JP6801000B2 - 細胞画像評価装置および細胞画像評価制御プログラム - Google Patents
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Description
との評価結果を「1」、「分化細胞の領域である」との評価結果を「2」、「白すじが密に存在する領域である」との評価結果を「3」、「未分化細胞の領域である」との評価結果を「4」、および「細胞が積層状態の領域である」との評価結果を「5」として示している。
その領域ER11に対応する第2の細胞画像における領域ER12とが特定される。そして、図7Iに示すように、領域ER11に含まれる関心領域Rのうち、中心に位置する特定の関心領域SR11およびその周辺の関心領域R11の評価結果と、領域ER12の中心に位置する特定の関心領域SR12の評価結果とが対応付けられ、この対応関係が予測器22によって機械学習される。より具体的には、図8に示すように、領域ER11の各関心領域Rの評価結果を左上の評価結果から右下の評価結果に向けて順に配列した学習特徴量が求められ、この学習特徴量に対応する学習クラスとして、領域ER12の特定の関心領域SR12の評価結果が求められる。そして、図8に示す学習特徴量と学習クラスとの関係が、予測器22によって機械学習される。
20 細胞画像評価装置
21 評価器
22 予測器
23 制御部
23a 統合部
23b 操作内容決定部
30 表示装置
40 入力装置
CR 細胞コロニー領域
ER11 領域
ER12 領域
ER21 領域
ER22 領域
ER31 領域
ER32 領域
R 関心領域
SR 特定の関心領域
W ウェル
Claims (15)
- 細胞を撮影した細胞画像の各関心領域について、該各関心領域に含まれる細胞の状態を評価し、該評価結果を出力する評価器と、
時系列に細胞を撮影した少なくとも2以上の細胞画像のうち、成長前段階の細胞を撮影した少なくとも1つの第1の細胞画像内における特定の前記関心領域の周辺領域の前記評価器による評価結果と、前記成長前段階よりも後の時点において前記第1の細胞画像と同じ撮影対象を撮影した第2の細胞画像内における前記特定の関心領域の細胞の状態との関係を予め機械学習させた予測器であって、細胞が収容された容器内を少なくとも1つの特定の時点に撮影した第3の細胞画像の前記評価器による評価結果のうちの複数の関心領域各々の周辺領域の評価結果に基づいて、前記特定の時点よりも後の時点の前記容器内の前記複数の関心領域の細胞の状態を予測して出力する予測器と、
前記予測器により出力された前記複数の関心領域の細胞の状態を統合して、前記容器全体の細胞の状態を取得する統合部と、
を備えた細胞画像評価装置。 - 前記予測器が、前記細胞の状態の出力として、2以上の各状態への遷移確率を出力する請求項1記載の細胞画像評価装置。
- 前記予測器が、前記細胞の状態の出力として、2以上の各状態への遷移確率をそれぞれ出力し、
前記統合部が、前記各関心領域の2以上の各状態の遷移確率を該状態毎に統合して、前記容器全体の細胞の状態を取得する請求項1記載の細胞画像評価装置。 - 前記予測器が、前記細胞の状態の出力として、2以上の各細胞の状態への遷移確率をそれぞれ出力し、
前記統合部が、前記各関心領域の2以上の各状態の遷移確率のうち、最も大きい遷移確率の状態を統合して、前記容器全体の細胞の状態を取得する請求項1記載の細胞画像評価装置。 - 前記予測器が、少なくとも1つの培養条件の入力を受け付ける請求項1から4いずれか1項記載の細胞画像評価装置。
- 前記評価器が、少なくとも細胞が未分化状態であるか、または分化状態であるかを評価する請求項1から5いずれか1項記載の細胞画像評価装置。
- 前記評価器が、少なくとも核小体の密度を評価する請求項1から5いずれか1項記載の細胞画像評価装置。
- 前記評価器が、少なくとも白すじの密度を評価する請求項1から5いずれか1項記載の細胞画像評価装置。
- 前記評価器が、少なくとも細胞が線維芽細胞であるか、またはフィーダー細胞であるかを評価する請求項1から5いずれか1項記載の細胞画像評価装置。
- 前記評価器が、少なくとも細胞が多能性幹細胞であるか、またはフィーダー細胞であるかを評価する請求項1から5いずれか1項記載の細胞画像評価装置。
- 前記評価器が、少なくとも細胞であるか、または非細胞であるかを評価する請求項1から5いずれか1項記載の細胞画像評価装置。
- 前記評価器が、少なくとも細胞が生細胞であるか、または死細胞であるかを評価する請求項1から5いずれか1項記載の細胞画像評価装置。
- 前記予測器から出力された細胞の状態の情報を取得し、該細胞の状態の情報に基づいて、前記細胞に対する操作内容を決定する操作内容決定部を備えた請求項1から12いずれか1項記載の細胞画像評価装置。
- 前記細胞に対する操作内容が、継代、培地交換、培地の変更、薬剤添加、ピッキングまたは遺伝子検査である請求項13記載の細胞画像評価装置。
- コンピュータを、
細胞を撮影した細胞画像の各関心領域について、該各関心領域に含まれる細胞の状態を評価し、該評価結果を出力する評価器と、
時系列に細胞を撮影した少なくとも2以上の細胞画像のうち、成長前段階の細胞を撮影した少なくとも1つの第1の細胞画像内における特定の前記関心領域の周辺領域の前記評価器による評価結果と、前記成長前段階よりも後の時点において前記第1の細胞画像と同じ撮影対象を撮影した第2の細胞画像内における前記特定の関心領域の細胞の状態との関係を予め機械学習させた予測器であって、細胞が収容された容器内を少なくとも1つの特定の時点に撮影した第3の細胞画像の前記評価器による評価結果のうちの複数の関心領域各々の周辺領域の評価結果に基づいて、前記特定の時点よりも後の時点の前記容器内の前記複数の関心領域の細胞の状態を予測して出力する予測器と、
前記予測器により出力された前記複数の関心領域の細胞の状態を統合して、前記容器全体の細胞の状態を取得する統合部として機能させる細胞画像評価プログラム。
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