JP6970647B2 - シミアン（ゴリラ）アデノウイルス又はアデノウイルスベクター、及び使用方法 - Google Patents

シミアン（ゴリラ）アデノウイルス又はアデノウイルスベクター、及び使用方法 Download PDF

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Description

関連出願の相互参照
本特許出願は、２０１１年１０月５日出願の米国仮特許出願第６１／５４３，６６１号（参照により組み込まれる）の利益を主張する。
電子提出された物件の参照による組み込み
本明細書と同時に提出される以下：４１５，７４８バイトのＡＳＣＩＩ（テキスト）ファイル１件、名称「７１１２５０ＳｅｑｕｅｎｃｅＬｉｓｔｉｎｇ＿ＳＴ２５．ＴＸＴ，」２０１２年１０月５日作成と特定される、コンピューターで読み取り可能なヌクレオチド／アミノ酸の配列表が本明細書中、参照によりその全体が組み込まれる。
発明の背景
生物学上適切な形状及び量におけるｉｎ ｖｉｖｏでのタンパク質送達は、数十年にわたり薬物及びワクチン開発の障害となっている。従来のタンパク質送達の取り組みに対して成功を収めた代替手段であるとすでに証明された一つの解決策は、ｉｎ ｖｉｖｏでのタンパク質産生のために外来核酸配列を送達することである。遺伝子導入ベクターは、多種多様な細胞型に入り、大きな核酸配列を許容する容量を有し、安全であり、かつ患者を治療するために必要な量を生み出し得ることが理想である。ウイルスベクターは、これらの有利な特性を伴う遺伝子導入ベクターである（例えば、Ｔｈｏｍａｓら，Ｎａｔｕｒｅ
Ｒｅｖｉｅｗ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，４：３４６−３５８（２００３）を参照）。その上、多くのウイルスベクターは多様な細胞型に感染できるよう改変される一方、ウイルスベクターは特定の細胞型を標的とするようにも変更され得、それによりベクターの治療効果が増強され得る（例えば、Ｋａｙら，Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，７（１）：３３−４０（２００１）を参照）。
治療を目的として哺乳類細胞への外来タンパク質の送達のために使用されており、成功した例のあるウイルスベクターとしては、例えば、レトロウイルス（例えばＣａｖａｚｚａｎａ−Ｃａｌｖｏら，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２８８（５４６６）：６６９−６７２（２０００）を参照）、レンチウイルス（例えばＣａｒｔｉｅｒら，Ｓｃｉｅｎｃｅ，３２６：８１８−８２３（２００９）を参照）、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）（例えばＭｅａｓｅら，Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｒｈｅｕｍａｔｏｌｏｇｙ，２７（４）：６９２−７０３（２０１０）を参照）、単純ヘルペスウイルス（ＨＳＶ）（例えばＧｏｉｎｓら，Ｇｅｎｅ
Ｔｈｅｒ．，１６（４）：５５８−５６９（２００９）を参照）、ワクシニアウイルス（例えばＭａｙｒｈｏｆｅｒら，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，８３（１０）：５１９２−５２０３（２００９）を参照）、及びアデノウイルス（例えばＬａｓａｒｏ ａｎｄ Ｅｒｔｌ，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｔｈｅｒａｐｙ，１７（８）：１３３３−１３３９（２００９）を参照）が挙げられる。
その有利な特性にも関わらず、いくつかの要因によりウイルスの遺伝子導入ベクターは広範な使用を妨げられている。これに関して、ある種の細胞は現在利用可能なウイルスベクターによる遺伝子の送達を容易には受け入れない。例えば、リンパ球はアデノウイルスの取り込みを妨げられている（Ｓｉｌｖｅｒら，Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，１６５：３７７−３８７（１９８８）、及びＨｏｒｖａｔｈら，Ｊ．Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，６２（１）：３４１−３４５（１９８８））。加えて、宿主細胞のゲノムに組み込まれるウイルスベクター（例えばレトロウイルスベクター）は、がん遺伝子への挿入変異の原因となる可能性を有す
る（例えばＣａｖａｚｚａｎａ−Ｃａｌｖｏら，上記、及びＨａｃｅｉｎ−Ｂｅｙ−Ａｂｉｎａら，Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．，３４８：２５５−２５６（２００３）を参照）。
ウイルスベクターの免疫原性もまた、遺伝子導入のためのウイルスベクター使用の妨げとなっている。アメリカ合衆国民の大多数が、遺伝子導入ベクターとして現在開発中の多くのウイルス（例えばアデノウイルス）の野生型形状に曝露された経験がある。結果として、多くのアメリカ合衆国民は、ある種のウイルスをベースとした遺伝子導入ベクターに対する既存の免疫（ｐｒｅ−ｅｘｉｓｔｉｎｇ ｉｍｍｕｎｉｔｙ）を獲得している。かかるベクターは、血流から速やかに除去され、それにより、生物学的に適切な量の遺伝子産物を送達するということへのベクターの有効性が低下する。さらに、ある種のウイルスベクターの免疫原性は効果的な繰り返し投与（ウイルスベクターがワクチン応用に使用された場合に、病原体に対する免疫系の「促進（ｂｏｏｓｔｉｎｇ）」に有効であり得る）を阻み、それにより、ウイルスベクターの投与量のごく一部のみが宿主細胞へその積荷を送達する結果となる。
従って、ｉｎ ｖｉｖｏで哺乳類細胞への効率的な遺伝子送達のために使用され得る、改良されたウイルスベクターに対するニーズが残っている。本発明は、かかるウイルスベクターを提供する。
発明の簡単な要旨
本発明は、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターを提供する。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、（ａ）配列番号１に対して少なくとも９７％同一である核酸配列、（ｂ）配列番号２に対して少なくとも９７．５％同一である核酸配列、（ｃ）配列番号３に対して少なくとも８０％同一である核酸配列、（ｄ）配列番号４に対して少なくとも９６％同一である核酸配列、及び（ｅ）配列番号５に対して少なくとも９６％同一である核酸配列、からなる群より選択される１つ以上の核酸配列を含む。
本発明は、（ａ）配列番号６に対して少なくとも９８．４％同一である核酸配列、（ｂ）配列番号７に対して少なくとも９９．０１％同一である核酸配列、（ｃ）配列番号８に対して少なくとも９７．０８％同一である核酸配列、（ｄ）配列番号９に対して少なくとも９６．５２％同一である核酸配列、及び（ｅ）配列番号１０に対して少なくとも９８．４９％同一である核酸配列、からなる群より選択される１つ以上の核酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクターを提供する。
本発明は、（ａ）配列番号６の少なくとも１２１個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、（ｂ）配列番号７の少なくとも４６２個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、（ｃ）配列番号８の少なくとも２３４個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、（ｄ）配列番号９の少なくとも６０６個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、及び（ｅ）配列番号１０の少なくとも１８８個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、からなる群より選択される１つ以上の核酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクターを提供する。
本発明は、（ａ）配列番号１１に対して少なくとも９３％同一であるアミノ酸配列、（ｂ）配列番号１３に対して少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列、（ｃ）配列番号１４に対して少なくとも９２％同一であるアミノ酸配列、及び（ｄ）配列番号１５に対して少なくとも８８％同一であるアミノ酸配列、からなる群より選択される１つ以上のアミノ
酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクターを提供する。
本発明は、（ａ）配列番号１１に対して少なくとも９３％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、（ｂ）配列番号１２に対して少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、（ｃ）配列番号１３に対して少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、（ｄ）配列番号１４に対して少なくとも９２％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、及び（ｅ）配列番号１５に対して少なくとも８８％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、からなる群より選択される１つ以上の核酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクターを提供する。
本発明は、（ａ）配列番号１６に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列、（ｂ）配列番号１８に対して少なくとも９７．８％同一であるアミノ酸配列、（ｃ）配列番号１９に対して少なくとも９９．１％同一であるアミノ酸配列、及び（ｄ）配列番号２０に対して少なくとも９９．２％同一であるアミノ酸配列、からなる群より選択される１つ以上のアミノ酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクターを提供する。
本発明は、（ａ）配列番号１６に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、（ｂ）配列番号１７に対して少なくとも９９．５％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、（ｃ）配列番号１８に対して少なくとも９７．８％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、（ｄ）配列番号１９に対して少なくとも９９．１％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、及び（ｅ）配列番号２０に対して少なくとも９９．２％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、からなる群より選択される１つ以上の核酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクターを提供する。
本発明は、（ａ）配列番号１６の少なくとも８９個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、（ｂ）配列番号１８の少なくとも２４７個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、（ｃ）配列番号１９の少なくとも２３０個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、及び（ｄ）配列番号２０の少なくとも２３１個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、からなる群より選択される１つ以上のアミノ酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクターを提供する。
本発明は、（ａ）配列番号１６の少なくとも８９個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列、（ｂ）配列番号１７の少なくとも２８６個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列、（ｃ）配列番号１８の少なくとも２４７個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列、（ｄ）配列番号１９の少なくとも２３０個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列、及び（ｅ）配列番号２０の少なくとも２３１個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列、からなる群より選択される１つ以上の核酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクターを提供する。
発明の詳細な説明
アデノウイルスは一般にヒトにおける良性の病状と関連しており、ヒトを含む様々な種から単離されたアデノウイルスのゲノムが、広く研究されている。アデノウイルスは、中程度の大きさ（９０〜１００ｎｍ）であり、約３６ｋｂの２本鎖ＤＮＡを含みエンベロープを持たない正二十面体のウイルスである。アデノウイルスのカプシドは、ウイルスによる細胞への感染の初期段階における重要な相互作用を媒介し、アデノウイルス生活環の終わりにアデノウイルスゲノムをパッケージングするために必要である。カプシドは、２４０のヘキソン、１２のペントン基部タンパク質及び１２のファイバーを含む、２５２のカ
