JP5975074B2 - データ表示方法、プログラム、データ解析装置及び微小粒子分析システム - Google Patents

データ表示方法、プログラム、データ解析装置及び微小粒子分析システム Download PDF

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Description

本発明は、データ表示方法、プログラム、データ解析装置及び微小粒子分析システムに関する。より詳しくは、微小粒子から発せられる蛍光の種類などを分析する技術に関する。
一般に、細胞、微生物及びリポソームなどの生体関連微小粒子を分析する場合は、フローサイトメトリー(フローサイトメーター)が利用されている(例えば、非特許文献1参照。)。フローサイトメトリーは、流路内を1列になって通流する微小粒子に特定波長のレーザ光(励起光)を照射して、各微小粒子から発せられた蛍光や散乱光を検出することにより、複数の微小粒子を1個ずつ分析する方法である。このフローサイトメトリーでは、光検出器で検出した光を電気的信号に変換して数値化し、統計解析を行うことにより、個々の微小粒子の種類、大きさ及び構造などを判定することができる。
また、近年、フローサイトメトリーにおいて、複数の蛍光色素を使用したマルチカラー分析が普及してきている(例えば、特許文献1,2参照。)。これら従来のフローサイトメータでは、通常、波長が異なる複数の光源と、各色素から発せられた光を検出するための複数の検出器を備えている。一方、蛍光色素はスペクトルを持つため、マルチカラー分析のように一度の測定で複数の蛍光色素を使用すると、検出器に目的以外の蛍光色素からの光が漏れ込み、分析精度が低下する。そこで、従来のフローサイトメータでは、目的の蛍光色素からの光情報のみを取り出すため、光検出器で検出した光を電気的信号に変換して数値化する際に、数学的な補正、即ち、蛍光補正を行っている。
特開2006−230333号公報 特表2008−500558号公報
中内啓光監修,「細胞工学別冊 実験プロトコルシリーズ フローサイトメトリー自由自在」,第2版,株式会社秀潤社,2006年8月31日発行
前述したように、蛍光色素はそれぞれ特有のスペクトルを持っており、そのスペクトル情報は、蛍光色素自身の特徴を表すものとして重要なデータとなる。しかしながら、従来のフローサイトメータは、目的とする蛍光色素からの光を、例えば特定のバンド幅をもつ光を受光するセンサで検出し、その検出データを対応データとして扱っているため、各蛍光色素のスペクトル情報を提示することができないという問題点がある。
そこで、本発明は、微小粒子から発せられた蛍光のスペクトラム情報を視覚で理解することができるデータ表示方法、プログラム、データ解析装置及び微小粒子分析システムを提供することを主目的とする。
本発明に係るデータ表示方法は、流路を通流する微小粒子から発せられた蛍光を、複数の波長領域で同時に検出して得た検出データを、複数の微小粒子分積算又は平均して得た蛍光スペクトルを表示する。
前記複数の微小粒子は、2以上の色素で修飾された微小粒子又はそれぞれ異なる色素で修飾された2種以上の微小粒子とすることもできる。
また、前記検出データは、複数の微小粒子を連続して検出することにより取得されたものとすることもできる。
更に、前記検出データを一旦保存し、前記保存されたデータを読み出して積算又は平均化することもできる。
更にまた、前記蛍光スペクトルの表示形態は、例えば、密度プロット、ドットプロット又は等高線プロットとすることもできる。
また、この表示方法では、前記検出データの積算数に応じて色を変えて表示することもできる。
更に、前記蛍光スペクトルから選択された特定領域のデータのみを抽出して表示してもよい。
その場合、抽出されたデータを、例えば二次元プロット表示することもできる。
更にまた、前記検出データは、電圧パルスの高さ、幅及び面積のうち少なくとも1種とすることもできる。
