JP6506842B2 - マイクロトモグラフィにおける容器内で画像化された試料のビーム・ハードニング・アーチファクトの補正 - Google Patents
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関連出願の相互参照
本出願は、2014年8月16日に出願された「Tomographic Reconstruction for Material Characterization」という名称の米国特許仮出願第62/038,263号の優先権を主張するものである。
以下に記載される研究は、岩石試料を模擬する合成物体の数値解析に基づく。この試料は、表1に記載された材料データベースを使用してモデル化される。この数値試料は、異なる球形鉱物粒がランダムに充填された円筒容器からなる。選択した鉱物組成は、石英60%、カオリナイト20%、方解石20%である。分析物体は、再構成されたデータと比較するために、N3ボクセル・体積にラスタ化される(すなわち、N3は、再構成された体積・サイズに対応する)。図1(a)〜(c)は、本明細書の技法を用いて調べられた合成物体の図であり、表1に示されたラベルで陰影付けされたその物体のZ(x)体積の2D中心スライスおよびρ(x)体積の2D中心スライス、ならびに3D多平面レンダリングを示す図である。模擬物体のこれらの図では、(a)が、物体Z(x)体積の中心スライスを示し、(b)が、物体ρ(x)体積の中心スライスを示し、(c)が、5123個のボクセル・体積に画像化された物体の3D視覚化を示す。
確立された反復期待値最大化(EM)アルゴリズムは、一組の放射線写真から試料の3D構造体積を提供する断層撮影再構成の幅広いクラスを指す。所与の試料μに基づく測定値Rを観察するp(R|μ)で示される期待値は、下式によって定義することができるポアソン分布に従う。
μE1(x)およびμE2(x)をそれぞれ、エネルギーE1およびE2における2つの取得から標準OSCアルゴリズムを用いて再構成された断層像とする。以下の式系のうちの一方の式系をそれぞれのボクセルxで解くことによって、体積対(Z,ρ)または([Znρ],ρ)を回復することができる。
本明細書において、(Z,ρ)体積および([Znρ],ρ)体積から材料ラベル付けを実行することができることが分かった。後者は、ρ体積の雑音によって限定されないという利点を有する。しかしながら、前項で詳述したマッチング・プロセスは断層撮影再構成後に実行されるが、このプロセスを、反復再構成技法中に実行することもでき、アルゴリズムの後続の反復中に、誤ったマッチングを補正することができる。したがって、次に、修正されたデュアル・エネルギーOSCアルゴリズムについて詳述する。このアルゴリズムは、([Znρ],ρ)体積の再構成に基づき、それぞれの反復でのボクセルの制約付き更新を含む。この更新は、再構成中のそれぞれのボクセルを、データベース内の最も確からしい材料により近づける。
上で論じた断層撮影セグメント化技法とともに、本発明のいくつかの実施形態は、改良された参照なし多材料ビーム・ハードニング補正法を提供する。この方法は、地質学的材料の3次元画像化向けのデータ品質を維持することに重点を置いており、また、自動化を見据えている。この技法は、他の分野にも適用することができる。このビーム・ハードニング補正技法は、上で論じた再構成および材料識別技法と組み合わせて適用することができ、または、その代わりに、他の再構成技法を使用して独立して適用することもできる。この補正を積分減衰空間で適用する参照なしポスト再構成(RPC)補正技法が提供される。ビーム・ハードニング補正法に必要なセグメント化プロセスの自動化を可能にする容器のみ前補正技法も提供される。この方法は、プロセスのさまざまな段階で、材料ライブラリを参照する技法を含むさまざまなセグメント化技法を使用することができる。
RPC技法の概要
ここで提示する、下記の技法のベースとして使用されるRPC法は、上で論じたKrumm他の方法とは異なる。この方法は、Krumm他の技法がしたように強度空間(I/I0)で補正を適用するのではなく、積分減衰空間(R)で補正を適用する。R空間を使用することには明確ないくつかの利点があることを本発明の発明者は見出した。それらの利点を以下に示す。本明細書では、本明細書においてRPC法と言うとき、それは一般に、減衰空間で適用するように修正された方法を指す。しかしながら、これは限定を意図したものではなく、本明細書に記載された技法のうちのいくつかの技法は、強度空間を使用する先行するRPC技法ととともに使用しても利益を得ることができる。したがって、本明細書の説明は、下記のさまざまな技法と個別に組み合わされたいずれの手法の使用をもサポートすると解釈すべきである。
