JP2014530606A - シミアン(ゴリラ)アデノウイルス又はアデノウイルスベクター、及び使用方法 - Google Patents
シミアン(ゴリラ)アデノウイルス又はアデノウイルスベクター、及び使用方法 Download PDFInfo
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- C12N2840/00—Vectors comprising a special translation-regulating system
- C12N2840/60—Vectors comprising a special translation-regulating system from viruses
Abstract
Description
本特許出願は、2011年10月5日出願の米国仮特許出願第61/543,661号(参照により組み込まれる)の利益を主張する。
本明細書と同時に提出される以下:415,748バイトのASCII(テキスト)ファイル1件、名称「711250SequenceListing_ST25.TXT,」2012年10月5日作成と特定される、コンピューターで読み取り可能なヌクレオチド/アミノ酸の配列表が本明細書中、参照によりその全体が組み込まれる。
生物学上適切な形状及び量におけるin vivoでのタンパク質送達は、数十年にわたり薬物及びワクチン開発の障害となっている。従来のタンパク質送達の取り組みに対して成功を収めた代替手段であるとすでに証明された一つの解決策は、in vivoでのタンパク質産生のために外来核酸配列を送達することである。遺伝子導入ベクターは、多種多様な細胞型に入り、大きな核酸配列を許容する容量を有し、安全であり、かつ患者を治療するために必要な量を生み出し得ることが理想である。ウイルスベクターは、これらの有利な特性を伴う遺伝子導入ベクターである(例えば、Thomasら,Nature Review Genetics,4:346−358(2003)を参照)。その上、多くのウイルスベクターは多様な細胞型に感染できるよう改変される一方、ウイルスベクターは特定の細胞型を標的とするようにも変更され得、それによりベクターの治療効果が増強され得る(例えば、Kayら,Nature Medicine,7(1):33−40(2001)を参照)。
本発明は、アデノウイルス又はアデノウイルスベクターを提供する。アデノウイルス又はアデノウイルスベクターは、(a)配列番号1に対して少なくとも97%同一である核酸配列、(b)配列番号2に対して少なくとも97.5%同一である核酸配列、(c)配列番号3に対して少なくとも80%同一である核酸配列、(d)配列番号4に対して少なくとも96%同一である核酸配列、及び(e)配列番号5に対して少なくとも96%同一である核酸配列、からなる群より選択される1つ以上の核酸配列を含む。
アデノウイルスは一般にヒトにおける良性の病状と関連しており、ヒトを含む様々な種から単離されたアデノウイルスのゲノムが、広く研究されている。アデノウイルスは、中程度の大きさ(90〜100nm)であり、約36kbの2本鎖DNAを含みエンベロープを持たない正二十面体のウイルスである。アデノウイルスのカプシドは、ウイルスによる細胞への感染の初期段階における重要な相互作用を媒介し、アデノウイルス生活環の終わりにアデノウイルスゲノムをパッケージングするために必要である。カプシドは、240のヘキソン、12のペントン基部タンパク質及び12のファイバーを含む、252のカプソメアを含む(Ginsbergら,Virology,28:782−83(1966))。ヘキソンは、3つの同一タンパク質すなわちポリペプチドII(polypeptide II)を含む(Robertsら,Science,232:1148−51(1986))。ペントン基部は5つの同一タンパク質を含み、ファイバーは3つの同一タンパク質を含む。タンパク質IIIa、VI及びIXは、アデノウイルスのコートに存在し、ウイルスのカプシドを安定化させると考えられている(Stewartら,Cell,67:145−54(1991)、及びStewartら,EMBOJ.,12(7):2589−99(1993))。pIXを別としてカプシドタンパク質の発現は、アデノウイルスポリメラーゼタンパク質に依存している。従って、ポリメラーゼタンパク質遺伝子が存在し発現している場合のみ、アデノウイルス粒子の主要な構成要素がゲノムから発現する。
本実施例は、コットンラットにおける呼吸器合胞体ウイルス(Respiratory Syncytial Virus(RSV))のFタンパク質をコードするアデノウイルスベクターの免疫原性を実証する。
Claims (101)
- (a)配列番号1に対して少なくとも97%同一である核酸配列、
(b)配列番号2に対して少なくとも97.5%同一である核酸配列、
(c)配列番号3に対して少なくとも80%同一である核酸配列、
(d)配列番号4に対して少なくとも96%同一である核酸配列、及び
(e)配列番号5に対して少なくとも96%同一である核酸配列、
からなる群より選択される1つ以上の核酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。 - 配列番号1に対して少なくとも97%同一である核酸配列を含む、請求項1に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号1の核酸配列を含む、請求項2に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号2に対して少なくとも97.5%同一である核酸配列を含む、請求項1〜3のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号2の核酸配列を含む、請求項4に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号3に対して少なくとも80%同一である核酸配列を含む、請求項1〜5のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号3の核酸配列を含む、請求項6に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号4に対して少なくとも96%同一である核酸配列を含む、請求項1〜7のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号4の核酸配列を含む、請求項8に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号5に対して少なくとも96%同一である核酸配列を含む、請求項1〜9のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号5の核酸配列を含む、請求項10に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- (a)配列番号6に対して少なくとも98.4%同一である核酸配列、
(b)配列番号7に対して少なくとも99.01%同一である核酸配列、
(c)配列番号8に対して少なくとも97.08%同一である核酸配列、
(d)配列番号9に対して少なくとも96.52%同一である核酸配列、及び
(e)配列番号10に対して少なくとも98.49%同一である核酸配列、
からなる群より選択される1つ以上の核酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。 - 配列番号6に対して少なくとも98.4%同一である核酸配列を含む、請求項12に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号6の核酸配列を含む、請求項13に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号7に対して少なくとも99.01%同一である核酸配列を含む、請求項12〜14のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号7の核酸配列を含む、請求項15に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号8に対して少なくとも97.08%同一である核酸配列を含む、請求項12〜16のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号8の核酸配列を含む、請求項17に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号9に対して少なくとも96.52%同一である核酸配列を含む、請求項12〜18のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号9の核酸配列を含む、請求項19に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号10に対して少なくとも98.49%同一である核酸配列を含む、請求項12〜20のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号10の核酸配列を含む、請求項21に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- (a)配列番号6の少なくとも121個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、
(b)配列番号7の少なくとも462個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、
(c)配列番号8の少なくとも234個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列、
(d)配列番号9の少なくとも606個の連続するヌレオチドを含む核酸配列、及び
(e)配列番号10の少なくとも188個の連続するクレオチドを含む核酸配列、
