JP6810146B2 - 受容体媒介化学療法による癌の治療のためのペプチド化合物およびペプチドコンジュゲート - Google Patents

受容体媒介化学療法による癌の治療のためのペプチド化合物およびペプチドコンジュゲート Download PDF

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Description

関連出願
本出願は、2015年11月24日に出願された米国特許出願第62/259178号の優先権の利益を主張するものであり、当該出願は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本開示は、癌を治療するためのペプチド化合物およびコンジュゲート化合物、プロセス、方法およびこれらの使用に関する。

最近の世界保健機関(WHO)の報告書(2014年2月)によると、2012年には820万人の患者が癌で死亡した。したがって、癌は、発展途上国と先進国の両方において増えつつある健康問題である。また、年間癌症例数は2012年の1400万人から今後20年間で2200万人に増加すると推定されている(WHO、2014年)。現在、癌の古典的治療法は、化学療法、放射線療法および外科手術である。
化学療法に対する耐性は、依然として癌治療の失敗の主要な原因である。この耐性表現型は、多数の機序に起因する。多剤耐性(MDR)とその駆動機序の「伝統的」な理解は、混乱した細胞癌ネットワークの複雑さをあまりにも簡略化し、いくつかの経路/遺伝子ファミリーに重点を置いている(Orit、2013年)。そのような観点から、薬剤耐性は、薬剤排出の誘導、DNA修復の活性化、標的タンパク質の変動、薬物取り込みの減少、代謝の変化、隔離およびアポトーシス経路の変化に関連する(Fodalet、2011年;Gillet、2010年)。最近では、腫瘍内不均一性も、同じ腫瘍内で発生する癌細胞間で観察される差異に関連して、薬物耐性の主要な促進因子であると推測されている。実際、多くの原発ヒト腫瘍は、主として確率過程および微小環境シグナルの結果であると報告された遺伝的に異なる細胞亜集団を含むことが見出されている。腫瘍内の遺伝的差異または不均一性に加えて、治療耐性は、クロマチン修飾またはDNAメチル化に関連するエピジェネティックな変化(Sanz−Moreno、2008年)など、いくつかの他の非遺伝的プロセスによっても引き起こされ得る。これらのプロセスの1つの研究は、単一の遺伝子クローンを用いた系で実施され、腫瘍細胞の間に機能的変動性があると結論付けた(Kreso、2013年;Marusyk、2013年)。明らかに、遺伝的および非遺伝的な仮定の両方と不均一性との統合を新しい実験的および計算的モデルの設計に含め、より良い説明と最終的にはMDRの問題に対する解決策を有するべきである。
多剤耐性
原発腫瘍の治療における臨床的進歩は遅かった。これらの腫瘍の治療に関連する問題の1つは、抗癌薬に対するその応答が比較的弱いことである(Zhou、2008年;Silvia、2015年)。化学療法および免疫療法の有効性は、癌細胞による生来の、または獲得したMDR表現型によって損なわれている。MDR表現型に関与する主要な機序の1つは、MDR細胞からさまざまな抗癌薬を汲み出す膜輸送体であるP−糖タンパク質(P−gp)の発現を含む。P−gpはまた、腎臓、肝臓および腸のような多数の正常分泌組織において発現される。ヒトにおいて、P−gpは2つのMDR遺伝子(MDR1およびMDR3)によってコードされることが報告されている。ヒトMDR1は耐性表現型を付与するが、ヒトMDR3は耐性表現型を付与しない。したがって、P−gpは、癌細胞から薬物を排出してその侵入を制限し、細胞傷害性濃度に達するのを妨げる「保護者(guardian)」と考えることができる。
腫瘍不均一性
腫瘍内および腫瘍間の不均一性
癌は、科学者がそれらに取り組む新しい方法を見つけたとたんに、新たな複雑さを明らかにする、悪意ある敵である。最近の希望は、不正確な化学療法剤(Fisher、2013年)よりも効果的で低毒性の療法を約束する、癌細胞の特異的分子異常に的を絞る新世代の「標的治療薬」に置かれている。しかし、研究者らは、癌の最も古くかつ最もよく知られている複雑性のうちの1つである腫瘍不均一性を、以前は過小評価していた可能性があることを現在は認識している。これは、標的治療薬の成功と失望を部分的に説明し、現在の研究戦略の広範な再検討を促すはずである。
腫瘍不均一性は、原発腫瘍およびその転移腫瘍内、または同じ組織病理学的サブタイプの腫瘍間(それぞれ、腫瘍内および腫瘍間)の、異なる生物学的挙動を抱え得る異なる遺伝子型および表現型を有する細胞の亜集団の存在を指す(Corbin、2013年)。奥深い配列決定技術の出現により、腫瘍内および腫瘍間の不均一性の程度および出現率はますます認識されている。日常的な病理学的評価の一部を形成する腫瘍内不均一性の特徴が存在するが、その決定はまだ臨床的意思決定プロセスの一部を形成していない。核多形性は、腫瘍内不均一性の別の例であり、これは、例えば、乳癌のグレーディングにおいて考慮される。同一の腫瘍型の患者間、および同じ患者の異なる腫瘍部位の間で、腫瘍の挙動に著しい変化があり、後者は、通常、治療に対する差次的または混合型の応答として現れることも、癌を治療する臨床医には容易に明らかである。
腫瘍の進行および不均一性のモデルとしてのクローン進化
癌発生のクローン進化モデルはNowell(1976年)によって最初に提唱され、ダーウィンの自然淘汰モデル、すなわち遺伝子的に不安定な細胞は遺伝的変化を蓄積し、選択圧は生物学的適応優位性を有する変異亜集団の成長と生存に有利に働くことについて詳細に述べている。空間的および時間的不均一性は、全体として、腫瘍が、変動する腫瘍微小環境に適応可能にし得る。要約すると、不均一な腫瘍は複雑な生態系または社会とみなされるべきであり、小さな腫瘍亜集団であっても腫瘍全体の成長に影響を及ぼし、それによって腫瘍の不均一性を積極的に維持することができると主張されている(Heppner、1984年;Marusyk、2010年;Bonavia、2011年)。このモデルでは、サブクローンは腫瘍微小環境内のさまざまな生態的地位を占め、腫瘍「社会」の生存優位性は個々の亜集団の生存優位性を上回り、サブクローン間の関係は、この目的のために競合的、片利共生的、または相利共生的となり得る。
腫瘍不均一性の臨床的意義
腫瘍病変内および腫瘍病変間の亜集団間の関係を含む癌不均一性の問題は、癌における薬物療法に難解な密接な関係を有する可能性がある。重大な増殖または生存経路に対する腫瘍の依存性を利用しようとする標的療法は、ある範囲の固形腫瘍タイプにおいて患者の転帰を有意に改善したが、進行した疾患の大多数において、標的治療がすべての分子的に選択された患者に役立たないことも明らかであり、臨床的利益が観察される場合でさえ、それは多くの場合限られた期間である(Gore、2011年;Diaz、2012年)。腫瘍不均一性は、これらの臨床現象を部分的に説明することができ、これはMDR表現型を回避するより効率的なプラットフォームの開発を促す。
Orit、2013年 Fodalet、2011年 Gillet、2010年 Sanz−Moreno、2008年 Kreso、2013年 Marusyk、2013年 Zhou、2008年 Silvia、2015年 Fisher、2013年 Corbin、2013年 Nowell、1976年 Heppner、1984年 Marusyk、2010年 Bonavia、2011年 Gore、2011年 Diaz、2012年
したがって、第1の態様は、式(I)、式(II)、式(III)、式(IV)、式(V)、式(VI)、式(VII)、式(VIII)、式(IX)、式(X)、式(XI)および式(XII):
GVXAKAGVXNXFKSESY(I)(配列番号1)
(XGVX10AKAGVX11NX12FKSESY(配列番号2)
YKX13LRRX14APRWDX15PLRDPALRX1617L(III)(配列番号3)
YKX18LRR(X19PLRDPALRX2021L(IV)(配列番号4)
IKLSGGVQAKAGVINMDKSESM(V)(配列番号5)
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESY(VI)(配列番号6)
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESYK(VII)(配列番号7)
GVQAKAGVINMFKSESY(VIII)(配列番号8)
GVRAKAGVRNMFKSESY(IX)(配列番号9)
GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY(X)(配列番号10)
YKSLRRKAPRWDAPLRDPALRQLL(XI)(配列番号11)
YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRQLL(XII)(配列番号12)
YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRPLL(XIII)(配列番号13)
(式中、
1、2、3、4、5、、X、X、X、X10、X11、X12、X13、X14、X15、18およびX19は独立して、任意のアミノ酸から選択され、
16、X17、X20およびX21は独立して、Q、P、Y、IおよびLから選択され、
nは0、1、2、3、4または5であり、
が複数存在する場合、Xの各々は独立して、任意のアミノ酸から選択され、
19が複数存在する場合、Xの各々は独立して、任意のアミノ酸から選択され、
少なくとも1つの保護基および/または少なくとも1つの標識剤が、場合によりN末端および/またはC末端においてペプチドに連結されている)
の化合物から選択される化合物と少なくとも80%の配列同一性を有するペプチド化合物である。
さらなる態様において、実際には、約5または6個のアミノ酸が省略または除去されている、本開示に記載の任意のペプチド化合物であるペプチド化合物が提供される。
さらなる態様において、実際には、先に提示されたペプチド化合物において定義された少なくとも5個または少なくとも6個の連続するアミノ酸を含む化合物であるペプチド化合物が提供される。
さらなる態様において、式(I)、式(II)、式(III)、式(IV)、式(V)、式(VI)、式(VII)、式(VIII)、式(IX)、式(X)、式(XI)および式(XII):
GVXAKAGVXNXFKSESY(I)(配列番号1)
(XGVX10AKAGVX11NX12FKSESY(配列番号2)
YKX13LRRX14APRWDX15PLRDPALRX1617L(III)(配列番号3)
YKX18LRR(X19PLRDPALRX2021L(IV)(配列番号4)
IKLSGGVQAKAGVINMDKSESM(V)(配列番号5)
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESY(VI)(配列番号6)
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESYK(VII)(配列番号7)
GVQAKAGVINMFKSESY(VIII)(配列番号8)
GVRAKAGVRNMFKSESY(IX)(配列番号9)
GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY(X)(配列番号10)
YKSLRRKAPRWDAPLRDPALRQLL(XI)(配列番号11)
YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRQLL(XII)(配列番号12)
YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRPLL(XIII)(配列番号13)
(式中、
1、2、3、4、5、、X、X、X、X10、X11、X12、X13、X14、X15、18およびX19は独立して、任意のアミノ酸から選択され、
16、X17、X20およびX21は独立して、Q、P、Y、IおよびLから選択され、
nは0、1、2、3、4または5であり、
が複数存在する場合、Xの各々は独立して、任意のアミノ酸から選択され、
19が複数存在する場合、Xの各々は独立して、任意のアミノ酸から選択され、
少なくとも1つの保護基および/または少なくとも1つの標識剤が、場合によりN末端および/またはC末端においてペプチドに連結されている)
の化合物から選択される化合物と少なくとも80%の配列同一性を有するペプチド化合物である。
さらなる態様において、
A−(B)
(式中、
nは1、2、3または4であり、
Aは、場合により保護基によって保護されている本開示に定義されるペプチド化合物であり、および
Bは、BがAに連結されている少なくとも1つの治療剤である)
の式を有するコンジュゲート化合物が本明細書において開示される。
さらなる態様において、
A−(B)
(式中、
nは1、2、3または4であり、
Aは、場合により保護基によって保護されている本開示に定義されるペプチド化合物であり、および
Bは、ペプチド化合物の遊離アミンにおいて、ペプチド化合物のN末端位において、ペプチド化合物の遊離−SHにおいて、またはペプチド化合物の遊離カルボキシルにおいて、BがAに連結されている少なくとも1つの治療剤である)
の式を有するコンジュゲート化合物が本明細書において開示される。
本明細書に開示のさらなる態様は、
A−(B)
(式中、
nは1、2、3または4であり、
Aは、場合により保護基によって保護されている本開示に定義されるペプチド化合物であり、および
Bは、ペプチド化合物のリジン残基の遊離アミンにおいて場合によりリンカーを介して、またはペプチド化合物のN末端位において、場合によりリンカーを介してBがAに連結されている少なくとも1つの治療剤である)
の式を有するコンジュゲート化合物である。
さらなる態様において、本明細書に開示のコンジュゲート化合物を調製するための方法であって、
中間体を得るためにリンカーと治療剤とを反応させる工程;
場合により中間体を精製する工程;
治療剤がリンカーを介してペプチド化合物に連結されているコンジュゲート化合物を得るように、中間体とペプチド化合物とを反応させる工程;および
場合によりコンジュゲート化合物を精製する工程;
を含み、
治療剤が、リジン残基の遊離アミンにおいて、またはN末端においてペプチド化合物に連結されており、ペプチド化合物が1、2、3または4つの連結治療剤分子を含む方法が提供される。
別の態様において、本明細書に開示の少なくとも1つの化合物の治療有効量を、それを必要とする対象に投与する工程を含む、癌を治療する方法が提供される。
別の態様において、ソルチリンを発現する少なくとも1つの癌細胞を、本明細書に定義される少なくとも1つの化合物と接触させる工程を含む、ソルチリン発現を伴う癌を治療する方法が提供される。
別の態様において、本明細書に定義される少なくとも1つの化合物の治療有効量を、それを必要とする対象に投与する工程を含む、ソルチリン発現を伴う疾患を治療する方法が提供される。
別の態様において、癌を治療するための、本明細書に開示の化合物の使用が提供される。
別の態様は、少なくとも2つの本明細書に開示の化合物を含むライブラリーである。
別の態様は、本開示に定義される少なくとも1つの化合物を含むリポソーム、グラフェンまたはナノ粒子である。
別の態様は、本開示に定義される少なくとも1つの化合物でコーティングされたリポソーム、グラフェンまたはナノ粒子である。
別の態様は、少なくとも1つの治療剤またはsiRNAが充填されたリポソーム、グラフェンまたはナノ粒子であり、リポソームは、本開示に定義される少なくとも1つの化合物でコーティングされる。
別の態様は、本開示に定義されるリポソーム、グラフェンまたはナノ粒子などを含む薬物送達システムに関する。
別の態様は、本開示に定義されるリポソーム、グラフェンまたはナノ粒子の薬物送達システムにおける使用である。
さらなる態様は、本明細書に開示の2つ以上の化合物を含む多量体に関する。
本開示のさらなる特徴および利点は、添付図面において例を用いて例示される、特定の実施形態の以下の説明からより容易に明らかになるであろう。
表面プラズモン共鳴を用いたKatanaペプチドとソルチリンとの相互作用を示す。ビオチン化Katanaペプチドをストレプトアビジンセンサーチップ上に固定化した。A.次いで、可溶性ソルチリンを固定化ペプチド上に注入した。次いで、表面プラズモン共鳴シグナルを経時的にモニターした。 細胞表面における、排出ポンプのP−糖タンパク質(P−gpまたはMDR1)の先行技術表現である。多剤耐性に関連する排出ポンプのP−gpまたはMDR1は、多くの癌細胞およびさまざまな組織の細胞表面で高度に発現される。 ヒト癌細胞株におけるソルチリンの免疫検出を示す。ヒト癌細胞溶解物由来の等量のタンパク質をゲル電気泳動により分離した。電気泳動後、タンパク質をPVDF膜に移し、このソルチリン受容体に対するモノクローナル抗体を用いてソルチリンを免疫検出した。ソルチリンは、ホースラッディシュペルオキシダーゼおよび化学発光試薬に結合させたマウスIgGに対する二次抗体によって視覚化することができた。 Katanaペプチドにコンジュゲートした抗癌薬の概略図である。 Katanaペプチドにコンジュゲートした植物化学物質の概略図である。 薬物−Katanaペプチドコンジュゲートの構造を示す。ドセタキセルとのKatanaペプチドコンジュゲートの例である。異なる数(n=1〜4)の抗癌剤または植物化学物質分子を、KatanaペプチドのN末端およびリジンに組み込むことができる。 薬物−Katanaペプチドコンジュゲートの構造を示す。ドキソルビシンとのKatanaペプチドコンジュゲートの例である。異なる数(n=1〜4)の抗癌剤または植物化学物質分子を、KatanaペプチドのN末端およびリジンに組み込むことができる。 薬物−Katanaペプチドコンジュゲートの構造を示す。クルクミンとの植物化学物質−Katanaペプチドコンジュゲートの例である。異なる数(n=1〜4)の抗癌剤または植物化学物質分子を、KatanaペプチドのN末端およびリジンに組み込むことができる。 MDR1をトランスフェクトしたMDCK細胞における、非コンジュゲート薬物およびKatana−ペプチド−薬物コンジュゲートの取り込みを示す。6A.MDCK−MDR1細胞を、50nMの[H]−ドセタキセルまたは[125I]−Katanaペプチド−ドセタキセルコンジュゲート(KBA105)のいずれかと、P−gp(MDR1)阻害剤のシクロスポリンA(CsA)(10μM)の存在下または非存在下で37℃において1時間インキュベートした。6B.MDCK−MDR1細胞を、50nMの[14C]−ドキソルビシンまたは[125I]−Katanaペプチド−ドキソルビシンコンジュゲート(KBB106)のいずれかと、CsA(10μM)の存在下または非存在下で37℃において1時間インキュベートした。インキュベーション後、細胞を洗浄し、細胞に蓄積した放射活性を定量した。結果は、取り込みfmol/タンパク質1mgを単位として表した。 SKOV3癌細胞における放射標識ドセタキセルおよびKatanaコンジュゲート(KBA105)の取り込みを示す。細胞を放射標識化合物と共に2時間までインキュベートした。インキュベーション後、細胞をPBSで3回洗浄し、蓄積した放射活性を定量した。結果を、時間の関数としての取り込み(fmol/タンパク質1mg)で表した。 SK−MEL28癌細胞における放射標識ドセタキセルおよびKatanaコンジュゲート(KBA105)の取り込みを示す。細胞を放射標識化合物と共に2時間までインキュベートした。インキュベーション後、細胞をPBSで3回洗浄し、蓄積した放射活性を定量した。結果を、時間の関数としての取り込み(fmol/タンパク質1mg)で表した。 Katanaドキソルビシンコンジュゲート(KBB106)の取り込みが、ソルチリン発現が減少した細胞において、またはソルチリンリガンドによって減少したことを示す。卵巣癌細胞にソルチリンsiRNA(siSortilin)を24時間トランスフェクトし、次いでKBB106と共にインキュベートした。KBB106の蓄積を、蛍光ドキソルビシンの放出によって、時間の関数としてモニターした。 Katanaドキソルビシンコンジュゲート(KBB106)の取り込みが、ソルチリン発現が減少した細胞において、またはソルチリンリガンドによって減少したことを示す。卵巣癌細胞を、ソルチリンリガンド(Katanaペプチド、プログラニュリン)の存在下または非存在下においてKBB106と共にインキュベートした。KBB106の蓄積を、蛍光ドキソルビシンの放出によって推定した。 コンジュゲートドセタキセルが卵巣癌細胞のより良好で持続的な細胞死を誘導することを示す。卵巣(SKOV3)癌細胞のアポトーシスに対するKBA105の効果を、ドセタキセルのそれと比較した。インキュベーション後、細胞を洗浄し、アネキシンVで染色した。 コンジュゲートドセタキセルが卵巣癌細胞のより良好で持続的な細胞死を誘導することを示す。コンジュゲートドセタキセルは、非コンジュゲートドセタキセルよりも強いアポトーシスを誘導する。このレベルのアポトーシスは、P−gp(MDR1)阻害剤のシクロスポリンA(CsA)の存在下でのドセタキセルの測定と同様である。 コンジュゲートドセタキセルが卵巣癌細胞のより良好で持続的な細胞死を誘導することを示す。ドセタキセルと比較した、KBA015によるアポトーシス効力の用量依存的増加。漸増濃度のKBA105またはドセタキセルと共に細胞を5時間インキュベートし、次いでアポトーシスのレベルを決定した。結果を、薬物濃度の関数としてのアポトーシス百分率で表す。 卵巣癌、皮膚癌および乳癌細胞のアポトーシスに対するKatana−薬物コンジュゲートの効果を示す。癌細胞を2μMのKatana−薬物コンジュゲートまたは非コンジュゲートのドセタキセルもしくはカバジタキセルと共に5時間インキュベートした。インキュベーション後、細胞を洗浄し、アネキシンVで染色した。結果を、異なる薬物のアポトーシス百分率で表した。 非コンジュゲートペプチドおよびソルチリンリガンドによる、癌細胞アポトーシスに対するKatana−薬物コンジュゲート効果の逆転を示す。遊離ペプチド、ニューロテンシン(NT)およびプログラニュリンの非存在下または存在下で、卵巣(SKOV3)癌細胞を2μMのドセタキセル(Docetaxe)Katana−薬物コンジュゲートKBA−105(11A)およびKBA−201(11B)と共に5時間インキュベートした。インキュベーション後、細胞を洗浄し、アネキシンVで染色した。結果を、SKOV3癌細胞のアポトーシス百分率で表した。 Katana−ペプチドにコンジュゲートさせたドセタキセルの、卵巣癌細胞に対する抗遊走効果の増加を示す。 卵巣癌細胞におけるコンジュゲートドセタキセルの受容体媒介内在化に関するKatanaプラットフォーム送達および証拠の検証を提供する一連のグラフである。ニューロテンシンとドセタキセルとの同時インキュベーションは、細胞遊走に対するドセタキセルの効果を変化させてない。対照的に、Katana−ドセタキセルコンジュゲートへの遊離ペプチドまたはニューロテンシンの付加は、SKOV3遊走に対するその効果を逆転させる。対照的に、Katana−ドセタキセルコンジュゲートへの遊離ペプチドまたはニューロテンシンの付加は、SKOV3遊走に対するその効果を逆転させる。 卵巣癌細胞におけるコンジュゲートドセタキセルの受容体媒介内在化に関するKatanaプラットフォーム送達および証拠の検証を提供する一連のグラフである。Katana−ペプチド(遊離ペプチド)とドセタキセルとの同時インキュベーションは、細胞遊走に対するドセタキセルの効果を変化させてない。対照的に、Katana−ドセタキセルコンジュゲートへの遊離ペプチドまたはニューロテンシンの付加は、SKOV3遊走に対するその効果を逆転させる。 卵巣癌細胞におけるコンジュゲートドセタキセルの受容体媒介内在化に関するKatanaプラットフォーム送達および証拠の検証を提供する一連のグラフである。結果は、特異的ソルチリンsiRNAを用いたソルチリン遺伝子サイレンシングが、卵巣癌細胞の遊走に対するドセタキセルコンジュゲート(KBA105)の効果を逆転させることを示している。 卵巣癌、皮膚癌および乳癌細胞の遊走に対するKatana−薬物コンジュゲートの効果を示す。細胞を異なるKatanaタキサンコンジュゲートと共に2時間インキュベートし、次いで細胞遊走を行った。すべてのコンジュゲートは、さまざまな癌細胞の遊走に強く影響を与えた。 卵巣癌細胞の遊走に対するKatana−薬物コンジュゲートの効果を示す。細胞を、漸増濃度のドキソルビシンまたはコンジュゲートドキソルビシン(KBB106)と共に2時間インキュベートし、細胞遊走を行った。 卵巣癌細胞の遊走に対するKatana−薬物コンジュゲートの効果を示す。結果は、ニューロテンシン(NT)およびKatanaペプチド(KBP106)が、卵巣癌細胞(ES−2)遊走に対するKBB106の効果を逆転させたことを示している。 卵巣癌細胞の遊走に対するKatana−薬物コンジュゲートの効果を示す。ソルチリンリガンドであるプログラニュリン(PGR)もまた、卵巣癌細胞(ES−2)遊走に対するドキソルビシンコンジュゲート(KBB106)の効果を逆転させた。 卵巣癌および脳腫瘍における相対的なソルチリン発現の図である。ヒト正常組織および卵巣癌生検(Ghaemimaneshら、2014年)のウエスタンブロットにより、ソルチリンが検出された。結果は、正常組織と比較して、卵巣癌生検でソルチリンが過剰発現されることを示す。 卵巣癌および脳腫瘍における相対的なソルチリン発現の図である。異なる脳腫瘍グレードの患者由来のcDNAサンプル(Origene;Rockville、MD、USA)において、ソルチリン遺伝子レベルを推定した。 卵巣癌および脳腫瘍における相対的なソルチリン発現の図である。卵巣腫瘍グレードの患者由来のcDNAサンプル(Origene;Rockville、MD、USA)において、ソルチリン遺伝子レベルを推定した。 Human Protein Atlasウェブサイト(http://www.proteinatlast.org)のヒト癌におけるソルチリン(SORT1)発現の先行技術表現である。 免疫組織化学(IHC)による卵巣組織におけるソルチリンの発現を示す。ソルチリンは、原発卵巣腫瘍および卵巣転移腫瘍において過剰発現し、非悪性の健康な卵巣組織においてほぼ検出不能である。 免疫組織化学(IHC)による卵巣組織におけるソルチリンの発現を示す。ソルチリンは、一連の正常卵巣組織、良性腫瘍、境界性腫瘍、悪性腫瘍ならびに卵巣癌由来の転移腫瘍においてもIHCによって検出された。結果は、ソルチリン発現がその悪性表現型の関数として増加し、卵巣転移腫瘍においてより高いことを示す。 ドセタキセル−Katanaペプチドコンジュゲート(KBA−105)の薬物動態を表す図である。マウスに5mg/kgの放射標識コンジュゲートを注射した。血漿を異なる時点で収集し、放射活性を計数し、血漿レベルを時間の関数としてプロットした。次いで、「PK solutions」のソフトウェアを使用して、薬物動態パラメータを曲線から抽出した。 時間の関数としての非コンジュゲートおよびコンジュゲートドセタキセルの濃度を示すグラフである。マウスに、放射線標識[H]−ドセタキセルまたは放射性標識[125I]−KBA105をドセタキセルの等用量(ドセタキセル=2.2mg/kg;KBA105=5mg/kg)で静脈注射した。血漿サンプルをさまざまな時点で採取し、放射活性を定量した。結果を、時間の関数としての血漿中のKBA105またはドセタキセル濃度で表す。GraphPad Prismソフトウェアを用いて、KBA105およびドセタキセルについて、この期間の曲線下の面積(AUC1−24)を評価した。KBA105およびドセタキセルのAUC1−24の間の比は約35であると計算した。 125I]−Katanaペプチド−ドセタキセルの組織分布を示す。CD−1マウスに、静脈内ボーラス注射(21A)を介して5mg/kgの放射性標識コンジュゲート、または2.2mgの放射性標識ドセタキセル(21B)を注射した。表記の時間(1時間、6時間、24時間)にマウスを犠牲にし、生理食塩水で8分間灌流した。次いで、組織を収集し、放射活性を測定した。結果は、ng/組織1gを単位として表す。 卵巣皮下腫瘍に対するKBA105およびドセタキセルの効果を示す。SKOV3癌細胞をマウスの側腹部に移植した。腫瘍成長は、Carestreamの近赤外イメージングシステムを用いた発光によってモニターした。腫瘍が同様の発光に達したとき、ドセタキセルをドセタキセルの等用量(10mg/kg/週)で用いてマウスを処置した。 卵巣皮下腫瘍に対するKBA105およびドセタキセルの効果を示す。SKOV3癌細胞をマウスの側腹部に移植した。腫瘍成長は、Carestreamの近赤外イメージングシステムを用いた発光によってモニターした。腫瘍が同様の発光に達したとき、KBA105をドセタキセルの等用量(10mg/kg/週)で用いてマウスを処置した。 図22の発光の定量を示す。結果を、処置後の日数の関数として発光強度で表す。 処置日にわたってモニターした、ドセタキセルおよびKBA105で処置したマウスの体重を示すグラフである。結果は、投与されたドセタキセル用量が、体重に強い影響を及ぼすことを示している。対照的に、ドセタキセルの等用量では、KBA105はマウスの体重に影響を及ぼさない。これらの結果は、ドセタキセルの等用量ではKBA105がより良好に忍容されることを示している。 卵巣皮下腫瘍に対するドキソルビシンコンジュゲート(KBB106)および非コンジュゲートドキソルビシンの効果を示す。マウスの側腹部にES−2卵巣癌細胞を移植した。腫瘍成長は、キャリパーを用いて測定した。腫瘍が約150mmの腫瘍体積に達したとき、マウスを、ドキソルビシンまたはKBB106のドキソルビシンの等用量(6mg/kg/週)で処置した。 卵巣皮下腫瘍に対するドキソルビシンコンジュゲート(KBB106)および非コンジュゲートドキソルビシンの効果を示す。結果は、ドキソルビシンまたはKBB106で処置したマウスにおける、処置後14日目のビヒクル群と比較した腫瘍体積の増加を示す。 卵巣皮下腫瘍に対するドキソルビシンコンジュゲート(KBB106)および非コンジュゲートドキソルビシンの効果を示す。KBB106の有効性および忍容性のため、コンジュゲートを用いたマウスの処置は処置後66日目まで続けた。 卵巣皮下腫瘍に対するドキソルビシンコンジュゲート(KBB106)の効果を示す。マウスの側腹部にSKOV3卵巣癌細胞を移植した。腫瘍が約150mmの体積に達したとき、矢印で示すようにマウスをKBB106(18mg/kg/週)で処置した。結果は、KBB106で処置したマウスにおける、ビヒクル群と比較した腫瘍体積の進行(D0における最初の腫瘍体積を差し引いた)を示す。 卵巣皮下腫瘍に対するドキソルビシンコンジュゲート(KBB106)の効果を示す。処置の間、マウスの体重をモニターした。KBB106で処置したマウスにおける体重減少の欠如は、処置が忍容性良好であることを示唆している。 乳房皮下腫瘍に対するドセタキセルコンジュゲート(KBA106)および非コンジュゲートドセタキセルの効果を示す。マウスの側腹部に、ルシフェラーゼを発現するMDA−MB231乳癌細胞を移植した。腫瘍増殖を、Carestreamのインビボイメージングシステムを用いて、発光により視覚化した。マウスを、ビヒクル、ドセタキセル(15mg/kg/週)またはKBA106(50mg/kg/週)で処置した。初期発光強度は差し引いた。 乳房皮下腫瘍に対するドセタキセルコンジュゲート(KBA106)および非コンジュゲートドセタキセルの効果を示す。結果は、74日目の癌細胞に関連する残留発光によって評価された残存腫瘍負荷を示す。腫瘍サイズがエンドポイント限界に達したため、すべてのマウスを犠牲にしたので、ビヒクルで処置したマウスについての値は利用できなかった(N/A)。 乳房皮下腫瘍に対するドセタキセルコンジュゲート(KBA106)および非コンジュゲートドセタキセルの効果を示す。腫瘍発光の結果は、初期の腫瘍発光と比較した、処置後D74日目の進行の百分率で表した。ドセタキセル群では腫瘍発光は100%増加したが、一方、KBA106で処置した群では発光は100%減少した。KBA106群では、処置後74日目には発光は検出不能になり、これらのマウスには残存腫瘍がないことが示唆された。 癌細胞増殖に対するクルクミンコンジュゲート(KBC106)および非コンジュゲートクルクミンの効果を示す。乳癌細胞(MDA−MB231)を、漸増濃度のKBC106またはクルクミンと共にインキュベートした。72時間後、両方の分子の抗増殖特性を評価するために、チミジン取り込みアッセイを行った。抗増殖性曲線からIC50値を抽出した。結果は、KBC106が、非コンジュゲートクルクミンと比較して、これらの乳癌細胞に対してより強い抗増殖活性(約100倍)を有することを示している。 ES−2卵巣癌細胞におけるクルクミンコンジュゲート(KBC106)の優先的なソルチリン依存性取り込みを示す。癌細胞を、KBC106またはクルクミンと共にインキュベートした。両方の分子の取り込みを、蛍光ライブイメージングによって評価した。KBC1006についてより高い蛍光の蓄積が検出され、コンジュゲートのより良い細胞内在化が示された。 ES−2卵巣癌細胞におけるクルクミンコンジュゲート(KBC106)の優先的なソルチリン依存性取り込みを示す。KBC106の取り込みを、ソルチリンリガンドであるニューロテンシン(NT)およびプログラニュリンならびに遊離Katanaペプチドの存在下でインビトロ蛍光イメージングによってモニターした。卵巣癌細胞におけるKBC106の蓄積は、ソルチリンリガンドによって阻害された。 ES−2卵巣癌細胞におけるクルクミンコンジュゲート(KBC106)の優先的なソルチリン依存性取り込みを示す。KBC106の蓄積の結果を、ソルチリンリガンドの存在下または非存在下におけるKBC106蛍光強度で表した。データは、ソルチリンリガンドによるKBC106の取り込みの薬理学的競合を実証している。 クルクミンコンジュゲート(KBC106)が癌細胞アポトーシスを誘導することの実証である。 クルクミンコンジュゲート(KBC106)が子宮内膜(MES)皮下腫瘍の腫瘍成長を阻害することの実証である。マウスの側腹部に子宮内膜(MES)癌細胞を移植した。腫瘍成長は、キャリパーを用いて測定した。腫瘍が約150mmの体積に達したとき、マウスを60mg/kg/週のKBC106で週2回処置した。
本明細書中で使用される場合、用語「ペプチド化合物」または「Katanaペプチド」、「Katana Biopharma Peptide」または「KBP」は、例えば、細菌タンパク質に由来するペプチド、または多剤耐性癌細胞を含む癌細胞上に発現される受容体を標的とする受容体のリガンドに由来するペプチドを指す。例えば、該ペプチド化合物は、細胞透過に関与する細菌タンパク質に由来するか、または例えば、プログラニュリンおよびニューロテンシンなどのソルチリンリガンドに由来し得る。特定の実施形態において、ペプチド化合物は、(例えば、共有結合、原子またはリンカーを介して)少なくとも1つの治療剤(抗癌剤または植物化学物質など)に連結され、それにより、例えば、癌を治療するために使用可能なコンジュゲート化合物が形成される。特定の他の実施形態において、ペプチド化合物は、リポソームの表面に使用することができる。例えば、ペプチド化合物は、少なくとも1つの治療剤(抗癌剤または植物化学物質、または遺伝子またはsiRNAなど)を充填することができるリポソームまたはナノ粒子をコーティングするために使用することができる。
用語「Katana Biopharma Peptideファミリー1ペプチド化合物」または「KBPファミリー1ペプチド化合物」は、細菌細胞透過性タンパク質に由来するペプチド化合物を指す。例えば、KBPファミリー1ペプチド化合物は、IKLSGGVQAKAGVINMDKSESM(配列番号5)のアミノ酸配列を有するタンパク質に由来し得る。KBPファミリー1ペプチド化合物の非限定的な例を以下に示す:
本明細書で使用される場合、ペプチド化合物KBP−101は、IKLSGGVQAKAGVINMDKSESM(配列番号5)のアミノ酸配列によって表される。
本明細書で使用される場合、ペプチド化合物KBP−102は、スクシニル基がN末端に結合した配列番号6のペプチド配列を含む、スクシニル−IKLSGGVQAKAGVINMFKSESYのアミノ酸配列によって表される。
本明細書で使用される場合、ペプチド化合物KBP−103は、ビオチン分子がC末端に連結された配列番号7のペプチド配列を含む、IKLSGGVQAKAGVINMFKSESYK(ビオチン)のアミノ酸配列によって表される。
本明細書で使用される場合、ペプチド化合物KBP−104は、GVQAKAGVINMFKSESY(配列番号8)のアミノ酸配列によって表される。
本明細書で使用される場合、ペプチド化合物KBP−105は、アセチル−GVRAKAGVRNMFKSESY(配列番号14)のアミノ酸配列によって表される。
本明細書で使用される場合、ペプチド化合物KBP−106は、アセチル−GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY(配列番号15)のアミノ酸配列によって表される。
用語「Katana Biopharma Peptideファミリー2ペプチド化合物」または「KBPファミリー2ペプチド化合物」は、ソルチリンリガンドであるプログラニュリンおよびニューロテンシンに由来するペプチドを指す。例えば、ペプチドは、ヒト、ラットまたはマウスのプログラニュリンから誘導することができる。例えば、KBPファミリー2ペプチド化合物は、例えばアミノ酸配列KCLRREAPRWDAPLRDPALRQLL(配列番号19)を有するヒトプログラニュリンから、例えばアミノ酸配列KCLRKKTPRWDILLRDPAPRPLL(配列番号20)を有するラットプログラニュリンから、例えばアミノ酸配列KCLRKKIPRWDMFLRDPVPRPLL(配列番号21)を有するマウスプログラニュリンから、または例えばアミノ酸配列XLYENKPRRPYIL(配列番号22)を有するニューロテンシンから誘導することができる。KBPファミリー2ペプチド化合物の非限定的な例を以下に示す:
本明細書で使用される場合、ペプチド化合物KBP−201は、アセチル−YKSLRRKAPRWDAPLRDPALRQLL(配列番号16)のアミノ酸配列によって表される。
本明細書で使用される場合、ペプチド化合物KBP−202は、アセチル−YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRQLL(配列番号17)のアミノ酸配列によって表される。
本明細書で使用される場合、ペプチド化合物KBP−203は、アセチル−YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRPLL(配列番号18)のアミノ酸配列によって表される。
本明細書で使用される用語「ソルチリン」は、受容体のVacuolar Protein Sorting 10タンパク質(Vps10)ファミリーに属する、SORT1遺伝子によってコードされるニューロン1型膜糖タンパク質を指す。ソルチリン(ニューロテンシン受容体3としても知られている)は、中枢神経系および末梢神経系において豊富に発現され、他のタイプの組織においても発現される。例えば、ソルチリンの発現は、例えば、卵巣癌、乳癌、結腸癌および前立腺癌を含む多くの癌においてアップレギュレートされる。ソルチリンは2種の形態、完全長形態(110kDa)、およびソルチリン過剰発現細胞由来の上清培地において以前に検出された、その大型内腔ドメイン(または外部ドメイン)に対応する切断形態(95kDa)で存在し得る(Navarroら、2002年)。本明細書に記載のペプチド化合物およびコンジュゲート化合物は、ソルチリンに対する高い結合親和性を有することができ、したがって、ソルチリンを発現または過剰発現する癌細胞を特異的に標的とすることができる。
本文書において使用される場合、用語「化合物」は、式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)、(VI)、(VII)、(VIII)、(IX)、(X)、(XI)、(XII)、(XIII)、(XIV)、(XV)、(XVI)、(XVII)、(XVIII)、(XIX)、(XX)、(XXI)、(XXII)、(XXIII)、(XXIV)(XXV)、(XXVI)、(XXVII)、(XXVIII)、(XXIX)、(XXX)、(XXXI)、(XXXII)、(XXXIII)、(XXXIV)、(XXXV)、(XXXVI)、(XXXVII)、(XXXVIII)、(XXXIX)、(XXXX)、(XXXXI)もしくは(XXXXII)の化合物、またはこれらの化合物の医薬として許容され得る塩、溶媒和物、水和物および/またはプロドラッグ、これら後者の化合物の異性体、もしくはこれら後者の化合物のラセミ混合物、および/または本開示で先に示したような(1または複数の)化合物で作製された(1または複数の)組成物を指す。表現「化合物」はまた、本明細書に開示のさまざまな化合物の混合物も指す。
本開示の化合物には、プロドラッグが含まれる。概して、このようなプロドラッグは、理論上それが由来する化合物にインビボで容易に変換可能なこれらの化合物の機能的誘導体である。本開示の化合物のプロドラッグは、利用可能なヒドロキシまたはアミノ基で形成された従来のエステルであってもよい。例えば、本開示の化合物中の利用可能なOHまたは窒素は、塩基の存在下、場合により不活性溶媒(例えばピリジン中の酸塩化物)中で活性化酸を用いてアシル化することができる。プロドラッグとして利用されているいくつかの一般的なエステルは、フェニルエステル、脂肪族(C−C24)エステル、アシルオキシメチルエステル、カルバメートおよびアミノ酸エステルである。特定の例では、本開示の化合物のプロドラッグは、化合物中の1または複数のヒドロキシ基がインビボでヒドロキシ基に変換され得る基としてマスクされているものである。適切なプロドラッグの選択および調製のための従来の手順は、例えば、「Design of Prodrugs」H.Bundgaard編、Elsevier、1985年に記載されている。
本開示の化合物は、放射標識形態、例えば構造内にH、H、14C、15Nまたは放射性ハロゲン、例えば125Iを組み込むことによって標識された化合物を含む。本開示の化合物の放射性標識化合物は、当技術分野で公知の標準的な方法を用いて調製することができる。
化合物に言及するとき、本明細書で使用される表現「これらの誘導体」は、同様の反応性を有し、同じ所望の結果を得るために化合物の代替物として使用できる化合物の誘導体を意味する。
本明細書で使用される場合、用語「癌」は、原発癌または続発癌を意味し、非転移性癌および/または転移性癌を含む。癌への言及には、癌細胞への言及が含まれる。例えば、癌は、卵巣癌、脳癌、乳癌、メラノーマ、結腸直腸癌、膠芽細胞腫、肝臓癌、肺癌、前立腺癌、子宮頸癌、頭部癌、胃癌、腎臓癌、子宮内膜癌、精巣癌、尿路上皮癌、急性リンパ芽球性白血病、急性骨髄性白血病、ホジキンリンパ腫、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫、軟部組織癌、骨肉腫、甲状腺癌、移行細胞膀胱癌、ウィルムス腫瘍、神経膠腫、膵臓癌または脾臓癌である。本明細書で使用される場合、用語「癌」は、ソルチリンの発現を伴う任意の癌も含む。
本明細書で使用される場合、用語「治療剤」は、対照と比較して、対象において(例えば、臨床症状または癌性細胞の量によって決定される)癌を阻害、抑制または低減することによって治療効果を生じさせることができる薬剤を意味する。治療剤の例には、例えば、抗癌剤および植物化学物質が含まれる。
本明細書において使用される場合、用語「抗癌剤」は、癌細胞に毒性を生じさせることができる薬剤を意味する。例えば、タイヘイヨウイチイのタキサス・ブレビフォリア(Taxus brevifolia)の樹皮に由来するタキサンは、抗癌剤として使用することができる。タキサンには、例えば、パクリタキセル、ドセタキセルおよびカバジタキセルが含まれる。他の抗癌剤としては、例えばDNAをインターカレーションすることによって作用するアントラサイクリン化合物が挙げられる。例えば、アントラサイクリンには、ドキソルビシンおよびダウノルビシンが含まれる。
本明細書で使用される場合、用語「ドセタキセル」または「doce」は、構造:

を有する抗癌剤、またはこれらの医薬として許容され得る塩、溶媒和物もしくはプロドラッグ、ならびにこれらの混合物を意味する。例えば、ドセタキセルは、その側鎖の2位の炭素原子に結合した酸素原子を介して、本開示のペプチド化合物にコンジュゲートすることができる。ドセタキセルは、直接またはリンカーを介してペプチド化合物に連結させることができる。
本明細書で使用される場合、用語「ドキソルビシン」または「doxo」は、構造:

を有する抗癌剤、またはこれらの医薬として許容され得る塩、溶媒和物もしくはプロドラッグ、ならびにこれらの混合物を意味する。例えば、ドキソルビシンは、14位の炭素原子に結合した酸素原子を介して、本開示のペプチド化合物にコンジュゲートすることができる。ドキソルビシンは、直接またはリンカーを介してペプチド化合物に連結させることができる。
本明細書で使用される場合、用語「カバジタキセル」または「cab」は、構造:

を有する抗癌剤、またはこれらの医薬として許容され得る塩、溶媒和物もしくはプロドラッグ、ならびにこれらの混合物を意味する。例えば、カバジタキセルは、その側鎖の2位の炭素原子に結合した酸素原子を介して、本開示のペプチド化合物にコンジュゲートすることができる。カバジタキセルは、直接またはリンカーを介してペプチド化合物に連結させることができる。
本明細書で使用される場合、用語「植物化学物質」は、植物において天然に存在し、癌を治療するために使用できる化合物を意味する。植物化学物質の例としては、例えば、クルクミン、ゲニステイン、レスベラトロール、エピガロカテキン−(3)−ガレート(EGCG)、ピペリン、スルフォラファン、ケルセチン、ルペオールおよびβ−カロテンが挙げられる。クルクミン(ジフェルロイルメタン)は、スパイスのターメリック(クルクマ・ロンガ(Curcuma longa))に存在する黄色色素であり、6,000を超える引用(Hosseini、2015年)に示されているように、抗酸化性、抗炎症性、抗癌性、抗ウイルス性、および抗菌性の活性に関連している。使用することができる他の植物化学物質としては、以下に示すものが挙げられるが、これらに限定されない:
本明細書で使用される場合、用語「クルクミン」または「cur」は、構造:

を有する植物化学物質、またはこれらの医薬として許容され得る塩、溶媒和物もしくはプロドラッグ、ならびにこれらの混合物を意味する。例えば、クルクミンは、そのフェノール基の酸素原子を介して、本開示のペプチド化合物にコンジュゲートすることができる。クルクミンは、直接またはリンカーを介してペプチド化合物に連結させることができる。
本明細書で使用される場合、用語「コンジュゲート化合物」または「ペプチド−薬物コンジュゲート」は、場合によりリンカーを介して、少なくとも1つの治療剤に連結された本明細書に開示のペプチド化合物を含む化合物を指す。コンジュゲート化合物は、例えば1、2、3または4分子の連結治療剤を含むことができる。これらの1〜4分子の治療剤は、同じであっても、または異なっていてもよく、すなわち、4種までの異なる治療剤をペプチドに連結することができる。(1または複数の)治療剤は、少なくとも1つの共有結合、少なくとも1つの原子または少なくとも1つのリンカーを介してペプチドに連結される。コンジュゲート化合物は、癌の治療に使用することができる。コンジュゲート化合物の例としては、以下に示すコンジュゲート化合物が挙げられるが、これらに限定されない:
本明細書で使用される場合、用語「コンジュゲートする」は、例えば、上で定義したコンジュゲートの調製を指す。このような動作は、場合によりリンカーを介して、ペプチド化合物を少なくとも1つの治療剤と連結させる工程を含む。
例えば、以下は、本明細書に開示のいくつかのコンジュゲート化合物の一般的な化学式である。
ドセタキセル−Katanaペプチドコンジュゲート:
ドキソルビシン−Katanaペプチドコンジュゲート:
クルクミン−Katanaペプチドコンジュゲート:
例えば、以下は、本明細書に開示のいくつかのコンジュゲート化合物の化学構造である。
ドセタキセル−KBP−102薬物(3:1)またはKBA−102:
ドセタキセル−KBP105薬物(2:1)またはKBA−105:
クルクミン−KBP106(2:1)またはKBC−106:
本明細書で使用される場合、用語「リンカー」は、本明細書に開示のペプチド化合物を少なくとも1つの治療剤に結合させる化学構造を意味する。リンカーは、ペプチド化合物上の異なる官能基においてペプチド化合物に連結することができる。例えば、リンカーは、第1級アミン(アミン(−NH2))においてペプチド化合物に連結することができ、この基は、各ポリペプチド鎖のN末端(アルファ−アミンと呼ばれる)、およびリジン(Lys、K)残基の側鎖中(イプシロン−アミンと呼ばれる)に存在する。例えば、リンカーは、カルボキシル(−COOH)においてペプチド化合物に連結することができ、この基は、各ポリペプチド鎖のC末端、ならびにアスパラギン酸(Asp、D)およびグルタミン酸(Glu、E)の側鎖中に存在する。例えば、リンカーは、スルフヒドリル(−SH)においてペプチド化合物に連結することができ、この基は、システイン(Cys、C)の側鎖中に存在する。多くの場合、タンパク質の二次または三次構造の一部として、システインは、ジスルフィド結合(−S−S−)を介してそれらの側鎖の間で一緒に連結される。ほとんどのタイプの反応性基によってそれらを架橋に利用できるようにするには、これらをスルフヒドリルに還元しなければならない。例えば、リンカーは、カルボニル(−CHO)においてペプチド化合物と連結させることができ、メタ−過ヨウ素酸ナトリウムによる多糖類の翻訳後修飾を酸化(グリコシル化)することにより、ケトンまたはアルデヒド基を糖タンパク質中に生成することができる。例えば、リンカーは切断可能なリンカーであり得る。例えば、リンカーは切断不能なリンカーであり得る。
以下の表は、標準的な化学コンジュゲーションのためのいくつかの主要リンカーの反応性クラスおよび化学基をまとめたものである:
例えば、ホモ二官能性およびヘテロ二官能性の架橋剤を使用することができる。例えば、ジスクシンイミジルスベレート(DSS)は、短いスペーサーアームのいずれかの末端に同一のアミン反応性NHS−エステル基を有するホモ二官能性架橋剤である。例えば、スルホスクシンイミジル4−(N−マレイミドメチル)シクロヘキサン−1−カルボキシラート(スルホ−SMCC)は、シクロヘキサンスペーサーアームの一端にアミン反応性スルホ−NHSエステル基を有し、反対端にスルフヒドリル反応性マレイミド基を有するヘテロ二官能性架橋剤である。これにより、連続的な2段階コンジュゲーション手順が可能になる。市販されているホモ二官能性架橋剤の中には、以下のものが挙げられる:BSOCOES(ビス(2−[スクシンイミドオキシカルボニルオキシ]エチル)スルホン;DPDPB(1,4−ジ−(3’−[2−ピリジルジチオ]−プロピオンアミド)ブタン;DSS(ジスクシンイミジルスベレート);DST(ジスクシンイミジルタータレート);スルホDST(スルホジスクシンイミジルタータレート);DSP(ジチオビス(スクシンイミジルプロピオネート);DTSSP(3,3’−ジチオビス(スルホスクシンイミジルプロピオネート);EGS(エチレングリコールビス(スクシンイミジルスクシネート));およびBASED(ビス(β−[4−アジドサリチルアミド]‐エチル)ジスルフィドヨウ素化)。
ポリペプチドは、種々のリンカー、例えば、スルフヒドリル基、アミノ基(アミン)、または任意の適切な反応性基を介してコンジュゲートされ得る。リンカーは共有結合であってもよい。リンカー基は、例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、または15個の炭素原子などの適応性のあるアームを含むことができる。
代表的なリンカーとしては、ピリジンジスルフィド、チオスルホネート、ビニルスルホネート、イソシアネート、イミドエステル、ジアジン、ヒドラジン、チオール、カルボン酸、マルチペプチドリンカー、およびアセチレンが挙げられるが、これらに限定されない。代替的には、使用可能な他のリンカーとしては、BS[ビス(スルホスクシンイミジル)スベレート](接近可能な第一級アミンを標的とするホモ二官能性N−ヒドロキシスクシンイミドエステルである)、NHS/EDC(N−ヒドロキシスクシンイミドおよび1−エチル−3−(3−ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド(NHS/EDCは第1級アミン基とカルボキシル基とのコンジュゲーションを可能にする)、スルホ−EMCS([N−ε−マレイミドカプロン酸]ヒドラジド(スルホ−EMCSは、スルフヒドリル基およびアミノ基に対して反応性のヘテロ二官能性反応性基である)、ヒドラジド(ほとんどのタンパク質は露出した炭水化物を含み、ヒドラジドはカルボキシル基を第一級アミンに結合するための有用な試薬である)が挙げられる。
共有結合を形成するためには、ペプチドを修飾するのに必要なレベルでヒドロキシル部分が生理学的に許容され得る広範囲の活性カルボキシル基(例えば、エステル)を化学反応性基として使用することができる。特定の薬剤としては、例えば、N−ヒドロキシスクシンイミド(NHS)、N−ヒドロキシ−スルホスクシンイミド(スルホ−NHS)、マレイミド−ベンゾイル−スクシンイミド(MBS)、ガンマ−マレイミド−ブチリルオキシスクシンイミドエステル(GMBS)、マレイミドプロピオン酸(MPA)、マレイミドヘキサン酸(MHA)、およびマレイミドウンデカン酸(MUA)が挙げられる。
第一級アミンはNHSエステルの主な標的であり、NHSエステルは、第一級アミンと反応して共有アミド結合を形成する。タンパク質のN末端に存在する接近可能なα−アミン基およびリジンのε−アミンは、NHSエステルと反応する。したがって、本明細書に開示のコンジュゲート化合物は、ペプチドのN末端アミノまたはリジンのε−アミンにコンジュゲートされたNHSエステルを有するリンカーを含むことができる。アミド結合は、NHSエステルがN−ヒドロキシスクシンイミドを放出する第一級アミンと反応すると形成される。反応性基を含有するスクシンイミドは、より単純にはスクシンイミジル基と呼ぶことができる。いくつかの実施形態において、タンパク質上の官能基はチオール基であり、化学反応性基はγ−マレイミド−ブチルアミド(GMBAまたはMPA)などのマレイミド含有基である。このようなマレイミド含有基は、本明細書においてマレイミド基と呼ぶことができる。
アミン−アミンリンカーとしては、NHSエステル、イミドエステルなどが挙げられ、その例を以下に列挙する。
リンカーは、以下に列挙するマレイミドおよびピリジルジチオールなどのスルフヒドリル−スルフヒドリルリンカーであってもよい。
リンカーは、NHSエステル/マリエイド化合物を含むアミン−スルフヒドリルリンカーであってもよい。これらの化合物の例を以下に提供する。
リンカーは、アミノ基および非選択的実体と反応することができる。このようなリンカーとしては、NHSエステル/アリールアジドおよびNHSエステル/ジアジリンリンカーが挙げられ、その例を以下に列挙する。
例示的なアミン−カルボキシルリンカーとしては、カルボジイミド化合物(例えば、DCC(N、N−ジシクロヘキシルカルボジイミド)およびEDC(1−エチル−3−[3−ジメチルアミノプロピル]カルボジイミド))が挙げられる。例示的なスルフヒドリル−非選択的リンカーとしては、ピリジルジチオール/アリールアジド化合物(例えば、APDP(N−[4−(p−アジドサリチルアミド)ブチル]−3’−(2’−ピリジルジチオ)プロピオンアミド))が挙げられる。例示的スルフヒドリル−炭水化物リンカーとしては、マレイミド/ヒドラジド化合物(例えばBMPH(N−[β−マレイミドプロピオン酸]ヒドラジド)、EMCH([N−ε−マレイミドカプロン酸]ヒドラジド)、MPBH 4−(4−N−マレイミドフェニル)酪酸ヒドラジド)、およびKMUH(N−[κ−マレイミドウンデカン酸]ヒドラジド))、ならびにピリジルジチオール/ヒドラジド化合物(例えば、PDPH(3−(2−ピリジルジチオ)プロピオニルヒドラジド)が挙げられる。例示的炭水化物−非選択的リンカーとしては、ヒドラジド/アリールアジド化合物(例えば、ABH(p−アジドベンゾイルヒドラジド))が挙げられる。例示的ヒドロキシル−スルフヒドリルリンカーとしては、イソシアネート/マレイミド化合物(例えば、(N−[p−マレイミドフェニル]イソシアネート))が挙げられる。例示的アミン‐DNAリンカーとしては、NHSエステル/ソラレン化合物(例えば、SPB(スクシンイミジル−[4−(ソラレン−8−イルオキシ)]−ブチレート))が挙げられる。
コンジュゲートペプチドにおいて多様な複雑性の分枝点を作製するために、リンカーは3〜7個の実体を結合することができる。
TMEAおよびTSATは、それらのマレイミド基を介してスルフヒドリル基に到達する。THPPのヒドロキシル基およびカルボキシ基は、第一級または第二級アミンと反応することができる。他の有用なリンカーは、式:Y=C=N−Q−A−C(O)−Z(式中、Qはホモ芳香族またはヘテロ芳香族環系であり、Aは単結合または非置換または置換の二価のC1−30架橋基であり、YはOまたはSであり、およびZはCl、Br、I、N、N−スクシンイミジルオキシ、イミダゾリル、1−ベンゾトリアゾリルオキシ、OAr(式中、Arは電子不足活性化アリール基である)またはOC(O)R(式中、Rは−A−Q−N=C=Y、またはC4−20第三級アルキルである)である)に従う(米国特許第4,680,338号を参照されたい)。
他の有用なリンカーは、式

