JP6760477B2 - 細胞観察装置 - Google Patents
細胞観察装置 Download PDFInfo
- Publication number
- JP6760477B2 JP6760477B2 JP2019502314A JP2019502314A JP6760477B2 JP 6760477 B2 JP6760477 B2 JP 6760477B2 JP 2019502314 A JP2019502314 A JP 2019502314A JP 2019502314 A JP2019502314 A JP 2019502314A JP 6760477 B2 JP6760477 B2 JP 6760477B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- unit
- image
- range
- focus
- display
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims description 40
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 claims description 38
- 230000008859 change Effects 0.000 claims description 35
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 claims description 27
- 238000009826 distribution Methods 0.000 claims description 3
- 230000009467 reduction Effects 0.000 claims description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 62
- 238000000034 method Methods 0.000 description 18
- 230000008569 process Effects 0.000 description 13
- 238000013500 data storage Methods 0.000 description 10
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 9
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 8
- 230000004044 response Effects 0.000 description 5
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 4
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 230000001427 coherent effect Effects 0.000 description 2
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 238000001093 holography Methods 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 2
- 230000010363 phase shift Effects 0.000 description 2
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 1
- 238000000386 microscopy Methods 0.000 description 1
- 210000001778 pluripotent stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000001172 regenerating effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
- C12M1/00—Apparatus for enzymology or microbiology
- C12M1/34—Measuring or testing with condition measuring or sensing means, e.g. colony counters
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/17—Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
- G01N21/41—Refractivity; Phase-affecting properties, e.g. optical path length
-
- G—PHYSICS
- G02—OPTICS
- G02B—OPTICAL ELEMENTS, SYSTEMS OR APPARATUS
- G02B21/00—Microscopes
-
- G—PHYSICS
- G03—PHOTOGRAPHY; CINEMATOGRAPHY; ANALOGOUS TECHNIQUES USING WAVES OTHER THAN OPTICAL WAVES; ELECTROGRAPHY; HOLOGRAPHY
- G03H—HOLOGRAPHIC PROCESSES OR APPARATUS
- G03H1/00—Holographic processes or apparatus using light, infrared or ultraviolet waves for obtaining holograms or for obtaining an image from them; Details peculiar thereto
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Sustainable Development (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Optics & Photonics (AREA)
- Microscoopes, Condenser (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Holo Graphy (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)
