JP6568515B2 - ステープルドおよびステッチドポリペプチドならびにその使用 - Google Patents

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Description

関連出願
本願は、参照によって本明細書に組み込まれる2013年3月13日出願の米国仮特許出願U.S.S.N.61/779,917の米国特許法第119条(e)の下における優先権を請求する。
ペプチドおよびポリペプチドがホルモン、酵素阻害剤および基質、神経伝達物質、およびニューロメディエーターとして果たす重要な生物学的役割は、ペプチドまたはペプチドミメティックの治療剤としての幅広い使用に至った。ペプチドの生物活性な立体配座は、αヘリックス、βシート、ターン、およびループなどの構造要素を組み合わせており、重要である。なぜならば、それは受容体または酵素の選択的な生物学的認識を可能にし、それによって、細胞−細胞情報交換に影響を与えるならびに/または不可欠な細胞機能、例えば代謝、免疫防御、および生殖を制御するからである(Babine et al., Chem. Rev. (1997) 97: 1359)。αヘリックスはペプチドの主な構造成分の1つである。しかしながら、αヘリックスペプチドは解けてランダムコイルを形成する傾向を有し、それらは多くの場合に生物学的により少なく活性であるかまたはさらには不活性であり、蛋白質加水分解に対して高度に敏感である。
多くの研究グループが、治療薬としてのより堅牢なペプチドの設計および合成のための戦略を開発して来た。例えば、1つの戦略は、ペプチド鎖中により堅牢な官能性を組み込みながら、ペプチドの固有の立体配座および二次構造をなお維持することであった(例えば、Gante et al., Angew. Chem. Int. Ed. Engl. (1994) 33: 1699-1720、Liskamp et al., Recl. Trav. Chim. Pays-Bas (1994) 113: 1、Giannis et al., Angew. Chem. Int. Ed. Engl. (1993) 32: 1244、P. D. Bailey, Peptide Chemistry, Wiley, New York, 1990, p. 182、およびそれらに引用された参照物参照)。別の手法は、共有結合的な架橋によってペプチドを安定化することであった(例えば、Phelan et al., J. Am. Chem. Soc. (1997) 119:455、Leuc et al., Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA (2003) 100: 11273、Bracken et al., J. Am. Chem. Soc. (1994) 116:6432、およびYan et al., Bioorg. Med. Chem. (2004) 14: 1403参照)。αヘリックス二次構造を有しやすいポリペプチドを架橋することは、ポリペプチドをその固有のαヘリックス立体配座に拘束し得る。拘束された二次構造は、蛋白質加水分解による切断に対するペプチドの耐性を増大させ、ペプチドの疎水性を増大させ、(例えば、エネルギー依存的な輸送機構、例えばピノサイトーシスによる)標的細胞の膜中へのペプチドのより良い貫入を可能にし、および/または対応する未架橋のペプチドに対して相対的なペプチドの生物学的活性の改善に至り得る。
ペプチドを架橋するための1つのかかる技術は「ペプチドステープリング」である。「ペプチドステープリング」は、閉環メタセシス(RCM)反応を用いて架橋を形成し、ポリペプチド中に存在する2つのオレフィン含有側鎖が共有結合的に連結される(「ステープリングされた(ステープルド)」)合成方法論を記載するために新造された用語である(J. Org. Chem. (2001) vol. 66, issue 16の表紙絵(αヘリックスペプチドのメタセシスに基づく架橋を記載している)、Blackwell et al., Angew Chem. Int. Ed. (1994) 37:3281、およびUS7,192,713参照)。「ペプチドステッチ」は、多重ステープルド(「ステッチド(ステッチされた)」としても公知の)ポリペプチドを提供するための、単一のポリペプチド鎖中の複数の「ステープリング」事象を伴う(WO2008/121767およびWO2011/008260参照)。全炭化水素架橋を用いるペプチドのステープリングは、その固有の立体配座および/または二次構造を維持することを、特に生理的に関係する障害において助けることが示されている(Schafmiester et al., J. Am. Chem. Soc. (2000) 122:5891-5892、Walensky et al., Science (2004) 305: 1466-1470参照)。このステープリング技術はアポトーシス誘導性のBID−BH3のαヘリックスに適用されて、非ステープルドポリペプチドと比較して、動物モデルにおける白血病の悪性増殖のより高い抑圧をもたらした。Walensky et al., Science (2004) 305: 1466-1470、米国特許出願公開第2005/02506890号、および米国特許出願公開第 2006/0008848号参照。しかしながら、治療薬または研究ツールとして有用であり得るポリペプチドをステープリングおよびステッチするための新たな技術の開発には必要および関心が残っている。
「ペプチドステープリング」は、閉環メタセシス(RCM)反応を用いてオレフィン部分同士を共有結合的に連結することによって(すなわち「一緒になってステープリングされた」)、ポリペプチド鎖の側鎖を架橋することを指す。「ペプチドステッチ」は、単一のポリペプチド鎖中の複数の「ステープル」を包含し、多重ステープルド(「ステッチド」としてもまた公知の)ポリペプチドを提供する(国際PCT公開WO2008/121767およびWO2011/008260参照)。ペプチドステープリングおよびステッチは、ポリペプチドのαヘリックス立体配座を安定化する。本発明は、αヘリックス中の2つのアミノ酸のα炭素同士を繋ぐへテロ脂肪族または環含有架橋を有する、ステープルドおよびステッチドポリペプチドを提供する。本発明は、ステープルドまたはステッチドポリペプチドの医薬組成物、本発明のポリペプチドを調製する方法、さらには本発明のポリペプチドを用いる方法をさらに提供する。本発明は、ステープルの閉環メタセシス(RCM)後の改変、例えば−C(=O)O−逆挿入、もたらされたオレフィンの還元、または標的化部分の付加もまた提供する。
1つの側面において、本発明は式(I)のステープルドポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩を提供し、R、R、R、R2a、R3a、R2b、R3b、L、L、XAA、p、m、n、およびqは本明細書において定義される通りである。
別の側面において、本発明は、式(VI)のステッチドポリペプチド(すなわち、多重ステープルドポリペプチド(polpeptide))、
またはその医薬的に許容される塩を提供し、R、R、R、R2a、R3a、R2b、R3b、L、L、XAA、p、m、s、t、y、z、n、およびqは本明細書において定義される通りである。
別の側面において、本発明は、式(I)のステープルドポリペプチドを作る方法を提供する。かかる方法は、式(i)、
またはその塩を閉環メタセシス(RCM)触媒によって処理することを含む。
別の側面において、本発明は、式(VI)のステッチドポリペプチドを作る方法を提供する。かかる方法は、式(ii)、
またはその塩を閉環メタセシス(RCM)触媒によって処理することを含む。
別の側面において、本発明は、式(I)もしくは(VI)の化合物またはその医薬的に許容される塩、および任意に医薬的に許容される担体を含む医薬組成物を提供する。ある態様において、本明細書に記載の医薬組成物は、式(I)もしくは(VI)の化合物またはその医薬的に許容される塩の治療有効量を含む。
別の側面において、本発明は、式(I)もしくは(VI)の化合物またはその医薬的に許容される塩あるいはその医薬組成物を含むキットを提供する。ある態様において、キットは、式(I)もしくは(VI)の化合物またはその医薬的に許容される塩あるいはその医薬組成物を投与するための指示書きをさらに含む。キットは、対象またはヘルスケア専門家のために使用または処方情報を記載する容器詰め情報もまた含み得る。かかる情報は規制当局、例えば米国食品医薬品局(FDA)によって要求され得る。キットは、化合物または組成物の投与のためのデバイス、例えば非経口投与のためのシリンジもまた任意に含み得る。
別の側面において、本発明は障害をインビボまたはインビトロで治療する方法を提供し、これは対象に式(I)または(VI)の化合物の治療有効量を投与することを含む。例示的な障害は、増殖性障害、神経系障害、免疫系障害、内分泌系障害、心血管系障害、血液系障害、炎症性障害、および尚早なまたは望まれない細胞死によって特徴づけられる障害である。
本願は、種々の登録済み特許、公開済み特許願、雑誌記事、および他の公開を参照しているが、それらの全ては参照によって本明細書に組み込まれる。
本発明の種々の態様の詳細が本明細書において示される。本発明の他の特徴、目的、および利点は、発明を実施するための形態、図面、例、および特許請求の範囲から明らかである。
定義
具体的な官能基および化学用語の定義を下により詳細に記載する。化学元素はHandbook of Chemistry and Physics, 75th Ed.内表紙の元素周期表CAS版に従って同定され、具体的な官能基はそこに記載の通りに一般的に定義される。加えて、有機化学の一般的な法則、さらには具体的な官能部分および反応性は、Organic Chemistry, Thomas Sorrell, University Science Books, Sausalito, 1999、Smith and March March's Advanced Organic Chemistry, 5th Edition, John Wiley & Sons, Inc., New York, 2001、Larock, Comprehensive Organic Transformations, VCH Publishers, Inc., New York, 1989、およびCarruthers, Some Modern Methods of Organic Synthesis, 3rd Edition, Cambridge University Press, Cambridge, 1987に記載されている。
本明細書に記載の化合物、アミノ酸、およびポリペプチドは1つまたは2つ以上の不斉中心を含み得、それゆえに種々の異性体形態、例えばエナンチオマーおよび/またはジアステレオマーとして存在し得る。例えば、本明細書に記載の化合物、アミノ酸、およびポリペプチドは、個別のエナンチオマー、ジアステレオマー、もしくは幾何異性体の形態であり得、または立体異性体の混合物の形態であり得る(ラセミ混合物および1つまたは2つ以上の立体異性体が濃縮された混合物を含む)。異性体は当業者に公知の方法(キラル高圧液体クロマトグラフィー(HPLC)ならびにキラル塩の形成および結晶化を含む)によって混合物から単離され得る。または、好ましい異性体が不斉合成によって調製され得る。例えば、Jacques et al., Enantiomers, Racemates and Resolutions (Wiley Interscience, New York, 1981)、Wilen et al., Tetrahedron 33:2725 (1977); Eliel, E.L. Stereochemistry of Carbon Compounds (McGraw-Hill, NY, 1962)、およびWilen, S.H. Tables of Resolving Agents and Optical Resolutions p. 268 (E.L. Eliel, Ed., Univ. of Notre Dame Press, Notre Dame, IN 1972)参照。本発明は、加えて、他の異性体を実質的に含まない個別の異性体およびその代わりに種々の異性体の混合物としての、本明細書に記載の化合物、アミノ酸、およびポリペプチドを包含する。
値の範囲が挙げられているときには、範囲内の各値および部分範囲を包含することが意図されている。例えば「C1−6アルキル」は、C、C、C、C、C、C、C1−6、C1−5、C1−4、C1−3、C1−2、C2−6、C2−5、C2−4、C2−3、C3−6、C3−5、C3−4、C4−6、C4−5、およびC5−6アルキルを包含することが意図されている。
本明細書において用いられる場合、接尾辞「エン」で終わる置換基名は、本明細書において定義されるモノラジカル基からの追加の水素原子の除去に由来する、ビラジカルを指す。それゆえに、例えば、本明細書において定義されるモノラジカルのアルキルは、追加の水素原子の除去によってビラジカルのアルキレンとなる。同様に、アルケニルはアルケニレンであり、アルキニルはアルキニレンであり、ヘテロアルキルはヘテロアルキレンであり、ヘテロアルケニルはヘテロアルケニレンであり、ヘテロアルキニルはへテロアルキニレンであり、カルボシクリルはカルボシクリレンであり、ヘテロシクリルはヘテロシクリレンであり、アリールはアリーレンであり、ヘテロアリールはへテロアリーレンである。
用語「脂肪族」は、本明細書において用いられる場合、飽和および不飽和の非芳香族、直鎖(すなわち非分岐)、分岐、非環式、および環式(すなわち炭素環式)炭化水素を両方含む。いくつかの態様において、脂肪族基は1つまたは2つ以上の官能基によって任意に置換される。当業者には当然のことながら、「脂肪族」は本明細書においてはアルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、およびシクロアルケニル部分を含むことが意図されている。
用語「へテロ脂肪族」は、本明細書において用いられる場合、1つまたは2つ以上の酸素、硫黄、窒素、リン、またはケイ素原子を、例えば炭素原子の代わりに含有する脂肪族部分を指す。へテロ脂肪族部分は分岐、非分岐、環式、もしくは非環式であり得、飽和および不飽和ヘテロ環、例えばモルフォリノ、ピロリジニルなどを含む。ある態様において、へテロ脂肪族部分は、1つまたは2つ以上の部分によるその上の水素原子の1つまたは2つ以上の独立の置き換えによって置換される。部分は、脂肪族、へテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、アルコキシ、アリールオキシ、ヘテロアルコキシ、ヘテロアリールオキシ、アルキルチオ、アリールチオ、ヘテロアルキルチオ、ヘテロアリールチオ、−F、−Cl、−Br、−I、−OH、−NO、−CN、−CF、−CHCF、−CHCl、−CHOH、−CHCHOH、−CHNH、−CHSOCH、−C(O)R、−CO(R)、−CON(R、−OC(O)Rxa、−OCOxa、−OCON(Rxa、−N(Rxa、−S(O)xa、−NRxa(CO)Rxaを含むが、それらに限定されない。Rxaのそれぞれは独立して脂肪族、へテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、アリールアルキル、またはヘテロアリールアルキルを含むが、それらに限定されない。上および本明細書に記載の脂肪族、へテロ脂肪族、アリールアルキル、またはヘテロアリールアルキル置換基のいずれかは、置換もしくは無置換の分岐もしくは非分岐の環式もしくは非環式であり得、上および本明細書に記載のアリールもしくはヘテロアリール置換基のいずれかは置換もしくは無置換であり得る。一般的に適用可能な置換基の追加の例は、本明細書に記載の例において示される具体的な態様によって例示される。
本明細書において用いられる場合、「アルキル」は、1〜30個の炭素原子を有する直鎖もしくは分岐飽和炭化水素基のラジカルを指す(「C1−30アルキル」)。いくつかの態様においてアルキル基は1〜20個の炭素原子を有する(「C1−20アルキル」)。いくつかの態様においてアルキル基は1〜10個の炭素原子を有する(「C1−10アルキル」)。いくつかの態様においてアルキル基は1〜9つの炭素原子を有する(「C1−9アルキル」)。いくつかの態様においてアルキル基は1〜8つの炭素原子を有する(「C1−8アルキル」)。いくつかの態様においてアルキル基は1〜7つの炭素原子を有する(「C1−7アルキル」)。いくつかの態様においてアルキル基は1〜6つの炭素原子を有する(「C1−6アルキル」)。いくつかの態様においてアルキル基は1〜5つの炭素原子を有する(「C1−5アルキル」)。いくつかの態様においてアルキル基は1〜4つの炭素原子を有する(「C1−4アルキル」)。いくつかの態様においてアルキル基は1〜3つの炭素原子を有する(「C1−3アルキル」)。いくつかの態様においてアルキル基は1〜2つの炭素原子を有する(「C1−2アルキル」)。いくつかの態様においてアルキル基は1つの炭素原子を有する(「Cアルキル」)。いくつかの態様においてアルキル基は2〜6つの炭素原子を有する(「C2−6アルキル」)。C1−6アルキル基の例は、メチル(C)、エチル、(C)、n−プロピル(C)、イソプロピル(C)、n−ブチル(C)、tert−ブチル(C)、sec−ブチル(C)、イソブチル(C)、n−ペンチル(C)、3−ペンタニル(C)、アミル(C)、ネオペンチル(C)、3−メチル−2−ブタニル(C)、第3級アミル(C)、およびn−ヘキシル(C)を含む。アルキル基の追加の例はn−ヘプチル(C)、n−オクチル(C)および同様のものを含む。別様に指定されていない限り、アルキル基のそれぞれは独立して無置換であるか(「無置換アルキル」)、または1つもしくは2つ以上の置換基によって置換される(「置換アルキル」)。ある態様においてアルキル基は無置換C1−10アルキル(例えば−CH)である。ある態様においてアルキル基は置換C1−10アルキルである。
「ペルハロアルキル」は本明細書において定義される置換アルキル基であり、水素原子の全てが独立してハロゲン、例えば、フルオロ、ブロモ、クロロ、またはヨードによって置き換えられる。いくつかの態様においてアルキル部分は1〜8つの炭素原子を有する(「C1−8ペルハロアルキル」)。いくつかの態様においてアルキル部分は1〜6つの炭素原子を有する(「C1−6ペルハロアルキル」)。いくつかの態様においてアルキル部分は1〜4つの炭素原子を有する(「C1−4ペルハロアルキル」)。いくつかの態様においてアルキル部分は1〜3つの炭素原子を有する(「C1−3ペルハロアルキル」)。いくつかの態様においてアルキル部分は1〜2つの炭素原子を有する(「C1−2ペルハロアルキル」)。いくつかの態様において水素原子の全てはフルオロによって置き換えられる。いくつかの態様において水素原子の全てはクロロによって置き換えられる。ペルハロアルキル基の例は−CF、−CFCF、−CFCFCF、−CCl、−CFCl、−CFCl、および同様のものを含む。
本明細書において用いられる場合、「ヘテロアルキル」は、1〜30個の炭素原子を有し、主鎖中に含まれる酸素、窒素、および硫黄から独立して選択される1〜10個のヘテロ原子をさらに含む、直鎖もしくは分岐飽和炭化水素基のラジカルを指す(「C1−30ヘテロアルキル」)。いくつかの態様において、ヘテロアルキル基は1〜20個の炭素原子および1〜10個のヘテロ原子を有する(「C1−20ヘテロアルキル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキル基は1〜20個の炭素原子および1〜10個のヘテロ原子を有する(「C1−10ヘテロアルキル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキル基は1〜9つの炭素原子および1〜6つのヘテロ原子を有する(「C1−9ヘテロアルキル」)。いくつかの態様において、ヘテロアルキル基は1〜8つの炭素原子および1〜5つのヘテロ原子を有する(「C1−8ヘテロアルキル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキル基は1〜7つの炭素原子および1〜4つのヘテロ原子を有する(「C1−7ヘテロアルキル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキル基は1〜6つの炭素原子および1〜3つのヘテロ原子を有する(「C1−6ヘテロアルキル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキル基は1〜5つの炭素原子および1〜2つのヘテロ原子を有する(「C1−5ヘテロアルキル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキル基は1〜4つの炭素原子および1〜2つのヘテロ原子を有する(「C1−4ヘテロアルキル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキル基は1〜3つの炭素原子および1〜2つのヘテロ原子を有する(「C1−3ヘテロアルキル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキル基は1〜2つの炭素原子および1つのヘテロ原子を有する(「C1−2ヘテロアルキル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキル基は1つの炭素原子および1つのヘテロ原子を有する(「Cヘテロアルキル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキル基は2〜6つの炭素原子および1〜3つのヘテロ原子を有する(「C2−6ヘテロアルキル」)。別様に指定されていない限り、ヘテロアルキル基のそれぞれは独立して無置換であるか(「無置換ヘテロアルキル」)、または1つもしくは2つ以上の置換基によって置換される(「置換ヘテロアルキル」)。ある態様においてヘテロアルキル基は無置換C1−10アルキルである。ある態様においてヘテロアルキル基は置換C1−10ヘテロアルキルである。
本明細書において用いられる場合、「アルケニル」は、2〜30個の炭素原子、1つまたは2つ以上の炭素−炭素二重結合を有し、三重結合を有さない直鎖もしくは分岐炭化水素基のラジカルを指す(「C2−30アルケニル」)。いくつかの態様においてアルケニル基は2〜20個の炭素原子を有する(「C2−20アルケニル」)。いくつかの態様においてアルケニル基は2〜10個の炭素原子を有する(「C2−10アルケニル」)。いくつかの態様においてアルケニル基は2〜9つの炭素原子を有する(「C2−9アルケニル」)。いくつかの態様においてアルケニル基は2〜8つの炭素原子を有する(「C2−8アルケニル」)。いくつかの態様においてアルケニル基は2〜7つの炭素原子を有する(「C2−7アルケニル」)。いくつかの態様においてアルケニル基は2〜6つの炭素原子を有する(「C2−6アルケニル」)。いくつかの態様においてアルケニル基は2〜5つの炭素原子を有する(「C2−5アルケニル」)。いくつかの態様においてアルケニル基は2〜4つの炭素原子を有する(「C2−4アルケニル」)。いくつかの態様においてアルケニル基は2〜3つの炭素原子を有する(「C2−3アルケニル」)。いくつかの態様においてアルケニル基は2つの炭素原子を有する(「Cアルケニル」)。1つまたは2つ以上の炭素−炭素二重結合は、内部(例えば2−ブテニル中)または末端(例えば1−ブテニル中)であり得る。C2−4アルケニル基の例は、エテニル(C)、1−プロペニル(C)、2−プロペニル(C)、1−ブテニル(C)、2−ブテニル(C)、ブタジエニル(C)、および同様のものを含む。C2−6アルケニル基の例は、前述のC2−4アルケニル基、さらにはペンテニル(C)、ペンタジエニル(C)、ヘキセニル(C)、および同様のものを含む。アルケニルの追加の例は、ヘプテニル(C)、オクテニル(C)、オクタトリエニル(C)、および同様のものを含む。別様に指定されていない限り、アルケニル基のそれぞれは独立して無置換であるか(「無置換アルケニル」)、または1つもしくは2つ以上の置換基によって置換される(「置換アルケニル」)。ある態様においてアルケニル基は無置換C2−10アルケニルである。ある態様においてアルケニル基は置換C2−10アルケニルである。
本明細書において用いられる場合、「ヘテロアルケニル」は、2〜30個の炭素原子、1つまたは2つ以上の炭素−炭素二重結合を有し、三重結合を有さず、主鎖中に含まれる酸素、窒素、および硫黄から独立して選択される1〜10個のヘテロ原子をさらに含む、直鎖もしくは分岐炭化水素基のラジカルを指す(「C2−30ヘテロアルケニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルケニル基は2〜20個の炭素原子および1〜10個のヘテロ原子を有する(「C2−20ヘテロアルケニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルケニル基は2〜10個の炭素原子および1〜10個のヘテロ原子を有する(「C2−10ヘテロアルケニル」)。いくつかの態様において、ヘテロアルケニル基は2〜9つの炭素原子および1〜6つのヘテロ原子を有する(「C2−9ヘテロアルケニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルケニル基は2〜8つの炭素原子および1〜5つのヘテロ原子を有する(「C2−8ヘテロアルケニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルケニル基は2〜7つの炭素原子および1〜4つのヘテロ原子を有する(「C2−7ヘテロアルケニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルケニル基は2〜6つの炭素原子および1〜3つのヘテロ原子を有する(「C2−6ヘテロアルケニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルケニル基は2〜5つの炭素原子および1〜2つのヘテロ原子を有する(「C2−5ヘテロアルケニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルケニル基は2〜4つの炭素原子および1〜2つのヘテロ原子を有する(「C2−4ヘテロアルケニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルケニル基は2〜3つの炭素原子および1〜2つのヘテロ原子を有する(「C2−3ヘテロアルケニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルケニル基は2つの炭素原子および1つのヘテロ原子を有する(「Cヘテロアルケニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルケニル基は2〜6つの炭素原子および1〜3つのヘテロ原子を有する(「C2−6ヘテロアルケニル」)。別様に指定されていない限り、ヘテロアルケニル基のそれぞれは独立して無置換であるか(「無置換ヘテロアルケニル」)、または1つもしくは2つ以上の置換基によって置換される(「置換ヘテロアルケニル」)。ある態様においてヘテロアルケニル基は無置換C2−10ヘテロアルケニルである。ある態様においてヘテロアルケニル基は置換C2−10ヘテロアルケニルである。
本明細書において用いられる場合、「アルキニル」は、2〜30個の炭素原子、1つまたは2つ以上の炭素−炭素三重結合、および任意に1つまたは2つ以上の二重結合を有する直鎖もしくは分岐炭化水素基のラジカルを指す(「C2−30アルキニル」)。いくつかの態様においてアルキニル基は2〜20個の炭素原子を有する(「C2−20アルキニル」)。いくつかの態様においてアルキニル基は2〜10個の炭素原子を有する(「C2−10アルキニル」)。いくつかの態様においてアルキニル基は2〜9つの炭素原子を有する(「C2−9アルキニル」)。いくつかの態様においてアルキニル基は2〜8つの炭素原子を有する(「C2−8アルキニル」)。いくつかの態様においてアルキニル基は2〜7つの炭素原子を有する(「C2−7アルキニル」)。いくつかの態様においてアルキニル基は2〜6つの炭素原子を有する(「C2−6アルキニル」)。いくつかの態様においてアルキニル基は2〜5つの炭素原子を有する(「C2−5アルキニル」)。いくつかの態様においてアルキニル基は2〜4つの炭素原子を有する(「C2−4アルキニル」)。いくつかの態様においてアルキニル基は2〜3つの炭素原子を有する(「C2−3アルキニル」)。いくつかの態様においてアルキニル基は2つの炭素原子を有する(「Cアルキニル」)。1つまたは2つ以上の炭素−炭素三重結合は内部(例えば2−ブチニル中)または末端(例えば1−ブチニル中)であり得る。C2−4アルキニル基の例は、限定なしにエチニル(C)、1−プロピニル(C)、2−プロピニル(C)、1−ブチニル(C)、2−ブチニル(C)、および同様のものを含む。C2−6アルケニル基の例は、前述のC2−4アルキニル基、さらにはペンチニル(C)、ヘキシニル(C)、および同様のものを含む。アルキニルの追加の例は、ヘプチニル(C)、オクチニル(C)、および同様のものを含む。別様に指定されていない限り、アルキニル基のそれぞれは独立して無置換であるか(「無置換アルキニル」)、または1つまたは2つ以上の置換基によって置換される(「置換アルキニル」)。ある態様においてアルキニル基は無置換C2−10アルキニルである。ある態様においてアルキニル基は置換C2−10アルキニルである。
本明細書において用いられる場合、「ヘテロアルキニル」は、2〜30個の炭素原子、1つまたは2つ以上の炭素−炭素三重結合、任意に1つまたは2つ以上の二重結合を有し、主鎖中に含まれる酸素、窒素、および硫黄から独立して選択される1〜10個のヘテロ原子をさらに含む、直鎖もしくは分岐炭化水素基のラジカルを指す(「C2−30ヘテロアルキニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキニル基は2〜20個の炭素原子および1〜10個のヘテロ原子を有する(「C2−20ヘテロアルキニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキニル基は2〜10個の炭素原子および1〜10個のヘテロ原子を有する(「C2−10ヘテロアルキニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキニル基は2〜9つの炭素原子および1〜6つのヘテロ原子を有する(「C2−9ヘテロアルキニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキニル基は2〜8つの炭素原子および1〜5つのヘテロ原子を有する(「C2−8ヘテロアルキニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキニル基は2〜7つの炭素原子および1〜4つのヘテロ原子を有する(「C2−7ヘテロアルキニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキニル基は2〜6つの炭素原子および1〜3つのヘテロ原子を有する(「C2−6ヘテロアルキニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキニル基は2〜5つの炭素原子および1〜2つのヘテロ原子を有する(「C2−5ヘテロアルキニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキニル基は2〜4つの炭素原子および1〜2つのヘテロ原子を有する(「C2−4ヘテロアルキニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキニル基は2〜3つの炭素原子および1〜2つのヘテロ原子を有する(「C2−3ヘテロアルキニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキニル基は2つの炭素原子および1つのヘテロ原子を有する(「Cヘテロアルキニル」)。いくつかの態様においてヘテロアルキニル基は2〜6つの炭素原子および1〜3つのヘテロ原子を有する(「C2−6ヘテロアルキニル」)。別様に指定されていない限り、ヘテロアルキニル基のそれぞれは独立して無置換であるか(「無置換ヘテロアルキニル」)、または1つもしくは2つ以上の置換基によって置換される(「置換ヘテロアルキニル」)。ある態様においてヘテロアルキニル基は無置換C2−10ヘテロアルキニルである。ある態様においてヘテロアルキニル基は置換C2−10ヘテロアルキニルである。
本明細書において用いられる場合、「カルボシクリル(carbocyclyl)」または「炭素環式」は、3〜10個の環内炭素原子(「C3−10カルボシクリル」)および0個のヘテロ原子を非芳香族環系中に有する、非芳香族の環式炭化水素基のラジカルを指す。いくつかの態様において、カルボシクリル基は3〜8つの環内炭素原子を有する(「C3−8カルボシクリル」)。いくつかの態様においてカルボシクリル基は3〜6つの環内炭素原子を有する(「C3−6カルボシクリル」)。いくつかの態様においてカルボシクリル基は3〜6つの環内炭素原子を有する(「C3−6カルボシクリル」)。いくつかの態様においてカルボシクリル基は5〜10個の環内炭素原子を有する(「C5−10カルボシクリル」)。例示的なC3−6カルボシクリル基は、限定なしにシクロプロピル(C)、シクロプロペニル(C)、シクロブチル(C)、シクロブテニル(C)、シクロペンチル(C)、シクロペンテニル(C)、シクロヘキシル(C)、シクロヘキセニル(C)、シクロヘキサジエニル(C)、および同様のものを含む。例示的なC3−8カルボシクリル基は、限定なしに前述のC3−6カルボシクリル基、さらにはシクロヘプチル(C)、シクロヘプテニル(C)、シクロヘプタジエニル(C)、シクロヘプタトリエニル(C)、シクロオクチル(C)、シクロオクテニル(C)、ビシクロ[2.2.1]ヘプタニル(C)、ビシクロ[2.2.2]オクタニル(C)、および同様のものを含む。例示的なC3−10カルボシクリル基は、限定なしに前述のC3−8カルボシクリル基、さらにはシクロノニル(C)、シクロノネニル(C)、シクロデシル(C10)、シクロデセニル(C10)、オクタヒドロ−1H−インデニル(C)、デカヒドロナフタレニル(C10)、スピロ[4.5]デカニル(C10)、および同様のものを含む。前述の例が例示する通り、ある態様において、カルボシクリル基は単環式(「単環式カルボシクリル」)または多環式(例えば、縮合、架橋、またはスピロ環系を含有する。例えば二環式系(「二環式カルボシクリル」)または三環式系(「三環式カルボシクリル」))であり、飽和であり得るか、あるいは1つまたは2つ以上の炭素−炭素二重または三重結合を含有し得る。「カルボシクリル」は、上で定義されたカルボシクリル環が1つまたは2つ以上のアリールまたはヘテロアリール基と縮合しており、結合点がカルボシクリル環上にある環系もまた含む。かかる場合に、炭素数は、炭素環式環系中の炭素数を継続して指定する。別様に指定されていない限り、カルボシクリル基のそれぞれは独立して無置換であるか(「無置換カルボシクリル」)、または1つもしくは2つ以上の置換基によって置換される(「置換カルボシクリル」)。ある態様においてカルボシクリル基は無置換C3−10カルボシクリルである。ある態様においてカルボシクリル基は置換C3−10カルボシクリルである。
いくつかの態様において、「カルボシクリル」は、3〜10個の環内炭素原子を有する単環式飽和カルボシクリル基である(「C3−10シクロアルキル」)。いくつかの態様においてシクロアルキル基は3〜8つの環内炭素原子を有する(「C3−8シクロアルキル」)。いくつかの態様においてシクロアルキル基は3〜6つの環内炭素原子を有する(「C3−6シクロアルキル」)。いくつかの態様においてシクロアルキル基は5〜6つの環内炭素原子を有する(「C5−6シクロアルキル」)。いくつかの態様においてシクロアルキル基は5〜10個の環内炭素原子を有する(「C5−10シクロアルキル」)。C5−6シクロアルキル基の例はシクロペンチル(C)およびシクロヘキシル(C)を含む。C3−6シクロアルキル基の例は、前述のC5−6シクロアルキル基、さらにはシクロプロピル(C)およびシクロブチル(C)を含む。C3−8シクロアルキル基の例は、前述のC3−6シクロアルキル基、さらにはシクロヘプチル(C)およびシクロオクチル(C)を含む。別様に指定されていない限り、シクロアルキル基のそれぞれは独立して無置換であるか(「無置換シクロアルキル」)、または1つもしくは2つ以上の置換基によって置換される(「置換シクロアルキル」)。ある態様においてシクロアルキル基は無置換C3−10シクロアルキルである。ある態様においてシクロアルキル基は置換C3−10シクロアルキルである。
本明細書において用いられる場合、「ヘテロシクリル(heterocyclyl)」または「ヘテロ環式」は、環内炭素原子および1〜4つの環内ヘテロ原子を有する3〜14員非芳香族環系のラジカルを指し、各ヘテロ原子は独立して窒素、酸素、および硫黄から選択される(「3〜14員ヘテロシクリル」)。1つまたは2つ以上の窒素原子を含有するヘテロシクリル基において、結合点は原子価が許す限り炭素または窒素原子であり得る。ヘテロシクリル基は単環式(「単環式ヘテロシクリル」)または多環式(例えば、縮合、架橋、またはスピロ環系、例えば二環式系(「二環式ヘテロシクリル」)または三環式系(「三環式ヘテロシクリル」))であり得、飽和であり得るか、あるいは1つまたは2つ以上の炭素−炭素二重または三重結合を含有し得る。ヘテロシクリル多環式環系は、1つまたは2つ以上のヘテロ原子を1つまたは両方の環内に含み得る。「ヘテロシクリル」は、上で定義されたヘテロシクリル環が1つまたは2つ以上のカルボシクリル基と縮合しており、結合点がカルボシクリルまたはヘテロシクリル環上にある環系、あるいは上で定義されたヘテロシクリル環が1つまたは2つ以上のアリールまたはヘテロアリール基と縮合しており、結合点がヘテロシクリル環上にある環系もまた含む。かかる場合に、環員数は、ヘテロシクリル環系中の環員数を継続して指定する。別様に指定されていない限り、ヘテロシクリルのそれぞれは独立して無置換であるか(「無置換ヘテロシクリル」)、または1つもしくは2つ以上の置換基によって置換される(「置換ヘテロシクリル」)。ある態様においてヘテロシクリル基は無置換3〜14員ヘテロシクリルである。ある態様においてヘテロシクリル基は置換3〜14員ヘテロシクリルである。
いくつかの態様において、ヘテロシクリル基は環内炭素原子および1〜4つの環内ヘテロ原子を有する5〜10員非芳香族環系であり、各ヘテロ原子は独立して窒素、酸素、および硫黄から選択される(「5〜10員ヘテロシクリル」)。いくつかの態様において、ヘテロシクリル基は環内炭素原子および1〜4つの環内ヘテロ原子を有する5〜8員非芳香族環系であり、各ヘテロ原子は独立して窒素、酸素、および硫黄から選択される(「5〜8員ヘテロシクリル」)。いくつかの態様において、ヘテロシクリル基は環内炭素原子および1〜4つの環内ヘテロ原子を有する5〜6員非芳香族環系であり、各ヘテロ原子は独立して窒素、酸素、および硫黄から選択される(「5〜6員ヘテロシクリル」)。いくつかの態様において、5〜6員ヘテロシクリルは窒素、酸素、および硫黄から選択される1〜3つの環内ヘテロ原子を有する。いくつかの態様において、5〜6員ヘテロシクリルは窒素、酸素、および硫黄から選択される1〜2つの環内ヘテロ原子を有する。いくつかの態様において、5〜6員ヘテロシクリルは窒素、酸素、および硫黄から選択される1つの環内ヘテロ原子を有する。
