JP6634081B2 - フローサイトメトリー細胞ソートシステム及びその使用方法 - Google Patents
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- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Description
例示的な実施形態を更に詳細に説明する前に、以下の定義を記載して、説明で使用される用語の意味及び範囲を示し、定義する。
本発明の態様は、細胞をソートするシステム及びその使用方法を含む。幾つかの場合、システムは、細胞の混合物を含む試料が装填されたフローチャネルを有するフローサイトメーターシステムであり、細胞が検出され及び/又は識別(すなわち、分析)される検知領域を、細胞は実質的に一度に1つずつ通過する。次に、この分析細胞のフローストリームをソートして、所望の分析細胞の母集団を細胞受け取り場所に送ることができ、その間、フローストリームの残りの部分は破棄されるか、又は別個に収集される。
本システムは、試料から望ましい細胞母集団を分け、分離することが可能な細胞ソーターを含み得る。機械的ソート、静電的ソート、又は磁気的ソートが可能な細胞ソーター等の標的粒子(例えば、細胞)を分析し、及び/又は分けるために好都合な任意の細胞ソーターが、本システムにおいて用途を有し得る。幾つかの場合、細胞ソーターは、フローサイトメーターシステムの一部である。特定の場合、システムは、液滴ストリームを生成するように構成され、この場合、液滴は分析細胞を含む。関心のある液滴を受け取り場所に逸らすことは、液滴を静電荷電し、静電場を印加することにより荷電液滴をフローストリームから偏向させることを介して、細胞ソーターにより達成し得る。そのような静電場は、フローストリームに隣接して位置決めされる偏向板により生成し得る。本明細書で使用される場合、「偏向」又は「偏向された」という用語は、関心のある液滴が液滴分析フローストリームから静電的に偏向されることを指し、それにより、細胞ソーターは、フローストリーム中の関心のある細胞を識別して追跡し、関心のある細胞を含むフローストリームの液滴のみ逸らして、容器に収集し得る。幾つかの場合、システムは、1つの液滴を各容器に偏向するように構成される。
システムは、容器を搭載する支持ステージを含み得る。支持ステージは、容器を所定位置に保持し、容器を細胞ソーターのフローストリームに相対して移動させるように構成される任意の好都合な搭載デバイスであり得る。支持ステージは、他のタイプの支持構造の中でも特に、平坦な基板、輪郭を有する搭載デバイス、円筒形又は管状支持構造、又はレーザ若しくはLEDホルダーを含み得る。幾つかの場合、支持ステージはマルチウェルトレイ用のマウントである。本明細書で使用される場合、「マルチウェルトレイ」及び「マルチウェルプレート」という用語は、任意の好都合なフォーマットで構成し得る収集容器、例えば、ウェル、バイアル、管等の二次元アレイを指すために同義で使用される。関心のあるマルチウェルトレイとしては、容器の12ウェル、24ウェル、96ウェル、及び384ウェルプレート又はトレイ等のX−Y平面において一連の行及び列(例えば、2×3、2×6、3×4、8×12、16×24)で配置されるウェル、管、及び/又はバイアルの構成を含む構造が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書で使用される場合、「容器」という用語は、容器の構成(例えば、マルチウェルトレイ内のウェル、バイアル、管等)のうちの1つであり得る離散容器を指す。本システム内の容器の数に応じて、2つ以上、3つ以上、又は4つ以上等、及び5つ以上の支持ステージを含め、支持ステージの数も必要に応じて変更し得る。特定の実施形態では、関心のあるシステムは、搭載容器、例えば、搭載マルチウェルトレイを有する支持ステージ等の1つの支持ステージを含む。特定の実施形態では、支持ステージは、6つ以上、12以上、24以上、48以上、96以上、又は384以上の離散した搭載容器等の2つ以上の搭載容器を含む。