Krumm他は、強度空間で適用されるKrumm他のRPC法が、ある範囲の試料タイプに関して、全ての材料(相)が互いから正確に区別されるときに非常によく機能することを示した。しかしながら、しばしば、μCT分析の目標は異なる相の分離であり、オリジナルの画像上で正確なセグメント化が可能な場合には補正は必要ない。補正に対して不正確なセグメント化が使用されると、その結果として新たなアーチファクトが導入されうる。これが起こるのは、相1が、相2とは異なる量の補正を必要とする場合に、相2として誤って識別された相1の領域が、相1の他の領域とは異なって補正され、誤って識別された相1の領域がもはや、相1の他の領域に似ていないということがあるためである。したがって、KrummのRPC法などの補正法は、実際の特徴から区別できないアーチファクトを導入することがあるため、それらの補正法を使用するときには十分に注意しなければならない。
検討する最初の試料は、0.3mmの平らなアルミニウム・シートをフィルタとして使用して、直径5mmのベントハイム砂岩を80kVで画像化した実験データである。このフィルタは、このような試料のビーム・ハードニングを軽減する目的には不十分である。図8は、異なるセグメント化に対するこの補正法の効果を示すために使用された実験砂岩試料の一連の断面を示す。図8(a)は、この砂岩の再構成された2次元スライスを示し、図8(b)には、ビーム・ハードニングのアーチファクトであるこの岩石のカッピング・アーチファクトを強調するためにコントラストが調整されたこの同じスライスが示されている。この実施形態は、内部セグメント化を実行して細孔空間を分離することによってビーム・ハードニング補正を実行するのではなしに、この砂岩試料全体を、空気とケイ素とからなる1つの相として取り扱うことによってビーム・ハードニング補正を実行する。このプロセスでは、ある量の空気−ケイ素相を通過する全ての放射線が同様の量のビーム・ハードニングを受けると仮定する。
2つの材料:試料および容器を仮定した補正
次に、非常に減衰性の高いチタン容器内の石英岩石試料の場合を表す模擬データを考える。図9(a)〜(b)は、チタン容器内の模擬ケイ素試料の断面を示す。図9(a)は、アメリカ国立標準技術研究所(NIST)から入手したケイ素およびチタンの減衰係数を使用して異なるエネルギーの多数の再投影を1つにまとめることによって生成されたこの手順のシミュレーションを示す。図9(a)に示されているように、このビーム・ハードニングは、容器の内縁の付近に明るいハロー効果を生じさせた。このハローは、岩石の周囲の空気をセグメント化するときに、特にそのセグメント化が自動的に試みられる場合に課題を提起する。容器自体は、例えば強度値に対して自動k平均クラスタリングを使用することによって簡単にセグメント化することができる。容器の内部のセグメント化を回避するため、容器を単一の相とみなす。明瞭にするため、このプロセスは、画像を2つの領域にセグメント化する。容器が第1の相であり、容器の内側のあらゆるものが1つのグループとしてグループ分けされ、もう一方の相として取り扱われる。次いでRPC法が適用される。その後の補正が図9(b)に示されている。図9(c)の強度線図は、容器相においてはカッピング・アーチファクトが除去されたことを示している。このことは、その領域内のグレー値の線が平らであることによって示されている。
容器のみ補正
容器の内部を単一の相として取り扱う技法、または上で論じたように集塊相を使用する技法に加えて、容器だけが存在する場合に、すなわち同じ容器が試料ではなく空気で満たされている場合に適用されるであろう補正を検討することは、自動化プロセスにとって有利である。これを実行するためには、このプロセスが、同じ多色ビームによって空の容器を画像化した場合に生じるであろう減衰を近似しなければならない。したがって、このプロセスは、容器の中心を通過するX線を無視すべきである。それらのX線は試料によってエネルギーが高くなることがあり、空の容器を表さないためである。そのために、このプロセスは、容器のサイズおよび形状に関する情報を有していなければならない。このような情報は、初期断層像上でセグメント化を実施することによって得ることができ、または、使用される容器を記述した予め定められた容器形状データを受け取ることによって得ることもできる。このようなデータは減衰データも含むことができる。
本明細書の議論は、1つの材料として取り扱うことができるかなり一様に不均質な試料を含む手順を考慮している。しかしながら、時には、相間の相対的なコントラストが変化するという欠点があるにも関わらず、画像の残りの部分に対してそれらが有する不明瞭にする効果のためにセグメント化する必要がある材料が試料内にあることがある。これは特に、画像化されたときにストリーキング・アーチファクトを生じさせる減衰性の高い材料、例えば砂岩中の高密度黄鉄鉱包有物に当てはまる。本発明の発明者のシミュレーションでは、5つの鉄包有物を含めることにより、上記の技法を用いてこれを模擬した。これは、補正なしでは、図13(a)に示されているように重大なストリーキング効果を引き起こす。