本発明に係るプログラムは、解析部で、流路を通流する微小粒子から発せられた蛍光を、複数の波長領域で同時に検出して得た検出データを、複数の微小粒子分積算又は平均する演算機能と、表示部に、前記演算機能により得た蛍光スペクトルを表示させる機能を、コンピュータに実行させるものである。
本発明に係るデータ解析装置は、流路を通流する微小粒子から発せられた蛍光を、複数の波長領域で同時に検出して得た検出データを、複数の微小粒子分積算又は平均して得た蛍光スペクトルを、表示装置に表示させる。
本発明に係る微小粒子分析システムは、流路を通流する微小粒子に励起光を照射する光照射部、前記微小粒子から発せられた蛍光を、複数の波長領域で同時に検出する検出部、を備える測定装置と、前記測定装置で検出した各波長領域の光を電圧パルスに変換する変換部、前記変換部で変換された電圧パルスを定量化して検出データとする解析部、を備える解析装置と、各波長領域における検出データをスペクトル表示する表示装置と、を有し、前記流路に2以上の微小粒子を通流させ、複数の微小粒子の検出データを積算又は平均して得た蛍光スペクトルを前記表示装置に表示する。
本発明によれば、微小粒子から発せられた蛍光のスペクトラム情報を提示することが可能であるため、ユーザーが測定データを視覚で理解することができる。
本発明の第2の実施形態に係る微小粒子分析装置の構成を示す図である。 測定結果の表示例を示す図である。 図2に示す表示例についてゲートをかける方法を示す図である。 ゲート後の表示例を示す図である。
以下、本発明を実施するための形態について、添付の図面を参照して詳細に説明する。なお、本発明は、以下に示す各実施形態に限定されるものではない。また、説明は、以下の順序で行う。

1.第1の実施の形態
(スペクトル表示の方法の例)
2.第2の実施の形態
(スペクトル表示する微小粒子分析装置の例)
<1.第1の実施の形態>
[全体構成]
先ず、本発明の第1の実施形態のデータ表示方法について説明する。本実施形態のデータ表示方法においては、細胞やマイクロビーズなどの微小粒子から発せられた蛍光を、複数の波長領域で同時に検出し、波長領域毎の検出データをスペクトル表示する。
[検出データ]
本実施形態のデータ表示方法では、光検出器により検出された光を、波長領域毎に電圧パルス(電気的信号)に変換し、定量化して検出データとする。具体的には、電圧パルスの高さ、幅又は面積を求めて、検出データとする。
[表示形態]
本実施形態のデータ表示方法では、前述した方法で求めた波長領域毎の検出データを、スペクトル表示する。その表示方法は、特に限定されるものではないが、例えば、密度プロット、ドットプロット又は等高線などが挙げられる。また、表示されているスペクトルから特定領域のデータのみを抽出し、そのスペクトラムチャートを拡大表示したり、ヒストグラムや二次元プロットを表示したりすることもできる。
更に、このデータ表示方法では、複数の微小粒子を連続して検出することにより取得された検出データを演算処理し、その結果を表示することも可能である。その演算処理としては、例えば、検出データを積算したり、全微粒子の検出データの平均値を算出したりすることなどが挙げられる。更にまた、本実施形態のデータ表示方法では、検出しながら表示を行うこともできるが、検出データを一旦保存し、この保存されたデータを読み出して表示してもよい。その場合も、検出データを演算処理し、その結果を表示してもよい。
従来の二次元プロットでは、蛍光補正を行っても、そのデータをユーザーが視覚で判断することは困難であった。これに対して、本実施形態のデータ表示方法では、微小粒子から発せられた蛍光のスペクトラム情報を提示することができるため、蛍光補正の有無及び蛍光補正の結果にかかわらず、ユーザーが測定データを視覚で理解することができる。また、本実施形態のデータ表示方法では、特定領域のデータを抽出することにより、微小粒子について種々の情報を得ることが可能である。
本実施形態のデータ表示方法は、微小粒子や細胞などの分析装置に限らず、例えば、製造装置、検査装置及び医療用装置などにも適用可能である。
<2.第2の実施の形態>
