JP6435341B2 - ポリ(酸)膜分離マトリックスを含むスピンカラム並びにその製造及び使用方法 - Google Patents
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Description
上記で概要を述べたように、本発明の態様は、複合試料の成分を分離するように構成されたスピンカラムを含む。スピンカラムの態様は、第1端部に試料入口部を、第2端部に試料出口部を有する細長い中空構造体、及び流体が必ずポリ(酸)膜を通って流動して第1端部から第2端部に構造体を横切ることになるように細長い中空構造体中に位置するポリ(酸)膜マトリックスを含む。
本発明の態様は、例えば本明細書に記載のように、本発明のスピンカラムを使用して液体試料を処理する方法をさらに含む。該方法の態様は、スピンカラムの試料入口部を通して、例えば上記のようなポリ(酸)マトリックスを有するスピンカラムに試料を導入し、試料をポリ(酸)膜を通して移動させて、試料を処理することを含む。任意の好都合なプロトコルを使用して、例えばピペットによって、試料をスピンラムに導入することができる。試料入口部から試料出口部へのスピンカラムを通しての試料の移動は、任意の好都合なプロトコルを使用して、例えば、スピンカラムを遠心機などの中で回転させることによって、または、例えば試料出口部に吸引をかけることにより、スピンカラムの試料出口部に陰圧をかけることによって、または、例えば加圧された空気、気体または液体を試料入口部にかけることにより、試料入口部に陽圧をかけることによって、達成され得る。
本明細書に記載のスピンカラム及び方法は、限定されないが、タンパク質精製用途、抗体精製用途、分析物検出用途、選択的分析物濃縮用途、制御されたタンパク質及びペプチド消化用途、制御されたタンパク質またはペプチド修飾用途、環境浄化用途などを含めた様々な異なる用途に使用される。
本発明の態様はまた、本発明の方法を実施するために使用するためのキットを含む。キットは、例えば上記のようなスピンカラムを少なくとも含む。キット及びシステムは、本発明の方法に使用されるいくつかの随意の成分を含むこともできる。目的の随意の成分としては、(例えば、上記のような)抽出/装填/洗浄バッファ(複数可)を含めたバッファ、容器、例えば、収集チューブ及び/またはマルチウェルプレートなどが挙げられる。さらに、キット及びシステムは、親和性ペプチドタグ付きポリペプチドを生成するための試薬、例えば、金属イオン親和性ペプチドをコードするベクター、例えばUS7,176,298に開示されているもの(そのベクターの開示は参照により本明細書に組み込まれる)を含むことができる。本発明のキットでは、都合または所望に応じて、1種または複数種の成分が同じまたは異なる容器中に存在する。
材料:
被評価膜
直径25mmのいくつかの膜を評価した。親水性の高ヒドロキシル化ナイロン膜(LoProdyne(登録商標)LP(ナイロン6,6膜、Pall Corporation,Port Washington,NY)、細孔サイズ1.2μm、厚さ110μm)。膜細孔を3つの異なる化学作用で改変した。1型膜を、ポリ(アクリル酸)/ポリエチレンイミン/ポリ(アクリル酸)(PAA/PEI/PAA)ポリマーを用いて積層(LBL)形状に改変し、非常に高い結合能での、hisタグ付きタンパク質の迅速な精製を目的に、ニッケル−ニトリロ三酢酸(Ni−NTA)を用いて機能化した。2型膜を、ポリ(2−メタクリロイルスクシネート)ポリマーを用いて膜ブッシュ形状に改変し、非常に高い結合能での、hisタグ付きタンパク質の迅速な精製を目的に、Ni−NTAを用いて機能化した。制御されたタンパク質消化を目的に、3型膜をトリプシンで機能化した。
膜を約7mmの直径の円盤状に切り、様々なバリエーション、すなわち、単層、2層、3層、上部を上、上部を下などでスピンカラムに組み立てた。スピンカラムの組立て後、有効な濾過/結合領域は直径約5mmであった。
