JP6925019B2 - 細胞内の酸素濃度の変化をモニターするための融合タンパク質 - Google Patents
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Description
[1]
GFP又はその変異体であるドナーと、
配列番号1で表されるアミノ酸配列と少なくとも90%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列から成るタンパク質及び酸素と可逆的に結合することができる化合物を含むアクセプターと
を含む融合タンパク質であって、
アクセプターへ酸素が結合する前後でドナーとアクセプターとの間のFRET効率が変化する、融合タンパク質。
[2]
アクセプターへの酸素の結合前と比較して、アクセプターへの酸素の結合後にドナーとアクセプターとの間のFRET効率が低下する、[1]に記載の融合タンパク質。
[3]
前記ドナーが、配列番号2〜4から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列から成る蛍光タンパク質である、[1]又は[2]に記載の融合タンパク質。
[4]
ドナー及びアクセプターを連結するリンカーをさらに含む、[1]〜[3]のいずれか1つに記載の融合タンパク質。
[5]
前記リンカーがペプチドリンカーである、[4]に記載の融合タンパク質。
[6]
シグナルペプチドをさらに含む、[1]〜[5]のいずれか1つに記載の融合タンパク質。
[7]
酸素と可逆的に結合することができる化合物がヘムである、[1]〜[6]のいずれか1つに記載の融合タンパク質。
[8]
[1]〜[7]のいずれか1つに記載の融合タンパク質(ただし酸素と可逆的に結合することができる化合物を除く)をコードするDNA。
[9]
[8]に記載のDNAを有する組み換えベクター。
[10]
[9]に記載の組み換えベクターにより形質転換された宿主細胞。
[11]
細胞内の酸素濃度の変化をモニターする方法であって、
[1]〜[7]のいずれか1つに記載の融合タンパク質を細胞内に存在させ、
励起光によって励起されたドナーから発生する蛍光を検出し、
検出された蛍光の蛍光強度に基づいて細胞内の酸素濃度の変化をモニターすること
を含む、方法。
GFP又はその変異体であるドナーと、
配列番号1で表されるアミノ酸配列と少なくとも90%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列から成るタンパク質及び酸素と可逆的に結合することができる化合物を含むアクセプターと
を含む融合タンパク質であって、
アクセプターへ酸素が結合する前後でドナーとアクセプターとの間のFRET効率が変化する、融合タンパク質である。以下で「本発明の融合タンパク質」とも呼ぶ。
ANA(Anaerobic aerobic sensor protein)発現用ベクターの調製
蛍光タンパク質VenusとDosHとを、逆平行リンカー(Antiparallel coiled coil linker; APCリンカー)で連結することにより、融合タンパク質(配列番号7)発現用ベクター(pET21a−ANA)を構築した。当該融合タンパク質にヘムが結合したものを、以下で「ANA(Anaerobic aerobic sensor protein)」とも呼ぶ。
ANA−YG発現用ベクターの調製
蛍光タンパク質Venusにおける203番目のチロシン残基をスレオニン残基へと置換(Y203T)したタンパク質とDosHとをAPCリンカーで連結することにより、融合タンパク質(配列番号8)発現用ベクター(pET21a−ANA−YG)を構築した。当該融合タンパク質にヘムが結合したものを、以下で「ANA−YG」とも呼ぶ。ANA−YGは、黄緑色の蛍光を示す変異型ANAである。
ANA−G発現用ベクターの調製
蛍光タンパク質EGFPとDosHとをAPCリンカーで連結することにより、融合タンパク質(配列番号9)発現用ベクター(pET21a−ANA−G)を構築した。当該融合タンパク質にヘムが結合したものを、以下で「ANA−G」とも呼ぶ。ANA−Gは、緑色の蛍光を示す変異型ANAである。pET21a−ANA−GはpET21a−ANAにおけるVenusのコード領域をEGFPのコード領域と入れ替えることで作製した。
大腸菌におけるANA及びその変異体の発現と精製
