JP6042131B2 - イヌにおける呼吸器疾患管理のための材料および方法 - Google Patents
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Description
本出願は、任意の図面(figure)、表、核酸配列、アミノ酸配列および図(drawing)を含めて、全体が参照により本明細書に組み入れられる、2005年4月21日付けで提出された米国特許仮出願第60/673,443号の恩典を主張する。
「ケンネルコフ」、つまり感染性気管気管支炎(ITB)は、主として咳を特徴とするイヌの急性伝染性呼吸器感染症である(Fordら、1998年)。イヌITBは世界中で最も蔓延しているイヌの感染性呼吸器疾患の一つと考えられており、イヌが犬舎のような過密集団の環境下で飼育されると大流行が流行割合に達することがある。大半の大流行は、イヌ-イヌ間の直接的な接触または呼吸器分泌物のエアロゾル化に起因する(Fordら、1998年)。臨床徴候は、上下気道の上皮にコロニーを形成する細菌性およびウイルス性物質の一つまたは組み合わせに感染することによって引き起こされる。イヌパラインフルエンザウイルス(CPiV)および気管支敗血症菌(ボルデテラブロンキセプチカ(Bordetella bronchiseptica))は感染したイヌから分離される最も一般的な有機体であるが、イヌジステンパーウイルス(CDV)ならびに1型および2型イヌアデノウイルス(CAV-1、CAV-2)などの複数のその他のウイルス、ならびに連鎖球菌(Streptococcus sp.)、パスツレラムルトシダ(Pasteurella multocoda)および大腸菌(Escherichia coli)などの細菌が臨床上の経過および帰結に影響を及ぼし得る(Fordら、1998年)。過密集団では罹患率の高い大流行が極めて効率的および急速に発生するが、合併症である呼吸器感染症および死亡は稀である。生命の危険性のある二次的細菌性肺炎が発症する可能性があるが、ITB症例の大部分は自己限定的であり、何ら治療することなく回復する(Fordら、1998年)。
本発明は、イヌ科に感染してイヌ科に呼吸器疾患を引き起こすことのできる分離されたインフルエンザウイルスに関する。本発明は、本発明のインフルエンザウイルスに対する免疫応答を誘発するための組成物および帆法にも関する。本発明は、さらに、本発明のウイルスを同定して、本発明のウイルスの動物への感染を診断するための組成物および方法にも関する。
本発明は、イヌ科に感染して呼吸器疾患を引き起こすことのできる分離されたインフルエンザウイルスに関する。一つの態様において、本発明のインフルエンザウイルスは配列番号:2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、33、34、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76もしくは78、またはその機能性/免疫原性断片もしくは変異型のいずれかに示されるアミノ酸配列を持つタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む。具体的な態様において、ポリヌクレオチドは配列番号:1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75もしくは77、またはその断片もしくは変異型のいずれかに示されるヌクレオチド配列を含む。具体的な態様において、本発明のインフルエンザウイルスはH3亜型である。ウイルスは、本明細書に開示される方法に従って、感染したイヌから分離して細胞または卵で培養することができる。一つの例示的態様において、インフルエンザウイルスはインフルエンザAウイルスである。
Tm=81.5 C+16.6 Log[Na+]+0.41(%G+C)-0.61(%ホルムアミド)-600/塩基対の二本鎖の長さ。
(1)1×SSPE、0.1%SDSにおいて室温で15分ずつ2回(低ストリンジェントな洗浄)
(2)0.2×SSPE、0.1%SDSにおいてTm-20Cで15分間1回(中ストリンジェントな洗浄)。
グレイハウンドからの血液および鼻腔スワブの採取
呼吸器疾患の大流行が発生しているレース用犬舎の臨床的に疾患または正常なグレイハウンドから、頚静脈穿刺により急性期および回復期の血液試料を採取した。回復期試料は急性試料の4〜12週後に採取した。血清を分離にして-80℃で保存した。鼻腔スワブを採取して、細菌分離のための提出まで活性炭を加えたAmies輸送培地(Becton Dickinson Biosciences)に収容した。
2004年1月のフロリダトラックでの大流行において死亡した8頭中5頭のグレイハウンドについて、University of Florida College of Veterinary Medicine(UF CVM)のAnatomic Pathology Serviceにて徹底した死亡後検査を実施した。もう1頭のイヌの死亡後検査は個人の動物病院で実施されて、組織を病理組織学的診断のためにUF CVMに提出した。組織は10%中性緩衝ホルマリン中で固定して、パラフィンに包埋し、5μmの切片を病理組織学的診断のためのヘマトキシリン・エオジンで染色するか、または以下に記載する通り免疫組織化学的検査に備えて加工した。未固定の組織は細菌培養に提出して、同じく-80℃で保存した。
急性期および回復期の対の血清試料は、イヌジステンパーウイルス、2型アデノウイルスおよびパラインフルエンザウイルスに対する血清中和試験のため、Cornell University College of Veterinary MedicineのAnimal Health Diagnostic Laboratory(AHDL)に送付した。抗体価は、細胞培養物のウイルス感染を阻害する血清の最終希釈として現される。急性期および回復期試料間の抗体価の≧4倍の増加として定義されるセロコンバージョンはウイルス感染を示した。これらのウイルス性病原体に対するセロコンバージョンは検出されなかった。
対の鼻腔スワブおよび死亡後組織は、細菌の分離および同定のためにUF CVMのDiagnostic Clinical Microbiology/Parasitology/Serology Serviceに送付した。試料は、非選択培地ならびにボルデテラ属(Regan-Lowe; Remel)およびマイコプラズマ属(Remel)の選択培地で培養した。すべての培養物は、増殖なしと報告する前に21日間維持した。数頭のグレイハウンドから得られた鼻腔スワブは、細菌培養のためにKansas State University College of Veterinary MedicineのDepartment of Diagnostic Medicine/Pathobiologyにも送付した。臨床的に疾患が認められて試験が行われた70頭のイヌの内、気管支敗血症菌(Bordetella bronchiseptica)が1頭ノイヌの鼻腔から分離されて、マイコプラズマ属は33頭のイヌの鼻腔から回収された。パスツレラムルトシダは、膿性鼻分泌物の見られるイヌの鼻腔から広く回収された。2004年1月の大流行で死亡したイヌの内の2頭では死亡後に肺に若干の大腸菌の増殖が認められ、1頭では大腸菌およびストレプトコッカスカニス(Streptococcus canis)の若干の増殖が見られ、またもう1頭では緑膿菌(Pseudomonas aeruginosa)および酵母の若干の増殖が認められた。死亡したイヌの気管または肺からは、気管支敗血症菌およびマイコプラズマは分離されなかった。
凍結組織を融解して、0.5%ウシ血清アルブミン(BSA)および抗生物質を強化した10倍量の最小必須培地(MEM)を加えてホモジナイズした。遠心分離により固体の細片を除去して、上清を培養細胞または10日齢の孵化鶏卵に接種した。死亡したグレイハウンド由来の組織ホモジネートを、広範囲のウイルス性病原体の複製を支持する種々の細胞培養物に接種した。細胞培養物には、Vero(アフリカミドリザル腎上皮細胞、ATCC No. CCL-81)、A-72(イヌ腫瘍線維芽細胞、CRL-1542)、HRT-18(ヒト直腸上皮細胞、CRL-11663)、MDCK(イヌ腎上皮細胞、CCL-34)、イヌ一次腎上皮細胞(AHDL, Cornell University)、イヌ一次肺上皮細胞(AHDL)、およびウシ一次精巣細胞(AHDL)が含まれた。MDCKおよびHRT細胞は2.5μg/mL TPCK処理トリプシン(Sigma)を強化したMEMで培養し、残りの細胞株は10%ウシ胎児血清および抗生物質を強化したMEMで培養した。細胞は、25cm2のフラスコを用いて5%CO2含有加湿大気中、37℃で培養した。対照培養には強化MEMを接種した。培養物は形態学的変化を1日1回観察して、接種後5日に回収した。回収した液体および細胞は遠心分離により清澄化して、最初の接種において記載した通り、新鮮な細胞に接種し;2回の盲目継代を行った。清澄化した上清の血球凝集活性は、記載される通り(Burlesonら、1992年;Kendalら、1982年)、ニワトリまたはシチメンチョウの赤血球を用いて測定した。鶏胚を用いたウイルス分離では、組織ホモジネートの0.1mLを尿膜嚢に接種して、35℃にて48時間、インキュベートした。2回の盲目継代後、尿膜腔液の血球凝集活性を、記載される通り(Burlesonら、1992年;Kendalら、1982年)、測定した。
製造業者の説明書に従ってRNeasyキット(Qiagen, Valencia, CA)を用いて、組織培養上清または尿膜腔液から全RNAを抽出した。全RNA(10ng)は、一段階RT-PCRキット(Qiagen, Valencia, CA)を製造業者の説明書に従って使用して、cDNAに逆転写した。cDNA内の8つのインフルエンザウイルス遺伝子のコード領域のPCR増幅は、汎用遺伝子特異的プライマーセットを用いて既報(Klimovら、1992a)の通り実施した。得られたDNA単位複製配列は、サイクルシーケンシングダイターミネーターケミストリー(ABI)を用いたApplied Biosystems 3100自動DNAシーケンサーでの自動シーケンシングのための鋳型として用いられた。ヌクレオチド配列は、GCG Package(著作権)、バージョン10.0(Accelyrs)(Womble, 2000)を用いて解析した。ヌクレオチド配列からの系統発生の推定およびブーツストラップの算出にはPhylogeny Inference Package(著作権)バージョン3.5を用いた(Felsenstein、1989年)。系統樹は、MEGA(著作権)プログラム(Kumarら、2004年)において実行されたTamura-Neiガンマモデルを用いて近隣結合法により得られた系統樹と比較して、PAUP(著作権)4.0ベータプログラム(Sinauer Associates)により確認した。
6カ月齢の4頭の特定病原体除去ビーグル犬[(雌雄各2頭(Liberty Research)]を使用した。理学的検査、ならびに詳細な血球計測/型別計測を含むベースラインの血液検査、血清化学的検査パネル、および尿検査より、動物が健常であることが明らかとなった。動物は、実験動物管理認定協会より認定されたBSL 2-強化施設内で群飼いした。ベースラインの直腸温度は1日2回、7日間、記録した。イヌは、気管内チューブの挿管に備えて、プロポフォール(ディプリバン(登録商標)、Zeneca Pharmaceuticals、0.4mg/kg体重〜効果)の静脈内注入により麻酔した。各イヌにA/イヌ/フロリダ/43/2004(イヌ/FL/04)(H3N8)ウイルスを106.6の半数組織培養物感染用量(TCID50)の総用量で接種して、半量は気管内チューブを介して気管末端に投与して、残りの半量はカテーテルを介して深部鼻気道に投与した。理学的検査および直腸温の記録は、1日2回、接種後(p.i.)14日間実施した。p.i.0、3、5、7、10および14日に頚静脈穿刺により血液試料(4mL)を採取した。鼻腔および口咽頭の標本は、各イヌからp.i.0〜5、7、10および14日にポリエステルスワブ(Fisher Scientific)を用いて採取した。スワブはウイルス輸送培地(Remel)に回収して、-80℃で保存した。2頭のイヌ(雌雄各1頭)はp.i.5日にBeuthanasia-D(登録商標)液(1mL/5kg体重;Schering-Plough Animal Health Corp)の静脈内接種により安楽死させて、残りの2頭は14日目に死亡後検査のために安楽死させた。組織学的検査のための組織は既述の通り加工した。ウイルス培養用の組織は-80℃で保存した。この試験は、University of Florida Institutional Animal Care and Use Committeeにより承認された。