1つのヘテロ原子を含有する例示的な3員ヘテロシクリル基は、限定なしにアジルジニル(azirdinyl)、オキシラニル、およびチオレニルを含む。1つのヘテロ原子を含有する例示的な4員ヘテロシクリル基は、限定なしにアゼチジニル、オキセタニル、およびチエタニルを含む。1つのヘテロ原子を含有する例示的な5員ヘテロシクリル基は、限定なしにテトラヒドロフラニル、ジヒドロフラニル、テトラヒドロチオフェニル、ジヒドロチオフェニル、ピロリジニル、ジヒドロピロリル、およびピロリル−2,5−ジオンを含む。2つのヘテロ原子を含有する例示的な5員ヘテロシクリル基は、限定なしにジオキソラニル、オキサチオラニル、およびジチオラニルを含む。3つのヘテロ原子を含有する例示的な5員ヘテロシクリル基は、限定なしにトリアゾリニル、オキサジアゾリニル、およびチアジアゾリニルを含む。1つのヘテロ原子を含有する例示的な6員ヘテロシクリル基は、限定なしにピペリジニル、テトラヒドロピラニル、ジヒドロピリジニル、およびチアニルを含む。2つのヘテロ原子を含有する例示的な6員ヘテロシクリル基は、限定なしにピペラジニル、モルホリニル、ジチアニル、およびジオキサニルを含む。2つのヘテロ原子を含有する例示的な6員ヘテロシクリル基は限定なしにトリアジナニルを含む。1つのヘテロ原子を含有する例示的な7員ヘテロシクリル基は、限定なしにアゼパニル、オキセパニル、およびチエパニルを含む。1つのヘテロ原子を含有する例示的な8員ヘテロシクリル基は、限定なしにアゾカニル、オキセカニル、およびチオカニルを含む。例示的な二環式ヘテロシクリル基は、限定なしに、インドリニル、イソインドリニル、ジヒドロベンゾフラニル、ジヒドロベンゾチエニル、テトラヒドロベンゾチエニル、テトラヒドロベンゾフラニル、テトラヒドロインドリル、テトラヒドロキノリニル、テトラヒドロイソキノリニル、デカヒドロキノリニル、デカヒドロイソキノリニル、オクタヒドロクロメニル、オクタヒドロイソクロメニル、デカヒドロナフチリジニル、デカヒドロ−1,8−ナフチリジニル、オクタヒドロピロロ[3,2−b]ピロール、インドリニル、フタルイミジル、ナフタルイミジル、クロマニル、クロメニル、1H−ベンゾ[e][1,4]ジアゼピニル、1,4,5,7−テトラヒドロピラノ[3,4−b]ピロリル、5,6−ジヒドロ−4H−フロ[3,2−b]ピロリル、6,7−ジヒドロ−5H−フロ[3,2−b]ピラニル、5,7−ジヒドロ−4H−チエノ[2,3−c]ピラニル、2,3−ジヒドロ−1H−ピロロ[2,3−b]ピリジニル、2,3−ジヒドロフロ[2,3−b]ピリジニル、4,5,6,7−テトラヒドロ−1H−ピロロ−[2,3−b]ピリジニル、4,5,6,7−テトラヒドロフロ[3,2−c]ピリジニル、4,5,6,7−テトラヒドロチエノ[3,2−b]ピリジニル、1,2,3,4−テトラヒドロ−1,6−ナフチリジニル、および同様のものを含む。
本明細書において用いられる場合、「アリール」は、芳香族環系中に提供された6〜14個の環内炭素原子および0個のヘテロ原子を有する単環式または多環式(例えば二環式または三環式)4n+2芳香族環系(例えば、環式配列によって共有された6、10、または14個のπ電子を有する)のラジカルを指す(「C6−14アリール」)。いくつかの態様においてアリール基は6つの環内炭素原子を有する(「Cアリール」、例えばフェニル)。いくつかの態様においてアリール基は10個の環内炭素原子を有する(「C10アリール」、例えば1−ナフチルおよび2−ナフチルなどのナフチル)。いくつかの態様において、アリール基は14個の環内炭素原子を有する(「C14アリール」、例えばアントラシル(anthracyl))。「アリール」は、上で定義されたアリール環が1つまたは2つ以上のカルボシクリルまたはヘテロシクリル基と縮合しており、ラジカルまたは結合点がアリール環上にある環系もまた含む。かかる場合に、炭素原子数はアリール環系中の炭素原子数を継続して指定する。別様に指定されていない限り、アリール基のそれぞれは独立して無置換であるか(「無置換アリール」)、または1つもしくは2つ以上の置換基によって置換される(「置換アリール」)。ある態様においてアリール基は無置換C6−14アリール基である。ある態様においてアリール基は置換C6−14アリール基である。
「アラルキル」は「アルキル」の下位集合であり、本明細書において定義されるアリール基によって置換された本明細書において定義されるアルキル基を指し、結合点はアルキル部分上にある。
本明細書において用いられる場合、「ヘテロアリール」は、芳香族環系中に提供された環内炭素原子および1〜4つの環内ヘテロ原子を有する、5〜14員単環式または多環式(例えば二環式または三環式)4n+2芳香族環系(例えば、環式配列によって共有された6、10、または14個のπ電子を有する)のラジカルを指し、各ヘテロ原子は独立して窒素、酸素、および硫黄から選択される(「5〜14員ヘテロアリール」)。1つまたは2つ以上の窒素原子を含有するヘテロアリール基において、結合点は原子価が許す限り炭素または窒素原子であり得る。ヘテロアリール多環式環系は1つまたは2つ以上のヘテロ原子を1つまたは両方の環内に含み得る。「ヘテロアリール」は、上で定義されたヘテロアリール環が1つまたは2つ以上のカルボシクリルまたはヘテロシクリル基と縮合しており、結合点がヘテロアリール環上にある環系を含む。かかる場合に、環員数はヘテロアリール環系中の環員数を継続して指定する。「ヘテロアリール」は、上で定義されたヘテロアリール環が1つまたは2つ以上のアリール基と縮合しており、結合点がアリールまたはヘテロアリール環上にある環系もまた含む。かかる場合に、環員数は縮合多環式(アリール/ヘテロアリール)環系中の環員数を指定する。1つの環がヘテロ原子を含有しない多環式ヘテロアリール基(例えばインドリル、キノリニル、カルバゾリルおよび同様のもの)は、結合点はいずれの環、すなわちヘテロ原子を有する環(例えば2−インドリル)またはヘテロ原子を含有しない環(例えば5−インドリル)上でもあり得る。
いくつかの態様において、ヘテロアリール基は芳香族環系中に提供された環内炭素原子および1〜4つの環内ヘテロ原子を有する5〜10員芳香族環系であり、各ヘテロ原子は独立して窒素、酸素、および硫黄から選択される(「5〜10員ヘテロアリール」)。いくつかの態様において、ヘテロアリール基は芳香族環系中に提供された環内炭素原子および1〜4つの環内ヘテロ原子を有する5〜8員芳香族環系であり、各ヘテロ原子は独立して窒素、酸素、および硫黄から選択される(「5〜8員ヘテロアリール」)。いくつかの態様において、ヘテロアリール基は芳香族環系中に提供された環内炭素原子および1〜4つの環内ヘテロ原子を有する5〜6員芳香族環系であり、各ヘテロ原子は独立して窒素、酸素、および硫黄から選択される(「5〜6員ヘテロアリール」)。いくつかの態様において、5〜6員ヘテロアリールは窒素、酸素、および硫黄から選択される1〜3つの環内ヘテロ原子を有する。いくつかの態様において、5〜6員ヘテロアリールは窒素、酸素、および硫黄から選択される1〜2つの環内ヘテロ原子を有する。いくつかの態様において、5〜6員ヘテロアリールは窒素、酸素、および硫黄から選択される1つの環内ヘテロ原子を有する。別様に指定されていない限り、ヘテロアリール基のそれぞれは独立して無置換であるか(「無置換ヘテロアリール」)、または1つもしくは2つ以上の置換基によって置換される(「置換ヘテロアリール」)。ある態様においてヘテロアリール基は無置換5〜14員ヘテロアリールである。ある態様においてヘテロアリール基は置換5〜14員ヘテロアリールである。
1つのヘテロ原子を含有する例示的な5員ヘテロアリール基は、限定なしにピロリル、フラニル、およびチオフェニルを含む。2つのヘテロ原子を含有する例示的な5員ヘテロアリール基は、限定なしにイミダゾリル、ピラゾリル、オキサゾリル、イソオキサゾリル、チアゾリル、およびイソチアゾリルを含む。3つのヘテロ原子を含有する例示的な5員ヘテロアリール基は、限定なしにトリアゾリル、オキサジアゾリル、およびチアジアゾリルを含む。4つのヘテロ原子を含有する例示的な5員ヘテロアリール基は限定なしにテトラゾリルを含む。1つのヘテロ原子を含有する例示的な6員ヘテロアリール基は限定なしにピリジニルを含む。2つのヘテロ原子を含有する例示的な6員ヘテロアリール基は、限定なしにピリダジニル、ピリミジニル、およびピラジニルを含む。3または4つのヘテロ原子を含有する例示的な6員ヘテロアリール基は、限定なしにそれぞれトリアジニルおよびテトラジニルを含む。1つのヘテロ原子を含有する例示的な7員ヘテロアリール基は、限定なしにアゼピニル、オキセピニル、およびチエピニルを含む。例示的な5,6−二環式ヘテロアリール基は、限定なしにインドリル、イソインドリル、インダゾリル、ベンゾトリアゾリル、ベンゾチオフェニル、イソベンゾチオフェニル、ベンゾフラニル、ベンゾイソフラニル、ベンゾイミダゾリル、ベンゾオキサゾリル、ベンゾイソオキサゾリル、ベンゾオキサジアゾリル、ベンゾチアゾリル、ベンゾイソチアゾリル、ベンゾチアジアゾリル、インドリジニル、およびプリニルを含む。例示的な6,6−二環式ヘテロアリール基は、限定なしにナフチリジニル、プテリジニル、キノリニル、イソキノリニル、シンノリニル、キノキサリニル、フタラジニル、およびキナゾリニルを含む。例示的な三環式ヘテロアリール基は、限定なしにフェナントリジニル、ジベンゾフラニル、カルバゾリル、アクリジニル、フェノチアジニル、フェノキサジニル、およびフェナジニルを含む。
「ヘテロアラルキル」は「アルキル」の下位集合であり、本明細書において定義されるヘテロアリール基によって置換された本明細書において定義されるアルキル基を指し、結合点はアルキル部分上にある。
本明細書において用いられる場合、用語「部分不飽和」は、少なくとも1つの二重または三重結合を含む基を指す。用語「部分不飽和」は、複数の不飽和部位を有する環を包含することは意図されているが、本明細書において定義される芳香族基(例えばアリールまたはヘテロアリール部分)を含むことは意図されていない。
本明細書において用いられる場合、用語「飽和」は、二重または三重結合を含有しない、すなわち全て単結合を含有する基を指す。
本明細書において定義されるアルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリール基は任意に置換される(例えば、「置換」もしくは「無置換」アルキル、「置換」もしくは「無置換」アルケニル、「置換」もしくは「無置換」アルキニル、「置換」もしくは「無置換」カルボシクリル、「置換」もしくは「無置換」ヘテロシクリル、「置換」もしくは「無置換」アリール、または「置換」もしくは「無置換」ヘテロアリール基)。一般的に、用語「置換」は、用語「任意に」が先行しているか否かにかかわらず、基(例えば炭素または窒素原子)の上に存在する少なくとも1つの水素が、許容される置換基、例えば置換によって安定な化合物(例えば、転位、環化、脱離、または他の反応による変換を自発的に受けることがない化合物)をもたらす置換基によって置き換えられるということを意味する。別様に指示されない限り、「置換」された基は基の1つまたは2つ以上の置換可能な位置に置換基を有し、いずれかの所与の構造中の1つより多い位置が置換されるときには、置換基は各位置において同じかまたは異なる。用語「置換」は、有機化合物の全ての許容される置換基、安定な化合物の形成をもたらす本明細書に記載の置換基のいずれか、による置換を含むと考えられる。本発明は、安定な化合物に到達するためにいずれかおよび全てのかかる組み合わせを考える。本発明の目的のためには、ヘテロ原子、例えば窒素は、ヘテロ原子の原子価を満たして安定な部分の形成をもたらす水素置換基および/または本明細書に記載のいずれかの好適な置換基を有し得る。
例示的な炭素原子置換基は、ハロゲン、−CN、−NO、−N、−SOH、−SOH、−OH、−ORaa、−ON(Rbb、−N(Rbb、−N(Rbb 、−N(ORcc)Rbb、−SH、−SRaa、−SSRcc、−C(=O)Raa、−COH、−CHO、−C(ORcc、−COaa、−OC(=O)Raa、−OCOaa、−C(=O)N(Rbb、−OC(=O)N(Rbb、−NRbbC(=O)Raa、−NRbbCOaa、−NRbbC(=O)N(Rbb、−C(=NRbb)Raa、−C(=NRbb)ORaa、−OC(=NRbb)Raa、−OC(=NRbb)ORaa、−C(=NRbb)N(Rbb、−OC(=NRbb)N(Rbb、−NRbbC(=NRbb)N(Rbb、−C(=O)NRbbSOaa、−NRbbSOaa、−SON(Rbb、−SOaa、−SOORaa、−OSOaa、−S(=O)Raa、−OS(=O)Raa、−Si(Raa、−OSi(Raa−C(=S)N(Rbb、−C(=O)SRaa、−C(=S)SRaa、−SC(=S)SRaa、−SC(=O)SRaa、−OC(=O)SRaa、−SC(=O)ORaa、−SC(=O)Raa、−P(=O)aa、−OP(=O)aa、−P(=O)(Raa、−OP(=O)(Raa、−OP(=O)(ORcc、−P(=O)N(Rbb、−OP(=O)N(Rbb、−P(=O)(NRbb、−OP(=O)(NRbb、−NRbbP(=O)(ORcc、−NRbbP(=O)(NRbb、−P(Rcc、−P(Rcc、−OP(Rcc、−OP(Rcc、−B(Raa、−B(ORcc、−BRaa(ORcc)、C1−10アルキル、C1−10ペルハロアルキル、C2−10アルケニル、C2−10アルキニル、C3−14カルボシクリル、3〜14員ヘテロシクリル、C6−14アリール、および5〜14員ヘテロアリールを含むが、それらに限定されない。各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは独立して0、1、2、3、4、または5つのRdd基によって置換される。
あるいは炭素原子上の2つのジェミナル水素が、基=O、=S、=NN(Rbb、=NNRbbC(=O)Raa、=NNRbbC(=O)ORaa、=NNRbbS(=O)aa、=NRbb、または=NORccによって置き換えられる。
aaのそれぞれは独立してC1−10アルキル、C1−10ペルハロアルキル、C2−10アルケニル、C2−10アルキニル、C3−10カルボシクリル、3〜14員ヘテロシクリル、C6−14アリール、および5〜14員ヘテロアリールから選択されるか、あるいは2つのRaa基が連結されて3〜14員ヘテロシクリルまたは5〜14員ヘテロアリール環を形成し、各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは独立して0、1、2、3、4、または5つのRdd基によって置換される。
bbのそれぞれは独立して水素、−OH、−ORaa、−N(Rcc、−CN、−C(=O)Raa、−C(=O)N(Rcc、−COaa、−SOaa、−C(=NRcc)ORaa、−C(=NRcc)N(Rcc、−SON(Rcc、−SOcc、−SOORcc、−SORaa、−C(=S)N(Rcc、−C(=O)SRcc、−C(=S)SRcc、−P(=O)aa、−P(=O)(Raa、−P(=O)N(Rcc、−P(=O)(NRcc、C1−10アルキル、C1−10ペルハロアルキル、C2−10アルケニル、C2−10アルキニル、C3−10カルボシクリル、3〜14員ヘテロシクリル、C6−14アリール、および5〜14員ヘテロアリールから選択されるか、あるいは2つのRbb基が連結されて3〜14員ヘテロシクリルまたは5〜14員ヘテロアリール環を形成し、各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは独立して0、1、2、3、4、または5つのRdd基によって置換される。
ccのそれぞれは独立して水素、C1−10アルキル、C1−10ペルハロアルキル、C2−10アルケニル、C2−10アルキニル、C3−10カルボシクリル、3〜14員ヘテロシクリル、C6−14アリール、および5〜14員ヘテロアリールから選択されるか、あるいは、2つのRcc基が連結されて3〜14員ヘテロシクリルまたは5〜14員ヘテロアリール環を形成する。各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは独立して0、1、2、3、4、または5つのRdd基によって置換される。
ddのそれぞれは独立してハロゲン、−CN、−NO、−N、−SOH、−SOH、−OH、−ORee、−ON(Rff、−N(Rff、−N(Rff 、−N(ORee)Rff、−SH、−SRee、−SSRee、−C(=O)Ree、−COH、−COee、−OC(=O)Ree、−OCOee、−C(=O)N(Rff、−OC(=O)N(Rff、−NRffC(=O)Ree、−NRffCOee、−NRffC(=O)N(Rff、−C(=NRff)ORee、−OC(=NRff)Ree、−OC(=NRff)ORee、−C(=NRff)N(Rff、−OC(=NRff)N(Rff、−NRffC(=NRff)N(Rff、−NRffSOee、−SON(Rff、−SOee、−SOORee、−OSOee、−S(=O)Ree、−Si(Ree、−OSi(Ree、−C(=S)N(Rff、−C(=O)SRee、−C(=S)SRee、−SC(=S)SRee、−P(=O)ee、−P(=O)(Ree、−OP(=O)(Ree、−OP(=O)(ORee、C1−6アルキル、C1−6ペルハロアルキル、C2−6アルケニル、C2−6アルキニル、C3−10カルボシクリル、3〜10員ヘテロシクリル、C6−10アリール、5〜10員ヘテロアリールから選択される。各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは、独立して0、1、2、3、4、または5つのRgg基によって置換される。あるいは2つのジェミナルRdd置換基が連結されて=Oまたは=Sを形成する。
eeのそれぞれは独立してC1−6アルキル、C1−6ペルハロアルキル、C2−6アルケニル、C2−6アルキニル、C3−10カルボシクリル、C6−10アリール、3〜10員ヘテロシクリル、および3〜10員ヘテロアリールから選択される。各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは独立して0、1、2、3、4、または5つのRgg基によって置換される。
ffのそれぞれは独立して水素、C1−6アルキル、C1−6ペルハロアルキル、C2−6アルケニル、C2−6アルキニル、C3−10カルボシクリル、3〜10員ヘテロシクリル、C6−10アリール、および5〜10員ヘテロアリールから選択されるか、あるいは2つのRff基が連結されて3〜14員ヘテロシクリルまたは5〜14員ヘテロアリール環を形成する。各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは独立して0、1、2、3、4、または5つのRgg基によって置換される。
ggのそれぞれは独立してハロゲン、−CN、−NO、−N、−SOH、−SOH、−OH、−OC1−6アルキル、−ON(C1−6アルキル)、−N(C1−6アルキル)、−N(C1−6アルキル) 、−NH(C1−6アルキル) 、−NH(C1−6アルキル)、−NH 、−N(OC1−6アルキル)(C1−6アルキル)、−N(OH)(C1−6アルキル)、−NH(OH)、−SH、−SC1−6アルキル、−SS(C1−6アルキル)、−C(=O)(C1−6アルキル)、−COH、−CO(C1−6アルキル)、−OC(=O)(C1−6アルキル)、−OCO(C1−6アルキル)、−C(=O)NH、−C(=O)N(C1−6アルキル)、−OC(=O)NH(C1−6アルキル)、−NHC(=O)(C1−6アルキル)、−N(C1−6アルキル)C(=O)(C1−6アルキル)、−NHCO(C1−6アルキル)、−NHC(=O)N(C1−6アルキル)、−NHC(=O)NH(C1−6アルキル)、−NHC(=O)NH、−C(=NH)O(C1−6アルキル)、−OC(=NH)(C1−6アルキル)、−OC(=NH)OC1−6アルキル、−C(=NH)N(C1−6アルキル)、−C(=NH)NH(C1−6アルキル)、−C(=NH)NH、−OC(=NH)N(C1−6アルキル)、−OC(NH)NH(C1−6アルキル)、−OC(NH)NH、−NHC(NH)N(C1−6アルキル)、−NHC(=NH)NH、−NHSO(C1−6アルキル)、−SON(C1−6アルキル)、−SONH(C1−6アルキル)、−SONH、−SO1−6アルキル、−SOOC1−6アルキル、−OSO1−6アルキル、−SOC1−6アルキル、−Si(C1−6アルキル)、−OSi(C1−6アルキル)−C(=S)N(C1−6アルキル)、C(=S)NH(C1−6アルキル)、C(=S)NH、−C(=O)S(C1−6アルキル)、−C(=S)SC1−6アルキル、−SC(=S)SC1−6アルキル、−P(=O)(C1−6アルキル)、−P(=O)(C1−6アルキル)、−OP(=O)(C1−6アルキル)、−OP(=O)(OC1−6アルキル)、C1−6アルキル、C1−6ペルハロアルキル、C2−6アルケニル、C2−6アルキニル、C3−10カルボシクリル、C6−10アリール、3〜10員ヘテロシクリル、5〜10員ヘテロアリールである。あるいは2つのジェミナルRgg置換基が連結されて=Oまたは=Sを形成し得る。Xは対イオンである。
本明細書において用いられる場合、用語「ヒドロキシル」または「ヒドロキシ」は基−OHを指す。用語「置換ヒドロキシル」または「置換ヒドロキシル」は、さらに、親分子に直接的に結合された酸素原子が水素より他の基によって置換されたヒドロキシル基を指し、−ORaa、−ON(Rbb、−OC(=O)SRaa、−OC(=O)Raa、−OCOaa、−OC(=O)N(Rbb、−OC(=NRbb)Raa、−OC(=NRbb)ORaa、−OC(=NRbb)N(Rbb、−OS(=O)Raa、−OSOaa、−OSi(Raa、−OP(Rcc、−OP(Rcc、−OP(=O)aa、−OP(=O)(Raa、−OP(=O)(ORcc、−OP(=O)N(Rbb、および−OP(=O)(NRbbから選択される基を含む。Raa、Rbb、およびRccは本明細書において定義される通りである。
本明細書において用いられる場合、用語「チオール」または「チオ」は基−SHを指す。用語「置換チオール」または「置換チオ」は、さらに、親分子に直接的に結合された硫黄原子が水素より他の基によって置換されたチオール基を指し、−SRaa、−S=SRcc、−SC(=S)SRaa、−SC(=O)SRaa、−SC(=O)ORaa、および−SC(=O)Raaから選択される基を含む。RaaおよびRccは本明細書において定義される通りである。
本明細書において用いられる場合、用語「アミノ」は基−NHを指す。用語「置換アミノ」は、さらに、本明細書において定義される一置換アミノ、二置換アミノ、または三置換アミノを指す。
本明細書において用いられる場合、用語「一置換アミノ」は、親分子に直接的に結合された窒素原子が1つの水素および水素より他の1つの基によって置換されたアミノ基を指し、−NH(Rbb)、−NHC(=O)Raa、−NHCOaa、−NHC(=O)N(Rbb、−NHC(=NRbb)N(Rbb、−NHSOaa、−NHP(=O)(ORcc、および−NHP(=O)(NRbbから選択される基を含む。Raa、Rbb、およびRccは本明細書において定義される通りであり、基−NH(Rbb)のRbbは水素でない。
本明細書において用いられる場合、用語「二置換アミノ」は、親分子に直接的に結合された窒素原子が水素より他の2つの基によって置換されたアミノ基を指し、−N(Rbb、−NRbbC(=O)Raa、−NRbbCOaa、−NRbbC(=O)N(Rbb、−NRbbC(=NRbb)N(Rbb、−NRbbSOaa、−NRbbP(=O)(ORcc、および−NRbbP(=O)(NRbbから選択される基を含む。Raa、Rbb、およびRccは本明細書において定義される通りであり、ただし親分子に直接的に結合された窒素原子は水素によって置換されない。
本明細書において用いられる場合、用語「三置換アミノ」または「第4級アミノ塩」または「第4級塩」は、窒素がカチオン性となるように4つの基に共有結合的に結合された窒素原子を指し、カチオン性窒素原子はさらにアニオン性対イオン(例えば式−N(Rbb および−N(Rbbの基など)と錯化し、RbbおよびXは本明細書において定義される通りである。
本明細書において用いられる場合、「対イオン」または「アニオン性対イオン」は、電子的中性を維持するためにカチオン性第4級アミノ基と結びついた負荷電基である。例示的な対イオンは、ハロゲン化物イオン(例えばF、Cl、Br、I)、NO 、ClO 、OH、HPO 、HSO 、スルホン酸イオン(例えば、メタンスルホン酸、トリフルオロメタンスルホン酸、p−トルエンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸、10−カンファースルホン酸、ナフタレン−2−スルホン酸、ナフタレン−1−スルホン酸−5−スルホン酸、エタン−1−スルホン酸−2−スルホン酸、および同様のもの)、およびカルボン酸イオン(例えば、酢酸、エタン酸、プロパン酸、安息香酸、グリセリン酸、乳酸、酒石酸、グリコール酸、および同様のもの)を含む。
本明細書において用いられる場合、用語「スルホニル」は−SON(Rbb、−SOaa、および−SOORaaから選択される基を指し、RaaおよびRbbは本明細書において定義される通りである。
本明細書において用いられる場合、用語「スルフィニル」は基−S(=O)Raaを指し、Raaは本明細書において定義される通りである。
本明細書において用いられる場合、用語「アシル」は、親分子に直接的に結合された炭素がsp混成しており、酸素、窒素、または硫黄原子によって置換された基、例えば、ケトン(−C(=O)Raa)、カルボン酸(−COH)、アルデヒド(−CHO)、エステル(−COaa)、チオエステル(−C(=O)SRaa、−C(=S)SRaa)、アミド(−C(=O)N(Rbb、−C(=O)NRbbSOaa)チオアミド(−C(=S)N(Rbb)、およびイミン(−C(=NRbb)Raa、−C(=NRbb)ORaa)、−C(=NRbb)N(Rbb)から選択される基を指し、RaaおよびRbbは本明細書において定義される通りである。
本明細書において用いられる場合、用語「アジド」は式−Nの基を指す。
本明細書において用いられる場合、用語「シアノ」は式−CNの基を指す。
本明細書において用いられる場合、用語「イソシアノ」は式−NCの基を指す。
本明細書において用いられる場合、用語「ニトロ」は式−NOの基を指す。
本明細書において用いられる場合、用語「ハロ」または「ハロゲン」は、フッ素(フルオロ、−F)、塩素(クロロ、−Cl)、臭素(ブロモ、−Br)、またはヨウ素(ヨード、−I)を指す。
本明細書において用いられる場合、用語「オキソ」は式=Oの基を指す。
本明細書において用いられる場合、用語「チオオキソ」は式=Sの基を指す。
本明細書において用いられる場合、用語「イミノ」は式=N(R)の基を指す。
本明細書において用いられる場合、用語「シリル」は基−Si(Raaを指し、Raaは本明細書において定義される通りである。
窒素原子は原子価が許す限り置換もしくは無置換であり得、第1級、第2級、第3級、および第4級窒素原子を含む。例示的な窒素原子置換基は、水素、−OH、−ORaa、−N(Rcc、−CN、−C(=O)Raa、−C(=O)N(Rcc、−COaa、−SOaa、−C(=NRbb)Raa、−C(=NRcc)ORaa、−C(=NRcc)N(Rcc、−SON(Rcc、−SOcc、−SOORcc、−SORaa、−C(=S)N(Rcc、−C(=O)SRcc、−C(=S)SRcc、−P(=O)aa、−P(=O)(Raa、−P(=O)N(Rcc、−P(=O)(NRcc、C1−10アルキル、C1−10ペルハロアルキル、C2−10アルケニル、C2−10アルキニル、C3−10カルボシクリル、3〜14員ヘテロシクリル、C6−14アリール、および5〜14員ヘテロアリールを含むが、それらに限定されない。あるいは窒素原子に結合された2つのRcc基が連結されて3〜14員ヘテロシクリルまたは5〜14員ヘテロアリール環を形成する。各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは独立して0、1、2、3、4、または5つのRdd基によって置換される。Raa、Rbb、Rcc、およびRddは上で定義された通りである。
ある態様において、窒素原子上に存在する置換基はアミノ保護基(本明細書においては「窒素保護基」ともまた言われる)である。アミノ保護基は、−OH、−ORaa、−N(Rcc、−C(=O)Raa、−C(=O)N(Rcc、−COaa、−SOaa、−C(=NRcc)Raa、−C(=NRcc)ORaa、−C(=NRcc)N(Rcc、−SON(Rcc、−SOcc、−SOORcc、−SORaa、−C(=S)N(Rcc、−C(=O)SRcc、−C(=S)SRcc、C1−10アルキル(例えば、アラルキル、ヘテロアラルキル)、C2−10アルケニル、C2−10アルキニル、C3−10カルボシクリル、3〜14員ヘテロシクリル、C6−14アリール、および5〜14員ヘテロアリール基を含むが、それらに限定されない。各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アラルキル、アリール、およびヘテロアリールは独立して0、1、2、3、4、または5つのRdd基によって置換される。Raa、Rbb、Rcc、およびRddは本明細書において定義される通りである。アミノ保護基は当分野において周知であり、参照によって本明細書に組み込まれるProtecting Groups in Organic Synthesis, T. W. Greene and P. G. M. Wuts, 3rd edition, John Wiley & Sons, 1999に詳細に記載されているものを含む。
例えば、アミノ保護基、例えばアミド基(例えば−C(=O)Raa)は、ホルムアミド、アセトアミド、クロロアセトアミド、トリクロロアセトアミド、トリフルオロアセトアミド、フェニルアセトアミド、3−フェニルプロパンアミド、ピコリンアミド、3−ピリジルカルボキサミド、N−ベンゾイルフェニルアラニル誘導体、ベンズアミド、p−フェニルベンズアミド、o−ニトフェニルアセトアミド、o−ニトロフェノキシアセトアミド、アセトアセトアミド、(Ν’−ジチオベンジルオキシアシルアミノ)アセトアミド、3−(p−ヒドロキシフェニル)プロパンアミド、3−(o−ニトロフェニル)プロパンアミド、2−メチル−2−(o−ニトロフェノキシ)プロパンアミド、2−メチル−2−(o−フェニルアゾフェノキシ)プロパンアミド、4−クロロブタンアミド、3−メチル−3−ニトロブタンアミド、o−ニトロケイ皮酸アミド、N−アセチルメチオニン誘導体、o−ニトロベンズアミド、およびo−(ベンゾイルオキシメチル)ベンズアミドを含むが、それらに限定されない。
アミノ保護基、例えばカルバメート基(例えば−C(=O)ORaa)は、メチルカルバメート、エチルカルバマンテ(ethyl carbamante)、9−フルオレニルメチルカルバメート(Fmoc)、9−(2−スルホ)フルオレニルメチルカルバメート、9−(2,7−ジブロモ)フルオロエニルメチルカルバメート、2,7−ジ−t−ブチル−[9−(10,10−ジオキソ−10,10,10,10−テトラヒドロチオキサンチル)]メチルカルバメート(DBD−Tmoc)、4−メトキシフェナシルカルバメート(Phenoc)、2,2,2−トリクロロエチルカルバメート(Troc)、2−トリメチルシリルエチルカルバメート(Teoc)、2−フェニルエチルカルバメート(hZ)、1−(1−アダマンチル)−1−メチルエチルカルバメート(Adpoc)、1,1−ジメチル−2−ハロエチルカルバメート、1,1−ジメチル−2,2−ジブロモエチルカルバメート(DB−t−BOC)、1,1−ジメチル−2,2,2−トリクロロエチルカルバメート(TCBOC)、1−メチル−1−(4−ビフェニリル)エチルカルバメート(Bpoc)、1−(3,5−ジ−t−ブチルフェニル)−1−メチルエチルカルバメート(t−Bumeoc)、2−(2’−および4’−ピリジル)エチルカルバメート(Pyoc)、2−(N,N−ジシクロヘキシルカルボキサミド)エチルカルバメート、t−ブチルカルバメート(BOC)、1−アダマンチルカルバメート(Adoc)、ビニルカルバメート(Voc)、アリルカルバメート(Alloc)、1−イソプロピルアリルカルバメート(Ipaoc)、シンナミルカルバメート(Coc)、4−ニトロシンナミルカルバメート(Noc)、8−キノリルカルバメート、N−ヒドロキシピペリジニルカルバメート、アルキルジチオカルバメート、ベンジルカルバメート(Cbz)、p−メトキシベンジルカルバメート(Moz)、p−ニトベンジルカルバメート、p−ブロモベンジルカルバメート、p−クロロベンジルカルバメート、2,4−ジクロロベンジルカルバメート、4−メチルスルフィニルベンジルカルバメート(Msz)、9−アントリルメチルカルバメート、ジフェニルメチルカルバメート、2−メチルチオエチルカルバメート、2−メチルスルホニルエチルカルバメート、2−(p−トルエンスルホニル)エチルカルバメート、[2−(1,3−ジチアニル)]メチルカルバメート(Dmoc)、4−メチルチオフェニルカルバメート(Mtpc)、2,4−ジメチルチオフェニルカルバメート(Bmpc)、2−ホスホニオエチルカルバメート(Peoc)、2−トリフェニルホスホニオイソプロピルカルバメート(Ppoc)、1,1−ジメチル−2−シアノエチルカルバメート、m−クロロ−p−アシルオキシベンジルカルバメート、p−(ジヒドロキシボリル)ベンジルカルバメート、5−ベンゾイソオキサゾリルメチルカルバメート、2−(トリフルオロメチル)−6−クロモニルメチルカルバメート(Tcroc)、m−ニトロフェニルカルバメート、3,5−ジメトキシベンジルカルバメート、o−ニトロベンジルカルバメート、3,4−ジメトキシ−6−ニトロベンジルカルバメート、フェニル(o−ニトロフェニル)メチルカルバメート、t−アミルカルバメート、S−ベンジルチオカルバメート、p−シアノベンジルカルバメート、シクロブチルカルバメート,シクロヘキシルカルバメート、シクロペンチルカルバメート、シクロプロピルメチルカルバメート、p−デシルオキシベンジルカルバメート、2,2−ジメトキシアシルビニルカルバメート、o−(N,N−ジメチルカルボキサミド)ベンジルカルバメート、1,1−ジメチル−3−(N,N−ジメチルカルボキサミド)プロピルカルバメート、1,1−ジメチルプロピニルカルバメート、ジ(2−ピリジル)メチルカルバメート、2−フラニルメチルカルバメート、2−ヨードエチルカルバメート、イソボリンル(isoborynl)カルバメート、イソブチルカルバメート、イソニコチニルカルバメート、p−(p’−メトキシフェニルアゾ)ベンジルカルバメート、1−メチルシクロブチルカルバメート、1−メチルシクロヘキシルカルバメート、1−メチル−1−シクロプロピルメチルカルバメート、1−メチル−1−(3,5−ジメトキシフェニル)エチルカルバメート、1−メチル−1−(p−フェニルアゾフェニル)エチルカルバメート、1−メチル−1−フェニルエチルカルバメート、1−メチル−1−(4−ピリジル)エチルカルバメート、フェニルカルバメート、p−(フェニルアゾ)ベンジルカルバメート、2,4,6−トリ−t−ブチルフェニルカルバメート、4−(トリメチルアンモニウム)ベンジルカルバメート、および2,4,6−トリメチルベンジルカルバメートを含むが、それらに限定されない。
アミノ保護基、例えばスルホンアミド基(例えば−S(=O)aa)は、p−トルエンスルホンアミド(Ts)、ベンゼンスルホンアミド、2,3,6,−トリメチル−4−メトキシベンゼンスルホンアミド(Mtr)、2,4,6−トリメトキシベンゼンスルホンアミド(Mtb)、2,6−ジメチル−4−メトキシベンゼンスルホンアミド(Pme)、2,3,5,6−テトラメチル−4−メトキシベンゼンスルホンアミド(Mte)、4−メトキシベンゼンスルホンアミド(Mbs)、2,4,6−トリメチルベンゼンスルホンアミド(Mts)、2,6−ジメトキシ−4−メチルベンゼンスルホンアミド(iMds)、2,2,5,7,8−ペンタメチルクロマン−6−スルホンアミド(Pmc)、メタンスルホンアミド(Ms)、β−トリメチルシリルエタンスルホンアミド(SES)、9−アントラセンスルホンアミド、4−(4’,8’−ジメトキシナフチルメチル)ベンゼンスルホンアミド(DNMBS)、ベンジルスルホンアミド、トリフルオロメチルスルホンアミド、およびフェナシルスルホンアミドを含むが、それらに限定されない。
他のアミノ保護基は、フェノチアジニル−(10)−アシル誘導体、N’−p−トルエンスルホニルアミノアシル誘導体、N’−フェニルアミノチオアシル誘導体、N−ベンゾイルフェニルアラニル誘導体、N−アセチルメチオニン誘導体、4,5−ジフェニル−3−オキサゾリン−2−オン、N−フタルイミド、N−ジチアスクシンイミド(Dts)、N−2,3−ジフェニルマレイミド、N−2,5−ジメチルピロール、N−1,1,4,4−テトラメチルジシリルアザシクロペンタン付加物(STABASE)、5−置換1,3−ジメチル−1,3,5−トリアザシクロヘキサン−2−オン、5−置換1,3−ジベンジル−1,3,5−トリアザシクロヘキサン−2−オン、1−置換3,5−ジニトロ−4−ピリドン、N−メチルアミン、N−アリルアミン、N−[2−(トリメチルシリル)エトキシ]メチルアミン(SEM)、N−3−アセトキシプロピルアミン、N−(1−イソプロピル−4−ニトロ−2−オキソ−3−ピローリン(pyroolin)−3−イル)アミン、第4級アンモニウム塩、N−ベンジルアミン、N−ジ(4−メトキシフェニル)メチルアミン、N−5−ジベンゾスベリル(dibenzosuberyl)アミン、N−トリフェニルメチルアミン(Tr)、N−[(4−メトキシフェニル)ジフェニルメチル]アミン(MMTr)、N−9−フェニルフルオレニルアミン(PhF)、N−2,7−ジクロロ−9−フルオレニルメチレンアミン、N−フェロセニルメチルアミノ(Fcm)、N−2−ピコリルアミノN’−オキシド、N−1,1−ジメチルチオメチレンアミン、N−ベンジリデンアミン、N−p−メトキシベンジリデンアミン、N−ジフェニルメチレンアミン、N−[(2−ピリジル)メシチル]メチレンアミン、N−(N’,N’−ジメチルアミノメチレン)アミン、N,N’−イソプロピリデンジアミン、N−p−ニトロベンジリデンアミン、N−サリチリデンアミン、N−5−クロロサリチリデンアミン、N−(5−クロロ−2−ヒドロキシフェニル)フェニルメチレンアミン、N−シクロヘキシリデンアミン、N−(5,5−ジメチル−3−オキソ−1−シクロヘキセニル)アミン、N−ボラン誘導体、N−ジフェニルボロン酸誘導体、N−[フェニル(ペンタアシルクロムまたはタングステン)アシル]アミン、N−銅キレート、N−亜鉛キレート、N−ニトロアミン、N−ニトロソアミン、アミンN−オキシド、ジフェニルホスフィンアミド(Dpp)、ジメチルチオホスフィンアミド(Mpt)、ジフェニルチオホスフィンアミド(Ppt)、ジアルキルホスホロアミダート、ジベンジルホスホロアミダート、ジフェニルホスホロアミダート、ベンゼンスルフェンアミド、o−ニトロベンゼンスルフェンアミド(Nps)、2,4−ジニトロベンゼンスルフェンアミド、ペンタクロロベンゼンスルフェンアミド、2−ニトロ−4−メトキシベンゼンスルフェンアミド、トリフェニルメチルスルフェンアミド、および3−ニトロピリジンスルフェンアミド(Npys)を含むが、それらに限定されない。
ある態様において、酸素原子上に存在する置換基はヒドロキシル保護基(本明細書においては「酸素保護基」ともまた言われる)である。ヒドロキシル保護基は、−Raa、−N(Rbb、−C(=O)SRaa、−C(=O)Raa、−COaa、−C(=O)N(Rbb、−C(=NRbb)Raa、−C(=NRbb)ORaa、−C(=NRbb)N(Rbb、−S(=O)Raa、−SOaa、−Si(Raa、−P(Rcc、−P(Rcc、−Ρ(=O)aa、−P(=O)(Raa、−P(=O)(ORcc、−P(=O)N(Rbb、および−P(=O)(NRbbを含むが、それらに限定されない。Raa、Rbb、およびRccは本明細書において定義される通りである。ヒドロキシル保護基は当分野において周知であり、参照によって本明細書に組み込まれるProtecting Groups in Organic Synthesis, T. W. Greene and P. G. M. Wuts, 3rd edition, John Wiley & Sons, 1999に詳細に記載されているものを含む。