プソメアを含む（Ｇｉｎｓｂｅｒｇら，Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，２８：７８２−８３（１９６６））。ヘキソンは、３つの同一タンパク質すなわちポリペプチドＩＩ（ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ ＩＩ）を含む（Ｒｏｂｅｒｔｓら，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２３２：１１４８−５１（１９８６））。ペントン基部は５つの同一タンパク質を含み、ファイバーは３つの同一タンパク質を含む。タンパク質ＩＩＩａ、ＶＩ及びＩＸは、アデノウイルスのコートに存在し、ウイルスのカプシドを安定化させると考えられている（Ｓｔｅｗａｒｔら，Ｃｅｌｌ，６７：１４５−５４（１９９１）、及びＳｔｅｗａｒｔら，ＥＭＢＯＪ．，１２（７）：２５８９−９９（１９９３））。ｐＩＸを別としてカプシドタンパク質の発現は、アデノウイルスポリメラーゼタンパク質に依存している。従って、ポリメラーゼタンパク質遺伝子が存在し発現している場合のみ、アデノウイルス粒子の主要な構成要素がゲノムから発現する。
アデノウイルスはそのいくつかの特徴により、治療用途で遺伝物質を細胞へ移入させるための（すなわち、「遺伝子治療」）、又はワクチン応用において抗原送達システムとして使用するための、理想的な運搬体となる。例えば、アデノウイルスは、高い力価で生み出され得（例えば約１０１３粒子単位（ｐａｒｔｉｃｌｅ ｕｎｉｔｓ（ｐｕ）））、非複製細胞及び複製細胞に対して遺伝物質を移入し得る。アデノウイルスゲノムは、大量の外来ＤＮＡ（最大で約８ｋｂまで）を運ぶよう操作され得、アデノウイルスのカプシドは、より長い配列でさえ移入を促進し得る（Ｃｕｒｉｅｌら，Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ．，３：１４７−１５４（１９９２））。加えて、アデノウイルスは一般に宿主細胞の染色体へ組み込まれず、線状エピソームとして維持され、それによって組換えアデノウイルスが正常な細胞機能を妨害するであろう可能性を最小限にする。
本発明は、少なくとも部分的には、これまでに同定又は単離されていないアデノウイルスの発見及び単離に基礎を置いている。本明細書に記載のアデノウイルスは、ゴリラから単離された。ヒガシゴリラ（Ｇｏｒｉｌｌａ ｂｅｒｉｎｇｅｉ）及びニシゴリラ（Ｇｏｒｉｌｌａ ｇｏｒｉｌｌａ）の２つの種の中に、４種の広く認識されたゴリラの亜種がある。ニシゴリラ種には、ニシローランドゴリラ亜種（Ｇｏｒｉｌｌａ ｇｏｒｉｌｌａ
ｇｏｒｉｌｌａ）及びクロスリバーゴリラ亜種（Ｇｏｒｉｌｌａ ｇｏｒｉｌｌａ ｄｉｅｈｌｉ）が含まれる。ヒガシゴリラ種には、マウンテンゴリラ亜種（Ｇｏｒｉｌｌａ
ｂｅｒｉｎｇｅｉ ｂｅｒｉｎｇｅｉ）及びヒガシローランドゴリラ亜種（Ｇｏｒｉｌｌａ ｂｅｒｉｎｇｅｉ ｇｒａｕｅｒｉ）が含まれる（例えばＷｉｌｓｏｎ ａｎｄ Ｒｅｅｄｅｒ編，Ｍａｍｍａｌｉａｎ Ｓｐｅｃｉｅｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｗｏｒｌｄ，第３版，Ｊｏｈｎｓ Ｈｏｐｋｉｎｓ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｂａｌｔｉｍｏｒｅ，Ｍａｒｙｌａｎｄ（２００５）を参照）。本発明のアデノウイルスは、ヒガシローランドゴリラ（Ｇｏｒｉｌｌａ ｂｅｒｉｎｇｅｉ ｇｒａｕｅｒｉ）より単離された。
いくつかのかかるアデノウイルスゲノムは分析されており、例えば、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、配列番号２４、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７又は配列番号２８の核酸配列（そのそれぞれがアデノウイルスを独自に定義づける働きのあるいくつかの部分配列（すなわち核酸配列の配列番号１〜１０及びアミノ酸配列の配列番号１１〜２０）を含む）をアデノウイルスが有し得ることが決定されている。配列番号６〜１０は、それぞれ配列番号１６〜２０のアミノ酸配列をコードする。配列番号１〜５は、それぞれ配列番号６〜１０の核酸配列の部分である。配列番号１１〜１５は、それぞれ配列番号１６〜２０のアミノ酸配列の部分である。
アデノウイルスは、アデノウイルスベクター（例えば遺伝子送達運搬体）として使用され既に公知であるアデノウイルスと同様の方法で変更され得る。
本明細書で使用する用語「アデノウイルス」は、アデノウイルスの生活環をもつ（ｐａｒｔｉｃｉｐａｔｅ ｉｎ）能力を保持し、かつ、例えば破壊（例えば超音波処理）、変性（例えば熱又は溶剤を用いて）又は架橋（例えばホルマリン架橋を介して）により物理的に不活性化されていないアデノウイルスを指す。「アデノウイルスの生活環」は、（１）ウイルスの結合及び細胞への侵入、（２）アデノウイルスゲノムの転写及びアデノウイルスタンパク質の翻訳、（３）アデノウイルスゲノムの複製、及び（４）ウイルス粒子の組立てを含む（例えばＦｉｅｌｄｓ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，第５版，Ｋｎｉｐｅら（編），Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ Ｗｉｌｌｉａｍｓ＆Ｗｉｌｋｉｎｓ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，ＰＡ（２００６）を参照）。
本明細書で使用する用語「アデノウイルスベクター」は、そのアデノウイルスゲノムがアデノウイルスゲノムに関して非天然である核酸配列を収容するよう操作されているアデノウイルスを指す。典型的には、例えば遺伝子導入のため非天然の核酸配列の挿入をアデノウイルスに収容するために、アデノウイルスのアデノウイルスゲノムに１つ以上の変異（例えば欠失、挿入又は置換）を導入することによりアデノウイルスベクターは作製される。
アデノウイルス及びアデノウイルスベクターは、複製可能、条件付きで複製可能又は複製欠損であり得る。
複製可能なアデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、典型的な宿主細胞（すなわち、アデノウイルスによって典型的に感染され得る細胞）において複製し得る。複製可能なアデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、野生型アデノウイルスと比較して１つ以上の変異（例えば、１つ以上の欠失、挿入及び／又は置換）（宿主細胞でのウイルスの複製を阻害しない）をアデノウイルスゲノムに有し得る。例えば、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、Ｅ３領域（アデノウイルスゲノム又はアデノウイルスの増殖に必須ではない）として知られるアデノウイルス初期領域の部分的又は全体的な欠失を有し得る。
条件付きで複製するアデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、事前に決められた条件下で複製するように改変されたアデノウイルス又はアデノウイルスベクターである。例えば、複製に必須な遺伝子機能（例えばアデノウイルス初期領域によってコードされる遺伝子機能）は、誘導可能な、抑制可能な又は組織特異的な転写制御配列（例えばプロモーター）と操作可能に連結され得る。かかる実施形態において、転写制御配列と相互作用する特定の因子が存在すること又は存在しないことが複製に必要となる。条件付きで複製するアデノウイルスベクターは、米国特許第５，９９８，２０５号にさらに記載されている。
複製欠損アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、典型的な宿主細胞（特にアデノウイルス又はアデノウイルスベクターに感染されたヒトの宿主細胞）においてアデノウイルス又はアデノウイルスベクターが複製しないような、例えば１つ以上の複製に必須な遺伝子機能又は領域の欠損の結果、１つ以上の複製に必要なアデノウイルスゲノムの遺伝子機能又は領域の補完を必要とするアデノウイルス又はアデノウイルスベクターである。
本明細書で使用される遺伝子機能又はゲノム領域の欠損とは、全体又は部分的にその核酸配列が破壊された（例えば欠失した）遺伝子の機能を妨げ又は消失させるために十分な（例えば、遺伝子産物の機能が少なくとも約２倍、５倍、１０倍、２０倍、３０倍又は５０倍減少するような）アデノウイルスゲノムの遺伝物質の破壊（例えば欠失）として定義される。多くの場合、遺伝子領域全体の欠失は、複製に必須な遺伝子機能の破壊に必要ではない。しかしながら、１つ以上の導入遺伝子のために十分なスペースをアデノウイルス
ゲノム中に提供する目的のためには、１つ以上の遺伝子領域の大部分の除去が望ましいかもしれない。遺伝物質の欠失が好ましい一方、付加又は置換による遺伝物質の変異もまた、遺伝子機能の破壊に適している。複製に必須な遺伝子機能とは、アデノウイルスの複製（例えば増殖）に必要であるそれらの遺伝子機能であり、例えば、アデノウイルス初期領域（例えばＥ１、Ｅ２及びＥ４領域）、後期領域（例えばＬ１、Ｌ２、Ｌ３、Ｌ４及びＬ５領域）、ウイルスのパッケージングに関与する遺伝子（例えばＩＶａ２遺伝子）、及びウイルス関連ＲＮＡ（例えばＶＡ−ＲＮＡ−１及び／又はＶＡ−ＲＮＡ−２）によってコードされる。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターが複製可能又は複製欠損であるかに関わらず、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは少なくともアデノウイルスゲノムの一部分を保持する。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、タンパク質コード領域又は非タンパク質コード領域を含む、アデノウイルスゲノムの任意の部分を含み得る。望ましくは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、アデノウイルスタンパク質をコードする少なくとも一つの核酸配列を含む。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、例えば、初期領域遺伝子（すなわち、Ｅ１Ａ、Ｅ１Ｂ、Ｅ２Ａ、Ｅ２Ｂ、Ｅ３及び／又はＥ４領域）のいずれか１つがコードするタンパク質、又はウイルスの構造タンパク質をコードする後期領域遺伝子（すなわち、Ｌ１、Ｌ２、Ｌ３、Ｌ４及びＬ５領域）のいずれか１つがコードするタンパク質などの任意の適切なアデノウイルスタンパク質をコードする核酸配列を含み得る。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、ｐＩＸタンパク質、ＤＮＡポリメラーゼタンパク質、ペントンタンパク質、ヘキソンタンパク質及び／又はファイバータンパク質をコードする１つ以上の核酸配列を含むことが望ましい。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、アデノウイルスタンパク質の完全長アミノ酸配列をコードする完全長核酸配列を含み得る。あるいは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、アデノウイルスタンパク質の完全長アミノ酸配列の一部分をコードする完全長核酸配列の一部分を含み得る。
核酸配列の一「部分」は、少なくとも１０個のヌクレオチド（例えば、約１０個から約５０００個のヌクレオチド）を含む。好ましくは、核酸配列の一「部分」は、１０個以上（例えば１５個以上、２０個以上、２５個以上、３０個以上、３５個以上、４０個以上、４５個以上、５０個以上又は１００個以上）のヌクレオチドであるが、５，０００個未満（例えば４９００個以下、４０００個以下、３０００個以下、２０００個以下、１０００個以下、８００個以下、５００個以下、３００個以下又は１００個以下）のヌクレオチドを含む。好ましくは、核酸配列の一部分は、約１０個から約３５００個のヌクレオチド（例えば、約１０個、２０個、３０個、５０個、１００個、３００個、５００個、７００個、１０００個、１５００個、２０００個、２５００個又は３０００個のヌクレオチド）、約１０個から約１０００個のヌクレオチド（例えば、約２５個、５５個、１２５個、３２５個、５２５個、７２５個又は９２５個のヌクレオチド）若しくは約１０個から約５００個のヌクレオチド（例えば、約１５個、３０個、４０個、５０個、６０個、７０個、８０個、９０個、１５０個、１７５個、２５０個、２７５個、３５０個、３７５個、４５０個、４７５個、４８０個、４９０個、４９５個又は４９９個のヌクレオチド）、又は前述の値のうち任意の２種により決められる範囲である。より好ましくは、核酸配列の一「部分」は約３２００個以下のヌクレオチド（例えば、約１０個から約３２００個のヌクレオチド、約１０個から約３０００個のヌクレオチド、若しくは約３０個から約５００個のヌクレオチド、又は前述の値のうち任意の２種により決められる範囲）を含む。
アミノ酸配列の一「部分」は、少なくとも３個のアミノ酸（例えば、約３個から約１２００個のアミノ酸）を含む。好ましくはアミノ酸配列の一「部分」は、３個以上（例えば
、５個以上、１０個以上、１５個以上、２０個以上、２５個以上、３０個以上、４０個以上又は５０個以上）のアミノ酸であるが、１２００個未満（例えば１，０００個以下、８００個以下、７００個以下、６００個以下、５００個以下、４００個以下、３００個以下、２００個以下又は１００個以下）のアミノ酸を含む。好ましくは、アミノ酸配列の一部分は、約３個から約５００個のアミノ酸（例えば約１０個、１００個、２００個、３００個、４００個又は５００個のアミノ酸）、約３個から約３００個のアミノ酸（例えば約２０個、５０個、７５個、９５個、１５０個、１７５個又は２００個のアミノ酸）、若しくは約３個から約１００個のアミノ酸（例えば、約１５個、２５個、３５個、４０個、４５個、６０個、６５個、７０個、８０個、８５個、９０個、９５個又は９９個のアミノ酸）、又は前述の値のうち任意の２種により決められる範囲である。より好ましくは、アミノ酸配列の一「部分」は、約５００個以下のアミノ酸（例えば約３個から約４００個のアミノ酸、約１０個から約２５０個のアミノ酸若しくは約５０個から約１００個のアミノ酸又は前述の値のうち任意の２種により決められる範囲）を含む。