Description
しかしながら、位相差顕微鏡では顕微画像を撮影する際に焦点合わせを行う必要があるため、広い観察対象領域を細かく区画したそれぞれの小領域についての顕微画像を取得するような場合、測定に多大な時間が掛かり実用的でないという問題がある。これを解決するために、近年、デジタルホログラフィ技術を用いたホログラフィック顕微鏡が開発され実用に供されている(特許文献1、2等参照)。
また、一つの細胞培養プレート全体や一若しくは複数のウェル全体の領域についての画像はサイズが大きいため、焦点位置が相違する複数の画像を作成するのには時間が掛かる。
さらにまた、一つの細胞培養プレート全体や一若しくは複数のウェル全体の領域について焦点位置が共通であるとは限らず、一つの細胞培養プレート内のウェル毎に底面の高さが相違していたり細胞培養プレートの底面が傾いていたりするために、観察対象領域全体に対して一つの焦点位置を決めることができないこともある。
a)前記ホログラフィック顕微鏡による1回の撮影で得られる所定の大きさの撮像単位に対応するホログラムデータに基づいて作成される再構成画像を複数繋ぎ合わせることで観察対象領域全体の再構成画像を作成し、前記表示部に表示する全体画像作成部と、
b)前記表示部に表示された観察対象領域全体の再構成画像上で、焦点位置合わせ対象範囲をユーザに指定させる焦点位置合わせ対象範囲指定部と、
c)前記焦点位置合わせ対象範囲指定部により指定された焦点位置合わせ対象範囲に対応するホログラムデータに基づいて、該焦点位置合わせ対象範囲が複数の撮像単位に跨る場合には該複数の撮像単位にそれぞれ対応する再構成画像を繋ぎ合わせることにより、前記焦点位置合わせ対象範囲における焦点位置が相違する複数の再構成画像を作成する焦点位置比較画像作成部と、
d)前記焦点位置が相違する複数の再構成画像のうちの一つが表示される画像表示枠と、焦点位置を所定範囲で変化させるための操作子であるスライダーとが配置された画面を前記表示部に表示する焦点位置合わせ用表示処理部と、
e)ユーザによる前記スライダーの操作に応じて前記焦点位置が相違する複数の再構成画像を選択し、前記画像表示枠中に描出させる焦点位置比較画像表示処理部と、
f)ユーザにより指定された前記焦点位置が相違する複数の再構成画像のうちの一つに対応する焦点位置を合焦位置であると決定する合焦位置決定部と、
を備えることを特徴としている。
また、上記ホログラフィック顕微鏡はその方式を問わず、インライン型、オフアクシス型、位相シフト型などのいずれでもよい。
また上記構成によれば、ユーザが焦点位置合わせ対象範囲を絞り込むことで、焦点位置比較画像作成部により作成される位相画像等の再構成画像のデータ量を少なく抑えることができる。それによって、位相情報等を算出する処理や得られた位相情報等を用いて画像を作成する処理を高速化することができる。その結果、合焦位置を決定する作業に掛かる時間を短縮し、細胞観察の作業を効率的に行うことができる。
そこで、本発明に係る細胞観察装置では、好ましくは、前記スライダーに割り当てられる焦点位置の変化の範囲及びその変化のピッチをユーザが設定するための焦点位置合わせパラメータ設定部をさらに備える構成とするとよい。
前記表示部に表示されている観察対象領域全体の再構成画像である広範囲表示画像上で、同一の焦点位置を適用可能である同一焦点位置適用範囲をユーザが指定するための同一焦点位置適用範囲指定部、をさらに備え、
前記焦点位置合わせ対象範囲指定部は、前記同一焦点位置適用範囲指定部により指定された同一焦点位置適用範囲毎に焦点位置合わせ対象範囲をユーザに指定させる構成とするとよい。
この構成によれば、例えば上述したように一つの細胞培養プレート中のウェル毎に適切な焦点位置が異なる場合であっても、ウェル毎に焦点位置を定めることができ、また逆に同一ウェル内では焦点位置を共通にすることができる。
前記広範囲表示画像上の一部の範囲をユーザが拡大観察範囲として指定するための拡大観察範囲指定部と、
該指定された拡大観察範囲について少なくとも前記広範囲表示画像よりも倍率の高い拡大画像を作成し該拡大画像を前記表示部の画面上に表示する拡大画像作成部と、
をさらに備える構成とするとよい。
前記表示部に表示されている前記広範囲表示画像上の前記拡大観察範囲を移動させる又は拡大若しくは縮小させる操作をユーザが行うための操作部をさらに備え、
前記拡大画像作成部は、前記操作部を介した操作による移動後の又は拡大若しくは縮小後の拡大画像を作成して表示することが好ましい。
これにより、ユーザは観察対象領域内の任意の部位における拡大画像を確認して焦点位置が適当か否かを判断することができる。
図1は本実施例の細胞観察装置の要部の構成図である。
顕微観察部1はインライン型ホログラフィック顕微鏡(In-line Holographic Microscopy:IHM)であり、レーザダイオードなどを含む光源部10とイメージセンサ部11とを備え、光源部10とイメージセンサ部11との間に、観察対象である細胞13を含む細胞培養プレート12が配置される。細胞培養プレート12は例えばモータ等の駆動源を含む移動部14により、X軸、Y軸の2軸方向に移動自在である。
なお、この制御・処理部2の実体はパーソナルコンピュータ又はより高性能なワークステーションであり、そうしたコンピュータにインストールされた専用の制御・処理ソフトウェアを該コンピュータ上で動作させることで上記各機能ブロックの機能が実現される。したがって、入力部3はキーボードやマウス等のポインティングデバイスを含む。また、後述するように制御・処理部2の機能を一つのコンピュータでなく、通信ネットワークを介して接続された複数のコンピュータで分担する構成とすることもできる。
図6は、細胞培養プレート12全体の位相画像200上で、二つのウェル201に対応する領域について同一焦点位置適用範囲210が指定された例を示す模式図である。
なお、強度画像や擬似位相画像については位相画像について求めた焦点位置を利用してもよいし、或いは、強度画像や擬似位相画像について位相画像と同様の手法で焦点位置を決めるようにしてもよい。
10…光源部
11…イメージセンサ
12…細胞培養プレート
13…細胞
14…移動部
15…参照光
16…物体光
2…制御・処理部
20…撮影制御部
21…測定データ記憶部
22…位相情報算出部
23…全体画像作成部
24…焦点位置比較画像作成部
25…画像データ記憶部
26…合焦処理部
27…焦点位置情報記憶部
28…表示処理部
29…操作受付処理部
