JP6311835B2 - 反応機構生成方法及び反応機構生成装置 - Google Patents
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Description
図3は、各原子間の結合有無を行列情報として表した図である。例えば、反応系内に配置された分子を構成する各原子に原子ID(1、2、3、4、5・・・)を付した反応系において、ある時間tにおける各原子の位置情報(R)の差を求める。各原子の位置情報の差の絶対値が、各原子間の結合距離となる。そして、図3の左側に示すように、各原子間の結合距離が閾値(Cutoff)を超えた場合には結合無しと評価し、各原子間の結合距離が閾値(Cutoff)より小さい場合には、結合有と評価する。そして、各原子間で結合有りと評価した場合を1とし、結合無しと評価した場合を0とし、図3の右側に示すような行列情報としてまとめる。また、時間ステップΔt後(時間t+Δt)における各原子の位置情報から、上記と同様にして結合有無を評価し、行列情報としてまとめる。そして、時間tにおける行列情報と時間ステップΔt後(時間t+Δt)の行列情報を比較し、各原子間の結合の有無が異なる場合に、化学反応が起こったと判断する。
後に示すように原子の位置情報から、反応系内の各分子の分子種を特定することができるが、これにより各分子種の分子の個数を各時間ステップにおいて求めることができる。時間ステップの前後を比較し、個数が変化している分子種があった場合に、化学反応が起こったと判断する。
図11は、水素分子と酸素分子をシミュレーションセル中に配置した状態を示す図である。実施例1では、1辺が25オングストロームの正方体としたシミュレーションセル中に、水素分子66分子、酸素分子33分子をランダムな位置にセットした。次に、反応速度定数を計算したい温度となるように、各原子にランダムな初期速度を与えた。初期原子位置、初期原子速度のもと、上式(1)で表されるニュートンの運動方程式に従って、各分子を構成する原子の位置情報を逐次計算した。運動方程式は時間に関する差分法によって計算した。運動方程式の解法アルゴリズムには様々なものがあるが、実施例1では速度ベルレ法を用いた。計算の時間ステップは0.1フェムト秒とした。また、反応系の温度を一定に保つためにNose−Hooverサーモスタットを用いた。また、各原子に働く力を計算する方法として第一原理法、半経験的方法、分子力場法等があるが、実施例1では反応分子力場法ReaxFFを使用した。
実施例2では、1辺が25オングストロームの正方体としたシミュレーションセル中に、メタン分子50分子、酸素分子100分子をランダムな位置にセットし、3000K、3250K、3500K、3750K、4000Kの設定温度で、実施例1と同様に分子動力学計算(10回)を行い、素反応、分子動力学計算中に起こった素反応の回数、反応速度定数を求めた。図15に、3000Kにおける素反応、反応速度定数、及び分子動力学計算中に起こった素反応の回数を含むベースモデルの一部を示す。
3_4簡略化モデルをベースとして、従来知られているDRG(Directed Relation Graph)法、DRGEP(DRG with Error Propagation)法、DRGEPSA(DRGEP and Sensitivity Analysis)法の3つの簡略化法を実行した。この3つの簡略化法においては、実施例2と同様に、得られる簡略化モデルの定容断熱条件下での着火遅れ時間が、3_4簡略化モデルの着火遅れ時間に対して20%以下となるように、モデルの簡略化を実行した。また、10_5簡略化モデルをベースとして、上記3つの簡略化法を実行した。
Claims (14)
- 反応系内の各分子を構成する原子について、時間ステップ毎に分子動力学計算を行うステップと、
前記時間ステップ前後で前記反応系内に化学反応が起こった場合、前記化学反応に寄与した反応分子及び生成分子を特定するステップと、
前記反応分子と前記生成分子との原子の種類の関連性に基づいて、前記関連性のある反応分子及び生成分子から構成された素反応を構築するステップと、
