JP6540710B2 - 速い解離速度の相互作用カイネティクスの決定方法 - Google Patents
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Description
R=Yhigh/x
未満の反応データを除外することによってなされる。
式中、Rは、その値未満ではアルゴリズムが解離相データをフィッティングから除外するRU単位の反応であり、
Yhighは、各曲線の解離相におけるベースラインに比して最も高い反応であり、
xは、ユーザーユーザーによって設定或いはプログラムソフトウェアにコードされた任意の数である。
(a)分析物を含有する溶液を、光センサ表面に固定化された固定化リガンド又はその類似物に接触させるステップと、
(b)固定化リガンド又は類似物に対する溶液中の分析物の結合をモニターするステップであって、結合を表面の特性の変化として測定するステップと、
(c)相互作用カイネティクスを自動的に測定するステップであって、測定ステップが、フィッティング用のカイネティクス情報を含む解離相の部分を最初に規定することを含むステップと、
を含む、分析物に対する相互作用カイネティクス測定方法に関する。
この式を変形すると次の式が得られる。
dA/dt=kt×(Conc−A)−(ka×A×B−kd×AB)
式中、Aは、センサ表面における分析物の濃度、
Bは、固定化相互作用物、
Concは、注入された分析物の濃度である。
B[0]=Rmax
dB/dt=−(ka×A×B−kd×AB)
AB[0]=0
dAB/dt=(ka×A×B−kd×AB)
全反応:
AB+RI
式中、RIは、試料とランニング緩衝液との間の屈折率不整合である。
rfは、所与の点におけるフィッティングさせた値であり、
rxは、同じ点における実験値であり、
nは、データポイント数である。
フィッティングの近似度は、カイ二乗の統計値で表すことができる。
rxは、同じ点における実験値であり、
nは、データポイント数であり、
pは、フィッティングさせたパラメータの数である。
センサーグラムのデータでは、データポイント数は、このモデルにおける、フィッティングさせたパラメータの数よりも非常に多く、
式中、Rは、その値未満ではアルゴリズムが解離相データをフィッティングから除外するRU単位の反応であり、
Yhighは、各曲線の解離相におけるベースラインに比して最も高い反応であり、
xは、ユーザーユーザーによって設定或いはプログラムソフトウェアにコードされた任意の数である。このようにして、x=20の場合、Rが、最も大きい反応の5%未満であるデータは、フィッティングから除外される。適切な数xを設定することに注意が払われるべきである。この数が大きすぎると、曲線にドリフトがある場合に影響を受けることがあり、この数が小さすぎると、有用なデータが意図せずに除外されることがある。
Claims (11)
- 分析物に対する相互作用カイネティクスを求める方法であって、
(a)分析物を含有する溶液を、光センサ表面に固定化された固定化リガンド又はその類似物に接触させるステップと、
(b)固定化リガンド又は類似物に対する溶液中の分析物の結合をモニターするステップであって、少なくとも前記リガンド又はその類似物と前記分析物との間の解離相を示す表面の特性の変化として前記結合を測定する、モニターするステップと、
(c)相互作用カイネティクスを自動的に測定するステップであって、前記特性の変化から得られたデータを用いて解離相を表し且つフィッティング用のカイネティクス情報を含むデータの部分を最初に規定することを含む、測定ステップと
を含む方法。 - リガンド又はその類似物が一連の表面に固定化される、請求項1に記載の方法。
- 光センサ表面が、エバネッセント波センシングに基づく検出器の一部分である、請求項1又は2に記載の方法。
- エバネッセント波センシングが、表面プラズモン共鳴に基づく、請求項1乃至3のいずれか1項に記載の方法。
- フィッティング用のカイネティクス情報を含む解離相の部分を規定するステップが、
R=Yhigh/x
未満の反応データを除外することによってなされる、請求項1乃至4のいずれか1項に記載の方法。
式中、Rは、その値未満ではアルゴリズムが解離相データをフィッティングから除外するRU単位の反応であり、
Yhighは、各曲線の解離相におけるベースラインに比して最も高い反応であり、
xは、ユーザーユーザーによって設定或いはプログラムソフトウェアにコードされた任意の数である。 - xが20である、請求項5に記載の方法。
- フィッティング用のカイネティクス情報を含む解離相の部分を規定するステップが、R=0(ベースライン)未満の反応データを除外することによってなされる、請求項1乃至4のいずれか1項に記載の方法。
- フィッティング用のカイネティクス情報を含む解離相の部分を規定するステップが、R=x(xは、ユーザーユーザーによって設定或いはプログラムにコードされた数である)未満の反応データを除外することによってなされる、請求項1乃至4のいずれか1項に記載の方法。
- 測定ステップが、ドリフト、外乱又は単独異常曲線を調整するステップをさらに含む、請求項1乃至8のいずれか1項に記載の方法。
- 分子相互作用を研究するための解析システムであって、請求項1乃至9のいずれか1項に記載の相互作用カイネティクス測定方法のステップを実行するためのプログラムコード手段を含むコンピューター処理手段を備える、解析システム。
- コンピュータープログラム製品であって、コンピューター可読媒体に格納或いは電気信号又は光信号で搬送される、請求項1乃至9のいずれか1項に記載の方法のステップを実行するためのプログラムコード手段を備える、コンピュータープログラム製品。
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