3…入力部
4…表示部
100…焦点位置合わせ画面
101…画像表示枠
102…焦点位置変更スライダー
103…つまみ
104…「決定」ボタン
Claims (6)
- 細胞を含む試料をホログラフィック顕微鏡で測定することにより得られたホログラムデータに基づく演算処理を行うことで、位相、強度、又は擬似位相の少なくともいずれかの2次元分布を示す再構成画像を作成して表示部に表示する細胞観察装置であって、
a)前記ホログラフィック顕微鏡による1回の撮影で得られる所定の大きさの撮像単位に対応するホログラムデータに基づいて作成される再構成画像を、複数繋ぎ合わせることで観察対象領域全体の再構成画像を作成し、前記表示部に表示する全体画像作成部と、
b)前記表示部に表示された観察対象領域全体の再構成画像上で、焦点位置合わせ対象範囲をユーザに指定させる焦点位置合わせ対象範囲指定部と、
c)前記焦点位置合わせ対象範囲指定部により指定された焦点位置合わせ対象範囲に対応するホログラムデータに基づいて、該焦点位置合わせ対象範囲が複数の撮像単位に跨る場合には該複数の撮像単位にそれぞれ対応する再構成画像を繋ぎ合わせることにより、前記焦点位置合わせ対象範囲における焦点位置が相違する複数の再構成画像を作成する焦点位置比較画像作成部と、
d)前記焦点位置が相違する複数の再構成画像のうちの一つが表示される画像表示枠と、焦点位置を所定範囲で変化させるための操作子であるスライダーとが配置された画面を前記表示部に表示する焦点位置合わせ用表示処理部と、
e)ユーザによる前記スライダーの操作に応じて前記焦点位置が相違する複数の再構成画像を選択し、前記画像表示枠中に描出させる焦点位置比較画像表示処理部と、
f)ユーザにより指定された前記焦点位置が相違する複数の再構成画像のうちの一つに対応する焦点位置を合焦位置であると決定する合焦位置決定部と、
を備えることを特徴とする細胞観察装置。 - 請求項1に記載の細胞観察装置であって、
前記試料は細胞培養プレートであり、前記観察対象領域は該細胞培養プレート全体又は該プレートに形成されている一又は複数のウェルが含まれる領域であることを特徴とする細胞観察装置。 - 請求項1に記載の細胞観察装置であって、
前記スライダーに割り当てられる焦点位置の変化の範囲及びその変化のピッチをユーザが設定するための焦点位置合わせパラメータ設定部をさらに備えることを特徴とする細胞観察装置。 - 請求項1に記載の細胞観察装置であって、
前記表示部に表示されている観察対象領域全体の再構成画像である広範囲表示画像上で、同一の焦点位置を適用可能である同一焦点位置適用範囲をユーザが指定するための同一焦点位置適用範囲指定部、をさらに備え、
前記焦点位置合わせ対象範囲指定部は、前記同一焦点位置適用範囲指定部により指定された同一焦点位置適用範囲毎に焦点位置合わせ対象範囲をユーザに指定させることを特徴とする細胞観察装置。 - 請求項4に記載の細胞観察装置であって、
前記広範囲表示画像上の一部の範囲をユーザが拡大観察範囲として指定するための拡大観察範囲指定部と、
該指定された拡大観察範囲について少なくとも前記広範囲表示画像よりも倍率の高い拡大画像を作成し該拡大画像を前記表示部の画面上に表示する拡大画像作成部と、
をさらに備えることを特徴とする細胞観察装置。 - 請求項5に記載の細胞観察装置であって、
前記表示部に表示されている前記広範囲表示画像上の前記拡大観察範囲を移動させる又は拡大若しくは縮小させる操作をユーザが行うための操作部をさらに備え、
前記拡大画像作成部は、前記操作部を介した操作による移動後の又は拡大若しくは縮小後の拡大画像を作成して表示することを特徴とする細胞観察装置。
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
PCT/JP2017/007728 WO2018158810A1 (ja) | 2017-02-28 | 2017-02-28 | 細胞観察装置 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPWO2018158810A1 JPWO2018158810A1 (ja) | 2019-12-19 |
JP6760477B2 true JP6760477B2 (ja) | 2020-09-23 |
Family
ID=63371117
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2019502314A Active JP6760477B2 (ja) | 2017-02-28 | 2017-02-28 | 細胞観察装置 |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP6760477B2 (ja) |
WO (1) | WO2018158810A1 (ja) |
Families Citing this family (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP7015144B2 (ja) * | 2017-10-25 | 2022-02-02 | オリンパス株式会社 | 画像処理装置および顕微鏡システム |
WO2021261150A1 (ja) * | 2020-06-25 | 2021-12-30 | 富士フイルム株式会社 | 情報処理装置、その作動方法及び作動プログラム |
WO2021261158A1 (ja) * | 2020-06-25 | 2021-12-30 | 富士フイルム株式会社 | 情報処理装置、その作動方法及び作動プログラム |
Family Cites Families (11)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP4667944B2 (ja) * | 2005-04-20 | 2011-04-13 | シスメックス株式会社 | 画像作成装置 |
JP2009047460A (ja) * | 2007-08-15 | 2009-03-05 | Lasertec Corp | 共焦点顕微鏡 |
JP5048038B2 (ja) * | 2009-11-05 | 2012-10-17 | シスメックス株式会社 | 血液細胞分類結果の表示方法および血液細胞分類結果表示用プログラム |
WO2011089908A1 (ja) * | 2010-01-20 | 2011-07-28 | 株式会社ニコン | 細胞観察装置及び細胞培養方法 |
