JP6136934B2 - Fmoc基の除去方法 - Google Patents
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Description
HS−L−COOH (I)
(式中、Lは、置換基を有していてもよいC1−8アルキレン基を示す。)
で表される化合物、Fmoc基で保護されたアミノ基含有化合物および塩基を混合して、式(II):
Fm−S−L−COOH (II)
(式中、Fmは、9−フルオレニルメチル基を示し、Lは、前記の通りである。)
で表される化合物およびアミノ基含有化合物を含む反応混合物を得る工程、および
得られた反応混合物を塩基性水溶液で洗浄することによって、式(II)で表される化合物を除去する工程
を含む、Fmoc基の除去方法。
[2] 塩基が、有機塩基である上記[1]に記載の方法。
[3] 有機塩基が、1,8−ジアザビシクロ[5.4.0]−7−ウンデセンである上記[2]に記載の方法。
[4] 式(I)で表される化合物が、3−メルカプトプロピオン酸、チオリンゴ酸およびシステインからなる群から選ばれる少なくとも一つである、上記[1]〜[3]のいずれか一つに記載の方法。
[5] 塩基性水溶液が、炭酸リチウム、炭酸カリウム、炭酸ナトリウム、炭酸水素リチウム、炭酸水素カリウム、炭酸水素ナトリウム、水酸化リチウム、水酸化カリウムおよび水酸化ナトリウムからなる群から選ばれる少なくとも一つの水溶液である上記[1]〜[4]のいずれか一つに記載の方法。
[6] Fmoc基で保護されたアミノ基含有化合物が、N−Fmoc−C−保護ペプチド、N−Fmoc−C−保護アミノ酸またはN−Fmoc−C−保護アミノ酸アミドであり、
得られたアミノ基含有化合物が、C−保護ペプチド、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドである、上記[1]〜[5]のいずれか一つに記載の方法。
[7] 上記[6]に記載の方法を含む、液相合成法によるペプチドの製造方法。
[8] (1)縮合剤の存在下、C−保護ペプチド、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドと、N−Fmocアミノ酸またはN−Fmocペプチドとを縮合させて、N−Fmoc−C−保護ペプチドを得る工程、および/または
(2)C−保護ペプチド、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドと、N−Fmocアミノ酸活性エステルまたはN−Fmocペプチド活性エステルとを縮合させて、N−Fmoc−C−保護ペプチドを得る工程
を含む、上記[7]に記載の製造方法。
[9] 前記工程(1)において、さらに活性化剤を存在させる上記[8]に記載の製造方法。
[10] 上記[6]に記載の方法で得られたC−保護ペプチド、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドを固体として単離せずに、前記工程(1)および/または前記工程(2)で使用する、上記[8]または[9]に記載の製造方法。
[11] ワンポット合成でペプチドを製造する、上記[10]に記載の製造方法。
本発明(即ち、明細書および請求の範囲)において使用する記号の意味を、以下に記載する。
Ac:アセチル
Alloc:アリルオキシカルボニル
At:7−アザベンゾトリアゾール−1−イル
Boc:tert−ブトキシカルボニル
BOP:1−ベンゾトリアゾリルオキシ−トリス−ジメチルアミノ−ホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート
Bpr:1,1−ジメチル−2−フェニル−エチル
Bsmoc:1,1−ジオキソベンゾ[b]チオフェン−2−イルメトキシカルボニル
Bt:ベンゾトリアゾール−1−イル
Bzl:ベンジル
Bzl(2,4−OPhy):2,4−ジ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジル
Bzl(3,4,5−OPhy):3,4,5−トリ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジル
Bzl(2−OBzl(3,4,5−OPhy)−4−OMe):2−[3,4,5−トリ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジロキシベンジルオキシ]−4−メトキシベンジル
CDI:カルボニルジイミダゾール
6−Cl−HOBt(HOCt):6−クロロ−1−ヒドロキシベンゾトリアゾール
CPME:シクロペンチルメチルエーテル
Ct:6−クロロベンゾトリアゾール−1−イル
DABCO:1,4−ジアザビシクロ[2.2.2]オクタン
DBF:ジベンゾフルベン
DBU:1,8−ジアザビシクロ[5.4.0]−7−ウンデセン
DCC:ジシクロヘキシルカルボジイミド
Dhbt:3,4−ジヒドロ−4−オキソ−1,2,3−ベンゾトリアジン−3−イル
DIPC:ジイソプロピルカルボジイミド
DMAP:N,N−ジメチル−4−アミノピリジン
Dmb:2,4−ジメトキシベンジル
DMF:N,N−ジメチルホルムアミド
DMT−MM:4−(4,6−ジメトキシ−1,3,5−トリアジン−2−イル)−4−メチルモルホニウム クロリド
Dpm:ジフェニルメチル
Dpm(4,4’−OPhy):4,4’−(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ジフェニルメチル
EDC:1−エチル−3−(3−ジメチルアミノプロピル)−カルボジイミド
EDC.HCl:1−エチル−3−(3−ジメチルアミノプロピル)−カルボジイミド塩酸塩
Et:エチル
Fm:9−フルオレニルメチル
Fmoc:9−フルオレニルメトキシカルボニル
HATU:O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム ヘキサフルオロホスフェート
HBTU:O−(ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム ヘキサフルオロホスフェート
HCTU:O−(6−クロロベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム ヘキサフルオロホスフェート
HOAt:1−ヒドロキシ−7−アザベンゾトリアゾール
HOBt:1−ヒドロキシベンゾトリアゾール
HONb:N−ヒドロキシ−5−ノルボルネン−2,3−ジカルボキシイミド
HOOBt(HODhbt):3−ヒドロキシ−3,4−ジヒドロ−4−オキソ−1,2,3−ベンゾトリアジン
HOPht:N−ヒドロキシフタルイミド
HOSu:N−ヒドロキシスクシンイミド
iPr:イソプロピル
Me:メチル
MsOH:メタンスルホン酸
Nb:5−ノルボルネン−2,3−ジカルボキシイミドイル
NMP:N−メチルピロリドン
Pbf:2,2,4,6,7−ペンタメチルジヒドロベンゾフラン−5−スルホニル
Pht:フタルイミドイル
PyBOP:1−ベンゾトリアゾリルオキシ−トリス−ピロリジノ−ホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート
PyBroP:ブロモ−トリス−ピロリジノ−ホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート
Su:スクシンイミドイル
TBTU:O−ベンゾトリアゾール−1−イル−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム テトラフルオロボレート
tBu:tert−ブチル
Trt:トリチル
THF:テトラヒドロフラン
TsOH:p−トルエンスルホン酸
Z:ベンジルオキシカルボニル
PG0:ペプチドのC末端のカルボキシ基またはアミド基の保護基
PGn:アミノ基の保護基(添え字のnは1以上の整数であり、PGnはAAnのアミノ基の保護基であることを示す。)
HOE:活性化剤
E:活性基
Gly:グリシン
Ala:アラニン
Val:バリン
Leu:ロイシン
Ile:イソロイシン
Met:メチオニン
Phe:フェニルアラニン
Tyr:チロシン
Trp:トリプトファン
His:ヒスチジン
