としては蛍光物質であることが好ましい。蛍光物質としては、フルオレセイン色素、インドシアニン色素等のシアニン色素(DY647、Cy5、DY490等)、ローダミン色素(CR110、TAMRA)、クマリン色素、EvoBlue色素、オキサジン色素(ATTO)、カルボピロニン色素、Alexa色素、等の蛍光色素;GFP等の蛍光タンパク質;金コロイド、量子ドット等のナノ粒子等が挙げられる。放射性元素含有物質としては、18F等の放射性同位体でラベルした、糖、アミノ酸、核酸、19FでラベルしたMRIプローブなどが挙げられる。磁性物質としては、フェリクロームなどの磁性体を有するもの、フェライトナノ粒子、ナノ磁性粒子等が挙げられる。上記のシグナル物質の中でも、検出限界及び/又は感度を一層向上させる観点から、ローダミン色素が好ましい。
本開示の分析用センサは、検出対象のセンシングに用いられる。より具体的な用途としては、特異的結合性基の種類に応じて決定されるが、例えば、腎機能、肝機能、炎症の有無又は程度;腫瘍の有無又は程度等に基づく診断目的又は治療モニタリング等の目的で用いることができる。
本開示の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法としては、分子インプリントポリマーを合成し且つ分子インプリント凹部内に所定の官能基を導入する方法を特に制限なく用いることができる。以下に、本開示の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法のいくつかの例を挙げる。
例えば、図5(A)に示した基板状の検出対象の分析用センサ作製用基材10-C’の製造方法は、以下の工程(1-1)~工程(1-4)を含む。
・前記特異的結合性分子の結合用基に対し、第1の可逆的連結基を介して、鋳型を導入する工程(1-2);
・重合性モノマーを加え、前記重合性モノマーを基質とし、前記重合開始性基を重合性開始剤として、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成することで前記基板表面にポリマー膜を形成する工程(1-3);及び
・前記第1の可逆的連結基を開裂させて前記特異的結合性分子の結合用基へ変換するとともに前記鋳型を除去する工程(1-4)。
但し、前記特異的結合性分子の結合用基が小型物質に適合される基である。
・前記工程(1-3)において、前記重合性モノマー及び前記重合性官能基を基質とし、前記重合開始性基を重合性開始剤として、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成し;
・前記工程(1-4)において、前記第1の可逆的連結基及び前記第2の可逆的連結基を開裂させてそれぞれ前記特異的結合性分子の結合用基及びシグナル物質の結合用基へ変換するとともに前記鋳型を除去する。
・基板30に、検出対象の標的に対する特異的結合性分子の結合用基22’と重合開始性基INIとを表面に有する単分子膜SAMを形成する単分子膜形成工程(1-1);・特異的結合性分子の結合用基22’に対し、第1の可逆的連結基22を介して、鋳型60を導入する工程(1-2);
・重合性モノマーM28を加え、重合性モノマーM28を基質とし、重合開始性基INIを重合性開始剤として、鋳型60の表面の一部に対する分子インプリントポリマー20aを合成することで基板30表面にポリマー膜を形成する工程(1-3);
・第1の可逆的連結基22を開裂させて特異的結合性分子の結合用基22’へ変換するとともに鋳型60を除去する工程(1-4);但し、
(II)
・鋳型60の表面を、第2の可逆的連結基23を介して重合性官能基27で修飾する修飾工程を含み;
・前記工程(1-3)において、重合性モノマーM28及び重合性官能基27を基質とし、重合開始性基INIを重合性開始剤として、鋳型60の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマー20aを合成し;
・前記工程(1-4)において、第1の可逆的連結基22及び前記第2の可逆的連結基23を開裂させてそれぞれ特異的結合性分子の結合用基22’及びシグナル物質の結合用基23’へ変換するとともに鋳型60を除去する。
以下の図12-2~図12-5に示す基板状の検出対象の分析用センサ作製用基材10a-C’の製造方法で用いる鋳型は、必要に応じて、適当な表面修飾がなされたものとして用意する。
鋳型60は、検出対象又は検出対象の標的と同じ物質であってもよいし、検出対象又は検出対象の標的とは異なる物質であってもよい。また、検出対象又は検出対象の標的とは異なる物質である場合における鋳型60としては、生体分子であってもよいし、粒子コア(人工粒子とも呼ばれている。)であってもよい。
鋳型60は、図12-1a、図12-1bの鋳型601、鋳型602として示すように、その表面が結合性基22’’で修飾された形態で用意することができる。
工程(1-1)では、図12-2に示すように、基板30に、検出対象の標的に対する特異的結合性分子の結合用基22’と重合開始性基INIとを表面に有する単分子膜SAMを形成する。
工程(1-2)では、図12-3a及び図12-3bに示すように、基板30上の特異的結合性分子の結合用基22’に対し、第1の可逆的連結基22を介して、鋳型60を導入する。
工程(1-3)では、図12-4に示すように、重合性モノマーM28を加え、重合性モノマーM28及び重合性官能基27を基質とし、重合開始性基INIを重合性開始剤として、鋳型60の表面の一部に対する分子インプリントポリマー20aを合成することで基板30表面にポリマー膜を形成する。
工程(1-4)では、図12-5に示すように、第1の可逆的連結基22を開裂させて標的に対する特異的結合性分子の結合用基22’へ変換し、第2の可逆的連結基23を開裂させてシグナル物質の結合用基23’へ変換することで、鋳型60を除去する。上述の表面修飾工程で第2の可逆的連結基23が鋳型60の表面のみにデリバリされているため、鋳型60が除去された跡である分子インプリント凹部21には、特異的結合性分子の結合用基22’が残るとともに、凹部21内にのみ、第2の可逆的連結基23から生じたシグナル物質の結合用基23’が配置される。これによって、分析用センサ作製用基材10a-C’が得られる。
例えば、図6(A)に示した基板状の検出対象の分析用センサ作製用基材10-P’の製造方法は、以下の工程(1-11)~工程(1-13)を含む。
・前記重合性官能基を基質とし、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成する工程(1-12)と;及び
・前記第1の可逆的連結基を開裂させて前記分子インプリントポリマーから前記鋳型を除去し、前記特異的結合性分子の結合用基を生じる工程(1-13)。
但し、前記特異的結合性分子の結合用基が小型物質に適合される基である。
・重合性官能基27を基質とし、鋳型60の表面の一部に対する分子インプリントポリマー20を合成する工程(1-12)と;及び
・第1の可逆的連結基22を開裂させて分子インプリントポリマー20から鋳型60を除去し、特異的結合性分子の結合用基22’を生じる工程(1-13)。
以下、各工程について図を参照しながら詳述する。
工程(1-11)では、図13-1(図13-1a及び図13-1b)に示すように、表面が、第1の可逆的連結基22を介して重合性官能基27で修飾された、分子インプリントの鋳型60を用意する。
工程(1-12)では、図13-2に示すように、重合性官能基27を基質とし、鋳型60の表面の一部に対する分子インプリントポリマー20を合成する。
工程(1-13)では、図13-3に示すように、第1の可逆的連結基22を開裂させて分子インプリントポリマー20から鋳型60を除去し、特異的結合性分子の結合用基22’を生じる。これによって、分析用センサ作製用基材10’(10-P’)が得られる。