(式中、RはH、C1−6アルキル、C2−6アルケニル、C6−12アリールもしくはアラルキルまたはこれらの二価の有機−O−、−S−と結合したもの、または

(式中、R’は、C1−6アルキル、連結部分である)であり、Rは、H、C1−12アルキル、C6−12アリール、またはC6−12アラルキルであり、Rは、







または隣接する窒素の孤立電子対を非局在化することができる別の化学構造であり、Rは、Rをペプチドベクターまたは薬剤に結合することができるペンダント反応性基である)を有する(例えば、米国特許第5,306,809号を参照されたい)。
リンカーは、少なくとも1つのアミノ酸残基を含み、少なくとも、または約2、3、4、5、6、7、10、15、20、25、30、40または50アミノ酸残基のペプチドであり得る。リンカーが単一のアミノ酸残基である場合、リンカーは任意の天然または非天然のアミノ酸(例えば、GlyまたはCys)であり得る。リンカーが短いペプチドである場合、リンカーは、配列[Gly−Gly−Gly−Gly−Ser](式中、nは1〜6の整数である)を有するペプチドなどのグリシンリッチペプチド(適応性の傾向があるもの)(米国特許第7,271,149号を参照されたい)またはセリンリッチペプチドリンカー(米国特許第5,525,491号を参照されたい)であり得る。セリンリッチペプチドリンカーとしては、式[X−X−X−X−Gly](式中、Xのうち2つまでがThrであり、残りのXがSerであり、およびyは1から5までの整数であるものを含む)のリンカーが挙げられる(例えば、Ser−Ser−Ser−Ser−Gly、(式中、yは1より大きい))。他のリンカーとしては、剛性リンカー(例えば、PAPAPおよび(PT)P(式中、nは2、3、4、5、6または7である))およびα−ヘリカルリンカー(例えばA(EAAAK)A(nは1、2、3、4または5である))が挙げられる。
リンカーは、脂肪族リンカー(例えば、ポリペプチドに対するアミド結合および治療剤へのエステル結合を有する)であり得る。脂肪族リンカーが使用される場合、それは長さ(例えばC−C20)およびそれが含む化学的部分(例えば、アミノ基またはカルバメート)に関して変化し得る。
適切なアミノ酸リンカーの例は、コハク酸、Lys、GluおよびAsp、またはジペプチド、例えばGly−Lysである。リンカーがコハク酸である場合、その1つのカルボキシル基は、アミノ酸残基のアミノ基とアミド結合を形成でき、その他のカルボキシル基は、例えば、ペプチドまたは置換基のアミノ基とアミド結合を形成することができる。リンカーがLys、Glu、またはAspの場合、そのカルボキシル基はアミノ酸残基のアミノ基とアミド結合を形成していてもよく、そのアミノ基は、例えば、置換基のカルボキシル基とアミド結合を形成していてもよい。Lysがリンカーとして使用される場合、さらなるリンカーがLysのε−アミノ基と置換基との間に挿入されていてもよい。さらなるリンカーはコハク酸であってもよく、このコハク酸はLysのε−アミノ基および置換基に存在するアミノ基とアミド結合を形成することができる。一実施形態において、さらなるリンカーは、GluまたはAspであり(例えば、Lysのε−アミノ基とアミド結合を形成し、置換基に存在するカルボキシル基と別のアミド結合を形成する)、すなわち置換基はNε−アシル化リジン残基である。
リンカーは分枝ポリペプチドであってもよい。例示的分枝ペプチドリンカーは、米国特許第6,759,509号に記載されている。
リンカーは、切断可能な結合(例えば、チオエステル結合)または切断不能結合(例えば、マレイミド結合)を提供することができる。例えば、細胞傷害性タンパク質は、ポリペプチド内のリジン残基およびポリペプチドのアミノ末端に存在する修飾された遊離アミンと反応するリンカーに結合することができる。したがって、本発明のコンジュゲート化合物に有用なリンカーは、治療剤部分がコンジュゲートされているポリペプチドまたは修飾ポリペプチド上の第一級アミンと反応性の基を含むことができる。より具体的には、リンカーは、モノフルオロシクロオクチン(MFCO)、ビシクロ[6.1.0]ノニン(BCN)、N−スクシンイミジル−S−アセチルチオアセテート(SATA)、N−スクシンイミジル−S−アセチルチオプロピオネート(SATP)、マレイミドおよびジベンゾシクロオクチンエステル(DBCOエステル)からなる群から選択され得る。所与のリンカー内の有用なシクロオクチンとしては、OCT、ALO、MOFO、DIFO、DIBO、BARAC、DIBAC、およびDIMACが挙げられる。
リンカーは、例えば、短いアーム(<2炭素鎖)、中型アーム(2〜5炭素鎖)、または長いアーム(3〜6炭素鎖)などの適応性のあるアームを含むことができる。
クリックケミストリーは、ペプチド(DBCO、TCO、テトラジン、アジドおよびアルキンリンカー)上でのコンジュゲーションにも使用することができる。リンカーのこれらのファミリーは、アミン、カルボキシルおよびスルフヒドリル基に対して反応性であり得る。さらに、これらのリンカーは、オリゴヌクレオチド配列への組み込みのために、ビオチン化、ペグ化、蛍光イメージング色素での修飾、またはホスホラミダイト化することもできる。
本明細書で使用される場合、用語「中間体」は、リンカーと反応して、それにより、治療剤の中間体または活性化形態を形成する治療剤を指す。中間体は、本明細書に開示のペプチド化合物と反応させて、それにより、癌を治療するために使用できる本明細書に開示のコンジュゲート化合物を形成することができる。
用語「アミノ酸」は、当業者に公知の一般的な天然の(遺伝的にコードされた)アミノ酸または合成アミノ酸およびこれらの一般的な誘導体を指す。アミノ酸に適用される場合、「標準」または「タンパク質原性」とは、その天然構成中の遺伝的にコードされた20種のアミノ酸を意味する。同様に、アミノ酸に適用する場合、「非標準」、「非天然」または「珍しい」は、非天然、稀有または合成のアミノ酸の広い選択、例えばHunt,S.によるChemistry and Biochemistry of the Amino Acids、Barrett,G.C.編、Chapman and Hall:New York、1985年に記載のものなどを指す。非標準アミノ酸のいくつかの例としては、非アルファアミノ酸、D−アミノ酸が挙げられる。
アミノ酸に使用される略語およびペプチドの称号は、J.Biol.Chem.1972年、247、977−983頁のIUPAC−IUB Commission of Biochemical Nomenclatureの規則に従う。この文書は更新されており:Biochem.J.、1984年、219、345−373頁;Eur.J.Biochem.、1984年、138、9−37頁;1985年、152、1;Int.J.Pept.Prot.Res.、1984,24、p84の後;J.Biol.Chem.、1985年、260、14−42頁;Pure Appl.Chem.1984年、56、595−624頁;Amino Acids and Peptides、1985年、16、387−410頁;Biochemical Nomenclature and Related Documents、第2版、Portland Press、1992年、39−67頁に記載されている。この規則の拡張は、JCBN/NC−IUB Newsletter 1985、1986、1989年に掲載されており、Biochemical Nomenclature and Related Documents、第2版、Portland Press、1992年、68−69頁を参照されたい。
用語「アンタゴニスト」は、タンパク質、受容体、酵素、相互作用などの内因性リガンドの作用の少なくとも一部を低減させる化合物を指す。
用語「阻害剤」は、タンパク質、受容体、酵素、相互作用などの正常な活性を低減させる化合物を指す。
用語「インバースアゴニスト」は、構成的に活性な受容体の活性をその基底レベル以下に低減させる化合物を指す。
用語「ライブラリー」は、例えば創薬目的のために使用することができる化合物のコレクションを指す。例えば、ライブラリー化合物は、本明細書に開示のペプチド化合物および/またはコンジュゲート化合物であり得る。
本明細書で使用される場合、用語「混合物」は、2つ以上の化合物を含む組成物を意味する。一実施形態において、混合物は、2つ以上の別個の化合物の混合物である。さらなる実施形態において、化合物が「混合物」と呼ばれる場合、これは、化合物の2つ以上の「形態」、例えば化合物の塩、溶媒和物、プロドラッグ、または適用できる場合には立体異性体を任意の比率で含み得ることを意味する。当業者は、混合物中の化合物が形態の混合物として存在し得ることを理解されよう。例えば、化合物は、化合物の塩の水和物、または化合物のプロドラッグの塩の水和物として存在し得る。本明細書に開示の化合物のすべての形態は、本出願の範囲内である。
「モジュレータ」という用語は、生物学的または化学的な過程または機序に影響を及ぼす化合物を指す。例えば、モジュレータは、生物学的または化学的過程または機序を増加、促進、アップレギュレート、活性化、阻害、減少、遮断、防止、遅延、脱感作、不活性化、ダウンレギュレートなどすることができる。したがって、モジュレータは、「アゴニスト」または「アンタゴニスト」であり得る。モジュレータによって影響を受ける例示的な生物学的過程または機序には、酵素結合、受容体結合およびホルモン放出または分泌が含まれるが、これらに限定されない。モジュレータによって影響を受ける例示的な化学的過程または機序には、触媒作用および加水分解が含まれるが、これらに限定されない。
用語「ペプチド」は、アミド結合を用いて互いに共有結合した少なくとも2つのアミノ酸を含む化合物を指す。
本明細書で使用される場合、用語「プロドラッグ」は、対象に投与されたときに徐々に活性形態に変換されて、より良好な治療応答および/または毒性レベルの低減を生じる、公知の化合物または組成物の活性形態の誘導体を指す。概して、プロドラッグは、理論上それが由来する化合物にインビボで容易に変換可能な、本明細書に開示の化合物の機能的誘導体である。プロドラッグには、アシルエステル、カーボネート、ホスフェートおよびウレタンが含まれるが、これらに限定されない。これらの群は例示的なものであり、包括的ではなく、当業者はプロドラッグの他の公知の変種を調製することができる。プロドラッグは、例えば、利用可能なヒドロキシ、チオール、アミノまたはカルボキシル基を用いて形成することができる。例えば、本開示の化合物中の利用可能なOHおよび/またはNHは、塩基の存在下、場合により不活性溶媒(例えば、ピリジン中の酸塩化物)中で活性化酸を用いてアシル化することができる。プロドラッグとして利用されているいくつかの一般的なエステルは、フェニルエステル、脂肪族(C−C24)エステル、アシルオキシメチルエステル、カルバメートおよびアミノ酸エステルである。特定の例において、本開示の化合物のプロドラッグは、化合物中のヒドロキシおよび/またはアミノ基が、インビボでヒドロキシおよび/またはアミノ基に変換され得る基としてマスクされているものである。適切なプロドラッグの選択および調製のための従来の手順は、例えば、「Design of Prodrugs」H.Bundgaard編、Elsevier、1985年に記載されている。
用語「保護基」は、分子上のアミン、ヒドロキシルまたはカルボキシルなどの潜在的に反応性の官能基が、分子の他の場所で化学変化が生じる際に、化学反応を受けることを防ぐために使用できる任意の化合物を指す。多数のこのような保護基が当業者に公知であり、例えば、Protective Groups in Organic Synthesis、T.W.Greene and P.G.Wuts編、John Wiley&Sons、New York、第4版、2006年、1082頁、ISBN 9780471697541に見出すことができる。アミノ保護基の例としては、フタルイミド、トリクロロアセチル、ベンジルオキシカルボニル、tert−ブトキシカルボニル、およびアダマンチル−オキシカルボニルが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、アミノ保護基はカルバメートアミノ保護基であり、これらはアミノ基に結合したときにカルバメートを形成するアミノ保護基として定義される。他の実施形態において、アミノカルバメート保護基は、アリルオキシカルボニル(Alloc)、ベンジルオキシカルボニル(Cbz)、9フルオレニルメトキシカルボニル(Fmoc)、tert−ブトキシカルボニル(Boc)およびα,αジメチル−3,5ジメトキシベンジルオキシカルボニル(Ddz)である。より新しい窒素保護基についての最近の議論については、Tetrahedron 2000年、56、2339−2358頁を参照されたい。ヒドロキシル保護基の例としては、アセチル、tert−ブチルジメチルシリル(TBDMS)、トリチル(Trt)、tert−ブチルおよびテトラヒドロピラニル(THP)が挙げられるが、これらに限定されない。カルボキシル保護基の例としては、メチルエステル、tert−ブチルエステル、ベンジルエステル、トリメチルシリルエチルエステル、および2,2,2−トリクロロエチルエステルが挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される場合、用語「配列同一性」は、2つのポリペプチド配列または2つの核酸配列間の配列同一性の百分率を指す。2つのアミノ酸配列または2つの核酸配列の同一性パーセントを決定するために、配列を最適な比較目的のためにアライメントする(例えば、第2のアミノ酸または核酸配列との最適なアライメントのために、第1のアミノ酸または核酸配列の配列にギャップを導入してもよい)。次いで、対応するアミノ酸位またはヌクレオチド位のアミノ酸残基またはヌクレオチドを比較する。第1の配列における座位が第2の配列における対応する座位と同じアミノ酸残基またはヌクレオチドによって占有される場合、分子はその座位において同一である。2つの配列間の同一性パーセントは、配列によって共有される同一座位の数の関数である(すなわち、同一性%=同一重複座位の数/座位の総数×100%)。一実施形態において、2つの配列は同じ長さである。2つの配列間の同一性パーセントの決定は、数学的アルゴリズムを用いて達成することもできる。2つの配列の比較に利用される数学的アルゴリズムの好ましい非限定的な例は、KarlinおよびAltschul、1990年、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.87:2264−2268頁のアルゴリズムであり、KarlinおよびAltschul、1993年、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.90:5873−5877頁において修正されている。このようなアルゴリズムは、Altschulら、1990年、J.Mol.Biol.215:403のNBLASTおよびXBLASTプログラムに組み込まれている。BLASTヌクレオチド検索を、NBLASTヌクレオチドプログラムパラメータを、例えば、score=100、wordlength=12に設定して行い、本出願の核酸分子と相同なヌクレオチド配列を得ることができる。BLASTタンパク質検索を、XBLASTプログラムパラメータを、例えばscore−50、wordlength=3に設定して行い、本開示のタンパク質分子と相同なアミノ酸配列を得ることができる。比較目的のためのギャップアライメントを得るために、Altschulら、1997年、Nucleic Acids Res.25:3389−3402頁に記載のGapped BLASTを利用することができる。あるいは、PSI−BLASTを用いて、分子間の遠隔の関係を検出する反復検索を行うことができる(同上)。BLAST、Gapped BLAST、およびPSI−Blastプログラムを利用する場合、それぞれのプログラム(例えば、XBLASTおよびNBLAST)のデフォルトパラメータを使用することができる(例えば、NCBIウェブサイト参照)。配列の比較に利用される数学的アルゴリズムの別の好ましい非限定的な例は、MyersおよびMiller、1988年、CABIOS 4:11−17頁のアルゴリズムである。このようなアルゴリズムは、GCG配列アライメントソフトウェアパッケージの一部であるALIGNプログラム(バージョン2.0)に組み込まれている。アミノ酸配列を比較するためにALIGNプログラムを利用する場合、PAM120重み付け残基表、ギャップ長ペナルティ12、ギャップペナルティ4を用いることができる。2つの配列間の同一性パーセントは、ギャップを許容するか否かを問わず、上記と同様の技術を用いて決定することができる。同一性パーセントの計算では、通常、完全一致のみがカウントされる。
本明細書で使用される場合、表現「〜から本質的になる」は、述べられた特徴、要素、成分、群、整数および/または工程、ならびに特徴、要素、成分、群、整数、および/または工程の基本的および新規な(1または複数の)特徴に実質的に影響を与えないものの存在を含めることを意図している。
用語「固相化学」は、反応の1つの成分がポリマー材料(以下に定義されるような固体支持体)に共有結合される化学反応の実施を指す。固相で化学を行うための反応方法は、ペプチドおよびオリゴヌクレオチド化学の伝統的な分野の外でより広く知られ、確立されている(Solid−Phase Synthesis:A Practical Guide、F.Albericio編、CRC Press、2000年、848頁、ISBN:978−0824703592;Organic Synthesis on Solid Phase 、第2版、Florencio Zaragoza Dorwald、Wiley−VCH、2002年、530頁、ISBN:3−527−30603−X;Solid−Phase Organic Synthesis:Concepts,Strategies,and Applications、P.H.Toy、Y.Lam編、Wiley、2012年、568頁、ISBN:978−0470599143)。
用語「固体支持体」、「固相」または「樹脂」は、固相化学を行うために利用される機械的および化学的に安定なポリマーマトリックスを指す。これは「Resin」、「P−」または以下の記号で表される:
適切なポリマー材料の例としては、ポリスチレン、ポリエチレン、ポリエチレングリコール(PEG、ChemMatrix(登録商標)(Matrix Innovation、Quebec、Quebec、Canada;J.Comb.Chem.2006年、8、213−220頁)を含むがこれに限定されない)、ポリエチレングリコールをグラフトまたは共有結合させたポリスチレン(PEG−ポリスチレンとも呼ばれる、TentaGel(商標)、Rapp,W.;Zhang,L.;Bayer,E.In Innovations and Perspectives in Solid Phase Synthesis.Peptides,Polypeptides and Oligonucleotides;Epton,R.編、;SPCC Ltd.:Birmingham,UK;205頁)、ポリアクリレート(CLEAR(商標))、ポリアクリルアミド、ポリウレタン、PEGA[ポリエチレングリコールポリ(N,N ジメチル−アクリルアミド)コポリマー、Tetrahedron Lett.1992年、33、3077−3080頁]、セルロースなどが挙げられるが、これらに限定されない。これらの物質は、構造を機械的に安定化させるための架橋結合を形成するような追加の化学薬剤を場合により含むことができ、例えばジビニルベンゼン(DVB、通常0.1〜5%、好ましくは0.5〜2%)で架橋されたポリスチレンが挙げられる。この固体支持体としては、非限定的な例として、アミノメチルポリスチレン、ヒドロキシメチルポリスチレン、ベンズヒドリルアミンポリスチレン(BHA)、メチルベンズヒドリルアミン(MBHA)ポリスチレン、およびさらなる誘導体化または反応のために、遊離の化学官能基、最も典型的にはNHまたは−OHを含む他のポリマー主鎖を挙げることができる。この用語はまた、これらの官能基を高い割合で含む(「装填」する)「ウルトラレジン」、例えばポリエチレンイミンおよび架橋分子から調製されたもの(J.Comb.Chem.2004年、6、340−349頁)を含むことを意味する。合成の終わりに、樹脂は典型的には廃棄されるが、リサイクル可能であることが示されている(Tetrahedron Lett.1975年、16、3055頁)。
一般に、樹脂として使用される物質は不溶性ポリマーであるが、特定のポリマーは溶媒に応じて異なる溶解度を有し、また固相化学にも使用することができる。例えば、ポリエチレングリコールは、化学反応を行うことができる多くの有機溶媒に可溶であるが、ジエチルエーテルなどの他の溶媒には不溶性であるため、この様式で利用することができる。したがって、反応は溶液中で均一に実施され、次いでジエチルエーテルの添加によりポリマー上の生成物が沈殿し、固体として処理され得る。これは「液相」化学と呼ばれている。
「医薬として許容され得る」という表現は、動物またはヒトなどの対象の治療に適合することを意味する。
「医薬として許容され得る塩」という表現は、動物またはヒトなどの対象の治療に適切または適合する酸付加塩または塩基付加塩を意味する。
本明細書で使用される場合、表現「医薬として許容され得る酸付加塩」は、本開示の任意の化合物またはその中間体いずれかの、任意の非毒性の有機塩または無機塩を意味する。適切な塩を形成する例示的無機酸としては、塩酸、臭化水素酸、硫酸およびリン酸、ならびにオルトリン酸一水素ナトリウムおよび硫酸水素カリウムなどの金属塩が挙げられる。適切な塩を形成する例示的有機酸としては、モノ−、ジ−、およびトリカルボン酸、例えばグリコール酸、乳酸、ピルビン酸、マロン酸、コハク酸、グルタル酸、フマル酸、リンゴ酸、酒石酸、クエン酸、アスコルビン酸、マレイン酸、安息香酸、フェニル酢酸、桂皮酸、およびサリチル酸、ならびにスルホン酸、例えばp−トルエンスルホン酸およびメタンスルホン酸が挙げられる。モノまたはジ酸塩のいずれかを形成することができ、このような塩は、水和、溶媒和または実質的に無水の形態のいずれかで存在することができる。一般に、本開示の化合物の酸付加塩は、水および種々の親水性有機溶媒に可溶性であり、一般にそれらの遊離塩基形態と比較してより高い融点を示す。適切な塩の選択は、当業者に公知である。他の医薬として許容され得ない塩、例えば、シュウ酸塩は、例えば、本開示の化合物の単離、実験室使用、またはその後の医薬として許容され得る酸付加塩への変換に使用することができる。
本明細書で使用される用語「医薬として許容され得る塩基付加塩」は、本開示の任意の酸化合物、またはその中間体のいずれかの、任意の非毒性の有機塩基付加塩または無機塩基付加塩を意味する。塩基付加塩を形成することができる本開示の酸性化合物としては、例えば、COHが官能基である化合物が挙げられる。適切な塩を形成する例示的無機塩基としては、水酸化リチウム、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、水酸化カルシウム、水酸化マグネシウムまたは水酸化バリウムが挙げられる。適切な塩を形成する例示的有機塩基としては、脂肪族、脂環式または芳香族の有機アミン、例えばメチルアミン、トリメチルアミンおよびピコリンまたはアンモニアが挙げられる。適切な塩の選択は、当業者には公知である。他の医薬として許容され得ない塩基付加塩は、例えば、本開示の化合物の単離、実験室使用、またはその後の医薬として許容され得る酸付加塩への変換に使用することができる。
所望の化合物塩の形成は、標準的な技術を用いて達成される。例えば、中性化合物を適切な溶媒中で酸または塩基で処理し、形成された塩を濾過、抽出または任意の他の適切な方法によって単離する。
所望の化合物塩の形成は、標準的な技術を用いて達成される。例えば、中性化合物を適切な溶媒中で酸または塩基で処理し、形成された塩を濾過、抽出または任意の他の適切な方法によって単離する。
本明細書で使用される場合、用語「溶媒和物」は、適切な溶媒の分子が結晶格子に組み込まれている化合物またはその医薬として許容され得る塩を意味する。適切な溶媒は、投与される投薬量で生理学的に忍容性である。適切な溶媒の例は、エタノール、水などである。水が溶媒である場合、その分子は「水和物」と呼ばれる。溶媒和物の形成は、化合物および溶媒和物に応じて変動する。一般に、溶媒和物は、化合物を適切な溶媒に溶解させ、冷却するかまたは貧溶媒を用いて溶媒和物を単離することによって形成される。溶媒和物は、典型的には周囲条件下で乾燥または共沸させる。
本明細書で使用される場合、用語「対象」は、マウス、ラット、イヌおよびヒトなどの哺乳動物を含む動物界のすべてのメンバーを含む。
「適した(suitable)」および「適切な(appropriate)」という用語は、特定の群または条件の選択が、実施される特定の合成操作および分子の同一性に依存するが、その選択が、当技術分野の当業者の十分範囲内であることを意味する。本明細書に記載のすべてのプロセス工程は、表記の製品を提供するのに適した条件下で行われるべきである。当業者は、例えば、反応溶媒、反応時間、反応温度、反応圧力、反応剤比、および反応を無水または不活性雰囲気下で実施すべきかどうかなどを含むすべての反応条件が、所望の生成物の収率を最適化するために変化し、それを行うことがその技術の範囲内であることを理解されよう。
本開示の化合物または組成物の「治療有効量」、「有効量」または「十分量」という表現は、哺乳動物、例えばヒトを含む対象に投与されたときに、臨床結果を含む有益または所望の結果をもたらすために十分な量であり、したがって、「治療有効量」または「有効量」は、それが適用される状況に依存する。例えば、癌を治療する状況において、量は、化合物または組成物の投与なしで得られる応答と比較して、癌のこのような治療を達成するのに十分な化合物または組成物の量である。本開示の所与の化合物または組成物の有効量に相当する量は、さまざまな要因、例えば所与の薬物または化合物、医薬製剤、投与経路、疾患または障害のタイプ、治療される対象または宿主のアイデンティティなどに応じて変動するが、それにもかかわらず、当業者は日常的に決定することができる。また、本明細書で使用される場合、本開示の化合物または組成物の「治療有効量」または「有効量」は、対照と比較して、対象において(例えば、臨床症状または癌性細胞の量による決定で)癌を阻害、抑制または低減する量である。
本明細書で使用される場合、当技術分野で十分に理解されるように、「治療」または「治療する」は、臨床結果を含む有益または所望の結果を得るためのアプローチである。有益なまたは所望の臨床結果には、限定されないが、腫瘍進行の低減、腫瘍サイズの低減、腫瘍成長速度の低下、腫瘍浸潤および転移能の低下、1または複数の症状または状態の緩和または改善、疾患の程度の減退、疾病の状態の安定化(すなわち、悪化させない)、疾患の広がりの防止、疾患進行の遅延または減速、病状の改善または緩和、および(部分的または全体的いずれかの)寛解が、検出可能であろうと、または検出不能であろうと含まれる。「治療」または「治療する」はまた、治療を受けなかった場合の予想される生存と比較して、生存を延長させることを意味し得る。
本明細書で使用される場合、用語「忍容性」または「忍容される」は、治療剤が該治療剤で治療された対象によって耐えられるか、または許容され得る程度を意味する。例えば、忍容性は、(i)体重減少の維持または欠如、(ii)治療に耐える期間および(iii)副作用の減少または欠如などのさまざまなパラメータを測定することによって評価することができる。例えば、このような治療剤を使用する治療中に体重減少が観察されない場合、治療剤が対象によって忍容されることが十分に確立される。
本明細書で使用される場合、用語「投与される」または「投与する」は、インビトロ(例えば、細胞培養)またはインビボ(例えば、対象において)のいずれかで、本願の化合物または組成物の治療有効量を細胞に投与することを意味する。
本開示の範囲を理解する上で、本明細書で使用される用語「含む(comprising)」およびその派生語は、記載された特徴、要素、成分、群、整数および/または工程の存在を含めるが、他の記載していない特徴、要素、成分、群、整数および/または工程の存在を排除しないオープンエンドの用語を意図している。前述は、用語「含む(including)」、「有する(having)」、およびそれらの派生語などの類似の意味を有する単語にも適用される。最後に、本明細書で使用される場合、「実質的に」、「約」および「おおよそ」などの程度の用語は、最終結果が大きく変化しないような被修飾用語の妥当な逸脱量を意味する。これらの程度の用語は、この逸脱が修飾する単語の意味を否定しない場合には、被修飾用語の少なくとも±5%の逸脱を含むと解釈されるべきである。
本明細書および添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「a」、「an」および「the」は、内容が明確に他のことを指示しない限り、複数の言及を含む。したがって、例えば、「化合物(a compound)」を含む組成物は、2以上の化合物の混合物を含む。内容が明確に指示しない限り、用語「または」は、内容が明確に他のことを指示しない限り、一般的に「および/または」を含む意味で用いられることにも留意すべきである。
「追加の」または「第2の」成分を含む組成物において、本明細書で使用される第2の成分は、他の成分または第1の成分と化学的に異なる。「第3の」成分は、他の成分、第1の成分および第2の成分と異なり、またさらに列挙される成分、または「追加の」成分は同様に異なる。
特定の項に記載された定義および実施形態は、当業者によって理解されるように、本明細書に記載の適切な他の実施形態に適用可能であることが意図される。
本明細書中のエンドポイントによる数値範囲の列挙は、その範囲内に包含されるすべての数および分数(例えば、1〜5は1、1.5、2、2.75、3、3.90、4および5を含む)を含む。これらのすべての数および分数は、用語「約」によって修飾されるとみなされることも理解されたい。
原発腫瘍および続発腫瘍に対する新しい療法のための、治療剤を癌細胞へ輸送可能にするプラットフォームが最近開発された。このアプローチは、細菌タンパク質または癌細胞で発現される受容体のリガンド(例えば、ソルチリン/シンデカン)に由来するペプチド化合物を利用する。本開示において、抗癌剤および植物化学物質と、これらのペプチド化合物の1つとのコンジュゲーションが記載されている。例えば、抗癌剤、例えばドセタキセル、カバジタキセルおよびドキソルビシンは、ペプチド化合物とコンジュゲートすることができる。植物化学物質、例えばクルクミンもペプチド化合物とコンジュゲートすることができる。さらに、Katanaペプチドへのコンジュゲーションの後、コンジュゲートKatanaペプチドの取り込みはP−gp阻害剤のシクロスポリンAの影響を受けず、KatanaペプチドはP−gpなどの排出ポンプの基質ではないことが確認された。これらの結果は、これらのペプチド−薬物コンジュゲートが腫瘍学以外の他の用途にも使用できることをさらに示している。非コンジュゲート治療剤と比較してより大きな腫瘍アポトーシスを誘導することに加えて、本明細書に記載のコンジュゲート化合物は、より大きな忍容性および毒性減少も提供し得る。
ペプチド化合物、ならびにペプチド化合物に連結された少なくとも1つの治療剤を含むコンジュゲート化合物が本明細書において開示される。このような化合物は、癌、例えばソルチリン発現を伴う癌の治療に使用することができる。
