JP6166349B2 - 植物の生育に関するaba応答のための合成化合物 - Google Patents
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Description
本願は、その全体が参照により本明細書に援用される、2012年3月30日に出願された米国仮特許出願第61/618,386号に対する優先権の利益を主張する。
本発明は、全米科学財団により授与された助成金番号DGE0504249およびIOS0820508に基づく政府支援を受けてなされた。政府は、本発明における特定の権利を有する。
アブシジン酸(ABA)は、非生物的ストレス応答に関連付けられるシグナル伝達を調節する植物ホルモンである(Cutler et al.,2010,Abscisic Acid:Emergence of a Core Signaling Network.Annual Review of Plant Biology61:651−679)。ABAシグナル経路は、多数のアプローチを介して、植物ストレス応答および関連する生産特性を改善するために利用されている(Yang et al.,2010)。ABAの植物への直接的な適用は、それらの水利用効率を改善し(Raedmacher et al.,1987)、この理由のため、ABAアゴニストの発見(Park et al.,2009;Melcher et al.,2010,Identification and mechanism of ABA receptor antagonism. Nature Structural & Molecular Biology17(9):1102−1110)は、かかる分子が作物生産高を改善するために有益でありうる(Notman et al.,2009)ため、ますます注目を受けている。最初に特定された合成ABAアゴニストは、ピラバクチンと称されるナフタレンスルホンアミドであり(Park et al.,2009)、それは種子におけるABAシグナル伝達を効率的に活性化するが、非生物学的ストレス耐性の最も決定的な側面が発生する栄養組織においては限られた活性を有する。ピラバクチンに高度に類似したスルホンアミドは、ABAアゴニスト(米国特許出願公開第20130045952号参照)および非生物的ストレス調整化合物(米国特許出願公開第20110230350号参照)として開示されており、また非スルホンアミドABAアゴニストも説明されている(米国特許出願公開第20130045952号および同第20110271408号参照)。ABA経路の活性化への補完的なアプローチは、遺伝学的方法を介してABAに対する植物の感受性を増加させることに関する。例えば、ファルネシルトランスフェラーゼβサブユニット遺伝子の条件的アンチセンスは、植物のABA感受性を増加させ、アブラナおよびシロイヌナズナの双方において、適度な乾燥下での生産高を改善する(Wang et al.,2005)。このように、生産高に寄与する特性を改善するためのABAシグナル伝達の操作が、現在良好に確立されている。
式中、
R1は、H、C1〜6アルキル、C2〜6アルケニル、C2〜6アルキニル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群から選択され、
R2は、それぞれ1〜4個のR2a基で置換されていてもよい、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群から選択され、
各R2aは独立して、H、ハロゲン、C1〜6アルキル、C1〜6アルコキシ、C1〜6ハロアルキル、C1〜6ハロアルコキシ、C2〜6アルケニル、C2〜6アルキニル、−OH、C1〜6アルキルヒドロキシ、−CN、−NO2、−C(O)R2b、−C(O)OR2b、−OC(O)R2b、−C(O)NR2bR2c、−NR2bC(O)R2c、−SO2R2b、−SO2OR2b、−SO2NR2bR2c、および−NR2bSO2R2cからなる群から選択され、
R2bおよびR2cのそれぞれは独立して、HおよびC1〜6アルキルからなる群から選択され、
R3、R4、およびR5のそれぞれは独立して、HおよびC1〜6アルキルからなる群から選択され、
Lは、結合およびC1〜6アルキレンからなる群から選択されるリンカーであり、
下付文字mは、0〜4の整数であり、
下付文字nは、0〜3の整数である。
[本発明1001]
式Iの化合物またはその塩もしくは異性体を含む、農業用製剤:
式中、
R 1 は、H、C 1〜6 アルキル、C 2〜6 アルケニル、C 2〜6 アルキニル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群から選択され、
R 2 は、それぞれ1〜4個のR 2a 基で置換されていてもよい、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群から選択され、
各R 2a は独立して、H、ハロゲン、C 1〜6 アルキル、C 1〜6 アルコキシ、C 1〜6 ハロアルキル、C 1〜6 ハロアルコキシ、C 2〜6 アルケニル、C 2〜6 アルキニル、−OH、C 1〜6 アルキルヒドロキシ、−CN、−NO 2 、−C(O)R 2b 、−C(O)OR 2b 、−OC(O)R 2b 、−C(O)NR 2b R 2c 、−NR 2b C(O)R 2c 、−SO 2 R 2b 、−SO 2 OR 2b 、−SO 2 NR 2b R 2c 、および−NR 2b SO 2 R 2c からなる群から選択され、
