JP6374392B2 - Xbp1、cd138およびcs1ペプチド、該ペプチドを含有する薬学的組成物、ならびにかかるペプチドおよび組成物を使用する方法 - Google Patents

Xbp1、cd138およびcs1ペプチド、該ペプチドを含有する薬学的組成物、ならびにかかるペプチドおよび組成物を使用する方法 Download PDF

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Description

本出願は、2012年11月5日に出願された米国特許出願第61/722,446号および2013年3月15日に出願された米国特許出願第61/790,780号の優先権を請求し、その全体の内容が、参照により本明細書に援用される。
連邦政府後援の研究または開発に関する声明
本出願に記載の研究は、米国国立衛生研究所によってそれぞれ授与された助成金PO1−78378、PO1−155258およびP50−100707に支援された。したがって、政府は、本発明における特定の権利を有する。
背景
弱毒化された微生物、組換えタンパク質およびDNAワクチンを含むいくつかのタイプのワクチンが、感染症の防止のために開発された。近年、がん患者を処置するためのワクチン免疫療法の開発に関する研究が行われている。
要旨
本開示は、HLA−A分子などのMHCクラス1分子に結合する免疫原性ペプチドに関する。X−Boxタンパク質1(XBP1)、CD138およびCD2サブセット1(CS1)に由来するペプチドは、免疫原性であり、例えば、様々ながん細胞に対して免疫応答を誘導するために有用であることが見出された。いくつかの実施形態において、それらのペプチドは、HLA−A分子に対する高い親和性、HLA−Aのペプチド結合間隙(peptide binding cleft)内における高い安定性、ならびに細胞(例えば、がん細胞)の表面上でMHC分子との関連で発現された場合、T細胞(例えば、エフェクターメモリーT細胞および/またはセントラルメモリーT細胞)の活性化および増殖を誘導する能力を有する。
さらに、これらのペプチドの組み合わせが、標的抗原に対して広範囲の免疫応答を誘導し得ること、およびこの広範囲の応答が、主要な治療上のハードル(とりわけ、腫瘍関連抗原の発現の不均一性、特定の抗原の高頻度の変異および個体間のヒトT細胞レパートリーのばらつきを含む)を克服し得ることが見出された。したがって、例えば、薬学的組成物において組み合される、これらのペプチドの様々な組み合わせの投与は、様々ながんに対して、増強された免疫応答を提供し得る。
上記ペプチド(およびそれらの薬学的組成物)が、種々の用途(例えば、免疫応答を誘導するための方法、T細胞(例えば、エフェクター(effectory)メモリーT細胞および/またはセントラルメモリーT細胞を含む)を活性化するための方法、抗体を産生させるための方法、ならびに例えば、がん(例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLまたはCML)、多発性骨髄腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症および前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を処置するための方法)において使用され得ることは、以下の記載から明らかである。
1つの態様において、本開示は、複数のMHC分子、例えば、HLA−A分子(例えば、HLA−A2およびHLA−A24)に対する親和性、複数のMHC分子(例えば、HLA−A2およびHLA−A24)のペプチド結合間隙内における高い安定性、ならびに細胞(例えば、がん細胞)の表面上でMHC分子(例えば、HLA−A2またはHLA−A24)との関連で発現された場合、例えば、エフェクターメモリーT細胞および/またはセントラルメモリーT細胞を含む、T細胞の活性化および増殖を誘導する能力を有する、ペプチド、例えば、XBP1ペプチド、CD138ペプチドおよびCS−1ペプチドを特徴とする。
上記ペプチド(およびそれらの薬学的組成物)が、種々の用途(例えば、免疫応答を誘導するための方法、T細胞(例えば、エフェクターメモリーT細胞および/またはセントラルメモリーT細胞)を活性化するための方法、抗体を産生させるための方法、ならびに例えば、がん(例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLまたはCML)、多発性骨髄腫および前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を処置するための方法)において使用され得ることは、以下の記載から明らかである。
1つの態様において、本開示は、配列番号51〜536のいずれか1つと少なくとも66(例えば、少なくとも66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98または99)%同一のアミノ酸配列を含む単離されたペプチドを特徴とする。そのペプチドは、主要組織適合複合体(MHC)分子(例えば、MHCクラスIまたはクラスII分子)に結合し得る。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号51〜536のいずれか1つのアミノ酸配列または配列番号51〜536のいずれかと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%同一のアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号51〜536のいずれか1つのアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、そのペプチドは、3つ、2つまたは1つの置換を有する、配列番号51〜536のいずれか1つのアミノ酸配列を含む。それらの置換は、保存的または非保存的であり得る。1つの実施形態において、そのペプチドは、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLもしくはCMLまたは多発性骨髄腫を有するかまたは有するリスクがある被験体を処置するために使用される。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体を処置するために使用される。
ある実施形態において、がんは、本明細書中に記載されるがんである。例えば、がんは、膀胱がん(進行性(accelerated)および転移性膀胱がんを含む)、乳がん(例えば、エストロゲンレセプター陽性乳がん、エストロゲンレセプター陰性乳がん、HER−2陽性乳がん、HER−2陰性乳がん、トリプルネガティブ乳がん、炎症性乳がん)、結腸がん(結腸直腸がんを含む)、腎臓がん(例えば、腎細胞癌(例えば、乳頭状腎細胞癌、明細胞癌、嫌色素性(chromphobic)癌))、肝臓がん、肺がん(小細胞肺がんおよび非小細胞肺がん(腺がん、扁平上皮癌、気管支肺胞癌および大細胞癌を含む)を含む)、泌尿生殖器がん、例えば、卵巣がん(卵管(fallopian)がん、子宮内膜がんおよび腹膜がんを含む)、子宮頸がん、前立腺がんおよび精巣がん、リンパ系のがん、直腸がん、喉頭がん、膵がん(膵外分泌癌を含む)、胃がん(例えば、胃食道がん、胃上部がんまたは胃下部がん)、消化器がん(例えば、肛門がんまたは胆管がん)、胆嚢がん、甲状腺がん、白血病(例えば、急性骨髄性白血病)、神経細胞がんおよびグリア細胞がん(例えば、多形神経膠芽腫)ならびに頭頸部がん(例えば、鼻咽頭がん)であり得る。1つの実施形態において、がんは、乳がん(例えば、浸潤性小葉癌、浸潤性乳管癌、小葉乳管混合癌、乳管内篩状(intraductal cribriform)癌、浸潤性乳管小葉癌または浸潤癌)である。1つの実施形態において、がんは、結腸腺癌(例えば、粘液性腺癌)である。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、配列番号51〜536のいずれか1つと少なくとも66(例えば、少なくとも66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98または99)%同一のアミノ酸配列からなる。1つの実施形態において、上記ペプチドは、3つ、2つまたは1つの置換を有する、配列番号51〜536のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。1つの実施形態において、上記ペプチドは、配列番号51〜536のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、グループCからの非スプライシング型XBP1ペプチド(例えば、表3を参照のこと)、例えば、配列番号51〜206のいずれか1つのアミノ酸配列を含む非スプライシング型XBP−1ペプチドまたは配列番号51〜206のいずれか1つと70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む非スプライシング型XBP1ペプチドである。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号51〜206のいずれか1つのアミノ酸配列または配列番号51〜206のいずれか1つと70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、グループCからの非スプライシング型XBP1ペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、そのペプチドは、3つ、2つ、1つの置換を有する、配列番号51〜206のいずれか1つのアミノ酸配列を含む。それらの置換は、保存的または非保存的であり得る。1つの実施形態において、グループCからの非スプライシング型XBP1ペプチドは、配列番号51〜206のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、グループCからのCD138ペプチド、例えば、配列番号207〜371のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCD138ペプチドまたは配列番号207〜371のいずれか1つのアミノ酸配列と70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むCD138ペプチドである。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号207〜371のいずれか1つのアミノ酸配列または配列番号207〜371のいずれか1つと70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、グループCからのCD138ペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、そのペプチドは、配列番号207〜371のいずれか1つのアミノ酸配列の3つ、2つ、1つの置換を有するアミノ酸配列を含む。それらの置換は、保存的または非保存的であり得る。1つの実施形態において、グループCからのCD138ペプチドは、配列番号207〜371のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、グループCからのCS−1ペプチド、例えば、配列番号372〜536のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCS−1ペプチドまたは配列番号372〜536のいずれか1つのアミノ酸配列と70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むCS−1ペプチドである。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号372〜536のいずれか1つのアミノ酸配列または配列番号372〜536のいずれか1つと70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、グループCからのCS−1ペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、そのペプチドは、3つ、2つ、1つの置換を有する、配列番号372〜536のいずれか1つのアミノ酸配列を含む。それらの置換は、保存的または非保存的であり得る。1つの実施形態において、グループCからのCS−1ペプチドは、配列番号372〜536のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。
1つの実施形態において、グループCからのペプチド、例えば、XBPペプチド、CD138ペプチドおよび/またはCS−1ペプチドは、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLまたはCMLを有するかまたは有するリスクがある被験体を処置するために使用される。1つの実施形態において、グループCからのペプチドは、前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体を処置するために使用される。ある実施形態において、がんは、膀胱がん(進行性および転移性膀胱がんを含む)、乳がん(例えば、エストロゲンレセプター陽性乳がん、エストロゲンレセプター陰性乳がん、HER−2陽性乳がん、HER−2陰性乳がん、トリプルネガティブ乳がん、炎症性乳がん)、結腸がん(結腸直腸がんを含む)、腎臓がん(例えば、腎細胞癌(例えば、乳頭状腎細胞癌、明細胞癌、嫌色素性癌))、肝臓がん、肺がん(小細胞肺がんおよび非小細胞肺がん(腺癌、扁平上皮癌、気管支肺胞癌および大細胞癌を含む)を含む)、泌尿生殖器がん、例えば、卵巣がん(卵管がん、子宮内膜がんおよび腹膜がんを含む)、子宮頸がん、前立腺がんおよび精巣がん、リンパ系のがん、直腸がん、喉頭がん、膵がん(膵外分泌癌を含む)、胃がん(例えば、胃食道がん、胃上部がんまたは胃下部がん)、消化器がん(例えば、肛門がんまたは胆管がん)、胆嚢がん、甲状腺がん、白血病(例えば、急性骨髄性白血病)、神経細胞がんおよびグリア細胞がん(例えば、多形神経膠芽腫)ならびに頭頸部がん(例えば、鼻咽頭がん)であり得る。
いくつかの実施形態において、本明細書中に記載される任意の単離されたペプチドは、主要組織適合複合体(MHC)分子(例えば、MHCクラスIまたはクラスII分子)に結合し得る。そのMHC分子は、例えば、ヒトMHC分子であり得る。そのMHC分子は、例えば、HLA−A分子、HLA−B分子および/またはHLA−C分子であり得る。好ましくは、そのMHC分子は、1つ以上のHLA−A分子(例えば、HLA−A1、HLA−A2、HLA−A3およびHLA−A24)である。
1つの態様において、本開示は、例えば、HLA−A2分子に対する高い親和性、HLA−A2のペプチド結合間隙内における高い安定性、ならびに細胞(例えば、がん細胞)の表面上でMHC分子との関連で発現された場合、T細胞(例えば、エフェクターメモリーT細胞および/またはセントラルメモリーT細胞)の活性化および増殖を誘導する能力を有する、X−Boxタンパク質1(XBP1)、CD138およびCD2サブセット1(CS1)由来の免疫原性ペプチドを特徴とする。例えば、これらのペプチドのすべてまたはサブセットは、多発性骨髄腫細胞、詳細には、くすぶり型多発性骨髄腫細胞、結腸がん細胞、乳がん細胞、膵がん細胞、前立腺がん細胞および白血病、例えば、急性骨髄性白血病(AML)細胞を含む様々ながん細胞の表面上でMHC分子との関連で発現され、これらのペプチドの存在は、これらのおよび他のがんに対するT細胞の活性化および増殖を誘導する。
さらに、これらのペプチドの組み合わせが、標的抗原に対して広範囲の免疫応答を誘導し得ること、およびこの広範囲の応答が、主要な治療上のハードル(とりわけ、腫瘍関連抗原発現の不均一性、特定の抗原の高頻度の変異および個体間のヒトT細胞レパートリーのばらつきを含む)を克服し得ることが見出された。したがって、例えば、薬学的組成物において組み合される、これらのペプチドの組み合わせの投与は、様々ながんに対して、増強された免疫応答を提供し得る。
上記ペプチド(およびそれらの薬学的組成物)が、種々の用途(例えば、免疫応答を誘導するための方法、T細胞(例えば、エフェクターメモリーT細胞および/またはセントラルメモリーT細胞)を活性化するための方法、抗体を産生させるための方法、ならびに例えば、がん(例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLまたはCML)、多発性骨髄腫および前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を処置するための方法)において使用され得ることは、以下の記載から明らかである。
1つの態様において、本開示は、配列番号1〜18のいずれか1つと少なくとも66(例えば、少なくとも66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98または99)%同一のアミノ酸配列を含む単離されたペプチドを特徴とする。そのペプチドは、主要組織適合複合体(MHC)分子(例えば、MHCクラスIまたはクラスII分子)に結合し得る。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号1〜18のいずれか1つのアミノ酸配列または配列番号1〜18のアミノ酸配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%同一のアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号1〜18のいずれか1つのアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、そのペプチドは、配列番号1〜18のいずれか1つのアミノ酸配列の3つ、2つまたは1つの置換を有するアミノ酸配列を含む。それらの置換は、保存的または非保存的であり得る。1つの実施形態において、そのペプチドは、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、乳がん(例えば、浸潤性小葉癌、浸潤性乳管癌、小葉乳管混合癌、乳管内篩状癌、浸潤性小葉乳管(lobular and ductal)癌、浸潤癌)、結腸がん(例えば、腺癌、例えば、粘液性腺癌)、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLもしくはCMLまたは多発性骨髄腫を有するかまたは有するリスクがある被験体を処置するために使用される。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体を処置するために使用される。ある実施形態において、がんは、本明細書中に記載されるがんである。例えば、そのがんは、膀胱がん(進行性および転移性膀胱がんを含む)、乳がん(例えば、エストロゲンレセプター陽性乳がん、エストロゲンレセプター陰性乳がん、HER−2陽性乳がん、HER−2陰性乳がん、トリプルネガティブ乳がん、炎症性乳がん)、結腸がん(結腸直腸がんを含む)、腎臓がん(例えば、腎細胞癌(例えば、乳頭状腎細胞癌、明細胞癌、嫌色素性癌))、肝臓がん、肺がん(小細胞肺がんおよび非小細胞肺がん(腺癌、扁平上皮癌、気管支肺胞癌および大細胞癌を含む)を含む)、泌尿生殖器がん、例えば、卵巣がん(卵管がん、子宮内膜がんおよび腹膜がんを含む)、子宮頸がん、前立腺がんおよび精巣がん、リンパ系のがん、直腸がん、喉頭がん、膵がん(膵外分泌癌を含む)、胃がん(例えば、胃食道がん、胃上部がんまたは胃下部がん)、消化器がん(例えば、肛門がんまたは胆管がん)、胆嚢がん、甲状腺がん、白血病(例えば、急性骨髄性白血病)、神経細胞がんおよびグリア細胞がん(例えば、多形神経膠芽腫)ならびに頭頸部がんであり得る。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、配列番号1〜18のいずれか1つと少なくとも66(例えば、少なくとも66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98または99)%同一のアミノ酸配列からなる。1つの実施形態において、上記ペプチドは、3つ、2つまたは1つの置換を有する配列番号1〜18のアミノ酸配列のいずれかからなる。1つの実施形態において、上記ペプチドは、配列番号1〜18のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチド(例えば、表1を参照のこと)、例えば、配列番号1〜6のいずれか1つのアミノ酸配列を含む非スプライシング型XBP−1ペプチド、配列番号1〜6のいずれか1つのアミノ酸配列と70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む非スプライシング型XBP1ペプチドである。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号1〜6のいずれか1つのアミノ酸配列または配列番号1〜6のいずれか1つのアミノ酸配列と70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、そのペプチドは、配列番号1〜6のいずれか1つのアミノ酸配列の3つ、2つ、1つの置換を有するアミノ酸配列を含む。それらの置換は、保存的または非保存的であり得る。1つの実施形態において、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチドは、配列番号1〜6のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、グループAからのスプライシング型XBP1ペプチド、例えば、配列番号7〜10のいずれか1つのアミノ酸配列を含むスプライシング型XBP−1ペプチド、配列番号7〜10のいずれか1つのアミノ酸配列と70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むスプライシング型XBP1ペプチドである。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号7〜10のいずれか1つのアミノ酸配列または配列番号7〜10のいずれか1つのアミノ酸配列と70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、グループAからのスプライシング型XBP1ペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、そのペプチドは、配列番号7〜10のいずれか1つのアミノ酸配列の3つ、2つ、1つの置換を有するアミノ酸配列を含む。それらの置換は、保存的または非保存的であり得る。1つの実施形態において、グループAからのスプライシング型XBP1ペプチドは、配列番号7〜10のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、グループAからのCD138ペプチド、例えば、配列番号11〜14のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCD138ペプチド、配列番号11〜14のいずれか1つのアミノ酸配列と70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むCD138ペプチドである。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号11〜14のいずれか1つのアミノ酸配列または配列番号11〜14のいずれか1つのアミノ酸配列と70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、グループAからのCD138ペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、そのペプチドは、配列番号11〜14のいずれか1つのアミノ酸配列の3つ、2つ,1つの置換を有するアミノ酸配列を含む。それらの置換は、保存的または非保存的であり得る。1つの実施形態において、グループAからのCD138ペプチドは、配列番号11〜14のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、グループAからのCS−1ペプチド、例えば、配列番号15〜18のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCS−1ペプチド、配列番号15〜18のいずれか1つのアミノ酸配列と70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むCS−1ペプチドである。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号15〜18のいずれか1つのアミノ酸配列または配列番号15〜18のいずれか1つのアミノ酸配列と70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、グループAからのCS−1ペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、そのペプチドは、配列番号15〜18のいずれか1つのアミノ酸配列の3つ、2つ、1つの置換を有するアミノ酸配列を含む。それらの置換は、保存的または非保存的であり得る。1つの実施形態において、グループAからのCS−1ペプチドは、配列番号15〜18のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。
1つの実施形態において、グループAからのペプチド、例えば、非スプライシング型XBP1ペプチド、スプライシング型XBP1ペプチド、CD138ペプチドおよび/またはCS−1ペプチドは、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLまたはCMLを有するかまたは有するリスクがある被験体を処置するために使用される。1つの実施形態において、グループAからのペプチド、例えば、非スプライシング型XBP1ペプチド、スプライシング型XBP1ペプチド、CD138ペプチドおよび/またはCS−1ペプチドは、前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体を処置するために使用される。ある実施形態において、がんは、本明細書中に記載されるがんである。例えば、そのがんは、膀胱がん(進行性および転移性膀胱がんを含む)、乳がん(例えば、エストロゲンレセプター陽性乳がん、エストロゲンレセプター陰性乳がん、HER−2陽性乳がん、HER−2陰性乳がん、トリプルネガティブ乳がん、炎症性乳がん)、結腸がん(結腸直腸がんを含む)、腎臓がん(例えば、腎細胞癌(例えば、乳頭状腎細胞癌、明細胞癌、嫌色素性癌))、肝臓がん、肺がん(小細胞肺がんおよび非小細胞肺がん(腺癌、扁平上皮癌、気管支肺胞癌および大細胞癌を含む)を含む)、泌尿生殖器がん、例えば、卵巣がん(卵管がん、子宮内膜がんおよび腹膜がんを含む)、子宮頸がん、前立腺がんおよび精巣がん、リンパ系のがん、直腸がん、喉頭がん、膵がん(膵外分泌癌を含む)、胃がん(例えば、胃食道がん、胃上部がんまたは胃下部がん)、消化器がん(例えば、肛門がんまたは胆管がん)、胆嚢がん、甲状腺がん、白血病(例えば、急性骨髄性白血病)、神経細胞がんおよびグリア細胞がん(例えば、多形神経膠芽腫)ならびに頭頸部がんであり得る。
いくつかの実施形態において、本明細書中に記載される任意の単離されたペプチドは、主要組織適合複合体(MHC)分子(例えば、MHCクラスIまたはクラスII分子)に結合し得る。そのMHC分子は、例えば、HLA−A2分子であり得る。そのMHC分子は、例えば、ヒトMHC分子であり得る。
別の態様において、本開示は、例えば、HLA−A24分子に対する高い親和性、HLA−A24のペプチド結合間隙内における高い安定性、ならびに細胞(例えば、がん細胞)の表面上でMHC分子との関連で発現された場合、T細胞(例えば、エフェクターメモリーT細胞および/またはセントラルメモリーT細胞)の活性化および増殖を誘導する能力を有する、X−Boxタンパク質1(XBP1)、CD138およびCD2サブセット1(CS1)由来の免疫原性ペプチドを特徴とする。例えば、これらのペプチドのすべてまたはサブセットは、多発性骨髄腫細胞、結腸がん細胞、乳がん細胞、膵がん細胞、前立腺がん細胞および白血病、例えば、急性骨髄性白血病(AML)細胞を含む様々ながん細胞の表面上でMHC分子との関連で発現され、これらのペプチドの存在は、これらのおよび他のがんに対するT細胞の活性化および増殖を誘導する。
上記ペプチド(およびそれらの薬学的組成物)が、種々の用途(例えば、免疫応答を誘導するための方法、T細胞(例えば、エフェクターメモリーT細胞および/またはセントラルメモリーT細胞)を活性化するための方法、抗体を産生させるための方法、ならびに例えば、がん(例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLまたはCML)、多発性骨髄腫および前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を処置するための方法)において使用され得ることは、以下の記載から明らかである。
1つの態様において、本開示は、配列番号29〜50のいずれか1つと少なくとも66(例えば、少なくとも66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98または99)%同一のアミノ酸配列を含む単離されたペプチドを特徴とする。そのペプチドは、主要組織適合複合体(MHC)分子(例えば、MHCクラスIまたはクラスII分子)に結合し得る。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号29〜50のいずれか1つのアミノ酸配列または配列番号29〜50のアミノ酸配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%同一のアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号29〜50のいずれか1つのアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、そのペプチドは、配列番号29〜50のいずれか1つのアミノ酸配列の3つ、2つまたは1つの置換を有するアミノ酸配列を含む。それらの置換は、保存的または非保存的であり得る。1つの実施形態において、そのペプチドは、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん(例えば、浸潤性小葉癌、浸潤性乳管癌、小葉乳管混合癌、乳管内篩状癌、浸潤性小葉乳管癌、浸潤癌)、結腸がん(例えば、結腸腺癌、例えば、粘液性腺癌)、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLもしくはCMLまたは多発性骨髄腫を有するかまたは有するリスクがある被験体を処置するために使用される。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体を処置するために使用される。ある実施形態において、がんは、本明細書中に記載されるがんである。例えば、そのがんは、膀胱がん(進行性および転移性膀胱がんを含む)、乳がん(例えば、エストロゲンレセプター陽性乳がん、エストロゲンレセプター陰性乳がん、HER−2陽性乳がん、HER−2陰性乳がん、トリプルネガティブ乳がん、炎症性乳がん)、結腸がん(結腸直腸がんを含む)、腎臓がん(例えば、腎細胞癌(例えば、乳頭状腎細胞癌、明細胞癌、嫌色素性癌))、肝臓がん、肺がん(小細胞肺がんおよび非小細胞肺がん(腺癌、扁平上皮癌、気管支肺胞癌および大細胞癌を含む)を含む)、泌尿生殖器がん、例えば、卵巣がん(卵管がん、子宮内膜がんおよび腹膜がんを含む)、子宮頸がん、前立腺がんおよび精巣がん、リンパ系のがん、直腸がん、喉頭がん、膵がん(膵外分泌癌を含む)、胃がん(例えば、胃食道がん、胃上部がんまたは胃下部がん)、消化器がん(例えば、肛門がんまたは胆管がん)、胆嚢がん、甲状腺がん、白血病(例えば、急性骨髄性白血病)、神経細胞がんおよびグリア細胞がん(例えば、多形神経膠芽腫)ならびに頭頸部がん(例えば、鼻咽頭がん)であり得る。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、配列番号29〜50のいずれか1つと少なくとも66(例えば、少なくとも66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98または99)%同一のアミノ酸配列からなる。1つの実施形態において、上記ペプチドは、3つ、2つまたは1つの置換を有する配列番号29〜50のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。1つの実施形態において、上記ペプチドは、配列番号29〜50のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチド(表2を参照のこと)、例えば、配列番号29および33〜37のいずれか1つのアミノ酸配列を含む非スプライシング型XBP−1ペプチドまたは配列番号29および33〜37のいずれか1つと70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む非スプライシング型XBP1ペプチドである。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号29および33〜37のいずれか1つのアミノ酸配列または配列番号29および33〜37のいずれか1つと70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、そのペプチドは、3つ、2つ、1つの置換を有する、配列番号29および33〜37のいずれか1つのアミノ酸配列を含む。それらの置換は、保存的または非保存的であり得る。1つの実施形態において、非スプライシング型XBP1ペプチドは、配列番号19のアミノ酸配列からのものであり、配列番号29のアミノ酸配列、および配列番号19の中の配列番号29に対してC末端側の1、2、3、4、5、6、7、8、9個以上(例えば、1、2、3個)のアミノ酸を含む。1つの実施形態において、非スプライシング型XBP1ペプチドは、配列番号19のアミノ酸配列からのものであり、配列番号33のアミノ酸配列、ならびに配列番号19の中の配列番号33に対してN末端側の1、2、3、4、5個以上(例えば、1または2個)のアミノ酸および/または配列番号19の中の配列番号33に対してC末端側の1、2、3個以上(or moire)(例えば、1個)のアミノ酸を含む。1つの実施形態において、非スプライシング型XBP1ペプチドは、配列番号19のアミノ酸配列からのものであり、配列番号36のアミノ酸配列、ならびに配列番号19の中の配列番号36に対してN末端側の1、2、3、4、5、6、7、8、9個以上(例えば、1、2、3または4個)のアミノ酸および/または配列番号19の中の配列番号36に対してC末端側の1、2、3、5、6個以上(例えば、1、2、3、4、5または6個)のアミノ酸を含む。1つの実施形態において、非スプライシング型XBP1ペプチドは、配列番号19のアミノ酸配列からのものであり、配列番号34、35または37のいずれか1つのアミノ酸配列、ならびに配列番号19の中の配列番号34、35または37のいずれか1つに対してN末端側および/またはC末端側の1、2、3、4、5、6、7、8、9個以上(例えば、1、2、3個)のアミノ酸を含む。1つの実施形態において、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチドは、配列番号29および33〜37のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチド、例えば、配列番号30、38および39のいずれか1つのアミノ酸配列を含むスプライシング型XBP−1ペプチドまたは配列番号30、38および39のいずれか1つと70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むスプライシング型XBP1ペプチドである。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号30、38および39のいずれか1つのアミノ酸配列または配列番号30、38および39のいずれか1つと70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、そのペプチドは、3つ、2つ、1つの置換を有する、配列番号30、38および39のいずれか1つのアミノ酸配列を含む。それらの置換は、保存的または非保存的であり得る。1つの実施形態において、スプライシング型XBP1ペプチドは、配列番号20のアミノ酸配列からのものであり、配列番号30、38および39のいずれか1つのアミノ酸配列、ならびに配列番号20の中の配列番号30、38および39のいずれか1つに対してN末端側および/またはC末端側の1、2、3、4、5、6、7、8、9個以上(例えば、1、2、3個)のアミノ酸を含む。1つの実施形態において、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチドは、配列番号30、38および39のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、グループBからのCD138ペプチド、例えば、配列番号31のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCD138ペプチド、または配列番号31および40〜45のいずれか1つと70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むCD138ペプチドである。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号31および40〜45のいずれか1つのアミノ酸配列または配列番号31および40〜45のいずれか1つと70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、グループBからのCD138ペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、そのペプチドは、3つ、2つ、1つの置換を有する、配列番号31および40〜45のいずれか1つのアミノ酸配列を含む。それらの置換は、保存的または非保存的であり得る。1つの実施形態において、CD138ペプチドは、配列番号21のアミノ酸配列からのものであり、配列番号31のアミノ酸配列および配列番号21の中の配列番号31に対してN末端側の1、2、3、4、5、6、7、8個以上(例えば、1、2、3、4個)のアミノ酸を含む。1つの実施形態において、CD138ペプチドは、配列番号21のアミノ酸配列からのものであり、配列番号42または44のアミノ酸配列、ならびに配列番号21の中の配列番号42もしくは44に対してN末端側の1、2、3、4、5個以上(例えば、1、2、3、4個)のアミノ酸および/または配列番号21の中の配列番号42もしくは44に対してC末端側の1、2、3、4、5、6、7、8、9個以上(例えば、1、2、3、4、5、6個)のアミノ酸を含む。1つの実施形態において、CD138ペプチドは、配列番号21のアミノ酸配列からのものであり、配列番号45のアミノ酸配列、ならびに配列番号21の中の配列番号45に対してN末端側の1、2、3、4、5、6、7、8個以上(例えば、1、2、3または4個)のアミノ酸および/または配列番号21の中の配列番号45に対してC末端側の1、2、3、5、6、7、8、9個以上(例えば、1、2、3、4、5または6個)のアミノ酸を含む。1つの実施形態において、CD138ペプチドは、配列番号21のアミノ酸配列からのものであり、配列番号40、41または43のいずれか1つのアミノ酸配列、ならびに配列番号21の中の配列番号40、41または43のいずれか1つに対してN末端側および/またはC末端側の1、2、3、4、5、6、7、8、9個以上(例えば、1、2、3個)のアミノ酸を含む。1つの実施形態において、グループBからのCD138ペプチドは、配列番号31および40〜45のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。
1つの実施形態において、上記ペプチドは、グループBからのCS−1ペプチド、例えば、配列番号32および46〜50のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCS−1ペプチドまたは配列番号32および46〜50のいずれか1つと70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むCS−1ペプチドである。1つの実施形態において、そのペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、配列番号32および46〜50のいずれか1つのアミノ酸配列または配列番号32および46〜50のいずれか1つと70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。1つの実施形態において、グループBからのCS−1ペプチドは、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であり、そのペプチドは、配列番号32および46〜50のいずれか1つの、3つ、2つ、1つの置換を有するアミノ酸配列を含む。それらの置換は、保存的または非保存的であり得る。1つの実施形態において、CS−1ペプチドは、配列番号22のアミノ酸配列からのものであり、配列番号32のアミノ酸配列および配列番号22の中の配列番号32に対してC末端側の1、2、3、4、5、6、7、8、9個以上(例えば、1、2、3個)のアミノ酸を含む。1つの実施形態において、CS−1ペプチドは、配列番号22のアミノ酸配列からのものであり、配列番号46〜50のいずれか1つのアミノ酸配列ならびに配列番号22の中の配列番号46〜50のいずれか1つに対してN末端側および/またはC末端側の1、2、3、4、5、6、7、8、9個以上(例えば、1、2、3個)のアミノ酸を含む。1つの実施形態において、グループBからのCS−1ペプチドは、配列番号32および46〜50のいずれか1つのアミノ酸配列からなる。
1つの実施形態において、グループBからのペプチド、例えば、非スプライシング型XBP1ペプチド、スプライシング型XBP1ペプチド、CD138ペプチドおよび/またはCS−1ペプチドは、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLまたはCMLを有するかまたは有するリスクがある被験体を処置するために使用される。1つの実施形態において、グループBからのペプチド、例えば、非スプライシング型XBP1ペプチド、スプライシング型XBP1ペプチド、CD138ペプチドおよび/またはCS−1ペプチドは、前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体を処置するために使用される。ある実施形態において、がんは、本明細書中に記載されるがんである。例えば、そのがんは、膀胱がん(進行性および転移性膀胱がんを含む)、乳がん(例えば、エストロゲンレセプター陽性乳がん、エストロゲンレセプター陰性乳がん、HER−2陽性乳がん、HER−2陰性乳がん、トリプルネガティブ乳がん、炎症性乳がん)、結腸がん(結腸直腸がんを含む)、腎臓がん(例えば、腎細胞癌(例えば、乳頭状腎細胞癌、明細胞癌、嫌色素性癌))、肝臓がん、肺がん(小細胞肺がんおよび非小細胞肺がん(腺癌、扁平上皮癌、気管支肺胞癌および大細胞癌を含む)を含む)、泌尿生殖器がん、例えば、卵巣がん(卵管がん、子宮内膜がんおよび腹膜がんを含む)、子宮頸がん、前立腺がんおよび精巣がん、リンパ系のがん、直腸がん、喉頭がん、膵がん(膵外分泌癌を含む)、胃がん(例えば、胃食道がん、胃上部がんまたは胃下部がん)、消化器がん(例えば、肛門がんまたは胆管がん)、胆嚢がん、甲状腺がん、白血病(例えば、急性骨髄性白血病)、神経細胞がんおよびグリア細胞がん(例えば、多形神経膠芽腫)ならびに頭頸部がん(例えば、鼻咽頭がん)であり得る。
いくつかの実施形態において、本明細書中に記載される任意の単離されたペプチドは、主要組織適合複合体(MHC)分子と会合した状態で、T細胞上の抗原特異的T細胞レセプターによって認識され得る。
別の態様において、本開示は、本明細書中に記載されるペプチド、例えば、グループA、グループBもしくはグループCからの非スプライシング型XBP1ペプチド、グループAもしくはグループBからのスプライシング型XBP1ペプチド、グループA、グループBもしくはグループCからのCD138ペプチドおよび/またはグループA、グループBもしくはグループCからのCS−1ペプチドからなる第1のアミノ酸配列(例えば、本明細書中に記載されるもの);ならびに第1のアミノ酸配列と異種の第2のアミノ酸配列を含む融合タンパク質を特徴とする。
いくつかの実施形態において、第2のアミノ酸配列は、標的化ポリペプチド、免疫刺激分子、免疫グロブリンもしくはその抗原結合フラグメント、免疫グロブリン分子のFcレセプター結合領域またはキャリアポリペプチドを含み得るか、またはそれらであり得る。標的化ポリペプチドは、例えば、単離されたペプチドを抗原提示細胞(例えば、樹状細胞、マクロファージ、単球またはB細胞)に対して標的化するポリペプチドであり得る。免疫刺激分子は、例えば、サイトカインまたはTヘルパーエピトープであり得る。免疫グロブリンは、例えば、一本鎖Fv免疫グロブリンフラグメントまたは免疫グロブリン分子全体であり得る。キャリアポリペプチドは、KLH(キーホールリンペットヘモシアニン)ポリペプチドまたはアルブミンポリペプチドを含み得るか、またはそれらであり得る。
いくつかの実施形態において、本明細書中に記載される任意の単離されたペプチドは、リンカー配列を含み得る。そのリンカー配列は、第1のアミノ酸配列を第2のアミノ酸配列に直接または間接的に接続し得る。そのリンカー配列は、1つ以上のアミノ酸、例えば、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9または10個のアミノ酸を含み得るか、またはそれらからなり得る。1つの実施形態において、そのリンカーは、少なくとも1つ(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10個以上)のプロテアーゼ切断部位を含み得るか、またはそれらからなり得る。
いくつかの実施形態において、第2のアミノ酸配列は、第1のアミノ酸配列に対してアミノ末端側またはカルボキシ末端側であり得る。
いくつかの実施形態において、本明細書中に記載される任意の単離されたペプチドまたは融合タンパク質は、検出可能に標識され得る。その検出可能な標識は、発光標識、蛍光標識、放射性標識および酵素標識からなる群より選択され得る。
