JP6282813B2 - ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼの発現をbZIP型転写因子により調整する方法、bZIP型転写因子をコードする遺伝子が導入されたイソプレノイド産生植物、及び該イソプレノイド産生植物を用いたポリイソプレノイドの製造方法 - Google Patents

ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼの発現をbZIP型転写因子により調整する方法、bZIP型転写因子をコードする遺伝子が導入されたイソプレノイド産生植物、及び該イソプレノイド産生植物を用いたポリイソプレノイドの製造方法 Download PDF

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Description

本発明は、ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼの発現をbZIP型転写因子により調整する方法、bZIP型転写因子をコードする遺伝子が導入されたイソプレノイド産生植物、及び該イソプレノイド産生植物を用いたポリイソプレノイドの製造方法に関する。
現在、工業用ゴム製品に用いられている天然ゴム(ポリイソプレノイドの1種)は、トウダイグサ科のパラゴムノキ(Hevea brasiliensis)や桑科植物のインドゴムノキ(Ficus elastica)などのゴム産生植物より採取することにより得られる。
現在、工業用ゴム製品に用いられている天然ゴムは、パラゴムノキをほぼ唯一の採取源としている。パラゴムノキは東南アジアや南米などの限られた地域でのみ生育可能な植物である。更に、パラゴムノキは、植樹からゴムの採取が可能な成木になるまでに7年程度を要し、また、天然ゴムを採取できる期間は20〜30年に限られる。今後、開発途上国を中心に天然ゴムの需要の増大が見込まれているが、上述の理由によりパラゴムノキによる天然ゴムの大幅な増産は困難である。そのため、天然ゴム資源の枯渇が懸念されており、パラゴムノキの成木以外の安定的な天然ゴムの供給源やパラゴムノキにおける天然ゴムの生産効率の改善が望まれている。
パラゴムノキでの天然ゴムの生産効率を改善する方法としては、例えば、より大量の天然ゴムを得るために、より大量のラテックスを採取する方法が挙げられる。具体的には、例えば、ゴムノキの幹に対してエチレンやEthephon(2−クロロエチルホスホン酸)による刺激を加える方法、ジャスモン酸やジャスモン酸前駆体のリノレン酸等を配合したラノリンにより乳管分化を促進する方法がある(例えば、非特許文献1)。
しかし、エチレン刺激によるラテックスを増産する方法は、幹に対し長期的に使用し続けると樹皮割れが生じ易くなるおそれがある。また、エチレン刺激は、乳管からのラテックスの流出をより円滑にする方法であり、樹木のラテックス生産能力そのものを改善するものではなく、当該方法によるラテックスの増産には限界があり、十分ではない。
また、ジャスモン酸等を用いて乳管形成を促進し、乳管数を増大させることが可能であるが、タッピングによってラテックスを回収する際に、乳管から流出するラテックスが傷口で凝固し、生産されたラテックスを十分に回収できないという問題がある。
一方、ポリイソプレノイドの生合成量は、光応答、傷害応答、冷温処理等によって変化することが知られている。しかしながら、どの転写因子がこれらの応答により活性化され、ポリイソプレノイドの生合成量を制御しているか具体的には分かっていない。
Hao、他、Annals of Botany、2000年、第85巻、37〜43ページ
本発明は、前記課題を解決し、ポリイソプレノイドの生合成経路を増強する方法を提供することを目的とする。また、ポリイソプレノイドの生合成経路が増強されたイソプレノイド産生植物、及び該イソプレノイド産生植物を用いたポリイソプレノイドの製造方法を提供することを目的とする。
本発明は、ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼの発現をbZIP型転写因子により調整する方法に関する。
上記方法においては、上記bZIP型転写因子をコードする遺伝子を宿主に導入することにより、該宿主において、上記ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼの発現を調整することが好ましい。
上記遺伝子が、以下の[1]又は[2]に記載のDNAであることが好ましい。
[1]配列番号1,3のいずれかの配列番号で表される塩基配列からなるDNA
[2]配列番号1,3のいずれかの配列番号で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ転写因子活性を有する蛋白質をコードするDNA
上記方法が、ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼの発現を増強する方法であることがより好ましい。
上記bZIP型転写因子が、以下の[1]〜[3]のいずれかに記載の蛋白質であることが好ましい。
[1]配列番号2,4のいずれかの配列番号で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
[2]配列番号2,4のいずれかの配列番号で表されるアミノ酸配列において、1若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び/又は付加を含む配列からなり、かつ転写因子活性を有する蛋白質
[3]配列番号2,4のいずれかの配列番号で表されるアミノ酸配列と80%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ転写因子活性を有する蛋白質
上記宿主がイソプレノイド産生植物であることが好ましい。