からなる群より選択される1つ以上の核酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。 - 配列番号6の少なくとも121個の連続するクレオチドを含む核酸配列を含む、請求項23に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号6の核酸配列を含む、請求項24に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号7の少なくとも462個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列を含む、請求項23〜25のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号7の核酸配列を含む、請求項26に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号8の少なくとも234個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列を含む、請求項23〜27のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号8の核酸配列を含む、請求項28に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号9の少なくとも606個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列を含む、請求項23〜29のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号9の核酸配列を含む、請求項30に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号10の少なくとも188個の連続するヌクレオチドを含む核酸配列を含む、請求項23〜31のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号10の核酸配列を含む、請求項32に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- (a)配列番号11に対して少なくとも93%同一であるアミノ酸配列、
(b)配列番号13に対して少なくとも80%同一であるアミノ酸配列、
(c)配列番号14に対して少なくとも92%同一であるアミノ酸配列、及び
(d)配列番号15に対して少なくとも88%同一であるアミノ酸配列、
からなる群より選択される1つ以上のアミノ酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。 - 配列番号11に対して少なくとも93%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項34に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号11のアミノ酸配列を含む、請求項35に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号13に対して少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項34〜36のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号13のアミノ酸配列を含む、請求項37に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号14に対して少なくとも92%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項34〜38のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号14のアミノ酸配列を含む、請求項39に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号15に対して少なくとも88%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項34〜40のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号15のアミノ酸配列を含む、請求項41に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- (a)配列番号11に対して少なくとも93%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、
(b)配列番号12に対して少なくとも95%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、
(c)配列番号13に対して少なくとも80%同一であるアミノ酸配列コードする核酸配列、
(d)配列番号14に対して少なくとも92%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、及び
(e)配列番号15に対して少なくとも88%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、
からなる群より選択される1つ以上の核酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。 - 配列番号11に対して少なくとも93%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項43に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号11のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項44に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号12に対して少なくとも95%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項43〜45のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号12のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項46に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号13に対して少なくとも80%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項43〜47のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号13のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項48に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号14に対して少なくとも92%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項43〜49のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号14のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項50に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号15に対して少なくとも88%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項43〜51のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号15のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項52に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- (a)配列番号16に対して少なくとも99%同一であるアミノ酸配列、
(b)配列番号18に対して少なくとも97.8%同一であるアミノ酸配列、
(c)配列番号19に対して少なくとも99.1%同一であるアミノ酸配列、及び
(d)配列番号20に対して少なくとも99.2%同一であるアミノ酸配列、
からなる群より選択される1つ以上のアミノ酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。 - 配列番号16に対して少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項54に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号16のアミノ酸配列を含む、請求項55に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号18に対して少なくとも97.8%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項54〜56のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号18のアミノ酸配列を含む、請求項57に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号19に対して少なくとも99.1%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項54〜58のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号19のアミノ酸配列を含む、請求項59に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号20に対して少なくとも99.2%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項54〜60のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号20のアミノ酸配列を含む、請求項61に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- (a)配列番号16に対して少なくとも99%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、
(b)配列番号17に対して少なくとも99.5%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、
(c)配列番号18に対して少なくとも97.8%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、
(d)配列番号19に対して少なくとも99.1%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、及び
(e)配列番号20に対して少なくとも99.2%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列、
