JP6963033B2 - 細胞画像処理装置、細胞画像処理方法および細胞画像処理プログラム - Google Patents
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Description
細胞増殖率が、時間間隔をあけた2枚の画像における細胞量の変化を示す増殖パラメータのみならず、細胞流入量および細胞流出量を表す遊走パラメータをも考慮して求められるので、細胞分裂による細胞の増殖の度合をより精度よく検出して、細胞培養を精度よく管理することができる。
このようにすることで、時間間隔をあけて取得された2枚の評価画像を処理してそれぞれの計数領域内に存在する細胞数を計数してその差分を時間間隔で除算することにより簡易に増殖パラメータを算出することができる。
また、上記態様においては、前記増殖パラメータ算出部が、前記計数領域の面積に対する細胞領域の面積の割合であるコンフルエンシーの変化率を増殖パラメータとして算出してもよい。
このようにすることで、時間間隔をあけて取得された2枚の評価画像を処理してそれぞれの計数領域の外縁を超えて流入した細胞数および流出した細胞数を計数してその差分を時間間隔で除算することにより簡易に遊走パラメータを算出することができる。
また、上記態様においては、前記遊走パラメータ算出部が、前記計数領域を撮影した2枚の画像の射影変換の変換パラメータである画像変形量を遊走パラメータとして算出してもよい。
また、上記態様においては、前記遊走パラメータ算出部が、画像処理で検出したいくつかの注目細胞の移動量の平均値である注目細胞移動量を遊走パラメータとしてもよい。
また、上記態様においては、前記遊走パラメータ算出部が、前記細胞の長さを前記細胞の速度で除算した時間以下の間隔をあけて撮影した、前記画像を用いてもよい。
このようにすることで、増殖率算出部により、許容誤差以下の精度の高い細胞増殖率を算出することができる。
このようにすることで、増殖パラメータ、遊走パラメータおよび細胞増殖率を簡易に算出することができる。
また、上記態様においては、前記細胞死亡率は、領域内に単位時間当たりに浮遊した細胞数を計数することにより検出されてもよい。
また、上記態様においては、前記増殖パラメータ、前記遊走パラメータ、前記細胞増殖率および前記細胞死亡率のうちの少なくとも1つをグラフとして出力してもよい。
また、上記態様においては、前記増殖パラメータ、前記遊走パラメータ、前記細胞増殖率および前記細胞死亡率のうちの少なくとも1つを時間変化を表すグラフとして出力してもよい。
本実施形態に係る細胞画像処理装置1は、図1に示されるように、顕微鏡等の撮像部50により時間間隔をあけた撮影により取得された複数枚の画像Pn,Pn+1が入力され、細胞Xの増殖率等の情報をモニタ等の表示部60に向けて出力する装置である。
処理部3は、メモリ2に記憶されている画像Pn,Pn+1を処理して、画像(評価画像)Pn,Pn+1内の所定の計数領域R内における細胞数の単位時間当たりの変化率である細胞数変化率(増殖パラメータ)を算出する細胞数変化率算出部(増殖パラメータ算出部)4と、画像(評価画像)Pn,Pn+1内の計数領域R内への単位時間当たりの細胞Xの流入数である細胞流入率(遊走パラメータ)を算出する細胞流入率算出部(遊走パラメータ算出部)5と、画像(評価画像)Pn,Pn+1内の計数領域R内からの単位時間当たりの細胞Xの流出数である細胞流出率(遊走パラメータ)を算出する細胞流出率算出部(遊走パラメータ算出部)6と、算出された細胞数変化率、細胞流入率および細胞流出率から増殖測定画像内の計数領域Rにおける細胞増殖率を算出する増殖率算出部7とを備えている。
また、本実施形態に係る細胞画像処理装置1は、計数領域Rの大きさを設定する領域サイズ算出部8を備えている。
Δt2≦D/V (1)
ここで、Dは細胞Xの長さ、Vは細胞Xの遊走速度である。
ΔNBIRTH/Δt=A×L2 (2)
(ΔNMOVEIN−ΔNMOVEOUT)/Δt=4×L×(B−C) (3)
K=((ΔNMOVEIN−ΔNMOVEOUT)/Δt)/(ΔNBIRTH/Δt)
=4(B−C)/A×L (4)
ここで、
Aは計数領域Rにおいて、単位面積当たり単位時間に発生する細胞数、
