JP6772063B2 - 誘導可能なキメラポリペプチドを使用して細胞を活性化するための方法 - Google Patents
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Description
本技術は、概して免疫学の分野に関し、部分的には、CD40、MyD88またはCD40およびMyD88ポリペプチドを含む誘導可能なキメラポリペプチドを使用して、例えば、T細胞およびキメラ抗原レセプターを発現しているT細胞を含む細胞を活性化するための方法に関する。本技術は、さらに部分的には、患者において免疫応答を誘導するためおよび腫瘍を処置するための治療方法に関する。
2014年2月14日に出願され、「Methods for Activating T Cells Using an Inducible Chimeric Polypeptide」という名称の米国仮特許出願第61/940,347号;2014年3月13日に出願され、「Methods for Activating T Cells Using an Inducible Chimeric Polypeptide」という名称の米国仮特許出願第61/952,839号;および2014年9月9日に出願され、「Methods for Activating T Cells Using an Inducible Chimeric Polypeptide」という名称の米国仮特許出願第62/047,875号に基づく優先権を主張する。これらはすべて参照され、その全体が本明細書中に参照によって組み込まれる。
T細胞の活性化は、病原微生物(例えば、ウイルス、細菌および寄生生物)、外来タンパク質および環境内の有害な化学物質に対する防御免疫において、ならびにがんおよび他の過剰増殖性疾患に対する免疫としても、重要な工程である。T細胞は、その表面上に、細胞表面上に提示された抗原を認識するレセプター(すなわち、T細胞レセプター)を発現している。正常な免疫応答では、これらの抗原がT細胞レセプターに結合することにより、細胞内の変化が惹起され、T細胞の活性化に至る。
キメラ抗原レセプター(CAR)によって操作されたT細胞の抗腫瘍有効性は、養子移入後のそれらの細胞の生存およびインビボにおける拡大に依存する。共刺激ドメイン(例えば、CD28および4−1BB)を含めることによって、白血病を処置するための、CD19によって標的化されるCARのT細胞拡大が向上したが1−4、そのCARを介してこれらのシグナル伝達ドメインと抗原認識とが密接に結び付くと、抑制されないT細胞活性化による強い毒性がもたらされた5,6。本明細書中には、CAR T細胞治療をコントロールするための方法が提供され、その方法は、1つの実施形態において、T細胞共刺激スイッチ、すなわち、共刺激分子によって誘導可能なMyD88/CD40(iMC)に依存し、そのiMCは、小分子である二量体化化学誘導物質(chemical inducer of dimerization)(CID)リミズシド(rimiducid)(AP1903)によってインビボにおいて活性化可能であり、それにより、CARによって改変されたT細胞に共刺激が提供され、T細胞の増殖、生存および抗腫瘍有効性が誘導される。iMCに基づく誘導可能な共刺激は、インビボにおけるT細胞の拡大を制御するために使用されることがあり、CAR−T細胞治療の安全性および有効性をコントロールする新しい治療法の選択肢となる。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
a)誘導可能なキメラ刺激分子をコードする第1のポリヌクレオチドであって、該誘導可能なキメラ刺激分子は、(i)MyD88ポリペプチド領域またはTIRドメインを欠く切断型MyD88ポリペプチド領域;(ii)CD40細胞外ドメインを欠くCD40細胞質ポリペプチド領域、および(iii)多量体化領域を含む、第1のポリヌクレオチド;ならびに
b)キメラ抗原レセプターをコードする第2のポリヌクレオチド
を含む、核酸。
(項目2)
前記誘導可能なキメラ刺激分子が、さらに(iv)膜標的化領域を含む、項目1に記載の核酸。
(項目3)
前記キメラ刺激分子がポリペプチドであって、領域(i)〜(iii)を、該ポリペプチドのアミノ末端からカルボキシル末端に向かって(i)、(ii)、(iii)という順序で含むポリペプチドである、項目1に記載の核酸。
(項目4)
前記キメラ刺激分子がポリペプチドであって、領域(i)〜(iv)を、該ポリペプチドのアミノ末端からカルボキシル末端に向かって(iv)、(i)、(ii)、(iii)という順序で含むポリペプチドである、項目2に記載の核酸。
(項目5)
前記多量体化領域が、リガンド結合領域である、項目1〜4のいずれか1項に記載の核酸。
(項目6)
前記リガンド結合領域が、FKBP12領域である、項目5に記載の核酸。
(項目7)
前記FKBP12領域が、FKBP12v36領域である、項目6に記載の核酸。
(項目8)
前記FKBP12領域が、Fv’Fvlsである、項目6に記載の核酸。
(項目9)
前記多量体化領域が、配列番号11のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその機能的フラグメントおよび配列番号13のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその機能的フラグメントを含むか、または配列番号12におけるヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドまたはその機能的フラグメントをさらに含む、項目5に記載の核酸。
(項目10)
前記多量体化領域が、配列番号13のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその機能的フラグメントをさらに含むか、または配列番号12におけるヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドまたはその機能的フラグメントをさらに含む、項目9に記載の核酸。
(項目11)
残基36がバリンであるFvポリペプチドバリアントをさらに含む、項目9に記載の核酸。
(項目12)
前記リガンドが、FK506二量体または二量体のFK506アナログリガンドである、項目5〜11のいずれか1項に記載の核酸。
(項目13)
前記リガンドが、AP1903である、項目12に記載の核酸。
(項目14)
領域(i)〜(iv)の少なくとも1つが、コドン最適化されたヌクレオチド配列によってコードされる、項目1〜13のいずれか1項に記載の核酸。
(項目15)
前記第1のポリヌクレオチドと前記第2のポリヌクレオチドの両方に作動可能に連結されたプロモーターをさらに含む、項目1〜14のいずれか1項に記載の核酸。
(項目16)
前記第1のポリヌクレオチドに作動可能に連結された第1のプロモーターおよび前記第2のポリヌクレオチドに作動可能に連結された第2のプロモーターをさらに含む、項目1〜14のいずれか1項に記載の核酸。
(項目17)
前記第1のポリヌクレオチドと前記第2のポリヌクレオチドとの間にリンカーポリペプチドをコードする第3のポリヌクレオチドをさらに含み、ここで、該リンカーポリペプチドは、翻訳中または翻訳後の該第1および第2のポリヌクレオチドの翻訳産物を分断している、項目1〜16のいずれか1項に記載の核酸。
(項目18)
前記リンカーポリペプチドが、2Aポリペプチドである、項目17に記載の核酸。
(項目19)
前記キメラ抗原レセプターが、
(i)膜貫通領域;(ii)T細胞活性化分子;および(iii)抗原認識部分
を含む、項目1〜18のいずれか1項に記載の核酸。
(項目20)
前記キメラ抗原レセプターが、共刺激分子をさらに含む、項目19に記載の核酸。
(項目21)
前記共刺激分子が、CD28、OX40および4−1BBからなる群より選択される、項目20に記載の核酸。
(項目22)
前記T細胞活性化分子が、ITAMを含みシグナル1を与える分子である、項目19〜21のいずれか1項に記載の核酸。
(項目23)
前記T細胞活性化分子が、CD3ζポリペプチドである、項目19〜22のいずれか1項に記載の核酸。
(項目24)
前記T細胞活性化分子が、Fcイプシロンレセプターガンマ(FcεR1γ)サブユニットポリペプチドである、項目19〜22のいずれか1項に記載の核酸。
(項目25)
前記抗原認識部分が、腫瘍細胞上の抗原に結合する、項目19〜24のいずれか1項に記載の核酸。
(項目26)
前記抗原認識部分が、過剰増殖性疾患に関与する細胞上の抗原に結合する、項目19〜24のいずれか1項に記載の核酸。
(項目27)
前記抗原認識部分が、PSMA、PSCA、MUC1、CD19、ROR1、Mesothelin、GD2、CD123、MUC16およびHer2/Neuからなる群より選択される抗原に結合する、項目19〜24のいずれか1項に記載の核酸。
(項目28)
前記抗原認識部分が、PSCAに結合する、項目19〜24のいずれか1項に記載の核酸。
(項目29)
前記抗原認識部分が、CD19に結合する、項目19〜24のいずれか1項に記載の核酸。
(項目30)
前記抗原認識部分が、Her2/Neuに結合する、項目19〜24のいずれか1項に記載の核酸。
(項目31)
前記抗原認識部分が、ウイルス抗原または細菌抗原に結合する、項目19〜24のいずれか1項に記載の核酸。
(項目32)
前記抗原認識部分が、一本鎖可変フラグメントである、項目19〜31のいずれか1項に記載の核酸。
(項目33)
前記膜貫通領域が、CD28膜貫通領域である、項目19〜32のいずれか1項に記載の核酸。
(項目34)
前記膜貫通領域が、CD8膜貫通領域である、項目19〜32のいずれか1項に記載の核酸。
(項目35)
CD8ストーク領域をさらに含む、項目34に記載の核酸。
(項目36)
前記キメラ刺激分子が、配列番号49のアミノ酸配列を有するMyD88ポリペプチドもしくは配列番号137のアミノ酸配列を有する切断型MyD88ポリペプチドまたはそれらの機能的フラグメントを含む、項目1〜35のいずれか1項に記載の核酸。
(項目37)
前記MyD88ポリペプチドが、配列番号49のアミノ酸配列を有する、項目1〜36のいずれか1項に記載の核酸。
(項目38)
前記細胞質CD40ポリペプチドが、配列番号9のアミノ酸配列またはその機能的フラグメントを有する、項目1〜37のいずれか1項に記載の核酸。
(項目40)
前記CD3ζポリペプチドが、配列番号39のアミノ酸配列またはその機能的フラグメントを含む、項目23〜38のいずれか1項に記載の核酸。
(項目41)
前記膜標的化領域が、レセプターのミリストイル化領域、パルミトイル化領域、プレニル化領域および膜貫通配列からなる群より選択される、項目2〜40のいずれか1項に記載の核酸。
(項目42)
前記膜標的化領域が、ミリストイル化領域である、項目2〜40のいずれか1項に記載の核酸。
(項目43)
前記ミリストイル化領域が、配列番号3のアミノ酸配列またはその機能的フラグメントを有する、項目42に記載の核酸。
(項目44)
前記核酸が、ウイルスベクター内に含まれている、項目1〜43のいずれか1項に記載の核酸。
(項目45)
前記ウイルスベクターが、レトロウイルスベクターである、項目44に記載の核酸。
(項目46)
前記レトロウイルスベクターが、マウス白血病ウイルスベクターである、項目44に記載の核酸。
(項目47)
前記レトロウイルスベクターが、SFGベクターである、項目44に記載の核酸。
(項目48)
前記ウイルスベクターが、アデノウイルスベクターである、項目44に記載の核酸。
(項目49)
前記ウイルスベクターが、レンチウイルスベクターである、項目44に記載の核酸。
(項目50)
前記ウイルスベクターが、アデノ随伴ウイルス(AAV)、ヘルペスウイルスおよびワクシニアウイルスからなる群より選択される、項目44に記載の核酸。
(項目51)
前記核酸が、プラスミド内に含まれている、項目1〜43のいずれか1項に記載の核酸。
(項目52)
項目2〜19のいずれか1項に記載の核酸によってコードされるキメラ刺激分子ポリペプチド。
(項目53)
項目1〜51のいずれか1項に記載の核酸でトランスフェクトされたまたは形質導入された、改変された細胞。
(項目54)
前記改変された細胞が、T細胞、腫瘍浸潤リンパ球、NK−T細胞、TCRを発現している細胞またはNK細胞である、項目53に記載の改変された細胞。
(項目55)
前記細胞が、T細胞である、項目53に記載の改変された細胞。
(項目56)
前記細胞が、骨髄から得られるかまたは調製される、項目53〜55のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目57)
前記細胞が、臍帯血から得られるかまたは調製される、項目53〜55のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目58)
前記細胞が、末梢血から得られるかまたは調製される、項目53〜55のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目59)
前記細胞が、末梢血単核球から得られるかまたは調製される、項目53〜55のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目60)
前記細胞が、ヒト細胞である、項目53〜55のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目61)
前記細胞が、エレクトロポレーション、ソノポレーション、バイオリスティック(例えば、Au粒子を用いた遺伝子銃)、脂質トランスフェクション、ポリマートランスフェクション、ナノ粒子またはポリプレックスからなる群より選択される方法を用いて、前記核酸ベクターによってトランスフェクトされるかまたは形質導入される、項目53〜60のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目62)
被験体におけるT細胞媒介性の免疫応答を刺激するための方法であって、
a)項目53〜61のいずれか1項に記載の改変された細胞を該被験体に投与する工程;および
b)有効量の、前記多量体化領域に結合する多量体リガンドを投与することにより、該被験体においてT細胞媒介性の免疫応答を刺激する工程
を含む、方法。
(項目63)
前記キメラ抗原レセプターが、標的細胞に結合する、項目62に記載の方法。
(項目64)
前記標的細胞が、腫瘍細胞である、項目63に記載の方法。
(項目65)
前記被験体における標的細胞の数または濃度が、前記改変された細胞の投与後に減少する、項目63〜64のいずれか1項に記載の方法。
(項目66)
前記改変された細胞またはリガンドを投与する前に前記被験体から得られる第1のサンプル中の標的細胞の数または濃度を測定する工程、該改変された細胞およびリガンドを投与した後に該被験体から得られる第2のサンプル中の標的細胞の数または濃度を測定する工程、および該第1のサンプル中の標的細胞の数または濃度と比べて該第2のサンプル中の標的細胞の数または濃度の増加または減少を判定する工程をさらに含む、項目62〜65のいずれか1項に記載の方法。
(項目67)
前記第2のサンプル中の標的細胞の濃度が、前記第1のサンプル中の標的細胞の濃度と比べて減少する、項目66に記載の方法。
(項目68)
前記第2のサンプル中の標的細胞の濃度が、前記第1のサンプル中の標的細胞の濃度と比べて増加する、項目66に記載の方法。
(項目69)
さらなる用量のリガンドが、前記被験体に投与される、項目66〜68のいずれか1項に記載の方法。
(項目70)
多量体リガンドの有効量が、標的細胞の数または濃度を減少させ、細胞傷害性の症候を減少させるのに有効な量である、項目62〜69のいずれか1項に記載の方法。
(項目71)
前記多量体リガンドを投与した後に、細胞傷害性の症候のレベルが前記被験体において決定され、(i)該多量体リガンドの投与が中止されるか、または(ii)投与された多量体リガンドの以前の用量よりも低いさらなる用量の多量体リガンドが投与される、項目62〜69.1に記載の方法。
(項目72)
前記多量体リガンドを投与した後に、細胞傷害性の症候のレベルが、前記被験体において決定され、投与された多量体リガンドの以前の用量よりも高いさらなる用量の多量体リガンドが投与される、項目62〜69.1に記載の方法。
(項目73)
前記多量体リガンドを投与した後に、前記被験体における標的細胞の数または濃度が決定され、(i)該多量体リガンドの投与が中止されるか、または(ii)投与された多量体リガンドの以前の用量よりも低いさらなる用量の多量体リガンドが投与される、項目62〜69.1に記載の方法。
(項目74)
前記多量体リガンドを投与した後に、前記被験体における標的細胞の数または濃度が決定され、投与された多量体リガンドの以前の用量よりも高いさらなる用量の多量体リガンドが投与される、項目62〜69.1に記載の方法。
(項目75)
前記多量体リガンドのさらなる用量が、前記以前の用量よりも120%〜200%高い、項目74に記載の方法。
(項目76)
前記多量体リガンドのさらなる用量が、前記以前の用量よりも約150%高い、項目74に記載の方法。
(項目77)
被験体に抗腫瘍免疫を提供するための方法であって、有効量の項目53〜61のいずれか1項に記載の改変された細胞を該被験体に投与する工程および前記多量体化領域に結合するリガンドを投与することにより該被験体に抗腫瘍免疫を提供する工程を含む、方法。
(項目78)
標的抗原の高発現に関連する疾患または状態を有する被験体を処置するための方法であって、有効量の項目53〜61のいずれか1項に記載の改変された細胞、および有効量の、前記多量体化領域に結合するリガンドを該被験体に投与する工程を含む、方法。
(項目79)
前記標的抗原が、腫瘍抗原である、項目78に記載の方法。
(項目80)
前記改変された細胞が、自己のT細胞である、項目53〜79のいずれか1項に記載の方法。
(項目81)
前記改変された細胞が、同種異系のT細胞である、項目53〜79のいずれか1項に記載の方法。
(項目82)
被験体における腫瘍サイズを減少させるための方法であって、該方法は、項目53〜61のいずれか1項に記載の改変された細胞を該被験体に投与する工程を含み、前記抗原認識部分は、該腫瘍上の抗原に結合する、方法。
(項目83)
前記被験体が、腫瘍を有すると診断されている、項目62〜82のいずれか1項に記載の方法。
(項目84)
前記被験体が、がんを有する、項目62〜83のいずれか1項に記載の方法。
(項目85)
前記被験体が、固形腫瘍を有する、項目62〜83のいずれか1項に記載の方法。
(項目86)
前記改変された細胞が、腫瘍浸潤リンパ球またはT細胞である、項目62〜83のいずれか1項に記載の方法。
(項目87)
前記改変された細胞が、腫瘍床に送達される、項目62〜86のいずれか1項に記載の方法。
(項目88)
前記がんが、前記被験体の血液中または骨髄中に存在する、項目84に記載の方法。
(項目89)
前記被験体が、血液疾患または骨髄疾患を有する、項目62〜83のいずれか1項に記載の方法。
(項目90)
前記被験体が、任意の状態または幹細胞移植によって緩和され得る状態と診断されている、項目62〜83のいずれか1項に記載の方法。
(項目91)
前記被験体が、鎌状赤血球貧血または異染性白質ジストロフィーと診断されている、項目62〜83のいずれか1項に記載の方法。
(項目92)
前記被験体が、原発性免疫不全状態、血球貪食リンパ組織球増多症(HAH)または他の血球貪食状態、遺伝性骨髄不全状態、異常ヘモグロビン症、代謝状態および破骨細胞状態からなる群より選択される状態と診断されている、項目62〜83のいずれか1項に記載の方法。
(項目93)
前記疾患または状態が、重症複合免疫不全症(SCID)、複合免疫不全症(CID)、先天性T細胞欠損/欠損症、分類不能型免疫不全症(CVID)、慢性肉芽腫症、IPEX(免疫不全、多腺性内分泌障害、腸症、X連鎖)またはIPEX様、ウィスコット・オールドリッチ症候群、CD40リガンド欠損症、白血球接着不全、DOCA8欠損症、IL−10欠損症/IL−10レセプター欠損症、GATA2欠損症、X連鎖リンパ球増殖性疾患(XAP)、軟骨毛髪形成不全、シュバッハマン・ダイアモンド症候群、ダイアモンドブラックファン貧血、先天性角化異常症、ファンコニー貧血、先天性好中球減少症、鎌状赤血球症、サラセミア、ムコ多糖症、スフィンゴリピドーシスおよび大理石骨病からなる群より選択される、項目62〜83のいずれか1項に記載の方法。
(項目94)
さらなる用量の前記リガンドを前記被験体に投与するべきであるかを判定する工程をさらに含む、項目62〜93のいずれか1項に記載の方法。
(項目95)
さらなる用量の前記リガンドを前記被験体に投与する工程をさらに含み、ここで、前記疾患または状態の症候は、症候の減少後になおも残っているかまたは検出される、項目62〜93のいずれか1項に記載の方法。
(項目96)
多量体リガンドの有効量が、標的抗原を発現している細胞の数もしくは濃度または該標的抗原を発現している細胞の組織浸潤の程度を減少させ、前記細胞傷害性の症候を減少させるのに有効な量である、項目78〜93のいずれか1項に記載の方法。
(項目97)
前記多量体リガンドを投与した後に、細胞傷害性の症候のレベルが前記被験体において決定され、(i)該多量体リガンドの投与が中止されるか、または(ii)投与された多量体リガンドの以前の用量よりも低いさらなる用量の多量体リガンドが投与される、項目78〜96に記載の方法。
(項目98)
前記多量体リガンドを投与した後に、細胞傷害性の症候のレベルが、前記被験体において決定され、投与された多量体リガンドの以前の用量よりも高いさらなる用量の多量体リガンドが投与される、項目78〜97に記載の方法。
(項目99)
前記多量体リガンドを投与した後に、前記被験体における標的抗原を発現している細胞の数もしくは濃度または該標的抗原を発現している細胞の組織浸潤の程度が決定され、(i)該多量体リガンドの投与が中止されるか、または(ii)投与された多量体リガンドの以前の用量よりも低いさらなる用量の多量体リガンドが投与される、項目78〜97に記載の方法。
(項目100)
前記多量体リガンドを投与した後に、前記被験体における標的抗原を発現している細胞の数もしくは濃度または該標的抗原を発現している細胞の組織浸潤の程度が決定され、投与された多量体リガンドの以前の用量よりも高いさらなる用量の多量体リガンドが投与される、項目78〜99に記載の方法。
(項目101)
被験体における状態または疾患の有無またはステージを特定する工程;および
該被験体において特定された状態または疾患の有無またはステージに基づいて、項目53〜61のいずれか1項に記載のリガンドを投与する指示、該リガンドのその後の投与量を維持する指示または該被験体に投与される該リガンドのその後の投与量を調整する指示を伝える工程
をさらに含む、項目62〜100のいずれか1項に記載の方法。
(項目102)
前記状態が、白血病である、項目62〜101のいずれか1項に記載の方法。
(項目103)
前記被験体が、HIV、インフルエンザ、疱疹、ウイルス性肝炎、エプスタイン・バー、ポリオ、ウイルス性脳炎、麻疹、水痘、サイトメガロウイルス(CMV)、アデノウイルス(ADV)、HHV−6(ヒトヘルペスウイルス6,I)およびパピローマウイルスからなる群より選択されるウイルス病因の感染症と診断されているか、または肺炎、結核および梅毒からなる群より選択される細菌病因の感染症と診断されているか、またはマラリア、トリパノソーマ症、リーシュマニア症、トリコモナス症およびアメーバ症からなる群より選択される寄生生物病因の感染症と診断されている、項目62〜101のいずれか1項に記載の方法。
(項目104)
前記改変された細胞が、エキソビボにおいてトランスフェクトされるかまたは形質導入される、項目62〜103のいずれか1項に記載の方法。
(項目105)
前記改変された細胞が、インビボにおいてトランスフェクトされるかまたは形質導入される、項目53〜61のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目106)
前記リガンドが、AP1903である、項目62〜104のいずれか1項に記載の方法。
(項目107)
細胞においてキメラ刺激分子を発現させるための方法であって、該方法は、項目1〜51のいずれか1項に記載の核酸を、該核酸が細胞に組み込まれる条件下において該細胞と接触させる工程を含み、それにより、該細胞は、該組み込まれた核酸からキメラ抗原レセプターを発現する、方法。
(項目108)
前記核酸が、エキソビボにおいて前記細胞と接触される、項目107に記載の方法。
(項目109)
前記核酸が、インビボにおいて前記細胞と接触される、項目107に記載の方法。
(項目110)
標的抗原の高発現に関連する疾患または状態を有する被験体を処置するための方法であって、該方法は、多量体リガンド結合領域に結合する多量体リガンドを投与する工程を含み、ここで、
a)該多量体リガンドは、該多量体リガンド領域、MyD88ポリペプチド領域またはTIRドメインを欠く切断型MyD88ポリペプチド領域およびCD40細胞外ドメインを欠くCD40細胞質ポリペプチド領域を含む誘導可能なキメラ刺激分子に結合し;
b)該被験体内を循環しているT細胞は、(i)該誘導可能なキメラ刺激分子;および(ii)該標的抗原に結合するキメラ抗原レセプターを発現し;
c)該標的抗原は、該被験体内を循環している標的細胞上に存在し;
d)該被験体における標的細胞の数または濃度は、該多量体リガンドを投与した後に減少する、
方法。
(項目111)
前記誘導可能なキメラ刺激分子が、膜標的化領域をさらに含む、項目110に記載の方法。
(項目112)
前記キメラ刺激分子を発現しているT細胞が、項目1〜51のいずれか1項に記載の核酸を含む、項目110または111のいずれか1項に記載の方法。
(項目113)
前記標的抗原が、腫瘍細胞によって発現され、前記キメラ抗原レセプターが、前記腫瘍細胞に結合する、項目110〜112のいずれか1項に記載の方法。
(項目114)
前記改変された細胞またはリガンドを投与する前に前記被験体から得られる第1のサンプル中の標的細胞の数または濃度を測定する工程、該改変された細胞およびリガンドを投与した後に該被験体から得られる第2のサンプル中の標的細胞の数または濃度を測定する工程、および該第1のサンプル中の標的細胞の数または濃度と比べて該第2のサンプル中の標的細胞の数または濃度の増加または減少を判定する工程をさらに含む、項目110〜113のいずれか1項に記載の方法。
(項目115)
前記第2のサンプル中の標的細胞の濃度が、前記第1のサンプル中の標的細胞の濃度と比べて減少する、項目113に記載の方法。
(項目116)
前記第2のサンプル中の標的細胞の濃度が、前記第1のサンプル中の標的細胞の濃度と比べて増加する、項目113に記載の方法。
(項目117)
さらなる用量の前記リガンドが、前記被験体に投与される、項目110〜116のいずれか1項に記載の方法。
(項目118)
前記標的抗原が、腫瘍抗原である、項目110〜117のいずれか1項に記載の方法。
(項目119)
前記被験体が、がんを有するまたは腫瘍を有すると診断されている、項目110〜118のいずれか1項に記載の方法。
(項目120)
前記被験体が、固形腫瘍を有する、項目110〜119のいずれか1項に記載の方法。
(項目121)
前記がんが、前記被験体の血液中または骨髄中に存在する、項目119に記載の方法。
(項目122)
前記被験体が、血液疾患または骨髄疾患を有する、項目110〜121のいずれか1項に記載の方法。
(項目123)
前記被験体が、任意の状態または幹細胞移植によって緩和され得る状態と診断されている、項目110〜122のいずれか1項に記載の方法。
(項目124)
前記被験体が、鎌状赤血球貧血または異染性白質ジストロフィーと診断されている、項目110〜117のいずれか1項に記載の方法。
(項目125)
前記被験体が、原発性免疫不全状態、血球貪食リンパ組織球増多症(HAH)または他の血球貪食状態、遺伝性骨髄不全状態、異常ヘモグロビン症、代謝状態および破骨細胞状態からなる群より選択される状態と診断されている、項目110〜117のいずれか1項に記載の方法。
(項目126)
前記疾患または状態が、重症複合免疫不全症(SCID)、複合免疫不全症(CID)、先天性T細胞欠損/欠損症、分類不能型免疫不全症(CVID)、慢性肉芽腫症、IPEX(免疫不全、多腺性内分泌障害、腸症、X連鎖)またはIPEX様、ウィスコット・オールドリッチ症候群、CD40リガンド欠損症、白血球接着不全、DOCA8欠損症、IL−10欠損症/IL−10レセプター欠損症、GATA2欠損症、X連鎖リンパ球増殖性疾患(XAP)、軟骨毛髪形成不全、シュバッハマン・ダイアモンド症候群、ダイアモンドブラックファン貧血、先天性角化異常症、ファンコニー貧血、先天性好中球減少症、鎌状赤血球症、サラセミア、ムコ多糖症、スフィンゴリピドーシスおよび大理石骨病からなる群より選択される、項目110〜117のいずれか1項に記載の方法。
(項目127)
さらなる用量の前記多量体リガンドを前記被験体に投与するべきであるかを判定する工程をさらに含む、項目110〜127のいずれか1項に記載の方法。
(項目128)
さらなる用量の前記多量体リガンドを前記被験体に投与する工程をさらに含み、ここで、前記疾患または状態の症候は、症候の減少後になおも残っているかまたは検出される、項目110〜128のいずれか1項に記載の方法。
(項目129)
被験体における状態または疾患の有無またはステージを特定する工程;および
該被験体において特定された状態または疾患の有無またはステージに基づいて、前記多量体リガンドを該被験体に投与する指示、該多量体リガンドのその後の投与量を維持する指示または該被験体に投与される該多量体リガンドのその後の投与量を調整する指示を伝える工程
をさらに含む、項目110〜127のいずれか1項に記載の方法。
(項目130)
前記状態が、白血病である、項目110〜117のいずれか1項に記載の方法。
(項目131)
前記被験体が、HIV、インフルエンザ、疱疹、ウイルス性肝炎、エプスタイン・バー、ポリオ、ウイルス性脳炎、麻疹、水痘、サイトメガロウイルス(CMV)、アデノウイルス(ADV)、HHV−6(ヒトヘルペスウイルス6,I)およびパピローマウイルスからなる群より選択されるウイルス病因の感染症と診断されているか、または肺炎、結核および梅毒からなる群より選択される細菌病因の感染症と診断されているか、またはマラリア、トリパノソーマ症、リーシュマニア症、トリコモナス症およびアメーバ症からなる群より選択される寄生生物病因の感染症と診断されている、項目110〜117のいずれか1項に記載の方法。
(項目133)
前記リガンドが、AP1903である、項目110〜132のいずれか1項に記載の方法。
(項目134)
誘導可能なキメラ刺激分子をコードするポリヌクレオチドを含む核酸でトランスフェクトされたまたは形質導入された、改変されたT細胞であって、ここで、該誘導可能なキメラ刺激分子は、(i)MyD88ポリペプチド領域またはTIRドメインを欠く切断型MyD88ポリペプチド領域;(ii)CD40細胞外ドメインを欠くCD40細胞質ポリペプチド領域、および(iii)多量体化領域を含む、改変されたT細胞。
(項目135)
前記誘導可能なキメラ刺激分子が、(iv)膜標的化領域をさらに含む、項目134に記載の改変されたT細胞。
(項目136)
前記キメラ刺激分子がポリペプチドであって、領域(i)〜(iii)を、該ポリペプチドのアミノ末端からカルボキシル末端に向かって(i)、(ii)、(iii)という順序で含むポリペプチドである、項目134に記載の改変されたT細胞。
(項目137)
前記キメラ刺激分子がポリペプチドであって、領域(i)〜(iv)を、該ポリペプチドのアミノ末端からカルボキシル末端に向かって(iv)、(i)、(ii)、(iii)という順序で含むポリペプチドである、項目135に記載の改変されたT細胞。
(項目138)
前記多量体化領域が、リガンド結合領域である、項目134〜137のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目139)
前記リガンド結合領域が、FKBP12領域である、項目138に記載の改変されたT細胞。
(項目140)
前記FKBP12領域が、FKBP12v36領域である、項目138に記載の改変されたT細胞。
(項目141)
前記FKBP12領域が、Fv’Fvlsである、項目140に記載の改変されたT細胞。
(項目142)
前記多量体化領域が、配列番号11のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその機能的フラグメントおよび配列番号13のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその機能的フラグメントを含むか、または配列番号12におけるヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチまたはその機能的フラグメントをさらに含む、項目138に記載の改変されたT細胞。
(項目143)
前記多量体化領域が、配列番号13のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその機能的フラグメントをさらに含むか、または配列番号12におけるヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドまたはその機能的フラグメントをさらに含む、項目142に記載の改変されたT細胞。
(項目144)
残基36がバリンであるFvポリペプチドバリアントをさらに含む、項目142に記載の改変されたT細胞。
(項目145)
前記リガンドが、FK506二量体または二量体のFK506アナログリガンドである、項目134〜144のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目146)
前記リガンドが、AP1903である、項目145に記載の改変されたT細胞。
(項目147)
領域(i)〜(iv)の少なくとも1つが、コドン最適化されたヌクレオチド配列によってコードされる、項目134〜146のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目148)
前記誘導可能なキメラ刺激分子をコードするポリヌクレオチドに作動可能に連結されたプロモーターをさらに含む、項目134〜147のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目149)
前記改変された細胞が、キメラ抗原レセプターをコードするポリヌクレオチドをさらに含む、項目134〜148のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目150)
前記キメラ抗原レセプターが、
(i)膜貫通領域;(ii)T細胞活性化分子;および(iii)抗原認識部分
を含む、項目149に記載の改変されたT細胞。
(項目151)
前記改変された細胞が、T細胞レセプターをコードするポリヌクレオチドをさらに含む、項目134〜150のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目152)
前記改変された細胞が、T細胞レセプターまたはT細胞レセプターに基づくキメラ抗原レセプターをコードするポリヌクレオチドを含む核酸でトランスフェクトされるかまたは形質導入される、項目145〜151のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目153)
前記キメラ抗原レセプターが、共刺激分子をさらに含む、項目150に記載の改変されたT細胞。
(項目154)
前記共刺激分子が、CD28、OX40および4−1BBからなる群より選択される、項目153に記載の改変されたT細胞。
(項目155)
前記T細胞活性化分子が、ITAMを含みシグナル1を与える分子である、項目150に記載の改変されたT細胞。
(項目156)
前記T細胞活性化分子が、CD3ζポリペプチドである、項目150に記載の改変されたT細胞。
(項目157)
前記T細胞活性化分子が、Fcイプシロンレセプターガンマ(FcεR1γ)サブユニットポリペプチドである、項目150に記載の改変されたT細胞。
(項目158)
前記抗原認識部分が、腫瘍細胞上の抗原に結合する、項目150〜157のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目159)
前記抗原認識部分が、過剰増殖性疾患に関与する細胞上の抗原に結合する、項目150〜157のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目160)
前記抗原認識部分が、PSMA、PSCA、MUC1、CD19、ROR1、Mesothelin、GD2、CD123、MUC16およびHer2/Neuからなる群より選択される抗原に結合する、項目150〜157のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目161)
前記抗原認識部分が、PSCAに結合する、項目150〜157のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目162)
前記抗原認識部分が、CD19に結合する、項目150〜157のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目163)
前記抗原認識部分が、Her2/Neuに結合する、項目150〜157のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目164)
前記抗原認識部分が、ウイルス抗原または細菌抗原に結合する、項目150〜157のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目165)
前記抗原認識部分が、一本鎖可変フラグメントである、項目150〜157のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目166)
前記膜貫通領域が、CD28膜貫通領域である、項目150〜157のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目167)
前記膜貫通領域が、CD8膜貫通領域である、項目150〜157のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目168)
前記キメラ抗原レセプターが、CD8ストーク領域をさらに含む、項目167に記載の改変されたT細胞。
(項目169)
前記キメラ刺激分子が、配列番号5のアミノ酸配列を有する切断型MyD88ポリペプチドまたはその機能的フラグメントを含む、項目134〜169のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目170)
前記MyD88ポリペプチドが、配列番号49のアミノ酸配列を有する、項目134〜169のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目171)
前記細胞質CD40ポリペプチドが、配列番号9のアミノ酸配列またはその機能的フラグメントを有する、項目134〜70のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目172)
前記CD3ζポリペプチドが、配列番号39のアミノ酸配列またはその機能的フラグメントを含む、項目156〜171のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目173)
前記膜標的化領域が、レセプターのミリストイル化領域、パルミトイル化領域、プレニル化領域および膜貫通配列からなる群より選択される、項目135〜172のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目174)
前記膜標的化領域が、ミリストイル化領域である、項目135〜173のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目175)
前記ミリストイル化領域が、配列番号3のアミノ酸配列またはその機能的フラグメントを有する、項目174に記載の改変されたT細胞。
(項目176)
被験体におけるT細胞媒介性の免疫応答を刺激するための方法であって、
a)項目134〜175のいずれか1項に記載の改変されたT細胞を該被験体に投与する工程;および
b)有効量の、前記多量体化領域に結合する多量体リガンドを投与することにより、該被験体においてT細胞媒介性の免疫応答を刺激する工程
を含む、方法。
(項目177)
前記キメラ抗原レセプターが、標的細胞に結合する、項目176に記載の方法。
(項目178)
前記標的細胞が、腫瘍細胞である、項目176に記載の方法。
(項目179)
前記被験体における標的細胞の数または濃度が、前記リガンドの投与後に減少する、項目176〜178のいずれか1項に記載の方法。
(項目180)
前記改変された細胞またはリガンドを投与する前に前記被験体から得られる第1のサンプル中の標的細胞の数または濃度を測定する工程、該改変された細胞およびリガンドを投与した後に該被験体から得られる第2のサンプル中の標的細胞の数または濃度を測定する工程、および該第1のサンプル中の標的細胞の数または濃度と比べて該第2のサンプル中の標的細胞の数または濃度の増加または減少を判定する工程をさらに含む、項目176〜179のいずれか1項に記載の方法。
(項目181)
前記第2のサンプル中の標的細胞の濃度が、前記第1のサンプル中の標的細胞の濃度と比べて減少する、項目180に記載の方法。
(項目182)
前記第2のサンプル中の標的細胞の濃度が、前記第1のサンプル中の標的細胞の濃度と比べて増加する、項目181に記載の方法。
(項目183)
さらなる用量の前記リガンドが、前記被験体に投与される、項目176〜182のいずれか1項に記載の方法。
(項目184)
被験体に抗腫瘍免疫を提供するための方法であって、有効量の項目134〜175のいずれか1項に記載の改変されたT細胞を該被験体に投与する工程および前記多量体化領域に結合するリガンドを投与することにより該被験体に抗腫瘍免疫を提供する工程を含む、方法。
(項目185)
標的抗原の高発現に関連する疾患または状態を有する被験体を処置するための方法であって、有効量の項目134〜175のいずれか1項に記載の改変されたT細胞、および有効量の、前記多量体化領域に結合するリガンドを該被験体に投与する工程を含む、方法。
(項目186)
前記標的抗原が、腫瘍抗原である、項目185に記載の方法。
(項目187)
前記改変されたT細胞が、自己のT細胞である、項目176〜186のいずれか1項に記載の方法。
(項目188)
前記改変されたT細胞が、同種異系のT細胞である、項目176〜186のいずれか1項に記載の方法。
(項目189)
被験体における腫瘍サイズを減少させるための方法であって、該方法は、項目134〜175のいずれか1項に記載の改変されたT細胞を該被験体に投与する工程を含み、前記抗原認識部分は、該腫瘍上の抗原に結合する、方法。
(項目190)
前記被験体が、腫瘍を有すると診断されている、項目176〜189のいずれか1項に記載の方法。
(項目191)
前記被験体が、がんを有する、項目176〜190のいずれか1項に記載の方法。
(項目192)
前記被験体が、固形腫瘍を有する、項目176〜191のいずれか1項に記載の方法。
(項目193)
前記改変されたT細胞が、腫瘍浸潤リンパ球、NK細胞またはNK−T細胞である、項目176〜192のいずれか1項に記載の方法。
(項目194)
前記改変されたT細胞が、腫瘍床に送達される、項目176〜193のいずれか1項に記載の方法。
(項目195)
前記がんが、前記被験体の血液中または骨髄中に存在する、項目191に記載の方法。
(項目196)
前記被験体が、血液疾患または骨髄疾患を有する、項目176〜195のいずれか1項に記載の方法。
(項目197)
前記被験体が、任意の状態または幹細胞移植によって緩和され得る状態と診断されている、項目176〜196のいずれか1項に記載の方法。
(項目198)
前記被験体が、鎌状赤血球貧血または異染性白質ジストロフィーと診断されている、項目176〜190のいずれか1項に記載の方法。
(項目199)
前記被験体が、原発性免疫不全状態、血球貪食リンパ組織球増多症(HAH)または他の血球貪食状態、遺伝性骨髄不全状態、異常ヘモグロビン症、代謝状態および破骨細胞状態からなる群より選択される状態と診断されている、項目176〜190のいずれか1項に記載の方法。
(項目200)
前記疾患または状態が、重症複合免疫不全症(SCID)、複合免疫不全症(CID)、先天性T細胞欠損/欠損症、分類不能型免疫不全症(CVID)、慢性肉芽腫症、IPEX(免疫不全、多腺性内分泌障害、腸症、X連鎖)またはIPEX様、ウィスコット・オールドリッチ症候群、CD40リガンド欠損症、白血球接着不全、DOCA8欠損症、IL−10欠損症/IL−10レセプター欠損症、GATA2欠損症、X連鎖リンパ球増殖性疾患(XAP)、軟骨毛髪形成不全、シュバッハマン・ダイアモンド症候群、ダイアモンドブラックファン貧血、先天性角化異常症、ファンコニー貧血、先天性好中球減少症、鎌状赤血球症、サラセミア、ムコ多糖症、スフィンゴリピドーシスおよび大理石骨病からなる群より選択される、項目176〜190のいずれか1項に記載の方法。
(項目201)
さらなる用量の前記リガンドを前記被験体に投与するべきであるかを判定する工程をさらに含む、項目176〜200のいずれか1項に記載の方法。
(項目202)
さらなる用量の前記リガンドを前記被験体に投与する工程をさらに含み、ここで、前記疾患または状態の症候は、症候の減少後になおも残っているかまたは検出される、項目176〜201のいずれか1項に記載の方法。
(項目203)
被験体における状態または疾患の有無またはステージを特定する工程;および
該被験体において特定された状態または疾患の有無またはステージに基づいて、項目C53〜C61のいずれか1項に記載のリガンドを投与する指示、該リガンドのその後の投与量を維持する指示または該被験体に投与される該リガンドのその後の投与量を調整する指示を伝える工程
をさらに含む、項目176〜202のいずれか1項に記載の方法。
(項目204)
前記状態が、白血病である、項目176〜203のいずれか1項に記載の方法。
(項目205)
前記被験体が、HIV、インフルエンザ、疱疹、ウイルス性肝炎、エプスタイン・バー、ポリオ、ウイルス性脳炎、麻疹、水痘、サイトメガロウイルス(CMV)、アデノウイルス(ADV)、HHV−6(ヒトヘルペスウイルス6,I)およびパピローマウイルスからなる群より選択されるウイルス病因の感染症と診断されているか、または肺炎、結核および梅毒からなる群より選択される細菌病因の感染症と診断されているか、またはマラリア、トリパノソーマ症、リーシュマニア症、トリコモナス症およびアメーバ症からなる群より選択される寄生生物病因の感染症と診断されている、項目176〜203のいずれか1項に記載の方法。
(項目206)
前記改変されたT細胞が、エキソビボにおいてトランスフェクトされるかまたは形質導入される、項目176〜205のいずれか1項に記載の方法。
(項目207)
前記改変されたT細胞が、インビボにおいてトランスフェクトされるかまたは形質導入される、項目134〜175のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
(項目208)
前記リガンドが、AP1903である、項目176〜206のいずれか1項に記載の方法。
(項目209)
誘導可能なキメラ刺激分子をコードするポリヌクレオチドを含む核酸であって、ここで、該誘導可能なキメラ刺激分子は、(i)MyD88ポリペプチド領域またはTIRドメインを欠く切断型MyD88ポリペプチド領域;(ii)CD40細胞外ドメインを欠くCD40細胞質ポリペプチド領域、および(iii)多量体化領域を含む、核酸。
(項目210)
前記キメラ刺激分子がポリペプチドであって、領域(i)〜(iii)を、該ポリペプチドのアミノ末端からカルボキシル末端に向かって(i)、(ii)、(iii)という順序で含むポリペプチドである、項目209に記載の核酸。
(項目211)
前記多量体化領域が、リガンド結合領域である、項目209〜210のいずれか1項に記載の核酸。
(項目212)
前記リガンド結合領域が、FKBP12領域である、項目211に記載の核酸。
(項目213)
前記FKBP12領域が、FKBP12v36領域である、項目211に記載の核酸。
(項目214)
前記FKBP12領域が、Fv’Fvlsである、項目211に記載の核酸。
(項目215)
前記多量体化領域が、配列番号11のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその機能的フラグメントおよび配列番号13のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む、項目211に記載の核酸。
(項目216)
前記多量体化領域が、配列番号13のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその機能的フラグメントをさらに含む、項目215に記載の核酸。
(項目217)
残基36がバリンであるFvポリペプチドバリアントをさらに含む、項目215に記載の核酸。
(項目218)
前記リガンドが、FK506二量体または二量体のFK506アナログリガンドである、項目209〜217のいずれか1項に記載の核酸。
(項目219)
前記リガンドが、AP1903である、項目218に記載の核酸。
(項目220)
領域(i)〜(iii)の少なくとも1つが、コドン最適化されたヌクレオチド配列によってコードされる、項目209〜219のいずれか1項に記載の核酸。
(項目221)
前記ポリヌクレオチドに作動可能に連結されたプロモーターをさらに含む、項目209〜220のいずれか1項に記載の核酸。
(項目222)
前記核酸が、ウイルスベクター内に含まれている、項目209〜221のいずれか1項に記載の核酸。
(項目223)
前記ウイルスベクターが、レトロウイルスベクターである、項目222に記載の核酸。
(項目224)
前記レトロウイルスベクターが、マウス白血病ウイルスベクターである、項目223に記載の核酸。
(項目225)
前記レトロウイルスベクターが、SFGベクターである、項目223に記載の核酸。
(項目226)
前記ウイルスベクターが、アデノウイルスベクターである、項目222に記載の核酸。
(項目227)
前記ウイルスベクターが、レンチウイルスベクターである、項目222に記載の核酸。
(項目228)
前記ウイルスベクターが、アデノ随伴ウイルス(AAV)、ヘルペスウイルスおよびワクシニアウイルスからなる群より選択される、項目222に記載の核酸。
(項目229)
前記核酸が、プラスミド内に含まれている、項目209〜222のいずれか1項に記載の核酸。
(項目230)
項目209〜230のいずれか1項に記載の核酸でトランスフェクトされたまたは形質導入された、改変された細胞。
(項目231)
前記改変された細胞が、T細胞、腫瘍浸潤リンパ球、NK−T細胞、TCRを発現している細胞またはNK細胞である、項目230に記載の改変された細胞。
(項目232)
前記細胞が、T細胞である、項目230に記載の改変された細胞。
(項目234)
前記細胞が、骨髄から得られるかまたは調製される、項目230〜232のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目235)
前記細胞が、臍帯血から得られるかまたは調製される、項目230〜232のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目236)
前記細胞が、末梢血から得られるかまたは調製される、項目230〜232のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目237)
前記細胞が、末梢血単核球から得られるかまたは調製される、項目230〜232のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目238)
前記細胞が、ヒト細胞である、項目230〜237のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目239)
前記細胞が、エレクトロポレーション、ソノポレーション、バイオリスティック(例えば、Au粒子を用いた遺伝子銃)、脂質トランスフェクション、ポリマートランスフェクション、ナノ粒子またはポリプレックスからなる群より選択される方法を用いて、前記核酸ベクターによってトランスフェクトされるかまたは形質導入される、項目230〜238のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目240)