肺ホモジネート、および遠心分離によるスワブ輸送培地の清澄化により調製したスワブ抽出液の段階希釈は、0.5%BSAおよび抗生物質を強化したMEMで調製した。プラークアッセイ法は、6穴組織培養プレート中の単層のMDCK細胞を用いて既報(Burlesonら、1992年)の通り実施した。接種した単層細胞層に0.8%アガロースおよびTPCK-トリプシン 1.5μg/mLを含む強化MEMを重層した。細胞は、固定およびクリスタルバイオレットでの染色前に、5%CO2を含む加湿大気中で37℃にて72時間、培養した。ウイルス濃度は、組織1グラム当たりまたはスワブ当たりのプラーク形成単位(PFU)として表した。
グレイハウンドおよびビーグル犬由来の脱パラフィンおよび再水和した5μm肺組織切片をBond-Rite(商標)スライドガラス(Richard-Allan Scientific, Kalamazoo, MI)にセットして、プロテイナーゼK(DakoCytomation, Carpenteria, CA)、ペルオキシダーゼ遮断試薬(Dako(登録商標)En Vision(商標)Peroxidase Kit, Dako Corp.)で順次処理した。切片を、イヌジステンパーウイルス(VMRD, Inc.)、2型イヌアデノウイルス(VMRD, Inc.)、イヌパラインフルエンザウイルス(VMRD, Inc.)、またはインフルエンザA H3(Chemicon International, Inc.)に対するモノクローナル抗体の1:500希釈と共に室温で2時間インキュベートした。対照には、同一の切片とマウスIgG(1mg/mL、Serotec, Inc.)のインキュベート、およびモノクローナル抗体と通常のイヌ肺切片のインキュベートが含まれた。一次抗体で処理した後、切片は製造業者の説明書に従って二次イムノペルオキシダーゼおよびペルオキシダーゼ基質試薬(Dako(登録商標)EnVision(商標)Peroxidase Kit, Dako Corp.)と共にインキュベートした。切片をヘマトキシリンで対比染色して、清澄化剤#2およびBluing試薬(Richard-Allan Scientific, Kalamazoo, MI)で処理して脱水し、Permount(ProSciTech)を用いてカバーガラスをかけた。
血清試料は、56℃での60分間の熱非働化前に、レセプター破壊酵素(RDE, Denka)(血清1容積:RDE 3容積)と共にインキュベートした。インフルエンザA/イヌ/FL/04(H3N8)ウイルスはMDCK細胞を用いて37℃にて36〜48時間、増殖させた。ウイルス培養の上清を回収して、遠心分離により清澄化して-80℃で保存した。HIアッセイ法は既報(Kendalら、1982年)の通り実施した。つまり、25μl中4血球凝集単位のウイルスをマイクロタイターウェルの段階希釈した等量の血清に加えて、室温で30分間、インキュベートした。等量の0.5% v/vシチメンチョウ赤血球を加えて、30分後に血球凝集力価を目視により求めた。エンドポイントのHI力価は、血球凝集を完全に阻害する血清の最終希釈として定義された。セロコンバージョンは、急性期および回復期の対の試料間におけるHI力価の≧4倍の増大として定義された。単一試料の血清陽性は≧1:32のHI抗体価として定義された。
A/イヌ/FL/04(H3N8)に対する血清抗体反応の中和は、既報のMNアッセイ法(Roweら、1999年)により検出された。但し、イヌ血清はアッセイ前に上記のようにRDE処理した。エンドポイントの力価は、100 TCID50のウイルスを50%中和する血清の最高希釈として定義された。セロコンバージョンは、急性期および回復期の対の試料間におけるMN力価の≧4倍の増大として定義された。単一試料の血清陽性は≧1:80のMN力価として定義された。
2004年1月に、フロリダのトラックの2箇所の犬舎およびこれらの犬舎にイヌを供給する地元飼育場で飼育されている22頭のレース用グレイハウンドにおいて呼吸器疾患の大流行が発生した。各犬舎建物には約60頭、飼育場には約300頭のイヌがいた。大流行は6日間起こって、その後、新しい症例は特定されなかった。22頭中14頭のイヌが39.5〜41.5℃の発熱を示し、10〜14日間にわたって咳をして、最終的に回復した。残りの8頭の内、見かけ上健康であった6頭のイヌは予想に反して死亡して、口および鼻から出血が見られた。その他の2頭のイヌは、急激な悪化のために、口および鼻からの出血発生の24時間以内に安楽死させた。これらの双方のイヌが41℃の熱を呈した。8頭中4頭の死亡例は犬舎施設で発生して、4頭は飼育場で発生した。死亡例の50%が大流行の3日目に発生した。22頭のイヌは17カ月齢から4歳であったが、73%は17〜33カ月齢であった。
グレイハウンドの臨床的および病理学的観察所見におけるイヌ/FL/04ウイルスの役割について検討するため、本発明者らはインフルエンザA H3に対するモノクローナル抗体を用いて肺組織の免疫組織化学的染色(IHC)を実施した。ウイルス性H3抗原は気管支および細気管支の上皮細胞、気管支腺上皮細胞の細胞質に一貫して検出され、またマクロファージは気道腔および肺胞腔に検出された(図2A)。これらのデータは、多くのイヌにおけるH3亜型のインフルエンザウイルスの肺感染の診断を支持する。
呼吸器疾患大流行の病因論におけるイヌ/FL/04様ウイルスの関与について調べるため、本発明者らは血球凝集阻害(HI)およびマイクロ中和(MN)により病気のイヌ11頭および無症状の接触犬16頭から採取した急性期および回復期の対の血清を分析した。急性期から回復期までのイヌ/FL/04に対する抗体価の≧4倍の増加として定義されるセロコンバージョンが、両アッセイ法において、11頭中8頭(73%)の病犬で発生した(表1)。セロコンバージョンはHIアッセイ法では16頭中6頭(38%)の無症状接触犬で発生し、MNアッセイ法では16頭中8頭(50%)がセロコンバージョンを示した(表1)。セロコンバージョンのデータは、イヌのイヌ/FL/04様ウイルスの感染が大半の動物において呼吸器疾患の発症と時間的に一致することを実証した。
イヌ/FL/04ウイルスのイヌへの感染能力についてより理解するために、4頭の6カ月齢の純系ビーグル犬に106.6半数組織培養物感染用量(TCID50)を気管内または鼻腔内経路によりそれぞれ接種した。すべてのイヌが接種後(p.i.)最初の2日間に発熱(直腸温 ≧39℃)を発症したが、14日間の観察期間を通して咳または鼻分泌物などの呼吸器症状を示したものはいなかった。ウイルス排出は、鼻および口咽頭のスワブにおけるウイルスの定量によって調べた。4頭中2頭のイヌのみが検出可能量のウイルスを排出した。1頭のイヌはp.i.1日および2日にウイルスを排出し(スワブ当たり1.0〜2.5 log10 PFU)、その他のイヌは接種後連続4日間にわたってウイルスを排出した(スワブ当たり1.4〜4.5 log10 PFU)。p.i. 5日における2頭のイヌの死亡後検査より、グレイハウンドにおける自然発生性疾患に見られる所見とほぼ等しい壊死性増殖性気管炎、気管支炎および細気管支炎が認められたが、肺出血または気管支肺炎は認められなかった。IHCにより、ウイルスH3抗原が気管支、細気管支および気管支腺の上皮細胞の細胞質に検出された(図2B)。感染性ウイルスが1頭のイヌの肺組織から回収された。p.i.14日における残りの2頭の死亡後検査より、呼吸組織における最小限の組織学的変化、IHCによるウイルスH3抗原の不在、および肺ホモジネートからのウイルスの無回収が確認された。これらの後者の2頭のイヌにおけるセロコンバージョンは、MNアッセイ法においてp.i.7日に検出され、14日までに抗体価はさらに2〜3倍に増加した。これらの結果より、熱性反応、肺実質におけるウイルス抗原および感染性ウイルスの存在、インフルエンザに典型的な病理組織学的所見、ならびにセロコンバージョンに示されるように、イヌ/FL/04感染に対するイヌの感受性が確立された。実験的に接種したビーグル犬において重度の疾患および死亡を再現できなかったことは、自然感染したグレイハウンドの大集団が無症候性であったことを考えると、驚くべきことではない。
2004年1月の大流行以前にイヌ/FL/04様インフルエンザウイルスがフロリダのグレイハウンド集団で広まっていたかどうかを調べるため、65頭のレース用グレイハウンドに由来する保存血清についてHIおよびMNアッセイ法を用いてイヌ/FL/04に対する抗体の存在を調べた。1996年〜1999年に試料採取した33頭のイヌでは、検出可能な抗体はなかった。2000年〜2003年に試料採取した32頭の内、9頭は双方のアッセイ法において血清陽性であった−2000年に1頭、2002年に2頭、および2003年に6頭(表5)。血清陽性のイヌは1999年から2003年まで病因不明の呼吸器疾患の大流行に関与したフロリダのトラックで飼育されており、イヌ/FL/04様ウイルスがこれらの大流行の原因物質であった可能性があることを示唆する。この可能性をさらに調べるために、本発明者らは2003年3月に出血性気管支肺炎のために死亡したグレイハウンドから採取された保存組織を調べた。1頭のイヌに由来する肺ホモジネートをMDCK細胞および鶏胚に接種したところ、H3N8インフルエンザウイルスが回収されて、A/イヌ/フロリダ/242/2003(イヌ/FL/03)と命名された。イヌ/FL/03の完全ゲノムの配列解析はイヌ/FL/04に対して>99%同一性を示し(表4)、イヌ/FL/04様ウイルスが2004年以前にグレイハウンドに感染していたことを示す。
2004年6月から8月にフロリダ、テキサス、アラバマ、アーカンソー、ウェストバージニアおよびカンザスの14箇所のトラックで何千頭ものレース用グレイハウンドに呼吸器疾患の大流行が発生した。
a 疾病の臨床徴候を伴うイヌの頭数。
b 臨床的疾病犬と接触して飼育されている無症候性のイヌの頭数。
c A/イヌ/フロリダ/43/04ウイルスを用いた血球凝集阻害(HI)アッセイ法。
d A/イヌ/フロリダ/43/04ウイルスを用いたマイクロ中和(MN)アッセイ法
e 急性期および回復期の対の血清の抗体価が少なくとも4倍に増加したイヌのパーセント。
f 回復期血清において陽性抗体価(HI抗体価 ≧32:MN抗体価 ≧80)を伴うイヌのパーセント。
g 回復期血清の抗体価幾何学平均。
* 成熟H3 HAのアミノ酸残基(一文字表記)および位置。アミノ酸コードは、A=アラニン、D=アスパラギン酸、G=グリシン、I=イソロイシン、K=リジン、L=ロイシン、M=メチオニン、N=アスパラギン、R=アルギニン、S=セリン、T=スレオニン、V=バリン、W=トリプトファンである。
† 共通のウマH3 HAからの変化なしを示す。
a イヌ#43由来のウイルス分離物に対する血球凝集阻害力価
b ポリクローナル抗血清はフェレットにおいて作出されたが、その他のすべての抗血清はヒツジまたはヤギにおいて作出された。
a 動物種からのインフルエンザウイルス分離物の大半の相同遺伝子に対するA/イヌ/フロリダ/43/04(H3N8)遺伝子のヌクレオチドおよびアミノ酸(括弧内)配列同一性パーセント、続いてそれらのGenbank配列データベースアクセッション番号。
b 該当なし:N8ノイラミニダーゼはヒトまたはブタのウイルスではこれまで報告されなかった。
a フロリダのレース用グレイハウンドからの血清試料採取年。
b 6頭の2003年血清陽性犬の範囲を含む、血清陽性犬におけるマイクロ中和試験抗体価。
a A/イヌ/フロリダ/43/04(H3N8)を用いたHIにより試験した臨床的に疾病の見られるイヌの頭数。
b 急性期および回復期血清の抗体価における≧4倍の増加を示すイヌのパーセント。
c 回復期血清において陽性の抗体価(HI抗体価>16)を示したイヌのパーセント。
d 回復期血清における抗体価幾何学平均
イヌの組織
フロリダ北東部の保護施設におけるインフルエンザ大流行で2005年4月/5月に死亡した6頭の雑種犬およびフロリダ南東部の動物病院でのインフルエンザ大流行において2005年5月に死亡した1頭のペットのヨークシャーテリアについて、University of Florida College of Veterinary MedicineのAnatomic Pathology Serviceにて死亡後検査を実施した。組織は10%中性緩衝ホルマリン中で固定して、パラフィンに包埋し、病理組織学的診断のための5μmの切片をヘマトキシリン・エオジンで染色した。未固定の組織は、ウイルス学的分析まで-80℃で保存した。