本システムは、支持ステージ(したがって、搭載マルチウェルトレイ)の連続的な移動を細胞ソーターからの細胞の送出と同期させるコントローラを含み得る。幾つかの実施形態では、制御論理が記憶されたコンピュータ使用可能媒体を含むコンピュータプログラム製品が記載される。制御論理は、コンピュータのプロセッサにより実行されると、プロセッサに本明細書に記載される機能を実行させる。コントローラの論理は、マルチウェルトレイが移動する際、マルチウェルトレイの相対位置に従って、分析細胞を特定のウェルに向けることができ、収集することができるタイムスロットを識別し得る。本明細書で使用する場合、「同期」という用語は、逸らされたフローストリームを受け取るように容器が適宜位置決めされる場合のみ、関心のあるフローストリームを受け取り場所に逸らすことが行われるプロセスを指す。容器は、フローストリームからその場所に逸らされた液体が容器の口内部で収集されるときは随時、受け取り場所に位置決めされていると見なされる。本明細書で使用される場合、「タイムスロット」という用語は、1つの離散した搭載容器が細胞ソーターの逸らされたフローストリームを受け取り収集する(例えば、偏向液滴受け取り位置において偏向液滴を受け取る)ために適切な位置にある、支持ステージの軌跡中の時間期間を指す。幾つかの場合、支持ステージの軌跡は、x−y平面でのステージの(例えば、提案される)連続的な移動との偏向液滴受け取り場所(直交するz軸から射影される)の相対位置をプロットすることにより特定される。
記憶された命令(例えば、本明細書に記載のような)を含むメモリを含むコンピュータ可読媒体も提供される。本明細書に記載の命令及びアルゴリズムは、任意の好都合なコンピュータ可読媒体、例えば、コンピュータにより直接読み取りアクセスすることができる任意の媒体に記録することができる。そのような媒体としては、フロッピーディスク、ハードディスク記憶媒体、及び磁気テープ等の磁気記憶媒体;CD−ROM等の光学記憶媒体;RAM及びROM等の電気記憶媒体;ポータブルフラッシュドライブ;並びに磁気/光学記憶媒体等のこれらのカテゴリのハイブリッドが挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態では、システムはフローサイトメーターを含む。そのような実施形態の幾つかの場合、本システムは、例えば、光散乱によりフローストリームからの液滴の偏向及び/又は収集を検出するように構成し得る。前方散乱光を、照射されたフローストリームから1つ又は複数の前方散乱検出器により収集し得る。特定の実施形態では、前方散乱検出器は、光源からフローストリームの逆側に位置決めされ、前方散乱光を収集し検出するように位置決めされる。特定の実施形態では、本システムは、内部全反射により上流を伝搬する光から光信号を検出することにより、フローストリームとの位置合わせを評価するように構成される。
これまでに概説したように、本発明の態様は、本システムを使用して細胞を容器にソートする方法を含む。幾つかの実施形態では、方法は、例えば、上述したように、細胞を含む試料を、細胞をソートするシステムに装填することと、システムが動作して、支持ステージを二次元で連続的に移動させ、容器が偏向液滴受け取り場所と位置合わせされると、偏向信号を細胞ソーターに送信するようにシステムを動作させながら、細胞をソートすることとを含む。
本明細書に記載される本システム、本方法、及び本コンピュータ可読媒体は、フローサイトメーターでのマルチウェルトレイへの偏向液滴の収集等の粒子の収集を自動化することが望ましい様々な異なる用途における使用を見出す。本開示は、生物学的試料から準備された細胞が、研究、研究所でのテスト、及び治療での使用に望ましいことがある用途における使用も見出す。幾つかの実施形態では、本方法及び本デバイスは、標的流体試料又は組織生物学的試料から準備された個々の細胞の取得を促進し得る。例えば、本方法及び本システムは、ガン等の疾病の研究又は診断用試料として使用される流体試料又は組織試料からの細胞の取得を促進する。同様に、本方法及び本システムは、治療に使用される流体試料又は組織試料からの細胞の取得を促進する。本開示の方法及びデバイスでは、従来のフローサイトメトリーシステムと比較して、強化された効率及び低コストで生物学的試料(例えば、器官、組織、組織断片、流体)からの細胞を分けて収集することができる。
例1:システムの設計
ソーター機器(例えば、図1の101)、容器トレイを担持し、且つソーターに対して連続的に移動することができるステージ(例えば、図1の102)と、ソーター及びステージの相互作用を調整するコントローラ(例えば、図1の103)とを含むシステム(例えば、図1の100)が設計される。図1は、このシステムのブロック図を示す。ソーターは、ソートする準備ができたときをコントローラに通知する。次に、コントローラはステージの移動を開始する。特定のウェルへの細胞の堆積が可能であり、十分に可能且つ確実である位置にステージがあるとき、コントローラは、液滴をウェルに逸らすようにソーターに通知する。