したがって、第1の態様は、式(I)、式(II)、式(III)、式(IV)、式(V)、式(VI)、式(VII)、式(VIII)、式(IX)、式(X)、式(XI)、式(XII)および式(XIII):
GVXAKAGVXNXFKSESY(I)(配列番号1)
(XGVX10AKAGVX11NX12FKSESY(配列番号2)
YKX13LRRX14APRWDX15PLRDPALRX1617L(III)(配列番号3)
YKX18LRR(X19PLRDPALRX2021L(IV)(配列番号4)
IKLSGGVQAKAGVINMDKSESM(V)(配列番号5)
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESY(VI)(配列番号6)
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESYK(VII)(配列番号7)
GVQAKAGVINMFKSESY(VIII)(配列番号8)
GVRAKAGVRNMFKSESY(IX)(配列番号9)
GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY(X)(配列番号10)
YKSLRRKAPRWDAPLRDPALRQLL(XI)(配列番号11)
YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRQLL(XII)(配列番号12)
YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRPLL(XIII)(配列番号13)
(式中、
1、2、3、4、5、、X、X、X、X10、X11、X12、X13、X14、X15、18およびX19は独立して、任意のアミノ酸から選択され、
16、X17、X20およびX21は独立して、Q、P、Y、IおよびLから選択され、
nは0、1、2、3、4または5であり、
が複数存在する場合、Xの各々は独立して、任意のアミノ酸から選択され、
19が複数存在する場合、Xの各々は独立して、任意のアミノ酸から選択され、
少なくとも1つの保護基および/または少なくとも1つの標識剤が、場合によりN末端および/またはC末端においてペプチドに連結されている)
の化合物から選択される化合物と少なくとも80%の配列同一性を有するペプチド化合物である。
例えば、ペプチド化合物は、以下を含むペプチド化合物である:
GVXAKAGVXNXFKSESY(I)(配列番号1)
(XGVX10AKAGVX11NX12FKSESY(配列番号2)
YKX13LRRX14APRWDX15PLRDPALRX1617L(III)(配列番号3)
YKX18LRR(X19PLRDPALRX2021L(IV)(配列番号4)
IKLSGGVQAKAGVINMDKSESM(V)(配列番号5)
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESY(VI)(配列番号6)
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESYK(VII)(配列番号7)
GVQAKAGVINMFKSESY(VIII)(配列番号8)
GVRAKAGVRNMFKSESY(IX)(配列番号9)
GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY(X)(配列番号10)
YKSLRRKAPRWDAPLRDPALRQLL(XI)(配列番号11)
YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRQLL(XII)(配列番号12)または
YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRPLL(XIII)(配列番号13)。
例えば、ペプチド化合物は、本質的に以下からなるペプチド化合物である:
GVXAKAGVXNXFKSESY(I)(配列番号1)
(XGVX10AKAGVX11NX12FKSESY(配列番号2)
YKX13LRRX14APRWDX15PLRDPALRX1617L(III)(配列番号3)
YKX18LRR(X19PLRDPALRX2021L(IV)(配列番号4)
IKLSGGVQAKAGVINMDKSESM(V)(配列番号5)
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESY(VI)(配列番号6)
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESYK(VII)(配列番号7)
GVQAKAGVINMFKSESY(VIII)(配列番号8)
GVRAKAGVRNMFKSESY(IX)(配列番号9)
GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY(X)(配列番号10)
YKSLRRKAPRWDAPLRDPALRQLL(XI)(配列番号11)
YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRQLL(XII)(配列番号12)または
YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRPLL(XIII)(配列番号13)。
例えば、ペプチド化合物は、以下からなるペプチド化合物である:
GVXAKAGVXNXFKSESY(I)(配列番号1)
(XGVX10AKAGVX11NX12FKSESY(配列番号2)
YKX13LRRX14APRWDX15PLRDPALRX1617L(III)(配列番号3)
YKX18LRR(X19PLRDPALRX2021L(IV)(配列番号4)
IKLSGGVQAKAGVINMDKSESM(V)(配列番号5)
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESY(VI)(配列番号6)
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESYK(VII)(配列番号7)
GVQAKAGVINMFKSESY(VIII)(配列番号8)
GVRAKAGVRNMFKSESY(IX)(配列番号9)
GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY(X)(配列番号10)
YKSLRRKAPRWDAPLRDPALRQLL(XI)(配列番号11)
YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRQLL(XII)(配列番号12)または
YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRPLL(XIII)(配列番号13)。
別の態様によれば、式(I)、式(II)、式(III)、式(IV)、式(V)、式(VI)、式(VII)、式(VIII)、式(IX)、式(X)、式(XI)、式(XII)および式(XIII):
GVXAKAGVXNXFKSESY(I)(配列番号1)
(XGVX10AKAGVX11NX12FKSESY(配列番号2)
YKX13LRRX14APRWDX15PLRDPALRX1617L(III)(配列番号3)
YKX18LRR(X19PLRDPALRX2021L(IV)(配列番号4)
IKLSGGVQAKAGVINMDKSESM(V)(配列番号5)
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESY(VI)(配列番号6)
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESYK(VII)(配列番号7)
GVQAKAGVINMFKSESY(VIII)(配列番号8)
GVRAKAGVRNMFKSESY(IX)(配列番号9)
GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY(X)(配列番号10)
YKSLRRKAPRWDAPLRDPALRQLL(XI)(配列番号11)
YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRQLL(XII)(配列番号12)
YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRPLL(XIII)(配列番号13)
(式中、
1、2、3、4、5、、X、X、X、X10、X11、X12、X13、X14、X15、18およびX19は独立して、任意のアミノ酸から選択され、
16、X17、X20およびX21は独立して、Q、P、Y、IおよびLから選択され、
nは0、1、2、3、4または5であり、
が複数存在する場合、Xの各々は独立して、任意のアミノ酸から選択され、
19が複数存在する場合、Xの各々は独立して、任意のアミノ酸から選択され、
少なくとも1つの保護基および/または少なくとも1つの標識剤が、場合によりN末端および/またはC末端においてペプチドに連結されている)
の化合物から選択される化合物と少なくとも80%の配列同一性を有するペプチド化合物である。
例えば、ペプチド化合物は、式(I)、式(II)、式(III)、式(IV)、式(V)、式(VI)、式(VII)、式(VIII)、式(IX)、式(X)、式(XI)、式(XII)および式(XIII)のペプチド化合物から選択されるペプチド化合物と、少なくとも80%、少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する。
例えば、ペプチド化合物は、式(I)または配列番号1によって表されるペプチド化合物と、少なくとも80%、少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する。
例えば、ペプチド化合物は、式(II)または配列番号2によって表されるペプチド化合物と、少なくとも80%、少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する。
例えば、ペプチド化合物は、式(III)または配列番号3によって表されるペプチド化合物と、少なくとも80%、少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する。
例えば、ペプチド化合物は、式(IV)または配列番号4によって表されるペプチド化合物と、少なくとも80%、少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する。
例えば、ペプチド化合物は、式(V)または配列番号5によって表されるペプチド化合物と、少なくとも80%、少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する。
例えば、ペプチド化合物は、式(VI)または配列番号6によって表されるペプチド化合物と、少なくとも80%、少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する。
例えば、ペプチド化合物は、式(VII)または配列番号7によって表されるペプチド化合物と、少なくとも80%、少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する。
例えば、ペプチド化合物は、式(VIII)または配列番号8によって表されるペプチド化合物と、少なくとも80%、少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する。
例えば、ペプチド化合物は、式(IX)または配列番号9によって表されるペプチド化合物と、少なくとも80%、少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する。
例えば、ペプチド化合物は、式(X)または配列番号10によって表されるペプチド化合物と、少なくとも80%、少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する。
例えば、ペプチド化合物は、式(XI)または配列番号11によって表されるペプチド化合物と、少なくとも80%、少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する。
例えば、ペプチド化合物は、式(XII)または配列番号12によって表されるペプチド化合物と、少なくとも80%、少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する。
例えば、ペプチド化合物は、式(XIII)または配列番号13によって表されるペプチド化合物と、少なくとも80%、少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する。
一実施形態において、nは0である。一実施形態において、nは1である。一実施形態において、nは2である。一実施形態において、nは3である。一実施形態において、nは4である。一実施形態において、nは5である。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(I)または式(II)で表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(I)または配列番号1で表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(II)または配列番号2によって表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(V)、式(VI)、式(VII)、式(VIII)、式(IX)または式(X)によって表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(V)によって表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(VI)によって表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(VII)によって表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(VIII)によって表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(IX)によって表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(X)によって表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(III)または式(IV)によって表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(III)によって表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(IV)によって表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(XI)、式(XII)または式(XIII)によって表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(XI)によって表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(XII)によって表される。
一実施形態において、ペプチド化合物は、式(XIII)によって表される。
一実施形態において、ペプチドは、配列番号1のアミノ酸配列によって表される。一実施形態において、ペプチドは、配列番号2のアミノ酸配列によって表される。一実施形態において、ペプチドは、配列番号3のアミノ酸配列によって表される。一実施形態において、ペプチドは、配列番号4のアミノ酸配列によって表される。一実施形態において、ペプチドは、配列番号5のアミノ酸配列によって表される。一実施形態において、ペプチドは、配列番号6のアミノ酸配列によって表される。一実施形態において、ペプチドは、配列番号7のアミノ酸配列によって表される。一実施形態において、ペプチドは、配列番号8のアミノ酸配列によって表される。一実施形態において、ペプチドは、配列番号9のアミノ酸配列によって表される。一実施形態において、ペプチドは、配列番号10のアミノ酸配列によって表される。一実施形態において、ペプチドは、配列番号11のアミノ酸配列によって表される。一実施形態において、ペプチドは、配列番号12のアミノ酸配列によって表される。一実施形態において、ペプチドは、配列番号13のアミノ酸配列によって表される。
一実施形態において、少なくとも1つの保護基がN末端および/またはC末端においてペプチドに連結される。
一実施形態において、スクシニル基がペプチド化合物に連結される。例えば、ペプチド化合物は、配列番号6に対応し、スクシニル基がN末端に結合した、スクシニル−IKLSGGVQAKAGVINMFKSESYの配列を有する。
一実施形態において、アセチル基がペプチド化合物に連結される。例えば、ペプチド化合物は、アセチル−GVRAKAGVRNMFKSESY(配列番号14)の配列を有する。例えば、ペプチド化合物は、アセチル−GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY(配列番号15)の配列を有する。例えば、ペプチド化合物は、アセチル−YKSLRRKAPRWDAPLRDPALRQLL(配列番号16)の配列を有する。例えば、ペプチド化合物は、アセチル−YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRQLL(配列番号17)の配列を有する。例えば、ペプチド化合物は、アセチル−YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRPLL(配列番号18)の配列を有する。
一実施形態において、少なくとも1つの標識剤が、N末端および/またはC末端においてペプチドに連結される。
当業者は、一般に使用される標識剤が使用できることを理解されよう。例えば、標識剤はビタミンである。例えば、標識剤はビオチンである。
一実施形態において、ペプチド化合物はビオチン化される。例えば、ペプチド化合物は、配列番号7に対応し、C末端にビオチン分子が結合した、IKLSGGVQAKAGVINMFKSESYK(ビオチン)の配列を有する。
一実施形態において、X16は、Q、P、Y、IおよびLから独立して選択される。
例えば、X16はQである。
例えば、X16はPである。
例えば、X16はYである。
例えば、X16はIである。
一実施形態において、X17はQ、P、Y、IおよびLから独立して選択される。
例えば、X17はQである。
例えば、X17はPである。
例えば、X17はYである。
例えば、X17はIである。
一実施形態において、X20は、Q、P、Y、IおよびLから独立して選択される。
例えば、X20はQである。
例えば、X20はPである。
例えば、X20はYである。
例えば、X20はIである。
一実施形態において、X21はQ、P、Y、IおよびLから独立して選択される。
例えば、X21はQである。
例えば、X21はPである。
例えば、X21はYである。
例えば、X21はIである。
一実施形態において、ペプチド化合物は、以下から選択される:
GVXAKAGVXNXFKSESY(配列番号1);
(XGVX10AKAGVX11NX12FKSESY(配列番号2);
YKX13LRRX14APRWDX15PLRDPALRX1617L(配列番号3);
YKX18LRR(X19PLRDPALRX2021L(配列番号4);
IKLSGGVQAKAGVINMDKSESM(配列番号5);
スクシニル−IKLSGGVQAKAGVINMFKSESY(スクシニル基がN末端に結合した配列番号6を含む);
IKLSGGVQAKAGVINMFKSESYK(ビオチン)(ビオチン分子がC末端に結合した配列番号7を含む);
GVQAKAGVINMFKSESY(配列番号8);
アセチル−GVRAKAGVRNMFKSESY(配列番号14);
アセチル−GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY(配列番号15);
アセチル−YKSLRRKAPRWDAPLRDPALRQLL(配列番号16);
アセチル−YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRQLL(配列番号17);および
アセチル−YKSLRRKAPRWDAYLRDPALRPLL(配列番号18)。
一実施形態において、ペプチド化合物は、ペプチド末端で優先的結合部位を得る、または増加させるために、1または複数のアミノ酸残基の付加によってC末端および/またはN末端において修飾することができる。例えば、アミノ酸はシステインであってよい。例えば、アミノ酸はリジンであってよい。
本明細書に記載のペプチド化合物は、小分子、ペプチド、抗癌ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、診断薬、造影剤または放射性核種剤、モノクローナル抗体などの大分子、抗癌剤および植物化学物質などの治療剤に、または治療剤、造影剤、遺伝子、siRNAを充填されたナノ粒子、リポソーム、グラフェン粒子を含む薬物送達システムに連結、結合、混合またはコンジュゲートすることができる。得られたコンジュゲート化合物は、例えば癌を治療するための単剤療法または併用療法として使用することができる。
したがって、本明細書に開示の第2の態様は、
A−(B)
(式中、
nは1、2、3または4であり、
Aは、場合により保護基によって保護されている、請求項1から14のいずれか1項に記載のペプチド化合物であり、および
Bは、BがAに連結されている少なくとも1つの治療剤である)
の式を有するコンジュゲート化合物である。
本明細書に開示の第3の態様は、
A−(B)
(式中、
nは1、2、3または4であり、
Aは、本明細書に記載のペプチド化合物であり、および
Bは、ペプチド化合物のリジン残基の遊離アミンにおいて場合によりリンカーを介して、またはペプチド化合物のN末端位において、場合によりリンカーを介してBがAに連結されている少なくとも1つの治療剤である)
の式を有するコンジュゲート化合物である。
一実施形態において、Bは、リンカー、場合により切断可能なリンカーを介してAに連結される。
使用可能な抗癌剤としては、例えば、アルキル化剤、例えばナイトロジェンマスタード(メルファラン、シクロホスファミド、イホスファミド)、ニトロソウレア、アルキルスルホネート、エチレンイミン、トリアゼン、メチルヒドラジンおよびプラチナ配位錯体、例えばシスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチンが挙げられる。
例えば、葉酸アンタゴニスト(例えば、メトトレキセート)、プリンアンタゴニストおよびピリミジンアンタゴニスト(例えば、5−フルオロウラシルおよびシータバリン(cytabarine))などの代謝拮抗物質を抗癌剤として使用することができる。
例えば、天然産物を抗癌剤として使用することができる。このような天然産物としては、例えば、ビンカアルカロイド(例えば、ビンクリスチン、ビンブラスチン)、タキサン類(例えば、パクリタキセル、ドセタキセル、およびカバジタキセル)、毒素類、エピポドフィロトキシン(epipodopyllotoxin)類(例えば、エトポシド)、およびカンプトテシン(camtothecin)類(例えば、イリノテカン)などの植物性産物、ならびに例えば、抗生物質(例えば、ドキソルビシンおよびブレオマイシンなどの微生物産物、ならびに酵素、例えば、L−アスパラギナーゼが挙げられる。
他の使用可能な抗癌剤としては、例えば、メイタンシン、オーリスタチン、ドルスタチン(Dolastin)、カリケアマイシン(Chalicheamicin)、エムタンシン、アマニチン、ピロロベンゾジアゼピン、ツブリシン、ヒドロキシ尿素、メシル酸イマチニブ、リツキシマブ、エピルビシン、ボルテゾミブ、ゾレドロン酸、ゲフチニブ、ロイコボリン、パミドロネートおよびゲムシタビンが挙げられる。
例えば、コルチコステロイド(プレドニゾン、デキサメタゾン)、エストロゲン(エチニルエストラジオール(Ethinyloestradiol))、抗エストロゲン(タモキシフェン)、プロゲステロン誘導体(酢酸メゲストロール)、アンドロゲン(プロピオン酸テストステロン)、抗アンドロゲン(フルタミド、ビカルタミド)、アロマターゼ阻害剤(レトロゾール、アナストラゾール)、5−アルファレダクターゼ阻害剤(フィナステリド)、GnRHアナログ(ロイプロリド、ブセレリン)および成長ホルモン、グルカゴンならびにインスリン阻害剤(オクトレオチド)などのホルモンおよびアンタゴニストを抗癌剤として使用することができる。
例えば、本明細書に開示の化合物は、例えばチロシンキナーゼ阻害剤(TKI)(例えば、メシル酸イマチニブ、ゲフィチニブ、エルロチニブ、ソラフェニブ、スニチニブ、ダサチニブ、ラパチニブ、ニロチニブおよびボルテゾミブ)、抗体、モノクローナル抗体(mAB)(例えば、リツキシマブ、トラスツズマブ、アレムツズマブ、セツキシマブ、ベバシズマブおよびイピリムマブ)、ラパマイシン機構的標的(mechanistic target of rapamycin)(mTOR)阻害剤ならびに抗体−薬物コンジュゲート(例えば、トラスツズマブエムタンシン(T−MD1)を含む、標的癌療法に使用される抗癌剤に連結することができる。
例えば、本明細書に開示の化合物は、例えば、ブセレリン、ゴナドレリン、ゴセレリン、ヒストレリン、ロイプロリド、ナファレリン、トリプトレリン、アバレリックス、セトロレリクス、デガレリクスおよびガニレリクスなどの、ペプチド系癌療法に使用されるペプチドに連結することができる。
一実施形態において、治療剤は抗癌剤である。
例えば、抗癌剤は、ドセタキセル、カバジタキセル、パクリタキセル、ドキソルビシンおよびダウノマイシンである。
一実施形態において、抗癌剤はドセタキセルである。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XIV)、式(XV)、式(XVI)、式(XVII)および式(XVIII)の化合物から選択される:
IK(ドセタキセル)LSGGVQAK(ドセタキセル)AGVINMFK(ドセタキセル)SESY(XIV)
(各リジン残基にドセタキセル分子が連結されている、配列番号6を有するペプチド化合物を含む);
GVQAK(ドセタキセル)AGVINMFK(ドセタキセル)SESY(XV)
(各リジン残基にドセタキセル分子が連結されている、配列番号8を有するペプチド化合物を含む);
GVRAK(ドセタキセル)AGVRNMFK(ドセタキセル)SESY(XVI)
(各リジン残基にドセタキセル分子が連結されている、配列番号9を有するペプチド化合物を含む);
GVRAK(ドセタキセル)AGVRN(Nle)FK(ドセタキセル)SESY(XVII)
(各リジン残基にドセタキセル分子が連結されている、配列番号10を有するペプチド化合物を含む);ならびに
YK(ドセタキセル)SLRRK(ドセタキセル)APRWDAPLRDPALRQL(XVIII)
(各リジン残基にドセタキセル分子が連結されている、配列番号11を有するペプチド化合物を含む)。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XIV)によって表される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XV)によって表される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XVI)によって表される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XVII)によって表される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XVIII)によって表される。
別の実施形態において、コンジュゲート化合物は、以下から選択される:
スクシニル−IK(ドセタキセル)LSGGVQAK(ドセタキセル)AGVINMFK(ドセタキセル)SESY(XIX)
(各リジン残基にドセタキセル分子が連結され、スクシニル基がN末端に結合した、配列番号6を有するペプチド化合物を含む);
アセチル−GVRAK(ドセタキセル)AGVRNMFK(ドセタキセル)SESY(XX)
(各リジン残基にドセタキセル分子が連結されている、配列番号14を有するペプチド化合物を含む);
アセチル−GVRAK(ドセタキセル)AGVRN(Nle)FK(ドセタキセル)SESY(XXI)
(各リジン残基にドセタキセル分子が連結されている、配列番号15を有するペプチド化合物を含む);ならびに
アセチル−YK(ドセタキセル)SLRRK(ドセタキセル)APRWDAPLRDPALRQLL(XXII)
(各リジン残基にドセタキセル分子が連結されている、配列番号16を有するペプチド化合物を含む)。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XIX)によって表される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XX)によって表される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXI)によって表される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXII)によって表される。
さらに別の実施形態において、抗癌剤はドキソルビシンである。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXIII)、式(XXIV)および式(XXV)の化合物から選択される:
GVQAK(ドキソルビシン)AGVINMFK(ドキソルビシン)SESY(XXIII)
(各リジン残基にドキソルビシン分子が連結されている、配列番号8を有するペプチド化合物を含む);
GVRAK(ドキソルビシン)AGVRN(Nle)FK(ドキソルビシン)SESY(XXIV)
(各リジン残基にドキソルビシン分子が連結されている、配列番号10を有するペプチド化合物を含む);ならびに
YK(ドキソルビシン)SLRRK(ドキソルビシン)APRWDAPLRDPALRQLL(XXV)
(各リジン残基にドキソルビシン分子が連結されている、配列番号11を有するペプチド化合物を含む)。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXIII)によって表される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXIV)によって表される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXV)によって表される。
例えば、コンジュゲート化合物は、
アセチル−GVRAK(ドキソルビシン)AGVRN(Nle)FK(ドキソルビシン)SESY(XXVI)
(各リジン残基にドキソルビシン分子が連結されている、配列番号15を有するペプチド化合物を含む);ならびに
アセチル−YK(ドキソルビシン)SLRRK(ドキソルビシン)APRWDAPLRDPALRQLL(XXVII)
(各リジン残基にドキソルビシン分子が連結されている、配列番号16を有するペプチド化合物を含む);