7頭の各イヌに由来する凍結肺組織を融解して、使い捨ての組織グラインダー(Kendall, Lifeline Medical Inc., Danbury, CT)を用いて、0.5%ウシ血清アルブミン(BSA)および抗生物質(ゲンタマイシンおよびシプロフロキサシン)を強化した最小必須培地(MEM)を加えてホモジナイズした。市販のキット(RNeasy(登録商標)Mini Kit, QIAGEN Inc., Valencia, CA)を製造業者の説明書に従って用いて全RNAを抽出し、最終液量 60μLの緩衝液で溶出した。呼吸器疾患を伴わないイヌから採取した肺組織からも、全RNAを抽出した。
ROXをパッシブレファレンス色素として含むQuantiTect(登録商標)プローブRT-PCRキット(QIAGEN Inc., Valencia, CA)を用いて、イヌ組織試料から抽出された全RNAに対して一段階定量的リアルタイムRT-PCRを実施した。つまり、2つのプライマー-プローブセットを各試料中のインフルエンザA配列の検出に用いた(表7)。1つのプライマー-プローブセットはイヌヘマグルチニン(H3)遺伝子配列に選択的であった。他方のプライマー-プローブセットはA型インフルエンザウイルスのマトリックス(M)遺伝子の高度に保存的領域をターゲットとした。各リアルタイムRT-PCR反応において、最終液量 25μL中、2X QuantiTech(登録商標) Probe RT-PCR Master Mix 12.5μL、QuantiTech(登録商標)RT Mix 0.25μL、フォワードおよびリバースプライマー(それぞれ、0.4μMの最終濃度)、プローブ(0.1μMの最終濃度)、ならびにRNaseフリーの水を含む反応混合液に抽出した全RNA 5μLを加えた。イヌ組織試料から抽出されたRNAの存在に関する内因性の内部対照である18S rRNAの検出には、TaqMan(登録商標)リボソームRNA対照試薬(Applied Biosystems, Foster City, CA)を製造業者の説明書に従って使用した。
7頭の各イヌに由来する凍結肺組織を融解して、0.5%(BSA)および抗生物質(ゲンタマイシンおよびシプロフロキサシン)を強化した10倍量のDulbecco修正イーグル培地(DMEM)を加えてホモジナイズした。遠心分離により固体の細片を除去して、上清を1μg/mL TPCK処理したトリプシン(Sigma-Aldrich Corp., St. Louis, MO)および抗生物質(ゲンタマイシンおよびシプロフロキサシン)を加えたDMEMで培養したMadin-Darbyイヌ腎(MDCK)細胞に接種した。細胞は、25cm2のフラスコを用いて5%CO2含有加湿大気中、37℃にて培養した。培養物は形態学的変化を1日1回観察して、接種後5日に回収した。回収した培養物を遠心分離により清澄化して、上清を初回接種において記載した通り新鮮なMDCK細胞に接種し;血球凝集またはRT-PCRによりインフルエンザウイルスの証拠を示さなかった試料についてはさらに2回の継代を行った。清澄化した上清の血球凝集活性は、既報の通り(Burleson, F.ら、1992年;Kendal, P.ら、1982年)、0.5%シチメンチョウ赤血球を用いて測定した。RT-PCRは、下記の通り、実施した。
ホモジネートは、MDCK細胞の接種に関して上記の通り、凍結肺組織から調製した。ホモジネート(0.2mL)を10日齢の孵化鶏卵の尿嚢に接種した。35℃にて48時間インキュベート後、尿膜腔液の回収前に一晩、卵を4℃で冷却した。清澄化した上清の血球凝集活性は、既報の通り(Burleson, F.ら、1992年;Kendal, P.ら、1982年)、0.5%シチメンチョウ赤血球を用いて測定した。RT-PCRは、下記の通り、実施した。初回接種後にインフルエンザウイルスの証拠を示さなかった試料については、孵化鶏卵を用いたさらに2回の継代を行った。
製造業者の説明書に従ってQIAamp(登録商標)ウイルスRNAミニキット(QIAGEN Inc., Valencia, CA)を用いて、MDCK上清または尿膜腔液からウイルスRNAを抽出した。ウイルスRNAは、QIAGEN(登録商標)一段階RT-PCRキット(QIAGEN Inc., Valencia, CA)を製造業者の説明書に従って使用して、cDNAに逆転写した。cDNA内の8つのインフルエンザウイルス遺伝子のコード領域のPCR増幅は、汎用遺伝子特異的プライマーセット(プライマー配列は要求に応じて与えられる)を用いて既報(Klimov, A.ら、1992b)の通り実施した。得られたDNA単位複製配列は、サイクルシーケンシングダイターミネーターケミストリー(Applied Biosystems, Foster City, CA)を用いたABI PRISM(登録商標)3100自動DNAシーケンサーでの自動シーケンシングのための鋳型として用いられた。ヌクレオチド配列はLasergene 6 Package(登録商標)(DNASTAR, Inc., Madison, WI)を用いて解析した。ヌクレオチド配列からの系統発生の推定およびブーツストラップの算出にはPHYLIPバージョン3.5(著作権)ソフトウェアプログラムを用いた(Felsenstein, J.、1989年)。系統樹は、MEGA(著作権)プログラム(Kumar, S.ら、2004年)において実行されたTamura-Neiモデルを用いて近隣結合法により得られた系統樹と比較して、PAUP(著作権)4.0ベータプログラム(Sinauer Associates, Inc., Sunderland, MA)により確認した。
血清試料は、56℃での30分間の熱非働化前に、レセプター破壊酵素(RDE、デンカ生検株式会社、東京、日本)(血清1容積:RDE 3容積)と共にインキュベートした。インフルエンザA/イヌ/ジャクソンビル/05(H3N8)ウイルスはMDCK細胞を用いて5%CO2中、37℃にて72時間、増殖させた。ウイルス培養の上清を回収して、遠心分離により清澄化して-80℃で保存した。HIアッセイ法で用いられるその他のウイルスはすべて、10日齢の孵化鶏卵で培養し、尿膜腔液を回収して-80℃で保存した。HIアッセイ法は既報(Kendal, P.ら、1982年)の通り実施した。つまり、25μl中4血球凝集単位のウイルスを96穴プラスチックプレートにて段階希釈した等量の血清に加えて、室温で30分間、インキュベートした。等量の0.5%シチメンチョウ赤血球を加えて、30分後に血球凝集力価を目視により求めた。エンドポイントのHI力価は、血球凝集を完全に阻害する血清の最終希釈として定義された。
2005年4月および5月に、既報(Crawford, P.C.ら、2005年)の呼吸器疾患大流行がフロリダ北東部の保護施設に収容されていたイヌで発生した。この大流行には3カ月齢から9歳までの齢期範囲の少なくとも58頭が関与し、純系のイヌおよび雑種犬が含まれた。最も一般的な臨床徴候は、7〜21日間にわたる膿性鼻分泌物および咳であった。≧7日にわたって臨床疾患が認められた43頭の内、41頭はイヌ/FL/04(H3N8)に対して32から>1024のHI抗体価を示した。少なくとも10頭の犬が肺炎に進行し、この内、6頭は安楽死させた。これらの6頭の雑種犬は、4カ月齢から3歳までの雌雄各3頭であった。臨床徴候の期間は、安楽死の時点で2〜10日であった。死亡後検査において、これらのイヌは肺のうっ血および浮腫を示した。呼吸器の組織学的検査では、鼻炎、気管炎、気管支炎、細気管支炎および化膿性気管支肺炎が認められた。気管、気管支、細気管支および気管支腺に、上皮細胞の壊死およびびらんが認められた。呼吸組織に好中球およびマクロファージの浸潤が見られた。
7頭のイヌから得られた肺組織を、A型インフルエンザのM遺伝子およびイヌH3N8インフルエンザAウイルスのH3遺伝子を検出する定量的リアルタイムRT-PCRアッセイ法で解析した。7頭すべてのイヌの肺がインフルエンザAのM遺伝子およびイヌインフルエンザH3遺伝子の双方に関して陽性であった(表8)。MDCK細胞で3回継代後、3日間の肺炎の後に死亡した保護施設のイヌの肺からインフルエンザAのH3N8亜型のウイルスが分離された。このウイルスはA/イヌ/ジャクソンビル/05(H3N8)(イヌ/Jax/05)と命名された。孵化鶏卵で2回継代後、同じく3日間の肺炎の後に死亡したペットのイヌの肺からインフルエンザAのH3N8亜型のウイルスが分離された。このウイルスはA/イヌ/マイアミ/05(H3N8)(イヌ/マイアミ/05)と命名された。
イヌ/Jax/05およびイヌ/マイアミ/05の配列解析の結果、それらのヘマグルチニン(HA)遺伝子は2004年および2005年のトラックでのインフルエンザ大流行時に肺炎で死亡したレース用グレイハウンドの肺から回収されたイヌ/FL/04、イヌ/TX/04およびイヌ/アイオワ/05分離物と98%一致することが明らかとなった(Crawford, P.C, ら、2005年;Yoon K-Yら、2005年)。さらに、イヌ/Jax/05およびイヌ/マイアミ/05のHA遺伝子は、2000年以降に分離された現代のウマインフルエンザウイルスと98%一致した。HA遺伝子の系統学的比較では、イヌ/Jax/05およびイヌ/マイアミ/05ウイルスはイヌ/FL/04、イヌ/TX/04、およびイヌ/アイオワ/05のグレイハウンド分離物、ならびに現代のウマ分離物とクラスターを形成し、1990年代初期に分離された古いウマウイルスとは異なる群を形成することが示された(図4)。さらに、イヌ/Jax/05、イヌ/マイアミ/05およびイヌ/アイオワ/05分離物はイヌ/FL/04またはイヌ/FL/03よりもイヌ/Tx/04により密接に関連した。2005年の分離物は先の2003年および2004年イヌウイルスから枝分れしたと思われる亜型を形成し、約10箇所の最節約法的に情報価値のある部位が異なる。これらの相違は、外部の感染源から定期的に再導入されるのとは対照的に、イヌからイヌへと水平伝播するという仮説を支持する。2003年から2005年までの突然変異の蓄積は、イヌインフルエンザウイルスに生じたと予想されるように、ウイルスが新しい宿主に伝達された後に受けなければならない適応の進行中の過程を例示するものである。
6検体のすべてのイヌ分離物には、それらを現代のウマインフルエンザと区別する保存的アミノ酸置換があった(表9)。これらの保存的置換はI15M、N83S、W222L、I328TおよびN483Tであった。成熟HAタンパク質を系統学的に比較した結果、イヌ/Jax/05、イヌ/マイアミ/05およびイヌ/アイオワ/05ウイルスはイヌ/TX/04分離物と共に亜型を形成することが示された(図4)。この亜型とその他のイヌウイルスを区別する3つのアミノ酸変化(L118V、K261NおよびG479E)があった(表9)。2005年の分離物をそれらのルーツであるイヌ/TX/04と区別する2つのアミノ酸変化(F79LおよびG218E)があった。さらに、グレイハウンド以外のイヌからの2005年分離物であるイヌ/Jax/05およびイヌ/マイアミ/05は1個のアミノ酸変化であるR492Kがイヌ/アイオワ/05グレイハウンド分離物と異なった。最後に、イヌ/Jax/05は一つのアミノ酸S107Pにおいてイヌ/マイアミ/05とは異なった。その他のすべてのH3N8ウマおよびイヌウイルスにおいて、Tを持つA/ウマ/チーリン/1/89(Guo Y.ら、1992年)を除いてSは107の位置に保存される。
血球凝集阻害(HI)試験は、以前および現代のウマインフルエンザウイルスおよびイヌインフルエンザウイルス、ならびにインフルエンザウイルスに感染したウマおよびイヌから2005年に採取された血清を用いて実施された(表10)。イヌ/FL/04に対して免疫したフェレットの血清も分析に含めた。ウマ血清のHI抗体価は現代のウマウイルスを以前の分離物と比較して調べた結果、8〜16倍高かったが、イヌウイルスを用いて調べると少なくとも1/4低下した。イヌ血清は以前のウマウイルスとは非反応性であったが、現代のウマ分離物およびイヌ分離物を用いて調べると抗体価は4倍に増加した。これは、イヌインフルエンザウイルスに対して免疫されたフェレットの血清についても観察された。これらの血清反応パターンは、イヌインフルエンザウイルスおよび現代のウマインフルエンザウイルスの間の抗原類似性を実証するものであり、系統学的解析と一致した。イヌ/マイアミ/05分離物に対するウマ、イヌおよびフェレット血清の抗体価は、2003年および2004年のイヌ分離物における抗体価とほぼ等しかった。しかし、イヌ/Jax/05分離物の抗体価は1/2〜1/4であった。このことは、イヌ/Jax/05が抗原的にはその他のイヌ分離物とは異なり、成熟HAの107位における単一のアミノ酸の変化に一部関連し得ることを示唆する。
a 下線を引いた文字rはaまたはgのヌクレオチドを示し、下線を引いた文字kはgまたはtのヌクレオチドを示す。
b 大文字は固定された核酸残基を示す。
a 抗体価は、ウマ、イヌまたはフェレットの血清の段階希釈、ならびに抗原のカラムに列記されるウイルスを用いて実施した血球凝集阻害試験で求められた。
b イヌ/FL/04ウイルスで免疫したフェレットの血清
イヌインフルエンザウイルス接種物