図2は、上から見た24ウェルトレイ(200)の概略図を示す。破線201は、ストップアンドゴー設計でのトレイに対するソーターのノズルの軌跡を示す。軌跡は、ウェルA1の中心202で開始し、D1で終了する。
図3は、本発明の実施形態での24ウェルトレイ(300)の断片及びノズルの軌跡(破線301)の断片の概略図を示す。軌跡のこの断片は、点302から開始してウェルA1の左側に延び、ウェルA6を超えて延びる。陰影付きエリア304は、ウェルへの液滴の堆積が可能且つ確実な領域を表わす。ノズルがそのようなエリア内部に配置される場合、ソーターは、堆積を可能にするコマンドをコントローラから取得する。
1.細胞をソートするシステムであって、
分析液滴ストリームを生成するように構成され、且つ分析液滴ストリームからの分析液滴を偏向液滴受け取り場所に偏向させることが可能な偏向器を備える細胞ソーターと、
容器を備え、且つ二次元で連続的に移動するように構成される支持ステージと、
前記偏向液滴受け取り場所との前記容器の位置合わせを特定し、且つ前記容器が前記偏向液滴受け取り場所と位置合わせされたときに、偏向信号を前記細胞ソーターに送信するための記憶された命令を含むメモリに、動作可能に結合されるプロセッサと
を備えるシステム。
2.メモリは、容器が偏向液滴受け取り場所と位置合わせされるタイムスロットを特定するための命令を含む付記1に記載のシステム。
3.偏向信号は、初期偏向サブ信号及び最終偏向サブ信号を含み、メモリは、タイムスロットの開始時、分析液滴が存在する場合に分析液滴を偏向させるように偏向器を構成する初期偏向サブ信号を細胞ソーターに送信することにより、偏向信号を生成するための命令を含む付記1又は2に記載のシステム。
4.偏向信号を生成するための命令は、タイムスロットの終了時、分析液滴を偏向しないように偏向器を構成する最終偏向サブ信号を細胞ソーターに送信することを更に含む付記3に記載のシステム。
5.偏向信号を生成するための命令は、1つの分析液滴がタイムスロット中に偏向された後、最終偏向サブ信号を細胞ソーターに送信することを更に含み、最終偏向サブ信号は、分析液滴を偏向しないように偏向器を構成する付記3に記載のシステム。
6.メモリは、細胞ソーターからの偏向液滴の頻度を決定するアルゴリズムを含む付記1〜5のいずれか一つに記載のシステム。
7.メモリは、タイムスロットの長さを偏向液滴の頻度に合わせ、それにより、細胞ソーターがタイムスロット中に1つの液滴を偏向することが決定されるアルゴリズムを含む付記6に記載のシステム。
8.メモリは、細胞ソーターからの偏向液滴の頻度の変化に応答して、支持ステージの速度を自動的に調整するための命令を含む付記7に記載のシステム。
9.支持ステージは2つ以上の容器を備え、システムは、X−Y平面での支持ステージの連続的な移動を介して、Z次元において2つ以上の容器を偏向液滴受け取り場所に自動的に且つ順次位置合わせするように構成される付記1〜8のいずれか一つに記載のシステム。
10.標的細胞を含むと判断される分析液滴を偏向するように構成される付記1〜9のいずれか一つに記載のシステム。
11.1つの液滴を容器に偏向するように構成される付記1に記載のシステム。
12.支持ステージは、マルチウェルトレイとして構成される2つ以上の容器を備える付記1〜11のいずれか一つに記載のシステム。
13.フローサイトメーターシステムである付記1〜12のいずれか一つに記載のシステム。
14.記憶された命令を含むメモリを備えるコンピュータ可読媒体であって、命令は、
X−Y平面において、容器を備える支持ステージを連続的に移動させるための命令と、
偏向液滴受け取り場所との容器の位置合わせを特定するアルゴリズムと、
容器が偏向液滴受け取り場所と位置合わせされたときに偏向信号を細胞ソーターに送信するための命令であって、細胞ソーターは、分析液滴ストリームからの分析液滴を偏向液滴受け取り場所に偏向させることが可能な偏向器を備える、命令と
を含む媒体。
15.メモリは、容器が偏向液滴受け取り場所と位置合わせされるタイムスロットを特定するための命令を含む付記14に記載の媒体。
16.偏向信号は、初期偏向サブ信号及び最終偏向サブ信号を含み、
メモリは、タイムスロットの開始時、分析液滴が存在する場合に分析液滴を偏向させるように偏向器を構成する初期偏向サブ信号を細胞ソーターに送信することにより、偏向信号を生成するための命令を含む付記15に記載の媒体。