前記改変された細胞が、T細胞レセプターをコードするポリヌクレオチドをさらに含む、項目230〜239のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目241)
前記改変された細胞が、T細胞レセプターまたはT細胞レセプターに基づくキメラ抗原レセプターをコードするポリヌクレオチドを含む核酸でトランスフェクトされるかまたは形質導入される、項目230〜240のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目242)
前記改変された細胞が、キメラ抗原レセプターをコードするポリヌクレオチドをさらに含む、項目230〜241のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目243)
前記キメラ抗原レセプターが、
(i)膜貫通領域;(ii)T細胞活性化分子;および(iii)抗原認識部分
を含む、項目242に記載の改変された細胞
(項目244)
前記キメラ抗原レセプターが、共刺激分子をさらに含む、項目243に記載の改変された細胞。
(項目245)
前記共刺激分子が、CD28、OX40および4−1BBからなる群より選択される、項目244に記載の改変された細胞。
(項目246)
前記T細胞活性化分子が、ITAMを含みシグナル1を与える分子である、項目243に記載の改変された細胞。
(項目247)
前記T細胞活性化分子が、CD3ζポリペプチドである、項目243に記載の改変された細胞。
(項目248)
前記T細胞活性化分子が、Fcイプシロンレセプターガンマ(FcεR1γ)サブユニットポリペプチドである、項目243に記載の改変された細胞。
(項目249)
前記抗原認識部分が、腫瘍細胞上の抗原に結合する、項目243〜248のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目250)
前記抗原認識部分が、過剰増殖性疾患に関与する細胞上の抗原に結合する、項目243〜249のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目251)
前記抗原認識部分が、PSMA、PSCA、MUC1、CD19、ROR1、Mesothelin、GD2、CD123、MUC16およびHer2/Neuからなる群より選択される抗原に結合する、項目243〜250のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目252)
前記抗原認識部分が、PSCAに結合する、項目243〜250のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目253)
前記抗原認識部分が、CD19に結合する、項目243〜248のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目254)
前記抗原認識部分が、Her2/Neuに結合する、項目243〜248のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目255)
前記抗原認識部分が、ウイルス抗原または細菌抗原に結合する、項目243〜248のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目256)
前記抗原認識部分が、一本鎖可変フラグメントである、項目243〜255のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目257)
前記膜貫通領域が、CD28膜貫通領域である、項目243〜256のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目258)
前記膜貫通領域が、CD8膜貫通領域である、項目243〜256のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目259)
前記キメラ抗原レセプターが、CD8ストーク領域をさらに含む、項目258に記載の改変された細胞。
(項目260)
前記キメラ刺激分子が、配列番号5のアミノ酸配列を有する切断型MyD88ポリペプチドまたはその機能的フラグメントを含む、項目230〜250のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目261)
前記MyD88ポリペプチドが、配列番号49のアミノ酸配列を有する、項目230〜260のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目262)
前記細胞質CD40ポリペプチドが、配列番号9のアミノ酸配列またはその機能的フラグメントを有する、項目230〜261のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目263)
前記CD3ζポリペプチドが、配列番号39のアミノ酸配列またはその機能的フラグメントを含む、項目247〜261のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目264)
被験体におけるT細胞媒介性の免疫応答を刺激するための方法であって、
a)項目230〜263のいずれか1項に記載の改変された細胞を該被験体に投与する工程;および
b)有効量の、前記多量体化領域に結合する多量体リガンドを投与することにより、該被験体においてT細胞媒介性の免疫応答を刺激する工程
を含む、方法。
(項目265)
前記キメラ抗原レセプターが、標的細胞に結合する、項目264に記載の方法。
(項目266)
前記標的細胞が、腫瘍細胞である、項目264に記載の方法。
(項目267)
前記被験体における標的細胞の数または濃度が、前記リガンドの投与後に減少する、項目265〜266のいずれか1項に記載の方法。
(項目268)
前記改変された細胞またはリガンドを投与する前に前記被験体から得られる第1のサンプル中の標的細胞の数または濃度を測定する工程、該改変された細胞および該リガンドを投与した後に該被験体から得られる第2のサンプル中の標的細胞の数または濃度を測定する工程、および該第1のサンプル中の標的細胞の数または濃度と比べて該第2のサンプル中の標的細胞の数または濃度の増加または減少を判定する工程をさらに含む、項目265〜267のいずれか1項に記載の方法。
(項目269)
前記第2のサンプル中の標的細胞の濃度が、前記第1のサンプル中の標的細胞の濃度と比べて減少する、項目268に記載の方法。
(項目270)
前記第2のサンプル中の標的細胞の濃度が、前記第1のサンプル中の標的細胞の濃度と比べて増加する、項目268に記載の方法。
(項目271)
さらなる用量のリガンドが、前記被験体に投与される、項目264〜270のいずれか1項に記載の方法。
(項目272)
被験体に抗腫瘍免疫を提供するための方法であって、有効量の項目230〜263のいずれか1項に記載の改変された細胞を該被験体に投与する工程および前記多量体化領域に結合するリガンドを投与することにより該被験体に抗腫瘍免疫を提供する工程を含む、方法。
(項目273)
標的抗原の高発現に関連する疾患または状態を有する被験体を処置するための方法であって、有効量の項目230〜263のいずれか1項に記載の改変された細胞、および有効量の、前記多量体化領域に結合するリガンドを該被験体に投与する工程を含む、方法。
(項目274)
前記標的抗原が、腫瘍抗原である、項目273に記載の方法。
(項目275)
前記改変された細胞が、T細胞である、項目273または274のいずれか1項に記載の方法。
(項目276)
前記改変された細胞が、同種異系のT細胞である、項目273または274のいずれか1項に記載の方法。
(項目277)
被験体における腫瘍サイズを減少させるための方法であって、該方法は、項目230〜263のいずれか1項に記載の改変された細胞を該被験体に投与する工程を含み、前記抗原認識部分は、該腫瘍上の抗原に結合する、方法。
(項目278)
前記被験体が、腫瘍を有すると診断されている、項目264〜277のいずれか1項に記載の方法。
(項目279)
前記被験体が、がんを有する、項目264〜278のいずれか1項に記載の方法。
(項目280)
前記被験体が、固形腫瘍を有する、項目264〜279のいずれか1項に記載の方法。
(項目281)
前記改変された細胞が、腫瘍浸潤リンパ球である、項目264〜280のいずれか1項に記載の方法。
(項目282)
前記改変された細胞が、腫瘍床に送達される、項目264〜281のいずれか1項に記載の方法。
(項目283)
前記がんが、前記被験体の血液中または骨髄中に存在する、項目279に記載の方法。
(項目284)
前記被験体が、血液疾患または骨髄疾患を有する、項目264〜283のいずれか1項に記載の方法。
(項目285)
前記被験体が、任意の状態または幹細胞移植によって緩和され得る状態と診断されている、項目264〜283のいずれか1項に記載の方法。
(項目286)
前記被験体が、鎌状赤血球貧血または異染性白質ジストロフィーと診断されている、項目264〜277のいずれか1項に記載の方法。
(項目287)
前記被験体が、原発性免疫不全状態、血球貪食リンパ組織球増多症(HAH)または他の血球貪食状態、遺伝性骨髄不全状態、異常ヘモグロビン症、代謝状態および破骨細胞状態からなる群より選択される状態と診断されている、項目264〜277のいずれか1項に記載の方法。
(項目288)
前記疾患または状態が、重症複合免疫不全症(SCID)、複合免疫不全症(CID)、先天性T細胞欠損/欠損症、分類不能型免疫不全症(CVID)、慢性肉芽腫症、IPEX(免疫不全、多腺性内分泌障害、腸症、X連鎖)またはIPEX様、ウィスコット・オールドリッチ症候群、CD40リガンド欠損症、白血球接着不全、DOCA8欠損症、IL−10欠損症/IL−10レセプター欠損症、GATA2欠損症、X連鎖リンパ球増殖性疾患(XAP)、軟骨毛髪形成不全、シュバッハマン・ダイアモンド症候群、ダイアモンドブラックファン貧血、先天性角化異常症、ファンコニー貧血、先天性好中球減少症、鎌状赤血球症、サラセミア、ムコ多糖症、スフィンゴリピドーシスおよび大理石骨病からなる群より選択される、項目264〜277のいずれか1項に記載の方法。
(項目289)
さらなる用量の前記リガンドを前記被験体に投与するべきであるかを判定する工程をさらに含む、項目264〜288のいずれか1項に記載の方法。
(項目290)
さらなる用量の前記リガンドを前記被験体に投与する工程をさらに含み、ここで、前記疾患または状態の症候は、症候の減少後になおも残っているかまたは検出される、項目264〜289のいずれか1項に記載の方法。
(項目291)
被験体における状態または疾患の有無またはステージを特定する工程;および
該被験体において特定された状態または疾患の有無またはステージに基づいて、前記リガンドを投与する指示、該リガンドのその後の投与量を維持する指示または該被験体に投与される該リガンドのその後の投与量を調整する指示を伝える工程
をさらに含む、項目264〜290のいずれか1項に記載の方法。
(項目292)
前記状態が、白血病である、項目264〜291のいずれか1項に記載の方法。
(項目293)
前記被験体が、HIV、インフルエンザ、疱疹、ウイルス性肝炎、エプスタイン・バー、ポリオ、ウイルス性脳炎、麻疹、水痘、サイトメガロウイルス(CMV)、アデノウイルス(ADV)、HHV−6(ヒトヘルペスウイルス6,I)およびパピローマウイルスからなる群より選択されるウイルス病因の感染症と診断されているか、または肺炎、結核および梅毒からなる群より選択される細菌病因の感染症と診断されているか、またはマラリア、トリパノソーマ症、リーシュマニア症、トリコモナス症およびアメーバ症からなる群より選択される寄生生物病因の感染症と診断されている、項目264〜291のいずれか1項に記載の方法。
(項目294)
前記改変された細胞が、エキソビボにおいてトランスフェクトされるかまたは形質導入される、項目264〜293のいずれか1項に記載の方法。
(項目295)
前記改変された細胞が、インビボにおいてトランスフェクトされるかまたは形質導入される、項目230〜263のいずれか1項に記載の改変された細胞。
(項目296)
前記リガンドが、AP1903である、項目264〜294のいずれか1項に記載の方法。
キメラ抗原レセプター(CAR)を発現しているT細胞は、いくつかのタイプのがんの処置に対して長期間の有効性を示したが、しかしながら、過剰なT細胞の活性化に関連する毒性、例えば、サイトカイン放出症候群(CRS)が、なおも懸念として残っている。ステロイドを用いるか、またはベクター内への自殺遺伝子(例えば、誘導可能なカスパーゼ−9、HSV−TK、CD20、切断型EGFR)7−12の組み込みを用いることにより、安全性プロファイルを改善することができるが、これらの現行のアプローチは、治療のレベルを低下させることがあるか、または治療を終わらせることがあり、ゆえに、有効性を損なう可能性がある。より最近では、IL−6レセプターの遮断がCRSを管理するために使用されている6;しかしながら、このストラテジーは、直接的なT細胞の細胞傷害性が組織損傷に関与しているときには、あまり有効でない可能性がある13。さらに、CAR−T細胞の有効性は、CAR−T細胞の不良な生存、活性化および増殖に起因して、おそらく、腫瘍内微小環境のより深刻な阻害作用に起因して、固形腫瘍においてより限定的である14,15。したがって、腫瘍を標的とするT細胞のコントロールされた拡大および生存を可能にするストラテジーは、毒性を最小限に抑えつつ、治療効力を最大にし得る。
米国では、前立腺がんは、男性において最も一般的な固形悪性腫瘍である。2008年の前立腺がんの新しい症例は推定186,320例であり、28,660人が死亡すると予想された。Jemal Aら、Cancer statistics,2008.CA Cancer J Clin.58:71−96,2008.一次療法の後にPSA−進行を経験する患者のおよそ70%が、その疾患の経過中の任意の時点において転移する。Gittes RF,N Engl J Med.324:236−45,1991.アンドロゲン枯渇療法(ADT)は、転移性前立腺がんに対する標準的な治療法であり、80〜85%の患者において、一時的な腫瘍のコントロールまたは後退を達成する。Crawford EDら、N Engl J Med.321:419−24,1989;Schellhammer PFら、J Urol.157:1731−5,1997;Scher HI and Kelly WK,J Clin Oncol.11:1566−72,1993;Small EJ and Srinivas S,Cancer.76:1428−34,1995.
ホルモン療法に対する奏功期間ならびにホルモン療法開始後の生存時間は、いくつかの因子に依存することが示されており、その因子としては、原発性腫瘍のグリーソン和(Gleason Sum)、ADT開始後に検出不可能な最下点PSAを達成する能力、およびADT開始前のPSA倍加時間が挙げられる。ホルモン療法にもかかわらず、転移性前立腺がんを有する実質的にすべての患者が、最終的には進行性疾患を発症する。Kelly WK and Slovin SF,Curr Oncol Rep.2:394−401,2000;Scher HIら、J Natl Cancer Inst.88:1623−34,1996;Small EJ and Vogelzang NJ,J Clin Oncol.15:382−8,1997.原発性腫瘍のグリーソン和、すなわちグリーソンスコアを用いることにより、その腫瘍の微視的評価に基づいて男性の前立腺がんのレベルがグレーディングされる。より高いグリーソンスコアは、そのがんが、より高悪性度であり、広がる可能性がより高いので、より不良な予後を有するがんであることを意味する。このグレーディングシステムの例は、Gleason DF.,The Veteran’s Administration Cooperative Urologic Research Group:histologic grading and clinical staging of prostatic carcinoma.In Tannenbaum M(ed.)Urologic Pathology:The Prostate.Lea and Febiger,Philadelphia,1977;171−198において論じられている。
抗原提示細胞(APC)は、その表面上に外来抗原を主要組織適合遺伝子複合体(MHC)分子とともにディスプレイすることによって、その外来抗原に対してT細胞をプライムし得る細胞である。APCには、2つのタイプ、プロフェッショナルおよび非プロフェッショナルがある。プロフェッショナルAPCは、MHCクラスI分子とMHCクラスII分子の両方を発現し、非プロフェッショナルAPCは、MHCクラスII分子を恒常的に発現しない。特定の実施形態では、プロフェッショナルAPCが、本明細書中の方法において使用される。プロフェッショナルAPCとしては、例えば、B細胞、マクロファージおよび樹状細胞が挙げられる。
自然免疫系は、微生物に存在する保存された分子パターンを認識するために、一連の生殖細胞系列によってコードされるレセプターを用いる。これらの分子パターンは、微生物のある特定の構成物に存在し、その構成物としては、リポ多糖類、ペプチドグリカン、リポテイコ酸、ホスファチジルコリン、リポタンパク質を含む細菌特異的タンパク質、細菌のDNA、ウイルスの一本鎖および二本鎖RNA、非メチル化CpG−DNA、マンナンならびに種々の他の細菌および真菌細胞壁の構成要素が挙げられる。そのような分子パターンは、植物アルカロイドなどの他の分子にも存在し得る。自然免疫の認識のこれらの標的は、微生物が産生するのであって、感染した宿主生物が産生するのではないので、病原体関連分子パターン(PAMP)と呼ばれる(Janewayら(1989)Cold Spring Harb.Symp.Quant.Biol.,54:1−13;Medzhitovら、Nature,388:394−397,1997)。
発現構築物は、共刺激ポリペプチドおよびリガンド結合ドメインをコードし、これらはすべて、作動可能に連結されている。一般に、用語「作動可能に連結された」は、プロモーター配列が第2の配列に機能的に連結されていることを示すと意味され、ここで、そのプロモーター配列は、第2の配列に対応するDNAの転写を開始および媒介する。より詳細には、1つより多いリガンド結合ドメインが、発現構築物において使用される。なおもさらに、その発現構築物は、膜標的化配列を含む。適切な発現構築物は、上記のFKBPリガンド結合エレメントのいずれかの側に共刺激ポリペプチドエレメントを含み得る。発現構築物は、ベクター、例えば、ウイルスベクターまたはプラスミドに挿入され得る。提供される方法の工程は、任意の好適な方法を使用して行われ得、これらの方法としては、本明細書中に提示される細胞に核酸を形質導入する方法、形質転換する方法または別途提供する方法が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、切断型MyD88ペプチドは、配列番号4のヌクレオチド配列(DNAリンカー有りもしくは無しで、または配列番号5のアミノ酸配列を有する)によってコードされる。いくつかの実施形態において、CD40細胞質ポリペプチド領域は、配列番号8におけるポリヌクレオチド配列によってコードされる。
共刺激ポリペプチド分子は、細胞の生存および増殖に関与するシグナル伝達経路の活性化によって細胞媒介性の免疫応答を増幅することができる。企図される共刺激タンパク質としては、例えば、腫瘍壊死因子レセプター(TNFR)ファミリーのメンバー(すなわち、CD40、RANK/TRANCE−R、OX40、4−1BB)およびCD28ファミリーのメンバー(CD28、ICOS)が挙げられるが、これらに限定されない。共刺激タンパク質には、例えば、CD28、4−1BB、OX40およびCD3ゼータ鎖、または例えばそれらの細胞質領域が含まれ得る。2つ以上の共刺激ポリペプチドまたは共刺激ポリペプチドの細胞質領域が、本明細書中で論じられる誘導可能なキメラシグナル伝達分子において使用され得る。例えば、誘導可能なCSMは、CD28細胞質ポリペプチドおよび4−1BB細胞質ポリペプチドを含み得る。または、例えば、誘導可能なCSMは、CD28細胞質ポリペプチドおよびOX40細胞質ポリペプチドを含み得る。または、例えば、誘導可能なCSMは、CD3ゼータドメインポリペプチドをさらに含み得る。
発現構築物のリガンド結合(「二量体化」)ドメインは、天然または非天然のリガンド、例えば、非天然の合成リガンドを使用して誘導を可能にし得る任意の好都合なドメインであり得る。多量体化領域またはリガンド結合ドメインは、構築物の性質およびリガンドの選択に応じて、細胞膜に対して内側または外側であり得る。上に示された細胞質領域と会合されるリガンド結合タンパク質を含むレセプターをはじめとした多種多様のリガンド結合タンパク質が公知である。本明細書中で使用されるとき、用語「リガンド結合ドメインは、用語「レセプター」と相互交換可能であり得る。リガンド(例えば、小さい有機リガンド)が公知であるかまたは容易に生成され得るリガンド結合タンパク質が、特に興味深い。これらのリガンド結合ドメインまたはレセプターには、FKBPおよびシクロフィリンレセプター、ステロイドレセプター、テトラサイクリンレセプター、上に示された他のレセプターなど、ならびに抗体から得ることができる「非天然の」レセプター、特に、重鎖または軽鎖サブユニット、その変異された配列、確率論的手順、コンビナトリアル合成などによって得られるランダムアミノ酸配列が含まれる。ある特定の実施形態において、リガンド結合領域は、FKBPリガンド結合領域、シクロフィリンレセプターリガンド結合領域、ステロイドレセプターリガンド結合領域、シクロフィリンレセプターリガンド結合領域およびテトラサイクリンレセプターリガンド結合領域からなる群より選択される。しばしば、リガンド結合領域は、FvFvls配列を含む。時折、Fv’Fvls配列は、さらなるFv’配列をさらに含む。例としては、例えば、Kopytek,S.J.ら、Chemistry & Biology 7:313−321(2000)およびGestwicki,J.E.ら、Combinatorial Chem.& High Throughput Screening 10:667−675(2007);Clackson T(2006)Chem Biol Drug Des 67:440−2;Clackson,T.,in Chemical Biology:From Small Molecules to Systems Biology and Drug Design(Schreiber,s.ら、eds.,Wiley,2007))において論じられているものが挙げられる。
形質導入されるシグナルは、通常、キメラタンパク質分子のリガンド媒介性のオリゴマー化によって、すなわち、リガンドが結合した後のオリゴマー化の結果として、生じ得るが、他の結合事象、例えば、アロステリックな活性化が、シグナルを惹起するために使用され得る。キメラタンパク質の構築物は、様々なドメインの順序および個々のドメインの反復の数に関して、変動し得る。
F36V−FKPBと同一のポリペプチド配列をコードするが、ヌクレオチドレベルでは62%の相同性しか有しない。F36V’−FKBPは、レトロウイルスベクターにおける組換えを減少させるようにデザインされた(Schellhammer,P.F.ら、J.Urol.157,1731−5(1997))。F36V’−FKBPは、PCRアセンブリ手順によって構築された。その導入遺伝子は、1コピーのF36V−FKBPに直接連結された1コピーのF36V’−FKBPを含む。
分子量:1411.65)である。ある特定の実施形態において、リガンドは、AP20187である。ある特定の実施形態において、リガンドは、AP20187アナログ、例えば、AP1510などである。いくつかの実施形態において、ある特定のアナログは、FKBP12に対して適切であり得、ある特定のアナログは、FKBP12のゆらぎバージョンに対して適切であり得る。ある特定の実施形態において、1つのリガンド結合領域が、キメラタンパク質に含められる。他の実施形態において、2つ以上のリガンド結合領域が、含められる。例えば、リガンド結合領域が、FKBP12である場合、これらの領域の2つが含められる場合、一方は、例えば、ゆらぎバージョンであり得る。
膜標的化配列は、細胞表面膜へのキメラタンパク質の輸送を提供し、ここで、同じ配列または他の配列が、細胞表面膜へのキメラタンパク質の結合をコードし得る。細胞膜と会合した分子は、膜会合を容易にするある特定の領域を含み、そのような領域は、キメラタンパク質分子に組み込まれることにより、膜標的化分子をもたらし得る。例えば、いくつかのタンパク質は、アシル化される配列をN末端またはC末端に含み、これらのアシル部分は、膜会合を容易にする。そのような配列は、アシルトランスフェラーゼによって認識され、特定の配列モチーフに一致することが多い。ある特定のアシル化モチーフは、単一のアシル部分(その後に、陰イオン性脂質頭部基との会合を改善するいくつかの正に帯電した残基(例えば、ヒトc−Src:M−G−S−N−K−S−K−P−K−D−A−S−Q−R−R−R)が続くことが多い)によって修飾されることができ、他のものは、複数のアシル部分によって修飾されることができる。例えば、タンパク質チロシンキナーゼSrcのN末端配列は、単一のミリストイル部分を含み得る。二重アシル化領域は、ある特定のタンパク質キナーゼ(例えば、Srcファミリーメンバーのサブセット(例えば、Yes、Fyn、Lck)およびGタンパク質アルファサブユニット)のN末端領域内に配置されている。そのような二重アシル化領域は、そのようなタンパク質の最初の18アミノ酸の中に配置されることが多く、それは、配列モチーフMet−Gly−Cys−Xaa−Cysに一致し、ここで、Metは、切断され、Glyは、N−アシル化され、Cys残基のうちの1つは、S−アシル化される。Glyは、ミリストイル化されることが多く、Cysは、パルミトイル化され得る。配列モチーフCys−Ala−Ala−Xaa(いわゆる「CAAXボックス」)に一致するアシル化領域は、Gタンパク質ガンマサブユニットのC末端由来のC15またはC10イソプレニル部分によって修飾され得、他のタンパク質(例えば、ワールドワイドウェブアドレスebi.ac.uk/interpro/DisplayIproEntry?ac=IPR001230)もまた使用され得る。これらのおよび他のアシル化モチーフとしては、例えば、Gauthier−Campbellら、Molecular Biology of the Cell 15:2205−2217(2004);Glabatiら、Biochem.J.303:697−700(1994)およびZlakineら、J.Cell Science 110:673−679(1997)において論じられているものが挙げられ、そのモチーフは、膜局在化を誘導するためにキメラ分子に組み込まれ得る。ある特定の実施形態において、アシル化モチーフを含むタンパク質由来の天然の配列が、キメラタンパク質に組み込まれる。例えば、いくつかの実施形態において、Lck、FynもしくはYesまたはGタンパク質アルファサブユニットのN末端部分(例えば、そのようなタンパク質由来の最初の25個のN末端アミノ酸またはそれより少ないアミノ酸(例えば、随意の変異を有する、その天然の配列の約5〜約20アミノ酸、約10〜約19アミノ酸または約15〜約19アミノ酸))が、キメラタンパク質のN末端の中に組み込まれ得る。ある特定の実施形態において、CAAXボックスモチーフ配列を含むGタンパク質ガンマサブユニット由来の約25アミノ酸以下のC末端配列(例えば、随意の変異を有する、天然の配列の約5〜約20アミノ酸、約10〜約18アミノ酸または約15〜約18アミノ酸)が、キメラタンパク質のC末端に連結され得る。
ある特定の実施形態において、発現構築物は、その発現構築物にマーカーを含めることによってその発現がインビトロまたはインビボにおいて識別される核酸構築物を含む。そのようなマーカーは、その発現構築物を含む細胞の容易な識別を可能にする識別可能な変化を細胞にもたらし得る。通常、薬物選択マーカーを含めることが、クローニングおよび形質転換体の選択に役立つ。例えば、ネオマイシン、ピューロマイシン、ハイグロマイシン、DHFR、GPT、ゼオシンおよびヒスチジノールに対する抵抗性を付与する遺伝子は、有用な選択マーカーである。あるいは、単純ヘルペスウイルスのチミジンキナーゼ(tk)などの酵素が使用される。免疫学的表面マーカーを含む細胞外の非シグナル伝達ドメインまたは様々なタンパク質(例えば、CD34、CD19、LNGFR)もまた使用され得、それにより、磁性抗体または蛍光抗体によって媒介される選別のための直接的方法が可能になる。使用される選択マーカーは、遺伝子産物をコードする核酸と同時に発現されることができる限り、重要であると考えられない。選択マーカーのさらなる例としては、例えば、レポーター(例えば、GFP、EGFP、ベータ−galまたはクロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ(CAT))が挙げられる。ある特定の実施形態において、マーカータンパク質、例えば、CD19などは、例えば、免疫磁気選択などにおいて、移入するための細胞の選択のために使用される。
本明細書中のキメラ抗原レセプターは、一回貫通型(single−pass)または複数回貫通型(multiple pass)の膜貫通配列を含み得る(例えば、キメラタンパク質のN末端またはC末端に)。一回貫通型膜貫通領域は、ある特定のCD分子、チロシンキナーゼレセプター、セリン/トレオニンキナーゼレセプター、TGFβ、BMP、アクチビンおよびホスファターゼに見られる。一回貫通型膜貫通領域は、シグナルペプチド領域および約20〜約25アミノ酸(それらの多くは、疎水性アミノ酸であり、アルファヘリックスを形成し得る)の膜貫通領域を含むことが多い。短いトラックの正に帯電したアミノ酸が、タンパク質を膜に繋ぎ止めるために膜貫通の範囲の後に続くことが多い。複数回貫通型タンパク質には、イオンポンプ、イオンチャネルおよびトランスポーターが含まれ、膜を複数回またぐ2つまたはそれを超えるらせんを含む。複数回貫通型タンパク質のすべてまたは実質的にすべてが、時折、キメラタンパク質に組み込まれる。一回貫通型および複数回貫通型膜貫通領域に対する配列は、公知であり、キメラタンパク質分子に組み込むために選択され得る。
1.プロモーター
目的のポリヌクレオチド配列の発現をコントロールするために使用される特定のプロモーターは、標的化された細胞においてそのポリヌクレオチドの発現を指示することができる限り、重要であると考えられない。したがって、ヒト細胞が標的化される場合、ポリヌクレオチド配列コード領域は、例えば、ヒト細胞において発現されることができるプロモーターに隣接しておよびそのプロモーターの支配下に配置され得る。一般的に言えば、そのようなプロモーターは、ヒトプロモーターまたはウイルスプロモーターを含み得る。
エンハンサーは、同じDNA分子上の離れた位置に配置されたプロモーターからの転写を増加させる遺伝的エレメントである。初期の例としては、コード配列に隣接し、かついくつかのイントロンの中に存在する、免疫グロブリンおよびT細胞レセプターに関連するエンハンサーが挙げられる。多くのウイルスプロモーター(例えば、CMV、SV40およびレトロウイルスLTR)は、エンハンサーの活性と密接に関連し、単一エレメントのように扱われることが多い。エンハンサーは、ほぼプロモーターのように組織化される。すなわち、エンハンサーは、多くの個々のエレメントから構成され、その各々が、1つ以上の転写性タンパク質に結合する。エンハンサーとプロモーターとの基本的な区別は、操作上のものである。エンハンサー領域は概して、少し離れて、しばしば向きに関係なく、転写を刺激する;これは、プロモーター領域またはその構成要素エレメントには必ずしも当てはまらない。他方で、プロモーターは、特定の部位において特定の向きでRNA合成の開始を指示する1つ以上のエレメントを有するのに対し、エンハンサーは、これらの特異性を欠く。プロモーターおよびエンハンサーは、しばしば重複し、近接することから、しばしば非常によく似たモジュール構成を有するようである。エンハンサーのサブセットには、転写活性を増加させ得るだけでなく、ゲノムにインテグレートされたとき、隣接する配列から転写性エレメントを(インスレーターエレメントとともに)隔離するのを助け得る、遺伝子座調節領域(LCR)が含まれる。
cDNAインサートが使用される場合、遺伝子転写産物の適切なポリアデニル化をもたらすためにポリアデニル化シグナルを含めることが通常望ましい。ポリアデニル化シグナルの性質は、本方法の実施の成功にとって重大であるとは考えられておらず、任意のそのような配列(例えば、ヒトまたはウシの成長ホルモンおよびSV40のポリアデニル化シグナルならびにLTRポリアデニル化シグナル)が、使用される。1つの非限定的な例は、pCEP3プラスミド(Invitrogen,Carlsbad,California)に存在するSV40ポリアデニル化シグナルである。ターミネーターもまた、発現カセットのエレメントとして企図される。これらのエレメントは、メッセージレベルを高めるため、およびそのカセットから他の配列への読み過ごしを最小限にするために役立ち得る。終止シグナル配列またはポリ(A)シグナル配列は、例えば、mRNAの3’末端における保存配列(AAUAAA)から約11〜30ヌクレオチド下流に位置し得る(Montgomery,D.L.ら、1993.DNA Cell Biol.12:777−83;Kutzler,M.A.,and Weiner,D.B.,2008.Nature Rev.Gen.9:776−88)。
特定の開始シグナルもまた、コード配列の効率的な翻訳に必要とされることがある。これらのシグナルは、ATG開始コドンまたは隣接する配列を含む。ATG開始コドンをはじめとした外来性翻訳調節シグナルが、提供される必要があり得る。開始コドンは、インサート全体の翻訳を確実にするために、所望のコード配列の読み枠とインフレームで配置される。外来性翻訳調節シグナルおよび開始コドンは、天然または合成であり得る。発現の効率は、適切な転写エンハンサーエレメントを含めることによって上昇し得る。
タンパク質産生は、導入遺伝子におけるコドンを最適化することによっても増加され得る。タンパク質産生を増加させるために、種特異的コドンの変更が用いられ得る。また、コドンが最適化されることにより、最適化されたRNAが生成され得、それにより、より効率的な翻訳がもたらされ得る。RNAに組み込まれるコドンを最適化することによって、不安定性を引き起こす二次構造をもたらすエレメント、例えばリボソーム結合を阻害し得るmRNA二次構造、またはmRNAの核外輸送を阻害し得るクリプティック(cryptic)配列などのエレメントが、除去され得る(Kutzler,M.A.,and Weiner,D.B.,2008.Nature Rev.Gen.9:776−88;Yan.,J.ら、2007.Mol.Ther.15:411−21;Cheung,Y.K.ら、2004.Vaccine 23:629−38;Narum.,D.L.ら、2001.69:7250−55;Yadava,A.,and Ockenhouse,C.F.,2003.Infect.Immun.71:4962−69;Smith.,J.M.ら、2004.AIDS Res.Hum.Retroviruses 20:1335−47;Zhou,W.ら、2002.Vet.Microbiol.88:127−51;Wu,X.ら、2004.Biochem.Biophys.Res.Commun.313:89−96;Zhang,W.ら、2006.Biochem.Biophys.Res.Commun.349:69−78;Deml,L.A.ら、2001.J.Virol.75:1099−11001;Schneider,R.M.ら、1997.J.Virol.71:4892−4903;Wang,S.D.ら、2006.Vaccine 24:4531−40;zur Megede,J.ら、2000.J.Virol.74:2628−2635)。例えば、FBP12または他の多量体化領域ポリペプチド、共刺激ポリペプチド細胞質シグナル伝達領域およびCD19配列が、コドンの変更によって最適化され得る。
リーダー配列は、mRNAの安定性を高めるためおよびより効率的な翻訳をもたらすために付加され得る。リーダー配列は、通常、mRNAを小胞体に標的化することに関与する。例としては、自身の切断を遅延させる、HIV−1エンベロープ糖タンパク質(Env)に対するシグナル配列、およびIgE遺伝子リーダー配列が挙げられる(Kutzler,M.A.,and Weiner,D.B.,2008.Nature Rev.Gen.9:776−88;Li,V.ら、2000.Virology 272:417−28;Xu,Z.L.ら、2001.Gene 272:149−56;Malin,A.S.ら、2000.Microbes Infect.2:1677−85;Kutzler,M.A.ら、2005.J.Immunol.175:112−125;Yang.,J.S.ら、2002.Emerg.Infect.Dis.8:1379−84;Kumar.,S.ら、2006.DNA Cell Biol.25:383−92;Wang,S.ら、2006.Vaccine 24:4531−40)。IgEリーダーは、小胞体への挿入を高めるために使用され得る(Tepler,Iら(1989)J.Biol.Chem.264:5912)。
本明細書中で使用される「核酸」は、一般に、核酸塩基を含む、DNA、RNAまたはその誘導体もしくはアナログの分子(1本、2本またはそれより多くの鎖)のことを指す。核酸塩基には、例えば、DNA(例えば、アデニン「A」、グアニン「G」、チミン「T」またはシトシン「C」)またはRNA(例えば、A、G、ウラシル「U」またはC)に見られる天然に存在するプリンまたはピリミジン塩基が含まれる。用語「核酸」は、用語「オリゴヌクレオチド」および「ポリヌクレオチド」を包含し、その各々は、用語「核酸」の亜属として包含される。核酸は、少なくとも、多くとも、または約3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、441、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990もしくは1000ヌクレオチド長、またはこの中の導き出せる任意の範囲の長さであり得る。
下記で論じられる修飾のいずれかが、核酸に適用され得る。修飾の例としては、RNAもしくはDNAの骨格、糖または塩基、およびそれらの様々な組み合わせに対する変更が挙げられる。核酸における任意の好適な数の骨格結合、糖および/または塩基が、修飾され得る(例えば、独立して、約5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、最大100%)。修飾されていないヌクレオシドは、ベータ−D−リボ−フラノースの1’炭素に結合された塩基アデニン、シトシン、グアニン、チミンまたはウラシルのうちのいずれか1つである。
いくつかの実施形態において、例えば、アッセイにおけるコントロールまたは標準物質として、または治療薬として使用するための核酸が、提供される。核酸は、当該分野で公知の任意の手法(例えば、化学合成、酵素的生成または生物学的生成など)によって作製され得る。核酸は、生物学的サンプルから回収され得るかまたは単離され得る。核酸は、組換えであり得るか、または天然であり得るかもしくは細胞にとって内因性であり得る(細胞のゲノムから産生され得る)。生物学的サンプルは、小さい核酸分子の回収率を高めるような方法で処理され得ることが企図される。一般に、方法は、グアニジニウムおよび界面活性剤を有する溶液で細胞を溶解する工程を含み得る。
細胞内での導入遺伝子発現の効果を媒介するために、発現構築物を細胞に移行させる必要があり得る。そのような移行は、ウイルスによる遺伝子移入方法またはウイルスによらない遺伝子移入方法を使用し得る。この項では、遺伝子移入の方法および組成物の考察が提供される。
細胞、例えば、T細胞をトランスフェクトするためもしくは形質導入するため、または本方法のヌクレオチド配列もしくは組成物を投与するために、任意の適切な方法が使用され得る。ある特定の例が、本明細書中に提示され、それらの例としてはさらに、カチオン性ポリマー、脂質様分子およびある特定の市販品、例えば、IN−VIVO−JET PEIなどを使用した送達などの方法が挙げられる。
生物から取り出された血管細胞および血管組織をエキソビボの環境においてトランスフェクトするために、様々な方法が利用可能である。例えば、イヌ内皮細胞は、インビトロにおけるレトロウイルス遺伝子移入によって遺伝的に変更され、イヌに移植された(Wilsonら、Science,244:1344−1346,1989)。別の例では、ユカタンミニブタ内皮細胞を、インビトロにおいてレトロウイルスでトランスフェクトし、ダブルバルーンカテーテルを使用して動脈に移植した(Nabelら、Science,244(4910):1342−1344,1989)。したがって、細胞または組織が、取り出され、本明細書中に提示されるポリヌクレオチドを使用してエキソビボにおいてトランスフェクトされ得ることが企図される。特定の態様において、移植された細胞または組織は、生物の中に配置され得る。例えば、動物由来の樹状細胞が、発現ベクターでその細胞をトランスフェクトし、次いで、トランスフェクトされたまたは形質導入された細胞をその動物に投与して戻す。
ある特定の実施形態において、細胞または核酸ベクターもしくはウイルスベクターは、1つ以上の注射(すなわち、針による注射)、例えば、例えば、皮下、皮内、筋肉内、静脈内、前立腺内(intraprotatic)、腫瘍内、腹腔内(intrintraperitoneal)などを介して、細胞小器官、細胞、組織または生物に送達され得る。注射の方法としては、例えば(foe example)、食塩水溶液を含む組成物の注射が挙げられる。さらなる実施形態は、直接マイクロインジェクションによるポリヌクレオチドの導入を含む。使用される発現ベクターの量は、抗原の性質、ならびに使用される細胞小器官、細胞、組織または生物に応じて変動し得る。
ある特定の実施形態において、ポリヌクレオチドは、エレクトロポレーションを介して細胞小器官、細胞、組織または生物に導入される。エレクトロポレーションは、細胞およびDNAの懸濁液を高圧放電に曝露することを含む。この方法のいくつかの変法では、ある特定の細胞壁分解酵素(例えば、ペクチン分解酵素)を使用して、標的レシピエント細胞を、未処理の細胞よりもエレクトロポレーションによる形質転換に対してより感受性にする(参照により本明細書中に援用される米国特許第5,384,253号)。
他の実施形態では、リン酸カルシウム沈殿を用いて、ポリヌクレオチドが細胞に導入される。この手法を用いて、ヒトKB細胞が、アデノウイルス5DNAでトランスフェクトされた(Graham and van der Eb,(1973)Virology,52,456−467)。また、この様式において、マウスL(A9)、マウスC127、CHO、CV−1、BHK、NIH3T3およびHeLa細胞が、ネオマイシンマーカー遺伝子でトランスフェクトされ(Chen and Okayama,Mol.Cell Biol.,7(8):2745−2752,1987)、ラット肝細胞が、種々のマーカー遺伝子でトランスフェクトされた(Rippeら、Mol.Cell Biol.,10:689−695,1990)。
別の実施形態では、DEAE−デキストランの後にポリエチレングリコールを使用して、ポリヌクレオチドが細胞に送達される。この様式において、レポータープラスミドが、マウス骨髄腫細胞および赤白血病細胞に導入された(Gopal,T.V.,Mol Cell Biol.1985 May;5(5):1188−90)。
さらなる実施形態は、直接音波負荷(direct sonic loading)によるポリヌクレオチドの導入を含む。LTK線維芽細胞が、音波処理負荷によってチミジンキナーゼ遺伝子でトランスフェクトされた(Fechheimerら(1987)Proc.Nat’l Acad.Sci.USA,84,8463−8467)。
さらなる実施形態において、ポリヌクレオチドは、脂質複合体、例えば、リポソームなどの中に閉じ込められ得る。リポソームは、リン脂質二重層膜および内側の水性媒質を特徴とする小胞構造である。多重膜リポソームは、水性媒質によって隔てられた複数の脂質層を有する。それらは、リン脂質が過剰量の水溶液に懸濁されると、自発的に形成する。それらの脂質成分は、自己再配列を起こした後、閉鎖構造を形成し、水および溶解した溶質を脂質二重層の間に閉じ込める(Ghosh and Bachhawat,(1991)In:Liver Diseases,Targeted Diagnosis and Therapy Using Specific Receptors and Ligands.pp.87−104)。Lipofectamine(Gibco BRL)またはSuperfect(Qiagen)と複合体化されたポリヌクレオチドも企図される。
なおもさらに、ポリヌクレオチドは、レセプター媒介性送達ビヒクルを介して標的細胞に送達され得る。これらは、標的細胞において生じているレセプター媒介性エンドサイトーシスによる高分子の選択的取り込みを利用する。様々なレセプターの細胞型特異的分布に照らして、この送達方法は、別の特異性の程度を付加する。
微粒子銃法は、ポリヌクレオチドを少なくとも1つの細胞小器官、細胞、組織または生物に導入するために使用され得る(米国特許第5,550,318号;米国特許第5,538,880号;米国特許第5,610,042号;およびPCT出願WO94/09699;これらの各々は、参照により本明細書中に援用される)。この方法は、DNAでコーティングされた微小発射体が高速度に加速して、それらが細胞膜を貫通し、細胞を殺傷せずにそれらの細胞に入ることを可能にする能力に依存する(Kleinら(1987)Nature,327,70−73)。当該分野で公知の多種多様の微粒子銃法が存在し、それらの多くは、本方法に適用可能である。
被験体内の単数または複数の細胞がヌクレオチド配列によってコードされる遺伝子を発現し得るようにそのヌクレオチド配列またはそのヌクレオチド配列を含む組成物をその細胞またはその被験体に投与するのに適した任意のウイルスベクターが、本方法において使用され得る。ある特定の実施形態において、導入遺伝子は、細胞への遺伝子移入を媒介するウイルス粒子に組み込まれる。代表的には、そのウイルスは、単純に、適切な宿主細胞に生理学的条件下で曝露されることにより、ウイルスの取り込みが可能になり得る。本方法は、下記で論じられるように、種々のウイルスベクターを使用して都合よく使用される。
アデノウイルスは、その中程度のサイズのDNAゲノム、操作の容易性、高力価、広範囲な標的細胞および高感染力を理由に、遺伝子トランスファーベクターとして使用するのに特に適している。およそ36kbのウイルスゲノムは、ウイルスDNAの複製およびパッケージングに必要なシス作用性エレメントを含む100〜200塩基対(bp)の末端逆位配列(ITR)が境を接している。異なる転写単位を含む、ゲノムの初期(E)領域および後期(L)領域は、ウイルスDNA複製の開始によって分割される。
レトロウイルスは、そのRNAを逆転写のプロセスによって感染細胞において二本鎖DNAに変換する能力を特徴とする一本鎖RNAウイルスの群である(Coffin,(1990)In:Virology,ed.,New York:Raven Press,pp.1437−1500)。次いで、得られたDNAは、プロウイルスとして細胞染色体内に安定に組み込み、ウイルスタンパク質の合成を指示する。その組み込みにより、レシピエント細胞およびその子孫においてウイルス遺伝子配列が保持される。レトロウイルスゲノムは、3つの遺伝子、それぞれキャプシドタンパク質、ポリメラーゼ酵素およびエンベロープ成分をコードするgag、polおよびenvを含む。psiと呼ばれる、gag遺伝子から上流に見られる配列は、ゲノムをビリオンにパッケージングするためのシグナルとして機能する。2つの長い末端反復(LTR)配列が、ウイルスゲノムの5’および3’末端に存在する。これらは、強力なプロモーター配列およびエンハンサー配列を含み、宿主細胞ゲノムへの組み込みにも必要である(Coffin,1990)。したがって、例えば、本技術は、例えば、細胞を形質導入するために使用されるポリヌクレオチドがその細胞のゲノムに組み込まれた細胞を含む。
AAVは、約4700塩基対の直鎖状の一本鎖DNAを使用する。末端逆位反復配列は、ゲノムに隣接している。2つの遺伝子が、ゲノム内に存在し、いくつかの異なる遺伝子産物を生じる。第1に、cap遺伝子は、VP−1、VP−2およびVP−3と命名された3つの異なるビリオンタンパク質(VP)を生成する。第2に、rep遺伝子は、4つの非構造タンパク質(NS)をコードする。これらのrep遺伝子産物の1つ以上は、AAV転写のトランス活性化に関与する。
他のウイルスベクターも、本発明の方法および組成物において発現構築物として用いられる。ワクシニアウイルス(Ridgeway,(1988)In:Vectors:A survey of molecular cloning vectors and their uses,pp.467−492;Baichwal and Sugden,(1986)In,Gene Transfer,pp.117−148;Couparら、Gene,68:1−10,1988)カナリアポックスウイルスおよびヘルペスウイルスなどのウイルスに由来するベクターが使用される。これらのウイルスは、様々な哺乳動物細胞への遺伝子移入において使用するためのいくつかの特徴を提供する。
本方法は、疾患を処置するかまたは予防する方法も包含し、ここで、例えば注入による細胞の投与が、有益であり得る。
リガンド誘導物質の投与量および投与スケジュールは、処置される疾患または状態のレベルを決定することによって最適化され得る。例えば、任意の残存している固形腫瘍のサイズ、または標的化される細胞、例えば、患者の中に残存している可能性がある腫瘍細胞またはCD19発現B細胞などのレベルが、決定され得る。
ある特定の実施形態において、生物学的経路、例えば、免疫学的経路、例えば、NF−カッパーB経路、Akt経路および/またはp38経路を活性化するシグナル伝達共刺激ポリペプチドの操作を組み込んだDC活性化ストラテジーが企図される。このDC活性化システムは、APC活性化においてCD4+T細胞を助けるための要件に取って代わるので、免疫応答を増強する標準的なワクチンとともにまたは標準的なワクチンなしで使用され得る(Bennett,S.R.ら、Nature,1998,Jun.4.393:p.478−80;Ridge,J.P.,D.R.F,and P.Nature,1998,Jun.4.393:p.474−8;Schoenberger,S.P.ら、Nature,1998,Jun.4.393:p.480−3)。したがって、本明細書中に提示されるDC活性化システムは、MHCクラスII特異的ペプチドを作製する必要性を回避することによって、免疫応答を増強する。
特定の実施形態において、形質導入された細胞を投与する前に、それらの細胞を抗原(本明細書中では「標的抗原」とも称される)でチャレンジする。チャレンジの後、負荷された形質導入された細胞は、被験体に非経口的に、皮内に、結節内に、またはリンパ内に(intralymphatically)、投与される。さらなる非経口的経路としては、皮下、筋肉内、腹腔内、静脈内、動脈内、心筋内、経心内膜、経心外膜(transepicardial)、鞘内、前立腺内、腫瘍内および注入の手法が挙げられるが、これらに限定されない。
発現は、広く前立腺特異的ではあるが前立腺特異的に限らず、進行型のホルモン不応性疾患において維持される。Israeli RSら、Cancer Res.54:1807−11,1994.前立腺以外の正常な組織における弱い検出が、唾液腺、脳、小腸、十二指腸粘膜、近位尿細管および結腸陰窩の神経内分泌細胞においても見られた。Silver DAら、Clin Cancer Res.3:81−5,1997;Troyer JKら、Int J Cancer.62:552−8,1995.さらに、PSMAは、アンドロゲン枯渇療法(ADT)の後にアップレギュレートされる。Wright GL,Jr.ら、Urology.48:326−34,1996.ほとんどのPSMAは、細胞質タンパク質として発現されるが、選択的スプライシングされた膜貫通型は、新生物前立腺細胞の頂端表面上の優勢型(predominate form)である。Su SLら、Cancer Res.55:1441−3,1995;Israeli RSら、Cancer Res.54:6306−10,1994.