Bは計数領域Rの境界線において、単位長さ当たり単位時間に計数領域Rに進入する細胞数、
Cは計数領域Rの境界線において、単位長さ当たり単位時間に計数領域Rから退出する細胞数、
Lは正方形からなる計数領域Rの一辺の長さである。
L=4(B−C)/A×Ka (5)
領域サイズ算出部8は、過去の細胞数A,B,Cおよび許容誤差Kaをメモリ2から読み出し、読み出された細胞数A,B,Cおよび許容誤差Kaを用いて条件式(5)を用いて計数領域Rの一辺の長さを算出するようになっている。
ΔNBIRTH/Δt=ΔN/Δt−ΔNMOVEIN/Δt+ΔNMOVEOUT/Δt (6)
ここでは、本実施形態に係る細胞画像処理方法を、
Δt1=Δt2=Δt
として説明する。
次に、メモリ2から細胞数A,B,Cおよび許容誤差Kaが読み出される(ステップS2)。そして、読み出された細胞数A,B,Cおよび許容誤差Kaを用いて計数領域Rの一辺の長さLが算出される(領域サイズ算出ステップS3)。
そして、増殖率算出部7において、下式(7)により単位時間当たりの細胞増殖率ΔNBIRTHn+1/Δtが算出される(増殖率算出ステップS9)。
ΔNBIRTHn+1/Δt
=(Nn+1−Nn)/Δt−ΔNMOVEINn+1/Δt+ΔNMOVEOUTn+1/Δt (7)
ΔNBIRTHn+1=(Nn+1−Nn)−ΔNMOVEINn+1+ΔNMOVEOUTn+1 (8)
プロセッサにより構成する場合、本発明は、増殖パラメータ算出ステップS5,S6、遊走パラメータ算出ステップS7,S8および増殖率算出ステップS9および領域サイズ算出ステップS3をコンピュータにより実行可能な細胞画像処理プログラムにより構成してもよい。
この場合には、増殖率算出部7は、下式(9)により細胞増殖率ΔNBIRTHn+1/Δtを算出すればよい(ステップS13)。
ΔNBIRTHn+1/Δt
=(Nn+1−Nn)/Δt−ΔNMOVEINn+1/Δt
+ΔNMOVEOUTn+1/Δt+ΔNDEATHn+1/Δt (9)
ここで、細胞Xとして培養容器の底面に接着して増殖する細胞Xを観察している場合には、細胞Xの死亡数ΔNBIRTHn+1は、底面に接着できずに浮遊した細胞数Nn+1を計数することにより容易に検出することができる。
また、遊走パラメータとして、細胞流入率ΔNMOVEINn+1/Δtと細胞流出率ΔNMOVEOUTn+1/Δtとの差分を例示したが、これに代えて、計数領域Rを撮影した2枚の画像Pn,Pn+1の射影変換の変換パラメータである画像変形量、あるいは、画像処理で検出したいくつかの注目細胞の移動量の平均値である注目細胞移動量を採用してもよい。
r=2×(B−C)/(A×K) (10)
L2=2×(B−C)×L1/(A×L1×K+2×(C−B)) (11)
4 細胞数変化率算出部(増殖パラメータ算出部)
5 細胞流入率算出部(遊走パラメータ算出部)
6 細胞流出率算出部(遊走パラメータ算出部)
7 増殖率算出部(増殖率算出部)
X 細胞
Nn,Nn+1 細胞数
ΔN/Δt 細胞数変化率
ΔNMOVEOUT/Δt,ΔNMOVEIN/Δt2 細胞流入率(遊走パラメータ)
ΔNMOVEOUT/Δt,ΔNMOVEOUT/Δt2 細胞流出率(遊走パラメータ)
ΔNBIRTH/Δt 細胞増殖率(増殖パラメータ)
Pn,Pn+1 画像(評価画像)
S3 領域サイズ算出ステップ
S5,S6 増殖パラメータ算出ステップ
S7,S8 遊走パラメータ算出ステップ
S9 増殖率算出ステップ
Claims (13)
- 時間間隔をあけて細胞を撮影することにより取得された複数枚の画像が入力され、
入力された前記画像の内のいずれか2枚の評価画像を処理して該評価画像の所定の計数領域内の単位時間当たりの前記細胞の量の変化を表す細胞数変化率を算出する増殖パラメータ算出部と、
各前記評価画像の前記計数領域の単位時間当たりの前記細胞の流入量を表す細胞流入率および流出量を表す細胞流出率を算出する遊走パラメータ算出部と、
過去の細胞増殖率、前記細胞流入率および前記細胞流出率に基づいて、誤差評価の指標が所定の許容誤差以下となるように前記計数領域の大きさを算出し、前記計数領域を算出した大きさに設定する領域サイズ算出部と、