[装置の全体構成]
次に、本発明の第2の実施形態に係る微小粒子分析装置について説明する。図1は本実施形態の微小粒子分析装置の構成を示す図であり、図2はその測定結果の表示例を示す図である。図1に示すように、本実施形態の微小粒子分析装置1には、少なくとも、検出部2と、変換部3と、解析部4と、表示部5が設けられている。
[検出部2の構成]
検出部2は、分析対象の微小粒子から発せられた蛍光を、複数の波長領域で同時に検出可能な構成であればよい。具体的には、波長領域毎にその波長領域を検出可能なセンサを配置した構成や、多チャンネル光電子倍増管(Photo-Multiplier Tube:PMT)などのように複数の光を同時に検出可能な検出器を備えた構成とすることができる。この検出部2で検出する波長領域の数、即ち、検出部2に配設される検出器のチャンネル数又はセンサ数などは、使用する色素の数以上であればよいが、現在のマルチカラー分析では6〜8色が一般的で、最大でも10〜12色であることから、12以上であることが好ましい。
また、本実施形態の微小粒子分析装置1では、検出部2に分光器を設け、微小粒子から発せられた蛍光が、この分光器で分光された後、多チャンネルPMTなどの検出器に入射する構成としてもよい。更に、検出部2には、必要に応じて、対物レンズ、集光レンズ、ピンホール、バンドカットフィルター、ダイクロックミラーなどを設けることもできる。
[変換部3の構成]
変換部3は、検出部2で検出した各波長領域の光を、それぞれ電圧パルス(電気的信号)に変換するものであり、例えばADコンバータなどを使用することができる。
[解析部4の構成]
解析部4では、電子計算機などを用いて変換部3で変換された電圧パルスを処理して定量化し、検出データとする。具体的には、電圧パルスの高さ(peak)、幅(width)又は面積(integral)を求め、これらを検出データとして使用する。そして、その結果は、波長領域毎に関連付けられ、記憶部(図示せず)などに保存される。
[表示部5の構成]
表示部5は、解析部4での処理で得た検出データ、即ち、本実施形態の微小粒子分析装置1の測定結果を表示するものである。具体的には、表示部5には、例えば、図2に示すように、横軸に検出部のチャンネル番号をとり、縦軸に強度をとって、チャンネル毎の蛍光強度を示した「密度プロット」などが表示される。このとき、チャンネル番号が大きくなるに従い、検出波長が高くなるようにすると、検出光(蛍光)のスペクトラム情報が得られる。
[微小粒子分析装置1の動作]
次に、本実施形態の微小粒子分析装置1の動作について説明する。本実施形態の微小粒子分析装置1で分析とする微小粒子は、特に限定されるものではないが、例えば細胞やマイクロビーズなどが挙げられる。また、これら微小粒子を修飾する蛍光色素の種類及び数も、特に限定されるものではなくFITC(fluorescein isothiocyanete:C2111NOS)、PE(phycoerythrin)、PerCP(periidinin chlorophyll protein)、PE−Cy5及びPE−Cy7などの公知の色素を、必要に応じて適宜選択して使用することができる。更に、各微小粒子が複数の蛍光色素で修飾されていてもよい。
この微小粒子分析装置1を使用して微小粒子を光学的に分析する際は、先ず、光照射部の光源から励起光を出射し、流路内を通流する微小粒子に照射する。次に、微小粒子から発せられた蛍光を、検出部2で検出する。その際、例えば、微小粒子から発せられた蛍光を、プリズムや回折格子などの分光器で分光し、検出部2に配設された各センサやPMTの各チャンネルに、それぞれ異なる波長領域の光を入射させる。
その後、検出部2において取得された各波長領域のデータは、変換部3で電圧パルスに変換され、更に、解析部4において定量化され、保存される。そして、その結果は、例えば図2に示す「密度プロット」などの形式で、表示部5に表示される。なお、図2に示す「密度プロット」は、32チャンネルPMTを使用し、FITCのみで修飾されているサンプル、PEのみで修飾されているサンプル及びNegativeサンプルを混合したものを測定した結果である。