から選択することができる。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXVI)によって表される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXVII)によって表される。
一実施形態において、抗癌剤はカバジタキセルである。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXVIII)、式(XXIX)および(XXX)の化合物から選択される:
GVRAK(カバジタキセル)AGVRNMFK(カバジタキセル)SESY(XXVIII)
(各リジン残基にカバジタキセル分子が連結されている配列番号9を有するペプチド化合物を含む);
GVRAK(カバジタキセル)AGVRN(Nle)FK(カバジタキセル)SESY(XXIX)
(各リジン残基にカバジタキセル分子が連結されている配列番号10を有するペプチド化合物を含む);
およびYK(カバジタキセル)SLRRK(カバジタキセル)APRWDAPLRDPALRQL(XXX)
(各リジン残基にカバジタキセル分子が連結されている、配列番号9を有するペプチド化合物を含む)。一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXVIII)によって表される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXIX)によって表される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXX)によって表される。
例えば、コンジュゲート化合物は、式(XXXI)、式(XXXII)および(XXXIII)の化合物から選択することができる:
アセチル−GVRAK(カバジタキセル)AGVRNMFK(カバジタキセル)SESY(XXXI)
(各リジン残基にカバジタキセル分子が連結されている配列番号14を有するペプチド化合物を含む);
アセチル−GVRAK(カバジタキセル)AGVRN(Nle)FK(カバジタキセル)SESY(XXXII)
(各リジン残基にカバジタキセル分子が連結されている配列番号15を有するペプチド化合物を含む);および
アセチル−YK(カバジタキセル)SLRRK(カバジタキセル)APRWDAPLRDPALRQLL(XXXIII)
(各リジン残基にカバジタキセル分子が連結されている配列番号16を有するペプチド化合物を含む)。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXXI)によって表される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXXII)によって表される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXXIII)によって表される。
使用できる他の治療剤としては、植物化学物質が挙げられる。
一実施形態において、植物化学物質はクルクミンである。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、式(XXXIV)によって表される:
GVRAK(クルクミン)AGVRN(Nle)FK(クルクミン)SESY(XXXIV)
(各リジン残基にクルクミン分子が連結されている配列番号10を有するペプチド化合物を含む)。
例えば、コンジュゲート化合物は、式(XXXV)で表される:
アセチル−GVRAK(クルクミン)AGVRN(Nle)FK(クルクミン)SESY(XXXV)
(各リジン残基にクルクミン分子が連結されている、配列番号15を有するペプチド化合物を含む)。
一実施形態において、少なくとも1つの治療剤であるBは、リンカーを介して、ペプチド化合物のリジン残基の遊離アミンにおいて、ペプチド化合物Aに連結される。
一実施形態において、少なくとも1つの治療剤であるBは、リンカーを介して、ペプチド化合物のN末端位においてペプチド化合物Aに連結される。
一実施形態において、リンカーは、コハク酸およびジメチルグルタル酸リンカーから選択される。
例えば、リンカーは切断可能なリンカーである。
例えば、リンカーは切断不能なリンカーである。
例2に示すように、コンジュゲート化合物は、少なくとも1つの治療剤をペプチド化合物に連結する切断可能なリンカーを含むことができる。例えば、少なくとも1つの治療剤は、エステル結合に対するエステラーゼの作用によってペプチド化合物から放出され得る。
例えば、例2および図4に示すように、治療剤は、ペプチド上の利用可能な遊離アミン、リジンまたはアミノ末端において、ペプチド結合などの結合を形成することによってペプチド化合物にコンジュゲートすることができる。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、ペプチド化合物に連結された1分子の治療剤を含む。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、ペプチド化合物に連結された2分子の治療剤を含む。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、ペプチド化合物に連結された3分子の治療剤を含む。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、ペプチド化合物に連結された4分子の治療剤を含む。
一実施形態において、ペプチド化合物への治療剤のコンジュゲーション、それによるコンジュゲート化合物の形成は、治療剤の効力を変えることはない。
例えば、表4に示すように、ドセタキセル−KatanaペプチドコンジュゲートのIC50値は、卵巣癌、乳癌および皮膚癌細胞における非コンジュゲートドセタキセルのIC50値に類似している。
本明細書に開示のコンジュゲート化合物は、多剤耐性薬物細胞から他の治療剤を汲み出すP−糖タンパク質膜輸送体ポンプなどの排出ポンプの基質ではないため、治療剤を細胞内に輸送するためにも使用することができる。
例えば、図6に示すように、ヒト多剤耐性遺伝子MDR1をトランスフェクトした腎臓上皮細胞であるMDCK−MDR細胞におけるドセタキセル−コンジュゲートの取り込みは、非コンジュゲートドセタキセルと比較してより速く、より高濃度で蓄積する。
さらなる態様において、本明細書に開示のコンジュゲート化合物を調製するための方法であって、
中間体を得るためにリンカーと治療薬とを反応させる工程;
場合により中間体を精製する工程;
コンジュゲート化合物を得るように、中間体とペプチド化合物とを反応させる工程;および
場合によりコンジュゲート化合物を精製する工程;
を含み、
治療剤が、リジン残基の遊離アミンにおいて、またはN末端においてペプチド化合物に連結されており、ペプチド化合物が1、2、3または4つの連結治療剤分子を含む方法が提供される。
例えば、ペプチド化合物は、1つの連結治療剤分子を含む。例えば、ペプチド化合物は、2つの連結治療剤分子を含む。例えば、ペプチド化合物は、3つの連結治療剤分子を含む。例えば、ペプチド化合物は、4つの連結治療剤分子を含む。
例えば、リンカーはコハク酸である。
例えばリンカーはジメチルグルタル酸リンカーである。
一実施形態において、ペプチド化合物は、中間体と反応する前にN末端において保護される。
コンジュゲート化合物の合成の例を例11および12に示す。
例えば、FMOCなどの保護基を、リンカーの組み込み前に、治療剤上の遊離アミンに保護基として付加することができる。合成後、コンジュゲート化合物は保護基から脱保護することができる。例えば、保護剤FMOCを含むコンジュゲート化合物は、ピペリジンを用いて脱保護することができる。当業者には、他の公知の化学試薬をコンジュゲート化合物の脱保護に使用できることが容易に理解されよう。
例えば、治療剤および/またはペプチド化合物のN末端をアセチル化によってキャップすることができ、それによってN末端に不可逆的な保護基を提供することができる。
一実施形態において、中間体は、ペプチド化合物と反応する前に活性化される。
例えば、中間体はペプチド化合物と反応する前に、N,N,N′,N′−テトラメチル−O−(ベンゾトリアゾール−1−イル)ウロニウムテトラフルオロボレート(TBTU)、(2−(1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート)(HBTU)、および(1−[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]−1H−1,2,3−トリアゾロ[4,5−b]ピリジニウム3−オキシドヘキサフルオロホスフェート)(HATU)から任意に選択されるカップリング剤を用いて活性化される。
例えば、リンカーに連結された治療剤を含む中間体は、ペプチド化合物とコンジュゲートする前に、ペプチドカップリング試薬であるTBTUで活性化することができる。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、その合成後に精製される。
本明細書に開示の化合物はまた、融合タンパク質に関連して使用することができる。例えば、融合タンパク質は、本明細書開示の化合物、例えばペプチド化合物と、1または複数のタンパク質またはその機能的ドメインなどの一部とを融合させることによって操作することができる。融合タンパク質は、例えば、組換えDNA技術によって操作し、細菌または哺乳動物タンパク質発現系などのタンパク質発現系を用いて発現させることができる。いくつかの実施形態において、ペプチドリンカーがタンパク質間に付加される。他の実施形態において、融合タンパク質は、タンパク質を連結するリンカーを含まない。
一般的に使用されるタンパク質発現系としては、細菌、酵母、バキュロウイルス/昆虫、植物および哺乳動物細胞、より最近では糸状菌、例えばミセリオフソラ・サーモフィラ(Myceliophthora thermophile)由来のものが挙げられる。
さらに、いくつかの実施形態において、本明細書に記載の化合物は、1または複数の他の化合物と会合、結合または連結して、二量体、三量体または四量体などの多量体、ならびに分枝状ペプチドを形成することができる。このような化合物は、例えば、共有結合、原子またはリンカーを介して一緒に連結することができる。例えば、多量体は、2つ以上のペプチド化合物および/または2つ以上のコンジュゲート化合物を含む。化合物の多量体(例えば、二量体、三量体)形態を作製する方法は、米国特許第9,161,988号に記載されており、当該特許はその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本開示の別の態様は、本明細書に開示の少なくとも1つの化合物の治療有効量を、それを必要とする対象に投与する工程を含む、疾患を治療する方法を含む。
例えば、ソルチリンを発現する少なくとも1つの癌細胞と、本明細書に開示の少なくとも1つの化合物とを接触させる工程を含む、ソルチリン発現を伴う癌を治療する方法が本明細書において提供される。
例えば、本明細書に開示の少なくとも1つの化合物の治療有効量を、それを必要とする対象に投与する工程を含む、ソルチリン発現を伴う疾患を治療する方法が本明細書において提供される。
例えば、少なくとも1つの受容体を発現する少なくとも1つの癌細胞と、少なくとも1つの本明細書に開示の化合物とを接触させる工程を含む、液胞タンパク質選別10(Vps10)ファミリーの受容体から選択される少なくとも1つの受容体の発現を伴う癌を治療する方法が本明細書において提供される。
例えば、本明細書に開示の少なくとも1つの化合物の治療有効量を、それを必要とする対象に投与する工程を含む、液胞タンパク質選別10(Vps10)ファミリーの受容体から選択される少なくとも1つの受容体の発現を伴う疾患を治療する方法が、本明細書において提供される。
例えば、少なくとも1つの受容体は、ソルチリン、SorL1、SorCS1、SorCS2、およびSorCS3から選択される。
例えば、少なくとも1つの受容体は、神経および非神経細胞におけるタンパク質輸送ならびに細胞内および細胞間シグナル伝達において多面的な機能を果たす。
例えば、治療剤を伴う薬物治療の方法において、本方法が、治療剤および本明細書に開示の少なくとも1つの化合物を投与することによって、それを必要とする対象に投与される治療剤の忍容性を高める工程を含むように改善される。
例えば、治療剤を伴う薬物治療の方法において、本方法が、本明細書に開示の少なくとも1つの化合物にコンジュゲートされた治療剤を投与することによって、それを必要とする対象に投与される治療剤の忍容性を高める工程を含むように改善される。
例えば、治療剤の忍容性を高める方法であって、
治療剤を含む本明細書に開示のコンジュゲート化合物を得る工程、および
コンジュゲート化合物の治療有効量をそれを必要とする対象に投与する工程、
を含む方法が本明細書において提供される。
例えば、治療剤の忍容性を高める方法であって、
治療剤と本明細書に開示のペプチド化合物とをコンジュゲートして、コンジュゲート化合物を得る工程、および
コンジュゲート化合物の治療有効量をそれを必要とする対象に投与する工程、
を含む方法が本明細書において提供される。
例えば、治療剤の抗増殖活性を増加させる方法であって、
治療剤を含む本明細書に開示のコンジュゲート化合物を得る工程、および
コンジュゲート化合物の治療有効量をそれを必要とする対象に投与する工程、
を含む方法が本明細書において提供される。
例えば、治療剤の抗増殖活性を増加させる方法であって、
治療剤と本明細書に開示のペプチド化合物とをコンジュゲートして、コンジュゲート化合物を得る工程、および
コンジュゲート化合物の治療有効量をそれを必要とする対象に投与する工程、
を含む方法が本明細書において提供される。
例えば、抗増殖活性は、非コンジュゲート治療剤と比較して、少なくとも10倍、少なくとも20倍、少なくとも30倍、少なくとも40倍、少なくとも50倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、または少なくとも100倍増加される。
例えば、癌は、卵巣癌、脳癌、乳癌、メラノーマ、結腸直腸癌、膠芽細胞腫、肝臓癌、肺癌、前立腺癌、子宮頸癌、頭部癌、胃癌、腎臓癌、子宮内膜癌、精巣癌、尿路上皮癌、急性リンパ芽球性白血病、急性骨髄性白血病、ホジキンリンパ腫、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫、軟部組織癌、骨肉腫、甲状腺癌、移行細胞膀胱癌、ウィルムス腫瘍、神経膠腫、膵臓癌または脾臓癌である。
例えば、癌はソルチリン発現を伴う癌である。
例えば、本明細書において、治療剤の細胞内在化を増加させる方法であって、
治療剤を含む本明細書に開示のコンジュゲート化合物を得る工程、および
コンジュゲート化合物の治療有効量をそれを必要とする対象に投与する工程、
を含む方法が本明細書において提供される。
例えば、本明細書において、治療剤の細胞内在化を増加させる方法であって、
治療剤と本明細書に開示のペプチド化合物とをコンジュゲートして、コンジュゲート化合物を得る工程、および
コンジュゲート化合物の治療有効量をそれを必要とする対象に投与する工程、
を含む方法が本明細書において提供される。
例えば、本明細書において、治療剤の細胞内在化を増加させる方法であって、
治療剤と本明細書に開示のペプチド化合物とをコンジュゲートして、コンジュゲート化合物を得る工程、および
少なくとも1つの細胞と、コンジュゲート化合物とを接触させる工程、
を含む方法が本明細書において提供される。
別の態様は、疾患を治療するための、本明細書に開示の少なくとも1つの化合物の使用を含む。
さらなる態様は、疾患を治療するための、本明細書に開示の1または複数の化合物を含む。
一実施形態において、疾患は癌である。
別の態様は、本明細書に開示の少なくとも1つの化合物の治療有効量を、それを必要とする対象に投与する工程を含む、癌を治療する方法を提供する。
別の態様は、癌を治療するための、本明細書に開示の少なくとも1つの化合物の使用を含む。
さらに別の態様は、癌を治療するための、本明細書に開示の1または複数の化合物を含む。
一実施形態において、化合物は、本明細書に開示のコンジュゲート化合物である。
本明細書に開示の化合物を用いて治療することができる癌としては、血液癌および固形癌が挙げられ、例えば、卵巣、子宮内膜、皮膚、脳、脊髄、乳房、結腸、小腸、肝臓、肺、前立腺、頭部、頚部、胃、骨、甲状腺、膀胱、腎臓、膵臓および脾臓の腫瘍が含まれるが、これらに限定されない。
一実施形態において、癌は卵巣癌である。
一実施形態において、癌は乳癌である。
一実施形態において、癌は脳癌である。
一実施形態において、癌は肺癌である。
一実施形態において、癌は皮膚癌である。
一実施形態において、癌は血液癌である。
一実施形態において、血液癌は、急性骨髄性白血病(AML)、急性リンパ球性白血病(ALL)、慢性リンパ球性白血病(CLL)および慢性骨髄性白血病(CML)などの白血病である。別の実施形態において、血液癌は骨髄腫である。一実施形態において、血液癌は、非ホジキンリンパ腫およびホジキンリンパ腫などのリンパ腫である。
一実施形態において、癌は脳癌である。一実施形態において、脳癌は膠芽細胞腫である。
一実施形態において、癌は肝臓癌である。一実施形態において、肝臓癌は肝細胞腺癌である。
一実施形態において、癌は肺癌である。一実施形態において、肺癌は非小細胞肺癌である。
一実施形態において、癌は腎臓癌である。一実施形態において、腎臓癌はウィルムス腫瘍である。
一実施形態において、癌は膀胱癌である。一実施形態において、膀胱癌は移行細胞膀胱癌である。
一実施形態において、癌は、乳癌、メラノーマ、結腸直腸癌、膠芽細胞腫および肝細胞腺癌から選択される。
一実施形態において、コンジュゲート化合物は、癌細胞に対してアポトーシスを誘導する。
例えば、Katana−薬物コンジュゲートは、例えば卵巣癌細胞、メラノーマ癌細胞および乳癌細胞などの癌細胞においてアポトーシスを誘導する。
図10に示すように、ドセタキセル−コンジュゲートおよびカバジタキセルコンジュゲートは、癌細胞におけるアポトーシスの誘導において、非コンジュゲートドセタキセルおよびカバジタキセルより強力である。同様に、図30に示されるように、クルクミンコンジュゲートは、非コンジュゲートクルクミンと比較して、癌細胞においてより多くのアポトーシスを誘導する。
一実施形態において、Katana−薬物コンジュゲートはまた、腫瘍抑制の誘導において非コンジュゲート治療剤よりも強力である。
一実施形態において、本明細書に開示の化合物は、例えば多剤耐性癌における癌の治療に使用することができる。
図6に示すように、コンジュゲート化合物は、ヒト多剤耐性遺伝子MDR1を有するMDCKトランスフェクト細胞において、ドセタキセルコンジュゲートは非コンジュゲートドセタキセルと比較してより速い速度およびより高濃度で蓄積した。
一実施形態において、本明細書に開示の化合物はまた、癌細胞の遊走能を低下させる。
例えば、図16に示すように、コンジュゲート化合物と共にインキュベートした癌細胞で細胞遊走を評価した。この結果は、Katana−薬物コンジュゲートが癌細胞の遊走能を強く低下させることを示している。
一実施形態において、本明細書に開示の化合物は、腫瘍成長を減少させるために使用することができる。
例4に示されるように、Katana薬物コンジュゲートは、マウス異種移植片腫瘍モデルにおいて腫瘍発光を定量することによって測定して、腫瘍成長の減少において非コンジュゲート化合物より有効である。
本明細書に開示の化合物は、ソルチリン/シンデカン受容体が発現および/または関与する疾患を治療するために使用することができる。
例えば、本明細書に開示の化合物は、炎症性疾患(Mortensen、2014年)、リソソーム障害(Coutinho、2012年、Prabakaran、2012年)および心臓血管疾患(Kjolby、2015年)を治療するために使用することができる。
例えば、少なくとも1つの治療剤の細胞内在化を高めるための、本明細書に開示のコンジュゲート化合物の使用が提供される。
例えば、ソルチリン発現を伴う疾患を治療するための、本明細書に開示の少なくとも1つの化合物の使用が提供される。
例えば、使用は、液胞タンパク質選別10(Vps10)ファミリーの受容体から選択される少なくとも1つの受容体の発現を伴う疾患を治療するためのものである。
例えば、少なくとも1つの受容体は、ソルチリン、SorL1、SorCS1、SorCS2、およびSorCS3から選択される。
例えば、少なくとも1つの受容体は、神経および非神経細胞におけるタンパク質輸送ならびに細胞内および細胞間シグナル伝達において多面的な機能を果たす。
例えば、癌を治療するための、本明細書に開示の少なくとも1つの化合物の使用が提供される。
例えば、癌を治療するための医薬品の製造における、本明細書に開示の化合物の使用が提供される。
例えば、癌はソルチリン発現を伴う癌である。
例えば、癌は、卵巣癌、脳癌、乳癌、メラノーマ、結腸直腸癌、膠芽細胞腫、肝臓癌、肺癌、前立腺癌、子宮頸癌、頭部癌、胃癌、腎臓癌、子宮内膜癌、精巣癌、尿路上皮癌、急性リンパ芽球性白血病、急性骨髄性白血病、ホジキンリンパ腫、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫、軟部組織癌、骨肉腫、甲状腺癌、移行細胞膀胱癌、ウィルムス腫瘍、神経膠腫、膵臓癌または脾臓癌である。
例えば、ソルチリンを発現する細胞を選択的に標的化するための、本明細書に開示の化合物の使用が提供される。
ある種の抗癌剤は有効であるが、副作用を伴うことは周知である。ドキソルビシンは、例えば、用量依存的に心毒性を伴う。ヒトにおいて、ドキソルビシンの最大累積投与量は550mg/mである。この閾値を超える累積投与量は、心毒性の増加率と関連している。本明細書で述べるように、本明細書に記載の化合物は、ソルチリンを発現する細胞を選択的に標的化する。したがって、それらは、ソルチリンを発現する癌細胞に抗癌剤を選択的に送達し、したがって、抗癌剤(例えば、ドキソルビシン)によって引き起こされる一般的な細胞毒性を減少させる。
例えば、薬物送達システムにおける本明細書に開示の化合物の使用が提供される。
例えば、場合により発現系、場合により細菌、酵母、バキュロウイルス/昆虫、植物細胞、哺乳動物細胞および糸状菌、場合によりミセリオフソラ・サーモフィラ(Myceliophthora thermophila)菌に由来する発現系を用いて操作された融合タンパク質に関連した、本明細書に開示の化合物の使用が提供される。
例えば、ソルチリン発現を伴う疾患を治療するための医薬品の製造における、本明細書に開示の化合物の使用が提供される。
例えば、治療剤の忍容性を高めるための、本明細書に開示の化合物の使用が提供される。
例えば、治療剤の忍容性を高めるための、本明細書に開示の化合物の使用が提供される。
例えば、治療剤の抗増殖活性を増加させるための、本明細書に開示の化合物の使用が提供される。
別の態様は、少なくとも2つの本明細書に開示の化合物を含むライブラリーである。
さらに別の態様は、生物学的標的を調節する化合物を同定するための、本明細書に記載のライブラリーの使用である。
前述のように、本明細書中に開示の化合物は、薬物送達システムに関連して使用することができる。例えば、化合物は、治療剤が充填されたナノ粒子、リポソーム、グラフェン粒子の表面に連結、結合、混合、吸着させることができる。例えば、化合物は、リンカー、原子または結合を介して表面に連結させることもできる。
本明細書に開示の態様は、本明細書に開示の少なくとも1つの化合物を含むリポソーム、グラフェンまたはナノ粒子である。
別の態様は、本明細書に開示の少なくとも1つの化合物でコーティングされたリポソーム、グラフェンまたはナノ粒子である。
別の態様は、少なくとも1つの治療剤、遺伝子またはsiRNAが充填されたリポソーム、グラフェンまたはナノ粒子であり、リポソームまたはナノ粒子は、本明細書に定義の少なくとも1つの化合物でコーティングされる。例えば、少なくとも1つの化合物は、リポソームまたはナノ粒子の表面に連結させることができる。
一実施形態において、少なくとも1つの化合物は、本明細書に開示のペプチド化合物である。一実施形態において、少なくとも1つの化合物は、本明細書に開示のコンジュゲート化合物である。
リポソームまたはナノ粒子の異なる実施形態は、当業者によって想定されよう。例えば、リポソームまたはナノ粒子は、リポソームまたはナノ粒子の表面にコーティングされた本明細書に開示の少なくとも1つのペプチド化合物、およびリポソームまたはナノ粒子内の治療剤、例えば抗癌剤を含むことができる。例えば、リポソームまたはナノ粒子は、リポソームまたはナノ粒子の表面にコーティングされた本明細書に開示の少なくとも1つのコンジュゲート化合物、およびリポソームまたはナノ粒子内の治療剤、例えば抗癌剤を含むことができる。
例えば、本明細書中に開示の2つ以上の化合物を含む多量体が提供される。
例えば、本明細書中に開示される2つ以上の化合物は、互いに直接的または間接的に連結される。
例えば、2つ以上の化合物は、共有結合を介して直接連結される。
例えば、2つ以上の化合物は、リンカーを介して間接的に連結される。
例えば、多量体は二量体、三量体または四量体である。
本開示のさらなる実施形態を、以下の例を参照して説明する。これらの例は、本開示の実施形態を例示するためのものであり、本開示の範囲を限定するものではないことを理解されたい。
[例1]
ペプチド化合物の生成
主要な目標の1つは、Katana受容体媒介プラットフォームが、これらの細胞上で発現される受容体に向かうペプチド−薬物コンジュゲートを使用することによって癌細胞に対して有効であるかどうかを決定することである。Katanaペプチドの第1ファミリーは細菌細胞透過性タンパク質に由来し、第2ファミリーはソルチリンリガンドである、プログラニュリンおよびニューロテンシンに基づく(表1)。
まず、表面プラズモン共鳴(SPR)を用いて、これらのペプチドがソルチリンによって認識されるかどうかを調べた。このアプローチのために、ビオチンをペプチド合成中にKatana−Biopharma peptideのC末端に付加した。次いでビオチン化ペプチド(KBP−103)を製造者の推奨手順を用いてストレプトアビジンセンサーチップ上に固定化した。次いで、漸増濃度の可溶型ソルチリンを、センサーチップにわたって注入した。次いで、固定化KBP−103と受容体ソルチリンとの間の相互作用をリアルタイムでモニターした。代表的な相互作用曲線を図1に示し、センサーグラム曲線から、親和定数ならびにKaおよびKdを決定し、表2に示す。BIA評価ソフトウェアを用いて種々の注入から親和定数(K、KおよびK)を抽出した。ソルチリンに対するKatanaペプチドの親和定数(K)は低いnM範囲にあり、このペプチドがこの受容体に対して高い親和性を有することを示している。
ウエスタンブロットによる種々の癌細胞におけるソルチリンの発現もまた調査した。結果は、試験したほとんどの癌細胞において、ソルチリンが検出可能であることを示している。場合によっては、この受容体の発現レベルは非常に高かった。多くの乳癌細胞、メラノーマ、結腸直腸癌、膠芽細胞腫および肝細胞腺癌において高い発現が見られた(図3)。これは、ソルチリンが、乳癌、結腸直腸癌、肺癌、前立腺癌および卵巣癌を含む異なる固形腫瘍において発現することが報告されていることから(Roseli、2015年;Ghaemimanesh、2014年;Hammati、2009年)、文献と一致している。
[例2]
Katana−ペプチド−薬物コンジュゲートの生成
ドセタキセルおよびドキソルビシンは抗癌剤の原理の証明のために最初に選択されたが、クルクミンは植物化学物質の中から選択された。ドセタキセルはパクリタキセルの半合成類似体であり、希少なタイヘイヨウイチイのタキサス・ブレビフォリア(Taxus brevifolia)の樹皮由来の抽出物である。この薬剤は、局所進行性または転移性乳癌、頭頸部癌、胃癌、ホルモン不応性前立腺癌および非小細胞肺癌の治療薬として、FDA(National Cancer Institute)の認可を受けている。ドセタキセルは、特定の癌の種類および段階に応じて、単一の薬剤として、または他の化学療法薬と併用して使用することができる。カバジタキセル(以前のXRP−6258、商品名Jevtana(商標))は、天然タキソイドの半合成誘導体である。これは、Sanofi−Aventisによって開発された微小管阻害剤である。カバジタキセルは、2010年6月17日、ホルモン不応性前立腺癌の治療薬としてU.S.FDAにより認可された。ドキソルビシンは、天然産物のダウノマイシンと密接に関連するアントラサイクリン抗腫瘍抗生物質(注:この文脈において、これは細菌感染症の治療に使用されることを意味してはいない)であり、すべてのアントラサイクリン系と同様にDNAのインターカレーションにより作用し、生命を脅かす心臓障害である最も重篤な有害作用を有する(国立がん研究所)。ドキソルビシンは、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、乳癌、胃癌、ホジキンリンパ腫、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫、卵巣癌、小細胞肺癌、軟部組織および骨肉腫、甲状腺癌、移行細胞膀胱癌およびウィルムス腫瘍の治療に単独で、または他の薬物と併用して使用することが認可されている。クルクミン(ジフェルロイルメタン)は、スパイスのターメリック(クルクマ・ロンガ(Curcuma longa))に存在する黄色色素であり、6,000を超える引用(Hosseini、2015年)に示されているように、抗酸化性、抗炎症性、抗癌性、抗ウイルス性、および抗菌性の活性に関連している。
アミンコンジュゲート戦略を用いて、抗癌剤(例えば、ドセタキセル、カバジタキセル、ドキソルビシン)または植物化学物質(例えば、クルクミン)をペプチドにコンジュゲートすることができる。簡潔には、ドセタキセルは、活性化ドセタキセルとペプチド結合(アミド結合)を形成することにより、ペプチド上の利用可能な遊離アミン(リジンまたはアミノ末端)上の(1または複数の)Katanaペプチドにコンジュゲートすることができる。KBP−101では、4つの遊離アミン、N末端および3つのリジンがコンジュゲーションに利用可能である。したがって、ペプチドに1、2、3および4つのドセタキセルを付加することによって、異なるコンジュゲートを生成することができる。同様のコンジュゲーション戦略を、ドキソルビシンおよびクルクミンにより用いることができる(図4および5)。
例えば、以下の戦略が、薬物とKatanaペプチドとのコンジュゲーションに使用されている。N末端をブロックし、3つの他のコンジュゲーション部位をすべてドセタキセルで飽和させ、それによってペプチド分子当たり3分子のドセタキセルのペプチド薬物コンジュゲートを形成した。全コンジュゲーションをHPLCで分析し、コンジュゲートをマススペクトル(MALDI−TOF)によって確認した。ドセタキセルは、エステラーゼによるエステル結合の切断によって放出させることができる。
抗癌剤(例えば、ドセタキセル、ドキソルビシン)および植物化学物質(例えばクルクミン)は、切断可能なリンカーを用いてコンジュゲートさせる。次いで、天然の薬物を、エステル結合に対するエステラーゼの作用によってベクターから放出させることができる。2つのKatana−抗癌剤コンジュゲート(AおよびB)および1つの植物化学物質−Katana薬物コンジュゲート(C)の構造の例を図5に示す。
ドセタキセル、ドキソルビシン、クルクミン、カバジタキセルと、Katanaペプチドとの間には異なるコンジュゲートが生成されている。これらのコンジュゲートを以下の表3に要約する。

[例3]
コンジュゲート化合物のインビトロ効果
種々の細胞株増殖に対するドセタキセル−Katanaペプチドコンジュゲートの効果を評価し、非コンジュゲートドセタキセルと比較した(表4)。ドセタキセル−Katanaペプチドコンジュゲートについて得られたIC50値は、被検癌細胞におけるドセタキセルのIC50値と非常に類似していた。全体として、これらの結果は、インビトロで細胞増殖をブロックするドセタキセル−Katanaペプチドコンジュゲートの効力が、非コンジュゲートドセタキセルと類似していることを示しており、抗癌剤の効力がコンジュゲーションにより変化しないままであることを示している。
抗癌薬−Katana−ペプチドコンジュゲートがP−gp基質でもあり得るかどうかを決定するために、ヒトMDR1を有するMDCKトランスフェクト細胞を使用した(MDCK−MDR1)。図6に示すように、P−gp基質[H]−ドセタキセルの蓄積は、P−gp競合阻害剤であるシクロスポリンA(CsA)の存在下で2倍増加した。しかし、[125I]−ドセタキセル−Katanaペプチドコンジュゲートの蓄積に対するCsA効果の欠如は、KBPへのそのコンジュゲーションにより、薬物部分がP−gpによってもはや認識されないことを示す。後者の結果により、KatanaコンジュゲートがP−gpの排出作用を効率的にバイパスすることが確認される。
さらに、放射標識された[125I]−Katanaコンジュゲート(KBA−105)の取り込みを、卵巣SKOV3癌細胞およびSKMEL−28メラノーマ癌細胞において非コンジュゲート放射標識[H]−ドセタキセルの取り込みと図7で比較した。結果は、SKOV3(図7A)およびSKMEL−28細胞(図7B)におけるコンジュゲート取り込みが、非コンジュゲートドセタキセルよりも速く、高濃度で蓄積することを実証している。
ソルチリン受容体を発現する細胞において、Katanaコンジュゲートの取り込みが増加する。図8に示すように、Katanaドキソルビシンコンジュゲート(KBB106)の取り込みは、ソルチリン発現が減少した細胞では減少した。例えば、図8Aは、ソルチリンsiRNAをトランスフェクトした卵巣癌細胞におけるKBB106の取り込みの減少を示し、図8Bは、ソルチリンリガンド、すなわちKatanaペプチドおよびプログラニュリンによる薬理学的阻害による、卵巣癌細胞におけるKBB106の取り込みの減少を示す。
ドキタキセルおよびKB−ペプチドのコンジュゲートドセタキセルの卵巣癌細胞死に対する影響もまた、アネキシンV/PI染色を用いたフローサイトメトリー分析によって評価した(図9)。結果は、コンジュゲートドセタキセルが遊離薬物と比較してより高い持続的な細胞死を誘導したことを示す(図9A)。同様の細胞死を誘導するために、P−gp阻害剤であるシクロスポリンA(CsA)の付加が必要である(図9B)。これらの結果は、KBP−ドセタキセルコンジュゲートが、一部はP−gp排出ポンプをバイパスするその能力により、より強力であることを示す。
5時間の薬物への曝露後、漸増濃度のドセタキセル−Katanaペプチドコンジュゲート(KBA−105)またはドセタキセル濃度の、卵巣SKOV3癌細胞のアポトーシスに対する効果(図9)も評価した。結果は、KBA−105コンジュゲートが、比較的短いインキュベーション時間後にこれらの癌細胞のアポトーシスを誘導することを示す。
このアポトーシスアッセイを用いて、さまざまな癌細胞に対してコンジュゲートをスクリーニングした(図10)。結果は、5時間後、すべてのKatana−薬物コンジュゲートが、試験した癌細胞モデルのアポトーシスを誘導することを示している。それらのほとんどは、非コンジュゲート親薬剤であるドセタキセルまたはカバジタキセルよりも強力である。
Katana−薬物コンジュゲートによって誘導されたアポトーシスが受容体媒介エンドサイトーシスに関連するかどうかを決定するために、過剰の遊離ペプチドおよび2つのソルチリンリガンドであるニューロテンシン(NT)またはプログラニュリンの非存在下または存在下でアッセイを行った(図11)。遊離ペプチドの付加は、コンジュゲートによって誘発されたSKOV3(図11A)およびSK−MEL28(図11B)のアポトーシスを逆転させ、KBA−105によるこれらの細胞の誘導が受容体媒介性であることを示した。さらに、2つのソルチリンリガンドであるニューロテンシンおよびプログラニュリンも、Katana−薬物コンジュゲートによって誘導されるアポトーシスを阻害し、ソルチリンがアポトーシスのこの受容体媒介誘導に関与することを示唆している。
SKOV3卵巣癌細胞の遊走に対するKBP生成物の影響。これらの癌細胞を、遊離のドセタキセルまたはKatana−ドセタキセルコンジュゲートのいずれかと共に2時間インキュベートし、次いで、xCELLigenceバイオセンサーシステムを用いて細胞遊走をリアルタイムで時間の関数として測定した。このアッセイは、SKOV3卵巣癌細胞機能に対するこれらの分子の細胞効果を反映する。図12に示すように、Katana−ドセタキセルコンジュゲートは、SKOV3細胞に対してより強い効果を有し、遊離ドセタキセルと比較した場合、それらの遊走のより強い阻害をもたらす。コンジュゲートドセタキセルによる癌細胞遊走のより強力な阻害は、これらの癌細胞の浸潤または転移能が、非コンジュゲートドセタキセルよりもコンジュゲートによって、より強く影響を受けることを示唆している。
興味深いことに、過剰の遊離Katanaペプチド(図13A)またはニューロテンシン(図13B)のいずれかを付加すると、Katana−ドセタキセルコンジュゲートの遊走効果が大きく逆転した。遊離のドセタキセルによる癌細胞遊走の減少は、遊離のKatana−ペプチドまたはニューロテンシンのいずれによっても影響を受けなかった。さらに、特異的ソルチリンsiRNAを用いたソルチリン遺伝子サイレンシングは、癌細胞遊走に対するKatana−ドセタキセルコンジュゲートの効果を逆転させることが見出された(図13C)。これらの結果は、Katana−ドセタキセルコンジュゲートが遊離薬物のものとは異なる独特な作用機序を有するという発想を裏付ける。ソルチリンリガンドのニューロテンシンがコンジュゲートの細胞効果を有意に逆転させたという事実は、コンジュゲートの内在化または作用機序におけるソルチリンファミリーの受容体メンバーの密接な関係をさらに裏付ける。
特異的siRNAまたはスクランブルsiRNA配列を用いたソルチリンの遺伝子サイレンシング後の、細胞遊走に対するドセタキセルおよびKBP−ドセタキセルの効果を評価した。使用した実験条件下で、ソルチリン遺伝子発現は約80%減少した。図14の結果は、SKOV3細胞遊走に対する遊離ドセタキセルの効果が、ソルチリン発現の減少によって影響を受けないことを明らかに示している。対照的に、ソルチリン発現が低い場合、コンジュゲートドセタキセルの効果は強く減少する。特異的siRNAを用いたソルチリン発現の減少は、コンジュゲートドセタキセルの細胞毒性効果を逆転させたが、卵巣癌細胞における遊離ドセタキセルの細胞毒性効果を逆転させなかった。
この第2の細胞アッセイを用いて、さまざまなKatana−薬物コンジュゲートをスクリーニングした(図15)。図15Aに示すように、卵巣(SKOV3およびES−2)癌細胞を、ドキソルビシンまたはコンジュゲートドキソルビシン(KBB106)(2μM)と共に2時間インキュベートし、洗浄し、細胞遊走を行った。結果は、Katana−薬物コンジュゲートがこれらの癌細胞の遊走能力に強く影響を与えたことを示している。例えば、KBA−106は、これらの細胞の細胞遊走能力をほとんど完全になくし、Katana−薬物コンジュゲートが癌の浸潤または転移の分散に対して強い効果を発揮することを示した。しかし、図15Bおよび15Cに示すように、癌細胞を、ソルチリンリガンド(ニューロテンシン、Katanaペプチドまたはプログラニュリン)の存在下で、コンジュゲートドキソルビシン(KBB106)と共にインキュベートすると、ドキソルビシンコンジュゲートの遊走効果が逆転した。
表面プラズモン共鳴、アポトーシスおよび遊走の結果は、Katana−ペプチドおよびコンジュゲートが、ソルチリン受容体と相互作用するか、またはこれを必要とするという証拠を提供した。興味深いことに、ソルチリン受容体は、正常な卵巣組織と比較して卵巣癌において過剰発現することが報告されている(図16A)(Hemmati 2009年、Ghaemimanesh 2014年)。また、ソルチリンは、結腸、前立腺、膵臓および肺などのさまざまなヒト固形腫瘍において発現されることが示された。さらに、ソルチリン発現は乳癌の攻撃性と関連している(Roseli、2015年)。ここで、この受容体が、グレードI〜グレードIV(図16B)のさまざまなヒト脳腫瘍およびグレードI〜グレードIV(図16C)のさまざまなヒト卵巣癌において発現することも観察された。全体として、ソルチリンはKatana−ペプチドの輸送に関与しているので、これらの結果は、ドセタキセル−Katanaペプチドコンジュゲートがソルチリン受容体を発現する腫瘍を標的化できることを示している。
卵巣および脳の腫瘍におけるソルチリン発現に関するこれらの結果に加えて、「ヒトタンパク質アトラス」において高レベルのソルチリンがさまざまなヒト癌において報告されている。ウェブサイトhttp://www.proteinatlas.org/から得られた図17は、メラノーマ、乳癌、子宮内膜癌および肺癌を含むヒト癌の生検で高いソルチリン発現が検出されたことを明確に示している。
[例4]
コンジュゲート化合物のインビボ効果
ソルチリンは癌組織で過剰発現するが、健康組織ではほとんど検出不能である。図18Aおよび18Bに示すように、組織におけるソルチリン発現は、悪性組織表現型の関数として増加する。特に、ソルチリン発現は、卵巣転移においてより高い。
a)ドセタキセル
薬物動態および組織分布に対するKatana Biopharma peptideに対する薬物コンジュゲーションの影響を評価するために、マウスに[125I]−ドセタキセル−Katanaペプチドコンジュゲートを注射した。血漿をさまざまな時間に収集した(図19A)。血漿に関連する放射活性を定量し、薬物動態パラメータを決定した。図19に示すように、コンジュゲートドセタキセルの半減期は6時間である。この血漿中半減期は、遊離ドセタキセルについて文献で報告されている1時間の半減期(欧州医薬品庁のドセタキセルテバの評価報告書)よりも有意に高い。図20において、ドセタキセル−Katanaペプチドコンジュゲートの血漿中濃度を、静脈内ボーラス注射後の非コンジュゲートドセタキセルの血漿中濃度と比較した。結果は、ドセタキセル−Katanaペプチドコンジュゲートについての曲線下面積が、非コンジュゲートドセタキセルについてのものと比較してはるかに高いことを示す。
組織分布については、放射標識されたKatana−薬物コンジュゲート(KBA−105)およびドセタキセルを、ドセタキセルの等用量で静脈内ボーラス注射によって投与した(図21)。表記の時間(1時間、6時間および24時間)において、静脈内ボーラス注射の2時間、6時間および24時間後、8ml/分の流速で生理食塩水を用いて8分間全身灌流を行った。次いで、組織を収集し、放射活性を定量し、放射標識コンジュゲート(KBA−105)のレベルを定量した。結果は、肺、肝臓、脾臓および腎臓組織におけるコンジュゲートの高い蓄積を示す。さらに、KBA−105について測定されたレベルは、ほとんどの組織においてドセタキセルのレベルよりも高かった。両方の放射標識化合物のレベルの差をさらに特徴付けるために、異なる組織についてAUC1−24値を計算し、表5において比較した。KBA−105とドセタキセルとの間のAUC1−24の比は、Katana−薬物コンジュゲートが非コンジュゲートドセタキセルより高いレベルで蓄積し得ることを示す。
Katana−薬物コンジュゲートのインビボでの有効性をさらに評価するために、ルシフェラーゼを発現するSKOV3癌細胞をマウスの側腹部に移植した。同様の腫瘍を有するマウスを、ドセタキセルまたはKatana−薬物コンジュゲートKBA−105のいずれかをドセタキセルの等用量(10mg/kg/週)で用いて処置した。ドセタキセルで処置したマウスは3回の処置を受け、KBA−105で処置したマウスは5回の処置を受けた。腫瘍イメージングは、ルシフェラーゼ基質のルシフェリンを注入し、CarestreamのXtremeイメージングシステムを使用することによってさまざまな日に実施した。
図22のイメージング結果は、ドセタキセルで処置したマウスと比較した、KBA−105で処置したマウスについてのさまざまな日のはるかに低い発光を示す。次いで、発光を定量化し、移植後の日の関数としてプロットした(図23)。これらの早期定量発光の結果は、KBA−105が、この卵巣動物腫瘍モデルにおける腫瘍増殖を減少させるために非コンジュゲートドセタキセルよりも有効であり得ることを示唆している。ドセタキセルで処置したマウスは、20%に近い体重減少を示し(図22A)、一方、KBA−105で処置したマウスの体重は、20mg/kg/週の処置によって影響を受けないままであった(図22B)。さらに、KBA−105による5回の処置後に処置されたマウスの体重は影響を受けなかった(図24)が、等用量のドセタキセルで処置されたマウスはわずか3回の処置後に強い影響を受けた。
b)ドキソルビシン
コンジュゲートおよび非コンジュゲートドキソルビシンの効果を卵巣皮下腫瘍についても評価した。マウスにES−2卵巣癌細胞を移植した。腫瘍成長は、キャリパーを用いて測定した。腫瘍が約150mmの腫瘍体積に達したとき、マウスを、ドキソルビシンまたはKatana−ドキソルビシンコンジュゲートKBB106をドキソルビシンの等用量(6mg/kg/週)で用いて処置した。結果は、KBB106で処置したマウスでは、最初の処置後の腫瘍体積がほぼ同じままであったが、ドキソルビシンで処置したマウスでは、最初の処置後に腫瘍体積が増加したことを示す(図25A)。同様に、図25Bに示されるように、ビヒクル群と比較して、KBB106処置マウスでは腫瘍体積が97%減少したが、ビヒクル群に比べてドキソルビシン処置マウスでは43%減少した。KBB106処置マウスにおけるSKOV3異種移植片腫瘍の進行もまた、対照群と比較して有意に減少した(図26A)。
コンジュゲートドキソルビシンによる腫瘍サイズの抑制がより効果的であっただけでなく、コンジュゲートドキソルビシンの忍容性も非コンジュゲートドキソルビシンよりも優れていた。図25Cにおいて、KBB106での治療は、治療後66日目まで続けられたことが示されている。さらに、KBB106での処置はマウスの体重にほとんど影響を及ぼさず(図26B)、このことから、コンジュゲートドキソルビシンでの治療が十分に忍容されることが示された。
ドセタキセルおよびドセタキセルコンジュゲート処置マウスにおいて、残存腫瘍負荷を評価した(図27)。マウスに、ルシフェラーゼを発現するMDA−MB231乳癌細胞を側腹部に移植した。腫瘍増殖を、Carestreamのインビボイメージングシステムを用いて、発光により視覚化した。マウスを、ビヒクル、ドセタキセル(15mg/kg/週)またはKBA106(50mg/kg/週)で処置した。処置の74日後、ドセタキセルコンジュゲート処置マウスでは発光は検出不可であり(図27Bおよび27C)、マウスに残存腫瘍がないことが示唆された。
c)クルクミン
植物化学物質のクルクミン(非コンジュゲートおよびコンジュゲート)もまた、癌細胞増殖について試験した(図28)。乳癌細胞(MDA−MB231)を、漸増濃度のKBC106またはクルクミンと共にインキュベートした。72時間後、両方の分子の抗増殖特性を評価するために、チミジン取り込みアッセイを行った。抗増殖性曲線からIC50値を抽出した。図28Aに示すように、KBC106は、非コンジュゲートクルクミンと比較して、これらの乳癌細胞に対してより強い抗増殖活性(約100倍)を有した。増殖アッセイはまた、異なるタイプの癌細胞(卵巣癌、乳癌、皮膚癌および結腸直腸癌細胞)を用いて行われた。抗増殖曲線からIC50値を算出した。すべての場合において、以下の表6に示すように、クルクミンコンジュゲート(KBC106)は、非コンジュゲートクルクミンよりも強力な抗増殖活性(9〜100倍)を有していた。
本明細書において実証されるように、クルクミンコンジュゲート(KBC106)の細胞取り込みは、ソルチリン依存性である。図29Aに示すように、コンジュゲートまたは非コンジュゲートクルクミンと共にインキュベートした癌細胞を、蛍光ライブイメージングを用いて両方の分子の取り込みについて評価した。細胞が、非コンジュゲートクルクミンとは対照的に、コンジュゲートクルクミンの細胞内在化を増加させたことが見出された。加えて、ソルチリンリガンド(ニューロテンシン、プログラニュリンおよび遊離Katanaペプチド)は、コンジュゲートクルクミンの細胞更新を阻害することが示された(図29Bおよび29C)。
図30では、クルクミンコンジュゲート(KBC106)が癌細胞のアポトーシスを誘導するかどうかをさらに評価した。癌細胞を、KBC106およびクルクミンと共にインキュベートした。最初の列では、両分子の取り込みを蛍光顕微鏡でモニターすることができる。KBC1006についてより高い蛍光の蓄積が検出され、コンジュゲートのより良い細胞内在化が示された。クルクミン蓄積は、これらの癌細胞ではほとんど見られなかった。2番目の列では、アルファ−チューブリンが蛍光および画像によって検出され、KBC106が癌細胞微小管に強く影響するが、クルクミン単独ではほとんど影響がないことが示された。3番目の列では、細胞核を蛍光色素DAPIで標識した。非コンジュゲートクルクミンとは対照的に、KBC106は明らかに核断片化を誘導し、コンジュゲートが癌細胞のアポトーシスを誘導し、クルクミン単独ではアポトーシスを誘導しないことを示した。最後の列(併合)は、KBC106蛍光がα−チューブリン検出と共局在していることを示している。
クルクミンコンジュゲート(KBC106)は、子宮内膜癌の成長に対して抑制効果を有することも示された(図31)。マウスの側腹部に子宮内膜(MES)癌細胞を移植した。腫瘍成長は、キャリパーを用いて測定した。腫瘍が約150mmの体積に達したとき、マウスを60mg/kg/週のKBC106で週2回処置した。処置後28日目の結果は、表7に示すように、KBC1006がビヒクル群と比較して腫瘍成長を約62%阻害することを示している。
結論として、この結果は、抗癌薬(小分子、mAbのような生物学的物質)および植物化学物質を含む薬物−Katanaペプチドコンジュゲートの新規適用を説明する。これらの抗癌薬コンジュゲートは、細胞増殖の効率的な阻害および細胞毒性の誘導により証明されるように、インビトロで依然として活性なままである。重要なことに、Katanaペプチドコンジュゲートで得られたデータは、抗癌薬とKatanaペプチドとのコンジュゲーションがP−gp作用から逃れることを可能にすることを示している。さらに、これらの結果は、抗癌薬または植物化学物質とKatanaペプチドとのコンジュゲーションが、1)癌細胞において発現または過剰発現されるソルチリンのような受容体を標的とし、したがってコンジュゲート薬物の副作用を潜在的に減少させることによって、2)P−gp排出ポンプをバイパスすることによって、および/または3)治療薬の薬物動態またはバイオアベイラビリティーを改変することによって、インビボのそれらの効率を増加させることを示唆している。実際には、例えば、抗癌薬ドセタキセルとKatanaペプチドとのコンジュゲーションは、遊離薬物の半減期を約1時間から約6時間に増加させる。さらに、(1または複数の)受容体を特異的に標的化することにより、Katana−薬物コンジュゲートは、KBA−105およびKBB106を用いたインビボ研究で観察されるように等用量の非コンジュゲート薬物と比較して、忍容性がより良好である。まとめると、本開示に記載のデータは、(1または複数の)Katanaペプチドにコンジュゲートされた抗癌薬および植物化学物質が、卵巣癌、乳癌、肺癌および皮膚癌などの原発腫瘍に対して使用できることを示唆している。特に、これらのコンジュゲートは、ソルチリンの発現または過剰発現を伴う癌に対して使用することができる。さらに、P−gp排出ポンプは、他の疾患における潜在的に有効な薬物の蓄積を制限することができるので、Katanaペプチドへのコンジュゲーションは、腫瘍学以外の適応症に使用される可能性がある。さらに、Katanaペプチドは、抗癌ペプチド、より大きな生体物質(例えば、モノクローナル抗体)、siRNA、ならびにナノ粒子およびリポソームなどの薬物送達システムを含む他のタイプの分子にコンジュゲートすることができる。
[例5]
細胞増殖アッセイ
癌細胞を96ウェル白色プレート(Perkin Elmer)で培養した。低血清培地中で24時間同調させた。細胞を、非コンジュゲート薬物(ドセタキセル、カバジタキセル、ドキソルビシン)または薬物−Katanaペプチドコンジュゲートと2または3日間インキュベートした後、すべての培地を吸引し、細胞を、2.5μCi/mL[メチル−H]チミジン(Perkin Elmer)を含有する培地を用いて37℃/95%O/5%COにおいて4時間パルス標識した。細胞を洗浄し、固定し、乾燥させ、その後シンチレーション液(Microscint0、Perkin Elmer)を添加した。24時間後、プレートリーダー(TopCount、Perkin Elmer)でカウントすることによって細胞関連トリチウムを定量した。取り込まれた[H]チミジンを各薬物濃度に対してプロットした。
[例6]
xCELLigenceバイオセンサーシステムによる細胞遊走アッセイ
実験は、xCELLigenceシステム(Roche Diagnostics、QC)のリアルタイム細胞分析装置(RTCA)二重プレート(DP)装置を用いて行った。このシステムは供給業者の指示書に従って使用した。次いで、細胞(25000細胞/ウェル)をCIM−プレート16(Roche diagnostics)上の無血清培地に播種した。これらのプレートは、膜の底側に金電極アレイを有する従来のトランスウェル(Transwells)(細孔サイズ8μm)と類似しており、細胞遊走のリアルタイム測定を提供する。細胞播種の前に、上部チャンバーからのウェルの下側を25μLのPBS中0.15%ゼラチンでコーティングし、37℃において1時間インキュベートした。下部チャンバーを無血清培地で満たした。各ウェルの上部チャンバーを、コンジュゲートドセタキセル(2μM)または遊離ドセタキセル(2μM)を用いて2時間予備処理した、またはしなかった、100μLのSKOV3−ルシフェラーゼ細胞(2.5×10細胞/mL)で満たした。接着の30分後、細胞遊走を5分ごとに8時間モニターした。インピーダンス値を、RTCA DP Instrumentによって測定し、遊走活性細胞の量を反映する細胞指数と呼ばれる任意の単位として表した。各実験は2連のウェルで行った。
[例7]
コンジュゲートのヨウ素化
ペプチドを、Sigma製のヨード−ビーズを用いて標準的な手順でヨウ素化した。Katana−ペプチドを0.1Mリン酸緩衝液、pH6.5(PB)で希釈した。2種のヨードビーズを各タンパク質に使用した。これらのビーズをワットマンのフィルター上で3mlのPBで2回洗浄し、60μlのPBに再懸濁した。Amersham−Pharmacia biotech製の125I(1mCi)をビーズ懸濁液に室温において5分間添加した。各ペプチドのヨウ素化は、100μg(80−100μl)の添加によって開始した。室温において10分間インキュベートした後、HPLCにより遊離ヨウ素を除去した。
[例8]
MDCK−MDR1における薬物蓄積
H]−ドセタキセルおよび[125I]−ドセタキセル−Katanaペプチドコンジュゲートの細胞取り込みを、24ウェルプレートで成長させたP−gp過剰発現MDCK−MDR1細胞において測定した。細胞をPBSで3回洗浄し、血清を含まない、P−gp阻害剤であるシクロスポリンA(10μM)を含むか、または含まない培養培地において37℃で30分間プレインキュベートした。次いで、放射性標識分子(50nM)を60分間添加した。細胞を氷冷PBSで3回迅速に洗浄し、次いで500μLの0.1M NaOHで溶解した。細胞に保持された放射性標識分子の量をβ−シンチレーション計数(Packard モデル1900TR)によって計数した。細胞溶解物のアリコートを並行して使用して、細胞タンパク質濃度を決定した。
[例9]
異種移植腫瘍モデル
ルシフェラーゼを発現するSKOV3癌細胞(2.5×10細胞)をマウスの右複側部に移植した。ルシフェラーゼ基質のルシフェリンを注入することにより、Carestream製の近赤外(NiR)イメージングシステムを用いて腫瘍成長をモニターした。ドセタキセルとKatana−薬物コンジュゲート(KBA−105)をドセタキセルの等用量(10mg/kg/週)を用いてマウスを処置した。ドセタキセル処置は、体重減少(約−20%)のために3回の注射後に停止した。KBA−105での処置は、等用量で処置したマウスの体重が5回の処置後でさえも影響を受けなかったので、より忍容性良好であった。SKOV3/Luc癌細胞の腫瘍成長に関連する発光を、機器ソフトウェアによる治療後の日の関数として定量した。
[例10]
薬物動態および組織分布
ドセタキセル−Katanaペプチドコンジュゲートをヨードビーズを用いて[125I]−で放射標識した。放射標識後、遊離ヨウ素を除去した。マウスにドセタキセル−[125I]−Katanaペプチドコンジュゲートを5mg/kgで注射した。表記の時間に血漿を採取した。1、2および24時間後、いくつかのマウスを生理食塩水で灌流し、屠殺し、組織を採取した。血漿および組織中の放射活性を放射活性計数器で測定し、結果を計算し、血漿についてはμl/mlで、またはng/g組織で表した。
[例11]
ドセタキセル−Katanaペプチド(KBA−106)コンジュゲートの合成
DoceSuOH
DIEA(0.21ml、1.2mmol)を、ドセタキセル(0.81g、1.0mmol)および無水コハク酸(105mg、1.05mmol)のDMSO(5ml)中懸濁液に撹拌しながら滴下した。混合物を室温で撹拌し、UPLC−MSによりモニターした。2時間後、反応は完了した。溶媒を除去し、得られた残留物をDCMに溶解し、Biotageシリカカラムに負荷して精製した。DoceSuOHが、凍結乾燥後に白色粉末として得られ、UPLC−MS純度は>95%であった。
KBP106−(SuDoce)
DoceSuOHを予備活性化するために、DoceSuOH(213mg、0.234mmol)およびTBTU(75mg、0.234mmol)のDMSO(3〜4ml)中溶液にDIEA(0.234mmol)を滴下した。予備活性化の完了をUPLC−MSでモニターし、次にDMSO(0.2ml)中KBP106(120mg、0.062mmol)の溶液を添加した。混合物を室温において撹拌した。完了まで、反応をUPLC−MSによりモニターした。反応混合物を、30RPC樹脂カラムおよびAKTA精製器システム(10%〜80%ACN)を用いて精製し、凍結乾燥後にKBP106−(SuDoce)2(145mg)が白色粉末として得られ、UPLC−MS純度は>95%であった。
[例12]
ドキソルビシン−Katanaペプチド(KBA−106)コンジュゲートの合成
ドキソルビシンFmoc−DmgOH
リンカーDmgをドキソルビシンに組み込むために、Doxoの糖中の遊離第一級アミンを、最初にFmoc基によって保護する必要がある。このDoxoFmoc中間体をBiotageシステムで精製した。次いで、DoxoFmoc(0.81g、1.0mmol)およびジメチルグルタル酸(Dmg)無水物(105mg、1.05mmol)のDMSO(xml)中懸濁液にDIEA(0.21ml、1.2mmol)を撹拌しながら滴下した。混合物を室温において撹拌し、反応をUPLC−MSによってモニターした。完了後、溶媒を除去し、得られた残留物をDCMに溶解し、Biotageシリカカラムに負荷して精製した。DoxoFmoc−DmgOHが、凍結乾燥後、赤色粉末として得られ、UPLC−MS−MS純度は>95%であった。
KBB106−(Dmg−FmocDoxo)コンジュゲート
DmgOH−FmocDoxoを予備活性化するために、DIEA(0.234mmol)を、DmgOH−FmocDoxo(27.3mg、0.03mmol)およびTBTU(9.6mg、0.03mmol)のDMSO(3〜4ml)中溶液に滴下して加えた。予備活性化の完了をUPLC−MSでモニターし、次にKBP106(16mg、0.008mmol)のDMSO(0.2ml)中溶液を加えた。混合物を室温において撹拌した。完了まで、反応をUPLC−MSによりモニターした。反応混合物を、30RPC樹脂カラムおよびAKTA精製器システム(10%〜80%ACN;0.1ギ酸)を用いて精製し、KBP106−(DmgOH−FmocDoxo)2を得た。
KBP106−Dmg−FmocDoxoからのFmoc脱保護
Dmg−FmocDoxo(50mg)を1.5mlのDMSOに溶解し、10μlのピペリジンを添加した。混合物は瞬間的に紫色に変わり、Doxo部分からのFmoc基の除去をUPLC−MSによってモニターした。脱保護は約10分で完了した。遊離のFmoc基およびピペリジンを除去するために、次いで、混合物を、AKTA精製器システムを10〜80%ACN;0.1ギ酸の勾配で使用して、精製のために30RPC樹脂カラムに直接負荷した。KBP106−Dmg−Doxoが赤色粉末として得られ、UPLC−MS純度は>95%であった。
[例13]
クルクミン−Katanaペプチド(KBA−106)コンジュゲートの合成
クルクミン(0.5g)のピリジン(4ml)中溶液にDmg(1.5当量)を添加した。混合物を65℃において還流下で撹拌し、反応をUPLC−MSによってモニターした。Dmgの取り込み後、溶媒を除去し、得られた残留物をDCMに溶解し、Biotageシリカカラムに負荷して精製した。Cur−DmgOHが、凍結乾燥後に黄色粉末として得られ、UPLC−MS純度は>95%であった。
DmgOHへのNHSリンカーの付加
この第二段階において、NHSリンカーをDmgOH−Curに付加した。簡潔には、5倍過剰のNHS(224mg;1.95mmol)およびEDC(373mg;1.95mmol)をDMSO中のDmgOH−Cur(200mg;0.39mmol)に添加した。NHS組み込みの完了後、混合物をAKTA精製器システム(10−80%ACN;0.1%FA勾配)で精製のために30RPC樹脂に直接負荷した。
KBP106−(DmgCur)
DMSOに溶解したNHS−DmgCur(38mg;0.062mmol)にKBP106(50mg;0.026mmol)の溶液を添加することによって、80%DMSO(pH9.8)中でコンジュゲートを行った。混合物を室温において撹拌し、コンジュゲーションをUPLC−MSによってモニターした。反応混合物を、30RPC樹脂カラムおよびAKTA精製器システム(10%〜80%ACN;0.1ギ酸)を用いて精製し、KBP106−(DmgCur)2が凍結乾燥後に黄色粉末として得られ、UPLC−MS純度は>95%であった。
[例14]
カバジタキセル−Katanaペプチド(KBA−106)コンジュゲートの合成
カバジタキセル−SuOH
DIEA(0.21ml、1.2mmol)を、カバジタキセル(0.81g、1.0mmol)および無水コハク酸(105mg、1.05mmol)のDMSO(x ml)中懸濁液に撹拌しながら滴下した。混合物を室温で撹拌し、UPLC−MSによりモニターした。2時間後、反応は完了した。溶媒を除去し、得られた残留物をDCMに溶解し、Biotageシリカカラムに負荷して精製した。カバジタキセル−SuOHが、凍結乾燥後に白色粉末として得られ、UPLC−MS−MS純度は>95%であった。
KBP106−(Suカバジタキセル)
カバジタキセルSuOHを予備活性化するために、DIEA(0.234mmol)を、カバジタキセルSuOH(219mg、0.234mmol)およびTBTU(75mg、0.234mmol)のDMSO(3〜4ml)中溶液に滴下した。予備活性化の完了をUPLC−MSでモニターし、次にDMSO(0.2ml)中KBP106(120mg、0.062mmol)の溶液を添加した。混合物を室温において撹拌した。完了まで、反応をUPLC−MSによりモニターした。反応混合物を、30RPC樹脂カラムおよびAKTA精製器システム(10%〜80%ACN)を用いて精製し、凍結乾燥後に白色粉末としてKBP106−(Suカバジタキセル)2(150mg)が得られ、UPLC−MS−MS純度は>95%であった。
[例15]
ドセタキセル−Katanaペプチド(KBA−105)コンジュゲートの合成
2ステッププロセス:
1.ドセタキセルへのリンカーの付加
−コハク酸の付加(一晩)
−Biotageにおける精製(1時間)
−溶媒の蒸発(30分)
2.コンジュゲーション
−TBTUによるドセタキセルの活性化(5〜10分)
−ペプチドの付加
−DMF中での反応(pHに従う必要はない)
−反応時間30分
−30RPCで精製した後、−80℃において凍結乾燥
全収率約75%
純度>95%。
[例16]
ドキソルビシン−Katanaペプチド(KBB−106)コンジュゲートの合成
4ステッププロセス:
1.ドキソルビシン遊離アミンに対するFmocの付加
2.ドキソルビシン−Fmoc中間体へのリンカーの組み込み
−ジメチルグルタル酸(DMG)リンカー
−Aktaでのドキソルビシン(Fmoc)−DMGの精製、その後の凍結乾燥
3.コンジュゲーション
−TBTUによるドキソルビシン−DMGの活性化(5〜10分)
−ペプチドの付加
−DMSO中での反応(pHに従う必要はない)
−反応時間30分
−AKTA(30RPC樹脂)で精製した後、凍結乾燥
4.ピペリジンによるFmoc基の脱保護(5〜10分)、その後の精製
全収率約42%
純度>95%。
本開示の[00154](上記[0125])から[00371] (上記[0342])の実施形態は、適用可能な場合、実施形態のすべての組み合わせを作成できることを実証するために、本開示においてこのような様式で提示される。したがって、これらの実施形態は、(先に提示された実施形態を包含する)先行請求項のいずれかに従属するすべての実施形態の従属請求項を作成するのと等価な方法で説明に提示され、それによりすべての可能な様式で組み合わせることができることが実証される。例えば、適用可能な場合、[00154](上記[0125])から[00371] (上記[0342])の実施形態の間のすべての可能な組み合わせが本開示によって包含される。
参考文献
1.Bonavia R,Inda MM,Cavenee WK,Furnari FB.Heterogeneity maintenance in glioblastoma:a social network.Cancer Res.2011,71:4055−4060.
2.Corbin EM,Morrison SJ Tumour heterogeneity and cancer cell plasticity.Nature 2013,501,328−337.
3.Diaz Jr LA,Williams RT,Wu J,Kinde I,Hecht JR,Berlin J,Allen B,Bozic I,
4.Fisher R,Pusztai L,Swanton C.Cancer heterogeneity:implications for targeted therapeutics.British Journal of Cancer.2013,108;479−485.
5.Fodale V,Pierobon M,Liotta L,Petricoin E.Mechanism of cell adaptation:when and how do cancer cells develop chemoresistance? Cancer J 2011;17:89−95.
6.Ghaemimanesh F,Ahmadian G,Talebi S,Zarnani AH.Behmanesh M,Hemmati S,Hadavi R,Jeddi−Tehrani M,Farzi M,Akhondi MM,Rabbani H.The Effect of Sortilin Silencing on Ovarian Carcinoma Cells.Avicenna J Med Biotech.2014;6:169−177.
7.Gillet JP,Gottesman MM.Mechanisms of multidrug resistance in cancer.Methods Mol Biol 2010;596:47−76.
8.Gore ME,Larkin JM Challenges and opportunities for converting renal cell carcinoma into a chronic disease with targeted therapies.Br J Cancer 2011,104:399−406.
9.Hemmati S.,Zarnani AH,Mahmoudi AR,Sadeghi MR,Soltanghoraee H,Mohammad Mehdi Akhondi MM,Tarahomi M,Jeddi−Tehrani M,Hodjattallah Rabbani H.Ectopic Expression of Sortilin 1(NTR−3) in Patients with Ovarian Carcinoma.Avicenna J Med Biotech.2009;1:125−131.
10.Heppner GH.Tumor heterogeneity.Cancer Res.1984,44:2259−2265.
11.Hosseini A,Ghorbani A.Cancer therapy with phytochemicals:evidence from clinical studies.Avicenna J Phytomed.2015;5:84−97.
12.Kjolby M,Nielsen MS,Petersen CM.Sortilin,encoded by the cardiovascular risk gene SORT1,and its suggested functions in cardiovascular disease.Curr Atheroscler Rep.2015 Apr;17(4):496.
13.Kreso A,O’Brien CA,van Galen P,Gan OI,Notta F,Brown AM,et al.Variable clonal repopulation dynamics influence chemotherapy response in colorectal cancer.Science 2013;339:543−548.
14.Marusyk A,Polyak K.Cancer.Cancer cell phenotypes,in fifty shades of grey.Science 2013;339:528−529.
15.Marusyk A,Polyak K.Tumor heterogeneity:causes and consequences.Biochim Biophys Acta 2010,1805:105−117.
16.Mortensen MB et al.Targeting sortilin in immune cells reduces proinflammatory cytokines and atherosclerosis.J Clin Invest.2014;124(12):5317−5322.
17.Nowell PC.The clonal evolution of tumor cell populations.Science,1976,194:23−28.
18.Navarro,V.,Vincent,J,and Mazella,J.Shedding of the luminal domain of the neurotensin receptor−3/Sortilin in the HT29 cell line.Biochem.Biophys.Res.Commun,298,760−764.
19.Orit Lavi,James M.Greene,Doron Levy,and Michael M.Gottesman.The Role of Cell Density and Intratumoral Heterogeneity in Multidrug Resistance.Cancer Res;.2013 73(24);7168−7175.
20.Prabakaran et al.Mannose 6−phosphate receptor and sortilin mediated endocytosis of α−galactosidase A in kidney endothelial cells.PLoS One.2012;7(6):e39975.
21.Reiter JG,Nowak MA,Kinzler KW,Oliner KS,Vogelstein B.The molecular evolution of acquired resistance to targeted EGFR blockade in colorectal cancers.Nature 2012,486:537−540.
22.Roselli S,Pundavela J,Demont Y,Faulkner S,Keene S,Attia J,Jiang CC,Zhang XD,Walker MM,Hondermarck H.Sortilin is associated with breast cancer aggressiveness and contributes to tumor cell adhesion and invasion.Oncotarget.2015;6:10473−10486.
23.Sanz−Moreno V,Gadea G,Ahn J,Paterson H,Marra P,Pinner S,et al.Rac activation and inactivation control plasticity of tumor cell movement.Cell 2008;135:510−523.
24.Silva R,Vilas−Boas V,Carmo H,Dinis−Oliveira RJ,Carvalho F,de Lourdes Bastos M,Remiao.Modulation of P−glycoprotein efflux pump:induction and activation as a therapeutic strategy.Pharmacol Ther.2015;149:1−123.
25.Zhou SF.Structure,function and regulation of P−glycoprotein and its clinical relevance in drug disposition.Xenobiotica.2008;38:802−832.
配列表1
<223>合成構築体
<223>Xaaは任意のアミノ酸であってよい
<223>Xaaは任意のアミノ酸であってよい
<223>Xaaは任意のアミノ酸であってよい
<223>Xaaは任意のアミノ酸であってよい
配列表2
<223>合成構築体
<223>Xaaは任意のアミノ酸であってよく、存在または非存在のいずれであってもよい
<223>Xaaは任意のアミノ酸であってよい
<223>Xaaは任意のアミノ酸であってよい
<223>Xaaは任意のアミノ酸であってよい
配列表3
<223>合成構築体
<223>Xaaは任意のアミノ酸であってよい
<223>Xaaは任意のアミノ酸であってよい
<223>Xaaは任意のアミノ酸であってよい
<223>XaaはGln、Pro、Tyr、IleまたはLeuのいずれかであってよい
配列表4
<223>合成構築体
<223>Xaaは任意のアミノ酸であってよい
<223>Xaaは任意のアミノ酸であってよく、存在または非存在のいずれであってもよい
<223>XaaはGln、Pro、Tyr、IleまたはLeuのいずれかであってよい
配列表5〜9 <223>合成構築体
配列表10
<223>合成構築体
<223>XaaはNleである
配列表11〜13 <223>合成構築体
配列表14
<223>合成構築体
<223>アセチル化
配列表15
<223>合成構築体
<223>アセチル化
<223>XaaはNleである
配列表16
<223>合成構築体
<223>アセチル化
配列表17
<223>合成構築体
<223>アセチル化
配列表18
<223>合成構築体
<223>アセチル化
配列表22 <223>Xaaは任意のアミノ酸であってよい

Claims (33)

  1. 式(X)
    GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY(X)(配列番号10)
    アミノ酸配列からなる化合物であって
    少なくとも1つの保護基および/または少なくとも1つの標識剤が、N末端および/またはC末端において前記ペプチド化合物に連結されていて、
    Vacuolar Protein Sorting 10(Vps10)ファミリー受容体に結合する、
    ペプチド化合物。
  2. 式(X)
    GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY(X)(配列番号10)
    アミノ酸配列からなる化合物であって
    Vacuolar Protein Sorting 10タンパク質(Vps10)ファミリー受容体に結合する、
    ペプチド化合物。
  3. N末端において連結されている少なくとも1つの保護基を含む、請求項1に記載のペプチド化合物。
  4. 少なくとも1つの保護基としてアセチル又はスクシニルを含む、請求項1又は3に記載のペプチド化合物。
  5. 式(X)
    GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY(X)(配列番号10)
    からなる、ペプチド化合物。
  6. 式(XXXIX)により表される、請求項1に記載のペプチド化合物:
    アセチル−GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY (XXXIX)(配列番号15)。
  7. 式(XXXIX):
    アセチル−GVRAKAGVRN(Nle)FKSESY (XXXIX)(配列番号15)
    からなる、ペプチド化合物。
  8. 式A−(B)のコンジュゲート化合物:
    (式中、
    nは1、2、3または4であり、
    Aは、保護基によって保護されている請求項1からのいずれかに記載のペプチド化合物であり、および
    Bは、少なくとも1つの治療剤であって、Aに連結されていて、前記ペプチド化合物の遊離アミンにおいて、前記ペプチド化合物のN末端位において、前記ペプチド化合物の遊離−SHにおいて、または前記ペプチド化合物の遊離カルボキシルにおいて、連結されている)。
  9. 式A−(B)のコンジュゲート化合物:
    (式中、
    nは1、2、3または4であり、
    Aは、保護基によって保護されている請求項1からのいずれかに記載のペプチド化合物であり、および
    Bは、少なくとも1つの治療剤であって、Aに連結されていて、前記ペプチド化合物のリジン残基の遊離アミンにおいてリンカーを介して、または前記ペプチド化合物のN末端位において、リンカーを介して、連結されている)。
  10. 式A−(B)のコンジュゲート化合物:
    (式中、
    nは1、2、3または4であり、
    Aは、請求項1からのいずれか1項に記載のペプチド化合物であり、および
    Bは、少なくとも1つの治療剤であって、Aに連結されている)。
  11. 式A−(B)のコンジュゲート化合物:
    (式中、
    nは1、2、3または4であり、
    Aは、請求項1からのいずれか1項に記載のペプチド化合物であり、および
    Bは、少なくとも1つの治療剤であって、Aに連結されていて、前記ペプチド化合物のリジン残基の遊離アミンにおいて、または前記ペプチド化合物のN末端位において、連結されている)。
  12. Bが、リンカーを介してAに連結されている、請求項又は10に記載のコンジュゲート化合物。
  13. 少なくとも1つの治療剤が抗癌剤である、請求項から12のいずれかに記載のコンジュゲート化合物。
  14. 抗癌剤が、ドセタキセル、カバジタキセル、パクリタキセル、ドキソルビシンまたはダウノマイシンである、請求項13に記載のコンジュゲート化合物。
  15. 前記抗癌剤がドセタキセルである、請求項14に記載のコンジュゲート化合物。
  16. 式(XVII)の化合物である、請求項から11のいずれかに記載のコンジュゲート化合物:
    GVRAK(ドセタキセル)AGVRN(Nle)FK(ドセタキセル)SESY(XVII)
    (配列番号10の配列を有し、各リジン残基にドセタキセル分子が連結されているペプチド化合物を含む)。
  17. 式(XXI)の化合物である、請求項から11のいずれかに記載のコンジュゲート化合物:
    アセチル−GVRAK(ドセタキセル)AGVRN(Nle)FK(ドセタキセル)SESY(XXI)
    (配列番号15の配列を有し、各リジン残基にドセタキセル分子が連結されているペプチド化合物を含む)。
  18. 前記抗癌剤がドキソルビシンである、請求項13に記載のコンジュゲート化合物。
  19. 式(XXIV)の化合物である、請求項から11のいずれかに記載のコンジュゲート化合物:
    GVRAK(ドキソルビシン)AGVRN(Nle)FK(ドキソルビシン)SESY(XXIV)
    (配列番号10を有し、各リジン残基にドキソルビシン分子が連結されているペプチド化合物を含む)。
  20. 式(XXVI)の化合物である、請求項から11のいずれかに記載のコンジュゲート化合物:
    アセチル−GVRAK(ドキソルビシン)AGVRN(Nle)FK(ドキソルビシン)SESY(XXVI)
    (配列番号15を有し、各リジン残基にドキソルビシン分子が連結されているペプチド化合物を含む)。
  21. 式(XXXIV)の化合物である、請求項から11のいずれかに記載のコンジュゲート化合物:
    GVRAK(クルクミン)AGVRN(Nle)FK(クルクミン)SESY(XXXIV)
    (配列番号10を有し、各リジン残基にクルクミン分子が連結されているペプチド化合物を含む)。
  22. 式(XXXV)の化合物である、請求項から11のいずれかに記載のコンジュゲート化合物:
    アセチル−GVRAK(クルクミン)AGVRN(Nle)FK(クルクミン)SESY(XXXV)
    (配列番号15を有し、各リジン残基にクルクミン分子が連結されているペプチド化合物を含む)。
  23. Bが、前記ペプチド化合物の前記リジン残基の前記遊離アミンにおいて、リンカーを介してAに連結されている、請求項から22のいずれかに記載のコンジュゲート化合物。
  24. Bが、前記ペプチド化合物の前記N末端位において、リンカーを介してAに連結されている、請求項から15及び18のいずれかに記載のコンジュゲート化合物。
  25. リンカーが、コハク酸およびジメチルグルタル酸からなる群から選択される、請求項23または24に記載のコンジュゲート化合物。
  26. ソルチリン発現を伴う疾患を治療するための、請求項1から25のいずれかに記載の少なくとも1つの化合物を含む医薬組成物。
  27. Vacuolar Protein Sorting 10(Vps10)ファミリー受容体から選択される少なくとも1つの受容体の発現を伴う疾患を治療するための、請求項1から25のいずれかに記載の少なくとも1つの化合物を含む医薬組成物。
  28. 少なくとも1つの受容体がソルチリン、SorL1、SorCS1、SorCS2、およびSorCS3から選択される、請求項27に記載の医薬組成物。
  29. Vacuolar Protein Sorting 10(Vps10)ファミリー受容体から選択される少なくとも1つの受容体の発現を伴う癌を治療するための、請求項1から25のいずれかに記載の化合物を含む医薬組成物。
  30. 癌が、卵巣癌、脳癌、乳癌、メラノーマ、結腸直腸癌、膠芽細胞腫、肝臓癌、肺癌、前立腺癌、子宮頸癌、頭部癌、胃癌、腎臓癌、子宮内膜癌、精巣癌、尿路上皮癌、急性リンパ芽球性白血病、急性骨髄性白血病、ホジキンリンパ腫、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫、軟部組織癌、骨肉腫、甲状腺癌、移行細胞膀胱癌、ウィルムス腫瘍、神経膠腫、膵臓癌または脾臓癌である、請求項29に記載の医薬組成物。
  31. 癌が乳癌である、請求項30に記載の医薬組成物。
  32. 請求項1から25のいずれかに記載の少なくとも1つの化合物を含む、リポソーム、グラフェンまたはナノ粒子。
  33. 治療剤およびsiRNAの少なくとも1つが担持されたリポソーム、グラフェンまたはナノ粒子であって、請求項1からのいずれかに記載の少なくとも1つの化合物でコーティングされているリポソーム、グラフェンまたはナノ粒子。
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Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
PL3380495T3 (pl) * 2015-11-24 2021-12-13 Transfert Plus, S.E.C. Związki peptydowe i koniugaty peptydowe do leczenia nowotworu poprzez chemioterapię receptorową
EP3625245A4 (en) * 2017-05-24 2020-12-16 Transfert Plus, S.E.C. PEPTIDE COMPOUNDS, CONJUGATE COMPOUNDS AND THEIR USES IN THE TREATMENT OF INFLAMMATORY DISEASES
US11389460B2 (en) 2017-09-15 2022-07-19 City Of Hope Methods and compositions for treating endometrial cancer
EP3844190A4 (en) * 2018-08-24 2022-06-08 Transfert Plus, S.E.C. METHODS AND COMPOUNDS FOR TARGETING SORTILIN RECEPTORS AND INHIBITING VASCULOGEN MIMETICISM
EP3986921A2 (en) * 2019-06-20 2022-04-27 Aarhus Universitet Sorcs2 crystal structure and uses thereof
KR20220113980A (ko) * 2019-12-06 2022-08-17 쎄러테크놀로지스 인코포레이티드 소틸린 결합 접합체 화합물, 조성물 및 암을 치료하기 위한 이들의 용도
US20230338555A1 (en) * 2020-05-18 2023-10-26 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Conjugated oligonucleotides and uses thereof
CA3208147A1 (en) * 2021-02-26 2022-09-01 Richard Beliveau Methods and compounds for targeting cancer stem cells
CN116731113A (zh) * 2022-03-01 2023-09-12 上海智肽生物科技有限公司 针对sort1的多肽化合物及其药物偶联物

Family Cites Families (21)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4680338A (en) 1985-10-17 1987-07-14 Immunomedics, Inc. Bifunctional linker
JPH04334377A (ja) 1990-12-31 1992-11-20 Akzo Nv 酸−不安定性リンカー分子
US5525491A (en) 1991-02-27 1996-06-11 Creative Biomolecules, Inc. Serine-rich peptide linkers
US6759509B1 (en) 1996-11-05 2004-07-06 Bristol-Myers Squibb Company Branched peptide linkers
IL142707A0 (en) * 2000-04-27 2002-03-10 Pfizer Prod Inc Methods of treating obesity using a neurotensin receptor ligand
SI1724284T1 (sl) 2000-12-07 2009-12-31 Lilly Co Eli Glp-1 fuzijski proteini
US8344211B2 (en) 2008-08-13 2013-01-01 Ceres, Inc. Plant nucleotide sequences and corresponding polypeptides
TW200634019A (en) 2004-12-21 2006-10-01 Wyeth Corp Thienoisoquinoline-phenylsulfonamides and their use as er-nfkb inhibitors
WO2008019187A2 (en) * 2006-05-30 2008-02-14 Mayo Foundation For Medical Education And Research Detecting and treating dementia
EP2077278A1 (fr) * 2007-12-21 2009-07-08 Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Peptide dérivé du récepteur 3 de la neurotensine et utilisation dans le traitemement de maladies psychiatriques
EP2274327B1 (en) * 2008-04-27 2019-03-27 H. Lundbeck A/S Crystal structure of human sortilin and uses thereof for identifying ligands to sortilin
WO2010022175A1 (en) * 2008-08-19 2010-02-25 Yale University Identification of sortilin as a neuronal receptor for the frontotemporal dementia protein, progranulin
BRPI0922689A2 (pt) * 2008-12-05 2018-11-06 Angiochem Inc. conjugados de neurotensina ou análogos de neurotensina e usos dos mesmos
US8147849B2 (en) 2009-02-20 2012-04-03 Novartis Ag Protective antigens for group B Streptococcus hypervirulent strains
IN2012DN00248A (ja) 2009-07-02 2015-05-01 Angiochem Inc
CA2786255A1 (en) 2009-12-31 2011-07-07 Organomed Corporation Formulations from natural products, turmeric, and aspirin
EP2740726A1 (en) * 2012-12-07 2014-06-11 3B Pharmaceuticals GmbH Neurotensin receptor ligands
EP3280441B1 (en) 2015-04-07 2021-09-29 Alector LLC Anti-sortilin antibodies and methods of use thereof
PL3380495T3 (pl) * 2015-11-24 2021-12-13 Transfert Plus, S.E.C. Związki peptydowe i koniugaty peptydowe do leczenia nowotworu poprzez chemioterapię receptorową
EP3625245A4 (en) * 2017-05-24 2020-12-16 Transfert Plus, S.E.C. PEPTIDE COMPOUNDS, CONJUGATE COMPOUNDS AND THEIR USES IN THE TREATMENT OF INFLAMMATORY DISEASES
EP3844190A4 (en) * 2018-08-24 2022-06-08 Transfert Plus, S.E.C. METHODS AND COMPOUNDS FOR TARGETING SORTILIN RECEPTORS AND INHIBITING VASCULOGEN MIMETICISM

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Publication number Publication date
PT3380495T (pt) 2021-08-19
US20220356209A1 (en) 2022-11-10
JP2019501141A (ja) 2019-01-17
CA3071494A1 (en) 2017-06-01
US11780882B2 (en) 2023-10-10
ES2882634T3 (es) 2021-12-02
AU2016358324A1 (en) 2018-07-05
JP2020189867A (ja) 2020-11-26
EP3380495A4 (en) 2019-02-27
CN116478245A (zh) 2023-07-25
BR112018010535A2 (pt) 2018-11-13
US20200392184A1 (en) 2020-12-17
ZA201804117B (en) 2022-08-31
EP3380495B1 (en) 2021-05-19
EP3380495A1 (en) 2018-10-03
AU2016358324B2 (en) 2021-03-11
JP7095035B2 (ja) 2022-07-04
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