ウイルス接種物は、Madin-Darbyイヌ腎(MDCK)上皮細胞に既報(Crawfordら、2005年)のオリジナル分離物の3回継代物であるA/イヌ/FL/43/04(H3N8)のストックを接種して調製した。1μg/mL TPCK処理トリプシン(Sigma-Aldrich Corp., St. Louis, MO)および抗生物質(ゲンタマイシンおよびシプロフロキサシン)を強化したDulbecco最小必須培地(DMEM)中の接種されたMDCK細胞は、250cm2のフラスコに入れて5%CO2を含む加湿大気中、37℃にて生育させた。培養物は形態学的変化を1日1回観察して、接種後5日に回収した。回収した培養物は遠心分離によって清澄化して、上清をイヌの接種まで-80℃で保存した。ReedおよびMuench法によるウイルス力価の測定には、上清の画分を使用した。力価は、1mL当たり107半数組織培養物感染用量(TCID50)のA/イヌ/フロリダ/43/04(イヌ/FL/04)であった。
コロニーで繁殖した4カ月齢の8頭の雑種犬(Marshall BioResources, North Rose, NY)(雌雄各4頭)をUniversity of Florida Institutional Animal Care and Use Committeeにより承認された実験的接種試験に使用した。イヌの体重は13〜17kgであった。イヌは、理学的検査、ベースラインの血液検査、および接種前2週間の体温記録に基づいて、健常であった。すべてのイヌは、施設への到着時および2週間後に採取した対の血清試料について実施した血清学的検査に基づいて、イヌインフルエンザウイルスへの曝露歴はなかった。イヌは、気管内チューブの挿管に備えて、プロポフォール(ディプリバン(登録商標)、Zeneca Pharmaceuticals、行うために0.4mg/kg体重)の静脈内注入により麻酔した。6頭(雌雄各3頭)のイヌに、気管内チューブに挿入した直径の小さなゴム製カテーテルを介して5mL無菌生理食塩液中107 TCID50のイヌ/FL/04ウイルスを遠位気管に投与して、それぞれ接種した。2頭のイヌ(雌雄各1頭)には等量の無菌生理食塩液を偽接種した。偽接種した対照のイヌは、ウイルス接種したイヌとは別の部屋に収容して、別の担当者がケアした。理学的検査および直腸温の記録は、1日2回、接種後(p.i.)6日間実施した。
ウイルス排出をモニターするために、p.i.0〜6日にポリエステルスワブ(Fisher Scientific International Inc., Pittsburgh, PA)を用いて口咽頭標本を各イヌから1日2回、採取した。スワブは、0.5%ウシ血清アルブミン(BSA)を含む無菌リン酸緩衝生理食塩液(PBS)1mLに収容した。直腸スワブは0日から6日まで1日1回、各イヌから採取した。スワブ抽出液は、スワブ輸送培地を遠心分離によって清澄化して調製した。スワブ抽出液の画分は、Directigen(商標)の市販の免疫アッセイキット(BD, Franklin Lakes, NJ)を製造業者の説明書に従って用いて、インフルエンザAウイルス核タンパク質について直ちに検査した。残りの抽出液は、その他のウイルス学的アッセイ法まで-80℃にて保存した。
p.i. 1日に、偽接種した1頭およびウイルス接種した1頭のイヌをBeuthanasia-D(登録商標)液(1mL/5kg体重;Schering-Plough Animal Health Corp)の静脈内注入により安楽死させた。p.i. 2日から5日まで毎日、ウイルス接種した1頭のイヌを同様に安楽死させた。p.i. 6日に偽接種およびウイルス接種した残りのイヌを安楽死させた。詳細な死亡後検査は1名の試験担当者(WLC)により実施された。組織は10%中性緩衝ホルマリン中で固定して、パラフィンに包埋し、5μmの切片を病理組織学的診断のためにヘマトキシリン・エオジンで染色するか、または以下に記載する通り免疫組織化学的検査に備えて加工した。未固定の肺組織は、細菌の分離および同定のため、University of Florida College of Veterinary MedicineのDiagnostic Clinical Microbiology/Parasitology/Serology Serviceに送付した。試料は、非選択培地およびボルデテラ属(Regan-Lowe; Remel, Lenexa, KS)およびマイコプラズマ属(Remel)の選択培地で培養した。すべての培養物は、増殖なしと報告する前に21日間維持した。未固定の組織は、同じくウイルス学的分析まで-80℃で保存した。
脱パラフィンおよび再水和した5μmの気管および肺組織切片をBond-Rite(商標)スライドガラス(Richard-Allan Scientific, Kalamazoo, MI)にセットして、プロテイナーゼK(DAKOCytomation, Carpenteria, CA)ペルオキシダーゼ遮断試薬(DAKO(登録商標)EnVision(商標)ペルオキシダーゼキット、DAKO Corp., Carpenteria, CA)で順次処理した。切片は、インフルエンザA H3に対するモノクローナル抗体の1:500希釈(Chemicon International, Inc., Ternecula, CA)と共に室温で2時間、インキュベートした。対照には、同一の切片とマウスIgG(1mg/mL、Serotec, Inc. Raleigh, NC)のインキュベート、およびモノクローナル抗体と正常なイヌ肺切片のインキュベートが含まれた。一次抗体で処理した後、切片は製造業者の説明書に従って二次イムノペルオキシダーゼおよびペルオキシダーゼ基質試薬(Dako(登録商標)EnVision(商標)ペルオキシダーゼキット、Dako Corp.)と共にインキュベートした。ヘマトキシリンで切片を対比染色して、清澄化剤#2およびBluing試薬(Richard-Allan Scientific, Kalamazoo, MI)で処理して脱水し、Permount(ProSciTech, Queensland, Australia)を用いてカバーガラスをかけた。
各イヌに由来する肺および気管の組織を融解して、使い捨ての組織グラインダー(Kendall, Lifeline Medical Inc., Danbury, CT)を用いて、0.5%ウシ血清アルブミン(BSA)および抗生物質(ゲンタマイシンおよびシプロフロキサシン)を強化した最小必須培地(MEM)を加えてホモジナイズした。市販のキット(RNeasy(登録商標)ミニキット、QIAGEN Inc., Valencia, CA)を製造業者の説明書に従って用いて、組織ホモジネートならびに口咽頭および直腸スワブ抽出液から全RNAを抽出して、最終液量 60μLの緩衝液で溶出した。
ROXをパッシブレファレンス色素として含むQuantiTect(登録商標)プローブRT-PCRキット(QIAGEN Inc., Valencia, CA)およびA型インフルエンザウイルスのマトリックス(M)遺伝子の高度保存領域をターゲットとするプライマー-プローブセット(Payungporn S.ら、2006年a;Payungporn S.ら、2006年b)を用いて、全RNAに対して一段階定量的リアルタイムRT-PCRを実施した。各リアルタイムRT-PCR反応において、最終液量 25μL中、2X QuantiTech(登録商標) Probe RT-PCR Master Mix 12.5μL、QuantiTech(登録商標)RT Mix 0.25μL、フォワードおよびリバースプライマー(それぞれ、0.4μMの最終濃度)、プローブ(0.1μMの最終濃度)、ならびにRNaseフリーの水を含む反応混合液に抽出した全RNA 5μLを加えた。スワブおよび組織試料から抽出されたRNAの存在に関する内因性の内部対照として、また標準化対照としてのGAPDHの検出には、TaqMan(登録商標)GAPDH対照試薬(Applied Biosystems, Foster City, CA)を製造業者の説明書に従って使用した。
ウイルス接種したイヌから得られた肺および気管の凍結組織を融解して、0.5%BSAおよび抗生物質を強化した10倍量のDMEM中でホモジナイズした。遠心分離により固体の細片を除去して、上清を上記の通り1μg/mLのTPCK処理したトリプシン(Sigma-Aldrich Corp., St. Louis, MO)および抗生物質を強化したDMEMで培養したMDCK細胞に接種した。細胞は、25cm2のフラスコを用いて5%CO2含有加湿大気中、37℃にて培養した。培養物は形態学的変化を1日1回観察して、接種後5日に回収した。回収した培養物を遠心分離により清澄化して、上清を初回接種において記載した通り新鮮なMDCK細胞に接種し;血球凝集またはRT-PCRによりインフルエンザウイルスの証拠を示さなかった試料についてはさらに2回の継代を行った。清澄化した上清の血球凝集活性は、上記の通り0.5%シチメンチョウ赤血球(Crawfordら、2005年)を用いて測定した。RT-PCRは、下記の通り、実施した。
製造業者の説明書に従ってQIAamp(登録商標)ウイルスRNAミニキット(QIAGEN Inc., Valencia, CA)を用いて、MDCK上清からウイルスRNAを抽出した。ウイルスRNAは、QIAGEN(登録商標)一段階RT-PCRキット(QIAGEN Inc., Valencia, CA)を製造業者の説明書に従って使用して、cDNAに逆転写した。cDNA内の8つのインフルエンザウイルス遺伝子のコード領域のPCR増幅は、汎用遺伝子特異的プライマーセット(プライマー配列は要求に応じて与えられる)を用いて既報(Crawfordら、2005年)の通り実施した。得られたDNA単位複製配列は、サイクルシーケンシングダイターミネーターケミストリー(Applied Biosystems, Foster City, CA)を用いたABI PRISM(登録商標)3100自動DNAシーケンサーでの自動シーケンシングのための鋳型として用いられた。ヌクレオチド配列はLasergene 6 Package(登録商標)(DNASTAR, Inc., Madison, WI)を用いて解析した。呼吸器での複製中に何らかの変化が生じたか否かを調べるために、感染犬から回収されたウイルスのヌクレオチド配列を接種物中のウイルスの配列と比較した。
ウイルス接種された6頭のすべてのイヌが最初のp.i. 2日間に発熱(直腸温 ≧39℃)を発症したが、6日間の観察期間を通して咳または鼻分泌物などの呼吸器症状を示したものはいなかった。偽接種したイヌは臨床的に健常な状態を維持した。
インフルエンザAの核タンパク質がp.i. 24時間にウイルス接種したイヌの1頭から採取された口咽頭スワブで検出された。p.i. 72、84および120時間に1頭のイヌから、またp.i. 108、120および132時間にはもう1頭のイヌから採取された口咽頭スワブが定量的リアルタイムRT-PCRによりウイルスに関して陽性であった(表11)。スワブ抽出液1μL当たりのインフルエンザM遺伝子コピーの絶対数は、p.i.3日から6日まで経時的に増加した。直腸スワブには、ウイルスは検出されなかった。
特定病原体除去ビーグルを用いた過去の実験的感染(Crawfordら、2005年)とは対照的に、ウイルス接種した雑種犬は、p.i.1日から6日までの肺の肉眼的および組織学的分析により示される通り、肺炎を発症した。肺炎に加えて、イヌは、自然感染したイヌにおける報告(Crawfordら、2005年)と同様に鼻炎、気管炎、気管支炎および細気管支炎を呈した。気道の裏打ち細胞および気管支腺に上皮の壊死およびびらんが認められ、粘膜下組織には好中球およびマクロファージの浸潤が見られた(図5、上段)。免疫組織化学的検査により、気管支、細気管支および気管支腺の上皮細胞にウイルス性H3抗原が検出された(図5、下段)。細菌の重複感染はなかった。2頭の偽接種犬の呼吸組織は正常であった。
気管および肺は、p.i. 1日から6日まですべてのイヌにおいて定量的リアルタイムRT-PCRによりウイルスに関して陽性であった(表12)。気管ホモジネート1μL当たりのインフルエンザM遺伝子コピーの絶対数はp.i. 1日から5日まで増加して、その後、6日には減少した。肺ホモジネート1μL当たりのM遺伝子コピーの絶対数はp.i. 1日から6日まで減少した。一般に、気管には6日間の各p.i.日に肺よりも≧1log10多いウイルスが含まれた。
a A/イヌ/FL/43/04(H3N8)ウイルスの接種後の、イヌから口咽頭スワブが採取された時期。
b 標準化比は、各スワブ抽出液についてM(Ct)をGAPDH(Ct)で割って算出した。
c スワブ抽出液1μL当たりのマトリックス遺伝子コピーの絶対数。
a A/イヌ/FL/43/04(H3N8)ウイルスの接種後の、イヌから組織が採取された時期。