アデノウイルスｐＩＸタンパク質は、アデノウイルスカプシドに存在し、ヘキソン９量体相互作用を強化することが示されており、完全長ゲノムのパッケージングに必須である（例えば、Ｂｏｕｌａｎｇｅｒら，Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．，４４：７８３−８００（１９７９）；Ｈｏｒｗｉｔｚ Ｍ．Ｓ．，“Ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ”ｉｎ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，第二版，Ｂ．Ｎ．Ｆｉｅｌｄｓら（編），Ｒａｖｅｎ Ｐｒｅｓｓ，Ｌｔｄ．，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ｐｐ．１６７９−１７２１（１９９０）、Ｇｈｏｓｈ−Ｃｈｏｕｄｈｕｒｙら，ＥＭＢＯ Ｊ．，６：１７３３−１７３９（１９８７）及びｖａｎ Ｏｏｓｔｒｕｍら，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，５６：４３９−４４８（１９８５）を参照）。アデノウイルス構造への寄与に加えて、アデノウイルス主要後期プロモーター（ＭＬＰ）活性を刺激することなど、ｐＩＸは転写特性を示すことが示されている（例えばＬｕｔｚら，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，７１（７）：５１０２−５１０９（１９９７）を参照）。アデノウイルスｐＩＸタンパク質の全体又は一部分をコードする核酸配列としては、例えば、配列番号６及び配列番号１が挙げられる。完全長ｐＩＸタンパク質又はその一部分を含むアミノ酸配列としては、例えば、配列番号１６及び配列番号１１が挙げられる。
アデノウイルスＤＮＡポリメラーゼタンパク質は、ｉｎ ｖｉｔｒｏ及びｉｎ ｖｉｖｏの両方においてウイルスＤＮＡの複製に必須である。ポリメラーゼは、アデノウイルスＤＮＡの５’末端に共有結合している末端タンパク質（ＴＰ）の前駆体（ｐＴＰ）との複合体として共精製される（Ｆｉｅｌｄら，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２５９：９４８７−９４９５（１９８４））。アデノウイルスＤＮＡポリメラーゼ及びｐＴＰの両方は、Ｅ２領域によりコードされる。ポリメラーゼタンパク質は、ｐＩＸを除く全ての構造タンパク質の発現に必要である。ポリメラーゼタンパク質の遺伝子配列なしでは、ポリメラーゼタンパク質は産生されない。結果として、ウイルスゲノムは複製されず、主要後期プロモーターは活性化されず、カプシドタンパク質は発現しない。アデノウイルスＤＮＡポリメラーゼタンパク質の全体又は一部分をコードする核酸配列としては、例えば、配列番号７が挙げられる。配列番号２は、配列番号７の部分である。完全長アデノウイルスＤＮＡポリメラーゼ又はその一部分を含むアミノ酸配列としては、例えば、配列番号１７及び配列番号１２が挙げられる。
アデノウイルスヘキソンタンパク質は、アデノウイルスカプシドにおいて最も大きくかつ最も豊富なタンパク質である。ヘキソンタンパク質は、ウイルスカプシドの組立て、カプシドの正二十面体の対称性の決定（これによりカプシドの体積及びＤＮＡのパッケージングの大きさの限界が決まる）、及びカプシドの完全性に必須である。さらに、ヘキソンは、アデノウイルスベクターの中和を減少させるよう変更するための第一標的である（例えばＧａｌｌら，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，７２：１０２６０−２６４（１９９８）及びＲｕｘ
ら，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，７７（１７）：９５５３−９５６６（２００３）を参照）。ヘキソンタンパク質の主要な構造的特徴は血清型を超えてアデノウイルス間で共有されるが、ヘキソンタンパク質は血清型間で大きさ及び免疫学的特性が異なる（Ｊｏｒｎｖａｌｌら，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２５６（１２）：６１８１−６１８６（１９８１））。１５種類のアデノウイルスヘキソンタンパク質の比較によって、ヘキソンの主たる抗原性領域及び血清型特異的な領域はループ１及びループ２（すなわち、それぞれＬＩ又はｌ１、及びＬＩＩ又はｌ２）にあるようであり、その中にアデノウイルス血清型間で長さ及び配列の異なる７つの別々の超可変領域（ＨＶＲ１からＨＶＲ７）があることが明らかとなった（Ｃｒａｗｆｏｒｄ−Ｍｉｋｓｚａら，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，７０（３）：１８３６−１８４４（１９９６））。全体又は一部分のアデノウイルスヘキソンタンパク質をコードする核酸配列としては、例えば、配列番号９及び配列番号４が挙げられる。完全長アデノウイルスヘキソンタンパク質又はその一部分を含むアミノ酸配列としては、例えば、配列番号１９及び配列番号１４が挙げられる。
アデノウイルスファイバータンパク質は、尾部（ｔａｉｌ）、軸部（ｓｈａｆｔ）及びノブ（ｋｎｏｂ）の三つのドメインを有するアデノウイルスポリペプチドＩＶのホモトリマーである（Ｄｅｖａｕｘら，Ｊ．Ｍｏｌｅｃ．Ｂｉｏｌ．，２１５：５６７−８８（１９９０）、Ｙｅｈら，Ｖｉｒｕｓ Ｒｅｓ．，３３：１７９−９８（１９９１））。ファイバータンパク質は、ノブ及び軸部ドメインを介して細胞表面の受容体に対する最初のウイルスの結合を媒介する（Ｈｅｎｒｙら，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，６８（８）：５２３９−４６（１９９４））。三量体化のためのアミノ酸配列はノブに位置しており、それはファイバーのアミノ末端（尾部）がペントン基部と適切に結合するために必要なようである（Ｎｏｖｅｌｌｉら，Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，１８５：３６５−７６（１９９１））。細胞受容体の認識及びペントン基部への結合に加え、ファイバーは血清型同一性の一因となる。異なるアデノウイルス血清型由来のファイバータンパク質は、大幅に異なる（例えばＧｒｅｅｎら，ＥＭＢＯ Ｊ．，２：１３５７−６５（１９８３）、Ｃｈｒｏｂｏｃｚｅｋら，Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，１８６：２８０−８５（１９９２）、及びＳｉｇｎａｓら，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，５３：６７２−７８（１９８５）を参照）。このように、ファイバータンパク質は、アデノウイルスの生活環に重要となる複数の機能を有する。アデノウイルスファイバータンパク質の全体又は一部分をコードする核酸配列としては、例えば、配列番号１０が挙げられる。配列番号５は、配列番号１０の部分である。完全長アデノウイルスファイバータンパク質又はその一部分を含むアミノ酸配列としては、例えば、配列番号２０及び配列番号１５が挙げられる。
アデノウイルスペントン基部タンパク質は、正二十面体のカプシドの頂点に位置し、５つの同一の単量体を含む。ペントン基部タンパク質は、正二十面体のカプシドの複数の切子面（ｆａｃｅｔ）においてヘキソンタンパク質を架橋するための構造を提供し、ファイバータンパク質がカプシドに組み込まれるのに必須な接合部分を提供する。ペントン基部のそれぞれの単量体は、ＲＧＤトリペプチドモチーフを含む（Ｎｅｕｍａｎｎら，Ｇｅｎｅ，６９：１５３−１５７（１９８８））。ＲＧＤトリペプチドはαｖインテグリンとの結合を媒介し、ペントン基部のＲＧＤ配列に点変異を有するアデノウイルスは、細胞に感染する能力が制限される（Ｂａｉら，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，６７：５１９８−５２０５（１９９３））。従って、ペントン基部タンパク質は、カプシドの構築及びウイルスと細胞の相互作用の最大限の効率を得るために必須である。アデノウイルスペントン基部タンパク質の全体又はその一部分をコードする核酸配列としては、例えば、配列番号８及び配列番号３が挙げられる。完全長アデノウイルスペントン基部タンパク質又はその一部分を含むアミノ酸配列としては、例えば、配列番号１８及び配列番号１３が挙げられる。
本明細書に記載の核酸又はアミノ酸配列の「同一性」は、関心の核酸又はアミノ酸配列と、参照の核酸又はアミノ酸配列との比較により決定され得る。参照配列において、関心
配列となるように変更及び／又は改変（ｍｏｄｉｆｉｅｄ）されている（例えば点変異、挿入又は欠失などによって）ヌクレオチド又はアミノ酸残基の数を数える。かかる変更の総数を関心配列の全長から差し引き、その差を関心配列の長さで割り、百分率として表す。二つ以上の配列間での最適なアラインメント取得及び同一性計算のためのいくつかの数学的アルゴリズムは、公知であり、いくつかの利用可能なソフトウエアプログラムに組み込まれている。かかるプログラムの例としては、ＣＬＵＳＴＡＬ−Ｗ、Ｔ−Ｃｏｆｆｅｅ及びＡＬＩＧＮ（核酸及びアミノ酸配列のアラインメントのため）、ＢＬＡＳＴプログラム（例えばＢＬＡＳＴ ２．１、ＢＬ２ＳＥＱ及びそれらの後のバージョン）及びＦＡＳＴＡプログラム（例えばＦＡＳＴＡ３ｘ、ＦＡＳＴＭ及びＳＳＥＡＲＣＨ）（配列のアラインメント及び配列相同性検索のため）などが挙げられる。配列のアラインメントのアルゴリズムは、例えば、Ａｌｔｓｃｈｕｌら，Ｊ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌ．，２１５（３）：４０３−４１０（１９９０）、Ｂｅｉｇｅｒｔら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，１０６（１０）：３７７０−３７７５（２００９）、Ｄｕｒｂｉｎら編，Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ：Ｐｒｏｂａｌｉｓｔｉｃ Ｍｏｄｅｌｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ａｎｄ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ，Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ，ＵＫ（２００９）、Ｓｏｄｉｎｇ，Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ，２１（７）：９５１−９６０（２００５）、Ａｌｔｓｃｈｕｌら，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，２５（１７）：３３８９−３４０２（１９９７）、及びＧｕｓｆｉｅｌｄ，Ａｌｇｏｒｉｔｈｍｓ ｏｎ Ｓｔｒｉｎｇｓ，Ｔｒｅｅｓ ａｎｄ Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ，Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ ＵＫ（１９９７））にも開示されている。
一実施形態において、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、以下の核酸配列を１つ以上含む：（ａ）配列番号１に対して少なくとも９７％同一である（例えば、少なくとも９８．２０％、少なくとも９９．４１％又は１００％同一である）核酸配列、（ｂ）配列番号２に対して少なくとも９７．５％同一である（例えば、少なくとも９８．５％、少なくとも９９．５％又は１００％同一である）核酸配列、（ｃ）配列番号３に対して少なくとも８０％同一である（例えば、少なくとも８２．２２％、少なくとも８４．４４％、少なくとも８６．６７％、少なくとも８８．８９％、少なくとも９１．１１％、少なくとも９３．３３％、少なくとも９５．５６％、少なくとも９７．７８％又は１００％同一である）核酸配列、（ｄ）配列番号４に対して少なくとも９６％同一である（例えば、少なくとも９６．９％、少なくとも９７．８％、少なくとも９８．７％、少なくとも９９．６％又は１００％同一である）核酸配列、及び（ｅ）配列番号５に対して少なくとも９６％同一である（例えば、少なくとも９６．８３％又は１００％同一である）核酸配列。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、前述の配列のうち１種、２種、３種、４種又は全５種を、単独又は任意の組み合わせで含み得る。これに関して、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、前述の配列のうち任意の２種を任意の組み合わせで、前述の配列のうち任意の３種を任意の組み合わせで、前述の配列のうち任意の４種を任意の組み合わせで、又は前述の配列のうち全５種を含み得る。例えば、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１に対して少なくとも９７％同一である核酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号２に対して少なくとも９７．５％同一である核酸配列、及び配列番号３に対して少なくとも８０％同一である核酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１に対して少なくとも９７％同一である核酸配列、配列番号３に対して少なくとも８０％同一である核酸配列、及び配列番号５に対して少なくとも９６％同一である核酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、（ａ）配列番号１の核酸配列、（ｂ）配列番号２の核酸配列、（ｃ）配列番号３の核酸配列、（ｄ）配列番号４の核酸配列、又は（ｅ）配列番号５の核酸配列、を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクター
は、（ａ）配列番号１に対して少なくとも９７％同一である核酸配列、（ｂ）配列番号２に対して少なくとも９７．５％同一である核酸配列、（ｃ）配列番号３に対して少なくとも８０％同一である核酸配列、（ｄ）配列番号４に対して少なくとも９６％同一である核酸配列、及び（ｅ）配列番号５に対して少なくとも９６％同一である核酸配列、を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、（ａ）配列番号１の核酸配列、（ｂ）配列番号２の核酸配列、（ｃ）配列番号３の核酸配列、（ｄ）配列番号４の核酸配列、及び（ｅ）配列番号５の核酸配列、を含み得る。
別の実施形態において、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、以下の核酸配列の１つ以上を含む：（ａ）配列番号６に対して少なくとも９８．４％同一である（例えば、少なくとも９８．６５％、少なくとも９８．９％、少なくとも９９．１５％、少なくとも９９．４％、少なくとも９９．６５％、少なくとも９９．９％又は１００％同一である）核酸配列、（ｂ）配列番号７に対して少なくとも９９．０１％同一である（例えば、少なくとも９９．０４％、少なくとも９９．０７％、少なくとも９９．１０％、少なくとも９９．１４％、少なくとも９９．１７％、少なくとも９９．２０％、少なくとも９９．２３％、少なくとも９９．２６％、少なくとも９９．２９％、少なくとも９９．３３％、少なくとも９９．３６％、少なくとも９９．３９％、少なくとも９９．４２％、少なくとも９９．４５％、少なくとも９９．４８％、少なくとも９９．５２％、少なくとも９９．５５％、少なくとも９９．５８％、少なくとも９９．６１％、少なくとも９９．６４％、少なくとも９９．６７％、少なくとも９９．７０％、少なくとも９９．７４％、少なくとも９９．７７％、少なくとも９９．８０％、少なくとも９９．８３％、少なくとも９９．８６％、少なくとも９９．８９％、少なくとも９９．９３％、少なくとも９９．９６％、少なくとも９９．９９％又は１００％同一である）核酸配列、（ｃ）配列番号８に対して少なくとも９７．０８％同一である（例えば、少なくとも９７．１３％、少なくとも９７．１８％、少なくとも９７．２３％、少なくとも９７．２８％、少なくとも９７．３３％、少なくとも９７．３８％、少なくとも９７．４３％、少なくとも９７．４９％、少なくとも９７．５４％、少なくとも９７．５９％、少なくとも９７．６４％、少なくとも９７．６９％、少なくとも９７．７４％、少なくとも９７．７９％、少なくとも９７．８４％、少なくとも９７．８９％、少なくとも９７．９４％、少なくとも９７．９９％、少なくとも９８．０４％、少なくとも９８．０９％、少なくとも９８．１４％、少なくとも９８．１９％、少なくとも９８．２５％、少なくとも９８．３０％、少なくとも９８．３５％、少なくとも９８．４０％、少なくとも９８．４５％、少なくとも９８．５０％、少なくとも９８．５５％、少なくとも９８．６０％、少なくとも９８．６５％、少なくとも９８．７０％、少なくとも９８．７５％、少なくとも９８．８０％、少なくとも９８．８５％、少なくとも９８．９０％、少なくとも９８．９５％、少なくとも９９．０１％、少なくとも９９．０６％、少なくとも９９．１１％、少なくとも９９．１６％、少なくとも９９．２１％、少なくとも９９．２６％、少なくとも９９．３１％、少なくとも９９．３６％、少なくとも９９．４１％、少なくとも９９．４６％、少なくとも９９．５％１、少なくとも９９．５６％、少なくとも９９．６１％、少なくとも９９．６６％、少なくとも９９．７１％、少なくとも９９．７６％、少なくとも９９．８２％、少なくとも９９．８７％、少なくとも９９．９２％、少なくとも９９．９７％又は１００％同一である）核酸配列、（ｄ）配列番号９に対して少なくとも９６．５２％同一である（例えば、少なくとも９６．５５％、少なくとも９６．５９％、少なくとも９６．６２％、少なくとも９６．６６％、少なくとも９６．６９％、少なくとも９６．７３％、少なくとも９６．７６％、少なくとも９６．８０％、少なくとも９６．８３％、少なくとも９６．８７％、少なくとも９６．９０％、少なくとも９６．９４％、少なくとも９６．９７％、少なくとも９７．０１％、少なくとも９７．０４％、少なくとも９７．０８％、少なくとも９７．１１％、少なくとも９７．１５％、少なくとも９７．１８％、少なくとも９７．２２％、少なくとも９７．２５％、少なくとも９７．２９％、少なくとも９７．３２％、少なくとも９７．３６％、少なくとも９７．３９％、少なくとも９７．４３％、少なくとも９７．４６％、少な
くとも９７．５０％、少なくとも９７．５３％、少なくとも９７．５７％、少なくとも９７．６０％、少なくとも９７．６４％、少なくとも９７．６７％、少なくとも９７．７１％、少なくとも９７．７４％、少なくとも９７．７８％、少なくとも９７．８１％、少なくとも９７．８５％、少なくとも９７．８８％、少なくとも９７．９２％、少なくとも９７．９５％、少なくとも９７．９９％、少なくとも９８．０２％、少なくとも９８．０６％、少なくとも９８．０９％、少なくとも９８．１３％、少なくとも９８．１６％、少なくとも少なくとも９８．２０％、少なくとも９８．２３％、少なくとも９８．２７％、少なくとも９８．３０％、少なくとも９８．３４％、少なくとも９８．３７％、少なくとも少なくとも９８．４０％、少なくとも９８．４４％、少なくとも９８．４７％、少なくとも９８．５１％、少なくとも９８．５４％、少なくとも９８．５８％、少なくとも９８．６１％、少なくとも９８．６５％、少なくとも９８．６８％、少なくとも９８．７２％、少なくとも９８．７５％、少なくとも９８．７９％、少なくとも９８．８２％、少なくとも９８．８６％、少なくとも９８．８９％、少なくとも９８．９３％、少なくとも９８．９６％、少なくとも９９．００％、少なくとも９９．０３％、少なくとも９９．０７％、少なくとも９９．１０％、少なくとも９９．１４％、少なくとも９９．１７％、少なくとも９９．２１％、少なくとも９９．２４％、少なくとも９９．２８％、少なくとも９９．３１％、少なくとも９９．３５％、少なくとも９９．３８％、少なくとも９９．４２％、少なくとも９９．４５％、少なくとも９９．４９％、少なくとも９９．５２％、少なくとも９９．５６％、少なくとも９９．５９％、少なくとも９９．６３％、少なくとも９９．６６％、少なくとも９９．７０％、少なくとも９９．７３％、少なくとも９９．７７％、少なくとも９９．８０％、少なくとも９９．８４％、少なくとも９９．８７％、少なくとも９９．９１％、少なくとも９９．９４％、少なくとも９９．９８％又は１００％同一である）核酸配列、及び（ｅ）配列番号１０に対して少なくとも９８．４９％同一である（例えば、少なくとも９８．５５％、少なくとも９８．６０％、少なくとも９８．６６％、少なくとも９８．７２％、少なくとも９８．７８％、少なくとも９８．８３％、少なくとも９８．８９％、少なくとも９８．９５％、少なくとも９９．０１％、少なくとも９９．０６％、少なくとも９９．１２％、少なくとも９９．１８％、少なくとも９９．２４％、少なくとも９９．２９％、少なくとも９９．３５％、少なくとも９９．４１％、少なくとも９９．４７％、少なくとも９９．５２％、少なくとも９９．５８％、少なくとも９９．６４％、少なくとも９９．７０％、少なくとも９９．７５％、少なくとも９９．８１％、少なくとも９９．８７％、少なくとも９９．９３％、少なくとも９９．９８％又は１００％同一である）核酸配列。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、前述の配列のうち１種、２種、３種、４種又は全５種を、単独又は任意の組み合わせで含み得る。これに関して、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、前述の配列のうち任意の２種を任意の組み合わせで、前述の配列のうち任意の３種を任意の組み合わせで、前述の配列のうち任意の４種を任意の組み合わせで、又は前述の配列のうち全５種を含み得る。例えば、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号６に対して少なくとも９８．４％同一である核酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号７に対して少なくとも９９．０１％同一である核酸配列、及び配列番号８に対して少なくとも９７．０８％同一である核酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号８に対して少なくとも９７．０８％同一である核酸配列、配列番号９に対して少なくとも９６．５２％同一である核酸配列、及び配列番号１０に対して少なくとも９８．４９％同一である核酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、（ａ）配列番号６の核酸配列、（ｂ）配列番号７の核酸配列、（ｃ）配列番号８の核酸配列、（ｄ）配列番号９の核酸配列、又は（ｅ）配列番号１０の核酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、（ａ）配列番号６に対して少なくとも９８．４％同一である核酸配列、（ｂ）配列番号７に対して少なくとも９９．０１％同一である核酸配列、（ｃ）配列番号８に対して少なくとも９７．０８％同一である核酸配列、（ｄ）配
列番号９に対して少なくとも９６．５２％同一である核酸配列、及び（ｅ）配列番号１０に対して少なくとも９８．４９％同一である核酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、（ａ）配列番号６の核酸配列、（ｂ）配列番号７の核酸配列、（ｃ）配列番号８の核酸配列、（ｄ）配列番号９の核酸配列、及び（ｅ）配列番号１０の核酸配列、を含み得る。
別の実施形態において、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、以下の核酸配列を１つ以上含む：（ａ）配列番号６の少なくとも１２１個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、（ｂ）配列番号７の少なくとも４６２個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、（ｃ）配列番号８の少なくとも２３４個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、（ｄ）配列番号９の少なくとも６０６個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、又は（ｅ）配列番号１０の少なくとも１８８個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号６の少なくとも１２１個（例えば１２５個以上、１３０個以上、１５０個以上、２００個以上、２５０個以上又は３００個以上）の連続するヌクレオチドであるが、配列番号６の３９９個以下（例えば３９８個以下、３５０個以下又は２７５個以下）の連続するヌクレオチドを含む核酸配列を含み得る。好ましくは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号６の１２１個から３００個の連続するヌクレオチド（例えば１２５個、１５０個、１７５個、２００個、２５０個又は２７５個の連続するヌクレオチド）、配列番号６の１２１個から２００個の連続するヌクレオチド（例えば１３０個、１４０個、１４５個、１６０個、１６５個、１７０個、１８０個、１８５個、１９０個、１９５個又は１９９個の連続するヌクレオチド）若しくは配列番号６の１２１個から１５０個の連続するヌクレオチド（例えば１２２個、１２３個、１２４個、１２５個、１２６個、１２７個、１２８個、１２９個、１３０個、１３１個、１３２個、１３３個、１３４個、１３５個、１３６個、１３７個、１３８個、１３９個、１４０個、１４１個、１４２個、１４３個、１４４個、１４５個、１４６個、１４７個、１４８個又は１４９個の連続するヌクレオチド）、又は前述の値のうち任意の２種により決められる範囲を含む核酸配列を含む。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号７の少なくとも４６２個（例えば４７０個以上、５００個以上、６００個以上、７００個以上、８００個以上、９００個以上又は１，０００個以上）の連続するヌクレオチドであるが、配列番号７の３１６８個以下（例えば３，１００個以下、３，０００個以下、２，５００個以下、２，０００個以下又は１，５００個以下）の連続するヌクレオチドを含む核酸配列を含み得る。好ましくは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号７の４６２個から２，０００個の連続するヌクレオチド（例えば４７５個、５００個、７００個、１，０００個、１，２００個、１，５００個又は１，７００個の連続するヌクレオチド）、配列番号７の４６２個から１，０００個の連続するヌクレオチド（例えば４９０個、５２５個、５７５個、６００個、６５０個、６７５個、７２５個、７５０個、８００個、８５０個、９００個又は９５０個の連続するヌクレオチド）若しくは配列番号７の４６２個から８００個の連続するヌクレオチド（例えば４８０個、４８５個、４９０個、４９５個、４９９個、５１０個、５１５個、５３０個、５４０個、５５０個、５６０個、５６５個、５７０個、５８０個、５８５個、５９０個、５９５個、６１５個、６２５個、６３０個、６４０個、６６０個、６６５個、６７０個、６８０個、６８５個、６９０個、６９５個、７０５個、７１５個、７３０個、７４０個、７５５個、７６０個、７６５個、７７０個、７７５個、７８０個、７８５個、７９０個、７９５個又は７９９個の連続するヌクレオチド）、又は前述の値のうち任意の２種により決められる範囲を含む核酸配列を含む。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号８の少なくとも２３４個（例えば２３５個以上、２５０個以上、３００個以上、３５０個以上、４００個以上、４５０