例示的な酸素保護基は、メチル、メトキシルメチル(MOM)、メチルチオメチル(MTM)、t−ブチルチオメチル、(フェニルジメチルシリル)メトキシメチル(SMOM)、ベンジルオキシメチル(BOM)、p−メトキシベンジルオキシメチル(PMBM)、(4−メトキシフェノキシ)メチル(p−AOM)、グアイアコールメチル(GUM)、t−ブトキシメチル、4−ペンテニルオキシメチル(POM)、シロキシメチル、2−メトキシエトキシメチル(MEM)、2,2,2−トリクロロエトキシメチル、ビス(2−クロロエトキシ)メチル、2−(トリメチルシリル)エトキシメチル(SEMOR)、テトラヒドロピラニル(THP)、3−ブロモテトラヒドロピラニル、テトラヒドロチオピラニル、1−メトキシシクロヘキシル、4−メトキシテトラヒドロピラニル(MTHP)、4−メトキシテトラヒドロチオピラニル、4−メトキシテトラヒドロチオピラニルS,S−ジオキシド、1−[(2−クロロ−4−メチル)フェニル]−4−メトキシピペリジン−4−イル(CTMP)、1,4−ジオキサン−2−イル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロチオフラニル、2,3,3a,4,5,6,7,7a−オクタヒドロ−7,8,8−トリメチル−4,7−メタノベンゾフラン−2−イル、1−エトキシエチル、1−(2−クロロエトキシ)エチル、1−メチル−1−メトキシエチル、1−メチル−1−ベンジルオキシエチル、1−メチル−1−ベンジルオキシ−2−フルオロエチル、2,2,2−トリクロロエチル、2−トリメチルシリルエチル、2−(フェニルセレニル)エチル、t−ブチル、アリル、p−クロロフェニル、p−メトキシフェニル、2,4−ジニトロフェニル、ベンジル(Bn)、p−メトキシベンジル、3,4−ジメトキシベンジル、o−ニトロベンジル、p−ニトロベンジル、p−ハロベンジル、2,6−ジクロロベンジル、p−シアノベンジル、p−フェニルベンジル、2−ピコリル、4−ピコリル、3−メチル−2−ピコリルN−オキシド、ジフェニルメチル、p,p’−ジニトロベンズヒドリル、5−ジベンゾスベリル(dibenzosuberyl)、トリフェニルメチル、α−ナフチルジフェニルメチル、p−メトキシフェニルジフェニルメチル、ジ(p−メトキシフェニル)フェニルメチル、トリ(p−メトキシフェニル)メチル、4−(4’−ブロモフェナシルオキシフェニル)ジフェニルメチル、4,4’,4”−トリス(4,5−ジクロロフタルイミドフェニル)メチル、4,4’,4”−トリス(レブリノイルオキシフェニル)メチル、4,4’,4”−トリス(ベンゾイルオキシフェニル)メチル、3−(イミダゾール−1−イル)ビス(4’,4”−ジメトキシフェニル)メチル、1,1−ビス(4−メトキシフェニル)−1’−ピレニルメチル、9−アントリル、9−(9−フェニル)キサンテニル、9−(9−フェニル−10−オキソ)アントリル、1,3−ベンゾジチオラン−2−イル、ベンゾイソチアゾリルS,S−ジオキシド、トリメチルシリル(TMS)、トリエチルシリル(TES)、トリイソプロピルシリル(TIPS)、ジメチルイソプロピルシリル(IPDMS)、ジエチルイソプロピルシリル(DEIPS)、ジメチルtヘキシルシリル、t−ブチルジメチルシリル(TBDMS)、t−ブチルジフェニルシリル(TBDPS)、トリベンジルシリル、トリ−p−キシリルシリル、トリフェニルシリル、ジフェニルメチルシリル(DPMS)、t−ブチルメトキシフェニルシリル(TBMPS)、蟻酸、蟻酸ベンゾイル、酢酸、クロロ酢酸、ジクロロ酢酸、トリクロロ酢酸、トリフルオロ酢酸、メトキシ酢酸、トリフェニルメトキシ酢酸、フェノキシ酢酸、p−クロロフェノキシ酢酸、3−フェニルプロピオン酸、4−オキソペンタノアート(レブリナート)、4,4−(エチレンジチオ)ペンタノアート(レブリノイルジチオアセタール)、ピバロエート(pivaloate)、アダマントエート(adamantoate)、クロトン酸、4−メトキシクロトン酸、安息香酸、p−フェニル安息香酸、2,4,6−トリメチル安息香酸(メシト酸)、メチルカーボネート、9−フルオレニルメチルカーボネート(Fmoc)、エチルカーボネート、2,2,2−トリクロロエチルカーボネート(Troc)、2−(トリメチルシリル)エチルカーボネート(TMSEC)、2−(フェニルスルホニル)エチルカーボネート(Psec)、2−(トリフェニルホスホニオ)エチルカーボネート(Peoc)、イソブチルカーボネート、ビニルカーボネート、アリルカーボネート、t−ブチルカーボネート(BOC)、p−ニトロフェニルカーボネート、ベンジルカーボネート、p−メトキシベンジルカーボネート、3,4−ジメトキシベンジルカーボネート、o−ニトロベンジルカーボネート、p−ニトロベンジルカーボネート、S−ベンジルチオカーボネート、4−エトキシ−1−ナフトチル(napththyl)カーボネート、メチルジチオカーボネート、2−ヨード安息香酸、4−アジドブチレート、4−ニトロ−4−メチルペンタノアート、o−(ジブロモメチル)安息香酸、2−ホルミルベンゼンスルホン酸、2−(メチルチオメトキシ)エチル、4−(メチルチオメトキシ)酪酸、2−(メチルチオメトキシメチル)安息香酸、2,6−ジクロロ−4−メチルフェノキシ酢酸、2,6−ジクロロ−4−(1,1,3,3−テトラメチルブチル)フェノキシ酢酸、2,4−ビス(1,1−ジメチルプロピル)フェノキシ酢酸、クロロジフェニル酢酸、イソ酪酸、モノスクシノアート(monosuccinoate)、(E)−2−メチル−2−ブテン酸、o−(メトキシアシル)安息香酸、α−ナフトエ酸、硝酸、アルキルΝ,Ν,Ν’,Ν’−テトラメチルホスホロジアミダート、アルキルN−フェニルカルバメート、ホウ酸、ジメチルホスフィノチオイル、アルキル2,4−ジニトロフェニルスルフェン酸、硫酸、メタンスルホン酸(メシレート)、ベンジルスルホン酸、およびトシル酸(Ts)を含むが、それらに限定されない。
「チオール保護基」は当分野において周知であり、参照によって本明細書に組み込まれるProtecting Groups in Organic Synthesis, T. W. Greene and P. G. M. Wuts, 3rd edition, John Wiley & Sons, 1999に詳細に記載されているものを含む。保護されたチオール基の例は、チオエステル、炭酸エステル、スルホン酸アリルチオエーテル、チオエーテル、シリルチオエーテル、アルキルチオエーテル、アリールアルキルチオエーテル、およびアルキルオキシアルキルチオエーテルをさらに含むが、それらに限定されない。エステル基の例は、蟻酸エステル、酢酸エステル、プロプリオナート(proprionate)、吉草酸エステル、クロトン酸エステル、および安息香酸エステルを含む。エステル基の具体的な例は、蟻酸エステル、蟻酸ベンゾイル、クロロ酢酸エステル、トリフルオロ酢酸エステル、メトキシ酢酸エステル、トリフェニルメトキシ酢酸エステル、p−クロロフェノキシ酢酸エステル、3−フェニルプロピオン酸エステル、4−オキソペンタノアート、4,4−(エチレンジチオ)ペンタノアート、ピバロエート(pivaloate)(トリメチル酢酸エステル)、クロトン酸エステル、4−メトキシ−クロトン酸エステル、安息香酸エステル、p−ベニル安息香酸エステル、2,4,6−トリメチル安息香酸エステルを含む。炭酸エステルの例は、9−フルオレニルメチル、エチル、2,2,2−トリクロロエチル、2−(トリメチルシリル)エチル、2−(フェニルスルホニル)エチル、ビニル、アリル、およびp−ニトロベンジルカーボネートを含む。シリル基の例は、トリメチルシリル、トリエチルシリル、t−ブチルジメチルシリル、t−ブチルジフェニルシリル、トリイソプロピルシリルエーテル、および他のトリアルキルシリルエーテルを含む。アルキル基の例は、メチル、ベンジル、p−メトキシベンジル、3,4−ジメトキシベンジル、トリチル、t−ブチル、およびアリルエーテル、またはその誘導体を含む。アリールアルキル基の例は、ベンジル、p−メトキシベンジル(MPM)、3,4−ジメトキシベンジル、O−ニトロベンジル、p−ニトロベンジル、p−ハロベンジル、2,6−ジクロロベンジル、p−シアノベンジル、2−および4−ピコリルエーテルを含む。
用語「アミノ酸」は、アミノ基およびカルボキシル基を両方含有する分子を指す。アミノ酸はα−アミノ酸およびβ−アミノ酸を含み、それらの構造は下に説明されている。ある態様においてアミノ酸はα−アミノ酸である。ある態様においてアミノ酸は非天然アミノ酸である。ある態様においてアミノ酸は天然アミノ酸である。ある態様においてアミノ酸は非天然アミノ酸である。
例示的なアミノ酸は、限定なしに、天然α−アミノ酸、例えばペプチド中に見いだされる20個の普通の天然に起こるα−アミノ酸のDおよびL異性体、非天然α−アミノ酸、天然β−アミノ酸(例えばβ−アラニン)、ならびに非天然(unnnatural)β−アミノ酸を含む。本発明のペプチドの構築に用いられるアミノ酸は有機合成によって調製され得るか、または他の経路、例えば天然供給源の分解またはそれからの単離などによって得られる。アミノ酸は市販であり得るか、または合成され得る。
「ペプチド」または「ポリペプチド」は、ペプチド(アミド)結合によって一緒になって連結されたアミノ酸残基のポリマーを含む。この用語(単数または複数)は、本明細書において用いられる場合、いずれかのサイズ、構造、または機能の蛋白質、ポリペプチド、およびペプチドを指す。この用語(単数または複数)は、本明細書において用いられる場合、ステープルド、非ステープルド、ステッチド、および非ステッチドポリペプチドを含む。典型的には、ペプチドまたはポリペプチドは少なくとも3アミノ酸の長さである。ペプチドまたはポリペプチドは、個別の蛋白質または一連の蛋白質を指し得る。本発明の蛋白質は好ましくは天然アミノ酸のみを含有するが、当分野において公知の非天然アミノ酸(すなわち、天然には起こらないがポリペプチド鎖中には組み込まれ得る化合物)および/またはアミノ酸アナログがその代わりに用いられ得る。ペプチドまたはポリペプチド中のアミノ酸の1つまたは2つ以上は、例えば化学的実体、例えば炭水化物基、ヒドロキシル基、リン酸基、ファルネシル基、イソファルネシル基、脂肪酸基、複合体化、官能化、または他の改変のためのリンカーの付加によって改変され得る。ペプチドまたはポリペプチドは、単一の分子でもまたあり得るか、または複数分子複合体、例えば蛋白質であり得る。ペプチドまたはポリペプチドは、天然に起こる蛋白質またはペプチドのただの断片であり得る。ペプチドまたはポリペプチドは、天然に起こる、組み換え、もしくは合成、またはそのいずれかの組み合わせであり得る。
本明細書において用いられる場合、用語「塩」または「医薬的に許容される塩」は、正しい医学的判断の範囲内において、ヒトおよびより下等な動物の組織と接触する使用にとって好適であって、過度の毒性、刺激、アレルギー応答、および同様のものがなく、適当な効果/リスク比に見合った塩を指す。医薬的に許容される塩は当分野において周知である。例えばBerge et al.は医薬的に許容される塩を詳細にJ. Pharmaceutical Sciences (1977) 66: 1-19に記載している。本発明の化合物、アミノ酸、およびポリペプチドの医薬的に許容される塩は、好適な無機および有機酸および塩基に由来するものを含む。医薬的に許容される非毒性の酸付加塩の例はアミノ基の塩であり、無機酸、例えば塩化水素酸、臭化水素酸、リン酸、硫酸、および過塩素酸によって、または有機酸、例えば酢酸、シュウ酸、マレイン酸、酒石酸、クエン酸、コハク酸、もしくはマロン酸によって、あるいは、当分野において用いられる他の方法、例えばイオン交換を用いることによって、形成される。他の医薬的に許容される塩は、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、安息香酸塩、重硫酸塩、ホウ酸塩、酪酸塩、しょうのう酸塩、カンファースルホン酸塩、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、二グルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、蟻酸塩、フマル酸塩、グルコヘプトン酸塩、グリセロリン酸塩、グルコン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、ヨウ化水素塩、2−ヒドロキシ−エタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸塩、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル硫酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、2−ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パモ酸塩、ペクチニン酸塩、過硫酸塩、3−フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、p−トルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩、吉草酸塩、および同様のものを含む。適切な塩基に由来する塩は、アルカリ金属、アルカリ土類金属、アンモニウム、およびN(C1−4アルキル)塩を含む。代表的なアルカリまたはアルカリ土類金属塩はナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウム、および同様のものを含む。さらなる医薬的に許容される塩は、適切なときには、第4級アミノ塩、例えば本明細書において定義される三置換アミノ基を含む。
それらおよび他の例示的な官能基は、発明を実施するための形態、実施例、および特許請求の範囲においてより詳細に記載される。本発明は、置換基の上の例示的なリストによっていかにも限定されることは意図されていない。
ピロリジン側鎖からのAlloc部分からの例示的なステープルの形成および続いてのCO逆挿入を示す。
ステープルドまたはステッチドポリペプチドを形成するための化学反応を示す。
アミノステープルドi,i+7ペプチドの予備的な特徴づけを示す。(a)アミノステープリングされたステープルドi,i+7ペプチドを調製する一般的なスキーム。(R)−Alloc−ピロリジンアミノ酸はSAH−p53−8ペプチド配列中のi位置に、Sアミノ酸はi+7位置に組み込まれた。RCMの後、Allocステープルド中間体へのほぼ完全な変換が得られた。この中間体は次にPdによって媒介されるCO逆挿入に供され、これは指示されているi,i+7アミノステープルドペプチドへのほぼ完全な変換を与えた。アミノステープル中の二重結合はEまたはZ立体配座であり得る。(b)SAH−p53−8ペプチド中の第1世代ステープル(長い点線、FITC−β−ala−p53−8のR/S炭化水素ステープルド)およびアミノステープルド版(実線、FITC−β−ala−p53−8のPyr/Sアミノステープルド)による同等レベルのヘリックス誘導を示す、円偏光二色性(CD)スペクトル。未改変親ペプチドもまた示されている(短い点線)。未改変ペプチド、全炭化水素ステープルドペプチド、およびアミノステープルドペプチドの配列比較を表(i)に示す。 αヘリックスペプチドは、特徴的な2つの最小値を208nmおよび222nmに有するCDスペクトルを示す。
(c)SAH−p53−8のアミノステープルド版は、元の炭化水素ステープルド版よりも堅牢な細胞貫入を示す。HeLa細胞を、β−アラニンリンカーによってペプチドから分離されたフルオレセインイソチオシアネートによってN末端標識した10μΜのペプチドによって、37℃で4時間、10%ウシ胎児血清を含有する培地中で処理した。細胞を洗浄し、パラホルムアルデヒドによって固定し、次にオリンパスFV300フロービュー共焦点蛍光顕微鏡を用いてイメージングした。アミノステープルドペプチドは、それらの条件においてより高い細胞内蓄積を示す。これはより堅牢なフルオレセイン信号によって立証されている。装置の設定は、示されている各画像の取得について同一であった。
アミノステープルドポリペプチドおよび非ステープルドポリペプチドのトリプシン処理スキームを示す。第1の星印に位置するアミノ酸はPyrであり、第2の星印に位置するアミノ酸はSである。トリプシンはポリペプチドのKおよびRのC末端側でペプチドを切断する。非ステープルドペプチドのトリプシン蛋白質加水分解は2つの断片をもたらす。共有結合的な架橋を有するのアミノステープルドペプチドの蛋白質加水分解は、トリプシンによる蛋白質加水分解後に単一の断片を生ずる。
非ステープルドポリペプチドおよびアミノステープルドポリペプチドのトリプシン処理前およびトリプシン処理後のLC/MSスペクトルを示す。トリプシン処理実験はLC/MSによって分析され、Pyrアミノ酸のAlloc基およびSのオレフィンのRCM、その後のPd(PPhによって触媒されるCO逆挿入が、共有結合的な架橋を有するアミノステープルドペプチドを生成するということを確認している。(A)はトリプシン処理前の非ステープルドポリペプチドのLC/MSスペクトルを示す。(B)はトリプシン処理後の非ステープルドポリペプチドのLC/MSスペクトルを示す。(C)はトリプシン処理前のアミノステープルドポリペプチドのLC/MSスペクトルを示す。(D)はトリプシン処理後のアミノステープルドポリペプチドのLC/MSスペクトルを示す。
異なるピロリジン側鎖(2〜5と付番)を有する非ステープルドペプチドのCDスペクトルを示す。用いられた元ペプチドはRNAseA野生型ペプチド配列EWATAAKFLAAHAである。下線の残基は凡例に示されたアミノ酸と置き換えられた。アセチルキャップまたはAlloc保護基を側鎖窒素上に有するピロリジンアミノ酸は、シクロペンタンアミノ酸よりも高いαヘリックス性を誘導した。これは、それらが架橋の非存在下であってもαヘリックス性を誘導するのに有用であるということを示唆している。第2級アミンを含有するピロリジンアミノ酸は架橋の非存在下ではヘリックス性を減少させるように見えた。
異なる立体化学をα炭素に有するAllocステープルドi,i+4ピロリジンペプチドのCDスペクトルを示す。対応する配列はEWA*TAA*KFLAAHAである。星印は、指示された立体化学を有するS5アミノ酸またはピロリジンアミノ酸に対応する。ピロリジンアミノ酸の複数の組み合わせは、かなりのヘリックス安定化を有するAllocステープルドペプチドを生ずる。
異なる異なるアゼチジン(Az)側鎖を有する非ステープルドペプチドのCDスペクトルを示す。用いられた元ペプチドはRNAseA野生型ペプチド配列EWATAAKFLAAHAである。下線の残基は凡例に示されたアミノ酸(2〜4と付番)と置き換えられた。Alloc保護基を側鎖窒素上に有するアゼチジンアミノ酸は、シクロブタンアミノ酸と同じくらいαヘリックス性を誘導した。これは、架橋の非存在下であってもαヘリックス性を誘導するのに有用であるということを示唆している。第2級アミンを含有するアゼチジンアミノ酸は架橋の非存在下ではヘリックス性を減少させるように見えた。
Allocステープルドi,i+4アゼチジンペプチドを示している。元配列はEWA*TAA*KFLAAHAである。星印はS5アミノ酸またはアゼチジンアミノ酸に対応する。図8は、Allocステープリングがアゼチジンペプチドのαヘリックス性を増大させるということを示している。
Allocステープルドハイブリッドi,i+4ピロリジン/アゼチジンペプチドを示す。元配列はEWA*TAA*KFLAAHAである。星印は、指示された立体化学を有するSアミノ酸、アゼチジンアミノ酸、またはピロリジンアミノ酸に対応する。Pyr...AzおよびAz...PyrのAllocステープルドペプチドは、全炭化水素ステープルドペプチドと同等のヘリックス安定化を生ずる。
本明細書に記載の例示的なアミノステープルドおよびallocステープルドペプチドを形成するために用いられた、Fmocによって保護されたアミノ酸の構造(およびそれらの略語)を示す。アミノステープルドペプチドは1つまたは2つの第3級アミンをステープル中に含有し、allocステープルドペプチドは1つまたは2つのカルバメートをステープル中に含有する。
円偏光二色性(CD)スペクトルを例示的なアミノステープルドおよびallocステープルドペプチドについて示す。CDスペクトルは野生型ペプチドおよび/または炭化水素ステープルドペプチドと比較されている。Acはアセチルキャップの略語である。b−alaはβ−アラニンの略語である。
蛍光偏光(FP)結合試験データを示す。FAMは5−カルボキシフルオレセインの略語である。FITCはフルオレセインイソチオシアネート異性体1の略語である。
例示的な標識ペプチドについて、共焦点顕微鏡法を用いる細胞貫入試験データを示す。
例示的な標識ペプチドについて、フローサイトメトリーを用いる細胞貫入試験データを示す。
本発明は、1つまたは2つ以上のステープルを含有する本発明のポリペプチドを提供し、ただしステープルの少なくとも1つはへテロ脂肪族基または環式基を含む。ステープル中のへテロ脂肪族部分または環式部分の存在は、ポリペプチドのαヘリックス構造を安定化することを助ける。本発明は、本発明のステープルドまたはステッチドポリペプチドを含む医薬組成物、ならびに本発明のポリペプチドを調製するおよび用いる方法もまた提供する。本発明は、ステープルが1つまたは2つのカルバメート部分(「Allocステープルドペプチド」)または1つもしくは2つの第3級アミン部分(「アミノステープルドペプチド」)を含有することを可能にする。本発明は、ステープルの閉環メタセシス(RCM)後の改変、例えば−C(=O)O−逆挿入もまた提供する。例えば、ピロリジン側鎖上のAlloc部分を含有するステープルドポリペプチドをパラジウム触媒によって処理することは、COが除かれたポリペプチド中の減少したサイズのステープルを提供する(図1)。
本明細書に記載の本発明のステープルドおよびステッチドポリペプチドは、かかる安定化された二次構造モチーフが有利であるあらゆる場合に、例えば治療剤、生物学的プローブ、または薬物送達剤として有用であり得る。本発明のステープルドまたはステッチドポリペプチドは、蛋白質−蛋白質、蛋白質−リガンド、細胞−細胞、または蛋白質−受容体の結合相互作用のモジュレータとして機能し得る。ある態様において、それらのステープルドポリペプチドは対象の障害(例えば、増殖性障害、神経系障害、免疫系障害、内分泌系障害、心血管系障害、血液系障害、炎症性障害、および尚早なまたは望まれない細胞死によって特徴づけられる障害からなる群から選択される障害)の治療に有用である。本発明は、研究ツールとしての、例えば細胞または生化学研究における本発明のステープルドおよびステッチドポリペプチドの使用もまた考える。
ポリペプチド
本発明は、少なくとも1つのステープル中にへテロ脂肪族部分または環式部分を有するステープルドまたはステッチドポリペプチドを提供する。1つの側面において、本発明は式(I)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩を提供し、
のそれぞれの場合は独立して単結合、二重結合、または三重結合を表し、
のそれぞれの場合は独立して水素、アシル、置換もしくは無置換C1−6アルキル、またはアミノ保護基であり、
2aおよびR2bのそれぞれは独立して置換もしくは無置換アルキル、置換もしくは無置換アルケニル、置換もしくは無置換アルキニル、置換もしくは無置換ヘテロアルキル、置換もしくは無置換カルボシクリル、または置換もしくは無置換ヘテロシクリルであり、
3aおよびR3bのそれぞれは独立して置換もしくは無置換アルキレン、無置換ヘテロアルキレン、置換もしくは無置換カルボシクリレン、または置換もしくは無置換ヘテロシクリレンであるか、あるいは任意にR2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素が連結されて環を形成するか、あるいは任意にR2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素が連結されて環を形成し、
は独立して結合、置換もしくは無置換C1−10アルキレン、または−C(=O)ORL1−であり、
は独立して結合、置換もしくは無置換C1−10アルキレン、または−C(=O)ORL2−であり、ただしR2aおよびR3aもR2bおよびR3bも環を形成しないときにはLは−C(=O)ORL1−であるかまたはLは−C(=O)ORL1−であり、
L1およびRL2のそれぞれは独立して任意に置換C1−10アルキレンであり、
は独立して−R、−OR、−N(R、または−SRであり、Rのそれぞれの場合は独立して水素、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の脂肪族、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のへテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、アシル、樹脂、ヒドロキシル、アミノ、またはチオール保護基であり、あるいは2つのR基が一緒になって5〜6員ヘテロ環式もしくはヘテロ芳香族環を形成し、
は独立して水素、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の脂肪族、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のへテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、アシル、樹脂、アミノ保護基、任意にリンカーによって連結された標識であり、リンカーは環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のアルキレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のアルケニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のアルキニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のヘテロアルキレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のヘテロアルケニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のヘテロアルキニレン、アリーレン、ヘテロアリーレン、またはアシレン(acylene)から選択されるか、あるいはRおよびRが一緒になって5〜6員ヘテロ環式もしくはヘテロ芳香族環を形成し、
AAのそれぞれの場合は独立してアミノ酸であり、
mは独立して2〜6の整数であり(両端を含む)、
pおよびnのそれぞれの場合は独立して0または1〜100の整数であり(両端を含む)、
qは1〜10の整数である(両端を含む)。
別の側面において、本発明は式(VI)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩を提供し、
のそれぞれは独立して単結合、二重結合、または三重結合を表し、
のそれぞれは独立して水素、アシル、置換もしくは無置換C1−6アルキル、またはアミノ保護基であり、
2aおよびR2bのそれぞれは独立して置換もしくは無置換アルキル、置換もしくは無置換アルケニル、置換もしくは無置換アルキニル、置換もしくは無置換ヘテロアルキル、置換もしくは無置換カルボシクリル、置換もしくは無置換ヘテロシクリルであり、
3aおよびR3bのそれぞれは独立して置換もしくは無置換アルキレン、無置換ヘテロアルキレン、置換もしくは無置換カルボシクリレン、または置換もしくは無置換ヘテロシクリレンであるか、あるいは任意にR2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素が連結されて環を形成するか、あるいは任意にR2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素が連結されて環を形成し、
は独立して結合、置換もしくは無置換C1−10アルキレン、または−C(=O)ORL1−であり、
は独立して結合、置換もしくは無置換C1−10アルキレン、または−C(=O)ORL2−であり、ただしR2aおよびR3aもR2bおよびR3bも環を形成しないときにはLは−C(=O)ORL1−であるかまたはLは−C(=O)ORL1−であり、
L1およびRL2のそれぞれは独立して任意置換C1−10アルキレンであり、
は独立して−R、−OR、−N(R、または−SRであり、Rのそれぞれは独立して水素、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の脂肪族、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のへテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、アシル、樹脂、ヒドロキシル、アミノ、もしくはチオール保護基であるか、あるいは2つのR基が一緒になって5〜6員ヘテロ環式もしくはヘテロ芳香族環を形成し、
は独立して水素、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の脂肪族、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のへテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、アシル、樹脂、アミノ保護基、任意にリンカーによって連結された標識であり、リンカーは環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のアルキレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のアルケニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のアルキニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のヘテロアルキレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のヘテロアルケニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のヘテロアルキニレン、アリーレン、ヘテロアリーレン、またはアシレンから選択されるか、あるいはRおよびRが一緒になって5〜6員ヘテロ環式もしくはヘテロ芳香族環を形成し、
AAのそれぞれは独立してアミノ酸であり、
pおよびnのそれぞれは独立して0または1〜100の整数であり、
mおよびsのそれぞれは独立して2〜6の整数であり、
q、t、s、y、およびzのそれぞれは独立して1〜10の整数である。
式(I)および(VI)について上で一般的に記載された通り、R3aは独立して置換もしくは無置換アルキレン、置換もしくは無置換ヘテロアルキレン、置換もしくは無置換カルボシクリレン、または置換もしくは無置換ヘテロシクリレンであるか、あるいは任意にR2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素が連結されて環を形成する。ある態様においてR3aは置換もしくは無置換アルキレンである。ある態様においてR3aは置換もしくは無置換C1−10アルキレンである。ある態様においてR3aは置換C1−10アルキレンである。ある態様においてR3aは無置換C1−10アルキレンである。ある態様においてR3aは置換もしくは無置換ヘテロアルキレンである。ある態様においてR3aは置換ヘテロアルキレンである。ある態様においてR3aは無置換ヘテロアルキレンである。ある態様においてR3aは少なくとも1つの窒素を含有する置換もしくは無置換ヘテロアルキレンである。ある態様においてR3aは−(CH−X−であり、jは独立して0〜10の整数であり、Xは独立して結合、−CR−、または−NR−であり、RおよびRのそれぞれは独立して水素、ハロゲン、またはC1−6アルキルである。ある態様においてR3aは−(CH−である。ある態様においてR3aは−(CH−NR−である。ある態様においてR3aは−(CH−NH−である。ある態様においてR3aは−(CHj+1−である。ある態様においてjは0である。ある態様においてjは1である。ある態様においてjは2である。ある態様においてjは3である。ある態様においてjは4である。ある態様においてjは5である。ある態様においてjは6である。ある態様においてjは7である。ある態様においてjは8である。ある態様においてjは9である。ある態様においてjは10である。
式(I)および(VI)について上で一般的に記載された通り、R2aは独立して置換もしくは無置換アルキル、置換もしくは無置換アルケニル、置換もしくは無置換アルキニル、置換もしくは無置換ヘテロアルキル、置換もしくは無置換カルボシクリル、置換もしくは無置換ヘテロシクリルである。ある態様においてR2aは置換もしくは無置換C1−10アルキルである。ある態様においてR2aは置換メチルである。ある態様においてR2aは無置換メチルである。ある態様においてR2aは置換エチルである。ある態様においてR2aは無置換エチルである。ある態様においてR2aは置換n−プロピルである。ある態様においてR2aは無置換n−プロピルである。ある態様においてR2aは置換イソプロピルである。ある態様においてR2aは無置換イソプロピルである。ある態様においてR2aは置換もしくは無置換ヘテロアルキルである。ある態様において、R2aは少なくとも1つの窒素を有する置換もしくは無置換ヘテロアルキルである。ある態様において、R2aは少なくとも1つの窒素を含有する無置換ヘテロアルキルである。ある態様において、R2aは少なくとも1つの窒素を含有する置換ヘテロアルキルである。
ある態様において、R2aおよびR3aの少なくとも1つは、それらが結合された炭素原子と一緒になって連結されて環を形成する。この場合には、ある態様において、それらが結合された炭素原子と一緒のR2aおよびR3aによって形成される環は、置換もしくは無置換C3−6カルボシクリルもしくはヘテロシクリルである。ある態様において、それらが結合された炭素原子と一緒のR2aおよびR3aによって形成される環は、置換もしくは無置換C3−6カルボシクリルである。ある態様において、それらが結合された炭素原子と一緒のR2aおよびR3aによって形成される環は、置換もしくは無置換C3−6ヘテロシクリルである。ある態様において、それらが結合された炭素原子と一緒のR2aおよびR3aによって形成される環は、少なくとも1つのO、N、もしくはS原子を含有する置換もしくは無置換C3−6ヘテロシクリルである。ある態様において、それらが結合された炭素原子と一緒のR2aおよびR3aによって形成される環は、少なくとも1つの窒素原子を含有する置換もしくは無置換C3−6ヘテロシクリルである。ある態様において、それらが結合された炭素原子と一緒のR2aおよびR3aによって形成される環は、1つの窒素原子を含有する置換もしくは無置換C3−6ヘテロシクリルである。ある態様において、それらが結合された炭素原子と一緒のR2aおよびR3aによって形成される環は、1つの窒素(nitogen)原子を含有する無置換C3−6ヘテロシクリルである。
ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素は連結されて環を形成する。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
であり、Xは独立して−CR−または−N−であり、j1は独立して0、1、2、3、4、5、または6である。ある態様においてj1は0であり、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は、式
である。ある態様においてjは0であり、Xはアミノ酸のα炭素に直接的に連結される。ある態様においてjは1である。ある態様においてjは2である。ある態様においてjは3である。ある態様においてjは4である。ある態様においてjは5である。ある態様においてjは6である。ある態様においてjは7である。ある態様においてjは8である。ある態様においてjは9である。ある態様においてjは10である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。
ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。
ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素によって形成される環は式
である。
本明細書において用いられる場合、jおよびj1のそれぞれは独立して1〜10の整数である。ある態様においてjは1である。ある態様においてjは2である。ある態様においてjは3である。ある態様においてjは4である。ある態様においてjは5である。ある態様においてjは6である。ある態様においてjは7である。ある態様においてjは8である。ある態様においてjは9である。ある態様においてjは10である。ある態様においてj1は1である。ある態様においてj1は2である。ある態様においてj1は3である。ある態様においてj1は4である。ある態様においてj1は5である。ある態様においてj1は6である。ある態様においてj1は7である。ある態様においてj1は8である。ある態様においてj1は9である。ある態様においてj1は10である。
ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素は、連結されて環を形成しない。この場合には、R3aは独立して置換もしくは無置換アルキレン、置換もしくは無置換アルケニレン、置換もしくは無置換アルキニレン、置換もしくは無置換ヘテロアルキレン、または置換もしくは無置換ヘテロシクリレンである。ある態様において、R3aは独立して置換もしくは無置換C1−10アルキレンである。ある態様においてR3aは置換C1−10アルキレンである。ある態様においてR3aは独立して−(CH−であり、jは0〜10の整数である。
ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素は、連結されて環を形成しない。この場合には、R2aは独立して置換もしくは無置換アルキル、置換もしくは無置換アルケニル、置換もしくは無置換アルキニル、置換もしくは無置換ヘテロアルキル、または置換もしくは無置換ヘテロシクリルである。ある態様において、R2aは独立して置換もしくは無置換C1−10アルキルである。ある態様において、R2aは独立して置換メチルである。ある態様において、R2aは独立して無置換メチルである。ある態様において、R2aは独立して置換エチルである。ある態様において、R2aは独立して無置換エチルである。ある態様において、R2aは独立して置換もしくは無置換C2−6アルキルである。
上で一般的に記載された通り、R3bは独立して置換もしくは無置換アルキレン、置換もしくは無置換ヘテロアルキレン、置換もしくは無置換カルボシクリレン、または置換もしくは無置換ヘテロシクリレンであるか、あるいは任意にR2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素が連結されて環を形成する。ある態様においてR3bは置換もしくは無置換C1−10アルキレンである。ある態様においてR3bは置換C1−10アルキレンである。ある態様においてR3bは無置換C1−10アルキレンである。ある態様においてR3bは置換もしくは無置換ヘテロアルキレンである。ある態様においてR3bは置換ヘテロアルキレンである。ある態様においてR3bは無置換ヘテロアルキレンである。ある態様においてR3bは少なくとも1つの窒素を有する置換もしくは無置換ヘテロアルキレンである。ある態様においてR3bは−(CH−X−であり、kは独立して0〜10の整数であり、Xは独立して結合、−CR−、または−NR−であり、RおよびRのそれぞれは独立して水素、ハロゲン、またはC1−6アルキルである。ある態様においてR3bは−(CH−である。ある態様においてR3bは−(CH−NR−である。ある態様においてR3bは−(CH−NH−である。ある態様においてR3bは−(CHk+1−である。ある態様においてkは0である。ある態様においてkは1である。ある態様においてkは2である。ある態様においてkは3である。ある態様においてkは4である。ある態様においてkは5である。ある態様においてkは6である。ある態様においてkは7である。ある態様においてkは8である。ある態様においてkは9である。ある態様においてkは10である。
上で一般的に記載された通り、R2bは独立して置換もしくは無置換アルキル、置換もしくは無置換アルケニル、置換もしくは無置換アルキニル、置換もしくは無置換ヘテロアルキル、置換もしくは無置換カルボシクリル、または置換もしくは無置換ヘテロシクリルである。ある態様においてR2bは置換もしくは無置換C1−10アルキルである。ある態様においてR2bは置換もしくは無置換ヘテロアルキルである。ある態様においてR2bは少なくとも1つの窒素原子を有する置換もしくは無置換ヘテロアルキルである。ある態様においてR2bは少なくとも1つの窒素原子を有する無置換ヘテロアルキルである。ある態様においてR2bは少なくとも1つの窒素原子を有する置換ヘテロアルキルである。
ある態様において、少なくとも1つの場合には、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素は連結されて環を形成する。この場合には、ある態様において、それらが結合された炭素原子と一緒のR2bおよびR3bによって形成される環は、置換もしくは無置換C3−6カルボシクリルもしくはヘテロシクリルである。ある態様において、それらが結合された炭素原子と一緒のR2bおよびR3bによって形成される環は、置換もしくは無置換C3−6カルボシクリルである。ある態様において、それらが結合された炭素原子と一緒のR2bおよびR3bによって形成される環は、置換もしくは無置換C3−6ヘテロシクリルである。ある態様において、それらが結合された炭素原子と一緒のR2bおよびR3bによって形成される環は、少なくとも1つのO、N、もしくはS原子を有する置換もしくは無置換C3−6ヘテロシクリルである。ある態様において、それらが結合された炭素原子と一緒のR2bおよびR3bによって形成される環は、少なくとも1つのNを有する置換もしくは無置換C3−6ヘテロシクリルである。ある態様において、それらが結合された炭素原子と一緒のR2bおよびR3bによって形成される環は、1つのNを有する置換もしくは無置換C3−6ヘテロシクリルである。ある態様において、それらが結合された炭素原子と一緒のR2bおよびR3bによって形成される環は、1つのNを有する無置換C3−6ヘテロシクリルである。
ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
であり、kは本明細書において定義される通りであり、Xは独立して−CR−または−N−であり、k1は独立して0、1、2、3、4、5、または6である。ある態様においてk1は0であり、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様においてk1は1である。ある態様においてk1は2である。ある態様においてk1は3である。ある態様においてk1は4である。ある態様においてk1は5である。ある態様においてk1は6である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素によって形成される環は式
である。
本明細書において用いられる場合、kは0〜10の整数であり、k1は独立して1〜10の整数である。ある態様においてkは0である。ある態様においてkは1である。ある態様においてkは2である。ある態様においてkは3である。ある態様においてkは4である。ある態様においてkは5である。ある態様においてkは6である。ある態様においてkは7である。ある態様においてkは8である。ある態様においてkは9である。ある態様においてkは10である。ある態様においてk1は1である。ある態様においてk1は2である。ある態様においてk1は3である。ある態様においてk1は4である。ある態様においてk1は5である。ある態様においてk1は6である。ある態様においてk1は7である。ある態様においてk1は8である。ある態様においてk1は9である。ある態様においてk1は10である。
ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素は、連結されて環を形成しない。この場合には、R3bは独立して置換もしくは無置換アルキレン、置換もしくは無置換アルケニレン、置換もしくは無置換アルキニレン、置換もしくは無置換ヘテロアルキレン、または置換もしくは無置換ヘテロシクリレンである。ある態様において、R3bは独立して置換もしくは無置換C1−10アルキレンである。ある態様において、R3bは置換C1−10アルキレンである。ある態様において、R3bは独立して−(CH−であり、kは上で定義された通りである。
ある態様において、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素は、連結されて環を形成しない。この場合には、ある態様において、R2bは独立して置換もしくは無置換C1−10アルキル、置換もしくは無置換アルケニル、置換もしくは無置換アルキニル、置換もしくは無置換ヘテロアルキル、または置換もしくは無置換ヘテロシクリルである。ある態様において、R2bは独立して置換もしくは無置換C1−10アルキルである。ある態様において、R2bは独立して置換メチルである。ある態様において、R2bは独立して無置換メチルである。ある態様において、R2bは独立して置換エチルである。ある態様において、R2bは独立して無置換エチルである。ある態様において、R2bは独立して置換もしくは無置換C2−6アルキルである。
ある態様において、少なくとも1つの場合には、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素は連結されて環を形成せず、R2b、R3bならびにR2bおよびR3bが結合された炭素は連結されて環を形成しない。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素は連結されて環を形成せず、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素は連結されて環を形成する。ある態様において、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素は連結されて環を形成し、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素は連結されて環を形成しない。ある態様において、少なくとも1つの場合には、R2a、R3a、ならびにR2aおよびR3aが結合された炭素は連結されて環を形成し、R2b、R3b、ならびにR2bおよびR3bが結合された炭素は連結されて環を形成する。
上で一般的に記載された通り、Lは独立して結合、置換もしくは無置換C1−10アルキレン、または−C(=O)ORL1−であり、RL1は任意に置換C1−10アルキレンである。いくつかの態様においてLは置換もしくは無置換C1−10アルキレンである。いくつかの態様においてLは置換C1−10アルキレンである。いくつかの態様においてLは−(CH−であり、gは0または1〜10の整数である。いくつかの態様においてgは0であり、Lは結合である。いくつかの態様においてgは1である。いくつかの態様においてgは2である。いくつかの態様においてgは3である。いくつかの態様においてgは4である。いくつかの態様においてgは5である。いくつかの態様においてgは6である。いくつかの態様においてgは7である。いくつかの態様においてgは8である。いくつかの態様においてgは9である。いくつかの態様においてgは10である。ある態様においてRL1は置換C1−10アルキレンである。ある態様においてRL1は−(CHg1−であり、g1は1〜10の整数である。いくつかの態様においてg1は1である。いくつかの態様においてg1は2である。いくつかの態様においてg1は3である。いくつかの態様においてg1は4である。いくつかの態様においてg1は5である。いくつかの態様においてg1は6である。いくつかの態様においてg1は7である。いくつかの態様においてg1は8である。いくつかの態様においてg1は9である。いくつかの態様においてg1は10である。
上で一般的に記載された通り、Lは独立して結合、置換もしくは無置換C1−10アルキレン、または−C(=O)ORL2−であり、RL2は任意に置換C1−10アルキレンである。いくつかの態様においてLは置換もしくは無置換C1−10アルキレンである。いくつかの態様においてLは置換C1−10アルキレンである。いくつかの態様においてLは−(CH−であり、hは0または1〜10の整数である。いくつかの態様においてhは0であり、Lは結合である。いくつかの態様においてhは1である。いくつかの態様においてhは2である。いくつかの態様においてhは3である。いくつかの態様においてhは4である。いくつかの態様においてhは5である。いくつかの態様においてhは6である。いくつかの態様においてhは7である。いくつかの態様においてhは8である。いくつかの態様においてhは9である。いくつかの態様においてhは10である。ある態様においてRL2は置換C1−10アルキレンである。ある態様においてRL2は−(CHh1−であり、h1は1〜10の整数である。いくつかの態様においてh1は1である。いくつかの態様においてh1は2である。いくつかの態様においてh1は3である。いくつかの態様においてh1は4である。いくつかの態様においてh1は5である。いくつかの態様においてh1は6である。いくつかの態様においてh1は7である。いくつかの態様においてh1は8である。いくつかの態様においてh1は9である。いくつかの態様においてh1は10である。
ある態様において、ステープルの少なくとも1つでは、同じステープルのR2aおよびR3aもR2bおよびR3bも連結されて環を形成しない。この場合には、Lは−C(=O)ORL1−であるかまたはLは−C(=O)ORL2−であり、RL1およびRL2のそれぞれは任意に置換C1−10アルキレンである。この場合には、ある態様においてRL1は置換C1−10アルキレンである。この場合には、ある態様においてRL1は−(CHg1−であり、g1は上で定義された通りである。この場合には、ある態様においてRL2は置換C1−10アルキレンである。この場合には、ある態様においてRL2は−(CHh1−であり、h1は上で定義された通りである。
ある態様においてqは0である。ある態様においてqは1である。ある態様においてqは2である。ある態様においてqは3である。ある態様においてqは4である。ある態様においてqは5である。ある態様においてqは6である。ある態様においてqは7である。ある態様においてqは8である。ある態様においてqは9である。ある態様においてqは10である。
ある態様において、−[XAA]−は式
に対応し、RおよびR’のそれぞれは独立して水素または本明細書において定義される好適なアミノ酸側鎖であり、Rは本明細書において定義される通りである。好適なアミノ酸側鎖は、表1〜3において提供されるおよび本明細書に記載の天然および非天然アミノ酸側鎖を両方含むが、それらに限定されない。ある態様においてXAAのそれぞれはα−アミノ酸である。ある態様において、XAAのそれぞれは表1において提供される天然L−アミノ酸である。ある態様において、XAAのそれぞれは独立して表1において提供される天然L−アミノ酸、または表2において提供される非天然D−アミノ酸である。
ある態様においてXAAのそれぞれは天然アミノ酸である。ある態様においてXAAのそれぞれはα−アミノ酸である。ある態様においてXAAのそれぞれは表1において提供される天然L−アミノ酸である。ある態様においてXAAのそれぞれは独立して表1において提供される天然L−アミノ酸、または表2、3、4、および/もしくは5において提供される非天然アミノ酸である。
それらのいずれかが本発明のペプチド中に含まれ得る多くの公知の非天然アミノ酸が存在している。例えば、S. Hunt, The Non-Protein Amino Acids: In Chemistry and Biochemistry of the Amino Acids, edited by G. C. Barrett, Chapman and Hall, 1985参照。非天然アミノ酸のいくつかの追加の例は、4−ヒドロキシプロリン、デスモシン、γ−アミノ酪酸、β−シアノアラニン、ノルバリン、4−(E)−ブテニル−4(R)−メチル−N−メチル−L−トレオニン、N−メチル−L−ロイシン、1−アミノ−シクロプロパンカルボン酸、1−アミノ−2−フェニル−シクロプロパンカルボン酸、1−アミノ−シクロブタンカルボン酸、4−アミノ−シクロペンテンカルボン酸、3−アミノ−シクロヘキサンカルボン酸、4−ピペリジル酢酸、4−アミノ−1−メチルピロール−2−カルボン酸、2,4−ジアミノ酪酸、2,3−ジアミノプロピオン酸、2,4−ジアミノ酪酸、2−アミノヘプタン二酸、4−(アミノメチル)安息香酸、4−アミノ安息香酸、オルト、メタ、およびパラ置換フェニルアラニン(例えば、−C(=O)C、−CF、−CN、−ハロ、−NO、−CHによって置換される)、二置換フェニルアラニン、置換チロシン(例えば、−C(=O)C、−CF、−CN、−ハロ、−NO、−CHによってさらに置換される)、ならびにスタチンである。さらに、本発明における使用のためのアミノ酸は誘導体化されて、ヒドロキシル化、リン酸化、スルホン化、アシル化、アルキル化、ファルネシル化、ゲラニル化(geryanylated)、および/またはグリコシル化されたアミノ酸残基を含み得る。
基RはポリペプチドのN末端に対応する。例えば−[XAA]−が式
のα−アミノ酸に対応する場合、結果として、ある態様において、R−[XAA−は式
に対応し、p、R、およびR'は本明細書において定義される通りであり、
は水素、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換脂肪族、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換へテロ脂肪族、置換もしくは無置換アリール、置換もしくは無置換ヘテロアリール、置換もしくは無置換アシル、樹脂、好適なアミノ保護基、任意にリンカーによって連結された標識であり、リンカーは環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換アルキレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換アルケニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換アルキニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換ヘテロアルキレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換ヘテロアルケニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換ヘテロアルキニレン、置換もしくは無置換アリーレン、置換もしくは無置換ヘテロアリーレン、または置換もしくは無置換アシレンであるか、あるいはRおよびRが一緒になって置換もしくは無置換ヘテロ環式もしくはヘテロ芳香族環を形成する。
ある態様においてRは水素である。ある態様においてRはC1−6アルキルである。ある態様においてRは−CHである。ある態様においてRはアミノ保護基である。ある態様においてRは−Bocである。ある態様においてRは−Fmocである。ある態様においてRはアシルである。ある態様においてRは−(C=O)CHである。ある態様においてRは標識である。ある態様においてRは樹脂である。ある態様においてRは固体担持体である。
ある態様において、Rは任意にリンカーによって連結された標識であり、リンカーは、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換アルキレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換アルケニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換アルキニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換ヘテロアルキレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換ヘテロアルケニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換ヘテロアルキニレン、置換もしくは無置換アリーレン、置換もしくは無置換ヘテロアリーレン、または置換もしくは無置換アシレンである。
上で一般的に記載された通り、基Rはペプチド鎖のC末端に対応し、変数−R、−OR、−N(R、または−SRに対応し、Rは本明細書において定義される通りである。例えば−[XAA]−が式
のα−アミノ酸に対応する場合、結果として、ある態様において−[XAA−Rは式
に対応し、Rのそれぞれは独立して水素、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換脂肪族、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換ヘテロ脂肪族、置換もしくは無置換アリール、置換もしくは無置換ヘテロアリール、置換もしくは無置換アシル、樹脂、または好適なヒドロキシル、アミノ、もしくはチオール保護基である。2つのR基は一緒になって任意に置換もしくは無置換ヘテロ環式もしくはヘテロ芳香族環を形成し得る。
ある態様においてRは−ORであり、Rは水素、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換脂肪族、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換へテロ脂肪族、置換もしくは無置換アリール、置換もしくは無置換ヘテロアリール、置換もしくは無置換アシル、樹脂、または好適なヒドロキシル保護基である。
ある態様においてRは−SRであり、Rは水素、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換脂肪族、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換へテロ脂肪族、置換もしくは無置換アリール、置換もしくは無置換ヘテロアリール、置換もしくは無置換アシル、樹脂、または好適なチオール保護基である。
ある態様においてRは−N(Rであり、Rのそれぞれは独立して水素、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換脂肪族、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換へテロ脂肪族、置換もしくは無置換アリール、置換もしくは無置換ヘテロアリール、置換もしくは無置換アシル、樹脂、好適なアミノ保護基であるか、あるいは2つのR基が一緒になって置換もしくは無置換ヘテロ環式もしくはヘテロ芳香族環を形成する。
本明細書において用いられる場合、「標識」は、標識が結合された本発明のポリペプチドの検出を可能にする部分に組み込まれた少なくとも1つの元素、同位体、または官能基を有する部分を指す。標識は、ポリペプチドに直接的に(すなわち結合によって)結合された部分または連結基によってポリペプチドに結合された部分を包含する。当然のことながら、標識は、検出されようとする本発明のポリペプチドの生物学的活性または特徴と干渉しないいずれかの位置で、ポリペプチドに結合され得る。一般的に、標識は5つの種類のいずれか1つ(または2つ以上)に属し得る。a)同位体部分(これは放射性または重同位体であり得、H、H、13C、14C、15N、18F、31P、32P、35S、67Ga、99mTc(Tc−99m)、111In、123I、125I、169Yb、および186Reを含むが、それらに限定されない)を含有する標識、b)免疫部分(これは抗体または抗原であり得、酵素(例えば西洋ワサビペルオキシダーゼなど)に結合され得る)を含有する標識、c)有色、発光、燐光、または蛍光部分である標識(例えば蛍光標識FITCなど)、d)1つまたは2つ以上の光親和性部分を有する標識、ならびにe)1つまたは2つ以上の公知の結合パートナーを有するリガンド部分を有する標識(例えばビオチン−ストレプトアビジン、FK506−FKBP)。上記の標識のそれらの型のいずれかは、本明細書において定義される「診断剤」とも言われ得る。例示的な標識はFITC、5−カルボキシフルオレセイン(FAM)、およびビオチンを含むが、それらに限定されない。
ある態様において、標識は本発明のポリペプチドに直接的に(すなわち結合によって)結合される。ある態様において、標識は本発明のポリペプチドに間接的に(すなわちリンカーによって)結合される。ある態様において、リンカーは環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換アルキレンである。ある態様において,リンカーは環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換アルケニレンである。ある態様において、リンカーは環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換アルキニレンである。ある態様において、リンカーは環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換ヘテロアルキレンである。ある態様において、リンカーは環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換ヘテロアルケニレンである。ある態様において、リンカーは環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の置換もしくは無置換ヘテロアルキニレンである。ある態様において、リンカーは置換もしくは無置換アリーレンである。ある態様において、リンカーは置換もしくは無置換ヘテロアリーレンである。ある態様において、リンカーは置換もしくは無置換アシレンである。ある態様において、リンクされているのはβ−アラニン(β−ala)リンカーである。
本明細書において用いられる場合、「診断剤」はイメージング剤を指す。例示的なイメージング剤は、ポジトロン断層法(PET)、コンピュータ断層撮影(CAT)、単一光子放射断層撮影法、x線、蛍光透視、および核磁気共鳴イメージング(MRI)に用いられるもの、ならびに造影剤を含むが、それらに限定されない。
ある態様において、例えば生物学的標的の同定において、標識は、放射性同位体、好ましくは検出可能な粒子(例えばβ粒子)を放出する同位体を含む。ある態様において、標識は、生物学的系における分子間相互作用の直接的な解明のための1つまたは2つ以上の光親和性部分を含む。種々の公知の光反応基が用いられ得、主にジアゾ化合物、アジ化物、またはジアジリンからニトレンまたはカルベンへの光変換に頼る(その全内容が参照によって本明細書に組み込まれるBayley, H., Photogenerated Reagents in Biochemistry and Molecular Biology (1983), Elsevier, Amsterdam参照)。本発明のある態様において、用いられる光親和性標識は1つまたは2つ以上のハロゲン部分によって置換されたo−、m−、およびp−アジドベンゾイルであり、4−アジド−2,3,5,6−テトラフルオロ安息香酸を含むが、それに限定されない。ある態様において標識は1つまたは2つ以上の蛍光部分を含む。ある態様において標識は蛍光標識FITCである。ある態様において、標識は、1つまたは2つ以上の公知の結合パートナーを有するリガンド部分を含む。ある態様において標識はリガンド部分ビオチンを含む。
本明細書において用いられる場合、「固体担持体」は、ポリペプチドが結合される固体の不溶性表面を含むが、それに限定されない。固体担持体はガラス板、ガラスビーズ、樹脂、および同様のものを含むが、それらに限定されない。
本明細書において用いられる場合、「樹脂」は、固相合成に有用であり、それにポリペプチドが結合される物質を指す。固相合成は周知の合成技術である。一般的に、Atherton, E., Sheppard, R.C. Solid Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach, IRL Press, Oxford, England, 1989およびStewart J.M., Young, J. D. Solid Phase Peptide Synthesis, 2nd edition, Pierce Chemical Company, Rockford, 1984参照。それらのそれぞれの全内容はここで参照によって本明細書に組み込まれる。本発明によって用いられ得る例示的な樹脂は、アルケニル樹脂、アミン官能化樹脂、ベンズヒドリルアミン(BHA)樹脂、Br官能化樹脂、クロロメチル樹脂、CHO官能化樹脂、Cl官能化樹脂、COH官能化樹脂、Hypo-Gel樹脂、I官能化樹脂、MBHA樹脂、OH官能化樹脂、オキシム樹脂、PEG樹脂、Boc−Blzペプチド合成樹脂、Fmoc−tBuペプチド合成樹脂、チオール官能化樹脂、およびWang樹脂を含むが、それらに限定されない。
例示的なアルケニル樹脂はREM樹脂、ビニルスルホンポリマー結合樹脂、およびビニル−ポリスチレン樹脂を含むが、それらに限定されない。
例示的なアミン官能化樹脂は、アミジン樹脂、N−(4−ベンジルオキシベンジル)ヒドロキシルアミン(ポリマー結合)、(アミノメチル)ポリスチレン、ポリマー結合(R)−(+)−α−メチルベンジルアミン、2−クロロトリチルKnorr樹脂、2−N−Fmoc−アミノ−ジベンゾシクロヘプタ−1,4−ジエン(ポリマー結合樹脂)、4−[4−(1−Fmoc−アミノエチル)−2−メトキシ−5−ニトロフェノキシ]ブチルアミド(butyramido)メチル−ポリスチレン樹脂、4−ベンジルオキシベンジルアミン(ポリマー結合)、4−カルボキシベンゼンスルホンアミド(ポリマー結合)、ビス(tert−ブトキシカルボニル)チオイソ尿素(ポリマー結合)、ジメチルアミノメチル−ポリスチレン、Fmoc−3−アミノ−3−(2−ニトロフェニル)プロピオン酸(ポリマー結合)、N−メチルアミノメチル化ポリスチレン、PAL樹脂、Sieberアミド樹脂、tert−ブチルN−(2−メルカプトエチル)カルバメート(ポリマー結合)、およびトリフェニルクロロメタン−4−カルボキサミドポリマー結合樹脂を含むが、それらに限定されない。
例示的なベンズヒドリルアミン(BHA)樹脂は、2−クロロベンズヒドリルクロリド(ポリマー結合)、HMPB−ベンズヒドリルアミン(ポリマー結合)、4−m(ポリマー結合)、ベンズヒドリルクロリド(ポリマー結合)、およびベンズヒドリルアミンポリマー結合樹脂を含むが、それらに限定されない。
例示的なPEG樹脂はエチレングリコールポリマー結合樹脂を含むが、それに限定されない。
変数mは、変数XAAによって定義されるどれだけ多くのアミノ酸が、式(I)〜(V)のポリペプチド中の末端不飽和(unstaturated)側鎖を含有するアミノ酸間に存在するかを指示する。式(I)〜(V)のポリペプチドについて下で説明される通り、変数mは、iのC末端側の末端不飽和側鎖を含有するアミノ酸の位置、例えば位置i+3、i+4、i+5、i+6、およびi+7に関する情報を提供する。表6は、式(I)中に存在する末端不飽和側鎖の具体的な位置を相関付けている。
変数mおよびsは、変数XAAによって定義されるどれだけ多くのアミノ酸が、式(VI)〜(IX)のビスポリペプチド中の末端不飽和側鎖を含有するアミノ酸間に存在するかを指示する。ある態様においてmは2である。ある態様においてmは3である。ある態様においてmは4である。ある態様においてmは5である。ある態様においてmは6である。例えば、式(VI)のポリペプチドについて下で説明される通り、変数R、R、R、R2a、R2b、R3a、R3b、L、L、p、m、s、t、n、およびqは上で定義された通りであり、iはα,α−二置換(末端不飽和アミノ酸側鎖)アミノ酸の1つの部位を表し、変数mは、iのN末端側の末端不飽和側鎖を含有するアミノ酸の位置、例えば位置i+3、i+4、i+5、i+6、およびi+7に関する情報を提供する。sは、iのC末端側の末端不飽和側鎖を含有するアミノ酸の位置、例えば位置i+3、i+4、i+5、i+6、およびi+7に関する情報を提供する。表3は、それらの具体的なiの位置を式(VI)〜(IX)について変数mおよびsと相対的に相関付けている。
ある態様においてmのそれぞれは独立して2〜6の整数である。ある態様においてmは2である。ある態様においてmは3である。ある態様においてmは4である。ある態様においてmは5である。ある態様においてmは6である。
ある態様においてsのそれぞれは独立して2〜6の整数である。ある態様においてsは2である。ある態様においてsは3である。ある態様においてsは4である。ある態様においてsは5である。ある態様においてsは6である。
ある態様においてmは2であり、sは2である。ある態様においてmは2であり、sは3である。ある態様においてmは2であり、sは4である。ある態様においてmは2であり、sは5である。ある態様においてmは2であり、sは6である。
ある態様においてmは3であり、sは2である。ある態様においてmは3であり、sは3である。ある態様においてmは3であり、sは4である。ある態様においてmは3であり、sは5である。ある態様においてmは3であり、sは6である。
ある態様においてmは4であり、sは2である。ある態様においてmは4であり、sは3である。ある態様においてmは4であり、sは4である。ある態様においてmは4であり、sは5である。ある態様においてmは4であり、sは6である。
ある態様においてmは5であり、sは2である。ある態様においてmは5であり、sは3である。ある態様においてmは5であり、sは4である。ある態様においてmは5であり、sは5である。ある態様においてmは5であり、sは6である。
ある態様においてmは6であり、sは2である。ある態様においてmは6であり、sは3である。ある態様においてmは6であり、sは4である。ある態様においてmは6であり、sは5である。ある態様においてmは6であり、sは6である。
本明細書において用いられる場合、「ステープル」は、1つのα−アミノ酸を第2のα−アミノ酸に結合している架橋全体を包含するが、各アミノ酸のα炭素およびそれらが一部をなすポリペプチド鎖は除外する。
ある態様において、ステープル中の2つのアミノ酸は(i,i+3)または(i,i−3)によって関係づけられ、式(I)または(VI)のポリペプチド中に提供されたステープルのα炭素からα炭素まで、10個未満の連続して結合された原子を含む。
ある態様において、ステープル中の2つのアミノ酸は(i,i+4)または(i,i−4)によって関係づけられ、式(I)または(VI)のポリペプチド中に提供されたステープルのα炭素からα炭素まで、8〜15個の連続して結合された原子を含む。
ある態様において、ステープル中の2つのアミノ酸は(i,i+7)または(i,i−7)によって関係づけられ、、式(I)または(VI)のポリペプチド中に提供されたステープルのα炭素からα炭素まで、11〜20個の連続して結合された原子を含む。
上で一般的に定義された通り、pおよびnのそれぞれは独立して0または1〜100の整数である。
ある態様においてpは0または1〜100の整数である。ある態様においてpは0である。ある態様においてpは1〜100の整数である。ある態様においてpは75〜100の整数である。ある態様においてpは50〜100の整数である。ある態様においてpは25〜100の整数である。ある態様においてpは15〜100の整数である。ある態様においてpは10〜100の整数である。ある態様においてpは5〜100の整数である。ある態様においてpは10〜75の整数である。ある態様においてpは25〜50の整数である。ある態様においてpは1〜10の整数である。ある態様においてpは3〜6の整数である。
ある態様においてnは0または1〜100の整数である。ある態様においてnは0である。ある態様においてnは1〜100の整数である。ある態様においてnは75〜100の整数である。ある態様においてnは50〜100の整数である。ある態様においてnは25〜100の整数である。ある態様においてnは15〜100の整数である。ある態様においてnは10〜100の整数である。ある態様においてnは5〜100の整数である。ある態様においてnは10〜75の整数である。ある態様においてnは25〜50の整数である。ある態様においてnは1〜10の整数である。ある態様においてnは1〜5の整数である。
上で一般的に定義された通り、qは1〜10の整数である。ある態様においてqは1〜9の整数である。ある態様においてqは1〜8の整数である。ある態様においてqは1〜7の整数である。ある態様においてqは1〜6の整数である。ある態様においてqは1〜5の整数である。ある態様においてqは1〜4の整数である。ある態様においてqは1〜3の整数である。ある態様においてqは1〜2の整数である。ある態様においてqは10である。ある態様においてqは9である。ある態様においてqは8である。ある態様においてqは7である。ある態様においてqは6である。ある態様においてqは5である。ある態様においてqは4である。ある態様においてqは3である。ある態様においてqは2である。ある態様においてqは1である。
ある態様においてmは6であり、pは3または6であり、nは0または2であり、qは1である。ある態様においてmは6であり、pは6であり、nは2であり、qは1である。ある態様においてmは6であり、pは3であり、nは0であり、qは1である。ある態様において、ポリペプチドは1つの第3級アミンを有するステープルを有する。ある態様において、ポリペプチドは2つの第3級アミンを有するステープルを有する。ある態様において、ポリペプチドは1つのカルバメートを有するステープルを有する。ある態様において、ポリペプチドは2つのカルバメートを有するステープルを有する。ある態様において、ポリペプチドは、EおよびZ配置(confirguration)を有する両方のステープルを含む。ある態様において、ステープルは、E配置を有する二重結合を有する。ある態様において、ステープルは、Z配置を有する二重結合を有する。
上で一般的に定義された通り、yは1〜10の整数である。ある態様においてyは10である。ある態様においてyは9である。ある態様においてyは8である。ある態様においてyは7である。ある態様においてyは6である。ある態様においてyは5である。ある態様においてyは4である。ある態様においてyは3である。ある態様においてyは2である。ある態様においてyは1である。
上で一般的に定義された通り、zは1〜10の整数である。ある態様においてzは10である。ある態様においてzは9である。ある態様においてzは8である。ある態様においてzは7である。ある態様においてzは6である。ある態様においてzは5である。ある態様においてzは4である。ある態様においてzは3である。ある態様においてzは2である。ある態様においてzは1である。
ある態様においてyは1であり、zは1である。ある態様においてyは1であり、zは2である。ある態様においてyは1であり、zは3である。ある態様においてyは1であり、zは4である。ある態様においてyは1であり、zは5である。ある態様においてyは1であり、zは6である。ある態様においてyは2であり、zは1である。ある態様においてyは2であり、zは2である。ある態様においてyは2であり、zは3である。ある態様においてyは2であり、zは4である。ある態様においてyは2であり、zは5である。ある態様においてyは2であり、zは6である。ある態様においてyは3であり、zは6である。ある態様においてyは3であり、zは1である。ある態様においてyは3であり、zは2である。ある態様においてyは3であり、zは3である。ある態様においてyは3であり、zは4である。ある態様においてyは3であり、zは5である。ある態様においてyは3であり、zは6である。ある態様においてyは4であり、zは6である。ある態様においてyは4であり、zは1である。ある態様においてyは4であり、zは2である。ある態様においてyは4であり、zは3である。ある態様においてyは4であり、zは4である。ある態様においてyは4でありzは5である。ある態様においてyは4であり、zは6である。ある態様においてyは5であり、zは6である。ある態様においてyは5であり、zは1である。ある態様においてyは5であり、zは2である。ある態様においてyは5であり、zは3である。ある態様においてyは5であり、zは4である。ある態様においてyは5であり、zは5である。ある態様においてyは5であり、zは6である。ある態様においてyは6であり、zは6である。ある態様においてyは6であり、zは1である。ある態様においてyは6であり、zは2である。ある態様においてyは6であり、zは3である。ある態様においてyは6であり、zは4である。ある態様においてyは6であり、zは5である。ある態様においてyは6であり、zは6である。
ポリペプチドおよび蛋白質の例示的な二次構造モチーフはαヘリックス、α−L、310ヘリックス、πヘリックス、およびII型ヘリックス(例えば左巻きヘリックス)を含むが、それらに限定されない。ある態様において、本発明のポリペプチドの主な二次構造モチーフはαヘリックスである。
ある態様において、上の式(I)〜(X)またはその下位集合のポリペプチドはαヘリックスポリペプチドである。ある態様において、上の式(I)〜(X)またはその下位集合のポリペプチドは実質的にαヘリックスのポリペプチドである。本明細書において用いられる場合、表現「実質的にαヘリックス」は、(I)平均して約(−90°,−15°)〜約(−35°,−70°)の範囲の主鎖(φ,ψ)二面角および/もしくは(ii)1つの残基のψ二面角および次の残基のφ二面角が合計で平均して約−80°〜約−125°になるような二面角を含む、ならびに/または(iii)ポリペプチド鎖中に提供されたアミノ酸の少なくとも50%、60%、70%、80%、90%、または95%にαヘリックス立体配座をとらせるポリペプチドを指す。
ある態様において、本発明のポリペプチドは、1つの残基のψ二面角および次の残基のφ二面角が合計で平均して約−100°〜約−110°になるような二面角をとる。ある態様において、本発明のポリペプチドは、1つの残基のψ二面角および次の残基のφ二面角が合計で平均して約−105°になるような二面角をとる。ポリペプチドのαヘリックス二次構造の確認は、周知の分析技術、例えばx線結晶解析、電子結晶解析、繊維回折、蛍光異方性、円偏光二色性(circular dichrosim)(CD)、および核磁気共鳴分光法によって確認され得る。
ある態様において、本発明のポリペプチドは公知のαヘリックスペプチドと相同である。ある態様において、本発明のポリペプチドは公知のαヘリックスペプチドと少なくとも80%、85%、90%、または95%相同である。
ある態様において、本発明は、本発明のポリペプチドの合成に用いられる中間体および出発物質もまた提供する。例えば、本発明は式(D)のアミノ酸を提供し、
、R、R、L、X、j、およびjは本明細書において定義される。
ある態様において、本発明は、本発明のポリペプチドの合成に用いられる中間体もまた提供する。例えば、本発明は次の構造のいずれか1つのアミノ酸、
およびその塩を提供し、gは0または1〜10の整数である。
ある態様において、本明細書において提供されるアミノ酸は次の構造、
およびその塩のいずれか1つから選択され、gは0または1〜10の整数である。
ある態様においてgは0である。ある態様においてgは1である。ある態様においてgは2である。ある態様においてgは3である。ある態様においてgは4である。ある態様においてgは5である。ある態様においてgは6である。ある態様においてgは7である。ある態様においてgは8である。ある態様においてgは9である。ある態様においてgは10である。
ある態様において、式(I)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(II)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(II−a)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(II−a−1)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(II−a−2)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(II−a−3)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(II−a−4)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(Il−b)もしくは(II−c)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(II−b−1)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(II−b−2)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(II−c−1)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
請求項8に記載のポリペプチド。ポリペプチドは式(II−c−2)、
またはその医薬的に許容される塩である。