なおも別の態様において、本開示は、(i)本明細書中に記載される任意の単離されたペプチドをコードする単離された核酸;(ii)(i)の単離された核酸を含むベクター;または(iii)(ii)のベクターを含む培養細胞を特徴とする。そのベクターは、発現調節配列に作動可能に連結され得る。その培養細胞は、原核細胞または真核細胞であり得る。その培養細胞は、例えば、真菌細胞、植物細胞または動物細胞(例えば、線形動物細胞、昆虫細胞、鳥類細胞、魚類細胞または哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞))であり得る。その培養細胞は、本明細書中に記載される任意の免疫細胞などの免疫細胞であり得る。
別の態様において、本開示は、ペプチドを産生させる方法を特徴とする。その方法は、本明細書中に記載される任意の培養細胞を、ペプチドの発現を可能にする条件下で培養する工程を含む。その方法は、ペプチドを細胞または細胞が培養された培地から単離する工程も含み得る。
別の態様において、本開示は、本明細書中に記載される任意の単離されたペプチド(または融合タンパク質)の1つ以上および薬学的に許容され得るキャリアを含む薬学的組成物を特徴とする。1つの実施形態において、その組成物は、少なくとも2つのペプチド、例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14個以上の本明細書中に記載されるペプチドを含む。例えば、1つの実施形態において、その組成物は、少なくとも2、3または4個の本明細書中に記載されるペプチドを含む。
1つの実施形態において、上記組成物は、少なくとも2つのペプチドを含む。例えば、上記組成物は、非スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチド、およびスプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループAからのスプライシング型XBP1ペプチドを含み;上記組成物は、非スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチド、およびCD138ペプチド、例えば、グループAからのCD138ペプチドを含み;上記組成物は、非スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチド、およびCS−1ペプチド、例えば、グループAからのCS−1ペプチドを含み;上記組成物は、スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループAからのスプライシング型XBP1ペプチド、およびCD138ペプチド、例えば、グループAからのCD138ペプチドを含み;上記組成物は、スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループAからのスプライシング型XBP1ペプチド、およびCS−1ペプチド、例えば、グループAからのCS−1ペプチドを含み;上記組成物は、CD138ペプチド、例えば、グループAからのCD138ペプチド、およびCS−1ペプチド、例えば、グループAからのCS−1ペプチドを含む。
1つの実施形態において、上記組成物は、少なくとも3つのペプチドを含む。例えば、上記組成物は、非スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループAから記載された非スプライシング型XBP1ペプチド、スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループからAのスプライシング型XBP1ペプチド、およびCD138ペプチド、例えば、グループAからのCD138ペプチドを含み;上記組成物は、非スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチド、スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループAからのスプライシング型XBP1ペプチド、およびCS−1ペプチド、例えば、グループからAのCS−1ペプチドを含み;上記組成物は、非スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチド、CD138ペプチド、例えば、グループAからのCD138ペプチド、およびCS−1ペプチド、例えば、グループAからのCS−1ペプチドを含み;上記組成物は、スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループAからのスプライシング型XBP1ペプチド、CD138ペプチド、例えば、グループAからのCD138ペプチド、およびCS−1ペプチド、例えば、グループAからのCS−1ペプチドを含む。1つの実施形態において、上記組成物は、少なくとも3つのペプチド、例えば、非スプライシング型XBP1ペプチド(例えば、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチド)、スプライシング型XBP1ペプチド(例えば、グループAからのスプライシング型XBP−1ペプチド)およびCD138ペプチド(例えば、グループAからのCD138ペプチド)を含む。
1つの実施形態において、上記組成物は、4つのペプチドを含み、例えば、上記組成物は、非スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチド、スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループAからのスプライシング型XBP1ペプチド、CD138ペプチド、例えば、グループAからのCD138ペプチド、およびCS−1ペプチド、例えば、グループAからのCS−1ペプチドを含む。
1つの実施形態において、上記組成物は、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であって、配列番号1〜6のいずれか、例えば、配列番号6のアミノ酸配列を含む、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチドを含む。1つの実施形態において、上記組成物は、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であって、配列番号7〜10のいずれか、例えば、配列番号10のアミノ酸配列を含む、グループAからのスプライシング型XBP1ペプチドを含む。1つの実施形態において、上記組成物は、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であって、配列番号11〜14のいずれか、例えば、配列番号12のアミノ酸配列を含む、グループAからのCD138ペプチドを含む。1つの実施形態において、上記組成物は、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であって、配列番号15〜18のいずれか、例えば、配列番号16のアミノ酸配列を含む、グループAからのCS−1ペプチドを含む。
1つの実施形態において、上記組成物は、4つのペプチドを含み、その4つのペプチドは、配列番号6のアミノ酸配列を含む(例えば、それからなる)グループAからのペプチド、配列番号10のアミノ酸配列を含む(例えば、それからなる)グループAからのペプチド、配列番号12のアミノ酸配列を含む(例えば、それからなる)グループAからのペプチド、および配列番号16のアミノ酸配列を含む(例えば、それからなる)グループAからのペプチドである。
1つの実施形態において、上記組成物は、少なくとも2つのペプチドを含む。例えば、上記組成物は、非スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチド、およびスプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチドを含み;上記組成物は、非スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチド、およびCD138ペプチド、例えば、グループBからのCD138ペプチドを含み;上記組成物は、非スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチド、およびCS−1ペプチド、例えば、グループBからのCS−1ペプチドを含み;上記組成物は、スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチド、およびCD138ペプチド、例えば、グループBからのCD138ペプチドを含み;上記組成物は、スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチド、およびCS−1ペプチド、例えば、グループBからのCS−1ペプチドを含み;上記組成物は、CD138ペプチド、例えば、グループBからのCD138ペプチド、およびCS−1ペプチド、例えば、グループBからのCS−1ペプチドを含む。
1つの実施形態において、上記組成物は、少なくとも3つのペプチドを含む。例えば、上記組成物は、非スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループBから記載された非スプライシング型XBP1ペプチド、スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチド、およびCD138ペプチド、例えば、グループBからのCD138ペプチドを含み;上記組成物は、非スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチド、スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチド、およびCS−1ペプチド、例えば、グループBからのCS−1ペプチドを含み;上記組成物は、非スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチド、CD138ペプチド、例えば、グループBからのCD138ペプチド、およびCS−1ペプチド、例えば、グループBからのCS−1ペプチドを含み;上記組成物は、スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチド、CD138ペプチド、例えば、グループBからのCD138ペプチド、およびCS−1ペプチド、例えば、グループBからのCS−1ペプチドを含む。1つの実施形態において、上記組成物は、少なくとも3つのペプチド、例えば、非スプライシング型XBP1ペプチド(例えば、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチド)、スプライシング型XBP1ペプチド(例えば、グループBからのスプライシング型XBP−1ペプチド)およびCD138ペプチド(例えば、グループBからのCD138ペプチド)を含む。
1つの実施形態において、上記組成物は、4つのペプチドを含み、例えば、上記組成物は、非スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチド、スプライシング型XBP1ペプチド、例えば、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチド、CD138ペプチド、例えば、グループBからのCD138ペプチド、およびCS−1ペプチド、例えば、グループBからのCS−1ペプチドを含む。
1つの実施形態において、上記組成物は、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であって、配列番号29および33〜37のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチドを含む。1つの実施形態において、上記組成物は、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であって、配列番号30、38および39のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチドを含む。1つの実施形態において、上記組成物は、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であって、配列番号31および40〜45のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、グループBからのCD138ペプチドを含む。1つの実施形態において、上記組成物は、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、最大25、30または35アミノ酸長であって、配列番号32および46〜50のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、グループBからのCS−1ペプチドを含む。
1つの実施形態において、上記組成物は、4つのペプチドを含み、その4つのペプチドは、配列番号29および33〜37のいずれか1つのアミノ酸配列を含む(例えば、それからなる)グループBからのペプチド、配列番号30、38および39のいずれか1つのアミノ酸配列を含む(例えば、それからなる)グループBからのペプチド、配列番号31および40〜45のいずれか1つのアミノ酸配列を含む(例えば、それからなる)グループBからのペプチド、ならびに配列番号32および46〜50のいずれか1つのアミノ酸配列を含む(例えば、それからなる)グループBからのペプチドである。
1つの実施形態において、上記組成物は、グループAおよびグループBからのペプチドを含む。例えば、上記組成物は、グループAからの1、2、3、4つ以上のペプチドおよびグループBからの1、2、3、4つ以上のペプチドを含む。
上記組成物は、例えば、1つ以上のさらなる薬剤、例えば、1つ以上の治療薬、診断薬または予防薬または免疫刺激剤もしくは免疫調節剤(immune modulating agents)も含み得る。免疫刺激剤としては、例えば、Tヘルパーエピトープ、変更されたペプチドリガンド、アジュバントまたは本明細書中に記載される他の任意の免疫刺激剤が挙げられるが、これらに限定されない。Tヘルパーエピトープは、例えば、PADRE配列またはユニバーサル破傷風トキソイドTヘルパー(TT Th)エピトープであり得る。アジュバントは、フロイント完全アジュバント、フロイント不完全アジュバント、ミョウバン、Tollレセプターに対するリガンド、サポニン(例えば、QS21)、RIBI、コレラ毒素(CT)、大腸菌易熱性トキシン(LT)、変異CT(MCT)、変異大腸菌易熱性トキシン(MLT)、カルボキシメチルセルロース、ポリイノシン酸−ポリシチジル酸およびポリ−L−リジン二本鎖RNAを含むアジュバント(例えば、ポリIC−LC、例えば、ヒルトノール(hiltonol))、水と油のエマルジョン(water−and−oil emulsion)を含むアジュバント(例えば、モンタナイド)、ならびにタンパク質(例えば、サイトカイン、補体、GCSF、GM−CSF)を含むアジュバントからなる群より選択され得る。1つの実施形態において、免疫刺激剤は、カルボキシメチルセルロース、ポリイノシン酸−ポリシチジル酸およびポリ−L−リジン二本鎖RNAを含むアジュバント、例えば、ポリIC−LC、例えば、ヒルトノールである。1つの実施形態において、アジュバントは、水と油のエマルジョン、例えば、モンタナイドである。1つの実施形態において、アジュバントは、タンパク質、例えば、サイトカイン、補体、GCSF、GM−CSFである。1つの実施形態において、免疫調節剤は、タンパク質、例えば、免疫系を調節する抗体であり得る。例えば、免疫系を調節する抗体は、抗CTLA4抗体、例えば、イピリムマブ(ipilimumab)もしくはトレメリムマブ(tremelimumab)、または抗PD−1抗体、または抗PDL−1抗体であり得る。1つの実施形態において、免疫調節剤は、小分子アジュバント、例えば、サリドマイドまたはサリドマイド誘導体、例えば、レナリドマイドであり得る。
上記組成物は、上に開示されたもの以外の免疫原性ペプチド、例えば、WT1由来の免疫原性ペプチドまたはその誘導体も含み得る。例示的なWT1ペプチドは、米国特許第7,598,221号(その内容が、参照により本明細書中に援用される)に記載されている。1つの実施形態において、上記組成物は、例えば、WT1クラス1エピトープ;RMFPNAPYL(配列番号538)(WT1 126〜134)を含む(またはそれからなる)ペプチド;YMFPNAPYL(配列番号539)を含む(またはそれからなる)ペプチド;RSDELVRHHNMHQRNMTKL(配列番号540)(WT1 427〜445)を含む(またはそれからなる)ペプチド;PGCNKRYFKLSHLQMHSRKHTG(配列番号541)(WT1 331〜352)を含む(またはそれからなる)ペプチド;SGQARMFPNAPYLPSCLES(配列番号542)(WT1 122〜140)を含む(またはそれからなる)ペプチド;およびSGQAYMFPNAPYLPSCLES(配列番号543)を含む(またはそれからなる)ペプチドの1つ以上から選択される、WT1由来の1つ以上の免疫原性ペプチドまたはその誘導体を含む。他の免疫原性ペプチドとしては、MUC1由来の免疫原性ペプチド、gp100由来の免疫原性ペプチド、TRP−2由来の免疫原性ペプチド、MAG1由来の免疫原性ペプチド、NY−ESO1由来の免疫原性ペプチド、HER−2由来の免疫原性ペプチド;およびAIM2由来の免疫原性ペプチドが挙げられるが、これらに限定されない。
1つの実施形態において、本明細書中に記載される組成物は、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、乳がん(例えば、浸潤性小葉癌、浸潤性乳管癌、小葉乳管混合癌、乳管内篩状癌、浸潤性小葉乳管癌、浸潤癌)、結腸がん(例えば、結腸腺癌、例えば、粘液性腺癌)、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLもしくはCMLまたは多発性骨髄腫を有するかまたは有するリスクがある被験体を処置するために使用される。1つの実施形態において、本明細書中に記載される組成物は、前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体を処置するために使用される。ある実施形態において、がんは、本明細書中に記載されるがんである。例えば、そのがんは、膀胱がん(進行性および転移性膀胱がんを含む)、乳がん(例えば、エストロゲンレセプター陽性乳がん、エストロゲンレセプター陰性乳がん、HER−2陽性乳がん、HER−2陰性乳がん、トリプルネガティブ乳がん、炎症性乳がん)、結腸がん(結腸直腸がんを含む)、腎臓がん(例えば、腎細胞癌(例えば、乳頭状腎細胞癌、明細胞癌、嫌色素性癌))、肝臓がん、肺がん(小細胞肺がんおよび非小細胞肺がん(腺癌、扁平上皮癌、気管支肺胞癌および大細胞癌を含む)を含む)、泌尿生殖器がん、例えば、卵巣がん(卵管がん、子宮内膜がんおよび腹膜がんを含む)、子宮頸がん、前立腺がんおよび精巣がん、リンパ系のがん、直腸がん、喉頭がん、膵がん(膵外分泌癌を含む)、胃がん(例えば、胃食道がん、胃上部がんまたは胃下部がん)、消化器がん(例えば、肛門がんまたは胆管がん)、胆嚢がん、甲状腺がん、白血病(例えば、急性骨髄性白血病)、神経細胞がんおよびグリア細胞がん(例えば、多形神経膠芽腫)ならびに頭頸部がんであり得る。
なおも別の態様において、本開示は、(i)グループA、グループBおよび/またはグループCからの任意の単離されたペプチドの1つ以上;ならびにそのペプチドを、被験体、例えば、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLもしくはCMLまたは多発性骨髄腫を有する被験体、あるいは前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体に投与するための指示;(ii)本明細書中に記載される組成物、および上記ペプチドを被験体、例えば、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLもしくはCMLまたは多発性骨髄腫を有する被験体、あるいは前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体に投与するための指示;および/または(iii)単離されたペプチドをコードする単離された核酸の1つ以上、単離された核酸を含む1つ以上のベクターもしくはそれらのベクターを含む1つ以上の培養細胞および単離されたペプチドを生成するための指示を含むキットを特徴とする。ある実施形態において、がんは、本明細書中に記載されるがんである。例えば、そのがんは、膀胱がん(進行性および転移性膀胱がんを含む)、乳がん(例えば、エストロゲンレセプター陽性乳がん、エストロゲンレセプター陰性乳がん、HER−2陽性乳がん、HER−2陰性乳がん、トリプルネガティブ乳がん、炎症性乳がん)、結腸がん(結腸直腸がんを含む)、腎臓がん(例えば、腎細胞癌(例えば、乳頭状腎細胞癌、明細胞癌、嫌色素性癌))、肝臓がん、肺がん(小細胞肺がんおよび非小細胞肺がん(腺癌、扁平上皮癌、気管支肺胞癌および大細胞癌を含む)を含む)、泌尿生殖器がん、例えば、卵巣がん(卵管がん、子宮内膜がんおよび腹膜がんを含む)、子宮頸がん、前立腺がんおよび精巣がん、リンパ系のがん、直腸がん、喉頭がん、膵がん(膵外分泌癌を含む)、胃がん(例えば、胃食道がん、胃上部がんまたは胃下部がん)、消化器がん(例えば、肛門がんまたは胆管がん)、胆嚢がん、甲状腺がん、白血病(例えば、急性骨髄性白血病)、神経細胞がんおよびグリア細胞がん(例えば、多形神経膠芽腫)ならびに頭頸部がんであり得る。
いくつかの実施形態において、上記キットは、例えば、1つ以上の薬学的に許容され得るキャリア、1つ以上の免疫刺激剤もしくは免疫調節剤または1つ以上の治療薬、診断薬もしくは予防薬も含み得る。1つの実施形態において、免疫刺激剤は、本明細書中に記載される免疫刺激剤である。1つ以上の免疫刺激剤は、Tヘルパーエピトープ、変更されたペプチドリガンドおよびアジュバントからなる群より選択され得る。1つの実施形態において、免疫刺激剤は、カルボキシメチルセルロース、ポリイノシン酸−ポリシチジル酸およびポリ−L−リジン二本鎖RNAを含むアジュバント(例えば、ポリIC−LC t、例えば、ヒルトノール);水と油のエマルジョンを含むアジュバント(例えば、モンタナイド);タンパク質(例えば、サイトカイン、補体、GCSF、GM−CSF)を含むアジュバントである。1つの実施形態において、免疫調節剤は、本明細書中に記載される免疫調節剤、例えば、タンパク質、例えば、免疫系を調節する抗体(例えば、抗CTLA4抗体、例えば、イピリムマブまたはトレメリムマブ、抗PD−1抗体、抗PDL−1抗体)、小分子アジュバント(例えば、サリドマイドまたはサリドマイド誘導体、例えば、レナリドマイド)である。1つの実施形態において、上記キットは、免疫刺激剤および/または免疫調節剤を、本明細書中に記載されるペプチド(単数または複数)または本明細書中に記載される組成物とともに投与するための指示をさらに含む。
1つの実施形態において、上記キットは、さらなる免疫原性ペプチド、例えば、Wt1由来の免疫原性ペプチドまたはその誘導体、例えば、本明細書中に記載される免疫原性WT1ペプチドをさらに含む。他の免疫原性ペプチドとしては、MUC1由来の免疫原性ペプチド、gp100由来の免疫原性ペプチド、TRP−2由来の免疫原性ペプチド、MAG1由来の免疫原性ペプチド、NY−ESO1由来の免疫原性ペプチド、HER−2由来の免疫原性ペプチド;およびAIM2由来の免疫原性ペプチドが挙げられるが、これらに限定されない。1つの実施形態において、上記キットは、さらなる免疫原性ペプチド、例えば、WT1ペプチドを、本明細書中に記載されるペプチド(単数または複数)または本明細書中に記載される組成物とともに投与するための指示をさらに含む。
別の態様において、本開示は、容器;およびその容器内に含められた組成物を含む製造品を特徴とし、ここで、その組成物は、本明細書中に記載される組成物である。その容器は、その組成物が哺乳動物、例えば、ヒトにおいて免疫応答を誘導するために使用するためのものであることを示す表示を有し得る。その表示は、その組成物が、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLもしくはCMLまたは多発性骨髄腫を有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある哺乳動物、あるいは前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体に投与されるべきであることをさらに示し得る。その製造品は、その組成物を哺乳動物、例えば、ヒトに投与するための指示も含み得る。その組成物は、例えば、溶液状態、乾燥されたまたは凍結乾燥された状態であり得る。
ある実施形態において、がんは、本明細書中に記載されるがんである。例えば、そのがんは、膀胱がん(進行性および転移性膀胱がんを含む)、乳がん(例えば、エストロゲンレセプター陽性乳がん、エストロゲンレセプター陰性乳がん、HER−2陽性乳がん、HER−2陰性乳がん、トリプルネガティブ乳がん、炎症性乳がん)、結腸がん(結腸直腸がんを含む)、腎臓がん(例えば、腎細胞癌(例えば、乳頭状腎細胞癌、明細胞癌、嫌色素性癌))、肝臓がん、肺がん(小細胞肺がんおよび非小細胞肺がん(腺癌、扁平上皮癌、気管支肺胞癌および大細胞癌を含む)を含む)、泌尿生殖器がん、例えば、卵巣がん(卵管がん、子宮内膜がんおよび腹膜がんを含む)、子宮頸がん、前立腺がんおよび精巣がん、リンパ系のがん、直腸がん、喉頭がん、膵がん(膵外分泌癌を含む)、胃がん(例えば、胃食道がん、胃上部がんまたは胃下部がん)、消化器がん(例えば、肛門がんまたは胆管がん)、胆嚢がん、甲状腺がん、白血病(例えば、急性骨髄性白血病)、神経細胞がんおよびグリア細胞がん(例えば、多形神経膠芽腫)ならびに頭頸部がんであり得る。
なおも別の態様において、本開示は、被験体において免疫応答を誘導するための方法を特徴とし、その方法は、本明細書中に記載される任意の単離されたペプチドの1つ以上および/または本明細書中に記載される組成物を被験体に送達する工程、例えば、投与する工程を含む。1つの実施形態において、その被験体には、少なくとも2つ、例えば、2、3または4つの、グループAからのペプチドが投与される。例えば、その被験体には、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチド、グループAからのスプライシング型XBP1ペプチド、グループAからのCD138ペプチド、グループAからのCS−1ペプチドおよびそれらの組み合わせのうちの2つ以上が投与され得る。1つの実施形態において、その被験体には、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチド(例えば、配列番号6を含む非スプライシング型XBP1ペプチド)、グループAからのスプライシング型XBP1ペプチド(例えば、配列番号10を含むスプライシング型XBP1ペプチド)、グループAからのCD138ペプチド(例えば、配列番号12を含むCD138ペプチド)およびグループAからのCS−1ペプチド(例えば、配列番号16を含むCS−1ペプチド)が投与される。1つの実施形態において、その被験体には、少なくとも2つ、例えば、2、3または4つの、グループBからのペプチドが投与される。例えば、その被験体には、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチド、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチド、グループBからのCD138ペプチド、グループBからのCS−1ペプチドおよびそれらの組み合わせが投与され得る。1つの実施形態において、その被験体には、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチド(例えば、配列番号29を含む非スプライシング型XBP1ペプチド)、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチド(例えば、配列番号30を含むスプライシング型XBP1ペプチド)、グループBからのCD138ペプチド(例えば、配列番号31を含むCD138ペプチド)およびグループBからのCS−1ペプチド(例えば、配列番号32を含むCS−1ペプチド)が投与される。1つの実施形態において、その被験体には、少なくとも2つ(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20個以上)の、グループCからのペプチドが投与される。別の実施形態において、その被験体には、グループAおよびグループCまたはグループBおよびグループCからの2つ以上のペプチドが投与される。
上記方法は、1つ以上のペプチドまたは組成物を被験体に送達した後に、その被験体において免疫応答が生じたかを測定する工程も含み得る。その1つ以上のペプチドは、薬学的組成物、例えば、本明細書中に記載される薬学的組成物として被験体に送達され得る。その被験体は、例えば、哺乳動物(例えば、ヒト)または本明細書中に記載される他の任意の被験体であり得る。その被験体は、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLもしくはCMLまたは多発性骨髄腫を有し得るか、それらを有すると疑われ得るか、それらを発症するリスクがあり得るか、またはそれらから寛解している可能性がある。1つの実施形態において、その被験体は、前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する。ある実施形態において、がんは、本明細書中に記載されるがんである。例えば、そのがんは、膀胱がん(進行性および転移性膀胱がんを含む)、乳がん(例えば、エストロゲンレセプター陽性乳がん、エストロゲンレセプター陰性乳がん、HER−2陽性乳がん、HER−2陰性乳がん、トリプルネガティブ乳がん、炎症性乳がん)、結腸がん(結腸直腸がんを含む)、腎臓がん(例えば、腎細胞癌(例えば、乳頭状腎細胞癌、明細胞癌、嫌色素性癌))、肝臓がん、肺がん(小細胞肺がんおよび非小細胞肺がん(腺癌、扁平上皮癌、気管支肺胞癌および大細胞癌を含む)を含む)、泌尿生殖器がん、例えば、卵巣がん(卵管がん、子宮内膜がんおよび腹膜がんを含む)、子宮頸がん、前立腺がんおよび精巣がん、リンパ系のがん、直腸がん、喉頭がん、膵がん(膵外分泌癌を含む)、胃がん(例えば、胃食道がん、胃上部がんまたは胃下部がん)、消化器がん(例えば、肛門がんまたは胆管がん)、胆嚢がん、甲状腺がん、白血病(例えば、急性骨髄性白血病)、神経細胞がんおよびグリア細胞がん(例えば、多形神経膠芽腫)ならびに頭頸部がんであり得る。
いくつかの実施形態において、上記方法は、がん細胞(または複数のがん細胞)が、XBP1、CD138またはCS−1のうちの1つ以上を発現しているかを決定する工程を含み得る。
いくつかの実施形態において、上記方法は、1つ以上のさらなる処置、例えば、化学療法剤、電離放射線、手術または1つ以上のさらなる免疫療法剤を被験体に施行する工程をさらに含み得る。電離放射線の1つ以上の形態は、例えば、ガンマ線照射、X線照射またはベータ線照射であり得る。1つ以上の化学療法剤は、本明細書中に記載される化学療法剤、例えば、白金ベースの薬剤、タキサン、トポイソメラーゼ(topisomerase)阻害剤、代謝拮抗物質、アルキル化剤、プロテアーゼ阻害剤およびビンカアルカロイドからなる群より選択される化学療法剤であり得る。例示的な化学療法剤としては:シスプラチン、カルボプラチン、プロカルバジン、メクロレタミン、シクロホスファミド、カンプトテシン、アドリアマイシン、イホスファミド、メルファラン、クロラムブシル、ブスルファン(bisulfan)、ニトロソ尿素(nitrosurea)、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、ブレオマイシン、プリカマイシン(plicomycin)、マイトマイシン、エトポシド、ベランピル(verampil)、ポドフィロトキシン、タキソール、トランス白金(transplatinum)、5−フルオロウラシル(flurouracil)、ビンクリスチン(vincristin)、ビンブラスチン(vinblastin)、メトトレキサートおよび上述のいずれかのアナログが挙げられるが、これらに限定されない。上記方法は、1つ以上の免疫刺激剤、例えば、本明細書中に記載される1つ以上の免疫刺激剤を被験体に投与する工程も含み得る。
1つの実施形態において、上記方法は、さらなる免疫原性ペプチド、例えば、WT1由来の免疫原性ペプチドまたはその誘導体、例えば、本明細書中に記載される免疫原性WT1ペプチドを、本明細書中に記載される1つ以上のペプチドとともに投与する工程をさらに含む。他の免疫原性ペプチドとしては、MUC1由来の免疫原性ペプチド、gp100由来の免疫原性ペプチド、TRP−2由来の免疫原性ペプチド、MAG1由来の免疫原性ペプチド、NY−ESO1由来の免疫原性ペプチド、HER−2由来の免疫原性ペプチド;およびAIM2由来の免疫原性ペプチドが挙げられるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態において、上記送達する工程は、グループA、グループBおよび/もしくはグループCからの1つ以上のペプチドまたは本明細書中に記載される組成物を被験体に投与する工程を含む。いくつかの実施形態において、上記送達する工程は、1つ以上の核酸を被験体に投与する工程を含み、それらの核酸の各々は、1つ以上のペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、そのヌクレオチド配列は、発現調節配列に作動可能に連結されている。その核酸は、その核酸でトランスフェクトされ、1つ以上のペプチドを発現している、組換え細胞内に存在し得る。その組換え細胞は、被験体から得られた細胞をトランスフェクトすることによって作製された、トランスフェクトされた細胞またはトランスフェクトされた細胞の子孫であり得る。その組換え細胞は、抗原提示細胞(例えば、樹状細胞、マクロファージ、単球またはB細胞であるがこれらに限定されない)であり得る。
上に記載された方法のいずれかのいくつかの実施形態において、送達する工程は、1つ以上のペプチドを細胞と接触させる工程;および1つ以上のペプチドを細胞と接触させた後に、その細胞を被験体に送達する工程を含む。その細胞は、例えば、抗原提示細胞(例えば、本明細書中に記載されるもののいずれか)であり得る。その細胞は、例えば、被験体から得られた、細胞または細胞の子孫であり得る。いくつかの実施形態において、その細胞は、被験体と同じ種の別の被験体から得られた細胞または細胞の子孫であり得る。その他の被験体は、被験体と共通の少なくとも1つのMHC分子を発現し得る。その少なくとも1つのMHC分子は、例えば、MHCクラスI分子(例えば、HLA−A2分子および/またはHLA−A24分子)であり得る。
別の態様において、本開示は、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLもしくはCMLまたは多発性骨髄腫を有する被験体あるいは前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体を処置するための方法を特徴とする。1つの実施形態において、その方法は、グループAからの1つ以上(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17または18個)の任意のペプチドまたは本明細書中に記載される組成物を被験体に投与する工程を含み、ここで、その被験体は、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、乳がん(例えば、浸潤性小葉癌、浸潤性乳管癌、小葉乳管混合癌、乳管内篩状癌、浸潤性小葉乳管癌、浸潤癌)、結腸がん(例えば、結腸腺癌、例えば、粘液性腺癌)、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLもしくはCMLまたは多発性骨髄腫を有するかまたは発症するリスクがあるか、あるいはその被験体は、前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する。1つの実施形態において、その方法は、グループBからの1つ以上(例えば、1、2、3または4つ)の任意のペプチドまたは本明細書中に記載される組成物を被験体に投与する工程を含み、その被験体は、がん、本明細書中に記載されるがん、例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん(例えば、浸潤性小葉癌、浸潤性乳管癌、小葉乳管混合癌、乳管内篩状癌、浸潤性小葉乳管癌、浸潤癌)、結腸がん(例えば、結腸腺癌、例えば、粘液性腺癌)、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLもしくはCMLまたは多発性骨髄腫を有するか、または発症するリスクがある。1つの実施形態において、その方法は、グループCからの1つ以上(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20個以上)の任意のペプチドまたは本明細書中に記載される組成物を被験体に投与する工程を含み、ここで、その被験体は、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、乳がん(例えば、浸潤性小葉癌、浸潤性乳管癌、小葉乳管混合癌、乳管内篩状癌、浸潤性小葉乳管癌、浸潤癌)、結腸がん(例えば、結腸腺癌、例えば、粘液性腺癌)、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLもしくはCMLまたは多発性骨髄腫を有するかまたは発症するリスクがあるか、あるいはその被験体は、前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する。
ある実施形態において、がんは、本明細書中に記載されるがんである。例えば、そのがんは、膀胱がん(進行性および転移性膀胱がんを含む)、乳がん(例えば、エストロゲンレセプター陽性乳がん、エストロゲンレセプター陰性乳がん、HER−2陽性乳がん、HER−2陰性乳がん、トリプルネガティブ乳がん、炎症性乳がん)、結腸がん(結腸直腸がんを含む)、腎臓がん(例えば、腎細胞癌(例えば、乳頭状腎細胞癌、明細胞癌、嫌色素性癌))、肝臓がん、肺がん(小細胞肺がんおよび非小細胞肺がん(腺癌、扁平上皮癌、気管支肺胞癌および大細胞癌を含む)を含む)、泌尿生殖器がん、例えば、卵巣がん(卵管がん、子宮内膜がんおよび腹膜がんを含む)、子宮頸がん、前立腺がんおよび精巣がん、リンパ系のがん、直腸がん、喉頭がん、膵がん(膵外分泌癌を含む)、胃がん(例えば、胃食道がん、胃上部がんまたは胃下部がん)、消化器がん(例えば、肛門がんまたは胆管がん)、胆嚢がん、甲状腺がん、白血病(例えば、急性骨髄性白血病)、神経細胞がんおよびグリア細胞がん(例えば、多形神経膠芽腫)ならびに頭頸部がんであり得る。
1つの実施形態において、上記被験体には、少なくとも2つ、例えば、2、3または4つの、グループAからのペプチドが投与される。例えば、その被験体には、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチド、グループAからのスプライシング型XBP1ペプチド、グループAからのCD138ペプチド、グループAからのCS−1ペプチドおよびそれらの組み合わせのうちの2つ以上が投与され得る。1つの実施形態において、その被験体には、グループAからの非スプライシング型XBP1ペプチド(例えば、配列番号6を含む非スプライシング型XBP1ペプチド)、グループAからのスプライシング型XBP1ペプチド(例えば、配列番号10を含むスプライシング型XBP1ペプチド)、グループAからのCD138ペプチド(例えば、配列番号12を含むCD138ペプチド)およびCS−1ペプチド(例えば、配列番号16を含むCS−1ペプチド)が投与される。その1つ以上のペプチドは、薬学的組成物、例えば、グループAからの薬学的組成物として被験体に送達され得る。
1つの実施形態において、上記被験体には、少なくとも2つ、例えば、2、3または4つの、グループBからのペプチドが投与される。例えば、その被験体には、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチド、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチド、グループBからのCD138ペプチド、グループBからのCS−1ペプチドおよびそれらの組み合わせが投与され得る。1つの実施形態において、その被験体には、グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチド(例えば、配列番号29を含む非スプライシング型XBP1ペプチド)、グループBからのスプライシング型XBP1ペプチド(例えば、配列番号30を含むスプライシング型XBP1ペプチド)、グループBからのCD138ペプチド(例えば、配列番号31を含むCD138ペプチド)およびグループBからのCS−1ペプチド(例えば、配列番号32を含むCS−1ペプチド)が投与される。
1つの実施形態において、上記被験体には、少なくとも2つ(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20個以上)の、グループCからのペプチドが投与される。別の実施形態において、その被験体には、グループAおよびグループCまたはグループBおよびグループCからの2つ以上のペプチドが投与される。
1つの実施形態において、上記方法は、さらなる薬剤を被験体に投与する工程、例えば、化学療法剤および/または免疫刺激剤および/または免疫調節剤を投与する工程をさらに含む。1つの実施形態において、そのさらなる薬剤は、免疫刺激剤、例えば、本明細書中に記載される免疫刺激剤である。1つの実施形態において、その免疫刺激剤は、カルボキシメチルセルロース、ポリイノシン酸−ポリシチジル酸およびポリ−L−リジン二本鎖RNAを含むアジュバント(例えば、ポリIC−LC、例えば、ヒルトノール);水と油のエマルジョンを含むアジュバント(例えば、モンタナイド);タンパク質(例えば、サイトカイン、補体、GCSF、GM−CSF)を含むアジュバントである。1つの実施形態において、そのさらなる薬剤は、免疫調節剤、例えば、本明細書中に記載される免疫調節剤である。1つの実施形態において、その免疫調節剤は、タンパク質、例えば、免疫系を活性化する抗体(例えば、抗CTLA4抗体、例えば、イピリムマブまたはトレメリムマブ、抗PD−1抗体、抗PDL−1抗体);小分子アジュバント(例えば、サリドマイドまたはサリドマイド誘導体、例えば、レナリドマイド)である。1つの実施形態において、上記方法は、さらなる免疫原性ペプチド、例えば、WT1由来の免疫原性ペプチドまたはその誘導体、例えば、本明細書中に記載されるWT1ペプチドを、上記ペプチドの1つ以上とともに投与する工程を含む。他の免疫原性ペプチドとしては、MUC1由来の免疫原性ペプチド、gp100由来の免疫原性ペプチド、TRP−2由来の免疫原性ペプチド、MAG1由来の免疫原性ペプチド、NY−ESO1由来の免疫原性ペプチド、HER−2由来の免疫原性ペプチド;およびAIM2由来の免疫原性ペプチドが挙げられるが、これらに限定されない。
1つの実施形態において、上記方法は、グループA、グループBおよび/もしくはグループCからのペプチドまたは本明細書中に記載される組成物を1回以上の追加投与が施行される工程(administered)をさらに含む。1つの実施形態において、上記被験体には、前回の投与の約14日後にさらなる1回以上の追加投与が施行され、例えば、上記被験体にはグループA、グループBおよび/もしくはグループCからのペプチドまたは本明細書中に記載される組成物の、2、3、4、5、6、7、8、9または10回投与が1週間おきに施行される。
別の態様において、本開示は、処置を必要とする哺乳動物のための処置を選択するための方法を特徴とする。その方法は、哺乳動物におけるがん、例えば、本明細書中に記載されるがんの1つ以上のがん細胞、例えば、乳がん細胞、結腸がん細胞、膵がん細胞、前立腺がん、血液細胞、例えば、形質細胞が、XBP1を発現しているかを決定する工程;およびそれらのがん細胞の1つ以上が、XBP1を発現している場合、グループA、グループBおよび/もしくはグループCからの1つ以上のペプチド、そのようなペプチドを含む融合タンパク質または本明細書中に記載される組成物をその哺乳動物のための治療薬として選択する工程を含む。その方法は、上記がん細胞の1つ以上がXBP1を発現していることを決定した後に、グループA、グループBおよび/もしくはグループCからの1つ以上のペプチド、そのようなペプチドを含む融合タンパク質または本明細書中に記載される組成物を被験体に送達する工程も含み得る。
なおも別の態様において、本開示は、がんを有する哺乳動物のための処置を選択するための方法を特徴とする。その方法は、哺乳動物におけるがん、例えば、本明細書中に記載されるがんの1つ以上のがん細胞、例えば、乳がん細胞、結腸がん細胞、膵がん細胞、前立腺がん細胞、血液細胞、例えば、形質細胞が、CD138を発現しているかを決定する工程;およびそれらのがん細胞の1つ以上が、CD138を発現している場合、グループA、グループBおよび/もしくはグループCからの1つ以上のペプチド、そのようなペプチドを含む融合タンパク質または本明細書中に記載される組成物をその哺乳動物のための治療薬として選択する工程を含む。その方法は、上記がん細胞の1つ以上がCD138を発現していることを決定した後に、グループA、グループBおよび/もしくはグループCからの1つ以上のペプチド、そのようなペプチドを含む融合タンパク質または本明細書中に記載される組成物を被験体に送達する工程も含み得る。
別の態様において、本開示は、処置を必要とする哺乳動物のための処置を選択するための方法を特徴とする。その方法は、哺乳動物におけるがん、例えば、本明細書中に記載されるがんの1つ以上のがん細胞、例えば、乳がん細胞、結腸がん細胞、膵がん細胞、前立腺がん細胞、血液細胞、例えば、形質細胞が、CS−1を発現しているかを決定する工程;およびそれらのがん細胞の1つ以上が、CS−1を発現している場合、グループA、グループBおよび/もしくはグループCからの1つ以上のペプチド、そのようなペプチドを含む融合タンパク質または本明細書中に記載される組成物をその哺乳動物のための治療薬として選択する工程を含む。その方法は、上記がん細胞の1つ以上がCS1を発現していることを決定した後に、グループA、グループBおよび/もしくはグループCから選択された1つ以上のペプチド、そのようなペプチドを含む融合タンパク質または本明細書中に記載される組成物を被験体に送達する工程も含み得る。