「参照なしポスト再構成補正(RPC)」の項で述べたとおり、このRPC補正は、Krumm他の論文で実行されたように強度空間(I空間)で適用されるのではなく、減衰空間(R空間)で適用された。試料がその成分材料に完璧にセグメント化された場合、補正空間の選択は重要ではなく、両方の補正が同じ結果を生み出す。これらの2つの方法の主な違いは、超平面適合の勾配が持つ補正に対する影響である。どちらの方法の場合も、それぞれの方向の勾配が、それぞれの相に対する平均グレースケール値を決定する。R空間補正に関しては、相内のコントラストが任意の勾配に対して一定であり続ける。すなわち、細孔空間が、岩石と同じ相にグループ分けされる場合、岩石と細孔の間の平均絶対グレースケール差はほぼ一定のままである。I空間補正の場合には、相間のコントラスト変化に整合するように相内のコントラストが変化する。すなわち、コントラストの全体的な一貫性が維持される。しかしながら、このことは、Rmono適合に対して「正しい」勾配があることも意味し、他の任意の平面が当てはめられた場合、結果は、特に相内のコントラスト変化に関して劣化する。このことは、R空間補正が、不正確なセグメント化に対してより堅牢であることを意味するが、R空間補正には、相内および独立した相間のコントラストの欠点(または潜在的な利点)が付属する。多数の材料を単一の相としてグループ分けし、容器と試料の間の相対的コントラストについては考慮しない上記のいくつかの実施形態では、試料相内にコントラスト変化がないことを保証するのに、R空間補正の方がより適切であった。しかしながら、全ての材料がセグメント化されるときなど、他の場合には、I空間補正は、潜在的に、画像全体のオリジナルの相対的コントラスト値に対してより高い忠実度を有する。
Claims (19)
- RPCを適用することが、材料ごとに模擬単色投影を生成するために、セグメント化された前記断層像のそれぞれの相を再投影することをさらに含み、前記模擬単色投影が前記積分減衰空間で算出される、請求項1に記載の方法。
- 断層撮影再構成をビーム・ハードニングに関して補正する方法であって、
(a)断層撮影投影データから初期断層像を再構成すること、
(b)前記断層像を2つ以上の相にセグメント化すること、
(c)セグメント化された前記断層像に基づいて、参照なしポスト再構成補正(RPC)補正を算出すること、
(d)ビーム・ハードニング効果に関して補正するために、前記RPC補正を断層撮影投影データに適用すること、および
(e)補正された前記断層撮影投影データから最終断層像を再構成すること
を含み、
試料材料を保持する容器に起因するビーム・ハードニング効果に関して補正し、前記試料自体に起因するビーム・ハードニング効果に関しては補正しないために、前記断層像に容器のみ前補正を適用することをさらに含む方法。 - 前記容器だけを通過する一組の放射線を選択し、選択された前記一組の放射線に基づいて前記容器に関する積分減衰を算出することによって、前記容器のみ前補正を生成することをさらに含む、請求項3に記載の方法。
- 予め定められた容器形状データを受け取ること、および前記予め定められた容器形状データに基づいて前記容器のみ前補正を生成することをさらに含む、請求項3に記載の方法。
- 前記断層像をセグメント化することが、前記容器のみ前補正を生成する目的に使用される容器形状データを提供する、請求項3に記載の方法。
- 断層撮影再構成をビーム・ハードニングに関して補正する方法であって、
(a)断層撮影投影データから初期断層像を再構成すること、
(b)前記断層像を2つ以上の相にセグメント化すること、
(c)セグメント化された前記断層像に基づいて、参照なしポスト再構成補正(RPC)補正を算出すること、
(d)ビーム・ハードニング効果に関して補正するために、前記RPC補正を断層撮影投影データに適用すること、および
(e)補正された前記断層撮影投影データから最終断層像を再構成すること
を含み、
前記セグメント化が、半径方向距離およびグレースケール強度を使用して前記相を区別するk平均クラスタリング技法を実行することを含む方法。 - 断層撮影再構成をビーム・ハードニングに関して補正する方法であって、
(a)断層撮影投影データから初期断層像を再構成すること、
(b)前記断層像を2つ以上の相にセグメント化すること、
(c)セグメント化された前記断層像に基づいて、参照なしポスト再構成補正(RPC)補正を算出すること、
(d)ビーム・ハードニング効果に関して補正するために、前記RPC補正を断層撮影投影データに適用すること、および
(e)補正された前記断層撮影投影データから最終断層像を再構成すること
を含み、
前記セグメント化が、前記初期再構成に対する反復セグメント化および再構成プロセスの一部を構成し、前記反復セグメント化および再構成プロセスが、
(i)前記試料中の多数の体積要素の1つまたは複数の推定される材料特性を、断層撮影再構成アルゴリズムを使用して決定するステップと、
(ii)材料ディクショナリ内の最も確からしい材料を体積要素ごとに決定するために、前記1つまたは複数の推定される材料特性を、記憶された材料特性データを参照することによって、確率的分類に基づいて修正するステップと、