R 2b およびR 2c のそれぞれは独立して、HおよびC 1〜6 アルキルからなる群から選択され、
R 3 、R 4 、およびR 5 のそれぞれは独立して、HおよびC 1〜6 アルキルからなる群から選択され、
Lは、結合およびC 1〜6 アルキレンからなる群から選択されるリンカーであり、
下付文字mは、0〜4の整数であり、
下付文字nは、0〜3の整数である。
[本発明1002]
前記化合物が、式:
を有する、本発明1001の製剤。
[本発明1003]
前記化合物が、式:
を有する、本発明1002の製剤。
[本発明1004]
R 1 が、C 1〜6 アルキルであり、かつ
R 2 が、それぞれ1〜4個のR 2a 基で置換されていてもよい、アリールおよびヘテロアリールからなる群から選択される、本発明1002の製剤。
[本発明1005]
各R 2a が独立して、H、ハロゲン、およびC 1〜6 アルキルからなる群から選択される、本発明1004の製剤。
[本発明1006]
R 2 が、フェニル、ナフチル、チオフェン、フラン、ピロール、およびピリジルからなる群から選択される、本発明1004の製剤。
[本発明1007]
R 1 が、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、iso−ブチル、sec−ブチル、tert−ブチル、ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、およびヘキシルからなる群から選択され、
R 2 が、それぞれ1個のR 2a 基で置換されていてもよい、フェニルおよびチオフェンからなる群から選択され、
各R 2a が独立して、H、F、Cl、メチル、およびエチルからなる群から選択され、かつ
Lが、結合およびメチレンからなる群から選択される、本発明1004の製剤。
[本発明1008]
前記化合物が、式:
を有する、本発明1007の製剤。
[本発明1009]
前記化合物が、式:
を有する、本発明1007の製剤。
[本発明1010]
前記化合物が、図14または18に示される化合物のうちの1つである、本発明1001の製剤。
[本発明1011]
前記化合物が、
である、本発明1001の製剤。
[本発明1012]
殺真菌剤、除草剤、駆除剤、殺線虫剤、殺虫剤、植物活性剤、共力剤、除草剤毒性緩和剤、植物成長調節剤、防虫剤、殺ダニ剤、軟体動物駆除剤、または肥料のうちの少なくとも1つを更に含む、本発明1001の製剤。
[本発明1013]
界面活性剤を更に含む、本発明1001の製剤。
[本発明1014]
担体を更に含む、本発明1001の製剤。
[本発明1015]
植物における非生物的ストレス耐性を増加させる方法であって、植物を本発明1001〜1014のいずれかの製剤と接触させないことに比べて該植物における非生物学的ストレス耐性を増加させるのに十分な量の該製剤と、該植物を接触させるステップを含む、方法。
[本発明1016]
前記植物が単子葉植物である、本発明1015の方法。
[本発明1017]
前記植物が双子葉植物である、本発明1015の方法。
[本発明1018]
前記非生物的ストレス耐性が乾燥耐性を含む、本発明1015の方法。
[本発明1019]
前記接触させるステップが、航空機または潅水によって前記製剤を前記植物に送達することを含む、本発明1015の方法。
[本発明1020]
植物における種子発芽を抑制する方法であって、種子を、発芽を抑制するのに十分な量の本発明1001〜1014のいずれかの製剤と接触させるステップを含む、方法。
[本発明1021]
本発明1001〜1014のいずれかの製剤と接触している、植物。
[本発明1022]
前記植物が種子である、本発明1021の植物。
[本発明1023]
PYR/PYLタンパク質を活性化する方法であって、該PYR/PYLタンパク質を、本発明1001〜1014のいずれかの化合物と接触させるステップを含む、方法。
[本発明1024]
前記PYR/PYLタンパク質が細胞によって発現される、本発明1023の方法。
[本発明1025]
前記細胞が植物細胞である、本発明1024の方法。
[本発明1026]
前記PYR/PYLタンパク質が内因性タンパク質である、本発明1024の方法。
[本発明1027]
前記PYR/PYLタンパク質が異種タンパク質である、本発明1024の方法。
[本発明1028]
前記細胞が2型タンパク質ホスファターゼ(PP2C)を更に発現する、本発明1024の方法。
[本発明1029]
前記2型タンパク質ホスファターゼが、HAB1(Homology to ABI1)、ABI1(Abscisic acid insensitive 1)、またはABI2(Abscisic acid insensitive 2)である、本発明1028の方法。