pET21a−ANAプラスミドを用いて大腸菌BL21株を形質転換し、37℃下、アンピシリン(50μg/ml)を含むLB寒天培地で培養した。翌日、5mLのLB液体培地に植菌し前培養を行った。さらに、この前培養液を1.5LのLB液体培地に植菌し本培養を行った。OD600=0.6の時点で、IPTGを終濃度1mMとなるように添加し、20℃で一晩培養した。菌体を遠心分離により回収し、cOmplete(Roche)とヘミンを含むTNH−バッファー(25mM Tris−HCl;pH8.0、150mM NaCl,25μMヘミン)に懸濁し、ソニケーション(Sonifier model 250、Branson)により大腸菌細胞を破砕した。破砕後、37,000xg、60分間(RP50-2 rotor)遠心し、可溶性画分を分離した。Ni−NTA樹脂を用いて可溶性画分に含まれるANAタンパク質を分離し、20mのイミダゾールを含むTN−バッファーで非特異的吸着を洗浄した後に、250mMのイミダゾールを含むTN−バッファーでANAを溶出した。ANA−YG及びANA−Gについても、pET21a−ANA−YGプラスミド及びpET21a−ANA−Gプラスミドを用いて同様に調製した。
酸素に依存した、ANA及びその変異体の蛍光強度変化の測定
実施例4において外気中で調製したANA、ANA−YG及びANA−Gをそれぞれ嫌気チャンバー(COY, Glass Lake, MI)に入れ、亜ジチオン酸ナトリウムを終濃度0.5mMとなるように添加して10秒間撹拌し、ANA、ANA−YG及びANA−Gに結合した酸素およびそれらのタンパク質溶液中に含まれる溶存酸素を除去した。その後速やかに嫌気的なTN−バッファーを用いて20倍希釈し、酸素解離型のANA、ANA−YG及びANA−Gの溶液(1〜2μM)とした。調製した溶液をキュベットに封入して嫌気チャンバーの外へ出し、嫌気状態を保ったまま蛍光分光光度計(FP8500,Jasco)を用いて蛍光強度を測定した(嫌気)。次にキュベットを開封して溶液を空気に暴露した後10秒間混合し、速やかに蛍光強度を測定した(好気)。ANA溶液では、500nm励起時における527nm蛍光強度を測定した。ANA−YG溶液は、485nm励起時における513nm蛍光強度測定した。ANA−G溶液は、485nm励起時における510nm蛍光強度を測定した。結果を図2〜4に示す。いずれの場合も、嫌気条件下と比較して好気条件下においてFRET効率が低下し、蛍光強度が大きくなった。
ANAの酸素感受性の確認
嫌気チャンバー内の酸素解離型のANA溶液へ、空気飽和したTN−バッファーを、溶存酸素濃度が0μM、6.1μM、17.2μM、18.4μM、19.6μM、20.8μM、22.1μM及び36.8μMとなるように混合した。混合溶液をキュベットに封入して嫌気チャンバーの外へ出し、蛍光分光光度計を用いて500nm励起時における527nm蛍光強度を測定した。結果を図5に示す。ANAは、10μM以下であっても酸素濃度変化を検出することができた。
ANAの蛍光強度変化の可逆性の確認
嫌気チャンバー内において調製した酸素解離型のANA溶液(1μM)をキュベットに封入し、嫌気状態を保ったまま蛍光分光光度計を用いて500nm励起時における527nm蛍光強度を測定した(ステップ1)。キュベットを開封してANA溶液を空気に暴露した後10秒間混合し、500nm励起時における527nm蛍光強度を測定した(ステップ2)。酸素暴露したANA溶液を回収し、終濃度2μMとなるようにヘミンを添加した後にNi−NTA樹脂を用いてANAを分離した。分離されたANAを用いて、前述のように、嫌気チャンバー内において酸素解離型のANA溶液(0.33μM)を調製し、キュベットに封入し、嫌気状態を保ったまま蛍光分光光度計を用いて蛍光強度を測定し(ステップ3)、ANA溶液を空気に暴露して10秒間混合した後に蛍光強度を測定した(ステップ4)。ANAの蛍光強度変化を図6に示す。ANAへの酸素の結合が可逆的であること、及び酸素濃度変化をANAの蛍光強度の変化として検出できることが確認された。
HeLa細胞におけるANA発現コンストラクトの作製
(1)ANA発現用プラスミドの調製
pcDNA3.1(−)を鋳型とし、以下の二つのプライマーを用いてPCRを行い増幅した後、XhoIとBamHI処理(プライマーの下線部が切断部位)を行った。
ミトコンドリアターゲッティング用プラスミド(MTP)とANAとの融合タンパク質(配列番号10)を発現するためのプラスミドを、ANAのコード領域の5’末端にMTP(mitocondrial targeting peptide)をコードする塩基配列を付加することで構築した。MTPコード領域は、pEGFP−N1(Clontech)を鋳型とし、以下の二つのプライマー用いてPCRを行い増幅した。なお、当該融合タンパク質にヘムが結合したものを、以下で「mtp−ANA」とも呼ぶ。
HeLa細胞におけるANAの蛍光の観察
実施例8で調製したプラスミド、pcDNA3.1−ANAおよびpcDNA3.1−mtp−ANAを用いて、ガラスボトムディッシュで培養したHeLa細胞に導入した。形質転換は、Lipofectamin3000 (Life technologies)を用い、付属のプロトコールに従って行った。プラスミドの導入後、細胞内のヘム生合成量を増加させるために培地に5−アミノレブリン酸を添加し、さらに20〜24時間培養して、ANAを発現させた。顕微鏡観察の結果を図7に示す。使用した顕微鏡の仕様は以下の通りである。顕微鏡本体:IX73(Olympus)、ハロゲン光源:TH4−100(Olympus)、蛍光ミラーユニット: U−FYFPフィルター(Olympus)。mtp−ANAを使用した場合には、ミトコンドリアへのANAの局在化が確認された。
protoANA発現用ベクターの調製
蛍光タンパク質VenusとDosHとを、2アミノ酸(Gly−Ser)からなるリンカーで連結した融合タンパク質(配列番号40)の発現用ベクター(pET21a−protoANA)を調製した。なお、当該融合タンパク質にヘムが結合したものを、以下で「protoANA」とも呼ぶ。
酸素に依存したprotoANAの蛍光強度変化の測定
実施例10で調製したprotoANA発現用ベクターを用いて、実施例4と同様の方法でprotoANAを調製した。得られたprotoANAを用いて実施例5と同様の実験を行った結果、嫌気条件下と比較して好気条件下においてFRET効率が低下し、蛍光強度が大きくなった。結果を図8に示す。嫌気条件下と比較して好気条件下においてFRET効率が低下し、蛍光強度が大きくなった。
Claims (10)
- GFP又はその変異体であるドナーと、
配列番号1で表されるアミノ酸配列と少なくとも90%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列から成るタンパク質及び酸素と可逆的に結合することができる化合物を含むアクセプターと
を含む融合タンパク質であって、
アクセプターへ酸素が結合する前後でドナーとアクセプターとの間のFRET効率が変化し、
ここで、前記ドナーは、配列番号2〜4から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列から成る蛍光タンパク質であり、
前記配列番号1で表されるアミノ酸配列と少なくとも90%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列から成るタンパク質は、前記化合物への酸素の可逆的な結合/解離に伴って吸収スペクトルが変化するタンパク質である、融合タンパク質。 - アクセプターへの酸素の結合前と比較して、アクセプターへの酸素の結合後にドナーとアクセプターとの間のFRET効率が低下する、請求項1に記載の融合タンパク質。
- ドナー及びアクセプターを連結するリンカーをさらに含む、請求項1又は2に記載の融合タンパク質。
- 前記リンカーがペプチドリンカーである、請求項3に記載の融合タンパク質。
- シグナルペプチドをさらに含む、請求項1〜4のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
- 酸素と可逆的に結合することができる化合物がヘムである、請求項1〜5のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
- 請求項1〜6のいずれか1項に記載の融合タンパク質(ただし酸素と可逆的に結合することができる化合物を除く)をコードするDNA。
- 請求項7に記載のDNAを有する組み換えベクター。
- 請求項8に記載の組み換えベクターにより形質転換された宿主細胞。
- 細胞内の酸素濃度の変化をモニターする方法であって、
請求項1〜6のいずれか1項に記載の融合タンパク質を細胞内に存在させ、
励起光によって励起されたドナーから発生する蛍光を検出し、
検出された蛍光の蛍光強度に基づいて細胞内の酸素濃度の変化をモニターすること
を含む、方法。
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JP2017040778A JP6925019B2 (ja) | 2017-03-03 | 2017-03-03 | 細胞内の酸素濃度の変化をモニターするための融合タンパク質 |
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CN112940088B (zh) * | 2020-07-23 | 2022-04-26 | 中国农业科学院生物技术研究所 | DosH蛋白中提高蛋白有序性的氨基酸序列以及相关的突变位点和重组蛋白 |
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