例えば、図10(A)に示した基板状の検出対象の分析用センサ作製用基材10c-P’の製造方法は、以下の工程(1-21)~工程(1-24)を含む。
・前記重合性官能基及び前記鋳型との相互作用基を含むモノマーを基質とし、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成する工程(1-22);
・前記第3の可逆的連結基を開裂させて前記分子インプリントポリマーから前記鋳型を除去する工程(1-23);及び
・検出対象の標的に対する特異的結合性分子の結合用基及びシグナル物質の結合用基を含む機能性基を有する分子を、第3の可逆的連結基を介して導入する工程(1-24)。
但し、前記特異的結合性分子の結合用基が小型物質に適合される基である。
・重合性官能基27及び鋳型60cとの相互作用基25を含むモノマーM25を基質とし、鋳型60の表面の一部に対する分子インプリントポリマー20cを合成する工程(1-22);
・第3の可逆的連結基26bを開裂させて分子インプリントポリマー20cから鋳型60cを除去する工程(1-23);及び
・検出対象の標的に対する特異的結合性分子の結合用基22’及びシグナル物質の結合用基23’を含む機能性基24bを有する機能性分子R24を、第3の可逆的連結基26bを介して導入する工程(1-24)。
以下、各工程について図を参照しながら詳述する。
工程(1-21)では、図14-1に示すように、表面が第3の可逆的連結基26bを介して重合性官能基27で修飾された、分子インプリントの鋳型60cを用意する。
工程(1-22)では、図14-2に示すように、重合性官能基27を基質とし、鋳型60の表面の一部に対する分子インプリントポリマー20cを合成する。
工程(1-23)では、図14-3に示すように、第3の可逆的連結基26bを開裂させて分子インプリントポリマー20cから鋳型60cを除去する。これによって、分子インプリントポリマー20cの凹部21c表面に相互作用基25と結合性基26b’とが配される。結合性基26b’は、第3の可逆的連結基26bの開裂により生じる基であり、具体的には、上記表1の第1-1欄に示す基が挙げられ、好ましくはチオール基が挙げられる。
工程(1-24)では、図14-4に示すように、検出対象の標的に対する特異的結合性分子の結合用基22’及びシグナル物質の結合用基23’を含む機能性基24bを有する機能性分子R24を、第3の可逆的連結基26bを介してポリマー20cの凹部21cに導入する。
図7(A)、図11(A)のように、粒子が基板に固定された検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法は、上記の「3-2.粒子状の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法-1」及び「3-3.粒子状の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法-2」で述べた製造方法と、ポリマー粒子を基板30上に固定する方法とを適宜組み合わせればよい。
本開示の検出対象の分析用センサの製造方法は、以下の工程を含む。
検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法を行う工程(1);及び
前記特異的結合性分子の結合用基に、前記特異的結合性分子を結合する工程(2)。
特異的結合性分子の結合用基22’に、特異的結合性分子R42を結合する工程(2)。
検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法を行う工程(1);
前記特異的結合性分子の結合用基に、前記特異的結合性分子を結合する工程(2);及び
前記シグナル物質結合用基にシグナル物質を結合する工程(3)。
特異的結合性分子22’の結合用基に、特異的結合性分子R42を結合する工程(2);及び
シグナル物質結合用基23’にシグナル物質R43を結合する工程(3)。
本開示の検出対象の分析法は、検出対象の分析用センサに、検出対象を含む試料を接触させ、前記特異的結合性基に前記検出対象を結合する工程と;前記特異的結合性基と前記検出対象との結合を検出する工程と、を含む。
検出対象の分析用センサについては、上記「2.検出対象の分析用センサ」で述べた通りである。
検出対象としては、検出対象の標的が特異的結合性基42と特異的に結合する対象であれば特に限定させるものではなく、上記「2-1.検出対象」で述べたとおりのものが挙げられる。
検出対象又は検出対象の標的が分子プリント凹部内の特異的結合性基42に特異的に捕捉されると、特異的結合性基と前記検出対象との結合を検出する。
5.5、R-フィコエリトリン(R-PE)/アロフィコシアニン(APC)等が挙げら
れる。
また、図10(B)に示す検出対象の分析用センサ10c-Pが、アルブミン(他の血漿タンパク質でもよい)を鋳型60cとする分子インプリント凹部21c及びアルブミンとの特異的な相互作用基25を有し上記「2-4.用途」に示す用途に用いられる場合のターゲティング動向を、図16-1及び図16-2に模式的に示す。図示された例では、分析用センサ10c-Pの検出対象70がエクソソームのような膜構造を有する微小粒体であり、直接的なターゲットである標的72が当該微小粒体の表面に発現している腫瘍マーカータンパク質である場合(上記「2-1.検出対象」の「態様2」である場合の具体例)を挙げて示している。また、図16-1及び図16-2には、いずれも、分子インプリント凹部21cの拡大図(i)と、(i)に対応する検出対象の分析用センサ10c-Pの全体図(ii)との両方を模式的に示している。
A)被験体から試料(例えば、尿、髄液、汗、鼻水、唾液、血液または涙を含む)を採取する工程、
B)前記試料を前記分析用センサと接触させる工程、
C)前記分析用センサからのシグナルを検出する工程、および
D)前記シグナルを分析してから前記被験体を診断する(例えば、疾患の有無若しくは進行を判定する)工程
を含む。
A)前記被験体から得られた試料(例えば、尿、髄液、汗、鼻水、唾液、血液または涙を含む)を前記診断または検査システムに提供する工程、
B)前記診断または検査システムが、前記試料を前記分析用センサと接触させるように起動する工程、
C)前記診断または検査システムが、前記分析用センサからのシグナルを検出する工程、および
D)前記診断または検査システムが、前記シグナルを分析してから前記被験体を診断または検査する(例えば、検出結果から疾患の有無または進行を判定する)工程
を含む。
A)前記被験体から得られた試料(例えば、尿、髄液、汗、鼻水、唾液、血液または涙を含む)を前記診断または検査システムに提供する工程、
B)前記診断または検査システムが、前記試料を前記分析用センサと接触させるように起動する工程、
C)前記診断または検査システムが、前記分析用センサからのシグナルを検出する工程、および
D)前記診断または検査システムが、前記シグナルを分析してから該被験体を診断または検査する(例えば、検出結果から疾患の有無または進行を判定する)工程
を含む。
A)前記被験体から得られた試料(例えば、尿、髄液、汗、鼻水、唾液、血液または涙を含む)を提供する提供部、
B)前記試料を前記分析用センサと接触させるように起動する起動部、
C)前記分析用センサからのシグナルを検出する検出部、および
D)前記シグナルを分析してから該被験体を診断または検査する(例えば、検出結果から疾患の有無または進行を判定する)診断部
を含む。
1.愛玩動物(ネコ、イヌ、鳥類など)の動物のがんを含む疾病の検査
2.家畜(ウシ、ウマ、ブタ、ニワトリなど)の保有する感染症原因ウイルスや感染性タンパク質(プリオンなど)、その他の病原性/感染性因子の検出
3.有害動物(鳥類、コウモリ、キツネ、マングース、アライグマ等)の保有する感染症原因ウイルスや感染性タンパク質(プリオンなど)、その他の病原性/感染性因子の検出