Lys:リジン
Arg:アルギニン
Ser:セリン
Thr:トレオニン
Asp:アスパラギン酸
Glu:グルタミン酸
Asn:アスパラギン
Gln:グルタミン
Cys:システイン
Pro:プロリン
Orn:オルニチン
Sar:サルコシン
β−Ala:β−アラニン
GABA:γ−アミノ酪酸
Dap:2,3−ジアミノプロパン酸
PG0で表されるC末端のアミド基の保護基としては、例えば、Dmb、ビス(4−メトキシフェニル)メチル、トリチル等が挙げられる。アミド基は、アルキル基等の置換基を有していてもよい。なお、アミド基はカルバモイル基ともいう。
(1)WO2010/113939A1に記載のジフェニルメタン化合物を保護化試薬として用いる保護基、
(2)WO2010/104169A1に記載のフルオレン化合物を保護化試薬として用いる保護基、
(3)WO2011/078295A1に記載のベンジル化合物を保護化試薬として用いる保護基、
(4)WO2012/029794A1に記載の分岐鎖含有芳香族化合物を保護化試薬として用いる保護基
等を用いることができる。
これらの保護化試薬を用いてC末端のカルボキシ基またはアミド基を保護すれば、後述のN−Fmoc−C−保護ペプチド等およびC−保護ペプチド等の脂溶性を向上させることができ、後述する液相合成法によるペプチドの製造方法において、例えば、カップリング工程のワークアップの水洗において、水層側に不純物を効率的に除去することができる。
2,3,4−トリオクタデカノキシベンゾヒドロール;
[フェニル(2,3,4−トリオクタデカノキシフェニル)メチル]アミン;
4,4’−ジドコソキシベンゾヒドロール;
ジ(4−ドコソキシフェニル)メチルアミン;
4,4−ジ(12−ドコソキシドデシルオキシ)ベンゾヒドロール;
アミノ−ビス[4−(12−ドコソキシドデシルオキシ)フェニル]メタン;
N−ベンジル−[ビス(4−ドコシルオキシフェニル)]メチルアミン;
(4−メトキシ−フェニル)−[4−(3,4,5−トリス−オクタデシロキシ−シクロヘキシルメトキシ)−フェニル]−メタノール;
{(4−メトキシ−フェニル)−[4−(3,4,5−トリス−オクタデシロキシ−シクロヘキシルメトキシ)−フェニル]−メチル}−アミン;
[ビス−(4−ドコソキシ−フェニル)−メチル]−アミン
等が挙げられる。
2−ドコシロキシ−9−(4−クロロフェニル)−9−フルオレノール;
2−ドコシロキシ−9−(4−クロロフェニル)−9−ブロモフルオレン;
2,7−ジドコシロキシ−9−(4−クロロフェニル)−9−ブロモフルオレン;
2−(12−ドコシロキシ−ドデカノキシ)−9−(3−フルオロフェニル)−9−ブロモフルオレン;
1,12−ビス−[12−(2’−O−9−(4−クロロフェニル)−9−フルオレノール)−ドデシロキシ]−ドデカン;
1,12−ビス−[12−(2’−O−9−(4−クロロフェニル)−9−ブロモフルオレン)−ドデシロキシ]−ドデカン;
2−(3−オクタデシロキシ−2,2−ビス−オクタデシロキシメチル−プロポキシ)−9−(4−クロロフェニル)−9−フルオレノール;
2−(3−オクタデシロキシ−2,2−ビス−オクタデシロキシメチル−プロポキシ)−9−(4−クロロフェニル)−9−ブロモフルオレン;
9−(4−クロロフェニル)−2−(3,4,5−トリス(オクタデシロキシ)シクロヘキシルメトキシ)−9−フルオレノール;
9−(4−クロロフェニル)−2−(3,4,5−トリス(オクタデシロキシ)シクロヘキシルメトキシ)−9−ブロモフルオレン
等が挙げられる。
4−(12’−ドコシルオキシ−1’−ドデシルオキシ)ベンジルアルコール;
4−(12’−ドコシルオキシ−1’−ドデシルオキシ)−2−メトキシベンジルアルコール;
4−(12’−ドコシルオキシ−1’−ドデシルオキシ)−2−メトキシベンジルアミン;
2−(12’−ドコシルオキシ−1’−ドデシルオキシ)−4−メトキシベンジルアルコール;
2−(12’−ドコシルオキシ−1’−ドデシルオキシ)−4−メトキシベンジルアミン;
4−メトキシ−2−[3’,4’,5’−トリス(オクタデシルオキシ)ベンジルオキシ]ベンジルアルコール;
2−[3’,5’−ジ(ドコシルオキシ)ベンジルオキシ]−4−メトキシベンジルアルコール;
2−メトキシ−4−[2’,2’,2’−トリス(オクタデシルオキシメチル)エトキシ]ベンジルアルコール;
2−メトキシ−4−[2’,2’,2’−トリス(オクタデシルオキシメチル)エトキシ]ベンジルアミン;
4−メトキシ−2−[3’,4’,5’−トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]ベンジルアルコール;
4−[3’,4’,5’−トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]ベンジルアルコール;
1,22−ビス[12−(4−ヒドロキシメチル−3−メトキシフェノキシ)ドデシルオキシ]ドコサン;
1,22−ビス[12−(2−ヒドロキシメチル−5−メトキシフェノキシ)ドデシルオキシ]ドコサン;
2−ドコシルオキシ−4−メトキシベンジルアルコール;
2−メトキシ−4−[3’,4’,5’−トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]ベンジルアルコール;
3,5−ジメトキシ−4−[3’,4’,5’−トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルメチルオキシ]ベンジルアルコール;
N−(4−ヒドロキシメチル−3−メトキシフェニル)−3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルカルボキサミド;
N−(5−ヒドロキシメチル−2−メトキシフェニル)−3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルカルボキサミド;
N−(4−ヒドロキシメチルフェニル)−3,4,5−トリス(オクタデシルオキシ)シクロヘキシルカルボキサミド
等が挙げられる。
2,4−ジ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルアルコール;
3,5−ジ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルアルコール;
4−(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルアルコール;
1−[(2−クロロ−5−(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)フェニル)]−1−フェニルメタンアミン;
3,4,5−トリ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルアルコール;
3,4,5−トリ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルアミン;
4−(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルアミン;
2−[3’,4’,5’−トリ(2’’,3’’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルオキシ]−4−メトキシベンジルアルコール;
4−(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)−2−メトキシベンジルアルコール;
4−(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)−2−メトキシベンジルアミン;
4−(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)−2−メチルベンジルアルコール;
4−(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)−2−メチルベンジルアミン;
2,2,4,8,10,10−ヘキサメチル−5−ドデカン酸(4−ヒドロキシメチル)フェニルアミド;
4−(3,7,11−トリメチルドデシルオキシ)ベンジルアルコール;
