JP2015029504A - コロニーカウント装置、コロニーカウント方法、およびコロニーカウントプログラム - Google Patents
コロニーカウント装置、コロニーカウント方法、およびコロニーカウントプログラム Download PDFInfo
- Publication number
- JP2015029504A JP2015029504A JP2013163602A JP2013163602A JP2015029504A JP 2015029504 A JP2015029504 A JP 2015029504A JP 2013163602 A JP2013163602 A JP 2013163602A JP 2013163602 A JP2013163602 A JP 2013163602A JP 2015029504 A JP2015029504 A JP 2015029504A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- luminance
- colony
- peak
- peaks
- image
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Images
Landscapes
- Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
Abstract
【解決手段】 コロニーカウント装置は、培養された菌の画像を取得する画像取得部と、前記菌の画像において、輝度ピークを検出するピーク検出部と、前記ピーク検出部が検出した輝度ピークの数に基づいてコロニーをカウントするカウント部と、を備える。
【選択図】 図3
Description
p(a,b)≦P(x,y) a,bは(a−x)2+(b−y)2≦r12を満たす範囲。
p(c,d)≦P(x,y)−t c,dは(r12≦(x−c)2+(y−d)2≦r22を満たす範囲。
まず、近接ピーク点検出部40は、互いの距離がしきい値以下となる複数の輝度ピークを検出する。ピーク点方向検出部50は、これらの輝度ピークから見た、コロニーの中心方向を検出する。コロニーの周りの輝度は、コロニー内の輝度より低いため、光沢周辺において輝度が低い方向から高い方向を求めることで中心方向を検出することができる。すなわち、輝度勾配を求めることによって、中心方向を検出することができる。図11(a)は、各光沢3における輝度勾配を表す図である。輝度勾配の検出方法として、以下のような方法が考えられる。まず、図11(b)を参照して、輝度ピークについて、その周辺の画素情報を取得し、上側、下側、右側、左側の指定サイズの領域について、その輝度の平均を検出する。それぞれをAu,Ad,Ar,Alとすると、輝度の勾配方向(勾配角度θ)は、下記式(4)で表すことができる。
ピーク点方向交差検出部60は、中心方向が交差する点を求める。この交差する点は、中心方向上の直線の交点により求めることができる。輝度ピークの位置をそれぞれ(x1,y1)、(x2,y2)とし、勾配をそれぞれa1,a2とした場合、二つの頂点の交点は、下記式(6)および下記式(7)で求めることができる。
例えば、図12(b)のように複数の輝度ピークが同一コロニー内に現れる場合、図12(d)のように一方の輝度ピークから中心方向の交点への輝度の変化、および当該交点から他方の輝度ピークへの輝度の変化は小さくなる。これに対して、図12(c)のように輝度ピークが異なるコロニーに現れる場合、図12(e)のように一方の輝度ピークから中心方向の交点への輝度の変化、および当該交点から他方の輝度ピークへの輝度の変化は、コロニーの境界付近で大きくなる。そこで、一方の輝度ピークから中心方向の交点への輝度の変化、および当該交点から他方の輝度ピークへの輝度の変化において、所定のしきい値を超える部分が無ければ、それらの輝度ピークは同一のコロニー内に現れているものと判定することができる。
20 ピーク点検出部
30 菌検出部
40 近接ピーク点検出部
50 ピーク点方向検出部
60 ピーク点方向交差検出部
70 点間変化検出部
80 同一コロニー判定部
100 コロニーカウント装置
Claims (8)
- 培養された菌の画像を取得する画像取得部と、
前記菌の画像において、輝度ピークを検出するピーク検出部と、
前記ピーク検出部が検出した輝度ピークの数に基づいてコロニーをカウントするカウント部と、を備えることを特徴とするコロニーカウント装置。 - 前記カウント部は、複数の輝度ピークから、輝度値の低い方から輝度値の高い方に直線を引いた場合に、当該複数の直線が、輝度値の変化が所定のしきい値を超える部分をまたぐ場合、当該複数の輝度ピークを1つの輝度ピークとしてカウントすることを特徴とする請求項1記載のコロニーカウント装置。
- 前記複数の輝度ピークの距離は、所定のしきい値以下であることを特徴とする請求項2記載のコロニーカウント装置。
- 前記カウント部は、複数の輝度ピークから、輝度値の低い方から輝度値の高い方に直線を引いた場合に、当該複数の直線の交点と、当該複数の輝度ピークとの距離がしきい値以下であれば、当該複数の輝度ピークを1つの輝度ピークとしてカウントすることを特徴とする請求項1記載のコロニーカウント装置。
- 前記カウント部は、複数の輝度ピーク間が、輝度値の変化が所定のしきい値を超える部分をまたぐ場合、当該複数の輝度ピークを1つの輝度ピークとしてカウントすることを特徴とする請求項1記載のコロニーカウント装置。
- 前記菌は、黄色ブドウ球菌であることを特徴とする請求項1〜5のいずれか一項に記載のコロニーカウント装置。
- 培養された菌の画像を取得し、
前記菌の画像において、輝度ピークを検出し、
検出された輝度ピークの数に基づいてコロニーをカウントする、ことを特徴とするコロニーカウント方法。 - コンピュータに、
培養された菌の画像を取得するステップと、
前記菌の画像において、輝度ピークを検出するステップと、
検出された輝度ピークの数に基づいてコロニーをカウントするステップと、を実行させることを特徴とするコロニーカウントプログラム。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2013163602A JP6229365B2 (ja) | 2013-08-06 | 2013-08-06 | コロニーカウント装置、コロニーカウント方法、およびコロニーカウントプログラム |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2013163602A JP6229365B2 (ja) | 2013-08-06 | 2013-08-06 | コロニーカウント装置、コロニーカウント方法、およびコロニーカウントプログラム |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2015029504A true JP2015029504A (ja) | 2015-02-16 |
JP6229365B2 JP6229365B2 (ja) | 2017-11-15 |
Family
ID=52515375
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2013163602A Active JP6229365B2 (ja) | 2013-08-06 | 2013-08-06 | コロニーカウント装置、コロニーカウント方法、およびコロニーカウントプログラム |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP6229365B2 (ja) |
Cited By (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2016158577A (ja) * | 2015-03-03 | 2016-09-05 | 富士フイルム株式会社 | 細胞コロニー検出装置および方法並びにプログラム |
EP3115929A1 (en) * | 2015-07-06 | 2017-01-11 | Fujitsu Limited | Image apparatus, image processing method and image processing program |
CN106337019A (zh) * | 2014-12-26 | 2017-01-18 | 富士通株式会社 | 图像设备和图像处理方法 |
JP2019080578A (ja) * | 2019-02-27 | 2019-05-30 | 富士フイルム株式会社 | 細胞コロニー検出装置および方法並びにプログラム |