さらに、PSMAは、架橋後に内部移行され、結合した抗体または放射性ヌクレオチドもしくはウイルスおよび他の高分子複合体と複合体化したリガンドを内部移行するために使用されている。Liu Hら、Cancer Res.58:4055−60,1998;Freeman LMら、Q J Nucl Med.46:131−7,2002;Kraaij Rら、Prostate.62:253−9,2005.Banderらは、腫瘍を微小管阻害剤で前処置すると、PSMAの異常な基底面標的化および抗体媒介性の内部移行が増加することを実証した。Christiansen JJら、Mol Cancer Ther.4:704−14,2005.腫瘍の標的化は、前立腺だけでなく腎臓および他の腫瘍の腫瘍血管内皮においてもPSMAの異所性発現が観察されることによって容易になり得る。Liu Hら、Cancer Res.57:3629−34,1997;Chang SSら、Urology.57:801−5,2001;Chang SSら、Clin Cancer Res.5:2674−81,1999.
PSMAは、対応する良性の組織の血管内皮細胞には見られない。de la Taille Aら、Cancer Detect Prev.24:579−88,2000.転移性前立腺疾患の初期の組織学的研究の1つは、約50%(18個中8個)の骨転移(8個中7個のリンパ節転移)だけしかPSMAを発現しなかったことを示唆したが、PSMAの外部ドメインに標的化された、より感度の高い試薬である177Luで放射標識されたMoAb J591は、30人中30人の患者において骨および軟部組織の転移の既知のすべての部位を標的化することができたことから、進行した前立腺疾患におけるほぼ普遍的な発現が示唆される。Bander NHら、J Clin Oncol.23:4591−601,2005.
前立腺特異的抗原、すなわちPSAは、PSA、例えば、PSMAに対して免疫応答、例えば、細胞傷害性Tリンパ球応答を誘導し得、かつ任意の抗PSA抗体によって特異的に認識され得る、任意の抗原を含むと意味される。本方法において使用されるPSAは、従来の方法を用いてアッセイされるとき、細胞を負荷するために使用されることができる。したがって、「前立腺特異的抗原」または「PSA」は、例えば、PSAの野生型アミノ酸配列を有するタンパク質、またはPSAタンパク質の一部を含むポリペプチドのことを指すことがある。
Tリンパ球は、本明細書中で論じられる発現ベクターを含む細胞との接触によって活性化され得、ここで、その細胞は、抗原でチャレンジされているか、トランスフェクトされているか、パルスされているか、または電気融合されている。
臨床適用が企図される場合、薬学的組成物(発現構築物、発現ベクター、融合タンパク質、形質導入された細胞、活性化T細胞、形質導入されたT細胞、および負荷されたT細胞)を、意図される用途にとって適切な形態で調製する必要があり得る。一般に、これは、発熱物質ならびにヒトまたは動物にとって有害であり得る他の不純物を本質的に含まない組成物を調製することを伴い得る。
AP1903 APIは、Alphora Research Inc.によって製造されており、AP1903 Drug Product for Injectionは、Formatech Incによって作製されている。それは、非イオン性可溶化剤Solutol HS 15(250mg/mL,BASF)の25%溶液中のAP1903の5mg/mL溶液として製剤化されている。室温において、この製剤は、わずかに黄色の透明の溶液である。冷蔵されると、この製剤は、可逆的な相転移を起こし、乳白色の溶液になる。この相転移は、室温に再度温めると、元に戻る。1本分は、3mLのガラスバイアルにおける2.33mLである(バイアル1本あたり合計約10mgのAP1903 for Injection)。
1つの例において、患者には、非DEHPで非エチレンオキシドの滅菌された注入セットを使用して、2時間にわたるIV注入によって、単一の固定された用量のAP1903 for Injection(0.4mg/kg)が投与される。AP1903の用量は、すべての患者に対して個別に計算され、体重が≧10%上下しない限り、再計算されない。計算された用量は、注入前に0.9%生理食塩水で100mLに希釈される。
本方法は、病原微生物によって引き起こされる疾患および/または過剰増殖性疾患の処置または予防の方法も包含する。
ある特定の実施形態において、共刺激ポリペプチド(例えば、本明細書中で論じられるもの)を提供することができる発現構築物が、細胞に、および例えばT細胞において提供される。発現ベクターおよびその中に使用される遺伝的エレメントに関する長い考察が、参照によりこの項に援用される。ある特定の例では、発現ベクターは、ウイルスベクター(例えば、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス、ワクシニアウイルスおよびレトロウイルス)であり得る。別の例では、ベクターは、リソソームによって被包された発現ベクターであり得る。
企図される別の治療は、形質導入されたT細胞の投与である。それらのT細胞は、インビトロにおいて形質導入され得る。薬学的に許容され得る組成物としての製剤は、本明細書中で論じられる。
本明細書中に提示される発現ベクターの有効性を高めるために、これらの組成物および方法をその疾患の処置において有効な作用物質と組み合わせることが、望ましい場合がある。
キメラ抗原レセプター(CAR)は、T細胞に抗原特異性を伝えるためにデザインされた人工レセプターである。それらは、T細胞を活性化し、特異免疫をもたらすように選択された、抗原特異的な構成要素、膜貫通の構成要素および細胞内の構成要素を含む。キメラ抗原レセプターを発現しているT細胞は、がん治療をはじめとした様々な治療において使用され得る。
例えば前立腺がんを含む固形腫瘍がんに対する処置は、処置の経過中にIL−6、IL6−sRまたはVCAM−1の濃度を決定することによって、最適化され得る。IL−6とは、インターロイキン6のことを指す。IL−6sRとは、IL−6可溶性レセプターのことを指し、そのレベルは、IL−6のレベルと密接に相関することが多い。VCAM−1とは、血管細胞接着分子のことを指す。種々のステージまたはタイプのがんを有する種々の患者は、様々な治療に対して異なって反応し得る。処置に対する応答は、様々な体液中または組織内のIL−6、IL−6sRまたはVCAM−1の濃度またはレベルを追跡することによってモニターされ得る。IL−6、IL−6sRまたはVCAM−1などのポリペプチドの濃度、レベルまたは量の決定には、完全長ポリペプチドまたはそのフラグメントもしくはバリアントの検出が含まれ得る。そのフラグメントまたはバリアントは、例えば、免疫学的方法、質量分析、核酸ハイブリダイゼーションなどによって検出されるのに十分であり得る。個々の患者に対する処置の最適化は、過量投与の結果としての副作用を回避するのに役立つこともあるし、その処置がいつ無効であるかを判定し、処置の経過を変更するのに役立つこともあるし、いつ用量を増加させ得るかを判定するのに役立つこともある。本明細書中で論じられる技術は、臨床医が生物学的マーカー、例えば、IL−6、IL−6sRまたはVCAM−1を追跡すること、および被験体に投与するための薬物またはワクチンのその後の用量を維持し得るか、減少させ得るかまたは増加させ得るかを判定すること、およびその後の投与のタイミングを決定することを可能にすることによって、固形腫瘍がんを処置するための治療方法を最適化する。
生物学的マーカーの有無または量は、被験体内(例えば、インサイチュ)または被験体外(例えば、エキソビボ)において決定され得る。いくつかの実施形態において、生物学的マーカーの有無または量は、細胞(例えば、分化細胞、幹細胞)において決定され得、ある特定の実施形態では、生物学的マーカーの有無または量は、実質的に無細胞の媒質(例えば、インビトロ)において決定され得る。用語「被験体において生物学的マーカーの有無または量を特定する」は、本明細書中で使用されるとき、生物学的マーカーを評価するため、およびその被験体における有無または量を推測するための当該分野で公知の任意の方法(例えば、インサイチュ、エキソビボにおいてまたはインビトロにおける方法)のことを指す。
1つまたはそれを超える生物学的マーカーの有無または量は、当該分野で公知の任意の好適な方法によって決定され得、非限定的な決定方法は、本明細書中で論じられる。生物学的マーカーの有無または量の決定は、時折、生物学的アッセイの使用を含む。生物学的アッセイにおいて、そのアッセイにおいて検出される1つまたはそれを超えるシグナルは、生物学的マーカーの有無または量に変換され得る。そのアッセイにおいて検出されたシグナルの変換は、例えば、検量線、1つまたはそれを超える標準物質(例えば、内部標準、外部標準)、チャート、シグナルを生物学的マーカーの有無または量に変換するコンピュータプログラムなど、および前述のものの組み合わせの使用を含み得る。
その後の薬物用量を調整することまたは維持することについての指示は、生物学的マーカーの有無に基づき得る。例えば、(i)生物学的マーカーのレベルの低感度の測定が利用可能であるとき、(ii)生物学的マーカーのレベルが、薬物に応答して急激に変化するとき、(iii)低レベルもしくは高レベルの生物学的マーカーが存在するとき、および/または(iv)薬物が、投与のレベルにおいて明らかに有毒でないとき、生物学的マーカーの有無は、その後の薬物用量を調整するかまたは維持する指示を作製するのに十分であり得る。
いくつかの実施形態において、例えば、アッセイにおいてコントロールまたは標準物質として使用するため、または治療薬として使用するために、抗体または小分子が提供される。いくつかの実施形態において、抗体または他の小分子は、サイトカインもしくはサイトカインレセプター(IL−6、IL−6sRを含むがこれらに限定されない)に結合し、そのサイトカインの作用を変化させるように形成されているか、またはVCAM−1に結合するように形成されていることがある。ある特定の実施形態において、抗体または他の小分子は、サイトカインまたはレセプターをコードするmRNAの構造に結合し得る。
for Inducing Selective Apoptosisという表題の米国特許出願番号13/112,739(これらの全体が参照により本明細書中に援用される)に論じられている。
以下の実施例において論じられる研究において用いられた材料および方法が、本明細書中以後、論じられる。
T細胞を、iMCおよび表面マーカー、ΔCD19、CD19の細胞外の部分をコードするバイシストロニックベクター、またはMyD88/CD40シグナル伝達の構成要素を欠くがタンデムのFKBP12v36リガンド結合ドメインを保持しているコントロールベクターで形質導入した(図1aおよび4a)。フローサイトメトリーによって類似の形質導入効率を確認した後(それぞれ77±10%および62±16%のCD3+CD19+)(図5a,b)、形質導入されたT細胞および形質導入されていないT細胞を10nMリミズシドと接触させた;iMCによって改変されたT細胞においてのみ、二量体化によってIFN−γの産生が誘発された(図5c)。重要なことには、iMCの発現は、形質導入されたT細胞の表現型または分化状態を変化させなかった(図5D)。樹状細胞において観察されたように25、リミズシドの滴定は、iMCスイッチの高感度を実証し、ナノモル濃度未満の範囲(EC50=約0.12nM)でT細胞を活性化した(図1b)。MyD88だけまたはCD40だけを発現するさらなるベクター(図4a、6aおよび6b)は、両方の分子が、リミズシド曝露の後に、相乗的に作用することによりT細胞を活性化することを示した(図1c)。
T細胞の活性化をさらに特徴づけるために、マルチプレックスアレイ解析を行うことにより、種々のサイトカインおよびケモカインを測定した(図9aおよび9b)。GM−CSF、TNF−α、IL−5、IL−6、IL−8およびIL−13の分泌は、リミズシドによって誘導されたが、IL−2および他のサイトカインの産生は、アップレギュレートされず、これは、完全なT細胞活性化にはNFATとNF−κBの両方のシグナル伝達が必要であるという仮説19と一致した。このことを調べるために、共刺激されたT細胞を、CD3架橋有りおよび無しで、リミズシドで処理した後、IL−2の産生およびCD25(高親和性IL−2レセプター)の発現を測定した。両方のシグナル(例えば、TCRおよびiMC)によって活性化された、iMC(およびそれほどではないがiM)によって改変されたT細胞だけが、測定可能なIL−2を産生し(図1f)、CD25の発現を増加させた(図1gおよび1h)。これらのデータは、iMCが、T細胞において共刺激シグナルとして機能し得ることを示唆しており、ここで、天然のTCRとiMCとの同時のシグナル伝達が、IL−2の産生およびT細胞増殖の持続に必要とされる。
TCR複合体の主要なシグナル伝達構成要素としては、2本の非共有結合的に連結されたCD3ζ鎖が挙げられ、その各々は、3つの免疫受容活性化チロシンモチーフ(immunoreceptor tyrosine−based activation motif)(ITAM)を含み、その2本のCD3ζ鎖は、シグナル伝達カスケードを惹起してNFATの活性化をもたらすチロシンキナーゼであるζ活性化タンパク質70kDa(ZAP70)に結合する。第1世代CARは、代表的には、タンパク質特異的scFv領域がCD3ζ細胞質領域に結合した状態で構築され、そのscFvによる標的抗原の認識は、天然のTCRシグナル伝達を模倣し、T細胞の活性化および標的細胞の細胞溶解を誘導する。誘導可能なMyD88/CD40が、CD3ζポリペプチド分子を含むキメラ抗原レセプターに共刺激活性を提供し得るかを調べるために、腫瘍関連表面タンパク質である前立腺幹細胞抗原(PSCA)を認識する第1世代CAR28を構築し、それを用いることにより、T細胞をiMCまたはFKBPのみのコントロールベクターと同時形質導入した(図4bおよび5a)。CD3、CD19および抗CAR抗体を用いたフローサイトメトリー解析は、それらのT細胞のおよそ70±21%および58±23%が、それぞれ、CARとコントロールの両方、またはCARとiMCベクターの両方で形質導入されたことを示し(図2b、10aおよび10b)、CARによって改変されたT細胞が、PSCA+腫瘍細胞株(すなわち、Capan−1およびHPAC)に対する細胞傷害性機能を保持したことを示した(図10c)。CAR(腫瘍抗原による)とiMC(リミズシドによる)との同時活性化によって、T細胞の拡大および腫瘍管理の増加がもたらされ得るかを調べるために、GFPによって改変されたPSCA+腫瘍細胞株(Capan−1)に対して共培養アッセイを行った。リミズシドの非存在下において、PSCA.ζおよびコントロールベクターまたはPSCA.ζCARおよびiMCで操作されたT細胞は、形質導入されていないT細胞と比べて有意な腫瘍殺滅を示した;しかしながら、リミズシド添加によるiMCの活性化は、Capan−1−GFPの排除をさらに高めた(図2c)。フローサイトメトリー解析は、リミズシドによって活性化されたCAR+iMC+T細胞の出現頻度の劇的な増加を示した(図2c)。さらに、CARとiMCの両方で改変されたT細胞は、IL−2を産生しただけでなく、CD25の発現をアップレギュレートし、腫瘍抗原とリミズシドの両方の存在下において増殖した(図2dおよび2e)。IL−2の産生に対する必要条件をさらに定義するために、T細胞に、PSCA.ζ有りまたは無しでiMCまたはコントロールベクター(FKBP)を形質導入し(図10d)、網羅的解析を行ったところ、腫瘍抗原の刺激およびリミズシドの活性化が変化した(図2f)。iMCおよびCARだけを形質導入され、腫瘍抗原とリミズシドの両方で刺激されたT細胞だけが、IL−2を産生した。重要なことには、リミズシドによって誘導されるiMCの活性化は、同様に、外来性IL−2またはTCR活性化の非存在下においてCAR T細胞の生存を改善した(図11)ことから、CARおよびiMCを介した同時活性化は、T細胞の応答を増幅し得るが、iMCの活性化のみでは、生存および存続を改善し得ることが示唆される。
腫瘍細胞およびリミズシドによるCARとiMCとの同時活性化が、抗腫瘍有効性の改善に変換されるかを評価するために、免疫不全マウスにおける腫瘍異種移植研究を行った。Capan−1腫瘍細胞を皮下移植されたShorn(「SHrN」無毛NOD.SCID)マウスを、形質導入されていないT細胞またはiMCもしくはコントロールベクターとともにPSCA.ζCARを同時形質導入されたT細胞で2回、静脈内処置した(図3a)。リミズシド(5mg/kg)を、1日目から100日目まで1週間に2回、腹腔内(i.p.)注射によって投与し、外来性IL−2を21日目まで投与した。インビトロ研究によると、iMCおよびPSCA.ζCARを形質導入されたT細胞で処置されたマウスは、形質導入されていないT細胞またはPSCA.ζCARおよびコントロールベクターで形質導入されたT細胞と比べて、有意に改善された腫瘍管理および生存を示した(図3bおよび3c)。iMCの架橋は、T細胞の共刺激をもたらすとみられるので、iMCが第2世代PSCA−CAR(PSCA.28.ζ)におけるCD28の機能(例えば、増殖および生存の増加)に取って代わり得るかを判定するために、iMCを試験した(図4b)。ここで、形質導入されていないT細胞、あるいはFKBPおよびPSCA.ζもしくはPSCA.28.ζまたはiMCおよびPSCA.ζで改変されたT細胞(図12a)を、共培養アッセイにおいて、腫瘍殺滅およびIL−2分泌について調べた。CD28シグナル伝達ドメインを含めることによって、腫瘍殺滅、T細胞増殖およびIL−2産生が改善されたが、これらの特徴は、iMC活性化によってなおもさらに高度に増強された(図12b〜12d)ことから、iMCは、CAR分子内に組み込まれたアクセサリーシグナル伝達ドメインの代わりに、リミズシド依存的共刺激スイッチとして作用し得ることが示唆される。このことをインビボにおいて評価するために、Capan−1腫瘍を有する免疫不全マウスを単回のPSCA.ζ、PSCA.28.ζまたはPSCA.ζおよびiMCによって改変されたT細胞で処置し、次いで、IL−2補充なしで5mg/kgのリミズシドを隔週で投与した(図13a)。PSCA.ζおよびコントロールベクターを発現しているT細胞またはPSCA.28.ζを発現しているT細胞と比べて、PSCA.ζおよびiMCによって改変されたT細胞は、腫瘍量の有意な減少および全体的な生存の改善をもたらした(図13bおよび13c)。これらのデータから、IL−2産生およびおそらく他の因子の増加が、CD28内部ドメインを含むCAR分子によって達成される上記のT細胞の存続および抗腫瘍機能を改善することが示唆される。
リミズシドによって媒介されるiMCの活性化は、CARによって改変されたT細胞に対して成長の利点を提供したので、インビボにおけるT細胞の拡大を、NOD/SCID IL−2Rγ欠損(NSG)マウスにおいて生物発光(BLI)を用いて調べた。形質導入されていないものおよびiMCまたはFKBPを同時形質導入されたPSCA.ζCARに、続いて、EGFP−ホタルルシフェラーゼ融合タンパク質(EGFPluc)をコードするレトロウイルスを形質導入し(図14)、それを、Capan−1腫瘍を有するNSGマウスに注入し、2.5mg/kgリミズシドで1週間に1回(qw)または1週間に2回(biw)処置し、生物発光をイメージングした(図3d)。リミズシドの全身投与によるiMCの活性化によって、iMC活性化を欠くT細胞と比べて、高い腫瘍管理が可能になった(図3e)。インビボイメージングは、リミズシドで処置されたマウスの全身(図3fおよび3g)と皮下腫瘍部位(図3h)の両方において、T細胞のBLIの劇的な増加を示した。これらのデータは、リミズシドを用いたT細胞共刺激の外部管理によって、T細胞の拡大および有効性がインビボにおいて調節できることを示している。
中程度の二量体化剤(dimerizer)非依存的な(「基底」の)NF−κB誘導およびIL−6分泌が、時折、誘導可能なMyD88/CD40キメラ刺激分子を用いたとき観察される。この活性は低いにもかかわらず、アミノ末端のミリストイル化領域を含まない改変されたMyD88/CD40キメラ刺激分子がデザインされた。この改変されたMyD88/CD40キメラ刺激分子は、アミノ末端のミリストイル化領域を含むキメラ刺激分子よりも低いレベルの自発的な二量体化、すなわち、より低い基底活性を有するかを判定するために試験された。
pSFG−iΔMC−2A−aCD19−Q−8stm−CD3ζ(随意のミリストイル化標的化ドメインを伴う)。
本願の誘導可能なキメラポリペプチドを、様々な細胞型において、腫瘍抗原とともに発現させた。形質導入された細胞は、キメラポリペプチドを発現し、免疫応答を誘導したことがケモカインおよびサイトカインの分泌によって実証された。例えばIL−6の発現によって実証されるような免疫応答は、AP1903リガンドの存在下と非存在下の両方において活性化された。細胞株には、ケラチノサイト、メラノサイト(例えば、B16−F10メラノーマ)、マクロファージ(例えば、IC−21)および線維芽細胞(例えば、BLK−CL4)が含まれた。図22は、AP1903と接触した後のキメラポリペプチドの発現が、形質導入された細胞において炎症性サイトカインおよびケモカインの発現を誘導し得るプロセスの模式的な概要を提供している。図23は、形質導入された細胞におけるPSMAの発現およびサイトカインの分泌を測定するために使用されたアッセイの模式図を提供している。それらの細胞は、4つのアデノウイルスAd5ベクター:Ad5−iMC−RP−FL;Ad5−iMC−P2A−P−FL;Ad5f35iMC−RP−FL;またはAd5f35iMC−P2A−FLのうちの1つで形質導入された。図24は、IC−21マクロファージの形質導入の後の結果のグラフを提供しており、IL−6を産生することによるAP1903に対する応答を示している。IC−21マクロファージは、24ウェルプレートにおいて100,000細胞/ml/ウェルで培養された。アデノウイルスを、1000、2000、4000、8000および16000v.p./細胞比で加え、細胞を24時間インキュベートした。その後、100nMのAP1903をすべてのウェルに加え、翌日、細胞および培養上清を回収した。A.細胞を抗ヒトPSMA抗体LNI−17(Biolegend,San Diego,CA)で標識し、PSMAの発現をフローサイトメトリーによって解析した。形質導入されていない細胞と比較したときのPSMA+細胞のパーセンテージが表されている。B.IL−6を、ELISA(e−Bioscience,San Diego,CA)によって培養上清から評価した。図25は、種々のレベルの細胞プレーティングおよび感染効率においてキメラポリペプチドを形質導入されたマクロファージにAP1903を加えた後のIL−6の発現も評価している。IC−21マクロファージは、24ウェルプレートにおいて50,000細胞/ml/ウェルで培養された。アデノウイルスを、6000、12000、18000、24000および30000v.p./細胞比で加え、細胞を24時間インキュベートした。次いで、100nMのAP1903をすべてのウェルに加え、翌日、細胞および培養上清を回収した。A.細胞を抗ヒトPSMA抗体LNI−17(Biolegend,San Diego,CA)で標識し、PSMAの発現をフローサイトメトリーによって解析した。形質導入されていない細胞と比較したときのPSMA+細胞のパーセンテージが表されている。B.IL−6を、ELISA(e−Bioscience,San Diego,CA)によって培養上清から評価した。図26は、形質導入された細胞の活性化がAP1903の添加有りおよび無しで生じたことを実証しているアッセイの結果を提示している。IC−21マクロファージは、6ウェルプレートにおいて300,000細胞/ウェルで培養された。アデノウイルスを、Ad5f35−iMC−RP−FLに対しては24,000v.p./細胞比で、およびAd5−iMC−P2A−P−FLに対しては18000v.p./細胞で加え、細胞を24時間インキュベートした。次いで、100nMのAP1903を加え、6時間後および20時間後に培養上清を回収した。IL−6を、ELISA(e−Bioscience,San Diego,CA)によって培養上清から評価した。
以下のヌクレオチド配列を使用して、Ad5−iMC−P2A−P−FLおよびAd5f35−iMC−P2A−P−FLベクターを構築した。それらのヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列も提供される。
初代T細胞におけるiMCの活性化を試験する実験:
1.293T細胞の一過性のトランスフェクションによってレトロウイルスを生成する:
2.CD3/CD28によって活性化されたT細胞にSFG−MC.Fv1.Fv2.2A.ΔCD19プラスミドベクター(配列はこの実施例および図36に提供されている)を形質導入し、フローサイトメトリーによってCD3+CD19+の発現を調べることによって形質導入効率を測定する。
3.10nM AP1903有りまたは無しでT細胞を活性化し、24、48および72時間後に以下の解析を行う:
a.マルチプレックス解析を用いて、サイトカインおよびケモカインの産生を測定する。
b.CD25、CD69、CD80、CD86ならびにMHCクラスIおよびII抗体を用いて、CD4+およびCD8+T細胞の活性化の表現型を測定する。
c.CFSE希釈および細胞数測定を用いて、増殖を測定する。
d.Alamar blueアッセイおよび細胞数測定アッセイを用いて、外来性IL−2の非存在下における細胞生存を測定する。
4.さらなるマーカー(例えば、CD62LおよびCD45RAおよびCD45RO)を用いて、CD4およびCD8T細胞のメモリーの表現型を調べる。