個以上又は５００個）の連続するヌクレオチドであるが、配列番号８の１，９７４個以下（例えば１，９００個以下、１，８００個以下、１，５００個以下、１，２００個以下、１，０００個以下、８５０個以下、８００個以下、７５０個以下又は７００個以下）の連続するヌクレオチドを含む核酸配列を含み得る。好ましくは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号８の２３４個から１，５００個の連続するヌクレオチド（例えば２９０個、３００個、４００個、５００個、６００個、７００個、８００個、９００個、１，０００個又は１，２００個の連続するヌクレオチド）、配列番号８の２３４個から１，０００個の連続するヌクレオチド（例えば２９５個、３５０個、４５０個、５５０個、６５０個、７５０個、８５０個又は９５０個の連続するヌクレオチド）若しくは配列番号８の２３４個から５００個の連続するヌクレオチド（例えば２９０個、３０５個、３１０個、３１５個、３２５個、３４０個、３４５個、３６０個、３６５個、３７０個、３７５個、３８０個、３８５個、３９０個、３９５個、４０５個、４２５個、４３０個、４４０個、４５５個、４６０個、４６５個、４７０個、４７５個、４８０個、４８５個、４９０個、４９５個又は４９９個の連続するヌクレオチド）、又は前述の値のうち任意の２種により決められる範囲を含む核酸配列を含む。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号９の少なくとも６０６個（例えば６１０個以上、６５０個以上、７００個以上、８００個以上又は１，０００個以上）の連続するヌクレオチドであるが、配列番号９の２８６５個以下（例えば２，８００個以下、２，５００個以下、２，０００個以下、１，８００個以下又は１，５００個以下）の連続するヌクレオチドを含む核酸配列を含み得る。好ましくは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号９の６０６個から２，０００個の連続するヌクレオチド（例えば６１５個、６５０個、７００個、８００個、９００個、１，０００個、１，２００個、１，５００個、１，７００個又は１，９００個の連続するヌクレオチド）、配列番号９の６０６個から１，０００個の連続するヌクレオチド（例えば６３０個、６４５個、６６５個、６７５個、７２５個、７５０個、７７５個、８２５個、８５０個、８７５個、９２５個、９５０個又は９７５個の連続するヌクレオチド）若しくは配列番号９の６０６個から８００個の連続するヌクレオチド（例えば６２０個、６３５個、６４０個、６５５個、６６０個、６７０個、６８０個、６８５個、６９０個、６９５個、６９９個、７０５個、７１５個、７３０個、７３５個、７４０個、７４５個、７５５個、７６０個、７６５個、７７０個、７８５個、７９０個、７９５個又は７９９個の連続するヌクレオチド）、又は前述の値のうち任意の２種により決められる範囲を含む核酸配列を含む。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１０の少なくとも１８８個（例えば１８９個以上、２００個以上、３００個以上、５００個以上、７００個以上又は９００個以上）の連続するヌクレオチドであるが、配列番号１０の１，７４０個以下（例えば１，７００個以下、１，５００個以下、１，２００個以下又は１，０００個以下）の連続するヌクレオチドを含む核酸配列を含み得る。好ましくは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１０の１８８個から１，５００個の連続するヌクレオチド（例えば２００個、４００個、６００個、８００個、１，０００個、１，２００個又は１，４００個の連続するヌクレオチド）、配列番号１０の１８８個から１，０００個の連続するヌクレオチド（例えば１９５個、２５０個、３５０個、４５０個、５５０個、６５０個、７５０個、８５０個又は９５０個の連続するヌクレオチド）若しくは配列番号１０の１８８個から５００個の連続するヌクレオチド（例えば１９０個、２２５個、２３０個、２４０個、２５５個、２６０個、２６５個、２７０個、２７５個、３１５個、３２５個、３３０個、３４０個、３５５個、３６０個、３６５個、３７０個、３７５個、３８０個、３８５個、３９０個、３９５個、４１５個、４２５個、４３０個、４４０個、４５５個、４６０個、４６５個、４７０個、４７５個、４８０個、４８５個、４９０個、４９５個又は４９９個の連続するヌクレオチド）、又は前述の値のうち任意の２種により決められる範囲を含む核酸配列を含む。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、前述の配列のうち１種、２種、３種、４種又は全５種を単独又は任意の組み合わせで含み得る。これに関して、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、前述の配列のうち任意の２種を任意の組み合わせで、前述の配列のうち任意の３種を任意の組み合わせで、前述の配列のうち任意の４種を任意の組み合わせで、又は前述の配列の全５種を含み得る。例えば、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号６の少なくとも１２１個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号８の少なくとも２３４個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、及び配列番号１０の少なくとも１８８個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号７の少なくとも連続する４６２個のヌクレオチドを含む核酸配列、配列番号９の少なくとも６０６個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、及び配列番号１０の少なくとも１８８個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号６の少なくとも１２１個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、配列番号７の少なくとも４６２個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、配列番号８の少なくとも２３４個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、及び配列番号９の少なくとも６０６個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、（ａ）配列番号６の少なくとも１２１個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、（ｂ）配列番号７の少なくとも４６２個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、（ｃ）配列番号８の少なくとも２３４個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、（ｄ）配列番号９の少なくとも６０６個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、及び（ｅ）配列番号１０の少なくとも１８８個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列を含み得る。
別の実施形態において、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは以下のアミノ酸配列を１つ以上含む：（ａ）配列番号１１に対して少なくとも９３％同一である（例えば、少なくとも９６．５７％又は１００％同一である）アミノ酸配列、（ｂ）配列番号１３に対して少なくとも８０％同一である（例えば、少なくとも８６．６７％、少なくとも９３．３３％又は１００％同一である）アミノ酸配列、（ｃ）配列番号１４に対して少なくとも９２％同一である（例えば、少なくとも９７．５６％又は１００％同一である）アミノ酸配列、及び（ｄ）配列番号１５に対して少なくとも８８％同一である（例えば、少なくとも９４．６７％又は１００％同一である）アミノ酸配列。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、前述のアミノ酸配列のうち１種、２種、３種又は全４種を、単独又は任意の組み合わせで含み得る。これに関して、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、前述の配列のうち任意の２種を任意の組み合わせで、前述の配列のうち任意の３種を任意の組み合わせで、又は前述の配列のうち全４種を含み得る。例えば、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは配列番号１１に対して少なくとも９３％同一であるアミノ酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１１に対して少なくとも９３％同一であるアミノ酸配列、及び配列番号１３に対して少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１１に対して少なくとも９３％同一であるアミノ酸配列、配列番号１３に対して少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列、及び配列番号１５に対して少なくとも８８％同一であるアミノ酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、（ａ）配列番号１１のアミノ酸配列、（ｂ）配列番号１３のアミノ酸配列、（ｃ）配列番号１４のアミノ酸配列、又は（ｄ）配列番号１５のアミノ酸配列、を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、（ａ）配列番号１１に対して少なくとも９３％同一であるアミノ酸配列、（ｂ）配列番号１３に対して少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列、（ｃ）配列番号１４に対して少なくとも９２％同一であるアミノ酸配列、及び（ｄ）配列番号１５に対して少なくとも８８％同一であるア
ミノ酸配列、を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、（ａ）配列番号１１のアミノ酸配列、（ｂ）配列番号１３のアミノ酸配列、（ｃ）配列番号１４のアミノ酸配列、及び（ｄ）配列番号１５のアミノ酸配列、を含み得る。
別の実施形態において、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは以下のアミノ酸配列を１つ以上含む：（ａ）配列番号１６に対して少なくとも９９％同一である（例えば、少なくとも９９．７５％又は１００％同一である）アミノ酸配列、（ｂ）配列番号１８に対して少なくとも９７．８％同一である（例えば、少なくとも９７．９５％、少なくとも９８．１０％、少なくとも９８．２６％、少なくとも９８．４１％、少なくとも９８．５６％、少なくとも９８．７１％、少なくとも９８．８６％、少なくとも９９．０２％、少なくとも９９．１７％、少なくとも９９．３２％、少なくとも９９．４７％、少なくとも９９．６２％、少なくとも９９．７８％、少なくとも９９．９３％又は１００％同一である）アミノ酸配列、（ｃ）配列番号１９に対して少なくとも９９．１％同一である（例えば、少なくとも９９．２０％、少なくとも９９．３１％、少なくとも９９．４１％、少なくとも９９．５２％、少なくとも９９．６２％、少なくとも９９．７３％、少なくとも９９．８３％、少なくとも９９．９４％又は１００％同一である）アミノ酸配列、及び（ｄ）配列番号２０に対して少なくとも９９．２％同一である（例えば、少なくとも９９．３７％、少なくとも９９．５４％、少なくとも９９．７２％、少なくとも９９．８９％又は１００％同一である）アミノ酸配列。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、前述のアミノ酸配列のうち１種、２種、３種又は全４種を、単独又は任意の組み合わせで含み得る。これに関して、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、前述の配列のうち任意の２種を任意の組み合わせで、前述の配列のうち任意の３種を任意の組み合わせで、又は前述の配列のうち全４種を含み得る。例えば、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１６に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１６に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列、及び配列番号１９に対して少なくとも９９．１％同一であるアミノ酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１６に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列、配列番号１９に対して少なくとも９９．１％同一であるアミノ酸配列、及び配列番号２０に対して少なくとも９９．２％同一であるアミノ酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、（ａ）配列番号１６のアミノ酸配列、（ｂ）配列番号１８のアミノ酸配列、（ｃ）配列番号１９のアミノ酸配列、又は（ｄ）配列番号２０のアミノ酸配列、を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、（ａ）配列番号１６に対して少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列、（ｂ）配列番号１８に対して少なくとも９７．８％同一であるアミノ酸配列、（ｃ）配列番号１９に対して少なくとも９９．１％同一であるアミノ酸、及び（ｄ）配列番号２０に対して少なくとも９９．２％同一であるアミノ酸配列、を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、（ａ）配列番号１６のアミノ酸配列、（ｂ）配列番号１８のアミノ酸配列、（ｃ）配列番号１９のアミノ酸配列、及び（ｄ）配列番号２０のアミノ酸配列、を含み得る。