b 標準化比は、各組織ホモジネートについてM(Ct)をGAPDH(Ct)で割って算出した。
c 組織ホモジネート1μL当たりのマトリックス遺伝子コピーの絶対数。
ウイルス株
イヌインフルエンザウイルス株ならびにトリ、ウマおよびヒト由来のウイルス株(表15に列記)を孵化鶏卵またはMDCK細胞で増殖させて、それらの感染性をニワトリ胚におけるエンドポイント希釈またはプラーク法により定量した。シチメンチョウ赤血球(red blood cell)の赤血球(erythrocytes)を用いた血球凝集試験により、迅速なウイルスの定量が実施された。
2005年にウイルス性呼吸器疾患が疑われる症例から採取された合計60頭のイヌの肺組織について、イヌインフルエンザウイルスの存在を調べた。
20〜30mgの重量の肺組織のブロックを使い捨ての組織グラインダー(Kendal)に入れてホモジナイズした。製造業者の説明書に従って市販のキット(RNeasyミニキット、Qiagen, Valencia, CA)を用いて全RNAを抽出し、最終液量 60μLの液量で溶出した。
CLUSTAL Xプログラム(バージョン1.8)を用いて、様々な亜型および多様な動物種に由来するH3およびM遺伝子のマルチプル配列アラインメントを実施した。マトリックス(M)プライマーおよびプローブはインフルエンザAウイルスの異なる亜型に対応する公知の配列を通じての保存領域から選択され、H3ヘマグルチニン遺伝子特異的なプライマーおよびプローブはウマおよびイヌインフルエンザAウイルス遺伝子に特異的にマッチして、相同のトリおよびヒト遺伝子にはミスマッチするように選択した(表13)。プライマー設計ソフトウェア(OLIGOS バージョン9.1)およびEXIQON(http://lnatools.com)より提供されるウェブ上の解析ツールをTmの算出ならびに二次構造および自己ハイブリダイゼーションの予測に使用した。18S rRNAの保存領域を、イヌ組織試料から抽出されたRNAの存在に関する内因性内部対照として使用した。Pre-Developed TaqMan(登録商標)Assay Reagents for Eukaryotic 18S rRNA(VIC/TAMRA) (Applied Biosystems)を組織試料における18S rRNAのリアルタイム検出に使用した。
一段階定量的リアルタイムRT-PCRは、ROXをパッシブレファレンス色素として含むQuantitectプローブRT-PCRキット(Qiagen, Valencia, CA)を用いて実施した 各リアルタイムRT-PCR反応において、最終液量 20μL中、2X QuantiTechプローブRT-PCRマスターミックス 10μL、QuantiTech RT Mix 0.2μL、プライマー(H3遺伝子については最終濃度0.4μM、M遺伝子については最終濃度0.6μM)、プローブ(H3遺伝子については最終濃度0.1μM、M遺伝子については最終濃度0.2μM)、RNaseフリーの水を含む反応混合液と化合するための鋳型としてRNA試料の5μLを使用した。一段階リアルタイムRT-PCRはMx3005PリアルタイムQPCRシステム(Stratagene)を用いて実施した。サイクリング条件は、50℃、30分間の逆転写過程を含んだ。HotStarTaq DNAポリメラーゼを活性化するための95℃、15分間の1回目変性段階の後、増幅は変性(94℃、15秒間)およびアニーリング/伸展(60℃、30秒間)を含む40サイクルの期間中に実施された。FAM(H3およびM検出のため発光波長516nm)およびVIC(18S rRNA検出のため発光波長555nm)の蛍光シグナルはサイクル当たり1回ずつ、伸展段階の終了時に得た。リアルタイムPCRアッセイ法のデータの取得および解析はMx3005Pソフトウェア バージョン2.02(Stratagene)を用いて実施した。
各プライマー/プローブセットの特異性について試験するために、インフルエンザAウイルスの複数の公知の亜型から抽出されたRNAをリアルタイムRT-PCRアッセイ法における鋳型として用いた(表15)。
イヌインフルエンザAウイルス(A/イヌ/フロリダ/242/2003(H3N8))の遺伝子は、T7プロモーターと結合したプライマーを用いることによってH3(nt 1〜487)およびM(nt 1〜276)のPCR単位複製配列を作出するために使用した(表13)。続いて、リボプローブインビトロ転写システム-T7(Promega)を製造業者の説明書に従って用いることによって、H3およびM遺伝子の精製PCR単位複製配列をインビトロにおける転写のための鋳型として用いた。転写されたRNAの濃度は、260nmでの吸光度を測定して算出した。次に、感受性試験を実施するためにRNAを108〜10コピー/μLの範囲で10倍段階希釈した。さらに、リアルタイムRT-PCRの全体の性能を調べるために、初期RNA鋳型濃度(コピー/μL)の対数を各希釈より得られた閾値サイクル(Ct)に対してプロットして標準曲線を作成した。
106.67EID50/mL(HA=64)のA/ワイオミング/3/2003 (H3N2)および107.17EID50/mL(HA=16)のA/イヌ/フロリダ/242/2003(H3N8)を含む2つのウイルス株のストックウイルスを検出閾値アッセイ法に使用した。高速インフルエンザA抗原検出キットであるDirectigen Flu A(Becton, Dickinson and Company)を製造業者の説明書に従って使用して、標本のリン酸緩衝生理食塩液(PBS)(125μL)の対数希釈を用いた。それぞれのDirectigen Flu A検査装置には膜の中央部に紫色のドットとして現れるH1N1インフルエンザ抗原スポットがあり、核タンパク質(NP)に対するモノクローナル抗体に基づいて検査の完全性が示される。ドットを取り巻く紫色の三角形の出現は、試験標本におけるインフルエンザNPの存在を示す。三角形からの紫色のシグナルの強度は、+(三角形の輪郭)、++(明るく着色した三角形)、+++(暗紫色の三角形)および++++(極めて暗紫色の三角形)としてスコア化される。ウイルスRNAはQIAampウイルスRNAミニキット(Qiagen, Valencia, CA)を用いて各ウイルス希釈液の125μL画分からウイルスRNAを抽出し、最終液量50μLに溶出した。抽出したウイルスRNAの5μL容量を、Directigen Flu Aキットを用いた比較感受性試験においてリアルタイムRT-PCRにより試験した。
イヌインフルエンザに関するリアルタイムRT-PCRアッセイ法は、宿主細胞由来の18S rRNAならびにインフルエンザAウイルスゲノム由来のMおよびH3をターゲットとする3つの分子プローブからの情報に依拠する(表14)。宿主遺伝子の増幅は標本の品質および完全性に関するレポーターである。イヌインフルエンザ(H3N8)ウイルスを含む臨床的、剖検または実験的試料は3つのプローブを用いて増幅シグナルが得られることが期待された。Mおよび18S rRNAプローブを用いた場合は増幅シグナルを与えるがH3については陰性である標本は、ヒト、ブタもしくはトリ由来、またはH3以外の亜型に由来するインフルエンザウイルスH3亜型の指標である。これらの稀なケースは、シーケンシングによって分析することができる単位複製配列cDNAを作出するためのHA汎用プライマーを用いたRT-PCRにより解決することができる。適切に採取および取り扱われたインフルエンザAウイルスを含まない標本は、18S rRNA単位複製配列シグナルのみを与える。18S rRNAプローブおよびH3プローブのみが増幅シグナルを与える状況は、そうでないことが証明されない限り、技術が不完全であることの指標であり;Mプローブでの偽陰性またはH3での偽陽性のいずれかが実証されなければならない。最後に、3つのプローブを用いて増幅シグナルを与えられない標本は、不完全な試料の採取、変性、RNA抽出の不備、またはPCRで用いられたポリメラーゼの阻害物質の存在が示唆される。
*注:大文字=LNA(固定された核酸)残基、r=aまたはg、k=gまたはt、下線=T7プロモーター配列
* 臨床試料の亜型はヌクレオチドシーケンシングによって確認された点に留意されたい。
配列番号:1は、本発明に従って使用することができるPB2タンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(フロリダ/43/04)のヌクレオチド配列である。
配列番号:2は、配列番号:1によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:3は、本発明に従って使用することができるPB1タンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(フロリダ/43/04)のヌクレオチド配列である。
配列番号:4は、配列番号:3によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:5は、本発明に従って使用することができるPAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(フロリダ/43/04)のヌクレオチド配列である。
配列番号:6は、配列番号:5によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:7は、本発明に従って使用することができるNSタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(フロリダ/43/04)のヌクレオチド配列である。
配列番号:8は、配列番号:7によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:9は、本発明に従って使用することができるNPタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(フロリダ/43/04)のヌクレオチド配列である。
配列番号:10は、配列番号:9によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:11は、本発明に従って使用することができるNAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(フロリダ/43/04)のヌクレオチド配列である。
配列番号:12は、配列番号:11によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:13は、本発明に従って使用することができるMAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(フロリダ/43/04)のヌクレオチド配列である。
配列番号:14は、配列番号:13によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:15は、本発明に従って使用することができるHAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(フロリダ/43/04)のヌクレオチド配列である。
配列番号:16は、配列番号:15によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:17は、本発明に従って使用することができるPB2タンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(FL/242/03)のヌクレオチド配列である。
配列番号:18は、配列番号:17によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:19は、本発明に従って使用することができるPB1タンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(FL/242/03)のヌクレオチド配列である。
配列番号:20は、配列番号:19によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:21は、本発明に従って使用することができるPAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(FL/242/03)のヌクレオチド配列である。
配列番号:22は、配列番号:21によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:23は、本発明に従って使用することができるNSタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(FL/242/03)のヌクレオチド配列である。