US11010590B2 (en) | 2017-09-25 | 2021-05-18 | Olympus Corporation | Image processing device, cell-cluster recognition apparatus, cell-cluster recognition method, and cell-cluster recognition program for binarizing and segmenting smoothed cell image in which gap between cells in each cell cluster is filled in |
CN113159262A (zh) * | 2020-04-09 | 2021-07-23 | 英特科学公司 | 微生物学中应用于菌落计数器的图像处理方法 |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2000039329A1 (fr) * | 1998-12-28 | 2000-07-06 | Sapporo Breweries Ltd. | Procede de comptage de micro-organismes et dispositif permettant d'effectuer ledit comptage |
-
2013
- 2013-08-06 JP JP2013163602A patent/JP6229365B2/ja active Active
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2000039329A1 (fr) * | 1998-12-28 | 2000-07-06 | Sapporo Breweries Ltd. | Procede de comptage de micro-organismes et dispositif permettant d'effectuer ledit comptage |
Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN106337019A (zh) * | 2014-12-26 | 2017-01-18 | 富士通株式会社 | 图像设备和图像处理方法 |
US9996937B2 (en) | 2014-12-26 | 2018-06-12 | Fujitsu Limited | Image apparatus, image processing method, and computer readable, non-transitory medium |
JP2016158577A (ja) * | 2015-03-03 | 2016-09-05 | 富士フイルム株式会社 | 細胞コロニー検出装置および方法並びにプログラム |
EP3115929A1 (en) * | 2015-07-06 | 2017-01-11 | Fujitsu Limited | Image apparatus, image processing method and image processing program |
US11010590B2 (en) | 2017-09-25 | 2021-05-18 | Olympus Corporation | Image processing device, cell-cluster recognition apparatus, cell-cluster recognition method, and cell-cluster recognition program for binarizing and segmenting smoothed cell image in which gap between cells in each cell cluster is filled in |
JP2019080578A (ja) * | 2019-02-27 | 2019-05-30 | 富士フイルム株式会社 | 細胞コロニー検出装置および方法並びにプログラム |
CN113159262A (zh) * | 2020-04-09 | 2021-07-23 | 英特科学公司 | 微生物学中应用于菌落计数器的图像处理方法 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP6229365B2 (ja) | 2017-11-15 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6229365B2 (ja) | コロニーカウント装置、コロニーカウント方法、およびコロニーカウントプログラム | |
JP5742399B2 (ja) | 画像処理装置及びプログラム | |
JP5765026B2 (ja) | 画像処理装置及びプログラム | |
US20130107010A1 (en) | Surface segmentation from rgb and depth images | |
JP6317725B2 (ja) | 取得された画像内のクラッタを決定するためのシステム及び方法 | |
Lopez-Molina et al. | Generating fuzzy edge images from gradient magnitudes | |
JP5339065B2 (ja) | 対象物追跡装置 | |
JP2012115342A5 (ja) | ||
US10304202B2 (en) | Evaluation device for skin texture based on skin blob and method thereof | |
JP2018181333A5 (ja) | ||
US20150227789A1 (en) | Information processing apparatus, information processing method, and program | |
US20120207379A1 (en) | Image Inspection Apparatus, Image Inspection Method, And Computer Program | |
JP2013206259A (ja) | 部位推定装置、部位推定方法、および部位推定プログラム | |
CN110832542B (zh) | 识别处理设备、识别处理方法和程序 | |
JP2018152055A (ja) | ビジョンシステムにおいてカラー画像と対照してカラーの候補ポーズをスコアリングするためのシステム及び方法 | |
JP6975177B2 (ja) | 生物学的対象物の検出 | |
JP5780791B2 (ja) | 細胞の追跡処理方法 | |
US11030751B2 (en) | Cell image evaluation device, method, and program | |
JP2016116461A (ja) | 細胞判定方法、細胞数計測方法 | |
JP2011233060A (ja) | 物体認識装置、物体認識方法、及びコンピュータプログラム | |
JP2010271921A (ja) | 皮膚領域抽出方法、皮膚領域抽出装置、および皮膚領域抽出プログラム | |
CN104881652B (zh) | 一种基于玉米穗凸性特征的行数自动检测方法 | |
JP2010117229A (ja) | 高さ情報取得装置、高さ情報取得方法、及びプログラム | |
WO2019181072A1 (ja) | 画像処理方法、コンピュータプログラムおよび記録媒体 | |
JP2019091308A (ja) | 対象物検出器、画像解析装置、対象物検出方法、画像解析方法、プログラム、及び、学習データ |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20160510 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20170127 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20170207 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20170407 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20170919 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20171002 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6229365 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |