JP6966756B2 - β−グルカン結合タンパク質、β−グルカン検出キット、人工DNAおよび細菌 - Google Patents
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Description
本発明のβ−グルカン結合タンパク質(Sup BGRP)は、以下の配列番号1のアミノ酸配列を含んでいる。このアミノ酸配列は、従来知られているカイコなどの各種昆虫由来のβ−グルカン結合タンパク質(BGRP)のアミノ酸配列と、本発明者らのこれまでの知見に基づいて、約36残基(カイコに対しては23残基)のアミノ酸変異を導入することで人工的に作製したβ−グルカン結合タンパク質(Sup BGRP)である。
(配列番号1)
Met Asn His Lys Val His His His His His His Ile Glu Gly Arg His Met Glu Leu Gly
Thr Tyr Glu Val Pro Asp Ala Lys Leu Glu Ala Ile Tyr Pro Lys Gly Leu Arg Val Ser
Ile Pro Asp Asp Gly Phe Ser Leu Phe Ala Phe His Gly Lys Leu Asn Glu Glu Met Glu
Gly Leu Glu Ala Gly Thr Trp Ser Arg Asp Ile Thr Lys Ala Lys Asn Gly Arg Trp Thr
Phe Arg Asp Arg Asn Ala Glu Leu Lys Ile Gly Asp Lys Ile Tyr Phe Trp Thr Tyr Val
Ile Lys Asp Gly Leu Gly Tyr Arg Gln Asp Asn Gly Glu Trp Thr Val Thr Gly Tyr Val
Asp Glu Asp Gly Asn Pro Val Asp Thr Asp Gly Pro Thr Thr Thr Pro Thr Gly Ser Glu
Phe Lys Leu Val Asp Leu Gln Ser Arg
本発明のβ−グルカン検出キットは、上述した本発明のβ−グルカン結合タンパク質(Sup BGRP)を含み、これ以外にも、β−グルカン検出、測定のための各種の材料を含むことができる。
本発明の人工DNAは、上述した本発明のβ−グルカン結合タンパク質(Sup BGRP)をコードしている。具体的には、本発明の人工DNAとしては、以下の配列番号2の塩基配列を含む人工DNAを例示することができる。この人工DNAは、例えば、公知のDNA自動合成機などを使用して作製することができる。
(配列番号2)
atgaatcacaaagtgcatcatcatcatcatcatatcgaaggtaggcatatggagctcggt
acctatgaagtgcctgatgcgaaactcgaagccatttaccccaaagggttacgcgttagc
attccggatgatggcttttcgctgtttgccttccatgggaaactgaacgaggagatggaa
ggtctggaagctggaacttggagtcgggacatcacgaaagcgaagaacggtcgttggacc
tttcgtgaccgcaatgcagagctgaaaattggcgacaagatctacttctggacctacgtc
atcaaagatggcttgggttatcgccaggataacggagaatggaccgtaacgggctatgtg
gacgaagatggcaatccggttgataccgatggtccgactacgacaccaaccggatccgaa
ttcaagcttgtcgacctgcagtctagatag
本発明の細菌は、上述した本発明の人工DNAが導入されることで形質転換されている。細菌の種類は、例えば、大腸菌、P seudomonas、Bacillus subtilis、Bacillus stearothermophilus、酵母その他の菌類などを例示することができるが、大腸菌であることが好ましい。
His‐Tagアフィニティ−クロマトグラフィーで精製した各BGRP試料(Sup BGRP、Bm BGRP、Tc BGRP)に2×SDS-Sample Bufferを1:1になるように混合し、ボルテックス後3分煮沸し、サンプルを作成した。 15%アクリルアミドゲル濃度でLaemmli法を用いてサンプル試薬の分離を行った。分子量マーカーにはDynaMarker Protein MultiColor Stable (BioDynamics Laboratory Inc.) を使用した。
Sup BGRPをコードするDNA配列(配列番号2)およびBm BGRPおよびTc BGRPをコードする公知のDNA配列に基づいて作成したプラスミドを、ヒートショック法を用いて大腸菌BL21株に遺伝子導入を行った。
<1>BGRP結合反応性試験では、以下の表2に示したβ-グルカンを使用した。
BGRPを10mM Bicine buffer (pH8.0)にて透析し、回収後Biotin-(AC5)2-Sulfo-OSu (DOJINDO)をタンパク質溶液に添加した。よく混和したあと,室温で2時間インキュベートした。その後PBSで透析を行い、透析後0.04%Proclinになるように加え冷蔵保存した。
HABAを3.5mgはかりとりDMSO 125μLに溶解した(HABA-DMSO溶液)。Avidin を2.5mgはかりとりPBSに溶解した。そこに、HABA-DMSO溶液を50μL加えPBSで5mLにメスアップした(HABA-Avidin溶液)。384well plateに(+)Biotinをスタンダードにし、HABA-Avidin溶液と混ぜ合わせ50μL/well入れた。サンプルもスタンダードと同様にHABA-Avidin溶液と混ぜ合わせ50μL/well入れた。その後、測定波長500nmで吸光度を測定した。付属の検量線ソフトにより、試料溶液中のbiotin濃度を算出した。同じ試料溶液中のタンパク濃度をBCA法により求め、Biotin: Proteinの分子比(B/P比)を算出した。