17.メモリは、タイムスロットの終了時、分析液滴を偏向しないように偏向器を構成する最終偏向サブ信号を細胞ソーターに送信することにより、偏向信号を生成するための命令を更に含む付記16に記載の媒体。
18.メモリは、1つの分析液滴がタイムスロット中に偏向された後、最終偏向サブ信号を細胞ソーターに送信するための命令を更に含み、最終偏向サブ信号は、分析液滴を偏向しないように偏向器を構成する付記16に記載の媒体。
19.支持ステージは2つ以上の容器を備える付記14〜18のいずれか一つに記載の媒体。
20.メモリは、X−Y平面において支持ステージを自動的に且つ連続的に移動させて、Z次元において2つ以上の容器を偏向液滴受け取り場所に順次位置合わせするための命令を含む付記19に記載の媒体。
21.メモリは、タイムスロットの長さを偏向液滴の頻度に合わせ、それにより、細胞ソーターがタイムスロット中に1つの液滴を偏向させることが決定されるアルゴリズムを含む付記14〜20のいずれか一つに記載の媒体。
22.メモリは、細胞ソーターからの偏向液滴の頻度変化に応答して、支持ステージの速度を調整するための命令を含む付記21に記載の媒体。
23.細胞を容器にソートする方法であって、
(a)細胞を含む試料を、細胞をソートするシステムに装填することとし、前記システムは、
分析液滴ストリームを生成するように構成され、且つ分析液滴を偏向液滴受け取り場所に偏向させることが可能な偏向器を備える細胞ソーターと、
容器を備え、且つ二次元で連続的に移動するように構成される支持ステージと、
前記偏向液滴受け取り場所との前記容器の位置合わせを特定し、且つ前記容器が前記偏向液滴受け取り場所と位置合わせされたときに、偏向信号を前記細胞ソーターに送信するための記憶された命令を含むメモリに、動作可能に結合されるプロセッサと
を備えており、
(b)前記システムが動作して、前記支持ステージを二次元で連続的に移動させ、且つ前記容器が前記偏向液滴受け取り場所と位置合わせされたときに前記偏向信号を前記細胞ソーターに送信するように前記システムを動作させている間に、前記細胞をソートすることと
を含む方法。
24.システムは、容器が偏向液滴受け取り場所と位置合わせされるタイムスロットを特定するように動作する付記23に記載の方法。
25.偏向信号は、初期偏向サブ信号及び最終偏向サブ信号を含み、
システムは、タイムスロットの開始時、分析液滴が存在する場合に分析液滴を偏向させるように偏向器を構成する初期偏向サブ信号を細胞ソーターに送信することにより、偏向信号を生成するように動作する付記24に記載の方法。
26.システムは、タイムスロットの終了時、最終偏向サブ信号を細胞ソーターに送信するように動作し、最終偏向サブ信号は、分析液滴を偏向しないように偏向器を構成する付記25に記載の方法。
27.システムは、1つの分析液滴がタイムスロット中に偏向された後、最終偏向サブ信号を細胞ソーターに送信するように動作し、最終偏向サブ信号は、分析液滴を偏向しないように偏向器を構成する付記25に記載の方法。
28.支持ステージは2つ以上の容器を備え、X−Y平面において支持ステージを自動的に且つ連続的に移動させて、Z次元において2つ以上の容器を偏向液滴受け取り場所に順次位置合わせし、それにより、2つ以上の容器において分析細胞を収集することを含む付記23〜27のいずれか一つに記載の方法。
29.支持ステージは12以上の容器を備える付記23〜28のいずれか一つに記載の方法。
30.分析液滴ストリームは、ソートされた標的細胞を含むように特定される付記23〜29のいずれか一つに記載の方法。
31.細胞ソーターは、標的細胞が存在すると判断される場合にのみ分析液滴を偏向する付記23〜30のいずれか一つに記載の方法。
32.1つの液滴を2つ以上の容器のそれぞれに偏向させることを含む付記28に記載の方法。
33.12以上の容器のそれぞれにおいて標的細胞を収集することを含む付記29に記載の方法。
34.システムは、タイムスロットの長さを偏向液滴の頻度を合わせ、それにより、細胞ソーターがタイムスロット中に1つの液滴を偏向させることが決定されるように動作する付記23〜33のいずれか一つに記載の方法。
35.細胞ソーターからの偏向液滴の頻度変化に応答して、支持ステージの速度を調整することを更に含む付記34に記載の方法。
36.細胞を12以上の容器にソートするために経過する時間は、支持ステージを断続的に移動させることを含む制御方法の少なくとも1/2である付記29に記載の方法。
本願は、2014年12月4日に出願された米国仮特許出願第62/087,662号明細書に対する優先権を主張するものであり、この出願の開示は参照により本明細書に援用される。
Claims (15)
- 細胞をソートするシステムであって、
分析液滴ストリームを生成するように構成され、且つ前記分析液滴ストリームからの分析液滴を偏向液滴受け取り場所に偏向させることが可能な偏向器を備える細胞ソーターと、
容器を備え、且つ細胞がソートされるときに二次元で連続的に移動するように構成される支持ステージと、
前記偏向液滴受け取り場所との前記容器の位置合わせを特定し、且つ前記容器が前記偏向液滴受け取り場所と位置合わせされたときに、偏向信号を前記細胞ソーターに送信するための記憶された命令を含むメモリに、動作可能に結合されるプロセッサと
を備えることを特徴とするシステム。 - 前記メモリは、前記容器が前記偏向液滴受け取り場所と位置合わせされるタイムスロットを特定するための命令を含むことを特徴とする請求項1に記載のシステム。
- 前記偏向信号は、初期偏向サブ信号及び最終偏向サブ信号を含み、前記メモリは、前記タイムスロットの開始時、分析液滴が存在する場合に前記分析液滴を偏向させるように前記偏向器を構成する初期偏向サブ信号を前記細胞ソーターに送信することにより、前記偏向信号を生成するための命令を含むことを特徴とする請求項2に記載のシステム。
- 前記偏向信号を生成するための前記命令は、前記タイムスロットの終了時、分析液滴を偏向しないように前記偏向器を構成する最終偏向サブ信号を前記細胞ソーターに送信することを更に含むことを特徴とする請求項3に記載のシステム。
- 前記偏向信号を生成するための前記命令は、1つの分析液滴が前記タイムスロット中に偏向された後、最終偏向サブ信号を前記細胞ソーターに送信することを更に含み、前記最終偏向サブ信号は、分析液滴を偏向しないように前記偏向器を構成することを特徴とする請求項3に記載のシステム。
- 前記メモリは、前記細胞ソーターからの偏向液滴の頻度を決定するアルゴリズムを含むことを特徴とする請求項1に記載のシステム。
- 前記メモリは、タイムスロットの長さを偏向液滴の前記頻度に合わせ、それにより、前記細胞ソーターが前記タイムスロット中に1つの液滴を偏向することが決定されるアルゴリズムを含むことを特徴とする請求項6に記載のシステム。
- 前記メモリは、前記細胞ソーターからの偏向液滴の前記頻度の変化に応答して、前記支持ステージの速度を自動的に調整するための命令を含むことを特徴とする請求項7に記載のシステム。
- 前記支持ステージは2つ以上の容器を備え、及び前記システムは、X−Y平面での前記支持ステージの連続的な移動を介して、Z次元において前記2つ以上の容器を前記偏向液滴受け取り場所に自動的に且つ順次位置合わせするように構成されることを特徴とする請求項1〜8のいずれか一項に記載のシステム。
- 標的細胞を含むと判断される分析液滴を偏向するように構成されることを特徴とする請求項1〜9のいずれか一項に記載のシステム。
- 1つの液滴を前記容器に偏向するように構成されることを特徴とする請求項1に記載のシステム。
- 前記支持ステージは、マルチウェルトレイとして構成される2つ以上の容器を備えることを特徴とする請求項1〜11のいずれか一項に記載のシステム。
- フローサイトメーターシステムであることを特徴とする請求項1〜12のいずれか一項に記載のシステム。
- 細胞を容器にソートする方法であって、
(a)細胞を含む試料を、細胞をソートするシステムに装填することとし、前記システムは、
分析液滴ストリームを生成するように構成され、且つ分析液滴を偏向液滴受け取り場所に偏向させることが可能な偏向器を備える細胞ソーターと、
容器を備え、且つ二次元で連続的に移動するように構成される支持ステージと、
前記偏向液滴受け取り場所との前記容器の位置合わせを特定し、且つ前記容器が前記偏向液滴受け取り場所と位置合わせされたときに、偏向信号を前記細胞ソーターに送信するための記憶された命令を含むメモリに、動作可能に結合されるプロセッサと
を備えており、
(b)前記システムが動作して、前記支持ステージを二次元で連続的に移動させ、且つ前記容器が前記偏向液滴受け取り場所と位置合わせされたときに前記偏向信号を前記細胞ソーターに送信するように前記システムを動作させている間に、前記細胞をソートすることと
を含むことを特徴とする方法。 - 前記システムは、請求項1〜13のいずれか一項に記載のシステムであることを特徴とする請求項14に記載の方法。
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