4.水産物の品質や鮮度チェック
5.農産物の品質や鮮度チェック
6.植物や樹木などの病原菌・ウイルスチェック
本実施例では、基板状の検出対象の分析センサ10a1-C(シグナル物質としてAlexaFluor 647を導入)を作製した。この基板状の検出対象の分析センサは、検出対象を、HER2過剰発現型乳がん細胞株であるSK-BR-3細胞が発現するエクソソームとし、検出対象の標的をHER2とし、特異的結合性分子として抗HER2アフィボディを選択して導入した。また、シグナル物質としてAlexa Fluor 647を導入した。更に、得られた基板状の検出対象の分析センサを用いて検出対象の分析を行った。
図12-1aに準じて、ポリヒスチジンタグ及びチオール基で修飾された鋳型シリカ粒子の作製を行った。
・Sicastar(R)-red F(micromod;平均粒子径は200nm;固形分濃度は25mg/mL;粒子表面の官能基はカルボキル基(1μmol/g);蛍光特性は励起569nm、蛍光585nm)
・・鋳型60:シリカ粒子
・・結合性基BG22’’:カルボキシル基
・2-アミノエタンチオール塩酸塩(東京化成工業)
・・結合性基BG23’:アミノ基
・・結合性基23’’:チオール基
・ポリヒスチジンタグ(サーモフィッシャーサイエンティフィック;His-tag;Ac-KHHHHHH-NH2;Acはアセチル基、Kはリシン残基、Hはヒスチジン残基を表す。)
・・結合性基BG22’:アミノ基
・・結合性基22’’:ポリヒスチジン
・DMT-MM(4-(4,6-ジメトキシ-1,3,5-トリアジン-2-イル)-4-メチルモルホリニウムクロリド;トリアジン系縮合剤)
Sicastar(R)-red F表面のカルボキシル基に対して20等量の2-アミノエタンチオール塩酸塩、ポリヒスチジンタグ、及びDMT-MMを加え、振盪(25℃、終夜)することで、ポリヒスチジンタグ及びチオール基で修飾されたシリカ粒子を作製した。その後、遠心分離(10,000g,15分)で分散媒を水に置換した。さらに、遠心分離(10,000g,10分)で分散媒を水に置換する操作を2回行った。作製したシリカ粒子を100μL採取し、乾燥重量を測定した。得られたシリカ粒子の固形分濃度は7.41mg/mLであった。
図12-2に準じて、基板に、NTA-Ni錯体と重合開始性基とを表面に有する単分子膜を形成した。
・Amino-EG6-undecanethiol hydrochloride(同仁化学研究所)
・・結合性基BG1’:アミノ基
・2-(2-bromoisobutyryloxy) undecyl thiol(SURF MODS)
・・重合性開始基INI:-CBr基
・Isothiocyanobenzyl-NTA(同仁化学研究所)、無水NiCl2(ナカライテスク)
・・特異的結合性分子の結合用基22’:ニッケル-ニトリロトリ酢酸由来基
金スパッタガラス基板をエタノールで洗浄後、UVオゾン処理(20分)を行い、金基板表面の有機物を分解した。その後、0.5mMのamino-EG6-undecanthiol hydrochloride及び0.5mMの2-(2-bromoisobutyryloxy) undecyl thiolを含むエタノール溶液に基板を浸漬させ静置(25℃、終夜)し、混成自己組織化単分子膜(mixed SAMs)を形成した。
図12-3aに準じて、基板に鋳型を導入し、鋳型の表面をメタクリロイル基で修飾した。
・M231:2-(2-pyridyl)dithioethyl methacrylamide
・・シグナル物質の結合用基23’:ピリジルジスルフィド基(チオール基に変換される)
・・重合性官能基27:メタクリロイル基
・・第1の可逆的連結基22:配位結合
・・第2の可逆的連結基23:ジスルフィド基
上記[1]で作製したポリヒスチジンタグ及びチオール基で修飾されたシリカ粒子を基板に滴下し、静置(室温,1時間)させることでシリカ粒子を固定化した。
図12-4に準じて、分子インプリントポリマーのポリマー膜を合成した。
・M28:2-メタクリロイルオキシエチルホスホリルコリン(MPC)
表4の重合レシピに従い、表面開始原子移動ラジカル重合(SI-ATRP)系を、上記[3]で得られた基板上に構築し、分子インプリントポリマー20aのポリマー薄膜を合成した。具体的には、シュレンクフラスコに上記重合レシピのL-アスコルビン酸を除く溶液を調製し、上記[3]で得られた基板を入れて窒素置換した後、L-アスコルビン酸をシリンジで注入し重合を開始した。重合は40℃で3時間行い、その後、基板を純水で洗浄した。
図12-5に準じて、分子インプリントポリマーから鋳型を切り出し、基板状の検出対象の分析センサ10a-C’を得た。
図12-6に準じて、基板状の検出対象の分析センサ10a-C’に、Alexa Fluor 647及び抗HER2アフィボディを導入した。
・R43:Alexa Fluor 647 C2-maleimide(サーモフィッシャーサイエンティフィク)
・・シグナル基43:Alexa Fluor 647
・・結合性基23’’:マレイミド基
・R42:Z342-EGFP-Histag
・・特異的結合性基42:抗HER2アフィボディ
・・結合性基22’’:ポリヒスチジンタグ
・・他のシグナル基sg:EGFR
Z342-EGFP-Histagにおける抗HER2アフィボディのHER2に対する生来的なKdは、EGFRが融合している影響によって、EGFRが融合していない抗HER2アフィボディのHER2に対する生来的なKdに比べて大きい(つまり、EGFRが融合していない抗HER2アフィボディよりも結合能が劣る)。実際にZ342-EGFP-Histagにおける抗HER2アフィボディ分子のHER2に対する生来的なKdは、1.06×10-10Mであった。
上記[5]で得られた基板状の検出対象の分析センサ作製用基材10a-C’を純水で洗浄し、100μMのAlexa Fluor 647 C2 Maleimide(20%DMSO水溶液中)を滴下して静置(室温、1時間)することで、分子インプリント凹部21内のチオール基(シグナル物質の結合用基23’)を利用して蛍光基Alexa Fluor 647(シグナル基43)を導入した。
上記[6]で得られた基板状の検出対象の分析センサ10a1-Cを用い、SIC自動分注装置つき蛍光顕微鏡によるエクソソーム捕捉試験を行った。
SK-BR-3細胞株(Her2高発現)培養上清から次のようにしてエクソソーム(SK-BR-3細胞が発現するエクソソーム)を精製した。
相対蛍光強度を下記式に従って算出し、相対蛍光強度とエクソソーム濃度との関係を調べた。結果を図17Aに示す。
蛍光強度変化に基づいて、解離定数Kdを、DeltaGraphを用いたカーブフィッティングによって算出した。算出式は以下の通りである。
アフィボディを導入しないことを除いて実施例1と同様にして比較用の検出対象の分析センサを作製した。この比較用の検出対象の分析センサについて、実施例1と同様に相対蛍光強度とエクソソーム濃度との関係を調べた。結果を図17Bに示す。
本実施例では、基板状の検出対象の分析センサ10a1-C(シグナル物質としてローダミンを導入)を作製した。この基板状の検出対象の分析センサは、実施例1と同様、検出対象を、HER2過剰発現型乳がん細胞株であるSK-BR-3細胞が発現するエクソソームとし、検出対象の標的をHER2とし、特異的結合性分子として抗HER2アフィボディを選択して導入した。また、シグナル物質としてローダミンを導入した。更に、得られた基板状の検出対象の分析センサを用いて検出対象の分析を行った。
シグナル物質R43としてAlexa Fluor 647 C2-maleimideの代わりにTetramethylrhodamine(TAMRA)-5 C2 maleimideを用いたことを除いて、実施例1と同様の方法で作製した。同じようにして、合計3枚(N=3)の基板状の検出対象の分析センサ10a1-C(シグナル物質としてローダミンを導入)を作製した。