「アゴニスト」は、例えば、説明される標的タンパク質の発現を誘発もしくは活性化する、または、1つ以上の植物PYR/PYLタンパク質(またはコードしているポリヌクレオチド)に結合、刺激、増加、開放、活性化、促進、活性を強化、感作、もしくはそれらの活性を上方制御する、作用物質である。アゴニストは、自然発生的分子および合成分子を含むことができる。幾つかの実施形態では、アゴニストは、農業用製剤を製造するために農薬と組み合わせられる。好適な農薬の例としては、殺真菌剤、除草剤、駆除剤、肥料、および/または界面活性剤が挙げられる。アゴニストがPYR/PYLタンパク質を「刺激する」または「刺激しない」かどうかを決定するための分析としては、例えば、本明細書に説明される通り、推定アゴニストを精製したPYR/PYLタンパク質に接触させ、次にPYR/PYLタンパク質活性における機能的効果を決定すること、または本明細書に説明される通り、推定アゴニストをPYR/PYLタンパク質を発現している細胞に接触させ、次に説明される標的タンパク質活性における機能的効果を決定することが挙げられる。当業者であれば、アゴニストがPYR/PYLタンパク質を刺激するかまたは刺激しないかを決定するために、分析が好適であるかを決定できるであろう。推定アゴニストで処理されるPYR/PYLタンパク質を含む試料または分析は、効果の範囲を検証するためにアゴニストを伴わない対照試料と比較される。対照試料(アゴニストで処理されていない)は、100%の相対的活性値を割り当てられる。PYR/PYLタンパク質のアゴニズムは、対照に対する活性値が110%、任意で150%、任意で200、300%、400%、500%、もしくは1000〜3000%、またはそれ以上であるときに、達成される。
(1)アラニン(A)、セリン(S)、トレオニン(T);
(2)アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E);
(3)アスパラギン(N)、グルタミン(Q);
(4)アルギニン(R)、リジン(K);
(5)イソロイシン(I)、ロイシン(L)、メチオニン(M)、バリン(V);および
(6)フェニルアラニン(F)、チロシン(Y)、トリプトファン(W)。
(例えば、Creighton,Proteins(1984)を参照。)
I.導入
本発明は、一部には、選択的アブシジン酸(ABA)アゴニストの発見に基づく。これまでのABAアゴニストと異なり、本明細書で説明されるアゴニストは、植物栄養組織内のABA経路を強力に活性化し、非生物的ストレス耐性を誘発する。新規のアゴニストは、植物の作物種におけるストレス耐性を誘発するために使用されることができる。アゴニストは、ブロッコリー、ハツカダイコン、アルファルファ、ダイズ、オオムギ、およびコーン(トウモロコシ)を含むがそれらに限定されない、単子葉および双子葉植物種におけるストレス耐性を誘発するために使用されることができる。
本発明は、小分子ABAアゴニスト、すなわち、PYR/PYLタンパク質を活性化する化合物を提供する。例示的なABAアゴニストとしては、例えば、以下から選択される化合物が挙げられる:
式Iの化合物、またはその塩もしくは異性体:
式中、
R1は、H、C1〜6アルキル、C2〜6アルケニル、C2〜6アルキニル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群から選択され、
R2は、それぞれ1〜4個のR2a基で置換されていてもよい、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群から選択され、
各R2aは独立して、H、ハロゲン、C1〜6アルキル、C1〜6アルコキシ、C1〜6ハロアルキル、C1〜6ハロアルコキシ、C2〜6アルケニル、C2〜6アルキニル、−OH、C1〜6アルキルヒドロキシ、−CN、−NO2、−C(O)R2b、−C(O)OR2b、−OC(O)R2b、−C(O)NR2bR2c、−NR2bC(O)R2c、−SO2R2b、−SO2OR2b、−SO2NR2bR2c、および−NR2bSO2R2cからなる群から選択され、
R2bおよびR2cのそれぞれは独立して、HおよびC1〜6アルキルからなる群から選択され、
R3、R4、およびR5のそれぞれは独立して、HおよびC1〜6アルキルからなる群から選択され、
Lは、結合およびC1〜6アルキレンからなる群から選択されるリンカーであり、
下付文字mは、0〜4の整数であり、
下付文字nは、0〜3の整数である。
本発明は、植物に対する接触のために製剤化される農業用化学製剤であって、本発明のABAアゴニストを含む、農業用製剤を提供する。幾つかの実施形態では、アゴニストと接触させられる植物は、内因性PYR/PYLポリペプチドを含むかまたは発現する。幾つかの実施形態では、アゴニストと接触させられる植物は、異種PYR/PYLポリペプチドを含まないかまたは発現しない(例えば、植物は、遺伝子導入でないか、または、遺伝子導入であるが異種PYR/PYLタンパク質以外の異種タンパク質を発現する)。幾つかの実施形態では、アゴニストと接触させられる植物は、本明細書に説明されるような異種PYR/PYLポリペプチドを含むかまたは発現する。
ABAアゴニストの製剤および組成物は、様々な既知の方法を用いて、例えば、繁殖材料上に組成物を噴霧する、霧化する、浸す、注入する、潅水する、まぶす、もしくは散布すること、または、植物の上に組成物を、ブラシで塗る、もしくは注ぐ、もしくはそうでなければ接触させることによって、あるいは、播種の場合には、種子を液体組成物でコーティングする、種子を液体組成物中に封入する、種子に液体組成物を噴霧する、種子を液体組成物中に浸す、種子を液体組成物中に浸漬する、もしくはそうでなければ種子を処理することによって、植物に適用されることができる。植物または種子を植え付け前に直接処理することの代わりに、本発明の製剤は、その中に種子が植え付けられる土壌または他の媒体中に導入されることもできる。例えば、製剤は、噴霧すること、散布すること、注入すること、潅水すること、ないしはそうでなければ土壌を処理することによって、土壌中に導入されることができる。幾つかの実施形態では、担体もこの実施形態において使用される。担体は、上述の通り、固体または液体であることができる。幾つかの実施形態では、泥炭がABAアゴニストの担体として水中に懸濁され、この混合物が、土壌もしくは植え付け媒体中に、および/または種子の上に植え付け時に噴霧される。
