JP6407026B2 - ペピーノモザイクウイルス抵抗性トマト植物 - Google Patents
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Description
- 連鎖群(LG)6 の物理的位置 32,363,349 bp と 34,505,939 bp の間、好ましくは位置 33,558,627 bp と 34,505,939 bp の間に位置する QTL1 またはその PepMV-抵抗性を付与する部分(PepMV-resistance-conferring part)、および/または
- LG 7 の物理的位置 60,667,821 bp と 62,460,220 bp の間、好ましくは位置 61,387,356 bp と 62,253,846 bp の間に位置する QTL2 またはその PepMV-抵抗性を付与する部分、および/または
- LG 9 の物理的位置 60,998,420 bp と 62,512,587 bp の間、好ましくは位置 61,494,664 bp と 62,385,023 bp の間、より好ましくは位置 61,723,339 bp と 62,385,023 bp の間に位置する QTL3 またはその PepMV-抵抗性を付与する部分。
- QTL1 もしくはその PepMV-抵抗性を付与する部分および QTL2 もしくはその PepMV-抵抗性を付与する部分、または
- QTL1 もしくはその PepMV-抵抗性を付与する部分および QTL3 もしくはその PepMV-抵抗性を付与する部分、または
- QTL2 もしくはその PepMV-抵抗性を付与する部分および QTL3 もしくはその PepMV-抵抗性を付与する部分。
- 寄託物 NCIMB 41927 および/または NCIMB 42068 および/または NCIMB 42069 において配列番号1、配列番号4、および配列番号5 (表 2) によって特徴付けられる分子マーカーと連鎖している QTL1 またはその抵抗性を付与する部分、および/または
- 寄託物 NCIMB 41927 および/または NCIMB 41928 および/または NCIMB 42068 および/または NCIMB 42069 において配列番号2、配列番号6、および配列番号7 (表 2) によって特徴付けられる分子マーカーと連鎖している QTL2 またはその抵抗性を付与する部分、および/または
- 寄託物 NCIMB 41928 および/または NCIMB 42069 において配列番号3、配列番号8、および配列番号9 (表 2) によって特徴付けられる分子マーカーと連鎖している QTL3 またはその抵抗性を付与する部分。
- 連鎖群(LG) 6 の物理的位置 32,363,349 bp と 34,505,939 bp の間、好ましくは位置 33,558,627 bp と 34,505,939 bp の間 に位置する QTL1;
- LG 7 の物理的位置 60,667,821 bp と 62,460,220 bp の間、好ましくは位置 61,387,356 bp と 62,253,846 bp の間に位置する QTL2;
- LG 9 の物理的位置 60,998,420 bp と 62,512,587 bp の間、好ましくは位置 61,494,664 bp と 62,385,023 bp の間、より好ましくは位置 61,723,339 bp と 62,385,023 bp の間に位置する QTL3。
a) その代表的種子が NCIMB 41927 または NCIMB 42068 として寄託された QTL1 および QTL2 を含む植物、またはその代表的種子が NCIMB 41928 として寄託された QTL2 および QTL3 を含む植物を、該遺伝的決定因子を含まない植物と交雑して F1 集団を得る工程;
b) 所望により、F1 の植物の1巡以上の自殖および/または交雑を行ってさらなる世代の集団を得る工程;
c) 該集団から、QTL1 および/または QTL2 を含む植物、または QTL2 および/または QTL3 を含む植物を選抜する工程;
d) 選抜された QTL1 および/または QTL2 を含む植物を、その代表的種子が NCIMB 41928 として寄託された QTL2 および QTL3 を含む植物と交雑するか、または、選抜された QTL2 および/または QTL3 を含む植物を、その代表的種子が NCIMB 41927 または NCIMB 42068 として寄託された QTL1 および QTL2 を含む植物と交雑する工程;
e) 工程 d) において得られた植物を自殖して分離集団を得る工程;