ある態様において、式(III)もしくは式(IV)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(III−a)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(III−a−1)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(III−a−2)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(III−a−3)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(III−a−4)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(III−b)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(III−b−1)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(III−b−2)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(III−b−3)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(III−b−4)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(III−c)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(III−c−1)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(III−c−2)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(IV−a)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(IV−a−1)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(IV−a−2)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(IV−a−3)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(IV−a−4)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(IV−b)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(IV−b−1)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(IV−b−2)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(IV−b−3)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(IV−b−4)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(IV−c)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(IV−c−1)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(IV−c−2)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(V)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(V−a)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(V−b)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(V−b−1)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(V−c)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(V−c−1)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(V−d)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(V−d−1)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(V−d−2)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(V−d−3)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(VI)のポリペプチドが提供される。
ある態様において、式(VII)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(VIII)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(IX)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、式(X)のポリペプチド、
またはその医薬的に許容される塩が提供される。
ある態様において、ステープルは、それぞれカルバメート部分を含む2つのアミノ酸を用いて調製される。ある態様において、ステープルは、カルバメート部分を有さない1つから選択されるアミノ酸を用いて調製され、別のアミノ酸はカルバメート部分を有する1つから選択される。ある態様において、ステープルは、Pyr、Pyr、Az、SN、SN、SN、RN、RN、RN、S、S、R、およびRから選択される2つのアミノ酸を用いて調製される。ある態様において、用いられるアミノ酸は図10に示されている例示的なアミノ酸の1つのアナログである。例えば、追加のメチレン単位を含有するS、S、R、またはRのアナログ(例えばS10またはR10)が用いられ得る。ある態様において、ステープルは、R、R、S、S、またはそのアナログから選択されるアミノ酸、およびPyr、Pyr、Az、SN、SN、SN、RN、RN、またはRNから選択される別のアミノ酸を用いて調製される。ある態様において、ステープルは、RまたはSから選択されるアミノ酸、およびPyr、Pyr、Az、SN、SN、SN、RN、RN、またはRNから選択される別のアミノ酸を用いて調製される。ある態様において、ステープルはPyrおよびSから調製される。ある態様においてステープルはRおよびPyrを用いている。ある態様においてステープルはAzおよびSを用いて調製される。ある態様において、ステープルはRおよびAzを用いて調製される。ある態様においてステープルはRおよびSNを用いて調製される。ある態様においてステープルはRおよびSNを用いて調製される。ある態様においてステープルはRおよびSNを用いて調製される。ある態様において、ステープルはS10およびSNを用いて調製される。ある態様において、ステープルはRNおよびSを用いて調製される。ある態様において、ステープルはRNおよびSNを用いて調製される。ある態様において、ステープルは1つまたは2つのカルバメート部分を含むAllocステープルである。ある態様において、ステープルは2つのカルバメート部分を含むAllocステープルである。ある態様において、ステープルは1つのカルバメート部分を有するAllocステープルである。ある態様において、ステープルは1つまたは2つのアミノ部分を含むアミノステープルである。ある態様において、ステープルは2つのアミノ部分を含むアミノステープルである。ある態様において、ステープルは1つのアミノ部分を有するアミノステープルである。ある態様において架橋アミノ酸は位置iおよびi+7に位置する。ある態様においてステープルドペプチドはp53のペプチドセグメントから調製される。ある態様において、ステープルドペプチドはp53−4親ペプチドから調製される。ある態様において、ステープルドペプチドはp53−8親ペプチドから調製される。ある態様において、ステープルドペプチドはPM2親ペプチドから調製される。
本発明のペプチドの例を表8に挙げる。
ステープルドおよびステッチドポリペプチドを調製する方法
本発明は、式(I)〜(X)のポリペプチドおよびその塩を調製する方法にもまた関する。本発明は、本発明のポリペプチド(polypetide)の合成の中間体もまた提供する。合成は、式(i)もしくは(ii)の非ステープルドポリペプチド前駆体またはその塩を調製することを典型的には含み、
、R、R、R2a、R3a、L、L、p、m、n、q、s、t、y、z、およびXAAは式(I)および(VI)において定義された通りである。次に、非ステープルドポリペプチド前駆体は閉環メタセシス触媒によって処理されて、式(I)または(VI)の本発明のステープルドポリペプチドを提供する。
本発明の非ステープルドポリペプチドの合成は、アミノ酸およびアミノ酸アナログの所望の配列および数の選択を第1に含む。当業者には当然のことながら、選択されるアミノ酸構造(天然または非天然)の数、立体化学、および型は、調製されるべきポリペプチドのサイズ、具体的なアミノ酸が所望の構造モチーフ(例えばαヘリックス)を生ずる能力、およびミミックすることが望ましいいずれかの具体的なペプチド配列(例えばp53ドナーヘリックスペプチド)に依存する。
ひとたびアミノ酸が選択されたら、本発明の非ステープルドポリペプチドの合成は標準的な脱保護およびカップリング反応を用いて達成され得る。ペプチド結合の形成およびポリペプチド合成は当業者に周知の技術であり、固相および溶液相方法を両方包含する。一般的に、Bodanszky and Bodanszky, The Practice of Peptide Synthesis, Springer-Verlag, Berlin, 1984、Atherton and Sheppard, Solid Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach, IRL Press at Oxford University Press Oxford, England, 1989、およびStewart and Young, Solid Phase Peptide Synthesis, 2nd edition, Pierce Chemical Company, Rockford, 1984参照。それらのそれぞれの全内容は参照によって本明細書に組み込まれる。溶液相および固相技術の両方において、保護基の選択肢、さらには用いられる具体的なカップリング技術が考慮されなくてはならない。溶液相および固相反応のためのペプチド合成技術の詳細な議論については、参照によってその全内容が本明細書に組み込まれるHecht, Bioorganic chemistry: Peptides and Proteins, Oxford University Press, New York: 1998参照。
ある態様において、方法は、国際出願第PCT/US2010/001952号(これもまた参照によって本明細書に組み込まれる)に記載の戦略に従って、別のポリペプチドまたは蛋白質にライゲーションすることによって本発明のステープルドペプチドを結びつけることを含む。
ある態様において、方法は、式(i)または(ii)の非ステープルドポリペプチド前駆体の溶液相合成を含む。上述の溶液相合成はポリペプチドの構築のための周知の技術である。例示的な溶液相合成は、(1)アミノ保護基によってN末端を保護されたアミノ酸を提供するステップ、(2)酸素保護基によってC末端を保護されたアミノ酸を提供するステップ、(3)N保護されたアミノ酸をC保護されたアミノ酸にカップリングするステップ、(4)カップリング反応の生成物をN末端またはC末端で脱保護するステップ、ならびに(5)所望のポリペプチドが得られるまでステップ(3)〜(4)を繰返すステップを含み、上のステップのいずれかでカップリングされたアミノ酸の少なくとも2つは、それぞれ少なくとも1つの末端不飽和アミノ酸側鎖を含み、任意にアミノ酸が2つの末端不飽和アミノ酸側鎖を含む。上の合成の過程で、種々のパラメータ(末端不飽和側鎖を有するアミノ酸の配置、アミノ酸の立体化学、末端不飽和側鎖の長さおよび官能性、ならびに用いられるアミノ酸残基を含むが、それらに限定されない)が変えられ得る。
ある態様において、方法は、式(i)または(ii)の非ステープルドポリペプチド前駆体の固相合成を含む。上述の固相合成はポリペプチドの構築のための周知の技術である。例示的な固相合成は(1)樹脂結合アミノ酸を提供するステップ、(2)樹脂結合アミノ酸を脱保護するステップ、(3)脱保護された樹脂結合アミノ酸にアミノ酸をカップリングするステップ、(4)所望のペプチドが得られるまでステップ(3)を繰返すステップを含み、上のステップのいずれかにおいてカップリングされたアミノ酸の少なくとも2つは、それぞれ少なくとも1つの末端不飽和アミノ酸側鎖を含み、任意にアミノ酸が2つの末端不飽和アミノ酸側鎖を含む。上の合成の過程で、種々のパラメータ(末端不飽和側鎖を有するアミノ酸の配置、アミノ酸の立体化学、末端不飽和側鎖の長さおよび官能性、ならびに用いられるアミノ酸残基を含むが、それらに限定されない)が変えられ得る。
所望のポリペプチドが合成された後、式(i)または(ii)のポリペプチドは具体的な触媒と接触させられて、ステープリングまたは複数のステープリングを促進し、式(I)または(VI)のポリペプチドを提供する。例えば、樹脂結合ポリペプチドが触媒と接触させられてステープリングを促進し得るか、第1に樹脂から切断され、次に触媒と接触させられてステープリングを促進し得る。そこで1〜2つの末端不飽和アミノ酸側鎖を含むアミノ酸が、近位の末端不飽和側鎖を提供するためにポリペプチド鎖中に組み込まれる。それらの近位の末端不飽和側鎖は、ポリペプチドのいずれかの所与の立体配座において、互いに同じ平面内またはポリペプチド鎖の同じ側にあり得る。触媒による処理によって、それらの近位の側鎖はステープリングによって互いと反応して、立体配座的に安定化されたポリペプチドを提供する。ある態様において、近位の末端不飽和側鎖は、もたらされたステープルが本発明のステープルドポリペプチドの生物学的/治療活性と干渉しないように配列される。
本発明のポリペプチドのステープリング後に、方法は追加の合成改変(単数または複数)をさらに含み得る。いずれかの化学的または生物学的改変が、ステープルドまたはステッチドポリペプチドに対してなされ得る。ある態様において改変はポリペプチドのAlloc部分に行われる。ある態様において、改変はCOをステープルドペプチドのAlloc部分から逆挿入する。ある態様においてCO逆挿入はパラジウム触媒の存在下で行われる。ある態様においてCO逆挿入はPd(PPhの存在下で行われる。ある態様において、約10〜80モル%のパラジウム触媒がCO逆挿入のために用いられる。ある態様において、約20〜40モル%のパラジウム触媒がCO逆挿入のために用いられる。
ある態様において、ステープルドまたはステッチドペプチドの追加の改変は、メタセシス反応から提供される二重結合に対する還元、酸化、および求核または求電子付加を含み、合成的に改変されたポリペプチドを提供する。他の改変は、ステープルドポリペプチド骨格のどこか、例えばステープルドポリペプチドのN末端、ステープルドポリペプチドのC末端、ステープルドポリペプチドのアミノ酸側鎖、または1つまたは2つ以上の改変されたもしくは未改変のステープルド部位(すなわちステープル)などにおいて、治療活性剤、標識、または診断剤によるステープルドポリペプチドの複合体化またはステープルドポリペプチドを合成的に改変することを含み得る。かかる改変は、ペプチドまたは治療活性剤の細胞、組織、または臓器への送達に有用であり得る。かかる改変は、ある態様において、細胞または組織の具体的な型への標的化を可能にし得る。
1つの側面において、式(I)のポリペプチドまたはその塩を作る方法が提供され、これは、
(i)式(A)のアミノ酸、
またはその塩を提供するステップと、
(ii)式(B)のアミノ酸、
またはその塩を提供するステップと、
(iii)少なくとも1つの追加のアミノ酸を提供するステップと、
(iv)式(A)および(B)ならびに任意にステップ(iii)のアミノ酸をカップリングして、式(i)のポリペプチド、
またはその塩を提供するステップとを含む。
別の側面において、式(VI)のポリペプチドまたはその塩を作る方法が提供され、これは、
(I)式(A)のアミノ酸、
またはその塩を提供するステップと、
(ii)式(B)のアミノ酸、
またはその塩を提供するステップと、
(iii)式(C)のアミノ酸、
またはその塩を提供するステップと、
(iv)少なくとも1つのアミノ酸を提供するステップと、
(v)(A)、(B)、および(C)、ならびに任意にステップ(iv)のアミノ酸をカップリングして、式(ii)のポリペプチド、
またはその塩を提供するステップとを含む。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−1)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−2)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−3)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−4)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−5)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−6)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−7)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−8)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−9)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−10)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−11)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−12)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−13)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−14)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−15)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−16)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−17)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式(A−18)、
またはその塩である。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は、
からなる群またはその塩から選択され、gおよびg1のそれぞれは本明細書において定義される通りである。
ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。
ある態様において、式(A)は式
である。ある態様において、式(A)は式
である。ある態様において、式(A)は式
である。ある態様において、式(A)は式
である。上で一般的に用いられた通り、o1、o2、o3、o4は本明細書において定義される通りである。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(A)のアミノ酸は式
である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−1)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−2)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−3)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−4)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−5)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−6)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−7)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−8)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−9)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−10)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−11)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−12)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−13)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−14)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−15)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−16)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−17)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式(B−18)、
またはその塩である。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は次の構造の1つ、
またはその塩であり、hおよびh1は本明細書において定義される通りである。
ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。
ある態様において、式(B)は式
である。ある態様において、式(B)は式
である。ある態様において、式(B)は式
である。ある態様において、式(B)は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。ある態様において、式(B)のアミノ酸は式
である。
本明細書において用いられる場合、o1、o2、o3、およびo4のそれぞれは独立して0、1、2、3、4、5、または6である。ある態様においてo1は0である。ある態様においてo1は1である。ある態様においてo1は2である。ある態様においてo1は3である。ある態様においてo1は4である。ある態様においてo1は5である。ある態様においてo1は6である。本明細書において用いられる場合o2のそれぞれは独立して0、1、2、3、4、5、または6である。ある態様においてo2は0である。ある態様においてo2は1である。ある態様においてo2は2である。ある態様においてo2は3である。ある態様においてo2は4である。ある態様においてo2は5である。ある態様においてo2は6である。ある態様においてo3は0である。ある態様においてo3は1である。ある態様においてo3は2である。ある態様においてo3は3である。ある態様においてo3は4である。ある態様においてo3は5である。ある態様においてo3は6である。ある態様においてo4は0である。ある態様においてo4は1である。ある態様においてo4は2である。ある態様においてo4は3である。ある態様においてo4は4である。ある態様においてo4は5である。ある態様においてo4は6である。
ある態様において任意のアミノ酸は式(C)、
またはその塩であり、R、R、R、y、およびzは本明細書において定義される通りである。
ある態様において、式(C)の任意のアミノ酸は、
およびその塩からなる群から選択される。
ある態様において式(A)は位置iにあり、式(B)は位置i+3にあってステープルドペプチドを形成する。ある態様において式(A)は位置iにあり、式(B)は位置i+4にあってステープルドペプチドを形成する。ある態様において式(A)は位置iにあり、式(B)は位置i+5にあってステープルドペプチドを形成する。ある態様において式(A)は位置iにあり、式(B)は位置i+6にあってステープルドペプチドを形成する。ある態様において式(A)は位置iにあり、式(B)は位置i+7にあってステープルドペプチドを形成する。ある態様において式(A)は位置iにあり、式(B)は位置i+8にあってステープルドペプチドを形成する。ある態様において式(A)は位置iにあり、式(B)は位置i+9にあってステープルドペプチドを形成する。ある態様において式(A)は位置iにあり、式(B)は位置i+10にあってステープルドペプチドを形成する。ある態様において式(A)は位置iにあり、式(B)は位置i+11にあってステープルドペプチドを形成する。ある態様において、Rキラリティを有する式(A)のアミノ酸のα炭素は位置iにある。ある態様において、Sキラリティを有する式(A)のアミノ酸のα炭素は位置iにある。ある態様において、Rキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+3にある。ある態様において、Sキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+3にある。ある態様において、Rキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+4にある。ある態様において、Sキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+4にある。ある態様において、Rキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+5にある。ある態様において、Sキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+5にある。ある態様において、Rキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+6にある。ある態様において、Sキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+6にある。ある態様において、Rキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+7にある。ある態様において、Sキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+7にある。ある態様において、Rキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+8にある。ある態様において、Sキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+8にある。ある態様において、Rキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+9にある。ある態様において、Sキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+9にある。ある態様において、Rキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+10にある。ある態様において、Sキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+10にある。ある態様において、Rキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+11にある。ある態様において、Sキラリティを有する式(B)のアミノ酸のα炭素は位置i+11にある。
本明細書において用いられる場合、ステップ(iv)の表現「少なくとも1つの追加のアミノ酸を提供する」は、本明細書において定義される少なくとも1つの天然または非天然アミノ酸を提供することを指す。上の合成方法は、ポリペプチド式(I)を生ずるためにいずれかおよび全ての公知のアミノ酸を用い得る。ある態様において、上の合成方法によって用いることが可能なアミノ酸は本明細書において定義および記載される。
ある態様において、ステップ(iv)は、(A)、(B)、および(C)から少なくとも1つの構造的に異なるアミノ酸を提供する。ある態様において、ステップ(iv)は少なくとも2つの構造的に異なるアミノ酸を提供する。ある態様において、ステップ(iv)は少なくとも3つの構造的に異なるアミノ酸を提供する。ある態様において、ステップ(iv)は少なくとも4つの構造的に異なるアミノ酸を提供する。ある態様において、ステップ(iv)は少なくとも5つの構造的に異なるアミノ酸を提供する。異なるアミノ酸同士は、異なる二次構造を形成する異なる傾向を有する。例えば、メチオニン(M)、アラニン(A)、ロイシン(L)、グルタミン酸(E)、およびリシン(K)は全て、特に高いαヘリックスを形成する傾向を有する。対照的に、プロリン(P)およびグリシン(G)はαヘリックス遮断因子である。それゆえに、ある態様において、ステップ(iv)のアミノ酸の少なくとも1つは、アラニン、アルギニン、アスパラギン、アスパラギン酸、システイン、グルタミン酸、グルタミン、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、リシン、メチオニン、フェニルアラニン、セリン、トレオニン、トリプトファン、チロシン、およびバリンから選択される基を指す。
ある態様において、ステップ(iv)の「少なくとも1つのアミノ酸」はジペプチドまたはポリペプチドである。ある態様において、ステップ(iv)はジペプチドを提供することを含む。ある態様において、ステップ(iv)はポリペプチドを提供することを含む。ある態様においてポリペプチドは少なくとも4つのアミノ酸を含む。ある態様においてポリペプチドは少なくとも5つのアミノ酸を含む。
ある態様において、カップリングステップ(v)はカップリング試薬の使用を含む。例示的なカップリング試薬は、ベンゾトリアゾール−1−イルオキシ−トリス(ジメチルアミノ)−ホスホニウムヘキサフルオロリン酸塩(BOP)、ベンゾトリアゾール−1−イル−オキシ−トリス−ピロリジノ−ホスホニウムヘキサフルオロリン酸塩(PyBOP)、ブロモ−トリス−ピロリジノホスホニウムヘキサフルオロリン酸塩(PyBroP)、1−エチル−3−(3−ジメチルlアミノプロピル)カルボジイミド(EDC)、Ν,Ν'−カルボニルジイミダゾール(CDI)、3−(ジエトキシホスホリルオキシ)−1,2,3−ベンゾトリアジン−4(3H)−オン(DEPBT)、1−ヒドロキシ−7−アザベンゾトリアゾール(HOAt)、1−ヒドロキシ−7−ベンゾトリアゾール(HOBt)、2−(7−アザ−1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロリン酸塩(HATU)、2−(6−クロロ−lH−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルアミニウム(aminium)ヘキサフルオロホスフェート(HCTU)、2−(1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロリン酸塩(HBTU)、O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−N,N,N',N'−テトラメチルウロニウムテトラフルオロボレート(TATU)、2−(1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムテトラフルオロボレート(TBTU)、N,N,N',N'−テトラメチル−O−(3,4−ジヒドロ−4−オキソ−1,2,3−ベンゾトリアジン−3−イル)ウラニウム(uranium)テトラフルオロボレート(TDBTU)、(1−シアノ−2−エトキシ−2−オキソエチリデンアミノオキシ)ジメチルアミノ−モルフォリノ−カルベニウムヘキサフルオロリン酸塩(COMU)、およびO−(N−スクシンイミジル)−1,1,3,3−テトラメチルウラニウム(uranium)テトラフルオロボレート(TSTU))を含むが、それらに限定されない。
ある態様において、カップリングステップ(v)は塩基を含む。例示的な塩基は、炭酸カリウム、水酸化カリウム、水酸化ナトリウム、水酸化テトラブチルアンモニウム、水酸化ベンジルトリメチルアンモニウム、水酸化トリエチルベンジルアンモニウム、1,1,3,3−テトラメチルグアニジン、1,8−ジアザビシクロ[5.4.0]ウンデカ−7−エン(DBU)、N−メチルモルホリン、ジイソプロピルエチルアミン(DIPEA)、テトラメチルエチレンジアミン(TMEDA)、ピリジン(Py)、1,4−ジアザビシクロ[2.2.2]オクタン(DABCO)、Ν,Ν−ジメチルアミノピリジン(DMAP)、またはトリエチルアミン(NEt)を含むが、それらに限定されない。
ある態様において、カップリングステップ(v)は媒体中で行われる。媒体は溶媒または溶媒混合物であり、組み合わせられた反応パートナーおよび試薬との組み合わせで、それらの間の反応の進行を容易にする。溶媒は反応成分の1つもしくは2つ以上を可溶化し得るか、またはその代わりに、溶媒は反応成分の1つまたは2つ以上の懸濁を容易にし得る。一般的にMarch's Advanced Organic Chemistry: Reactions, Mechanisms, and Structure, M.B. Smith and J. March, 5th Edition, John Wiley & Sons, 2001およびComprehensive Organic Transformations, R.C. Larock, 2nd Edition, John Wiley & Sons, 1999参照。それらのそれぞれの全内容は参照によって本明細書に組み込まれる。溶媒は、エーテル、ハロゲン化炭化水素、芳香族溶媒、極性非プロトン性溶媒、またはその混合物を含む。他の態様において、溶媒はジエチルエーテル、ジオキサン、テトラヒドロフラン(THF)、ジクロロメタン(DCM)、ジクロロエタン(DCE)、アセトニトリル(ACN)、クロロホルム、トルエン、ベンゼン、ジメチルホルムアミド(DMF)、ジメチルアセトアミド(DMA)、ジメチルスルホキシド(DMSO)、N−メチルピロリジノン(NMP)、またはその混合物である。
ある態様において、カップリングステップ(v)は約0℃〜約100℃の温度で行われる。
ある態様において、カップリングステップ(v)はカップリング試薬、塩基、および媒体を含み、約0℃〜約100℃の温度で行われる。
ある態様において、方法は、
(v)式(i)のポリペプチドを閉環メタセシス(RCM)触媒によって処理して、式(I−x)のポリペプチド、
またはその塩を提供するステップをさらに含む。
ある態様において、方法は、
(vi)式(ii)のポリペプチドを閉環メタセシス(RCM)触媒によって処理して、式(VI−x)のポリペプチド、
またはその塩を提供するステップをさらに含む。
ある態様において、RCM触媒はタングステン(W)、モリブデン(Mo)、またはルテニウム(Ru)触媒である。ある態様においてRCM触媒はルテニウム触媒である。好適なオレフィンメタセシス触媒の例は、シュロック触媒、第1世代グラブス触媒またはベンジリデン−ビス(トリシクロヘキシルホスフィン)ジクロロルテニウム、第2世代グラブス触媒またはベンジリデン[1,3−ビス(2,4,6−トリメチルフェニル)−2−ミダゾリジニリデン(midazolidinylidene)]ジクロロ−(トリシクロヘキシルホスフィン)ルテニウム、および第2世代ホベイダ−グラブス触媒または1,3−ビス−(2,4,6−トリメチルフェニル)−2−イミダゾリジニリデン)ジクロロ(o−イソプロポキシp−フェニルメチレン)ルテニウムを含むが、それらに限定されない。上の合成方法によって用いることが可能なRCM触媒は、Grubbs et al. , Acc. Chem. Res. 1995, 28, 446-452、U.S. Pat. No. 5,811,515、Schrock et al., Organometallics (1982) 1 1645、Gallivan et al., Tetrahedron Letters (2005) 46:2577-2580、Furstner et al., J. Am. Chem. Soc. (1999) 121:9453、およびChem. Eur. J. (2001) 7:5299に記載されている。それらのそれぞれの全内容は参照によって本明細書に組み込まれる。
メタセシス触媒は、それが重合を促進することを可能にするいずれかの好適な形態で提供され得る。例えば、触媒は、好適な担体物質、例えば溶媒または恐らくは固体などと組み合わせられて錠剤を形成し得る。当然のことながら、いずれかのかかる担体物質は硬化系の他の成分と適合するべきである。
また当然のことながら、RCM触媒に加えて、炭素−炭素結合または炭素−ヘテロ原子結合の形成を促進することが可能な他の試薬もまた用いられ得る。例えば、用いられ得る他の反応は、パラジウムカップリング反応、遷移金属によって触媒されるクロスカップリング反応、ピナコールカップリング(末端アルデヒド)、ヒドロジルコネーション(末端アルキン)、求核付加反応、およびNHK(野崎・檜山・岸(Furstner et al., J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 12349))カップリング反応、還元的アミノ化、マイケル付加、環式カーボネートアルキル化(Parrish et al., Perspectives on Alkyl Carbonates in Organic Synthesis, Tetrahedron, 2000, 56, 8207-8237)、エポキシド(expoxide)による求核置換、ヴィルゲロット・キンドラー反応、またはヒュスゲン環化付加(Mundy et al., Name Reactions and Reagents in Organic Synthesis, 2005, Wiley-Interscience, 2 Ed.)を含むが、それらに限定されない。炭素−炭素結合または炭素−ヘテロ原子結合の形成の例が図2Aおよび2Bに示されている。それゆえに、適切な反応性部分が所望のアミノ酸中に第1に組み込まれ、次にペプチドは1つまたは2つ以上のステープルの形成を実現する反応障害に供される。
ある態様において、ステープリングステップは、1つのステープルド生成物を好ましい生成物として生ずる。本明細書において用いられる場合、「好ましい生成物」は、異性体の混合物中に主な成分として存在する1つの構造異性体を指す。ある態様において、「好ましい生成物」は、異性体の混合物の少なくとも約50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%、または99%の成分として存在する1つの構造異性体を指す。
ある態様において、方法は、
(vii)式(I−x)のポリペプチドの二重結合を改変して式(I−y)のポリペプチド、
またはその塩を提供するステップをさらに含み、R、R、R、R2a、R3a、R2b、R3b、L、L、XAA、p、m、n、およびqは上で定義された通りであり、RIYのそれぞれは独立して水素、ハロゲン、ヒドロキシル、ニトロ、アルコキシ、−N(R、任意置換脂肪族であり、vは0、1、または2である。
ある態様において、方法は、
(vii)式(VI−x)のポリペプチドの二重結合を改変して式(VI−y)の式のポリペプチド、
またはその塩を提供するステップをさらに含み、R、R、R、R2a、R3a、R2b、R3b、L、L、XAA、p、m、n、およびqは式(VI)において定義される通りであり、RIIYのそれぞれは独立して水素、ハロゲン、ヒドロキシル、ニトロ、アルコキシ、−N(R、任意置換脂肪族であり、v1およびv2のそれぞれは独立して0、1、または2である。