本発明はまた、bZIP型転写因子をコードする遺伝子が導入されたイソプレノイド産生植物に関する。
上記遺伝子が、以下の[1]又は[2]に記載のDNAであることが好ましい。
[1]配列番号1,3のいずれかの配列番号で表される塩基配列からなるDNA
[2]配列番号1,3のいずれかの配列番号で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ転写因子活性を有する蛋白質をコードするDNA
本発明はまた、上記イソプレノイド産生植物を用いたポリイソプレノイドの製造方法に関する。
本発明の方法は、ポリイソプレノイドの生合成経路の上流に位置するメバロン酸(MVA)経路の律速段階であるヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼの発現をbZIP型転写因子により調整する方法であるので、MVA経路によりイソペンテニル二リン酸(IPP)が生合成される際の律速部位が増強されることにより、ポリイソプレノイドの生合成経路を好適に増強できる。また、本発明のイソプレノイド産生植物は、bZIP型転写因子をコードする遺伝子が導入されたイソプレノイド産生植物であるので、ポリイソプレノイドの生合成経路が好適に増強されており、該イソプレノイド産生植物を使用してポリイソプレノイドの製造を行うことにより、ポリイソプレノイドの製造量を増大できる。
ポリイソプレノイドの生合成経路の一部を示す模式図である。
本発明者らは、ポリイソプレノイドの生合成経路を増強するために、種々の検討を行った。ポリイソプレノイドの生合成経路の一部を図1に示す。ポリイソプレノイドの生合成経路のなかでも、重要物質の1つであるイソペンテニル二リン酸(IPP)を生合成する経路として、メバロン酸(MVA)経路(図1に記載のCytosol MVA pathway)とMEP経路(図1に記載のPlastidial DXP pathway)の2種類の経路が知られている。
本発明者らは、ゴムラテックスにおいてIPPを提供する一般的な経路であるという理由から、MVA経路に着目し、図1の点線で囲った経路の増強を考慮して、ポリイソプレノイドの生合成経路に関与している様々な蛋白質の中から、重要な働きをしているのではないかと予想される複数の蛋白質を選定し、その中でも、ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼ(HMG−CoAレダクターゼ)がMVA経路の律速段階であることを見出した。
そして、本発明者らは、HMG−CoAレダクターゼの発現を制御するために、HMG−CoAレダクターゼの発現を制御可能な転写因子の探索を行うこととした。具体的には、パラゴムノキの葉由来のHMG−CoAレダクターゼ(該HMG−CoAレダクターゼのアミノ酸配列を配列表配列番号6に示す)をコードする遺伝子(該遺伝子の塩基配列を配列表配列番号5に示す)とそのプロモーター領域を含むDNA断片をクローニングした(詳細は実施例参照)。そして、得られたDNA断片の塩基配列を調査し、HMG−CoAレダクターゼをコードする遺伝子のプロモーター領域の塩基配列を明らかにした。
更に、明らかにしたプロモーター領域の塩基配列について、植物プロモーター用解析データベース(A Datebase of Plant Cis−acting Regulatory DNA Elements (PLACE))を用いて解析を行った。解析の結果、bZIP型転写因子の結合(認識)サイト(ACACNNG)が見つかった。
この解析結果より、bZIP型転写因子が、HMG−CoAレダクターゼの発現を制御可能な転写因子であること、すなわち、bZIP型転写因子が、MVA経路によるIPP生合成の律速部位を増強でき、ポリイソプレノイドの生合成経路を好適に制御可能な転写因子であることが強く示唆された。そして、酵母を使用して確認試験を行ったところ、bZIP型転写因子の中で、BZIP9(シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)由来のBZIP9の塩基配列及びアミノ酸配列をそれぞれ配列表配列番号1,2に示す)、BZIP61(シロイヌナズナ由来のBZIP61の塩基配列及びアミノ酸配列をそれぞれ配列表配列番号3,4に示す)を使用するとHMG−CoAレダクターゼの発現を増強できることを確認した。
このように、本発明者らは、bZIP型転写因子が、HMG−CoAレダクターゼの発現を好適に増強可能な転写因子であり、MVA経路によるIPP生合成の律速部位を増強でき、ポリイソプレノイドの生合成経路を好適に増強可能な転写因子であることを発見した。そして、bZIP型転写因子により、MVA経路によるIPP生合成の律速部位が増強されることにより、ポリイソプレノイドの生合成経路を好適に増強することが可能であり、bZIP型転写因子をコードする遺伝子をイソプレノイド産生植物に導入し、該イソプレノイド産生植物を使用してポリイソプレノイドの製造を行うことにより、ポリイソプレノイドの製造量を増大できることを見出した。
なお、本明細書において、ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼ(HMG−CoAレダクターゼ)は、メバロン酸経路の律速酵素の一つであり、ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼ(NADPH)(EC 1.1.1.34)とヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼ(EC 1.1.1.88)の両方を含む。
本発明の方法は、ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼの発現をbZIP型転写因子により調整する方法である。