からなる群より選択される1つ以上の核酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。 - 配列番号16に対して少なくとも99%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項63に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号16のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項64に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号17に対して少なくとも99.5%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項63〜65のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号17のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項66に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号18に対して少なくとも97.8%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項63〜67のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号18のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項68に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号19に対して少なくとも99.1%同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項63〜69のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号19のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項70に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号20に対して少なくとも99.2%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項63〜71のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号20のアミノ酸配列を含む、請求項72に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- (a)配列番号16の少なくとも89個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、
(b)配列番号18の少なくとも247個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、
(c)配列番号19の少なくとも230個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、及び
(d)配列番号20の少なくとも231個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列、
からなる群より選択される1つ以上のアミノ酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。 - 配列番号16の少なくとも89個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列を含む、請求項74に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号16のアミノ酸配列を含む、請求項75に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号18の少なくとも247個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列を含む、請求項74〜76のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号18のアミノ酸配列を含む、請求項77に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号19の少なくとも230個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列を含む、請求項74〜78のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号19のアミノ酸配列を含む、請求項79に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号20の少なくとも231個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列を含む、請求項74〜80のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号20のアミノ酸配列を含む、請求項81に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- (a)配列番号16の少なくとも89個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列、
(b)配列番号17の少なくとも286個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列、
(c)配列番号18の少なくとも247個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列、
(d)配列番号19の少なくとも230個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列、及び
(e)配列番号20の少なくとも231個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列、
からなる群より選択される1つ以上の核酸配列を含むアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。 - 配列番号16の少なくとも89個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項83に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号16のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項84に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号17の少なくとも286個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項83〜85のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号17のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項86に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号18の少なくとも247個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項83〜87のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号18のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項88に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号19の少なくとも230個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項83〜89のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号19のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項90に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号20の少なくとも231個の連続するアミノ酸残基を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項83〜91のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 配列番号20のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項92に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- アデノウイルス又はアデノウイルスベクターが、増殖のためにアデノウイルスゲノムの1つ以上の初期領域の欠損の補完を必要とし、増殖のためにアデノウイルスゲノムの他のいかなる欠損の補完も必要としない、請求項1〜93のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 1つ以上の初期領域がアデノウイルスゲノムE1領域、E2領域及びE4領域からなる群より選択される、請求項94に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- アデノウイルス又はアデノウイルスベクターが、増殖のためにアデノウイルスゲノムE1領域の欠損の補完を必要とし、増殖のためにアデノウイルスゲノムの他のいかなる欠損の補完も必要としない、請求項95に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- アデノウイルス又はアデノウイルスベクターが、増殖のためにアデノウイルスゲノムE1A領域又はE1B領域の欠損の補完を必要とし、増殖のためにアデノウイルスゲノムの他のいかなる欠損の補完も必要としない、請求項95に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- アデノウイルス又はアデノウイルスベクターが、増殖のために、最大限で、アデノウイルスゲノムE4領域の欠損の補完を必要とし、増殖のためにアデノウイルスゲノムの他のいかなる欠損の補完も必要としない、請求項95に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- アデノウイルス又はアデノウイルスベクターが、増殖のためにアデノウイルスゲノムE1領域の欠損の補完及びアデノウイルスゲノムE4領域の欠損の補完を必要とし、増殖のためにアデノウイルスゲノムの他のいかなる欠損の補完も必要としない、請求項95に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 更に導入遺伝子を含む、請求項1〜99のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター。
- 請求項1〜100のいずれか1項に記載のアデノウイルス又はアデノウイルスベクター及び医薬上許容される担体を含む組成物。
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