JP6229365B2 - コロニーカウント装置、コロニーカウント方法、およびコロニーカウントプログラム - Google Patents
コロニーカウント装置、コロニーカウント方法、およびコロニーカウントプログラム Download PDFInfo
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Description
p(a,b)≦P(x,y) a,bは(a−x)2+(b−y)2≦r12を満たす範囲。
p(c,d)≦P(x,y)−t c,dは(r12≦(x−c)2+(y−d)2≦r22を満たす範囲。
まず、近接ピーク点検出部40は、互いの距離がしきい値以下となる複数の輝度ピークを検出する。ピーク点方向検出部50は、これらの輝度ピークから見た、コロニーの中心方向を検出する。コロニーの周りの輝度は、コロニー内の輝度より低いため、光沢周辺において輝度が低い方向から高い方向を求めることで中心方向を検出することができる。すなわち、輝度勾配を求めることによって、中心方向を検出することができる。図11(a)は、各光沢3における輝度勾配を表す図である。輝度勾配の検出方法として、以下のような方法が考えられる。まず、図11(b)を参照して、輝度ピークについて、その周辺の画素情報を取得し、上側、下側、右側、左側の指定サイズの領域について、その輝度の平均を検出する。それぞれをAu,Ad,Ar,Alとすると、輝度の勾配方向(勾配角度θ)は、下記式(4)で表すことができる。
ピーク点方向交差検出部60は、中心方向が交差する点を求める。この交差する点は、中心方向上の直線の交点により求めることができる。輝度ピークの位置をそれぞれ(x1,y1)、(x2,y2)とし、勾配をそれぞれa1,a2とした場合、二つの頂点の交点は、下記式(6)および下記式(7)で求めることができる。
例えば、図12(b)のように複数の輝度ピークが同一コロニー内に現れる場合、図12(d)のように一方の輝度ピークから中心方向の交点への輝度の変化、および当該交点から他方の輝度ピークへの輝度の変化は小さくなる。これに対して、図12(c)のように輝度ピークが異なるコロニーに現れる場合、図12(e)のように一方の輝度ピークから中心方向の交点への輝度の変化、および当該交点から他方の輝度ピークへの輝度の変化は、コロニーの境界付近で大きくなる。そこで、一方の輝度ピークから中心方向の交点への輝度の変化、および当該交点から他方の輝度ピークへの輝度の変化において、所定のしきい値を超える部分が無ければ、それらの輝度ピークは同一のコロニー内に現れているものと判定することができる。
20 ピーク点検出部
30 菌検出部
40 近接ピーク点検出部
50 ピーク点方向検出部
60 ピーク点方向交差検出部
70 点間変化検出部
80 同一コロニー判定部
100 コロニーカウント装置
Claims (5)
- 培養された菌の画像を取得する画像取得部と、
前記菌の画像において、輝度ピークを検出するピーク検出部と、
前記ピーク検出部が検出した輝度ピークの数に基づいてコロニーをカウントするカウント部と、を備え、
前記カウント部は、複数の輝度ピークの周辺の輝度分布から各輝度ピーク周辺の輝度勾配を算出し、当該輝度勾配において輝度値の低い方から輝度値の高い方に直線を引いた場合に各輝度ピークから当該直線の交点までに輝度値の変化が所定のしきい値を超える部分をまたぐか否かを判定し、またがないと判定した場合に、当該複数の輝度ピークを1つの輝度ピークとしてカウントすることを特徴とするコロニーカウント装置。 - 前記複数の輝度ピークの距離は、所定のしきい値以下であることを特徴とする請求項1記載のコロニーカウント装置。
- 前記菌は、黄色ブドウ球菌であることを特徴とする請求項1または2に記載のコロニーカウント装置。
- 培養された菌の画像を取得し、
前記菌の画像において、輝度ピークを検出し、
検出された輝度ピークの数に基づいてコロニーをカウントし、
前記カウントの際に、複数の輝度ピークの周辺の輝度分布から各輝度ピーク周辺の輝度勾配を算出し、当該輝度勾配において輝度値の低い方から輝度値の高い方に直線を引いた場合に各輝度ピークから当該直線の交点までに輝度値の変化が所定のしきい値を超える部分をまたぐか否かを判定し、またがないと判定した場合に、当該複数の輝度ピークを1つの輝度ピークとしてカウントすることを特徴とするコロニーカウント方法。 - コンピュータに、
培養された菌の画像を取得するステップと、
前記菌の画像において、輝度ピークを検出するステップと、
検出された輝度ピークの数に基づいてコロニーをカウントするステップと、を実行させ、
前記カウントするステップにおいて、複数の輝度ピークの周辺の輝度分布から各輝度ピーク周辺の輝度勾配を算出し、当該輝度勾配において輝度値の低い方から輝度値の高い方に直線を引いた場合に各輝度ピークから当該直線の交点までに輝度値の変化が所定のしきい値を超える部分をまたぐか否かを判定し、またがないと判定した場合に、当該複数の輝度ピークを1つの輝度ピークとしてカウントすることを特徴とするコロニーカウントプログラム。
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