当業者には当然のことながら、かかる変換を促進するために様々な反応、障害、および反応剤が用いられ得、したがって様々な反応、障害、および反応剤が考えられる。一般的に、March's Advanced Organic Chemistry: Reactions, Mechanisms, and Structure, M.B. Smith and J. March, 5th Edition, John Wiley & Sons, 2001、Advance Organic Chemistry, Part B, Reactions and Synthesis, Carey and Sundberg, 3rd Edition, Plenum Press, New York, 1993、およびComprehensive Organic Transformations, R.C. Larock, 2nd Edition, John Wiley & Sons, 1999参照。それらのそれぞれの全体はここで参照によって本明細書に組み込まれる。例示的な反応剤は、二重結合と反応性のいずれかの剤であり得る。ある態様において、反応剤は、例えば水素化、オスミル化(osmylation)、ヒドロキシル化(モノまたはジ)、アミノ化、ハロゲン化、環化付加(例えば、シクロプロパン化、アジリジン化、エポキシ化)、オキシ水銀化、および/またはヒドロホウ素化(hydroboronation)反応によって、二重結合と反応して官能化ステープルを提供することが可能である。当業者には当然のことながら、それらの上記の変換は、具体的な安定化された構造および所望の生物学的相互作用と適合する官能基を導入するであろう。特に好ましい態様において、ほんの一例では、安定化された構造の親水性がヒドロキシル部分の導入によって増大させられ得る。当業者には当然のことながら、それらの合成改変は、具体的な安定化された構造および所望の生物学的相互作用と適合する官能性を導入するように選択されるであろう。
ある態様において、式(I−x)のポリペプチドは式(I−z1)であり、
、R、R、R2a、R3a、R2b、R3b、L、L、XAA、p、m、n、q、g1、およびhは式(I)において定義される通りである。ある態様において、方法は、−C(=O)O−を逆挿入するステップをさらに含まない。ある態様において、方法は、
(vii)−C(=O)O−を式(I−z1)から逆挿入して式(I−z)のポリペプチドを提供するステップをさらに含む。
ある態様において式(I−x)のポリペプチドは式(I−z2)であり、
、R、R、R2a、R3a、R2b、R3b、L、L、XAA、p、m、n、q、g、およびh1は、式(I)において定義された通りである。ある態様において、方法は、−C(=O)O−を逆挿入するステップをさらに含まない。ある態様において、方法は、
(vii)−C(=O)O−を式(I−z2)から逆挿入して式(I−z)のポリペプチドを提供するステップをさらに含む。
ある態様において式(I−x)のポリペプチドは式(I−z3)であり、
、R、R、R2a、R3a、R2b、R3b、L、L、XAA、P、m、n、q、g1、およびh1は、式(I)において定義された通りである。ある態様において、方法は、−C(=O)O−を逆挿入するステップをさらに含まない。ある態様において、方法は、
(vii)−C(=O)O−を式(I−z3)から逆挿入して式(I−z1)、式(I−z2)、もしくは式(I−z)のポリペプチド、またはその混合物を提供するステップをさらに含む。
ある態様において、方法は、
(vii)式(VI−x)のポリペプチドの二重結合を改変して、式(VI−y)のポリペプチド、
またはその塩を提供するステップをさらに含み、R、R、R、R2a、R3a、R2b、R3b、L、L、XAA、p、m、n、およびqは式(VI)において定義された通りであり、RIIYのそれぞれは独立して水素、ハロゲン、ヒドロキシル、ニトロ、アルコキシ、−N(R、任意置換脂肪族であり、v1およびv2のそれぞれは独立して0、1、または2である。
ある態様において、式(VI−x)のポリペプチドは式(VI−z1)であり、
、R、R、R2a、R3a、R2b、R3b、L、L、XAA、p、m、n、q、s、t、g1、およびhは式(VI)において定義された通りである。ある態様において、方法は、−C(=O)O−を逆挿入するステップをさらに含まない。ある態様において、方法は、
(vii)−C(=O)O−を式(VI−zl)から逆挿入して、式(VI−z)のポリペプチドを提供するステップをさらに含む。
ある態様において、式(VI−x)のポリペプチドは式(VI−z2)であり、
、R、R、R2a、R3a、R2b、R3b、L、L、XAA、p、m、n、q、s、t、g、およびh1は式(VI)において定義される通りである。ある態様において、方法は、−C(=O)O−を逆挿入するステップをさらに含まない。ある態様において、方法は、
(vii)−C(=O)O−を式(VI−z2)から逆挿入して式(VI−z)のポリペプチドを提供するステップをさらに含む。
ある態様において、式(VI−x)のポリペプチドは式(VI−z3)であり、
、R、R、R2a、R3a、R2b、R3b、L、L、XAA、p、m、n、q、s、t、g1、およびh1は式(VI)において定義された通りである。ある態様において、方法は、−C(=O)O−を逆挿入するステップをさらに含まない。ある態様において、方法は、
(vii)−C(=O)O−を式(VI−z3)から逆挿入して、式(VI−z1)、式(VI−z2)、もしくは式(VI−z)のポリペプチド、またはその混合物を提供するステップをさらに含む。
ある態様において、−C(=O)O−を逆挿入するための触媒はパラジウム(Pd)触媒である。ある態様において、−C(=O)O−を逆挿入するための触媒はPd(PPhである。ある態様において、−C(=O)O−を逆挿入するための触媒はルテニウム触媒である。ある態様において、−C(=O)O−を逆挿入するための触媒は[Cp*RuCl]、[Cp*RuCl]とbpy、または[Cp*RuCl]とTMEDAである。ある態様において、−C(=O)O−を逆挿入するための触媒は遷移金属触媒である。ある態様において、−C(=O)O−を逆挿入するための触媒は[Ir(COD)Cl]またはNi[P(OEt)である。ある態様において、−C(=O)O−を逆挿入するための触媒は第VI族金属触媒である。ある態様において、−C(=O)O−を逆挿入するための触媒はMo(CO)−dppeである。(Chemical Reviews, (2011), 111, 1846-1913、Tet. Lett., 2007, 48(40). 7084-7098、Chemistry Letters, (1984), 1721-1724、Synlett, (2005), 18, 2759-2762参照)。
ある態様において、ステープリング方法は図2Aおよび2Bに挙げられたいずれか1つであり得る。
別の側面において、ある態様において、上の方法は、式(I)または式(VI)の本発明のポリペプチドを活性化して、次に治療活性剤との複合体化を行い、治療活性剤と複合体化された式(I)または式(VI)のポリペプチドを提供することをさらに含む。
さらに、別の側面において、ある態様において、上の方法は、式(I)または式(VI)のポリペプチドを標識によって処理して、標識と複合体化された式(I)または式(VI)のポリペプチドを提供することをさらに含む。
別の側面において、ある態様において、上の方法は、式(I)または式(VI)のポリペプチドを診断剤によって処理して、診断剤と複合体化された式(I)または式(VI)のポリペプチドを提供することをさらに含む。
本明細書において用いられる場合、2つの実体が互いに「複合体化」されるときには、それらは直接的または間接的な共有結合的または非共有結合的な相互作用によって連結される。ある態様において結びつきは共有結合的である。他の態様において結びつきは非共有結合的である。非共有結合的な相互作用は、水素結合、ファンデルワールス相互作用、疎水性相互作用、磁性相互作用、および静電的相互作用を含む。間接的な共有結合的な相互作用は、2つの実体が任意にリンカー基によって共有結合的に繋がれるときである。
剤(例えば、標識、診断剤、治療活性剤)の本発明のポリペプチドとの複合体化は、種々の異なる方法によって達成され得る。剤は、ステープリングの部位でポリペプチドと、またはポリペプチド(polypetide)鎖のN末端またはC末端と、直接的または間接的に共有結合的に複合体化され得る。その代わりに、剤は、ステープリングの部位でポリペプチドと、またはポリペプチド(polypetide)鎖のN末端またはC末端と、直接的または間接的に非共有結合的に複合体化され得る。間接的な共有結合的な複合体化は、1つまたは2つ以上の共有結合的な結合による。間接的な非共有結合的な複合体化は、1つまたは2つ以上の非共有結合的な結合による。複合体化は、非共有結合的および共有結合的な力/結合の組み合わせにもまたより得る。剤は、共有結合的または非共有結合的な連結基によってもまた複合体化され得る。
いずれかの結合が、治療活性剤、標識、および/または診断剤の本発明のポリペプチドとの複合体化に用いられ得る。かかる結合は、アミド結合、エステル結合、ジスルフィド結合、炭素−炭素結合、カルバメート、カーボネート、尿素、ヒドラジド、および同様のものを含む。いくつかの態様において、結合は、生理的障害下において切断可能である(例えば、酵素的に切断可能、高いまたは低いpH、熱、光、超音波、x線によって切断可能)。しかしながら、いくつかの態様において結合は切断可能でない。
また当業者には当然のことながら、上記の合成方法は本発明のポリペプチドのコンビナトリアル合成にもまた適用され得る。コンビナトリアル合成技術は溶液中で適用され得るが、コンビナトリアル技術は固相上でスプリット・アンド・プール技術を用いて実施されることがより典型的である。コンビナトリアル合成の過程で、種々のパラメータ(末端不飽和側鎖を有するアミノ酸の配置、アミノ酸の立体化学、末端不飽和側鎖の長さおよび官能性、ならびに用いられるアミノ酸残基を含むが、それらに限定されない)が変えられ得る。
使用および治療の方法
本発明は、その必要がある対象の障害を治療する方法を提供し、これは対象に式(I)〜(X)のポリペプチドまたはその塩の有効量を投与することを含む。
本発明は、その必要がある対象の障害を治療する方法を提供し、これは式(I)〜(X)のポリペプチドまたはその塩の有効量をとるように対象に指示することを含む。
本発明は、障害を治療する際の使用のための式(I)〜(X)のポリペプチドまたはその塩もまた提供する。
本明細書において用いられる場合、「疾患」または「障害」は交換可能に用いられる。
投与が考えられる「対象」は、ヒト(すなわち、いずれかの年齢群の男性または女性、例えば、小児科の対象(例えば、幼児、児童、思春期)または成人の対象(例えば、若年成人、中年成人、または高齢成人))および/または他の非ヒト動物、例えば哺乳動物(例えば霊長類(例えばカニクイザル、アカゲザル)、商業的に関係する哺乳動物、例えば牛、ブタ、馬、羊、ヤギ、猫、および/または犬)および鳥類(例えば、商業的に関係する鳥類、例えば鶏、鴨類、ガチョウ、および/または七面鳥)、爬虫類、両生類、および魚類を含むが、それらに限定されない。ある態様において、非ヒト動物は哺乳動物である。非ヒト動物は発生のいずれかの時期にある雄または雌であり得る。非ヒト動物はトランスジェニック動物であり得る。
本明細書において用いられる場合、別様に指定されていない限り、用語「治療する」、「治療すること」、および「治療」は、対象が障害に罹患している間に起こり、障害の深刻さを減少させるかまたは障害の進行を遅延もしくは減速させる行為(「治療の治療」)を考え、対象が障害に罹患し始める前に起こり、障害を阻害するかまたは障害の深刻さを減少させる行為(「予防の治療」)もまた考える。
一般的に、化合物の「有効量」は所望の生物学的応答を惹起し、すなわち障害を治療するのに十分な量を指す。当業者には当然のことながら、本発明の化合物の有効量は、所望の生物学的エンドポイント、化合物の薬物動態、治療されようとする障害、投与の様式、ならびに年齢、健康、および対象などの因子に依存して変わり得る。有効量は治療および予防の治療を包含する。
本明細書において用いられる場合、別様に指定されていない限り、化合物の「治療有効量」は、障害の治療に際して治療効果を提供するか、または障害と結びついた1つまたは2つ以上の症状を遅延させるもしくは最小化するのに十分な量を指す。化合物の治療有効量は、単独でまたは他の療法との組み合わせで、障害の治療に際して治療効果を提供する治療剤の量を意味する。用語「治療有効量」は、全般的な療法を改善する、障害の症状もしくは原因を減少させるもしくは防ぐ、または別の治療剤の治療有効性を増強する量を包含し得る。
本明細書において用いられる場合、別様に指定されていない限り、化合物の「予防有効量」は、障害または障害と結びついた1つもしくは2つ以上の症状を予防、あるいはその再発を予防するのに十分な量である。化合物の予防有効量は、単独でまたは他の剤との組み合わせで、障害の予防に際して予防効果を提供する治療剤の量を意味する。用語「予防有効量」は、全般的な予防を改善するまたは別の予防剤の予防有効性を増強する量を包含し得る。
例示的な障害は、増殖性障害、神経系障害、免疫系障害、内分泌系障害、心血管系障害、血液系障害、炎症性障害、および尚早なまたは望まれない細胞死によって特徴づけられる障害を含むが、それらに限定されない。
本明細書において用いられる場合、増殖性障害は、癌、造血系の腫瘍性障害、増殖性乳部疾患、肺の増殖性障害、結腸の増殖性障害、肝臓の増殖性障害、および卵巣の増殖性障害を含むが、それらに限定されない。
例示的な癌は、癌腫、肉腫もしくは転移性障害、乳癌、卵巣癌、結腸癌、肺癌、線維肉腫、筋肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨肉腫、脊索腫、血管肉腫、内皮肉腫、リンパ管腫、リンパ管内皮肉腫、滑膜腫、中皮腫、ユーイング腫瘍、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、胃癌、食道癌、直腸癌、膵癌、卵巣癌、前立腺癌、子宮癌、頭部および頸部の癌、皮膚癌、脳の癌、扁平上皮癌、脂腺癌、乳頭状癌、乳頭状腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌、気管支原性癌、腎細胞癌、ヘパトーマ、胆管癌、絨毛癌、セミノーマ、胚性腫瘍、ウィルムス腫瘍、子宮頸癌、精巣癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、グリオーマ、星細胞腫、髄芽腫、頭蓋咽頭腫、上衣腫、松果体腫、血管芽腫、聴神経腫瘍、乏突起細胞腫、髄膜腫、メラノーマ、神経芽細胞腫、網膜芽細胞腫、白血病、リンパ腫、およびカポジ肉腫を含むが、それらに限定されない。
例示的な造血系の腫瘍性障害は、造血系の起源の、例えば骨髄、リンパ球、もしくは赤血球系から生ずる過形成性/腫瘍性細胞、またはその前駆体細胞を含む障害を含むが、それらに限定されない。ある態様において、障害は、不十分に分化した急性白血病、例えば、赤芽球性白血病および急性巨核芽球性白血病から生ずる。追加の例示的な骨髄障害は、急性前骨髄性白血病(APML)、急性骨髄性白血病(AML)、および慢性骨髄性白血病(CML)を含むが、それらに限定されない。リンパ系の悪性腫瘍は、B系ALLおよびT系ALLを含む急性リンパ芽球性白血病(ALL)、慢性リンパ性白血病(CLL)、前リンパ球性白血病(PLL)、有毛細胞性白血病(HLL)、およびワルデンシュトレーム型マクログロブリン血症(WM)を含むが、これらに限定されない。悪性リンパ腫の追加の形態は、非ホジキンリンパ腫およびその亜型、末梢T細胞リンパ腫、成人T細胞白血病/リンパ腫(ATL)、皮膚T細胞リンパ腫(CTCL)、大顆粒リンパ球性白血病(LGF)、ホジキン病、ならびにリード・シュテルンベルク病を含むが、それらに限定されない。
例示的な増殖性乳部疾患は、上皮過形成、硬化性腺症、および小導管(small duct)乳頭腫、腫瘍(例えば、間質腫瘍(例えば、乳腺線維腺腫、葉状腫瘍、および肉腫)および上皮性腫瘍(例えば大導管(large duct)乳頭腫))、乳部の癌腫(非浸潤性乳管癌(パジェット病を含む)および非浸潤性小葉癌を含むインサイチュ(非浸潤性)癌腫、ならびに浸潤性(浸潤する)癌腫(浸潤性乳管癌、浸潤性小葉癌、髄様癌、粘液(ムチン性)癌、管状癌、および浸潤性乳頭状癌を含むが、それらに限定されない)を含む)、ならびにその他の悪性新生物を含むが、それらに限定されない。男性乳部の障害は女性化乳房症および癌腫を含むが、それらに限定されない。
肺の例示的な増殖性障害は、気管支原性癌(傍腫瘍性症候群、細気管支肺胞上皮癌、神経内分泌腫瘍、例えば気管支カルチノイド、その他の腫瘍、および転移性腫瘍を含む)、胸膜の病変(炎症性胸水、非炎症性胸水、気胸、および胸膜腫瘍(孤在性線維性腫瘍(胸膜線維腫)および悪性中皮腫を含む)を含む)を含むが、それらに限定されない。
結腸の例示的な増殖性障害は、非腫瘍性ポリープ、アデノーマ、家族性症候群、大腸癌、結腸直腸癌、およびカルチノイド腫瘍を含むが、それらに限定されない。
肝臓の例示的な増殖性障害は、結節性過形成、アデノーマ、および悪性腫瘍(肝臓の原発性癌および転移性腫瘍を含む)を含むが、それらに限定されない。
卵巣の例示的な増殖性障害は、卵巣腫瘍、例えば、体腔上皮の腫瘍、漿液性腫瘍、粘液性腫瘍、類内膜(endometeriod)腫瘍、明細胞腺癌、嚢胞腺線維腫、ブレンナー腫瘍、表層上皮性腫瘍、胚細胞腫瘍、例えば、成熟(良性)奇形腫、単胚葉性奇形腫、未成熟悪性奇形腫、未分化胚細胞腫、内胚葉洞腫瘍、絨毛癌、性索間質性腫瘍、例えば、顆粒膜・莢膜細胞腫、莢膜細胞腫線維腫(thecomafibroma)、アンドロブラストーマ、ヒル(hill)細胞腫、および性腺芽腫、ならびに転移性腫瘍、例えばクルーケンベルグ腫瘍を含むが、それらに限定されない。
本明細書に記載のポリペプチドは、過活性な細胞死または生理的傷害を原因とする細胞死によって特徴づけられる障害を治療、予防、または診断するためにもまた用いられ得る。尚早なもしくは望まれない細胞死、またはその代わりに望まれないもしくは過剰な細胞増殖によって特徴づけられる障害のいくつかの例は、低細胞性/低形成、無細胞性/無形成、または高細胞性/過形成障害を含むが、それらに限定されない。かかる障害は、ファンコーニ貧血、再生不良性貧血、サラセミア(thalaessemia)、先天性好中球減少症、骨髄異形成を含むが、それらに限定されない。アポトーシスを減少させるように作用する本発明のポリペプチドは、望ましくないレベルの細胞死と結びついた障害を治療するために用いられ得る。それゆえに、本発明の抗アポトーシスペプチドは、ウィルス感染と結びついた細胞死をもたらすものなどの障害、例えばヒト免疫不全ウィルス(HIV)による感染と結びついた感染を治療するために用いられ得る。
様々な神経系疾患はニューロンの具体的なセットの漸次的な減少によって特徴づけられ、抗アポトーシスペプチドはそれらの障害の治療に用いられ得る。かかる障害は、アルツハイマー病、パーキンソン病、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、網膜色素変性、脊髄性筋萎縮症、および小脳変性症の種々の形態を含む。それらの障害における細胞減少は炎症性応答を誘導せず、アポトーシスが細胞死の機構であるように見える。加えて、いくつもの血液系疾患は血球の減少した生成と結びついている。それらの障害は、慢性疾患を結びついた貧血、再生不良性貧血、慢性好中球減少症、および骨髄異形成症候群を含む。血球生成の障害、例えば骨髄異形成症候群および再生不良性貧血の一部の形態は、骨髄内における増大したアポトーシス細胞死と結びついている。それらの障害は、アポトーシスを促進する遺伝子の活性化、間質細胞もしくは造血系の生存因子の後天的な不全、または毒素および免疫応答のメディエータの直接的な効果からもたらされ得る。細胞死と結びついた2つの普通の障害は心筋梗塞および卒中である。両方の障害において、虚血の中心領域(これは、血流の急性の減少の事象において生成する)内の細胞は壊死の結果として急速に死ぬように見える。しかしながら中心の虚血領域の外では、細胞はより延長された時間をかけて死に、形態的にはアポトーシスによって死ぬように見える。本発明の抗アポトーシスペプチドは、望ましくない細胞死と結びついた全てのかかる障害を治療するために用いられ得る。
本明細書に記載のポリペプチドによって治療され得る神経系障害のいくつかの例は、アルツハイマー病、ダウン症、オランダ型遺伝性アミロイド性脳出血、反応性アミロイドーシス、蕁麻疹および難聴を伴う家族性アミロイド腎症、マックル・ウェルズ症候群、特発性骨髄腫、マクログロブリン血症型骨髄腫、家族性アミロイドポリニューロパチー、家族性アミロイド心筋症、限局性心アミロイド、全身性老人性アミロイドーシス、成人発症型糖尿病、インスリノーマ、限局性心房アミロイド、甲状腺の髄様癌、家族性アミロイドーシス、アミロイドーシスを伴う遺伝性脳出血、家族性アミロイドポリニューロパチー、スクレイピー、クロイツフェルト・ヤコブ病、ゲルストマン・ストロイスラー・シャインカー症候群、牛海綿状脳症、プリオン媒介型疾患、ハンチントン病、ピック病、筋萎縮性側索硬化症(Schlerosis)(ALS)、パーキンソン病、およびレビー小体病を含むが、それらに限定されない。
本明細書に記載のポリペプチドによって治療され得る内分泌系障害のいくつかの例は、糖尿病、甲状腺機能低下症、下垂体機能低下症、副甲状腺機能低下症、性腺機能低下症、生殖障害を含むが、それらに限定されない。
本明細書に記載のポリペプチドによって治療され得る免疫系障害のいくつかの例は、臓器移植片拒絶、関節炎、狼瘡、炎症性腸疾患(IBD)、クローン病、喘息、多発性硬化症、糖尿病、移植片対宿主病、自己免疫疾患、乾癬、関節リウマチを含むが、それらに限定されない。
本明細書に記載のポリペプチドによって治療または予防され得る心血管系障害の例は、アテローム性動脈硬化、心筋梗塞、卒中、血栓症、動脈瘤、心不全、虚血性心疾患、狭心症、急性心臓死、高血圧性心疾患、非冠血管疾患(例えば細動脈硬化症、小血管疾患、腎症、高トリグリセリド血症、高コレステロール血症、高脂血症、黄色腫症、喘息、高血圧、肺気腫、および慢性肺疾患)、あるいは、インターベンション処置に伴う心血管系の状態(「手術合併血管外傷」)、例えば、血管形成術、シャント、ステント、合成もしくは天然の移植片、留置カテーテル、弁、または他のインプラントデバイスの配置後の再狭窄を含むが、これらに限定されない。
本発明のポリペプチドは、固有の蛋白質−蛋白質、蛋白質−リガンド、および/または蛋白質−受容体相互作用を遮断することによって、上記の障害を治療するのに役立ち得る。例えば、多くの生物学的に重要な蛋白質/蛋白質相互作用、例えばp53/MDM2およびBcl−X1/Bakは、1つの蛋白質がヘリックスをそのヘリックス受容パートナーの割れ目の中に供与することによって媒介される。p53およびMDM2の相互作用ならびにp53遺伝子の変異は、全ての報告された癌症例の実質的に半分において同定されている(参照によってその全内容が本明細書に組み込まれるShair Chem. & Biol. 1997, 4, 791参照)。細胞にストレスがかけられると、p53は細胞周期停止およびDNA修復またはプログラム細胞死をもたらす応答を指揮すると信じられている。p53蛋白質の機能を直接的に改変するp53遺伝子の変異と同様に、p53はMDM2中の変更によって改変され得る。MDM2蛋白質は、p53に結合して、p53のトランス活性化ドメインに結びつくことによって転写活性化を遮断することが示されている。例えば、p53のトランス活性化ドメインに由来する11アミノ酸のペプチドは、MDM2の割れ目の中に挿入する2.5巻きの両親媒性αヘリックスを形成する。
それゆえに、ある態様において、本発明のポリペプチドは、ヘリックスアクセプターにかたく結合して固有の蛋白質/蛋白質相互作用を遮断することが可能なαヘリックスポリペプチドである。次に、それらの構造は、最適な小分子ペプチドを同定するためのハイスループット技術を用いてスクリーニングされ得る。ある態様において、本発明のポリペプチドは、アフリカツメガエルMDM2蛋白質に結合することが可能なαヘリックスp53ポリペプチドである。MDM2相互作用を遮断する新規の構造は、軟部肉腫(これは野生型p53の存在下でMDM2を過剰発現する)の制御を含むが、それらに限定されない多くの適用にとって有用であり得る。それらの癌は、MDM2を遮断して、それによってp53の抑圧を予防し得る小分子によって抑えられ得る。加えて、MDM2−p53相互作用の小分子遮断因子は、従来の化学療法におけるp53依存的なアポトーシス応答の程度を制御および調節することを助けるアジュバント療法として用いられ得る。
加えて、本発明のポリペプチドは材料科学の分野において有用であり得る。例えば脂質および他のポリマー分子などの分子がペプチドに結合されて、それゆえにバイオ材料を生じ得る。
上述の使用に加えて、本発明のポリペプチドは生物無機化学または触媒反応の研究のために、重要な生物学的環境をミミックすることが可能な遷移金属に対する配位子として、または具体的な遷移金属触媒と協調して作用して所望の化学反応を実現することによって用いられ得る。
本発明は、細胞内の生物学的経路を改変する方法をさらに提供し、これは細胞を式(I)〜(X)のポリペプチドまたはその塩によって処理することを含む。かかる方法はインビトロまたはインビボの方法を含む。かかるポリペプチドは研究ツールとして例えば細胞試験にとって有用であり得る。
本発明は、式(I)〜(X)のポリペプチドまたはその塩、および医薬的に許容される添加剤を含む医薬組成物を提供する。医薬組成物は治療の使用のための組成物、さらには美容組成物を含む。かかる組成物は1つまたは2つ以上の追加の治療活性剤を任意に含み得る。いくつかの態様に従って、本発明の組成物を含む医薬組成物をその必要がある対象に投与する方法が提供される。いくつかの態様において、本発明の組成物はヒトに投与される。本発明の目的のためには、「活性成分」は一般的に本明細書に記載の式(II)のポリペプチドを指す。
本明細書において提供される医薬組成物の記載はヒトへの投与のための医薬組成物に主に関するが、当業者には当然のことながら、かかる組成物は、一般的に全ての種類の動物への投与に好適である。種々の動物への投与のための医薬組成物の改変は十分に理解されており、通常の獣医薬理学者はせいぜい単なる通常の実験によってかかる改変を設計および/または実施し得る。
本明細書に記載の医薬組成物は、薬理学の分野において公知のまたは今後開発されるいずれかの方法によって調製され得る。一般的に、かかる調製方法は、活性成分を添加剤および/または1つもしくは2つ以上の他の補助成分と結びつけて、次に、必要であるおよび/または望ましい場合には、生成物を所望の単一または複数用量単位に成形および/または容器詰めするステップを含む。
本発明の医薬組成物は、バルクで、単一の単位用量として、および/または複数の単一の単位用量として、調製、容器詰め、および/または販売され得る。本明細書において用いられる場合、「単位用量」は、活性成分の所定量を含む医薬組成物の個別的な量である。活性成分の量は、一般的に、対象に投与されるであろう活性成分の投与量および/またはかかる投与量の便利な画分(例えばかかる投与量の1/2または1/3)に等しい。
本発明の医薬組成物中の活性成分、医薬的に許容される添加剤、および/またはいずれかの追加の成分の相対的な量は、治療される対象の素性、サイズ、および/または障害に依存して、さらに組成物が投与される経路に依存して変わるであろう。例えば、組成物は0.1%〜100%(w/w)の活性成分を含み得る。
本明細書において用いられる場合、医薬的に許容される添加剤は、いずれかおよび全ての溶媒、分散媒、希釈剤、または他の液体基剤、分散または懸濁助剤、界面活性剤、等張化剤、増粘または乳化剤、保存料、固体結合剤、滑剤、および同様のものを、所望の具体的な剤形に適するように含む。Remington's The Science and Practice of Pharmacy, 21st Edition, A. R. Gennaro, (Lippincott, Williams & Wilkins, Baltimore, MD, 2006)は、医薬組成物を製剤するのに用いられる種々の添加剤およびその調製のための公知技術を開示している。いずれかの従来の担体媒体がある物質またはその誘導体と不適合である(例えば、いずれかの望ましくない生物学的効果を生成すること、または別様に、医薬組成物のいずれかの他の成分(単数または複数)と有害に相互作用することによる)限りを除いて、その使用は本発明の範囲内だと考えられる。
いくつかの態様において、医薬的に許容される添加剤は少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、または100%純粋である。いくつかの態様において、添加剤は、ヒトへの使用および獣医学的使用を認可されている。いくつかの態様において添加剤は米国食品医薬品局によって認可されている。いくつかの態様において添加剤は医薬グレードである。いくつかの態様において、添加剤は米国薬局方(USP)、欧州薬局方(EP)、英国薬局方、および/または国際薬局方の基準を満たす。
医薬組成物の製造に用いられる医薬的に許容される添加剤は、不活性な希釈剤、分散および/もしくは造粒剤、界面活性剤および/もしくは乳化剤、崩壊剤、結合剤、保存料、緩衝剤、滑剤、ならびに/または油を含むが、それらに限定されない。かかる添加剤は本発明の製剤中に任意に含まれ得る。ココアバターおよび座薬用ワックス、着色料、コーティング剤、甘味料、香料、ならびに芳香剤などの添加剤は製剤者の判断に従って組成物中に存在し得る。
例示的な希釈剤は、炭酸カルシウム、炭酸ナトリウム、リン酸カルシウム、リン酸二カルシウム、硫酸カルシウム、リン酸水素カルシウム、リン酸ナトリウム、ラクトース、ショ糖、セルロース、微結晶セルロース、カオリン、マンニトール、ソルビトール、イノシトール、塩化ナトリウム、乾燥澱粉、コーンスターチ、粉糖、およびその組み合わせを含むが、それらに限定されない。
例示的な造粒および/または分散剤は、馬鈴薯澱粉、コーンスターチ、タピオカ澱粉、澱粉グリコール酸ナトリウム、粘土、アルギン酸、グアーガム、シトラスパルプ、寒天、ベントナイト、セルロースおよび木材生成物、天然海綿、カチオン交換樹脂、炭酸カルシウム、ケイ酸塩、炭酸ナトリウム、架橋ポリビニルピロリドン(クロスポビドン)、カルボキシメチル澱粉ナトリウム(澱粉グリコール酸ナトリウム)、カルボキシメチルセルロース、内部架橋カルボキシメチルセルロースナトリウム(クロスカルメロース)、メチルセルロース、糊化澱粉(スターチ1500)、微結晶澱粉、水不溶性澱粉、カルボキシメチルセルロースカルシウム、ケイ酸マグネシウムアルミニウム(ビーガム)、ラウリル硫酸ナトリウム、第4級アンモニウム化合物、およびその組み合わせを含むが、それらに限定されない。
例示的な界面活性剤および/または乳化剤は、天然乳化剤(例えばアカシア、寒天、アルギン酸、アルギン酸ナトリウム、トラガカント、コンドラックス(chondrux)、コレステロール、キサンタン、ペクチン、ゼラチン、卵黄、カゼイン、ウールファット、コレステロール、ワックス、およびレシチン)、コロイド状粘土(例えばベントナイト[ケイ酸アルミニウム]およびビーガム[ケイ酸アルミニウムマグネシウム])、長鎖アミノ酸誘導体、高分子量アルコール(例えばステアリルアルコール、セチルアルコール、オレイルアルコール、モノステアリン酸トリアセチン、ジステアリン酸エチレングリコール、モノステアリン酸グリセリル、およびモノステアリン酸プロピレングリコール、ポリビニルアルコール)、カルボマー(例えばカルボキシポリメチレン、ポリアクリル酸、アクリル酸ポリマー、およびカルボキシビニルポリマー)、カラギーナン、セルロース誘導体(例えばカルボキシメチルセルロースナトリウム、粉末セルロース、ヒドロキシメチルセルロース、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、メチルセルロース)、ソルビタン脂肪酸エステル(例えばポリオキシエチレンソルビタンモノラウレート[Tween−20]、ポリオキシエチレンソルビタン[Tween−60]、ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート[Tween−80]、ソルビタンモノパルミテート[Span−40]、ソルビタンモノステアレート[Span−60]、ソルビタントリステアレート[Span−65]、グリセリルモノオレエート、ソルビタンモノオレエート[Span−80])、ポリオキシエチレンエステル(例えばモノステアリン酸ポリオキシエチレン[Myrj−45]、ポリオキシエチレン水添ヒマシ油、ポリエトキシル化ヒマシ油、ステアリン酸ポリオキシメチレン、およびソルトール)、ショ糖脂肪酸エステル、ポリエチレングリコール脂肪酸エステル(例えばクレモフォア)、ポリオキシエチレンエーテル、(例えばポリオキシエチレンラウリルエーテル[Brij−30])、ポリビニルピロリドン、モノラウリン酸ジエチレングリコール、オレイン酸トリエタノールアミン、オレイン酸ナトリウム、オレイン酸カリウム、オレイン酸エチル、オレイン酸、ラウリン酸エチル、ラウリル硫酸ナトリウム、プルロニックF68、ポロキサマー188、臭化セトリモニウム、塩化セチルピリジニウム、塩化ベンザルコニウム、ドクサートナトリウム、および/またはその組み合わせを含むが、それらに限定されない。
例示的な結合剤は、澱粉(例えばコーンスターチおよび澱粉糊)、ゼラチン、糖(例えばショ糖、グルコース、ブドウ糖、デキストリン、モラセス、ラクトース、ラクチトール、マンニトール)、天然および合成ガム(例えばアカシア、アルギン酸ナトリウム、アイリッシュモスエキス、パンワール(panwar)ガム、ガティガム、イサポル(isapol)殻粘液、カルボキシメチルセルロース、メチルセルロース、エチルセルロース、ヒドロキシエチルセルロース、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、微結晶セルロース、酢酸セルロース、ポリビニルピロリドン、ケイ酸アルミニウムマグネシウム(ビーガム)、およびカラマツアラボガラクタン)、アルギン酸、ポリエチレンオキシド、ポリエチレングリコール、無機カルシウム塩、ケイ酸、ポリメタクリレート、ワックス、水、アルコール、およびその組み合わせを含むが、それらに限定されない。
例示的な保存料は、抗酸化剤、キレート剤、抗微生物保存料、抗真菌保存料、アルコール保存料、酸性保存料、および他の保存料を含み得る。例示的な抗酸化剤は、αトコフェロール、アスコルビン酸、パルミチン酸アコルビル(acorbyl)、ブチル化ヒドロキシアニソール、ブチル化ヒドロキシトルエン、モノチオグリセロール、ピロ亜硫酸カリウム、プロピオン酸、没食子酸プロピル、アスコルビン酸ナトリウム、亜硫酸水素ナトリウム、ピロ亜硫酸ナトリウム、および亜硫酸ナトリウムを含むが、それらに限定されない。例示的なキレート剤は、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)、クエン酸一水和物、エデト酸二ナトリウム、エデト酸二カリウム、エデト酸、フマル酸、リンゴ酸、リン酸、エデト酸ナトリウム、酒石酸、およびエデト酸三ナトリウムを含む。例示的な抗微生物保存料は、塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム、ベンジルアルコール、ブロノポール、セトリミド、塩化セチルピリジニウム、クロルヘキシジン、クロロブタノール、クロロクレゾール、クロロキシレノール、クレゾール、エチルアルコール、グリセリン、ヘキセチジン、イミド尿素、フェノール、フェノキシエタノール、フェニルエチルアルコール、硝酸フェニル水銀、プロピレングリコール、およびチメロサールを含むが、それらに限定されない。例示的な抗真菌保存料は、ブチルパラベン、メチルパラベン、エチルパラベン、プロピルパラベン、安息香酸、ヒドロキシ安息香酸、安息香酸カリウム、ソルビン酸カリウム、安息香酸ナトリウム、プロピオン酸ナトリウム、およびソルビン酸を含むが、それらに限定されない。例示的なアルコール保存料は、エタノール、ポリエチレングリコール、フェノール、フェノール化合物、ビスフェノール、クロロブタノール、ヒドロキシ安息香酸、およびフェニルエチルアルコールを含むが、それらに限定されない。例示的な酸性保存料は、ビタミンA、ビタミンC、ビタミンE、β−カロテン、クエン酸、酢酸、デヒドロ酢酸、アスコルビン酸、ソルビン酸、およびフィチン酸を含むが、それらに限定されない。他の保存料は、トコフェロール、酢酸トコフェロール、デテロオキシム(deteroxime)メシレート、セトリミド、ブチル化ヒドロキシアニソール(BHA)、ブチル化ヒドロキシトルエンド(toluened)(BHT)、エチレンジアミン、ラウリル硫酸ナトリウム(SLS)、ラウリルエーテル硫酸ナトリウム(SLES)、亜硫酸水素ナトリウム、ピロ亜硫酸ナトリウム、亜硫酸カリウム、ピロ亜硫酸カリウム、Glydant Plus、Phenonip、メチルパラベン、Germall 115、Germaben II、Neolone、Kathon、およびEuxylを含むが、それらに限定されない。ある態様において保存料は抗酸化剤である。他の態様において保存料はキレート剤である。
例示的な緩衝剤は、クエン酸緩衝溶液、酢酸緩衝溶液、リン酸緩衝溶液、塩化アンモニウム、炭酸カルシウム、塩化カルシウム、クエン酸カルシウム、グルビオン酸カルシウム、グルコヘプトン酸カルシウム、グルコン酸カルシウム、D−グルコン酸、グリセロリン酸カルシウム、乳酸カルシウム、プロパン酸、レブリン酸カルシウム、ペンタン酸、二塩基性リン酸カルシウム、リン酸、三塩基性リン酸カルシウム、水酸化リン酸カルシウム、酢酸カリウム、塩化カリウム、グルコン酸カリウム、カリウム混合物、二塩基性リン酸カリウム、一塩基性リン酸カリウム、リン酸カリウム混合物、酢酸ナトリウム、炭酸水素ナトリウム、塩化ナトリウム、クエン酸ナトリウム、乳酸ナトリウム、二塩基性リン酸ナトリウム、一塩基性リン酸ナトリウム、リン酸ナトリウム混合物、トロメタミン、水酸化マグネシウム、水酸化アルミニウム、アルギン酸、発熱物質不含水、等張食塩水、リンゲル液、エチルアルコール、およびその組み合わせを含むが、それらに限定されない。
例示的な滑剤は、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸、シリカ、タルク、麦芽、ベヘン酸(behanate)グリセリル、水添植物油、ポリエチレングリコール、安息香酸ナトリウム、酢酸ナトリウム、塩化ナトリウム、ロイシン、ラウリル硫酸マグネシウム、ラウリル硫酸ナトリウム、およびその組み合わせを含むが、それらに限定されない。
例示的な油は、アーモンド、アンズ核、アボカド、ババス、ベルガモット、クロスグリ種子、ルリジサ、ケード、カモミール、キャノーラ、キャラウェイ、カルナウバ、ヒマシ、シナモン、ココアバター、ココナッツ、タラ肝、コーヒー、トウモロコシ、綿実、エミュー、ユーカリ、月見草、魚、亜麻仁、ゲラニオール、ヒョウタン、葡萄種子、ヘーゼルナッツ、ヒソップ、ミリスチン酸イソプロピル、ホホバ、ククイナッツ、ラバンジン、ラベンダー、レモン、アオモジ、マカデミアナッツ、ゼニアオイ、マンゴー種子、メドウフォーム種子、ミンク、ナツメグ、オリーブ、オレンジ、オレンジラフィー、ヤシ、パーム核、ピーチ核、ピーナッツ、ケシ種子、カボチャ種子、セイヨウアブラナ、米ぬか、ローズマリー、ベニバナ、ビャクダン、サザンカ、キダチハッカ、シーバックソーン、ゴマ、シアバター、シリコーン、大豆、ヒマワリ、ティーツリー、アザミ、椿、ベチバー、クルミ、および小麦胚芽油を含むが、それらに限定されない。例示的な油は、ステアリン酸ブチル、カプリル酸トリグリセリド、カプリン酸トリグリセリド、シクロメチコン、セバシン酸ジエチル、ジメチコン360、ミリスチン酸イソプロピル、ミネラルオイル、オクチルドデカノール、オレイルアルコール、シリコーンオイル、およびその組み合わせを含むが、それらに限定されない。
経口および非経口投与のための液体剤形は、医薬的に許容されるエマルション、マイクロエマルション、溶液、懸濁物、シロップ剤、およびエリキシル剤を含むが、それらに限定されない。活性成分に加えて、液体剤形は、当分野において普通に用いられる不活性な希釈剤、例えば水または他の溶媒、可溶化剤および乳化剤、例えばエチルアルコール、イソプロピルアルコール、炭酸エチル、酢酸エチル、ベンジルアルコール、安息香酸ベンジル、プロピレングリコール、1,3−ブチレングリコール、ジメチルホルムアミド、油(特に綿実、落花生、トウモロコシ、胚芽、オリーブ、ヒマシ、およびゴマ油)、グリセロール、テトラヒドロフルフリルアルコール、ポリエチレングリコール、およびソルビタンの脂肪酸エステル、ならびにその混合物などを含み得る。不活性な希釈剤以外に、経口組成物は、アジュバント、例えば湿潤剤、乳化および懸濁剤、甘味料、香料、ならびに芳香剤を含み得る。非経口投与のためのある態様において、本発明の複合体は、可溶化剤、例えばクレモフォール、アルコール、油、変性油、グリコール、ポリソルベート、シクロデキストリン、ポリマー、およびその組み合わせと混合される。
注射用調製物、例えば無菌の注射用の水性または油性懸濁物が、分散または湿潤剤および懸濁剤を用いて公知技術に従って製剤され得る。無菌の注射用調製物は、非毒性の非経口的に許容される希釈剤または溶媒中の無菌の注射用溶液、懸濁物、またはエマルション、例えば1,3−ブタンジオール中の溶液であり得る。用いられ得る許容される基剤および溶媒には、水、リンゲル液(USP)、および等張塩化ナトリウム溶液がある。加えて、無菌の不揮発性油が溶媒または懸濁媒として従来用いられている。この目的にはいずれかの無刺激性の不揮発性油が用いられ得、合成モノまたはジグリセリドを含む。加えて、オレイン酸などの脂肪酸が注射剤の調製に用いられる。