5.TGFβおよび/またはIL−10を産生するTreg細胞の存在下における、休止T細胞およびiMCによって活性化されたT細胞の耐性を試験する。
1.iMCの架橋は、この実施例において列挙されるT細胞活性化マーカーを用いてアッセイしたとき、T細胞の活性化を駆動し、T細胞増殖を増加させるTh1サイトカイン(例えば、IL−2およびIFNγ)および細胞傷害性を増加させるIFNγの同化を増大する。2.T細胞は、iMCの架橋によって活性化され、アポトーシスの変化は、ほとんどまたは全く無い。
3.メモリーの表現型(phonotype)の増加ならびにTreg細胞の阻害作用に対するCD4+およびCD8+T細胞の耐性の増大が観察される。
細胞株
がん細胞株LNCaP、PC3、DU145およびA549、ならびにヒト胎児腎細胞株HEK−293Tを、American Type Culture Collection(Rockville,MD)から入手する。細胞を、37℃における5%二酸化炭素(CO2)を含む加湿雰囲気において、10%ウシ胎児血清(Hyclone,Waltham,MA)および2mM L−グルタミンを含む完全IMDM(Sigma,St Louis,MO)中で維持する。形質導入されたT細胞およびPHA芽球を、100U/ml IL−2(Cellgenix)が補充されたCellgenix DC(Cellgenix)培地中で維持する。
拡大および形質導入のためのT細胞の活性化は、可溶性αCD3およびαCD28(Miltenyi Biotec,Auburn,CA)を使用して行われる。PBMCを、100U/ml IL−2(Cellgenix)が補充されたCellgenix DC培地に、1×106細胞/mlで再懸濁し、0.2μg/ml αCD3および0.5μg/ml αCD28可溶性抗体で刺激する。次いで、細胞を37℃、5%CO2において4日間培養する。4日目に、IL−2を含む1mlの新鮮培地を加える。7日目に、形質導入に向けて、細胞を収集し、Cellgenix DC培地に再懸濁する。
誘導可能なキメラポリペプチドの構築物は、Blue Heron Bio(Bothell,WA)によって合成され、模式図が図36に示されている。そのキメラポリペプチドの発現、ならびに炎症性サイトカインおよびケモカインの発現および分泌の評価を、これらの導入遺伝子をコードするレトロウイルスまたはレンチウイルスをT細胞に個別にまたは同時に形質導入することによって行う。
レトロウイルスの一過性の生成のために、GeneJuiceトランスフェクション試薬(Novagen,Madison,WI)を使用して、gag−polおよびRD114エンベロープをコードするプラスミドとともに、キメラポリペプチド構築物で293T細胞をトランスフェクトする。トランスフェクションの48〜72時間後にウイルスを収集し、急速凍結し、使用するまで約80℃で保存する。レンチウイルスの一過性の生成のために、GeneJuiceを使用して、プラスミドpLP1(gag/pol)、pLP2(rev)およびpLP/VSVG(VSVG env)とともに、上記構築物で293T細胞をトランスフェクトする。トランスフェクションの48〜72時間後にウイルスを収集し、急速凍結し、使用するまで約80℃で保存する。大規模なレトロウイルスの生成のために、一過性VSV−Gシュードタイプ化レトロウイルス上清を用いた複数回の形質導入によって、安定なFLYRD18由来レトロウイルス産生株を作製する。導入遺伝子発現が最も高いFLYRD18細胞を、単一細胞ソーティングし、最も高いウイルス力価をもたらすクローンを拡大し、リンパ球形質導入のためのウイルスを作製するために使用する。このクローンの導入遺伝子発現、機能およびレトロウイルス力価は、8週間超にわたる連続培養中、維持される。組織培養用の処理が行われていない24ウェルプレートを、37℃において1時間または4℃において一晩、7μg/ml Retronectin(TakaraBio,Otsu,Shiga,Japan)でコーティングする。それらのウェルを、リン酸緩衝食塩水(PBS)で洗浄し、次いで、37℃において30分間、プレートを1.5mlの上清とともにインキュベートすることによって、レトロウイルス上清でコーティングする。続いて、T細胞芽球を、100U/ml IL−2が補充されたウイルス上清において1ウェルあたり5×105細胞でプレーティングする。60時間にわたって形質導入を行う。形質導入後、細胞を収集し、フローサイトメトリーによってCD19またはGFPの発現について表現型分析を行う。
形質導入された各T細胞株の細胞傷害活性は、例えば、以前に提示されたような標準的な4時間の51Cr放出アッセイにおいて評価され得る。T細胞に上記レトロウイルスまたはレンチウイルスを形質導入し、それを、フィトヘマグルチニン(PHA)によって刺激された自家リンパ球(PHA芽球)、LNCaP、PC3またはDU145およびA549がん細胞株、ならびにヒトPSMAを発現するトランスジェニックA549(A549−PSMA)を含む、Cr51で標識された標的細胞と比較する。完全培地または1%Triton X−100(Sigma,St Louis,MO)中でインキュベートされた標的細胞をそれぞれ自発的なおよび最大の51Cr放出を決定するために使用する。3つ組ウェルの特異的溶解の平均パーセンテージを、100×(実験による放出−自発的な放出)/(最大放出−自発的な放出)として計算した。クロム放出アッセイに加えて、共培養実験を行う。ここでは、細胞株LNCaP、PC3、DU145、A549およびA549−PSMAを、蛍光性mOrangeを発現するように形質導入し、標的細胞として使用する。mOrangeを発現している腫瘍細胞を、完全培地中、IL−2(50U/ml)の存在下において、形質導入されていないT細胞または改変されたT細胞とともに、腫瘍細胞とT細胞とが1:10という比で共培養する。24時間後、T細胞を100nM AP1903で刺激する。72時間後、細胞を捕集し、カウントし、T細胞を検出するためにCD3で標識し、mOrange腫瘍細胞のパーセンテージをフローサイトメトリー(LSRII;BD)によって解析する。
形質導入されたT細胞の細胞表面の表現型を、以下のモノクローナル抗体を使用して調べる:CD3、CD4、CD8、CD19、CD25、CD27、CD28、CD44、CD45RA、CD45RO、CD62L、CD80、CD83、CD86、CD127、CD134、CD137、HLA−ABCおよびHLA−DR。100nM AP903を用いておよび用いずに、表現型分析を行う。適切なアイソタイプマッチコントロールを各実験において使用し、LSRIIフローサイトメーター(BD)を用いて細胞を解析する。抗F(ab’)2(Jackson ImmunoResearch Laboratories,West Grove,PA)を使用して、キメラポリペプチドの発現を評価する。
100nM AP1903による刺激の前および後(24時間)のT細胞培養上清中のインターフェロン−γ(IFN−γ)、IL−2、IL−4、IL−5、IL−10および腫瘍壊死因子−α(TNFα)の濃度を、ヒトTh1/Th2サイトカインサイトメトリビーズアレイ(BD Pharmingen)を使用して測定する。培養上清中の誘導されたサイトカイン産生を、製造者の指示書に従って酵素結合免疫吸着測定法(ELISA;R&D Systems,Minneapolis,MN)によって検証する。
AP1903によって誘導される活性化の増殖効果を、AP1903に曝露した後の、形質導入されたT細胞および形質導入されていないT細胞の細胞成長を測定することによって評価する。T細胞を、37℃において10分間、10μMカルボキシフルオレセインジアセテート、スクシンイミジルエステル(CFSE)で標識する。インキュベーション後、細胞をPBS中で洗浄し、次いで、Cellgenix DC培地に再懸濁する。その後、1×106個のCFSEで標識された改変T細胞または形質導入されていないT細胞を、Cellgenix DC培地のみにおいて培養するか、または100nM AP1903で刺激する。5日後、細胞を収集し、CD3−PerCP.Cy5.5およびCD19−PEで標識し、CFSE希釈についてフローサイトメトリーによって解析する。
インビボにおける腫瘍サイズに対する活性化T細胞の効果は、例えば以下のとおりアッセイされ得る。6〜8週齢の非肥満糖尿病重症複合免疫不全(NOD/SCID)マウスに照射し(250rad)、Matrigel(BD Bioscience)に再懸濁された10×106〜15×106個のLNCaP腫瘍細胞を、そのマウスの右側腹部の皮下に注射する。2週間後、直径がおよそ0.5cmの腫瘍を有するマウスの尾静脈に、形質導入されていないT細胞または形質導入されたT細胞(合計15×106個)を注射する。それらのマウスを、ランダムに2群に分ける:T細胞を拡大するために、1群には、CID(50μg AP1903、腹腔内、1週間に2回)を投与し、もう1群には、キャリアのみ(16.7%プロパンジオール、22.5%PEG400および1.25%Tween80、腹腔内、1週間に2回)を投与する。21日間にわたるノギス測定によって、腫瘍の成長についてマウスを評価する。末梢血サンプルを、7、14および21日目に後眼窩出血によって採取することにより、ヒトCD3/ヒトCD19発現T細胞に対するフローサイトメトリー解析を用いて、形質導入されたT細胞またはコントロールT細胞の残留および拡大を測定する。
8931bp ds−DNA
/note=“MMLV Psi”
/note=“モロニーマウス白血病ウイルス(MMLV)のパッケージングシグナル”
CDS 1226..3802
/codon_start=1
/note=“iMC−2A−デルタ−CD19”
/translation=”
/note=“Myr”
misc_feature 1268..1273
/note=“XhoI”
misc_feature 1274..1789
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/note=“SalI”
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/note=“L1”
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misc_feature 2327..2647
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misc_feature 2648..2665
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misc_feature 2666
/note=“SalI”
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/note=“SalI”
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/note=“フューリン”
misc_feature 2684..2725
/product=“サルウイルス5由来のエピトープタグ”
/note=“V5タグ”
misc_feature 2726..2794
/note=“L−2A”
misc_feature 2795..2800
/note=“MluI”
misc_feature 2801..3802
/note=“dCD19”
misc_feature 3962..4551
/note=“LTR”
primer_bind complement(5250..5266)
/note=“M13 fwd”
/note=“共通のシークエンシングプライマー、複数の類似のバリアントのうちの1つ”
promoter 5741..5845
/gene=“bla”
/note=“AmpRプロモーター”
CDS 5846..6706
/codon_start=1
/gene=“bla”
/product=“ベータ−ラクタマーゼ”
/note=“AmpR”
/note=“アンピシリン、カルベニシリンおよび関連する抗生物質に対する耐性を付与する”
/translation=”
/direction=RIGHT
/note=“ori”
/note=“高コピー数colE1/pMB1/pBR322/pUC複製起点”
promoter 7789..7819
/note=“lacプロモーター”
/note=“大腸菌のlacオペロンに対するプロモーター”
protein_bind 7827..7843
/bound_ moiety=“lacIによってコードされるlacリプレッサー”
/note=“lacオペレーター”
/note=“このlacリプレッサーは、lacオペレーターに結合して、大腸菌における転写を阻害する。この阻害は、ラクトースまたはイソプロピル−ベータ−D−チオガラクトピラノシド(IPTG)を加えることによって軽減され得る”
primer _bind7851..7867
/note=“M13 rev”
/note=“共通のシークエンシングプライマー、複数の類似のバリアントのうちの1つ”
LTR 8276..8869
/note=“モロニーマウス白血病ウイルス由来の長い末端反復配列”
ORIGIN
ヒトを治療するために、改変されたT細胞を使用する方法が、この実施例に提示される。これらの方法は、他の非T細胞にも適用され得る。
遺伝子改変されたT細胞の大規模産生
T細胞は、標準的な方法を用いて健常志願者から作製される。簡潔には、健常ドナーまたはがん患者由来の末梢血単核球(PBMC)を、可溶性αCD3およびαCD28(Miltenyi Biotec,Auburn,CA)を使用して、拡大および形質導入のために活性化する。PBMCを、100U/ml IL−2(Cellgenix)が補充されたCellgenix DC培地に、1×106細胞/mlで再懸濁し、0.2μg/ml αCD3および0.5μg/ml αCD28可溶性抗体で刺激する。次いで、細胞を37℃、5%CO2において4日間培養する。4日目に、IL−2を含む1mlの新鮮培地を加える。7日目に、形質導入に向けて、細胞を収集し、Cellgenix DC培地に再懸濁する。
SFGベースのプラスミドは、自己切断可能な2A様配列を介して、細胞質シグナル伝達ドメインを欠く切断型ヒトCD19に連結された誘導可能なキメラポリペプチドからなる。1つの反復(interation)において、その誘導可能なキメラポリペプチドは、F36V変異を有し、短いVal−Gluリンカーを介してヒトキメラポリペプチドに接続された、ヒトFK506結合タンパク質(FKBP12;GenBank AH002818)からなる。そのF36V変異は、合成ホモ二量体化剤(homodimerizer)AP20187またはAP1903に対するFKBP12の結合親和性を高める。その2A様配列は、Thosea asigna昆虫ウイルス由来の20アミノ酸ペプチドをコードし、それは、グリシンと末端プロリン残基との間での>99%の切断を媒介して、誘導可能なキメラポリペプチドのC末端に19個の追加のアミノ酸およびCD19のN末端に1つの追加のプロリン残基をもたらす。CD19は、細胞質内ドメインを242アミノ酸から19アミノ酸に短縮し、リン酸化に対する潜在的な部位である保存されたすべてのチロシン残基を除去する、アミノ酸333(TDPTRRF)で切断される、完全長CD19(GenBank NM001770)からなる。
T細胞の活性化および拡大のための培養液は、100U/ml IL−2(Cellgenix)が補充された無血清Cellgenix DC培地(Cellgenix)である。レトロウイルスベクターで形質導入する前の7日間にわたって、T細胞を可溶性抗CD3および抗CD28(Miltenyi Biotec)によって活性化する。必要であれば、ΔCD19の免疫磁気選択を形質導入後の4日目に行い;陽性画分をさらに2日間にわたって拡大し、凍結保存する。
臨床適用のための形質導入プロセスのスケールアップでは、10mlの抗CD3 0.5μg/mlおよび抗CD28 0.2μg/mlまたは10mlのフィブロネクチン7μg/mlで4℃において一晩コーティングされた、組織培養用に処理されていないT75フラスコ(Nunc,Rochester,NY)を使用する。高細胞粘着性のためにコロナ処理されたフッ化エチレンプロピレンバッグ(2PF−0072AC,American Fluoroseal Corporation,Gaithersburg,MD)も使用する。PBMCを、抗CD3、抗CD28によってコーティングされたフラスコに、100U/ml IL−2が補充された培地中、1×106細胞/mlで播種する。レトロウイルス形質導入に向けて、レトロネクチンでコーティングされたフラスコまたはバッグを、10mlのレトロウイルス含有上清で2〜3時間、一度負荷する。活性化T細胞を、レトロウイルスベクター含有新鮮培地と100U/ml IL−2が補充されたT細胞培養液とが3:1の中に1×106細胞/mlで播種する。細胞を、翌朝収集し、組織培養用に処理されたT75またはT175フラスコ内、100U/ml IL−2が補充された培養液中で、約5×105細胞/ml〜8×105細胞/mlの播種密度で拡大する。
CD19に対する免疫磁気選択は、1つの例において、形質導入の4日後に行われ得る。細胞を、モノクローナルマウス抗ヒトCD19抗体(Miltenyi Biotech,Auburn,CA)に結合体化された常磁性マイクロビーズで標識し、小規模実験ではMSまたはLSカラムにおいて、および大規模実験ではCliniMacs Plus自動選択デバイスにおいて、選択する。CD19によって選択された細胞を、さらに4日間拡大し、形質導入後の8日目に凍結保存する。これらの細胞は、「遺伝子改変細胞」と称される。
フローサイトメトリー解析(FACSCaliburおよびCellQuestソフトウェア;Becton Dickinson)を、以下の抗体を使用して行う:CD3、CD4、CD8、CD19、CD25、CD27、CD28、CD45RA、CD45RO、CD56およびCD62L。CD19−PE(クローン4G7;Becton Dickinson)は、最適な染色をもたらすと見出されており、その後のすべての解析において使用された。形質導入されていないコントロールを、CD19に対するネガティブゲートを設定するために使用する。
対応のある両側スチューデントt検定を使用して、サンプル間の差の統計的有意性を判定する。すべてのデータを平均値±1標準偏差として表す。
ベクターの構築および発現の確認
ヒトFK506結合タンパク質(FKBP)、例えば、FKBP12v36(Fv)に融合されたシグナル伝達分子をコードする、治療薬としての使用に適した発現ベクターを構築する。これらの方法は、1つまたはそれを超える誘導可能なシグナル伝達分子を発現させるためにも使用され得る。誘導可能なCSMは、小分子医薬を使用して二量体化(または多量体化)され得る。誘導可能なCSMをコードする核酸を、リガンド結合ドメインをコードする核酸に融合し、蛍光マーカーであるGFPの発現も可能にする、SFGレトロウイルスベクターまたはpLenti7.3レンチウイルスベクターに挿入する。
細胞株
がん細胞株LNCaP、PC3、DU145およびA549、ならびにヒト胎児腎細胞株HEK−293Tを、American Type Culture Collection(Rockville,MD)から入手する。細胞を、37℃における5%二酸化炭素(CO2)を含む加湿雰囲気において、10%ウシ胎児血清(Hyclone,Waltham,MA)および2mM L−グルタミンを含む完全IMDM(Sigma,St Louis,MO)中で維持する。形質導入されたT細胞およびPHA芽球を、100U/ml IL−2(Cellgenix)が補充されたCellgenix DC(Cellgenix)培地中で維持する。
拡大および形質導入のためのT細胞の活性化は、可溶性αCD3およびαCD28(Miltenyi Biotec,Auburn,CA)を使用して行われる。PBMCを、100U/ml IL−2(Cellgenix)が補充されたCellgenix DC培地に、1×106細胞/mlで再懸濁し、0.2μg/ml αCD3および0.5μg/ml αCD28可溶性抗体で刺激する。次いで、細胞を37℃、5%CO2において4日間培養する。4日目に、IL−2を含む1mlの新鮮培地を加える。7日目に、形質導入に向けて、細胞を収集し、Cellgenix DC培地に再懸濁する。
PSMA、PSCA、MUC1およびHer2/Neuを標的化するコドン最適化された一本鎖可変フラグメントで構成される誘導可能なCSM(iCSM)およびCAR−CD3ゼータ構築物は、Blue Heron Bio(Bothell,WA)によって合成される。iCSM構築物は、T細胞レセプターのCD28、4−1BBおよびCD3ゼータ鎖を含む共刺激内部ドメインにインフレームで連結されたFKBP12v36ドメインからなる。CAR構築物は、ヒトIgG1−Ch2Ch3ドメインおよびCD3−ゼータ鎖をインフレームで含むscFvフラグメントをクローニングすることによって作製される。iCSM構築物とCAR−CD3ゼータ構築物の両方を、エメラルドGFPを共発現する、SFGレトロウイルス骨格またはpLenti7.3レンチウイルス骨格(Invitrogen)にサブクローニングする。iCSMの刺激作用および共刺激作用、ならびにCAR−CD3ゼータの細胞傷害性の評価を、これらの導入遺伝子をコードするレトロウイルスまたはレンチウイルスでT細胞を個別にまたは同時に形質導入することによって行う。
レトロウイルスの一過性の生成のために、GeneJuiceトランスフェクション試薬(Novagen,Madison,WI)を使用して、gag−polおよびRD114エンベロープをコードするプラスミドとともに、iCSM構築物で293T細胞をトランスフェクトする。トランスフェクションの48〜72時間後にウイルスを収集し、急速凍結し、使用するまで−80℃で保存する。レンチウイルスの一過性の生成のために、GeneJuiceを使用して、プラスミドpLP1(gag/pol)、pLP2(rev)およびpLP/VSVG(VSVG env)とともに、iCAR構築物で293T細胞をトランスフェクトする。トランスフェクションの48〜72時間後にウイルスを収集し、急速凍結し、使用するまで−80℃で保存する。大規模なレトロウイルスの生成のために、一過性VSV−Gシュードタイプ化レトロウイルス上清を用いた複数回の形質導入によって、安定なFLYRD18由来レトロウイルス産生株を作製する。導入遺伝子発現が最も高いFLYRD18細胞を、単一細胞ソーティングし、最も高いウイルス力価をもたらすクローンを拡大し、リンパ球形質導入のためのウイルスを作製するために使用する。このクローンの導入遺伝子発現、機能およびレトロウイルス力価を、8週間超にわたる連続培養中、維持する。組織培養用の処理が行われていない24ウェルプレートを、37℃において1時間または4℃において一晩、7μg/ml Retronectin(TakaraBio,Otsu,Shiga,Japan)でコーティングする。それらのウェルを、リン酸緩衝食塩水(PBS)で洗浄し、次いで、37℃において30分間、プレートを1.5mlの上清とともにインキュベートすることによって、レトロウイルス上清でコーティングする。続いて、T細胞芽球を、100U/ml IL−2が補充されたウイルス上清において1ウェルあたり5×105細胞でプレーティングする。60時間にわたって形質導入を行う。形質導入後、細胞を収集し、フローサイトメトリーによってCD19またはGFPの発現について表現型分析を行う。
形質導入された各T細胞株の細胞傷害活性を、先に提示されたような、標準的な4時間の51Cr放出アッセイにおいて評価する。iCSM、PSMA CAR−CD3ゼータ、またはiCSMウイルスとCARウイルスの両方で形質導入されたT細胞を、フィトヘマグルチニン(PHA)によって刺激された自家リンパ球(PHA芽球)、LNCaP、PC3またはDU145およびA549癌細胞株、ならびにヒトPSMAを発現するトランスジェニックA549(A549−PSMA)を含む、Cr51で標識された標的細胞に対して比較する。完全培地または1%Triton X−100(Sigma,St
Louis,MO)中でインキュベートされた標的細胞をそれぞれ自発的なおよび最大の51Cr放出を決定するために使用する。3つ組ウェルの特異的溶解の平均パーセンテージを、100×(実験による放出−自発的な放出)/(最大放出−自発的な放出)として計算した。クロム放出アッセイに加えて、共培養実験を行う。ここでは、細胞株LNCaP、PC3、DU145、A549およびA549−PSMAを、蛍光性mOrangeを発現するように形質導入し、標的細胞として使用する。mOrangeを発現している腫瘍細胞を、完全培地中、IL−2(50U/ml)の存在下において、形質導入されていないT細胞またはCARによって改変されたT細胞とともに、腫瘍細胞とT細胞とが1:10という比で共培養する。24時間後、iCARを有するT細胞を100nM AP1903で刺激する。72時間後、細胞を捕集し、カウントし、T細胞を検出するためにCD3で標識し、mOrange腫瘍細胞のパーセンテージをフローサイトメトリー(LSRII;BD)によって解析する。
iCARを形質導入されたT細胞の細胞表面の表現型を、以下のモノクローナル抗体を使用して調べる:CD3、CD4、CD8、CD19、CD25、CD27、CD28、CD44、CD45RA、CD45RO、CD62L、CD80、CD83、CD86、CD127、CD134、CD137、HLA−ABCおよびHLA−DR。iCSM刺激剤として10〜100nM AP1903を用いておよび用いずに、表現型分析を行う。適切なアイソタイプマッチコントロールを各実験において使用し、LSRIIフローサイトメーター(BD)を用いて細胞を解析する。抗F(ab’)2(Jackson ImmunoResearch Laboratories,West Grove,PA)を使用して、CARの発現を評価した。