なおも別の態様において、本開示は、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がんまたは前がん性の障害、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を有する哺乳動物のための治療薬を選択するための方法を特徴とする。その方法は、その哺乳動物の1つ以上のがん細胞が、XBP1、CD138および/またはCS−1を発現している場合、グループA、グループBおよび/もしくはグループCからの1つ以上のペプチド、そのようなペプチドを含む融合タンパク質または本明細書中に記載される組成物をその哺乳動物のための治療薬として選択する工程を含む。その方法は、上記がん細胞の1つ以上がXBP1、CD138および/またはCS−1を発現していることを決定した後に、グループA、グループBおよび/もしくはグループCから選択された1つ以上のペプチド、そのようなペプチドを含む融合タンパク質または本明細書中に記載される組成物を被験体に送達する工程も含み得る。
上記方法のいずれかのいくつかの実施形態において、上記被験体または哺乳動物は、がん、例えば、本明細書中に記載されるがん、例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がんに対する治療を受けたことがあり、かつその治療に非反応性だった、被験体または哺乳動物であり得、例えば、グループA、グループBおよび/もしくはグループCからのペプチド、そのようなペプチドを含む融合タンパク質または本明細書中に記載される組成物は、第2選択、第3選択または第4選択の処置であり得る。
なおも別の態様において、本開示は、本明細書中に記載される組成物および(ii)主要組織適合複合体(MHC)分子多量体を特徴とし、ここで、その多量体は、MHC分子の2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9または10個以上)のペプチド結合領域を含む。いくつかの実施形態において、各ペプチド結合領域は、それに結合されたグループA、グループBおよび/またはグループCからのペプチドを有する。いくつかの実施形態において、各ペプチド結合領域は、それに非共有結合的にまたは共有結合的に結合されたグループA、グループBおよび/またはグループCからのペプチドを有する。MHC分子多量体は、2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9または10個以上)のMHC分子全体を含み得る。MHC分子多量体は、ヒトMHC分子を含み得る。MHC分子多量体は、MHCクラスI分子、例えば、HLA−A分子、例えば、HLA−A2分子またはHLA−A24分子を含み得る。
いくつかの実施形態において、上記2つ以上のペプチド結合領域は、同じMHC分子に由来し得る。いくつかの実施形態において、上記2つ以上のペプチド結合領域は、異なるMHC分子に由来する。いくつかの実施形態において、上記2つ以上のペプチド結合領域は、同じMHC分子に由来する少なくとも2つ(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9または10個以上)の領域と、異なるMHC分子に由来する少なくとも1つ(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10個以上)の領域との混合物であり得る。
いくつかの実施形態において、MHC分子多量体は、上記組成物の1つ以上の(one of more)ペプチドの少なくとも1つに結合することができる。
いくつかの実施形態において、上記組成物は、検出可能に標識され得る。例えば、上記ペプチドの1つ以上および/または上記ペプチド結合領域の1つ以上が、検出可能に標識され得る。いくつかの実施形態において、上記1つ以上のMHC分子多量体の少なくとも1つまたは上記1つ以上のペプチドの少なくとも1つが、検出可能に標識される。
別段定義されない限り、本明細書中で使用されるすべての専門用語および科学用語は、本発明が属する分野の当業者が通常理解している意味と同じ意味を有する。矛盾する場合、定義を含む本文書が、支配するものとする。好ましい方法および材料が、下記に記載されるが、本明細書中に記載されるそれらと類似または等価の方法および材料もまた、本発明の実施または試験において使用することができる。本明細書中で述べられるすべての刊行物、特許出願、特許および他の参考文献は、その全体が参照により援用される。本明細書中に開示される材料、方法および例は、単に例証的であって、限定すると意図されていない。
本発明は、例えば、以下の項目も提供する。
(項目1)
本明細書中に記載されている非スプライシング型XBP1ペプチド、本明細書中に記載されているスプライシング型XBP1ペプチド、本明細書中に記載されているCD138ペプチドおよび本明細書中に記載されているCS−1ペプチド、ならびに必要に応じて、薬学的に許容され得るキャリアを含む、薬学的組成物。
(項目2)
前記非スプライシング型XBP1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号6のアミノ酸配列を含む、項目1に記載の薬学的組成物。
(項目3)
前記スプライシング型XBP1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号10のアミノ酸配列を含む、項目1に記載の薬学的組成物。
(項目4)
前記CD138ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号12のアミノ酸配列を含む、項目1に記載の薬学的組成物。
(項目5)
前記非スプライシング型CS−1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号16のアミノ酸配列を含む、項目1に記載の薬学的組成物。
(項目6)
前記非スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号6のアミノ酸配列からなる、項目1に記載の薬学的組成物。
(項目7)
前記スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号10のアミノ酸配列からなる、項目1に記載の薬学的組成物。
(項目8)
前記CD138ペプチドが、配列番号12のアミノ酸配列からなる、項目1に記載の薬学的組成物。
(項目9)
前記CS−1ペプチドが、配列番号16のアミノ酸配列からなる、項目1に記載の薬学的組成物。
(項目10)
前記非スプライシング型XBP1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号6のアミノ酸配列を含み;前記スプライシング型XBP1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号10のアミノ酸配列を含み;前記CD138ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号12のアミノ酸配列を含み;かつ前記CS−1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号16のアミノ酸配列を含む、項目1に記載の薬学的組成物。
(項目11)
前記非スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号6のアミノ酸配列からなり;前記スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号10のアミノ酸配列からなり;前記CD138ペプチドが、配列番号12のアミノ酸配列からなり;かつ前記CS−1ペプチドが、配列番号16のアミノ酸配列からなる、項目1に記載の薬学的組成物。
(項目12)
1つ以上の免疫刺激剤または免疫調節剤をさらに含む、先行する項目のいずれかに記載の薬学的組成物。
(項目13)
前記免疫刺激剤が、カルボキシメチルセルロース、ポリイノシン酸−ポリシチジル酸およびポリ−L−リジン二本鎖RNAを含むアジュバント(例えば、ポリIC−LC、例えば、ヒルトノール);水と油のエマルジョンを含むアジュバント(例えば、モンタナイド);ならびにタンパク質(例えば、サイトカイン、GCSF、GM−CSF)を含むアジュバントから選択される、項目12に記載の薬学的組成物。
(項目14)
前記免疫調節剤が、免疫系を活性化する抗体(例えば、抗CTLA4抗体、例えば、イピリムマブまたはトレメリムマブ);抗PD−1抗体、抗PDL−1抗体、小分子アジュバント(例えば、サリドマイドまたはサリドマイド誘導体、例えば、レナリドマイド)から選択される、項目12に記載の薬学的組成物。
(項目15)
項目1〜14のいずれかに記載の組成物および該組成物を被験体に投与するための指示を含むキット。
(項目16)
1つ以上の薬学的に許容され得るキャリアをさらに含む、項目15に記載のキット。
(項目17)
1つ以上の免疫刺激剤および/または免疫調節剤をさらに含む、項目15または16に記載のキット。
(項目18)
前記被験体が、がん、例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病(例えば、AMLまたはCML)、多発性骨髄腫またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症(Waldenstrom’s macrogloulinemia)を有する、項目15〜17のいずれかに記載のキット。
(項目19)
前記被験体が、くすぶり型多発性骨髄腫を有する、項目15〜17のいずれかに記載のキット。
(項目20)
容器および該容器内に含められた項目1〜14のいずれかに記載の組成物を含む、製造品。
(項目21)
前記容器が、前記組成物が哺乳動物において免疫応答を誘導するために使用するためのものであることを示す表示を有する、項目20に記載の製造品。
(項目22)
前記容器が、前記組成物が、がん、例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、白血病(例えば、AMLまたはCML)、多発性骨髄腫またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症を処置するために使用するためのものであることを示す表示を有する、項目20に記載の製造品。
(項目23)
前記容器が、前記組成物が、くすぶり型多発性骨髄腫を処置するために使用するためのものであることを示す表示を有する、項目20に記載の製造品。
(項目24)
前記組成物を前記哺乳動物に投与するための指示をさらに含む、項目20〜23のいずれかに記載の製造品。
(項目25)
被験体において免疫応答を誘導するための方法であって、該方法は、項目1〜14のいずれかに記載の組成物を被験体に送達する工程を含む、方法。
(項目26)
前記組成物を前記被験体に送達した後に、該被験体において免疫応答が生じたかを決定する工程をさらに含む、項目25に記載の方法。
(項目27)
前記被験体が、ヒトである、項目25または26に記載の方法。
(項目28)
前記被験体が、乳がん、結腸がん、膵がん、白血病(例えば、AMLまたはCML)、多発性骨髄腫またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症を有するか、または有していると疑われる、項目25〜27のいずれか1項に記載の方法。
(項目29)
前記被験体が、くすぶり型多発性骨髄腫を有する、項目25〜27のいずれか1項に記載の方法。
(項目30)
1つ以上のがん細胞が、XBP1、CD138またはCS1を発現しているかを決定する工程をさらに含む、項目28に記載の方法。
(項目31)
前記被験体が、がん、例えば、乳がん、結腸がん、白血病(例えば、AMLまたはCML)、多発性骨髄腫またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症から寛解している、項目28または30に記載の方法。
(項目32)
前記組成物を、さらなる処置、例えば、1つ以上の化学療法剤、1つ以上の形態の電離放射線または1つ以上の免疫療法剤と組み合わせて投与する工程を含む、項目25〜31のいずれかに記載の方法。
(項目33)
前記被験体に1つ以上の免疫刺激剤および/または免疫調節剤を投与する工程をさらに含む、項目25〜31のいずれか1項に記載の方法。
(項目34)
前記免疫刺激剤が、カルボキシメチルセルロース、ポリイノシン酸−ポリシチジル酸およびポリ−L−リジン二本鎖RNAを含むアジュバント(例えば、ポリIC−LC、例えば、ヒルトノール);水と油のエマルジョンを含むアジュバント(例えば、モンタナイド);ならびにタンパク質(例えば、サイトカイン、GCSF、GM−CSF)を含むアジュバントから選択される、項目33に記載の方法。
(項目35)
前記免疫調節剤が、免疫系を活性化する抗体(例えば、抗CTLA4抗体、例えば、イピリムマブまたはトレメリムマブ、PD−1抗体、抗PDL−1抗体);小分子アジュバント(例えば、サリドマイドまたはサリドマイド誘導体、例えば、レナリドマイド)から選択される、項目33に記載の方法。
(項目36)
がん、例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、白血病(例えば、AMLまたはCML)、多発性骨髄腫またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症を処置するための方法であって、該方法は、項目1〜14のいずれかに記載の任意の組成物の1つ以上を被験体に投与する工程を含み、ここで、該被験体は、がん、例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、白血病(例えば、AMLまたはCML)、多発性骨髄腫またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症を有するか、または発症するリスクがある、方法。
(項目37)
1つ以上の免疫刺激剤および/または免疫調節剤を前記被験体に投与する工程をさらに含む、項目36に記載の方法。
(項目38)
前記免疫刺激剤が、カルボキシメチルセルロース、ポリイノシン酸−ポリシチジル酸およびポリ−L−リジン二本鎖RNAを含むアジュバント(例えば、ポリIC−LC、例えば、ヒルトノール);水と油のエマルジョンを含むアジュバント(例えば、モンタナイド);ならびにタンパク質(例えば、サイトカイン、GCSF、GM−CSF)を含むアジュバントから選択される、項目37に記載の方法。
(項目39)
前記免疫調節剤が、免疫系を活性化する抗体(例えば、抗CTLA4抗体、例えば、イピリムマブまたはトレメリムマブ、PD−1抗体、PDL−1抗体);小分子アジュバント(例えば、サリドマイドまたはサリドマイド誘導体、例えば、レナリドマイド)から選択される、項目37に記載の方法。
(項目40)
くすぶり型多発性骨髄腫を処置するための方法であって、該方法は、項目1〜14のいずれかに記載の任意の組成物の1つ以上を被験体に投与する工程を含み、ここで、該被験体は、くすぶり型多発性骨髄腫を有する、方法。
(項目41)
1つ以上の免疫刺激剤および/または免疫調節剤を前記被験体に投与する工程をさらに含む、項目40に記載の方法。
(項目42)
前記免疫刺激剤が、カルボキシメチルセルロース、ポリイノシン酸−ポリシチジル酸およびポリ−L−リジン二本鎖RNAを含むアジュバント(例えば、ポリIC−LC、例えば、ヒルトノール);水と油のエマルジョンを含むアジュバント(例えば、モンタナイド);ならびにタンパク質(例えば、サイトカイン、GCSF、GM−CSF)を含むアジュバントから選択される、項目41に記載の方法。
(項目43)
前記免疫調節剤が、免疫系を活性化する抗体(例えば、抗CTLA4抗体、例えば、イピリムマブまたはトレメリムマブ、PD−1抗体、抗PDL−1抗体);小分子アジュバント(例えば、サリドマイドまたはサリドマイド誘導体、例えば、レナリドマイド)から選択される、項目41に記載の方法。
(項目44)
被験体における乳がんを処置する方法であって、該方法は、本明細書中に記載されている非スプライシング型XBP1ペプチド、本明細書中に記載されているスプライシング型XBP1ペプチド、本明細書中に記載されているCD138ペプチドおよび本明細書中に記載されているCS−1ペプチドのうちの1つ以上を投与し、それにより、乳がんを有する該被験体を処置する工程を含む、方法。
(項目45)
前記非スプライシング型XBP1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号6のアミノ酸配列を含む、項目44に記載の方法。
(項目46)
前記スプライシング型XBP1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号10のアミノ酸配列を含む、項目44に記載の方法。
(項目47)
前記CD138ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号12のアミノ酸配列を含む、項目44に記載の方法。
(項目48)
前記CS−1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号16のアミノ酸配列を含む、項目44に記載の方法。
(項目49)
前記非スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号6のアミノ酸配列からなる、項目44に記載の方法。
(項目50)
前記スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号10のアミノ酸配列からなる、項目44に記載の方法。
(項目51)
前記CD138ペプチドが、配列番号12のアミノ酸配列からなる、項目44に記載の方法。
(項目52)
前記CS−1ペプチドが、配列番号16のアミノ酸配列からなる、項目44に記載の方法。
(項目53)
被験体における結腸がんを処置する方法であって、該方法は、本明細書中に記載されている非スプライシング型XBP1ペプチド、本明細書中に記載されているスプライシング型XBP1ペプチド、本明細書中に記載されているCD138ペプチドおよび本明細書中に記載されているCS−1ペプチドのうちの1つ以上を投与し、それにより、結腸がんを有する該被験体を処置する工程を含む、方法。
(項目54)
前記非スプライシング型XBP1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号6のアミノ酸配列を含む、項目53に記載の方法。
(項目55)
前記スプライシング型XBP1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号10のアミノ酸配列を含む、項目53に記載の方法。
(項目56)
前記CD138ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号12のアミノ酸配列を含む、項目53に記載の方法。
(項目57)
前記CS−1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号16のアミノ酸配列を含む、項目53に記載の方法。
(項目58)
前記非スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号6のアミノ酸配列からなる、項目53に記載の方法。
(項目59)
前記スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号10のアミノ酸配列からなる、項目53に記載の方法。
(項目60)
前記CD138ペプチドが、配列番号12のアミノ酸配列からなる、項目53に記載の方法。
(項目61)
前記CS−1ペプチドが、配列番号16のアミノ酸配列からなる、項目53に記載の方法。
(項目62)
被験体における膵がんを処置する方法であって、該方法は、本明細書中に記載されている非スプライシング型XBP1ペプチド、本明細書中に記載されているスプライシング型XBP1ペプチド、本明細書中に記載されているCD138ペプチドおよび本明細書中に記載されているCS−1ペプチドのうちの1つ以上を投与し、それにより、膵がんを有する該被験体を処置する工程を含む、方法。
(項目63)
前記非スプライシング型XBP1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号6のアミノ酸配列を含む、項目62に記載の方法。
(項目64)
前記スプライシング型XBP1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号10のアミノ酸配列を含む、項目62に記載の方法。
(項目65)
前記CD138ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号12のアミノ酸配列を含む、項目62に記載の方法。
(項目66)
前記CS−1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号16のアミノ酸配列を含む、項目62に記載の方法。
(項目67)
前記非スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号6のアミノ酸配列からなる、項目62に記載の方法。
(項目68)
前記スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号10のアミノ酸配列からなる、項目58に記載の方法。
(項目69)
前記CD138ペプチドが、配列番号12のアミノ酸配列からなる、項目62に記載の方法。
(項目70)
前記CS−1ペプチドが、配列番号16のアミノ酸配列からなる、項目62に記載の方法。
(項目71)
被験体における白血病(例えば、AML)を処置する方法であって、該方法は、本明細書中に記載されている非スプライシング型XBP1ペプチド、本明細書中に記載されているスプライシング型XBP1ペプチド、本明細書中に記載されているCD138ペプチドおよび本明細書中に記載されているCS−1ペプチドのうちの1つ以上を投与し、それにより、白血病を有する該被験体を処置する工程を含む、方法。
(項目72)
前記非スプライシング型XBP1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号6のアミノ酸配列を含む、項目71に記載の方法。
(項目73)
前記スプライシング型XBP1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号10のアミノ酸配列を含む、項目71に記載の方法。
(項目74)
前記CD138ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号12のアミノ酸配列を含む、項目71に記載の方法。
(項目75)
前記CS−1ペプチドが、35アミノ酸長以下であり、配列番号16のアミノ酸配列を含む、項目71に記載の方法。
(項目76)
前記非スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号6のアミノ酸配列からなる、項目71に記載の方法。
(項目77)
前記スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号10のアミノ酸配列からなる、項目71に記載の方法。
(項目78)
前記CD138ペプチドが、配列番号12のアミノ酸配列からなる、項目71に記載の方法。
(項目79)
前記CS−1ペプチドが、配列番号16のアミノ酸配列からなる、項目71に記載の方法。
本発明、例えば、被験体において免疫応答を誘導するための方法の他の特徴および利点は、以下の記載、図面および特許請求の範囲から明らかである。
図1aは、マルチペプチドカクテルのHLA−A2結合能を示している棒グラフである。Y軸は、平均蛍光強度を表しており、X軸は、そのカクテルのペプチド濃度を表している。インフルエンザウイルスマトリックスタンパク質58−66(IVMP58−66;GILGFVFTL)(配列番号25)を、HLA−A2特異的ポジティブコントロールペプチドとして使用した。
図1bは、T2細胞を使用したときのマルチペプチドカクテルのHLA−A2安定性を示している棒グラフである。Y軸は、平均蛍光強度を表しており、X軸は、Brefeldin A(BFA)で処置した後の時間を表している。インフルエンザウイルスマトリックスタンパク質58−66(IVMP58−66;GILGFVFTL)(配列番号25)を、HLA−A2特異的ポジティブコントロールペプチドとして使用した。
図2は、マルチペプチド特異的CTL(MP−CTL)の異なる表現型を示している一連の棒グラフである。Y軸は、所与の集団における細胞のパーセンテージを示している。
図3は、HLA−A2MM細胞株に応答したMP−CTLによるIFN−γ産生を示している一連の棒グラフである。Y軸は、所与の集団におけるIFN−γ+細胞のパーセンテージを示している。
図4は、初代骨髄腫細胞および多発性骨髄腫細胞株を含むHLA−A2+MM細胞用いての刺激によるMP−CTL増殖の誘導を示している。上のパネルは、フローサイトメトリー解析からの代表的なドットプロットである。Y軸は、CD8発現を示しており、X軸は、細胞増殖の直接的な尺度であるCFSE染色の減少を示している。下のパネルは、初代多発性骨髄腫細胞(下の左パネル)および多発性骨髄腫細胞株(下の右パネル)に対するMP−CTLの増殖応答を示している棒グラフである。棒グラフにおけるY軸は、増殖しているMP−CTLのパーセンテージを示しており、X軸は、試験された刺激性MM細胞の起源を示している。
図5は、初代MM細胞および細胞株を含むHLA−A2+MM細胞に対するMP−CTLの細胞傷害活性を示している一連のグラフである。Y軸は、パーセント細胞傷害性を示しており、X軸は、エフェクター細胞(MP−CTL)と標的細胞との比を示している。
図6aは、単一のドナー(ドナーA)から生成したマルチペプチド特異的CTLのペプチド特異的応答を示している一連のドットプロットである。Y軸は、CD107αの発現レベルを示しており、X軸は、IFN−γの発現レベルを示している。
図6bは、3人のドナー(ドナーB、ドナーCおよびドナーD)から生成したマルチペプチド特異的CTLのペプチド特異的応答を示している一連の棒グラフである。Y軸は、CD107α+細胞(上のパネル)またはIFN−γ+細胞(下のパネル)のパーセンテージを示しており、X軸は、K562−A2細胞によって提示されたペプチドを示している。
図7は、様々ながん細胞株における非スプライシング型XBP1およびスプライシング型XBP1の相対的な発現を示している表である。相対的な発現レベルは、プラス記号またはマイナス記号で示され、また、プラス記号の数を示す数字も示されている。
図8aは、HLA−A2+乳がん細胞株に対するXBP1−CTLの6日目における増殖応答を示している一連のヒストグラムである。X軸は、細胞増殖の直接的な尺度であるCFSE染色の減少を示している。 図8bは、HLA−A2+乳がん細胞に対するXBP1−CTLの7日目における増殖応答を示している一連のヒストグラムである。X軸は、細胞増殖の直接的な尺度であるCFSE染色の減少を示している。
図9は、HLA−A2+乳がん細胞株に対するXBP1−CTLのIFN−γ産生および細胞活性化(CD69発現)を示している一連のドットプロットである。Y軸は、CD69の発現を示しており、X軸は、IFN−γの発現を示している。
図10は、HLA−A2+乳がん細胞株に対するXBP1−CTLの脱顆粒(CD107α)を示している一連のドットプロットである。Y軸は、CD107αの発現を示しており、X軸は、CD8の発現を示している。
図11は、HLA−A2+膵がん細胞株および結腸がん細胞株に対するXBP1−CTLの増殖応答を示している一連のヒストグラムである。X軸は、細胞増殖の直接的な尺度であるCFSE染色の減少を示している。
図12は、HLA−A2+膵がん細胞株および結腸がん細胞株に対するXBP1−CTLのIFN−γ産生および脱顆粒応答を示している一連のドットプロットである。Y軸は、CD107αの発現を示しており、X軸は、IFN−γの発現を示している。
図13は、様々ながん細胞株における相対的なCD138の発現を示している表である。相対的な発現は、プラス記号またはマイナス記号で示され、また、プラス記号の数を示す数字も示されている。
図14は、様々ながん細胞株における相対的なCS1の発現を示している表である。相対的な発現は、プラス記号またはマイナス記号で示され、また、プラス記号の数を示す数字も示されている。
図15aおよびbは、異なるくすぶり型多発性骨髄腫患者のT細胞からの、免疫原性のXBP1非スプライシング型、XBP1スプライシング型、CD138およびCS−1 HLA−A2特異的ペプチドのカクテルによって誘導されたCD8+CTLの増加を示している一連の棒グラフである。左側のパネルにおけるY軸は、CD3+CD8+CTLのパーセンテージを示しており、右側のパネルにおけるY軸は、CD4+Th細胞のパーセンテージを示しており、X軸は、表現型解析の前のペプチド刺激の回数を示している。
図15aおよびbは、異なるくすぶり型多発性骨髄腫患者のT細胞からの、免疫原性のXBP1非スプライシング型、XBP1スプライシング型、CD138およびCS−1 HLA−A2特異的ペプチドのカクテルによって誘導されたCD8+CTLの増加を示している一連の棒グラフである。左側のパネルにおけるY軸は、CD3+CD8+CTLのパーセンテージを示しており、右側のパネルにおけるY軸は、CD4+Th細胞のパーセンテージを示しており、X軸は、表現型解析の前のペプチド刺激の回数を示している。
図16aは、HLA−A2に拘束された様式での、骨髄腫細胞に対する、くすぶり型多発性骨髄腫患者から生成したMP−CTLの増殖応答を示している一連のヒストグラムである。X軸は、細胞増殖の直接的な尺度であるCFSE染色の減少を示している。刺激の5日後の応答が、上段のパネルに示されており、6日後の応答が、中段のパネルに示されており、7日後の応答が、下段のパネルに示されている。
図16bは、HLA−A2に拘束された様式での、骨髄腫細胞に応答した、第2のくすぶり型多発性骨髄腫患者から生成したMP−CTLの増殖応答を示している一連のヒストグラムである。Y軸は、細胞数を示しており、X軸は、CFSE染色を示している。刺激の5日後の応答が、上段のパネルに示されており、6日後の応答が、中段のパネルに示されており、7日後の応答が、下段のパネルに示されている。
図17aは、HLA−A2に拘束された様式での、骨髄腫細胞株に応答した、くすぶり型多発性骨髄腫患者から生成したMP−CTLのIFN−γ産生を示している一連のドットプロットである。Y軸は、IFN−γの発現を示しており、X軸は、CD8の発現を示している。
図17bは、HLA−A2に拘束された様式での、骨髄腫細胞株に応答した、4人のくすぶり型多発性骨髄腫患者から生成したMP−CTLのIFN−γ産生を示している一連の棒グラフである。Y軸は、IFN−γ+細胞のパーセンテージを示しており、X軸は、MP−CTLを刺激するために使用された細胞のタイプを示している。
図18aは、HLA−A2に拘束された様式での、骨髄腫細胞株に応答した、くすぶり型多発性骨髄腫患者から生成したMP−CTLの脱顆粒を示している一連のドットプロットである。Y軸は、CD107αの発現を示しており、X軸は、CD8の発現を示している。
図18bは、HLA−A2に拘束された様式での、骨髄腫細胞株に応答した、4人のくすぶり型多発性骨髄腫患者から生成したMP−CTLの脱顆粒を示している一連の棒グラフである。Y軸は、CD107α+細胞のパーセンテージを示しており、X軸は、MP−CTLを刺激するために使用された細胞のタイプを示している。
図19aは、個々のペプチドを提示しているK562−A2細胞に応答した、くすぶり型多発性骨髄腫患者から生成したCD3+CD8+CD137+MP−CTLの間での多機能性のIFN−γ産生および脱顆粒(CD107α)を示している一連のドットプロットである。Y軸は、CD107αの発現を示しており、Y軸は、+細胞を示しており、X軸は、IFN−γの発現を示している。
図19bは、個々のペプチドを提示しているK562−A2細胞に応答した、3人のくすぶり型多発性骨髄腫患者から生成したCD3+CD8+CD137+MP−CTLの間での多機能性のIFN−γ産生および脱顆粒(CD107α)を示している一連の棒グラフである。Y軸は、IFN−γとCD107αの両方を発現しているCD3+CD8+CD137+細胞のパーセンテージを示しており、X軸は、K562 A2細胞によって提示されたペプチドを示している。
図19cは、個々のペプチドを提示しているK562−A2細胞に応答した、3人のくすぶり型多発性骨髄腫患者から生成したCD3+CD8+CD137+MP−CTLの間でのIFN−γ産生と脱顆粒(CD107α)の両方を示している要約の棒グラフである。Y軸は、IFN−γとCD107αの両方を発現しているCD3+CD8+CD137+細胞のパーセンテージを示しており、X軸は、K562−A2細胞によって提示されたペプチドを示している。
図19dは、個々のペプチドを提示しているK562−A2細胞に応答した、3人のくすぶり型多発性骨髄腫患者から生成したCD3+CD8+CD137+MP−CTLの間でのIFN−γ産生と脱顆粒(CD107α)の両方を示している、2つの別個の実験からの要約の棒グラフである。Y軸は、IFN−γとCD107αの両方を発現しているCD3+CD8+CD137+細胞のパーセンテージを示しており、X軸は、K562−A2細胞によって提示されたペプチドを示している。
図20aは、4人のくすぶり型多発性骨髄腫患者から生成したMP−CTLにおけるメモリーCD8T細胞の増加を示している、一連のドットプロット(上のパネル)および棒グラフ(下のパネル)である。ドットプロットにおけるY軸は、CCR7の発現を示しており、X軸は、CD45RPの発現を示している。棒グラフにおけるY軸は、X軸上に定義されたT細胞サブセットについて陽性の細胞のパーセンテージを示している。
図20bは、2人のくすぶり型多発性骨髄腫患者から生成したMP−CTLの間でのエフェクターメモリー(EM)細胞の増加を示している一連の棒グラフである。4回から7回へのペプチド刺激の回数の増加は、EMタイプの細胞のパーセンテージの増加をもたらした。棒グラフにおけるY軸は、X軸上に定義されたT細胞サブセットについて陽性の細胞のパーセンテージを示している。
図20cは、3人のくすぶり型多発性骨髄腫患者由来のエフェクターメモリー細胞(EM)およびターミナルエフェクター細胞(TE)の間でのIFN−γ+CD107α+の増加を示している一連のヒストグラムである。Y軸は、IFN−γ+CD107α+二重陽性細胞のパーセンテージを示しており、X軸は、MP−CTLを刺激するために使用された細胞のタイプを示している。
図20dは、MM細胞株(HLA−A2+U266細胞またはHLA−A2−RPMI細胞)に応答した、4人のくすぶり型多発性骨髄腫患者から生成したMP−CTLにおけるナイーブおよびメモリーCD8+T細胞サブセットに対するCD69活性化を示している一連の棒グラフである。Y軸は、CD69+細胞のパーセンテージを示しており、X軸は、CTLの部分集団を示している。
図21は、非スプライシング型XBP1、スプライシング型XBP1、CD138およびCS1由来のペプチドの、HLA−A24に対する親和性を示しているグラフである。T2細胞を、1mg/mlの濃度の示されているペプチドに曝露した。HIVエンベロープタンパク質583−591(RYLKDQQLL;配列番号537)を、HLA−A24特異的ポジティブコントロールペプチドとして使用した。
図22は、非スプライシング型XBP1ペプチド4(配列番号35)、非スプライシング型XBP1ペプチド7(配列番号29)およびスプライシング型ペプチド1(配列番号30)の、HLA−A24に対する親和性を示しているグラフである。T2細胞を、示されている濃度のペプチドに曝露した。
図23は、CD138ペプチド1(配列番号31)、3(配列番号41)および4(配列番号42)の、HLA−A24に対する親和性を示しているグラフである。T2細胞を、示されている濃度のペプチドに曝露した。
図24は、CS1ペプチド3(配列番号48)および5(配列番号32)の、HLA−A24に対する親和性を示しているグラフである。T2細胞を、示されている濃度のペプチドに曝露した。
図25は、ペプチド特異的CTLを生成するために使用された方法の模式図である。示されているペプチドを提示しているAPCを、ドナー由来のCD3+Tリンパ球を刺激するために使用して、ペプチド特異的CTLを生成した。
図26aは、2人のドナー(ドナーAおよびドナーB)由来のTリンパ球上に提示された非スプライシング型XBP1ペプチド7によって誘導されたCD8+T細胞の増加を示している棒グラフである。Y軸は、CD8+Tリンパ球のパーセンテージを示しており、X軸は、表現型解析の前のペプチド刺激の回数を示している。
図26bは、2人のドナー(ドナーAおよびドナーB)由来のTリンパ球上に提示されたスプライシング型XBP1ペプチド1によって誘導されたCD8+T細胞の増加を示している棒グラフである。Y軸は、CD8+Tリンパ球のパーセンテージを示しており、X軸は、表現型解析の前のペプチド刺激の回数を示している。
図26cは、2人のドナー(ドナーAおよびドナーB)由来のTリンパ球上に提示されたCD138ペプチド1によって誘導されたCD8+T細胞の増加を示している棒グラフである。Y軸は、CD8+Tリンパ球のパーセンテージを示しており、X軸は、表現型解析の前のペプチド刺激の回数を示している。
図26dは、2人のドナー(ドナーAおよびドナーB)由来のTリンパ球上に提示されたCS1ペプチド1によって誘導されたCD8+T細胞の増加を示している棒グラフである。Y軸は、CD8+Tリンパ球のパーセンテージを示しており、X軸は、表現型解析の前のペプチド刺激の回数を示している。
図27は、様々な多発性骨髄腫の腫瘍細胞に対するペプチド特異的CTLの応答を評価するために使用された方法の模式図である。ペプチド特異的CTLを、KMS、OPM1またはU266多発性骨髄腫細胞とともに5時間インキュベートし、IFN−γ産生、CD107αアップレギュレーション、CD8T細胞増殖またはIL−2産生についてアッセイした。
図28は、多発性骨髄腫細胞に応答したペプチド特異的CTLのIFN−γ産生およびCD8発現を示している一連のドットプロットである。Y軸は、IFN−γの発現レベルを示しており、X軸は、CD8の発現を示している。解析されたCTL集団のペプチド特異性が、左に示されている。CD8+、IFN−γ+の集団が、四角で囲まれた領域に表されている。
図29aは、CTLの集団および部分集団におけるIFN−γ発現を示している一連のドットプロットである。非スプライシング型XBP1ペプチド7(配列番号29)に特異的なCTLをKMS11細胞で刺激した。四角で囲まれた領域に表されている集団が、グラフ上に示されている。
図29bは、CTLの集団および部分集団におけるIFN−γ発現を示している一連のドットプロットである。スプライシング型XBP1ペプチド1(配列番号30)に特異的なCTLを、KMS11細胞で刺激した。四角で囲まれた領域に表されている集団が、グラフ上に示されている。
図29cは、CTLの集団および部分集団におけるIFN−γ発現を示している一連のドットプロットである。CD138ペプチド1(配列番号31)に特異的なCTLを、KMS11細胞で刺激した。四角で囲まれた領域に表されている集団が、グラフ上に示されている。
図29dは、CTLの集団および部分集団におけるIFN−γ発現を示している一連のドットプロットである。CS1ペプチド5(配列番号32)に特異的なCTLを、KMS11細胞で刺激した。四角で囲まれた領域に表されている集団が、グラフ上に示されている。
図30は、脱顆粒を測定するために使用されたCD107α検出アッセイの模式図である。腫瘍細胞の脱顆粒に起因する溶解性顆粒の放出は、抗CD107α抗体によって検出され得る、CTLにおけるCD107αのアップレギュレーションを引き起こす。
図31は、ペプチド特異的CTLにおけるIFN−γ発現および脱顆粒を示している一連のドットプロットである。CTLを、上部に示されているように、刺激しないかまたはKMS11細胞もしくはOPM1細胞で刺激した。CTLのペプチド特異性が、左に示されている。Y軸は、CD107αの発現を表し、X軸は、IFN−γの発現を表している。
図32は、多発性骨髄腫細胞に応答したペプチド特異的CTLの増殖を測定するために使用されたアッセイの模式図である。ペプチド特異的CTLおよび照射された多発性骨髄腫細胞を、6または8日間にわたって共にインキュベートし、CTLの増殖をCFSEの取り込みによって測定した。
図33aは、骨髄腫細胞に対するペプチド特異的CTLの6日目の増殖応答を示している一連のヒストグラムである。CTLのペプチド特異性が、左に示されている。X軸は、細胞増殖の直接的な尺度であるCFSE染色の減少を示している。
図33bは、骨髄腫細胞に対するペプチド特異的CTLの8日目の増殖応答を示している一連のヒストグラムである。CTLのペプチド特異性が、左に示されている。X軸は、細胞増殖の直接的な尺度であるCFSE染色の減少を示している。
図34は、骨髄腫細胞に応答したペプチド特異的CTLのIL−2産生を示している一連のドットプロットである。CTLのペプチド特異性が、左に示されている。Y軸は、IL−2の発現を示しており、X軸は、CD8の発現を示している。四角で囲まれた領域は、IL−2+CD8+集団を表している。
図35は、様々な結腸がん細胞株に応答した、ドナーA由来のペプチド特異的CTLのIFN−γ発現を示している一連のドットプロットである。CTLを、上部に示されているように、刺激しないか、またはSW80細胞、WiDr細胞もしくはLS180細胞で刺激した。CTLのペプチド特異性が、左に示されている。Y軸は、IFN−γの発現を示しており、X軸は、CD8の発現を示している。四角で囲まれた領域は、IFN−γ+CD8+集団を表している。
図36は、様々な結腸がん細胞株に応答した、ドナーA由来のペプチド特異的CTLにおけるIFN−γ発現および脱顆粒を示している一連のドットプロットである。CTLを、上部に示されているように、刺激しないか、またはSW80細胞、WiDr細胞もしくはLS180細胞で刺激した。CTLのペプチド特異性が、左に示されている。Y軸は、CD107αの発現を表しており、X軸は、IFN−γの発現を表している。
図37は、様々な結腸がん細胞株に応答した、ドナーB由来のペプチド特異的CTLのIFN−γ発現を示している一連のドットプロットである。CTLを、上部に示されているように、刺激しないか、またはSW80細胞、WiDr細胞もしくはLS180細胞で刺激した。CTLのペプチド特異性が、左に示されている。Y軸は、IFN−γの発現を示しており、X軸は、CD8の発現を示している。四角で囲まれた領域は、IFN−γ+CD8+集団を表している。
図38は、ドナーB由来のペプチド特異的CTLにおけるIFN−γ発現および脱顆粒を示している一連のドットプロットである。CTLを、上部に示されているように、刺激しないか、またはSW80細胞、WiDr細胞もしくはLS180細胞で刺激した。CTLのペプチド特異性が、左に示されている。Y軸は、CD107αの発現を表しており、X軸は、IFN−γの発現を表している。
図39aは、SW480腫瘍細胞に対するCD138ペプチド特異的CTLの脱顆粒応答を示している一連のヒストグラムである。CTLおよびSW480腫瘍細胞を、左に示されているような様々な細胞:細胞比で共インキュベートし、上部に示されているように、CD107α、IFN−γおよびIL−2の発現について解析した。
図39bは、LS180腫瘍細胞に対するCD138ペプチド特異的CTLの様々な応答を示している一連のヒストグラムである。CTLおよびLS180腫瘍細胞を、左に示されているような様々な細胞:細胞比で共インキュベートし、上部に示されているように、CD107α、IFN−γおよびIL−2の発現について解析した。
図40aは、異なるがん細胞タイプに応答した、ドナーA由来のペプチド特異的CTLのIFN−γ発現を示している一連のドットプロットである。CTLを、単独でインキュベートしたか、またはSW480結腸がん細胞もしくはKMS11多発性骨髄腫細胞とともに共インキュベートし、IFN−γの発現について解析した。CTLのペプチド特異性が、左に示されている。Y軸は、IFN−γの発現を示しており、X軸は、CD8の発現を示している。四角で囲まれた領域は、IFN−γ+CD8+集団を表している。
図40bは、異なるがん細胞タイプに応答した、ドナーA由来のペプチド特異的CTLの脱顆粒およびIFN−γ発現を示している一連のドットプロットである。CTLを、単独でインキュベートしたか、またはSW480結腸がん細胞もしくはKMS11多発性骨髄腫細胞とともに共インキュベートし、IFN−γの発現について解析した。CTLのペプチド特異性が、左に示されている。Y軸は、CD107αの発現を示しており、X軸は、IFN−γの発現を示している。
図41aは、異なるがん細胞タイプに応答した、ドナーB由来のペプチド特異的CTLのIFN−γ発現を示している一連のドットプロットである。CTLを、単独でインキュベートしたか、またはSW480結腸がん細胞もしくはKMS11多発性骨髄腫細胞とともに共インキュベートし、IFN−γの発現について解析した。CTLのペプチド特異性が、左に示されている。Y軸は、IFN−γの発現を示しており、X軸は、CD8の発現を示している。四角で囲まれた領域は、IFN−γ+CD8+集団を表している。
図41bは、異なるがん細胞タイプに応答した、ドナーB由来のペプチド特異的CTLの脱顆粒およびIFN−γ発現を示している一連のドットプロットである。CTLを、単独でインキュベートしたか、またはSW480結腸がん細胞もしくはKMS11多発性骨髄腫細胞とともに共インキュベートし、IFN−γの発現について解析した。CTLのペプチド特異性が、左に示されている。Y軸は、CD107αの発現を示しており、X軸は、IFN−γの発現を示している。
図42は、様々な膵がん細胞株に応答した、ドナーB由来のペプチド特異的CTLのIFN−γ発現を示している一連のドットプロットである。CTLを、単独でインキュベートしたか、または8902、PL45もしくはMiaPaca細胞とともに共インキュベートし、IFN−γの発現について解析した。CTLのペプチド特異性が、左に示されている。Y軸は、IFN−γの発現を示しており、X軸は、CD8の発現を示している。四角で囲まれた領域は、IFN−γ+CD8+集団を表している。
図43は、Panc1膵臓腫瘍細胞に対するCD138ペプチド特異的CTLの様々な応答を示している、一連のヒストグラムおよびドットプロットである。CTLおよびPanc1細胞を、左に示されているような1:1または1:5という様々な細胞:細胞比で共インキュベートし、上部に示されているように、CD107α、IFN−γおよびIL−2の発現について解析した。ドットプロットのY軸は、CD107αの発現を示しており、ヒストグラムおよびドットプロットのX軸は、各グラフの下に示されているようなIFN−γまたはIL−2の発現を示している。