上記[1]で得られた基板状の検出対象の分析センサ10a1-C(シグナル物質としてローダミンを導入、N=3)のそれぞれについて、実施例1と同様の方法でSK-BR-3細胞が発現するエクソソームの分析を行った。なお、エクソソームの濃度は、2.0×10-17M、5.0×10-17M、1.0×10-16M、2.0×10-16M、5.0×10-16M、1.0×10-15M、2.0×10-15M、及び1.0×10-14Mとした。蛍光顕微鏡の測定条件については、測定地点は7ポイント、フィルタはGW(励起)-Cy3(蛍光)、対物レンズは5倍、露光時間は0.1秒、光量は100%、光源は水銀ランプとした。結果を図18に示す。
実施例1の[7]と同様に、蛍光強度変化に基づいて解離定数Kdを算出した。結果、本実施例のローダミン及び抗HER2アフィボディを導入した基板状の検出対象の分析センサ10a1-Cによる解離定数Kdは、8.41×10-18であり、本実施例で用いた抗HER2アフィボディの生来的なKd(1.06×10-10)に対して9オーダー弱ものという各段の向上効果が得られており、後述の比較例2と比較して驚異的な結合能向上効果が認められた。また、本実施例による結合能向上効果は、後述の実施例3、5と比較しても顕著に優れていた。
以下の式に従って検出限界(DL)も算出した。
抗HER2アフィボディの代わりに抗Her2抗体(この抗Her2抗体の、Her2に対する生来的な解離定数は、5.8×10-10M)を導入したことを除いて実施例1と同様にして分析用センサを作製した。具体的には、実施例1の[6]において、基板状の検出対象の分析センサ10a-C’に、Z342-EGFP-Histagを結合する代わりに、以下の手順を行った。
本実施例では、基板状の検出対象の分析センサ(但し、特異的結合性基に融合したシグナル物質を利用する基板状の検出対象の分析センサ101タイプのもの)を作製した。この基板状の検出対象の分析センサは、実施例1と同様、検出対象を、HER2過剰発現型乳がん細胞株であるSK-BR-3細胞が発現するエクソソームとし、検出対象の標的をHER2とし、特異的結合性分子として抗HER2アフィボディを選択して導入した。また、シグナル物質を導入せず特異的結合性基に融合したシグナル物質を利用した。更に、得られた基板状の検出対象の分析センサを用いて検出対象の分析を行った。
Tetramethylrhodamine-5 C2 maleimideを導入する工程を除外したことを除いて、実施例3と同様にして基板状の検出対象の分析センサを作製した(N=2)。つまり、本実施例の基板状の検出対象の分析センサは、実施例2の基板状の検出対象の分析センサ10a-Cと異なり、シグナル物質を導入していない。ここで、このセンサにおいては、特異的結合性基42を与える特異的結合性分子R42として上述(実施例1の欄)のとおりZ342-EGFP-Histag(蛍光基EGFPが融合した抗HER2アフィボディとポリヒスチジンタグを有する分子)を用いているため、特異的結合性基42は、厳密には、蛍光基EGFPが融合した抗HER2アフィボディ、つまり、シグナル基43が特異的結合性基42に結合した特異的結合性基44である。従って、本実施例の基板状の検出対象の分析センサは、特異的結合性基に融合したシグナル物質を利用する基板状の検出対象の分析センサ101タイプのものである。
上記[1]で得られた基板状の検出対象の分析センサ(抗HER2アフィボディに融合したEGFPを利用、N=2)のそれぞれについて、実施例2と同様の方法及び条件(但し、フィルタはEGFPを測定するためBW(励起)-Cy3(蛍光)に変更した)でSK-BR-3細胞が発現するエクソソームの分析を行った。結果を図19に示す。
蛍光強度変化に基づいて、実施例1の[7]と同様にして解離定数Kdを算出した。結果、解離定数Kdは、2.29×10-17であり、蛍光基EGFPが融合した抗HER2アフィボディの生来的なKd(1.06×10-10)に対して各段に向上していた。
実施例2と同様にして検出限界(DL)も算出した。結果、検出限界(DL)は、3.70×10-14Mであった。
本実施例では、粒子状且つ基板に固定された検出対象の分析センサ10-PCを作製した。この粒子状且つ基板に固定された検出対象の分析センサは、検出対象を、HER2過剰発現型乳がん細胞株であるSK-BR-3細胞が発現するエクソソームとし、検出対象の標的をHER2とし、特異的結合性分子として抗HER2アフィボディを選択して導入した。更に、得られた粒子状且つ基板に固定された検出対象の分析センサ10-PCを用いて検出対象の分析を行った。
下記スキームに従って、後述の[2]で用いる、ジスルフィド結合型メタクリロイル修飾試薬(下記スキームの化合物(5))を合成した。本実施例では、この試薬を、結合性基BG22’と第1の可逆的連結基22重合性官能基27とを含むモノマーM222とし
て用いた。
図13-1bに準じて、ジスルフィド結合を介してメタクリロイル基で修飾された鋳型HSAの作製を行った。
・Albumin, from Human Serum (HSA;ヒト血清アルブミン)(和光純薬工業)
・・鋳型60:HSA
・・結合性基BG22’’:アミノ基
・M222:上記[1]で合成された化合物(5)
・・結合性基BG22’:カルボン酸活性エステル基
・・第1の可逆的連結基22:ジスルフィド基
・・重合性官能基27:メタクリロイル基
HSA (100mg, 2.23 μmol ) を溶解した10 mM リン酸緩衝溶液( pH 7.4 ) 2 mL と、上記[1]で合成された化合物(5) (20 mg, 44.6 μmol, 20eq ) を溶解した10 mM リン酸緩衝溶液( pH 7.4 )1 mL とを混合し、4 ℃で一晩反応させた。その後、アミコンウルトラ-4 10 kDa (4 ℃, 7500 G, 20 min ) で 3 回洗浄を行い、ジスルフィド結合を介してメタクリロイル基で修飾された鋳型HSAを得た。
図13-2に準じて、分子インプリントポリマーの粒子を合成した。
・M28:2-メタクリロイロキシエチルホスホリルコリン(MPC)
・M29:N-イソプロピルアクリルアミド(NIPAm)
表5の重合レシピに従い、シュレンクフラスコ50mL中で窒素雰囲気下、70℃で16時間無乳化剤沈殿重合を行うことで、分子インプリントポリマー20の粒子MIP-NGsを合成した。
図13-3に準じて、分子インプリントポリマーから鋳型を除去した。
得られたMIP-NGsについて、動的光散乱(DLS)測定及び透過型電子顕微鏡(TEM)測定を行った。TEM測定では、透過型電子顕微像において粒子の長軸と短軸の平均値を粒径とし、ランダムに選んだ粒子100個の当該粒径を測定してその平均値を個数平均粒子径とした。結果を下記表に示す。また、TEM画像を図20に示す。図20中、スケールバーの長さは50nmである。
図15(ただし、粒子状分子インプリントポリマー20を、粒子状分子インプリントポリマー20に読み替え)に準じて、上記[4]で得られた分子インプリントポリマー20の粒子MIP-NGsを基板に固定した。
図13-4に準じて、上記[6]で得られた検出対象の分析用センサ作製用基材10-PC’に、抗Her2アフィボディを導入した。
・Anti-Her2 Affibody(R) Molecule (抗Her2アフィボディ分子、アブカム株式会社;この分子の生来的なKdは3.2×10-11M、分子量が6,000程度である。)
・ジチオスレイトール
・・特異的結合性基42:抗Her2アフィボディ
・・結合性基22’’:チオール基