該領域サイズ算出部により設定された前記計数領域について算出された前記細胞数変化率、前記細胞流入率および前記細胞流出率に基づいて、前記細胞数変化率から前記細胞流入率を減算し、前記細胞流出率を加算することにより、細胞増殖率を算出する増殖率算出部とを備える細胞画像処理装置。 - 前記増殖パラメータ算出部が、単位時間当たりに前記計数領域内において増加した細胞数を前記細胞数変化率として算出する請求項1に記載の細胞画像処理装置。
- 前記増殖パラメータ算出部が、前記計数領域の面積に対する細胞領域の面積の割合であるコンフルエンシーの変化率を前記細胞数変化率として算出する請求項1に記載の細胞画像処理装置。
- 前記遊走パラメータ算出部が、単位時間当たりに前記計数領域の外縁から流入した細胞数と流出した細胞数との差を算出する請求項1から請求項3のいずれかに記載の細胞画像処理装置。
- 前記遊走パラメータ算出部が、前記細胞の長さを前記細胞の速度で除算した時間以下の間隔をあけて撮影した、前記画像を用いる請求項1から請求項4のいずれかに記載の細胞画像処理装置。
- 前記領域サイズ算出部が、過去の前記細胞増殖率に対する過去の前記細胞流入率と前記細胞流出率との差分の比率と前記所定の許容誤差とを比較して、前記計数領域の大きさの下限を算出する請求項1から請求項5のいずれかに記載の細胞画像処理装置。
- 前記計数領域が長方形である請求項1から請求項6のいずれかに記載の細胞画像処理装置。
- 前記計数領域内における単位時間当たりの前記細胞の死亡数である細胞死亡率を算出する細胞死亡率算出部を備える請求項1から請求項7のいずれかに記載の細胞画像処理装置。
- 前記細胞死亡率は、領域内に単位時間当たりに浮遊した細胞数を計数することにより検出される請求項8に記載の細胞画像処理装置。
- 前記細胞数変化率、前記細胞流入率、前記細胞流出率および前記細胞増殖率のうちの少なくとも1つをグラフとして出力する請求項1から請求項9のいずれかに記載の細胞画像処理装置。
- 前記細胞数変化率、前記細胞流入率、前記細胞流出率、前記細胞増殖率および前記細胞死亡率のうちの少なくとも1つを時間変化を表すグラフとして出力する請求項8または請求項9に記載の細胞画像処理装置。
- 時間間隔をあけて細胞を撮影することにより取得された複数枚の画像が入力され、
入力された前記画像の内のいずれか2枚の前記画像を処理して該画像の所定の計数領域内の単位時間当たりの前記細胞の量の変化を表す細胞数変化率を算出する増殖パラメータ算出ステップと、
各前記画像の前記計数領域の単位時間当たりの前記細胞の流入量を表す細胞流入率および流出量を表す細胞流出率を算出する遊走パラメータ算出ステップと、
過去の細胞増殖率、前記細胞流入率および前記細胞流出率に基づいて、誤差評価の指標が所定の許容誤差以下となるように前記計数領域の大きさを算出し、前記計数領域を算出した大きさに設定する領域サイズ算出ステップと、
該領域サイズ算出ステップにより設定された前記計数領域について算出された前記細胞数変化率、前記細胞流入率および前記細胞流出率に基づいて、前記細胞数変化率から前記細胞流入率を減算し、前記細胞流出率を加算することにより、細胞増殖率を算出する増殖率算出ステップとを含む細胞画像処理方法。 - 時間間隔をあけて細胞を撮影することにより取得された複数枚の画像が入力され、
入力された前記画像の内のいずれか2枚の前記画像を処理して該画像の所定の計数領域内の単位時間当たりの前記細胞の量の変化を表す細胞数変化率を算出する増殖パラメータ算出ステップと、
各前記画像の前記計数領域の単位時間当たりの前記細胞の流入量を表す細胞流入率および流出量を表す細胞流出率を算出する遊走パラメータ算出ステップと、
過去の細胞増殖率、前記細胞流入率および前記細胞流出率に基づいて、誤差評価の指標が所定の許容誤差以下となるように前記計数領域の大きさを算出し、前記計数領域を算出した大きさに設定する領域サイズ算出ステップと、
該領域サイズ算出ステップにより設定された前記計数領域について算出された前記細胞数変化率、前記細胞流入率および前記細胞流出率に基づいて、前記細胞数変化率から前記細胞流入率を減算し、前記細胞流出率を加算することにより、細胞増殖率を算出する増殖率算出ステップとをコンピュータに実行させる細胞画像処理プログラム。
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