この「密度プロット」は、横軸にPMTのチャンネル番号(波長依存番号)をとり、縦軸に蛍光強度をとって、積算数0を青色とし、積算数が増す、即ち、密度が高くなるに従い赤色になるようにしている。このとき、検出波長が最も小さいチャンネルの番号を1とし、番号が大きくなるに従い検出波長が高くなるようにすれば、蛍光スペクトルに相当する情報が得られる。そして、このスペクトラム情報から、ユーザーは、サンプルが何の蛍光にラベルされているかを認識することができる。
更に、本実施形態の微小粒子分析装置1では、図2に示すデータについて、特定のサンプル群だけを選び出し、そのサンプル(微小粒子)のみのデータを抽出し表示するゲーティングを行うこともできる。その際の表示形態は特に限定されるものではなく、ヒストグラム、二次元プロット及びスペクトラムチャートなど、種々の形態で表示することが可能である。図3は図2に示す表示例についてゲートをかける方法を示す図であり、図4はゲート後の表示例を示す図である。従来のフローサイトメータでは、通常、二次元プロットに対してゲーティング処理を行っているため、2チャンネル分の情報にのみゲートをかけることとなる。
これに対して、図3に示すように、本実施形態の微小粒子分析装置1では、蛍光スペクトルについて、例えば10チャンネル分まとめてゲートをかける。そして、図4に示すように、ゲーティングしたサンプルのデータを、スペクトラムプロットで、ドットプロットモードにしたり、色を変化させたりすることも可能である。これにより、より明示的なゲーティングを実現することが可能であり、そのデータをユーザーが明確に確認することができる。また、ゲーティングしたサンプルのデータを、二次元プロットで表示することも可能である。
また、蛍光スペクトルに基づきゲートする領域を選択できるため、例えば1つの微小粒子に2種類の蛍光色素が固定されているのか、それぞれ異なる蛍光色素で修飾された2個の微小粒子を含むのかも、容易に切り分けることができる。更に、他の蛍光色素からの漏れ込みがない部分をゲーティングすることにより、蛍光補正の有無及び蛍光補正の結果にかかわらず、ユーザーは、視覚によって、表示されているデータから、種々の情報を得ることが可能である。
なお、本実施形態の微小粒子分析装置1では、前述した「密度プロット」、「ドットプロット」だけでなく、「等高線プロット」、「二次元プロット」、「二次元ヒストグラム」などを表示することも可能である。また、複数の微小粒子を連続して測定し、検出部2で検出されたデータを随時積算し、表示部5に表示されている蛍光スペクトルにリアルタイムで反映させることもできる。更に、保存されたデータを読み出して使用して表示したり、複数の微小粒子を連続して測定した結果を一旦保存し、全サンプルの平均値を使用して表示したりすることもできる。
1 微小粒子分析装置
2 検出部
3 変換部
4 解析部
5 表示部

Claims (14)

  1. 流路を通流する微小粒子から発せられた蛍光を、複数の波長領域で同時に検出して得た検出データについて検出回数を積算して波長をパラメーターとしてスペクトル表示し、
    前記蛍光スペクトルから選択され、ゲーティング処理された領域のデータのみを抽出して表示するデータ表示方法。
  2. 前記蛍光スペクトルは、前記波長領域と前記検出データに基づく蛍光強度を軸として表示され、
    前記蛍光スペクトルに対する特定の蛍光強度範囲の選択に応じて前記特定の波長領域に含まれ、かつ前記蛍光強度範囲に含まれるデータのみを抽出して表示する請求項1に記載のデータ表示方法。
  3. 抽出されたデータを二次元プロット表示する請求項1又は2に記載のデータ表示方法。
  4. 前記蛍光スペクトルは、前記波長領域と前記検出データに基づく蛍光強度を軸として表示され、
    前記得られた検出データの複数の微小粒子分の積算は、特定の波長領域及び蛍光強度が検出された微小粒子の積算数として前記蛍光スペクトル上に表示される請求項1〜3のいずれか1項に記載のデータ表示方法。