1mg/mL抗Her2アフィボディ分子の溶液(10 mM PB, 137 mM NaCl, 0.05vol% Tween20 (pH 7.4);PBST)10μLを、20mMのDTT溶液(50 mM PB, 137 mM NaCl (pH7.5))40μLに加え、25℃、2時間で反応後、Amicon Ultra-0.5 (MWCO: 10 kDa)を用いて限外濾過(4℃,14000×g,15分)を3回行い、PBSTにて精製した。これにより、抗Her2アフィボディを与える分子R42を得た。
上記[7]で得られた粒子状かつ基板に固定された検出対象の分析用センサ10-PCを用い、SPR測定を行った。
SK-BR-3細胞が発現するエクソソームを、PBS(10mM phosphate,140mM NaCl,pH7.4)中に、0×10-16M、0.032×10-16M、0.064×10-16M、0.125×10-16M、0.25×10-16M、0.5×10-16M、1.0×10-16M、2.5×10-16M、5.0×10-16M、10×10-16M、50×10-16M、100×10-16M、500×10-16M、1000×10-16Mの濃度で溶解させたエクソソーム溶液を調製した。調製されたエクソソーム溶液を、上記[7]で得られた粒子状かつ基板に固定された検出対象の分析用センサ10-PCに添加した。
フローレート:20μL/分
インジェクション量:100μL
温度:25℃
データポイント:インジェクション後6分経過時
ランニングバッファ:PBS
エクソソーム溶液のインジェクト直前及びインジェクト6分経過時におけるレゾナンスユニット(RU)値の差をレスポンスの変化量として、吸着等温線を作成した。その結果を図21に示す。さらに、実施例1の[7]と同様にしてカーブフィッティングによる解離定数Kdを算出した。その結果、解離定数Kdは2.0×10-18(M)であり、本実施例で用いた抗HER2アフィボディ分子の生来的なKd(3.2×10-11M)に対して各段に向上していた。
本実施例では、粒子状且つ基板に固定された検出対象の分析センサ10b-PCを作製した。この粒子状且つ基板に固定された検出対象の分析センサは、検出対象を、HER2過剰発現型乳がん細胞株であるSK-BR-3細胞が発現するエクソソームとし、検出対象の標的をHER2とし、特異的結合性分子として抗HER2アフィボディを選択して導入した。また、シグナル物質として、ATTO647Nを導入した。更に、得られた粒子状且つ基板に固定された検出対象の分析センサ10b-PCを用いて検出対象の分析を行った。
図14-1に準じて、ジスルフィド結合を介してメタクリロイル基で修飾された鋳型HSAの作製を行った。
・Albumin, from Human Serum (HSA;ヒト血清アルブミン)(和光純薬工業)
・・鋳型60c:HSA
・・結合性基BG6’’:アミノ基
・M27:実施例4の[1]で合成された化合物(5)
・・結合性基BG6’:カルボン酸活性エステル基
・・第3の可逆的連結基26b:ジスルフィド基
・・重合性官能基27:メタクリロイル基
HSA (100mg, 2.23 μmol ) を溶解した10 mM リン酸緩衝溶液( pH 7.4 ) 2 mL と、実施例4の[1]で合成された化合物(5) (20 mg, 44.6 μmol, 20eq ) を溶解した10 mM リン酸緩衝溶液( pH 7.4 )1 mL とを混合し、4 ℃で一晩反応させた。その後、アミコンウルトラ-4 10 kDa (4 ℃, 7500 G, 20 min ) で 3 回洗浄を行い、ジスルフィド結合を介してメタクリロイル基で修飾された鋳型HSAを得た。
図14-2に準じて(但し、相互作用基25を有するモノマーM25は用いなかった)、分子インプリントポリマーの粒子を合成した。
図14-3(但し、相互作用基25は不在)に準じて、分子インプリントポリマーから鋳型を除去した。
図15(ただし、粒子状分子インプリントポリマー20cを、粒子状分子インプリントポリマー20bに読み替え)に準じて、上記[3]で得られた分子インプリントポリマー20b(分子インプリントポリマー20cの相互作用基25がない態様のもの)の粒子MIP-NGsを基板に固定した。具体的な実験手順は、実施例4の[6]と同様である。
下記スキームに従って、後述の[6]で用いる、機能性基24bと標的に対する特異的結合性分子の結合用基22b’とを有する機能性分子R24を合成した。機能性分子R24は、上記式(7a)で表される化合物である。
図14-4(但し、相互作用基25は不在)に準じ、機能性分子R24を、分子インプリント凹部21c(但し、相互作用基25は不在)の結合性基26b’’に導入した。
・機能性分子R24:上記[5]で得られた、上記式(7a)で表される化合物
・・特異的結合性分子の結合用基22b’:ピリジルジスルフィド基
・・シグナル物質の結合用基23b’:アミノ基
・・結合性基26b’’:ピリジルジスルフィド基
上記[4]で得られた分子インプリントポリマー20b(分子インプリントポリマー20cの相互作用基25がない態様のもの)の粒子MIP-NGsが固定された基板を、機能性分子R24の900μg/mLPBS溶液に浸漬し、機能性分子R24のピリジルジスルフィド基(結合性基26b’’)と分子インプリントポリマー20bのチオール基(結合性基26b’)とを、室温℃で2時間反応させた。これによって、検出対象の分析用センサ作製用基材10b-PC’を得た。
図14-5(但し、相互作用基25は不在)に準じ、検出対象の分析用センサ作製用基材10b-PC’に、抗Her2アフィボディと蛍光物質とを導入した。
・抗Her2アフィボディを与える分子R42:Anti-Her2 Affibody(R) Molecule (抗Her2アフィボディ分子、アブカム株式会社)及びジチオスレイトールを用い、実施例4の[7-2]で合成された化合物
・・特異的結合性基42:抗Her2アフィボディ(この分子の生来的なKdは3.2×10-11M、分子量が6,000程度である。)
・・結合性基22b’’:チオール基
・シグナル物質R43:Atto647N-NHS(ATTO-TEC)
・・シグナル基43:Atto647N
・・結合性基23b’’:カルボン酸活性エステル基
抗Her2アフィボディを与える分子R42の10μg/mLPBS溶液を、上記[7]でえられた検出対象の分析用センサ作製用基材10b-PC’と反応させ(室温、2時間)、ピリジルジスルフィド基(特異的結合性分子の結合用基22b’)に抗Her2アフィボディ(特異的結合性基42)の導入を行った。その後、100μMの2-メルカプトエタノール溶液を反応させることで、残存したピリジルジスルフィド基(特異的結合性分子の結合用基22b’の残存基)のキャッピングを行った。次いで、基板をAtto647N-NHS溶液と反応させ(室温、2時間) アミノ基(シグナル物質の結合用基23b’)にAtto647N(シグナル基43)を導入した。これによって、検出対象の分析用センサ10b-PC(検出対象の分析用センサ10c-Pの相互作用基25が無い態様のものが基板に固定されたもの)を得た。
上記[7]で得られた検出対象の分析用センサ10b-PC(検出対象の分析用センサ10c-Pの相互作用基25が無い態様のものが基板に固定されたもの)を用い、SIC 自動分注装置付き蛍光顕微鏡によるエクソソーム捕捉試験を行った。
SK-BR-3細胞が発現するエクソソームを、PBS(10mM phosphate,140mM NaCl,pH7.4)中に、0~1.0×10-13Mの濃度で溶解させたエクソソーム溶液を調製した。調製されたエクソソーム溶液を、上記[7]で得られた検出対象の分析用センサに滴下した。
相対蛍光強度を実施例1と同様にして、相対蛍光強度を算出し、相対蛍光強度とエクソソーム濃度との関係を調べた。結果を図22に示す。
23に示す。
抗HER2アフィボディの代わりに抗Her2ナノボディを導入したことを除いて実施例1と同様にして、基板状の検出対象の分析センサ10a-C(シグナル物質としてAlexa Fluor 647を導入)を作製した。抗Her2ナノボディ分子の生来的なKdは、1×10-9Mである。