100nM AP1903による刺激の前および後(24時間)のT細胞培養上清中のインターフェロン−γ(IFN−γ)、IL−2、IL−4、IL−5、IL−10および腫瘍壊死因子−α(TNFα)の濃度を、ヒトTh1/Th2サイトカインサイトメトリビーズアレイ(BD Pharmingen)を使用して計測する。培養上清中の誘導されたサイトカイン産生を、製造者の指示書に従って酵素結合免疫吸着測定法(ELISA;R&D Systems,Minneapolis,MN)によって検証する。
iCSMを介したAP1903誘導性シグナル伝達の増殖効果を、AP1903に曝露した後の、形質導入されたT細胞および形質導入されていないT細胞の細胞成長を計測することによって評価する。T細胞を、37℃において10分間、10μMカルボキシフルオレセインジアセテート、スクシンイミジルエステル(CFSE)で標識する。インキュベーション後、細胞をPBS中で洗浄し、次いで、Cellgenix DC培地に再懸濁する。その後、1×106個のCFSEで標識されたiCSM改変T細胞または形質導入されていないT細胞を、Cellgenix DC培地のみにおいて培養するか、または100nM AP1903で刺激する。5日後、細胞を収集し、CD3−PerCP.Cy5.5およびCD19−PEで標識し、CFSE希釈についてフローサイトメトリーによって解析する。
6〜8週齢の非肥満糖尿病重症複合免疫不全(NOD/SCID)マウスを照射し(250rad)、Matrigel(BD Bioscience)に再懸濁された10×106〜15×106個のLNCaP腫瘍細胞を、そのマウスの右側腹部の皮下に注射する。2週間後、直径がおよそ0.5cmの腫瘍を有するマウスの尾静脈に、形質導入されていないT細胞またはiCSM/CARを形質導入されたT細胞(合計15×106個)を注射した。それらのマウスを、ランダムに2群に分ける:T細胞を拡大するために、1群には、CID(50〜125μg AP1903、腹腔内、1週間に2回)を投与し、もう1群には、キャリアのみ(16.7%プロパンジオール、22.5%PEG400および1.25%Tween80、腹腔内、1週間に2回)を投与する。21日間にわたるノギス計測によって、腫瘍の成長についてマウスを評価する。末梢血サンプルを、7、14および21日目に後眼窩出血によって採取することにより、ヒトCD3/ヒトCD19発現T細胞に対するフローサイトメトリー解析を用いて、iCSMまたはコントロールT細胞の残留および拡大を計測する。
誘導可能なCSMの発現が、T細胞の特色を変化させないことを確実にするために、形質導入されていないまたは非機能性の誘導可能なCAR(PSMA CAR−CD3ゼータのみ)の表現型、抗原特異性、増殖能および機能を、iCSM/CARを形質導入されたT細胞と比較する。形質導入された細胞および形質導入されていない細胞におけるCD4+、CD8+、CD56+およびTCRα/β+細胞の数を比較し、IFN−γ、TNFα、IL−10、IL−4、IL−5およびIL−2を含むサイトカインの産生産生も同様に比較する。指数関数的に増えるCTLの成長の特色、ならびに増殖に対する抗原およびIL−2への依存性を評価し、抗原刺激の際のタイプTH1およびTH2サイトカインの表現型データおよび分泌データも同様に評価する。
発現構築物、およびヒト細胞においてその発現構築物を使用する方法が、この実施例に提示される。
遺伝子改変されたT細胞の大規模産生
T細胞は、標準的な方法を用いて健常志願者から作製される。簡潔には、健常ドナーまたはがん患者由来の末梢血単核球(PBMC)を、可溶性αCD3およびαCD28(Miltenyi Biotec,Auburn,CA)を使用して、拡大および形質導入のために活性化する。PBMCを、100U/ml IL−2(Cellgenix)が補充されたCellgenix DC培地に、1×106細胞/mlで再懸濁し、0.2μg/ml αCD3および0.5μg/ml αCD28可溶性抗体で刺激する。次いで、細胞を37℃、5%CO2において4日間培養する。4日目に、IL−2を含む1mlの新鮮培地を加える。7日目に、形質導入に向けて、細胞を収集し、Cellgenix DC培地に再懸濁する。
SFGプラスミドは、切断可能な2A様配列を介して切断型ヒトCD19に連結された誘導可能なCSMからなる。その誘導可能なCSMは、F36V変異を有し、Ser−Gly−Gly−Gly−Serリンカーを介してヒトCSMに接続された、ヒトFK506結合タンパク質(FKBP12;GenBank AH002818)からなる。そのF36V変異は、合成ホモ二量体化剤(homodimerizer)AP20187またはAP1903に対するFKBP12の結合親和性を高める。その2A様配列は、Thosea asigna昆虫ウイルス由来の20アミノ酸ペプチドをコードし、それは、グリシンと末端プロリン残基との間での>95%の切断を媒介して、iCSMのC末端に19個の追加のアミノ酸およびCD19のN末端に1つの追加のプロリン残基をもたらす。CD19は、細胞質内ドメインを242アミノ酸から19アミノ酸に短縮し、リン酸化に対する潜在的な部位である保存されたすべてのチロシン残基を除去する、アミノ酸333(TDPTRRF)で切断される、完全長CD19(GenBank NM001770)からなる。
T細胞の活性化および拡大のための培養液は、100U/ml IL−2(Cellgenix)が補充された無血清Cellgenix DC培地(Cellgenix)である。レトロウイルスベクターで形質導入する前の7日間にわたって、T細胞を可溶性抗CD3および抗CD28(Miltenyi Biotec)によって活性化する。必要であれば、ΔCD19の免疫磁気選択を形質導入後の4日目に行い;陽性画分をさらに2日間にわたって拡大し、凍結保存した。
臨床適用のための形質導入プロセスのスケールアップでは、10mlの抗CD3 0.5μg/mlおよび抗CD28 0.2μg/mlまたは10mlのフィブロネクチン7μg/mlで4℃において一晩コーティングされた、組織培養用に処理されていないT75フラスコ(Nunc,Rochester,NY)を使用する。高細胞粘着性のためにコロナ処理されたフッ化エチレンプロピレンバッグ(2PF−0072AC,American Fluoroseal Corporation,Gaithersburg,MD)も使用する。PBMCを、抗CD3、抗CD28によってコーティングされたフラスコに、100U/ml IL−2が補充された培地中、1×106細胞/mlで播種する。レトロウイルス形質導入に向けて、レトロネクチンでコーティングされたフラスコまたはバッグを、10mlのレトロウイルス含有上清で2〜3時間、一度負荷する。活性化T細胞を、レトロウイルスベクター含有新鮮培地と100U/ml IL−2が補充されたT細胞培養液とが3:1の比の中に1×106細胞/mlで播種する。細胞を、翌朝収集し、組織培養用に処理されたT75またはT175フラスコ内、100U/ml IL−2が補充された培養液中で、約5×105細胞/ml〜8×105細胞/mlの播種密度で拡大する。
CD19に対する免疫磁気選択は、例えば、形質導入の4日後に行われ得る。細胞を、モノクローナルマウス抗ヒトCD19抗体(Miltenyi Biotech,Auburn,CA)に結合体化された常磁性マイクロビーズで標識し、小規模実験ではMSまたはLSカラムにおいて、および大規模実験ではCliniMacs Plus自動選択デバイスにおいて、選択する。CD19によって選択された細胞を、さらに4日間拡大し、形質導入後の8日目に凍結保存する。これらの細胞は、「遺伝子改変細胞」と称される。
フローサイトメトリー解析(FACSCaliburおよびCellQuestソフトウェア;Becton Dickinson)を、以下の抗体を使用して行う:CD3、CD4、CD8、CD19、CD25、CD27、CD28、CD45RA、CD45RO、CD56およびCD62L。CD19−PE(クローン4G7;Becton Dickinson)は、最適な染色をもたらすと見出されており、その後のすべての解析において使用された。形質導入されていないコントロールを、CD19に対するネガティブゲートを設定するために使用する。CAR発現を、抗F(ab’)2(Jackson ImmunoResearch Laboratories,West Grove,PA)を使用して評価する。
対応のある両側スチューデントt検定を使用して、サンプル間の差の統計的有意性を判定する。すべてのデータを平均値±1標準偏差として表す。
目的:2つのFKBPv36分子に連結されたシグナル伝達分子をコードするレトロウイルスベクターで初代T細胞を形質導入することにより、そのT細胞のAP1903活性化を可能にすること。この実験では、二量体化に応答したサイトカインの産生を、マルチプレックスサイトカインビーズアレイを使用して計測した。
誘導可能なT細胞分子のデザインおよびクローニング:
1.2つのSFGベースのレトロウイルスベクターを、Gibsonクローニングによって構築した(ここで、PCR産物を、pAd1127−02−iMCから増幅し、LFv1.Fv2L DNAフラグメントの代わりにpBP0320−SFG−Myr.LFv1.Fv2L.2A.ΔCD19構築物に挿入した)。
2.一過性のトランスフェクション法によってレトロウイルスを作製し、ここで、HEK293T細胞を以下のプラスミドでトランスフェクトした:a.SFGレトロウイルスプラスミド(pBP0171またはpBP0172;それぞれRV−171またはRV−172)b.レトロウイルスエンベローププラスミド(RD114)c.Gag/polプラスミド(pEQ−PAM−E)。
IL−2が補充されたT細胞増殖培地中において、抗CD3抗体および抗CD28抗体で活性化した。3日後、T細胞を活性化し、収集し、レトロウイルス形質導入の準備を整えた。それらのT細胞を形質導入するために、まず、組織培養用に処理されていないプレートを4℃において一晩、Retronectinでコーティングした。次いで、Retronectinを除去し、プレートをPBSで洗浄した。次いで、レトロウイルス上清を、Retronectinプレートをコーティングするために使用した。次いで、活性化T細胞をウェルに加え、プレートを遠心分離することにより、ウイルス粒子の結合および形質導入を促進した。48時間後、それらのT細胞を収集し、CD3とCD19との共発現についてフローサイトメトリーによって解析することにより、ウイルスの形質導入効率を決定した。
5.T細胞のAP1903依存性T細胞活性化を評価するために、1×105個の形質導入されていない(NT)T細胞またはコントロールレトロウイルス(RV−171)もしくはiMCを含むレトロウイルス(RV−172)で形質導入されたT細胞を、96ウェルプレートに3つ組でプレーティングし、培地のみまたは10nM AP1903を含む培地を用いて37℃、5%CO2において培養した。
a.塩基性FGF、G−CSF、GM−CSF、IFN−ガンマ、IL−1Ra、IL−1ベータ、IL−2、IL−4、IL−5、IL−6、IL−8、IL−7、IL−8、IL−9、IL−10、IL−12p70、IL−13、IL−15、IL−17RA、エオタキシン、IP10、MCP−1、MIP−1アルファ、MIP−1ベータ、PDGF−bb、RANTES、TNF−アルファおよびVEGF。
形質導入効率:
1.2人の健常ドナー由来のT細胞を、レトロウイルスで形質導入し、48時間後、CD3+CD19+共発現についてフローサイトメトリーによって決定された効率は、以下のとおりだった:
a.ドナー063
i.NT=6.54%
ii.RV−171=73.9%
iii.RV−172=54.6%
b.ドナー707
i.NT=2.16%
ii.RV−171=85.2%
iii.RV−172=73.6% 。
3.サイトカインおよびケモカインの分泌の解析から、AP1903二量体化に対する顕著な依存性が示された。T細胞によって産生された以下のサイトカインおよびケモカインは、24時間にわたって誘導を示したが、コントロールベクターで形質導入されたT細胞または形質導入されていないT細胞からは誘導されなかった:
a.GM−CSF、IFN−ガンマ、IL−13、IL−4、IL−5、IL−6、IL−8、IL−1ベータ、IL−12p70、IP10、MIP−1アルファ、MIP−1ベータ、RANTESおよびTNF−アルファ。
a.塩基性FGF、G−CSF、IL−1Ra、IL−2、IL−7、IL−9、IL−10、IL−15、IL−17RA、エオタキシン、MCP−1、PDGF−bbおよびVEGF。
RV0171=SFG−Myr.Fv’.Fv.2A.ΔCD19;RV0172=SFG=Myr.MyD88/CD40.Fv’.Fv.2A.ΔCD19。
目的:2つのFKBPv36分子に連結されたシグナル伝達分子をコードするレトロウイルスベクターで初代T細胞を形質導入することにより、そのT細胞のAP1903活性化を可能にすること。この実験では、AP1903活性化の2つの態様を調べた。第1に、T細胞が、腫瘍細胞の近位に存在する場合、それらの活性化によって腫瘍細胞の殺傷が誘導されるのか?第2に、T細胞が、AP1903を介して活性化される場合、それらは増殖するのか?
方法:
誘導可能なT細胞分子のデザインおよびクローニングならびにレトロウイルスの産生
1.方法は、上記の実施例4において論じられた方法と本質的に同じである。同じ細胞をこのアッセイのために使用した。
2.CAPAN−1をATCCから購入した。続いて、EGFP/ホタルルシフェラーゼ融合タンパク質に対する遺伝子、ならびに安定にトランスフェクトされた細胞が、G418抗生物質とともに培養することによって長い時間にわたって選択されるのを可能にするネオマイシン耐性遺伝子を含むpBP0168−pcDNA3.1−EGFPlucプラスミドによるトランスフェクションによって、その細胞株を遺伝子改変した。培養後、高いGFP発現を有するクローンを選択し、>95%GFPを有する細胞株が得られるまで継代培養した。
3.形質導入されていないT細胞またはRV−171(コントロールベクター)もしくはRV−172(iMCベクター)で形質導入された細胞を、10nM AP1903ありまたはなしで50U/ml IL−2が補充された培地中においてT細胞と腫瘍細胞とが5:1の比で培養した。次いで、共培養物を37℃および5%CO2において72時間インキュベートした。続いて、蛍光顕微鏡法によって、および0.25%トリプシン/EDTAを用いて培養物を収集し、培養物中のGFP+CD3−腫瘍細胞の頻度をフローサイトメトリーによって計測することによって、GFP+腫瘍細胞の存在について培養物を解析した。
4.共培養物のウェルを調べたところ、両方のドナーにおいて、AP1903で刺激されたRV−172(iMC含有ベクター)で形質導入されたT細胞は、大きなT細胞芽球コロニーによって明らかであるように、増殖していることが明らかだった。さらに、蛍光顕微鏡法によって、AP1903を投与されたRV−172を形質導入されたT細胞を含む共培養物は、非常に少ない生存可能なGFP+腫瘍細胞しか示さなかった。これらの最初の観察の後、T細胞および腫瘍細胞を収集し、フローサイトメトリーによって解析することにより、残存しているCAPAN−1 GFP+腫瘍細胞の頻度を決定した。
ヒトを治療するために、改変されたT細胞を使用する方法が、この実施例に提示される。この実施例では、共刺激ポリペプチドの細胞質領域は、CD40およびMyD88に由来する。これらの方法は、他の細胞、例えば、NKおよびNKT細胞など、ならびに腫瘍浸潤リンパ球に対して適合され得、本明細書中で論じられるような他の共刺激ポリペプチド細胞質領域を含むキメラ共刺激ポリペプチドに対しても適合され得る。
遺伝子改変されたT細胞の大規模産生
T細胞は、標準的な方法を用いて健常志願者から作製される。簡潔には、健常ドナーまたはがん患者由来の末梢血単核球(PBMC)を、可溶性αCD3およびαCD28(Miltenyi Biotec,Auburn,CA)を使用して、拡大および形質導入のために活性化する。PBMCを、100U/ml IL−2(Cellgenix)が補充されたCellgenix DC培地に、1×106細胞/mlで再懸濁し、0.2μg/ml αCD3および0.5μg/ml αCD28可溶性抗体で刺激する。次いで、細胞を37℃、5%CO2において4日間培養する。4日目に、IL−2を含む1mlの新鮮培地を加える。7日目に、形質導入に向けて、細胞を収集し、Cellgenix DC培地に再懸濁する。
SFGプラスミドは、切断可能な2A様配列を介して切断型ヒトCD19に連結された誘導可能なキメラポリペプチドからなる。その誘導可能なキメラポリペプチドは、F36V変異を有し、Ser−Gly−Gly−Gly−Serリンカーを介してヒトキメラポリペプチドに接続された、ヒトFK506結合タンパク質(FKBP12;GenBank AH002818)からなる。そのF36V変異は、合成ホモ二量体化剤AP20187またはAP1903に対するFKBP12の結合親和性を高める。その2A様配列は、Thosea asigna昆虫ウイルス由来の20アミノ酸ペプチドをコードし、それは、グリシンと末端プロリン残基との間での>99%の切断を媒介して、誘導可能なキメラポリペプチドのC末端に19個の追加のアミノ酸およびCD19のN末端に1つの追加のプロリン残基をもたらす。CD19は、細胞質内ドメインを242アミノ酸から19アミノ酸に短縮し、リン酸化に対する潜在的な部位である保存されたすべてのチロシン残基を除去する、アミノ酸333(TDPTRRF)で切断される、完全長CD19(GenBank NM001770)からなる。
T細胞の活性化および拡大のための培養液は、100U/ml IL−2(Cellgenix)が補充された無血清Cellgenix DC培地(Cellgenix)である。レトロウイルスベクターで形質導入する前の7日間にわたって、T細胞を可溶性抗CD3および抗CD28(Miltenyi Biotec)によって活性化する。必要であれば、ΔCD19の免疫磁気選択を形質導入後の4日目に行い;陽性画分をさらに2日間にわたって拡大し、凍結保存する。
臨床適用のための形質導入プロセスのスケールアップでは、10mlの抗CD3 0.5μg/mlおよび抗CD28 0.2μg/mlまたは10mlのフィブロネクチン7μg/mlで4℃において一晩コーティングされた、組織培養用に処理されていないT75フラスコ(Nunc,Rochester,NY)を使用する。高細胞粘着性のためにコロナ処理されたフッ化エチレンプロピレンバッグ(2PF−0072AC,American Fluoroseal Corporation,Gaithersburg,MD)も使用する。PBMCを、抗CD3、抗CD28によってコーティングされたフラスコに、100U/ml IL−2が補充された培地中、1×106細胞/mlで播種する。レトロウイルス形質導入に向けて、レトロネクチンでコーティングされたフラスコまたはバッグを、10mlのレトロウイルス含有上清で2〜3時間、一度負荷する。活性化T細胞を、100U/ml IL−2が補充された、3:1の比のレトロウイルスベクター含有新鮮培地およびT細胞培養培地中に1×106細胞/mlで播種する。細胞を、翌朝収集し、組織培養用に処理されたT75またはT175フラスコ内、100U/ml IL−2が補充された培養培地中で、約5×105細胞/ml〜8×105細胞/mlの播種密度で拡大する。
CD19に対する免疫磁気選択は、例えば、形質導入の4日後に行われ得る。細胞を、モノクローナルマウス抗ヒトCD19抗体(Miltenyi Biotech,Auburn,CA)に結合体化された常磁性マイクロビーズで標識し、小規模実験ではMSまたはLSカラムにおいて、および大規模実験ではCliniMacs Plus自動選択デバイスにおいて、選択する。CD19によって選択された細胞を、さらに4日間拡大し、形質導入後の8日目に凍結保存する。これらの細胞は、「遺伝子改変細胞」と称される。
本願の方法を使用して、進行した治療抵抗性白血病を有する白血病患者を処置する本実施例は、他の状態または疾患、例えば、他の過剰増殖性疾患または固形腫瘍などにも適用され得る。これらの方法は、標的抗原に応じて一本鎖可変フラグメントが変化し得るという理解の下で、本質的には論じられるように使用され得る。
目的:2つのFKBPv36分子に連結されたシグナル伝達分子をコードするレトロウイルスベクターで初代T細胞を形質導入することにより、そのT細胞のAP1903活性化を可能にすること。この実験は、切断型MyD88およびCD40ポリペプチドを含む誘導可能な共刺激分子が、CAPAN−1腫瘍細胞上に高度に発現される前立腺幹細胞抗原(PSCA)を認識するCARで形質導入されたT細胞によるGFP改変CAPAN−1(膵臓腺癌)細胞の殺傷を改善するかを調べるためにデザインされる。
誘導可能なT細胞分子のデザインおよびクローニング:
1.T細胞の形質導入は、RV−172(SFG−Myr.MyD88/CD40.Fv.Fv’.2A.ΔCD19)およびRV−89(SFG.PSCAscFv.CH2CH3.CD28.ゼータ)を用いて行う。そのscFvは、ヒト化モノクローナル抗体1G8(US2012077962A1におけるヒト化抗PSCAから得られる)由来のscFvを使用してPSCAを標的化する。これは、ヒトIgG1のCH2CH3領域に連結され、それは続いて、その分子の膜貫通部分と細胞質部分の両方を含むCD28に連結される。CD28は、CD3ゼータの細胞質部分に連結される。
2.本質的には、前の実施例と同じである。
3.CAPAN−1をATCCから購入する。続いて、EGFP/ホタルルルシフェリン融合タンパク質に対する遺伝子、ならびに安定にトランスフェクトされた細胞が、G418抗生物質とともに培養することによって長い時間にわたって選択されるのを可能にするネオマイシン耐性遺伝子を含むpBP0168−pcDNA3.1−EGFPlucによるトランスフェクションによって、その細胞株を遺伝子改変する。培養後、高いGFP発現を有するクローンを選択し、>95%GFPを有する細胞株が得られるまで継代培養する。
4.形質導入されていないT細胞またはRV−89(PSCA CAR)およびRV−172(iMCベクター)で共形質導入されたT細胞を、10nM AP1903ありまたはなしで50U/ml IL−2が補充された培地中においてT細胞と腫瘍細胞とが5:1の比で培養する。次いで、共培養物を37℃および5%CO2において72時間インキュベートする。続いて、蛍光顕微鏡法によって、および0.25%トリプシン/EDTAを用いて培養物を回収し、培養物中のGFP+CD3−腫瘍細胞の頻度をフローサイトメトリーによって計測することによって、GFP+腫瘍細胞の存在について培養物を解析する。
1.培養物を蛍光顕微鏡法によって調べることにより、誘導可能な共刺激分子およびキメラ抗原レセプターを形質導入されたT細胞を含むウェルおよびAP1903を投与されたウェルにおける腫瘍細胞殺傷の改善を評価する。
T細胞の条件に正規化することにより、腫瘍細胞殺傷に対するiMC活性化の効果が示される。
図41は、誘導可能なMyD88、CD40およびMyD88/CD40キメラポリペプチドの模式図を提供している。MyD88、CD40または両方の分子が、潜在的なキメラ抗原レセプター構築物に内部ドメインとして含められるべきであるかを調べるために、AP1903結合ドメインのみを含む(Fv’Fv)か、またはMyD88(iMyD88)、CD40(iCD40)もしくはMyD88とCD40の両方(iMC)と遺伝的に融合されている、4つの異なるベクターをデザインした(図41a)。CD3/CD28によって活性化されたT細胞に形質導入し、各ベクターの形質導入効率を、CD3T細胞の表面上のCD19のフローサイトメトリー検出(CD3+CD19+)によって測定したところ、各レトロウイルスは、初代T細胞において、形質導入されていないT細胞と比べて十分に発現されたことが示された(57%〜95%)(図41b)。次いで、AP1903への曝露の後にiMyD88、iCD40またはiMCがT細胞を活性化する能力を、ELISAによってIFN−γおよびIL−6の産生を測定することによってアッセイした。iMCを形質導入されたT細胞だけが、AP1903活性化の後にかなりの量のIFN−γとIL−6の両方を産生したことが観察されたのに対し、NT、iMyD88およびiCD40のいずれもがサイトカイン産生を示さなかった(図41cおよびd)。これらのデータから、MyD88およびCD40が、ヒトT細胞において活性化シグナル伝達分子として相乗作用を示すこと、およびCAR分子が、複合のMCシグナル伝達ドメインを含めることの恩恵を受けるはずであることが示唆される。
以下の参考文献は、本明細書中の実施例において引用されているか、または例えば本明細書中の実施例を含む関連し得るさらなる情報を提供する。
本明細書中に提供される誘導可能なMyD88/CD40共刺激分子を発現する改変された細胞は、T細胞レセプターも発現し得る。これらの例では、そのT細胞レセプターは、その細胞にとって内在性であってもよいし、T細胞レセプターをコードするポリヌクレオチドを含む核酸によるトランスフェクションまたは形質転換を介してその細胞に提供されてもよい。ある特定の例では、そのT細胞レセプターは、誘導可能なMyD88/CD40共刺激分子と同じ核酸ベクターにおいて発現され得る。いくつかの例では、改変された細胞は、腫瘍浸潤リンパ球である。