  5. 前記検出データの積算数に応じて色を変えて表示する請求項4に記載のデータ表示方法。
  6. 前記微小粒子の積算数は、最小の点を青色で、最小の点から増加するに従い赤色で表示する請求項4又は5に記載のデータ表示方法。
  7. 前記検出データは、電圧パルスの高さ、幅及び面積のうち少なくとも1種である請求項1〜6のいずれか1項に記載のデータ表示方法。
  8. 流路を通流する微小粒子から発せられた蛍光を、複数の波長領域で同時に検出して得た検出データについて検出回数を積算して波長をパラメーターとしてスペクトル表示し、
    前記表示される蛍光スペクトルは、前記波長領域と前記検出データに基づく蛍光強度を軸として表示され、
    前記得られた検出データの複数の微小粒子分の積算は、特定の波長領域及び蛍光強度が検出された微小粒子の積算数として前記蛍光スペクトル上に表示されるデータ表示方法。
  9. 前記蛍光スペクトルから選択され、ゲーティング処理された領域のデータのみを抽出して表示する請求項8に記載のデータ表示方法。
  10. 前記微小粒子の積算数は、色の違いにより可視化される請求項8又は9に記載のデータ表示方法。
  11. 流路を通流する微小粒子から発せられた蛍光を、複数の波長領域で同時に検出して得た検出データについて検出回数を積算して波長をパラメーターとして、表示装置にスペクトル表示させ、
    前記蛍光スペクトルから選択され、ゲーティング処理された領域のデータのみを抽出し、表示装置に表示させるデータ解析装置。
  12. 流路を通流する微小粒子から発せられた蛍光を、複数の波長領域で同時に検出して得た検出データについて検出回数を積算して波長をパラメーターとして、表示装置にスペクトル表示させ、
    前記表示される蛍光スペクトルは、前記波長領域と前記検出データに基づく蛍光強度を軸として表示され、
    前記得られた検出データの複数の微小粒子分の積算は、特定の波長領域及び蛍光強度が検出された微小粒子の積算数として前記蛍光スペクトル上に表示されるデータ解析装置。
  13. 流路を通流する微小粒子に励起光を照射する光照射部、
    前記微小粒子から発せられた蛍光を、複数の波長領域で同時に検出する検出部、
    を備える測定装置と、
    前記測定装置で検出した各波長領域の光を電圧パルスに変換する変換部、
    前記変換部で変換された電圧パルスを定量化して検出データとする解析部、
    を備える解析装置と、
    各波長領域における検出データをスペクトル表示する表示装置と、
    を有し、
    前記表示装置は、複数の微小粒子の検出データについて検出回数を積算して波長をパラメーターとしてスペクトル表示し、前記蛍光スペクトルから選択され、ゲーティング処理された領域のデータのみを抽出して表示する微小粒子分析システム。
  14. 流路を通流する微小粒子に励起光を照射する光照射部、
    前記微小粒子から発せられた蛍光を、複数の波長領域で同時に検出する検出部、
    を備える測定装置と、
    前記測定装置で検出した各波長領域の光を電圧パルスに変換する変換部、
    前記変換部で変換された電圧パルスを定量化して検出データとする解析部、
    を備える解析装置と、
    各波長領域における検出データをスペクトル表示する表示装置と、
    を有し、
    前記表示装置は、複数の微小粒子の検出データについて検出回数を積算して波長をパラメーターとしてスペクトル表示し、
    前記表示される蛍光スペクトルは、前記波長領域と前記検出データに基づく蛍光強度を軸として表示され、
    前記得られた検出データの複数の微小粒子分の積算は、特定の波長領域及び蛍光強度が検出された微小粒子の積算数として前記蛍光スペクトル上に表示される微小粒子分析システム。
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