(iii)前記断層撮影再構成アルゴリズムの1回または複数回の追加の反復を実行するステップであり、それぞれの反復が、前記体積要素の前記1つまたは複数の推定される材料特性を更新するステップと、
(iv)前記試料であることを示している再構成された体積にラベルを付けて、同様の特性を有する材料の領域に分類するステップと
を含む方法。 - 断層撮影再構成をビーム・ハードニングに関して補正する方法であって、
(a)断層撮影投影データから初期断層像を再構成すること、
(b)前記断層像を2つ以上の相にセグメント化すること、
(c)セグメント化された前記断層像に基づいて、参照なしポスト再構成補正(RPC)補正を算出すること、
(d)ビーム・ハードニング効果に関して補正するために、前記RPC補正を断層撮影投影データに適用すること、および
(e)補正された前記断層撮影投影データから最終断層像を再構成すること
を含み、
前記最終断層像を再構成することが、
(i)前記試料中の多数の体積要素の1つまたは複数の推定される材料特性を、断層撮影再構成アルゴリズムを使用して決定すること、
(ii)材料ディクショナリ内の最も確からしい材料を体積要素ごとに決定するために、前記1つまたは複数の推定される材料特性を、記憶された材料特性データを参照することによって、確率的分類に基づいて修正すること、
(iii)前記断層撮影再構成アルゴリズムの1回または複数回の追加の反復を実行し、それぞれの反復が、前記体積要素の前記1つまたは複数の推定される材料特性を更新すること、および
(iv)前記試料であることを示している再構成された体積にラベルを付けて、同様の特性を有する材料の領域に分類すること
をさらに含む方法。 - 断層撮影再構成をビーム・ハードニングに関して補正する方法であって、
(a)断層撮影投影データから初期断層像を再構成すること、
(b)試料材料を保持する容器に起因するビーム・ハードニング効果に関して補正し、試料材料自体に起因するビーム・ハードニング効果に関しては補正しないために、前記断層像に容器のみ前補正を適用すること、
(c)前記断層像を2つ以上の相にセグメント化すること、
(d)セグメント化された前記断層像に基づいて、参照なしポスト再構成補正(RPC)補正を算出すること、
(e)ビーム・ハードニング効果に関して補正するために、前記RPC補正を断層撮影投影データに適用すること、および
(f)補正された前記断層撮影投影データから最終断層像を再構成すること
を含む方法。 - RPCを適用することが、材料ごとに模擬単色投影を生成するために、セグメント化された前記断層像のそれぞれの相を再投影することをさらに含み、前記模擬単色投影が前記積分減衰空間で算出される、請求項9に記載の方法。
- 前記容器だけを通過する一組の放射線を選択し、選択された前記一組の放射線に基づいて前記容器に関する積分減衰を算出することによって、前記容器のみ前補正を生成することをさらに含む、請求項9に記載の方法。
- 予め定められた容器形状データを受け取ること、および前記予め定められた容器形状データに基づいて前記容器のみ前補正を生成することをさらに含む、請求項9に記載の方法。
- 前記断層像をセグメント化することが、前記容器のみ前補正を生成する目的に使用される容器形状データを提供する、請求項9に記載の方法。
- 前記セグメント化が、半径方向距離およびグレースケール強度を使用して前記相を区別するk平均クラスタリング技法を実行することを含む、請求項9に記載の方法。
- 前記最終断層像を再構成することが、
(a)前記試料中の多数の体積要素の1つまたは複数の推定される材料特性を、断層撮影再構成アルゴリズムを使用して決定すること、
(b)材料ディクショナリ内の最も確からしい材料を体積要素ごとに決定するために、前記1つまたは複数の推定される材料特性を、記憶された材料特性データを参照することによって、確率的分類に基づいて修正すること、
(c)前記断層撮影再構成アルゴリズムの1回または複数回の追加の反復を実行し、それぞれの反復が、前記体積要素の前記1つまたは複数の推定される材料特性を更新すること、および
(d)前記試料であることを示している再構成された体積にラベルを付けて、同様の特性を有する材料の領域に分類すること
をさらに含む、請求項9に記載の方法。 - 前記断層像を2つ以上の相にセグメント化することが、集塊材料の少なくとも1つの相に分離することをさらに含む、請求項9に記載の方法。
- 集塊材料ライブラリを参照して、前記集塊材料を同定することをさらに含む、請求項16に記載の方法。
- 試料を通して導かれるX線ビーム源と、
回転試料ホルダと、
前記X線ビーム源からのエネルギーを検出するX線検出器と、
前記X線ビーム源、前記回転試料ホルダおよび前記X線検出器に動作可能に接続されたシステム・コントローラであり、請求項1から8のいずれか一項に記載の方法を実行するためのコンピュータ命令を含むプログラム記憶装置を含むシステム・コントローラと
を備える断層撮影システム。
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