bZIP型転写因子としては、塩基性領域を持つロイシンジッパーモチーフを構造的特徴とする転写因子であれば特に限定されず、例えば、BZIP9(シロイヌナズナ由来のBZIP9の塩基配列及びアミノ酸配列をそれぞれ配列表配列番号1,2に示す)、BZIP61(シロイヌナズナ由来のBZIP61の塩基配列及びアミノ酸配列をそれぞれ配列表配列番号3,4に示す)等が挙げられる。
なお、本明細書において、転写因子とは、遺伝子の転写量を増加もしくは減少(好ましくは増加)させる活性を有するタンパク質のことを言う。
bZIP型転写因子は、その由来は特に限定されないが、パラゴムノキ、ノゲシ、グアユール、ロシアンタンポポ、又は、シロイヌナズナ由来の転写因子であることが好ましい。
(bZIP型転写因子のアミノ酸配列)
bZIP型転写因子の具体例としては、下記[1]が挙げられる。
[1]配列番号2,4のいずれかの配列番号で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
また、転写因子は、元のアミノ酸配列において、1若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、又は付加を含む場合であっても転写因子活性を有する場合があることが知られている。従って、bZIP型転写因子の具体例としては、下記[2]も挙げられる。
[2]配列番号2,4のいずれかの配列番号で表されるアミノ酸配列において、1若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び/又は付加を含む配列からなり、かつ転写因子活性を有する蛋白質
ここで、本明細書において、転写因子活性とは、ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼをコードする遺伝子の転写量を増加もしくは減少(好ましくは増加)させる活性をいう。
なお、転写因子活性を維持するためには、配列番号2で表されるアミノ酸配列において、好ましくは1若しくは複数個のアミノ酸、より好ましくは1〜55個のアミノ酸、更に好ましくは1〜41個のアミノ酸、特に好ましくは1〜27個のアミノ酸、最も好ましくは1〜13個のアミノ酸、より最も好ましくは1〜5個のアミノ酸、更に最も好ましくは1〜2個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び/又は付加を含むアミノ酸配列であることが好ましい。
また、転写因子活性を維持するためには、配列番号4で表されるアミノ酸配列において、好ましくは1若しくは複数個のアミノ酸、より好ましくは1〜65個のアミノ酸、更に好ましくは1〜49個のアミノ酸、特に好ましくは1〜32個のアミノ酸、最も好ましくは1〜16個のアミノ酸、より最も好ましくは1〜6個のアミノ酸、更に最も好ましくは1〜3個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び/又は付加を含むアミノ酸配列であることが好ましい。
アミノ酸置換の例としては、保存的置換が好ましく、具体的には以下のカッコ内のグループ内での置換が挙げられる。例えば、(グリシン、アラニン)(バリン、イソロイシン、ロイシン)(アスパラギン酸、グルタミン酸)(アスパラギン、グルタミン)(セリン、トレオニン)(リジン、アルギニン)(フェニルアラニン、チロシン)である。
なお、アミノ酸の置換、欠失、挿入、及び/又は付加は、bZIP型転写因子としての活性ドメイン、および転写因子結合サイトへの結合ドメインその他の転写因子活性に重要な部分以外の領域に導入されることが好ましい。そのようなドメインは、既知のbZIP型転写因子との相同性解析から当業者は適宜決定することができる。
また、転写因子のアミノ酸配列と配列同一性の高いアミノ酸配列を有する蛋白質も同様の活性を有する場合があることが知られている。従って、bZIP型転写因子の具体例としては、下記[3]も挙げられる。
[3]配列番号2,4のいずれかの配列番号で表されるアミノ酸配列と80%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ転写因子活性を有する蛋白質
なお、転写因子活性を維持するためには、配列番号2,4のいずれかの配列番号で表されるアミノ酸配列との配列同一性は、好ましくは85%以上、より好ましくは90%以上、更に好ましくは95%以上、特に好ましくは98%以上、最も好ましくは99%以上である。
アミノ酸配列や塩基配列の配列同一性は、Karlin and AltschulによるアルゴリズムBLAST[Pro. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 5873(1993)]やFASTA[Methods Enzymol., 183, 63(1990)]を用いて決定することができる。
転写因子活性を有する蛋白質であることを確認する方法としては、例えば、従来公知の方法である、ゲルシフトアッセイや、β-ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼ、若しくはGFP(Green Fluorescent Protein)等をレポーター遺伝子としたレポーターアッセイ等により確認する方法が挙げられる。
なお、bZIP型転写因子としては、
[1−1]配列番号2で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
[2−1]配列番号2で表されるアミノ酸配列において、1若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び/又は付加を含む配列からなり、かつ転写因子活性を有する蛋白質
[3−1]配列番号2で表されるアミノ酸配列と80%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ転写因子活性を有する蛋白質