2−(3,7,11−トリメチルドデシルオキシ)−9−フェニルフルオレン−9−オール
等が挙げられる。
Eで表される活性基とは、アミノ基による求核攻撃を受けて「EO−」として容易に脱離し、アミド結合を生成させ得る基を意味し、例えば、Bt、Ct、At、OBt、Su、Pht、Nb、ペンタフルオロフェニル等が挙げられる。
本発明において使用する用語を、以下、順に説明する。
本発明において「アミノ基含有化合物」とは、第1級アミノ基および/または第2級アミノ基を有する化合物を意味する。
「Fmoc基で保護されたアミノ基含有化合物」とは、アミノ基含有化合物が有する第1級アミノ基および/または第2級アミノ基の少なくとも一つが、Fmoc基で保護された化合物を意味する。
カルボキシ基が保護されているアミノ酸は「H−AA−OPG0」と表示され、アミノ基が保護されているアミノ酸は「PGn−AA−OH」と表示される。
アミノ基が保護され、且つカルボキシ基が活性エステル化されているアミノ酸は「PGn−AA−OE」と表示される。
PGn−AA−OHの対称酸無水物は「(PGn−AA)2−O」と表示される。
アミド基が保護されているアミノ酸アミドは「H−AA−NHPG0」と表示され、アミノ基が保護されているアミノ酸アミドは「PGn−AA−NH2」と表示される。
C末端が保護されているペプチドを「H−AAn’−AAn’−1−・・・−AA1−(OPG0 or NHPG0)」と表示し、さらにN末端が保護されているペプチドを「PGn’−AAn’−AAn’−1−・・・−AA1−(OPG0 or NHPG0)」と表示する。
「C−保護アミノ酸アミド」とは、アミド基が保護されており、アミノ基が保護されていないアミノ酸アミドを意味し、これは「H−AA−NHPG0」と表示される。
「N−保護アミノ酸アミド」とは、アミノ基が保護されており、アミド基が保護されていないアミノ酸アミドを意味し、これは「PGn−AA−NH2」と表示される。
「N−保護アミノ酸活性エステル」とは、アミノ基が保護されており、カルボキシ基がEにより活性化されたアミノ酸を意味し、これは「PGn−AA−OE」と表示される。
「N−保護ペプチド活性エステル」とは、N末端のアミノ基が保護されており、C末端のカルボキシ基がEにより活性化されたペプチドを意味する。
なお、N−保護アミノ酸活性エステルまたはN−保護ペプチド活性エステルとして単離可能なものは、Eがペンタフルオロフェニル、SuまたはNbであるものである。その他のN−保護アミノ酸活性エステルまたはN−保護ペプチド活性エステルは、N−保護アミノ酸を縮合剤(例えば、EDC)および活性化剤(例えば、HOBt)と反応させることにより、反応系中で生成される。
「N−Fmocアミノ酸アミド」とは、アミノ基がFmocで保護されており、アミド基が保護されていないアミノ酸アミドを意味する。
「N−Fmocアミノ酸活性エステル」とは、アミノ基がFmocで保護されており、カルボキシ基がEにより活性エステル化されたアミノ酸を意味する。
「N−Fmocペプチド活性エステル」とは、N末端のアミノ基がFmocで保護されており、C末端のカルボキシ基がEにより活性エステル化されたペプチドを意味する。
なお、N−Fmocアミノ酸活性エステルまたはN−Fmocペプチド活性エステルとして単離可能なものは、Eがペンタフルオロフェニル、SuまたはNbであるものである。その他のN−Fmocアミノ酸活性エステルまたはN−Fmocペプチド活性エステルは、N−Fmocアミノ酸を縮合剤(例えば、EDC)および活性化剤(例えば、HOBt)と反応させることにより、反応系中で生成される。
「N−保護−C−保護ペプチド」とは、N末端のアミノ基およびC末端のカルボキシ基またはアミド基のいずれもが保護されているペプチド意味し、これは「PGn’−AAn’−AAn’−1−・・・−AA1−(OPG0 or NHPG0)」(n’は2以上の整数を示す)と表示される。
「N−Fmoc−C−保護ペプチド」とは、N末端のアミノ基がFmocで保護され、C末端のカルボキシ基またはアミド基が保護されているペプチドを意味する。
本発明のFmoc基の除去方法は、
化合物(I)(即ち、HS−L−COOH)、Fmoc基で保護されたアミノ基含有化合物および塩基を混合して、化合物(II)(即ち、Fm−S−L−COOH)およびアミノ基含有化合物を含む反応混合物を得る工程、および
得られた反応混合物を塩基性水溶液で洗浄することによって、化合物(II)を除去する工程
を含むことを特徴とする(前記式中、Lは置換基を有していてもよいC1−8アルキレン基を示し、Fmは、9−フルオレニルメチル基を示す)。
Fmoc基で保護されたアミノ基含有化合物が、N−Fmoc−C−保護ペプチド等であり、対応して得られるアミノ基含有化合物が、C−保護ペプチド等である場合、本発明のFmoc基の除去方法を、液相合成法によるペプチドの製造方法(以下「ペプチド液相合成法」と略称することがある。)で好適に使用することができる。本発明において「液相合成法」とは、固相合成法ではない合成法を意味し、全ての試薬が溶媒に溶解している均一反応に加えて、試薬の全部または一部が溶媒に溶解せず、分散または懸濁している不均一反応も包含する。
以下、上述したFmoc基の除去方法を含む、本発明のペプチド液相合成法について説明する。
(1)縮合剤(好ましくは縮合剤および活性化剤)の存在下、C−保護ペプチド、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドと、N−Fmocアミノ酸またはN−Fmocペプチドとを縮合させて、N−Fmoc−C−保護ペプチドを得る工程(以下「カップリング工程(1)」と略称する。)、および/または
(2)C−保護ペプチド、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドと、N−Fmocアミノ酸活性エステルまたはN−Fmocペプチド活性エステルとを縮合させて、N−Fmoc−C−保護ペプチドを得る工程(以下「カップリング工程(2)」と略称する。)
を含む。なお、本発明のペプチド液相合成法は、ペプチド合成化学で常用される一般的な方法を特に制限なく採用することができる。
A1は、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドを示す;
PA2およびPAn’+1は、それぞれ、N−Fmocアミノ酸を示す;
PAE2およびPAEn’+1は、それぞれ、N−Fmocアミノ酸活性エステルを示す;
PP2およびPPn’+1は、それぞれ、N−Fmoc−C−保護ペプチドを示す;
P2、Pn’、Pn’+1およびPmは、それぞれ、C−保護ペプチドを示し、添え字の2、n’、n’+1およびmは、各C−保護ペプチドのアミノ酸残基の数を示し、n’は2以上の整数を示し、mは3以上の整数であって、最終目的物であるペプチドのアミノ酸残基数を示す;
Pは、最終目的物であるペプチド(アミノ酸残基数m)を示す。
以下、各工程について順に説明する。
カップリング工程(1)では、例えば、溶媒中において、C−保護ペプチド、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドと、N−Fmocアミノ酸と、縮合剤(好ましくは縮合剤および活性化剤)とを混合することによって、アミノ酸残基が一つ伸長したN−Fmoc−C−保護ペプチドが得られる。また、N−Fmocアミノ酸に替えてN−Fmocペプチドを使用すれば、N−Fmocペプチドのアミノ酸残基の数だけアミノ酸残基が伸長したN−Fmoc−C−保護ペプチドが得られる。ここで、使用するN−Fmocペプチドのアミノ酸残基数は、好ましくは2〜20、より好ましくは2〜10である。
カップリング工程(2)では、例えば、溶媒中において、C−保護ペプチド、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドと、N−Fmocアミノ酸活性エステルとを混合することによって、アミノ酸残基が一つ伸長したN−Fmoc−C−保護ペプチドが得られる。また、N−Fmocアミノ酸活性エステルに替えてN−Fmocペプチド活性エステルを使用すれば、N−Fmocペプチド活性エステルのアミノ酸残基の数だけアミノ酸残基が伸長したN−Fmoc−C−保護ペプチドが得られる。ここで、使用するN−Fmocペプチド活性エステルのアミノ酸残基数は、好ましくは2〜10、より好ましくは2〜5である