配列番号:24は、配列番号:23によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:25は、本発明に従って使用することができるNPタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(FL/242/03)のヌクレオチド配列である。
配列番号:26は、配列番号:25によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:27は、本発明に従って使用することができるNAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(FL/242/03)のヌクレオチド配列である。
配列番号:28は、配列番号:27によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:29は、本発明に従って使用することができるMAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(FL/242/03)のヌクレオチド配列である。
配列番号:30は、配列番号:29によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:31は、本発明に従って使用することができるHAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(FL/242/03)のヌクレオチド配列である。
配列番号:32は、配列番号:31によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:33は、N末端の16のアミノ酸シグナル配列が除去されている配列番号:16に示すHAタンパク質の成熟型である。
配列番号:34は、N末端の16のアミノ酸シグナル配列が除去されている配列番号:32に示すHAタンパク質の成熟型である。
配列番号:35は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:36は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:37は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:38は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:39は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:41は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:42は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:43は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:44は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:45は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:46は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:47は、本発明に従って使用することができるPB2タンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(マイアミ/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:48は、配列番号:47によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:49は、本発明に従って使用することができるPB1タンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(マイアミ/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:50は、配列番号:49によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:51は、本発明に従って使用することができるPAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(マイアミ/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:52は、配列番号:51によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:53は、本発明に従って使用することができるNSタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(マイアミ/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:54は、配列番号:53によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:55は、本発明に従って使用することができるNPタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(マイアミ/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:56は、配列番号:55によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:57は、本発明に従って使用することができるNAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(マイアミ/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:58は、配列番号:57によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:59は、本発明に従って使用することができるMAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(マイアミ/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:60は、配列番号:59によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:61は、本発明に従って使用することができるHAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(マイアミ/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:62は、配列番号:61によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:63は、本発明に従って使用することができるPB2タンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(ジャクソンビル/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:64は、配列番号:63によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:65は、本発明に従って使用することができるPB1タンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(ジャクソンビル/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:66は、配列番号:65によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:67は、本発明に従って使用することができるPAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(ジャクソンビル/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:68は、配列番号:67によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:69は、本発明に従って使用することができるNSタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(ジャクソンビル/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:70は、配列番号:69によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:71は、本発明に従って使用することができるNPタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(ジャクソンビル/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:72は、配列番号:71によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:73は、本発明に従って使用することができるNAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(ジャクソンビル/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:74は、配列番号:73によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:75は、本発明に従って使用することができるMAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(ジャクソンビル/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:76は、配列番号:75によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:77は、本発明に従って使用することができるHAタンパク質をコードするイヌインフルエンザウイルス(ジャクソンビル/2005)のヌクレオチド配列である。
配列番号:78は、配列番号:77によってコードされるアミノ酸配列である。
配列番号:79は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:80は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:81は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:82は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:83は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:84は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:85は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:86は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:87は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
配列番号:88は、本発明に従って用いることができるオリゴヌクレオチドである。
Claims (30)
- 配列番号:34に示されるアミノ酸配列と99%またはそれよりも高い配列同一性を持つポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含み、イヌ科動物に感染することができる分離されたイヌインフルエンザウイルスであって、インフルエンザA型である、前記ウイルス。
- A/イヌ/フロリダ/242/03と命名されるウイルス分離物である、イヌ科動物に感染することができる分離されたイヌインフルエンザウイルスであって、インフルエンザA型である、前記ウイルス。
- 請求項1または2記載のイヌインフルエンザウイルスのゲノムセグメントまたは遺伝子を含み、配列番号:34に示されるアミノ酸配列と99%またはそれより高い配列同一性を持つポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチドを含む、ポリヌクレオチド発現構築物。