JP5444530B2 (ja) * | 2010-07-07 | 2014-03-19 | 公立大学法人兵庫県立大学 | ホログラフィック顕微鏡、微小被写体のホログラム画像記録方法、高分解能画像再生用ホログラム作成方法、および画像再生方法 |
WO2013070287A1 (en) * | 2011-11-07 | 2013-05-16 | The Regents Of The University Of California | Maskless imaging of dense samples using multi-height lensfree microscope |
JP5996334B2 (ja) * | 2012-08-28 | 2016-09-21 | オリンパス株式会社 | 顕微鏡システム、標本画像生成方法及びプログラム |
JP2015082095A (ja) * | 2013-10-24 | 2015-04-27 | 株式会社キーエンス | 画像処理装置、顕微鏡システム、画像処理方法およびプログラム |
JP5950473B2 (ja) * | 2014-06-12 | 2016-07-13 | レーザーテック株式会社 | レーザ顕微鏡及びスキャナー |
WO2016146279A1 (en) * | 2015-03-13 | 2016-09-22 | Universite Paris Descartes | Optical system for shaping the wavefront of the electric field of an input light beam |
JP6716121B2 (ja) * | 2015-04-09 | 2020-07-01 | 国立大学法人神戸大学 | ディジタルホログラフィック顕微鏡 |
-
2017
- 2017-02-28 WO PCT/JP2017/007728 patent/WO2018158810A1/ja active Application Filing
- 2017-02-28 JP JP2019502314A patent/JP6760477B2/ja active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JPWO2018158810A1 (ja) | 2019-12-19 |
WO2018158810A1 (ja) | 2018-09-07 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6348504B2 (ja) | 生体試料の分割画面表示及びその記録を取り込むためのシステム及び方法 | |
JP6860064B2 (ja) | 細胞観察装置 | |
CN110214290A (zh) | 显微光谱测量方法和系统 | |
JP6032767B2 (ja) | マイクロタイタープレート特性の画像の提示および評価の方法 | |
JP6760477B2 (ja) | 細胞観察装置 | |
Sioma | 3D imaging methods in quality inspection systems | |
JP2015082095A (ja) | 画像処理装置、顕微鏡システム、画像処理方法およびプログラム | |
JP6950813B2 (ja) | 細胞観察装置 | |
JP6900704B2 (ja) | 細胞観察システム | |
JP4296207B2 (ja) | 顕微測定装置 | |
WO2018158946A1 (ja) | 細胞観察装置 | |
KR100897674B1 (ko) | 표본 검사 시스템 및 표본 검사 방법 | |
US9823269B2 (en) | Surface analyzer | |
Adamczyk et al. | Three-dimensional measurement system for crime scene documentation | |
WO2019043953A1 (ja) | 細胞観察装置 | |
JP7036192B2 (ja) | 細胞観察装置 | |
JP4046161B2 (ja) | 標本画像データ処理方法及び標本検査システム | |
JP2017173653A (ja) | 画像取得システム | |
JP2022506170A (ja) | サンプル領域を画像化するための顕微鏡システムおよび相応する方法 | |
US20230288691A1 (en) | Microscope system, superimposing unit, and operation method | |
AU2013273789A1 (en) | Thickness estimation for Microscopy | |
Conklin | Tutorial for Collecting and Processing Images of Composite Structures to Determine the Fiber Volume Fraction | |
JP2006331852A (ja) | 表面観察分析装置 | |
JP2021048825A (ja) | 細胞観察装置 | |
WO2023078527A1 (en) | Method for providing position information for retrieving a target position in a microscopic sample, method for examining and/or processing such a target position and means for implementing these methods |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20190712 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20190712 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20200804 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20200817 |
|
R151 | Written notification of patent or utility model registration |
Ref document number: 6760477 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R151 |