様々な出発材料を、製造したスピンカラムの評価で使用した。タンパク質試料出発材料は、前もって精製されたタンパク質試料か、組換えタンパク質を発現する細胞の全細胞可溶化物のいずれかであった。使用した前もって精製されたタンパク質試料には、アフィニティータグなしで発現するオワンクラゲGFP(AcGFP)タンパク質(タグなし旧GFP)、新しく精製された6×ヒスチジン−アスパラギンタグ付きAcGFP(6HN−AcGFP)及び精製されたヒスチジンタグ付きユビキチン(Hisタグ付きユビキチン(HisU)(Sigma−Aldrich,St.Louis,MO)が含まれる。使用した全細胞可溶化物タンパク質試料には、6HN−AcGFP及び6His−GFPuvを発現する細胞の可溶化物が含まれる。
全細胞可溶化物からのタンパク質精製
6HN−AcGFPを発現する細胞を増殖させ、遠心分離によってペレット化した。0.25gの細胞ペレットを4mLのxTractorバッファ(細胞溶解バッファ、Clontech Laboratories,Mountain View,CA)に溶解した。すべての遠心分離ステップは、9000×gで4分間行った。2型(ブラシ)単層(上側が上)膜スピンカラムを、500μLのリン酸緩衝食塩水(PBS)での3回の洗浄によって平衡化した。600μL及び900μLの細胞可溶化物を、別々の平衡化したスピンカラムに装填した。その後に、スピンカラムを300μLの洗浄バッファII(20mM NaPO4、0.15M NaCl、pH7.6)で2回洗浄した。洗浄に続いて、300μLの溶出バッファ(20mM NaPO4 、0.5Mイミダゾール、0.5M NaCl、pH7.6)を2回加えることによって、タンパク質をスピンカラムから溶出した。個々の解析のために、連続的な溶出を別々にした。溶出に続いて、タンパク質の収量を、600μL及び900μL可溶化物試料について、それぞれ142μg及び231μgであると決定した。
様々な配向の膜を用いて製造されたスピンカラムについて、スピンカラムの性能を評価した。
異なる膜配向を有するスピンカラムについて、スピンカラムの性能を評価した。
試薬を引くペリスタルティックポンプをともなうマニホールド上の3ヘッドフィルタリングデバイス(3−headed filtering device)を使用して製造されたLBL膜について、スピンカラムの性能を評価した。小規模の47mm LoProdyne(登録商標)(ナイロン6,6膜、Pall Corporation,Port Washington,NY)膜を、Ni−NTA(NTA−リジン)、ニッケル−イミノ二酢酸(Ni−IDA、リンカーなし)及びNi−IDA−ポリエチレングリコール(PEG)(PEGリンカーを有するIDA)を使用して調製した。スピンカラムはまた、200μLのTALON(登録商標)(コバルトアフィニティー樹脂、Clontech Laboratories,Mountain View,CA)樹脂を使用して調製した。2枚の紙の間に膜をはさんで、標準的な穴あけ器を使用して膜を切った。膜の容積は2.16μLであり、TALONの容積は200μLであった。スピンカラムを屋内にて手作業で組み立てた。
試薬を引くペリスタルティックポンプをともなうマニホールド上の3ヘッドフィルタリングデバイスを使用して製造されたLBL膜について、タンパク質結合能を評価した。小規模の47mm LoProdyne(登録商標)(ナイロン6,6膜、Pall Corporation,Port Washington,NY)膜を調製した。
試薬を引くペリスタルティックポンプをともなうマニホールド上の3ヘッドフィルタリングデバイスを使用して製造されたLBL膜について、スピンカラムの再現性を評価した。小規模の47mm LoProdyne(登録商標)(ナイロン6,6膜、Pall Corporation,Port Washington,NY)膜を未改変で、及びPAA/PEI/PAポリマーを単独で、及びNi−NTAまたはNi−IDAともに使用して調製した。Ni−NTA膜の3つの別々のバッチを使用した。Ni−NTA膜の2つのバッチを別の日に調製し(Ni−NTA1及びNi−NTA2)、2つのバッチを同じ日に調製し、異なった条件、標準的な条件及び−20℃で保管した(それぞれNi−NTA1及びNi−NTA−20)。膜及びスピンカラムを前述のように調製した。
試薬を引くペリスタルティックポンプをともなうマニホールド上の3ヘッドフィルタリングデバイスを使用して製造された多層LBL膜について、スピンカラムの性能を評価した。小規模の47mm LoProdyne(登録商標)(ナイロン6,6膜、Pall Corporation,Port Washington,NY)及びSterliTech(Kent,WA)膜を前述のように調製し、若干の変更を加えてNi−NTAで機能化した。以前の試行にあるような使用8〜10分前と比べて、使用4分前に、1−エチル−3−[3−ジメチルアミノプロピル]カルボジイミド塩酸塩(EDC)をN−ヒドロキシスクシンイミド(NHS)に加えた。
1型膜及び2型膜の両方が、予め精製された及び粗製の細胞可溶化物から標的タンパク質を効果的に分離した。2型膜はより高い容量を有し、最初の試行において、タグ付きのAcGFPに対して約106mg/cm3の結合能まで達する。2型膜はより長い試料接触時間を有し、1型膜はより急速な試料通過を有する。上側が上形状と比べて上側が下形状は膜についての性能に有意に影響を及ぼさず、これは、いずれの配向でも膜は効果的かつ急速なタンパク質精製ができたからである。膜性能は、再使用及び続く貯蔵の際に有意に保持された。多層膜はタンパク質精製能力を維持し、これは、多層スタック内の個々の膜の位置にかかわらず、タンパク質結合能の変動がほとんどないことを示す。
1.第1端部に試料入口部を、第2端部に試料出口部を有する細長い中空構造体と、流体がポリ(酸)膜を通って流動して第1端部から第2端部に中空構造体を横切ることになるように中空構造体中に位置するポリ(酸)膜マトリックスとを備えるスピンカラム。
2.ポリ(酸)膜マトリックスは、多孔性膜支持体の表面に吸着しているポリ(酸)成分を含む付記1に記載のスピンカラム。
3.ポリ(酸)成分はポリ(酸)フィルムを含む付記2に記載のスピンカラム。
4.ポリ(酸)成分がポリ(酸)ブラシを含む付記2に記載のスピンカラム。
5.ポリ(酸)成分は、金属イオンと錯体形成した金属イオンキレート配位子をさらに含む付記3または4に記載のスピンカラム。
6.金属イオンキレート配位子はアスパラギン酸ベースの金属イオンキレート配位子を含む付記5に記載のスピンカラム。
7.金属イオンはCo2+を含む付記5または6に記載のスピンカラム。
8.中空構造体はチューブである付記1〜7のいずれか一つに記載のスピンカラム。
9.ポリ(酸)膜は第2端部の近位に位置する付記1〜8のいずれか一つに記載のスピンカラム。
10.ポリ(酸)マトリックスは、それぞれ多孔性膜支持体の表面に吸着しているポリ(酸)成分を有する2つ以上の積層された膜を含む付記1〜9のいずれか一つに記載のスピンカラム。
11.ポリ(酸)マトリックスは、それぞれ多孔性膜支持体の表面に吸着しているポリ(酸)成分を有する3つ以上の積層された膜を含む付記1〜10のいずれか一つに記載のスピンカラム。
12.試料入口部は第1の直径を有し、試料出口部は第2の直径を有する付記1〜11のいずれか一つに記載のスピンカラム。
13.第1の直径は第2の直径より長い付記12に記載のスピンカラム。
14.1μL〜1Lの範囲にわたる容積を有する付記1〜13のいずれか一つに記載のスピンカラム。
15.ポリ(酸)膜と支持関係でフリットを含む付記1〜14のいずれか一つに記載のスピンカラム。
16.フリットは中空構造体から分離可能である付記15に記載のスピンカラム。
17.収集チューブ中で入れ子になっている付記1〜16のいずれか一つに記載のスピンカラム。
18.収集チューブはキャップを含む付記17に記載のスピンカラム。
19.第1端部にキャップを含む付記1〜18のいずれか一つに記載のスピンカラム。
20.キャップはスナップキャップである付記18または19に記載のスピンカラム。
21.キャップはスクリューキャップである付記18または19に記載のスピンカラム。
22.付記1〜21のいずれか一つに記載のスピンカラムに試料入口部を介して液体の試料を導入することと、試料を処理するために、ポリ(酸)膜を通って試料を移動させることとを有する液体試料の処理方法。
23.スピンカラムを回転させることによって、ポリ(酸)膜を通って試料を移動させる付記21に記載の方法。
24.中空構造体の第2端部に吸引をかけることによって、ポリ(酸)膜を通って試料を移動させる付記22に記載の方法。
25.ポリ(酸)膜は試料中のタンパク質に結合するように構成されており、試料からタンパク質を分離する方法である付記22〜24のいずれか一つに記載の方法。
26.ポリ(酸)膜は試料中の核酸に結合するように構成されており、試料から核酸を分離する方法である付記22〜24のいずれか一つに記載の方法。
27.ポリ(酸)膜は試料中の目的の分析物に特異的に結合するように構成されており、試料から分析物を分離する方法である付記22〜24のいずれか一つに記載の方法。
28.分析物は、タンパク質、核酸及び小分子から成る群から選択される付記27に記載の方法。
29.結合した分子をポリ(酸)膜から遊離させることをさらに有する付記25〜28のいずれか一つに記載の方法。
30.付記1〜14のいずれか一つに記載のスピンカラムと、スピンカラムを入れ子関係で受け入れるように構成された収集チューブとを備えるキット。
35U.S.C.§119(e)に従って、本出願は、2014年2月21日に出願された米国特許仮出願第61/943,174号及び2014年6月4日に出願された米国特許仮出願第62/007,798号の出願日に対して優先権を主張し、これらの出願の開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
Claims (17)
- 第1端部に試料入口部を、第2端部に試料出口部を有する細長い中空構造体と、
タンパク質に結合するように構成された多孔性膜支持体と
を備えており、
前記多孔性膜支持体は、前記多孔性膜支持体の表面に吸着しているポリ(酸)成分を含んでおり、
流体が前記多孔性膜支持体を通って流動して前記第1端部から前記第2端部に前記中空構造体を横切ることになるように、前記中空構造体中に前記多孔性膜支持体は位置している
ことを特徴とするスピンカラム。 - 前記ポリ(酸)成分はポリ(酸)フィルムまたはポリ(酸)ブラシを含むことを特徴とする請求項1に記載のスピンカラム。
- 前記ポリ(酸)成分は、金属イオンと錯体形成した金属イオンキレート配位子をさらに含むことを特徴とする請求項1または2に記載のスピンカラム。
- 前記金属イオンキレート配位子はアスパラギン酸ベースの金属イオンキレート配位子を含むことを特徴とする請求項3に記載のスピンカラム。
- 前記中空構造体はチューブであることを特徴とする請求項1〜4のいずれか一項に記載のスピンカラム。
- 前記多孔性膜支持体は前記第2端部の近位に位置することを特徴とする請求項1〜5のいずれか一項に記載のスピンカラム。
- 前記中空構造体は、それぞれ多孔性膜支持体の表面に吸着しているポリ(酸)成分を有する2つ以上の積層された多孔性膜支持体を含むことを特徴とする請求項1〜6のいずれか一項に記載のスピンカラム。
- 前記試料入口部は第1の直径を有し、前記試料出口部は第2の直径を有することを特徴とする請求項1〜7のいずれか一項に記載のスピンカラム。
- 前記第1の直径は前記第2の直径より長いことを特徴とする請求項8に記載のスピンカラム。
- 前記多孔性膜支持体と支持関係でフリットを含むことを特徴とする請求項1〜9のいずれか一項に記載のスピンカラム。
- 収集チューブ中で入れ子になっていることを特徴とする請求項1〜10のいずれか一項に記載のスピンカラム。
- 請求項1〜11のいずれか一項に記載のスピンカラムに前記試料入口部を介して液体の試料を導入することと、
前記試料を処理するために、前記多孔性膜支持体を通って前記試料を移動させることと
を有することを特徴とする試料の処理方法。 - 前記スピンカラムを回転させることによって、前記多孔性膜支持体を通って前記試料を移動させることを特徴とする請求項12に記載の試料の処理方法。
- 請求項1〜11のいずれか一項に記載のスピンカラムと、
前記スピンカラムを入れ子関係で受け入れるように構成された収集チューブと
を備えることを特徴とするキット。 - 前記多孔性膜支持体は、少なくとも79μgのタンパク質結合収量を有することを特徴とする請求項1〜11のいずれか一項に記載のスピンカラム。
- 前記中空構造体は、3mm〜15mmの直径を有することを特徴とする請求項15に記載のスピンカラム。
- 金属イオンキレートは、少なくとも四座キレート配位子であることを特徴とする請求項1〜11および16のいずれか一項に記載のスピンカラム。
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