注射用製剤は、例えば細菌リテーナフィルタによる濾過によって、または無菌化剤を無菌固体組成物の形態(これは、使用前に無菌水または他の無菌の注射用媒体中に溶解または分散され得る)で組み込むことによって、無菌化され得る。
薬物の効果を延ばすためには、多くの場合に、皮下または筋肉内注射からの薬物の吸収を減速させることが望ましい。これは、不十分な水可溶性を有する結晶または非結晶物質の液体懸濁物の使用によって達成され得る。次に薬物の吸収速度はその溶解速度に依存し、これは翻って結晶サイズおよび結晶形態に依存し得る。その代わりに、非経口投与された薬物形態の遅延された吸収は、薬物を油基剤中に溶解または懸濁することによって達成され得る。
直腸または膣内投与のための組成物は典型的には座薬であり、本発明の複合体を非刺激性の添加剤または担体(例えば、ココアバター、ポリエチレングリコール、もしくは座薬用ワックス)と混合することによって調製され得る。これらは、常温において固体であるが体温においては液体であり、したがって直腸または膣腔において融けて活性成分を放出する。
経口投与のための固体剤形は、カプセル剤、錠剤、丸薬、粉末、および顆粒剤を含む。かかる固体剤形において、活性成分は少なくとも1つの不活性な医薬的に許容される添加剤または担体と混合される。それらは例えばクエン酸ナトリウムまたはリン酸二カルシウム、ならびに/あるいは(a)充填剤または増量剤、例えば澱粉、ラクトース、ショ糖、グルコース、マンニトール、およびケイ酸、(b)結合剤、例えばカルボキシメチルセルロース、アルギン酸、ゼラチン、ポリビニルピロリジノン、ショ糖、およびアカシアなど、(c)保湿剤、例えばグリセロール、(d)崩壊剤、例えば寒天、炭酸カルシウム、馬鈴薯もしくはタピオカ澱粉、アルギン酸、あるケイ酸塩、および炭酸ナトリウム、(e)溶解遅延剤、例えばパラフィン、(f)吸収促進剤、例えば 第4級アンモニウム化合物、(g)湿潤剤、例えばセチルアルコールおよびモノステアリン酸グリセロールなど、(h)吸着剤、例えばカオリンおよびベントナイト粘土、ならびに(i)滑剤、例えばタルク、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウム、固体ポリエチレングリコール、ラウリル硫酸ナトリウム、およびその混合物である。カプセル剤、錠剤、および丸薬の場合には、剤形は緩衝剤を含み得る。
類似の型の固体組成物が、ソフトおよびハードの充填ゼラチンカプセル剤の充填剤として用いられ得、添加剤、例えばラクトースまたは乳糖、さらには高分子量ポリエチレングリコールおよび同様のものを用いる。錠剤、糖衣剤、カプセル剤、丸薬、および顆粒剤の固体剤形は、コーティングおよびシェル、例えば腸溶コーティングおよび医薬製剤分野において周知の他のコーティングによって調製され得る。それらは任意に乳白剤を含み得、活性成分(単数または複数)を、専らまたは優先的に腸管のある部位において、任意に遅延型様式で放出する組成物であり得る。用いられ得る包埋組成物の例は、ポリマー物質およびワックスを含む。類似の型の固体組成物が、ソフトおよびハードの充填ゼラチンカプセル剤の充填剤として用いられ得、添加剤、例えばラクトースまたは乳糖、さらには高分子量ポリエチレングリコールおよび同様のものを用いる。
活性成分は、上記の1つまたは2つ以上の添加剤を有するマイクロカプセル化形態であり得る。錠剤、糖衣剤、カプセル剤、丸薬、および顆粒剤の固体剤形は、コーティングおよびシェル、例えば腸溶コーティング、放出制御コーティング、および医薬製剤分野において公知の他のコーティングによって調製され得る。かかる固体剤形において、活性成分は、少なくとも1つの不活性な希釈剤、例えばショ糖、ラクトース、または澱粉と混合され得る。かかる剤形は、正常な慣業として、不活性な希釈剤よりも他の追加の物質、例えば錠剤化滑剤および他の錠剤化助剤、かかるステアリン酸マグネシウムおよび微結晶セルロースを含み得る。カプセル剤、錠剤、および丸薬の場合には、剤形は緩衝剤を含み得る。それらは任意に乳白剤を含み得、活性成分(単数または複数)を、専らまたは優先的に腸管のある部位において、任意に遅延型様式で放出する組成物であり得る。用いられ得る包埋組成物の例は、ポリマー物質およびワックスを含む。
本発明の複合体の外用および/または経皮投与のための剤形は、軟膏、ペースト剤、クリーム、ローション、ゲル、粉末、溶液、スプレー、吸入剤、および/またはパッチを含み得る。一般的に、活性成分は、無菌の障害において、医薬的に許容される担体および/またはいずれかの必要とされる保存料および/または緩衝剤と、要求され得るように混合され得る。加えて、本発明は経皮パッチの使用も考え、これは多くの場合に、体への活性成分の制御された送達を提供するという追加の利点を有する。かかる剤形は、例えば活性成分を適切な媒体中に溶解および/または調合することによって調製され得る。その代わりにまたは加えて、速度は、速度制御膜を提供することによってならびに/または活性成分をポリマーマトリックスおよび/もしくはゲル中に分散することによって制御され得る。
本明細書に記載の皮内医薬組成物を送達する際の使用のための好適なデバイスは、短針デバイス、例えば米国特許4,886,499、5,190,521、5,328,483、5,527,288、4,270,537、5,015,235、5,141,496、および5,417,662に記載のものを含む。皮内組成物は、皮膚中への針の有効貫入長を限定するデバイス、例えばPCT公開WO99/34850に記載のものおよびその機能上の均等物によって投与され得る。噴射注射デバイスが、例えば米国特許5,480,381、5,599,302、5,334,144、5,993,412、5,649,912、5,569,189、5,704,911、5,383,851、5,893,397、5,466,220、5,339,163、5,312,335、5,503,627、5,064,413、5,520,639、4,596,556、4,790,824、4,941,880、4,940,460、ならびにPCT公開WO97/37705およびWO97/13537に記載されている。その代わりにまたは加えて、従来のシリンジが皮内投与の古典的なマントゥー法に用いられ得る。
外用投与のための製剤は、液体および/または半液体調製物、例えばリニメント剤、ローション、水中油および/または油中水エマルション、例えばクリーム、軟膏、および/またはペースト剤、および/または溶液および/または懸濁物を含むが、それらに限定されない。外用投与可能な製剤は、例えば約1%〜約10%(w/w)の活性成分を含み得るが、活性成分の濃度は溶媒中への活性成分の可溶性限度まで高くあり得る。外用投与のための製剤は、本明細書に記載の追加の成分の1つまたは2つ以上をさらに含み得る。
本発明の医薬組成物は、口腔からの経肺投与のための製剤として調製、容器詰め、および/または販売され得る。かかる製剤は、活性成分を含んで約0.5〜約7ナノメートルまたは約1〜約6ナノメートルの範囲の直径を有する乾燥粒子を含み得る。かかる組成物は、便利には、乾燥粉末レザーバ(これには噴射剤流が導かれて粉末を分散し得る)を含むデバイスを用いるおよび/または自己噴射性溶媒/粉末ディスペンサー容器(例えば、密閉容器中の低沸点噴射剤中に溶解および/または懸濁された活性成分を含むデバイス)を用いる投与のための乾燥粉末の形態である。かかる粉末は、重量による粒子の少なくとも98%が0.5ナノメートルよりも大きい直径を有し、個数による粒子の少なくとも95%が7ナノメートルよりも小さい直径を有する粒子を含む。その代わりに、重量による粒子の少なくとも95%が1ナノメートルよりも大きい直径を有し、個数による粒子の少なくとも90%が6ナノメートルよりも小さい直径を有する。乾燥粉末組成物は固体微粉末希釈剤、例えば糖を含み得、便利には単位剤形で提供される。
低沸点噴射剤は、一般的に、大気圧において華氏65度未満の沸点を有する液体噴射剤を含む。一般的に、噴射剤は組成物の50〜99.9%(w/w)を構成し得、活性成分は組成物の0.1=20%(w/w)を構成し得る。噴射剤は、追加の成分、例えば液体非イオン性および/または固体アニオン性界面活性剤および/または固体希釈剤(これは、活性成分を含む粒子と同じオーダーの粒径を有し得る)をさらに含み得る。
経肺送達のために製剤された本発明の医薬組成物は、溶液および/または懸濁物の液滴の形態の活性成分を提供し得る。かかる製剤は、活性成分を含む水性のおよび/または希アルコール性の任意に無菌の溶液および/または懸濁物として調製、容器詰め、および/または販売され得、便利にはいずれかのネブライゼーションおよび/または霧化デバイスを用いて投与され得る。かかる製剤は1つまたは2つ以上の追加の成分をさらに含み得、それらは香料、例えばサッカリンナトリウム、揮発油、緩衝剤、界面活性剤、および/または保存料、例えばメチルヒドロキシ安息香酸を含むが、それらに限定されない。この投与経路によって提供される液滴は、約0.1〜約200ナノメートルの範囲の平均直径を有し得る。
経肺送達に有用だとして本明細書に記載の製剤は、本発明の医薬組成物の鼻腔内送達に有用である。鼻腔内投与のための別の製剤は粗粒粉末であり、活性成分を含み、約0.2〜500マイクロメートルの平均粒子を有する。かかる製剤は、かぎタバコが吸われるやり方で、すなわち鼻孔の近くに保持された粉末の容器からの鼻腔による急速な吸入によって投与される。
鼻腔投与のための製剤は、例えば約0.1%(w/w)ほど少し〜100%(w/w)ほど多くの活性成分を含み得、本明細書に記載の追加の成分の1つまたは2つ以上を含み得る。本発明の医薬組成物は、口腔内投与のための製剤として調製、容器詰め、および/または販売され得る。かかる製剤は、例えば従来の方法を用いて作られた錠剤および/またはロゼンジの形態であり得、例えば0.1〜20%(w/w)の活性成分であり得、残部は、経口的に溶解可能および/または分解可能な組成物ならびに任意に本明細書に記載の追加の成分の1つまたは2つ以上を含む。その代わりに、口腔内投与のための製剤は、活性成分を含む粉末ならびに/またはエアロゾル化および/もしくは霧化溶液および/または懸濁物を含み得る。かかる粉末化、エアロゾル化および/またはエアロゾル化製剤は、分散されたときに約0.1〜約200ナノメートルの範囲の平均粒径および/または液滴サイズを有し得、本明細書に記載の追加の成分の1つまたは2つ以上をさらに含み得る。
本発明の医薬組成物は、経眼投与のための製剤として調製、容器詰め、および/または販売され得る。かかる製剤は、例えば点眼薬の形態であり得、例えば水性または油性液体担体中の活性成分の0.1/1.0%(w/w)溶液および/または懸濁物を含む。かかる点薬は、緩衝剤、塩、および/または本明細書に記載の追加の成分の1つもしくは2つ以上の他のものをさらに含み得る。有用な他の経眼投与可能な製剤は、活性成分を微結晶形態でおよび/またはリポソーム調製物中に含むものを含む。点耳薬および/または点眼薬は本発明の範囲内であると考えられる。
医薬剤の製剤および/または製造における一般的な考慮事項は、例えばRemington: The Science and Practice of Pharmacy 21st ed., Lippincott Williams & Wilkins, 2005に見いだされ得る。
本明細書において提供される本発明のポリペプチドは、典型的には、投与の容易さおよび投与量の統一性のために投与量単位形態で製剤される。しかしながら、当然のことながら、本発明の組成物の合計の1日使用量は、担当医によって正しい医学的判断の範囲内において判断されるであろう。いずれかの具体的な対象のための具体的な治療有効用量レベルは種々の因子に依存するであろう。それらは、治療される疾患、障害、または障害、および障害の深刻さ、用いられる具体的な活性成分の活性、対象の年齢、体重、一般的な健康、性別、および食事、用いられる具体的な活性成分の投与時間、投与経路、および排泄速度、治療の長さ、用いられる具体的な活性成分と組み合わせでまたは同時に用いられる薬物、ならびに医学分野において周知の同様の因子を含む。
式(I)〜(X)のポリペプチド、その塩、またはその医薬組成物はいずれかの経路によって投与され得る。いくつかの態様において、式(II)のポリペプチド、その塩、またはその医薬組成物は種々の経路(経口、静脈内、筋肉内、動脈内、骨髄内、脊髄内、皮下、心室内、経皮、皮内、直腸、膣内、腹腔内、外用(例えば、粉末、軟膏、クリーム、および/もしくは点薬による)、粘膜、鼻腔、バッカル(bucal)、経腸、舌下、気管内点滴、気管支内点滴、および/もしくは吸入による、ならびに/または経口スプレー、鼻腔スプレー、および/またはエアロゾルとして、を含む)によって投与される。具体的に考えられる経路は、全身静脈内注射、輸血および/またはリンパ輸注による局所投与、および/または患部への直接的な投与である。一般的に、最も適切な投与経路は種々の因子に依存するであろう。それらは剤の性質(例えば、胃腸管の環境におけるその安定性)および/または対象の障害(例えば、対象が経口投与を忍容することが可能であるかどうか)を含む。現在のところ、経口および/または鼻腔スプレーおよび/またはエアロゾル経路が、治療剤を直接的に肺および/または呼吸器系に送達するためには最も普通に用いられている。しかしながら、本発明は薬物送達の科学の起こりうる進歩を考慮に入れ、いずれかの適切な経路による本発明の医薬組成物の送達を包含する。
ある態様において、式(II)のポリペプチド、その塩、またはその医薬組成物は、約0.001mg/kg〜約100mg/kg、約0.01mg/kg〜約50mg/kg、約0.1mg/kg〜約40mg/kg、約0.5mg/kg〜約30mg/kg、約0.01mg/kg〜約10mg/kg、約0.1mg/kg〜約10mg/kg、または約1mg/kg〜約25mg/kg対象の体重/日をを1日1または2回以上送達して、所望の治療効果を得るのに十分な投与量レベルで投与され得る。所望の投与量は、1日3回、1日2回、1日1回、2日毎、3日毎、毎週、2週毎、3週毎、または4週毎に送達され得る。ある態様において、所望の投与量は、複数の投与(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、または15以上の投与)を用いて送達され得る。
当然のことながら、本明細書に記載の用量範囲は、提供される医薬組成物の成人への投与のための案内を提供している。例えば児童または思春期に投与される量は、医療従事者または当業者によって決定され得、成人に投与されるものよりも低いかまたはそれと同じであり得る。有効量を達成するために要求される本発明のポリペプチドの正確な量は、例えば対象の種、年齢、および一般的な障害、副作用または障害の深刻さ、具体的な化合物(単数または複数)の素性、投与の様式、および同様のものに依存して対象毎に変わる。
いくつかの態様において、本発明は、本発明のポリペプチドを含む「治療カクテル」を包含する。いくつかの態様において、本発明のポリペプチドは複数の標的に結合し得る単一の種を含む。いくつかの態様において、異なる本発明のポリペプチドは異なる標的化部分種を含み、異なる標的化部分種の全てが同じ標的に結合し得る。いくつかの態様において、異なる本発明のポリペプチドは異なる標的化部分種を含み、異なる標的化部分種の全てが異なる標的に結合し得る。いくつかの態様において、かかる異なる標的は同じ細胞型と結びついており得る。いくつかの態様において、かかる異なる標的は異なる細胞型と結びついており得る。
当然のことながら、本発明のポリペプチドおよび本発明の医薬組成物は併用療法に用いられ得る。併用レジメンに用いるための療法(治療薬または処置)の具体的な組み合わせは、所望の治療薬および/または処置ならびに達成されるべき所望の治療効果の適合性を考慮に入れるであろう。当然のことながら、用いられる療法は同じ目的(例えば、腫瘍を検出するために有用な本発明の複合体は、腫瘍を検出するために有用な別の剤と同時に投与され得る)の所望の効果を達成し得、またはそれらは異なる効果(例えばいずれかの副作用の制御)を達成し得る。
本発明の医薬組成物は、単独でまたは1つもしくは2つ以上の治療活性剤との組み合わせで投与され得る。「との組み合わせで」によって、剤が必ず同時に投与および/または一緒になっての送達のために製剤されなければならないということは意図されないが、送達のそれらの方法は本発明の範囲内である。組成物は、1つまたは2つ以上の他の所望の治療薬または医学的処置と同時、その前、またはそれに続いて投与され得る。一般的に、各剤はその剤について決定された用量でおよび/またはタイムスケジュールで投与され得る。加えて、本発明は、それらのバイオアベイラビリティを改善し得る、それらの代謝を減少させ得るおよび/または改変し得る、それらの排泄を阻害し得る、および/またはそれらの体内分布を改変し得る剤との組み合わせでの本発明の医薬組成物の送達を包含する。さらに当然のことながら、この組み合わせで用いられる治療活性剤および本発明のポリペプチドは単一の組成物として一緒になって投与または異なる組成物として別々に投与され得る。
併用レジメンに用いられる具体的な組み合わせは、治療活性剤および/または処置と本発明のポリペプチドおよび/または達成されるべき所望の治療効果との適合性を考慮に入れることになるであろう。当然のことながら、用いられる組み合わせは同じ障害について所望の効果を達成し得(例えば、本発明のポリペプチドは、同じ障害を治療するために用いられる別の治療活性剤と同時に投与され得る)、および/またはそれらは異なる効果(例えば、いずれかの副作用の制御)を達成し得る。
本明細書において用いられる場合、「治療活性剤」は、障害の治療、予防、遅延、減少、または寛解のための医薬として用いられるいずれかの物質を指し、予防および治療の治療を含む療法にとって有用な物質を指す。治療活性剤は、例えば式(I)または(VI)の化合物の効果を増強することまたは副作用を減少させることによって、別の化合物の効果または有効性を増大させる化合物もまた含む。
ある態様において、治療活性剤は、抗癌剤、抗生物質、抗ウィルス剤、抗HIV剤、抗寄生虫剤、抗原虫剤、麻酔薬、抗凝固薬、酵素の阻害剤、ステロイド剤、ステロイド性もしくは非ステロイド性抗炎症薬、抗ヒスタミン薬、免疫抑制剤、抗腫瘍剤、抗原、ワクチン、抗体、充血除去剤、鎮静剤、オピオイド、鎮痛剤、解熱剤、避妊薬、ホルモン、プロスタグランジン、プロゲステロン作用薬、抗緑内障薬、眼薬、抗コリン薬、鎮痛剤、抗うつ剤、抗精神病薬、神経毒、睡眠薬、精神安定剤、抗痙攣薬、筋弛緩薬、抗パーキンソン薬、抗れん縮薬、筋収縮剤、チャネル遮断剤、縮瞳薬、抗分泌薬、抗血栓薬、抗凝結薬、抗コリン薬、β−アドレナリン遮断薬、利尿剤、心血管系作用薬、血管作動薬、血管拡張薬、抗高血圧薬、血管新生剤、細胞−細胞外マトリックス相互作用のモジュレータ(例えば細胞増殖阻害剤および抗接着分子)、またはDNA、RNA、蛋白質−蛋白質相互作用、蛋白質−受容体相互作用の阻害剤/挿入剤である。
いくつかの態様において、本発明の医薬組成物は、癌を治療する、軽減する、寛解させる、緩和する、癌の発症を遅延させる、癌の進行を阻害する、癌の深刻さを減少させる、および/または癌の1つまたは2つ以上の症状または特徴の発生を減少させるのに有用ないずれかの治療活性剤または処置(例えば、外科手術、放射線療法)との組み合わせで投与され得る。
キット
本発明は、本発明のポリペプチドの1つまたは2つ以上を含む種々のキットもまた提供する。例えば、本発明は、本発明のポリペプチドおよび使用のための指示書きを含むキットを提供する。キットは複数の異なるポリペプチドを含み得る。キットはいくつかの追加の成分または試薬のいずれかをいずれかの組み合わせで含み得る。種々の組み合わせの全ては明確には示されないが、各組み合わせは本発明の範囲に含まれる。
本発明のある態様に従って、キットは、例えば(i)送達されるべき1つまたは2つ以上の本発明のポリペプチドおよび任意に1つまたは2つ以上の具体的な治療活性剤、(ii)その必要がある対象への投与のための指示書きを含み得る。
キットは典型的には指示書きを含み、これは例えばプロトコールを含み得るおよび/または本発明のポリペプチドの生成、その必要がある対象への本発明のポリペプチドの投与、新規の本発明のポリペプチドの設計のための障害を記載し得る。キットは、一般的に1つまたは2つ以上のベッセルまたは容器を含んでおり、個別の成分および試薬のいくつかまたは全てが別々に収容されるようになっており得る。キットは、個別の容器を相対的に密にまとめて市販用に納めるための手段、例えば、プラスチック箱もまた含み得る。その中には、指示書き、梱包材、例えばスタイロフォームなどが納められており得る。識別子、例えばバーコード、高周波数識別(ID)タグなどが、キット中もしくは表面、またはキットに含まれるベッセルもしくは容器の1つまたは2つ以上に存在し得る。識別子は、例えば、品質管理、在庫管理、トラッキング、ワークステーション間の移動の目的のために、キットを固有に同定するために用いられ得る。
本明細書に記載の発明をより完全に理解するために次の例を示す。当然のことながら、それらの例は説明の目的のために過ぎず、本発明を限定するものとして解釈されるべきものではない。
本明細書に記載の本発明をより完全に理解するために次の例を示す。当然のことながら、それらの例は説明の目的のために過ぎず、本発明を限定するものとして解釈されるべきものではない。
実施例1
アミノ酸1の調製をスキーム1に示す。
100g(0.543mol)の1(100g、5.4mol)をTHF(1000mL)中にとり、−78℃まで冷却した。228mL(0.570モル)のn−BuLi(2.5M、THF中)を30分かけて液滴として追加した。次に溶液を追加の30分間激しく攪拌した。81gのヨウ化メチル(0.57mol)をTHFによって250mLまで希釈し、−78℃まで冷却した。ヨウ化メチルを次に30分かけて液滴として追加した。ヨウ化メチルの追加の完了後に、反応を−78℃で2時間攪拌した。次に、1Lのジエチルエーテル、その後に500mLのHOを混合物に追加した。反応を次に室温まで温めた。水性層を複数回ジエチルエーテルによって抽出し、有機層を組み合わせ、飽和チオ硫酸ナトリウムによって洗浄し、ブラインによって一度洗浄し、MgSOによって乾燥した。有機物を減圧下で(under vaccum)濃縮して残さを与え、これをクロマトグラフィーによって50:1から20:1の石油エーテル:ジエチルエーテルの勾配によって精製し、110g(80.5%)の2(淡黄色油)を生じた。1H NMR: (400 MHz, CDCl3-d) ppm 0.60 - 0.72 (m, 3 H), 0.94 - 1.03 (m, 3 H), 1.26 - 1.35 (m, 3 H), 2.07 - 2.30 (m, 1 H), 3.53 - 3.70 (m, 6 H), 3.89 (br. s., 2 H).
40g(0.202mol)の2を400mLのTHF中にとり、−78℃まで冷却した。85mL(0.212mol)のn−BuLi(2.5M、THF中)を20分かけて液滴として追加した。溶液を次に追加の40分間激しく攪拌した。30gの1−ブロモ−2−クロロエタン(0.212モル)をTHFによって200mLまで希釈し、−78℃まで冷却した。1−ブロモ−2−クロロエタンを次に90分かけて液滴として追加した。1−ブロモ−2−クロロエタンの追加の完了後に、反応を−78℃で追加の90分間攪拌した。500mLのジエチルエーテル、その後に500mLのHOを反応に追加した。反応を次に室温まで温めた。水性層をジエチルエーテルによって抽出し、組み合わせた有機物をHOによって一度、ブラインによって一度洗浄し、次にNaSOによって乾燥した。次に、組み合わせた有機層を減圧下で濃縮して残さを与え、これをクロマトグラフィーによって精製して(石油エーテル:ジエチルエーテル=50:1)、生成物3を淡黄色油として与えた(36g、収率70%)。1H NMR: (400 MHz, CDCl3-d) ppm 0.61 (d, J = 6.78 Hz, 3 H), 1.00 (d, J = 6.78 Hz, 3 H), 1.23 - 1.32 (m, 3 H), 1.91 - 2.02 (m, 1 H), 2.11 - 2.32 (m, 2 H), 3.13 - 3.34 (m, 2 H), 3.60 (d, J = 7.53 Hz, 6 H), 3.80 - 3.95 (m, 1 H).
DMSO(300mL)中の3(20g、0.075mol)の溶液にNaI(33g、0.226mol)およびNaN(15g、226mmol)を25℃で追加し、次に混合物溶液を80℃で一晩攪拌した。次に溶液を冷却して水を追加し、ジエチルエーテルによって抽出し(150ml*3)、ブライン(50ml)によって洗浄し、NaSOによって乾燥し、減圧下で濃縮して粗製生成物を与え、これを次のステップに直接的に用いた。
19g(0.0711mol)の4を300mLのTHF中にとり、室温で攪拌した。71mL(0.0711mol)の(CHP(1M、THF中)を次にシリンジによって数分かけて追加した。45分間の撹拌後に、9.2mL(0.850mol)のアリルクロロホルメートを追加し、反応を追加の60分間室温で攪拌した。100mLの0.4MのKPOを次に追加して、ホスホニウム中間体を5に変換した。生成物を複数回DCMによって抽出し、組み合わせた有機物をブラインによって洗浄し、NaSOによって乾燥し、減圧下で濃縮して残さを与えた。もたらされた黄色油をクロマトグラフィーによってシリカゲルによって3:1の石油エーテル:酢酸エチルを用いて精製し、17g(71.0%、3ステップ)の5を無色油として生じた。1H NMR: (400 MHz, CDCl3-d) ppm 0.62 (d, J = 7.03 Hz, 3 H), 1.00 (d, J = 6.78 Hz, 3 H), 1.26 (s, 3 H), 1.68 - 1.78 (m, 1 H), 1.91 - 2.01 (m, 1 H), 2.11 - 2.23 (m, 1 H), 2.96 - 3.14 (m, 2 H), 3.60 (d, J = 3.76 Hz, 6 H), 3.85 - 3.92 (m, 1 H), 4.46 (br. s., 2 H), 5.08 - 5.20 (m, 2 H), 5.77 - 5.95 (m, 1 H).
17g(0.052mol)の5を300mLのTHF中にとり、室温で撹拌した。3.12g(0.078mol)のNaH(60%分散物、ミネラルオイル中)を追加した。反応を10分間撹拌した後、23g(0.156モル)のCHIをシリンジによって5分かけて追加した。3時間撹拌した後、反応を水の追加によってクエンチし、生成物を複数回ジエチルエーテルによって抽出した。組み合わせた有機物をHO、飽和チオ硫酸ナトリウム、ブラインによって洗浄し、NaSOによって乾燥し、減圧下で濃縮して残さを与え、これをクロマトグラフィーによってシリカゲルによって精製して(5:1の石油エーテル:酢酸エチル)、13g(73.1%)の6(微黄色油)を生じた。1H NMR:(400 MHz, CDCl3-d) ppm 0.64 - 0.73 (m, 3 H), 1.02 - 1.11 (m, 3 H), 1.28 - 1.38 (m, 3 H), 1.68 - 1.82 (m, 1 H), 1.99 - 2.12 (m, 1 H), 2.18 - 2.39 (m, 1 H), 2.76 - 2.89 (m, 3 H), 2.97 - 3.25 (m, 2 H), 3.67 (s, 6 H), 3.90 - 4.04 (m, 1 H), 4.46 - 4.70 (m, 2 H), 5.14 - 5.22 (m, 1 H), 5.25 - 5.36 (m, 1 H), 5.81 - 6.02 (m, 1 H).
THF(50ml)中の6(6g、17.7mmol)の溶液にHCl/HO(150ml、0.25N)を18℃で追加した。次に、混合物溶液を18℃で一晩撹拌し、次にaq.NaOHによってpH=8まで塩基性化し、DCMによって抽出し、ブラインによって洗浄し、NaSOによって乾燥し、減圧下で濃縮して残さを与え、これを次のステップに直接的に用いた。
THF(100ml)およびHO(100ml)中の7(10g、0.041mol)の溶液にNaCO(8.7g、0.087mol)およびFmocCl(10.3g、0.082mol)を10℃で追加し、次に混合物溶液を10℃で0.5時間撹拌し、複数の酢酸エチルによって抽出し、HO、ブラインによって洗浄し、減圧下で濃縮して粗製物を与え、これをクロマトグラフィーによってシリカゲルによって精製して(石油エーテル:酢酸エチル=15:1)、生成物を無色油として与えた(8.5g、45%)。1H NMR: (400 MHz, CDCl3-d) ppm 1.48 - 1.60 (m, 3 H), 2.01 - 2.20 (m, 1 H), 2.23 - 2.50 (m, 1 H), 2.75 (br. s., 3 H), 2.96 - 3.39 (m, 2 H), 3.69 (br. s., 3 H), 4.04 - 4.21 (m, 1 H), 4.23 - 4.41 (m, 2 H), 4.43 - 4.55 (m, 2 H), 5.04 - 5.15 (m, 1 H), 5.15 - 5.20 (m, 1 H), 5.23 (s, 2 H), 5.60 - 5.99 (m, 2 H), 7.21 - 7.28 (m, 2 H), 7.33 (t, J =7.40 Hz, 2 H), 7.55 (br. s., 2 H), 7.70 (d, J =7.53 Hz, 2 H).
MeOH(80ml)およびHO(80ml)中の8(8.5g、0.0183mol)の溶液にNaOH(4.38g、0.109mol)を12℃で追加し、次に混合物を12℃で一晩撹拌した。混合物溶液を1NのHClによってpH=4まで酸性化し、次に減圧下で溶媒を除き、MeCN(15ml)およびHO(15ml)によって溶解し、Fmoc-OSu(9.3g、0.0275mol)およびDIEA(9.5g、0.0732mol)を12℃で追加し、次に混合物溶液を室温で一晩撹拌し、酢酸エチルによって抽出し、1NのHClによって洗浄し、ブラインによって洗浄し、減圧下で濃縮して粗製生成物を与え、これをクロマトグラフィーによってシリカゲルによって精製して(石油エーテル:酢酸エチル=10:l〜1:1)、生成物を淡色固体として与えた。生成物をSFCを用いて分離して、最終生成物を淡色固体として与えた(3.8g、44%)。1H NMR: WH10057-012-1D1 (400 MHz, DMSO-d6) ppm 1.35 (br. s., 3 H), 1.81 - 1.97 (m, 1 H), 1.99 - 2.20 (m, 1 H), 2.79 (d, J = 12.05 Hz, 3 H), 3.09 - 3.28 (m, 2 H), 4.17 - 4.33 (m, 3 H), 4.41 - 4.60 (m, 2 H), 4.97 - 5.40 (m, 2 H), 5.78 - 6.08 (m, 1 H), 7.35 (d, J = 7.53 Hz, 2 H), 7.43 (s, 2 H), 7.49 - 7.57 (m, 1 H), 7.68 - 7.77 (m, 2 H), 7.90 (d, J = 7.53 Hz, 2 H), 12.37 - 12.75 (m, 1 H). LCMS: WH10057-012-1B3 (M+l: 232.13). SFC: WH10057-012-1B2_2 ee=100%.
実施例2
アミノ酸2の調製をスキーム2に示す。
78.5g(396.42mmol)の合成中間体2を1.1LのTHF中にとり、−78℃まで冷却した。436mL(436mmol)のn-BuLi(2.5M、ヘキサン中)を次に10分かけて液滴として追加し、反応を次に−78℃で追加の60分間撹拌した。203g(1.189mol)のジブロモメタンを200mLのTHF中にとり、−78℃まで冷却した。THF中のジブロモメタンの溶液を次に40分かけて反応に液滴として追加した。追加の完了後に、反応を撹拌しながら、−20℃まで3時間かけて温まることを可能にした。この3時間の終わりに、TLC分析は反応が実質的に完全であるということを指示した。ジエチルエーテルおよびHOを追加し、反応を室温まで温めた。有機物が集められ、水性層は生成物を含有しなかった。有機物を次にHO、ブラインによって洗浄し、MgSOによって乾燥し、減圧下で濃縮した。もたらされた黄色油をシリカゲルによってクロマトグラフィーにかけて、95g(82.7%)の化合物10(微黄色油)を生じた。1H NMR WH10098-005- 1A (400 MHz, CHLOROFORM-d) 0.61 (d, J = 6.78 Hz, 3 H), 1.02 (d, J = 6.78 Hz, 3 H), 1.38 (s, 3 H), 2.13 - 2.32 (m, 1 H), 3.33 (d, J = 9.29 Hz, 1 H), 3.63 (d, J = 7.03 Hz, 6 H), 3.69 (d, J = 9.54 Hz, 1 H), 3.96 (d, J = 3.26 Hz, 1 H).
40g(137mol)の化合物10を400mLのDMSO中にとった。24g(369mmol)のNaNを追加し、反応を80℃まで加熱し、TLC分析(20:1のヘキサン:酢酸エチル)によって化合物11の消費が確認されるまで>24時間撹拌した。室温まで冷却後に、HOを反応に追加して、次に生成物を複数回DCMによって抽出した。組み合わせた有機物をMgSOによって乾燥し、減圧下で濃縮して油を与えた。結果の油を直接的に次のステップに用いた。LCMS: WH10098-007-1A (M+l=254.2)
17.3(68.5mmol)の化合物11を160mLのTHF中にとり、室温で撹拌した。70mL(70mmol)の(CHP(1M、THF中)を次にシリンジによって数分かけて追加した。45分間の撹拌後に、8.8mL(70mmol)のアリルクロロホルメートを追加して、反応を追加の60分間室温で撹拌した。600mLの0.4MのNaPO(pH7)を次に追加して、ホスホニウム中間体を化合物12に変換した。生成物を複数回DCMによって抽出し、組み合わせた有機物をブラインによって洗浄し、NaSOによって乾燥し、減圧下で濃縮した。もたらされた黄色油をシリカゲルによって10:1のヘキサン:酢酸エチルを用いてクロマトグラフィーにかけ、13g(62%)の化合物12(無色油)を生じた。1H NMR: (400 MHz, CHLOROFORM-d) 0.71 (d, J = 6.78 Hz, 3 H), 0.83 - 0.93 (m, 1 H), 1.09 (d, J =6.78 Hz, 3 H), 1.33 (s, 3 H), 2.26 (dq, J =10.29, 6.78 Hz, 1 H), 3.30 (dd, J =12.92, 5.65 Hz, 1 H), 3.54 (dd, J =12.92, 6.65 Hz, 1 H), 3.68 (d, J =4.27 Hz, 6 H), 3.99 (d, J =3.26 Hz, 1 H), 4.50 - 4.64 (m, 2 H), 4.82 (br. s., 1 H), 5.19 - 5.38 (m, 2 H), 5.92 (ddt, J =16.75, 10.98, 5.46, 5.46 Hz, 1 H).
13g(41.8mmol)の化合物12を105mLのTHF中にとり、室温で撹拌した。2.5g(62.7mmol)のNaH(60%分散物、ミネラルオイル中)を追加した。反応を10分間撹拌した後、17.8g(125.4mmol)のCHIをシリンジによって約5分かけて追加した。1時間後に、TLC分析(5:1のヘキサン:酢酸エチル)によって反応が完全であることが確認され、反応をKHPOの飽和溶液の追加によってクエンチした。HOを次に溶液に追加し、生成物を複数回DCMによって抽出した。組み合わせた有機物をHO、飽和チオ硫酸ナトリウム、ブラインによって洗浄し、NaSOによって乾燥し、減圧下で濃縮した。もたらされた黄色油をシリカゲルによってクロマトグラフィーにかけて(20:1のヘキサン:酢酸エチル)、11.3g(83.7%)の化合物13(微黄色油)を生じた。1HNMR: (400 MHz, CHLOROFORM-d) 0.58 (d, J = 6.02 Hz, 3 H), 0.99 (d, J = 6.78 Hz, 3 H), 1.24 (d, J=6.53 Hz, 3 H), 1.62 (s, 1 H), 2.20 (dtd, J = 13.58, 6.70, 6.70, 3.39 Hz, 1 H), 2.77 (s, 3 H), 3.40 - 3.54 (m, 2 H), 3.55 - 3.64 (m, 6 H), 3.85 (br. s., 1 H), 4.47 (br. s., 2 H), 5.05 - 5.33 (m, 2 H), 5.84 (d, J = 5.02 Hz, 1 H).
400mlの0.25NのHCIを250mlのTHF中の化合物13(10g、30mmol)の溶液に追加して、撹拌を一晩15℃で継続した。過剰なHCIおよびTHFを減圧下で蒸発させて、粗製化合物14を油として得、これを次のステップにさらなる精製なしに用いた。
THF(135ml)および水(135ml)中の化合物14(9g、粗製)、FmocCl(13.9g、54mmol、2eq.)、KCO(7.45g、54mmol、2eq.)の混合物を、TLC分析(1:1のヘキサン:酢酸エチル)によって化合物15(9g、74%)の消費が確認されるまで室温で5h撹拌した。1H NMR: WH10098-011-1A 1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-d) 1.52 - 1.73 (m, 3 H), 2.81 (br. s., 3 H), 3.45 - 3.90 (m, 5 H), 4.17 (d, J = 6.53 Hz, 1 H), 4.20 - 4.40 (m, 2 H), 4.54 (br. s., 2 H) 5.05 - 5.32 (m, 2 H), 5.86 (d, J = 10.29 Hz, 1 H), 7.20 - 7.27 (m, 2 H), 7.33 (t, J = 7.40 Hz, 2 H), 7.53 (d, J = 5.52 Hz, 2 H), 7.69 (d, J = 7.53 Hz, 2 H).
6Nの塩化水素酸の水性溶液(32ml)を、ジオキサン(160ml)中の化合物15(8g、17.6mmol、1eq.)の撹拌された溶液に室温で追加した。次に、混合物を還流下で2d撹拌した。50%の生成物のみがLC−MSによって見いだされた。約40%の非Alloc副生成物もまたLC−MSによって検出された。そこで混合物を室温まで冷却し、NaOH(1mol/L)によってpH=8まで酸性化し、ジオキサンを減圧(reduce pressure)下において除き、水性残さをEtOAc(3*200ml)によって抽出した。抽出された有機物を組み合わせ、NaSOによって乾燥し、濾過し、減圧(reduce pressure)下で濃縮して化合物2の混合物を与えた(8.1g)。アミノ酸2の混合物(8.1g)をジオキサン(100ml)、HO(200ml)中に溶解した。次にKCO(12.96g、2eq.)、Alloc-Cl(2.835g、1.5eq.)を追加した。混合物を10℃で一晩撹拌した。反応を水性HCl(1mol/L)によってpH=7まで酸性化した。混合物を減圧下で乾燥状態まで濃縮して、油を提供した。粗製生成物をクロマトグラフィーによってシリカゲルによって1:1のヘキサン:酢酸エチルを用いて精製し、7g(91%)のアミノ酸2(無色油、eeは80%)を生じた。エナンチオマーをSFCによって精製して、アミノ酸2のs(5g、ee>99%)を無色(colurless)固体として与えた。1HNMR: (400 MHz, DMSO-d6) 1.23 (br. s., 3 H), 2.64 - 2.84 (m, 3 H), 3.18 (d, J = 5.02 Hz, 1 H), 3.49 - 3.69 (m, 1 H), 3.86 (d, J = 14.05 Hz, 1 H), 4.17 - 4.32 (m, 2 H), 4.36 - 4.59 (m, 3 H), 5.09 - 5.34 (m, 2 H), 5.91 (d, J = 10.04 Hz, 1 H), 7.30 - 7.36 (m, 2 H), 7.38 - 7.47 (m, 2 H), 7.61 (br. s., 1 H), 7.66 - 7.77 (m, 2 H), 7.89 (d, J = 7.28 Hz, 2 H), 12.64 (br. s., 1 H). LCMS: WH10098-029-1C (M+l=439.2).