のいずれかであることが好ましい。
(bZIP型転写因子をコードするDNA)
また、bZIP型転写因子をコードするDNAとしては、下記[1]又は[2]が挙げられる。
[1]配列番号1,3のいずれかの配列番号で表される塩基配列からなるDNA
[2]配列番号1,3のいずれかの配列番号で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ転写因子活性を有する蛋白質をコードするDNA
ここでいう「ハイブリダイズする」とは、特定の塩基配列を有するDNAまたは該DNAの一部にDNAがハイブリダイズする工程である。したがって、該特定の塩基配列を有するDNAまたは該DNAの一部の塩基配列は、ノーザンまたはサザンブロット解析のプローブとして有用であるか、またはPCR(Polymerase Chain Reaction)解析のオリゴヌクレオチドプライマーとして使用できる長さのDNAであってもよい。プローブとして用いるDNAとしては、少なくとも100塩基以上、好ましくは200塩基以上、より好ましくは500塩基以上のDNAをあげることができるが、少なくとも10塩基以上、好ましくは15塩基以上のDNAであってもよい。
DNAのハイブリダイゼーション実験の方法はよく知られており、例えばモレキュラー・クローニング第2版、第3版(2001年)、Methods for General and Molecular Bacteriology, ASM Press(1994)、Immunology methods manual, Academic press(Molecular)に記載の他、多数の他の標準的な教科書に従ってハイブリダイゼーションの条件を決定し、実験を行うことができる。
上記のストリンジェントな条件とは、例えばDNAを固定化したフィルターとプローブDNAとを50%ホルムアミド、5×SSC(750mMの塩化ナトリウム、75mMのクエン酸ナトリウム)、50mMのリン酸ナトリウム(pH7.6)、5×デンハルト溶液、10%の硫酸デキストラン、および20μg/lの変性させたサケ精子DNAを含む溶液中で42℃で一晩、インキュベートした後、例えば約65℃の0.2×SSC溶液中で該フィルターを洗浄する条件をあげることができるが、より低いストリンジェント条件を用いることもできる。ストリンジェントな条件の変更は、ホルムアミドの濃度調整(ホルムアミドの濃度を下げるほど低ストリンジェントになる)、塩濃度および温度条件の変更により可能である。低ストリンジェント条件としては、例えば6×SSCE(20×SSCEは、3mol/lの塩化ナトリウム、0.2mol/lのリン酸二水素ナトリウム、0.02mol/lのEDTA、pH7.4)、0.5%のSDS、30%のホルムアミド、100μg/lの変性させたサケ精子DNAを含む溶液中で、37℃で一晩インキュベートした後、50℃の1×SSC、0.1%SDS溶液を用いて洗浄する条件をあげることができる。また、さらに低いストリンジェントな条件としては、上記した低ストリンジェント条件において、高塩濃度(例えば5×SSC)の溶液を用いてハイブリダイゼーションを行った後、洗浄する条件をあげることができる。
上記した様々な条件は、ハイブリダイゼーション実験のバックグラウンドを抑えるために用いるブロッキング試薬を添加、または変更することにより設定することもできる。上記したブロッキング試薬の添加は、条件を適合させるために、ハイブリダイゼーション条件の変更を伴ってもよい。
上記したストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能なDNAとしては、例えばBLASTおよびFASTA等のプログラムを用いて、上記パラメータに基づいて計算したときに、配列番号1,3のいずれかの配列番号で表される塩基配列と少なくとも80%以上、好ましくは90%以上、より好ましくは95%以上、さらに好ましくは98%以上、特に好ましくは99%以上の配列同一性を有する塩基配列からなるDNAをあげることができる。
上記したDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAが、転写因子活性を有する蛋白質をコードするDNAであることを確認する方法としては、例えば、従来公知の方法である、ゲルシフトアッセイや、β-ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼ、若しくはGFP(Green Fluorescent Protein)等をレポーター遺伝子としたレポーターアッセイ等により確認する方法が挙げられる。
なお、bZIP型転写因子をコードするDNAとしては、
[1−1]配列番号1で表される塩基配列からなるDNA
[2−1]配列番号1で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ転写因子活性を有する蛋白質をコードするDNA
のいずれかであることが好ましい。
なお、bZIP型転写因子及び該bZIP型転写因子をコードするDNAは、Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Second Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)、Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons (1987−1997)、Nucleic Acids Research, 10, 6487(1982)、Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 79, 6409(1982) 、Gene, 34, 315 (1985) 、Nucleic Acids Research, 13, 4431 (1985) 、Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82, 488 (1985) 等に記載の部位特異的変異導入法を用いて、例えば配列番号1,3のいずれかの配列番号で表される塩基配列(シロイヌナズナ由来のBZIP9の塩基配列、又はシロイヌナズナ由来のBZIP61の塩基配列)に部位特異的変異を導入することにより、取得することができる。