f) QTL1 および QTL2、または QTL2 および QTL3、または QTL1 および QTL3、または QTL1 および QTL2 および QTL3 を含む植物を選抜する工程。
a) その代表的種子が NCIMB 41927 または NCIMB 42068 として寄託された QTL1 および QTL2 を含む植物、またはその代表的種子が NCIMB 41928 として寄託された QTL2 および QTL3 を含む植物、またはその代表的種子が NCIMB 42069 として寄託された QTL1 および QTL2 および QTL3 を含む植物を、該遺伝的決定因子を含まない植物と交雑して F1 集団を得る工程;
b) F1 の植物の1巡以上の自殖および/または交雑を行って、さらなる世代の集団を得る工程;
c) 所望により、該集団から QTL 1、2 および 3 のうち1つまたは2つを含む植物を選抜し、次いで QTL 1、2 および 3 のうち残りの QTL を少なくとも含む植物と交雑し、その後、工程 b) を繰り返す工程;
d) QTL1 および QTL2 および QTL3 を含む植物を選抜する工程。
a) その代表的種子が NCIMB 42069 として寄託された QTL1 および QTL2 および QTL3 を含む植物を、該 QTL を含まない植物と交雑して F1 集団を得る工程;
b) F1 の植物の1巡以上の自殖および/または交雑を行ってさらなる世代の集団を得る工程;
c) 所望により、該集団から QTL 1、2 および 3 のうち1つまたは2つを含む植物を選抜し、次いで QTL 1、2 および 3 のうちの残りの QTL を少なくとも含む植物と交雑し、その後、工程 b) を繰り返す工程;
d) QTL1 および QTL2 および QTL3 を含む植物を選抜する工程。
a) その代表的種子が NCIMB 41927 および NCIMB 42068 として寄託された QTL1 および QTL2 を含む植物、またはその代表的種子が NCIMB 41928 として寄託された QTL2 および QTL3 を含む植物を、該遺伝的決定因子を含まない植物と交雑して F1 集団を得る工程;
b) 所望により、F1 の植物の1巡以上の自殖および/または交雑を行ってさらなる世代の集団を得る工程;
c) 該集団から、QTL1 および/または QTL2 を含む植物、または QTL2 および/または QTL3 を含む植物を選抜する工程;
d) 選抜された QTL1 および/または QTL2 を含む植物を、その代表的種子が NCIMB 41928 として寄託された QTL2 および QTL3 を含む植物と交雑するか、または、選抜された QTL2 および/または QTL3 を含む植物を、その代表的種子が NCIMB 41927 および NCIMB 42068 として寄託された QTL1 および QTL2 を含む植物と交雑する工程;
e) 工程 d) において得られた植物を自殖して分離集団を得る工程;
f) QTL1 および QTL2、または QTL2 および QTL3、または QTL1 および QTL3、または QTL1 および QTL2 および QTL3 を含む植物を選抜する工程。
a) その代表的種子が NCIMB 41927 または NCIMB 42068 として寄託された QTL1 および QTL2 を含む植物、またはその代表的種子が NCIMB 41928 として寄託された QTL2 および QTL3 を含む植物、またはその代表的種子が NCIMB 42069 として寄託された QTL1 および QTL2 および QTL3 を含む植物を、該遺伝的決定因子を含まない植物と交雑して F1 集団を得る工程;
b) F1 の植物の1巡以上の自殖および/または交雑を行ってさらなる世代の集団を得る工程;
c) 所望により、該集団から QTL 1、2 および 3 の1つまたは2つを含む植物を選抜し、次いで QTL 1、2 および 3 のうち残りの QTL を少なくとも含む植物と交雑し、その後、工程 b) を繰り返す工程;
d) QTL1 および QTL2 および QTL3 を含む植物を選抜する工程。
a) その代表的種子が NCIMB 42069 として寄託された QTL1 および QTL2 および QTL3 を含む植物を、該 QTL を含まない植物と交雑して F1 集団を得る工程;
b) F1 の植物の1巡以上の自殖および/または交雑を行ってさらなる世代の集団を得る工程;
c) 所望により、該集団から QTL 1、2 および 3 のうち1つまたは2つを含む植物を選抜し、次いで QTL 1、2 および 3 のうち残りの QTL を少なくとも含む植物と交雑し、その後、工程 b) を繰り返す工程;