本発明の実施形態はまた、推定化学的アゴニストをスクリーニングして、この推定アゴニストが、PYR/PYL受容体ポリペプチドに接触するときに、PYR/PYL受容体ポリペプチドを刺激するかどうかを決定するための方法を提供する。本明細書で使用するとき、作用物質は、その作用物質の存在が、例えば、PYR/PYL受容体からの下流シグナル伝達を増大させるように、受容体活性の活性化または上方制御をもたらすならば、PYR/PYL受容体タンパク質を「刺激する」。本発明に関して、作用物質は、作用物質が200μΜ以下の濃度で存在するとき、作用物質のPYR/PYL受容体への接触が、PYR/PYL受容体活性の活性化または上方制御をもたらすならば、PYR/PYL受容体を刺激する。作用物質が200μΜ以下の濃度で存在するとき、作用物質がPYR/PYL受容体タンパク質活性の活性化または上方制御を誘発しないならば、作用物質は、PYR/PYL受容体を著しく刺激しない。本明細書で使用するとき、「活性化」は、作用物質によって誘発されるべき活性の最小閾値を必要とする。この活性の最小閾値が満たされたかどうかの決定は、例えば、誘発されるべき酵素活性のレベルの最小値を設定する酵素的ホスファターゼ分析を用いて、または比色検出試薬(例えば、パラニトロフェニルリン酸)の存在下で、色の変化が観察されると活性の最小閾値が満たされる酵素的ホスファターゼ分析を用いて、達成することができる。
任意で、PYR/PRLポリペプチドに結合することが可能な作用物質についてスクリーニングすることによって、そのように同定された作用物質のうちの少なくとも幾つかがおそらくPYR/PYLポリペプチド調整物質であるように、予備スクリーニングを実施することができる。
PYR/PYLポリペプチドアゴニストは、PYR/PYLポリペプチドの活性を活性化するまたは増加させる作用物質についてスクリーニングすることによって、同定することができる。アンタゴニストは、活性を減少させることによって同定することができる。
PYR/PYLポリペプチドの発現を増加させる化合物についてのスクリーニングも提供される。スクリーニング法は概して、試験化合物を、PYR/PYLポリペプチドを発現する1つ以上の細胞に接触させて、次にPYR/PYL発現における増加(転写産物かまたは翻訳産物かのいずれか)を検出する、細胞に基づいた、または植物に基づいた分析を実施することに関する。分析は、PYR/PYLを自然に発現する細胞を用いて、またはPYR/PYLを発現するように組み換え技術によって変更された細胞において、またはPYR/PYLプロモーターの制御下でレポーター遺伝子を発現するように組み換え技術によって変更された細胞において、実施されることができる。
前述のスクリーニング法のいずれかによって初めに同定された作用物質は、見かけの活性を検証するため、および/または作用物質の他の生物学的効果を決定するために更に試験することができる。幾つかの場合、同定される作用物質は、植物ストレス(例えば、乾燥耐性)、種子発芽、またはABAによって影響を受ける別の表現型をもたらす能力に関して試験される。多数のかかる分析および表現型は、当該技術分野において既知であり、本発明の方法に従って採用されることができる。
本発明のハイスループット分析では、1日で最大数千の異なる調整物質またはリガンドをスクリーニングすることが可能である。具体的には、マイクロタイタープレートの各ウェルが、選択した可能性のある調整物質に対する別々の分析を実行するために使用することができ、または、濃度もしくはインキュベーション時間効果を観察すべき場合、5〜10ウェルの全てが単一の調整物質を試験することができる。したがって、単一の標準マイクロタイタープレートは、約100個(例えば、96個)の調整物質を分析することができる。1536ウェルプレートを使用する場合であれば、単一のプレートは、約100〜約1500個の異なる化合物を容易に分析することができる。1日あたり幾つかの異なるプレートを分析することが可能であり、最大約6,000〜20,000個またはそれを超える異なる化合物に関する分析スクリーニングが、本発明の統合システムを用いて可能である。それに加えて、試薬操作に対するマイクロ流体アプローチを使用することができる。
本発明はまた、植物における非生物的ストレス耐性を増加させる方法も提供する。したがって、幾つかの実施形態では、植物は、植物における非生物的ストレス耐性を増加させるのに十分な量で、本明細書に説明されるABAアゴニスト、またはABAアゴニスト製剤と接触させられる。植物に適用されるABAアゴニスト製剤の量は、植物をABAアゴニスト製剤と接触させないことに比べて非生物的ストレス耐性を増加させるのに十分であることができる。植物は、本明細書に説明される方法のいずれかを用いて、ABA製剤と接触させることができる。非生物的ストレス耐性における増加は、植物の成長または生存に悪影響を及ぼす非生物的ストレス条件に対する植物成長および/または生存を改善することができる。非生物的ストレスは、本明細書に説明される物理的または化学的条件を含む。
本発明はまた、種子発芽を抑制する方法も提供する。したがって、幾つかの実施形態では、植物、植物部位、または種子は、種子発芽を抑制するのに十分な量のABAアゴニスト製剤と接触させられる。種子は、本明細書に説明される方法のいずれかを用いてABA製剤と接触させることができる。幾つかの実施形態では、種子は、ABAアゴニスト製剤と直接接触させられる。幾つかの実施形態では、地面または土壌は、植え付けまたは種子の播種の前かまたは後かのいずれかに、ABAアゴニスト製剤と接触させられる。幾つかの実施形態では、植物は、その後に植物から成長する種子の発芽を抑制するのに十分なABAアゴニスト製剤と接触させられる。
本発明はまた、PYR/PYL受容体ポリペプチドを活性化する方法も提供する。幾つかの実施形態では、PYR/PYLポリペプチドは、上述の化合物と接触させられ、活性化されたPYR/PYLポリペプチドは、PP2Cポリペプチドに結合する。幾つかの実施形態では、PYR/PYLポリペプチドは、アゴニスト化合物LC66C6によって活性化されることが可能である。幾つかの実施形態では、活性化されるPYR/PYLタンパク質は、配列番号:1〜119のうちの任意のものと実質的に同一である。様々な植物からのABA受容体の配列の例は、その全体が参照により本明細書に援用される米国特許出願公開第2011/0271408号に提供される。
この実施例は、本明細書で説明される新規のABAアゴニストが、多数のPYR/PYL受容体に結合し、活性化することを実証する。
化学的スクリーニング
前述の酵母ツーハイブリッドシステムを、ハイスループットスクリーニング(HTS)において用いて、ABAアゴニストを特定した(Peterson FC,et al.(2010)Structural basis for selective activation of ABA receptors.Nature Structural&Molecular Biology17(9):1109−1111参照)。このシステムでは、アゴニスト促進性受容体−PP2C相互作用は、URA3またはHIS3レポーター遺伝子の発現を引き起こし、親株のウラシルまたはヒスチジン要求性を救出する。(Peterson FC, et al.(2010);Vidal M, Brachmann RK, Fattaey A, Harlow E, & Boeke JD (1996) Reverse two−hybrid and one−hybrid systems to detect dissociation of protein−protein and DNA−protein interactions. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 93(19):10315−10320)。HTSを、PYR1、PYL1、PYL2、PYL3、またはPYL4に対する結合ドメイン(BD)融合を発現する5個の異なるレポーター株を用いて実施した。これらは、HAB1(pACT−HAB1)に対する活性化ドメイン(AD)融合と共発現され、使用した構築体は、これまでに説明されている(Park et al.2009)。これらの株を、2つの別々のスクリーニングに利用した。第1のスクリーニングでは、Chembridge(San Diego,米国)から得した約65,000個の化合物を、本質的にGassner NC,et al.(2007)に説明される通りに、ハローアッセイ法を用いてアゴニスト活性に関して分析した(Accelerating the discovery of biologically active small molecules using a high−throughput yeast halo assay.Journal of Natural Products70(3):383−390)。この方法では、酵母株を、10mMのDMSO貯蔵液から分析プレート上に移動させた選択的寒天および化合物ピン内に埋め込み、ヒットは、活性化合物周辺の増加された細胞密度によって明らかになる。ハローアッセイ法を用いる実験は、選択を向上するために酵母株PJ69−4Aおよび10mMの3−アミノトリアゾールを補充した培地を利用した。ハロースクリーニングを、自動マイクロプレートホテル(Thermo Cytomat)と、化合物を分析プレート上に配置するために使用した384ピンツール(V&P Scientific)とを備えたBiomek FXを用いて組み立てた。各化学的転移の前に、ピンを、DMSO/水の1:1混合物中で洗浄し、その後95%エタノールで洗浄した。化学的転移の後、プレートを28℃でインキュベートし、候補アゴニストは手動検査により明らかであった。
HAB1およびPYLタンパク質を、わずかな改変を加えて、これまでに説明されている通りに発現させ、精製した(Park SY,et al.(2009)Abscisic Acid Inhibits Type 2C Protein Phosphatases via the PYR/PYL Family of START Proteins.Science324(5930):1068−1071)。GST−HAB1、−ABI1、および−ABI2融合タンパク質を得るために、HAB1 cDNAを、pGex−2Tへクローニングし、一方ABI1およびABI2 cDNAを、ベクターpGex−4T−1へクローニングした。発現は、BL21[DE3]pLysS宿主細胞内で実施した。転換した細胞を、一晩予備培養し、LB培地へ移動させ、約0.5のA600を培養するように30℃で培養した。培養物を次に氷上で冷却し、MnCl2を4mMまで添加し、またIPTGを0.3mMまで添加した。15℃にて16時間インキュベーション後、細胞を採取し、これまでに説明されている通り、グルタチオンアガロース上で組み換えタンパク質を精製した(Park SY,et al.(2009)。6×His−PYL受容体融合タンパク質を得るために、全13のABA受容体に関する受容体cDNAを、ベクターpET28へクローニングし、これまでに説明されている通りに発現させ、精製した(Mosquna A, et al.(2011)Potent and selective activation of abscisic acid receptors in vivo by mutational stabilization of their agonist−bound conformation.PNAS108(51):20838−20843)。これは、可溶性および機能性タンパク質をPYL7、PYL11、およびPYL12以外の全ての受容体に関して生成した(受容体媒介性PP2C抑制分析を用いて分析した)。これら3個の受容体はしたがって、ベクターpMAL−cを用いてマルトース結合(MBP)融合タンパク質として代わりに発現され、これらの構築体の発現は、GST−HAB1に関して使用したものと同一の誘発条件でBL21[DE3]pLysS宿主株内で行った。組み換えMBP−PYL融合タンパク質を、アミロース樹脂(New England Biolab,Inc.)を用いて、製造者の精製説明書を用いて超音波分解および不要物除去した溶解物から精製した。この試みは、活性MBP−PYL11融合タンパク質を生成したが、PYL7およびPYL12に関しては生成しなかった。
この実施例は、新規のABAアゴニストが、発芽および植物成長を抑制することを実証する。
シロイヌナズナの発芽および胚軸成長の抑制分析のために、完熟後約4週の種子を、5%のNaClOおよび0.05%のTween−20を含有する溶液で10分間表面殺菌し、水で4回濯いだ。殺菌した種子を、0.1%の寒天で懸濁し、化学物質の存在下で、1/2のMurashige and Skoog(MS)塩(Sigma−Aldrich)を含有する0.8%固化寒天培地上に蒔き、4℃で4日間保管し、次に暗条件または明条件下で22℃に移した。発芽は4日間のインキュベーション後に決定し、一方胚軸成長は、6日間のインキュベーション後に撮影した。
次の対立遺伝子/変異体株を使用した:aba2−1(Leon−Kloosterziel KM,et al.(1996)Isolation and characterization of abscisic acid−deficient Arabidopsis mutants at two new loci.Plant J 10(4):655−661)、abil−1(Umezawa T,et al.(2009)Type 2C protein phosphatases directly regulate abscisic acid−activated protein kinases in Arabidopsis.Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 106(41):17588−17593)、abi3−9、abi4−11(Nambara E,et al.(2002)A screen for genes that function in abscisic acid signaling in Arabidopsis thaliana.Genetics161(3):1247−1255)、およびpry1pyl1pyl2ply44重体(Park SY,et al.(2009)Abscisic Acid Inhibits Type 2C Protein Phosphatases via the PYR/PYL Family of START Proteins.Science 324(5930):1068−1071);これらの株は全て、コロンビアバックグラウンドである。利用したpry1pyl1pyl2ply44重変異体ステインは、コロンビアに3回戻し交配した。オオムギおよびダイズ種子は、Living Whole Foods,Inc.,から購入し、一方トウモロコシ種子は、W.Atlee Burpee&Co.から得た。これらの材料を用いた生理学的実験に使用した詳細な方法は、サポート情報として提供される。
この実施例は、アゴニストLC66C6は、乾燥ストレス耐性を誘発することを実証する。
生理学的分析を、22±2℃および相対湿度(RH)45±10%にて16/8時間の明/暗サイクル下で成長させたシロイヌナズナ植物において実施した。シロイヌナズナにおける蒸散水分損失分析のため、植物を、25μΜの化合物および0.05%のTween−20を含有する4mlの溶液のエアロゾル噴霧によって予備処理した。化合物または分析対照1個あたり12個の4週齢の植物に噴霧した。化合物による一晩の予備処理後、地上部分を根から脱離させ、2時間にわたって20分間隔にてその生重量を測定した。気孔開口を測定するために、植物を、上述の化合物で予備処理し、プラスチック蓋で覆って高RHを維持し、一晩の予備処理後、葉表皮の模様を、鈴木式万能顕微鏡印画法(Suzuki's Universal Micro−Printing)(SUMP)法を用いて、SUMPインプレッション液(SUMP impression solution)をSUMP Bプレート(SUMP Laboratory)と共に用いて得た。葉の模様を光学顕微鏡検査によって分析し、気孔開口を、ImageJ1.43v software(National Institutes of Health,米国)を用いて孔幅から決定した。シロイヌナズナ乾燥ストレス分析に関して、約1.5mlの25μΜ化学溶液を、1日毎に3日間にわたりエアロゾルによって植物に適用した。植物を、ポット1個あたり100gの土壌を含有する四角い6×6×5cmのポット内で成長させた。ダイズ乾燥ストレス分析を、25±2℃、65±10%RH、16/8時間の明/暗サイクル下で成長させた植物において実施した。0.05%のTween−20を含有する約20mlの50μΜ化学溶液を、ポット1個あたり4回(ポット1個あたり3つの植物)、それぞれ3日間噴霧した。使用したポットは、250mlの大きさであり、ポット1個あたり200gの土壌を含有した。測定される水分損失が蒸散媒介であるように、ポットをパラフィルムで覆った。土壌水分含有量%を、ポット重量を測定し、乾燥土壌重量を総重量から除去することによってコンピュータ計算することによって決定した。
ダイズ、オオムギ、およびトウモロコシを用いた水分損失分析に関して、0.05%のTween−20を含有する100μΜの化学溶液を、植物の地上部に噴霧した。使用したダイズ、オオムギ、およびトウモロコシ植物は、それぞれ約4週齢、2週齢、および2週齢であった。化合物を、水分損失分析を実施する16時間前に適用した。水分損失を測定するために、シュート全体を脱離させ、その生重量を観察した。
この実施例は、LC66C6は、ABA応答性遺伝子を、(+)−ABAによって誘発されるものと同様の様式で誘発することを実証する。
全RNAを、RNAeasy Plant Mini Kit(Qiagen,米国)を用いて製造者の説明書に従って単離した。cDNA合成、標識、シロイヌナズナATH1チップ(Affymetrix,米国)に対するハイブリッド形成を、Affymetrixプロトコルを用いてUniversity of California at RiversideのIIGB Core Instrumentation Facilityによって実施した。3つ組の生物学的試料を、DMSO対照、ABA、ピラバクチン、およびキナバクチン処理のためにハイブリッド形成させ、化合物を、25μΜの最終濃度にて適用し、RNAを、化合物または対照への6時間の曝露後に凍結させた組織から調製した。プローブセットのための発現シグナルは、MAS5 Statistical Algorithm(Affymetrix,米国)によって算出および正規化した。全ての実験において、シグナルの存在に関して配列データの実験的フィルタリングを実施した。各化学処理における平均転写レベルを、その対照実験と比較し、変化倍数値をコンピュータ計算するために使用した。Log2変換した変化倍数値を使用して、実験条件間のピアソン相関係数をコンピュータ計算した。
全RNAを、植物RNA精製試薬(Invitrogen,米国)を用いて製造者の説明書に従って単離した。cDNAを、QantiTec reverse transcription kit(Qiagen,米国)を用いて1μgの全RNAから合成した。Maxima(登録商標)SYBR Green/Fluorescein qPCR Master Mix(Fermentas)を用いたリアルタイムPCRを、iQ5 real−time PCR detection system(Bio−Rad,Hercules,CA)を用いて実施した。標的mRNAの相対量を、相対標準曲線法を用いて決定し、内部対照mRNAの相対量によって正規化した。3つ組の生物学的実験を実施した。これらの実験に使用したプライマー配列を、表1に示す。
既存のABA応答性プロモーター−GUS融合は、本発明者らの実験においては、高いバックグラウンドレベルか、またはABAに対する応答における比較的低い誘発レベルかのいずれかの理由のため、理想的ではない。MAPKKK18は、低いバックグラウンドレベルを有する高度にABA誘発可能な遺伝子であり(Matsui A,et al.,Plant Cell Physiol49(8):1135−1149(2008))、MAPKKK18はまた、乾燥および塩ストレスによって強く誘発される。したがって、本発明者らは、MAPKKK18プロモーター::GUSレポーター遺伝子導入植物におけるアゴニストの効果を特徴決定した。GUS染色を、次の組成物の反応緩衝剤において実施した:50mMのリン酸ナトリウム緩衝剤 pH7.0、0.05%のTween−20、2.5mMのフェロシアン化カリウム、2.5mMのフェリシアン化カリウム、1mMのX−gluc。反応緩衝剤を、試験試料中に10分間2回、減圧湿潤させ、次に37℃で5時間インキュベートした。試料を70%のエタノールで洗浄することによって反応を停止し、65℃でのインキュベーションによってクロロフィル色素を脱色した。
この実施例は、ABA異化に関する鍵酵素は、LC66C6によって誘発される応答に影響しないことを実証する。
この実施例は、LC66C6が、単子葉植物および双子葉植物を含む多様な植物種において生物活性であることを示す。
この実施例は、ABAおよび本明細書に説明されるアゴニストの化学構造、ならびにインビトロおよびインビボでのアゴニストの効果を示す。
この実施例は、LC66C6が、ABA欠損変異体植物の大きさを増加させることができることを示す。