図44は、非スプライシング型ヘテロクリティック(heteroclitic)XBP1ペプチドおよびスプライシング型ヘテロクリティックXBP1ペプチドのカクテルで誘導されたCTLにおける、T細胞(ナイーブT細胞、セントラルメモリー(CM)、エフェクター細胞およびエフェクターメモリー(EM)CD8T細胞)の表現型の変化を示している一連のドットプロットである。ドットプロットにおけるY軸は、CCR7の発現を示しており、X軸は、CD45RPの発現を示している。
図45は、非スプライシング型ヘテロクリティックXBP1ペプチドおよびスプライシング型ヘテロクリティックXBP1ペプチドのカクテルに応答した、3人のドナーにおけるセントラルメモリーCD3+CD8+T細胞の生成を表している一連の棒グラフである。
図46は、非スプライシング型ヘテロクリティックXBP1ペプチドおよびスプライシング型ヘテロクリティックXBP1ペプチドのカクテルに応答した、3人のドナーにおけるエフェクターメモリーCD3+CD8+T細胞の生成を表している一連の棒グラフである。
図47は、MB231乳がん細胞に対するXBP1ペプチドカクテル特異的CTLの増殖応答を示している一連のヒストグラムである。その応答により、CD45RO−非メモリー細胞の増殖およびCD45RO+メモリー細胞の増殖の状態となり、それらのメモリー細胞内でのその割合は、CD45RO+、CCR7+セントラルメモリーT細胞およびCD45RO+、CCR7−エフェクターメモリーT細胞での割合である。
図48は、LS180結腸がん細胞に対するXBP1ペプチドカクテル特異的CTLの増殖応答を示している一連のヒストグラムである。その応答により、CD45RO−非メモリー細胞の増殖およびCD45RO+メモリー細胞の増殖の状態となり、それらのメモリー細胞内でのその割合は、CD45RO+、CCR7+セントラルメモリーT細胞およびCD45RO+、CCR7−エフェクターメモリーT細胞での割合である。
図49は、Panc1膵がん細胞に対するXBP1ペプチドカクテル特異的CTLの増殖応答を示している一連のヒストグラムである。その応答により、CD45RO−非メモリー細胞の増殖およびCD45RO+メモリー細胞の増殖の状態となり、それらのメモリー細胞内でのその割合は、CD45RO+、CCR7+セントラルメモリーT細胞およびCD45RO+、CCR7−エフェクターメモリーT細胞での割合である。
図50は、様々な腫瘍細胞(MB231、MCF7、LS180、SW480、Panc1およびPL45)に対するXBP1ペプチドカクテル特異的CTLの様々な応答を示している一連のヒストグラムである。セントラルメモリーT細胞およびエフェクターメモリーT細胞を、IFN−γの発現について解析した。
図51は、様々な腫瘍細胞(MB231、MC7、LS180、SW480、Panc1およびPL45)に対するXBP1カクテル特異的CTLのエフェクターメモリーT細胞およびセントラルメモリーT細胞によるIFN−γの発現を示している棒グラフ(bar grafts)である。
図52は、様々な腫瘍細胞(MB231、MCF7、LS180、SW480、Panc1およびPL45)に対するXBP1ペプチドカクテル特異的CTLの様々な応答を示している一連のヒストグラムである。セントラルメモリーT細胞およびエフェクターメモリーT細胞を、IL−2の発現について解析した。
図53は、様々な腫瘍細胞(MB231、MC7、LS180、SW480、Panc1およびPL45)に対するXBP1カクテル特異的CTLのエフェクターメモリーT細胞およびセントラルメモリーT細胞によるIL−2の発現を示している棒グラフを表している。
図54は、様々な腫瘍細胞(MB231、MCF7、LS180、SW480、Panc1およびPL45)に対するXBP1ペプチドカクテル特異的CTLの様々な応答を示している一連のヒストグラムである。セントラルメモリーT細胞およびエフェクターメモリーT細胞を、細胞傷害性について解析した。
図55は、様々な腫瘍細胞(MB231、MC7、LS180、SW480、Panc1およびPL45)に対するXBP1カクテル特異的CTLのエフェクターメモリーT細胞およびセントラルメモリーT細胞の細胞傷害性を示している棒グラフを表している。
図56は、XBP1カクテル特異的CTLの非メモリーT細胞およびメモリーT細胞によるTbetの発現を示している棒グラフを表している。
図57は、XBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるTbetの発現を示している棒グラフを表している。
図58は、様々な腫瘍細胞(MB231、SW480およびPanc1)に対するXBP1カクテル特異的CTLの非メモリーT細胞およびメモリーT細胞によるTbetおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図59は、MB231乳がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるTbetおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図60は、Panc1膵がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるTbetおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図61は、SW480結腸がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるTbetおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図62は、XBP1カクテル特異的CTLの非メモリーT細胞およびメモリーT細胞によるEomesの発現を示している棒グラフを表している。
図63は、XBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるEomesの発現を示している棒グラフを表している。
図64は、様々な腫瘍細胞(MB231、SW480およびPanc1)に対するXBP1カクテル特異的CTLの非メモリーT細胞およびメモリーT細胞によるEomesおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図65は、MB231乳がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるEomesおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図66は、Panc1膵がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるEomesおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図67は、SW480結腸がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるEomesおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図68は、様々な腫瘍細胞(MB231、SW480およびPanc1)に対するXBP1カクテル特異的CTLの非メモリーT細胞およびメモリーT細胞によるグランザイムBの発現を示している棒グラフを表している。
図69は、MB231乳がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるグランザイムBおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図70は、Panc1膵がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるグランザイムBおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図71は、SW480結腸がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるグランザイムBおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図72は、アジュバントであるレナリドマイドの存在下および非存在下における、XBP1カクテル特異的CTLの非メモリーT細胞およびメモリーT細胞の数を示している棒グラフを表している。
図73は、アジュバントであるレナリドマイドの存在下および非存在下における、XBP1カクテル特異的CTLのセントラルメモリーT細胞およびエフェクターメモリーT細胞の数を示している棒グラフを表している。
図74は、アジュバントであるレナリドマイドの存在下および非存在下における、XBP1カクテル特異的CTLにおけるCD40L、CD69およびCD38の発現を示している棒グラフを表している。
図75は、アジュバントであるレナリドマイドの存在下または非存在下における、MB231乳がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるTbetおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図76は、アジュバントであるレナリドマイドの存在下または非存在下における、MB231乳がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるEomesおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図77は、アジュバントであるレナリドマイドの存在下または非存在下における、Panc1膵がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるTbetおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図78は、アジュバントであるレナリドマイドの存在下または非存在下における、Panc1膵がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるEomesおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図79は、アジュバントであるレナリドマイドの存在下または非存在下における、SW480結腸がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるTbetおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図80は、アジュバントであるレナリドマイドの存在下または非存在下における、SW480結腸がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLのナイーブT細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞およびエフェクターT細胞によるEomesおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図81は、アジュバントであるレナリドマイドの存在下または非存在下における、MB231乳がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLの非メモリーT細胞およびメモリーT細胞によるグランザイムおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図82は、アジュバントであるレナリドマイドの存在下または非存在下における、Panc1膵がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLの非メモリーT細胞およびメモリーT細胞によるグランザイムおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
図83は、アジュバントであるレナリドマイドの存在下または非存在下における、SW480結腸がん細胞に対するXBP1カクテル特異的CTLの非メモリーT細胞およびメモリーT細胞によるグランザイムおよびIFN−γの発現を示している棒グラフを表している。
詳細な説明
本開示は、XBP1、CD138およびCS−1に由来する免疫原性ペプチド(およびそれらの薬学的組成物)を特徴とし、それは、例えば、被験体において、免疫応答を誘導する(例えば、CTL応答を刺激する)ためまたは抗体の産生を刺激するために使用され得る。それらのペプチドは、種々の用途(例えば、免疫応答を誘導するための方法、抗体を産生させるための方法、ならびにがん(例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病(例えば、AMLまたはCML)および形質細胞障害(例えば、多発性骨髄腫またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症))または前がん性の障害(例えば、くすぶり型多発性骨髄腫))を処置するための方法)において使用され得る。それらのペプチドはまた、MHC分子多量体組成物に含められ得、例えば、細胞集団中のT細胞を検出するための方法において使用され得る。
上記ペプチド、ならびにそれらのペプチドを生成するためおよび使用するための例示的な方法の詳細な説明が、下記に示される。
ペプチド
グループAペプチド。本開示は、表1に示されるような配列番号1〜18のいずれか1つと十分な同一性を有するかまたは同一であるアミノ酸配列を含む単離されたペプチド(「グループAペプチド」)を特徴とする。
Figure 0006374392
好ましくは、グループAからの単離されたペプチドは、少なくとも9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30または35アミノ酸長(例えば、9〜35アミノ酸長、例えば、9〜30、9〜25、9〜20、9〜15アミノ酸長)であり、配列番号1〜18のアミノ酸配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%同一性であるかまたは同一であるアミノ酸配列を含む。他の好ましいペプチドは、少なくとも9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30または35アミノ酸長(例えば、9〜35アミノ酸長、例えば、9〜30、9〜25、9〜20、9〜15アミノ酸長)であり得、配列番号1〜18のアミノ酸配列、または配列番号1〜18のアミノ酸配列の1、2、3もしくは4つの置換を有するアミノ酸配列を含み得る。その置換は、保存的または非保存的置換であり得る。
グループAからの「非スプライシング型XBP1」ペプチドには、表1に示されたペプチドが含まれ、それは、261アミノ酸および以下の配列:
MVVVAAAPNPADGTPKVLLLSGQPASAAGAPAGQALPLMVPAQRGASPEAASGGLPQARKRQRLTHLSPEEKALRRKLKNRVAAQTARDRKKARMSELEQQVVDLEEENQKLLLENQLLREKTHGLVVENQELRQRLGMDALVAEEEAEAKGNEVRPVAGSAESAALRLRAPLQQVQAQLSPLQNISPWILAVLTLQIQSLISCWAFWTTWTQSCSSNALPQSLPAWRSSQRSTQKDPVPYQPPFLCQWGRHQPSWKPLMN(配列番号19;Genbankアクセッション番号NP_005071)を有するスプライシングされていない形態のヒトXBP1タンパク質からの少なくとも5つ(例えば、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34または35個)連続したアミノ酸のアミノ酸配列を有するペプチド、ならびに配列番号19のアミノ酸配列に由来するアミノ酸の1、2、3、4、5つ以下の置換(例えば、保存的置換)を有するペプチドのことを指す。表1において言及されたアミノ酸位置は、配列番号19に基づく。
グループAからの「スプライシング型XBP1」ペプチドには、表1に示されたペプチドが含まれ、それは、376アミノ酸および以下の配列:
MVVVAAAPNPADGTPKVLLLSGQPASAAGAPAGQALPLMVPAQRGASPEAASGGLPQARKRQRLTHLSPEEKALRRKLKNRVAAQTARDRKKARMSELEQQVVDLEEENQKLLLENQLLREKTHGLVVENQELRQRLGMDALVAEEEAEAKGNEVRPVAGSAESAAGAGPVVTPPEHLPMDSGGIDSSDSESDILLGILDNLDPVMFFKCPSPEPASLEELPEVYPEGPSSLPASLSLSVGTSSAKLEAINELIRFDHIYTKPLVLEIPSETESQANVVVKIEEAPLSPSENDHPEFIVSVKEEPVEDDLVPELGISNLLSSSHCPKPSSCLLDAYSDCGYGGSLSPFSDMSSLLGVNHSWEDTFANELFPQLISV(配列番号20;Genbankアクセッション番号NP_001073007)を有するスプライシングされた形態のヒトXBP1(XBP1スプライシング型)タンパク質からの少なくとも5つ(例えば、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、31、32、33、34または35個)連続したアミノ酸のアミノ酸配列を有するペプチド、ならびに配列番号20のアミノ酸配列に由来するアミノ酸の1、2、3、4、5つ以下の置換(例えば、保存的置換)を有するペプチドのことを指す。表1において言及されたアミノ酸位置は、配列番号20に基づく。
グループAからの「CD138」ペプチドには、表1に示されたペプチドが含まれ、それは、310アミノ酸および以下の配列:
MRRAALWLWLCALALSLQPALPQIVATNLPPEDQDGSGDDSDNFSGSGAGALQDITLSQQTPSTWKDTQLLTAIPTSPEPTGLEATAASTSTLPAGEGPKEGEAVVLPEVEPGLTAREQEATPRPRETTQLPTTHQASTTTATTAQEPATSHPHRDMQPGHHETSTPAGPSQADLHTPHTEDGGPSATERAAEDGASSQLPAAEGSGEQDFTFETSGENTAVVAVEPDRRNQSPVDQGATGASQGLLDRKEVLGGVIAGGLVGLIFAVCLVGFMLYRMKKKDEGSYSLEEPKQANGGAYQKPTKQEEFYA(配列番号21;Genbankアクセッション番号NP_002988)を有するヒトCD138タンパク質からの少なくとも5つ(例えば、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34または35個)連続したアミノ酸のアミノ酸配列を有するペプチド、ならびに配列番号21のアミノ酸配列に由来するアミノ酸の1、2、3、4、5つ以下の置換(例えば、保存的置換)を有するペプチドのことを指す。表1において言及されたアミノ酸位置は、配列番号21に基づく。
グループAからの「CS−1」ペプチドには、表1に示されたペプチドが含まれ、それは、335アミノ酸および以下の配列:
MAGSPTCLTLIYILWQLTGSAASGPVKELVGSVGGAVTFPLKSKVKQVDSIVWTFNTTPLVTIQPEGGTIIVTQNRNRERVDFPDGGYSLKLSKLKKNDSGIYYVGIYSSSLQQPSTQEYVLHVYEHLSKPKVTMGLQSNKNGTCVTNLTCCMEHGEEDVIYTWKALGQAANESHNGSILPISWRWGESDMTFICVARNPVSRNFSSPILARKLCEGAADDPDSSMVLLCLLLVPLLLSLFVLGLFLWFLKRERQEEYIEEKKRVDICRETPNICPHSGENTEYDTIPHTNRTILKEDPANTVYSTVEIPKKMENPHSLLTMPDTPRLFAYENVI(配列番号22;Genbankアクセッション番号NP_067004)を有するヒトCS−1タンパク質からの少なくとも5つ(例えば、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34または35個)連続したアミノ酸のアミノ酸配列を有するペプチド、ならびに配列番号22のアミノ酸配列に由来するアミノ酸の1、2、3、4、5つ以下の置換(例えば、保存的置換)を有するペプチドのことを指す。表1において言及されたアミノ酸位置は、配列番号22に基づく。
グループBペプチド。本開示は、表2に示されるような配列番号29〜50のいずれか1つと十分な同一性を有するかまたは同一であるアミノ酸配列を含む単離されたペプチド(「グループBペプチド」)も特徴とする。
Figure 0006374392
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好ましくは、グループBからの単離されたペプチドは、少なくとも9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30または35アミノ酸長(例えば、9〜35アミノ酸長、例えば、9〜30、9〜25、9〜20、9〜15アミノ酸長)であり、配列番号29〜50のアミノ酸配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%同一性であるかまたは同一であるアミノ酸配列を含む。他の好ましいペプチドは、少なくとも9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30または35アミノ酸長(例えば、9〜35アミノ酸長、例えば、9〜30、9〜25、9〜20、9〜15アミノ酸長)であり得、配列番号29〜50のアミノ酸配列、または配列番号29〜50のアミノ酸配列の1、2、3もしくは4つの置換を有するアミノ酸配列を含み得る。その置換は、保存的または非保存的置換であり得る。
グループBからの「非スプライシング型XBP1」ペプチドには、表2に示されたペプチドが含まれ、それは、261アミノ酸および配列番号19のアミノ酸配列を有するスプライシングされていない形態のヒトXBP1タンパク質からの少なくとも5つ(例えば、5、6、7、8、9、10、11または12個)連続したアミノ酸のアミノ酸配列を有するペプチド、ならびに配列番号19のアミノ酸配列に由来するアミノ酸の1、2、3、4、5つ以下の置換(例えば、保存的置換)を有するペプチドのことを指す。グループBからの非スプライシング型XBP1ペプチドには、配列番号29および33〜37のいずれか1つの一部または全部を含む配列番号19からのアミノ酸配列、例えば、配列番号29および33〜37のいずれか1つに対してN末端側および/またはC末端側の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20個のアミノ酸を含む配列を有するペプチドが含まれる。表2において言及されたアミノ酸位置は、配列番号19に基づく。
グループBからの「スプライシング型XBP1」ペプチドには、表2に示されたペプチドが含まれ、それは、376アミノ酸および配列番号20のアミノ酸配列を有するスプライシングされた形態のヒトXBP1(XBP1スプライシング型)タンパク質からの少なくとも5つ(例えば、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、31、32、33、34または35個)連続したアミノ酸のアミノ酸配列を有するペプチド、ならびに配列番号20のアミノ酸配列に由来するアミノ酸の1、2、3、4、5つ以下の置換(例えば、保存的置換)を有するペプチドのことを指す。グループBからのスプライシング型XBP1ペプチドには、配列番号30、38および39のいずれか1つの一部または全部を含む配列番号20からのアミノ酸配列、例えば、配列番号30、38および39のいずれか1つに対してN末端側および/またはC末端側の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20個のアミノ酸を含む配列を有するペプチドが含まれる。表2において言及されたアミノ酸位置は、配列番号20に基づく。
グループBからの「CD138」ペプチドには、表2に示されたペプチドが含まれ、それは、310アミノ酸および配列番号21のアミノ酸配列を有するヒトCD138タンパク質からの少なくとも5つ(例えば、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34または35個)連続したアミノ酸のアミノ酸配列を有するペプチド、ならびに配列番号21のアミノ酸配列に由来するアミノ酸の1、2、3、4、5つ以下の置換(例えば、保存的置換)を有するペプチドのことを指す。グループBからのCD138ペプチドには、配列番号31および40〜45のいずれか1つの一部または全部を含む配列番号21からのアミノ酸配列、例えば、配列番号31および46〜50のいずれか1つに対してN末端側および/またはC末端側の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20個のアミノ酸を含む配列を有するペプチドが含まれる。表2において言及されたアミノ酸位置は、配列番号21に基づく。
グループBからの「CS−1」ペプチドには、表2に示されたペプチドが含まれ、それは、335アミノ酸および配列番号22のアミノ酸配列を有するヒトCS−1タンパク質からの少なくとも5つ(例えば、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34または35個)連続したアミノ酸のアミノ酸配列を有するペプチド、ならびに配列番号22のアミノ酸配列に由来するアミノ酸の1、2、3、4、5つ以下の置換(例えば、保存的置換)を有するペプチドのことを指す。グループBからのCS1ペプチドには、配列番号32および46〜50のいずれか1つの一部または全部を含む配列番号22からのアミノ酸配列、例えば、配列番号32および46〜50のいずれか1つに対してN末端側および/またはC末端側の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20個のアミノ酸を含む配列を有するペプチドが含まれる。表2において言及されたアミノ酸位置は、配列番号22に基づく。
グループCペプチド。本開示は、表3に示されるような配列番号51〜536のいずれか1つと十分な同一性を有するかまたは同一であるアミノ酸配列を含む単離されたペプチド(「グループCペプチド」)を特徴とする。
Figure 0006374392
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好ましくは、グループCからの単離されたペプチドは、少なくとも9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30または35アミノ酸長(例えば、9〜35アミノ酸長、例えば、9〜30、9〜25、9〜20、9〜15アミノ酸長)であり、配列番号51〜536のアミノ酸配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%同一性であるかまたは同一であるアミノ酸配列を含む。他の好ましいペプチドは、少なくとも9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30または35アミノ酸長(例えば、9〜35アミノ酸長、例えば、9〜30、9〜25、9〜20、9〜15アミノ酸長)であり得、配列番号51〜536のアミノ酸配列、または配列番号51〜536のアミノ酸配列の1、2、3もしくは4つの置換を有するアミノ酸配列を含み得る。その置換は、保存的または非保存的置換であり得る。
グループCからの「非スプライシング型XBP1」ペプチドには、表3に示されたそれらのペプチドが含まれ、それは、261アミノ酸および配列番号19のアミノ酸配列を有するスプライシングされていない形態のヒトXBP1タンパク質からの少なくとも5つ(例えば、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34または35個)連続したアミノ酸のアミノ酸配列を有するペプチド、ならびに配列番号19のアミノ酸配列に由来するアミノ酸の1、2、3、4、5つ以下の置換(例えば、保存的置換)を有するペプチドのことを指す。グループCからの非スプライシング型XBP1ペプチドには、配列番号51〜206の一部または全部を含む配列番号19からのアミノ酸配列を有するペプチドが含まれる。表3において言及されたアミノ酸位置は、配列番号19に基づく。
グループCからの「CD138」ペプチドには、表3に示されたそれらのペプチドが含まれ、それは、310アミノ酸および配列番号21のアミノ酸配列を有するヒトCD138タンパク質からの少なくとも5つ(例えば、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34または35個)連続したアミノ酸のアミノ酸配列を有するペプチド、ならびに配列番号21のアミノ酸配列に由来するアミノ酸の1、2、3、4、5つ以下の置換(例えば、保存的置換)を有するペプチドのことを指す。グループCからのCD138ペプチドには、配列番号207〜371の一部または全部を含む配列番号21からのアミノ酸配列を有するペプチドが含まれる。表3において言及されたアミノ酸位置は、配列番号21に基づく。
グループCからの「CS−1」ペプチドには、表3に示されたそれらのペプチドが含まれ、それは、335アミノ酸および配列番号22のアミノ酸配列を有するヒトCS−1タンパク質からの少なくとも5つ(例えば、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34または35個)連続したアミノ酸のアミノ酸配列を有するペプチド、ならびに配列番号22のアミノ酸配列に由来するアミノ酸の1、2、3、4、5つ以下の置換(例えば、保存的置換)を有するペプチドのことを指す。グループCからのCS−1ペプチドには、配列番号372〜536の一部または全部を含む配列番号22からのアミノ酸配列を有するペプチドが含まれる。表3において言及されたアミノ酸位置は、配列番号22に基づく。
ペプチド全般。
本明細書中に記載されるペプチドは、関連する配列が、配列番号19〜22を有する野生型で全長の成熟ヒトタンパク質として存在する場合、多くの場合、それらのペプチドのNおよびC末端アミノ酸の残基番号を用いて言及される(例えば、XBP1118−126)。これらのペプチドは、頻繁に、配列番号19〜22を有する野生型で全長の成熟タンパク質の対応するセグメントと同一の配列を有し得る。しかしながら、用語「非スプライシング型XBP1ペプチド」(例えば、アミノ酸位置:118〜136、185〜193、186〜194、190〜198、193〜200または111〜119を有する非スプライシング型XBP1ペプチド)、「スプライシング型XBP1ペプチド」(例えば、アミノ酸位置:197〜205、194〜202、224〜232、368〜376を有するスプライシング型XBP1ペプチド)、「CD138ペプチド」(例えば、アミノ酸位置:256〜264、265〜273、260〜268、5〜13または7〜15を有するCD138ペプチド)およびCS1ペプチド(例えば、アミノ酸位置236〜245、240〜248、239〜247、232〜240または9〜17を有するCS−1ペプチド)が、ヒト以外の種の(それぞれ)XBP1非スプライシング型ペプチド、XBP1スプライシング型ペプチド、CD138またはCS−1ポリペプチドのペプチドフラグメントであり得ることが理解される。当業者によって認識されるように、そのような非ヒトポリペプチドのペプチドフラグメントのNおよびC末端のアミノ酸の番号は、ヒトポリペプチドの対応するペプチドフラグメントにおける番号と必ずしも同じでない。さらに、非ヒトポリペプチドのペプチドフラグメントの長さおよび/またはアミノ酸は、ヒトポリペプチドの対応するペプチドフラグメントにおけるそれらと必ずしも同じでないだろう。当業者は、非ヒトの非スプライシング型XBP1、スプライシング型XBP1、CD138およびCS−1ポリペプチドに由来するペプチドのN末端およびC末端のアミノ酸、長さならびにアミノ酸配列を確立する方法を承知しているだろう。これを行うために有用な方法の1つは、配列アラインメント、特に、最大相同性(maximum homology)配列アラインメントである。
2つのペプチド配列(例えば、配列番号1〜18および29〜536のペプチドならびにそのペプチドと少なくとも66%同一であり得る別のアミノ酸配列)間の同一性パーセントは、Clustal W(The European Bioinformatics Institute(EMBL−EBI)、BLAST−Protein(National Center for Biotechnology Information(NCBI),United States National Institutes of Health)およびPSAlign(University of Texas A&M;Szeら(2006)Journal of Computational Biology 13:309−319)を含むがこれらに限定されない種々のアルゴリズムおよびコンピュータプログラムを使用して決定され得る。
上に記載されたヒトペプチドおよび非ヒトペプチドのバリアントもまた本明細書中に開示される。本明細書中に記載されるヒトペプチドおよび非ヒトペプチドのバリアントには、(i)多くとも4つ(例えば、3、2または1つ)のアミノ酸置換(例えば、保存的または非保存的置換);(ii)末端もしくは内部の欠失;または(iii)末端もしくは内部の付加を有するペプチドの形態(これらのすべてが、下記で詳しく述べられる)が含まれ得る。
本開示は、配列番号1〜18および29〜536のいずれかのアミノ酸配列(表1〜3に示されたような)を含むか、それからなるか、またはそれから本質的になるが、多くとも4つ(例えば、多くとも3つ、多くとも2つまたは多くとも1つ)の置換を有する、ペプチドも特徴とする。これらの置換は、例えば、保存的または非保存的であり得る(上に記載されたように)。
保存的置換には、以下の群内の置換が含まれる:バリン、アラニンおよびグリシン;ロイシン、バリンおよびイソロイシン;アスパラギン酸およびグルタミン酸;アスパラギンおよびグルタミン;セリン、システインおよびトレオニン;リジンおよびアルギニン;ならびにフェニルアラニンおよびチロシン。非極性の疎水性アミノ酸には、アラニン、ロイシン、イソロイシン、バリン、プロリン、フェニルアラニン、トリプトファンおよびメチオニンが含まれる。極性の中性アミノ酸には、グリシン、セリン、トレオニン、システイン、チロシン、アスパラギンおよびグルタミンが含まれる。正に帯電した(塩基性)アミノ酸には、アルギニン、リジンおよびヒスチジンが含まれる。負に帯電した(酸性)アミノ酸には、アスパラギン酸およびグルタミン酸が含まれる。上述の極性、塩基性または酸性の群の1つのメンバーの、同じ群の別のメンバーによる任意の置換は、保存的置換と見なされ得る。対照的に、非保存的置換は、異なる特徴を有する別のアミノ酸に対する、1つのアミノ酸の置換である。
いくつかの実施形態において、上記ペプチドのいずれかの3、4、5、6、7および8つの位置のうちの1つ以上(例えば、1、2、3、4つまたは5つすべて)は、置換されない。いくつかの実施形態において、上記ペプチドのいずれかの3、4、5、6、7および8つの位置のうちの1つ以上は、表1〜3の中のペプチドのアミノ酸と同一である。
本明細書中に記載されるペプチド(例えば、本明細書中に記載される非スプライシング型XBP1ペプチド、本明細書中に記載されるスプライシング型XBP1ペプチド、本明細書中に記載されるCD138ペプチドおよび/または本明細書中に記載されるCS−1ペプチド)の第1のアミノ酸配列;および第1のアミノ酸配列と異種である第2のアミノ酸配列を含む融合タンパク質もまた特徴とする。
上記ペプチドの第2の異種アミノ酸配列は、通常、配列番号1〜18および29〜536のいずれかの免疫原性ペプチドの細胞における産生に悪影響を及ぼさない(および悪影響を及ぼさないように選択される)。細胞機構は、そのペプチドの中の任意のさらなる配列を除去することにより、配列番号1〜18および29〜536のいずれかの免疫原性ペプチドをもたらすと予想され、そのペプチドは、クラスIまたはクラスII MHC分子によって提示されることにより、XBP1、CD138またはCS1を発現しているがん細胞に対する免疫応答が刺激される。
第1のアミノ酸配列と「異種」であるアミノ酸配列、または用語「異種アミノ酸配列」は、第1のアミノ酸配列が天然に存在する場合、それに隣接しているアミノ酸配列以外の任意のアミノ酸配列である。例えば、ヒトXBP1におけるLLREKTHGL(配列番号1)に直接隣接する2つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20個以上)および/または20個未満(例えば、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2または1個)のカルボキシ末端および/またはアミノ末端のアミノ酸は、配列番号1と異種であると見なされない。配列番号1〜18および29〜536のいずれかのアミノ酸配列と100%未満同一であるかまたはそれらの配列に1〜4つの保存的置換を含む第1のアミノ酸配列を含む融合タンパク質は、決して天然には存在しない可能性があることが理解される。
いくつかの実施形態において、第2のアミノ酸配列は、単一のアミノ酸であり得る。第1のアミノ酸配列と「異種」であるアミノ酸、または用語「異種アミノ酸」は、第1のアミノ酸配列が天然に存在する場合、それに隣接しているアミノ酸以外の任意のアミノ酸であることが理解される。例えば、ヒトXBP1においてLLREKTHGL(配列番号1)に直接隣接している2つのアミノ酸は、配列番号1と異種であると見なされない。
異種配列は、例えば、組換えタンパク質の精製のために使用される配列(例えば、FLAG、ポリヒスチジン(例えば、ヘキサヒスチジン)(配列番号544)、赤血球凝集素(hemagluttanin)(HA)、グルタチオン−S−トランスフェラーゼ(GST)またはマルトース結合タンパク質(MBP))であり得る。異種配列は、診断マーカーまたは検出可能なマーカー、例えば、ルシフェラーゼ、緑色蛍光タンパク質(GFP)またはクロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ(CAT)として有用なタンパク質でもあり得る。いくつかの実施形態において、融合タンパク質は、KDEL(配列番号23)配列などの別のタンパク質または本明細書中に記載される他の任意のもの由来のシグナル配列を含み得る。いくつかの実施形態において、融合タンパク質は、免疫グロブリン分子の全部または一部(例えば、免疫グロブリン重鎖定常領域の全部または一部;下記を参照のこと)を含み得る。いくつかの実施形態において、融合タンパク質は、治療的ポリペプチドもしくは免疫刺激ポリペプチド(例えば、Tヘルパーエピトープ(例えば、PADREエピトープまたは破傷風トキソイドユニバーサルTヘルパー細胞エピトープ)またはサイトカインもしくはケモカインの全部もしくは一部)および/または例えば、免疫応答の誘発(例えば、抗体の産生)において有用なキャリア(例えば、KLH)を含み得る。いくつかの実施形態において、融合タンパク質は、1つ以上のリンカー、例えば、ペプチド配列を含むリンカー(下記を参照のこと)を含み得る。融合タンパク質は、標的化ポリペプチドも含み得る。異種配列は、様々な長さであり得、場合によっては、異種アミノ酸配列に結合している第1のアミノ酸配列よりも長い配列であり得る。第1のアミノ酸配列および第1と異種である第2のアミノ酸配列を含む融合タンパク質は、天然に存在するタンパク質と順序どおりに対応しないことが理解される。
標的化ポリペプチドは、本明細書中で使用される場合、それらが付着されている部分(例えば、第1のアミノ酸配列)を、特定の組織(例えば、リンパ節)もしくは細胞(例えば、抗原提示細胞または他の免疫細胞)、またはインビトロの場合、特定の単離された分子もしくは分子錯体に標的化するポリペプチドである。標的化ポリペプチドは、例えば、抗体(免疫グロブリン)もしくはその抗原結合フラグメント、または細胞表面レセプターに対するリガンドであり得る。抗体(またはその抗原結合フラグメント)は、例えば、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、ヒト化抗体、完全ヒト抗体、一本鎖抗体、キメラ抗体、または抗体のFabフラグメント、F(ab’)フラグメント、Fab’フラグメント、FvフラグメントもしくはscFvフラグメントであり得る。Fc領域を含むかまたはFc領域である(抗原結合領域を伴ってまたは伴わずに)抗体フラグメントは、試薬を、Fcレセプターを発現している細胞(例えば、抗原提示細胞、例えば、指状嵌入樹状細胞、マクロファージ、単球またはB細胞)に標的化するためにも使用され得る。細胞表面レセプターに対するリガンドは、例えば、ケモカイン、サイトカイン(例えば、インターロイキン1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15または16)またはデスレセプターリガンド(例えば、FasLまたはTNFα)であり得る。
いくつかの実施形態において、異種配列は、例えば、細胞または細胞の特定のコンパートメント(例えば、小胞体またはゴルジ装置)へのペプチドの送達を助ける「輸送配列」であり得る。輸送配列としては、例えば、膜転位配列、トランスポータン配列、アンテナペディア配列、環状インテグリン結合ペプチドおよびTat媒介ペプチドまたはそれらの改変バージョンが挙げられ得る。
リンカー、例えば、リンカーペプチドは、第1のアミノ酸配列を1つ以上の異種アミノ酸配列に直接または間接的に接続し得る。例えば、リンカーは、第1のアミノ酸配列を第2のアミノ酸配列に接続し得る。リンカーペプチドは、例えば、少なくとも4〜6つのアミノ酸がグリシンである一続きのアミノ酸であり得るか、またはそれを含み得る(例えば、Manceboら(1990)Mol.Cell.Biol.10:2492−2502を参照のこと)。リンカーペプチドはまた、6つ以上(例えば、7、8、9、10、11または12個以上)のヒスチジン残基であり得るか、またはそれを含み得る。そのリンカーペプチドは、少なくとも1つ(例えば、1、2、3、4、5、6、7または8個以上)のプロテアーゼ切断部位であり得るか、またはそれを含み得る。そのプロテアーゼ部位は、例えば、トリプシン、キモトリプシン(chymotrypin)またはXa因子切断部位であり得る。そのようなプロテアーゼ部位は、例えば、第1のアミノ酸配列を異種配列から切り離すのに有用であり得る。例えば、トリプシンプロテアーゼ切断部位によってポリヒスチジン配列(この場合、精製のために使用される)に連結された第1のアミノ酸配列を含む融合タンパク質の発現および精製の後、そのポリヒスチジン配列は、その融合タンパク質をトリプシンと接触させることによって、第1のアミノ酸配列から除去され得る。
第1のアミノ酸配列および第2のアミノ酸配列は、種々の方法で互いと会合され得る。本明細書中で使用される場合、2つ以上の原子間または分子単位間の相互作用の文脈における「〜と会合される」は、2つ以上の原子または分子単位(例えば、第1のアミノ酸配列および第2のアミノ酸配列)の任意の共有結合もしくは非共有結合または物理的混合を含む。共有結合の化学的性質(2つの原子が1つ以上の価電子対を共有すること)は、当該分野で公知であり、それには、例えば、ジスルフィド結合またはペプチド結合が含まれる。非共有結合は、価電子対の共有を伴わない原子間または分子間の化学結合である。例えば、非共有結合性の相互作用としては、例えば、疎水性相互作用、水素結合相互作用、イオン結合、ファンデルワールス結合または双極子間相互作用が挙げられる。そのような非共有結合性の相互作用の例としては、抗体と抗原の複合体化または結合対相互作用(結合対の第1のメンバーと第2のメンバーとの相互作用、例えば、ストレプトアビジンとビオチンとの間の相互作用)が挙げられる。したがって、用語「〜と会合される」(例えば、第1のアミノ酸配列および第2のアミノ酸配列の文脈において)は、用語「含む(comprising)」と同一の広がりをもつことが理解される。
いくつかの実施形態において、第1のアミノ酸配列および第2のアミノ酸配列は、単一の核酸配列によってコードされ得る(および単一の核酸配列から融合タンパク質として発現され得る)。場合によっては、第1のアミノ酸配列および第2のアミノ酸配列は、2つ以上(例えば、3、4、5または6つ以上)の異なる核酸配列によってコードされ得る。例えば、第1のアミノ酸配列は、第1の核酸配列によってコードされ得、第2のアミノ酸配列は、第2の核酸配列によってコードされ得る(下記の「ペプチドを産生させるための核酸および方法」を参照のこと)。
別々に発現されるかまたは産生される場合、第1のアミノ酸配列および第2のアミノ酸配列は、いくつかの公知の化学的架橋剤のいずれかを用いて共に架橋され得る。そのような化学的架橋剤の例は、2つのアミノ酸残基を、「妨害された(hindered)」ジスルフィド結合を含む結合を介して連結するものである。これらの結合において、架橋単位内のジスルフィド結合は、例えば、還元型グルタチオンまたは酵素ジスルフィドレダクターゼの作用による還元から保護される(ジスルフィド結合のいずれかの側の基を妨害することによって)。1つの好適な化学的架橋剤である4−スクシンイミジルオキシカルボニル−α−メチル−α(2−ピリジルジチオ)トルエン(SMPT)は、2つのアミノ酸配列の一方における末端リジンおよび他方の末端システインを利用して、それらのアミノ酸配列の間にそのような結合を形成する。ヘテロ二官能性試薬は、各アミノ酸配列における異なる結合部分によって架橋する。このようにして、得られる「二量体」は、ホモ二量体(例えば、2つの第1のアミノ酸配列または2つの第2のアミノ酸配列)でもホモ二量体とヘテロ二量体との混合物でもなく、ヘテロ二量体(第1および第2のアミノ酸配列を含むペプチド)である。したがって、第1のアミノ酸配列における結合部分は、システイン残基であり得、他方では、リジン残基であり得る。他の有用な架橋剤としては、2つのアミノ基を連結する化学物質(例えば、N−5−アジド−2−ニトロベンゾイルオキシスクシンイミド)、2つのスルフヒドリル基を連結する化学物質(例えば、1,4−ビス−マレイミドブタン)、アミノ基およびスルフヒドリル基を連結する化学物質(例えば、m−マレイミドベンゾイル−N−ヒドロキシスクシンイミドエステル)、アミノ基およびカルボキシル基を連結する化学物質(例えば、4−[p−アジドサリチルアミド]ブチルアミン)ならびにアミノ基およびアルギニンの側鎖に存在するグアニジウム(guanadium)基を連結する化学物質(例えば、p−アジドフェニルグリオキサール一水和物)が挙げられるがこれらに限定されない。