その結果、解離定数Kdは5.81×10-19(M)であり、本実施例で用いた抗HER2ナノボディ分子の生来的なKd(1×10-9M)に対して各段に向上していた。
本実施例では、粒子状の検出対象の分析センサ10c-Pの基板に固定された態様のものを作製した。この粒子状且つ基板に固定された検出対象の分析センサは、検出対象を、HER2過剰発現型乳がん細胞株であるSK-BR-3細胞が発現するエクソソームとし、検出対象の標的をHER2とし、特異的結合性分子として抗HER2アフィボディを選択して導入した。また、シグナル物質として、ATTO647Nを導入した。また、この分析センサは、鋳型であるHSAと相互作用する相互作用基25も有する。更に、得られた基板に固定された粒子状の検出対象の分析センサ10c-Pを用いて検出対象の分析を行った。
図14-1に準じて、ジスルフィド結合を介してメタクリロイル基で修飾された鋳型HSAの作製を行った。
・Albumin, from Human Serum (HSA;ヒト血清アルブミン)(和光純薬工業)
・・鋳型60c:HSA
・・結合性基BG6’’:アミノ基
・・相互作用部位65c:カルボキシル基
・M27:実施例4の[1]で合成された化合物(5)
・・結合性基BG6’:カルボン酸活性エステル基
・・第3の可逆的連結基26b:ジスルフィド基
・・重合性官能基27:メタクリロイル基
実施例5の[1-2]と同じ手順を行った。
図14-2に準じて、分子インプリントポリマーの粒子を合成した。
・M25:ピロリジルアクリレート(PyA)
・・相互作用基25:ピロリジル基
・M28:2-メタクリロイロキシエチルホスホリルコリン(MPC)
・M29:N-イソプロピルアクリルアミド(NIPAm)
表7の重合レシピに従い、シュレンクフラスコ50mL中で窒素雰囲気下、70℃で16時間無乳化剤沈殿重合を行うことで、分子インプリントポリマー20cの粒子MIP-NGsを合成した。
図14-3に準じて、分子インプリントポリマー20cから鋳型を除去した。具体的な手順は、実施例5の[3]と同様である。
得られた分子インプリントポリマー20cの粒子MIP-NGsについて、実施例4の[5]と同様にして、動的光散乱(DLS)測定及び透過型電子顕微鏡(TEM)測定を行った。測定結果を下記表に示す。また、TEM画像を図24に示す。図24中、スケールバーの長さは50nmである。
図15に準じて、上記[3]で得られた分子インプリントポリマー20cの粒子MIP-NGsを基板に固定した。具体的な実験手順は、実施例4の[6]及び実施例5の[4]と同様である。これによって、基板に固定された粒子状の検出対象の分析センサ作製用基板10c-P’を得た。
図14-4に準じ、機能性分子R24を、分子インプリント凹部21cの結合性基26b’’に導入した。具体的な実験手順は、実施例5の[6]と同様である。
図14-5に準じ、基板に固定された検出対象の分析用センサ作製用基材10c-P’に、抗Her2アフィボディと蛍光物質(Atto647N-NHS)とを導入した。具体的な実験手順は、実施例5の[7]と同様である。これによって、基板に固定された粒子状の検出対象の分析センサ10c-Pを得た。
上記[7]で得られた、基板に固定された検出対象の分析用センサ10c-Pを用い、SIC 自動分注装置付き蛍光顕微鏡によるエクソソーム捕捉試験を行った。
SK-BR-3細胞が発現するエクソソームと、HSAとを、下記表に示す濃度で含む(a)~(d)の試料液を調製した。
相対蛍光強度を実施例1と同様にして、相対蛍光強度を算出した。結果を図25に示す。図25に示すように、試料液(a)~(d)はいずれも同じ濃度の検出対象(SK-BR-3細胞が発現するエクソソーム)を含むに関わらず、試料液(d)のようにHSAがある程度の濃度ある場合は全く消光が確認されない一方で、試料液(a)~(c)のようにHSA濃度がゼロ又は低い場合には消光が確認された。HSAがある程度の濃度である試料液(d)では、図16-1に示すように、HSAが相互作用基25及びHSAを鋳型とする分子インプリント凹部21cによって捕捉され、これにより抗Her2アフィボディ(特異的結合性基42)が遮蔽される一方で、HSA濃度がゼロ又は低い試料液(a)~(c)では、図16-2に示すようにHSAが捕捉されず、抗Her2アフィボディ(特異的結合性基42)が露出し、検出対象であるSK-BR-3細胞が発現するエクソソームが捕捉されるという、二重ターゲティングが奏された結果であると認められる。
本実施例では、センシング対象をブタ血清アルブミン(PSA)とする粒子を、基板に固定化しない遊離状態で用い、PSA及びトランスフェリンそれぞれに対する免疫応答を試験した。
本実施例では、図2のセンシング用ナノ粒子10aに相当する、Fcドメインセンシング用(且つFcドメイン捕捉を介したIgGセンシング用)ナノ粒子を合成した。
式51bに示す機能性モノマーを設計し、以下のスキームに従って合成した。なお、式51bに示す機能性モノマーは、ボロニルアリール基と二価アミノ基とを有しており、MIP-NGsにおいて、ボロニルアリール基はIgGのFcドメインの糖鎖との相互作用し、2級アミノ基はポストインプリンティング修飾において蛍光分子の導入に用いられる。
収量: 175 mg (0.668 mmol, 42.5 %)
1H-NMR (500 MHz, D2O): δ=7.62 (d, 2H, phenyl), 7.30 (d, 2H, phenyl), 5.69 (s, 1H, vinyl), 5.44 (s, 1H, vinyl), 3.97 (s, 2H, N-CH2-), 3.47 (t, 2H, -CH2-), 2.99 (br, 2H, -CH2-), 1.89 (s, 3H, -Me)
10mgのIgGを10mMリン酸緩衝液(pH7.4,140mM NaCl)(5mL)に溶解させ、抗体溶液を調製した。10mMリン酸緩衝液(pH7.4,140mM NaCl)に0.02M L-システイン,0.002M EDTA,0.1mg/mLパパインを溶解させ、酵素溶液を調製した。抗体溶液と酵素溶液とを同量混合し、37℃で24時間反応させた。その後、反応液を10kDaの限外ろ過膜(7500g,20分×3)を用いて溶媒を20mMリン酸緩衝液(pH7.0)に置換した。続いて100kDaの限外ろ過膜(Amicon Ultra)(7500g,20分×3)を用いて未反応のIgGを分離した。得られた溶液(1mL)についてProtein Aカラム(HitrapTM Protein A HP,Cytiva)を用いて精製を行った。結合バッファーとして20mMリン酸緩衝液(pH7.0)を用い、溶出バッファーとして0.1M クエン酸緩衝液(pH3.0)を用い、シリンジ(流速:約1mL/分)にて精製行った。精製後の溶液について、10kDaの限外ろ過膜(7500g,20分×3)を用いて溶媒を10mM炭酸緩衝液(pH9.2)に置換した。Fcドメインの精製はSDS-PAGEで確認した。
下記表に示した成分の混合物(プレポリマー溶液)を、50℃で12時間、無乳化剤沈殿重合に供し、ポリマーナノゲルを合成した(工程1)。なお、プレポリマー溶液に含ませるモノマーには、粒子の精製作業を容易化するために、標識モノマーも用いた。重合後の溶液(2mL)を、限外ろ過膜(10kDa,7500×g,20分×3)にて10mMリン酸緩衝液(pH7.4,140mM NaCl)に置換した。得られた溶液(2mL)をサイズ排除クロマトグラフィー(Sephadex G-100)を通し、未反応のモノマーを除去した。これによって得られた溶液(1mL)と40mg/mL SDS水溶液(1mL)とを混合し、5分間インキュベーションし、その後、陰イオン交換樹脂(DEAE-Sephadex,10cm,1.5cm i.d.)に添加し、10mM Tris-HCl緩衝液(pH7.4,140mM NaCl)を溶出液として溶出を行った(工程2)。その後、SDSを除去するために脱塩カラム(PD-10)(溶出液:10mMリン酸緩衝液(pH7.4,140mM NaCl)を通すことで精製を行った。