実施例3
アミノ酸3および4の調製をスキーム3に示す。
MeOH(1000mL)中のHARV−120823−1(80g、0.432mol)およびNHOAc(46.61g、0.605mol)の溶液に、NaCN(21.71g、0.432mol)を室温で追加した。追加後に、混合物を室温で一晩撹拌した。TLC(石油エーテル/EtOAc=3/l)によって反応が完全であることが示された。混合物を濃縮し、水(300mL)を追加した。混合物をDCM(3*450mL)によって抽出した。組み合わせた有機層をブラインによって洗浄し、NaSOによって乾燥し、減圧下で濃縮して粗製HARV−120823_2を与えた。粗製生成物を水性HCl(<1N)中に溶解し、DCMによって抽出した。水性層にNaHCOを追加してpH=8を調整し、DCMによって抽出した。有機層をNaSOによって乾燥し、減圧下で濃縮して純粋な生成物HARV−120823_2を与えた(85g、収率93%)。1HNMR (CDCl3, 400 MHz, WH10085-001-1A): δ3.76-3.73 (m, 1H), 3.61-3.43 (m, 3H), 2.34-2.32 (m, 1H), 1.82 (s, 2H), 1.45 (s, 9H).
ジオキサン(800mL)中のHARV−120823−2(85g、0.4mol)、NaHCO(67.6g、0.804mol)の混合物に、ジオキサン(200mL)中のFmoc-Cl(104g、0.4mol)の溶液を液滴として追加した。次に、もたらされた混合物を室温で別の3hr撹拌した。300mLの水を追加して、DCM(2*450mL)によって抽出した。組み合わせた有機層をNaSOによって乾燥し、濾過して減圧下で濃縮し、粗製生成物HARV−120823−3を与え、これをシリカカラムクロマトグラフィーによって精製して純粋な生成物HARV−120823−3を与えた(150g、収率86%)。1HNMR (CDCl3, 400 MHz, WH10085-002-1A): δ7.77-7.75 (d, 2H), 7.57-7.55 (d, 2H), 7.42-7.38 (m, 2H), 7.33-7.26 (m, 2H), 5.50- 5.48 (m, 1H), 4.54-4.53 (m, 2H), 4.22-4.19 (m, 1H), 3.68-3.67 (m, 1H), 3.58-3.46 (m, 3H), 2.46-2.32 (m, 2H), 1.46 (s, 9H).(図26参照)
濃縮された水性HCl(1000mL)中のHARV−120823−3(150g、0.346mol)の溶液を、20min室温で撹拌した。次に混合物を加熱して一晩還流させた。混合物を減圧下で濃縮して120gの粗製生成物HARV−120823−4を与え、これをさらなる精製なしに次のステップに直接的に用いた。1HNMR (DMSO, 400 MHz, WH10085-005-1A): δ 7.90-7.84 (m, 2H), 7.74-7.65 (m, 2H), 7.44-7.29 (m, 4H), 4.38-4.31 (m, 1H), 4.29-4.22 (m, 2H), 3.74-3.29 (m, 4H), 2.36-2.29 (m, 1H), 2.21-2.13 (m, 1H).
CHCN(200mL)中のHARV−120823−4(100g、0.284mol)の溶液にピリジンを追加して、pH=7を調整した。次に混合物を30min撹拌した。次にAlloc−Cl(34.21g、0.284mol)を液滴として追加した。追加後に、もたらされた混合物を1h撹拌した。混合物を濃縮し、残さをDCM中に溶解し、HCl溶液によって洗浄し、有機層を分離し、NaSOによって乾燥し、濃縮して粗製生成物HARV−120823を与え、これをシリカカラムクロマトグラフィーによって精製して純粋な生成物HARV−120823を与えた(80g、収率75%)。1HNMR (CDCl3, 400 MHz, WH10085-006-1A): δ 7.76-7.74 (d, 2H), 7.57-7.56 (d, 2H), 7.41-7.38 (m, 2H), 7.32-7.29 (m, 2H), 5.93-5.89 (m, 1H), 5.32-5.19 (m, 2H), 4.59 (m, 2H), 4.43 (m, 2H), 4.20-4.18 (m, 1H), 4.00-3.93 (m, 1H), 3.76-3.54 (m, 3H), 2.53-2.27 (m, 2H).
5.06gのアミノ酸3および5.07gのアミノ酸4をキラル分離によって得た。
1HNMR (DMSO, 400 MHz, WH10085-006-2F): δ 12.91 (brs, 1 H); 8.067-8.054 (d, J=5.2 Hz, 1H), 7.90-7.88 (d, 2H), 7.71-7.69 (d, 2H), 7.43-7.39 (m, 2H), 7.35-7.31 (m, 2H), 5.96-5.86 (m, 1H), 5.31-5.15 (m, 2H), 4.53-4.52 (m, 2H), 4.32-4.30 (m, 2H), 4.24-4.21 (m, 1H), 3.83-3.63 (m, 1H), 3.61-3.51 (m, 3H), 2.23-2.17 (m, 2H).
実施例4
アミノ酸5の調製をスキーム3に示す。
40mLの水中の2,4−ジメトキシベンジルアミン(24.2g、144.7mmol)および酢酸(8.4g、140mmol)を、THF(80mL)中のtert−ブチル3−オキソアゼチジン−1−カルボキシレート(20g、116.8mmol)の溶液に追加した。5分後に、10mLの水中のシアン化ナトリウム(1.03g、116.8mmol)の溶液を追加し、混合物を60℃で15時間加熱した。冷却後に、反応混合物をEA(150mL*2)によって抽出した。有機物をブラインによって洗浄し、硫酸マグネシウムによって乾燥し、濾過して減圧下で濃縮した。もたらされた残さをシリカゲルカラムによってPE/EA=20/1〜5/1を用いて精製し、35gの生成物を淡黄色油として与えた(収率86.24%)。
エタノール(400mL)中の3−シアノ−3−(2,4−ジメトキシ−ベンジルアミノ)−アゼチジン−1−カルボン酸tert−ブチルエステル(35g、100mmol)の溶液にNaOH(12.09g、300mmol)を追加した。混合物を室温で16時間撹拌した。次にNaOHの水性溶液(200mL、5M)を追加し、混合物を90℃で2h撹拌した。LCMSによって出発物質が消費されたことが示された。室温まで冷却後に、残さを酢酸によってpH約6まで中性化した。沈殿物を濾過し、水によって洗浄し、減圧下で乾燥して30gの生成物(収率81.27%)を与えた。1HNMR (400 MHz, DMSO-d6, WH10085-004-1A)δ7.22 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 6.54 (s, 1H), 6.49 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 4.12-4.08 (m, 2H), 3.78-3.75 (m, 8H), 3.67 (s, 2H), 1.38 (s, 9H).
DCM(200mL)中の3−(2,4−ジメトキシ−ベンジルアミノ)−アゼチジン−1,3−ジカルボン酸モノ−tert−ブチルエステル(21g、57.31mmol)の溶液に、TMSCl(6.23g、57.31mmol)、FmocCl(14.83g、57.31mmol)、およびDIEA(14.81g、114.63mmol)を追加した。混合物を室温で30分間撹拌し、TLCおよびLCMSによって出発物質が消費されたことが示された。次に水を追加し、混合物をDCM(3×150mL)によって抽出した。組み合わせた有機層をsat.NaHCO3およびブラインによって洗浄し、MgSO4によって乾燥し、濃縮して残さを与え、これを直接的に次のステップに用いた。
CFCOOH(200mL)中の3−[(2,4−ジメトキシ−ベンジル)−(9H−フルオレン−9−イルメトキシカルボニル)−アミノ]−アゼチジン−1,3−ジカルボン酸モノ−tert−ブチルエステル(30g、51mmol)を60℃で16時間撹拌した。LCMSによって出発物質が消費されたことが示された。室温まで冷却後に、混合物を濃縮して残さを与え、これを直接的に次のステップに用いた。
THF(200mL)中の3−(9H−フルオレン−9−イルメトキシカルボニルアミノ)−アゼチジン−3−カルボン酸(30g、88.66mmol)の溶液に、sat.NaHCO(40mL)およびAlloc−Cl(11g、88.7mmol)を追加した。混合物を室温で30分間撹拌し、TLCおよびLCMSによって出発物質が消費されたことが示された。次に水を追加して、混合物をDCM(3×150mL)によって抽出した。組み合わせた有機層をsat.NaHCO、ブラインによって洗浄し、MgSOによって乾燥して濃縮した。残さをシリカゲルカラムによって精製して(DCM:MeOH=100:1〜5:1)、6.5gの生成物を与えた(3ステップの収率30.2%)。1HNMR (400 MHz, DMSO-d6): 7.89 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 7.68 (d, J = 7.2 Hz, 2H), 7.43-7.32 (m, 4H), 5.93-5.86 (m, 1H), 5.27 (d, J = 17.2 Hz, 1H), 5.16 (d, J = 14.4 Hz, 1H), 4.48 (d, J = 5.2 Hz, 2H), 4.33 (d, J = 6.4 Hz, 2H), 4.24 (t, J = 6.4 Hz, 1H), 4.12-4.00 (m, 4H). MS: m/z 445.2 [M+Na]+.
実施例5
ステープルドペプチドの調製
固相ペプチド合成:ペプチドは、Fmoc化学を用いて次の樹脂の1つを用いて調製した。Rink Amide MBHA、Rink Amide MBHA Low Loading、PAL-NovaSyn TG、NovaPEG Rink Amide樹脂、またはNovaPEG Rink Amide Low Loading樹脂。乾燥樹脂を典型的にはジクロロメタン中で、次にN−メチル−2−ピロリドン(NMP)中で使用前に膨潤させた。Fmoc保護基を、NMP中の25%(v/v)ピペリジンを用いて除いた(4×5min)。天然アミノ酸は、典型的には60分間4当量のFmoc保護したアミノ酸、カップリング試薬としての4当量の(1−シアノ−2−エトキシ−2−オキソエチリデンアミノオキシ)ジメチルアミノ−モルフォリノ−カルベニウムヘキサフルオロリン酸塩(COMU)、および塩基としての8当量のΝ,Ν−ジイソプロピルエチルアミン(DIPEA)を用いてカップリングした。非天然アミノ酸(例えば、S、Pyrおよびその他、例えば図10に示されているもの)は、典型的には120分間3当量のFmoc保護されたアミノ酸、カップリング試薬としての3当量の(1−シアノ−2−エトキシ−2−オキソエチリデンアミノオキシ)ジメチルアミノ−モルフォリノ−カルベニウムヘキサフルオロリン酸塩(COMU)、および塩基としての6当量のN,N−ジイソプロピルエチルアミン(DIPEA)を用いてカップリングした。NMPを用いて、樹脂(5×1min)を各カップリングおよび脱保護ステップ間に洗浄した。
N末端アセチル化:円偏光二色性分光法(CD)に用いたペプチドが調製され、自由なN末端またはアセチル化N末端を有した。N末端を固相上でアセチル化するためには、N末端Fmocを脱保護し、樹脂を続いてNMPによって洗浄した。アセチル化は、典型的には樹脂結合ペプチドを1〜2時間NMP中の20当量の無水酢酸および40当量のDIPEAの溶液によって処理することによって行った。反応の完了後に、樹脂を典型的にはNMP(5×1min)、DCM(3×1min)によって洗浄し、メタノールによって乾燥した。
フルオレセインイソチオシアネート異性体I(FITC)によるN末端標識:固相上でのFITCによる標識前に、Fmoc−β−アラニンを天然アミノ酸について上記の手順を用いてペプチドのN末端にカップリングした。N末端Fmocの続いての脱保護後に、樹脂結合ペプチドをNMP中の7当量のFITCおよび14当量のDIPEAの溶液によって4時間処理した。反応の完了後に、樹脂を典型的にはNMP(5×1min)、DCM(3×1min)によって洗浄し、メタノールによって乾燥した。
5−カルボキシフルオレセイン(FAM)によるN末端標識:固相上でのFAMによる標識前に、Fmoc−β−アラニンを天然アミノ酸について上記の手順を用いてペプチドのN末端にカップリングした。N末端Fmocの続いての脱保護後に、樹脂結合ペプチドを、典型的には8当量のFAM、8当量のΝ,Ν−ジイソプロピルカルボジイミド(DIC)、および8当量のHOBT・HOのNMP中の溶液によって2時間処理した。カップリング反応後に、樹脂をNMP(5×1min)によって洗浄し、その後にNMP中の25%ピペリジン(3×10min、または溶液が有色でなくなるまで)によって洗浄した。NMP中の25%ピペリジンによる最終洗浄後に、樹脂を典型的にはNMP(5×1min)、DCM(3×1min)によって洗浄し、メタノールによって乾燥した。
閉環メタセシス:閉環メタセシスは、固相上でN末端アセチルキャップまたはN末端Fmocを含有するペプチドを用い、次の一般的な手順を用いて実施した。樹脂を乾燥1,2−ジクロロエタン(DCE)中で少なくとも20分間膨潤させた。樹脂結合ペプチドを、次に(樹脂の初期量と相対的に)25モル%の第1世代グラブスメタセシス触媒(ベンジリデン−ビス(トリシクロヘキシルホスフィン)ジクロロルテニウム、ビス(トリシクロヘキシルホスフィン)ベンジリデンルテニウム(IV)ジクロリド)(DCE中におよそ8〜10mg/mLの濃度に溶解した)によって2時間処理した。一般的に、炭化水素ステープルドまたはallocステープルド生成物への完全な変換を達成するためには、触媒による2回または3回の処理を用いた。各処理間に、過剰な触媒をDCEによる洗浄(3×1min)によって除いた。触媒による最終処理後に、樹脂は典型的には複数回DCEによって洗浄し、複数回DCMによって洗浄し、メタノールによって乾燥した。
パラジウムによって触媒されるCO逆挿入:閉環メタセシスによって上の手順を用いて調製したallocステープルドペプチドを含有する樹脂を、乾燥ジクロロメタン(DCM)中で少なくとも20分間膨潤させた。樹脂を次におよそ5〜10mMの最終濃度まで乾燥DCM中に溶解した20〜40モル%(ステープル中に存在するカルバメートのモルと相対的に、樹脂の初期量と相対的に計算した)のPd(PPhによって15〜30分間処理した。典型的には、allocステープルド出発物質の完全な反応を保証するために2回の処理を実施した。各処理間に、樹脂を乾燥DCM(3×1min)によって洗浄した。
ペプチドの切断/脱保護および精製:側鎖保護基を除き、次の手順を用いて同時にペプチドを樹脂から切断した。乾燥樹脂をトリフルオロ酢酸:トリイソプロピルシラン:水(95:2.5:2.5)の溶液によって3時間処理した。インキュベーションの完了後に、溶液の体積をN2(g)の流れ下における蒸発によって減少させ、もたらされた残さを冷ジエチルエーテルによって処理した。沈殿したペプチドを遠心分離によってペレット化し、上清を傾瀉し、ペレットを風乾した。粗製ペプチドは典型的にはアセトニトリル:水の1:1溶液中に溶解し、次に逆相HPLCによって0.1%(v/v)トリフルオロ酢酸を含有するアセトニトリルおよび0.1%(v/v)トリフルオロ酢酸を含有する水を移動相の成分として用いて精製した。HPLC画分の純度をLC/MSによって評価し、きれいな画分を集め、speedvacによって濃縮した。ペプチドを次に乾燥状態まで凍結乾燥した。
液体クロマトグラフィー−質量分析(LC/MS):精製したAllocステープルドおよびアミノステープルドペプチドを、逆相LC/MSによってAgilent社1260シリーズ装置およびZorbax社SB-C18カラムを用いて分析した。移動相はアセトニトリルおよび水の勾配からなり、両方とも0.1%(v/v)トリフルオロ酢酸を含有した。
表9は、(陽イオンまたは陰イオンモードによる)LC/MSからのエレクトロスプレー質量スペクトルデータを例示的なペプチドについて提供している。
実施例6
ステープルドペプチドの特徴づけ
円偏光二色性(CD)分光法:CDスペクトル(図11A〜11D)は、未標識ペプチドを用いて10mMリン酸ナトリウム(pH7.0)緩衝液中で得た。生データは、モル楕円率の濃度とは独立の単位に変換した。αヘリックスは、典型的には2つの最小値をおよそ208nmおよび222nmに、最大値をおよそ192nmに示す。図11Dにおいては、同じ質量を有する2つの明確なLC/MSピークがAc−PM2のPyr/PyrのAllocステープルドペプチドについて見いだされた。これらは、ステープル中のオレフィンのEおよびZ異性体におそらく対応している。両方のペプチドはαヘリックスであるが、1つの異性体は微かにより高いαヘリックス性を示す。
蛍光偏光(FP)結合試験データ:p53−4、p53−8、およびPM2ペプチド配列は全てE3ユビキチンリガーゼHDM2のp53動員ポケットに結合することが公知である。それらの結合実験では、HDM2(残基17〜125)のヘキサヒスチジンタグ版をE.coli中で発現させて、>90%の純度まで精製した。標準的な蛍光偏光試験を用いて、このHDM2構築物へのFITC標識ペプチドの結合を検討した。試験は室温で実施し、用いた緩衝液は50mMのTRIS(pH8.0)、140mMのNaCl、5mMのβ−メルカプトエタノールであった。図12A〜12Kに示すエラーバーは二重実験の標準偏差である。各プロットにおいて指示されている解離定数(K)は、データをヒルの式に対してフィッティングすることによって見いだされた。
共焦点顕微鏡法による細胞貫入:Pen/Strepを含むDMEM/10%FBS中で増殖したHeLa細胞を10μΜのFITC標識ペプチドによって37℃で3.5時間処理し、次に洗浄して、パラホルムアルデヒドによって固定した。標識ペプチドの細胞内蓄積(図13A〜13C)を次に20×対物を用いてオリンパスFV300共焦点蛍光顕微鏡によってイメージングした。
フローサイトメトリーによる細胞貫入:Pen/Strepを含むRPMI−1640/10%FBS中で増殖したJurkat細胞を5μΜのFITC標識ペプチドによって37℃で4時間処理し、次に複数回洗浄して、ヨウ化プロピジウムを含有するPBS中に懸濁した。標識ペプチドの細胞内蓄積を次にフローサイトメトリーによって分析した。死細胞はヨウ化プロピジウムについて陽性であり、分析から除いた。試料は二重で実施した。平均の細胞蛍光を図14Aに示す。
Pen/Strepを含むEMEM/10%FBS中で増殖したHela細胞を5μΜのFAM標識ペプチドによって37℃で4時間処理し、次に複数回洗浄して、ヨウ化プロピジウムを含有するPBS中に懸濁した。標識ペプチドの細胞内蓄積を次にフローサイトメトリーによって分析した。死細胞はヨウ化プロピジウムについて陽性であり、分析から除いた。試料は二重または三重で実施した。平均の細胞蛍光を図14Bに示す。
均等物および範囲
特許請求の範囲において、冠詞、例えば「a」、「an」、および「the」は、逆に指示されていないかまたは文脈から別様に明らかでない限り、1つまたは1つよりより多くを意味し得る。「または」を群の1つまたは2つ以上のメンバー間に含む請求項または記載は、群のメンバーの1つ、1つより多く、または全てが所与の生成物またはプロセスにおいて存在する、用いられる、または別様に関係する場合には、逆に指示されていないかまたは文脈から別様に明らかでない限り満たされていると考えられる。本発明は、所与の生成物またはプロセスにおいて群の正確に1つのメンバーが存在する、用いられる、または別様に関係する態様を含む。本発明は、所与の生成物またはプロセスにおいて群のメンバーの1つより多くまたは全てが存在する、用いられる、または別様に関係する態様を含む。
さらに、本発明は、挙げられた請求項の1つまたは2つ以上からの1つまたは2つ以上の限定、要素、節、および説明用語が別の請求項に導入される、全ての変形、組み合わせ、および並びかえを包含する。例えば、別の請求項に依存的ないずれかの請求項は、同じ元の請求項に依存的ないずれかの他の請求項に見いだされる1つまたは2つ以上の限定を含むように改変され得る。要素がリストとして、例えばマーカッシュ群形式で示されている場合には、要素の各下位群もまた開示されるものであり、いずれかの要素(単数または複数)は群から除かれ得る。当然のことながら、一般的に、本発明または本発明の態様が具体的な要素および/または特徴を含むと言う場合には、本発明のある態様または本発明のある側面は、かかる要素および/または特徴からなるかまたは本質的になる。簡単の目的のために、それらの態様は本明細書において一々具体的には示されなかった。尚、用語「を含む」および「を含有する」は開放的であることが意図されており、追加の要素またはステップの包含を許す。範囲が与えられている場合には、エンドポイントは含まれる。さらに、別様に指示されないかまたは文脈および当業者の理解から別様に明らかでない限り、範囲として表された値は、文脈が明らかに別様に指示しない限り、記載の範囲内のいずれかの具体的な値または部分範囲を、本発明の異なる態様において範囲の下限の単位の1/10までとり得る。
本願は、種々の登録済み特許、公開済み特許願、雑誌記事、および他の公開を参照しているが、その全体は参照によって本明細書に組み込まれる。組み込まれた参照物のいずれかと本明細書との間に矛盾がある場合には、本明細書が制御する。加えて、従来技術に属する本発明のいずれかの具体的な態様は、請求項のいずれか1つまたは2つ以上から明確に除外され得る。かかる態様は当業者に公知であると考えられるので、その除外が本明細書において明確に示されていない場合であっても、除外され得る。本発明のいずれかの具体的な態様は、従来技術の存在に関するか否かにかかわらず、いずれかの理由で、いずれかの請求項から除外され得る。
当業者は、ごく通常の実験を用いて、本明細書に記載の具体的な態様の多くの均等物を認識するかまたは確認することが可能であろう。本明細書に記載の本発明の態様の範囲は、上の発明を実施するための形態に限定されることを意図されておらず、正しくは添付の特許請求の範囲において示される通りとする。当業者には当然のことながら、本明細書に対する種々の変更および改変が、次の特許請求の範囲において定義される本発明の趣旨または範囲から逸脱することなく作られ得る。

Claims (47)

  1. のそれぞれの場合は独立して単結合または二重結合を表し、
    のそれぞれの場合は独立して水素、アシル、置換もしくは無置換C1−6アルキル、またはアミノ保護基であり、
    2aおよびR2bのそれぞれは独立して置換もしくは無置換アルキル、置換もしくは無置換アルケニル、置換もしくは無置換アルキニル、置換もしくは無置換ヘテロアルキル、置換もしくは無置換カルボシクリル、置換もしくは無置換ヘテロシクリルであり、
    3aおよびR3bのそれぞれは独立して置換もしくは無置換アルキレン、無置換ヘテロアルキレン、置換もしくは無置換カルボシクリレン、または置換もしくは無置換ヘテロシクリレンであるか、あるいは任意に、R 2a 、R 3a 、ならびに2aおよびR3a が結合された炭素が連結されて環を形成するか、あるいは任意に、R 2b 、R 3b 、ならびに2bおよびR3b が結合された炭素が連結されて環を形成し、
    ここで、R 2a 、R 3a 、R 2b およびR 3b については、R 2a 、R 3a 、ならびにR 2a およびR 3a が結合された炭素が連結されて環を形成するか、R 2b 、R 3b 、ならびにR 2b およびR 3b が結合された炭素が連結されて環を形成するかの、少なくとも一方の条件を満たし、
    は独立して結合、置換もしくは無置換C1−10アルキレン、または−C(=O)ORL1−であり、
    は独立して結合、置換もしくは無置換C1−10アルキレン、または−C(=O)ORL2−であり、
    ここで−R3a−L−および−R3b−L−の少なくとも1つは、アミノ基またはカルバメート基を含み、
    L1およびRL2のそれぞれは独立して任意置換C1−10アルキレンであり、
    は独立して−R、−OR、−N(R、または−SRであり、Rのそれぞれの場合は独立して水素、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の脂肪族、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のへテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、アシル、樹脂、ヒドロキシル、アミノ、またはチオール保護基であるか、あるいは2つのR基が一緒になって5〜6員ヘテロ環式またはヘテロ芳香族環を形成し、
    は独立して水素、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の脂肪族、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のへテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、アシル、樹脂、アミノ保護基、任意にリンカーによって連結された標識であり、リンカーは環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のアルキレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のアルケニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のアルキニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のヘテロアルキレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のヘテロアルケニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のヘテロアルキニレン、アリーレン、ヘテロアリーレン、またはアシレンから選択されるか、あるいはRおよびR が一緒になって5〜6員ヘテロ環式もしくはヘテロ芳香族環を形成し、
    AAのそれぞれの場合は独立してアミノ酸であり、
    mは独立して2〜6の整数であり(両端を含む)、
    pおよびnのそれぞれの場合は独立して0または1〜100の整数であり(両端を含む)、
    qは独立して1〜10の整数である(両端を含む)、
    式(I)のポリペプチド、またはその医薬的に許容される塩。
  2. ポリペプチドが式(III)もしくは式(IV)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    式(III)中、X は−N−であり、かつ、X は結合、−CR −、または−NR −であり、
    式(IV)中、X は結合、−CR −、または−NR −であり、かつ、X は−N−であり、
    は独立して水素、アシル、置換もしくは無置換C1−6アルキル、またはアミノ保護基であり、
    およびRのそれぞれは独立して水素、ハロゲン、−NO、−OH、−CN、またはC1−6アルキルであり、
    j、k、j1、およびk1のそれぞれは独立して0〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項1に記載のポリペプチド。
  3. ポリペプチドが式(III−a)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    j、k、およびj1のそれぞれは独立して0〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項に記載のポリペプチド。
  4. ポリペプチドが式(III−a−1)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    j、k、およびj1のそれぞれは独立して0〜10の整数であり(両端を含む)、
    gおよびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項に記載のポリペプチド。
  5. ポリペプチドが式(III−a−2)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    j、k、およびj1のそれぞれは独立して0〜10の整数であり(両端を含む)、
    gおよびh1のそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項に記載のポリペプチド。
  6. ポリペプチドが式(III−b)、
    またはその医薬的に許容される塩である、
    請求項に記載のポリペプチド。
  7. ポリペプチドが式(III−b−1)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    gおよびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項に記載のポリペプチド。
  8. ポリペプチドが式(III−b−2)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    g1およびh1のそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項に記載のポリペプチド。
  9. ポリペプチドが式(III−b−3)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    gおよびh1のそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項に記載のポリペプチド。
  10. ポリペプチドが式(III−b−4)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    g1およびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項に記載のポリペプチド。
  11. ポリペプチドが式(III−c)、
    またはその医薬的に許容される塩である、
    請求項に記載のポリペプチド。
  12. ポリペプチドが式(III−c−1)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    gおよびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項に記載のポリペプチド。
  13. ポリペプチドが式(III−c−2)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    g1およびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項に記載のポリペプチド。
  14. ポリペプチドが式(IV−a)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    j、k、およびk1のそれぞれは独立して0〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項1に記載のポリペプチド。
  15. ポリペプチドが式(IV−a−1)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    gおよびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項14に記載のポリペプチド。
  16. ポリペプチドが式(IV−a−2)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    およびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項14に記載のポリペプチド。
  17. ポリペプチドが式(IV−b)、
    またはその医薬的に許容される塩である、請求項に記載のポリペプチド。
  18. ポリペプチドが式(IV−b−1)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    gおよびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項17に記載のポリペプチド。
  19. ポリペプチドが式(IV−b−2)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    およびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項17に記載のポリペプチド。
  20. ポリペプチドが式(IV−b−3)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    およびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項17に記載のポリペプチド。
  21. ポリペプチドが式(IV−b−4)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    gおよびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項17に記載のポリペプチド。
  22. ポリペプチドが式(IV−c)、
    またはその医薬的に許容される塩である、請求項に記載のポリペプチド。
  23. ポリペプチドが式(IV−c−1)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    gおよびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項22に記載のポリペプチド。
  24. ポリペプチドが式(IV−c−2)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    gおよびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項22に記載のポリペプチド。
  25. ポリペプチドが式(V)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    およびX のそれぞれは独立して−N−または−CR であり、
    は独立して水素、ハロゲン、−NO 、−OH、−CN、またはC 1−6 アルキルであり、
    j、k、j1、およびk1のそれぞれは独立して0〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項1に記載のポリペプチド。
  26. ポリペプチドが式(V−b)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    j、k、j1、およびk1のそれぞれは独立して0〜10の整数であり(両端を含む)、
    gおよびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項1に記載のポリペプチド。
  27. ポリペプチドが式(V−b−1)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    j、k、j1、およびk1のそれぞれは独立して0〜10の整数であり(両端を含む)、
    g1およびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項に記載のポリペプチド。
  28. ポリペプチドが式(V−c)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    j、k、j1、およびk1のそれぞれは独立して0〜10の整数であり(両端を含む)、
    gおよびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項1に記載のポリペプチド。
  29. ポリペプチドが式(V−c−1)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    j、k、j1、およびk1のそれぞれは独立して0〜10の整数であり(両端を含む)、
    gおよびh1のそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項に記載のポリペプチド。
  30. ポリペプチドが式(V−d)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    j、k、j1、およびk1のそれぞれは独立して0〜10の整数であり(両端を含む)、
    gおよびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項1に記載のポリペプチド。
  31. ポリペプチドが式(V−d−1)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    j、k、j1、およびk1のそれぞれは独立して0〜10の整数であり(両端を含む)、
    g1およびh1のそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項に記載のポリペプチド。
  32. ポリペプチドが式(V−d−2)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    j、k、j1、およびk1のそれぞれは独立して0〜10の整数であり(両端を含む)、
    gおよびh1のそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項に記載のポリペプチド。
  33. ポリペプチドが式(V−d−3)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    j、k、j1、およびk1のそれぞれは独立して0〜10の整数であり(両端を含む)、
    g1およびhのそれぞれは独立して0または1〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項に記載のポリペプチド。
  34. のそれぞれの場合は独立して単結合、二重結合、または三重結合を表し、
    のそれぞれの場合は独立して水素、アシル、置換もしくは無置換C1−6アルキル、またはアミノ保護基であり、
    2aおよびR2bのそれぞれは独立して置換もしくは無置換アルキル、置換もしくは無置換アルケニル、置換もしくは無置換アルキニル、置換もしくは無置換ヘテロアルキル、置換もしくは無置換カルボシクリル、置換もしくは無置換ヘテロシクリルであり、
    3aおよびR3bのそれぞれは独立して置換もしくは無置換アルキレン、無置換ヘテロアルキレン、置換もしくは無置換カルボシクリレン、または置換もしくは無置換ヘテロシクリレンであるか、あるいは任意に、R 2a 、R 3a 、ならびに2aおよびR3a が結合された炭素が連結されて環を形成するか、あるいは任意に、R 2b 、R 3b 、ならびに2bおよびR3b が結合された炭素が連結されて環を形成し、
    ここで、R 2a 、R 3a 、R 2b およびR 3b については、R 2a 、R 3a 、ならびにR 2a およびR 3a が結合された炭素が連結されて環を形成しているか、R 2b 、R 3b 、ならびにR 2b およびR 3b が結合された炭素が連結されて環を形成しているかの、少なくとも一方の条件を満たし、
    は独立して結合、置換もしくは無置換C1−10アルキレン、または−C(=O)ORL1−であり、
    は独立して結合、置換もしくは無置換C1−10アルキレン、または−C(=O)ORL2−であり、RL1およびRL2のそれぞれは独立して任意置換C1−10アルキレンであり、
    ここで−R3a−L−および−R3b−L−の少なくとも1つは、アミノ基またはカルバメート基を含み、
    は独立して−R、−OR、−N(R、または−SRであり、Rのそれぞれの場合は独立して水素、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の脂肪族、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のへテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、アシル、樹脂、ヒドロキシル、アミノ、またはチオール保護基であるか、あるいは2つのR基が一緒になって5〜6員ヘテロ環式もしくはヘテロ芳香族環を形成し、
    は独立して水素、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐の脂肪族、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のへテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、アシル、樹脂、アミノ保護基、任意にリンカーによって連結された標識であり、リンカーは環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のアルキレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のアルケニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のアルキニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のヘテロアルキレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のヘテロアルケニレン、環式もしくは非環式の分岐もしくは非分岐のヘテロアルキニレン、アリーレン、ヘテロアリーレン、またはアシレンから選択されるか、あるいはRおよびRが一緒になって5〜6員ヘテロ環式もしくはヘテロ芳香族環を形成し、
    AAのそれぞれの場合は独立してアミノ酸であり、
    pおよびnのそれぞれの場合は独立して0または1〜100の整数であり(両端を含む)、
    mおよびsのそれぞれは独立して2〜6の整数であり(両端を含む)、
    q、t、y、およびzのそれぞれは独立して1〜10の整数である(両端を含む)、
    式(VI)のポリペプチド、またはその医薬的に許容される塩。
  35. ポリペプチドが式(VIII)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    は−N−であり、X は結合、−CR −、または−NR −であり、R およびR のそれぞれは独立して水素、ハロゲン、−NO 、−OH、−CN、またはC 1−6 アルキルであり、
    j、k、およびj1のそれぞれは独立して0〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項34に記載のポリペプチド。
  36. ポリペプチドが式(IX)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    は結合、−CR −、または−NR −であり、X は−N−であり、R およびR のそれぞれは独立して水素、ハロゲン、−NO 、−OH、−CN、またはC 1−6 アルキルであり、
    j、k、およびk1のそれぞれは独立して0〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項34に記載のポリペプチド。
  37. ポリペプチドが式(X)、
    またはその医薬的に許容される塩であり、
    およびX のそれぞれは独立して−N−または−CR −であり、R は水素、ハロゲン、−NO 、−OH、−CN、またはC 1−6 アルキルであり、
    j、k、j1、およびk1のそれぞれは独立して0〜10の整数である(両端を含む)、
    請求項34に記載のポリペプチド。
  38. 請求項1〜37のいずれか1項に記載のポリペプチドおよび医薬的に許容される添加剤を含む、組成物。
  39. 障害を治療する際の使用のための、請求項1〜37のいずれか1項に記載のポリペプチド。
  40. 方法が、
    (i)式(A)のアミノ酸、
    またはその塩を提供するステップと、
    (ii)式(B)のアミノ酸、
    またはその塩を提供するステップと、
    (iii)少なくとも1つのアミノ酸を提供することが、天然アミノ酸および非天然アミノ酸からなる群から独立して選択されるステップと、
    (iv)式(A)および(B)ならびに任意に(iii)のアミノ酸をカップリングするステップと、
    を含み、
    ここで、R 2a 、R 3a 、ならびにR 2a およびR 3a が結合された炭素が連結されて環を形成しているか、または、R 2b 、R 3b 、ならびにR 2b およびR 3b が結合された炭素が連結されて環を形成している、
    請求項1に記載のポリペプチドを作る方法。
  41. ステップ(iii)のポリペプチドを触媒によって処理するステップをさらに含む、請求項40に記載の方法。
  42. 触媒がルテニウム触媒である、請求項41に記載の方法。
  43. ポリペプチドを処理するパラジウム触媒のステップをさらに含む、請求項42に記載の方法。
  44. 方法が、
    (i)式(C)のビスアミノ酸
    を提供するステップと、
    (ii)式(A)のアミノ酸、
    またはその塩を提供するステップと、
    (iii)式(B)のアミノ酸、
    またはその塩を提供するステップと、
    (iv)少なくとも1つのアミノ酸を提供するステップと、
    (v)(A)、(B)、および(C)、ならびに任意に(iv)のアミノ酸をカップリングするステップと、
    を含み、
    ここで、R 2a 、R 3a 、ならびにR 2a およびR 3a が結合された炭素が連結されて環を形成しているか、または、R 2b 、R 3b 、ならびにR 2b およびR 3b が結合された炭素が連結されて環を形成している、
    請求項34に記載のポリペプチドを作る方法。
  45. ステップ(v)のポリペプチドを触媒によって処理するステップをさらに含む、請求項44に記載の方法。
  46. 触媒がルテニウム触媒である、請求項45に記載の方法。
  47. (v)のポリペプチドをパラジウム触媒によって処理するステップ(vi)をさらに含む、請求項46に記載の方法。
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