上記結合部分は、好ましくは、各アミノ酸配列の末端(CまたはN)に存在する。それらの結合部分は、上で示されたように、各アミノ酸配列におけるシステイン残基、または一方におけるシステインおよび他方におけるリジンであり得る。それらの結合部分が、2つのシステイン残基である場合、架橋は、例えば、アミノ酸配列を酸化条件に曝露することによって、もたらされ得る。
融合タンパク質は、第1のアミノ酸配列および第2のアミノ酸配列を含み得るか、または融合タンパク質は、1つより多い(例えば、2、3、4、5、6、7または8つ以上の)さらなる異種アミノ酸配列を含み得る。そのさらなる異種アミノ酸配列は、第1のアミノ酸配列のアミノ末端および/またはカルボキシ末端に隣接し得るかまたは連結され得る。
2つより多いアミノ酸配列が連結される場合、それらのアミノ酸配列の少なくとも1つは、1つより多い架橋部分を有し得る。例えば、第1のアミノ酸配列は、アミノ末端およびカルボキシ末端に架橋部分を有し得る。そのような多量体は、「連続的に」構築され得る。したがって、各アミノ酸配列は、その鎖における末端のアミノ酸配列だけが、ドメイン間(または作用物質間(inter−agent))の結合に関与する1つの残基を有する一方で、「内部の」アミノ酸配列の各々は、ドメイン間の結合に関与する2つの部分を有するように、その次のアミノ酸配列に連結される。あるいは、1つのアミノ酸配列(例えば、第1のアミノ酸配列)は、複数(例えば、2、3、4または5つ)の他のアミノ酸配列に連結され得る。
第1の構成要素および第2の構成要素を含むペプチド組成物も特徴とされ、ここで、その第1の構成要素は、本明細書中に記載されるペプチドである。第2の構成要素は、例えば、異種アミノ酸配列(上に記載されたような)、他の任意の抗原ペプチド(例えば、本明細書中に記載されるもの以外のペプチド、検出可能な標識(下記を参照のこと)、治療薬、診断薬または予防薬(下記を参照のこと)であり得る。例えば、ペプチド組成物は、配列番号1〜18および29〜536のいずれかからなるかまたはそれから本質的になるアミノ酸配列ならびに放射性核種などの検出可能な標識を含み得る。
いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるペプチドは、異種である最大200個(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190または200個)のアミノ酸をアミノ末端および/またはカルボキシ末端に有し得ることが理解される。
本明細書中に記載されるペプチドは、主要組織適合複合体(MHC)分子(例えば、MHCクラスI分子またはMHCクラスII分子)に結合し得る。「主要組織適合複合体」または「MHC」は、生理学的な免疫応答に関与する細胞相互作用の制御において役割を果たす遺伝子の一群である。ヒトでは、MHCは、HLA複合体として公知である(例えば、Paulら、FUNDAMENTAL IMMUNOLOGY,3rd Edition,Raven Press,New York,(1993)およびStitesら、IMMUNOLOGY,8th Edition,Lange Publishing,Los Altos,Calif.(1994)を参照のこと)。
「HLAスーパータイプまたはファミリー」は、本明細書中で使用される場合、共有されるペプチド結合特異性に基づいてグループ分けされるHLA分子のセットのことを指す。ある特定のアミノ酸モチーフを有するペプチドに対していくらか類似の結合親和性を共有するHLAクラスI分子は、HLAスーパータイプにグループ分けされる。HLAスーパーファミリー、HLAスーパータイプファミリー、HLAファミリーおよびHLA xx様分子(ここで、xxは、特定のHLAタイプを表す)という用語は、同義語である。HLAクラスI分子のタイプとしては、例えば、HLA−A1、HLA−A2、HLA−A3、HLA−A24、HLA−B7、HLA−B27、HLA−B44、HLA−B58またはHLA−B62が挙げられる。そのようなHLA分子は、米国特許第7,026,443号(その開示全体がすべて、参照により援用される)に詳細に記載されている。
ペプチドは、高親和性または中間の親和性でMHC分子に結合し得る。本明細書中で使用される場合、HLAクラスI分子に対するペプチドの「高親和性」結合は、50nM未満(例えば、45、40、35、30、25、20、15、10、5、1、0.5、0.1nMまたは0.05nM未満)の解離定数(K)での結合として定義される。「中間の親和性」は、約50nM〜約500nM(例えば、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、110、115、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490または500nM)のKでのHLAクラスI分子に対するペプチドの結合である。HLAクラスII分子に対するペプチドの「高親和性」結合は、100nM未満(例えば、95、90、85、80、75、70、65、60、55、50、45、40、35、30、25、20、15、10、5、1、0.5、0.1nMまたは0.05nM未満)のKでの結合として定義される。HLAクラスII分子に対するペプチドの「中間の親和性」は、約100〜約1000nM(例えば、100、110、115、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990または1000nM)のKでの結合である。ペプチドおよびMHC分子の結合親和性を決定するための方法は、当該分野で公知であり、添付の実施例に示される。好適な方法は、例えば、米国特許第7,026,443号にも記載されている。
本明細書中に記載されるペプチドは、MHC分子と会合した状態において、T細胞上の抗原特異的T細胞レセプターによって認識され得る。種々の好適な方法を用いることにより、ペプチドが、MHC分子と会合した状態において、T細胞上のT細胞レセプターによって認識されるかを決定することができる。例えば、正常な被験体由来の末梢血リンパ球(PBL)を、インビトロにおいて数週間にわたって抗原提示細胞の存在下で試験ペプチドとともに培養し得る。そのペプチドに特異的なT細胞は、この時間の間に活性化状態になり、例えば、増殖アッセイ(カルボキシフルオレセイン(carboxyfluoroscein)スクシンイミジルエステル(CFSE)アッセイまたはH−チミジンアッセイ)、限界希釈アッセイ、細胞傷害性アッセイ(例えば、カルセイン放出アッセイ)またはサイトカイン放出アッセイ(例えば、IFNγ)、リンフォカイン放出アッセイもしくは51Cr放出アッセイ(例えば、Wentworth,P.A.ら、Mol.Immunol.32:603,1995;Celis,E.ら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91:2105,1994;Tsai,V.ら、J.Immunol.158:1796,1997;Kawashima,I.ら、Human Immunol.59:1,1998(これらの各開示はその全体が、参照により援用される)を参照のこと)を使用して検出され得る。好適なインビボ方法は、HLAトランスジェニックマウスを免疫することを含み、ここで、アジュバント中のペプチドを、HLAトランスジェニックマウスの皮下に投与し、免疫化の数週間後に、脾細胞を取り出し、インビトロにおいて試験ペプチドの存在下でおよそ1週間培養し、ペプチド特異的T細胞を、例えば、51Cr放出アッセイを用いて検出する(例えば、Wentworth,P.A.ら、J.Immunol.26:97,1996;Wentworth,P.A.ら、Int.Immunol.8:651,1996;Alexander,J.ら、J.Immunol.159:4753,1997(これらの各開示はその全体が、参照により援用される)を参照のこと)。好適な方法は、添付の実施例にも示される。例えば、ペプチド(MHC分子との関連で)によるT細胞の活性化は、IFN−γサイトカイン産生、CD107α脱顆粒またはカルセイン放出細胞傷害性アッセイによって決定され得る(例えば、実施例13および14を参照のこと)。
さらに、抗原特異的T細胞の直接的な定量が、検出可能に標識されたMHC複合体(例えば、本明細書中に記載されるMHC分子多量体組成物(下記を参照のこと)またはHLA−I四量体(例えば、Altman,J.D.ら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:10330,1993およびAltman,J.D.ら、Science 274:94,1996(これらの各開示はその全体が、参照により援用される)に記載されているような)のいずれか)でT細胞を染色することによって行われ得る。
いくつかの実施形態において、上記ペプチドは、それらのペプチドの1つ以上の特性を調節するため(例えば、増加または減少させるため)に、改変され得る(例えば、それらのペプチドのアミノ酸が置換され得る)。例えば、表1に示されたペプチドのうちの1つの、1つ以上(例えば、2、3または4個)のアミノ酸が、MHC分子に対するそのペプチドの親和性を高めるために、置換され得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるペプチドのうちの1つのアミノ酸(例えば、そのペプチドのアミノ酸残基と接触するT細胞レセプター)は、T細胞レセプターとそのペプチド(MHC分子との関連で)との間の結合相互作用を増強するために、改変され得る。そのような改変されたペプチドは、多くの場合、「変更されたペプチドリガンド」と称される(例えば、Kalergisら(2000)J Immunol.165(1):280;Conlonら(2002)Science 1801;および国際公開番号WO02070003(これらの各開示はその全体が、参照により援用される)を参照のこと)。
ペプチドを改変するため、ならびにその改変の影響を決定するための好適な方法は、添付の実施例に示され、例えば、Collinsら(Immunlogical Reviews(1998)163:151−160(この開示はその全体が、参照により援用される))に記載されている。
ペプチドを産生させるための核酸および方法
本開示は、1つ以上(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13または14個)の本明細書中に記載される任意のペプチド(または本明細書中に記載される融合タンパク質)をコードする核酸配列(ならびに核酸配列を含む核酸ベクター)およびそれを産生させるための方法も特徴とする。そのような方法は、必要に応じて、1つ以上の本明細書中に記載される任意のペプチド(または本明細書中に記載される融合タンパク質)をコードする核酸配列を含む核酸ベクターを含む細胞(または細胞の群)を提供する工程(その核酸配列は、発現調節配列に作動可能に連結されている)、およびその細胞を、そのペプチド(または融合タンパク質)の発現を可能にする条件下で培養する工程を含み得る。その方法は、その細胞またはその細胞を培養した培地から1つ以上のペプチド(またはタンパク質)を単離する工程も含み得る。
本明細書中に記載されるペプチド(または融合タンパク質)の1つ以上を組換え発現するための核酸配列およびベクター(例えば、発現ベクター)を構築するための好適な方法は、当業者に周知であり、例えば、Sambrookら、Molecular Cloning:A Laboratory Manual Second Edition vol.1、2および3.Cold Spring Harbor Laboratory Press:Cold Spring Harbor,New York,USA,Nov.1989(この開示はその全体が、参照により援用される)に記載されている。それらの核酸およびベクターは、例えば、多種多様の宿主細胞(例えば、細菌細胞、酵母細胞または哺乳動物細胞を含む)においてそれらのペプチド(または融合タンパク質)を発現させるために使用され得る。それらの核酸およびベクターは、例えば、下記に記載されるようなインビボおよびエキソビボでの方法においても使用され得る。
ペプチドをコードする配列(または融合タンパク質をコードする配列)は、核酸によってコードされるペプチド(または融合タンパク質)の発現を指向するプロモーターおよび/またはエンハンサーエレメントに作動可能に連結され得る。エンハンサーは、時間、位置およびレベルに関して、発現の特異性を提供する。プロモーターとは異なり、エンハンサーは、プロモーターが存在する条件で、転写開始部位から不定の距離に位置する場合、機能し得る。エンハンサーは、転写開始部位の下流または関連する遺伝子のエキソンの中にも位置し得る。コード配列をプロモーターの制御下に置くためには、ペプチドの翻訳読み枠の翻訳開始部位を、プロモーターの1〜約50ヌクレオチド下流(3’)に位置させる必要がある。目的のプロモーターとしては、サイトメガロウイルスhCMV前初期遺伝子、SV40アデノウイルスの初期もしくは後期プロモーター、lac系、trp系、TAC系、TRC系、ファージAの主要オペレ−ターおよびプロモーター領域、fdコートタンパク質の制御領域、3ホスホグリセリン酸キナーゼに対するプロモーター、酸ホスファターゼのプロモーター、ならびに酵母α接合因子のプロモーター、アデノウイルスE1b最小プロモーター、またはチミジンキナーゼ最小プロモーターが挙げられるが、これらに限定されない。
ペプチドをコードする配列、融合タンパク質をコードする配列、またはそのような配列を含むベクターは、シグナルペプチドをコードするリーダー配列を含み得る。そのリーダー配列は、本明細書中に記載されるペプチドまたは融合タンパク質の1つ以上をコードする配列の5’末端に存在し得る。シグナルペプチドは、所与のペプチド(または融合タンパク質)のすぐN末端側であり得るか、またはリーダー配列が、ペプチドまたは融合タンパク質をコードする核酸配列とインフレームである条件で、1つ以上(例えば、2、3、4、6、8、10、15または20個)のアミノ酸によってそのペプチドから分断され得る。シグナルペプチドは、通常、分泌前に(当然のことながら、そのシグナルペプチドが、膜貫通(trasmembrane)タンパク質の挿入を指向しない限り)、ペプチド(または融合タンパク質)から切断され、それが結合しているペプチド(または融合タンパク質)を、翻訳中に宿主細胞の小胞体(ER)の内腔に指向させ、次いで、そのペプチド(または融合タンパク質)は、分泌小胞を介して、宿主細胞の環境に分泌される。有用なシグナルペプチドとしては、例えば、サイトカインもしくは成長因子の天然のリーダー配列、KDEL(配列番号23)、または例えば、米国特許第5,827,516号(その開示はその全体が、参照により本明細書中に援用される)に記載されている、任意のシグナル配列が挙げられる。
いくつかの実施形態において、ペプチドをコードする配列(または融合タンパク質をコードする配列)の5’末端は、非天然のATG「開始配列」を含み得る。すなわち、例えば、ATG配列は、ペプチド(または融合タンパク質)が正しく転写され、翻訳されるのを確実にするために、そのペプチド(または融合タンパク質)をコードする核酸に付加され得る。リーダー配列は、通常、ATG開始配列を含むが、リーダー配列がATG開始配列を含まない実施形態では、リーダー配列をコードする核酸の5’末端にATG配列が付加され得る。
ペプチドをコードする配列および発現ベクターを構築するための好適な方法は、当業者に周知であり、例えば、Sambrookら、Molecular Cloning:A Laboratory Manual Second Edition vol.1、2および3.Cold Spring Harbor Laboratory Press:Cold Spring Harbor,New York,USA,Nov.1989(その開示はその全体が、参照により本明細書中に援用される)に記載されている。
組換えベクターは、種々の方法を用いて細胞内に導入され得、それらの方法は、その核酸が導入される細胞のタイプに少なくとも部分的に依存し得る。例えば、細菌細胞は、エレクトロポレーションまたは熱ショックなどの方法を用いて形質転換され得る。酵母細胞をトランスフェクトするための方法としては、例えば、スフェロプラスト法または全細胞塩化リチウム酵母形質転換法が挙げられる(例えば、米国特許第4,929,555号;Hinnenら(1978)Proc.Nat.Acad.Sci.USA 75:1929;Itoら(1983)J.Bacteriol.153:163;米国特許第4,879,231号;およびSreekrishnaら(1987)Gene 59:115(これらの各開示はその全体が、参照により本明細書中に援用される)を参照のこと)。動物細胞のトランスフェクションは、例えば、リン酸カルシウム、エレクトロポレーション、熱ショック、リポソームもしくはトランスフェクション試薬(例えば、FUGENE(登録商標)またはLIPOFECTAMINE(登録商標))を用いるか、または裸の核酸ベクターを溶液中の細胞と接触させることによって(例えば、Sambrookら、前出を参照のこと)、細胞にベクターを導入することを特徴とし得る。
本明細書中に記載されるペプチド(または融合タンパク質)の小規模または大規模産生のために使用され得る発現系としては、組換えバクテリオファージDNA、プラスミドDNAまたはコスミドDNA発現ベクターで形質転換された微生物、例えば、細菌(例えば、大腸菌およびB.subtilis);組換え酵母発現ベクターで形質転換された真菌(例えば、酵母(例えば、SaccharomycesおよびPichia));組換えウイルス発現ベクター(例えば、バキュロウイルス)に感染した昆虫細胞系;組換えウイルス発現ベクター(例えば、カリフラワーモザイクウイルス(CaMV)およびタバコモザイクウイルス(TMV))に感染したかもしくは組換えプラスミド発現ベクター(例えば、Tiプラスミド)で形質転換された植物細胞系;または哺乳動物細胞のゲノムに由来するプロモーター(例えば、メタロチオネインプロモーター)もしくは哺乳動物ウイルスに由来するプロモーター(例えば、アデノウイルス後期プロモーター、CMVプロモーター、SV40プロモーターまたはワクシニアウイルス7.5Kプロモーター)を含む組換え発現構築物を有する哺乳動物細胞系(例えば、COS、CHO、BHK、293、VERO、HeLa、MDCK、WI38およびNIH 3T3細胞)が挙げられるが、これらに限定されない。哺乳動物から直接得られたか、プラスミドベクターでトランスフェクトされたか、またはウイルスベクター(例えば、ウイルスベクター、例えば、とりわけ、ヘルペスウイルス、レトロウイルス、ワクシニアウイルス、弱毒化ワクシニアウイルス、カナリアポックスウイルス、アデノウイルスおよびアデノ随伴ウイルス)に感染した、初代細胞または二次細胞(secondary cell)もまた宿主細胞として有用である。
上に記載されたように、本明細書中に記載される任意のペプチド(または融合タンパク質)の発現の後、それらのペプチド(または融合タンパク質)は、標準的な手法を用いて、培養細胞から、またはそれらの細胞が培養された培地から、単離され得る(Sambrookら、前出を参照のこと)。タンパク質を単離する方法は、当該分野で公知であり、それらとしては、例えば、液体クロマトグラフィー(例えば、HPLC)、アフィニティークロマトグラフィー(例えば、金属キレート化またはイムノアフィニティークロマトグラフィー)、イオン交換クロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、沈殿または差次的可溶化(differential solubilization)が挙げられる。
より小さいペプチド(例えば、200未満(例えば、175未満、150未満、125未満、100未満、90未満、80未満、70未満または60未満)のアミノ酸を有するペプチド)は、FMOC固相合成などの標準的な化学的手段によって化学的に合成され得る(実施例1を参照のこと)。
本明細書中に記載されるペプチド(および融合タンパク質)は、単離され得るが、必ずしも単離されなくてもよい。用語「単離される」は、本明細書中に記載される任意のペプチド(または融合タンパク質)に適用される場合、天然に付随する構成要素(例えば、タンパク質または他の天然に存在する生物学的分子もしくは有機分子)から分離または精製された、ペプチド、そのフラグメント(または組成物の場合、巨大分子複合体)のことを指す。組換え分子(例えば、組換えペプチド)は、常に「単離」されていると理解される。典型的には、ペプチド(またはフラグメントまたは巨大分子複合体)は、調製物中の同じタイプの全分子の少なくとも60重量%、例えば、サンプル中の同じタイプの全分子の60%を構成する場合、単離されている。例えば、本明細書中に記載されるペプチドは、調製物中またはサンプル中の全タンパク質の少なくとも60重量%を構成する場合、単離されていると見なされる。いくつかの実施形態において、調製物中の分子は、調製物中の同じタイプの全分子の少なくとも75重量%、少なくとも90重量%または少なくとも99重量%からなる。
同様に、本明細書中に記載される、ペプチドをコードする配列、融合タンパク質をコードする配列またはそのような配列を含むベクターもまた、単離され得る。用語「単離される」は、本明細書中に記載される、ペプチドをコードする配列、融合タンパク質をコードする配列またはベクターのいずれかに適用される場合、天然に付随する構成要素(例えば、核酸、タンパク質または他の天然に存在する生物学的分子もしくは有機分子)から分離または精製された、ペプチドをコードする配列、融合タンパク質をコードする配列またはベクター、それらのフラグメントのことを指す。組換え分子(例えば、組換えベクター、またはペプチドをコードする配列もしくは融合タンパク質をコードする配列)は、常に「単離」されていると理解される。典型的には、ペプチドをコードする配列、融合タンパク質をコードする配列またはベクター(またはそれらのフラグメント)は、調製物中の同じタイプの全分子の少なくとも60重量%、例えば、サンプル中の同じタイプの全分子の60%を構成する場合、単離されている。例えば、本明細書中に記載される、ペプチドをコードする配列またはベクターは、調製物中またはサンプル中の全核酸の少なくとも60重量%を構成する場合、単離されていると見なされる。いくつかの実施形態において、調製物中の分子は、調製物中の同じタイプの全分子の少なくとも75重量%、少なくとも90重量%または少なくとも99重量%からなる。
いくつかの実施形態において、単離されたペプチド、融合タンパク質、ペプチドをコードする配列、融合タンパク質をコードする配列またはベクターは、凍結され得るか、凍結乾燥され得るか、または固定化され得、それらの分子が活性(例えば、ペプチドがMHCクラスI分子などのMHC分子に結合する能力、またはベクターが細胞内でのペプチドの発現を支持する能力)を保持することを可能にする適切な条件下で保存され得る。
ペプチドのさらなる処理
本明細書中に記載される任意のペプチド(または融合タンパク質)の発現または合成の後、それらのペプチド(または融合タンパク質)は、さらに処理され得る。そのさらなる処理には、ペプチド(または融合タンパク質)に対する化学的もしくは酵素的な修飾が含まれ得るか、またはそれらのペプチド(または融合タンパク質)が修飾される場合、その処理には、既存の修飾の酵素的もしくは化学的な変更またはその両方が含まれ得る。ペプチドのさらなる処理には、異種アミノ酸配列(例えば、上に記載された任意の異種アミノ酸配列であるがこれらに限定されない)の付加(共有結合性または非共有結合性の連結)が含まれ得る。酵素的処理は、ペプチドを、例えば、1つ以上のプロテアーゼ、ホスファターゼまたはキナーゼと、そのペプチドが修飾されるのを可能にする条件下で、接触させる工程を含み得る。酵素的処理は、ペプチドを、そのペプチドをグリコシル化することができるかまたはそのペプチドのグリコシル化を修飾することができる1つ以上の酵素(例えば、オリゴサッカリルトランスフェラーゼまたはマンノシダーゼ)と、接触させる工程を含み得る。
上記処理には、ペプチドへの、例えば検出可能な標識の、付加が含まれ得る。例えば、ペプチドは、酵素(例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼまたはアセチルコリンエステラーゼ)、蛍光材料(例えば、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミン、フルオレセイン、塩化ダンシル、アロフィコシアニン(APC)またはフィコエリトリン)、発光材料(例えば、ランタニドまたはそのキレート)、生物発光材料(例えば、ルシフェラーゼ、ルシフェリンまたはエクオリン)または放射性核種(例えば、H、32P、33P、125Iまたは35S)で検出可能に標識され得る。
上記処理は、上記ペプチド(または融合タンパク質)をポリマー(例えば、ポリアルキレングリコール部分、例えば、ポリエチレングリコール部分)に結合させることも含み得る。いくつかの実施形態において、そのポリマーは、ペプチド上のN末端の部位において、そのペプチドに結合される。いくつかの実施形態において、ペプチドは、ポリマーが結合体化され得る内部ポリマー結合体化部位をもたらす1つ以上の内部アミノ酸挿入を含み得る。
薬学的組成物
本明細書中に記載されるペプチド、融合タンパク質、およびそれらのペプチドまたは融合タンパク質をコードする核酸のいずれかが、薬学的組成物に組み込まれ得る。そのような組成物は、典型的には、それらのペプチド(および/またはそれらのペプチドをコードする核酸)の1つ以上および薬学的に許容され得るキャリアを含む。本明細書中で使用される場合、語「薬学的に許容され得るキャリア」には、医薬の投与に適合する、溶媒、分散媒、コーティング、抗菌剤および抗真菌剤、等張剤および吸収遅延剤などが含まれる。1つ以上のペプチドが、シロップ、エリキシル、懸濁液、粉末、顆粒、錠剤、カプセル、ロゼンジ、トローチ、溶液、クリーム、軟膏、ローション、ゲル、エマルジョンなどの形態の薬学的組成物として製剤化され得る。補助的な活性な化合物(例えば、1つ以上の化学療法剤)もまた、組成物に組み込まれ得る。好ましくは、組成物は、本明細書中に記載される2つ以上(例えば、2、3、4、5または6つ)のペプチドを含む。組成物は、本明細書中に開示される免疫原性ペプチド以外の免疫原性ペプチド、例えば、WT1由来のペプチドまたはその誘導体、例えば、本明細書中に記載されるような免疫原性ペプチドも含み得る。他の免疫原性ペプチドとしては、MUC1由来の免疫原性ペプチド、gp100由来の免疫原性ペプチド、TRP−2由来の免疫原性ペプチド、MAG1由来の免疫原性ペプチド、NY−ESO1由来の免疫原性ペプチド、HER−2由来の免疫原性ペプチド;およびAIM2由来の免疫原性ペプチドが挙げられるが、これらに限定されない。
薬学的組成物は、通常、意図される投与経路と適合するように製剤化される。投与経路の例としては、経口、直腸および非経口的、例えば、静脈内、筋肉内、皮内、皮下、吸入、経皮的または経粘膜的が挙げられる。非経口適用のために使用される溶液または懸濁液は、以下の構成要素:無菌の希釈剤(例えば、注射用水、食塩水溶液、固定油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコールまたは他の合成溶媒);抗菌剤(例えば、ベンジルアルコールまたはメチルパラベン);抗酸化剤(例えば、アスコルビン酸または重亜硫酸ナトリウム);キレート剤(例えば、エチレンジアミン四酢酸);緩衝剤(例えば、酢酸塩、クエン酸塩またはリン酸塩および浸透圧を調整するための作用物質、例えば、塩化ナトリウムまたはデキストロース)を含み得る。pHは、酸または塩基(例えば、塩酸または水酸化ナトリウム)で調整され得る。組成物は、ガラスまたはプラスチックで作られた、アンプル、使い捨て注射器または複数回投与バイアルに封入され得る。
注射可能な使用に適した薬学的組成物には、無菌の水溶液(水溶性である場合)または分散液、および無菌の注射可能な溶液または分散液の即時調製用の無菌の粉末が含まれる。静脈内投与の場合、好適なキャリアとしては、生理食塩水、静菌水、Cremophor EL(商標)(BASF,Parsippany,N.J.)またはリン酸緩衝食塩水(PBS)が挙げられる。すべての場合において、薬学的組成物は、無菌でなければならなく、容易な注射可能性(easy syringability)が存在する程度に流動性であるべきである。薬学的組成物は、製造条件下および貯蔵条件下において安定であるべきであり、微生物(例えば、細菌および真菌)による任意の汚染から保護されなければならない。キャリアは、例えば、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコールおよび液体ポリエチレングリコールなど)およびそれらの好適な混合物を含む溶媒または分散媒であり得る。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティングの使用、分散液の場合、要求される粒径の維持、および界面活性物質の使用によって、維持され得る。微生物による汚染の防止は、様々な抗菌剤および抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、アスコルビン酸、チメロサールなどによって達成され得る。多くの場合、等張剤、例えば、糖類、多価アルコール類、例えば、マンニトール(manitol)、ソルビトール、塩化ナトリウムを組成物中に含めることが望ましいだろう。注射可能な組成物の長期の吸収は、吸収を遅延させる作用物質、例えば、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンを組成物中に含めることによって、促進され得る。
無菌の注射可能な溶液は、要求される場合、上に列挙された成分のうちの1つまたは組み合わせとともに、1つ以上のペプチド(またはそのペプチドをコードする1つ以上の核酸)を要求される量で適切な溶媒に組み込んだ後、濾過滅菌することによって、調製され得る。一般に、分散液は、ペプチド(または融合タンパク質、もしくはペプチドをコードする核酸)を、塩基性分散媒および上に列挙された成分からの要求される他の成分を含む無菌のビヒクルに組み込むことによって、調製される。無菌の注射可能な溶液を調製するための無菌の粉末の場合、調製方法は、その予め濾過滅菌された溶液から、活性成分+任意のさらなる所望の成分の粉末をもたらす真空乾燥または凍結乾燥を含み得る。
経口組成物は、通常、不活性な希釈剤または可食キャリアを含む。経口の治療的投与の目的で、1つ以上のペプチド(または融合タンパク質)は、賦形剤とともに組み込まれ、錠剤、トローチまたはカプセル、例えば、ゼラチンカプセルの形態で使用され得る。経口組成物はまた、うがい薬として使用するために流動性のキャリアを使用して調製され得る。薬学的に適合性の結合剤および/またはアジュバント材料を、組成物の一部として含み得る。錠剤、丸剤、カプセル、トローチなどは、以下の成分のいずれかまたは類似の性質の化合物を含み得る:結合剤(例えば、微結晶性セルロース、トラガカントガムまたはゼラチン);賦形剤(例えば、デンプンまたはラクトース)、崩壊剤(例えば、アルギン酸、Primogelまたはトウモロコシデンプン);潤滑剤(例えば、ステアリン酸マグネシウムまたはステロート(sterotes));滑剤(glidant)(例えば、コロイド状二酸化ケイ素);甘味剤(例えば、スクロースまたはサッカリン);香味剤(例えば、ペパーミント、サリチル酸メチルまたはオレンジ香料)。
粉末および錠剤は、1%〜95%(w/w)の、個別のペプチドまたは2つ以上のペプチドの混合物を含み得る。ある特定の実施形態において、そのペプチドは、約5%〜70%(w/w)の範囲であり得る。好適なキャリアは、炭酸マグネシウム、ステアリン酸マグネシウム、タルク、糖、ラクトース、ペクチン、デキストリン、デンプン、ゼラチン、トラガカント、メチルセルロース、カルボキシメチルセルロースナトリウム、低融点ろう、カカオバターなどである。用語「調製物」には、ペプチドが、他のキャリアを伴ってまたは伴わずに、キャリアによって包囲され、それにより、それと会合している、カプセルを提供するキャリアとして封入材料を伴うペプチド(または核酸)の製剤が含まれると意図されている。同様に、カシェおよびロゼンジが含まれる。錠剤、粉末、カプセル、丸剤、カシェおよびロゼンジは、経口投与に適した固形の剤形として使用され得る。
経口使用に適した水溶液は、活性な構成要素を水に溶解し、好適な着色料、香料、安定剤および増粘剤を所望のとおりに加えることによって、調製され得る。経口使用に適した水性懸濁液は、微粉化された活性な構成要素を、粘稠性材料、例えば、天然ゴムまたは合成ゴム、樹脂、メチルセルロース、カルボキシメチルセルロースナトリウム、および他の周知の懸濁剤とともに水に分散させることによって、生成され得る。
吸入による投与の場合、上記ペプチド(または融合タンパク質または核酸)は、好適な噴霧剤、例えば、二酸化炭素などの気体を含む加圧容器もしくはディスペンサーまたは噴霧器からのエアロゾルスプレーの形態で送達され得る。
全身投与は、経粘膜的または経皮的な手段によっても行われ得る。経粘膜的または経皮的投与の場合、透過すべきバリアに対して適切な浸透剤が、製剤において使用される。そのような浸透剤は、当該分野で広く公知であり、それらとしては、例えば、経粘膜的投与の場合、界面活性剤、胆汁酸塩およびフシジン酸誘導体が挙げられる。経粘膜的投与は、点鼻薬または坐剤を使用することによって達成され得る。経皮的投与の場合、上記ペプチド(または融合タンパク質または核酸)は、当該分野で広く公知であるような軟膏、膏薬、ゲルまたはクリームに製剤化され得る。
上記ペプチド(または融合タンパク質または核酸)は、直腸送達用の坐剤(例えば、カカオバターおよび他のグリセリドなどの従来の坐剤基剤を用いて)または停留浣腸(retention enemas)の形態でも調製され得る。
1つの実施形態において、上記ペプチド(または融合タンパク質または核酸)は、それらのペプチド(融合タンパク質または核酸)を身体からの迅速な排出から保護するキャリアを用いて調製され得る(例えば、インプラントおよびマイクロカプセル化された送達系を含む、放出制御製剤)。生分解性の生体適合性ポリマー(例えば、エチレンビニルアセテート、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステルおよびポリ乳酸)が使用され得る。そのような製剤を調製するための方法は、当業者に明らかであろう。それらの材料は、Alza CorporationおよびNova Pharmaceuticals,Inc.からも商業的に入手することができる。リポソーム懸濁液(例えば、APC特異的抗原に対するモノクローナル抗体によってAPCに標的化されたリポソームを含む)もまた、薬学的に許容され得るキャリアとして使用され得る。これらは、当業者に公知の方法に従って、例えば、米国特許第4,522,811号に記載されているように、調製され得る。
投与を容易にするためおよび投与量の均一性のために、経口または非経口組成物を投薬単位形態(dosage unit form)で製剤化することが、有益であり得る。投薬単位形態は、本明細書中で使用される場合、処置される被験体に対する単位投与量として適した物理的に別個の単位のことを指し;各単位は、必要とされる薬学的キャリアとともに所望の治療効果をもたらすように計算された所定の量のペプチド(または融合タンパク質または核酸)を含む。投薬単位は、使用するための指示も伴い得る。
上記ペプチド(または融合タンパク質)をコードする核酸分子は、ベクターに挿入され得、遺伝子治療ベクター(上に記載されたような)として使用され得る。遺伝子治療ベクターは、例えば、静脈内注射、局所投与(例えば、米国特許第5,328,470号を参照のこと)または定位注射(例えば、Chenら(1994)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91:3054−3057を参照のこと)によって、被験体に送達され得る。遺伝子治療ベクターの薬学的調製物は、許容され得る希釈剤中に遺伝子治療ベクターを含み得るか、または遺伝子送達ビヒクルが埋め込まれている持続放出マトリックスを含み得る。あるいは、完全な遺伝子送達ベクターが、組換え細胞からインタクトに産生され得る場合(例えば、レトロウイルスベクター)、薬学的調製物は、遺伝子送達系を産生する1つ以上の細胞を含み得る(下記の「エキソビボ方法」を参照のこと)。
遺伝子送達ビヒクルのさらなる例としては、リポソーム、天然ポリマーおよび合成ポリマーを含む生体適合性ポリマー;リポタンパク質;ポリペプチド;多糖類;リポ多糖類;人工ウイルスエンベロープ;金属粒子;細菌;ウイルス(例えば、バキュロウイルス、アデノウイルスおよびレトロウイルス);バクテリオファージ;コスミド;プラスミド;真菌ベクター、ならびに種々の真核生物宿主および原核生物宿主における発現について記載されており、遺伝子治療ならびに単純なタンパク質発現のために使用され得る、当該分野において典型的に使用される他の組換えビヒクルが挙げられるが、これらに限定されない。
ウイルスベクターの例としては、レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、アルファウイルスベクターなどが挙げられる。抗体またはそのフラグメントなどの標的化部分を含むリポソームは、被験体に送達するための核酸の薬学的組成物を調製するためにも使用され得る。
本明細書中に記載される任意の薬学的組成物が、下記に記載されるような投与に対する指示とともに、容器、パックまたはディスペンサーの中に含められ得る。
MHC分子多量体組成物およびその組成物を使用するための方法
本開示は、(i)上に記載された1つ以上の任意のペプチド、および(ii)主要組織適合複合体(MHC)分子多量体を含む組成物も特徴とする。その多量体は、2つ以上(例えば、3、4、5、6、7、8、9または10個以上)のMHC分子全体またはMHC分子のペプチド結合領域を含む。その1つ以上のペプチドは、MHC分子多量体と会合(例えば、共有結合的または非共有結合的に結合)し得る。
上記多量体のMHC分子は、MHCクラスI分子(例えば、HLA−A分子、例えば、HLA−A2またはHLA−A24分子)またはMHCクラスII分子であり得る。そのMHC分子は、哺乳動物(例えば、げっ歯類、非ヒト霊長類、ヒトまたは本明細書中に記載される他の任意の哺乳動物)のMHC分子であり得る。
上記多量体における2つ以上のMHC分子(またはそのMHC分子のペプチド結合領域)は、同じMHC分子または異なるMHC分子に由来し得る。例えば、MHC分子多量体は、5つのMHC分子を含み得、そのうちの3つは、同じMHC分子であり、そのうちの2つは、最初の3つとは異なる。別の例では、多量体の各MHC分子は、異なる。それらのMHC分子の少なくとも1つは、上記ペプチドのうちの少なくとも1つに結合し得る。
いくつかの実施形態において、上記組成物は、少なくとも2つ(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11または15個以上)の本明細書中に記載される任意のペプチドを含み得る。上記組成物は、本明細書中に開示される免疫原性ペプチド以外の免疫原性ペプチド、例えば、WT1由来のペプチドまたはその誘導体も含み得る。他の免疫原性ペプチドとしては、MUC1由来の免疫原性ペプチド、gp100由来の免疫原性ペプチド、TRP−2由来の免疫原性ペプチド、MAG1由来の免疫原性ペプチド、NY−ESO1由来の免疫原性ペプチド、HER−2由来の免疫原性ペプチド;およびAIM2由来の免疫原性ペプチドが挙げられるが、これらに限定されない。
上記組成物はまた、検出可能な標識に会合され得る。例えば、上記多量体のMHC分子の1つ以上が、検出可能な標識に共有結合的にまたは非共有結合的に結合され得る。好適な検出可能な標識(例えば、酵素、蛍光材料、発光材料、生物発光材料または放射性核種)ならびに検出可能な標識をペプチドまたはMHC分子に連結するための方法が、上に記載されている。
MHC多量体組成物は、以下のとおり、上に記載されたペプチドを使用して生成され得る:HLA分子に結合するペプチドを、対応するHLA重鎖およびβ−ミクログロブリンの存在下においてリフォールディングすることにより、三分子複合体を生成する。次いで、その複合体を、予め重鎖へと操作された部位における重鎖のカルボキシル末端においてビオチン化する。次いで、ストレプトアビジンを加えることによって、多量体形成を誘導する。
T細胞レセプターが、多種多様の他のペプチド−MHC複合体の中で、標的細胞上の特異的なペプチド−MHC複合体を認識することができる場合、本明細書中に記載されるMHC多量体組成物は、例えば、無関係のT細胞の集団内の抗原特異的T細胞を検出するために使用され得る(下記を参照のこと)。そのようなアッセイのために、その多量体は、一般に、検出可能に標識される(上記を参照のこと)。
例えば、多量体MHC分子/ペプチド複合体は、免疫原への曝露後の抗原特異的CTLの存在について末梢血単核球を評価するアッセイにおいて使用され得る。そのMHC多量体複合体は、抗原特異的CTLを直接可視化するため(例えば、Oggら、Science 279:2103−2106,1998;およびAltmanら、Science 174:94−96,1996を参照のこと)および末梢血単核球のサンプル中の抗原特異的CTL集団の頻度を決定するために、使用され得る。1つの例において、MHC多量体を多量体化するために使用される検出可能に標識されたストレプトアビジンは、その多量体のMHC分子/ペプチド複合体に結合するT細胞を標識するために使用され得る。これを行うために、その多量体で処理された細胞は、例えば、標識(例えば、ビオチンに結合体化されたフルオロフォア)に曝露される。次いで、それらの細胞は、例えば、フローサイトメトリーを使用して、容易に単離され得るかまたは検出され得る。
用途
本明細書中に記載される、ペプチド、融合タンパク質(およびそれらの薬学的組成物)、MHC多量体を含む組成物、キットおよび製造品は、種々の方法において使用され得る。例えば、本明細書中に記載されるペプチドは、(i)被験体(例えば、がんを有する被験体)において免疫応答を誘導するため;(ii)培養中のT細胞(例えば、セントラルメモリーT細胞および/またはエフェクターメモリーT細胞)を活性化するため;および/または(iii)がんを処置するためもしくは防止するために、使用され得る。がんとしては、例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん、結腸がん、膵がん、血液細胞がん、例えば、形質細胞がん、例えば、多発性骨髄腫および白血病(leaukemia)、例えば、AMLまたはCMLが挙げられる。本明細書中に記載されるペプチドは、くすぶり型多発性骨髄腫などの前がん状態を処置するためにも使用され得る。上に記載されたように、MHC多量体を含む組成物は、例えば、無関係のT細胞の集団内の抗原特異的T細胞を検出するために、使用され得る。
上記ペプチド(またはその薬学的組成物)、MHC多量体を含む組成物、キットまたは製造品の有用性は、本明細書中に記載される任意の特定の実施形態に決して限定されないが、これらの試薬が使用され得る例示的な方法を、下記に提供する。
免疫応答を誘導するための方法
本開示は、被験体において免疫応答を誘導するための種々の方法も特徴とする。被験体において免疫応答を誘導するための方法は、本明細書中に記載される任意の1つ以上のペプチドまたは本明細書中に記載される任意の薬学的組成物を被験体に投与する工程を含み得る。免疫応答は、CD8T細胞、CD4T細胞、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)、T1応答、T2応答または両方のタイプの応答の組み合わせであり得る。
上記の任意の方法は、例えば、被験体においてがん(例えば、形質細胞障害、例えば、多発性骨髄腫もしくはワルデンシュトレームマクログロブリン血症、またはXBP1、CD138もしくはCS1を発現している他の任意のがん)を処置するためまたは防止するため(がんに対する予防)の方法でもあり得る。用語「防止する(prevent)」、「防止する(preventing)」または「防止」は、所与の状態に対する所与の処置に関連して本明細書中で使用される場合、それらは、処置された被験体が、臨床的に観察可能なレベルの状態をまったく発症しないこと(例えば、その被験体は、その状態の1つ以上の症状を示さないか、またはがんの場合、その被験体は、検出可能なレベルのがんを発症しないこと)を意味する。
本明細書中で使用される場合、障害、例えば、がんを有する被験体を「処置する(treat)」、「処置」または「処置する(treating)」という用語は、所与の障害に対する所与の処置に関連して使用され、ここで、その障害の少なくとも1つの症状は、治療されるか、治癒するか、緩和されるか、軽減されるか、変化するか、治されるか、回復するか、または改善される。処置には、その障害またはその障害の症状を緩和するか、軽減するか、変化させるか、治すか、回復させるか、改善するか、またはそれに影響するのに有効な量の組成物の投与が含まれる。処置は、障害の症状の増悪もしくは悪化を阻害し得るか、または処置がない場合よりも、被験体においてよりゆっくりおよび/もしくはより低い程度に状態(例えば、被験体においてより少ない症状またはより少ない数のがん細胞)を発症させ得る。例えば、処置とは、その状態の間に、例えば、その状態(進行がん)の所与の兆候をもたらすと予想されたがんの早期診断(例えば、被験体由来のサンプルにおけるいくつかのがん細胞の検出)の間に、処置が与えられ、そうでない場合に予想されるよりもその状態のより少ないおよび/またはより軽度の症状を被験体が経験する場合、その状態を「処置した」と言われるだろう。処置とは、被験体が、がん(例えば、形質細胞障害、例えば、多発性骨髄腫またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症)の単なる軽度の明らかな症状を示す場合、そのがんを「処置」し得る。
ある実施形態において、がんは、本明細書中に記載されるがんである。例えば、そのがんは、膀胱がん(進行性膀胱がんおよび転移性膀胱がんを含む)、乳がん(例えば、エストロゲンレセプター陽性乳がん、エストロゲンレセプター陰性乳がん、HER−2陽性乳がん、HER−2陰性乳がん、トリプルネガティブ乳がん、炎症性乳がん)、結腸がん(結腸直腸がんを含む)、腎臓がん(例えば、腎細胞癌(例えば、乳頭状腎細胞癌、明細胞癌、嫌色素性癌))、肝臓がん、肺がん(小細胞肺がんおよび非小細胞肺がん(腺癌、扁平上皮癌、気管支肺胞癌および大細胞癌を含む)を含む)、泌尿生殖器がん、例えば、卵巣がん(卵管がん、子宮内膜がんおよび腹膜がんを含む)、子宮頸がん、前立腺がんおよび精巣がん、リンパ系のがん、直腸がん、喉頭がん、膵がん(膵外分泌癌を含む)、胃がん(例えば、胃食道がん、胃上部がんまたは胃下部がん)、消化器がん(例えば、肛門がんまたは胆管がん)、胆嚢がん、甲状腺がん、白血病(例えば、急性骨髄性白血病)、神経細胞がんおよびグリア細胞がん(例えば、多形神経膠芽腫)ならびに頭頸部がん(例えば、鼻咽頭がん)であり得る。
一般に、被験体に送達されるペプチド(複数可)は、薬学的に許容され得るキャリア(例えば、生理食塩水)に懸濁され、経口的に、直腸に、または非経口的に投与され、例えば、静脈内に、皮下に、筋肉内に、髄腔内に、腹腔内に、直腸内に、膣内に、鼻腔内に、胃内に、気管内に、または肺内に注射される(下記を参照のこと)。