別の実施形態において、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、以下のアミノ酸配列を１つ以上含む：（ａ）配列番号１６の少なくとも８９個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、（ｂ）配列番号１８の少なくとも２４７個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、（ｃ）配列番号１９の少なくとも２３０個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、及び（ｄ）配列番号２０の少なくとも２３１個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１６の少なくとも８９個（例
えば９０個以上、１００個以上又は１１０個以上）の連続するアミノ酸残基であるが、配列番号１６の１３３個以下（例えば１３０個以下、１２５個以下、１２０個以下又は１１５個以下）の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列を含み得る。好ましくは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１６の８９個から１３０個（例えば９０個、１００個、１１０個、１１５個、１２０個又は１２５個の連続するアミノ酸残基）の連続するアミノ酸残基、配列番号１６の８９個から１１５個（例えば９５個、１１０個又は１１２個の連続するアミノ酸残基）の連続するアミノ酸残基、若しくは配列番号１６の８９個から１００個（例えば８９個、９０個、９１個、９２個、９３個、９４個、９５個、９６個、９７個、９８個又は９９個の連続するアミノ酸残基）の連続するアミノ酸残基、又は前述の値のうち任意の２種により決められる範囲を含むアミノ酸配列を含む。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１８の少なくとも２４７個（例えば２５０個以上、２７５個以上、３００個以上又は４００個以上）の連続するアミノ酸残基であるが、配列番号１８の６５８個以下（例えば６５０個以下、５５０個以下又は４５０個以下）の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列を含み得る。好ましくは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１８の２４７個から６００個（例えば２５５個、２７５個、３００個、４００個又は５００個の連続するアミノ酸残基）の連続するアミノ酸残基、配列番号１８の２４７個から５００個（例えば３２５個、３５０個、３７５個、４２５個、４５０個又は４７５個の連続するアミノ酸残基）の連続するアミノ酸残基、若しくは配列番号１８の２４７個から４００個（例えば２６５個、２８０個、２８５個、２９０個、２９５個、３６０個、３６５個、３８０個、３８５個、３９０個、３９５個又は３９９個の連続するアミノ酸残基）の連続するアミノ酸残基、又は前述の値のうち任意の２種により決められる範囲を含む酸配列（ａｃｉｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅ）を含む。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１９の少なくとも２３０個（例えば、２５０個以上、３００個以上、３５０個以上、４００個以上又は５００個以上）の連続するアミノ酸残基であるが、配列番号１９の９５５個以下（例えば、９５０個以下、９００個以下、８００個以下、７００個以下又は６００個以下）の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列を含み得る。好ましくは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１９の２３０個から８００個の連続するアミノ酸残基（例えば、２４０個、２６０個、２７０個、２８０個、２９０個、３００個、３５０個、３９０個、４００個、５００個、６００個又は７５０個の連続するアミノ酸残基）、配列番号１９の２３０個から６００個の連続するアミノ酸残基（例えば、２５５個、２６５個、２７５個、２８５個、２９５個、３０５個、３２５個、３３５個、３４５個、３５５個、３６５個、３７５個、３８５個、３９５個、４２５個、４４５個、４５０個、４６５個、４７５個、５２５個、５４５個、５５０個、５６５個又は５７５個の連続するアミノ酸残基）、又は配列番号１９の２３０個から５００個の連続するアミノ酸残基（例えば、２３５個、２４５個、２９９個、３２０個、３３０個、３４０個、３６０個、３７０個、３８５個、３８９個、３９５個、３９９個、４１５個、４３５個、４４０個、４６０個、４７０個、４８０個又は４９９個の連続するアミノ酸残基）、又は前述の値のうち任意の２種により決められる範囲を含む酸配列（ａｃｉｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅ）を含む。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号２０の少なくとも２３１個（例えば、２５０個以上、３００個以上又は３５０個以上）の連続するアミノ酸残基であるが、配列番号２０の５８０個以下（例えば、５７５個以下、５５０個以下、５００個以下、４５０個以下又は４００個以下）の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列を含み得る。好ましくは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号２０の２３１個から５００個の連続するアミノ酸残基（例えば、２４５個、２５５個、２７５個、３００個、３５０個、３７５個又は４００個の連続するアミノ酸残基）、配列番号２０の２３
１個から４００個の連続するアミノ酸残基（例えば、２３５個、２６５個、２８０個、２８５個、２９５個、３０５個、３１５個、３２５個、３３５個、３４５個、３５５個、３６５個、３７５個、３８５個、３９５個又は３９９個の連続するアミノ酸残基）、又は配列番号２０の２３１個から３００個の連続するアミノ酸残基（例えば、２４０個、２５０個、２６０個、２７０個又は２９９個の連続するアミノ酸残基）、又は前述の値のうち任意の２種により決められる範囲を含む酸配列（ａｃｉｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅ）を含む。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、前述のアミノ酸配列のうち１種、２種、３種又は全４種を、単独又は任意の組み合わせで含み得る。これに関して、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、前述の配列のうち任意の２種を任意の組み合わせで、前述の配列のうち任意の３種を任意の組み合わせで、又は前述の配列のうち全４種を含み得る。例えば、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１６の少なくとも８９個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１６の少なくとも８９個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、及び配列番号１９の少なくとも２３０個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１６の少なくとも８９個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、配列番号１８の少なくとも２４７個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、及び配列番号１９の少なくとも２３０個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１６の少なくとも８９個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、配列番号１８の少なくとも２４７個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、及び配列番号２０の少なくとも２３１個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列を含み得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、（ａ）配列番号１６の少なくとも８９個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、（ｂ）配列番号１８の少なくとも２４７個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、（ｃ）配列番号１９の少なくとも２３０個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、及び（ｄ）配列番号２０の少なくとも２３１個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、を含み得る。
別の実施形態において、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、前述のアミノ酸配列（例えば配列番号１１〜２０のいずれかのアミノ酸配列、又は本明細書に記載のそれらのバリアント及び／又は部分のいずれか）のいずれか１つ以上をコードする１つ以上の核酸配列を含む。例えば、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、配列番号１７に対して少なくとも９９．５％同一である（例えば、少なくとも９９．５９％、少なくとも９９．６９％、少なくとも９９．７８％、少なくとも９９．８８％、少なくとも９９．９７％又は１００％同一である）アミノ酸配列をコードする核酸配列、又は配列番号１２に対して少なくとも９５％同一である（例えば、少なくとも９７．９４％又は１００％同一である）アミノ酸配列をコードする核酸配列を含み得る。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、例えば、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、配列番号２４、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７又は配列番号２８の核酸配列を含み得る。
本明細書で論ずる通り、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、複製可能、条件付きで複製又は複製欠損であり得る。好ましくは、複製欠損アデノウイルス又はアデノウイルスベクターが、１つ以上のアデノウイルスゲノム領域の少なくとも１つの複製に必須な遺伝子機能の補完を、増殖のため（例えばアデノウイルスベクターの粒子形成のため）に必要とするように、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは複製欠損である。
複製欠損アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、１つ以上の増殖のためのアデノウイルスゲノム領域において１つ以上の複製に必須な遺伝子機能に欠損をもたらすため
に任意の適切な方法により改変され得る。１つ以上のアデノウイルスゲノム領域中の１つ以上の複製に必須な遺伝子機能の欠損の補完とは、欠損している複製に必須な遺伝子機能を提供するための外来手段の使用を指す。かかる補完は、任意の適した方法で（例えば、補完細胞及び／又は破壊された複製に必須な遺伝子機能をコードする外来のＤＮＡ（例えばヘルパーアデノウイルス）を使用することにより）達成され得る。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、アデノウイルスゲノムの初期領域（すなわち、Ｅ１〜Ｅ４領域）のみの、アデノウイルスゲノムの後期領域（すなわち、Ｌ１〜Ｌ５領域）のみの、アデノウイルスゲノムの初期領域及び後期領域の両方の、又は全てのアデノウイルス遺伝子の（すなわち、高容量アデノベクター（ＨＣ−Ａｄ）、Ｍｏｒｓｙら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９５：９６５−９７６（１９９８）；Ｃｈｅｎら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９４：１６４５−１６５０（１９９７）；及びＫｏｃｈａｎｅｋら、Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ．，１０：２４５１−２４５９（１９９９）を参照）１つ以上の複製に必須な遺伝子機能を欠損し得る。複製欠損アデノウイルスベクターの例は、米国特許第５，８３７，５１１号；第５，８５１，８０６号、第５，９９４，１０６号；第６，１２７，１７５号；第６，４８２，６１６号；及び第７，１９５，８９６号、並びに国際特許出願公開ＷＯ１９９４／０２８１５２、ＷＯ１９９５／００２６９７、ＷＯ１９９５／０１６７７２、ＷＯ１９９５／０３４６７１、ＷＯ１９９６／０２２３７８、ＷＯ１９９７／０１２９８６、ＷＯ１９９７／０２１８２６及びＷＯ２００３／０２２３１１に開示されている。