- 免疫原がイヌ科動物に感染することができるインフルエンザウイルスに対する免疫応答を誘発することができ、配列番号:34に示されるアミノ酸配列と99%またはそれより高い配列同一性を持つポリペプチドまたは該ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、請求項1または2記載のイヌインフルエンザウイルスの免疫原を含む組成物。
- 免疫原が無細胞のウイルス全体もしくはその一部;ウイルス性ポリヌクレオチド;ウイルス性タンパク質;ウイルス性ポリペプチドもしくはペプチド;ウイルスが感染した細胞;組換え型ウイルスベクターをベースとする構築物;リアソータントウイルス;または該ウイルスの裸の核酸を含む、請求項4記載の組成物。
- 非ヒト動物に請求項1または2記載のイヌインフルエンザウイルスに対する免疫応答を誘発するための方法であって、請求項4または5の組成物の有効量を該動物に投与する段階を含む方法。
- 免疫応答が動物のインフルエンザウイルスによる感染を予防または阻害する防御免疫応答である、請求項6記載の方法。
- 組成物がアジュバントをさらに含む、請求項6記載の方法。
- 動物がイヌ科である、請求項6記載の方法。
- イヌ科動物が飼い慣らされたイヌである、請求項9記載の方法。
- 組成物が非経口的に投与される、請求項6記載の方法。
- 組成物が経皮的、腹腔内または筋肉内に投与される、請求項11記載の方法。
- 組成物が鼻腔または経口的に投与される、請求項6記載の方法。
- 配列番号:34のアミノ酸配列または配列番号:34と95%よりも高い配列同一性を持つアミノ酸配列を含むヘマグルチニン(HA)をコードするポリヌクレオチドを含み、該HAタンパク質が、該アミノ酸配列の82位のセリン、221位のロイシン、327位のスレオニン、および482位のスレオニンを含む、イヌ科動物に感染することができる分離されたイヌインフルエンザウイルスであって、インフルエンザA型である、前記ウイルス。
- 配列番号:34のアミノ酸配列または配列番号:34と95%よりも高い配列同一性を持つアミノ酸配列を含むヘマグルチニン(HA)を含み、該HAタンパク質が、該アミノ酸配列の82位のセリン、221位のロイシン、327位のスレオニン、および482位のスレオニンを含む、イヌ科動物に感染することができる分離されたイヌインフルエンザウイルスであって、インフルエンザA型である、前記ウイルス。
- 前記ポリヌクレオチドが、配列番号:32のアミノ酸配列または配列番号:32と95%よりも高い配列同一性を持つアミノ酸配列を含むヘマグルチニン(HA)をコードする、請求項14記載のイヌインフルエンザウイルス。
- 前記ヘマグルチニン(HA)が、配列番号:32のアミノ酸配列または配列番号:32と95%よりも高い配列同一性を持つアミノ酸配列を含む、請求項15記載のイヌインフルエンザウイルス。
- 配列番号:34のアミノ酸配列と99%またはそれよりも高い配列同一性を持つポリペプチドをコードする、請求項1または2記載のイヌインフルエンザウイルスのゲノムセグメントまたは遺伝子を含む単離されたポリヌクレオチド。
- 配列番号:34のアミノ酸配列または配列番号:34と95%よりも高い配列同一性を持つアミノ酸配列を含むヘマグルチニン(HA)をコードし、該HAタンパク質が、該アミノ酸配列の82位のセリン、221位のロイシン、327位のスレオニン、および482位のスレオニンを含む、請求項1または2記載のイヌインフルエンザウイルスのゲノムセグメントまたは遺伝子を含む単離されたポリヌクレオチド。
- 配列番号:32のアミノ酸配列または配列番号:32と95%よりも高い配列同一性を持つアミノ酸配列を含むヘマグルチニン(HA)をコードする、請求項19記載のポリヌクレオチド。
- 前記ポリヌクレオチドが、配列番号:34のアミノ酸配列または配列番号:34と95%よりも高い配列同一性を持つアミノ酸配列を含むヘマグルチニン(HA)をコードし、該HAタンパク質が、該アミノ酸配列の82位のセリン、221位のロイシン、327位のスレオニン、および482位のスレオニンを含む、請求項3記載のポリヌクレオチド発現構築物。
- 前記ポリヌクレオチドが、配列番号:32のアミノ酸配列または配列番号:32と95%よりも高い配列同一性を持つアミノ酸配列を含むヘマグルチニン(HA)をコードする、請求項21記載のポリヌクレオチド発現構築物。
- 配列番号:34のアミノ酸配列と99%またはそれよりも高い配列同一性を持つ、請求項1または2記載のイヌインフルエンザウイルスのゲノムセグメントまたは遺伝子を含む単離されたポリヌクレオチドによってコードされる単離されたポリペプチド。
- 配列番号:34のアミノ酸配列または配列番号:34と95%よりも高い配列同一性を持つアミノ酸配列を含むヘマグルチニン(HA)であり、該HAタンパク質が、該アミノ酸配列の82位のセリン、221位のロイシン、327位のスレオニン、および482位のスレオニンを含む、請求項1または2記載のイヌインフルエンザウイルスのゲノムセグメントまたは遺伝子を含む単離されたポリヌクレオチドによってコードされる単離されたポリペプチド。
- 配列番号:32のアミノ酸配列または配列番号:32と95%よりも高い配列同一性を持つアミノ酸配列を含む、請求項24記載のポリペプチド。
- 前記インフルエンザウイルスが、配列番号:34のアミノ酸配列または配列番号:34と95%よりも高い配列同一性を持つアミノ酸配列を含むヘマグルチニン(HA)をコードするポリヌクレオチドを含み、該HAタンパク質が、該アミノ酸配列の82位のセリン、221位のロイシン、327位のスレオニン、および482位のスレオニンを含む、請求項4記載の組成物。
- 前記インフルエンザウイルスが、配列番号:34のアミノ酸配列または配列番号:34と95%よりも高い配列同一性を持つアミノ酸配列を含むヘマグルチニン(HA)を含み、該HAタンパク質が、該アミノ酸配列の82位のセリン、221位のロイシン、327位のスレオニン、および482位のスレオニンを含む、請求項4記載の組成物。
- 前記ポリヌクレオチドが、配列番号:32のアミノ酸配列または配列番号:32と95%よりも高い配列同一性を持つアミノ酸配列を含むヘマグルチニン(HA)をコードする、請求項26記載の組成物。
- 前記ヘマグルチニン(HA)が、配列番号:32のアミノ酸配列または配列番号:32と95%よりも高い配列同一性を持つアミノ酸配列を含む、請求項27記載の組成物。
- 請求項26〜29のいずれか一項記載の組成物の有効量を前記動物に投与する段階を含む、請求項6記載の方法。
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Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2018050636A (ja) * | 2005-04-21 | 2018-04-05 | ユニバーシティ オブ フロリダ リサーチ ファンデーション インコーポレーティッド | イヌにおける呼吸器疾患管理のための材料および方法 |
Families Citing this family (18)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
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US7959929B2 (en) | 2005-04-21 | 2011-06-14 | University Of Florida Research Foundation, Inc. | Materials and methods for respiratory disease control in canines |
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US7425336B2 (en) * | 2005-08-25 | 2008-09-16 | Mevial Limited | Canine influenza vaccines |
RS20080138A (en) | 2005-10-07 | 2009-07-15 | Pfizer Products Inc., | Vaccines and methods to treat canine influenza |
US7468187B2 (en) | 2005-10-18 | 2008-12-23 | Iowa State University Research Foundation, Inc. | Canine influenza virus and related compositions and methods of use |
CA2626489C (en) * | 2005-10-19 | 2020-10-27 | University Of Florida Research Foundation, Inc | Materials and methods for respiratory disease control in canines |
AU2013205112C1 (en) * | 2005-10-19 | 2015-12-03 | Cornell Research Foundation, Inc. | Influenza viruses able to infect canids, uses thereof |
EP1941033A2 (en) * | 2005-10-20 | 2008-07-09 | Wyeth a Corporation of the State of Delaware | Compositions and methods for the treatment of canine influenza virus disease |
GB0613977D0 (en) | 2006-02-07 | 2006-08-23 | Peptcell Ltd | Peptide sequences and compositions |
US7682619B2 (en) | 2006-04-06 | 2010-03-23 | Cornell Research Foundation, Inc. | Canine influenza virus |
WO2008070332A2 (en) | 2006-10-25 | 2008-06-12 | Intervet International B.V. | Feline influenza vaccine and method of use |
CN101838708B (zh) * | 2010-03-30 | 2012-07-18 | 华南农业大学 | 一种检测犬流感的方法 |
EP2953967B1 (en) * | 2013-02-07 | 2019-05-01 | Massachusetts Institute of Technology | Human adaptation of h5 influenza |
CN103881983B (zh) * | 2014-03-07 | 2016-08-31 | 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 | 重组犬流感病毒毒株、其制备方法及由其制备得到的疫苗 |
WO2017004453A1 (en) * | 2015-07-02 | 2017-01-05 | Indevr, Inc. | Universal priming mixture for amplification of influenza viral gene segments for diagnostic applications |
CN110592276A (zh) * | 2019-07-08 | 2019-12-20 | 北京世纪元亨动物防疫技术有限公司 | 用于检测犬流感病毒的特异性引物及试剂盒 |
CN115074461B (zh) * | 2021-03-11 | 2023-08-25 | 上海市农业科学院 | 犬流感病毒、犬冠状病毒和犬呼肠孤病毒的三重pcr检测方法 |
Family Cites Families (39)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5034322A (en) | 1983-01-17 | 1991-07-23 | Monsanto Company | Chimeric genes suitable for expression in plant cells |
US4965188A (en) | 1986-08-22 | 1990-10-23 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences using a thermostable enzyme |