金スパッタガラス基板(4.3×9.8mm)を、純水及びEtOHで洗浄し、UV-O3洗浄(20分)を行った。洗浄後の基板を1mM 11-メルカプトウンデカン酸のEtOH溶液に浸漬させることで自己組織化単分子膜形成を利用して表面にカルボキシ基を導入した(25℃,24時間)。基板をEtOHで洗浄した後、基板を0.2M EDC及び0.05M NHSを溶解させた水溶液中に浸漬させることで、表面カルボキシ基の活性化を行った(25℃,1時間)。反応後の基板上に50μLの蛍光基導入MIP-NGs(実施例5)又は蛍光基導入NIP-NGs(比較例4)の溶液(PBS中、0.5mg/mL)を添加し、アミンカップリングによりナノ粒子の固定化を行った(25℃,1時間)。その後、未反応能活性エステルに対して1Mアミノエタノール水溶液(50μL)を滴下することで不活性化を行った(25℃,0.5時間)。最後にProtein free blocking buffer(50μL)を滴下し表面のブロッキングを行った(25℃,0.5時間)。なお、固定化前後での表面での蛍光強度を測定し、固定化後の基板で蛍光強度の増加が観察されたことから、粒子の固定を確認した。
作製したセンシング用基板のタンパク質の蛍光検出能について、自動液体ハンドリングロボット付き蛍光顕微鏡を用いて検討を行った。測定シーケンス条件は次の通りである。
蛍光顕微鏡
フィルタ: Cy5 対物レンズ:×5 露光時間:0.1秒
光量: 12% 光源:水銀ランプ
ROI:基板中心部3×5の15か所
自動分注装置のシークエンス
1.チップ取り付け
2.サンプル吸引 150μL
3.反応5分(25℃)
4.測定位置 keep 2→4の繰り返し
分析用センサ作製用基材(基板状)…10-C’,10a-C’
分析用センサ作製用基材(粒子状)…10-P’,10a-P’,10c-P’
分析用センサ作製用基材(粒子固定基板状)…10-PC’,10b-PC’
分析用センサ…10,101,10a,10b,10c
分析用センサ(基板状)…10-C,10a-C,10a1-C
分析用センサ(粒子状)…10-P,10a-P,10c-P
分析用センサ(粒子固定基板状)…10-PC,10b-PC
分子インプリントポリマー…20,20a,20b,20c
分子インプリント凹部…21,21c
標的に対する特異的結合性分子の結合用基…22’,22b’(チオール、ジスルフィド)
結合性基…22’’(ジスルフィド)
特異的結合性分子の結合用基及び重合性官能基を含むモノマー…M22
第1の可逆的連結基…22
シグナル物質の結合用基…23’,23b’
第2の可逆的連結基…23
重合性モノマー(シグナル物質の結合用基を与えるモノマー)…M231,M232
機能性基…24b
機能性基と標的に対する特異的結合性分子の結合用基とを有する機能性分子…R24(検出対象前記分子インプリント凹部の鋳型との)相互作用基…25
鋳型との相互作用基を含むモノマー…M25
結合性基…26b’’
第3の可逆的連結基26b
重合性官能基…27
重合性モノマー…M221
重合性モノマー(例えば化合物(5))…M222
重合性モノマー(例えば生体適合性モノマー)…M28
重合性モノマー(例えばアクリルアミドモノマー)…M29
基板…30
(基板上の)結合性基…BG1’
(標的に対する)特異的結合性基…42
(標的に対する)特異的結合性分子…R42
他のシグナル基…sg
他のシグナル基を有する特異的結合性基…421
シグナル基…43
シグナル物質…R43
シグナル基を有する特異的結合性基…44
鋳型…60,601,602,60c
(鋳型上の)相互作用部位…65c
(鋳型上の)結合性基…BG6’’,BG9’’BG22’’,BG23’’
(BG6’’,BG9’’,BG22’’,BG23’’に対応する)結合性基…BG6’,BG9’BG22’,BG23’
検出対象…70
標的…72
INI…重合開始性基
SAM…単分子膜
Claims (35)
- 検出対象の標的を受け入れる分子インプリント凹部と、
前記分子インプリント凹部内に設けられた、前記標的に対する結合性分子の結合用基とを有する分子インプリントポリマーを含み、
前記結合性分子の結合用基が小型物質に適合される基であり、
前記分子インプリント凹部が、前記小型物質に適合される形状または構成を有し、
ここで前記小型物質が10万以下の分子量を有する、
検出対象の分析用センサ作製用基材。 - 1個の前記分子インプリント凹部内に、複数の小型物質に適合される形状または構成を有し、前記1個の分子インプリント凹部内に、前記複数の小型物質に適合される基を有する、請求項1に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 検出対象の標的を受け入れる分子インプリント凹部と、
前記分子インプリント凹部内に設けられた、前記標的に対する結合性分子の結合用基とを有する分子インプリントポリマーを含み、
前記分子インプリント凹部が、小型物質に適合される形状または構成を有し、
ここで前記小型物質が10万以下の分子量を有する、
検出対象の分析用センサ作製用基材。 - 1個の前記分子インプリント凹部内に、複数の小型物質に適合される形状または構成を有する、請求項3に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 前記小型物質が45,000以下の分子量を有する、請求項1から4のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 前記分子インプリント凹部内に、更にシグナル物質の結合用基を有する、請求項1から5のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 前記分子インプリント凹部表面において、前記結合性分子の結合用基及び前記シグナル物質の結合用基が互いに独立している、請求項6に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 前記結合性分子の結合用基が、アミノ基、カルボキシ基、ボロン酸基、cis-ジオール基、アルデヒド基、ケトン基、オキシアミノ基、ヒドラジド基、ビオチン(ビオシチン、デ
スチオビオチン)基、ニッケル-ニトリロトリ酢酸由来基、チオ―ル基、およびピリジル
ジスルフィド基からなる群から選択される基である、請求項1~9のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。 - 前記結合性分子の結合用基が、ニッケル-ニトリロトリ酢酸由来基、チオ―ル基、およびピリジルジスルフィド基からなる群から選択される基である、請求項1~10のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 前記結合性分子の結合用基が、抗体のFcドメイン結合タンパク質、アビジン、ストレプトアビジン、ニュートラアビジン、請求項10に記載の結合用基を1つもしくは複数含むポリマー、デンドリマー、またはオリゴDNAを介して小型物質に適合される、請求項1~11のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 前記抗体のFcドメイン結合タンパク質が、プロテインA、プロテインG、プロテインL、またはプロテインA/Gである、請求項12に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 前記分子インプリント凹部内に、前記検出対象又は前記分子インプリント凹部の鋳型との相互作用基を更に有する、請求項1~13のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 前記結合性分子が、特異的結合性分子である、請求項1~14のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 前記特異的結合性分子が、抗体ミメティック、リン脂質結合性タンパク質、人工(高分子)レセプター及びレクチンからなる群から選択される、請求項15に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 前記検出対象が、膜構造を有する微小粒体である、請求項1~16のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 前記分子インプリント凹部の鋳型が粒子コアまたは生体分子である、請求項1~17のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 前記分子インプリント凹部の鋳型がシリカ粒子または血清タンパク質である、請求項1~18のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 前記分子インプリント凹部の鋳型が血清タンパク質であり、前記検出対象が膜構造を有する微小粒体であり、前記標的が前記微小粒体の表面に発現している分子である、請求項1~19のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 基板と、前記基板の表面上に設けられたポリマー膜と、を含み
前記分子インプリントポリマーが前記ポリマー膜を構成している、請求項1~20のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。 - 前記分子インプリントポリマーが粒子状である、請求項1~20のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 粒子状の前記分子インプリントポリマーが、基板上に固定されている、請求項22に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材。
- 請求項15または請求項15に直接もしくは間接的に従属する請求項16~23のいずれか1項に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材と、
前記特異的結合性分子の結合用基に結合した前記検出対象の標的に対する特異的結合性基とを含み、
前記特異的結合性基が小型物質基である、検出対象の分析用センサ。 - シグナル物質の結合用基に結合したシグナル基をさらに含む、請求項24に記載の検出対象の分析用センサ。
- 請求項24又は25に記載の検出対象の分析用センサに、検出対象を含む試料を接触させ、前記特異的結合性基に前記検出対象を結合する工程と、
前記特異的結合性基と前記検出対象との結合を検出する工程と、
を含む、検出対象の分析法。 - 基板に、検出対象の標的に対する結合性分子の結合用基と重合開始性基とを表面に有する単分子膜を形成する単分子膜形成工程(1-1)と、
前記結合性分子の結合用基に対し、第1の可逆的連結基を介して、鋳型を導入する工程(1-2)と、
重合性モノマーを加え、前記重合性モノマーを基質とし、前記重合開始性基を重合性開始剤として、前記鋳型の表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成することで前記基板表面にポリマー膜を形成する工程(1-3)と、
前記第1の可逆的連結基を開裂させて前記結合性分子の結合用基へ変換するとともに前記鋳型を除去する工程(1-4)と、
を含み、
前記結合性分子の結合用基が小型物質に適合される基であり、
分子インプリント凹部が、小型物質に適合される形状または構成を有し、
ここで前記小型物質が10万以下の分子量を有する、
検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。 - 前記鋳型の前記表面を、第2の可逆的連結基を介して重合性官能基で修飾する修飾工程を含み、
前記工程(1-3)において、前記重合性モノマー及び前記重合性官能基を基質とし、前記重合開始性基を重合性開始剤として、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成し、
前記工程(1-4)において、前記第1の可逆的連結基及び前記第2の可逆的連結基を開裂させてそれぞれ前記結合性分子の結合用基及びシグナル物質の結合用基へ変換するとともに前記鋳型を除去する、請求項27に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。 - 表面が、第1の可逆的連結基を介して重合性官能基で修飾された、分子インプリントの鋳型を用意する工程(1-11)と、
前記重合性官能基を基質とし、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成する工程(1-12)と、
前記第1の可逆的連結基を開裂させて前記分子インプリントポリマーから前記鋳型を除去し、結合性分子の結合用基を生じる工程(1-13)と、を含み、
前記結合性分子の結合用基が小型物質に適合される基であり、
分子インプリント凹部が、小型物質に適合される形状または構成を有し、
ここで前記小型物質が10万以下の分子量を有する、
検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。 - 表面が第3の可逆的連結基を介して重合性官能基で修飾された、分子インプリントの鋳型を用意する工程(1-21)と、
前記重合性官能基を基質とし、前記鋳型の前記表面の一部に対する分子インプリントポリマーを合成する工程(1-22)と、
前記第3の可逆的連結基を開裂させて前記分子インプリントポリマーから前記鋳型を除去する工程(1-23)と、
検出対象の標的に対する結合性分子の結合用基及びシグナル物質の結合用基を含む機能性基を有する分子を、第3の可逆的連結基を介して導入する工程(1-24)と、を含み、
前記結合性分子の結合用基が小型物質に適合される基であり、
分子インプリント凹部が、小型物質に適合される形状または構成を有し、
ここで前記小型物質が10万以下の分子量を有する、
検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。 - 前記工程(1-22)において、前記鋳型との相互作用基を含むモノマーをさらに前記基質とする、請求項30に記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
- 前記小型物質が45,000以下の分子量を有する、請求項27~31のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
- 前記結合性分子が、特異的結合性分子である、請求項20~24のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法。
- 請求項27~33のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法を行う工程(1)と、
前記結合性分子の結合用基に、前記結合性分子を結合する工程(2)と、を含む、検出対象の分析用センサの製造方法。 - 請求項28、30及び31のいずれかに記載の検出対象の分析用センサ作製用基材の製造方法を行う工程(1)と、
前記結合性分子の結合用基に、前記結合性分子を結合する工程(2)と、
シグナル物質結合用基にシグナル物質を結合する工程(3)を含む、検出対象の分析用センサの製造方法。
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