(形質転換体)
bZIP型転写因子をコードする遺伝子を宿主に導入することにより、bZIP型転写因子を発現するように形質転換された生物体(形質転換体)が得られる。そして、当該形質転換体では、bZIP型転写因子が発現することにより、ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼの発現が調整(増強)される。その結果、MVA経路によるIPP生合成の律速部位が増強されることにより、ポリイソプレノイドの生合成経路が好適に増強され、形質転換体においてポリイソプレノイドの製造量を好適に増大できる。
次に、bZIP型転写因子を発現するように形質転換された生物体(形質転換体)の作製方法について簡単に説明する。ここでは、主として上記bZIP型転写因子を発現するように形質転換された形質転換体の作製方法について簡単に説明する。このような形質転換体は、導入したいbZIP型転写因子をコードする遺伝子が決まれば、従来公知の方法により作製することができる。
具体的には、例えば、適当な発現ベクターのプロモーターの下流に、配列番号1,3のいずれかの配列番号で表される塩基配列(シロイヌナズナ由来のBZIP9の塩基配列、又はシロイヌナズナ由来のBZIP61の塩基配列)を含むDNAを適当な制限酵素等を用いて挿入し、組換え体DNAを作製する。そして、該組換え体DNAを該発現ベクターに適合した宿主細胞に導入することにより、形質転換体を得ることができる。
また、上記説明では、配列番号1,3のいずれかの配列番号で表される塩基配列(シロイヌナズナ由来のBZIP9の塩基配列、又はシロイヌナズナ由来のBZIP61の塩基配列)を含むDNAを用いる場合について説明したが、シロイヌナズナ由来の他のbZIP型転写因子、又はシロイヌナズナ以外の生物由来のbZIP型転写因子をコードするDNAを用いてもよい。この場合には、公知の手法により、例えば、配列番号1で表される塩基配列の一部をプローブとして用いて、スクリーニングすることにより、bZIP型転写因子をコードするDNAを特定し、単離すればよい。DNA分子をプローブとして用いて、目的とするDNA分子を単離する方法については、Molecular Cloning,2nd edition,Cold Spring Harbor press(1989)等に記載されている。また、上記DNAに変異を導入したDNAを用いてもよい。
宿主(宿主細胞)としては、微生物、酵母、動物細胞、昆虫細胞等、植物細胞等、目的とする遺伝子を発現できるものであればいずれも用いることができるが、現状では、ポリイソプレノイドを生合成できる生物は、植物(イソプレノイド産生植物)だけであることから、宿主としては植物(イソプレノイド産生植物)が好ましく、宿主細胞としては植物細胞(イソプレノイド産生植物の植物細胞)が好ましい。なお、今後の技術の発展に伴い、植物細胞以外においてもポリイソプレノイドを生合成できるようになった場合には、当該細胞にも好適に上述のbZIP型転写因子をコードする遺伝子を導入することが可能である。
イソプレノイド産生植物としては、イソプレノイドを産生可能な植物であれば特に限定されず、例えば、パラゴムノキ(Hevea brasiliensis)等のHevea属;ノゲシ(Sonchus oleraceus)、オニノゲシ(Sonchus asper)、ハチジョウナ(Sonchus brachyotus)等のSonchus属;セイタカアワダチソウ(Solidago altissima)、アキノキリンソウ(Solidago virgaurea subsp. asiatica)、ミヤマアキノキリンソウ(Solidago virgaurea subsp. leipcarpa)、キリガミネアキノキリンソウ(Solidago virgaurea subsp. leipcarpaf. paludosa)、オオアキノキリンソウ(Solidago virgaurea subsp. gigantea)、オオアワダチソウ(Solidago gigantea Ait. var. leiophylla Fernald)等のSolidago属;ヒマワリ(Helianthus annuus)、シロタエヒマワリ(Helianthus argophyllus)、ヘリアンサス・アトロルベンス(Helianthus atrorubens)、ヒメヒマワリ(Helianthus debilis)、コヒマワリ(Helianthus decapetalus)、ジャイアントサンフラワー(Helianthus giganteus)等のHelianthus属;タンポポ(Taraxacum)、エゾタンポポ(Taraxacum venustum H.Koidz)、シナノタンポポ(Taraxacum hondoense Nakai)、カントウタンポポ(Taraxacum platycarpum Dahlst)、カンサイタンポポ(Taraxacum japonicum)、セイヨウタンポポ(Taraxacum officinale Weber)、ロシアンタンポポ(Taraxacum koksaghyz)等のTaraxacum属;イチジク(Ficus carica)、インドゴムノキ(Ficus elastica)、オオイタビ(Ficus pumila L.)、イヌビワ(Ficus erecta Thumb.)、ホソバムクイヌビワ(Ficus ampelas Burm.f.)、コウトウイヌビワ(Ficus benguetensis Merr.)、ムクイヌビワ(Ficus irisana Elm.)、ガジュマル(Ficus microcarpa L.f.)、オオバイヌビワ(Ficus septica Burm.f.)、ベンガルボダイジュ(Ficus benghalensis)等のFicus属;グアユール(Parthenium argentatum)、アメリカブクリョウサイ(Parthenium hysterophorus)、ブタクサ(Parthenium hysterophorus)等のParthenium属;レタス(Lactuca serriola)、ベンガルボダイジュ等が挙げられる。なかでも、Hevea属、Sonchus属、Taraxacum属、及びParthenium属からなる群より選択される少なくとも1種の属に属する植物であることが好ましく、パラゴムノキ、ノゲシ、グアユール、及びロシアンタンポポからなる群より選択される少なくとも1種であることがより好ましい。
発現ベクターとしては、上記宿主細胞において自律複製可能ないしは染色体中への組込が可能で、上記組換え体DNAを転写できる位置にプロモーターを含有しているものを使用できる。
植物細胞を宿主細胞として用いる場合には、発現ベクターとして、例えば、pBI系のベクター、pUC系のベクター、Tiプラスミド、タバコモザイクウイルスベクター等をあげることができる。
プロモーターとしては、植物細胞中で機能するものであればいずれのものを用いてもよく、例えば、カリフラワーモザイクウイルス(CaMV)の35Sプロモーター、イネアクチン1プロモーター、ノパリン合成酵素遺伝子プロモーター、タバコモザイクウィルスの35Sプロモーター、イネ由来アクチン遺伝子プロモーター等をあげることができる。
なお、イソプレノイド化合物が生合成される組織、例えば乳管に特異的に発現するプロモーターを持った発現ベクターを使用することが好ましい。ポリイソプレノイドが生合成される組織に特異的に発現させることにより、植物の生長遅延などの弊害を抑制することが出来る。
組換えベクターの導入方法としては、植物細胞にDNAを導入する方法であればいずれも用いることができ、例えば、アグロバクテリウム(Agrobacterium)を用いる方法(特開昭59−140885号公報、特開昭60−70080号公報、WO94/00977号公報)、エレクトロポレーション法(特開昭60−251887号公報)、パーティクルガン(遺伝子銃)を用いる方法(特許第2606856号、特許第2517813号)等をあげることができる。
以上の方法等により、bZIP型転写因子をコードする遺伝子が導入された形質転換体(形質転換植物細胞)が得られる。
本発明は、bZIP型転写因子をコードする遺伝子が導入されたイソプレノイド産生植物を提供するものである。該イソプレノイド産生植物は、形質転換植物細胞を有するイソプレノイド産生植物であれば特に限定されず、例えば、上述の方法で得られた形質転換植物細胞のみならず、その子孫又はクローン、さらにそれらを継代させて得られる子孫植物の全てを含む概念である。一旦、ゲノム内に上記DNAやベクターが導入された形質転換植物細胞が得られれば、該形質転換植物細胞から有性生殖、無性生殖、組織培養、細胞培養、細胞融合等により子孫又はクローンを得ることが可能である。また、該形質転換植物細胞やその子孫あるいはクローンから繁殖材料(例えば、種子、果実、切穂、塊茎、塊根、株、不定芽、不定胚、カルス、プロトプラスト等)を得て、それらを基に該イソプレノイド産生植物を量産することも可能である。
形質転換植物細胞から植物体を再生する方法は、例えば、ユーカリでは土肥らの方法(特願平11−127025号公報)、イネではFujimuraらの方法(Fujimuraら(1995), Plant Tissue Culture Lett.,vol.2:p74−)、トウモロコシではShillitoらの方法(Shillitoら(1989), Bio/Technology,vol.7:p581−)、ジャガイモではVisserらの方法(Visserら(1989), Theor.Appl.Genet.,vol.78:p589−)、シロイヌナズナではAkamaらの方法(Akamaら(1992), Plant Cell Rep.,vol.12:p7−)が知られており、当業者であれば、これらを参照して形質転換植物細胞から植物体を再生できる。
再生した植物体において、周知の手法を用いることで、目的の転写因子遺伝子の発現を確認することが出来る。例えば、目的の転写因子の発現をウエスタンブロット解析すればよい。
上記形質転換植物体から種子を得る方法としては、例えば、形質転換植物体を適当な培地において発根させ、その発根体を水分含有の土を入れたポットに移植する。適当な栽培条件下で生育させ、最終的に種子を形成させて、該種子を得る。また、種子から植物体を得る方法としては、例えば、前記のようにして得られた形質転換植物体由来の種子を、水分含有の土に播種し、適当な栽培条件下で生育させることにより植物体を得ることができる。
本発明では、bZIP型転写因子をコードする遺伝子が導入されたイソプレノイド産生植物を使用してポリイソプレノイドの製造を行うことにより、ポリイソプレノイドの製造量を増大できる。具体的には、上述の方法で得られた形質転換植物細胞、形質転換植物細胞から得られたカルス、該カルスから再分化した細胞等を適当な培地で培養したり、形質転換植物細胞から再生された形質転換植物体、該形質転換植物体から得られた種子から得られた植物体等を適当な栽培条件下で生育させたりすることにより、ポリイソプレノイドを製造することができる。本発明のイソプレノイド産生植物は、導入されたbZIP型転写因子により、MVA経路によるIPP生合成の律速部位が増強されることにより、ポリイソプレノイドの生合成経路が好適に増強されているため、ポリイソプレノイドの製造量を好適に増大できる。