US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
US4683195A (en) | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
US4800159A (en) | 1986-02-07 | 1989-01-24 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences |
US5106739A (en) | 1989-04-18 | 1992-04-21 | Calgene, Inc. | CaMv 355 enhanced mannopine synthase promoter and method for using same |
US6309647B1 (en) * | 1999-07-15 | 2001-10-30 | Aventis Pasteur | Poxvirus—canine dispemper virus (CDV) or measles virus recombinants and compositions and methods employing the recombinants |
US5756102A (en) * | 1990-11-20 | 1998-05-26 | Virogenetics Corporation | Poxvirus-canine distemper virus (CDV) recombinants and compositions and methods employing the recombinants |
US5994056A (en) | 1991-05-02 | 1999-11-30 | Roche Molecular Systems, Inc. | Homogeneous methods for nucleic acid amplification and detection |
US5612487A (en) | 1991-08-26 | 1997-03-18 | Edible Vaccines, Inc. | Anti-viral vaccines expressed in plants |
US5484719A (en) | 1991-08-26 | 1996-01-16 | Edible Vaccines, Inc. | Vaccines produced and administered through edible plants |
UA48104C2 (uk) | 1991-10-04 | 2002-08-15 | Новартіс Аг | Фрагмент днк, який містить послідовність,що кодує інсектицидний протеїн, оптимізовану для кукурудзи,фрагмент днк, який забезпечує направлену бажану для серцевини стебла експресію зв'язаного з нею структурного гена в рослині, фрагмент днк, який забезпечує специфічну для пилку експресію зв`язаного з нею структурного гена в рослині, рекомбінантна молекула днк, спосіб одержання оптимізованої для кукурудзи кодуючої послідовності інсектицидного протеїну, спосіб захисту рослин кукурудзи щонайменше від однієї комахи-шкідника |
RU2193065C2 (ru) * | 1994-03-14 | 2002-11-20 | Мерк энд Ко. Инк. | Конструкция днк (варианты), днк-вектор, иммуногенная композиция против вируса гриппа, способ индукции иммунного ответа, вакцина и способ вакцинации |
DK0752888T3 (da) * | 1994-03-30 | 2007-12-03 | Virogenetics Corp | Nukleotid- og aminosyresekvenser af gB, gC- og gD-hunde-herpesvirus og anvendelser deraf |
GB9524395D0 (en) | 1995-11-29 | 1996-01-31 | Nickerson Biocem Ltd | Promoters |
US6252139B1 (en) | 1996-07-18 | 2001-06-26 | The Salk Institute For Biological Studies | Method of increasing growth and yield in plants |
US6063385A (en) | 1997-11-07 | 2000-05-16 | Wisconsin Alumni Research Foundation | DNA vaccine for parvovirus |
US6472375B1 (en) | 1998-04-16 | 2002-10-29 | John Wayne Cancer Institute | DNA vaccine and methods for its use |
US6579528B1 (en) * | 1998-08-13 | 2003-06-17 | The University Of Pittsburgh - Of The Commonwealth System Of Higher Education | Cold-adapted equine influenza viruses |
US6482414B1 (en) * | 1998-08-13 | 2002-11-19 | The University Of Pittsburgh-Of The Commonwealth System Of Higher Education | Cold-adapted equine influenza viruses |
US6177082B1 (en) * | 1998-08-13 | 2001-01-23 | The University Of Pittsburgh-Of The Commonwealth System Of Higher Education | Cold-adapted equine influenza viruses |
CA2348665C (en) | 1998-11-24 | 2003-04-15 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Root-preferred promoters and their use |
JP2000230931A (ja) * | 1998-12-07 | 2000-08-22 | Katakura Industries Co Ltd | 家畜インフルエンザウイルスに対する抗体の検出方法およびこれに用いるキット |
DE19960843A1 (de) | 1999-12-16 | 2001-06-28 | Florian Grundler | Wurzelspezifischer Promotor |
KR20030013451A (ko) * | 2000-06-23 | 2003-02-14 | 아메리칸사이아나미드컴파니 | 인플루엔자 에이/유돈/72(에이치3엔2) 게놈의뉴클레오타이드 서열 |
US6455760B1 (en) | 2000-11-16 | 2002-09-24 | The Salk Institute Of Biological Studies | Expression of flavin-containing monoxygenases in plants |
US20040067506A1 (en) | 2000-12-04 | 2004-04-08 | Ben Scheres | Novel root specific promoter driving the expression of a novel lrr receptor-like kinase |
US20060121447A1 (en) * | 2002-04-12 | 2006-06-08 | Ilaria Capua | Purified subfragment codifying for neuroaminidase, recombinant neuroaminidase and its use in zooprophylaxis |
US7285656B2 (en) | 2002-04-26 | 2007-10-23 | Her Majesty The Queen In Right Of Canada, As Represented By The Minister Of Natural Resources Canada, Canadian Forest Service | Root-specific conifer gene promoter and its use |
US20040123349A1 (en) | 2002-12-20 | 2004-06-24 | Qi Xie | SINAT5, an Arabidopsis thaliana gene promotes ubiquitin related degradation |
CA2523676A1 (en) * | 2003-05-15 | 2005-02-17 | The Board Of Regents For Oklahoma State University | Dna vaccine expressing ha1 of equine-2 influenza virus |
CN1458168A (zh) * | 2003-06-02 | 2003-11-26 | 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 | 重组猪流感病毒np抗原、其制备方法及在诊断中的应用 |
US8592197B2 (en) | 2003-07-11 | 2013-11-26 | Novavax, Inc. | Functional influenza virus-like particles (VLPs) |
CA2606429A1 (en) * | 2005-04-21 | 2006-11-02 | University Of Florida Research Foundation, Inc. | Materials and methods for respiratory disease control in canines |
RS20080138A (en) * | 2005-10-07 | 2009-07-15 | Pfizer Products Inc., | Vaccines and methods to treat canine influenza |
US7468187B2 (en) * | 2005-10-18 | 2008-12-23 | Iowa State University Research Foundation, Inc. | Canine influenza virus and related compositions and methods of use |
CA2626489C (en) * | 2005-10-19 | 2020-10-27 | University Of Florida Research Foundation, Inc | Materials and methods for respiratory disease control in canines |
EP1941033A2 (en) * | 2005-10-20 | 2008-07-09 | Wyeth a Corporation of the State of Delaware | Compositions and methods for the treatment of canine influenza virus disease |
US7682619B2 (en) * | 2006-04-06 | 2010-03-23 | Cornell Research Foundation, Inc. | Canine influenza virus |
-
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