前記構築した素反応の反応速度定数を算出するステップと、を含む反応機構生成方法。 - 前記反応分子及び前記生成分子を特定するステップでは、前記時間ステップ前後の分子動力学計算から得られる原子の位置情報から、前記化学反応に寄与した前記反応分子及び前記生成分子を特定することを特徴とする請求項1記載の反応機構生成方法。
- 前記素反応の反応速度定数を算出するステップでは、前記反応分子と同じ分子種の分子の個数の時間履歴を算出し、前記反応分子と同じ分子種の分子の個数の時間履歴に基づいて、前記素反応の反応速度定数を算出することを特徴とする請求項1記載の反応機構生成方法。
- 前記素反応を構築するステップにおいて構築された複数の素反応を含むベースモデルを作成するステップと、
前記分子動力学計算中に起こった素反応の回数に基づいて、前記ベースモデルの前記複数の素反応を絞り込み、前記ベースモデルより素反応の数が少ない簡略化モデルを作成するステップと、を含むことを特徴とする請求項1記載の反応機構生成方法。 - 前記簡略化モデルの精度を評価するステップを含むことを特徴とする請求項4記載の反応機構生成方法。
- 前記素反応を構築するステップにおいて構築された複数の素反応を含むベースモデルを作成するステップと、
前記分子動力学計算中に起こった素反応の回数、及び前記分子動力学計算において設定された複数の設定温度のうち、同一の素反応が存在する設定温度の個数に基づいて、前記ベースモデルの前記複数の素反応を絞り込み、前記ベースモデルより素反応の数が少ない簡略化モデルを作成するステップと、を含むことを特徴とする請求項1記載の反応機構生成方法。 - 前記簡略化モデルの精度を評価するステップを含むことを特徴とする請求項6記載の反応機構生成方法。
- 反応系内の各分子を構成する原子について、時間ステップ毎に分子動力学計算を行う力学計算演算部と、
前記時間ステップ前後で前記反応系内に化学反応が起こった場合、前記化学反応に寄与した反応分子及び生成分子を特定する分子特定部と、
前記反応分子と前記生成分子との原子の種類の関連性に基づいて、前記関連性のある反応分子及び生成分子から構成された素反応を構築する素反応構築部と、
前記構築した素反応の反応速度定数を算出する反応速度定数算出部と、を含むことを特徴とする反応機構生成装置。 - 前記分子特定部は、前記時間ステップ前後の分子動力学計算から得られる原子の位置情報から、前記化学反応に寄与した反応分子及び生成分子を特定することを特徴とする請求項8記載の反応機構生成装置。
- 前記反応速度定数算出部は、前記反応分子と同じ分子種の分子の個数の時間履歴を算出し、前記反応分子と同じ分子種の分子の個数の時間履歴に基づいて、前記素反応の反応速度を算出することを特徴とする請求項8記載の反応機構生成装置。
- 前記素反応構築部において構築された複数の素反応を含むベースモデルを作成するベースモデル作成部と、
前記分子動力学計算中に起こった素反応の回数に基づいて、前記ベースモデルの前記複数の素反応を絞り込み、前記ベースモデルより素反応の数が少ない簡略化モデルを作成する簡略化モデル作成部と、を含むことを特徴とする請求項8記載の反応機構生成装置。 - 前記簡略化モデルの精度を評価するモデル精度評価部を含むことを特徴とする請求項11記載の反応機構生成装置。
- 前記素反応構築部において構築された複数の素反応を含むベースモデルを作成するベースモデル作成部と、
前記分子動力学計算中に起こった素反応の回数、及び前記分子動力学計算において設定された複数の設定温度のうち、同一の素反応が存在する設定温度の個数に基づいて、前記ベースモデルの前記複数の素反応を絞り込み、前記ベースモデルより素反応の数が少ない簡略化モデルを作成する簡略化モデル作成部と、を含むことを特徴とする請求項8記載の反応機構生成装置。 - 前記簡略化モデルの精度を評価するモデル精度評価部を含むことを特徴とする請求項13記載の反応機構生成装置。
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