投与は、薬学的組成物の定期的なボーラス注射による投与であり得るか、または外部のリザーバー(例えば、IVバッグ)もしくは内部のリザーバー(例えば、生体分解可能な(bioerodable)インプラント、生体人工器官、または埋め込まれた試薬産生細胞のコロニー)からの静脈内投与もしくは腹腔内投与による、途切れないかもしくは連続的なものであり得る。例えば、米国特許第4,407,957号、同第5,798,113号および同第5,800,828号(各々はその全体が、参照により本明細書中に援用される)を参照のこと。
一般に、必要とされるペプチドまたは核酸の投与量は、投与経路の選択;製剤の性質;被験体の疾病の性質または重症度;被験体の免疫状態;被験体のサイズ、体重、表面積、年齢および性別;投与されている他の薬物;ならびに担当の医療専門家の判断に依存する。
免疫応答を誘導するためのペプチドの好適な投与量は、被験体1kgあたり0.000001〜10mgの試薬または抗原性/免疫原性組成物の範囲内である。必要とされる投与量の広範な変動は、試薬の多様性および様々な投与経路の異なる効率を考慮して予想されるべきである。例えば、経鼻投与または直腸投与は、静脈内注射による投与よりも多い投与量を必要とし得る。これらの投与量のレベルの変動は、当該分野において十分に理解されているような、最適化するための標準的で経験的なルーチンを用いて調整され得る。投与は、単回または複数回(例えば、2、3、4、6、8、10、20、50、100、150倍またはそれ以上)であり得る。例えば、ペプチド(複数可)は、初回免疫として投与され得、次いで、その後、追加免疫として1回以上投与され得る。
治療効果(例えば、被験体において免疫応答を誘導する1つ以上のペプチドまたはそれらのペプチドをコードする核酸の有効性)を最適化するために、それらのペプチドまたは核酸を含む組成物は、まず、種々の投薬レジメンで投与され得る。単位用量およびレジメンは、例えば、哺乳動物の種、その免疫状態、哺乳動物の体重を含む因子に依存する。
薬学的組成物(例えば、本明細書中に記載される薬学的組成物)に対する投薬頻度は、医療従事者(例えば、医師または看護師)の技能および臨床上の判断の範囲内である。典型的には、投与レジメンは、最適な投与パラメータを確立し得る臨床試験によって確立される。しかしながら、その従事者が、被験体の年齢、健康状態、体重、性別および医学的状態に従って、そのような投与レジメンを変更してもよい。
いくつかの実施形態において、薬学的組成物は、少なくとも2回(例えば、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、15または20回以上)、被験体に投与され得る。例えば、薬学的組成物は、3ヶ月間にわたって1ヶ月に1回;1ヶ月間にわたって1週間に1回;1週間おきに、3年間にわたって1年に1回、5年間にわたって1年に1回;5年に1回;10年に1回;または生涯にわたって3年に1回、被験体に投与され得る。
いくつかの実施形態において、試薬は、免疫調節因子(immune modulator)(例えば、Tollレセプターリガンドまたはアジュバント(下記を参照のこと))とともに、投与され得る。
本明細書中で定義されるように、ペプチドまたはペプチドをコードする核酸の「治療有効量」は、処置される被験体において免疫応答をもたらすことができる、ペプチドまたは核酸の量である。ペプチドの治療有効量(すなわち、有効投与量)は、被験体の体重またはサンプルの重量1キログラムあたりのミリグラム、マイクログラム、ナノグラムまたはピコグラムの量の試薬を含む(例えば、1キログラムあたり約1ナノグラム〜1キログラムあたり約500マイクログラム、1キログラムあたり約1マイクログラム〜1キログラムあたり約500ミリグラム、1キログラムあたり約100マイクログラム〜1キログラムあたり約5ミリグラムまたは1キログラムあたり約1マイクログラム〜1キログラムあたり約50マイクログラム)。核酸の治療有効量もまた、被験体の体重またはサンプルの重量1キログラムあたりのマイクログラム、ナノグラムまたはピコグラムの量の試薬を含む(例えば、1キログラムあたり約1ナノグラム〜1キログラムあたり約500マイクログラム、1キログラムあたり約1マイクログラム〜1キログラムあたり約500マイクログラム、1キログラムあたり約100マイクログラム〜1キログラムあたり約500マイクログラムまたは1キログラムあたり約1マイクログラム〜1キログラムあたり約50マイクログラム)。
本明細書中で定義されるように、ペプチドまたはペプチドをコードする核酸の「予防有効量」は、処置される被験体においてがん細胞(例えば、乳がん細胞、結腸がん細胞、膵がん細胞、前立腺がん細胞、多発性骨髄腫細胞またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症細胞)に対する免疫応答をもたらすことができる、ペプチドまたは核酸の量であり、その免疫応答は、被験体においてがんの発症を防止することができるか、または被験体ががんを発症するもしくは発症を継続する確率を実質的に減少させることができる(上記を参照のこと)。ペプチドの予防有効量(すなわち、有効投与量)は、被験体の体重またはサンプルの重量1キログラムあたりのミリグラム、マイクログラム、ナノグラムまたはピコグラムの量の試薬を含む(例えば、1キログラムあたり約1ナノグラム〜1キログラムあたり約500マイクログラム、1キログラムあたり約1マイクログラム〜1キログラムあたり約500ミリグラム、1キログラムあたり約100マイクログラム〜1キログラムあたり約5ミリグラムまたは1キログラムあたり約1マイクログラム〜1キログラムあたり約50マイクログラム)。核酸の予防有効量もまた、被験体の体重またはサンプルの重量1キログラムあたりのマイクログラム、ナノグラムまたはピコグラムの量の試薬を含む(例えば、1キログラムあたり約1ナノグラム〜1キログラムあたり約500マイクログラム、1キログラムあたり約1マイクログラム〜1キログラムあたり約500マイクログラム、1キログラムあたり約100マイクログラム〜1キログラムあたり約500マイクログラムまたは1キログラムあたり約1マイクログラム〜1キログラムあたり約50マイクログラム)。
被験体は、抗原に対して免疫応答できる任意の動物(例えば、哺乳動物、例えば、ヒト(例えば、ヒト患者)または非ヒト霊長類(例えば、チンパンジー、ヒヒまたはサル)、マウス、ラット、ウサギ、モルモット、スナネズミ、ハムスター、ウマ、家畜の一種(例えば、ウシ、ブタ、ヒツジまたはヤギ)、イヌ、ネコまたはクジラであるがこれらに限定されない)であり得る。被験体は、がん(例えば、多発性骨髄腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、またはXBP1、CD138もしくはCS−1を発現している他の任意のタイプのがん(例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん、結腸がん、膵がん、白血病、例えば、AMLまたはCML))を有するか、有していると疑われるか、または発症するリスクがある被験体であり得る。被験体は、がん、例えば、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、例えば、AMLもしくはCML、多発性骨髄腫またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症から寛解している被験体であり得る。
上記方法は、1つ以上のペプチド(または核酸)を被験体に投与する前に、被験体のがん(例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん、結腸がん、膵(pancreactic)がん、前立腺がん、白血病または形質細胞障害、例えば、多発性骨髄腫もしくはワルデンシュトレームマクログロブリン血症)の1つ以上のがん細胞が、XBP1、CD138またはCS−1を発現しているかを決定する工程も含み得る。これらのタンパク質の発現は、mRNAとタンパク質の両方の発現を含む。細胞におけるタンパク質およびmRNAの発現を検出するための方法は、当該分野で公知であり、それらとしては、例えば、タンパク質を検出するための、酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)、ウエスタンブロッティングおよびドットブロッティング法または免疫組織化学法、ならびにmRNAを検出するための、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT−PCR)またはノーザンブロッティング法が挙げられる(Sambrookら、前出を参照のこと)。
上記ペプチドまたは組成物は、他の公知の治療と組み合わせて使用され得る。「組み合わせて」投与されるとは、本明細書中で使用される場合、2つ(またはそれ以上)の異なる処置が、その障害による被験体の苦痛の経過の間に被験体に送達されること、例えば、被験体がその障害と診断された後、かつその障害が治療されるかもしくは排除される前または処置が他の理由により中断される前に、その2つ以上の処置が送達されることを意味する。いくつかの実施形態において、1つの処置の送達は、第2の処置の送達が始まるときになおも行われており、その結果投与に関して重複が存在する。これは、時折、「同時」または「併用送達」と本明細書中で称される。他の実施形態において、1つの処置の送達は、他方の処置の送達が始まる前に終了する。いずれかの場合のいくつかの実施形態において、処置は、併用投与に起因して、より効果的である。例えば、第2の処置が、より効果的であり、例えば、より少ない第2の処置で、等価な効果が見られるか、または第2の処置は、第2の処置を第1の処置の非存在下において投与した場合に見られるであろう程度よりも大きく症状を減少させるか、または第1の処置と類似の状況が見られる。いくつかの実施形態において、送達は、症状の減少、またはその障害に関する他のパラメータが、一方の処置が他方の非存在下において送達されたときに観察されるであろうものよりも大きいような送達である。2つの処置の効果は、部分的に相加的であるか、完全に相加的であるか、または相加的より大きい可能性がある。送達は、送達される第1の処置の効果が、第2の処置が送達されるときになおも検出可能であるような送達であり得る。
さらなる処置は、例えば、手術、1つ以上の化学療法剤、1つ以上の形態の電離放射線および/または1つ以上の免疫調節剤であり得る。
1つ以上の形態の電離放射線は、ガンマ線照射、X線照射またはベータ線照射であり得る。
化学療法剤の例示的なクラスとしては、例えば、以下が挙げられる:
アルキル化剤(ナイトロジェンマスタード、エチレンイミン誘導体、スルホン酸アルキル、ニトロソ尿素およびトリアゼンを含むが、これらに限定されない):ウラシルマスタード(Aminouracil Mustard(登録商標)、Chlorethaminacil(登録商標)、Demethyldopan(登録商標)、Desmethyldopan(登録商標)、Haemanthamine(登録商標)、Nordopan(登録商標)、Uracil nitrogen mustard(登録商標)、Uracillost(登録商標)、Uracilmostaza(登録商標)、Uramustin(登録商標)、Uramustine(登録商標))、クロルメチン(Mustargen(登録商標))、シクロホスファミド(Cytoxan(登録商標)、Neosar(登録商標)、Clafen(登録商標)、Endoxan(登録商標)、Procytox(登録商標)、Revimmune(商標))、イホスファミド(Mitoxana(登録商標))、メルファラン(Alkeran(登録商標))、クロラムブシル(Leukeran(登録商標))、ピポブロマン(Amedel(登録商標)、Vercyte(登録商標))、トリエチレンメラミン(Hemel(登録商標)、Hexalen(登録商標)、Hexastat(登録商標))、トリエチレンチオホスホルアミン、テモゾロミド(Temodar(登録商標))、チオテパ(Thioplex(登録商標))、ブスルファン(Busilvex(登録商標)、Myleran(登録商標))、カルムスチン(BiCNU(登録商標))、ロムスチン(CeeNU(登録商標))、ストレプトゾシン(Zanosar(登録商標))およびダカルバジン(DTIC−Dome(登録商標))。
抗EGFR抗体(例えば、セツキシマブ(Erbitux(登録商標))およびパニツムマブ(Vectibix(登録商標))。
抗HER−2抗体(例えば、トラスツズマブ(Herceptin(登録商標))。
代謝拮抗物質(葉酸アンタゴニスト(本明細書中では抗葉酸剤とも称される)、ピリミジンアナログ、プリンアナログおよびアデノシンデアミナーゼ阻害剤を含むが、これらに限定されない):メトトレキサート(Rheumatrex(登録商標)、Trexall(登録商標))、5−フルオロウラシル(Adrucil(登録商標)、Efudex(登録商標)、Fluoroplex(登録商標))、フロクスウリジン(FUDF(登録商標))、シタラビン(Cytosar−U(登録商標)、Tarabine PFS)、6−メルカプトプリン(Puri−Nethol(登録商標)))、6−チオグアニン(Thioguanine Tabloid(登録商標))、リン酸フルダラビン(Fludara(登録商標))、ペントスタチン(Nipent(登録商標))、ペメトレキセド(Alimta(登録商標))、ラルチトレキセド(raltitrexed)(Tomudex(登録商標))、クラドリビン(Leustatin(登録商標))、クロファラビン(clofarabine)(Clofarex(登録商標)、Clolar(登録商標))、メルカプトプリン(Puri−Nethol(登録商標))、カペシタビン(Xeloda(登録商標))、ネララビン(Arranon(登録商標))、アザシチジン(Vidaza(登録商標))およびゲムシタビン(Gemzar(登録商標))。好ましい代謝拮抗物質としては、例えば、5−フルオロウラシル(Adrucil(登録商標)、Efudex(登録商標)、Fluoroplex(登録商標))、フロクスウリジン(FUDF(登録商標))、カペシタビン(Xeloda(登録商標))、ペメトレキセド(Alimta(登録商標))、ラルチトレキセド(Tomudex(登録商標))およびゲムシタビン(Gemzar(登録商標))が挙げられる。
ビンカアルカロイド:ビンブラスチン(Velban(登録商標)、Velsar(登録商標))、ビンクリスチン(Vincasar(登録商標)、Oncovin(登録商標))、ビンデシン(Eldisine(登録商標))、ビノレルビン(Navelbine(登録商標))。
白金ベースの薬剤:カルボプラチン(Paraplat(登録商標)、Paraplatin(登録商標))、シスプラチン(Platinol(登録商標))、オキサリプラチン(Eloxatin(登録商標))。
アントラサイクリン:ダウノルビシン(Cerubidine(登録商標)、Rubidomycin(登録商標))、ドキソルビシン(Adriamycin(登録商標))、エピルビシン(Ellence(登録商標))、イダルビシン(Idamycin(登録商標))、ミトキサントロン(Novantrone(登録商標))、バルルビシン(Valstar(登録商標))。好ましいアントラサイクリンとしては、ダウノルビシン(Cerubidine(登録商標)、Rubidomycin(登録商標))およびドキソルビシン(Adriamycin(登録商標))が挙げられる。
トポイソメラーゼ阻害剤:トポテカン(Hycamtin(登録商標))、イリノテカン(Camptosar(登録商標))、エトポシド(Toposar(登録商標)、VePesid(登録商標))、テニポシド(Vumon(登録商標))、ラメラリン(lamellarin)D、SN−38、カンプトテシン。
タキサン:パクリタキセル(Taxol(登録商標))、ドセタキセル(Taxotere(登録商標))、ラロタキセル(larotaxel)、カバジタキセル(cabazitaxel)。
エポチロン:イクサベピロン(ixabepilone)、エポチロンB、エポチロンD、BMS310705、デヒデロン(dehydelone)、ZK−エポチロン(ZK−EPO)。
ポリADP−リボースポリメラーゼ(PARP)阻害剤:(例えば、BSI201、Olaparib(AZD−2281)、ABT−888、AG014699、CEP9722、MK4827、KU−0059436(AZD2281)、LT−673、3−アミノベンズアミド)。
抗生物質:アクチノマイシン(Cosmegen(登録商標))、ブレオマイシン(Blenoxane(登録商標))、ヒドロキシ尿素(Droxia(登録商標)、Hydrea(登録商標))、マイトマイシン(Mitozytrex(登録商標)、Mutamycin(登録商標))。
免疫調節物質:レナリドマイド(Revlimid(登録商標))、サリドマイド(Thalomid(登録商標))。
免疫細胞抗体:アレムツズマブ(alemtuzamad)(Campath(登録商標))、ゲムツズマブ(Myelotarg(登録商標))、リツキシマブ(Rituxan(登録商標))、トシツモマブ(Bexxar(登録商標))。
インターフェロン(例えば、IFN−アルファ(Alferon(登録商標)、Roferon−A(登録商標)、Intron(登録商標)−A)またはIFN−ガンマ(Actimmune(登録商標)))。
インターロイキン:IL−1、IL−2(Proleukin(登録商標))、IL−24、IL−6(Sigosix(登録商標))、IL−12。
HSP90阻害剤(例えば、ゲルダナマイシン(geldanamycin)またはその任意の誘導体)。ある特定の実施形態において、HSP90阻害剤は、ゲルダナマイシン、17−アルキルアミノ−17−デスメトキシゲルダナマイシン(「17−AAG」)または17−(2−ジメチルアミノエチル)アミノ−17−デスメトキシゲルダナマイシン(「17−DMAG」)から選択される。
血管新生阻害剤(A6(Angstrom Pharmacueticals)、ABT−510(Abbott Laboratories)、ABT−627(Atrasentan)(Abbott Laboratories/Xinlay)、ABT−869(Abbott Laboratories)、Actimid(CC4047、Pomalidomide)(Celgene Corporation)、AdGVPEDF.11D(GenVec)、ADH−1(Exherin)(Adherex Technologies)、AEE788(Novartis)、AG−013736(Axitinib)(Pfizer)、AG3340(Prinomastat)(Agouron Pharmaceuticals)、AGX1053(AngioGenex)、AGX51(AngioGenex)、ALN−VSP(ALN−VSP O2)(Alnylam Pharmaceuticals)、AMG386(Amgen)、AMG706(Amgen)、Apatinib(YN968D1)(Jiangsu Hengrui Medicine)、AP23573(Ridaforolimus/MK8669)(Ariad Pharmaceuticals)、AQ4N(Novavea)、ARQ197(ArQule)、ASA404(Novartis/Antisoma)、Atiprimod(Callisto Pharmaceuticals)、ATN−161(Attenuon)、AV−412(Aveo Pharmaceuticals)、AV−951(Aveo Pharmaceuticals)、Avastin(Bevacizumab)(Genentech)、AZD2171(Cediranib/Recentin)(AstraZeneca)、BAY 57−9352(Telatinib)(Bayer)、BEZ235(Novartis)、BIBF1120(Boehringer Ingelheim Pharmaceuticals)、BIBW2992(Boehringer Ingelheim Pharmaceuticals)、BMS−275291(Bristol−Myers Squibb)、BMS−582664(Brivanib)(Bristol−Myers Squibb)、BMS−690514(Bristol−Myers Squibb)、Calcitriol、CCI−779(Torisel)(Wyeth)、CDP−791(ImClone Systems)、Ceflatonin(Homoharringtonine/HHT)(ChemGenex Therapeutics)、Celebrex(Celecoxib)(Pfizer)、CEP−7055(Cephalon/Sanofi)、CHIR−265(Chiron Corporation)、NGR−TNF、COL−3(Metastat)(Collagenex Pharaceuticals)、Combretastatin(Oxigene)、CP−751,871(Figitumumab)(Pfizer)、CP−547,632(Pfizer)、CS−7017(Daiichi Sankyo Pharma)、CT−322(Angiocept)(Adnexus)、Curcumin、Dalteparin(Fragmin)(Pfizer)、Disulfiram(Antabuse)、E7820(Eisai Limited)、E7080(Eisai Limited)、EMD121974(Cilengitide)(EMD Pharmaceuticals)、ENMD−1198(EntreMed)、ENMD−2076(EntreMed)、Endostar(Simcere)、Erbitux(ImClone/Bristol−Myers Squibb)、EZN−2208(Enzon Pharmaceuticals)、EZN−2968(Enzon Pharmaceuticals)、GC1008(Genzyme)、Genistein、GSK1363089(Foretinib)(GlaxoSmithKline)、GW786034(Pazopanib)(GlaxoSmithKline)、GT−111(Vascular Biogenics Ltd.)、IMC−−1121B(Ramucirumab)(ImClone Systems)、IMC−18F1(ImClone Systems)、IMC−3G3(ImClone LLC)、INCB007839(Incyte Corporation)、INGN241(Introgen Therapeutics)、Iressa(ZD1839/Gefitinib)、LBH589(Faridak/Panobinostst)(Novartis)、Lucentis(Ranibizumab)(Genentech/Novartis)、LY317615(Enzastaurin)(Eli Lilly and Company)、Macugen(Pegaptanib)(Pfizer)、MEDI522(Abegrin)(MedImmune)、MLN518(Tandutinib)(Millennium)、Neovastat(AE941/Benefin)(Aeterna Zentaris)、Nexavar(Bayer/Onyx)、NM−3(Genzyme Corporation)、Noscapine(Cougar Biotechnology)、NPI−2358(Nereus Pharmaceuticals)、OSI−930(OSI)、Palomid529(Paloma Pharmaceuticals,Inc.)、Panzem Capsules(2ME2)(EntreMed)、Panzem NCD(2ME2)(EntreMed)、PF−02341066(Pfizer)、PF−04554878(Pfizer)、PI−88(Progen Industries/Medigen Biotechnology)、PKC412(Novartis)、Polyphenon E(Green Tea Extract)(Polypheno E International,Inc)、PPI−2458(Praecis Pharmaceuticals)、PTC299(PTC Therapeutics)、PTK787(Vatalanib)(Novartis)、PXD101(Belinostat)(CuraGen Corporation)、RAD001(Everolimus)(Novartis)、RAF265(Novartis)、Regorafenib(BAY73−4506)(Bayer)、Revlimid(Celgene)、Retaane(Alcon Research)、SN38(Liposomal)(Neopharm)、SNS−032(BMS−387032)(Sunesis)、SOM230(Pasireotide)(Novartis)、Squalamine(Genaera)、Suramin、Sutent(Pfizer)、Tarceva(Genentech)、TB−403(Thrombogenics)、Tempostatin(Collard Biopharmaceuticals)、Tetrathiomolybdate(Sigma−Aldrich)、TG100801(TargeGen)、Thalidomide(Celgene Corporation)、Tinzaparin Sodium、TKI258(Novartis)、TRC093(Tracon Pharmaceuticals Inc.)、VEGF Trap(Aflibercept)(Regeneron Pharmaceuticals)、VEGF Trap−Eye(Regeneron Pharmaceuticals)、Veglin(VasGene Therapeutics)、Bortezomib(Millennium)、XL184(Exelixis)、XL647(Exelixis)、XL784(Exelixis)、XL820(Exelixis)、XL999(Exelixis)、ZD6474(AstraZeneca)、Vorinostat(Merck)およびZSTK474を含むが、これらに限定されない)。
抗アンドロゲン(ニルタミド(Nilandron(登録商標))およびビカルタミド(Caxodex(登録商標))を含むが、これらに限定されない)。
抗エストロゲン(タモキシフェン(Nolvadex(登録商標))、トレミフェン(Fareston(登録商標))、レトロゾール(Femara(登録商標))、テストラクトン(Teslac(登録商標))、アナストロゾール(Arimidex(登録商標))、ビカルタミド(Casodex(登録商標))、エキセメスタン(Aromasin(登録商標))、フルタミド(Eulexin(登録商標))、フルベストラント(Faslodex(登録商標))、ラロキシフェン(Evista(登録商標)、Keoxifene(登録商標))およびラロキシフェン塩酸塩を含むが、これらに限定されない)。
抗高カルシウム血症剤(硝酸ガリウム(III)水和物(Ganite(登録商標))およびパミドロン酸二ナトリウム(Aredia(登録商標))を含むが、これらに限定されない)。
アポトーシス誘導因子(エタノール,2−[[3−(2,3−ジクロロフェノキシ)プロピル]アミノ]−(9Cl)、ガンボギン酸(gambogic acid)、エンベリンおよび三酸化ヒ素(Trisenox(登録商標))を含むが、これらに限定されない)。
オーロラキナーゼ阻害剤(ビヌクレイン(binucleine)2を含むが、これに限定されない)。
ブルトン型チロシンキナーゼ阻害剤(テルレ酸(terreic acid)を含むが、これに限定されない)。
カルシニューリン阻害剤(シペルメトリン、デルタメトリン、フェンバレレートおよびチロホスチン8を含むが、これらに限定されない)。
CaMキナーゼII阻害剤(5−イソキノリンスルホン酸、4−[{2S)−2−[(5−イソキノリニルスルホニル)メチルアミノ]−3−オキソ−3−{4−フェニル−1−ピペラジニル)プロピル]フェニルエステルおよびベンゼンスルホンアミドを含むが、これらに限定されない)。
CD45チロシンホスファターゼ阻害剤(ホスホン酸を含むが、これに限定されない)。
CDC25ホスファターゼ阻害剤(1,4−ナフタレンジオン,2,3−ビス[(2−ヒドロキシエチル)チオ]−(9Cl)を含むが、これに限定されない)。
CHKキナーゼ阻害剤(デブロモヒメニアルジシンを含むが、これに限定されない)。
シクロオキシゲナーゼ阻害剤(1H−インドール−3−アセトアミド,1−(4−クロロベンゾイル)−5−メトキシ−2−メチル−N−(2−フェニルエチル)−(9Cl)、5−アルキル置換2−アリールアミノフェニル酢酸およびその誘導体(例えば、セレコキシブ(Celebrex(登録商標))、ロフェコキシブ(Vioxx(登録商標))、エトリコキシブ(etoricoxib)(Arcoxia(登録商標))、ルミラコキシブ(lumiracoxib)(Prexige(登録商標))、バルデコキシブ(Bextra(登録商標))または5−アルキル−2−アリールアミノフェニル酢酸を含むが、これらに限定されない)。
cRAFキナーゼ阻害剤(3−(3,5−ジブロモ−4−ヒドロキシベンジリデン)−5−ヨード−1,3−ジヒドロインドール−2−オンおよびベンズアミド,3−(ジメチルアミノ)−N−[3−[(4−ヒドロキシベンゾイル)アミノ]−4−メチルフェニル]−(9Cl)を含むが、これらに限定されない)。
サイクリン依存性キナーゼ阻害剤(オロモウシン(olomoucine)およびその誘導体、プルバラノールB、ロスコビチン(roascovitine)(Seliciclib(登録商標))、インジルビン、ケンパウロン(kenpaullone)、プルバラノールAおよびインジルビン−3’−モノオキシムを含むが、これらに限定されない)。
システインプロテアーゼ阻害剤(4−モルホリンカルボキサミド,N−[(1S)−3−フルオロ−2−オキソ−1−(2−フェニルエチル)プロピル]アミノ]−2−オキソ−1−(フェニルメチル)エチル]−(9Cl)を含むが、これに限定されない)。
DNAインターカレーター(プリカマイシン(Mithracin(登録商標))およびダプトマイシン(Cubicin(登録商標))を含むが、これらに限定されない)。
DNA鎖切断剤(ブレオマイシン(Blenoxane(登録商標))を含むが、これに限定されない)。
E3リガーゼ阻害剤(N−((3,3,3−トリフルオロ−2−トリフルオロメチル)プロピオニル)スルファニルアミドを含むが、これらに限定されない)。
EGF経路阻害剤(チロホスチン46、EKB−569、エルロチニブ(Tarceva(登録商標))、ゲフィチニブ(Iressa(登録商標))、ラパチニブ(lapatinib)(Tykerb(登録商標))ならびにWO97/02266、EP0564409、WO99/03854、EP0520722、EP0566226、EP0787722、EP0837063、米国特許第5,747,498号、WO98/10767、WO97/30034、WO97/49688、WO97/38983およびWO96/33980に一般的におよび詳細に開示されている化合物を含むが、これらに限定されない)。
ファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤(A−ヒドロキシファルネシルホスホン酸、ブタン酸,2−[(2S)−2−[[(2S,3S)−2−[[(2R)−2−アミノ−3−メルカプトプロピル]アミノ]−3−メチルペンチル]オキシ]−1−オキソ−3−フェニルプロピル]アミノ]−4−(メチルスルホニル)−1−メチルエチルエステル(2S)−(9Cl)およびマニュマイシンAを含むが、これらに限定されない)。
Flk−1キナーゼ阻害剤(2−プロペンアミド,2−シアノ−3−[4−ヒドロキシ−3,5−ビス(1−メチルエチル)フェニル]−N−(3−フェニルプロピル)−(2E)−(9Cl)を含むが、これに限定されない)。
グリコーゲンシンターゼキナーゼ−3(GSK3)阻害剤(インジルビン−3’−モノオキシムを含むが、これに限定されない)。
熱ショックタンパク質90(Hsp90)シャペロン調節因子(AUY922、STA−9090、ATI13387、MCP−3100、IPI−504、IPI−493、SNX−5422、Debio0932、HSP990、DS−2248、PU−H71、17−DMAG(Alvespimycin)およびXL888を含むが、これらに限定されない)。
ヒストン脱アセチル化酵素(HDAC)阻害剤(スベロイルアニリドヒドロキサム酸(SAHA)、[4−(2−アミノ−フェニルカルバモイル)−ベンジル]−カルバミン酸ピリジン−3−イルメチルエステルおよびその誘導体、酪酸、ピロキサミド(pyroxamide)、トリコスタチンA、オキサムフラチン(oxamflatin)、アピシジン(apicidin)、デプシペプチド、デプデシン(depudecin)、トラポキシンならびにWO02/22577に開示されている化合物を含むが、これらに限定されない)。
I−カッパーB−アルファキナーゼ阻害剤(IKK)(2−プロペンニトリル,3−[(4−メチルフェニル)スルホニル]−(2E)−(9Cl)を含むが、これに限定されない)。
イミダゾテトラジノン(imidazotetrazinone)(テモゾロミド(Methazolastone(登録商標)、Temodar(登録商標)およびその誘導体(例えば、米国特許第5,260,291号に一般的におよび詳細に開示されているような))およびMitozolomideを含むが、これらに限定されない)。
インスリン様成長因子経路阻害剤(例えば、IGF阻害剤またはIGFレセプター(IGFR1またはIGFR2)阻害剤としては、小分子阻害剤、例えば、OSI−906;抗IGF抗体または抗IGFR抗体、例えば、AVE−1642、MK−0646、IMC−A12(シキスツマブ(cixutumab))、R1507、CP−751,871(Figitumumab)が挙げられるが、これらに限定されない)。
インスリンチロシンキナーゼ阻害剤(ヒドロキシル−2−ナフタレニルメチルホスホン酸を含むが、これに限定されない)。
c−Jun−N末端キナーゼ(JNK)阻害剤(ピラゾールアントロン(pyrazoleanthrone)および没食子酸エピガロカテキンを含むが、これらに限定されない)。
マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ(MAP)阻害剤(ベンゼンスルホンアミド,N−[2−[[[3−(4−クロロフェニル)−2−プロペニル]メチル]アミノ]メチル]フェニル]−N−(2−ヒドロキシエチル)−4−メトキシ−(9Cl)を含むが、これらに限定されない)。
MDM2阻害剤(トランス−4−ヨード、4’−ボラニル−カルコンを含むが、これらに限定されない)。
MEK阻害剤(ブタンジニトリル,ビス[アミノ[2−アミノフェニル)チオ]メチレン]−(9Cl)を含むが、これに限定されない)。
MMP阻害剤(Actinonin、没食子酸エピガロカテキン、コラーゲンペプチド模倣物および非ペプチド模倣物阻害剤、テトラサイクリン誘導体マリマスタット(marimastat)(Marimastat(登録商標))、プリノマスタット(prinomastat)、インサイクリニド(incyclinide)(Metastat(登録商標))、サメ軟骨抽出物AE−941(Neovastat(登録商標))、Tanomastat、TAA211、MMI270BまたはAAJ996を含むが、これらに限定されない)。
mTor阻害剤(ラパマイシン(Rapamune(登録商標))ならびにそのアナログおよび誘導体、AP23573(リダフォロリムス(ridaforolimus)、デフォロリムス(deforolimus)またはMK−8669としても知られる)、CCI−779(テムシロリムスとしても知られる)(Torisel(登録商標))およびSDZ−RADを含むが、これらに限定されない)。
NGFRチロシンキナーゼ阻害剤(チロホスチンAG879を含むが、これに限定されない)。
p38 MAPキナーゼ阻害剤(フェノール,4−[4−(4−フルオロフェニル)−5−(4−ピリジニル)−1H−イミダゾール−2−イル]−(9Cl)およびベンズアミド,3−(ジメチルアミノ)−N−[3−[(4−ヒドロキシルベンゾイル)アミノ]−4−メチルフェニル]−(9Cl)を含むが、これらに限定されない)。
p56チロシンキナーゼ阻害剤(ダムナカンタールおよびチロホスチン46を含むが、これらに限定されない)。
PDGF経路阻害剤(チロホスチンAG1296、チロホスチン9、1,3−ブタジエン−1,1,3−トリカルボニトリル,2−アミノ−4−(1H−インドール−5−イル)−(9Cl)、イマチニブ(Gleevec(登録商標))およびゲフィチニブ(Iressa(登録商標))ならびに欧州特許第0564409号およびPCT公開番号WO99/03854に一般的におよび詳細に開示されている化合物を含むが、これらに限定されない)。
ホスファチジルイノシトール3−キナーゼ阻害剤(ワートマニンおよびケルセチン二水和物を含むが、これらに限定されない)。
ホスファターゼ阻害剤(カンタリジン酸、カンタリジンおよびL−ロイシンアミドを含むが、これらに限定されない)。
PKC阻害剤(1−H−ピロロ−2,5−ジオン,3−[1−[3−(ジメチルアミノ)プロピル]−1H−インドール−3−イル]−4−(1H−インドール−3−イル)−(9Cl)、ビスインドリルマレイミドIX、Sphinogosine、スタウロスポリンおよびヒペリシンを含むが、これらに限定されない)。
PKCデルタキナーゼ阻害剤(ロットレリン(rottlerin)を含むが、これに限定されない)。ポリアミン合成阻害剤(DMFOを含むが、これに限定されない)。
プロテアソーム阻害剤(アクラシノマイシンA、グリオトキシンおよびボルテゾミブ(Velcade(登録商標))を含むが、これらに限定されない)。
タンパク質ホスファターゼ阻害剤(カンタリジン酸、カンタリジン、L−P−ブロモテトラミソールオキサレート、2(5H)−フラノン、4−ヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)−3−(1−オキソヘキサデシル)−(5R)−(9Cl)およびベンジルホスホン酸を含むが、これらに限定されない)。
タンパク質チロシンキナーゼ阻害剤(チロホスチンAg216、チロホスチンAg1288、チロホスチンAg1295、ゲルダナマイシン、ゲニステインおよび7H−ピロロ[2,3−d]ピリミジン誘導体を含むが、これらに限定されない);
PTP1B阻害剤(L−ロイシンアミドを含むが、これに限定されない)。
SRCファミリーチロシンキナーゼ阻害剤(PP1およびPP2を含むが、これらに限定されない)。
Sykチロシンキナーゼ阻害剤(ピセタノール(piceatannol)を含むが、これに限定されない)。
Janus(JAK−2および/またはJAK−3)チロシンキナーゼ阻害剤(チロホスチンAG490および2−ナフチルビニルケトンを含むが、これらに限定されない)。
レチノイド(イソトレチノイン(Accutane(登録商標)、Amnesteem(登録商標)、Cistane(登録商標)、Claravis(登録商標)、Sotret(登録商標))およびトレチノイン(Aberel(登録商標)、Aknoten(登録商標)、Avita(登録商標)、Renova(登録商標)、Retin−A(登録商標)、Retin−A MICRO(登録商標)、Vesanoid(登録商標))を含むが、これらに限定されない)。
RNAポリメラーゼII伸長阻害剤(5,6−ジクロロ−1−ベータ−D−リボフラノシルベンゾイミダゾールを含むが、これに限定されない)。
セリン/トレオニンキナーゼ阻害剤(2−アミノプリンを含むが、これに限定されない)。
ステロール生合成阻害剤(スクアレンエポキシダーゼおよびCYP2D6を含むが、これらに限定されない)。VEGF経路阻害剤(抗VEGF抗体、例えば、ベバシズマブおよび小分子、例えば、スニチニブ(sunitinib)(Sutent(登録商標))、ソラフェニブ(sorafinib)(Nexavar(登録商標))、ZD6474(バンデタニブ(vandetanib)としても知られる)(Zactima(商標))、SU6668、CP−547632、AV−951(チボザニブ(tivozanib))およびAZD2171(セジラニブ(cediranib)としても知られる)(Recentin(商標))を含むが、これらに限定されない)。
例えば、1つ以上の化学療法剤は、シスプラチン、カルボプラチン、プロカルバジン、メクロレタミン、シクロホスファミド、カンプトテシン、アドリアマイシン、イホスファミド、メルファラン、クロラムブシル、ブスルファン(bisulfan)、ニトロソ尿素、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、ブレオマイシン、プリカマイシン、マイトマイシン、エトポシド、ベランピル(verampil)、ポドフィロトキシン、タモキシフェン、タキソール、サリドマイド、レナリドマイド、プロテオソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ)、hsp90阻害剤(例えば、タネスピマイシン(tenespinmycin))、トランス白金(transplatinum)、5−フルオロウラシル、ビンクリスチン、ビンブラスチン、メトトレキサートまたは上述のいずれかのアナログからなる群より選択され得る。免疫調節剤としては、例えば、種々のケモカインおよびサイトカイン(例えば、インターロイキン2(IL−2)、顆粒球/マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)およびインターロイキン12(IL−12))が挙げられる。
1つの実施形態において、さらなる治療は、1つ以上のさらなる免疫原性ペプチド、例えば、WT1またはその誘導体に由来する1つ以上の免疫原性ペプチドである。例示的なWT1免疫原性ペプチドとしては、WT1クラス1エピトープ;RMFPNAPYL(配列番号538)(WT1 126〜134)を含む(またはそれからなる)ペプチド;YMFPNAPYL(配列番号539)を含む(またはそれからなる)ペプチド;RSDELVRHHNMHQRNMTKL(配列番号540)(WT1 427〜445)を含む(またはそれからなる)ペプチド;PGCNKRYFKLSHLQMHSRKHTG(配列番号541)(WT1 331〜352)を含む(またはそれからなる)ペプチド;SGQARMFPNAPYLPSCLES(配列番号542)(WT1 122〜140)を含む(またはそれからなる)ペプチド;およびSGQAYMFPNAPYLPSCLES(配列番号543)を含む(またはそれからなる)ペプチドが挙げられるが、これらに限定されない。他のWT1免疫原性ペプチドは、米国特許第7,598,221号(この内容は、参照により本明細書中に援用される)に記載されている。他の免疫原性ペプチドとしては、MUC1由来の免疫原性ペプチド、gp100由来の免疫原性ペプチド、TRP−2由来の免疫原性ペプチド、MAG1由来の免疫原性ペプチド、NY−ESO1由来の免疫原性ペプチド、HER−2由来の免疫原性ペプチド;およびAIM2由来の免疫原性ペプチドが挙げられるが、これらに限定されない。
被験体は、がん(例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、多発性骨髄腫またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症)を有し得るか、有していると疑われ得るか、または発症するリスクがあり得る。「がんを有していると疑われる」被験体は、がんの1つ以上の症状を有する被験体である。がんの症状は、当業者に周知であり、通常、それらとしては、疼痛、体重減少、脱力、過度の疲労、摂食困難、食欲不振、慢性咳嗽、息切れの悪化、喀血(coughing up blood)、血尿、血便、悪心、嘔吐、腹部膨満、鼓脹、腹水(fluid in peritoneal cavity)、膣出血、便秘、腹部膨満感、結腸の穿孔、急性腹膜炎(感染、発熱、疼痛)、疼痛、吐血、大量の発汗、発熱、高血圧、貧血、下痢、黄疸、眩暈、悪寒、筋痙攣、嚥下困難などが挙げられるがこれらに限定されない。多発性骨髄腫の症状としては、詳細には、例えば、骨痛(例えば、背部または肋骨)、血液中の高レベルのカルシウム、過度の口渇もしくは排尿、便秘、悪心、食欲不振、錯乱、脚の脱力もしくはしびれ、体重減少または反復性感染症が挙げられる。ワルデンシュトレームマクログロブリン血症を示す症状としては、例えば、脱力、リンパ節の腫れ、重度の疲労、鼻出血、体重減少、神経学的問題が挙げられる。
本明細書中で使用される場合、「がんを発症するリスクがある」被験体は、がんを発症する素因、すなわち、がんを発症する遺伝的素因を有する(例えば、腫瘍抑制遺伝子における変異(例えば、BRCA1、p53、RBまたはAPCにおける変異)か、がんをもたらし得る状況に曝されたことがあるか、または現在、がんをもたらし得る状況に影響を受けている)被験体である。したがって、ある被験体が、変異原性または発がん性のレベルのある特定の化合物(例えば、タバコの煙の中の発がん性の化合物、例えば、アクロレイン、4−アミノビフェニル、芳香族アミン、ベンゼン、ベンズ{ベンザ}アントラセン、ベンゾ{ベンザ}ピレン、ホルムアルデヒド、ヒドラジン、ポロニウム−210(ラドン)、ウレタンまたは塩化ビニル)に曝露されたことがある場合、その被験体は、「がんを発症するリスクがある」被験体でもあり得る。その被験体が、例えば、大線量の紫外線もしくはX線に曝露されたことがあるか、または腫瘍を引き起こす/腫瘍に関連するウイルス(例えば、パピローマウイルス、エプスタイン・バーウイルス、B型肝炎ウイルスまたはヒトT細胞白血病リンパ腫ウイルス)に曝露された(例えば、感染した)ことがある場合、その被験体は、「がんを発症するリスクがあり」得る。さらに、ある被験体が、炎症(例えば、慢性炎症)に罹患している場合、その被験体は、「がんを発症するリスクがあり」得る。例えば、ある被験体が、意義不明の単クローン性免疫グロブリン血症(MGUS)を有する場合、その被験体は、多発性骨髄腫を発症するリスクがあり得る。被験体は、本明細書中に記載される任意のがん、例えば、膀胱がん(進行性膀胱がんおよび転移性膀胱がんを含む)、乳がん(例えば、エストロゲンレセプター陽性乳がん、エストロゲンレセプター陰性乳がん、HER−2陽性乳がん、HER−2陰性乳がん、トリプルネガティブ乳がん、炎症性乳がん)、結腸がん(結腸直腸がんを含む)、腎臓がん(例えば、腎細胞癌(例えば、乳頭状腎細胞癌、明細胞癌、嫌色素性癌))、肝臓がん、肺がん(小細胞肺がんおよび非小細胞肺がん(腺癌、扁平上皮癌、気管支肺胞癌および大細胞癌を含む)を含む)、泌尿生殖器がん、例えば、卵巣がん(卵管がん、子宮内膜がんおよび腹膜がんを含む)、子宮頸がん、前立腺がんおよび精巣がん、リンパ系のがん、直腸がん、喉頭がん、膵がん(膵外分泌癌を含む)、胃がん(例えば、胃食道がん、胃上部がんまたは胃下部がん)、消化器がん(例えば、肛門がんまたは胆管がん)、胆嚢がん、甲状腺がん、白血病(例えば、急性骨髄性白血病)、神経細胞がんおよびグリア細胞がん(例えば、多形神経膠芽腫)、頭頸部がんまたは多発性骨髄腫を発症するリスクがあり得る。