d) QTL1 および QTL2 および QTL3 を含む植物を選抜する工程。
a) その代表的種子が寄託番号 NCIMB 41927 および NCIMB 41928 および NCIMB 42068 および NCIMB 42069 の下に NCIMB に寄託されたペピーノモザイクウイルスに対する抵抗性を含むトマト植物を、所望の形質を含む第2のトマト植物と交雑して F1 後代を作出する工程;
b) ペピーノモザイクウイルスに対する抵抗性および該所望の形質を含む F1 後代を選抜する工程;
c) 選抜された F1 後代をどちらかの親と交雑して、戻し交雑後代を作出する工程;
d) 該所望の形質およびペピーノモザイクウイルスに対する抵抗性を含む戻し交雑後代を選抜する工程; および
e) 所望により、工程 c) および d) を連続して1回以上繰り返して、該所望の形質およびペピーノモザイクウイルスに対する抵抗性を含む選抜された第4代以上の戻し交雑後代を作出する工程。本発明は、この方法により作出されるトマト植物、および該植物から得られるトマト果実を包含する。
ペピーノモザイクウイルスに対する抵抗性をもたらす本発明の遺伝的決定因子を含むトマト(Solanum lycopersicum) 11R.412000 および 11R.446400 の種子を、2012年1月13日に、それぞれ受託番号 NCIMB 41927 および NCIMB 41928 の下に NCIMB Ltd(Ferguson Building、Craibstone Estate、Bucksburn、Aberdeen AB21 9YA、UK)に寄託した。
本発明のトマト植物の作出
本発明をもたらした研究において、ペピーノモザイクウイルス抵抗性についてのバイオアッセイ(実施例 2 を参照)を行うことにより、出願人の遺伝資源の中からペピーノモザイクウイルスに対して免疫があるソラナム・ペルビアナム(S. peruvianum)植物を同定した。免疫レベルの抵抗性を、連続的バイオアッセイによって繰り返し確認した。様々な研究において多くの目録(accession)がスクリーニングされたが、ソラナム・ペルビアナムにおける免疫を有するかまたは高度に抵抗性の植物について先行する報告はなされていなかったため、ソラナム・ペルビアナムにおける免疫の同定は非常に驚くべきものであった。
ペピーノモザイクウイルス抵抗性についてのバイオアッセイ
ペピーノモザイクウイルスには非常に攻撃的な遺伝子型が存在するが、その挙動および病徴発現は予測不可能な場合がある。したがって、十分な反復を伴う非常に徹底したアッセイを行って生産者の条件における良好な能力を確保することが、抵抗性植物の作出にとって極めて重要である。
QTL マッピングおよびマーカー作成
実施例 1 から得られた 184 個体の BC1S1 植物からなる大きな集団を、ペピーノモザイクウイルスに対する抵抗性をマッピングするために用いた。1巡目において 880 個の SNP マーカーを解析し、追加の 559 個の SNP マーカーを2巡目に含めた。これらの SNP マーカーのうち 281 個が1巡目において多型であり、2巡目においては 387 個の多型 SNP を追加することができ、その結果、184 個体の BC1S1 植物に対して PepMV 抵抗性についての QTL 解析を行うために用いた合計 671 個のマーカーを得ることができた。
抵抗性の導入
依然として QTL1 および QTL2 および QTL3 をホモ接合型で含んでいる、T 12R.107 の自殖した植物を、本発明の抵抗性を付与する QTL のいずれも保有しないトマト植物と交雑した。該交雑から得られた F1 は、本発明の3つ全ての QTL をヘテロ接合の状態で有していた。該 F1 集団は十分な抵抗性レベルが期待できなかったため、PepMV 抵抗性についての表現型による試験は行わなかった。また、ヘテロ接合性の QTL は全て次の F2 世代において分離するため、該 F1 における選抜はこの形質と関連しないものである。
Claims (15)
- NCIMB41927および/またはNCIMB42068および/またはNCIMB42069において配列番号1、配列番号4または配列番号5によって特徴付けられる分子マーカーと連鎖しているQTL1もしくはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、ならびにNCIMB41927および/またはNCIMB41928および/またはNCIMB42068および/またはNCIMB42069において配列番号2、配列番号6または配列番号7によって特徴付けられる分子マーカーと連鎖しているQTL2もしくはそのPepMV−抵抗性を付与する部分;