各BGRPを0.1M phosphate buffer (pH6.8)で20、5、1.25、0.31、0.08、0 μg/mLの濃度に希釈し、96well NUNC ELISA plateに50 μL/well入れ、37℃で2時間又は4℃で一晩置いた。その後、PBSTで3回洗浄し、BPBSで室温1時間置いた。CSBGを100 ng/mLにBPBSで希釈し50 μL/well入れ、37℃ 1時間培養した。PBSTで3回洗浄後、各Bio-BGRPをBPBSで0.5μg/mLの濃度に希釈し50μL/well加え、37℃ 1時間培養した。PBSTで3回洗浄後、Streptavidin-HRP (BioLegend)を0.2 μg/mLの濃度にBPBSで希釈し、50μL/well入れ37℃ 1時間培養した。PBSTで5回洗浄後、TMBを50μL/well入れ、Stop solutionを50 μL/well入れ反応を停止させ、測定波長450 nm、参照波長630nmの吸光度で測定を行った。
β-グルカンの三重螺旋構造はアルカリにより、その水素結合が解離し、一部一重螺旋構造を有することが知られている。トリプルヘリックス構造を保持したものと部分的にヘリックス構造が開裂したもので結合性がどのように変化するのかLaminarinとSPGを用いて、実施例3と同様に検討した。
BGRPの酸アルカリ等の液性による結合性への影響を調べるため広域緩衝液のBritton-Robinson buffer (pH3-12) (BR-buffer) と、図10に示した緩衝液(T2buffer) ならびにPBSのNaCl濃度のみを変化させた水溶液を用いてELISAで検討した。
BGRPの結合性に対するNaCl濃度の影響を調べるため、リン酸緩衝液中のNaCl濃度を変えた反応液でBGRPとβ−グルカン(Laminarin)との反応性をELISAで検討した。
<1>BGRPの熱安定性を検討するために、BGRP(Sup BGRP、Bm BGRP、Tc BGRP、Dectin‐1)のPBS溶液をThermal cyclerを用いて40℃、50℃、60℃、70℃、80℃、90℃で30分処理あるいは−20℃の冷凍庫にて30分処理した。
A溶液:1Mトリシン/NaOH(pH7.0):1.79gのトリシンを5mLのDIWで溶解し、5M NaOHでpH7.0に調整した。 最後にそれをDIWで希釈して10mlの溶液を作った。
B溶液:1M Bis-Tris/HCl (pH7.0):DIW 40mLで10.46g Bis-Trisを可溶化した。pHを6MのHClで7.0に調整し、次いでそれをDIWで希釈して50mLの溶液を作った。
アクリルアミド溶液(48%Acrylamide 1.5% Bis-acrylamide aqueous solution):19.2gのアクリルアミドおよび600mg Bis-acrylamideを40mLのDIWで溶解した。
5×試料緩衝液:50mg CBB G-250(TCI)および6.5mg 6-amino-n-caproic acid(Wako)をチューブ内で秤量した。次に100μLのB溶液を加えた。その後、17.4μgのPMSF(Sigma)をEtOHに溶解したものを溶液に加えた。 その後、DIWで合計1mLに溶解した。 最後に、この緩衝液とグリセロールを1:1で混合した。
バッファ陰極緩衝液:ガラスビン中に20mgのCBB G‐250を計量し、5mLのA溶液、1.5mLのB溶液および93.5mLのDIWを加えた。
アノード緩衝液:25mLのB溶液をDIWで500mLに希釈した。
ゲル緩衝液:1.97gの6-amino-n-caproic acidをチューブ内で秤量した。次に1.5mLのB溶液をチューブに注いだ。最後にDIWで15mLに希釈した。調製した溶液はすべて4℃で保存した。ゲル作製および電気泳動は、SE260マイティスモールIIデラックスミニ垂直電気泳動ユニット(Hoefer)を用いて行った。
ゲル10%分離ゲル:4 mLのゲルバッファー、1.6 mLのアクリルアミド溶液、1 mLのグリセロール、1.4 mLのDIW、および32 μLの10%APS水溶液をチューブ内で穏やかに混合した。ゲルを作製する直前に3.2μLTEMEDを加えた。
上部ゲル:1mLのゲル緩衝液、0.16mLのアクリルアミド溶液、0.84mLのDIWおよび16μLの10%APS水溶液をチューブ内で穏やかに混合した。ゲルを作製する直前に1.6μLのTEMEDを加えた。
電気泳動タンパク質およびβ−グルカンの混合物試料を流す前に、電気泳動ユニットを氷水(1L/hour)で循環させることによって低温に保った。2μgのBGRPまたはDectin-1-Fcおよび2μgのBG(Laminarin、CSBG)を混合し(Sup BGRP:Laminarin, Bm BGRP:Laminarin, Dectin-1:Laminarin, Tc BGRP:CSBG)、室温でインキュベートした。1時間 次に5×試料緩衝液を添加し、そして氷上で5分間インキュベートした。最初の1時間、100Vで電気泳動を行った。その後、電気泳動が終了するまで出力を150Vに変更した。電気泳動後、ゲルを固定し、10%メタノールおよび15%酢酸を含有する水溶液で1時間漂白した。 その後、ゲルをDIWで3回洗浄した。最後に、ゲルをスキャンして画像を得た。
Claims (7)
- β−グルカンとの結合性を有するβ−グルカン結合タンパク質であって、配列番号1のアミノ酸配列を含むことを特徴とするβ−グルカン結合タンパク質。
- 前記β−グルカンは、β−1,3グルカンまたはβ−1,3−1,6グルカンであることを特徴とする請求項1のβ−グルカン結合タンパク質。
- 前記β−グルカンは、三重螺旋構造を有することを特徴とする請求項1のβ−グルカン結合タンパク質。
- 請求項1から3のいずれかのβ−グルカン結合タンパク質を含むβ−グルカン検出キット。
- 請求項1のβ−グルカン結合タンパク質をコードする人工DNA。
- 配列番号2の塩基配列を含む、請求項5の人工DNA。
- 請求項5または6の人工DNAが導入された細菌。
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