ここで、本明細書において、ポリイソプレノイドは、イソプレン単位(C)で構成された重合体の総称である。ポリイソプレノイドとしては、例えばモノテルペン(C10)、セスキテルペン(C15)、ジテルペン(C20)、セスタテルペン(C25)、トリテルペン(C30)、テトラテルペン(C40)、天然ゴムなどの重合体が挙げられる。
以上の説明の通り、本発明では、bZIP型転写因子により、ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼの発現を調整(増強)できるため、MVA経路によるIPP生合成の律速部位が増強されることにより、ポリイソプレノイドの生合成経路が好適に増強され、形質転換体においてポリイソプレノイドの製造量を好適に増大できる。
また、bZIP型転写因子をコードする遺伝子が導入された本発明のイソプレノイド産生植物は、導入されたbZIP型転写因子により、MVA経路によるIPP生合成の律速部位が増強されることにより、ポリイソプレノイドの生合成経路が好適に増強されているため、該イソプレノイド産生植物を使用してポリイソプレノイドの製造を行うことにより、ポリイソプレノイドの製造量を好適に増大できる。
以上のように、本発明の方法、本発明のイソプレノイド産生植物、及び本発明のポリイソプレノイドの製造方法により、ポリイソプレノイドの製造量を増大できるため、懸念されている天然ゴム資源の枯渇に対応することが可能である。
実施例に基づいて、本発明を具体的に説明するが、本発明はこれらのみに限定されるものではない。
(プロモーター配列の調製)
パラゴムノキの葉由来のHMG−CoAレダクターゼをコードする遺伝子(該遺伝子の塩基配列を配列表配列番号5に示す)とそのプロモーターを含むDNA断片を以下の手順でクローニングした。まず、パラゴムノキの葉からゲノムDNAを抽出した。抽出は市販のゲノムDNA抽出キットを用いて行った。HMG−CoAレダクターゼをコードする遺伝子のプロモーター領域を含む遺伝子の増幅はプライマー1〜6に示すようなランダムプライマーとHMG−CoAレダクターゼをコードする遺伝子に対応したプライマーを用いたTAIL−PCR法を行うことにより得た。
プライマー1:5’−ntcgastwtsgwgtt−3’ (配列番号7)
プライマー2:5’−ngtcgtswganawgaa−3’ (配列番号8)
プライマー3:5’−wgtgnagwancanag−3’ (配列番号9)
プライマー4:5’−sttntastnctntgc−3’ (配列番号10)
プライマー5:5’−sstggstanatwatwct−3’ (配列番号11)
プライマー6:5’−agwgnagwancanaga−3’ (配列番号12)
上記プライマーを使用して得られたDNA断片の塩基配列を調べた結果、HMG−CoAレダクターゼのプロモーター配列が得られた。HMG−CoAレダクターゼのプロモーター配列の塩基配列を配列番号13に示した。
上記プロモーター配列は植物プロモーター用解析データベース(A Datebase of Plant Cis−acting Regulatory DNA Elements(PLACE))( http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/)を用いて解析を行った。
解析の結果、bZIP型転写因子の結合(認識)サイト(ACACNNG)が見つかった。
(プロモーター領域の増幅)
上記遺伝子のプロモーター領域は以下の範囲をPCRによって増幅した。
HMG−CoAレダクターゼプロモーター:−1〜−1500bp、−1〜−1000bp、−1〜−500bp
PCR産物はpMD20T(タカラバイオ)にクローニングし、pMD20T−hmgpro(−1500)、pMD20T−hmgpro(−1000)、pMD20T−hmgpro(−500)を構築した。挿入されたPCR産物のシークエンス解析を行うことにより変異導入がないことを確認した。
(レポーター配列結合ベクターの構築)
(プロモーター領域の増幅)で構築したプラスミドをSpeIと、HindIII、KpnI、又はBamHIで制限処理することにより、pYES3/CT/LacZのT7プロモーター領域が除かれた部位、すなわちレポーターであるlacZ遺伝子の直上に、各プロモーター配列断片を組み込み、pYES3−hmgprolacZ(−1500)、pYES3−hmgprolacZ(−1000)、pYES3−hmgpro(−500)を構築した。ライゲーションはLigation high ver.2(TOYOBO)を用いて行った。
(酵母染色体への遺伝子導入ベクターの構築)
(レポーター配列結合ベクターの構築)で構築したプラスミドのSpeIサイトからCYC1 transcription termination signalまでをPCRで増幅し、その断片をSalI、SmaI、XbaI、又はSphIで制限酵素処理を行うことにより、各種プロモーター配列とlacZ遺伝子を連結させたDNA断片を得た。得られたDNA断片を酵母の染色体上に挿入するため、同じく制限酵素処理したpAUR101 DNA(タカラバイオ)に組み込み、pAUR101−hmgprolacZ(−1500)pAUR101−hmgprolacZ(−1000)、pAUR101−hmgpro(−500)を構築した。ライゲーションは先ほど同様Ligation high ver.2を用いて行った。
(転写因子遺伝子の獲得)
次に、シロイヌナズナのcDNAライブラリーを鋳型にし、PCRを行った。PCRによりAt5g24800(BZIP9)(配列番号1)、At3g58120(BZIP61)(配列番号3)の2種類のPCR断片が得られた。得られたPCR産物はpMD20Tにクローニングし、pMD20T−BZIP9、pMD20T−BZIP61を構築した。挿入されたPCR産物のシークエンス解析を行うことにより変異導入がないことを確認した。