NCIMB41927および/またはNCIMB41928および/またはNCIMB42068および/またはNCIMB42069において配列番号2、配列番号6または配列番号7によって特徴付けられる分子マーカーと連鎖しているQTL2もしくはそのPepMV−抵抗性を付与する部分ならびにNCIMB41928および/またはNCIMB42069において配列番号3、配列番号8または配列番号9によって特徴付けられる分子マーカーと連鎖しているQTL3もしくはそのPepMV−抵抗性を付与する部分;または
NCIMB41927および/またはNCIMB42068および/またはNCIMB42069において配列番号1、配列番号4または配列番号5によって特徴付けられる分子マーカーと連鎖しているQTL1もしくはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、NCIMB41927および/またはNCIMB41928および/またはNCIMB42068および/またはNCIMB42069において配列番号2、配列番号6または配列番号7によって特徴付けられる分子マーカーと連鎖しているQTL2もしくはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、ならびにNCIMB41928および/またはNCIMB42069において配列番号3、配列番号8または配列番号9によって特徴付けられる分子マーカーと連鎖しているQTL3もしくはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、
を含む遺伝的決定因子を保有するトマト植物(Solanum lycopersicum L.)であって、該遺伝的決定因子がペピーノモザイクウイルス(PepMV)に対する抵抗性を付与するものである、トマト植物。 - ペピーノモザイクウイルスに対する抵抗性(PepMV−抵抗性)を付与する遺伝的決定因子を含む請求項1に記載のトマト植物(Solanum lycopersicum L.)であって:
−連鎖群(LG)6の物理的位置32,363,349bpと34,505,939bpの間に位置する、QTL1またはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、
−連鎖群(LG)7の物理的位置60,667,821bpと62,460,220bpの間に位置する、QTL2またはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、および
−連鎖群(LG)9の物理的位置60,998,420bpと62,512,587bpの間に位置する、QTL3またはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、
を含む、トマト植物。 - PepMV−抵抗性を付与する遺伝的決定因子を含む請求項1に記載のトマト植物(Solanum lycopersicum L.)であって:
−連鎖群(LG)6の物理的位置33,558,627bpと34,505,939bpの間に位置する、QTL1またはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、
−連鎖群(LG)7の物理的位置61,387,356bpと62,253,846bpの間に位置する、QTL2またはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、および
−連鎖群(LG)9の物理的位置61,494,664bpと62,385,023bpの間に位置する、QTL3またはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、
を含む、トマト植物。 - PepMV−抵抗性を付与する遺伝的決定因子を含む請求項1に記載のトマト植物(Solanum lycopersicum L.)であって:
−連鎖群(LG)6の物理的位置33,558,627bpと34,505,939bpの間に位置する、QTL1またはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、
−連鎖群(LG)7の物理的位置61,387,356bpと62,253,846bpの間に位置する、QTL2またはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、および
−連鎖群(LG)9の物理的位置61,723,339bpと62,385,023bpの間に位置する、QTL3またはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、