アデノウイルスゲノムの初期領域には、Ｅ１、Ｅ２、Ｅ３及びＥ４領域が含まれる。Ｅ１領域はＥ１Ａ及びＥ１Ｂサブ領域を含み、Ｅ１領域における複製必須遺伝子機能の１つ以上の欠損には、Ｅ１Ａ、Ｅ１Ｂサブ領域のどちらか一方又はＥ１Ａ及びＥ１Ｂサブ領域の両方における複製に必須な遺伝子機能の１つ以上の欠損が含まれ得、それにより、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターが増殖するため（例えばアデノウイルスベクターの粒子形成のため）にアデノウイルスゲノムのＥ１Ａサブ領域及び／又はＥ１Ｂサブ領域の補完が必要となる。Ｅ２領域はＥ２Ａ及びＥ２Ｂサブ領域を含み、Ｅ２領域における複製に必須な遺伝子機能の１つ以上の欠損には、Ｅ２Ａ、Ｅ２Ｂサブ領域のどちらか一方又はＥ２Ａ及びＥ２Ｂサブ領域の両方における複製に必須な遺伝子機能の１つ以上の欠損が含まれ得、それにより、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターが増殖するため（例えばアデノウイルスベクターの粒子形成のため）にアデノウイルスゲノムのＥ２Ａサブ領域及び／又はＥ２Ｂサブ領域の補完が必要となる。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターの増殖のため（例えばアデノウイルスベクターの粒子形成のため）に、Ｅ３領域の部分又は全体の欠失がＥ３領域のいずれの遺伝子機能の補完も必要としないように、Ｅ３領域は、複製に必須な遺伝子機能をいずれも含まない。本発明に関して、Ｅ３領域は、ヒトアデノウイルス５のＥ３領域の１２．５Ｋタンパク質（ＮＣＢＩ ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ＡＰ＿０００２１８）と高い相同性を持つタンパク質をコードするオープンリーディングフレームから始まり、ヒトアデノウイルス５のＥ３領域の１４．７Ｋタンパク質（ＮＣＢＩ ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ＡＰ＿０００２２４．１）と高い相同性を持つタンパク質をコードするオープンリーディングフレームで終わる領域として定義される。Ｅ３領域は、全体又は部分的に欠失されてもよく、全体又は部分的に保持されてもよい。欠失の大きさは、そのゲノムが最適なゲノムのパッケージングの大きさと厳密に適合するアデノウイルス又はアデノウイルスベクターを保持するように調整されてもよい。欠失が大きくなれば、アデノウイルス又はアデノウイルスゲノムに、より大きな異種の核酸配列の挿入を収容するであろう。本発明の一実施形態において、Ｅ３領域に存在するＬ４ポリアデニル化シグナル配列は、保持される。
Ｅ４領域は、複数のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）を含む。ＯＲＦ６（及び場合によってはＯＲＦ３）を除くＥ４領域の全てのオープンリーディングフレームの欠失を伴うアデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターの増殖のため（例えばアデノウイルスベクターの粒子形成のため）にＥ４領域のいかなる遺伝子機能の補完も必要としない。反対に、Ｅ４領域のＯＲＦ６（及び場合によってはＯＲＦ３）の破壊又は欠失を伴う（例えばＥ４領域のＯＲＦ６及び／又はＯＲＦ３に基づく複製に必須な遺伝子機能の欠損を伴う）アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、Ｅ４領域の他のオープンリーディングフレーム、又は天然のＥ４プロモーター、ポリアデニル化配列、及び／又は右側末端逆位配列（ＩＴＲ）のいずれかの破壊又は欠失の有無に関わらず、Ｅ４領域（特にＥ４領域のＯＲＦ６及び／又はＯＲＦ３）の補完がアデノウイルス又はアデノウイルスベクターの増幅のため（例えばアデノウイルスベクターの粒子形成のため）に必要となる。アデノウイルスゲノムの後期領域には、Ｌ１、Ｌ２、Ｌ３、Ｌ４及びＬ５領域が含まれる。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、国際特許出願公開ＷＯ２０００／０００６２８で述べられているとおり、主要後期プロモーター（ＭＬＰ）に変異を有し得、これにより必要に応じてアデノウイルス又はアデノウイルスベクターを複製欠損にし得る。
複製に必須な遺伝子機能の１つ以上の欠損を含むアデノウイルスゲノムの１つ以上の領域は、望ましくは、アデノウイルスゲノムの１つ以上の初期領域（すなわち、Ｅ１、Ｅ２及び／又はＥ４領域）であり、任意選択で、Ｅ３領域の全体の又は部分的な欠失を伴ってよい。
複製欠損アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、宿主細胞でのウイルスの複製を阻害しない１つ以上の変異（例えば１つ以上の欠失、挿入、及び／又は置換）（野生型アデノウイルスと比較して）をアデノウイルスゲノムに有し得る。従って、１つ以上の複製に必須な遺伝子機能の欠損に加え、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、複製に必須ではない別の点に関して欠損し得る。例えば、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、アデノウイルス又はアデノウイルスゲノムの増殖に必須でないＥ３領域として知られるアデノウイルス初期領域の部分的又は全体的な欠失を有し得る。
一実施形態において、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは複製欠損であり、増殖のため（例えばアデノウイルスベクターの粒子形成のため）に、最大限で、アデノウイルスゲノムのＥ１領域又はＥ４領域の補完を必要とする。従って、複製欠損アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、増殖のため（例えばアデノウイルスベクターの粒子形成のため）に、アデノウイルスゲノムのＥ１Ａサブ領域及び／又はＥ１Ｂ領域（Ｅ１−欠損アデノウイルスベクターと表される）、又はアデノウイルスゲノムのＥ４領域（Ｅ４−欠損アデノウイルスベクターと表される）の少なくとも１つの複製に必須な遺伝子機能の補完を必要とする。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、アデノウイルスゲノムのＥ１領域の少なくとも一つの複製に必須な遺伝子機能（望ましくは全ての複製に必須な遺伝子機能）、及びアデノウイルスゲノムの非必須Ｅ３領域の少なくとも１つの遺伝子機能を欠損し得る（Ｅ１／Ｅ３−欠損アデノウイルスベクターと表される）。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、アデノウイルスゲノムのＥ４領域の少なくとも１つの複製に必須な遺伝子機能（望ましくは全ての複製に必須な遺伝子機能）、及びアデノウイルスゲノムの非必須Ｅ３領域の少なくとも１つの遺伝子機能を欠損し得る（Ｅ３／Ｅ４−欠損アデノウイルスベクターと表される）。
一実施形態において、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは複製欠損であり、増殖のため（例えばアデノウイルスベクターの粒子形成のため）に、最大限で、アデノウイルスゲノムのＥ２領域（好ましくはＥ２Ａサブ領域）の補完を必要とする。従って、複製欠損アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、増殖のため（例えばアデノウイル
スベクターの粒子形成のため）に、アデノウイルスゲノムのＥ２Ａサブ領域の少なくとも１つの複製に必須な遺伝子機能の補完を必要とする（Ｅ２Ａ−欠損アデノウイルスベクターと表される）。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、アデノウイルスゲノムのＥ２Ａ領域の少なくとも１つの複製に必須な遺伝子機能（望ましくは全ての複製に必須な遺伝子機能）及びアデノウイルスゲノムの非必須Ｅ３領域の少なくとも１つの遺伝子機能を欠損し得る（Ｅ２Ａ／Ｅ３−欠損アデノウイルスベクターと表される）。
一実施形態において、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは複製欠損であり、増殖のため（例えばアデノウイルスベクターの粒子形成のため）に、最大限で、アデノウイルスゲノムのＥ１領域及びＥ４領域の補完を必要とする。従って、複製欠損アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、増殖のため（例えばアデノウイルスベクターの粒子形成のため）に、アデノウイルスゲノムのＥ１及びＥ４領域の両方の少なくとも１つの複製に必須な遺伝子機能の補完を必要とする（Ｅ１／Ｅ４−欠損アデノウイルスベクターと表される）。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、アデノウイルスゲノムのＥ１領域の少なくとも１つの複製に必須な遺伝子機能（望ましくは全ての複製に必須な遺伝子機能）、アデノウイルスゲノムのＥ４領域の少なくとも１つの複製に必須な遺伝子機能、及びアデノウイルスゲノムの非必須Ｅ３領域の少なくとも１つの遺伝子機能を欠損し得る（Ｅ１／Ｅ３／Ｅ４−欠損アデノウイルスベクターと表される）。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、好ましくは、増殖のため、最大限で、アデノウイルスゲノムのＥ１領域の補完を必要とし、かつ、増殖のため、アデノウイルスゲノムの他のいかなる欠損の補完も必要としない。より好ましくは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、増殖のため、最大限で、アデノウイルスゲノムのＥ１及びＥ４領域の補完を必要とし、かつ、増殖のためにアデノウイルスゲノムの他のいかなる欠損の補完も必要としない。
アデノウイルスゲノムの複製に必須な複数の遺伝子機能が欠損している場合（例えばＥ１／Ｅ４−欠損アデノウイルスベクター）、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、複製に必須な単一の遺伝子機能を欠損するアデノウイルス又はアデノウイルスベクター（例えばＥ１−欠損アデノウイルスベクター）により得られるのと同様に、補完細胞株でのウイルス増殖を提供するスペーサー配列を含み得る。スペーサー配列は、例えば、少なくとも約１５塩基対（例えば約１５ヌクレオチドから約１２，０００ヌクレオチドの間）、好ましくは約１００ヌクレオチドから約１０，０００ヌクレオチド、より好ましくは約５００ヌクレオチドから約８，０００ヌクレオチド、更に一層好ましくは約１，５００ヌクレオチドから約６，０００ヌクレオチド、最も好ましくは約２，０００ヌクレオチドから約３，０００ヌクレオチドの長さ、又は前述の値のうち任意の２種により決められる範囲の配列など望ましい長さの任意のヌクレオチド配列（単数）又は配列（複数）を含み得る。スペーサー配列は、コード又は非コード、及びアデノウイルスゲノムに対して天然又は非天然であり得るが、しかし欠損領域に対して複製に必須な機能を回復させない。スペーサーは、発現カセットも含み得る。より好ましくは、スペーサーは、ポリアデニル化配列、及び／又はアデノウイルス若しくはアデノウイルスベクターに対して非天然である遺伝子を含む。アデノウイルスベクターにおけるスペーサーの使用は、例えば、米国特許第５，８５１，８０６号及び国際特許出願公開ＷＯ１９９７／０２１８２６に更に記載されている。
全体又は部分的なアデノウイルスゲノム（例えばアデノウイルスゲノムのＥ１、Ｅ３及びＥ４領域）の除去により、結果として生じるアデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、アデノウイルスカプシドへパッケージングされる能力を保持しながらも、外来の核酸配列の挿入を許容し得る。外来の核酸配列は、その場所への挿入がアデノウイルス又はアデノウイルスベクター粒子の形成を許す限り、アデノウイルスゲノムの任意の場所に挿入され得る。外来の核酸配列は、好ましくは、アデノウイルスゲノムのＥ１領域、Ｅ３領
域又はＥ４領域に置かれる。
本発明の複製欠損アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、高力価のウイルスベクターストックを作製するために適したレベルで、複製欠損アデノウイルス又はアデノウイルスベクターに存在しないがウイルスの増殖に必要である遺伝子機能を提供する補完細胞株において、生み出され得る。かかる補完細胞株は公知であり、２９３細胞（例えばＧｒａｈａｍら，Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．，３６：５９−７２（１９７７）に記載）、ＰＥＲ．Ｃ６細胞（例えば国際特許出願公開ＷＯ１９９７／０００３２６並びに米国特許５，９９４，１２８号及び第６，０３３，９０８号に記載）、及び２９３−ＯＲＦ６細胞（例えば国際特許出願公開ＷＯ９５／３４６７１及びＢｒｏｕｇｈら，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，７１：９２０６−９２１３（１９９７）に記載）が挙げられるが、これらに限定されない。本発明の複製欠損アデノウイルス又はアデノウイルスベクターを生み出すのに適切な他の補完細胞株は、その発現が宿主細胞においてウイルス増殖を阻害する導入遺伝子をコードするアデノウイルスベクターを増殖させるために作製された補完細胞を含む（例えば米国特許出願公開第２００８／０２３３６５０号を参照）。更なる適切な補完細胞は、例えば米国特許第６，６７７，１５６号及び第６，６８２，９２９号、並びに国際特許出願公開ＷＯ２００３／０２０８７９に記載されている。いくつかの例において、細胞のゲノムは、その遺伝子産物が複製欠損アデノウイルスベクターの全ての欠損を補完するような核酸配列を含む必要はない。複製欠損アデノウイルスベクターに欠けている１つ以上の複製に必須な遺伝子機能は、ヘルパーウイルス（例えば複製欠損アデノウイルス又はアデノウイルスベクターの複製のため必要な１つ以上の必須遺伝子機能をトランスに供給するアデノウイルスベクター）により供給され得る。あるいは、本発明のアデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、本発明の複製欠損アデノウイルス又はアデノウイルスベクターに欠けている１つ以上の複製に必須な遺伝子機能を補完する非天然の複製に必須な遺伝子を含み得る。例えば、Ｅ１／Ｅ４−欠損アデノウイルスベクターは、異なるアデノウイルス（例えば本発明のアデノウイルス若しくはアデノウイルスベクターと異なる血清型のアデノウイルス、又は本発明のアデノウイルス若しくはアデノウイルスベクターと異なる種のアデノウイルス）から得られた又は由来するＥ４ ＯＲＦ６をコードする核酸配列を含むよう改変され得る。
アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、更に導入遺伝子を含み得る。用語「導入遺伝子」は、本明細書において、非天然核酸配列がタンパク質（例えばペプチド又はポリペプチド）を産生するために発現され得るように、適した制御要素（例えばプロモーター）と操作可能に連結された非天然の核酸配列と定義される。制御要素（例えばプロモーター）は、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターに対して天然又は非天然であり得る。
「非天然」な核酸配列とは、アデノウイルスの天然に位置し天然に存在するアデノウイルスの核酸配列ではない、任意の核酸配列（例えばＤＮＡ、ＲＮＡ又はｃＤＮＡ配列）である。従って、非天然核酸配列は、アデノウイルスで天然に見られ得るが、アデノウイルスゲノム中の非天然な場所に位置し得るか、及び／又は非天然プロモーターに操作可能に結合され得る。用語「非天然核酸配列」、「異種の核酸配列」及び「外来の核酸配列」は、同意語であり、本発明に関して交換可能に使用され得る。非天然核酸配列は好ましくはＤＮＡであり、好ましくはタンパク質をコードする（すなわち、１つ以上のタンパク質をコードする１つ以上の核酸配列）。
非天然核酸配列は、予防的又は治療的に哺乳類の疾病を処置するために使用され得る治療用タンパク質をコードし得る。適切な治療用タンパク質の例としては、サイトカイン、毒素、腫瘍抑制タンパク質、成長因子、ホルモン、受容体、分裂促進因子、免疫グロブリン、神経ペプチド、神経伝達物質及び酵素が挙げられる。あるいは、非天然核酸配列は、
病原体（例えば細菌又はウイルス）の抗原をコードし得、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターはワクチンとして使用され得る。
本発明は、本明細書に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター、及びそれらのための担体（例えば医薬上許容される担体）を含む組成物を提供する。組成物は、望ましくは、担体（好ましくは生理学上（例えば医薬上）許容される担体）、及びアデノウイルス又はアデノウイルスベクターを含む、生理学上許容される（例えば医薬上許容される）組成物である。本発明の関連の中で、任意の適切な担体を使用でき、かかる担体は当該分野で周知である。担体の選択は、組成物の特定の使用（例えば動物への投与）及び組成物を投与するために使用される特定の方法により、ある程度決定されるであろう。理想的には、複製欠損アデノウイルスベクターに関して、医薬組成物は好ましくは複製可能なアデノウイルスを含まない。医薬組成物は、任意選択で、滅菌的であり得る。
適切な組成物には、抗酸化物質、緩衝液及び静菌薬を含み得る水性及び非水性の等張滅菌溶液、並びに懸濁化剤、可溶化剤、増粘剤、安定剤及び防腐剤を含み得る水性及び非水性の滅菌懸濁液が挙げられる。組成物は、単位服用量又は複数回分の服用量でアンプルやバイアルなどの密閉された容器中に提示され得、滅菌液体担体（例えば、水）を使用直前に添加することのみを必要とするフリーズドライ（凍結乾燥）の状態で保存され得る。即時溶液及び懸濁液は、滅菌の粉末、顆粒及び錠剤から調製され得る。好ましくは、担体は緩衝生理食塩溶液である。より好ましくは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターを投与前に損傷から守るよう製剤化された組成物の一部である。例えば、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターの調製、保存又は投与に使用される機器（ガラス製品、注射器又は注射針など）上で、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターの損失を減少させるよう、組成物は製剤化され得る。組成物は、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターの光感受性及び／又は温度感受性を減少させるように製剤化され得る。このような目的のために、組成物は好ましくは、医薬上許容される液体担体、例えば上記のものなど、並びにポリソルベート８０、Ｌ−アルギニン、ポリビニルピロリドン、トレハロース及びこれらの組み合わせからなる群より選択される安定化剤を含む。かかる組成物の使用は、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターの保存可能期間を延長させるであろうし、その投与を容易にすることであろう。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターを含む組成物の製剤化は、例えば米国特許第６，２２５，２８９号、米国特許第６，５１４，９４３号及び国際特許出願公開ＷＯ２０００／０３４４４４に更に記載されている。
組成物は、導入効率を増強するようにも製剤化され得る。さらに、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターが他の治療剤又は生物活性剤との組成物中に存在し得ることを当業者なら理解するであろう。例えば、イブプロフェン又はステロイドなどの炎症を制御する因子は、アデノウイルス及びアデノウイルスベクターのｉｎ ｖｉｖｏ投与に伴う腫れや炎症を減少させるために組成物の一部になり得る。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターを使用して抗原をコードする核酸配列を宿主に送達する場合、免疫系促進剤又はアジュバント（例えばインターロイキン、リポ多糖又は二本鎖ＲＮＡ）を、抗原に対する任意の免疫応答を増強又は変更させるために投与できる。抗生物質（すなわち、殺菌剤及び抗真菌剤）は、既存の感染を治療する及び／又は将来の感染危険性（遺伝子導入手順と関連する感染など）を減少させるために存在し得る。
以下の実施例は、本発明を更に説明するものであるが、その範囲を限定するものであると決して解釈すべきではないことは当然である。
実施例１
本実施例は、コットンラットにおける呼吸器合胞体ウイルス（Ｒｅｓｐｉｒａｔｏｒｙ
Ｓｙｎｃｙｔｉａｌ Ｖｉｒｕｓ（ＲＳＶ））のＦタンパク質をコードするアデノウイルスベクターの免疫原性を実証する。
配列番号２２の核酸配列を有するゴリラアデノウイルスを、（１）Ｅ１領域の欠失による複製欠損を提供するよう、かつ（２）ヒト呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）の融合（Ｆ）糖タンパク質を発現するように遺伝子操作により改変した。細胞の細胞質内でＲＳＶは複製するため、ＲＮＡプロセッシングシグナル（例えばＲＮＡスプライシング部位）の除去によりＦタンパク質をコードする遺伝子を細胞核内で発現するように改変し、哺乳類細胞での発現のためコドンを最適化した。アデノウイルスベクターからのＦタンパク質の発現は、ｉｎ ｖｉｔｒｏでのＨＥＫ−２９３細胞の感染、並びに感染細胞のタンパク質抽出液及び市販の抗ＲＳＶポリクローナル抗体（Ｐａｂ７１３３Ｐ，Ｍａｉｎｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｐｏｒｔｌａｎｄ，Ｍａｉｎｅ）を用いたウエスタンブロッティング分析により検証した。
ＲＳＶ Ｆ糖タンパク質を発現するＥ１欠失アデノウイルスベクター１０７粒子単位（ｐｕ）を脛骨筋へ単回投与しコットンラット（Ｓｉｇｍｏｄｏｎ ｈｉｓｐｉｄｕｓ）に注入した。２８日後、当該動物に生きたヒトＲＳＶ（１０６粒子形成単位（ｐａｒｔｉｃｌｅ ｆｏｒｍｉｎｇ ｕｎｉｔｓ（ｐｆｕ））の鼻腔内投与）を抗原投与した。抗原投与５日後、当該動物の肺におけるＲＳＶのウイルス量を測定した。Ｆタンパク質を発現するアデノウイルスベクターにより免疫性を与えられた動物は、肺に検出可能なＲＳＶを有さなかった（検出限界、７０ｐｆｕ／肺組織１グラム）。
本実施例の結果は、ＲＳＶ Ｆタンパク質をコードする本発明のアデノウイルスベクターがｉｎ ｖｉｖｏで免疫原性であり、かつコットンラットにおいてＲＳＶ感染に対する完全な防御を授与し得ることを実証する。
刊行物、特許出願及び特許を含む、本明細書で引用された全ての参考文献は、それぞれの参考文献が参照によって組み込まれることが個々に且つ具体的に示されており、かつその全体が本明細書に記載されているのと同程度まで、参照によって本明細書中に組み込まれる。
本発明の説明の文脈における（特に、以下の特許請求の範囲の文脈における）、用語「ａ」及び「ａｎ」及び「ｔｈｅ」並びに同様の指示対象の使用は、本明細書中に特記しないか文脈と明らかに矛盾しない限り、単数形及び複数形の両方をカバーすると解釈すべきである。用語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「有する（ｈａｖｉｎｇ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」及び「含む（ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ）」は、特記しない限り、オープンエンドの用語（即ち、「〜を含むがそれらに限定されない」を意味する）と解釈すべきである。本明細書中の値の範囲の記述は、本明細書中に特記しない限り、その範囲内に入る各個別の値に個々に言及する省略方法として働くことのみを意図しており、各個別の値は、それが本明細書中に個々に記述されているかのように本明細書中に組み込まれる。本明細書中に記載される全ての方法は、本明細書中に特記しない又は文脈と明らかに矛盾しない限り、任意の適切な順序で実施できる。本明細書中に提供される任意の及び全ての例又は例示的語句（例えば、「など（ｓｕｃｈ ａｓ）」）の使用は、本発明をよりよく説明することのみを意図しており、特段特許請求されない限り、本発明の範囲に限定を課すものではない。本明細書中の全ての語句は、特許請求されていない任意の要素を本発明の実施に必須のものとして示していると解釈すべきではない。
発明を実施するための発明者が知る最良の形態を含む、本発明の好ましい実施形態が本明細書中に記載されている。これらの好ましい実施形態のバリエーションは、上述の説明
を読めば当業者に明らかとなり得る。本発明者らは、当業者がかかるバリエーションを適宜使用することを予期しており、本発明者らは、本明細書中に具体的に記載されたのとは異なる方法で本発明が実施されることを意図している。従って、本発明は、適用法によって許容されるとおり、本明細書中に添付した特許請求の範囲に記載される対象の全ての改変及び等価物を含む。さらに、その全ての可能なバリエーションでの上記要素の任意の組合せが、本明細書中に特記しない又は文脈と明らかに矛盾しない限り、本発明によって含まれる。

Claims (7)

  1. （ａ）配列番号６の核酸配列、
    （ｂ）配列番号８の核酸配列、
    （ｃ）配列番号９の核酸配列、及び、
    （ｄ）配列番号１０の核酸配列、
    を含む、アデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
  2. （ａ）配列番号１６のアミノ酸配列をコードする核酸配列、
    （ｂ）配列番号１８のアミノ酸配列をコードする核酸配列、
    （ｃ）配列番号１９のアミノ酸配列をコードする核酸配列、及び
    （ｄ）配列番号２０のアミノ酸配列をコードする核酸配列、
    を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
  3. アデノウイルス又はアデノウイルスベクターが、増殖のためにアデノウイルスゲノムの１つ以上の初期領域の欠損の補完を必要とし、増殖のためにアデノウイルスゲノムの他のいかなる欠損の補完も必要としない、請求項１又は２に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
  4. アデノウイルス又はアデノウイルスベクターが、非天然の核酸配列をさらに含む、請求項１〜３のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
  5. 非天然の核酸配列が導入遺伝子である、請求項４に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
  6. 非天然の核酸配列が、導入遺伝子又はアデノウイルスに天然に見いだされる核酸配列であるが該アデノウイルスゲノム中の非天然の位置に存在する核酸配列である、請求項４に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
  7. 請求項１〜６のいずれか１項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター及び医薬上許容される担体を含む組成物。
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