多発性骨髄腫は、米国において毎年およそ45,000人が罹患している血液のがんである。多発性骨髄腫は、骨髄内での形質細胞の多巣性増殖およびクローン増殖を特徴とし、それは、骨格機能不全、血清単クローン性免疫グロブリン血症、免疫抑制および終末器官続発症(end−organ sequelae)をもたらし得る。くすぶり型多発性骨髄腫(SMM)患者は、アクティブ多発性骨髄腫への進行に対して高リスクである。骨髄移植および化学療法を含む処置が、アクティブ多発性骨髄腫を発症する患者を処置するために使用されるが、これらの段階の疾患を有する患者の予後は、不良であることが多い。
くすぶり型多発性骨髄腫(SMM)は、腎機能障害、高カルシウム血症、骨疾患または貧血を伴わない、骨髄における形質細胞の単クローン性増殖、ならびに血液中および/または尿中の単クローン性タンパク質を特徴とする無症候性の形質細胞増殖性障害である。SMMの診断には、≧3g/dLの血清単クローン性(M)タンパク質レベルおよび/または>10%の骨髄クローン形質細胞(BMPC)、ならびに終末器官の損傷(すなわち、高カルシウム血症、腎機能不全、貧血または骨病変[CRAB])がないことが必要である。SMMは、無症候性であるにもかかわらず、症候性多発性骨髄腫(MM)またはアミロイドーシスへの進行の高リスクに関連する。
現在、SMMに対する積極的な処置は存在しない。代わりに、「用心深い」待機アプローチがとられており、症候性の疾患に進行した後に、処置が開始される。ほとんどの患者の場合、進行は、貧血の増大(正常下限未満である2g/dLより低いまたは<10g/dLのヘモグロビン)および/または骨格の合併症(骨病変および/またはびまん性骨粗鬆症を含む)によって示される。
くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体は、多発性骨髄腫の発症に対してリスクがある被験体でもある。くすぶり型多発性骨髄腫は、例えば、被験体の尿中または血液中の、高レベルの単クローン性タンパク質によって決定され得る。さらに、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体は、骨髄における骨髄腫細胞数の増加を示し得る。現在、SMMは、新たに診断されたMMの全症例のおよそ15%を占めると推定されている。診断から症候性のMMまで進行する時間の中央値は、2〜3年の範囲であり、SMMから処置を必要とする症候性のMMまでに進行する1年間のリスクは、10%であると推定される。進行のリスクは、1)≧3g/dLという単クローン性タンパク質のレベル;2)BMPC≧10%;および3)異常な無血清軽鎖(FLC)比の存在に左右される。表1に示されるように、進行までの時間の中央値は、これらの予後基準のうちの1つだけを満たす患者(10年)またはこれらの基準のうちの2つを満たす患者(5.1年)と比べて、これらの基準の3つすべてを満たす患者において著しく短い(1.9年)。同様に、5年までに症候性のMMに進行する患者の割合は、これらの基準の1または2つしか満たさない患者(それぞれ25%および51%)と比べて、3つすべての予後基準を満たす患者において著しく高い(76%)。
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最近のデータは、関与していない免疫グロブリン(Ig)アイソタイプのうちの1つまたは2つの減少として定義されるBMPCの異常な表現型の存在、ならびにMタンパク質が安定して残存しているかまたは経時的に進行的に悪化しているかを含む、SMMに対する他の予後基準の重要性を証明している。進行(evolving)SMMと称される、この後者の場合、血清Mタンパク質レベルの進行的上昇を有する患者は、安定したMタンパク質を有する患者と比べて、進行までの時間(TTP)の中央値が、短い(それぞれ1.3年 対 3.9年)。
いくつかの実施形態において、上記方法は、本明細書中に記載されるペプチド、核酸または組成物を被験体に投与した後に、その被験体において免疫応答が生じたかを決定する工程も含み得る。被験体において免疫応答が生じたかを決定するための好適な方法は、被験体由来の生物学的サンプル中における、例えば、ペプチドに特異的な抗体の存在を検出するためのイムノアッセイの使用を含む。例えば、ペプチドまたは組成物を被験体に投与した後、生物学的サンプル(例えば、血液サンプル)を、その被験体から得て、そのペプチドに特異的な抗体の存在について試験し得る。免疫応答は、サンプル中の活性化されたT細胞の存在または量についてアッセイすることによっても検出され得る。そのようなアッセイとしては、例えば、増殖アッセイ、限界希釈アッセイ、細胞傷害性アッセイ(例えば、リンフォカイン放出アッセイまたは51Cr放出アッセイ)(上に記載されたような)が挙げられる。
いくつかの実施形態において、上記方法は、被験体ががんを有するかを決定する工程も含み得る。そのような決定のための好適な方法は、被験体において検出されるがんのタイプに依存するが、当該分野で公知である。そのような方法は、定性的または定量的であり得る。例えば、医療従事者は、ある被験体が、多発性骨髄腫の2つ以上(例えば、3、4、5または6つ以上)の症状(例えば、本明細書中に記載される症状のいずれか)を示す場合、その被験体が多発性骨髄腫を有すると診断し得る。被験体は、血中カルシウムレベル、白血球細胞数もしくは赤血球細胞数、または被験体の尿中のタンパク質量を測定することによってもまた、多発性骨髄腫を有すると決定され得る。
エキソビボアプローチ。被験体において免疫応答を誘導するためのエキソビボストラテジーは、被験体から得られた好適なAPC(例えば、樹状細胞、単球またはマクロファージ)を本明細書中に記載される任意のペプチドまたは組成物と接触させる工程を含み得る。あるいは、それらの細胞を、上記ペプチドの1つ以上をコードする核酸(例えば、発現ベクター)でトランスフェクトし、必要に応じて、それらのペプチドの発現を可能にする時間にわたっておよびそのような条件下で培養し得る。そのトランスフェクション方法は、細胞のタイプおよび細胞にトランスフェクトされる核酸に依存する。(上記の「ペプチドを産生させるための核酸および方法」およびSambrookら、前出を参照のこと)。次いで、接触またはトランスフェクションの後、細胞を被験体に戻す。
上記細胞は、MHCクラスIまたはMHCクラスII分子を発現している広範囲のタイプの任意の細胞であり得る。例えば、それらの細胞としては、骨髄細胞、マクロファージ、単球、樹状細胞、T細胞(例えば、Tヘルパー細胞、CD4細胞、CD8細胞または細胞傷害性T細胞)またはB細胞が挙げられ得る。
免疫応答を刺激するためのエキソビボ方法は、インビトロにおいてT細胞(例えば、被験体から得られたリンパ球の集団中のT細胞)を、本明細書中に記載されるペプチドのうちの1つと結合するMHC分子を発現している抗原提示細胞と、そのT細胞を活性化するのに十分な時間にわたって(および条件下において)接触させる工程を含み得る。接触の後、活性化されたT細胞を、細胞を得た被験体に再導入する。本明細書中に記載されるペプチドのうちの1つと結合するMHC分子を発現しているAPCを生成するための方法は、この項において上記されている。
任意のエキソビボ方法のいくつかの実施形態において、細胞は、被験体以外の同じ種の被験体から得ることができ(同種間)、試薬(または免疫原性/抗原性組成物)と接触され得、被験体に投与され得る。
被験体において抗体を産生させるための方法
免疫原(例えば、本明細書中に記載される任意の1つ以上のペプチド)に特異的な抗体を産生させる方法は、当該分野で公知であり、下記に詳述される。例えば、本明細書中に記載されるペプチドに特異的な抗体または抗体フラグメントは、免疫化によって、例えば、動物を用いて、またはファージディスプレイなどのインビトロの方法によって、生成され得る。本明細書中に記載されるペプチドの全部または一部は、抗体または抗体フラグメントを生成するために使用され得る。
あるペプチドを使用して、好適な被験体(例えば、ウサギ、ヤギ、マウス、またはヒトなどの他の哺乳動物)をそのペプチドで免疫することによって、抗体を調製することができる。適切な免疫原性調製物は、例えば、本明細書中に記載される試薬のいずれかを含み得る。その調製物は、アジュバント(例えば、フロイント完全アジュバントもしくはフロイント不完全アジュバント、ミョウバン、RIBIまたは同様の免疫賦活性剤)をさらに含み得る。アジュバントには、例えば、コレラ毒素(CT)、大腸菌易熱性トキシン(LT)、変異CT(MCT)(Yamamotoら(1997)J.Exp.Med.185:1203−1210)変異体大腸菌易熱性トキシン(MLT)(Di Tommasoら(1996)Infect.Immunity 64:974−979)、カルボキシメチルセルロース、ポリイノシン酸−ポリシチジル酸およびポリ−L−リジン二本鎖RNAの組み合わせ(例えば、ポリIC−LC、例えば、ヒルトノール(hiltonol))、水と油のエマルジョン(例えば、モンタナイド)、ならびにタンパク質(例えば、サイトカイン、補体、GCSF、GM−CSF)も含まれる。MCTおよびMLTは、親分子と比べて、アジュバント活性を実質的に損なわずに毒性を実質的に低下させる点変異を含む。免疫原性ペプチド調製物(例えば、本明細書中に記載される試薬のいずれか)で好適な被験体を免疫することにより、ポリクローナル抗ペプチド抗体応答が誘導される。
本明細書中で使用される抗体という用語は、免疫グロブリン分子および免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分(すなわち、ペプチド(例えば、本明細書中に記載されるペプチド)に特異的に結合する抗原結合部位を含む分子)のことを指す。本明細書中に記載されるペプチドに特異的に結合する抗体は、そのペプチドに結合するがサンプル中の他の分子には実質的に結合しない抗体である。免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分の例としては、例えば、F(ab)フラグメント、F(ab’)フラグメント、または本明細書中に記載される他の任意の抗体フラグメント(下記を参照のこと)が挙げられる。
抗ペプチド抗体は、モノクローナル抗体、またはポリクローナル抗体の調製物であり得る。モノクローナル抗体という用語は、本明細書中で使用される場合、ペプチドと免疫反応することができるただ1つの種の抗原結合部位を含む抗体分子の集団のことを指す。したがって、モノクローナル抗体組成物は、典型的には、それと免疫反応する特定のペプチドに対して単一の結合親和性を示す。
ポリクローナル抗ペプチド抗体は、好適な被験体をペプチド免疫原で免疫することによって、上に記載されたように調製され得る。免疫された被験体における抗ペプチド抗体価は、標準的な手法(例えば、固定化されたペプチドを用いる酵素結合免疫吸着測定法(ELISA))によって、経時的にモニターされ得る。所望であれば、そのペプチドに対する抗体分子は、哺乳動物(例えば、血液)から単離され、IgG画分を得るためにプロテインAクロマトグラフィーなどの手法によってさらに精製され得る。免疫してから適切な時間が経過した後、例えば、抗ペプチド抗体価が最も高くなるとき、抗体産生細胞を被験体から得て、それを使用することにより、標準的な手法(例えば、Kohler and Milstein(1975)Nature 256:495−497によって初めて記載されたハイブリドーマ法、ヒトB細胞ハイブリドーマ法(Kozborら(1983)Immunol.Today 4:72)またはEBV−ハイブリドーマ法(Coleら(1985),Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,Inc.,pp.77−96))によってモノクローナル抗体を調製することができる。リンパ球と不死化細胞株とを融合するために使用される多くの周知のプロトコルのいずれかを、抗ペプチドモノクローナル抗体を生成する目的で適用することができる(例えば、Current Protocols in Immunology,前出;Galfreら(1977)Nature 266:55052;R.H.Kenneth,Monoclonal Antibodies:A New Dimension In Biological Analyses,Plenum Publishing Corp.,New York,New York(1980);およびLerner(1981)Yale J.Biol.Med.,54:387−402(これらの各開示はその全体が、参照により援用される)を参照のこと)。
モノクローナル抗体を分泌するハイブリドーマを調製する代替法として、ペプチドに結合する免疫グロブリンライブラリーメンバーを単離するために本明細書中に記載されるペプチドを用いて、組換えコンビナトリアル免疫グロブリンライブラリー(例えば、抗体ファージディスプレイライブラリー)をスクリーニングすることによって、モノクローナル抗ペプチド抗体を同定し、単離することができる。
抗ペプチド抗体(例えば、モノクローナル抗体)は、アフィニティークロマトグラフィーまたは免疫沈降などの手法によって、ペプチドを単離するために使用され得る。さらに、抗ペプチド抗体は、本明細書中に記載されるスクリーニングアッセイにおいてペプチドを検出するために使用され得る。抗体は、必要に応じて、検出可能な標識(例えば、本明細書中に記載される標識のいずれか、または結合対の第1もしくは第2のメンバー(例えば、ストレプトアビジン/ビオチンまたはアビジン/ビオチン)に結合され得る(その第2のメンバーは、検出可能な標識に結合体化され得る)。
標的ペプチド(例えば、本明細書中に記載されるペプチド)に対する非ヒト抗体は、非ヒト宿主(例えば、げっ歯類)においても産生され得、次いで、例えば、米国特許第6,602,503号、EP239400、米国特許第5,693,761号および米国特許第6,407,213号(これらの各開示はその全体が、参照により援用される)に記載されているようにヒト化され得る。
治療を選択するための方法
がん(例えば、形質細胞障害、例えば、多発性骨髄腫および/もしくはワルデンシュトレームマクログロブリン血症、またはXBP1、CD138もしくはCS1が発現されている任意のがん(例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん、結腸がん、膵がん、白血病、例えば、AMLまたはCML))または前がん状態(例えば、くすぶり型多発性骨髄腫)を有する被験体に対する治療を選択するための方法は、必要に応じて、被験体のがんの1つ以上の細胞(例えば、形質細胞)がXBP1を発現しているかを決定する工程;および1つ以上の細胞がXBP1を発現している場合、その被験体に対する治療として、本明細書中に記載されるペプチドまたは組成物、例えば、本明細書中に記載されるXBP1ペプチドまたはXBP1ペプチドを含む組成物を選択する工程を含む。
がんを有する被験体に対する治療を選択するための方法は、必要に応じて、被験体のがんの1つ以上の細胞(例えば、形質細胞)がCD138を発現しているかを決定する工程;および1つ以上の細胞がCD138を発現している場合、その被験体に対する治療として、本明細書中に記載されるペプチドまたは組成物、例えば、本明細書中に記載されるCD138ペプチドまたはCD138ペプチドを含む組成物を選択する工程を含み得る。
がんを有する被験体に対する治療を選択するための方法は、必要に応じて、被験体のがんの1つ以上の細胞(例えば、形質細胞)がCS−1を発現しているかを決定する工程;および1つ以上の細胞がCS−1を発現している場合、その被験体に対する治療として、本明細書中に記載されるペプチドまたは組成物、例えば、本明細書中に記載されるCS−1ペプチドまたはCS−1ペプチドを含む組成物を選択する工程を含み得る。
被験体のがんの1つ以上の細胞(例えば、形質細胞)が、XBP1、CD138およびCS−1のうちの2つ以上を発現する場合、好適なペプチドの組み合わせが、例えば、本明細書中に記載される組成物を介して、その被験体に送達され得ることが理解される。例えば、被験体のがんの1つ以上の細胞(例えば、形質細胞)が、XBP1およびCD138を発現していると決定される場合、治療を選択するための方法は、その被験体に対する治療として:本明細書中に記載される、少なくとも1つのXBP1ペプチドおよび少なくとも1つのCD138ペプチド、またはそのようなペプチドを含む組成物を選択する工程を含み得る。
1つ以上の細胞がXBP1、CD138またはCS−1を発現しているかを決定するための方法は、当該分野で公知であり、上に記載されている。例えば、被験体から得られた生物学的サンプル(例えば、血液サンプルまたはリンパ節組織サンプル)が、本明細書中に記載される方法によって生成された、XBP1、CD138またはCS−1に特異的な抗体を使用して試験されることにより、細胞(または細胞可溶化物)によって発現されたXBP1、CD138またはCS−1ポリペプチドの存在または量が検出され得る。(例えば、実施例およびSambrookら、前出を参照のこと)。ポリペプチドの存在または量について生物学的サンプルをアッセイするための方法としては、例えば、ELISA、免疫組織化学、フローサイトメトリー、ウエスタンブロッティングアッセイまたはドットブロッティングアッセイが挙げられる。
いくつかの実施形態において、本明細書中に記載される任意の方法は、被験体から生物学的サンプルを提供する工程および/または被験体から生物学的サンプルを得る工程も含み得る。本明細書中に記載される方法に適した生物学的サンプルとしては、目的の被検体タンパク質(例えば、XBP1、CD138またはCS−1タンパク質)を含む、任意の生体液、細胞、組織またはそれらの画分が挙げられる。生物学的サンプルは、例えば、被験体(例えば、ヒトなどの哺乳動物)から得られた検体であり得るか、またはそのような被験体に由来し得る。例えば、サンプルは、生検によって得られた組織切片、または組織培養において配置されたかもしくは組織培養に適合された細胞であり得る。生物学的サンプルは、細胞を含む生体液(例えば、尿、血液、血漿、血清、唾液、精液、痰、脳脊髄液、涙、粘液または吸引液(例えば、肺または乳頭の吸引液))または紙もしくはポリマー基材上に吸収されたそのようなサンプルでもあり得る。生物学的サンプルは、所望であれば、特定の細胞型を含む画分にさらに分画され得る。例えば、血液サンプルは、血清、または特定のタイプの血液細胞(例えば、赤血球細胞または白血球細胞(白血球))を含む画分に分画され得る。所望であれば、サンプルは、被験体由来のサンプルタイプの組み合わせ、例えば、組織と生体液との組み合わせであり得る。
生物学的サンプルは、被験体、例えば、がん(例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病(例えば、AMLまたはCML)、多発性骨髄腫および/またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症)を有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある被験体から得ることができる。生物学的サンプルを得るための任意の好適な方法を使用することができるが、例示的な方法としては、例えば、静脈切開、スワブ(例えば、頬側スワブ)、吸引または細針吸引生検の手順が挙げられる。細針吸引しやすい組織の非限定的な例としては、リンパ節、肺、甲状腺、乳房および肝臓が挙げられる。サンプルは、例えば、顕微解剖(例えば、レーザーキャプチャー顕微解剖(LCM)またはレーザー顕微解剖(LMD))、膀胱洗浄、スメア(PAPスメア)または管洗浄(ductal lavage)によっても回収され得る。
例えば、上に記載された方法を用いて、被験体においてがん(例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、白血病、多発性骨髄腫および/またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症)または前がん状態、例えば、くすぶり型多発性骨髄腫を検出した後、医療従事者(例えば、医師)は、例えば、(i)医薬に対する処方箋を書くこと;(ii)被験体に医薬を与えること(しかし必ずしも投与ではない)(例えば、患者が医師の診療所にいる間、その患者に対して処方薬のサンプルを手渡すこと);(iii)提案されるまたは推奨される治療様式(例えば、本明細書中に記載されるペプチドの1つ以上を含む治療)に関する患者とのコミュニケーション(口頭、書面(処方箋以外)または電子的(電子メール、安全なサイトへの電子ポスト(electronic post)));または(iv)被験体に対する好適な治療様式を同定し、例えば、患者記録を経由して、他の医療関係者にその情報を流すことによって、その被験体に対する適切な治療様式(例えば、本明細書中に記載されるペプチドの1つ以上を含む治療)を選択することができる。終わりの(iv)は、例えば、2つ以上の治療または治療薬が、異なる医療従事者によって患者に投与される場合、有用であり得る。
被験体においてXBP1、CD138またはCS−1の存在または量を検出した後(上記の方法のいずれかを用いて);および/または被験体に対する治療を選択した後、医療従事者(例えば、医師)は、その被験体に適切な治療様式を施すことができる。上に詳述されたような本明細書中に記載されるペプチドの1つ以上を含む治療を施すための方法。
さらに、医療従事者はまた、がんを処置する1つ以上のさらなる治療薬、または抗がん剤の副作用を処置する1つ以上の医薬も選択、処方および/または投与することができる。多発性骨髄腫および/またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症を処置するための好適な化学療法剤としては、例えば、メルファラン、シクロホスファミド、ビンクリスチン、ドキソルビシン、プレドニゾン、デキサメタゾン、プロテオソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ)、サリドマイドまたはレナリドマイドが挙げられる。
抗がん剤の副作用としては、例えば、貧血、消化管の症状(例えば、悪心、嘔吐、下痢)、白血球減少(感染を引き起こし得る、白血球細胞数の減少)、一時的な毛髪脱落または血小板減少(出血を引き起こし得る、血小板数の減少)が挙げられる。したがって、医師は、ビンクリスチンなどの化学療法剤を、抗貧血薬(例えば、エポエチンアルファ(例えば、Procrit(登録商標)またはEpogen(登録商標)))とともに被験体に処方し得るかまたは投与し得る。
キットおよび製造品
本開示は、種々のキットも特徴とする。それらのキットは、例えば、1つ以上(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10個以上)の本明細書中に記載される任意のペプチドまたは組成物(または1つ以上のペプチドをコードする核酸配列を含む発現ベクター);およびそのペプチドまたは組成物を被験体に投与するための指示を含み得る。そのキットは、1つ以上の薬学的に許容され得るキャリアおよび/または1つ以上の免疫刺激剤および/または1つ以上の免疫調節剤を含み得る。免疫刺激剤は、例えば、Tヘルパーエピトープ、変更されたペプチドリガンドまたはアジュバントであり得る。1つの実施形態において、免疫刺激剤は、カルボキシメチルセルロース、ポリイノシン酸−ポリシチジル酸およびポリ−L−リジン二本鎖RNAの組み合わせ(例えば、ポリIC−LC、例えば、ヒルトノール);水と油のエマルジョン(例えば、モンタナイド);またはタンパク質(例えば、サイトカイン、補体、GCSF、GM−CSF)であり得る。1つの実施形態において、免疫調節剤は、タンパク質、例えば、免疫系を活性化する抗体(例えば、抗CTLA4抗体、例えば、イピリムマブまたはトレメリムマブ、抗PD−1抗体、抗PDL−1抗体);小分子アジュバント(例えば、サリドマイドまたはサリドマイド誘導体、例えば、レナリドマイド)である。
上記キットは、1つ以上の治療薬、診断薬または予防薬も含み得る。その1つ以上の治療薬、診断薬または予防薬としては、(i)炎症反応を調節する薬剤(例えば、アスピリン、インドメタシン、イブプロフェン、ナプロキセン、ステロイド、クロモリンナトリウムまたはテオフィリン);(ii)腎臓および/もしくは心臓血管の機能に影響する薬剤(例えば、フロセミド、サイアザイド、アミロライド、スピロノラクトン、カプトプリル、エナラプリル、リシノプリル、ジルチアゼム、ニフェジピン、ベラパミル、ジゴキシン、イソルジル、ドブタミン、リドカイン、キニジン、アデノシン、ジギタリス、メバスタチン、ロバスタチン、シンバスタチンまたはメバロネート);(iii)消化管機能に影響する薬物(例えば、オメプラゾールまたはスクラルファート);(iv)抗生物質(例えば、テトラサイクリン、クリンダマイシン、アンホテリシンB、キニン、メチシリン、バンコマイシン、ペニシリンG、アモキシシリン、ゲンタマイシン、エリスロマイシン、シプロフロキサシン、ドキシサイクリン、ストレプトマイシン、ゲンタマイシン、トブラマイシン、クロラムフェニコール、イソニアジド、フルコナゾールまたはアマンタジン);(v)抗がん剤(例えば、シクロホスファミド、メトトレキサート、フルオロウラシル、シタラビン、メルカプトプリン、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ドキソルビシン、ブレオマイシン、マイトマイシンC、ヒドロキシ尿素、プレドニゾン、タモキシフェン、シスプラチンまたはダカルバジン(decarbazine));(vi)免疫調節剤(例えば、インターロイキン、インターフェロン(例えば、インターフェロンガンマ(IFN−γ)、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、腫瘍壊死因子アルファ(TNFα)、腫瘍壊死因子ベータ(TNFβ)、シクロスポリン、FK506、アザチオプリン、ステロイド);(ix)血液および/または造血器官に対して作用する薬物(例えば、インターロイキン、G−CSF、GM−CSF、エリトロポイエチン、ヘパリン、ワルファリンまたはクマリン);または(vii)ホルモン(例えば、成長ホルモン(GH)、プロラクチン、黄体形成ホルモン、TSH、ACTH、インスリン、FSH、CG、ソマトスタチン、エストロゲン、アンドロゲン、プロゲステロン、性腺刺激ホルモン放出ホルモン(GnRH)、チロキシン、トリヨードチロニン);ホルモンアンタゴニスト;石灰化および骨代謝に影響する薬剤(例えば、カルシウム、ホスフェート、副甲状腺ホルモン(PTH)、ビタミンD、ビスホスホネート、カルシトニン、フッ化物)が挙げられるが、これらに限定されない。
容器;およびその容器内に含められた組成物を含む製造品もまた特徴とし、ここで、その組成物は、哺乳動物(例えば、ヒト)において免疫応答を誘導するための活性成分を含み、その活性成分は、1つ以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9または10個以上)の本明細書中に記載される任意のペプチドを含み、その容器は、その組成物が、哺乳動物(例えば、本明細書中に記載される哺乳動物のいずれか)において免疫応答を誘導するために使用するためのものであることを示す表示を有する。その表示は、その組成物が、がん、例えば、肺がん、肝臓がん、胆管がん、胃がん、子宮頸がん、鼻咽頭がん、乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がん、多発性骨髄腫、くすぶり型多発性骨髄腫および/またはワルデンシュトレームマクログロブリン血症を有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある哺乳動物に投与されるべきであることをさらに示し得る。その製造品の組成物は、乾燥され得るかまたは凍結乾燥され得、乾燥されたまたは凍結乾燥された組成物を可溶化するための、例えば、1つ以上の溶液(および/または指示)を含み得る。
上記製造品は、哺乳動物(例えば、上に記載されたような)に上記組成物を投与するための指示も含み得る。
以下の実施例は、本発明を限定するのではなく例証することを意図されている。
実施例1:材料および方法
細胞株。多発性骨髄腫細胞株:McCAR、MM1SおよびU266は、American Type Culture Collection(ATCC;Manassas,VA)から入手した。ヒト急性骨髄性白血病(AML)細胞株ML−2は、Dr.Y.Matsuo,Fujisaki Cell Center,Okayama,Japanの厚意により提供された。HLA−A2.1分子を発現しているヒトB細胞およびT細胞ハイブリッドであるT2細胞株(Zweerinkら(1993)J Immunol.150(5):1763−71)は、Dr.J.Molldrem(University of Texas M.D.Anderson Cancer Center,Houston,TX)によって提供され、抗原提示細胞(APC)の起源として使用した。K562−A0201細胞は、Karen Anderson(Dana Farber Cancer Institute,Boston,MA)によって提供され、CTLに対して個々のペプチドを提示する免疫モニタリングアッセイにおいて使用した。LnCap、VCap、MB231、MCF7、BT474、LS180、SW480、WiDRr、OCI、U937、HEL、UT7、HL60、Nomo1およびTHP1を含む様々ながん細胞をATCCから入手した。すべての細胞株を、10%ウシ胎仔血清(FCS;BioWhittaker,Walkersville,MD)、100IU/mlのペニシリンおよび100μg/mlのストレプトマイシン(Gibco−Life Technologies)が補充されたRPMI−1640培地(Gibco−Life Technologies,Rockville,MD)中で培養した。
試薬。フィコエリトリン(PE)に結合体化されたマウス抗ヒトCD80またはCD83モノクローナル抗体(mAb)は、Immunotech(Hialeigha,FL)から購入した。FITC、PE、PerCP、PerCP−Cy5.5、APC、Pacific Blue、APC−H7またはPE−Cy7に結合体化された、マウス抗ヒトCD3、CD4、CD8、CCR7、CD45RO、CD69、CD107α、IFN−γおよびHLA−A2 mAbは、Becton Dickinson(BD)/PharmingenまたはBD/Biosciences(San Diego,CA)から購入した。組換えヒトIL−2、IL−4、IFN−αおよびTNF−αは、R&D Systems(Minneapolis,MN)から購入し、GM−CSFは、Immunex(Seattle,WA)から入手した。
合成ペプチド。インフルエンザウイルスタンパク質マトリックスペプチド58−66(GILGFVFTL;配列番号25)およびMAGE−3ペプチド(FLWGPRALV;配列番号26)を、コントロールHLA−A2結合ペプチドとして使用した。6つの天然の非スプライシング型XBP1ペプチド:XBP1118−126(LLREKTHGL;配列番号1);XBP1185−193(NISPWILAV(配列番号2));XBP1190−198(ILAVLTLQI(配列番号3));XBP1193−201VLTLQIQSL(配列番号4));XBP1111−119(KLLLENQLL(配列番号5));XBP194−102(RMSELEQQV(配列番号27));SP XBP1197−205(GILDNLDPV(配列番号7))、SP XBP1194−202(ILLGILDNL(配列番号8))、SP XBP1368−376(ELFPQLISV(配列番号9))を含む3つの天然のスプライシング型XBP1ペプチド;ヘテロクリティックXBP1(YISPWILAV(配列番号6));およびスプライシング型ヘテロクリティックXBP1(YILDNLDPV(配列番号2));およびYLFPQLISV(配列番号10))ペプチドをデザインし、潜在的なHLA−A2結合ペプチドとして調べた。本明細書中で使用される場合、「ヘテロクリティック」(例えば、ヘテロクリティックペプチド)とは、対応する野生型ペプチドよりも免疫原性であるペプチドを生成するために、1つ以上のアミノ酸が野生型または元の配列から改変されたペプチドの形態のことを指す。例えば、すぐ上に記載された例示的なヘテロクリティックペプチドにおいて、太字のアミノ酸は、XBP1の野生型配列から改変されたアミノ酸を示している。
4つの天然のCD138ペプチド:CD138256−264(VIAGGLVGL(配列番号11));CD138260−268(GLVGLIFAV(配列番号12));CD1385−13(ALWLWLCAL(配列番号13));およびCD1387−15(WLWLCALAL(配列番号14))をデザインし、潜在的なHLA−A2結合ペプチドとして調べた。
4つの天然のCS1ペプチド:CS1−P1:CS1236−245(LLLSLFVLGL(配列番号15));CS1−P2:CS1239−247(SLFVLGLFL(配列番号16));CS1−P3:CS1232−240(LLVPLLLSL(配列番号17));およびCS1−P4:CS19−17(TLIYILWQL(配列番号18))をデザインし(3つの異なるデータベースRANKPEP、BIMASおよびNetMHCを使用して)、潜在的なHLA−A2結合ペプチドとして調べた。(例えば、Recheら(2002)Human Immunology 63:710−709を参照のこと)。
XBP−1およびCD138ペプチドを、標準的なFMOC(9−フルオレニルメチル−オキシカルボニル)化学によって合成し(Biosynthesis,Lewisville,TX)、逆相クロマトグラフィーを使用して>85%に精製し、質量分析によって分子量について検証した。CS1ペプチドは、New England Peptides LLCが95%超の純度で合成した。
ヘテロクリティックXBP1 US185−193(YISPWILAV)(配列番号6)、ヘテロクリティックXBP1 SP368−376(YLFPQLISV)(配列番号10)、天然のCD138260−268(GLVGLIFAV)(配列番号12)および天然のCS1239−247(SLFVLGLFL)(配列番号16)ペプチドは、それぞれ、XBP1非スプライシング型(US)、XBP1スプライシング型(SP)、CD138およびCS1抗原に由来した。インフルエンザウイルスマトリックスタンパク質58−66(GILGFVFTL)(配列番号25)およびCMV pp65(NLVPMVATV)(配列番号28)を、HLA−A2特異的コントロールペプチドとして選択した。すべてのペプチドを、標準的なfmoc(9−フルオレニルメチル−オキシカルボニル)化学によって合成し、逆相クロマトグラフィーを使用して>90%に精製し、質量分析によって分子量について検証した(Biosynthesis,Lewisville,TX)。凍結乾燥されたペプチドを、DMSO(Sigma,St.Louis,MO)に溶解し、AIM−V培地(Gibco−Life Technologies)において希釈し、−140℃で保存した。
ペプチド結合アッセイ。4つのHLA−A2ペプチド、ヘテロクリティックXBP1 US185−193、ヘテロクリティックXBP1 SP368−376、CD138260−268およびCS1239−247のカクテルを、T2細胞株を使用して結合親和性について評価した。そのアッセイにおいて、T2細胞を、3回洗浄し、1×10細胞/mlの最終濃度になるように無血清AIM−V培地(Gibco−Life Technologies)に再懸濁し、48ウェル組織培養プレートに移した。それらの細胞を、0〜50μg/mlの範囲の総ペプチド濃度の上記4つのペプチドのカクテル+3μg/mlのヒトβ2−ミクログロブリン(Sigma,St Louis,MO)でパルスし、加湿空気中、37℃、5%COにおいてインキュベートした。一晩のインキュベーションの後、細胞を洗浄し、4℃において15分間、マウス抗ヒトHLA−A2−FITC mAbで染色し、FACSCanto(商標)IIフローサイトメーター(Becton Dickinson,San Jose,CA)を用いて解析した。
ペプチド安定性アッセイ。上記マルチペプチドカクテルを、HLA−A2の安定性について経時的に調べた。マルチペプチドカクテル(25μg/ml;6.25μg/ml/ペプチド)でパルスされたT2細胞の一晩のインキュベーションの後、それらの細胞を洗浄して、未結合のペプチドを除去し、10μg/mlのBrefeldin A(Sigma)とともに37℃および5%COにおいて1時間インキュベートすることにより、新しく合成されるHLA−A2分子の細胞表面発現をブロックした。ペプチド/HLA−A2複合体の安定性を、BFA処置の0、2、4、6および14時間後に、細胞をマウス抗ヒトHLA−A2−FITC mAbで染色し、フローサイトメトリーで解析することによって、測定した。
単球由来の成熟樹状細胞の生成。末梢血単核球(PBMC)を、HLA−A2正常個体から得られたロイコパック(leukopaks)から、Ficoll−Paque(商標)Plus(Amersham Pharmacia Biotech AB,Uppsala Sweden)上の標準的な密度勾配遠心分離によって単離した。樹状細胞(DC)を生成するために、接着性細胞画分として単離された単球を、10%FCSが補充されたRPMI−1640培地(Gibco−Life Technologies)中の1,000U/mlのGM−CSFおよび1,000U/mlのIL−4の存在下において7日間培養した。新鮮培地+GM−CSFおよびIL−4を、1日おきにその培養物に加えた。7日目に、1,000U/mlのIFN−α+10ng/mlのTNF−αを新鮮GM−CSFおよびIL−4とともに、10%FCS−RPMI中に加え、さらに3日間インキュベートすることによって、成熟DC(mDC)を得た。
CD3T細胞の単離。CD3T細胞を、StemCell Technologies(Vancouver,Canada)製のEasySep(登録商標)磁石およびRobosep(登録商標)を使用して、非接着性細胞画分からネガティブ選択によって得た。手短に言えば、T細胞濃縮は、CD14、CD16、CD19、CD20、CD36、CD56、CD66b、CD123およびグリコホリンAに対する二重特異性四量体抗体複合体における標識による、B細胞、単球、NK細胞、赤血球細胞、血小板および好塩基球を含む非CD3T細胞の枯渇によって達成される。磁気的に標識された望まれない細胞を除去した後、濃縮されたCD3T細胞を洗浄し、フローサイトメトリーによって調べた。
MM患者の骨髄単核細胞からの初代CD138細胞の単離。骨髄単核細胞(BMMC)を、MM患者から得られた骨髄細胞から、Ficoll−Paque(商標)Plusの上の標準的な密度勾配遠心分離によって単離した。CD138MM細胞を、RoboSep(登録商標)CD138免疫磁気ポジティブ選択法(StemCell Technologies)を用いてBMMCから単離した。
ペプチド特異的CTLの誘導。個々のペプチドに特異的なCTL(ペプチド特異的CTL)またはマルチプルペプチドに特異的なCTL(MP−CTL)を、正常なHLA−A2またはHLA−A24+ドナーから得られたCD3Tリンパ球の反復刺激によってエキソビボにおいて生成した(図25を参照のこと)。手短に言えば、APC(mDCまたはT2細胞)を、加湿空気中の37℃および5%COにおいて、ヘテロクリティックXBP1 US185−193、ヘテロクリティックXBP1 SP368−376、CD138260−268およびCS1239−247ペプチド(25μg/ml総ペプチド)の個々のペプチドまたはカクテルで一晩パルスした。負荷されたAPCを回収し、洗浄し、20Gyで照射し、10%ヒトAB血清(Gemni Bio Products,West Sacramento,CA)が補充されたAIM−V培地に再懸濁した。mpパルスされ、照射されたmDCを使用して、10%ヒトAB血清が補充されたAIM−V培地中において、APC/mpとCD3T細胞の1:20の比で自己のCD3T細胞を初回刺激した。その培養物を、合計4サイクルにわたって、照射されたAPC/mpで7日ごとに再刺激することにより、mpに特異的なCTLを生成した。IL−2(50U/ml)を、2回目の刺激の2日後に培養物に加え、その培養が完了するまで補充した。
XBP1−CTL、CD138−CTLまたは標的細胞の表現型解析。4回目の刺激の1週間後に、MP−CTLおよびコントロールT細胞を、4℃において30分間、CD3−PacBlue、CD8−APC−H7、CCR7−PeCy7、CD45RO−PEおよび/またはCD69−PerCP mAbで染色することによって、全CD3CD8T細胞またはナイーブT細胞、エフェクターメモリーT細胞および活性化されたCD3CD8T細胞について評価した。染色の後、それらの細胞を洗浄し、2%パラホルムアルデヒド−PBS中で固定し、フローサイトメトリーによって解析した。
ウエスタンブロッティング。各細胞株(U266、McCAR、ML−2およびMM1S)由来のおよそ100μgのタンパク質可溶化物を、Laemmliのサンプルバッファー(1%ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)、0.05%β−メルカプトエタノール、10%グリセロールおよび0.001%ブロモフェノールブルーを含む0.1M Tris−HCl緩衝液,pH6.8)に懸濁し、2分間煮沸し、80Vで2時間、8〜16%の勾配ドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE)(Xcell Surelock Mini Cell,Invitrogen,Carlsbad,CA)に供した。タンパク質ラダー(既知分子量のタンパク質の混合物)を、そのゲルにおいてサイズマーカーとして使用することにより、ペプチドの分子量を決定した(Invitrogen,Carlsbad,CA)。ゲルを、Tris−グリシン緩衝液中において、ニトロセルロース膜(Trans−Blot,0.2ミクロンの転写膜,Bio−Rad Laboratories,CA)上に40Vで2時間、エレクトロブロットした。ニトロセルロース膜上へのタンパク質の移行を、Ponceau S染色によって確かめた。その膜とマウス抗ヒトXBP1抗体または抗ヒトCD138抗体とのンキュベーションを、一定に揺らしながら、1%BSAを含むリン酸緩衝食塩水およびTween20(PBST)中で1時間行った。その膜をPBSTで3回洗浄し、3%脱脂粉乳を含むPBST中、抗マウスIgG−西洋ワサビペルオキシダーゼ結合体において1時間インキュベートした。洗浄後、製品マニュアルに提供されている指示に従って(Amersham Life Sciences Inc.,Arlington Heights,IL)高感度化学発光を使用して、特定のタンパク質を検出した。
IFN−γ ELISA。多発性骨髄腫(MM)細胞(McCAR、MM1S)、急性骨髄性白血病(AML)細胞(ML−2)またはT2細胞(上記)とともに共培養した後のXBP1−CTL、CD138−CTLまたはCS1−CTLによるIFN−γ放出を、BD Biosciences(San Diego,CA)製のヒトIFN−γ ELISAキットを使用して測定した(図27を参照のこと)。簡潔には、標準物質としての精製されたIFN−γの希釈物またはCTL上清を、モノクローナル抗ヒトIFN−γ捕捉抗体で予めコーティングされた96ウェルプレートのウェルに移し、室温において2時間インキュベートした。数回洗浄した後、検出抗体およびアビジン−西洋ワサビペルオキシダーゼ結合体を含む緩衝液を各ウェルに加え、室温において1時間インキュベートした。それらのウェルを洗浄し、次いで、各ウェルに西洋ワサビペルオキシダーゼ基質溶液を加え、室温において30分間インキュベートした。停止液を各ウェルに加え、PerkinElmer Wallac Victor2カウンター(PerkinElmer,Wellesley,MA)を用いて、450nmにおける吸光度を決定した。CTL培養上清中に存在するサイトカインの量を、IFN−γ検量線に基づいて計算した。
カルボキシフルオレセインスクシンイミジルエステル(CFSE)追跡による細胞増殖。CTLの増殖を、多発性骨髄腫(MM)細胞(McCAR、MM1S)、急性骨髄性白血病(AML)細胞(ML−2)またはT2細胞(上記)とともに共培養した後に測定した(図27および32を参照のこと)。個々のXBP1−CTL、CD138−CTL、CS1−CTLまたはマルチペプチドによって生成されたCTLを、PBS(Gibco−BRL)中で2回洗浄し、1×10細胞/mlの濃度でRPMI−1640培養培地に再懸濁した。DMSO中の5mM原液の形態のCFSE(Molecular Probes,Eugene,OR)を、5μMの最終濃度が得られるように上記CTLに加え、光から保護されたCO恒温器内で37℃において10分間インキュベートした。インキュベーションの後、上記CTL細胞の体積の5倍に等しい体積の氷冷PBS(2%FCSを含む)をそれらの細胞に加えることにより、反応をクエンチした。細胞を氷上で5分間インキュベートし、遠心し、合計3回洗浄した後、新しいPBS(2%FCSを含む)に再懸濁した。CFSEで標識されたT細胞を、RPMI培養培地で2×10細胞/mlの濃度に調整し、2×10細胞/mlの初代多発性骨髄腫細胞、MM細胞株、様々ながん細胞株または個々のペプチドを提示しているK562−A2細胞で刺激した。刺激された、CFSEで標識された細胞を、フローサイトメトリーによって調べた。
細胞傷害性アッセイ。個々のXBP1−CTL、CD138−CTL、CS1−CTLまたはマルチペプチドによって生成されたCTLの細胞傷害活性を、例えば、Rodenら(1999)J.Immunol Methods 226:29−41によって記載されたような、カルセイン放出アッセイによって測定した。簡潔には、T2、U266細胞、McCAR細胞、ML−2細胞、MM1S細胞株または初代多発性骨髄腫細胞を含む標的細胞(3×10細胞)を、10mMカルセイン−AM(Molecular Probes)を含む無血清培養培地中において37℃で30分間インキュベートし、5%FCSを含む冷PBS中で3回洗浄し、96ウェルU底マイクロタイタープレート(3つ組のウェル/サンプル)において、エフェクター細胞(5×10細胞/ウェル)とともに様々なエフェクター:標的細胞比でインキュベートした。プレートを、37℃および5%COにおいて3時間インキュベートした。インキュベーションの後、それらの細胞を、1,000rpmにおける5分間の遠心分離によってペレットにし、100μlの上清を96ウェル平底マイクロタイタープレート(Nunc)のウェルに移し、それらの細胞から放出された蛍光の量としてカルセイン放出を測定した(VICTOR−1420マルチラベルカウンター(PerkinElmer,Boston,MA)を使用して)。最大のカルセイン放出が、界面活性剤によって放出された標的細胞のカウントおよびエフェクター細胞の非存在下における標的細胞からの自発的な放出のカウントから得られた。細胞傷害性を、以下のとおり計算した:%特異的溶解=[(実験による放出−自発的な放出)÷(最大放出−自発的な放出)]×100。