を含む、トマト植物。 - 遺伝的決定因子がQTL1もしくはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、およびQTL2もしくはそのPepMV−抵抗性を付与する部分、およびQTL3もしくはそのPepMV−抵抗性を付与する部分を含むものである、請求項1〜4のいずれか1項に記載のトマト植物。
- 以下の工程:
a)NCIMB41927またはNCIMB42068として寄託された種子から生育した植物もしくはその後代植物、またはNCIMB41928として寄託された種子から生育した植物もしくはその後代植物、またはNCIMB42069として寄託された種子から生育した植物もしくはその後代植物を、他の植物と交雑してF1集団を得る工程;
b)該F1の植物の1巡以上の自殖および/または交雑を行ってさらなる世代の集団を得る工程;
c)所望により、該集団からペピーノモザイクウイルス抵抗性であり、QTL1、2および3のうち1つまたは2つを含む植物を選抜し、次いでQTL1、2および3のうち残りのQTLを少なくとも含む植物と交雑し、その後、工程b)を繰り返す工程;
d)QTL1およびQTL2、QTL2およびQTL3、またはQTL1およびQTL2およびQTL3を含む植物を選抜する工程、ここで、QTL1は配列番号1、配列番号4および配列番号5で示されるマーカーのいずれか一つまたは組み合わせにより同定され、QTL2は配列番号2、配列番号6および配列番号5で示されるマーカーのいずれか一つまたは組み合わせにより同定され、QTL3は配列番号3、配列番号8および配列番号9で示されるマーカーのいずれか一つまたは組み合わせにより同定される、
を含む方法によって得られ得る、ペピーノモザイクウイルス抵抗性(PepMV−抵抗性)であるトマト植物(Solanum lycopersicum L.)。 - 請求項1または6に記載のトマト植物の種子であって、該種子から生育させ得る植物がペピーノモザイクウイルス抵抗性であり、QTL1およびQTL2、QTL2およびQTL3、またはQTL1およびQTL2およびQTL3を含む、種子。
- ペピーノモザイクウイルス抵抗性であり、QTL1およびQTL2、QTL2およびQTL3、またはQTL1およびQTL2およびQTL3を含む、請求項1または6に記載のトマト植物の後代または請求項7に記載のトマト種子の後代。
- 請求項1または6に記載の植物を生産するため、又は請求項7に記載の種子を生産するために適した繁殖材料であって、該繁殖材料が有性生殖に適しており、特に小胞子、花粉、子房、胚珠、胚嚢および卵細胞から選択されるものであるか、または栄養生殖に適しており、特に挿し木、根、茎、細胞、プロトプラストから選択されるものであるか、または再生可能な細胞の組織培養に適しており、特に葉、花粉、胚、子葉、胚軸、成長点の細胞、根、根端、葯、花、種子および茎から選択されるものであり、且つ、該繁殖材料から生産される植物がペピーノモザイクウイルス抵抗性であり、QTL1およびQTL2、QTL2およびQTL3、またはQTL1およびQTL2およびQTL3を含む、繁殖材料。
- 請求項1〜6のいずれか1項に記載の植物のトマト果実。
- 請求項10に記載のトマト果実またはその部分を、所望により加工された形態で含む食品。
- 請求項1〜6のいずれか1項に記載の植物、または請求項7の種子もしくは請求項9に記載の繁殖材料から生産される植物の、ペピーノモザイクウイルス抵抗性トマト植物の作出のための育種計画における遺伝資源としての使用。
- ペピーノモザイクウイルスに対する抵抗性を有するトマト(Solanum lycopersicum)植物を同定するための、トマト(Solanum lycopersicum)におけるペピーノモザイクウイルスに対する抵抗性を付与するQTLと遺伝的に連鎖する、配列番号1〜9のいずれかの配列を含む、トマト(Solanum lycopersicum)ゲノム中に存在する分子マーカーの使用。
- トマト(Solanum lycopersicum)植物においてペピーノモザイクウイルス抵抗性を付与するQTLを同定するための、トマト(Solanum lycopersicum)におけるペピーノモザイクウイルスに対する抵抗性を付与するQTLと遺伝的に連鎖する、配列番号1〜9のいずれかの配列を含む、トマト(Solanum lycopersicum)ゲノム中に存在する分子マーカーの使用。
- 分子マーカーが、分子SNPマーカーである、請求項13または14に記載の使用。
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