(転写因子発現ベクターの構築)
(転写因子遺伝子の獲得)で構築したプラスミドをSpeI、BamHI、又はEcoRVで制限処理することにより、p427TEF(コスモバイオ)のTEF1プロモーター領域の下流に、各転写因子遺伝子を組み込み、pTEF−BZIP9、pTEF−BZIP61を構築した。ライゲーションはLigation high ver.2を用いて行った。
(酵母の形質転換)
(酵母染色体への遺伝子導入ベクターの構築)と(転写因子発現ベクターの構築)において構築したプラスミドはエレクトロポレーション法を用いることにより酵母(BY4741株)に導入した。遺伝子導入酵母の選別は抗真菌抗生物質であるAureobasidin A(タカラバイオ)とG418(和光純薬工業)を含む培地上で酵母を培養することで行った。
(転写因子の効果確認)
形質転換酵母をX−galを含む培地上で培養することにより、転写因子活性によるlacZの発現を調査した。具体的には、プロモーター配列につながれたレポーター遺伝子であるlacZが発現すると、培地に含まれるX−galが分解されて青色を呈するため、青色を呈した場合に、転写因子活性によりlacZが発現したと判断した。10回試験を行い、転写因子活性によりlacZが発現した回数を表1に示した。
Figure 0006282813
表1より、At5g24800(BZIP9)(配列番号1,2)、At3g58120(BZIP61)(配列番号3,4)(特に、At5g24800(BZIP9))を用いることでレポーター遺伝子の活性が増加することがわかった。更に、プロモーター領域の配列が長いほどレポーター遺伝子の活性が発現した回数が多い、すなわち、At5g24800(BZIP9)、At3g58120(BZIP61)の結合サイトの数が多いプロモーター配列ほどレポーター遺伝子の活性が発現した回数が多いことから、At5g24800(BZIP9)、At3g58120(BZIP61)が、HMG−CoAレダクターゼの転写因子として機能することが立証された。このことからAt5g24800(BZIP9)、At3g58120(BZIP61)(特に、At5g24800(BZIP9))をイソプレノイド産生植物に導入することにより、MVA経路によるIPP生合成の律速部位が増強され、ポリイソプレノイドの生合成経路を好適に増強でき、ポリイソプレノイドの産出量を好適に増加させることができることが裏付けられた。
(配列表フリーテキスト)
配列番号1:シロイヌナズナ由来のBZIP9をコードする遺伝子の塩基配列
配列番号2:シロイヌナズナ由来のBZIP9のアミノ酸配列
配列番号3:シロイヌナズナ由来のBZIP61をコードする遺伝子の塩基配列
配列番号4:シロイヌナズナ由来のBZIP61のアミノ酸配列
配列番号5:パラゴムノキ由来のHMG−CoAレダクターゼをコードする遺伝子の塩基配列
配列番号6:パラゴムノキ由来のHMG−CoAレダクターゼのアミノ酸配列
配列番号7:プライマー1
配列番号8:プライマー2
配列番号9:プライマー3
配列番号10:プライマー4
配列番号11:プライマー5
配列番号12:プライマー6
配列番号13:パラゴムノキ由来のHMG−CoAレダクターゼのプロモーター配列の塩基配列

Claims (5)

  1. bZIP型転写因子をコードする遺伝子を宿主に導入することにより、該宿主において、ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼの発現を該bZIP型転写因子により調整し、
    前記遺伝子が、以下の[1]又は[2]に記載のDNAであり、
    該宿主が、Hevea属であるイソプレノイド産出植物である方法。
    [1]配列番号1,3のいずれかの配列番号で表される塩基配列からなるDNA
    [2]配列番号1,3のいずれかの配列番号で表される塩基配列と90%以上の配列同一性を有する塩基配列からなり、かつ転写因子活性を有する蛋白質をコードするDNA
  2. ヒドロキシメチルグルタリルCoAレダクターゼの発現を増強する方法である請求項記載の方法。
  3. 前記bZIP型転写因子が、以下の[1]〜[3]のいずれかに記載の蛋白質である請求項1又は2記載の方法。
    [1]配列番号2,4のいずれかの配列番号で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
    [2]配列番号2で表されるアミノ酸配列において、1〜27個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び/又は付加を含む配列からなり、かつ転写因子活性を有する蛋白質、又は、配列番号4で表されるアミノ酸配列において、1〜32個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び/又は付加を含む配列からなり、かつ転写因子活性を有する蛋白質
    [3]配列番号2,4のいずれかの配列番号で表されるアミノ酸配列と90%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ転写因子活性を有する蛋白質
  4. bZIP型転写因子をコードする遺伝子が導入された、Hevea属であり、
    前記遺伝子が、以下の[1]又は[2]に記載のDNAであるイソプレノイド産生植物。
    [1]配列番号1,3のいずれかの配列番号で表される塩基配列からなるDNA
    [2]配列番号1,3のいずれかの配列番号で表される塩基配列と90%以上の配列同一性を有する塩基配列からなり、かつ転写因子活性を有する蛋白質をコードするDNA
  5. 請求項に記載のイソプレノイド産生植物を用いたポリイソプレノイドの製造方法。
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