カップリング工程(1)および(2)の反応終了後、N−Fmocアミノ酸活性エステル、N−Fmocペプチド活性エステル、N−Fmocアミノ酸のイソウレアエステル、N−Fmocアミノ酸の対称酸無水物などのアミン成分と縮合し得る反応混合物中の残留物および副生成物を除去するため、スルファニル基担持シリカゲル等の固相求核剤除去試薬(例えば、SHシリカ(富士シリシア社製)など)を加え、攪拌後、濾去してもよい。また、洗浄工程にて、炭酸ナトリウムなど弱塩基性水溶液で洗浄して、活性エステルを失活させてもよい。
特に、C末端のカルボキシ基またはアミド基の保護基として、上述の(1)WO2010/113939A1に記載のジフェニルメタン化合物を保護化試薬として用いる保護基、(2)WO2010/104169A1に記載のフルオレン化合物を保護化試薬として用いる保護基、(3)WO2011/078295A1に記載のベンジル化合物を保護化試薬として用いる保護基、又は(4)WO2012/029794A1に記載の分岐鎖含有芳香族化合物を保護化試薬として用いる保護基を用いた場合、酸性水溶液での洗浄、塩基性水溶液での洗浄および/または必要に応じて行う水洗により、目的物以外の不純物を水層側に効率的に除去することができる。
本発明のペプチド液相合成法では、上述のFmoc基の除去方法を、伸長反応開始時に使用するC−保護ペプチド、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドを調製するために行ってもよく、N末端脱保護工程の少なくとも一つ(好ましくは全部)として行ってもよい。なお、以下では、伸長反応開始時に使用するC−保護ペプチド、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドの調製のためのFmoc基の除去工程も、N末端脱保護工程に含めて説明する。
最終脱保護工程で、所望のアミノ酸残基数を有するC−保護ペプチドのC末端の保護基、必要に応じてその側鎖官能基の保護基を除去することによって、最終目的物であるペプチドを得ることができる。
例えば、保護基がMe、Et等の低級アルキル基である場合は、水または水性有機溶媒などの溶媒中、水酸化ナトリウム、水酸化カリウムなどの塩基とC−保護ペプチドとを、−20〜40℃で0.5〜10時間反応させることによって、脱保護することができる。
保護基がtBu、Pbf、Dmb、ビス(4−メトキシフェニル)メチル等である場合は、クロロホルム、塩化メチレン、酢酸エチル、ジオキサンなどの溶媒中、トリフルオロ酢酸、塩酸、メタンスルホン酸、トシル酸、ギ酸などの酸とC−保護ペプチドとを、−20〜40℃で0.5〜10時間反応させることによって、脱保護することができる。
保護基がZ基である場合は、メタノール、DMF、酢酸などの溶媒中、パラジウム炭素などの触媒を用いて、0〜40℃で0.5〜100時間、C−保護ペプチドを水素化反応させるか、或いはフッ化水素、トリフルオロメタンスルホン酸などの強酸とC−保護ペプチドとを、−20〜40℃で0.5〜10時間反応させることによって、脱保護することができる。
保護基がAlloc基である場合は、テトラキストリフェニルホスフィンパラジウム等の0価パラジウム均一系触媒を用いたC−保護ペプチドの分解反応によって、脱保護することができる。0価パラジウム均一系触媒の使用量は、除去する保護基に対して、通常0.01〜1.0当量、好ましくは0.05〜0.5当量である。
(i)3,4,5−トリ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルアルコールとN−Fmocアミノ酸との縮合、およびそれに続く3−メルカプトプロピオン酸を用いたFmoc基の除去
3,4,5−トリ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルアルコール(2.0g,2.00mmol)をクロロホルム(20mL)に溶かし、Fmoc−Leu−OH(779mg,2.20mmol)を加えた後、氷冷下にてEDC.HCl(465mg,2.43mmol)、DMAP(24mg,0.20mmol)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、溶媒を減圧留去し、残渣をCPME(20mL)に溶解させた。この溶液に、氷冷下にて3−メルカプトプロピオン酸(0.87mL,10.02mmol)、DBU(1.70mL,11.39mmol)を加え、室温で3時間撹拌した。反応終了後、氷冷下にて1N塩酸/CPME(1.40mL,1.40mmol)、CPME(10mL)、20%食塩水(20mL)を加えて、有機層および水層を得た。室温でこれらを撹拌しながら、水層のpHが9.0になるまで、10%炭酸ナトリウム水溶液を滴下した後、有機層および水層を分液した(以下、この操作を「pH=9.0洗浄」と略称することがある)。pH=9.0洗浄をもう一度繰り返した。得られた有機層を、室温にて、10%炭酸ナトリウム水溶液(20mL)で2回、20%食塩水(20mL)で1回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、H−Leu−OBzl(3,4,5−OPhy)を含むCPME溶液(30mL)を得た。このCPME溶液を、そのまま次工程で用いた。
TOF−MS:1110.9[MH+]
測定機器:Waters LCT Premier XE
キャピラリー電圧:3000V
サンプルコーン電圧:86V
ディソルレーション温度:350℃
ソース部温度:120℃
注入量:2μL
上記の実施例1(i)で得られたH−Leu−OBzl(3,4,5−OPhy)のCPME溶液(30mL)に、HOBt(81mg,0.60mmol)、Fmoc−Tyr(tBu)−OH(1.01g,2.20mmol)を加えた後、氷冷下にてEDC.HCl(465mg,2.43mmol)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、溶媒を20mLまで減圧留去し、濃縮した反応溶液に氷冷下にて、3−メルカプトプロピオン酸(0.85mL,9.81mmol)、DBU(1.66mL,11.18mmol)を加え、室温で3時間攪拌した。反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、1N塩酸/CPME(1.30mL,1.30mmol)、CPME(15mL)、20%食塩水(25mL)を加えて、有機層および水層を得た。次いで、上述のpH=9.0洗浄を2回行った。得られた有機層を、室温にて、10%炭酸ナトリウム水溶液で2回、20%食塩水で1回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、H−Tyr(tBu)−Leu−OBzl(3,4,5−OPhy)のCPME溶液を得た。このCPME溶液を、そのまま次工程で用いた。
TOF−MS:1329.9[MH+]
上記の実施例1(ii)と同様にして、前工程で得られたC−保護ペプチドと下記のN−Fmocアミノ酸またはN−Fmocペプチド(下記表1にて「N−Fmocアミノ酸等」と記載する)とを縮合し、次いでFmoc基を除去することによって、順次ペプチド鎖を伸張させた。
上記の実施例1(iii)で得られたH−Gly−Gly−Asn(Trt)−Gly−Asp(OtBu)−Phe−Glu(OtBu)−Glu(OtBu)−Ile−Pro−Glu(OtBu)−Glu(OtBu)−Tyr(tBu)−Leu−OBzl(3,4,5−OPhy)のCPME溶液(65mL)に、HOBt(81mg,0.60mmol)、Fmoc−Gly−Gly−OH(765mg,2.16mmol)、EDC.HCl(465mg,2.43mmol)を加え、室温で終夜攪拌した。反応溶液に氷冷下にて、3−メルカプトプロピオン酸(0.85mL,9.81mmol)、DBU(2.34mL,15.68mmol)を添加し、室温で3時間攪拌した。反応終了後、反応溶液を1N塩酸/CPME(5mL,5.00mmol)で中和し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣に80体積%アセトニトリル水溶液(60mL)を加え、その沈殿物をろ過で回収した。回収した沈殿物をアセトニトリル(50mL)でスラリー洗浄し、次いで乾燥させることによって、H−Gly−Gly−Gly−Gly−Asn(Trt)−Gly−Asp(OtBu)−Phe−Glu(OtBu)−Glu(OtBu)−Ile−Pro−Glu(OtBu)−Glu(OtBu)−Tyr(tBu)−Leu−OBzl(3,4,5−OPhy)(4.60g,1.42mmol)を得た。最終的に得られたC−保護ペプチドの収率は、実施例1(i)の出発原料である3,4,5−トリ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルアルコール(2.00mmol)から計算して、71%であった。
TOF−MS:3239.2[MH+]
(i)4,4’−(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ジフェニルメチルアミンとN−Fmocアミノ酸との縮合、およびそれに続く3−メルカプトプロピオン酸を用いたFmoc基の除去
4,4’−(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ジフェニルメチルアミン(2.0g,2.38mmol)をクロロホルム(20mL)に溶かし、HOBt(32mg,0.24mmol)、Fmoc−Leu−OH(1.02g,2.89mmol)を加えた後、氷冷下にてEDC.HCl(607mg,3.17mmol)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、溶媒を減圧留去し、残渣をCPME(20mL)に溶解させた。この溶液に、氷冷下にて3−メルカプトプロピオン酸(1.03mL,11.89mmol)、DBU(2.02mL,13.55mmol)を加え、室温で3時間撹拌した。反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、1N塩酸/CPME(1.50mL,1.50mmol)、CPME(10mL)、20%食塩水(20mL)を加えて、有機層および水層を得た。次いで、上述のpH=9.0洗浄を2回行った。得られた有機層を、室温にて10%炭酸ナトリウム水溶液(20mL)およびDMF(4mL)の混合溶媒で1回、10%炭酸ナトリウム水溶液(20mL)で1回、20%食塩水(20mL)で2回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、H−Leu−NHDpm(4,4’−OPhy)のCPME溶液(30mL)を得た。このCPME溶液を、そのまま次工程で用いた。
TOF−MS:889.6[MH+]
H−Leu−NHDpm(4,4’−OPhy)のCPME溶液(30mL)に、HOBt(192mg,1.43mmol)、Fmoc−Tyr(tBu)−OH(1.26g,2.74mmol)を加えた後、氷冷下にてEDC.HCl(607mg,3.17mmol)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、溶媒を25mLまで減圧留去し、濃縮した反応溶液に氷冷下にて、3−メルカプトプロピオン酸(1.03mL,11.89mmol)、DBU(2.02mL,13.55mmol)を加え、室温で3時間撹拌した。反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、1N塩酸/CPME(1.50mL,1.50mmol)、CPME(5mL)、20%食塩水(25mL)を加えて、有機層および水層を得た。次いで、上述のpH=9.0洗浄を2回行った。得られた有機層を、10%炭酸ナトリウム水溶液で2回、20%食塩水で2回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、H−Tyr(tBu)−Leu−NHDpm(4,4’−OPhy)のCPME溶液を得た。このCPME溶液を、そのまま次工程で用いた。
TOF−MS:1108.7[MH+]
H−Tyr(tBu)−Leu−NHDpm(4,4’−OPhy)のCPME溶液(30mL)に、HOBt(96mg,0.71mmol)、Fmoc−Glu(OtBu)−OH(1.11g,2.61mmol)を加えた後、氷冷下にてEDC.HCl(552mg,2.88mmol)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、溶媒を25mLまで減圧留去し、濃縮した反応溶液に氷冷下にて、3−メルカプトプロピオン酸(0.62mL,7.13mmol)、DBU(1.60mL,10.70mmol)を加え、室温で3時間撹拌した。反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、1N塩酸/CPME(3.21mL,3.21mmol)、CPME(10mL)、20%食塩水(25mL)を加えて、有機層および水層を得た。次いで、上述のpH=9.0洗浄を3回行った。得られた有機層を、室温にて10%炭酸ナトリウム水溶液(25mL)およびDMF(5mL)の混合溶媒で1回、10%炭酸ナトリウム水溶液(25mL)で2回、20%食塩水(25mL)で2回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、H−Glu(OtBu)−Tyr(tBu)−Leu−NHDpm(4,4’−OPhy)のCPME溶液を得た。このCPME溶液を、そのまま次工程で用いた。
TOF−MS:1293.8[MH+]
上記の実施例2(iii)と同様にして、前工程で得られたC−保護ペプチドと下記のN−Fmocアミノ酸とを縮合し、次いでFmoc基を除去することによって、順次ペプチド鎖を伸張させた。
上記の実施例2(iv)で得られたH−Gly−Pro−Lys(Boc)−Glu(OtBu)−Glu(OtBu)−Leu−Pro−Glu(OtBu)−Glu(OtBu)−Tyr(tBu)−Leu−NHDpm(4,4’−OPhy)のCPME溶液(45mL)に、HOBt(192mg,1.43mmol)、Fmoc−Gly−Gly−OH(765mg,2.62mmol)、EDC.HCl(552mg,2.88mmol)を加え、室温で終夜撹拌した。反応終了後、氷冷下で3−メルカプトプロピオン酸(0.62mL,7.13mmol)、DBU(1.78mL,11.89mmol)を添加し、室温で3時間攪拌した。反応終了後、反応溶液を1N塩酸/CPME(4.28mL,4.28mmol)で中和し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣に80体積%アセトニトリル水溶液(70mL)を加え、その沈殿物をろ過で回収した。回収した沈殿物をアセトニトリル(50mL)でスラリー洗浄し、次いで乾燥させることによって、H−Gly−Pro−Lys(Boc)−Glu(OtBu)−Glu(OtBu)−Leu−Pro−Glu(OtBu)−Glu(OtBu)−Tyr(tBu)−Leu−NHDpm(4,4’−OPhy)(4.40g,1.72mmol)を得た。最終的に得られたC−保護ペプチドの収率は、実施例2(i)の出発原料である4,4’−(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ジフェニルメチルアミン(2.38mmol)から計算して、72%であった。
TOF−MS:2555.1[MH+]
(i)2,4−ジ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルアルコールとN−Fmocアミノ酸との縮合、およびそれに続く3−メルカプトプロピオン酸を用いたFmoc基の除去
2,4−ジ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルアルコール(2.0g,2.85mmol)をクロロホルム(20mL)に溶かし、Fmoc−Gly−OH(1.12g,3.77mmol)を加えた後、氷冷下にてEDC.HCl(794mg,4.14mmol)、DMAP(42mg,0.34mmol)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、溶媒を減圧留去し、残渣をCPME(20mL)に溶解させた。この溶液に、氷冷下にて3−メルカプトプロピオン酸(0.74mL,8.56mmol)、DBU(1.91mL,12.83mmol)を加え、室温で3時間撹拌した。反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、1N塩酸/CPME(3.85mL,3.85mmol)、CPME(15mL)、20%食塩水(25mL)を加えて、有機層および水層を得た。次いで、上述のpH=9.0洗浄を2回行った。得られた有機層を、10%炭酸ナトリウム水溶液(25mL)およびDMF(2.5mL)の混合溶媒で1回、10%炭酸ナトリウム水溶液(25mL)で2回、20%食塩水(25mL)で3回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、H−Gly−OBzl(2,4−OPhy)のCPME溶液(35mL)を得た。このCPME溶液を、そのまま次工程で用いた。
TOF−MS:758.6[MH+]
H−Gly−OBzl(2,4−OPhy)のCPME溶液(35mL)に、HOBt(116mg,0.86mmol)、Fmoc−Glu(OtBu)−OH(1.60g,3.76mmol)を加えた後、氷冷下にてEDC.HCl(794mg,4.14mmol)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、溶媒を20mLまで減圧留去し、濃縮した反応溶液に氷冷下にて、DBU(1.02mL,6.84mmol)を加え、室温で3時間撹拌した。反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、1N塩酸/CPME(5.48mL,5.48mmol)、CPME(20mL)、20%食塩水(30mL)を加えて、有機層および水層を得た。次いで、上述のpH=9.0洗浄を2回行った。得られた有機層を、室温にて10%炭酸ナトリウム水溶液(30mL)およびDMF(3mL)の混合溶媒で1回、10%炭酸ナトリウム水溶液(30mL)で1回、20%食塩水(30mL)で2回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、H−Glu(OtBu)−Gly−OBzl(2,4−OPhy)のCPME溶液(40mL)をそのまま次工程に移行させた。
TOF−MS:943.5[MH+]
H−Glu(OtBu)−Gly−OBzl(2,4−OPhy)のCPME溶液(40mL)に、HOBt(116mg,0.86mmol)、Fmoc−Leu−OH(1.11g,3.14mmol)を加えた後、氷冷下にてEDC.HCl(662mg,3.45mmol)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、溶媒を25mLまで減圧留去し、濃縮した反応溶液に氷冷下にて、3−メルカプトプロピオン酸(0.74mL,8.56mmol)、DBU(1.91mL,12.83mmol)を加え、室温で3時間撹拌した。反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、1N塩酸/CPME(3.85mL,3.85mmol)、CPME(15mL)、20%食塩水(25mL)を加えて、有機層および水層を得た。次いで、上述のpH=9.0洗浄を3回行った。得られた有機層を、室温にて10%炭酸ナトリウム水溶液(25mL)およびDMF(2.5mL)の混合溶媒で1回、10%炭酸ナトリウム水溶液(25mL)で2回、20%食塩水(25mL)で3回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、H−Leu−Glu(OtBu)−Gly−OBzl(2,4−OPhy)のCPME溶液を得た。このCPME溶液を、そのまま次工程で用いた。
TOF−MS:1056.7[MH+]
上記の実施例3(iii)と同様にして、前工程で得られたC−保護ペプチドと下記のN−Fmocアミノ酸とを縮合し、次いでFmoc基を除去することによって、順次ペプチド鎖を伸張させた。
上記の実施例3(iv)で得られたH−Val−Ser(tBu)−Ser(tBu)−Tyr(tBu)−Leu−Glu(OtBu)−Gly−OBzl(2,4−OPhy)のCPME溶液(80mL)に、HOBt(193mg,1.43mmol)、Fmoc−Asp(OtBu)−OH(1.29g,3.14mmol)とEDC.HCl(662mg,3.45mmol)を加え、室温で終夜撹拌した。反応終了後、氷冷下で3−メルカプトプロピオン酸(0.74mL,8.56mmol)、DBU(1.91mL,12.83mmol)を添加し室温で3時間攪拌した。反応終了後、MsOH(0.25mL,3.85mmol)およびクロロホルム(2.5mL)の混合液で中和し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣に80体積%アセトニトリル水溶液(60mL)を加え、その沈殿物をろ過で回収した。回収した沈殿物をアセトニトリル(50mL)でスラリー洗浄し、次いで乾燥させることによって、H−Asp(OtBu)−Val−Ser(tBu)−Ser(tBu)−Tyr(tBu)−Leu−Glu(OtBu)−Gly−OBzl(2,4−OPhy)(3.62g,1.97mmol)を得た。最終的に得られたC−保護ペプチドの収率は、実施例3(i)の出発原料である2,4−ジ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルアルコール(2.85mmol)から計算して、69%であった。
TOF−MS:1832.0[MH+]
(i)2−(3,4,5−トリ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルオキシ)−4−メトキシベンジルアルコールとN−Fmocアミノ酸との縮合、およびそれに続く3−メルカプトプロピオン酸を用いたFmoc基の除去
2−(3,4,5−トリ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルオキシ)−4−メトキシベンジルアルコール(2.0g,1.76mmol)をクロロホルム(25mL)に溶かし、氷冷下にてFmoc−Ser(tBu)−OH(176mg,0.46mmol)、EDC.HCl(97mg,0.51mmol)、DMAP(2.2mg,0.018mmol)を30分おきに各6回加えた後、室温で終夜攪拌した。反応終了後、溶媒を減圧留去し、残渣をCPME(20mL)に溶解させた。この溶液に、氷冷下にて3−メルカプトプロピオン酸(0.46mL,5.27mmol)、DBU(1.34mL,9.00mmol)を加え、室温で3時間攪拌した。反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、MsOH(0.22mL,3.33mmol)およびCPME(2.2mL)の混合液を滴下し、CPME(15mL)、20%食塩水(30mL)を加えて、有機層および水層を得た。次いで、上述のpH=9.0洗浄を3回行った。得られた有機層を、室温にて10%炭酸ナトリウム水溶液(30mL)およびDMF(3mL)の混合溶媒で1回、10%炭酸ナトリウム水溶液(30mL)で2回、20%食塩水(30mL)で3回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、H−Ser(tBu)−OBzl(2−OBzl(3,4,5−OPhy)−4−OMe)のCPME溶液(35mL)を得た。このCPME溶液を、そのまま次工程で用いた。
TOF−MS:1276.8[MH+]
H−Ser(tBu)−OBzl(2−OBzl(3,4,5−OPhy)−4−OMe)のCPME溶液(35mL)に、HOBt(71mg,0.43mmol)を加えた後、氷冷下にてFmoc−Thr(tBu)−OH(1.00g,2.51mmol)、EDC.HCl(529mg,2.76mmol)、DMF(10mL)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、反応溶液に20%食塩水(30mL)を加えて、有機層および水層を得た。得られた有機層および水層を撹拌しながら、水層のpHが6.0になるまで、10%炭酸ナトリウム水溶液を滴下した後、有機層および水層を分液した(以下、この操作を「pH=6.0洗浄」と略称することがある)。pH=6.0洗浄を、さらに2回繰り返した。得られた有機層の溶媒を減圧留去し、シクロヘキサン(40mL)に溶解させ、80体積%アセトニトリル水溶液(30mL)で4回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、得られたろ液の溶媒を減圧留去し、Fmoc−Thr(tBu)−Ser(tBu)−OBzl(2−OBzl(3,4,5−OPhy)−4−OMe)を得た。
TOF−MS:1655.9[MH+]
Fmoc−Thr(tBu)−Ser(tBu)−OBzl(2−OBzl(3,4,5−OPhy)−4−OMe)をCPME(25mL)に溶解させた。この溶液に、氷冷下にてDBU(0.26mL,1.76mmol)を加え、室温で3時間撹拌した。なお、このFmoc基の除去の際に、化合物(I)を使用しなかった。
反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、1N塩酸/CPME(1.67mL,1.67mmol)、HOBt(237mg,1.76mmol)、Fmoc−Phe−OH(1.16g,2.98mmol)、EDC.HCl(629mg,3.28mmol)、DMF(6mL)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、20%食塩水(30mL)を加えて、有機層および水層を得た。次いで、上述のpH=6.0洗浄を3回行った。得られた有機層の溶媒を減圧留去し、シクロヘキサン(40mL)に溶解させ、80体積%アセトニトリル水溶液(30mL)で4回、20%食塩水(30mL)で1回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、得られたろ液の溶媒を減圧留去し、Fmoc−Phe−Thr(tBu)−Ser(tBu)−OBzl(2−OBzl(3,4,5−OPhy)−4−OMe)を得た。
TOF−MS:1802.9[MH+]
実施例4(iii)で得られたFmoc−Phe−Thr(tBu)−Ser(tBu)−OBzl(2−OBzl(3,4,5−OPhy)−4−OMe)の全量をCPME(25mL)に溶解させた。この溶液に、氷冷下にてDBU(0.26mL,1.76mmol)を加え、室温で3時間撹拌した。なお、このFmoc基の除去の際に、化合物(I)を使用しなかった。
反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、1N塩酸/CPME(1.67mL,1.67mmol)、HOBt(237mg,1.76mmol)、Fmoc−Thr(tBu)−OH(0.91g,2.29mmol)、EDC.HCl(629mg,3.28mmol)、DMF(6mL)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、20%食塩水(30mL)を加えて、有機層および水層を得た。次いで、上述のpH=6.0洗浄を3回行った。得られた有機層の溶媒を減圧留去し、シクロヘキサン(40mL)に溶解させ、20%食塩水(30mL)で1回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、得られたろ液の溶媒を減圧留去し、Fmoc−Thr(tBu)−Phe−Thr(tBu)−Ser(tBu)−OBzl(2−OBzl(3,4,5−OPhy)−4−OMe)を得た。
TOF−MS:1959.9[MH+]
実施例4(iv)で得られたFmoc−Thr(tBu)−Phe−Thr(tBu)−Ser(tBu)−OBzl(2−OBzl(3,4,5−OPhy)−4−OMe)をCPMEに溶かし、そのCPME溶液(30mL)を得た。このCPME溶液に、氷冷下にて3−メルカプトプロピオン酸(0.46mL,5.27mmol)、DBU(1.18mL,7.90mmol)を加え、室温で3時間撹拌した。反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、MsOH(0.15mL,2.37mmol)およびCPME(1.5mL)の混合液、CPME(20mL)、20%食塩水(30mL)を加えて、有機層および水層を得た。次いで、上述のpH=9.0洗浄を2回行った。得られた有機層を、室温にて10%炭酸ナトリウム水溶液で3回、20%食塩水で3回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、H−Thr(tBu)−Phe−Thr(tBu)−Ser(tBu)−OBzl(2−OBzl(3,4,5−OPhy)−4−OMe)のCPME溶液を得た。このCPME溶液に、氷冷下にてHOBt(71mg,0.53mmol)、Fmoc−Lys(Boc)−OH(994mg,2.12mmol)、EDC.HCl(402mg,2.01mmol)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、反応溶液の溶媒を減圧留去し、80体積%アセトニトリル水溶液(40mL)を加え、その沈殿物をろ過で回収した。回収した沈殿物を乾燥させることによって、Fmoc−Lys(Boc)−Thr(tBu)−Phe−Thr(tBu)−Ser(tBu)−OBzl(2−OBzl(3,4,5−OPhy)−4−OMe)(3.56g,1.63mmol)を得た。最終的に得られたN−Fmoc−C−保護ペプチドの収率は、実施例4(i)の出発原料である2−(3,4,5−トリ(2’,3’−ジヒドロフィチルオキシ)ベンジルオキシ)−4−メトキシベンジルアルコール(1.76mmol)から計算して、93%であった。
TOF−MS:2188.1[MH+]
(i)C−保護アミノ酸塩とN−Fmocアミノ酸との縮合、およびそれに続くチオリンゴ酸を用いたFmoc基の除去
H−Leu−OBzl・TsOH塩(394mg,1.00mmol)をクロロホルム(10mL)に溶かし、トリエチルアミン(0.14mL,1.00mmol)、HOBt(14mg,0.10mmol)、Fmoc−Tyr(tBu)−OH(506mg,1.10mmol)を加えた後、氷冷下にてEDC.HCl(232mg,1.21mmol)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、チオリンゴ酸(450mg,3.00mmol)、DBU(1.49mL,10.00mmol)を加え、室温で3時間撹拌した。反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、MsOH(0.23mL,3.60mmol)およびクロロホルム(2.3mL)の混合液を滴下し、クロロホルム(10mL)、20%食塩水(20mL)を加えて、有機層および水層を得た。次いで、上述のpH=9.0洗浄を3回行った。得られた有機層を、室温にて10%炭酸ナトリウム水溶液(20mL)で3回、20%食塩水(20mL)で3回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、H−Tyr(tBu)−Leu−OBzlのクロロホルム溶液(20mL)を得た。このクロロホルム溶液を、そのまま次工程で用いた。
TOF−MS:441.2[MH+]
H−Tyr(tBu)−Leu−OBzlのクロロホルム溶液(20mL)に、HOBt(41mg,0.30mmol)を加えた後、氷冷下にてFmoc−Glu(OtBu)−OH(468mg,1.10mmol)、EDC.HCl(232mg,1.21mmol)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、チオリンゴ酸(450mg,3.00mmol)、DBU(1.49mL,10.00mmol)を加え、室温で3時間撹拌した。反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、MsOH(0.23mL,3.60mmol)およびクロロホルム(2.3mL)の混合液を滴下し、クロロホルム(10mL)、20%食塩水(20mL)を加えて、有機層および水層を得た。次いで、上述のpH=9.0洗浄を3回行った。得られた有機層を、室温にて10%炭酸ナトリウム水溶液(20mL)で3回、20%食塩水(20mL)で2回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、H−Glu(OtBu)−Tyr(tBu)−Leu−OBzlのクロロホルム溶液(30mL)を得た。このクロロホルム溶液を、そのまま次工程で用いた。
TOF−MS:626.2[MH+]
H−Glu(OtBu)−Tyr(tBu)−Leu−OBzlのクロロホルム溶液(30mL)に、HOBt(68mg,0.50mmol)を加えた後、氷冷下にてFmoc−Glu(OtBu)−OH(468mg,1.10mmol)、EDC.HCl(232mg,1.21mmol)を加え、室温で終夜攪拌した。反応終了後、溶媒を15mLまで減圧留去し、濃縮した反応溶液に氷冷下にて、チオリンゴ酸(450mg,3.00mmol)、DBU(1.34mL,9.00mmol)を加え、室温で3時間撹拌した。反応終了後、反応溶液に氷冷下にて、MsOH(0.17mL,2.70mmol)およびクロロホルム(1.7mL)の混合液を滴下し、クロロホルム(15mL)、20%食塩水(30mL)を加えて、有機層および水層を得た。次いで、上述のpH=9.0洗浄を3回行った。得られた有機層を、室温にて10%炭酸ナトリウム水溶液(30mL)で3回、20%食塩水(30mL)で2回攪拌洗浄し、有機層および水層を分液した。得られた有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過して、そのろ液を回収し、回収したろ液の溶媒を減圧留去した。得られた残渣にヘキサン(10mL)を加え、その沈殿物をろ過で回収した。回収した沈殿物を乾燥させることによって、H−Glu(OtBu)−Glu(OtBu)−Tyr(tBu)−Leu−OBzl(787mg,0.97mmol)を得た。最終的に得られたC−保護ペプチドの収率は、実施例5(i)の出発原料であるH−Leu−OBzl・TsOH塩(1.00mmol)から計算して、97%であった。
TOF−MS:811.2[MH+]
Fmoc−Leu−OBzl(3,4,5−OPhy)(0.075mmol)をクロロホルム(1mL)に溶かし、氷冷下にてチオリンゴ酸(33.8mg,0.23mmol)、DBU(0.09mL,0.60mmol)を加え、室温で4時間攪拌した。反応終了時における化合物(II)(即ち、DBF−チオリンゴ酸付加体)の生成率は91%であった。なお、化合物(II)の生成率は、まず、合成したDBFを標準品として使用するHPLCでDBFを定量分析して、DBFの生成率を算出し、次いで化合物2の生成率を(100−DBFの生成率)として算出した。以下の生成率の算出法も同様である。
HPLCの条件は、以下の通りである。
測定機器:Waters AQUITY UPLC BEH C18 50mm x 2.1mm I.D., 1.7μm
測定温度:40℃
フローレート:0.4mL/min
注入量:2μL
測定波長:220nm
移動層A:0.05体積%トリフルオロ酢酸水溶液
移動層B:0.05体積%トリフルオロ酢酸アセトニトリル溶液
グラジェントタイムプログラム:移動層Bの濃度を、10分間で20体積%から90体積%まで直線的に増加させた。
Fmoc−Leu−OBzl(3,4,5−OPhy)(0.075mmol)をクロロホルム(1mL)に溶かし、氷冷下にてシステイン(27mg,0.23mmol)、DBU(0.022mL,0.15mmol)を加え、室温で3時間攪拌した。反応終了時における化合物(II)(即ち、DBF−システイン付加体)の生成率は95%であった。反応終了後、反応溶液を濃縮し、濃縮した反応溶液にCPMEを(5mL)を加え、この反応溶液を、室温にて10%炭酸ナトリウム水溶液(5mL)で3回洗浄し、化合物(II)を除去した。
Fmoc−Leu−OBzl(3,4,5−OPhy)(0.075mmol)をCPME(1mL)に溶かし、氷冷下にてチオサリチル酸(35mg,0.23mmol)、DBU(0.041mL,0.28mmol)を加え、室温で3.5時間攪拌した。反応終了時におけるDBF−チオサリチル酸付加体の生成率は21%であった。
本発明がその好ましい態様を参照して提示又は記載される一方、本明細書中において、添付の請求の範囲で包含される発明の範囲を逸脱することなく、形態や詳細の様々な変更をなし得ることは当業者に理解されるであろう。本明細書中に示され又は参照されたすべての特許、特許公報及びその他の刊行物は、参照によりその全体が取り込まれる。
Claims (13)
- 式(I):
HS−L−COOH (I)
(式中、Lは、置換基を有していてもよいC1−8アルキレン基を示す。)
で表される化合物、Fmoc基で保護されたアミノ基含有化合物および塩基を混合して、式(II):
Fm−S−L−COOH (II)
(式中、Fmは、9−フルオレニルメチル基を示し、Lは、前記の通りである。)
で表される化合物およびアミノ基含有化合物を含む反応混合物を得る工程、および
得られた反応混合物を塩基性水溶液で洗浄することによって、式(II)で表される化合物を除去する工程
を含む、Fmoc基の除去方法。 - 塩基が、1,8−ジアザビシクロ[5.4.0]−7−ウンデセン、ナトリウム tert−ブトキシドおよびカリウム tert−ブトキシドから選ばれる少なくとも一つである、請求項1に記載の方法。
- 塩基が、有機塩基である請求項1に記載の方法。
- 有機塩基が、1,8−ジアザビシクロ[5.4.0]−7−ウンデセンである請求項3に記載の方法。
- 式(I)で表される化合物が、3−メルカプトプロピオン酸、チオリンゴ酸およびシステインからなる群から選ばれる少なくとも一つである、請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。
- 塩基性水溶液が、炭酸リチウム、炭酸カリウム、炭酸ナトリウム、炭酸水素リチウム、炭酸水素カリウム、炭酸水素ナトリウム、水酸化リチウム、水酸化カリウムおよび水酸化ナトリウムからなる群から選ばれる少なくとも一つの水溶液である請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
- 式(I)で表される化合物、Fmoc基で保護されたアミノ基含有化合物および塩基の反応温度が0〜50℃であり、且つ塩基の使用量が、式(I)で表される化合物のカルボキシ基1molあたり0.5〜5molである、請求項1〜6のいずれか一項に記載の方法。
- Fmoc基で保護されたアミノ基含有化合物が、N−Fmoc−C−保護ペプチド、N−Fmoc−C−保護アミノ酸またはN−Fmoc−C−保護アミノ酸アミドであり、
得られたアミノ基含有化合物が、C−保護ペプチド、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドである、請求項1〜7のいずれか一項に記載の方法。 - 請求項8に記載の方法を含む、液相合成法によるペプチドの製造方法。
- (1)縮合剤の存在下、C−保護ペプチド、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドと、N−Fmocアミノ酸またはN−Fmocペプチドとを縮合させて、N−Fmoc−C−保護ペプチドを得る工程、および/または
(2)C−保護ペプチド、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドと、N−Fmocアミノ酸活性エステルまたはN−Fmocペプチド活性エステルとを縮合させて、N−Fmoc−C−保護ペプチドを得る工程
を含む、請求項9に記載の製造方法。 - 前記工程(1)において、さらに活性化剤を存在させる請求項10に記載の製造方法。
- 請求項8に記載の方法で得られたC−保護ペプチド、C−保護アミノ酸またはC−保護アミノ酸アミドを固体として単離せずに、前記工程(1)および/または前記工程(2)で使用する、請求項10または11に記載の製造方法。
- ワンポット合成でペプチドを製造する、請求項12に記載の製造方法。
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