CD107α脱顆粒アッセイ。CD107α脱顆粒を、多発性骨髄腫(MM)細胞(McCAR、MM1S)、急性骨髄性白血病(AML)細胞(ML−2)またはT2細胞(上記)とともに共培養した後に測定した(図27および30を参照のこと)。細胞傷害活性の測定であるCD107α脱顆粒アッセイを、下記に詳述されるような軽微な改変を加えて、Bettsら(2003)およびMittendorfら(2005)に記載されているとおりに行った。個々のペプチドでパルスされた、初代多発性骨髄腫細胞、MM細胞株、様々ながん細胞株またはK562−A2細胞を、様々なエフェクター:標的比でCTLとともに共培養した。CD107αおよびCD107b(両方とも、検出可能な標識FITCに結合体化されている)の各々の10μlアリコートを、CD138−CTLの添加と同時に、各ウェルに加えた。それらの細胞を含むプレートを、1000rpmで5分間遠心し、37℃で1時間インキュベートした。インキュベーションの後、Brefeldin AおよびMonensinを各ウェルに加え、それらの細胞を37℃でさらに4時間インキュベートした。それらの細胞を回収し、洗浄し、蛍光色素に結合体化された抗ヒトMABで染色した。それらの細胞を洗浄し、フローサイトメトリーによって解析した。
CD107αのアップレギュレーションおよび細胞内IFN−γの産生。多発性骨髄腫(MM)細胞(McCAR、MM1S)、急性骨髄性白血病(AML)細胞(ML−2)またはT2細胞(上記)とともに共培養した後、CD107αのアップレギュレーションおよびIFN−γの産生を測定した(図27および30を参照のこと)。CD107α脱顆粒、およびIFN−γを産生するCD8CTLを、フローサイトメトリーによって、細胞表面マーカーおよび細胞内サイトカインの染色によって決定した。簡潔には、1×10個のキラー細胞(responder cell)(MP−CTL,コントロールT細胞)を、1×10個の刺激細胞(それぞれのペプチドでパルスされた、HLA−A2McCARまたはU266MM細胞株またはK562−A0201細胞)で刺激した。その培養物にCD107α mAbを加え、細胞を37℃、5%のCO恒温器に入れた。1時間のインキュベーションの後、CD28/CD49d mAb(BD)およびタンパク質輸送阻害剤Brefeldin A(BD)およびMonensin(BD)をその細胞培養物に加え、さらに5時間インキュベートした。ベースラインコントロールとして、MP−CTLを、CD28/CD49d mAb、Brefeldin AおよびMonensin単独を含む培地中で、さらなる刺激なしで培養した。インキュベーションの後、それらの細胞を回収し、洗浄し、表面をCD3−PacBlueおよびCD8−APC−H7、CCR7−PeCy7、CD45RO−PEおよび/またはCD69−PerCP抗ヒトmAbで30分間染色した。次いで、細胞を透過処理し、Cytofix/Cytoperm(BD)を使用して固定し、抗IFN−γ FITC mAbで45分間染色することにより、細胞内のサイトカイン産生を検出した。最後に、細胞をPerm/Wash溶液(BD)で洗浄し、2%パラホルムアルデヒド中で固定し、フローサイトメトリーによって取得した。
IL−2産生アッセイ。CD107α脱顆粒、およびIL−2を産生するCD3+CD8+CTLを、細胞表面マーカーおよび細胞内のサイトカイン染色によって、フローサイトメトリーで同定した。簡潔には、ペプチド特異的CTLまたはコントロールT細胞を、CD107a mAbの存在下において、特定の各刺激因子(stimulator)で刺激した。1時間のインキュベーションの後、CD28/CD49d mAb(BD)ならびにタンパク質輸送阻害剤Brefeldin AおよびMonensinをその培養物に加え、さらに5時間インキュベートした。ベースラインコントロールとして、そのCTLを、CD28/CD49d mAb、Brefeldin AおよびMonensin単独を含む培地中で培養した。インキュベーションの後、細胞をCD3−PacBlueおよびCD8−APC−H7抗ヒトmAbで染色し、続いて固定/透過処理を行い、抗IL−2 APC抗ヒトmAbで染色することにより、細胞内のサイトカイン産生を検出した。染色の後、細胞をPerm/Wash溶液で3回洗浄し、2%パラホルムアルデヒド中で固定し、フローサイトメトリーによって解析した。
統計解析。結果は、平均値±SEとして表される。独立スチューデントのt検定を用いて、群を比較した。p<0.05の場合、差を有意であると見なした。
実施例2:XBP1非スプライシング型、XBP1スプライシング型、CD138およびCS1に特異的なペプチドのマルチペプチド(MP)カクテルは、高いHLA−A2結合親和性および安定性を示す。
4つの免疫原性ペプチド、ヘテロクリティックXBP1 US185−193(YISPWILAV,配列番号6)、ヘテロクリティックXBP1 SP368−376(YLFPQLISV,配列番号10)、天然のCD138260−268(GLVGLIFAV,配列番号1)および天然のCS1239−247(SLFVLGLFL,配列番号1)(表1)は、免疫応答を誘導すると個別に証明されている。ここでは、本発明者らは、それらをMPカクテルとして評価した。そのMPカクテルのHLA−A2特異的結合および安定性を、フローサイトメトリーによってT2細胞上のHLA−A2分子のアップレギュレーションを測定することによって評価した(27)。ペプチド結合アッセイは、用量依存的様式(0〜50μg/ml)でT2細胞上のHLA−A2の平均蛍光強度(MFI)の上昇を示し、25μg/mlの総ペプチド濃度においてプラトーに達し(6.25μg/ペプチド/ml;MFI:10,787.33±2,371.71)、これは、最も高い総ペプチド濃度,50μg/ml(MFI:10,889.33±2,888.48)と類似だった(図1a)。ゆえに、25μg/mlというMP濃度(6.25μg/ペプチド/ml)を、HLA−A2結合安定性の評価のために選択した。
ペプチド結合安定性アッセイでは、T2細胞を、25μg/mlの上記MPカクテルで一晩パルスし、洗浄して、未結合のペプチドを除去し、次いで、Brefeldin A(BFA)で処置することにより、新しく合成されるHLA−A2分子の細胞表面発現をブロックした。次いで、T2細胞を、BFA処置の0、2、4、6または14時間後に、HLA−A2 MFIについて評価した。フローサイトメトリー解析は、MPカクテルの安定性が、BFA処置の6時間後まで高度に維持されることを証明した(MFI:0時間後=9,726.00±1,373.24、2時間後=9,132.33±1,435.51、4時間後:9,125.33±1,130.62、6時間後:8,818.67±413.50)(図1b)。BFA処置の14時間後、MPカクテルのHLA−A2特異的親和性は、より低くなったが、コントロールインフルエンザウイルスマトリックスタンパク質(IVMP)58−66ペプチドの親和性(MFI:4,921.33±1,428.16)よりも高かった(MFI:6,793.67±1,617.01)。これらの結果に基づいて、本発明者らは、MPカクテルの高レベルのHLA−A2特異的親和性および安定性を確認し、そのカクテルを、免疫原性およびMM特異的CTLを誘導する能力についてさらに評価することを進めた。
Figure 0006374392


実施例3:マルチペプチド特異的CTLは、特定のT細胞サブタイプである異なる表現型を示す
上記MPカクテル(25μg/ml合計;6.25μg/ml/ペプチド)でパルスされたAPCで毎週、HLA−A2正常ドナーのT細胞を刺激することによって、MP−CTLを生成した。4回目の刺激の1週間後、得られたMP−CTLを、表現型および機能活性について評価した。フローサイトメトリー解析は、そのMP−CTLが、コントロールT細胞培養物(ドナー1:25%、ドナー2:25%;図2)と比べて、より高い割合のCD3CD8T細胞(ドナー1:86%、ドナー2:74%)を含むことを示した。本発明者らは、MP−CTL内のCD3CD8T細胞サブセットにおいて異なる表現型の変化も観察した。エフェクターメモリーT細胞(EM:CD45ROCCR7/CD3CD8)の頻度は、ナイーブT細胞(CD45ROCCR7/CD3CD8)の対応する減少(ドナー1:コントロール74% 対 MP−CTL 8%、ドナー2:コントロール60% 対 MP−CTL 6%)と関連して、上昇した(ドナー1:コントロール5% 対 MP−CTL 44%、ドナー2:コントロール4% 対 MP−CTL 35%)。さらに、本発明者らは、コントロールT細胞培養物と比べて、MP−CTL内の活性化されたCD69/CD3CD8T細胞の頻度の上昇を観察した(ドナー1:コントロール3% 対 MP−CTL 39%、ドナー2:コントロール5% 対 MP−CTL 13%;図2)。したがって、これらの結果は、XBP1、CD138またはCS1に特異的なMPカクテルによるCD3T細胞の反復刺激が、異なる表現型の変化および抗原特異的CTLに特徴的なCD3/CD8T細胞サブセットの拡大をもたらすことを証明する。
実施例4:マルチペプチド特異的CTLは、HLA−A2MM細胞に応答してIFN−γを産生する高い割合のCD8CTLを含む。
MP−CTLを、HLA−A2MM細胞株で刺激したときに、細胞内IFN−γを産生する能力についてフローサイトメトリーによって解析した。MP−CTL内の、EM(CD45ROCCR7)と活性化された(CD69)CD3CD8T細胞の両方が、HLA−A2MM細胞株に応答してIFN−γを産生した(図3)。IFN−γ産生細胞の頻度は、McCAR細胞[ドナー1:コントロール 対 MP−CTL−0% 対 4.7%EM細胞、0.8% 対 6.1%活性化された細胞;ドナー2:0.2% 対 2.7%EM細胞、1% 対 3.9%活性化された細胞]またはU266細胞[ドナー1:コントロール 対 MP−CTL−0% 対 8%EM細胞、0% 対 11.2%活性化された細胞;ドナー2:0.4% 対 2.9%EM細胞、1.3% 対 3.0%活性化された細胞]のいずれかでの刺激において上昇した。MP−CTL内のナイーブ(CD45ROCCR7)CD3CD8T細胞は、MM細胞株で刺激したとき、最低レベルのIFN−γ産生を示した(データ示さず)。
実施例5:マルチペプチド特異的CTLは、HLA−A2MM細胞に応答して細胞増殖を示す。
MP−CTLの機能を、CFSE増殖アッセイを用いて解析した。MP−CTLの増殖を、HLA−A2MM初代細胞または細胞株での刺激の後の、CFSEで標識されたMP−CTL(Q1ゲート細胞(gated cell))の蛍光の減少として5日目に測定した(図4)。MP−CTLは、異なる3人のHLA−A2MM患者から得られたCD138初代細胞に応答して高レベルの細胞増殖を示した(細胞の増殖:33%、29%または41%)。さらに、MP−CTLは、McCAR(細胞の増殖:57%)およびU266(細胞の増殖:49%)を含むHLA−A2MM細胞株に応答して高レベルの細胞増殖を示した。培地単独において培養されたMP−CTLは、低レベル(5%)の増殖を示した。まとめると、これらのデータは、HLA−A2初代MM細胞またはMM細胞株のいずれかで刺激したときに増殖する能力によってMP−CTLの機能活性を証明する。
実施例6:マルチペプチド特異的CTLは、HLA−A2MM細胞の特異的な溶解を誘導する。
本発明者らは、4時間のカルセイン放出アッセイを用いて、MP−CTLの細胞傷害活性を評価した。異なるHLA−A2ドナーのCD3T細胞から生成されたMP−CTLを、HLA−A2MM初代細胞または細胞株に対する細胞傷害活性について評価した(図5)。HLA−A2初代MM細胞は、MP−CTLによって効果的に溶解された([ドナーA MP−CTL;患者#1:6〜29%,患者#2:0〜49%]、[ドナーB MP−CTL;患者#1:0〜17%、患者#2:0〜15%)。さらに、MP−CTLは、様々なエフェクター:標的細胞比において、U266細胞(ドナーA MP−CTL:0〜85%、ドナーB MP−CTL:2〜44%)およびMcCAR細胞(ドナーA MP−CTL:0〜13%、ドナーB MP−CTL:0〜79%:)に対して高レベルの細胞傷害活性を示した。MP−CTLと比べて、同じドナー由来のコントロールCD3T細胞は、HLA−A2MM初代細胞または細胞株に対して有意に低いレベルの細胞傷害性を示した。さらに、MP−CTLは、HLA−A2乳がん細胞株(MCF−7)、HLA−A2MM細胞株(MM1S)または異なる3人のMM患者由来のHLA−A2初代細胞を含む、抗原不適合またはMHC不適合の腫瘍細胞を溶解しなかった(データ示さず)。まとめると、これらのデータは、HLA−A2によって拘束され、かつ抗原特異的である、MP−CTLの細胞傷害活性を裏付ける。
実施例7:マルチペプチド特異的CTLは、関連する各ペプチドに対して個別の免疫応答を発生させる
MP−CTLを、ヘテロクリティックXBP1 US185−193(YISPWILAV)(配列番号6)、ヘテロクリティックXBP1 SP368−376(YLFPQLISV)(配列番号10)、天然のCD138260−268(GLVGLIFAV)(配列番号12)および天然のCS1239−247(SLFVLGLFL)(配列番号16)を含む関連する各ペプチドに応答して、脱顆粒する能力(CD107α発現)および細胞内IFN−γを産生する能力について解析した。それらの解析は、それぞれのペプチドでパルスされたK562−A0201細胞に対する特異的なMP−CTL応答を測定することによって、行われた。コントロールとして、本発明者らは、ペプチドなしでパルスされたK562−A0201細胞、または無関係のHLA−A2特異的CMV pp65(NLVPMVATV)(配列番号28)ペプチドでパルスされたK562−A0201細胞を使用した。図6aは、ドナーAのMP−CTLからのペプチド特異的な応答の代表的なフローサイトメトリー解析を示している。そのMP−CTLは、XBP1 US(2.7%)、CD138(1.7%)およびCS1(12.5%)ペプチドに応答して、高い割合のCD107αIFNγ/CD3CD8T細胞(ゲートQ2)を示したが、XBP1 SP(0.2%)ペプチドには応答しなかった。無関係のCMV pp65ペプチド(0.2%)またはペプチドなし(0.2%)のコントロールに対して応答は観察されなかった。さらなる解析を、3人のさらなるHLA−A2ドナー(ドナーB、ドナーC、ドナーD)から生成されたMP−CTLを用いて、各個別のペプチドを提示しているK562−A0201細胞に応答したCD107α脱顆粒またはIFN−γ産生について行った(図6b)。特異的な応答が、これらの各ドナーから生成されたMP−CTLにおいて、関連するすべてのペプチドに対して検出されたが、無関係のCMV pp65ペプチドに対しては検出されなかった。しかしながら、異なる個体から生成されたCTLの間で、関連する各ペプチドに対する脱顆粒およびIFN−γ産生における特異的な応答のレベルにばらつきが検出された。ゆえに、これらの研究は、XBP1 US、XBP1 SP、CD138およびCS1エピトープを含むMPカクテルが、MM細胞上の複数の抗原を標的化することができる特異的なCTLによってそれぞれのペプチドに対する応答を誘導し得ることを示す。
実施例8:がん細胞株におけるXBP1の発現。
様々ながん細胞株を、非スプライシング型およびスプライシング型XBP1抗原の発現についてフローサイトメトリーによって解析した。関連する発現レベルは、プラス記号またはマイナス記号で示され、また、プラス記号の数を示す数字も示されている(図7)。
実施例9:HLA−A2+乳がん細胞に応答したXBP1−CTLの増殖。
乳がん細胞株からの刺激細胞に応答したXBP1−CTLの増殖を、CFSE増殖アッセイを用いて解析した。XBP1−CTLの増殖を、HLA−A2乳がん細胞株MCF−7、HLA−A2乳がん細胞株BT434、HLA−A2前立腺がん細胞株LnCap、HLA−A2前立腺がん細胞株VCapおよびNK感受性CML K562または細胞なしでの刺激の後のCFSEで標識されたMP−CTL(P3ゲート細胞)の蛍光の減少として6および7日目に測定した。XBP1−CTLは、6日目(図8a)および7日目(図8b)に、HLA−A2乳がん細胞に応答して高レベルの細胞増殖を示したが、コントロールとして働いた他のがん細胞株に対しては細胞増殖を示さなかった。
実施例10:HLA−A2+乳がん細胞に応答したXBP1−CTLのIFN−γ産生および細胞活性化。
XBP1−CTLを、乳がん細胞株(MB231、MCF−7、BT434)および前立腺がん細胞株(LnCAP、VCap)に応答したCD8+T細胞におけるIFN−γ発現およびCD69アップレギュレーションについてフローサイトメトリーによって解析した。XBP1−CTLのIFN−γ発現および活性化(CD69)は、MB231およびMCF−7を含むHLA−A2+乳がん細胞で刺激されると増加したが、コントロールとして働いた他のがん細胞株で刺激されても増加しなかった(図9)。
実施例11:HLA−A2+乳がん細胞株に応答したXBP1−CTLの脱顆粒(CD107α)。
XBP1−CTLを、乳がん細胞株(MB231、MCF−7、BT434)および前立腺がん細胞株(LnCAP、VCap)に応答して脱顆粒する能力について解析した。CD107αのアップレギュレーションを、フローサイトメトリーによって、ゲーティングされたCD8T細胞における細胞傷害活性の尺度として解析した。有意なレベルの脱顆粒(CD107αのアップレギュレーション)が、MB231およびMCF−7を含むHLA−A2+乳がん細胞に応答して検出されたが、コントロールとして働いた他のがん細胞株に応答して検出されることはなかった(図10)。
実施例12:HLA−A2+膵がんおよび結腸がん細胞株に応答したXBP1−CTLの増殖。
膵がんおよび結腸がん細胞株に応答したXBP1−CTLの増殖を、CFSEベースのアッセイを用いて行った。XBP1−CTLの増殖を、HLA−A2前立腺がん細胞株(LnCap)、HLA−A2膵がん細胞株(8902)、HLA−A2膵がん細胞株(MiaPaca)、HLA−A2結腸がん細胞株(LS180)およびHLA−A2結腸がん細胞株(WiDr)または細胞なしのコントロールでの刺激の後のCFSEで標識されたXBP1−CTLの蛍光の減少として6日目に測定した。XBP1−CTLは、HLA−A2膵臓細胞株8902およびHLA−A2結腸がん細胞株LS180に応答して、より高いレベルの細胞増殖を示した(図11)。
実施例13:HLA−A2+膵がんおよび結腸がん細胞株に応答した、XBP1−CTLのIFN−γ産生および脱顆粒。
XBP1−CTLを、膵がんまたは結腸がん細胞株に応答して脱顆粒する能力およびIFN−γを産生する能力について解析した。XBP1−CTLを、HLA−A2+膵がん細胞株(Pan1およびPL45)、HLA−A2−膵がん細胞株(MiaPaca)、HLA−A2+結腸がん細胞株(LS180およびSW480)、HLA−A2−前立腺がん細胞株(WiDr)または細胞なしのコントロールとともにインキュベートした。CD107αおよびIFN−γ産生を、フローサイトメトリーによって解析した。XBP1−CTLによるCD107αアップレギュレーションおよびIFN−γ産生は、HLA−A2+膵がん細胞およびHLA−A2+結腸がん細胞で刺激されると増加したが、他のコントロールがん細胞で刺激されても増加せず、抗原特異的様式およびHLA−A2に拘束された様式での応答を示した(図12)。
さらに、下に示されるようなcanEvolve(http://www.canevolve.org/AnalysisResults/AnalysisResults.html)およびOncomine(http://www.webcitation.org/getfile?fileid=bcbe297e4085b19933cca759a88e0e2b9fac3b1e)公的データベースを検索することによって示されるように、健常ドナー由来の細胞と比べて、有意に高いレベルのXBP1遺伝子発現が、乳がん患者または結腸がん患者由来の原発腫瘍細胞において見られた。
Figure 0006374392
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実施例14:がん細胞株におけるCD138およびCS1の発現。
様々ながん細胞株を、フローサイトメトリーによって、CD138およびCS1抗原の発現について解析した。様々ながん細胞株に対する相対的なCD138およびCS−1の発現レベルは、プラス記号またはマイナス記号で示され、また、CD138(図13)およびCS1(図14)の発現レベルを示す数字も示されている。
実施例15:XBP1/CD138/CS1ペプチドでの刺激によるくすぶり型多発性骨髄腫患者由来のT細胞におけるCD8+CTLのパーセンテージ。
4人のHLA−A2+くすぶり型多発性骨髄腫患者から得られたT細胞から生成されたマルチペプチド特異的CTL(MP−CTL)を、フローサイトメトリーによって特定のT細胞について解析した。各患者のT細胞から生成されたMP−CTLは、高いパーセンテージのCD3+CD8+CTLおよび低いパーセンテージのCD3+CD4+Th細胞を示す(図15)。
実施例16:くすぶり型多発性骨髄腫患者由来のMP−CTLの増殖。
様々なMM細胞株に応答した、2人のくすぶり型多発性骨髄腫患者から生成されたMP−CTLの増殖を、CFSEベースのアッセイを用いて解析した。細胞増殖を、HLA−A2細胞株(McCAR)、HLA−A2細胞株(MM1S、RPMI)、NK感受性細胞株(K562)での刺激におけるまたは刺激なしでの、CFSEで標識されたMP−CTL(P3ゲート)の蛍光の減少として5、6および7日目に測定した。両方のSMM患者のT細胞から生成されたMP−CTLは、HLA−A2多発性骨髄腫細胞株McCARに応答して高レベルの細胞増殖を示したが、HLA−A2−細胞株に対してもNK感受性細胞株に対しても高レベルの細胞増殖を示さなかったことから、多発性骨髄腫細胞に対する、HLA−A2に拘束されたMP−CTL活性が証明される(図16a、b)。
実施例17:くすぶり型多発性骨髄腫患者から生成されたMP−CTLによるIFN−γの産生。
様々なMM細胞株に応答した、4人のくすぶり型多発性骨髄腫患者から生成されたMP−CTLのIFN−γ産生を解析した。その産生を、HLA−A2+細胞株(McCAR、U266)、HLA−A2−細胞株(MM1S、RPMI)、NK感受性細胞株(K562)での刺激の後またはいかなる刺激なしで、フローサイトメトリーによって解析した。4人すべての患者から生成されたMP−CTLが、HLA−A2多発性骨髄腫細胞株で刺激したとき、HLA−A2に拘束された様式で、IFN−γ産生の増加を示した(図17a、b)。
実施例18:骨髄腫細胞株に対する、くすぶり型多発性骨髄腫患者から生成されたMP−CTLの脱顆粒(CD107α)。
4人のくすぶり型多発性骨髄腫患者から生成されたMP−CTLを、様々なHLA−A2+およびHLA−A2−がん細胞株に応答した細胞傷害活性の尺度として、脱顆粒について解析した。それらの解析は、U266、McCAR、MM1S、RPMI、K562細胞または刺激細胞なしに対するMP−CTL特異的応答を測定することによって行われた。CD107αのアップレギュレーションを、フローサイトメトリーによって、ゲーティングされたCD8+T細胞において解析した。SMM患者から生成されたMP−CTLは、HLA−A2+MM細胞株であるU266およびMcCARに応答して高いレベルのCD107α脱顆粒を示した(図18a)。多発性骨髄腫細胞に対する、HLA−A2に拘束された脱顆粒応答が、4人のSMM患者から生成されたMP−CTLを用いて確認された(図18b)。
実施例19:くすぶり型多発性骨髄腫患者から生成されたMP−CTLからのCD3+CD8+CD137+サブセットの中のIFN−γ+CD107α+二重陽性細胞のパーセンテージ。
くすぶり型多発性骨髄腫患者から生成されたMP−CTLのCD3+CD8+CD137+サブセットを、個々のペプチドを提示するK562−A2細胞に応答した、脱顆粒する能力(CD107α発現)およびIFN−γ産生について解析した。CD107αおよび/またはIFN−γの発現を、フローサイトメトリーを用いて、CD3+CD8+CD137+サブセット内で解析した。3人のSMM患者から生成されたMP−CTLは、高いレベルのペプチド特異的なIFN−γ産生および/またはCD107α脱顆粒を示した(図19a〜d)。
実施例20:くすぶり型多発性骨髄腫患者から生成されたMP−CTLの表現型の特徴づけ。
合計4つのマルチペプチドでの刺激によって生成されたMP−CTLを、ナイーブ(native)、セントラルメモリー(CM)、エフェクターメモリー(EM)およびターミナルエフェクター(TE)CD8+Tサブセットについて、フローサイトメトリーによって解析した。4人のSMM患者から生成されたMP−CTLは、高いパーセンテージのEMおよびTE CD8細胞を示す(図20a)。SMM患者#2およびSMM患者#4由来のMP−CTLに、さらなる3回のマルチペプチド刺激(合計7サイクルの刺激)を与え、それらをフローサイトメトリーによって解析した。さらなる3サイクルのMP刺激は、EMサブセットのさらなる拡大をもたらした(サイクル4 対 サイクル7)(図20b)。さらなる実験において、3人のSMM患者から生成されたMP−CTLからのEMおよびTEサブセットを、様々ながん細胞株に応答したIFN−γ産生およびCD107αアップレギュレーションについて評価した。TEと比べて、3人すべての患者由来のMP−CTL内のEM細胞が、HLA−A2+MM細胞株McCARに応答して、より高いパーセンテージのIFN−γ+CD107α+二重陽性細胞を示す(図20c)。さらに、ナイーブ(CD45ROCCR7)CD8T細胞と比べて、4人のくすぶり型多発性骨髄腫患者から生成されたMP−CTL内のメモリー(CD45RO)タイプのCD8T細胞は、HLA−A2多発性骨髄腫細胞株U266に対してCD69活性化マーカーのより高い発現を示したことから、メモリーサブセットによるMP−CTLのより高い抗腫瘍活性が裏付けられた(図20d)。
実施例21.非スプライシング型XBP1、スプライシング型XBP1、CD138およびCS1由来のペプチドは、高親和性でHLA−A24に結合する。
非スプライシング型またはスプライシング型XBP1タンパク質(上記を参照のこと)の全長配列を、検索ソフトウェアSYFPEITHI(MHCリガンドおよびペプチドモチーフのデータベース,Institute for Cell Biology,Department of lmmunology,Heidlberg)を用いて解析して、HLA−A24に特異的なペプチドを予測した後、BIMASプログラムを用いて解析して、長い半減期解離速度を有するペプチドを選択した。非スプライシング型XBP1由来の以下のペプチドを、潜在的なHLA−A24結合ペプチドとして選択した:ペプチド1(配列番号33)、ペプチド2(配列番号5)、ペプチド3(配列番号34)、ペプチド4(配列番号35)、ペプチド5(配列番号36)、ペプチド6(配列番号37)およびペプチド7(配列番号29)。スプライシング型XBP1由来の以下のペプチドを、潜在的なHLA−A24結合ペプチドとして選択した:ペプチド1(配列番号30)、ペプチド2(配列番号38)、ペプチド3(配列番号39)およびペプチド4(配列番号5)。CD138由来の以下のペプチドを、潜在的なHLA−A24結合ペプチドとして選択した:ペプチド1(配列番号31)、ペプチド2(配列番号40)、ペプチド3(配列番号41)、ペプチド4(配列番号42)、ペプチド5(配列番号43)、ペプチド6(配列番号44)およびペプチド7(配列番号45)。CS1由来の以下のペプチドを、潜在的なHLA−A24結合ペプチドとして選択した:ペプチド1(配列番号46)、ペプチド2(配列番号47)、ペプチド3(配列番号48)、ペプチド4(配列番号49)、ペプチド5(配列番号32)およびペプチド6(配列番号50)。これらの天然XBP1ペプチド、およびHLA−A24結合ペプチドであると知られているHIVエンベロープタンパク質583−591(配列番号537)のHLA−A24親和性を、T2ペプチド結合アッセイを用いて、1mg/mlのペプチド濃度において評価した。それらのペプチドの特異的な親和性を、HLA−A24へのペプチド結合後のT2細胞に対するHLA−A24アップレギュレーションの関数である、HLA−A24−平均蛍光強度(MFI)として評価した。試験されたペプチドのうち、以下のペプチドが、HLA−A24に対して、HIVエンベロープタンパク質583−591(配列番号537)の結合親和性に匹敵するかまたはそれより高い結合親和性を示した:非スプライシング型XBP1由来のペプチド4および7、スプライシング型XBP1由来のペプチド1、CD138由来のペプチド1、3および4、ならびにCS1由来のペプチド3および5(図21)。次いで、それらの高親和性ペプチドのHLA−A24親和性を、より低いペプチド濃度を使用して、T2ペプチド結合アッセイにおいて解析した(図22〜24)。これらのデータに基づいて、各タンパク質由来の1つのペプチドを含む以下の4つのペプチドを、さらなる調査のために選択した:非スプライシング型XBP1由来のペプチド7(XBP1186−194,配列:ISPWILAVL,配列番号29)、スプライシング型XBP1由来のペプチド1(SP XBP1224−232,配列:VYPEGPSSL,配列番号30)、CD138由来のペプチド3(CD138265−273,配列:IFAVCLVGF,配列番号31)およびCS1由来のペプチド5(CS1240−248,配列:LFVLGLFLW,配列番号32)。
実施例22:XBP1、CD138およびCS1ペプチドでの刺激による2人のドナー由来のT細胞におけるCD8+CTLのパーセンテージ
2人のドナー患者由来のCTLを、フローサイトメトリーによって特定のT細胞について解析した。各患者のT細胞から生成されたペプチド特異的CTLは、高いパーセンテージのCD8+CTLを示す(図26)。
実施例23:HLA−A24+多発性骨髄腫細胞に応答したペプチド特異的CTLのIFN−γ産生および細胞活性化
ペプチド特異的CTLを、HLA−A24+(KMS)およびHLA−A24−(OMP1およびU266)多発性骨髄腫細胞株に応答したIFN−γおよびCD8の発現について、フローサイトメトリーによって解析した。ペプチド特異的CTLのIFN−γ発現は、HLA−A24+で刺激されると増加したが、HLA−A24−多発性骨髄腫細胞で刺激されても増加しなかった(図28および29)。
実施例24:HLA−A24+多発性骨髄腫細胞株に応答したペプチド特異的CTLのIFN−γ産生および脱顆粒
ペプチド特異的CTLを、多発性骨髄腫細胞株に応答して脱顆粒する能力およびIFN−γを産生する能力について解析した。ペプチド特異的CTLを、HLA−A24+(KMS11)およびHLA−A24−(OMP1)多発性骨髄腫細胞株とともにインキュベートした。CD107αおよびIFN−γ産生をフローサイトメトリーによって解析した。ペプチド特異的CTLによるCD107αのアップレギュレーションおよびIFN−γの産生は、HLA−A24+多発性骨髄腫細胞での刺激によって増加したが、HLA−A24−多発性骨髄腫細胞での刺激では増加しなかった(図31)。
実施例25:HLA−A24+多発性骨髄腫細胞に応答したペプチド特異的CTLの増殖。
多発性骨髄腫細胞からの刺激に応答したペプチド特異的CTLの増殖を、CFSE増殖アッセイを用いて解析した。ペプチド特異的CTLの増殖を、HLA−A24多発性骨髄腫細胞株KMS11もしくはHLA−A24多発性骨髄腫細胞株OMP1での刺激のいずれかの後または刺激なしでの、CFSEで標識されたMP−CTL(P3ゲート細胞)の蛍光の減少として6および8日目に測定した。そのペプチド特異的CTLは、6日目(図33a)および8日目(図33b)に、HLA−A24多発性骨髄腫細胞に応答して高レベルの細胞増殖を示したが、HLA−A24多発性骨髄腫細胞に応答して、高レベルの細胞増殖を示すことはなかった。
実施例26:HLA−A24+多発性骨髄腫細胞に応答したペプチド特異的CTLによるIL−2産生。
多発性骨髄腫細胞からの刺激に応答したペプチド特異的CTLによるIL−2産生を、フローサイトメトリーによって解析した。ペプチド特異的CTLの増殖によるIL−2産生を、HLA−A24多発性骨髄腫細胞株KMS11もしくはHLA−A24多発性骨髄腫細胞株OMP1およびU266での刺激のいずれかの後にまたは刺激なしで、測定した。そのペプチド特異的CTLは、HLA−A24多発性骨髄腫細胞に応答して高レベルのIL−2産生を示したが、HLA−A24多発性骨髄腫細胞に応答して、高レベルのIL−2産生を示すことはなかった(図34)。
実施例27:HLA−A24+結腸がん細胞に応答したペプチド特異的CTLのIFN−γ産生および細胞活性化。
2人のドナー由来のペプチド特異的CTLを、HLA−A24+結腸がん細胞株(SW480)およびHLA−A24−結腸がん細胞株(WiDrおよびLS180)に応答したIFN−γおよびCD8の発現についてフローサイトメトリーによって解析した。CD8およびIFN−γの発現を、フローサイトメトリーによって解析した。ペプチド特異的CTLのIFN−γの発現は、HLA−A24+で刺激されると増加したが、HLA−A24−結腸がん細胞で刺激されても増加しなかった(図35および37)。
実施例28:HLA−A24+結腸がん細胞に応答したペプチド特異的CTLのIFN−γ産生および脱顆粒。
ペプチド特異的CTLを、HLA−A24+結腸がん細胞株(SW480)およびHLA−A24−結腸がん細胞株(WiDrおよびLS180)に応答して脱顆粒する能力およびIFN−γを産生する能力について解析した。CD107αおよびIFN−γ産生を、フローサイトメトリーによって解析した。ペプチド特異的CTLによるCD107αのアップレギュレーションおよびIFN−γの産生は、HLA−A24+の刺激によって増加したが、HLA−A24−結腸がん細胞で刺激されても増加しなかった(図36および38)。
実施例29:様々な量のHLA−A24+結腸がん細胞に応答したCD138−CTLにおける脱顆粒ならびにIFN−γおよびIL−2の産生。
CD138−CTLを、CTLと腫瘍細胞の5:1、1:1および1:5という比においてHLA−A24+結腸がん細胞(SW480)およびHLA−A24−結腸がん細胞(LS180)に応答して脱顆粒する能力ならびにIFN−γおよびIL−2を産生する能力について解析した。脱顆粒、IFN−γ産生およびIL−2産生は、HLA−A24+結腸がん細胞で刺激されると、腫瘍細胞に対するより高い割合のCTLにおいて実質的な増加を示した(図39a)が、HLA−A24−結腸がん細胞で刺激されても増加を示さなかった(図39b)。
実施例30:HLA−A24+結腸がん細胞および多発性骨髄腫細胞に応答したHLA−A24特異的CD138ペプチド特異的CTLの細胞活性化、IFN−γ産生および脱顆粒。
2人のドナー由来のペプチド特異的CTLを、HLA−A24+結腸がん細胞株(SW480)および多発性骨髄腫細胞株(KMS11)に応答したCD8発現、脱顆粒およびIFN−γ産生について解析した。両方のドナー由来のスプライシング型XBP1−CTLおよびCD138−CTLが、結腸がん細胞に応答して高い活性化、IFN−γ産生および脱顆粒を示した(図40および41)。ドナーA由来の非スプライシング型XBP1−CTLは、結腸がん細胞に応答して高い活性化、IFN−γ産生および脱顆粒を示したのに対し、これらの効果は、ドナーB由来の非スプライシング型XBP1−CTLにおける多発性骨髄腫細胞に対する応答において、より強かった(図40および41)。
実施例31:HLA−A24+膵がん細胞に応答したペプチド特異的CD138−CTLのIFN−γ産生および細胞活性化。
ドナーB由来のペプチド特異的CTLを、HLA−A24+結腸がん細胞株(8902およびPL45)およびHLA−A24−結腸がん細胞株(MiaPaca)に応答したIFN−γおよびCD8の発現についてフローサイトメトリーによって解析した。CD8およびIFN−γの発現を、フローサイトメトリーによって解析した。ペプチド特異的CTLのIFN−γ発現は、HLA−A24+膵がん細胞で刺激されると増加したが、HLA−A24−膵がん細胞で刺激されても増加しなかった(図42)。
実施例32:様々な量のHLA−A24+膵がん細胞に応答したCD138−CTLにおける脱顆粒ならびにIFN−γおよびIL−2の産生。
CD138−CTLを、CTLと腫瘍細胞の1:1および1:5という比においてHLA−A24+(Panc1)膵がん細胞に応答して脱顆粒する能力ならびにIFN−γおよびIL−2を産生する能力について解析した。脱顆粒、IFN−γ産生およびIL−2産生は、CTLと腫瘍細胞の1:1という比においてより高かった(図43)。
実施例33:非スプライシング型ヘテロクリティックXBP1184−192(YISPWILAV)(配列番号6)およびスプライシング型ヘテロクリティックXBP1 SP196−204(YLFPQLISV)(配列番号10)ペプチドによる、機能的に活性なメモリー細胞の誘導。
非スプライシング型ヘテロクリティックXBP1184−192(YISPWILAV)(配列番号6)およびスプライシング型ヘテロクリティックXBP1 SP196−204(YLFPQLISV)(配列番号10)ペプチドのカクテルで誘導された細胞傷害性Tリンパ球(CTL)は、腫瘍細胞上の特異的なXBP1抗原を認識して標的化し得る、セントラルメモリー(CM)CD8T細胞とエフェクターメモリー(EM)CD8T細胞の両方を含む(図44、45および46)。XBP1ペプチド特異的CTL(XBP1−CTL)は、乳がん細胞株(MB231;図47)、結腸がん細胞株(LS180;図48)または膵がん細胞株(Panc1;図49)に応答して、メモリーCTLサブセット内の高レベルの細胞増殖を示す。全体的に見て、エフェクターメモリーCTLは、種々の腫瘍細胞株に応答して、セントラルメモリーCTL(図47、48および49)と比べてより高いレベルの細胞増殖を有した。対照的に、セントラルメモリーCTLは、HLA−A2乳がん細胞株(MB231、MCF7)、結腸がん細胞株(LS180、SW480)および膵がん細胞株(Panc1、PL45)に応答して、エフェクターメモリーCTLと比べてより高いレベルのIFN−γ産生、IL−2産生および細胞傷害活性を誘導した(図50、51、52、53、54、55)。T−betおよびEomesは、エフェクターおよびメモリーT細胞に見られる重要な転写制御因子であり、抗腫瘍活性に関する役割を有する。XBP1−CTLメモリー細胞は、T−bet(図56、57、58)とEomes(図62、63、64)の両方の高レベルの発現を示した。乳がん株、結腸がん株および膵がん株に応答して、T−bet(図59、60、61)およびEome(図65、66、67)細胞は、高レベルのIFN−γ産生を示す。XBP1−CTL内のメモリー細胞を、乳がん株、結腸がん株および膵がん株に対するグランザイムBのアップレギュレーション(抗腫瘍細胞傷害活性の指標)について評価した。非メモリー細胞と比べて、メモリー細胞は、より高いレベルのグランザイムのアップレギュレーションを示した(図68)。さらに、グランザイムXPB1−CTLは、乳がん細胞、結腸がん細胞または膵がん細胞に応答してIFN−γも産生した(図69、70、71)。ゆえに、非スプライシング型ヘテロクリティックXBP1184−192(YISPWILAV)(配列番号6)およびスプライシング型ヘテロクリティックXBP1 SP196−204(YLFPQLISV)(配列番号10)ペプチドのカクテルで誘導されたCTLは、セントラルメモリーCD8T細胞とエフェクターメモリーCD8T細胞の両方を含み、そのXBP1−CTLのメモリー細胞は、乳がん、結腸がんおよび膵がん細胞に対して抗腫瘍活性を示した。
実施例34:レナリドマイド処置は、XBP1−CTL内のメモリー細胞サブセットの総数および機能を増加させる。
XBP1ペプチド特異的CTL内のメモリーCD8+T細胞の数は、レナリドマイドでの処置(5μMで5日間)の後に増加する(図72)。この観察結果は、XBP1−CTL内の非メモリーCD8T細胞の全体の減少に対応する。セントラルメモリーCD8T細胞またはセントラルメモリーCD3CD8T細胞の頻度のそれぞれ一貫した増加またはいくらかの増加は、レナリドマイドでの処置後に検出される(図73)。さらに、T細胞活性化および他の免疫学的機能に対する重要なマーカー(すなわち、CD40L、CD69、CD38)が、レナリドマイドで処置されるとXBP1−CTL上で増加する(図74)。XBP1−CTLの、全CD3CD8T細胞、セントラルメモリーCD3CD8T細胞およびエフェクターメモリーCD3CD8T細胞が、レナリドマイドでの処置によって、乳がん細胞(MB231;図75、76)、膵がん細胞(Panc1;図77、78)または結腸がん細胞(SW480;図79、80)に応答した、高いレベルのT−bet発現/IFN−γ産生およびEomes発現/IFN−g産生を示す。レナリドマイドで処置されたメモリーXBP1−CTLは、XBP1 CTL単独と比べて、乳がん細胞(MB231;図81)、膵がん細胞(Panc1;図82)または結腸がん細胞(SW480;図83)に対して多機能性の免疫応答(細胞傷害性およびIFN−γ産生)を増加させた。ゆえに、これらの結果は、非スプライシング型ヘテロクリティックXBP1184−192(YISPWILAV)(配列番号6)およびスプライシング型ヘテロクリティックXBP1 SP196−204(YLFPQLISV)(配列番号10)ペプチドのカクテルで誘導されたCTLの抗活性が、レナリドマイドによるCTLの処置によって増強されたという証拠を提供する。

他の実施形態
本発明は、その詳細な説明と併せて記載されてきたが、前述の説明は、本発明の範囲を例証することを意図しており、限定することを意図するものではなく、本発明の範囲は、添付の特許請求の範囲によって定義される。他の態様、利点および改変は、以下の特許請求の範囲の範囲内である。

Claims (17)

  1. 配列番号6のアミノ酸配列を含む、35アミノ酸長以下の非スプライシング型XBP1ペプチド、
    配列番号10のアミノ酸配列を含む、35アミノ酸長以下のスプライシング型XBP1ペプチド、および
    配列番号12のアミノ酸配列を含む、35アミノ酸長以下のCD138ペプチド
    を含む組成物であって、トリプルネガティブ乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がんもしくは白血病を有する被験体において免疫応答を誘導すること、および/または被験体におけるトリプルネガティブ乳がん、結腸がん、膵がん、前立腺がんもしくは白血病を処置することにおいて使用するための組成物。
  2. 配列番号16のアミノ酸配列を含む、35アミノ酸長以下のCS−1ペプチドをさらに含む、請求項1に記載の組成物。
  3. 前記非スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号6のアミノ酸配列からなり、
    前記スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号10のアミノ酸配列からなり、および
    前記CD138ペプチドが、配列番号12のアミノ酸配列からなる、
    請求項1または2に記載の組成物。
  4. 前記非スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号6のアミノ酸配列からなり、
    前記スプライシング型XBP1ペプチドが、配列番号10のアミノ酸配列からなり、
    前記CD138ペプチドが、配列番号12のアミノ酸配列からなり、および
    前記CS−1ペプチドが、配列番号16のアミノ酸配列からなる、
    請求項2に記載の組成物。
  5. 前記乳がんが、炎症性乳がんである、請求項1〜4のいずれかに記載の組成物。
  6. 化学療法剤、電離放射線または免疫療法剤のうちの1つ以上から選択されるさらなる処置と組み合わせて投与するために製剤化される、請求項1〜5のいずれかに記載の組成物。
  7. 1つ以上の免疫刺激剤および/または1つ以上の免疫調節剤を組み合わせて投与するために製剤化される、請求項1〜6のいずれかに記載の組成物。
  8. 前記1つ以上の免疫刺激剤が、カルボキシメチルセルロース、ポリイノシン酸−ポリシチジル酸およびポリ−L−リジン二本鎖RNAを含むアジュバント;水と油のエマルジョンを含むアジュバント;ならびにタンパク質を含むアジュバントから選択される、請求項7に記載の組成物。
  9. 前記1つ以上の免疫調節剤が、免疫系を活性化する抗体および小分子アジュバントから選択される、請求項7に記載の組成物。
  10. カルボキシメチルセルロース、ポリイノシン酸−ポリシチジル酸およびポリ−L−リジン二本鎖RNAを含む前記アジュバントがポリICLCである、請求項8に記載の組成物。
  11. 水と油のエマルジョンを含む前記アジュバントがモンタナイドである、請求項8に記載の組成物。
  12. 前記小分子アジュバントがサリドマイド誘導体である、請求項9に記載の組成物。
  13. 前記小分子アジュバントがレナリドマイドである、請求項9に記載の組成物。
  14. 抗PD−1抗体、抗PDL−1抗体またはHDAC阻害剤と組み合わせて使用するための、請求項1〜13のいずれかに記載の組成物。
  15. 配列番号6のアミノ酸配列を含む、35アミノ酸長以下の非スプライシング型XBP1ペプチド、
    配列番号10のアミノ酸配列を含む、35アミノ酸長以下のスプライシング型XBP1ペプチド、および
    配列番号12のアミノ酸配列を含む、35アミノ酸長以下のCD138ペプチド
    を含む組成物であって、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体において免疫応答を誘導することにおいて、抗PD−1抗体と組み合わせて使用するための組成物。
  16. 配列番号6のアミノ酸配列を含む、35アミノ酸長以下の非スプライシング型XBP1ペプチド、
    配列番号10のアミノ酸配列を含む、35アミノ酸長以下のスプライシング型XBP1ペプチド、および
    配列番号12のアミノ酸配列を含む、35アミノ酸長以下のCD138ペプチド
    を含む組成物であって、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体において免疫応答を誘導することにおいて、抗PDL−1抗体と組み合わせて使用するための組成物。
  17. 配列番号6のアミノ酸配列を含む、35アミノ酸長以下の非スプライシング型XBP1ペプチド、
    配列番号10のアミノ酸配列を含む、35アミノ酸長以下のスプライシング型XBP1ペプチド、および
    配列番号12のアミノ酸配列を含む、35アミノ酸長以下のCD138ペプチド
    を含む組成物であって、くすぶり型多発性骨髄腫を有する被験体において免疫応答を誘導することにおいて、HDAC阻害剤と組み合わせて使用するための組成物。
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