この実施例は、LC66C6が、コケにおける原糸体成長を弱く抑制することができるが、単細胞性緑藻類クラミドモナスの成長には効果を有さないことを示す。
Claims (29)
- 式Iの化合物またはその塩を含む、非生物学的ストレス耐性を増加させるための農業用製剤:
式中、
R1は、H、C1〜6アルキル、C2〜6アルケニル、C2〜6アルキニル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群から選択され、
R2は、それぞれ1〜4個のR2a基で置換されていてもよい、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群から選択され、
各R2aは独立して、H、ハロゲン、C1〜6アルキル、C1〜6アルコキシ、C1〜6ハロアルキル、C1〜6ハロアルコキシ、C2〜6アルケニル、C2〜6アルキニル、−OH、C1〜6アルキルヒドロキシ、−CN、−NO2、−C(O)R2b、−C(O)OR2b、−OC(O)R2b、−C(O)NR2bR2c、−NR2bC(O)R2c、−SO2R2b、−SO2OR2b、−SO2NR2bR2c、および−NR2bSO2R2cからなる群から選択され、
R2bおよびR2cのそれぞれは独立して、HおよびC1〜6アルキルからなる群から選択され、
R3、R4、およびR5のそれぞれは独立して、HおよびC1〜6アルキルからなる群から選択され、
Lは、結合およびC1〜6アルキレンからなる群から選択されるリンカーであり、
下付文字mは、0〜4の整数であり、
下付文字nは、0〜3の整数であり、
式中−N(R 5 )SO 2 LR 2 スルホンアミドが第6位にある。 - R 1 が、C 1〜6 アルキルであり、
R 2 が、それぞれ1〜4個のR 2a 基で置換されていてもよい、フェニルおよびチオフェンからなる群から選択され、かつ
各R 2a が独立して、ハロゲンおよびC 1〜6 アルキルからなる群から選択される、請求項2に記載の製剤。 - R1が、C1〜6アルキルであり、かつ
R2が、それぞれ1〜4個のR2a基で置換されていてもよい、アリールおよびヘテロアリールからなる群から選択される、請求項2に記載の製剤。 - 各R2aが独立して、H、ハロゲン、およびC1〜6アルキルからなる群から選択される、請求項4に記載の製剤。
- R2が、フェニル、ナフチル、チオフェン、フラン、ピロール、およびピリジルからなる群から選択される、請求項4に記載の製剤。
- R1が、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、iso−ブチル、sec−ブチル、tert−ブチル、ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、およびヘキシルからなる群から選択され、
R2が、それぞれ1個のR2a基で置換されていてもよい、フェニルおよびチオフェンからなる群から選択され、
各R2aが独立して、H、F、Cl、メチル、およびエチルからなる群から選択され、かつ
Lが、結合およびメチレンからなる群から選択される、請求項4に記載の製剤。 - 殺真菌剤、除草剤、殺線虫剤、殺虫剤、植物活性剤、除草剤毒性緩和剤、植物成長調節剤、防虫剤、殺ダニ剤、軟体動物駆除剤、または肥料のうちの少なくとも1つを更に含む、請求項1に記載の製剤。
- 界面活性剤を更に含む、請求項1に記載の製剤。
- 担体を更に含む、請求項1に記載の製剤。
- 植物における非生物的ストレス耐性を増加させる方法であって、植物を請求項1〜14のいずれか一項に記載の製剤と接触させないことに比べて該植物における非生物学的ストレス耐性を増加させるのに十分な量の該製剤と、該植物を接触させるステップを含む、方法。
- 前記植物が単子葉植物である、請求項15に記載の方法。
- 前記植物が双子葉植物である、請求項15に記載の方法。
- 前記非生物的ストレス耐性が乾燥耐性を含む、請求項15に記載の方法。
- 前記接触させるステップが、航空機または潅水によって前記製剤を前記植物に送達することを含む、請求項15に記載の方法。
- 植物における種子発芽を抑制する方法であって、種子を、発芽を抑制するのに十分な量の請求項1〜14のいずれか一項に記載の製剤と接触させるステップを含む、方法。
- 請求項15〜20のいずれか一項に記載の方法で処理された、植物。
- 前記植物が種子である、請求項21に記載の植物。
- PYR/PYLタンパク質を活性化する方法であって、該PYR/PYLタンパク質を、請求項1〜14のいずれか一項に記載の製剤と接触させるステップを含む、方法。
- 前記PYR/PYLタンパク質が細胞によって発現される、請求項23に記載の方法。
- 前記細胞が植物細胞である、請求項24に記載の方法。
- 前記PYR/PYLタンパク質が前記細胞にとって内因性である、請求項24に記載の方法。
- 前記PYR/PYLタンパク質が前記細胞にとって異種である、請求項24に記載の方法。
- 前記細胞が2型タンパク質ホスファターゼ(PP2C)を更に発現する、請求項24に記載の方法。
- 前記2型タンパク質ホスファターゼが、HAB1(Homology to ABI1)、ABI1(Abscisic acid insensitive 1)、またはABI2(Abscisic acid insensitive 2)である、請求項28に記載の方法。
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