標的細胞(例えば、腫瘍細胞)の迅速かつ完全な排除が、いくつかの臨床上のシナリオにおいて望まれ得るが、これらの細胞の部分的な排除および減少がより望ましい場合がある他の多くのシナリオも存在する。そのようなシナリオの可能性は、キメラ抗原レセプター(CAR)−T細胞の標的に固有の様々な特性および関連する有害事象(AE)のタイプによって左右される。これらの特性には、標的化される分子および器官、毒性の重症度、ならびに発生の迅速性が含まれる。これらの特性に関して異なるプロファイルを有する異なるタイプのCAR−T細胞標的が少なくとも5つ存在し、それらの特性は、各患者に対して適切なレベルのCAR−T細胞活性を達成するために、よりコントロールされた量の多量体リガンドの送達の恩恵を受け得る臨床上のシナリオに関連し得る有効性および安全性を左右し、十分な治療効果をもたらしながらも、有害事象、例えば、サイトカインストームまたはオフターゲット毒性を回避する必要性とのバランスがとられる。これらの例では、十分な投与量の多量体リガンドを治療のために使用し、かつ有害な副作用をもたらし得る過剰な活性を回避しつつ、よりコントロールされたレベルの共刺激が望まれる場合がある。
本技術のある特定の実施形態の例を、この後に提供する。
b)キメラ抗原レセプターをコードする第2のポリヌクレオチド
を含む、核酸。
(i)膜貫通領域;(ii)T細胞活性化分子;および(iii)抗原認識部分
を含む、実施形態A1〜A18のいずれか1つに記載の核酸。
a)実施形態A53〜A61のいずれか1つに記載の改変された細胞をその被験体に投与する工程;および
b)有効量の、前記多量体化領域に結合する多量体リガンドを投与することにより、その被験体においてT細胞媒介性の免疫応答を刺激する工程
を含む、方法。
その被験体において特定された状態または疾患の有無またはステージに基づいて、実施形態A53〜A61のいずれか1つに記載のリガンドを投与する指示、そのリガンドのその後の投与量を維持する指示またはその被験体に投与されるそのリガンドのその後の投与量を調整する指示を伝える工程
をさらに含む、実施形態A62〜A86.5のいずれか1つに記載の方法。
a)その多量体リガンドは、前記多量体リガンド領域、MyD88ポリペプチド領域またはTIRドメインを欠く切断型MyD88ポリペプチド領域およびCD40細胞外ドメインを欠くCD40細胞質ポリペプチド領域を含む誘導可能なキメラ刺激分子に結合し;
b)被験体内を循環しているT細胞は、(i)誘導可能なキメラ刺激分子;および(ii)標的抗原に結合するキメラ抗原レセプターを発現し;
c)標的抗原は、被験体内を循環している標的細胞上に存在し;
d)被験体における標的細胞の数または濃度は、多量体リガンドを投与した後に減少する、
方法。
その被験体において特定された状態または疾患の有無またはステージに基づいて、前記多量体リガンドをその被験体に投与する指示、その多量体リガンドのその後の投与量を維持する指示またはその被験体に投与されるその多量体リガンドのその後の投与量を調整する指示を伝える工程
をさらに含む、実施形態B1〜B18のいずれか1つに記載の方法。
(i)膜貫通領域;(ii)T細胞活性化分子;および(iii)抗原認識部分
を含む、実施形態C16に記載の改変されたT細胞。
a)実施形態C1〜C43のいずれか1つに記載の改変されたT細胞をその被験体に投与する工程;および
b)有効量の、前記多量体化領域に結合する多量体リガンドを投与することにより、その被験体においてT細胞媒介性の免疫応答を刺激する工程
を含む、方法。
その被験体において特定された状態または疾患の有無またはステージに基づいて、実施形態C53〜C61のいずれか1つに記載のリガンドを投与する指示、そのリガンドのその後の投与量を維持する指示またはその被験体に投与されるそのリガンドのその後の投与量を調整する指示を伝える工程
をさらに含む、実施形態C62〜C86のいずれか1つに記載の方法。
a)実施形態D21〜D53のいずれか1つに記載の改変された細胞をその被験体に投与する工程;および
b)有効量の、前記多量体化領域に結合する多量体リガンドを投与することにより、その被験体においてT細胞媒介性の免疫応答を刺激する工程
を含む、方法。
その被験体において特定された状態または疾患の有無またはステージに基づいて、前記リガンドを投与する指示、そのリガンドのその後の投与量を維持する指示またはその被験体に投与されるそのリガンドのその後の投与量を調整する指示を伝える工程
をさらに含む、実施形態D54〜D80のいずれか1つに記載の方法。
本技術のある特定の実施形態の例を、この後に提供する。
キメラタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む核酸でT細胞をトランスフェクトするかまたは形質導入する工程
を含み、ここで、そのキメラタンパク質は、
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、および
c)MyD88ポリペプチド
を含み、それによって、そのT細胞は活性化される、方法。
キメラタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む核酸でT細胞をトランスフェクトするかまたは形質導入する工程
を含み、ここで、そのキメラタンパク質は、
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、および
c)CD40細胞質領域であって、ここで、そのCD40ポリペプチドは、機能的な細胞外ドメインを有しない、CD40細胞質領域
を含み、それによって、そのT細胞は活性化される、方法。
キメラタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む核酸でT細胞をトランスフェクトするかまたは形質導入する工程
を含み、ここで、そのキメラタンパク質は、
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、
c)MyD88ポリペプチド、および
d)CD40ポリペプチド細胞質領域であって、ここで、そのCD40ポリペプチドは、機能的な細胞外ドメインを有しない、CD40ポリペプチド細胞質領域
を含み、それによって、そのT細胞は活性化される、方法。
キメラタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む核酸でT細胞をトランスフェクトするかまたは形質導入する工程
を含み、ここで、そのキメラタンパク質は、
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、および
c)CD40ポリペプチド細胞質領域であって、ここで、そのCD40ポリペプチドは、機能的な細胞外ドメインを有しない、CD40ポリペプチド細胞質領域
を含み、それによって、そのT細胞は活性化される、方法。
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、および
c)MyD88ポリペプチド
を含む、T細胞。
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、
c)MyD88ポリペプチド、および
d)CD40ポリペプチド細胞質領域であって、ここで、そのCD40ポリペプチドは、機能的な細胞外ドメインを有しない、CD40ポリペプチド細胞質領域
を含む、T細胞。
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、および
c)CD40ポリペプチド細胞質領域であって、ここで、そのCD40ポリペプチドは、機能的な細胞外ドメインを有しない、CD40ポリペプチド細胞質領域
を含む、T細胞。
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、および
c)MyD88ポリペプチド領域
を含み、それによって、そのT細胞は活性化される、方法。
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、
c)MyD88ポリペプチド、および
d)CD40ポリペプチド細胞質領域であって、ここで、そのCD40ポリペプチドは、機能的な細胞外ドメインを有しない、CD40ポリペプチド細胞質領域
を含み、それによって、そのT細胞は活性化される、方法。
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、および
c)CD40ポリペプチド細胞質領域であって、ここで、そのCD40ポリペプチドは、機能的な細胞外ドメインを有しない、CD40ポリペプチド細胞質領域
を含み、それによって、そのT細胞は活性化される、方法。
本技術のある特定の実施形態の例を、この後に提供する。
キメラタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む核酸でその細胞をトランスフェクトするかまたは形質導入する工程を含み、ここで、そのキメラタンパク質は、
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、および
c)MyD88ポリペプチド
を含み、それによって、その細胞は活性化される、方法。
キメラタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む核酸でその細胞をトランスフェクトするかまたは形質導入する工程を含み、ここで、そのキメラタンパク質は、
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、
c)MyD88ポリペプチド、および
d)CD40ポリペプチド細胞質領域であって、ここで、そのCD40ポリペプチドは、機能的な細胞外ドメインを有しない、CD40ポリペプチド細胞質領域
を含み、それによって、その細胞は活性化される、方法。
キメラタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む核酸でその細胞をトランスフェクトするかまたは形質導入する工程を含み、ここで、そのキメラタンパク質は、
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、および
c)CD40ポリペプチド細胞質領域であって、ここで、そのCD40ポリペプチドは、機能的な細胞外ドメインを有しない、CD40ポリペプチド細胞質領域
を含み、それによって、その細胞は活性化される、方法。
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、および
c)MyD88ポリペプチド
を含む、細胞。
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、
c)MyD88ポリペプチド、および
d)CD40ポリペプチド細胞質領域であって、ここで、そのCD40ポリペプチドは、機能的な細胞外ドメインを有しない、CD40ポリペプチド細胞質領域
を含み、ここで、その細胞は、樹状細胞またはB細胞ではない、細胞。
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、および
c)CD40ポリペプチド細胞質領域であって、ここで、そのCD40ポリペプチドは、機能的な細胞外ドメインを有しない、CD40ポリペプチド細胞質領域
を含む、細胞。
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、および
c)MyD88ポリペプチド
を含み、それによって、その細胞は活性化され、ここで、その細胞は、樹状細胞またはB細胞ではない、方法。
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、
c)MyD88ポリペプチド、および
d)CD40ポリペプチド細胞質領域であって、ここで、そのCD40ポリペプチドは、機能的な細胞外ドメインを有しない、CD40ポリペプチド細胞質領域
を含み、それによって、その細胞は活性化される、方法。
a)膜標的化領域、
b)多量体化領域、および
c)CD40ポリペプチド細胞質領域であって、ここで、そのCD40ポリペプチドは、機能的な細胞外ドメインを有しない、CD40ポリペプチド細胞質領域
を含み、それによって、その細胞は活性化される、方法。
その被験体において特定された状態または疾患の有無またはステージに基づいて、多量体結合領域に結合する多量体リガンドを投与する指示、その多量体リガンドのその後の投与量を維持する指示またはその患者に投与されるその多量体リガンドのその後の投与量を調整する指示を伝える工程
をさらに含む、実施形態J43〜J74のいずれか1つに記載の方法。
腫瘍サイズの増加および/または腫瘍細胞数の増加の存在が判定された場合、さらなる用量の該多量体リガンドをその被験体に投与する工程
を含む、実施形態J78に記載の方法。
その被験体においてCD19を発現しているB細胞の増加の存在が判定された場合、さらなる用量の該多量体リガンドをその被験体に投与する工程
を含む、実施形態J77に記載の方法。
その被験体において特定された状態または疾患の有無またはステージに基づいて、多量体結合領域に結合する多量体リガンドを投与する指示、その多量体リガンドのその後の投与量を維持する指示またはその患者に投与されるその多量体リガンドのその後の投与量を調整する指示を伝える工程
をさらに含む、実施形態K43〜K74のいずれか1つに記載の方法。
腫瘍サイズの増加および/または腫瘍細胞数の増加の存在が判定された場合、さらなる用量の該多量体リガンドをその被験体に投与する工程
を含む、実施形態K78に記載の方法。
その被験体においてCD19を発現しているB細胞の増加の存在が判定された場合、さらなる用量の該多量体リガンドをその被験体に投与する工程
を含む、実施形態K77に記載の方法。
キメラ抗原レセプターをコードする第2のポリヌクレオチド
を含む、核酸。
その被験体において特定された状態または疾患の有無またはステージに基づいて、実施形態L31〜L36のいずれか1つに記載の改変された細胞を投与する指示、その改変された細胞のその後の投与量を維持する指示またはその患者に投与される改変された細胞のその後の投与量を調整する指示を伝える工程
をさらに含む、実施形態L37〜L63のいずれか1つに記載の方法。
(i)膜貫通領域;(ii)T細胞活性化分子;および(iii)抗原認識部分
を含む、実施形態M1に記載の核酸、改変された細胞または方法。
Claims (53)
- a)誘導可能なキメラ刺激分子をコードする第1の核酸配列であって、該誘導可能なキメラ刺激分子は、(i)MyD88ポリペプチド領域またはTIRドメインを欠く切断型MyD88ポリペプチド領域;(ii)CD40細胞外ドメインを欠くCD40細胞質ポリペプチド領域、および(iii)多量体化領域を含む、第1のポリヌクレオチド;ならびに
b)キメラ抗原レセプターをコードする第2の核酸配列
を含む、核酸であって、該誘導可能なキメラ刺激分子が、領域(i)〜(iii)を、ポリペプチドのアミノ末端からカルボキシ末端に向かって(i)、(ii)、(iii)という順序で含むポリペプチドである、核酸。 - 前記誘導可能なキメラ刺激分子が、さらに(iv)膜標的化領域を含む、請求項1に記載の核酸。
- 前記キメラ刺激分子がポリペプチドであって、領域(i)〜(iv)を、該ポリペプチドのアミノ末端からカルボキシル末端に向かって(iv)、(i)、(ii)、(iii)という順序で含むポリペプチドである、請求項2に記載の核酸。
- 前記多量体化領域が、FKBP12領域である、請求項1〜3のいずれか一項に記載の核酸。
- 前記FKBP12領域が、FKBP12v36領域である、請求項4に記載の核酸。
- 前記FKBP12領域が、Fv’Fvlsである、請求項4に記載の核酸。
- 前記多量体化領域が、配列番号11のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその機能的フラグメント、あるいは配列番号10のヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドまたはその機能的フラグメントを含む、請求項4に記載の核酸。
- 前記多量体化領域が、配列番号13のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその機能的フラグメント、あるいは配列番号12のヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドまたはその機能的フラグメントをさらに含む、請求項7に記載の核酸。
- 残基36がバリンであるFvポリペプチドバリアントをさらに含む、請求項7に記載の核酸。
- 前記多量体化領域が、多量体リガンドに結合し、前記多量体リガンドが、FK506二量体または二量体のFK506アナログリガンドである、請求項4〜9のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記多量体リガンドが、AP1903である、請求項10に記載の核酸。
- 前記第1の核酸配列と前記第2の核酸配列の両方に作動可能に連結されたプロモーターをさらに含む、請求項1〜11のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の核酸配列に作動可能に連結された第1のプロモーターおよび前記第2の核酸配列に作動可能に連結された第2のプロモーターをさらに含む、請求項1〜11のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の核酸配列と前記第2の核酸配列との間にリンカーポリペプチドをコードする第3の核酸配列をさらに含み、ここで、該リンカーポリペプチドは、翻訳中または翻訳後の該第1および第2の核酸配列の翻訳産物を分断している、請求項1〜12のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記リンカーポリペプチドが、2Aポリペプチドである、請求項14に記載の核酸。
- 前記誘導可能なキメラ刺激分子が、配列番号49のアミノ酸配列を有するMyD88ポリペプチド領域もしくは配列番号134のアミノ酸配列を有する切断型MyD88ポリペプチド領域またはそれらの機能的フラグメントを含む、請求項1〜15のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記誘導可能なキメラ刺激分子が、配列番号49のアミノ酸配列を有するMyD88ポリペプチド領域を含む、請求項16に記載の核酸。
- 前記CD40細胞質ポリペプチド領域が、配列番号9のアミノ酸配列またはその機能的フラグメントを有する、請求項1〜17のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記核酸が、ウイルスベクター内に含まれている、請求項1〜18のいずれか1項に記載の核酸。
- 請求項1〜19のいずれか1項に記載の核酸でトランスフェクトされたまたは形質導入された、改変された細胞。
- 前記改変された細胞が、T細胞、腫瘍浸潤リンパ球、NK−T細胞、TCRを発現している細胞またはNK細胞である、請求項20に記載の改変された細胞。
- 前記改変された細胞が、T細胞である、請求項21に記載の改変された細胞。
- 前記改変された細胞が、ヒト細胞である、請求項20〜22のいずれか1項に記載の改変された細胞。
- 被験体におけるT細胞媒介性の免疫応答を刺激するための組み合わせ物であって、
(a)請求項20〜23のいずれか一項に記載の改変された細胞;および
(b)前記多量体化領域に結合する有効量の多量体リガンド
を含む、組み合わせ物。 - 前記被験体が、腫瘍を有すると診断されているか、がんを有するか、あるいは血液疾患または骨髄疾患を有する、請求項24に記載の組み合わせ物。
- 細胞において誘導可能なキメラ刺激分子を発現させるためのエキソビボ方法であって、該方法は、請求項1〜19のいずれか1項に記載の核酸を、該核酸が細胞に組み込まれる条件下において該細胞と接触させる工程を含み、それにより、該細胞は、該組み込まれた核酸からキメラ抗原レセプターを発現する、方法。
- 誘導可能なキメラ刺激分子をコードするポリヌクレオチドを含む核酸でトランスフェクトされたまたは形質導入された、改変されたT細胞であって、ここで、該誘導可能なキメラ刺激分子は、(i)MyD88ポリペプチド領域またはTIRドメインを欠く切断型MyD88ポリペプチド領域;(ii)CD40細胞外ドメインを欠くCD40細胞質ポリペプチド領域、および(iii)多量体化領域を含み、該誘導可能なキメラ刺激分子が、領域(i)〜(iii)を、ポリペプチドのアミノ末端からカルボキシ末端に向かって(i)、(ii)、(iii)という順序で含むポリペプチドである、改変されたT細胞。
- 前記誘導可能なキメラ刺激分子が、(iv)膜標的化領域をさらに含む、請求項27に記載の改変されたT細胞。
- 前記多量体化領域が、FKBP12領域である、請求項27に記載の改変されたT細胞。
- 前記FKBP12領域が、FKBP12v36領域である、請求項29に記載の改変されたT細胞。
- 前記FKBP12領域が、Fv’Fvlsである、請求項29に記載の改変されたT細胞。
- 前記多量体化領域が、配列番号11のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその機能的フラグメント、あるいは配列番号10のヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチまたはその機能的フラグメントを含む、請求項29に記載の改変されたT細胞。
- 前記多量体化領域が、配列番号13のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその機能的フラグメント、あるいは配列番号12のヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドまたはその機能的フラグメントをさらに含む、請求項32に記載の改変されたT細胞。
- 残基36がバリンであるFvポリペプチドバリアントをさらに含む、請求項30に記載の改変されたT細胞。
- 前記多量体化領域が、多量体化リガンドに結合し、前記多量体リガンドが、FK506二量体または二量体のFK506アナログリガンドである、請求項27〜34のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
- 前記多量体リガンドが、AP1903である、請求項35に記載の改変されたT細胞。
- 前記誘導可能なキメラ刺激分子をコードするポリヌクレオチドに作動可能に連結されたプロモーターをさらに含む、請求項27〜36のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
- 前記改変された細胞が、キメラ抗原レセプターをコードするポリヌクレオチドをさらに含む、請求項27〜37のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
- 前記誘導可能なキメラ刺激分子が、配列番号5のアミノ酸配列を有する切断型MyD88ポリペプチド領域またはその機能的フラグメントを含む、請求項27〜38のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
- 前記誘導可能なキメラ刺激分子が、配列番号49のアミノ酸配列を有するMyD88ポリペプチド領域を含む、請求項27〜38のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
- 前記細胞質CD40ポリペプチドが、配列番号9のアミノ酸配列またはその機能的フラグメントを有する、請求項27〜40のいずれか1項に記載の改変されたT細胞。
- 前記膜標的化領域が、レセプターのミリストイル化領域、パルミトイル化領域、プレニル化領域および膜貫通配列からなる群より選択される、請求項28に記載の改変されたT細胞。
- 前記膜標的化領域が、ミリストイル化領域である、請求項42に記載の改変されたT細胞。
- 前記ミリストイル化領域が、配列番号3のアミノ酸配列またはその機能的フラグメントを有する、請求項43に記載の改変されたT細胞。
- 被験体におけるT細胞媒介性の免疫応答を刺激するための組み合わせ物であって、
(a)請求項27〜44のいずれか一項に記載の改変されたT細胞;および
(b)前記多量体化領域に結合する有効量の多量体リガンド
を含む、組み合わせ物。 - 被験体におけるT細胞媒介性の免疫応答を刺激するための組み合わせ物であって、
(a)請求項38に記載の改変されたT細胞;および
(b)前記多量体化領域に結合する有効量の多量体リガンド
を含み、前記キメラ抗原受容体が標的細胞に結合する、組み合わせ物。 - 前記標的細胞が腫瘍細胞である、請求項46に記載の組み合わせ物。
- 前記多量体リガンドが、AP1903またはAP20187である、請求項45〜47のいずれか一項に記載の組み合わせ物。
- a)誘導可能なキメラ刺激分子をコードする第1の核酸配列であって、ここで、該誘導可能なキメラ刺激分子は、(i)MyD88ポリペプチド領域またはTIRドメインを欠く切断型MyD88ポリペプチド領域;(ii)CD40細胞外ドメインを欠くCD40細胞質ポリペプチド領域、および(iii)位置36におけるアミノ酸置換を含む改変されたFKBP12ポリペプチドを含む多量体化領域を含み、前記改変されたFKBP12ポリペプチドが、AP1903に結合し、前記誘導可能なキメラ刺激分子が、膜標的化領域を含まない、第1のポリヌクレオチドと、
b)キメラ抗原受容体をコードする第2の核酸配列と
を含む、核酸であって、該誘導可能なキメラ刺激分子が、領域(i)〜(iii)を、ポリペプチドのアミノ末端からカルボキシ末端に向かって(i)、(ii)、(iii)という順序で含むポリペプチドである、核酸。 - 請求項49に記載の核酸でトランスフェクトされたまたは形質導入された改変された細胞。
- 前記改変された細胞が、T細胞、腫瘍浸潤リンパ球、NK−T細胞、TCR発現細胞、またはNK細胞である、請求項50に記載の改変された細胞。
- 前記改変された細胞がT細胞である、請求項51に記載の改変された細胞。
- 前記改変された細胞がヒト細胞である、請求項50〜52のいずれか一項に記載の改変された細胞。
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